isoform	chrom	strand	length	exons	structural_category	associated_gene	associated_transcript	ref_length	ref_exons	diff_to_TSS	diff_to_TTS	diff_to_gene_TSS	diff_to_gene_TTS	subcategory	RTS_stage	all_canonical	min_sample_cov	min_cov	min_cov_pos	sd_cov	FL	n_indels	n_indels_junc	bite	iso_exp	gene_exp	ratio_exp	FSM_class	coding	ORF_length	CDS_length	CDS_start	CDS_end	CDS_genomic_start	CDS_genomic_end	predicted_NMD	perc_A_downstream_TTS	seq_A_downstream_TTS	dist_to_cage_peak	within_cage_peak	pos_cage_peak	dist_to_polya_site	within_polya_site	polyA_motif	polyA_dist	ORF_seq	TSS_genomic_coord	TTS_genomic_coord	experiment_id	entry_id	LRGASP_id
tx.1	chr1	-	818	5	FSM	ENSMUSG00000033845.14	ENSMUST00000130201.8	1894	5	-17	1093	12	137	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_1	911.97762445139	408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGAGTCCCTGGTCTTTTT	1632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4855950	4844521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_4844740_4847747_4847872_4852790_4852957_4854173_4854329_4855795
tx.10	chr1	+	1886	4	ISM	ENSMUSG00000033813.16	ENSMUST00000165720.3	2854	10	33919	0	33919	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1602	junction_3	172.83711021267	766	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTTTTTGTCTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4962179	4968132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_4962293_4963639_4963787_4965156_4965229_4966578
tx.100	chr1	-	1165	8	NNC	ENSMUSG00000026134.12	novel	1975	14	NA	NA	247	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	37	junction_7	107.409572788139	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGCAAGTGGGAGTCTT	8824	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33660976	33492888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_33493386_33503133_33503203_33519538_33519622_33523762_33523890_33551096_33551283_33553225_33553299_33572376_33572445_33660914
tx.10000	chr2	-	1049	9	ISM	ENSMUSG00000037197.12	ENSMUST00000040314.12	1599	12	6582	2	-5822	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1239	junction_6	100.601239430735	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGCTCTCTGGTTGTTT	3545	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11601491	11590249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_11590540_11590644_11590718_11591677_11591777_11592531_11592606_11593738_11593903_11595499_11595642_11598218_11598276_11600141_11600240_11601439
tx.10001	chr2	+	1587	7	FSM	ENSMUSG00000047909.12	ENSMUST00000056108.12	1618	7	31	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_3	18.7742435858871	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTTGGCCTATTCAATT	4799	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11783332	11795136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_11783714_11784487_11784709_11786287_11786331_11788451_11788561_11789101_11789264_11791034_11791114_11794544
tx.10002	chr2	+	1314	4	ISM	ENSMUSG00000047909.12	ENSMUST00000156067.8	1485	7	4705	0	-20	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_2	12.7104506432917	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTTGGCCTATTCAATT	9546	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11788079	11795136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_11788561_11789101_11789264_11791034_11791114_11794544
tx.10003	chr2	+	630	2	FSM	ENSMUSG00000047909.12	ENSMUST00000142622.2	534	2	107	-203	107	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTTGGCCTATTCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11791075	11795136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_11791114_11794544
tx.10004	chr2	-	2054	15	FSM	ENSMUSG00000026767.13	ENSMUST00000028105.13	2344	15	33	257	-2	112	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_11	25.5990473355904	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTATGTGGGAACTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12424248	12352330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_12353015_12355739_12355812_12360087_12360176_12361715_12361789_12369257_12369331_12386913_12386995_12391419_12391491_12400989_12401070_12402303_12402378_12404833_12404949_12405835_12405888_12408808_12408980_12410670_12410732_12414811_12414892_12423969
tx.10005	chr2	-	1425	8	NIC	ENSMUSG00000026767.13	novel	1843	10	NA	NA	0	112	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	20	junction_7	51.1843407175855	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTATGTGGGAACTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12424252	12352330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_12353015_12355739_12355812_12360087_12360176_12361715_12361789_12369257_12369331_12386913_12386995_12391419_12391491_12423969
tx.10006	chr2	+	1314	4	NIC	ENSMUSG00000026730.13	novel	3571	5	NA	NA	9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	7	junction_1	21.1712593442672	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATGTGTTTTCCACTTAT	4721	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12928860	13006425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_12929010_12985103_12985370_12999560_12999702_13005667
tx.10007	chr2	+	1811	5	FSM	ENSMUSG00000026730.13	ENSMUST00000134794.8	3571	5	-35	1795	-5	46	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	18.3490462967425	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGACTTTGGCTTTCTG	4728	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12928867	13006471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_12929010_12982970_12983429_12985103_12985370_12999560_12999702_13005667
tx.10008	chr2	-	1510	9	FSM	ENSMUSG00000026727.11	ENSMUST00000028059.9	1546	9	81	-45	-1	45	multi-exon	FALSE	canonical	3	310	junction_5	20.3588893361106	334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGGGTGTGCACATTTTTT	7124	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13276145	13081777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_13082419_13174808_13174942_13221580_13221696_13221999_13222083_13223819_13223939_13229115_13229237_13246555_13246607_13275721_13275834_13276010
tx.10009	chr2	-	1576	10	NIC	ENSMUSG00000026723.11	novel	3788	11	NA	NA	0	-2097	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	4	junction_9	11.4998658070539	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATGATCCTTAGAAAATTA	9034	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13549474	13515921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_13516502_13520825_13520956_13521469_13521528_13524566_13524911_13526073_13526158_13526888_13526959_13527634_13527701_13528236_13528309_13530428_13530506_13549379
tx.1001	chr1	+	1824	12	FSM	ENSMUSG00000026546.17	ENSMUST00000085894.12	1908	12	83	1	-9	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_1	6.26415751889171	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACAGCTCCACTTCACTG	5505	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172348693	172373436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_172348749_172355356_172355483_172357376_172357520_172359647_172359793_172360097_172360269_172361512_172361692_172362777_172362908_172366045_172366193_172368053_172368168_172368751_172368946_172372658_172372884_172373241
tx.10010	chr2	+	1835	9	FSM	ENSMUSG00000026728.10	ENSMUST00000028062.8	2193	9	358	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	229	junction_1	35.7786161694384	454	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGGTGTGTTATTTTA	79	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13579120	13587637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_13579806_13580351_13580413_13583223_13583320_13583399_13583562_13584231_13584358_13584828_13585050_13585450_13585495_13586423_13586510_13587283
tx.10011	chr2	+	692	4	ISM	ENSMUSG00000026728.10	ENSMUST00000148248.3	535	5	662	-348	662	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	288	junction_2	15.9373774505092	280	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGGTGTGTTATTTTA	2061	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13584841	13587637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_13585050_13585450_13585495_13586423_13586510_13587283
tx.10012	chr2	-	1050	4	NNC	ENSMUSG00000063275.16	novel	871	6	NA	NA	10764	460	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	45.7626728046147	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAATATCAGTGTTGGACG	9840	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14050067	14031181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_14031818_14040589_14040769_14049593_14049683_14049921
tx.10013	chr2	-	843	5	NNC	ENSMUSG00000063275.16	novel	871	6	NA	NA	36	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	42.8018691180654	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATTGCATTGTTTCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14060795	14031641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_14031818_14040589_14040769_14049593_14049683_14049921_14050067_14060541
tx.10014	chr2	-	806	2	FSM	ENSMUSG00000086657.3	ENSMUST00000152524.2	801	2	77	-82	-9	82	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATATGTTATGGATTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14078668	14075060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_14075592_14078393
tx.10015	chr2	+	697	6	ISM	ENSMUSG00000026718.18	ENSMUST00000028050.14	3981	13	-77	15752	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	230	junction_4	11.9766439372639	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGAAGAAGATTTAGCCA	4696	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14078922	14133424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_14079148_14107211_14107297_14120627_14120704_14120788_14120885_14122199_14122347_14133356
tx.10016	chr2	+	2885	14	FSM	ENSMUSG00000026718.18	ENSMUST00000102960.11	5000	14	21	2094	11	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	181	junction_8	24.7443735759998	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATATTCTGATTTTGTTT	4703	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14078929	14152351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_14079148_14107211_14107297_14120627_14120704_14120788_14120885_14122199_14122347_14133356_14133448_14133789_14133983_14135834_14135930_14139163_14139253_14142297_14142386_14142946_14143002_14143766_14143921_14146512_14146689_14151029
tx.10017	chr2	-	2441	11	FSM	ENSMUSG00000026707.16	ENSMUST00000028034.15	2897	11	-19	475	13	-475	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_2	8.53287759199674	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTGAAAGGTGAAGTCT	959	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15054110	15000416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_15001358_15002977_15003104_15014220_15014370_15017950_15018096_15034839_15034960_15041085_15041168_15042884_15043039_15044543_15044654_15047037_15047118_15051958_15052115_15053732
tx.10018	chr2	-	1372	5	ISM	ENSMUSG00000026707.16	ENSMUST00000028034.15	2897	11	-21	42451	11	-1147	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_4	7.69334127671456	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAAACCTGAAGTATAAC	957	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15054112	15042392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_15043039_15044543_15044654_15047037_15047118_15051958_15052115_15053732
tx.10019	chr2	+	1048	6	FSM	ENSMUSG00000017418.15	ENSMUST00000239125.2	3608	6	-11	2571	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_3	13.7346277707115	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCTGACATCTGAAGTTT	4730	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15060122	15081406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_15060386_15072949_15073011_15074630_15074779_15077934_15078019_15079772_15079925_15081066
tx.10020	chr2	+	2773	14	FSM	ENSMUSG00000026748.14	ENSMUST00000028081.13	6947	14	18	4156	18	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_8	9.12179261942059	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCGACACTTTTGGTTCAA	117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16361132	16756494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_16362049_16516832_16517045_16552927_16553075_16570146_16570217_16643397_16643521_16654919_16655039_16665584_16665685_16674304_16674401_16674633_16674716_16708127_16708195_16716892_16717041_16718480_16718520_16734063_16734225_16756001
tx.10021	chr2	-	282	2	Intergenic	novelGene_748	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGAGAGTTTAGCACTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17933131	17910471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_17910715_17933092
tx.10022	chr2	+	1267	2	Intergenic	novelGene_749	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTTGTTAGTCTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17940957	17952121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_17941086_17950982
tx.10023	chr2	+	606	3	Intergenic	novelGene_750	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATGGCCAATTTATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17940957	17957560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_17941086_17951431_17951592_17957242
tx.10024	chr2	-	692	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000054057.3	novel	363	2	NA	NA	13	5599	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGAACTACAACTATCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18033558	18024404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_18024617_18028048_18028201_18033230
tx.10025	chr2	+	674	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000054057.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTACTTGTTTGAAGGC	4480	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18032445	18033222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_18032675_18032777
tx.10026	chr2	+	520	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000054057.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTACTTGTTTGAAGGC	4488	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18032453	18033222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_18032675_18032923
tx.10027	chr2	-	540	2	NNC	ENSMUSG00000054057.3	novel	3217	2	NA	NA	280	234	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGGGCTCGGGTTCCTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18033291	18032502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_18032669_18032917
tx.10028	chr2	+	612	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000054074.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCTGACTCACAGACTTC	3240	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18052255	18053840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_18052359_18052997_18053097_18053430
tx.10029	chr2	+	811	4	ISM	ENSMUSG00000026743.17	ENSMUST00000153279.2	651	6	-207	27048	-9	17588	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_3	72.0061725749181	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTACTGGCTTACGTAC	4633	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18069437	18087654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_18069676_18069845_18070006_18075935_18076016_18087321
tx.10030	chr2	+	973	8	ISM	ENSMUSG00000026743.17	ENSMUST00000114680.9	3543	23	-95	84740	-44	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_1	45.5299856340493	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTGGATCCATCACTTAA	4598	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18069402	18131041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_18069676_18069845_18070006_18075935_18076016_18106268_18106324_18114592_18114703_18127055_18127160_18128529_18128624_18130944
tx.10031	chr2	-	994	2	ISM	ENSMUSG00000026740.13	ENSMUST00000148401.8	456	3	-237	21022	-237	459	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTTTGGGCTTGTTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18224605	18221486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_18222137_18224261
tx.10032	chr2	+	386	2	Intergenic	novelGene_751	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTTAAGGAGAGAGGAAAA	4687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18458455	18458964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_18458528_18458650
tx.10033	chr2	-	267	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000051154.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTATGTTTGTTTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18677201	18673378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_18673591_18677146
tx.10034	chr2	+	920	8	FSM	ENSMUSG00000051154.12	ENSMUST00000061158.5	935	8	7	8	-3	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	388	junction_2	22.7909756576714	1256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCGGCATTCTGTTTGGAG	67	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18677240	18681034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_18677415_18678705_18678818_18678935_18679000_18679091_18679127_18679466_18679528_18679619_18679677_18679760_18679821_18680677
tx.10035	chr2	-	664	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037683.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGTTTTCCATTTTAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19297312	19293282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_19293794_19297159
tx.10036	chr2	+	1196	5	FSM	ENSMUSG00000023094.15	ENSMUST00000023856.9	1196	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_1	15.0996688705415	526	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTTGTCTCAGTCTGT	4784	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19376446	19399787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_19376591_19382972_19383074_19388051_19388129_19398018_19398167_19399061
tx.10037	chr2	+	953	4	NNC	ENSMUSG00000036617.18	novel	3074	4	NA	NA	-173	5920	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_3	82.3097132110718	89	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGGTTGTGATGTCTG	4623	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20524428	20673047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_20524739_20534769_20535054_20666708_20666908_20672887
tx.10038	chr2	+	1223	2	FSM	ENSMUSG00000075514.5	ENSMUST00000126967.2	854	2	-17	-352	-17	352	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTGTATATTTGTGATTT	3592	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20973847	20975160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_20974195_20974284
tx.10039	chr2	+	2604	3	FSM	ENSMUSG00000048550.18	ENSMUST00000054591.10	3899	3	21	1274	6	456	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	4.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCATTTGCTTTATTTTAT	4805	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21210555	21218546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_21210657_21214695_21214853_21216200
tx.10040	chr2	+	1599	11	FSM	ENSMUSG00000026784.15	ENSMUST00000053729.14	1642	11	40	3	-33	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	239	junction_4	19.641792178923	435	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAAGTGGTTTGTCTTTGTTT	5648	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22785573	22830275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_22785775_22791292_22791358_22791764_22791886_22796806_22796938_22802611_22802754_22805213_22805326_22805426_22805537_22819551_22819633_22819755_22819870_22825570_22825652_22829834
tx.10041	chr2	+	1501	10	NIC	ENSMUSG00000026784.15	novel	1642	11	NA	NA	27	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	31	junction_8	77.9635875755748	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTTTGTCTTTGTTTCAC	5635	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22785560	22830278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_22785775_22791292_22791358_22791764_22791886_22796806_22796938_22802611_22802754_22805213_22805326_22805426_22805537_22819551_22819633_22825570_22825652_22829834
tx.10042	chr2	-	3061	10	FSM	ENSMUSG00000058835.15	ENSMUST00000126112.8	3360	10	8	291	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_4	54.5400521080666	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGATATTGTTAAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22930199	22830375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_22832060_22836587_22836774_22840195_22840283_22843446_22843624_22847029_22847131_22850718_22850860_22852412_22852514_22861094_22861272_22884534_22884703_22929960
tx.10043	chr2	-	2979	9	FSM	ENSMUSG00000058835.15	ENSMUST00000149719.8	3303	9	46	278	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_2	106.193220122567	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGATATTGTTAAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22930207	22830375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_22832060_22836587_22836774_22843446_22843621_22847029_22847131_22850718_22850860_22852412_22852514_22861094_22861272_22884534_22884703_22929960
tx.10044	chr2	-	3058	10	FSM	ENSMUSG00000058835.15	ENSMUST00000140164.8	3403	10	54	291	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_4	62.0443887296789	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGATATTGTTAAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22930199	22830375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_22832060_22836587_22836774_22840195_22840283_22843446_22843621_22847029_22847131_22850718_22850860_22852412_22852514_22861094_22861272_22884534_22884703_22929960
tx.10045	chr2	+	372	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000058835.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGGATGAATGAAAGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22892964	22893576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_22893029_22893268
tx.10046	chr2	+	3574	13	FSM	ENSMUSG00000026781.18	ENSMUST00000028121.15	3630	13	56	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	26.6993289553627	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTAACTGTATTGACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22958235	23004525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_22958299_22959462_22959632_22965501_22965623_22968155_22968229_22970350_22970466_22977496_22977632_22979602_22979801_22980487_22980595_22984300_22984530_22989573_22989777_23000256_23000299_23000665_23000776_23002516
tx.10047	chr2	+	424	4	ISM	ENSMUSG00000026781.18	ENSMUST00000227809.2	1986	13	24	34690	-10	-2238	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_1	31.3723161756065	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAGGGAAAATAATTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22958236	22968227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_22958299_22959462_22959632_22965501_22965623_22968155
tx.10048	chr2	+	3703	13	FSM	ENSMUSG00000026781.18	ENSMUST00000114526.9	3725	13	17	5	13	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	24.981103969912	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAATGCTAACTGTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22959096	23004520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_22959297_22959462_22959632_22965501_22965623_22968155_22968229_22970350_22970466_22977496_22977632_22979602_22979801_22980487_22980595_22984300_22984530_22989576_22989777_23000256_23000299_23000665_23000776_23002516
tx.10049	chr2	+	2496	5	ISM	ENSMUSG00000026781.18	ENSMUST00000114523.10	3632	12	25059	-3	185	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	30.7926533445885	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTAACTGTATTGACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22984397	23004525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_22984530_22989573_22989777_23000256_23000299_23000665_23000776_23002516
tx.10050	chr2	+	2485	5	ISM	ENSMUSG00000026781.18	ENSMUST00000114526.9	3725	13	25321	5	188	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	27.8926513619627	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAATGCTAACTGTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22984400	23004520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_22984530_22989576_22989777_23000256_23000299_23000665_23000776_23002516
tx.10051	chr2	-	1225	7	FSM	ENSMUSG00000026779.7	ENSMUST00000136207.2	1201	7	-21	-3	-21	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	131	junction_4	13.2759180473518	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGTTGTGATACTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23045930	23026692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_23027056_23029919_23030068_23030510_23030618_23035375_23035465_23036053_23036194_23040999_23041138_23045690
tx.10052	chr2	+	2942	19	FSM	ENSMUSG00000026775.10	ENSMUST00000028117.4	4707	19	146	1619	-3	-1619	multi-exon	TRUE	canonical	3	665	junction_5	65.7463325738674	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTACTATCTCACTGACAA	7219	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23046526	23087653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_23046744_23050203_23050336_23052512_23052676_23054510_23054610_23058296_23058407_23062967_23063119_23065180_23065265_23071037_23071121_23073224_23073316_23076189_23076343_23076877_23077011_23077791_23077855_23081024_23081138_23082418_23082575_23083099_23083252_23084528_23084656_23084746_23084821_23085333_23085421_23086899
tx.10053	chr2	-	1389	4	ISM	ENSMUSG00000026976.16	ENSMUST00000028355.11	2560	12	39707	-5	10008	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTATCTTGGGATGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24325904	24310566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_24311637_24312980_24313068_24319538_24319641_24325774
tx.10054	chr2	-	1415	3	ISM	ENSMUSG00000004113.19	ENSMUST00000100348.10	7182	47	154684	-22	-829	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTACTGCCTTCCTGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24498375	24496364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_24497113_24497453_24497699_24497953
tx.10055	chr2	-	1380	4	NNC	ENSMUSG00000004113.19	novel	9655	46	NA	NA	-1278	28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.09120616516523	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTCCTGGGTTCCATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24498824	24496358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_24497113_24497453_24497699_24497953_24498159_24498648
tx.10056	chr2	-	1661	4	ISM	ENSMUSG00000036893.18	ENSMUST00000134775.3	1971	9	4276	-359	4276	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	248	junction_2	12.9185482500507	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACTTTAAATGGAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24692091	24680795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_24682143_24682292_24682469_24691518_24691598_24692032
tx.10057	chr2	-	841	4	ISM	ENSMUSG00000036893.18	ENSMUST00000102938.10	4680	27	-7	86298	0	-13562	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_3	43.2075096353503	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATCTGGTCAACCATCG	9606	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24809610	24767466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_24767639_24774157_24774715_24777014_24777082_24809565
tx.10058	chr2	-	450	2	NNC	ENSMUSG00000036893.18	novel	5953	27	NA	NA	3	-49114	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTATTTATGTGTGAGA	9593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24809623	24803018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_24803411_24809565
tx.10059	chr2	-	1615	8	FSM	ENSMUSG00000026972.16	ENSMUST00000028349.14	1666	8	51	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_2	7.55658923167897	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGCGAGTGGCTGGCCT	9368	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24825213	24815363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_24815689_24815767_24816207_24816283_24816461_24816556_24816740_24816889_24817045_24817137_24817189_24817740_24817852_24825039
tx.10060	chr2	-	1262	8	NNC	ENSMUSG00000026972.16	novel	1666	8	NA	NA	-21	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_2	26.6182383384945	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGCGAGTGGCTGGCCT	9360	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24825221	24815363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_24815689_24815767_24815846_24816283_24816461_24816556_24816740_24816889_24817045_24817137_24817189_24817740_24817852_24825039
tx.10061	chr2	-	1502	7	NIC	ENSMUSG00000026972.16	novel	1666	8	NA	NA	-11	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_6	24.8445164976097	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGCGAGTGGCTGGCCT	9370	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24825211	24815363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_24815689_24815767_24816207_24816283_24816461_24816556_24816740_24816889_24817045_24817137_24817189_24825039
tx.10062	chr2	+	813	3	ISM	ENSMUSG00000026974.12	ENSMUST00000148042.3	1103	6	3034	-150	3034	150	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	887	junction_2	9.5	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGTCGTGTAGTCAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24843255	24849428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_24843389_24848047_24848229_24848929
tx.10063	chr2	+	580	2	ISM	ENSMUSG00000026974.12	ENSMUST00000148042.3	1103	6	7926	-150	7926	150	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	887	junction_1	0	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGTCGTGTAGTCAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24848147	24849428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_24848229_24848929
tx.10064	chr2	+	1633	9	NIC	ENSMUSG00000026975.11	novel	1666	9	NA	NA	-5	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	39	junction_3	28.4250659629841	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGTGTATGCATCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24852447	24862175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_24852638_24853034_24853169_24853467_24853556_24855568_24855667_24856513_24856687_24858896_24858967_24859061_24859128_24859517_24859691_24861534
tx.10065	chr2	-	740	2	FSM	ENSMUSG00000036850.5	ENSMUST00000045604.4	776	2	34	2	34	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_1	0	2742	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTATGTGTTTTGAATCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24865076	24864130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_24864694_24864899
tx.10066	chr2	-	732	3	NNC	ENSMUSG00000103217.2	novel	2051	2	NA	NA	-2567	-1705	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTATATTCTGTCATAA	4305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25075918	25072497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_25072894_25074976_25075202_25075807
tx.10067	chr2	-	2552	13	FSM	ENSMUSG00000013465.20	ENSMUST00000059849.15	2637	13	81	4	-27	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	539	junction_7	54.5501807716732	257	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGGTGAGGAATCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25101420	25089727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25090479_25090670_25090780_25091056_25091199_25093152_25093260_25093359_25093503_25093898_25093995_25094209_25094313_25095138_25095252_25096171_25096358_25099865_25100097_25100449_25100550_25100720_25100885_25101113
tx.10068	chr2	-	1424	3	NIC	ENSMUSG00000013465.20	novel	2637	13	NA	NA	-31	-4422	intron_retention	FALSE	canonical	3	611	junction_2	30	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAACCAAAAAACCAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25101424	25099600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_25100550_25100720_25100885_25101113
tx.10069	chr2	-	1459	3	ISM	ENSMUSG00000036752.5	ENSMUST00000043584.5	1598	4	438	2	390	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1343	junction_2	31.5	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTCGCCTGTCCAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25114276	25112173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_25113381_25113945_25114057_25114135
tx.1007	chr1	-	260	2	FSM	ENSMUSG00000026526.15	ENSMUST00000130996.2	539	2	277	2	277	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1049	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCTTTTTAAAATTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	175431574	175428943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_175429133_175431503
tx.10070	chr2	-	1551	4	FSM	ENSMUSG00000036752.5	ENSMUST00000043584.5	1598	4	45	2	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1343	junction_2	25.8499946271217	4060	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTCGCCTGTCCAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25114669	25112173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25113381_25113945_25114057_25114135_25114245_25114545
tx.10071	chr2	-	1081	4	ISM	ENSMUSG00000006469.14	ENSMUST00000006638.8	2183	13	3169	-1	1851	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_2	0.942809041582063	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGAGTGTTGGCTTTCTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25121207	25118908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_25119528_25120584_25120710_25120784_25120902_25120987
tx.10072	chr2	+	413	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036731.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCTTTAGTGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25130856	25131435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_25130956_25131121
tx.10073	chr2	+	1698	2	NNC	ENSMUSG00000044628.6	novel	1137	2	NA	NA	-624	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	42	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCACTTGTTCACTGATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25132316	25134272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_25132536_25132793
tx.10074	chr2	-	2378	14	NIC	ENSMUSG00000006471.19	novel	2336	14	NA	NA	5	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_13	51.3601968696111	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCTCACTTCTCTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25145390	25137234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_25137867_25137971_25138067_25138133_25138253_25138347_25138498_25138643_25138759_25138916_25139025_25139111_25139333_25139416_25139539_25139805_25140016_25140107_25140210_25140291_25140391_25141732_25141831_25144875_25144954_25145161
tx.10075	chr2	-	2325	14	FSM	ENSMUSG00000006471.19	ENSMUST00000114349.9	2336	14	17	-6	-6	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_3	18.4333117547694	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGCTCACTTCTCTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25145404	25137234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25137867_25137971_25138067_25138133_25138253_25138347_25138498_25138643_25138759_25138916_25139025_25139111_25139333_25139416_25139539_25139805_25140016_25140107_25140210_25140291_25140391_25141732_25141831_25144875_25144954_25145228
tx.10076	chr2	+	1958	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000078201.6	novel	854	1	NA	NA	12	1355	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGTGTTATGCAGCAAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25145462	25147659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_25146686_25146924
tx.10077	chr2	+	776	3	ISM	ENSMUSG00000048707.10	ENSMUST00000137361.2	441	4	4666	-329	-29	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	162	junction_2	2	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCTTTTGCCTTCTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25158918	25159897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_25159058_25159144_25159252_25159367
tx.10078	chr2	-	858	3	FSM	ENSMUSG00000026966.7	ENSMUST00000028342.7	862	3	4	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	707	junction_2	68	2862	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTCTGCTAGCTACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25162424	25161050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25161594_25161940_25162141_25162309
tx.10079	chr2	+	2680	13	FSM	ENSMUSG00000026965.13	ENSMUST00000028341.11	3004	13	21	303	21	-303	multi-exon	TRUE	canonical	3	410	junction_2	48.8355374929182	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTTTGTTGGATCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25162510	25175624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_25162690_25162926_25163550_25163811_25163945_25164677_25164853_25166327_25166448_25167647_25167766_25168335_25168518_25169183_25169326_25170138_25170215_25170294_25170499_25174573_25174704_25174948_25175185_25175262
tx.1008	chr1	-	1603	10	FSM	ENSMUSG00000026526.15	ENSMUST00000027810.14	2636	10	29	1004	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	699	junction_3	99.2506491566916	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCTTTTTAAAATTTAATT	821	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	175453172	175428943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_175429133_175431503_175431658_175433620_175433749_175435382_175435587_175437202_175437369_175439712_175439896_175442302_175442480_175444094_175444206_175446616_175446752_175453016
tx.10080	chr2	+	739	2	ISM	ENSMUSG00000026965.13	ENSMUST00000129265.2	1332	4	-94	2895	23	-2895	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	457	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAAGCAGCAGTGCTGGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25162512	25163488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_25162690_25162926
tx.10081	chr2	-	405	2	ISM	ENSMUSG00000026959.14	ENSMUST00000114318.10	3920	21	7567	19076	-6131	544	internal_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAACAAAACTTCACTTGG	9861	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25201540	25200268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_25200488_25201354
tx.10082	chr2	+	1216	5	ISM	ENSMUSG00000036646.14	ENSMUST00000149464.8	2030	6	-14	2335	-14	-1067	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	358	junction_4	24.7285260377565	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGATTCAATCCAAGTA	3984	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25222759	25232225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_25222989_25223446_25223556_25224388_25224505_25228124_25228280_25231618
tx.10083	chr2	+	3734	13	FSM	ENSMUSG00000036646.14	ENSMUST00000042390.5	3755	13	21	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	302	junction_8	34.4394597647653	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGTGCAGTGTTACTTT	3986	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25222761	25242224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_25222989_25223446_25223556_25224388_25224505_25228124_25228280_25231618_25231729_25233235_25233422_25234979_25235129_25235417_25235607_25238047_25238239_25238582_25238704_25239181_25239380_25239462_25239595_25240373
tx.10084	chr2	-	349	2	FSM	ENSMUSG00000026958.14	ENSMUST00000149953.2	466	2	117	0	117	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	339	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTCTAGTAGGATCCATG	4083	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25242769	25242301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25242579_25242697
tx.10085	chr2	-	464	4	ISM	ENSMUSG00000026958.14	ENSMUST00000139108.8	2167	10	2935	14	-536	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_3	26.0298973404728	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTCTAGTAGGATCCATG	3430	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25243422	25242301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_25242579_25242697_25242769_25243164_25243230_25243371
tx.10086	chr2	-	1676	13	FSM	ENSMUSG00000026958.14	ENSMUST00000028332.8	1682	13	6	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_10	27.0014145719977	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTCTAGTAGGATCCATG	9007	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25246365	25242301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25242579_25242697_25242769_25243164_25243230_25243371_25243529_25243619_25243739_25244244_25244306_25244479_25244647_25244752_25244835_25244904_25245041_25245569_25245734_25245825_25245966_25246040_25246155_25246242
tx.10087	chr2	-	814	5	ISM	ENSMUSG00000026956.16	ENSMUST00000102925.4	3349	9	1707	1601	153	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	362	junction_3	47.3781331417775	520	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGATTGTCTGTCTATTT	1385	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25253987	25251501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_25251752_25252082_25252150_25252674_25252861_25253255_25253397_25253817
tx.10088	chr2	-	1715	9	FSM	ENSMUSG00000026956.16	ENSMUST00000102925.4	3349	9	33	1601	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	362	junction_3	36.5288841192829	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGATTGTCTGTCTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25255661	25251501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25251752_25252082_25252150_25252674_25252861_25253255_25253397_25253817_25254012_25254112_25254286_25254523_25254700_25254892_25255098_25255338
tx.10089	chr2	+	1697	7	FSM	ENSMUSG00000026955.14	ENSMUST00000028329.13	3121	7	14	1410	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_3	10.077477638554	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGCTGTATTTCTCATAA	6671	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25262346	25266815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_25263011_25263427_25263530_25264963_25265077_25265696_25265844_25265979_25266088_25266175_25266287_25266363
tx.10090	chr2	+	1601	6	FSM	ENSMUSG00000026955.14	ENSMUST00000114293.9	1600	6	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	40.9536323175369	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGCTGTATTTCTCATAA	6665	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25262340	25266815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_25263011_25264963_25265077_25265696_25265844_25265979_25266088_25266175_25266287_25266363
tx.10091	chr2	+	1912	9	FSM	ENSMUSG00000015085.9	ENSMUST00000028328.3	1935	9	23	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.69096865730859	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGTGTCCATAGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25285908	25291333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_25286102_25287407_25287526_25288012_25288164_25288302_25288463_25288543_25288772_25289293_25289549_25289628_25289749_25290575_25290711_25290781
tx.10092	chr2	+	1484	9	FSM	ENSMUSG00000015094.17	ENSMUST00000071442.12	1485	9	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	4.24264068711928	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCTTCTGGGTTCACTGA	3127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25293083	25299506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_25293378_25296226_25296374_25297607_25297749_25297852_25298027_25298125_25298193_25298271_25298360_25298618_25298699_25298916_25299014_25299110
tx.10093	chr2	-	918	7	FSM	ENSMUSG00000047617.12	ENSMUST00000114261.9	981	7	61	2	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_6	3.94405318873308	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGAGTTGTGAAGATTG	5297	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25351045	25349495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25349714_25349786_25349872_25350020_25350087_25350178_25350370_25350456_25350507_25350666_25350728_25350798
tx.10094	chr2	-	979	6	FSM	ENSMUSG00000047617.12	ENSMUST00000125710.8	917	6	-15	-47	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	2.82842712474619	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGAGTTGTGAAGATTG	5307	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25351035	25349495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25349714_25349786_25349872_25350020_25350087_25350178_25350370_25350456_25350507_25350666
tx.10095	chr2	-	657	6	FSM	ENSMUSG00000015090.14	ENSMUST00000137417.2	645	6	-11	-1	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.57681974534503	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATCTTTGCTTTTGTCTGTC	6473	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25359180	25356722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25356844_25357298_25357358_25357829_25357932_25358083_25358201_25358844_25358922_25358999
tx.10096	chr2	-	1217	7	FSM	ENSMUSG00000015083.12	ENSMUST00000040042.11	1150	7	-67	0	-67	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	2.38047614284762	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTTTGTCGTTTTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25390692	25388662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25388836_25388916_25388956_25389025_25389128_25389409_25389518_25389600_25389672_25389850_25389988_25390105
tx.10097	chr2	-	2090	10	ISM	ENSMUSG00000026942.14	ENSMUST00000028311.13	3044	11	7855	876	55	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_2	15.0562730456342	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTGTTCATCTGGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25429097	25408869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_25409641_25410339_25410489_25414351_25414530_25414878_25415161_25417485_25417561_25418243_25418319_25420298_25420461_25426687_25426787_25427082_25427162_25428877
tx.10098	chr2	-	2133	11	FSM	ENSMUSG00000026942.14	ENSMUST00000028311.13	3044	11	32	879	2	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_10	20.6164982477626	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGGTGTTCATCTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25436920	25408872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25409641_25410339_25410489_25414351_25414530_25414878_25415161_25417485_25417561_25418243_25418319_25420298_25420461_25426687_25426787_25427082_25427162_25428877_25429097_25436873
tx.10099	chr2	+	708	5	FSM	ENSMUSG00000015092.10	ENSMUST00000015236.4	722	5	14	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2396	junction_4	232.166965781095	12285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCCTCCTGGATTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25447872	25452094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_25448042_25450162_25450215_25450551_25450713_25450980_25451075_25451862
tx.101	chr1	-	1616	10	NNC	ENSMUSG00000026134.12	novel	1975	14	NA	NA	-14678	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_9	101.707763399863	85	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGTGCAAGTGGGAGTC	2988	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33677083	33492890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_33493386_33503133_33503203_33519538_33519622_33523762_33523890_33551096_33551283_33553225_33553299_33572376_33572445_33667475_33667614_33669418_33669515_33676802
tx.1010	chr1	+	2837	15	FSM	ENSMUSG00000039748.12	ENSMUST00000039725.12	7796	15	207	4752	-6	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_2	66.5922714152693	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGAAGTTTAAATGCTAAT	9760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	175708353	175736303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_175708423_175708697_175708767_175710460_175710635_175714255_175714376_175715143_175715268_175716289_175716428_175719499_175719713_175720439_175720628_175721306_175721401_175723693_175723920_175726954_175727199_175728445_175729020_175731901_175732004_175733361_175733556_175735995
tx.10100	chr2	-	619	3	FSM	ENSMUSG00000036504.7	ENSMUST00000039156.7	937	3	318	0	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	774	junction_2	2.5	5729	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCTGACTTGTGTCTTGC	5518	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25464918	25463441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25463712_25464199_25464325_25464694
tx.10101	chr2	+	840	4	NNC	ENSMUSG00000052403.12	novel	798	9	NA	NA	-26	-19265	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAAAGTAATTCATCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25497877	25502505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_25497977_25499329_25499482_25499771_25499817_25501961
tx.10102	chr2	-	774	5	FSM	ENSMUSG00000026939.13	ENSMUST00000142087.2	795	5	-9	30	-9	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_4	9.85837207656518	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTCTGAAGCAATTAAACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25512026	25510108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25510543_25511077_25511186_25511386_25511471_25511619_25511687_25511945
tx.10103	chr2	-	977	4	FSM	ENSMUSG00000026939.13	ENSMUST00000150165.8	975	4	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	9.10433352249844	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGAGCTCTGAAGCAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25511975	25510113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25510543_25511077_25511186_25511386_25511471_25511619
tx.10104	chr2	-	784	5	NIC	ENSMUSG00000026939.13	novel	795	5	NA	NA	-7	5	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	2	3	junction_2	18.9406969248758	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGCTCTGAAGCAATTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25512024	25510110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_25510543_25511077_25511186_25511372_25511471_25511619_25511687_25511945
tx.10105	chr2	-	1695	10	FSM	ENSMUSG00000036352.17	ENSMUST00000036509.14	1852	10	157	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	686	junction_2	68.2632884002073	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTGTGTTACTTCATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25911602	25888554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25889080_25895337_25895477_25896538_25896626_25897730_25897966_25898872_25898982_25899172_25899276_25900533_25900642_25904903_25904978_25906307_25906429_25911408
tx.10106	chr2	-	905	7	ISM	ENSMUSG00000036352.17	ENSMUST00000036509.14	1852	10	179	9193	-2	1159	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	737	junction_6	45.8539347639146	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGAGCAGATGCTCGGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25911580	25897747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_25897966_25898872_25898982_25899172_25899276_25900533_25900642_25904903_25904978_25906307_25906429_25911408
tx.10107	chr2	-	721	3	FSM	ENSMUSG00000075467.5	ENSMUST00000028295.9	2916	3	25	2170	15	-2170	multi-exon	FALSE	canonical	3	313	junction_2	24.5	1247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGGCCTGGGCTCCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26242097	26240302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26240571_26241346_26241487_26241784
tx.10108	chr2	-	582	2	FSM	ENSMUSG00000075467.5	ENSMUST00000125848.2	2766	2	14	2170	14	-2170	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGGCCTGGGCTCCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26242098	26240302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26240571_26241784
tx.10109	chr2	-	1141	9	ISM	ENSMUSG00000026928.15	ENSMUST00000100303.10	1947	12	2071	11	2071	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_2	6.02987354759617	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGTTGGTTGGATATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26247688	26242198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_26242424_26242496_26242574_26242952_26243027_26244368_26244418_26244841_26244884_26245344_26245537_26246769_26246896_26247196_26247341_26247476
tx.10110	chr2	+	2184	13	FSM	ENSMUSG00000026926.15	ENSMUST00000076431.13	3135	13	7	944	-2	-944	multi-exon	FALSE	canonical	3	1351	junction_8	105.114619979018	494	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTGGCCTCACAGTGAG	651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26279357	26286190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_26279445_26279947_26280151_26280242_26280323_26280506_26280590_26281095_26281191_26281877_26281979_26282423_26282688_26282917_26283011_26283097_26283217_26283308_26283400_26283529_26283593_26285036_26285182_26285430
tx.10111	chr2	+	1948	12	ISM	ENSMUSG00000026926.15	ENSMUST00000076431.13	3135	13	741	949	724	-949	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1351	junction_7	95.7629649423275	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCCTGGCTGGCCTCACA	1385	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26280091	26286185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_26280151_26280242_26280323_26280506_26280590_26281095_26281191_26281877_26281979_26282423_26282688_26282917_26283011_26283097_26283217_26283308_26283400_26283529_26283593_26285036_26285182_26285430
tx.10112	chr2	+	708	2	ISM	ENSMUSG00000026926.15	ENSMUST00000076431.13	3135	13	5685	1142	4097	-1142	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1458	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGAGTGGCTTGAGACTT	6329	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26285035	26285992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_26285182_26285430
tx.10113	chr2	-	786	2	ISM	ENSMUSG00000026924.18	ENSMUST00000091252.5	8737	30	-4	31998	-4	533	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGATGGTGCCGTGACCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26335232	26331442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_26332083_26335086
tx.10114	chr2	+	624	2	FSM	ENSMUSG00000086714.2	ENSMUST00000151521.2	600	2	-24	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGCATGTAGTTTTTTT	5478	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26335911	26348007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_26336213_26347684
tx.10115	chr2	+	777	3	NNC	ENSMUSG00000086714.2	novel	600	2	NA	NA	-16	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGCATGTAGTTTTTTT	5486	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26335919	26348007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_26336213_26346452_26346614_26347684
tx.10116	chr2	+	1156	9	FSM	ENSMUSG00000026921.21	ENSMUST00000239075.2	1163	9	8	-1	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_1	46.4239970273995	291	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTTGTCAATGGGGGAAT	180	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26476649	26482694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_26476694_26479056_26479182_26479341_26479459_26480391_26480508_26480668_26480765_26480910_26481076_26481675_26481741_26482129_26482293_26482429
tx.10117	chr2	+	1113	8	ISM	ENSMUSG00000026921.21	ENSMUST00000150404.10	892	9	501	-239	-291	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	262	junction_6	44.7227285502527	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTTGTCAATGGGGGAAT	2586	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26479055	26482694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_26479182_26479341_26479459_26480391_26480508_26480668_26480765_26480910_26481076_26481675_26481741_26482129_26482293_26482429
tx.10118	chr2	+	453	3	FSM	ENSMUSG00000026921.21	ENSMUST00000152988.9	723	3	270	0	258	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	262	junction_1	11.5	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTTGTCAATGGGGGAAT	5246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26481715	26482694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_26481741_26482129_26482293_26482429
tx.10119	chr2	-	1387	6	FSM	ENSMUSG00000026922.14	ENSMUST00000028286.12	1489	6	87	15	-34	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	292.487674954006	932	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTCTTTCAGAGAGTGGG	9568	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26494257	26483083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26483775_26484791_26484865_26486091_26486188_26486302_26486479_26487215_26487350_26494040
tx.10120	chr2	-	1285	6	FSM	ENSMUSG00000026922.14	ENSMUST00000131940.8	1273	6	-34	22	-34	-22	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_5	210.357219985433	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCAGAGGTCTCTTTCAGA	9568	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26494257	26483090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26483775_26484791_26484865_26486091_26486188_26486302_26486479_26487215_26487350_26494135
tx.10121	chr2	-	759	4	Intergenic	novelGene_753	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	19.7033556081755	307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGGAATCTTTCTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26530256	26527187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_26527646_26528052_26528108_26529424_26529484_26530069
tx.10122	chr2	-	742	4	Intergenic	novelGene_754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_3	6.37704215656966	569	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGGAATCTTTCTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26530256	26527187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_26527646_26528052_26528108_26529441_26529484_26530069
tx.10123	chr2	-	479	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000077192.5	novel	132	1	NA	NA	-923	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGAGGTGGGATTGTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26530256	26529191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_26529484_26530069
tx.10124	chr2	+	545	5	NNC	ENSMUSG00000086775.8	novel	3947	3	NA	NA	195	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.6583123951777	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCACCTGTGTCTCTCGGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26533521	26535956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_26533589_26533708_26533780_26533860_26533969_26535513_26535616_26535759
tx.10125	chr2	-	1688	7	NNC	ENSMUSG00000015787.16	novel	1811	6	NA	NA	50	-204	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_4	1.7950549357115	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGAAGTTTTTAGTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26746760	26732718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_26733887_26735967_26736103_26736585_26736622_26738262_26738320_26738932_26739003_26746433_26746565_26746669
tx.10126	chr2	-	802	2	NNC	ENSMUSG00000015787.16	novel	1811	6	NA	NA	74	-13315	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAAACAAAAAAAGAGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26746736	26745829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_26746565_26746669
tx.10127	chr2	+	428	2	Intergenic	novelGene_757	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGTCTTGGCTTCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26768924	26776546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_26769186_26776379
tx.10128	chr2	-	2101	2	ISM	ENSMUSG00000036160.14	ENSMUST00000047632.14	2971	5	9866	337	-402	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	256	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCATGTGTTCGTATTTG	NA	False	NA	-15	True	NA	NA	NA	26783025	26780783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_26782738_26782878
tx.10129	chr2	-	2631	5	FSM	ENSMUSG00000036160.14	ENSMUST00000047632.14	2971	5	3	337	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_1	26.2154534578367	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCATGTGTTCGTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26792888	26780783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26782738_26782878_26783080_26789348_26789438_26789740_26789945_26792705
tx.10130	chr2	-	1368	4	FSM	ENSMUSG00000015776.13	ENSMUST00000015920.12	973	4	-73	-322	35	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_1	17.7951304200522	278	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCTGTTGTCTGTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26800654	26795277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26796006_26798104_26798314_26799004_26799086_26800304
tx.10131	chr2	-	838	3	FSM	ENSMUSG00000015776.13	ENSMUST00000102899.10	3506	3	35	2633	35	214	multi-exon	FALSE	canonical	3	168	junction_1	2.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTTGGTTGTGTGTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26800654	26797906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26798314_26799004_26799086_26800304
tx.10132	chr2	+	908	8	FSM	ENSMUSG00000062647.17	ENSMUST00000102898.5	914	8	0	6	0	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	2861	junction_1	795.089880684786	4665	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGACTGCCTTTGGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26800775	26803324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_26800843_26801017_26801139_26801433_26801584_26802030_26802172_26802377_26802458_26802682_26802814_26802999_26803070_26803176
tx.10133	chr2	+	1040	7	NIC	ENSMUSG00000062647.17	novel	914	8	NA	NA	-10	-6	intron_retention	FALSE	canonical	3	4686	junction_6	264.743114483959	407	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGACTGCCTTTGGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26800818	26803324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_26801139_26801433_26801584_26802030_26802172_26802377_26802458_26802682_26802814_26802999_26803070_26803176
tx.10134	chr2	-	961	9	NNC	ENSMUSG00000015790.17	novel	1173	9	NA	NA	-9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	36	junction_4	108.788498932562	197	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGGCTCAGTCTGAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26806366	26803394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_26803518_26803588_26803671_26803924_26804088_26804186_26804224_26804718_26804908_26805443_26805527_26805607_26805742_26805966_26806019_26806268
tx.10135	chr2	-	996	9	FSM	ENSMUSG00000015790.17	ENSMUST00000015934.13	1173	9	177	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	328	junction_4	27.1834048639974	2308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGGCTCAGTCTGAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26806365	26803394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26803518_26803588_26803671_26803924_26804088_26804186_26804260_26804718_26804908_26805443_26805527_26805607_26805742_26805966_26806019_26806268
tx.10136	chr2	+	1186	6	FSM	ENSMUSG00000014873.16	ENSMUST00000015017.8	1203	6	17	0	3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	245	junction_5	33.4388995034227	1163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATATGTGTATCATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26806395	26810195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_26806516_26806716_26806872_26807439_26807544_26808884_26809068_26809203_26809371_26809738
tx.10137	chr2	+	1124	6	NIC	ENSMUSG00000014873.16	novel	1203	6	NA	NA	9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	21	junction_3	115.994827470883	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATATGTGTATCATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26806401	26810195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_26806516_26806716_26806872_26807439_26807544_26808940_26809068_26809203_26809371_26809738
tx.10138	chr2	+	841	4	ISM	ENSMUSG00000014873.16	ENSMUST00000015017.8	1203	6	1131	0	70	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	245	junction_3	24.9443825784929	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATATGTGTATCATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26807509	26810195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_26807544_26808884_26809068_26809203_26809371_26809738
tx.10139	chr2	-	2802	6	FSM	ENSMUSG00000014867.10	ENSMUST00000015011.10	3281	6	477	2	-68	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	778	junction_1	38.262252939418	813	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATAGTGTGGTCCTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26823463	26810053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26812184_26814356_26814544_26814964_26815009_26815619_26815697_26816780_26816968_26823286
tx.10140	chr2	-	2150	7	FSM	ENSMUSG00000052406.15	ENSMUST00000136710.2	1121	7	-51	-978	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	74.3611681816076	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGTGTGTGGAAGTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26854342	26843574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26844609_26845506_26845582_26848490_26848580_26850235_26850430_26850614_26850753_26852394_26852736_26854063
tx.10141	chr2	-	2225	8	FSM	ENSMUSG00000052406.15	ENSMUST00000064244.11	2281	8	56	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	152	junction_5	23.9344342497821	196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGTGTGTGGAAGTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26854342	26843574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26844609_26845506_26845582_26846300_26846376_26848490_26848580_26850235_26850430_26850614_26850753_26852394_26852736_26854063
tx.10142	chr2	+	1246	5	FSM	ENSMUSG00000015488.15	ENSMUST00000114007.8	2689	5	20	1423	20	-632	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_3	7.54983443527075	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTGGTATGATGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26899957	26909678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_26900118_26904104_26904178_26905495_26905622_26908384_26908493_26908899
tx.10143	chr2	+	1265	4	FSM	ENSMUSG00000015488.15	ENSMUST00000114005.9	1286	4	24	-3	24	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	42.9262934186807	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCTGTTCATCTATTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26899961	26906864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_26900118_26904104_26904178_26905495_26905622_26905954
tx.10144	chr2	+	696	4	ISM	ENSMUSG00000015488.15	ENSMUST00000133126.2	415	5	-42	981	-42	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_3	41.0636362518253	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTTTCCAGCCTGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26899982	26907452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_26900118_26904104_26904178_26905495_26905622_26907090
tx.10145	chr2	+	1625	2	NNC	ENSMUSG00000109946.2	novel	509	2	NA	NA	-19	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCCTTTCTCATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27332495	27334233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_27332827_27332939
tx.10146	chr2	-	3038	12	FSM	ENSMUSG00000026918.17	ENSMUST00000077737.13	5272	12	28	2206	-4	58	multi-exon	TRUE	canonical	3	192	junction_7	30.2258714644446	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAACAAACCTTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27365670	27337796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_27338593_27339212_27339339_27340268_27340562_27342844_27343087_27344324_27344517_27346920_27347050_27349468_27349841_27351540_27351756_27352432_27352581_27353466_27353605_27353900_27354206_27365588
tx.10147	chr2	-	1045	3	ISM	ENSMUSG00000026918.17	ENSMUST00000028282.15	5419	12	24982	2243	13700	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	243	junction_2	26.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGATTAAAAAAAAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27340428	27337833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_27338593_27339212_27339339_27340268
tx.10148	chr2	-	1666	9	ISM	ENSMUSG00000026918.17	ENSMUST00000077737.13	5272	12	36	7403	3	14	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_4	32.1548985381699	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAGACAAGGACAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27365662	27342993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_27343087_27344324_27344517_27346920_27347050_27349468_27349841_27351540_27351756_27352432_27352581_27353466_27353605_27353900_27354206_27365588
tx.10149	chr2	+	2854	14	FSM	ENSMUSG00000026917.16	ENSMUST00000113952.10	2890	14	36	0	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1324	junction_4	114.959164347413	349	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTTCCATATAAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27405204	27426547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_27405293_27408640_27408805_27409360_27409470_27409754_27409829_27410338_27410429_27410584_27410675_27410839_27410924_27415117_27415174_27418285_27418333_27421650_27421727_27423004_27423039_27423348_27423424_27423779_27423868_27424768
tx.1015	chr1	-	394	2	Intergenic	novelGene_76	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATGTCTAGAATTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	176436104	176425062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_176425344_176435991
tx.10150	chr2	+	1869	2	ISM	ENSMUSG00000026917.16	ENSMUST00000140396.2	1031	12	14005	-1492	5994	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1440	junction_1	0	206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTTCCATATAAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27423777	27426547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_27423868_27424768
tx.10151	chr2	+	216	2	NNC	ENSMUSG00000085929.2	novel	803	2	NA	NA	0	-381	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTGGTCGAGGCGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27430437	27432816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_27430578_27432740
tx.10152	chr2	+	3531	2	FSM	ENSMUSG00000085929.2	ENSMUST00000142511.2	803	2	0	-2728	0	2728	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTCCTGTGTGCATCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27430437	27436102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_27430607_27432740
tx.10153	chr2	+	411	2	Intergenic	novelGene_761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTGCCTGGCTTAAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27530884	27532086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_27530987_27531777
tx.10154	chr2	-	799	3	FSM	ENSMUSG00000026831.17	ENSMUST00000086370.11	812	3	13	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	7	723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGCCACGCCTCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28356331	28352012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_28352447_28355148_28355228_28356045
tx.10155	chr2	+	2068	4	FSM	ENSMUSG00000035772.12	ENSMUST00000038600.4	2080	4	-1	13	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	508	junction_2	49.4592986426438	989	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCTGGTGTCAGACTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28358076	28361177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_28358155_28358254_28358372_28358832_28358963_28359434
tx.10156	chr2	+	1994	3	ISM	ENSMUSG00000035772.12	ENSMUST00000038600.4	2080	4	173	13	149	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	508	junction_1	48	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCTGGTGTCAGACTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28358250	28361177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_28358372_28358832_28358963_28359434
tx.10157	chr2	+	1049	3	Intergenic	novelGene_762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATCCGCCGTGGCTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28369408	28377016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_28369616_28370436_28370687_28376424
tx.10158	chr2	-	2526	12	FSM	ENSMUSG00000026816.15	ENSMUST00000028157.9	2739	12	213	0	-78	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	147	junction_7	20.5992858738452	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGGTGTTTGATGCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28473078	28456322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_28457190_28457619_28457797_28458496_28458640_28459303_28459387_28460430_28460529_28460624_28460706_28461124_28461240_28462207_28462313_28463388_28463585_28467887_28468087_28469529_28469750_28472836
tx.10159	chr2	+	1429	11	ISM	ENSMUSG00000026812.17	ENSMUST00000028155.12	7674	23	6	18566	0	94	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	14.2828568570857	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTAGTTTCTGGGCTTCT	3458	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28531254	28562613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_28531303_28542180_28542244_28548616_28548803_28551593_28551698_28552472_28552626_28553511_28553657_28555019_28555175_28555567_28555642_28560880_28561057_28561777_28561894_28562404
tx.10160	chr2	+	1618	10	ISM	ENSMUSG00000026812.17	ENSMUST00000153625.8	2388	11	-6	1473	1	-227	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	13.8198283028765	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAGAAAAGAAAAGG	3459	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28531255	28562292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_28531303_28542180_28542244_28548616_28548803_28551593_28551698_28552472_28552626_28553511_28553657_28555019_28555175_28555567_28555642_28560880_28561057_28561777
tx.10161	chr2	-	543	4	NIC	ENSMUSG00000026809.16	novel	671	5	NA	NA	3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.62466929133727	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGGCTTGGTTTCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28589683	28582091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_28582165_28583635_28583839_28585918_28586096_28589593
tx.10162	chr2	-	1457	4	FSM	ENSMUSG00000026809.16	ENSMUST00000144209.8	574	4	49	-932	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	1.24721912892465	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGGCTTGGTTTCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28589690	28582091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_28583072_28583635_28583839_28585918_28586096_28589593
tx.10163	chr2	-	685	5	FSM	ENSMUSG00000026809.16	ENSMUST00000102877.8	671	5	-16	2	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	1.22474487139159	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGCCTGGCTTGGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28589679	28582093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_28582165_28582923_28583072_28583635_28583839_28585918_28586096_28589593
tx.10164	chr2	+	1579	13	FSM	ENSMUSG00000026807.9	ENSMUST00000074156.7	1567	13	-12	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.54405625374562	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATAGCCTTCTTTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28590163	28703177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_28590287_28592700_28592786_28599938_28599989_28602286_28602401_28606428_28606498_28623818_28623901_28624385_28624458_28625514_28625716_28629544_28629677_28632671_28632762_28649953_28650096_28699671_28699753_28702839
tx.10165	chr2	-	1785	4	ISM	ENSMUSG00000035666.15	ENSMUST00000037117.6	6941	5	6397	3268	6397	-3268	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	207	junction_1	11.6714276000077	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGATGATTCTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28723901	28715584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_28716810_28717489_28717579_28720513_28720645_28723561
tx.10166	chr2	+	3249	20	FSM	ENSMUSG00000026806.16	ENSMUST00000113853.3	3271	20	18	4	18	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_10	16.137738156191	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTACAGAGGACTCAGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28730488	28795579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_28730873_28734849_28735107_28735209_28735286_28736005_28736050_28737452_28737524_28738297_28738363_28744782_28744828_28746206_28746249_28747131_28747197_28748747_28748868_28748999_28749107_28749880_28750090_28750727_28750905_28753727_28753788_28764142_28764194_28765701_28765842_28771154_28771237_28776902_28777015_28782390_28782554_28794600
tx.10167	chr2	+	1458	5	ISM	ENSMUSG00000026806.16	ENSMUST00000113853.3	3271	20	35252	1	18570	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	109	junction_3	15.6744218394172	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAGAGGACTCAGCAGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28765722	28795582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_28765842_28771154_28771237_28776902_28777015_28782390_28782554_28794600
tx.10168	chr2	-	1108	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083773.5	novel	1000	1	NA	NA	-73	196	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGAAATGTGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28824694	28823425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_28824337_28824497
tx.10169	chr2	-	1139	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083773.5	novel	1000	1	NA	NA	-73	195	multi-exon	FALSE	canonical	2	100	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGAAATGTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28824694	28823426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_28824484_28824612
tx.10170	chr2	-	706	3	NNC	ENSMUSG00000079502.9	novel	1042	6	NA	NA	82271	206	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	5	38	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCAGACCTTGTTCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28847101	28845175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_28845637_28846006_28846109_28846958
tx.10171	chr2	-	1263	6	FSM	ENSMUSG00000079502.9	ENSMUST00000157048.4	1042	6	-15	-206	-15	206	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	3.07245829914744	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCAGACCTTGTTCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28945093	28845175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_28845637_28846006_28846109_28852643_28852750_28874307_28874534_28875813_28875914_28944825
tx.10172	chr2	+	1670	4	ISM	ENSMUSG00000043535.14	ENSMUST00000061578.9	10970	26	172	51310	172	712	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	157	junction_1	22.939534045447	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTAATACTTTGTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29015175	29021173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29015562_29015863_29015976_29016885_29017076_29020191
tx.10173	chr2	+	1247	8	FSM	ENSMUSG00000026799.16	ENSMUST00000028139.11	1254	8	2	5	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_3	14.0393034305954	870	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACAAGGCTCTGTGTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29236832	29414800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_29237060_29239857_29240003_29303399_29303531_29361304_29361399_29390230_29390339_29399434_29399477_29412785_29412864_29414378
tx.10174	chr2	+	860	6	NNC	ENSMUSG00000026799.16	novel	1254	8	NA	NA	-34404	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	71.9844427636972	172	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACAAGGCTCTGTGTTCTGC	5296	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29352118	29414800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_29352235_29361304_29361399_29390230_29390339_29399434_29399477_29412785_29412864_29414378
tx.10175	chr2	+	458	2	Intergenic	novelGene_765	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAATGTTTTGTGAAGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29442416	29443394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_29442703_29443222
tx.10176	chr2	-	2570	8	FSM	ENSMUSG00000039826.14	ENSMUST00000048044.12	3408	8	842	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_2	23.9267589931935	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATGTGATGTTTTAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29677672	29666117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_29667969_29668743_29668881_29669834_29669908_29672131_29672214_29673323_29673386_29674964_29675040_29676487_29676620_29677514
tx.10177	chr2	-	2506	7	FSM	ENSMUSG00000039826.14	ENSMUST00000156846.8	3930	7	2	1422	2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_4	39.677869566464	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATGTGATGTTTTAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29677670	29666117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_29667969_29668743_29668881_29669834_29669908_29672131_29672214_29674964_29675040_29676487_29676620_29677514
tx.10178	chr2	-	983	6	FSM	ENSMUSG00000039826.14	ENSMUST00000177133.8	806	6	7	-184	-4	184	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_3	43.1879612855249	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAGAAACAGAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29677676	29668421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_29668881_29669834_29669908_29672131_29672214_29674964_29675040_29676487_29676620_29677514
tx.10179	chr2	-	1044	7	ISM	ENSMUSG00000039826.14	ENSMUST00000048044.12	3408	8	838	2301	-4	183	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_1	24.0791518861349	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGAAAAAAAGAAACAGAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29677676	29668422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_29668881_29669834_29669908_29672131_29672214_29673323_29673386_29674964_29675040_29676487_29676620_29677514
tx.1018	chr1	+	506	2	FSM	ENSMUSG00000063659.12	ENSMUST00000195002.2	394	2	143	-255	28	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAGATGCTTCAAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	177270059	177275058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_177270162_177274654
tx.10180	chr2	-	2011	6	ISM	ENSMUSG00000039826.14	ENSMUST00000177467.8	744	7	-42	641	-4	196	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	134	junction_3	19.239542614106	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGGCTGGGTCTCTGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29677676	29668409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_29669908_29672131_29672214_29673323_29673386_29674964_29675040_29676487_29676620_29677514
tx.10181	chr2	-	674	2	ISM	ENSMUSG00000039826.14	ENSMUST00000175644.2	371	3	-19	1164	-4	-1164	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTGGAGTACAAAACAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29677664	29676095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_29676620_29677514
tx.10182	chr2	+	1251	7	FSM	ENSMUSG00000026798.11	ENSMUST00000028137.10	1991	7	4	736	4	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_3	15.3884877605162	473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGCTCCCTTTGCCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29678274	29687019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_29678370_29678448_29678581_29679914_29680012_29680468_29680572_29685392_29685523_29685947_29686042_29686419
tx.10183	chr2	+	1328	4	ISM	ENSMUSG00000059316.3	ENSMUST00000080065.3	4054	13	9634	1066	5270	-1066	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	161	junction_1	10.8730042868667	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGACAGCCTGGCTCCTT	156	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29702279	29706468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29702415_29702563_29702729_29702799_29702947_29705587
tx.10184	chr2	+	1214	5	FSM	ENSMUSG00000069020.10	ENSMUST00000091142.4	2196	5	42	940	-11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	254	junction_1	41.2158949921023	1826	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTTGTTTACTAGCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29717395	29734074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_29717448_29722703_29722775_29731413_29731496_29732732_29732782_29733114
tx.10185	chr2	+	1163	4	ISM	ENSMUSG00000069020.10	ENSMUST00000091142.4	2196	5	5349	940	5296	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	316	junction_2	24.1660919471891	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTTGTTTACTAGCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29722702	29734074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29722775_29731413_29731496_29732732_29732782_29733114
tx.10186	chr2	-	1351	2	FSM	ENSMUSG00000039798.3	ENSMUST00000047607.3	1406	2	520	-465	520	465	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAATGATAATGATGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29759809	29758269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_29759383_29759571
tx.10187	chr2	+	1442	9	ISM	ENSMUSG00000039787.14	ENSMUST00000047521.7	2715	12	6	4494	6	8	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_3	3.70809924354783	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTCCGTCTCATTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29759511	29768358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29759738_29761034_29761146_29761286_29761405_29762574_29762710_29762819_29763025_29765616_29765737_29765999_29766077_29766172_29766280_29768015
tx.10188	chr2	+	2271	17	NIC	ENSMUSG00000026790.20	novel	2305	17	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	561	junction_4	172.1394783308	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGCGTGTTGCACAAAGT	7203	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29779806	29812551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_29779934_29782197_29782289_29783012_29783167_29783455_29783525_29791088_29791260_29792192_29792354_29793332_29793463_29793987_29794120_29802580_29802653_29804242_29804315_29804405_29804523_29804745_29804932_29805219_29805330_29807621_29807758_29810786_29810898_29811015_29811121_29812224
tx.10189	chr2	+	419	2	ISM	ENSMUSG00000026790.20	ENSMUST00000153216.8	828	5	-29	9015	1	-99	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1240	junction_1	0	281	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAAAGCATGAGAGAGA	7204	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29779807	29782490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29779934_29782197
tx.1019	chr1	-	2543	13	FSM	ENSMUSG00000015961.9	ENSMUST00000016105.9	2771	13	13	215	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	944	junction_9	76.3848079718008	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGCTTTGTGTGTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	177624064	177590742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_177591864_177595220_177595371_177597490_177597589_177598706_177598832_177599637_177599793_177601140_177601268_177603146_177603229_177604022_177604131_177604378_177604446_177610408_177610460_177611614_177611684_177612461_177612565_177623777
tx.10190	chr2	+	636	3	ISM	ENSMUSG00000026790.20	ENSMUST00000113763.8	2364	17	30	30062	0	-100	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_1	25.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAATAAAAGCATGAGAGAG	7223	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29779826	29782489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29779934_29780777_29781015_29782197
tx.10191	chr2	+	3071	16	FSM	ENSMUSG00000019715.15	ENSMUST00000019859.9	4030	16	10	949	8	-949	multi-exon	FALSE	canonical	3	458	junction_9	44.6713430387859	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCTGATATGTGGTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29825447	29849434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_29825611_29826021_29826250_29828506_29828618_29829146_29829296_29829494_29829556_29830093_29830349_29832549_29832779_29833736_29833850_29834000_29834071_29838901_29839045_29839167_29839359_29840613_29840744_29842566_29842672_29845617_29845701_29847761_29847826_29848458
tx.10192	chr2	+	855	3	FSM	ENSMUSG00000019715.15	ENSMUST00000154490.8	860	3	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	530	junction_2	57.5	254	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGATAGGAAGACAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29825444	29828967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_29825611_29826021_29826250_29828506
tx.10193	chr2	+	894	5	ISM	ENSMUSG00000057738.15	ENSMUST00000129241.3	7585	57	51754	-268	-175	1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	492	junction_2	20.6321957144653	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGCTCCTCTTTATCTA	5698	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29920145	29921464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29920209_29920328_29920383_29920463_29920611_29920686_29920835_29920982
tx.10194	chr2	-	1809	9	FSM	ENSMUSG00000039715.9	ENSMUST00000113711.3	1814	9	0	5	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_3	11.9973955507018	272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTACCTGAGAGCCCCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29938893	29921562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_29921985_29922084_29922243_29922413_29922647_29922761_29922930_29923285_29923396_29923817_29923976_29924774_29924885_29928186_29928439_29938695
tx.10195	chr2	+	1589	8	FSM	ENSMUSG00000054766.14	ENSMUST00000102866.10	2824	8	246	989	246	159	multi-exon	FALSE	canonical	3	11761	junction_1	1825.6496299752	16826	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAGCCCTGACACTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29952110	29961600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_29952293_29958280_29958339_29958971_29959115_29959338_29959443_29959529_29959644_29960196_29960368_29960452_29960600_29960930
tx.10196	chr2	+	966	2	ISM	ENSMUSG00000054766.14	ENSMUST00000147590.2	844	3	329	-366	329	366	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15823	junction_1	0	3248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACCTGATGCTTTTCTGTC	NA	False	NA	-14	True	NA	NA	NA	29960510	29961807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29960600_29960930
tx.10197	chr2	+	3023	22	NIC	ENSMUSG00000026785.15	novel	3460	21	NA	NA	-2	-1	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	77	junction_7	19.7860437769826	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCAGGGGTTGTGTAGTGT	1316	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29967693	29981030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_29967812_29969545_29969775_29969937_29970084_29970586_29970699_29970767_29970896_29971064_29971249_29972827_29972975_29973052_29973163_29973250_29973395_29974702_29974779_29974861_29975025_29975194_29975292_29975371_29975440_29976448_29976513_29976643_29976736_29977036_29977214_29978531_29978595_29978707_29978785_29979850_29979994_29980079_29980188_29980342_29980424_29980534
tx.10198	chr2	+	1627	12	ISM	ENSMUSG00000026785.15	ENSMUST00000137240.8	3449	21	6094	8	195	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_1	21.0414781242405	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGGCCAGGGGTTGTGTA	8482	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29974859	29981026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29975025_29975194_29975292_29975371_29975440_29976448_29976513_29976643_29976736_29977036_29977214_29978531_29978595_29978707_29978785_29979850_29979994_29980079_29980188_29980342_29980424_29980534
tx.10199	chr2	-	1141	5	FSM	ENSMUSG00000015335.17	ENSMUST00000102865.11	1165	5	24	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	614	junction_1	34.0917878674616	1826	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCCGTGGACTCTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29983636	29980955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_29981579_29981678_29981846_29981999_29982078_29982416_29982554_29983500
tx.102	chr1	-	1380	10	NNC	ENSMUSG00000026134.12	novel	1975	14	NA	NA	-14687	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	64	junction_9	88.3062851670253	245	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGTGCAAGTGGGAGTC	2979	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33677092	33492890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_33493386_33503133_33503203_33519538_33519622_33523762_33523890_33551096_33551283_33553225_33553299_33572376_33572445_33667475_33667614_33669418_33669515_33677047
tx.10200	chr2	+	894	8	ISM	ENSMUSG00000039678.13	ENSMUST00000044556.12	3595	12	-10	5165	-10	-230	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_7	4.74234076362795	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCGAGTGGAAAGGTAGAC	2687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30023747	30036860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_30023925_30024808_30024883_30026684_30026726_30027132_30027195_30027293_30027394_30030486_30030570_30032273_30032434_30036663
tx.10201	chr2	+	1017	8	NNC	ENSMUSG00000039678.13	novel	3595	12	NA	NA	-5	1233	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_7	5.03862631101383	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAATCTATTATTGTACA	2737	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30023797	30033769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_30023925_30024808_30024883_30026684_30026726_30027132_30027195_30027293_30027394_30030486_30030570_30032273_30032434_30033399
tx.10202	chr2	+	1942	7	ISM	ENSMUSG00000039678.13	ENSMUST00000044556.12	3595	12	63	8274	3	1215	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_6	2.80871659105879	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAACAACCAAAACC	2760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30023820	30033751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_30023925_30024808_30024883_30026684_30026726_30027132_30027195_30027293_30027394_30030486_30030570_30032273
tx.10203	chr2	+	960	5	FSM	ENSMUSG00000039678.13	ENSMUST00000134013.2	501	5	-20	-439	-5	439	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	2.69258240356725	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCTAGCTTCATTTATT	2752	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30023812	30027964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30023925_30024808_30024883_30026684_30026726_30027132_30027195_30027293
tx.10204	chr2	+	550	3	NNC	ENSMUSG00000015337.6	novel	1063	3	NA	NA	-9	-24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	184.5	128	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTGACCATCTCTACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30061495	30064057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_30061581_30062853_30062964_30063702
tx.10205	chr2	+	692	3	FSM	ENSMUSG00000015337.6	ENSMUST00000015481.6	1063	3	347	24	347	-24	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_1	35	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTGACCATCTCTACTCC	-2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30061851	30064057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30062079_30062853_30062964_30063702
tx.10206	chr2	-	2020	11	FSM	ENSMUSG00000039660.17	ENSMUST00000144093.8	2010	11	11	-21	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	299	junction_5	40.8044115262063	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCACCTATGCTCACGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30068460	30063463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30064198_30064933_30065082_30065198_30065302_30065725_30065825_30065930_30066004_30066373_30066505_30066626_30066677_30066750_30066841_30067334_30067495_30067604_30067978_30068401
tx.10207	chr2	-	1823	12	FSM	ENSMUSG00000039660.17	ENSMUST00000100220.5	1805	12	1	-19	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	299	junction_5	38.9436974393538	822	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCACCTATGCTCACGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30068461	30063463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30064198_30064933_30065082_30065198_30065302_30065725_30065825_30065930_30066004_30066373_30066505_30066626_30066677_30066750_30066841_30067334_30067495_30067604_30067734_30067931_30067978_30068401
tx.10208	chr2	-	1144	2	ISM	ENSMUSG00000039660.17	ENSMUST00000127309.8	2123	10	-9	3431	-1	-521	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	347	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGTATAATAAGCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30068463	30066895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_30067978_30068401
tx.10209	chr2	-	1855	13	FSM	ENSMUSG00000039648.15	ENSMUST00000044038.10	1876	13	21	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_12	20.7811011899434	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCAGCTTCTCTCTTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30095838	30075135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30075582_30075678_30075766_30076203_30076284_30076368_30076556_30076657_30076748_30076844_30076922_30077198_30077320_30077700_30077830_30078064_30078152_30078226_30078377_30081936_30082085_30084065_30084125_30095644
tx.1021	chr1	+	460	4	FSM	ENSMUSG00000026500.7	ENSMUST00000027781.7	471	4	9	2	9	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	422	junction_3	43.5150037981793	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATTGTTTTACATGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	178146703	178150256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_178146774_178149309_178149425_178149506_178149571_178150045
tx.10210	chr2	+	1313	11	NIC	ENSMUSG00000079484.13	novel	1678	12	NA	NA	-10	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23.5391163810369	299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATATGTACGGGTACTT	10005	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30156820	30172160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_30156954_30159700_30159864_30164481_30164558_30164687_30164736_30167014_30167071_30167159_30167223_30167634_30167657_30169966_30170096_30170182_30170300_30171021_30171149_30171781
tx.10211	chr2	+	675	8	NIC	ENSMUSG00000079484.13	novel	751	9	NA	NA	1	-7	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	30.5834422322849	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTATATATGTTTTATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30156831	30169531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_30156954_30159700_30159864_30164481_30164558_30164687_30164736_30167014_30167071_30167159_30167223_30167634_30167657_30169406
tx.10212	chr2	+	671	7	NNC	ENSMUSG00000079484.13	novel	751	9	NA	NA	1	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	37.1412469125933	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTATATATGTTTTATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30156831	30169531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_30156954_30159700_30159864_30164481_30164558_30164687_30164736_30167014_30167071_30167159_30167223_30169388
tx.10213	chr2	+	551	7	FSM	ENSMUSG00000052533.15	ENSMUST00000113634.3	534	7	-16	-1	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_6	456.698539033743	223	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTGTTTCTTGTGTATA	4862	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30176422	30193822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30176483_30186659_30186715_30188427_30188502_30190811_30190897_30191020_30191102_30192012_30192058_30193671
tx.10214	chr2	+	493	6	ISM	ENSMUSG00000052533.15	ENSMUST00000113634.3	534	7	10219	-1	10217	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_5	499.750497748627	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTGTTTCTTGTGTATA	1829	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30186657	30193822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_30186715_30188427_30188502_30190811_30190897_30191020_30191102_30192012_30192058_30193671
tx.10215	chr2	-	1770	10	NNC	ENSMUSG00000026860.17	novel	1810	11	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	108.638828517839	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGATCTCAGTCCATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30249277	30234820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_30235440_30235710_30235952_30236364_30236466_30236622_30236748_30238566_30238630_30240299_30240393_30240595_30240730_30244864_30244994_30245272_30245415_30249154
tx.10216	chr2	-	1760	11	FSM	ENSMUSG00000026860.17	ENSMUST00000028214.15	1810	11	47	3	-4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_5	55.8	293	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCAGGATCTCAGTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30249281	30234823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30235440_30235710_30235952_30236364_30236466_30236622_30236713_30237092_30237117_30238566_30238630_30240299_30240393_30240595_30240730_30244864_30244994_30245272_30245415_30249154
tx.10217	chr2	-	1693	10	FSM	ENSMUSG00000026860.17	ENSMUST00000113620.10	1694	10	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_5	106.475639131188	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCAGGATCTCAGTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30249277	30234823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30235440_30235710_30235952_30236364_30236466_30236622_30236713_30237092_30237117_30240299_30240393_30240595_30240730_30244864_30244994_30245272_30245415_30249154
tx.10218	chr2	+	3375	16	FSM	ENSMUSG00000026858.19	ENSMUST00000077977.14	3381	16	4	2	4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	32	junction_1	8.28385310240484	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTCTCTGTGTCTTGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30254248	30275531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30254318_30257563_30257800_30258888_30259100_30260306_30260420_30261126_30261245_30261544_30261682_30265684_30265803_30266657_30266759_30267490_30267607_30267982_30268056_30268185_30268273_30271649_30271749_30271950_30272086_30272977_30273032_30273601_30273719_30273940
tx.10219	chr2	+	2087	8	FSM	ENSMUSG00000026856.15	ENSMUST00000028209.15	2251	8	162	2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	287	junction_6	27.7995742149158	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCTGAGCATACATTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30282427	30290539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30282525_30285670_30285772_30285988_30286074_30286164_30286265_30286443_30286543_30287030_30287160_30287479_30287570_30289153
tx.1022	chr1	-	1047	3	ISM	ENSMUSG00000039630.11	ENSMUST00000037748.9	7640	14	7496	4227	19	3296	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6129	junction_2	38.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCAGTTGTCTAATGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	178157866	178156134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_178156973_178157432_178157505_178157729
tx.10220	chr2	+	1699	4	ISM	ENSMUSG00000026856.15	ENSMUST00000123202.8	2294	9	4021	0	839	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	287	junction_2	23.8932812499432	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCTGAGCATACATTACT	24	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30286448	30290539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_30286543_30287030_30287160_30287479_30287570_30289153
tx.10221	chr2	-	673	4	ISM	ENSMUSG00000026853.16	ENSMUST00000028207.13	3833	14	271	7635	6	-621	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_2	5.71547606649408	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCCACCCTGACCTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30305554	30298747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_30298807_30299968_30300088_30302994_30303259_30305323
tx.10222	chr2	+	2566	10	FSM	ENSMUSG00000039515.12	ENSMUST00000042055.10	2586	10	20	0	20	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	440	junction_4	51.3501655905104	401	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTGTGTGAGACATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30306070	30337817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30306345_30316410_30316509_30318327_30318415_30321972_30322099_30325575_30325694_30327581_30327682_30328240_30328366_30329675_30329777_30333301_30333410_30336388
tx.10223	chr2	+	2310	2	Intergenic	novelGene_766	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTCTCTACCTCCTCCCT	116	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30364399	30383857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_30364487_30381634
tx.10224	chr2	+	984	2	Intergenic	novelGene_767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGGTACACCTGCCTTTC	3874	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30662584	30665448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_30663296_30665175
tx.10225	chr2	+	825	3	Intergenic	novelGene_768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGGTACACCTGCCTTTC	4192	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30662902	30665448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_30663296_30663787_30663947_30665175
tx.10226	chr2	-	520	3	ISM	ENSMUSG00000044320.15	ENSMUST00000129484.8	969	7	7155	-17	162	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	10.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTAGGTGCCTGATTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30686514	30685574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_30685818_30686120_30686296_30686412
tx.10227	chr2	-	1426	7	FSM	ENSMUSG00000044320.15	ENSMUST00000050003.9	1672	7	-16	262	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_6	6.6248689714506	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTAGGTGCCTGATTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30691735	30685574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30685818_30686156_30686296_30686412_30686579_30687879_30687993_30690735_30690829_30690925_30691014_30691151
tx.10228	chr2	+	1189	4	FSM	ENSMUSG00000026857.10	ENSMUST00000138889.8	1192	4	8	-5	7	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_2	216.499422632025	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCCAGGCAGTCTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30697960	30713034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30698096_30709640_30709781_30710460_30710714_30712373
tx.10229	chr2	+	1258	4	FSM	ENSMUSG00000026857.10	ENSMUST00000041830.10	1387	4	119	10	3	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	480	junction_2	33.3466640010661	1382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCAGGCAGTCTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30697956	30713035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30698096_30709640_30709845_30710460_30710714_30712373
tx.1023	chr1	-	907	2	ISM	ENSMUSG00000039630.11	ENSMUST00000037748.9	7640	14	7863	4225	386	3298	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6206	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTTGTCTAATGGGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	178157499	178156132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_178156973_178157432
tx.10230	chr2	+	1088	3	ISM	ENSMUSG00000026857.10	ENSMUST00000041830.10	1387	4	122	1837	6	555	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	480	junction_2	39	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTTGCAAATCTTTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30697959	30711208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_30698096_30709640_30709845_30710460
tx.10231	chr2	-	2109	6	FSM	ENSMUSG00000039483.11	ENSMUST00000041726.4	4147	6	2038	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_2	13.3356664625357	184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTGTCTTTGTATGACA	1720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30718307	30713108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30714517_30714652_30714740_30715463_30715573_30715666_30715774_30716934_30717111_30718085
tx.10232	chr2	-	1305	3	FSM	ENSMUSG00000050737.14	ENSMUST00000102852.6	3647	3	33	2309	33	502	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	10.5	1030	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCGGTGTCTAAGACCCA	8444	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30793276	30781791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30782839_30790878_30790962_30793101
tx.10233	chr2	+	3029	5	FSM	ENSMUSG00000026848.15	ENSMUST00000028199.12	3039	5	10	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	21	junction_2	34.4990941910074	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCCTGAGCTTTTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30842980	30849027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30843236_30843763_30844030_30845789_30845966_30846459_30846588_30846823
tx.10234	chr2	-	1374	5	FSM	ENSMUSG00000026849.19	ENSMUST00000028200.9	1401	5	27	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	220.841996685413	1854	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGGTGGCTTTGTGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30857918	30850638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30851210_30853486_30853615_30853705_30853882_30857101_30857368_30857685
tx.10235	chr2	-	1030	6	ISM	ENSMUSG00000026851.10	ENSMUST00000028205.10	1984	9	2996	658	1561	-658	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	354	junction_3	8.40476055578028	771	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTGTCTTCTAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30868957	30862846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_30863314_30863703_30863803_30863912_30864050_30865902_30866101_30867903_30867982_30868906
tx.10236	chr2	-	1301	9	FSM	ENSMUSG00000026851.10	ENSMUST00000028205.10	1984	9	25	658	25	-658	multi-exon	FALSE	canonical	3	349	junction_7	16.1240309786356	1475	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTGTCTTCTAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30871928	30862846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30863314_30863703_30863803_30863912_30864050_30865902_30866101_30867903_30867982_30868906_30868978_30870010_30870063_30871494_30871555_30871789
tx.10237	chr2	+	1632	4	NNC	ENSMUSG00000026854.17	novel	622	2	NA	NA	-569	-944	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	12	junction_1	12.5521135891752	44	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCTAGCTTGTACTGTGA	7631	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30909261	30912650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_30909404_30909796_30909900_30910840_30910913_30911335
tx.10238	chr2	-	1950	9	FSM	ENSMUSG00000075415.14	ENSMUST00000113552.9	1910	9	-36	-4	-18	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_4	13.559475469206	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTTGTGTCTTCTTGTTT	4801	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31031987	30943242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30944231_30945439_30945587_30948900_30949030_30972985_30973091_30974034_30974098_30986038_30986187_30987105_30987163_30995253_30995370_31031790
tx.10239	chr2	-	795	2	ISM	ENSMUSG00000075415.14	ENSMUST00000136181.8	635	6	-54	49227	-1	-8703	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	166	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTTAACTTAGGTTTGCT	4767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31032021	30994805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_30995370_31031790
tx.10240	chr2	-	514	2	FSM	ENSMUSG00000087269.2	ENSMUST00000133550.2	920	2	-2	408	-2	-408	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTTTATGTTGTTTG	8884	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31042305	31041060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_31041263_31041993
tx.10241	chr2	-	929	2	ISM	ENSMUSG00000087269.2	ENSMUST00000148230.2	577	3	-13	4026	-13	158	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAAAAAAAAAATCAC	8873	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31042316	31040494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_31041263_31042155
tx.10242	chr2	+	1972	18	NNC	ENSMUSG00000000194.14	novel	6134	18	NA	NA	6	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	147.775875374029	345	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGGAGCCTGGGTCTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31042333	31104623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_31042494_31057032_31057160_31058175_31058227_31058808_31058892_31061953_31062094_31064213_31064252_31066909_31066967_31067796_31067908_31068265_31068400_31073591_31073668_31074809_31074884_31075500_31075619_31078694_31078826_31081858_31081907_31097690_31097741_31099078_31099163_31100460_31100583_31104255
tx.10243	chr2	+	1716	17	NNC	ENSMUSG00000000194.14	novel	6134	18	NA	NA	-5150	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	150.914089799462	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGGAGCCTGGGTCTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31057128	31104623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_31057160_31058175_31058227_31058808_31058892_31061953_31062094_31064213_31064252_31066909_31066967_31067796_31067908_31068265_31068400_31073591_31073668_31074809_31074884_31075500_31075619_31078694_31078826_31081858_31081907_31097690_31097741_31099078_31099163_31100460_31100583_31104255
tx.10244	chr2	+	1409	13	NNC	ENSMUSG00000000194.14	novel	6134	18	NA	NA	1934	42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	130.240456037626	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTGGGAGCCTGGGTCTG	3747	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31064212	31104620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_31064252_31066909_31066967_31067796_31067908_31068265_31068400_31073591_31073668_31074809_31074884_31075500_31075619_31078694_31078826_31081858_31081907_31097690_31097741_31099078_31099163_31100460_31100583_31104255
tx.10245	chr2	+	1618	16	FSM	ENSMUSG00000076441.10	ENSMUST00000102840.5	1696	16	76	2	76	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2348	junction_1	252.729068811291	7573	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTCTCTGCGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31360294	31410682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_31360352_31364718_31364783_31366897_31367008_31368946_31369016_31370986_31371176_31376500_31376558_31378589_31378665_31382325_31382397_31383156_31383188_31388158_31388250_31390844_31390930_31391499_31391565_31400121_31400254_31404690_31404848_31408737_31408804_31410383
tx.10246	chr2	+	1567	15	ISM	ENSMUSG00000076441.10	ENSMUST00000102840.5	1696	16	4494	2	4494	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2559	junction_4	228.633395618043	572	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTCTCTGCGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31364712	31410682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_31364783_31366897_31367008_31368946_31369016_31370986_31371176_31376500_31376558_31378589_31378665_31382325_31382397_31383156_31383188_31388158_31388250_31390844_31390930_31391499_31391565_31400121_31400254_31404690_31404848_31408737_31408804_31410383
tx.10247	chr2	-	593	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084226.2	novel	795	1	NA	NA	516	5906	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTCATGTTTGCATACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31442191	31436006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_31436342_31439809_31440008_31442131
tx.10248	chr2	+	3257	19	NNC	ENSMUSG00000026843.16	novel	3268	19	NA	NA	66	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	154	junction_18	127.170586318894	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTAGTCTGTTTTGTTTG	559	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31462728	31507532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_31462966_31473166_31473273_31482474_31482509_31484854_31484905_31485261_31485334_31486605_31486664_31488549_31488713_31490464_31490564_31493222_31493328_31494625_31494729_31495254_31495356_31498096_31498239_31501590_31501752_31502496_31502571_31502848_31502921_31503042_31503120_31504722_31504795_31505509_31505699_31506190
tx.10249	chr2	+	1678	9	FSM	ENSMUSG00000039356.16	ENSMUST00000038474.14	1686	9	8	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	842	junction_6	46.6797600679352	1102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGGAGTCTCACCGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31560734	31571361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_31560874_31562483_31562586_31564526_31564573_31564706_31564797_31565850_31565917_31566679_31566749_31568462_31568640_31569862_31569992_31570501
tx.1025	chr1	+	786	7	FSM	ENSMUSG00000026495.9	ENSMUST00000027775.9	3580	7	-85	2879	-67	163	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_5	10.1447851956888	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTATGGAAGGACAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	178233582	178309199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_178233699_178264966_178265052_178283380_178283454_178302446_178302527_178303249_178303293_178303389_178303457_178308877
tx.10250	chr2	+	1407	6	FSM	ENSMUSG00000001864.14	ENSMUST00000001920.13	3117	6	108	1602	-27	502	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	6.46838465151849	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTCTCCATGTGTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31840258	31861852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_31840394_31840540_31840603_31852226_31852294_31855082_31855125_31859641_31859805_31860914
tx.10251	chr2	+	789	4	FSM	ENSMUSG00000001855.16	ENSMUST00000130975.2	738	4	-46	-5	4	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_1	1.88561808316413	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAAGGCTTTTAATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31864451	31869973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_31864621_31866511_31866708_31867775_31867928_31869701
tx.10252	chr2	+	955	7	ISM	ENSMUSG00000001855.16	ENSMUST00000065398.13	6605	36	4	69145	4	3270	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_4	13.4039795085887	314	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGCATGTGAAAGATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31864451	31873238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_31864621_31866511_31866708_31867775_31867928_31869701_31869901_31870521_31870593_31872622_31872687_31873134
tx.10253	chr2	-	1124	2	FSM	ENSMUSG00000086216.2	ENSMUST00000128298.2	951	2	-171	-2	-171	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTTCTTGTTTTTATTTA	NA	False	NA	-117	True	NA	NA	NA	32126565	32122791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_32123532_32126181
tx.10254	chr2	+	2870	20	FSM	ENSMUSG00000039254.17	ENSMUST00000036473.16	2918	20	48	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_15	17.3977423950124	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTATGTTATTTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32126649	32145017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32126754_32127371_32127524_32130438_32130546_32130676_32130728_32131664_32131812_32132904_32133017_32133476_32133543_32133630_32133725_32134245_32134402_32135558_32135690_32136026_32136123_32137548_32137642_32138626_32138724_32140481_32140575_32140800_32140922_32141273_32141372_32141921_32142036_32142887_32143015_32143727_32143906_32144284
tx.10255	chr2	+	2459	16	ISM	ENSMUSG00000039254.17	ENSMUST00000036473.16	2918	20	5060	0	-2709	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_11	15.9192406295722	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTATGTTATTTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32131661	32145017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32131812_32132904_32133017_32133476_32133543_32133630_32133725_32134245_32134402_32135558_32135690_32136026_32136123_32137548_32137642_32138626_32138724_32140481_32140575_32140800_32140922_32141273_32141372_32141921_32142036_32142887_32143015_32143727_32143906_32144284
tx.10256	chr2	-	1925	7	FSM	ENSMUSG00000002550.17	ENSMUST00000002625.15	2005	7	80	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_2	20.9741904889478	196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATTTGTCCTGTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32150091	32145013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_32146224_32146629_32146679_32148101_32148197_32148288_32148432_32148582_32148680_32149591_32149752_32149920
tx.10257	chr2	-	720	5	NNC	ENSMUSG00000044627.12	novel	768	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1492.44472259444	685	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTCTGATCCTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32178043	32168827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_32169144_32170720_32170816_32171697_32171823_32177608_32177647_32177897
tx.10258	chr2	-	731	5	FSM	ENSMUSG00000044627.12	ENSMUST00000183946.8	768	5	37	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3309	junction_1	124.51380445557	26345	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTCTGATCCTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32178043	32168827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_32169144_32170720_32170816_32171697_32171823_32177608_32177658_32177897
tx.10259	chr2	-	715	4	NNC	ENSMUSG00000044627.12	novel	768	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1628.30675515668	703	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTCTGATCCTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32178043	32168827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_32169144_32170720_32170816_32171697_32171856_32177897
tx.10260	chr2	-	606	4	FSM	ENSMUSG00000044627.12	ENSMUST00000113397.9	580	4	-26	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_2	1606.82426612938	723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTCTGATCCTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32178043	32168827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_32169144_32170720_32170816_32177608_32177658_32177897
tx.10261	chr2	+	387	5	ISM	ENSMUSG00000002546.18	ENSMUST00000129193.3	847	12	-18	5029	4	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	94	junction_1	18.8198698188909	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCACAGGACTGGGACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32178348	32187183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32178409_32182104_32182228_32186637_32186734_32186976_32187021_32187119
tx.10262	chr2	+	666	4	ISM	ENSMUSG00000039205.17	ENSMUST00000125818.2	996	7	801	1927	801	0	internal_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_3	4.78423336480244	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGTCCCCACCAGCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32266301	32268311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32266440_32267304_32267375_32267520_32267643_32267975
tx.10263	chr2	-	620	2	FSM	ENSMUSG00000039195.5	ENSMUST00000048792.5	680	2	53	7	-23	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	268	junction_1	0	2018	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCACTGCCCCCTTCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32271897	32269119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_32269546_32271703
tx.10264	chr2	+	1084	4	ISM	ENSMUSG00000026820.6	ENSMUST00000028162.5	4978	7	4456	3033	2881	1163	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_3	9.20144916122817	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGGTCTGACAATGGTGC	2028	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32290363	32292751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32290565_32290889_32291091_32291498_32291617_32292187
tx.10265	chr2	+	618	2	ISM	ENSMUSG00000026820.6	ENSMUST00000028162.5	4978	7	5654	3034	4079	1162	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGGTCTGACAATGGTG	3226	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32291561	32292750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32291617_32292187
tx.10266	chr2	+	2849	2	FSM	ENSMUSG00000039164.3	ENSMUST00000048431.3	4650	2	1805	-4	1805	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACACACTCCTCTTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32342273	32346969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32342962_32344808
tx.10267	chr2	+	852	4	FSM	ENSMUSG00000026810.13	ENSMUST00000028151.7	869	4	9	8	0	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_1	58.5965490072202	1605	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGTCTCTCTGCCATCC	4782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32460878	32463583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32460925_32461217_32461308_32462308_32462412_32462970
tx.10268	chr2	+	1108	3	FSM	ENSMUSG00000026810.13	ENSMUST00000128039.2	655	3	37	-490	37	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	393	junction_2	5	518	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGTCTCTCTGCCATCC	4819	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32460915	32463583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32461308_32462308_32462412_32462970
tx.10269	chr2	+	1808	2	FSM	ENSMUSG00000026810.13	ENSMUST00000150419.2	851	2	-842	-115	338	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	393	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGTCTCTCTGCCATCC	5120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32461216	32463583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32462412_32462970
tx.10270	chr2	+	1645	6	FSM	ENSMUSG00000079442.13	ENSMUST00000102818.11	3626	6	-15	1996	-15	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_4	7.22218803410712	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTGTCTCTGTGGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32477091	32487714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32477240_32477592_32477694_32479456_32479643_32484001_32484415_32485705_32485814_32487025
tx.10271	chr2	+	951	3	ISM	ENSMUSG00000079442.13	ENSMUST00000179989.2	2826	5	6624	1373	-27	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	4.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTGTCTCTGTGGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32484260	32487714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32484415_32485705_32485814_32487025
tx.10272	chr2	+	413	4	ISM	ENSMUSG00000026811.19	ENSMUST00000095044.10	2394	7	-1	8403	-1	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_2	14.9666295470958	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGAGCAGCTCCTGAGGGG	3368	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32497036	32502415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32497124_32498053_32498109_32499237_32499329_32502235
tx.10273	chr2	+	250	2	ISM	ENSMUSG00000026811.19	ENSMUST00000126636.8	438	3	-1	2566	-1	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGAGCAGCTCCTGAGGGG	3385	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32497053	32502415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32497124_32502235
tx.10274	chr2	+	2067	7	FSM	ENSMUSG00000026817.15	ENSMUST00000113277.8	2063	7	0	-4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	98.788775790685	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTGAGTGTATTGAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32515448	32525070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32515551_32518462_32518501_32519860_32519897_32520246_32520411_32521087_32521205_32523305_32523498_32523652
tx.10275	chr2	+	1987	6	ISM	ENSMUSG00000026817.15	ENSMUST00000113277.8	2063	7	2989	-1	36	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	200	junction_1	44.5268458348444	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAAGTGAGTGTATTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32518437	32525067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32518501_32519860_32519897_32520246_32520411_32521087_32521205_32523305_32523498_32523652
tx.10276	chr2	+	2057	6	FSM	ENSMUSG00000026817.15	ENSMUST00000068271.5	2034	6	-20	-3	-20	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_1	85.0895998345274	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAAGTGAGTGTATTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32519495	32525067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32519629_32519860_32519897_32520246_32520411_32521087_32521205_32523305_32523498_32523652
tx.10277	chr2	+	1988	5	ISM	ENSMUSG00000026817.15	ENSMUST00000068271.5	2034	6	279	-1	262	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	270	junction_4	19.9374020373769	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAGAAGTGAGTGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32519794	32525065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32519897_32520246_32520411_32521087_32521205_32523305_32523498_32523652
tx.10278	chr2	+	1892	4	ISM	ENSMUSG00000026817.15	ENSMUST00000068271.5	2034	6	730	-6	713	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	270	junction_3	23.0120741254576	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTGAGTGTATTGAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32520245	32525070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32520411_32521087_32521205_32523305_32523498_32523652
tx.10279	chr2	+	1532	2	ISM	ENSMUSG00000026817.15	ENSMUST00000068271.5	2034	6	3865	-3	3848	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	270	junction_1	0	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAAGTGAGTGTATTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32523380	32525067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32523498_32523652
tx.1028	chr1	-	967	7	ISM	ENSMUSG00000055067.16	ENSMUST00000068437.13	3360	9	154438	2204	-105057	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	343	junction_1	12.7758452644912	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGCGACTTGGCTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	178921967	178784814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_178785128_178799752_178799862_178871301_178871477_178877855_178877944_178913888_178914000_178920430_178920534_178921899
tx.10280	chr2	+	2911	15	FSM	ENSMUSG00000026814.17	ENSMUST00000009705.14	3422	15	-26	537	-26	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_1	26.1475405640955	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCCCTCTGGGTTGTATG	529	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32536580	32572133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32537037_32547527_32547683_32559434_32559576_32561353_32561520_32562229_32562396_32562848_32562970_32563261_32563437_32563603_32563747_32567564_32567703_32567934_32567974_32568467_32568585_32568902_32569155_32570292_32570348_32571207_32571310_32571448
tx.10281	chr2	-	2242	15	FSM	ENSMUSG00000009566.13	ENSMUST00000028148.11	2273	15	31	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	280	junction_8	41.2442327446381	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTATTCTCCTAGCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32584166	32572620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_32573481_32574761_32574829_32575325_32575402_32575730_32575882_32576565_32576656_32576749_32576898_32577156_32577235_32577424_32577528_32577613_32577676_32577771_32577850_32577931_32578047_32581201_32581267_32582462_32582517_32582604_32582734_32584000
tx.10282	chr2	-	1002	2	FSM	ENSMUSG00000009555.17	ENSMUST00000130399.2	444	2	105	-663	105	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1331	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGCGTTTCCTGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32599628	32597449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_32598302_32599478
tx.10283	chr2	-	1811	6	NIC	ENSMUSG00000009555.17	novel	1733	7	NA	NA	52	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	1092	junction_4	84.0514128376198	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGCGTTTCCTGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32602717	32597449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_32598302_32599478_32599957_32600054_32600222_32600488_32600580_32602042_32602125_32602576
tx.10284	chr2	-	1661	7	FSM	ENSMUSG00000009555.17	ENSMUST00000009699.16	1733	7	72	0	45	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1063	junction_2	88.3259430870807	237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGCGTTTCCTGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32602724	32597449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_32598302_32599478_32599628_32599784_32599957_32600054_32600222_32600488_32600580_32602042_32602125_32602576
tx.10285	chr2	+	1516	5	FSM	ENSMUSG00000009563.17	ENSMUST00000009707.14	1536	5	20	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_1	20.9105236663265	438	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGACCAAAGTTTCTTAC	609	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32647265	32652256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32647463_32648682_32648949_32649538_32649715_32650600_32650729_32651507
tx.10286	chr2	+	1430	5	FSM	ENSMUSG00000009563.17	ENSMUST00000156617.8	915	5	-1	-514	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	95.4214336509361	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGACCAAAGTTTCTTAC	609	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32647265	32652256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32647463_32648768_32648949_32649538_32649715_32650600_32650729_32651507
tx.10287	chr2	+	961	5	FSM	ENSMUSG00000053746.9	ENSMUST00000066352.6	952	5	-9	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_4	3.34477204006491	426	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGAAGCTTCCTGTGGGGT	8182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32665788	32667609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32665908_32666315_32666536_32666718_32666819_32666994_32667041_32667133
tx.10288	chr2	+	1153	4	FSM	ENSMUSG00000053746.9	ENSMUST00000138214.2	908	4	-97	-148	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_3	3.85861230093008	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGAAGCTTCCTGTGGGGT	8173	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32665779	32667609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32665908_32666315_32666819_32666994_32667041_32667133
tx.10289	chr2	-	876	7	ISM	ENSMUSG00000026797.17	ENSMUST00000077458.7	3616	20	0	26731	0	1822	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_4	2.80871659105879	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGATTTTATCTGTTAGC	5192	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32737214	32704703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_32705040_32707297_32707402_32708438_32708518_32709845_32709923_32711846_32711929_32713547_32713598_32737066
tx.1029	chr1	-	601	5	ISM	ENSMUSG00000055067.16	ENSMUST00000111134.2	1229	6	22	10057	-14	-10057	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	351	junction_3	38.1338104573881	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTTGAAGCTTCTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179345584	179232845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_179232985_179237971_179238030_179239242_179239351_179250919_179250984_179345352
tx.10290	chr2	-	1343	6	ISM	ENSMUSG00000026797.17	ENSMUST00000077458.7	3616	20	-4	28526	0	27	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_3	2.78567765543682	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAGAAAAGAAAAG	5188	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32737218	32706498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_32707402_32708438_32708518_32709845_32709923_32711846_32711929_32713547_32713598_32737066
tx.10291	chr2	+	3678	14	FSM	ENSMUSG00000026796.17	ENSMUST00000028135.15	3714	14	36	0	36	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	292	junction_12	30.0169577319103	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTCATGTGCTGCTGGG	8893	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32766161	32815266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32766417_32795780_32795912_32799860_32799990_32801352_32801459_32802431_32802600_32809004_32809121_32809507_32809613_32809714_32809878_32810964_32811153_32812080_32812237_32812569_32812687_32812867_32812976_32813058_32813171_32813442
tx.10292	chr2	+	665	7	FSM	ENSMUSG00000038900.18	ENSMUST00000126610.2	1242	7	126	451	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2580	junction_6	1457.06650690885	31952	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGCTTGGCTGCTTTTTGG	5767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32851696	32854057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32851852_32852060_32852135_32852585_32852685_32852996_32853079_32853508_32853596_32853752_32853866_32854002
tx.10293	chr2	+	757	7	FSM	ENSMUSG00000038900.18	ENSMUST00000102811.10	729	7	-26	-2	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	310	junction_1	2477.85254246943	9539	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGCTTGGCTGCTTTTTGG	5796	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32851725	32854057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32851973_32852060_32852135_32852585_32852685_32852996_32853079_32853508_32853596_32853752_32853866_32854002
tx.10294	chr2	+	1066	6	NIC	ENSMUSG00000038900.18	novel	1242	7	NA	NA	-6	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	2580	junction_5	1481.81753262674	598	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGCTTGGCTGCTTTTTGG	5796	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32851725	32854057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_32851852_32852060_32852135_32852585_32852685_32852996_32853596_32853752_32853866_32854002
tx.10295	chr2	-	1701	8	ISM	ENSMUSG00000026791.15	ENSMUST00000028129.13	2108	10	643	-9	578	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_4	9.40690150465961	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAGCCAGAAGTCTTTTG	4593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32871451	32862992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_32863745_32864849_32864996_32865325_32865497_32865931_32866041_32866148_32866293_32866872_32867073_32870013_32870114_32871372
tx.10296	chr2	-	2101	10	FSM	ENSMUSG00000026791.15	ENSMUST00000028129.13	2108	10	16	-9	2	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_4	8.32666399786453	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAGCCAGAAGTCTTTTG	3966	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32872078	32862992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_32863745_32864849_32864996_32865325_32865497_32865931_32866041_32866148_32866293_32866872_32867073_32870013_32870114_32871372_32871580_32871732_32871896_32871969
tx.10297	chr2	-	589	2	ISM	ENSMUSG00000038860.16	ENSMUST00000049618.9	3678	28	96731	-2	18693	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCTGCAACCCTTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32879647	32876383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_32876843_32879517
tx.10298	chr2	-	336	3	FSM	ENSMUSG00000068966.11	ENSMUST00000113158.8	6602	3	38	6228	31	-417	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCGTCCTCGCAGCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33321298	33302347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_33302508_33318112_33318233_33321242
tx.10299	chr2	-	219	2	FSM	ENSMUSG00000068966.11	ENSMUST00000134589.2	664	2	28	417	28	-417	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCGTCCTCGCAGCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33321301	33302347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_33302508_33321242
tx.103	chr1	-	1966	14	FSM	ENSMUSG00000026134.12	ENSMUST00000027312.11	1975	14	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_10	82.0868352460372	353	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGTGCAAGTGGGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33708867	33492890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_33493386_33503133_33503203_33519538_33519622_33523762_33523890_33551096_33551283_33553225_33553299_33572376_33572445_33667475_33667614_33669418_33669515_33701326_33701448_33702857_33702938_33706125_33706230_33707938_33708102_33708704
tx.10300	chr2	+	183	2	Intergenic	novelGene_770	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGCCTGGAGTCATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33329753	33331553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_33329818_33331434
tx.10301	chr2	-	1721	2	NIC	ENSMUSG00000026788.14	novel	4998	3	NA	NA	6	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTATGTTCTCATCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33358565	33343535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_33345136_33358444
tx.10302	chr2	-	1699	3	FSM	ENSMUSG00000026788.14	ENSMUST00000028125.12	4998	3	6	3293	6	-58	multi-exon	TRUE	canonical	3	44	junction_1	8.5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATTTCTGAAAGACCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33358538	33343591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_33345136_33354925_33354987_33358444
tx.10303	chr2	-	1827	4	FSM	ENSMUSG00000026788.14	ENSMUST00000113156.2	1828	4	-57	58	-3	-58	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	10.6770782520313	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATTTCTGAAAGACCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33358574	33343591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_33345136_33352277_33352370_33354925_33354987_33358444
tx.10304	chr2	+	409	2	FSM	ENSMUSG00000086939.2	ENSMUST00000134014.2	390	2	-19	0	-19	0	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGATAGATTATCACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33379774	33393644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_33379998_33393458
tx.10305	chr2	+	1568	2	NNC	ENSMUSG00000086939.2	novel	390	2	NA	NA	10	4411	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTAATATGATTAAGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33379803	33398055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_33379998_33396681
tx.10306	chr2	-	527	3	NNC	ENSMUSG00000038740.10	novel	520	3	NA	NA	10932	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	38	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAAGTGTGTTTTGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33765925	33763620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_33763860_33764349_33764473_33765760
tx.10307	chr2	-	460	3	FSM	ENSMUSG00000038740.10	ENSMUST00000146892.2	520	3	65	-5	65	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_1	8	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAAGTGTGTTTTGATGA	4278	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33777429	33763620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_33763860_33764349_33764473_33777331
tx.10308	chr2	-	1719	3	NNC	ENSMUSG00000087461.3	novel	2668	4	NA	NA	80967	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATTCTATCTTGGAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33916774	33908306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_33909667_33915810_33915970_33916574
tx.10309	chr2	-	1672	3	NNC	ENSMUSG00000087461.3	novel	2668	4	NA	NA	80959	-903	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_1	1	71	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACTGTTTACCCTCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33916782	33909203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_33910509_33915810_33915970_33916574
tx.1031	chr1	+	1910	12	FSM	ENSMUSG00000038936.14	ENSMUST00000040538.10	1948	12	35	3	-15	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_9	16.3434218576322	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACTTTTTCCCCCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179495809	179514751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_179496111_179498147_179498261_179503955_179504037_179505605_179505736_179506444_179506495_179507149_179507281_179508056_179508175_179508997_179509118_179509215_179509273_179511769_179511882_179513260_179513343_179514136
tx.10310	chr2	+	757	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087461.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTTGACTAGGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33972709	33976482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_33972886_33975901
tx.10311	chr2	+	634	2	Intergenic	novelGene_771	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTTGTTTGTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34021385	34027616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_34021538_34027134
tx.10312	chr2	+	746	3	Intergenic	novelGene_772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTTGTTTGTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34021399	34027616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_34021538_34024820_34024947_34027134
tx.10313	chr2	+	2400	12	FSM	ENSMUSG00000038696.15	ENSMUST00000147337.8	3111	12	-323	1034	-2	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_6	16.5988150527989	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTGGTTGGTATGATGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34296871	34513927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_34297267_34322014_34322343_34325144_34325235_34334269_34334419_34387712_34387886_34408684_34408862_34423799_34423910_34453066_34453175_34471203_34471345_34487434_34487573_34509856_34509955_34513434
tx.10314	chr2	+	592	2	ISM	ENSMUSG00000038696.15	ENSMUST00000129633.2	691	3	260	6	260	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCGTGGTTGGTATGATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34509853	34513925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_34509955_34513434
tx.10315	chr2	+	2549	8	FSM	ENSMUSG00000026864.14	ENSMUST00000100171.3	2613	8	-3	67	-3	-67	multi-exon	FALSE	canonical	3	2314	junction_3	220.40537791135	486	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTTTGTGAAAAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34662103	34666476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_34662459_34662570_34662803_34663181_34663320_34663832_34663946_34664039_34664431_34664546_34664785_34665077_34665246_34665562
tx.10316	chr2	+	2467	9	FSM	ENSMUSG00000026864.14	ENSMUST00000028222.13	3672	9	122	1083	-3	-67	multi-exon	FALSE	canonical	3	1920	junction_1	305.196632312678	888	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTTTGTGAAAAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34662103	34666476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_34662159_34662240_34662459_34662570_34662803_34663181_34663320_34663832_34663946_34664039_34664431_34664546_34664785_34665077_34665246_34665562
tx.10317	chr2	+	1587	4	ISM	ENSMUSG00000026864.14	ENSMUST00000100171.3	2613	8	2057	67	486	-67	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2476	junction_1	207.799582931888	222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTTTGTGAAAAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34664163	34666476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_34664431_34664546_34664785_34665077_34665246_34665562
tx.10318	chr2	-	1145	7	NIC	ENSMUSG00000070953.14	novel	2968	8	NA	NA	-2131	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	56	junction_4	137.725169167521	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTGACTTTTTACAAAAG	5113	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34687448	34669228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_34669542_34670608_34670759_34674557_34674708_34675578_34675738_34680514_34680668_34685183_34685342_34687386
tx.10319	chr2	-	1148	7	ISM	ENSMUSG00000070953.14	ENSMUST00000118108.2	1431	8	2292	-20	-2131	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	358	junction_4	38.762811502206	536	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTGACTTTTTACAAAAG	5113	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34687448	34669228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_34669542_34670608_34670759_34674557_34674708_34675578_34675741_34680514_34680668_34685183_34685342_34687386
tx.10320	chr2	-	1467	8	FSM	ENSMUSG00000070953.14	ENSMUST00000118108.2	1431	8	-16	-20	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_7	117.809081109381	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTGACTTTTTACAAAAG	2805	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34689756	34669228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_34669542_34670608_34670759_34674557_34674708_34675578_34675741_34680514_34680668_34685183_34685342_34687386_34687446_34689434
tx.10321	chr2	-	1184	8	FSM	ENSMUSG00000070953.14	ENSMUST00000145903.8	2968	8	123	1661	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_7	62.9123134503371	590	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTGACTTTTTACAAAAG	2760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34689801	34669228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_34669542_34670608_34670759_34674557_34674708_34675578_34675741_34680514_34680668_34685183_34685342_34687386_34687446_34689762
tx.10322	chr2	+	418	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035949.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAGACAGCAAAGGCATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34692208	34701900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_34692482_34701755
tx.10323	chr2	+	511	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035949.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1.5	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATTGGAGGAGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34692353	34702252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_34692482_34701755_34701957_34702070
tx.10324	chr2	-	1054	4	ISM	ENSMUSG00000035949.16	ENSMUST00000113078.8	1872	6	12064	0	-2454	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	277	junction_3	19.5106808355492	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTGTTCTTTGAAATTG	NA	False	NA	43	True	NA	NA	NA	34701129	34695349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_34696012_34697289_34697460_34698525_34698613_34700994
tx.10325	chr2	-	1908	8	FSM	ENSMUSG00000035949.16	ENSMUST00000113080.9	1923	8	18	-3	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	239	junction_7	72.0294724259395	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTGTTCTTTGAAATTG	9219	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34716224	34695349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_34696012_34697289_34697460_34698525_34698613_34700994_34701129_34702826_34703022_34712569_34713080_34715973_34716083_34716183
tx.10326	chr2	-	2503	4	FSM	ENSMUSG00000035949.16	ENSMUST00000131534.8	1930	4	100	-673	4	673	multi-exon	FALSE	canonical	3	239	junction_3	100.641277151409	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAGTGACAGTGAAGCG	9220	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34716223	34701177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_34703022_34712569_34713080_34715973_34716083_34716183
tx.10327	chr2	-	1863	9	NIC	ENSMUSG00000026869.13	novel	4397	10	NA	NA	-6	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	104	junction_8	158.265945089271	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGCGTTGGTATTCCGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34760951	34742111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_34742846_34744263_34744405_34746459_34746570_34747649_34747842_34750643_34750787_34753468_34753579_34755538_34755668_34755993_34756108_34760761
tx.10328	chr2	-	2009	10	FSM	ENSMUSG00000026869.13	ENSMUST00000028225.12	4397	10	22	2366	-7	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	516	junction_4	38.498997902623	290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGCGTTGGTATTCCGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34760952	34742111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_34742846_34744263_34744405_34746459_34746570_34747649_34747842_34750643_34750787_34753468_34753579_34755538_34755668_34755993_34756108_34756904_34757050_34760761
tx.10329	chr2	+	549	2	Intergenic	novelGene_776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGATTGAGTCTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34956830	34958757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_34957071_34958448
tx.10330	chr2	+	864	2	Intergenic	novelGene_775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGATTGAGTCTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34956804	34958757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_34957360_34958448
tx.10331	chr2	-	1690	8	FSM	ENSMUSG00000026878.18	ENSMUST00000028238.15	3081	8	85	1306	-53	618	multi-exon	FALSE	canonical	3	853	junction_1	102.482054178141	564	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTTTGTACAGTGTGACC	9637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35091047	35071522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_35072460_35073404_35073436_35073755_35073844_35076685_35076753_35079911_35080090_35081523_35081578_35082632_35082692_35090771
tx.10332	chr2	-	1677	7	NNC	ENSMUSG00000026878.18	novel	3081	8	NA	NA	-53	618	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	402.811646085639	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTTTGTACAGTGTGACC	9637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35091047	35071522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_35072478_35073755_35073844_35076685_35076753_35079911_35080090_35081523_35081578_35082632_35082692_35090771
tx.10333	chr2	-	2825	7	FSM	ENSMUSG00000026880.12	ENSMUST00000028241.7	2787	7	-37	-1	-37	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_2	5.5876848714134	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTGAGTCTTGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35227025	35203996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_35206068_35210342_35210478_35211494_35211699_35213675_35213759_35215325_35215399_35216432_35216537_35226870
tx.10334	chr2	-	2208	2	FSM	ENSMUSG00000026880.12	ENSMUST00000202568.2	890	2	36	-1354	36	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTCTGTGAGTCTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35210481	35203998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_35206068_35210342
tx.10335	chr2	-	1185	4	NIC	ENSMUSG00000035778.18	novel	3391	8	NA	NA	772	1830	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	24	junction_3	31.6789449880446	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAAACAAATGATCCAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35352471	35311510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_35312281_35313243_35313425_35322525_35322645_35352356
tx.10336	chr2	-	626	4	ISM	ENSMUSG00000035778.18	ENSMUST00000113002.9	3391	8	-1	21837	-1	1313	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_3	30.739045022396	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGCCTTAGTAATTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35351279	35312027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_35312281_35313243_35313425_35322525_35322645_35351206
tx.10337	chr2	+	822	6	NNC	ENSMUSG00000026883.18	novel	6219	15	NA	NA	-11379	123	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	113.442496446438	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAACGCAACAGCTACCTGG	4407	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35500613	35600068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_35500706_35533899_35534004_35551503_35551638_35597659_35597814_35598825_35598925_35599829
tx.10338	chr2	-	793	4	FSM	ENSMUSG00000026895.8	ENSMUST00000070112.6	861	4	68	0	68	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1222	junction_2	59.9184631163235	10119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTGTGTTTTATTATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35939350	35926337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_35926654_35929723_35929890_35934361_35934526_35939203
tx.10339	chr2	-	2455	6	FSM	ENSMUSG00000026889.13	ENSMUST00000028251.10	2617	6	162	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	240	junction_3	16.6300932047899	577	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTATGTGGTCTTATTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36026623	36006090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_36007987_36010824_36010911_36012863_36012951_36017136_36017264_36024146_36024276_36026493
tx.10340	chr2	+	1319	7	FSM	ENSMUSG00000026887.10	ENSMUST00000028250.9	2623	7	253	1051	8	-1051	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_1	20.1941960858945	483	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAGAGTGGTTTGGATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36026653	36079608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_36026712_36031457_36031670_36037914_36038071_36043604_36043724_36049610_36049703_36067126_36067287_36079086
tx.10341	chr2	+	383	2	NNC	ENSMUSG00000087187.2	novel	476	4	NA	NA	1977	82	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTGTTTTTCACTAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36112478	36113028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_36112587_36112753
tx.10342	chr2	-	2446	2	ISM	ENSMUSG00000009030.15	ENSMUST00000009174.15	2858	4	3559	1	3416	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	157	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGTATATTAGATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37245785	37240086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_37242395_37245647
tx.10343	chr2	-	2805	4	FSM	ENSMUSG00000009030.15	ENSMUST00000009174.15	2858	4	52	1	-27	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_1	14.3527000944073	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCCTGTATATTAGATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37249292	37240086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_37242395_37245647_37245830_37247215_37247393_37249154
tx.10344	chr2	-	2625	2	FSM	ENSMUSG00000050714.10	ENSMUST00000067043.5	5267	2	-35	2677	-21	173	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGTATCATTTTATACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37333168	37324856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_37327012_37332698
tx.10345	chr2	+	1469	10	ISM	ENSMUSG00000035437.16	ENSMUST00000066055.10	4247	19	-3	52883	-3	-1867	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_1	49.1884760166394	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTTCACCTGGGTGCCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37342253	37382091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_37342314_37359388_37359589_37362306_37362527_37363590_37363796_37365303_37365479_37373739_37373898_37377077_37377189_37377523_37377591_37379742_37379846_37381921
tx.10346	chr2	+	2039	14	ISM	ENSMUSG00000035437.16	ENSMUST00000066055.10	4247	19	-2	12296	-2	-12296	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_1	41.7052208217027	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCGGTTCTGAATCTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37342254	37422678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_37342314_37359388_37359589_37362306_37362527_37363590_37363796_37365303_37365479_37373739_37373898_37377077_37377189_37377523_37377591_37379742_37379846_37381921_37382092_37385594_37385770_37392879_37392974_37398939_37399091_37422527
tx.10347	chr2	+	1811	2	ISM	ENSMUSG00000035437.16	ENSMUST00000159092.2	1763	14	46976	-1383	46976	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	256	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTGCTTCATACAAAAGT	1248	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37453506	37456448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_37453646_37454776
tx.10348	chr2	-	1018	3	ISM	ENSMUSG00000026915.17	ENSMUST00000028279.10	16348	17	56544	13351	3325	-63	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	769	junction_2	23.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGGATTGTGATTATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37480753	37473230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_37474119_37476521_37476567_37480668
tx.10349	chr2	-	3176	18	NNC	ENSMUSG00000026915.17	novel	3144	18	NA	NA	-18	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	65	junction_17	156.356305014051	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTTTTGTTCTTGTGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37593378	37473167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_37474119_37476521_37476567_37480668_37480793_37486715_37486857_37489132_37489268_37490756_37490916_37492946_37493147_37493933_37494027_37514184_37514297_37514504_37514603_37515189_37515302_37516493_37516590_37517446_37517539_37525435_37525581_37530862_37531029_37535482_37535704_37537127_37537298_37593262
tx.10350	chr2	-	1225	5	ISM	ENSMUSG00000035392.18	ENSMUST00000150896.8	1036	10	147	189088	-12	897	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	2.91547594742265	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTGGAACAGCCAGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38177242	38015718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_38016661_38026937_38026988_38049818_38049863_38133413_38133485_38177124
tx.10351	chr2	+	2250	10	FSM	ENSMUSG00000026749.12	ENSMUST00000054234.10	10338	10	51	8037	26	803	multi-exon	FALSE	canonical	3	219	junction_1	27.0760246548697	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGTGCTGGAGGAAACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38401705	38476581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_38401806_38440564_38440684_38447827_38447969_38448864_38448928_38450892_38451004_38458858_38458968_38459639_38459748_38467250_38467346_38472394_38472509_38475291
tx.10352	chr2	+	2259	10	FSM	ENSMUSG00000026749.12	ENSMUST00000112895.8	1513	10	61	-807	61	807	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	94.3328752769929	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGGAGGAAACAGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38401886	38476585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_38401992_38440564_38440684_38447827_38447969_38448864_38448928_38450892_38451004_38458858_38458968_38459639_38459748_38467250_38467346_38472394_38472509_38475291
tx.10353	chr2	+	2168	9	ISM	ENSMUSG00000026749.12	ENSMUST00000112895.8	1513	10	38738	-820	35926	820	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	285	junction_3	10.1234566725008	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTGAATTTTGTTCTTC	8031	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38440563	38476598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_38440684_38447827_38447969_38448864_38448928_38450892_38451004_38458858_38458968_38459639_38459748_38467250_38467346_38472394_38472509_38475291
tx.10354	chr2	-	821	6	ISM	ENSMUSG00000026750.7	ENSMUST00000028083.6	1160	8	1810	0	1643	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1531	junction_5	115.553277755328	5463	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTGGTTGTAATGTTGG	4023	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38532289	38478047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_38478301_38480708_38480861_38503443_38503503_38523862_38523979_38530084_38530226_38532189
tx.10355	chr2	-	994	8	FSM	ENSMUSG00000026750.7	ENSMUST00000028083.6	1160	8	166	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1531	junction_5	118.933011500129	16018	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTGGTTGTAATGTTGG	2379	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38533933	38478047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_38478301_38480708_38480861_38503443_38503503_38523862_38523979_38530084_38530226_38532189_38532288_38533369_38533464_38533852
tx.10356	chr2	+	1459	4	NNC	ENSMUSG00000083722.3	novel	2918	21	NA	NA	-43	-3324	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_3	1.69967317119759	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCCCCATCTACCATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38559385	38563240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_38559477_38560826_38560923_38561172_38561237_38562032
tx.10357	chr2	-	1618	2	FSM	ENSMUSG00000085755.2	ENSMUST00000141133.2	1165	2	0	-453	0	453	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAATTGGAAGGCTCACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38888270	38886271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_38887374_38887754
tx.10358	chr2	-	479	3	FSM	ENSMUSG00000062997.7	ENSMUST00000152441.2	541	3	100	-38	100	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	39700	junction_1	236.5	1216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCTTCATGTTTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38894955	38891592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_38891778_38894118_38894201_38894743
tx.10359	chr2	-	472	4	FSM	ENSMUSG00000062997.7	ENSMUST00000080861.6	946	4	473	1	-29	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	27807	junction_3	5721.16085733967	39248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCTTCATGTTTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38895163	38891592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_38891778_38894118_38894201_38894743_38894881_38895095
tx.10360	chr2	+	1031	4	NNC	ENSMUSG00000026755.15	novel	752	4	NA	NA	25	201	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	449.53704580997	2739	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGCGGTGTGTTCTCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38898112	38905606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_38898359_38903128_38903200_38903734_38903912_38905069
tx.10361	chr2	-	2898	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000026755.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGCACCGGCTCCGCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38901264	38898152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_38900075_38900288
tx.10362	chr2	-	984	4	ISM	ENSMUSG00000026754.17	ENSMUST00000136261.2	1494	9	-64	8532	-8	-8532	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_3	10.6770782520313	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGAAGTTTGAAGACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38955561	38945615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_38946163_38953253_38953517_38954686_38954736_38955436
tx.10363	chr2	-	314	3	ISM	ENSMUSG00000026754.17	ENSMUST00000136261.2	1494	9	-51	16280	5	-16280	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_2	12	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCAGAAGAGACTGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38955548	38953363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_38953517_38954686_38954736_38955436
tx.10364	chr2	-	1288	9	ISM	ENSMUSG00000035236.18	ENSMUST00000157038.8	1233	10	1	3098	-1	129	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3.37036719067819	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACTAACAAAATAACTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39080741	38996591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_38997085_38997219_38997319_38998318_38998416_39011122_39011222_39013015_39013103_39015101_39015198_39022966_39023099_39080000_39080046_39080601
tx.10365	chr2	-	1576	7	FSM	ENSMUSG00000026753.6	ENSMUST00000028087.6	4115	7	95	2444	-36	-21	multi-exon	FALSE	canonical	3	417	junction_2	25.493463214453	704	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCCTCCTTGTTGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39116368	39086809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_39087602_39089674_39089885_39090053_39090134_39094844_39094987_39096663_39096730_39100969_39101066_39116178
tx.10366	chr2	+	379	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082536.2	novel	1365	1	NA	NA	1267	328	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	932	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGAAATTGAAGAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40447030	40447456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_40447295_40447341
tx.10367	chr2	+	392	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082536.2	novel	1365	1	NA	NA	1267	329	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1320	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAAATTGAAGAAGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40447030	40447457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_40447307_40447341
tx.10368	chr2	-	1218	5	ISM	ENSMUSG00000049252.18	ENSMUST00000167270.5	10071	63	486065	480405	486065	268	internal_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.433012701892219	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTATAAAGCTTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41193025	41171809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_41172277_41174106_41174239_41185476_41185722_41186007_41186173_41192816
tx.10369	chr2	+	434	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000049252.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCATAGTCTATGTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41510822	41512146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_41511051_41511940
tx.10370	chr2	+	1039	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000081999.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTTTACTTTTTATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41877137	41878878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_41878011_41878712
tx.10371	chr2	-	1031	2	NNC	ENSMUSG00000081999.4	novel	662	2	NA	NA	-37	347	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	101	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTGAATCATCCCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41878878	41877137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_41878015_41878724
tx.10372	chr2	-	1027	2	NNC	ENSMUSG00000081999.4	novel	662	2	NA	NA	-37	347	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	105	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTGAATCATCCCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41878878	41877137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_41878015_41878728
tx.10373	chr2	-	1034	2	NNC	ENSMUSG00000081999.4	novel	662	2	NA	NA	-37	347	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	106	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTGAATCATCCCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41878878	41877137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_41878022_41878728
tx.10374	chr2	+	421	2	Intergenic	novelGene_780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_1	0	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43085690	43086553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_43085874_43086315
tx.10375	chr2	+	509	3	Intergenic	novelGene_779	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	1.5	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43085690	43086550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_43085874_43086137_43086229_43086315
tx.10376	chr2	-	2549	11	NIC	ENSMUSG00000036890.14	novel	2564	11	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	29	junction_10	9.30644937664198	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTTGCGTCTAAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44817275	44454423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_44455547_44460430_44460523_44461224_44461296_44465454_44465600_44481892_44482003_44525013_44525329_44642058_44642233_44646279_44646448_44715362_44715556_44750302_44750339_44817153
tx.10377	chr2	+	835	3	NIC	ENSMUSG00000086202.2	novel	635	4	NA	NA	-2	3	intron_retention	FALSE	canonical	3	17	junction_1	10	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTCTTTATATCAGATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45586614	45588462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_45586642_45586810_45587155_45587998
tx.10378	chr2	+	1002	2	FSM	ENSMUSG00000086202.2	ENSMUST00000134308.2	424	2	-195	-383	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTCTTTATATCAGATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45586616	45588462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_45587155_45587998
tx.10381	chr2	+	1110	3	ISM	ENSMUSG00000052155.6	ENSMUST00000063886.4	5686	11	82897	2802	6617	219	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	3.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGTGTTATTTAAGAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48787017	48790479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_48787123_48788489_48788621_48789605
tx.10382	chr2	-	1664	14	FSM	ENSMUSG00000026761.13	ENSMUST00000028098.11	4066	14	36	2366	1	126	multi-exon	FALSE	canonical	3	352	junction_6	44.7134201423734	521	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTTGATACTCTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48839252	48795201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_48795612_48799277_48799346_48799430_48799527_48800197_48800307_48802573_48802661_48807176_48807351_48817107_48817260_48819692_48819742_48823091_48823178_48823561_48823635_48826783_48826875_48827463_48827541_48830344_48830413_48839128
tx.10383	chr2	-	1165	7	FSM	ENSMUSG00000026761.13	ENSMUST00000090976.10	1153	7	-7	-5	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	170.808290847436	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACAGACTTTGGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48839253	48821964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_48822610_48823091_48823178_48823561_48823635_48826783_48826875_48827463_48827541_48830344_48830413_48839128
tx.10384	chr2	+	698	3	ISM	ENSMUSG00000026764.16	ENSMUST00000146247.2	729	7	-209	19219	-209	-19219	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTGCCCCAGCTCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49590381	49601044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_49590618_49590968_49591118_49600731
tx.10385	chr2	+	1990	5	FSM	ENSMUSG00000050447.16	ENSMUST00000128451.8	563	5	-14	-1413	-14	1413	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1.73205080756888	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTCTTTTTGTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49956459	50082095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_49956597_50055480_50055670_50063612_50063712_50078722_50078854_50080661
tx.10386	chr2	-	1630	7	ISM	ENSMUSG00000026766.17	ENSMUST00000102769.11	1342	8	45	0	4	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	533	junction_6	61.03664655125	243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTGTGTTTTTTATTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50186684	50169892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_50170415_50171114_50171202_50177806_50177938_50178938_50179045_50181296_50181515_50182820_50182966_50186263
tx.10387	chr2	-	1298	8	FSM	ENSMUSG00000026766.17	ENSMUST00000134480.8	803	8	-26	-469	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_6	199.415574689068	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTGTGTTTTTTATTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50186725	50169892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_50170415_50171114_50171202_50177806_50177938_50178938_50179045_50181296_50181515_50182820_50182926_50186263_50186322_50186654
tx.10388	chr2	-	1332	8	FSM	ENSMUSG00000026766.17	ENSMUST00000102769.11	1342	8	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	465	junction_7	76.2190720146573	1084	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTGTGTTTTTTATTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50186719	50169892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_50170415_50171114_50171202_50177806_50177938_50178938_50179045_50181296_50181515_50182820_50182966_50186263_50186322_50186654
tx.10389	chr2	-	1312	8	NIC	ENSMUSG00000026766.17	novel	1342	8	NA	NA	-5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	38	junction_7	208.37515226541	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTGTGTTTTTTATTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50186734	50169892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_50170415_50171114_50171202_50177806_50177938_50178938_50179045_50181296_50181515_50182820_50182966_50186263_50186322_50186689
tx.10390	chr2	-	2826	5	FSM	ENSMUSG00000017144.9	ENSMUST00000017288.9	2828	5	2	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	429	junction_2	50.2792203599061	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTGGGATGTTTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51039121	51020449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_51022558_51024094_51024230_51027147_51027258_51038235_51038324_51038736
tx.10391	chr2	-	700	4	NNC	ENSMUSG00000086523.2	novel	603	3	NA	NA	-82269	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.16024689946929	35	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTAGTTTCCGGCTCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51337780	51253570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_51253903_51266332_51266409_51306587_51306703_51337603
tx.10392	chr2	-	1065	8	ISM	ENSMUSG00000026946.10	ENSMUST00000145481.8	1162	9	374	4	340	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_3	2.44114392723358	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCAGTGTCTTCTTACT	9016	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51862642	51838516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_51838789_51839995_51840103_51842453_51842641_51842787_51842895_51845937_51846101_51848908_51849005_51850582_51850673_51862599
tx.10393	chr2	+	1741	6	FSM	ENSMUSG00000053475.6	ENSMUST00000065927.6	1710	6	-31	0	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	0.632455532033676	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTGTAGTTCTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51927989	51946698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_51928282_51933740_51933879_51937442_51937605_51940854_51941084_51942315_51942357_51945819
tx.10394	chr2	+	3101	26	NNC	ENSMUSG00000036202.17	novel	8509	36	NA	NA	-1	14	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_16	121.215748151798	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAAACTGTCGGCCAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51962842	51997751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_51962879_51963148_51963266_51964258_51964338_51966092_51966190_51966992_51967121_51967204_51967300_51968342_51968533_51971237_51971331_51972676_51972816_51975038_51975191_51978659_51978778_51979535_51979701_51980185_51980297_51982053_51982117_51982291_51982393_51983514_51983606_51984600_51984675_51985833_51986015_51987928_51988037_51988368_51988519_51988864_51988965_51993444_51993710_51994557_51994601_51995446_51995650_51996912_51997013_51997649
tx.10395	chr2	+	713	5	ISM	ENSMUSG00000036202.17	ENSMUST00000145130.8	2789	14	13860	-14	-7551	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	447	junction_4	29.2232783924049	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAAACTGTCGGCCAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51993444	51997751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_51993710_51994557_51994601_51995446_51995650_51996912_51997013_51997649
tx.10396	chr2	+	4177	7	ISM	ENSMUSG00000036202.17	ENSMUST00000112693.10	8509	36	37986	2	-166	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	521	junction_3	89.7100266909384	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTAGTTAGTGCCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52000829	52012393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_52003013_52006259_52006407_52006679_52006758_52006846_52006963_52009028_52009183_52010271_52010381_52011003
tx.10397	chr2	-	493	4	NNC	ENSMUSG00000026950.19	novel	1825	18	NA	NA	9	-36765	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATTTTAACACTGCTCCT	9044	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52268477	52255610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_52255752_52257415_52257535_52257948_52258105_52268400
tx.10399	chr2	-	1160	8	ISM	ENSMUSG00000055371.18	ENSMUST00000102759.8	4717	14	27224	2912	27180	-2912	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_4	19.7535840199355	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTGAAGGCCATAAAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52604988	52584587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_52584950_52590016_52590184_52593113_52593265_52596410_52596466_52597929_52598018_52598154_52598238_52599607_52599703_52604829
tx.104	chr1	-	1923	14	NNC	ENSMUSG00000026134.12	novel	1975	14	NA	NA	22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_13	105.020031901498	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGTGCAAGTGGGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33708854	33492890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_33493386_33503133_33503203_33519538_33519622_33523762_33523890_33551096_33551283_33553225_33553299_33572376_33572445_33667475_33667614_33669418_33669515_33701326_33701448_33702857_33702938_33706125_33706230_33707938_33708102_33708734
tx.10400	chr2	-	3014	14	FSM	ENSMUSG00000055371.18	ENSMUST00000102759.8	4717	14	6	1697	-4	-1697	multi-exon	FALSE	canonical	3	181	junction_4	18.080359738789	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGAAATCTTATCGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52632206	52583372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_52584950_52590016_52590184_52593113_52593265_52596410_52596466_52597929_52598018_52598154_52598238_52599607_52599703_52604829_52605017_52605699_52605770_52606436_52606584_52609708_52609808_52609913_52609990_52610895_52610981_52632072
tx.10401	chr2	+	1807	4	FSM	ENSMUSG00000026960.7	ENSMUST00000028336.7	2548	4	7	734	7	-734	multi-exon	FALSE	canonical	3	497	junction_2	8.2192186706253	932	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGTCTTGCTTGCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53082106	53108498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_53082535_53084295_53084350_53092930_53093064_53107306
tx.10402	chr2	-	993	2	NNC	ENSMUSG00000054181.12	novel	1541	2	NA	NA	-162	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	17	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCTGCTTGGAGATAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57128682	57126240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_57126985_57128433
tx.10403	chr2	+	2514	17	FSM	ENSMUSG00000026827.13	ENSMUST00000028167.3	5620	17	57	3049	57	-183	multi-exon	TRUE	canonical	3	146	junction_2	27.9815089612766	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAAGATGTTGGTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57128450	57257682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_57128580_57157984_57158095_57179856_57180029_57194372_57194498_57195819_57195918_57196943_57197108_57228858_57229024_57230075_57230221_57235242_57235437_57245471_57245607_57245771_57245948_57246530_57246663_57247666_57247826_57254042_57254156_57254261_57254341_57254516_57254616_57257363
tx.10404	chr2	-	1568	2	NNC	ENSMUSG00000087455.8	novel	1635	3	NA	NA	1788	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTGTGATTGCCCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59215238	59212837	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_59214299_59215131
tx.10405	chr2	-	1596	2	ISM	ENSMUSG00000087455.8	ENSMUST00000137162.8	1635	3	1857	-5	1857	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACATTTGTGATTGCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59215169	59212840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_59214299_59215031
tx.10406	chr2	+	895	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087455.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATGTCTCACCGTATAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59213643	59216956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_59214188_59216605
tx.10407	chr2	-	2025	11	FSM	ENSMUSG00000026988.16	ENSMUST00000028368.14	2072	11	47	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_10	21.0228447171167	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAATGCCTAAGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59712881	59682707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_59683306_59688953_59689095_59691904_59692082_59692963_59693071_59693160_59693202_59694645_59694680_59703559_59703654_59704582_59704673_59707010_59707196_59708473_59708895_59712744
tx.10408	chr2	-	474	2	FSM	ENSMUSG00000026987.17	ENSMUST00000134908.2	406	2	-67	-1	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTTAATTGACTTCTGC	9136	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60040159	60036936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_60037308_60040056
tx.10409	chr2	-	559	3	NNC	ENSMUSG00000026987.17	novel	406	2	NA	NA	15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_2	1	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTTAATTGACTTCTGC	9127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60040168	60036936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_60037308_60038462_60038539_60040056
tx.10410	chr2	+	3557	10	FSM	ENSMUSG00000026977.18	ENSMUST00000102748.11	3594	10	32	5	6	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	327	junction_5	27.2519112479596	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAGTTTGAACTTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60040262	60079550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_60040429_60059261_60059427_60060027_60060224_60062543_60062712_60064242_60065342_60067097_60067271_60071286_60071397_60073900_60074015_60075555_60075605_60078233
tx.10411	chr2	+	2132	6	ISM	ENSMUSG00000026977.18	ENSMUST00000067542.15	2244	10	9856	-1245	-2129	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	327	junction_1	33.2180673730426	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTTAGTTTGAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60064968	60079546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_60065342_60067097_60067271_60071286_60071397_60073900_60074015_60075555_60075605_60078233
tx.10412	chr2	+	1699	5	ISM	ENSMUSG00000026977.18	ENSMUST00000067542.15	2244	10	12049	-1249	64	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	332	junction_4	29.4830459756111	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAGTTTGAACTTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60067161	60079550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_60067271_60071286_60071397_60073900_60074015_60075555_60075605_60078233
tx.10413	chr2	-	1017	6	FSM	ENSMUSG00000060703.13	ENSMUST00000074606.11	1354	6	337	0	267	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_2	6.41872261435249	345	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCACTGCCTGGTCTTCTT	4269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60114495	60082336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_60082836_60085414_60085442_60087376_60087548_60088226_60088344_60102445_60102557_60114403
tx.10414	chr2	-	990	5	FSM	ENSMUSG00000060703.13	ENSMUST00000028356.9	1257	5	267	0	267	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	33.0189339621981	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCACTGCCTGGTCTTCTT	4269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60114495	60082336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_60082836_60087376_60087548_60088226_60088344_60102445_60102557_60114403
tx.10415	chr2	+	965	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060703.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGTTGTGTTCTATTCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60097922	60099285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_60098215_60098612
tx.10416	chr2	-	1516	9	ISM	ENSMUSG00000026980.16	ENSMUST00000028362.9	5172	35	-52	59213	20	-59213	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	506	junction_3	46.8386525745564	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGAAATAACTAAGGATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60213627	60183316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_60183377_60184748_60184907_60185712_60185905_60187620_60187762_60188811_60188923_60195354_60195520_60199102_60199274_60206201_60206574_60213481
tx.10417	chr2	-	2130	6	ISM	ENSMUSG00000026980.16	ENSMUST00000028362.9	5172	35	-52	62493	20	-62493	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	533	junction_4	45.5174691739336	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAACAACGAAAGTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60213627	60186596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_60187762_60188811_60188923_60195354_60195520_60199102_60199274_60206201_60206574_60213481
tx.10418	chr2	-	1103	3	NNC	ENSMUSG00000026980.16	novel	6901	35	NA	NA	-24	-78132	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	331.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGAGAGAAAATTTATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60213671	60202235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_60202777_60206201_60206574_60213481
tx.10419	chr2	-	1526	2	ISM	ENSMUSG00000026980.16	ENSMUST00000028362.9	5172	35	-69	81107	3	-81107	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	663	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACTTTACTCTAAGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60213644	60205210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_60206574_60213481
tx.10420	chr2	+	526	4	NNC	ENSMUSG00000087283.2	novel	566	3	NA	NA	-27278	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	54	junction_1	58.0344725141876	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAAGTGTGGTGGTATACC	2608	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60214590	60242918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_60214668_60241980_60242062_60242190_60242353_60242712
tx.10421	chr2	+	578	3	FSM	ENSMUSG00000087283.2	ENSMUST00000131457.2	566	3	-17	5	-17	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_2	3	468	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAAGTGTGGTGGTATACC	9329	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60241851	60242918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_60242062_60242190_60242353_60242712
tx.10422	chr2	+	1959	8	NIC	ENSMUSG00000064289.16	novel	2227	9	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	7	junction_2	16.9741700527476	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACTTACGTCGTGCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61423422	61484434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_61423553_61443994_61444143_61457246_61457359_61458064_61458184_61474058_61474130_61474650_61474767_61480081_61480633_61483722
tx.10423	chr2	+	1492	12	FSM	ENSMUSG00000026914.16	ENSMUST00000028278.14	1541	12	49	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1717	junction_5	150.997564426748	5332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTCCCGAGGTCTTTTTG	8596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61542086	61630720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_61542218_61550787_61550916_61553053_61553106_61590979_61591052_61591318_61591439_61594180_61594252_61595192_61595344_61607016_61607125_61614176_61614252_61615777_61615904_61627738_61627802_61630325
tx.10424	chr2	+	902	6	ISM	ENSMUSG00000026914.16	ENSMUST00000028278.14	1541	12	53171	0	-521	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1783	junction_2	120.238097123998	3875	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTCCCGAGGTCTTTTTG	104	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61595208	61630720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_61595344_61607016_61607125_61614176_61614252_61615777_61615904_61627738_61627802_61630325
tx.10425	chr2	-	1806	9	ISM	ENSMUSG00000035000.9	ENSMUST00000047812.8	5268	26	55461	1628	937	-1628	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	241	junction_6	20.4110111214511	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATTATTTCTATTCTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62187114	62162044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_62163064_62164599_62164674_62164940_62165014_62175399_62175465_62178161_62178262_62178844_62178900_62182465_62182661_62184882_62184953_62186959
tx.10426	chr2	-	3301	26	FSM	ENSMUSG00000035000.9	ENSMUST00000047812.8	5268	26	325	1642	-47	-1642	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_12	33.8302586451833	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAATGTTTTGTGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62242250	62162058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_62163064_62164599_62164674_62164940_62165014_62175399_62175465_62178161_62178262_62178844_62178900_62182465_62182661_62184882_62184953_62186959_62187059_62187303_62187352_62189127_62189250_62189620_62189675_62190628_62190697_62190952_62191061_62193005_62193051_62195271_62195408_62203098_62203212_62204709_62204871_62208547_62208669_62209440_62209514_62209620_62209674_62215517_62215587_62216774_62216867_62217408_62217505_62241558_62241644_62242129
tx.10427	chr2	-	1028	9	ISM	ENSMUSG00000035000.9	ENSMUST00000047812.8	5268	26	281	44180	71	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_8	22.5596431709369	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTTTCTCTGATTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62242294	62204596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_62204871_62208547_62208669_62209440_62209514_62209620_62209674_62215517_62215587_62216774_62216867_62217408_62217505_62241558_62241644_62242129
tx.10428	chr2	-	612	2	ISM	ENSMUSG00000035000.9	ENSMUST00000047812.8	5268	26	331	80730	-41	-3101	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAACAGAACAAACTAAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62242244	62241146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_62241644_62242129
tx.10429	chr2	+	749	2	Intergenic	novelGene_781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTAGCTACCACTTGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62241517	62243416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_62241654_62242803
tx.10430	chr2	+	1194	8	FSM	ENSMUSG00000026893.5	ENSMUST00000028257.3	3330	8	3	2133	3	1545	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_6	22.3332825667003	291	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTTATACTTGTGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62494631	62522320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_62494804_62502620_62502795_62509499_62509570_62516308_62516353_62516620_62516769_62520304_62520419_62520734_62520794_62521907
tx.10431	chr2	+	1466	6	ISM	ENSMUSG00000026893.5	ENSMUST00000028257.3	3330	8	14868	1518	-7045	-1518	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_4	26.1335034008072	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGTTCAGAAATTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62509496	62522935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_62509570_62516308_62516353_62516620_62516769_62520304_62520419_62520734_62520794_62521907
tx.10432	chr2	+	964	2	Intergenic	novelGene_785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGGTGTTTATAGTAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65232592	65237603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_65232743_65236789
tx.10433	chr2	+	953	2	Intergenic	novelGene_786	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTCTGGTGTTTATAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65232603	65237600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_65232804_65236847
tx.10434	chr2	+	736	2	NNC	ENSMUSG00000044647.17	novel	1056	3	NA	NA	-2	-31710	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGTCTTATTTTTGCTTT	5676	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65676183	65677452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_65676229_65676761
tx.10435	chr2	-	294	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000044647.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGAGCTTTGGAAGGGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65680727	65678443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_65678616_65680605
tx.10436	chr2	-	686	8	ISM	ENSMUSG00000027030.16	ENSMUST00000126663.8	2578	11	51964	1283	51964	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_5	6.20401450017385	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCGAGTTCTGCTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68144899	68042074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_68042338_68051247_68051313_68093578_68093648_68097382_68097436_68137384_68137453_68139335_68139399_68144707_68144738_68144824
tx.10437	chr2	-	580	6	ISM	ENSMUSG00000027030.16	ENSMUST00000126663.8	2578	11	57463	1286	57463	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_5	6.20966987850401	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTCCGAGTTCTGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68139400	68042077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_68042338_68051247_68051313_68093578_68093648_68097382_68097436_68137384_68137453_68139335
tx.10438	chr2	+	2396	10	FSM	ENSMUSG00000027035.11	ENSMUST00000028426.9	7038	10	7	4635	-2	1003	multi-exon	TRUE	canonical	3	48	junction_8	6.54896090146283	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTAACCCCTTGCCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68691791	68939991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_68692150_68764858_68764965_68777570_68777702_68833090_68833149_68877488_68877540_68881123_68881217_68898972_68899102_68901675_68901783_68935346_68935504_68938785
tx.10439	chr2	-	980	2	Intergenic	novelGene_787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTGTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68958819	68956604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_68957427_68958661
tx.1044	chr1	-	1037	4	FSM	ENSMUSG00000060743.13	ENSMUST00000161308.8	2841	4	71	1733	-14	132	multi-exon	TRUE	canonical	3	2337	junction_3	156.5907617539	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTTCTGGTCTTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180641126	180630129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_180630771_180637681_180637836_180639363_180639515_180641035
tx.10440	chr2	-	1359	7	FSM	ENSMUSG00000005233.17	ENSMUST00000005365.15	1352	7	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	811	junction_6	34.6121365997536	2454	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTGTAACTCTCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69036545	69024238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_69024890_69027478_69027578_69030328_69030434_69032915_69033063_69035199_69035266_69035369_69035523_69036407
tx.10442	chr2	+	1454	12	FSM	ENSMUSG00000063145.11	ENSMUST00000074963.9	1468	12	14	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_4	9.81144550053239	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATGTTTTGAAAGTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69477565	69497915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_69477687_69479365_69479449_69483125_69483192_69484406_69484457_69484589_69484718_69485842_69485979_69487240_69487337_69491379_69491443_69493369_69493505_69495369_69495454_69497284_69497309_69497447
tx.10443	chr2	+	2717	14	FSM	ENSMUSG00000042133.17	ENSMUST00000090858.10	6127	14	10	3400	10	1064	multi-exon	TRUE	canonical	3	282	junction_1	41.7748260879032	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACACTTTGGTGTAATACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69553158	69580956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_69553302_69562089_69562158_69562540_69562619_69562723_69562799_69563161_69563270_69563532_69563578_69564634_69564723_69566211_69566242_69566332_69566473_69571829_69572038_69573956_69574125_69576371_69576460_69579304_69579442_69579615
tx.10444	chr2	-	1847	9	FSM	ENSMUSG00000070883.4	ENSMUST00000094942.4	1844	9	-3	0	-3	0	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_5	1.58113883008419	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGGTTTGATTCTTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69619922	69588376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_69588810_69592065_69592231_69602275_69602469_69606473_69606614_69608403_69608561_69611982_69612177_69612288_69612463_69617503_69617731_69619758
tx.10445	chr2	-	1167	4	NNC	ENSMUSG00000070883.4	novel	1844	9	NA	NA	3043	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2.05480466765633	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGGTTTGATTCTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69609289	69588377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_69588810_69592065_69592231_69608403_69608561_69608876
tx.10446	chr2	-	1411	7	ISM	ENSMUSG00000070883.4	ENSMUST00000094942.4	1844	9	-3	13737	-3	9155	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_3	1.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTCCGCTCTTATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69619922	69602113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_69602469_69606473_69606614_69608403_69608561_69611982_69612177_69612288_69612463_69617503_69617731_69619758
tx.10447	chr2	+	2189	4	FSM	ENSMUSG00000027088.11	ENSMUST00000112266.8	2194	4	5	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	37.7918274528002	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTCTTCTGAAATCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69619998	69627567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_69620249_69620629_69620666_69622680_69622836_69625819
tx.10448	chr2	+	2198	4	FSM	ENSMUSG00000027088.11	ENSMUST00000151298.8	667	4	39	-1570	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	45.0653845971483	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTCTTCTGAAATCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69620005	69627567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_69620301_69620629_69620666_69622716_69622836_69625819
tx.10449	chr2	+	2239	4	FSM	ENSMUSG00000027088.11	ENSMUST00000028494.9	2260	4	21	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_2	4.49691252107735	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTCTTCTGAAATCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69620000	69627567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_69620301_69620629_69620666_69622680_69622836_69625819
tx.10450	chr2	+	389	2	Intergenic	novelGene_788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	3813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69673976	69676544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_69674115_69676293
tx.10451	chr2	+	706	6	ISM	ENSMUSG00000068882.14	ENSMUST00000090852.11	2001	12	30	4229	30	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1600	junction_1	84.8608272408418	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTCTTAGGTTTCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69691935	69697901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_69692057_69693567_69693660_69696533_69696638_69696831_69697007_69697615_69697724_69697795
tx.10452	chr2	+	726	7	ISM	ENSMUSG00000068882.14	ENSMUST00000090852.11	2001	12	29	2984	29	-348	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1600	junction_1	77.7633518367675	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAGAAAGAAAGCAGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69691934	69699146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_69692057_69693567_69693660_69696533_69696638_69696831_69697007_69697615_69697724_69697795_69697897_69699122
tx.10453	chr2	+	1694	12	FSM	ENSMUSG00000068882.14	ENSMUST00000090852.11	2001	12	31	276	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1543	junction_7	118.150135613357	3793	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAATAGTTCTTTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69691936	69701854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_69692057_69693567_69693660_69696533_69696638_69696831_69697007_69697615_69697724_69697795_69697897_69699122_69699195_69699485_69699526_69700223_69700365_69700728_69700925_69701021_69701178_69701465
tx.10454	chr2	-	957	7	FSM	ENSMUSG00000051730.16	ENSMUST00000060447.13	968	7	14	-3	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	432	junction_3	75.5058864519111	2057	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTTCTCTTTTCTTATG	6820	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69715945	69701538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_69701661_69702075_69702126_69704227_69704280_69709445_69709529_69711110_69711293_69711640_69711756_69715592
tx.10455	chr2	-	877	6	FSM	ENSMUSG00000051730.16	ENSMUST00000142127.8	851	6	-7	-19	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_3	209.013492387453	231	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTTCTCTTTTCTTATG	6817	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69715948	69701538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_69701661_69702075_69702126_69704227_69704280_69711110_69711293_69711640_69711756_69715592
tx.10456	chr2	-	903	3	ISM	ENSMUSG00000051730.16	ENSMUST00000135487.2	2090	4	3	2766	3	-2766	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	609	junction_2	8.5	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCTGGATTTTTCCTTGT	6820	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69715945	69710857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_69711293_69711640_69711756_69715592
tx.10457	chr2	+	692	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000047965.10	novel	579	1	NA	NA	-26	128	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAATAAAATGGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70289299	70290032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_70289901_70289941
tx.10458	chr2	+	683	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000047965.10	novel	579	1	NA	NA	-24	134	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAATGGAATGTTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70289301	70290038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_70289901_70289954
tx.10459	chr2	+	1228	7	ISM	ENSMUSG00000070880.11	ENSMUST00000130604.8	1197	9	76	2403	-45	133	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_6	3.80423740350444	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATAGTTATCTTATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70392461	70415077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_70392677_70394111_70394255_70397529_70397593_70403049_70403209_70404412_70404656_70409454_70409546_70414763
tx.1046	chr1	+	683	5	ISM	ENSMUSG00000038806.8	ENSMUST00000038091.8	3213	7	-15	6914	-15	-5054	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	433	junction_2	47.0604664235279	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAAGGAAATGCTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180678676	180688764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_180678858_180683367_180683486_180685687_180685800_180687465_180687636_180688662
tx.10460	chr2	+	1210	9	FSM	ENSMUSG00000014959.13	ENSMUST00000112205.2	1196	9	-14	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	630	junction_6	27.9463772249642	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGAGGCCTCCCGTTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70491919	70519704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_70492105_70506808_70506890_70508242_70508447_70508871_70508959_70509775_70509907_70513240_70513374_70514323_70514448_70518729_70518817_70519526
tx.10461	chr2	+	2220	10	FSM	ENSMUSG00000014959.13	ENSMUST00000028509.11	2238	10	0	18	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	519	junction_9	56.2121203045731	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGTGTTCTAAGTGGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70491919	70522069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_70492105_70506808_70506890_70508242_70508447_70508871_70508959_70509775_70509907_70513240_70513374_70514323_70514448_70518729_70518817_70519526_70519647_70521001
tx.10462	chr2	-	2893	10	ISM	ENSMUSG00000041997.17	ENSMUST00000038584.9	4280	20	83496	0	-24008	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	205	junction_9	22.1799598124963	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTGTGAAAATTACACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70572576	70542750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_70544510_70546955_70547064_70548125_70548238_70551417_70551554_70551901_70552072_70552250_70552433_70554345_70554428_70555823_70555922_70568764_70568832_70572397
tx.10463	chr2	-	3967	20	FSM	ENSMUSG00000041997.17	ENSMUST00000038584.9	4280	20	313	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_17	29.5425886295749	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTGTGAAAATTACACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70655759	70542750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_70544510_70546955_70547064_70548125_70548238_70551417_70551554_70551901_70552072_70552250_70552433_70554345_70554428_70555823_70555922_70568764_70568832_70572397_70572587_70575846_70575984_70576277_70576389_70579578_70579672_70580778_70580869_70582578_70582675_70584783_70584831_70587817_70587894_70600347_70600420_70617220_70617340_70655536
tx.10464	chr2	-	2200	3	ISM	ENSMUSG00000041997.17	ENSMUST00000038584.9	4280	20	294	55830	-37	-17243	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	217	junction_2	11.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAATTCCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70655778	70598580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_70600420_70617220_70617340_70655536
tx.10465	chr2	+	733	3	Intergenic	novelGene_789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGAGACTCCTGCCATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70749569	70752689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_70749848_70752128_70752333_70752438
tx.10466	chr2	-	2114	10	NIC	ENSMUSG00000041975.18	novel	2347	10	NA	NA	2	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_7	29.4505234814822	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTTGCTTTTGTTGGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70885925	70794907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_70796024_70796791_70796858_70797393_70797501_70803596_70803737_70806417_70806482_70810720_70810771_70812198_70812312_70823827_70823920_70848563_70848719_70885714
tx.10467	chr2	-	2344	10	FSM	ENSMUSG00000041975.18	ENSMUST00000112186.9	2347	10	0	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_7	14.8332292963476	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTTGCTTTTGTTGGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70885927	70794907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_70796024_70796791_70796858_70797393_70797501_70803596_70803737_70806417_70806482_70810720_70810771_70812198_70812540_70823827_70823920_70848563_70848719_70885714
tx.10468	chr2	-	605	3	ISM	ENSMUSG00000041975.18	ENSMUST00000124208.2	1597	4	2	12278	2	8	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	111	junction_1	3	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTCTTTTGGTAGTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70885925	70823680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_70823920_70848563_70848719_70885714
tx.10469	chr2	-	644	2	NNC	ENSMUSG00000041975.18	novel	2254	10	NA	NA	-1	-53466	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGCTACATGTTTTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70885928	70877154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_70877585_70885714
tx.1047	chr1	+	3219	7	FSM	ENSMUSG00000038806.8	ENSMUST00000038091.8	3213	7	-10	4	-10	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	422	junction_5	43.0761599444003	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAATTGTTTTGGAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180678681	180695674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_180678858_180683367_180683486_180685687_180685800_180687465_180687636_180688662_180688784_180689922_180690407_180693636
tx.10470	chr2	+	1940	15	FSM	ENSMUSG00000041966.19	ENSMUST00000064141.12	1905	15	-37	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_14	54.6553207074357	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGTGGCTTTATGACTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70886087	70929484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_70886464_70886838_70886943_70890696_70890788_70893702_70893840_70903464_70903544_70905790_70905881_70908403_70908509_70908817_70908924_70912254_70912398_70914768_70914879_70916882_70916971_70917658_70917743_70918690_70918847_70920132_70920278_70929358
tx.10471	chr2	+	2488	14	FSM	ENSMUSG00000041966.19	ENSMUST00000154704.8	7739	14	5	5246	5	334	multi-exon	FALSE	canonical	3	168	junction_11	23.2697075602773	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATCAATTCTAGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70886092	70920956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_70886464_70886838_70886943_70890696_70890788_70893702_70893840_70903464_70903544_70905790_70905881_70908403_70908509_70908817_70908924_70912254_70912398_70914768_70914879_70916882_70916971_70917658_70917743_70918690_70918847_70920132
tx.10472	chr2	+	1389	9	ISM	ENSMUSG00000041966.19	ENSMUST00000102701.5	1703	13	-74	6399	-3	192	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_1	19.2467529729043	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAATAGTGTTTTGTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70886121	70912589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_70886464_70886838_70886943_70890696_70890788_70893702_70893840_70903464_70903544_70905790_70905881_70908403_70908509_70908817_70908924_70912254
tx.10473	chr2	+	1315	4	FSM	ENSMUSG00000027015.5	ENSMUST00000028403.3	5339	4	120	3904	120	-3904	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.471404520791032	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70948386	70969366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_70948657_70959996_70960206_70967832_70967988_70968685
tx.10474	chr2	+	2512	16	FSM	ENSMUSG00000027012.16	ENSMUST00000112138.8	2466	16	-39	-7	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	270	junction_1	83.3153580613376	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAATTTTCACTTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71042062	71093642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_71042190_71044782_71044900_71049644_71049763_71058943_71059035_71066258_71066375_71077032_71077129_71077356_71077520_71077632_71077733_71078164_71078291_71079130_71079278_71079652_71079767_71080062_71080197_71081185_71081331_71088427_71088569_71091165_71091292_71092991
tx.10475	chr2	+	217	2	ISM	ENSMUSG00000027012.16	ENSMUST00000149735.2	2248	4	-32	15989	0	-15989	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	502	junction_1	0	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTATGTTTGATTCACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71042315	71044896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_71042419_71044782
tx.10476	chr2	+	2486	16	FSM	ENSMUSG00000027012.16	ENSMUST00000081710.12	2631	16	140	5	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	499	junction_2	40.1836893389456	449	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAATTTTCACTTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71042317	71093642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_71042419_71044782_71044900_71049644_71049763_71058943_71059035_71066258_71066375_71077032_71077129_71077356_71077520_71077632_71077733_71078164_71078291_71079130_71079278_71079652_71079767_71080062_71080197_71081185_71081331_71088427_71088569_71091165_71091292_71092991
tx.10477	chr2	-	911	4	ISM	ENSMUSG00000027010.17	ENSMUST00000147553.2	994	8	15084	-338	3228	-49	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_2	6.23609564462324	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCCTCCTGATGACTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71109905	71105082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_71105698_71106775_71106867_71106984_71107144_71109859
tx.10478	chr2	-	2297	16	NNC	ENSMUSG00000027010.17	novel	6351	18	NA	NA	-5256	-49	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	57	junction_15	22.4311291636323	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCCTCCTGATGACTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71164440	71105082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_71105698_71106775_71106867_71106984_71107144_71109859_71109999_71112813_71112955_71123703_71123785_71124015_71124069_71127008_71127168_71128913_71128996_71138399_71138485_71141806_71141901_71142768_71142908_71145326_71145474_71154319_71154460_71163948_71164065_71164384
tx.10479	chr2	-	647	5	NIC	ENSMUSG00000027010.17	novel	550	3	NA	NA	-22	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	8.57321409974112	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCTCTAGAATTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71197899	71160083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_71160375_71163948_71164065_71174233_71174377_71196870_71196925_71197856
tx.1048	chr1	+	2473	4	FSM	ENSMUSG00000066652.6	ENSMUST00000085797.6	2473	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1148	junction_3	71.1071179434395	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGAGAGAGCGAGTCATCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180720672	180726668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_180720999_180721699_180721947_180722160_180722407_180725014
tx.10480	chr2	+	2848	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027010.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTAAAATAGTATTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71178259	71181334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_71180934_71181054_71181196_71181301
tx.10481	chr2	+	2767	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027010.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCAAACAGAGAGACTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71178306	71181196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_71180932_71181054
tx.10482	chr2	+	2796	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027010.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTAAAATAGTATTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71178309	71181334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_71180932_71181054_71181196_71181301
tx.10483	chr2	+	1493	11	FSM	ENSMUSG00000027018.12	ENSMUST00000028408.3	1576	11	-24	107	-24	-107	multi-exon	FALSE	canonical	3	1873	junction_8	150.054156890104	11716	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCGCCCACTGCTTTCTT	5094	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71219579	71271859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_71219649_71220246_71220343_71239331_71239408_71240486_71240608_71250518_71250699_71250933_71251056_71251554_71251660_71251976_71252084_71264398_71264551_71269039_71269157_71271511
tx.10484	chr2	+	1374	10	ISM	ENSMUSG00000027018.12	ENSMUST00000028408.3	1576	11	693	107	693	-107	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1873	junction_7	142.306398700519	13344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCGCCCACTGCTTTCTT	5811	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71220296	71271859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_71220343_71239331_71239408_71240486_71240608_71250518_71250699_71250933_71251056_71251554_71251660_71251976_71252084_71264398_71264551_71269039_71269157_71271511
tx.10485	chr2	+	1330	9	ISM	ENSMUSG00000027018.12	ENSMUST00000028408.3	1576	11	19726	107	-2	-107	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1873	junction_6	148.790488187249	864	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCGCCCACTGCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71239329	71271859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_71239408_71240486_71240608_71250518_71250699_71250933_71251056_71251554_71251660_71251976_71252084_71264398_71264551_71269039_71269157_71271511
tx.10486	chr2	+	1263	10	FSM	ENSMUSG00000041921.17	ENSMUST00000037210.9	1321	10	61	-3	4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	42	junction_6	11.0565326201412	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATTGTGTCCAGTCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71283680	71355538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_71283743_71337128_71337287_71340084_71340235_71341755_71341905_71342469_71342513_71345980_71346145_71352876_71352975_71354145_71354194_71355060_71355140_71355226
tx.10487	chr2	-	670	2	Intergenic	novelGene_790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCATGTATCCTCACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71486750	71483334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_71483905_71486650
tx.10488	chr2	+	385	3	Intergenic	novelGene_791	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTGAAGTATATTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71486280	71487955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_71486488_71487073_71487162_71487865
tx.10489	chr2	+	540	3	NNC	ENSMUSG00000064263.7	novel	641	4	NA	NA	-73	2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	4	junction_1	15	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCAAGACTCGGTTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71549687	71561312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_71549853_71560693_71560778_71561021
tx.1049	chr1	+	1580	7	FSM	ENSMUSG00000026520.9	ENSMUST00000027802.9	1580	7	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1025	junction_3	51.6120679255884	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTAGTCTCACTGTGTAG	16	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180731857	180735653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_180732096_180732308_180732380_180733438_180733619_180733727_180733950_180734159_180734253_180734354_180734519_180735041
tx.10490	chr2	+	637	3	NNC	ENSMUSG00000064263.7	novel	641	4	NA	NA	9661	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	8	junction_1	13	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATCAAGACTCGGTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71559421	71561310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_71559686_71560693_71560778_71561021
tx.10491	chr2	-	1440	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087570.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	2	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCTCATTGTAGTGTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71575615	71572489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_71573596_71573802_71573967_71575445
tx.10492	chr2	-	1176	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084794.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATATGCAAGACAGACCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71580655	71578401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_71579277_71580354
tx.10493	chr2	+	1250	4	ISM	ENSMUSG00000027111.17	ENSMUST00000112101.8	4156	26	59037	0	-3052	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	515	junction_3	29.2612751298063	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCTTTATAAACATGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71676320	71687115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_71676428_71676507_71676607_71679724_71679851_71686197
tx.10494	chr2	+	573	3	ISM	ENSMUSG00000004085.15	ENSMUST00000135204.2	559	4	-74	9042	-8	179	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_1	3	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGAATGGTGTTTCCACC	3317	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72116063	72186145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_72116200_72128531_72128725_72185901
tx.10495	chr2	+	1307	10	FSM	ENSMUSG00000004085.15	ENSMUST00000150126.8	1227	10	-40	-40	9	40	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_9	4.98887651569859	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATAGTGTTAGCCTTGCCA	3334	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72116080	72220223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_72116200_72128531_72128725_72185901_72185990_72194971_72195074_72198744_72198811_72202070_72202100_72202214_72202353_72208977_72209065_72214474_72214550_72219813
tx.10496	chr2	+	649	2	ISM	ENSMUSG00000055612.16	ENSMUST00000157019.2	614	5	-71	3073	23	-2436	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1379	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCACATGCACATTTATTT	8592	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72306525	72309768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_72306656_72309249
tx.10497	chr2	+	2398	9	FSM	ENSMUSG00000055612.16	ENSMUST00000102691.11	2424	9	25	1	25	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1115	junction_3	87.0351042683353	497	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGTGTTTATTTTTGTT	8594	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72306527	72317236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_72306656_72309249_72309373_72312034_72312293_72312772_72312857_72313698_72313906_72314222_72314361_72314942_72315093_72315519_72315657_72316063
tx.10498	chr2	+	1032	3	Intergenic	novelGene_792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTGAGTTGGATAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72497935	72502824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_72498031_72500915_72501123_72502094
tx.10499	chr2	-	2067	2	FSM	ENSMUSG00000027109.17	ENSMUST00000129565.2	645	2	344	-1766	344	-87	multi-exon	FALSE	canonical	3	451	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTTAAAAAGAGGTGTATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72771084	72766857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_72768727_72770886
tx.105	chr1	+	2476	8	NNC	ENSMUSG00000004768.15	novel	4322	8	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	42.5133832469499	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGTGCTTTTCCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33758972	33779792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_33759255_33760688_33760781_33762866_33763087_33764014_33764101_33773782_33773940_33775880_33775968_33777368_33777462_33778333
tx.1050	chr1	+	1606	4	FSM	ENSMUSG00000038793.9	ENSMUST00000037361.9	1620	4	15	-1	15	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_2	33.0790299468141	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTTTGTTTCCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180762601	180765966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_180762925_180764111_180764359_180764573_180764820_180765176
tx.10500	chr2	+	1231	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084213.2_ENSMUSG00000082455.4	novel	528	1	NA	NA	-77	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGCAGGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72786164	72947666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_72786740_72947010
tx.10501	chr2	+	467	3	FSM	ENSMUSG00000063714.16	ENSMUST00000123087.8	583	3	46	70	-46	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	97	junction_1	49.5	836	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAATCTCCTGCAAGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72809813	72818951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_72809940_72817871_72817977_72818715
tx.10502	chr2	-	1616	10	ISM	ENSMUSG00000027108.16	ENSMUST00000028517.13	2175	11	1486	398	-1	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	336	junction_4	37.318780232273	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGTGTGTTTGGGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73043305	72923542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_72924069_72927488_72927612_72929635_72929733_72930417_72930559_72972241_72972340_72972651_72972733_72987081_72987258_73029744_73029873_73033668_73033813_73043203
tx.10503	chr2	-	1736	11	FSM	ENSMUSG00000027108.16	ENSMUST00000028517.13	2175	11	41	398	6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	336	junction_4	35.4120036145937	2290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGTGTGTTTGGGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73044750	72923542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_72924069_72927488_72927612_72929635_72929733_72930417_72930559_72972241_72972340_72972651_72972733_72987081_72987258_73029744_73029873_73033668_73033813_73043203_73043305_73044629
tx.10504	chr2	-	978	8	FSM	ENSMUSG00000027108.16	ENSMUST00000100015.6	905	8	-73	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	132.211333609089	485	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCGTGTTTTGTTCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73044750	72967870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_72968000_72972241_72972340_72972651_72972733_72987081_72987258_73029744_73029873_73033668_73033813_73043203_73043305_73044629
tx.10505	chr2	-	1918	9	NNC	ENSMUSG00000041777.13	novel	2821	10	NA	NA	-1	-763	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	35.9191801131373	482	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATGTCCTTAAGACTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73142912	73114211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_73115380_73116681_73116768_73117952_73118060_73134083_73134202_73136229_73136283_73136620_73136686_73137198_73137273_73140800_73140896_73142760
tx.10506	chr2	+	1319	8	FSM	ENSMUSG00000008226.15	ENSMUST00000090811.11	3309	8	45	1945	-8	-426	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_5	26.8791702981764	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTTAATGGTCATTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73142989	73166217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_73143058_73145775_73145937_73148589_73148772_73149646_73149844_73152328_73152539_73160106_73160270_73161326_73161502_73166054
tx.10507	chr2	+	1879	4	FSM	ENSMUSG00000008226.15	ENSMUST00000112050.2	1897	4	3	15	-2	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	8.65383665716478	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATTTTATTATTACACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73143000	73151125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_73143058_73145775_73145937_73148589_73148772_73149646
tx.10508	chr2	+	631	4	ISM	ENSMUSG00000008226.15	ENSMUST00000123621.2	1239	5	2665	426	2665	-426	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	5.35412613473634	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTTAATGGTCATTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73152408	73166217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_73152539_73160106_73160270_73161326_73161502_73166054
tx.10509	chr2	+	465	3	ISM	ENSMUSG00000008226.15	ENSMUST00000123621.2	1239	5	10399	426	10399	-426	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_1	2.5	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTTAATGGTCATTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73160142	73166217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_73160270_73161326_73161502_73166054
tx.10510	chr2	+	652	3	ISM	ENSMUSG00000087176.2	ENSMUST00000144735.2	1062	5	-79	3268	-79	-3268	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGGAAAGAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73217234	73247574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_73217701_73218793_73218920_73247514
tx.10511	chr2	+	387	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027107.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTCCCCCAATTTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73391304	73395722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_73391513_73395543
tx.10512	chr2	+	498	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027107.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTCCCCCAATTTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73391318	73395722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_73391638_73395543
tx.10513	chr2	+	520	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027107.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTCCCCCAATTTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73392324	73395722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_73392666_73395543
tx.10514	chr2	+	503	2	FSM	ENSMUSG00000086382.2	ENSMUST00000147235.2	493	2	-10	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTGCCAATTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73415193	73419552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_73415352_73419207
tx.10515	chr2	-	1693	8	NNC	ENSMUSG00000056486.19	novel	4050	13	NA	NA	-19	136	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	95.6088972036065	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACATTCATTCATTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73509988	73442543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_73443541_73444998_73445112_73448264_73448403_73454458_73454537_73455220_73455395_73462089_73462175_73490023_73490102_73509958
tx.10516	chr2	-	2129	13	NNC	ENSMUSG00000056486.19	novel	4050	13	NA	NA	-27	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	79.3089510851217	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTAATAGCTTTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73605438	73442679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_73443541_73444998_73445112_73448264_73448403_73454458_73454537_73455220_73455395_73462089_73462175_73490023_73490102_73509958_73510248_73537262_73537377_73540798_73540831_73546707_73546764_73551746_73551786_73605366
tx.10517	chr2	-	4214	14	FSM	ENSMUSG00000027104.19	ENSMUST00000112017.8	2396	14	-70	-1748	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	231	junction_5	32.1212569481487	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTATAATTTGCTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73722969	73646861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_73649493_73653544_73653651_73658815_73659023_73660135_73660286_73672703_73672791_73675782_73675898_73676540_73676720_73680932_73681062_73681207_73681327_73684138_73684236_73693512_73693583_73704013_73704090_73710628_73710726_73722818
tx.10518	chr2	-	4075	13	FSM	ENSMUSG00000027104.19	ENSMUST00000112010.9	4037	13	-50	12	7	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_9	68.6093510795398	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTTTATAATTTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73722930	73646864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_73649493_73653544_73653651_73658815_73659023_73660135_73660286_73672703_73672791_73675782_73675898_73676540_73676720_73680932_73681062_73681207_73681327_73693512_73693583_73704013_73704090_73710628_73710726_73722818
tx.10519	chr2	-	641	4	ISM	ENSMUSG00000018770.10	ENSMUST00000111996.8	723	5	263	0	220	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4118	junction_1	167.551650411315	6090	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGCTGTGATTTGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73741406	73738790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_73739052_73739527_73739722_73740207_73740286_73741298
tx.1052	chr1	-	1703	9	FSM	ENSMUSG00000038776.14	ENSMUST00000036928.12	1741	9	36	2	36	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_5	19.7214984217731	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGTGTGGGCCAGATACC	5764	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180845098	180817120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_180817546_180817957_180818084_180819497_180819607_180821443_180821653_180822192_180822323_180823513_180823742_180827287_180827469_180829363_180829552_180844991
tx.10520	chr2	-	689	5	FSM	ENSMUSG00000018770.10	ENSMUST00000018914.3	714	5	25	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2058	junction_4	989.165146727279	22698	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGCTGTGATTTGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73741645	73738790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_73739052_73739527_73739722_73740207_73740286_73741298_73741405_73741595
tx.10521	chr2	-	3176	13	FSM	ENSMUSG00000009207.16	ENSMUST00000064503.13	3195	13	0	19	0	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_6	31.6842056692114	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAATCTTTTTATAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74409292	74350696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_74352642_74359974_74360146_74360849_74360921_74362219_74362326_74367647_74367846_74378181_74378234_74378318_74378403_74381404_74381446_74385331_74385391_74399284_74399473_74401278_74401321_74403881_74403971_74409162
tx.10522	chr2	-	3164	14	FSM	ENSMUSG00000009207.16	ENSMUST00000111993.9	3321	14	4	153	4	-103	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_2	86.7381968506344	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTTATTTGTTCTGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74409288	74350787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_74352642_74358435_74358519_74359974_74360146_74360849_74360921_74362219_74362326_74367647_74367846_74378181_74378234_74378318_74378403_74381404_74381446_74385331_74385391_74399284_74399473_74401278_74401321_74403881_74403971_74409162
tx.10523	chr2	-	1479	5	FSM	ENSMUSG00000009207.16	ENSMUST00000154706.8	4096	5	-29	2646	3	-2646	multi-exon	FALSE	canonical	3	231	junction_2	34.6914975174033	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCACAAGAAACTCACACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74409289	74384357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_74385391_74399284_74399473_74401278_74401321_74403881_74403971_74409162
tx.10524	chr2	-	446	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000075279.6	novel	580	1	NA	NA	0	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAACACTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74422253	74421683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_74422096_74422219
tx.10525	chr2	-	515	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000075279.6	novel	580	1	NA	NA	0	-25	multi-exon	FALSE	canonical	2	50	junction_1	0	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74422253	74421698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_74421900_74421939
tx.10526	chr2	+	1239	10	FSM	ENSMUSG00000027099.10	ENSMUST00000028511.8	2950	10	19	1692	-8	235	multi-exon	FALSE	canonical	3	767	junction_7	57.1160827926797	267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTTTCATTTACTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74656165	74707083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_74656388_74677581_74677630_74678642_74678690_74689748_74689822_74697214_74697292_74698663_74698757_74699226_74699266_74699647_74699774_74700751_74700829_74706646
tx.10527	chr2	+	1026	3	FSM	ENSMUSG00000027099.10	ENSMUST00000129284.2	728	3	-63	-235	-63	235	multi-exon	FALSE	canonical	3	805	junction_2	1.5	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTTTCATTTACTTTGA	1241	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74699261	74707083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_74699774_74700751_74700829_74706646
tx.10528	chr2	-	737	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081406.5	novel	750	1	NA	NA	-32	70	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	520	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAATGTGTCAAATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75022198	75021346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_75021913_75022027
tx.10529	chr2	-	664	2	Intergenic	novelGene_793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATTGATCTTTATTTTG	3922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75463896	75457247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_75457815_75463799
tx.10530	chr2	-	814	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082152.2	novel	745	1	NA	NA	20	5503	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCCACTTTGGGGTGTGTG	4112	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75463706	75457478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_75457815_75463228
tx.10531	chr2	+	710	2	Intergenic	novelGene_794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGTCGTCTGTTCGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75464334	75465121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_75464502_75464578
tx.10532	chr2	+	663	2	Intergenic	novelGene_795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	0	615	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGTCGTCTGTTCGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75464361	75465121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_75464502_75464598
tx.10533	chr2	+	2245	11	FSM	ENSMUSG00000059005.14	ENSMUST00000111962.8	5150	11	0	2905	0	381	multi-exon	FALSE	canonical	3	3726	junction_1	2097.55310779012	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGACTGGCTGGCATGCT	7481	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75489610	75496846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_75489668_75491809_75491933_75492014_75492162_75492239_75492451_75492830_75492921_75493004_75493101_75493188_75493270_75493914_75494059_75495371_75495495_75495577_75495646_75495741
tx.10534	chr2	+	1928	11	FSM	ENSMUSG00000059005.14	ENSMUST00000111964.8	1654	11	8	-282	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3912	junction_1	2045.95805431099	676	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTTGGTTTTTGTGCAT	7483	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75489612	75496465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_75489734_75491809_75491933_75492014_75492162_75492239_75492451_75492830_75492921_75493004_75493101_75493188_75493270_75493914_75494059_75495371_75495495_75495577_75495646_75495741
tx.10535	chr2	+	1515	5	ISM	ENSMUSG00000059005.14	ENSMUST00000111964.8	1654	11	3593	-666	365	384	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9771	junction_2	461.594722131872	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGCTGGCATGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75493197	75496849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_75493270_75493914_75494059_75495371_75495495_75495577_75495646_75495741
tx.10536	chr2	+	1393	4	ISM	ENSMUSG00000059005.14	ENSMUST00000111961.8	1734	10	4341	-384	1132	384	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9771	junction_1	527.676879244191	197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGCTGGCATGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75493964	75496849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_75494059_75495371_75495495_75495577_75495646_75495741
tx.10537	chr2	-	2373	5	FSM	ENSMUSG00000015839.7	ENSMUST00000102672.5	2475	5	99	3	-53	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	494	junction_1	38.2058568808501	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTTTGGACTTTTTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75534886	75505859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_75507529_75507888_75508057_75508831_75508922_75509506_75509774_75534707
tx.10538	chr2	-	893	3	ISM	ENSMUSG00000015839.7	ENSMUST00000102672.5	2475	5	100	2617	-52	-2617	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	545	junction_1	28.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGGCCTGTAAACTACAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75534885	75508473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_75508922_75509506_75509774_75534707
tx.10539	chr2	-	372	2	ISM	ENSMUSG00000015839.7	ENSMUST00000102672.5	2475	5	99	3724	-53	-3724	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	602	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGAGAATTCCTCCCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75534886	75509580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_75509774_75534707
tx.1054	chr1	-	1982	14	ISM	ENSMUSG00000026516.9	ENSMUST00000027797.9	9392	23	16	26835	16	-17991	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	480	junction_9	88.1404876440457	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTATGTGTATGAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180971753	180941537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_180941867_180945000_180945251_180947919_180948065_180951431_180951550_180954502_180954605_180957073_180957209_180957958_180958036_180958302_180958436_180962356_180962630_180964437_180964496_180966635_180966733_180966818_180966872_180969890_180969965_180971615
tx.10540	chr2	+	445	3	NNC	ENSMUSG00000086813.2	novel	1939	4	NA	NA	-33	-3210	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGGGTTCTCTCTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75607498	75609440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_75607585_75607994_75608131_75609217
tx.10541	chr2	+	390	3	ISM	ENSMUSG00000086813.2	ENSMUST00000135682.2	1939	4	-32	3210	-32	-3210	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGGGTTCTCTCTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75607499	75609440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_75607585_75607994_75608131_75609271
tx.10542	chr2	-	599	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042410.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACATGTCTTCAAATAATC	5111	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75699999	75696000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_75696501_75699900
tx.10543	chr2	+	4661	12	ISM	ENSMUSG00000042410.17	ENSMUST00000047232.14	7359	20	34623	1700	-1583	-1700	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	643	junction_4	70.2567899133288	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAAGTGTGGAGCTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75697143	75759994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_75697217_75698648_75698758_75707814_75707943_75718459_75718512_75722135_75722213_75724388_75724502_75730525_75730596_75733261_75733324_75735202_75735293_75739944_75740045_75741964_75742023_75756265
tx.10544	chr2	+	4589	11	ISM	ENSMUSG00000042410.17	ENSMUST00000047232.14	7359	20	36127	1700	-79	-1700	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	643	junction_3	73.6152837391801	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAAGTGTGGAGCTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75698647	75759994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_75698758_75707814_75707943_75718459_75718512_75722135_75722213_75724388_75724502_75730525_75730596_75733261_75733324_75735202_75735293_75739944_75740045_75741964_75742023_75756265
tx.10545	chr2	-	655	4	FSM	ENSMUSG00000056436.5	ENSMUST00000028430.6	655	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_3	45.146674542232	1476	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGTGCGTTATGTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76190794	76184285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_76184581_76186423_76186617_76187916_76187946_76190656
tx.10546	chr2	-	626	3	NIC	ENSMUSG00000056436.5	novel	655	4	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	45	junction_2	94.5	577	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGTGCGTTATGTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76190794	76184285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_76184581_76186423_76186617_76190656
tx.10547	chr2	+	1877	10	FSM	ENSMUSG00000042369.9	ENSMUST00000046389.5	1898	10	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	321	junction_1	22.7991769398766	470	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATGACTTATTTATATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76200348	76214112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_76200773_76202378_76202502_76203903_76204031_76205699_76205823_76206662_76206849_76208724_76208855_76209021_76209107_76209261_76209426_76210708_76210910_76213798
tx.10548	chr2	-	490	3	Intergenic	novelGene_796	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGCATGCTGGCCATCTTT	9656	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76230478	76228704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_76228872_76229832_76229952_76230274
tx.10549	chr2	+	541	2	FSM	ENSMUSG00000042359.19	ENSMUST00000133275.2	593	2	53	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAACTTTGTTTTCCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76236904	76238276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_76237034_76237864
tx.10550	chr2	+	1308	2	FSM	ENSMUSG00000042359.19	ENSMUST00000134213.2	422	2	0	-886	0	422	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAATTCTTGGTTTTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76236904	76238697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_76237034_76237518
tx.10551	chr2	+	1207	3	NNC	ENSMUSG00000042359.19	novel	593	2	NA	NA	0	3077	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTGTCATTCTAACAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76236904	76241352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_76237034_76237864_76237950_76240359
tx.10552	chr2	+	564	4	NIC	ENSMUSG00000042359.19	novel	2674	21	NA	NA	51	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	17	junction_3	15.6418242755334	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGATGTTCTCAGAGTTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76398514	76410378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_76398587_76407355_76407464_76409516_76409655_76410132
tx.10553	chr2	+	543	4	ISM	ENSMUSG00000042359.19	ENSMUST00000111930.9	3853	25	185259	542	23697	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_2	1.69967317119759	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTACGCGTGGTTTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76422160	76426398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_76422273_76423683_76423811_76425107_76425231_76426217
tx.10554	chr2	-	1583	8	FSM	ENSMUSG00000002731.7	ENSMUST00000002808.7	1614	8	-8	39	-8	-39	multi-exon	TRUE	canonical	3	32	junction_1	7.52953368748825	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGAGCTCTGCTCATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76478367	76460280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_76460913_76463876_76464052_76467138_76467234_76469543_76469662_76470584_76470664_76473566_76473649_76477468_76477639_76478135
tx.10555	chr2	-	821	6	ISM	ENSMUSG00000002731.7	ENSMUST00000002808.7	1614	8	-5	6849	-5	48	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_4	3.65513337649941	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGATGTCCCTTCATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76478364	76467090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_76467234_76469543_76469662_76470584_76470664_76473566_76473649_76477468_76477639_76478135
tx.10556	chr2	-	894	4	FSM	ENSMUSG00000002732.15	ENSMUST00000002809.14	860	4	-34	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	10.2089285540757	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTTTTGCAAATCTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76503448	76493387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_76493697_76496020_76496155_76502040_76502193_76503149
tx.10557	chr2	-	2046	12	ISM	ENSMUSG00000044033.17	ENSMUST00000164114.9	6222	24	0	39568	0	-4592	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	25	junction_4	5.66269509178089	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCCAGCACCTTTTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77000961	76879906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_76880103_76884920_76885113_76888236_76888357_76889883_76890026_76905179_76905353_76919413_76919609_76938706_76938824_76954465_76954720_76958572_76958682_76962525_76962718_76998854_76998978_77000728
tx.10558	chr2	-	737	3	FSM	ENSMUSG00000044033.17	ENSMUST00000111833.3	631	3	-99	-7	-39	7	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	20	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGATGTTAATCTCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77001019	76992317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_76992641_76998854_76998978_77000728
tx.10559	chr2	-	2459	10	ISM	ENSMUSG00000042272.18	ENSMUST00000102660.8	8990	18	53248	5735	-13093	480	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_7	13.5464450258917	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTTTATGTTTGTATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77042864	77016418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_77017605_77018843_77018966_77021304_77021497_77022042_77022166_77022842_77022925_77027166_77027327_77028632_77028748_77029209_77029405_77036549_77036673_77042703
tx.1056	chr1	-	778	7	ISM	ENSMUSG00000026516.9	ENSMUST00000027797.9	9392	23	10	43654	10	5362	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	480	junction_2	118.928082843746	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAGAATCTTCAAGAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180971759	180958356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_180958436_180962356_180962630_180964437_180964496_180966635_180966733_180966818_180966872_180969890_180969965_180971615
tx.10560	chr2	-	394	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000081611.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGTCATTTCTGACCATT	7342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77139809	77117247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_77117450_77139617
tx.10561	chr2	+	597	4	Intergenic	novelGene_797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.89897948556636	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTCCCTCCACGACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77174318	77186350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_77174403_77175198_77175307_77184667_77184824_77186101
tx.10562	chr2	-	3259	20	FSM	ENSMUSG00000027014.15	ENSMUST00000111821.9	3388	20	16	113	16	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	143	junction_19	43.213763581536	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTGTCTTTTTTTCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77776681	77726109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_77726923_77734139_77734379_77734467_77734570_77735700_77735829_77737425_77737579_77738411_77738490_77741853_77741915_77745840_77745923_77747399_77747508_77751161_77751225_77751310_77751518_77751753_77751890_77754483_77754538_77754830_77755000_77757551_77757681_77759599_77759843_77761778_77761890_77763042_77763108_77766936_77767067_77776493
tx.10563	chr2	-	446	2	Intergenic	novelGene_798	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGACATCTTGGGTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78597356	78595059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_78595402_78597252
tx.10564	chr2	+	1487	6	FSM	ENSMUSG00000027011.15	ENSMUST00000028398.14	2249	6	189	573	-4	423	multi-exon	FALSE	canonical	3	305	junction_4	9.66643677887566	332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTGTGTAGAGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78699579	78751064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_78699750_78700800_78701023_78702765_78702817_78744017_78744151_78749030_78749179_78750301
tx.10565	chr2	+	960	2	Intergenic	novelGene_799	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	57	junction_1	0	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGATATTTTAAATGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80026597	80042075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_80026685_80041202
tx.10566	chr2	+	805	5	FSM	ENSMUSG00000027006.14	ENSMUST00000125000.8	1034	5	230	-1	230	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_2	15.833114033569	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTATGTGTTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80146039	80155133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_80146150_80147592_80147944_80149503_80149667_80151587_80151639_80155003
tx.10567	chr2	+	562	3	ISM	ENSMUSG00000027006.14	ENSMUST00000125000.8	1034	5	215	5543	215	-5543	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	256	junction_2	20.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAATATGGAGAAAAGGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80146024	80149589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_80146150_80147592_80147944_80149503
tx.10568	chr2	+	3833	23	FSM	ENSMUSG00000027006.14	ENSMUST00000028392.8	4042	23	213	-4	213	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	242	junction_19	21.5763108543292	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTTGAAGATGATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80146022	80184391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_80146150_80147592_80147944_80149503_80149667_80151587_80151639_80155003_80155087_80155338_80155471_80155961_80156056_80157001_80157080_80158415_80158460_80161612_80161751_80163272_80163363_80164069_80164184_80165796_80165912_80170816_80170945_80171155_80171273_80174260_80174363_80175267_80175424_80176855_80176990_80177687_80177742_80177991_80178140_80179612_80179733_80180972_80181078_80183202
tx.10569	chr2	+	446	2	ISM	ENSMUSG00000027006.14	ENSMUST00000125000.8	1034	5	241	7193	241	-7193	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	297	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGGTAGGCAAACTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80146050	80147939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_80146150_80147592
tx.1057	chr1	-	1017	6	ISM	ENSMUSG00000026516.9	ENSMUST00000027797.9	9392	23	17	47329	17	1687	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	480	junction_1	120.247078966601	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATCCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180971752	180962031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_180962630_180964437_180964496_180966635_180966733_180966818_180966872_180969890_180969965_180971615
tx.10570	chr2	+	663	4	FSM	ENSMUSG00000027001.11	ENSMUST00000147290.8	1324	4	124	537	-2	369	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	41.0446910899164	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTGTTATTTCAGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80447567	80461537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_80447629_80451537_80451585_80454551_80454705_80461135
tx.10571	chr2	+	866	4	FSM	ENSMUSG00000027001.11	ENSMUST00000151204.2	1993	4	-41	1168	-1	369	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	40.1441845795323	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTGTTATTTCAGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80447568	80461537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_80447951_80451537_80451585_80454669_80454705_80461135
tx.10572	chr2	+	974	4	FSM	ENSMUSG00000027001.11	ENSMUST00000028384.5	1632	4	191	467	5	370	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_1	4.10960933531265	637	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGTTATTTCAGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80447579	80461538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_80447951_80451537_80451585_80454551_80454705_80461135
tx.10573	chr2	+	1548	9	FSM	ENSMUSG00000026999.15	ENSMUST00000028382.13	1559	9	15	-4	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_4	57.0169930810105	1197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGTTTGGAAGGTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80469174	80489250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_80469277_80472968_80473140_80474495_80474624_80476752_80476808_80483197_80483340_80485136_80485207_80486292_80486422_80487532_80487698_80488664
tx.10574	chr2	+	992	4	Intergenic	novelGene_800	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.88561808316413	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTGTTTATTTATTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80836018	80941976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_80836475_80838674_80838792_80930568_80930650_80941638
tx.10575	chr2	+	807	6	ISM	ENSMUSG00000027091.15	ENSMUST00000081591.7	2111	10	81	4429	-21	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	656	junction_4	87.6251105562783	256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAGAAGGAAGATGAAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83474859	83490537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_83475072_83483701_83483804_83487359_83487472_83488352_83488506_83488873_83488966_83490401
tx.10576	chr2	+	2023	10	FSM	ENSMUSG00000027091.15	ENSMUST00000081591.7	2111	10	83	5	-19	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	620	junction_6	95.2257875645245	1616	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAACTATGGGCCTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83474861	83494961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_83475072_83483701_83483804_83487359_83487472_83488352_83488506_83488873_83488966_83490401_83490585_83491490_83491638_83491776_83491879_83492492_83492617_83494163
tx.10577	chr2	+	921	2	ISM	ENSMUSG00000027091.15	ENSMUST00000134789.2	1407	5	2140	5	2140	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	715	junction_1	0	337	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAACTATGGGCCTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83492493	83494961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_83492617_83494163
tx.10578	chr2	-	1338	9	NIC	ENSMUSG00000027082.16	novel	2027	10	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	91	junction_8	41.6863286941894	211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATGTTGACTGTCCCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84307107	84263198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_84263529_84264585_84264766_84274353_84274483_84275083_84275261_84282900_84282940_84284143_84284342_84288366_84288478_84304042_84304144_84307034
tx.10579	chr2	-	1308	9	NIC	ENSMUSG00000027082.16	novel	2027	10	NA	NA	-8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	96	junction_8	40.1230529122598	355	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATGTTGACTGTCCCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84307127	84263198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_84263529_84264585_84264766_84274353_84274483_84275083_84275261_84282900_84282940_84284143_84284342_84288366_84288478_84304042_84304144_84307084
tx.10580	chr2	-	668	4	FSM	ENSMUSG00000076437.12	ENSMUST00000117299.10	747	4	73	6	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1785	junction_1	271.099407761966	24567	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGGAGCAAGTTTAAATTT	369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84501041	84499564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_84499742_84500330_84500461_84500588_84500735_84500826
tx.10581	chr2	-	644	4	FSM	ENSMUSG00000076437.12	ENSMUST00000102647.11	654	4	10	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	329	junction_1	946.216677088287	3834	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGGAGCAAGTTTAAATTT	368	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84501042	84499564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_84499742_84500355_84500461_84500588_84500735_84500826
tx.10582	chr2	-	794	3	FSM	ENSMUSG00000076437.12	ENSMUST00000102646.4	783	3	0	-11	0	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	2216	junction_1	111	520	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTAAGGTTTTTCTCCCTTG	369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84501041	84500027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_84500461_84500588_84500735_84500826
tx.10583	chr2	-	2009	8	FSM	ENSMUSG00000050043.17	ENSMUST00000053664.9	1977	8	-31	-1	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1517	junction_2	94.3986336808766	2231	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCCTTGCTGTTTTTCCTT	5260	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84508431	84501659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_84502877_84503367_84503498_84503597_84503664_84503843_84503951_84505748_84505826_84506088_84506203_84506440_84506502_84508194
tx.10584	chr2	+	673	4	ISM	ENSMUSG00000027080.7	ENSMUST00000102645.4	2059	5	23	1943	23	-1227	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	447	junction_3	25.381533094402	312	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAGAAGAAGGTAGGGG	3380	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84508768	84516616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_84509006_84515534_84515792_84515946_84516044_84516534
tx.10585	chr2	+	2029	5	FSM	ENSMUSG00000027080.7	ENSMUST00000102645.4	2059	5	23	7	23	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	447	junction_3	24.2525771826418	1415	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGTATAGAGGCTGGAGT	3380	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84508768	84518552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_84509006_84515534_84515792_84515946_84516044_84516534_84516630_84517209
tx.10586	chr2	-	1849	3	FSM	ENSMUSG00000027079.16	ENSMUST00000028475.9	1912	3	63	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	238	junction_1	30.5	927	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTATGATTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84557631	84553465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_84554562_84555872_84556501_84557506
tx.10587	chr2	-	1199	2	ISM	ENSMUSG00000027079.16	ENSMUST00000028475.9	1912	3	63	1961	-11	-1959	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	299	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAAGGGGGGGGGTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84557631	84555426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_84556501_84557506
tx.10588	chr2	-	615	2	NNC	ENSMUSG00000097187.2	novel	726	2	NA	NA	454	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACACTCTCCTGCTTCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84573545	84572512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_84573045_84573462
tx.10589	chr2	-	828	2	FSM	ENSMUSG00000097187.2	ENSMUST00000181711.2	726	2	-101	-1	-101	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACTCTCCTGCTTCCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84574100	84572511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_84573045_84573805
tx.1059	chr1	+	524	4	FSM	ENSMUSG00000062169.14	ENSMUST00000111059.2	3127	4	17	2586	17	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_3	804.702429473156	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTGAACTCCAGCAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180978512	180993973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_180978627_180981299_180981369_180983423_180983537_180993745
tx.10590	chr2	-	1817	7	ISM	ENSMUSG00000023224.13	ENSMUST00000023994.10	1768	8	526	-27	250	27	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_3	14.4270194041905	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTGTGTACTAGTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84605222	84595703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_84596172_84597618_84597839_84600117_84600255_84600436_84600641_84601768_84601904_84603474_84603989_84605083
tx.10591	chr2	+	1367	4	FSM	ENSMUSG00000027078.15	ENSMUST00000102642.9	1560	4	20	173	14	-173	multi-exon	FALSE	canonical	3	170	junction_3	17.1075032271418	627	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTCTCGTGGGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84629191	84640347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_84629277_84633122_84633219_84636680_84636868_84639348
tx.10592	chr2	-	628	3	ISM	ENSMUSG00000027077.8	ENSMUST00000028471.6	1761	8	6934	0	6934	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_1	1.5	305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATGTGTGGCAGTTTGCC	4703	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84646062	84641519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_84641884_84645634_84645787_84645950
tx.10593	chr2	-	1003	4	ISM	ENSMUSG00000027077.8	ENSMUST00000028471.6	1761	8	6397	0	6397	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	109	junction_3	14.8996644257513	806	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATGTGTGGCAGTTTGCC	4166	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84646599	84641519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_84641884_84645634_84645787_84645950_84646066_84646227
tx.10594	chr2	+	666	3	FSM	ENSMUSG00000027076.11	ENSMUST00000028470.10	690	3	24	0	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_1	17.5	7101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAGTGTCTTTACTTGAGA	6441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84657364	84660557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_84657492_84657942_84658058_84660133
tx.10595	chr2	+	726	4	NIC	ENSMUSG00000027074.15	novel	2621	6	NA	NA	2	2873	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_1	16.391054470859	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACATGTGTGATAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84766962	84771547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_84766989_84767866_84768214_84768566_84768697_84771324
tx.10596	chr2	+	2607	13	NNC	ENSMUSG00000027074.15	novel	2583	13	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_12	10.9125310232472	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGCTTCTACCTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84766979	84788853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_84767194_84767866_84768214_84768566_84768697_84771324_84771372_84774585_84774663_84774861_84774955_84777183_84777324_84778678_84778777_84780316_84780536_84780764_84780885_84785774_84785962_84786615_84786727_84788029
tx.10597	chr2	+	1006	4	ISM	ENSMUSG00000027074.15	ENSMUST00000090726.6	2583	13	-8	17194	-8	2985	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	7.58653778449403	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGCTTGCCTGGTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84766999	84771659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_84767194_84767866_84768214_84768566_84768697_84771324
tx.10598	chr2	+	2394	12	NNC	ENSMUSG00000027074.15	novel	2583	13	NA	NA	632	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	11.2653935088434	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGCTTCTACCTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84767865	84788853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_84768214_84768566_84768697_84771324_84771372_84774585_84774663_84774861_84774955_84777183_84777324_84778678_84778777_84780316_84780536_84780764_84780885_84785774_84785962_84786615_84786727_84788029
tx.10599	chr2	+	801	3	ISM	ENSMUSG00000027074.15	ENSMUST00000141650.8	835	6	876	3283	632	2973	internal_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_1	2.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGTGCATTCCAGGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84767865	84771647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_84768214_84768566_84768697_84771324
tx.106	chr1	+	2398	8	NNC	ENSMUSG00000004768.15	novel	4322	8	NA	NA	-9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	52.1454011121101	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTCTTGTCTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33758958	33779853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_33759102_33760688_33760781_33762866_33763087_33764014_33764101_33773782_33773940_33775880_33775968_33777368_33777462_33778333
tx.1060	chr1	+	664	5	FSM	ENSMUSG00000062169.14	ENSMUST00000134115.8	3268	5	18	2586	18	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	1843	junction_1	136.918543302213	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTGAACTCCAGCAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180978513	180993973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_180978627_180981299_180981369_180983423_180983537_180989639_180989781_180993745
tx.10600	chr2	+	2787	17	FSM	ENSMUSG00000027067.17	ENSMUST00000077798.13	2739	17	-48	0	-48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1260	junction_7	140.688874382447	321	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATGTCCTTATGTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84867529	84877453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_84867673_84868137_84868314_84868696_84868883_84870217_84870324_84870608_84870800_84870902_84871134_84871262_84871367_84871451_84871581_84871778_84872001_84872586_84872660_84873036_84873176_84873299_84873346_84874662_84874793_84875753_84875925_84876027_84876117_84876596_84876784_84876989
tx.10601	chr2	+	2976	16	ISM	ENSMUSG00000027067.17	ENSMUST00000077798.13	2739	17	228	0	7	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1260	junction_6	129.702223059848	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATGTCCTTATGTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84867805	84877453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_84868314_84868696_84868883_84870217_84870324_84870608_84870800_84870902_84871134_84871262_84871367_84871451_84871581_84871778_84872001_84872586_84872660_84873036_84873176_84873299_84873346_84874662_84874793_84875753_84875925_84876027_84876117_84876596_84876784_84876989
tx.10602	chr2	+	742	3	ISM	ENSMUSG00000027067.17	ENSMUST00000145097.2	679	4	431	-391	327	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1634	junction_1	29	562	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATGTCCTTATGTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84876025	84877453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_84876117_84876596_84876784_84876989
tx.10603	chr2	+	1549	7	ISM	ENSMUSG00000033955.14	ENSMUST00000048400.4	4799	8	5644	6	2839	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	230	junction_4	19.0613046073277	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTTGTCCAGGATTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84894146	84903386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_84894361_84900331_84900702_84900950_84901102_84901216_84901354_84902049_84902208_84902439_84902513_84902940
tx.10604	chr2	+	644	3	ISM	ENSMUSG00000033955.14	ENSMUST00000048400.4	4799	8	13581	5	10776	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	268	junction_1	1.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTTGTCCAGGATTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84902083	84903387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_84902208_84902439_84902513_84902940
tx.10605	chr2	+	672	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082908.5	novel	253	1	NA	NA	-116	370	multi-exon	FALSE	canonical	1	11	junction_1	0	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGAGTCTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87356372	87357111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_87356560_87356626
tx.10606	chr2	+	624	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082908.5	novel	253	1	NA	NA	-87	367	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_1	0	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87356401	87357108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_87356560_87356642
tx.10607	chr2	+	452	3	Intergenic	novelGene_802	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTATGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90411167	90415392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_90411261_90411454_90411715_90415293
tx.10608	chr2	+	786	3	ISM	ENSMUSG00000051329.14	ENSMUST00000057481.7	5684	37	2169	51858	2169	-8050	internal_fragment	FALSE	canonical	3	579	junction_2	41.5	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTTTTTTTCTTTCAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90509727	90514814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_90509853_90510115_90510228_90514265
tx.10609	chr2	+	1517	9	ISM	ENSMUSG00000051329.14	ENSMUST00000057481.7	5684	37	2170	42081	2170	8	internal_fragment	FALSE	canonical	3	521	junction_6	48.3806521245839	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGTATGATTATTTGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90509728	90524591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_90509853_90510115_90510228_90514265_90514477_90515316_90515540_90517637_90517717_90519449_90519565_90520410_90520570_90523396_90523475_90524175
tx.10610	chr2	+	1408	12	ISM	ENSMUSG00000051329.14	ENSMUST00000057481.7	5684	37	2171	36157	2171	-1898	internal_fragment	FALSE	canonical	3	459	junction_11	56.4547650412945	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAATTACTTTAGCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90509729	90530515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_90509853_90510115_90510228_90514265_90514477_90515316_90515540_90517637_90517717_90519449_90519565_90520410_90520570_90523396_90523475_90524175_90524274_90526983_90527069_90528203_90528273_90530459
tx.10611	chr2	+	2340	14	ISM	ENSMUSG00000051329.14	ENSMUST00000057481.7	5684	37	36579	0	-3765	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	510	junction_2	69.9022986814221	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGTATATTAAGATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90544137	90566672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_90544238_90547937_90548034_90548157_90548253_90548342_90548440_90548531_90548638_90551533_90551695_90552373_90552435_90553680_90553792_90553955_90554080_90555945_90556048_90560022_90560165_90563124_90563251_90563449_90563555_90565758
tx.10612	chr2	+	1095	13	FSM	ENSMUSG00000027282.18	ENSMUST00000136872.8	2596	13	83	1418	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2037	junction_4	251.273534000079	8863	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGATTGGTGTCTGCCTTT	179	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90677581	90695736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_90677730_90679714_90679800_90679941_90680049_90683183_90683211_90683394_90683458_90685267_90685326_90685779_90685832_90687149_90687210_90689819_90689914_90690806_90690855_90691725_90691794_90693933_90694010_90695527
tx.10613	chr2	-	935	7	FSM	ENSMUSG00000005510.10	ENSMUST00000005647.4	1046	7	117	-6	-8	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1877	junction_6	40.2105569333339	6870	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCTGTGGTGGTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90735054	90724973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_90725222_90728727_90728848_90728980_90729107_90732706_90732857_90733190_90733289_90734766_90734833_90734927
tx.10614	chr2	-	810	6	ISM	ENSMUSG00000005510.10	ENSMUST00000005647.4	1046	7	337	-6	152	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1898	junction_3	37.1429670328045	295	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCTGTGGTGGTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90734834	90724973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_90725222_90728727_90728848_90728980_90729107_90732706_90732857_90733190_90733289_90734766
tx.10615	chr2	+	2361	4	FSM	ENSMUSG00000005505.13	ENSMUST00000111464.8	2343	4	-18	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	29.2726645334669	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGTGTCTGTGTTGACT	2317	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90735065	90740905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_90735157_90736009_90736628_90737888_90737996_90739360
tx.10616	chr2	+	1288	2	ISM	ENSMUSG00000005505.13	ENSMUST00000090682.4	2437	4	19	3756	-7	752	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAAATAGGAAACATTTG	2357	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90735105	90737149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_90735254_90736009
tx.10617	chr2	-	849	3	ISM	ENSMUSG00000063235.19	ENSMUST00000111461.13	1316	4	554	13	105	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	356	junction_2	10	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTCCCCTGGCCCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90747835	90741069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_90741664_90744327_90744520_90747772
tx.10618	chr2	-	1066	4	FSM	ENSMUSG00000063235.19	ENSMUST00000111461.13	1316	4	237	13	-139	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	312	junction_3	26.7332502076846	848	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTCCCCTGGCCCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90748152	90741069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_90741664_90744327_90744520_90747772_90747854_90747953
tx.10619	chr2	+	1582	12	FSM	ENSMUSG00000002102.16	ENSMUST00000067663.14	1636	12	60	-6	14	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1724	junction_1	113.356309451931	3544	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTTCTCAGCCTCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90884413	90889783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_90884677_90884919_90885004_90885323_90885450_90885802_90885908_90885992_90886056_90886249_90886388_90887002_90887147_90887256_90887406_90888109_90888207_90888354_90888501_90889390_90889473_90889598
tx.10620	chr2	+	650	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000002105.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGGTTTATTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90900759	90901968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_90900852_90901410
tx.10621	chr2	+	1436	5	FSM	ENSMUSG00000002111.9	ENSMUST00000002180.8	2034	5	599	-1	-85	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	7.28010988928052	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAGTGTCTCATTCAAGA	9216	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90927039	90946102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_90927339_90929774_90929872_90943599_90943791_90944589_90944756_90945419
tx.10622	chr2	+	1153	7	ISM	ENSMUSG00000002100.16	ENSMUST00000169776.2	4163	35	16249	0	16249	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_4	1.34370962471642	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGATGTCTCCTGTTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90964737	90966861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_90964955_90965134_90965275_90965436_90965597_90965691_90965829_90966080_90966268_90966448_90966487_90966587
tx.10623	chr2	-	1209	3	ISM	ENSMUSG00000040687.17	ENSMUST00000111369.8	5582	31	36451	0	-3619	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_2	8.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGGCTCCTGTGCACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90973220	90967704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_90968747_90969053_90969101_90973100
tx.10624	chr2	+	2679	11	FSM	ENSMUSG00000002103.17	ENSMUST00000239169.2	4652	11	7	1966	-5	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_7	11.5134703716994	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTAGGCCAGATACCACTG	5067	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91033263	91042476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_91033394_91033945_91034042_91034584_91034672_91036100_91036254_91036354_91036454_91036532_91036623_91037061_91037195_91038161_91038245_91038384_91038492_91038605_91038782_91040951
tx.10625	chr2	-	1819	10	FSM	ENSMUSG00000002109.15	ENSMUST00000028696.5	1557	10	15	-277	-7	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_8	17.7888854188351	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCAAAAGCCCAACAGGGTT	3012	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91067312	91041923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_91042358_91042624_91042671_91042794_91042960_91047010_91047154_91047397_91047576_91047651_91047752_91049088_91049235_91064452_91064645_91065159_91065297_91067034
tx.10626	chr2	+	605	2	Intergenic	novelGene_804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGAGAAAATCTGGCATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91067481	91068406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_91067747_91068066
tx.10627	chr2	+	1776	10	NIC	ENSMUSG00000027257.14	novel	1862	11	NA	NA	-3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	32	junction_1	17.8519286920123	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGAGCGTCTTTTGATAGC	4772	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91087179	91095023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_91087272_91090515_91090607_91090748_91090906_91091515_91091752_91091855_91092012_91093112_91093289_91093403_91093525_91093631_91093769_91094109_91094232_91094535
tx.10628	chr2	+	1861	11	FSM	ENSMUSG00000027257.14	ENSMUST00000028694.12	1862	11	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	20.1345474247622	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGAGCGTCTTTTGATAGC	4751	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91087158	91095023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_91087272_91090208_91090273_91090515_91090607_91090748_91090906_91091515_91091752_91091855_91092012_91093112_91093289_91093403_91093525_91093631_91093769_91094109_91094232_91094535
tx.10629	chr2	+	2772	16	FSM	ENSMUSG00000027255.15	ENSMUST00000080008.13	3068	16	296	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	197	junction_10	19.1619994317457	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTCCTCTCCGTCCTGCCT	5798	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91095614	91107276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_91095750_91095916_91096036_91096570_91096644_91097469_91097602_91097680_91097762_91098501_91098584_91098796_91098854_91099796_91099850_91100277_91100415_91100502_91100635_91103885_91104015_91104097_91104233_91105139_91105267_91105417_91105512_91105620_91105740_91106109
tx.10630	chr2	+	556	3	FSM	ENSMUSG00000027255.15	ENSMUST00000150701.8	520	3	-17	-19	14	19	multi-exon	FALSE	canonical	3	261	junction_2	6.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAATACAAACTGAACTAG	5835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91095651	91096909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_91095750_91095916_91096036_91096570
tx.10631	chr2	-	1617	9	FSM	ENSMUSG00000040591.19	ENSMUST00000102594.11	1977	9	-53	413	9	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	72	junction_5	19.7673974007708	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATGAGTCTAAAGCCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91275040	91108587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_91109303_91109534_91109599_91112090_91112201_91112809_91113006_91114579_91114666_91135093_91135179_91214073_91214205_91252210_91252314_91274913
tx.10632	chr2	-	359	3	FSM	ENSMUSG00000040591.19	ENSMUST00000139490.8	307	3	-51	-1	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	64	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTTCTTTTTTCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91275033	91249127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_91249264_91252210_91252314_91274913
tx.10633	chr2	+	2395	18	ISM	ENSMUSG00000040549.17	ENSMUST00000111338.10	6665	44	19	47558	19	7935	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	508	junction_5	45.5637505405536	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTGGTCTTGATTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91357125	91403451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_91357196_91376666_91376761_91379118_91379313_91380896_91381104_91385611_91385784_91386844_91386978_91387919_91388021_91389393_91389508_91391151_91391257_91393098_91393189_91393293_91393459_91394664_91394794_91395965_91396149_91398481_91398596_91398981_91399093_91400524_91400618_91402692_91402879_91403317
tx.10634	chr2	+	346	4	ISM	ENSMUSG00000040549.17	ENSMUST00000139433.8	2226	11	11253	2391	2333	-2391	internal_fragment	FALSE	canonical	3	514	junction_2	50.2062413118794	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCAAAGAAAAGAAGCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91387917	91393122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_91388021_91389393_91389508_91391151_91391257_91393098
tx.10635	chr2	+	717	2	ISM	ENSMUSG00000040549.17	ENSMUST00000111337.3	6384	42	73478	-6	23723	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	665	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCCAAAATGCTCTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91450155	91451014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_91450185_91450326
tx.10636	chr2	-	488	3	ISM	ENSMUSG00000027249.16	ENSMUST00000028681.15	1988	14	7932	-2	7913	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGTGTGCCCAATGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91458827	91455662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_91455919_91456046_91456118_91458666
tx.10637	chr2	-	2005	13	ISM	ENSMUSG00000027249.16	ENSMUST00000028681.15	1988	14	361	-2	342	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_12	3.05845821725043	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGTGTGCCCAATGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91466398	91455662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_91455919_91456046_91456118_91458666_91458849_91459004_91459179_91459495_91459664_91460294_91460422_91460497_91460612_91460853_91461172_91463320_91463458_91463535_91463642_91465243_91465295_91465515_91465541_91466122
tx.10638	chr2	+	2854	14	FSM	ENSMUSG00000027247.17	ENSMUST00000111329.8	3201	14	346	1	-16	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	195	junction_1	49.9501526672271	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATTTGGCTGTTTAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91480550	91502670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_91480598_91482108_91482169_91484417_91484553_91484780_91484877_91492642_91492731_91498541_91498674_91498830_91498918_91499073_91499173_91499530_91499639_91499729_91499807_91499996_91500075_91500490_91500620_91500810_91500915_91501056
tx.10639	chr2	+	2880	14	NNC	ENSMUSG00000027247.17	novel	2866	14	NA	NA	-1	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_1	115.844059639872	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCATTTGGCTGTTTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91480565	91502669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_91480598_91482093_91482169_91484390_91484553_91484780_91484877_91492642_91492731_91498541_91498674_91498830_91498918_91499073_91499173_91499530_91499639_91499729_91499807_91499996_91500075_91500490_91500620_91500810_91500915_91501056
tx.1064	chr1	-	3512	14	FSM	ENSMUSG00000004880.12	ENSMUST00000005003.12	3510	14	15	-17	-3	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	1956	junction_6	154.844109428974	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTCTTTGCCACAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181669929	181642882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_181644584_181644829_181644953_181645053_181645135_181646404_181646574_181647428_181647555_181648238_181648343_181649000_181649193_181653186_181653242_181656276_181656474_181659106_181659300_181659713_181659798_181663622_181663854_181665942_181666122_181669852
tx.10640	chr2	+	2883	14	FSM	ENSMUSG00000027247.17	ENSMUST00000090614.11	2866	14	-18	1	-18	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	46	junction_2	93.668116113923	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATTTGGCTGTTTAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91480548	91502670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_91480598_91482108_91482169_91484390_91484553_91484780_91484877_91492642_91492731_91498541_91498674_91498830_91498918_91499073_91499173_91499530_91499639_91499729_91499807_91499996_91500075_91500490_91500620_91500810_91500915_91501056
tx.10641	chr2	-	3524	16	FSM	ENSMUSG00000027244.15	ENSMUST00000076803.12	3551	16	20	7	20	-6	multi-exon	TRUE	canonical	3	217	junction_4	20.2170445141937	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATAGCTTCCTATTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91540901	91504969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_91506809_91509071_91509201_91509657_91509775_91510264_91510343_91510687_91510803_91511903_91512041_91515013_91515105_91515495_91515595_91516126_91516224_91516845_91516887_91518985_91519127_91520135_91520183_91522772_91522893_91524269_91524351_91526262_91526345_91540591
tx.10642	chr2	-	2422	15	NIC	ENSMUSG00000027244.15	novel	3551	16	NA	NA	-18	653	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	44	junction_3	59.708176379208	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATTTTATAGAAGTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91540882	91505974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_91506809_91509071_91509201_91509657_91509775_91510687_91510803_91511903_91512041_91515013_91515105_91515495_91515595_91516126_91516224_91516845_91516887_91518985_91519127_91520135_91520183_91522772_91522893_91524269_91524351_91526262_91526345_91540591
tx.10643	chr2	+	2116	3	NIC	ENSMUSG00000027243.9	novel	2308	3	NA	NA	7	22	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	33	junction_1	34.5	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGACTGCTCTTGTGGG	3380	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91541204	91551912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_91541321_91542424_91543211_91550698
tx.10644	chr2	+	2378	3	FSM	ENSMUSG00000027243.9	ENSMUST00000090608.6	2308	3	-49	-21	20	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	26	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGGACTGCTCTTGTGG	3393	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91541217	91551911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_91541597_91542424_91543211_91550698
tx.10645	chr2	+	2173	3	NIC	ENSMUSG00000027243.9	novel	2308	3	NA	NA	-25	21	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_1	37.5	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGGACTGCTCTTGTGG	3412	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91541236	91551911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_91541411_91542424_91543211_91550698
tx.10646	chr2	+	1459	2	ISM	ENSMUSG00000027243.9	ENSMUST00000090608.6	2308	3	1698	-21	425	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGGACTGCTCTTGTGG	5140	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91542964	91551911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_91543211_91550698
tx.10647	chr2	-	430	2	ISM	ENSMUSG00000027239.15	ENSMUST00000111309.8	771	5	736	16	736	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2823	junction_1	0	323	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCTTTTTTAATATATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91761297	91760165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_91760461_91761162
tx.10648	chr2	-	742	4	ISM	ENSMUSG00000027239.15	ENSMUST00000111309.8	771	5	191	16	191	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2268	junction_3	242.697342383472	1511	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCTTTTTTAATATATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91761842	91760165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_91760461_91761162_91761325_91761440_91761600_91761716
tx.10649	chr2	-	874	5	FSM	ENSMUSG00000027239.15	ENSMUST00000090602.6	714	5	-15	-145	-15	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	492	junction_4	939.630878324036	1527	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCTTTTTTAATATATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91762059	91760165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_91760461_91761162_91761325_91761440_91761600_91761716_91761794_91761878
tx.1065	chr1	-	3005	11	ISM	ENSMUSG00000004880.12	ENSMUST00000005003.12	3510	14	10161	-11	-3064	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1956	junction_6	150.911099658044	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGCCTCATTTCTTTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181659783	181642888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_181644584_181644829_181644953_181645053_181645135_181646404_181646574_181647428_181647555_181648238_181648343_181649000_181649193_181653186_181653242_181656276_181656474_181659106_181659300_181659713
tx.10650	chr2	-	801	5	FSM	ENSMUSG00000027239.15	ENSMUST00000111309.8	771	5	-46	16	-35	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_4	1107.84859073792	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCTTTTTTAATATATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91762079	91760165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_91760461_91761162_91761325_91761440_91761600_91761716_91761794_91761971
tx.10651	chr2	-	762	5	FSM	ENSMUSG00000027239.15	ENSMUST00000069423.13	773	5	18	-7	18	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	1617	junction_4	477.436121381699	4141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCTTTTTTAATATATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91762107	91760165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_91760461_91761162_91761325_91761440_91761600_91761716_91761794_91762038
tx.10652	chr2	+	1159	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040479.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACACCTGGCTTCTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91762243	91764857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_91762645_91762981_91763296_91764413
tx.10653	chr2	+	782	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087197.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACGAGACGCTATGACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91872164	91873811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_91872297_91872579_91872768_91873349
tx.10654	chr2	-	1432	6	ISM	ENSMUSG00000040434.17	ENSMUST00000176774.8	2377	15	3522	0	-688	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_5	15.8189759466282	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGAGTGTTTTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92197809	92195390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_92195841_92195971_92196168_92196263_92196414_92196662_92196942_92197360_92197522_92197613
tx.10655	chr2	+	1235	10	NNC	ENSMUSG00000027222.15	novel	1392	11	NA	NA	-31	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72.4084777793387	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTGGCTCTGTGTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92205806	92211563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_92206021_92206937_92207049_92207774_92207909_92208035_92208137_92208937_92209019_92209140_92209294_92209378_92209452_92209560_92209681_92210754_92210820_92211380
tx.10656	chr2	+	1215	11	FSM	ENSMUSG00000027222.15	ENSMUST00000028650.9	1392	11	177	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	202	junction_1	17.2869893272368	824	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGTGGCTCTGTGTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92205827	92211562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_92206021_92206215_92206252_92206971_92207049_92207774_92207909_92208035_92208137_92208937_92209019_92209140_92209294_92209378_92209452_92209560_92209681_92210754_92210820_92211380
tx.10657	chr2	-	991	4	ISM	ENSMUSG00000027223.16	ENSMUST00000111279.9	3274	12	7512	-2	7512	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_2	11.2249721603218	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGAGTGGGTGTATTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92215564	92214018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_92214767_92215068_92215168_92215268_92215340_92215491
tx.10658	chr2	-	2218	2	ISM	ENSMUSG00000068742.12	ENSMUST00000090559.12	3976	12	22375	0	20724	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTTGTGTAATCTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92242013	92233990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_92236166_92241970
tx.10659	chr2	-	3104	2	FSM	ENSMUSG00000049922.9	ENSMUST00000067631.7	3139	2	39	-4	39	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACAGCATGTTTTATGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92290100	92283104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_92285120_92289011
tx.1066	chr1	-	612	3	ISM	ENSMUSG00000004880.12	ENSMUST00000005003.12	3510	14	11	20602	-7	121	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	2209	junction_1	121	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTTTTGTTTTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181669933	181663501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_181663854_181665942_181666122_181669852
tx.10660	chr2	-	1067	2	Intergenic	novelGene_805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTATGCCCATTTGTTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92302368	92293652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_92294580_92302228
tx.10661	chr2	+	2819	8	NIC	ENSMUSG00000068735.15	novel	2703	8	NA	NA	-10	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	62	junction_2	86.7591082085498	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATCTGCGTGGTGTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93017918	93032099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_93018093_93027241_93027324_93027806_93028094_93028607_93028667_93028883_93028933_93029239_93029337_93029701_93029804_93030130
tx.10662	chr2	+	2653	8	FSM	ENSMUSG00000068735.15	ENSMUST00000111266.8	2703	8	45	5	9	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_2	82.3119997699148	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATCTGCGTGGTGTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93017937	93032099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_93018093_93027241_93027324_93027953_93028094_93028607_93028667_93028883_93028933_93029239_93029337_93029701_93029804_93030130
tx.10663	chr2	+	2649	8	FSM	ENSMUSG00000068735.15	ENSMUST00000090554.11	2654	8	10	-5	10	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	171	junction_2	50.0424309757148	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATCTGCGTGGTGTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93017938	93032099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_93018093_93027241_93027324_93027956_93028094_93028607_93028667_93028883_93028933_93029239_93029337_93029701_93029804_93030130
tx.10664	chr2	-	672	3	FSM	ENSMUSG00000027217.14	ENSMUST00000152141.2	674	3	5	-3	5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	26	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTGTGTGAGATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93164845	93141604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_93141967_93142291_93142373_93164616
tx.10665	chr2	-	1730	9	FSM	ENSMUSG00000027215.14	ENSMUST00000099696.8	1657	9	-73	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	3.52668399491647	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTCTGAAGAGGCGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93292829	93249455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_93250288_93250584_93250669_93250899_93251101_93252171_93252274_93260289_93260365_93260475_93260601_93264205_93264279_93267732_93267816_93292674
tx.10666	chr2	-	1787	10	FSM	ENSMUSG00000027215.14	ENSMUST00000028644.11	1824	10	37	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_8	1.4229164972073	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTCTGAAGAGGCGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93292810	93249455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_93250288_93250584_93250669_93250899_93251101_93252171_93252274_93260289_93260365_93260475_93260601_93264205_93264279_93267732_93267816_93273713_93273790_93292674
tx.10667	chr2	-	2494	13	ISM	ENSMUSG00000027198.17	ENSMUST00000028623.13	2871	14	8798	1	8775	-1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	390	junction_9	30.1389144905165	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCTGTCTAGAATGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93644115	93525976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_93526617_93533538_93533622_93534827_93534957_93537578_93537723_93560502_93560670_93569914_93570105_93592897_93593030_93621354_93621449_93625979_93626120_93628516_93628713_93636369_93636487_93642241_93642332_93643743
tx.10668	chr2	-	1487	7	ISM	ENSMUSG00000027198.17	ENSMUST00000028623.13	2871	14	59882	1	33303	-1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	407	junction_5	25.6823545130374	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCTGTCTAGAATGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93593031	93525976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_93526617_93533538_93533622_93534827_93534957_93537578_93537723_93560502_93560670_93569914_93570105_93592897
tx.10669	chr2	-	2137	15	NNC	ENSMUSG00000075023.12	novel	2224	15	NA	NA	-46179	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_14	23.9396562810986	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCAGGCCTGCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93745681	93685706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_93686126_93687041_93687196_93687289_93687433_93688239_93688382_93688481_93688528_93689700_93689791_93691361_93691463_93691813_93691892_93692118_93692217_93693135_93693203_93693444_93693515_93694263_93694335_93694736_93694797_93696026_93696575_93745631
tx.10670	chr2	-	896	6	ISM	ENSMUSG00000040174.15	ENSMUST00000040005.13	1228	10	5950	-5	407	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_3	40.1895508807949	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTTGATCCAAAAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93835125	93810976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_93811323_93811860_93811960_93826527_93826738_93831769_93831859_93833397_93833502_93835077
tx.10671	chr2	-	1257	10	FSM	ENSMUSG00000040174.15	ENSMUST00000040005.13	1228	10	-24	-5	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_3	32.7210431781547	258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTTGATCCAAAAGCTTT	8851	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93841099	93810976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_93811323_93811860_93811960_93826527_93826738_93831769_93831859_93833397_93833502_93835077_93835126_93837191_93837227_93838383_93838488_93838787_93838938_93841027
tx.10672	chr2	-	1835	11	FSM	ENSMUSG00000027195.11	ENSMUST00000028619.5	1902	11	62	5	7	-5	multi-exon	TRUE	canonical	3	670	junction_5	45.0653969249135	854	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAGTGTATTTTTGATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93988247	93863038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_93864007_93864271_93864422_93874217_93874284_93875705_93875788_93882598_93882634_93895898_93895944_93896753_93896819_93913511_93913620_93945337_93945414_93947774_93947822_93988054
tx.10673	chr2	-	3429	20	NNC	ENSMUSG00000027194.17	novel	3408	20	NA	NA	-3	23	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_8	57.9778350999836	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATCTTTATTGTTTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94237027	94158258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_94158831_94160862_94161017_94163137_94163398_94172971_94173143_94189095_94189283_94192684_94192910_94193044_94193123_94194610_94194777_94194914_94195035_94196866_94197014_94199657_94199771_94202081_94202243_94204862_94205003_94205426_94205572_94206374_94206485_94207945_94208078_94208338_94208451_94209033_94209204_94216436_94216527_94236851
tx.10674	chr2	-	2036	3	NIC	ENSMUSG00000027194.17	novel	3408	20	NA	NA	-2	1590	intron_retention	FALSE	canonical	3	256	junction_1	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAAAAAAGGGGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94237036	94207442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_94209204_94216436_94216527_94236851
tx.10675	chr2	-	484	2	ISM	ENSMUSG00000027194.17	ENSMUST00000094801.5	3408	20	4	57939	4	-7188	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	261	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATGTAATAATACTGACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94237029	94216220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_94216527_94236851
tx.10676	chr2	+	1459	2	FSM	ENSMUSG00000045464.6	ENSMUST00000152313.2	2040	2	581	0	581	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAAGAATCCTAAGTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94237076	94242027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_94237312_94240803
tx.10677	chr2	-	3698	14	FSM	ENSMUSG00000027193.13	ENSMUST00000028617.7	3736	14	-8	46	-8	-46	multi-exon	FALSE	canonical	3	777	junction_1	163.356364354585	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTGTCTTAATGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94268489	94242072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_94244127_94248600_94248738_94249215_94249293_94251330_94251388_94251777_94251872_94252641_94252824_94253756_94253847_94255318_94255424_94255935_94256143_94257277_94257430_94257856_94257923_94258390_94258485_94260023_94260186_94268268
tx.10678	chr2	-	3698	14	NNC	ENSMUSG00000027193.13	novel	3736	14	NA	NA	-7	-50	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	565	junction_1	211.688282609319	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTTTTGTGTCTTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94268488	94242076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_94244132_94248600_94248738_94249215_94249293_94251330_94251388_94251777_94251872_94252641_94252824_94253756_94253847_94255318_94255424_94255935_94256143_94257277_94257430_94257856_94257923_94258390_94258485_94260023_94260186_94268268
tx.10679	chr2	-	952	7	FSM	ENSMUSG00000027165.17	ENSMUST00000111231.10	2273	7	-20	1341	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_5	14.4299072146089	421	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTCTGTGGAAATGTACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101459355	101392466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_101392700_101406356_101406497_101413865_101413933_101415588_101415661_101416656_101416815_101440868_101441021_101459225
tx.1068	chr1	-	1479	7	ISM	ENSMUSG00000022995.17	ENSMUST00000193074.6	1971	13	95880	-689	-1164	-372	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	359	junction_3	25.7940561628708	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGTACTTAATCTTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181746089	181732381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_181733463_181733951_181734010_181735862_181735942_181740871_181740939_181744763_181744813_181745822_181745881_181746002
tx.10680	chr2	-	1800	2	FSM	ENSMUSG00000027165.17	ENSMUST00000177007.2	1458	2	0	-342	0	342	multi-exon	FALSE	canonical	3	166	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGGAAAGGAAAAGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101459354	101439349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_101441021_101459225
tx.10681	chr2	+	3120	8	FSM	ENSMUSG00000027164.9	ENSMUST00000004949.8	6169	8	-7	3056	4	-3056	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_2	13.2603444409969	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATTTCCTCAAAACAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101508777	101528958	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_101508966_101511169_101511373_101514823_101515142_101518808_101518960_101520400_101520560_101521772_101521845_101524599_101524678_101527007
tx.10682	chr2	+	614	3	NNC	ENSMUSG00000027164.9	novel	6169	8	NA	NA	0	-3998	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	43	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTGAGTCATTGGAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101508773	101512582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_101508966_101511169_101511373_101512363
tx.10683	chr2	+	525	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032841.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACACTTGTTTGCGTCTC	2351	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101627125	101628490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_101627383_101628222
tx.10684	chr2	+	1187	6	FSM	ENSMUSG00000027163.14	ENSMUST00000028584.8	1191	6	4	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_2	9.72830920561225	439	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGCTGGTCGTGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101716601	101731991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_101716665_101725479_101725606_101727384_101727525_101729212_101729248_101730213_101730318_101731272
tx.10685	chr2	-	3801	6	FSM	ENSMUSG00000048058.18	ENSMUST00000058790.12	3833	6	32	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_4	7.56306816047562	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCGTGTGAATGGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102016698	101780547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_101783521_101785173_101785520_101888251_101888387_101900277_101900404_101943877_101944025_102016624
tx.10686	chr2	-	1992	4	NNC	ENSMUSG00000027189.17	novel	5612	5	NA	NA	-77	1325	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	43.1817862838798	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATATTTGTAAGTGGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102230679	102133513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_102134850_102187745_102188002_102211208_102211287_102230357
tx.10687	chr2	-	1845	11	FSM	ENSMUSG00000010914.11	ENSMUST00000011058.9	2506	11	28	633	-23	-633	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_1	20.370567002418	465	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATCATATTGACGTTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102903830	102852052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_102852615_102854509_102854575_102858620_102858780_102860622_102860682_102863507_102863656_102865559_102865735_102871387_102871487_102872538_102872739_102877065_102877167_102888841_102888923_102903634
tx.10688	chr2	-	1109	5	FSM	ENSMUSG00000010914.11	ENSMUST00000111183.2	2078	5	-23	992	-23	-992	multi-exon	FALSE	canonical	3	362	junction_1	7.44983221287567	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGAGTATGTGCGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102903830	102870955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_102871487_102872538_102872739_102877065_102877167_102888841_102888923_102903634
tx.10689	chr2	+	860	7	NNC	ENSMUSG00000010911.13	novel	919	7	NA	NA	-3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_6	133.735331490556	78	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTTGGAAATTTTCTTGA	4610	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102904036	102922986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_102904187_102913299_102913401_102917457_102917507_102918905_102919024_102919747_102919884_102922093_102922223_102922809
tx.10690	chr2	+	897	7	FSM	ENSMUSG00000010911.13	ENSMUST00000011055.7	919	7	20	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	304	junction_6	40.9691618442729	1464	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTGGAAATTTTCTTGAT	4613	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102904039	102922987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_102904187_102913299_102913401_102917457_102917507_102918905_102919024_102919747_102919884_102922093_102922262_102922809
tx.10691	chr2	-	2432	13	FSM	ENSMUSG00000027187.11	ENSMUST00000028610.10	2613	13	28	153	-7	-153	multi-exon	FALSE	canonical	3	472	junction_10	47.7368364636321	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGACCGTGTTTGGTTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103315477	103284346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_103285167_103285422_103285507_103287194_103287303_103290586_103290718_103293631_103293771_103297421_103297575_103298038_103298231_103300643_103300770_103302110_103302216_103303295_103303427_103304674_103304786_103307093_103307266_103315317
tx.10692	chr2	-	1141	4	ISM	ENSMUSG00000027187.11	ENSMUST00000028610.10	2613	13	24790	153	24755	-153	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	550	junction_2	25.1705295048705	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGACCGTGTTTGGTTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103290715	103284346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_103285167_103285422_103285507_103287194_103287303_103290586
tx.10693	chr2	-	394	3	ISM	ENSMUSG00000027187.11	ENSMUST00000111168.4	779	6	8	19769	8	-19769	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	605	junction_1	5.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGACCCCTATTGCCGTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103315462	103304708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_103304786_103307093_103307266_103315317
tx.10694	chr2	-	1623	4	FSM	ENSMUSG00000027185.16	ENSMUST00000127581.8	1639	4	31	-15	11	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	307	junction_1	12.4721912892465	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAAATGCCCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103591575	103583349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_103584576_103587513_103587606_103588015_103588139_103591393
tx.10695	chr2	-	4018	18	FSM	ENSMUSG00000027184.15	ENSMUST00000111147.8	4069	18	56	-5	56	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1559	junction_1	126.714184008996	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATGTGTGGTTATGGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103627393	103595357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_103597209_103598750_103598815_103599147_103599249_103599779_103599975_103602041_103602193_103603013_103603164_103603318_103603430_103604078_103604141_103605761_103605871_103605954_103606111_103606278_103606366_103606449_103606503_103608307_103608446_103609508_103609592_103609677_103609917_103613300_103613388_103613487_103613551_103627075
tx.10696	chr2	-	3034	11	ISM	ENSMUSG00000027184.15	ENSMUST00000111147.8	4069	18	21082	0	-14	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1559	junction_1	118.096104931534	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCTCATGTGTGGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103606367	103595362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_103597209_103598750_103598815_103599147_103599249_103599779_103599975_103602041_103602193_103603013_103603164_103603318_103603430_103604078_103604141_103605761_103605871_103605954_103606111_103606278
tx.10697	chr2	-	3085	12	ISM	ENSMUSG00000027184.15	ENSMUST00000111147.8	4069	18	20952	-5	-144	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1559	junction_1	138.731323663004	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATGTGTGGTTATGGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103606497	103595357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_103597209_103598750_103598815_103599147_103599249_103599779_103599975_103602041_103602193_103603013_103603164_103603318_103603430_103604078_103604141_103605761_103605871_103605954_103606111_103606278_103606366_103606449
tx.10698	chr2	-	472	3	FSM	ENSMUSG00000027184.15	ENSMUST00000145770.8	828	3	-79	435	52	-37	multi-exon	FALSE	canonical	3	1788	junction_1	55	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGTAAAAAATACTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103627397	103613300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_103613388_103613487_103613551_103627075
tx.10699	chr2	+	608	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000086687.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTGGCTTGGTCATGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103627554	103635525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_103627638_103635000
tx.107	chr1	+	2002	6	NNC	ENSMUSG00000004768.15	novel	4322	8	NA	NA	3479	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	46.44136087584	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGTGCTTTTCCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33762966	33779792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_33763087_33764014_33764101_33773782_33773940_33775880_33775968_33777368_33777462_33778333
tx.10700	chr2	+	1384	10	FSM	ENSMUSG00000027180.13	ENSMUST00000102565.4	3720	10	-26	2362	-10	-2348	multi-exon	FALSE	canonical	3	344	junction_6	33.1058907144937	328	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGTAGACATTTTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103858178	103885487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_103858312_103860688_103860779_103863940_103864105_103873248_103873364_103876002_103876208_103878278_103878325_103880615_103880701_103881478_103881602_103883709_103883826_103885180
tx.10701	chr2	+	2762	11	NIC	ENSMUSG00000027180.13	novel	4740	11	NA	NA	-7	-7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	77	junction_10	96.8347045227072	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCAACTGTATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103858181	103887842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_103858312_103860688_103860779_103863940_103864105_103873248_103873364_103876002_103876208_103878278_103878325_103880615_103880701_103881478_103881602_103883709_103883826_103885180_103885372_103886345
tx.10702	chr2	+	2792	11	FSM	ENSMUSG00000027180.13	ENSMUST00000028603.10	4740	11	113	1835	-10	-1598	multi-exon	FALSE	canonical	3	178	junction_10	68.8773547691838	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATACACAGTCTACTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103858178	103891750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_103858312_103860688_103860779_103863940_103864105_103873248_103873364_103876002_103876208_103878278_103878325_103880615_103880701_103881478_103881602_103883709_103883826_103885180_103885372_103890226
tx.10703	chr2	+	631	4	FSM	ENSMUSG00000032679.13	ENSMUST00000040423.12	1691	4	20	1040	-19	51	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_1	38.5082963644055	780	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGAGGGAGGAGTTTAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103926165	103944659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_103926273_103934515_103934595_103941084_103941190_103944319
tx.10704	chr2	+	737	5	FSM	ENSMUSG00000032679.13	ENSMUST00000153312.2	681	5	-5	-51	-5	51	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	94.0063162771524	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGAGGGAGGAGTTTAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103926179	103944659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_103926273_103928069_103928190_103934515_103934595_103941084_103941190_103944319
tx.10705	chr2	-	1564	3	NNC	ENSMUSG00000068373.16	novel	2415	11	NA	NA	39582	23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGGGGTGTGTGTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104031946	104015308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_104016253_104022779_104022910_104031456
tx.10706	chr2	+	742	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000068373.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	3.89711431702997	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTTCTTGGTCATGATA	3001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104030846	104053119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_104031169_104031298_104031363_104031614_104031755_104051497_104051618_104053023
tx.10707	chr2	+	976	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000068373.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	1.5	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATCCTGCATCCCTGCCTC	3004	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104030849	104032207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_104031169_104031298_104031363_104031614
tx.10708	chr2	-	658	3	ISM	ENSMUSG00000068373.16	ENSMUST00000156278.8	2415	11	33030	15936	33030	6743	internal_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTGTGTAGGGCAAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104038498	104031267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_104031672_104035403_104035586_104038426
tx.10709	chr2	+	1480	4	NNC	ENSMUSG00000086454.8	novel	770	3	NA	NA	-2	113	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	184	junction_1	171.663106759205	381	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTTGCTGTGTTAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104389526	104399290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_104389830_104390068_104390321_104398205_104398836_104398995
tx.10710	chr2	+	1202	4	NNC	ENSMUSG00000086454.8	novel	536	3	NA	NA	-2	113	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	101	junction_1	198.704694347052	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTTGCTGTGTTAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104389526	104399290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_104389552_104390068_104390321_104398205_104398836_104398995
tx.10711	chr2	+	1245	4	NNC	ENSMUSG00000086454.8	novel	536	3	NA	NA	-2	113	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	58	junction_1	214.187353086549	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTTGCTGTGTTAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104389526	104399290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_104389595_104390068_104390321_104398205_104398836_104398995
tx.10712	chr2	+	1720	3	NNC	ENSMUSG00000086454.8	novel	770	3	NA	NA	-2	114	intron_retention	FALSE	canonical	3	251	junction_2	163	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTTGCTGTGTTAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104389526	104399291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_104390321_104398205_104398836_104398995
tx.10713	chr2	+	1366	3	FSM	ENSMUSG00000086454.8	ENSMUST00000127350.2	536	3	-11	-819	2	116	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_1	238	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGCTGTGTTAATGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104389525	104399293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_104389552_104390068_104390321_104398205
tx.10714	chr2	+	1643	3	FSM	ENSMUSG00000086454.8	ENSMUST00000146553.8	770	3	19	-892	-2	116	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_1	196.5	206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGCTGTGTTAATGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104389526	104399293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_104389830_104390068_104390321_104398205
tx.10715	chr2	+	782	2	FSM	ENSMUSG00000027176.9	ENSMUST00000137961.2	644	2	-138	0	-43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	327	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGAGTGCTTTAGCCTTTT	6857	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104420824	104439774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_104421048_104439215
tx.10716	chr2	+	643	3	FSM	ENSMUSG00000027176.9	ENSMUST00000122900.2	2589	3	-31	1977	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	327	junction_1	20.5	299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGAGTGCTTTAGCCTTTT	6878	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104420845	104439774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_104421048_104439215_104439318_104439435
tx.10717	chr2	-	1217	7	NIC	ENSMUSG00000027173.8	novel	1801	9	NA	NA	65	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_6	54.5588367422425	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTACTCAGAATGGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104573158	104552128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_104552464_104553220_104553300_104553383_104553510_104553652_104553796_104554914_104555127_104557466_104557657_104573026
tx.10718	chr2	-	1739	9	FSM	ENSMUSG00000027173.8	ENSMUST00000028595.8	1801	9	65	-3	65	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_7	14.7394029729837	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTCAGAATGGTGTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104573158	104552125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_104552464_104553220_104553300_104553383_104553510_104553652_104553796_104554914_104555127_104557466_104557657_104558427_104558556_104560528_104560920_104573026
tx.10719	chr2	-	1185	4	ISM	ENSMUSG00000027173.8	ENSMUST00000028595.8	1801	9	34	5025	34	-4228	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_2	10.6770782520313	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAACCAACAGAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104573189	104557153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_104557657_104558427_104558556_104560528_104560920_104573026
tx.1072	chr1	+	1308	3	FSM	ENSMUSG00000026511.8	ENSMUST00000027792.6	1367	3	39	20	8	-20	multi-exon	FALSE	canonical	3	1020	junction_2	65.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTGTTGAAGTTTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181952353	181959952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_181952541_181956248_181956318_181958900
tx.10720	chr2	-	1171	6	ISM	ENSMUSG00000074994.7	ENSMUST00000117237.2	8973	12	30002	15185	30002	-15185	internal_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_1	22.5920339943087	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTGTTTTATTTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104617039	104600324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_104600526_104606516_104606735_104607663_104607798_104608481_104608599_104610279_104610606_104616864
tx.10721	chr2	-	1093	6	FSM	ENSMUSG00000027171.11	ENSMUST00000028593.11	2872	6	80	1699	80	-1699	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	3.61109401705356	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAATTCACCACAGCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104680141	104662784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_104663156_104669666_104669800_104672399_104672449_104675334_104675499_104679420_104679546_104679890
tx.10722	chr2	+	828	5	NNC	ENSMUSG00000045106.13	novel	3944	18	NA	NA	-6	-22451	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_4	22.017038856304	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTAAAAGTAAAGGTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104716662	104759461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_104716839_104737885_104738044_104745002_104745075_104757248_104757321_104759111
tx.10723	chr2	+	4064	18	FSM	ENSMUSG00000045106.13	ENSMUST00000111114.8	3944	18	10	-130	10	130	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_15	13.2482289734989	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCTTAAGTGCTGAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104716678	104830212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_104716839_104737885_104738044_104745002_104745075_104757248_104757321_104759867_104759904_104761319_104761395_104775761_104775801_104781851_104781988_104782213_104782294_104803511_104803641_104804202_104804263_104805900_104806006_104811334_104811446_104815318_104815454_104820212_104820397_104821424_104822898_104824813_104824948_104829307
tx.10724	chr2	+	2437	3	ISM	ENSMUSG00000045106.13	ENSMUST00000111114.8	3944	18	104840	-139	-1026	139	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	5.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCTGAATATTCTTTCAAA	139	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104821508	104830221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_104822898_104824813_104824948_104829307
tx.10725	chr2	-	1261	11	FSM	ENSMUSG00000027170.13	ENSMUST00000028592.12	1283	11	22	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1722	junction_10	235.400531010446	3100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGACTAATCTAGCTAATT	2662	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104847403	104830000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_104830187_104830586_104830648_104831615_104831760_104835269_104835352_104836125_104836226_104837100_104837185_104843195_104843291_104843542_104843667_104844089_104844229_104845114_104845248_104847290
tx.10726	chr2	+	320	2	FSM	ENSMUSG00000045106.13	ENSMUST00000130611.2	318	2	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTTCCTTAATGATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104847465	104848251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_104847549_104848014
tx.10727	chr2	-	1341	3	ISM	ENSMUSG00000005973.7	ENSMUST00000127019.2	2208	5	3337	-1	3337	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1666	junction_2	11	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGTGTCTTGTGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105222356	105217272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_105218372_105219321_105219522_105222314
tx.10728	chr2	-	2025	6	FSM	ENSMUSG00000005973.7	ENSMUST00000006128.7	2720	6	58	637	58	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1454	junction_3	103.827549330609	233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGTGTCTTGTGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105229606	105217272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_105218372_105219321_105219522_105222314_105222376_105223933_105224113_105225023_105225218_105229314
tx.10729	chr2	-	1581	10	FSM	ENSMUSG00000027167.12	ENSMUST00000122965.8	3048	10	55	1412	-26	-1412	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_4	20.3548762623191	377	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGTTTGCCTTAGAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105734854	105532783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_105533207_105622560_105622668_105624861_105624971_105639610_105639800_105644610_105644696_105662475_105662616_105672576_105672706_105696303_105696426_105727246_105727283_105734613
tx.1073	chr1	+	1239	2	FSM	ENSMUSG00000026511.8	ENSMUST00000111018.2	823	2	52	-468	8	-20	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTGTTGAAGTTTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181952353	181959952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_181952541_181958900
tx.10730	chr2	+	807	7	FSM	ENSMUSG00000042670.6	ENSMUST00000037499.6	955	7	14	134	14	-134	multi-exon	FALSE	canonical	3	400	junction_1	38.970073988468	3423	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATGTTTTAAATATAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105734996	105795769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_105735076_105738668_105738775_105761063_105761198_105763609_105763699_105767336_105767464_105794524_105794636_105795608
tx.10731	chr2	+	668	6	NIC	ENSMUSG00000042670.6	novel	955	7	NA	NA	19	-134	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	32	junction_2	170.067516004674	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATGTTTTAAATATAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105735001	105795769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_105735076_105738668_105738775_105763609_105763699_105767336_105767464_105794524_105794636_105795608
tx.10732	chr2	+	623	5	ISM	ENSMUSG00000042670.6	ENSMUST00000037499.6	955	7	26080	134	26080	-134	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	405	junction_4	35.6265350546471	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTATGTTTTAAATATAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105761062	105795769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_105761198_105763609_105763699_105767336_105767464_105794524_105794636_105795608
tx.10733	chr2	-	905	5	FSM	ENSMUSG00000027166.15	ENSMUST00000102555.11	1197	5	292	0	6	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	201	junction_2	6.37867541108654	1440	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAAGAGTATTCTTTATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105833602	105797053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_105797440_105800792_105800862_105811326_105811466_105832273_105832421_105833438
tx.10734	chr2	+	592	2	ISM	ENSMUSG00000016386.16	ENSMUST00000125023.2	1054	7	168832	-425	134196	254	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGACAGAAAGAAACACAAAA	1441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106695030	106697801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_106695114_106697292
tx.10735	chr2	-	1422	5	FSM	ENSMUSG00000027122.16	ENSMUST00000028536.13	3337	5	29	1886	2	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_1	43.6863823176056	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTTGTCCATTTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106804740	106794757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_106795216_106795766_106795992_106797444_106797573_106799416_106799904_106804616
tx.10736	chr2	-	1962	4	NIC	ENSMUSG00000027122.16	novel	3337	5	NA	NA	7	10	intron_retention	FALSE	canonical	3	182	junction_3	33.9247533357118	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAATTTTCTTGTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106804735	106794763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_106795992_106797444_106797573_106799416_106799904_106804616
tx.10737	chr2	-	1388	5	NNC	ENSMUSG00000027122.16	novel	3337	5	NA	NA	0	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	134	junction_4	54.0046294311886	111	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAATTTTCTTGTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106804742	106794763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_106795216_106795766_106795992_106797444_106797573_106799416_106799904_106804646
tx.10738	chr2	-	1939	4	NNC	ENSMUSG00000027122.16	novel	3337	5	NA	NA	0	10	intron_retention	FALSE	canonical	3	134	junction_3	55.0292851327566	63	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAATTTTCTTGTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106804742	106794763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_106795992_106797444_106797573_106799416_106799904_106804646
tx.10739	chr2	-	516	2	FSM	ENSMUSG00000027122.16	ENSMUST00000124598.2	2277	2	6	1755	6	-1755	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAAGCTTTGCCCCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106804736	106799507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_106799904_106804616
tx.1074	chr1	-	1833	3	FSM	ENSMUSG00000038633.6	ENSMUST00000035295.6	2048	3	20	195	20	-195	multi-exon	FALSE	canonical	3	1138	junction_1	20.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGCCTTAGTGGAATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	182110349	182103531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_182104459_182106540_182107284_182110186
tx.10740	chr2	-	475	2	NNC	ENSMUSG00000027122.16	novel	3337	5	NA	NA	7	-5399	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAGAAGAAGAAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106804735	106803151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_106803508_106804616
tx.10741	chr2	-	1893	6	FSM	ENSMUSG00000057234.10	ENSMUST00000081631.10	1894	6	-1	2	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_4	7.25534285888682	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATTTATTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109108636	108922643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_108923643_108961829_108962009_108967685_108967878_109021896_109022034_109104733_109105021_109108537
tx.10742	chr2	+	3301	17	NNC	ENSMUSG00000027115.15	novel	3369	17	NA	NA	-24	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	75	junction_16	78.8546923144083	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTTTGGTTTTCCTGTTTT	1440	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109111146	109172092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_109111239_109118141_109118512_109120023_109120182_109122409_109122515_109123315_109123427_109125283_109125482_109126964_109127142_109128419_109128495_109128681_109128795_109133147_109133311_109137194_109137360_109140891_109141014_109148219_109148456_109163600_109164013_109164665_109164774_109168911_109169018_109171502
tx.10743	chr2	+	1576	6	NNC	ENSMUSG00000027115.15	novel	3369	17	NA	NA	20311	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	149.324612840616	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGGTTTTCCTGTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109142678	109172094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_109142797_109148219_109148456_109163600_109164013_109164665_109164774_109168911_109169022_109171502
tx.10744	chr2	+	2341	2	ISM	ENSMUSG00000027162.8	ENSMUST00000151163.2	746	4	-17	2	0	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	366	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCCTTGAGAGAATCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109721197	109727081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_109721267_109724809
tx.10745	chr2	+	2591	5	FSM	ENSMUSG00000027162.8	ENSMUST00000028583.8	4228	5	7	1630	7	-1630	multi-exon	FALSE	canonical	3	354	junction_4	22.349496638627	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGCCAAATACATAGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109721204	109729718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_109721267_109724809_109724929_109725452_109725525_109726580_109726791_109727590
tx.10746	chr2	+	754	4	FSM	ENSMUSG00000027162.8	ENSMUST00000151163.2	746	4	-10	2	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	366	junction_1	18.4932420089069	338	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCCCTTGAGAGAATCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109721204	109727081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_109721267_109724809_109724929_109725452_109725525_109726580
tx.10747	chr2	+	2523	4	ISM	ENSMUSG00000027162.8	ENSMUST00000028583.8	4228	5	3611	1637	3594	-1637	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	354	junction_3	23.7907545067406	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAAAGGAGCCAAATACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109724808	109729711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_109724929_109725452_109725525_109726580_109726791_109727590
tx.10748	chr2	+	634	3	ISM	ENSMUSG00000027160.17	ENSMUST00000028580.12	2070	6	0	12882	0	-8283	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	465	junction_2	38	649	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGCAGGTAACAAAAACCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109848161	109862779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_109848560_109852226_109852360_109862676
tx.10749	chr2	+	792	4	ISM	ENSMUSG00000027160.17	ENSMUST00000028580.12	2070	6	0	4590	0	9	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	423	junction_3	48.8353241914998	362	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAGGTATTTTTAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109848161	109871071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_109848560_109852226_109852360_109862676_109862785_109870918
tx.10750	chr2	+	1602	6	FSM	ENSMUSG00000027160.17	ENSMUST00000028580.12	2070	6	0	468	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	423	junction_3	38.5455574612691	867	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTTTTGCATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109848161	109875193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_109848560_109852226_109852360_109862676_109862785_109870918_109871078_109871605_109871748_109874531
tx.10751	chr2	+	531	2	ISM	ENSMUSG00000027160.17	ENSMUST00000028580.12	2070	6	1	23301	1	-18702	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	541	junction_1	0	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACTAAACAGTGTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109848162	109852360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_109848560_109852226
tx.10752	chr2	+	465	2	FSM	ENSMUSG00000027133.4	ENSMUST00000028553.4	1109	2	41	603	41	-603	multi-exon	FALSE	canonical	3	3938	junction_1	0	14058	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCATTTTGTGTGTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112092311	112093011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_112092423_112092657
tx.10753	chr2	-	955	5	FSM	ENSMUSG00000027131.4	ENSMUST00000028551.4	983	5	20	8	13	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	778	junction_3	24.5395089600424	6209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAATGTTTCACAAGTTCC	5017	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112198352	112193363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_112193700_112194136_112194298_112194496_112194651_112197746_112197862_112198163
tx.10754	chr2	+	2874	10	FSM	ENSMUSG00000027132.4	ENSMUST00000028552.4	2886	10	12	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	424	junction_7	47.4201082523719	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTGGTGTGCATAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112209567	112244585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_112209703_112234505_112234622_112235102_112235144_112236418_112236699_112237930_112238050_112238727_112238779_112238868_112238959_112239485_112239576_112240487_112240582_112242727
tx.10755	chr2	+	1112	10	NNC	ENSMUSG00000027132.4	novel	2886	10	NA	NA	-1	-2804	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_9	161.88984213858	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATGTGTATAGTGCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112209569	112241781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_112209703_112234505_112234622_112235102_112235144_112236418_112236699_112237930_112238050_112238727_112238779_112238868_112238959_112239485_112239576_112240487_112240582_112241683
tx.10756	chr2	+	1743	4	FSM	ENSMUSG00000027132.4	ENSMUST00000151257.2	1734	4	-3	-6	-3	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	500	junction_1	36.4264860903284	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGTTGTGTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112209567	112237869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_112209703_112234505_112234622_112235102_112235144_112236418
tx.10757	chr2	+	2750	9	NIC	ENSMUSG00000027132.4	novel	2886	10	NA	NA	2	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	7	junction_4	170.123806020792	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTGGTGTGCATAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112209572	112244585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_112209703_112234505_112234622_112235102_112235144_112236418_112236699_112238727_112238779_112238868_112238959_112239485_112239576_112240487_112240582_112242727
tx.10758	chr2	+	1066	5	FSM	ENSMUSG00000055943.6	ENSMUST00000069747.6	5826	5	35	4725	35	-4725	multi-exon	FALSE	canonical	3	432	junction_1	48.4355241532493	3787	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAAGATTATCTTCTGTTT	395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112285376	112297782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_112285646_112289804_112289925_112293145_112293285_112295081_112295163_112297325
tx.10759	chr2	+	903	5	NNC	ENSMUSG00000055943.6	novel	5826	5	NA	NA	37	-4725	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	77	junction_1	188.575415948103	522	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAAGATTATCTTCTGTTT	397	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112285378	112297782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_112285485_112289804_112289925_112293145_112293285_112295081_112295163_112297325
tx.10760	chr2	+	1226	6	FSM	ENSMUSG00000003604.15	ENSMUST00000003705.12	4735	6	189	3320	189	342	multi-exon	FALSE	canonical	3	555	junction_4	26.4227174983952	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGATGTTTCCTTTCTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112323497	112461598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_112323567_112344794_112344973_112455499_112455571_112458093_112458190_112460084_112460422_112461123
tx.10761	chr2	+	1406	6	NNC	ENSMUSG00000003604.15	novel	4735	6	NA	NA	377	342	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_1	226.791181486406	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGATGTTTCCTTTCTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112323685	112461598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_112323935_112344794_112344973_112455499_112455571_112458093_112458190_112460084_112460422_112461123
tx.10762	chr2	-	1695	2	FSM	ENSMUSG00000087545.2	ENSMUST00000148420.2	832	2	42	-905	42	905	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113272607	113270120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_113271473_113272264
tx.10763	chr2	-	368	2	NNC	ENSMUSG00000087106.2	novel	734	3	NA	NA	-20530	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGTTCTTCTTCAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113354909	113331017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_113331271_113354794
tx.10764	chr2	-	5050	12	FSM	ENSMUSG00000041219.15	ENSMUST00000102545.8	4958	12	-38	-54	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	279	junction_2	47.4803134497789	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCTTGTCTGCGTGTTGTA	5979	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113679039	113661836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_113664808_113665122_113665262_113667210_113667317_113667770_113667898_113670019_113670188_113671043_113671119_113671941_113672086_113672251_113672416_113673030_113673285_113673591_113673689_113675599_113675671_113678305
tx.10765	chr2	-	849	3	ISM	ENSMUSG00000040383.17	ENSMUST00000043160.13	4888	35	69363	2	13211	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	302	junction_1	6	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTAAGGCATACTTGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113936457	113931652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_113932211_113934484_113934599_113936280
tx.10766	chr2	-	1282	6	ISM	ENSMUSG00000040383.17	ENSMUST00000043160.13	4888	35	62680	2	6528	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	279	junction_5	12.6237870704476	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTAAGGCATACTTGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113943140	113931652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_113932211_113934484_113934599_113936280_113936456_113938584_113938671_113940364_113940536_113942962
tx.10767	chr2	-	1069	8	NNC	ENSMUSG00000040383.17	novel	3112	9	NA	NA	16	-2012	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	93.8902963841421	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCGTTAGTAAATGTTTGT	7826	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114005803	113985235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_113985523_113986727_113986829_113988020_113988090_113989350_113989492_113992044_113992166_114000486_114000549_114003171_114003229_114005572
tx.10768	chr2	-	1093	9	FSM	ENSMUSG00000040383.17	ENSMUST00000131785.8	3112	9	5	2014	5	-2014	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_1	25.6307920283397	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTCGTTAGTAAATGTTT	7815	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114005814	113985237	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_113985523_113986727_113986829_113988020_113988090_113989350_113989492_113992044_113992166_113996673_113996710_114000507_114000549_114003171_114003229_114005572
tx.10769	chr2	-	1561	5	ISM	ENSMUSG00000040383.17	ENSMUST00000129504.8	914	6	3	1903	3	-1903	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	261	junction_2	16.9558249578132	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGAATTGTCAGGAGTACT	7813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114005816	113990982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_113992166_113996673_113996710_114000507_114000549_114003171_114003229_114005572
tx.10770	chr2	-	1462	3	NNC	ENSMUSG00000040321.4	novel	4300	2	NA	NA	8	2200	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCTGGCTTTGCCATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114031913	114026840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_114028109_114031435_114031534_114031817
tx.10771	chr2	-	1364	2	FSM	ENSMUSG00000040321.4	ENSMUST00000050668.4	4300	2	37	2899	8	2200	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCTGGCTTTGCCATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114031913	114026840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_114028109_114031817
tx.10772	chr2	-	266	2	FSM	ENSMUSG00000040321.4	ENSMUST00000123562.2	2597	2	0	2331	0	-2331	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAGAAAGAGGCGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114031921	114031371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_114031534_114031817
tx.10773	chr2	-	795	6	ISM	ENSMUSG00000057147.14	ENSMUST00000102542.10	2734	9	85421	1509	-23652	216	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_3	21.0009523593574	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTGTGCGCGCGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114400024	114348409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_114348774_114350192_114350281_114353524_114353620_114366005_114366068_114398400_114398520_114399957
tx.10774	chr2	-	1189	9	FSM	ENSMUSG00000057147.14	ENSMUST00000102542.10	2734	9	36	1509	-23	216	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_3	18.9670767383907	296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTGTGCGCGCGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114485409	114348409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_114348774_114350192_114350281_114353524_114353620_114366005_114366068_114398400_114398520_114399957_114400032_114475201_114475396_114478221_114478317_114485311
tx.10775	chr2	-	895	8	ISM	ENSMUSG00000057147.14	ENSMUST00000102542.10	2734	9	7126	1708	7049	17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_3	18.6831802563106	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCTCTGATATTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114478319	114348608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_114348774_114350192_114350281_114353524_114353620_114366005_114366068_114398400_114398520_114399957_114400032_114475201_114475396_114478221
tx.10776	chr2	+	2675	12	NNC	ENSMUSG00000040282.14	novel	2735	11	NA	NA	-29	-173	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	26	junction_1	114.47061046905	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTACCAGTTTGGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115412167	115609076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_115412467_115434044_115434112_115461485_115461532_115462416_115462482_115469484_115469546_115473144_115473218_115500062_115500143_115500489_115500540_115505206_115505275_115516865_115516932_115517544_115517651_115607382
tx.10777	chr2	+	2595	11	FSM	ENSMUSG00000040282.14	ENSMUST00000110918.3	2735	11	-39	179	-22	-179	multi-exon	FALSE	canonical	3	283	junction_9	22.3015694514983	215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCTAAGTTACCAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115412174	115609070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_115412467_115461485_115461532_115462416_115462482_115469484_115469546_115473144_115473218_115500062_115500143_115500489_115500540_115505206_115505275_115516865_115516932_115517544_115517651_115607382
tx.10778	chr2	+	2598	11	FSM	ENSMUSG00000040282.14	ENSMUST00000166472.8	2770	11	-7	179	-7	-179	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_9	96.2369991219593	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCTAAGTTACCAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115412189	115609070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_115412467_115461485_115461532_115462416_115462482_115469484_115469546_115473144_115473218_115500062_115500143_115500489_115500540_115505206_115505275_115516865_115516932_115517526_115517651_115607382
tx.10779	chr2	-	526	2	NNC	ENSMUSG00000086328.2	novel	721	2	NA	NA	295	24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCCCTGTGGCTTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115897630	115896674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_115897100_115897529
tx.10780	chr2	+	438	4	ISM	ENSMUSG00000027349.6	ENSMUST00000028825.5	1861	8	-4	11313	-4	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_2	0.471404520791032	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATTCTCAGTTAGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117080215	117090708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_117080320_117088114_117088261_117089701_117089837_117090655
tx.10781	chr2	+	697	3	Intergenic	novelGene_806	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTTTGGGATATGGCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117539513	117589010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_117539652_117541128_117541243_117588565
tx.10782	chr2	-	1066	6	FSM	ENSMUSG00000027344.15	ENSMUST00000028820.7	1025	6	-40	-1	-30	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.68328157299975	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTCGGTTTTGTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118087477	118075143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_118075447_118078775_118078873_118080286_118080442_118082119_118082301_118083766_118083900_118087280
tx.10783	chr2	-	759	5	FSM	ENSMUSG00000009549.15	ENSMUST00000009693.15	798	5	40	-1	-23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1430	junction_1	23.7421039505769	8340	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTGGTTTGTTTTTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118310152	118306329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_118306789_118307307_118307341_118309401_118309515_118309858_118309932_118310071
tx.10784	chr2	+	596	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000009549.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTGTGTTTAAGAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118306330	118309512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_118306811_118309396
tx.10785	chr2	-	1621	2	Intergenic	novelGene_807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGCTCACTGCCTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118418265	118416486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_118418029_118418186
tx.10786	chr2	+	3631	23	FSM	ENSMUSG00000040084.10	ENSMUST00000038341.8	3668	23	37	0	37	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	422	junction_10	74.3091181573454	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGTTGCTGGCAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118428728	118472072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_118428943_118430618_118430766_118435894_118435955_118437024_118437170_118440263_118440461_118443055_118443223_118445411_118445627_118445924_118446017_118448186_118448417_118452615_118452729_118453550_118453667_118454761_118454812_118456503_118456562_118457333_118457443_118460383_118460647_118461425_118461560_118462239_118462381_118462891_118462993_118465608_118465759_118467180_118467324_118468881_118469057_118470113_118470221_118471568
tx.10787	chr2	+	1352	9	FSM	ENSMUSG00000027331.16	ENSMUST00000134661.8	4602	9	201	3049	-28	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	391	junction_3	12.8038080273019	1031	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCTGACTAACACTAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118644684	118665128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_118644791_118644881_118644974_118648344_118648472_118649315_118649364_118653900_118654007_118654173_118654268_118659439_118659496_118662033_118662109_118664480
tx.10788	chr2	+	2071	12	FSM	ENSMUSG00000027332.12	ENSMUST00000028807.6	3665	12	40	1554	-34	340	multi-exon	FALSE	canonical	3	194	junction_8	15.0382432594562	273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGCGCCCAAAGCCGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118692474	118711836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_118692649_118699915_118700006_118700211_118700264_118701858_118702029_118703365_118703460_118703648_118703786_118705145_118705243_118706796_118706891_118707368_118707451_118708141_118708247_118708355_118708429_118710933
tx.10789	chr2	-	1478	4	FSM	ENSMUSG00000039983.14	ENSMUST00000036470.14	1870	4	11	381	-5	-381	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_3	9.0921211313239	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGTGTAGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118859863	118848640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_118849646_118852549_118852707_118857618_118857869_118859797
tx.10790	chr2	-	1322	3	NIC	ENSMUSG00000039983.14	novel	1870	4	NA	NA	-7	-382	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_1	14.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAACTGTGTAGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118859865	118848641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_118849646_118857618_118857869_118859797
tx.10791	chr2	-	811	3	FSM	ENSMUSG00000039983.14	ENSMUST00000110833.2	732	3	-5	-74	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	11	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATTTGTTAAGCATCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118859863	118852211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_118852707_118857618_118857869_118859797
tx.10792	chr2	+	2079	3	FSM	ENSMUSG00000027324.2	ENSMUST00000028796.2	2706	3	28	599	28	-599	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_2	2.5	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTTGCTTTTTTTTTTTT	3283	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118865298	118869651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_118865950_118867398_118867696_118868520
tx.10793	chr2	+	1975	10	FSM	ENSMUSG00000027323.11	ENSMUST00000028795.10	3368	10	21	1372	11	710	multi-exon	FALSE	canonical	3	651	junction_5	89.2808026867762	2365	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTATCTTTCCTGTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118943308	118966399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_118943516_118946792_118946882_118949088_118949227_118951906_118952025_118954264_118954357_118957543_118957639_118961984_118962099_118964554_118964685_118964867_118964990_118965529
tx.10794	chr2	+	1182	4	ISM	ENSMUSG00000027323.11	ENSMUST00000028795.10	3368	10	18750	1373	39	709	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	676	junction_2	62.7587975240656	1078	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGTATCTTTCCTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118962037	118966398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_118962099_118964554_118964685_118964867_118964990_118965529
tx.10795	chr2	-	2178	13	FSM	ENSMUSG00000070730.12	ENSMUST00000094695.12	2249	13	72	-1	2	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	215	junction_12	29.1989107483291	226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTTTGACTGTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118987443	118967480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_118968234_118968827_118968909_118969519_118969574_118969832_118969932_118970524_118970603_118970740_118970817_118973108_118973170_118976818_118976922_118977789_118978076_118983856_118984001_118984370_118984564_118986838_118987033_118987387
tx.10796	chr2	-	2157	13	NNC	ENSMUSG00000070730.12	novel	2249	13	NA	NA	-1	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_11	78.0777746153724	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTTTGACTGTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118987446	118967480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_118968234_118968827_118968909_118969519_118969574_118969832_118969932_118970524_118970603_118970740_118970817_118973108_118973170_118976818_118976922_118977789_118978076_118983856_118984001_118984370_118984540_118986838_118987033_118987387
tx.10797	chr2	+	637	3	FSM	ENSMUSG00000046814.4	ENSMUST00000057454.4	645	3	-5	13	-5	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	2.5	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTGTTCCTCAGTTCTGT	1203	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118998248	119002858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_118998355_119000156_119000252_119002422
tx.10798	chr2	-	1008	11	FSM	ENSMUSG00000034278.4	ENSMUST00000038439.4	1008	11	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_10	69.3010822426317	1555	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTACTTTTCTTCCTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119039276	119002980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_119003167_119009832_119009944_119010365_119010447_119010967_119011046_119011406_119011451_119014079_119014177_119014397_119014484_119016176_119016265_119016509_119016569_119016826_119016897_119039168
tx.10799	chr2	+	1652	11	NNC	ENSMUSG00000068580.12	novel	2008	11	NA	NA	-19	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.466752224391	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCAGATGTTTTTTCTGT	270	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119039473	119047529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_119039669_119040962_119041085_119041261_119041313_119041661_119041781_119041878_119042025_119042386_119042496_119045314_119045522_119045934_119046009_119046689_119046789_119046912_119047023_119047109
tx.108	chr1	-	807	2	NNC	ENSMUSG00000042215.9	novel	1860	3	NA	NA	2385	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTAGCATTGGCCATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33785415	33784564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_33785227_33785270
tx.10800	chr2	+	1657	11	NNC	ENSMUSG00000068580.12	novel	2008	11	NA	NA	-19	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	41.3816384402551	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGATGTTTTTTCTGTCC	270	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119039473	119047531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_119039669_119040962_119041085_119041261_119041313_119041661_119041781_119041878_119042025_119042386_119042496_119045311_119045522_119045934_119046009_119046689_119046789_119046912_119047023_119047109
tx.10801	chr2	-	788	4	FSM	ENSMUSG00000027317.9	ENSMUST00000076084.6	787	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	4.96655480858378	444	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGGGAGTGTGGTGTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119060388	119048599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_119048905_119049106_119049140_119049244_119049329_119060022
tx.10802	chr2	+	2141	10	FSM	ENSMUSG00000027315.14	ENSMUST00000110817.3	2323	10	169	13	169	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	281	junction_4	16.649620912898	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTGTGTTTGTTGAGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119068202	119079995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119068725_119075635_119075764_119075990_119076130_119076217_119076389_119076540_119076568_119076839_119076966_119077077_119077129_119078491_119078663_119078836_119078885_119079237
tx.10803	chr2	-	1404	2	ISM	ENSMUSG00000034226.8	ENSMUST00000037360.8	1703	3	479	-5	479	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTGGTCTCCTGGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119101274	119099676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_119100969_119101162
tx.10804	chr2	-	1662	3	FSM	ENSMUSG00000034226.8	ENSMUST00000037360.8	1703	3	41	0	41	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGCTGTCTGTGGTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119101712	119099681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_119100969_119101162_119101222_119101396
tx.10805	chr2	-	1739	4	NNC	ENSMUSG00000034226.8	novel	1703	3	NA	NA	-6726	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	29	junction_3	7.54247233265651	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGCTGTCTGTGGTCTCCT	4279	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119108479	119099681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_119100969_119101162_119101222_119101396_119101722_119108411
tx.10806	chr2	+	1548	2	ISM	ENSMUSG00000034216.13	ENSMUST00000151500.2	3914	5	5870	18	5870	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAATTAAATTAAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119125137	119128789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_119125271_119127374
tx.10807	chr2	+	1506	2	NNC	ENSMUSG00000027313.4	novel	1637	3	NA	NA	61	-60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAATATGGTTTGTCTCTG	7213	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119181770	119184802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_119182144_119183669
tx.10808	chr2	+	1518	3	FSM	ENSMUSG00000027313.4	ENSMUST00000028780.4	1637	3	61	58	61	-58	multi-exon	FALSE	canonical	3	568	junction_2	33	844	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATATGGTTTGTCTCTGTA	7213	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119181770	119184804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119182118_119182837_119182874_119183669
tx.10809	chr2	-	709	5	ISM	ENSMUSG00000034154.16	ENSMUST00000110808.2	3928	28	19345	48621	-18588	-18036	internal_fragment	TRUE	canonical	3	21	junction_4	4.55521678957215	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTATATTTATTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119288749	119281810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_119281932_119284536_119284699_119286865_119286934_119287052_119287223_119288561
tx.10810	chr2	+	2583	7	FSM	ENSMUSG00000014077.14	ENSMUST00000014221.13	2609	7	23	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_2	25.1197133741609	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTTGGTTGAGTTTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119378200	119417505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119378399_119391211_119391285_119397130_119397212_119402248_119402377_119411175_119411238_119415010_119415134_119415587
tx.10811	chr2	+	961	3	FSM	ENSMUSG00000085438.2	ENSMUST00000153581.2	8300	3	22	7317	22	-561	multi-exon	FALSE	canonical	3	345	junction_2	41.5	1618	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTCTCTTGGAGAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119424805	119430666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119424916_119426739_119426993_119430068
tx.10812	chr2	+	1402	2	ISM	ENSMUSG00000085438.2	ENSMUST00000147425.2	1381	3	32	3192	26	-3192	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	428	junction_1	0	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATCGAAGAAAAAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119424809	119428035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_119424916_119426739
tx.10813	chr2	+	836	3	FSM	ENSMUSG00000085438.2	ENSMUST00000147425.2	1381	3	32	513	26	-513	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_2	178.5	450	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTAATAGTCTTAAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119424809	119430714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119424916_119426739_119426824_119430068
tx.10814	chr2	-	1462	5	NIC	ENSMUSG00000072980.4	novel	1082	6	NA	NA	-29	15	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	58	junction_3	272.52247613729	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTGTATCTTTTGCTGG	7451	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119448979	119439977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_119440846_119442232_119442337_119443492_119443575_119448334_119448402_119448638
tx.10815	chr2	-	1585	6	FSM	ENSMUSG00000072980.4	ENSMUST00000123818.2	1082	6	-29	-474	-29	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	618	junction_4	35.3870032639103	595	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTGTATCTTTTGCTGG	7451	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119448979	119439977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_119440846_119442232_119442337_119443492_119443575_119446012_119446136_119448334_119448402_119448638
tx.10816	chr2	+	955	4	ISM	ENSMUSG00000027306.16	ENSMUST00000068225.15	2960	11	428	19255	-3	400	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	927	junction_3	183.430883138279	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGACTCTGGGTACCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119449206	119461386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_119449377_119454598_119454668_119458027_119458175_119460817
tx.10817	chr2	+	2148	11	FSM	ENSMUSG00000027306.16	ENSMUST00000068225.15	2960	11	431	381	0	-381	multi-exon	FALSE	canonical	3	927	junction_3	141.2501327433	1229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCATTGTTTTAAGCGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119449209	119480260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119449377_119454598_119454668_119458027_119458175_119460817_119460987_119464200_119464300_119465958_119466069_119468928_119469045_119470057_119470216_119474264_119474382_119477570_119477680_119479373
tx.10818	chr2	+	2049	10	FSM	ENSMUSG00000027306.16	ENSMUST00000028771.8	3526	10	12	1465	0	-381	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_4	379.300265433633	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCATTGTTTTAAGCGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119449209	119480260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119449377_119454598_119454668_119458027_119458175_119460817_119460987_119465958_119466069_119468928_119469045_119470057_119470216_119474264_119474382_119477570_119477680_119479373
tx.10819	chr2	-	1268	4	ISM	ENSMUSG00000027305.10	ENSMUST00000028768.2	1451	5	2137	-5	2137	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	302	junction_2	10.9848380355227	232	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCAGCCTTTTTCTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119491142	119485926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_119486274_119486848_119486924_119488754_119488941_119490482
tx.10820	chr2	-	1486	5	NIC	ENSMUSG00000027305.10	novel	1478	5	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	11	junction_4	131.115407180087	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCAGCCTTTTTCTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119493293	119485926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_119486274_119486848_119486924_119488754_119488941_119490482_119491141_119493073
tx.10821	chr2	-	1479	5	FSM	ENSMUSG00000027305.10	ENSMUST00000110801.8	1478	5	-1	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_4	75.083287088406	590	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCAGCCTTTTTCTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119493302	119485926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_119486274_119486848_119486924_119488754_119488941_119490482_119491141_119493089
tx.10822	chr2	-	1314	5	FSM	ENSMUSG00000027305.10	ENSMUST00000110802.8	1308	5	-6	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_4	88.8453712919249	749	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCAGCCTTTTTCTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119493308	119485926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_119486274_119486848_119486924_119488754_119488941_119490482_119491141_119493260
tx.10823	chr2	+	706	5	ISM	ENSMUSG00000027304.10	ENSMUST00000028767.9	4664	18	29	24385	25	-1440	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_4	18.907670401189	738	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGCAGGAAGAAGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119505577	119541503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_119505762_119522596_119522708_119531598_119531747_119535919_119536125_119541445
tx.10824	chr2	+	1296	6	ISM	ENSMUSG00000027296.8	ENSMUST00000028758.8	1818	7	6850	0	6850	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_3	8.97997772825746	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGCCTCCTCCCCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119579667	119581744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_119579768_119579842_119580060_119580153_119580359_119580574_119580677_119580957_119581030_119581144
tx.10825	chr2	+	1072	5	ISM	ENSMUSG00000027296.8	ENSMUST00000028758.8	1818	7	7149	0	7149	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_2	8.48528137423857	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGCCTCCTCCCCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119579966	119581744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_119580060_119580153_119580359_119580574_119580677_119580957_119581030_119581144
tx.10826	chr2	-	1256	6	NIC	ENSMUSG00000034032.16	novel	4714	23	NA	NA	2	33	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_4	181.465148169008	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGGCTCAGAAATGTAAG	489	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119617993	119608098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_119608820_119610536_119610658_119613126_119613217_119613563_119613713_119617701_119617779_119617895
tx.10827	chr2	-	1417	6	FSM	ENSMUSG00000034032.16	ENSMUST00000156506.8	1385	6	-5	-27	0	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_5	119.666870937616	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGTGAGGCTCAGAAA	482	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119618000	119608104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_119608820_119610536_119610658_119613126_119613217_119613563_119613713_119614214_119614452_119617895
tx.10828	chr2	+	3733	19	FSM	ENSMUSG00000027298.18	ENSMUST00000028763.10	3989	19	256	0	256	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	227	junction_12	19.4854329889133	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTGTTTTGTTTTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119630250	119648585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119630365_119632028_119632213_119632759_119632861_119633720_119633892_119635248_119635336_119636095_119636212_119638315_119638494_119639213_119639360_119639883_119640029_119640385_119640516_119640597_119640699_119640958_119641055_119641341_119641423_119642078_119642172_119642540_119642663_119643025_119643136_119643283_119643444_119643643_119643781_119647124
tx.10829	chr2	+	782	2	Intergenic	novelGene_809	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTATAAATTTAAGTCTTC	5758	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119680836	119685389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_119680961_119684731
tx.10830	chr2	+	1368	2	NNC	ENSMUSG00000033943.16	novel	11982	25	NA	NA	-24669	-14302	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	67	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAATGTAAAACAAGACTTT	7983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119703039	119734129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_119703365_119733086
tx.10831	chr2	+	841	2	ISM	ENSMUSG00000033943.16	ENSMUST00000141776.8	2763	3	3	14616	3	-14616	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGTTCATACTTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119727715	119733815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_119727828_119733086
tx.10832	chr2	+	1189	6	NIC	ENSMUSG00000098789.8	novel	1373	8	NA	NA	-10	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_4	57.5902769571392	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACACTTGTTCTCATGTTCC	NA	False	NA	133	True	NA	NA	NA	119857974	119863075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_119858058_119860538_119860693_119860769_119861024_119861296_119861354_119862321_119862482_119862594
tx.10833	chr2	+	1362	8	FSM	ENSMUSG00000098789.8	ENSMUST00000044675.5	1373	8	11	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_5	32.3128836376389	378	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACACTTGTTCTCATGTTCC	NA	False	NA	133	True	NA	NA	NA	119857974	119863075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119858058_119860538_119860693_119860769_119861024_119861296_119861354_119861787_119861884_119862055_119862133_119862321_119862482_119862594
tx.10834	chr2	+	1285	7	NIC	ENSMUSG00000098789.8	novel	1373	8	NA	NA	-10	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	17	junction_5	49.2084568161025	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACACTTGTTCTCATGTTCC	NA	False	NA	133	True	NA	NA	NA	119857974	119863075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_119858058_119860538_119860693_119860769_119861024_119861296_119861354_119861787_119861884_119862321_119862482_119862594
tx.10835	chr2	+	1266	7	NIC	ENSMUSG00000098789.8	novel	1373	8	NA	NA	-10	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	16	junction_4	49.0736408087093	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACACTTGTTCTCATGTTCC	NA	False	NA	133	True	NA	NA	NA	119857974	119863075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_119858058_119860538_119860693_119860769_119861024_119861296_119861354_119862055_119862133_119862321_119862482_119862594
tx.10836	chr2	-	1235	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033852.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACACCCCACACCCTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119863075	119861726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_119862479_119862592
tx.10837	chr2	-	3397	6	FSM	ENSMUSG00000027293.14	ENSMUST00000028755.8	3730	6	21	312	21	-312	multi-exon	FALSE	canonical	3	216	junction_2	18.4217263034711	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTCGTGAGTCTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119985066	119919967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_119922166_119927443_119927609_119932500_119932914_119958072_119958171_119967379_119967557_119984720
tx.10838	chr2	-	1426	5	NIC	ENSMUSG00000046971.8	novel	3116	20	NA	NA	8932	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_4	4.76313972081441	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTGTCACTGAGCCTGT	3680	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120133926	120130446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_120131110_120131377_120131565_120132677_120132845_120133207_120133424_120133733
tx.10839	chr2	-	1611	5	ISM	ENSMUSG00000046971.8	ENSMUST00000142183.2	2610	15	8933	9	8933	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_2	2.54950975679639	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTGTCACTGAGCCTGT	3681	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120133925	120130446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120131110_120131377_120131565_120132677_120132845_120133207_120133424_120133547
tx.1084	chr1	+	2152	10	FSM	ENSMUSG00000042901.11	ENSMUST00000109166.8	4279	10	262	1865	-16	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_8	45.1526901978029	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGGATGGTTGTTACACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	183078854	183104466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_183079173_183085612_183085683_183087358_183087413_183087819_183087875_183094595_183094660_183094913_183095018_183097514_183097638_183099746_183099870_183103138_183103257_183103343
tx.10840	chr2	-	1533	6	ISM	ENSMUSG00000046971.8	ENSMUST00000054651.8	3116	20	10721	0	8933	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_5	3.9293765408777	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTGTCACTGAGCCTGT	3681	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120133925	120130446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120131110_120131377_120131565_120132677_120132845_120133207_120133424_120133547_120133656_120133733
tx.10841	chr2	-	463	5	ISM	ENSMUSG00000027291.16	ENSMUST00000147085.8	3379	18	-16	22287	0	-888	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_2	26.8979553126255	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCTGTGACCTCCAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120183606	120174622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120174701_120176098_120176142_120176808_120176874_120180644_120180711_120183395
tx.10842	chr2	-	508	4	ISM	ENSMUSG00000027291.16	ENSMUST00000147085.8	3379	18	-12	23636	0	-2237	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_1	27.0102861065105	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTTCTTCAAATTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120183602	120175971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120176142_120176808_120176874_120180644_120180711_120183395
tx.10843	chr2	-	1615	7	ISM	ENSMUSG00000033808.17	ENSMUST00000090042.12	2874	20	33566	0	33566	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	394	junction_3	25.8306450214125	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTGTCTCTCTCATTTAT	6246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120200984	120185792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120187020_120190014_120190046_120190519_120190576_120193359_120193422_120193842_120193917_120199724_120199829_120200923
tx.10844	chr2	+	1507	6	NNC	ENSMUSG00000062646.13	novel	3099	5	NA	NA	-78	-662	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.03324125159934	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TCATAATGTGGAAATAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120234603	120253478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_120234751_120235453_120235541_120236746_120236810_120241915_120242025_120249838_120249967_120252505
tx.10845	chr2	+	1612	5	FSM	ENSMUSG00000062646.13	ENSMUST00000154574.8	3099	5	265	1222	-40	-1222	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	3.77491721763537	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAGCTGAAGAATGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120234641	120252918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_120235541_120236746_120236810_120241915_120242025_120249838_120249967_120252505
tx.10846	chr2	+	481	2	ISM	ENSMUSG00000079110.13	ENSMUST00000141181.9	1367	9	2884	-1	2810	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCATTCTCCTTATTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120334593	120335392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_120334636_120334953
tx.10847	chr2	-	3679	5	ISM	ENSMUSG00000027288.17	ENSMUST00000171215.8	6391	19	25648	-2789	-1347	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1064	junction_1	77.8568397766054	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCATTTTGTTATTTGTCT	8425	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120344693	120337305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120340624_120340967_120341115_120343183_120343256_120344097_120344170_120344623
tx.10848	chr2	-	1564	5	ISM	ENSMUSG00000027288.17	ENSMUST00000055241.13	9085	22	0	27762	0	705	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	681	junction_1	204.702680734767	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCCTTCCACTTCCAACCC	9821	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120394288	120365062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120366161_120369775_120369974_120376323_120376386_120385711_120385797_120394167
tx.10849	chr2	+	1992	8	FSM	ENSMUSG00000027287.15	ENSMUST00000028743.10	2658	8	-3	669	-3	-669	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	118.449334729914	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAGAAAGCTGTATTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120398168	120431067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_120398243_120414749_120414847_120415631_120415674_120416036_120416086_120416639_120416758_120425281_120425438_120427123_120427269_120429756
tx.10850	chr2	+	576	6	NNC	ENSMUSG00000027287.15	novel	2730	9	NA	NA	0	4367	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_5	144.558638621149	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTTTCTGGTTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120398177	120421115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_120398288_120414749_120414847_120415631_120415674_120416036_120416086_120416639_120416758_120420955
tx.10851	chr2	+	2030	8	FSM	ENSMUSG00000027287.15	ENSMUST00000110711.9	2723	8	24	669	-2	-669	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_4	7.72221814385119	957	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAGAAAGCTGTATTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120398175	120431067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_120398288_120414749_120414847_120415631_120415674_120416036_120416086_120416639_120416758_120425281_120425438_120427123_120427269_120429756
tx.10852	chr2	+	1572	3	ISM	ENSMUSG00000027287.15	ENSMUST00000116437.8	2730	9	27141	672	4324	-672	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	374	junction_2	11.5	195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCAATAGAAAGCTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120425318	120431064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_120425438_120427123_120427269_120429756
tx.10853	chr2	-	1949	6	FSM	ENSMUSG00000027286.17	ENSMUST00000102497.10	1962	6	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_5	44.5394207416307	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTCTGGAAGTAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120439823	120434718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_120435740_120436428_120436615_120438279_120438549_120439153_120439293_120439398_120439505_120439595
tx.10854	chr2	-	1799	6	FSM	ENSMUSG00000027286.17	ENSMUST00000102499.8	1961	6	162	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_5	57.8321709777525	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTCTGGAAGTAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120439839	120434718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_120435740_120436428_120436615_120438279_120438549_120439153_120439293_120439398_120439505_120439761
tx.10855	chr2	-	1808	6	NIC	ENSMUSG00000027286.17	novel	1962	6	NA	NA	-5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_5	69.0582362937253	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTCTGGAAGTAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120439841	120434718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_120435740_120436428_120436615_120438279_120438549_120439153_120439293_120439398_120439505_120439754
tx.10856	chr2	-	1951	6	NNC	ENSMUSG00000027286.17	novel	1962	6	NA	NA	-3	43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	69.0582362937253	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCTCCATGGAGATCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120439799	120434675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_120435740_120436428_120436615_120438279_120438549_120439153_120439293_120439398_120439505_120439612
tx.10857	chr2	+	1372	6	FSM	ENSMUSG00000027285.14	ENSMUST00000124187.8	3154	6	32	1750	32	-96	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_2	54.4147038951789	1099	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTAACTATATGCATGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120439895	120450291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_120440027_120442818_120442912_120443531_120443602_120446335_120446469_120448353_120448463_120449455
tx.10858	chr2	+	1302	5	FSM	ENSMUSG00000027285.14	ENSMUST00000028741.14	1430	5	32	96	32	-96	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	111.162887242101	249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTAACTATATGCATGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120439895	120450291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_120440027_120442818_120442912_120446335_120446469_120448353_120448463_120449455
tx.10859	chr2	+	1248	7	ISM	ENSMUSG00000033705.18	ENSMUST00000180041.9	15004	32	-19	47199	-19	-9621	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.46249406456535	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTCCTGGGACATGTAGG	8680	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120459582	120499163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_120459752_120461903_120461974_120464653_120464771_120495360_120495478_120496853_120496887_120496974_120497037_120498483
tx.10860	chr2	-	844	7	ISM	ENSMUSG00000027272.6	ENSMUST00000028728.6	7768	47	95224	2322	-3965	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_2	6.80685928555405	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAGAGAACTTTCTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120705972	120693071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120693273_120694798_120694901_120696870_120697042_120698706_120698785_120701469_120701527_120703604_120703714_120705846
tx.10861	chr2	-	1727	12	ISM	ENSMUSG00000027272.6	ENSMUST00000028728.6	7768	47	46	80477	23	4712	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_8	6.58447962262975	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGCAGTTTTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120801150	120771226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120771606_120772957_120773057_120775131_120775221_120776314_120776423_120776754_120776879_120777102_120777166_120778238_120778378_120780520_120780652_120786090_120786202_120791565_120791645_120793844_120794102_120801002
tx.10862	chr2	-	713	5	ISM	ENSMUSG00000027272.6	ENSMUST00000133408.2	1480	9	-70	4609	9	-4609	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_1	9.02773504263389	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAATTGCCTCCTGAACTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120801164	120780547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120780652_120786090_120786202_120791565_120791645_120793844_120794102_120801002
tx.10863	chr2	+	1516	11	FSM	ENSMUSG00000023572.17	ENSMUST00000060455.15	1569	11	41	12	-4	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_6	15.0811140172071	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAATGTGTCATTTAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120838924	120847373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_120839091_120839198_120839259_120839523_120839604_120840307_120840390_120841914_120842012_120842163_120842238_120842833_120842911_120843179_120843458_120844438_120844500_120846611_120846659_120846879
tx.10864	chr2	+	2540	11	FSM	ENSMUSG00000027259.16	ENSMUST00000119031.8	2477	11	-63	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	26.5369553641709	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGCTTGAATTGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120970915	120987159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_120971091_120972573_120972785_120973004_120973136_120973629_120973691_120976513_120976602_120978721_120978804_120980700_120980828_120981611_120981693_120982910_120983050_120985199_120985301_120985815
tx.10865	chr2	+	2593	11	NIC	ENSMUSG00000027259.16	novel	2477	11	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	76	junction_1	16.3572613844739	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGCTTGAATTGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120970919	120987159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_120971148_120972573_120972785_120973004_120973136_120973629_120973691_120976513_120976602_120978721_120978804_120980700_120980828_120981611_120981693_120982910_120983050_120985199_120985301_120985815
tx.10866	chr2	-	2615	3	ISM	ENSMUSG00000050619.15	ENSMUST00000163766.8	3611	6	-12	4941	-12	-496	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	2	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTCATTATCTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121001618	120996117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120997200_120999679_120999885_121000290
tx.10867	chr2	+	3089	18	FSM	ENSMUSG00000027263.13	ENSMUST00000110658.8	4250	18	50	1111	3	610	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_12	41.5047418810901	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATACTCAATTTAGCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121001698	121028140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121001953_121004038_121004168_121005820_121005944_121006251_121006306_121007008_121007066_121009150_121009231_121013969_121014172_121014814_121014981_121015182_121015308_121018612_121018664_121019005_121019112_121019842_121019951_121020307_121020447_121022713_121022892_121024422_121024558_121025890_121026008_121026583_121026724_121027215
tx.10868	chr2	+	3544	18	FSM	ENSMUSG00000027263.13	ENSMUST00000039541.12	4206	18	21	641	-4	-640	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_12	42.7635326321784	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTATCTCCCTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121001716	121028610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121001953_121004038_121004168_121005820_121005944_121006251_121006306_121007008_121007066_121009150_121009231_121013969_121014172_121014814_121014981_121015182_121015308_121018612_121018664_121019005_121019112_121019842_121019951_121020304_121020447_121022713_121022892_121024422_121024558_121025890_121026008_121026583_121026724_121027215
tx.10869	chr2	-	422	2	ISM	ENSMUSG00000033526.17	ENSMUST00000137087.2	572	5	1222	3522	1222	-5	internal_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTTAAAATGATTCAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121178050	121177533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_121177867_121177961
tx.10870	chr2	-	1433	10	ISM	ENSMUSG00000033526.17	ENSMUST00000150081.8	2485	18	-25	6695	-3	-5	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	56	junction_9	18.8017598335769	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTTTAAAATGATTCAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121185817	121177533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_121177867_121177961_121178124_121178947_121179050_121179174_121179330_121179654_121179741_121179955_121180047_121180427_121180624_121180957_121181133_121181397_121181495_121185781
tx.10871	chr2	-	1218	8	ISM	ENSMUSG00000033526.17	ENSMUST00000150081.8	2485	18	-25	7829	-3	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_7	19.2629495272608	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCAGTCTCTGTATTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121185817	121178667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_121179050_121179174_121179330_121179654_121179741_121179955_121180047_121180427_121180624_121180957_121181133_121181397_121181495_121185781
tx.10872	chr2	+	1519	10	FSM	ENSMUSG00000000308.15	ENSMUST00000078222.9	1518	10	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_1	32.5602954456217	393	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTCTGTGTTATTTCTAT	800	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121188255	121194218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121188341_121189276_121189483_121190059_121190259_121190425_121190522_121191036_121191259_121191383_121191470_121191586_121191711_121193155_121193291_121193455_121193582_121193978
tx.10873	chr2	+	1601	9	FSM	ENSMUSG00000000308.15	ENSMUST00000000317.13	1620	9	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_3	17.8881070826401	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTCTGTGTTATTTCTAT	1654	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121189109	121194218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121189483_121190059_121190259_121190425_121190522_121191036_121191259_121191383_121191470_121191586_121191711_121193155_121193291_121193455_121193582_121193978
tx.10874	chr2	-	1621	8	NNC	ENSMUSG00000033486.15	novel	2247	13	NA	NA	-19	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.84522774326339	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTCTGGTAAGTTCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121244292	121224835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_121224969_121227433_121227602_121227941_121228370_121230205_121230318_121240618_121240688_121240857_121241032_121242630_121242772_121243896
tx.10875	chr2	-	1347	4	NIC	ENSMUSG00000033486.15	novel	2247	13	NA	NA	-16	4411	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	4	junction_1	5.90668171555645	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCTGCGTCTGTTTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121244289	121236295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_121236935_121240857_121241032_121242630_121242772_121243896
tx.10876	chr2	-	1335	3	NIC	ENSMUSG00000033486.15	novel	2247	13	NA	NA	6	498	intron_retention	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATAGAAATCCCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121244267	121240208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_121241032_121242630_121242772_121243896
tx.10877	chr2	-	867	2	ISM	ENSMUSG00000033486.15	ENSMUST00000038073.5	2247	13	9	17437	9	-1566	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAGAAAAAAATTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121244264	121242272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_121242772_121243896
tx.10878	chr2	+	1903	13	FSM	ENSMUSG00000027248.14	ENSMUST00000028683.14	2770	13	160	707	52	-707	multi-exon	FALSE	canonical	3	3731	junction_4	277.160252481404	2860	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTGTCGTTTTTTTCCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121244415	121268461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121244687_121252929_121253009_121255005_121255124_121257075_121257184_121259934_121260065_121262132_121262250_121262754_121262881_121263997_121264181_121264465_121264575_121265269_121265399_121266401_121266482_121266837_121266896_121268066
tx.10879	chr2	-	1688	11	FSM	ENSMUSG00000027246.13	ENSMUST00000116432.2	1674	11	-12	-2	-12	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_5	7.95235814082842	241	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTGCGATCATTAGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121273094	121269505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_121270031_121270107_121270153_121270328_121270501_121270596_121270640_121270714_121270908_121271576_121271653_121271742_121271823_121271907_121272095_121272191_121272305_121272626_121272663_121272876
tx.10880	chr2	+	1157	2	FSM	ENSMUSG00000074884.13	ENSMUST00000134412.2	3105	2	0	1948	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	5931	junction_1	0	440	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGCGCCTGGTTTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121279848	121281538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121279923_121280455
tx.10881	chr2	+	521	3	FSM	ENSMUSG00000074884.13	ENSMUST00000139253.8	3056	3	173	2362	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	5931	junction_1	722	42893	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGAGCGCCTGGTTTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121279848	121281539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121279923_121280455_121280565_121281201
tx.10882	chr2	-	443	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027245.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAACCCTCACAGCTTCCG	1512	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121288791	121287564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_121287783_121288566
tx.10883	chr2	+	587	4	FSM	ENSMUSG00000027245.12	ENSMUST00000126764.2	961	4	138	236	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4276	junction_2	190.202231556017	32584	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGGCTCTTATATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121287581	121288917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121287773_121288126_121288183_121288472_121288525_121288629
tx.10884	chr2	-	2597	7	FSM	ENSMUSG00000048222.4	ENSMUST00000056732.4	3362	7	41	724	41	-724	multi-exon	FALSE	canonical	3	438	junction_3	20.2457128520803	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATGCAGTTCTTGAAGTT	9236	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121304507	121291439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_121292786_121292867_121292958_121295259_121295420_121297216_121297378_121297468_121297578_121300259_121300798_121304314
tx.10886	chr2	-	2262	7	FSM	ENSMUSG00000068479.6	ENSMUST00000089926.6	4198	7	8	1928	8	-1928	multi-exon	FALSE	canonical	3	409	junction_6	26.8747093007534	211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTGTCTACAGAGTAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121337138	121324319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_121325329_121325410_121325501_121327809_121327970_121329766_121329928_121330018_121330128_121332812_121333351_121336943
tx.10887	chr2	+	3584	13	FSM	ENSMUSG00000033411.17	ENSMUST00000036647.13	5053	13	442	1027	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	334	junction_9	41.0940655353327	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATGCTCTTTCTCAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121786923	121843096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121787099_121799550_121799761_121807811_121807951_121809372_121809523_121811632_121811846_121817429_121817509_121819270_121819383_121823826_121823914_121834381_121834445_121834548_121834629_121837343_121837471_121838201_121838298_121841043
tx.10888	chr2	+	558	4	ISM	ENSMUSG00000033411.17	ENSMUST00000131258.8	4290	6	-34	11460	-8	-11460	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	361	junction_3	50.7302232949507	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAAATTAGAAGATAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121786932	121809415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_121787099_121799550_121799761_121807811_121807951_121809372
tx.10889	chr2	+	688	3	ISM	ENSMUSG00000033411.17	ENSMUST00000131258.8	4290	6	-31	12749	-5	-12749	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	416	junction_2	34.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGTAAAAAAGGTAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121786935	121808126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_121787099_121799550_121799761_121807811
tx.10890	chr2	+	1327	7	ISM	ENSMUSG00000033411.17	ENSMUST00000128883.8	1236	9	-81	4671	-6	-1282	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	361	junction_3	40.3429740544194	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTTTGAGACCCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121786885	121819593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_121787099_121799550_121799761_121807811_121807951_121809372_121809523_121811632_121811846_121817429_121817509_121819270
tx.10891	chr2	+	1927	8	ISM	ENSMUSG00000033411.17	ENSMUST00000128883.8	1236	9	-20	-434	6	21	intron_retention	FALSE	canonical	3	361	junction_3	40.3110356085866	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAGAAATGACTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121786946	121824698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_121787099_121799550_121799761_121807811_121807951_121809372_121809523_121811632_121811846_121817429_121817509_121819270_121819383_121823826
tx.10892	chr2	+	1808	8	FSM	ENSMUSG00000027236.9	ENSMUST00000028668.8	5413	8	32	3573	32	-3573	multi-exon	FALSE	canonical	3	888	junction_1	160.980921673524	1109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTGTTATATCCCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121859058	121883506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121859206_121859288_121859393_121871636_121871692_121872062_121872155_121877916_121878032_121880967_121881130_121882222_121882297_121882447
tx.10893	chr2	-	1835	6	FSM	ENSMUSG00000033396.14	ENSMUST00000135847.2	1813	6	-1	-21	-1	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_3	7.08237248385031	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTATGTGTGTGGTGTTTT	6989	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121948857	121938125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_121938967_121939173_121939312_121942196_121942390_121943495_121943721_121945088_121945271_121948601
tx.10894	chr2	-	1173	8	ISM	ENSMUSG00000027233.5	ENSMUST00000028665.5	2434	18	61006	3	61006	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_6	12.4408806040441	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTTCCGTGTTGCCAGAC	182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121955664	121950591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_121950930_121951640_121951790_121952264_121952360_121954198_121954340_121954816_121954977_121955099_121955234_121955327_121955382_121955562
tx.10895	chr2	-	1291	9	ISM	ENSMUSG00000027233.5	ENSMUST00000028665.5	2434	18	60796	5	60796	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_8	14.1399257423793	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGCTTCCGTGTTGCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121955874	121950593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_121950930_121951640_121951790_121952264_121952360_121954198_121954340_121954816_121954977_121955099_121955234_121955327_121955382_121955562_121955661_121955750
tx.10896	chr2	-	1391	10	ISM	ENSMUSG00000027233.5	ENSMUST00000028665.5	2434	18	60368	5	60368	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_9	15.8449275288675	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGCTTCCGTGTTGCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121956302	121950593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_121950930_121951640_121951790_121952264_121952360_121954198_121954340_121954816_121954977_121955099_121955234_121955327_121955382_121955562_121955661_121955750_121955872_121956199
tx.10897	chr2	+	874	4	FSM	ENSMUSG00000060802.9	ENSMUST00000102476.5	860	4	-1	-13	-1	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	168	junction_2	12.4721912892465	518	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATTGTTGCCAGACATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121978165	121983577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121978286_121981353_121981633_121982127_121982157_121983131
tx.10898	chr2	-	858	4	NNC	ENSMUSG00000027233.5	novel	2434	18	NA	NA	-6	-52755	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.6770782520313	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGTGGAGTCAATCAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122016676	122003343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_122003923_122004421_122004482_122009575_122009730_122016611
tx.10899	chr2	-	1685	2	ISM	ENSMUSG00000027233.5	ENSMUST00000028665.5	2434	18	0	57515	0	-57515	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTGTACTTTGTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122016670	122008103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_122009730_122016611
tx.109	chr1	-	1765	4	NNC	ENSMUSG00000042215.9	novel	1860	3	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.2968437932844	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTAGCATTGGCCATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33796825	33784564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_33785227_33785270_33786098_33787297_33787408_33796659
tx.1090	chr1	+	915	2	ISM	ENSMUSG00000039384.9	ENSMUST00000048655.8	2792	4	34548	759	34548	-759	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTTCCCAGTTTCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	183801125	183807074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_183801421_183806454
tx.10900	chr2	+	2115	7	FSM	ENSMUSG00000027229.6	ENSMUST00000028661.6	2115	7	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	42.3910367884533	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGTTTCTCAAAGTGAT	1945	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122016752	122036878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_122016834_122016944_122017027_122018390_122018531_122021087_122021150_122023712_122023787_122028866_122028956_122035291
tx.10901	chr2	+	1913	5	NIC	ENSMUSG00000027229.6	novel	2115	7	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	63	junction_2	27.6450718935582	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGTTTCTCAAAGTGAT	1945	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122016752	122036878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_122016834_122016944_122017027_122023712_122023787_122028866_122028956_122035291
tx.10902	chr2	+	1978	6	NIC	ENSMUSG00000027229.6	novel	2115	7	NA	NA	1	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	28	junction_2	38.5725290848293	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTCTCAAAGTGATTATA	1946	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122016753	122036882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_122016834_122016944_122017027_122021087_122021150_122023712_122023787_122028866_122028956_122035291
tx.10903	chr2	+	1820	4	NIC	ENSMUSG00000027229.6	novel	448	5	NA	NA	-94	-96	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	63	junction_1	28.5228952870419	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTAAGTTGTTTACATTG	2053	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122016860	122036782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_122017027_122023712_122023787_122028866_122028956_122035291
tx.10904	chr2	+	544	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000070692.7	novel	399	1	NA	NA	-8522	26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCCTCACAGACATGGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122041951	122050898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_122041980_122050382
tx.10905	chr2	+	2294	9	FSM	ENSMUSG00000027227.8	ENSMUST00000110551.4	2352	9	57	1	57	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_3	10.5763592507063	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCGTATGTGGTTTGTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122065286	122095820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_122065440_122076962_122076997_122079279_122079445_122083667_122083828_122087322_122087442_122089545_122089612_122090660_122090837_122093668_122093791_122094521
tx.10906	chr2	+	716	4	ISM	ENSMUSG00000118663.1	ENSMUST00000239506.1	2347	8	10058	-186	10032	186	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	1.24721912892465	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAGGAGAGTTATTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122471177	122474936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_122471230_122472613_122472745_122473758_122473885_122474529
tx.10907	chr2	+	682	5	FSM	ENSMUSG00000033213.17	ENSMUST00000047498.15	792	5	4	106	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_4	21.9146070008111	1279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGATTTGTGCAAGAGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122479773	122483005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_122479862_122479991_122480054_122480176_122480263_122481135_122481197_122482620
tx.10908	chr2	+	605	4	FSM	ENSMUSG00000033213.17	ENSMUST00000110512.4	751	4	146	0	146	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_3	25.0377492776186	679	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGATTTGTGCAAGAGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122479980	122483005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_122480054_122480176_122480263_122481135_122481197_122482620
tx.10909	chr2	+	2087	5	FSM	ENSMUSG00000005804.15	ENSMUST00000005954.9	3484	5	21	1376	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_2	4.54835134966506	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAAGGCTGGCGATTCTTTT	8290	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122580443	122590019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_122580625_122584508_122584651_122586045_122586134_122587974_122588062_122588430
tx.10910	chr2	+	1558	6	ISM	ENSMUSG00000035183.15	ENSMUST00000070353.4	1954	9	-36	4772	-36	679	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	1.46969384566991	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAAGGAGCATTTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124910007	124925825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_124910222_124910691_124910872_124922540_124922625_124922713_124922818_124923146_124923248_124924950
tx.10911	chr2	+	1487	8	NIC	ENSMUSG00000035183.15	novel	1954	9	NA	NA	-29	-289	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	4	junction_6	24.7608974154074	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTCTAACACTTAATTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124910014	124930308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_124910222_124910691_124910872_124922540_124922625_124922713_124922818_124923146_124923248_124924950_124925235_124929339_124929442_124929883
tx.10912	chr2	+	1697	9	FSM	ENSMUSG00000035183.15	ENSMUST00000070353.4	1954	9	-32	289	-32	-289	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_6	24.0624188310319	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTCTAACACTTAATTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124910011	124930308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_124910222_124910691_124910872_124922540_124922625_124922713_124922818_124923146_124923248_124924950_124925235_124927576_124927784_124929339_124929442_124929883
tx.10913	chr2	-	1520	3	ISM	ENSMUSG00000027201.17	ENSMUST00000089825.13	1631	15	20791	-1093	-7071	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	668	junction_1	10	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACAGCTTACTTGTTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124938002	124929660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_124930958_124937627_124937680_124937831
tx.10914	chr2	-	1790	6	ISM	ENSMUSG00000027201.17	ENSMUST00000089825.13	1631	15	18359	-1089	-9503	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	388	junction_4	143.638991920718	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATACAGCTTACTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124940434	124929664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_124930958_124937627_124937680_124937831_124938041_124939482_124939555_124939896_124939996_124940369
tx.10915	chr2	-	2455	12	ISM	ENSMUSG00000027201.17	ENSMUST00000089825.13	1631	15	2930	-1093	2930	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	388	junction_4	114.438117096657	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACAGCTTACTTGTTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124955863	124929660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_124930958_124937627_124937680_124937831_124938041_124939482_124939555_124939896_124939996_124940369_124940439_124942238_124942341_124950875_124950940_124951073_124951124_124951589_124951744_124952399_124952592_124955768
tx.10916	chr2	-	417	2	NNC	ENSMUSG00000086416.2	novel	2839	3	NA	NA	-28939	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATTTTGTGGGGTTTTTGG	303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125088371	125049447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_125049786_125088292
tx.10917	chr2	-	502	3	NNC	ENSMUSG00000086416.2	novel	2839	3	NA	NA	-28946	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATTTTGTGGGGTTTTTGG	296	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125088378	125049447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_125049789_125053584_125053660_125088292
tx.10918	chr2	+	840	6	FSM	ENSMUSG00000027203.16	ENSMUST00000051605.9	1950	6	234	876	-184	-16	multi-exon	TRUE	canonical	3	2160	junction_3	102.069780052668	11048	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGATTTTACATAAACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125089635	125099652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_125089817_125091085_125091178_125092892_125092938_125098768_125098844_125098989_125099061_125099276
tx.10919	chr2	-	312	2	ISM	ENSMUSG00000068394.5	ENSMUST00000089776.3	5768	28	9	58096	9	-58096	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAAAAAGAGGTGAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125467024	125463103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_125463187_125466795
tx.1092	chr1	-	975	7	ISM	ENSMUSG00000073481.10	ENSMUST00000068725.10	1917	8	4451	609	4141	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	760	junction_6	71.9760762722973	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCGCTATTACGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	184573627	184545873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_184546081_184551397_184551545_184554531_184554604_184554685_184554748_184564772_184564914_184566056_184566226_184573450
tx.10920	chr2	-	1973	13	FSM	ENSMUSG00000027206.14	ENSMUST00000110463.8	3392	13	124	1295	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_9	189.484534695813	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGGTTCTTGATGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125700935	125673518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_125674258_125675643_125675703_125676673_125676757_125678061_125678160_125681068_125681122_125681225_125681405_125682243_125682419_125684352_125684431_125684541_125684653_125686729_125686856_125690126_125690205_125691659_125691774_125700855
tx.10921	chr2	-	1951	13	FSM	ENSMUSG00000027206.14	ENSMUST00000028635.6	2073	13	125	-3	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	620	junction_9	116.017838666685	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGGTTCTTGATGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125700934	125673518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_125674258_125675643_125675703_125676673_125676757_125678061_125678160_125681068_125681122_125681225_125681405_125682243_125682419_125684352_125684431_125684541_125684632_125686729_125686856_125690126_125690205_125691659_125691774_125700855
tx.10922	chr2	-	917	8	ISM	ENSMUSG00000027206.14	ENSMUST00000028635.6	2073	13	124	7707	-19	3413	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	620	junction_4	119.244903198315	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGTCTGTCTGCTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125700935	125681228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_125681405_125682243_125682419_125684352_125684431_125684541_125684632_125686729_125686856_125690126_125690205_125691659_125691774_125700855
tx.10923	chr2	-	932	8	ISM	ENSMUSG00000027206.14	ENSMUST00000110463.8	3392	13	130	9005	-13	3413	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	314	junction_4	223.528841219971	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGTCTGTCTGCTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125700929	125681228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_125681405_125682243_125682419_125684352_125684431_125684541_125684653_125686729_125686856_125690126_125690205_125691659_125691774_125700855
tx.10924	chr2	+	1792	10	FSM	ENSMUSG00000027207.16	ENSMUST00000094604.9	1928	10	136	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_4	15.4040238449986	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTGTTGCTCTTGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125708162	125825507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_125708306_125720197_125720287_125729783_125729908_125735272_125735364_125738564_125738712_125771480_125771580_125773172_125773326_125788703_125788915_125817179_125817382_125824974
tx.10925	chr2	+	1181	4	NIC	ENSMUSG00000023330.13	novel	1342	5	NA	NA	18	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	21	junction_2	74.5534856477028	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCGCCCTTACCTTTCGA	7297	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125994078	126007197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_125994135_125996465_125996781_126001689_126001949_126006646
tx.10926	chr2	+	1325	5	FSM	ENSMUSG00000023330.13	ENSMUST00000170908.8	1342	5	18	-1	18	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_1	15.4495145554804	223	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCGCCCTTACCTTTCGA	7297	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125994078	126007197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_125994135_125996465_125996781_126000329_126000474_126001689_126001949_126006646
tx.10927	chr2	+	1643	5	NNC	ENSMUSG00000023330.13	novel	1342	5	NA	NA	63	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	57	junction_1	62.1867148191637	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCGCCCTTACCTTTCGA	7342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125994123	126007197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_125994498_125996465_125996781_126000329_126000474_126001689_126001949_126006646
tx.10928	chr2	+	2324	10	FSM	ENSMUSG00000027359.17	ENSMUST00000061491.14	2918	10	616	-22	-567	22	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_5	10.1592261783666	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTTCTCTCTCTACTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126394942	126430185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_126395553_126403456_126403667_126406597_126406757_126409666_126409792_126416621_126416817_126419779_126419871_126420768_126420968_126422825_126422924_126428171_126428303_126429679
tx.10929	chr2	-	1394	8	FSM	ENSMUSG00000027361.16	ENSMUST00000103226.10	1338	8	-51	-5	7	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	353	junction_7	27.2074419591255	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATGAGTGCAGAATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126517457	126480935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_126481265_126488482_126488669_126491987_126492102_126492428_126492541_126494152_126494348_126495474_126495643_126500389_126500498_126517275
tx.10930	chr2	-	1398	8	ISM	ENSMUSG00000027361.16	ENSMUST00000110424.9	2613	9	-42	10103	0	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_2	122.412484357318	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATGAGTGCAGAATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126517464	126480935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_126481265_126488482_126488666_126491987_126492102_126492428_126492541_126494152_126494348_126495474_126495643_126500389_126500498_126517275
tx.10931	chr2	-	816	5	ISM	ENSMUSG00000027361.16	ENSMUST00000103226.10	1338	8	23176	-2	10980	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	368	junction_3	26.6129667643425	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATTGAATGAGTGCAGAAT	6423	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126494230	126480938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_126481265_126488482_126488669_126491987_126492102_126492428_126492541_126494152
tx.10932	chr2	+	577	2	NNC	ENSMUSG00000098024.2	novel	497	2	NA	NA	-312	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATTGGTAGTAATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126517523	126525724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_126517737_126525360
tx.10933	chr2	+	616	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000098024.2	novel	497	2	NA	NA	-312	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATTGGTAGTAATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126517523	126525724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_126517737_126525321
tx.10934	chr2	-	1335	3	ISM	ENSMUSG00000027364.15	ENSMUST00000151140.2	980	4	2751	-399	2731	399	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_2	2	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126622627	126619209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_126620029_126621850_126622047_126622307
tx.10935	chr2	-	1154	3	NNC	ENSMUSG00000027364.15	novel	980	4	NA	NA	2956	397	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	5.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTTTTTTTTTGGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126622402	126619211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_126620029_126621850_126622047_126622261
tx.10936	chr2	-	2003	6	ISM	ENSMUSG00000027365.15	ENSMUST00000155675.8	1123	9	4801	-1262	5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	330	junction_1	18.5299757150408	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTTTAATGAGTTTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126639744	126633484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_126634877_126637151_126637259_126637362_126637415_126639030_126639237_126639386_126639470_126639581
tx.10937	chr2	-	1963	15	ISM	ENSMUSG00000027365.15	ENSMUST00000103224.10	7107	39	14	38611	14	665	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_9	21.566697683688	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGACACAATCATTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126718136	126672095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_126672184_126673116_126673258_126675607_126675662_126677375_126677511_126679254_126679356_126682663_126682737_126684775_126684900_126686219_126686395_126687993_126688166_126690416_126690542_126691818_126692033_126693262_126693462_126696562_126696602_126700332_126700413_126717893
tx.10938	chr2	-	1365	9	ISM	ENSMUSG00000027365.15	ENSMUST00000134408.2	2201	14	-30	12021	14	-12018	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_3	25.5804490773716	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTTGTGAGTAGAGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126718136	126684781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_126684900_126686219_126686395_126687993_126688166_126690416_126690542_126691818_126692033_126693262_126693462_126696562_126696602_126700332_126700413_126717893
tx.10939	chr2	-	2129	15	FSM	ENSMUSG00000027366.13	ENSMUST00000028844.11	5616	15	200	3287	200	586	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	6.77630927178938	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAGAAGACAGTTCATGTA	8479	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126774955	126735597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_126736207_126746829_126746991_126750025_126750101_126754562_126754666_126755451_126755509_126759130_126759206_126759719_126759802_126761558_126761661_126762237_126762335_126765375_126765528_126767665_126767800_126768207_126768298_126768736_126768920_126769668_126769789_126774866
tx.10940	chr2	-	482	4	ISM	ENSMUSG00000027366.13	ENSMUST00000028844.11	5616	15	178	35919	178	-11436	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	4.49691252107735	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGACTTCAAAGACATGAAAG	8457	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126774977	126768229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_126768298_126768736_126768920_126769668_126769789_126774866
tx.10941	chr2	-	586	3	Intergenic	novelGene_810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCTGGATAAGTTAATGAC	872	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126843557	126838730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_126838966_126842058_126842236_126843383
tx.10942	chr2	+	390	3	NNC	ENSMUSG00000001998.16	novel	731	6	NA	NA	-2	-115	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAATGTCATTCTGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126850634	126855377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_126850821_126853710_126853783_126855245
tx.10943	chr2	+	2319	5	FSM	ENSMUSG00000001999.16	ENSMUST00000142861.2	1460	5	2	-861	0	861	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	50.701947694344	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGTAAAAAAAAATTCTAACT	2211	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126912586	126930651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_126912651_126922449_126922579_126924851_126924971_126927882_126928003_126928764
tx.10944	chr2	+	1161	8	FSM	ENSMUSG00000001999.16	ENSMUST00000002064.15	1160	8	-1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	50.5988626152721	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAGAATAGTGTTGATGACT	2210	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126912585	126939004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_126912651_126922449_126922579_126924851_126924971_126927882_126928003_126928764_126928863_126933958_126934067_126937005_126937178_126938654
tx.10945	chr2	-	2657	18	FSM	ENSMUSG00000034906.16	ENSMUST00000110387.4	2695	18	21	17	21	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	394	junction_9	30.9044738701424	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAGTGCCCAGTAAACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126975853	126945745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_126946201_126947765_126947842_126948023_126948116_126949273_126949391_126950404_126950579_126955479_126955591_126958451_126958575_126959425_126959533_126959996_126960146_126963044_126963248_126963959_126964052_126965456_126965647_126966750_126966876_126967470_126967607_126968034_126968128_126969023_126969115_126969404_126969643_126975768
tx.10946	chr2	-	543	3	Intergenic	novelGene_811	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAAGAGTCAATGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127024712	127015919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_127016179_127023108_127023264_127024583
tx.10947	chr2	-	546	3	Intergenic	novelGene_812	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAAGAGTCAATGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127024712	127015919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_127016179_127023108_127023267_127024583
tx.10948	chr2	-	343	2	FSM	ENSMUSG00000044145.3	ENSMUST00000150956.2	2364	2	-23	2044	3	-2044	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTAGATCTTCTCTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127050197	127046530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127046771_127050094
tx.10949	chr2	+	560	3	ISM	ENSMUSG00000003660.11	ENSMUST00000103220.4	6745	45	30337	1	644	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	796	junction_1	97.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGTCCTTAACAGTGATA	81	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127080655	127082370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_127080741_127081798_127081892_127081988
tx.10950	chr2	-	1406	7	FSM	ENSMUSG00000003662.11	ENSMUST00000003759.11	3075	7	59	1610	59	72	multi-exon	FALSE	canonical	3	164	junction_2	19.7793382655291	798	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAAATTGTGATCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127089677	127084467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127084958_127086832_127086921_127087642_127087845_127088332_127088422_127088521_127088634_127088929_127089079_127089401
tx.10951	chr2	+	1155	4	FSM	ENSMUSG00000034850.16	ENSMUST00000035871.15	4811	4	34	3622	-27	-36	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	34.6634613902818	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTGCTCCTTTCCTATT	2368	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127089861	127099405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_127090005_127090411_127090730_127097924_127098090_127098876
tx.10952	chr2	+	2201	5	ISM	ENSMUSG00000027367.17	ENSMUST00000125049.2	2869	7	20075	-3	704	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	326	junction_2	27.9732014613987	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGAGTGTTCATTTCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127132698	127140855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_127132803_127132877_127132961_127134070_127134171_127137403_127137489_127139026
tx.10953	chr2	+	2646	22	FSM	ENSMUSG00000046338.5	ENSMUST00000062211.4	2628	22	-18	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	53.4925768898164	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTGAAGTACATGTCCAAT	4983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127267100	127278012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_127267142_127269160_127269292_127269412_127269527_127270165_127270240_127270604_127270710_127270916_127271046_127272774_127272875_127273202_127273337_127273582_127273683_127273777_127273991_127274291_127274415_127274569_127274653_127274891_127275011_127275505_127275577_127275651_127275911_127275997_127276147_127276307_127276386_127276711_127276844_127276926_127277048_127277130_127277197_127277394_127277451_127277764
tx.10954	chr2	+	823	7	ISM	ENSMUSG00000046338.5	ENSMUST00000062211.4	2628	22	8906	0	8906	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	218	junction_2	19.2303290547914	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTGAAGTACATGTCCAAT	5259	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127276024	127278012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_127276147_127276307_127276386_127276711_127276844_127276926_127277048_127277130_127277197_127277394_127277451_127277764
tx.10955	chr2	-	1221	8	FSM	ENSMUSG00000027371.11	ENSMUST00000028848.4	1211	8	-10	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_6	10.321366781822	340	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTAGCTTCCACTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127286480	127278134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127278327_127278465_127278554_127278656_127278766_127280032_127280193_127280429_127280490_127282305_127282523_127283793_127284045_127286336
tx.10956	chr2	-	878	8	FSM	ENSMUSG00000079056.13	ENSMUST00000088538.6	1296	8	319	99	319	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	5.52175659716791	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTTTACTTCCAAGACAC	9947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127324100	127300148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127300309_127301249_127301313_127301902_127302008_127302352_127302461_127306967_127307039_127307268_127307339_127307773_127307899_127323924
tx.10957	chr2	-	1019	9	FSM	ENSMUSG00000079056.13	ENSMUST00000103215.11	2732	9	-18	1731	-18	11	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	30.8015320235861	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTTTACTTCCAAGACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127363308	127300148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127300309_127301249_127301313_127301902_127302008_127302352_127302461_127306967_127307039_127307268_127307339_127307773_127307899_127352748_127352915_127363157
tx.10958	chr2	+	1466	12	FSM	ENSMUSG00000027374.13	ENSMUST00000028852.13	4481	12	172	2843	-25	131	multi-exon	FALSE	canonical	3	1110	junction_4	149.07045314213	1006	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACATGGTATATAGCTGTG	4139	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127429313	127445906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_127429406_127432614_127432702_127433733_127433872_127436363_127436490_127437583_127437818_127438819_127438855_127440105_127440197_127441931_127441979_127442748_127442807_127443297_127443361_127444304_127444442_127445548
tx.10959	chr2	+	893	8	ISM	ENSMUSG00000027374.13	ENSMUST00000028852.13	4481	12	8572	2843	121	131	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1269	junction_3	143.497564510371	609	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACATGGTATATAGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127437713	127445906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_127437818_127438819_127438855_127440105_127440197_127441931_127441979_127442748_127442807_127443297_127443361_127444304_127444442_127445548
tx.10960	chr2	-	2334	4	FSM	ENSMUSG00000027375.15	ENSMUST00000028854.15	2778	4	444	0	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_3	8.83176086632785	411	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTGTCTCACTCTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127498171	127475145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127476975_127480508_127480635_127482140_127482309_127497960
tx.10961	chr2	-	1393	5	NNC	ENSMUSG00000027377.3	novel	2006	4	NA	NA	-834	-820	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_4	23.2849200127464	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTGCTGGGTTTGGGGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127572686	127547125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_127547844_127550756_127550880_127554188_127554357_127571675_127571900_127572526
tx.10962	chr2	-	1160	4	FSM	ENSMUSG00000027377.3	ENSMUST00000028856.3	2006	4	27	819	27	-819	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_2	4.54606056566195	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCTGGGTTTGGGGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127571825	127547124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127547844_127550756_127550880_127554188_127554357_127571675
tx.10963	chr2	-	1580	14	ISM	ENSMUSG00000027378.17	ENSMUST00000110357.2	2296	20	18547	-2	-16280	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_11	14.5081083226102	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGTTATATCTAAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127612270	127582653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_127583109_127584991_127585037_127587815_127587890_127589919_127590033_127595892_127595993_127598011_127598089_127599598_127599682_127601495_127601607_127603081_127603157_127605698_127605828_127607943_127608039_127610090_127610179_127611534_127611578_127612178
tx.10964	chr2	-	2261	20	FSM	ENSMUSG00000027378.17	ENSMUST00000110357.2	2296	20	37	-2	-6	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	41	junction_11	13.7437973922422	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGTTATATCTAAATTTT	2828	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127630780	127582653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127583109_127584991_127585037_127587815_127587890_127589919_127590033_127595892_127595993_127598011_127598089_127599598_127599682_127601495_127601607_127603081_127603157_127605698_127605828_127607943_127608039_127610090_127610179_127611534_127611578_127612178_127612313_127614020_127614123_127615817_127616020_127619188_127619314_127621023_127621085_127621982_127622057_127630705
tx.10965	chr2	+	307	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027378.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGGGTCTGCTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127586194	127586871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_127586305_127586674
tx.10966	chr2	-	442	2	FSM	ENSMUSG00000051319.7	ENSMUST00000135091.2	800	2	0	358	0	-358	multi-exon	FALSE	canonical	3	537	junction_1	0	6622	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGAATCTTTTTCCTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127634408	127633665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127633753_127634053
tx.10967	chr2	-	3407	25	NNC	ENSMUSG00000027379.15	novel	3418	25	NA	NA	10	4	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_18	144.978350874268	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGACCTAGTTGTTCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127673769	127643040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_127643359_127644937_127645045_127646101_127646271_127646393_127646552_127646728_127646891_127647199_127647316_127648145_127648290_127649728_127649932_127650886_127650975_127652528_127652704_127654867_127654950_127655748_127655846_127656557_127656669_127656758_127656888_127658008_127658068_127659171_127659399_127661132_127661285_127663594_127663777_127663857_127663915_127665878_127665980_127667026_127667071_127669220_127669418_127671357_127671497_127671597_127671658_127673639
tx.10968	chr2	+	1051	4	FSM	ENSMUSG00000027381.17	ENSMUST00000110341.9	5036	4	-2	3987	-1	118	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	11.2644968324772	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGAGGGCTTTTCTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127967956	128000480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_127968173_127970539_127970935_127989004_127989115_128000150
tx.10969	chr2	+	1171	10	ISM	ENSMUSG00000014353.16	ENSMUST00000143398.3	2100	19	7	14237	7	-12223	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	117	junction_8	12.1908688759504	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCTGAGCTTTTTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128660229	128679422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_128660424_128665002_128665064_128666335_128666431_128668176_128668309_128670325_128670377_128672429_128672521_128673117_128673180_128673369_128673554_128676034_128676135_128679221
tx.1097	chr1	+	869	7	ISM	ENSMUSG00000026615.15	ENSMUST00000192284.6	5638	20	14	31319	0	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	2037	junction_4	266.097517630077	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGGAAGATTTTGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	185095254	185111077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_185095441_185099727_185099813_185101773_185101874_185103085_185103243_185105114_185105255_185106314_185106410_185110971
tx.10970	chr2	-	1567	9	FSM	ENSMUSG00000027387.12	ENSMUST00000028866.9	1624	9	57	0	57	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	159	junction_3	33.6115214621415	418	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGTTTTCATACTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128785940	128768187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_128768732_128770806_128770849_128771766_128771877_128772711_128772824_128773197_128773321_128775118_128775253_128777231_128777467_128781762_128781857_128785767
tx.10971	chr2	-	1555	9	NNC	ENSMUSG00000027387.12	novel	1624	9	NA	NA	57	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	42	junction_6	71.0922595997623	82	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGTTTTCATACTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128785940	128768187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_128768732_128770806_128770849_128771766_128771877_128772711_128772824_128773197_128773321_128775118_128775253_128777243_128777467_128781762_128781857_128785767
tx.10972	chr2	+	1061	2	FSM	ENSMUSG00000027394.14	ENSMUST00000144730.2	1053	2	-7	-1	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTTATTTCTAATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128907897	128910026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_128908224_128909291
tx.10973	chr2	+	2007	7	FSM	ENSMUSG00000027394.14	ENSMUST00000035812.14	4567	7	26	2534	-17	-2534	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_4	11.1118055338555	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATAATCTTACTTTACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128907887	128935669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_128908224_128910774_128910854_128917775_128918009_128923129_128923266_128923893_128924164_128930913_128931058_128934860
tx.10974	chr2	+	4007	15	FSM	ENSMUSG00000027395.16	ENSMUST00000103205.11	3998	15	-8	-1	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	224	junction_10	36.5564282853179	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGTGATTTTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128942906	128968515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_128943184_128944882_128945051_128945497_128945645_128947168_128947302_128949906_128950044_128951150_128951375_128951959_128952132_128954561_128954734_128955420_128955703_128957558_128957693_128959847_128960019_128960959_128961117_128964989_128965187_128965630_128965885_128967133
tx.10975	chr2	+	556	4	FSM	ENSMUSG00000037938.5	ENSMUST00000035481.5	1325	4	96	673	-8	-19	multi-exon	FALSE	canonical	3	556	junction_1	75.455652906562	3046	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGCCTTCAGTATTGAA	3921	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128971715	128975381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_128971778_128972097_128972239_128972320_128972487_128975194
tx.10976	chr2	+	494	3	ISM	ENSMUSG00000037938.5	ENSMUST00000035481.5	1325	4	478	673	328	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	695	junction_1	18	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGCCTTCAGTATTGAA	4303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128972097	128975381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_128972239_128972320_128972487_128975194
tx.10977	chr2	+	3278	11	FSM	ENSMUSG00000027397.15	ENSMUST00000028880.10	3316	11	37	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	202	junction_5	146.125973050652	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTCTTGTGCTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129040720	129053535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_129040913_129041368_129041985_129042102_129042244_129042419_129042506_129045978_129046076_129048286_129048407_129049529_129049797_129049900_129050460_129050960_129051144_129051791_129051877_129052603
tx.10978	chr2	+	1611	4	ISM	ENSMUSG00000027397.15	ENSMUST00000110315.2	3219	10	8819	-6	769	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	499	junction_3	37.1573231902766	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTCTTGTGCTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129050048	129053535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_129050460_129050960_129051144_129051791_129051877_129052603
tx.10979	chr2	+	651	3	NNC	ENSMUSG00000056738.12	novel	3431	5	NA	NA	-3276	-5959	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACATAGGTGTCTGTTTCC	656	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129066665	129067932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_129066836_129067327_129067517_129067640
tx.10980	chr2	-	1091	2	ISM	ENSMUSG00000048327.7	ENSMUST00000052708.7	3137	9	26601	0	26601	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	306	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGCCTGTTGTTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129112531	129110129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_129111184_129112494
tx.10981	chr2	-	1663	4	ISM	ENSMUSG00000048327.7	ENSMUST00000052708.7	3137	9	1	16454	1	-16454	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	312	junction_1	5.79271573232759	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCACCCATTCCTGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129139131	129126583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_129128021_129132877_129132930_129138233_129138301_129139024
tx.10982	chr2	-	464	2	NNC	ENSMUSG00000081888.2	novel	682	2	NA	NA	-6	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTCCTTCTGCTGGATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129221322	129220178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_129220438_129221117
tx.10983	chr2	+	718	2	Intergenic	novelGene_813	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATGGTCAGATTGGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129261709	129263500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_129261836_129262908
tx.10984	chr2	+	3598	8	FSM	ENSMUSG00000037902.19	ENSMUST00000103202.10	3982	8	384	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_1	10.6215030259663	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGGGGGTGTTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129435508	129474148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_129435615_129450823_129451181_129457366_129457685_129458142_129458479_129460376_129460491_129463122_129463148_129469865_129469906_129471846
tx.10985	chr2	+	642	2	ISM	ENSMUSG00000037885.19	ENSMUST00000166282.3	5445	3	1060	4300	1060	-987	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGGCACCTTTTTATTGT	7291	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129643496	129669907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_129643925_129669693
tx.10986	chr2	-	1100	7	FSM	ENSMUSG00000027404.17	ENSMUST00000103199.9	1161	7	54	7	-15	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	3295	junction_4	264.518850409989	9246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTGATATATTCATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130021269	130013561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_130013864_130014522_130014649_130014955_130015095_130015526_130015680_130017249_130017362_130018934_130019087_130021153
tx.10987	chr2	+	1862	12	FSM	ENSMUSG00000027405.17	ENSMUST00000103198.11	1877	12	10	5	-4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1876	junction_9	231.115011975273	1696	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTATGTGTGTATTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130116359	130121228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_130116397_130116553_130116644_130116951_130117067_130117582_130117745_130117895_130118095_130118355_130118544_130118626_130118779_130118951_130119053_130119395_130119545_130119768_130119891_130120075_130120211_130120816
tx.10988	chr2	+	1826	11	ISM	ENSMUSG00000027405.17	ENSMUST00000103198.11	1877	12	203	5	141	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1876	junction_8	216.309408024709	352	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTATGTGTGTATTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130116552	130121228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_130116644_130116951_130117067_130117582_130117745_130117895_130118095_130118355_130118544_130118626_130118779_130118951_130119053_130119395_130119545_130119768_130119891_130120075_130120211_130120816
tx.10989	chr2	-	572	3	ISM	ENSMUSG00000027406.14	ENSMUST00000028892.11	1616	12	3995	3	-1	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	839	junction_1	16.5	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATCTGGTTTTGTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130122472	130121231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_130121647_130122182_130122244_130122376
tx.1099	chr1	+	782	4	ISM	ENSMUSG00000026615.15	ENSMUST00000046514.13	4906	32	38370	18146	1756	15	internal_fragment	FALSE	canonical	3	2638	junction_2	105.925550374885	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGCCGAATGGTACTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	185133610	185142411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_185133866_185139157_185139392_185139687_185139951_185142381
tx.10990	chr2	-	628	4	ISM	ENSMUSG00000027406.14	ENSMUST00000028892.11	1616	12	3535	3	-461	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	805	junction_3	27.3536509852382	552	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATCTGGTTTTGTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130122932	130121231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_130121647_130122182_130122244_130122376_130122472_130122875
tx.10991	chr2	-	1357	10	ISM	ENSMUSG00000027406.14	ENSMUST00000028892.11	1616	12	523	3	391	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	745	junction_6	52.0486477095713	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATCTGGTTTTGTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130125944	130121231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_130121647_130122182_130122244_130122376_130122472_130122875_130123023_130123132_130123236_130123326_130123461_130123557_130123691_130123767_130123829_130125628_130125750_130125857
tx.10992	chr2	-	1511	12	FSM	ENSMUSG00000027406.14	ENSMUST00000028892.11	1616	12	102	3	-11	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	745	junction_6	49.1089192551946	1421	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATCTGGTTTTGTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130126365	130121231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_130121647_130122182_130122244_130122376_130122472_130122875_130123023_130123132_130123236_130123326_130123461_130123557_130123691_130123767_130123829_130125628_130125750_130125857_130125957_130126090_130126169_130126301
tx.10993	chr2	+	958	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027406.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTATGCTATAATTTAAAT	2574	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130125886	130126944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_130126185_130126284
tx.10994	chr2	-	2386	14	FSM	ENSMUSG00000027408.8	ENSMUST00000028897.8	2366	14	-20	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_8	18.681383322448	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTCTTGAGTTCCTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130239514	130232694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_130233063_130233157_130233261_130234990_130235131_130235303_130235602_130235685_130235866_130235951_130236149_130236229_130236354_130236656_130236746_130236841_130236993_130237555_130237644_130237748_130237889_130238027_130238138_130238250_130238413_130239278
tx.10995	chr2	-	475	2	ISM	ENSMUSG00000027408.8	ENSMUST00000130533.2	676	3	1932	-1	1932	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTCTTGAGTTCCTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130233264	130232694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_130233063_130233157
tx.10996	chr2	-	2228	7	FSM	ENSMUSG00000037773.15	ENSMUST00000089581.11	3496	7	-10	1278	-7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_6	6.9940450861191	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCCTGTGTCGGGGAGCA	8047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130266208	130260880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_130261254_130261549_130261811_130263809_130264057_130264144_130264296_130264385_130264625_130264732_130264813_130265331
tx.10997	chr2	+	2641	24	FSM	ENSMUSG00000027411.18	ENSMUST00000028900.11	3161	24	-15	535	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	83.6383654878219	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTTGTTGTATGCTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130266269	130285654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_130266368_130279541_130279631_130279834_130279933_130280016_130280146_130280226_130280372_130280488_130280605_130280702_130280826_130280965_130281022_130281355_130281446_130281539_130281635_130281760_130281838_130282150_130282283_130282371_130282500_130282626_130282663_130282819_130282929_130283084_130283220_130283314_130283424_130283527_130283626_130283713_130283822_130284092_130284171_130284254_130284425_130284506_130284604_130285215_130285320_130285433
tx.10998	chr2	+	671	5	ISM	ENSMUSG00000027411.18	ENSMUST00000028900.11	3161	24	17806	536	563	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	348	junction_2	33.9153357642232	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATAGTTGTTGTATGCTGTCT	6392	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130284090	130285653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_130284171_130284254_130284425_130284506_130284604_130285215_130285320_130285433
tx.10999	chr2	+	532	4	ISM	ENSMUSG00000027411.18	ENSMUST00000028900.11	3161	24	18030	535	-772	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	348	junction_1	39.1606378338703	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTTGTTGTATGCTGTCTG	6616	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130284314	130285654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_130284425_130284506_130284604_130285215_130285320_130285433
tx.11	chr1	+	1933	14	FSM	ENSMUSG00000033793.13	ENSMUST00000044369.13	2049	14	35	81	5	29	multi-exon	FALSE	canonical	3	428	junction_7	59.3277926628703	816	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTTCTTAAATTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5153337	5232671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_5153502_5154639_5154787_5159231_5159335_5163585_5163676_5165837_5165952_5168251_5168357_5171292_5171347_5187612_5187711_5194499_5194693_5203306_5203486_5206034_5206161_5213972_5214075_5220170_5220285_5232327
tx.110	chr1	-	1801	3	FSM	ENSMUSG00000042215.9	ENSMUST00000044691.9	1860	3	59	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	4.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTAGCATTGGCCATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33796817	33784564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_33786098_33787297_33787408_33796659
tx.1100	chr1	+	752	3	ISM	ENSMUSG00000026615.15	ENSMUST00000192284.6	5638	20	38370	2446	1756	-2446	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2638	junction_2	84.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTGAGACGTGTTTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	185133610	185139950	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_185133866_185139157_185139392_185139687
tx.11000	chr2	+	435	2	ISM	ENSMUSG00000027303.19	ENSMUST00000077303.4	3066	22	101662	322	7673	-322	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	288	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCCTGGAAACTGGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130394125	130395621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_130394253_130395313
tx.11001	chr2	+	967	4	FSM	ENSMUSG00000037740.9	ENSMUST00000145614.2	4278	4	10	3301	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	506	junction_2	32.273139846559	813	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTGCCCATTTACTGGCT	395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130405671	130407314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_130405911_130406000_130406148_130406227_130406352_130406857
tx.11002	chr2	+	1040	3	FSM	ENSMUSG00000037740.9	ENSMUST00000046149.9	1057	3	17	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	543	junction_1	21	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTGCCCATTTACTGGCT	402	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130405678	130407314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_130405911_130406000_130406352_130406857
tx.11003	chr2	+	694	3	FSM	ENSMUSG00000027301.8	ENSMUST00000028764.6	537	3	-157	0	-157	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGACTGGTGTCTAATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130417935	130418974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_130418250_130418510_130418713_130418796
tx.11004	chr2	-	2378	6	FSM	ENSMUSG00000027300.11	ENSMUST00000028761.5	3731	6	25	1328	14	-1328	multi-exon	TRUE	canonical	3	59	junction_5	36.0477461153953	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGATTCCTCCTAGCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130471933	130433249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_130433935_130439217_130439377_130441433_130442632_130444476_130444573_130446404_130446547_130471835
tx.11005	chr2	-	1554	3	ISM	ENSMUSG00000027300.11	ENSMUST00000028761.5	3731	6	29815	1328	29804	-1328	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_1	14	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGATTCCTCCTAGCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130442143	130433249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_130433935_130439217_130439377_130441433
tx.11006	chr2	-	2521	7	NNC	ENSMUSG00000027300.11	novel	3731	6	NA	NA	18	-1328	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	113	junction_5	32.7078821624934	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGGATTCCTCCTAGCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130471929	130433249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_130433935_130439217_130439377_130441433_130442632_130444476_130444573_130446404_130446547_130470408_130470556_130471835
tx.11007	chr2	-	3175	3	NNC	ENSMUSG00000079043.4	novel	3015	2	NA	NA	-13	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	66	junction_1	74	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCACAAAGTCTTACTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130471960	130455759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_130458663_130470408_130470556_130471835
tx.11008	chr2	-	1120	9	FSM	ENSMUSG00000068290.12	ENSMUST00000089559.11	1238	9	44	74	44	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	130.411607995608	1174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCTTGTTGTTTGTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130506535	130495953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_130496243_130496581_130496631_130497105_130497163_130500219_130500259_130500508_130500632_130503656_130503759_130503996_130504110_130505267_130505475_130506394
tx.11009	chr2	-	1125	9	NNC	ENSMUSG00000068290.12	novel	1238	9	NA	NA	49	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	158	junction_6	79.2338311581612	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGCTTGTTGTTTGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130506530	130495954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_130496243_130496581_130496631_130497105_130497163_130500219_130500259_130500508_130500632_130503656_130503759_130503985_130504110_130505267_130505475_130506394
tx.1101	chr1	-	492	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000026615.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAGAAGAGGAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	185139943	185139155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_185139387_185139682
tx.11010	chr2	+	1192	8	FSM	ENSMUSG00000074797.12	ENSMUST00000103193.5	1390	8	198	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	338	junction_5	87.1842992792643	1319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGTCTGTCTTGAGTTT	5433	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130509727	130523534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_130509856_130513320_130513379_130513475_130513541_130513979_130514054_130516158_130516191_130517548_130517665_130521254_130521332_130522892
tx.11011	chr2	+	1187	7	NNC	ENSMUSG00000074797.12	novel	1390	8	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	191.914622220982	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGTCTGTCTTGAGTTT	5440	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130509734	130523534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_130509856_130513320_130513379_130513475_130513541_130513979_130514054_130517514_130517665_130521254_130521332_130522892
tx.11012	chr2	+	1184	7	NNC	ENSMUSG00000074797.12	novel	1390	8	NA	NA	5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	191.914622220982	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGTCTGTCTTGAGTTT	5438	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130509732	130523534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_130509856_130513320_130513379_130513475_130513541_130513979_130514054_130517519_130517665_130521254_130521332_130522892
tx.11013	chr2	-	1220	4	ISM	ENSMUSG00000074796.11	ENSMUST00000144945.8	2861	10	2872	0	2872	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_3	13.1993265821489	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGCAGTCGCCCTCCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130527613	130526032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_130526424_130526531_130526702_130526777_130526974_130527150
tx.11014	chr2	-	1113	5	ISM	ENSMUSG00000074796.11	ENSMUST00000099362.11	3196	21	11843	0	2889	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_4	16.4544826719043	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGCAGTCGCCCTCCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130527596	130526032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_130526424_130526531_130526702_130526777_130526974_130527150_130527325_130527414
tx.11015	chr2	+	243	2	Intergenic	novelGene_814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTCTGAGAATTTCAAACA	40	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130539570	130545961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_130539710_130545857
tx.11016	chr2	-	1307	8	Fusion	ENSMUSG00000089662.2_ENSMUSG00000027309.19	novel	1984	7	NA	NA	6	115	multi-exon	TRUE	canonical	3	31	junction_1	16.7063473211928	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTGGTGTGTATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130682046	130645305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr2_-_130645843_130648790_130648869_130652741_130652849_130654764_130654862_130656098_130656224_130662388_130662509_130664340_130664421_130681883
tx.11017	chr2	-	1978	7	FSM	ENSMUSG00000027309.19	ENSMUST00000110243.8	1984	7	13	-7	0	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_6	9.03081145609604	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATATTTTTTATTAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130682052	130647588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_130648869_130652741_130652849_130654764_130654862_130656098_130656224_130662388_130662509_130664340_130664421_130681883
tx.11018	chr2	+	519	3	Intergenic	novelGene_815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCGGTGGCAGAATGTTTG	5209	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130938362	130950321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_130938564_130948065_130948154_130950091
tx.11019	chr2	+	794	2	ISM	ENSMUSG00000074793.11	ENSMUST00000127862.2	2007	12	15423	1007	15423	-1007	internal_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGGAGAGAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130984836	130986140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_130985032_130985541
tx.1102	chr1	+	641	4	ISM	ENSMUSG00000026615.15	ENSMUST00000046514.13	4906	32	57106	5	20492	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3057	junction_3	18.8030730348939	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTATCTATTTGGTTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	185152346	185160552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_185152485_185156507_185156587_185160048_185160114_185160193
tx.11020	chr2	-	1286	6	FSM	ENSMUSG00000027327.17	ENSMUST00000103188.10	1241	6	-37	-8	-15	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	656	junction_1	33.1336686770421	2277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTTAGCGGGGGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131001977	130988236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_130988896_130989080_130989204_130990075_130990215_130993537_130993681_130995513_130995631_131001872
tx.11021	chr2	-	1510	7	FSM	ENSMUSG00000027329.10	ENSMUST00000110218.9	2600	7	369	721	-179	574	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	1.24721912892465	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCTGTGCCTGCCTTCTC	8401	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131016752	131012956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_131013711_131013821_131013946_131014123_131014179_131014289_131014330_131014542_131014700_131015115_131015228_131016484
tx.11022	chr2	+	3088	16	FSM	ENSMUSG00000027330.17	ENSMUST00000028804.15	3089	16	6	-5	-3	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_7	16.6951756171922	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTTTGTTATGCAGAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131028874	131040420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131029301_131030025_131030148_131030998_131031051_131033064_131033107_131033269_131033307_131033515_131033642_131033732_131033856_131034476_131034609_131034987_131035069_131035158_131035333_131035514_131035608_131036034_131036098_131036258_131036358_131036545_131036680_131038896_131039009_131039148
tx.11023	chr2	+	1588	3	FSM	ENSMUSG00000068264.12	ENSMUST00000110208.8	1521	3	-67	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_2	10	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTCCTCTTTTTGTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131052292	131055434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131052602_131053182_131053394_131054366
tx.11024	chr2	+	1377	2	FSM	ENSMUSG00000068264.12	ENSMUST00000134086.2	868	2	3	-512	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTCCTCTTTTTGTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131052292	131055434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131052602_131054366
tx.11025	chr2	+	2874	7	FSM	ENSMUSG00000037523.14	ENSMUST00000041362.12	2867	7	-7	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_4	7.24377127070024	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTGAGTTCCAAATTTC	7257	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131075979	131089945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131076048_131080655_131080831_131082234_131082413_131083799_131083970_131085038_131085193_131087122_131087590_131088283
tx.11026	chr2	+	692	4	ISM	ENSMUSG00000037514.19	ENSMUST00000138509.8	1791	9	19908	-1	8562	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	415	junction_2	62.3110477095889	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTGGAGGTCATCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131124666	131138612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_131124689_131129393_131129518_131135318_131135445_131138192
tx.11027	chr2	-	2219	6	FSM	ENSMUSG00000048911.16	ENSMUST00000059372.11	5978	6	35	3724	16	858	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	4.63033476111609	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGCTGTTCCCAGTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131194766	131143707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_131145501_131146171_131146252_131147571_131147614_131150394_131150438_131155082_131155233_131194655
tx.11028	chr2	+	1378	6	FSM	ENSMUSG00000027333.19	ENSMUST00000110179.9	1320	6	-60	2	-40	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	49.3128786423993	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCCTTTGCTTCTCTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131333802	131367090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131333957_131353903_131354138_131358136_131358364_131362014_131362189_131363978_131364140_131366662
tx.11029	chr2	+	2227	8	FSM	ENSMUSG00000027333.19	ENSMUST00000110186.9	2170	8	-63	6	-43	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_6	48.183746942177	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCACGCTCCTTTGCTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131333799	131367086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131333957_131353903_131354138_131358136_131358364_131362014_131362189_131362331_131363092_131363978_131364140_131366163_131366254_131366662
tx.11030	chr2	+	1723	8	FSM	ENSMUSG00000027333.19	ENSMUST00000110180.2	1617	8	-104	-2	-34	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	45.6709616134134	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTCCTTTGCTTCTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131333808	131367089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131333957_131353903_131354138_131358136_131358364_131362014_131362189_131362331_131362567_131362974_131363092_131363978_131364140_131366662
tx.11031	chr2	+	2131	7	FSM	ENSMUSG00000027333.19	ENSMUST00000028806.12	2270	7	125	14	-34	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_6	10.8269211792745	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTCCTTTGCTTCTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131333808	131367089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131333957_131353903_131354138_131358136_131358364_131362014_131362189_131362331_131363092_131363978_131364140_131366662
tx.11032	chr2	+	1917	6	ISM	ENSMUSG00000027333.19	ENSMUST00000028806.12	2270	7	20289	11	3101	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	113	junction_5	11.7881296226331	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTGCTTCTCTCCTCAG	963	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131353972	131367092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_131354138_131358136_131358364_131362014_131362189_131362331_131363092_131363978_131364140_131366662
tx.11033	chr2	+	1087	3	ISM	ENSMUSG00000027333.19	ENSMUST00000110180.2	1617	8	28680	-2	487	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	113	junction_2	10.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTCCTTTGCTTCTCTCCT	9583	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131362592	131367089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_131363092_131363978_131364140_131366662
tx.11034	chr2	+	1177	4	ISM	ENSMUSG00000027333.19	ENSMUST00000110186.9	2170	8	28730	3	487	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_2	47.3919824442911	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTCCTTTGCTTCTCTCCT	9583	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131362592	131367089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_131363092_131363978_131364140_131366163_131366254_131366662
tx.11035	chr2	+	1731	3	Intergenic	novelGene_816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGTGTGAATTTATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131684738	131696147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_131685177_131692277_131692491_131695067
tx.11036	chr2	+	2160	3	FSM	ENSMUSG00000079037.10	ENSMUST00000091288.13	2184	3	24	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_2	0.5	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGGCGGGGTTTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131751871	131780349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131751924_131754114_131754213_131778339
tx.11037	chr2	+	2109	2	ISM	ENSMUSG00000079037.10	ENSMUST00000091288.13	2184	3	2265	1	2251	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACACCTGGCGGGGTTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131754112	131780348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_131754213_131778339
tx.11038	chr2	-	2023	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027338.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTTGTGGTATGACCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131796908	131794347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_131796196_131796733
tx.11039	chr2	-	2972	11	FSM	ENSMUSG00000027339.16	ENSMUST00000028814.15	8233	11	110	5151	110	-1714	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_10	8.85494212290515	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTCTTCCCGTTATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131871811	131836485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_131838374_131840164_131840263_131842352_131842475_131843605_131843658_131844801_131844904_131846218_131846380_131847227_131847317_131849285_131849438_131851605_131851682_131854481_131854573_131871670
tx.1104	chr1	-	1409	5	FSM	ENSMUSG00000039246.9	ENSMUST00000045388.8	1578	5	22	147	0	-147	multi-exon	FALSE	canonical	3	108	junction_3	16.3477827242718	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGACTTTCAGATTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	185849485	185820074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_185820966_185821640_185821757_185832389_185832560_185846460_185846561_185849353
tx.11040	chr2	-	1579	4	FSM	ENSMUSG00000027341.11	ENSMUST00000028816.9	1612	4	33	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	556	junction_2	26.7332502076846	1258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGTGTTGTTATTGAT	4903	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132089694	132081411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_132082547_132085938_132086062_132087875_132087995_132089492
tx.11041	chr2	-	1290	6	FSM	ENSMUSG00000027342.15	ENSMUST00000028817.7	1518	6	104	124	104	-124	multi-exon	FALSE	canonical	3	1968	junction_1	234.222629137323	7333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAGCAGTGCCGCCTTTGT	8329	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132095130	132091205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_132091616_132091693_132091818_132093163_132093359_132093610_132093679_132093822_132093921_132094735
tx.11042	chr2	+	510	2	FSM	ENSMUSG00000087377.2	ENSMUST00000124336.2	921	2	0	411	0	-411	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTTTCTAGAATGTCCG	545	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132095276	132102842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_132095450_132102505
tx.11043	chr2	+	1422	13	NNC	ENSMUSG00000058793.15	novel	8073	13	NA	NA	-9	58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	134.366491978717	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGTCATTTTTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132127849	132147306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_132127886_132135164_132135302_132136303_132136401_132137450_132137549_132139144_132139289_132139553_132139613_132140388_132140472_132142473_132142562_132143151_132143221_132143999_132144153_132146278_132146399_132146772_132146877_132147072
tx.11044	chr2	+	1413	13	NNC	ENSMUSG00000058793.15	novel	627	5	NA	NA	3461	58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	154.594361691061	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGTCATTTTTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132131319	132147306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_132131347_132135164_132135302_132136303_132136401_132137450_132137549_132139144_132139289_132139553_132139613_132140388_132140472_132142473_132142562_132143151_132143221_132143999_132144153_132146278_132146399_132146772_132146877_132147072
tx.11045	chr2	+	1387	12	NNC	ENSMUSG00000058793.15	novel	8396	13	NA	NA	7305	58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	120.441886127229	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGTCATTTTTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132135163	132147306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_132135302_132136303_132136401_132137450_132137549_132139144_132139289_132139553_132139613_132140388_132140472_132142473_132142562_132143151_132143221_132143999_132144153_132146278_132146399_132146772_132146877_132147072
tx.11046	chr2	-	529	4	ISM	ENSMUSG00000027346.16	ENSMUST00000148833.8	3431	18	-21	35400	-12	145	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_3	12.8322510366134	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGGAAGGAAGAAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132420119	132406401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_132406632_132410539_132410637_132414104_132414175_132419987
tx.11047	chr2	+	1073	3	FSM	ENSMUSG00000044991.11	ENSMUST00000061891.11	1076	3	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	20.5	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGACTCAGTCTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132528853	132592975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_132528902_132533869_132534052_132592132
tx.11048	chr2	+	1026	2	ISM	ENSMUSG00000044991.11	ENSMUST00000110132.3	1471	3	1666	0	1666	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_1	0	219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGACTCAGTCTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132533868	132592975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_132534052_132592132
tx.11049	chr2	-	2806	11	FSM	ENSMUSG00000037376.15	ENSMUST00000039554.7	2828	11	19	3	19	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	339	junction_5	30.9683709613535	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTCATTAATGATACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132657955	132646129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_132647533_132648630_132648718_132648816_132648920_132650123_132650210_132650580_132650937_132651748_132651874_132652125_132652210_132652336_132652429_132652908_132653019_132653967_132654096_132657723
tx.1105	chr1	-	1238	4	FSM	ENSMUSG00000039246.9	ENSMUST00000195481.2	584	4	0	-654	0	-148	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	56.8174464598878	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTGACTTTCAGATTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	185849485	185820075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_185820966_185821640_185821757_185846460_185846561_185849353
tx.11050	chr2	-	567	4	ISM	ENSMUSG00000037376.15	ENSMUST00000039554.7	2828	11	15	6209	15	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	367	junction_2	42.9055810925442	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCACATTACTTGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132657959	132652335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_132652429_132652908_132653019_132653967_132654096_132657723
tx.11051	chr2	-	473	3	ISM	ENSMUSG00000037376.15	ENSMUST00000039554.7	2828	11	17	6781	17	-546	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	367	junction_1	46	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAACGGATTCTTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132657957	132652907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_132653019_132653967_132654096_132657723
tx.11052	chr2	+	568	4	ISM	ENSMUSG00000027353.15	ENSMUST00000028831.15	3179	19	23455	188	23372	-188	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_3	19.6015872373189	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAAGAGTAAATTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132681515	132685627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_132681584_132682663_132682741_132684522_132684713_132685394
tx.11053	chr2	+	693	3	ISM	ENSMUSG00000027353.15	ENSMUST00000028831.15	3179	19	24601	-3	24518	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_2	21.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTTCAGGTCACAAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132682661	132685818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_132682741_132684522_132684713_132685394
tx.11054	chr2	+	403	2	ISM	ENSMUSG00000027357.17	ENSMUST00000154160.2	720	7	16358	-266	16358	266	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	811	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTAGGTTTTTGATTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132706015	132708073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_132706102_132707756
tx.11055	chr2	-	1083	3	ISM	ENSMUSG00000043110.3	ENSMUST00000049787.3	3715	5	-26	9635	-26	-9635	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCAATCCTTACTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132722837	132719859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_132720138_132721154_132721836_132722713
tx.11056	chr2	-	688	4	ISM	ENSMUSG00000027356.9	ENSMUST00000134937.2	5236	14	86	31710	86	14	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAGAAAAAAATAGTA	6071	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132787463	132778018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_132778083_132781201_132781436_132783856_132784026_132787242
tx.11057	chr2	-	1175	8	FSM	ENSMUSG00000034723.12	ENSMUST00000038228.11	5488	8	11	4302	-2	516	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_5	5.36808406515884	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTCTGTTTCCCTCTGGT	2703	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134486054	134440406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_134440786_134441929_134441994_134442807_134442910_134451450_134451497_134462474_134462604_134463307_134463354_134481641_134481758_134485761
tx.11058	chr2	-	1533	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083879.5	novel	807	1	NA	NA	-18	771	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAACTCAGGTGGTGGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134605568	134603972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_134605350_134605412
tx.11059	chr2	+	422	3	NNC	ENSMUSG00000084762.2	novel	412	4	NA	NA	-2384	-2580	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	453	junction_1	119.5	548	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAAAAACCTTGATTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135488442	135491403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_135488469_135490846_135490892_135491052
tx.1106	chr1	-	663	2	ISM	ENSMUSG00000001305.6	ENSMUST00000162336.2	3092	4	13008	-6	13008	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1064	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGCTTCCCTGCTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	186468514	186453282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_186453744_186468312
tx.11060	chr2	+	560	6	NNC	ENSMUSG00000084762.2	novel	412	4	NA	NA	-2384	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_5	272.795454507585	697	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAGCCCAAAATCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135488442	135493987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_135488469_135490846_135490892_135491052_135491123_135492537_135492672_135493417_135493482_135493766
tx.11061	chr2	+	426	5	NNC	ENSMUSG00000084762.2	novel	412	4	NA	NA	-2384	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_4	251.746400172872	2414	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAGCCCAAAATCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135488442	135493987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_135488469_135490846_135490892_135491052_135491123_135493417_135493482_135493766
tx.11062	chr2	+	395	4	NNC	ENSMUSG00000084762.2	novel	412	4	NA	NA	-2384	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	286.975415129744	906	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAGCCCAAAATCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135488442	135493987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_135488469_135490846_135490892_135491052_135491123_135493733
tx.11063	chr2	+	356	4	NNC	ENSMUSG00000084762.2	novel	412	4	NA	NA	-2384	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	189.342722771874	798	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAGCCCAAAATCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135488442	135493987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_135488469_135490846_135490892_135493417_135493482_135493766
tx.11064	chr2	+	401	4	NNC	ENSMUSG00000084762.2	novel	412	4	NA	NA	19	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	289.034023372105	782	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAGCCCAAAATCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135490845	135493987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_135490892_135491052_135491123_135493417_135493482_135493766
tx.11065	chr2	+	331	3	NNC	ENSMUSG00000084762.2	novel	412	4	NA	NA	19	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	68	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAGCCCAAAATCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135490845	135493987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_135490892_135493417_135493482_135493766
tx.11066	chr2	-	482	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084762.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135498692	135492498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_135492806_135498517
tx.11067	chr2	-	437	2	FSM	ENSMUSG00000086928.2	ENSMUST00000140949.2	503	2	66	0	66	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTCATACATTCTTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135654781	135653864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_135654220_135654699
tx.11068	chr2	-	724	3	FSM	ENSMUSG00000115423.3	ENSMUST00000227806.2	944	3	220	0	220	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	323	junction_1	8.5	1663	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAAGCTGCCTTCACAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136733089	136723190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_136723560_136727392_136727621_136732962
tx.11069	chr2	+	205	2	Intergenic	novelGene_818	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATCGCTTACATCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137108029	137108277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_137108183_137108225
tx.1107	chr1	-	745	3	ISM	ENSMUSG00000001305.6	ENSMUST00000162336.2	3092	4	11653	-6	11653	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1064	junction_1	19	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGCTTCCCTGCTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	186469869	186453282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_186453744_186468312_186468512_186469784
tx.11070	chr2	-	3390	14	FSM	ENSMUSG00000045624.16	ENSMUST00000046030.8	3396	14	6	0	6	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	379	junction_8	12.585330053057	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCCGTTTGTATAGCATT	6983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140012478	139961802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_139962826_139965450_139965598_139966847_139966925_139971119_139971208_139980852_139980975_139990672_139990835_139996713_139996862_139998974_139999090_140000399_140000553_140001613_140001715_140002302_140002417_140006128_140006503_140009691_140010376_140012396
tx.11071	chr2	-	471	2	ISM	ENSMUSG00000045624.16	ENSMUST00000046030.8	3396	14	13	48177	13	-8697	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	434	junction_1	0	556	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAAGAAAACTGACCAAAAG	6990	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140012471	140009979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_140010376_140012396
tx.11072	chr2	+	1092	11	FSM	ENSMUSG00000027384.7	ENSMUST00000044825.5	1166	11	25	49	25	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	226	junction_10	17.7042367810646	885	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTCCCAGAATTTTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140012593	140045560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_140012854_140013946_140013988_140019153_140019218_140023493_140023542_140025817_140025922_140029663_140029704_140030634_140030833_140035502_140035564_140044785_140044870_140045207_140045291_140045451
tx.11073	chr2	+	772	3	NNC	ENSMUSG00000068205.15	novel	852	5	NA	NA	0	-3105	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_2	33	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGGAACAATACATAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140237375	140259310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_140237642_140242781_140242899_140258921
tx.11074	chr2	+	1089	4	FSM	ENSMUSG00000068205.15	ENSMUST00000043836.8	3552	4	4	2459	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_3	7.40870359029762	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGATTCCTGTTTATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140237358	140262415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_140237642_140242781_140242899_140260736_140260835_140261824
tx.11075	chr2	+	511	3	ISM	ENSMUSG00000068205.15	ENSMUST00000150460.8	762	4	-6	57449	1	29732	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_2	35	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTGGTTCACTTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140237355	140294606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_140237642_140242781_140242899_140294498
tx.11076	chr2	-	2915	3	FSM	ENSMUSG00000051379.13	ENSMUST00000110057.3	3977	3	0	1062	0	65	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	10.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGTTCCAATGGTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140513389	140501179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_140503672_140505180_140505380_140513165
tx.11077	chr2	-	5096	26	FSM	ENSMUSG00000038844.11	ENSMUST00000043589.8	6383	26	99	1188	12	49	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_14	9.18050107564941	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGTAGTTCAGTTTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142743352	142460581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_142461837_142490347_142490432_142514208_142514299_142532498_142532622_142544542_142544594_142545861_142545959_142549178_142549332_142553614_142554959_142556598_142556653_142581442_142581532_142582828_142582912_142598008_142598147_142599816_142599869_142600709_142600830_142675996_142676057_142679436_142679503_142688848_142689025_142689910_142690043_142690212_142690382_142691783_142691927_142695546_142695657_142696353_142696452_142699230_142699348_142704346_142704461_142707263_142707334_142743244
tx.11078	chr2	+	954	7	FSM	ENSMUSG00000008333.13	ENSMUST00000008477.13	2061	7	0	1107	0	-1107	multi-exon	FALSE	canonical	3	784	junction_1	113.59540777103	1969	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGGTTTATTGTCCTAT	1988	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142904958	142913666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_142905019_142906461_142906551_142907095_142907269_142910180_142910322_142911293_142911345_142912807_142912897_142913315
tx.11079	chr2	+	895	6	ISM	ENSMUSG00000008333.13	ENSMUST00000008477.13	2061	7	1501	1108	138	-1108	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	918	junction_5	81.7518195516161	537	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTGGTTTATTGTCCTA	3489	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142906459	142913665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_142906551_142907095_142907269_142910180_142910322_142911293_142911345_142912807_142912897_142913315
tx.1108	chr1	-	921	4	ISM	ENSMUSG00000001305.6	ENSMUST00000001339.6	1321	5	9592	108	9559	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	944	junction_3	67.3366335824878	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGCTTCCCTGCTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	186471963	186453282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_186453744_186468312_186468512_186469784_186469883_186471800
tx.11080	chr2	+	1703	4	FSM	ENSMUSG00000015932.9	ENSMUST00000103172.4	1911	4	208	0	208	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1386	junction_2	119.658774112984	4225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTTCTTTGTGTGGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143757447	143785244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_143757568_143780304_143780613_143781871_143781949_143784046
tx.11081	chr2	-	1297	2	ISM	ENSMUSG00000027422.16	ENSMUST00000037875.6	2701	3	22126	10	-5972	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTGAAACAATCCAGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143831057	143827782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_143828090_143830067
tx.11082	chr2	-	465	2	ISM	ENSMUSG00000027422.16	ENSMUST00000037875.6	2701	3	55	4159	55	-4159	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAATGGGAAGATACCTGA	9813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143853128	143831931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_143832187_143852918
tx.11083	chr2	-	1455	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082480.2_ENSMUSG00000082436.2	novel	886	1	NA	NA	0	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATATATATATATATATAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144103461	143984368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_143985389_144103026
tx.11084	chr2	-	1915	13	FSM	ENSMUSG00000027423.16	ENSMUST00000028909.5	2419	13	94	410	94	-410	multi-exon	FALSE	canonical	3	1195	junction_10	117.133352305064	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATATGGAGTGCTTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144112398	144092452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_144093153_144094364_144094451_144095581_144095742_144096645_144096733_144096822_144096863_144097259_144097336_144097418_144097525_144099019_144099116_144099789_144099914_144100976_144101099_144102644_144102756_144103839_144103945_144112296
tx.11085	chr2	-	1989	14	FSM	ENSMUSG00000027423.16	ENSMUST00000110030.10	2512	14	113	410	-9	-410	multi-exon	FALSE	canonical	3	1124	junction_13	126.932773522376	429	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATATGGAGTGCTTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144112713	144092452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_144093153_144094364_144094451_144095581_144095742_144096645_144096733_144096822_144096863_144097259_144097336_144097418_144097525_144099019_144099116_144099789_144099914_144100976_144101099_144102644_144102756_144103839_144103945_144112296_144112380_144112620
tx.11086	chr2	+	2052	5	FSM	ENSMUSG00000027424.12	ENSMUST00000110028.8	2308	5	255	1	18	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	188.862383761299	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTAGTCTTTCAGTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144112837	144122435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_144112935_144113834_144114405_144118234_144118452_144120913_144121047_144121400
tx.11087	chr2	+	790	2	ISM	ENSMUSG00000027424.12	ENSMUST00000028910.9	2840	5	83	8613	42	-7902	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	360	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCTTAATCTTCGTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144112902	144114534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_144112993_144113834
tx.11088	chr2	+	2014	5	FSM	ENSMUSG00000027424.12	ENSMUST00000028910.9	2840	5	114	712	73	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	360	junction_1	65.1517459474418	329	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTAGTCTTTCAGTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144112933	144122435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_144112993_144113834_144114405_144118234_144118452_144120913_144121047_144121400
tx.11089	chr2	-	1125	3	ISM	ENSMUSG00000037279.14	ENSMUST00000103171.10	1547	4	602	0	233	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	5.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCTTTTTTAAAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144173013	144147094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_144147840_144159630_144159821_144172823
tx.1109	chr1	-	1187	5	FSM	ENSMUSG00000001305.6	ENSMUST00000001339.6	1321	5	26	108	-7	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	944	junction_3	58.7962583843564	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGCTTCCCTGCTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	186481529	186453282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_186453744_186468312_186468512_186469784_186469883_186471800_186472061_186481360
tx.11090	chr2	-	1531	4	FSM	ENSMUSG00000037279.14	ENSMUST00000037423.4	1539	4	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	4.64279609239471	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCTTTTTTAAAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144174058	144147094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_144147840_144159630_144159821_144172823_144173042_144173680
tx.11091	chr2	+	910	2	FSM	ENSMUSG00000098387.3	ENSMUST00000183618.3	693	2	15	-232	15	232	multi-exon	FALSE	canonical	3	459	junction_1	0	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCATTATTATTATTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144210930	144215873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_144211078_144215110
tx.11092	chr2	+	1298	3	FSM	ENSMUSG00000083674.4	ENSMUST00000124788.2	1079	3	-218	-1	-218	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAAGTGTACGTTTTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144300981	144309715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_144301321_144306398_144306495_144308852
tx.11093	chr2	+	1390	4	NNC	ENSMUSG00000083674.4	novel	1079	3	NA	NA	-205	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.10960933531265	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCACTCAAGTGTACGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144300994	144309709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_144301321_144305759_144305871_144306398_144306495_144308852
tx.11094	chr2	-	577	3	ISM	ENSMUSG00000037259.16	ENSMUST00000124823.8	2038	6	-54	13423	-4	217	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGCCTCCTGAGTGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144369338	144364165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_144364487_144367499_144367617_144369199
tx.11095	chr2	+	1864	9	FSM	ENSMUSG00000027427.14	ENSMUST00000028914.9	4403	9	30	2509	0	592	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_5	6.30352084156148	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGCCCTTCATTCAGTCT	627	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144369667	144381406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_144369846_144370622_144370741_144374273_144374342_144375077_144375146_144376218_144376332_144377860_144378005_144378202_144378311_144379085_144379278_144380531
tx.11096	chr2	+	553	2	ISM	ENSMUSG00000027427.14	ENSMUST00000134051.2	690	3	988	-76	988	76	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAACGAGAAGATGTTCACT	3727	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144379083	144380890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_144379278_144380531
tx.11097	chr2	-	2130	5	FSM	ENSMUSG00000027428.10	ENSMUST00000028915.6	2170	5	40	0	-39	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_1	20.0873094266007	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCTGACTGCTGTGGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144392749	144384184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_144385930_144386293_144386380_144389913_144390020_144391023_144391067_144392599
tx.11098	chr2	+	2762	20	NIC	ENSMUSG00000027429.17	novel	2779	20	NA	NA	-5	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	371	junction_1	64.9806278398403	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATGCAGATTTTGTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144398170	144432665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_144398245_144401126_144401362_144404051_144404110_144406485_144406573_144408682_144408920_144409020_144409107_144409802_144409948_144410535_144410695_144411019_144411136_144414398_144414523_144416586_144416668_144420251_144420342_144421216_144421324_144423863_144424018_144425610_144425689_144427517_144427680_144428293_144428381_144428785_144428942_144429421_144429488_144432205
tx.11099	chr2	+	555	3	ISM	ENSMUSG00000027429.17	ENSMUST00000128210.2	2417	17	22095	3	9871	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	606	junction_1	33.5	331	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGCAGATTTTGTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144428913	144432666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_144428942_144429421_144429488_144432205
tx.111	chr1	-	2246	6	ISM	ENSMUSG00000042197.14	ENSMUST00000139143.8	3578	13	37061	0	6613	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	264	junction_2	25.1284699096463	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGAGGAAATTTTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33816405	33800625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_33801291_33804924_33804991_33808801_33808989_33809849_33809981_33811973_33812115_33815349
tx.11100	chr2	+	528	2	ISM	ENSMUSG00000027429.17	ENSMUST00000128210.2	2417	17	22601	4	10377	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	673	junction_1	0	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATGCAGATTTTGTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144429419	144432665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_144429488_144432205
tx.11101	chr2	+	459	2	FSM	ENSMUSG00000074754.5	ENSMUST00000136628.2	471	2	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	228	junction_1	0	3501	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACCAGTGTCTTCTTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144435985	144437286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_144436126_144436967
tx.11102	chr2	+	1243	6	FSM	ENSMUSG00000027430.13	ENSMUST00000028917.7	1350	6	72	35	72	-35	multi-exon	TRUE	canonical	3	290	junction_5	10.373041983912	559	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTTTATTATTAAATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144441888	144610643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_144442012_144445707_144445799_144459111_144459348_144477677_144477785_144588820_144588994_144610130
tx.11103	chr2	+	2186	4	NNC	ENSMUSG00000001768.17	novel	1668	5	NA	NA	114	-54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.24721912892465	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGGGGATGGGAATACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145517400	145556855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_145517505_145519003_145519100_145554374_145554499_145554993
tx.11104	chr2	+	1019	6	FSM	ENSMUSG00000002728.15	ENSMUST00000110000.8	1142	6	16	107	0	-107	multi-exon	FALSE	canonical	3	961	junction_2	184.608775522725	2666	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTCTGGAAGTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145745176	145758238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_145745283_145750510_145750536_145753592_145753684_145754312_145754449_145757453_145757600_145757723
tx.11105	chr2	+	1049	6	FSM	ENSMUSG00000002728.15	ENSMUST00000002805.14	1172	6	16	107	0	-107	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_3	436.248094551713	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTCTGGAAGTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145745176	145758238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_145745283_145750510_145750536_145753592_145753714_145754312_145754449_145757453_145757600_145757723
tx.11106	chr2	+	994	5	NIC	ENSMUSG00000002728.15	novel	1142	6	NA	NA	0	-107	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	559.902223606944	411	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTCTGGAAGTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145745176	145758238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_145745283_145753592_145753684_145754312_145754449_145757453_145757600_145757723
tx.11107	chr2	-	2350	14	FSM	ENSMUSG00000001767.6	ENSMUST00000001818.5	3428	14	298	780	-2	-780	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_8	24.6650940380394	211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGTTACTTGAGTCCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145776636	145760178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_145760521_145761659_145761909_145762516_145762619_145763691_145763932_145765763_145765845_145766634_145766695_145767427_145767620_145768695_145768867_145770040_145770220_145772453_145772621_145773189_145773349_145774165_145774258_145774732_145774886_145776473
tx.11108	chr2	+	749	3	NNC	ENSMUSG00000037143.18	novel	640	6	NA	NA	-13	-9606	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGTCTCTTACTGCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145776690	145786128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_145776761_145781759_145781912_145785601
tx.11109	chr2	+	1117	5	ISM	ENSMUSG00000074749.11	ENSMUST00000099278.9	2183	14	8	80439	8	363	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	117	junction_3	13.1244047484067	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTCAGGTGAGATGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146697791	146731578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_146697964_146703039_146703103_146705626_146705790_146712685_146712767_146730940
tx.1111	chr1	-	1793	3	FSM	ENSMUSG00000026608.14	ENSMUST00000192200.2	908	3	271	-1156	-111	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	202	junction_2	16	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGTGTCTTCAGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	188706548	188703291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_188704881_188706262_188706402_188706483
tx.11110	chr2	+	2171	14	FSM	ENSMUSG00000074749.11	ENSMUST00000099278.9	2183	14	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_6	16.1728825562271	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCACTGTAATTAGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146697795	146812017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_146697964_146703039_146703103_146705626_146705790_146712685_146712767_146730940_146731587_146732900_146733205_146777722_146777805_146783929_146784096_146784836_146784900_146792442_146792509_146794897_146794985_146798119_146798217_146811463_146811508_146811876
tx.11111	chr2	+	2083	13	NIC	ENSMUSG00000074749.11	novel	2183	14	NA	NA	19	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	7	junction_3	33.9094996522607	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCACTGTAATTAGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146697802	146812017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_146697964_146703039_146703103_146705626_146705790_146730940_146731587_146732900_146733205_146777722_146777805_146783929_146784096_146784836_146784900_146792442_146792509_146794897_146794985_146798119_146798217_146811463_146811508_146811876
tx.11112	chr2	+	1646	10	ISM	ENSMUSG00000074749.11	ENSMUST00000099278.9	2183	14	33207	0	33162	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_2	12.3117930015729	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCACTGTAATTAGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146730990	146812017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_146731587_146732900_146733205_146777722_146777805_146783929_146784096_146784836_146784900_146792442_146792509_146794897_146794985_146798119_146798217_146811463_146811508_146811876
tx.11113	chr2	+	1364	14	ISM	ENSMUSG00000027433.6	ENSMUST00000028921.6	3434	30	30	43112	30	-3399	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	956	junction_9	69.62707084233	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGATGAAGGTGAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146854945	146876808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_146855117_146866427_146866556_146866634_146866747_146867114_146867227_146868300_146868360_146868434_146868525_146869226_146869300_146869514_146869566_146870012_146870171_146871257_146871333_146871414_146871549_146871646_146871705_146871788_146871897_146876773
tx.11114	chr2	+	3403	30	FSM	ENSMUSG00000027433.6	ENSMUST00000028921.6	3434	30	31	0	31	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	956	junction_9	74.1082057489866	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGGTGTCTGGTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146854946	146919920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_146855117_146866427_146866556_146866634_146866747_146867114_146867227_146868300_146868360_146868434_146868525_146869226_146869300_146869514_146869566_146870012_146870171_146871257_146871333_146871414_146871549_146871646_146871705_146871788_146871897_146876773_146876819_146878583_146878716_146880088_146880208_146882735_146882872_146883907_146884016_146884093_146884184_146884779_146884853_146889554_146889639_146891211_146891310_146891902_146891983_146893632_146893690_146903168_146903238_146903325_146903458_146905152_146905281_146910711_146910776_146916804_146916947_146919402
tx.11115	chr2	+	1767	14	ISM	ENSMUSG00000027433.6	ENSMUST00000028921.6	3434	30	27832	0	-1718	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	994	junction_12	78.2074316600661	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGGTGTCTGGTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146882747	146919920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_146882872_146883907_146884016_146884093_146884184_146884779_146884853_146889554_146889639_146891211_146891310_146891902_146891983_146893632_146893690_146903168_146903238_146903325_146903458_146905152_146905281_146910711_146910776_146916804_146916947_146919402
tx.11116	chr2	+	570	2	ISM	ENSMUSG00000027433.6	ENSMUST00000028921.6	3434	30	61979	0	13535	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1236	junction_1	0	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGGTGTCTGGTGTCTGA	8529	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146916894	146919920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_146916947_146919402
tx.11117	chr2	-	924	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036992.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCAGGCGCTAGCATCCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148517949	148514563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_148514738_148517199
tx.11118	chr2	+	938	2	FSM	ENSMUSG00000036992.11	ENSMUST00000047177.4	956	2	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	586	junction_1	0	2637	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATGTCTAAATCTTGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148514563	148517947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_148514756_148517201
tx.11119	chr2	+	1774	5	ISM	ENSMUSG00000027439.10	ENSMUST00000028928.8	4232	6	90	2841	90	-107	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	12.7573508221731	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGTTCACCCAGGTAAAT	461	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148523032	148532028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_148523136_148525513_148526889_148528433_148528529_148529923_148530092_148531995
tx.1112	chr1	-	3119	13	ISM	ENSMUSG00000026608.14	ENSMUST00000085678.8	3706	18	10841	0	717	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	165	junction_10	20.4469163662614	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGTGTCTTCAGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	188729196	188703291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_188704881_188706262_188706402_188706483_188706669_188708807_188708905_188710693_188710850_188713421_188713593_188715206_188715324_188715403_188715492_188719712_188719829_188724759_188724951_188727938_188728030_188728596_188728738_188729158
tx.11120	chr2	+	4094	6	FSM	ENSMUSG00000027439.10	ENSMUST00000028928.8	4232	6	138	0	-50	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	11.7983049630021	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGTCTGCTTTGTAAAAG	509	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148523080	148534869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_148523136_148525513_148526889_148528433_148528529_148529923_148530092_148531995_148532154_148532626
tx.11121	chr2	+	787	2	ISM	ENSMUSG00000027439.10	ENSMUST00000028928.8	4232	6	140	8622	-48	278	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACAAGAAGGCTCCGAGA	511	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148523082	148526247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_148523136_148525513
tx.11122	chr2	-	653	4	NNC	ENSMUSG00000027438.15	novel	3087	4	NA	NA	-2	-2359	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.64997911442	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGCTATCTTTAGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148574335	148550696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_148551003_148551236_148551354_148554594_148554675_148574185
tx.11123	chr2	-	438	2	ISM	ENSMUSG00000027447.7	ENSMUST00000028938.7	860	3	2644	0	2519	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2071	junction_1	0	713	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTTTGAGTTGTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148714852	148713641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_148713964_148714736
tx.11124	chr2	-	772	3	FSM	ENSMUSG00000027447.7	ENSMUST00000028938.7	860	3	88	0	-37	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2071	junction_1	68	14329	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTTTGAGTTGTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148717408	148713641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_148713964_148714736_148714851_148717072
tx.11125	chr2	+	712	2	Intergenic	novelGene_819	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACATGTAAGTAAGTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149451069	149469096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_149451324_149468638
tx.11126	chr2	+	1998	4	FSM	ENSMUSG00000074736.11	ENSMUST00000109935.8	2050	4	0	52	0	-52	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	14.290634073484	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTTTGCTTACGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149672707	149846260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_149672846_149741337_149741896_149772824_149772963_149845096
tx.11127	chr2	+	1967	4	NIC	ENSMUSG00000074736.11	novel	620	2	NA	NA	49	-52	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	3	junction_1	14.7044966667418	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTTTGCTTACGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149672890	149846260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_149672998_149741337_149741896_149772824_149772963_149845096
tx.11128	chr2	+	1500	3	ISM	ENSMUSG00000074736.11	ENSMUST00000109934.2	2081	5	68935	52	68856	-52	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_2	8.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTTTGCTTACGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149741697	149846260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_149741896_149772824_149772963_149845096
tx.11129	chr2	-	2301	4	FSM	ENSMUSG00000068134.14	ENSMUST00000089207.13	4127	4	23	1803	-7	947	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	10.2089285540757	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAATGGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149978605	149958128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_149960121_149961484_149961549_149961744_149961872_149978487
tx.11130	chr2	-	1619	3	FSM	ENSMUSG00000068134.14	ENSMUST00000109931.8	4033	3	12	2402	-10	348	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	23.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTGTGTATTTTAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149978586	149958727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_149960121_149961744_149961872_149978487
tx.11131	chr2	+	837	4	FSM	ENSMUSG00000079009.9	ENSMUST00000109926.8	1728	4	4	887	4	-760	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_3	16.0485374896143	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTGTGACCAGTGTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150023678	150034312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_150023791_150032312_150032440_150032638_150032700_150033775
tx.11132	chr2	+	627	4	NNC	ENSMUSG00000079009.9	novel	1728	4	NA	NA	4	12937	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_3	25.381533094402	115	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTTGTCTTGGCCTCGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150023678	150048136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_150023791_150032312_150032440_150032638_150032700_150047809
tx.11133	chr2	+	394	4	FSM	ENSMUSG00000079008.3	ENSMUST00000109922.2	3018	4	0	2624	0	-2624	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	13.8804418757713	526	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCATAATGCAGAGACACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150099436	150109596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_150099549_150108044_150108172_150108370_150108432_150109502
tx.11134	chr2	+	2117	4	FSM	ENSMUSG00000095315.3	ENSMUST00000238230.2	2159	4	40	2	40	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_3	5.43650214343336	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCACATTTTGGGGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150153390	150168930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_150153479_150165621_150165749_150165947_150166009_150167089
tx.11135	chr2	-	2494	4	NIC	ENSMUSG00000063364.11	novel	745	5	NA	NA	0	1831	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_1	3.29983164553722	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGATGTGATGTGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150204662	150182924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_150185076_150186228_150186290_150186499_150186627_150204507
tx.11136	chr2	-	2396	5	NNC	ENSMUSG00000063364.11	novel	745	5	NA	NA	8	1801	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	8.03118920210451	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGACAAGTGCCAACAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150204677	150182954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_150184778_150184860_150185076_150186228_150186290_150186499_150186627_150204507
tx.11137	chr2	-	441	4	NNC	ENSMUSG00000068130.12	novel	2922	4	NA	NA	-1	4663	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.31245915016974	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTGGTCATGGCATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150293407	150244397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_150244565_150252860_150252922_150253130_150253258_150293321
tx.11138	chr2	-	3282	4	FSM	ENSMUSG00000068130.12	ENSMUST00000109916.8	2922	4	-11	-349	-11	349	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	3.29983164553722	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAACTAAAGTTAAAGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150293417	150248711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_150251710_150252860_150252922_150253130_150253258_150293321
tx.11139	chr2	-	2340	4	FSM	ENSMUSG00000074731.4	ENSMUST00000109914.2	2734	4	0	394	0	-394	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	6.12825877028341	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTAGGGGCAGTCATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150327011	150313304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_150315345_150316415_150316477_150316675_150316803_150326899
tx.11140	chr2	-	2216	9	NNC	ENSMUSG00000033096.8	novel	2235	9	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	29.6479341607472	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTCTGCTGATTATTACT	1022	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150450464	150424999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_150426109_150427682_150427876_150428300_150428436_150428907_150429087_150430822_150430940_150431952_150432046_150436221_150436338_150442163_150442281_150450307
tx.11141	chr2	-	2906	10	ISM	ENSMUSG00000027452.12	ENSMUST00000028944.4	3618	14	30118	6	-25	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_6	13.5655700712511	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTATGGGGATGTTTTTG	5029	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150480060	150460030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_150461713_150463433_150463553_150466718_150466783_150466909_150467038_150467685_150467813_150468132_150468246_150469196_150469290_150470413_150470552_150471665_150471814_150479766
tx.11142	chr2	-	2902	11	ISM	ENSMUSG00000027452.12	ENSMUST00000028944.4	3618	14	29758	6	-385	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_6	13.1848397790796	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTATGGGGATGTTTTTG	4669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150480420	150460030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_150461713_150463433_150463553_150466718_150466783_150466909_150467038_150467685_150467813_150468132_150468246_150469196_150469290_150470413_150470552_150471665_150471814_150479766_150479920_150480283
tx.11143	chr2	-	3575	14	FSM	ENSMUSG00000027452.12	ENSMUST00000028944.4	3618	14	37	6	-7	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_13	14.5093318267649	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTATGGGGATGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150510141	150460030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_150461713_150463433_150463553_150466718_150466783_150466909_150467038_150467685_150467813_150468132_150468246_150469196_150469290_150470413_150470552_150471665_150471814_150479766_150479920_150480283_150480460_150484631_150484832_150501755_150501853_150509804
tx.11145	chr2	-	1049	2	NNC	ENSMUSG00000086563.2	novel	768	3	NA	NA	-32	2840	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGTTATTTGGCATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150548828	150543615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_150544440_150548603
tx.11146	chr2	+	2521	14	FSM	ENSMUSG00000033068.17	ENSMUST00000094467.6	2540	14	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_1	18.2695141678424	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTTTGCCTCATTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150590980	150613595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_150591154_150594929_150595254_150597962_150598040_150600662_150600807_150602022_150602099_150603152_150603189_150604295_150604385_150605485_150605566_150606034_150606100_150607369_150607472_150608878_150609017_150610784_150610842_150612211_150612325_150612548
tx.11147	chr2	+	613	2	ISM	ENSMUSG00000033059.8	ENSMUST00000045441.8	3909	20	13	29971	13	-12214	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGGTTTGAGTGGTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150628667	150643707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_150629031_150643457
tx.11148	chr2	+	3878	20	FSM	ENSMUSG00000033059.8	ENSMUST00000045441.8	3909	20	23	8	23	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_10	16.3671517531211	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTCACTGTGGTATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150628677	150673670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_150629031_150643457_150643560_150648112_150648192_150650716_150650821_150653173_150653306_150655310_150655423_150655840_150655924_150656905_150657050_150657537_150657631_150658669_150658817_150659557_150659722_150660765_150660881_150661793_150661896_150662654_150662803_150665895_150665955_150668248_150668391_150669024_150669233_150670363_150670499_150671547_150671615_150672281
tx.11149	chr2	+	3156	12	ISM	ENSMUSG00000033059.8	ENSMUST00000045441.8	3909	20	28492	12	-95	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_2	17.093810198649	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGTTGGTCACTGTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150657146	150673666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_150657631_150658669_150658817_150659557_150659722_150660765_150660881_150661793_150661896_150662654_150662803_150665895_150665955_150668248_150668391_150669024_150669233_150670363_150670499_150671547_150671615_150672281
tx.1115	chr1	-	496	3	ISM	ENSMUSG00000026605.15	ENSMUST00000165962.2	3001	12	-27	25076	-27	25	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_1	7.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAGAAAAACTGGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	189420310	189415997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_189416162_189417141_189417336_189420172
tx.11150	chr2	-	1172	7	ISM	ENSMUSG00000032046.16	ENSMUST00000141899.8	1969	13	64880	-4	-129	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_4	104.331868999309	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTGTTTTCTCTACAAA	7246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150681771	150674432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_150675061_150676198_150676327_150677192_150677272_150679271_150679355_150680230_150680315_150680660_150680699_150681639
tx.11151	chr2	-	1925	13	FSM	ENSMUSG00000032046.16	ENSMUST00000141899.8	1969	13	68	-24	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	81.835709402029	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGAATCAGAGTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150746583	150674412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_150675061_150676198_150676327_150677192_150677272_150679271_150679355_150680230_150680315_150680660_150680699_150681639_150681770_150684165_150684212_150685310_150685342_150688163_150688284_150690271_150690378_150700279_150700405_150746276
tx.11152	chr2	+	1097	7	FSM	ENSMUSG00000027454.11	ENSMUST00000028948.5	1087	7	-10	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	394	junction_1	28.3058690419888	1258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGAATCTCCTGGTAGCTT	2412	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150751503	150773200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_150751714_150754700_150754766_150758055_150758155_150759788_150759880_150767801_150767919_150769961_150770037_150772760
tx.11153	chr2	-	1006	2	ISM	ENSMUSG00000068115.14	ENSMUST00000109896.8	5093	24	72367	0	3878	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTTTAAAGTTTTAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150778951	150776438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_150777360_150778866
tx.11154	chr2	-	1370	2	FSM	ENSMUSG00000053916.5	ENSMUST00000066640.5	1394	2	13	11	13	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_1	0	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTTTTCATCCTTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150881305	150871615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_150872837_150881156
tx.11155	chr2	+	1374	9	FSM	ENSMUSG00000027455.17	ENSMUST00000028949.16	1364	9	-10	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1010	junction_3	133.71979799192	2723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTACCAATTCTGTTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151336202	151353225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_151336333_151338503_151338602_151342634_151342710_151344933_151345100_151346030_151346124_151347272_151347383_151348166_151348305_151351428_151351594_151352826
tx.11156	chr2	-	721	3	FSM	ENSMUSG00000087433.2	ENSMUST00000148705.2	433	3	-145	-143	-145	143	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGACTACCTTGTTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151384413	151382507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_151382806_151383342_151383525_151384172
tx.11157	chr2	-	643	3	NNC	ENSMUSG00000087433.2	novel	433	3	NA	NA	-122	127	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCACCTTGTTATGACTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151384390	151382523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_151382806_151383342_151383525_151384211
tx.11158	chr2	-	522	3	NNC	ENSMUSG00000087433.2	novel	433	3	NA	NA	-138	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGCTATGACTCACCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151384406	151382645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_151382806_151383342_151383525_151384226
tx.11159	chr2	-	439	3	NNC	ENSMUSG00000087433.2	novel	433	3	NA	NA	-544	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGCTATGACTCACCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151384812	151382645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_151382806_151383342_151383525_151384715
tx.1116	chr1	-	487	2	FSM	ENSMUSG00000026603.14	ENSMUST00000132289.2	489	2	152	-150	152	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	363	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGGTTTCTGAATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	189614417	189612688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_189613064_189614305
tx.11160	chr2	-	245	2	NNC	ENSMUSG00000087433.2	novel	433	3	NA	NA	-533	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGGGCTATGACTCACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151384801	151382646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_151382806_151384715
tx.11161	chr2	+	1562	5	FSM	ENSMUSG00000032966.15	ENSMUST00000044011.12	1658	5	95	1	-7	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2063	junction_1	209.807501057517	2571	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTGTCATGGAGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151384497	151403611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_151384665_151384737_151384786_151399305_151399419_151401377_151401541_151402540
tx.11162	chr2	+	1228	2	FSM	ENSMUSG00000044364.6	ENSMUST00000060196.3	1435	2	207	0	-96	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAGGCTACTTGGCATTT	152	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151544134	151549230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_151544366_151548233
tx.11163	chr2	-	1343	7	FSM	ENSMUSG00000032869.16	ENSMUST00000042452.11	3809	7	17	2449	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	320	junction_3	11.5385826204473	555	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCACGCTCCTTTTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151583213	151560180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_151560606_151561404_151561564_151562742_151562797_151571410_151571597_151576141_151576225_151577393_151577547_151582930
tx.11164	chr2	-	1711	2	FSM	ENSMUSG00000027459.17	ENSMUST00000062047.6	1754	2	43	0	43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_1	0	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTTTGGACTCTTCTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151822096	151811317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_151812845_151821912
tx.11165	chr2	+	2413	5	FSM	ENSMUSG00000027463.15	ENSMUST00000073228.12	2669	5	-14	270	10	-234	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	24.8294180358703	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGGGCTGTGTACACACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151838440	151850908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_151838572_151845971_151846599_151847451_151847940_151849400_151849525_151849865
tx.11166	chr2	+	2342	5	FSM	ENSMUSG00000027463.15	ENSMUST00000109861.8	2590	5	17	231	-15	-231	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	23.0976189249022	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGCTGTGTACACACAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151841801	151850911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_151841859_151845971_151846599_151847451_151847940_151849400_151849525_151849865
tx.11167	chr2	+	2553	4	ISM	ENSMUSG00000027463.15	ENSMUST00000109861.8	2590	5	4186	-36	4154	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_2	0.471404520791032	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTGACTTGTGTGCTCAC	3047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151845970	151851178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_151846599_151847451_151847940_151849400_151849525_151849865
tx.11168	chr2	+	2604	2	FSM	ENSMUSG00000032802.9	ENSMUST00000137751.2	446	2	-11	-2147	-11	-18	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCATGCAATAGCCTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151947424	151953278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_151947659_151950908
tx.11169	chr2	+	2582	2	FSM	ENSMUSG00000032802.9	ENSMUST00000041500.8	2812	2	206	24	206	-24	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_1	0	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACACACCATGCAATAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151947649	151953272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_151947868_151950908
tx.1117	chr1	-	654	3	ISM	ENSMUSG00000026603.14	ENSMUST00000130804.8	1077	6	5009	-2	-1621	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	363	junction_1	3.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGGTTTCTGAATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	189616190	189612688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_189613064_189614305_189614415_189616020
tx.11170	chr2	+	539	4	NNC	ENSMUSG00000074698.11	novel	600	6	NA	NA	-5	1479	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	43.3769011751134	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGAGTATAAGAAAAACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152068790	152096241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_152068912_152076831_152076928_152092321_152092532_152096129
tx.11171	chr2	+	474	3	ISM	ENSMUSG00000074698.11	ENSMUST00000124791.8	600	6	-56	6508	1	1479	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	55	junction_1	19	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTGAGTATAAGAAAAACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152068759	152096241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_152068912_152092321_152092532_152096129
tx.11172	chr2	+	2688	13	FSM	ENSMUSG00000074698.11	ENSMUST00000099224.10	4206	13	5	1513	5	-1513	multi-exon	FALSE	canonical	2	55	junction_1	32.1674222709181	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTTAGATTTAAGTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152068763	152122259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_152068912_152092321_152092532_152096129_152096242_152099297_152099400_152099860_152099912_152100595_152100656_152102678_152102763_152105102_152105214_152114547_152114650_152116012_152116114_152117317_152117467_152118866_152118954_152120888
tx.11173	chr2	-	963	4	ISM	ENSMUSG00000027466.16	ENSMUST00000130165.8	1842	5	3732	3	3732	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	483	junction_1	69.4854101392675	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGGAAAGGTGTCATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152161185	152158256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_152158835_152160231_152160376_152160632_152160732_152161043
tx.11174	chr2	-	1072	5	FSM	ENSMUSG00000027466.16	ENSMUST00000130165.8	1842	5	757	13	757	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	483	junction_1	67.5092586242806	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTTTCCCAGAAGGGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152164160	152158266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_152158835_152160231_152160376_152160632_152160732_152161043_152161224_152164079
tx.11175	chr2	-	707	2	ISM	ENSMUSG00000027466.16	ENSMUST00000130165.8	1842	5	4557	3	4557	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	483	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGGAAAGGTGTCATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152160360	152158256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_152158835_152160231
tx.11176	chr2	-	2374	12	FSM	ENSMUSG00000027466.16	ENSMUST00000109847.9	2384	12	7	3	7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	444	junction_6	68.3604931579153	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGGAAAGGTGTCATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152174325	152158256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_152158835_152160231_152160376_152160632_152160732_152161043_152161224_152164079_152164192_152165091_152165253_152166186_152166361_152166444_152166561_152168135_152168335_152169166_152169261_152172879_152173025_152173953
tx.11177	chr2	-	2257	6	NIC	ENSMUSG00000027466.16	novel	2384	12	NA	NA	6	-173	intron_retention	FALSE	canonical	3	546	junction_5	37.5552925697564	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATCTCATTGGATGCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152174326	152165030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_152166361_152166444_152166561_152168135_152168335_152169166_152169261_152172879_152173025_152173953
tx.11178	chr2	-	2048	4	FSM	ENSMUSG00000032715.10	ENSMUST00000040312.7	2026	4	-22	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	926	junction_3	7.71722460186015	506	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTTGGTGACTTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152185974	152179341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_152180608_152181634_152181928_152184956_152185248_152185776
tx.11179	chr2	+	834	4	NNC	ENSMUSG00000068062.4	novel	1999	5	NA	NA	4446	-6744	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAATAGTCTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152192034	152210325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_152192195_152196921_152197146_152203718_152203865_152210021
tx.1118	chr1	-	1602	12	NNC	ENSMUSG00000026603.14	novel	1680	12	NA	NA	-29	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	98.8538448651751	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGGTTTCTGAATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	189654479	189612688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_189613064_189614305_189614415_189616020_189616199_189617495_189617617_189618717_189618829_189621011_189621115_189623596_189623665_189628767_189628893_189629619_189629681_189632014_189632126_189642047_189642112_189654303
tx.11180	chr2	-	1419	3	FSM	ENSMUSG00000059361.7	ENSMUST00000079278.5	1455	3	36	0	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCGTGGCTTCCTTTTGA	8725	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152218522	152210674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_152211844_152216015_152216211_152218467
tx.11181	chr2	-	1289	3	NNC	ENSMUSG00000059361.7	novel	1455	3	NA	NA	36	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCAGCGTGGCTTCCTTT	8725	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152218522	152210677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_152211844_152216142_152216211_152218467
tx.11182	chr2	-	801	2	NNC	ENSMUSG00000074681.3	novel	624	2	NA	NA	-4459	61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGTGTAATGAGGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152310999	152300913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_152301513_152310797
tx.11183	chr2	+	1569	12	FSM	ENSMUSG00000019188.17	ENSMUST00000125366.8	5204	12	17	3618	-8	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_7	14.82905345753	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGCCTAGTGTTTCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152511397	152546972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_152511685_152519461_152519561_152522970_152523054_152528017_152528107_152530582_152530669_152530756_152530883_152531763_152531822_152533712_152533797_152536406_152536444_152537401_152537505_152542102_152542189_152546541
tx.11184	chr2	+	687	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000042814.9	novel	912	1	NA	NA	118	5	multi-exon	TRUE	canonical	3	34	junction_1	0	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGGGGTGTTGTAACCACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152529072	152529871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_152529294_152529405
tx.11185	chr2	+	933	2	FSM	ENSMUSG00000042745.10	ENSMUST00000038368.9	934	2	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTGCTGTGACTTCTTGGA	4423	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152578171	152579330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_152578666_152578891
tx.11186	chr2	+	754	5	FSM	ENSMUSG00000009876.14	ENSMUST00000010020.12	727	5	-29	2	-29	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_4	3.69966214673719	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCTTTGGACTATCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152596063	152606955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_152596145_152597074_152597160_152598929_152599095_152602557_152602690_152606664
tx.11187	chr2	-	2574	3	FSM	ENSMUSG00000007659.19	ENSMUST00000109820.5	2568	3	-2	-4	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_2	91.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACAGCCTTGGCTCTGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152672588	152622587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_152624203_152671346_152672023_152672305
tx.11188	chr2	-	2392	3	FSM	ENSMUSG00000007659.19	ENSMUST00000007803.12	2417	3	25	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_2	89.5	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACAGCCTTGGCTCTGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152673623	152622587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_152624203_152671346_152672023_152673522
tx.11189	chr2	-	2410	3	NIC	ENSMUSG00000007659.19	novel	2417	3	NA	NA	7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	31	junction_2	148	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACAGCCTTGGCTCTGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152673623	152622587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_152624203_152671346_152672041_152673522
tx.1119	chr1	-	1051	9	ISM	ENSMUSG00000026603.14	ENSMUST00000027897.8	1680	12	80	4697	-30	-143	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	299	junction_4	18.6543393075177	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGGTCTCCTGTGTGCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	189654480	189617385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_189617617_189618717_189618829_189621011_189621115_189623596_189623665_189628767_189628893_189629619_189629681_189632014_189632126_189642047_189642112_189654303
tx.11190	chr2	-	2437	3	NIC	ENSMUSG00000007659.19	novel	2417	3	NA	NA	-20	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_2	154.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACAGCCTTGGCTCTGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152672606	152622587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_152624203_152671346_152672023_152672460
tx.11191	chr2	+	2802	18	FSM	ENSMUSG00000027469.17	ENSMUST00000109816.8	3483	18	46	635	29	-635	multi-exon	FALSE	canonical	3	597	junction_2	86.1429969118501	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTGGTTTCAGTCACAGT	2754	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152689943	152735939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_152690030_152696840_152696923_152709103_152709278_152711572_152711696_152715009_152715137_152717460_152717593_152718486_152718613_152722023_152722146_152722934_152723087_152724113_152724283_152726093_152726233_152726930_152727148_152730022_152730116_152731065_152731243_152732410_152732558_152733362_152733475_152734032_152734221_152735503
tx.11192	chr2	-	1235	5	FSM	ENSMUSG00000027472.15	ENSMUST00000028972.9	1273	5	38	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_2	13.6656503687164	740	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTGAGTTGTCACCCACC	8677	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152857309	152850809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_152851657_152852177_152852259_152854300_152854376_152855929_152856006_152857153
tx.11193	chr2	+	2057	13	FSM	ENSMUSG00000003283.16	ENSMUST00000189688.2	2090	13	27	6	27	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_9	8.17346655682615	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCCAAGGGTCAGCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152950414	152993353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_152950675_152966089_152966208_152970182_152970226_152970962_152971063_152971763_152971863_152973140_152973245_152975988_152976139_152976543_152976697_152978617_152978798_152980181_152980259_152986338_152986493_152990866_152990999_152992866
tx.11194	chr2	+	510	3	ISM	ENSMUSG00000003283.16	ENSMUST00000189688.2	2090	13	35	23037	35	-23037	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_2	5.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAACAAAACAAAACAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152950422	152970322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_152950675_152966089_152966208_152970182
tx.11195	chr2	+	1538	9	ISM	ENSMUSG00000003283.16	ENSMUST00000189688.2	2090	13	21374	6	21374	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_5	5.80947501931113	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCCAAGGGTCAGCTTCT	3818	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152971761	152993353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_152971863_152973140_152973245_152975988_152976139_152976543_152976697_152978617_152978798_152980181_152980259_152986338_152986493_152990866_152990999_152992866
tx.11196	chr2	+	2057	18	NIC	ENSMUSG00000068040.11	novel	3896	18	NA	NA	-1	-1605	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_1	123.527310906505	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGGCACAGTGTTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153003459	153050781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_153003492_153020805_153020923_153024307_153024408_153029182_153029352_153029450_153029584_153030873_153030998_153032750_153032870_153032970_153033083_153033849_153033921_153036196_153036330_153037230_153037313_153037409_153037486_153040269_153040354_153042562_153042739_153044257_153044322_153045701_153045822_153046454_153046545_153050526
tx.11197	chr2	+	3600	18	FSM	ENSMUSG00000068040.11	ENSMUST00000089027.3	3896	18	238	58	0	-58	multi-exon	FALSE	canonical	3	350	junction_1	53.5920770883495	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTTTCTGGTCCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153003460	153052328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_153003492_153020808_153020923_153024307_153024408_153029182_153029352_153029450_153029584_153030873_153030998_153032750_153032870_153032970_153033083_153033849_153033921_153036196_153036330_153037230_153037313_153037409_153037486_153040269_153040354_153042562_153042739_153044257_153044322_153045701_153045822_153046454_153046545_153050526
tx.11198	chr2	+	2023	17	ISM	ENSMUSG00000068040.11	ENSMUST00000089027.3	3896	18	17585	1605	-11511	-1605	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	460	junction_5	37.7110208526632	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGGCACAGTGTTCCTA	6201	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153020807	153050781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_153020923_153024307_153024408_153029182_153029352_153029450_153029584_153030873_153030998_153032750_153032870_153032970_153033083_153033849_153033921_153036196_153036330_153037230_153037313_153037409_153037486_153040269_153040354_153042562_153042739_153044257_153044322_153045701_153045822_153046454_153046545_153050526
tx.11199	chr2	+	2558	7	FSM	ENSMUSG00000046020.14	ENSMUST00000049863.12	5600	7	-18	3060	-18	-99	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_4	7.06320670013903	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGAGTGTAACTGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153083434	153109107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_153083646_153085557_153085680_153090368_153090552_153091600_153091714_153101519_153101713_153103117_153103361_153107614
tx.112	chr1	-	3883	15	FSM	ENSMUSG00000042197.14	ENSMUST00000019861.13	3958	15	75	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	234	junction_7	31.7753594690564	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGAGGAAATTTTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33853533	33800625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_33801291_33804924_33804991_33808801_33808989_33809849_33809981_33811973_33812115_33815349_33816945_33818124_33818273_33818976_33819131_33821148_33821276_33822121_33822273_33822933_33823046_33825487_33825614_33844419_33844501_33852807_33852892_33853418
tx.1120	chr1	-	1509	5	ISM	ENSMUSG00000089872.11	ENSMUST00000160889.8	2694	6	34609	0	11036	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_3	7.44983221287567	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCTTCCTCATTTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190531624	190505075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_190505901_190514731_190514828_190515760_190515844_190530848_190530939_190531209
tx.11200	chr2	+	1170	2	ISM	ENSMUSG00000027475.10	ENSMUST00000028977.7	5635	9	0	16096	0	-16096	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACATTAAGAACAAGCCAAG	7813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153133332	153159214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_153133425_153158136
tx.11201	chr2	-	1287	9	FSM	ENSMUSG00000056941.18	ENSMUST00000071852.10	3210	9	30	1893	-11	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	166	junction_3	11.9373363863133	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCTGAATCCACAAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153474671	153460745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_153461433_153462365_153462415_153463689_153463740_153463963_153464055_153464570_153464609_153464691_153464749_153470384_153470488_153471112_153471167_153474513
tx.11202	chr2	+	2374	7	FSM	ENSMUSG00000027479.15	ENSMUST00000028981.9	7336	7	14	4948	14	-4948	multi-exon	FALSE	canonical	3	1002	junction_3	91.867204884732	839	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAACAAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153583207	153610282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_153583340_153588175_153588300_153597850_153597997_153599844_153600053_153603455_153603578_153606866_153607020_153608793
tx.11203	chr2	+	899	9	ISM	ENSMUSG00000027485.16	ENSMUST00000028987.7	1637	16	11118	-1	11118	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_5	2.47171499166065	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTTGTCCGGGTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154053416	154062264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_154053504_154054853_154055034_154055384_154055439_154055913_154056073_154057180_154057249_154058135_154058182_154059090_154059155_154060123_154060201_154062100
tx.11204	chr2	+	957	8	ISM	ENSMUSG00000027485.16	ENSMUST00000028987.7	1637	16	12410	-1	12410	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_4	2.49897938350513	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTTGTCCGGGTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154054708	154062264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_154055034_154055384_154055439_154055913_154056073_154057180_154057249_154058135_154058182_154059090_154059155_154060123_154060201_154062100
tx.11205	chr2	-	495	2	Intergenic	novelGene_824	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTACATCTCAAAGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154065274	154063936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_154064353_154065195
tx.11206	chr2	+	1637	15	FSM	ENSMUSG00000038572.8	ENSMUST00000045959.8	1637	15	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_6	7.50951777032701	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTGTCTGAGTTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154065661	154082822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_154065814_154066857_154067075_154069010_154069116_154069982_154070115_154070773_154070859_154070950_154071015_154071386_154071473_154072092_154072276_154074753_154074808_154075108_154075259_154076410_154076479_154076607_154076654_154078677_154078742_154080747_154080828_154082671
tx.11207	chr2	-	1984	14	FSM	ENSMUSG00000027487.12	ENSMUST00000028990.10	1970	14	-8	-6	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_3	9.02265393460642	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTGTCTACTTTTTTCA	5672	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154214647	154177299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_154177538_154184220_154184362_154187785_154187936_154190570_154190702_154192737_154192794_154194101_154194200_154195109_154195341_154196009_154196131_154202476_154202688_154207881_154207983_154210133_154210169_154210731_154210836_154212555_154212876_154214600
tx.11208	chr2	-	1157	4	ISM	ENSMUSG00000027488.13	ENSMUST00000109728.8	2131	8	27248	2	27129	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_1	13.6950923894494	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCATGTCTGTGGTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154222771	154218234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_154218829_154218926_154219115_154219927_154220125_154222593
tx.11209	chr2	-	1072	4	NNC	ENSMUSG00000027488.13	novel	2131	8	NA	NA	28598	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_3	56.9580742495936	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGGCATCATGTCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154221302	154218240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_154218829_154218926_154219115_154219927_154220125_154221203
tx.11210	chr2	-	387	2	Intergenic	novelGene_827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGCAGAAGTTTCTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154271225	154269731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_154270000_154271106
tx.11211	chr2	+	2507	11	FSM	ENSMUSG00000038533.16	ENSMUST00000045270.15	6069	11	-11	3573	0	819	multi-exon	TRUE	canonical	3	422	junction_9	50.3348785634772	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATGGATCATTTTGGACAA	5306	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154278403	154377703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_154278557_154342319_154342464_154346472_154346715_154352427_154352518_154357736_154357919_154359628_154359883_154363070_154363157_154365823_154366020_154370756_154370826_154373141_154373333_154376803
tx.11212	chr2	+	618	2	ISM	ENSMUSG00000038533.16	ENSMUST00000099178.10	3247	9	10	25539	-1	-3903	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	587	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTAGGGCAACCCCTTGG	5316	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154278413	154342794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_154278557_154342319
tx.11213	chr2	+	1780	10	ISM	ENSMUSG00000038533.16	ENSMUST00000109725.8	6080	11	15	7756	1	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_9	133.715378581283	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACAGTCTACCACACACAC	5318	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154278415	154373520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_154278557_154342319_154342464_154346472_154346715_154352427_154352518_154357736_154357919_154359628_154359883_154363070_154363157_154365823_154366020_154370756_154370826_154373144
tx.11214	chr2	+	1774	10	ISM	ENSMUSG00000038533.16	ENSMUST00000045270.15	6069	11	7	7759	7	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	422	junction_9	51.6952131413383	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATAACAGTCTACCACACA	5324	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154278421	154373517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_154278557_154342319_154342464_154346472_154346715_154352427_154352518_154357736_154357919_154359628_154359883_154363070_154363157_154365823_154366020_154370756_154370826_154373141
tx.11215	chr2	-	1839	13	FSM	ENSMUSG00000027489.16	ENSMUST00000000895.13	1829	13	-10	0	-10	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	34	junction_6	10.0840220150494	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCCCCTGTCTCT	7301	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154400796	154386318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_154387088_154387174_154387267_154387945_154388024_154388147_154388261_154388589_154388644_154388720_154388801_154388956_154389076_154389344_154389482_154396566_154396665_154396819_154396846_154397503_154397613_154398976_154399002_154400657
tx.11216	chr2	+	743	3	FSM	ENSMUSG00000038523.11	ENSMUST00000045116.11	704	3	-39	0	-39	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTGTCTGCCACTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154390768	154391923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_154390988_154391255_154391316_154391459
tx.11217	chr2	-	2430	7	FSM	ENSMUSG00000027490.18	ENSMUST00000000894.6	2755	7	326	-1	326	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	459.079392794851	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCTGGGTTTGAAACTCTC	10000	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154411314	154401552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_154402856_154402950_154403171_154403266_154403382_154404857_154405011_154405814_154406035_154406337_154406429_154410986
tx.11218	chr2	-	549	4	Intergenic	novelGene_828	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGACATTGCTCCTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154426982	154423723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_154423927_154424225_154424376_154424852_154424921_154426854
tx.11219	chr2	-	962	4	FSM	ENSMUSG00000000876.12	ENSMUST00000000896.11	2789	4	2	1825	2	-1825	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_1	13.4246870437348	351	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGTCTGTGGCTTGATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154445626	154429502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_154430013_154434084_154434284_154438121_154438185_154445436
tx.1122	chr1	-	1276	6	NNC	ENSMUSG00000089872.11	novel	503	4	NA	NA	-5	2662	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.2756668824971	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACTTTTTCCTTTAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190643972	190614910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_190615600_190617530_190617625_190620845_190620962_190631647_190631769_190637279_190637316_190643752
tx.11220	chr2	+	281	2	NNC	ENSMUSG00000059842.13	novel	3000	14	NA	NA	-26	-27375	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAATGGTCTAGTTTTATG	5755	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154455249	154461323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_154455323_154461115
tx.11221	chr2	+	365	3	NNC	ENSMUSG00000059842.13	novel	3000	14	NA	NA	-14	-27375	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAATGGTCTAGTTTTATG	5767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154455261	154461323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_154455323_154460195_154460292_154461115
tx.11222	chr2	+	116	2	NNC	ENSMUSG00000038467.16	novel	1616	5	NA	NA	-47	-14	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGAGTTGCTGGGCTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154498890	154536187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_154498950_154536130
tx.11223	chr2	+	1008	5	FSM	ENSMUSG00000038467.16	ENSMUST00000044277.10	1616	5	90	518	90	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	13.5738719604982	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGAGTTGCTGGGCTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154499027	154536187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_154499292_154531437_154531616_154533129_154533245_154534468_154534596_154535863
tx.11224	chr2	+	456	3	NNC	ENSMUSG00000038467.16	novel	1616	5	NA	NA	77	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	17	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGAGTTGCTGGGCTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154499014	154536187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_154499292_154531437_154531560_154536130
tx.11225	chr2	+	1494	9	NIC	ENSMUSG00000027593.16	novel	1747	9	NA	NA	-18	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	17	junction_1	44.2965856472031	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTGAGGTGGAATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154632997	154709166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_154633152_154662926_154663010_154699188_154699454_154701597_154701671_154703759_154703927_154705469_154705584_154705733_154705970_154707827_154707877_154708813
tx.11226	chr2	+	1408	8	NIC	ENSMUSG00000027593.16	novel	1802	10	NA	NA	-17	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	53.0813776484863	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCTCTGAGGTGGAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154632998	154709164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_154633152_154699188_154699454_154701597_154701671_154703759_154703927_154705469_154705584_154705733_154705970_154707827_154707877_154708813
tx.11227	chr2	+	1143	7	ISM	ENSMUSG00000027593.16	ENSMUST00000058089.13	1747	9	66225	16	65667	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_4	14.6363322667334	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGCTCTGAGGTGGAATGGT	5086	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154699301	154709165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_154699454_154701597_154701671_154703759_154703927_154705469_154705584_154705733_154705970_154707827_154707877_154708813
tx.11228	chr2	+	619	3	ISM	ENSMUSG00000027593.16	ENSMUST00000058089.13	1747	9	72674	17	72116	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	166	junction_1	0	534	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCTCTGAGGTGGAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154705750	154709164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_154705970_154707827_154707877_154708813
tx.11229	chr2	-	969	6	ISM	ENSMUSG00000074656.13	ENSMUST00000166171.8	2312	10	8361	1012	8361	-1012	internal_fragment	FALSE	canonical	3	12105	junction_2	877.466945246372	863	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGTCGATCTGTCCTTCA	NA	False	NA	-98	True	NA	NA	NA	154726341	154714349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_154714821_154715468_154715555_154718535_154718593_154719590_154719740_154720389_154720485_154726230
tx.1123	chr1	+	2196	8	NIC	ENSMUSG00000026634.17	novel	3714	9	NA	NA	9	-1183	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	62.1285697861577	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190660697	190677976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_190660956_190669640_190669898_190671283_190671354_190673070_190673493_190674317_190674445_190675026_190675085_190675973_190676138_190677136
tx.11230	chr2	-	1435	9	FSM	ENSMUSG00000074656.13	ENSMUST00000099173.11	2542	9	84	1023	-20	-1015	multi-exon	FALSE	canonical	3	11792	junction_7	843.012372017754	17174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAAGTCGATCTGTCCT	3716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154734771	154714352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_154714821_154715468_154715555_154718535_154718593_154719590_154719740_154720389_154720485_154726230_154726367_154729623_154729728_154730102_154730281_154734609
tx.11231	chr2	-	533	4	ISM	ENSMUSG00000074656.13	ENSMUST00000166171.8	2312	10	-71	12942	-22	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11792	junction_2	580.448868453449	3889	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAATGTTAAATTCCCAGA	3714	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154734773	154726279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_154726367_154729623_154729728_154730102_154730281_154734609
tx.11232	chr2	+	337	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000074656.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAGCTCGCCAAAGCGCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154730126	154734796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_154730264_154734596
tx.11233	chr2	-	312	2	FSM	ENSMUSG00000074656.13	ENSMUST00000135524.2	4102	2	-39	3829	-16	-3829	multi-exon	FALSE	canonical	3	12952	junction_1	0	8381	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGAGGAAGACAGTAGGAAG	3720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154734767	154730126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_154730281_154734609
tx.11234	chr2	+	331	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000074656.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGCGCAGAGCTCGCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154730126	154734788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_154730302_154734632
tx.11235	chr2	+	585	2	FSM	ENSMUSG00000027596.11	ENSMUST00000148300.2	510	2	-73	-2	-73	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAAGTGTGACTATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154889461	154892933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_154889661_154892547
tx.11236	chr2	-	1418	5	ISM	ENSMUSG00000027597.16	ENSMUST00000054607.16	2543	10	10218	380	10168	-380	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1013	junction_2	97.2763460456857	909	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGCATGTATGTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154906199	154901609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_154902501_154904068_154904264_154905699_154905818_154905908_154905997_154906073
tx.11237	chr2	-	2122	10	FSM	ENSMUSG00000027597.16	ENSMUST00000054607.16	2543	10	41	380	-9	-380	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	366.363443645113	254	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGCATGTATGTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154916376	154901609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_154902501_154904068_154904264_154905699_154905818_154905908_154905997_154906073_154906282_154906733_154906847_154907456_154907607_154909242_154909319_154910747_154910939_154916284
tx.11238	chr2	+	1660	4	ISM	ENSMUSG00000027598.17	ENSMUST00000138468.8	3711	6	-15	7049	0	-4191	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_2	29.7694847490215	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAGAAGTCCAGATCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154975428	155012018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_154975506_154980115_154980193_155005312_155005404_155010603
tx.11239	chr2	+	658	4	FSM	ENSMUSG00000047459.15	ENSMUST00000109682.9	684	4	22	4	22	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1428	junction_1	142.385236438177	7177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGTGTTGTGTCTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155078476	155092193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155078538_155084650_155084727_155089690_155089859_155091840
tx.1124	chr1	+	1562	3	FSM	ENSMUSG00000026634.17	ENSMUST00000137608.8	1585	3	35	-12	35	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	37.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGAAGAAAAGAATCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190660723	190670644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_190660956_190665063_190665390_190669640
tx.11240	chr2	+	598	3	ISM	ENSMUSG00000047459.15	ENSMUST00000135831.2	534	4	5919	-193	5919	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1727	junction_2	3	949	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGTGTTGTGTCTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155084649	155092193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_155084727_155089690_155089859_155091840
tx.11241	chr2	+	816	3	FSM	ENSMUSG00000027602.10	ENSMUST00000154596.2	826	3	14	-4	14	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	438	junction_2	23	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTGCCTCCAGCTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155118822	155119992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155118934_155119017_155119125_155119394
tx.11242	chr2	-	1623	12	FSM	ENSMUSG00000038383.17	ENSMUST00000077626.13	1636	12	10	3	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_4	21.4987987363815	443	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTGTTGTTCTGATGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155199340	155120165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155120570_155134609_155134753_155139002_155139128_155140965_155141110_155143120_155143276_155156421_155156520_155170500_155170602_155173068_155173179_155177280_155177344_155178601_155178662_155187567_155187633_155199185
tx.11243	chr2	+	851	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000083341.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTTGGATTTCTAAGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155315815	155342069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_155315987_155341389
tx.11244	chr2	+	2838	18	NNC	ENSMUSG00000027605.19	novel	2931	18	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	17.3986437048457	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTTTTTTAGGTATCTG	2104	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155359964	155404666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_155360205_155363900_155364097_155391110_155391203_155391395_155391500_155391718_155391792_155392022_155392099_155392274_155392390_155397773_155397916_155398252_155398424_155398697_155398832_155399016_155399150_155399229_155399287_155399468_155399550_155400510_155400620_155402541_155402611_155402949_155403127_155403665_155403741_155403872
tx.11245	chr2	+	554	2	FSM	ENSMUSG00000027605.19	ENSMUST00000149788.2	3563	2	8	3001	8	-3001	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGTGGGTGGCATGTGAG	2100	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155359960	155364210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155360205_155363900
tx.11246	chr2	-	730	2	ISM	ENSMUSG00000027610.18	ENSMUST00000175993.2	756	6	8054	-308	8054	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	925	junction_1	0	919	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTCATTGTTTCATGTAC	8120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155406870	155405100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_155405640_155406679
tx.11247	chr2	-	1906	13	FSM	ENSMUSG00000027610.18	ENSMUST00000079691.13	1963	13	57	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	779	junction_12	109.121491925285	870	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTCATTGTTTCATGTAC	8407	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155434673	155405100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155405640_155406679_155406870_155408722_155408805_155409612_155409808_155413438_155413506_155414843_155414922_155415014_155415096_155419441_155419559_155420208_155420349_155420631_155420708_155423807_155423954_155429361_155429497_155434613
tx.11248	chr2	+	1110	7	ISM	ENSMUSG00000074652.4	ENSMUST00000092995.6	6163	42	20987	100	-1252	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_1	4.6785562825394	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGTCCTTATTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155474118	155476127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_155474465_155474546_155474673_155474767_155474939_155475084_155475190_155475272_155475369_155475782_155475921_155475999
tx.11249	chr2	+	683	6	ISM	ENSMUSG00000074652.4	ENSMUST00000092995.6	6163	42	21493	103	-746	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_2	4.07921561087423	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGCCACTGTCCTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155474624	155476124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_155474673_155474767_155474939_155475084_155475190_155475272_155475369_155475782_155475921_155475999
tx.1125	chr1	+	2501	9	FSM	ENSMUSG00000026634.17	ENSMUST00000066632.14	3714	9	35	1178	35	-1178	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	32.0263563334951	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGTCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190660723	190677981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_190660956_190665063_190665390_190669640_190669898_190671283_190671354_190673070_190673493_190674317_190674445_190675026_190675085_190675973_190676138_190677136
tx.11251	chr2	-	1883	11	FSM	ENSMUSG00000038312.11	ENSMUST00000040833.5	2290	11	60	347	60	-347	multi-exon	TRUE	canonical	3	287	junction_6	17.8672885463911	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTACATGCTGGATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155571335	155543943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155544513_155547574_155547697_155550851_155550997_155552763_155552889_155555257_155555400_155557929_155558142_155560183_155560310_155564351_155564458_155568554_155568595_155570810_155570922_155571150
tx.11252	chr2	-	1453	2	FSM	ENSMUSG00000074649.7	ENSMUST00000124586.2	1615	2	162	0	162	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCTGTACAAACCTATGAAT	7261	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155661184	155659649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155661004_155661085
tx.11253	chr2	-	1265	6	FSM	ENSMUSG00000027613.16	ENSMUST00000029142.15	1500	6	230	5	-32	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1052	junction_5	244.745255316625	6411	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCAGTGTGCTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155668615	155661756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155662032_155664756_155664939_155665111_155665289_155665784_155665961_155668044_155668131_155668246
tx.11254	chr2	-	1313	9	ISM	ENSMUSG00000005882.19	ENSMUST00000109636.11	2633	10	8583	1022	8291	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	315	junction_1	50.5809993970068	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTCTTTGTTCCAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155763647	155689862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_155690447_155693278_155693393_155700031_155700110_155729028_155729138_155743217_155743276_155751272_155751346_155752276_155752385_155753660_155753757_155763554
tx.11255	chr2	-	2139	10	FSM	ENSMUSG00000005882.19	ENSMUST00000109636.11	2633	10	254	240	0	-240	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_1	57.3294572333165	599	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTATACTGTGAGGTATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155771976	155689080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155690447_155693278_155693393_155700031_155700110_155729028_155729138_155743217_155743276_155751272_155751346_155752276_155752385_155753660_155753757_155763554_155763648_155771932
tx.11256	chr2	-	1950	8	ISM	ENSMUSG00000005882.19	ENSMUST00000109636.11	2633	10	18531	235	-1175	-235	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	315	junction_1	43.4229319646677	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGTGAGGTATGCGCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155753699	155689075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_155690447_155693278_155693393_155700031_155700110_155729028_155729138_155743217_155743276_155751272_155751346_155752276_155752385_155753660
tx.11257	chr2	+	1327	13	FSM	ENSMUSG00000005881.14	ENSMUST00000006035.13	1377	13	50	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	758	junction_4	74.7846445171437	1363	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGGTCTCAGTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155850014	155860199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155850149_155850284_155850356_155850483_155850572_155850779_155850900_155852359_155852454_155853019_155853186_155853268_155853327_155857908_155857941_155858625_155858723_155858808_155858874_155859499_155859637_155859716_155859773_155859990
tx.11258	chr2	+	1311	12	NIC	ENSMUSG00000005881.14	novel	1349	14	NA	NA	-9	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_7	261.145189343697	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGGTCTCAGTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155850016	155860199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_155850149_155850284_155850356_155850483_155850572_155850779_155850900_155852359_155852454_155853019_155853186_155853268_155853327_155858607_155858723_155858808_155858874_155859499_155859637_155859716_155859773_155859990
tx.11259	chr2	+	439	4	ISM	ENSMUSG00000005881.14	ENSMUST00000150970.8	463	6	408	-129	-298	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	797	junction_2	21.7613316585993	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGGTCTCAGTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155858836	155860199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_155858874_155859499_155859637_155859716_155859773_155859990
tx.11260	chr2	+	1507	12	FSM	ENSMUSG00000038180.12	ENSMUST00000038860.12	1473	12	-34	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	5.51781487472492	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGGTTTGTGCTAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155907129	155911421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155907592_155908053_155908159_155908486_155908554_155908724_155908787_155909008_155909053_155909231_155909258_155909374_155909484_155909666_155909743_155909856_155909973_155910290_155910459_155911056_155911147_155911239
tx.11261	chr2	+	1211	11	NNC	ENSMUSG00000038180.12	novel	747	9	NA	NA	-24	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6.48382603097893	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGGAGGTTTGTGCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155907637	155911418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_155907806_155908053_155908159_155908486_155908554_155908724_155908787_155909008_155909080_155909374_155909484_155909666_155909743_155909856_155909973_155910290_155910459_155911056_155911147_155911239
tx.11262	chr2	+	1184	12	NIC	ENSMUSG00000038180.12	novel	747	9	NA	NA	5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_1	5.06486846443059	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGGTTTGTGCTAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155907666	155911421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_155907806_155908053_155908159_155908486_155908554_155908724_155908787_155909008_155909053_155909231_155909258_155909374_155909484_155909666_155909743_155909856_155909973_155910290_155910459_155911056_155911147_155911239
tx.11263	chr2	-	3466	16	FSM	ENSMUSG00000074643.13	ENSMUST00000109607.10	3441	16	-21	-4	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	257	junction_15	28.8510350286124	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCCGCTCTTGTTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155953880	155913760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155915582_155915718_155915956_155916095_155916230_155918156_155918209_155919318_155919374_155919475_155919610_155919694_155919755_155919848_155919936_155920066_155920154_155920251_155920342_155920493_155920575_155920671_155920744_155920819_155920895_155920982_155921163_155921258_155921385_155953705
tx.11264	chr2	-	1096	3	FSM	ENSMUSG00000089824.11	ENSMUST00000109604.9	6635	3	25	5514	-15	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_2	80.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGTCTCTTCCCATCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155953851	155939391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155940293_155945268_155945318_155953705
tx.11265	chr2	-	3747	3	FSM	ENSMUSG00000089824.11	ENSMUST00000059647.12	6667	3	-4	2924	1	2603	multi-exon	FALSE	canonical	3	245	junction_2	24	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATTGTATGTACCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155953880	155936801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155940293_155945268_155945350_155953705
tx.11266	chr2	+	388	3	FSM	ENSMUSG00000067847.14	ENSMUST00000088610.11	569	3	178	3	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	748	junction_1	118.5	4686	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAGTCTATTTTTACCTA	6529	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155986136	155987714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155986201_155986378_155986510_155987521
tx.11267	chr2	+	462	2	FSM	ENSMUSG00000067847.14	ENSMUST00000109597.10	550	2	88	0	81	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	985	junction_1	0	627	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAGTCTATTTTTACCTA	6633	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155986240	155987714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155986510_155987521
tx.11268	chr2	-	2766	17	FSM	ENSMUSG00000027620.17	ENSMUST00000109587.9	2810	17	44	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1358	junction_5	409.933526432945	427	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCGTTTTTCAAATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156022114	155989158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_155990112_155990204_155990284_155991155_155991262_155992654_155992737_155996158_155996210_156000319_156000398_156000956_156001162_156003487_156003554_156003747_156003886_156004648_156004802_156006725_156006844_156009457_156009512_156009604_156009671_156014747_156014943_156019255_156019306_156021096_156021161_156021806
tx.11269	chr2	-	420	3	ISM	ENSMUSG00000027620.17	ENSMUST00000109584.8	667	4	46	2562	4	25	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1623	junction_1	363	5161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTTTGACTAAGGAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156022112	156019255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_156019306_156021096_156021161_156021806
tx.11270	chr2	-	1006	2	FSM	ENSMUSG00000027620.17	ENSMUST00000128243.2	1008	2	20	-18	4	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	2349	junction_1	0	857	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAGAAAAAGAACAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156022112	156020460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_156021161_156021806
tx.11271	chr2	-	784	3	FSM	ENSMUSG00000027620.17	ENSMUST00000137340.2	715	3	-49	-20	2	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	533	junction_1	908	1823	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCAAGAAAAAGAACAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156022114	156020460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_156020873_156021096_156021161_156021806
tx.11272	chr2	+	1736	11	ISM	ENSMUSG00000038116.17	ENSMUST00000037401.10	5737	18	102	17407	-10	17	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	289	junction_1	26.5510828404417	382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAAACCAAGCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156038663	156134465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_156038718_156065254_156065370_156093695_156093868_156096145_156096231_156106200_156106281_156109074_156109463_156114461_156114576_156115602_156115792_156118408_156118589_156129720_156130000_156134385
tx.11273	chr2	-	414	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027624.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGAATAAAACTGACCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156275501	156274595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_156274775_156275266
tx.11274	chr2	+	2621	4	FSM	ENSMUSG00000027628.11	ENSMUST00000029158.4	3427	4	-8	814	4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_3	2.16024689946929	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCCTGTGTGAGTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156389507	156410078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_156389804_156392568_156393370_156397746_156397977_156408784
tx.11275	chr2	+	1450	7	FSM	ENSMUSG00000061689.16	ENSMUST00000109566.9	1595	7	-19	164	-5	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	183	junction_1	73.2575365861197	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGTTTCTCACCCTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156562945	156604880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_156563008_156587754_156588117_156590251_156590341_156590863_156591277_156602770_156602863_156603692_156603849_156604604
tx.11276	chr2	-	627	4	NNC	ENSMUSG00000087179.9	novel	388	3	NA	NA	-2	59868	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	14	junction_1	68.5127725318426	30	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTGGTCATAGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156681742	156615100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_156615230_156679742_156679834_156680337_156680457_156681454
tx.11277	chr2	-	512	4	NNC	ENSMUSG00000087179.9	novel	388	3	NA	NA	4	59868	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	14	junction_1	67.4009561422454	43	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTGGTCATAGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156681808	156615100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_156615230_156679742_156679834_156680337_156680457_156681635
tx.11278	chr2	-	521	4	NNC	ENSMUSG00000087179.9	novel	388	3	NA	NA	-16	30833	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	80.4003869531871	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGTCTTAGCTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156681828	156644135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_156644337_156679742_156679834_156680337_156680457_156681718
tx.11279	chr2	+	2697	4	FSM	ENSMUSG00000062175.14	ENSMUST00000073352.10	2690	4	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_3	80.1373820385967	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAATTTTTTGTTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156682012	156697490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_156682159_156686075_156686302_156695048_156695149_156695265
tx.11280	chr2	+	2857	3	FSM	ENSMUSG00000062175.14	ENSMUST00000081335.13	2900	3	43	0	43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_2	7.5	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAATTTTTTGTTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156681969	156697490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_156682159_156686075_156686302_156695048
tx.11281	chr2	+	2807	3	NNC	ENSMUSG00000062175.14	novel	2900	3	NA	NA	279	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	30	junction_1	93.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAATTTTTTGTTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156682298	156697490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_156682438_156686075_156686302_156695048
tx.11282	chr2	+	2682	4	NNC	ENSMUSG00000062175.14	novel	2900	3	NA	NA	287	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_1	82.8908251188809	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAATTTTTTGTTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156682306	156697490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_156682438_156686075_156686302_156695048_156695149_156695265
tx.11283	chr2	+	2670	2	ISM	ENSMUSG00000062175.14	ENSMUST00000073352.10	2690	4	4054	0	3132	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	217	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAATTTTTTGTTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156686073	156697490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_156686302_156695048
tx.11284	chr2	-	1398	3	NNC	ENSMUSG00000085741.9	novel	1196	3	NA	NA	-11	29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	12	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTGCTTGGCTTTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156704894	156694320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_156694611_156695350_156695939_156704374
tx.11285	chr2	+	887	4	FSM	ENSMUSG00000027637.4	ENSMUST00000029165.4	1045	4	158	0	141	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1149	junction_1	99.8031395631754	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGGCATGCCTGGTA	4800	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156705205	156715483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_156705338_156707176_156707281_156714257_156714388_156714962
tx.11286	chr2	+	761	3	FSM	ENSMUSG00000027637.4	ENSMUST00000152551.2	765	3	169	-165	163	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_1	636.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGGCATGCCTGGTA	4822	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156705227	156715483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_156705338_156714257_156714388_156714962
tx.11287	chr2	+	578	2	ISM	ENSMUSG00000027637.4	ENSMUST00000029165.4	1045	4	9283	0	-131	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1366	junction_1	0	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTGGCATGCCTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156714330	156715483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_156714388_156714962
tx.11288	chr2	-	2533	15	ISM	ENSMUSG00000027634.15	ENSMUST00000072298.13	2586	16	21913	0	-16750	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_4	16.2683177761349	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGCTGCTGGTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156812063	156769264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_156770802_156773135_156773188_156773349_156773386_156776861_156776910_156779246_156779299_156779405_156779472_156780470_156780575_156782276_156782334_156785906_156785994_156786304_156786366_156787936_156788000_156790161_156790283_156791953_156792060_156800386_156800423_156811956
tx.11289	chr2	-	2611	16	FSM	ENSMUSG00000027634.15	ENSMUST00000072298.13	2586	16	-25	0	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_4	17.2644786258439	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGCTGCTGGTGTTATTT	5889	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156834001	156769264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_156770802_156773135_156773188_156773349_156773386_156776861_156776910_156779246_156779299_156779405_156779472_156780470_156780575_156782276_156782334_156785906_156785994_156786304_156786366_156787936_156788000_156790161_156790283_156791953_156792060_156800386_156800423_156811956_156812059_156833918
tx.11290	chr2	-	1879	11	NNC	ENSMUSG00000027635.16	novel	2080	11	NA	NA	-16	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_9	63.4460400655549	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTATGTGACAGTGTGTCT	8118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156849011	156837182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_156838202_156838652_156838741_156839526_156839675_156840639_156840718_156841055_156841116_156842753_156842845_156843602_156843676_156844608_156844683_156847087_156847193_156847767_156847794_156848894
tx.11291	chr2	-	3165	10	ISM	ENSMUSG00000027635.16	ENSMUST00000103129.9	2080	11	4	12	4	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	171	junction_9	21.9027029168029	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTTGAAGTGTACACTAT	8138	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156848991	156837196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_156838202_156838652_156838741_156839526_156839675_156840639_156840718_156841055_156841116_156842753_156842845_156843602_156843676_156844608_156844683_156847087_156847412_156847767
tx.11292	chr2	-	2070	11	FSM	ENSMUSG00000027635.16	ENSMUST00000103129.9	2080	11	0	10	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_10	28.450131809888	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGAAGTGTACACTATGT	8134	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156848995	156837194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_156838202_156838652_156838741_156839526_156839675_156840639_156840718_156841055_156841116_156842753_156842845_156843602_156843676_156844608_156844683_156847087_156847412_156847767_156847794_156848894
tx.11293	chr2	-	1451	6	ISM	ENSMUSG00000027635.16	ENSMUST00000103129.9	2080	11	6185	-3	2366	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	177	junction_5	23.2172349774903	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATGTGACAGTGTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156842810	156837181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_156838202_156838652_156838741_156839526_156839675_156840639_156840718_156841055_156841116_156842753
tx.11294	chr2	-	2006	16	FSM	ENSMUSG00000027639.17	ENSMUST00000057725.10	3926	16	59	1861	0	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_1	26.3435423248701	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTGCGGTTAGTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156977126	156941313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_156941424_156943640_156943779_156946751_156946857_156948150_156948244_156949348_156949486_156951336_156951453_156952467_156952560_156954719_156954862_156956141_156956243_156958271_156958428_156962401_156962473_156963750_156963867_156965208_156965370_156968691_156968765_156971769_156971837_156976798
tx.11295	chr2	-	1625	7	FSM	ENSMUSG00000027639.17	ENSMUST00000149313.8	1375	7	-247	-3	22	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	78.9887474405198	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTGTTGTTTTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156977104	156961480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_156962312_156962401_156962473_156963750_156963867_156965208_156965370_156968691_156968765_156971769_156971837_156976798
tx.11296	chr2	+	390	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084113.2	novel	360	1	NA	NA	-50	103	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTGTCTATTGATTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157010689	157011202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_157010831_157010953
tx.11297	chr2	-	2323	15	ISM	ENSMUSG00000027641.14	ENSMUST00000154721.8	2715	16	1	2811	1	-2811	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_2	35.4011991034087	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAACTCTGTATTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157046453	157011708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_157012051_157016694_157016828_157017447_157017613_157019138_157019277_157029854_157029959_157030142_157030256_157033826_157033994_157034995_157035183_157035931_157035982_157037199_157037361_157037460_157037590_157037679_157037745_157038074_157038276_157041335_157041470_157046219
tx.11298	chr2	-	2395	13	FSM	ENSMUSG00000027641.14	ENSMUST00000124518.2	2383	13	-7	-5	1	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_1	21.3559450478992	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTGTATACATGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157046453	157016900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_157017613_157019138_157019277_157029854_157029959_157030142_157030256_157033826_157033994_157034995_157035183_157035931_157035982_157037199_157037361_157037460_157037590_157037679_157037745_157038074_157038276_157041335_157041470_157046219
tx.11299	chr2	+	2477	17	FSM	ENSMUSG00000027642.16	ENSMUST00000116380.9	2756	17	17	262	17	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	1870	junction_1	194.730412606121	443	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTGATGGAGCCTTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157120995	157167977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_157121256_157125503_157125698_157131447_157131544_157132456_157132633_157136072_157136149_157137173_157137309_157139301_157139479_157141460_157141580_157144325_157144432_157152120_157152213_157154396_157154512_157156697_157156893_157158042_157158130_157159866_157159963_157162040_157162117_157163662_157163793_157167630
tx.113	chr1	-	1979	4	ISM	ENSMUSG00000042197.14	ENSMUST00000139143.8	3578	13	37061	7712	6613	-7712	internal_fragment	FALSE	canonical	3	309	junction_1	6.12825877028341	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACTGTTTCTAAGATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33816405	33808337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_33808989_33809849_33809981_33811973_33812115_33815349
tx.1130	chr1	-	1216	10	FSM	ENSMUSG00000026632.18	ENSMUST00000110893.10	1242	10	13	13	13	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	11.4309521329882	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTTTTAAAAAAGGAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190795116	190778035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_190778518_190781478_190781560_190785056_190785170_190787052_190787109_190787458_190787569_190788559_190788623_190791023_190791109_190792309_190792384_190793421_190793455_190794997
tx.11300	chr2	+	2218	16	ISM	ENSMUSG00000027642.16	ENSMUST00000127252.8	2314	17	4157	-1	0	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2037	junction_7	165.421831153636	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTGATGGAGCCTTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157125502	157167977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_157125698_157131447_157131544_157132456_157132633_157136072_157136149_157137173_157137309_157139301_157139479_157141460_157141580_157144325_157144432_157152120_157152213_157154396_157154512_157156697_157156893_157158042_157158130_157159866_157159963_157162040_157162117_157163662_157163793_157167630
tx.11301	chr2	-	302	2	Intergenic	novelGene_829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCTTCCTAACAAAGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157205656	157203068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_157203261_157205546
tx.11302	chr2	-	541	3	Intergenic	novelGene_830	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCTTCCTAACAAAGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157206339	157203068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_157203261_157205546_157205655_157206098
tx.11303	chr2	+	1092	3	FSM	ENSMUSG00000063019.6	ENSMUST00000081202.6	1107	3	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	219	junction_1	136	942	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCTGTGTTGCTACTG	5232	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157209528	157238683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_157209561_157220968_157221175_157237829
tx.11304	chr2	+	1062	2	ISM	ENSMUSG00000063019.6	ENSMUST00000081202.6	1107	3	11453	0	11453	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	491	junction_1	0	574	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCTGTGTTGCTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157220966	157238683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_157221175_157237829
tx.11305	chr2	-	2056	2	FSM	ENSMUSG00000067787.11	ENSMUST00000109528.9	2056	2	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_1	0	179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGGTTTTATGTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157408257	157398281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_157400248_157408167
tx.11306	chr2	+	1132	2	FSM	ENSMUSG00000067786.17	ENSMUST00000153739.9	1146	2	32	-18	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCTTTTGTGGCTTCTTTT	9293	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157402029	157404442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_157402181_157403461
tx.11307	chr2	-	709	2	FSM	ENSMUSG00000087547.2	ENSMUST00000131365.2	629	2	0	-80	0	80	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_1	0	1731	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCCTGTGGTGGGAAGAA	8707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157439240	157437422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_157437906_157439014
tx.11308	chr2	+	1879	16	FSM	ENSMUSG00000027649.16	ENSMUST00000029178.7	2442	16	40	523	40	-523	multi-exon	FALSE	canonical	3	501	junction_9	43.3601968015214	516	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGGGGCTGACATTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157579360	157733011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_157579480_157616330_157616520_157621731_157621839_157630911_157631052_157641346_157641445_157648594_157648689_157651384_157651477_157659674_157659748_157659970_157660030_157661373_157661523_157678429_157678612_157710219_157710318_157713027_157713109_157726052_157726191_157726347_157726421_157732824
tx.11309	chr2	+	393	3	ISM	ENSMUSG00000027649.16	ENSMUST00000029178.7	2442	16	146737	523	94274	-523	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	601	junction_1	1.5	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGGGGCTGACATTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157726057	157733011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_157726191_157726347_157726421_157732824
tx.1131	chr1	-	424	5	NIC	ENSMUSG00000026632.18	novel	342	4	NA	NA	0	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_1	15.9216833280907	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATGCATTGGTATGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190795101	190790093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_190790222_190791023_190791109_190792309_190792384_190793421_190793455_190794997
tx.11310	chr2	-	3809	8	FSM	ENSMUSG00000027650.13	ENSMUST00000029179.11	3830	8	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_3	12.5746749055231	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATGAGAGATTTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157870332	157823722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_157824381_157834887_157834976_157835273_157835479_157837300_157837442_157838996_157839146_157842539_157842729_157848938_157851279_157870293
tx.11311	chr2	-	745	2	ISM	ENSMUSG00000027650.13	ENSMUST00000109522.2	3765	7	16306	-7	14156	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	208	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGATGAGAGATTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157834976	157823724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_157824381_157834887
tx.11312	chr2	-	933	2	ISM	ENSMUSG00000027650.13	ENSMUST00000029179.11	3830	8	3	26680	3	287	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGTAAAAAGTACTGGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157870350	157850402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_157851279_157870293
tx.11313	chr2	-	597	2	NNC	ENSMUSG00000027650.13	novel	3830	8	NA	NA	21	-14308	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCTTCTACTGGCTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157870332	157864997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_157865556_157870293
tx.11314	chr2	+	3627	7	FSM	ENSMUSG00000027651.17	ENSMUST00000103123.10	4504	7	-10	887	-10	-887	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_3	28.7807806241133	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTGATGTTTCTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157870406	157919240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_157870966_157877915_157878046_157885325_157885460_157889838_157889949_157892006_157892134_157900571_157900748_157916849
tx.11315	chr2	+	613	2	ISM	ENSMUSG00000027651.17	ENSMUST00000109519.9	1597	4	-20	12660	-9	-12660	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	185	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTAAAAGGAAAGGACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157870407	157877970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_157870966_157877915
tx.11316	chr2	-	2053	4	ISM	ENSMUSG00000037820.16	ENSMUST00000103122.10	3596	13	22111	0	15411	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	175	junction_1	15.084944665313	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAAGGTCTGCCTTGTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157966245	157958321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_157959872_157960766_157960904_157962044_157962206_157966040
tx.11317	chr2	-	1909	9	ISM	ENSMUSG00000037820.16	ENSMUST00000103122.10	3596	13	55	10224	12	719	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	151	junction_4	21.3248681121361	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAACACAGTGAAGTCTTCT	8861	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157988301	157968545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_157969275_157970558_157970663_157971242_157971379_157973250_157973429_157974348_157974478_157976170_157976290_157980626_157980870_157984914_157985095_157988210
tx.11318	chr2	+	1898	15	FSM	ENSMUSG00000016024.10	ENSMUST00000016168.9	2525	15	91	536	-28	-536	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1.75691055374984	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATCCCAGCTGAACCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158148503	158174236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_158148714_158150600_158150716_158151520_158151650_158155392_158155549_158156072_158156137_158159456_158159521_158161591_158161684_158162183_158162361_158163974_158164035_158166428_158166597_158167626_158167695_158168147_158168191_158169436_158169501_158170265_158170343_158173825
tx.11319	chr2	-	551	2	ISM	ENSMUSG00000085385.8	ENSMUST00000154242.2	346	3	979	-243	-642	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGCCTTTTAAATCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158199405	158197698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_158197962_158199117
tx.11320	chr2	-	882	6	FSM	ENSMUSG00000085385.8	ENSMUST00000133449.8	933	6	37	14	-1	6	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	32.8048776861003	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGCCTTTTAAATCTGTG	8326	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158203463	158197698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_158197962_158199117_158199184_158201101_158201252_158202383_158202520_158202862_158202991_158203324
tx.11321	chr2	-	983	6	NIC	ENSMUSG00000085385.8	novel	933	6	NA	NA	-1	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	34	junction_3	23.4059821413245	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGCCTTTTAAATCTGTG	8326	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158203463	158197698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_158197962_158199117_158199184_158201101_158201353_158202383_158202520_158202862_158202991_158203324
tx.11322	chr2	-	920	6	NIC	ENSMUSG00000085385.8	novel	1046	7	NA	NA	-1	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	13	junction_3	30.9476978142155	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGCCTTTTAAATCTGTG	8326	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158203463	158197698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_158197962_158199117_158199184_158201101_158201353_158202446_158202520_158202862_158202991_158203324
tx.11323	chr2	+	1332	5	FSM	ENSMUSG00000044349.17	ENSMUST00000109488.8	5864	5	3	4529	3	26	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_4	1.92028643696715	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGATGTCACGTGTAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158217560	158223536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_158217809_158218000_158218247_158218913_158218993_158222690_158222772_158222858
tx.11324	chr2	+	1127	3	ISM	ENSMUSG00000037761.17	ENSMUST00000045644.9	2402	9	10840	5	4099	-5	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	110	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTTATTCTGTGTGTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158477647	158481126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_158478068_158478587_158478721_158480552
tx.11325	chr2	+	2270	4	FSM	ENSMUSG00000027654.3	ENSMUST00000029183.3	2266	4	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	282	junction_3	16.3571255285137	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGTGATTCTTTTTGTT	402	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158610008	158628557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_158610508_158621764_158621933_158625052_158625178_158627079
tx.11326	chr2	+	1698	3	ISM	ENSMUSG00000027654.3	ENSMUST00000029183.3	2266	4	11825	0	-1490	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	282	junction_2	15	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGTGATTCTTTTTGTT	7453	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158621837	158628557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_158621933_158625052_158625178_158627079
tx.11327	chr2	+	3229	22	FSM	ENSMUSG00000027655.15	ENSMUST00000109478.9	3284	22	55	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	62	junction_9	12.5862106454921	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTTCTCCTGTCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158636781	158700134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_158636849_158643294_158643429_158648317_158648411_158648842_158648921_158657349_158657455_158659282_158659345_158660181_158660252_158662305_158662366_158668224_158668338_158669822_158669920_158671422_158671582_158673581_158673793_158676789_158676915_158678560_158678616_158682470_158682567_158684224_158684320_158684775_158684854_158685997_158686128_158688827_158688910_158691401_158691474_158693630_158693743_158698999
tx.11328	chr2	+	2186	11	ISM	ENSMUSG00000027655.15	ENSMUST00000145692.8	3249	22	36805	0	4249	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_4	8.0628778981205	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTTCTCCTGTCTGTGG	5489	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158673586	158700134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_158673793_158676789_158676915_158678560_158678616_158682470_158682567_158684224_158684320_158684775_158684854_158685997_158686128_158688827_158688910_158691401_158691474_158693630_158693743_158698999
tx.11329	chr2	-	968	2	NNC	ENSMUSG00000078956.4	novel	340	3	NA	NA	-36289	773	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	28	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTTGAAGTGTGTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160498180	160409525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_160410363_160498049
tx.11330	chr2	+	614	2	FSM	ENSMUSG00000078955.4	ENSMUST00000128681.2	575	2	-37	-2	-37	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGGCTGTTGTCTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160425239	160427113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_160425531_160426790
tx.11331	chr2	+	567	5	ISM	ENSMUSG00000070544.7	ENSMUST00000109468.3	3856	21	90	38287	-2	-474	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	362	junction_4	42.2670084108161	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAAAAGGAAAATGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160487897	160526397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_160488183_160488527_160488553_160512019_160512123_160524570_160524695_160526367
tx.11332	chr2	+	537	4	ISM	ENSMUSG00000070544.7	ENSMUST00000109468.3	3856	21	90	39990	-2	-2177	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	398	junction_3	29.7806797922561	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACAGAACTTTGCCTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160487897	160524694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_160488183_160488527_160488553_160512019_160512123_160524570
tx.11333	chr2	-	250	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000070544.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAATCTGAAATCTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160498181	160493070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_160493189_160498049
tx.11335	chr2	-	1490	10	ISM	ENSMUSG00000057133.15	ENSMUST00000138078.8	3092	17	-11	17847	-11	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	19.8997487421324	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGTGTATTTGACTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160951006	160867800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_160867994_160868168_160868256_160871097_160871216_160871822_160871882_160872666_160872730_160881113_160881264_160883904_160884053_160894307_160894826_160901838_160901895_160950908
tx.11336	chr2	-	1072	8	ISM	ENSMUSG00000057133.15	ENSMUST00000138078.8	3092	17	56434	17847	-63	5	internal_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	21.8155533357955	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACGTGTATTTGACTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160894561	160867800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_160867994_160868168_160868256_160871097_160871216_160871822_160871882_160872666_160872730_160881113_160881264_160883904_160884053_160894307
tx.11337	chr2	-	740	5	FSM	ENSMUSG00000057133.15	ENSMUST00000130265.2	675	5	-63	-2	-63	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_4	14.2653426176871	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAAGGGTCTTCTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160894561	160871756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_160871882_160872666_160872730_160881113_160881264_160883904_160884053_160894307
tx.11338	chr2	+	1357	4	ISM	ENSMUSG00000016921.15	ENSMUST00000193611.6	2897	5	1898	-142	1765	142	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	867	junction_3	54.1376845541891	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTTGTGCTGTTAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162775345	162777270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_162775471_162775573_162775783_162776147_162776232_162776331
tx.11339	chr2	+	1229	3	ISM	ENSMUSG00000016921.15	ENSMUST00000193611.6	2897	5	2124	-137	1991	137	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	867	junction_2	27.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACCTTATTTTGTGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162775571	162777265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_162775783_162776147_162776232_162776331
tx.11340	chr2	+	1629	5	ISM	ENSMUSG00000017868.17	ENSMUST00000018012.14	2693	14	11870	0	1088	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_3	4.54835134966506	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTACTGGGTATGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162841119	162856047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_162841189_162845191_162845288_162846066_162846223_162848713_162848804_162854829
tx.11341	chr2	+	2130	13	FSM	ENSMUSG00000017858.13	ENSMUST00000018002.13	2248	13	118	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_1	53.5787971122906	333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCTGTCATTGATATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162859391	162888061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_162859454_162864294_162864420_162865269_162865358_162867250_162867381_162867807_162867884_162869950_162870023_162871654_162871782_162873100_162873191_162875154_162875224_162878478_162878634_162882546_162882635_162884610_162884720_162887122
tx.11342	chr2	+	2664	14	NNC	ENSMUSG00000017861.12	novel	3651	14	NA	NA	-71	976	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	97	junction_1	809.068256568618	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCGACTCTGCCCTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162896535	162925595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_162896724_162901420_162901515_162903443_162903516_162904376_162904470_162906199_162906421_162910075_162910236_162914543_162914835_162916301_162916725_162917555_162917696_162919706_162919810_162921513_162921628_162922637_162922743_162924469_162924620_162925085
tx.11343	chr2	+	1394	7	ISM	ENSMUSG00000017861.12	ENSMUST00000018005.10	3651	14	19846	1013	-212	976	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2736	junction_1	195.581753295706	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCGACTCTGCCCTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162916452	162925595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_162916725_162917555_162917696_162919706_162919810_162921513_162921628_162922637_162922743_162924469_162924620_162925085
tx.11344	chr2	+	892	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000070708.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGTCTCCACCCTCAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162928955	162931532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_162929770_162931454
tx.11345	chr2	-	760	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000070708.6	novel	822	1	NA	NA	-1757	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	735	junction_1	0	3341	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTCCGGGCTGTGCTGGTT	912	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162931532	162928955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_162929642_162931458
tx.11346	chr2	-	886	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000070708.6	novel	822	1	NA	NA	-1757	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	698	junction_1	0	2930	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTCCGGGCTGTGCTGGTT	912	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162931532	162928955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_162929768_162931458
tx.11347	chr2	+	1347	3	NNC	ENSMUSG00000086152.2	novel	714	3	NA	NA	-5	309	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_2	1.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGTCTAGTCAGCTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162964520	162986188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_162964699_162982755_162983125_162985388
tx.11348	chr2	+	978	2	NNC	ENSMUSG00000086152.2	novel	714	3	NA	NA	-5	309	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGTCTAGTCAGCTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162964520	162986188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_162964699_162985388
tx.11349	chr2	-	1625	4	FSM	ENSMUSG00000035399.13	ENSMUST00000046908.10	1620	4	-7	2	-7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	367	junction_1	31.0268700752536	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTATTGTGTGTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163261455	163247743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_163249010_163253316_163253431_163257454_163257576_163261331
tx.1135	chr1	-	1974	4	FSM	ENSMUSG00000026628.14	ENSMUST00000027941.14	1984	4	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_2	6.37704215656966	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTAGTGTGGCACTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190915527	190902492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_190903877_190904571_190904680_190909427_190909672_190915289
tx.11350	chr2	+	1180	6	FSM	ENSMUSG00000017943.16	ENSMUST00000018087.13	2220	6	18	1022	18	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.49666295470958	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCAGTGTCTCTGTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163280415	163295873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_163280646_163287953_163288147_163289418_163289593_163292485_163292584_163293420_163293536_163295503
tx.11351	chr2	-	1533	2	FSM	ENSMUSG00000048486.7	ENSMUST00000109418.2	3967	2	6	2428	6	-2428	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCCTGGCACTTGGATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163314543	163310726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_163312039_163314322
tx.11352	chr2	+	329	3	NNC	ENSMUSG00000053353.6	novel	740	2	NA	NA	157	1032	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAACCGTGGAGACAAATG	126	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163314621	163315957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_163314671_163314941_163315081_163315816
tx.11353	chr2	-	1014	2	ISM	ENSMUSG00000017707.10	ENSMUST00000017851.4	3683	10	18784	1389	18778	-1389	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	577	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTGTTTGTGTATTTG	4385	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163468267	163466580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_163467500_163468172
tx.11354	chr2	-	2272	10	FSM	ENSMUSG00000017707.10	ENSMUST00000017851.4	3683	10	22	1389	16	-1389	multi-exon	FALSE	canonical	3	366	junction_6	56.7393868903371	569	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTGTTTGTGTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163487029	163466580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_163467500_163468172_163468398_163469791_163469973_163471046_163471138_163472845_163473016_163474025_163474164_163476354_163476435_163478730_163478925_163481085_163481248_163486917
tx.11355	chr2	+	1010	4	FSM	ENSMUSG00000035268.15	ENSMUST00000064703.13	1036	4	25	1	9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	323	junction_1	29.6348143611905	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTTATGATCTTTTCTT	8628	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163500343	163568073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_163500413_163545405_163545476_163563047_163563222_163567376
tx.11356	chr2	+	942	3	FSM	ENSMUSG00000035268.15	ENSMUST00000164399.8	983	3	36	5	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_1	157.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTTATGATCTTTTCTT	8626	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163500341	163568073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_163500413_163563047_163563222_163567376
tx.11357	chr2	-	332	2	ISM	ENSMUSG00000017697.4	ENSMUST00000017841.4	1688	12	22599	230	3226	-230	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCAGCACATGGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163569560	163568733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_163568969_163569463
tx.11358	chr2	-	1443	12	FSM	ENSMUSG00000017697.4	ENSMUST00000017841.4	1688	12	15	230	15	-230	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	12.1526108476007	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCAGCACATGGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163592144	163568733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_163568969_163569463_163569564_163570036_163570167_163571931_163571997_163572217_163572320_163572400_163572473_163573024_163573153_163574176_163574293_163574773_163574918_163577268_163577392_163580082_163580145_163591978
tx.11359	chr2	+	2387	6	FSM	ENSMUSG00000018326.10	ENSMUST00000018470.10	3013	6	240	386	240	-386	multi-exon	FALSE	canonical	3	1292	junction_3	139.446620611616	432	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCCACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163837119	163860122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_163837286_163853521_163853825_163855925_163856050_163857150_163857315_163858022_163858119_163858588
tx.1136	chr1	+	569	2	FSM	ENSMUSG00000073478.7	ENSMUST00000139056.3	716	2	-1	148	-1	-148	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGCTTCAGTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190956649	190957884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_190956740_190957405
tx.11360	chr2	+	595	5	ISM	ENSMUSG00000018326.10	ENSMUST00000018470.10	3013	6	16879	1775	16336	1530	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1292	junction_2	145.279902257676	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGACTTTCGATTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163853758	163858733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_163853825_163855925_163856050_163857150_163857315_163858022_163858119_163858588
tx.11361	chr2	+	610	2	NNC	ENSMUSG00000054582.5	novel	750	2	NA	NA	-19	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCTTGCCTGGAAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163889287	163892456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_163889338_163891896
tx.11362	chr2	-	1859	7	FSM	ENSMUSG00000018322.11	ENSMUST00000109384.10	1923	7	64	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	532	junction_3	35.0606617165164	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTGGCTCTGACGCATTT	5945	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163913025	163895459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_163896428_163896620_163896748_163900585_163900734_163902758_163902929_163906811_163906965_163908489_163908590_163912832
tx.11363	chr2	+	1286	10	ISM	ENSMUSG00000018209.16	ENSMUST00000018353.14	5232	11	1	37491	1	-336	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	214	junction_9	13.5819415328763	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAATCAGATCAACAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163916058	163959953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_163916168_163921432_163921514_163925549_163925679_163928414_163928530_163930760_163930926_163938658_163938827_163940358_163940497_163941616_163941746_163942329_163942517_163959888
tx.11364	chr2	+	1934	11	FSM	ENSMUSG00000018209.16	ENSMUST00000018353.14	5232	11	-2	3300	-2	-3300	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_9	12.953763931769	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGGTGTCTCTGTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163916055	163994144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_163916168_163921432_163921514_163925549_163925679_163928414_163928530_163930760_163930926_163938658_163938827_163940358_163940497_163941616_163941746_163942329_163942517_163959888_163960047_163993592
tx.11365	chr2	+	588	2	ISM	ENSMUSG00000018209.16	ENSMUST00000137866.2	694	3	690	0	690	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	214	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCTGTTTCCTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163942329	163960289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_163942517_163959888
tx.11366	chr2	+	897	3	ISM	ENSMUSG00000018209.16	ENSMUST00000018353.14	5232	11	26272	3300	690	-3300	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	214	junction_1	16	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGGTGTCTCTGTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163942329	163994144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_163942517_163959888_163960047_163993592
tx.11367	chr2	-	490	3	FSM	ENSMUSG00000051769.3	ENSMUST00000063251.3	488	3	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	2.5	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTATGTAATAACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164042052	164040782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_164040933_164041577_164041737_164041871
tx.11368	chr2	-	607	2	ISM	ENSMUSG00000051769.3	ENSMUST00000063251.3	488	3	16	0	16	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTATGTAATAACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164042034	164040782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_164040933_164041577
tx.11369	chr2	+	485	2	ISM	ENSMUSG00000017004.8	ENSMUST00000017148.8	628	3	592	-5	-118	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAAATCTCTTGCTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164175251	164176321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_164175559_164176143
tx.11370	chr2	-	1315	5	FSM	ENSMUSG00000017009.4	ENSMUST00000017153.4	2458	5	0	1143	0	510	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_3	6.36396103067893	425	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCCTTTATGGGAGCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164285106	164267309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_164268158_164270812_164271009_164271599_164271647_164273106_164273234_164285009
tx.11371	chr2	+	1305	3	ISM	ENSMUSG00000045503.17	ENSMUST00000072452.11	1606	4	307	166	-31	-166	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	303	junction_1	8.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACCTCAACTGTGGCAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164303197	164307262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_164303450_164305220_164305289_164306277
tx.11372	chr2	+	2544	12	FSM	ENSMUSG00000017721.16	ENSMUST00000103101.11	2562	12	18	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_9	44.392501786631	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCGTTGCTTCCTTCCTAA	5130	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164339457	164350221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_164339678_164339785_164339964_164341714_164341843_164342110_164342212_164342351_164342439_164343000_164343089_164343193_164343292_164343404_164343571_164344397_164344599_164348302_164348469_164348569_164348654_164349194
tx.11373	chr2	+	2325	13	NNC	ENSMUSG00000017721.16	novel	2611	13	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_12	51.0299476342623	12	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCGTTGCTTCCTTCCTAA	5125	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164339452	164350221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_164339678_164339785_164339964_164341714_164341843_164342110_164342212_164342351_164342439_164343000_164343089_164343193_164343292_164343404_164343571_164344397_164344599_164348302_164348469_164348569_164348654_164349194_164349527_164349750
tx.11375	chr2	+	285	2	Intergenic	novelGene_832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCAAAACCTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164365669	164393435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_164365786_164393266
tx.11376	chr2	+	585	4	NIC	ENSMUSG00000017723.12	novel	849	5	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	36	junction_1	229.843908386153	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGCTTGCCTCACTTTC	233	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164404618	164410430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_164404725_164405976_164406133_164407711_164407859_164410254
tx.11377	chr2	+	730	5	FSM	ENSMUSG00000017723.12	ENSMUST00000017867.10	849	5	119	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	478	junction_3	30.4251129825347	2965	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGCTTGCCTCACTTTC	232	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164404617	164410430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_164404725_164405227_164405372_164405976_164406133_164407711_164407859_164410254
tx.11378	chr2	+	416	3	FSM	ENSMUSG00000017723.12	ENSMUST00000109344.9	429	3	13	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	240.5	921	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGCTTGCCTCACTTTC	246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164404631	164410430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_164404725_164407711_164407859_164410254
tx.11379	chr2	-	641	3	NNC	ENSMUSG00000074594.10	novel	252	3	NA	NA	-141	4	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGGGTTCTGTGGTTCTCA	3635	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164493824	164491546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_164491738_164492404_164492547_164493516
tx.11380	chr2	+	456	2	FSM	ENSMUSG00000070529.8	ENSMUST00000094344.6	459	2	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACACTCTTAATAATCACTG	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	164497968	164499288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_164498119_164498982
tx.11381	chr2	+	452	3	NIC	ENSMUSG00000074593.12	novel	443	4	NA	NA	0	18	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGTTCATTTCCTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164557224	164560006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_164557395_164558914_164559085_164559894
tx.11382	chr2	+	359	3	NNC	ENSMUSG00000074593.12	novel	443	4	NA	NA	1234	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_1	2	39	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTCAAAATTCTTGTTCA	718	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164558458	164559996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_164558546_164558914_164559085_164559894
tx.11383	chr2	+	619	2	ISM	ENSMUSG00000074593.12	ENSMUST00000103097.10	443	4	1339	-4	1339	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGAATTCAAAATTCTTG	823	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164558563	164559992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_164559085_164559894
tx.11384	chr2	-	953	7	NNC	ENSMUSG00000086453.8	novel	676	6	NA	NA	16	3957	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.25830573921179	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGTGGCTTATAAAATTAT	2108	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164611570	164592204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_164592283_164592624_164592779_164594312_164594409_164595992_164596225_164601148_164601261_164609632_164609834_164611490
tx.11386	chr2	+	934	5	NNC	ENSMUSG00000001403.14	novel	967	6	NA	NA	26	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	715.889787257787	1436	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTTCTCAAGTTACCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164611848	164614827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_164612001_164613186_164613300_164613773_164613979_164614086_164614147_164614423
tx.11387	chr2	+	936	6	FSM	ENSMUSG00000001403.14	ENSMUST00000088248.13	967	6	31	0	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1606	junction_1	43.6458474542539	2905	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTTCTCAAGTTACCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164611848	164614827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_164612001_164612286_164612315_164613212_164613300_164613773_164613979_164614086_164614147_164614423
tx.11388	chr2	+	1528	3	NNC	ENSMUSG00000050373.14	novel	2590	3	NA	NA	7	153	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATCTCTTTATTGTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164627943	164634697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_164628249_164628617_164628776_164633632
tx.11389	chr2	-	1116	6	FSM	ENSMUSG00000017307.17	ENSMUST00000103094.11	1152	6	36	0	-24	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	284	junction_4	26.9250812440743	1234	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGCTGACCTTTAATAGAA	8202	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164646766	164634687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_164634931_164636904_164637100_164637571_164637730_164641639_164641866_164644916_164645054_164646609
tx.11390	chr2	-	979	5	FSM	ENSMUSG00000017307.17	ENSMUST00000134611.4	1017	5	35	3	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_4	121.847240428333	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGCTGACCTTTAATAGAA	8202	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164646766	164634687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_164634931_164636904_164637100_164637571_164637730_164641639_164641866_164646609
tx.11391	chr2	+	2378	2	FSM	ENSMUSG00000017764.3	ENSMUST00000017908.3	2705	2	327	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	571	junction_1	0	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTGTCTTGTCTGGTTTA	8854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164664932	164668791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_164665121_164666601
tx.11392	chr2	-	577	2	FSM	ENSMUSG00000039873.5	ENSMUST00000042775.5	1014	2	440	-3	440	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGAGGGTCTCCTTGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164674936	164672648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_164672908_164674618
tx.11393	chr2	-	353	2	ISM	ENSMUSG00000017754.14	ENSMUST00000109316.8	2226	15	17384	3	16638	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	388	junction_1	0	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGGGTTTCTCTAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164682078	164681440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_164681749_164682033
tx.11394	chr2	-	624	6	ISM	ENSMUSG00000017754.14	ENSMUST00000109316.8	2226	15	12884	3	12138	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	366	junction_5	18.1989010657237	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGGGTTTCTCTAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164686578	164681440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_164681749_164682033_164682111_164682240_164682305_164682414_164682458_164686354_164686423_164686514
tx.11395	chr2	-	1691	15	FSM	ENSMUSG00000017754.14	ENSMUST00000109316.8	2226	15	532	3	-214	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	336	junction_14	23.0625812315366	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGGGTTTCTCTAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164698930	164681440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_164681749_164682033_164682111_164682240_164682305_164682414_164682458_164686354_164686423_164686514_164686680_164688513_164688574_164688659_164688837_164693432_164693525_164694392_164694457_164694536_164694601_164696185_164696342_164696846_164696976_164698623_164698724_164698806
tx.11396	chr2	-	1772	16	FSM	ENSMUSG00000017754.14	ENSMUST00000059954.14	1809	16	34	3	34	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	278	junction_15	32.6696597268271	424	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGGGTTTCTCTAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164699597	164681440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_164681749_164682033_164682111_164682240_164682305_164682414_164682458_164686354_164686423_164686514_164686680_164688513_164688574_164688659_164688837_164693432_164693525_164694392_164694457_164694536_164694601_164696185_164696342_164696846_164696976_164698623_164698724_164698806_164698918_164699503
tx.11397	chr2	+	510	2	FSM	ENSMUSG00000039849.7	ENSMUST00000145327.2	611	2	64	37	11	-37	multi-exon	FALSE	canonical	3	441	junction_1	0	1481	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTATGATGTCGTTAACAA	5960	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164721287	164725082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_164721410_164724694
tx.11398	chr2	+	1053	2	FSM	ENSMUSG00000085436.2	ENSMUST00000129364.2	1127	2	78	-4	78	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTTGGATACGGTGTTC	7318	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164753351	164761877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_164753671_164761143
tx.11399	chr2	+	1178	3	NNC	ENSMUSG00000085436.2	novel	1127	2	NA	NA	79	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTTTTTTGGATACGGTG	7319	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164753352	164761874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_164753671_164756011_164756141_164761143
tx.114	chr1	-	872	7	NNC	ENSMUSG00000042197.14	novel	542	2	NA	NA	2	-273	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	7	junction_1	116.134500568187	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTCTGCTGTGGCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33853505	33821531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_33821763_33822121_33822273_33822933_33823046_33825487_33825614_33844419_33844501_33852807_33852892_33853418
tx.11400	chr2	+	1444	7	ISM	ENSMUSG00000017737.3	ENSMUST00000017881.3	3175	13	2588	714	111	-714	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.816496580927726	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAGTCAATCAGCTTATC	6694	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164792726	164797056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_164792922_164793026_164793183_164794339_164794674_164794774_164794915_164795183_164795335_164795438_164795543_164796692
tx.11401	chr2	-	3117	8	FSM	ENSMUSG00000039804.16	ENSMUST00000040381.15	3179	8	60	2	-4	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	73	junction_1	19.1790702249582	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGTGCTAATCTTTCTT	3042	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164876727	164842278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_164844092_164844558_164844880_164846016_164846217_164851242_164851370_164852370_164852508_164854755_164855083_164865065_164865133_164876602
tx.11402	chr2	-	973	5	NNC	ENSMUSG00000053166.15	novel	3702	12	NA	NA	39146	-7683	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.03811374126261	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGCTGATTTAGCTCTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164984233	164961929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_164962266_164965435_164965554_164965641_164965764_164977103_164977241_164983973
tx.11403	chr2	+	554	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000053166.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATATCCTTCCAGATCTGA	2207	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165057886	165058968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_165058055_165058582
tx.11404	chr2	-	1974	10	NIC	ENSMUSG00000017664.17	novel	1843	11	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	63	junction_9	61.9452167365908	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCTCTGGAGACTACCA	5691	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165129758	165118473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_165119194_165119371_165119502_165120160_165120337_165122536_165122621_165122705_165122875_165123227_165123301_165124000_165124065_165124702_165124854_165125168_165125521_165129703
tx.11405	chr2	-	1924	9	ISM	ENSMUSG00000017664.17	ENSMUST00000109299.8	1926	10	4150	0	-5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_4	16.0657827384787	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCTCTGGAGACTACCA	9924	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165125525	165118473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_165119194_165119371_165119502_165120160_165120337_165122536_165122621_165122705_165122875_165123227_165123301_165124000_165124065_165124702_165124854_165125168
tx.11406	chr2	-	1976	10	FSM	ENSMUSG00000017664.17	ENSMUST00000109300.9	2008	10	33	-1	0	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	110	junction_9	47.7596864973064	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCTCTGGAGACTACCAG	5693	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165129756	165118472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_165119194_165119371_165119502_165120160_165120337_165122536_165122621_165122705_165122875_165123227_165123301_165124000_165124065_165124702_165124854_165125168_165125524_165129703
tx.11407	chr2	-	1137	9	NNC	ENSMUSG00000017670.17	novel	639	6	NA	NA	10	1224	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	114.629225658206	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTACAAACTTAAAAGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165168389	165149608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_165149982_165150832_165150985_165152094_165152195_165153542_165153725_165156650_165156702_165157523_165157597_165157917_165157959_165158158_165158272_165168337
tx.11408	chr2	-	878	7	ISM	ENSMUSG00000017670.17	ENSMUST00000103088.10	3052	20	10	18797	10	-996	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	269	junction_6	34.3870938321665	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCTGAACATCCTCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165168389	165151828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_165152195_165153542_165153725_165156650_165156702_165157523_165157597_165157917_165157959_165158158_165158272_165168337
tx.11409	chr2	+	483	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039671.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	42	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCCCCCCCGGCCCCGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165652161	165657588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_165652330_165657273
tx.1141	chr1	-	4086	15	FSM	ENSMUSG00000037474.14	ENSMUST00000027933.11	4212	15	0	126	0	-126	multi-exon	FALSE	canonical	3	463	junction_7	26.7651349516417	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTAAGATGGCTTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	191307656	191269602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_191271454_191272815_191273649_191278602_191278736_191280407_191280498_191285099_191285213_191288552_191288658_191288895_191289000_191290172_191290247_191293536_191293650_191295222_191295289_191300402_191300524_191300606_191300669_191301778_191301878_191302690_191302817_191307460
tx.11410	chr2	+	876	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039671.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	9	51	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATCCCTTGGCCAGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165652177	165659193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_165652330_165657273_165657453_165658648
tx.11411	chr2	-	1127	2	NNC	ENSMUSG00000039671.19	novel	2484	11	NA	NA	23657	5	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	3	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGGTTGTGTTTAATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165670385	165669043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_165669638_165669852
tx.11412	chr2	-	2289	12	NNC	ENSMUSG00000039671.19	novel	2515	11	NA	NA	15	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	164.953988074912	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGCTCTCTTGTTCCGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165740921	165669100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_165669638_165669852_165670610_165675228_165675345_165676809_165676888_165679200_165679257_165680731_165680820_165681917_165682011_165684683_165684798_165687940_165688085_165693919_165694069_165717624_165717696_165740835
tx.11413	chr2	+	495	2	FSM	ENSMUSG00000085274.2	ENSMUST00000155786.2	847	2	3	349	3	-349	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTGACAAATTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165699606	165700605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_165699939_165700442
tx.11414	chr2	+	516	5	ISM	ENSMUSG00000027678.18	ENSMUST00000109252.8	5757	23	1	22979	0	-3907	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_1	21.2999413144731	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTGTCTTCTACAGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165834556	165890411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_165834679_165876804_165876884_165889375_165889481_165889702_165889876_165890374
tx.11415	chr2	+	748	6	ISM	ENSMUSG00000027678.18	ENSMUST00000109252.8	5757	23	1	21237	0	-2165	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_1	19.0515091265758	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACAGGTGGGCTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165834556	165892153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_165834679_165876804_165876884_165889375_165889481_165889702_165889876_165890374_165890476_165891985
tx.11416	chr2	-	2048	11	ISM	ENSMUSG00000006800.15	ENSMUST00000088086.4	3927	21	72576	-7	-4590	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	857	junction_6	52.4100181263086	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTTGGGACTTTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165924629	165915832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_165916739_165917414_165917469_165917691_165917726_165919437_165919562_165920956_165921100_165921379_165921550_165921936_165921997_165922716_165922812_165923206_165923304_165923397_165923627_165924493
tx.11417	chr2	-	995	2	NNC	ENSMUSG00000006800.15	novel	4580	21	NA	NA	0	568	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAATCAATCTAGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165997583	165973944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_165974775_165997418
tx.11418	chr2	+	425	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000006800.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGGCATATGTGTGCATGT	959	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165984334	165989666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_165984500_165989406
tx.11419	chr2	+	356	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000006800.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTACTTATTTGTTTCCT	968	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165984343	166003628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_165984500_166003428
tx.11420	chr2	-	1641	2	Intergenic	novelGene_833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCTTGGTCATAGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166096636	166094480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_166095994_166096508
tx.11421	chr2	-	593	3	Intergenic	novelGene_835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAAGAGTGACATTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166279608	166265544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_166265912_166275999_166276134_166279516
tx.11422	chr2	-	424	2	Intergenic	novelGene_836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTTTTTGCTCTCCGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166279608	166275801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_166276134_166279516
tx.11423	chr2	-	1339	2	Intergenic	novelGene_838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATGGCTTATGTGTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166338047	166334148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_166335201_166337760
tx.11424	chr2	-	1305	2	Intergenic	novelGene_837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTATGTGTGGGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166338027	166334142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_166335181_166337760
tx.11425	chr2	-	1551	4	ISM	ENSMUSG00000085682.3	ENSMUST00000228242.2	1106	5	-17	1172	5	493	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.5193489244852	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTGCTTTTTTAAAAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166351089	166343132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_166344399_166345246_166345340_166347371_166347507_166351032
tx.11426	chr2	+	1123	2	Intergenic	novelGene_839	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGTGGTCCCAGTGTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166387826	166389631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_166387916_166388597
tx.11427	chr2	+	3631	25	FSM	ENSMUSG00000002718.15	ENSMUST00000002790.14	3641	25	-3	13	-3	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	726	junction_12	67.9214722226255	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAACTCAGAATGGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166747975	166788296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_166748098_166757089_166757185_166761532_166761676_166763889_166763992_166764074_166764221_166764673_166764765_166768270_166768379_166769163_166769257_166769362_166769531_166769632_166769763_166770877_166770944_166771704_166771908_166772501_166772587_166774052_166774115_166776672_166776810_166777842_166777947_166779261_166779360_166781554_166781706_166781829_166782039_166783137_166783236_166783326_166783413_166783934_166784017_166784979_166785127_166786296_166786529_166787623
tx.11428	chr2	-	1678	4	FSM	ENSMUSG00000039536.17	ENSMUST00000149454.2	774	4	201	-1105	-74	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_3	25.8499946271217	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTTTCCAATTGAGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166792950	166790060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_166791280_166791663_166791750_166792150_166792274_166792700
tx.11429	chr2	-	2961	12	FSM	ENSMUSG00000039536.17	ENSMUST00000109238.9	2976	12	7	8	7	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_8	58.6274129884562	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTACTAAGAAAGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166838178	166790074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_166791280_166791663_166791750_166792150_166792274_166792700_166793021_166793190_166793267_166794245_166794393_166795127_166795272_166796819_166797051_166801942_166802042_166805348_166805515_166806498_166806638_166837953
tx.11430	chr2	-	2843	12	FSM	ENSMUSG00000039536.17	ENSMUST00000109235.8	3569	12	3	723	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_8	51.6000192196774	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTGTTAATTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166838195	166790191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_166791280_166791663_166791750_166792150_166792274_166792700_166793021_166793190_166793267_166794245_166794393_166795127_166795272_166796819_166797033_166801942_166802042_166805348_166805515_166806498_166806638_166837953
tx.11431	chr2	+	868	3	ISM	ENSMUSG00000074578.15	ENSMUST00000238277.2	572	5	1	4	1	-4	intron_retention	FALSE	canonical	3	874	junction_1	67	377	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATCTGCTGTGTCTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166905141	166907778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_166905218_166905555_166905648_166907078
tx.11432	chr2	+	436	4	NNC	ENSMUSG00000074578.15	novel	659	4	NA	NA	1	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	446.952147575355	485	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATCTGCTGTGTCTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166905141	166907778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_166905218_166905555_166905648_166907078_166907138_166907569
tx.11433	chr2	+	662	4	FSM	ENSMUSG00000074578.15	ENSMUST00000125841.3	525	4	-1	-136	1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	874	junction_1	54.7783412186483	295	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATCTGCTGTGTCTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166905141	166907778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_166905218_166905555_166905648_166907078_166907401_166907606
tx.11434	chr2	+	446	5	FSM	ENSMUSG00000074578.15	ENSMUST00000189909.7	738	5	288	4	1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	874	junction_1	47.5105251496971	29619	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATCTGCTGTGTCTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166905141	166907778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_166905218_166905555_166905648_166907078_166907138_166907353_166907401_166907606
tx.11435	chr2	-	1119	6	ISM	ENSMUSG00000017969.14	ENSMUST00000018113.8	2107	10	19237	287	-12951	-287	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_5	14.8404851672713	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTGCTTCCAAATCGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167063287	167045113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_167045389_167048653_167048806_167049101_167049284_167050100_167050270_167056727_167056910_167063128
tx.11437	chr2	+	618	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000017969.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.69967317119759	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	46	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167062880	167065658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_167063185_167063338_167063420_167065106_167065243_167065561
tx.1144	chr1	+	1630	3	FSM	ENSMUSG00000037461.11	ENSMUST00000192681.2	849	3	-24	-757	-10	757	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_2	18	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGTTGAAGATTTCGTC	8309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	191307863	191316590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_191308064_191314510_191314641_191315290
tx.11440	chr2	+	760	7	NNC	ENSMUSG00000039463.15	novel	1884	6	NA	NA	-23	-2795	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	57.3190389157235	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTCTGGAACTTGTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167263608	167286075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_167263686_167266038_167266218_167276701_167276783_167283048_167283108_167285228_167285276_167285368_167285453_167285842
tx.11441	chr2	+	1157	2	FSM	ENSMUSG00000039463.15	ENSMUST00000150326.2	2059	2	-17	919	-6	-919	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAGTCAGGGTAGAGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167263625	167267135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_167263686_167266038
tx.11442	chr2	+	417	3	NNC	ENSMUSG00000039463.15	novel	1476	3	NA	NA	-8	2874	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_2	47	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGGTTATGCATACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167263623	167270928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_167263686_167266038_167266218_167270752
tx.11444	chr2	+	2151	6	FSM	ENSMUSG00000006418.18	ENSMUST00000078050.7	2502	6	344	7	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	578	junction_2	31.1088411870323	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTAAGCTGCAATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167345352	167358086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_167345522_167348966_167349118_167352795_167352903_167353131_167353247_167354436_167354545_167356585
tx.11445	chr2	+	345	3	ISM	ENSMUSG00000006418.18	ENSMUST00000078050.7	2502	6	345	5272	-12	-5263	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	578	junction_2	39.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGACGTCATGTTCCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167345353	167352821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_167345522_167348966_167349118_167352795
tx.11446	chr2	+	1063	7	NNC	ENSMUSG00000006418.18	novel	3001	8	NA	NA	-11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_6	219.784490404173	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTAAGCTGCAATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167345354	167358086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_167345522_167348966_167349118_167352795_167352903_167353131_167353247_167354436_167354545_167356585_167356701_167357786
tx.11447	chr2	-	1739	4	FSM	ENSMUSG00000078923.11	ENSMUST00000109207.10	2041	4	94	208	-14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2167	junction_3	78.0555357848927	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTCGGTGGTTTTATTTT	9412	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167473921	167449765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_167451168_167452223_167452350_167459748_167459898_167473859
tx.11448	chr2	-	1678	3	ISM	ENSMUSG00000078923.11	ENSMUST00000109207.10	2041	4	14117	208	-7330	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2304	junction_1	23.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTCGGTGGTTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167459898	167449765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_167451168_167452223_167452350_167459748
tx.11449	chr2	-	1849	5	FSM	ENSMUSG00000078923.11	ENSMUST00000151365.8	924	5	-3	-922	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_4	1117.10764924424	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCGGTGGTTTTATTTTAA	9423	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167473910	167449763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_167451168_167452223_167452350_167459748_167459898_167471089_167471209_167473859
tx.11450	chr2	+	633	3	Intergenic	novelGene_841	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTATTTTGTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167580881	167584184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_167580962_167581066_167581240_167583804
tx.11451	chr2	+	1866	10	FSM	ENSMUSG00000027540.14	ENSMUST00000126839.8	4292	10	-34	2460	11	2188	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	47.9021636666927	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTACAACACATTGTTGT	1071	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167774257	167818845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_167774477_167793875_167794000_167805547_167805639_167806929_167807031_167809648_167809748_167813612_167813751_167815979_167816190_167816648_167816811_167817228_167817450_167818344
tx.11452	chr2	+	1748	9	FSM	ENSMUSG00000027540.14	ENSMUST00000029053.8	4213	9	18	2447	18	2201	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_4	11.7997616501351	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTGTTTTTAACATTTAT	1078	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167774264	167818858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_167774477_167805547_167805639_167806929_167807031_167809648_167809748_167813612_167813751_167815979_167816190_167816648_167816811_167817228_167817450_167818344
tx.11453	chr2	-	862	4	NNC	ENSMUSG00000087648.2	novel	1309	2	NA	NA	19	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10.3708994574027	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTAGCTACTTTATTTGGC	7148	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167996414	167994518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_167994845_167994957_167995094_167995412_167995672_167996273
tx.11454	chr2	-	1308	2	FSM	ENSMUSG00000087648.2	ENSMUST00000129713.2	1309	2	3	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATTAGCTACTTTATTTG	7132	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167996430	167994520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_167995672_167996273
tx.11455	chr2	-	1045	9	FSM	ENSMUSG00000078919.11	ENSMUST00000154111.8	2293	9	15	1233	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	450	junction_3	8.66656650583148	1626	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCTGCTTTCATTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168072284	168052200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_168052557_168053285_168053401_168054879_168054949_168059600_168059697_168061139_168061166_168061956_168062034_168065040_168065075_168069322_168069423_168072112
tx.11456	chr2	+	692	2	Intergenic	novelGene_842	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTGTCTGGTATGTGGT	5308	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168236572	168244719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168236722_168244176
tx.11458	chr2	-	1065	6	ISM	ENSMUSG00000027546.16	ENSMUST00000109175.9	3729	28	90320	0	26327	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	272	junction_5	24.8676496677913	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGCAGGCTTTTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168485939	168476357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_168476829_168479420_168479625_168480989_168481048_168481801_168481911_168482550_168482616_168485781
tx.11460	chr2	-	345	2	Intergenic	novelGene_843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTCTTTAGTCCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168689847	168673637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_168673830_168689694
tx.11461	chr2	+	1411	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027551.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGTGGTGGCTAGAGGCC	1368	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168767915	168771414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_168768867_168770954
tx.11462	chr2	-	1007	6	FSM	ENSMUSG00000027551.16	ENSMUST00000109161.3	1009	6	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_1	185.215982031789	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTACTGTTGTTACCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168797207	168776732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_168776860_168777130_168777383_168781890_168781954_168782656_168782819_168793464_168793699_168797038
tx.11463	chr2	+	769	2	Intergenic	novelGene_845	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCCTTGTTTTTCTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168798166	168800168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168798567_168799799
tx.11464	chr2	+	934	2	Intergenic	novelGene_844	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCCTTGTTTTTCTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168798160	168800168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168798567_168799640
tx.11465	chr2	+	911	2	Intergenic	novelGene_846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCCTTGTTTTTCTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168798166	168800168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168798567_168799657
tx.11466	chr2	+	689	2	Intergenic	novelGene_847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCCTTGTTTTTCTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168798169	168800168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168798567_168799876
tx.11468	chr2	-	836	4	Intergenic	novelGene_849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.64279609239471	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATATGTATATATATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168812087	168805805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_168806372_168807365_168807476_168807896_168807975_168812005
tx.11469	chr2	-	1147	4	Intergenic	novelGene_850	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3.55902608401044	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATATGTATATATATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168812302	168805805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_168806372_168807365_168807476_168807800_168807975_168812005
tx.11470	chr2	+	498	2	FSM	ENSMUSG00000086348.2	ENSMUST00000140241.2	473	2	-25	0	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGTTCTCTATAGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168820162	168820826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_168820481_168820646
tx.11471	chr2	+	1269	3	Intergenic	novelGene_852	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	9	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTATGGTGATTATTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168847931	168866331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168848074_168864580_168864668_168865291
tx.11472	chr2	+	447	2	Intergenic	novelGene_853	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGCTGTCCCGTGAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168847931	168878546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168848074_168878241
tx.11473	chr2	+	1861	2	Intergenic	novelGene_854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCAGCCAGACCGGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168847934	168850301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168848074_168848579
tx.11474	chr2	+	468	2	Intergenic	novelGene_851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCTACCTCTGATATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168847929	168861292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168848074_168860968
tx.11475	chr2	+	531	3	Intergenic	novelGene_855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	5.5	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGCTGTCCCGTGAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168847934	168878546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168848074_168864580_168864668_168878241
tx.11476	chr2	+	1880	2	Intergenic	novelGene_856	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTATGGTGATTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168847942	168866329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_168848074_168864580
tx.11477	chr2	-	847	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047907.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCATCTGTTGTCTTCTCA	2720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	169885311	169876995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_169877424_169884892
tx.11478	chr2	-	1015	2	Intergenic	novelGene_857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATACGCGGTTTAGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170020143	170018925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170019838_170020040
tx.11479	chr2	-	353	2	Intergenic	novelGene_860	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTAGCCTACAATGCAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170035969	170035460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170035717_170035872
tx.11480	chr2	+	641	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084013.2	novel	846	1	NA	NA	-69	183	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGAGCAGCTGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170126885	170127983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_170127007_170127463
tx.11481	chr2	+	839	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084013.2	novel	846	1	NA	NA	-58	186	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGAGCAGCTGGGTGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170126896	170127986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_170127213_170127463
tx.11482	chr2	-	1600	2	ISM	ENSMUSG00000013523.14	ENSMUST00000156657.8	594	3	-38	-785	17	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTGAGGTGGTTTTTTTT	4163	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170191698	170189065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_170190069_170191101
tx.11483	chr2	-	1421	3	FSM	ENSMUSG00000013523.14	ENSMUST00000156657.8	594	3	-42	-785	13	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	33.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTGAGGTGGTTTTTTTT	4159	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170191702	170189065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_170190069_170191101_170191384_170191566
tx.11484	chr2	-	1347	3	FSM	ENSMUSG00000013523.14	ENSMUST00000152461.2	371	3	-33	-943	-33	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	23.5	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTGAGGTGGTTTTTTTT	4113	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170191748	170189065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_170190069_170191101_170191384_170191686
tx.11485	chr2	+	677	4	FSM	ENSMUSG00000052033.14	ENSMUST00000063682.12	935	4	203	55	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	676	junction_1	80.8469060769936	2756	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCTCTATATTATTATT	4045	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170353357	170360988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_170353390_170357658_170357767_170358469_170358611_170360592
tx.11486	chr2	+	646	3	ISM	ENSMUSG00000052033.14	ENSMUST00000109147.3	445	5	3180	-350	848	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	792	junction_1	40.5	587	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCTCTATATTATTATT	8345	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170357657	170360988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_170357767_170358469_170358611_170360592
tx.11487	chr2	-	515	2	NNC	ENSMUSG00000043583.2	novel	1395	2	NA	NA	739	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATATCTGTGTGGGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170443198	170421340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_170421614_170442956
tx.11488	chr2	-	534	2	Intergenic	novelGene_861	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATTTTTACTTCGATTT	4569	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170466146	170460737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170461154_170466028
tx.11489	chr2	-	532	2	Intergenic	novelGene_862	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATTTTTACTTCGATTT	2409	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170468306	170460737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170461154_170468190
tx.1149	chr1	+	3162	8	FSM	ENSMUSG00000026622.16	ENSMUST00000027931.8	3227	8	64	1	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_7	41.1061344049071	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTGTGATGTTTGTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	191553619	191565161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_191553854_191554258_191554477_191554603_191554845_191557594_191557678_191558334_191558462_191559261_191559482_191561503_191561630_191563248
tx.11490	chr2	-	385	2	Intergenic	novelGene_863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170515460	170512871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170513139_170515342
tx.11491	chr2	-	555	3	Intergenic	novelGene_864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_2	1.5	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170515761	170512871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170513139_170515342_170515518_170515648
tx.11492	chr2	-	778	2	Intergenic	novelGene_866	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATGGCTCTCTCGAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170537921	170533692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170534117_170537567
tx.11493	chr2	-	774	2	Intergenic	novelGene_865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATGGCTCTCTCGAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170537920	170533692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170534114_170537567
tx.11494	chr2	+	706	2	NNC	ENSMUSG00000027560.5	novel	1768	8	NA	NA	144115	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	96	junction_1	0	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGTTAGTTCTTTCTGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170717841	170721689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_170717952_170721093
tx.11495	chr2	-	697	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027560.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGGCAGCTAGGAGTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170721689	170717841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_170717950_170721100
tx.11496	chr2	-	477	3	Intergenic	novelGene_868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTGGTTTTGTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171774810	171763983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_171764227_171765609_171765713_171774679
tx.11497	chr2	-	542	3	Intergenic	novelGene_867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTGGTTTTGTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171774805	171763983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_171764297_171765609_171765713_171774679
tx.11499	chr2	-	564	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085949.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4.24264068711928	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTATGGGTATTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172136504	172127335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_172127474_172134257_172134405_172135339_172135530_172136415
tx.115	chr1	-	391	4	ISM	ENSMUSG00000042197.14	ENSMUST00000019861.13	3958	15	74	24878	-27	31	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	286	junction_3	33.3299998333167	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAGGGCATTTAGGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33853534	33825503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_33825614_33844419_33844501_33852807_33852892_33853418
tx.11500	chr2	-	508	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085949.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGATGTGTAGTCAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172134491	172132003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_172132278_172134257
tx.11501	chr2	+	790	3	FSM	ENSMUSG00000027495.5	ENSMUST00000028995.5	3617	3	36	2791	36	-2791	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_1	7.5	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGCTGTTCCTCATGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172187520	172194878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_172187768_172193374_172193545_172194505
tx.11502	chr2	+	445	2	ISM	ENSMUSG00000027495.5	ENSMUST00000028995.5	3617	3	5978	2801	5978	-2801	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTTTTTTAATGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172193462	172194868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_172193545_172194505
tx.11503	chr2	-	1848	9	FSM	ENSMUSG00000027496.16	ENSMUST00000109140.10	1862	9	8	6	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1025	junction_8	140.198965759381	491	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGAGTACGTGGGTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172212447	172198115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_172198902_172199000_172199176_172201674_172201824_172204694_172204834_172205517_172205710_172206361_172206417_172208841_172209092_172210905_172210953_172212392
tx.11504	chr2	+	1967	6	NIC	ENSMUSG00000027498.15	novel	3451	6	NA	NA	1	-1365	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	132	junction_1	102.721760109531	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTGTTCCTCCTTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172212601	172223003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_172212777_172214848_172215050_172217557_172217836_172217971_172218170_172219535_172219927_172222279
tx.11505	chr2	+	1877	6	FSM	ENSMUSG00000027498.15	ENSMUST00000116375.2	3451	6	211	1363	211	-1363	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_1	74.6527963307471	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTTCCTCCTTCTTCACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172212864	172223005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_172212948_172214848_172215050_172217557_172217836_172217971_172218170_172219535_172219927_172222279
tx.11507	chr2	+	754	2	ISM	ENSMUSG00000027498.15	ENSMUST00000116375.2	3451	6	7245	1363	7245	-1363	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	339	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTGTTCCTCCTTCTTCACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172219898	172223005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_172219927_172222279
tx.11508	chr2	+	1114	9	FSM	ENSMUSG00000027502.12	ENSMUST00000029005.4	2173	9	22	1037	22	-1037	multi-exon	FALSE	canonical	3	407	junction_4	19.7416912902618	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGCGTGGTCACTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172282497	172310791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_172282660_172286566_172286662_172287246_172287341_172288541_172288682_172288954_172289034_172305096_172305211_172308193_172308252_172308348_172308445_172310515
tx.11511	chr2	+	2766	7	FSM	ENSMUSG00000028640.12	ENSMUST00000170744.2	2776	7	8	2	8	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_1	218.277091992927	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAAGTCTGGTTCTGACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172392918	172400537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_172393142_172393326_172393810_172393915_172393968_172395335_172395553_172395960_172396080_172397984_172398130_172399010
tx.11512	chr2	+	2434	6	ISM	ENSMUSG00000028640.12	ENSMUST00000170744.2	2776	7	521	6	521	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	564	junction_3	44.2113107699828	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGAAAGTCTGGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172393431	172400533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_172393810_172393915_172393968_172395335_172395553_172395960_172396080_172397984_172398130_172399010
tx.11513	chr2	+	1883	3	Intergenic	novelGene_869	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAATTTATATTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172419553	172468690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_172419745_172430932_172431176_172467241
tx.11514	chr2	+	1720	3	Intergenic	novelGene_870	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	11.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAATTTATATTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172419560	172468690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_172419745_172420215_172420303_172467241
tx.11515	chr2	+	446	2	Intergenic	novelGene_871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTCTTGGATCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172636826	172645414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_172637054_172645195
tx.11516	chr2	+	495	2	Intergenic	novelGene_872	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTTTTGTCAGGTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172668485	172671473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_172668700_172671192
tx.11517	chr2	-	1775	7	FSM	ENSMUSG00000008999.8	ENSMUST00000009143.8	3670	7	256	1639	27	-1639	multi-exon	TRUE	canonical	3	82	junction_3	13.8734358477712	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTATCCCCGTTTCTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172781858	172711443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_172712080_172714664_172714776_172717007_172717085_172721118_172721317_172735240_172735390_172758259_172758453_172781447
tx.11518	chr2	-	719	2	ISM	ENSMUSG00000008999.8	ENSMUST00000009143.8	3670	7	67338	1668	67109	-1668	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACGTTACAGATATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172714776	172711472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_172712080_172714664
tx.11519	chr2	+	1537	12	NIC	ENSMUSG00000027509.12	novel	1742	12	NA	NA	13	-59	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	57	junction_1	326.651961776187	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCCCTTCATCCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172841929	172857473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_172842044_172844451_172844547_172845299_172845405_172846952_172847046_172848673_172848761_172849852_172849940_172850036_172850109_172851162_172851271_172853792_172853900_172853972_172854049_172854419_172854615_172857075
tx.11520	chr2	+	1645	12	FSM	ENSMUSG00000027509.12	ENSMUST00000029013.10	1742	12	38	59	31	-59	multi-exon	FALSE	canonical	3	1013	junction_10	106.078950794457	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCCCTTCATCCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172841947	172857473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_172842170_172844451_172844547_172845299_172845405_172846952_172847046_172848673_172848761_172849852_172849940_172850036_172850109_172851162_172851271_172853792_172853900_172853972_172854049_172854419_172854615_172857075
tx.11521	chr2	+	885	5	ISM	ENSMUSG00000027509.12	ENSMUST00000029013.10	1742	12	9252	59	-2295	-59	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1013	junction_3	156.47763418457	157	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCCCTTCATCCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172851161	172857473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_172851271_172853792_172853900_172853972_172854049_172854419_172854615_172857075
tx.11522	chr2	+	1751	4	FSM	ENSMUSG00000027510.18	ENSMUST00000029014.16	1768	4	26	-9	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	657	junction_1	63.0766729200793	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGGTTTGAGGTTTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172863720	172876527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_172864064_172864584_172864709_172865119_172865175_172875298
tx.11523	chr2	-	792	4	FSM	ENSMUSG00000027514.15	ENSMUST00000109116.3	770	4	-19	-3	-6	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.816496580927726	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTTCATCCCAAGTATGC	1393	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173060722	173055524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_173055703_173057469_173057659_173058564_173058802_173060534
tx.11524	chr2	-	1867	4	NNC	ENSMUSG00000038400.16	novel	4538	4	NA	NA	-3676	1226	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	46.9254728266003	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTAGTTTTTTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173080191	173068612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_173070137_173070368_173070420_173076099_173076255_173080054
tx.11525	chr2	+	659	4	FSM	ENSMUSG00000027518.4	ENSMUST00000029023.4	646	4	-15	2	-15	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGTTTGTATGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173364363	173370292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_173364525_173367796_173367879_173369637_173369740_173369978
tx.11526	chr2	-	994	7	NIC	ENSMUSG00000055897.14	novel	5637	16	NA	NA	-5	8	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	2	5	junction_3	8.33999733546454	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCTTTCTCCTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173501337	173437890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_173438321_173438832_173438981_173441382_173441481_173450525_173450673_173457275_173457370_173501115_173501161_173501305
tx.11527	chr2	-	897	6	NIC	ENSMUSG00000055897.14	novel	755	6	NA	NA	-6	8	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	5.17687164221791	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCTTTCTCCTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173501338	173437890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_173438321_173438832_173438981_173450525_173450673_173457275_173457370_173501115_173501161_173501305
tx.11528	chr2	-	769	6	FSM	ENSMUSG00000055897.14	ENSMUST00000142320.8	755	6	-6	-8	-6	8	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	7.55248303539968	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCTTTCTCCTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173501338	173437890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_173438193_173438832_173438981_173450525_173450673_173457275_173457370_173501115_173501161_173501305
tx.11529	chr2	-	802	5	NIC	ENSMUSG00000055897.14	novel	755	6	NA	NA	-5	8	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	5.8309518948453	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTCTTTCTCCTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173501337	173437890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_173438321_173438832_173438981_173450525_173450673_173501115_173501161_173501305
tx.11530	chr2	+	1925	6	FSM	ENSMUSG00000054455.6	ENSMUST00000067530.6	7032	6	123	4984	123	1230	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_2	5.74804314527997	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTCCTTTTGTCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173579426	173621148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_173579544_173603909_173604063_173613313_173613418_173616186_173616268_173617904_173618082_173619855
tx.11535	chr2	+	1009	3	ISM	ENSMUSG00000039263.17	ENSMUST00000153957.8	2052	10	9659	0	9266	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	269	junction_2	7.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGTCTCCGCTCACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173962631	173964495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_173962918_173963271_173963383_173963883
tx.11540	chr2	+	879	4	ISM	ENSMUSG00000027523.21	ENSMUST00000238267.2	1071	7	1069	0	736	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	818	junction_2	41.1204193666467	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACGGTGTTGCTCTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	174187178	174188537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_174187356_174187441_174187573_174187782_174187851_174188034
tx.11541	chr2	+	2251	15	FSM	ENSMUSG00000016253.13	ENSMUST00000109075.8	2279	15	29	-1	-18	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	502	junction_12	51.3083913254758	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATTTTACTCATTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	174257625	174269296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_174257750_174261819_174261939_174262116_174262227_174263502_174263613_174264359_174264468_174264844_174264998_174265168_174265300_174265775_174265942_174266398_174266534_174266906_174267047_174267705_174267821_174268109_174268206_174268281_174268423_174268609_174268740_174268823
tx.11542	chr2	-	552	2	ISM	ENSMUSG00000016256.11	ENSMUST00000016400.9	1441	6	10399	1	10399	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	526	junction_1	0	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTTGTGTACTTTATTTAC	5573	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	174270433	174269286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_174269776_174270370
tx.11543	chr2	-	1391	6	FSM	ENSMUSG00000016256.11	ENSMUST00000016400.9	1441	6	49	1	49	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	493	junction_4	13.5292276202302	465	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTTGTGTACTTTATTTAC	5378	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	174280783	174269286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_174269776_174270370_174270537_174270848_174271000_174275280_174275461_174279957_174280122_174280542
tx.11544	chr2	-	402	3	FSM	ENSMUSG00000016252.8	ENSMUST00000016396.8	421	3	16	3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1326.5	1119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGGGTTTTGTTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	174305882	174302867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_174303015_174304292_174304423_174305757
tx.11545	chr2	-	1416	6	FSM	ENSMUSG00000016257.16	ENSMUST00000016401.15	1553	6	128	9	-19	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	812	junction_2	54.463198583998	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTGAGACAGAAGAGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	174314746	174306868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_174307730_174308518_174308622_174308732_174308804_174310090_174310181_174311129_174311299_174314624
tx.11546	chr2	+	639	3	Intergenic	novelGene_874	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTCATGAGATTAATGTT	4917	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	174314935	174317098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_174315086_174315606_174315685_174316687
tx.11548	chr2	+	1360	3	ISM	ENSMUSG00000078906.10	ENSMUST00000109070.3	1281	4	-105	1167	-27	469	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	436	junction_1	382.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAATTCATACAGATAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	174852006	174859874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_174852115_174858430_174858558_174858749
tx.11550	chr2	-	419	4	FSM	ENSMUSG00000078905.9	ENSMUST00000072895.10	625	4	-50	256	-32	-256	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_2	18.263503375737	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTGTAACCAATGTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	174909606	174903597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_174903715_174905392_174905454_174905660_174905788_174909492
tx.11553	chr2	+	472	5	NIC	ENSMUSG00000078887.11	novel	599	6	NA	NA	-16	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	44	junction_4	79.6649232724164	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTGTAACCAATGTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	175661062	175671684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_175661175_175664841_175664897_175670021_175670149_175670349_175670411_175671567
tx.11557	chr2	-	1396	4	FSM	ENSMUSG00000078903.11	ENSMUST00000109055.2	965	4	7	-438	7	438	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_2	81.8141525382715	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATTAGATTGCTCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	175048685	175038296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_175039399_175039599_175039727_175044851_175044907_175048573
tx.11558	chr2	+	417	4	FSM	ENSMUSG00000078872.10	ENSMUST00000108970.9	948	4	-73	604	-73	-604	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_2	72.8666971637631	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTGTAACCAATGTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	176766039	176778223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_176766152_176776035_176776163_176776368_176776430_176778106
tx.11559	chr2	-	414	4	NNC	ENSMUSG00000078869.3	novel	1050	3	NA	NA	-5325	-837	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	267	junction_3	127.14908135291	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTGTAACCAATGTGGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	176964154	176957283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_176957402_176958542_176958604_176958795_176958923_176964046
tx.11560	chr2	-	235	2	NNC	ENSMUSG00000078869.3	novel	1050	3	NA	NA	-5324	-2348	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	267	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATATTGTGATTTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	176964153	176958794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_176958923_176964046
tx.11563	chr2	+	412	4	FSM	ENSMUSG00000094786.2	ENSMUST00000108947.3	1209	4	-107	904	-7	-302	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_1	52.0405824546788	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGACTGTAACCAATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	177190000	177200360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_177190111_177198701_177198829_177199035_177199097_177200246
tx.11564	chr2	-	410	4	FSM	ENSMUSG00000078865.9	ENSMUST00000108945.8	1348	4	-38	976	-27	-976	multi-exon	FALSE	canonical	3	688	junction_1	226.200992236747	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGACTGTAACCAATGTG	2310	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	177270030	177261972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_177262087_177263226_177263288_177263479_177263607_177269922
tx.11565	chr2	+	506	6	FSM	ENSMUSG00000078864.11	ENSMUST00000148388.2	744	6	-23	261	-23	-261	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_4	86.0497530501977	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGACTGTAACCAATGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	177401057	177411494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_177401169_177404638_177404694_177409531_177409569_177409836_177409964_177410168_177410230_177411379
tx.11566	chr2	-	2740	4	FSM	ENSMUSG00000095362.8	ENSMUST00000108939.9	1576	4	-23	-1141	-5	1141	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_1	217.946476609893	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCTTTTAACATTTCTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	177482134	177472442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_177474890_177476043_177476105_177476312_177476440_177482029
tx.11567	chr2	-	1075	3	FSM	ENSMUSG00000095362.8	ENSMUST00000150650.2	310	3	-5	-760	-5	760	multi-exon	FALSE	canonical	3	312	junction_1	213.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTTTGCATTTGTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	177482134	177475261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_177476105_177476312_177476440_177482029
tx.11568	chr2	-	1367	3	FSM	ENSMUSG00000078861.9	ENSMUST00000108923.2	1372	3	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	29	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAATTTTAAAAGAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	177720264	177710282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_177711409_177711615_177711743_177720150
tx.11571	chr2	+	1714	3	NNC	ENSMUSG00000039138.2	novel	737	3	NA	NA	7	2045	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_2	26.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAACAAAAACAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179056735	179060720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_179056894_179057552_179057714_179059325
tx.11575	chr2	-	924	7	FSM	ENSMUSG00000027566.16	ENSMUST00000029082.9	914	7	-6	-4	-6	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	3926	junction_1	568.041078326794	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATGAGAACCTGTCGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179684232	179678162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_179678367_179678730_179678794_179679175_179679296_179679857_179679981_179680517_179680643_179681145_179681273_179684070
tx.11577	chr2	+	1224	2	ISM	ENSMUSG00000039069.20	ENSMUST00000142608.8	2339	5	-9	7623	-5	-7623	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACCCACAGGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179712375	179714777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_179712409_179713586
tx.11580	chr2	+	372	6	NNC	ENSMUSG00000039001.13	novel	394	6	NA	NA	-2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	45	junction_1	2882.90848970272	853	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGTCTGCTTTTGCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179899208	179900234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_179899241_179899392_179899477_179899580_179899645_179899778_179899851_179900022_179900079_179900170
tx.11581	chr2	+	342	6	NNC	ENSMUSG00000039001.13	novel	394	6	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2798.83568649537	695	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTCTGCTTTTGCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179899208	179900235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_179899241_179899413_179899477_179899580_179899645_179899778_179899851_179900032_179900079_179900170
tx.11582	chr2	+	354	6	FSM	ENSMUSG00000039001.13	ENSMUST00000059080.7	394	6	39	1	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3954	junction_5	1417.02976680097	69636	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGCTTTTGCTGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179899208	179900237	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_179899241_179899413_179899477_179899580_179899645_179899778_179899851_179900022_179900079_179900170
tx.11583	chr2	+	324	5	ISM	ENSMUSG00000039001.13	ENSMUST00000059080.7	394	6	240	3	199	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3954	junction_4	1482.42763314099	28758	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTCTGCTTTTGCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179899409	179900235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_179899477_179899580_179899645_179899778_179899851_179900022_179900079_179900170
tx.11584	chr2	+	669	3	Intergenic	novelGene_875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTTCCTTTCTTACATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	179932513	179954543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_179932581_179950635_179950820_179954125
tx.11585	chr2	+	2969	12	FSM	ENSMUSG00000038963.16	ENSMUST00000038259.13	3010	12	26	15	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_3	7.21568539381252	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATCCTTGTGTGATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180098063	180116645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180098167_180105733_180106622_180107389_180107481_180108850_180108973_180109359_180109472_180112896_180113052_180113846_180114043_180114197_180114364_180114453_180114627_180114895_180114961_180115306_180115456_180115896
tx.11586	chr2	+	1803	4	FSM	ENSMUSG00000027569.16	ENSMUST00000150757.8	1825	4	20	2	11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_2	3.55902608401044	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTATCTTGGAAGTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180224535	180228095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180224749_180225193_180225316_180226198_180226665_180227093
tx.11587	chr2	+	1502	5	FSM	ENSMUSG00000027569.16	ENSMUST00000029085.9	1510	5	25	-17	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_3	10.4253297309965	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATCTTGGAAGTTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180224529	180228097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180224749_180225193_180225316_180226198_180226281_180226589_180226665_180227093
tx.11588	chr2	+	1610	5	NIC	ENSMUSG00000027569.16	novel	1488	4	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	6	junction_3	27.8836869871974	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTATCTTGGAAGTTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180224524	180228097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_180224749_180225193_180225316_180226198_180226281_180226486_180226665_180227093
tx.11589	chr2	+	2248	7	FSM	ENSMUSG00000049401.11	ENSMUST00000029087.4	2449	7	196	5	-21	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_6	11.4370256428652	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTGTGGCCGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180231233	180237624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180231415_180232779_180232849_180233409_180233489_180234219_180234299_180234896_180234964_180235362_180235512_180236000
tx.11590	chr2	+	2175	22	ISM	ENSMUSG00000027570.16	ENSMUST00000103059.2	2846	32	6738	384	1775	199	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_11	3.68363421063118	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTAGTACTGGTTATAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180246752	180263594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_180247068_180247519_180247574_180248267_180248322_180248600_180248655_180248875_180248930_180249419_180249474_180250224_180250279_180251118_180251173_180251273_180251328_180251848_180251894_180251982_180252037_180252452_180252507_180253052_180253107_180253221_180253294_180254746_180254783_180255939_180255985_180257080_180257114_180257269_180257417_180257595_180257651_180258173_180258357_180261485_180261564_180263022
tx.11592	chr2	-	1116	3	ISM	ENSMUSG00000038932.14	ENSMUST00000037877.11	2225	6	4090	0	3729	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_1	1	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTCCCAGTGAGTCGCTTT	9459	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180280411	180263748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_180264508_180277046_180277189_180280196
tx.11594	chr2	+	1029	3	ISM	ENSMUSG00000027573.12	ENSMUST00000029090.9	1655	5	138	3241	138	753	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	177	junction_2	6.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGATATGCATTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180352047	180357285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_180352144_180354983_180355114_180356482
tx.11595	chr2	+	1449	5	FSM	ENSMUSG00000027573.12	ENSMUST00000029090.9	1655	5	111	95	111	-92	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_3	7.56224173112709	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGAGAGACTCATTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180352020	180360431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180352144_180354983_180355114_180356482_180356680_180358651_180358850_180359630
tx.11596	chr2	+	962	2	ISM	ENSMUSG00000027573.12	ENSMUST00000078687.6	2063	4	4342	100	4342	-100	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTATGTGATGAGAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180358680	180360423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_180358850_180359630
tx.11597	chr2	+	2221	13	FSM	ENSMUSG00000023393.16	ENSMUST00000094218.4	2275	13	54	0	54	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	124	junction_2	30.6879455161143	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGTTGTTTTATTCAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180367109	180384073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180367245_180373672_180373871_180374225_180374366_180375509_180375610_180377635_180377767_180378479_180378577_180378799_180378897_180379384_180379473_180380201_180380237_180381611_180381728_180382318_180382375_180382505_180382536_180383075
tx.11598	chr2	-	1574	2	ISM	ENSMUSG00000038848.15	ENSMUST00000037299.15	3184	5	9977	4	9415	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	596	junction_1	0	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAAGCTTGTGTGTTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180552765	180546173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_180547462_180552479
tx.11599	chr2	+	1566	7	FSM	ENSMUSG00000038840.8	ENSMUST00000108875.2	1178	7	-388	0	-388	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	4.30761599444003	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTCAGCTAGGCTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180570427	180575803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180571307_180572597_180572698_180573051_180573131_180573211_180573258_180574711_180574784_180574929_180575129_180575612
tx.116	chr1	-	2406	7	FSM	ENSMUSG00000042182.17	ENSMUST00000062289.11	2487	7	81	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	6.36832439151427	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACTTTCTTATGGTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33946816	33891132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_33892449_33901734_33901855_33902822_33903016_33903603_33903825_33917340_33917519_33922521_33922730_33946646
tx.11600	chr2	+	795	7	NNC	ENSMUSG00000038840.8	novel	1529	6	NA	NA	-433	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.71854812358213	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTCAGCTAGGCTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180570382	180575803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_180570491_180572597_180572698_180573051_180573131_180573211_180573258_180574711_180574784_180574929_180575129_180575612
tx.11601	chr2	-	974	7	FSM	ENSMUSG00000027574.16	ENSMUST00000103053.10	950	7	-21	-3	-21	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_2	10.8576649832682	221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATTCGCATCCCTGGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180596513	180576561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_180576823_180577735_180577821_180578943_180579005_180584822_180585021_180585533_180585615_180585869_180586008_180596363
tx.11602	chr2	+	2723	14	NIC	ENSMUSG00000027575.20	novel	2714	14	NA	NA	-1	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	35	junction_1	65.799947842644	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTTCTGTGGTTTGTGTG	4024	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180609016	180624250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_180609123_180609326_180609608_180612843_180612908_180613366_180613477_180613776_180613949_180614487_180614589_180615253_180615341_180615852_180615950_180618099_180618157_180619112_180619146_180620963_180621021_180621453_180621514_180622190_180622268_180622829
tx.11603	chr2	+	2640	14	FSM	ENSMUSG00000027575.20	ENSMUST00000029092.13	2714	14	8	66	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_1	25.5745805752046	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCTGTGGTTTGTGTGTCT	4042	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180609034	180624253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180609123_180609394_180609608_180612843_180612908_180613366_180613477_180613776_180613949_180614487_180614589_180615253_180615341_180615852_180615950_180618099_180618157_180619112_180619146_180620963_180621021_180621453_180621514_180622190_180622268_180622829
tx.11604	chr2	+	1875	13	NNC	ENSMUSG00000027575.20	novel	2714	14	NA	NA	-1	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	78.4121943464294	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGCTAGTTCTTTCTTCT	4044	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180609036	180623497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_180609123_180609394_180609608_180612843_180612908_180613366_180613477_180613776_180613949_180614487_180614589_180615253_180615341_180615852_180615950_180618099_180618157_180620937_180621021_180621453_180621514_180622190_180622268_180622829
tx.11605	chr2	+	846	5	FSM	ENSMUSG00000016344.15	ENSMUST00000016488.13	1160	5	49	265	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_1	270.955139275859	1127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGGTATGTTTGAAACAT	3385	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180829088	180830299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180829248_180829342_180829530_180829601_180829680_180829796_180829894_180829974
tx.11606	chr2	+	735	5	FSM	ENSMUSG00000016344.15	ENSMUST00000108841.2	689	5	-44	-2	-4	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	258	junction_1	248.035279748668	1045	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGGTATGTTTGAAACAT	3381	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180829084	180830299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180829248_180829457_180829530_180829601_180829680_180829796_180829894_180829974
tx.11607	chr2	+	805	4	FSM	ENSMUSG00000016344.15	ENSMUST00000146089.8	750	4	-53	-2	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_1	285.921123544395	644	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGGTATGTTTGAAACAT	3383	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180829086	180830299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_180829248_180829457_180829680_180829796_180829894_180829974
tx.11608	chr2	+	738	4	ISM	ENSMUSG00000016344.15	ENSMUST00000108841.2	689	5	163	-2	-37	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	629	junction_1	111.05254011803	1157	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGGTATGTTTGAAACAT	3588	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180829291	180830299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_180829530_180829601_180829680_180829796_180829894_180829974
tx.11609	chr2	-	928	5	FSM	ENSMUSG00000027581.13	ENSMUST00000103045.4	1136	5	213	-5	213	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_1	19.0312243431683	538	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGTGGCTTTTCATTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180956080	180948246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_180948617_180949008_180949201_180950513_180950690_180950939_180951036_180955986
tx.11610	chr2	+	394	2	ISM	ENSMUSG00000038685.19	ENSMUST00000146273.8	1966	16	-14	26377	0	-2613	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	246	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTAGAGAGGGGGCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180961531	180962874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_180961650_180962598
tx.11611	chr2	-	1711	8	NIC	ENSMUSG00000038671.16	novel	2447	8	NA	NA	-2	595	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	46	junction_7	90.1022095359781	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCATCCCTTCAATCAGT	6127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181007146	181000297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_181001355_181001431_181001533_181002793_181002865_181003183_181003266_181005806_181005890_181006103_181006192_181006397_181006492_181007011
tx.11612	chr2	-	1715	8	FSM	ENSMUSG00000038671.16	ENSMUST00000127988.8	2447	8	51	681	-2	586	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_2	23.8627025172878	987	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTGTCTAACCATCCCT	6127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181007146	181000306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_181001355_181001431_181001533_181002793_181002865_181003183_181003266_181005806_181005890_181006103_181006192_181006397_181006505_181007011
tx.11613	chr2	-	1576	7	ISM	ENSMUSG00000038671.16	ENSMUST00000108808.8	1133	8	637	-579	97	579	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_2	24.0537592349581	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAAGGCTGCCTGTCTAAC	6766	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181006507	181000313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_181001355_181001431_181001533_181002793_181002865_181003183_181003266_181005806_181005890_181006103_181006192_181006397
tx.11614	chr2	+	2076	6	FSM	ENSMUSG00000027582.17	ENSMUST00000108807.9	2072	6	0	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_3	10.1074230147946	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTCAGTGGAGACTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181007197	181022579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_181008046_181020175_181020310_181020543_181020700_181021362_181021483_181021566_181021973_181022167
tx.11615	chr2	+	1931	7	NNC	ENSMUSG00000027582.17	novel	2072	6	NA	NA	0	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	26	junction_1	46.3204418516634	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGAGACTCAGCTGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181007197	181022586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_181007286_181007437_181008046_181020175_181020310_181020543_181020700_181021362_181021483_181021566_181021973_181022167
tx.11616	chr2	+	1223	5	ISM	ENSMUSG00000027582.17	ENSMUST00000108807.9	2072	6	12988	-9	-1	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	135	junction_2	8.55862138431185	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTGGAGACTCAGCTGGC	6746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181020185	181022584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_181020310_181020543_181020700_181021362_181021483_181021566_181021973_181022167
tx.11617	chr2	+	1517	8	FSM	ENSMUSG00000000827.19	ENSMUST00000149163.8	3603	8	13	2073	-3	-363	multi-exon	FALSE	canonical	3	669	junction_5	184.043805788132	934	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGTTATGATACAATGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181138970	181157686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_181139126_181141637_181141784_181143697_181143847_181144668_181144729_181149958_181150061_181153366_181153409_181154831_181154881_181156872
tx.11618	chr2	+	1480	7	FSM	ENSMUSG00000000827.19	ENSMUST00000000844.15	2950	7	-3	1473	-3	-358	multi-exon	FALSE	canonical	3	318	junction_5	284.174486695919	305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGATACAATGTAGAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181138970	181157691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_181139126_181141637_181141784_181143697_181143847_181144668_181144729_181149958_181150061_181154831_181154881_181156872
tx.11619	chr2	+	753	7	ISM	ENSMUSG00000000827.19	ENSMUST00000149163.8	3603	8	2783	2579	82	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	669	junction_4	181.646787903215	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTGTGCCATCCTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181141740	181157180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_181141784_181143697_181143847_181144668_181144729_181149958_181150061_181153366_181153409_181154831_181154881_181156872
tx.1162	chr1	-	841	2	FSM	ENSMUSG00000009633.4	ENSMUST00000009777.4	871	2	31	-1	31	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATTATTTAATTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	192955494	192954467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_192955111_192955296
tx.11620	chr2	+	1215	6	ISM	ENSMUSG00000000827.19	ENSMUST00000184849.8	854	8	2765	-765	82	-365	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	318	junction_4	292.074921895051	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGGGTTATGATACAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181141740	181157684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_181141784_181143697_181143847_181144668_181144729_181149958_181150061_181154831_181154881_181156872
tx.11621	chr2	-	2421	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000827.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCCTGTGGCCCTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181160103	181157215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_181159593_181160059
tx.11622	chr2	+	972	5	FSM	ENSMUSG00000000826.17	ENSMUST00000072334.12	6578	5	63	5543	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_4	50.7413785780402	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTCTGTTTTATCCTTTT	7068	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181162340	181191383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_181162491_181188163_181188282_181189132_181189347_181190462_181190635_181191065
tx.11623	chr2	+	1076	6	FSM	ENSMUSG00000000826.17	ENSMUST00000116365.9	3728	6	-7	2659	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_5	67.7642973843897	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTCTGTTTTATCCTTTT	7039	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181162311	181191383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_181162491_181188163_181188282_181189132_181189347_181190462_181190635_181190718_181190794_181191065
tx.11624	chr2	+	1023	6	FSM	ENSMUSG00000000826.17	ENSMUST00000108797.8	3664	6	-1	2642	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	79.8884221899519	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTCTGTTTTATCCTTTT	7070	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181162342	181191383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_181162491_181163027_181163081_181188163_181188282_181189132_181189347_181190462_181190635_181191065
tx.11625	chr2	+	1098	7	NIC	ENSMUSG00000000826.17	novel	3728	6	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	55	junction_1	77.7924589318699	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTCTGTTTTATCCTTTT	7070	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181162342	181191383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_181162491_181163027_181163081_181188163_181188282_181189132_181189347_181190462_181190635_181190718_181190794_181191065
tx.11626	chr2	-	1816	14	NNC	ENSMUSG00000089917.8	novel	1849	15	NA	NA	-4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	39.7572515807423	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTGTGGCAGAATGTAACC	4573	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181223775	181210941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_181211184_181211260_181211418_181211488_181211597_181211701_181211825_181211925_181211989_181212101_181212196_181212292_181212392_181214853_181214929_181215007_181215198_181216004_181216077_181216161_181216333_181216443_181216551_181216639_181216828_181223648
tx.11628	chr2	-	1817	14	NNC	ENSMUSG00000089917.8	novel	1782	14	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	32.5776269109327	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCGTGTGGCAGAATGTA	4572	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181223776	181210944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_181211184_181211260_181211418_181211488_181211597_181211701_181211825_181211925_181211989_181212101_181212196_181212292_181212392_181214853_181214929_181215007_181215198_181216004_181216077_181216161_181216333_181216443_181216551_181216639_181216831_181223648
tx.11629	chr2	-	710	4	FSM	ENSMUSG00000089917.8	ENSMUST00000146823.8	676	4	-29	-5	1	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_3	13.0724477007517	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGTATGGTGCGAATGTC	4548	False	NA	94	True	NA	NA	NA	181223800	181216072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_181216333_181216443_181216551_181216639_181216831_181223648
tx.11630	chr2	-	2099	5	FSM	ENSMUSG00000038605.12	ENSMUST00000183836.2	2131	5	37	-5	37	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	19.6850196850295	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCAGTGTTGGGTCTCTGG	1080	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181240954	181237008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_181238399_181238539_181238681_181238964_181239137_181239220_181239387_181240724
tx.11631	chr2	+	3029	21	FSM	ENSMUSG00000002455.15	ENSMUST00000002529.7	3054	21	26	-1	26	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	340	junction_3	47.7921280128851	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGGGGCTTGGGCCTCAC	2520	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181243137	181297454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_181243325_181249912_181250082_181257769_181257889_181262361_181262441_181263579_181263757_181263954_181264111_181273227_181273323_181273723_181273881_181274547_181274711_181277825_181277945_181278685_181278905_181282384_181282508_181287263_181287386_181289081_181289221_181290818_181290939_181291214_181291392_181291889_181292024_181292878_181292971_181294226_181294342_181296628_181296756_181297214
tx.11632	chr2	+	333	2	ISM	ENSMUSG00000002455.15	ENSMUST00000002529.7	3054	21	53551	-1	53497	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	512	junction_1	0	460	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGGGGCTTGGGCCTCAC	3919	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181296662	181297454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_181296756_181297214
tx.11633	chr2	-	906	6	NIC	ENSMUSG00000002458.14	novel	1511	6	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	48.4090900554844	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTTGTTCTTTCAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181335742	181330214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_181330512_181331169_181331405_181331494_181331570_181333025_181333148_181333282_181333389_181335671
tx.11634	chr2	-	1377	5	FSM	ENSMUSG00000002458.14	ENSMUST00000108772.8	779	5	-2	-596	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_4	46.2729672703189	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTTGTTCTTTCAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181335742	181330214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_181331089_181331169_181331405_181331494_181331570_181333025_181333148_181335671
tx.11635	chr2	-	1471	6	FSM	ENSMUSG00000002458.14	ENSMUST00000002532.9	1511	6	40	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_5	20.8461027532726	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTTGTTCTTTCAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181335730	181330214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_181331089_181331169_181331405_181331494_181331570_181333025_181333148_181333282_181333389_181335671
tx.11636	chr2	+	3532	7	FSM	ENSMUSG00000027589.15	ENSMUST00000029116.14	3569	7	26	11	26	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_6	11.3431330181157	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTCAGTATTGCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181479672	181499243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_181479778_181482947_181483132_181484167_181484499_181486188_181486292_181488260_181488433_181493378_181493503_181496730
tx.11637	chr2	+	2711	3	ISM	ENSMUSG00000027589.15	ENSMUST00000029116.14	3569	7	8699	24	2099	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_2	3.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTACGACATTCTATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181488345	181499230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_181488433_181493378_181493503_181496730
tx.11639	chr2	+	641	3	FSM	ENSMUSG00000038628.9	ENSMUST00000039551.9	2948	3	89	2218	66	-2218	multi-exon	FALSE	canonical	3	712	junction_2	38.5	2194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGTTTTCTCTGTGTAGTC	8985	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181506218	181510405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_181506363_181507738_181507827_181509996
tx.11640	chr2	+	299	2	Intergenic	novelGene_876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATGAATGAATGAATGAAT	2130	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181559484	181560341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_181559537_181560094
tx.11641	chr2	-	663	4	Intergenic	novelGene_877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	1.69967317119759	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTTCAAAGCCATCAAAGAA	4285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181594988	181589558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_181589970_181591081_181591143_181591321_181591403_181594878
tx.11642	chr3	-	1778	5	FSM	ENSMUSG00000040374.14	ENSMUST00000059021.10	1749	5	-30	1	-30	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_2	14.3592304807744	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGATTGTGCATTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5641329	5625560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_5626825_5627728_5627793_5628224_5628333_5628679_5628790_5641097
tx.11643	chr3	-	1762	4	NIC	ENSMUSG00000040374.14	novel	1749	5	NA	NA	-76	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_1	25.9786236911983	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTGTGCATTTATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5641375	5625558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_5626825_5628224_5628333_5628679_5628790_5641097
tx.11644	chr3	-	1660	5	NIC	ENSMUSG00000040374.14	novel	1749	5	NA	NA	-6	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	8	junction_1	22.6936114358204	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGATTGTGCATTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5641216	5625561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_5626821_5627728_5627793_5628224_5628333_5628679_5628790_5641097
tx.11645	chr3	+	650	3	ISM	ENSMUSG00000043542.13	ENSMUST00000193010.2	1420	8	-50	33231	-47	-32657	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_1	6	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTTTTGTTTACTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7568495	7583904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_7568588_7581515_7581593_7583423
tx.11646	chr3	+	1590	9	FSM	ENSMUSG00000043542.13	ENSMUST00000051064.9	3292	9	-45	1747	-45	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_7	36.9256008752735	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGAAAAGGAAGACCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7568497	7617149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_7568588_7581515_7581593_7583423_7583541_7589185_7589328_7591328_7591478_7593089_7593190_7593644_7593745_7604135_7604244_7616442
tx.11647	chr3	+	1466	8	NIC	ENSMUSG00000043542.13	novel	3292	9	NA	NA	-21	14	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	16	junction_6	66.9154202660923	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGAAAAGGAAGACCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7568521	7617149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_7568588_7581515_7581593_7583423_7583541_7589185_7589328_7591328_7591478_7593089_7593190_7604135_7604244_7616442
tx.11648	chr3	+	758	2	FSM	ENSMUSG00000043542.13	ENSMUST00000192835.2	443	2	270	-585	270	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGATGAAAAGGAAGACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7604189	7617146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_7604244_7616442
tx.11650	chr3	-	393	2	Intergenic	novelGene_909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGTTCCCAGTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8311633	8311174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_8311431_8311496
tx.11651	chr3	+	804	5	FSM	ENSMUSG00000027500.11	ENSMUST00000029002.9	2073	5	163	1106	8	-1075	multi-exon	FALSE	canonical	3	1699	junction_2	84.762535946018	6780	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGTTTTGCTTGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8574582	8625560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_8574691_8606900_8606997_8610632_8610806_8619851_8620044_8625325
tx.11652	chr3	-	682	3	FSM	ENSMUSG00000040269.6	ENSMUST00000042148.6	783	3	100	1	100	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	890	junction_1	0.5	8126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCCTGCCGTGGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8988878	8867206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_8867475_8965045_8965228_8988646
tx.11653	chr3	-	2069	6	NNC	ENSMUSG00000027506.16	novel	6317	6	NA	NA	-7	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1105.06589848751	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATAGGTTTCAATATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9069545	8994656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_8996225_9000047_9000101_9009670_9009773_9012540_9012690_9018743_9018860_9069464
tx.11654	chr3	-	2083	6	NNC	ENSMUSG00000027506.16	novel	6317	6	NA	NA	-11	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1105.06589848751	1104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATAGGTTTCAATATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9069549	8994656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_8996235_9000047_9000101_9009670_9009773_9012540_9012690_9018743_9018860_9069464
tx.11655	chr3	+	1930	5	NNC	ENSMUSG00000069114.9	novel	7414	6	NA	NA	891	-4867	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	27.0924343682881	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGCCTTGAAACGCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9316552	9345526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_9317141_9329594_9330481_9343313_9343413_9345015_9345197_9345350
tx.11656	chr3	-	672	2	FSM	ENSMUSG00000040209.13	ENSMUST00000192832.2	1455	2	1187	-404	1187	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	358	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTTTTCTATGTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9504909	9503351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_9503959_9504844
tx.11657	chr3	-	1863	9	FSM	ENSMUSG00000040209.13	ENSMUST00000041124.13	13834	9	634	11337	634	-65	multi-exon	FALSE	canonical	3	267	junction_2	34.7697785440172	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGCATCTCTCTGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9674511	9503416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_9503959_9504844_9504943_9511019_9511125_9512334_9512603_9517323_9517425_9535951_9536179_9539558_9539663_9630123_9630360_9674329
tx.11659	chr3	+	680	4	FSM	ENSMUSG00000027533.11	ENSMUST00000029046.9	987	4	36	271	-21	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	202	junction_1	88.411914732499	1834	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGATATGTGTGTGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10077643	10081396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_10077779_10080030_10080204_10080531_10080634_10081126
tx.1166	chr1	-	1642	10	FSM	ENSMUSG00000016481.16	ENSMUST00000075451.12	1651	10	7	2	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_9	54.0893179933677	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGGTGTGTGGTTCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	194813862	194786099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_194786216_194789125_194789231_194793387_194793464_194794681_194794706_194796963_194797150_194799786_194800189_194805997_194806084_194811454_194811555_194812137_194812318_194813495
tx.11660	chr3	-	807	5	FSM	ENSMUSG00000027530.16	ENSMUST00000119761.2	548	5	-222	-37	-213	4	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.11803398874989	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTTGCACAATATCACCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10366456	10310973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_10311113_10312672_10312775_10315099_10315273_10317296_10317418_10366184
tx.11661	chr3	-	2159	9	FSM	ENSMUSG00000027531.17	ENSMUST00000065938.15	4185	9	32	1994	32	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_8	38.1901083397259	724	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATACCATTTTCTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10396467	10379009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_10380362_10381162_10381315_10386671_10386781_10387963_10388073_10389111_10389158_10391166_10391272_10393404_10393539_10394002_10394069_10396381
tx.11662	chr3	-	1411	2	FSM	ENSMUSG00000027531.17	ENSMUST00000195155.2	734	2	489	-1166	489	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	364	junction_1	0	773	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGAATACCATTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10381223	10379011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_10380362_10381162
tx.11663	chr3	-	1218	3	ISM	ENSMUSG00000039795.15	ENSMUST00000140634.2	743	7	3709	-857	-189	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	339	junction_1	29.5	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACAATTATTGCATTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10409976	10405019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_10405966_10406053_10406210_10409860
tx.11664	chr3	-	1604	8	FSM	ENSMUSG00000039795.15	ENSMUST00000037839.12	1610	8	1	5	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	339	junction_1	173.164190104923	464	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTATTGCATTTGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10416376	10405017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_10405966_10406053_10406210_10409860_10409983_10410994_10411087_10411169_10411298_10412224_10412265_10413569_10413613_10416301
tx.11665	chr3	-	1807	8	NIC	ENSMUSG00000039795.15	novel	1610	8	NA	NA	0	-7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	120	junction_6	235.712813848219	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGAGACAATTATTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10416376	10405021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_10405966_10406053_10406210_10409860_10409983_10410994_10411087_10411169_10411298_10412224_10412472_10413569_10413613_10416301
tx.11666	chr3	+	1211	5	FSM	ENSMUSG00000027536.7	ENSMUST00000029049.7	6188	5	39	4938	-12	-4938	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_1	13.9709520076479	1068	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTCTAGTGAGTCTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10432005	10455459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_10432282_10450611_10450790_10452096_10452212_10454608_10454763_10454971
tx.11667	chr3	-	1471	7	FSM	ENSMUSG00000027534.17	ENSMUST00000099223.11	2512	7	10	1031	-5	89	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	44.7837396086273	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCTCCAGACTAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10505152	10483907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_10484284_10485799_10485937_10491222_10491293_10499417_10499567_10500505_10500593_10502870_10503345_10504974
tx.11668	chr3	-	1570	8	FSM	ENSMUSG00000027534.17	ENSMUST00000029047.12	2288	8	-3	721	-3	70	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_2	14.2771402841703	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATAGTGTCTTGCCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10505150	10483926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_10484284_10485256_10485377_10485799_10485937_10491222_10491293_10499417_10499567_10500505_10500593_10502870_10503345_10504974
tx.11669	chr3	+	2671	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000095661.2	novel	2798	1	NA	NA	-46	-4	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGAAAAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12920849	12923689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_12921867_12922035
tx.1167	chr1	-	1339	10	NIC	ENSMUSG00000016481.16	novel	1651	10	NA	NA	-4	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	121	junction_9	50.3432661280975	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGGTGTGTGGTTCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	194813873	194786099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_194786216_194789125_194789231_194793387_194793464_194794681_194794706_194796963_194797150_194799786_194800189_194805997_194806084_194811454_194811555_194812137_194812318_194813809
tx.11670	chr3	+	661	3	ISM	ENSMUSG00000027550.15	ENSMUST00000165436.2	1518	10	-86	14720	24	-14720	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_2	22.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGCTACAGTGAGGAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14598907	14601813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_14599083_14601058_14601265_14601533
tx.11671	chr3	+	3385	19	FSM	ENSMUSG00000027550.15	ENSMUST00000169079.8	5638	19	0	2253	0	-55	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_7	12.3057750168542	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGAGCTATCATAATAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14598882	14631108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_14599083_14601058_14601265_14601533_14601600_14602269_14602438_14604688_14604865_14604970_14605175_14610555_14610753_14612306_14612455_14613167_14613317_14615310_14615516_14616447_14616588_14619363_14619566_14622248_14622435_14623310_14623486_14624287_14624452_14627183_14627393_14627483_14627622_14628018_14628155_14630792
tx.11672	chr3	+	347	3	ISM	ENSMUSG00000027552.15	ENSMUST00000165922.3	1751	8	9468	3524	9468	-3524	internal_fragment	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	98	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCTACTGTCCTAAGAGA	3362	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14653198	14667844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_14653362_14666059_14666107_14667707
tx.11673	chr3	+	960	3	ISM	ENSMUSG00000027552.15	ENSMUST00000165922.3	1751	8	25017	4	25017	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	223	junction_1	4	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATTGATCTTTGGGGGA	6869	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14668747	14671364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_14668966_14670184_14670230_14670667
tx.11674	chr3	-	412	4	FSM	ENSMUSG00000078784.9	ENSMUST00000185384.7	435	4	18	5	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4849	junction_3	245.494512271773	9880	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATTTCTTTAAATCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14676327	14671348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_14671469_14672236_14672354_14674600_14674718_14676269
tx.11675	chr3	-	1180	3	FSM	ENSMUSG00000078784.9	ENSMUST00000186870.7	1174	3	-6	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4849	junction_2	211	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATTTCTTTAAATCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14676327	14671348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_14672354_14674600_14674718_14676269
tx.11676	chr3	-	860	2	FSM	ENSMUSG00000078784.9	ENSMUST00000190064.2	508	2	-24	-328	-6	328	multi-exon	FALSE	canonical	3	4849	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14676327	14673915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_14674718_14676269
tx.11677	chr3	+	1097	7	FSM	ENSMUSG00000027555.9	ENSMUST00000029071.9	2299	7	12	1190	12	-1190	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_4	16.344384016808	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGCCTTCCTGACAATAA	2191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14706798	14726872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_14706906_14710096_14710295_14715718_14715838_14719943_14720040_14721288_14721352_14721968_14722125_14726514
tx.11678	chr3	+	1529	7	FSM	ENSMUSG00000027562.13	ENSMUST00000029078.9	1788	7	259	0	48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_4	9.4339811320566	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGGTGCCTGATTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14951746	14965830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_14951847_14952893_14953092_14960081_14960201_14960594_14960688_14961759_14961823_14962973_14963130_14965030
tx.1168	chr10	+	1160	6	ISM	ENSMUSG00000040675.18	ENSMUST00000117291.8	3669	28	116243	2	57081	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	315	junction_5	67.5911236775954	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTGTTCAGCTAGTAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4039360	4106109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_4039396_4039995_4040174_4053235_4053344_4056376_4056530_4098008_4098127_4105541
tx.11683	chr3	-	1685	5	NIC	ENSMUSG00000039519.7	novel	2166	6	NA	NA	-16	-321	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_1	6.28490254498827	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATGGCAATCATTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18297518	18126434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_18126918_18150686_18150894_18151367_18151959_18157864_18158002_18297251
tx.11684	chr3	-	1135	3	ISM	ENSMUSG00000039519.7	ENSMUST00000035625.7	2166	6	-15	25113	-15	-25113	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	12	junction_2	5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTCTGTGATAATTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18297517	18151226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_18151959_18157864_18158002_18297251
tx.11685	chr3	-	1661	7	FSM	ENSMUSG00000027599.10	ENSMUST00000029125.10	3673	7	-14	2026	-14	-2026	multi-exon	TRUE	canonical	3	251	junction_6	16.1761140780679	265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACCTCTACAAAAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19217243	19187591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_19188388_19189006_19189082_19189170_19189288_19198493_19198684_19203649_19203742_19211635_19211857_19217073
tx.11686	chr3	-	1635	7	NNC	ENSMUSG00000027599.10	novel	3673	7	NA	NA	-14	-2034	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	32	junction_1	91.40280204798	40	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAAAACCTCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19217243	19187599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_19188370_19189006_19189082_19189170_19189288_19198493_19198684_19203649_19203742_19211635_19211857_19217073
tx.11687	chr3	+	2786	8	FSM	ENSMUSG00000027601.14	ENSMUST00000130645.8	2953	8	132	35	-23	-35	multi-exon	FALSE	canonical	3	831	junction_1	130.277568667669	324	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGCTGTTGAATTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19242405	19274946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_19242453_19254189_19254332_19260615_19260715_19265631_19265748_19269634_19269868_19271343_19271588_19272325_19272486_19273201
tx.11688	chr3	+	2741	7	ISM	ENSMUSG00000027601.14	ENSMUST00000130645.8	2953	8	11914	35	-11548	-35	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	975	junction_4	80.6948986409096	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGCTGTTGAATTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19254187	19274946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_19254332_19260615_19260715_19265631_19265748_19269634_19269868_19271343_19271588_19272325_19272486_19273201
tx.11689	chr3	+	660	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000106182.2	novel	383	1	NA	NA	-93	10272	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTATAATTTGAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19822943	19833691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_19823584_19833671
tx.11690	chr3	-	3807	17	FSM	ENSMUSG00000027615.15	ENSMUST00000012580.13	4016	17	-7	216	-7	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_7	9.33324032691755	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTAATAATTTCCTATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20089486	20050324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_20051194_20056486_20056578_20057388_20057596_20062978_20063087_20064963_20065153_20065552_20065739_20066860_20067095_20068186_20068368_20069989_20070172_20072974_20073084_20073966_20074122_20076921_20077004_20079894_20080085_20083123_20083210_20083310_20083483_20084477_20084970_20089212
tx.11691	chr3	-	741	2	ISM	ENSMUSG00000027615.15	ENSMUST00000155121.2	3824	7	-21	13968	0	4496	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTGAAAGAGGCGGAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20089479	20084495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_20084970_20089212
tx.11692	chr3	-	281	2	Intergenic	novelGene_911	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCTTTGTCTTGGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20111881	20103046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_20103249_20111802
tx.11693	chr3	-	1712	7	FSM	ENSMUSG00000019528.19	ENSMUST00000178328.8	1698	7	-11	-3	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_2	8.93805845186128	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGGTTGTTTAAGTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20209271	20176247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_20177029_20179421_20179642_20192180_20192308_20204702_20204866_20205116_20205292_20206893_20207030_20209161
tx.11694	chr3	+	585	3	Intergenic	novelGene_912	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAAGCCTCCAACCAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21990378	21992765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_21990595_21990785_21991063_21992673
tx.11695	chr3	+	2959	17	FSM	ENSMUSG00000027630.14	ENSMUST00000193734.6	8237	17	218	5060	-11	-434	multi-exon	TRUE	canonical	3	32	junction_2	67.0932187333414	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGCTTCTCAAAGTGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22131033	22265698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_22131119_22143576_22143687_22203105_22203173_22233366_22233470_22242529_22242676_22243931_22244155_22245078_22245212_22245555_22245698_22246183_22246248_22246333_22246432_22247271_22247333_22254483_22254606_22254753_22254829_22257260_22257389_22257990_22258157_22263675_22263778_22264564
tx.11696	chr3	+	2176	16	FSM	ENSMUSG00000027630.14	ENSMUST00000202747.4	4209	16	154	1879	0	293	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_1	26.4420540469575	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTTCTTGCTTCCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22131044	22265036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_22131119_22203105_22203173_22233366_22233470_22242529_22242676_22243931_22244155_22245078_22245212_22245555_22245698_22246183_22246248_22246333_22246432_22247271_22247333_22254483_22254606_22254753_22254829_22257260_22257389_22257990_22258157_22263675_22263778_22264564
tx.11697	chr3	+	1211	2	ISM	ENSMUSG00000027630.14	ENSMUST00000201467.2	354	4	6342	-952	6342	-437	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	224	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTAGCTTCTCAAAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22263697	22265695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_22263778_22264564
tx.11698	chr3	+	448	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000057036.8	novel	444	1	NA	NA	-24	56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24387207	24387731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_24387475_24387550
tx.11699	chr3	+	446	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000057036.8	novel	444	1	NA	NA	-24	62	multi-exon	FALSE	canonical	3	644	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAATTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24387207	24387737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_24387299_24387382
tx.117	chr1	-	1072	3	ISM	ENSMUSG00000042182.17	ENSMUST00000062289.11	2487	7	81	25692	33	-3986	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_2	1	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGACTTGATGTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33946816	33916824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_33917519_33922521_33922730_33946646
tx.11701	chr3	+	409	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000063887.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTTGGTAATGTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26318516	26328359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_26318693_26328126
tx.11703	chr3	-	4074	25	NNC	ENSMUSG00000027699.20	novel	4086	25	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_15	161.977278927907	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTATGTGTCCTGTCAT	1857	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27207980	27151370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_27152638_27154976_27155121_27156543_27156652_27169544_27169700_27171926_27172066_27176109_27176230_27176545_27176625_27178051_27178134_27181027_27181125_27181882_27181994_27184202_27184272_27185933_27186054_27191173_27191311_27192650_27192874_27192996_27193060_27193158_27193279_27193680_27193812_27195774_27195849_27199100_27199209_27200104_27200195_27200985_27201169_27202943_27203037_27203141_27203222_27204177_27204330_27207851
tx.11704	chr3	-	597	5	ISM	ENSMUSG00000027699.20	ENSMUST00000176535.8	712	6	-22	928	0	-868	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	581	junction_4	57.9956894949961	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCTGATTGTAGGATTGTT	1838	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27207999	27201044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_27201169_27202943_27203037_27203141_27203222_27204177_27204330_27207851
tx.11705	chr3	+	2097	5	FSM	ENSMUSG00000027698.15	ENSMUST00000046515.15	4480	5	16	2367	16	-2367	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_3	11.2333209693305	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCTGTTGTTACTTAAGA	5584	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27237129	27296740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_27237365_27276816_27277046_27280221_27280292_27293680_27293853_27295349
tx.11706	chr3	-	2374	3	ISM	ENSMUSG00000039286.13	ENSMUST00000195008.6	6886	27	281462	1268	281462	-1268	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_2	14.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCATTACCAGTGATTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27483085	27471578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_27473752_27480182_27480311_27483012
tx.11707	chr3	+	895	4	ISM	ENSMUSG00000027692.17	ENSMUST00000162037.9	4276	31	-307	160369	-20	11946	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	9.62635271879577	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGTGCCCATTTGTTTGT	4097	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28317404	28560229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_28317849_28413139_28413206_28548115_28548173_28559901
tx.11708	chr3	-	1198	2	NNC	ENSMUSG00000091329.3	novel	546	3	NA	NA	-41	-38237	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTCTCACAGACCTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28835298	28831174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_28832194_28835119
tx.11709	chr3	+	3494	5	FSM	ENSMUSG00000050192.9	ENSMUST00000060500.9	5027	5	58	1475	58	-1475	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_1	7.24568837309472	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAGCTATCTGGTAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28835482	28851520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_28835563_28836164_28836366_28836876_28836982_28847833_28847966_28848544
tx.1171	chr10	+	1031	5	ISM	ENSMUSG00000040675.18	ENSMUST00000117291.8	3669	28	116972	2	57810	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	315	junction_4	75.4300172345201	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTGTTCAGCTAGTAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4040089	4106109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_4040174_4053235_4053344_4056376_4056530_4098008_4098127_4105541
tx.11710	chr3	-	928	2	FSM	ENSMUSG00000103827.2	ENSMUST00000193336.2	232	2	-17	-679	-17	679	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAGAAATTAGCTACTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28859502	28856273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_28857110_28859410
tx.11711	chr3	+	482	4	FSM	ENSMUSG00000039221.11	ENSMUST00000194649.2	525	4	41	2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3779	junction_1	1855.270390596	24050	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTATGGTTCATCAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28859658	28861571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_28859693_28860651_28860742_28860885_28861008_28861335
tx.11712	chr3	+	548	4	NIC	ENSMUSG00000039221.11	novel	552	4	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	450	junction_2	3086.0505864652	1863	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTATGGTTCATCAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28859659	28861571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_28859693_28860651_28860742_28860818_28861008_28861335
tx.11713	chr3	-	630	4	NNC	ENSMUSG00000104444.2	novel	274	2	NA	NA	-2286	-2982	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGTTTGTGTGTATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28870420	28864335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_28864615_28864735_28864862_28868019_28868135_28870310
tx.11714	chr3	+	3447	8	FSM	ENSMUSG00000037730.14	ENSMUST00000195751.2	3474	8	-43	70	-30	63	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_2	49.6608908662808	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCAGCTAATCTTTTTCT	8749	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30656749	30672580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_30656845_30657652_30657820_30661185_30661980_30663133_30663294_30665589_30665769_30666617_30666702_30667700_30667788_30670699
tx.11715	chr3	-	1836	11	FSM	ENSMUSG00000027702.8	ENSMUST00000029252.8	1891	11	55	0	55	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	297	junction_6	40.0710618776194	300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTGTCTTGAGTTTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30701963	30678415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_30679052_30684121_30684249_30685430_30685587_30685941_30686097_30688693_30688790_30690390_30690520_30696887_30696972_30697432_30697498_30697596_30697719_30699343_30699465_30701818
tx.11716	chr3	-	729	4	ISM	ENSMUSG00000027702.8	ENSMUST00000029252.8	1891	11	51	18745	51	-18745	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	353	junction_2	40.185680147148	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAATTGAGTCTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30701967	30697160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_30697498_30697596_30697719_30699343_30699465_30701818
tx.11717	chr3	+	788	3	NNC	ENSMUSG00000027703.17	novel	2387	8	NA	NA	10834	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_1	6.5	137	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTGTGGGAAGAATGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30712868	30726583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_30713166_30714049_30714247_30726289
tx.11718	chr3	-	766	2	FSM	ENSMUSG00000074653.11	ENSMUST00000130731.2	705	2	-55	-6	-22	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTTCAGTTTGTATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30754014	30752264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_30752864_30753847
tx.11719	chr3	+	783	2	Intergenic	novelGene_914	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGAAAGAAAGA	9135	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30755468	30757312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_30755690_30756750
tx.11720	chr3	+	2267	4	ISM	ENSMUSG00000051860.14	ENSMUST00000172593.2	1511	8	5595	-1679	418	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_3	2.44948974278318	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCAGGCTCTTCTCTCTTT	950	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30810788	30821323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_30810898_30812474_30812594_30816287_30816399_30819395
tx.11721	chr3	+	992	3	ISM	ENSMUSG00000051860.14	ENSMUST00000172593.2	1511	8	5608	2580	431	-2580	internal_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_2	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAGGTAATAATTGGCTT	963	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30810801	30817064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_30810898_30812474_30812594_30816287
tx.11722	chr3	+	446	4	ISM	ENSMUSG00000027706.9	ENSMUST00000029256.9	3967	8	450	11270	-11	8452	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	760	junction_3	45.4923681023043	3041	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAGATGGTGAAAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30847473	30864142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_30847533_30854279_30854389_30855208_30855315_30863970
tx.11723	chr3	+	2347	8	FSM	ENSMUSG00000027706.9	ENSMUST00000029256.9	3967	8	450	1170	-11	61	multi-exon	FALSE	canonical	3	556	junction_4	88.1522338147515	417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGCCATTGGACTCTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30847473	30874242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_30847533_30854279_30854389_30855208_30855315_30863970_30864176_30864593_30864687_30866444_30866506_30868382_30868503_30872648
tx.11724	chr3	+	1907	5	NIC	ENSMUSG00000037661.15	novel	1977	4	NA	NA	-8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	39	junction_4	111.904814463007	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCATTTTATTTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30910090	30951339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_30910207_30931383_30931482_30944090_30944191_30948277_30948390_30949858
tx.11725	chr3	+	1691	3	FSM	ENSMUSG00000037661.15	ENSMUST00000166278.7	1689	3	-4	2	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_2	125	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCATTTTATTTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30910094	30951339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_30910207_30931383_30931482_30949858
tx.11726	chr3	+	1790	4	FSM	ENSMUSG00000037661.15	ENSMUST00000194979.6	346	4	-46	-1398	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_2	25.3026129524645	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCATTTTATTTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30910095	30951339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_30910207_30931383_30931482_30944090_30944191_30949858
tx.11727	chr3	+	2021	4	FSM	ENSMUSG00000037661.15	ENSMUST00000046748.13	1977	4	-42	-2	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_2	83.6341238171756	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTTATTTGTTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30910095	30951341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_30910207_30931383_30931711_30944090_30944191_30949858
tx.11728	chr3	+	1955	4	NIC	ENSMUSG00000037661.15	novel	2139	4	NA	NA	-17	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	82	junction_1	76.6130247122221	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTTATTTGTTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30910120	30951341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_30910395_30931383_30931482_30944090_30944191_30949858
tx.11729	chr3	+	2086	5	NIC	ENSMUSG00000037661.15	novel	754	5	NA	NA	0	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	39	junction_4	77.9947914927657	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTCATTTTATTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30910098	30951338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_30910395_30931383_30931482_30944090_30944191_30948277_30948390_30949858
tx.11730	chr3	-	2351	6	FSM	ENSMUSG00000027663.13	ENSMUST00000029199.11	7797	6	16	5430	16	-5426	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_5	21.7568380055559	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGATGGAGTGTTATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32419811	32394370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_32395845_32397482_32397584_32397700_32397868_32399606_32399730_32415038_32415366_32419652
tx.11731	chr3	-	2289	6	NIC	ENSMUSG00000027663.13	novel	7672	7	NA	NA	-4	-5628	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	21	junction_5	41.5855744219074	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCCTCCCTCCCTCCCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32419613	32394572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_32395845_32397482_32397584_32397700_32397868_32399606_32399730_32415038_32415366_32419314
tx.11732	chr3	-	1805	6	NNC	ENSMUSG00000027663.13	novel	7797	6	NA	NA	1	-5903	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_5	45.5692879031481	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGAGGATGTGTTTGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32419826	32394847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_32395845_32397482_32397584_32397700_32397868_32399606_32399730_32415038_32415366_32419736
tx.11733	chr3	+	1830	7	FSM	ENSMUSG00000027667.14	ENSMUST00000193287.6	2211	7	291	90	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_1	65.8012580089131	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGCAAGCTGAAATACTTT	3197	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32564698	32574892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_32564739_32567149_32567342_32568532_32568604_32569432_32569502_32571177_32571289_32573258_32573394_32573680
tx.11734	chr3	+	1881	7	FSM	ENSMUSG00000027667.14	ENSMUST00000191783.6	1988	7	107	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	46.6455309280059	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGCAAGCTGAAATACTTT	3289	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32564790	32574892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_32564882_32567149_32567342_32568532_32568604_32569432_32569502_32571177_32571289_32573258_32573394_32573680
tx.11735	chr3	+	1791	6	ISM	ENSMUSG00000027667.14	ENSMUST00000191783.6	1988	7	2465	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_2	18.5752523536021	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGCAAGCTGAAATACTTT	5647	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32567148	32574892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_32567342_32568532_32568604_32569432_32569502_32571177_32571289_32573258_32573394_32573680
tx.11736	chr3	-	2283	10	FSM	ENSMUSG00000027669.15	ENSMUST00000155737.8	5997	10	50	3664	-6	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	60	junction_8	7.61253028131584	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTACTTTTCCATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32670684	32638144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_32639376_32641709_32641927_32643857_32644060_32644145_32644213_32645259_32645423_32647306_32647371_32650425_32650533_32652274_32652314_32656193_32656290_32670587
tx.11737	chr3	-	2262	9	NNC	ENSMUSG00000027669.15	novel	5997	10	NA	NA	-27	-43	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	23.6798305526032	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATCTATGTAATGTAAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32670705	32638189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_32639376_32641709_32641927_32643857_32644060_32644145_32644213_32645259_32645423_32647306_32647371_32650425_32650575_32656193_32656290_32670587
tx.11738	chr3	+	536	3	Intergenic	novelGene_916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCACTTGGCAATGGGTAAA	3253	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32715445	32730034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_32715607_32716700_32716876_32729834
tx.11739	chr3	-	881	7	FSM	ENSMUSG00000037531.9	ENSMUST00000043966.8	3364	7	383	2100	383	78	multi-exon	FALSE	canonical	3	685	junction_5	35.1931180141168	2434	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCAGTTGTTCTTCTAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32790913	32781645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_32781867_32782580_32782677_32784229_32784361_32785308_32785406_32787737_32787799_32788256_32788409_32790790
tx.11740	chr3	+	674	6	FSM	ENSMUSG00000027673.13	ENSMUST00000127477.8	1079	6	70	335	-11	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2813	junction_1	66.9226419084005	15433	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAAGATTCTGTGGCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32791208	32805380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_32791355_32799002_32799092_32800596_32800664_32801876_32801939_32802609_32802717_32805177
tx.11741	chr3	-	333	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000056900.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACATAGATATAGATATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32918760	32918306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_32918439_32918559
tx.11742	chr3	-	361	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000056900.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACATAGATATAGATATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32918760	32918306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_32918439_32918531
tx.11743	chr3	-	1544	3	FSM	ENSMUSG00000027676.12	ENSMUST00000197230.2	1557	3	13	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTTCTCTCCTGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33898446	33892142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_33893374_33895217_33895338_33898253
tx.11744	chr3	+	2137	17	FSM	ENSMUSG00000027680.16	ENSMUST00000197694.5	2129	17	-13	5	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	754	junction_15	164.164884719601	1106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAATGTTATTTTGTTTTC	4846	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34074243	34123489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_34074313_34093675_34093729_34095211_34095306_34100180_34100253_34100585_34100735_34101114_34101209_34101780_34101898_34103301_34103473_34104223_34104303_34108370_34108481_34110478_34110566_34112172_34112231_34112317_34112381_34115976_34116181_34118267_34118469_34122309_34122402_34123065
tx.11745	chr3	+	2045	16	FSM	ENSMUSG00000027680.16	ENSMUST00000200392.5	3014	16	-13	982	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	506	junction_15	191.49767622611	797	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAATGTTATTTTGTTTTC	4846	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34074243	34123489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_34074313_34093675_34093729_34095211_34095306_34100180_34100253_34100585_34100735_34101114_34101209_34101780_34101898_34103301_34103473_34104223_34104303_34108370_34108481_34110478_34110566_34112172_34112231_34112317_34112381_34115976_34116181_34118267_34118469_34123065
tx.11746	chr3	+	2131	15	FSM	ENSMUSG00000027680.16	ENSMUST00000198051.5	2127	15	-9	5	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	506	junction_14	198.096296929405	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAATGTTATTTTGTTTTC	4847	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34074244	34123489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_34074313_34093675_34093729_34095211_34095306_34100180_34100253_34100585_34100735_34101114_34101209_34101780_34101898_34103301_34103473_34104223_34104303_34108370_34108481_34110478_34110566_34112172_34112381_34115976_34116181_34118267_34118469_34123065
tx.11747	chr3	-	579	6	FSM	ENSMUSG00000027679.14	ENSMUST00000108195.10	659	6	9	71	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	3089	junction_3	262.703330774469	18034	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTGTCTTGGTATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34135461	34131498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_34131674_34132923_34132995_34133353_34133434_34134232_34134307_34134379_34134432_34135334
tx.11748	chr3	-	412	2	Intergenic	novelGene_918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGGTATTCCTAGTTATT	7659	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34753764	34752904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_34753101_34753548
tx.11749	chr3	-	687	4	FSM	ENSMUSG00000105153.5	ENSMUST00000198364.2	675	4	-13	1	-13	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGTTTGTTAAGCTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34770824	34763772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_34764079_34764315_34764508_34768115_34768187_34770706
tx.1175	chr10	+	987	3	ISM	ENSMUSG00000038587.11	ENSMUST00000045730.7	6195	4	-52	5798	-52	20	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1052	junction_2	17	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCCCTAGAATCTCCGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4216327	4303672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_4216669_4263742_4263858_4303141
tx.11750	chr3	+	2023	2	Intergenic	novelGene_920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGAAGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34818296	34821242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_34818433_34819355
tx.11751	chr3	-	714	4	Intergenic	novelGene_921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGTGACTGGAGAATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35637397	35625243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_35625444_35631027_35631362_35631904_35632012_35637324
tx.11752	chr3	+	707	3	Intergenic	novelGene_922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGACTCCTAGCAGTGGG	4051	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35787092	35789304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_35787353_35787440_35787545_35788961
tx.11753	chr3	+	738	5	ISM	ENSMUSG00000037400.18	ENSMUST00000200445.5	3028	22	-63	41492	-35	-18772	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	470	junction_4	34.6229692545281	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTATGTGGTAAATGATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35808219	35842345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_35808560_35832173_35832291_35836660_35836751_35838655_35838737_35842235
tx.11754	chr3	+	3334	12	ISM	ENSMUSG00000037400.18	ENSMUST00000200445.5	3028	22	-20	20859	8	-1452	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	350	junction_9	58.7120723362455	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATTAATTGTACACACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35808262	35862978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_35808560_35832173_35832291_35836660_35836751_35838655_35838737_35842235_35842344_35842574_35842704_35843706_35843811_35849907_35849956_35852742_35852808_35854632_35854715_35859882_35860034_35860916
tx.11755	chr3	-	3327	7	NIC	ENSMUSG00000027708.15	novel	4980	7	NA	NA	-11	515	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	5	junction_5	69.5741011839575	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCATGACTAAATCTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35986996	35947139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_35949849_35951612_35951710_35951941_35952025_35970368_35970500_35973149_35973319_35975261_35975337_35986933
tx.11756	chr3	-	2732	6	ISM	ENSMUSG00000027708.15	ENSMUST00000198389.5	3020	7	8886	160	0	-160	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	154	junction_3	20.9513722700925	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGATATTTGTGTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35975337	35947814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_35949849_35951612_35951710_35951941_35952025_35970368_35970500_35973149_35973319_35975119
tx.11757	chr3	-	1310	6	NIC	ENSMUSG00000027708.15	novel	4980	7	NA	NA	-2	300	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	38	junction_3	59.8351067518058	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATAATCTGGGGACTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35986987	35949158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_35949849_35951612_35951710_35951941_35952025_35973149_35973319_35975119_35975337_35986933
tx.11758	chr3	-	1441	7	FSM	ENSMUSG00000027708.15	ENSMUST00000108182.10	4980	7	634	2905	-2	300	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_3	19.8445346520284	218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATAATCTGGGGACTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35986987	35949158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_35949849_35951612_35951710_35951941_35952025_35970368_35970500_35973149_35973319_35975119_35975337_35986933
tx.11759	chr3	-	1505	2	ISM	ENSMUSG00000027708.15	ENSMUST00000196115.2	631	4	-49	3626	-37	-771	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTGGTAAAATGAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35987022	35973920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_35975337_35986933
tx.11760	chr3	-	1549	12	ISM	ENSMUSG00000027709.10	ENSMUST00000029259.10	2455	19	15621	0	4875	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	210	junction_8	28.8042696559594	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGAGCTGTAGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36039206	36013981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_36014279_36015081_36015154_36017733_36017842_36018475_36018614_36022572_36022623_36026626_36026714_36028222_36028440_36029943_36030054_36030809_36030994_36033071_36033200_36037881_36037964_36039130
tx.11761	chr3	-	2434	19	FSM	ENSMUSG00000027709.10	ENSMUST00000029259.10	2455	19	21	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	210	junction_8	26.6884748788316	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGAGCTGTAGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36054806	36013981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_36014279_36015081_36015154_36017733_36017842_36018475_36018614_36022572_36022623_36026626_36026714_36028222_36028440_36029943_36030054_36030809_36030994_36033071_36033200_36037881_36037964_36039130_36039243_36043992_36044115_36044197_36044346_36044845_36044968_36048064_36048161_36049929_36050067_36051673_36051721_36054629
tx.11762	chr3	-	647	5	ISM	ENSMUSG00000027709.10	ENSMUST00000200163.2	802	7	4875	604	4875	-604	internal_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	98.1147287617919	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCCAAACCTATAAATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36039206	36030548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_36030726_36030809_36030994_36033071_36033200_36037881_36037964_36039130
tx.11763	chr3	+	2475	18	FSM	ENSMUSG00000027710.15	ENSMUST00000011492.15	3930	18	62	1393	-26	88	multi-exon	FALSE	canonical	3	170	junction_2	13.4755962948483	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTAGTGCTCCTCCACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36120189	36145609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_36120420_36123858_36123953_36127655_36127758_36128498_36128606_36129391_36129493_36130124_36130204_36130870_36131046_36132586_36132661_36134369_36134446_36135959_36136031_36136257_36136378_36139562_36139692_36141868_36141949_36142636_36142764_36142963_36143042_36143480_36143610_36144230_36144304_36144979
tx.11764	chr3	+	3240	13	ISM	ENSMUSG00000027710.15	ENSMUST00000011492.15	3930	18	9994	-3	-796	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_4	13.4976849866931	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTTTTACCAAGGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36130121	36147005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_36130204_36130870_36131046_36132586_36132661_36134369_36134446_36135959_36136031_36136257_36136378_36139562_36139692_36141868_36141949_36142636_36142764_36142963_36143042_36143480_36143610_36144230_36144304_36144979
tx.11765	chr3	+	2934	4	FSM	ENSMUSG00000033883.12	ENSMUST00000197653.5	6689	4	55	3700	55	-3693	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	1.4142135623731	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAAAAAAAACATACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36205220	36220791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_36205345_36213670_36213798_36216780_36216877_36218204
tx.11766	chr3	-	1542	13	FSM	ENSMUSG00000027712.14	ENSMUST00000029266.14	1731	13	189	0	-46	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_1	8.69985632065266	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTAGGTTTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36529854	36503071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_36503556_36504460_36504584_36504786_36504846_36506335_36506432_36507619_36507714_36511141_36511199_36511607_36511688_36514591_36514683_36516029_36516144_36518116_36518212_36519399_36519485_36529578_36529610_36529721
tx.11767	chr3	-	1497	12	NNC	ENSMUSG00000027712.14	novel	1731	13	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	31.7903774619546	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTAGGTTTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36529820	36503071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_36503556_36504460_36504584_36504786_36504846_36506335_36506432_36507619_36507714_36511141_36511199_36511607_36511688_36514591_36514683_36516029_36516144_36518116_36518212_36519399_36519505_36529721
tx.11768	chr3	+	1598	12	FSM	ENSMUSG00000027714.12	ENSMUST00000029269.12	1617	12	19	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_11	43.5980892749872	667	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGAGAGCCGAATGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36606773	36619876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_36606901_36607183_36607279_36607954_36608075_36608188_36608292_36608786_36608925_36609630_36609714_36611011_36611145_36615251_36615341_36616166_36616314_36617221_36617407_36619366_36619446_36619577
tx.11769	chr3	+	368	2	ISM	ENSMUSG00000027714.12	ENSMUST00000029269.12	1617	12	12622	0	3132	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	373	junction_1	0	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTGAGAGCCGAATGAGT	2480	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36619376	36619876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_36619446_36619577
tx.1177	chr10	+	2212	2	ISM	ENSMUSG00000038587.11	ENSMUST00000215696.2	5931	3	8954	-1	8954	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1663	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACTGTTTTTTTATTAAA	NA	False	NA	-13	True	NA	NA	NA	4306721	4309471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_4307940_4308477
tx.11770	chr3	-	1720	8	FSM	ENSMUSG00000027715.10	ENSMUST00000029270.10	2965	8	183	1062	-3	51	multi-exon	FALSE	canonical	3	973	junction_1	54.4767315990441	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAACTTGATTTGTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36626116	36620075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_36620432_36620689_36620824_36621148_36621263_36621872_36622081_36622736_36622961_36623128_36623239_36624884_36625129_36625786
tx.11771	chr3	-	451	2	FSM	ENSMUSG00000027715.10	ENSMUST00000156575.2	953	2	170	332	170	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	973	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTTAATCTGAGATAAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36620824	36620115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_36620432_36620689
tx.11772	chr3	-	1966	7	ISM	ENSMUSG00000027715.10	ENSMUST00000029270.10	2965	8	544	1113	-55	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	973	junction_1	58.0363870534876	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAAGTCAAAGTTAATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36625755	36620126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_36620432_36620689_36620824_36621148_36621263_36621872_36622081_36622736_36622961_36623128_36623239_36624884
tx.11773	chr3	-	2597	19	FSM	ENSMUSG00000037325.11	ENSMUST00000108156.9	2687	19	88	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_12	6.84754619472471	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACTTGTGTCTTTATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36667538	36627292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_36627772_36629442_36629567_36629693_36629798_36629891_36630002_36632544_36632710_36636774_36636915_36644800_36644867_36646513_36646589_36648516_36648710_36652414_36652518_36653487_36653573_36656977_36657109_36658554_36658672_36659832_36659906_36661669_36661857_36664328_36664505_36664714_36664778_36666160_36666227_36667398
tx.11774	chr3	-	1815	6	ISM	ENSMUSG00000037325.11	ENSMUST00000108155.8	2437	18	-101	29700	3	4766	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_3	5.88557558782486	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTGTGTTTTTGTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36667535	36658719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_36659906_36661669_36661857_36664328_36664505_36664714_36664778_36666160_36666227_36667398
tx.11775	chr3	-	706	4	FSM	ENSMUSG00000037325.11	ENSMUST00000129671.2	1288	4	-2	584	-2	261	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	6.97614984548545	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATATGCGTGTATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36667540	36664069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_36664505_36664714_36664778_36666160_36666227_36667398
tx.11776	chr3	-	684	4	NNC	ENSMUSG00000037325.11	novel	1288	4	NA	NA	3	156	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.4419672692682	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTCAACTTCACATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36667535	36664174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_36664505_36664626_36664778_36666160_36666227_36667398
tx.11777	chr3	+	312	2	ISM	ENSMUSG00000037270.19	ENSMUST00000198742.5	3599	9	-33	25852	-33	-24556	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTCTGCCTAAGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36917219	36918638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_36917429_36918535
tx.11778	chr3	-	1065	5	FSM	ENSMUSG00000045031.19	ENSMUST00000102955.11	1064	5	-1	0	-1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_2	3.41869858279434	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAGTATCTTCTGGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37366596	37362770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_37363331_37363493_37363632_37364085_37364215_37364441_37364589_37366505
tx.11779	chr3	+	2447	2	FSM	ENSMUSG00000051444.10	ENSMUST00000057975.8	2433	2	-14	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACTGCCATTCTGTTTTTT	1237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37366688	37375599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_37366735_37373198
tx.1178	chr10	-	825	6	ISM	ENSMUSG00000019763.12	ENSMUST00000042251.11	3139	13	18969	1253	326	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_3	15.587174214719	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTCAGCTCTTAATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4363419	4353167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_4353502_4353873_4353991_4357804_4357926_4360712_4360790_4361666_4361732_4363308
tx.11780	chr3	-	1109	5	NNC	ENSMUSG00000050174.16	novel	1070	5	NA	NA	-15	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.5151445649137	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCCTCACTGGGTCACAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37473760	37459120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_37459641_37463656_37463712_37466508_37466565_37470849_37471054_37473486
tx.11781	chr3	-	1211	5	NIC	ENSMUSG00000050174.16	novel	1264	5	NA	NA	8	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.1657508881031	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTAATCCTCACTGGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37474352	37459125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_37459641_37463656_37463712_37466508_37466565_37470849_37471054_37473971
tx.11782	chr3	+	2903	16	FSM	ENSMUSG00000027722.15	ENSMUST00000108112.10	3295	16	391	1	-11	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	324	junction_1	47.7393850912314	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTAGTTTTATCTTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37474435	37633244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_37474650_37478659_37478785_37480237_37480396_37484194_37484254_37485781_37486427_37487286_37487417_37487787_37487845_37490790_37490915_37493249_37493506_37502556_37502712_37505791_37506002_37510923_37510978_37512469_37512550_37518680_37518808_37582306_37582472_37632900
tx.11783	chr3	+	2901	16	FSM	ENSMUSG00000027722.15	ENSMUST00000029277.13	2890	16	-11	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_1	86.3305276249369	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTAGTTTTATCTTGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37474435	37633245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_37474650_37478662_37478785_37480237_37480396_37484194_37484254_37485781_37486427_37487286_37487417_37487787_37487845_37490790_37490915_37493249_37493506_37502556_37502712_37505791_37506002_37510923_37510978_37512469_37512550_37518680_37518808_37582306_37582472_37632900
tx.11784	chr3	+	2246	2	NIC	ENSMUSG00000037211.13	novel	2481	3	NA	NA	-44	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCGAGTGCATCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37694051	37698746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_37694255_37696703
tx.11785	chr3	+	774	2	Intergenic	novelGene_923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	8239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37722947	37731802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_37723216_37731296
tx.11786	chr3	+	361	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100755.2	novel	425	1	NA	NA	-30	64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACATGGTGGAATAGGATTG	7634	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37768858	37769377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_37768897_37769054
tx.11787	chr3	+	1348	6	Intergenic	novelGene_924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.03960780543711	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGCACATGGAGACCGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40510564	40515185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_40510872_40511877_40511978_40512401_40512528_40512834_40513038_40514101_40514149_40514620
tx.11788	chr3	+	788	2	Intergenic	novelGene_925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCAGTGGTGTTCTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40514096	40515356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_40514149_40514620
tx.11789	chr3	+	1154	2	ISM	ENSMUSG00000060798.8	ENSMUST00000091186.7	6387	16	1	50157	1	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_1	0	215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTGCACTTGAGAACACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40594916	40609047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_40595159_40608135
tx.1179	chr10	-	1839	13	FSM	ENSMUSG00000019763.12	ENSMUST00000042251.11	3139	13	44	1256	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_3	17.5220099684178	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATCCTTTCAGCTCTTAAT	5706	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4382344	4353170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_4353502_4353873_4353991_4357804_4357926_4360712_4360790_4361666_4361732_4363308_4363416_4364542_4364644_4367152_4367193_4368555_4368632_4372081_4372191_4377170_4377692_4379076_4379172_4382265
tx.11790	chr3	+	1096	3	ISM	ENSMUSG00000060798.8	ENSMUST00000091186.7	6387	16	4	40206	4	9952	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	50.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGCAGCAGTGATGAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40594919	40618998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_40595159_40608135_40608684_40618689
tx.11791	chr3	+	1604	6	FSM	ENSMUSG00000069041.9	ENSMUST00000091184.9	2128	6	21	503	21	-503	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	1.93907194296653	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTAATGAGCCTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40663305	40680024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_40663657_40670945_40671074_40674920_40675039_40675936_40676092_40677055_40677182_40679298
tx.11792	chr3	+	1212	5	FSM	ENSMUSG00000025758.11	ENSMUST00000203320.2	1599	5	-22	409	0	-409	multi-exon	FALSE	canonical	3	337	junction_3	14.0956553590104	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAAGTGACTTTTCTTCAG	7794	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40754462	40760091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_40754719_40755434_40755531_40756219_40756316_40756392_40756508_40759442
tx.11793	chr3	+	3470	16	FSM	ENSMUSG00000025758.11	ENSMUST00000026858.11	3479	16	9	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_10	36.6472675955824	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGTTTATTGGCTAAATA	7794	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40754462	40771318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_40754719_40755434_40755531_40756219_40756316_40756392_40756508_40759442_40760356_40760921_40761023_40763181_40763544_40764711_40764817_40765096_40765200_40765668_40765819_40766314_40766449_40766528_40766621_40767165_40767311_40767900_40768027_40769416_40769524_40770749
tx.11794	chr3	-	3050	12	FSM	ENSMUSG00000025759.12	ENSMUST00000026859.11	3151	12	90	11	7	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_5	6.38308715692435	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTCCAGTACATATGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40801230	40772548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_40774156_40776297_40776546_40776629_40776734_40778261_40778397_40781308_40781418_40785058_40785115_40786447_40786593_40788378_40788493_40789603_40789845_40791523_40791568_40793848_40793941_40801075
tx.11795	chr3	-	2818	12	NIC	ENSMUSG00000025759.12	novel	3151	12	NA	NA	51	-95	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_9	8.60616730621008	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTTACTGTTGAAGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40801186	40772632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_40774156_40776297_40776546_40776629_40776734_40778261_40778397_40781308_40781418_40785058_40785115_40786447_40786593_40788378_40788493_40789603_40789741_40791523_40791568_40793848_40793941_40801075
tx.11796	chr3	-	971	3	FSM	ENSMUSG00000097583.3	ENSMUST00000181813.2	1032	3	79	-18	79	18	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAAGAAGCCAAAATGTA	6808	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40848479	40840313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_40841144_40841989_40842034_40848382
tx.11797	chr3	+	2511	13	FSM	ENSMUSG00000037818.17	ENSMUST00000108077.10	3277	13	-61	827	-2	3	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	7.57554545157567	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGGGTTCTGTCAGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40848695	40890745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_40848879_40859320_40859429_40860306_40860392_40864937_40865039_40871120_40871200_40871306_40871392_40873812_40873841_40877847_40877987_40884571_40884662_40885315_40885418_40887958_40888338_40889301_40889465_40889776
tx.11798	chr3	+	823	6	FSM	ENSMUSG00000037818.17	ENSMUST00000203892.2	1021	6	-75	273	-7	49	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	3.2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGTTTATGCCCTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40848704	40871582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_40848879_40859320_40859429_40860306_40860392_40864937_40865039_40871120_40871200_40871306
tx.11799	chr3	+	1253	6	ISM	ENSMUSG00000025762.17	ENSMUST00000191805.7	1705	10	16842	-4	-4164	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_3	7.11617874986288	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTTAAGGGCTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40921907	40932232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_40921941_40924325_40924470_40924885_40925052_40926795_40926941_40930935_40931111_40931642
tx.118	chr1	-	1405	5	FSM	ENSMUSG00000042111.10	ENSMUST00000042493.10	1705	5	300	0	300	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_1	5.33853912601566	776	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGCTCTCATTTTATTTT	7504	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34478453	34475750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_34476692_34476807_34476940_34477930_34478014_34478123_34478228_34478308
tx.11800	chr3	-	1582	3	FSM	ENSMUSG00000049940.8	ENSMUST00000058578.8	3007	3	257	1168	257	1026	multi-exon	FALSE	canonical	3	569	junction_2	17	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCTCGAGTCGGACTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41037224	41021928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_41023160_41024714_41024871_41037029
tx.11801	chr3	-	607	2	NNC	ENSMUSG00000097639.3	novel	2161	2	NA	NA	-4	-1439	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	175	junction_1	0	1467	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTAGGACTCTTAACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41447631	41439897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_41440396_41447522
tx.11802	chr3	-	562	2	NNC	ENSMUSG00000097639.3	novel	986	2	NA	NA	-11	-1439	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTAGGACTCTTAACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41447638	41439897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_41440396_41447574
tx.11803	chr3	-	1107	2	FSM	ENSMUSG00000097639.3	ENSMUST00000199155.2	2161	2	-8	1062	-6	63	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_1	0	316	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGATTTGTCAATTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41447633	41443175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_41444172_41447522
tx.11804	chr3	+	2876	11	FSM	ENSMUSG00000025764.15	ENSMUST00000026865.15	5481	11	1	2604	1	202	multi-exon	FALSE	canonical	3	683	junction_7	54.3710400856927	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACAAATGAAGTAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41510166	41568695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_41510255_41535629_41535708_41543368_41543458_41546117_41546276_41548201_41548390_41551049_41551262_41554456_41554625_41555801_41555919_41558904_41559427_41564237_41564356_41567557
tx.11805	chr3	+	2790	10	ISM	ENSMUSG00000025764.15	ENSMUST00000170711.8	2896	11	17586	-202	337	202	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	683	junction_6	57.1381259064275	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACAAATGAAGTAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41535627	41568695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_41535708_41543368_41543458_41546117_41546276_41548201_41548390_41551049_41551262_41554456_41554625_41555801_41555919_41558904_41559427_41564237_41564356_41567557
tx.11806	chr3	+	1695	3	ISM	ENSMUSG00000025764.15	ENSMUST00000170711.8	2896	11	40946	-202	2123	202	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	776	junction_1	7.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACAAATGAAGTAACTTT	3253	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41558987	41568695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_41559427_41564237_41564356_41567557
tx.11807	chr3	+	802	6	NIC	ENSMUSG00000025766.15	novel	3574	7	NA	NA	-15	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_4	13.0384048104053	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCATATTTTGTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41697073	41713369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_41697125_41699130_41699248_41700982_41701164_41703107_41703169_41710483_41710565_41713058
tx.11808	chr3	+	967	7	NIC	ENSMUSG00000025766.15	novel	3574	7	NA	NA	-2	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	10	junction_6	13.8132384166623	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCATATTTTGTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41697043	41713369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_41697125_41700982_41701164_41703107_41703169_41708023_41708076_41708158_41708359_41710483_41710565_41713058
tx.11809	chr3	+	793	6	FSM	ENSMUSG00000025766.15	ENSMUST00000108065.9	3452	6	-1	2660	-1	-61	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	11.0199818511647	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTCTCCACACTTGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41697047	41710705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_41697125_41700982_41701164_41703107_41703169_41708023_41708076_41708158_41708359_41710483
tx.11810	chr3	+	868	7	FSM	ENSMUSG00000025766.15	ENSMUST00000146165.8	3574	7	23	2683	-13	-75	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	8.72576007513895	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTTTACTTAATTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41697075	41710691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_41697125_41699130_41699248_41700982_41701164_41703107_41703169_41708023_41708076_41708158_41708359_41710483
tx.11811	chr3	+	1072	8	NIC	ENSMUSG00000025766.15	novel	4129	8	NA	NA	3	4	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	2	10	junction_7	11.8648855959121	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCATATTTTGTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41697055	41713369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_41697125_41699130_41699248_41700982_41701164_41703107_41703169_41708023_41708076_41708158_41708359_41710483_41710565_41713058
tx.11812	chr3	+	1051	6	FSM	ENSMUSG00000025766.15	ENSMUST00000194346.6	744	6	14	-321	14	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	7.2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGTCAGAAACCTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41699118	41710911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_41699248_41700982_41701164_41703107_41703169_41708023_41708076_41708158_41708359_41710483
tx.11813	chr3	+	1033	5	FSM	ENSMUSG00000049100.16	ENSMUST00000171554.8	7273	5	3193	3047	-1034	-3047	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGTGTCCTAGACTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45336033	45354033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_45336319_45337965_45338025_45338534_45338642_45347003_45347310_45353757
tx.11814	chr3	-	2825	2	FSM	ENSMUSG00000090919.7	ENSMUST00000195436.2	723	2	-38	-2064	-38	2064	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAAAAAAAAAATATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46402414	46399062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_46401725_46402251
tx.11815	chr3	-	592	2	FSM	ENSMUSG00000037910.3	ENSMUST00000036023.3	593	2	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAAGTTTAGATGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48563536	48560166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_48560355_48563132
tx.11816	chr3	-	487	2	Intergenic	novelGene_927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATAGGAACTATGGCAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49335633	49331835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_49332293_49335603
tx.11817	chr3	-	190	1	Intergenic	novelGene_928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCCATAGTGTAGTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49421896	49421706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_49421700_49421900
tx.11818	chr3	+	1093	4	Intergenic	novelGene_929	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGTTGTCTTCTGATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51103418	51107108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_51103596_51104932_51105034_51105819_51106307_51106780
tx.11819	chr3	-	2857	7	FSM	ENSMUSG00000037174.19	ENSMUST00000108051.8	2514	7	92	-435	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_6	34.1987654098149	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTGGTTTTGGTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51184843	51162650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_51164407_51164845_51165197_51166592_51166786_51168419_51168507_51172289_51172428_51174173_51174288_51184625
tx.1182	chr10	+	2293	5	NNC	ENSMUSG00000061759.16	novel	2429	5	NA	NA	-14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	80.5927260985754	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTCACTGGTTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4382605	4405140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_4382712_4384827_4384934_4389491_4389741_4400646_4400810_4403471
tx.11820	chr3	-	2947	7	FSM	ENSMUSG00000037174.19	ENSMUST00000108053.9	2611	7	99	-435	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_5	57.3626378596925	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTGGTTTTGGTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51184897	51162650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_51164407_51164845_51165197_51166592_51166786_51168419_51168507_51172289_51172464_51174173_51174288_51184625
tx.11821	chr3	-	527	3	ISM	ENSMUSG00000037174.19	ENSMUST00000108051.8	2514	7	34	9205	34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	154	junction_2	12	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGAGTGTGCGTCACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51184901	51172290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_51172428_51174173_51174288_51184625
tx.11822	chr3	-	563	3	ISM	ENSMUSG00000037174.19	ENSMUST00000091144.11	2366	6	-65	9207	34	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	34.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGAGTGTGCGTCACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51184901	51172290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_51172464_51174173_51174288_51184625
tx.11823	chr3	-	1231	4	FSM	ENSMUSG00000037161.15	ENSMUST00000038154.12	1232	4	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	186	junction_2	9.84321537348893	241	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTCTAGTCTTTCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51303968	51295832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_51296745_51298646_51298741_51299245_51299350_51303847
tx.11824	chr3	-	429	4	FSM	ENSMUSG00000037152.12	ENSMUST00000038108.12	1249	4	31	789	7	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	5471	junction_1	421.328322755017	15461	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCACTGGTCAGTGCTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51316378	51312886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_51313041_51314756_51314834_51315565_51315670_51316284
tx.11825	chr3	+	525	3	ISM	ENSMUSG00000063273.12	ENSMUST00000192523.6	629	7	-312	33185	-32	-4478	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	512	junction_1	21.5	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAAGCTTATGAATTGGT	NA	False	NA	-97	True	NA	NA	NA	51323404	51345806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_51323798_51343635_51343721_51345759
tx.11826	chr3	+	2213	15	ISM	ENSMUSG00000063273.12	ENSMUST00000029303.13	6090	20	-28	14777	-28	-1850	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	512	junction_1	35.8955400560901	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGGATGATGATGACGA	NA	False	NA	-93	True	NA	NA	NA	51323408	51368629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_51323798_51343635_51343721_51345759_51345865_51349326_51349485_51350156_51350292_51351218_51351373_51354067_51354188_51355761_51355858_51355973_51356081_51358730_51358804_51363254_51363425_51364718_51364872_51366042_51366172_51367367_51367582_51368504
tx.11827	chr3	+	4147	20	FSM	ENSMUSG00000063273.12	ENSMUST00000029303.13	6090	20	-11	1954	-11	1813	multi-exon	FALSE	canonical	3	462	junction_18	45.4091281535727	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTGTGAATATTTCCACT	NA	False	NA	-76	True	NA	NA	NA	51323425	51381452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_51323798_51343635_51343721_51345759_51345865_51349326_51349485_51350156_51350292_51351218_51351373_51354067_51354188_51355761_51355858_51355973_51356081_51358730_51358804_51363254_51363425_51364718_51364872_51366042_51366172_51367367_51367582_51368504_51368699_51370684_51370794_51373014_51373114_51377506_51377651_51378905_51379004_51380020
tx.11828	chr3	+	1267	6	ISM	ENSMUSG00000063273.12	ENSMUST00000029303.13	6090	20	-36	31801	-36	293	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	512	junction_1	37.1860188780676	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGCTTTTGATTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51323400	51351605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_51323798_51343635_51343721_51345759_51345865_51349326_51349485_51350156_51350292_51351218
tx.11829	chr3	+	2921	2	FSM	ENSMUSG00000027739.10	ENSMUST00000054387.8	3492	2	242	329	242	-329	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGAAGCGTTTCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51391628	51403324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_51392002_51400776
tx.11830	chr3	+	552	4	Intergenic	novelGene_931	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTGGTCATGGTATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51498274	51503835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_51498409_51503177_51503355_51503495_51503603_51503701
tx.11831	chr3	+	1312	4	Intergenic	novelGene_932	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	10.6770782520313	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGGAAGAAATCCAGAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51509158	51533499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_51509432_51518972_51519090_51532025_51532159_51532710
tx.11832	chr3	+	1187	3	Intergenic	novelGene_934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	5.5	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAAGGGGGAAGAAATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51509160	51533493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_51509432_51532025_51532159_51532710
tx.11833	chr3	+	1065	3	Intergenic	novelGene_935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	12.5	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAAGGGGGAAGAAATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51509160	51533493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_51509310_51532025_51532159_51532710
tx.11834	chr3	+	876	5	NNC	ENSMUSG00000074604.10	novel	2803	3	NA	NA	-11815	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	5.40254569624358	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTGCTGTGGCTTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51555965	51590096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_51556367_51571931_51572032_51584985_51585057_51589217_51589300_51589874
tx.11835	chr3	+	516	4	FSM	ENSMUSG00000074604.10	ENSMUST00000162125.8	351	4	-9	-156	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	6.18241233033047	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTGCTGTGGCTTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51579326	51590096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_51579468_51584985_51585057_51589217_51589300_51589874
tx.11836	chr3	-	2918	19	FSM	ENSMUSG00000027742.14	ENSMUST00000036665.10	3182	19	17	247	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	106	junction_7	14.5610676585896	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTGTAGTATTTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52924641	52889542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_52890613_52893821_52893902_52896530_52896585_52897379_52897488_52900175_52900344_52900860_52900993_52903428_52903547_52905677_52905770_52907901_52907967_52909666_52909759_52909833_52909963_52914666_52914761_52916473_52916545_52916893_52916977_52917996_52918109_52920326_52920386_52921235_52921308_52922889_52923034_52924466
tx.11837	chr3	-	451	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048332.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53026128	53020955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_53021169_53025890
tx.11838	chr3	-	1633	7	FSM	ENSMUSG00000042997.14	ENSMUST00000056749.14	5047	7	-3	3417	-3	-3412	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_4	5.77350269189626	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGATTGTGTTGGGGTGCGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53370756	53359420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_53360071_53360962_53361076_53363846_53363939_53365905_53366107_53369052_53369201_53369732_53369886_53370480
tx.11839	chr3	-	931	5	FSM	ENSMUSG00000027746.14	ENSMUST00000148338.8	381	5	19	-569	19	569	multi-exon	FALSE	canonical	3	324	junction_3	16.1012421881046	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTCTTTTTGAGGATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53771091	53764673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_53765417_53766662_53766696_53767654_53767695_53768635_53768694_53771034
tx.11840	chr3	-	990	6	FSM	ENSMUSG00000027746.14	ENSMUST00000146598.8	4890	6	23	3877	23	569	multi-exon	FALSE	canonical	3	324	junction_3	16.7737890770094	1540	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTCTTTTTGAGGATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53771228	53764673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_53765417_53766662_53766696_53767654_53767695_53768635_53768694_53771034_53771092_53771169
tx.11841	chr3	-	984	5	NIC	ENSMUSG00000027746.14	novel	290	6	NA	NA	23	561	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	152.884556119969	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTAAACCAGTCTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53771228	53764681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_53765417_53767619_53767695_53768635_53768694_53771034_53771092_53771169
tx.11842	chr3	+	1258	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069014.5	novel	1488	1	NA	NA	-23	17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCAACATGCTTAGTCAT	5417	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54388835	54390363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_54389497_54389766
tx.11843	chr3	+	1373	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069014.5	novel	1488	1	NA	NA	-24	11	multi-exon	TRUE	canonical	1	105	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAATGTTCAACATGCTT	5416	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54388834	54390357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_54389635_54389784
tx.11844	chr3	+	1271	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069014.5	novel	1488	1	NA	NA	-18	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTTCAACATGCTTAGT	5422	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54388840	54390360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_54389518_54389766
tx.11845	chr3	+	1383	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069014.5	novel	1488	1	NA	NA	-22	14	multi-exon	FALSE	canonical	1	168	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTTCAACATGCTTAGT	5418	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54388836	54390360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_54389605_54389745
tx.11846	chr3	+	1198	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069014.5	novel	1488	1	NA	NA	-15	17	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCAACATGCTTAGTCAT	5425	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54388843	54390363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_54389551_54389872
tx.11847	chr3	+	1154	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069014.5	novel	1488	1	NA	NA	-24	17	multi-exon	FALSE	canonical	2	161	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCAACATGCTTAGTCAT	5416	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54388834	54390363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_54389551_54389925
tx.11848	chr3	-	919	10	ISM	ENSMUSG00000027752.16	ENSMUST00000029316.16	1300	11	1056	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1829	junction_6	127.661976511856	1166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTAGTCCTTACGTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54641758	54636098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_54636315_54636614_54636722_54637185_54637307_54638495_54638593_54639401_54639448_54639532_54639639_54640120_54640167_54641078_54641153_54641523_54641588_54641716
tx.11849	chr3	-	955	11	FSM	ENSMUSG00000027752.16	ENSMUST00000029316.16	1300	11	345	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1645	junction_10	187.140588863026	7121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTAGTCCTTACGTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54642469	54636098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_54636315_54636614_54636722_54637185_54637307_54638495_54638593_54639401_54639448_54639532_54639639_54640120_54640167_54641078_54641153_54641523_54641588_54641716_54641754_54642428
tx.11850	chr3	+	1093	10	FSM	ENSMUSG00000036632.10	ENSMUST00000044567.4	1471	10	20	358	0	-358	multi-exon	FALSE	canonical	3	432	junction_5	39.5777091521022	1803	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCCTTTGTATATTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54642979	54656858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_54643071_54646202_54646375_54646682_54646730_54648799_54648869_54649567_54649661_54652018_54652133_54652527_54652588_54653886_54654039_54656028_54656115_54656649
tx.11851	chr3	-	657	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027796.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTCCAGCAGAATTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54693702	54687262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_54687821_54693603
tx.11852	chr3	+	825	4	NNC	ENSMUSG00000027796.3	novel	5368	6	NA	NA	30690	-3640	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.84754619472471	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACGTTTATATCACCGTT	598	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54693692	54705038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_54693779_54696606_54696829_54701652_54701910_54704778
tx.11853	chr3	-	766	3	FSM	ENSMUSG00000036615.8	ENSMUST00000044373.6	2162	3	318	1078	-53	28	multi-exon	FALSE	canonical	3	271	junction_1	17.5	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTCATATCACTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54714894	54711613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_54711997_54712780_54712889_54714619
tx.11854	chr3	-	1550	9	NIC	ENSMUSG00000027793.7	novel	1564	9	NA	NA	14	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	6	junction_8	1.65359456941537	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGGGGCTCTTTACTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54962444	54952889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_54953130_54953387_54953522_54954629_54954744_54955828_54956034_54957098_54957323_54957966_54958092_54958269_54958517_54961753_54961940_54962369
tx.11855	chr3	-	1554	9	FSM	ENSMUSG00000027793.7	ENSMUST00000029368.7	1560	9	12	-6	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3.25720355519885	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGGGGCTCTTTACTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54962464	54952889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_54953130_54953387_54953522_54954629_54954744_54955828_54956034_54957098_54957323_54957966_54958092_54958269_54958517_54961753_54961940_54962385
tx.11856	chr3	+	3767	9	FSM	ENSMUSG00000036580.16	ENSMUST00000044116.14	3770	9	-5	8	-5	-3	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	65.469339197826	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGGGCCTCAGATGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55019523	55044735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_55019639_55024404_55025217_55029020_55029219_55032175_55032347_55033954_55034076_55034915_55035111_55035637_55035797_55035919_55036011_55042830
tx.11857	chr3	+	2494	10	NNC	ENSMUSG00000036580.16	novel	3770	9	NA	NA	0	-1349	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	79.9825598273974	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAACCTATTTTTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55019533	55043383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_55019639_55022902_55022992_55024404_55025217_55029020_55029219_55032175_55032347_55033954_55034076_55034915_55035111_55035637_55035797_55035919_55036011_55042830
tx.11858	chr3	+	2354	11	FSM	ENSMUSG00000027794.5	ENSMUST00000029369.5	2364	11	7	3	7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	238	junction_8	29.6317397396778	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAGTGTGCAAGGAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55089455	55117375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_55089536_55096541_55096757_55097730_55097793_55097874_55097980_55099659_55099757_55102493_55102605_55104147_55104296_55104418_55104508_55111754_55111877_55115013_55115271_55116307
tx.11859	chr3	+	2279	10	ISM	ENSMUSG00000027794.5	ENSMUST00000029369.5	2364	11	7091	0	7091	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	238	junction_7	18.6070476492705	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTGTGCAAGGAATCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55096539	55117378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_55096757_55097730_55097793_55097874_55097980_55099659_55099757_55102493_55102605_55104147_55104296_55104418_55104508_55111754_55111877_55115013_55115271_55116307
tx.1186	chr10	-	1776	5	FSM	ENSMUSG00000019773.8	ENSMUST00000019907.8	1940	5	166	-2	166	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	762	junction_1	15.5623744974859	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATGTGTGCAGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5755434	5749157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_5749823_5750255_5750436_5751151_5751243_5751868_5752533_5755258
tx.11860	chr3	-	1905	7	FSM	ENSMUSG00000027803.15	ENSMUST00000029380.14	4697	7	-16	2808	-16	-2675	multi-exon	TRUE	canonical	3	192	junction_3	19.06494747494	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCATTGTATAGATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57483265	57365877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_57366532_57369939_57370053_57370863_57370986_57384777_57384978_57409152_57409290_57482243_57482679_57483021
tx.11861	chr3	-	613	3	ISM	ENSMUSG00000027803.15	ENSMUST00000120977.2	4533	7	112359	2938	112277	-2938	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	225	junction_1	3	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAAGCCTGCATTTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57370972	57366140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_57366532_57369939_57370053_57370863
tx.11862	chr3	-	963	5	NNC	ENSMUSG00000036513.16	novel	2992	5	NA	NA	4	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	228.435302657011	101	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTTCTAGACAGTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57559125	57553776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_57554287_57557462_57557637_57558111_57558195_57558842_57558921_57559007
tx.11863	chr3	-	975	5	FSM	ENSMUSG00000036513.16	ENSMUST00000160959.8	2992	5	10	2007	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	518	junction_3	10.5593560409714	2876	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTTCTAGACAGTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57559126	57553776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_57554298_57557462_57557637_57558111_57558195_57558842_57558921_57559007
tx.11864	chr3	-	891	4	FSM	ENSMUSG00000036513.16	ENSMUST00000041954.10	892	4	4	-3	4	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	244.439949453621	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTTCTAGACAGTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57559125	57553776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_57554298_57557462_57557637_57558842_57558921_57559007
tx.11865	chr3	+	2559	10	NIC	ENSMUSG00000036503.14	novel	2678	10	NA	NA	0	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	29	junction_5	45.5520323840878	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCACTTATATGAGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57643495	57742536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_57643622_57671677_57671804_57676460_57676542_57686803_57686930_57703618_57703717_57709867_57709959_57714442_57714549_57727927_57728022_57740384_57740466_57740906
tx.11866	chr3	+	2402	11	NNC	ENSMUSG00000036503.14	novel	2678	10	NA	NA	0	-288	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_2	55.1311164407179	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGTATTGTTCTGGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57643502	57742252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_57643622_57655311_57655456_57671677_57671804_57676460_57676542_57686803_57686930_57703618_57703707_57709867_57709959_57714442_57714549_57727927_57728022_57740384_57740466_57740906
tx.11867	chr3	+	1107	9	FSM	ENSMUSG00000036503.14	ENSMUST00000199041.2	1062	9	-45	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_8	24.8281594162757	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTCTCTTCATACAATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57643495	57740653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_57643622_57671677_57671804_57676460_57676542_57686803_57686930_57703618_57703707_57709867_57709959_57714442_57714549_57727927_57728022_57740384
tx.11868	chr3	+	2261	10	FSM	ENSMUSG00000036503.14	ENSMUST00000041826.14	2678	10	17	400	-3	-288	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_9	27.8053196793192	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGTATTGTTCTGGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57643499	57742252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_57643622_57671677_57671804_57676460_57676542_57686803_57686930_57703618_57703707_57709867_57709959_57714442_57714549_57727927_57728022_57740384_57740466_57740906
tx.11869	chr3	-	1816	3	FSM	ENSMUSG00000027805.17	ENSMUST00000066882.10	2342	3	521	5	-9	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	7	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCATTGGACTCCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57754979	57749320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_57750736_57752594_57752788_57754771
tx.1187	chr10	-	1033	7	NNC	ENSMUSG00000019774.9	novel	2588	7	NA	NA	-104	157	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	28	junction_4	8.85061203156784	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGTTGTTTTATGCAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5773650	5763054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_5763407_5764040_5764178_5765551_5765670_5767448_5767613_5768927_5768985_5770024_5770105_5773525
tx.11870	chr3	-	1644	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069008.4	novel	1252	1	NA	NA	-44	439	multi-exon	FALSE	canonical	2	86	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTCTCACCTAAGGAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58011712	58009977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_58010555_58010645
tx.11871	chr3	-	1120	3	FSM	ENSMUSG00000027808.9	ENSMUST00000029385.9	4611	3	20	3471	20	-3471	multi-exon	FALSE	canonical	3	847	junction_1	36.5	826	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTAGGGCATATTGTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58433293	58430708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_58431290_58432503_58432580_58432830
tx.11872	chr3	+	634	6	ISM	ENSMUSG00000027810.15	ENSMUST00000137469.8	1035	9	-80	4045	-80	-3833	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	689	junction_1	57.531208921767	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTGTTTTGTCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58433382	58449199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_58433508_58438507_58438578_58444954_58445030_58446948_58447068_58448460_58448561_58449054
tx.11873	chr3	+	2151	14	FSM	ENSMUSG00000027810.15	ENSMUST00000029387.15	2299	14	148	0	-73	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	611	junction_6	73.3195163601748	657	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGCCTTCAAGTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58433389	58464922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_58433508_58438507_58438578_58444954_58445030_58446948_58447068_58448460_58448561_58449054_58449138_58452415_58452490_58452648_58452794_58452920_58453038_58455813_58456386_58459989_58460104_58462955_58463073_58463993_58464060_58464541
tx.11874	chr3	-	674	2	Intergenic	novelGene_937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTTTTTTGTTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58483998	58482168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_58482386_58483541
tx.11875	chr3	+	1078	6	FSM	ENSMUSG00000075700.11	ENSMUST00000107924.3	3157	6	30	2049	30	-2049	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_4	12.1061967603372	337	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACCTGAAGTTCCCAAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58484086	58498505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_58484295_58492651_58492763_58493372_58493500_58495866_58495955_58497587_58497742_58498115
tx.11876	chr3	-	1209	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000056476.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTTGTACAAGGACAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58919609	58916419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_58917044_58919024
tx.11877	chr3	+	476	2	FSM	ENSMUSG00000027763.14	ENSMUST00000195839.6	3026	2	-51	2601	-6	-70	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTTCTCGATTTTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60408634	60436442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_60408845_60436176
tx.11878	chr3	+	1736	2	FSM	ENSMUSG00000027694.10	ENSMUST00000193411.2	182	2	-11	-1543	-11	1270	multi-exon	FALSE	canonical	3	1840	junction_1	0	1081	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGAGACTACTTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60784423	60786278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_60784468_60784586
tx.11879	chr3	-	1180	10	ISM	ENSMUSG00000027770.6	ENSMUST00000029336.6	5620	25	170	20937	170	-4760	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	420	junction_2	33.7836252248531	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGCCATCTATAAGGAACGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62414255	62396370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_62396460_62399771_62399854_62401150_62401318_62401764_62401840_62402878_62402959_62404149_62404321_62405510_62405550_62408254_62408490_62409394_62409520_62414138
tx.1188	chr10	-	890	5	ISM	ENSMUSG00000019774.9	ENSMUST00000019908.9	2588	7	4991	1168	-3164	157	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_4	10.1612007164508	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGTTGTTTTATGCAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5768919	5763054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_5763407_5764040_5764178_5765551_5765670_5767448_5767613_5768800
tx.11880	chr3	-	438	3	ISM	ENSMUSG00000027770.6	ENSMUST00000029336.6	5620	25	134	32896	134	-2976	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	475	junction_1	39	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCTAAGCTTAGATCAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62414291	62408329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_62408490_62409394_62409520_62414138
tx.11881	chr3	+	1172	3	NNC	ENSMUSG00000027820.13	novel	615	6	NA	NA	-68	-79562	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	32.5	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGTATTTTAACTTGAG	NA	False	NA	-59	True	NA	NA	NA	63148889	63155685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_63148988_63150636_63150788_63154762
tx.11882	chr3	+	3209	23	NIC	ENSMUSG00000027820.13	novel	3345	23	NA	NA	-10	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	270	junction_1	51.6275000395194	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGAATATTGAAGTTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63202858	63288521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_63203037_63207545_63207716_63208399_63208436_63234134_63234297_63235205_63235287_63235392_63235489_63235590_63235710_63237070_63237137_63247436_63247572_63249327_63249430_63250917_63251055_63251162_63251257_63252545_63252675_63253474_63253574_63254557_63254639_63256038_63256143_63266326_63266386_63269352_63269473_63272182_63272317_63272417_63272484_63275899_63275996_63276300_63276378_63287653
tx.11883	chr3	+	1024	9	NIC	ENSMUSG00000027820.13	novel	3345	23	NA	NA	1	-4477	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	270	junction_1	55.9797675504284	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCCAATGTAACACATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63202869	63247563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_63203037_63207545_63207716_63208399_63208436_63234134_63234297_63235205_63235287_63235392_63235489_63235590_63235710_63237070_63237137_63247436
tx.11884	chr3	-	1570	5	NNC	ENSMUSG00000048581.13	novel	1640	5	NA	NA	-7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.2294017814916	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTTTCTGAGATCACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63836819	63822104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_63823160_63827617_63827783_63832754_63832903_63834684_63834745_63836677
tx.11885	chr3	-	665	4	ISM	ENSMUSG00000048581.13	ENSMUST00000061706.7	1640	5	74	5363	-7	3970	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	5.73488351136175	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGGCTATTTATTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63836819	63827467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_63827783_63832754_63832903_63834684_63834745_63836677
tx.11886	chr3	-	2969	6	FSM	ENSMUSG00000027822.17	ENSMUST00000029402.15	3150	6	181	0	79	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_5	11.3666177907063	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAAAGCTGTTTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63872008	63849750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_63850838_63851986_63852203_63854989_63855108_63855492_63855678_63861234_63861426_63870836
tx.11887	chr3	+	2242	16	FSM	ENSMUSG00000027823.10	ENSMUST00000029405.8	8105	16	37	5826	37	-5826	multi-exon	FALSE	canonical	3	954	junction_10	99.4709114375767	1204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGTGTAACTGAGGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63883563	63924174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_63883732_63887556_63887739_63889831_63889947_63893020_63893119_63895079_63895184_63897575_63897770_63897937_63898104_63900611_63900764_63901220_63901395_63904227_63904334_63906022_63906139_63908933_63909060_63918977_63919094_63921674_63921806_63922845_63923019_63924053
tx.11888	chr3	+	525	4	ISM	ENSMUSG00000027823.10	ENSMUST00000029405.8	8105	16	35467	5826	35467	-5826	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1190	junction_1	67.7314960380734	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGTGTAACTGAGGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63918993	63924174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_63919094_63921674_63921806_63922845_63923019_63924053
tx.11889	chr3	+	384	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000097538.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTGGTCTGTGGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64548875	64565293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_64548932_64564965
tx.11890	chr3	-	815	5	FSM	ENSMUSG00000027828.13	ENSMUST00000029414.12	2957	5	33	2109	33	-84	multi-exon	FALSE	canonical	3	545	junction_4	56.4225132371822	503	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGAGTACCAGGGCATTT	2749	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65300011	65289184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_65289456_65290412_65290545_65295152_65295252_65298745_65298873_65299825
tx.11891	chr3	+	393	3	Intergenic	novelGene_939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTCGTCAGTGTGTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65550762	65573231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_65550864_65568846_65568949_65573041
tx.11892	chr3	+	2652	4	FSM	ENSMUSG00000074579.15	ENSMUST00000107848.8	609	4	-87	-1956	-80	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	4.32049379893857	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGTGTGTAATTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65573568	65593601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_65573733_65576510_65576600_65576924_65577035_65591312
tx.11893	chr3	+	646	3	FSM	ENSMUSG00000074579.15	ENSMUST00000099075.4	2461	3	7	1808	0	147	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	1	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTATGCGCTGGGATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65573655	65591792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_65573733_65576510_65576600_65591312
tx.11894	chr3	+	1783	10	FSM	ENSMUSG00000034544.18	ENSMUST00000065074.14	3224	10	4	1437	4	399	multi-exon	FALSE	canonical	3	299	junction_4	31.3821526695165	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCGATTTGTATCACGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66893008	67264291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_66893140_66901849_66902046_66903797_66903924_66989868_66990043_67088161_67088199_67113758_67113811_67197679_67197749_67257241_67257349_67262806_67262960_67263553
tx.11895	chr3	+	869	2	ISM	ENSMUSG00000034544.18	ENSMUST00000161726.2	3213	10	369532	1435	364527	402	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	336	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATTTGTATCACGCGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67262831	67264294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_67262960_67263553
tx.11896	chr3	+	1091	7	FSM	ENSMUSG00000048416.16	ENSMUST00000077916.12	1114	7	25	-2	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	4.04145188432738	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGTGGTTAAATTGGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67281454	67307333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_67281596_67291883_67292032_67300224_67300309_67301267_67301397_67302584_67302745_67305113_67305244_67307034
tx.11897	chr3	+	2608	18	NNC	ENSMUSG00000027774.17	novel	4078	18	NA	NA	-3	264	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_6	154.691388272057	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTATATATAATATTATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67337445	67382401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_67337656_67338982_67339136_67340687_67340821_67342837_67343043_67345878_67345996_67347434_67347590_67350887_67351043_67352105_67352191_67357011_67357154_67358631_67358734_67361002_67361060_67363905_67364044_67365220_67365304_67375139_67375303_67376798_67376944_67380795_67380957_67381885_67381940_67382051
tx.11898	chr3	-	1106	6	FSM	ENSMUSG00000047557.3	ENSMUST00000058981.3	1112	6	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_4	5.56417109729742	272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAGTCTAATTGCATTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67371253	67365330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_67365661_67365926_67365990_67368254_67368392_67368644_67368823_67369691_67369755_67370918
tx.11899	chr3	+	851	5	ISM	ENSMUSG00000027774.17	ENSMUST00000160529.2	924	7	11350	-264	11350	264	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	431	junction_1	44.6626241951814	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTATATATAATATTATATA	982	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67375161	67382401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_67375303_67376798_67376944_67380795_67380957_67381885_67381940_67382051
tx.119	chr1	+	1431	9	FSM	ENSMUSG00000026127.14	ENSMUST00000027303.14	5836	9	19	4386	19	456	multi-exon	FALSE	canonical	3	439	junction_1	56.5552826887109	1110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTGCCTAGCTCATTAC	5632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34478950	34484051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_34479009_34479121_34479231_34481990_34482075_34482458_34482569_34482643_34482777_34482849_34483005_34483077_34483173_34483276_34483351_34483438
tx.11900	chr3	-	712	2	ISM	ENSMUSG00000049404.8	ENSMUST00000054825.5	1325	6	35839	-78	35839	78	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTGTCTCTACTGTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67387017	67386226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_67386820_67386898
tx.11901	chr3	+	1984	16	FSM	ENSMUSG00000027775.10	ENSMUST00000029344.10	3011	16	27	1000	27	-1000	multi-exon	TRUE	canonical	3	661	junction_4	69.2886394407882	463	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATGATGGCTACCTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67490100	67510570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_67490311_67491976_67492030_67492930_67493044_67494633_67494677_67495250_67495319_67497163_67497273_67499902_67500006_67501631_67501731_67502100_67502213_67503501_67503559_67503926_67504084_67505360_67505459_67507272_67507386_67507925_67507974_67508654_67508713_67510027
tx.11902	chr3	+	2120	2	ISM	ENSMUSG00000027777.16	ENSMUST00000182719.8	2156	8	-18	129950	-18	-101650	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	304	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTTTTAATCCCAGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68401522	68403846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_68401703_68401906
tx.11903	chr3	+	2130	8	FSM	ENSMUSG00000027777.16	ENSMUST00000182719.8	2156	8	26	0	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	304	junction_1	72.6321455791344	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACGTCCTTTTGCTCACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68401566	68533796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_68401703_68401906_68402591_68503482_68503602_68523772_68523891_68524943_68525142_68525928_68526053_68528305_68528400_68533139
tx.11904	chr3	+	1572	7	FSM	ENSMUSG00000027777.16	ENSMUST00000170788.9	1730	7	155	3	155	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_1	136.891684675634	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATACGTCCTTTTGCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68479732	68533794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_68479997_68503482_68503602_68523772_68523891_68524943_68525142_68525928_68526053_68528305_68528400_68533139
tx.11905	chr3	+	781	3	ISM	ENSMUSG00000027777.16	ENSMUST00000170788.9	1730	7	198	9584	198	-1779	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_1	192	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGATTTGACAATGACCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68479775	68524213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_68479997_68503482_68503602_68523772
tx.11906	chr3	+	473	2	Intergenic	novelGene_940	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTAATTTACCTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68713265	68717758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_68713481_68717500
tx.11907	chr3	-	363	2	ISM	ENSMUSG00000027778.16	ENSMUST00000152502.8	2608	13	-15	76857	12	7993	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGACCCCAGATGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68911846	68901634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_68901916_68911764
tx.11908	chr3	+	1710	10	ISM	ENSMUSG00000034349.15	ENSMUST00000148385.8	4057	24	22820	0	-2545	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	677	junction_4	120.39379828989	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACAAGTTTCCTGTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68935160	68941956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_68935232_68935777_68935931_68936733_68936861_68937575_68937766_68938740_68938886_68939069_68939244_68940039_68940223_68940358_68940592_68941270_68941455_68941706
tx.11910	chr3	+	384	2	Intergenic	novelGene_942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCCCTACTTTTGGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69168229	69171308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_69168307_69171001
tx.11911	chr3	+	1345	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000090941.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCGTCACCTTTACAAAAAGA	4925	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69227344	69243128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_69228084_69242522
tx.11914	chr3	-	2221	3	FSM	ENSMUSG00000043300.3	ENSMUST00000061826.3	2028	3	50	-243	50	243	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCACCATGGAGTTGGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69506243	69481247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_69483294_69486658_69486725_69506134
tx.11916	chr3	+	1764	16	FSM	ENSMUSG00000027787.15	ENSMUST00000029358.15	9135	16	45	7326	-2	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	839	junction_3	66.7311687960648	1219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTGTGAAGGTTTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69629362	69656380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_69629456_69629741_69629800_69631589_69631725_69633693_69633791_69636670_69636752_69637737_69637867_69638897_69638989_69642378_69642458_69643325_69643423_69647252_69647371_69648841_69648988_69650848_69650962_69652545_69652619_69654061_69654169_69655630_69655702_69656104
tx.11917	chr3	+	667	6	ISM	ENSMUSG00000027787.15	ENSMUST00000029358.15	9135	16	19643	7326	-4804	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	898	junction_3	50.0135981509029	690	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTGTGAAGGTTTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69648960	69656380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_69648988_69650848_69650962_69652545_69652619_69654061_69654169_69655630_69655702_69656104
tx.11918	chr3	+	643	5	ISM	ENSMUSG00000027787.15	ENSMUST00000029358.15	9135	16	21528	7326	-2919	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	898	junction_2	55.4571906969691	1769	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTGTGAAGGTTTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69650845	69656380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_69650962_69652545_69652619_69654061_69654169_69655630_69655702_69656104
tx.11919	chr3	-	475	4	NNC	ENSMUSG00000034151.14	novel	2467	17	NA	NA	76410	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.63299316185545	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGAGAGTATCAATGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74974600	74945201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_74945397_74947190_74947327_74968839_74968963_74974579
tx.11920	chr3	-	1394	8	FSM	ENSMUSG00000027835.12	ENSMUST00000161137.8	1927	8	47	486	2	300	multi-exon	FALSE	canonical	3	1188	junction_3	125.646735098117	2122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTTTTGTCCTTAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75464116	75424282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_75424909_75428008_75428092_75428337_75428417_75434894_75435022_75436116_75436235_75440847_75440902_75448466_75448686_75464028
tx.11921	chr3	+	1615	9	FSM	ENSMUSG00000027834.16	ENSMUST00000029423.9	4091	9	-21	2497	-21	-2497	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	2.1650635094611	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTTTTTTTCATTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75464832	75548305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_75464950_75520386_75520655_75521760_75521992_75523874_75524070_75526425_75526631_75531165_75531264_75545224_75545312_75547555_75547646_75547981
tx.11922	chr3	+	776	5	ISM	ENSMUSG00000027834.16	ENSMUST00000029423.9	4091	9	61600	2497	61569	-2497	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	1.6393596310755	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTTTTTTTCATTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75526453	75548305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_75526631_75531165_75531264_75545224_75545312_75547555_75547646_75547981
tx.11923	chr3	-	1047	3	FSM	ENSMUSG00000099370.2	ENSMUST00000190602.2	1026	3	-17	-4	-17	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	94	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCATGGTCATGGTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75563055	75554748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_75555246_75556106_75556298_75562696
tx.11924	chr3	-	926	4	NNC	ENSMUSG00000099370.2	novel	1026	3	NA	NA	-21	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_1	82.6411250864577	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCATGGTCATGGTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75563059	75554748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_75555246_75556106_75556298_75562696_75562869_75562993
tx.11925	chr3	-	1253	3	NNC	ENSMUSG00000099370.2	novel	1026	3	NA	NA	-22	-137	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	71	junction_2	79.5	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGGTCTCCATTCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75563060	75555283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_75556298_75562696_75562869_75562993
tx.11926	chr3	-	1360	2	ISM	ENSMUSG00000099370.2	ENSMUST00000190602.2	1026	3	-9	536	-9	-142	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	230	junction_1	0	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAGGTGGTCTCCATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75563047	75555288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_75556298_75562696
tx.11927	chr3	-	1105	3	FSM	ENSMUSG00000034109.16	ENSMUST00000125405.2	817	3	-293	5	6	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	3	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACAAAAAAAAAACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75864250	75817167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_75817366_75818881_75818957_75863418
tx.11928	chr3	-	898	4	ISM	ENSMUSG00000061175.13	ENSMUST00000239298.2	2189	13	-206	31132	-206	-6572	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	39	junction_3	25.9358182185692	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATACACTACATACGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79439389	79419821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_79419906_79422409_79422557_79425371_79425499_79438849
tx.11929	chr3	-	719	2	ISM	ENSMUSG00000061175.13	ENSMUST00000239298.2	2189	13	-1	36425	-1	-11865	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTAGTGTTTTTGCCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79439184	79425114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_79425499_79438849
tx.1193	chr10	-	1035	3	ISM	ENSMUSG00000019795.18	ENSMUST00000161123.8	2607	9	23133	826	9024	-818	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	339	junction_1	213	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAGAAGCATTGGTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7515895	7505962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_7506741_7513819_7513990_7515808
tx.11930	chr3	+	1737	10	FSM	ENSMUSG00000027804.14	ENSMUST00000029382.13	1752	10	12	3	12	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2177	junction_5	219.851352699843	10182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATCTCTGGATGTCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79498683	79510954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_79498865_79500916_79501058_79502508_79502616_79504991_79505181_79506098_79506222_79506358_79506466_79507564_79507707_79509578_79509666_79509749_79509793_79510337
tx.11931	chr3	-	2244	13	FSM	ENSMUSG00000027809.15	ENSMUST00000029386.14	2377	13	118	15	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_10	10.8790701195767	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAGAGCATTTATTTATTTA	3702	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79536052	79511109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_79511473_79512211_79512434_79512936_79513120_79517105_79517275_79519218_79519363_79520928_79521070_79522306_79522454_79523230_79523309_79525613_79525733_79526145_79526228_79530044_79530275_79530847_79530986_79535824
tx.11932	chr3	-	709	3	FSM	ENSMUSG00000027809.15	ENSMUST00000149511.2	3740	3	-27	3058	-6	-3058	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACTTAAGGGTTTTTTTT	3702	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79536052	79529931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_79530275_79530847_79530986_79535824
tx.11933	chr3	+	1965	2	FSM	ENSMUSG00000027811.10	ENSMUST00000029388.10	1970	2	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_1	0	258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCGTTTCTTTAGACTCA	4374	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79536390	79540127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_79536664_79538435
tx.11934	chr3	+	1863	2	NNC	ENSMUSG00000027811.10	novel	1970	2	NA	NA	23	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCGTTTCTTTAGACTCA	4392	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79536408	79540127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_79536580_79538435
tx.11935	chr3	-	2759	12	NIC	ENSMUSG00000027956.12	novel	2898	12	NA	NA	-14	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	18	junction_3	3.82466981235684	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATTTCTTTTCTTCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79750233	79719873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_79721454_79724323_79724378_79728564_79728663_79729937_79730058_79732585_79732705_79734129_79734207_79734921_79735004_79739368_79739450_79741214_79741315_79743540_79743664_79746444_79746614_79750077
tx.11936	chr3	-	1108	6	NIC	ENSMUSG00000027956.12	novel	2898	12	NA	NA	3	4861	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	18	junction_4	4.16653333119993	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTCCACTGTAGAAAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79750216	79734507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_79735004_79739368_79739450_79741214_79741315_79743540_79743664_79746444_79746614_79750077
tx.11937	chr3	-	1727	2	ISM	ENSMUSG00000028020.17	ENSMUST00000194085.6	1341	8	61113	-1361	6279	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTGCTCTTTACTGCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80758283	80750906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_80752565_80758214
tx.11938	chr3	-	1778	3	NNC	ENSMUSG00000028020.17	novel	1341	8	NA	NA	6276	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTGCTCTTTACTGCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80758286	80750906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_80752565_80757734_80757783_80758214
tx.11939	chr3	+	1561	10	FSM	ENSMUSG00000033860.14	ENSMUST00000048486.13	1695	10	137	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	1.8324913891634	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACATTCCGTGGCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82915167	82922359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_82915290_82915459_82915505_82915680_82915865_82915954_82916049_82917370_82917502_82917762_82917897_82918651_82918837_82920070_82920349_82921444_82921615_82922141
tx.1194	chr10	-	1185	8	FSM	ENSMUSG00000019795.18	ENSMUST00000159917.8	2491	8	13	1293	13	-1293	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_1	203.876012741638	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTGGCTTTGCTTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7539054	7506437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_7506741_7513772_7513990_7515808_7515895_7516458_7516580_7520088_7520194_7523353_7523386_7524814_7524920_7538838
tx.11940	chr3	+	1781	15	FSM	ENSMUSG00000027998.12	ENSMUST00000150268.8	1851	15	7	63	-3	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	670	junction_6	49.0312790627637	1917	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTGTTTTATTTCTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82962835	82979599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_82962962_82964077_82964185_82965962_82966106_82966633_82966688_82967143_82967235_82968340_82968429_82973188_82973288_82973985_82974079_82975304_82975455_82975565_82975668_82976268_82976372_82976999_82977109_82977903_82978044_82978496_82978691_82979417
tx.11941	chr3	-	1344	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027996.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTTGTGTGTGTATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83680765	83679269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_83680427_83680578
tx.11942	chr3	-	2240	4	NNC	ENSMUSG00000027995.11	novel	3014	3	NA	NA	153	14439	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.5566238822398	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATAGTTGCAATTCTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83748921	83729139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_83730935_83738108_83738211_83748195_83748444_83748826
tx.11943	chr3	+	559	2	Intergenic	novelGene_943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTTGGCTACATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83765060	83776084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_83765430_83775894
tx.11944	chr3	-	855	7	ISM	ENSMUSG00000033767.15	ENSMUST00000052342.9	4815	34	14	62344	0	-20034	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_6	7.61577310586391	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATGCATTCTTCTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83947468	83867859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_83868105_83868824_83868942_83869604_83869729_83875464_83875534_83938915_83938960_83946621_83946693_83947283
tx.11945	chr3	-	760	7	NIC	ENSMUSG00000033752.8	novel	875	8	NA	NA	40	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	15	junction_3	79.9112354775945	309	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCCTTCTCCTCTTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84063053	83995239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_83995482_84000861_84000907_84012241_84012357_84041324_84041474_84045475_84045534_84049005_84049072_84062968
tx.11946	chr3	-	865	8	FSM	ENSMUSG00000033752.8	ENSMUST00000047368.8	875	8	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_3	22.7497476998793	3260	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCCTTCTCCTCTTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84063083	83995239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_83995482_84000861_84000907_84012241_84012357_84023733_84023809_84041324_84041474_84045475_84045534_84049005_84049072_84062968
tx.11947	chr3	+	754	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033752.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACTCTGTGTCACTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84062744	84067389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_84063077_84066661_84066812_84067117
tx.11948	chr3	+	768	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027993.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGCATTTTATAATATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84062766	84079280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_84063077_84078822
tx.11949	chr3	-	2985	7	ISM	ENSMUSG00000027993.17	ENSMUST00000065380.13	4296	12	21506	401	216	-16	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	56	junction_3	11.8801889247978	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAGGGGAGGAAGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84098639	84071044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_84072557_84074958_84075100_84078766_84078838_84080071_84080241_84084938_84085107_84085381_84085486_84097819
tx.1195	chr10	-	1130	8	FSM	ENSMUSG00000019795.18	ENSMUST00000162606.8	2757	8	318	1309	13	-1301	multi-exon	FALSE	canonical	3	339	junction_1	146.985630284746	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGAAGAGTGGCTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7539054	7506445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_7506741_7513819_7513990_7515808_7515895_7516458_7516580_7520088_7520194_7523353_7523386_7524814_7524920_7538838
tx.11950	chr3	-	2953	8	FSM	ENSMUSG00000074513.10	ENSMUST00000098990.10	2799	8	-154	0	-63	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	164	junction_6	7.88954358370519	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTTGCCCTGTCCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84489995	84403399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_84405199_84417114_84417290_84422939_84423098_84426788_84427011_84434992_84435106_84441893_84442003_84455240_84455343_84489720
tx.11951	chr3	-	684	5	ISM	ENSMUSG00000074513.10	ENSMUST00000098990.10	2799	8	-137	23509	-46	-21866	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_3	9.60143218483576	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGAAAACATTCTGAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84489978	84426908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_84427011_84434992_84435106_84441893_84442003_84455240_84455343_84489720
tx.11952	chr3	-	361	2	ISM	ENSMUSG00000074513.10	ENSMUST00000143514.3	1343	9	-46	50197	-46	-50197	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGAATACTTTACTTTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84489978	84455239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_84455343_84489720
tx.11953	chr3	+	698	3	ISM	ENSMUSG00000028086.16	ENSMUST00000029727.8	2221	11	22371	-2	22371	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_2	16	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAGAAAAAAAAAAAGAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84881823	84884954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_84881936_84883480_84883692_84884579
tx.11954	chr3	-	551	3	NNC	ENSMUSG00000085527.2	novel	1519	2	NA	NA	13	1053	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGCTGGAGAGATGGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85481239	85464433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_85464745_85480585_85480712_85481125
tx.11955	chr3	+	567	3	NNC	ENSMUSG00000028085.13	novel	1820	12	NA	NA	0	23847	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	93.5	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTGTGTTTTACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85481425	85507195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_85481627_85483170_85483322_85506980
tx.11956	chr3	+	2010	13	FSM	ENSMUSG00000028085.13	ENSMUST00000127348.8	3469	13	1	1458	1	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_6	19.0283049399806	210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGCCGTGGGTGCTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85481426	85561471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_85481627_85483170_85483322_85509166_85509281_85511687_85511887_85512321_85512445_85518658_85518773_85520769_85520855_85523921_85523967_85526130_85526321_85544230_85544365_85552276_85552356_85559587_85559723_85561030
tx.11957	chr3	+	524	2	Intergenic	novelGene_944	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTATCTATTCTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85859663	85863720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_85859926_85863458
tx.11958	chr3	-	1329	6	FSM	ENSMUSG00000049013.4	ENSMUST00000061343.4	949	6	-78	-302	-78	302	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_2	0.894427190999916	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGATGGTGTAAGGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85909876	85900814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_85901388_85904518_85904686_85905360_85905621_85907688_85907852_85908192_85908238_85909755
tx.11959	chr3	+	2338	5	ISM	ENSMUSG00000028082.15	ENSMUST00000238606.2	2623	13	36126	-1513	-4713	-633	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_4	11.5866302262565	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAGACTACACTGCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86027922	86035784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_86028040_86028440_86028494_86030452_86030640_86030992_86031091_86033901
tx.1196	chr10	-	1161	7	FSM	ENSMUSG00000019795.18	ENSMUST00000163085.8	1132	7	-29	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	667	junction_3	37.7491721763537	560	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATCATTCTTGCTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7539054	7513493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_7513990_7515808_7515895_7516458_7516580_7520088_7520194_7523353_7523386_7524814_7524920_7538838
tx.11960	chr3	-	895	6	FSM	ENSMUSG00000028081.7	ENSMUST00000029722.7	977	6	77	5	77	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	3673	junction_2	2509.92074775281	53783	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTTTGCTTCTGTCCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86049932	86045251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_86045418_86045789_86045900_86046346_86046556_86048545_86048734_86049004_86049109_86049814
tx.11961	chr3	+	1927	4	NNC	ENSMUSG00000028080.17	novel	6372	39	NA	NA	-451	-65357	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	34	junction_2	0.471404520791032	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGATTTTTTTCCCTCGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86131535	86193944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_86131791_86132375_86132812_86192303_86192536_86192940
tx.11962	chr3	-	3538	16	FSM	ENSMUSG00000028078.15	ENSMUST00000029719.14	4012	16	474	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_11	51.275031827283	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGGGGTGGGTGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86827685	86693459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_86694720_86699301_86699419_86700525_86700607_86701123_86701221_86706317_86706396_86706767_86706902_86712890_86713038_86713428_86713549_86720983_86721042_86722396_86722506_86723664_86723741_86731942_86732038_86739039_86739142_86743611_86743715_86813191_86813524_86827056
tx.11963	chr3	-	3536	16	FSM	ENSMUSG00000028078.15	ENSMUST00000195561.6	3486	16	-44	-6	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_11	36.9688156874593	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGGGGTGGGTGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86827686	86693459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_86694720_86699301_86699419_86700525_86700607_86701123_86701221_86706317_86706396_86706767_86706902_86712890_86713038_86713428_86713549_86720983_86721042_86722396_86722506_86723664_86723738_86731942_86732038_86739039_86739142_86743611_86743715_86813191_86813524_86827056
tx.11964	chr3	+	379	2	Intergenic	novelGene_945	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGAGTTCATTCTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86831019	86832015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_86831182_86831798
tx.11965	chr3	+	1534	6	FSM	ENSMUSG00000041750.14	ENSMUST00000194208.6	1527	6	-5	-2	-5	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	24.5568727650733	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTTATTGTTTTATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86893852	86897089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_86894013_86894294_86894568_86894849_86895129_86895584_86895863_86896457_86896555_86896642
tx.11966	chr3	+	1008	3	ISM	ENSMUSG00000041750.14	ENSMUST00000194208.6	1527	6	1543	-4	1508	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_2	4	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTGTTTTATTAAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86895400	86897091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_86895863_86896457_86896555_86896642
tx.11967	chr3	-	1328	3	FSM	ENSMUSG00000028076.13	ENSMUST00000107620.3	1475	3	147	0	147	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_1	1.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATCCAGAGGTTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86905107	86903140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_86903909_86903996_86904094_86904644
tx.11968	chr3	-	1861	5	ISM	ENSMUSG00000028076.13	ENSMUST00000029717.4	1946	6	371	0	-116	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_4	12.9687123493429	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATCCAGAGGTTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86906377	86903140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_86903909_86903996_86904094_86904644_86904924_86905378_86905658_86905939
tx.11969	chr3	-	991	4	ISM	ENSMUSG00000041734.16	ENSMUST00000159976.8	7236	16	174	16642	24	-10607	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_3	18.3726850393609	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATCGTAAAACAAACAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87081833	87002541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_87003094_87005048_87005214_87048283_87048427_87081702
tx.1197	chr10	+	1172	2	FSM	ENSMUSG00000040034.16	ENSMUST00000162346.2	458	2	-2	-712	-2	712	multi-exon	FALSE	canonical	3	1246	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGTATGGGGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7543275	7544767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_7543446_7543765
tx.11970	chr3	-	495	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048031.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTCTTTGCTTTCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87419983	87394322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_87394637_87419414_87419491_87419878
tx.11971	chr3	-	2063	7	FSM	ENSMUSG00000004895.10	ENSMUST00000005015.10	2099	7	27	9	27	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	312	junction_5	35.6401770789964	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGCCTACAAGGTGTCTG	2326	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87792888	87766218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_87766654_87767452_87767519_87769437_87769582_87774621_87774718_87776889_87777457_87779516_87779565_87792181
tx.11972	chr3	+	920	6	FSM	ENSMUSG00000019710.14	ENSMUST00000121920.8	1115	6	-27	222	0	-212	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_1	351.330841230883	850	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCTGCCTCTCCCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87826842	87830757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_87826959_87829123_87829356_87829437_87829534_87829694_87829799_87830241_87830373_87830516
tx.11973	chr3	+	969	6	FSM	ENSMUSG00000019710.14	ENSMUST00000019854.13	1226	6	35	222	5	-212	multi-exon	FALSE	canonical	3	263	junction_1	297.101329515706	1723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCTGCCTCTCCCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87826847	87830757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_87827013_87829123_87829356_87829437_87829534_87829694_87829799_87830241_87830373_87830516
tx.11974	chr3	+	1088	6	FSM	ENSMUSG00000019710.14	ENSMUST00000119968.8	1339	6	39	212	9	-212	multi-exon	FALSE	canonical	3	595	junction_1	165.189103756876	2199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCTGCCTCTCCCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87826851	87830757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_87827136_87829123_87829356_87829437_87829534_87829694_87829799_87830241_87830373_87830516
tx.11975	chr3	+	477	3	ISM	ENSMUSG00000019710.14	ENSMUST00000121048.2	1234	5	778	222	778	-212	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	993	junction_1	29.5	961	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCTGCCTCTCCCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87829693	87830757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_87829799_87830241_87830373_87830516
tx.11976	chr3	-	1757	8	FSM	ENSMUSG00000004896.17	ENSMUST00000005016.16	2492	8	-18	753	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	29.6922995583236	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCATGTAATTTTTATTTC	9425	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87837469	87830964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_87831220_87831650_87831836_87832253_87832739_87834037_87834182_87834361_87834425_87834869_87835063_87835230_87835356_87837162
tx.11977	chr3	-	683	2	ISM	ENSMUSG00000004896.17	ENSMUST00000160068.2	823	3	504	-1	504	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCATGTAATTTTTATTTC	237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87832078	87830964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_87831220_87831650
tx.11978	chr3	+	1797	4	FSM	ENSMUSG00000048039.9	ENSMUST00000055984.7	2893	4	201	895	201	-895	multi-exon	FALSE	canonical	3	350	junction_2	9.0921211313239	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTGTTTACTTCTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87837821	87847098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_87837919_87838637_87839583_87845880_87846082_87846544
tx.11979	chr3	+	902	4	FSM	ENSMUSG00000004885.6	ENSMUST00000005019.6	931	4	29	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	3.29983164553722	186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTCTGTGGCTCCCTGAG	8860	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87856001	87860683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_87856218_87859421_87859601_87859784_87859902_87860293
tx.1198	chr10	+	1283	8	FSM	ENSMUSG00000040034.16	ENSMUST00000040135.9	1286	8	6	-3	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1090	junction_2	84.4680835751418	1075	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATGTTGGCTTGCTGCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7543272	7554648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_7543446_7543765_7543889_7545316_7545395_7546702_7546884_7549348_7549485_7550769_7550922_7552003_7552127_7554331
tx.11980	chr3	+	1632	8	FSM	ENSMUSG00000028069.17	ENSMUST00000029707.13	1630	8	1	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_1	22.2417148068898	464	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTTTGTTTTGTTTTTGA	1720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87950415	87963300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_87950487_87958468_87958597_87958979_87959054_87959151_87959245_87959338_87959426_87961675_87961768_87962009_87962061_87962264
tx.11981	chr3	+	1760	9	FSM	ENSMUSG00000028069.17	ENSMUST00000166021.8	1768	9	8	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	81.6783898898601	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTTTGTTTTGTTTTTGA	1727	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87950422	87963300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_87950487_87950773_87950909_87958468_87958597_87958979_87959054_87959151_87959245_87959338_87959426_87961675_87961768_87962009_87962061_87962264
tx.11982	chr3	-	929	6	FSM	ENSMUSG00000028070.8	ENSMUST00000029708.8	908	6	-21	0	-21	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	839	junction_3	34.2963554915096	5126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGAGTCTTCTGGCCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87965823	87963826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_87964084_87964292_87964441_87965030_87965145_87965227_87965339_87965436_87965546_87965633
tx.11983	chr3	+	625	4	ISM	ENSMUSG00000028068.15	ENSMUST00000195465.2	3511	23	-26	20824	-18	14	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	238	junction_2	4.64279609239471	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGAAAGGGCAGCTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87989308	87994873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_87989400_87991237_87991326_87993456_87993614_87994584
tx.11984	chr3	+	511	2	ISM	ENSMUSG00000028068.15	ENSMUST00000193940.2	1564	3	-11	3195	-11	-3188	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GCGAAAAAGAAAACAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87989315	87991664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_87989400_87991237
tx.11985	chr3	-	947	3	FSM	ENSMUSG00000096935.6	ENSMUST00000181837.3	987	3	37	3	37	-3	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	2	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGTGCATTTCTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88085055	88078865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_88079566_88083157_88083243_88084893
tx.11986	chr3	-	1019	4	NNC	ENSMUSG00000096935.6	novel	987	3	NA	NA	-21	-3	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGTGCATTTCTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88085034	88078865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_88079566_88081296_88081390_88083157_88083243_88084893
tx.11987	chr3	-	776	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000097156.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTTCCCTGTGGTACTTG	5132	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88138493	88132587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_88132827_88133591_88133752_88138116
tx.11988	chr3	-	914	6	ISM	ENSMUSG00000104445.2	ENSMUST00000171887.4	1937	10	8774	250	8774	-250	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_4	1.46969384566991	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGTGCGCCTCTCCC	8072	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88153242	88150430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_88150756_88150899_88150974_88151831_88151954_88152439_88152574_88152742_88152881_88153121
tx.11989	chr3	-	486	4	FSM	ENSMUSG00000010538.15	ENSMUST00000107556.10	584	4	101	-3	-2	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	152	junction_3	20.138409955991	661	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATGGGTCTGAGTCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88204205	88190060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_88190292_88194404_88194525_88202697_88202758_88204130
tx.1199	chr10	+	1775	11	FSM	ENSMUSG00000019794.14	ENSMUST00000019929.13	1774	11	-1	0	-1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	353	junction_4	21.6323831327018	305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGTTTCAATTTAGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7601762	7638913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_7601888_7614486_7614662_7617171_7617330_7619319_7619501_7624539_7624662_7627307_7627414_7628507_7628667_7635460_7635588_7636498_7636634_7637006_7637134_7638553
tx.11990	chr3	+	1967	14	FSM	ENSMUSG00000001416.14	ENSMUST00000001452.14	1977	14	10	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2266	junction_3	121.304155843285	4202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTGTCATGTGTTTTT	3814	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88204432	88229074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_88204574_88206648_88206711_88208106_88208158_88208235_88208299_88210074_88210172_88212319_88212438_88216467_88216655_88218979_88219130_88220548_88220682_88220862_88220945_88225652_88225834_88227766_88228013_88228320_88228453_88228750
tx.11991	chr3	+	432	2	FSM	ENSMUSG00000001416.14	ENSMUST00000164122.2	472	2	43	-3	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2565	junction_1	0	924	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTGTCATGTGTTTTT	10	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88228344	88229074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_88228453_88228750
tx.11992	chr3	+	1553	6	FSM	ENSMUSG00000001418.14	ENSMUST00000177005.8	4219	6	25	2641	-7	91	multi-exon	FALSE	canonical	3	936	junction_4	66.9489357645064	1178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATGTATTTGTGAGTCTT	4020	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88232354	88235979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_88232509_88232983_88233239_88233421_88233620_88233717_88233937_88235163_88235421_88235509
tx.11993	chr3	-	1049	5	NNC	ENSMUSG00000028066.16	novel	1007	5	NA	NA	-33	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	377.05205210952	2565	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGAGGAGGTTTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88317671	88301444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_88301878_88303207_88303408_88306441_88306543_88307017_88307124_88317462
tx.11994	chr3	-	581	4	ISM	ENSMUSG00000028063.16	ENSMUST00000036252.7	1536	10	8554	-1	-151	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_3	9.67241208569794	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTGCCCTGGCCTTTCT	3911	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88392065	88390511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_88390721_88391133_88391254_88391353_88391462_88391921
tx.11995	chr3	-	628	4	FSM	ENSMUSG00000028062.16	ENSMUST00000119002.2	568	4	-59	-1	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_3	1254.14043161929	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTCACCTGCTTTC	1083	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88460225	88457125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_88457312_88458002_88458093_88459661_88459825_88460036
tx.11996	chr3	-	578	4	FSM	ENSMUSG00000028062.16	ENSMUST00000029698.15	668	4	90	0	-41	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2467	junction_3	160.918889161244	9804	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTCTCACCTGCTTTC	1067	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88460241	88457125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_88457312_88458002_88458093_88459661_88459825_88460102
tx.11997	chr3	+	1046	6	FSM	ENSMUSG00000041355.14	ENSMUST00000195014.6	1059	6	12	1	12	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3697	junction_1	473.044775893361	21114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTGTTTGTCTTGCGTCA	3569	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88486926	88495725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_88486994_88487186_88487342_88488280_88488380_88491083_88491193_88494171_88494250_88495187
tx.11998	chr3	+	989	5	FSM	ENSMUSG00000041355.14	ENSMUST00000035785.9	1189	5	199	1	199	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	4285	junction_2	286.022180083993	4984	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTGTTTGTCTTGCGTCA	3819	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88487176	88495725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_88487342_88488280_88488380_88491083_88491193_88494171_88494250_88495187
tx.11999	chr3	+	2914	14	FSM	ENSMUSG00000028060.15	ENSMUST00000029696.11	2981	14	-3	70	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	322	junction_11	33.2047619027415	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTGTCATTTCTCTTTTT	5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	88593106	88620161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_88593195_88593650_88593874_88596481_88596611_88596930_88597011_88600382_88600436_88600727_88600892_88603871_88604084_88606155_88606217_88607257_88607316_88607567_88607822_88616086_88616249_88617136_88617250_88618067_88618160_88618936
tx.12	chr1	+	1063	3	ISM	ENSMUSG00000051285.18	ENSMUST00000061280.17	5232	6	132	25516	-52	-12790	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_2	17.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATTTGTATGTGTCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159275	7218336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_7159441_7190417_7190840_7217860
tx.120	chr1	+	882	9	NNC	ENSMUSG00000026127.14	novel	5836	9	NA	NA	19	5151	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	33	junction_8	171.809305626907	188	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATACCAGTGGCCTCTCT	5632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34478950	34493588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_34479009_34479121_34479231_34481990_34482075_34482458_34482569_34482643_34482777_34482849_34483005_34483077_34483173_34483276_34483351_34493524
tx.1200	chr10	-	1541	8	FSM	ENSMUSG00000040006.14	ENSMUST00000124838.2	1525	8	-7	-9	-7	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	252	junction_3	35.482102415679	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTTTATTTTTAATTTTT	7482	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7656662	7643710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_7644350_7646120_7646285_7649061_7649196_7649711_7649869_7650981_7651134_7653537_7653635_7655066_7655127_7656524
tx.12000	chr3	+	1262	5	NIC	ENSMUSG00000028057.15	novel	1204	6	NA	NA	9	-64	intron_retention	FALSE	canonical	3	56	junction_3	7.24568837309472	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAGTGTGTGTACCGTGTG	2226	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88624153	88636970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_88624265_88624632_88624966_88633301_88633376_88633586_88633779_88636418
tx.12001	chr3	+	1145	6	FSM	ENSMUSG00000028057.15	ENSMUST00000172333.8	993	6	-35	-117	-12	-62	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	24.0881713710277	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGTGTGTACCGTGTGCA	2243	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88624170	88636972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_88624265_88624632_88624778_88624879_88624966_88633301_88633376_88633586_88633779_88636418
tx.12002	chr3	+	1116	6	FSM	ENSMUSG00000028057.15	ENSMUST00000029692.15	1204	6	26	62	-12	-62	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_4	6.67532770731145	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGTGTGTACCGTGTGCA	2243	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88624170	88636972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_88624265_88624632_88624778_88624908_88624966_88633301_88633376_88633586_88633779_88636418
tx.12003	chr3	-	1677	3	FSM	ENSMUSG00000068923.15	ENSMUST00000183267.2	1319	3	572	-930	572	930	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88669119	88653848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_88655318_88656088_88656210_88669032
tx.12004	chr3	+	709	2	ISM	ENSMUSG00000078684.9	ENSMUST00000135913.2	6190	19	49200	-392	49200	392	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGGGTCTGGTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88731722	88733286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_88731842_88732696
tx.12005	chr3	+	633	3	NIC	ENSMUSG00000054199.19	novel	7587	33	NA	NA	-3	8223	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_2	70	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTAAAAAGGGTACTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88742531	88761945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_88742597_88744296_88744828_88761908
tx.12006	chr3	-	1206	8	ISM	ENSMUSG00000068922.15	ENSMUST00000126245.2	1875	14	2119	27	194	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	691	junction_7	37.5499667110372	342	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGTGTGTAGGGACCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88819187	88816948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_88817218_88817436_88817547_88817620_88817726_88817932_88818118_88818189_88818322_88818593_88818747_88818843_88818979_88819070
tx.12007	chr3	-	1775	14	FSM	ENSMUSG00000068922.15	ENSMUST00000126245.2	1875	14	73	27	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	676	junction_13	37.3331396162909	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGTGTGTAGGGACCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88821233	88816948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_88817218_88817436_88817547_88817620_88817726_88817932_88818118_88818189_88818322_88818593_88818747_88818843_88818979_88819070_88819189_88819332_88819421_88819543_88819608_88820009_88820086_88820164_88820235_88820873_88821010_88821099
tx.12008	chr3	-	1478	13	FSM	ENSMUSG00000068921.15	ENSMUST00000090938.11	4760	13	450	2832	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	805	junction_4	46.7537134591705	1168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTGTATTGGATTTGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88857271	88830941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_88831221_88832600_88832719_88833578_88833669_88834317_88834378_88835515_88835675_88835753_88835835_88836702_88836834_88837782_88837876_88838218_88838328_88840871_88840974_88843455_88843561_88850081_88850136_88857174
tx.12009	chr3	-	1491	13	NIC	ENSMUSG00000068921.15	novel	4760	13	NA	NA	46	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	23	junction_12	242.200444994545	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTGTATTGGATTTGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88857532	88830941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_88831221_88832600_88832719_88833578_88833669_88834317_88834378_88835515_88835675_88835753_88835835_88836702_88836834_88837782_88837876_88838218_88838328_88840871_88840974_88843455_88843561_88850081_88850136_88857422
tx.1201	chr10	-	543	2	NNC	ENSMUSG00000040006.14	novel	353	2	NA	NA	-6	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTGTCCATGTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7668594	7667138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_7667359_7668271
tx.12010	chr3	-	740	6	ISM	ENSMUSG00000059743.13	ENSMUST00000196709.5	1382	11	6426	0	217	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2209	junction_1	120.112280804254	832	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGGTTTTATTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89002769	89000894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_89001151_89001537_89001673_89001758_89001837_89002166_89002240_89002320_89002410_89002660
tx.12011	chr3	-	1142	9	ISM	ENSMUSG00000059743.13	ENSMUST00000196709.5	1382	11	1054	0	481	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2209	junction_1	106.556323134763	1311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGGTTTTATTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89008141	89000894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_89001151_89001537_89001673_89001758_89001837_89002166_89002240_89002320_89002410_89002660_89002784_89002905_89002987_89006606_89006748_89007975
tx.12012	chr3	-	1195	10	FSM	ENSMUSG00000059743.13	ENSMUST00000081848.13	1237	10	42	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1662	junction_9	235.997175124336	3118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGGTTTTATTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89009224	89000894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_89001151_89001537_89001673_89001758_89001837_89002166_89002240_89002320_89002410_89002660_89002784_89002905_89002987_89006606_89006748_89007975_89008139_89009168
tx.12013	chr3	+	948	2	Intergenic	novelGene_947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGTCATCCCGTGTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89033261	89035249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_89033621_89034660
tx.12014	chr3	+	1294	8	ISM	ENSMUSG00000068917.13	ENSMUST00000128318.8	1885	12	5311	0	-1875	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	409	junction_7	61.9789299286624	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCCCCCAATCCCTGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89077596	89084228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89077717_89080683_89080851_89081503_89081599_89082251_89082382_89082464_89082548_89082698_89082779_89082951_89083043_89083700
tx.12015	chr3	+	1477	9	FSM	ENSMUSG00000028049.16	ENSMUST00000120697.8	1475	9	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	379	junction_2	249.13701049824	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACCCATTTCCTGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89084794	89090072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89084965_89085296_89085375_89086398_89086531_89086623_89086745_89087558_89087688_89088035_89088196_89088481_89088584_89089232_89089351_89089605
tx.12016	chr3	+	1477	9	FSM	ENSMUSG00000028049.16	ENSMUST00000029684.15	1489	9	12	0	-5	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	743	junction_2	141.598022585063	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACCCATTTCCTGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89084791	89090072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89084965_89085296_89085375_89086401_89086531_89086623_89086745_89087558_89087688_89088035_89088196_89088481_89088584_89089232_89089351_89089605
tx.12017	chr3	+	568	2	ISM	ENSMUSG00000028049.16	ENSMUST00000098941.5	1338	8	4423	-2	4185	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1099	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACCCATTTCCTGTATCT	463	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89089249	89090072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89089351_89089605
tx.12018	chr3	+	1784	11	FSM	ENSMUSG00000028048.12	ENSMUST00000077367.11	1779	11	0	-5	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	268	junction_1	28.1177879642051	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTGCTATCTGTGACTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89110234	89115991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89110394_89110778_89110849_89111291_89111484_89111581_89111729_89112753_89112888_89113098_89113272_89113440_89113676_89114533_89114759_89115130_89115295_89115618_89115736_89115823
tx.12019	chr3	-	1092	8	FSM	ENSMUSG00000064068.16	ENSMUST00000239452.2	1522	8	428	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	739	junction_1	39.053077434984	1750	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCAAAGAATCCCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89121214	89116389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_89116729_89116811_89116967_89117413_89117491_89117572_89117756_89117890_89117984_89119989_89120070_89120183_89120254_89121119
tx.1202	chr10	+	1467	12	ISM	ENSMUSG00000015757.11	ENSMUST00000015901.11	3471	13	22	8122	5	2139	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	222	junction_9	27.2533264328025	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTTACATTGTAATCAAG	1144	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7668676	7690777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_7668785_7671407_7671476_7671560_7671626_7673521_7673640_7674178_7674322_7675316_7675414_7676497_7676615_7677608_7677734_7680719_7680787_7683034_7683147_7686125_7686223_7690427
tx.12020	chr3	+	854	3	FSM	ENSMUSG00000028047.12	ENSMUST00000126372.2	426	3	-154	-274	-154	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	4	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTGCAATTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89132329	89134144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89132732_89133610_89133751_89133832
tx.12021	chr3	+	571	2	FSM	ENSMUSG00000028047.12	ENSMUST00000153129.2	455	2	-65	-51	-65	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTGCAATTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89133491	89134144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89133751_89133832
tx.12022	chr3	+	524	5	FSM	ENSMUSG00000042747.13	ENSMUST00000040888.12	1172	5	465	183	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1428	junction_1	178.055293378209	11788	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGTCTGTGAACTGTGA	7588	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89153737	89157030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89153823_89154084_89154240_89154371_89154436_89156380_89156448_89156877
tx.12023	chr3	+	563	5	NIC	ENSMUSG00000042747.13	novel	582	5	NA	NA	36	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	225	junction_1	697.396945791993	787	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGTCTGTGAACTGTGA	7627	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89153776	89157030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_89153901_89154084_89154240_89154371_89154436_89156380_89156448_89156877
tx.12024	chr3	+	389	2	FSM	ENSMUSG00000042737.10	ENSMUST00000040824.2	404	2	17	-2	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	539	junction_1	0	1859	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGTGTAGTTTTGAGTAT	6794	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89173875	89174386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89173914_89174035
tx.12025	chr3	-	992	6	FSM	ENSMUSG00000027953.14	ENSMUST00000029565.11	1022	6	30	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_5	11.5481600266016	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCAGAGTGATGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89177847	89175552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_89175906_89175979_89176100_89176356_89176519_89177133_89177258_89177368_89177447_89177692
tx.12026	chr3	-	976	6	NNC	ENSMUSG00000027953.14	novel	1022	6	NA	NA	-14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	9	junction_1	53.9051017993659	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCAGAGTGATGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89177847	89175552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_89175890_89175979_89176100_89176356_89176519_89177133_89177258_89177368_89177447_89177692
tx.12027	chr3	-	1703	5	NNC	ENSMUSG00000028039.12	novel	2363	5	NA	NA	1004	-581	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_4	82.3179810248041	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGAGTGTGTGTGGTTTCA	9999	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89227934	89221786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_89222875_89223114_89223193_89223376_89223443_89223769_89224060_89227753
tx.12028	chr3	-	1619	4	FSM	ENSMUSG00000028040.8	ENSMUST00000029674.8	1599	4	-21	1	-21	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	2.62466929133727	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCACCCTTCTTTGTGTGGC	1591	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89245356	89240697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_89241740_89242088_89242158_89242483_89242780_89245144
tx.12029	chr3	-	834	2	FSM	ENSMUSG00000028041.18	ENSMUST00000139705.2	507	2	-226	-101	-138	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	162	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTGCTCCTGGAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89247885	89246950	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_89247261_89247361
tx.1203	chr10	+	2873	13	FSM	ENSMUSG00000015757.11	ENSMUST00000015901.11	3471	13	26	572	-4	-572	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_12	33.3716446503115	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCAGCTTACTTTTTTCTT	1148	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7668680	7698327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_7668785_7671407_7671476_7671560_7671626_7673521_7673640_7674178_7674322_7675316_7675414_7676497_7676615_7677608_7677734_7680719_7680787_7683034_7683147_7686125_7686223_7690427_7690576_7696715
tx.12030	chr3	-	1257	2	ISM	ENSMUSG00000028042.16	ENSMUST00000107433.8	3650	3	6434	1506	6434	-1506	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATCTATCTCTGATTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89288062	89286456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_89287302_89287650
tx.12031	chr3	+	532	2	FSM	ENSMUSG00000074466.13	ENSMUST00000145400.8	923	2	391	0	271	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTGTTGTAGGGTTGTTT	5648	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89299547	89305531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89299814_89305265
tx.12032	chr3	+	383	2	FSM	ENSMUSG00000074466.13	ENSMUST00000126926.2	925	2	-15	557	-15	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTTGTTGTAGGGTTGT	7682	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89301581	89305529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89301701_89305265
tx.12033	chr3	-	1209	6	ISM	ENSMUSG00000042642.14	ENSMUST00000107426.8	2238	8	2970	415	2882	-415	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	278	junction_4	25.6780061531265	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTGGTGCCTGTTGCTCT	6708	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89316206	89310388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_89310609_89310702_89310777_89312887_89313078_89313161_89313261_89314715_89314864_89315728
tx.12034	chr3	-	1785	8	FSM	ENSMUSG00000042642.14	ENSMUST00000129308.9	2892	8	-6	1113	0	-415	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_7	45.7504321380282	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTGGTGCCTGTTGCTCT	3738	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89319176	89310388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_89310609_89310702_89310777_89312887_89313078_89313161_89313261_89314715_89314864_89315728_89316474_89318464_89318688_89319090
tx.12035	chr3	-	744	3	FSM	ENSMUSG00000028044.7	ENSMUST00000029679.4	849	3	105	0	-59	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2335	junction_2	153.5	8271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTGTGGTTATAAGACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89325585	89322778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_89323271_89323580_89323709_89325461
tx.12036	chr3	+	348	2	ISM	ENSMUSG00000047824.14	ENSMUST00000060061.11	3198	3	155	3968	-8	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	239	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTCCAATACTCAGGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89337722	89338467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89338037_89338433
tx.12037	chr3	+	1115	5	FSM	ENSMUSG00000027952.17	ENSMUST00000029564.12	1194	5	75	4	75	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	519	junction_1	43.1878165690279	1343	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCAGAGCTGGAGACTGAT	215	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89366499	89376316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89366772_89369188_89369253_89371602_89371756_89374853_89374984_89375820
tx.12038	chr3	+	545	2	ISM	ENSMUSG00000027952.17	ENSMUST00000184515.2	1156	5	8057	-3	8057	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	640	junction_1	0	478	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCAGAGCTGGAGACTGAT	7315	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89374934	89376316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89374984_89375820
tx.12039	chr3	+	689	4	NNC	ENSMUSG00000000794.10	novel	8314	2	NA	NA	-6638	-353	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0.816496580927726	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATAGGTCTTAAGATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89563186	89574715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_89563354_89568427_89568556_89570020_89570091_89574391
tx.1204	chr10	-	1216	2	Intergenic	novelGene_83	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCGTGGTCTCGCTGGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8422352	8419966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_8421034_8422203
tx.12040	chr3	-	495	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000794.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGTCCCTTTCTTAAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89574565	89573970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_89574143_89574242
tx.12041	chr3	+	1186	2	ISM	ENSMUSG00000027951.17	ENSMUST00000098924.9	5909	15	31	17517	31	776	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGTAGGCATGAGGCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89622359	89643236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89622458_89642148
tx.12042	chr3	+	609	2	ISM	ENSMUSG00000027951.17	ENSMUST00000029563.14	3753	15	19880	-3	4983	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGTAGCACAGACAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89657934	89658716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89658063_89658235
tx.12043	chr3	+	1329	12	ISM	ENSMUSG00000042572.13	ENSMUST00000196726.2	1650	13	1858	0	1858	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	945	junction_11	73.1353324973923	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTGGTCTTGACTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89683452	89690051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89683489_89683818_89683924_89684537_89684589_89686735_89686877_89687061_89687147_89687743_89687805_89687993_89688085_89688195_89688255_89688353_89688403_89688674_89688771_89689077_89689145_89689563
tx.12044	chr3	+	1185	10	ISM	ENSMUSG00000042572.13	ENSMUST00000196726.2	1650	13	2946	0	2946	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	945	junction_9	63.1506136153878	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTGGTCTTGACTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89684540	89690051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89684589_89686735_89686877_89687061_89687147_89687743_89687805_89687993_89688085_89688195_89688255_89688353_89688403_89688674_89688771_89689077_89689145_89689563
tx.12045	chr3	+	1100	9	ISM	ENSMUSG00000042572.13	ENSMUST00000196726.2	1650	13	5178	0	5178	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	945	junction_8	66.8214739062227	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTGGTCTTGACTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89686772	89690051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89686877_89687061_89687147_89687743_89687805_89687993_89688085_89688195_89688255_89688353_89688403_89688674_89688771_89689077_89689145_89689563
tx.12046	chr3	+	691	4	ISM	ENSMUSG00000042572.13	ENSMUST00000196726.2	1650	13	6768	0	6768	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	945	junction_3	53.7463177033243	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTGGTCTTGACTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89688362	89690051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89688403_89688674_89688771_89689077_89689145_89689563
tx.12047	chr3	+	659	3	ISM	ENSMUSG00000042572.13	ENSMUST00000196726.2	1650	13	7077	-5	7077	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	945	junction_2	41.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCTTGACTCATCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89688671	89690056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89688771_89689077_89689145_89689563
tx.12048	chr3	-	541	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000046280.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAATCTTCTCCTTTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89739429	89738033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_89738442_89739296
tx.12049	chr3	-	1052	6	ISM	ENSMUSG00000027944.14	ENSMUST00000198782.2	855	7	296	-172	269	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1573	junction_5	159.470373424031	542	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTTAGTCTTGGTTTTGT	7794	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89905400	89902759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_89903018_89903120_89903212_89903317_89903425_89903553_89903606_89904693_89904882_89905044
tx.1205	chr10	-	1179	2	ISM	ENSMUSG00000019790.18	ENSMUST00000136259.8	3791	7	17423	-644	6043	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAAGTGCTCAGCTCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9638649	9635680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_9636699_9638488
tx.12050	chr3	-	1118	7	FSM	ENSMUSG00000027944.14	ENSMUST00000079724.9	1139	7	14	7	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1573	junction_5	145.593040126695	2991	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTTAGTCTTGGTTTTGT	7204	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89905990	89902759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_89903018_89903120_89903212_89903317_89903425_89903553_89903606_89904693_89904882_89905044_89905311_89905834
tx.12051	chr3	+	475	4	NNC	ENSMUSG00000105552.2	novel	493	3	NA	NA	-448	-78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.43650214343336	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGAGTTGGTTCTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89905618	89908554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_89905694_89906451_89906605_89907478_89907593_89908421
tx.12052	chr3	+	1395	7	NIC	ENSMUSG00000027942.18	novel	1344	9	NA	NA	-113	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_1	175.223111742969	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCATTTCTTTAGAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89960007	89969754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_89960093_89960814_89960917_89963513_89963632_89963835_89963890_89965791_89965959_89966048_89966108_89968944
tx.12053	chr3	+	1438	7	FSM	ENSMUSG00000027942.18	ENSMUST00000162114.8	1411	7	-25	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_6	165.248718267008	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGTTGTTTGGGCTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89960123	89968303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89960427_89960814_89960917_89963513_89963632_89963835_89963890_89965791_89965959_89966048_89966108_89967668
tx.12054	chr3	+	1614	7	FSM	ENSMUSG00000027942.18	ENSMUST00000160640.8	2510	7	2	894	2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	422	junction_3	33.2549077413979	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCATTTCTTTAGAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89960122	89969754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89960427_89960814_89960917_89963513_89963632_89963835_89963890_89965791_89965959_89966048_89966108_89968944
tx.12055	chr3	+	893	2	ISM	ENSMUSG00000118506.2	ENSMUST00000238911.2	625	4	1427	-195	1427	195	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTAGGCCACAGGGCTTA	8084	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89971529	89973377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89971862_89972816
tx.12056	chr3	+	2118	8	FSM	ENSMUSG00000027940.19	ENSMUST00000029549.16	2230	8	110	2	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3249	junction_3	140.088164659085	1271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGACCGGCTTGACTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89986956	90008206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_89987171_89993752_89993887_89994761_89994880_89994980_89995052_89995707_89995784_89997103_89997167_89997316_89997387_90006834
tx.12057	chr3	+	476	2	ISM	ENSMUSG00000027939.12	ENSMUST00000029548.9	5681	40	18653	87370	18651	-87370	internal_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGATTGTGGGGCTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90030091	90031954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_90030127_90031513
tx.12058	chr3	-	574	4	FSM	ENSMUSG00000090733.7	ENSMUST00000200305.2	546	4	-24	-4	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	63	junction_3	8789.54951443285	429	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTCTTGTTTAACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90120954	90119973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90120061_90120240_90120352_90120499_90120609_90120687
tx.12059	chr3	-	343	4	FSM	ENSMUSG00000090733.7	ENSMUST00000170122.4	345	4	3	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	13930	junction_3	2970.01597451746	10946	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGTTTGTCTTGTTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90120955	90119976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90120061_90120240_90120352_90120499_90120609_90120916
tx.1206	chr10	-	1916	3	FSM	ENSMUSG00000019832.6	ENSMUST00000019974.5	2149	3	0	233	0	-233	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTGTGTTGAATGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10434009	10420978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_10422196_10426422_10426701_10433588
tx.12060	chr3	+	1104	8	FSM	ENSMUSG00000027935.15	ENSMUST00000065418.7	1107	8	5	-2	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	3.88613443106727	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCCATTTGCATTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90128098	90133278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_90128330_90129543_90129605_90130833_90130895_90131096_90131175_90131800_90131891_90132008_90132075_90132154_90132209_90132815
tx.12061	chr3	+	1094	5	FSM	ENSMUSG00000027937.16	ENSMUST00000029546.15	1101	5	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_4	18.2260116317312	869	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTAGTGTAATCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90138910	90143145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_90139348_90139501_90139540_90139735_90139819_90141229_90141310_90142689
tx.12062	chr3	+	2335	4	FSM	ENSMUSG00000052310.10	ENSMUST00000015467.9	2364	4	29	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_1	8.60232526704263	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTATGGTATCTGATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90155507	90160919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_90155567_90156252_90156471_90156632_90156764_90158992
tx.12063	chr3	+	573	4	ISM	ENSMUSG00000042390.10	ENSMUST00000049382.6	1906	10	7701	6169	-2063	-601	internal_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_3	1.69967317119759	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTCACAGGCTGCAGCCAA	2308	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90256661	90259258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_90256794_90257693_90257826_90258710_90258882_90259120
tx.12064	chr3	-	1858	9	ISM	ENSMUSG00000027932.15	ENSMUST00000132041.2	2016	10	410	-2	-273	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	73	junction_6	21.5895663458069	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGCCCATCTTCGAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90296561	90292545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_90292841_90293556_90293688_90293786_90293885_90294054_90294254_90294370_90294462_90294561_90294757_90294942_90295068_90295634_90295794_90295996
tx.12065	chr3	-	4289	30	FSM	ENSMUSG00000027933.12	ENSMUST00000029542.12	4337	30	48	0	48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_21	22.3924035870797	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTGCCTGAGTTGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90340788	90298702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90299413_90299518_90299676_90299834_90299908_90300097_90300199_90300402_90300571_90301052_90301102_90301380_90301495_90301629_90301706_90302444_90302514_90303684_90303839_90307610_90307731_90307901_90307947_90308374_90308479_90308711_90308767_90309149_90309280_90309614_90309735_90310385_90310493_90310812_90310905_90311291_90311372_90311820_90311909_90313480_90313673_90315808_90315907_90317304_90317435_90318507_90318653_90320836_90320904_90322464_90322550_90322799_90322914_90329042_90329127_90331310_90331395_90340110
tx.12066	chr3	-	1609	8	ISM	ENSMUSG00000027933.12	ENSMUST00000198562.2	2226	9	142	1873	49	-1873	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_3	15.4550038129126	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAATCAGACAAGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90340787	90317081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_90317435_90318507_90318653_90320836_90320904_90322464_90322550_90322799_90322914_90329042_90329127_90331310_90331395_90340110
tx.12067	chr3	-	740	2	FSM	ENSMUSG00000027931.13	ENSMUST00000152510.2	949	2	328	-119	328	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_1	0	483	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTCTCTTCTTGGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90358760	90357897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90358490_90358612
tx.12068	chr3	-	964	3	ISM	ENSMUSG00000027931.13	ENSMUST00000029540.13	4066	22	10769	0	2379	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	97	junction_2	38	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTCTCTTCTTGGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90362404	90357897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_90358490_90358612_90358705_90362124
tx.12069	chr3	+	1515	3	NNC	ENSMUSG00000087411.2	novel	663	4	NA	NA	-623	708	intron_retention	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACAGGATGGTGTGATA	267	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90358266	90365110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_90358727_90362372_90362550_90364232
tx.1207	chr10	+	890	2	ISM	ENSMUSG00000047648.14	ENSMUST00000129456.8	5060	3	-3	7817	-3	-5283	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	887	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACTTGAAAGACCAGGAC	7589	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11157070	11165979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_11157245_11165263
tx.12070	chr3	+	2016	14	FSM	ENSMUSG00000001016.13	ENSMUST00000001042.10	2027	14	8	3	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1252	junction_8	67.3276893371464	600	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACCAGTACAAGCATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90383461	90395683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_90383553_90384311_90384372_90384626_90384670_90387910_90388016_90388299_90388378_90388670_90388774_90390083_90390150_90391760_90391878_90392996_90393076_90393491_90393580_90394157_90394220_90394289_90394405_90394533_90394625_90394765
tx.12071	chr3	-	2095	2	FSM	ENSMUSG00000001018.16	ENSMUST00000107352.2	1843	2	-573	321	-8	23	multi-exon	FALSE	canonical	3	714	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAAAGGGTTCAGGACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90398308	90395653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90396901_90397460
tx.12072	chr3	-	1579	4	FSM	ENSMUSG00000001018.16	ENSMUST00000149884.2	1928	4	20	329	11	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	599	junction_3	50.1663898109747	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTTATTATGGTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90398320	90395669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90396901_90397460_90397580_90397854_90397902_90398138
tx.12073	chr3	-	1529	3	FSM	ENSMUSG00000001018.16	ENSMUST00000185005.2	1505	3	-17	-7	14	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_2	341	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTTATTATGGTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90398317	90395669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90396901_90397460_90397580_90398138
tx.12074	chr3	-	1341	3	ISM	ENSMUSG00000001017.16	ENSMUST00000001043.14	3257	5	6305	0	5876	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	1230	junction_2	25.5	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGGCTTTCTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90410453	90406262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_90407415_90409422_90409561_90410402
tx.12075	chr3	-	1997	6	FSM	ENSMUSG00000001017.16	ENSMUST00000049937.13	2012	6	24	-9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	892	junction_3	230.9202459725	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGGCTTTCTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90416781	90406262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90407415_90409422_90409561_90410402_90410590_90413414_90413569_90414851_90414934_90416497
tx.12076	chr3	-	1997	6	NIC	ENSMUSG00000001017.16	novel	2012	6	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	677	junction_3	303.893007487833	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGGCTTTCTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90416784	90406262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_90407415_90409422_90409561_90410402_90410587_90413414_90413569_90414851_90414934_90416497
tx.12077	chr3	-	611	3	FSM	ENSMUSG00000044080.10	ENSMUST00000060738.9	677	3	65	1	-49	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	340	junction_1	21.5	944	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCAATGTCTGTACCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90421634	90418341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90418672_90419302_90419457_90421507
tx.12078	chr3	+	451	3	ISM	ENSMUSG00000042312.11	ENSMUST00000048138.8	715	4	556	0	556	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_1	83.5	1902	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCTTATTTATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90422297	90431888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_90422327_90423156_90423350_90431659
tx.12079	chr3	+	338	3	NNC	ENSMUSG00000042312.11	novel	715	4	NA	NA	556	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	26	junction_1	185	126	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCTTATTTATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90422297	90431888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_90422327_90423269_90423350_90431659
tx.1208	chr10	+	3227	3	FSM	ENSMUSG00000047648.14	ENSMUST00000129456.8	5060	3	13	1820	13	714	multi-exon	FALSE	canonical	3	746	junction_2	70.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTTTGACTTTTTGAGGGG	7605	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11157086	11171976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_11157245_11165263_11167317_11170960
tx.12080	chr3	+	436	2	ISM	ENSMUSG00000042312.11	ENSMUST00000048138.8	715	4	1401	0	1401	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	396	junction_1	0	1874	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCTTATTTATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90423142	90431888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_90423350_90431659
tx.12081	chr3	+	1094	3	FSM	ENSMUSG00000074457.11	ENSMUST00000098911.10	1127	3	36	-3	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	6	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTTGGCTGCTTCCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90444596	90450458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_90444725_90449300_90449480_90449671
tx.12082	chr3	+	596	3	NNC	ENSMUSG00000001020.9	novel	336	2	NA	NA	-289	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCTGTTGTCTGAGAGAC	2265	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90511928	90513349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_90512066_90512303_90512460_90513046
tx.12083	chr3	+	451	2	FSM	ENSMUSG00000001020.9	ENSMUST00000142476.2	336	2	94	-209	94	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCTGTTGTCTGAGAGAC	2648	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90512311	90513349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_90512460_90513046
tx.12084	chr3	+	447	3	FSM	ENSMUSG00000001025.9	ENSMUST00000001051.9	731	3	285	-1	13	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	1	614	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATGTGTTCTGGCTTCCC	5482	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90520473	90521722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_90520534_90521049_90521212_90521497
tx.12085	chr3	+	388	2	ISM	ENSMUSG00000001025.9	ENSMUST00000198128.2	464	3	437	-1	-18	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATGTGTTCTGGCTTCCC	6057	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90521048	90521722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_90521212_90521497
tx.12086	chr3	-	2670	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000104028.2_ENSMUSG00000103286.2	novel	1206	1	NA	NA	-29	68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATCAAAGGGGAAGAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92170810	92134707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_92136028_92169460
tx.12087	chr3	-	2691	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000104028.2_ENSMUSG00000103286.2	novel	1206	1	NA	NA	-29	64	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAATCAAAGGGGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92170810	92134711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_92136028_92169435
tx.12088	chr3	-	1256	2	NNC	ENSMUSG00000042165.9	novel	1064	3	NA	NA	7	16	intron_retention	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92336723	92335356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_92335845_92335955
tx.12089	chr3	-	351	3	NNC	ENSMUSG00000102476.2	novel	2713	4	NA	NA	53346	-2299	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAATGACTATTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93319320	93216073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_93216271_93318976_93319053_93319242
tx.1209	chr10	+	527	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000045455.9	novel	613	1	NA	NA	20	2155	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATTTAGCACTAAAGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11484986	11487734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_+_11485498_11487718
tx.12090	chr3	-	1725	4	NNC	ENSMUSG00000102476.2	novel	2713	4	NA	NA	53360	-984	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.942809041582063	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAGTATCTTCCTAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93319306	93214758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_93216271_93266482_93266556_93318976_93319053_93319242
tx.12091	chr3	+	503	3	FSM	ENSMUSG00000027907.5	ENSMUST00000029515.5	511	3	9	-1	9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	443	junction_1	9.5	2275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGAGAGTCAGTAGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93427803	93433595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_93427861_93431357_93431507_93433298
tx.12092	chr3	+	650	3	FSM	ENSMUSG00000041959.15	ENSMUST00000045756.14	685	3	37	-2	37	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	427	junction_2	41.5	2188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACGTAGAGTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93462423	93471952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_93462519_93468250_93468403_93471549
tx.12093	chr3	+	415	2	FSM	ENSMUSG00000028145.10	ENSMUST00000196824.2	940	2	-14	539	-14	-539	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTGTTGCAGACTGAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94217422	94224938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_94217596_94224696
tx.12094	chr3	+	1738	6	FSM	ENSMUSG00000028145.10	ENSMUST00000049822.10	1781	6	41	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	4.47213595499958	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATATTTGCTTCTTGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94217436	94239845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_94217596_94224696_94224884_94230888_94231049_94231583_94231692_94237068_94237194_94238846
tx.12095	chr3	+	1567	5	NIC	ENSMUSG00000028145.10	novel	1781	6	NA	NA	-14	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	4	junction_1	7.81024967590665	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGCTTCTTGTTTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94217422	94239847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_94217596_94230888_94231049_94231583_94231692_94237068_94237194_94238846
tx.12096	chr3	+	1251	6	FSM	ENSMUSG00000028148.12	ENSMUST00000029794.11	1251	6	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.01980390271856	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTAGTTGATTCTTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94249405	94254659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_94249689_94250561_94250764_94251715_94251855_94253455_94253567_94253854_94253980_94254268
tx.12097	chr3	+	345	2	ISM	ENSMUSG00000028150.15	ENSMUST00000029795.10	2136	11	11	22588	11	-22394	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAAGCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94280111	94282559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_94280239_94282341
tx.12098	chr3	+	1249	6	NNC	ENSMUSG00000041912.13	novel	1231	6	NA	NA	-8	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	20.8134571851963	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTATGTGTATGTATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94320571	94333697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_94320630_94330108_94330259_94331001_94331109_94331807_94331998_94332869_94333014_94333097
tx.12099	chr3	+	1269	6	NNC	ENSMUSG00000041912.13	novel	1231	6	NA	NA	3	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	17.3505043154371	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACACATATTTTATGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94320582	94333688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_94320670_94330108_94330259_94331001_94331109_94331807_94331998_94332869_94333014_94333097
tx.121	chr1	+	1374	8	ISM	ENSMUSG00000026127.14	ENSMUST00000027303.14	5836	9	189	4386	-1	456	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	463	junction_5	50.0342739672374	323	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTGCCTAGCTCATTAC	5802	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34479120	34484051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_34479231_34481990_34482075_34482458_34482569_34482643_34482777_34482849_34483005_34483077_34483173_34483276_34483351_34483438
tx.1210	chr10	-	1398	3	Intergenic	novelGene_84	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTAGGCAAATGTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12899789	12893263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_12894260_12894545_12894627_12899468
tx.12100	chr3	+	912	3	NNC	ENSMUSG00000041912.13	novel	1231	6	NA	NA	1711	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTACACATATTTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94331817	94333685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_94331998_94332869_94333014_94333097
tx.12101	chr3	+	1623	7	FSM	ENSMUSG00000028140.14	ENSMUST00000029786.14	1612	7	2	-13	2	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	188	junction_4	26.1002341411379	513	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTCTGTGTTATTTCTT	8492	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94350633	94356028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_94350802_94350965_94351123_94351893_94352019_94352207_94352259_94353942_94354045_94354566_94354651_94355092
tx.12102	chr3	+	1534	6	NIC	ENSMUSG00000028140.14	novel	1612	7	NA	NA	-5	13	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_5	87.5337649138891	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTCTGTGTTATTTCTT	8497	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94350638	94356028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_94350802_94350965_94351123_94351893_94352019_94352207_94352259_94353942_94354045_94355092
tx.12103	chr3	+	1285	5	ISM	ENSMUSG00000028140.14	ENSMUST00000029786.14	1612	7	1275	-13	1263	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_2	7.0178344238091	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTCTGTGTTATTTCTT	9765	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94351906	94356028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_94352019_94352207_94352259_94353942_94354045_94354566_94354651_94355092
tx.12104	chr3	-	483	5	ISM	ENSMUSG00000028139.6	ENSMUST00000029785.4	630	7	649	2	-20	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTCTCTTATTTTCACTT	7909	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94380249	94372291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_94372403_94373063_94373191_94374191_94374239_94379469_94379547_94380128
tx.12105	chr3	-	2968	12	FSM	ENSMUSG00000028136.16	ENSMUST00000029783.16	6261	12	153	3140	-14	357	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	37.6139590757922	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAATACAGGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94489870	94407990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_94409373_94409476_94409537_94410162_94410292_94410765_94410916_94418348_94418439_94426354_94426519_94427494_94427574_94431492_94431598_94436218_94436284_94438503_94438697_94469075_94469308_94489551
tx.12106	chr3	-	1741	12	FSM	ENSMUSG00000028136.16	ENSMUST00000107283.8	3531	12	-17	1807	-17	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_1	30.5951975921464	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTCACTATGTCCCAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94489873	94408426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_94408579_94409476_94409537_94410162_94410292_94410765_94410916_94418348_94418439_94426354_94426519_94427494_94427574_94431492_94431598_94436218_94436284_94438503_94438697_94469075_94469308_94489551
tx.12107	chr3	-	2611	13	FSM	ENSMUSG00000005968.15	ENSMUST00000006123.11	2631	13	19	1	19	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_11	22.9474036294596	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGCCCCGTGGGTCTTTT	6460	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94566159	94520064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_94521499_94522030_94522132_94523076_94523161_94523928_94524035_94529357_94529453_94529994_94530124_94535503_94535618_94539903_94539970_94541764_94541855_94542715_94542803_94546231_94546334_94546701_94546777_94566031
tx.12108	chr3	-	2521	12	FSM	ENSMUSG00000005968.15	ENSMUST00000196733.5	2555	12	34	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_9	16.8728840118112	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTGCCCCGTGGGTCTTT	6474	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94566145	94520065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_94521499_94522030_94522132_94523076_94523161_94523928_94524035_94529357_94529453_94529994_94530124_94535503_94535618_94539903_94539970_94541764_94541855_94542715_94542803_94546231_94546334_94566031
tx.12109	chr3	+	2749	2	FSM	ENSMUSG00000085250.2	ENSMUST00000141485.2	1058	2	-1	-1690	-1	1690	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGACTCCGAAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94566266	94569112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_94566324_94566420
tx.1211	chr10	+	396	3	ISM	ENSMUSG00000019817.19	ENSMUST00000193426.6	1237	8	78	42646	78	-21665	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGATTTTGTCAAAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12936325	12960452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_12936604_12957219_12957267_12960381
tx.12110	chr3	-	273	3	ISM	ENSMUSG00000005779.13	ENSMUST00000005923.7	1183	7	1978	231	-140	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1538	junction_1	125.5	604	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGAGTTGGATTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94792294	94791634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_94791752_94791981_94792071_94792227
tx.12111	chr3	-	722	6	ISM	ENSMUSG00000005779.13	ENSMUST00000005923.7	1183	7	351	231	135	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1538	junction_1	146.048758981376	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGAGTTGGATTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94793921	94791634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_94791752_94791981_94792071_94792227_94792345_94792970_94793053_94793385_94793533_94793751
tx.12112	chr3	-	925	7	FSM	ENSMUSG00000005779.13	ENSMUST00000005923.7	1183	7	27	231	27	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1538	junction_1	134.402380931292	7656	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTGAGTTGGATTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94794245	94791634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_94791752_94791981_94792071_94792227_94792345_94792970_94793053_94793385_94793533_94793751_94793959_94794079
tx.12113	chr3	+	1713	12	FSM	ENSMUSG00000068874.14	ENSMUST00000090839.12	1712	12	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	7.58314791042644	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCAGATCACTCTGTGACG	2653	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94840365	94852069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_94840474_94844007_94844065_94844205_94844319_94844518_94844705_94845265_94845387_94846956_94847140_94847358_94847538_94849774_94849854_94849935_94850058_94851149_94851243_94851385_94851505_94851716
tx.12114	chr3	-	297	2	ISM	ENSMUSG00000087660.2	ENSMUST00000125186.2	1958	3	1515	640	1515	-640	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTTTGAGTTAAGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94867844	94866984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_94867163_94867725
tx.12115	chr3	-	562	4	ISM	ENSMUSG00000005625.16	ENSMUST00000107237.8	1332	10	8615	8	-83	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1001	junction_3	511.323337581569	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTTGCTTCAAATAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94941310	94940012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_94940296_94940792_94940858_94940943_94941076_94941228
tx.12116	chr3	-	1219	9	ISM	ENSMUSG00000005625.16	ENSMUST00000107237.8	1332	10	5868	7	-1479	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1001	junction_3	353.480882616019	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTGCTTCAAATAGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94944057	94940011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_94940296_94940792_94940858_94940943_94941076_94941228_94941338_94941876_94942093_94942252_94942322_94942548_94942636_94943120_94943236_94943915
tx.12117	chr3	-	1279	10	FSM	ENSMUSG00000005625.16	ENSMUST00000107237.8	1332	10	45	8	-17	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1001	junction_3	333.422654699207	954	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTTGCTTCAAATAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94949880	94940012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_94940296_94940792_94940858_94940943_94941076_94941228_94941338_94941876_94942093_94942252_94942322_94942548_94942636_94943120_94943236_94943915_94944057_94949818
tx.12118	chr3	-	788	2	FSM	ENSMUSG00000028126.17	ENSMUST00000107229.2	724	2	-64	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGCTTGTAGAGGAGTTG	1241	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95014198	95004353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95004630_95013686
tx.12119	chr3	+	1319	6	FSM	ENSMUSG00000008958.15	ENSMUST00000009102.9	1456	6	20	117	0	-117	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	358.969413738831	422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTCTGATGTGTAAGGT	2580	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95018352	95030245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95018526_95025535_95025689_95025959_95026075_95026441_95026619_95028572_95028718_95029689
tx.12120	chr3	-	855	7	FSM	ENSMUSG00000092607.10	ENSMUST00000172572.9	1054	7	16	183	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	365	junction_2	27.675199487387	810	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGGAGTCCGGTTCCTTG	1254	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95041306	95037029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95037195_95037474_95037670_95040135_95040225_95040327_95040423_95040510_95040600_95040868_95040940_95041155
tx.12121	chr3	-	1119	2	FSM	ENSMUSG00000013707.4	ENSMUST00000013851.4	1122	2	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGGGCTCACGGTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95049668	95046831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95047908_95049625
tx.12122	chr3	-	952	5	ISM	ENSMUSG00000038766.17	ENSMUST00000107209.8	8357	9	-50	21742	-5	-495	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_3	7.08872343937891	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCCTCACATATGCTG	8933	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95125070	95110818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95111237_95111951_95112120_95113773_95113914_95123524_95123580_95124899
tx.12124	chr3	+	992	2	ISM	ENSMUSG00000097167.2	ENSMUST00000181819.2	956	4	-21	6851	-21	-6851	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTGGTCTCCCATTTTGC	225	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95124746	95127118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_95125370_95126749
tx.12125	chr3	+	489	4	NNC	ENSMUSG00000097167.2	novel	956	4	NA	NA	523	-2733	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	4.96655480858378	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGTGTACGTGTGTGTA	769	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95125290	95131236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_95125370_95126749_95126861_95129089_95129197_95131044
tx.12126	chr3	-	1527	2	FSM	ENSMUSG00000053192.10	ENSMUST00000065482.6	1923	2	396	0	396	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGGGGCTTAGTTTTTTC	6776	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95135592	95126445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95127775_95135394
tx.12127	chr3	+	1245	5	FSM	ENSMUSG00000046722.15	ENSMUST00000053872.12	2805	5	45	1515	-33	232	multi-exon	FALSE	canonical	3	354	junction_1	33.5885024971343	477	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTTGCTATCTCTGTCTT	1919	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95136087	95142205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95136177_95139095_95139404_95139859_95139971_95140798_95140891_95141560
tx.12128	chr3	+	1156	4	ISM	ENSMUSG00000046722.15	ENSMUST00000107201.9	907	5	2830	-309	-505	229	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	380	junction_1	29.2232783924049	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCATCTTGCTATCTCTGT	1158	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95139092	95142202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_95139404_95139859_95139971_95140798_95140891_95141560
tx.12129	chr3	-	1254	2	FSM	ENSMUSG00000068860.6	ENSMUST00000090815.6	1959	2	520	185	520	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGGTCTCATTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95148389	95144415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95144541_95147260
tx.12130	chr3	-	771	3	FSM	ENSMUSG00000068860.6	ENSMUST00000107197.2	1289	3	520	-2	520	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	7.5	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGGTCTCATTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95148389	95144415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95144541_95147260_95147423_95147905
tx.12131	chr3	-	1492	10	FSM	ENSMUSG00000028115.17	ENSMUST00000107195.9	1810	10	2	316	2	238	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_9	2.53859103528797	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCTGAGTTTTAATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95158502	95148897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95149173_95150042_95150142_95150308_95150396_95151452_95151585_95152295_95152399_95152960_95153144_95155886_95156112_95157116_95157182_95157477_95157574_95158275
tx.12132	chr3	-	2835	8	FSM	ENSMUSG00000015711.9	ENSMUST00000015855.8	3140	8	305	0	305	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_5	23.7538396466589	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTTGTTTCTTTTTAAAA	4655	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95189082	95160984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95162739_95165337_95165497_95166550_95166646_95169521_95169681_95170902_95171088_95172728_95172932_95175541_95175635_95188895
tx.12133	chr3	+	2737	10	FSM	ENSMUSG00000038712.17	ENSMUST00000107187.9	2827	10	88	2	88	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	130	junction_1	26.9118359384908	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTGCGTTCCTACCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95190342	95203475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95190937_95194955_95195712_95198332_95198391_95198790_95198856_95199435_95199595_95199935_95200039_95200935_95201079_95202105_95202298_95202583_95202737_95202961
tx.12134	chr3	+	821	3	ISM	ENSMUSG00000038712.17	ENSMUST00000107187.9	2827	10	11889	2	2847	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	134	junction_1	40.5	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTGCGTTCCTACCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95202143	95203475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_95202298_95202583_95202737_95202961
tx.12135	chr3	+	796	3	ISM	ENSMUSG00000038712.17	ENSMUST00000133762.2	1373	6	2847	-5	2847	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	98.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCGTTCCTACCTTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95202143	95203477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_95202298_95202610_95202737_95202961
tx.12136	chr3	+	2039	11	FSM	ENSMUSG00000015714.12	ENSMUST00000015858.12	2216	11	150	27	-13	-27	multi-exon	FALSE	canonical	3	406	junction_10	31.9782738746168	495	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTGTGTCAGACTATTAA	4468	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95222544	95230883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95222657_95227372_95227547_95227952_95228071_95228252_95228372_95228500_95228559_95228646_95228698_95228885_95228979_95229141_95229271_95229437_95229545_95229630_95229785_95229959
tx.12137	chr3	-	856	3	ISM	ENSMUSG00000015697.15	ENSMUST00000124638.8	5652	21	32425	0	32359	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	215	junction_2	11.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTGGTCTGAAATGGTC	9129	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95232041	95230835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95231502_95231615_95231705_95231940
tx.12138	chr3	+	4372	22	NNC	ENSMUSG00000015522.19	novel	2699	22	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_11	68.3085569816557	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTTGTGTTGTGTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95341702	95404551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_95341873_95355682_95355795_95359895_95359941_95367687_95367733_95374103_95374149_95377487_95377702_95381849_95382064_95383390_95383494_95387505_95387572_95388064_95388151_95391082_95391164_95392169_95392305_95394559_95394635_95395665_95395818_95396902_95397014_95397191_95397268_95397565_95397690_95397863_95397967_95398333_95398482_95401008_95401172_95401757_95401925_95402614
tx.12139	chr3	+	375	4	FSM	ENSMUSG00000015522.19	ENSMUST00000107160.8	783	4	-34	442	4	-442	multi-exon	FALSE	canonical	3	293	junction_1	3.2659863237109	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTAGAATTCTTGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95341704	95367737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95341873_95355682_95355795_95359895_95359941_95367687
tx.1214	chr10	-	1057	6	ISM	ENSMUSG00000019814.6	ENSMUST00000019950.6	2297	11	10755	457	10015	-457	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	676	junction_1	33.9682204420544	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAATTGGTGTGCTCATTT	2271	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13058157	13054340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_13054741_13054866_13055068_13055398_13055452_13055738_13055879_13056633_13056762_13058022
tx.12140	chr3	+	1650	15	NIC	ENSMUSG00000028109.15	novel	1511	16	NA	NA	-13	181	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	40	junction_1	83.0812240877466	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTTGATATAGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95466974	95495163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_95467035_95468538_95468592_95469790_95469936_95473931_95473996_95474994_95475032_95477976_95477998_95478238_95478266_95482845_95482914_95483587_95483740_95485363_95485612_95487315_95487383_95487468_95487546_95488817_95488902_95492450_95492526_95494691
tx.12141	chr3	+	1519	15	FSM	ENSMUSG00000028109.15	ENSMUST00000029754.13	1385	15	-18	-116	-17	37	multi-exon	FALSE	canonical	3	195	junction_6	50.4359059821958	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTTTTTTAAATGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95466970	95495019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95467044_95468538_95468592_95469790_95469936_95473931_95473996_95474994_95475032_95477976_95477998_95478238_95478266_95482845_95482914_95483587_95483740_95485363_95485612_95487315_95487383_95487468_95487546_95488817_95488902_95492450_95492526_95494691
tx.12142	chr3	+	1435	14	ISM	ENSMUSG00000028109.15	ENSMUST00000171191.6	1437	15	-92	414	-91	-414	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_6	46.8710935255838	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAGAAAAGAAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95466896	95492695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_95467044_95468538_95468592_95469790_95469936_95473931_95473996_95474994_95475032_95477976_95477998_95478238_95478266_95482845_95482914_95483587_95483740_95485363_95485612_95487315_95487383_95487468_95487546_95488817_95488902_95492450
tx.12143	chr3	+	2812	5	FSM	ENSMUSG00000046519.16	ENSMUST00000177390.8	2836	5	23	1	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_3	6.87386354243376	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCTGTTCTCTCTGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95496267	95526552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95496446_95499027_95499217_95515216_95515349_95516982_95517098_95524354
tx.12144	chr3	+	666	5	NNC	ENSMUSG00000038619.13	novel	1130	4	NA	NA	-11	-1609	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	231.406568618957	68	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCATCTCCGATCTTCTCG	371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95532292	95537804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_95532488_95534059_95534186_95535851_95536019_95536546_95536610_95537689
tx.12145	chr3	+	646	5	NNC	ENSMUSG00000038619.13	novel	1130	4	NA	NA	0	-1610	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_4	225.514411956309	121	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCATCTCCGATCTTCTC	382	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95532303	95537803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_95532488_95534059_95534186_95535851_95536019_95536546_95536610_95537697
tx.12146	chr3	+	1163	4	FSM	ENSMUSG00000038619.13	ENSMUST00000058230.13	1130	4	-18	-15	0	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_3	204.491781959298	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGTTGTGAAGCAGTTG	382	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95532303	95539428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95532488_95534059_95534186_95535851_95536019_95538742
tx.12147	chr3	+	2263	3	FSM	ENSMUSG00000038619.13	ENSMUST00000037983.6	3845	3	-27	1609	0	-1609	multi-exon	FALSE	canonical	3	422	junction_2	58	157	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCATCTCCGATCTTCTCG	382	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95532303	95537804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95532488_95534059_95534186_95535851
tx.12148	chr3	+	976	3	FSM	ENSMUSG00000038612.17	ENSMUST00000037947.15	3418	3	282	2160	213	193	multi-exon	FALSE	canonical	3	754	junction_2	15.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCCCTGGAAGAGTCACTG	6699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95566380	95568327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95566799_95567071_95567320_95568017
tx.12149	chr3	+	1149	2	ISM	ENSMUSG00000038612.17	ENSMUST00000178686.2	858	4	791	-671	791	671	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	754	junction_1	0	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTTAAGAAAATTTATGAA	7277	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95566958	95568805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_95567320_95568017
tx.1215	chr10	-	1817	11	FSM	ENSMUSG00000019814.6	ENSMUST00000019950.6	2297	11	23	457	23	-457	multi-exon	FALSE	canonical	3	645	junction_7	42.5845042239545	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGAATTGGTGTGCTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13068889	13054340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_13054741_13054866_13055068_13055398_13055452_13055738_13055879_13056633_13056762_13058022_13058273_13058604_13058741_13061167_13061256_13066318_13066490_13067851_13067984_13068771
tx.12151	chr3	-	1178	4	ISM	ENSMUSG00000015850.12	ENSMUST00000015994.4	3856	18	9968	-3	-740	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_3	2.44948974278318	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCTCTTCGTTATGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95585201	95583510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95584280_95584420_95584566_95584837_95585018_95585117
tx.12152	chr3	-	535	3	ISM	ENSMUSG00000028107.15	ENSMUST00000199869.5	3614	12	8805	-2	-1	2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	554	junction_1	5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCCTTCATCTGAGT	9935	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95649459	95647285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95647632_95648633_95648749_95649385
tx.12153	chr3	-	634	4	ISM	ENSMUSG00000028107.15	ENSMUST00000199869.5	3614	12	8537	-2	-269	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	554	junction_1	4.10960933531265	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCCTTCATCTGAGT	9842	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95649727	95647285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95647632_95648633_95648749_95649385_95649459_95649627
tx.12154	chr3	-	2410	18	FSM	ENSMUSG00000028107.15	ENSMUST00000029752.15	2400	18	-8	-2	4	2	multi-exon	TRUE	canonical	1	178	junction_5	104.738626737206	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTGCCTTCATCTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95662191	95647285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95647632_95648633_95648749_95649385_95649459_95649627_95649730_95649889_95649991_95653096_95653175_95653344_95653483_95653846_95654010_95654750_95654969_95655353_95655453_95655798_95655946_95657650_95657730_95658012_95658078_95658178_95658297_95658817_95658943_95660318_95660443_95661630_95661828_95662069
tx.12155	chr3	-	3312	9	FSM	ENSMUSG00000028106.14	ENSMUST00000197449.2	3298	9	-7	-7	-7	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_5	23.6851087183488	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTCATGAATTGAGTATTG	10003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95726097	95679559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95681685_95683826_95684110_95687726_95687903_95691525_95691653_95692365_95692419_95693631_95693710_95694595_95694697_95697411_95697542_95725858
tx.12156	chr3	-	498	3	ISM	ENSMUSG00000015748.14	ENSMUST00000160155.8	2548	13	15737	-3	-1029	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	427	junction_1	25.5	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGATATTTTTCATATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95741149	95737926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95738278_95739872_95739935_95741064
tx.12157	chr3	-	550	4	ISM	ENSMUSG00000015748.14	ENSMUST00000160155.8	2548	13	15438	-3	-1328	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	427	junction_1	21.0449254902195	1653	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGATATTTTTCATATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95741448	95737926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95738278_95739872_95739935_95741064_95741149_95741395
tx.12158	chr3	-	735	5	ISM	ENSMUSG00000015748.14	ENSMUST00000160155.8	2548	13	14102	-3	193	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	427	junction_1	20.0561711201316	435	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGATATTTTTCATATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95742784	95737926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95738278_95739872_95739935_95741064_95741149_95741395_95741515_95742665
tx.12159	chr3	-	2422	16	FSM	ENSMUSG00000015748.14	ENSMUST00000015892.14	2933	16	20	491	20	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	400	junction_5	22.8428447343048	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGATATTTTTCATATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95763177	95737926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95738278_95739872_95739935_95741064_95741149_95741395_95741515_95742665_95742780_95742955_95743056_95743725_95743870_95747981_95748062_95751497_95751665_95752236_95752544_95754686_95754908_95755076_95755161_95756226_95756374_95758874_95759006_95760755_95760950_95763060
tx.1216	chr10	+	2268	7	FSM	ENSMUSG00000019810.16	ENSMUST00000121465.3	5741	7	61	3412	-22	80	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_3	15.7418409201578	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAATTATTTTATAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13376805	13391367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_13377118_13378814_13379003_13381482_13381823_13382449_13382661_13382978_13383170_13388361_13388471_13390450
tx.12160	chr3	-	413	2	FSM	ENSMUSG00000054312.7	ENSMUST00000072587.5	405	2	0	-8	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	901	junction_1	0	1577	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTTGGACATACAGAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95777931	95769957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95770245_95777805
tx.12161	chr3	-	458	3	FSM	ENSMUSG00000054312.7	ENSMUST00000067298.5	488	3	18	12	18	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	716	junction_2	92.5	3368	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCTTGGACATACAGAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95778813	95769957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95770245_95777805_95777928_95778764
tx.12162	chr3	+	339	2	FSM	ENSMUSG00000080727.3	ENSMUST00000143306.2	353	2	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTGGACTTATTGTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95778856	95782202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95778998_95782004
tx.12163	chr3	-	1427	6	NIC	ENSMUSG00000038550.11	novel	1398	6	NA	NA	19	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	53	junction_5	52.0292225580971	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95789367	95785811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_95786462_95787720_95787833_95787946_95788026_95788294_95788371_95788492_95788902_95789266
tx.12164	chr3	-	1024	5	NIC	ENSMUSG00000038550.11	novel	1939	5	NA	NA	13	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	4	junction_4	78.2959130478724	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95789373	95785811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_95786462_95787720_95787833_95787946_95788026_95788294_95788371_95789266
tx.12165	chr3	-	1014	5	FSM	ENSMUSG00000038550.11	ENSMUST00000161866.8	710	5	0	-304	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	75.7396857664461	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95789563	95785811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95786462_95787720_95787833_95787946_95788026_95788294_95788371_95789466
tx.12166	chr3	-	1424	6	FSM	ENSMUSG00000038550.11	ENSMUST00000036418.10	1398	6	-21	-5	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_5	32.3604697122894	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95789564	95785811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95786462_95787720_95787833_95787946_95788026_95788294_95788371_95788492_95788902_95789466
tx.12167	chr3	-	1111	6	NIC	ENSMUSG00000038550.11	novel	1398	6	NA	NA	2	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_5	70.7615714918769	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95789561	95785811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_95786462_95787720_95787833_95787946_95788026_95788294_95788371_95788492_95788592_95789466
tx.12168	chr3	-	810	6	FSM	ENSMUSG00000038543.14	ENSMUST00000036360.13	752	6	-54	-4	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	8.93532316147547	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCCTACTTCTTAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95799321	95791265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95791550_95792281_95792381_95795452_95795609_95796168_95796228_95797034_95797122_95799196
tx.12169	chr3	+	2056	6	FSM	ENSMUSG00000015750.16	ENSMUST00000015894.12	2863	6	-13	820	-13	23	multi-exon	FALSE	canonical	3	313	junction_4	15.0651916682132	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGGACTTGGCTTTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95801267	95804780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95801596_95802132_95802304_95802454_95802529_95802759_95802883_95803029_95803158_95803548
tx.1217	chr10	+	2028	8	FSM	ENSMUSG00000019810.16	ENSMUST00000060212.13	2007	8	64	-85	-19	85	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_7	35.0731015021425	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTATAATATTTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13376808	13391372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_13377118_13378814_13379003_13381482_13381823_13382449_13382661_13382978_13383170_13388361_13388471_13390450_13390619_13390860
tx.12170	chr3	+	1415	7	FSM	ENSMUSG00000015749.13	ENSMUST00000165307.8	3274	7	35	1824	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1451	junction_5	106.857641540301	3613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGGTGTAGTTTGGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95836592	95852878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95836963_95841220_95841371_95842087_95842211_95844335_95844508_95845193_95845352_95851618_95851674_95852491
tx.12171	chr3	+	1376	7	FSM	ENSMUSG00000015749.13	ENSMUST00000015893.13	1381	7	6	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	152	junction_5	557.690301352123	284	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGGTGTAGTTTGGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95836595	95852878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95836963_95841220_95841371_95842087_95842211_95844335_95844508_95845193_95845316_95851618_95851674_95852491
tx.12172	chr3	+	410	2	FSM	ENSMUSG00000015749.13	ENSMUST00000168471.2	502	2	135	-43	135	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1614	junction_1	0	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGGTGTAGTTTGGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95851650	95852878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95851674_95852491
tx.12173	chr3	-	2027	15	FSM	ENSMUSG00000015747.6	ENSMUST00000015891.6	2637	15	610	0	-26	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	42	junction_11	13.9571136130707	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCTTCAGTGTTTGATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95965168	95907143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95907464_95926920_95927053_95938317_95938440_95940090_95940199_95940976_95941136_95948649_95948818_95949620_95949735_95950105_95950241_95953663_95953775_95954309_95954448_95954558_95954628_95955619_95955700_95960350_95960412_95964291_95964427_95964993
tx.12174	chr3	-	404	2	FSM	ENSMUSG00000015747.6	ENSMUST00000140518.2	266	2	-137	-1	-26	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_1	0	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGGCATCATAATTATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95965168	95964197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_95964427_95964993
tx.12175	chr3	+	1543	6	FSM	ENSMUSG00000068856.4	ENSMUST00000076372.5	1915	6	200	172	-15	-172	multi-exon	FALSE	canonical	3	1297	junction_3	204.272758829953	1515	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGGTGAAGTAACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96079847	96084708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_96079924_96080286_96080416_96080856_96081400_96081638_96081846_96083950_96084125_96084294
tx.12176	chr3	-	572	2	FSM	ENSMUSG00000015943.12	ENSMUST00000016087.4	729	2	-54	211	-54	64	multi-exon	FALSE	canonical	3	441	junction_1	0	3236	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTTATTCCTTGATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96104956	96104114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96104596_96104865
tx.12177	chr3	-	793	2	ISM	ENSMUSG00000074398.6	ENSMUST00000098839.3	659	3	36	-3	36	3	intron_retention	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTGTTTTTAAACCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96465095	96463077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_96463377_96464601
tx.12178	chr3	-	660	3	FSM	ENSMUSG00000074398.6	ENSMUST00000098839.3	659	3	2	-3	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTGTTTTTAAACCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96465129	96463077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96463377_96464601_96464905_96465071
tx.12179	chr3	+	2807	8	FSM	ENSMUSG00000038393.15	ENSMUST00000074519.13	2827	8	3	17	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	279	junction_1	78.2390371795021	211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCTTTTCTTGTCTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96465275	96469182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_96465802_96466204_96466281_96466385_96466534_96466648_96466752_96466904_96467162_96467253_96467411_96467523_96467676_96467794
tx.1218	chr10	-	2023	12	FSM	ENSMUSG00000019809.17	ENSMUST00000019945.15	2129	12	87	19	68	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_6	16.7987602848376	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGCTTTGTTTAGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13428796	13399878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_13400713_13403484_13403582_13407001_13407125_13408083_13408155_13410415_13410582_13411298_13411354_13411452_13411520_13411686_13411812_13413174_13413219_13418367_13418450_13422093_13422226_13428569
tx.12180	chr3	+	2804	8	FSM	ENSMUSG00000038393.15	ENSMUST00000049093.8	2795	8	0	-9	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	228	junction_1	94.3746333956929	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCTTTTCTTGTCTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96465275	96469182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_96465802_96466207_96466281_96466385_96466534_96466648_96466752_96466904_96467162_96467253_96467411_96467523_96467676_96467794
tx.12181	chr3	+	2284	7	ISM	ENSMUSG00000038393.15	ENSMUST00000049093.8	2795	8	926	-9	-612	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	413	junction_1	39.6137602355545	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCTTTTCTTGTCTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96466201	96469182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_96466281_96466385_96466534_96466648_96466752_96466904_96467162_96467253_96467411_96467523_96467676_96467794
tx.12182	chr3	-	758	2	FSM	ENSMUSG00000028104.15	ENSMUST00000141579.2	545	2	317	-530	317	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTCTAACAGAGTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96487154	96485187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96485905_96487113
tx.12183	chr3	-	1407	8	FSM	ENSMUSG00000028104.15	ENSMUST00000091924.10	1427	8	20	0	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	65	junction_6	13.8534604827436	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTCTAACAGAGTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96501477	96485187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96485905_96487113_96487228_96487331_96487406_96487765_96487823_96488150_96488220_96488959_96489090_96489403_96489572_96501399
tx.12184	chr3	-	1245	7	FSM	ENSMUSG00000028104.15	ENSMUST00000145001.2	607	7	-8	-630	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_6	26.9794160220137	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTCTAACAGAGTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96501483	96485187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96485905_96487113_96487228_96487331_96487406_96487765_96487823_96488150_96488220_96488959_96489090_96501399
tx.12185	chr3	-	1116	6	NIC	ENSMUSG00000028104.15	novel	1427	8	NA	NA	-9	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_5	34.9777071861493	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTCTAACAGAGTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96501484	96485187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_96485905_96487113_96487228_96487331_96487406_96487765_96487823_96488150_96488220_96501399
tx.12186	chr3	+	713	6	FSM	ENSMUSG00000038374.11	ENSMUST00000196456.5	2604	6	0	1891	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2213	junction_2	872.428931202995	27366	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTATTACTTTACTGTTC	8642	False	NA	-70	True	NA	NA	NA	96537255	96539216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_96537345_96537617_96537678_96537792_96537871_96538181_96538319_96538747_96538885_96539004
tx.12187	chr3	+	710	6	FSM	ENSMUSG00000038374.11	ENSMUST00000048915.11	2608	6	7	1891	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2531	junction_2	745.762804114016	14603	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTATTACTTTACTGTTC	8642	False	NA	-70	True	NA	NA	NA	96537255	96539216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_96537345_96537617_96537678_96537795_96537871_96538181_96538319_96538747_96538885_96539004
tx.12188	chr3	+	915	5	ISM	ENSMUSG00000038354.14	ENSMUST00000122960.6	3295	14	14390	-25	4624	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_4	19.7294196569489	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATTGTTGTGGTTTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96592032	96598350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_96592491_96596461_96596552_96596760_96596827_96597507_96597613_96598154
tx.12189	chr3	+	212	2	ISM	ENSMUSG00000028101.19	ENSMUST00000162934.8	2281	14	-49	5982	9	-200	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAACACGAGCTGCTGGCC	2597	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96603708	96606808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_96603848_96606735
tx.1219	chr10	+	802	6	FSM	ENSMUSG00000019808.9	ENSMUST00000019944.9	1466	6	323	341	323	-341	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	288.190631353623	2125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCGTGAGCTCTTCCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13428960	13438779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_13429106_13432595_13432701_13435857_13436009_13437447_13437555_13438380_13438454_13438558
tx.12191	chr3	+	1460	4	ISM	ENSMUSG00000028101.19	ENSMUST00000107077.4	2695	15	6621	7	-428	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_3	29.0172362570938	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGTCATGGAGGGGAAGGG	9942	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96611053	96613282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_96611224_96611374_96611509_96611664_96611703_96612164
tx.12192	chr3	-	1148	8	FSM	ENSMUSG00000028100.12	ENSMUST00000029742.9	1039	8	-8	-101	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	22.7075461699679	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTTAAGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96615863	96613382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96613560_96613683_96613845_96614225_96614363_96614517_96614617_96614873_96614967_96615125_96615203_96615307_96615492_96615643
tx.12193	chr3	-	1100	7	NNC	ENSMUSG00000028100.12	novel	1110	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	23.4289706702336	83	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTTTTTTTTAAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96615863	96613383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_96613560_96613683_96613845_96614225_96614363_96614517_96614617_96614873_96614967_96615277_96615492_96615643
tx.12194	chr3	-	1104	7	NNC	ENSMUSG00000028100.12	novel	1110	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	23.4289706702336	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTTTTTTTTAAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96615863	96613383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_96613560_96613683_96613845_96614225_96614363_96614517_96614617_96614873_96614967_96615273_96615492_96615643
tx.12195	chr3	-	2204	15	FSM	ENSMUSG00000028099.9	ENSMUST00000029741.9	2390	15	153	33	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_5	23.0394515240839	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATATGTATCTGTTCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96634791	96618838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96619377_96620796_96620947_96621410_96621461_96621574_96621677_96622435_96622587_96622949_96623011_96623744_96623797_96623982_96624064_96626549_96626643_96626776_96626882_96629855_96629942_96630829_96631016_96631112_96631369_96633149_96633316_96634664
tx.12196	chr3	-	828	4	FSM	ENSMUSG00000028099.9	ENSMUST00000141377.8	808	4	-21	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	193	junction_1	11.8415464455544	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGGTGTGTGCCAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96634791	96630736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96631016_96631112_96631369_96633149_96633316_96634664
tx.12197	chr3	-	923	3	FSM	ENSMUSG00000028099.9	ENSMUST00000125183.2	923	3	2	-2	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_1	7.5	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGGTGTGTGCCAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96634789	96630736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96631369_96633149_96633316_96634664
tx.12199	chr3	-	1619	2	ISM	ENSMUSG00000028099.9	ENSMUST00000125183.2	923	3	0	1085	0	-1085	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	222	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96634791	96631823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_96633316_96634664
tx.122	chr1	+	485	3	NNC	ENSMUSG00000026124.5	novel	1040	6	NA	NA	1396	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	10.5	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCCTCCTTGCTTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34576124	34583392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_34576213_34576406_34576517_34583105
tx.1220	chr10	-	1409	6	FSM	ENSMUSG00000019806.14	ENSMUST00000162610.8	1554	6	145	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_1	15.3179633110933	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTGTCTGCACTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13744579	13522797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_13523451_13529329_13529494_13566267_13566384_13677591_13677694_13704986_13705143_13744361
tx.12200	chr3	+	892	4	ISM	ENSMUSG00000028098.14	ENSMUST00000029740.14	2209	9	44	14951	36	-7519	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	711	junction_1	57.9098916900693	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGGATTGGTGATAAAA	4839	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96635023	96683517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_96635227_96661650_96661710_96665292_96665351_96682945
tx.12201	chr3	+	2164	9	FSM	ENSMUSG00000028098.14	ENSMUST00000029740.14	2209	9	45	0	37	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	647	junction_7	60.034885691571	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAAGCTTCAGCGTCTCAA	4840	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96635024	96698468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_96635227_96661650_96661710_96665292_96665351_96682945_96683158_96690963_96691036_96692308_96692382_96693246_96693341_96695885_96696002_96697190
tx.12202	chr3	+	1895	7	ISM	ENSMUSG00000028098.14	ENSMUST00000029740.14	2209	9	30319	2	30144	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	647	junction_5	67.9863139822192	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTAAGCTTCAGCGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96665298	96698466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_96665351_96682945_96683158_96690963_96691036_96692308_96692382_96693246_96693341_96695885_96696002_96697190
tx.12203	chr3	-	1757	14	FSM	ENSMUSG00000028096.14	ENSMUST00000029738.14	4598	14	34	2807	0	398	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_5	18.4284960714547	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGGGGTCACTTGTCCA	1897	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96812628	96778403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_96778911_96779792_96779859_96780775_96780866_96782943_96783040_96787389_96787483_96787936_96788026_96789834_96789945_96797224_96797306_96798118_96798240_96800181_96800284_96800813_96800921_96804648_96804753_96805807_96805868_96812497
tx.12204	chr3	+	1674	10	FSM	ENSMUSG00000028093.16	ENSMUST00000090759.5	1754	10	31	49	31	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	1030	junction_1	83.6891662236509	2377	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTGAGATCAAAGGGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97066123	97083841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_97066682_97073158_97073288_97073389_97073521_97073855_97073933_97075302_97075391_97075756_97075890_97078957_97079059_97081118_97081215_97082943_97083110_97083646
tx.12205	chr3	+	628	5	ISM	ENSMUSG00000028093.16	ENSMUST00000090759.5	1754	10	9727	49	410	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1183	junction_2	46.2189084682882	1664	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTTGAGATCAAAGGGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97075819	97083841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_97075890_97078957_97079059_97081118_97081215_97082943_97083110_97083646
tx.12206	chr3	-	573	3	ISM	ENSMUSG00000028089.6	ENSMUST00000029730.5	3008	23	46631	-2	3540	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	296	junction_2	30.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTATGTTGCTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97470888	97468055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_97468404_97469894_97470004_97470772
tx.12207	chr3	-	2969	23	NNC	ENSMUSG00000028089.6	novel	3008	23	NA	NA	6	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_16	68.3504732250088	41	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTATGTTGCTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97517502	97468055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_97468404_97469894_97470004_97470772_97470888_97474074_97474146_97476416_97476516_97477517_97477721_97478219_97478384_97479876_97480026_97488318_97488494_97490032_97490187_97491123_97491239_97494426_97494538_97495555_97495630_97497221_97497319_97497869_97497963_97498520_97498677_97501323_97501487_97505007_97505090_97509337_97509370_97510324_97510440_97510975_97511083_97512413_97512527_97517378
tx.12208	chr3	-	2017	16	NNC	ENSMUSG00000028089.6	novel	3008	23	NA	NA	6	-1369	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	71.5978274034128	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCTAAAAGCATTGGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97517502	97479719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_97480026_97488318_97488494_97490032_97490187_97491123_97491239_97494426_97494538_97495555_97495630_97497221_97497319_97497869_97497963_97498520_97498677_97501323_97501487_97505007_97505090_97509337_97509370_97510324_97510440_97510975_97511083_97512413_97512527_97517378
tx.12209	chr3	+	2072	8	FSM	ENSMUSG00000038205.13	ENSMUST00000045743.13	5006	8	111	2823	109	56	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	11.768168758068	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCCTCGGTGTTCATAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97565638	97578305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_97565686_97565904_97566083_97569588_97569756_97570897_97570992_97571183_97571305_97573897_97574032_97574674_97574744_97577043
tx.1221	chr10	-	1057	6	FSM	ENSMUSG00000019806.14	ENSMUST00000019942.6	1439	6	126	256	-2	-256	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	33.5654584357193	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGACTGGTTTTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13744575	13528450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_13528756_13529329_13529494_13566267_13566384_13677591_13677694_13704986_13705143_13744361
tx.12210	chr3	+	1249	4	ISM	ENSMUSG00000038205.13	ENSMUST00000130924.8	1958	7	5754	181	-2562	-47	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_1	6.16441400296898	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATCCATGTTAACAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97571283	97578068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_97571305_97573897_97574032_97574674_97574744_97577043
tx.12212	chr3	+	643	2	FSM	ENSMUSG00000027879.10	ENSMUST00000130620.2	640	2	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	351	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTAGTGTGTTGTTTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97808537	97814980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_97808737_97814536
tx.12213	chr3	+	1398	5	FSM	ENSMUSG00000027879.10	ENSMUST00000029476.9	2810	5	25	1387	-1	38	multi-exon	FALSE	canonical	3	330	junction_4	8.07774721070176	1076	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGAATTTTTTTTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97808530	97829205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_97808737_97814536_97814647_97819894_97820056_97821815_97821963_97828431
tx.12214	chr3	+	877	2	ISM	ENSMUSG00000027879.10	ENSMUST00000130778.2	1355	5	13328	-38	7590	38	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	330	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGAATTTTTTTTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97821859	97829205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_97821963_97828431
tx.12215	chr3	-	1836	12	FSM	ENSMUSG00000053398.12	ENSMUST00000065793.12	1893	12	57	0	57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1070	junction_1	240.376770374213	3061	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTGTCTGTGTGATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98247249	98220485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_98220774_98221483_98221722_98222380_98222512_98223721_98223855_98226935_98227089_98227961_98228111_98228528_98228662_98235362_98235462_98235604_98235660_98240550_98240617_98241822_98241975_98247010
tx.12216	chr3	+	930	6	NNC	ENSMUSG00000004233.15	novel	4410	6	NA	NA	10	-1471	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	17.2973986483517	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAGAAACTTTTAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99048397	99122446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_99048505_99094796_99095055_99111851_99111933_99112540_99112627_99121971_99122091_99122167
tx.12217	chr3	+	2539	6	FSM	ENSMUSG00000004233.15	ENSMUST00000004343.7	4410	6	22	1849	-3	-849	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_2	3.66606055596467	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCAACGTTGTACTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99048405	99125670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_99048505_99094796_99095055_99111851_99111933_99112540_99112627_99121971_99122091_99123774
tx.12218	chr3	+	1016	5	ISM	ENSMUSG00000004233.15	ENSMUST00000004343.7	4410	6	5	5073	1	-1471	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_2	3.57071421427143	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTGAGAAACTTTTAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99048388	99122446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_99048505_99094796_99095055_99111851_99111933_99112540_99112627_99121971
tx.12219	chr3	+	1195	5	NIC	ENSMUSG00000004233.15	novel	4410	6	NA	NA	-3	667	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.1383571472171	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGATGTGATGATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99048405	99124584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_99048505_99111851_99111933_99112540_99112627_99121971_99122091_99123774
tx.1222	chr10	+	1284	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000071532.7_ENSMUSG00000112490.2	novel	567	1	NA	NA	-13	25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGTCTGTTCACCTATAT	7713	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14398808	14463271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_+_14399368_14462546
tx.12220	chr3	-	3428	27	FSM	ENSMUSG00000033285.16	ENSMUST00000052120.14	3432	27	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	562	junction_13	50.4098586206493	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTGGTTCCCTGAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100069719	100045495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_100046159_100046374_100046469_100047494_100047624_100048870_100048915_100049528_100049577_100049768_100049862_100050270_100050337_100050718_100050770_100051008_100051144_100051634_100051747_100051874_100051976_100052950_100053008_100053747_100053884_100054016_100054103_100055420_100055523_100057182_100057277_100058278_100058510_100059223_100059329_100060122_100060221_100060861_100060964_100061177_100061292_100062238_100062335_100063695_100063775_100064639_100064759_100067081_100067292_100068335_100068539_100069659
tx.12221	chr3	+	1632	4	ISM	ENSMUSG00000027865.11	ENSMUST00000029459.10	3008	14	32031	-5	-168	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_1	3.09120616516523	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAAGGTGTTCTATGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100101727	100114302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_100101946_100103858_100103914_100109289_100109434_100113087
tx.12222	chr3	-	2927	5	ISM	ENSMUSG00000008763.17	ENSMUST00000008907.14	7969	13	93555	3233	60644	-3233	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	127	junction_4	9.9373034571759	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACTGCCAGTGTCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100499264	100472756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_100475059_100485791_100485908_100489300_100489474_100495033_100495254_100499148
tx.12223	chr3	-	974	2	ISM	ENSMUSG00000008763.17	ENSMUST00000123442.2	508	3	-153	141	-2	-141	intron_retention	FALSE	canonical	3	133	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAGAAAGTCAAGAGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100592777	100563517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_100563591_100591876
tx.12224	chr3	+	2332	6	FSM	ENSMUSG00000033233.18	ENSMUST00000037409.13	4612	6	-27	2307	-27	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	2.33238075793812	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAGACTTCAAGTGCTTT	4304	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100829763	100839020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_100830716_100832256_100832991_100834540_100834671_100835370_100835486_100837132_100837260_100838746
tx.12225	chr3	-	652	5	ISM	ENSMUSG00000033222.17	ENSMUST00000127357.2	4544	17	-8	16778	-8	-4368	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	252	junction_2	7.62807315119618	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGGAATGGCTTCCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100876987	100870443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_100870784_100871371_100871442_100874321_100874409_100876748_100876852_100876935
tx.12226	chr3	-	1083	3	ISM	ENSMUSG00000033222.17	ENSMUST00000127357.2	4544	17	1	19806	1	-7396	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	266	junction_1	3.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACTGACCCTAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100876978	100873471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_100874409_100876748_100876852_100876935
tx.12227	chr3	-	379	2	ISM	ENSMUSG00000033222.17	ENSMUST00000127357.2	4544	17	-2	22853	-2	-10443	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	273	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAGGTCGCCATTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100876981	100876518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_100876852_100876935
tx.12229	chr3	+	1892	2	FSM	ENSMUSG00000042035.12	ENSMUST00000198995.5	1855	2	-21	-16	-21	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAATCTTGATTG	231	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101284377	101286872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_101284519_101285121
tx.1223	chr10	+	724	2	FSM	ENSMUSG00000111888.2	ENSMUST00000220256.2	1003	2	609	-330	609	330	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTATTACGCCTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14420842	14427105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_14421099_14426637
tx.12230	chr3	-	683	4	ISM	ENSMUSG00000033161.11	ENSMUST00000036493.8	3679	23	25037	4	-2087	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	413	junction_2	31.6684210040363	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCTTTTGAGTCCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101486963	101483538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_101483901_101484234_101484327_101486309_101486412_101486836
tx.12231	chr3	-	1261	8	ISM	ENSMUSG00000033161.11	ENSMUST00000036493.8	3679	23	22534	4	-4590	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	330	junction_6	53.0409930032943	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCTTTTGAGTCCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101489466	101483538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_101483901_101484234_101484327_101486309_101486412_101486836_101486968_101487089_101487236_101488462_101488587_101489040_101489196_101489317
tx.12232	chr3	+	846	2	Intergenic	novelGene_952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGTTTTGTGTTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101619285	101621374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_101619536_101620778
tx.12233	chr3	-	2334	5	NNC	ENSMUSG00000027860.16	novel	6531	8	NA	NA	-726	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	25	junction_4	103.228811385194	22	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAATCCAAATTGGCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102075015	102064021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_102065814_102070614_102070850_102072670_102072804_102074153_102074288_102074975
tx.12234	chr3	-	2347	4	ISM	ENSMUSG00000027860.16	ENSMUST00000161021.2	818	5	967	-1470	-23	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_3	77.2801541291309	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATCCAAATTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102073279	102064025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_102065814_102070614_102070850_102072670_102072804_102073088
tx.12235	chr3	-	852	3	FSM	ENSMUSG00000027860.16	ENSMUST00000162361.2	472	3	-24	-356	-24	179	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_2	87.5	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCCGTCTCTCTGGCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102073280	102070322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_102070850_102072670_102072804_102073088
tx.12236	chr3	-	770	2	ISM	ENSMUSG00000027860.16	ENSMUST00000162361.2	472	3	343	-356	343	179	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	316	junction_1	0	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCCGTCTCTCTGGCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102072913	102070322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_102070850_102072670
tx.12237	chr3	-	1314	3	FSM	ENSMUSG00000027860.16	ENSMUST00000160226.8	617	3	-518	-179	-518	179	multi-exon	FALSE	canonical	3	188	junction_2	64	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCCGTCTCTCTGGCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102074807	102070322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_102070850_102072670_102072804_102074153
tx.12238	chr3	+	1060	3	FSM	ENSMUSG00000027859.11	ENSMUST00000035952.5	904	3	9	-165	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGAGTCCTTTCTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102377243	102428329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_102377277_102421271_102421396_102427426
tx.12239	chr3	-	534	3	ISM	ENSMUSG00000086745.2	ENSMUST00000146624.2	590	4	8187	-1	8187	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGTTGAATTAGCAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102634546	102627545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_102627764_102633643_102633728_102634314
tx.1224	chr10	+	503	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000019868.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	3.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAATGACTTCATCCCTG	706	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14523770	14535616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_14523956_14528662_14528729_14535364
tx.12240	chr3	+	1739	8	FSM	ENSMUSG00000027858.14	ENSMUST00000029451.12	4484	8	416	2329	-12	758	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	8.2065180664829	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATAACTCAGATATTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102642260	102677279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_102642382_102657073_102657177_102664608_102664707_102665472_102665548_102666625_102666725_102668212_102668285_102672500_102672585_102676192
tx.12241	chr3	-	3277	32	NIC	ENSMUSG00000027855.14	novel	3437	33	NA	NA	-2	3	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	64	junction_8	14.4403037547212	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTCTCATTGATTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102843418	102725811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_102726279_102726371_102726459_102727854_102727999_102748177_102748358_102752347_102752405_102758879_102758955_102759434_102759528_102760703_102760815_102761426_102761544_102772172_102772236_102772389_102772453_102783618_102783682_102786089_102786172_102800853_102800925_102803170_102803289_102806169_102806274_102807347_102807453_102816221_102816284_102820736_102820805_102822471_102822657_102823119_102823215_102827844_102827954_102829703_102829778_102830316_102830387_102832516_102832576_102836564_102836639_102838943_102839012_102841520_102841578_102841922_102841967_102842124_102842198_102842859_102842982_102843301
tx.12242	chr3	-	570	7	ISM	ENSMUSG00000027855.14	ENSMUST00000199930.2	665	9	-11	6225	-1	-6225	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_6	13.1455526911407	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATGTGGTTTTATCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102843417	102836548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_102836639_102838943_102839012_102841520_102841578_102841922_102841967_102842124_102842198_102842859_102842982_102843301
tx.12243	chr3	+	526	3	ISM	ENSMUSG00000027854.13	ENSMUST00000029447.12	7375	5	27	11030	5	78	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	384	junction_2	20	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCGTGGGGTCGTTCCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102903050	102904745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_102903284_102903471_102903578_102904558
tx.12244	chr3	+	2359	5	FSM	ENSMUSG00000027854.13	ENSMUST00000029447.12	7375	5	32	4984	10	1281	multi-exon	FALSE	canonical	3	364	junction_4	22.0609949911603	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGATTTGCTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102903055	102910791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_102903284_102903471_102903578_102904558_102904702_102905805_102905920_102909023
tx.12245	chr3	+	2207	4	ISM	ENSMUSG00000027854.13	ENSMUST00000029447.12	7375	5	378	4978	37	1287	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	364	junction_3	15.121728296285	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTGCTCATTTTACTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102903401	102910797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_102903578_102904558_102904702_102905805_102905920_102909023
tx.12246	chr3	-	198	1	Intergenic	novelGene_953	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATTTCAAAAATTTACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102953790	102953592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_102953600_102953800
tx.12247	chr3	+	1170	7	FSM	ENSMUSG00000027852.15	ENSMUST00000029445.13	4470	7	46	3254	-17	261	multi-exon	FALSE	canonical	3	741	junction_4	34.7870505919787	549	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTGTTGCTGATTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102965646	102971976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_102965757_102966220_102966349_102967516_102967696_102969689_102969850_102970645_102970770_102971431_102971474_102971549
tx.12248	chr3	+	1061	6	ISM	ENSMUSG00000027852.15	ENSMUST00000196355.5	1920	7	1	1816	1	261	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	741	junction_3	37.2751928231096	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTGTTGCTGATTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102966219	102971976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_102966349_102967516_102967696_102969689_102969850_102970645_102970770_102971431_102971474_102971549
tx.12249	chr3	+	595	3	ISM	ENSMUSG00000027852.15	ENSMUST00000196355.5	1920	7	4425	1816	4340	261	internal_fragment	FALSE	canonical	3	788	junction_1	8.5	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTGTTGCTGATTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102970643	102971976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_102970770_102971431_102971474_102971549
tx.1225	chr10	+	532	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000019868.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	4.54606056566195	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTCATCCCTGTTTTAT	751	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14523815	14535622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_14523956_14528662_14528729_14532326_14532395_14535364
tx.12250	chr3	+	438	2	ISM	ENSMUSG00000070385.13	ENSMUST00000177250.2	751	6	4430	-14	4430	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCGCGAGTGGGTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103006195	103007036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_103006453_103006855
tx.12251	chr3	+	859	2	ISM	ENSMUSG00000007379.16	ENSMUST00000166143.9	3060	12	-41	25181	15	-25181	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	218	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGCTTGGAAAATATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103009934	103039407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_103010055_103038668
tx.12252	chr3	-	419	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000007379.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTTGTGAAAATCTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103029403	103026112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_103026360_103029231
tx.12253	chr3	+	1064	7	FSM	ENSMUSG00000005687.15	ENSMUST00000005830.15	1467	7	81	322	-13	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	3472	junction_4	166.601987449797	2794	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTGTGGCTATAGTGA	5010	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103079051	103086146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_103079182_103079263_103079357_103080590_103080662_103081655_103081818_103082934_103082986_103084654_103084736_103085670
tx.12254	chr3	+	1118	6	FSM	ENSMUSG00000005687.15	ENSMUST00000155520.8	737	6	2	-383	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	3472	junction_3	182.474107752306	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTGTGGCTATAGTGA	5038	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103079079	103086146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_103079357_103080590_103080662_103081655_103081818_103082934_103082986_103084654_103084736_103085670
tx.12255	chr3	-	715	3	NNC	ENSMUSG00000054379.8	novel	669	5	NA	NA	-20569	107	intron_retention	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	13.5	184	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCACAGTTATTTTGCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103126860	103105434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_103106051_103106128_103106160_103126792
tx.12256	chr3	-	532	2	NNC	ENSMUSG00000054379.8	novel	669	5	NA	NA	-20570	4	intron_retention	FALSE	canonical	3	194	junction_1	0	85	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCGTCCCAGGTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103126861	103105537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_103106001_103126792
tx.12257	chr3	-	308	2	ISM	ENSMUSG00000008730.18	ENSMUST00000135634.2	2430	9	32613	-14	-7597	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGGTATTTGCTTTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103665978	103661458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_103661639_103665850
tx.12258	chr3	-	2283	4	FSM	ENSMUSG00000027845.16	ENSMUST00000029435.15	4345	4	71	1991	5	289	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_3	4.71404520791032	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCAAGTCCCAGATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103716689	103709911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_103711372_103714709_103714893_103715387_103715554_103716215
tx.12259	chr3	+	2827	10	FSM	ENSMUSG00000032952.12	ENSMUST00000047285.7	2799	10	-28	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_7	8.73053390247253	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGTGCCTGTCGTCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103716915	103729341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_103717374_103719400_103719626_103720092_103720224_103720575_103720724_103722140_103722638_103725075_103725160_103726119_103726224_103727569_103727778_103727993_103728276_103728651
tx.1226	chr10	-	1327	8	FSM	ENSMUSG00000019868.17	ENSMUST00000154132.8	1974	8	69	578	9	22	multi-exon	FALSE	canonical	3	590	junction_6	66.3663302881692	953	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGTTGGAGATCCTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14581235	14531076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_14531590_14536809_14536897_14543675_14543853_14551677_14551787_14559807_14559884_14560624_14560753_14563357_14563453_14581093
tx.12260	chr3	+	371	2	ISM	ENSMUSG00000044165.13	ENSMUST00000062945.12	833	4	3412	3	3242	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCCAGTTTAGTTTTTTA	7467	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103743328	103745961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_103743587_103745848
tx.12261	chr3	+	788	8	ISM	ENSMUSG00000027843.14	ENSMUST00000029433.9	2743	21	28255	1	-90	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.755928946018454	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTTATGCTTCAAAGTGTA	4688	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103795847	103819562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_103795912_103796050_103796173_103797571_103797600_103809429_103809508_103810685_103810802_103812471_103812503_103816696_103816775_103819291
tx.12262	chr3	+	1377	7	ISM	ENSMUSG00000058388.15	ENSMUST00000090685.11	3006	18	28983	0	1009	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	15.8078742685058	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCAGTTTCTAGGCTTTTT	2929	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103904744	103914806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_103905022_103905987_103906120_103906586_103906674_103910762_103910919_103911702_103911799_103912814_103912941_103914303
tx.12263	chr3	+	3256	5	FSM	ENSMUSG00000032902.2	ENSMUST00000046212.2	4426	5	-34	1204	-34	-1204	multi-exon	FALSE	canonical	3	470	junction_2	50.2462685181696	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTCTTCCGCATGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104545949	104564574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_104546145_104556573_104556834_104558201_104558346_104560057_104560904_104562763
tx.12264	chr3	+	3055	4	ISM	ENSMUSG00000032902.2	ENSMUST00000046212.2	4426	5	10596	1204	10596	-1204	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	470	junction_1	22.4499443206436	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTCTTCCGCATGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104556579	104564574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_104556834_104558201_104558346_104560057_104560904_104562763
tx.12265	chr3	+	1066	5	FSM	ENSMUSG00000002233.14	ENSMUST00000002303.12	1202	5	136	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_3	22.8965062837106	1315	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGCAGCTTCCTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104696339	104701775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_104696400_104699204_104699369_104699880_104700002_104700215_104700347_104701185
tx.12266	chr3	+	1008	4	ISM	ENSMUSG00000002233.14	ENSMUST00000106787.8	959	5	2853	-115	-96	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_2	25.9615099714943	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGCAGCTTCCTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104699202	104701775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_104699369_104699880_104700002_104700215_104700347_104701185
tx.12267	chr3	-	712	4	ISM	ENSMUSG00000002227.16	ENSMUST00000002297.12	3498	20	22291	-4	21403	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1316	junction_2	22.0957512255687	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTTGCGTGTGTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104703267	104702147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_104702557_104702640_104702763_104703009_104703099_104703175
tx.12268	chr3	-	2934	10	FSM	ENSMUSG00000070372.12	ENSMUST00000094028.10	3193	10	105	154	0	-154	multi-exon	FALSE	canonical	3	308	junction_2	396.900211360208	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTGTCCTTTCTGTC	9278	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104771716	104730248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_104732441_104732722_104732786_104735842_104735915_104741413_104741493_104742040_104742121_104747097_104747305_104748143_104748208_104749976_104750029_104752233_104752298_104771655
tx.12269	chr3	-	1453	5	ISM	ENSMUSG00000070372.12	ENSMUST00000094028.10	3193	10	111	15992	6	1117	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1296	junction_1	106.040086759678	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAGTACACTGTAGCTGT	9284	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104771710	104746086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_104747305_104748143_104748208_104749976_104750029_104752233_104752298_104771655
tx.1227	chr10	+	703	3	NNC	ENSMUSG00000112227.2	novel	628	3	NA	NA	-119	-55	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	7	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGCTGACTTTTAATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15667405	15682758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_15667792_15677163_15677341_15682618
tx.12270	chr3	-	533	4	ISM	ENSMUSG00000070372.12	ENSMUST00000195912.2	360	6	-3	6401	-3	-651	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1298	junction_3	99.5199589138893	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATCTTCTTTCTGGTAA	9275	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104771719	104747854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_104748208_104749976_104750029_104752233_104752298_104771655
tx.12272	chr3	+	1104	5	ISM	ENSMUSG00000045576.17	ENSMUST00000106769.8	2428	14	571	51469	3	-7523	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_3	4.76313972081441	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATTTCAGAGCCTGGTGG	651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104772389	104782707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_104772625_104775339_104775423_104778161_104778328_104780837_104780893_104782142
tx.12273	chr3	+	1954	14	FSM	ENSMUSG00000045576.17	ENSMUST00000059271.13	5728	14	571	3203	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_11	6.94526359402813	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTAGTGTATTTTCTTTG	651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104772389	104834177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_104772625_104775339_104775423_104778161_104778328_104780837_104780893_104782142_104782259_104790108_104790188_104796601_104796757_104798779_104798878_104799512_104799628_104801682_104801756_104803011_104803115_104826666_104826818_104829502_104829596_104833745
tx.12274	chr3	+	807	7	NIC	ENSMUSG00000045576.17	novel	862	8	NA	NA	3	-10	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	10	junction_5	23.7065391822594	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAGCAAATAATTTTGTA	651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104772389	104790220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_104772625_104775339_104775423_104778161_104778328_104780837_104780893_104782142_104782259_104788239_104788280_104790108
tx.12276	chr3	-	1647	3	ISM	ENSMUSG00000027905.16	ENSMUST00000090680.11	2905	11	6918	5	6788	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_2	6.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAATGTCAGTTTATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105587972	105585590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_105587029_105587659_105587762_105587865
tx.12277	chr3	-	2776	11	FSM	ENSMUSG00000027905.16	ENSMUST00000090680.11	2905	11	124	5	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	276	junction_2	22.5302019520465	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAATGTCAGTTTATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105594766	105585590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_105587029_105587659_105587762_105587865_105587972_105588296_105588380_105590041_105590101_105590192_105590332_105590468_105590612_105590731_105590847_105591600_105591770_105593954_105594050_105594439
tx.12278	chr3	-	2150	2	ISM	ENSMUSG00000027905.16	ENSMUST00000132008.2	2257	7	-7	3423	1	-3423	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	347	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACCCACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105594767	105592227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_105594050_105594439
tx.12279	chr3	+	1031	2	FSM	ENSMUSG00000048458.9	ENSMUST00000066610.8	4701	2	42	3628	42	-942	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGATGCTCACTGAACCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105611956	105624530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_105612142_105623684
tx.1228	chr10	-	435	2	Intergenic	novelGene_85	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTCAGCACTCACTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17475122	17471358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_17471708_17475036
tx.12280	chr3	-	1400	8	FSM	ENSMUSG00000068798.11	ENSMUST00000090678.11	2407	8	-8	1015	-8	32	multi-exon	TRUE	canonical	3	409	junction_7	23.7667234354495	812	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGGTTTGTGTCTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105708660	105635597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_105636281_105639271_105639388_105645070_105645215_105646829_105646971_105648661_105648719_105653219_105653289_105657560_105657645_105708554
tx.12281	chr3	-	374	2	Intergenic	novelGene_955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCGTCTCTCACTCATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105733189	105729094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_105729349_105733069
tx.12282	chr3	-	1136	7	ISM	ENSMUSG00000000563.18	ENSMUST00000118209.8	1604	8	835	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4041	junction_4	350.10446853602	11477	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATAAGTTTCATACTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105866580	105850013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_105850380_105851002_105851183_105858906_105859033_105861333_105861498_105863211_105863358_105866177_105866215_105866463
tx.12283	chr3	+	2006	10	FSM	ENSMUSG00000000561.15	ENSMUST00000010278.12	3682	10	106	1570	-33	663	multi-exon	FALSE	canonical	3	910	junction_4	50.9162953856864	737	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCCTCCCCAGAGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105866790	105875506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_105867015_105867268_105867455_105868932_105869075_105869330_105869381_105871757_105871829_105871938_105871994_105872396_105872469_105873080_105873190_105873672_105873742_105874478
tx.12284	chr3	+	608	4	ISM	ENSMUSG00000000561.15	ENSMUST00000127464.8	1095	8	-39	4028	-39	-3487	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	940	junction_3	26.1576417557513	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGTGTTGAGTCCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105866784	105869380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_105867015_105867268_105867455_105868932_105869075_105869330
tx.12285	chr3	+	1914	12	FSM	ENSMUSG00000027901.13	ENSMUST00000029508.11	4050	12	160	1976	141	12	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.52662323852242	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAGGAGGCACTGCATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106389906	106408370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_106390030_106394188_106394365_106395166_106395280_106395887_106395958_106397650_106397729_106398541_106398683_106399744_106399894_106402146_106402325_106406133_106406176_106406536_106406622_106407070_106407311_106407851
tx.12286	chr3	-	1972	8	ISM	ENSMUSG00000040774.16	ENSMUST00000121231.8	2121	9	7978	-3	7978	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_5	22.3396782539453	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTTTCTCAATTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106446920	106410295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_106411061_106411841_106411968_106412465_106412625_106413036_106413169_106420118_106420204_106438452_106438595_106440670_106440819_106446505
tx.12287	chr3	-	2050	9	FSM	ENSMUSG00000040774.16	ENSMUST00000068301.11	2814	9	44	720	-15	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_8	25.7924407530579	417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTTTCTCAATTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106455074	106410295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_106411061_106411841_106411968_106412465_106412625_106413036_106413169_106420118_106420204_106438452_106438595_106440670_106440819_106446505_106446920_106454995
tx.12288	chr3	+	1807	9	FSM	ENSMUSG00000027900.16	ENSMUST00000067630.13	3271	9	33	1431	0	-386	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_2	15.9251177389682	306	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACATTGTTCAGTAGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106455146	106481775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_106455237_106459471_106459597_106462479_106462625_106469064_106469133_106473360_106473501_106478008_106478187_106478926_106479010_106480288_106480382_106480890
tx.12289	chr3	+	1807	9	NIC	ENSMUSG00000027900.16	novel	3271	9	NA	NA	0	-383	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	20	junction_2	37.0506410200957	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGTTCAGTAGTGTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106455146	106481778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_106455237_106459471_106459597_106462482_106462625_106469064_106469133_106473360_106473501_106478008_106478187_106478926_106479010_106480288_106480382_106480890
tx.1229	chr10	-	771	3	FSM	ENSMUSG00000078453.4	ENSMUST00000220433.2	275	3	-51	-445	-51	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	67.5	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCTGGTGGCTGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17898889	17887007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_17887565_17894586_17894654_17898742
tx.12290	chr3	+	1667	8	NIC	ENSMUSG00000027900.16	novel	3271	9	NA	NA	0	-381	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_2	44.8862507924652	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTCAGTAGTGTAAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106455146	106481780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_106455237_106459471_106459597_106469064_106469133_106473360_106473501_106478008_106478187_106478926_106479010_106480288_106480382_106480890
tx.12291	chr3	+	1981	10	NIC	ENSMUSG00000027900.16	novel	3271	9	NA	NA	0	-389	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_1	49.8998997994986	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGACATTGTTCAGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106455146	106481772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_106455237_106457814_106457992_106459471_106459597_106462479_106462625_106469064_106469133_106473360_106473501_106478008_106478187_106478926_106479010_106480288_106480382_106480890
tx.12292	chr3	+	1736	8	NIC	ENSMUSG00000027900.16	novel	3271	9	NA	NA	11	-378	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	4	junction_3	42.6375325701836	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTAGTGTAAATTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106455157	106481783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_106455237_106459471_106459597_106462479_106462625_106473360_106473501_106478008_106478187_106478926_106479010_106480288_106480382_106480890
tx.12293	chr3	+	1624	3	FSM	ENSMUSG00000056260.16	ENSMUST00000098751.10	929	3	-22	-673	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	16.5	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTATGGCTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106592280	106643893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_106592450_106641673_106641956_106642720
tx.12294	chr3	+	3138	4	FSM	ENSMUSG00000056260.16	ENSMUST00000098750.5	3103	4	-32	-3	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	11.8415464455544	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTATGGCTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106629219	106643893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_106629423_106638978_106640459_106641673_106641956_106642720
tx.12295	chr3	+	1421	2	ISM	ENSMUSG00000056260.16	ENSMUST00000098750.5	3103	4	12433	20	1455	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGATATTTTTCAATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106641684	106643870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_106641956_106642720
tx.12296	chr3	+	737	4	FSM	ENSMUSG00000087260.6	ENSMUST00000199317.2	743	4	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1062	junction_2	64.8194072447099	10128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGGTTCATTTCTGGTCT	3157	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107186320	107191398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_107186430_107187185_107187248_107189224_107189343_107190950
tx.12297	chr3	-	3128	2	FSM	ENSMUSG00000048109.11	ENSMUST00000061772.11	4343	2	695	520	123	-520	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTCTGCCTGGAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107240294	107233256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_107233621_107237530
tx.12298	chr3	-	940	2	NNC	ENSMUSG00000048109.11	novel	4343	2	NA	NA	39	-520	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	39	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTCTGCCTGGAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107240378	107233256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_107233621_107239802
tx.12299	chr3	-	1771	9	ISM	ENSMUSG00000014601.14	ENSMUST00000064759.7	3215	21	12726	0	1107	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	175	junction_2	25.7584937447825	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGTTGCCTTGTGTGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107526284	107519847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_107520783_107521910_107522116_107522630_107522736_107523076_107523144_107523823_107523925_107524127_107524255_107525373_107525472_107525631_107525707_107526226
tx.123	chr1	+	570	3	ISM	ENSMUSG00000026124.5	ENSMUST00000027298.5	1040	6	1426	2	1426	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0.5	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCCTCCTTGCTTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34576154	34583392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_34576328_34576406_34576517_34583105
tx.1230	chr10	-	773	3	FSM	ENSMUSG00000078453.4	ENSMUST00000020002.9	846	3	73	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_1	12	1571	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCTGGTGGCTGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17898963	17887007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_17887565_17894586_17894654_17898814
tx.12300	chr3	-	3220	21	FSM	ENSMUSG00000014601.14	ENSMUST00000064759.7	3215	21	-7	2	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_2	23.6893963620857	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGTGTTGCCTTGTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107539017	107519849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_107520783_107521910_107522116_107522630_107522736_107523076_107523144_107523823_107523925_107524127_107524255_107525373_107525472_107525631_107525707_107526226_107526299_107527355_107527420_107527524_107527591_107528642_107528861_107529187_107529371_107531702_107531831_107531940_107532048_107532996_107533066_107534051_107534173_107534260_107534396_107534703_107534779_107535471_107535542_107538816
tx.12301	chr3	-	2615	8	ISM	ENSMUSG00000027893.15	ENSMUST00000144864.8	1689	10	1391	-1359	326	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	702	junction_5	35.2368082133048	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATTTAGTAGTCGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107576499	107570439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_107572430_107572831_107572953_107574457_107574537_107574955_107575025_107575382_107575482_107575565_107575661_107575982_107576054_107576408
tx.12302	chr3	-	3646	17	FSM	ENSMUSG00000027893.15	ENSMUST00000029490.15	3863	17	217	0	162	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	702	junction_5	41.8762593094226	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAGTAGTCGTGTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107603659	107570435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_107572430_107572831_107572953_107574457_107574537_107574955_107575025_107575382_107575482_107575565_107575661_107575982_107576054_107576408_107576498_107577207_107577272_107577519_107577637_107578453_107578561_107579357_107579453_107580751_107580855_107581323_107581425_107582326_107582471_107585035_107585148_107603473
tx.12303	chr3	-	2641	9	ISM	ENSMUSG00000027893.15	ENSMUST00000144864.8	1689	10	655	-1359	-410	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	702	junction_5	32.961862432211	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATTTAGTAGTCGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107577235	107570439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_107572430_107572831_107572953_107574457_107574537_107574955_107575025_107575382_107575482_107575565_107575661_107575982_107576054_107576408_107576498_107577207
tx.12304	chr3	+	927	8	FSM	ENSMUSG00000004032.11	ENSMUST00000004134.11	945	8	18	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	3.52252228741084	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGTCTAGATGGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107803154	107806002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_107803315_107803613_107803690_107803941_107804007_107804603_107804686_107804777_107804879_107805282_107805379_107805481_107805593_107805766
tx.12305	chr3	-	1283	8	FSM	ENSMUSG00000004035.13	ENSMUST00000004137.11	1377	8	94	0	-56	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_6	2.49897938350513	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTTTTTCTTTGGTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107839039	107833649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_107834297_107836185_107836297_107836378_107836475_107837589_107837691_107837788_107837871_107838143_107838209_107838630_107838707_107838934
tx.12306	chr3	-	1161	8	FSM	ENSMUSG00000068762.12	ENSMUST00000106685.9	1153	8	-8	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_3	8.51649060616507	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGTGTCCTGTCGTATT	1782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107851073	107846162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_107846633_107848308_107848420_107848504_107848601_107849448_107849550_107849648_107849731_107850017_107850083_107850560_107850637_107850913
tx.12307	chr3	+	501	2	Intergenic	novelGene_957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGAAGATGATTTTTTTAA	9637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107862781	107869263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_107862918_107868898
tx.12308	chr3	+	370	2	Intergenic	novelGene_956	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGATGGAGCCATTTTCTC	9637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107862781	107863540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_107862918_107863306
tx.12309	chr3	-	1194	8	FSM	ENSMUSG00000004038.10	ENSMUST00000004136.10	1311	8	112	5	112	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_5	50.6947648547014	296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGAGTTGTGTCTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107876487	107871016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_107871613_107873402_107873514_107873594_107873691_107874890_107874992_107875081_107875164_107875451_107875517_107876078_107876155_107876420
tx.1231	chr10	+	444	3	ISM	ENSMUSG00000019854.18	ENSMUST00000150029.8	2462	19	67097	0	917	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_2	24	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATACATTGTATTTGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17998848	18000892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_17998922_17999346_17999453_18000627
tx.12310	chr3	-	1065	8	FSM	ENSMUSG00000040562.13	ENSMUST00000012348.9	1064	8	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	626	junction_6	40.3692143766479	1502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTCAGTGTATTATTTT	2041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107893770	107889017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_107889455_107891251_107891363_107891444_107891541_107892364_107892466_107892562_107892645_107892933_107892999_107893349_107893426_107893673
tx.12311	chr3	-	1163	8	FSM	ENSMUSG00000058135.13	ENSMUST00000004140.11	1289	8	124	2	-43	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	592	junction_3	56.1666616201374	1511	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATGAGTTGTGTCTTTTT	6707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107925165	107919572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_107920095_107922068_107922180_107922260_107922357_107923643_107923745_107923834_107923917_107924199_107924265_107924666_107924743_107925055
tx.12312	chr3	-	1615	10	ISM	ENSMUSG00000027889.18	ENSMUST00000102637.8	3586	19	-22	4363	-22	41	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_9	44.2065857336011	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTTTGTGACTGTGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107993989	107985742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_107986126_107986302_107986393_107986500_107986643_107986902_107987090_107987378_107987491_107987582_107987652_107987959_107988091_107988316_107988448_107993533_107993669_107993754
tx.12313	chr3	+	1906	9	Fusion	ENSMUSG00000009108.16_ENSMUSG00000056411.3	novel	2518	7	NA	NA	759	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_7	1.61535599791501	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGGGTTCCCTGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107994050	108008748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr3_+_107994208_108000509_108000683_108002456_108002500_108002754_108002897_108003665_108003824_108005282_108005412_108005626_108005757_108007303_108007458_108007928
tx.12314	chr3	+	1735	8	ISM	ENSMUSG00000009108.16	ENSMUST00000058669.15	2054	9	417	2	14	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_6	1.66598625567009	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCCTGGGTTCCCTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108000521	108008746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_108000683_108002456_108002500_108002754_108002897_108003665_108003824_108005282_108005412_108005626_108005757_108007303_108007458_108007928
tx.12315	chr3	-	3243	9	FSM	ENSMUSG00000000001.5	ENSMUST00000000001.5	3262	9	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	376	junction_4	42.0652395095998	234	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCACTTTTATTTGTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108053443	108014595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_108016633_108016718_108016929_108019250_108019405_108019788_108019919_108023078_108023208_108025616_108025775_108030857_108031000_108031110_108031154_108053203
tx.12316	chr3	-	2121	5	ISM	ENSMUSG00000000001.5	ENSMUST00000000001.5	3262	9	37	7056	37	-7056	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	407	junction_2	40.1022131558845	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAATTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108053425	108021651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_108023208_108025616_108025775_108030857_108031000_108031110_108031154_108053203
tx.12317	chr3	+	299	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048796.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATCTAATCTGATGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108107919	108108560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_108107998_108108339
tx.12318	chr3	-	531	2	ISM	ENSMUSG00000048997.18	ENSMUST00000141054.2	3224	8	5018	-76	5018	70	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAGCCAAATGAGTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108110872	108109467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_108109690_108110563
tx.12319	chr3	+	994	9	FSM	ENSMUSG00000068749.10	ENSMUST00000090569.10	1239	9	245	0	245	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2544	junction_4	248.775972262194	14764	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTAATAGTCTGTGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108164486	108187290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_108164622_108169001_108169069_108172381_108172509_108173748_108173817_108175108_108175217_108175348_108175408_108176143_108176247_108179606_108179694_108187050
tx.1232	chr10	-	1175	6	FSM	ENSMUSG00000059554.13	ENSMUST00000080860.13	1190	6	15	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_2	8.9977775033616	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGTTTTCTGTTTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18110729	18089423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_18089927_18092007_18092031_18095235_18095391_18100644_18100809_18106166_18106367_18110599
tx.12320	chr3	+	1767	7	NIC	ENSMUSG00000068744.13	novel	1686	8	NA	NA	-3	-10	intron_retention	FALSE	canonical	3	329	junction_1	60.1405760605009	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTCTGTATATCTGAA	7029	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108291151	108295485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_108291243_108291551_108291748_108292285_108292725_108293608_108293724_108293815_108294053_108294593_108294712_108294914
tx.12321	chr3	+	1648	8	FSM	ENSMUSG00000068744.13	ENSMUST00000102629.8	1687	8	-23	62	-3	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_1	112.452983372553	288	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTCTGTATATCTGAA	7029	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108291151	108295485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_108291212_108291551_108291602_108291689_108291748_108292285_108292725_108293608_108293724_108293815_108294053_108294593_108294712_108294914
tx.12322	chr3	+	1678	8	FSM	ENSMUSG00000068744.13	ENSMUST00000090561.10	1686	8	-2	10	-2	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	329	junction_1	57.4402973103556	392	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTCTGTATATCTGAA	7030	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108291152	108295485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_108291243_108291551_108291602_108291689_108291748_108292285_108292725_108293608_108293724_108293815_108294053_108294593_108294712_108294914
tx.12323	chr3	+	1295	5	ISM	ENSMUSG00000068744.13	ENSMUST00000090561.10	1686	8	1316	10	298	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	403	junction_2	35.947009611371	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTCTGTATATCTGAA	8348	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108292470	108295485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_108292725_108293608_108293724_108293815_108294053_108294593_108294712_108294914
tx.12324	chr3	-	1859	11	FSM	ENSMUSG00000068739.14	ENSMUST00000090553.12	3570	11	4	1707	4	40	multi-exon	FALSE	canonical	3	2549	junction_7	105.882198692698	3317	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTCTCTGCTGGGTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108352510	108333887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_108334298_108334575_108334706_108335489_108335648_108335921_108336052_108336556_108336779_108338780_108338937_108340333_108340478_108341364_108341524_108343201_108343283_108344824_108344896_108352312
tx.12325	chr3	-	884	5	ISM	ENSMUSG00000068739.14	ENSMUST00000090553.12	3570	11	15901	1708	15846	39	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2563	junction_4	108.283193525127	544	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTGTCTCTGCTGGGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108336613	108333888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_108334298_108334575_108334706_108335489_108335648_108335921_108336052_108336556
tx.12326	chr3	-	1267	5	ISM	ENSMUSG00000040412.18	ENSMUST00000048012.13	3321	21	73238	-5	1685	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.08972473588517	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTACGAAATTGGCTTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108370595	108365379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_108365785_108367000_108367167_108368254_108368434_108368511_108368639_108370205
tx.12327	chr3	+	669	5	FSM	ENSMUSG00000027886.8	ENSMUST00000029485.6	661	5	-6	-2	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.22474487139159	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCATGTGTCTGCTGTCC	565	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108444850	108452041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_108445016_108449803_108449918_108450754_108450871_108451351_108451477_108451892
tx.12328	chr3	-	2806	3	FSM	ENSMUSG00000068732.6	ENSMUST00000090546.6	2864	3	60	-2	60	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_1	15	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCCTGCTTTGTCATGT	5334	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108469722	108463738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_108466277_108467502_108467635_108469586
tx.12329	chr3	+	1289	4	FSM	ENSMUSG00000048100.14	ENSMUST00000143054.2	2443	4	1	1153	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_1	10.4986771653491	1058	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACTTGAGTTTGTGTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108479015	108489385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_108479065_108480195_108480275_108485431_108485530_108488322
tx.1233	chr10	-	1119	4	FSM	ENSMUSG00000019853.7	ENSMUST00000020000.7	2535	4	156	1260	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	0.471404520791032	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCCTTGCCTCCGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18421668	18416505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_18417081_18420012_18420194_18420825_18420962_18421441
tx.12331	chr3	+	4175	15	FSM	ENSMUSG00000040389.16	ENSMUST00000051145.15	4222	15	47	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_5	8.19064922297845	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTCCTTTTCTCACGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108498641	108553035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_108498914_108517192_108517360_108518671_108518756_108521648_108521734_108525805_108526609_108530638_108530766_108531872_108532052_108534518_108534777_108537007_108537084_108540376_108540535_108544306_108544477_108545208_108545380_108545941_108546074_108550377_108550597_108551761
tx.12332	chr3	+	247	2	ISM	ENSMUSG00000027884.17	ENSMUST00000124384.8	358	4	-37	2074	8	-1525	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCAGGAACGATGAGGAAAT	6604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108561236	108568786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_108561368_108568670
tx.12333	chr3	+	2032	12	FSM	ENSMUSG00000027884.17	ENSMUST00000106609.8	2043	12	11	0	11	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	66	junction_1	36.8117839559091	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGGTCTGGTGTGCAGTC	6607	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108561239	108586156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_108561297_108568670_108568812_108569247_108569350_108570839_108570948_108575278_108575501_108576014_108576156_108578217_108578312_108580135_108580234_108580596_108580744_108581952_108582280_108584000_108584295_108585855
tx.12334	chr3	+	2087	12	NIC	ENSMUSG00000027884.17	novel	2224	13	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	126	junction_1	23.1716555264122	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGGTCTGGTGTGCAGTC	6623	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108561255	108586156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_108561368_108568670_108568812_108569247_108569350_108570839_108570948_108575278_108575501_108576014_108576156_108578217_108578312_108580135_108580234_108580596_108580744_108581952_108582280_108584000_108584295_108585855
tx.12335	chr3	-	3449	14	NIC	ENSMUSG00000027883.16	novel	3498	15	NA	NA	-80	368	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	40	junction_13	22.5826555427157	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATTCGTTACATGTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108629512	108585585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_108587120_108589321_108589540_108589987_108590142_108594135_108594316_108597081_108597153_108604264_108604395_108604843_108604953_108606233_108606390_108607979_108608096_108608202_108608327_108609060_108609204_108609714_108609851_108610180_108610403_108629356
tx.12336	chr3	-	1159	4	ISM	ENSMUSG00000027883.16	ENSMUST00000029482.16	3498	15	35417	452	15621	-452	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_3	4.24264068711928	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGGTTATCTGTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108594208	108586405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_108587120_108589321_108589540_108589987_108590142_108594135
tx.12337	chr3	-	2907	15	FSM	ENSMUSG00000027883.16	ENSMUST00000029482.16	3498	15	139	452	-54	-452	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_14	18.8820182248852	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGGTTATCTGTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108629486	108586405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_108587120_108589321_108589540_108589987_108590142_108594135_108594316_108597081_108597153_108604264_108604395_108604843_108604953_108606233_108606390_108607979_108608096_108608202_108608327_108609060_108609204_108609714_108609851_108610180_108610403_108618592_108618897_108629356
tx.12338	chr3	-	687	2	ISM	ENSMUSG00000027883.16	ENSMUST00000029482.16	3498	15	160	32365	-33	-8027	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTATATTTTACTTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108629465	108618318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_108618897_108629356
tx.12339	chr3	-	2463	19	NNC	ENSMUSG00000027882.19	novel	2419	19	NA	NA	-25	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	29.2994859433269	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTGAGTTTTTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108747867	108700491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_108701181_108702117_108702270_108704696_108704783_108706539_108706633_108707370_108707478_108708050_108708190_108709426_108709508_108710861_108710928_108712373_108712432_108712553_108712650_108717188_108717318_108720193_108720285_108723640_108723796_108729103_108729205_108729830_108729910_108733321_108733399_108734341_108734424_108734888_108734939_108747735
tx.1234	chr10	+	1893	3	FSM	ENSMUSG00000019851.9	ENSMUST00000019998.9	1952	3	59	0	59	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_2	1	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTCTGCTTTGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18720826	18732821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_18721155_18729284_18729426_18731397
tx.12340	chr3	-	1756	16	NNC	ENSMUSG00000027882.19	novel	2419	19	NA	NA	-15	1118	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	31.8542514169354	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGAGCACATGCCTGCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108747857	108706309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_108706633_108707370_108707478_108708050_108708190_108709426_108709508_108710861_108710928_108712373_108712432_108712553_108712650_108717188_108717318_108720193_108720285_108723640_108723796_108729103_108729205_108729830_108729910_108733321_108733399_108734341_108734424_108734888_108734939_108747735
tx.12341	chr3	-	592	5	FSM	ENSMUSG00000027882.19	ENSMUST00000106596.4	553	5	-39	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	53.7331368896326	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTATTTGTACTGCTCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108747865	108732933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_108733187_108733321_108733399_108734341_108734424_108734888_108734939_108747735
tx.12342	chr3	-	2308	7	FSM	ENSMUSG00000027881.15	ENSMUST00000129273.8	3050	7	-41	783	-10	-441	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_5	171.074707527313	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTTTTGTAGGTGTGA	6840	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108819053	108810903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_108812079_108812426_108812651_108815102_108815164_108815247_108815400_108815651_108815721_108817658_108817712_108818479
tx.12343	chr3	-	2663	6	FSM	ENSMUSG00000027881.15	ENSMUST00000029480.9	3026	6	-2	365	-2	-25	multi-exon	FALSE	canonical	3	234	junction_4	114.013332553697	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTGTAGCAGCCCTATACT	6848	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108819045	108810487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_108812079_108812426_108812651_108815102_108815164_108815247_108815400_108815651_108815721_108818479
tx.12344	chr3	-	1120	5	FSM	ENSMUSG00000027881.15	ENSMUST00000145720.2	2108	5	-23	1011	-6	-1008	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_3	118.495516792831	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACTTCAATGATAACTTT	6844	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108819049	108814887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_108815164_108815247_108815400_108815651_108815721_108817658_108817712_108818479
tx.12345	chr3	-	1071	4	ISM	ENSMUSG00000027881.15	ENSMUST00000029480.9	3026	6	-10	4765	-10	-1008	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	234	junction_2	26.3986531642978	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACTTCAATGATAACTTT	6840	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108819053	108814887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_108815164_108815247_108815400_108815651_108815721_108818479
tx.12346	chr3	-	3044	2	FSM	ENSMUSG00000049300.12	ENSMUST00000190378.2	3051	2	10	-3	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTAACCTGGTCTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110158299	110153424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_110155172_110157002
tx.12347	chr3	-	3473	15	FSM	ENSMUSG00000027981.15	ENSMUST00000092154.10	3888	15	18	397	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	23.6233195061532	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTCTAATTTTTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113423780	113399112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_113400949_113401988_113402061_113402686_113402820_113404706_113404766_113404857_113404953_113407406_113407566_113409011_113409161_113410396_113410523_113413673_113413817_113414757_113414827_113415480_113415593_113416014_113416099_113418587_113418707_113421993_113422042_113423511
tx.12348	chr3	-	1821	15	FSM	ENSMUSG00000027981.15	ENSMUST00000106536.8	1839	15	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_8	14.9497457489813	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTCTAATTTTTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113423780	113399112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_113399297_113401988_113402061_113402686_113402820_113404706_113404766_113404857_113404953_113407406_113407566_113409011_113409161_113410396_113410523_113413673_113413817_113414757_113414827_113415480_113415593_113416014_113416099_113418587_113418707_113421993_113422042_113423511
tx.12349	chr3	+	1094	2	Intergenic	novelGene_960	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGAGTCAATTGTCGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115538527	115540135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_115538566_115539079
tx.1235	chr10	+	2087	7	FSM	ENSMUSG00000020009.14	ENSMUST00000020188.13	2112	7	25	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_4	3.14907393794853	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACTTGGATATTCATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19467721	19485977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_19467946_19473163_19473279_19477067_19477232_19479501_19479681_19481981_19482169_19483004_19483130_19484884
tx.12350	chr3	-	592	2	FSM	ENSMUSG00000054426.12	ENSMUST00000185424.2	433	2	-154	-5	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCCTTGGCTATGGTGATT	932	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115681755	115675226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_115675488_115681424
tx.12351	chr3	+	1274	9	NNC	ENSMUSG00000033554.18	novel	1576	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	90.812220405626	485	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATTGTTTTATAATCTCC	7740	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115681813	115722737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_115681927_115682088_115682247_115686360_115686486_115693343_115693453_115708688_115708810_115718860_115718901_115720345_115720450_115722157_115722405_115722480
tx.12352	chr3	+	1353	8	FSM	ENSMUSG00000033554.18	ENSMUST00000043342.10	1576	8	-21	244	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	254	junction_6	12.9331089117215	320	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATTGTTTTATAATCTCC	7737	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115681810	115722737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_115681927_115682088_115682247_115686360_115686486_115693343_115693453_115708688_115708810_115718860_115718901_115720345_115720450_115722157
tx.12353	chr3	-	2030	11	FSM	ENSMUSG00000054414.5	ENSMUST00000067485.4	9020	11	20	6970	20	-6970	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_7	12.5940462123973	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACTTTGTAGCCTATTTT	128	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115801035	115739591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_115740361_115747700_115747851_115750519_115750611_115772292_115772429_115775410_115775462_115778473_115778624_115783660_115783788_115784375_115784464_115786574_115786689_115800482_115800585_115800783
tx.12354	chr3	+	2883	5	FSM	ENSMUSG00000027963.15	ENSMUST00000029575.12	3000	5	3	114	3	-57	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_4	7.08872343937891	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGGTAATACACTTTTGC	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	115801113	115822552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_115801532_115804270_115804346_115817655_115818084_115818973_115819045_115820661
tx.12355	chr3	+	2180	5	FSM	ENSMUSG00000027963.15	ENSMUST00000106502.2	2840	5	109	551	109	-551	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	20.597329924046	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATAGGCTACCTTGTGAGT	161	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115801977	115822058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_115802187_115804270_115804346_115817655_115818084_115818973_115819045_115820661
tx.12356	chr3	-	635	4	FSM	ENSMUSG00000000339.15	ENSMUST00000124486.2	629	4	271	-277	271	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	276	junction_1	22.6421435969889	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGAGCTGCTGCTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116289343	116282611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_116282988_116286631_116286737_116287731_116287827_116289284
tx.12357	chr3	-	886	6	ISM	ENSMUSG00000000339.15	ENSMUST00000000348.15	1594	11	8537	0	-3706	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_1	22.6185764361951	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGAGCTGCTGCTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116293320	116282611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_116282988_116286631_116286737_116287731_116287827_116289284_116289344_116291238_116291364_116293194
tx.12358	chr3	-	1473	11	FSM	ENSMUSG00000000339.15	ENSMUST00000000348.15	1594	11	121	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	261	junction_7	31.9274176844918	347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGAGCTGCTGCTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116301736	116282611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_116282988_116286631_116286737_116287731_116287827_116289284_116289344_116291238_116291364_116293194_116293337_116294760_116294820_116297993_116298118_116300483_116300628_116301399_116301501_116301593
tx.12359	chr3	+	930	5	ISM	ENSMUSG00000000340.11	ENSMUST00000000349.11	3301	11	34	14777	-15	291	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	175	junction_2	23.7749868559375	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTCATTGTGAATGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116306752	116328853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_116306841_116313885_116314010_116317000_116317077_116326903_116327086_116328393
tx.1236	chr10	-	734	4	ISM	ENSMUSG00000020003.17	ENSMUST00000166511.9	1047	9	20485	-312	-17488	269	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_1	3.39934634239519	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATGACATGTCAATGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19762908	19736265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_19736741_19745039_19745140_19760523_19760580_19762805
tx.12360	chr3	+	3252	11	FSM	ENSMUSG00000000340.11	ENSMUST00000000349.11	3301	11	49	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_7	26.1091937830336	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTATGCCTTCATAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116306767	116343630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_116306841_116313885_116314010_116317000_116317077_116326903_116327086_116328393_116328516_116332737_116332955_116333303_116333471_116337416_116337495_116339630_116339823_116339942_116340015_116341681
tx.12361	chr3	-	803	2	ISM	ENSMUSG00000033439.13	ENSMUST00000199439.2	865	3	698	-243	698	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_1	0	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATCTGAGTGTGAGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116376427	116374741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_116375260_116376142
tx.12362	chr3	-	1665	11	FSM	ENSMUSG00000033439.13	ENSMUST00000184963.8	1616	11	-48	-1	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	31.2251501197352	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATCTGAGTGTGAGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116388533	116374741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_116375260_116376142_116376374_116378844_116378920_116379403_116379477_116382120_116382289_116383139_116383247_116383382_116383453_116383878_116383942_116385841_116385909_116386112_116386160_116388287
tx.12363	chr3	-	1865	11	ISM	ENSMUSG00000033439.13	ENSMUST00000041524.11	3402	12	19702	0	2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_7	13.8524366087703	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATCTGAGTGTGAGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116388534	116374741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_116375260_116376142_116376573_116378844_116378920_116379403_116379477_116382120_116382289_116383139_116383247_116383382_116383453_116383878_116383942_116385841_116385909_116386112_116386160_116388287
tx.12364	chr3	-	1178	6	ISM	ENSMUSG00000033439.13	ENSMUST00000156161.8	1991	9	2	4790	2	654	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_2	15.6920361967464	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAACATTTGGTTCTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116388534	116382562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_116383247_116383382_116383453_116383878_116383942_116385841_116385909_116386112_116386160_116388287
tx.12365	chr3	+	2167	14	FSM	ENSMUSG00000027959.15	ENSMUST00000198386.5	1894	14	0	-273	0	273	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_7	10.1538461538462	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTCGTTCCAGGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116388630	116415524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_116388828_116397110_116397172_116398845_116398926_116399313_116399419_116400971_116401144_116402032_116402099_116403912_116404033_116407554_116407747_116411904_116412100_116412208_116412299_116412372_116412553_116412899_116412982_116413706_116413841_116415031
tx.12366	chr3	-	2019	7	ISM	ENSMUSG00000089911.5	ENSMUST00000029570.9	2782	12	20821	6	3876	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	876	junction_3	32.3354810283276	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAAAGGTCTTGATCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116435505	116424818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_116426130_116427370_116427535_116428551_116428650_116429926_116430040_116434035_116434108_116434895_116435010_116435358
tx.12367	chr3	-	2719	12	FSM	ENSMUSG00000089911.5	ENSMUST00000029570.9	2782	12	62	1	-5	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	876	junction_3	57.2050104723397	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTCTTGATCTGTGAGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116456264	116424813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_116426130_116427370_116427535_116428551_116428650_116429926_116430040_116434035_116434108_116434895_116435010_116435358_116435578_116439014_116439130_116441430_116441559_116442167_116442231_116445052_116445149_116456043
tx.12368	chr3	-	885	5	ISM	ENSMUSG00000033400.15	ENSMUST00000159742.8	4344	28	-2	36422	-2	-177	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_4	9.01041064547005	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTAGTATTTTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116601780	116584605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_116584859_116585666_116585834_116587260_116587472_116600916_116601067_116601676
tx.12369	chr3	+	2216	16	NNC	ENSMUSG00000033386.11	novel	6823	15	NA	NA	2088	44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	57	junction_1	74.6183176795975	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAAAAAGAGAAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116655303	116697171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_116655359_116671882_116672100_116674415_116674553_116675406_116675502_116676697_116676846_116678755_116678939_116684553_116684653_116685488_116685637_116689136_116689251_116690326_116690443_116692811_116692899_116694252_116694351_116694601_116694661_116695962_116696107_116696578_116696641_116696717
tx.1237	chr10	+	725	3	FSM	ENSMUSG00000019996.18	ENSMUST00000214231.2	675	3	-50	0	-39	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	297	junction_2	12.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTTGGATGTCAGTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20024690	20109604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_20024827_20106529_20106629_20109114
tx.12370	chr3	+	2332	17	NNC	ENSMUSG00000033386.11	novel	6823	15	NA	NA	2111	94	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	203	junction_1	41.3407618912617	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGACAGGTTTGGTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116655326	116697221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_116655359_116659837_116659927_116671882_116672100_116674415_116674553_116675406_116675502_116676697_116676846_116678755_116678939_116684553_116684653_116685488_116685637_116689136_116689251_116690326_116690443_116692811_116692899_116694252_116694351_116694601_116694661_116695962_116696107_116696578_116696641_116696717
tx.12372	chr3	-	938	4	ISM	ENSMUSG00000028133.18	ENSMUST00000106467.8	1158	7	12437	-97	-438	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_3	13.0724477007517	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTTTCATGTTTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120952906	120949490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_120949707_120949835_120949952_120950049_120950166_120952416
tx.12373	chr3	-	1040	5	FSM	ENSMUSG00000028133.18	ENSMUST00000106466.10	1484	5	0	444	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_3	13.1244047484067	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTTTCATGTTTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120965344	120949490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_120949707_120949835_120949952_120950049_120950166_120952416_120952905_120965240
tx.12374	chr3	+	999	4	FSM	ENSMUSG00000039887.12	ENSMUST00000039442.12	2037	4	-36	1074	-36	313	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	14.5143607047182	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACAGGTTCTCTTGGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121085385	121155669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_121085633_121092252_121092408_121113728_121113861_121155204
tx.12375	chr3	+	2034	7	FSM	ENSMUSG00000053931.12	ENSMUST00000029773.13	2049	7	7	8	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4254	junction_2	486.023204750098	4627	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATGAACCACAGGCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121220152	121251848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_121220478_121243597_121243720_121243940_121244008_121245031_121245170_121245531_121245649_121248595_121248743_121250730
tx.12376	chr3	-	2498	15	FSM	ENSMUSG00000039865.9	ENSMUST00000039197.9	2620	15	122	0	122	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_10	3.70672307009404	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTGTTTGTTCATCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121325931	121253176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_121253726_121254750_121254988_121257062_121257201_121279910_121279998_121283846_121284004_121291367_121291534_121303022_121303210_121303840_121303966_121305970_121306061_121307305_121307467_121318475_121318570_121319315_121319453_121320712_121320856_121325315_121325421_121325809
tx.12377	chr3	+	354	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039865.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACTGTCTGATATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121262039	121264970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_121262125_121264701
tx.12379	chr3	-	755	5	ISM	ENSMUSG00000039865.9	ENSMUST00000039197.9	2620	15	116	65151	116	-4528	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_4	2.6809513236909	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACAACTCAGCCAACAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121325937	121318327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_121318570_121319315_121319453_121320712_121320856_121325315_121325421_121325809
tx.1238	chr10	+	1979	7	NNC	ENSMUSG00000019996.18	novel	1008	7	NA	NA	-14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_6	110.886453435736	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATGATGTATCTGATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20024715	20127638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_20024827_20106529_20106629_20109114_20109193_20121015_20121180_20122343_20122462_20126115_20126227_20126340
tx.12380	chr3	-	555	4	Intergenic	novelGene_961	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTTTCATTATGAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121383033	121357801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_121357952_121361250_121361470_121365186_121365251_121382911
tx.12381	chr3	-	368	3	Intergenic	novelGene_962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTTTCATTATGAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121383065	121357801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_121357952_121365186_121365251_121382911
tx.12383	chr3	+	1896	6	FSM	ENSMUSG00000028128.14	ENSMUST00000029771.13	1872	6	-24	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	13.6176356244394	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCATTTATATCTTCCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121517161	121528697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_121517452_121518625_121518732_121522985_121523204_121525172_121525352_121526029_121526190_121527754
tx.12384	chr3	-	1634	4	ISM	ENSMUSG00000028127.11	ENSMUST00000197383.5	3156	19	46474	135	160	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	194	junction_2	10.6770782520313	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAACATGTGCCTGACCTT	9269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121562341	121552557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_121553959_121555063_121555121_121558649_121558755_121562270
tx.12385	chr3	-	3384	23	FSM	ENSMUSG00000028127.11	ENSMUST00000029770.8	3489	23	105	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	145	junction_14	20.5277981251709	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACATGTGCCTGACCTTTT	7236	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121608846	121552555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_121553959_121555063_121555121_121558649_121558755_121562270_121562391_121562815_121562906_121563000_121563067_121563163_121563242_121565951_121566016_121567637_121567711_121567790_121567883_121569079_121569172_121569265_121569364_121569450_121569521_121570645_121570716_121573203_121573347_121575576_121575634_121577659_121577784_121578121_121578220_121579650_121579721_121585382_121585472_121586452_121586552_121590097_121590135_121608657
tx.12387	chr3	-	425	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028125.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGCATTTCCTTGCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121849208	121848395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_121848703_121849090
tx.12388	chr3	+	1235	2	ISM	ENSMUSG00000039756.13	ENSMUST00000197215.2	911	3	-22	-139	8	139	intron_retention	FALSE	canonical	3	1330	junction_1	0	246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGCAGGTATCAGTGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122068044	122069998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_122068128_122068846
tx.12389	chr3	+	2421	7	FSM	ENSMUSG00000039756.13	ENSMUST00000035776.10	2429	7	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1082	junction_6	112.264073604258	817	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGTGCCTCTTGGAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122068044	122078920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_122068128_122068846_122070460_122072394_122072534_122074376_122074473_122075977_122076143_122078042_122078153_122078705
tx.1239	chr10	+	1040	7	FSM	ENSMUSG00000019996.18	ENSMUST00000214823.2	1008	7	-20	-12	-6	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	237	junction_6	29.1018327028843	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATCACTTAAAACTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20024723	20133296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_20024827_20106529_20106629_20109114_20109193_20121015_20121180_20122343_20122462_20126115_20126227_20132929
tx.12390	chr3	+	632	2	FSM	ENSMUSG00000039756.13	ENSMUST00000199627.2	906	2	-459	733	297	-733	multi-exon	FALSE	canonical	3	1211	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGGTAAGCTATATGAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122069962	122072529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_122070460_122072394
tx.12391	chr3	+	1221	6	ISM	ENSMUSG00000039756.13	ENSMUST00000035776.10	2429	7	1927	0	298	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1082	junction_5	120.346167367308	1011	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGTGCCTCTTGGAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122069963	122078920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_122070460_122072394_122072534_122074376_122074473_122075977_122076143_122078042_122078153_122078705
tx.12392	chr3	+	1016	4	ISM	ENSMUSG00000028121.9	ENSMUST00000029766.9	3311	12	103482	0	-1386	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	159	junction_3	12.7540843131393	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGTCTCTTTATTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122316908	122323840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_122316990_122318572_122318685_122318935_122319149_122323230
tx.12393	chr3	-	508	4	ISM	ENSMUSG00000039735.17	ENSMUST00000239148.2	5357	15	-6	30872	-6	-11688	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_2	11.9536140513607	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTAATATTTATGATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122413370	122363245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_122363392_122364539_122364594_122383776_122383893_122413178
tx.12394	chr3	-	547	3	NNC	ENSMUSG00000039735.17	novel	5357	15	NA	NA	-24	-28479	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	39	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGATATCCGTTTTGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122413388	122380036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_122380258_122383776_122383893_122413178
tx.12395	chr3	-	969	5	Intergenic	novelGene_964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.866025403784439	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATGTGTAATGTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122477904	122455778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_122456152_122457726_122457862_122458780_122458890_122459901_122459995_122477645
tx.12396	chr3	+	451	2	ISM	ENSMUSG00000053965.11	ENSMUST00000066728.10	6939	21	42	111414	42	-28465	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCGAGTCCTGCTCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122522637	122541609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_122523017_122541537
tx.12397	chr3	+	525	2	FSM	ENSMUSG00000054091.10	ENSMUST00000106429.6	1160	2	187	448	187	-448	multi-exon	FALSE	canonical	3	1657	junction_1	0	7085	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTTATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122718038	122719385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_122718306_122719127
tx.12398	chr3	-	520	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000054091.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	533	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCAATTCCGGGTAACCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122719385	122718042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_122718303_122719125
tx.12399	chr3	-	1411	2	ISM	ENSMUSG00000039701.12	ENSMUST00000199923.5	1984	8	52	10847	13	-375	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTTTTTGTTTTAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122778107	122761664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_122762899_122777930
tx.124	chr1	+	450	2	ISM	ENSMUSG00000026124.5	ENSMUST00000027298.5	1040	6	1625	2	1625	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCCTCCTTGCTTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34576353	34583392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_34576517_34583105
tx.1240	chr10	+	2062	6	ISM	ENSMUSG00000019996.18	ENSMUST00000214823.2	1008	7	0	5649	0	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_3	18.1482781552411	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGTATGATGTATCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20024743	20127635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_20024827_20106529_20106629_20109114_20109193_20121015_20121180_20122343_20122462_20126115
tx.12400	chr3	+	1172	2	Intergenic	novelGene_965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTGGTTGCCAGAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123058446	123060305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_123058555_123059241
tx.12401	chr3	-	2613	11	NNC	ENSMUSG00000028114.17	novel	2741	11	NA	NA	9	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_8	82.5184221855944	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGTTTGTTTTCCTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123179625	123161945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_123163340_123164923_123165135_123166205_123166323_123167618_123167712_123168393_123168536_123169793_123169885_123173868_123173957_123174296_123174378_123176399_123176492_123177244_123177334_123179410
tx.12402	chr3	-	1865	10	NNC	ENSMUSG00000028114.17	novel	4202	10	NA	NA	15	-1151	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	86.9760858292257	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGGATTTGTGGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123179619	123164271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_123165135_123166205_123166323_123167618_123167712_123168393_123168536_123169793_123169885_123173868_123173957_123174296_123174378_123176399_123176492_123177244_123177334_123179410
tx.12403	chr3	-	1334	7	NNC	ENSMUSG00000028114.17	novel	7197	7	NA	NA	7	-4739	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	104.713365378489	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCAGGCATAGAGTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123179627	123167859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_123168536_123169793_123169885_123173868_123173957_123174296_123174378_123176399_123176492_123177244_123177334_123179410
tx.12404	chr3	-	380	3	FSM	ENSMUSG00000104960.2	ENSMUST00000196466.2	448	3	68	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	427	junction_1	15.5	6064	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGTGTCCTGTTTCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123301985	123301200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_123301310_123301465_123301512_123301760
tx.12406	chr3	-	2086	13	FSM	ENSMUSG00000027968.12	ENSMUST00000029588.10	2121	13	35	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	466	junction_6	145.639680948108	384	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTTGGTTTTATTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127346963	127330362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_127330684_127334193_127334286_127334447_127334608_127336680_127336806_127337802_127337928_127339474_127339620_127339695_127340053_127340124_127340219_127340302_127340468_127340569_127340654_127340738_127340840_127341010_127341196_127346831
tx.12407	chr3	-	761	6	ISM	ENSMUSG00000027968.12	ENSMUST00000029588.10	2121	13	35	9762	33	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	772	junction_1	64.3011663968858	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTGCTTACTTAGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127346963	127340124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_127340219_127340302_127340468_127340569_127340654_127340738_127340840_127341010_127341196_127346831
tx.12408	chr3	+	956	5	ISM	ENSMUSG00000051278.13	ENSMUST00000195955.2	3804	6	-159	3400	-15	-3400	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_3	5.7227615711298	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGGTATAGCTGACAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127347122	127355087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_127347305_127348944_127349035_127349841_127349923_127353219_127353280_127354544
tx.12409	chr3	+	2337	3	FSM	ENSMUSG00000028023.17	ENSMUST00000042587.12	2271	3	-63	-3	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTCTGGATTCTTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129007557	129013240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_129008431_129009287_129009494_129011982
tx.1241	chr10	+	1131	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000111356.2	novel	399	1	NA	NA	-52	156610	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAACCATTCACTCCTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20084183	20241244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_+_20084718_20240647
tx.12410	chr3	+	1415	2	NNC	ENSMUSG00000028023.17	novel	1942	5	NA	NA	3301	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTGGATTCTTTCTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129011224	129013242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_129011380_129011982
tx.12411	chr3	-	688	2	Intergenic	novelGene_967	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCATTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129268257	129266424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_129267086_129268230
tx.12412	chr3	-	631	3	NNC	ENSMUSG00000105837.5	novel	655	3	NA	NA	-80	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	27	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTTTTTTCTTGAAAATA	6881	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129325838	129321106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_129321464_129324707_129324814_129325670
tx.12413	chr3	-	728	3	FSM	ENSMUSG00000105837.5	ENSMUST00000197370.5	655	3	-63	-10	-63	10	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	7.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTTTTTCTTGAAAATAC	6898	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129325821	129321105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_129321464_129324707_129324814_129325557
tx.12414	chr3	+	2545	4	FSM	ENSMUSG00000041220.11	ENSMUST00000199910.5	2610	4	98	-33	67	33	multi-exon	FALSE	canonical	3	229	junction_1	79.2001683499894	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAGAAAGAAAGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129326101	129428653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_129326418_129398689_129398822_129421931_129422084_129426708
tx.12415	chr3	-	475	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041220.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTATTTTGAGTGCTCTCC	5380	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129327339	129326265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_129326668_129327266
tx.12416	chr3	+	473	2	ISM	ENSMUSG00000105960.2	ENSMUST00000199846.2	3871	5	4161	1993	4161	-1993	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGTAATGGGATCCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129551567	129555540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_129551788_129555287
tx.12417	chr3	-	1173	7	FSM	ENSMUSG00000028010.17	ENSMUST00000029643.15	1271	7	96	2	60	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	868	junction_6	342.204130113397	766	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGTTTATTGAACGGAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129624949	129618562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_129618859_129619196_129619266_129620472_129620624_129622553_129622614_129622985_129623141_129624243_129624503_129624766
tx.12418	chr3	-	441	3	ISM	ENSMUSG00000028010.17	ENSMUST00000029643.15	1271	7	4496	3	380	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1505	junction_2	0.5	424	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACGTTTATTGAACGGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129620549	129618563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_129618859_129619196_129619266_129620472
tx.12419	chr3	-	990	6	ISM	ENSMUSG00000028010.17	ENSMUST00000029643.15	1271	7	542	3	78	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1505	junction_2	175.642136174666	2086	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACGTTTATTGAACGGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129624503	129618563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_129618859_129619196_129619266_129620472_129620624_129622553_129622614_129622985_129623141_129624243
tx.1242	chr10	+	2167	7	ISM	ENSMUSG00000019996.18	ENSMUST00000116259.5	3831	18	124420	11	3903	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	250	junction_2	26.2958594121246	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTACCGTAGGGTTCCTG	153	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20149149	20157325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_20149201_20149524_20149627_20149991_20150043_20150347_20150406_20151921_20152022_20153870_20154092_20155741
tx.12420	chr3	-	365	2	FSM	ENSMUSG00000028010.17	ENSMUST00000143545.2	418	2	57	-4	57	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1506	junction_1	0	521	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACGTTTATTGAACGGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129619266	129618563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_129618859_129619196
tx.12421	chr3	+	1300	7	FSM	ENSMUSG00000027997.10	ENSMUST00000029626.9	1456	7	9	147	9	-147	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_5	8.11206234909197	284	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCTAATTCCTATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129695082	129707605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_129695156_129699114_129699157_129699551_129699702_129700049_129700127_129704171_129704348_129705766_129705924_129706980
tx.12422	chr3	+	1078	5	ISM	ENSMUSG00000027997.10	ENSMUST00000029626.9	1456	7	4583	149	-4454	-149	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_3	6.37867541108654	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTTCTAATTCCTATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129699656	129707603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_129699702_129700049_129700127_129704171_129704348_129705766_129705924_129706980
tx.12424	chr3	-	1049	4	FSM	ENSMUSG00000041084.9	ENSMUST00000043937.9	1067	4	11	7	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1781	junction_1	135.7063823931	5673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTAGAGTGTGGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130503082	130489567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_130490128_130496964_130497163_130499598_130499693_130502885
tx.12425	chr3	-	607	5	FSM	ENSMUSG00000062006.13	ENSMUST00000062601.14	624	5	15	2	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	513	junction_4	3512.03875085398	2591	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTCCGTTATCTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130523971	130520481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_130520609_130522396_130522501_130522699_130522800_130522877_130522952_130523769
tx.12426	chr3	-	437	5	FSM	ENSMUSG00000062006.13	ENSMUST00000079085.11	480	5	46	-3	-5	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	6284	junction_4	1283.0290331867	16746	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACGCTTCCGTTATCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130524001	130520484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_130520609_130522396_130522501_130522699_130522800_130522877_130522952_130523966
tx.12428	chr3	-	969	2	ISM	ENSMUSG00000027984.9	ENSMUST00000029610.9	1789	8	36441	18	36364	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	737	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTTAAGTAATTATAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131029309	131027085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_131027937_131029191
tx.12429	chr3	-	1733	8	FSM	ENSMUSG00000027984.9	ENSMUST00000029610.9	1789	8	38	18	38	-18	multi-exon	FALSE	canonical	3	722	junction_3	33.5492327841959	339	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCTTAAGTAATTATAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131065712	131027085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_131027937_131029191_131029309_131034585_131034659_131036164_131036255_131038808_131038936_131042064_131042223_131043451_131043581_131065524
tx.1243	chr10	+	876	4	ISM	ENSMUSG00000037608.17	ENSMUST00000186100.7	3231	13	0	16779	0	892	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	760	junction_3	128.608795275526	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGGCCTGGCCTTTCAG	2793	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20188217	20199233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_20188351_20193753_20193858_20197748_20197863_20198708
tx.12430	chr3	+	389	2	Intergenic	novelGene_968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTGGTCATGGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131069327	131070130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_131069424_131069837
tx.12431	chr3	-	1716	4	FSM	ENSMUSG00000027983.14	ENSMUST00000200236.2	1716	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGGCTATGGACAGCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131096849	131086936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_131087334_131089036_131089199_131091434_131092071_131096328
tx.12432	chr3	-	1295	2	ISM	ENSMUSG00000027983.14	ENSMUST00000200236.2	1716	4	0	4360	0	-3224	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCGAGAGGTGAACAGCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131096849	131091296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_131092071_131096328
tx.12433	chr3	+	2688	13	FSM	ENSMUSG00000028032.14	ENSMUST00000199878.5	2648	13	-39	-1	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	13.8531484588242	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGGTTTGTGTGCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131270617	131349432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_131270745_131273262_131273440_131285071_131285187_131288141_131288378_131288847_131288987_131290808_131290928_131305625_131305740_131307735_131307848_131311605_131311812_131313088_131313225_131324781_131325051_131337346_131337577_131348724
tx.12434	chr3	+	2503	12	FSM	ENSMUSG00000028032.14	ENSMUST00000029666.14	2600	12	97	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_4	6.54292880561694	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGGTTTGTGTGCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131270625	131349432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_131270745_131285071_131285187_131288141_131288378_131288847_131288987_131290808_131290928_131305625_131305740_131307735_131307848_131311605_131311812_131313088_131313225_131324781_131325051_131337346_131337577_131348724
tx.12435	chr3	+	924	2	ISM	ENSMUSG00000028032.14	ENSMUST00000200527.5	2811	15	66701	0	66665	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGGTTTGTGTGCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131337360	131349432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_131337577_131348724
tx.12436	chr3	-	1034	6	ISM	ENSMUSG00000028029.12	ENSMUST00000029663.11	1126	7	6746	0	101	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	862	junction_3	47.8388963083389	379	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTCTTGCTCATTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132382899	132366259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_132366503_132373145_132373315_132377739_132377949_132379725_132379891_132380509_132380624_132382765
tx.12437	chr3	-	1092	7	FSM	ENSMUSG00000028029.12	ENSMUST00000029663.11	1126	7	34	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	854	junction_6	52.4195150259477	3239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTCTTGCTCATTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132389611	132366259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_132366503_132373145_132373315_132377739_132377949_132379725_132379891_132380509_132380624_132382765_132382900_132389553
tx.12438	chr3	+	940	6	NNC	ENSMUSG00000028030.13	novel	3170	24	NA	NA	-19	16642	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	41	junction_1	24.8225703745603	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCATTAGCATTTGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132389885	132421532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_132390160_132392532_132392754_132400143_132400217_132411273_132411389_132413545_132413620_132421349
tx.12439	chr3	-	3489	12	FSM	ENSMUSG00000028018.16	ENSMUST00000029651.11	3503	12	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_3	19.4795930515641	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTGACTCCTCTCAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132797572	132687512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_132688981_132692145_132692216_132701926_132701958_132704585_132704720_132709424_132709554_132711148_132711194_132711320_132711437_132768326_132768421_132777660_132777913_132787799_132788268_132790336_132790787_132797340
tx.1244	chr10	+	3220	13	FSM	ENSMUSG00000037608.17	ENSMUST00000043881.12	5437	13	-13	2230	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	695	junction_11	110.864375352149	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTAACTATCAACTTTTA	2792	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20188216	20216015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_20188351_20193753_20193858_20197748_20197863_20198708_20199615_20200885_20201552_20201675_20201846_20203847_20203954_20205055_20205141_20207831_20208008_20209137_20209319_20210244_20210392_20215454_20215668_20215797
tx.12440	chr3	+	1616	7	FSM	ENSMUSG00000028016.10	ENSMUST00000029650.9	3101	7	86	1399	-12	-1399	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_1	13.0213499897497	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTGGATCTATTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132797686	132815350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_132797738_132802508_132802674_132804170_132804324_132806383_132806569_132808117_132808278_132812699_132812847_132814595
tx.12441	chr3	+	1558	6	ISM	ENSMUSG00000028016.10	ENSMUST00000029650.9	3101	7	4907	1407	-3640	-1407	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	157	junction_4	11.0815161417561	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGCCAAACTTGGATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132802507	132815342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_132802674_132804170_132804324_132806383_132806569_132808117_132808278_132812699_132812847_132814595
tx.12442	chr3	+	1170	12	FSM	ENSMUSG00000028013.17	ENSMUST00000029644.16	1226	12	47	9	35	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	471	junction_4	36.8801946894343	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTGAACTTCTCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133015917	133083830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_133016043_133026696_133026762_133028332_133028378_133032408_133032463_133036153_133036274_133045023_133045111_133053824_133053952_133073583_133073712_133076140_133076227_133079383_133079454_133082309_133082350_133083607
tx.12443	chr3	-	1402	2	NNC	ENSMUSG00000040943.13	novel	423	3	NA	NA	-25994	1155	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	63	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACCCAAGACATCATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133212437	133193140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_133194479_133212373
tx.12444	chr3	-	951	3	ISM	ENSMUSG00000040943.13	ENSMUST00000196398.5	9021	12	66	24176	0	520	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_2	6	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGTTATCCAGATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133250063	133193775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_133194479_133219789_133219935_133249960
tx.12445	chr3	-	644	3	NNC	ENSMUSG00000040943.13	novel	726	3	NA	NA	-15	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	50.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTACTAGTAAGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133250078	133219207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_133219589_133219789_133219935_133249960
tx.12446	chr3	-	510	2	FSM	ENSMUSG00000040943.13	ENSMUST00000195913.2	484	2	-22	-4	-6	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGATTTCTTTCTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133250069	133244518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_133244920_133249960
tx.12447	chr3	+	410	2	NIC	ENSMUSG00000105085.2	novel	352	3	NA	NA	-20	112	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGCTTGTTGTTTGTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133250837	133290926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_133250939_133290617
tx.12448	chr3	+	1106	10	FSM	ENSMUSG00000028167.16	ENSMUST00000120397.8	1172	10	66	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	10.4880884817015	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTAGTTTTTTTTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134987047	135010187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_134987130_134991275_134991429_134994021_134994101_134995315_134995413_134996754_134996864_135000988_135001050_135002580_135002695_135006434_135006494_135007322_135007416_135009928
tx.12449	chr3	+	1030	10	FSM	ENSMUSG00000028167.16	ENSMUST00000029817.11	1059	10	29	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	15.3099660916801	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTAGTTTTTTTTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134987050	135010187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_134987130_134991348_134991429_134994021_134994101_134995315_134995413_134996754_134996864_135000988_135001050_135002580_135002695_135006434_135006494_135007322_135007416_135009928
tx.1245	chr10	+	3083	12	FSM	ENSMUSG00000037608.17	ENSMUST00000092678.10	5307	12	2	2222	-1	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	294	junction_10	195.138687701892	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACTTTTAAAAACATTTG	2792	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20188216	20216025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_20188351_20193753_20193858_20197748_20197863_20198708_20199615_20200885_20201552_20201675_20201846_20203847_20203954_20205055_20205141_20207831_20208008_20209137_20209319_20215454_20215668_20215797
tx.12450	chr3	+	1475	4	FSM	ENSMUSG00000050150.17	ENSMUST00000160047.8	1196	4	-27	-252	-10	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_1	29.6348143611905	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATTGTTTTTTCTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135053779	135064080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_135053884_135054087_135054535_135060771_135060833_135063217
tx.12451	chr3	+	1473	4	NIC	ENSMUSG00000050150.17	novel	1407	4	NA	NA	-12	12	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	46	junction_1	42.1030481873542	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCATTGTTTTTTCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135053777	135064079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_135053884_135054090_135054535_135060771_135060833_135063217
tx.12452	chr3	+	1641	7	ISM	ENSMUSG00000050150.17	ENSMUST00000160460.8	2072	11	-37	18391	-8	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_5	29.9146935282461	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGAATTCTCAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135053781	135080453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_135053884_135054087_135054535_135060771_135060833_135063217_135063516_135077605_135077777_135078879_135079023_135080034
tx.12453	chr3	+	308	3	ISM	ENSMUSG00000050150.17	ENSMUST00000161417.6	783	6	7719	3706	-3535	1035	internal_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	15	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGCTTTATTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135096229	135099879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_135096290_135097921_135098011_135099720
tx.12454	chr3	-	973	3	FSM	ENSMUSG00000028165.10	ENSMUST00000029815.8	3361	3	505	1883	-13	1717	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_1	1	300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCATCTTATTACCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135129181	135114055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_135114652_135116771_135116987_135129019
tx.12455	chr3	+	1502	8	NNC	ENSMUSG00000078578.10	novel	1512	8	NA	NA	19	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1115.65161704371	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGCTGCCTGGATTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135144013	135171824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_135144114_135145404_135145560_135160946_135161011_135161106_135161139_135164558_135164641_135165735_135165842_135168710_135168805_135170955
tx.12456	chr3	+	1458	8	NNC	ENSMUSG00000078578.10	novel	738	8	NA	NA	58	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1174.85776820439	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTAGCTGCCTGGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135144134	135171821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_135144194_135145404_135145560_135160946_135161011_135161106_135161139_135164558_135164641_135165735_135165842_135168710_135168805_135170955
tx.12457	chr3	+	1546	8	NNC	ENSMUSG00000078578.10	novel	2504	8	NA	NA	-61	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1217.54104821219	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGCTGCCTGGATTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135144179	135171824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_135144324_135145404_135145560_135160946_135161011_135161106_135161139_135164558_135164641_135165735_135165842_135168710_135168805_135170955
tx.12458	chr3	+	1583	8	NNC	ENSMUSG00000078578.10	novel	2504	8	NA	NA	-11	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1082.26531131772	359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGCTGCCTGGATTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135144278	135171824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_135144460_135145404_135145560_135160946_135161011_135161106_135161139_135164558_135164641_135165735_135165842_135168710_135168805_135170955
tx.12459	chr3	+	1529	8	NNC	ENSMUSG00000078578.10	novel	3833	8	NA	NA	-9	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1058.12390771669	342	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGCTGCCTGGATTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135144498	135171824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_135144626_135145404_135145560_135160946_135161011_135161106_135161139_135164558_135164641_135165735_135165842_135168710_135168805_135170955
tx.1246	chr10	+	390	2	ISM	ENSMUSG00000037608.17	ENSMUST00000188546.2	834	4	6496	-63	6496	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1025	junction_1	0	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTAACTATCAACTTTTA	7055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20215495	20216015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_20215668_20215797
tx.12460	chr3	+	1617	7	NNC	ENSMUSG00000078578.10	novel	2515	7	NA	NA	218	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1020.43575931505	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGCTGCCTGGATTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135145189	135171824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_135145560_135160946_135161011_135161106_135161139_135164558_135164641_135165735_135165842_135168710_135168805_135170955
tx.12461	chr3	-	1009	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000105404.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAAAAGTCTTTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135191172	135180188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_135180708_135180906_135181060_135189722_135189758_135190870
tx.12462	chr3	+	3590	17	FSM	ENSMUSG00000028164.16	ENSMUST00000029814.10	3675	17	15	70	1	-70	multi-exon	TRUE	canonical	3	85	junction_8	25.1755554804656	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGCACTGACAACTTGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135191386	135277095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_135191619_135212669_135212765_135216735_135216842_135217563_135217735_135223663_135223788_135228752_135228929_135230277_135230389_135248072_135248225_135250486_135250605_135253310_135253398_135254960_135255129_135256823_135257043_135260520_135260686_135268965_135269111_135272248_135272392_135273224_135273483_135275975
tx.12463	chr3	+	1321	5	ISM	ENSMUSG00000028164.16	ENSMUST00000140893.8	2534	13	59161	-15	124	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_1	16.140012391569	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGCTGATAAATTGTATTT	8292	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135250540	135261303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_135250605_135253310_135253398_135254960_135255129_135256823_135257043_135260520
tx.12464	chr3	+	2437	9	ISM	ENSMUSG00000028164.16	ENSMUST00000029814.10	3675	17	59171	0	126	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_1	15.4793208830362	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCATTGAACACCATGTC	8294	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135250542	135277165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_135250605_135253310_135253398_135254960_135255129_135256823_135257043_135260520_135260686_135268965_135269111_135272248_135272392_135273224_135273483_135275975
tx.12465	chr3	+	2311	8	ISM	ENSMUSG00000028164.16	ENSMUST00000029814.10	3675	17	61938	65	-1355	-65	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_3	8.67555797182227	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGACAACTTGAAAGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135253309	135277100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_135253398_135254960_135255129_135256823_135257043_135260520_135260686_135268965_135269111_135272248_135272392_135273224_135273483_135275975
tx.12466	chr3	-	1742	7	ISM	ENSMUSG00000028163.18	ENSMUST00000129428.8	2520	13	14040	-227	-2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_1	5.39804491356722	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTCTGATCTCTGCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135300204	135290415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_135291277_135295087_135295266_135296076_135296250_135296540_135296608_135297314_135297440_135299591_135299695_135299969
tx.12467	chr3	+	843	3	FSM	ENSMUSG00000046818.8	ENSMUST00000053855.8	2722	3	64	1815	64	344	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_2	6.5	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATTTGTAGTTTGCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137329496	137332279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_137329645_137329892_137330035_137331726
tx.12468	chr3	+	790	2	FSM	ENSMUSG00000046818.8	ENSMUST00000165845.2	446	2	0	-344	0	344	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATTTGTAGTTTGCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137329797	137332279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_137330035_137331726
tx.12469	chr3	-	245	1	Intergenic	novelGene_969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGACAATGGATTGACTTAA	9296	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137555108	137554863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_137554900_137555100
tx.1247	chr10	+	1968	7	FSM	ENSMUSG00000019992.9	ENSMUST00000169712.3	1991	7	40	-17	-9	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_5	12.6150263134442	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTCAAATTATATTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20223555	20237067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_20223670_20224080_20224182_20228569_20228675_20229112_20229226_20229775_20230012_20233000_20233513_20236280
tx.12470	chr3	+	972	5	FSM	ENSMUSG00000037894.14	ENSMUST00000041045.14	1069	5	97	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13832	junction_1	739.113320134335	43572	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCGTGGTACTTTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137570344	137572683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_137570458_137570893_137570972_137571280_137571395_137571771_137571902_137572146
tx.12471	chr3	+	1317	8	FSM	ENSMUSG00000074212.8	ENSMUST00000090178.10	9477	8	185	7975	-27	-347	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_3	5.20204041600946	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGGACTGTTAATGACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137573620	137614343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_137573818_137591033_137591206_137598568_137598715_137607947_137608134_137609643_137609739_137610505_137610616_137611645_137611819_137614105
tx.12472	chr3	+	1314	7	FSM	ENSMUSG00000091512.6	ENSMUST00000168345.6	1295	7	-20	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_3	73.5090697351921	903	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGAGCTCTGTATAGGCC	60	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137624266	137634525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_137624425_137624633_137624680_137625681_137625717_137630872_137630932_137632569_137632704_137633107_137633172_137633707
tx.12473	chr3	-	1393	9	FSM	ENSMUSG00000028159.15	ENSMUST00000029806.13	3083	9	15	1675	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	5.49431524395898	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGTTGCTTTTGTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137687291	137638442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_137638951_137641342_137641431_137643497_137643584_137644897_137644961_137646621_137646670_137655407_137655539_137667202_137667337_137671641_137671765_137687079
tx.12474	chr3	-	1265	2	ISM	ENSMUSG00000028158.15	ENSMUST00000029805.13	3963	18	38701	209	38701	-209	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCCACACCAAGCATTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137798437	137795823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_137796991_137798339
tx.12475	chr3	+	1956	8	FSM	ENSMUSG00000004127.13	ENSMUST00000040321.13	4025	8	21	2048	0	1955	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_7	16.9609395196067	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTCTGTAAATAGCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137849229	137863534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_137849358_137853135_137853332_137854114_137854275_137855214_137855287_137856163_137856239_137857952_137858103_137860453_137860560_137862465
tx.12476	chr3	+	1180	3	ISM	ENSMUSG00000004127.13	ENSMUST00000161791.2	4258	6	20	6589	20	765	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	162	junction_1	9	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTTTAACAGGACGGGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137849249	137854990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_137849358_137853135_137853332_137854114
tx.12477	chr3	+	2569	9	NIC	ENSMUSG00000004127.13	novel	588	5	NA	NA	5	-1541	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	78.3194579909744	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTCTAAAATTCAGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137849626	137864038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_137849757_137852047_137852155_137853135_137853332_137854114_137854275_137855214_137855287_137856163_137856239_137857952_137858103_137860453_137860560_137862465
tx.12478	chr3	+	1160	7	ISM	ENSMUSG00000004127.13	ENSMUST00000162864.8	4064	8	3922	2649	3529	1351	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_6	16.8267313786394	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTAAGCCTCAAATCAGTC	NA	False	NA	-86	True	NA	NA	NA	137853199	137862930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_137853332_137854114_137854275_137855214_137855287_137856163_137856239_137857952_137858103_137860453_137860560_137862465
tx.12479	chr3	+	2133	6	ISM	ENSMUSG00000004127.13	ENSMUST00000162864.8	4064	8	4836	1545	4443	-1545	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_5	18.4238975246824	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACTTTTCTAAAATTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137854113	137864034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_137854275_137855214_137855287_137856163_137856239_137857952_137858103_137860453_137860560_137862465
tx.1248	chr10	+	1887	6	ISM	ENSMUSG00000019992.9	ENSMUST00000169712.3	1991	7	564	-49	327	49	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_4	13.6674796506159	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGGTTATTTTGTGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20224079	20237099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_20224182_20228569_20228675_20229112_20229226_20229775_20230012_20233000_20233513_20236280
tx.12480	chr3	+	1401	9	FSM	ENSMUSG00000028138.9	ENSMUST00000005964.7	1604	9	20	183	1	73	multi-exon	FALSE	canonical	3	1845	junction_1	151.305103598656	8640	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTGAGTTGAACAT	4944	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138148873	138161077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_138148955_138151050_138151153_138152843_138152986_138153612_138153701_138156659_138156880_138157004_138157266_138159502_138159639_138160428_138160568_138160845
tx.12481	chr3	+	1323	8	ISM	ENSMUSG00000028138.9	ENSMUST00000005964.7	1604	9	2194	183	2106	73	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1982	junction_2	114.955182038702	1639	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTGAGTTGAACAT	7118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138151047	138161077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_138151153_138152843_138152986_138153612_138153701_138156659_138156880_138157004_138157266_138159502_138159639_138160428_138160568_138160845
tx.12482	chr3	+	673	4	ISM	ENSMUSG00000028138.9	ENSMUST00000005964.7	1604	9	8246	183	-3066	73	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2033	junction_3	73.1862160671135	4883	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTGAGTTGAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138157099	138161077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_138157266_138159502_138159639_138160428_138160568_138160845
tx.12483	chr3	+	469	3	ISM	ENSMUSG00000028138.9	ENSMUST00000005964.7	1604	9	10687	183	-625	73	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2033	junction_2	89.5	2656	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTGAGTTGAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138159540	138161077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_138159639_138160428_138160568_138160845
tx.12484	chr3	-	1888	4	ISM	ENSMUSG00000005813.13	ENSMUST00000029804.13	2686	11	20549	0	-12	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	334	junction_2	10.077477638554	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCACTTTTTCTAGTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138174727	138164716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_138166262_138168125_138168192_138171984_138172129_138174594
tx.12485	chr3	-	2574	11	FSM	ENSMUSG00000005813.13	ENSMUST00000029804.13	2686	11	114	-2	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	305	junction_4	33.5143252953121	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTTTTTCTAGTTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138195162	138164714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_138166262_138168125_138168192_138171984_138172129_138174594_138174727_138177911_138178051_138179664_138179749_138180747_138180840_138184630_138184692_138186448_138186562_138188827_138188880_138195018
tx.12486	chr3	+	1633	7	FSM	ENSMUSG00000028156.13	ENSMUST00000200020.5	1421	7	851	-1063	-9	248	multi-exon	FALSE	canonical	3	1289	junction_1	283.691978894168	2869	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGATTTGTCCTTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138233036	138262223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_138233076_138252081_138252189_138253419_138253516_138256023_138256088_138256653_138256768_138259342_138259483_138261150
tx.12487	chr3	+	1592	6	ISM	ENSMUSG00000028156.13	ENSMUST00000196990.5	856	8	19035	-901	-4535	245	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1684	junction_2	178.575474239885	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTAGATTTGTCCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138252080	138262220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_138252189_138253419_138253516_138256023_138256088_138256653_138256768_138259342_138259483_138261150
tx.12488	chr3	-	2044	3	ISM	ENSMUSG00000028149.13	ENSMUST00000029796.11	3383	14	129301	-5	38768	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	7	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGATTACTTGGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138651530	138631665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_138633474_138647490_138647620_138651423
tx.12489	chr3	-	2378	13	FSM	ENSMUSG00000028273.16	ENSMUST00000029941.16	5016	13	23	2615	23	475	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_4	21.3476514451174	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCTGTTTAGTGAGTGT	7026	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142101431	141947965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_141948531_141950656_141950773_141953055_141953177_141955090_141955272_141964890_141965054_141983577_141983763_142009703_142009741_142010057_142010231_142017883_142018303_142020166_142020210_142058494_142058647_142097473_142097612_142101346
tx.1249	chr10	+	1291	2	ISM	ENSMUSG00000019992.9	ENSMUST00000169712.3	1991	7	9502	-26	9265	26	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATATTCTTACTGTTTTAT	3227	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20233017	20237076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_20233513_20236280
tx.12490	chr3	-	1167	6	ISM	ENSMUSG00000028273.16	ENSMUST00000195975.5	1845	15	113971	-475	26142	475	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_4	18.7573985403094	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCTGTTTAGTGAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141983598	141947965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_141948531_141950656_141950773_141953055_141953177_141955090_141955272_141964890_141965054_141983577
tx.12491	chr3	-	2901	13	NIC	ENSMUSG00000028273.16	novel	5016	13	NA	NA	15	1317	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	42	junction_9	45.7355775688419	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACAGCTTAAATCTGTGG	7018	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142101439	141947123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_141948531_141950656_141950773_141953055_141953177_141955090_141955272_141964890_141965054_141983577_141983763_142009703_142009741_142010057_142010231_142017883_142017976_142020166_142020210_142058494_142058647_142097473_142097612_142101346
tx.12492	chr3	-	2178	8	FSM	ENSMUSG00000028273.16	ENSMUST00000196908.5	1196	8	-72	-910	3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	69.1041804459183	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATACTTGTTTTCTTTCTTT	7006	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142101451	142008071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_142009183_142009703_142009741_142010057_142010231_142017883_142018303_142020166_142020210_142058494_142058647_142097473_142097612_142101346
tx.12493	chr3	-	2080	2	ISM	ENSMUSG00000028273.16	ENSMUST00000058626.9	873	10	34	86520	31	-86520	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAGAAAGAAAGTAAG	7034	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142101423	142095608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_142097612_142101346
tx.12494	chr3	+	537	4	ISM	ENSMUSG00000040213.14	ENSMUST00000129775.8	1798	15	-54	23739	-11	-5600	intron_retention	FALSE	canonical	3	81	junction_2	14.7271480229163	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAACTGTCTTAACCTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142406800	142426360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_142406937_142412449_142412553_142424136_142424196_142426121
tx.12495	chr3	+	1715	14	FSM	ENSMUSG00000040213.14	ENSMUST00000106218.8	1888	14	-10	183	-10	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_2	10.4835740777555	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGTTGTACTTTCTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142406801	142450105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_142406937_142412449_142412553_142424136_142424196_142426121_142426267_142428875_142429026_142431181_142431269_142431724_142431851_142431942_142432064_142435519_142435597_142436962_142437053_142440234_142440422_142443532_142443607_142443985_142444073_142449831
tx.12496	chr3	+	604	3	ISM	ENSMUSG00000040213.14	ENSMUST00000106218.8	1888	14	36731	4	170	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_2	8	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACACATACCTCATCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142443542	142450284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_142443607_142443985_142444073_142449831
tx.12497	chr3	+	1274	7	FSM	ENSMUSG00000028271.10	ENSMUST00000029938.10	1455	7	181	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	152	junction_1	21.5129160170246	1287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTGTTATAGTATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142470986	142489367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_142471050_142477146_142477254_142483951_142484086_142485452_142485600_142485730_142485861_142487100_142487383_142488956
tx.12498	chr3	-	2112	2	ISM	ENSMUSG00000004591.17	ENSMUST00000043812.15	6207	22	87850	1053	8966	-1053	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	461	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTGCATACCTTTGTTG	3188	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142499915	142497715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_142499776_142499863
tx.12499	chr3	-	1637	5	FSM	ENSMUSG00000028266.18	ENSMUST00000120539.8	1669	5	23	9	-17	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_4	8.32165848854662	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAACAGAGTTTGGGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143910958	143894299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_143895067_143899656_143899813_143900167_143900265_143907573_143907813_143910580
tx.125	chr1	+	3307	8	FSM	ENSMUSG00000026123.12	ENSMUST00000027297.11	3279	8	-28	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_4	21.365621823817	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTGTCTCATTGTGACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34889044	34918661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_34889145_34900953_34900999_34902086_34902240_34902551_34902655_34903553_34903594_34905221_34905312_34908380_34908487_34915991
tx.1250	chr10	+	1608	4	ISM	ENSMUSG00000019977.17	ENSMUST00000061324.6	1998	5	-5	2358	4	-2358	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1064	junction_1	54.5669822837543	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGGTACTTACCGTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21171911	21184747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_21172076_21175076_21175143_21180428_21180543_21183483
tx.12500	chr3	+	1223	5	FSM	ENSMUSG00000037072.17	ENSMUST00000082437.11	1514	5	288	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1325	junction_1	27.3404462289846	6193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTAGTCTGCTTTGTCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144276474	144303438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_144276561_144283346_144283515_144296372_144296437_144300661_144300712_144302583
tx.12501	chr3	+	1138	4	ISM	ENSMUSG00000037072.17	ENSMUST00000082437.11	1514	5	7159	3	-67	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1332	junction_2	24.9577420631132	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTAGTCTGCTTTGTCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144283345	144303438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_144283515_144296372_144296437_144300661_144300712_144302583
tx.12502	chr3	-	539	2	ISM	ENSMUSG00000037062.14	ENSMUST00000199854.5	1416	10	28235	-281	5497	281	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	342	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTGACTCATTTATTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144397731	144396825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_144397294_144397660
tx.12503	chr3	-	1516	9	FSM	ENSMUSG00000037062.14	ENSMUST00000163279.6	3961	9	224	2221	-1	281	multi-exon	TRUE	canonical	3	282	junction_5	25.8444868395563	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTGACTCATTTATTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144425872	144396825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_144397294_144397660_144397890_144402614_144402716_144403138_144403229_144411273_144411367_144412358_144412493_144414993_144415123_144418347_144418490_144425742
tx.12504	chr3	-	2195	6	NNC	ENSMUSG00000037033.10	novel	3361	14	NA	NA	20578	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_5	5.74804314527997	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAGTATTTCCTTAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144534540	144528383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_144529296_144530971_144531209_144531662_144531831_144533058_144533330_144533672_144533898_144534158
tx.12505	chr3	-	2170	6	NNC	ENSMUSG00000037033.10	novel	3361	14	NA	NA	19967	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_5	6.43117407632541	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAGTATTTCCTTAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144535151	144528383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_144529296_144530971_144531209_144531662_144531831_144533058_144533330_144533672_144533898_144534794
tx.12506	chr3	+	728	2	NIC	ENSMUSG00000085773.4	novel	1623	4	NA	NA	211	-746	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTCCAGAATTATTACTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144653532	144659893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_144653831_144659463
tx.12507	chr3	+	924	2	NNC	ENSMUSG00000085773.4	novel	1623	4	NA	NA	233	13019	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCATGCTCAAGTAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144653554	144673658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_144653831_144673010
tx.12508	chr3	+	2424	16	FSM	ENSMUSG00000028256.17	ENSMUST00000106192.9	2425	16	-19	20	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	23.1944437791084	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAGTATAAGTTTTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144824330	144859656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_144824544_144829971_144830137_144831853_144831987_144832783_144832913_144833591_144833652_144833770_144833843_144834650_144834768_144838392_144838579_144841385_144841496_144842348_144842485_144845544_144845656_144850072_144850178_144854291_144854378_144854675_144854839_144856720_144856847_144859144
tx.12509	chr3	+	2728	9	NNC	ENSMUSG00000028256.17	novel	764	7	NA	NA	-105	1036	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	9	junction_1	34.592042076177	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144824629	144844173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_144824690_144829971_144830137_144831853_144831987_144833591_144833652_144833770_144833843_144834650_144834768_144838392_144838579_144841385_144841496_144842348
tx.1251	chr10	+	2639	5	FSM	ENSMUSG00000019977.17	ENSMUST00000092674.14	2625	5	-24	10	-4	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_4	452.231688407613	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGAAGTATGTTTGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21171912	21187098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_21172076_21175076_21175143_21180428_21180543_21183483_21183679_21184997
tx.12510	chr3	+	2290	16	NNC	ENSMUSG00000028256.17	novel	913	7	NA	NA	-124	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	9	junction_1	26.9686237443935	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAGTATAAGTTTTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144824610	144859656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_144824690_144829971_144830137_144831853_144831987_144832783_144832913_144833591_144833652_144833770_144833843_144834650_144834768_144838392_144838579_144841385_144841496_144842348_144842485_144845544_144845656_144850072_144850178_144854291_144854378_144854675_144854839_144856720_144856847_144859144
tx.12511	chr3	+	698	3	ISM	ENSMUSG00000028256.17	ENSMUST00000198808.5	3747	6	9225	-2	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	109	junction_2	2.5	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAGTATAAGTTTTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144854778	144859656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_144854839_144856720_144856847_144859144
tx.12512	chr3	+	1126	11	FSM	ENSMUSG00000074182.9	ENSMUST00000199033.5	1127	11	6	-5	6	5	multi-exon	TRUE	canonical	3	509	junction_1	98.0487633782293	2051	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCATGTTACTGCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145281965	145309873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_145282049_145282605_145282752_145283856_145283923_145284006_145284114_145284199_145284286_145288283_145288388_145298570_145298640_145300354_145300436_145301878_145301957_145306212_145306335_145309689
tx.12513	chr3	+	1658	10	FSM	ENSMUSG00000074182.9	ENSMUST00000098534.9	2339	10	4	677	4	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	657	junction_9	57.8243402122986	347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCATGTTACTGCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145281990	145309873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_145282752_145283856_145283923_145284006_145284114_145284199_145284286_145288283_145288388_145298570_145298640_145300354_145300436_145301878_145301957_145306212_145306335_145309689
tx.12514	chr3	+	489	5	ISM	ENSMUSG00000074182.9	ENSMUST00000199033.5	1127	11	16656	-5	-3007	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	657	junction_4	74.4949662728966	2187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCATGTTACTGCCTTTTG	5869	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145298615	145309873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_145298640_145300354_145300436_145301878_145301957_145306212_145306335_145309689
tx.12515	chr3	+	469	4	ISM	ENSMUSG00000074182.9	ENSMUST00000199033.5	1127	11	18391	-5	-1272	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	657	junction_3	84.6417286107876	868	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCATGTTACTGCCTTTTG	7604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145300350	145309873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_145300436_145301878_145301957_145306212_145306335_145309689
tx.12516	chr3	-	2019	5	FSM	ENSMUSG00000028195.5	ENSMUST00000029846.5	2019	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	2.58602010819715	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGAATGTATGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145355736	145352730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_145353724_145353951_145354167_145354287_145354633_145354976_145355191_145355484
tx.12517	chr3	+	926	6	FSM	ENSMUSG00000028194.16	ENSMUST00000029845.15	3764	6	259	2579	259	-1568	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_5	17.0105849399719	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCCAATTTTAATCACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145464688	145597453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_145464920_145551459_145551560_145558005_145558080_145558911_145559032_145594838_145594983_145597196
tx.12518	chr3	+	2263	5	ISM	ENSMUSG00000028194.16	ENSMUST00000120310.2	2291	6	84959	-2	35228	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_4	9.17537465175128	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATGGTTGCCTTTGGGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145551461	145599023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_145551560_145558005_145558080_145558911_145559032_145594838_145594983_145597196
tx.12519	chr3	+	590	4	ISM	ENSMUSG00000028194.16	ENSMUST00000120310.2	2291	6	91501	1575	41770	-1575	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_3	9.7410927974683	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTAATTCCAATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145558003	145597446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_145558080_145558911_145559032_145594838_145594983_145597196
tx.1252	chr10	+	1893	13	ISM	ENSMUSG00000019977.17	ENSMUST00000219915.2	2733	18	-19	13958	-4	2321	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	854	junction_4	101.440013746494	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATATGTCTATGCGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21171912	21230824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_21172076_21175076_21175143_21180428_21180543_21183483_21183679_21212865_21212975_21217612_21217879_21218297_21218464_21220975_21221094_21223160_21223308_21225210_21225286_21227825_21227944_21228440_21228510_21230537
tx.12520	chr3	+	371	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105388.2	novel	321	1	NA	NA	-33	59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTCTCTCACAGAGGACC	8268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145584741	145585154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_145584841_145584882
tx.12521	chr3	+	1835	3	FSM	ENSMUSG00000028191.12	ENSMUST00000029842.9	1949	3	42	72	42	-72	multi-exon	FALSE	canonical	3	334	junction_2	11.5	712	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATGTGTCTGAGTCAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145630058	145640039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_145630271_145636160_145636450_145638705
tx.12522	chr3	+	1012	3	FSM	ENSMUSG00000036873.14	ENSMUST00000190472.2	724	3	-253	-35	-10	35	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_2	94.5	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGTTATTACTGAATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145643786	145650032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_145644084_145644652_145644852_145649516
tx.12523	chr3	+	977	3	FSM	ENSMUSG00000036873.14	ENSMUST00000039571.14	1547	3	18	552	-10	35	multi-exon	FALSE	canonical	3	242	junction_2	10.5	342	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGTTATTACTGAATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145643786	145650032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_145644084_145644652_145644852_145649551
tx.12524	chr3	+	1102	4	FSM	ENSMUSG00000036873.14	ENSMUST00000134575.8	1644	4	-8	550	-8	35	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_2	61.937244225282	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGTTATTACTGAATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145643788	145650032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_145644084_145644297_145644425_145644652_145644852_145649551
tx.12525	chr3	+	2188	6	ISM	ENSMUSG00000036825.13	ENSMUST00000039021.11	3410	14	26301	-6	436	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_2	49.5725730621278	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAAGCCTTGTGTTGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146136719	146145894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_146136835_146138235_146138373_146138730_146138902_146142297_146142413_146142930_146143097_146144410
tx.12526	chr3	+	566	3	ISM	ENSMUSG00000028189.13	ENSMUST00000029840.4	2629	6	-37	10572	-14	-2142	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	2	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAATATATTTACATAAAT	5940	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146156210	146160954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_146156386_146160101_146160241_146160702
tx.12527	chr3	+	2111	7	FSM	ENSMUSG00000028189.13	ENSMUST00000061937.13	2892	7	5	776	-3	-698	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	4.91313432432789	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGTTCTTGTTTCCTTTCT	5959	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146156229	146170828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_146156386_146160101_146160241_146160702_146160912_146163090_146163263_146164497_146164596_146165433_146165596_146169653
tx.12528	chr3	-	605	5	NNC	ENSMUSG00000028188.14	novel	1920	15	NA	NA	-18	-2024	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.79613860953409	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTATGTTTTAGGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146205482	146193189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_146193321_146194401_146194520_146195561_146195673_146199426_146199599_146205409
tx.12529	chr3	+	508	3	FSM	ENSMUSG00000068523.13	ENSMUST00000090031.12	593	3	59	26	-24	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3573	junction_2	41.5	15272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGGCCTCCTTACTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146205620	146211301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_146205776_146209014_146209155_146211088
tx.1253	chr10	+	2758	18	FSM	ENSMUSG00000019977.17	ENSMUST00000219915.2	2733	18	-19	-6	-4	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	828	junction_14	97.3053197904183	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAAAAATGTGTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21171912	21244788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_21172076_21175076_21175143_21180428_21180543_21183483_21183679_21212865_21212975_21217612_21217879_21218297_21218464_21220975_21221094_21223160_21223308_21225210_21225286_21227825_21227944_21228440_21228510_21230537_21230643_21234211_21234303_21234630_21234740_21240573_21240675_21243540_21243686_21244187
tx.12530	chr3	+	491	3	NNC	ENSMUSG00000068523.13	novel	593	3	NA	NA	-20	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1786.5	142	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGGCCTCCTTACTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146205624	146211301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_146205776_146209027_146209155_146211088
tx.12531	chr3	-	1257	9	FSM	ENSMUSG00000028187.11	ENSMUST00000029838.11	1661	9	16	388	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	514	junction_1	36.008462547018	1654	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTAGGTATTAAAGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146227168	146212098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_146212331_146212826_146212954_146213268_146213451_146213896_146213980_146217896_146218051_146218570_146218667_146223480_146223562_146225141_146225199_146226923
tx.12532	chr3	-	728	3	NNC	ENSMUSG00000048652.13	novel	729	4	NA	NA	-10	-1807	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACGGCGTGGTGCGCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146391240	146388011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_146388527_146390687_146390851_146391190
tx.12533	chr3	-	4298	10	FSM	ENSMUSG00000005034.16	ENSMUST00000102515.10	4347	10	51	-2	51	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	11.8415464455544	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGAGTCTTCTGTCCGAT	2749	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146518664	146435326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_146438469_146443688_146443854_146451014_146451138_146452354_146452451_146453675_146453803_146456237_146456321_146457201_146457301_146461386_146461516_146463461_146463524_146518392
tx.12534	chr3	+	532	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000005034.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTCTGTAGTTGTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146438213	146441122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_146438272_146438383_146438492_146440756
tx.12535	chr3	-	495	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000070343.4	novel	537	1	NA	NA	-18	51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAGAAGTGCTAGGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146545120	146544514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_146544596_146544706
tx.12536	chr3	+	624	4	NNC	ENSMUSG00000104786.2	novel	570	3	NA	NA	-17	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTGCTCACTAACCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148694770	148709673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_148694990_148704478_148704510_148706606_148706772_148709464
tx.12537	chr3	+	586	3	FSM	ENSMUSG00000104786.2	ENSMUST00000196445.2	570	3	-15	-1	-15	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGTTTTGCTCACTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148694772	148709668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_148694990_148706606_148706772_148709464
tx.12538	chr3	-	942	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000047676.7	novel	885	1	NA	NA	-78	85	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATGATAGCTATAATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149779257	149778209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_149778941_149779046
tx.12539	chr3	-	1459	6	NNC	ENSMUSG00000039131.16	novel	1596	6	NA	NA	310	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	12.1885191881541	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTGTGGGTATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151871077	151799475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_151799933_151808255_151808338_151813577_151813685_151833672_151833854_151843209_151843396_151870631
tx.1254	chr10	+	1886	13	ISM	ENSMUSG00000019977.17	ENSMUST00000219915.2	2733	18	45906	-6	-2733	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	828	junction_9	70.4526535262434	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAAAAATGTGTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21217837	21244788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_21217879_21218297_21218464_21220975_21221094_21223160_21223308_21225210_21225286_21227825_21227944_21228440_21228510_21230537_21230643_21234211_21234303_21234630_21234740_21240573_21240675_21243540_21243686_21244187
tx.12540	chr3	-	1389	6	FSM	ENSMUSG00000039131.16	ENSMUST00000046614.10	1596	6	207	0	207	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	6.40624695121879	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTGTGGGTATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151871660	151799475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_151799933_151808255_151808338_151813577_151813685_151833672_151833854_151843209_151843396_151871284
tx.12541	chr3	+	2423	20	NNC	ENSMUSG00000028034.16	novel	6523	20	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	344.405039197934	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTCGGTAAGTTGGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151916109	151938409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_151916338_151919613_151919705_151921228_151921268_151923045_151923086_151923471_151923522_151923612_151923685_151923849_151923908_151925320_151925484_151925569_151925669_151925772_151925875_151926101_151926205_151926322_151926424_151926903_151927051_151927720_151927882_151928465_151928618_151928922_151929003_151931716_151931855_151933807_151933883_151937513_151937660_151938031
tx.12542	chr3	+	1544	11	NNC	ENSMUSG00000028034.16	novel	6523	20	NA	NA	-1188	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	444.67205893782	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTCGGTAAGTTGGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151925811	151938409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_151925875_151926101_151926205_151926322_151926424_151926903_151927051_151927720_151927882_151928465_151928618_151928922_151929003_151931716_151931855_151933807_151933883_151937513_151937660_151938031
tx.12543	chr3	+	1535	11	NNC	ENSMUSG00000028034.16	novel	6523	20	NA	NA	-1188	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	482.616990998038	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTCGGTAAGTTGGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151925811	151938409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_151925875_151926101_151926205_151926322_151926424_151926903_151927051_151927720_151927882_151928465_151928618_151928922_151929003_151931716_151931846_151933807_151933883_151937513_151937660_151938031
tx.12544	chr3	-	1706	6	ISM	ENSMUSG00000054942.14	ENSMUST00000199334.5	4024	14	-14	38368	8	11450	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_4	9.69535971483266	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTTAACTGTGGGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152046034	152025581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_152026381_152027986_152028114_152039117_152039255_152040888_152041067_152043362_152043682_152045888
tx.12545	chr3	-	1610	5	ISM	ENSMUSG00000054942.14	ENSMUST00000199334.5	4024	14	-12	40068	10	9750	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_3	9.28708781050335	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGAGTATTATTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152046032	152027281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_152028114_152039117_152039255_152040888_152041067_152043362_152043682_152045888
tx.12546	chr3	-	1073	3	ISM	ENSMUSG00000054942.14	ENSMUST00000199397.2	2842	4	-35	3438	-1	2648	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_1	1.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGATATGTGTCAATAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152046045	152040469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_152041067_152043362_152043682_152045888
tx.12547	chr3	+	3896	24	FSM	ENSMUSG00000025437.16	ENSMUST00000117492.9	3886	24	-5	-5	-5	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	273	junction_13	62.1055263911158	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAATGTTGAATTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152052109	152098975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_152052277_152063476_152063609_152063782_152063837_152064272_152064336_152065919_152066073_152067536_152067640_152069614_152069685_152071850_152071965_152072377_152072457_152073872_152074288_152075913_152076055_152079022_152079136_152080256_152080427_152080551_152080623_152081878_152081913_152084480_152084527_152085072_152085254_152086150_152086278_152087351_152087522_152088547_152088630_152089752_152089862_152095377_152095481_152097286_152097356_152097845
tx.12548	chr3	+	321	3	ISM	ENSMUSG00000039068.17	ENSMUST00000089982.11	4197	14	1	36742	1	-5119	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	113	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATATTTCCACAATGATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152102321	152128372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_152102399_152125651_152125778_152128254
tx.12549	chr3	+	924	4	ISM	ENSMUSG00000039068.17	ENSMUST00000089982.11	4197	14	8	31627	-2	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	104.926429251908	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAGTTAAAAAGGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152102328	152133487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_152102399_152125651_152125778_152128254_152128409_152132913
tx.1255	chr10	+	1350	2	FSM	ENSMUSG00000037535.6	ENSMUST00000187763.2	485	2	-46	-819	-46	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCAGCTGCTGGCTACATC	6184	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21295329	21302464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_21295418_21301202
tx.12550	chr3	+	1554	11	FSM	ENSMUSG00000039047.18	ENSMUST00000159899.8	4737	11	6	3177	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_8	39.6252444787411	646	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGGTTTGTGTGTGCTGTCT	3963	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152419742	152491486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_152419865_152422698_152422753_152428121_152428214_152443822_152443959_152445765_152445878_152448125_152448223_152450081_152450200_152450350_152450462_152453237_152453411_152472075_152472161_152491032
tx.12551	chr3	-	2236	2	ISM	ENSMUSG00000052544.10	ENSMUST00000199707.2	416	3	19055	-1899	19055	1899	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	111	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGAGCGTTGTTTTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152912365	152909103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_152911229_152912254
tx.12552	chr3	-	684	2	NIC	ENSMUSG00000005493.16	novel	3110	21	NA	NA	213	-46627	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATAGCTGTTTTCATTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153611562	153609536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_153609967_153611308
tx.12553	chr3	-	599	2	ISM	ENSMUSG00000038975.15	ENSMUST00000167111.6	1418	8	3945	0	3833	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1082	junction_1	0	1515	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGTGTATATAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153613837	153612925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_153613379_153613691
tx.12554	chr3	-	973	6	ISM	ENSMUSG00000038975.15	ENSMUST00000167111.6	1418	8	1805	0	1693	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	355	junction_5	267.697291730791	923	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGTGTATATAGCTTT	8769	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153615977	153612925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_153613379_153613691_153613842_153614426_153614553_153614985_153615097_153615182_153615236_153615897
tx.12555	chr3	-	1388	9	FSM	ENSMUSG00000038975.15	ENSMUST00000196266.5	1271	9	48	-165	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	426	junction_3	203.564140690348	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGTGTATATAGCTTT	7076	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153617670	153612925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_153613379_153613691_153613842_153614426_153614537_153614985_153615097_153615182_153615236_153615700_153615799_153615897_153616004_153616327_153616526_153617561
tx.12556	chr3	-	1404	9	FSM	ENSMUSG00000038975.15	ENSMUST00000200209.5	1169	9	48	-283	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	607	junction_3	165.057565715722	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGTGTATATAGCTTT	7076	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153617670	153612925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_153613379_153613691_153613842_153614426_153614553_153614985_153615097_153615182_153615236_153615700_153615799_153615897_153616004_153616327_153616526_153617561
tx.12557	chr3	-	1306	8	FSM	ENSMUSG00000038975.15	ENSMUST00000167111.6	1418	8	112	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	355	junction_5	235.209329261041	921	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGTGTATATAGCTTT	7076	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153617670	153612925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_153613379_153613691_153613842_153614426_153614553_153614985_153615097_153615182_153615236_153615897_153616004_153616327_153616526_153617561
tx.12558	chr3	-	1406	10	NIC	ENSMUSG00000038975.15	novel	1399	10	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	357	junction_9	240.631627694519	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGTGTATATAGCTTT	6157	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153618589	153612925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_153613379_153613691_153613842_153614426_153614537_153614985_153615097_153615182_153615236_153615700_153615799_153615897_153616004_153616327_153616526_153617561_153617670_153618570
tx.12559	chr3	-	1422	10	NIC	ENSMUSG00000038975.15	novel	1775	10	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	357	junction_9	217.717962306997	343	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGTGTATATAGCTTT	6157	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153618589	153612925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_153613379_153613691_153613842_153614426_153614553_153614985_153615097_153615182_153615236_153615700_153615799_153615897_153616004_153616327_153616526_153617561_153617670_153618570
tx.1256	chr10	+	2626	12	FSM	ENSMUSG00000019970.16	ENSMUST00000164659.8	2602	12	-19	-5	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	251	junction_1	208.20654874943	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTCATGTGTTAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21854551	21875802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_21854882_21870864_21870941_21871372_21871449_21871692_21871798_21871924_21872009_21872121_21872254_21872457_21872571_21872877_21873002_21873240_21873337_21873796_21873953_21874058_21874149_21874558
tx.12560	chr3	-	1324	9	FSM	ENSMUSG00000038975.15	ENSMUST00000089950.11	1381	9	57	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	355	junction_5	268.62508724987	1260	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTGTGTATATAGCTTT	6157	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153618589	153612925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_153613379_153613691_153613842_153614426_153614553_153614985_153615097_153615182_153615236_153615897_153616004_153616327_153616526_153617561_153617670_153618570
tx.12561	chr3	-	699	2	ISM	ENSMUSG00000062908.13	ENSMUST00000072697.13	2047	12	18915	0	4425	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	941	junction_1	0	3215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCTCTGACTCTCCAGG	2168	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153631354	153627993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_153628640_153631301
tx.12562	chr3	-	1303	6	ISM	ENSMUSG00000062908.13	ENSMUST00000072697.13	2047	12	8276	0	434	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	896	junction_4	26.0967430918113	680	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCTCTGACTCTCCAGG	8268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153641993	153627993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_153628640_153631301_153631551_153635167_153635264_153635853_153635995_153638663_153638773_153641931
tx.12563	chr3	-	1891	12	FSM	ENSMUSG00000062908.13	ENSMUST00000072697.13	2047	12	156	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	875	junction_11	59.2580851965116	1485	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCTCTGACTCTCCAGG	148	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153650113	153627993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_153628640_153631301_153631551_153635167_153635264_153635853_153635995_153638663_153638773_153641931_153642063_153643339_153643421_153644190_153644292_153644533_153644604_153644706_153644805_153647519_153647608_153650032
tx.12564	chr3	-	1093	6	FSM	ENSMUSG00000047583.10	ENSMUST00000052774.8	4490	6	-6	3403	3	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_2	5.35163526410386	244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGAAAAGCAAGGTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154302738	154285470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_154285929_154293113_154293248_154296720_154296793_154299353_154299453_154300090_154300172_154302489
tx.12565	chr3	+	2035	9	FSM	ENSMUSG00000028199.19	ENSMUST00000029850.15	2507	9	472	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_1	25.4447931805311	246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCTTGTCTGTCTCGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154302819	154328819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_154302922_154310528_154310653_154312015_154312169_154317046_154317211_154319458_154319511_154324096_154324247_154327117_154327226_154327315_154327412_154327733
tx.12566	chr3	-	555	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028199.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGCCTCCCGGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154338039	154302979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_154303269_154337773
tx.12567	chr3	-	1884	4	FSM	ENSMUSG00000053870.8	ENSMUST00000066568.6	3518	4	43	1591	8	1210	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	2.16024689946929	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTGTAGCTTGGTAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154798997	154792145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_154793707_154795748_154795842_154797027_154797196_154798935
tx.12568	chr3	+	2728	11	FSM	ENSMUSG00000028180.19	ENSMUST00000106057.8	2737	11	-28	37	1	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	77	junction_9	297.644569915193	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAAGTGTTGTTTATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157239996	157253976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_157240112_157241970_157242024_157242114_157242224_157243223_157243307_157246269_157246347_157246691_157246827_157247336_157247507_157248794_157248882_157250600_157250760_157251711_157251787_157252311
tx.12569	chr3	+	427	5	ISM	ENSMUSG00000028180.19	ENSMUST00000106057.8	2737	11	-18	7667	-6	-1056	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	802	junction_1	69.0665439992476	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGCTCTCAGATATGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157240006	157246346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_157240112_157241970_157242024_157242114_157242224_157243223_157243307_157246269
tx.1257	chr10	+	2439	12	FSM	ENSMUSG00000019970.16	ENSMUST00000020145.12	2456	12	17	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	717	junction_1	88.4218850289119	610	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTCATGTGTTAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21870581	21875802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_21870725_21870864_21870941_21871372_21871449_21871692_21871798_21871924_21872009_21872121_21872254_21872457_21872571_21872877_21873002_21873240_21873337_21873796_21873953_21874058_21874149_21874558
tx.12570	chr3	+	2645	10	FSM	ENSMUSG00000028180.19	ENSMUST00000106058.8	2924	10	210	69	-6	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	697	junction_8	81.8057017542553	434	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGTGTTGTTTATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157240006	157253978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_157240112_157241970_157242024_157242114_157242224_157243223_157243307_157246269_157246347_157246691_157246827_157247336_157247507_157248794_157248882_157250600_157250760_157252311
tx.12571	chr3	+	1751	2	ISM	ENSMUSG00000028180.19	ENSMUST00000106063.6	691	6	4388	-1538	4388	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	697	junction_1	0	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGTGTTGTTTATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157250675	157253978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_157250760_157252311
tx.12572	chr3	-	1409	9	ISM	ENSMUSG00000028179.13	ENSMUST00000118539.2	1815	12	6558	0	6532	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	948	junction_5	61.3060967604365	372	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCCCTGATCCTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157624156	157599884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_157600465_157602828_157602968_157610781_157610835_157611819_157611942_157612956_157613110_157614535_157614614_157616519_157616578_157619236_157619369_157624062
tx.12573	chr3	-	1801	12	FSM	ENSMUSG00000028179.13	ENSMUST00000118539.2	1815	12	14	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	948	junction_5	60.9754048777046	2014	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCCCTGATCCTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157630700	157599884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_157600465_157602828_157602968_157610781_157610835_157611819_157611942_157612956_157613110_157614535_157614614_157616519_157616578_157619236_157619369_157624062_157624173_157625653_157625750_157626591_157626674_157630502
tx.12574	chr3	+	445	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028179.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTCTCGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157603513	157610483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_157603794_157610318
tx.12575	chr3	+	1149	7	ISM	ENSMUSG00000039988.15	ENSMUST00000164582.4	1735	14	41223	-256	116	256	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	289	junction_2	27.8851812497845	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCCTGGACCATTAACGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157694273	157711803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_157694422_157697317_157697450_157700233_157700396_157705293_157705374_157706710_157706810_157709345_157709447_157711376
tx.12576	chr3	+	625	3	ISM	ENSMUSG00000039988.15	ENSMUST00000164582.4	1735	14	53660	-254	1676	254	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	336	junction_2	8	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCCTGGACCATTAACGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157706710	157711801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_157706810_157709345_157709447_157711376
tx.12577	chr3	-	2630	13	FSM	ENSMUSG00000055436.19	ENSMUST00000121326.8	3106	13	30	446	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_12	95.9239788698437	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATGCTTCTGTAGAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157742246	157716555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_157717841_157717946_157718086_157718416_157718513_157719588_157719679_157721958_157722091_157723446_157723529_157724948_157725077_157727012_157727063_157727596_157727690_157728477_157728588_157732361_157732496_157737088_157737286_157742152
tx.12578	chr3	-	1364	2	FSM	ENSMUSG00000055436.19	ENSMUST00000145267.2	521	2	132	-975	132	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	573	junction_1	0	190	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATGCTTCTGTAGAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157718025	157716555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_157717841_157717946
tx.12579	chr3	-	1577	2	FSM	ENSMUSG00000055436.19	ENSMUST00000197292.2	930	2	1	-648	1	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAAGAAGAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157742250	157735806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_157737286_157742152
tx.1258	chr10	-	884	2	NNC	ENSMUSG00000090535.2	novel	732	5	NA	NA	4465	652	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTGCTGTCCCACCTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21919946	21915947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_21916731_21919845
tx.12580	chr3	+	2321	12	NIC	ENSMUSG00000063052.10	novel	2450	13	NA	NA	0	1	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	13	junction_1	239.919235721985	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATAGTGTTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157742336	157772727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_157742514_157754037_157754162_157757333_157757477_157758400_157758574_157760217_157760306_157760422_157760469_157761354_157761464_157764306_157764415_157766874_157766986_157768285_157768364_157769320_157769507_157771749
tx.12581	chr3	+	2705	15	FSM	ENSMUSG00000063052.10	ENSMUST00000072080.10	4142	15	40	1397	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	641	junction_2	81.4479926714224	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATAGTGTTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157742338	157772727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_157742514_157746077_157746260_157747222_157747297_157749197_157749328_157754037_157754162_157757333_157757477_157758400_157758574_157760217_157760306_157760422_157760469_157761354_157761464_157764306_157764415_157766874_157766986_157768285_157768364_157769320_157769507_157771749
tx.12582	chr3	+	2632	14	NIC	ENSMUSG00000063052.10	novel	4142	15	NA	NA	1	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	146	junction_2	190.962278254048	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTATAGTGTTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157742337	157772727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_157742514_157746077_157746260_157749197_157749328_157754037_157754162_157757333_157757477_157758400_157758574_157760217_157760306_157760422_157760469_157761354_157761464_157764306_157764415_157766874_157766986_157768285_157768364_157769320_157769507_157771749
tx.12583	chr3	+	487	4	ISM	ENSMUSG00000063052.10	ENSMUST00000072080.10	4142	15	46	24865	6	-8150	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	641	junction_2	117.109635242651	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCTCCAGCACAATGAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157742344	157749259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_157742514_157746077_157746260_157747222_157747297_157749197
tx.12584	chr3	+	2493	11	FSM	ENSMUSG00000028175.16	ENSMUST00000106041.3	1971	11	-26	-496	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_7	17.3262806164508	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTATTTTTTTCAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	159201068	159235592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_159201204_159204000_159204267_159219811_159219969_159221141_159221264_159221650_159221782_159222539_159222588_159226466_159226608_159229413_159229587_159232167_159232345_159233580_159233767_159234635
tx.12585	chr3	+	2863	10	ISM	ENSMUSG00000028175.16	ENSMUST00000120272.8	3323	12	18802	0	18777	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_9	12.6617924344984	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTATTTTTTTCAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	159219871	159235592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_159219969_159221141_159221264_159221650_159221782_159222539_159222588_159226466_159226608_159228162_159228994_159229413_159229587_159232167_159232345_159233580_159233767_159234635
tx.12586	chr3	+	2032	9	ISM	ENSMUSG00000028175.16	ENSMUST00000106041.3	1971	11	18777	-496	18777	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_5	17.3776976323102	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTATTTTTTTCAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	159219871	159235592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_159219969_159221141_159221264_159221650_159221782_159222539_159222588_159226466_159226608_159229413_159229587_159232167_159232345_159233580_159233767_159234635
tx.12587	chr3	+	464	3	ISM	ENSMUSG00000028173.11	ENSMUST00000198878.2	2050	13	83711	-3	74997	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_2	11.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTATTTCCGTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	159629084	159644303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_159629217_159639886_159640006_159644090
tx.12588	chr3	+	960	2	ISM	ENSMUSG00000028173.11	ENSMUST00000200191.2	2453	13	83709	-175	74997	175	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTGCTTAAAATGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	159629084	159640714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_159629217_159639886
tx.12589	chr4	+	596	3	Intergenic	novelGene_970	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGCTTAAGTGTCACCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3524314	3528641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_3524474_3527564_3527714_3528353
tx.1259	chr10	-	673	3	Intergenic	novelGene_86	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_1	2.5	1636	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCTGGTGTCAGTGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21934523	21930760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_21931017_21933427_21933570_21934248
tx.12590	chr4	-	2425	8	FSM	ENSMUSG00000028232.14	ENSMUST00000029891.12	2690	8	43	222	-1	-222	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_4	11.6233403467474	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATTCTTGAGATTCTTC	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3574810	3549262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_3550580_3551751_3551892_3554353_3554415_3560498_3560693_3564092_3564258_3569363_3569753_3570320_3570373_3574703
tx.12591	chr4	+	467	3	ISM	ENSMUSG00000028233.7	ENSMUST00000052712.6	4327	13	11	31431	11	1257	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_2	9.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGGGTCTACTCTTCATA	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3574885	3585188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_3575130_3583424_3583490_3585030
tx.12592	chr4	+	525	4	ISM	ENSMUSG00000028233.7	ENSMUST00000052712.6	4327	13	4	31117	4	1571	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	157	junction_3	13.1402688962847	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCAGAAGCGGTATTTAGA	-14	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3574878	3585502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_3575130_3583424_3583490_3585030_3585189_3585451
tx.12593	chr4	+	356	2	FSM	ENSMUSG00000042228.15	ENSMUST00000145083.2	687	2	-36	367	-21	-367	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACCGAACTATTTATGTGA	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3678093	3738809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_3678365_3738724
tx.12594	chr4	+	2372	8	ISM	ENSMUSG00000042228.15	ENSMUST00000041377.13	3463	13	-20	41493	-20	10944	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_2	8.63311138842179	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTACCACTTATCCAGTCC	5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3678094	3750120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_3678365_3738724_3738862_3742441_3742488_3743196_3743303_3745317_3745417_3745522_3745627_3746710_3746861_3748660
tx.12595	chr4	-	505	4	FSM	ENSMUSG00000028234.7	ENSMUST00000138502.2	3706	4	65	3136	65	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6653	junction_2	782.301021914767	375346	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCTGGCTTTTGTTCAG	-2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3835600	3834469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_3834684_3834935_3835010_3835191_3835292_3835483
tx.12596	chr4	+	559	5	FSM	ENSMUSG00000042198.13	ENSMUST00000108386.8	524	5	-32	-3	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	133.401649165218	1082	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTTTGGGGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3938855	3943526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_3938963_3939378_3939527_3941245_3941312_3942720_3942820_3943387
tx.12597	chr4	+	508	5	FSM	ENSMUSG00000042198.13	ENSMUST00000149544.8	426	5	-28	-54	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_1	158.419537936455	590	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTTTGGGGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3938861	3943526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_3938963_3939423_3939527_3941245_3941312_3942720_3942820_3943387
tx.12598	chr4	+	672	5	FSM	ENSMUSG00000042198.13	ENSMUST00000041122.11	672	5	-2	2	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	280	junction_1	68.1762421962372	3978	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTTTGGGGTTTTTTTT	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3938911	3943526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_3939132_3939378_3939527_3941245_3941312_3942720_3942820_3943387
tx.12599	chr4	+	625	5	FSM	ENSMUSG00000042198.13	ENSMUST00000121651.8	620	5	0	-5	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	167.916645988419	432	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTTTGGGGTTTTTTTT	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3938913	3943526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_3939132_3939423_3939527_3941245_3941312_3942720_3942820_3943387
tx.126	chr1	+	858	7	FSM	ENSMUSG00000026123.12	ENSMUST00000156687.8	5176	7	-12	4330	-12	-4330	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_4	21.2733531808118	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGATTTTGTGTGCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34889044	34908707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_34889145_34900953_34900999_34902086_34902240_34902551_34902655_34903553_34903594_34905221_34905312_34908380
tx.1260	chr10	+	657	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000069712.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAGTATACAAATGCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21934726	21949763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_21934857_21940036_21940260_21949459
tx.12600	chr4	+	580	4	FSM	ENSMUSG00000042198.13	ENSMUST00000119307.8	889	4	331	-22	-171	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	416	junction_3	14.7271480229163	259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTTTGGGGTTTTTTTT	332	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3939250	3943526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_3939527_3941245_3941312_3942720_3942820_3943387
tx.12601	chr4	-	1355	3	NNC	ENSMUSG00000045573.10	novel	721	3	NA	NA	-51	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTAAGAACTGGCTGTC	137	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4138870	4133529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_4134508_4138005_4138147_4138634
tx.12602	chr4	+	2170	3	FSM	ENSMUSG00000049119.15	ENSMUST00000054857.13	3210	3	-14	1054	-14	101	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	17	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTAAGTTGAGAGCAGAAT	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	5644106	5800047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_5644411_5729570_5729658_5798268
tx.12603	chr4	+	2182	4	FSM	ENSMUSG00000049119.15	ENSMUST00000124256.8	618	4	29	-1593	-2	29	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	25.9272486435067	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGATATTTATGTGGTTTTG	12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	5644118	5799975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_5644411_5678902_5678999_5729570_5729658_5798268
tx.12604	chr4	+	377	2	ISM	ENSMUSG00000049119.15	ENSMUST00000124256.8	618	4	103	119321	3	-54462	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTATGTGCTGAATGGAG	20	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	5644192	5679061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_5644411_5678902
tx.12605	chr4	+	793	2	Intergenic	novelGene_971	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGCTCAATTATTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5874356	5875770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_5874569_5875189
tx.12606	chr4	+	1663	9	NNC	ENSMUSG00000028243.6	novel	6642	8	NA	NA	3	-5060	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	6	junction_3	55.7808210767823	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATCAGCTCTTGGTAAGA	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6191100	6216628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_6191214_6196410_6196515_6198000_6198085_6202291_6202443_6203776_6203861_6204563_6204674_6208805_6208944_6214638_6214801_6215911
tx.12607	chr4	+	1542	8	FSM	ENSMUSG00000028243.6	ENSMUST00000029907.6	6642	8	5	5095	5	-5095	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_2	16.4614577676685	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTGTCATAAACTGAATT	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6191102	6216593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_6191214_6196410_6196515_6202291_6202443_6203776_6203861_6204563_6204674_6208805_6208944_6214638_6214801_6215911
tx.12608	chr4	+	1127	2	ISM	ENSMUSG00000028243.6	ENSMUST00000029907.6	6642	8	6	24261	6	-24261	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTTTAAAGCCCATAG	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6191103	6197427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_6191214_6196410
tx.12609	chr4	+	2083	9	FSM	ENSMUSG00000028249.16	ENSMUST00000029912.11	2745	9	33	629	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	359	junction_4	40.7944542799631	725	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCGTCTGTCTGTGCCTG	1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6365682	6395655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_6365760_6377076_6377143_6378965_6379048_6380989_6381100_6385025_6385188_6386532_6386709_6392945_6393118_6393636_6393729_6394509
tx.1261	chr10	-	563	2	FSM	ENSMUSG00000097327.8	ENSMUST00000181614.2	548	2	-11	-4	-11	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGCCTTGGTTTTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22024733	22020196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_22020414_22024387
tx.12610	chr4	+	2080	9	FSM	ENSMUSG00000028249.16	ENSMUST00000103008.12	2086	9	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_4	110.946425697271	259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCGTCTGTCTGTGCCTG	1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6365682	6395655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_6365760_6377076_6377143_6378965_6379048_6380989_6381100_6385028_6385188_6386532_6386709_6392945_6393118_6393636_6393729_6394509
tx.12611	chr4	+	2008	8	ISM	ENSMUSG00000028249.16	ENSMUST00000029912.11	2745	9	11425	629	234	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	359	junction_3	43.6100531379392	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCGTCTGTCTGTGCCTG	9110	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6377074	6395655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_6377143_6378965_6379048_6380989_6381100_6385025_6385188_6386532_6386709_6392945_6393118_6393636_6393729_6394509
tx.12612	chr4	-	1935	9	FSM	ENSMUSG00000041261.10	ENSMUST00000066674.8	3853	9	0	1918	0	-1918	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_2	2.31503239718152	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATTGTTGCACTCTCAAT	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8239041	8145279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_8146217_8169595_8169766_8183252_8183366_8184583_8184633_8185575_8185639_8189296_8189393_8221549_8221675_8237918_8238111_8238851
tx.12613	chr4	-	1090	9	NNC	ENSMUSG00000041261.10	novel	3853	9	NA	NA	-3	-20274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10.4095809233609	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCATTTTTTCTTGGTCTT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8239044	8163635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_8163725_8169595_8169766_8183252_8183366_8184583_8184633_8185575_8185639_8189296_8189393_8221549_8221675_8237918_8238111_8238851
tx.12614	chr4	+	866	8	FSM	ENSMUSG00000047187.10	ENSMUST00000060232.8	2133	8	165	1102	165	-1102	multi-exon	FALSE	canonical	3	1070	junction_6	76.6414924655499	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGGAGATTGTATTCATA	75	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8535808	8606676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_8535909_8561151_8561224_8572525_8572594_8577954_8578038_8578470_8578564_8582381_8582494_8604373_8604443_8606407
tx.12615	chr4	+	1553	5	ISM	ENSMUSG00000047187.10	ENSMUST00000060232.8	2133	8	42312	174	42312	-174	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1070	junction_3	63.2351761284809	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTAGTTGTTTACTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8577955	8607604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_8578038_8578470_8578564_8582381_8582494_8604373_8604443_8606407
tx.12616	chr4	-	580	2	FSM	ENSMUSG00000028207.19	ENSMUST00000130617.2	506	2	-52	-22	24	22	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTGCCTCCTTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9669138	9668290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_9668513_9668780
tx.12617	chr4	+	1382	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081715.2_ENSMUSG00000066315.10	novel	636	1	NA	NA	-27	41	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTCCATTCTGTAGAT	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10848392	10947134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_10849220_10946579
tx.12618	chr4	+	1328	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081715.2_ENSMUSG00000066315.10	novel	636	1	NA	NA	-26	36	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAACTTTTTTCCATTCTG	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10848393	10947129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_10849172_10946579
tx.12619	chr4	+	2105	6	FSM	ENSMUSG00000059482.16	ENSMUST00000080517.14	2116	6	15	-4	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_4	10.0079968025574	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTCTCTGTGCAATTAT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10874512	10899425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_10874773_10879522_10879611_10881800_10881869_10882406_10882473_10893262_10893359_10897898
tx.1262	chr10	+	1593	9	FSM	ENSMUSG00000053219.16	ENSMUST00000181645.8	1579	9	-14	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	39.8708853676464	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATGTGCTCCAGAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22034453	22059816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_22034618_22047902_22048001_22049079_22049150_22049774_22049866_22050191_22050310_22056516_22056772_22057023_22057288_22057844_22058015_22059453
tx.12620	chr4	-	2797	2	FSM	ENSMUSG00000049969.4	ENSMUST00000054776.4	2977	2	180	0	180	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	844	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTGTGTTTTTATATTG	149	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11007496	10988661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_10991355_11007392
tx.12621	chr4	-	1030	8	NIC	ENSMUSG00000050323.15	novel	863	9	NA	NA	2	3	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	35	junction_6	137.492263233171	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGGTCTGAGTTTTTTT	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11076202	11051041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_11051226_11053431_11053489_11059011_11059114_11060860_11060995_11062049_11062153_11070199_11070323_11073139_11073244_11075979
tx.12622	chr4	-	1089	9	FSM	ENSMUSG00000050323.15	ENSMUST00000126468.8	863	9	-56	-170	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_7	109.001146782958	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTGTGGTCTGAGTTTTTT	-20	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11076205	11051042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_11051226_11053431_11053489_11059011_11059114_11060860_11060995_11062049_11062153_11066650_11066708_11070199_11070323_11073139_11073244_11075979
tx.12623	chr4	-	970	9	NNC	ENSMUSG00000050323.15	novel	675	6	NA	NA	-15	-802	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	35	junction_7	135.700439848219	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTGAGCGTCACAGCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11076220	11052014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_11052064_11053431_11053489_11059011_11059114_11060860_11060995_11062049_11062153_11066650_11066708_11070199_11070323_11073139_11073244_11075979
tx.12624	chr4	+	1567	5	FSM	ENSMUSG00000028211.12	ENSMUST00000132010.8	5432	5	-12	3877	-2	2488	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_4	77.6997425993163	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATTTCTGTATATATGTT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11156428	11170502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_11156548_11164310_11164570_11165089_11165448_11167896_11167935_11169709
tx.12625	chr4	+	1532	4	FSM	ENSMUSG00000028211.12	ENSMUST00000029865.4	5404	4	6	3866	-4	2499	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_3	56.8409085860605	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATATGTTTTTTTTTCTCC	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11156436	11170513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_11156548_11164310_11164570_11165089_11165448_11169709
tx.12626	chr4	+	168	3	ISM	ENSMUSG00000028212.17	ENSMUST00000108324.4	2908	12	53	11770	47	-323	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	208	junction_1	9.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGATTTAAGGAAAAAGAGGG	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11191782	11192912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_11191816_11192680_11192718_11192814
tx.12627	chr4	+	2647	12	FSM	ENSMUSG00000028212.17	ENSMUST00000029866.16	3006	12	57	302	47	-198	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_2	64.9822607707368	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGCCATTGCTTGTAGA	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11191782	11204477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_11191816_11192680_11192718_11192817_11192912_11192992_11193047_11193925_11194078_11195019_11195156_11197152_11197300_11198728_11198825_11199296_11199432_11201304_11201417_11202189_11202348_11202984
tx.12628	chr4	+	2645	12	FSM	ENSMUSG00000028212.17	ENSMUST00000108324.4	2908	12	53	210	47	-203	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_1	27.8285779741998	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAAGTTTTGCCATTGCTT	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11191782	11204472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_11191816_11192680_11192718_11192814_11192912_11192992_11193047_11193925_11194078_11195019_11195156_11197152_11197300_11198728_11198825_11199296_11199432_11201304_11201417_11202189_11202348_11202984
tx.12629	chr4	-	1197	13	ISM	ENSMUSG00000040738.11	ENSMUST00000108319.9	3220	27	28583	-5	-5773	3	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	423	junction_9	24.8691017574464	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACAATTTAGTGGTGTTTT	9879	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11225675	11204377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_11204584_11208825_11208870_11209211_11209277_11209391_11209466_11211881_11211933_11213705_11213810_11216456_11216576_11218611_11218674_11218768_11218826_11219892_11219927_11221112_11221298_11223765_11223888_11225601
tx.1263	chr10	+	1474	8	NIC	ENSMUSG00000053219.16	novel	1579	9	NA	NA	7	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_1	37.3625371685793	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATGTGCTCCAGAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22034474	22059816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_22034618_22049079_22049150_22049774_22049866_22050191_22050310_22056516_22056772_22057023_22057288_22057844_22058015_22059453
tx.12630	chr4	-	2271	17	ISM	ENSMUSG00000045205.17	ENSMUST00000084892.12	6754	19	9	11379	9	4178	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_11	8.48436061232666	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTGTGAAGAGTGTTAC	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11322128	11272693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_11273140_11276863_11276947_11277928_11277986_11281003_11281125_11285053_11285174_11287474_11287634_11289669_11289744_11290190_11290290_11290390_11290523_11292553_11292689_11295935_11296060_11303311_11303458_11303946_11304069_11304299_11304391_11309365_11309491_11317072_11317181_11321999
tx.12631	chr4	+	734	3	ISM	ENSMUSG00000040720.16	ENSMUST00000108307.3	6571	25	60009	799	60009	-799	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_2	2	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGTATATATTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11546051	11549885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_11546301_11548730_11548875_11549544
tx.12632	chr4	-	551	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000078773.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTATCTTAAAGTATTGT	59	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11559137	11558518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_11558694_11558761
tx.12633	chr4	+	1902	8	ISM	ENSMUSG00000078773.12	ENSMUST00000070755.13	2870	15	-61	13576	-11	-3915	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	154	junction_7	24.0458745241809	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTATTTCTGTGTTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11558910	11602229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_11559014_11563326_11563478_11569820_11569933_11593620_11593816_11595666_11595940_11597831_11597995_11599675_11599902_11601550
tx.12634	chr4	+	1979	4	FSM	ENSMUSG00000078773.12_ENSMUSG00000094595.2	ENSMUST00000108306.9	652	4	-29	-1298	-2	1298	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_3	82.7056359761668	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGTAAAGCTCTGAGGA	-27	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11558919	11580255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_11559014_11563326_11563478_11569820_11569933_11578633
tx.12635	chr4	+	2501	5	NNC	ENSMUSG00000078773.12	novel	2403	4	NA	NA	8	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	23	junction_4	91.7261549395809	23	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATTGAATTTATGTTATG	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11558929	11585750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_11559014_11563326_11563478_11569820_11569933_11578633_11578714_11583676
tx.12636	chr4	+	2423	4	FSM	ENSMUSG00000078773.12	ENSMUST00000095145.12	2403	4	-12	-8	8	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_3	85.9883713068226	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGAATTTATGTTATGTA	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11558929	11585752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_11559014_11563326_11563478_11569820_11569933_11583676
tx.12637	chr4	+	2922	15	FSM	ENSMUSG00000078773.12	ENSMUST00000070755.13	2870	15	-50	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_12	66.7496464868725	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGTGTGTATCCTTAAGT	-25	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11558921	11615807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_11559014_11563326_11563478_11569820_11569933_11593620_11593816_11595666_11595940_11597831_11597995_11599675_11599902_11601550_11601759_11604865_11605006_11606045_11606337_11609293_11609470_11610303_11610566_11612371_11612439_11612617_11612819_11615442
tx.12638	chr4	+	1523	3	ISM	ENSMUSG00000078773.12	ENSMUST00000070755.13	2870	15	52508	0	2105	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	283	junction_1	10	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTGTGTGTATCCTTAA	6993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11611479	11615805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_11612439_11612617_11612819_11615442
tx.12639	chr4	-	4227	3	FSM	ENSMUSG00000049225.15	ENSMUST00000108299.2	2588	3	-16	-1623	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_2	3	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGTGAAATCTGGCTGTC	-29	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11966443	11958183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_11962234_11965613_11965649_11966301
tx.1264	chr10	-	1271	7	FSM	ENSMUSG00000071359.14	ENSMUST00000127698.8	2873	7	107	1495	21	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	232	junction_1	20.3367483471014	569	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCTTCATATCCATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22607239	22581272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_22581795_22583487_22583583_22583669_22583774_22585044_22585109_22585255_22585339_22587812_22587991_22607014
tx.12640	chr4	-	2592	2	NNC	ENSMUSG00000049225.15	novel	2588	3	NA	NA	-9	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGACTGCTATGTTTAATTC	-22	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11966436	11959806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_11962234_11966271
tx.12641	chr4	+	537	2	FSM	ENSMUSG00000085614.2	ENSMUST00000154194.2	535	2	18	-20	9	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTAATCAGGCTCCTTCC	680	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11966582	11994300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_11966684_11993864
tx.12642	chr4	-	1488	9	ISM	ENSMUSG00000049488.15	ENSMUST00000131145.9	3533	29	34349	-8	34338	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_4	3.85478598627732	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTTTGCGTTATTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12053589	12039354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_12039893_12040634_12040778_12043464_12043568_12045794_12045900_12046002_12046120_12047197_12047315_12047809_12047891_12051387_12051529_12053446
tx.12643	chr4	-	1841	13	ISM	ENSMUSG00000049488.15	ENSMUST00000131145.9	3533	29	30546	-1	30535	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_10	4.83261488913266	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAAAATTTTGGTTTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12057392	12039361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_12039893_12040634_12040778_12043464_12043568_12045794_12045900_12046002_12046120_12047197_12047315_12047809_12047891_12051387_12051529_12053446_12053587_12053674_12053775_12054745_12054833_12055030_12055130_12057315
tx.12644	chr4	+	3398	4	NNC	ENSMUSG00000052137.12	novel	3327	4	NA	NA	-61	26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_1	14.4299072146089	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTAACTTGTATTTGTGTA	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	12089377	12096269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_12089506_12089662_12089728_12092522_12092573_12093114
tx.12645	chr4	-	1134	8	NNC	ENSMUSG00000028218.20	novel	648	7	NA	NA	42	52913	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_4	130.899556445204	991	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACACAGTCTTTCTTTCAT	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	12171829	12100495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_12100753_12155648_12155769_12157650_12157765_12164087_12164193_12168222_12168325_12168964_12169034_12170983_12171219_12171697
tx.12646	chr4	-	1134	8	NIC	ENSMUSG00000028218.20	novel	1639	9	NA	NA	42	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_4	135.606423302203	1079	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACATAGTCTTTCTTTCAT	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	12171829	12153721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_12153979_12155648_12155769_12157650_12157765_12164087_12164193_12168222_12168325_12168964_12169034_12170983_12171219_12171697
tx.12647	chr4	+	1112	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060989.9	novel	1119	1	NA	NA	-52	386	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTGTAGTTCAGTTTT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	12232780	12234337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_12233419_12233863
tx.12648	chr4	+	527	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060989.9	novel	1119	1	NA	NA	-47	-573	multi-exon	FALSE	canonical	3	4269	junction_1	0	54	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGTTGTTCAGAAATACCA	1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	12232785	12233378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_12232839_12232904
tx.12649	chr4	+	1238	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060989.9	novel	1119	1	NA	NA	-46	386	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTGTAGTTCAGTTTT	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	12232786	12234337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_12233551_12233863
tx.1265	chr10	-	894	2	FSM	ENSMUSG00000071359.14	ENSMUST00000138022.2	557	2	10	-347	10	347	multi-exon	FALSE	canonical	3	264	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGTGATTCGTGTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22607250	22587332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_22587991_22607014
tx.12650	chr4	+	1229	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060989.9	novel	1119	1	NA	NA	-40	391	multi-exon	TRUE	canonical	1	102	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTAGTTCAGTTTTTCTAC	8	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12232792	12234342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_12233596_12233916
tx.12651	chr4	-	1565	2	Intergenic	novelGene_973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCACTACCACAATTTACAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12235911	12234298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_12235270_12235317
tx.12652	chr4	+	1532	5	FSM	ENSMUSG00000055963.13	ENSMUST00000183345.2	3545	5	-62	2075	-42	408	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	1.87082869338697	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTCACATGTTACTTTTA	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	12906795	12981478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_12906939_12917915_12918066_12962944_12963024_12974729_12974816_12980404
tx.12653	chr4	+	1524	5	FSM	ENSMUSG00000055963.13	ENSMUST00000143186.8	888	5	-26	-610	-26	413	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	1.6393596310755	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATGTTACTTTTATGTGT	10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	12906811	12981483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_12906939_12917915_12918066_12962941_12963024_12974729_12974816_12980404
tx.12654	chr4	-	2697	4	ISM	ENSMUSG00000040550.18	ENSMUST00000236953.2	3257	7	8128	-2	7936	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	323	junction_3	13.8162545173751	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTGTATATTCAAATTGT	8142	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14818459	14809504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_14811749_14812452_14812560_14815602_14815665_14818175
tx.12655	chr4	-	3089	7	FSM	ENSMUSG00000040550.18	ENSMUST00000236953.2	3257	7	166	2	-26	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	323	junction_3	17.5752351019521	376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACATGTGTATATTCAAA	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	14826421	14809508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_14811749_14812452_14812560_14815602_14815665_14818175_14818489_14822691_14822773_14825498_14825654_14826290
tx.12656	chr4	-	850	2	ISM	ENSMUSG00000040550.18	ENSMUST00000151012.3	2647	8	-33	14896	-33	-14896	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	328	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCTGAAACTCACTCTGT	-10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	14826428	14824941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_14825654_14826290
tx.12657	chr4	+	2313	7	FSM	ENSMUSG00000028221.4	ENSMUST00000029875.4	2339	7	115	-89	115	89	multi-exon	FALSE	canonical	3	286	junction_4	16.4688257693808	723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTTTGTTCTATTTCTTC	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	14864190	14915265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_14864438_14886533_14886683_14892392_14892500_14893500_14893625_14902486_14902540_14912431_14912523_14913723
tx.12658	chr4	+	872	6	FSM	ENSMUSG00000086587.8	ENSMUST00000136992.8	876	6	5	-1	5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_5	12.687001221723	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATGGTACAGAATTTTTG	5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	14930665	14953031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_14930771_14936440_14936540_14938483_14938558_14942199_14942276_14947438_14947546_14952620
tx.12659	chr4	+	756	5	NIC	ENSMUSG00000086587.8	novel	876	6	NA	NA	-1	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	17	junction_4	17.4928556845359	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATGGTACAGAATTTTTG	14	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	14930674	14953031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_14930771_14936440_14936540_14938483_14938558_14942199_14942276_14952620
tx.1266	chr10	-	509	6	FSM	ENSMUSG00000061983.8	ENSMUST00000218107.2	584	6	75	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2594	junction_5	774.773670177298	20309	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTGTTTGCTGGTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23663098	23661080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_23661172_23661473_23661576_23661799_23661903_23662661_23662779_23662891_23662943_23663053
tx.12660	chr4	-	1758	13	FSM	ENSMUSG00000040536.16	ENSMUST00000041606.14	4922	13	39	3125	39	-441	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	6.35249294896631	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACATTTGTGCTTTGTGAC	672	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15149092	14955369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_14955922_14957825_14957918_14960007_14960086_14965905_14966019_14975132_14975187_14978154_14978232_14989157_14989280_15004968_15005106_15052619_15052718_15065323_15065350_15111193_15111303_15140224_15140250_15148817
tx.12661	chr4	-	699	4	ISM	ENSMUSG00000040536.16	ENSMUST00000108273.2	2135	14	183790	563	182957	-563	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0.816496580927726	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATAACTGTGATTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14966004	14955491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_14955922_14957825_14957918_14960007_14960086_14965905
tx.12662	chr4	-	682	2	NNC	ENSMUSG00000040536.16	novel	4922	13	NA	NA	94052	58456	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	37	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTTCATTTTTTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15054909	15052505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_15052718_15054439
tx.12663	chr4	-	697	5	ISM	ENSMUSG00000040536.16	ENSMUST00000108273.2	2135	14	650	97579	-13	58454	internal_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_2	1.4790199457749	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATGGTTCATTTTTTATA	620	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15149144	15052507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_15052718_15065323_15065350_15111193_15111303_15140224_15140250_15148817
tx.12664	chr4	-	1000	3	NNC	ENSMUSG00000040536.16	novel	4922	13	NA	NA	64	-22742	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.5	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTCTTGTGGTCCTTATT	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	15149067	15133703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_15134429_15140224_15140250_15148817
tx.12665	chr4	+	2865	3	FSM	ENSMUSG00000043252.9	ENSMUST00000062684.9	4670	3	412	1393	412	-1393	multi-exon	FALSE	canonical	3	428	junction_2	4.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGTACTAATGTAGCAATG	50	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15266242	15285360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_15266750_15281006_15281163_15283158
tx.12666	chr4	-	1171	10	FSM	ENSMUSG00000028223.9	ENSMUST00000029877.9	2959	10	124	1664	-108	-1664	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_6	12.6207745648706	551	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGAGTGTCTGCTCTGCT	-10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	15945383	15918903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_15919095_15919193_15919257_15919831_15919979_15922484_15922558_15924253_15924354_15929726_15929875_15930913_15931001_15931124_15931183_15932892_15933096_15945282
tx.12667	chr4	+	2505	16	FSM	ENSMUSG00000028224.15	ENSMUST00000029879.15	2533	16	28	0	-14	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	165	junction_3	27.9629914152418	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTTTGTGTGGTAACGT	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	15957952	15992589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_15958111_15962310_15962445_15963771_15963921_15964246_15964407_15965133_15965238_15969340_15969459_15970720_15970915_15971765_15971864_15976034_15976165_15979140_15979414_15981306_15981749_15983953_15984023_15986508_15986665_15989001_15989116_15991181_15991232_15992433
tx.12668	chr4	+	821	6	ISM	ENSMUSG00000028224.15	ENSMUST00000029879.15	2533	16	23548	0	23506	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	214	junction_4	21.3316666015574	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTTTGTGTGGTAACGT	5060	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15981472	15992589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_15981749_15983953_15984023_15986508_15986665_15989001_15989116_15991181_15991232_15992433
tx.12669	chr4	-	2499	6	FSM	ENSMUSG00000041153.10	ENSMUST00000037198.10	2658	6	56	103	-11	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_2	19.0305018325844	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGTGTGAACACTGAGT	56	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16013832	15997223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_15999001_16001929_16002022_16005356_16005549_16006356_16006494_16008600_16008756_16013686
tx.1267	chr10	-	616	5	FSM	ENSMUSG00000061983.8	ENSMUST00000220070.2	494	5	-109	-13	4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3174	junction_1	596.623153674076	900	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTCTTGTTTGCTGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23663096	23661082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_23661172_23661473_23661576_23661799_23661903_23662661_23662779_23662891
tx.12670	chr4	-	2481	6	NIC	ENSMUSG00000041153.10	novel	2658	6	NA	NA	-22	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	39	junction_2	32.8852550545073	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGTGTGAACACTGAGT	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	16013843	15997223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_15999001_16001929_16002022_16005385_16005549_16006356_16006494_16008600_16008756_16013686
tx.12671	chr4	-	2920	16	FSM	ENSMUSG00000028228.6	ENSMUST00000029885.5	5648	16	5	2723	5	-2723	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_5	15.541199724889	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAACCGCATATACAAA	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	19570103	19521976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_19523295_19525002_19525240_19526283_19526418_19528059_19528112_19528187_19528243_19532398_19532533_19533054_19533115_19535211_19535299_19536526_19536626_19540740_19540831_19543253_19543338_19550587_19550660_19552243_19552319_19553717_19553898_19555361_19555502_19570000
tx.12672	chr4	-	1063	9	ISM	ENSMUSG00000028228.6	ENSMUST00000029885.5	5648	16	18	15812	-7	5546	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_4	14.7986485869487	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCTGCTTCAAAGGTTTGA	5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	19570090	19535065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_19535299_19536526_19536626_19540740_19540831_19543253_19543338_19550587_19550660_19552243_19552319_19553717_19553898_19555361_19555502_19570000
tx.12673	chr4	-	834	8	ISM	ENSMUSG00000028228.6	ENSMUST00000029885.5	5648	16	16	17271	-9	4087	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_3	15.8152600035406	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTATATCTTTGCAGCTA	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	19570092	19536524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_19536626_19540740_19540831_19543253_19543338_19550587_19550660_19552243_19552319_19553717_19553898_19555361_19555502_19570000
tx.12674	chr4	+	1484	8	ISM	ENSMUSG00000028229.12	ENSMUST00000029888.4	1734	10	-143	3670	-98	-3670	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_7	8.46601850858803	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTGTTGCTTTCCTGTCCT	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	19575063	19603262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_19575328_19580389_19580508_19586775_19586864_19588525_19588686_19595069_19595160_19599613_19599670_19601355_19601444_19602642
tx.12675	chr4	+	1138	10	FSM	ENSMUSG00000028229.12	ENSMUST00000029888.4	1734	10	-127	723	-82	-723	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_9	10.5736686696625	294	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGACTGTATGGCTTTTTTTC	8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	19575079	19606209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_19575328_19580389_19580508_19586775_19586864_19588525_19588686_19595069_19595160_19599613_19599670_19601355_19601444_19602642_19602674_19605402_19605537_19606084
tx.12676	chr4	-	3467	24	NIC	ENSMUSG00000041058.16	novel	6440	25	NA	NA	58	-1220	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_16	44.6113229161066	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTTCTGTGCTCAAGGT	28	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	19708935	19610892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_19611814_19618284_19618358_19619155_19619253_19621927_19622033_19623101_19623223_19627632_19627774_19627871_19628006_19631045_19631206_19635253_19635343_19638604_19638677_19638774_19638851_19639951_19640081_19640194_19640280_19640360_19640416_19641733_19641909_19643365_19643462_19659562_19659748_19661965_19662033_19662121_19662260_19672418_19672544_19673155_19673295_19678344_19678436_19687790_19687887_19708838
tx.12677	chr4	-	713	4	ISM	ENSMUSG00000041058.16	ENSMUST00000035982.8	4832	23	56423	1696	56423	-1696	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_3	8.98146239020499	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATTTGCTTTGCCTTGTTT	9965	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19622025	19611368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_19611814_19618284_19618358_19619155_19619253_19621927
tx.12678	chr4	-	601	3	ISM	ENSMUSG00000041058.16	ENSMUST00000108246.9	6440	25	30	69753	30	-68383	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_2	16.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATACTACTTCAGAAGACA	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	19708963	19678055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_19678436_19687790_19687887_19708838
tx.12679	chr4	+	2577	5	FSM	ENSMUSG00000073988.14	ENSMUST00000121491.8	2862	5	275	10	-75	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	15.2212844398888	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCACAAACCATGGTGTT	292	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20008281	20030460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_20008347_20014630_20014785_20021191_20021386_20023784_20023896_20028407
tx.1268	chr10	-	638	6	NIC	ENSMUSG00000061983.8	novel	490	7	NA	NA	2	5	intron_retention	FALSE	canonical	3	98	junction_3	1551.61727239677	2979	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCTTGTATTTCTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23663098	23661090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_23661172_23661473_23661576_23661799_23661903_23662522_23662779_23662891_23662943_23663053
tx.12680	chr4	+	2768	5	FSM	ENSMUSG00000073988.14	ENSMUST00000098244.2	3053	5	-30	315	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	18.1934053986603	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGGTGTTTATATTTTTC	-25	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	20008397	20030470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_20008644_20014630_20014785_20021191_20021386_20023784_20023896_20028407
tx.12681	chr4	+	2295	3	ISM	ENSMUSG00000073988.14	ENSMUST00000098244.2	3053	5	12837	315	12837	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_2	4	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGGTGTTTATATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20021264	20030470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_20021386_20023784_20023896_20028407
tx.12682	chr4	+	1280	9	FSM	ENSMUSG00000073987.5	ENSMUST00000098242.4	1965	9	44	641	44	-641	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_6	14.9080515158756	765	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTGTCTGTGATTATTG	19	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	20042095	20066109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_20042283_20046202_20046315_20049791_20049843_20052663_20052749_20054063_20054203_20057936_20058044_20058138_20058230_20063998_20064137_20065739
tx.12683	chr4	+	2153	12	FSM	ENSMUSG00000028252.21	ENSMUST00000102997.8	3365	12	-15	1227	10	765	multi-exon	FALSE	canonical	3	192	junction_11	80.4513096421711	233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGGTATATTAACTAATGT	5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21727710	21749319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_21727916_21730396_21730504_21732217_21732303_21732488_21732559_21735416_21735469_21740591_21740648_21741954_21741991_21742612_21742705_21743246_21743315_21746349_21746430_21746655_21746775_21748136
tx.12684	chr4	+	951	8	ISM	ENSMUSG00000028252.21	ENSMUST00000108240.3	1406	12	-35	5001	-6	4437	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	397	junction_1	40.2664594309214	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATTTTGTTTACTTTTGA	14	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21727719	21742961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_21727916_21730396_21730504_21732217_21732303_21732488_21732559_21735416_21735469_21740591_21740648_21741954_21741991_21742612
tx.12685	chr4	+	1420	12	FSM	ENSMUSG00000028252.21	ENSMUST00000108240.3	1406	12	-14	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_11	64.4238290701982	811	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTAGTTTTCTGGATTTT	-19	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21727740	21747962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_21727916_21730396_21730504_21732217_21732303_21732488_21732559_21735416_21735469_21740591_21740648_21741954_21741991_21742612_21742705_21743246_21743315_21746349_21746430_21746655_21746775_21747482
tx.12686	chr4	-	1561	4	FSM	ENSMUSG00000028251.6	ENSMUST00000029915.6	1588	4	25	2	25	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	232	junction_1	27.288581250528	956	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCATGCATGTATTTCTTT	8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21767187	21757383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_21758476_21759369_21759530_21759622_21759794_21767049
tx.12687	chr4	+	585	5	FSM	ENSMUSG00000040455.18	ENSMUST00000125262.2	592	5	12	-5	1	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	2.77263412660235	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGCCTGATAATCTTCCC	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21776272	21784845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_21776318_21780340_21780451_21781735_21781909_21782882_21782987_21784692
tx.12688	chr4	+	868	6	FSM	ENSMUSG00000028248.16	ENSMUST00000150368.8	822	6	-53	7	-20	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_4	174.396100873844	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGCCACTGAAGATGCGG	450	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21848027	21862116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_21848140_21854346_21854446_21857179_21857369_21859083_21859308_21860877_21860992_21861986
tx.12689	chr4	+	2864	12	FSM	ENSMUSG00000028248.16	ENSMUST00000029911.12	4545	12	462	1219	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_11	60.0897400518935	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTGCACCTTAATTTTAT	-14	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21848044	21875256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_21848140_21854346_21854446_21857179_21857369_21859083_21859308_21860819_21860992_21861986_21862178_21865876_21866015_21869515_21869616_21870351_21870406_21871437_21871609_21873585_21874673_21874912
tx.1269	chr10	+	558	2	Intergenic	novelGene_87	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCATGCTTGCTTCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23663323	23663984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_23663604_23663706
tx.12690	chr4	+	906	6	ISM	ENSMUSG00000028248.16	ENSMUST00000108229.2	2922	8	-10	9226	0	-7	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	402	junction_3	41.0346195303429	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGCCACTGAAGATGCGG	-11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21848047	21862116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_21848140_21854346_21854446_21857179_21857369_21859083_21859308_21860819_21860992_21861986
tx.12691	chr4	+	1258	7	FSM	ENSMUSG00000028247.3	ENSMUST00000029909.3	2651	7	0	1393	0	-1393	multi-exon	FALSE	canonical	3	302	junction_5	29.1414176426306	2360	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTGTGTCACCTAAGAGA	-10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21879672	21910769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_21879797_21892808_21892936_21896554_21896708_21899057_21899158_21900263_21900507_21908482_21908643_21910418
tx.12692	chr4	+	657	3	ISM	ENSMUSG00000028247.3	ENSMUST00000029909.3	2651	7	20688	1393	1649	-1393	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	302	junction_1	9.5	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTGTGTCACCTAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21900360	21910769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_21900507_21908482_21908643_21910418
tx.12693	chr4	+	2540	9	FSM	ENSMUSG00000040410.15	ENSMUST00000039234.10	2546	9	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_4	14.7627063914446	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTTGTTAAGAATCTTT	-33	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	22357548	22434091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_22357682_22375660_22375771_22376495_22377078_22385906_22386253_22390676_22390922_22403531_22403746_22422716_22422789_22427149_22427463_22433566
tx.12694	chr4	+	2625	10	FSM	ENSMUSG00000040410.15	ENSMUST00000184582.2	2570	10	-39	-16	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	25.9019995414816	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTTGTTAAGAATCTTT	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	22357576	22434091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_22357682_22375660_22375771_22376495_22377078_22385906_22386253_22390676_22390922_22403531_22403746_22422716_22422789_22427149_22427463_22433145_22433259_22433566
tx.12695	chr4	+	1908	2	Intergenic	novelGene_974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACGTGGTGTAGCGTCTTT	6	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22699814	22703724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_22700014_22702015
tx.12697	chr4	+	1355	5	FSM	ENSMUSG00000045751.17	ENSMUST00000138567.9	1350	5	-3	-2	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	361	junction_3	29.9457843443781	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCATTCTCGTTGATAA	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	24496458	24503415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_24497066_24497837_24497964_24500036_24500087_24502747_24502836_24502931
tx.12698	chr4	+	1158	6	NNC	ENSMUSG00000045751.17	novel	1350	5	NA	NA	-1	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_1	143.521426971724	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATTCTCGTTGATAAAG	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	24496460	24503417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_24496635_24496831_24497066_24497837_24497964_24500036_24500087_24502747_24502836_24502931
tx.12699	chr4	+	834	3	FSM	ENSMUSG00000028261.14	ENSMUST00000029925.10	3632	3	14	2784	14	-1268	multi-exon	FALSE	canonical	3	446	junction_2	23.5	1544	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGTTTGTTCTTTGTAGT	-23	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	24898096	24902217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_24898303_24898572_24898677_24901693
tx.127	chr1	+	775	3	NNC	ENSMUSG00000102531.2	novel	566	2	NA	NA	-4558	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCTTTGTCAGCATATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35914367	35920204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_35914437_35918789_35919054_35919762
tx.1270	chr10	+	2839	14	FSM	ENSMUSG00000037455.17	ENSMUST00000119597.8	2837	14	-3	1	-3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_6	14.8148334428987	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCATTGTATTCATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23672880	23703865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_23673082_23674643_23674784_23679655_23679752_23680085_23680160_23681790_23681939_23686686_23686844_23692190_23692328_23694957_23695060_23696711_23696804_23698820_23698917_23700583_23700659_23701844_23701939_23702040_23702094_23702491
tx.12700	chr4	+	1102	2	FSM	ENSMUSG00000028261.14	ENSMUST00000146721.2	2358	2	-32	1288	16	-1268	multi-exon	FALSE	canonical	3	446	junction_1	0	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGTTTGTTCTTTGTAGT	-21	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	24898098	24902217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_24898677_24901693
tx.12701	chr4	-	3950	20	NNC	ENSMUSG00000040359.15	novel	4316	19	NA	NA	0	81	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_7	58.0591445504322	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATAACTTCCTTGTATGTT	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	25281821	25248518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_25249970_25250425_25250689_25251335_25251517_25251931_25252018_25252298_25252380_25254558_25254690_25254770_25254935_25255993_25256116_25259214_25259338_25262205_25262327_25265422_25265603_25267691_25267868_25269027_25269175_25270559_25270619_25275805_25275937_25277988_25278104_25278603_25278702_25279345_25279375_25280622_25280769_25281675
tx.12702	chr4	-	2864	19	NNC	ENSMUSG00000040359.15	novel	4316	19	NA	NA	5	91	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	52.9239204710374	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTTTAAATTTATAGTGAA	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	25281816	25250055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_25250689_25251335_25251517_25251931_25252018_25252298_25252380_25254558_25254690_25254770_25254935_25255993_25256116_25259214_25259338_25262205_25262327_25265422_25265603_25267691_25267868_25269027_25269175_25270559_25270619_25275805_25275937_25277988_25278104_25278603_25278702_25279345_25279375_25280622_25280769_25281675
tx.12703	chr4	-	2102	15	NNC	ENSMUSG00000040359.15	novel	4316	19	NA	NA	9	-4189	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	58.4961624417206	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTTTTCCAGTAGTTTC	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	25281812	25254335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_25254690_25254770_25254935_25255993_25256116_25259214_25259338_25262205_25262327_25265422_25265603_25267691_25267868_25269027_25269175_25270559_25270619_25275805_25275937_25277988_25278104_25278603_25278702_25279345_25279375_25280622_25280769_25281675
tx.12704	chr4	-	2369	3	FSM	ENSMUSG00000055373.9	ENSMUST00000084770.5	12134	3	312	9453	21	113	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	8.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCTATCTGATCATTTAAA	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	25799834	25618784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_25620821_25709027_25709115_25799588
tx.12705	chr4	-	4865	5	FSM	ENSMUSG00000040520.8	ENSMUST00000041374.8	4867	5	-3	5	-3	-5	multi-exon	TRUE	canonical	3	44	junction_4	9.33742469849155	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAACTGGAAATCTATTCA	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	26346894	26324510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_26328309_26329085_26329163_26336620_26336731_26340416_26340999_26346596
tx.12706	chr4	-	388	3	Intergenic	novelGene_975	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCCCATGCCTTCTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31660984	31656985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_31657149_31658702_31658783_31660839
tx.12707	chr4	-	727	2	Intergenic	novelGene_976	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATTTGAAATAACAACTAG	6339	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32160955	32159328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_32159894_32160793
tx.12708	chr4	-	469	4	Intergenic	novelGene_977	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATTGTGGAGTTTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32186716	32162602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_32162705_32165419_32165492_32183826_32183947_32186541
tx.12709	chr4	+	1502	7	ISM	ENSMUSG00000028282.13	ENSMUST00000178925.8	6557	11	-35	12899	-13	865	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_1	38.5818034253916	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAAGTAGACATGTGAA	-11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	32615437	32640366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_32615493_32624083_32624167_32630177_32630247_32631065_32631167_32631805_32631881_32634767_32634884_32639363
tx.1271	chr10	+	1926	7	FSM	ENSMUSG00000037440.9	ENSMUST00000041416.8	2416	7	-21	511	-21	-511	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.59861050777091	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGGAGGGCCAAGTAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23770564	23780730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_23770990_23773190_23773322_23774305_23774499_23775291_23775584_23776482_23776842_23779283_23779455_23780375
tx.12710	chr4	+	702	2	ISM	ENSMUSG00000028282.13	ENSMUST00000124278.8	300	5	-17	7084	-17	-7084	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	-15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	32615433	32624726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_32615493_32624083
tx.12711	chr4	+	2219	2	ISM	ENSMUSG00000028282.13	ENSMUST00000029950.10	6799	11	24697	8891	16091	4873	internal_fragment	FALSE	canonical	3	231	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTGGAAAAAAATATAAAG	NA	False	NA	29	True	NA	NA	NA	32640174	32644374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_32641559_32643539
tx.12712	chr4	+	1257	4	ISM	ENSMUSG00000028282.13	ENSMUST00000029950.10	6799	11	30703	0	22097	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	269	junction_2	25.694789787469	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTATTAGTATGCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32646180	32653265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_32646661_32648026_32648127_32649172_32649258_32652673
tx.12713	chr4	+	453	3	FSM	ENSMUSG00000045854.5	ENSMUST00000062802.5	465	3	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	270	junction_2	3	1837	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGTTGGAATCCTCAATTG	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	32800264	32801383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_32800336_32800609_32800751_32801142
tx.12714	chr4	+	1513	7	FSM	ENSMUSG00000028278.15	ENSMUST00000098190.10	5008	7	263	3232	145	130	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_4	9.38823140367177	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGTACAATAACAGTGAGA	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	32983299	33018948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_32983608_32995801_32996098_33004150_33004351_33005133_33005249_33007069_33007213_33012903_33013053_33018646
tx.12715	chr4	+	534	3	ISM	ENSMUSG00000028278.15	ENSMUST00000136792.2	452	4	1934	-130	1934	130	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_2	7.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGTACAATAACAGTGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33007129	33018948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_33007213_33012903_33013053_33018646
tx.12716	chr4	+	1102	7	NIC	ENSMUSG00000028277.14	novel	3530	8	NA	NA	53	-2255	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	36	junction_6	28.5214344348636	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCAGGCTGTGGTCCAAA	21	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	33031468	33050108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_33031617_33036708_33036783_33038198_33038331_33040732_33040818_33041355_33041462_33043856_33043987_33049681
tx.12717	chr4	+	1121	8	FSM	ENSMUSG00000028277.14	ENSMUST00000124992.8	3530	8	75	2334	-37	-2334	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_6	15.4813910675932	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATTGTTTACAAAAAGATT	43	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	33031490	33050029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_33031617_33036708_33036783_33038198_33038331_33040732_33040818_33041355_33041462_33043856_33043987_33045079_33045200_33049681
tx.12718	chr4	+	1899	6	ISM	ENSMUSG00000028280.10	ENSMUST00000029947.6	2286	10	19795	0	19795	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_2	4.22374241638857	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGATGTCATCACTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33152315	33163588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_33152637_33157059_33157143_33158036_33158178_33160116_33160270_33161629_33161827_33162584
tx.12719	chr4	+	2437	16	FSM	ENSMUSG00000028274.18	ENSMUST00000108153.9	4157	16	22	1698	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_12	34.6965256025569	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTTCTTCTGGTTTTGTT	-14	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	33310332	33500916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_33310525_33320518_33320629_33324873_33324978_33325058_33325148_33329519_33329596_33330841_33331083_33337862_33337973_33338990_33339093_33356060_33356197_33362879_33362952_33368572_33368738_33379368_33379438_33404152_33404254_33443600_33443668_33498950_33499075_33500237
tx.1272	chr10	+	2184	10	FSM	ENSMUSG00000019998.7	ENSMUST00000220041.2	3435	10	-10	1261	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	188	junction_6	15.4632180063243	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAGTCCCAAGAACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24025214	24064859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_24025307_24031132_24031283_24053063_24053134_24055014_24055109_24055823_24055962_24056760_24056814_24057415_24057513_24058666_24058740_24060884_24060968_24063525
tx.12720	chr4	-	608	2	Intergenic	novelGene_979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGGCAAATAGGAGTGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33663771	33662888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_33663321_33663595
tx.12721	chr4	+	383	2	ISM	ENSMUSG00000028291.8	ENSMUST00000084299.6	1397	5	15041	339	15027	-339	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	826	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATGAAGTTAGTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34565977	34566569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_34566006_34566214
tx.12722	chr4	-	2273	20	FSM	ENSMUSG00000040044.12	ENSMUST00000108142.8	2266	20	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	292	junction_6	92.190426792828	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATTGCTTCATTCTTGCT	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34614920	34570795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_34571019_34571728_34571809_34572464_34572573_34575031_34575174_34576351_34576450_34577952_34578030_34579742_34579877_34584803_34584884_34585572_34585690_34586443_34586508_34586948_34587083_34593060_34593175_34595076_34595237_34597307_34597442_34598607_34598757_34599703_34599809_34605536_34605682_34607130_34607229_34611021_34611077_34614864
tx.12723	chr4	-	2276	20	FSM	ENSMUSG00000040044.12	ENSMUST00000048706.10	2300	20	24	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	324	junction_6	85.9268193438375	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATTGCTTCATTCTTGCT	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34614920	34570795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_34571019_34571728_34571809_34572464_34572573_34575031_34575174_34576351_34576450_34577952_34578033_34579742_34579877_34584803_34584884_34585572_34585690_34586443_34586508_34586948_34587083_34593060_34593175_34595076_34595237_34597307_34597442_34598607_34598757_34599703_34599809_34605536_34605682_34607130_34607229_34611021_34611077_34614864
tx.12724	chr4	+	1257	2	FSM	ENSMUSG00000028292.15	ENSMUST00000149620.2	434	2	0	-823	0	823	multi-exon	FALSE	canonical	3	576	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGGAAGAAGAAGAAGA	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34614960	34619744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_34615027_34618553
tx.12725	chr4	+	1964	21	NNC	ENSMUSG00000028292.15	novel	1868	20	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	83	junction_9	178.38710715744	99	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTGTGTAGTAGTGTGT	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34614960	34660164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_34615027_34618553_34618628_34623410_34623514_34625400_34625485_34630472_34630571_34633657_34633714_34636951_34637036_34639244_34639322_34640873_34640977_34645696_34645856_34646507_34646615_34647785_34647882_34650190_34650252_34652131_34652209_34654809_34654935_34656005_34656074_34656152_34656263_34656767_34656864_34657166_34657242_34659490_34659555_34659983
tx.12726	chr4	+	1861	20	FSM	ENSMUSG00000028292.15	ENSMUST00000029968.14	1868	20	4	3	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	576	junction_1	51.5992441268264	884	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTGTGTAGTAGTGTGT	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34614960	34660164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_34615027_34618553_34618628_34623410_34623514_34625400_34625485_34630472_34630571_34633657_34633714_34636951_34637036_34639244_34639322_34645696_34645856_34646507_34646615_34647785_34647882_34650190_34650252_34652131_34652209_34654809_34654935_34656005_34656074_34656152_34656263_34656767_34656864_34657166_34657242_34659490_34659555_34659983
tx.12727	chr4	-	1180	3	ISM	ENSMUSG00000028293.15	ENSMUST00000151549.8	1141	6	13905	-636	13812	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_1	6.5	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGTGCAGTTACTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34669557	34663256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_34664231_34668925_34669061_34669486
tx.12728	chr4	-	2032	8	FSM	ENSMUSG00000028293.15	ENSMUST00000029970.14	2039	8	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	108	junction_4	17.6831523646385	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGTGCAGTTACTTTGT	-14	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34687431	34663256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_34664231_34668925_34669061_34669486_34669664_34671779_34671847_34675029_34675183_34675471_34675632_34683284_34683463_34687243
tx.12729	chr4	-	1716	11	NIC	ENSMUSG00000028294.16	novel	1688	11	NA	NA	-1	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_10	2.61725046566048	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTACTGTGTATTTTTTTCC	-13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34730207	34711328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_34711596_34714394_34714536_34716304_34716504_34719044_34719165_34719572_34719782_34721415_34721575_34722607_34722797_34724814_34724906_34727904_34727989_34728795_34728909_34730063
tx.1273	chr10	+	1780	6	ISM	ENSMUSG00000019998.7	ENSMUST00000020174.7	2502	10	30607	0	27477	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_2	18.1394597493972	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAGTCCCAAGAACTCT	6432	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24055821	24064859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_24055962_24056760_24056814_24057415_24057513_24058666_24058740_24060884_24060968_24063525
tx.12730	chr4	-	1673	11	NNC	ENSMUSG00000028294.16	novel	1688	11	NA	NA	-8	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	2.61725046566048	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATTGTTTACTGTGTATT	-20	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34730214	34711335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_34711596_34714394_34714536_34716304_34716504_34719044_34719165_34719572_34719782_34721415_34721575_34722607_34722797_34724814_34724906_34727904_34727989_34728795_34728909_34730106
tx.12731	chr4	-	778	3	FSM	ENSMUSG00000028295.15	ENSMUST00000108134.8	782	3	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	76	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTTTGAGTTTTTCTTTT	-9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34778360	34768663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_34769148_34771257_34771415_34778223
tx.12732	chr4	-	740	3	FSM	ENSMUSG00000028295.15	ENSMUST00000029972.4	786	3	46	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_2	5.5	1488	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTTTGAGTTTTTCTTTT	-26	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34778377	34768663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_34769148_34771257_34771415_34778278
tx.12733	chr4	+	586	2	NNC	ENSMUSG00000028298.11	novel	687	4	NA	NA	12635	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	73	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAGATGTGCCGCCTTCT	1269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34906422	34907370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_34906704_34907065
tx.12734	chr4	+	887	2	NNC	ENSMUSG00000086792.2	novel	547	2	NA	NA	-17039	357	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGTTTGCAGTGGGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34945180	34967322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_34945338_34966592
tx.12735	chr4	-	2385	4	FSM	ENSMUSG00000073910.11	ENSMUST00000102975.10	6030	4	5	3640	5	-3640	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_3	2.86744175568088	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAAGTAGACATGAATGTA	-27	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	35157479	34952713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_34954048_34985915_34986119_35083769_35084390_35157251
tx.12736	chr4	-	1034	2	FSM	ENSMUSG00000073910.11	ENSMUST00000155725.2	1023	2	5	-16	5	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCTGATTGAAATGGTCGGA	-27	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	35157479	35083583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_35084390_35157251
tx.12737	chr4	-	2063	4	ISM	ENSMUSG00000028300.15	ENSMUST00000108126.8	2644	10	28750	-1	9046	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_3	11.0252236056942	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTATGTTTTAGTTCATTA	9767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35197084	35191285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_35193069_35193184_35193295_35194136_35194195_35196972
tx.12738	chr4	-	3155	11	FSM	ENSMUSG00000028300.15	ENSMUST00000108127.4	3193	11	38	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_8	10.8355895086516	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATGTTTTAGTTCATT	-19	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	35225842	35191286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_35193069_35193184_35193295_35194136_35194195_35196972_35197209_35205767_35205885_35211291_35211365_35213008_35213074_35213548_35213645_35217212_35217273_35218413_35218917_35225787
tx.12739	chr4	-	657	3	Intergenic	novelGene_980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTATTGGTGTCATTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39718753	39708408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_39708830_39718403_39718585_39718698
tx.1274	chr10	+	1639	5	ISM	ENSMUSG00000019998.7	ENSMUST00000020174.7	2502	10	31545	2	28415	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_1	19.0180834996589	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCTGAGTCCCAAGAACT	7370	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24056759	24064857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_24056814_24057415_24057513_24058666_24058740_24060884_24060968_24063525
tx.12740	chr4	+	227	2	ISM	ENSMUSG00000028405.10	ENSMUST00000102973.4	3832	21	309	34545	309	-5567	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	304	junction_1	0	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCAGGAAAGAGGTTCTT	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40143389	40163793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_40143542_40163718
tx.12741	chr4	+	3512	21	FSM	ENSMUSG00000028405.10	ENSMUST00000102973.4	3832	21	320	0	320	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	234	junction_5	35.2306684580353	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGTTGGCTTTGGAGTTGA	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40143400	40198338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_40143542_40163718_40163846_40164608_40164778_40167053_40167192_40175664_40175735_40175841_40176026_40176495_40176636_40177778_40177951_40178972_40179074_40180171_40180289_40181382_40181543_40182803_40182940_40183567_40183653_40184900_40185058_40186315_40186441_40188165_40188271_40189343_40189487_40190736_40190885_40193738_40193862_40196244_40196431_40197553
tx.12742	chr4	+	2684	15	ISM	ENSMUSG00000028405.10	ENSMUST00000102973.4	3832	21	33414	0	9618	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	255	junction_2	31.338588718338	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGTTGGCTTTGGAGTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40176494	40198338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_40176636_40177778_40177951_40178972_40179074_40180171_40180289_40181382_40181543_40182803_40182940_40183567_40183653_40184900_40185058_40186315_40186441_40188165_40188271_40189343_40189487_40190736_40190885_40193738_40193862_40196244_40196431_40197553
tx.12743	chr4	+	1616	7	ISM	ENSMUSG00000028405.10	ENSMUST00000102973.4	3832	21	43234	0	-4215	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	270	junction_5	34.6862925215263	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGTTGGCTTTGGAGTTGA	1345	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40186314	40198338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_40186441_40188165_40188271_40189343_40189487_40190736_40190885_40193738_40193862_40196244_40196431_40197553
tx.12744	chr4	-	2459	9	FSM	ENSMUSG00000040296.16	ENSMUST00000137903.8	3533	9	2	1072	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_4	6.68487097856047	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTTCCAATTCATTCCCT	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40220598	40204848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_40206107_40208450_40208595_40208770_40208923_40209878_40210050_40211549_40211641_40213730_40213880_40216354_40216491_40217329_40217488_40220398
tx.12745	chr4	+	331	2	FSM	ENSMUSG00000028407.5	ENSMUST00000129758.3	1044	2	-3	716	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_1	0	1374	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGCGTGTGGCCTTTTGTG	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40269575	40270224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_40269720_40270037
tx.12746	chr4	-	568	4	FSM	ENSMUSG00000071014.11	ENSMUST00000095128.10	659	4	20	71	8	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2502	junction_3	28.8251433455046	33263	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTGTCCGTGTTACTGTC	10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40279401	40270661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_40270848_40272809_40272855_40277652_40277746_40279157
tx.12747	chr4	-	1673	2	Intergenic	novelGene_981	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCTGAGCCTATCATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40597444	40594540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_40595084_40596314
tx.12748	chr4	-	1388	8	FSM	ENSMUSG00000028411.16	ENSMUST00000030119.10	5250	8	0	3862	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_6	8.59757915618919	660	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTTCCTGGATTGTGTAGT	1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40703194	40686243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_40686714_40688108_40688213_40690968_40691196_40693389_40693450_40694851_40695137_40695376_40695424_40697216_40697354_40703136
tx.12749	chr4	+	1470	9	FSM	ENSMUSG00000028410.14	ENSMUST00000030118.10	3376	9	49	1857	-30	-793	multi-exon	FALSE	canonical	3	1814	junction_2	361.659175709673	12968	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTGCCCTGTATGTATG	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40722528	40733107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_40722634_40723702_40723845_40723972_40724151_40726104_40726210_40727955_40728184_40730172_40730288_40731683_40731800_40732075_40732177_40732727
tx.1275	chr10	-	482	4	NNC	ENSMUSG00000087400.9	novel	468	4	NA	NA	-8054	74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.35702260395516	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTGGTTTTAGTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24434292	24425264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_24425486_24426402_24426540_24429540_24429632_24434259
tx.12750	chr4	+	1577	9	FSM	ENSMUSG00000028410.14	ENSMUST00000164233.8	5622	9	2	4043	2	-794	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_1	940.162278213182	525	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTTGCCCTGTATGTAT	-33	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40722923	40733106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_40723137_40723702_40723845_40723972_40724151_40726104_40726210_40727955_40728184_40730172_40730288_40731683_40731800_40732075_40732177_40732727
tx.12751	chr4	+	1134	7	ISM	ENSMUSG00000028410.14	ENSMUST00000030118.10	3376	9	1581	1858	12	-794	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2624	junction_1	147.058283985938	368	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTTGCCCTGTATGTAT	18	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40724060	40733106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_40724151_40726104_40726210_40727955_40728184_40730172_40730288_40731683_40731800_40732075_40732177_40732727
tx.12752	chr4	+	937	5	ISM	ENSMUSG00000028410.14	ENSMUST00000129204.8	4119	8	5036	794	3909	-794	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2693	junction_1	131.292374112132	739	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTTGCCCTGTATGTAT	854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40727957	40733106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_40728184_40730172_40730288_40731683_40731800_40732075_40732177_40732727
tx.12753	chr4	-	1154	8	ISM	ENSMUSG00000028409.12	ENSMUST00000030117.5	2418	12	5938	574	5413	-574	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1215	junction_7	73.3596118655301	711	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAAGTGCTCATAAGGGGG	7995	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40751985	40737115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_40737396_40738289_40738443_40739518_40739687_40743014_40743142_40744030_40744159_40745451_40745569_40748538_40748659_40751924
tx.12754	chr4	-	1788	12	FSM	ENSMUSG00000028409.12	ENSMUST00000030117.5	2418	12	56	574	16	-574	multi-exon	FALSE	canonical	3	1190	junction_8	75.1643928360578	4076	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAAGTGCTCATAAGGGGG	-11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40757867	40737115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_40737396_40738289_40738443_40739518_40739687_40743014_40743142_40744030_40744159_40745451_40745569_40748538_40748659_40751924_40752054_40753486_40753598_40754507_40754661_40755626_40755838_40757776
tx.12755	chr4	-	628	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000056412.7	novel	306	1	NA	NA	-203	166	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATAGGCACTGGGGGTTGG	6117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40775767	40775092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_40775596_40775642
tx.12756	chr4	-	501	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000056412.7	novel	306	1	NA	NA	-209	160	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAATAGGCACTGGG	6111	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40775773	40775098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_40775223_40775396
tx.12757	chr4	+	418	4	NNC	ENSMUSG00000028415.5	novel	397	4	NA	NA	3214	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.62466929133727	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAAGTGGCCCAGTCTTTG	3212	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40923267	40931395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_40923393_40924923_40924965_40929078_40929192_40931256
tx.12758	chr4	-	504	4	ISM	ENSMUSG00000028416.14	ENSMUST00000030125.5	1295	7	6646	16	6646	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1821	junction_3	195.380540370723	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGACTTGTGTTTTCTCAT	6712	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40941597	40936416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_40936677_40937131_40937195_40939076_40939185_40941524
tx.12759	chr4	-	1097	7	FSM	ENSMUSG00000028416.14	ENSMUST00000030125.5	1295	7	182	16	182	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	1821	junction_3	173.811599791907	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGACTTGTGTTTTCTCAT	248	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40948061	40936416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_40936677_40937131_40937195_40939076_40939185_40941524_40941639_40943624_40943708_40946168_40946298_40947721
tx.1276	chr10	-	887	2	NNC	ENSMUSG00000087400.9	novel	870	3	NA	NA	-594	66	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTTCTTCTTAAAAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24472309	24471080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_24471700_24472041
tx.12760	chr4	-	1123	8	NNC	ENSMUSG00000028416.14	novel	1348	7	NA	NA	-14	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	161	junction_7	669.499477983671	125	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGACTTGTGTTTTCTCAT	1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40948308	40936416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_40936677_40937131_40937195_40939076_40939185_40941524_40941639_40943624_40943708_40946168_40946298_40947721_40948051_40948271
tx.12761	chr4	+	1381	8	FSM	ENSMUSG00000028419.6	ENSMUST00000030128.6	1519	8	138	0	138	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	499	junction_1	44.0352363547231	563	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAATTGTAGTATCGCTTT	-18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40948544	40965303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_40948677_40949453_40949559_40950513_40950561_40952367_40952462_40952981_40953054_40958889_40958999_40960858_40960972_40964594
tx.12762	chr4	+	417	2	ISM	ENSMUSG00000028423.16	ENSMUST00000091614.7	3617	16	66	35927	66	-35488	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	562	junction_1	0	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGGCTCTCTGAGCAGAC	-20	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	40970971	40976681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_40971060_40976352
tx.12763	chr4	-	479	2	Intergenic	novelGene_983	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTTGCCTTGGTCTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41064461	41061561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_41061893_41064313
tx.12764	chr4	-	1765	6	FSM	ENSMUSG00000028435.9	ENSMUST00000055327.8	1765	6	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1694	junction_1	130.458269189806	512	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTTTTTGTGTGTGTTTT	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41098183	41092721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41093703_41093781_41094000_41094265_41094385_41094700_41094839_41095144_41095272_41098001
tx.12765	chr4	-	4431	26	FSM	ENSMUSG00000028430.15	ENSMUST00000030138.9	4599	26	168	0	168	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	287	junction_9	34.7585960591046	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGACTTGTCTTTCCTCTT	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41124287	41114426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41115507_41115681_41115784_41115883_41116079_41116375_41116466_41116594_41116720_41117394_41117493_41117659_41117813_41118089_41118254_41118417_41118573_41118648_41118767_41118882_41119024_41119236_41119313_41119412_41119562_41119753_41119877_41120006_41120185_41120273_41120390_41120537_41120640_41120723_41120783_41121006_41121128_41121210_41121366_41121451_41121587_41121778_41121948_41122123_41122304_41123258_41123376_41123458_41123660_41124158
tx.12766	chr4	+	1549	5	FSM	ENSMUSG00000036241.4	ENSMUST00000040008.4	3600	5	284	1767	284	577	multi-exon	FALSE	canonical	3	428	junction_4	37.5857353260516	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCGAGCACTTGGTTGCT	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41136026	41191613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_41136247_41174040_41174128_41183244_41183343_41189151_41189287_41190604
tx.12767	chr4	+	1196	3	FSM	ENSMUSG00000036241.4	ENSMUST00000129874.2	777	3	371	-790	371	577	multi-exon	FALSE	canonical	3	428	junction_2	53	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCGAGCACTTGGTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41183290	41191613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_41183343_41189151_41189287_41190604
tx.12768	chr4	-	949	9	NNC	ENSMUSG00000028433.15	novel	4380	29	NA	NA	14	-193	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	3	junction_1	334.30073941737	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGAGTGTTGTTGATGTTT	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41275102	41221784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_41221954_41223355_41223460_41226279_41226335_41227198_41227277_41229694_41229849_41233603_41233715_41235516_41235595_41251534_41251672_41275039
tx.12769	chr4	-	1352	6	ISM	ENSMUSG00000028436.9	ENSMUST00000030145.9	3442	9	13525	1196	13525	-1196	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	440	junction_1	60.3668783357231	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTTTACTCAGAGTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41301364	41292495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_41293215_41293932_41294112_41296310_41296474_41298285_41298352_41299406_41299601_41301333
tx.1277	chr10	+	2344	5	FSM	ENSMUSG00000019997.12	ENSMUST00000020171.12	2398	5	59	-5	59	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	4.81534007106456	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTGGCTGTTCATTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24471398	24474581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_24471687_24471773_24471997_24472244_24472497_24472629_24472842_24473212
tx.12770	chr4	-	1508	7	ISM	ENSMUSG00000028436.9	ENSMUST00000030145.9	3442	9	12150	1196	12150	-1196	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	440	junction_1	56.6992553351061	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTTTACTCAGAGTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41302739	41292495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_41293215_41293932_41294112_41296310_41296474_41298285_41298352_41299406_41299601_41301333_41301395_41302613
tx.12771	chr4	-	1123	4	ISM	ENSMUSG00000028436.9	ENSMUST00000030145.9	3442	9	16542	1196	16542	-1196	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	440	junction_1	72.5273894623419	326	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTTTACTCAGAGTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41298347	41292495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_41293215_41293932_41294112_41296310_41296474_41298285
tx.12772	chr4	-	807	5	ISM	ENSMUSG00000028436.9	ENSMUST00000030145.9	3442	9	15288	1711	15288	-1711	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	440	junction_1	65.6786685309622	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCAGTTTCCTTGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41299601	41293010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_41293215_41293932_41294112_41296310_41296474_41298285_41298352_41299406
tx.12773	chr4	-	2203	9	FSM	ENSMUSG00000028436.9	ENSMUST00000030145.9	3442	9	43	1196	43	-1196	multi-exon	FALSE	canonical	3	440	junction_1	50.3213113402264	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTTTACTCAGAGTCCAG	-10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41314846	41292495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41293215_41293932_41294112_41296310_41296474_41298285_41298352_41299406_41299601_41301333_41301395_41302613_41302821_41313210_41313466_41314487
tx.12774	chr4	-	2331	2	ISM	ENSMUSG00000028436.9	ENSMUST00000030145.9	3442	9	42	20195	42	-20195	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	561	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGGACTAA	-11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41314847	41311494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_41313466_41314487
tx.12775	chr4	+	517	2	Intergenic	novelGene_984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAATTAATTAATTAAATGG	10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41314956	41320641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_41315090_41320257
tx.12776	chr4	+	1632	3	ISM	ENSMUSG00000028437.15	ENSMUST00000108060.10	2514	6	-24	16711	-24	1770	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	290	junction_2	19	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACACTTGCTGTCTTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41348971	41373055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_41349232_41366889_41366931_41371724
tx.12777	chr4	+	721	4	ISM	ENSMUSG00000028437.15	ENSMUST00000108060.10	2514	6	40	10461	-12	-111	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	290	junction_2	19.7709101684492	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTGATGAGAAGGAAGAGC	-11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41349035	41379305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_41349232_41366889_41366931_41371724_41371850_41378946
tx.12778	chr4	+	2658	7	FSM	ENSMUSG00000028437.15	ENSMUST00000072866.12	3456	7	39	759	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	286	junction_5	24.6981780704569	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCATGCTGCCTTAACCTC	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41349034	41389766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_41349232_41366889_41366931_41371724_41371850_41378946_41379871_41387174_41387358_41388095_41388198_41388680
tx.12779	chr4	+	1731	6	NIC	ENSMUSG00000028437.15	novel	3456	7	NA	NA	-12	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_3	120.399335546339	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCCATGCTGCCTTAACC	-11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41349035	41389764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_41349232_41366889_41366931_41371724_41371850_41387174_41387358_41388095_41388198_41388680
tx.1278	chr10	-	677	3	Intergenic	novelGene_88	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTGAACTTCTGTTATACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24630570	24626374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_24626608_24629512_24629793_24630406
tx.12780	chr4	+	1280	3	ISM	ENSMUSG00000028437.15	ENSMUST00000132235.2	422	4	15541	-1074	15541	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	286	junction_1	6.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCATGCTGCCTTAACCTC	7716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41387265	41389766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_41387358_41388095_41388198_41388680
tx.12781	chr4	-	1080	2	FSM	ENSMUSG00000028438.17	ENSMUST00000127376.2	705	2	19	-394	19	394	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGACTCATAACTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41404767	41402906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41403896_41404676
tx.12782	chr4	-	1139	2	FSM	ENSMUSG00000028438.17	ENSMUST00000131532.2	1151	2	24	-12	-15	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGTTTAGACTCCATGT	-9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41464863	41454377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41455363_41464709
tx.12783	chr4	+	848	3	FSM	ENSMUSG00000028443.7	ENSMUST00000030154.7	845	3	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_1	26.5	1963	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGATGCTTTCTTGGAC	1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41465147	41480926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_41465181_41477513_41477648_41480245
tx.12784	chr4	+	813	2	ISM	ENSMUSG00000028443.7	ENSMUST00000030154.7	845	3	12362	3	12362	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_1	0	498	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACCTGTGATGCTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41477512	41480923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_41477648_41480245
tx.12785	chr4	-	1427	2	FSM	ENSMUSG00000046312.5	ENSMUST00000054920.5	4173	2	-34	2780	-34	1110	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCCGGCTGCCCGCGCTGGT	-26	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41503110	41498383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41499691_41502990
tx.12786	chr4	+	965	4	FSM	ENSMUSG00000061322.16	ENSMUST00000143198.2	965	4	-7	7	-7	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCTACCTTTATTTGTTT	1036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41631636	41638151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_41631788_41632139_41632489_41634961_41635148_41637872
tx.12787	chr4	-	835	2	FSM	ENSMUSG00000036114.4	ENSMUST00000038434.4	856	2	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	191	junction_1	0	3332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGGCCTGTTGTGTAAG	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41713513	41712032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41712815_41713460
tx.12788	chr4	-	817	7	FSM	ENSMUSG00000028447.12	ENSMUST00000030158.11	973	7	7	149	0	-149	multi-exon	FALSE	canonical	3	869	junction_5	34.1829229619443	6965	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCCTGTTGGCCTGCTGA	-9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41723163	41714946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41715260_41715395_41715456_41716395_41716455_41717356_41717441_41719836_41719924_41720782_41720868_41723034
tx.12789	chr4	-	1608	4	FSM	ENSMUSG00000036078.17	ENSMUST00000059354.15	1640	4	29	3	-10	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	474	junction_2	54.2647829320883	2836	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCGTTTCCTTATGTGTC	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41741330	41738495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41739581_41740549_41740643_41740775_41740977_41741101
tx.1279	chr10	-	973	6	NNC	ENSMUSG00000039166.17	novel	2092	8	NA	NA	21014	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_5	50.2736511504784	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGTGTTCTTACAGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25150984	25046021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_25046301_25096508_25096657_25115523_25115637_25143205_25143367_25147402_25147540_25150849
tx.12790	chr4	+	1323	11	NNC	ENSMUSG00000036073.19	novel	1595	11	NA	NA	251	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	94.6033826033721	1287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCAGAGGAGTAGTGTGGA	11	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41755503	41758695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_41755653_41755960_41756131_41756346_41756423_41756512_41756562_41756681_41756812_41756938_41757000_41757155_41757279_41757459_41757593_41757694_41757779_41758083_41758239_41758502
tx.12791	chr4	+	603	4	ISM	ENSMUSG00000036073.19	ENSMUST00000084695.12	1595	11	279	1972	-251	276	intron_retention	FALSE	canonical	3	279	junction_2	15.121728296285	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCATGTCTGTCCCTGAGA	14	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41755506	41756723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_41755653_41755960_41756131_41756346_41756423_41756512
tx.12792	chr4	+	483	5	ISM	ENSMUSG00000036073.19	ENSMUST00000084695.12	1595	11	279	1972	-251	276	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_4	21.7140507506085	762	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTCATGTCTGTCCCTGAGA	14	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41755506	41756723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_41755653_41755960_41756131_41756346_41756423_41756512_41756562_41756681
tx.12793	chr4	+	1752	13	FSM	ENSMUSG00000073889.11	ENSMUST00000098132.11	2009	13	257	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	3.12138680005467	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTCGTCTAATGTTGCT	4195	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41760452	41769474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_41760552_41763581_41763682_41763824_41763886_41764708_41764879_41765006_41765122_41765274_41765308_41765385_41765553_41766110_41766275_41767459_41767602_41767945_41768072_41768168_41768266_41768492_41768576_41769079
tx.12794	chr4	+	1768	13	FSM	ENSMUSG00000073889.11	ENSMUST00000108042.3	1768	13	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.0714111667687	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTCGTCTAATGTTGCT	1803	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41762308	41769474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_41762424_41763581_41763682_41763824_41763886_41764708_41764879_41765006_41765122_41765274_41765308_41765385_41765553_41766110_41766275_41767459_41767602_41767945_41768072_41768168_41768266_41768492_41768576_41769079
tx.12795	chr4	-	605	6	FSM	ENSMUSG00000073888.14	ENSMUST00000108037.9	590	6	-25	10	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_3	16.7020956768904	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCAAAAACTTCCGTCTC	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41774167	41769476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41769655_41769843_41769977_41771137_41771236_41773464_41773525_41773735_41773804_41774099
tx.12796	chr4	-	560	4	NIC	ENSMUSG00000073888.14	novel	552	4	NA	NA	-13	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_3	40.1192666378083	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCGTCTCTTTTATTTCA	620	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41773550	41769466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_41769655_41769843_41769977_41771137_41771291_41773464
tx.12797	chr4	-	506	4	FSM	ENSMUSG00000073888.14	ENSMUST00000136768.8	556	4	44	6	-20	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_3	19.3045763140937	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAAACTTCCGTCTCTTTT	613	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41773557	41769472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41769655_41769843_41769977_41771137_41771236_41773464
tx.12798	chr4	-	566	3	FSM	ENSMUSG00000073888.14	ENSMUST00000173865.9	657	3	91	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	31.5	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCACTGCCTCCCTGACTT	92	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41774078	41773187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41773351_41773464_41773525_41773735
tx.12799	chr4	-	408	2	FSM	ENSMUSG00000073888.14	ENSMUST00000144090.8	996	2	295	293	131	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCACTGCCTCCCTGACTT	364	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41773806	41773187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41773525_41773735
tx.128	chr1	+	483	2	FSM	ENSMUSG00000102531.2	ENSMUST00000194261.2	566	2	87	-4	87	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCTTTGTCAGCATATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35919012	35920204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_35919054_35919762
tx.1280	chr10	+	2025	6	ISM	ENSMUSG00000019978.17	ENSMUST00000092645.7	4280	20	93630	0	7	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	365	junction_1	14.319217855735	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCACTTCTCTTTTCAT	309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25377895	25399417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_25378286_25380034_25380158_25382072_25382172_25383674_25383756_25388870_25388980_25398194
tx.12800	chr4	-	359	4	FSM	ENSMUSG00000073888.14	ENSMUST00000108032.3	350	4	-9	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	26.6124448749494	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCACTGCCTCCCTGACTT	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41774167	41773187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41773351_41773464_41773525_41773735_41773804_41774099
tx.12801	chr4	-	472	3	FSM	ENSMUSG00000073888.14	ENSMUST00000133572.8	798	3	32	294	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_2	8.5	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCCACTGCCTCCCTGACT	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41774167	41773188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_41773525_41773735_41773804_41774099
tx.12802	chr4	+	400	3	NNC	ENSMUSG00000054885.12	novel	426	4	NA	NA	8410	-33	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACGATACACAATTAATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42744321	42767254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_42744437_42766686_42766852_42767134
tx.12803	chr4	-	3197	17	NNC	ENSMUSG00000028452.8	novel	3316	17	NA	NA	-7	-56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	68	junction_3	672.94966379366	1135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAGAAAAAAAAAAGACAT	9808	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43000440	42980018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_42980635_42980793_42980949_42982530_42982687_42982836_42983150_42983363_42983577_42984303_42984427_42984530_42984696_42985153_42985267_42985931_42986068_42986145_42986280_42988661_42988765_42990745_42990878_42993148_42993280_42993685_42993829_42995895_42996069_42996231_42996344_43000161
tx.12804	chr4	-	1184	4	NNC	ENSMUSG00000028452.8	novel	3316	17	NA	NA	2727	-57	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	68	junction_3	1265.39831234631	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAGAAAAAAAAAAGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42983094	42980019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_42980635_42980793_42980949_42982530_42982687_42982836
tx.12805	chr4	-	2695	14	FSM	ENSMUSG00000028453.11	ENSMUST00000030165.5	2771	14	82	-6	-51	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_11	17.9578731229673	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTATGTGTGTGTGTGTG	245	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43010273	43002336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_43003093_43003226_43003345_43003782_43003933_43004558_43004606_43004743_43005034_43005210_43005278_43006461_43006614_43006749_43006897_43006983_43007115_43007267_43007404_43008710_43008914_43009147_43009280_43009706_43009801_43010001
tx.12806	chr4	-	1532	5	ISM	ENSMUSG00000028454.17	ENSMUST00000149333.8	2312	11	4188	0	-1186	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	131	junction_4	29.1322415890024	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGCTAAGATCTGTGAGG	9550	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43020892	43017634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_43018039_43018147_43018219_43019211_43019436_43019646_43019854_43020266
tx.12807	chr4	-	987	4	ISM	ENSMUSG00000028454.17	ENSMUST00000149333.8	2312	11	5144	2	-230	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_2	7.31816613336672	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTAGCTAAGATCTGTGA	5876	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43019936	43017636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_43018039_43018147_43018219_43019211_43019436_43019646
tx.12808	chr4	-	1075	5	NNC	ENSMUSG00000028454.17	novel	4239	10	NA	NA	-1305	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_4	84.0992716972032	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTAGCTAAGATCTGTG	9431	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43021011	43017637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_43018039_43018147_43018219_43019211_43019436_43019646_43019854_43020839
tx.12809	chr4	-	1165	9	ISM	ENSMUSG00000028455.16	ENSMUST00000030169.15	1874	10	600	329	248	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2647	junction_5	244.637870126438	693	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCCTCATTGATTGGGGG	9189	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43031110	43028018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_43028294_43028937_43029067_43029278_43029359_43029492_43029638_43029769_43029905_43030048_43030151_43030239_43030299_43030435_43030536_43030970
tx.1281	chr10	+	1506	4	ISM	ENSMUSG00000019978.17	ENSMUST00000219372.2	523	5	3900	-1096	587	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	372	junction_3	13.8884444373331	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCACTTCTCTTTTCAT	4492	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25382078	25399417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_25382172_25383674_25383756_25388870_25388980_25398194
tx.12810	chr4	-	1243	10	FSM	ENSMUSG00000028455.16	ENSMUST00000030169.15	1874	10	302	329	28	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	2352	junction_9	320.749854459519	5806	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCCTCATTGATTGGGGG	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	43031408	43028018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_43028294_43028937_43029067_43029278_43029359_43029492_43029638_43029769_43029905_43030048_43030151_43030239_43030299_43030435_43030536_43030970_43031109_43031328
tx.12811	chr4	+	501	3	NIC	ENSMUSG00000096974.3	novel	551	4	NA	NA	19	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCAGGTGTCCTGCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43045984	43053254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_43046244_43051236_43051378_43053153
tx.12812	chr4	+	542	3	FSM	ENSMUSG00000096974.3	ENSMUST00000209785.2	551	3	12	-3	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCAGGTGTCCTGCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43045977	43053254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_43046278_43051236_43051378_43053153
tx.12813	chr4	+	1308	3	ISM	ENSMUSG00000035969.16	ENSMUST00000173682.8	4256	11	10901	-436	2006	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_2	9.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCCATTTTCTTTGTGCC	9435	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43425596	43427085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_43426129_43426227_43426366_43426447
tx.12814	chr4	+	812	6	FSM	ENSMUSG00000028461.13	ENSMUST00000030181.12	817	6	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	301	junction_5	16.9162643630324	1725	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGGTGTTCCTCTGTGCTT	-21	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	43493366	43495921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_43493537_43493607_43493760_43495194_43495256_43495341_43495433_43495508_43495622_43495696
tx.12815	chr4	-	1457	8	ISM	ENSMUSG00000028465.17	ENSMUST00000030187.14	8393	57	27876	-1	13101	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	264	junction_5	10.2638656838206	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCAGCCTGGCTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43534546	43531517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_43532086_43532191_43532321_43532829_43533013_43533125_43533189_43533303_43533430_43533553_43533679_43533862_43533969_43534389
tx.12816	chr4	+	569	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028465.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAAAGGCCTTGGGCAAT	1753	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43557676	43558503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_43557802_43558059
tx.12817	chr4	-	652	2	FSM	ENSMUSG00000028465.17	ENSMUST00000123985.2	937	2	278	7	9	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_1	0	452	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTATTATCTTCATATT	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	43562413	43559349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_43559718_43562129
tx.12818	chr4	+	1525	9	FSM	ENSMUSG00000028466.16	ENSMUST00000102944.11	1884	9	295	64	-186	-64	multi-exon	TRUE	canonical	3	77	junction_5	10.0615294563004	320	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCCTTGAATACTTCATC	-15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	43562626	43566996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_43562960_43563049_43563207_43563280_43563352_43563468_43563559_43565260_43565368_43565466_43565536_43566119_43566205_43566293_43566379_43566468
tx.12819	chr4	-	652	2	ISM	ENSMUSG00000028467.16	ENSMUST00000148426.8	3130	15	10253	-1	1806	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTAGTGTGGTGTGTCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43567836	43566927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_43567468_43567724
tx.1282	chr10	-	909	3	FSM	ENSMUSG00000112803.2	ENSMUST00000217933.2	542	3	-168	-199	-168	199	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAGAACTAATTCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25584009	25577108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_25577665_25581610_25581746_25583791
tx.12820	chr4	-	1245	6	ISM	ENSMUSG00000028467.16	ENSMUST00000148426.8	3130	15	9288	-1	841	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_3	4.79165942028438	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTAGTGTGGTGTGTCTGAG	9858	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43568801	43566927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_43567468_43567724_43567917_43567999_43568116_43568195_43568339_43568437_43568545_43568654
tx.12821	chr4	-	600	5	FSM	ENSMUSG00000028470.11	ENSMUST00000030192.5	610	5	12	-2	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	693	junction_3	25.1433390781734	3789	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTATCCCTGTCTTAAA	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	43656454	43654226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_43654412_43654512_43654586_43654715_43654821_43654905_43655047_43656358
tx.12822	chr4	+	511	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000028475.10_ENSMUSG00000043770.11	novel	4086	2	NA	NA	-120	26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCTTCATTGTGTCACAC	8384	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43663922	43734560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_43664407_43734533
tx.12823	chr4	+	736	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000071001.5	novel	1452	1	NA	NA	-7164	-529	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTGAACTGGTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43720023	43728110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_43720115_43727465
tx.12824	chr4	+	2038	5	FSM	ENSMUSG00000028480.15	ENSMUST00000030202.14	2320	5	282	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	229	junction_4	22.0567450001128	195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTCCTCTAATGCGATT	-24	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	43957682	43979118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_43957774_43968111_43968221_43968571_43968676_43970499_43970578_43977462
tx.12825	chr4	-	1307	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000070999.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCAGTTTCATGGTGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43993200	43983606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_43984710_43985992_43986071_43993074
tx.12826	chr4	+	1054	5	FSM	ENSMUSG00000028478.19	ENSMUST00000170241.8	1079	5	26	-1	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1242	junction_1	75.1631558677521	7634	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACATGAAGCATCTTTAATT	-9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	44012668	44032846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_44013009_44018812_44018851_44019873_44019992_44025448_44025561_44032400
tx.12827	chr4	-	831	3	ISM	ENSMUSG00000028479.19	ENSMUST00000174522.8	1797	9	14858	16	14858	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_1	3	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGATATCTGGTCCCAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44040439	44036825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_44037354_44038946_44039064_44040253
tx.12828	chr4	-	2825	12	FSM	ENSMUSG00000028479.19	ENSMUST00000102936.9	2920	12	95	0	53	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_9	6.79693659727954	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGATATCTGGTCCCAGAA	335	False	44072721	NA	False	NA	NA	NA	44072683	44036825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_44037354_44038946_44039064_44040253_44040437_44041662_44041885_44042162_44042293_44044758_44044970_44045902_44045991_44052770_44052984_44055204_44055358_44059775_44060228_44066754_44066961_44072361
tx.12829	chr4	+	387	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028479.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGATCATGTGCGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44050031	44050735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_44050119_44050435
tx.1283	chr10	+	716	4	NNC	ENSMUSG00000019889.11	novel	1464	3	NA	NA	-4	-984	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	79.432710866214	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGAATGTAACTGGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27950845	28139685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_27951174_28082129_28082253_28124427_28124504_28139496
tx.12830	chr4	-	1340	4	ISM	ENSMUSG00000028479.19	ENSMUST00000102936.9	2920	12	105	18162	-49	317	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_1	9.97775303139718	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCGCCGGGTGCAGTTTGC	-38	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	44072673	44054987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_44055358_44059775_44060228_44066754_44066961_44072361
tx.12831	chr4	-	3076	3	ISM	ENSMUSG00000028479.19	ENSMUST00000102936.9	2920	12	97	20852	55	2022	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_2	4	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTAAGCTTATTTTGTGT	337	False	44072721	NA	False	NA	NA	NA	44072681	44057677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_44060228_44066754_44066961_44072361
tx.12832	chr4	+	724	2	Intergenic	novelGene_986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCCAAGATGGTTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44269105	44270084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_44269221_44269475
tx.12833	chr4	+	2546	18	NNC	ENSMUSG00000035683.14	novel	2955	18	NA	NA	38	-378	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_12	109.85725245497	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGACTATTTGGAGTGTG	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	44300913	44364297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_44301073_44303570_44303667_44306031_44306118_44306989_44307107_44308905_44309050_44310289_44310359_44312163_44312257_44318023_44318123_44324199_44324269_44325640_44325740_44332879_44332967_44340625_44340753_44344912_44345024_44347123_44347356_44349843_44349941_44350941_44351111_44360871_44360976_44363709
tx.12834	chr4	+	1135	5	ISM	ENSMUSG00000035683.14	ENSMUST00000045607.12	2955	18	46302	379	43610	-379	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	413	junction_4	24.3361870472759	349	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGAGACTATTTGGAGTGT	9353	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44347177	44364296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_44347356_44349843_44349941_44350941_44351111_44360871_44360976_44363709
tx.12835	chr4	+	2505	9	FSM	ENSMUSG00000035649.18	ENSMUST00000107824.9	2503	9	10	-12	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_2	42.9270820694815	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTTTATTGTTACAAAAG	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	44756577	44932215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_44756693_44761849_44762475_44893532_44893571_44894915_44895042_44895818_44895990_44908450_44908487_44925974_44926071_44929117_44929236_44931035
tx.12836	chr4	+	1240	9	FSM	ENSMUSG00000035637.15	ENSMUST00000045078.13	1280	9	7	33	-1	-33	multi-exon	FALSE	canonical	3	277	junction_3	33.5326333591622	961	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGGCCTATGACTTGGGG	-24	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	44981401	44990701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_44981535_44982878_44983010_44983873_44983947_44984429_44984547_44985306_44985396_44986285_44986391_44987215_44987352_44988919_44989051_44990376
tx.12837	chr4	-	2900	2	FSM	ENSMUSG00000049657.10	ENSMUST00000055028.9	4316	2	49	1367	49	372	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTTTCCTCTGGTGATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45012345	44992608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_44995387_45012223
tx.12838	chr4	+	1605	12	FSM	ENSMUSG00000028318.15	ENSMUST00000133157.8	2986	12	51	1330	-28	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_4	16.5753974809925	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATCTCCCTCCTTTCATGT	-14	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	45018633	45032362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_45018793_45019273_45019378_45022207_45022285_45023192_45023279_45025769_45025829_45026763_45026909_45027363_45027472_45028002_45028100_45029337_45029472_45030752_45030835_45031366_45031499_45031940
tx.12839	chr4	-	636	2	FSM	ENSMUSG00000078713.9	ENSMUST00000107810.3	639	2	2	1	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2176	junction_1	0	15322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTGGTTTTGTGTTTTTAA	-14	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	45108112	45105208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_45105645_45107912
tx.1284	chr10	+	511	2	ISM	ENSMUSG00000019889.11	ENSMUST00000219761.2	1464	3	-164	58361	-8	-58361	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACAAACAAGATTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27950841	28082308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_27951174_28082129
tx.12840	chr4	+	1391	9	FSM	ENSMUSG00000035601.10	ENSMUST00000044673.9	2064	9	31	642	3	347	multi-exon	FALSE	canonical	3	203	junction_1	41.8103979292233	286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCCGATTTCCACCAGCT	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	45297157	45315489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_45297196_45300416_45300628_45301235_45301351_45304263_45304389_45305743_45305897_45307891_45307971_45308496_45308565_45314282_45314407_45315011
tx.12841	chr4	-	527	2	ISM	ENSMUSG00000028322.12	ENSMUST00000030003.10	1077	4	2825	16	2532	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	481	junction_1	0	345	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTTGGTAGTGTCTATA	2803	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45317804	45316628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_45317029_45317677
tx.12842	chr4	-	1051	4	FSM	ENSMUSG00000028322.12	ENSMUST00000030003.10	1077	4	10	16	10	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	481	junction_1	46.9065264352651	3201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTTGGTAGTGTCTATA	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	45320619	45316628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_45317029_45317677_45317830_45319549_45319700_45320270
tx.12843	chr4	-	1934	3	FSM	ENSMUSG00000045973.19	ENSMUST00000107796.8	4433	3	0	2499	0	819	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_2	5.5	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGGGGTTTTAATGCAA	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	45408761	45398421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_45400180_45404726_45404836_45408694
tx.12844	chr4	-	1825	2	FSM	ENSMUSG00000045973.19	ENSMUST00000132815.3	1005	2	-1	-819	0	819	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGGGGTTTTAATGCAA	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	45408761	45398421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_45400180_45408694
tx.12845	chr4	+	648	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000044813.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAACTGCTGTGATTGATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45531310	45533435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_45531549_45531926_45532012_45533110
tx.12846	chr4	+	2243	2	FSM	ENSMUSG00000035561.6	ENSMUST00000044384.5	2298	2	55	0	-44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTATCACTGTTTTCCTT	-28	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	45799076	45804604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_45799170_45802454
tx.12847	chr4	-	2079	11	NNC	ENSMUSG00000035495.16	novel	3726	10	NA	NA	-3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	59.5519940891991	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGGGAAGAGTGCTCTGTG	-27	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	46138458	46114742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_46115268_46116900_46117084_46119142_46119282_46119840_46120000_46120447_46120567_46124042_46124149_46124899_46125026_46129226_46129348_46131842_46132157_46135386_46135595_46138379
tx.12848	chr4	-	1904	6	FSM	ENSMUSG00000035495.16	ENSMUST00000160008.2	1547	6	-36	-321	6	321	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_5	18.8722017793367	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGAGTAAGAGTATCTGG	-18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	46138449	46123083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_46124149_46124899_46125026_46129226_46129348_46131842_46132157_46135386_46135595_46138379
tx.12849	chr4	-	569	2	ISM	ENSMUSG00000035495.16	ENSMUST00000160008.2	1547	6	-40	11695	2	402	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAGAAAGAAAAAAAGA	-22	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	46138453	46135099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_46135595_46138379
tx.1285	chr10	+	744	3	FSM	ENSMUSG00000019889.11	ENSMUST00000219761.2	1464	3	-157	877	-1	-877	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_2	6	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGCTGTCTTGTATTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27950848	28139792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_27951174_28082129_28082253_28139496
tx.12850	chr4	+	2876	23	FSM	ENSMUSG00000028330.9	ENSMUST00000030014.9	3010	23	134	0	134	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	296	junction_19	36.3529529761015	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGGGAGTCATGGTTTAT	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	46138746	46172403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_46138887_46144784_46144874_46145373_46145475_46147378_46147536_46149861_46149970_46150638_46150761_46152015_46152086_46152909_46153126_46155749_46155848_46156759_46156824_46157822_46157934_46159658_46159724_46161260_46161324_46162091_46162167_46162960_46163065_46165165_46165289_46166737_46166841_46167301_46167396_46168450_46168555_46169128_46169244_46169944_46170074_46170471_46170586_46171892
tx.12851	chr4	+	732	3	ISM	ENSMUSG00000028330.9	ENSMUST00000133286.2	781	8	4771	-424	4771	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	392	junction_1	14	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGGGAGTCATGGTTTAT	3894	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46169966	46172403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_46170074_46170471_46170586_46171892
tx.12852	chr4	+	564	2	ISM	ENSMUSG00000028330.9	ENSMUST00000133286.2	781	8	5337	-424	5337	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	420	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGGGAGTCATGGTTTAT	4460	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46170532	46172403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_46170586_46171892
tx.12853	chr4	-	313	2	ISM	ENSMUSG00000028329.14	ENSMUST00000141318.2	577	4	2446	0	2413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGATGCAGTCTTCACAGA	1079	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46183236	46175221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_46175416_46183117
tx.12854	chr4	-	430	3	ISM	ENSMUSG00000028329.14	ENSMUST00000030013.12	955	6	11906	0	1244	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_2	3	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGATGCAGTCTTCACAGA	9921	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46184405	46175221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_46175416_46183117_46183236_46184287
tx.12855	chr4	-	781	6	FSM	ENSMUSG00000028329.14	ENSMUST00000030013.12	955	6	174	0	167	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_2	5.6	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGATGCAGTCTTCACAGA	178	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46196137	46175221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_46175416_46183117_46183236_46184287_46184454_46185590_46185697_46193049_46193158_46196048
tx.12857	chr4	-	1510	5	FSM	ENSMUSG00000028331.13	ENSMUST00000030015.6	1527	5	1	16	1	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_4	13.5346776836392	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGGGTCTCTCTCTCTCTC	-13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	46389436	46379879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_46380311_46382058_46382686_46386093_46386252_46387567_46387743_46389317
tx.12858	chr4	-	765	2	ISM	ENSMUSG00000028331.13	ENSMUST00000030015.6	1527	5	7059	2	7040	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTCTGTCTGAGCTTTGA	7045	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46382378	46379865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_46380311_46382058
tx.12859	chr4	-	895	2	ISM	ENSMUSG00000028331.13	ENSMUST00000030015.6	1527	5	7	7097	7	-7097	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTTAGAAATTTGGATACT	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	46389430	46386960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_46387743_46389317
tx.1286	chr10	+	1194	8	ISM	ENSMUSG00000019889.11	ENSMUST00000218276.2	4754	34	510766	-71	-1373	71	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_2	29.1148324636731	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGACTGTATGAGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28461615	28472033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_28461692_28461918_28462069_28462903_28463078_28464923_28465056_28465254_28465381_28467880_28468045_28468765_28468902_28471797
tx.12860	chr4	+	720	4	ISM	ENSMUSG00000028333.11	ENSMUST00000102926.5	1716	7	17802	130	17802	-130	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5793	junction_2	213.552491595548	2737	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTCTCATGCTTTTCTT	13	False	NA	-53	True	NA	NA	NA	46468703	46472527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_46468788_46469882_46470008_46471397_46471468_46472086
tx.12861	chr4	+	607	3	ISM	ENSMUSG00000028333.11	ENSMUST00000102926.5	1716	7	19010	130	19010	-130	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5793	junction_1	2	5364	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTCTCATGCTTTTCTT	1189	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46469911	46472527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_46470008_46471397_46471468_46472086
tx.12862	chr4	+	513	2	ISM	ENSMUSG00000028333.11	ENSMUST00000102926.5	1716	7	20494	130	20494	-130	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5797	junction_1	0	1031	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTCTCATGCTTTTCTT	-2	True	NA	-25	True	NA	NA	NA	46471395	46472527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_46471468_46472086
tx.12863	chr4	+	1161	6	FSM	ENSMUSG00000028334.11	ENSMUST00000030018.5	2179	6	60	958	-11	-958	multi-exon	FALSE	canonical	3	811	junction_3	76.1377698648969	1744	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGCTGCTGCTGTCCAGT	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	46489307	46502674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_46489491_46492705_46492922_46499042_46499143_46500065_46500221_46500712_46500980_46502434
tx.12864	chr4	-	3025	2	FSM	ENSMUSG00000039740.7	ENSMUST00000044148.3	3021	2	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCAGTTTATGGTTGCG	-21	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	47474337	47469832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_47472459_47473938
tx.12865	chr4	+	554	4	FSM	ENSMUSG00000053317.12	ENSMUST00000065678.6	564	4	8	2	8	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2329	junction_2	60.4225859169308	17215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGGTTGCCTGTGCTTTA	-14	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	47474665	47483240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_47474754_47474911_47475010_47480130_47480233_47482974
tx.12866	chr4	+	467	3	FSM	ENSMUSG00000053317.12	ENSMUST00000125622.2	424	3	103	-146	-37	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2329	junction_1	74	1580	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGGTTGCCTGTGCTTTA	190	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47474910	47483240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_47475010_47480130_47480233_47482974
tx.12867	chr4	+	319	2	ISM	ENSMUSG00000053317.12	ENSMUST00000125622.2	424	3	5372	-146	5232	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2477	junction_1	0	603	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGGTTGCCTGTGCTTTA	142	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47480179	47483240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_47480233_47482974
tx.12868	chr4	+	2386	8	FSM	ENSMUSG00000061455.14	ENSMUST00000107720.9	5770	8	-5	3389	-2	887	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	8.24621125123532	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAGTATTTATTTCTTATC	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48124920	48183118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_48124959_48131764_48131950_48140419_48140486_48158810_48159034_48166927_48167044_48167205_48167257_48180669_48180757_48181498
tx.12869	chr4	+	1600	8	NIC	ENSMUSG00000061455.14	novel	5770	8	NA	NA	-2	5	intron_retention	FALSE	canonical	2	7	junction_1	13.490737563232	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCATTGTGACATGGGTG	12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48124932	48182236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_48125067_48131764_48131950_48140419_48140486_48158810_48159034_48166927_48167044_48167205_48167257_48180669_48180757_48181498
tx.1287	chr10	+	544	3	ISM	ENSMUSG00000019889.11	ENSMUST00000218276.2	4754	34	517033	-81	4894	81	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	199	junction_2	8.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGAGAGCATCCACATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28467882	28472043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_28468045_28468765_28468902_28471797
tx.12870	chr4	-	1616	12	FSM	ENSMUSG00000028343.11	ENSMUST00000030028.5	2624	12	-33	1041	-33	126	multi-exon	TRUE	canonical	3	625	junction_9	43.7020339182862	1119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCCTGGACAGTCTTTA	-13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48279591	48194363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_48194710_48196802_48196906_48204143_48204286_48205117_48205230_48208696_48208814_48211649_48211708_48218080_48218197_48219342_48219528_48236872_48236989_48241295_48241336_48243476_48243550_48279383
tx.12871	chr4	+	764	5	NNC	ENSMUSG00000028344.13	novel	3227	14	NA	NA	-2	25598	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.96074487943871	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTGCAGCTTTATTATTT	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48279823	48334800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_48279976_48283225_48283356_48307682_48307850_48333913_48334027_48334598
tx.12872	chr4	+	1156	3	FSM	ENSMUSG00000028344.13	ENSMUST00000156602.2	1866	3	93	617	27	-617	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAGTTATATTGATTAAT	29	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48279852	48308585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_48279976_48283225_48283356_48307682
tx.12873	chr4	-	1091	7	ISM	ENSMUSG00000028345.16	ENSMUST00000155905.8	2547	13	12023	0	2402	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	747	junction_6	46.2024530373298	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCATGAGCTTCCTTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48456901	48430857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_48431084_48433107_48433319_48434901_48435084_48436436_48436518_48451925_48452060_48452892_48452982_48456733
tx.12874	chr4	-	2616	15	NIC	ENSMUSG00000028345.16	novel	3102	15	NA	NA	13	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	43	junction_12	196.22390636355	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCATGAGCTTCCTTCATA	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48473446	48430857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_48431084_48433107_48433319_48434901_48435084_48436436_48436518_48451925_48452060_48452892_48452982_48456733_48456912_48458537_48458714_48459250_48459387_48459863_48460103_48462768_48462882_48467663_48467905_48468753_48468994_48469883_48470073_48473265
tx.12875	chr4	-	3091	15	FSM	ENSMUSG00000028345.16	ENSMUST00000030030.15	3102	15	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	662	junction_12	54.2776309771327	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCATGAGCTTCCTTCATA	-18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48473448	48430857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_48431084_48433107_48433319_48434901_48435084_48436436_48436518_48451925_48452060_48452892_48452982_48456733_48456912_48458537_48458714_48459250_48459387_48459863_48460103_48462768_48462882_48467663_48467905_48468280_48468994_48469883_48470073_48473265
tx.12876	chr4	-	954	3	ISM	ENSMUSG00000028345.16	ENSMUST00000030030.15	3102	15	13	37552	13	-703	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	823	junction_2	0.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAACTCCCCATGCCACTA	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48473446	48468409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_48468994_48469883_48470073_48473265
tx.12877	chr4	-	214	2	FSM	ENSMUSG00000028345.16	ENSMUST00000132911.2	942	2	-113	841	3	-841	multi-exon	FALSE	canonical	3	823	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACGCCAAGATGATTTTC	-26	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48473456	48470049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_48470073_48473265
tx.12878	chr4	-	329	3	Intergenic	novelGene_987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAAGACCAACTAACTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48513691	48507728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_48507849_48508467_48508589_48513603
tx.12879	chr4	+	560	2	Intergenic	novelGene_988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	0	300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCTTTGTCTTGGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48513748	48519022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_48514080_48518793
tx.12880	chr4	+	587	3	Intergenic	novelGene_989	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	1.5	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCTTTGTCTTGGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48513808	48519022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_48514080_48514498_48514586_48518793
tx.12881	chr4	+	1622	3	NNC	ENSMUSG00000039693.12	novel	1589	3	NA	NA	-65	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	150	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTTACACTGTGTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48539869	48561918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_48539966_48552379_48552831_48560843
tx.12882	chr4	+	1674	3	FSM	ENSMUSG00000039693.12	ENSMUST00000064807.9	1378	3	45	-341	45	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_1	89	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTTACACTGTGTATGT	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48540123	48561918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_48540272_48552379_48552831_48560843
tx.12883	chr4	+	1575	3	FSM	ENSMUSG00000039693.12	ENSMUST00000107704.2	1597	3	21	1	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_1	75.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTTACACTGTGTATGT	59	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48540519	48561918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_48540569_48552379_48552831_48560843
tx.12884	chr4	+	2067	10	NNC	ENSMUSG00000028347.15	novel	489	5	NA	NA	145	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	12	junction_1	181.670642158336	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTCTGCTTTGTGTGCTCA	393	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48585695	48663131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_48585770_48604580_48604691_48610412_48610543_48614956_48614984_48617234_48617332_48636839_48636989_48638979_48639046_48650294_48650419_48658773_48658933_48662000
tx.12885	chr4	+	2062	10	NNC	ENSMUSG00000028347.15	novel	489	5	NA	NA	151	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	12	junction_1	163.477562926069	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACGGTCTGCTTTGTGTGCT	399	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48585701	48663129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_48585770_48604580_48604691_48610412_48610543_48614956_48614984_48617231_48617332_48636839_48636989_48638979_48639046_48650294_48650419_48658773_48658933_48662000
tx.12886	chr4	+	2090	10	NNC	ENSMUSG00000028347.15	novel	489	5	NA	NA	217	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	184.628756638227	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTCTGCTTTGTGTGCTCA	465	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48585767	48663131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_48585865_48604580_48604691_48610412_48610543_48614956_48614984_48617234_48617332_48636839_48636989_48638979_48639046_48650294_48650419_48658773_48658933_48662000
tx.12887	chr4	+	1684	6	ISM	ENSMUSG00000028347.15	ENSMUST00000030032.13	2461	10	32103	0	-19657	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	418	junction_3	53.8494196811813	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTCTGCTTTGTGTGCTCA	1744	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48617276	48663131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_48617332_48636839_48636989_48638979_48639046_48650294_48650419_48658773_48658933_48662000
tx.12888	chr4	+	1443	4	ISM	ENSMUSG00000028347.15	ENSMUST00000030032.13	2461	10	53841	2	2081	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	418	junction_1	56.5351414805183	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACGGTCTGCTTTGTGTGCT	2113	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48639014	48663129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_48639046_48650294_48650419_48658773_48658933_48662000
tx.12889	chr4	+	1417	3	ISM	ENSMUSG00000028347.15	ENSMUST00000030032.13	2461	10	65118	0	13358	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	504	junction_2	25.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTCTGCTTTGTGTGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48650291	48663131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_48650419_48658773_48658933_48662000
tx.1289	chr10	+	2233	6	FSM	ENSMUSG00000019883.12	ENSMUST00000160399.8	1845	6	0	-388	0	388	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	32.6643536596088	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCTCACGACCTATGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29189161	29221944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_29189294_29193502_29193719_29198270_29198414_29207814_29207868_29210186_29210268_29220336
tx.12890	chr4	+	1268	2	ISM	ENSMUSG00000028347.15	ENSMUST00000030032.13	2461	10	73620	2	21860	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	504	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACGGTCTGCTTTGTGTGCT	751	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48658793	48663129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_48658933_48662000
tx.12891	chr4	-	2088	2	NNC	ENSMUSG00000044018.4	novel	2114	2	NA	NA	15	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATTAAGTTTTAAAGTGT	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	49521078	49512599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_49514571_49520961
tx.12892	chr4	-	1333	2	FSM	ENSMUSG00000044018.4	ENSMUST00000057829.4	2114	2	15	766	15	-766	multi-exon	FALSE	canonical	3	1281	junction_1	0	4227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATATGGGGCTATTATATAT	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	49521078	49513361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_49514578_49520961
tx.12893	chr4	+	2951	3	FSM	ENSMUSG00000039634.13	ENSMUST00000107696.2	2965	3	42	-28	42	28	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	6.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAGAAAGCTGAGATGTT	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	49521258	49531545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_49521596_49522397_49522483_49529016
tx.12894	chr4	-	2010	2	FSM	ENSMUSG00000039611.3	ENSMUST00000042750.3	2989	2	65	914	65	-914	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTGTCAGTTGTCTTGG	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	49597811	49585419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_49587242_49597623
tx.12895	chr4	-	304	2	Intergenic	novelGene_990	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAATGCATTTTAATGATA	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	49631952	49630657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_49630864_49631854
tx.12896	chr4	+	2163	14	NNC	ENSMUSG00000028309.15	novel	4154	21	NA	NA	13	-29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	17.045709519341	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCAGAAAAGGAGAGAGATT	14	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49632018	49650222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_49632212_49632364_49632513_49633253_49633411_49637905_49638074_49638186_49638339_49638624_49638808_49642065_49642185_49644483_49644631_49645618_49645697_49645885_49646006_49648285_49648466_49649269_49649406_49649725_49649848_49649962
tx.12897	chr4	+	2203	5	NNC	ENSMUSG00000028309.15	novel	648	5	NA	NA	-3	1602	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	22.0949654899029	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGATGGCGGTGTTTATTC	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	49632062	49658489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_49632212_49632364_49632513_49633253_49633411_49637905_49637985_49656819
tx.12898	chr4	+	1040	8	ISM	ENSMUSG00000028312.20	ENSMUST00000102915.10	5404	25	7	37253	-2	-321	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	347	junction_1	45.1758468969553	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTCTCAATTGTGAAATCG	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	52439249	52451007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_52439411_52440200_52440424_52442252_52442403_52445951_52446075_52447712_52447752_52449320_52449432_52449610_52449656_52450819
tx.12899	chr4	+	1508	6	FSM	ENSMUSG00000015247.11	ENSMUST00000015391.10	1552	6	44	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	527	junction_3	32.5785205311721	1342	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTATCAAGTGAGTCTT	-24	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	53011923	53022060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_53012048_53015014_53015226_53017048_53017208_53020181_53020332_53021110_53021198_53021283
tx.129	chr1	+	395	2	Intergenic	novelGene_15	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTTGTGGCATAACCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35956373	35957186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_35956578_35956995
tx.1290	chr10	+	2289	6	FSM	ENSMUSG00000019883.12	ENSMUST00000020034.6	3856	6	49	1518	49	391	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_5	6.04648658313239	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCACGACCTATGGATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29189544	29221947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_29189730_29193502_29193719_29198270_29198414_29207814_29207868_29210186_29210268_29220336
tx.12900	chr4	-	900	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000083735.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTAAGTGGTTTGGGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53327973	53307557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_53307653_53318650_53319316_53327833
tx.12901	chr4	+	446	4	Intergenic	novelGene_992	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23.6971634495683	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGACAGACTGAGCTATT	326	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53340448	53356057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_53340568_53340696_53340778_53342594_53342685_53355901
tx.12902	chr4	+	381	3	Intergenic	novelGene_993	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	26.5	402	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACATTAGTGGCAAGAGG	336	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53340458	53342785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_53340568_53340696_53340778_53342594
tx.12903	chr4	+	282	2	Intergenic	novelGene_994	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	157	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCAGAGTAAAAGCTAGAA	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	53341418	53342757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_53341538_53342594
tx.12904	chr4	+	1250	4	ISM	ENSMUSG00000028412.18	ENSMUST00000107645.2	2365	11	17964	-680	17964	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_3	171.897256134781	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCGTTGTCCGTGACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53553575	53622478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_53553624_53560914_53561152_53563140_53563222_53621594
tx.12905	chr4	+	2761	4	ISM	ENSMUSG00000028412.18	ENSMUST00000107651.9	4382	16	112914	18	17973	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	334	junction_3	24.9443825784929	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGTGTTTAGAAATTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53553584	53567800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_53553624_53560914_53561152_53563140_53563222_53565396
tx.12906	chr4	+	684	4	FSM	ENSMUSG00000054752.17	ENSMUST00000107643.8	2350	4	-63	1729	-44	-1729	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	1.69967317119759	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAAGCATCTACTTGTGG	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	53631426	53650061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_53631613_53646986_53647083_53647669_53647802_53649791
tx.12907	chr4	+	1594	7	NNC	ENSMUSG00000054752.17	novel	7467	13	NA	NA	25750	-3528	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_1	5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCATGCCTATCTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53669029	53697623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_53669098_53679793_53680004_53682099_53682199_53686387_53686518_53693983_53694085_53694607_53694860_53696889
tx.12908	chr4	+	777	3	FSM	ENSMUSG00000028420.14	ENSMUST00000151206.2	689	3	-30	-58	-18	58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	61	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGCATTTTTTTCATTTT	-34	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	53826026	53847902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_53826221_53840626_53840784_53847476
tx.12909	chr4	+	1447	6	FSM	ENSMUSG00000028420.14	ENSMUST00000030127.13	2862	6	-12	1427	-12	-1427	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_3	9.52050418832952	408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTGTATACAGTTATTT	-28	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	53826032	53860592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_53826221_53840626_53840784_53848865_53849051_53850473_53850562_53854311_53854430_53859881
tx.1291	chr10	-	1871	2	ISM	ENSMUSG00000038876.13	ENSMUST00000162335.8	1434	3	3264	-487	3264	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTGTTTGAGTCTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29230445	29222166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_29223880_29230287
tx.12910	chr4	+	1287	5	NIC	ENSMUSG00000028420.14	novel	2862	6	NA	NA	-9	-1427	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	25	junction_1	42.4345083628879	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTGTATACAGTTATTT	-25	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	53826035	53860592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_53826221_53848865_53849051_53850473_53850562_53854311_53854430_53859881
tx.12911	chr4	+	1250	5	NNC	ENSMUSG00000028420.14	novel	2862	6	NA	NA	-4	-1427	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	52.5707856133043	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTGTATACAGTTATTT	-20	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	53826040	53860592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_53826221_53848897_53849051_53850473_53850562_53854311_53854430_53859881
tx.12912	chr4	-	1806	2	Intergenic	novelGene_995	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAGAAAAGAGAAGAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53947484	53945463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_53947050_53947264
tx.12913	chr4	+	2777	10	FSM	ENSMUSG00000028426.11	ENSMUST00000030134.9	3810	10	3	1030	3	-1030	multi-exon	FALSE	canonical	3	1075	junction_8	117.532764016184	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACAGTGTTGGCTTTTATT	-15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	55350045	55391207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_55350428_55366776_55366859_55368044_55368125_55370203_55370473_55378233_55378290_55380988_55381117_55382479_55382616_55383586_55383715_55385409_55385602_55389883
tx.12914	chr4	+	999	2	ISM	ENSMUSG00000028426.11	ENSMUST00000030134.9	3810	10	35442	1472	35395	-1472	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1164	junction_1	0	284	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCATGTTTGCTTTTGATG	7152	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55385484	55390765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_55385602_55389883
tx.12915	chr4	-	1436	2	ISM	ENSMUSG00000003032.9	ENSMUST00000107619.3	3029	5	2471	0	1775	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1256	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACAATCTCTTTGTTTTTT	3331	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55529995	55527142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_55528301_55529717
tx.12916	chr4	-	2020	3	ISM	ENSMUSG00000003032.9	ENSMUST00000107619.3	3029	5	1771	0	1075	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1140	junction_2	58	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACAATCTCTTTGTTTTTT	2631	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55530695	55527142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_55528301_55529717_55529883_55529998
tx.12917	chr4	-	1617	13	ISM	ENSMUSG00000028431.12	ENSMUST00000030140.3	6160	37	19	34862	19	-8076	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	280	junction_8	21.3910352458428	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTCGTAAGTTCCTAAATAG	15	False	56802327	NA	False	NA	NA	NA	56802312	56784541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_56784638_56786587_56786753_56787740_56787972_56790130_56790225_56790887_56791012_56792026_56792118_56792384_56792482_56794089_56794176_56795505_56795587_56796503_56796586_56798657_56798811_56799974_56800138_56802158
tx.12918	chr4	-	1463	11	NNC	ENSMUSG00000028431.12	novel	6160	37	NA	NA	34	-12617	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	95.5351244307558	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTCATCTCAGAATTGGA	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	56802297	56789082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_56789436_56790130_56790225_56790887_56791012_56792026_56792118_56792384_56792482_56794089_56794176_56795505_56795587_56796503_56796586_56798657_56798811_56799974_56800138_56802158
tx.12919	chr4	+	1139	6	FSM	ENSMUSG00000038827.12	ENSMUST00000045368.12	4275	6	-1	3137	-1	517	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_2	10.8369737473153	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACAGTTTCTCATTGGCTT	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	56802347	56806464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_56802727_56803595_56803648_56804153_56804284_56805681_56805759_56805877_56805948_56806033
tx.1292	chr10	-	2010	4	FSM	ENSMUSG00000038876.13	ENSMUST00000161508.3	945	4	-17	-1048	4	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	93.3821301011185	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTGTTTGAGTCTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29238039	29222166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_29223880_29230287_29230444_29237280_29237342_29237959
tx.12920	chr4	+	1230	6	FSM	ENSMUSG00000038827.12	ENSMUST00000131520.8	4360	6	-7	3137	0	517	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	52.8189359983709	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACAGTTTCTCATTGGCTT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	56802344	56806464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_56802727_56803507_56803648_56804153_56804284_56805681_56805759_56805877_56805948_56806033
tx.12921	chr4	-	3134	19	FSM	ENSMUSG00000038816.15	ENSMUST00000045142.15	3664	19	-20	550	-20	-550	multi-exon	FALSE	canonical	3	197	junction_15	25.8110417562564	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATTTAAACCTTTTCTTGG	9409	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56865208	56811484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_56812389_56812510_56812595_56813177_56813292_56813829_56813887_56816180_56816230_56816988_56817144_56817246_56817298_56822517_56822556_56826273_56826425_56827251_56827345_56829483_56829643_56832905_56832993_56835177_56835379_56837731_56837903_56838965_56839056_56841560_56841681_56844446_56844635_56847809_56848000_56864976
tx.12922	chr4	-	1970	11	ISM	ENSMUSG00000038816.15	ENSMUST00000045142.15	3664	19	-15	15046	-15	22	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	197	junction_7	32.0661815625122	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGTCAGCCTTTTGTTTC	-32	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	56865203	56825980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_56826425_56827251_56827345_56829483_56829643_56832905_56832993_56835177_56835379_56837731_56837903_56838965_56839056_56841560_56841681_56844446_56844635_56847809_56848000_56864976
tx.12923	chr4	-	1248	3	ISM	ENSMUSG00000045589.8	ENSMUST00000128276.2	3514	4	17820	2103	17820	-2103	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAGAATTTGCTCTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56972316	56962238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_56963161_56968061_56968309_56972237
tx.12924	chr4	-	557	5	FSM	ENSMUSG00000028367.6	ENSMUST00000030051.6	1051	5	110	384	110	-384	multi-exon	TRUE	canonical	3	4612	junction_4	90.890043459116	82808	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCTGATGTGTTTTAATA	134	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57956301	57943756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_57943968_57945146_57945213_57950838_57950899_57951796_57951902_57956186
tx.12925	chr4	-	3373	4	NIC	ENSMUSG00000038668.15	novel	3512	4	NA	NA	79	-5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	105	junction_3	79.7927871983984	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGCGATGTGTGGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58553819	58435259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_58437635_58486476_58487225_58504621_58504782_58553729
tx.12926	chr4	-	1851	2	ISM	ENSMUSG00000038668.15	ENSMUST00000107570.2	3244	3	12618	838	12618	-838	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	250	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGCCAGTATCATTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58486785	58436092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_58437635_58486476
tx.12927	chr4	-	3285	3	ISM	ENSMUSG00000038668.15	ENSMUST00000107571.8	3543	4	48525	8	-5383	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	250	junction_1	20.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTTGGCGATGTGTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58504786	58435262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_58437635_58486476_58487225_58504621
tx.12928	chr4	-	2170	8	ISM	ENSMUSG00000050812.19	ENSMUST00000102889.10	7045	49	102017	0	1110	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_7	25.7452194888801	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATAATGTGTGTGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58810732	58798910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_58800321_58801732_58801805_58803669_58803759_58805540_58805647_58807750_58807890_58809395_58809589_58809681_58809726_58810615
tx.12929	chr4	-	545	4	ISM	ENSMUSG00000050812.19	ENSMUST00000102889.10	7045	49	107116	1119	6209	-1119	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_2	29.7806797922561	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGCTCCTTATTAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58805633	58800029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_58800321_58801732_58801805_58803669_58803759_58805540
tx.1293	chr10	-	1961	3	FSM	ENSMUSG00000038876.13	ENSMUST00000160372.9	1948	3	-8	-5	-8	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_2	66.5	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTGTTTGAGTCTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29238051	29222166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_29223880_29230287_29230444_29237959
tx.12930	chr4	-	687	5	ISM	ENSMUSG00000028378.7	ENSMUST00000030069.7	2296	10	11203	1078	11203	-1078	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	295	junction_1	62.0659931041146	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGTGATAGAGAATGAAAT	5968	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58975916	58966516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_58966764_58968758_58968878_58970990_58971100_58973534_58973691_58975860
tx.12931	chr4	-	1137	9	ISM	ENSMUSG00000028378.7	ENSMUST00000030069.7	2296	10	2259	1078	2259	-1078	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	295	junction_1	48.3063142870578	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGTGATAGAGAATGAAAT	2264	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58984860	58966516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_58966764_58968758_58968878_58970990_58971100_58973534_58973691_58975860_58975979_58978013_58978182_58981826_58981884_58982879_58982926_58984743
tx.12932	chr4	-	1184	10	FSM	ENSMUSG00000028378.7	ENSMUST00000030069.7	2296	10	34	1078	34	-1078	multi-exon	FALSE	canonical	3	293	junction_9	57.656068390259	1770	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGTGATAGAGAATGAAAT	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	58987085	58966516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_58966764_58968758_58968878_58970990_58971100_58973534_58973691_58975860_58975979_58978013_58978182_58981826_58981884_58982879_58982926_58984743_58984860_58987037
tx.12933	chr4	+	1059	3	FSM	ENSMUSG00000038607.13	ENSMUST00000041160.13	1192	3	128	5	128	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	257	junction_2	16.5	759	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGTAGTTTGTGTTTGG	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59035215	59041898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_59035319_59039226_59039359_59041074
tx.12934	chr4	-	3039	14	ISM	ENSMUSG00000038578.16	ENSMUST00000040166.14	3295	17	26349	-480	26349	480	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_3	15.9251206417917	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAGACAGCTCAACTCCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59412284	59314202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_59315410_59315711_59315806_59324867_59324908_59329462_59329722_59332936_59333034_59349825_59350013_59351637_59351730_59365721_59365915_59369530_59369641_59379598_59379786_59380860_59380959_59390572_59390753_59411269_59411450_59412169
tx.12935	chr4	-	1325	6	ISM	ENSMUSG00000038578.16	ENSMUST00000040166.14	3295	17	251	75525	251	-58251	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_4	13.8506317545446	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAATTGCATTATACCGGT	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59438382	59390207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_59390753_59411269_59411450_59412169_59412323_59423994_59424151_59427950_59428065_59438205
tx.12936	chr4	-	1149	5	ISM	ENSMUSG00000038578.16	ENSMUST00000040166.14	3295	17	239	96230	239	-78956	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_3	15.1657508881031	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATGTGTATATGCATGCA	-9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59438394	59410912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_59411450_59412169_59412323_59423994_59424151_59427950_59428065_59438205
tx.12937	chr4	-	432	2	Intergenic	novelGene_996	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGTTTGTCTTAGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59458109	59447238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_59447575_59458013
tx.12938	chr4	-	934	5	ISM	ENSMUSG00000028382.16	ENSMUST00000030076.12	6855	14	72	29217	3	18	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_4	19.8918953345326	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGGAAAAAAAATT	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59549292	59501084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_59501475_59514273_59514421_59517585_59517756_59524394_59524477_59549147
tx.12939	chr4	-	546	4	ISM	ENSMUSG00000028382.16	ENSMUST00000030076.12	6855	14	50	42426	0	3179	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_3	2.49443825784929	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATCTGCCTAATCAGGCT	5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59549314	59514293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_59514421_59517585_59517756_59524394_59524477_59549147
tx.1294	chr10	-	1943	3	FSM	ENSMUSG00000038876.13	ENSMUST00000160144.9	4323	3	385	1995	-10	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_2	74.5	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTGTTTGAGTCTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29238053	29222166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_29223880_29230287_29230444_29237979
tx.12940	chr4	-	274	2	ISM	ENSMUSG00000028382.16	ENSMUST00000148331.9	2016	14	-38	47760	12	-6935	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGTGTGTATGGTAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59549352	59524407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_59524477_59549147
tx.12941	chr4	+	1948	11	FSM	ENSMUSG00000028383.18	ENSMUST00000030078.12	2611	11	41	622	41	-621	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_3	12.963024338479	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCTTATGTAAAATGAAGC	9	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59581603	59618067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_59581776_59592154_59592319_59593236_59593336_59594395_59594511_59596862_59596967_59597256_59597356_59601372_59601568_59606471_59606544_59610509_59610876_59612681_59612811_59617634
tx.12942	chr4	-	1575	5	FSM	ENSMUSG00000038544.15	ENSMUST00000095063.11	3237	5	3	1659	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_4	41.7814252988095	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACTTTGTAAGGATCCTG	-25	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59783863	59771295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_59772460_59773915_59774007_59775446_59775550_59782253_59782335_59783727
tx.12943	chr4	-	1493	4	FSM	ENSMUSG00000038544.15	ENSMUST00000107526.8	1438	4	-54	-1	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_3	91.8416511659546	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACTTTGTAAGGATCCTG	-24	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59783862	59771295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_59772460_59773915_59774007_59775446_59775550_59783727
tx.12944	chr4	-	1541	3	FSM	ENSMUSG00000038544.15	ENSMUST00000128548.2	1654	3	-29	142	-1	-142	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_2	17	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATTGGTTATTCAGTTTG	-29	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59783867	59774229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_59775550_59782253_59782335_59783727
tx.12945	chr4	+	946	2	ISM	ENSMUSG00000028385.15	ENSMUST00000145199.8	2303	6	9838	826	9752	-826	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_1	0	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTTAGTGTATGTGTTTT	3738	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59894531	59899707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_59894678_59898907
tx.12946	chr4	+	877	7	FSM	ENSMUSG00000078689.9	ENSMUST00000107521.8	642	7	-81	-154	-81	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	4.92442890089805	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGTCTCTGTGTCCAGA	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59964212	60007274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_59964368_60003977_60004112_60004813_60004888_60005471_60005583_60005921_60006024_60006188_60006235_60007019
tx.12947	chr4	-	406	3	NNC	ENSMUSG00000084309.2	novel	389	4	NA	NA	1701	1120	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTGACACACCCATGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61931393	61929528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_61929705_61930632_61930744_61931274
tx.12948	chr4	-	2157	4	NIC	ENSMUSG00000028389.13	novel	3494	4	NA	NA	-107	8	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	17.4419672692682	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGTATTTTTACACTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62126790	62109217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_62110927_62122755_62122888_62123260_62123343_62126556
tx.12949	chr4	-	2060	4	FSM	ENSMUSG00000028389.13	ENSMUST00000222050.2	2017	4	-42	-1	-26	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	8.48528137423857	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAAATACTGTATTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62126709	62109224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62110927_62122755_62122888_62123260_62123343_62126565
tx.1295	chr10	-	1996	4	FSM	ENSMUSG00000038876.13	ENSMUST00000214896.2	781	4	-2	-1213	-2	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	95.3601360923712	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTGTTTGAGTCTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29238045	29222166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_29223880_29230287_29230444_29237280_29237342_29237979
tx.12950	chr4	+	893	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028389.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCTTTGTAGATGCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62149242	62151798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_62149549_62151211
tx.12951	chr4	+	1837	4	FSM	ENSMUSG00000066152.12	ENSMUST00000084530.9	1820	4	-17	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_3	15.369522511198	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTTTGTTGGTCCGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62204668	62216648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_62204812_62210868_62210936_62214123_62214314_62215211
tx.12952	chr4	+	2718	3	ISM	ENSMUSG00000066152.12	ENSMUST00000084530.9	1820	4	-3	3	-3	-3	intron_retention	FALSE	canonical	3	104	junction_2	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTGTGTTTGTTGGTCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62204682	62216645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_62204812_62210868_62210936_62214123
tx.12953	chr4	+	1604	3	NIC	ENSMUSG00000066152.12	novel	1820	4	NA	NA	26	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	7	junction_2	50	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTTTGTTGGTCCGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62204711	62216648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_62204812_62210868_62210936_62215211
tx.12954	chr4	+	554	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000066151.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATGCATTCAAATTCCCA	1260	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62232254	62233692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_62232615_62233498
tx.12955	chr4	-	955	6	ISM	ENSMUSG00000066151.13	ENSMUST00000107461.2	2337	19	74	19170	9	4325	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_4	10.7070070514593	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACTAACAGAATCGAATGC	7004	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62278697	62258048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_62258570_62258858_62258934_62263744_62263815_62264293_62264379_62270669_62270783_62278606
tx.12956	chr4	-	640	4	FSM	ENSMUSG00000066151.13	ENSMUST00000131977.2	1739	4	-73	1172	6	-1172	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_2	12.5698050899765	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGCTTGCTTTAGACATC	6922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62278779	62263545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62263815_62264293_62264379_62270669_62270783_62278606
tx.12957	chr4	-	1033	3	NIC	ENSMUSG00000066151.13	novel	1739	4	NA	NA	16	-1169	intron_retention	FALSE	canonical	3	72	junction_1	10.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTGCTTTAGACATCTCC	7011	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62278690	62263542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_62264379_62270669_62270783_62278606
tx.12958	chr4	+	1487	5	FSM	ENSMUSG00000066150.13	ENSMUST00000084526.12	3718	5	-17	2248	-17	-2248	multi-exon	FALSE	canonical	3	753	junction_3	40.1932830209228	1135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGACTCAGTACCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62278946	62307758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_62279081_62303728_62303916_62304327_62304401_62306103_62306273_62306834
tx.12959	chr4	-	717	3	FSM	ENSMUSG00000066149.12	ENSMUST00000107459.2	654	3	0	-63	0	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	175	222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGGTAGTAGCACTGCT	2681	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62326862	62312807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62313259_62320960_62321153_62326788
tx.1296	chr10	-	555	2	NNC	ENSMUSG00000069682.7	novel	365	2	NA	NA	-1	11	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	397	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATAGACTTCCTATATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29575377	29574730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_29574904_29574995
tx.12960	chr4	-	802	4	FSM	ENSMUSG00000066149.12	ENSMUST00000084525.12	819	4	17	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	361	junction_3	9.67241208569794	3571	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAGACGTCCTTAAAGGT	2681	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62326862	62312819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62313259_62320960_62321153_62322692_62322790_62326788
tx.12961	chr4	+	2711	14	FSM	ENSMUSG00000066148.4	ENSMUST00000084524.4	5223	14	0	2512	0	1147	multi-exon	FALSE	canonical	3	246	junction_9	29.7191986640079	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGAAAAAATCCTAATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62327033	62342715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_62327139_62327811_62327990_62329932_62330120_62332779_62332868_62333411_62333492_62333638_62333733_62334200_62334296_62334888_62334948_62336082_62336207_62337512_62337603_62340414_62340538_62340651_62340760_62340839_62340959_62341454
tx.12962	chr4	+	1782	5	ISM	ENSMUSG00000066148.4	ENSMUST00000084524.4	5223	14	10522	2388	-2525	1271	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	257	junction_2	24.8734295986701	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTGAAAGGATTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62337555	62342839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_62337603_62340414_62340538_62340651_62340760_62340839_62340959_62341454
tx.12963	chr4	+	1329	2	ISM	ENSMUSG00000066148.4	ENSMUST00000148774.2	912	3	810	-1147	810	1147	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	277	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGAAAAAATCCTAATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62340890	62342715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_62340959_62341454
tx.12964	chr4	-	1453	11	FSM	ENSMUSG00000028391.17	ENSMUST00000120095.8	2549	11	-6	1102	3	-100	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_10	54.6457683631587	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGTGTGGCTTTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62389130	62371970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62372175_62374047_62374211_62375676_62375819_62377052_62377121_62378558_62378660_62378756_62378902_62380377_62380453_62381580_62381714_62382163_62382307_62387073_62387171_62388948
tx.12965	chr4	-	1352	11	FSM	ENSMUSG00000028391.17	ENSMUST00000030087.14	1440	11	-12	100	-3	-100	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_2	19.4548194543152	359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGTGTGGCTTTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62389136	62371970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62372175_62374047_62374211_62375676_62375819_62377052_62377121_62378558_62378660_62378756_62378902_62380377_62380453_62381580_62381714_62382163_62382307_62387073_62387171_62389055
tx.12966	chr4	-	1145	2	FSM	ENSMUSG00000038422.3	ENSMUST00000037820.3	1205	2	8	52	8	-52	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATAGAACTGCGAGGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62420505	62417296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62418331_62420394
tx.12967	chr4	-	1225	12	FSM	ENSMUSG00000028393.11	ENSMUST00000030090.4	1206	12	-18	-1	-18	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	554	junction_1	45.4718149012465	1102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTGCCCTCTTCCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62438173	62427404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62427548_62428341_62428472_62428751_62428839_62428930_62429019_62429104_62429161_62429760_62429850_62429938_62430023_62430123_62430260_62431107_62431205_62431768_62431820_62432310_62432498_62438096
tx.12968	chr4	-	638	4	FSM	ENSMUSG00000028394.10	ENSMUST00000030091.10	1805	4	21	1146	-9	540	multi-exon	FALSE	canonical	3	309	junction_3	9.56846672960488	2723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCCCAGGCTCAGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62443284	62442031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62442348_62442554_62442674_62442986_62443073_62443167
tx.12969	chr4	+	602	4	NNC	ENSMUSG00000059810.19	novel	2072	18	NA	NA	-116	-16510	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	44.5944690142922	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGTGTGTTCTGGCCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62501721	62525643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_62501951_62521157_62521209_62524677_62524839_62525482
tx.1297	chr10	-	530	2	NNC	ENSMUSG00000069682.7	novel	365	2	NA	NA	-1	11	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATAGACTTCCTATATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29575377	29574730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_29575077_29575193
tx.12970	chr4	+	577	5	NNC	ENSMUSG00000059810.19	novel	2072	18	NA	NA	-93	-16505	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_4	32.2286751201473	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTCTGGCCTCTCTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62501744	62525648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_62501951_62521157_62521209_62523724_62523784_62524743_62524839_62525482
tx.12971	chr4	+	1234	4	ISM	ENSMUSG00000059810.19	ENSMUST00000098031.10	2072	18	-111	50033	-111	-16510	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_2	7.25718035235908	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGTGTGTTCTGGCCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62501726	62525643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_62501951_62521157_62521209_62523724_62523784_62524743
tx.12972	chr4	+	812	6	NNC	ENSMUSG00000059810.19	novel	2072	18	NA	NA	-93	-14981	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_5	35.689774445911	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCTTTTCATCAGGGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62501744	62527172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_62501951_62521157_62521209_62523724_62523784_62524743_62524839_62525845_62525915_62526840
tx.12973	chr4	-	788	7	NNC	ENSMUSG00000028356.5	novel	1268	10	NA	NA	4203	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_4	3.45205252953466	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATTCTGTGTGTTGGCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63068207	63061514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_63061638_63061903_63062078_63062387_63062556_63063501_63063584_63066938_63066986_63067655_63067758_63068115
tx.12974	chr4	-	377	2	ISM	ENSMUSG00000039137.19	ENSMUST00000133425.2	797	4	33406	0	-51	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGTGTAATGAAACTCACT	7488	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63379590	63378399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_63378705_63379518
tx.12975	chr4	+	1037	3	FSM	ENSMUSG00000039105.7	ENSMUST00000035301.7	1135	3	49	49	49	-49	multi-exon	FALSE	canonical	3	4249	junction_2	22.5	31204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTCCTGGCTCCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63463057	63468938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_63463237_63466821_63466923_63468181
tx.12976	chr4	+	285	3	ISM	ENSMUSG00000045917.18	ENSMUST00000077709.11	3765	10	-1	23895	-1	-29	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	16	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCATGAACTGCACCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63477016	63480699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_63477195_63479148_63479233_63480676
tx.12977	chr4	+	3145	10	FSM	ENSMUSG00000045917.18	ENSMUST00000077709.11	3765	10	-4	624	-4	-620	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_1	11.4901997962622	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGCGTGGTGTGGTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63477013	63503970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_63477195_63479148_63479233_63480676_63480869_63483893_63484004_63486697_63486806_63488180_63488331_63496037_63496149_63498169_63498251_63498529_63498710_63502022
tx.12978	chr4	+	266	2	ISM	ENSMUSG00000045917.18	ENSMUST00000077709.11	3765	10	3	25354	3	-1488	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGGGGCTTGGGGGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63477020	63479240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_63477195_63479148
tx.12979	chr4	+	1560	10	NNC	ENSMUSG00000045917.18	novel	3765	10	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_9	24.114439094441	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAGTAAGGGACCATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63477019	63504594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_63477195_63479148_63479233_63480676_63480869_63483893_63484004_63486697_63486806_63488180_63488331_63496037_63496149_63498169_63498251_63498529_63498710_63504225
tx.1298	chr10	-	438	3	FSM	ENSMUSG00000075266.6	ENSMUST00000099985.6	1532	3	10	1084	10	-1084	multi-exon	FALSE	canonical	3	2101	junction_1	71	1357	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGGCTTCTGAGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30076546	30073088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_30073223_30074461_30074576_30076356
tx.12980	chr4	+	3725	10	NIC	ENSMUSG00000045917.18	novel	3765	10	NA	NA	-5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	6	junction_1	22.7888861801829	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAGTAAGGGACCATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63477087	63504594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_63477195_63479118_63479233_63480676_63480869_63483893_63484004_63486697_63486806_63488180_63488331_63496037_63496149_63498169_63498251_63498529_63498710_63502022
tx.12981	chr4	-	1971	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000077214.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAACTGTGTGGCACTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64373891	64199114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_64199714_64203124_64203166_64225964_64226049_64351009_64351132_64372766
tx.12982	chr4	+	3171	2	FSM	ENSMUSG00000051675.14	ENSMUST00000050850.14	3194	2	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATGGTCATGTCTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65523245	65534475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_65523307_65531365
tx.12983	chr4	+	3166	2	FSM	ENSMUSG00000051675.14	ENSMUST00000107366.2	3191	2	25	0	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATGGTCATGTCTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65523247	65534475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_65523307_65531368
tx.12984	chr4	-	888	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000046341.6	novel	450	1	NA	NA	-92	448	multi-exon	FALSE	canonical	2	29	junction_1	0	355	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAATTATAAGGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69844408	69843418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_69844194_69844295
tx.12985	chr4	-	883	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000046341.6	novel	450	1	NA	NA	-92	446	multi-exon	FALSE	canonical	2	25	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAATTATAAGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69844408	69843420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_69844191_69844295
tx.12986	chr4	-	1052	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000083767.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTGTTGTTGTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74148159	74141296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_74141784_74147594
tx.12987	chr4	+	1049	6	NNC	ENSMUSG00000028397.14	novel	4196	22	NA	NA	-25	27074	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	90.5684271697372	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATTGGTCGACTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74170147	74218970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_74170324_74181045_74181207_74189430_74189607_74199133_74199249_74216677_74216872_74218743
tx.12988	chr4	+	4221	22	FSM	ENSMUSG00000028397.14	ENSMUST00000030102.12	4196	22	-24	-1	-24	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	55.9303502727513	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCGTCTTCTGTCTGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74170148	74324098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_74170324_74181045_74181207_74189430_74189607_74199133_74199249_74216677_74216872_74225201_74225252_74229883_74229988_74233748_74233887_74248891_74249086_74251869_74252106_74252785_74253106_74255118_74255228_74261606_74261789_74263679_74263894_74266636_74266714_74275578_74275635_74277656_74277766_74291802_74291989_74295866_74296038_74309613_74309734_74317583_74317677_74323057
tx.12989	chr4	+	1109	7	ISM	ENSMUSG00000028397.14	ENSMUST00000030102.12	4196	22	28	93924	28	-19624	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_5	82.7716067796735	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGGTTTATATATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74170200	74230173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_74170324_74181045_74181207_74189430_74189607_74199133_74199249_74216677_74216872_74225201_74225252_74229883
tx.12990	chr4	+	2033	9	ISM	ENSMUSG00000028397.14	ENSMUST00000030102.12	4196	22	93543	-3	82669	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	245	junction_1	11.4503002144049	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCTTCTGTCTGTCAATT	4062	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74263715	74324100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_74263894_74266636_74266714_74275578_74275635_74277656_74277766_74291802_74291989_74295866_74296038_74309613_74309734_74317583_74317677_74323057
tx.12991	chr4	-	741	2	FSM	ENSMUSG00000028398.9	ENSMUST00000030103.9	741	2	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	402	junction_1	0	4456	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTAGTTCTTTTAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75196542	75195590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_75196007_75196217
tx.12992	chr4	+	672	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028399.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTAGCATTTCATTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77228968	77232621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_77229411_77232391
tx.12993	chr4	-	3251	8	ISM	ENSMUSG00000028403.16	ENSMUST00000107239.8	1148	9	5842	-2142	-3302	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_1	13.5736840231082	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTATTGTTGGTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82772353	82722303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_82724699_82725249_82725294_82738566_82738684_82753682_82753822_82756512_82756625_82762340_82762440_82765779_82765977_82772205
tx.12994	chr4	-	2718	20	FSM	ENSMUSG00000038172.15	ENSMUST00000102823.10	8831	20	-4	6117	-4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_3	31.1407314036548	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTAGTGCTGAAGCCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83242496	83144653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_83145462_83148644_83148762_83150947_83151066_83155478_83155588_83158304_83158432_83159882_83159975_83160375_83160538_83162140_83162201_83162284_83162353_83163266_83163376_83164509_83164576_83165849_83165956_83171222_83171288_83174281_83174350_83179118_83179196_83180062_83180195_83181930_83182039_83189353_83189456_83216164_83216200_83242307
tx.12995	chr4	-	1825	16	FSM	ENSMUSG00000038172.15	ENSMUST00000048274.11	1804	16	-21	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_7	23.0820757780192	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAAATTCAATTTTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83242497	83158046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_83158432_83159882_83159975_83160375_83160538_83162140_83162201_83162284_83162353_83163266_83163376_83164509_83164576_83165849_83165956_83171222_83171288_83174281_83174350_83179118_83179196_83180062_83180195_83181930_83182039_83189353_83189456_83216164_83216200_83242307
tx.12996	chr4	-	913	7	FSM	ENSMUSG00000038172.15	ENSMUST00000030205.14	842	7	-71	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	86.0905531015647	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAATGCTCTATTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83242497	83177434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_83177704_83179118_83179196_83180062_83180195_83181930_83182039_83189353_83189456_83216164_83216200_83242307
tx.12997	chr4	-	443	4	NNC	ENSMUSG00000038172.15	novel	8831	20	NA	NA	-3	-11214	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	109.612448603655	49	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGTGTTCCTATTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83242495	83188779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_83188898_83189353_83189456_83216164_83216200_83242307
tx.12998	chr4	+	397	2	Intergenic	novelGene_999	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	22	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCCCGTCTATAGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83260443	83268279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_83260574_83268012
tx.12999	chr4	-	1635	3	NNC	ENSMUSG00000086321.2	novel	1461	3	NA	NA	648	-79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.5	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGGCCTGACAGGATTG	8023	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83308257	83296632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_83297717_83307384_83307604_83307925
tx.13	chr1	+	4199	6	FSM	ENSMUSG00000051285.18	ENSMUST00000061280.17	5232	6	142	891	-42	78	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_2	17.1650808329003	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCATTATCCAGTGGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159285	7242961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_7159441_7190417_7190840_7217860_7217964_7231115_7231288_7233471_7233596_7239738
tx.130	chr1	+	2693	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000102279.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTTTGGTTGTGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36024631	36033719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_36024686_36026666_36026768_36031181
tx.13000	chr4	+	942	6	FSM	ENSMUSG00000028483.14	ENSMUST00000071544.11	942	6	-2	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	396	junction_3	22.8875512014719	466	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTTTCTAGTCCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83335965	83360321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_83336292_83336942_83337021_83346018_83346104_83353427_83353533_83354560_83354711_83360123
tx.13001	chr4	+	1398	9	FSM	ENSMUSG00000028483.14	ENSMUST00000030206.10	1405	9	7	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	309	junction_6	50.2767341819255	995	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTGATTCTTTTCTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83335967	83371577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_83336292_83336942_83337021_83346018_83346104_83353427_83353533_83354560_83354711_83360123_83360207_83368307_83368473_83369441_83369550_83371277
tx.13002	chr4	-	1508	2	ISM	ENSMUSG00000028484.17	ENSMUST00000030207.15	3251	16	28277	0	2110	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1208	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTATTAGTAAGTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83376419	83373916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_83375317_83376311
tx.13003	chr4	-	1593	3	ISM	ENSMUSG00000028484.17	ENSMUST00000030207.15	3251	16	26535	0	368	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1107	junction_2	50.5	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTATTAGTAAGTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83378161	83373916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_83375317_83376311_83376424_83378080
tx.13004	chr4	-	945	4	NNC	ENSMUSG00000028484.17	novel	1973	11	NA	NA	-1715	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	221	junction_1	758.278899145221	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGATTTTTAGGTATTTTT	5006	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83384995	83380107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_83380657_83381831_83381951_83383161_83383388_83384944
tx.13005	chr4	+	832	3	ISM	ENSMUSG00000052407.18	ENSMUST00000126429.8	1388	6	-38	8056	31	-8056	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTATTTGTATGCTGTCT	8720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83443812	83465559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_83444008_83454026_83454175_83465070
tx.13006	chr4	+	2794	9	FSM	ENSMUSG00000028488.16	ENSMUST00000030212.15	2822	9	28	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	246	junction_4	17.2191753577226	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGAGGCTTCTGCTTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85123705	85307617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_85123859_85265360_85265430_85273563_85273637_85294577_85294722_85295630_85295765_85297488_85297648_85299641_85299746_85304026_85304158_85305790
tx.13007	chr4	+	831	5	FSM	ENSMUSG00000066113.17	ENSMUST00000120678.2	977	5	-30	176	17	-176	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.08972473588517	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGTAAATGTGTTCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85972181	86117756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_85972358_86005945_86006074_86029053_86029100_86074871_86075109_86117512
tx.13008	chr4	-	1736	3	NIC	ENSMUSG00000028492.14	novel	1716	4	NA	NA	-5	221	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTAGGTTTGTTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86457359	86362656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_86364055_86405976_86406157_86457201
tx.13009	chr4	-	543	3	ISM	ENSMUSG00000038047.19	ENSMUST00000123432.2	600	4	-32	2762	-2	2	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	184	junction_1	1	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTATTTCCTTTGTAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86530288	86523871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_86523953_86526131_86526228_86529922
tx.13010	chr4	-	1203	4	ISM	ENSMUSG00000028494.13	ENSMUST00000000466.13	1888	8	7941	140	-2971	-140	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	453	junction_2	79.0119540885358	449	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCTGCTCCTGTGTGGTCT	1442	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86580356	86574941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_86575642_86576817_86576953_86578324_86578507_86580170
tx.13011	chr4	-	1705	8	FSM	ENSMUSG00000028494.13	ENSMUST00000000466.13	1888	8	43	140	-31	-140	multi-exon	FALSE	canonical	3	453	junction_2	61.6944412539141	1040	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCTGCTCCTGTGTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86588254	86574941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_86575642_86576817_86576953_86578324_86578507_86580170_86580451_86582665_86582749_86586603_86586800_86586886_86586943_86588181
tx.13012	chr4	-	821	5	NNC	ENSMUSG00000028495.15	novel	878	5	NA	NA	-16	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9226.88346626313	605	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGGCTTTCATTAATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86775607	86772898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_86773180_86774103_86774251_86774382_86774594_86774964_86775097_86775557
tx.13013	chr4	-	834	5	FSM	ENSMUSG00000028495.15	ENSMUST00000102814.5	878	5	42	2	-16	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	14010	junction_1	3685.72343645043	44278	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGGCTTTCATTAATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86775607	86772898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_86773193_86774103_86774251_86774382_86774594_86774964_86775097_86775557
tx.13014	chr4	-	543	4	FSM	ENSMUSG00000028495.15	ENSMUST00000123229.8	639	4	-16	112	-16	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	18159	junction_1	2678.8979077225	555	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGATTTGGGGGGGGGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86775607	86774100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_86774251_86774382_86774594_86774964_86775097_86775557
tx.13015	chr4	-	370	3	FSM	ENSMUSG00000028495.15	ENSMUST00000130001.2	639	3	-38	307	-16	-307	multi-exon	FALSE	canonical	3	19365	junction_2	2491.5	410	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACTTGGTCATTGTAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86775607	86774405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_86774594_86774964_86775097_86775557
tx.13016	chr4	+	708	2	FSM	ENSMUSG00000038007.15	ENSMUST00000135874.2	2943	2	33	2202	33	129	multi-exon	FALSE	canonical	3	467	junction_1	0	4119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTTGGTGTGGTTCAAGA	4153	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86848960	86850857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_86849080_86850268
tx.13017	chr4	-	1905	11	NNC	ENSMUSG00000028496.18	novel	6069	11	NA	NA	-230	40	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_10	6.23618473106755	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTCTTTAAAGCCAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87951280	87692112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_87692384_87700523_87700596_87701885_87701958_87707523_87707624_87710089_87710220_87712172_87712249_87758918_87759627_87792074_87792219_87798302_87798386_87949760_87949942_87951212
tx.13018	chr4	-	557	5	ISM	ENSMUSG00000028496.18	ENSMUST00000149357.8	794	7	14423	-34	14394	34	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_4	2.54950975679639	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTATTTTTCTTTAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87710137	87692118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_87692384_87700523_87700596_87701885_87701958_87707523_87707624_87710089
tx.13019	chr4	-	2107	11	FSM	ENSMUSG00000028496.18	ENSMUST00000078090.12	6069	11	5	3957	5	34	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_9	3.7	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTATTTTTCTTTAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87951596	87692118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_87692384_87700523_87700596_87701885_87701958_87707523_87707624_87710089_87710220_87712172_87712249_87758918_87759627_87792074_87792219_87798302_87798386_87949760_87949942_87951320
tx.1302	chr10	-	1815	13	FSM	ENSMUSG00000019792.9	ENSMUST00000019927.7	2359	13	54	490	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_10	17.7080882335979	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTGATACTCAGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30476691	30410710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_30411241_30423652_30423774_30434914_30435047_30435159_30435233_30436813_30436979_30442421_30442503_30463434_30463592_30466020_30466156_30466838_30466932_30467016_30467099_30470110_30470185_30473735_30473802_30476585
tx.13020	chr4	+	1759	11	ISM	ENSMUSG00000038368.17	ENSMUST00000097992.10	5791	44	-21	213785	-20	14177	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_5	16.9292646030476	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAATTCAGTATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88012845	88115458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_88012913_88039506_88039596_88042824_88042900_88047134_88047290_88072873_88072979_88088143_88088246_88092849_88093055_88096318_88096526_88100820_88100909_88104116_88104320_88114995
tx.13021	chr4	+	763	4	ISM	ENSMUSG00000038368.17	ENSMUST00000161058.8	1430	9	-45	53624	-29	7608	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	135	junction_1	10.2306728354819	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAACCAAAAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88012836	88047657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_88012913_88039506_88039596_88042824_88042900_88047134
tx.13022	chr4	+	1185	8	ISM	ENSMUSG00000038368.17	ENSMUST00000161058.8	1430	9	-36	4576	-20	-4576	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_5	16.634117877153	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACCTTGTTTTCACCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88012845	88096705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_88012913_88039506_88039596_88042824_88042900_88047134_88047290_88072873_88072979_88088143_88088246_88092849_88093055_88096318
tx.13023	chr4	-	960	6	NIC	ENSMUSG00000028497.13	novel	4680	7	NA	NA	4	-1021	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_5	2.48193472919817	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATTAACTTCTGCACTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88357159	88332187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_88332584_88337935_88338062_88341227_88341335_88344972_88345086_88353175_88353304_88357069
tx.13024	chr4	-	1058	7	FSM	ENSMUSG00000028497.13	ENSMUST00000030221.3	2089	7	6	1025	-5	-1025	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.26691175145591	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAATTGATTAACTTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88357157	88332191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_88332584_88337935_88338062_88341227_88341335_88344972_88345086_88353175_88353304_88355696_88355801_88357069
tx.13025	chr4	+	2529	8	FSM	ENSMUSG00000062937.8	ENSMUST00000058030.10	2797	8	262	6	262	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	513	junction_1	29.2609651521041	1363	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTCAGATGATCAGATTAT	5310	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89055620	89099312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_89055762_89066425_89066513_89070245_89070305_89074682_89074851_89089364_89089468_89090381_89090622_89095039_89095163_89097704
tx.13026	chr4	-	494	2	ISM	ENSMUSG00000044303.7	ENSMUST00000060501.5	852	3	5358	0	5358	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGATTTTTAGCATAGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89195071	89192707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_89193012_89194881
tx.13027	chr4	-	899	3	FSM	ENSMUSG00000044303.7	ENSMUST00000107131.2	895	3	66	-70	66	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGATTTTTAGCATAGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89212824	89192707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_89193012_89194881_89195223_89212570
tx.13028	chr4	+	681	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000073802.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACAAGGGGTTTCTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89213135	89256244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_89213435_89214789_89214842_89255914
tx.13029	chr4	+	569	2	Intergenic	novelGene_1002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGATTAGCAAACTCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89213148	89215072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_89213435_89214789
tx.1303	chr10	-	623	5	FSM	ENSMUSG00000019791.13	ENSMUST00000161074.8	875	5	34	218	34	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_1	42.7492689995981	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGAAGAACTGTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30494441	30484354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_30484420_30486312_30486440_30487643_30487714_30490708_30490827_30494198
tx.13030	chr4	-	1380	2	FSM	ENSMUSG00000073802.6	ENSMUST00000097981.6	1390	2	9	1	9	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGAAGTTCAACTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89229267	89224536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_89225552_89228902
tx.13031	chr4	-	3672	6	NNC	ENSMUSG00000008489.19	novel	1552	6	NA	NA	-3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	41.6461282714252	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTGTGTATCTTTAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91260274	91139002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_91141808_91148997_91149224_91152228_91152383_91169450_91169555_91196847_91197089_91260132
tx.13032	chr4	-	3662	6	NNC	ENSMUSG00000008489.19	novel	1552	6	NA	NA	4	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	36.2082863444267	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTGTGTATCTTTAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91260267	91139002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_91141805_91148997_91149224_91152228_91152383_91169450_91169555_91196847_91197089_91260132
tx.13033	chr4	-	1141	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000095937.2	novel	1002	1	NA	NA	-72	196	multi-exon	FALSE	canonical	2	163	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAGACAGAATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91740978	91739708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_91740769_91740897
tx.13034	chr4	-	1587	5	FSM	ENSMUSG00000087128.8	ENSMUST00000133884.8	925	5	-11	-651	-11	651	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7.28010988928052	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTATGTGCAAGCGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94365428	94348516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_94349593_94352666_94352793_94353653_94353778_94356020_94356103_94365249
tx.13035	chr4	-	1756	6	NNC	ENSMUSG00000087128.8	novel	925	5	NA	NA	-8	654	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_5	4.63033476111609	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGTGCAAGCGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94365425	94348513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_94349593_94350122_94350292_94352666_94352793_94353653_94353778_94356020_94356103_94365249
tx.13036	chr4	-	1856	6	FSM	ENSMUSG00000028578.9	ENSMUST00000030313.9	2107	6	251	0	221	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_2	22.29798197147	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACAGATATCTTTTGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94444782	94388317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_94389654_94409298_94409373_94437355_94437432_94438658_94438744_94439501_94439703_94444698
tx.13037	chr4	-	1468	7	ISM	ENSMUSG00000028577.14	ENSMUST00000107107.9	2784	14	19731	0	-15	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	672	junction_2	51.5751878329105	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTGTGAGGTTTTCCTGTG	5437	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94471750	94457403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_94458147_94459923_94460089_94462218_94462321_94463402_94463472_94466623_94466693_94470717_94470938_94471650
tx.13038	chr4	-	2698	14	FSM	ENSMUSG00000028577.14	ENSMUST00000107107.9	2784	14	86	0	-23	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	626	junction_12	53.7532164993284	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTGTGAGGTTTTCCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94491395	94457403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_94458147_94459923_94460089_94462218_94462321_94463402_94463472_94466623_94466693_94470717_94470938_94471650_94471809_94472069_94472240_94474531_94474668_94474989_94475158_94475517_94475639_94475723_94475825_94478117_94478312_94491113
tx.13039	chr4	-	1080	4	FSM	ENSMUSG00000028577.14	ENSMUST00000129748.2	3886	4	1152	1654	1152	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	672	junction_2	16.2138486760204	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTGTGAGGTTTTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94463473	94457404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_94458147_94459923_94460089_94462218_94462321_94463402
tx.13040	chr4	+	2127	20	FSM	ENSMUSG00000028576.13	ENSMUST00000030311.11	2139	20	16	-4	16	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_8	18.5526129152575	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTTTTCCTGTGTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94502743	94581470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_94502889_94506203_94506339_94510090_94510227_94512967_94513017_94515213_94515313_94515488_94515550_94520913_94520974_94524010_94524073_94541163_94541303_94543065_94543129_94546743_94546888_94549184_94549226_94550823_94550904_94566501_94566556_94567416_94567515_94568170_94568298_94573858_94574023_94575047_94575174_94579956_94580018_94581187
tx.13041	chr4	+	815	7	NNC	ENSMUSG00000028576.13	novel	1713	14	NA	NA	21	-37117	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	75.347343829907	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATACCTCAGTCTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94502748	94515818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_94502889_94506203_94506339_94510090_94510227_94512967_94513017_94515213_94515313_94515488_94515550_94515623
tx.13042	chr4	+	1670	6	ISM	ENSMUSG00000028576.13	ENSMUST00000107104.3	1713	14	27	36330	27	-36330	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_4	9.62081077664455	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTACATTGCAGTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94502754	94516605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_94502889_94506203_94506339_94510090_94510227_94512967_94513017_94515213_94515313_94515488
tx.13043	chr4	+	979	9	NNC	ENSMUSG00000028576.13	novel	1713	14	NA	NA	25	-26042	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_8	62.4234531246069	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAGTGTGGACAAGGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94502752	94526893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_94502889_94506203_94506339_94510090_94510227_94512967_94513017_94515213_94515313_94515488_94515550_94520913_94520974_94524010_94524073_94526652
tx.13044	chr4	-	2577	20	FSM	ENSMUSG00000062627.10	ENSMUST00000075872.4	7420	20	14	4829	-8	156	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_15	17.5783170388094	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTAAACTTTCTCACATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94867323	94835105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_94835361_94836338_94836397_94836565_94836672_94839162_94839296_94840410_94840600_94841099_94841175_94841734_94841786_94842108_94842164_94845286_94845376_94847149_94847228_94848564_94848669_94849939_94850071_94853365_94854109_94856106_94856206_94857216_94857296_94858748_94858773_94858860_94858939_94861154_94861226_94863453_94863530_94867240
tx.13045	chr4	-	291	2	ISM	ENSMUSG00000062627.10	ENSMUST00000125427.2	575	6	5358	-133	5228	133	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTTTTTTTAATCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94836397	94835128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_94835361_94836338
tx.13046	chr4	-	1296	3	FSM	ENSMUSG00000062627.10	ENSMUST00000136130.2	704	3	-15	-577	10	577	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_1	6	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACTCTTTTATAGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94867327	94860092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_94861226_94863453_94863530_94867240
tx.13047	chr4	-	489	2	ISM	ENSMUSG00000062627.10	ENSMUST00000136130.2	704	3	-5	2448	-2	-2448	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATAGAGGAACCTAACCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94867317	94863117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_94863530_94867240
tx.13048	chr4	+	438	3	NNC	ENSMUSG00000087366.8	novel	730	4	NA	NA	-625	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACTGTGGTCCTTATCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94940562	94955659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_94940620_94953849_94953982_94955410
tx.13049	chr4	-	1023	3	Intergenic	novelGene_1003	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATTGTGTTCACATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96986589	96957227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_96958054_96960263_96960347_96986475
tx.1305	chr10	+	850	6	FSM	ENSMUSG00000000295.14	ENSMUST00000000304.14	858	6	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	475	junction_4	15.6025638918737	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTCTGTCTTCTGTTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31189386	31204200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_31189480_31190510_31190633_31192288_31192392_31196263_31196333_31202017_31202157_31203876
tx.13050	chr4	-	976	7	NNC	ENSMUSG00000028563.17	novel	1027	7	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	212.976328888134	1639	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTGACCTGTTATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98271493	98243606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_98243918_98246154_98246285_98253799_98253874_98258728_98258821_98263156_98263266_98268854_98268923_98271301
tx.13051	chr4	-	979	7	NNC	ENSMUSG00000028563.17	novel	1027	7	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	3	529	junction_2	26.6958174002346	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTGACCTGTTATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98271495	98243606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_98243918_98246154_98246285_98253799_98253874_98258728_98258821_98263156_98263266_98268854_98268925_98271302
tx.13052	chr4	+	1078	3	ISM	ENSMUSG00000087166.10	ENSMUST00000154279.3	2942	5	-6	4435	-6	401	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	363	junction_2	35	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGGAAGAAGAAACGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98614978	98622282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_98615078_98615631_98615708_98621379
tx.13053	chr4	+	3167	4	ISM	ENSMUSG00000087166.10	ENSMUST00000154279.3	2942	5	-27	0	-13	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	363	junction_2	40.8765077873452	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTTTACTTAATGTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98614957	98626717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_98615078_98615631_98615708_98621379_98622316_98624682
tx.13054	chr4	+	1090	3	FSM	ENSMUSG00000087166.10	ENSMUST00000152889.9	705	3	16	-401	2	401	multi-exon	FALSE	canonical	3	192	junction_2	120.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGGAAGAAGAAACGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98614986	98622282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_98615078_98615631_98615708_98621359
tx.13055	chr4	+	3049	3	ISM	ENSMUSG00000087166.10	ENSMUST00000154279.3	2942	5	643	2	598	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	363	junction_1	48.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGGTTTACTTAATGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98615627	98626715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_98615708_98621379_98622316_98624682
tx.13056	chr4	+	673	2	Intergenic	novelGene_1004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAGTTAAAATTGAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98623175	98623971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_98623691_98623813
tx.13057	chr4	+	1789	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035407.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCTTGGGTGTCCCAGGA	8892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98674734	98679687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_98674887_98678050
tx.13058	chr4	+	1881	3	FSM	ENSMUSG00000085843.2	ENSMUST00000133455.2	2251	3	-8	378	-8	-378	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	4	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTTTTCAACCCTACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98681996	98686759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_98682120_98684245_98684324_98685079
tx.13059	chr4	+	2813	11	FSM	ENSMUSG00000028550.16	ENSMUST00000180278.2	2792	11	-17	-4	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	10.6155546251715	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACACTTTTGTTTTGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99082366	99148024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_99082521_99100813_99100949_99104114_99104199_99106201_99106436_99109428_99109760_99111109_99111181_99112650_99112788_99116792_99116872_99117724_99117802_99123303_99123424_99146633
tx.13060	chr4	+	1076	2	FSM	ENSMUSG00000087332.2	ENSMUST00000132108.2	354	2	-9	-713	-9	713	multi-exon	TRUE	canonical	3	84	junction_1	0	234	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGATAGCTGGTCTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99457727	99461961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_99457876_99461033
tx.13061	chr4	+	737	2	Intergenic	novelGene_1006	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCCTCTCTCTCTCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99538515	99540129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_99538782_99539658
tx.13062	chr4	+	3112	15	FSM	ENSMUSG00000073792.12	ENSMUST00000097961.9	3079	15	-35	2	-34	-2	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	55.2805922322746	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGTTTGCGTGTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99603866	99651695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_99603944_99607267_99607471_99615099_99615185_99626360_99626451_99627450_99627540_99629770_99629854_99630591_99630657_99631991_99632178_99632726_99632863_99634562_99634649_99636922_99637008_99638965_99639037_99641053_99641123_99641229_99641429_99650107
tx.13063	chr4	+	728	5	ISM	ENSMUSG00000073792.12	ENSMUST00000144805.8	3947	14	-28	22818	-27	20	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	166	junction_1	24.1557446583623	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAAGTCTTACTCTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99603873	99627730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_99603944_99607267_99607471_99615099_99615185_99626360_99626451_99627450
tx.13064	chr4	-	793	9	FSM	ENSMUSG00000028549.18	ENSMUST00000146258.2	2806	9	30	1983	-22	-54	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_5	47.6377935572167	975	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTATATGCCTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99717393	99655621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_99655814_99657730_99657779_99668998_99669059_99670113_99670208_99677837_99677917_99686932_99687000_99690333_99690470_99702294_99702338_99717319
tx.13065	chr4	-	643	8	NIC	ENSMUSG00000028549.18	novel	2806	9	NA	NA	-8	-54	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_6	80.1386553520375	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTATATGCCTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99717379	99655621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_99655814_99657730_99657779_99668998_99669059_99670113_99670208_99677837_99677917_99686932_99687000_99702294_99702338_99717319
tx.13066	chr4	+	2175	14	NIC	ENSMUSG00000073791.14	novel	2121	14	NA	NA	4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	8	junction_1	4.74933816628712	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGACTGTCTTGTTAATTG	2024	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99717685	99769985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_99717792_99719626_99719818_99731496_99731709_99732648_99732736_99735289_99735486_99735908_99736028_99746056_99746199_99754598_99754709_99757733_99757892_99758840_99758975_99761882_99762032_99766776_99766987_99768120_99768229_99769732
tx.13067	chr4	+	2320	11	FSM	ENSMUSG00000025791.19	ENSMUST00000058351.16	2371	11	51	0	51	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	174	junction_5	14.102836594104	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTTGTCGCTTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99786661	99844491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_99787009_99818652_99818816_99819240_99819388_99820714_99820841_99821871_99822063_99824255_99824411_99827183_99827300_99836061_99836198_99839080_99839265_99841165_99841301_99843871
tx.13068	chr4	-	2578	11	ISM	ENSMUSG00000028530.15	ENSMUST00000102781.10	4906	25	102334	0	-7829	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	166	junction_8	13.865424623862	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCATATGCCTTTTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101020145	101009563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_101010788_101011734_101011846_101012212_101012331_101013589_101013763_101014148_101014274_101014950_101015144_101016010_101016106_101016211_101016363_101017228_101017381_101019003_101019140_101020045
tx.13069	chr4	-	4867	25	NNC	ENSMUSG00000028530.15	novel	4906	25	NA	NA	-16	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_12	41.4274591907348	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACATGCATATGCCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101122439	101009566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_101010788_101011734_101011846_101012212_101012331_101013589_101013763_101014148_101014274_101014950_101015144_101016010_101016106_101016211_101016363_101017228_101017381_101019003_101019140_101020045_101020174_101020854_101020943_101021650_101021799_101023739_101023847_101028431_101028619_101031282_101031407_101032270_101032429_101034764_101034954_101036651_101036992_101038976_101039141_101041533_101041688_101046275_101046400_101048671_101048871_101050979_101051061_101122238
tx.13070	chr4	-	1091	5	ISM	ENSMUSG00000028530.15	ENSMUST00000102781.10	4906	25	108205	661	-1958	-661	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	187	junction_4	10.1242283656583	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTTCCTGCTACCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101014274	101010224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_101010788_101011734_101011846_101012212_101012331_101013589_101013763_101014148
tx.13071	chr4	+	1531	4	NNC	ENSMUSG00000087361.8	novel	614	4	NA	NA	1777	615	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.816496580927726	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCATGGCACCTGGCTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101212756	101256993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_101213086_101224186_101224337_101252845_101252991_101256086
tx.13072	chr4	+	1648	5	ISM	ENSMUSG00000028527.19	ENSMUST00000106945.8	4175	6	411	2443	-3	773	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_2	35.8355619462009	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGTTTTTCTTCTGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101276926	101321749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_101277163_101304356_101304477_101317696_101317870_101320145_101320265_101320749
tx.13073	chr4	+	3970	4	NIC	ENSMUSG00000028527.19	novel	4186	6	NA	NA	0	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_1	134.910670033504	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGATGGAATTTCATAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101276929	101324194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_101277163_101317696_101317870_101320145_101320265_101320749
tx.13074	chr4	+	1891	4	FSM	ENSMUSG00000035212.15	ENSMUST00000030254.15	1898	4	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	539	junction_3	48.8011839564939	1875	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAGTTGCATTTCATAAA	8222	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101504921	101516561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_101505023_101509595_101509672_101513305_101513493_101515034
tx.13075	chr4	+	944	5	NNC	ENSMUSG00000035212.15	novel	1898	4	NA	NA	30	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_4	259.519267107473	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAGTTGCATTTCATAAA	8245	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101504944	101516561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_101505023_101509595_101509672_101513305_101513493_101515034_101515195_101516118
tx.13076	chr4	+	1792	3	ISM	ENSMUSG00000035212.15	ENSMUST00000030254.15	1898	4	4679	0	4604	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	539	junction_2	58	434	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAGTTGCATTTCATAAA	1479	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101509593	101516561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_101509672_101513305_101513493_101515034
tx.13077	chr4	-	919	3	FSM	ENSMUSG00000046133.4	ENSMUST00000051043.4	913	3	-6	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_2	115.5	1205	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTTTCTTCTTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101750992	101747216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_101747741_101747885_101748198_101750909
tx.13078	chr4	-	1010	4	NNC	ENSMUSG00000046133.4	novel	913	3	NA	NA	-9902	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	190.887983441133	613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTTTCTTCTTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101760888	101747216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_101747741_101747885_101748198_101760342_101760431_101760802
tx.13079	chr4	+	397	2	NNC	ENSMUSG00000037028.8	novel	1455	3	NA	NA	-1945	-1742	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATATTGAGGAATTGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101764372	101767363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_101764446_101767039
tx.1308	chr10	-	1107	5	FSM	ENSMUSG00000000296.9	ENSMUST00000214644.2	1103	5	-5	1	-4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	404	junction_1	42.7346463656832	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATGGCTGGATCTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31321855	31208373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_31208966_31222606_31222709_31233867_31234017_31255210_31255327_31321707
tx.13080	chr4	+	756	3	NNC	ENSMUSG00000070890.4	novel	1452	3	NA	NA	-1945	-1694	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_2	1	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTTGCTTTGCCCCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101795658	101798686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_101795732_101797576_101797891_101798317
tx.13081	chr4	-	1251	3	NNC	ENSMUSG00000078626.3	novel	951	4	NA	NA	9752	477	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	20	junction_1	2.5	86	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCTGGCTGGGTTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101828494	101824172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_101824980_101825125_101825438_101828362
tx.13082	chr4	-	845	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028524.22_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTATTCCGGTTCTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102716597	102698086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_102698876_102716541
tx.13083	chr4	+	334	2	FSM	ENSMUSG00000028522.17	ENSMUST00000136092.2	475	2	-27	168	-27	-168	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCTGGTGTTGTAGGCGT	2485	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102971559	102972933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_102971717_102972756
tx.13084	chr4	+	722	6	FSM	ENSMUSG00000028522.17	ENSMUST00000151588.8	2320	6	-2	1600	-2	-1600	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_1	21.6942388665747	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATGTATTAGCCTTATT	445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102976584	102998170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_102976707_102984469_102984495_102988162_102988309_102996554_102996714_102997307_102997441_102998033
tx.13085	chr4	+	722	7	FSM	ENSMUSG00000028522.17	ENSMUST00000124348.2	1918	7	-22	1218	-2	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_1	20.8619803044251	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTGAGTTAAATTAAATTAA	445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102976584	103000402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_102976707_102984469_102984495_102988162_102988309_102996554_102996714_102997307_102997441_102998033_102998099_103000330
tx.13086	chr4	+	1997	10	NNC	ENSMUSG00000035069.4	novel	1915	9	NA	NA	4	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	38.2935381197454	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCATCTGTCCTTGCCTT	46	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103171012	103223631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_103171081_103173440_103173536_103176218_103176726_103178836_103179066_103182215_103182390_103182489_103182598_103186034_103186164_103188501_103188577_103210698_103210849_103223169
tx.13087	chr4	+	1900	9	FSM	ENSMUSG00000035069.4	ENSMUST00000035780.4	1915	9	6	9	6	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	14.2560294261761	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCATCTGTCCTTGCCTT	48	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103171014	103223631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_103171081_103176218_103176726_103178836_103179066_103182215_103182390_103182489_103182598_103186034_103186164_103188501_103188577_103210698_103210849_103223169
tx.13088	chr4	+	1783	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000059195.11	novel	1128	1	NA	NA	-71	728	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCTTCAAGAGATATGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103420527	103422454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_103421939_103422082
tx.13089	chr4	+	1165	7	ISM	ENSMUSG00000028519.17	ENSMUST00000106830.9	5278	15	-30	64461	-30	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	2.40947204913349	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGACTGTTGTAACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104224756	104537580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_104224915_104336270_104336473_104462494_104462635_104470365_104470465_104535898_104536031_104536649_104536770_104537266
tx.13090	chr4	+	1083	8	NIC	ENSMUSG00000028519.17	novel	5278	15	NA	NA	-30	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_7	7.28991475552747	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGACTGTTGTAACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104224756	104537580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_104224915_104336270_104336473_104462494_104462635_104470365_104470465_104535898_104536031_104536649_104536770_104537266_104537306_104537387
tx.13091	chr4	+	1284	3	ISM	ENSMUSG00000028519.17	ENSMUST00000146078.8	2462	15	-22	135568	-22	-72563	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	3	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAGTTGACATTTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104224764	104463426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_104224915_104336270_104336473_104462494
tx.13092	chr4	+	1071	4	FSM	ENSMUSG00000029656.14	ENSMUST00000123892.2	1061	4	-4	-6	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	0.816496580927726	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATCTCTGTGTGGCACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104656400	104661743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_104656711_104657531_104657686_104658534_104658604_104661205
tx.13093	chr4	-	281	2	ISM	ENSMUSG00000028518.9	ENSMUST00000030243.8	7969	9	18	45569	18	-45569	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTCGTCATCCTCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104967069	104932639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_104932753_104966901
tx.13094	chr4	+	1551	6	FSM	ENSMUSG00000028517.9	ENSMUST00000064139.8	3159	6	1	1607	1	-1607	multi-exon	FALSE	canonical	3	181	junction_2	17.8616908494129	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTATCTTGTGGCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105014544	105088354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_105015161_105051999_105052158_105065720_105066002_105066396_105066455_105076524_105076702_105088093
tx.13095	chr4	+	936	5	ISM	ENSMUSG00000028517.9	ENSMUST00000064139.8	3159	6	37454	1608	37454	-1608	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_1	17.0495601116275	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCTTATCTTGTGGCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105051997	105088353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_105052158_105065720_105066002_105066396_105066455_105076524_105076702_105088093
tx.13096	chr4	+	577	2	Intergenic	novelGene_1007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCAATGCAGTGAATTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105095721	105096908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_105095992_105096601
tx.13097	chr4	+	405	2	Intergenic	novelGene_1008	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTCTTTGTCTGGGGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105100463	105102960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_105100572_105102663
tx.13098	chr4	-	386	2	Intergenic	novelGene_1010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGTATGACCGTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106173381	106172807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_106173071_106173258
tx.13099	chr4	-	2067	8	ISM	ENSMUSG00000054362.10	ENSMUST00000106788.2	1569	10	1437	-402	1437	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	5	junction_3	4.52656557650139	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGGTTCTACCAGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106472998	106448104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_106448885_106464485_106464620_106467596_106467723_106468609_106468772_106470305_106470450_106470564_106470700_106472231_106472355_106472535
tx.131	chr1	-	1992	3	NNC	ENSMUSG00000103708.2	novel	654	3	NA	NA	5414	1273	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTGCATCTAGGTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36044657	36040792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_36042488_36042894_36043073_36044538
tx.1310	chr10	-	2150	11	FSM	ENSMUSG00000039531.9	ENSMUST00000218055.2	2180	11	30	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_10	16.213882940246	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTTTGGTTTCTTGTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33827225	33795137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_33795372_33803396_33803618_33804007_33804160_33805816_33805983_33806151_33806341_33811084_33811254_33816153_33816276_33819645_33819757_33824924_33825495_33825743_33825861_33827126
tx.13100	chr4	+	2213	2	FSM	ENSMUSG00000043572.8	ENSMUST00000058905.8	2191	2	-22	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106508280	106512479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_106508329_106510314
tx.13101	chr4	-	2086	10	FSM	ENSMUSG00000025413.14	ENSMUST00000026480.13	2121	10	33	2	-10	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	276	junction_4	15.561903466677	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATCTTGTGTTGTTTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106536108	106519454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_106520429_106522852_106522936_106524692_106524775_106525233_106525452_106527645_106527733_106528820_106528946_106531607_106531686_106533794_106533957_106535381_106535500_106535949
tx.13102	chr4	-	433	2	Intergenic	novelGene_1011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTTAGAAAACACGCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106715802	106715187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_106715439_106715620
tx.13103	chr4	+	550	2	Intergenic	novelGene_1012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTTTGTTTGTTTTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106717048	106718506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_106717466_106718373
tx.13104	chr4	-	1480	7	FSM	ENSMUSG00000028622.12	ENSMUST00000030365.6	1498	7	10	8	10	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	549	junction_3	34.5976877840124	1793	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTGTGAGATTGTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106924055	106913078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_106913302_106914568_106914773_106917679_106917838_106919079_106919266_106921581_106921698_106921783_106921968_106923646
tx.13105	chr4	+	1507	6	ISM	ENSMUSG00000028621.18	ENSMUST00000106758.8	2516	7	1554	1021	-63	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_5	2.78567765543682	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGCCTCACGCTCAGTTTC	2485	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106925738	106942002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_106926021_106928066_106928216_106931069_106931158_106934872_106934978_106938087_106938292_106941323
tx.13106	chr4	-	1726	6	NNC	ENSMUSG00000028619.16	novel	6431	5	NA	NA	15	455	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_3	29.9492904757358	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGCATAGTTTCCCCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107035548	106996011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_106996997_107004711_107004906_107022744_107022887_107033670_107033822_107034761_107034902_107035434
tx.13107	chr4	-	1571	5	FSM	ENSMUSG00000028619.16	ENSMUST00000057043.10	6431	5	200	4660	19	455	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_1	11	196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGCATAGTTTCCCCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107035544	106996011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_106996997_107004711_107004906_107022744_107022887_107034761_107034902_107035434
tx.13108	chr4	-	1306	4	NNC	ENSMUSG00000028619.16	novel	389	4	NA	NA	2	856	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_1	34.7211110933328	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCTTCATAGAGGAGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107035561	107021998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_107022887_107033670_107033822_107034761_107034902_107035434
tx.13109	chr4	+	1508	8	FSM	ENSMUSG00000028618.12	ENSMUST00000030361.11	1775	8	267	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1513	junction_5	112.332959889567	3855	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGAGTGTTGGGCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107035862	107058193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_107036115_107042974_107043081_107044815_107044911_107047731_107047885_107049658_107049741_107050495_107050578_107054702_107054812_107057564
tx.1311	chr10	-	986	7	FSM	ENSMUSG00000019782.11	ENSMUST00000019917.6	1090	7	107	-3	69	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1217	junction_2	78.0243907733701	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTTACTTCCTCTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33895513	33872547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_33872845_33877132_33877196_33877653_33877787_33878419_33878564_33884988_33885120_33888067_33888134_33895361
tx.13110	chr4	-	548	2	FSM	ENSMUSG00000028617.11	ENSMUST00000142657.2	407	2	104	-245	104	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_1	0	479	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGCTTTTGAATTGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107093073	107090710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_107091182_107092996
tx.13111	chr4	-	1097	7	ISM	ENSMUSG00000028617.11	ENSMUST00000030360.11	1755	8	6152	0	-3853	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	194	junction_4	8.78761755097604	255	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGCTTTTGAATTGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107104577	107090710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_107091182_107092996_107093082_107096274_107096389_107096908_107096998_107098098_107098218_107100404_107100537_107104490
tx.13112	chr4	-	1707	8	FSM	ENSMUSG00000028617.11	ENSMUST00000030360.11	1755	8	48	0	48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	194	junction_4	9.55755924781585	899	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGCTTTTGAATTGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107110681	107090710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_107091182_107092996_107093082_107096274_107096389_107096908_107096998_107098098_107098218_107100404_107100537_107104490_107104978_107110471
tx.13113	chr4	+	648	6	FSM	ENSMUSG00000063172.14	ENSMUST00000046558.8	608	6	-33	-7	-6	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_1	99.534114754691	839	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATTCCATTTTTTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107111088	107137132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_107111193_107119663_107119777_107130809_107130917_107132419_107132489_107135123_107135168_107136921
tx.13114	chr4	+	616	6	FSM	ENSMUSG00000063172.14	ENSMUST00000106749.8	607	6	-11	2	-6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	216	junction_1	69.6746725862418	1007	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCCATTTTTTTTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107111088	107137133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_107111160_107119663_107119777_107130809_107130917_107132419_107132489_107135123_107135168_107136921
tx.13115	chr4	+	544	5	ISM	ENSMUSG00000063172.14	ENSMUST00000046558.8	608	6	8540	-5	-2	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	358	junction_3	17.4696164811939	413	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGATTCCATTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107119661	107137130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_107119777_107130809_107130917_107132419_107132489_107135123_107135168_107136921
tx.13116	chr4	+	1308	10	FSM	ENSMUSG00000057375.14	ENSMUST00000075693.12	1321	10	14	-1	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	322	junction_9	32.5261528202145	1105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTCCTTCAGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107171573	107217020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_107171660_107172959_107173040_107176138_107176303_107193310_107193392_107193633_107193722_107198182_107198300_107201708_107201876_107202205_107202389_107207610_107207736_107216803
tx.13117	chr4	+	2348	18	FSM	ENSMUSG00000028614.15	ENSMUST00000139560.8	4584	18	234	2002	-34	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	529	junction_11	46.6085071760132	221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTCTATGGCAGCCGAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107225214	107271541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_107225346_107225953_107226075_107228458_107228561_107231343_107231519_107232274_107232414_107237794_107237904_107238872_107238925_107240781_107240918_107241982_107242076_107243792_107243875_107246647_107246804_107247418_107247659_107247745_107247862_107250339_107250391_107252194_107252259_107252928_107253030_107268262_107268424_107271222
tx.13118	chr4	+	562	3	ISM	ENSMUSG00000028614.15	ENSMUST00000030357.15	2354	17	27869	-9	14287	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	631	junction_1	47.5	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCGTCTATGGCAGCCGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107252945	107271539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_107253030_107268262_107268424_107271222
tx.13119	chr4	+	654	5	FSM	ENSMUSG00000028609.7	ENSMUST00000030348.6	692	5	9	29	9	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	977	junction_1	47.9446295219809	13871	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACATCTTTTTTTGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107736960	107744592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_107737143_107738089_107738149_107740264_107740376_107742113_107742197_107744373
tx.1312	chr10	-	815	2	FSM	ENSMUSG00000046031.8	ENSMUST00000062784.8	1094	2	279	0	279	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTTTCTCCCAAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34003701	34002062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_34002563_34003386
tx.13120	chr4	+	699	8	FSM	ENSMUSG00000028608.16	ENSMUST00000135454.8	2997	8	32	2266	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	475	junction_1	98.5130261769001	1619	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTGCGTGAAGGTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107747041	107754315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_107747094_107747315_107747400_107748661_107748719_107749151_107749234_107749418_107749451_107750530_107750609_107752069_107752136_107754067
tx.13121	chr4	+	648	7	FSM	ENSMUSG00000028608.16	ENSMUST00000125107.8	1551	7	219	684	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	677	junction_4	47.0558179187229	1428	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTGCGTGAAGGTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107747314	107754315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_107747400_107748661_107748719_107749151_107749234_107749418_107749451_107750530_107750609_107752069_107752136_107754067
tx.13122	chr4	-	1109	2	ISM	ENSMUSG00000028607.17	ENSMUST00000030345.15	2372	5	16163	1	5319	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	161	junction_1	0	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATCTGGTTCCTTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107764644	107761178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_107761761_107764117
tx.13123	chr4	-	2347	5	FSM	ENSMUSG00000028607.17	ENSMUST00000030345.15	2372	5	24	1	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_2	11.5866302262565	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATCTGGTTCCTTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107780783	107761178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_107761761_107764117_107765423_107769837_107769945_107771460_107771542_107780511
tx.13124	chr4	-	2632	16	FSM	ENSMUSG00000028603.16	ENSMUST00000030340.15	2640	16	7	1	7	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	305	junction_7	132.795314509043	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTTGGCTTTTACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107975722	107901036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_107902043_107904786_107904867_107912635_107912766_107921082_107921186_107928453_107928608_107931552_107931661_107942351_107942500_107944208_107944360_107948433_107948521_107950020_107950085_107955218_107955346_107959487_107959553_107962240_107962373_107964813_107964886_107969423_107969482_107975575
tx.13125	chr4	-	1439	5	FSM	ENSMUSG00000028603.16	ENSMUST00000106701.2	772	5	43	-710	-13	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	566	junction_3	53.5601297608585	1411	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTTGGCTTTTACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107928573	107901036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_107902043_107904786_107904867_107912635_107912766_107921082_107921186_107928453
tx.13126	chr4	+	1274	10	FSM	ENSMUSG00000028601.19	ENSMUST00000052999.13	1307	10	33	0	4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	713	junction_3	43.9463758530471	3035	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTGCTGGAATTGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108022666	108036505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_108022859_108026911_108026980_108027057_108027146_108029285_108029373_108030076_108030170_108030991_108031049_108031183_108031372_108034269_108034321_108035567_108035616_108036103
tx.13127	chr4	-	2459	14	NNC	ENSMUSG00000034645.15	novel	2283	14	NA	NA	31	77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	21.3463963950184	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTGGGTTTACCAATTG	5574	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108075214	108038857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_108039111_108040844_108040943_108041629_108041692_108044436_108044632_108046643_108046689_108046765_108046928_108049106_108049161_108049248_108049349_108051175_108051245_108053340_108053518_108058389_108058531_108061791_108062544_108067252_108067419_108075029
tx.13128	chr4	-	2616	14	NNC	ENSMUSG00000034636.10	novel	8691	14	NA	NA	-37	5626	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	31.7814280924825	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTGATTTGTTTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108158330	108093036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_108093392_108094538_108094637_108099017_108099071_108099196_108099395_108101922_108101971_108102072_108102235_108107691_108107743_108107970_108108071_108109344_108109414_108112397_108112575_108117146_108117288_108123014_108123770_108129414_108129581_108158087
tx.13129	chr4	-	1178	3	ISM	ENSMUSG00000034636.10	ENSMUST00000043616.7	8691	14	-21	36064	-21	-24322	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_2	1	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTCAGGTTTTTTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108158314	108122984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_108123770_108129414_108129581_108158087
tx.13130	chr4	+	905	3	FSM	ENSMUSG00000048351.15	ENSMUST00000131656.2	3714	3	6	2803	6	58	multi-exon	FALSE	canonical	3	432	junction_2	33.5	3984	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACGTTTATGGGGGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108185342	108195938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_108185488_108189407_108189549_108195319
tx.13131	chr4	-	746	3	FSM	ENSMUSG00000059816.6	ENSMUST00000053157.7	593	3	-142	-11	-142	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_2	6	362	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGGAATCTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108240688	108224962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_108225239_108234543_108234684_108240358
tx.13132	chr4	-	1034	3	FSM	ENSMUSG00000028597.12	ENSMUST00000030332.7	1289	3	234	21	-3	-21	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_2	16.5	1157	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTAGCCCGTGGAAACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108263924	108257607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_108258195_108260397_108260660_108263739
tx.13133	chr4	+	656	2	ISM	ENSMUSG00000034610.15	ENSMUST00000106673.8	679	3	688	-288	104	288	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAACACACCCACTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108317310	108336638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_108317398_108336069
tx.13134	chr4	+	1369	4	ISM	ENSMUSG00000034610.15	ENSMUST00000043368.12	6054	31	91321	0	1662	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	135	junction_3	11.2249721603218	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAATTTGGTTAATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108407943	108416612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_108408011_108412578_108413027_108414518_108414672_108415911
tx.13135	chr4	-	497	3	ISM	ENSMUSG00000063800.6	ENSMUST00000125106.2	2889	6	5744	-3	-445	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	546	junction_2	38.5	256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGGCTTTTTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108424669	108422066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_108422465_108424101_108424151_108424619
tx.13136	chr4	-	1495	9	NNC	ENSMUSG00000063800.6	novel	1516	10	NA	NA	16	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	182.781973947105	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGGCTTTTTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108436517	108422066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_108422465_108424101_108424151_108424619_108424718_108425532_108425668_108427352_108427464_108430002_108430089_108432565_108432688_108434125_108434286_108436181
tx.13137	chr4	-	1500	10	FSM	ENSMUSG00000063800.6	ENSMUST00000079213.6	1516	10	16	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	462	junction_7	44.4233283170614	541	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGGCTTTTTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108436517	108422066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_108422465_108424101_108424151_108424619_108424718_108424810_108424838_108425554_108425668_108427352_108427464_108430002_108430089_108432565_108432688_108434125_108434286_108436181
tx.13138	chr4	+	3013	17	FSM	ENSMUSG00000028587.19	ENSMUST00000102744.4	3014	17	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	458	junction_7	60.5103296966724	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGGTATGGTTTGGGGT	5273	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108436651	108472030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_108436773_108445872_108445979_108447849_108447975_108450489_108450669_108452525_108452842_108454326_108454676_108456519_108456622_108457127_108457282_108459152_108459251_108460584_108460687_108461161_108461334_108461696_108461805_108462724_108462875_108463434_108463555_108469247_108469418_108470265_108470354_108471477
tx.13139	chr4	+	2920	16	NIC	ENSMUSG00000028587.19	novel	3014	17	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_2	149.780936333329	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGGTATGGTTTGGGGT	5241	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108436619	108472030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_108436773_108445872_108445979_108450489_108450669_108452525_108452842_108454326_108454676_108456519_108456622_108457127_108457282_108459152_108459251_108460584_108460687_108461161_108461334_108461696_108461805_108462724_108462875_108463434_108463555_108469247_108469418_108470265_108470354_108471477
tx.13140	chr4	+	1557	11	ISM	ENSMUSG00000028582.15	ENSMUST00000106665.8	2892	16	2007	-15	-1535	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	175	junction_6	25.684431081883	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTTTATGTAGCCATTT	6034	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108485251	108491317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_108485400_108485779_108485906_108486770_108486830_108486913_108487031_108487288_108487363_108487474_108487534_108487740_108487793_108488792_108488893_108489031_108489123_108490367_108490501_108490719
tx.13141	chr4	+	710	2	ISM	ENSMUSG00000028582.15	ENSMUST00000106665.8	2892	16	7147	-18	2745	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	269	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATGTAGCCATTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108490391	108491320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_108490501_108490719
tx.13142	chr4	-	975	6	NNC	ENSMUSG00000028568.17	novel	3141	6	NA	NA	10	274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	435.029838057115	282	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACTTTTTTTTTCCTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108690801	108673640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_108674084_108675381_108675442_108676332_108676535_108683296_108683404_108687714_108687781_108690704
tx.13143	chr4	-	987	6	FSM	ENSMUSG00000028568.17	ENSMUST00000102742.11	3141	6	5	2149	5	274	multi-exon	FALSE	canonical	3	1008	junction_1	73.428604780426	5702	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACTTTTTTTTTCCTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108690806	108673640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_108674084_108675381_108675442_108676332_108676535_108683296_108683411_108687714_108687781_108690704
tx.13144	chr4	+	1293	7	FSM	ENSMUSG00000028567.9	ENSMUST00000030296.9	1359	7	59	7	25	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	773	junction_6	37.6592913133296	5894	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGCTATGGTGGCCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108691856	108719317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_108692054_108703147_108703209_108710365_108710419_108713344_108713419_108715121_108715192_108716471_108716556_108718563
tx.13145	chr4	+	816	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000073775.5	novel	1629	1	NA	NA	75	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTGGTCTCTTGATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108705056	108706610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_108705181_108705918
tx.13146	chr4	+	1144	5	FSM	ENSMUSG00000003411.11	ENSMUST00000106650.9	3327	5	47	2136	47	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_4	5.5	493	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACCTGCTTGTTTCCTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108736306	108798385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_108736416_108747504_108747733_108781102_108781222_108786598_108786724_108797822
tx.13147	chr4	+	736	2	ISM	ENSMUSG00000053510.13	ENSMUST00000106644.9	3784	33	-143	47454	-28	-19011	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	601	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTGATGATGAAGAGGAAT	9912	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108857823	108870904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_108858362_108870706
tx.13148	chr4	+	3699	31	NNC	ENSMUSG00000053510.13	novel	4311	31	NA	NA	-9	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	119.88644627313	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAACGTGTATTTAAAGACG	9931	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108857842	108918349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_108858362_108870706_108871038_108875035_108875118_108876154_108876309_108881400_108881475_108884632_108884729_108885947_108886071_108889646_108889705_108890486_108890561_108891877_108891948_108895171_108895254_108896854_108896976_108897052_108897112_108897381_108897437_108900572_108900678_108901744_108901869_108903791_108903879_108904793_108904914_108906263_108906316_108908035_108908187_108911093_108911222_108912122_108912286_108913486_108913519_108913706_108913846_108915455_108915504_108915778_108915832_108916181_108916266_108916968_108917060_108917265_108917383_108917965_108918056_108918132
tx.13149	chr4	+	389	3	ISM	ENSMUSG00000053510.13	ENSMUST00000150784.8	1958	16	19912	313	1123	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	655	junction_1	2	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAAGACGTGTGTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108917310	108918359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_108917383_108917965_108918056_108918132
tx.13150	chr4	-	912	3	ISM	ENSMUSG00000028559.18	ENSMUST00000160271.8	2604	20	54578	0	2532	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	339	junction_1	3	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTTCTTTCATTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108920655	108918846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_108919530_108919661_108919798_108920562
tx.13151	chr4	-	952	4	ISM	ENSMUSG00000028559.18	ENSMUST00000160271.8	2604	20	53433	0	1387	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	323	junction_3	9.28559218478941	323	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTTCTTTCATTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108921800	108918846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_108919530_108919661_108919798_108920562_108920655_108921759
tx.13152	chr4	-	2596	20	NNC	ENSMUSG00000028559.18	novel	2604	20	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	111.911718273738	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTTCTTTCATTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108975221	108918846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_108919530_108919661_108919798_108920562_108920655_108921759_108921839_108922820_108922962_108923057_108923126_108923324_108923436_108924111_108924197_108925559_108925732_108929139_108929226_108930010_108930130_108930233_108930347_108940285_108940446_108943523_108943629_108944591_108944683_108955699_108955751_108957117_108957148_108958312_108958361_108959693_108959790_108975091
tx.13153	chr4	+	1194	7	NNC	ENSMUSG00000028558.15	novel	1606	8	NA	NA	-16175	-7416	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	33	junction_5	5.40575824674229	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTCCTCTTTTAAGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109075506	109103604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_109075716_109092970_109093073_109095974_109096179_109099353_109099449_109101248_109101459_109101885_109102000_109103344
tx.13154	chr4	+	946	7	ISM	ENSMUSG00000028552.14	ENSMUST00000175776.8	2802	25	-133	72150	11	104	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_4	24.4176620957499	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTACATCTGTAAAGTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109137475	109170512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_109137642_109154383_109154426_109161947_109162038_109162873_109162922_109166321_109166418_109169500_109169567_109170074
tx.13155	chr4	-	2264	3	FSM	ENSMUSG00000028557.11	ENSMUST00000030284.10	4061	3	342	1455	342	346	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_2	15	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAAGTTGTGCCATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109333530	109309749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_109311620_109314094_109314265_109333306
tx.13156	chr4	+	2187	19	FSM	ENSMUSG00000010517.8	ENSMUST00000102724.5	4468	19	373	1908	-36	-1908	multi-exon	FALSE	canonical	3	1050	junction_10	116.73236245551	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCATGAGTATATGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109534157	109819249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_109534270_109567986_109568056_109577952_109578000_109584586_109584790_109593787_109593880_109600062_109600155_109614776_109614883_109651964_109652052_109687002_109687099_109697512_109697640_109698505_109698570_109699484_109699567_109719005_109719161_109740832_109740970_109748098_109748188_109782494_109782576_109783081_109783160_109792679_109792896_109818995
tx.13157	chr4	+	825	6	ISM	ENSMUSG00000010517.8	ENSMUST00000102724.5	4468	19	207076	1910	42879	-1910	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1401	junction_2	6.43117407632541	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATCCATGAGTATATGTT	9449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109740860	109819247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_109740970_109748098_109748188_109782494_109782576_109783081_109783160_109792679_109792896_109818995
tx.13158	chr4	+	955	3	Intergenic	novelGene_1013	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	21.5	2109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGTGGAGCATGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109862637	109866106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_109862813_109864517_109864840_109865648
tx.13159	chr4	+	605	2	Intergenic	novelGene_1014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	465	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGTGGAGCATGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109864692	109866106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_109864840_109865648
tx.13160	chr4	-	1501	7	NIC	ENSMUSG00000028546.18	novel	4149	7	NA	NA	-33	248	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	11.852097798374	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATACCTTTGATGCATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110209139	110063307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_110063899_110066936_110066976_110068622_110068849_110070324_110070479_110083741_110083846_110108477_110108719_110208993
tx.13161	chr4	-	1769	7	NIC	ENSMUSG00000028546.18	novel	3997	7	NA	NA	-14	577	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	7	junction_1	10.286182749473	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGCAAATTTTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110209120	110062978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_110063857_110066936_110066976_110068622_110068849_110070324_110070479_110083741_110083846_110108477_110108719_110208993
tx.13162	chr4	-	1399	6	FSM	ENSMUSG00000028546.18	ENSMUST00000106603.9	3761	6	-23	2385	-23	237	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	6.48074069840786	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAACAAAAAAATACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110209129	110063318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_110063857_110068622_110068849_110070324_110070479_110083741_110083846_110108477_110108719_110208993
tx.13163	chr4	+	1320	6	FSM	ENSMUSG00000028545.14	ENSMUST00000030274.7	1826	6	135	371	53	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	5.19230199429887	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTTTGCATTTTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111272337	111317124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_111272598_111288213_111288348_111290365_111290751_111305702_111305852_111311281_111311496_111316946
tx.13164	chr4	+	1394	6	FSM	ENSMUSG00000028545.14	ENSMUST00000129760.8	1448	6	61	-7	-58	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	5.19230199429887	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTTTGCATTTTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111272345	111317124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_111272598_111288213_111288348_111290283_111290751_111305702_111305852_111311281_111311496_111316946
tx.13165	chr4	+	928	4	ISM	ENSMUSG00000028545.14	ENSMUST00000129760.8	1448	6	18079	-7	-30	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	2.94392028877595	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTTTGCATTTTTTTTGT	191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111290363	111317124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_111290751_111305702_111305852_111311281_111311496_111316946
tx.13166	chr4	+	598	2	ISM	ENSMUSG00000034401.17	ENSMUST00000070513.13	478	4	1	22267	0	-22267	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGGGTGAGTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111577206	111603687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_111577455_111603337
tx.13167	chr4	+	2368	13	FSM	ENSMUSG00000034401.17	ENSMUST00000084354.4	2239	13	-176	47	-9	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_11	28.7691964897643	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACCTCTGGTATTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111577225	111686334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_111577455_111603337_111603476_111604951_111605001_111624859_111624902_111625912_111626038_111631995_111632077_111636196_111636491_111637951_111638040_111641999_111642041_111656266_111656452_111663127_111663180_111679937_111680030_111685382
tx.13168	chr4	+	2217	11	NIC	ENSMUSG00000034401.17	novel	2466	13	NA	NA	3	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	35.5550277738606	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACCTCTGGTATTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111577237	111686334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_111577455_111624859_111624902_111625912_111626038_111631995_111632077_111636196_111636491_111637951_111638040_111641999_111642041_111656266_111656452_111663127_111663228_111679937_111680030_111685382
tx.13169	chr4	+	856	7	ISM	ENSMUSG00000034401.17	ENSMUST00000143879.8	1857	8	1630	705	1591	227	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_1	13.6676828890473	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTATTTGTACGCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111636384	111685626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_111636491_111637951_111638040_111641999_111642041_111656266_111656452_111663127_111663228_111679937_111680030_111685382
tx.13170	chr4	+	1035	2	FSM	ENSMUSG00000034401.17	ENSMUST00000132802.2	587	2	487	-935	487	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACCTCTGGTATTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111679946	111686334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_111680030_111685382
tx.13171	chr4	-	1805	6	FSM	ENSMUSG00000028719.9	ENSMUST00000030491.9	3170	6	63	1302	-29	-1302	multi-exon	FALSE	canonical	3	519	junction_1	39.0302446828098	446	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGATTTTCTTTCTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114844375	114817834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_114818953_114820261_114820359_114820552_114820630_114822079_114822233_114826414_114826562_114844162
tx.13172	chr4	+	862	4	FSM	ENSMUSG00000028716.16	ENSMUST00000030488.3	1119	4	222	35	-98	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	0.816496580927726	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGACTCTGACCCAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114946141	114951061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_114946410_114948338_114948448_114950117_114950214_114950672
tx.13173	chr4	+	1560	6	NNC	ENSMUSG00000083190.2	novel	1020	8	NA	NA	7747	634	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.92574776766556	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTTTTCATTTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115208731	115220946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_115209109_115209506_115209614_115209990_115210125_115212044_115212110_115212228_115212306_115220146
tx.13174	chr4	+	1745	9	FSM	ENSMUSG00000028710.19	ENSMUST00000239030.2	2160	9	22	393	22	50	multi-exon	FALSE	canonical	3	354	junction_5	26.518566609076	388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATCTAGATTTGCATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115642202	115669118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_115642502_115645458_115645568_115647777_115647829_115648419_115648483_115652600_115652652_115653951_115654000_115655162_115655259_115657514_115657623_115668198
tx.13175	chr4	+	2897	4	FSM	ENSMUSG00000028709.4	ENSMUST00000030477.4	2884	4	-13	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	9.42809041582063	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTGGTGGGAAGTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115685275	115693382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_115685439_115688419_115688887_115690829_115691033_115691318
tx.13176	chr4	+	1292	3	NNC	ENSMUSG00000028709.4	novel	2884	4	NA	NA	3611	-1032	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	29	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAACAAAAAAAACAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115689465	115692350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_115689523_115690829_115691033_115691318
tx.13177	chr4	+	2521	13	FSM	ENSMUSG00000028708.17	ENSMUST00000019677.12	2543	13	20	2	-3	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	99	junction_1	27.9607860325055	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGTGGCAGCCTTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115696414	115736445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_115696479_115705416_115705560_115714228_115714331_115717216_115717315_115720173_115720254_115721735_115721810_115723658_115723764_115727507_115727564_115730407_115730504_115731816_115732012_115732577_115732743_115733777_115733822_115735146
tx.13178	chr4	+	711	8	NIC	ENSMUSG00000028708.17	novel	1377	9	NA	NA	0	16	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_7	62.8051733212987	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAGAAGAAGAAGAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115696417	115724540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_115696479_115705416_115705560_115714228_115714331_115717216_115717315_115720173_115720254_115721735_115721810_115723658_115723764_115724492
tx.13179	chr4	+	1386	9	FSM	ENSMUSG00000028708.17	ENSMUST00000153766.8	1377	9	-2	-7	0	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_1	26.830195209875	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATAGCGTGTCTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115696417	115731074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_115696479_115705416_115705560_115714228_115714331_115717216_115717315_115720173_115720254_115721735_115721810_115723658_115723764_115727507_115727564_115730407
tx.13180	chr4	-	2506	15	FSM	ENSMUSG00000034171.14	ENSMUST00000049095.6	3827	15	200	1121	1	403	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	8.32257809350258	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGCTGGCTGGGATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115874923	115854986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_115855813_115856017_115856164_115856695_115856805_115857245_115857286_115857983_115858025_115858300_115858401_115859654_115859753_115860173_115860300_115861551_115861677_115861910_115861952_115862196_115862404_115862497_115862632_115862783_115862919_115865376_115865491_115874659
tx.13181	chr4	-	2214	6	FSM	ENSMUSG00000028706.15	ENSMUST00000030475.3	2439	6	62	163	62	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_2	15.8417170786503	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTGTGTGTGCGTGCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115911011	115890201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_115891509_115892948_115893074_115897265_115897427_115901881_115902037_115905526_115905862_115910880
tx.13182	chr4	-	518	4	FSM	ENSMUSG00000063882.13	ENSMUST00000078676.6	547	4	29	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1017	junction_2	25.9272486435067	17955	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTTTGTCCTTCCTTTGCC	7686	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115932239	115924161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_115924370_115927059_115927222_115927933_115927955_115932112
tx.13183	chr4	-	509	3	NNC	ENSMUSG00000063882.13	novel	547	4	NA	NA	-8	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	536	3999	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTTTGTCCTTCCTTTGC	7686	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115932239	115924162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_115924370_115927059_115927222_115932099
tx.13184	chr4	+	2142	4	ISM	ENSMUSG00000028703.15	ENSMUST00000030471.9	3065	10	129	6823	-65	1622	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_3	29.3295452099452	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGTAGATCTCTATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115932594	115947417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_115932805_115936585_115936673_115937745_115937817_115945643
tx.13185	chr4	-	725	3	ISM	ENSMUSG00000028702.16	ENSMUST00000139147.2	4571	4	1430	2691	1430	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	513	junction_1	25.5	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGGCCTGGGAACACATT	8396	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115955825	115954151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_115954569_115954654_115954819_115955681
tx.13186	chr4	-	1498	10	ISM	ENSMUSG00000028702.16	ENSMUST00000102704.4	3025	18	17812	-20	-5789	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	441	junction_4	45.5447141571261	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGGCCTGGGAACACATT	1177	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115963044	115954151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_115954569_115954654_115954819_115955681_115955862_115956136_115956216_115956534_115956659_115956833_115956945_115957464_115957596_115957735_115957811_115959025_115959153_115962954
tx.13187	chr4	+	564	3	FSM	ENSMUSG00000028700.15	ENSMUST00000144311.2	557	3	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	0.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGTTCATGCATATAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115981029	115996047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_115981314_115994890_115995026_115995902
tx.13188	chr4	-	938	2	FSM	ENSMUSG00000028701.5	ENSMUST00000030469.5	5742	2	17	4787	17	327	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGGCTTATCTCTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116001789	115994389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_115995032_116001493
tx.13189	chr4	+	425	2	FSM	ENSMUSG00000078593.3	ENSMUST00000106492.3	385	2	-36	-4	-36	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTACCCCATTCTGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116030532	116031491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116030827_116031360
tx.13190	chr4	+	2072	9	FSM	ENSMUSG00000028696.13	ENSMUST00000106479.8	2118	9	61	-15	58	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_7	9.43977621556783	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATGGTATTTATGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116364806	116395447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116364848_116367718_116368061_116372264_116372697_116377855_116378012_116381382_116381551_116386867_116387006_116387609_116387733_116389754_116389976_116394996
tx.13191	chr4	+	2025	8	ISM	ENSMUSG00000028696.13	ENSMUST00000030461.5	2115	9	2969	0	2969	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_6	9.03507902905251	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAACAGTACAAATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116367717	116395440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_116368061_116372264_116372697_116377855_116378012_116381382_116381551_116386867_116387006_116387609_116387733_116389754_116389976_116394996
tx.13192	chr4	+	339	2	ISM	ENSMUSG00000028696.13	ENSMUST00000106479.8	2118	9	16660	8371	16657	-8371	internal_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAGACATGTTCATTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116381405	116387061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_116381551_116386867
tx.13193	chr4	-	982	3	FSM	ENSMUSG00000055900.15	ENSMUST00000069674.6	974	3	-18	10	-17	-10	multi-exon	TRUE	canonical	3	51	junction_2	6.5	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGAAGCTAGCTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116413150	116410161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_116410927_116411964_116412101_116413069
tx.13194	chr4	-	847	2	ISM	ENSMUSG00000055900.15	ENSMUST00000069674.6	974	3	1032	64	1032	-64	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTCTTGGTATTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116412100	116410215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_116410927_116411964
tx.13195	chr4	+	1995	5	ISM	ENSMUSG00000034042.17	ENSMUST00000030460.15	3588	12	28	18955	28	-6515	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	268	junction_2	24.9136007032304	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTCTTTATTCTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116414882	116432124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_116415026_116426360_116427379_116428067_116428181_116430590_116430721_116431533
tx.13196	chr4	+	3545	12	FSM	ENSMUSG00000034042.17	ENSMUST00000030460.15	3588	12	40	3	40	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	268	junction_2	28.7128847743677	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACATTTTTTTTACTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116414894	116451076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116415026_116426360_116427379_116428067_116428181_116430590_116430721_116431533_116431812_116436443_116436517_116438446_116438641_116444567_116444709_116445775_116445941_116447362_116447488_116448425_116448529_116450002
tx.13197	chr4	-	409	2	NNC	ENSMUSG00000085408.2	novel	2436	3	NA	NA	-3	-3029	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGGTCTAGAGGAGTATG	9382	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116454830	116449958	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_116450146_116454608
tx.13198	chr4	-	1668	10	ISM	ENSMUSG00000028693.16	ENSMUST00000030456.14	2520	16	16916	0	-4777	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	898	junction_9	170.844597641277	435	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGAGGCTTTGATGGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116468222	116458805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_116458991_116459288_116459418_116459922_116460001_116460084_116460142_116461091_116461259_116461359_116461549_116461937_116462012_116462105_116462192_116462880_116462961_116467599
tx.13199	chr4	-	1367	9	FSM	ENSMUSG00000028692.15	ENSMUST00000030455.15	1420	9	53	0	53	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1447	junction_3	104.145331148352	7566	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGTTGTGTGCCTGACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116508824	116493706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_116493867_116494958_116495046_116495172_116495246_116496157_116496358_116497006_116497203_116498187_116498340_116499054_116499175_116502700_116502791_116508535
tx.132	chr1	-	602	2	ISM	ENSMUSG00000103708.2	ENSMUST00000193725.2	654	3	7052	-1	6998	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGTGCCTCTGGCCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36043073	36042064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_36042488_36042894
tx.13200	chr4	+	932	6	FSM	ENSMUSG00000028691.13	ENSMUST00000135573.8	2294	6	55	1307	0	243	multi-exon	FALSE	canonical	3	22651	junction_3	699.316637868713	37438	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTGATTCATTCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116542795	116556712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116542858_116544603_116544721_116548972_116549127_116550079_116550203_116550913_116551045_116556367
tx.13201	chr4	+	685	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028690.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTTGCTGGGAAATGGAG	1556	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116559629	116565532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_116560202_116565419
tx.13202	chr4	-	1880	4	FSM	ENSMUSG00000028690.5	ENSMUST00000030453.5	2106	4	71	155	-47	-155	multi-exon	TRUE	canonical	3	184	junction_2	7.07106781186548	200	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAACTTTGTTTGCCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116565532	116559630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_116561065_116561703_116561857_116563077_116563273_116565434
tx.13203	chr4	+	3029	11	FSM	ENSMUSG00000033985.18	ENSMUST00000045542.13	3033	11	2	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_7	8.01810451416044	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTTGAAATATGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116578146	116661437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116578454_116598812_116599116_116608301_116608424_116628996_116629046_116649284_116649432_116657729_116657813_116658356_116658442_116658645_116658730_116658916_116659004_116659420_116659539_116659793
tx.13204	chr4	-	1767	6	ISM	ENSMUSG00000028688.14	ENSMUST00000030451.10	2090	8	1121	0	4	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_2	12.2865780427261	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTGGTTATTTCTTATC	3060	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116663716	116661198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_116662253_116662328_116662492_116662682_116662943_116663181_116663341_116663455_116663553_116663682
tx.13205	chr4	-	2040	8	FSM	ENSMUSG00000028688.14	ENSMUST00000030451.10	2090	8	50	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_2	11.8252583351856	211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTGGTTATTTCTTATC	1989	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116664787	116661198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_116662253_116662328_116662492_116662682_116662943_116663181_116663341_116663455_116663553_116663682_116663724_116663813_116663957_116664664
tx.13206	chr4	+	1652	16	FSM	ENSMUSG00000028687.18	ENSMUST00000102699.8	1654	16	2	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_1	29.5893374188894	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTTTGGAGAACTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116664921	116676628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116664969_116671515_116671634_116672760_116672910_116672995_116673036_116673158_116673233_116673509_116673552_116673632_116673705_116673779_116673894_116673974_116674073_116674151_116674297_116674376_116674432_116674580_116674773_116674865_116675003_116675084_116675235_116675437_116675480_116676451
tx.13207	chr4	+	646	2	FSM	ENSMUSG00000086417.2	ENSMUST00000151670.2	636	2	-8	-2	-8	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGTGTATAGAGTGCTTT	3303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116682091	116687802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116682180_116687244
tx.13208	chr4	-	558	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000075390.6	novel	315	1	NA	NA	-334	51	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTTCTTAGTTTTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116697752	116697052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_116697421_116697562
tx.13209	chr4	+	1145	3	FSM	ENSMUSG00000046861.10	ENSMUST00000133234.2	400	3	-9	-736	-9	736	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	2	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAATGTGCTTTTGGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116860043	116861382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116860213_116860315_116860388_116860478
tx.13210	chr4	+	1532	12	FSM	ENSMUSG00000028683.15	ENSMUST00000106448.9	1555	12	23	0	17	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	567	junction_7	49.9305302519377	1471	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTGGCTCAGTGGTAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116876621	116944049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116876674_116879351_116879510_116885607_116885754_116901632_116901793_116909920_116910033_116915960_116916051_116922537_116922666_116923570_116923762_116925940_116926019_116927835_116927985_116938754_116938859_116943885
tx.13211	chr4	+	237	2	FSM	ENSMUSG00000028683.15	ENSMUST00000129587.2	541	2	307	-3	307	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	600	junction_1	0	1231	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGTGGCTCAGTGGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116938784	116944048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116938859_116943885
tx.13212	chr4	-	482	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028681.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCTGCTCTATGAACCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116958544	116957559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_116957980_116958482
tx.13213	chr4	+	2523	10	ISM	ENSMUSG00000028681.12	ENSMUST00000144620.8	4356	22	13404	0	-735	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_6	5.35412613473634	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGATGGCTGGAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116966696	116972580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_116966828_116966933_116967283_116967391_116967705_116967795_116967939_116968023_116968205_116968321_116968603_116968711_116968850_116971208_116971352_116971439_116971540_116971836
tx.13214	chr4	-	1096	2	ISM	ENSMUSG00000073771.12	ENSMUST00000153924.8	1956	4	1025	655	-40	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	170	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGAATATTTGTATTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116978502	116977070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_116978059_116978394
tx.13215	chr4	-	741	6	FSM	ENSMUSG00000047675.16	ENSMUST00000102696.5	860	6	112	7	-47	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8358	junction_5	1894.95893359197	46710	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTCTAGGTGTTTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117013328	117011030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_117011185_117011495_117011626_117011834_117012011_117012204_117012305_117012767_117012875_117013254
tx.13216	chr4	+	1017	3	NNC	ENSMUSG00000048772.16	novel	991	3	NA	NA	38	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTATCTATCCTGGGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117109185	117125779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_117109332_117122994_117123173_117125086
tx.13217	chr4	+	955	3	FSM	ENSMUSG00000048772.16	ENSMUST00000062824.12	991	3	38	-2	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	3.5	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTATCTATCCTGGGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117109185	117125779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_117109332_117123056_117123173_117125086
tx.13218	chr4	+	819	2	NIC	ENSMUSG00000048772.16	novel	991	3	NA	NA	-31	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTATCTATCCTGGGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117109205	117125779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_117109332_117125086
tx.13219	chr4	-	1095	3	FSM	ENSMUSG00000028677.20	ENSMUST00000223371.2	728	3	429	-796	46	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1044	junction_1	13.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTGTCTGTGTTTGAAG	3410	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117130551	117128660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_117129573_117130249_117130325_117130443
tx.13220	chr4	-	1422	7	NNC	ENSMUSG00000028677.20	novel	3029	15	NA	NA	-4322	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	381.184848713703	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTGTCTGTGTTTGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117135302	117128659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_117129573_117130249_117130325_117130443_117130553_117134567_117134647_117134778_117134835_117134935_117135027_117135203
tx.13221	chr4	-	1740	10	NNC	ENSMUSG00000028677.20	novel	1842	10	NA	NA	-56	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_5	365.792425790136	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTGTCTGTGTTTGAAG	9847	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117146366	117128660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_117129573_117130249_117130325_117130443_117130553_117134567_117134647_117134778_117134835_117134935_117135027_117135203_117135301_117142575_117142709_117143125_117143170_117146222
tx.13222	chr4	-	1828	10	NNC	ENSMUSG00000028677.20	novel	1949	11	NA	NA	-66	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	318.755914977798	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTGTCTGTGTTTGAAG	9837	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117146376	117128660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_117129573_117130249_117130325_117130443_117130553_117134567_117134647_117134778_117134835_117134935_117135027_117135203_117135301_117142575_117142709_117143047_117143170_117146222
tx.13223	chr4	+	491	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028677.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGACAGTTCCGTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117224658	117229706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_117224859_117229415
tx.13224	chr4	+	365	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028677.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACATAGATCTAGGGTCGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117237946	117250087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_117238250_117250025
tx.13225	chr4	+	394	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028677.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGCTGGCAGTTGCCTTTA	6587	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117258964	117265252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_117259130_117265023
tx.13226	chr4	+	613	3	NNC	ENSMUSG00000087228.2	novel	660	2	NA	NA	-15	3819	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATCTATTAGTATACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117353633	117361618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_117353926_117357416_117357526_117361406
tx.13227	chr4	+	1030	7	NNC	ENSMUSG00000033423.17	novel	596	4	NA	NA	-47	2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	91	junction_1	242.081769931842	109	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTGTGTCTGGAGCCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117407514	117531480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_117407560_117439796_117439914_117446294_117446355_117450267_117450360_117472365_117472439_117506503_117506604_117530937
tx.13228	chr4	+	1296	8	NNC	ENSMUSG00000033423.17	novel	1336	8	NA	NA	-37	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	100	junction_1	221.525785111774	62	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTAGTGTGTCTGGAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117407524	117531478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_117407560_117421817_117422096_117439796_117439914_117446294_117446355_117450267_117450360_117472365_117472439_117506503_117506604_117530937
tx.13229	chr4	+	1341	8	ISM	ENSMUSG00000033423.17	ENSMUST00000037127.15	1719	9	2601	14	356	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	348	junction_1	142.213550259991	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTGTGTCTGGAGCCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117410162	117531480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_117410241_117421817_117422096_117439796_117439914_117446294_117446355_117450267_117450360_117472365_117472439_117506503_117506604_117530937
tx.13230	chr4	+	985	6	ISM	ENSMUSG00000033423.17	ENSMUST00000037127.15	1719	9	32233	16	-89	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	648	junction_5	61.6097394897917	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTAGTGTGTCTGGAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117439794	117531478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_117439914_117446294_117446355_117450267_117450360_117472365_117472439_117506503_117506604_117530937
tx.13231	chr4	-	484	3	ISM	ENSMUSG00000009640.12	ENSMUST00000129510.2	1862	8	6483	-5	6483	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	228	junction_1	25	157	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATTGTTTCCTCACTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117532697	117531877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_117531992_117532217_117532514_117532623
tx.13232	chr4	-	1523	10	NNC	ENSMUSG00000009640.12	novel	1566	11	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	76.1110300080671	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATTGTTTCCTCACTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117539192	117531877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_117531992_117532217_117532514_117532623_117532697_117532928_117533001_117533146_117533333_117533546_117533715_117533805_117533965_117538039_117538236_117538466_117538563_117539029
tx.13233	chr4	-	1550	11	NNC	ENSMUSG00000009640.12	novel	1566	11	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	82.0646086933947	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATTGTTTCCTCACTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117539450	117531877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_117531992_117532217_117532514_117532623_117532697_117532928_117533001_117533146_117533333_117533546_117533715_117533805_117533965_117538039_117538236_117538466_117538563_117539029_117539180_117539410
tx.13234	chr4	-	411	2	ISM	ENSMUSG00000009640.12	ENSMUST00000129510.2	1862	8	6666	-5	6666	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	228	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATTGTTTCCTCACTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117532514	117531877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_117531992_117532217
tx.13235	chr4	-	536	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084260.2	novel	582	1	NA	NA	-217	56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTATGATTACTGGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117586713	117585858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_117586234_117586552
tx.13236	chr4	+	3316	14	NNC	ENSMUSG00000028542.18	novel	3479	14	NA	NA	-117	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	28.4762955505807	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTGCTGATGTGCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117692412	117726500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_117692675_117700215_117700333_117713071_117713229_117713886_117714019_117714399_117714671_117720625_117720763_117720885_117721021_117721109_117721214_117721601_117721840_117721950_117722086_117722194_117722295_117722392_117722494_117724955_117725127_117725244
tx.13237	chr4	-	1015	3	ISM	ENSMUSG00000028541.15	ENSMUST00000106421.9	1801	8	5979	-171	5158	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_2	4.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCTTGTCTGTCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117734330	117730327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_117731201_117734076_117734182_117734293
tx.13238	chr4	-	676	5	ISM	ENSMUSG00000033379.14	ENSMUST00000150204.8	935	7	1206	-7	-220	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2536	junction_3	94.6229359087954	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCTTCTGTTGGCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117743311	117741522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_117741839_117742300_117742492_117742825_117742878_117743000_117743071_117743264
tx.13239	chr4	-	1004	8	FSM	ENSMUSG00000033379.14	ENSMUST00000036380.14	1000	8	-4	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2123	junction_7	187.196393650942	8303	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGGCTTCTGTTGGCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117744530	117741522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_117741839_117742300_117742492_117742825_117742878_117743000_117743071_117743264_117743343_117743472_117743557_117743786_117743836_117744366
tx.1324	chr10	+	622	4	ISM	ENSMUSG00000019777.17	ENSMUST00000019911.14	2005	14	23507	0	-121	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1167	junction_3	69.7567201063812	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTTTTCTGTCTGTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36874046	36877885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_36874094_36874409_36874566_36876364_36876423_36877524
tx.13240	chr4	-	458	3	ISM	ENSMUSG00000033295.15	ENSMUST00000049074.13	7656	33	59774	18241	-531	-296	internal_fragment	FALSE	canonical	3	357	junction_1	15.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTGAGGGGTTCATGGA	2946	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118088828	118083650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_118083769_118087891_118088086_118088682
tx.13241	chr4	+	934	8	FSM	ENSMUSG00000006395.17	ENSMUST00000194248.2	936	8	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	6.43333157097011	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATATGTGTATATTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118217188	118219941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_118217429_118217502_118217587_118218812_118218928_118219070_118219150_118219237_118219288_118219387_118219458_118219559_118219695_118219780
tx.13242	chr4	+	1166	7	FSM	ENSMUSG00000006392.17	ENSMUST00000019229.15	1145	7	-21	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	450	junction_1	88.2754527349226	1709	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGCCATTCCTTGTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118266541	118272308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_118266584_118268081_118268201_118268854_118269000_118269548_118269690_118269860_118269943_118270823_118271073_118271920
tx.13243	chr4	+	1130	6	ISM	ENSMUSG00000006392.17	ENSMUST00000019229.15	1145	7	1513	0	531	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	642	junction_1	31.4388294947506	1009	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGCCATTCCTTGTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118268075	118272308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_118268201_118268854_118269000_118269548_118269690_118269860_118269943_118270823_118271073_118271920
tx.13244	chr4	+	1469	8	FSM	ENSMUSG00000006390.16	ENSMUST00000006557.13	1811	8	5	337	5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	108	junction_5	11.9505785019225	514	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATTGTGTGTGTGTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118285294	118289813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_118285413_118287692_118287753_118287911_118288103_118288259_118288341_118288462_118288520_118288605_118288712_118288793_118288931_118289094
tx.13245	chr4	-	1771	10	FSM	ENSMUSG00000006398.16	ENSMUST00000006565.13	1793	10	22	0	22	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1043	junction_4	200.755117703013	2353	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCCAGCATCCTTCCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118294527	118290097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_118290339_118290677_118290796_118291947_118292074_118292669_118292899_118292973_118293069_118293165_118293363_118293456_118293586_118293706_118293804_118293890_118294040_118294137
tx.13246	chr4	+	964	3	FSM	ENSMUSG00000028536.13	ENSMUST00000030261.6	958	3	-12	6	-12	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATAAGGAGTCTTTTTATA	8928	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118384427	118387419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_118384535_118386395_118386509_118386675
tx.13247	chr4	-	1777	2	FSM	ENSMUSG00000050854.10	ENSMUST00000150044.2	717	2	16	-1076	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTCTGCACCATGGCA	9107	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118400143	118398137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_118399569_118399797
tx.13248	chr4	-	1833	4	FSM	ENSMUSG00000050854.10	ENSMUST00000060214.10	1864	4	25	6	25	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.18993502999218	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTAGTTCTGTCTGCACC	8350	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118400900	118398143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_118399569_118399797_118399958_118400552_118400697_118400796
tx.13249	chr4	+	1054	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028730.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGCTAAGCCTTCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118401109	118423368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_118401237_118411568_118411644_118420251_118420313_118420798_118420924_118422702
tx.13250	chr4	+	1126	9	FSM	ENSMUSG00000028729.16	ENSMUST00000030501.15	2960	9	43	1791	-6	367	multi-exon	FALSE	canonical	3	2261	junction_5	110.190105612981	12985	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTGGGTTAAAACCAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118478038	118483182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_118478195_118478278_118478363_118478557_118478731_118479266_118479391_118480494_118480585_118480807_118480884_118481331_118481426_118482719_118482883_118483016
tx.13251	chr4	-	494	2	Intergenic	novelGene_1017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACATTGACTGTTTTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118929801	118928088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_118928317_118929535
tx.13252	chr4	-	592	2	Intergenic	novelGene_1016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGACATTGACTGTTTTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118929800	118928088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_118928317_118929436
tx.13253	chr4	+	520	3	Intergenic	novelGene_1018	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	6.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCTTGTATAATGCTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118929915	118941595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_118930018_118930792_118930857_118941241
tx.13254	chr4	+	477	3	Intergenic	novelGene_1019	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	5	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCTTGTATAATGCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118930210	118941594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_118930271_118930792_118930857_118941241
tx.13255	chr4	+	2514	10	FSM	ENSMUSG00000028645.12	ENSMUST00000030398.10	3260	10	93	653	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	565	junction_3	58.8236535946402	284	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTTTCAAATGCTTGTG	669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118966000	118994527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_118966170_118977587_118977684_118989319_118989481_118989639_118989881_118990293_118990457_118990548_118990737_118991051_118991157_118991565_118991668_118992925_118993130_118993442
tx.13256	chr4	-	2387	2	FSM	ENSMUSG00000045268.14	ENSMUST00000052715.10	2341	2	-49	3	-49	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCTGTGTACTTATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119031102	119026712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_119028240_119030242
tx.13257	chr4	-	1588	2	FSM	ENSMUSG00000045268.14	ENSMUST00000106355.5	1588	2	-3	3	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCTGTGTACTTATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119031395	119026712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_119028240_119031334
tx.13258	chr4	+	663	3	FSM	ENSMUSG00000028643.12	ENSMUST00000030395.9	733	3	70	0	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	443	junction_2	4.5	2896	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTTGTTCTTGCTTTAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119052572	119058495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_119052684_119053068_119053219_119058093
tx.13259	chr4	-	954	5	FSM	ENSMUSG00000078584.10	ENSMUST00000141112.2	7151	5	21	6176	-6	364	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_4	34.1869858279434	2324	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCGGAACCATTTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119089888	119083214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_119083725_119083997_119084130_119085223_119085311_119089550_119089667_119089779
tx.13260	chr4	+	931	5	FSM	ENSMUSG00000066058.12	ENSMUST00000084309.12	924	5	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.11803398874989	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGACATCATCCTATCTG	3298	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119112603	119117052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_119112993_119114082_119114248_119114348_119114434_119116004_119116158_119116913
tx.13261	chr4	-	596	2	FSM	ENSMUSG00000028639.15	ENSMUST00000145976.2	718	2	308	-186	308	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10943	junction_1	0	3019	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTAGTTTTGTCATAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119136339	119135177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_119135565_119136130
tx.13262	chr4	-	737	3	ISM	ENSMUSG00000028639.15	ENSMUST00000079644.13	1628	8	12951	0	533	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9851	junction_2	546	9131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTAGTTTTGTCATAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119138850	119135177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_119135565_119136130_119136397_119138766
tx.13263	chr4	-	1012	4	ISM	ENSMUSG00000028639.15	ENSMUST00000079644.13	1628	8	12183	0	-235	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9851	junction_2	447.097304845377	1564	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTAGTTTTGTCATAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119139618	119135177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_119135565_119136130_119136397_119138766_119138850_119139342
tx.13264	chr4	-	753	10	FSM	ENSMUSG00000060288.14	ENSMUST00000106318.8	800	10	47	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	2	32	junction_8	163.771144144263	683	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGTTCTGTAGTTACTATT	9629	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119177696	119157206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_119157381_119167955_119168045_119168728_119168770_119169415_119169504_119174224_119174318_119175740_119175784_119176716_119176762_119177026_119177051_119177365_119177431_119177605
tx.13265	chr4	-	643	3	ISM	ENSMUSG00000028637.17	ENSMUST00000143494.3	997	5	3174	0	3084	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	12	junction_1	6	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGGTGTTAGTAATTTC	5301	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119213915	119209442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_119209850_119210266_119210422_119213834
tx.13266	chr4	-	1824	9	NIC	ENSMUSG00000028637.17	novel	1312	6	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	12	junction_1	4.28478412525065	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGGTGTTAGTAATTTC	9767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119272674	119209442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_119209850_119210266_119210422_119213834_119214045_119216754_119216935_119250738_119250855_119255364_119255437_119258196_119258348_119261270_119261462_119272332
tx.13267	chr4	-	841	2	FSM	ENSMUSG00000028636.15	ENSMUST00000140641.2	1543	2	702	0	702	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_1	0	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGCGGGTTTCTGGTTTTTT	6269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119278853	119275726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_119276491_119278776
tx.13268	chr4	-	1413	3	FSM	ENSMUSG00000028636.15	ENSMUST00000030385.13	1443	3	30	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	273	junction_2	22	885	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGCGGGTTTCTGGTTTTTT	5535	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119279587	119275726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_119276491_119278776_119278881_119279042
tx.13269	chr4	+	1562	5	FSM	ENSMUSG00000000085.17	ENSMUST00000136801.8	1536	5	-23	-3	-23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	26.8735464723211	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGTCTTTTTAACCAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120374799	120387384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_120374904_120379651_120379847_120382194_120382261_120385352_120385496_120386330
tx.13270	chr4	-	1409	9	ISM	ENSMUSG00000028633.8	ENSMUST00000030381.8	2705	19	22191	0	16	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	663	junction_8	50.2195181179589	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGTGTGCTTTCTCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120405282	120397064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_120397852_120398489_120398579_120399059_120399205_120399727_120399825_120399906_120399963_120400924_120401022_120402214_120402259_120404502_120404566_120405251
tx.13271	chr4	-	2712	19	FSM	ENSMUSG00000028633.8	ENSMUST00000030381.8	2705	19	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	663	junction_8	52.1791784782653	341	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGTGTGCTTTCTCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120427480	120397064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_120397852_120398489_120398579_120399059_120399205_120399727_120399825_120399906_120399963_120400924_120401022_120402214_120402259_120404502_120404566_120405251_120405347_120406660_120406750_120410076_120410210_120411142_120411295_120415475_120415557_120415982_120416067_120418594_120418712_120419974_120420076_120422465_120422637_120424446_120424625_120427347
tx.13272	chr4	+	618	3	Intergenic	novelGene_1020	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGTCGTTAAAGCCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120427548	120429113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_120427577_120428419_120428580_120428683
tx.13273	chr4	-	1960	10	FSM	ENSMUSG00000032897.18	ENSMUST00000043429.12	1932	10	-28	0	-27	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	393	junction_8	23.5424491839793	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATCTGTGTCTGGGACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120682931	120614634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_120615494_120616528_120616589_120618824_120618933_120622410_120622570_120625922_120626097_120630868_120630965_120636316_120636431_120638668_120638741_120647573_120647687_120682726
tx.13274	chr4	+	1688	4	NNC	ENSMUSG00000032890.18	novel	2099	4	NA	NA	-17	-239	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	21.9544984001001	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACCTGTACACATCCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120711995	120741402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_120712131_120729673_120729848_120735034_120735283_120740271
tx.13275	chr4	+	660	3	NNC	ENSMUSG00000032890.18	novel	2099	4	NA	NA	-17	-6256	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	24	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTGTGATATGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120711995	120735385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_120712131_120729673_120729848_120735034
tx.13276	chr4	-	861	2	FSM	ENSMUSG00000028629.10	ENSMUST00000144114.2	703	2	-158	0	-158	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGACTTGATGTTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120779379	120778392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_120778610_120778735
tx.13277	chr4	-	2006	2	FSM	ENSMUSG00000028629.10	ENSMUST00000030375.9	1996	2	-10	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_1	0	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGACTTGATGTTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120782212	120778392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_120779894_120781707
tx.13278	chr4	-	2347	6	NIC	ENSMUSG00000064141.15	novel	2362	6	NA	NA	-36	-48	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_2	13.3476589707709	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTTTACTCATTTCAT	6800	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120808932	120787381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_120788704_120791529_120791626_120792263_120792391_120804485_120804767_120806528_120806758_120808640
tx.13279	chr4	-	321	2	ISM	ENSMUSG00000032870.9	ENSMUST00000043200.8	2905	10	45179	1206	3640	-1206	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	232	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGCCACTCTTTTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120829265	120826719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_120826862_120829086
tx.13280	chr4	+	2714	32	FSM	ENSMUSG00000028626.6	ENSMUST00000030372.6	2924	32	214	-4	-149	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_2	8.6239508704552	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTGTGGATGAGGATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120896795	120912523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_120896984_120898161_120898237_120899490_120899527_120899612_120899676_120900892_120900947_120901058_120901095_120901191_120901216_120901471_120901526_120901861_120901916_120902019_120902068_120902195_120902253_120902337_120902392_120902680_120902735_120903122_120903177_120903266_120903321_120903425_120903480_120906858_120906913_120907272_120907327_120907551_120907606_120908410_120908456_120908847_120908902_120909164_120909219_120909423_120909478_120909554_120909627_120909777_120909814_120909949_120909995_120910087_120910121_120910254_120910402_120910635_120910691_120910966_120911156_120911449_120911528_120911792
tx.13281	chr4	+	1050	4	ISM	ENSMUSG00000028626.6	ENSMUST00000140119.2	752	5	439	-503	439	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_3	2.44948974278318	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACTTCTTGTGGATGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120910634	120912519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_120910691_120910966_120911156_120911449_120911528_120911792
tx.13282	chr4	-	3396	10	FSM	ENSMUSG00000043207.11	ENSMUST00000058754.9	3429	10	31	2	31	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	242	junction_3	24.0005143977796	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACGTCCTGGTGTTGGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120955407	120916435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_120918418_120923010_120923155_120925906_120926012_120931669_120931855_120938368_120938511_120940017_120940171_120940505_120940623_120944505_120944593_120952748_120952896_120955073
tx.13283	chr4	-	1820	5	ISM	ENSMUSG00000043207.11	ENSMUST00000058754.9	3429	10	2	22631	2	1075	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	295	junction_1	6.68487097856047	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTCCTGCATTTTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120955436	120939064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_120940171_120940505_120940623_120944505_120944593_120952748_120952896_120955073
tx.13284	chr4	-	1458	5	ISM	ENSMUSG00000049878.14	ENSMUST00000056635.13	6242	8	1	24099	1	795	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	168	junction_1	18.6195461813654	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGAATGCTTAGTCTTTAA	6465	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121072280	121027178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_121028018_121039802_121039936_121045411_121045494_121047300_121047456_121072031
tx.13285	chr4	+	2291	9	FSM	ENSMUSG00000028657.15	ENSMUST00000030412.11	2381	9	3	87	-1	-87	multi-exon	FALSE	canonical	3	268	junction_2	20.6579282601136	303	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTGGTATCATTTTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122730037	122752784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_122730173_122737787_122737898_122738210_122738339_122739763_122739835_122742225_122742329_122747383_122747475_122748172_122748272_122749598_122749671_122751302
tx.13286	chr4	-	2725	13	NIC	ENSMUSG00000028656.15	novel	2737	13	NA	NA	1	-8	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	137	junction_12	229.274580652399	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTTATTCACCTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122779836	122752847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_122754011_122755726_122755871_122756197_122756281_122756415_122756540_122756693_122756879_122758373_122758552_122758962_122759069_122761277_122761364_122761445_122761590_122763486_122763565_122765189_122765291_122766124_122766247_122779625
tx.13287	chr4	-	2628	13	FSM	ENSMUSG00000028656.15	ENSMUST00000106255.8	2737	13	101	8	22	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	275	junction_12	193.312139642945	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTTATTCACCTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122779736	122752847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_122754011_122755726_122755871_122756197_122756281_122756415_122756540_122756693_122756879_122758373_122758552_122758962_122759069_122761277_122761364_122761445_122761590_122763486_122763565_122765189_122765291_122766124_122766250_122779625
tx.13288	chr4	+	2061	11	FSM	ENSMUSG00000028653.17	ENSMUST00000102649.4	2074	11	0	13	0	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_3	10.336343647538	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAGTTTCTATACAGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122910389	122948729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_122910577_122933238_122933380_122937505_122937605_122938283_122938430_122940667_122940811_122942561_122942674_122942944_122943058_122943269_122943348_122945858_122945969_122946276_122946395_122947915
tx.13289	chr4	+	1951	10	FSM	ENSMUSG00000028653.17	ENSMUST00000147165.8	1964	10	0	13	0	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_8	29.573929126016	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAGTTTCTATACAGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122910389	122948729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_122910577_122933238_122933380_122937505_122937605_122938283_122938430_122940667_122940811_122942561_122942674_122942944_122943058_122943269_122943348_122946276_122946395_122947915
tx.13290	chr4	-	1174	10	NNC	ENSMUSG00000028651.13	novel	1188	10	NA	NA	4	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	100	junction_9	309.335169215497	116	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTTGCCTCCTGCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123033740	123020909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_123021240_123021430_123021574_123024161_123024348_123027026_123027151_123028847_123028949_123029388_123029471_123030664_123030692_123031318_123031363_123032658_123032758_123033702
tx.13291	chr4	-	1185	10	FSM	ENSMUSG00000028651.13	ENSMUST00000030404.5	1188	10	2	1	2	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	832	junction_9	90.3078411481501	1137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTTGCCTCCTGCAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123033742	123020908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_123021240_123021430_123021574_123024161_123024348_123027026_123027151_123028847_123028949_123029388_123029471_123030664_123030692_123031318_123031363_123032658_123032758_123033694
tx.13292	chr4	-	1137	9	ISM	ENSMUSG00000028651.13	ENSMUST00000030404.5	1188	10	986	2	60	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	964	junction_1	52.992776630405	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTTGCCTCCTGCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123032758	123020909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_123021240_123021430_123021574_123024161_123024348_123027026_123027151_123028847_123028949_123029388_123029471_123030664_123030692_123031318_123031363_123032658
tx.13293	chr4	-	1184	9	NNC	ENSMUSG00000028651.13	novel	1188	10	NA	NA	4	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	354.711832865779	222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGTTGCCTCCTGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123033740	123020910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_123021240_123021430_123021574_123024161_123024348_123027026_123027151_123028847_123028949_123029388_123029501_123031318_123031363_123032658_123032758_123033694
tx.13294	chr4	+	2250	14	FSM	ENSMUSG00000011257.20	ENSMUST00000106243.8	3111	14	768	93	498	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_10	102.125111806737	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATGCCAGTTTTATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123177385	123192625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_123177601_123180472_123180667_123182751_123182868_123183991_123184132_123184663_123184759_123185525_123185664_123186656_123186753_123188364_123188638_123188785_123188874_123188994_123189115_123189722_123189851_123191471_123191566_123191653_123191887_123192305
tx.13295	chr4	+	2324	15	FSM	ENSMUSG00000011257.20	ENSMUST00000080178.13	3019	15	689	6	505	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	253	junction_1	59.8703105189263	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAATTTGATGCCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123177392	123192619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_123177601_123180472_123180667_123182751_123182868_123183991_123184132_123184663_123184759_123185525_123185664_123186656_123186753_123188364_123188638_123188785_123188874_123188994_123189115_123189542_123189630_123189722_123189851_123191471_123191566_123191653_123191887_123192305
tx.13296	chr4	+	1435	9	ISM	ENSMUSG00000011257.20	ENSMUST00000080178.13	3019	15	9949	8	-2104	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	344	junction_1	38.2424420637595	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTGAATTTGATGCCAGT	2922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123186652	123192617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_123186753_123188364_123188638_123188785_123188874_123188994_123189115_123189542_123189630_123189722_123189851_123191471_123191566_123191653_123191887_123192305
tx.13297	chr4	+	550	2	ISM	ENSMUSG00000011257.20	ENSMUST00000146156.2	1146	3	682	2	682	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	415	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTGATGCCAGTTTTATG	709	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123191654	123192623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_123191887_123192305
tx.13298	chr4	+	398	3	NNC	ENSMUSG00000087307.2	novel	678	3	NA	NA	-2653	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_2	10.5	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCCGCCTTTTATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123557020	123562523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_123557174_123561402_123561541_123562416
tx.13299	chr4	+	718	3	NNC	ENSMUSG00000087307.2	novel	431	2	NA	NA	-2647	134	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	39	junction_1	5	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCTTGAAAGAATCAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123557026	123565144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_123557174_123561402_123561541_123564711
tx.133	chr1	-	733	3	NNC	ENSMUSG00000103708.2	novel	654	3	NA	NA	6484	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGTGCCTCTGGCCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36043587	36042064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_36042488_36042894_36043073_36043455
tx.1330	chr10	+	2099	12	FSM	ENSMUSG00000019845.9	ENSMUST00000019991.8	2929	12	-26	856	21	105	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_3	7.58423767804153	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTAAACGGCTGCTACGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39009992	39026198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_39010104_39010201_39010276_39010983_39011037_39013129_39013188_39016818_39016935_39018250_39018373_39020370_39020559_39020751_39020928_39021568_39021710_39023307_39023449_39023758_39023934_39025454
tx.13300	chr4	+	576	3	NNC	ENSMUSG00000087307.2	novel	431	2	NA	NA	-2643	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_1	12.5	146	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGACCATTGTGGTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123557030	123565010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_123557174_123561406_123561541_123564711
tx.13301	chr4	-	1097	3	NNC	ENSMUSG00000028649.22	novel	17331	93	NA	NA	-2929	-144404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTTCTGTTGTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123581082	123577076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_123578035_123579172_123579228_123580998
tx.13302	chr4	-	596	2	NNC	ENSMUSG00000028649.22	novel	17331	93	NA	NA	-2929	-144850	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCCTACTGCCCTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123581082	123577522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_123578035_123580998
tx.13303	chr4	-	547	3	FSM	ENSMUSG00000028648.14	ENSMUST00000030401.14	525	3	3	-25	3	25	multi-exon	FALSE	canonical	3	1318	junction_2	395	361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGTGGTGAAAGGTTGTC	1835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123611992	123606477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_123606720_123609656_123609875_123611905
tx.13304	chr4	-	478	3	NNC	ENSMUSG00000028648.14	novel	525	3	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_2	1049	166	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTTTGCTTTTGGGTCA	1856	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123611971	123606502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_123606720_123609656_123609852_123611905
tx.13305	chr4	-	538	3	NNC	ENSMUSG00000028648.14	novel	599	3	NA	NA	35	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_2	1048	49	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCTTAGTCTGTTTGCTT	1888	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123611939	123606510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_123606720_123609656_123609875_123611828
tx.13306	chr4	-	548	3	FSM	ENSMUSG00000028648.14	ENSMUST00000106206.8	599	3	43	8	38	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_2	1021.5	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCTTAGTCTGTTTGCTT	1891	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123611936	123606510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_123606720_123609656_123609875_123611815
tx.13307	chr4	+	1421	7	FSM	ENSMUSG00000043333.13	ENSMUST00000106204.2	1120	7	-7	-294	-7	294	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	3.97562014729219	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGCTGGACTCTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123703699	123723991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_123703970_123708035_123708185_123711656_123711770_123716549_123716651_123718653_123718715_123720630_123720693_123723326
tx.13308	chr4	-	1064	2	Fusion	ENSMUSG00000054304.4_ENSMUSG00000085875.4	novel	1505	2	NA	NA	-13	-975	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACTGAGAGTAATGACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123811075	123796896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr4_-_123797790_123810904
tx.13309	chr4	+	384	4	FSM	ENSMUSG00000028647.14	ENSMUST00000106202.4	1536	4	89	1063	-38	290	multi-exon	FALSE	canonical	3	305	junction_3	15.9652400197707	224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTATCTGACCAAATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123798795	123803806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_123798881_123799026_123799100_123803426_123803476_123803629
tx.13310	chr4	+	560	5	FSM	ENSMUSG00000028647.14	ENSMUST00000030400.14	1685	5	173	952	-36	75	multi-exon	FALSE	canonical	3	284	junction_4	22.6163657557973	1638	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGGTCTTAAAGCAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123798797	123805110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_123798881_123799026_123799100_123803426_123803476_123803629_123803760_123804885
tx.13311	chr4	+	559	4	FSM	ENSMUSG00000028647.14	ENSMUST00000137685.2	500	4	16	-75	16	75	multi-exon	FALSE	canonical	3	284	junction_3	24.8596057893121	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGGTCTTAAAGCAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123798944	123805110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_123799100_123803426_123803476_123803629_123803760_123804885
tx.13312	chr4	+	501	2	Intergenic	novelGene_1021	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTCTAGAATTATGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124137850	124138671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_124137958_124138277
tx.13313	chr4	+	589	2	Intergenic	novelGene_1022	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTTGGAATGTGTACAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124137892	124138790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_124137969_124138277
tx.13314	chr4	-	456	2	Intergenic	novelGene_1023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_1	0	375	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGCCTTAGCTCCGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124252215	124246962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_124247180_124251976
tx.13315	chr4	-	979	8	FSM	ENSMUSG00000028907.8	ENSMUST00000030738.8	1603	8	14	610	14	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	1259	junction_4	134.593264834372	8807	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGAGACTTGATGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124587379	124572562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_124572780_124573494_124573606_124575985_124576117_124576205_124576300_124577027_124577142_124577545_124577649_124579881_124579944_124587232
tx.13316	chr4	+	1753	17	FSM	ENSMUSG00000028902.5	ENSMUST00000030734.5	1820	17	48	19	48	-19	multi-exon	FALSE	canonical	3	1027	junction_12	104.342509913266	1447	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTTGTTTCTGAAACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124608616	124626234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124608784_124609061_124609110_124609444_124609498_124609602_124609709_124610243_124610317_124612120_124612213_124615816_124615900_124616670_124616810_124617463_124617533_124618551_124618620_124618867_124618976_124620771_124620842_124621866_124622032_124622111_124622223_124623251_124623343_124625163_124625220_124625980
tx.13317	chr4	+	1133	10	ISM	ENSMUSG00000028902.5	ENSMUST00000030734.5	1820	17	8100	19	1143	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1027	junction_5	129.299059987226	431	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTTGTTTCTGAAACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124616668	124626234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_124616810_124617463_124617533_124618551_124618620_124618867_124618976_124620771_124620842_124621866_124622032_124622111_124622223_124623251_124623343_124625163_124625220_124625980
tx.13318	chr4	+	630	5	ISM	ENSMUSG00000028902.5	ENSMUST00000030734.5	1820	17	13345	19	6388	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1316	junction_1	41.4268934389244	789	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTTGTTTCTGAAACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124621913	124626234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_124622032_124622111_124622223_124623251_124623343_124625163_124625220_124625980
tx.13319	chr4	+	3000	18	ISM	ENSMUSG00000028894.19	ENSMUST00000094782.10	3809	24	9743	0	9715	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_11	23.4933547256022	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATGGTTCTCTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124645385	124695304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_124645486_124671133_124671231_124674163_124674332_124676182_124676285_124677680_124677796_124678103_124678221_124678965_124679154_124680310_124680423_124681264_124681375_124682861_124682998_124685298_124685410_124685985_124686149_124686966_124687203_124689148_124689263_124691617_124691703_124692044_124692173_124693560_124693673_124694498
tx.13320	chr4	+	797	2	FSM	ENSMUSG00000028890.14	ENSMUST00000147452.2	781	2	-13	-3	-13	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_1	0	329	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAATTCATGTTTATACTG	339	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124696361	124699174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124696437_124698452
tx.13321	chr4	-	676	2	FSM	ENSMUSG00000078570.11	ENSMUST00000137769.3	659	2	39	-56	39	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_1	0	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTGACTGACCTTTCTT	7951	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124744227	124743282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_124743756_124744024
tx.13322	chr4	-	733	3	FSM	ENSMUSG00000078570.11	ENSMUST00000163946.2	762	3	24	5	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_2	68	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTGACTGACCTTTCTT	7679	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124744499	124743282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_124743756_124744024_124744227_124744441
tx.13323	chr4	+	1282	5	FSM	ENSMUSG00000028889.18	ENSMUST00000102628.11	1634	5	350	2	-322	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	475	junction_1	43.7121264639459	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTGTAAATGGTTTATTT	1884	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124744821	124749033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124744960_124745485_124745601_124745692_124745813_124747666_124747810_124748267
tx.13324	chr4	+	1506	5	NNC	ENSMUSG00000028889.18	novel	724	4	NA	NA	-130	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	237.084768595538	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAAATGGTTTATTTTTCT	2076	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124745013	124749037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_124745372_124745485_124745601_124745692_124745813_124747666_124747810_124748267
tx.13325	chr4	+	1602	4	FSM	ENSMUSG00000028889.18	ENSMUST00000144851.3	724	4	-116	-762	-116	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	495	junction_1	37.6061460697879	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTGTAAATGGTTTATTT	2090	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124745027	124749033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124745601_124745692_124745813_124747666_124747810_124748267
tx.13326	chr4	-	1610	10	FSM	ENSMUSG00000028873.17	ENSMUST00000084296.10	1626	10	16	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1430	junction_6	123.940846105444	2261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCCTCGGTCATCTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124830694	124812257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_124812824_124813405_124813493_124814051_124814179_124815004_124815098_124815792_124815858_124817509_124817626_124820457_124820531_124824864_124824906_124830147_124830277_124830381
tx.13327	chr4	-	1037	6	ISM	ENSMUSG00000028873.17	ENSMUST00000084296.10	1626	10	13102	0	12592	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1526	junction_2	43.1110194729839	627	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTCCTCGGTCATCTGCATT	NA	False	NA	-25	True	NA	NA	NA	124817608	124812257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_124812824_124813405_124813493_124814051_124814179_124815004_124815098_124815792_124815858_124817509
tx.13328	chr4	+	2809	5	FSM	ENSMUSG00000044730.18	ENSMUST00000094769.13	2911	5	104	-2	104	2	multi-exon	FALSE	non_canonical	3	27	junction_4	9.02773504263389	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACATTTGGTAAATATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124830970	124838451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124831127_124832232_124832511_124834158_124834339_124836145_124836265_124836375
tx.13329	chr4	+	2345	16	FSM	ENSMUSG00000028869.14	ENSMUST00000030684.8	2366	16	25	-4	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	650	junction_4	51.4673575083168	237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAACTGTGTTCGCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124923809	124949173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124923988_124928030_124928116_124929007_124929103_124931314_124931455_124934729_124934915_124936406_124936474_124937357_124937517_124938016_124938131_124940038_124940168_124941295_124941401_124942139_124942299_124942472_124942587_124946196_124946649_124947247_124947328_124947934_124948021_124948976
tx.13330	chr4	+	707	4	ISM	ENSMUSG00000028869.14	ENSMUST00000030684.8	2366	16	22520	-4	-639	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	761	junction_1	28.2488937836511	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAACTGTGTTCGCTTTCTT	9212	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124946304	124949173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_124946649_124947247_124947328_124947934_124948021_124948976
tx.13331	chr4	+	332	3	FSM	ENSMUSG00000028869.14	ENSMUST00000147550.2	667	3	335	0	335	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	812	junction_2	7.5	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAACTGTGTTCGCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124947278	124949173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124947328_124947934_124948021_124948976
tx.13332	chr4	-	733	2	FSM	ENSMUSG00000086342.2	ENSMUST00000143705.2	620	2	-111	-2	-111	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTTTGTGCATTGCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124978851	124976647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_124976857_124978327
tx.13333	chr4	+	1196	7	FSM	ENSMUSG00000028863.14	ENSMUST00000154689.8	4550	7	8	3346	8	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	173	junction_5	63.7427555796648	221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGCAGCTGCCTCTTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124978934	125003685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124979060_124979937_124980054_124983667_124983756_124983894_124983941_124996631_124996825_125002115_125002150_125003091
tx.13334	chr4	+	884	6	FSM	ENSMUSG00000028863.14	ENSMUST00000055213.11	872	6	-9	-3	8	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_5	98.9605982196955	210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGCAGCTGCCTCTTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124978934	125003685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124979060_124979937_124980054_124983667_124983756_124983894_124983941_124996631_124996825_125003369
tx.13335	chr4	+	1250	8	FSM	ENSMUSG00000028863.14	ENSMUST00000184205.8	1054	8	-15	-181	-2	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_6	102.612805025016	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGCTGCCTCTTTGGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124978941	125003688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_124979060_124979937_124980054_124983667_124983756_124983894_124983941_124996631_124996825_125001444_125001503_125002115_125002150_125003091
tx.13336	chr4	+	1014	6	NIC	ENSMUSG00000028863.14	novel	872	6	NA	NA	-2	379	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_5	120.208818312135	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGCATCAACAGATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124978941	124997675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_124979060_124979937_124980054_124983667_124983756_124983894_124983941_124996631_124996825_124997222
tx.13337	chr4	-	1040	4	NIC	ENSMUSG00000085562.8	novel	3623	7	NA	NA	46	224	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGCATAATATATTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125816164	125783983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_125784527_125785276_125785384_125786974_125787070_125815869
tx.13338	chr4	-	848	4	NNC	ENSMUSG00000085562.8	novel	3623	7	NA	NA	-50	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.05480466765633	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGGTTCCTTTCAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125816153	125784205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_125784527_125786974_125787070_125812451_125812600_125815869
tx.13339	chr4	-	1169	5	NIC	ENSMUSG00000085562.8	novel	3623	7	NA	NA	51	230	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_4	0.707106781186548	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATATATTTTGATTTATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125816159	125783977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_125784527_125785276_125785384_125786974_125787070_125787635_125787764_125815869
tx.13340	chr4	+	892	8	FSM	ENSMUSG00000028861.14	ENSMUST00000030675.8	937	8	52	-7	0	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	1282	junction_7	51.9186962510439	5085	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGGAAGATGGCCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125940769	125949332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_125940993_125941226_125941272_125942427_125942507_125944272_125944322_125945117_125945203_125947292_125947352_125948753_125948946_125949172
tx.13341	chr4	+	1476	10	FSM	ENSMUSG00000042616.9	ENSMUST00000035497.5	5013	10	7	3530	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_8	4.26296135405575	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTTCCCCATTATTCTCA	2370	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125952364	125982458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_125952586_125967597_125967753_125970509_125970678_125971128_125971210_125976674_125976779_125977388_125977518_125978185_125978256_125980335_125980476_125981498_125981563_125982114
tx.13342	chr4	+	932	7	ISM	ENSMUSG00000042616.9	ENSMUST00000143712.3	1473	11	18732	-1	-5592	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_5	3.76017139089283	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTTCCCCATTATTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125971128	125982458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_125971210_125976674_125976779_125977388_125977518_125978185_125978256_125980335_125980476_125981498_125981563_125982114
tx.13343	chr4	+	808	2	FSM	ENSMUSG00000050188.9	ENSMUST00000179323.2	808	2	1	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTCTGTGCCTGATGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125990446	125992375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_125990501_125991621
tx.13344	chr4	+	850	2	FSM	ENSMUSG00000050188.9	ENSMUST00000055575.8	943	2	91	2	54	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_1	0	994	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTCTGTGCCTGATGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125990506	125992375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_125990603_125991621
tx.13345	chr4	+	959	3	FSM	ENSMUSG00000050212.5	ENSMUST00000052876.3	1689	3	731	-1	-57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	143	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGTCTCTCACTGGTTAC	7073	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126042267	126043668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_126042425_126042676_126042839_126043028
tx.13346	chr4	+	892	3	FSM	ENSMUSG00000050212.5	ENSMUST00000106152.3	1364	3	472	0	-57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	244	junction_1	47.5	560	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGTCTCTCACTGGTTAC	7073	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126042267	126043668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_126042425_126042743_126042839_126043028
tx.13347	chr4	+	797	2	NIC	ENSMUSG00000050212.5	novel	1364	3	NA	NA	-57	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGTCTCTCACTGGTTAC	7073	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126042267	126043668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_126042425_126043028
tx.13348	chr4	-	370	2	NIC	ENSMUSG00000073758.11	novel	1884	10	NA	NA	11410	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCAGTCTGGTCCTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126044984	126044394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_126044590_126044809
tx.13349	chr4	-	428	3	ISM	ENSMUSG00000073758.11	ENSMUST00000152402.8	2071	12	11410	-6	11410	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCAGTCTGGTCCTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126044984	126044394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126044590_126044669_126044728_126044809
tx.13350	chr4	-	1582	2	FSM	ENSMUSG00000043962.17	ENSMUST00000154702.2	609	2	500	-1473	500	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	903	junction_1	0	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGACTGTGTTTGTTGCTTG	9537	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126060769	126057874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_126059411_126060723
tx.13351	chr4	-	1872	3	FSM	ENSMUSG00000043962.17	ENSMUST00000140390.2	2656	3	788	-4	-185	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	779	junction_2	62	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGACTGTGTTTGTTGCTTG	8852	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126061454	126057874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_126059411_126060723_126060868_126061262
tx.13352	chr4	-	2740	8	ISM	ENSMUSG00000043962.17	ENSMUST00000080919.12	4378	11	24593	0	359	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	676	junction_7	73.4141175324012	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGACTGTGTTTGTTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126071960	126057874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126059411_126060723_126060868_126061262_126061459_126065486_126065675_126067236_126067322_126069128_126069241_126069976_126070150_126071654
tx.13353	chr4	-	1774	5	NNC	ENSMUSG00000043962.17	novel	378	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_2	325.07797141609	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGACTGTGTTTGTTGCTTG	6787	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126096440	126057874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_126059411_126060723_126060756_126080341_126080382_126088109_126088198_126096362
tx.13354	chr4	-	4360	12	NIC	ENSMUSG00000043962.17	novel	4378	11	NA	NA	5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	517	junction_11	115.160039556887	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGACTGTGTTTGTTGCTTG	6780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126096447	126057874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_126059411_126060723_126060868_126061262_126061459_126065486_126065675_126067236_126067322_126069128_126069241_126069976_126070150_126071654_126072351_126073704_126074608_126080227_126080382_126088109_126088198_126096362
tx.13355	chr4	-	1706	4	NNC	ENSMUSG00000043962.17	novel	4378	11	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_2	360.371413344005	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGACTGTGTTTGTTGCTTG	6767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126096460	126057874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_126059411_126060723_126060756_126080341_126080382_126096362
tx.13356	chr4	-	2288	3	FSM	ENSMUSG00000043962.17	ENSMUST00000151728.2	2238	3	-58	8	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	431	junction_2	228	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATTCAGTATCCTA	6764	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126096463	126072574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_126074608_126080227_126080382_126096362
tx.13357	chr4	-	2383	4	NIC	ENSMUSG00000043962.17	novel	339	5	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	517	junction_3	151.240059361122	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCAGTATCCTAAATAACT	6764	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126096463	126072567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_126074608_126080227_126080382_126088109_126088198_126096362
tx.13358	chr4	-	2630	3	FSM	ENSMUSG00000043962.17	ENSMUST00000168568.8	521	3	-2	-2107	-2	1926	multi-exon	FALSE	canonical	3	517	junction_2	84.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAGTTATCAGACCCTTAA	6773	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126096454	126077931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_126080382_126088109_126088198_126096362
tx.13359	chr4	+	1286	5	FSM	ENSMUSG00000028847.9	ENSMUST00000030660.9	1336	5	48	2	-27	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	345	junction_3	21.2882009573378	659	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATCCTGTCCTGTTTTCCTT	7673	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126156165	126169674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_126156331_126166470_126166569_126166767_126166868_126167682_126167866_126168934
tx.13360	chr4	-	1661	6	FSM	ENSMUSG00000042558.17	ENSMUST00000102617.5	1672	6	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	286	junction_3	41.9218320210365	293	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATGTCCTGTTCCTGTCTC	7087	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126215485	126209839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_126210659_126211095_126211197_126211512_126211698_126211776_126211985_126212191_126212289_126215234
tx.13361	chr4	-	1104	7	ISM	ENSMUSG00000028845.16	ENSMUST00000030658.13	1492	10	756	-2	756	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_6	3.0368111930481	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGGCTCTTTTCTGCTAC	4336	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126218236	126215913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126216213_126216364_126216445_126216612_126216757_126216912_126217021_126217149_126217265_126217431_126217576_126218022
tx.13362	chr4	-	763	2	ISM	ENSMUSG00000028845.16	ENSMUST00000030658.13	1492	10	2164	-2	2164	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGGCTCTTTTCTGCTAC	5744	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126216828	126215913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126216213_126216364
tx.13363	chr4	-	626	3	ISM	ENSMUSG00000028845.16	ENSMUST00000030658.13	1492	10	2133	-2	2133	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_2	2	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGGCTCTTTTCTGCTAC	5713	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126216859	126215913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126216213_126216364_126216445_126216612
tx.13364	chr4	-	1499	9	ISM	ENSMUSG00000028845.16	ENSMUST00000030658.13	1492	10	120	-2	120	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_7	3.35410196624968	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGGCTCTTTTCTGCTAC	3700	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126218872	126215913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126216213_126216364_126216445_126216612_126216757_126216912_126217021_126217149_126217265_126217431_126217576_126218022_126218229_126218386_126218513_126218595
tx.13365	chr4	-	1615	11	NIC	ENSMUSG00000028845.16	novel	1542	11	NA	NA	22	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_7	3.61247837363769	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGGCTCTTTTCTGCTAC	3366	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126219206	126215913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_126216213_126216364_126216445_126216612_126216757_126216912_126217021_126217149_126217265_126217431_126217576_126218022_126218229_126218386_126218513_126218595_126218802_126218926_126218997_126219089
tx.13366	chr4	-	425	2	ISM	ENSMUSG00000028842.16	ENSMUST00000123233.2	613	3	21	9532	21	-9532	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAACCGTGGAGTTTAG	2400	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126323313	126311020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126311193_126323060
tx.13367	chr4	+	502	2	Intergenic	novelGene_1025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCGCGGGAGTGTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126510345	126513596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_126510407_126513155
tx.13368	chr4	+	838	6	FSM	ENSMUSG00000028837.9	ENSMUST00000030642.3	859	6	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3349	junction_3	129.102439945959	10659	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTCTGGGTTTGGCCTTA	5401	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126571443	126603507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_126571639_126577914_126578038_126580821_126580893_126599850_126600014_126601346_126601397_126603271
tx.13369	chr4	-	3313	7	FSM	ENSMUSG00000028833.14	ENSMUST00000127079.2	2375	7	38	-976	9	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_6	61.3969326052477	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTCCTTTGTGGTCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126647193	126637547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_126639065_126640338_126640482_126640888_126641114_126642270_126642513_126643677_126644647_126645733_126645875_126647117
tx.13370	chr4	+	716	3	NNC	ENSMUSG00000028830.15	novel	4073	24	NA	NA	0	-11692	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_2	7	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTAATTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126647336	126670435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_126647456_126650691_126650862_126670008
tx.13371	chr4	-	1329	7	ISM	ENSMUSG00000042446.17	ENSMUST00000106108.9	7102	30	271	52995	35	14	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	222	junction_3	34.4141443789226	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATTTAGTGCCCCATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126861657	126808726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126809121_126809373_126809459_126816856_126817028_126817361_126817424_126819294_126819817_126842226_126842273_126861608
tx.13372	chr4	-	650	2	Intergenic	novelGene_1027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTATCTTTTTCAGTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126893222	126891894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_126892463_126893140
tx.13373	chr4	+	1136	3	ISM	ENSMUSG00000028820.14	ENSMUST00000030623.8	3465	10	5949	440	828	-440	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1050	junction_1	9	3935	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTTCATGTATTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126921065	126924589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_126921110_126921189_126921312_126923619
tx.13374	chr4	+	1094	2	ISM	ENSMUSG00000028820.14	ENSMUST00000030623.8	3465	10	6071	440	950	-440	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1068	junction_1	0	792	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTTCATGTATTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126921187	126924589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_126921312_126923619
tx.13375	chr4	-	2598	4	ISM	ENSMUSG00000043872.15	ENSMUST00000055013.10	3001	6	7602	-7	6189	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	404	junction_3	11.4406682011537	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGAAGTTTTGTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126945177	126941378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126943700_126944356_126944395_126944536_126944666_126945067
tx.13376	chr4	-	3348	8	FSM	ENSMUSG00000043872.15	ENSMUST00000106102.9	3852	8	12	492	12	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	376	junction_6	26.8206438918888	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGAAGTTTTGTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126954933	126941378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_126943700_126944356_126944395_126944536_126944666_126945067_126945219_126948000_126948176_126952585_126952825_126953302_126953453_126954788
tx.13377	chr4	-	3342	7	NNC	ENSMUSG00000043872.15	novel	3852	8	NA	NA	1	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	155.931608940159	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAATGAAGTTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126954944	126941381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_126943724_126944536_126944666_126945067_126945219_126948000_126948176_126952585_126952825_126953302_126953453_126954788
tx.13378	chr4	-	3209	7	NIC	ENSMUSG00000043872.15	novel	3852	8	NA	NA	-5	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	33	junction_6	141.739981029427	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCCTAATGAAGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126954950	126941384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_126943700_126944356_126944395_126944536_126944666_126945067_126945219_126948000_126948176_126952585_126952825_126954788
tx.13379	chr4	+	1033	3	NNC	ENSMUSG00000070737.11	novel	1120	3	NA	NA	-6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_1	45	83	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTGTACTTCGTCCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127019832	127023437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_127019894_127021611_127021793_127022646
tx.13380	chr4	+	1124	3	FSM	ENSMUSG00000070737.11	ENSMUST00000094712.5	1120	3	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_2	3.5	550	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTGTACTTCGTCCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127019834	127023437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_127019987_127021611_127021793_127022646
tx.13381	chr4	+	882	3	NNC	ENSMUSG00000042388.15	novel	2901	10	NA	NA	-3941	-13966	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_2	82.5	30	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGCACTTGGGAGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127093157	127094581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_127093672_127094056_127094130_127094286
tx.13382	chr4	+	1007	2	FSM	ENSMUSG00000042380.9	ENSMUST00000142029.2	1022	2	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	445	junction_1	0	2564	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATGGAGTCCTGCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127137591	127141602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_127137692_127140695
tx.13383	chr4	-	1607	2	FSM	ENSMUSG00000042367.13	ENSMUST00000106091.9	1623	2	16	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	984	junction_1	0	1693	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCGGTTCTTCCCTCCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127222938	127219027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_127220565_127222868
tx.13384	chr4	-	1838	2	FSM	ENSMUSG00000042367.13	ENSMUST00000046532.4	1880	2	42	0	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	980	junction_1	0	1783	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCGGTTCTTCCCTCCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127224595	127219027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_127220565_127224294
tx.13385	chr4	+	486	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042367.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_3	21.4165045389453	359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTAGTGTTTTTATTTTG	9240	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127224001	127237055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_127224096_127225680_127225785_127226134_127226258_127236890
tx.13386	chr4	+	442	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042367.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	31.7104959840674	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATGCGTGTGTTTGTGTGT	9249	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127224010	127232837	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_127224096_127225680_127225785_127226134_127226258_127232707
tx.13387	chr4	-	1332	2	FSM	ENSMUSG00000042357.3	ENSMUST00000046498.3	1721	2	1	388	1	-388	multi-exon	FALSE	canonical	3	573	junction_1	0	2348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAAGGTGTCCTTTGGGTCT	405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127251973	127248989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_127250167_127251818
tx.13388	chr4	+	1321	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042357.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTGGCCAGGAGGGGTGT	5171	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127248993	127251971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_127250144_127251800
tx.13389	chr4	-	688	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000079998.3	novel	420	1	NA	NA	-759	66	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATGTGTGTGCACCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127303350	127302105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_127302603_127303159
tx.1339	chr10	-	1225	10	FSM	ENSMUSG00000038510.13	ENSMUST00000183309.8	1296	10	4	67	4	-67	multi-exon	FALSE	canonical	3	1057	junction_7	76.0030863570847	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTGTTTGGATCATACTC	6561	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40123028	40099489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_40099917_40101292_40101438_40103554_40103658_40109103_40109204_40110817_40110895_40112118_40112201_40115743_40115784_40119851_40119890_40120580_40120714_40122948
tx.13390	chr4	+	1008	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000079998.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	1	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAAGTTGAGGCTAGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127302199	127308259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_127302952_127303602_127303687_127308087
tx.13391	chr4	+	577	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000079998.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAGAAGAAGAAGAAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127302445	127318939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_127302541_127311191_127311321_127318586
tx.13392	chr4	+	532	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000079998.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.49443825784929	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGAGGCTAGCGCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127302450	127308265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_127302541_127302789_127302970_127303602_127303687_127308087
tx.13393	chr4	+	511	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000079998.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	1.4142135623731	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGAGGCTAGCGCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127302450	127308265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_127302541_127302789_127302952_127303602_127303687_127308090
tx.13394	chr4	+	359	3	NNC	ENSMUSG00000087470.3	novel	311	2	NA	NA	-12943	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTAAGTTTTAATGATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127355697	127370634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_127355768_127368663_127368744_127370425
tx.13395	chr4	-	1293	6	ISM	ENSMUSG00000028789.17	ENSMUST00000106068.8	2049	11	12672	-2	11642	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_4	3.05941170815567	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAAACCCTTCAGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128843549	128825812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_128826285_128828249_128828465_128839849_128839963_128841251_128841412_128842584_128842751_128843382
tx.13396	chr4	-	933	4	ISM	ENSMUSG00000028789.17	ENSMUST00000106068.8	2049	11	14712	123	13682	-123	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_2	2.05480466765633	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGTGTCTGCCTCTGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128841509	128825937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_128826285_128828249_128828465_128839849_128839963_128841251
tx.13397	chr4	+	1741	7	FSM	ENSMUSG00000028792.15	ENSMUST00000102604.11	1781	7	40	0	40	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1917	junction_3	122.234746833023	4014	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTGTTGTGGAGTTTTTT	2909	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128887056	128905322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_128887230_128892926_128893053_128895943_128896055_128896166_128896262_128901505_128901579_128901826_128902023_128904355
tx.13398	chr4	+	933	6	FSM	ENSMUSG00000028792.15	ENSMUST00000030583.13	986	6	51	2	51	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1917	junction_3	119.822535443046	432	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTGCAGCACTCATCTAT	2920	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128887067	128902192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_128887230_128892926_128893053_128895943_128896055_128896166_128896262_128901505_128901579_128901826
tx.13399	chr4	+	1141	2	ISM	ENSMUSG00000028792.15	ENSMUST00000102604.11	1781	7	14832	0	14703	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1993	junction_1	0	280	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTGTTGTGGAGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128901848	128905322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_128902023_128904355
tx.134	chr1	-	783	3	FSM	ENSMUSG00000103708.2	ENSMUST00000193725.2	654	3	-124	-5	-124	5	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTCTGGCCTCTCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36050249	36042060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_36042488_36042894_36043073_36050071
tx.1340	chr10	-	714	6	FSM	ENSMUSG00000019837.9	ENSMUST00000217537.2	2526	6	-7	1819	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	403	junction_5	105.423716496811	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTCTTGTATGCAATTAC	8579	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40133674	40125517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_40125828_40127151_40127266_40130259_40130305_40130396_40130461_40133208_40133290_40133574
tx.13400	chr4	-	981	2	FSM	ENSMUSG00000085085.3	ENSMUST00000149472.3	1009	2	38	-10	38	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTACACTTCTTGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128951738	128943879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_128944703_128951580
tx.13401	chr4	-	1136	3	NNC	ENSMUSG00000085085.3	novel	1009	2	NA	NA	20	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	2	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTTACACTTCTTGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128951756	128943879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_128944703_128944860_128944998_128951580
tx.13402	chr4	+	1123	3	ISM	ENSMUSG00000028793.16	ENSMUST00000130803.3	815	5	1385	1362	1385	-2	internal_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_1	17.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTCATGTCACTGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128974148	128978317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_128974343_128976539_128976672_128977520
tx.13403	chr4	+	194	2	Intergenic	novelGene_1029	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACACCCACCAATTTCAAA	5258	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129040919	129041346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_129041063_129041295
tx.13404	chr4	-	1963	7	NIC	ENSMUSG00000040928.16	novel	4059	9	NA	NA	2	176	intron_retention	FALSE	canonical	3	119	junction_6	30.1482448355898	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCTTTCTGTACCTATTA	1115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129083408	129044163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_129044885_129049217_129049303_129072033_129072126_129073981_129074065_129075534_129076326_129077393_129077511_129083334
tx.13405	chr4	-	731	2	ISM	ENSMUSG00000040928.16	ENSMUST00000117497.8	1053	7	-27	30865	-10	-97	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGCCTCTGATAAAAATATA	1094	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129083429	129075689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_129076326_129083334
tx.13406	chr4	+	2397	13	FSM	ENSMUSG00000028811.13	ENSMUST00000106054.4	2909	13	141	371	-1	-371	multi-exon	FALSE	canonical	3	1466	junction_9	124.991221914003	1415	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGCACGGAGTCTCGTG	854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129083693	129113029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129083866_129090622_129090770_129090905_129091082_129094518_129094649_129099921_129100003_129101733_129101827_129103444_129103581_129104285_129104372_129107741_129107878_129108450_129108549_129109018_129109213_129110470_129110613_129112223
tx.13407	chr4	+	1629	3	FSM	ENSMUSG00000028811.13	ENSMUST00000128287.2	647	3	1	-983	1	983	multi-exon	FALSE	canonical	3	1802	junction_1	30	243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATAAACTGCTTTAAAAT	856	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129083695	129092217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129083866_129090622_129090770_129090905
tx.13408	chr4	+	1034	3	ISM	ENSMUSG00000028811.13	ENSMUST00000137591.2	921	6	2638	-573	1572	-371	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1470	junction_2	92.5	830	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGCACGGAGTCTCGTG	1343	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129109126	129113029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_129109213_129110470_129110613_129112223
tx.13409	chr4	-	2804	2	ISM	ENSMUSG00000050390.13	ENSMUST00000106051.8	5049	7	5189	4	4758	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	262	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTGTGACTGCTGTTT	5564	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129116515	129113374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_129115271_129115607
tx.13410	chr4	+	537	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000050390.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGTTAGTGAAGCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129133113	129137473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_129133318_129137140
tx.13411	chr4	+	816	4	NNC	ENSMUSG00000087575.8	novel	412	2	NA	NA	-9367	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.816496580927726	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTGCAGGTGTCAATCA	9430	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129146390	129158806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_129146584_129153889_129154064_129155723_129155906_129158539
tx.13412	chr4	+	381	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00002075153.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCACAGGCCAAATGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129170519	129177128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_129170684_129176911
tx.13413	chr4	-	1958	12	FSM	ENSMUSG00000057236.11	ENSMUST00000102598.4	4407	12	35	2414	35	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	482	junction_1	226.647613038099	1306	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCATGCTGGTGGGTTTTA	2527	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129229128	129203306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129203951_129211440_129211552_129211654_129211713_129212236_129212314_129214261_129214340_129215646_129215774_129215871_129216033_129216145_129216262_129216488_129216663_129222380_129222527_129228289_129228438_129229010
tx.13414	chr4	-	698	4	FSM	ENSMUSG00000057236.11	ENSMUST00000140291.2	722	4	26	-2	26	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_1	460.816666365269	2283	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCATGCTGGTGGGTTTT	3244	False	NA	-21	True	NA	NA	NA	129228411	129203307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129203670_129216594_129216663_129222380_129222527_129228289
tx.13415	chr4	-	847	5	NIC	ENSMUSG00000057236.11	novel	722	4	NA	NA	30	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	143	junction_1	413.387454454051	3207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCATGCTGGTGGGTTTT	2522	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129229133	129203307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_129203670_129216594_129216663_129222380_129222527_129228289_129228438_129229010
tx.13416	chr4	+	720	7	FSM	ENSMUSG00000057572.16	ENSMUST00000141235.8	3833	7	275	2838	-42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	561	junction_4	57.3866031598162	7219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTGTGTAGCAGTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129229762	129240826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129229933_129234520_129234546_129235269_129235392_129235533_129235617_129236913_129236967_129238004_129238042_129240596
tx.13417	chr4	-	2100	5	FSM	ENSMUSG00000028807.3	ENSMUST00000030610.3	2321	5	221	0	221	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_4	9.35414346693485	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTCGTGACACTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129271688	129247420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129248298_129251497_129251668_129253690_129254494_129263021_129263116_129271532
tx.13418	chr4	-	2743	3	ISM	ENSMUSG00000048485.13	ENSMUST00000053042.6	3288	4	7769	238	-520	-238	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTTTTTTTTTTTTAAA	8508	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129326842	129319795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_129321621_129322220_129322400_129326103
tx.13419	chr4	+	2654	10	ISM	ENSMUSG00000040859.15	ENSMUST00000048162.10	2823	11	360	45	105	-45	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_2	13.9920612412102	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTTACAGATTTGCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129355733	129382246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_129355796_129359022_129359140_129360615_129360784_129362786_129362842_129365719_129365836_129366216_129366286_129366490_129366570_129367567_129368039_129378829_129378934_129380833
tx.13420	chr4	+	1423	2	FSM	ENSMUSG00000047945.7	ENSMUST00000062356.7	1605	2	172	10	172	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	8029	junction_1	0	395	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATGTTTCATTGAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129407545	129409768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129407710_129408509
tx.13421	chr4	-	1985	14	FSM	ENSMUSG00000028800.16	ENSMUST00000102597.5	2038	14	53	0	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1463	junction_10	202.513203601978	2349	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCCTGGTTGGTTTAAGTT	8861	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129436453	129409896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129410430_129410692_129410742_129411148_129411302_129411585_129411717_129411805_129411915_129412623_129412765_129412844_129412954_129415210_129415304_129416155_129416298_129416755_129416895_129418038_129418114_129422719_129422838_129428406_129428520_129436373
tx.13422	chr4	-	1433	5	FSM	ENSMUSG00000000409.15	ENSMUST00000132030.2	779	5	-115	-539	-115	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	108	junction_2	15.6903632845132	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGTACATTTTTCTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129449756	129442148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129442794_129445297_129445430_129445509_129445664_129445740_129445818_129449331
tx.13423	chr4	-	1616	7	ISM	ENSMUSG00000000409.15	ENSMUST00000167288.8	2074	13	1817	5	-96	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_2	13.2214052035158	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTTCTACTGCATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129450348	129442141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_129442794_129445297_129445430_129445509_129445664_129445740_129445818_129449331_129449512_129449645_129449799_129450080
tx.13424	chr4	-	2200	12	FSM	ENSMUSG00000000409.15	ENSMUST00000067240.11	2185	12	-15	0	-15	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_9	59.1335510476424	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTTCTACTGCATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129452199	129442141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129442794_129445297_129445430_129445509_129445664_129445740_129445818_129449331_129449512_129449645_129449799_129450080_129450231_129450436_129450541_129450826_129450926_129451157_129451249_129451418_129451501_129451873
tx.13425	chr4	-	2107	13	FSM	ENSMUSG00000000409.15	ENSMUST00000167288.8	2074	13	-38	5	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_12	60.4484973620795	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTTCTACTGCATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129452203	129442141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129442794_129445297_129445430_129445509_129445664_129445740_129445818_129449331_129449512_129449645_129449799_129450080_129450231_129450436_129450541_129450826_129450926_129451157_129451249_129451418_129451501_129451873_129451984_129452080
tx.13426	chr4	-	586	6	ISM	ENSMUSG00000028798.17	ENSMUST00000102593.11	1123	11	5533	14	653	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1341	junction_3	47.6210037693453	493	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCCTTGTCAGGCATTTTG	2222	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129488908	129485766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_129485928_129486059_129486153_129486789_129486864_129487134_129487225_129487318_129487430_129488851
tx.13427	chr4	-	1055	10	ISM	ENSMUSG00000028798.17	ENSMUST00000102593.11	1123	11	146	14	97	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1341	junction_3	45.5241083871441	2536	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCCTTGTCAGGCATTTTG	6523	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129494295	129485766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_129485928_129486059_129486153_129486789_129486864_129487134_129487225_129487318_129487430_129488851_129488980_129489056_129489207_129490666_129490733_129492747_129492836_129494201
tx.13428	chr4	-	1089	11	FSM	ENSMUSG00000028798.17	ENSMUST00000102593.11	1123	11	20	14	-12	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	822	junction_10	179.667915889287	7426	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCCTTGTCAGGCATTTTG	6397	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129494421	129485766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129485928_129486059_129486153_129486789_129486864_129487134_129487225_129487318_129487430_129488851_129488980_129489056_129489207_129490666_129490733_129492747_129492836_129494201_129494295_129494386
tx.13429	chr4	+	814	5	FSM	ENSMUSG00000028797.21	ENSMUST00000102591.10	1437	5	0	623	0	28	multi-exon	FALSE	canonical	3	325	junction_2	181.287582310538	730	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAGACGAAGGGCAGCAC	3176	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129494472	129501698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129494525_129494775_129494928_129495987_129496055_129500879_129500973_129501248
tx.13430	chr4	+	911	5	FSM	ENSMUSG00000028797.21	ENSMUST00000152126.8	1519	5	-21	629	-1	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	284	junction_2	194.785779768442	712	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCAAAACAAACAAACAAGA	3175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129494471	129501685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129494525_129494775_129495037_129495987_129496055_129500879_129500973_129501248
tx.13431	chr4	+	841	4	FSM	ENSMUSG00000028797.21	ENSMUST00000173937.8	756	4	-9	-76	1	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	291.296336323606	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCAAAACAAACAAACAAGA	3178	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129494474	129501685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129494525_129494775_129495037_129500879_129500973_129501248
tx.13432	chr4	+	745	4	FSM	ENSMUSG00000028797.21	ENSMUST00000174819.8	652	4	-15	-78	0	26	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_2	255.064697674923	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAACAAGACGAAGGGCAGC	3176	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129494472	129501696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129494525_129494775_129494928_129500879_129500973_129501248
tx.13433	chr4	+	1018	6	NIC	ENSMUSG00000028797.21	novel	769	5	NA	NA	1	15	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	74	junction_2	295.098220936691	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCAAAACAAACAAACAAGA	3178	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129494474	129501685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_129494525_129494775_129494928_129495199_129495419_129495987_129496055_129500879_129500973_129501248
tx.13434	chr4	+	861	4	FSM	ENSMUSG00000028797.21	ENSMUST00000174350.8	1124	4	278	-15	-3	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	284	junction_1	212.397426224205	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCAAAACAAACAAACAAGA	3476	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129494772	129501685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129495037_129495987_129496055_129500879_129500973_129501248
tx.13435	chr4	+	943	4	ISM	ENSMUSG00000028797.21	ENSMUST00000102591.10	1437	5	109	636	82	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	325	junction_1	193.096406549221	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCCAAAACAAACAAACAAGA	3285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129494581	129501685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_129494928_129495987_129496055_129500879_129500973_129501248
tx.13436	chr4	-	308	3	FSM	ENSMUSG00000028795.16	ENSMUST00000141361.8	428	3	121	-1	121	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_2	1.5	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACTCGGTGCTCTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129514587	129513066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129513240_129514249_129514273_129514475
tx.13437	chr4	-	833	6	FSM	ENSMUSG00000028795.16	ENSMUST00000030586.15	879	6	46	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_3	6.82934843158555	390	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACTCGGTGCTCTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129517694	129513066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129513240_129514249_129514273_129514475_129514670_129514776_129514944_129516392_129516581_129517606
tx.13438	chr4	-	832	5	NNC	ENSMUSG00000028795.16	novel	879	6	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.9145973836909	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACTCGGTGCTCTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129517694	129513066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_129513240_129514453_129514670_129514776_129514944_129516392_129516581_129517606
tx.13439	chr4	-	2235	14	FSM	ENSMUSG00000003731.14	ENSMUST00000102590.11	5710	14	18	3457	18	47	multi-exon	TRUE	canonical	3	106	junction_4	15.2943505832485	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCTTGTATTAAGGTTG	8852	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129566542	129541229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129541973_129542990_129543170_129544476_129544605_129545380_129545507_129547230_129547310_129547634_129547799_129548080_129548181_129548657_129548747_129549222_129549355_129550100_129550196_129551181_129551282_129551560_129551654_129555098_129555233_129566469
tx.13440	chr4	-	1892	10	FSM	ENSMUSG00000053730.16	ENSMUST00000125445.8	1851	10	-41	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_7	9.25896295822207	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCCTGTGTCCTGTGATT	9993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129590630	129570147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129570602_129572364_129572486_129578104_129578293_129580563_129580901_129585760_129585916_129586225_129586310_129586428_129586512_129586858_129587079_129587678_129587806_129590507
tx.13441	chr4	-	1809	9	FSM	ENSMUSG00000053730.16	ENSMUST00000102588.10	1810	9	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	15	junction_6	5.99869777535091	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCCTGTGTCCTGTGATT	9993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129590630	129570147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_129570602_129572364_129572486_129578104_129578293_129580563_129580901_129585760_129585916_129586225_129586310_129586858_129587079_129587678_129587806_129590507
tx.13442	chr4	-	1784	9	NNC	ENSMUSG00000053730.16	novel	1810	9	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	10.4335696192626	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCCTGTGTCCTGTGATT	9987	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129590636	129570147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_129570602_129572364_129572486_129578104_129578293_129580563_129580901_129585760_129585916_129586225_129586310_129586858_129587079_129587678_129587806_129590538
tx.13443	chr4	+	1785	6	FSM	ENSMUSG00000028788.15	ENSMUST00000165853.2	3382	6	27	1570	14	-1545	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	1089.03101884198	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTGGCGCATATATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129714527	129742226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_129714593_129732770_129733472_129736462_129736556_129738854_129738986_129740257_129740333_129741506
tx.13444	chr4	+	788	3	ISM	ENSMUSG00000028788.15	ENSMUST00000165853.2	3382	6	24436	1626	5993	-1601	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2484	junction_2	109	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAACAAAAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129738936	129742170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_129738986_129740257_129740333_129741506
tx.13445	chr4	+	789	2	Intergenic	novelGene_1032	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTGCCTTGGTCATGGTG	5410	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129777965	129779200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_129778259_129778704
tx.13446	chr4	+	799	2	ISM	ENSMUSG00000085389.8	ENSMUST00000147634.8	564	4	353	1605	-81	-1605	internal_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTGTAGAATATGTGGC	5343	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129854519	129855708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_129854602_129854991
tx.13447	chr4	+	1899	3	ISM	ENSMUSG00000085389.8	ENSMUST00000147634.8	564	4	377	-1610	-57	1473	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_2	3.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGACATTTAGTGACCCT	5367	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129854543	129858923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_129854602_129854991_129855074_129857164
tx.13448	chr4	+	880	2	ISM	ENSMUSG00000085389.8	ENSMUST00000139884.2	541	3	10	1742	10	-1605	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTGTAGAATATGTGGC	5434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129854610	129855708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_129854774_129854991
tx.13449	chr4	-	464	2	Intergenic	novelGene_1033	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTCAGTGCTATTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129865899	129863840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_129864041_129865635
tx.13450	chr4	+	1496	5	FSM	ENSMUSG00000028779.17	ENSMUST00000030563.6	1551	5	56	-1	56	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	185	junction_1	25.1047804212664	1002	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTTCTTGACTGTGTGTC	9334	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130001404	130021928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_130001444_130014960_130015235_130018855_130019012_130019446_130019591_130021045
tx.13451	chr4	+	1460	4	ISM	ENSMUSG00000028779.17	ENSMUST00000030563.6	1551	5	13609	-1	13609	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	218	junction_2	13.4742552876052	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTTCTTGACTGTGTGTC	8213	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130014957	130021928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_130015235_130018855_130019012_130019446_130019591_130021045
tx.13452	chr4	-	701	3	ISM	ENSMUSG00000028776.15	ENSMUST00000175992.8	1847	11	7838	0	-343	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	281	junction_1	0.5	195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACAGTGTCTGGGAGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130060747	130059396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_130059999_130060095_130060142_130060694
tx.13453	chr4	-	1009	5	ISM	ENSMUSG00000028776.15	ENSMUST00000175992.8	1847	11	7197	0	-984	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	241	junction_4	17.0953209972788	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACAGTGTCTGGGAGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130061388	130059396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_130059999_130060095_130060142_130060694_130060819_130061048_130061095_130061197
tx.13454	chr4	-	1950	12	FSM	ENSMUSG00000028776.15	ENSMUST00000105999.9	1952	12	0	2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	185	junction_11	29.3189922368611	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACAGTGTCTGGGAGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130068595	130059396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_130059999_130060095_130060142_130060694_130060819_130061048_130061095_130061197_130061388_130061490_130061642_130061722_130061847_130062811_130062927_130063103_130063197_130066724_130066789_130067685_130068001_130068515
tx.13455	chr4	-	2037	12	NNC	ENSMUSG00000023232.18	novel	1452	11	NA	NA	-16291	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	4.95600478925055	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGCCTCCCATGTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130189289	130147289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_130147859_130149148_130149359_130152020_130152157_130152493_130152585_130154435_130154606_130156820_130156959_130157374_130157455_130158053_130158245_130158861_130159024_130172224_130172276_130174143_130174242_130189148
tx.13456	chr4	-	456	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000073752.3	novel	2118	1	NA	NA	1191	15359	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGTGTTTTTGCCTGCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130201275	130184989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_130185283_130201112
tx.13457	chr4	-	425	2	Intergenic	novelGene_1034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTTTTTGCCTGCATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130189278	130184987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_130185283_130189148
tx.13458	chr4	+	676	4	FSM	ENSMUSG00000028773.9	ENSMUST00000070532.8	823	4	143	4	143	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	4337	junction_3	149.244765402342	33188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGTTGTCTGTCTTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130202530	130209252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_130202644_130206083_130206257_130207746_130207849_130208964
tx.13459	chr4	-	1547	7	NIC	ENSMUSG00000028772.20	novel	2113	8	NA	NA	-13	375	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	73	junction_5	86.0503728444373	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGACCGCTTTCCCTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130253749	130209696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_130210602_130220985_130221132_130223366_130223468_130230870_130230963_130232276_130232378_130247928_130248050_130253668
tx.13460	chr4	-	1582	8	FSM	ENSMUSG00000028772.20	ENSMUST00000134159.3	2113	8	-13	544	-13	352	multi-exon	FALSE	canonical	3	221	junction_6	38.5094740529747	422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATAAACCTTCTCTTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130253749	130209719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_130210602_130220985_130221132_130223366_130223468_130230870_130230963_130232276_130232378_130243057_130243116_130247928_130248050_130253668
tx.13461	chr4	+	1560	10	FSM	ENSMUSG00000074088.7	ENSMUST00000105994.4	1584	10	31	-7	-31	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	1067	junction_7	51.5407066738946	3338	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGTGACTTGGATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130253955	130283826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_130254143_130256420_130256551_130258867_130258962_130261981_130262148_130271838_130271962_130277186_130277308_130278274_130278358_130279746_130279809_130282367_130282472_130283336
tx.13462	chr4	-	576	2	Intergenic	novelGene_1035	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAACTGGAGAAGTCCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130362535	130359652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_130360111_130362417
tx.13463	chr4	+	470	2	ISM	ENSMUSG00000028580.16	ENSMUST00000122847.2	1273	4	0	49589	0	-49589	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	620	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACCAGGTAAAAAAAGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390676	130396603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_130390779_130396235
tx.13464	chr4	+	822	5	ISM	ENSMUSG00000028580.16	ENSMUST00000097864.9	4017	22	-19	60925	0	460	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	442	junction_3	74.8431693610045	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAGGATTTGTAAGTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390677	130446652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_130390779_130396235_130396610_130428352_130428422_130445464_130445574_130446483
tx.13465	chr4	-	1169	2	Intergenic	novelGene_1036	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGGGAAATTCCATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130587119	130576182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_130577056_130586823
tx.13466	chr4	+	2515	8	FSM	ENSMUSG00000028581.18	ENSMUST00000151698.8	2600	8	83	2	83	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	425	junction_4	26.2071808199702	267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGTCTCATGTGGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130640518	130663450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_130640746_130653415_130653510_130654081_130654159_130655947_130656074_130656730_130656854_130658081_130658178_130659327_130659421_130661771
tx.13467	chr4	+	1855	3	ISM	ENSMUSG00000028581.18	ENSMUST00000030316.7	1322	8	14835	-1061	-1248	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	468	junction_1	13	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGTCTCATGTGGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130658094	130663450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_130658178_130659327_130659421_130661771
tx.13468	chr4	+	1337	10	FSM	ENSMUSG00000028910.13	ENSMUST00000030742.11	1337	10	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_6	17.6243378301319	519	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCATGCGTGTGGAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131570780	131595097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_131570990_131581026_131581125_131581895_131582028_131585067_131585212_131588071_131588175_131589086_131589190_131590228_131590303_131592367_131592429_131592566_131592640_131594757
tx.13469	chr4	+	1504	2	ISM	ENSMUSG00000028911.17	ENSMUST00000030743.10	3100	6	14882	0	14882	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	361	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCACCGCGCTTGAATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131627400	131629017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_131627463_131627575
tx.13470	chr4	-	1207	4	FSM	ENSMUSG00000040025.18	ENSMUST00000085181.5	955	4	-21	-231	-7	231	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	419.072255769283	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCACTTAGTATTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131939423	131913369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_131914259_131938062_131938143_131938742_131938768_131939210
tx.13471	chr4	-	1508	2	ISM	ENSMUSG00000040025.18	ENSMUST00000102570.5	2536	4	7350	-686	6054	226	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	983	junction_1	0	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAGTACCACTTAGTATT	5108	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131932066	131913374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_131914259_131931442
tx.13472	chr4	-	2790	5	FSM	ENSMUSG00000040025.18	ENSMUST00000152796.8	4129	5	187	1152	-11	226	multi-exon	FALSE	canonical	3	863	junction_4	54.1589097009901	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAGTACCACTTAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131939427	131913374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_131914259_131931442_131933027_131938062_131938143_131938742_131938768_131939210
tx.13473	chr4	-	1752	4	ISM	ENSMUSG00000040025.18	ENSMUST00000152796.8	4129	5	188	19373	-10	-17535	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	863	junction_3	46.783187863448	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTGACCAACTCTAGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131939426	131931595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_131933027_131938062_131938143_131938742_131938768_131939210
tx.13474	chr4	-	1915	10	FSM	ENSMUSG00000028901.14	ENSMUST00000105964.2	1925	10	53	-43	-28	43	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_9	18.219511993573	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCGTTGTAACTGCAAATG	1965	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131988860	131952938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_131953774_131955182_131955306_131958296_131958435_131959322_131959455_131962059_131962218_131964421_131964526_131969635_131969761_131973296_131973380_131978985_131979144_131988801
tx.13475	chr4	+	1334	6	FSM	ENSMUSG00000028899.12	ENSMUST00000030731.11	3787	6	16	2437	16	617	multi-exon	FALSE	canonical	3	439	junction_3	32.7987804651331	944	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTAGTGTCCATAGGACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132001701	132020640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_132001799_132010104_132010357_132012354_132012433_132016625_132016741_132019173_132019263_132019937
tx.13476	chr4	-	758	2	FSM	ENSMUSG00000089687.3	ENSMUST00000040411.7	761	2	23	-20	23	20	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTAATACCAACAGTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132030673	132029487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132029994_132030421
tx.13477	chr4	+	608	5	FSM	ENSMUSG00000086290.10	ENSMUST00000153474.9	606	5	-2	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_1	27.427176303805	6048	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCTTTTTTATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132035986	132038335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_132036219_132037148_132037215_132037461_132037527_132037761_132037816_132038144
tx.13478	chr4	-	1100	9	FSM	ENSMUSG00000028898.16	ENSMUST00000030730.14	1130	9	30	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	451	junction_8	39.2324801663112	1148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGCTTCTTCAACTGTAT	2346	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132056819	132039073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132039318_132041303_132041338_132041515_132041679_132046765_132046886_132048989_132049122_132052518_132052572_132053256_132053357_132055779_132055878_132056663
tx.13479	chr4	-	383	3	FSM	ENSMUSG00000085241.8	ENSMUST00000152943.8	437	3	53	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	959	junction_1	21	10158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCTGTGATTTAATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132080944	132079244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132079555_132079973_132080010_132080907
tx.13480	chr4	-	787	2	ISM	ENSMUSG00000028896.14	ENSMUST00000155129.2	507	6	-28	14126	-28	-12458	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1001	junction_1	0	6912	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCATTTGAATGTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132080944	132079259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_132080010_132080907
tx.13481	chr4	-	682	3	ISM	ENSMUSG00000066043.14	ENSMUST00000152271.8	1029	6	-9	15593	-4	-9083	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_2	5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGGATGGTTGTGAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132149761	132113854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_132114377_132140380_132140435_132149655
tx.13482	chr4	-	1673	3	FSM	ENSMUSG00000066042.5	ENSMUST00000102567.4	1675	3	5	-3	5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_2	8.5	322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTGATTCTGATTCTTAC	1052	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132191227	132186038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132187425_132190175_132190320_132191084
tx.13483	chr4	-	3473	10	FSM	ENSMUSG00000028893.9	ENSMUST00000030724.9	3475	10	2	0	2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	666	junction_4	59.9637750728526	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTGCTAATGGGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132237810	132219342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132221114_132221774_132221920_132224195_132224387_132224682_132224802_132225263_132225415_132226247_132226461_132226555_132226739_132227076_132227275_132229873_132229940_132237374
tx.13484	chr4	-	2089	9	NNC	ENSMUSG00000028893.9	novel	3475	10	NA	NA	19	-4112	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	255.128276559067	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTATCTTGTTAAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132237793	132223454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_132224004_132224195_132224387_132224682_132224802_132225263_132225415_132226247_132226461_132226555_132226739_132227076_132227275_132229873_132229940_132237374
tx.13485	chr4	-	499	3	FSM	ENSMUSG00000054428.13	ENSMUST00000067496.7	539	3	36	4	-28	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	7869	junction_2	284	42628	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCCTGATGCCTTCTACT	9277	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132260934	132257869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132258135_132260606_132260699_132260792
tx.13486	chr4	+	1387	9	FSM	ENSMUSG00000054405.15	ENSMUST00000094657.10	1401	9	9	5	-8	-5	multi-exon	TRUE	canonical	3	2684	junction_8	233.065676097962	12154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGATGGTCTCCTCCT	2340	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132262869	132281048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_132262975_132265497_132265600_132269092_132269150_132271366_132271434_132271967_132272063_132273947_132274020_132277687_132277780_132278845_132278922_132280327
tx.13487	chr4	+	2543	17	FSM	ENSMUSG00000028886.16	ENSMUST00000081726.13	5160	17	-13	2630	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_15	5.48542101848163	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGAAGTTCTGTCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132366343	132449446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_132366467_132384003_132384100_132389205_132389250_132394465_132394546_132397499_132397567_132400206_132400344_132417015_132417102_132420272_132420457_132422057_132422195_132426340_132426425_132428331_132428422_132431662_132431722_132434273_132434435_132437255_132437371_132439152_132439275_132446522_132446624_132448589
tx.13488	chr4	-	1825	3	FSM	ENSMUSG00000037752.5	ENSMUST00000045550.5	4245	3	17	2403	-1	1206	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	6.5	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTATGTACCACTAAGTG	4061	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132459840	132454610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132455882_132458186_132458384_132459483
tx.13489	chr4	-	1623	3	FSM	ENSMUSG00000037752.5	ENSMUST00000150104.2	376	3	-41	-1206	-23	1206	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	21.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTATGTACCACTAAGTG	4021	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132459880	132454610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132455882_132458186_132458384_132459725
tx.13490	chr4	-	1939	8	FSM	ENSMUSG00000028885.9	ENSMUST00000030709.9	2006	8	62	5	62	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_5	8.56666534317997	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGCAACCGTGAGGGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132484501	132460281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132461071_132465329_132465464_132465547_132465729_132466939_132467113_132468698_132468843_132472398_132472497_132473788_132474003_132484295
tx.13491	chr4	+	235	2	ISM	ENSMUSG00000028884.15	ENSMUST00000130090.8	823	5	-37	5449	4	-3333	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1616	junction_1	0	246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACGTAGACTGACGGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132495649	132496097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_132495778_132495990
tx.13492	chr4	+	1540	9	FSM	ENSMUSG00000028884.15	ENSMUST00000102561.11	1813	9	4	269	4	-269	multi-exon	FALSE	canonical	3	1317	junction_7	93.1791788706039	3332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTTCTGAAATGTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132495649	132505794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_132495778_132495990_132496098_132497856_132497959_132499151_132499266_132501137_132501213_132502327_132502445_132503558_132503667_132503963_132504059_132505100
tx.13493	chr4	-	2003	7	FSM	ENSMUSG00000028882.14	ENSMUST00000030702.14	2037	7	34	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_6	9.9121138007995	650	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGGTATGGTCTTGAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132570446	132554239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132555518_132556683_132556749_132557935_132558081_132560207_132560429_132561947_132562102_132567954_132568016_132570367
tx.13494	chr4	-	1736	4	ISM	ENSMUSG00000028879.5	ENSMUST00000030698.5	2934	9	23881	563	2632	-563	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	194	junction_1	12.657891697365	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTAGTTATTTTTATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132587939	132581374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_132582870_132584610_132584694_132585729_132585803_132587854
tx.13495	chr4	-	2323	9	FSM	ENSMUSG00000028879.5	ENSMUST00000030698.5	2934	9	48	563	48	-563	multi-exon	FALSE	canonical	3	172	junction_5	25.18928343562	490	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTAGTTATTTTTATGAG	6141	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132611772	132581374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132582870_132584610_132584694_132585729_132585803_132587854_132587961_132590136_132590181_132590469_132590608_132595478_132595579_132598898_132598969_132611558
tx.13496	chr4	-	3023	9	FSM	ENSMUSG00000028878.12	ENSMUST00000030696.11	3053	9	28	2	28	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_4	24.0676130931175	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCATGTTGTGATTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132649841	132626525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132628620_132629313_132629416_132631208_132631345_132638002_132638090_132640979_132641138_132643429_132643583_132645032_132645088_132648037_132648103_132649668
tx.13497	chr4	-	1551	8	FSM	ENSMUSG00000028878.12	ENSMUST00000097856.10	1863	8	-45	357	20	-357	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	31.9367998345712	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAAAACAAACCCAGTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132649849	132627918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132628620_132629313_132629416_132631208_132631345_132640979_132641138_132643429_132643583_132645032_132645088_132648037_132648103_132649668
tx.13498	chr4	+	1059	2	ISM	ENSMUSG00000037692.15	ENSMUST00000105914.2	5898	6	26376	-394	-380	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132793179	132804947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_132793589_132804297
tx.13499	chr4	+	1068	6	ISM	ENSMUSG00000028868.14	ENSMUST00000084241.12	5642	9	37	9326	2	-119	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	442	junction_3	37.2236483972219	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGAGACTGCGATTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132857852	132917741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_132858040_132903751_132903924_132912279_132912415_132912909_132913064_132916388_132916507_132917439
tx.135	chr1	+	340	2	NNC	ENSMUSG00000104201.2	novel	425	2	NA	NA	-6	-51	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCTTTACTTATATGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36050146	36050924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_36050277_36050714
tx.13500	chr4	+	1867	9	FSM	ENSMUSG00000028868.14	ENSMUST00000084241.12	5642	9	37	3738	2	-486	multi-exon	FALSE	canonical	3	420	junction_8	37.0776212829248	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACCATATGCTTCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132857852	132923329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_132858040_132903751_132903924_132912279_132912415_132912909_132913064_132916388_132916507_132917439_132917571_132919415_132919572_132921706_132922219_132923027
tx.13501	chr4	+	761	5	ISM	ENSMUSG00000028868.14	ENSMUST00000084241.12	5642	9	42	10561	7	-1354	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	442	junction_3	36.1135362433534	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGGGGAAGGGACCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132857857	132916506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_132858040_132903751_132903924_132912279_132912415_132912909_132913064_132916388
tx.13502	chr4	+	924	6	FSM	ENSMUSG00000028865.15	ENSMUST00000105910.2	986	6	60	2	60	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	9.2736184954957	186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCCTGACCTATGTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132948180	132951864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_132948379_132948753_132948916_132949015_132949088_132949479_132949525_132950913_132951059_132951562
tx.13503	chr4	+	1291	5	NIC	ENSMUSG00000028865.15	novel	986	6	NA	NA	68	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	38	junction_4	6.80073525436772	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCCTGACCTATGTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132948188	132951864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_132948916_132949015_132949088_132949479_132949525_132950913_132951059_132951562
tx.13504	chr4	-	1588	7	FSM	ENSMUSG00000028857.17	ENSMUST00000134781.8	613	7	-133	-842	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_5	347.535609686259	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTGTCTGTCATTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133005062	132993355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132994233_132995506_132995638_132995719_132995817_132997088_132997121_132997980_132998126_132998273_132998359_133004841
tx.13505	chr4	-	1382	5	FSM	ENSMUSG00000028857.17	ENSMUST00000139030.2	546	5	-5	-831	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_4	309.884151740614	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTGTCTGTCATTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133005086	132993355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132994233_132995506_132995638_132995719_132995817_132997088_132997121_133004841
tx.13506	chr4	-	1470	6	FSM	ENSMUSG00000028857.17	ENSMUST00000105907.9	1484	6	14	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	666	junction_4	52.562343935559	1023	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTGTCTGTCATTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133005089	132993355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_132994233_132995506_132995638_132995719_132995817_132997088_132997121_132998273_132998359_133004841
tx.13507	chr4	+	644	3	Intergenic	novelGene_1039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	3	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTATTTCTAGAATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133238397	133239709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_133238502_133238583_133238667_133239252
tx.13508	chr4	+	1903	4	NIC	ENSMUSG00000037600.17	novel	1708	4	NA	NA	7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_1	23.3666428910958	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGCCTGGTCATCAGTT	5507	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133246309	133258101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_133246364_133255050_133256321_133257141_133257217_133257597
tx.13509	chr4	+	2279	3	FSM	ENSMUSG00000037600.17	ENSMUST00000121797.2	2256	3	-20	-3	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	22.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGCCTGGTCATCAGTT	5571	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133246373	133258101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_133246423_133255050_133256321_133257141
tx.13510	chr4	-	1312	8	FSM	ENSMUSG00000028851.7	ENSMUST00000030665.7	1316	8	2	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2323	junction_4	508.87928082108	13734	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGTGTCCCTCGTCTAG	4462	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133273305	133259854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133260111_133260505_133260625_133260716_133260801_133261538_133261854_133262820_133262887_133262978_133263183_133268449_133268528_133273115
tx.13511	chr4	+	1126	2	FSM	ENSMUSG00000037583.3	ENSMUST00000042706.3	1132	2	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTAGTTGCTTGTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133280692	133283847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_133281277_133283305
tx.13512	chr4	+	1226	6	ISM	ENSMUSG00000028850.3	ENSMUST00000030662.3	2004	7	3470	4	-1489	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_2	10.2567051239665	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGATCTGCCTTAGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133305525	133311550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_133305646_133307096_133307272_133307961_133308022_133309782_133309905_133310292_133310421_133310929
tx.13513	chr4	+	1100	5	ISM	ENSMUSG00000028850.3	ENSMUST00000030662.3	2004	7	5047	4	88	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	10.5593560409714	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGATCTGCCTTAGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133307102	133311550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_133307272_133307961_133308022_133309782_133309905_133310292_133310421_133310929
tx.13515	chr4	+	1358	5	FSM	ENSMUSG00000028848.14	ENSMUST00000030661.14	1367	5	8	1	8	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_3	14.7394029729837	611	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACGTTTTTTTAGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133311680	133319045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_133312181_133313220_133313378_133315810_133315972_133317077_133317209_133318636
tx.13516	chr4	-	1001	3	FSM	ENSMUSG00000043257.16	ENSMUST00000067902.13	990	3	16	-27	16	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_1	36	211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGTTGGTTTCTCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133399942	133389537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133390103_133397048_133397172_133399629
tx.13517	chr4	-	2097	4	FSM	ENSMUSG00000043257.16	ENSMUST00000062118.11	3979	4	18	1864	18	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_1	27.7248384425711	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTGTCTTCTTGTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133399940	133389561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133390103_133391968_133393091_133397048_133397172_133399629
tx.13518	chr4	-	858	2	NIC	ENSMUSG00000043257.16	novel	990	3	NA	NA	12	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTGTCTTCTTGTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133399946	133389561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_133390103_133399629
tx.13519	chr4	-	2136	3	ISM	ENSMUSG00000043257.16	ENSMUST00000062118.11	3979	4	25	3684	25	-1817	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_1	27.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGATGGGTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133399933	133391381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_133393091_133397048_133397172_133399629
tx.13520	chr4	-	899	3	FSM	ENSMUSG00000043257.16	ENSMUST00000151837.2	653	3	10	-256	10	256	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	56.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTCCAGCTGTAATGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133399948	133395811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133396269_133397048_133397172_133399629
tx.13521	chr4	-	477	3	Intergenic	novelGene_1040	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGGCTATTCACATATAT	4487	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133541471	133519170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_133519526_133532398_133532442_133541392
tx.13522	chr4	-	1025	2	ISM	ENSMUSG00000003644.18	ENSMUST00000157067.9	2637	20	23652	-535	12269	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1270	junction_1	0	442	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGCCCGCTCTTCCTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133575972	133574600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_133575486_133575832
tx.13523	chr4	-	1167	6	FSM	ENSMUSG00000003038.16	ENSMUST00000100472.10	881	6	-14	-272	1	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	1086.09951661899	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTGGAATGCTGCCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133695218	133692058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133692885_133693261_133693358_133693739_133693791_133694070_133694107_133694267_133694313_133695105
tx.13524	chr4	-	1168	6	FSM	ENSMUSG00000003038.16	ENSMUST00000102553.11	1265	6	88	9	-4	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	1307	junction_3	652.309558415328	2555	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGAATGCTGCCTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133695224	133692057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133692885_133693261_133693358_133693739_133693791_133694076_133694107_133694267_133694313_133695105
tx.13525	chr4	-	1654	9	FSM	ENSMUSG00000012117.14	ENSMUST00000144668.8	3219	9	19	1546	0	347	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_8	7.46554586081956	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGATAGGCAGCCAACATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133728182	133697884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133698565_133707434_133707543_133710110_133710226_133718589_133718692_133719774_133719892_133721472_133721616_133724132_133724250_133727579_133727705_133728035
tx.13526	chr4	-	3469	4	FSM	ENSMUSG00000050966.10	ENSMUST00000051674.3	3505	4	24	12	24	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_1	2.62466929133727	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTGGTACTGGTCTCTCT	8274	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133746128	133730652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133733633_133735221_133735407_133745363_133745561_133746021
tx.13527	chr4	+	1156	8	ISM	ENSMUSG00000012123.18	ENSMUST00000121391.8	4761	20	13850	2	-10	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_1	10.7532624380336	219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGCTGGTGGTCTCGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133809612	133819813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_133809759_133809885_133809999_133814796_133814927_133816103_133816244_133816582_133816707_133818388_133818548_133819360_133819521_133819629
tx.13528	chr4	+	1041	7	NIC	ENSMUSG00000012123.18	novel	4761	20	NA	NA	-8	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_1	39.282806530197	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGCTGGTGGTCTCGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133809614	133819813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_133809759_133814796_133814927_133816103_133816244_133816582_133816707_133818388_133818548_133819360_133819521_133819629
tx.13529	chr4	+	426	3	FSM	ENSMUSG00000012123.18	ENSMUST00000146102.2	650	3	340	-116	5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_1	3	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGCTGGTGGTCTCGTCT	1983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133818465	133819813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_133818548_133819360_133819521_133819629
tx.13530	chr4	+	1567	15	FSM	ENSMUSG00000012126.17	ENSMUST00000074690.11	1573	15	10	-4	10	4	multi-exon	TRUE	canonical	3	35	junction_2	24.8785827078437	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCACAAGGCTCTCCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133829903	133854091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_133829960_133835562_133835667_133836401_133836431_133836870_133836970_133839825_133839921_133840225_133840281_133840667_133840745_133843341_133843469_133850702_133850915_133851152_133851231_133852144_133852266_133852376_133852481_133853517_133853592_133853676_133853818_133853896
tx.13531	chr4	+	992	8	NNC	ENSMUSG00000012126.17	novel	685	3	NA	NA	-5374	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	29.7506645441127	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCACAAGGCTCTCCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133845405	133854091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_133845473_133850702_133850915_133851152_133851231_133852144_133852266_133852376_133852481_133853517_133853592_133853676_133853818_133853896
tx.13532	chr4	+	517	4	ISM	ENSMUSG00000012126.17	ENSMUST00000156323.8	1419	14	22448	-5	-864	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	8.48528137423857	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCACAAGGCTCTCCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133852373	133854091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_133852481_133853517_133853592_133853676_133853818_133853896
tx.13533	chr4	-	701	3	FSM	ENSMUSG00000028843.9	ENSMUST00000030651.9	743	3	38	4	-12	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1437	junction_2	42.5	9555	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGACTGCTTGTGGTGTCCG	9264	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133856062	133854720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133855118_133855228_133855397_133855926
tx.13534	chr4	-	3854	14	FSM	ENSMUSG00000037443.14	ENSMUST00000040271.12	3893	14	39	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_5	49.639648211447	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCGGTTTCCTAGTGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133914384	133857168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133858751_133859542_133859769_133861379_133861488_133864881_133864933_133866145_133866240_133875320_133875476_133875919_133876073_133879414_133879601_133881119_133881238_133881573_133881708_133882987_133883683_133894599_133894753_133900123_133900192_133914253
tx.13535	chr4	-	1854	9	ISM	ENSMUSG00000037443.14	ENSMUST00000040271.12	3893	14	78	18052	17	4335	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	365	junction_5	45.0692175991552	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTTTGTGTTCTTTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133914345	133875220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_133875476_133875919_133876073_133879414_133879601_133881119_133881238_133881573_133881708_133882987_133883683_133894599_133894753_133900123_133900192_133914253
tx.13536	chr4	-	761	4	ISM	ENSMUSG00000037443.14	ENSMUST00000040271.12	3893	14	39	26105	12	-62	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	365	junction_1	43.3615292883245	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCCCAACCCAAGACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133914384	133883273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_133883683_133894599_133894753_133900123_133900192_133914253
tx.13537	chr4	-	630	3	FSM	ENSMUSG00000028840.11	ENSMUST00000030644.8	1994	3	4	1360	4	-1342	multi-exon	FALSE	canonical	3	614	junction_2	27	6669	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGCACACCTCCGATACTAA	7672	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133972899	133971959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_133972242_133972335_133972399_133972614
tx.13538	chr4	+	599	2	NNC	ENSMUSG00000086322.8	novel	802	2	NA	NA	666	42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGAGAGGCCCGCCCGGGGG	3808	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133971959	133972905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_133972279_133972625
tx.13539	chr4	-	1688	3	FSM	ENSMUSG00000050890.16	ENSMUST00000105876.9	4509	3	0	2821	0	721	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	10	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTCATCTTCGTCCCTAC	4291	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134014564	134005134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_134006428_134011556_134011859_134014471
tx.13540	chr4	-	1086	2	FSM	ENSMUSG00000050890.16	ENSMUST00000142504.2	1039	2	-35	-12	-7	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAACAACAACGATGTTTA	4284	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134014571	134010872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_134011859_134014471
tx.13541	chr4	-	569	2	Intergenic	novelGene_1041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTTTGTCCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134071096	134059273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_134059436_134070689
tx.13542	chr4	+	2092	8	FSM	ENSMUSG00000028836.15	ENSMUST00000105874.9	3153	8	-32	1093	-7	205	multi-exon	FALSE	canonical	3	255	junction_4	12.5324069711207	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAGAGAGGTCAAACCATAA	2049	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134070484	134080702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_134070648_134071318_134071528_134073213_134073361_134074650_134074805_134075787_134075957_134076595_134076702_134079261_134079397_134079693
tx.13543	chr4	+	1603	7	FSM	ENSMUSG00000028836.15	ENSMUST00000081094.6	2023	7	172	248	172	-248	multi-exon	FALSE	canonical	3	255	junction_3	13.4587848221483	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGATCTGAGGCTATTTT	2756	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134071191	134080249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_134071528_134073213_134073361_134074650_134074805_134075787_134075957_134076595_134076702_134079261_134079397_134079693
tx.13544	chr4	+	772	2	ISM	ENSMUSG00000028836.15	ENSMUST00000081094.6	2023	7	8161	248	8161	-248	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	295	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAGATCTGAGGCTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134079180	134080249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_134079397_134079693
tx.13545	chr4	-	1158	2	Intergenic	novelGene_1042	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATGTAGTTGACACTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134163617	134160737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_134161794_134163515
tx.13546	chr4	-	754	2	Intergenic	novelGene_1043	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGGCTTGCATTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134163621	134161018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_134161667_134163515
tx.13547	chr4	-	337	2	Intergenic	novelGene_1044	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTCATATTTCTATTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134195476	134193997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_134194230_134195371
tx.13548	chr4	+	1009	5	FSM	ENSMUSG00000028832.12	ENSMUST00000030636.11	1060	5	47	4	-32	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	455	junction_1	251.409029273016	1969	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTTCTTTCTGTTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134195677	134201150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_134195741_134197413_134197487_134197977_134198151_134200114_134200307_134200642
tx.13549	chr4	+	2070	2	FSM	ENSMUSG00000037348.16	ENSMUST00000081525.4	2351	2	278	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTCTTTGTTTTGACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134224285	134236121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_134224348_134234113
tx.13550	chr4	+	1248	3	FSM	ENSMUSG00000078521.3	ENSMUST00000105866.3	1275	3	25	2	25	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	435	junction_2	7.5	1398	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGGTTGGTGTCGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134238334	134251236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_134238481_134248782_134248913_134250264
tx.13551	chr4	-	1896	7	NNC	ENSMUSG00000046671.19	novel	2025	7	NA	NA	0	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	55	junction_6	178.015604809117	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGAATTTTTTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134262569	134252872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_134253824_134256399_134256722_134257585_134257798_134257990_134258101_134259454_134259560_134259937_134260064_134262499
tx.13552	chr4	-	1828	6	ISM	ENSMUSG00000046671.19	ENSMUST00000102550.10	2025	7	2514	12	2290	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	505	junction_1	21.3297913726318	236	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGAATTTTTTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134260065	134252872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_134253824_134256399_134256722_134257585_134257798_134257990_134258101_134259454_134259560_134259937
tx.13553	chr4	-	2002	7	FSM	ENSMUSG00000046671.19	ENSMUST00000102550.10	2025	7	11	12	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_6	159.506530691797	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGAATTTTTTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134262568	134252872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_134253824_134256399_134256722_134257585_134257798_134257990_134258101_134259454_134259560_134259937_134260064_134262392
tx.13554	chr4	-	1878	7	FSM	ENSMUSG00000046671.19	ENSMUST00000116279.10	1969	7	86	5	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	259	junction_6	102.782402298361	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGAATTTTTTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134262612	134252872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_134253824_134256399_134256722_134257585_134257798_134257990_134258101_134259454_134259560_134259937_134260064_134262560
tx.13555	chr4	-	2667	9	FSM	ENSMUSG00000037295.8	ENSMUST00000037828.8	6549	9	25	3857	25	1165	multi-exon	TRUE	canonical	3	50	junction_1	8.8175960442742	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGAGTATTGCTGGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134495310	134472721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_134474511_134475592_134475628_134476647_134476779_134477269_134477354_134477692_134477766_134482503_134482619_134484651_134484765_134486229_134486373_134495126
tx.13556	chr4	+	1040	7	ISM	ENSMUSG00000028825.8	ENSMUST00000030627.8	1514	10	19404	0	4130	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_4	4.69041575982343	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACAAGGTCTCTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134611250	134623483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_134611488_134611829_134611994_134612560_134612699_134617612_134617741_134619533_134619614_134621644_134621719_134623264
tx.13557	chr4	-	1183	7	FSM	ENSMUSG00000028822.12	ENSMUST00000030626.12	1204	7	21	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	544	junction_1	61.5938759582116	3461	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTTTCTCGTTATACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134642314	134625159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_134625788_134628010_134628072_134630960_134631054_134632654_134632723_134636923_134637037_134640401_134640507_134642199
tx.13558	chr4	+	2123	3	ISM	ENSMUSG00000037266.19	ENSMUST00000148900.8	3051	4	736	299	-132	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	813	junction_1	50	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATGGATGTTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134651638	134654683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_134651794_134652603_134654130_134654241
tx.13559	chr4	+	635	3	ISM	ENSMUSG00000037266.19	ENSMUST00000078084.7	1749	5	1732	299	-122	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	162	junction_1	375.5	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATGGATGTTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134652634	134654683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_134652744_134654045_134654130_134654241
tx.13560	chr4	+	1937	2	ISM	ENSMUSG00000037266.19	ENSMUST00000148900.8	3051	4	1732	299	-122	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	913	junction_1	0	224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATGGATGTTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134652634	134654683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_134654130_134654241
tx.13561	chr4	+	1288	7	FSM	ENSMUSG00000028821.9	ENSMUST00000030622.3	1369	7	73	8	-39	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	670	junction_5	39.6628149390445	4044	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTCGAACAGTGTCTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134658281	134664851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_134658330_134658490_134658596_134661766_134661893_134662242_134662361_134662684_134662776_134663293_134663393_134664150
tx.13562	chr4	+	1241	6	ISM	ENSMUSG00000028821.9	ENSMUST00000030622.3	1369	7	281	8	169	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	670	junction_4	40.4899987651272	249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTCGAACAGTGTCTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134658489	134664851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_134658596_134661766_134661893_134662242_134662361_134662684_134662776_134663293_134663393_134664150
tx.13563	chr4	+	961	4	ISM	ENSMUSG00000028821.9	ENSMUST00000030622.3	1369	7	4082	8	3970	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	670	junction_2	19.4422220952236	1178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTCGAACAGTGTCTGTAA	3162	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134662290	134664851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_134662361_134662684_134662776_134663293_134663393_134664150
tx.13564	chr4	+	611	3	Intergenic	novelGene_1045	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	0.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCCGTTGTCATTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134697537	134710999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_134697650_134701540_134701704_134710663
tx.13565	chr4	-	332	3	Intergenic	novelGene_1047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGCCTTAGTCCTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134774182	134772987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_134773142_134773325_134773387_134774065
tx.13566	chr4	-	733	4	Intergenic	novelGene_1046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.63299316185545	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTGGTGGTGGAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134778966	134772864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_134773142_134773325_134773387_134778475_134778691_134778786
tx.13567	chr4	-	337	2	NNC	ENSMUSG00000086884.2	novel	276	2	NA	NA	556	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGACTCATTGTTGAAGCCC	6664	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134847202	134845531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_134845678_134847011
tx.13568	chr4	-	383	2	FSM	ENSMUSG00000086884.2	ENSMUST00000146152.2	276	2	-107	0	-107	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGACTCATTGTTGAAGCCC	6001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134847865	134845531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_134845678_134847628
tx.13569	chr4	-	4066	6	FSM	ENSMUSG00000037242.9	ENSMUST00000037099.9	4119	6	48	5	48	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1299	junction_1	75.0269284990396	218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAAGGATTCTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135000077	134941284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_134944577_134945818_134946001_134950774_134950882_134953334_134953461_134966172_134966283_134999828
tx.13570	chr4	-	874	3	FSM	ENSMUSG00000037242.9	ENSMUST00000143370.2	3093	3	47	2172	47	-2172	multi-exon	FALSE	canonical	3	1403	junction_1	52	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAAAGGCTGGGATCCGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135000078	134952946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_134953461_134966172_134966283_134999828
tx.13571	chr4	+	152	1	Intergenic	novelGene_1048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGCAGCTCTGAGAGAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135021912	135022064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_135021900_135022100
tx.13572	chr4	-	1161	2	ISM	ENSMUSG00000028809.17	ENSMUST00000084846.12	3740	18	30760	-2	2365	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1321	junction_1	0	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACATTGCCACTCACATTT	NA	False	NA	-78	True	NA	NA	NA	135049795	135047799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_135048766_135049600
tx.13573	chr4	-	862	7	ISM	ENSMUSG00000028809.17	ENSMUST00000030613.11	2940	17	-30	18915	-15	1463	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1177	junction_2	62.6285344977298	473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCGACCAAGATCTCGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135080477	135068258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_135068347_135069680_135069885_135071174_135071291_135071809_135071981_135074045_135074169_135074425_135074516_135080407
tx.13574	chr4	-	436	3	ISM	ENSMUSG00000028809.17	ENSMUST00000134019.2	1073	4	4	922	4	-922	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1232	junction_2	64	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTCACTTTGTAAAACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135080509	135073924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_135074169_135074425_135074516_135080407
tx.13575	chr4	-	805	5	ISM	ENSMUSG00000028809.17	ENSMUST00000131373.8	619	6	-19	1213	-10	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1232	junction_4	48.602983447521	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAAGCCAGATCATTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135080472	135070934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_135071291_135071809_135071981_135074045_135074169_135074425_135074516_135080407
tx.13576	chr4	+	394	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043924.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGCTACTATTGTTGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135095913	135098797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_135096077_135098566
tx.13577	chr4	-	1629	5	NNC	ENSMUSG00000043924.17	novel	1801	5	NA	NA	4130	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	9.09326673973661	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTTTTGTCACCTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135108826	135096886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_135098022_135099187_135099273_135104301_135104388_135107962_135108150_135108690
tx.13578	chr4	-	1842	5	FSM	ENSMUSG00000043924.17	ENSMUST00000105859.8	1801	5	-41	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	5.49431524395898	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTTTTGTCACCTTGCA	5688	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135125542	135096886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_135098022_135099187_135099273_135104301_135104388_135107962_135108150_135125193
tx.13579	chr4	-	917	5	NIC	ENSMUSG00000059713.13	novel	5111	5	NA	NA	53	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_1	31.244999599936	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCATTGAGCAGTCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135161081	135139618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_135139802_135145690_135145863_135147556_135147731_135152524_135152754_135160922
tx.13580	chr4	-	927	5	NIC	ENSMUSG00000059713.13	novel	5111	5	NA	NA	40	-6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_4	38.7774096607806	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTCAGCTCATTGAGCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135161094	135139624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_135139802_135145690_135145863_135147556_135147731_135152524_135152757_135160922
tx.13581	chr4	+	761	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000059713.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTCTCACGGTGGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135147537	135154703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_135147937_135154341
tx.13582	chr4	-	2166	12	FSM	ENSMUSG00000028803.19	ENSMUST00000102549.10	5153	12	87	2900	-30	94	multi-exon	FALSE	canonical	2	39	junction_10	9.94031776933574	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTTCCAGTCCTTAGAGAT	4275	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135221847	135179102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_135179884_135191096_135191192_135192998_135193063_135194157_135194247_135195816_135195953_135199195_135199293_135201634_135201781_135204743_135204804_135206846_135207019_135209782_135209852_135218243_135218594_135221740
tx.13583	chr4	-	954	5	ISM	ENSMUSG00000028803.19	ENSMUST00000102549.10	5153	12	14	28418	14	2250	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	39	junction_3	12.7156399760295	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAACCCAAGCCCAGCTACC	4202	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135221920	135204620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_135204804_135206846_135207019_135209782_135209852_135218243_135218594_135221740
tx.13584	chr4	+	1799	4	ISM	ENSMUSG00000028801.15	ENSMUST00000063707.3	2380	9	29231	99	29231	-99	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	4.02768199119819	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGGGTTCTTTGTGATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135252528	135265015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_135252843_135256802_135256969_135260949_135261141_135263887
tx.13585	chr4	+	1417	2	ISM	ENSMUSG00000028801.15	ENSMUST00000063707.3	2380	9	37554	99	37554	-99	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGGGTTCTTTGTGATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135260851	135265015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_135261141_135263887
tx.13586	chr4	-	1039	3	ISM	ENSMUSG00000037188.8	ENSMUST00000105855.2	2789	16	25130	0	25130	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	271	junction_1	2	795	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCGGTTTTCATGCGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135275811	135269198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_135270085_135273553_135273619_135275723
tx.13587	chr4	+	565	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037188.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	1.5	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGTTGCCTAACTTGTCA	345	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135272522	135274420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_135272579_135273574_135273632_135273968
tx.13588	chr4	+	340	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037188.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTCACGCCAGCTCCTG	855	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135273032	135274114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_135273170_135273574_135273632_135273968
tx.13589	chr4	+	2754	3	NNC	ENSMUSG00000086788.3	novel	2963	3	NA	NA	-8279	5	intron_retention	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGCAATCATTAAGAAAGGG	7885	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135345686	135357514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_135345812_135354175_135354357_135355066
tx.13590	chr4	+	2787	2	FSM	ENSMUSG00000086788.3	ENSMUST00000134416.2	1002	2	-67	-1718	52	5	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGCAATCATTAAGAAAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135354017	135357514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_135354357_135355066
tx.13591	chr4	+	950	5	NNC	ENSMUSG00000062157.7	novel	4182	7	NA	NA	171	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	11.5217186218029	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAATGTGCACGCAGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135413768	135435492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_135413911_135417832_135417957_135426100_135426283_135428538_135428682_135435133
tx.13592	chr4	+	500	3	FSM	ENSMUSG00000028676.18	ENSMUST00000129718.2	717	3	-21	238	-1	192	multi-exon	FALSE	canonical	3	381	junction_2	671.5	1438	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGCTGGAAGAAGGACA	4685	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135583421	135586304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_135583603_135585615_135585783_135586152
tx.13593	chr4	-	1890	3	FSM	ENSMUSG00000028675.13	ENSMUST00000030436.12	1919	3	21	8	21	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	336	junction_2	18.5	791	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCCTAGTACATTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135601140	135598236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_135599766_135600205_135600411_135600984
tx.13594	chr4	+	1500	8	FSM	ENSMUSG00000028673.11	ENSMUST00000030434.5	2525	8	3	1022	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	268	junction_1	34.7786000351964	483	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGTGGTCAATCTCCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135648048	135666600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_135648462_135650277_135650413_135652859_135652998_135657209_135657316_135660209_135660411_135662000_135662192_135664233_135664334_135666384
tx.13595	chr4	+	1402	9	FSM	ENSMUSG00000028672.14	ENSMUST00000030432.8	1418	9	12	4	-5	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	659	junction_3	79.965617611571	1146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATTCAAACGTGTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135673770	135689924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_135673852_135677860_135677945_135679681_135679790_135681167_135681264_135682897_135683047_135686033_135686098_135687287_135687477_135688093_135688220_135689419
tx.13596	chr4	+	634	2	FSM	ENSMUSG00000028672.14	ENSMUST00000135644.2	685	2	448	-397	448	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	678	junction_1	0	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACATTCAAACGTGTGTTTA	1615	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135688090	135689924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_135688220_135689419
tx.13597	chr4	+	1421	11	FSM	ENSMUSG00000028671.17	ENSMUST00000102541.10	1430	11	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_1	18.7712546197637	429	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAGATTCTCACAGATGGC	4571	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135691046	135695489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_135691100_135692644_135692768_135692876_135692993_135693313_135693428_135693680_135693858_135694123_135694238_135694322_135694390_135694481_135694568_135694662_135694741_135694899_135695015_135695111
tx.13598	chr4	+	1372	10	FSM	ENSMUSG00000028671.17	ENSMUST00000102540.2	1537	10	165	0	135	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_8	10.2318794961967	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAGATTCTCACAGATGGC	6165	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135692640	135695489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_135692768_135692876_135692993_135693313_135693428_135693680_135693858_135694123_135694238_135694322_135694390_135694481_135694568_135694662_135694741_135694899_135695015_135695111
tx.13599	chr4	+	479	2	ISM	ENSMUSG00000028671.17	ENSMUST00000102540.2	1537	10	2438	0	1984	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	165	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAGATTCTCACAGATGGC	8438	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135694913	135695489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_135695015_135695111
tx.136	chr1	-	608	2	Intergenic	novelGene_19	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGCTCATGGTTTCAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36346674	36343972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_36344378_36346471
tx.13600	chr4	-	1604	10	FSM	ENSMUSG00000028670.15	ENSMUST00000067567.5	1626	10	19	3	-4	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	407	junction_1	24.7476149243608	515	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGGGCTCCCTTATGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135699918	135695537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_135696379_135696454_135696629_135696738_135696841_135696911_135696986_135697113_135697185_135697269_135697318_135697764_135697831_135697918_135697951_135698170_135698277_135699828
tx.13601	chr4	-	1508	6	FSM	ENSMUSG00000028669.16	ENSMUST00000105851.9	1700	6	50	142	50	-142	multi-exon	FALSE	canonical	3	496	junction_4	31.7893063780888	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTGTCTTTTCTTCTGTG	2165	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135714525	135702912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_135703808_135704459_135704569_135706107_135706213_135713251_135713330_135713702_135713747_135714248
tx.13602	chr4	-	2714	11	FSM	ENSMUSG00000028668.6	ENSMUST00000030427.6	4708	11	69	1925	69	-1925	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_6	17.5182761709022	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCAGGGTTTTTTGTTTTT	7773	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135749005	135732603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_135732989_135733481_135733661_135734422_135734535_135735090_135735272_135736356_135736455_135736556_135736713_135737060_135737176_135737539_135738720_135740180_135740288_135741710_135741768_135748861
tx.13603	chr4	-	1344	4	ISM	ENSMUSG00000028668.6	ENSMUST00000030427.6	4708	11	41	7033	41	-7033	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_3	7.93025150224688	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGAAGGTTGTGAAAACGT	7745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135749033	135737711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_135738720_135740180_135740288_135741710_135741768_135748861
tx.13604	chr4	-	616	6	FSM	ENSMUSG00000059291.16	ENSMUST00000102536.11	833	6	1	216	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	383	junction_1	3915.89487090754	40890	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTACAGTTGTGTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135780703	135777257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_135777328_135777590_135777702_135778481_135778614_135778924_135779032_135779877_135780029_135780658
tx.13605	chr4	-	404	4	ISM	ENSMUSG00000059291.16	ENSMUST00000102536.11	833	6	20	1452	20	58	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	6976	junction_3	1859.5557414489	484	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTCTATGTGGTATGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135780684	135778493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_135778614_135778924_135779032_135779877_135780029_135780658
tx.13606	chr4	+	948	3	FSM	ENSMUSG00000007872.4	ENSMUST00000008016.3	1278	3	325	5	-42	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	1.5	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTGTATGACATCTTGC	730	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135871132	135872698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_135871490_135871604_135871688_135872190
tx.13607	chr4	+	1082	5	ISM	ENSMUSG00000036995.8	ENSMUST00000047526.8	4225	25	5	15307	5	-15307	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_2	3.35410196624968	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAACTCAGCCCTGAGAGG	1327	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135933680	135957220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_135933959_135954718_135954792_135954873_135955020_135955709_135955785_135956710
tx.13608	chr4	+	2677	11	FSM	ENSMUSG00000066037.15	ENSMUST00000148843.10	21452	11	6	18769	6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_1	138.01771625411	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCTATTTCAAATTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136038284	136067989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_136038401_136041397_136041567_136043671_136043791_136044394_136044503_136046704_136046819_136054546_136054724_136056676_136056813_136059708_136059915_136063608_136063759_136066486_136066609_136066729
tx.13609	chr4	+	2515	10	FSM	ENSMUSG00000066037.15	ENSMUST00000131671.8	2543	10	26	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_1	97.5394823509124	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACCTATTTCAAATTCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136038278	136067990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_136038401_136043671_136043791_136044394_136044503_136046704_136046819_136054546_136054724_136056676_136056813_136059708_136059915_136063608_136063759_136066486_136066609_136066729
tx.1361	chr10	+	2878	6	FSM	ENSMUSG00000019818.16	ENSMUST00000019962.15	2922	6	38	6	38	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1648	junction_4	8.82269800004511	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAAAGTGTCATATTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41395447	41407038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_41395697_41397913_41398004_41399168_41399241_41400102_41400142_41402822_41402880_41404667
tx.13610	chr4	+	2681	11	FSM	ENSMUSG00000066037.15	ENSMUST00000105850.8	2683	11	-1	3	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_1	130.381325349914	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCTATTTCAAATTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136038277	136067989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_136038401_136041400_136041567_136043671_136043791_136044394_136044503_136046704_136046819_136054546_136054724_136056676_136056813_136059708_136059915_136063608_136063759_136066486_136066609_136066729
tx.13611	chr4	+	1445	2	FSM	ENSMUSG00000001089.15	ENSMUST00000142248.2	418	2	-39	-988	3	988	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAGAAAGAAAGAAGT	4160	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136197074	136250009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_136197162_136248651
tx.13612	chr4	+	922	3	ISM	ENSMUSG00000001089.15	ENSMUST00000105849.9	7438	4	3	8232	3	420	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_2	41.5	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TGAGAAAATAATAAAAGAGC	4160	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136197074	136268398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_136197162_136248651_136248755_136267666
tx.13613	chr4	+	997	4	ISM	ENSMUSG00000001089.15	ENSMUST00000170102.8	7526	5	8	8240	8	408	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_3	52.8225541054408	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAGAAAGAAAATGAGAAAA	4165	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136197079	136268386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_136197162_136248651_136248755_136266435_136266528_136267666
tx.13614	chr4	-	600	2	FSM	ENSMUSG00000036940.16	ENSMUST00000171424.2	828	2	553	-325	553	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	1741	junction_1	0	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAAAATTTATTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136279300	136277862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_136278345_136279182
tx.13615	chr4	-	1450	9	ISM	ENSMUSG00000036940.16	ENSMUST00000046846.14	2051	17	43065	-296	2258	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1510	junction_6	132.620699741782	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAAAATTTATTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136286554	136277862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_136278345_136279182_136279330_136279771_136279900_136281106_136281222_136281523_136281712_136282483_136282617_136284952_136285065_136285808_136285883_136286483
tx.13616	chr4	+	624	3	Intergenic	novelGene_1049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGGCACTCACCCCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136794991	136841281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_136795118_136803996_136804179_136840965
tx.13617	chr4	-	2028	5	ISM	ENSMUSG00000006699.18	ENSMUST00000051477.13	2108	6	21589	7	21568	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1798	junction_1	43.0203440246588	2922	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTGAGCCTGAAGGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137063442	137047013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_137048504_137056023_137056222_137056325_137056436_137059717_137059791_137063285
tx.13618	chr4	-	2083	6	FSM	ENSMUSG00000006699.18	ENSMUST00000051477.13	2108	6	18	7	-3	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	1589	junction_5	116.347067002138	7782	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTGAGCCTGAAGGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137085013	137047013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_137048504_137056023_137056222_137056325_137056436_137059717_137059791_137063285_137063441_137084956
tx.13619	chr4	-	1445	6	FSM	ENSMUSG00000006699.18	ENSMUST00000030417.10	1448	6	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	708.103664727136	443	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCTGGTGAAGCTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137085007	137049072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_137049931_137056023_137056222_137056325_137056436_137059717_137059791_137063285_137063441_137084956
tx.13620	chr4	+	1407	10	ISM	ENSMUSG00000028763.19	ENSMUST00000030547.15	14187	97	6	58547	6	-16814	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	21	junction_4	6.76227735764575	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTGTGCCGTCCCTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137196085	137239394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_137196236_137228369_137228506_137229586_137229632_137235111_137235222_137235320_137235380_137235614_137235776_137237852_137237982_137238217_137238473_137238556_137238677_137239152
tx.13621	chr4	+	1115	8	ISM	ENSMUSG00000028763.19	ENSMUST00000171332.2	14176	97	33479	58546	-20177	-16814	internal_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	6.96346148968797	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTGTGCCGTCCCTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137229592	137239394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_137229632_137235111_137235222_137235320_137235380_137235614_137235776_137237852_137237982_137238217_137238473_137238556_137238677_137239152
tx.13622	chr4	+	399	2	ISM	ENSMUSG00000043411.16	ENSMUST00000153100.8	619	4	462	1287	10	-1287	internal_fragment	FALSE	canonical	3	1306	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACTGTGAGAGGAGGAAAA	580	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137321527	137331932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_137321828_137331833
tx.13623	chr4	+	3463	27	NIC	ENSMUSG00000043411.16	novel	5722	28	NA	NA	-4	12	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	584	junction_9	231.427832630339	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACGTGTTTCAGATTTTCT	587	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137321534	137383654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_137321828_137331833_137331955_137333062_137333220_137333999_137334128_137335368_137335494_137336308_137336418_137338000_137338135_137339016_137339100_137340992_137341173_137343026_137343153_137343668_137343819_137348372_137348571_137350584_137350700_137352470_137352599_137355484_137355557_137360424_137360550_137360653_137360777_137361143_137361206_137362208_137362320_137365070_137365202_137365466_137365574_137366516_137366622_137371653_137371810_137377603_137377730_137380268_137380318_137382533_137382561_137383432
tx.13624	chr4	-	694	3	NNC	ENSMUSG00000087476.2	novel	471	2	NA	NA	-751	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTGCCATGTGTATATC	3142	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137434668	137424284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_137424676_137433832_137433943_137434475
tx.13625	chr4	+	1943	10	ISM	ENSMUSG00000041351.17	ENSMUST00000097837.11	3168	23	12385	0	1035	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	83	junction_7	18.9326290948839	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGGAGTTAAGAACAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137447217	137457172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_137447308_137447604_137447743_137449136_137449269_137452002_137452113_137452860_137452975_137454262_137454387_137454987_137455091_137455570_137455675_137455838_137455880_137456185
tx.13626	chr4	+	1965	10	NIC	ENSMUSG00000041351.17	novel	3168	23	NA	NA	1044	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	35	junction_7	31.0304509939654	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGGAGTTAAGAACAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137447226	137457172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_137447308_137447604_137447743_137449136_137449269_137452002_137452113_137452860_137452975_137454262_137454387_137454987_137455091_137455539_137455675_137455838_137455880_137456185
tx.13627	chr4	+	1780	9	ISM	ENSMUSG00000041351.17	ENSMUST00000097837.11	3168	23	12845	0	1495	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_6	18.2512842013925	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGGAGTTAAGAACAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137447677	137457172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_137447743_137449136_137449269_137452002_137452113_137452860_137452975_137454262_137454387_137454987_137455091_137455570_137455675_137455838_137455880_137456185
tx.13628	chr4	-	2474	12	FSM	ENSMUSG00000028766.11	ENSMUST00000030551.11	2522	12	45	3	45	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1320	junction_11	106.491531498949	736	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGAGCTGAGTCTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137523650	137469046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_137470014_137470495_137470616_137470945_137471138_137473703_137473839_137475069_137475140_137476859_137477004_137479862_137480039_137481178_137481354_137482395_137482512_137482940_137483061_137485882_137486044_137523552
tx.13629	chr4	-	1624	6	ISM	ENSMUSG00000028766.11	ENSMUST00000030551.11	2522	12	46700	-1	-2537	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1473	junction_1	83.0262609058122	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTGAGTCTTTGTGGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137476995	137469042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_137470014_137470495_137470616_137470945_137471138_137473703_137473839_137475069_137475140_137476859
tx.13630	chr4	-	635	3	NNC	ENSMUSG00000085823.8	novel	714	2	NA	NA	-30	504	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_1	4.5	69	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCCCAGGGCTGGAACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137611278	137609176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_137609451_137610538_137610721_137611099
tx.13631	chr4	+	3106	12	FSM	ENSMUSG00000028759.14	ENSMUST00000097836.10	3113	12	-6	13	-5	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	20.9126479187884	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGCTTAGTGAAAAGTTTC	4559	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137943931	137970468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_137944052_137949399_137949500_137950800_137950961_137953199_137953360_137955954_137956099_137956990_137957069_137957674_137957827_137961553_137961645_137964458_137964619_137966847_137966960_137967931_137968049_137968756
tx.13632	chr4	+	1336	5	NNC	ENSMUSG00000028758.13	novel	3453	15	NA	NA	29686	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.87082869338697	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGCCCTTTCCCAACCCTCT	2145	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138019495	138029283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_138019657_138021022_138021282_138023502_138023574_138025516_138025638_138028559
tx.13633	chr4	+	1981	11	FSM	ENSMUSG00000028757.5	ENSMUST00000030538.5	2120	11	116	23	116	-23	multi-exon	FALSE	canonical	3	2240	junction_8	67.8427593778437	1030	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTTCACTGGCTCTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138032156	138039916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_138032350_138032465_138032577_138035553_138035641_138036660_138036765_138036900_138036996_138037494_138037589_138037913_138038063_138038151_138038300_138038720_138038842_138038950_138039058_138039144
tx.13634	chr4	+	1356	4	FSM	ENSMUSG00000041241.13	ENSMUST00000044058.11	3733	4	20	2357	14	897	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_3	1.24721912892465	878	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCAGTCCTCTCCGACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138162001	138167219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_138162191_138164938_138165027_138165552_138165674_138166261
tx.13635	chr4	+	669	3	Intergenic	novelGene_1051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_1	9.5	606	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCTATATCTTTTCTGA	4289	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138225890	138255983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_138226002_138226562_138226737_138255599
tx.13636	chr4	+	964	2	Intergenic	novelGene_1052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTGTGTAGTAGTAAATTA	8813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138259286	138260540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_138259476_138259765
tx.13637	chr4	-	608	2	NNC	ENSMUSG00000043621.14	novel	2460	4	NA	NA	13276	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGTTATTGTCCCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138438891	138437147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_138437638_138438773
tx.13638	chr4	+	1661	6	FSM	ENSMUSG00000028750.13	ENSMUST00000030530.6	1618	6	-39	-4	-39	4	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.01980390271856	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTCTGAAGTTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138452596	138471890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_138452800_138453041_138453169_138458834_138458936_138461572_138461718_138463292_138463397_138470909
tx.13639	chr4	-	2003	5	FSM	ENSMUSG00000041193.16	ENSMUST00000102512.11	1976	5	-24	-3	-22	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_2	9.4339811320566	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGGTGTATGCTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138546590	138526551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_138527973_138528662_138528770_138531817_138531963_138533495_138533546_138546310
tx.13640	chr4	-	2128	6	FSM	ENSMUSG00000041193.16	ENSMUST00000030524.14	2131	6	-2	5	-2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_2	8.52291030106501	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGAATTCACATGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138590782	138526564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_138527973_138528662_138528770_138531817_138531963_138533495_138533546_138546310_138546427_138590480
tx.13641	chr4	+	665	3	ISM	ENSMUSG00000028751.14	ENSMUST00000105804.2	786	4	975	0	975	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_2	2	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTTCCATTATTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138607645	138610128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_138607801_138607980_138608088_138609725
tx.13642	chr4	+	3062	17	FSM	ENSMUSG00000041143.17	ENSMUST00000050949.9	3318	17	256	0	252	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_1	8.00780868902348	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTAAGGGTTCTTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138700471	138786478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_138700599_138704518_138704634_138710931_138711077_138712442_138712562_138717852_138718032_138723708_138723884_138725334_138725363_138737779_138737913_138746883_138746982_138747356_138747501_138748169_138748290_138748931_138749097_138750241_138750379_138757139_138757225_138779811_138779930_138781210_138781329_138785422
tx.13643	chr4	+	1004	7	NIC	ENSMUSG00000041143.17	novel	2922	16	NA	NA	46667	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_6	23.954238780549	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCACAGGCCTGAGCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138746886	138763946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_138746982_138747356_138747501_138748169_138748290_138748931_138749097_138750241_138750379_138757139_138757225_138763688
tx.13644	chr4	+	1989	9	NNC	ENSMUSG00000041143.17	novel	3318	17	NA	NA	46746	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.3497411229385	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTAAGGGTTCTTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138746965	138786478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_138747012_138747356_138747501_138748169_138748290_138748931_138749097_138750241_138750379_138757139_138757225_138779811_138779930_138781210_138781329_138785422
tx.13645	chr4	+	925	6	NIC	ENSMUSG00000041143.17	novel	2922	16	NA	NA	47121	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_5	25.8812673569128	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCACAGGCCTGAGCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138747340	138763946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_138747501_138748169_138748290_138748931_138749097_138750241_138750379_138757139_138757225_138763688
tx.13646	chr4	-	507	4	FSM	ENSMUSG00000050608.12	ENSMUST00000143971.2	2549	4	74	1968	-45	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	2580	junction_1	67.4553350167518	34637	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATGCCTTTATTCCTTTA	5253	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138858350	138831092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_138831324_138832300_138832411_138833166_138833215_138858232
tx.13647	chr4	+	1646	9	FSM	ENSMUSG00000028745.19	ENSMUST00000102508.10	1674	9	28	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1402	junction_1	117.624136553685	6772	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGCGCTGGCTGTACGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138920237	139019129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_138920340_138966219_138966310_138984571_138984694_138989294_138989409_139007306_139007449_139007778_139007896_139014339_139014406_139015066_139015144_139018313
tx.13648	chr4	+	1535	8	ISM	ENSMUSG00000028745.19	ENSMUST00000042675.9	1604	9	5525	-25	5525	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1491	junction_5	92.5224738280668	361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGACACAATCGGCGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138966218	139019119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_138966310_138984571_138984694_138989294_138989409_139007306_139007449_139007778_139007896_139014339_139014406_139015066_139015144_139018313
tx.13649	chr4	+	1397	7	ISM	ENSMUSG00000028745.19	ENSMUST00000042675.9	1604	9	23935	-35	23935	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1491	junction_4	98.2982988436502	1763	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGCGCTGGCTGTACGTTC	916	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138984628	139019129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_138984694_138989294_138989409_139007306_139007449_139007778_139007896_139014339_139014406_139015066_139015144_139018313
tx.13650	chr4	-	1512	9	FSM	ENSMUSG00000028744.16	ENSMUST00000053862.12	1532	9	23	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_8	18.155147341732	437	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTTTCTGCTGCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139037996	139025835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_139026281_139027536_139027723_139028322_139028416_139028560_139028704_139029100_139029189_139029735_139029866_139033753_139034002_139035039_139035162_139037939
tx.13651	chr4	+	1285	7	FSM	ENSMUSG00000028743.8	ENSMUST00000073787.7	1288	7	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	253	junction_5	35.9787746070127	563	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCGTCTCCTCTGCTGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139038057	139045737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_139038388_139041414_139041603_139041777_139041883_139044020_139044118_139044244_139044345_139044880_139045011_139045402
tx.13652	chr4	-	1028	8	FSM	ENSMUSG00000028741.14	ENSMUST00000102503.10	1221	8	186	7	-79	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	786	junction_5	119.708489460771	6224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTCTTTCTTTTTTTTTTT	5882	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139079701	139074752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_139075117_139075231_139075309_139075631_139075784_139075992_139076061_139076316_139076399_139076924_139077029_139077746_139077806_139079579
tx.13653	chr4	+	607	3	ISM	ENSMUSG00000066036.15	ENSMUST00000165860.8	15798	106	104640	-3	4919	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	416	junction_2	4.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTCTAGCTGCTGCTTGC	5153	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139212609	139216844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_139212687_139213295_139213459_139216477
tx.13654	chr4	+	506	2	ISM	ENSMUSG00000066036.15	ENSMUST00000165860.8	15798	106	105350	-3	5629	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	416	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTCTAGCTGCTGCTTGC	5863	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139213319	139216844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_139213459_139216477
tx.13655	chr4	+	651	4	ISM	ENSMUSG00000028737.16	ENSMUST00000146309.8	4142	15	187	14677	-28	-581	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_3	4.49691252107735	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAGAGATAGAGATAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139350391	139362321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_139350509_139361025_139361120_139361207_139361301_139361974
tx.13656	chr4	+	3167	15	FSM	ENSMUSG00000028737.16	ENSMUST00000039818.10	3382	15	212	3	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_3	22.7807876447301	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATATTTTGATCGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139350388	139376998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_139350509_139361025_139361120_139361207_139361301_139361974_139362023_139362699_139362856_139364269_139364420_139364496_139364572_139365685_139365874_139367923_139367998_139369387_139369585_139369824_139369873_139370700_139370854_139371422_139371545_139372289_139372409_139375468
tx.13657	chr4	+	2599	10	ISM	ENSMUSG00000028737.16	ENSMUST00000039818.10	3382	15	14150	3	13907	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_1	21.4941852602047	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATATTTTGATCGTGTGT	719	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139364326	139376998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_139364420_139364496_139364572_139365685_139365874_139367923_139367998_139369387_139369585_139369824_139369873_139370700_139370854_139371422_139371545_139372289_139372409_139375468
tx.13658	chr4	+	2306	7	NNC	ENSMUSG00000028737.16	novel	4142	15	NA	NA	18725	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	14	junction_1	86.9471423081607	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTGATCGTGTGTGTCC	5537	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139369144	139377002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_139369278_139369387_139369585_139369824_139369873_139370700_139370854_139371422_139371545_139372289_139372409_139375468
tx.13659	chr4	-	1428	6	ISM	ENSMUSG00000040972.9	ENSMUST00000039331.9	1979	10	208959	1	208959	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_3	14.9184449591772	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTCTGGCCCTATATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139765136	139754157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_139754390_139755034_139755074_139755359_139755553_139756008_139756095_139761661_139762137_139764733
tx.13660	chr4	-	734	5	NNC	ENSMUSG00000040972.9	novel	1979	10	NA	NA	213791	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_4	38.4016601203646	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATGTCTGGCCCTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139760304	139754160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_139754390_139755034_139755074_139755359_139755553_139756008_139756095_139760117
tx.13661	chr4	-	1989	10	FSM	ENSMUSG00000040972.9	ENSMUST00000039331.9	1979	10	-16	6	-16	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_6	13.4421485642992	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCAATGTCTGGCCCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139974111	139754162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_139754390_139755034_139755074_139755359_139755553_139756008_139756095_139761661_139762137_139764733_139764850_139794447_139794567_139834565_139834688_139884771_139884885_139973612
tx.13662	chr4	-	1135	5	ISM	ENSMUSG00000040972.9	ENSMUST00000039331.9	1979	10	211845	5	211845	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_3	15.3195136998535	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAATGTCTGGCCCTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139762250	139754161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_139754390_139755034_139755074_139755359_139755553_139756008_139756095_139761661
tx.13663	chr4	+	384	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040972.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTTGGTCATGATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139764885	139773907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_139765048_139766927_139767019_139773776
tx.13664	chr4	-	583	2	Intergenic	novelGene_1054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTCTGTAGAATACGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139975920	139974222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_139974700_139975814
tx.13665	chr4	-	535	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087084.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACACTGGAGTCTGGGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140113285	140070171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_140070393_140112971
tx.13666	chr4	+	656	2	ISM	ENSMUSG00000087084.2	ENSMUST00000126252.2	1720	3	-169	3088	-169	-3088	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCCTTTTTTTGGCTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140107771	140109797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140108031_140109400
tx.13667	chr4	+	710	2	ISM	ENSMUSG00000086159.2	ENSMUST00000141469.2	1163	4	3433	1	3433	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAATTGGAGACACAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140410496	140411927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140410674_140411394
tx.13668	chr4	-	670	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000086159.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	2	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGAGGAGAGGTTGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140412329	140410725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_140411134_140411591_140411749_140412224
tx.13669	chr4	-	1133	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000086159.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGAGGAGAGGTTGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140412334	140410725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_140411749_140412224
tx.13670	chr4	+	920	6	ISM	ENSMUSG00000040945.14	ENSMUST00000038893.6	3767	13	14449	1750	1544	-1750	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3941	junction_4	449.365508244681	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTAAGTTGTATTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140443232	140448781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140443344_140444330_140444512_140444935_140445042_140445650_140445724_140447855_140447934_140448410
tx.13671	chr4	+	691	5	ISM	ENSMUSG00000040945.14	ENSMUST00000038893.6	3767	13	15665	1750	2760	-1750	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3941	junction_3	342.334175185593	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTAAGTTGTATTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140444448	140448781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140444512_140444935_140445042_140445650_140445724_140447855_140447934_140448410
tx.13672	chr4	+	628	4	ISM	ENSMUSG00000040945.14	ENSMUST00000038893.6	3767	13	16151	1751	3246	-1751	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3941	junction_2	287.305876491705	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTAAGTTGTATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140444934	140448780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140445042_140445650_140445724_140447855_140447934_140448410
tx.13673	chr4	+	493	3	ISM	ENSMUSG00000040945.14	ENSMUST00000038893.6	3767	13	16895	1751	3990	-1751	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3941	junction_1	345.5	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTAAGTTGTATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140445678	140448780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140445724_140447855_140447934_140448410
tx.13674	chr4	+	448	2	ISM	ENSMUSG00000040945.14	ENSMUST00000038893.6	3767	13	19071	1752	6166	-1752	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4632	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTAAGTTGTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140447854	140448779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140447934_140448410
tx.13675	chr4	-	902	4	ISM	ENSMUSG00000040935.13	ENSMUST00000038749.11	2333	16	11517	1	1917	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	19	junction_1	1.24721912892465	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTTTTACGCCGCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140458437	140454666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_140455121_140456177_140456340_140457019_140457091_140458222
tx.13676	chr4	-	1075	5	NNC	ENSMUSG00000025330.7	novel	2316	16	NA	NA	7320	185	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_4	47.4368000607124	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACCACGGCTGGCAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140477916	140472990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_140473669_140475396_140475538_140475768_140475837_140477659_140477763_140477831
tx.13677	chr4	-	1034	5	ISM	ENSMUSG00000025330.7	ENSMUST00000026381.7	2316	16	23616	-189	7305	189	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	76	junction_4	19.8415599185145	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACGGCTGGCAAGATGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140477931	140472986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_140473669_140475396_140475538_140475768_140475837_140477659_140477763_140477891
tx.13678	chr4	-	1094	4	ISM	ENSMUSG00000025330.7	ENSMUST00000026381.7	2316	16	23681	-185	7370	185	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	111	junction_1	6.94422221866655	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAACCACGGCTGGCAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140477866	140472990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_140473669_140475396_140475538_140475768_140475837_140477659
tx.13679	chr4	+	1246	2	NNC	ENSMUSG00000085918.2	novel	2001	3	NA	NA	3404	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	72	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGTGTATGGGTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140541707	140544821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_140542139_140544006
tx.13680	chr4	+	508	2	Intergenic	novelGene_1055	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGAAGACAGTGGGTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140593426	140594556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_140593543_140594164
tx.13681	chr4	+	1124	2	ISM	ENSMUSG00000028927.7	ENSMUST00000030765.7	4774	16	4	34092	4	-14293	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAGAAGAAGAAGGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140633658	140645805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140633861_140644883
tx.13682	chr4	+	962	8	FSM	ENSMUSG00000009863.15	ENSMUST00000010007.9	1142	8	180	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2820	junction_2	205.868890316143	18718	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGCGTTACTCTCCATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140688693	140706504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_140688788_140693805_140693940_140698447_140698534_140700193_140700331_140700974_140701092_140703425_140703528_140704688_140704812_140706335
tx.13683	chr4	+	713	3	ISM	ENSMUSG00000036622.16	ENSMUST00000037055.14	3956	29	19478	0	1934	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_1	23	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCGGCACTGGTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140733661	140734641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140733815_140733989_140734160_140734251
tx.13684	chr4	+	714	2	ISM	ENSMUSG00000036622.16	ENSMUST00000151517.8	4266	26	19625	0	2108	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCGGCACTGGTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140733835	140734641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140734160_140734251
tx.13685	chr4	-	1875	8	FSM	ENSMUSG00000028923.15	ENSMUST00000030760.15	1906	8	26	5	11	-5	multi-exon	TRUE	canonical	3	362	junction_3	45.6883855200484	849	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACATCTCAGATGGATATG	8511	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140805642	140793827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_140794924_140795505_140795591_140797366_140797545_140799839_140799949_140800818_140800901_140800985_140801091_140802270_140802372_140805523
tx.13686	chr4	+	786	5	ISM	ENSMUSG00000045004.4	ENSMUST00000051907.3	2526	15	18741	0	3089	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTGTACTGGATGTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140834384	140840071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140834527_140834637_140834756_140838578_140838755_140839290_140839475_140839905
tx.13687	chr4	-	931	4	FSM	ENSMUSG00000040842.18	ENSMUST00000148204.8	3202	4	-41	2312	-2	1254	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_2	172.554017307303	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTTCTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140867079	140842623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_140843176_140845837_140846090_140847634_140847685_140867002
tx.13688	chr4	-	881	3	FSM	ENSMUSG00000040842.18	ENSMUST00000039939.7	3200	3	7	2312	-2	1254	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_2	204	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTTCTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140867079	140842623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_140843176_140845837_140846090_140867002
tx.13689	chr4	-	884	3	FSM	ENSMUSG00000040842.18	ENSMUST00000094549.11	3203	3	7	2312	-2	1254	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_2	123	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTTCTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140867079	140842623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_140843176_140845837_140846093_140867002
tx.13690	chr4	-	934	4	FSM	ENSMUSG00000040842.18	ENSMUST00000102487.4	3244	4	-2	2312	-2	1254	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_2	126.792043213374	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTTCTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140867079	140842623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_140843176_140845837_140846093_140847634_140847685_140867002
tx.13691	chr4	+	2654	10	FSM	ENSMUSG00000028920.10	ENSMUST00000030757.10	5934	10	19	3261	10	-3261	multi-exon	FALSE	canonical	3	178	junction_2	13.4283650402542	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTGTGGTCTTAGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140875242	140928112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_140875491_140895023_140895289_140898134_140898252_140907708_140907844_140920975_140921130_140922491_140922603_140924793_140924891_140925352_140925410_140926240_140926358_140926759
tx.13692	chr4	+	493	2	ISM	ENSMUSG00000028920.10	ENSMUST00000030757.10	5934	10	37	36087	28	-27237	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	204	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTACACTTGTTTTAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140875260	140895286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140875491_140895023
tx.13693	chr4	+	1024	3	ISM	ENSMUSG00000028919.12	ENSMUST00000006618.9	3414	17	11836	0	7779	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_1	4.5	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCATGTAGCATCTGCTTC	4613	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140982015	140984875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140982092_140983614_140983720_140984032
tx.13694	chr4	+	487	2	FSM	ENSMUSG00000085395.2	ENSMUST00000142429.2	564	2	4	73	4	-73	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGGGACTTTTGGTATAGC	660	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141005753	141007032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_141005856_141006647
tx.13695	chr4	-	910	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085836.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAATTAAGTACTTTTAAA	6913	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141081306	141078151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_141078287_141078773_141078963_141080720
tx.13696	chr4	-	1294	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085836.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAATTAAGTACTTTTAA	7015	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141081204	141078152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_141078963_141080720
tx.13697	chr4	-	1287	6	ISM	ENSMUSG00000033770.14	ENSMUST00000105790.8	2511	19	8334	0	4957	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_5	1.6	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTGTTCACCCATCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141117181	141111920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141112260_141112587_141112675_141114383_141114468_141114599_141114689_141115444_141115579_141116627
tx.13698	chr4	-	888	6	ISM	ENSMUSG00000006216.11	ENSMUST00000006378.9	2370	20	7993	4	-2664	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_3	20.1454709550311	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTAGTGTCCCCTCTCC	4471	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141135332	141131667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141131944_141132063_141132151_141132362_141132447_141132582_141132672_141134399_141134534_141135114
tx.13699	chr4	-	628	3	NIC	ENSMUSG00000006216.11	novel	2370	20	NA	NA	-2664	-4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_1	62	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTAGTGTCCCCTCTCC	4471	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141135332	141131667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_141131944_141134399_141134534_141135114
tx.137	chr1	-	2202	2	FSM	ENSMUSG00000010453.13	ENSMUST00000185614.2	2177	2	3	-28	1	28	multi-exon	TRUE	canonical	3	130	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACAAAAAAAACAAAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36408235	36404963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_36407116_36408185
tx.13700	chr4	-	912	7	NNC	ENSMUSG00000006216.11	novel	2370	20	NA	NA	-2953	-4	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	12	junction_6	35.5387112878337	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTAGTGTCCCCTCTCC	4182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141135621	141131667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_141131944_141132063_141132151_141132362_141132447_141132582_141132672_141134399_141134534_141135114_141135329_141135593
tx.13701	chr4	-	919	7	ISM	ENSMUSG00000006216.11	ENSMUST00000006378.9	2370	20	7674	4	-2983	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_6	23.8146780135464	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTAGTGTCCCCTCTCC	4152	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141135651	141131667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141131944_141132063_141132151_141132362_141132447_141132582_141132672_141134399_141134534_141135114_141135329_141135616
tx.13702	chr4	+	2026	3	NNC	ENSMUSG00000006221.8	novel	2769	3	NA	NA	751	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTGGAGACCCCACCTGA	899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141148840	141152626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_141149296_141149811_141149946_141151189
tx.13703	chr4	-	795	2	FSM	ENSMUSG00000070637.3	ENSMUST00000094544.3	905	2	-2	112	-2	-112	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCGTCCCCCCTTCCCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141163418	141160094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_141160768_141163296
tx.13704	chr4	-	732	2	NNC	ENSMUSG00000070637.3	novel	905	2	NA	NA	688	-230	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTATGCCTCTGTCCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141162728	141160212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_141160768_141162551
tx.13705	chr4	+	500	2	ISM	ENSMUSG00000006215.13	ENSMUST00000144899.2	338	3	-34	11710	-12	-11710	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_1	0	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCCAAGAAAAATCCTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141171982	141174930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_141172114_141174561
tx.13706	chr4	+	2699	16	FSM	ENSMUSG00000006215.13	ENSMUST00000006377.13	2722	16	27	-4	-3	4	multi-exon	TRUE	canonical	3	129	junction_3	19.5436832648187	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTGGTCCCTGTGTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141171991	141194540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_141172114_141174561_141174649_141189079_141189287_141189845_141190035_141190577_141190719_141190983_141191107_141191547_141191790_141191870_141192014_141192099_141192401_141192659_141192748_141192834_141192952_141193032_141193154_141193287_141193419_141193658_141193869_141193984_141194075_141194153
tx.13707	chr4	+	658	3	ISM	ENSMUSG00000006215.13	ENSMUST00000130482.2	867	7	962	-160	962	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	182	junction_1	5.5	286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTGGTCCCTGTGTCAC	15	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141193687	141194540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_141193869_141193984_141194075_141194153
tx.13708	chr4	-	2962	8	ISM	ENSMUSG00000006219.13	ENSMUST00000006381.11	3101	9	2273	0	518	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1168	junction_5	184.331002187226	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTCTTGTTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141323262	141303372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141305255_141308293_141308412_141310364_141310544_141312006_141312177_141316608_141316727_141317254_141317437_141322534_141322791_141323205
tx.13709	chr4	-	3014	9	FSM	ENSMUSG00000006219.13	ENSMUST00000105784.8	3036	9	22	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1168	junction_5	205.258944689385	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTCTTGTTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141327213	141303372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_141305255_141308293_141308412_141310364_141310544_141312006_141312177_141316608_141316727_141317254_141317437_141322534_141322791_141323205_141323260_141327158
tx.13710	chr4	-	3006	9	NIC	ENSMUSG00000006219.13	novel	3101	9	NA	NA	40	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	77	junction_8	503.602134005606	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTCTTGTTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141327303	141303372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_141305255_141308293_141308412_141310364_141310544_141312006_141312177_141316608_141316727_141317254_141317437_141322534_141322791_141323205_141323260_141327256
tx.13711	chr4	-	3082	9	NIC	ENSMUSG00000006219.13	novel	3101	9	NA	NA	-12	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	77	junction_8	503.602134005606	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTCTTGTTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141325547	141303372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_141305255_141308293_141308412_141310364_141310544_141312006_141312177_141316608_141316727_141317254_141317437_141322534_141322791_141323205_141323260_141325424
tx.13712	chr4	-	2901	7	ISM	ENSMUSG00000006219.13	ENSMUST00000006381.11	3101	9	2742	7	987	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1168	junction_5	178.87394692601	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTCCTTGTGTCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141322793	141303379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141305255_141308293_141308412_141310364_141310544_141312006_141312177_141316608_141316727_141317254_141317437_141322534
tx.13713	chr4	-	2600	9	NIC	ENSMUSG00000006219.13	novel	3101	9	NA	NA	-56	-659	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	7	junction_8	525.413036929043	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGAGGTAGCGGCGACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141325591	141304031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_141305255_141308293_141308412_141310364_141310544_141312006_141312177_141316608_141316727_141317254_141317437_141322534_141322791_141323205_141323260_141325291
tx.13714	chr4	-	1296	2	ISM	ENSMUSG00000043085.15	ENSMUST00000156246.2	2478	5	2215	-4	2215	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCGTTGAGGATCACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141343077	141341543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141342018_141342255
tx.13715	chr4	-	1481	6	FSM	ENSMUSG00000043085.15	ENSMUST00000053263.9	1671	6	190	0	-67	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_2	22.4535075210979	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCGTTGAGGATCACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141345359	141341543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_141342018_141342255_141342447_141343514_141343933_141344605_141344781_141344950_141345024_141345209
tx.13716	chr4	-	1304	3	NIC	ENSMUSG00000043085.15	novel	2478	5	NA	NA	-102	-2187	intron_retention	FALSE	canonical	3	109	junction_2	2.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCACAGCAGCCAGCGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141345394	141343734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_141344781_141344950_141345024_141345209
tx.13717	chr4	-	2130	2	ISM	ENSMUSG00000078515.5	ENSMUST00000177592.2	3539	10	34088	1	34088	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	233	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCATTTTAGAATGAGTGA	8943	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141416642	141410874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141412943_141416580
tx.13718	chr4	+	1404	7	FSM	ENSMUSG00000040706.5	ENSMUST00000038161.5	1407	7	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	1.49071198499986	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGCCTGTGGAGTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141473985	141486574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_141474411_141476885_141477089_141482135_141482185_141483109_141483306_141484696_141484877_141485649_141485735_141486308
tx.13719	chr4	-	2492	6	ISM	ENSMUSG00000040697.11	ENSMUST00000038014.11	5969	15	22842	1801	6604	-1801	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_4	2.57681974534502	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCCAGGCTTCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141495360	141489300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141491206_141491878_141492050_141493794_141493894_141493972_141494054_141495018_141495096_141495201
tx.13720	chr4	-	3965	15	FSM	ENSMUSG00000040697.11	ENSMUST00000038014.11	5969	15	205	1799	205	-1799	multi-exon	TRUE	canonical	3	44	junction_12	6.2974727681274	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCAGGCTTCATTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141517997	141489298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_141491206_141491878_141492050_141493794_141493894_141493972_141494054_141495018_141495096_141495201_141495385_141497163_141497348_141498217_141498349_141501811_141501971_141502676_141502782_141504205_141504391_141510083_141510418_141511998_141512066_141516199_141516385_141517900
tx.13721	chr4	-	1495	4	ISM	ENSMUSG00000040697.11	ENSMUST00000038014.11	5969	15	22842	5216	6604	4671	internal_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_2	3.29983164553722	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141495360	141492715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141493894_141493972_141494054_141495018_141495096_141495201
tx.13722	chr4	+	2078	9	FSM	ENSMUSG00000028914.14	ENSMUST00000030747.11	3897	9	193	1626	-39	663	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_8	15.5060472074607	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGCCTGTATTGTCCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141521115	141541661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_141521298_141523745_141524146_141531131_141531167_141532672_141532850_141533140_141533231_141534425_141534574_141538849_141539030_141539517_141539628_141540905
tx.13723	chr4	+	2144	9	NIC	ENSMUSG00000028914.14	novel	3897	9	NA	NA	21	658	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_1	54.6601717432355	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTATTTAGCCTGTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141521041	141541656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_141521298_141523748_141524146_141531131_141531167_141532672_141532850_141533140_141533231_141534425_141534574_141538849_141539030_141539517_141539628_141540905
tx.13724	chr4	+	3667	8	NNC	ENSMUSG00000028914.14	novel	3897	9	NA	NA	-17	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	64.3117407632541	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGATTGTTGAAGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141521137	141543267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_141521298_141523745_141524168_141532654_141532850_141533140_141533231_141534425_141534574_141538849_141539030_141539517_141539628_141540905
tx.13725	chr4	+	1467	9	NNC	ENSMUSG00000028914.14	novel	3897	9	NA	NA	-17	2322	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	6	junction_8	62.3326509543754	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGCCTTTTATGTAGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141521137	141545609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_141521298_141523745_141524146_141531131_141531167_141532672_141532850_141533140_141533231_141534425_141534574_141538849_141539030_141539517_141539628_141545442
tx.13726	chr4	+	3658	8	NNC	ENSMUSG00000028914.14	novel	3897	9	NA	NA	-11	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	76.9794565757247	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGATTGTTGAAGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141521143	141543267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_141521298_141523748_141524168_141532654_141532850_141533140_141533231_141534425_141534574_141538849_141539030_141539517_141539628_141540905
tx.13727	chr4	+	1393	6	ISM	ENSMUSG00000028914.14	ENSMUST00000030747.11	3897	9	11818	1626	-9328	663	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	161	junction_5	12.7027556065603	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGCCTGTATTGTCCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141532740	141541661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_141532850_141533140_141533231_141534425_141534574_141538849_141539030_141539517_141539628_141540905
tx.13728	chr4	-	618	3	FSM	ENSMUSG00000058579.6	ENSMUST00000127962.2	468	3	-150	0	-150	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_1	12.5	623	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGAATGAGTCTGTCTT	385	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141546663	141542272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_141542367_141545175_141545329_141546292
tx.13729	chr4	-	885	6	NNC	ENSMUSG00000062478.18	novel	784	7	NA	NA	994	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGAGTACATTTATTTA	9847	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141571545	141565549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_141565626_141565963_141566117_141567561_141567708_141568807_141568945_141570981_141571108_141571298
tx.13730	chr4	-	1820	3	ISM	ENSMUSG00000040659.4	ENSMUST00000036854.4	2381	4	12978	190	12978	-190	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	474	junction_2	38.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTGTGGTTTTTGATG	8984	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141589253	141585642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141587190_141587858_141587994_141589115
tx.13731	chr4	-	416	2	ISM	ENSMUSG00000040659.4	ENSMUST00000036854.4	2381	4	14236	1458	14236	-1458	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	551	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCAGGAGTCTCCTCGG	7953	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141587995	141586910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141587190_141587858
tx.13732	chr4	+	635	2	FSM	ENSMUSG00000085761.2	ENSMUST00000126231.2	630	2	-1	-4	-1	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGTAAAGTTCTGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141745207	141756311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_141745442_141755910
tx.13733	chr4	-	1299	2	ISM	ENSMUSG00000040616.4	ENSMUST00000036572.4	1875	3	46704	0	46704	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_1	0	514	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTGACCTCATTCAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141764911	141758302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141759406_141764715
tx.13734	chr4	-	1820	3	FSM	ENSMUSG00000040616.4	ENSMUST00000036572.4	1875	3	55	0	55	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_2	4	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTGACCTCATTCAGTCA	9855	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141811560	141758302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_141759406_141764715_141765245_141811372
tx.13735	chr4	-	1844	3	NNC	ENSMUSG00000040616.4	novel	1875	3	NA	NA	-392	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_2	75.5	48	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTGACCTCATTCAGTCA	9808	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141812007	141758302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_141759406_141764715_141765245_141811795
tx.13736	chr4	+	1303	4	NNC	ENSMUSG00000073728.11	novel	675	4	NA	NA	-22	22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.24933858267454	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCATCTATTGCCACTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141811586	141815432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_141812286_141812991_141813047_141813690_141813870_141815062
tx.13737	chr4	+	611	3	NNC	ENSMUSG00000073728.11	novel	675	4	NA	NA	817	21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCATCTATTGCCACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141812983	141815431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_141813047_141813690_141813870_141815062
tx.13738	chr4	-	2609	2	FSM	ENSMUSG00000040606.15	ENSMUST00000148812.2	5725	2	3120	-4	3120	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAATTCTATGTGATTTGA	4660	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141870656	141866550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_141869108_141870604
tx.13739	chr4	-	1305	4	ISM	ENSMUSG00000028583.15	ENSMUST00000030317.14	1817	6	25507	0	25406	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	463	junction_2	12.0277457017791	663	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGCCAACATTTGACACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143000627	142994000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_142994997_142995757_142995870_142997092_142997132_143000469
tx.13740	chr4	-	1760	6	FSM	ENSMUSG00000028583.15	ENSMUST00000030317.14	1817	6	57	0	-44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	463	junction_2	58.6153563496802	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGCCAACATTTGACACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143026077	142994000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_142994997_142995757_142995870_142997092_142997132_143000469_143000627_143002640_143002778_143025758
tx.13741	chr4	+	3523	4	FSM	ENSMUSG00000046862.15	ENSMUST00000037356.8	3260	4	-266	3	-251	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	39.6316371938716	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACCTCTGTTTCACTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143139290	143147658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_143139662_143143209_143143523_143143942_143144531_143145407
tx.13742	chr4	+	2190	4	NNC	ENSMUSG00000070618.11	novel	2095	4	NA	NA	-4871	18	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATTGTTATGTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143289173	143300386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_143289289_143297554_143297869_143298345_143298937_143299216
tx.13743	chr4	+	896	2	Intergenic	novelGene_1058	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCAGCTACAATCAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143714446	143715401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_143715073_143715131
tx.13744	chr4	-	3083	3	FSM	ENSMUSG00000078509.2	ENSMUST00000105762.2	1753	3	-547	-783	-547	783	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	7.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTGAGTATTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143721486	143716905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_143718582_143719503_143720077_143720652
tx.13745	chr4	+	2623	4	NNC	ENSMUSG00000078508.2	novel	1745	3	NA	NA	-3259	784	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	26	junction_1	5.90668171555645	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTGAGTATTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144053559	144060819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_144053628_144056792_144057106_144057681_144058255_144059150
tx.13746	chr4	+	2498	3	FSM	ENSMUSG00000078508.2	ENSMUST00000105751.2	1745	3	31	-784	31	784	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTGAGTATTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144056849	144060819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_144057106_144057681_144058255_144059150
tx.13747	chr4	+	2129	4	FSM	ENSMUSG00000070619.6	ENSMUST00000094526.5	2094	4	-26	-9	-26	9	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_3	3.09120616516523	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTTTTGTTATTTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144084485	144090998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_144084551_144088178_144088493_144088970_144089562_144089839
tx.13748	chr4	-	2430	4	FSM	ENSMUSG00000028591.12	ENSMUST00000030326.10	2460	4	29	1	-18	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_3	9.80929264637478	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGTTGTTGGTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144135005	144118244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_144119688_144121144_144121730_144122249_144122573_144134926
tx.13749	chr4	+	521	2	NNC	ENSMUSG00000028590.7	novel	767	2	NA	NA	-791	8	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	7	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAATGTTGGTATTCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144130646	144132879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_144130877_144132588
tx.13750	chr4	+	1356	6	FSM	ENSMUSG00000066026.15	ENSMUST00000154208.8	2337	6	414	567	272	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_1	25.4982352330509	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCCTTCGTTCACGTGTT	6360	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144620060	144654212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_144620280_144645220_144645365_144645954_144646075_144646410_144646650_144650475_144650602_144653704
tx.13751	chr4	-	339	3	Intergenic	novelGene_1059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCTGTGTCTAAGAAGAAG	6877	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144991458	144987188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_144987298_144988062_144988174_144991339
tx.13752	chr4	+	2438	3	FSM	ENSMUSG00000085101.8	ENSMUST00000150529.2	545	3	16	-1909	16	1909	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_2	10.5	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGCTTTGGTTGTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145136851	145178235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_145136997_145138756_145138851_145176036
tx.13753	chr4	+	2344	2	Fusion	ENSMUSG00000082082.2_ENSMUSG00000085101.8	novel	375	3	NA	NA	-14303	777	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	0	116	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGCTTTGGTTGTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145159006	145178235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr4_+_145159152_145176036
tx.13754	chr4	+	978	2	Fusion	ENSMUSG00000082352.2_ENSMUSG00000078503.10	novel	3044	5	NA	NA	-20	94	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	298	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGTAAGATTTGTTTTT	4999	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145241433	145301825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr4_+_145241589_145301002
tx.13755	chr4	-	446	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084279.2	novel	632	1	NA	NA	-14886	372	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACATCATGAAGTTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145471668	145455778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_145456204_145471647
tx.13756	chr4	+	306	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094417.2	novel	565	1	NA	NA	-85	14248	multi-exon	FALSE	canonical	3	220	junction_1	12	452	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTTCTTCTCTGGTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145501203	145516101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_145501361_145510590_145510684_145516045
tx.13757	chr4	+	324	3	Intergenic	novelGene_1060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	244	junction_2	92.5	1658	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTGCTGTTCACATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145508062	145516129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_145508210_145510590_145510684_145516045
tx.13758	chr4	+	705	6	NNC	ENSMUSG00000084350.2	novel	2413	3	NA	NA	-43743	-2021	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_4	163.313930820368	668	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTCTGTAAACAGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145508063	145554491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_145508210_145510590_145510684_145541336_145541383_145551778_145551837_145552678_145552806_145554256
tx.13759	chr4	+	322	3	FSM	ENSMUSG00000085525.8	ENSMUST00000144166.8	326	3	6	-2	6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	253	junction_2	93	1682	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTGCTGTTCACATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146206906	146215006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_146207052_146209452_146209546_146214922
tx.1376	chr10	+	1214	4	FSM	ENSMUSG00000019804.13	ENSMUST00000019939.12	1401	4	187	0	-72	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2006	junction_3	141.176800108548	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTGTGTGCTCTGGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42378213	42411366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_42378489_42401949_42402046_42409144_42409270_42410648
tx.13760	chr4	+	705	6	NNC	ENSMUSG00000070605.5	novel	4550	4	NA	NA	-33253	-4077	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	35	junction_4	272.465337244942	2883	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTCTGTAAACAGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146500226	146550672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_146500373_146502756_146502850_146533486_146533533_146547961_146548020_146548860_146548988_146550437
tx.13761	chr4	+	611	5	NNC	ENSMUSG00000070605.5	novel	4550	4	NA	NA	-16639	-4077	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	35	junction_3	291.29827926028	6119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTCTGTAAACAGTTTAA	1855	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146516840	146550672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_146516986_146533486_146533533_146547961_146548020_146548860_146548988_146550437
tx.13762	chr4	+	634	5	NNC	ENSMUSG00000070605.5	novel	4550	4	NA	NA	-16639	-4077	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	35	junction_3	299.080674735095	2715	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTCTGTAAACAGTTTAA	1855	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146516840	146550672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_146516986_146533486_146533556_146547961_146548020_146548860_146548988_146550437
tx.13763	chr4	+	4382	5	Fusion	ENSMUSG00000056300.15_ENSMUSG00000063245.12	novel	578	4	NA	NA	-3	63387	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	192.39201516695	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGGTTGACTTGGCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146599373	146806004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr4_+_146599500_146697966_146698060_146797298_146797381_146800390_146800518_146802050
tx.13764	chr4	+	326	3	NNC	ENSMUSG00000063245.12	novel	1275	6	NA	NA	20	-38371	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	119	junction_2	137	996	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTGCTGTTCACATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146695437	146703693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_146695586_146697966_146698060_146703608
tx.13765	chr4	+	1204	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000093919.2	novel	648	1	NA	NA	-347	14087	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACTGTGAAAATTCTCTG	3665	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147016851	147031933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_147017366_147031243
tx.13767	chr4	-	2583	5	FSM	ENSMUSG00000066000.13	ENSMUST00000037565.14	2558	5	-23	-2	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_4	194.56666595283	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGACTTGCTTGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147726988	147696393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_147698506_147699736_147699864_147702873_147702956_147725368_147725463_147726820
tx.13768	chr4	+	2125	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000070583.2	novel	1380	1	NA	NA	-156	1885	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAATATATTCACATATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147953279	147956700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_147953605_147954900
tx.13769	chr4	-	2894	19	FSM	ENSMUSG00000019055.16	ENSMUST00000019199.14	3243	19	42	307	0	-307	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_3	12.7855049099544	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATGAGAGATGCCTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148021182	147994516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_147995332_147997676_147997803_148000253_148000401_148001761_148001867_148002590_148002657_148003236_148003351_148004625_148004768_148005463_148005590_148005854_148005960_148007580_148007703_148009973_148010106_148010603_148010706_148011479_148011578_148012914_148012979_148013996_148014110_148015578_148015743_148016083_148016221_148017187_148017280_148021058
tx.13770	chr4	-	255	2	ISM	ENSMUSG00000019055.16	ENSMUST00000132075.2	358	3	-56	1042	3	-1042	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGGGCTTCCTGGGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148021221	148017187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_148017280_148021058
tx.13771	chr4	+	2115	3	FSM	ENSMUSG00000044496.7	ENSMUST00000103232.2	2731	3	618	-2	618	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	503	junction_1	12.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACTGGTCTGTGTGTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148025969	148031773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_148026515_148029064_148029919_148031057
tx.13772	chr4	+	670	3	FSM	ENSMUSG00000029019.9	ENSMUST00000103231.5	781	3	111	0	111	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	1	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGTCCGTGAGTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148070355	148071662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_148070559_148070752_148070976_148071418
tx.13773	chr4	+	1386	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029016.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGAAAGGAATGACAATGGG	2853	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148088717	148090510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_148089209_148089615
tx.13774	chr4	+	2815	13	NNC	ENSMUSG00000029009.18	novel	847	4	NA	NA	-11	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_12	34.6228689677149	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGAGGCTTGCTCTTGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148123604	148140667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_148123867_148126040_148126287_148127881_148128121_148128900_148129012_148132529_148132724_148135828_148136080_148136321_148136457_148136555_148136737_148136970_148137154_148138036_148138139_148139441_148139562_148139829_148140094_148140140
tx.13775	chr4	-	1126	5	FSM	ENSMUSG00000029007.9	ENSMUST00000030865.9	3996	5	17	2853	17	603	multi-exon	FALSE	canonical	3	1081	junction_4	44.285296657017	3929	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGCTGTCTTGGTATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148172471	148164370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148165062_148166019_148166216_148166727_148166834_148168415_148168451_148172373
tx.13776	chr4	+	779	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029005.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGAGGCTGAGGATCTTTG	3747	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148196799	148202150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_148197039_148197416_148197534_148201727
tx.13777	chr4	+	1198	8	FSM	ENSMUSG00000029003.12	ENSMUST00000105707.2	949	8	-246	-3	-227	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_6	213.795439137317	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGATGAACATGTGTATCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148224953	148230156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_148225292_148225371_148225491_148227442_148227515_148227998_148228100_148228720_148228816_148229110_148229185_148229582_148229654_148229828
tx.13778	chr4	+	1214	8	FSM	ENSMUSG00000029003.12	ENSMUST00000030860.9	1535	8	321	0	-221	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	623	junction_4	29.3730405338651	1701	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGATGAACATGTGTATCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148224959	148230156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_148225292_148225371_148225491_148227442_148227515_148227998_148228100_148228720_148228816_148229110_148229185_148229560_148229654_148229828
tx.13779	chr4	+	682	5	ISM	ENSMUSG00000029003.12	ENSMUST00000030860.9	1535	8	3369	0	-1239	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	623	junction_1	26.9536639438871	282	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGATGAACATGTGTATCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148228007	148230156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_148228100_148228720_148228816_148229110_148229185_148229560_148229654_148229828
tx.13780	chr4	-	1068	5	FSM	ENSMUSG00000055401.15	ENSMUST00000126615.8	794	5	31	-305	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	782	junction_1	8.18535277187245	539	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTTTGAGGGCTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148234145	148230243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148230643_148230777_148230914_148231296_148231393_148231751_148231879_148233835
tx.13781	chr4	-	1168	6	FSM	ENSMUSG00000055401.15	ENSMUST00000030858.14	1346	6	178	0	-89	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	164	junction_5	252.506158340742	572	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTTTGAGGGCTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148236192	148230243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148230643_148230777_148230914_148231296_148231393_148231751_148231879_148233835_148234124_148236070
tx.13782	chr4	-	1177	6	FSM	ENSMUSG00000055401.15	ENSMUST00000134261.2	811	6	-35	-331	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_5	248.50786707869	660	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTTTGAGGGCTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148236417	148230243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148230643_148230777_148230914_148231296_148231393_148231751_148231879_148233835_148234124_148236286
tx.13783	chr4	-	1113	6	FSM	ENSMUSG00000055401.15	ENSMUST00000056965.12	1163	6	51	-1	51	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_5	262.901958912443	704	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTTTGAGGGCTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148236465	148230243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148230643_148230777_148230914_148231296_148231393_148231751_148231879_148233835_148234124_148236398
tx.13784	chr4	-	1166	6	FSM	ENSMUSG00000055401.15	ENSMUST00000168503.8	1240	6	3	71	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	230	junction_5	226.118552976088	1814	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTTTGAGGGCTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148236589	148230243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148230643_148230777_148230914_148231296_148231393_148231751_148231879_148233835_148234124_148236469
tx.13785	chr4	+	1330	6	FSM	ENSMUSG00000041556.9	ENSMUST00000047951.9	1288	6	-49	7	-49	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_2	6.34350061086148	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATGGACGCACAGATGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148245028	148250874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_148245169_148248531_148248913_148249282_148249413_148249484_148249581_148250100_148250231_148250421
tx.13786	chr4	+	777	4	ISM	ENSMUSG00000041556.9	ENSMUST00000047951.9	1288	6	4237	7	4237	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_1	3.29983164553722	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATGGACGCACAGATGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148249314	148250874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_148249413_148249484_148249581_148250100_148250231_148250421
tx.13787	chr4	-	2491	3	NNC	ENSMUSG00000047719.3	novel	576	3	NA	NA	35	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_2	43	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCAGTGGCTTTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148529183	148518951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_148521100_148528384_148528543_148528998
tx.13788	chr4	-	2464	3	NNC	ENSMUSG00000047719.3	novel	576	3	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_2	31.5	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCAGTGGCTTTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148529215	148518951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_148521100_148528384_148528587_148529101
tx.13789	chr4	-	2974	2	FSM	ENSMUSG00000047719.3	ENSMUST00000051633.3	2992	2	18	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCAGTGGCTTTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148529210	148518951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148521100_148528384
tx.13790	chr4	+	1036	5	FSM	ENSMUSG00000028991.16	ENSMUST00000057580.8	1003	5	-33	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	19.0656759649376	692	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAGGCCTCTGACTATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148533048	148539430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_148533145_148536713_148536890_148537478_148537588_148538214_148538448_148539008
tx.13791	chr4	+	2775	25	FSM	ENSMUSG00000017264.17	ENSMUST00000017408.14	2790	25	15	0	-11	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	466	junction_4	49.4747234847138	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGGTTCTTGGTTGGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148642900	148666858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_148643036_148644004_148644142_148645469_148645594_148646763_148646869_148647169_148647336_148647477_148647593_148648300_148648377_148648569_148648681_148649056_148649201_148649660_148649852_148650735_148650893_148652823_148652973_148653107_148653159_148654843_148654956_148657375_148657427_148657567_148657647_148657734_148657842_148660265_148660362_148660606_148660682_148662874_148662963_148663837_148663915_148664815_148664988_148665558_148665621_148666214_148666292_148666740
tx.13792	chr4	+	1219	7	FSM	ENSMUSG00000006442.11	ENSMUST00000006611.9	1338	7	105	14	105	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	3072	junction_6	112.657297440808	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATGACCTCTGACCTTTT	8821	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148676064	148679062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_148676244_148676500_148676622_148676938_148677032_148677744_148677899_148678224_148678455_148678539_148678663_148678743
tx.13793	chr4	+	1140	6	ISM	ENSMUSG00000006442.11	ENSMUST00000006611.9	1338	7	441	14	26	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3072	junction_5	98.0399918400649	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATGACCTCTGACCTTTT	9157	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148676400	148679062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_148676622_148676938_148677032_148677744_148677899_148678224_148678455_148678539_148678663_148678743
tx.13794	chr4	+	907	5	ISM	ENSMUSG00000006442.11	ENSMUST00000006611.9	1338	7	991	14	576	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3072	junction_4	109.529676343902	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATGACCTCTGACCTTTT	9707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148676950	148679062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_148677032_148677744_148677899_148678224_148678455_148678539_148678663_148678743
tx.13795	chr4	+	845	5	NNC	ENSMUSG00000028979.18	novel	794	4	NA	NA	-3643	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	12.0933866224478	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGTGTGTCTCTTGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148683367	148688879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_148683507_148687124_148687354_148687448_148687627_148688143_148688276_148688712
tx.13796	chr4	+	743	5	NNC	ENSMUSG00000028979.18	novel	794	4	NA	NA	-41	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.3674043852949	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTGTCTCTTGCCGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148686969	148688881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_148687005_148687124_148687354_148687448_148687627_148688143_148688276_148688712
tx.13797	chr4	+	644	2	ISM	ENSMUSG00000028979.18	ENSMUST00000052060.7	3058	11	9273	2535	9262	-2535	internal_fragment	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACCGTTTATACATTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148696293	148697421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_148696624_148697107
tx.13798	chr4	-	1130	8	NIC	ENSMUSG00000041459.16	novel	2006	8	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	35	junction_2	407.75718064474	386	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGATTCATCACCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148711222	148701172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_148701302_148702022_148702093_148703130_148703249_148703640_148703812_148705048_148705190_148706405_148706570_148709581_148709834_148711137
tx.13799	chr4	-	819	2	FSM	ENSMUSG00000041459.16	ENSMUST00000147391.3	1011	2	111	81	111	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	409	junction_1	0	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAATGGATTCATCACCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148702713	148701173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148701302_148702022
tx.138	chr1	-	1090	8	NIC	ENSMUSG00000001143.14	novel	705	6	NA	NA	2	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	24	junction_1	59.6068753738756	190	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGAGTTTCTACTCCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36484336	36458949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_36459117_36463918_36464039_36467182_36467298_36467380_36467543_36477830_36477914_36478689_36478808_36482571_36482691_36484130
tx.13800	chr4	-	1197	8	NIC	ENSMUSG00000041459.16	novel	2006	8	NA	NA	0	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	168	junction_2	371.00008251278	2296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAATGGATTCATCACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148711222	148701175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_148701302_148702022_148702163_148703130_148703249_148703640_148703812_148705048_148705190_148706405_148706570_148709581_148709834_148711137
tx.13801	chr4	-	2170	7	NIC	ENSMUSG00000041459.16	novel	2006	8	NA	NA	0	2	intron_retention	FALSE	canonical	3	409	junction_1	257.510949066033	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGATTCATCACCTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148711222	148701170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_148701302_148702022_148703249_148703640_148703812_148705048_148705190_148706405_148706570_148709581_148709834_148711137
tx.13802	chr4	-	1775	7	FSM	ENSMUSG00000041459.16	ENSMUST00000105699.8	1904	7	-8	137	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	168	junction_1	346.808024064547	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCTTTGTTTTGCAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148711223	148701319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148702163_148703130_148703249_148703640_148703812_148705048_148705190_148706405_148706570_148709581_148709834_148711137
tx.13803	chr4	-	2740	6	FSM	ENSMUSG00000041459.16	ENSMUST00000084125.10	7477	6	254	4483	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1029	junction_2	35.1146692993114	394	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGTCTTTGTTTTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148711222	148701321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148703249_148703640_148703812_148705048_148705190_148706405_148706570_148709581_148709834_148711137
tx.13804	chr4	-	607	3	Intergenic	novelGene_1061	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTGGCAAGTTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148795025	148793591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_148793910_148794253_148794445_148794927
tx.13805	chr4	-	626	3	Intergenic	novelGene_1063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCTCCTTGGCAAGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148795025	148793595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_148793910_148794253_148794468_148794927
tx.13806	chr4	-	535	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087273.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTCCTCCTTGGCAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148798585	148793597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_148793910_148794253_148794445_148798553
tx.13807	chr4	+	497	3	Intergenic	novelGene_1065	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTTATTTTGATGGGTTTT	7550	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148958683	148960990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_148958780_148959400_148959695_148960883
tx.13808	chr4	+	1194	2	Intergenic	novelGene_1064	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTTATTTTGATGGGTTTT	7474	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148958607	148960990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_148959695_148960883
tx.13809	chr4	+	450	3	Intergenic	novelGene_1066	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTTATTTTGATGGGTTTT	7559	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148958692	148960990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_148958780_148959438_148959695_148960883
tx.13810	chr4	-	1957	9	FSM	ENSMUSG00000028975.17	ENSMUST00000103217.11	2006	9	49	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	391	junction_6	18.1757909043871	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGGCTCTGACCTCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149184284	149044991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149046252_149047898_149047991_149050678_149050777_149051980_149052084_149055006_149055093_149068493_149068623_149126177_149126263_149160476_149160525_149184228
tx.13811	chr4	+	1463	5	FSM	ENSMUSG00000028974.14	ENSMUST00000103216.10	1835	5	11	361	11	-361	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	2.34520787991171	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGGGCCTACCCTGTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149188613	149202966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_149188844_149190608_149190771_149192225_149192369_149201864_149202055_149202228
tx.13812	chr4	+	2435	6	FSM	ENSMUSG00000028974.14	ENSMUST00000030816.4	2457	6	24	-2	24	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	2.13541565040626	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGCCTTTGTTTGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149188626	149205106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_149188844_149190608_149190771_149192225_149192369_149201864_149202055_149202228_149202381_149203535
tx.13813	chr4	+	796	3	ISM	ENSMUSG00000028974.14	ENSMUST00000103216.10	1835	5	3673	586	50	-586	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAGTCTCTTGTCCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149192275	149202741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_149192369_149201864_149202055_149202228
tx.13814	chr4	+	1996	4	ISM	ENSMUSG00000028974.14	ENSMUST00000030816.4	2457	6	3683	-2	60	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_3	1.24721912892465	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGCCTTTGTTTGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149192285	149205106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_149192369_149201864_149202055_149202228_149202381_149203535
tx.13815	chr4	-	833	5	FSM	ENSMUSG00000073705.11	ENSMUST00000030813.10	1110	5	46	231	-6	111	multi-exon	FALSE	canonical	3	344	junction_3	40.8923892674419	1230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGCTGTGGCTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149222040	149212885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149213386_149214609_149214677_149216095_149216130_149216715_149216840_149221932
tx.13816	chr4	-	1573	7	ISM	ENSMUSG00000028961.16	ENSMUST00000084124.7	2218	13	8623	2	1915	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	350	junction_6	12.979684981625	219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGCTTCTTTGTTTCTTCT	4780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149242541	149234449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_149235221_149235309_149235433_149235569_149235670_149238320_149238455_149238622_149238754_149241063_149241254_149242417
tx.13817	chr4	-	2180	13	FSM	ENSMUSG00000028961.16	ENSMUST00000084124.7	2218	13	36	2	-11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	98	junction_7	73.9915066447194	676	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGCTTCTTTGTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149251128	149234449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149235221_149235309_149235433_149235569_149235670_149238320_149238455_149238622_149238754_149241063_149241254_149242417_149242553_149244515_149244586_149245291_149245411_149246085_149246152_149249506_149249687_149250463_149250540_149251043
tx.13818	chr4	-	1354	8	ISM	ENSMUSG00000028961.16	ENSMUST00000084124.7	2218	13	20	6199	20	-998	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	98	junction_2	82.2164887380151	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTGTCTGTCCGTCCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149251144	149240646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_149241254_149242417_149242553_149244515_149244586_149245291_149245411_149246085_149246152_149249506_149249687_149250463_149250540_149251043
tx.13819	chr4	-	1723	2	ISM	ENSMUSG00000028960.21	ENSMUST00000155968.8	896	3	1241	-1083	1241	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	270	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCCTGTGAGTCGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149415048	149412872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_149414195_149414647
tx.13820	chr4	-	1027	2	FSM	ENSMUSG00000028960.21	ENSMUST00000173005.2	621	2	-401	-5	14	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	264	junction_1	0	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTTGCTTCTGTCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149511074	149482951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149483243_149510338
tx.13821	chr4	-	689	4	FSM	ENSMUSG00000028996.10	ENSMUST00000030848.3	619	4	-36	-34	-36	34	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.16024689946929	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTGTTGGTTTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149539471	149534109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149534381_149537305_149537408_149537812_149537992_149539334
tx.13822	chr4	-	2137	4	ISM	ENSMUSG00000028992.14	ENSMUST00000030845.13	1238	5	10602	-988	10567	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_2	5.09901951359278	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGGACGACTACCCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149559053	149552027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_149553669_149554096_149554240_149557741_149557926_149558884
tx.13823	chr4	-	1193	5	FSM	ENSMUSG00000028992.14	ENSMUST00000030845.13	1238	5	7	38	7	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	4.60298815988049	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAGCTCAGTCACTAAAA	1659	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149569648	149553053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149553669_149554096_149554240_149557741_149557926_149558884_149559053_149569565
tx.13824	chr4	-	1619	4	FSM	ENSMUSG00000028992.14	ENSMUST00000119921.8	2657	4	13	1025	9	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	4.98887651569859	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACAGCTCAGTCACTAAAA	1661	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149569646	149553053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149554240_149557741_149557926_149558884_149559053_149569565
tx.13825	chr4	+	1296	8	NIC	ENSMUSG00000028990.14	novel	1817	7	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	53	junction_1	51.1324809905103	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTGTCTATGAAAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149569687	149581125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_149569731_149570314_149570457_149571208_149571318_149572512_149572649_149573086_149573186_149577655_149577752_149578188_149578271_149580536
tx.13826	chr4	+	1809	7	FSM	ENSMUSG00000028990.14	ENSMUST00000030842.8	1817	7	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_3	14.9517743280039	619	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTGTCTATGAAAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149569758	149581125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_149570457_149571208_149571318_149572512_149572649_149573086_149573186_149577655_149577752_149578188_149578271_149580536
tx.13827	chr4	+	897	2	NNC	ENSMUSG00000028988.14	novel	2674	5	NA	NA	17339	306	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGCTTTGCAATATTTAT	9510	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149646912	149649271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_149647200_149648661
tx.13828	chr4	+	1252	5	ISM	ENSMUSG00000039953.14	ENSMUST00000039144.7	3319	19	58299	-154	17807	154	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	508	junction_4	61.8763888733013	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTCTGTGCTAGTAGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149729393	149732510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_149729498_149729778_149729925_149730697_149730834_149731222_149731408_149731829
tx.13829	chr4	-	513	3	FSM	ENSMUSG00000039936.19	ENSMUST00000137430.8	824	3	16	295	16	31	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTTGCCACAGCGATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149760534	149758190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149758419_149758532_149758652_149760368
tx.13830	chr4	-	574	4	NIC	ENSMUSG00000039936.19	novel	824	3	NA	NA	-1	31	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.35702260395516	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTTGCCACAGCGATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149783063	149758190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_149758419_149758532_149758652_149781505_149781681_149783011
tx.13831	chr4	-	1316	7	FSM	ENSMUSG00000028982.10	ENSMUST00000105686.3	1887	7	136	435	136	-435	multi-exon	FALSE	canonical	3	394	junction_5	32.4623713791146	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCGTGCTGGGCTGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149858598	149828927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149829395_149833505_149833787_149836860_149836928_149838255_149838357_149840531_149840610_149846823_149847004_149858456
tx.13832	chr4	-	714	2	ISM	ENSMUSG00000028982.10	ENSMUST00000105686.3	1887	7	24981	436	24981	-436	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	481	junction_1	0	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCGTGCTGGGCTGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149833753	149828928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_149829395_149833505
tx.13833	chr4	-	1171	6	ISM	ENSMUSG00000028982.10	ENSMUST00000105686.3	1887	7	11733	436	11733	-436	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	394	junction_5	35.4705511657206	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCGTGCTGGGCTGTGTTC	9472	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149847001	149828928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_149829395_149833505_149833787_149836860_149836928_149838255_149838357_149840531_149840610_149846823
tx.13834	chr4	-	3086	3	FSM	ENSMUSG00000039911.14	ENSMUST00000038562.9	3092	3	6	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	6.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATCCGAGTCCTTTCGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150039494	149980739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_149982799_149990872_149991715_150039309
tx.13835	chr4	+	1748	4	FSM	ENSMUSG00000047875.7	ENSMUST00000094451.4	4900	4	251	2901	251	-2901	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	1.88561808316413	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCCAGAGTCCTGTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150172072	150187483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_150172594_150183214_150183429_150186036_150186235_150186668
tx.13836	chr4	+	1747	7	ISM	ENSMUSG00000062064.7	ENSMUST00000059893.8	1578	12	8858	-542	2	542	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_6	2.35702260395516	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTATTTGGGCTCCGGTTC	1364	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150242286	150253481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_150242665_150242931_150243123_150244475_150244587_150247654_150247757_150249565_150249642_150250811_150250940_150252720
tx.13837	chr4	+	1478	6	ISM	ENSMUSG00000062064.7	ENSMUST00000059893.8	1578	12	9394	-542	538	542	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_5	2.57681974534502	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTATTTGGGCTCCGGTTC	1900	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150242822	150253481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_150243123_150244475_150244587_150247654_150247757_150249565_150249642_150250811_150250940_150252720
tx.13838	chr4	-	1516	7	FSM	ENSMUSG00000028972.12	ENSMUST00000105683.9	1460	7	-56	0	-56	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	3.44802681092953	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGTTACTATTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150282983	150271471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_150271966_150273577_150273702_150276931_150277090_150278164_150278235_150280512_150280606_150281774_150281924_150282555
tx.13839	chr4	+	1768	12	FSM	ENSMUSG00000063524.14	ENSMUST00000080926.13	2027	12	253	6	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2891	junction_9	3966.2265098293	5069	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTGTGCTGGGCATCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150321661	150333330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_150321798_150323929_150324024_150325501_150325598_150326578_150326638_150328461_150328532_150328697_150328832_150329571_150329795_150331026_150331225_150331907_150332110_150332287_150332397_150332517_150332577_150332942
tx.1384	chr10	+	468	2	FSM	ENSMUSG00000045886.8	ENSMUST00000216543.2	456	2	-22	10	0	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAGAGTTTCGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43400079	43400631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_43400172_43400255
tx.13840	chr4	-	1122	3	Intergenic	novelGene_1068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCTAGGACTGAAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150825575	150822685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_150823472_150823668_150823841_150825411
tx.13841	chr4	+	1194	4	FSM	ENSMUSG00000028967.11	ENSMUST00000030811.2	3043	4	0	1849	0	-1849	multi-exon	FALSE	canonical	3	303	junction_2	19.3275853524323	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTACAGTGATGAAGATAGG	3781	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150939529	150951495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_150939729_150949531_150949727_150949820_150949898_150950772
tx.13842	chr4	+	2847	3	ISM	ENSMUSG00000028967.11	ENSMUST00000030811.2	3043	4	10001	-2	10001	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	303	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGTGTCTTGTCTAAACT	4196	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150949530	150953346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_150949727_150949820_150949898_150950772
tx.13843	chr4	-	766	6	ISM	ENSMUSG00000028964.15	ENSMUST00000105674.8	937	8	1201	-12	-12	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5402	junction_3	214.153776525188	9093	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTGTGTCTGGGGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150992882	150981589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_150981929_150985464_150985552_150988271_150988342_150989706_150989767_150991496_150991599_150992774
tx.13844	chr4	-	845	7	FSM	ENSMUSG00000028964.15	ENSMUST00000030805.14	908	7	63	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5402	junction_3	199.85446093484	30967	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTGTGTCTGGGGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150994320	150981589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_150981929_150985464_150985552_150988271_150988342_150989706_150989767_150991496_150991599_150992774_150992881_150994239
tx.13845	chr4	-	836	7	NNC	ENSMUSG00000028964.15	novel	908	7	NA	NA	-11	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	153	junction_6	2090.71572673092	895	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTGTGTCTGGGGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150994336	150981589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_150981929_150985464_150985552_150988271_150988342_150989706_150989767_150991496_150991599_150992774_150992881_150994264
tx.13846	chr4	-	2116	5	FSM	ENSMUSG00000028955.4	ENSMUST00000030797.4	2120	5	0	4	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_4	30.2685893295343	238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTGTCGTGTTTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151142410	151131760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_151133504_151134451_151134504_151135373_151135533_151140618_151140701_151142330
tx.13847	chr4	-	596	4	FSM	ENSMUSG00000014592.22	ENSMUST00000185034.8	2198	4	-34	1636	0	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	969	junction_2	33.2565782966318	1089	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGTTTAATGAGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151946195	151876666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_151876960_151914874_151914994_151920270_151920341_151946081
tx.13848	chr4	-	526	3	FSM	ENSMUSG00000014592.22	ENSMUST00000135780.2	506	3	0	-20	0	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_2	493.5	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAGTTTAATGAGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151946195	151876666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_151876960_151914874_151914994_151946081
tx.13849	chr4	+	534	5	ISM	ENSMUSG00000039768.17	ENSMUST00000139555.8	3841	9	-6	8058	-6	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	795	junction_4	70.2424373153438	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAAAGCGCACAGGTGCCT	9104	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152018181	152053083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_152018282_152034850_152034981_152037298_152037373_152041559_152041662_152052955
tx.1385	chr10	-	820	3	ISM	ENSMUSG00000019797.12	ENSMUST00000147196.3	860	4	7806	16	-7319	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	928	junction_2	15	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTCCTGTCATTTATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43409158	43401144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_43401405_43406593_43406667_43408671
tx.13850	chr4	+	2203	16	FSM	ENSMUSG00000039768.17	ENSMUST00000062904.11	3151	16	35	913	-5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	755	junction_7	69.5258864660415	568	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGGTTTGGAAACTAGTCT	9105	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152018182	152065681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_152018282_152034850_152034981_152037298_152037373_152041559_152041662_152052955_152053085_152054302_152054426_152055313_152055388_152057936_152058127_152058216_152058303_152058653_152058771_152061406_152061563_152062455_152062526_152063728_152063787_152063900_152064044_152064374_152064505_152065159
tx.13851	chr4	+	1900	13	ISM	ENSMUSG00000039768.17	ENSMUST00000062904.11	3151	16	23410	915	-42	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	755	junction_4	61.9327592366646	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGGGTTTGGAAACTAGT	2195	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152041557	152065679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_152041662_152052955_152053085_152054302_152054426_152055313_152055388_152057936_152058127_152058216_152058303_152058653_152058771_152061406_152061563_152062455_152062526_152063728_152063787_152063900_152064044_152064374_152064505_152065159
tx.13852	chr4	-	1111	4	FSM	ENSMUSG00000039759.11	ENSMUST00000036680.8	1124	4	14	-1	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_2	10.8730042868667	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGGCTGTCACTCGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152073440	152067094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_152067810_152068091_152068194_152070125_152070319_152073339
tx.13853	chr4	-	1011	3	FSM	ENSMUSG00000039759.11	ENSMUST00000105665.3	832	3	-15	-164	-5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	59.5	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGGCTGTCACTCGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152073442	152067094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_152067810_152070125_152070319_152073339
tx.13854	chr4	-	1283	2	FSM	ENSMUSG00000039759.11	ENSMUST00000146471.2	501	2	0	-782	0	782	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGGAAGCCAGGTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152073437	152069133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_152070319_152073339
tx.13855	chr4	-	577	3	ISM	ENSMUSG00000028952.13	ENSMUST00000155389.8	2312	10	6977	0	-68	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	8.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCAGTGTCTGTTCCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152105141	152104230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_152104578_152104646_152104736_152105000
tx.13856	chr4	-	1423	9	ISM	ENSMUSG00000028952.13	ENSMUST00000066715.11	2218	11	1643	3	29	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_7	9.0958438311132	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTCAGTGTCTGTTCCT	7158	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152110475	152104233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_152104578_152104646_152104736_152105000_152105166_152105235_152105373_152105745_152105901_152105998_152106086_152106483_152106577_152107152_152107265_152110234
tx.13857	chr4	-	736	2	ISM	ENSMUSG00000028952.13	ENSMUST00000156748.2	656	5	-519	4268	-519	618	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAAGGTGCAGCCGTTCCG	9377	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152111420	152110316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_152110477_152110844
tx.13858	chr4	-	961	3	ISM	ENSMUSG00000028952.13	ENSMUST00000155389.8	2312	10	-10	6086	0	618	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_2	6.5	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAAGGTGCAGCCGTTCCG	8669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152112128	152110316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_152110477_152110844_152111517_152111999
tx.13859	chr4	-	1205	2	ISM	ENSMUSG00000028950.4	ENSMUST00000030792.2	2863	6	7664	0	7664	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGGCTTCTTGGCTG	5436	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152115361	152112370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_152113455_152115240
tx.1386	chr10	-	878	4	FSM	ENSMUSG00000019797.12	ENSMUST00000147196.3	860	4	-34	16	-8	10	multi-exon	TRUE	canonical	3	617	junction_3	154.165135127528	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTCCTGTCATTTATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43416998	43401144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_43401405_43406593_43406667_43408671_43409154_43416935
tx.13860	chr4	-	876	2	ISM	ENSMUSG00000028943.19	ENSMUST00000207676.2	4618	12	-195	24402	-46	-20539	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGATCTGTATATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152236874	152233137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_152233510_152236370
tx.13861	chr4	+	1233	2	ISM	ENSMUSG00000028937.15	ENSMUST00000075363.10	1457	9	48	64015	48	-9959	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	360	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAGAAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152262638	152292294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_152262798_152291220
tx.13862	chr4	+	1389	9	FSM	ENSMUSG00000028937.15	ENSMUST00000075363.10	1457	9	66	2	66	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	360	junction_1	55.2466062306093	705	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGAAGCCTAGGTGGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152262656	152356307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_152262798_152291220_152291339_152302192_152302350_152307527_152307620_152314231_152314347_152322136_152322224_152337605_152337723_152345302_152345488_152355930
tx.13863	chr4	-	1377	7	ISM	ENSMUSG00000058498.13	ENSMUST00000076183.12	2466	17	5253	-1	-7	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_6	4.78423336480244	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGTACAGTGATCACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152397812	152391474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_152392074_152393294_152393361_152395840_152395959_152396228_152396281_152396527_152396714_152396846_152397034_152397643
tx.13864	chr4	-	150	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028936.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGCGCTAAGAGCCCGCA	6768	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152412036	152410302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_152410348_152411931
tx.13865	chr4	+	466	4	FSM	ENSMUSG00000028936.16	ENSMUST00000103191.11	474	4	8	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4243	junction_1	691.49805173663	129552	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGTGGTTTATCCTTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152410317	152416937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_152410353_152411937_152412043_152414460_152414586_152416736
tx.13866	chr4	+	432	3	ISM	ENSMUSG00000028936.16	ENSMUST00000103191.11	474	4	1627	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5596	junction_2	103	17256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGTGGTTTATCCTTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152411936	152416937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_152412043_152414460_152414586_152416736
tx.13867	chr4	+	275	2	ISM	ENSMUSG00000028936.16	ENSMUST00000150485.2	576	4	2575	-7	2498	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5596	junction_1	0	3852	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGTGGTTTATCCTTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152414511	152416937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_152414586_152416736
tx.13869	chr4	-	1360	15	FSM	ENSMUSG00000028931.13	ENSMUST00000030768.10	3597	15	54	2183	9	123	multi-exon	TRUE	canonical	1	4	junction_13	3.43748840443313	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAAAGGGAAATCACTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152561992	152477384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_152477582_152478198_152478288_152478746_152478868_152479385_152479481_152479581_152479703_152481212_152481299_152485404_152485492_152486381_152486426_152487492_152487538_152489056_152489102_152491583_152491664_152496441_152496480_152497273_152497318_152520261_152520395_152561857
tx.13870	chr4	-	519	2	Intergenic	novelGene_1069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTGTTTGTTTTAAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152668186	152665274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_152665662_152668054
tx.13872	chr4	+	461	3	Intergenic	novelGene_1070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTATGCCTTGGCCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153634345	153637704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_153634465_153636272_153636382_153637471
tx.13873	chr4	-	1387	3	Intergenic	novelGene_1072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACCCTATGTGTGTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153716677	153707673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_153708689_153711325_153711535_153716514
tx.13874	chr4	-	697	4	Intergenic	novelGene_1073	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGATATGTTTATGTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153913031	153911378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_153911654_153911958_153912102_153912491_153912569_153912829
tx.13875	chr4	-	587	2	Intergenic	novelGene_1074	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTACGGAAGGGTATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153912984	153912136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_153912569_153912829
tx.13876	chr4	+	1577	3	ISM	ENSMUSG00000047613.11	ENSMUST00000058393.9	1098	4	18	0	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	743	junction_1	52	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGTGTTCACAAAAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154041711	154046382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_154041780_154044205_154044320_154044987
tx.13877	chr4	+	1080	4	FSM	ENSMUSG00000047613.11	ENSMUST00000058393.9	1098	4	18	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	743	junction_1	42.5519290592879	1294	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGTGTTCACAAAAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154041711	154046382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_154041780_154044205_154044320_154044987_154045450_154045946
tx.13878	chr4	+	1014	3	ISM	ENSMUSG00000047613.11	ENSMUST00000058393.9	1098	4	2510	0	-45	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	801	junction_2	23	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGTGTTCACAAAAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154044203	154046382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_154044320_154044987_154045450_154045946
tx.13879	chr4	-	2039	7	FSM	ENSMUSG00000029027.10	ENSMUST00000030893.3	2093	7	54	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_6	5.79271573232759	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATGTCAAAATTTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154059529	154048905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_154050071_154053549_154053651_154054397_154054569_154056037_154056118_154057236_154057426_154059025_154059153_154059323
tx.13880	chr4	+	2515	6	ISM	ENSMUSG00000029028.15	ENSMUST00000030894.15	3395	7	4100	-1	-1511	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	350	junction_5	41.1698919114442	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGCATCAGCAGCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154100359	154105970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_154100566_154101874_154101992_154102826_154102943_154103386_154103490_154103850_154103941_154104087
tx.13881	chr4	-	461	4	FSM	ENSMUSG00000078350.12	ENSMUST00000125533.9	2568	4	273	1834	9	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	12.1928941054479	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACACAGGCCATTTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154110414	154107746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_154107911_154108144_154108275_154109960_154110079_154110365
tx.13882	chr4	-	543	4	FSM	ENSMUSG00000078350.12	ENSMUST00000146054.8	707	4	185	-21	1	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	2.35702260395516	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACACAGGCCATTTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154110422	154107746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_154107911_154108144_154108349_154109960_154110079_154110365
tx.13883	chr4	+	1601	12	FSM	ENSMUSG00000029029.15	ENSMUST00000030895.12	1598	12	2	-5	2	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_4	6.78354840224641	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTGGTGGTTGTTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154226830	154241278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_154226971_154229699_154229853_154230947_154231065_154233166_154233240_154236084_154236189_154236794_154236882_154237017_154237153_154237249_154237328_154238991_154239098_154239697_154239824_154240557_154240750_154240988
tx.13884	chr4	-	1412	3	ISM	ENSMUSG00000029030.15	ENSMUST00000030896.15	1724	4	405	0	-95	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	665	junction_1	21.5	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGTTGCTCCTTTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154244718	154241941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_154243023_154243725_154243880_154244541
tx.13885	chr4	-	1440	4	FSM	ENSMUSG00000029030.15	ENSMUST00000030896.15	1724	4	284	0	-216	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	665	junction_1	33.0891052899423	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGTTGCTCCTTTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154244839	154241941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_154243023_154243725_154243880_154244541_154244719_154244811
tx.13886	chr4	-	1127	5	ISM	ENSMUSG00000029032.13	ENSMUST00000144145.8	4123	14	18447	-24	1054	24	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_4	4.03112887414927	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATGTTCTGTCCTTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154365902	154362918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_154363553_154364154_154364257_154364692_154364767_154365287_154365477_154365774
tx.13887	chr4	-	787	3	ISM	ENSMUSG00000029032.13	ENSMUST00000144145.8	4123	14	19597	-15	2204	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_2	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACTGGTCTCATGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154364752	154362927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_154363553_154364154_154364257_154364692
tx.13889	chr4	-	3144	6	ISM	ENSMUSG00000039410.17	ENSMUST00000070313.14	8429	16	301732	2353	-212	-2353	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	8	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCAAGGTGTGTGCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154419591	154402934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_154405380_154407703_154407938_154412716_154412892_154413120_154413291_154418831_154418910_154419549
tx.13890	chr4	-	762	2	ISM	ENSMUSG00000039410.17	ENSMUST00000030902.13	8598	17	314481	4151	12467	3055	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGCAAAATGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154406842	154404732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_154405380_154406727
tx.13891	chr4	+	643	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000086810.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGCCATAAACATTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154739294	154743932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_154739423_154743417
tx.13893	chr4	+	687	4	ISM	ENSMUSG00000058183.15	ENSMUST00000131758.2	592	5	28	339	28	-339	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_2	0.471404520791032	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACACACACACACGATTGT	1607	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154966693	154969753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_154966787_154967629_154967792_154968080_154968162_154969402
tx.13894	chr4	-	837	7	FSM	ENSMUSG00000029059.10	ENSMUST00000030935.10	883	7	18	28	18	-28	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_6	8.17856276425687	191	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGCGTCTCACTGCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154983549	154980883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_154981055_154981496_154981616_154981805_154981882_154981962_154982027_154982584_154982637_154982932_154983138_154983399
tx.13895	chr4	+	2566	19	FSM	ENSMUSG00000029056.14	ENSMUST00000030931.11	2508	19	9	-67	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_8	27.1993100856585	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGTGAGAAGCAGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155048588	155065395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155048727_155053586_155053670_155054029_155054245_155054450_155054635_155054903_155054997_155055330_155055485_155055829_155056012_155056605_155056688_155056925_155057027_155059086_155059243_155060718_155060832_155061039_155061128_155061659_155061812_155062607_155062664_155062849_155062900_155063377_155063483_155063948_155064050_155064182_155064252_155064951
tx.13896	chr4	+	1096	6	ISM	ENSMUSG00000029056.14	ENSMUST00000030931.11	2508	19	6	9618	-4	-7901	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_2	8.21218606705913	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAGGATATTTGTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155048585	155055710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155048727_155053586_155053670_155054029_155054245_155054450_155054635_155054903_155054997_155055330
tx.13897	chr4	+	416	2	NNC	ENSMUSG00000029056.14	novel	2508	19	NA	NA	2	-13848	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTGTTCCAGCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155048591	155049763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_155048727_155049482
tx.13898	chr4	+	1583	6	FSM	ENSMUSG00000029047.14	ENSMUST00000103180.4	1688	6	34	71	-4	-71	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_5	7.62627038597505	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAAGGTCTTCATCTTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155151506	155156819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155151632_155152279_155152361_155153119_155153527_155154843_155155020_155155097_155155234_155156161
tx.13899	chr4	+	789	2	ISM	ENSMUSG00000029047.14	ENSMUST00000103180.4	1688	6	3623	78	3580	-78	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAAATGAAGGTCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155155095	155156812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155155234_155156161
tx.139	chr1	-	2238	8	FSM	ENSMUSG00000001143.14	ENSMUST00000125304.8	3378	8	19	1121	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_1	29.2707278728098	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTTCTGGCTCAGTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36484333	36462266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_36463585_36463918_36464039_36467182_36467298_36467380_36467543_36477830_36477914_36478689_36478808_36482571_36482691_36484130
tx.13900	chr4	-	1431	8	NIC	ENSMUSG00000029048.4	novel	1803	8	NA	NA	18	-273	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	91	junction_7	617.350990035619	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTGAGACTATTTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155170810	155158839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_155159486_155160045_155160182_155161168_155161248_155162950_155163051_155165255_155165361_155167123_155167212_155167565_155167694_155170661
tx.13901	chr4	-	1513	8	FSM	ENSMUSG00000029048.4	ENSMUST00000149796.2	1803	8	17	273	17	-273	multi-exon	FALSE	canonical	3	234	junction_7	582.015218259552	408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTGAGACTATTTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155170811	155158839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_155159486_155160045_155160182_155161168_155161248_155162950_155163051_155165255_155165361_155167123_155167212_155167565_155167775_155170661
tx.13902	chr4	-	1307	7	FSM	ENSMUSG00000029048.4	ENSMUST00000030914.4	1596	7	16	273	14	-273	multi-exon	FALSE	canonical	3	1097	junction_6	206.502959354635	2554	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTGAGACTATTTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155170814	155158839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_155159486_155160045_155160182_155161168_155161248_155162950_155163051_155165255_155165361_155167123_155167212_155170661
tx.13903	chr4	+	1753	14	FSM	ENSMUSG00000029049.15	ENSMUST00000030915.11	1659	14	-97	3	-97	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	16	junction_9	6.41927570616156	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGAGTAGCACCTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155170936	155229959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155171139_155171877_155171950_155173942_155174042_155175339_155175451_155176725_155176817_155177518_155177607_155185722_155185820_155186546_155186658_155195384_155195509_155195873_155196047_155213135_155213258_155213339_155213423_155226858_155226903_155229623
tx.13904	chr4	+	672	2	ISM	ENSMUSG00000029049.15	ENSMUST00000155775.8	389	5	-163	5259	-151	-5259	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGGTAAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155170882	155172293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155171139_155171877
tx.13905	chr4	+	415	2	Intergenic	novelGene_1075	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGAGTTCTGCGTCCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155319949	155321022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_155320064_155320721
tx.13906	chr4	+	1028	4	FSM	ENSMUSG00000073684.14	ENSMUST00000105627.8	710	4	-14	-304	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	91.7617688485909	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTTTCCTTCATAGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155334431	155341144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155334520_155335001_155335108_155335212_155335494_155340591
tx.13907	chr4	+	1050	4	FSM	ENSMUSG00000073684.14	ENSMUST00000178473.8	1076	4	23	3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_1	46.5784881201135	319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTTGTTTCCTTCATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155334445	155341141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155334520_155334962_155335108_155335212_155335494_155340591
tx.13908	chr4	+	1388	3	FSM	ENSMUSG00000073684.14	ENSMUST00000097747.9	1479	3	91	0	91	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_2	4.5	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTTGTTTCCTTCATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155334550	155341141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155335108_155335212_155335494_155340591
tx.13909	chr4	-	2349	18	FSM	ENSMUSG00000029053.17	ENSMUST00000030922.15	2641	18	-56	348	-56	31	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_14	28.8196876191202	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCCTCTGATGCCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155445874	155346525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_155346989_155347158_155347275_155352151_155352242_155352640_155352721_155353489_155353610_155355655_155355744_155355925_155356062_155357397_155357485_155371236_155371335_155374087_155374277_155374959_155375013_155377614_155377697_155378723_155378856_155385386_155385473_155439110_155439162_155440883_155440974_155441937_155442060_155445608
tx.1391	chr10	+	2329	8	FSM	ENSMUSG00000038160.8	ENSMUST00000039286.5	2352	8	28	-5	28	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_3	36.7828709025918	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTGGTGGCTCAAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44144381	44240292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_44144581_44162027_44162194_44165858_44165987_44170591_44170671_44179562_44179726_44195455_44195551_44222952_44223071_44238911
tx.13910	chr4	-	555	4	ISM	ENSMUSG00000029053.17	ENSMUST00000030922.15	2641	18	-43	92894	-43	1519	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	200	junction_1	19.2584757675391	219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATATGAGTGTTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155445861	155439071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_155439162_155440883_155440974_155441937_155442060_155445608
tx.13911	chr4	+	1250	8	ISM	ENSMUSG00000078490.11	ENSMUST00000094408.10	2949	21	0	19597	0	1519	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3.91751691451488	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTATTTGTATTTGCAAG	2332	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155493714	155507968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155494028_155500136_155500223_155503076_155503153_155503303_155503448_155504703_155504803_155506656_155506762_155507031_155507206_155507715
tx.13912	chr4	+	1021	4	FSM	ENSMUSG00000023153.10	ENSMUST00000145796.2	940	4	-16	-65	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.816496580927726	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCTCGGTCTTTGCGGAA	161	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155553587	155555311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155553804_155553918_155553961_155554445_155554625_155554727
tx.13913	chr4	+	1005	3	ISM	ENSMUSG00000023153.10	ENSMUST00000131599.8	622	4	146	-437	113	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTTCTCGGTCTTTGCGG	290	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155553716	155555309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155553961_155554445_155554625_155554727
tx.13914	chr4	+	901	4	ISM	ENSMUSG00000023153.10	ENSMUST00000178238.8	968	5	158	1	125	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.24721912892465	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGGTCTTTGCGGAAAGG	302	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155553728	155555314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155553804_155553900_155553961_155554445_155554625_155554727
tx.13915	chr4	+	1504	12	FSM	ENSMUSG00000029064.16	ENSMUST00000030940.14	3131	12	173	1454	173	162	multi-exon	FALSE	canonical	3	1763	junction_1	785.626496329864	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCCTGAGTGTGATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155575999	155642272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155576038_155600087_155600137_155611869_155611967_155618153_155618193_155619814_155619922_155625012_155625077_155627487_155627651_155636111_155636179_155637774_155637977_155639471_155639689_155641627_155641744_155641927
tx.13916	chr4	+	573	3	ISM	ENSMUSG00000029064.16	ENSMUST00000176308.2	812	4	1899	-165	1899	165	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3030	junction_2	300	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGAGTGTGATTGTGAGA	995	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155639579	155642275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155639689_155641627_155641744_155641927
tx.13917	chr4	+	440	2	ISM	ENSMUSG00000029064.16	ENSMUST00000176308.2	812	4	3971	-165	3971	165	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3030	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGAGTGTGATTGTGAGA	3067	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155641651	155642275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155641744_155641927
tx.13918	chr4	+	1742	11	NIC	ENSMUSG00000029063.17	novel	3152	12	NA	NA	-13	242	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	42	junction_9	206.213699835874	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCTTTTAACTGCAGTGC	9685	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155648269	155674319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_155648437_155661449_155661655_155663767_155663852_155668593_155668724_155669608_155669718_155669820_155669907_155671185_155671289_155671813_155671954_155672141_155672242_155673066_155673150_155673784
tx.13919	chr4	+	3031	12	FSM	ENSMUSG00000029063.17	ENSMUST00000105613.10	3152	12	115	6	-11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	675	junction_7	32.1412173266612	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTGAGTTAAGTAACAGCT	9687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155648271	155675452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155648437_155661449_155661655_155663767_155663852_155668593_155668724_155669608_155669718_155669820_155669907_155671185_155671289_155671813_155671954_155672141_155672242_155672317_155672476_155673066_155673150_155673784
tx.13920	chr4	+	1761	12	NNC	ENSMUSG00000029063.17	novel	3152	12	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_11	206.229111138539	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGTTAAGTAACAGCTTT	9693	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155648277	155675454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_155648437_155661449_155661655_155663767_155663852_155668593_155668724_155669608_155669718_155669820_155669907_155671185_155671289_155671813_155671954_155672141_155672242_155672317_155672476_155673066_155673150_155675050
tx.13921	chr4	+	2093	5	ISM	ENSMUSG00000029063.17	ENSMUST00000105612.2	2737	10	4920	4	638	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	687	junction_4	23.1084400165827	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGTTAAGTAACAGCTTT	1319	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155671871	155675454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155671954_155672141_155672242_155672317_155672476_155673066_155673150_155673784
tx.13922	chr4	+	406	2	ISM	ENSMUSG00000029062.15	ENSMUST00000105598.2	2673	20	24540	3	2082	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	573	junction_1	0	1769	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGTCTAACTTGCCTCG	5559	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155733906	155734392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155734069_155734148
tx.13923	chr4	-	1230	8	NNC	ENSMUSG00000029061.3	novel	1434	8	NA	NA	-15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4.18939379960434	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTGTGTTGTTTCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155737679	155735111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_155735341_155735463_155735591_155735695_155735807_155735887_155736053_155736441_155736568_155736678_155736819_155736905_155737043_155737484
tx.13924	chr4	-	1281	8	FSM	ENSMUSG00000029061.3	ENSMUST00000030937.2	1434	8	153	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	2.50713268211203	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTGTGTTGTTTCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155737688	155735111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_155735341_155735463_155735591_155735695_155735807_155735887_155736053_155736441_155736610_155736678_155736819_155736905_155737043_155737484
tx.13925	chr4	-	379	2	ISM	ENSMUSG00000029060.18	ENSMUST00000139788.8	1558	6	1556	-1	1556	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	380	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGCTTCCTGTTCCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155739628	155739138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_155739451_155739561
tx.13926	chr4	-	446	3	ISM	ENSMUSG00000029060.18	ENSMUST00000139788.8	1558	6	1408	-1	1408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	377	junction_2	1.5	358	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGCTTCCTGTTCCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155739776	155739138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_155739451_155739561_155739628_155739708
tx.13927	chr4	+	1056	5	FSM	ENSMUSG00000029038.10	ENSMUST00000030905.9	1472	5	321	95	-3	-95	multi-exon	FALSE	canonical	3	1510	junction_4	100.903419169025	2646	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAAGTGTCTGTTGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155789577	155818241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155789919_155799918_155800063_155815781_155815922_155816383_155816503_155817929
tx.13928	chr4	+	832	4	FSM	ENSMUSG00000029038.10	ENSMUST00000105595.2	874	4	-8	50	3	-50	multi-exon	FALSE	canonical	3	1675	junction_1	40.2685430026411	515	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTCAAATACTAAATTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155789583	155816596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155789919_155799918_155800063_155815781_155815922_155816383
tx.13929	chr4	-	1196	6	ISM	ENSMUSG00000029036.19	ENSMUST00000030903.12	2413	16	10875	3	-875	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	684	junction_5	67.8132730370685	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATTTTGCTTGATGGCTG	6424	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155834675	155825100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_155825810_155830485_155830595_155831770_155831939_155833127_155833199_155833613_155833666_155834588
tx.13930	chr4	-	2408	16	FSM	ENSMUSG00000029036.19	ENSMUST00000030903.12	2413	16	0	5	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	684	junction_5	53.203759265676	179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGATTTTGCTTGATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155845550	155825102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_155825810_155830485_155830595_155831770_155831939_155833127_155833199_155833613_155833666_155834588_155834714_155834929_155835056_155835324_155835382_155835893_155836050_155838023_155838094_155838338_155838505_155839213_155839284_155840135_155840196_155840517_155840620_155841548_155841626_155845258
tx.13931	chr4	+	311	2	FSM	ENSMUSG00000054514.4	ENSMUST00000155010.2	257	2	-42	-12	-10	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTTTGCTTGCTTTTTT	2549	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155845624	155848018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155845744_155847826
tx.13932	chr4	+	664	4	FSM	ENSMUSG00000029066.13	ENSMUST00000030942.13	764	4	100	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1236	junction_3	66.873013989202	5431	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTGAGTTATTTCCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155888077	155893288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155888200_155888289_155888401_155891364_155891443_155892935
tx.13933	chr4	+	2239	11	FSM	ENSMUSG00000029068.17	ENSMUST00000030944.11	2442	11	17	186	5	54	multi-exon	FALSE	canonical	3	294	junction_8	247.410205933385	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTGTGGGCTGTCATTC	4642	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155896962	155908814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155897267_155897624_155897700_155897915_155898026_155899699_155899821_155902379_155902445_155904785_155904886_155905240_155905346_155905429_155905572_155906268_155906378_155906461_155906555_155907799
tx.13934	chr4	+	997	6	ISM	ENSMUSG00000029068.17	ENSMUST00000139066.8	4220	11	6	5682	6	3003	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	604	junction_5	178.167786089405	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTGTATAGAAAGATATAAAA	4643	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155896963	155903318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155897267_155897624_155897700_155897915_155898026_155899699_155899821_155902379_155902445_155902995
tx.13935	chr4	+	795	4	FSM	ENSMUSG00000065990.13	ENSMUST00000084097.12	1159	4	303	61	-5	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	1785	junction_1	303.738191357111	8308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCGACCTAGAGTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155916110	155917526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155916193_155916439_155916528_155916808_155917255_155917347
tx.13936	chr4	+	815	4	FSM	ENSMUSG00000065990.13	ENSMUST00000105591.2	773	4	-6	-36	-2	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	281	junction_1	1010.64072086309	1005	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGCCGACCTAGAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155916119	155917524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155916224_155916439_155916528_155916808_155917255_155917347
tx.13937	chr4	+	969	3	FSM	ENSMUSG00000065990.13	ENSMUST00000105592.8	1029	3	66	-6	56	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	2371	junction_1	52	400	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGCCGACCTAGAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155916181	155917524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155916528_155916808_155917255_155917347
tx.13938	chr4	+	612	2	ISM	ENSMUSG00000065990.13	ENSMUST00000105592.8	1029	3	704	-6	694	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2475	junction_1	0	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGCCGACCTAGAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155916819	155917524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155917255_155917347
tx.13939	chr4	+	1765	7	ISM	ENSMUSG00000029070.10	ENSMUST00000030947.4	2203	10	1674	-6	-904	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_2	4.10960933531265	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTGGACCTGCTGCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155925856	155928551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155926004_155926118_155926590_155927013_155927173_155927249_155927290_155927361_155927439_155927515_155927597_155927761
tx.13940	chr4	-	2117	3	FSM	ENSMUSG00000029073.10	ENSMUST00000030950.8	2662	3	-1	546	-1	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_1	2.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTGGGATGGGTCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155953898	155949725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_155951343_155951569_155951795_155953623
tx.13941	chr4	+	1486	13	ISM	ENSMUSG00000029034.10	ENSMUST00000120794.8	1884	17	15624	-184	-2609	136	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	892	junction_10	52.1504234562546	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTTTATTCCTACTCTC	7068	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155969626	155973326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155969654_155969743_155969779_155970021_155970161_155970548_155970614_155971254_155971445_155971572_155971657_155971888_155971979_155972061_155972225_155972311_155972420_155972504_155972567_155972640_155972784_155972852_155972983_155973076
tx.13942	chr4	-	478	2	ISM	ENSMUSG00000051557.16	ENSMUST00000097737.5	1243	8	2182	-5	-86	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	357	junction_1	0	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTGTTTATTACTTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155974056	155973313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_155973626_155973890
tx.13943	chr4	-	1216	8	FSM	ENSMUSG00000051557.16	ENSMUST00000097737.5	1243	8	32	-5	6	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	268	junction_3	43.9103911276089	392	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTGTTTATTACTTTAGC	9112	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155976206	155973313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_155973626_155973890_155974054_155974125_155974181_155974955_155975127_155975209_155975360_155975508_155975697_155975814_155975873_155976087
tx.13944	chr4	-	1300	7	NIC	ENSMUSG00000051557.16	novel	1243	8	NA	NA	4	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	268	junction_3	43.8735556900611	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAAAGGTCTGTTTATTA	9139	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155976179	155973320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_155973626_155973890_155974054_155974125_155974181_155974955_155975127_155975209_155975360_155975508_155975873_155976087
tx.13945	chr4	-	775	5	ISM	ENSMUSG00000051557.16	ENSMUST00000097737.5	1243	8	32	1548	6	-30	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	293	junction_3	44.5954033505697	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGTATATTGCACATCCAT	9112	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155976206	155974866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_155975127_155975209_155975360_155975508_155975697_155975814_155975873_155976087
tx.13946	chr4	+	1980	5	ISM	ENSMUSG00000029033.17	ENSMUST00000137726.8	4101	22	12516	0	-531	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	8.78564169540279	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCTGCCTGCTCATTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155989284	155991708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_155989384_155989469_155989691_155989866_155989977_155990064_155990176_155990269
tx.13947	chr4	+	1457	8	FSM	ENSMUSG00000023286.17	ENSMUST00000105583.9	1434	8	-20	-3	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	230	junction_1	334.708584793838	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTCTGTGTGTGTTCTTAG	775	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156028305	156042171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_156028471_156030711_156030875_156033463_156033595_156035928_156035970_156039690_156039794_156039878_156040018_156040824_156040906_156041537
tx.13948	chr4	+	1297	7	FSM	ENSMUSG00000023286.17	ENSMUST00000103175.8	1309	7	15	-3	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	344	junction_1	275.8918870379	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTCTGTGTGTGTTCTTAG	772	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156028302	156042171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_156028471_156033463_156033595_156035928_156035970_156039690_156039794_156039878_156040018_156040824_156040906_156041537
tx.13949	chr4	+	1101	2	FSM	ENSMUSG00000023286.17	ENSMUST00000124092.2	847	2	-23	-231	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	961	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTCTGTGTGTGTTCTTAG	9471	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156040438	156042171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_156040906_156041537
tx.13950	chr4	+	1306	8	FSM	ENSMUSG00000023571.5	ENSMUST00000024338.5	1315	8	6	3	6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_4	2.37332110369088	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTTGGGTGCACTCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156046780	156051083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_156047195_156048999_156049117_156049224_156049346_156049436_156049589_156050050_156050160_156050322_156050414_156050538_156050618_156050860
tx.13951	chr4	+	1535	7	FSM	ENSMUSG00000029076.15	ENSMUST00000050078.13	5177	7	240	3402	-19	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	674	junction_3	38.3521692853076	545	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGTCCTCTCCAGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156077607	156094665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_156077792_156080645_156080976_156083854_156083992_156085126_156085241_156093243_156093403_156093600_156093777_156094230
tx.13952	chr4	+	2440	9	NIC	ENSMUSG00000059939.14	novel	2528	10	NA	NA	-8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	23	junction_4	67.7595703572565	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTTGAGGTCATGATGTC	8247	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194430	156211722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_156194481_156198345_156198459_156201466_156201561_156203620_156203697_156206807_156206874_156207991_156208127_156208432_156208459_156208548_156208580_156209873
tx.13953	chr4	+	2530	10	FSM	ENSMUSG00000059939.14	ENSMUST00000072554.13	2528	10	-4	2	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_5	55.1321644374276	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTGTTGAGGTCATGATG	8251	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194434	156211720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_156194481_156198345_156198459_156201466_156201561_156203620_156203697_156206389_156206486_156206807_156206874_156207991_156208127_156208432_156208459_156208548_156208580_156209873
tx.13954	chr4	+	1885	8	NNC	ENSMUSG00000059939.14	novel	2528	10	NA	NA	0	90	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_7	72.3610561626873	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGACGTCAAGCACACAT	8255	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194438	156210766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_156194481_156198345_156198459_156201466_156201561_156203620_156203697_156206389_156206874_156207991_156208127_156208432_156208459_156209851
tx.13955	chr4	+	2935	8	FSM	ENSMUSG00000059939.14	ENSMUST00000125786.8	2937	8	-2	4	1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	44.3313129302804	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGTTGTTGAGGTCATGA	8256	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194439	156211718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_156194481_156198345_156198459_156201466_156201561_156203620_156203697_156206389_156206874_156207991_156208127_156208432_156208580_156209873
tx.13956	chr4	+	2642	10	FSM	ENSMUSG00000059939.14	ENSMUST00000169550.8	2660	10	20	-2	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_5	55.5417760689095	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTTGAGGTCATGATGTC	8291	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194474	156211722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_156194631_156198345_156198459_156201466_156201561_156203620_156203697_156206389_156206486_156206807_156206874_156207991_156208127_156208432_156208459_156208548_156208580_156209873
tx.13957	chr4	+	2633	9	NNC	ENSMUSG00000059939.14	novel	2660	10	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	72.439630037708	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTTGAGGTCATGATGTC	8291	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194474	156211722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_156194631_156198345_156198459_156201466_156201561_156203620_156203697_156206389_156206486_156206807_156206874_156207991_156208127_156208432_156208459_156209851
tx.13958	chr4	+	2534	9	NIC	ENSMUSG00000059939.14	novel	2660	10	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	23	junction_4	68.1193805021743	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTGTTGAGGTCATGATG	8301	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194484	156211720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_156194631_156198345_156198459_156201466_156201561_156203620_156203697_156206807_156206874_156207991_156208127_156208432_156208459_156208548_156208580_156209873
tx.13959	chr4	-	755	2	FSM	ENSMUSG00000035692.8	ENSMUST00000085425.6	703	2	-24	-28	-24	28	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGCTTGTCCCTCTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156285277	156283883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_156284524_156285162
tx.13960	chr4	+	744	4	ISM	ENSMUSG00000095567.9	ENSMUST00000179543.8	2785	19	9419	192	3708	-179	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1821	junction_1	105.749179140497	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTTTGTTTGTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156329885	156331881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_156330001_156330287_156330424_156331133_156331221_156331475
tx.13961	chr4	+	597	3	ISM	ENSMUSG00000095567.9	ENSMUST00000179543.8	2785	19	9852	193	4141	-180	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2038	junction_1	7	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGTTTGTTTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156330318	156331880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_156330424_156331133_156331221_156331475
tx.13962	chr4	+	1208	7	Intergenic	novelGene_1076	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_5	9.7581874455363	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTGCCTCAGCTCACAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156390374	156409712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_156390627_156404917_156405026_156405277_156405347_156405588_156405691_156408356_156408565_156408842_156409051_156409451
tx.13965	chr5	-	929	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040274.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGGTTTGCTGTGATCGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3391677	3339982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_3340456_3364586_3364785_3380206_3380285_3391497
tx.13966	chr5	+	693	2	Intergenic	novelGene_1078	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCTACCAAAGTTTATTGA	29	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3343955	3348073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_3344033_3347457
tx.13967	chr5	+	627	3	Intergenic	novelGene_1079	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	20	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACTTTTCTAGGTTCAAA	29	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3343955	3350724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_3344033_3347457_3347765_3350481
tx.13968	chr5	+	1620	8	NIC	ENSMUSG00000040274.12	novel	2470	7	NA	NA	-23	-1156	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	66	junction_1	16.8861735494711	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGCTGCCATTTCGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3391461	3571069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_3391575_3394118_3394600_3440680_3440817_3478990_3479159_3523118_3523229_3565453_3565505_3569358_3569495_3570644
tx.13969	chr5	+	1429	7	FSM	ENSMUSG00000040274.12	ENSMUST00000042410.5	2470	7	-115	1156	-115	-1156	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_5	14.1852818873021	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGCTGCCATTTCGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3394196	3571069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_3394600_3440680_3440817_3478990_3479159_3523118_3523229_3565453_3565505_3569358_3569495_3570644
tx.13970	chr5	+	725	2	NNC	ENSMUSG00000040274.12	novel	697	2	NA	NA	-86	1013	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATTCTCTTTTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3394225	3395466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_3394600_3395115
tx.13971	chr5	+	774	5	NNC	ENSMUSG00000040274.12	novel	11525	8	NA	NA	2011	-1155	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	42.6577953016796	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCTGCCATTTCGTTTTC	697	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3522959	3571070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_3523011_3523118_3523229_3565453_3565505_3569358_3569495_3570644
tx.13972	chr5	+	372	4	ISM	ENSMUSG00000058503.12	ENSMUST00000198598.5	2750	5	-8	2499	-5	-2499	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	196	junction_3	8.17856276425687	234	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACACCACTTTCTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3593827	3608547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_3593948_3604638_3604737_3607743_3607823_3608472
tx.13973	chr5	+	2004	11	NNC	ENSMUSG00000058503.12	novel	1491	11	NA	NA	-3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	38	junction_10	49.5661174594097	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGTCTTTGTGTATCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3593829	3620241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_3593948_3604638_3604737_3607743_3607823_3608472_3608548_3608660_3608694_3609096_3609160_3609605_3609699_3611038_3611090_3614240_3614328_3615702_3615755_3618986
tx.13974	chr5	-	1894	5	FSM	ENSMUSG00000040302.18	ENSMUST00000042753.14	2368	5	472	2	-31	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_2	28.3813318926368	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGTGTGCTATCTGCGTG	1946	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3646113	3633979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_3634808_3640222_3640804_3641669_3641816_3645254_3645446_3645965
tx.13976	chr5	-	1034	4	ISM	ENSMUSG00000007415.16	ENSMUST00000007559.15	2545	5	1022	959	894	370	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	302	junction_1	70.8848832027441	323	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTAGTGTCTATTTTTCT	NA	False	NA	-95	True	NA	NA	NA	3696912	3690919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_3691581_3693557_3693742_3694880_3694941_3696783
tx.13977	chr5	-	1060	5	FSM	ENSMUSG00000007415.16	ENSMUST00000007559.15	2545	5	526	959	398	370	multi-exon	FALSE	canonical	3	302	junction_1	62.6592969957372	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTAGTGTCTATTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3697408	3690919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_3691581_3693557_3693742_3694880_3694941_3696783_3696910_3697379
tx.13978	chr5	-	854	3	ISM	ENSMUSG00000007415.16	ENSMUST00000119783.2	1278	4	894	0	894	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	421	junction_2	25	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATGTTACTTTATGCAT	NA	False	NA	-95	True	NA	NA	NA	3696912	3693076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_3693742_3694880_3694941_3696783
tx.13979	chr5	-	879	4	FSM	ENSMUSG00000007415.16	ENSMUST00000119783.2	1278	4	404	-5	404	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	421	junction_2	22.2910046630673	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTACTTTATGCATACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3697402	3693071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_3693742_3694880_3694941_3696783_3696910_3697379
tx.13980	chr5	+	2987	17	NNC	ENSMUSG00000000600.16	novel	2930	17	NA	NA	-3	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_16	59.7316590574044	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTAAACCATTTCTTCT	7982	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3853180	3891363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_3853484_3856418_3856569_3857298_3857459_3859635_3859729_3861255_3861386_3862331_3862576_3862741_3862858_3863050_3863195_3868526_3868684_3869309_3869418_3872086_3872244_3873633_3873786_3880605_3880773_3881495_3881584_3882019_3882227_3886777_3886899_3890873
tx.13981	chr5	+	3031	17	NNC	ENSMUSG00000000600.16	novel	2930	17	NA	NA	-17	80	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_16	61.5435567301728	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCACAAGATGGGTTTCCTT	7968	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3853166	3891439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_3853484_3856464_3856569_3857298_3857459_3859635_3859729_3861255_3861386_3862331_3862576_3862741_3862858_3863050_3863195_3868526_3868684_3869309_3869418_3872086_3872244_3873633_3873786_3880605_3880773_3881495_3881584_3882019_3882227_3886777_3886899_3890873
tx.13982	chr5	+	1142	5	ISM	ENSMUSG00000000600.16	ENSMUST00000080085.9	2930	17	-13	29632	-13	11	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_1	65.501908369146	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAACCCCAAAAAGCAATAA	7972	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3853170	3861727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_3853484_3856464_3856569_3857298_3857459_3859635_3859729_3861255
tx.13983	chr5	-	1369	2	FSM	ENSMUSG00000040429.7	ENSMUST00000044746.5	1376	2	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTATTTTGTATGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3943926	3940580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_3941898_3943874
tx.13984	chr5	+	1029	7	ISM	ENSMUSG00000040407.19	ENSMUST00000143365.8	2010	8	104	3188	8	91	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_3	6.50640709864771	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGAAGCTAGCTCATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3978281	4007801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_3978491_3998680_3998897_4001689_4001735_4004396_4004451_4004791_4004963_4006156_4006313_4007623
tx.13985	chr5	+	1922	8	FSM	ENSMUSG00000040407.19	ENSMUST00000143365.8	2010	8	103	-15	7	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	6.1145527311522	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGTGCTAGACAGAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3978280	4011004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_3978491_3998680_3998897_4001689_4001735_4004396_4004451_4004791_4004963_4006156_4006313_4007623_4007801_4010111
tx.13986	chr5	-	2055	2	NNC	ENSMUSG00000001467.6	novel	3931	10	NA	NA	20494	476	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACAGCTTTGTGATTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4132887	4130668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_4131193_4131356
tx.13987	chr5	-	2684	10	FSM	ENSMUSG00000001467.6	ENSMUST00000001507.5	3931	10	278	969	-47	-969	multi-exon	FALSE	canonical	3	648	junction_6	50.6347365275053	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGTGTACTGGCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4154468	4132113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_4133304_4136459_4136629_4137777_4137874_4141844_4142041_4142387_4142508_4149123_4149299_4150144_4150272_4151177_4151355_4152927_4153027_4154133
tx.13988	chr5	+	1368	2	FSM	ENSMUSG00000053178.6	ENSMUST00000177258.2	1368	2	1	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTATTTTGTATGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4242367	4247652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_4242419_4246335
tx.13990	chr5	-	3626	4	FSM	ENSMUSG00000046798.15	ENSMUST00000060947.14	3597	4	-29	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_3	5.18544972870135	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTCTCTGTCCTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5564902	5555108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_5558455_5561070_5561123_5563161_5563252_5564764
tx.13991	chr5	-	3001	10	NNC	ENSMUSG00000040464.16	novel	2972	10	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	36	junction_1	83.4476253277438	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGTTTCTGTTCCTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5609512	5587453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_5589452_5592246_5592426_5593290_5593369_5594065_5594174_5596352_5596406_5597926_5598001_5605237_5605383_5606064_5606157_5607212_5607407_5609432
tx.13992	chr5	-	1622	10	FSM	ENSMUSG00000040464.16	ENSMUST00000115441.9	2972	10	15	1335	0	444	multi-exon	FALSE	canonical	3	193	junction_5	43.7924397331066	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGCTGTATATGATATAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5609523	5588788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_5589452_5592301_5592426_5593290_5593369_5594065_5594174_5596352_5596406_5597926_5598001_5605237_5605383_5606064_5606157_5607212_5607407_5609432
tx.13993	chr5	-	798	4	NNC	ENSMUSG00000040473.16	novel	2920	5	NA	NA	-2	-432	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	4.49691252107735	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAGCTGTATATGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5714234	5697261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_5697607_5699789_5699856_5707787_5707848_5713907
tx.13994	chr5	-	667	3	ISM	ENSMUSG00000015653.14	ENSMUST00000015797.11	3657	6	-15	11149	-15	-6545	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_2	6.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGAGTACCTGGCTTCAT	5269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5744082	5732639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_5733056_5733291_5733418_5743957
tx.13995	chr5	-	730	3	ISM	ENSMUSG00000015653.14	ENSMUST00000150238.2	2552	4	-34	6545	11	-6545	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_2	16	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGAGTACCTGGCTTCAT	4784	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5744567	5732639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_5733056_5733291_5733418_5744379
tx.13996	chr5	-	1234	5	FSM	ENSMUSG00000015652.10	ENSMUST00000015796.9	1230	5	-9	5	-9	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	6.38357266740185	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAGTTTGTATCACAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5799335	5786321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_5786674_5789795_5789961_5790349_5790863_5792825_5792941_5799246
tx.13997	chr5	-	1145	4	NIC	ENSMUSG00000015652.10	novel	1230	5	NA	NA	-35	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	7	junction_3	12.684198393627	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAGTTTGTATCACAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5799361	5786321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_5786674_5789795_5789961_5790349_5790863_5799246
tx.13998	chr5	-	1486	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100801.2	novel	1941	1	NA	NA	-78	100	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5833633	5831514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_5832082_5832714
tx.13999	chr5	-	511	2	Intergenic	novelGene_1081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATCGTGAACTGGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8053776	8046432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_8046846_8053678
tx.14	chr1	+	3359	6	NIC	ENSMUSG00000051285.18	novel	1153	5	NA	NA	-32	15	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	23	junction_3	57.3006108169887	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAACTAAGAAAATAAACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159295	7242361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_7159441_7217860_7217964_7225303_7225496_7231115_7231288_7233471_7233596_7239738
tx.140	chr1	-	926	7	ISM	ENSMUSG00000001143.14	ENSMUST00000125304.8	3378	8	14	2772	0	-331	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_5	19.8997487421324	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTGTGGGATTCTGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36484338	36463917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_36464039_36467182_36467298_36467380_36467543_36477830_36477914_36478689_36478808_36482571_36482691_36484130
tx.1400	chr10	+	1057	3	ISM	ENSMUSG00000019849.12	ENSMUST00000099858.4	10933	15	85851	8200	85851	-8200	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	820	junction_2	33	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTTAGTTTTGGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45029149	45035094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_45029283_45031611_45031769_45034327
tx.14000	chr5	+	863	8	FSM	ENSMUSG00000003161.16	ENSMUST00000148633.4	2251	8	19	1369	-12	56	multi-exon	FALSE	canonical	3	434	junction_5	36.6795277382635	616	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCCTGAGCCATTATCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8106545	8117782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_8106640_8107537_8107622_8109352_8109423_8112383_8112428_8113259_8113408_8113636_8113751_8114557_8114617_8117532
tx.14001	chr5	-	2339	12	FSM	ENSMUSG00000002297.17	ENSMUST00000171808.8	2402	12	63	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	396	junction_3	47.2513937876549	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCCTGAGAATAAAAATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8472653	8447010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_8448163_8449687_8449813_8453079_8453192_8453611_8453741_8454870_8454917_8455801_8455839_8458233_8458311_8458493_8458564_8460009_8460061_8462120_8462301_8471220_8471394_8472466
tx.14003	chr5	-	1564	5	ISM	ENSMUSG00000002297.17	ENSMUST00000171808.8	2402	12	17800	0	324	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	396	junction_3	24.2332416321053	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCCTGAGAATAAAAATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8454916	8447010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_8448163_8449687_8449813_8453079_8453192_8453611_8453741_8454870
tx.14005	chr5	+	2710	11	NIC	ENSMUSG00000054099.12	novel	2784	12	NA	NA	-12	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_9	15.2712147519443	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGTGTATTTGTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8472837	8504793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_8473040_8477195_8477268_8477407_8477517_8478628_8478689_8480411_8480519_8490720_8490789_8492446_8492572_8493611_8493786_8497297_8497408_8502745_8502827_8503191
tx.14006	chr5	+	2766	12	FSM	ENSMUSG00000054099.12	ENSMUST00000066921.10	2784	12	14	4	6	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	8.37055050175789	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGTGTATTTGTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8472863	8504793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_8473040_8477195_8477268_8477407_8477517_8478628_8478689_8480411_8480519_8490720_8490789_8492446_8492572_8493611_8493786_8497297_8497408_8499612_8499695_8502745_8502827_8503191
tx.14007	chr5	+	2821	13	NIC	ENSMUSG00000054099.12	novel	4467	12	NA	NA	7	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_1	13.6829171678492	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGTGTTGGTTTACATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8472864	8504758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_8473040_8474796_8474888_8477195_8477268_8477407_8477517_8478628_8478689_8480411_8480519_8490720_8490789_8492446_8492572_8493611_8493786_8497297_8497408_8499612_8499695_8502745_8502827_8503191
tx.14008	chr5	+	2666	11	FSM	ENSMUSG00000054099.12	ENSMUST00000170496.6	2602	11	-9	-55	-9	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	12.7342059037853	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGATGTGTATTTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8472889	8504791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_8473040_8477407_8477517_8478628_8478689_8480411_8480519_8490720_8490789_8492446_8492572_8493611_8493786_8497297_8497408_8499612_8499695_8502745_8502827_8503191
tx.14009	chr5	+	614	4	ISM	ENSMUSG00000054099.12	ENSMUST00000197006.2	4467	12	31	27032	5	-912	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	17.931970208417	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGGAGAAATATGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8472903	8477722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_8473040_8474796_8474888_8477195_8477268_8477407
tx.14010	chr5	+	757	5	ISM	ENSMUSG00000028970.10	ENSMUST00000009058.10	4306	28	-39	55427	0	-2763	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_4	17.1955662890176	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGGGGAAACATTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8848146	8860888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_8848290_8848735_8848807_8855432_8855482_8856007_8856171_8860557
tx.14011	chr5	+	510	4	ISM	ENSMUSG00000028970.10	ENSMUST00000196580.5	690	6	-6	7397	0	-7397	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_1	3.74165738677394	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCAGTGTTGTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8848146	8856254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_8848290_8848735_8848807_8855432_8855482_8856007
tx.14012	chr5	-	2827	18	FSM	ENSMUSG00000003623.5	ENSMUST00000003720.5	2996	18	155	14	-127	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	168	junction_6	20.8630399507397	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTTTCACCTTACGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9047169	9016046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_9016973_9018646_9018767_9018869_9018964_9019047_9019127_9019915_9020040_9023585_9023717_9023944_9024053_9024132_9024217_9026007_9026110_9027454_9027581_9028197_9028292_9033688_9033798_9037767_9037893_9038103_9038286_9039605_9039731_9043505_9043642_9046451_9046548_9047103
tx.14013	chr5	+	926	4	ISM	ENSMUSG00000079659.6	ENSMUST00000115365.3	1040	5	471	0	471	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	350	junction_1	2.82842712474619	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTTTTTTTTTCCTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9151217	9169045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_9151396_9166479_9166531_9167458_9167564_9168453
tx.14014	chr5	-	3515	17	FSM	ENSMUSG00000042508.17	ENSMUST00000095017.11	3498	17	-13	-4	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_5	37.579706957346	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTTGAGCCATGCAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9211762	9168867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_9170139_9170349_9170495_9171084_9171463_9171781_9171938_9174441_9174528_9177956_9178109_9179147_9179377_9180367_9180478_9181275_9181309_9182455_9182614_9186065_9186143_9187125_9187241_9190385_9190481_9198899_9199023_9200375_9200493_9201797_9201919_9211613
tx.14015	chr5	-	814	7	ISM	ENSMUSG00000042508.17	ENSMUST00000184947.8	3089	9	-40	6697	-1	-3505	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	220	junction_2	20.5399340040052	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCATGATAGTGTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9211777	9186063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_9186143_9187125_9187241_9190385_9190481_9198899_9199023_9200375_9200493_9201797_9201919_9211613
tx.14016	chr5	-	1906	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000062038.6_ENSMUSG00000096810.2	novel	1002	1	NA	NA	-65	191	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTCTACAAACAACAAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13171798	13092208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_13093585_13171268
tx.14018	chr5	+	826	3	ISM	ENSMUSG00000040003.19	ENSMUST00000199514.2	899	6	-46	90750	-46	10793	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_1	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTTCAGTGATTTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20807448	20816601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_20807520_20814261_20814458_20816042
tx.14019	chr5	+	875	2	FSM	ENSMUSG00000045435.10	ENSMUST00000115259.3	1147	2	272	0	-44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	465	junction_1	0	858	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCCACATGCCTCTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21087460	21091868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_21087654_21091186
tx.14020	chr5	-	656	2	ISM	ENSMUSG00000039968.10	ENSMUST00000036489.10	5550	8	2	34611	2	-7497	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAAGATTTTACTGAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21156818	21132636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_21132729_21156254
tx.14021	chr5	+	2971	8	NNC	ENSMUSG00000047221.6	novel	3027	8	NA	NA	-16	-76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.489400572975	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCTCCTTTTTATTAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21629939	21687046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_21630579_21634721_21634832_21638688_21638782_21643697_21643837_21652313_21652356_21660779_21660876_21664156_21664292_21685329
tx.14022	chr5	+	1901	3	ISM	ENSMUSG00000047221.6	ENSMUST00000146056.2	941	6	21099	-1243	21099	-77	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_2	1.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCTCCTTTTTATTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21660825	21687045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_21660876_21664156_21664292_21685329
tx.14023	chr5	+	1995	6	FSM	ENSMUSG00000038525.17	ENSMUST00000072896.13	2221	6	142	84	4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	325	junction_5	40.0679422980517	487	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTCTTCCCCCACTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21851018	21867608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_21851234_21853617_21853767_21856742_21856878_21858373_21858551_21865550_21865623_21866361
tx.14024	chr5	+	1692	4	ISM	ENSMUSG00000038525.17	ENSMUST00000072896.13	2221	6	5882	7	3248	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	325	junction_3	45.1072795307661	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAAATTTTTTCCAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21856758	21867685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_21856878_21858373_21858551_21865550_21865623_21866361
tx.14025	chr5	-	654	3	NNC	ENSMUSG00000044968.17	novel	3954	5	NA	NA	28033	-2041	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_2	64	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGACATTAAAGTTCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21878359	21869941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_21870361_21875486_21875602_21878239
tx.14026	chr5	-	1085	3	ISM	ENSMUSG00000044968.17	ENSMUST00000115217.8	3954	5	25393	2039	25393	-2037	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_2	10.5	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAAAGTTCCATTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21880999	21869937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_21870361_21875486_21875602_21880452
tx.14027	chr5	+	1600	13	FSM	ENSMUSG00000029017.14	ENSMUST00000030882.12	1615	13	11	4	11	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	306	junction_5	33.8430815184827	613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGCGTTAGTCTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21942149	21962146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_21942275_21943866_21944008_21945037_21945125_21945482_21945613_21947755_21947955_21948376_21948457_21950975_21951089_21951975_21952120_21953746_21953908_21961399_21961486_21961584_21961674_21961812_21961889_21961977
tx.14028	chr5	+	406	4	ISM	ENSMUSG00000029017.14	ENSMUST00000030882.12	1615	13	19275	4	-103	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	373	junction_1	13.1993265821489	185	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGCGTTAGTCTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21961413	21962146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_21961486_21961584_21961674_21961812_21961889_21961977
tx.14029	chr5	-	1596	14	ISM	ENSMUSG00000029014.15	ENSMUST00000115195.8	1994	17	8401	-8	-8148	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	849	junction_11	101.645281806926	736	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTTGGAATTATAGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21981813	21962271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_21962408_21962762_21962918_21965363_21965472_21965623_21965725_21966538_21966724_21968443_21968514_21968738_21968828_21971553_21971704_21973434_21973557_21973643_21973736_21975482_21975549_21978775_21978857_21979931_21980074_21981714
tx.14030	chr5	-	1640	15	ISM	ENSMUSG00000029014.15	ENSMUST00000115195.8	1994	17	3855	-11	3793	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	849	junction_11	98.0981391156794	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAATTATAGTCATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21986359	21962268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_21962408_21962762_21962918_21965363_21965472_21965623_21965725_21966538_21966724_21968443_21968514_21968738_21968828_21971553_21971704_21973434_21973557_21973643_21973736_21975482_21975549_21978775_21978857_21979931_21980074_21981714_21981814_21986318
tx.14031	chr5	+	1448	12	ISM	ENSMUSG00000028932.9	ENSMUST00000030769.7	1785	13	1468	1	1468	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1482	junction_9	138.585355743117	5455	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGTGCTTCCAGATCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21991748	22008784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_21991883_22000105_22000144_22000760_22000843_22001530_22001631_22004420_22004553_22004933_22005007_22005541_22005638_22006205_22006371_22007523_22007612_22008067_22008271_22008363_22008461_22008544
tx.14032	chr5	+	1081	8	ISM	ENSMUSG00000028932.9	ENSMUST00000030769.7	1785	13	14153	1	5333	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1482	junction_5	167.368589938373	831	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGTGCTTCCAGATCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22004433	22008784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_22004553_22004933_22005007_22005541_22005638_22006205_22006371_22007523_22007612_22008067_22008271_22008363_22008461_22008544
tx.14033	chr5	+	517	3	ISM	ENSMUSG00000028932.9	ENSMUST00000030769.7	1785	13	17810	1	8990	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1770	junction_1	93.5	736	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGTGCTTCCAGATCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22008090	22008784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_22008271_22008363_22008461_22008544
tx.14034	chr5	-	2104	14	FSM	ENSMUSG00000029012.12	ENSMUST00000030872.12	2103	14	1	-2	1	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	527	junction_10	41.6678895284064	412	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTAGCTGTGTTCTTTGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22755372	22691484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_22692216_22704973_22705087_22721701_22721813_22727388_22727437_22728513_22728627_22729813_22729867_22731360_22731452_22731532_22731582_22734152_22734284_22738760_22738873_22742519_22742595_22751395_22751597_22752921_22753015_22755189
tx.14035	chr5	-	742	2	NNC	ENSMUSG00000073147.4	novel	719	3	NA	NA	2	101	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGGGGTTTGTTTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23638915	23627300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_23627901_23638773
tx.14036	chr5	-	629	2	NNC	ENSMUSG00000073147.4	novel	719	3	NA	NA	-59	35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTGTCATGCATGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23639326	23627366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_23627901_23639231
tx.14037	chr5	+	1143	7	ISM	ENSMUSG00000029004.16	ENSMUST00000196889.5	2061	13	6	12784	-2	-11835	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	3.28718048721934	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGGGAGAAAGAACAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23639444	23678614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_23639782_23655149_23655335_23668013_23668129_23669700_23669931_23672105_23672187_23676745_23676805_23678478
tx.14038	chr5	+	1929	13	ISM	ENSMUSG00000029004.16	ENSMUST00000094962.9	7252	26	11	18764	3	20	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_10	3.30298686376774	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGATACTTCAAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23639449	23690469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_23639782_23655149_23655335_23668013_23668129_23669700_23669931_23672105_23672187_23676745_23676805_23678478_23678652_23681483_23681523_23683511_23683743_23683850_23683982_23686206_23686325_23687399_23687510_23690344
tx.14039	chr5	-	2422	6	ISM	ENSMUSG00000062604.12	ENSMUST00000088392.9	6491	15	91918	2876	17502	-688	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	231	junction_5	29.7993288515027	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGCCTTGCTTATTACCC	NA	False	NA	-16	True	NA	NA	NA	23729614	23711137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_23712719_23718949_23719043_23719631_23719702_23723413_23723522_23723616_23723718_23729145
tx.14040	chr5	-	931	10	NNC	ENSMUSG00000062604.12	novel	946	9	NA	NA	-16	26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	67	junction_2	64.2716073097043	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACAGAAGAGACAGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23880981	23730702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_23730744_23731787_23731814_23732921_23733061_23745372_23745480_23750520_23750609_23751977_23752066_23753452_23753562_23770111_23770264_23880717_23880773_23880855
tx.14041	chr5	-	441	3	NNC	ENSMUSG00000062604.12	novel	4259	15	NA	NA	-14	-60009	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	140	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTATCTTTATTTTGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23880979	23879736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_23879999_23880717_23880773_23880855
tx.14042	chr5	-	1692	5	NNC	ENSMUSG00000105987.5	novel	345	4	NA	NA	-15	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.74536878161602	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTAGTCTGAGGTCTTCTT	5241	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23917680	23903289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_23904335_23904943_23905472_23915363_23915407_23916113_23916149_23917639
tx.14043	chr5	-	1168	5	NNC	ENSMUSG00000105987.5	novel	345	4	NA	NA	2	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.26291952316697	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTCTAGTCTGAGGTCTT	5259	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23917662	23903292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_23904335_23905429_23905455_23915363_23915407_23916113_23916149_23917639
tx.14044	chr5	-	2277	4	FSM	ENSMUSG00000105987.5	ENSMUST00000198984.5	345	4	-4	-1928	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	6.68331255192114	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATACTATTCTAGTCTGAG	5257	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23917664	23903297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_23905472_23915363_23915407_23916113_23916149_23917639
tx.14046	chr5	-	3132	16	FSM	ENSMUSG00000057541.15	ENSMUST00000119946.8	3407	16	33	242	33	-234	multi-exon	FALSE	canonical	3	301	junction_13	29.1369181623589	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGAAGGGCTCCTACTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23988676	23945887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_23946975_23947341_23947434_23948414_23948545_23951423_23951526_23952791_23952919_23953680_23953842_23954802_23954865_23957259_23957386_23959455_23959585_23965219_23965298_23967360_23967473_23973765_23973911_23980666_23980769_23980881_23980967_23983070_23983498_23988509
tx.14047	chr5	-	1195	2	ISM	ENSMUSG00000057541.15	ENSMUST00000131992.8	3645	16	37105	236	7659	-236	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	385	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAGAAGGGCTCCTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23947451	23945889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_23946975_23947341
tx.14048	chr5	-	2947	15	ISM	ENSMUSG00000057541.15	ENSMUST00000131992.8	3645	16	1317	-6	137	-1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	301	junction_13	30.0112223907617	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTGCATGTAAAAATCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23983239	23945647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_23946975_23947341_23947434_23948414_23948545_23951423_23951526_23952791_23952919_23953680_23953842_23954802_23954865_23957259_23957386_23959455_23959585_23965219_23965298_23967360_23967473_23973765_23973911_23980666_23980769_23980881_23980967_23983070
tx.14049	chr5	+	384	2	FSM	ENSMUSG00000028999.16	ENSMUST00000120869.6	1886	2	-3	1505	-3	-1505	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGTCTCTCTAAGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23992705	23993496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_23992881_23993287
tx.14050	chr5	+	369	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028998.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGAGGAGCTGCGCATGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24044649	24049133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_24044838_24048952
tx.14051	chr5	-	391	3	FSM	ENSMUSG00000028998.7	ENSMUST00000030851.7	1125	3	26	708	26	-708	multi-exon	FALSE	canonical	3	3790	junction_2	61.5	36071	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGCCTTTCATACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24049133	24044649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_24044827_24046707_24046757_24048968
tx.14053	chr5	+	2976	11	FSM	ENSMUSG00000028986.13	ENSMUST00000030841.10	2966	11	-7	-3	-7	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_4	4.51220566907139	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGATTTGCTTTGTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24305595	24365786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_24305873_24331819_24331923_24332666_24332761_24332977_24333103_24339961_24340138_24343303_24343479_24346148_24346292_24354122_24354364_24361887_24362090_24363536_24363635_24364444
tx.14054	chr5	+	792	6	ISM	ENSMUSG00000028986.13	ENSMUST00000030841.10	2966	11	-8	22464	-8	2318	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_4	5.70613704707484	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGTGGTTGAAATATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24305594	24343319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_24305873_24331819_24331923_24332666_24332761_24332977_24333103_24339961_24340138_24343303
tx.14055	chr5	-	1160	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000106133.2	novel	349	1	NA	NA	-67365	528	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAGACTGCTT	1661	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24391027	24322785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_24323743_24390824
tx.14056	chr5	+	1450	4	NNC	ENSMUSG00000048439.16	novel	1624	6	NA	NA	-2	822	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	32.7142510570275	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTCAATATATGTATCC	5181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24369995	24375701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_24370202_24372340_24372564_24374293_24374389_24374775
tx.14057	chr5	+	1706	7	FSM	ENSMUSG00000048439.16	ENSMUST00000049887.13	2914	7	35	1173	-2	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	52	junction_5	7.43116560320265	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGGGACTCTTTTGTACT	5181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24369995	24387838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_24370202_24372340_24372564_24374293_24374389_24380451_24380529_24382997_24383085_24386078_24386164_24386905
tx.14058	chr5	-	1764	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048439.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGAAGTTAAGTGACTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24393617	24374223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_24375240_24376114_24376263_24388207_24388405_24388526_24388835_24393522
tx.14059	chr5	-	972	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048439.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.24933858267454	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGGCTTTCAGTCTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24393612	24374651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_24375240_24376114_24376263_24388526_24388673_24393522
tx.14060	chr5	-	1169	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048439.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.30116263352131	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTATGGCTTTCAGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24393614	24374653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_24375240_24376114_24376263_24388207_24388405_24388526_24388673_24393522
tx.14061	chr5	-	836	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048439.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTATGGCTTTCAGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24393624	24374653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_24375240_24376114_24376263_24393522
tx.14062	chr5	-	1087	3	NIC	ENSMUSG00000038319.15	novel	741	4	NA	NA	-53	-23	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGGGTGCTGGTTAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24527305	24524609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_24525148_24526633_24526821_24526943
tx.14063	chr5	+	778	2	ISM	ENSMUSG00000028978.13	ENSMUST00000030834.7	4132	26	18691	103	18691	44	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTAATGTGTAAAGATGTT	1347	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24588498	24589369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_24588723_24588815
tx.14064	chr5	+	2702	16	FSM	ENSMUSG00000028973.19	ENSMUST00000073076.12	2939	16	239	-2	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_4	17.0567679626984	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGAGGCTGTAGCTTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24599391	24614945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_24599582_24604910_24605221_24605522_24605679_24605754_24605850_24605972_24606079_24606760_24606923_24607042_24607129_24607239_24607338_24608070_24608177_24610812_24610847_24611115_24611253_24611397_24611493_24611665_24611800_24612305_24612454_24613565_24613817_24614351
tx.14065	chr5	-	1150	12	NNC	ENSMUSG00000028969.11	novel	2059	12	NA	NA	-32	191	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_3	52.4982486917657	739	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGATGATATGGTGGTGG	NA	False	NA	-92	True	NA	NA	NA	24628560	24624182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_24624461_24624597_24624679_24624780_24624834_24625245_24625327_24625490_24625588_24625728_24625804_24625952_24626049_24627329_24627387_24627495_24627557_24627645_24627714_24627795_24627885_24628446
tx.14066	chr5	-	2549	9	FSM	ENSMUSG00000028959.15	ENSMUST00000149085.8	2552	9	4	-1	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1095	junction_1	118.721049102508	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTAAGTCTTGTTTCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24650181	24646036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_24646260_24646333_24646449_24646525_24646662_24646729_24646822_24646921_24647082_24647179_24647394_24648001_24648142_24648274_24648455_24648892
tx.14067	chr5	-	1839	10	FSM	ENSMUSG00000028959.15	ENSMUST00000030800.13	1893	10	54	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1073	junction_9	118.54686003725	426	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTAAGTCTTGTTTCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24650231	24646036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_24646260_24646333_24646449_24646525_24646662_24646729_24646822_24646921_24647082_24647179_24647394_24648001_24648142_24648274_24648455_24648892_24649304_24650063
tx.14068	chr5	-	1295	3	FSM	ENSMUSG00000028958.16	ENSMUST00000030799.15	1333	3	33	5	-30	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_2	11	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGTGTGTCTGTGTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24652819	24650460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_24651272_24651531_24651951_24652754
tx.14069	chr5	+	730	2	ISM	ENSMUSG00000023353.15	ENSMUST00000197513.2	1770	9	21426	-2	21007	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTTTCTCCTTTGGTGCC	9091	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24706176	24707037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_24706264_24706394
tx.14070	chr5	-	2513	14	FSM	ENSMUSG00000028953.11	ENSMUST00000030795.10	2569	14	58	-2	58	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1197	junction_13	122.348082348837	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTGGGTCTCTGAGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24782407	24770340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_24771002_24771476_24771681_24772181_24772311_24772498_24772562_24773202_24773314_24773564_24773655_24773735_24773856_24774068_24774165_24776141_24776245_24777000_24777097_24778419_24778775_24779164_24779378_24781516_24781726_24782344
tx.14071	chr5	-	1349	12	ISM	ENSMUSG00000028949.14	ENSMUST00000030791.12	1735	13	3363	0	289	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_8	20.0610638050861	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCCTTGTGGTCATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24803647	24797619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_24797803_24798014_24798117_24798222_24798346_24798634_24798771_24798919_24799018_24799829_24799992_24800140_24800243_24800387_24800484_24800720_24800844_24800949_24801073_24801804_24801848_24803589
tx.14072	chr5	+	2518	15	FSM	ENSMUSG00000028954.12	ENSMUST00000068825.8	3269	15	158	593	-5	-591	multi-exon	TRUE	canonical	3	384	junction_1	91.6660977100463	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGGTTGCAAAATCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24890979	24914783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_24891021_24894377_24894509_24897804_24897973_24899697_24899760_24900517_24900589_24902002_24902186_24902329_24902422_24903662_24903770_24906347_24906532_24907374_24907483_24908416_24908570_24911435_24911583_24912765_24912862_24913680_24913859_24913986
tx.14073	chr5	+	2588	15	FSM	ENSMUSG00000028954.12	ENSMUST00000197407.5	3546	15	450	508	-5	-508	multi-exon	FALSE	canonical	3	299	junction_1	111.175284472544	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACCACAGCAAGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24890979	24914866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_24891021_24894390_24894509_24897804_24897973_24899697_24899760_24900517_24900589_24902002_24902186_24902329_24902422_24903662_24903770_24906347_24906532_24907374_24907483_24908416_24908570_24911435_24911583_24912765_24912862_24913680_24913859_24913986
tx.14074	chr5	-	754	4	FSM	ENSMUSG00000038135.5	ENSMUST00000047119.5	768	4	15	-1	15	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	0.471404520791032	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTGGCGGGCCTCGGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24962991	24955999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_24956188_24959131_24959278_24961034_24961284_24962820
tx.14075	chr5	-	782	5	ISM	ENSMUSG00000028945.10	ENSMUST00000146310.2	522	6	5521	-419	5521	419	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1533	junction_1	55.574274624146	319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGAGCTACTTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25013436	25008245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_25008755_25011996_25012079_25012602_25012651_25012745_25012803_25013350
tx.14076	chr5	-	1174	8	FSM	ENSMUSG00000028945.10	ENSMUST00000030787.9	1784	8	185	425	-11	419	multi-exon	FALSE	canonical	3	1533	junction_1	69.8271919433531	2579	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGAGCTACTTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25047437	25008245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_25008755_25011996_25012079_25012602_25012651_25012745_25012803_25013350_25013434_25018795_25018864_25022757_25022830_25047182
tx.14077	chr5	-	1310	3	ISM	ENSMUSG00000028944.15	ENSMUST00000135525.2	651	5	2538	-1019	2538	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_1	12.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTTTGCTAAAGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25074213	25067754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_25068886_25071076_25071171_25074128
tx.14078	chr5	-	2182	12	FSM	ENSMUSG00000028944.15	ENSMUST00000114975.8	2205	12	17	6	0	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_1	21.3386701313649	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGCTAAAGTTTTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25113450	25067751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_25068886_25071076_25071171_25074128_25074276_25076052_25076091_25076491_25076658_25078881_25079009_25080158_25080214_25081986_25082033_25083702_25083762_25085681_25085764_25094079_25094184_25113320
tx.14079	chr5	-	1073	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000105763.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTCTGCTTGGTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25362311	25328845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_25329618_25360669_25360806_25362146
tx.14080	chr5	+	2507	12	FSM	ENSMUSG00000038072.15	ENSMUST00000045737.14	2552	12	45	0	45	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_8	26.0711042984152	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGACTCTTCTATCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25427924	25470916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_25428030_25452451_25452785_25453833_25453958_25455084_25455252_25457021_25457148_25459904_25460155_25462390_25462509_25463809_25463963_25466932_25467152_25468377_25468483_25469959_25470098_25470247
tx.14082	chr5	+	1278	2	Intergenic	novelGene_1084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTTGTTTTAATTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25704673	25709473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_25705645_25709166
tx.14083	chr5	+	1043	2	Intergenic	novelGene_1085	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTTGTTTTAATTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25704786	25709473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_25705645_25709288
tx.14084	chr5	-	1061	3	FSM	ENSMUSG00000028933.12	ENSMUST00000030773.12	3247	3	11	2175	11	64	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	2.5	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTCTGTCCCCTTCAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25910812	25896984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_25897827_25903248_25903331_25910675
tx.14085	chr5	+	365	2	NNC	ENSMUSG00000056367.15	novel	428	2	NA	NA	-35	-9637	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCTTGCTGAGAATGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25964959	25972701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_25965127_25972503
tx.14086	chr5	+	470	2	FSM	ENSMUSG00000056367.15	ENSMUST00000198693.2	428	2	-70	28	-28	-28	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATAATCCCTTGTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25964966	25982310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_25965127_25982000
tx.14087	chr5	+	2049	11	FSM	ENSMUSG00000056367.15	ENSMUST00000128727.8	2031	11	-18	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	35.2080956599473	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAACTGTTCCTTGTGGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25964976	26055686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_25965127_26014782_26014908_26016914_26017026_26027402_26027499_26030105_26030214_26034523_26034668_26036608_26036783_26037383_26037477_26053359_26053486_26054070_26054155_26054848
tx.14088	chr5	+	2106	12	FSM	ENSMUSG00000056367.15	ENSMUST00000088244.6	1712	12	-48	-346	-19	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	90	junction_4	20.0016528242663	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAACTGTTCCTTGTGGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25964975	26055686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_25965127_26003443_26003500_26014782_26014908_26016914_26017026_26027402_26027499_26030105_26030214_26034523_26034668_26036608_26036783_26037383_26037477_26053359_26053486_26054070_26054155_26054848
tx.14089	chr5	+	1961	11	NIC	ENSMUSG00000056367.15	novel	1712	12	NA	NA	-18	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	16	junction_6	37.7095478625772	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAACTGTTCCTTGTGGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25964976	26055686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_25965127_26003443_26003500_26014782_26014908_26016914_26017026_26027402_26027499_26030105_26030214_26036608_26036783_26037383_26037477_26053359_26053486_26054070_26054155_26054848
tx.14090	chr5	+	1217	5	ISM	ENSMUSG00000056367.15	ENSMUST00000128727.8	2031	11	71712	0	71670	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_4	17.2970373185699	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAACTGTTCCTTGTGGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26036706	26055686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_26036783_26037383_26037477_26053359_26053486_26054070_26054155_26054848
tx.14091	chr5	+	595	1	Intergenic	novelGene_1087	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCATTAGCTGAAAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26163038	26163633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_26163000_26163600
tx.14092	chr5	+	590	2	Intergenic	novelGene_1088	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTTCATTAGCTGAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26163044	26281167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_26163108_26280640
tx.14093	chr5	+	585	1	Intergenic	novelGene_1089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTCATTAGCTGAAAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26213427	26214012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_26213400_26214000
tx.14094	chr5	-	657	4	NNC	ENSMUSG00000002221.12	novel	736	5	NA	NA	6810	-1969	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	3	721	junction_1	83.973540806349	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTGGGTGATTATTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27949483	27947046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_27947498_27949108_27949174_27949254_27949331_27949418
tx.14095	chr5	+	2698	5	FSM	ENSMUSG00000045294.12	ENSMUST00000059155.11	2697	5	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1125	junction_2	41.7215471908701	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTGTATTCCTGAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28276359	28283660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_28276794_28278544_28278670_28279479_28279647_28280059_28280160_28281788
tx.14098	chr5	+	625	3	Intergenic	novelGene_1090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAGGTTCAAGGCTGATA	5553	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28323441	28326431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_28323684_28324724_28324802_28326125
tx.14099	chr5	+	855	2	NNC	ENSMUSG00000039095.9	novel	3539	2	NA	NA	2466	-1332	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGCTGAAGTCCAAAGATT	67	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28373157	28375832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_28373297_28375116
tx.141	chr1	-	1434	6	ISM	ENSMUSG00000001143.14	ENSMUST00000125304.8	3378	8	14	5408	0	919	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_4	20.8480214888608	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTTTATTGTCATTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36484338	36466553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_36467298_36467380_36467543_36477830_36477914_36478689_36478808_36482571_36482691_36484130
tx.14100	chr5	-	2320	4	NNC	ENSMUSG00000044681.20	novel	3018	4	NA	NA	100	806	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_3	81.5693297481079	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTAGCCAGAGCCACTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28414920	28406640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_28408435_28412284_28412382_28414121_28414326_28414695
tx.14101	chr5	-	1928	3	FSM	ENSMUSG00000044681.20	ENSMUST00000118882.2	1984	3	92	-36	92	36	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_1	2	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCAGAAGAGCTAAAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28414928	28407410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_28408435_28412284_28412382_28414121
tx.14102	chr5	+	457	3	ISM	ENSMUSG00000048271.15	ENSMUST00000030920.6	3955	7	21996	2882	21996	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	94	junction_2	3	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTTGTTTCCTTGATCTT	5703	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28544195	28557695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_28544307_28547392_28547513_28557469
tx.14104	chr5	+	1451	9	NIC	ENSMUSG00000029130.13	novel	1565	10	NA	NA	0	-16	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	13	junction_1	11.1242977306435	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCATGTTCGTTTGTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29400992	29430463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_29401083_29402923_29403019_29403571_29403837_29408052_29408196_29410666_29410700_29411171_29411297_29411693_29411803_29429114_29429283_29430040
tx.14105	chr5	+	1590	10	FSM	ENSMUSG00000029130.13	ENSMUST00000001247.12	1600	10	14	-4	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	13.0421917418852	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGCTAGTGTCTGACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29401008	29430524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_29401111_29401577_29401644_29402923_29403019_29403571_29403837_29408052_29408196_29410666_29410700_29411171_29411297_29411693_29411803_29429114_29429283_29430040
tx.14106	chr5	-	939	9	ISM	ENSMUSG00000010721.16	ENSMUST00000055195.11	4926	17	10	57589	10	-29314	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_4	8.10863737011343	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGTGTGTTACATACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29583372	29492388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_29492462_29496270_29496336_29497149_29497219_29497820_29497948_29528799_29528904_29551764_29551905_29566045_29566086_29568880_29568954_29583124
tx.14107	chr5	+	1521	6	ISM	ENSMUSG00000001569.11	ENSMUST00000001611.11	9219	11	7872	5917	1218	5571	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	157	junction_3	16.8237926758505	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGACCAGAGCGAGCAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29647533	29656924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_29647660_29648347_29648470_29651236_29651370_29651811_29651944_29654579_29654690_29656026
tx.14108	chr5	-	1098	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105032.2	novel	379	1	NA	NA	-9	181229	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCCCCAAGATTATCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29924713	29743096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_29743713_29924231
tx.14109	chr5	-	1169	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105032.2	novel	379	1	NA	NA	-13	181229	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCCCCAAGATTATCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29924717	29743096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_29743713_29924164
tx.14110	chr5	+	1549	8	FSM	ENSMUSG00000029131.15	ENSMUST00000114839.8	1605	8	45	11	-4	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	1788	junction_5	99.4337026590572	2511	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGGGTCTGCAGCCTTCTT	4591	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29940982	29972090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_29941115_29953342_29953434_29955935_29956046_29957394_29957458_29958539_29958651_29969396_29969529_29970503_29970646_29971322
tx.14111	chr5	+	2597	10	FSM	ENSMUSG00000029131.15	ENSMUST00000008733.15	2918	10	297	24	-4	-24	multi-exon	FALSE	canonical	3	618	junction_9	548.115559591832	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAATACAGTTTTATAC	4591	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29940982	29991452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_29941115_29953342_29953434_29955935_29956046_29957394_29957458_29958539_29958651_29969396_29969529_29970503_29970646_29971322_29971394_29986127_29986449_29990028
tx.14112	chr5	-	1008	7	FSM	ENSMUSG00000025747.13	ENSMUST00000026846.11	3163	7	-4	2159	-4	78	multi-exon	FALSE	canonical	3	1628	junction_1	98.4757443344412	3684	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGCTATGAATATCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30278619	30265983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_30266132_30266965_30267038_30268233_30268410_30269082_30269185_30273463_30273639_30276631_30276706_30278358
tx.14113	chr5	-	523	5	ISM	ENSMUSG00000025747.13	ENSMUST00000154751.6	2723	7	5124	-78	5032	78	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1628	junction_1	118.935644362823	1655	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGCTATGAATATCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30273488	30265983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_30266132_30266965_30267038_30268233_30268410_30269082_30269185_30273463
tx.14114	chr5	-	501	4	ISM	ENSMUSG00000025747.13	ENSMUST00000154751.6	2723	7	9425	-78	9333	78	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1628	junction_1	123.776680625499	828	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGCTATGAATATCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30269187	30265983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_30266132_30266965_30267038_30268233_30268410_30269082
tx.14115	chr5	+	2482	3	ISM	ENSMUSG00000044576.7	ENSMUST00000058045.5	3865	6	9635	-2	9635	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGGGTGTTGGCTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30319793	30323378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_30319986_30320884_30321055_30321258
tx.14116	chr5	-	2746	20	FSM	ENSMUSG00000025745.13	ENSMUST00000156859.3	4017	20	149	1122	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	340	junction_11	40.0253382350609	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGACTGGCCTGTTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30360011	30324423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_30324959_30325042_30325189_30325685_30325801_30326335_30326532_30327147_30327217_30327618_30327760_30328605_30328693_30331562_30331735_30333797_30333933_30334818_30334929_30337237_30337295_30339055_30339175_30339976_30340100_30345946_30346050_30347716_30347837_30349156_30349296_30350232_30350367_30352343_30352415_30352977_30353020_30359879
tx.14117	chr5	+	2022	16	FSM	ENSMUSG00000059447.14	ENSMUST00000026841.15	2033	16	3	8	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	438	junction_6	59.1301389591918	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACTGTTCGTAGTCTCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30360248	30389583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_30360338_30368666_30368742_30369023_30369069_30371662_30371763_30373521_30373567_30374493_30374594_30377623_30377712_30378807_30378996_30379788_30379970_30381885_30382008_30383637_30383718_30383794_30383843_30384549_30384638_30385312_30385388_30385918_30386084_30389050
tx.14118	chr5	+	2045	16	FSM	ENSMUSG00000059447.14	ENSMUST00000114783.6	2045	16	3	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	145.866361974088	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACTGTTCGTAGTCTCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30360272	30389583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_30360385_30368666_30368742_30369023_30369069_30371662_30371763_30373521_30373567_30374493_30374594_30377623_30377712_30378807_30378996_30379788_30379970_30381885_30382008_30383637_30383718_30383794_30383843_30384549_30384638_30385312_30385388_30385918_30386084_30389050
tx.14119	chr5	+	3306	10	FSM	ENSMUSG00000075703.17	ENSMUST00000145167.9	6803	10	44	3453	-10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_3	10.5725010181025	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTTGTCACTGTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30437622	30473972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_30437814_30452460_30452530_30453409_30453519_30457707_30457783_30461075_30461339_30462709_30462819_30468068_30468118_30469272_30469454_30470335_30470522_30471898
tx.1412	chr10	+	3003	11	FSM	ENSMUSG00000019891.16	ENSMUST00000069004.14	3024	11	21	0	3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	170	junction_2	11.5134703716994	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCCCTGACTTCTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52109735	52197472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_52109932_52137822_52138036_52160198_52160334_52162443_52162496_52166946_52167020_52180682_52180817_52187495_52187537_52188909_52188998_52190450_52190501_52193127_52193248_52195571
tx.14120	chr5	-	528	4	ISM	ENSMUSG00000053194.3	ENSMUST00000065486.3	769	7	47661	0	47661	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGACCCACTGCTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30655519	30642926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_30643112_30644788_30644878_30645828_30645939_30655375
tx.14121	chr5	+	1959	6	FSM	ENSMUSG00000029175.18	ENSMUST00000062962.12	3088	6	16	1113	-4	372	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_4	8.49470423263812	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTCCTTGATGTTTTGAC	6694	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30805292	30815960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_30805443_30812091_30812165_30812838_30813011_30813231_30813445_30814090_30814202_30814720
tx.14122	chr5	+	915	5	FSM	ENSMUSG00000029177.10	ENSMUST00000144742.6	1466	5	128	423	-7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1270	junction_1	201.219407612685	1931	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCGTGGCAGTCCCGCCA	9194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30824248	30831751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_30824458_30829807_30829915_30830325_30830404_30830636_30830788_30831381
tx.14123	chr5	+	905	5	NNC	ENSMUSG00000029177.10	novel	1466	5	NA	NA	-5	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	719.429808945946	159	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCCGTGGCAGTCCCGCC	9196	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30824250	30831750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_30824458_30829807_30829915_30830325_30830404_30830643_30830788_30831381
tx.14124	chr5	+	1054	6	FSM	ENSMUSG00000029177.10	ENSMUST00000133316.8	1031	6	8	-31	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	531	junction_2	579.285905231605	659	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGTGGCAGTCCCGCCATA	9194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30824248	30831753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_30824458_30827035_30827173_30829807_30829915_30830325_30830404_30830636_30830788_30831381
tx.14125	chr5	+	1423	9	NIC	ENSMUSG00000029168.15	novel	5191	13	NA	NA	-33	98	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	11	junction_8	19.6050854372023	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGTCCCTTATTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30869204	30944376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_30869347_30902565_30902831_30934663_30934823_30935318_30935499_30936211_30936281_30938822_30938868_30940538_30940615_30941654_30941812_30944046
tx.14126	chr5	+	1244	3	FSM	ENSMUSG00000029166.15	ENSMUST00000202025.2	488	3	55	-811	55	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	0.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCTCAATTGACCCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31021920	31023410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31022073_31022158_31022312_31022471
tx.14127	chr5	+	1087	3	NNC	ENSMUSG00000029166.15	novel	2442	6	NA	NA	146	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATGATTTCCTCAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31022011	31023403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_31022073_31022217_31022312_31022471
tx.14128	chr5	+	784	2	ISM	ENSMUSG00000038828.14	ENSMUST00000114716.4	2220	16	-43	5903	-43	-344	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	425	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAAAAGCTGGTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31026931	31028485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31027163_31027932
tx.14129	chr5	+	2776	17	FSM	ENSMUSG00000038828.14	ENSMUST00000201203.4	6110	17	1617	1717	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	358	junction_2	22.5422346662881	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTAGCTTTCCTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31026972	31034807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31027163_31027932_31028133_31028763_31028915_31029064_31029200_31029415_31029499_31029844_31029951_31030030_31030113_31030386_31030489_31030838_31030981_31031299_31031392_31031656_31031706_31031880_31031995_31032194_31032313_31033133_31033231_31033390_31033560_31033706_31033853_31034007
tx.14130	chr5	-	573	2	FSM	ENSMUSG00000038803.8	ENSMUST00000132034.5	576	2	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1088	junction_1	0	1143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTTTGTGGTCCCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31065066	31063861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31064111_31064742
tx.14131	chr5	-	470	3	FSM	ENSMUSG00000038803.8	ENSMUST00000132253.5	1144	3	41	633	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	823	junction_2	132.5	4929	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTTTGTGGTCCCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31065091	31063861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31064111_31064742_31064881_31065008
tx.14132	chr5	+	1323	7	FSM	ENSMUSG00000029162.16	ENSMUST00000201571.4	1087	7	-36	-200	-36	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	5.24933858267454	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTTGTCTGTCTGTCTGTC	1106	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31078897	31088590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31079352_31082082_31082200_31085786_31085860_31086864_31087012_31087891_31087981_31088059_31088218_31088305
tx.14133	chr5	-	1348	6	FSM	ENSMUSG00000029161.9	ENSMUST00000031051.9	1442	6	94	0	-91	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	4.51663591625449	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATGTGTCCTTGGTCCAG	5390	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31102841	31090486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31091333_31091503_31091626_31091722_31091794_31091886_31091953_31093221_31093325_31102701
tx.14134	chr5	+	1363	9	FSM	ENSMUSG00000006638.16	ENSMUST00000201125.4	1352	9	-11	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_5	7.48331477354788	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGCTGAGGTTCCCTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31107398	31112435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31107593_31110228_31110390_31110686_31110870_31111010_31111057_31111222_31111336_31111434_31111610_31111748_31111798_31111877_31112044_31112159
tx.14135	chr5	-	2030	9	FSM	ENSMUSG00000045302.14	ENSMUST00000074840.12	6300	9	81	4189	0	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	205	junction_7	28.1735691739616	497	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCAGTCCTCTTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31117624	31112385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31113082_31113273_31113434_31113605_31113679_31115231_31115406_31115576_31115702_31115814_31115896_31116059_31116281_31116566_31116757_31117314
tx.14136	chr5	-	3148	18	NIC	ENSMUSG00000006641.13	novel	3436	18	NA	NA	11	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	63	junction_17	22.1293773649543	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTGGCCTCTGTGTTCCT	744	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31205412	31193379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_31194298_31194446_31194563_31194752_31194857_31195057_31195237_31195357_31195445_31196285_31196354_31196647_31196761_31197097_31197187_31197705_31197836_31198001_31198143_31198487_31198643_31198887_31198956_31199481_31199534_31199922_31199989_31200293_31200804_31201856_31201936_31204973_31205144_31205309
tx.14137	chr5	-	3048	17	FSM	ENSMUSG00000006641.13	ENSMUST00000202520.4	3248	17	200	0	200	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	71	junction_13	19.5252240704172	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTGGCCTCTGTGTTCCT	1010	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31205146	31193379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31194298_31194446_31194563_31194752_31194857_31195057_31195237_31195357_31195445_31196285_31196354_31196647_31196761_31197097_31197187_31197705_31197836_31198001_31198143_31198487_31198643_31198887_31198956_31199481_31199534_31199922_31199989_31200293_31200804_31201856_31201936_31204973
tx.14138	chr5	-	498	4	FSM	ENSMUSG00000006641.13	ENSMUST00000200816.2	728	4	21	209	21	-209	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_3	22.86676384819	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTCAGGCTCCAGCGGGGC	754	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31205402	31200647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31200804_31201856_31201936_31204973_31205144_31205309
tx.14139	chr5	+	964	7	FSM	ENSMUSG00000013622.16	ENSMUST00000013766.13	966	7	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_6	22.1108319357027	1114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCCGTACCTGTGCGTG	910	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31205980	31211967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31206101_31206805_31206925_31209540_31209613_31209805_31209878_31210106_31210229_31211304_31211403_31211606
tx.14140	chr5	+	1143	6	ISM	ENSMUSG00000013629.17	ENSMUST00000013773.12	7137	44	21837	-7	804	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	810	junction_1	117.193173862644	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTCATGAGTACTATAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31233960	31235830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31234231_31234436_31234563_31234694_31234851_31234938_31235041_31235232_31235328_31235436
tx.14141	chr5	+	964	5	ISM	ENSMUSG00000013629.17	ENSMUST00000013773.12	7137	44	22215	0	1182	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	874	junction_1	101.327131115018	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGTTCGTCATGAGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31234338	31235823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31234563_31234694_31234851_31234938_31235041_31235232_31235328_31235436
tx.14142	chr5	-	1993	8	FSM	ENSMUSG00000029151.15	ENSMUST00000031037.14	2089	8	96	0	-50	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_5	6.02037357305871	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCAGTCCAATTCCTC	3840	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31250863	31243449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31244263_31245300_31245436_31245648_31245755_31245951_31246151_31246662_31246817_31246897_31247045_31247399_31247582_31250606
tx.14143	chr5	+	1563	6	FSM	ENSMUSG00000053856.8	ENSMUST00000066544.5	1565	6	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	5.93295878967653	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCAGTGTGTGTGGGACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31265664	31269870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31265766_31266230_31266347_31266838_31267053_31267521_31267664_31268456_31268524_31268947
tx.14144	chr5	+	1548	9	FSM	ENSMUSG00000062077.15	ENSMUST00000013771.15	1434	9	-116	2	-116	-2	multi-exon	TRUE	canonical	2	14	junction_1	4.29389100932942	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCTCGGCTCCTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31273939	31294970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31274422_31288385_31288559_31289331_31289504_31291393_31291490_31293386_31293621_31294096_31294120_31294231_31294357_31294464_31294558_31294820
tx.14145	chr5	+	397	3	ISM	ENSMUSG00000062077.15	ENSMUST00000013771.15	1434	9	20147	2	20125	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	2.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCCTCGGCTCCTTTTGCT	2844	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31294202	31294970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31294357_31294464_31294558_31294820
tx.14146	chr5	-	632	2	FSM	ENSMUSG00000038676.7	ENSMUST00000043475.7	504	2	-54	-74	-54	74	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCTATCTTCTGTCATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31296227	31295332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31295878_31296140
tx.14147	chr5	-	1660	7	ISM	ENSMUSG00000107283.4	ENSMUST00000154241.8	1724	8	506	6	-3	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	328	junction_5	25.2943779436371	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAATTGTGTCTTTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31311089	31298003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31299195_31302043_31302097_31302589_31302623_31302838_31302935_31303027_31303121_31303316_31303433_31311011
tx.14148	chr5	-	1693	8	FSM	ENSMUSG00000107283.4	ENSMUST00000154241.8	1724	8	25	6	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_7	57.209960599853	471	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGAATTGTGTCTTTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31311570	31298003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31299195_31302043_31302097_31302589_31302623_31302838_31302935_31303027_31303121_31303316_31303433_31311011_31311087_31311534
tx.14149	chr5	-	4329	19	FSM	ENSMUSG00000106864.4	ENSMUST00000088010.12	4552	19	223	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	356	junction_18	84.1706086352278	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGAGCTTGGCTTGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31337265	31313348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31315112_31315486_31315595_31315686_31315840_31316404_31316534_31316777_31316866_31317043_31317206_31317291_31317437_31323229_31323360_31323704_31323731_31325039_31325149_31325332_31325445_31325594_31325823_31326394_31326494_31327179_31327258_31327523_31327619_31330125_31330406_31331111_31331434_31331575_31331840_31337227
tx.1415	chr10	+	1871	5	FSM	ENSMUSG00000023068.17	ENSMUST00000023830.16	4605	5	560	2174	560	-2174	multi-exon	FALSE	canonical	3	398	junction_2	27.0370116691915	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGTCCAGTCACATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52294202	52314105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_52294265_52305288_52305415_52306162_52306313_52309440_52309541_52312672
tx.14150	chr5	-	4292	18	ISM	ENSMUSG00000106864.4	ENSMUST00000088010.12	4552	19	5648	0	5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	433	junction_16	63.3729554927753	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGAGCTTGGCTTGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31331840	31313348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31315112_31315486_31315595_31315686_31315840_31316404_31316534_31316777_31316866_31317043_31317206_31317291_31317437_31323229_31323360_31323704_31323731_31325039_31325149_31325332_31325445_31325594_31325823_31326394_31326494_31327179_31327258_31327523_31327619_31330125_31330406_31331111_31331434_31331575
tx.14151	chr5	+	850	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000106864.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCAGCTTTCCCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31336750	31338003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_31337007_31337409
tx.14152	chr5	-	543	3	ISM	ENSMUSG00000029145.13	ENSMUST00000200724.2	768	6	1951	-2	220	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	661	junction_2	34.5	503	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCATGACTCTGCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31347040	31344910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31345145_31345257_31345439_31346912
tx.14153	chr5	-	1968	12	FSM	ENSMUSG00000029145.13	ENSMUST00000114603.8	1966	12	-1	-1	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	556	junction_3	55.8517814183514	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCATGACTCTGCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31350359	31344910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31345145_31345257_31345439_31346912_31347091_31347224_31347353_31347702_31347806_31347925_31348003_31348180_31348296_31348492_31348585_31348708_31348792_31348884_31349092_31349496_31349633_31349925
tx.14154	chr5	-	1673	13	FSM	ENSMUSG00000029145.13	ENSMUST00000077693.10	2025	13	343	9	52	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	556	junction_3	56.1372326436643	1220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCATGACTCTGCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31350431	31344910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31345145_31345257_31345439_31346912_31347091_31347224_31347353_31347702_31347806_31347925_31348003_31348180_31348296_31348492_31348585_31348708_31348792_31348884_31349092_31349496_31349633_31349925_31349970_31350336
tx.14155	chr5	+	1956	15	FSM	ENSMUSG00000029146.15	ENSMUST00000031029.15	2018	15	62	0	-5	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	351	junction_8	24.4791664857432	533	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTGGTTCCCTCTCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31350632	31356244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31350810_31351212_31351288_31352139_31352258_31352758_31352824_31353089_31353201_31353294_31353386_31353520_31353609_31353824_31353895_31354326_31354420_31354513_31354718_31354964_31355091_31355206_31355285_31355413_31355489_31355579_31355622_31355701
tx.14156	chr5	+	827	5	ISM	ENSMUSG00000029146.15	ENSMUST00000202032.4	2111	15	3804	243	1608	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	411	junction_2	8.86002257333467	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTGGTTCCCTCTCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31355001	31356244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31355091_31355206_31355285_31355413_31355489_31355579_31355622_31355701
tx.14157	chr5	+	662	3	ISM	ENSMUSG00000029146.15	ENSMUST00000202032.4	2111	15	4214	243	2018	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	412	junction_2	2	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTGGTTCCCTCTCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31355411	31356244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31355489_31355579_31355622_31355701
tx.14158	chr5	-	2184	4	FSM	ENSMUSG00000043059.17	ENSMUST00000114590.8	2228	4	44	0	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_2	5.79271573232759	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATGTCTCTGCTGAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31359603	31356324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31357492_31357578_31358167_31358926_31359083_31359330
tx.14159	chr5	-	708	2	FSM	ENSMUSG00000029147.12	ENSMUST00000202402.2	1695	2	1421	-434	1421	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	657	junction_1	0	170	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTGCTCATAGTGTCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31361006	31360011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31360629_31360915
tx.14160	chr5	-	1188	5	ISM	ENSMUSG00000029147.12	ENSMUST00000202294.4	1868	10	15465	4	-17	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	614	junction_2	19.8037243971936	277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTGCTCATAGTGTCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31362444	31360011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31360629_31360915_31361019_31361373_31361504_31361796_31362032_31362341
tx.14161	chr5	+	2168	18	FSM	ENSMUSG00000029148.16	ENSMUST00000031034.12	2203	18	32	3	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	461	junction_13	30.9676692663879	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATCTTGTGTTGTGCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31398239	31408907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31398347_31401106_31401336_31401509_31401633_31401801_31401904_31402220_31402311_31402706_31402748_31403094_31403190_31404685_31404770_31405027_31405087_31405241_31405341_31406892_31407026_31407232_31407339_31407433_31407485_31407573_31407710_31407887_31407942_31408024_31408089_31408235_31408292_31408368
tx.14162	chr5	+	931	7	NIC	ENSMUSG00000029149.15	novel	904	7	NA	NA	-4	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_6	33.7819807326661	353	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCTGATTACAGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31409030	31410544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_31409159_31409262_31409448_31409535_31409596_31409708_31409916_31409998_31410134_31410238_31410352_31410441
tx.14163	chr5	+	1012	6	NIC	ENSMUSG00000029149.15	novel	904	7	NA	NA	4	1	intron_retention	FALSE	canonical	2	4	junction_5	36.8152142462868	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCTGATTACAGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31409053	31410544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_31409448_31409535_31409596_31409708_31409916_31409998_31410134_31410238_31410352_31410441
tx.14164	chr5	+	1105	5	NIC	ENSMUSG00000029149.15	novel	904	7	NA	NA	-6	1	intron_retention	FALSE	canonical	2	4	junction_4	41.0327613011847	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCTGATTACAGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31409043	31410544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_31409448_31409535_31409596_31409708_31410134_31410238_31410352_31410441
tx.14165	chr5	-	1124	7	ISM	ENSMUSG00000038552.15	ENSMUST00000041266.11	1375	8	429	-3	-9	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	6.89806736219163	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACTGGTTCCTGTATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31452786	31450226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31450509_31450757_31450831_31451029_31451158_31451447_31451538_31451973_31452179_31452349_31452466_31452556
tx.14166	chr5	+	3239	13	NIC	ENSMUSG00000062761.8	novel	3299	14	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	73	junction_1	77.4128093764563	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTCTGGTCCTCCTTGCTG	7147	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31609779	31639098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_31609922_31622789_31622978_31623575_31623681_31623935_31624020_31624665_31624791_31625497_31625585_31627701_31627801_31628340_31628509_31630113_31630306_31630796_31630899_31633016_31633080_31634124_31634224_31637313
tx.14167	chr5	+	1595	2	FSM	ENSMUSG00000062761.8	ENSMUST00000201599.2	331	2	-65	-1199	3	1199	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TACAAAAAAAAAAAAAAAAG	7164	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31609796	31611968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31609922_31610498
tx.14168	chr5	+	3268	14	FSM	ENSMUSG00000062761.8	ENSMUST00000076264.8	3299	14	31	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_1	41.4283440690995	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTCTGGTCCTCCTTGCTG	7177	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31609809	31639098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31609922_31610498_31610558_31622789_31622978_31623575_31623681_31623935_31624020_31624665_31624791_31625497_31625585_31627701_31627801_31628340_31628509_31630113_31630306_31630796_31630899_31633016_31633080_31634124_31634224_31637313
tx.14169	chr5	-	1427	2	NNC	ENSMUSG00000107142.2	novel	1535	2	NA	NA	-1203	2	intron_retention	FALSE	canonical	3	94	junction_1	0	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTGGTTATGTCTTTTG	719	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31646495	31643974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_31645334_31646427
tx.1417	chr10	+	946	4	FSM	ENSMUSG00000019857.8	ENSMUST00000020004.8	2201	4	153	1102	-150	-49	multi-exon	FALSE	canonical	3	699	junction_3	57.7119282875444	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTTCTCTTTTATATGT	1674	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53473200	53484219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_53473395_53478443_53478560_53482204_53482382_53483760
tx.14170	chr5	-	1301	2	NNC	ENSMUSG00000107142.2	novel	1535	2	NA	NA	-1205	2	intron_retention	FALSE	canonical	3	124	junction_1	0	310	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTGGTTATGTCTTTTG	717	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31646497	31643974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_31645206_31646427
tx.14171	chr5	+	1648	14	FSM	ENSMUSG00000064037.14	ENSMUST00000076949.13	3144	14	9	1487	-2	558	multi-exon	FALSE	canonical	3	859	junction_7	68.5179542833234	1015	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTGGTAAGCTTTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31652093	31668761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31652228_31652861_31652956_31654654_31654695_31655683_31655751_31656610_31656649_31658197_31658277_31658455_31658551_31660734_31660781_31661255_31661403_31662296_31662380_31663536_31663577_31664817_31664909_31666642_31666751_31668175
tx.14172	chr5	+	909	5	ISM	ENSMUSG00000064037.14	ENSMUST00000076949.13	3144	14	10211	1487	-2109	558	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	920	junction_2	60.462281630782	1134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTGGTAAGCTTTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31662295	31668761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31662380_31663536_31663577_31664817_31664909_31666642_31666751_31668175
tx.14173	chr5	-	2653	5	FSM	ENSMUSG00000053134.14	ENSMUST00000065388.11	2693	5	35	5	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_3	3.34477204006491	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAGTTATTCCAATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31684082	31671912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31673271_31675610_31675849_31677426_31677752_31679997_31680606_31683958
tx.14174	chr5	+	702	5	FSM	ENSMUSG00000029141.17	ENSMUST00000202273.4	660	5	-45	3	-45	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	37.2852182506687	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTGAGGTGATGATCATT	1892	False	NA	-11	True	NA	NA	NA	31701081	31711383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31701258_31703523_31703611_31705957_31706026_31708056_31708127_31711082
tx.14175	chr5	+	709	5	ISM	ENSMUSG00000029141.17	ENSMUST00000202950.4	2499	14	16725	0	-46	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_2	30.1029483605842	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGGTGATGATCATTCCC	1891	False	NA	-12	True	NA	NA	NA	31701080	31711386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31701258_31703523_31703611_31705954_31706026_31708056_31708127_31711082
tx.14176	chr5	+	617	4	FSM	ENSMUSG00000029141.17	ENSMUST00000202299.4	761	4	144	0	-45	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	30.9443945740671	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTGAGGTGATGATCAT	1892	False	NA	-11	True	NA	NA	NA	31701081	31711382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31701258_31705954_31706026_31708056_31708127_31711082
tx.14177	chr5	-	521	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000107015.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGAAGACAATGGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31754185	31714399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_31714689_31735252_31735340_31736569_31736641_31754111
tx.14178	chr5	+	461	3	NNC	ENSMUSG00000106918.4	novel	478	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1166.5	685	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGTCTCTTAGAGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31771299	31779988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_31771367_31773705_31773832_31779720
tx.14179	chr5	+	449	3	NNC	ENSMUSG00000106918.4	novel	478	4	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1166.5	6444	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGTCTCTTAGAGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31771300	31779988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_31771375_31773724_31773832_31779720
tx.14180	chr5	+	438	3	NIC	ENSMUSG00000106918.4	novel	478	4	NA	NA	4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	110	junction_1	1111.5	661	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGTCTCTTAGAGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31771303	31779988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_31771367_31773724_31773832_31779720
tx.14181	chr5	+	394	3	FSM	ENSMUSG00000106918.4	ENSMUST00000201923.2	773	3	451	-72	451	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1626	junction_1	353.5	1110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGTCTCTTAGAGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31771946	31779988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31771966_31773724_31773832_31779720
tx.14182	chr5	+	373	2	FSM	ENSMUSG00000106918.4	ENSMUST00000201620.2	2741	2	2368	0	2229	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2333	junction_1	0	1118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCTTGTCTCTTAGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31773724	31779986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31773832_31779720
tx.14183	chr5	-	1026	8	FSM	ENSMUSG00000029136.10	ENSMUST00000031018.10	1042	8	12	4	12	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	7.57816411992848	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACATGGGTGTGGCTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31854959	31781786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_31782001_31805064_31805254_31809152_31809245_31817250_31817416_31823062_31823126_31824204_31824269_31830656_31830790_31854853
tx.14184	chr5	+	1580	12	FSM	ENSMUSG00000052139.19	ENSMUST00000201352.4	1888	12	294	14	8	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	639	junction_9	56.490326824983	1243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCTTCTTTCAAGTCTTT	5846	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31855321	32242292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_31855422_31859169_31859322_31888310_31888388_31942921_31943017_31977821_31978017_31988428_31988504_32058398_32058509_32158704_32158805_32162053_32162125_32164578_32164662_32214854_32215009_32241924
tx.14185	chr5	+	797	5	FSM	ENSMUSG00000029134.15	ENSMUST00000202453.4	2938	5	-32	2173	-32	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	0.707106781186548	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCAGTGTCCATGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32510880	32521691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_32511049_32512129_32512235_32512660_32512757_32519870_32519946_32521338
tx.14186	chr5	+	2364	6	NIC	ENSMUSG00000014956.16	novel	5962	8	NA	NA	18	-5	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	552.155050687757	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAACGTCTGAGTGATTAT	3092	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32616583	32650095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_32616752_32640769_32640809_32642602_32642675_32643224_32643377_32644914_32645050_32648297
tx.14187	chr5	+	2784	8	FSM	ENSMUSG00000014956.16	ENSMUST00000015100.15	5962	8	406	2772	27	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1274	junction_2	51.5470856675363	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAACGTCTGAGTGATTAT	3101	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32616592	32650095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_32616752_32635409_32635542_32638033_32638265_32640703_32640809_32642602_32642675_32643224_32643377_32644914_32645050_32648297
tx.14188	chr5	+	4129	12	FSM	ENSMUSG00000014932.16	ENSMUST00000202543.4	2657	12	8	-1480	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	599	junction_1	80.0238600782178	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTATGTATTCTTTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32768522	32844401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_32768720_32797674_32797948_32802351_32802452_32809000_32809100_32810306_32810411_32810500_32810651_32812449_32812606_32812771_32812952_32816378_32816456_32818095_32818250_32821612_32821745_32841894
tx.14189	chr5	+	2575	2	ISM	ENSMUSG00000014932.16	ENSMUST00000168707.6	2259	13	52998	0	24802	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	877	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTATGTATTCTTTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32821676	32844401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_32821745_32841894
tx.14190	chr5	-	2164	8	FSM	ENSMUSG00000023452.20	ENSMUST00000061895.16	2183	8	16	3	-4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	685	junction_2	53.5235976948867	592	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCGTAGCTTTGTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32942974	32893647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_32894799_32895329_32895491_32895731_32895879_32896125_32896265_32896480_32896718_32922116_32922293_32931739_32931811_32942892
tx.14191	chr5	-	1033	5	NIC	ENSMUSG00000054280.15	novel	9959	11	NA	NA	3	4290	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	86	junction_4	14.456832294801	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTAGAAAAATGTGGTTT	7056	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33011597	32988671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_32988896_32989148_32989203_32992959_32993033_33001387_33001909_33011436
tx.14192	chr5	-	1343	2	NIC	ENSMUSG00000054280.15	novel	9959	11	NA	NA	9	-7759	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	86	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCCCAGAGAAACCTTTGG	7062	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33011591	33000720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_33001909_33011436
tx.14193	chr5	+	1609	2	FSM	ENSMUSG00000018965.12	ENSMUST00000019109.8	1764	2	155	0	93	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1727	junction_1	0	1231	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGCCTGGCCTTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33176314	33185310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_33176499_33183885
tx.14194	chr5	+	750	3	ISM	ENSMUSG00000011034.7	ENSMUST00000011178.5	4104	15	54018	1518	54018	-1518	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGGTTCCTGTCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33315580	33318696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_33315648_33316420_33316530_33318122
tx.14195	chr5	-	1543	5	ISM	ENSMUSG00000037373.13	ENSMUST00000079746.10	2279	9	23935	0	-1506	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	739	junction_1	57.8813441447242	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCTGGCACCAGTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33408403	33405066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_33406031_33406450_33406569_33406930_33407059_33407714_33407846_33408201
tx.14196	chr5	+	2146	9	FSM	ENSMUSG00000079562.8	ENSMUST00000114449.7	2193	9	45	2	-7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	507	junction_4	39.7106723690244	455	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGTGTGAGGTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33492897	33530638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_33492990_33515783_33515967_33517695_33517900_33520038_33520162_33523065_33523143_33525981_33526091_33527774_33527909_33528957_33529154_33529610
tx.14197	chr5	-	725	4	Intergenic	novelGene_1091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7.03957069398096	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTGTGTCTCTGCCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33692869	33641250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_33641417_33642093_33642377_33643280_33643446_33692758
tx.14198	chr5	-	531	3	Intergenic	novelGene_1092	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCGTCCATATTGTGTC	9184	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33643373	33641261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_33641417_33642093_33642377_33643280
tx.14199	chr5	-	1846	5	NIC	ENSMUSG00000037339.18	novel	2009	6	NA	NA	2	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_4	70.1248885917119	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCTGCCTAGATTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33786947	33757696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_33758225_33764807_33765572_33767775_33767831_33771946_33772179_33786680
tx.142	chr1	-	1111	7	NNC	ENSMUSG00000001143.14	novel	689	6	NA	NA	3	919	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72.8180762051719	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTTTATTGTCATTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36484335	36466553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_36466863_36467182_36467298_36467380_36467543_36477830_36477914_36478689_36478808_36482571_36482691_36484130
tx.14200	chr5	-	1973	6	FSM	ENSMUSG00000037339.18	ENSMUST00000065119.15	2009	6	30	6	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_2	26.6187903556867	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCTGCCTAGATTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33786949	33757696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_33758225_33764807_33765572_33767775_33767831_33771946_33772179_33786196_33786322_33786680
tx.14201	chr5	-	1674	8	FSM	ENSMUSG00000004642.14	ENSMUST00000057551.14	1906	8	230	2	1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1110	junction_4	44.1837535937436	1576	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACATTGCCCTATACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33809688	33797400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_33798273_33799244_33799327_33801080_33801231_33802843_33802982_33803353_33803414_33807086_33807192_33809306_33809424_33809538
tx.14202	chr5	-	1804	3	ISM	ENSMUSG00000019295.9	ENSMUST00000140931.2	2369	4	2328	1	-85	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_2	5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATGTACTTCATTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33812915	33810563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_33811959_33812056_33812217_33812666
tx.14203	chr5	-	2341	4	FSM	ENSMUSG00000019295.9	ENSMUST00000019439.9	2828	4	487	0	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_3	8.99382504215469	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACTTCATTTTGTTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33815273	33810559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_33811959_33812056_33812217_33812666_33813142_33814966
tx.14204	chr5	-	2836	4	FSM	ENSMUSG00000019295.9	ENSMUST00000140931.2	2369	4	-468	1	49	-1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	31.3793987620328	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATGTACTTCATTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33815711	33810563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_33811959_33812056_33812217_33812666_33813142_33814905
tx.14205	chr5	+	2338	15	NNC	ENSMUSG00000037313.17	novel	2187	15	NA	NA	10	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	256.734636286941	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAACCCAGGTCCTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33815907	33829542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_33816072_33818565_33818729_33818864_33818990_33821164_33821247_33821481_33822200_33824036_33824090_33824407_33824512_33825306_33825398_33825477_33825580_33826005_33826083_33826161_33826206_33826821_33826992_33828747_33828855_33829008_33829130_33829325
tx.14206	chr5	+	2198	15	FSM	ENSMUSG00000037313.17	ENSMUST00000114426.10	2187	15	-11	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	792	junction_7	83.9525193797308	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAACCCAGGTCCTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33815918	33829542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_33816072_33818565_33818729_33818864_33818990_33821164_33821247_33821610_33822200_33824036_33824090_33824407_33824512_33825306_33825398_33825477_33825580_33826005_33826083_33826161_33826206_33826821_33826992_33828747_33828855_33829008_33829130_33829325
tx.14207	chr5	-	1484	9	ISM	ENSMUSG00000005299.7	ENSMUST00000005431.6	5272	14	21897	2644	-7358	217	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	324	junction_8	49.848363814673	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATTTTTAATTTTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33918264	33899660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_33899957_33900985_33901125_33902359_33902548_33903583_33903719_33904719_33904855_33905504_33905646_33906085_33906218_33909835_33909956_33918066
tx.14208	chr5	-	1934	12	ISM	ENSMUSG00000005299.7	ENSMUST00000005431.6	5272	14	13295	2644	932	217	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	324	junction_8	48.0321861785502	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATTTTTAATTTTCATCA	9461	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33926866	33899660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_33899957_33900985_33901125_33902359_33902548_33903583_33903719_33904719_33904855_33905504_33905646_33906085_33906218_33909835_33909956_33918066_33918271_33918923_33919062_33919802_33919947_33926704
tx.14209	chr5	+	1198	6	ISM	ENSMUSG00000057406.17	ENSMUST00000202525.4	2269	13	6464	-69	117	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	260	junction_1	14.2407864951343	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCATGTGAAATGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34042958	34052839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_34042996_34044595_34044713_34048849_34048992_34049283_34049391_34050748_34050954_34052249
tx.14210	chr5	+	797	2	ISM	ENSMUSG00000057406.17	ENSMUST00000201572.2	537	3	1498	-400	1498	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	279	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCATGTGAAATGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34050746	34052839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_34050954_34052249
tx.14211	chr5	-	2217	11	FSM	ENSMUSG00000029111.8	ENSMUST00000030993.8	2580	11	104	259	-59	-259	multi-exon	FALSE	canonical	3	561	junction_5	32.3241395863834	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCACAGAGCTGTGTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34093653	34055518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_34056254_34056355_34056456_34056625_34056898_34057756_34057869_34058534_34058624_34058931_34059002_34059088_34059220_34060714_34060805_34077835_34077998_34079189_34079362_34093369
tx.14212	chr5	-	2414	3	FSM	ENSMUSG00000029111.8	ENSMUST00000132942.2	1926	3	-35	-453	-35	453	multi-exon	FALSE	canonical	3	633	junction_1	7	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGCTCAAATTGGAATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34093629	34076015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_34077998_34079189_34079362_34093369
tx.14213	chr5	+	335	3	NIC	ENSMUSG00000070858.13	novel	511	4	NA	NA	-4	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_1	15.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGTGTCCTGTATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34140849	34142353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_34140984_34141395_34141485_34142241
tx.14214	chr5	+	400	4	FSM	ENSMUSG00000070858.13	ENSMUST00000094869.12	477	4	73	4	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	12.3648246606609	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGTGTCCTGTATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34140849	34142353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_34140909_34141100_34141241_34141395_34141485_34142241
tx.14215	chr5	+	465	4	FSM	ENSMUSG00000070858.13	ENSMUST00000114383.8	511	4	46	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	4.98887651569859	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGTGTCCTGTATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34140859	34142353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_34140984_34141100_34141241_34141395_34141485_34142241
tx.14216	chr5	+	343	3	FSM	ENSMUSG00000070858.13	ENSMUST00000206020.2	661	3	318	0	221	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	2	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGTGTCCTGTATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34141098	34142353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_34141241_34141395_34141485_34142241
tx.14217	chr5	-	1926	4	ISM	ENSMUSG00000079555.3	ENSMUST00000060049.8	2073	5	1082	11	988	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	453	junction_3	32.3144274623924	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTACTATGCCTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34325789	34311234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_34311451_34320866_34321096_34323259_34323700_34324748
tx.14218	chr5	-	1989	5	FSM	ENSMUSG00000079555.3	ENSMUST00000060049.8	2073	5	73	11	-2	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	397	junction_4	45.778679535347	307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTACTATGCCTGCTGTG	9399	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34326798	34311234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_34311451_34320866_34321096_34323259_34323700_34324748_34325788_34326733
tx.14219	chr5	-	865	2	ISM	ENSMUSG00000079555.3	ENSMUST00000060049.8	2073	5	69	13768	-6	284	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	397	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAGGGCATGCACGAAGT	9395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34326802	34324991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_34325788_34326733
tx.14220	chr5	+	2875	7	NIC	ENSMUSG00000029110.14	novel	2895	8	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	314	junction_1	732.601623591491	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCTTTCATTTATTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34493733	34510780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_34493829_34499865_34500024_34504118_34504246_34506007_34506088_34507255_34507416_34508133_34508183_34508574
tx.14221	chr5	+	2877	7	NNC	ENSMUSG00000029110.14	novel	2895	8	NA	NA	10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	981.947667761486	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCTTTCATTTATTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34493743	34510780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_34493829_34499865_34500024_34504118_34504246_34506007_34506100_34507255_34507416_34508133_34508183_34508574
tx.14222	chr5	+	2920	7	NNC	ENSMUSG00000029110.14	novel	3046	8	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	824.87387924862	449	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCTTTCATTTATTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34493757	34510780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_34493886_34499865_34500024_34504118_34504246_34506007_34506100_34507255_34507416_34508133_34508183_34508574
tx.14223	chr5	+	2906	7	NIC	ENSMUSG00000029110.14	novel	3046	8	NA	NA	-1	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	1293	junction_4	355.934919144872	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCTTTCATTTATTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34493759	34510780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_34493886_34499865_34500024_34504118_34504246_34506007_34506088_34507255_34507416_34508133_34508183_34508574
tx.14224	chr5	+	2614	5	NNC	ENSMUSG00000029110.14	novel	3046	8	NA	NA	-4324	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	963.39669269725	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTATCTTTCATTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34504135	34510777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_34504246_34506007_34506100_34507255_34507416_34508133_34508183_34508574
tx.14225	chr3	+	201	1	Intergenic	novelGene_930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCACAGTTGGACTTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51287985	51288186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_51288000_51288200
tx.14226	chr5	+	1880	4	ISM	ENSMUSG00000037210.17	ENSMUST00000094867.8	3696	17	37747	-709	-2045	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_1	10.6562449087639	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCAGTCTGGTTGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34621427	34643800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_34621549_34622917_34623792_34633069_34633152_34642997
tx.14227	chr5	+	958	2	ISM	ENSMUSG00000037210.17	ENSMUST00000094867.8	3696	17	37750	19334	-2042	7320	internal_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAGAAAGGAGACAGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34621430	34623757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_34621549_34622917
tx.14228	chr5	+	851	2	ISM	ENSMUSG00000037210.17	ENSMUST00000094867.8	3696	17	49423	-709	9631	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCAGTCTGGTTGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34633103	34643800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_34633152_34642997
tx.14229	chr5	-	1996	6	FSM	ENSMUSG00000059866.14	ENSMUST00000087737.10	1987	6	-2	-7	-2	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_2	11.160645142643	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTGGGCTGGAATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34671337	34653423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_34654295_34656523_34656644_34656831_34657081_34658251_34658342_34660880_34661172_34670962
tx.14230	chr5	-	2188	5	NIC	ENSMUSG00000059866.14	novel	1987	6	NA	NA	-6	7	intron_retention	FALSE	canonical	3	117	junction_4	10.0623058987491	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTGGGCTGGAATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34671341	34653423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_34654295_34656523_34657081_34658251_34658342_34660880_34661172_34670962
tx.14231	chr5	-	1469	11	ISM	ENSMUSG00000001082.13	ENSMUST00000001109.11	1907	13	665	3	-2	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	347	junction_7	33.037705731482	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTCCGTCTTACTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34793868	34790988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_34791359_34791474_34791565_34791636_34791685_34791766_34791858_34791934_34792044_34792194_34792307_34792394_34792504_34792713_34792876_34792952_34793112_34793364_34793469_34793753
tx.14232	chr5	-	1865	13	FSM	ENSMUSG00000001082.13	ENSMUST00000001109.11	1907	13	39	3	-10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_12	65.1670929227321	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTCCGTCTTACTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34794494	34790988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_34791359_34791474_34791565_34791636_34791685_34791766_34791858_34791934_34792044_34792194_34792307_34792394_34792504_34792713_34792876_34792952_34793112_34793364_34793469_34793753_34793851_34793937_34794128_34794270
tx.14233	chr5	-	1738	13	FSM	ENSMUSG00000001082.13	ENSMUST00000114331.10	1754	13	16	0	-4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	36	junction_12	99.4937183946806	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTCCGTCTTACTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34794540	34790989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_34791359_34791474_34791565_34791636_34791685_34791766_34791858_34791934_34792044_34792194_34792307_34792394_34792504_34792713_34792876_34792952_34793112_34793364_34793469_34793753_34793851_34793937_34794128_34794442
tx.14234	chr5	-	2671	18	FSM	ENSMUSG00000036693.13	ENSMUST00000041364.13	2702	18	31	0	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	557	junction_10	61.2066102226557	291	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAAGGCTGTGTGGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34817461	34795879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_34795996_34796234_34796391_34796528_34796648_34798213_34798362_34798666_34798827_34801269_34801424_34802056_34802159_34804505_34804642_34805735_34805822_34806680_34806812_34807669_34807965_34809093_34809226_34809639_34809763_34811226_34811362_34811779_34811914_34814084_34814227_34815218_34815354_34817194
tx.14235	chr5	-	1441	8	FSM	ENSMUSG00000029103.17	ENSMUST00000030986.15	2981	8	62	1478	-8	90	multi-exon	FALSE	canonical	3	809	junction_2	73.9092107153867	303	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTCGAGTCCTTGCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35263048	35250322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_35250731_35252193_35252371_35253319_35253403_35254874_35255034_35255496_35255618_35256500_35256623_35259738_35259884_35262822
tx.14236	chr5	-	2786	11	FSM	ENSMUSG00000029097.12	ENSMUST00000030980.12	3790	11	-1	1005	-1	-1005	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_3	7.3	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCCAAGGGCTTCACAGCA	7625	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35732415	35714551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_35715400_35719835_35719953_35721366_35721800_35722704_35722889_35723765_35723873_35726104_35726177_35727214_35727323_35728387_35728457_35730046_35730267_35731423_35731539_35731902
tx.14237	chr5	-	2056	9	ISM	ENSMUSG00000029097.12	ENSMUST00000030980.12	3790	11	2250	1005	1854	-1005	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_3	8.07677998957505	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCCAAGGGCTTCACAGCA	9876	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35730164	35714551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_35715400_35719835_35719953_35721366_35721800_35722704_35722889_35723765_35723873_35726104_35726177_35727214_35727323_35728387_35728457_35730046
tx.14238	chr5	-	3748	11	NNC	ENSMUSG00000029097.12	novel	3790	11	NA	NA	8	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_9	21.9474372080204	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTCCCAATTTAATAGAAATA	7634	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35732406	35713551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_35715400_35719835_35719953_35721366_35721800_35722704_35722889_35723765_35723873_35726104_35726177_35727214_35727323_35728387_35728457_35730046_35730238_35731423_35731539_35731902
tx.14239	chr5	-	529	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029098.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCTTCAAATTACATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35780414	35769920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_35770341_35780305
tx.14240	chr5	+	952	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036553.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATTTGTGGTCATGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35856147	35859909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_35856270_35858548_35858760_35859290
tx.14241	chr5	+	1117	9	NIC	ENSMUSG00000029095.18	novel	2579	18	NA	NA	-2233	11	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	41	junction_6	17.726657186283	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCCTAAGAATGTGAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35969469	36015541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_35969564_35981368_35981457_35985467_35985527_35990396_35990475_35994291_35994442_35998624_35998746_36006147_36006250_36014471_36014525_36015169
tx.14242	chr5	+	975	4	FSM	ENSMUSG00000029198.4	ENSMUST00000031099.4	3528	4	170	2383	170	-2383	multi-exon	FALSE	canonical	3	2567	junction_1	75.3126815350509	7906	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATGCTGCACAGTCTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36622511	36629041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_36622600_36626781_36626945_36627945_36628028_36628399
tx.14243	chr5	-	1564	2	FSM	ENSMUSG00000055302.6	ENSMUST00000068795.4	1648	2	37	47	37	-47	multi-exon	FALSE	canonical	3	1678	junction_1	0	1523	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGCCCGGAGAGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36954079	36952257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_36953289_36953546
tx.14244	chr5	-	1572	8	ISM	ENSMUSG00000029119.10	ENSMUST00000031002.10	3330	19	15977	-14	-1713	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	157	junction_7	33.0448056988306	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGACCTCTCTTTTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36972020	36964250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_36964555_36965129_36965248_36966347_36966461_36967635_36967753_36970290_36970505_36970612_36970724_36971075_36971323_36971672
tx.14246	chr5	+	564	2	NNC	ENSMUSG00000063646.19	novel	849	3	NA	NA	0	-45912	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATCTGCTGAGTGCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37185678	37196742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_37185944_37196443
tx.14247	chr5	+	2533	13	NIC	ENSMUSG00000063646.19	novel	2496	20	NA	NA	-4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	99	junction_1	26.6327909832138	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCCTTTTTTATTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37185674	37282643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_37185944_37242579_37242843_37248470_37248966_37257979_37258190_37259108_37259229_37262156_37262304_37262954_37263096_37264602_37264663_37274785_37274915_37276122_37276252_37278284_37278369_37280623_37280687_37282220
tx.14248	chr5	+	666	3	ISM	ENSMUSG00000063646.19	ENSMUST00000212047.2	1191	6	7318	0	-2130	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	187	junction_1	1	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCCTTTTTTATTTGTG	1902	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37278188	37282643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_37278369_37280623_37280687_37282220
tx.14249	chr5	+	489	2	FSM	ENSMUSG00000063646.19	ENSMUST00000126527.3	516	2	302	-275	302	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCCTTTTTTATTTGTG	59	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37280620	37282643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_37280687_37282220
tx.14250	chr5	+	949	5	ISM	ENSMUSG00000050248.12	ENSMUST00000101258.5	2796	12	-133	36314	-24	-36314	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_3	3.16227766016838	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGAGGAAGAGTTTATTTC	8818	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37495818	37508794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_37496072_37504783_37504853_37505931_37506119_37507682_37507793_37508464
tx.14251	chr5	+	1722	9	NNC	ENSMUSG00000050248.12	novel	2796	12	NA	NA	-9	-15381	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_8	11.0227038425243	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATGACTCCCAATAGCAT	8833	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37495833	37529727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_37496072_37504783_37504853_37505931_37506119_37507682_37507793_37508464_37508519_37514743_37514879_37520860_37521001_37527867_37528193_37529263
tx.14253	chr5	+	1548	11	FSM	ENSMUSG00000029125.15	ENSMUST00000114126.9	3002	11	508	946	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_9	9.96794863550169	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTGCAGTCAGTGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38196593	38294163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_38196844_38249856_38249925_38262221_38262338_38263907_38263986_38264169_38264237_38273428_38273542_38278554_38278644_38284275_38284335_38285387_38285458_38292565_38292647_38293606
tx.14254	chr5	+	999	7	ISM	ENSMUSG00000029125.15	ENSMUST00000042146.15	1473	10	67612	4	-4179	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_5	10.2902326936221	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTGCAGTCAGTGAGTC	3827	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38264206	38294163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_38264237_38273428_38273542_38278554_38278644_38284275_38284335_38285387_38285458_38292565_38292647_38293606
tx.14255	chr5	-	1684	5	FSM	ENSMUSG00000029126.8	ENSMUST00000031009.8	2581	5	431	466	-3	-466	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_1	2.8613807855649	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGATTGTTTTCTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38316820	38295001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_38296217_38302052_38302164_38312951_38313069_38316220_38316376_38316734
tx.14256	chr5	-	1620	4	ISM	ENSMUSG00000029126.8	ENSMUST00000201363.4	820	5	306	-839	-68	431	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_1	2.16024689946929	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGTAGGTAAACTAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38316443	38295047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_38296217_38302052_38302164_38312951_38313069_38316220
tx.14257	chr5	+	1606	10	NIC	ENSMUSG00000067367.10	novel	1563	9	NA	NA	-6	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	190	junction_2	843.03156656333	196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTGTATCTATGATAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38377857	38391643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_38377980_38380477_38380572_38381970_38382142_38383232_38383348_38385198_38385307_38385393_38385478_38387904_38388335_38388616_38388704_38390585_38390672_38391334
tx.14258	chr5	+	1511	9	FSM	ENSMUSG00000067367.10	ENSMUST00000087514.9	1563	9	45	7	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2026	junction_5	151.553981719386	1346	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTGTATCTATGATAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38377858	38391643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_38377980_38381970_38382142_38383232_38383348_38385198_38385307_38385393_38385478_38387904_38388335_38388616_38388704_38390585_38390672_38391334
tx.14259	chr5	+	787	4	ISM	ENSMUSG00000067367.10	ENSMUST00000114106.8	1504	9	10008	-3	6038	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2295	junction_2	61.0700872404449	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTGTATCTATGATAACAA	NA	False	NA	20	True	NA	NA	NA	38388029	38391643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_38388335_38388616_38388704_38390585_38390672_38391334
tx.14260	chr5	+	726	5	FSM	ENSMUSG00000067365.12	ENSMUST00000119047.8	726	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	95.0167748347627	238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCTTTTTATACTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38417727	38425251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_38417837_38419340_38419483_38422155_38422315_38424522_38424629_38425041
tx.14261	chr5	+	1084	5	FSM	ENSMUSG00000067365.12	ENSMUST00000087511.10	1291	5	199	8	0	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_4	19.5751756058534	939	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTGCATTTGGTTAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38417727	38426970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_38417837_38419340_38419483_38422155_38422315_38424522_38424629_38426402
tx.14272	chr5	-	1558	6	NIC	ENSMUSG00000029128.13	novel	1635	7	NA	NA	-8	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	38	junction_4	194.631549343882	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTTGGGATTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41865508	41782317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_41783206_41790515_41790594_41793148_41793253_41845063_41845194_41860780_41860878_41865247
tx.14273	chr5	-	1647	7	FSM	ENSMUSG00000029128.13	ENSMUST00000031011.12	1635	7	-12	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	424	junction_3	45.374980869295	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTTGGGATTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41865509	41782318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_41783206_41790515_41790594_41793148_41793253_41845063_41845194_41855732_41855822_41860780_41860878_41865247
tx.14275	chr5	-	1856	2	FSM	ENSMUSG00000104846.2	ENSMUST00000197178.2	372	2	-34	-1450	-34	1450	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGAGTCTCCTATGTAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43512636	43508939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_43510700_43512540
tx.14277	chr5	-	2841	11	FSM	ENSMUSG00000039753.17	ENSMUST00000047857.16	2858	11	17	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	499	junction_3	32.2155242080584	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTTTTGTGTTGTGATTT	8845	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43939475	43901957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_43902718_43908203_43908353_43915563_43916287_43917084_43917168_43918048_43918198_43920158_43920285_43922650_43922834_43925405_43925593_43928078_43928175_43930785_43931002_43939306
tx.14281	chr5	-	1207	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029084.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTTCGCTGGTTTCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44026453	44020796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_44021648_44025879_44026040_44026257
tx.14282	chr5	+	2802	8	FSM	ENSMUSG00000029084.6	ENSMUST00000030964.6	3270	8	271	197	-36	-197	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_4	17.0353773551587	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAAAGTATTTGCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44026165	44069520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_44026463_44057674_44057805_44058762_44058899_44060936_44061023_44063505_44063580_44064854_44064948_44065264_44065352_44067621
tx.14284	chr5	-	1112	6	ISM	ENSMUSG00000015806.13	ENSMUST00000117425.8	1231	7	543	0	543	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	819	junction_4	96.2330504556517	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTGTCTTTTTCACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45604972	45591394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_45592021_45595184_45595269_45596626_45596736_45600778_45600920_45601988_45602086_45604917
tx.14285	chr5	-	1340	7	FSM	ENSMUSG00000015806.13	ENSMUST00000015950.12	1380	7	40	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	819	junction_4	94.8542741964395	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTGTCTTTTTCACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45607538	45591394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_45592021_45595184_45595269_45596626_45596736_45600778_45600920_45601988_45602086_45604917_45605011_45607348
tx.14286	chr5	+	1801	13	FSM	ENSMUSG00000039682.13	ENSMUST00000046122.11	2267	13	56	410	56	-410	multi-exon	FALSE	canonical	3	2266	junction_5	182.488412874169	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCATTTTCAAGCCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45650771	45669623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_45650904_45652507_45652624_45654261_45654317_45654670_45654777_45655775_45655936_45657744_45657910_45660721_45660881_45662064_45662190_45663515_45663605_45664448_45664552_45666779_45666860_45668449_45668560_45669222
tx.14287	chr5	+	1489	10	ISM	ENSMUSG00000039682.13	ENSMUST00000046122.11	2267	13	3963	411	-893	-411	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2266	junction_2	190.190417901976	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATGCATTTTCAAGCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45654678	45669622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_45654777_45655775_45655936_45657744_45657910_45660721_45660881_45662064_45662190_45663515_45663605_45664448_45664552_45666779_45666860_45668449_45668560_45669222
tx.14288	chr5	+	813	4	FSM	ENSMUSG00000015804.15	ENSMUST00000156481.8	4560	4	72	3675	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1736	junction_3	82.366390124991	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTTGTTGTTTGTATTC	7404	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45677642	45682943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_45677827_45679777_45679845_45680763_45680877_45682494
tx.14295	chr5	+	1574	9	FSM	ENSMUSG00000029089.9	ENSMUST00000030968.7	1616	9	42	0	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_5	8.92941067484299	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTAGTTCTACATATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48529712	48546187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_48529838_48531521_48531590_48531725_48531881_48532884_48532953_48534416_48534508_48536671_48536807_48537465_48537574_48539128_48539210_48545444
tx.14297	chr5	-	1621	2	ISM	ENSMUSG00000029090.13	ENSMUST00000030971.7	4480	19	97298	-1	10367	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	448	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATTGTGCTGGTGGCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50119050	50117296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_50118857_50118989
tx.14299	chr5	-	1588	8	ISM	ENSMUSG00000029169.12	ENSMUST00000031061.12	3010	14	27898	11	-983	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	782	junction_5	38.2878464225068	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGCCCAAGTCCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52319958	52307555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_52308121_52309151_52309322_52311378_52311570_52314796_52314920_52317571_52317764_52318234_52318344_52318928_52319079_52319870
tx.143	chr1	-	875	4	FSM	ENSMUSG00000079610.10	ENSMUST00000194894.4	664	4	12	-223	0	223	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	19.6015872373189	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATGGGCAAAGATAAATTT	7026	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36586300	36578217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_36578616_36580904_36581144_36581842_36581947_36586166
tx.14300	chr5	-	2997	14	FSM	ENSMUSG00000029169.12	ENSMUST00000031061.12	3010	14	2	11	2	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	749	junction_10	48.0023421519305	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGCCCAAGTCCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52347854	52307555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_52308121_52309151_52309322_52311378_52311570_52314796_52314920_52317571_52317764_52318234_52318344_52318928_52319079_52319870_52319958_52324042_52324211_52327262_52327482_52328765_52328926_52338323_52338518_52341809_52342246_52347621
tx.14301	chr5	-	337	2	ISM	ENSMUSG00000029169.12	ENSMUST00000199321.5	2550	12	-21	31072	4	17	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	854	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTGAGAGCTTCCACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52347852	52342139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_52342246_52347621
tx.14307	chr5	+	2687	28	FSM	ENSMUSG00000029176.14	ENSMUST00000031072.14	3854	28	104	1063	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_6	48.5716418249863	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTCATACTCTGTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52991457	53024076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_52991735_52993019_52993126_52996963_52997097_52999057_52999133_52999246_52999274_52999365_52999411_53000162_53000248_53000828_53000934_53002665_53002750_53003973_53004061_53005332_53005398_53005935_53005979_53006096_53006174_53007799_53007901_53007984_53008037_53012925_53012982_53013185_53013233_53014149_53014207_53014512_53014570_53016454_53016549_53018584_53018683_53019290_53019353_53019432_53019472_53019563_53019666_53020928_53021004_53021820_53021995_53023235_53023360_53023736
tx.14308	chr5	+	912	3	FSM	ENSMUSG00000061461.12	ENSMUST00000147148.5	922	3	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	318	junction_1	5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGCTGGTGTGTACTGTT	3417	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53424489	53435882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_53424701_53434484_53434542_53435238
tx.14321	chr5	-	3049	7	FSM	ENSMUSG00000047881.15	ENSMUST00000154169.4	3241	7	14	178	14	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	376	junction_5	64.4360147743481	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGCTTGAATGAGCGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64126226	64066417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_64068495_64082077_64082217_64084331_64084569_64087820_64087879_64093365_64093438_64095148_64095377_64125988
tx.14323	chr5	+	2224	14	FSM	ENSMUSG00000029171.13	ENSMUST00000087324.7	2369	14	-10	155	-10	32	multi-exon	FALSE	canonical	3	609	junction_6	76.13589532023	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATGTCTTCTGTGTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64250282	64285539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_64250432_64254321_64254490_64258289_64258397_64260196_64260282_64260719_64260804_64261056_64261251_64263097_64263288_64263950_64264049_64265011_64265193_64265512_64265607_64267858_64267989_64269350_64269541_64273642_64273777_64285119
tx.14329	chr5	+	918	4	NNC	ENSMUSG00000029178.15	novel	4016	3	NA	NA	-5464	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_1	319.679005670793	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGATGTGCTGTGGATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64955266	64980452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_64955374_64974077_64974174_64979216_64979701_64980221
tx.14333	chr5	-	550	2	NNC	ENSMUSG00000037913.13	novel	1012	8	NA	NA	33831	2985	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTTGGTACTGGTGCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65215096	65208703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_65209129_65214971
tx.14337	chr5	-	371	4	FSM	ENSMUSG00000029191.17	ENSMUST00000203644.2	485	4	-32	146	-24	-146	multi-exon	FALSE	canonical	3	537	junction_1	39.3474550920669	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAAAAATTGTCACTGTC	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	65492988	65468459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_65468507_65470300_65470377_65476747_65476874_65492866
tx.14341	chr5	-	1033	7	ISM	ENSMUSG00000047215.15	ENSMUST00000057885.13	738	8	88	0	24	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8565	junction_1	2258.85099233118	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTGTCCTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65548699	65545706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_65545785_65545904_65546023_65546413_65546495_65546820_65546954_65547730_65547827_65548081_65548198_65548288
tx.14342	chr5	-	720	8	NIC	ENSMUSG00000047215.15	novel	738	8	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	29	junction_1	5016.85754964892	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTGTCCTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65548743	65545706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_65545811_65545904_65546023_65546413_65546495_65546820_65546954_65547730_65547827_65548081_65548198_65548288_65548336_65548718
tx.14343	chr5	-	814	7	FSM	ENSMUSG00000047215.15	ENSMUST00000120094.5	680	7	-20	-114	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5084	junction_6	3284.20622914511	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTGTCCTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65548743	65545706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_65546023_65546413_65546495_65546820_65546954_65547730_65547827_65548081_65548198_65548288_65548336_65548718
tx.14344	chr5	-	717	8	FSM	ENSMUSG00000047215.15	ENSMUST00000057885.13	738	8	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5084	junction_7	3201.89202994551	4182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTGTCCTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65548766	65545706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_65545785_65545904_65546023_65546413_65546495_65546820_65546954_65547730_65547827_65548081_65548198_65548288_65548336_65548718
tx.14345	chr5	-	406	5	ISM	ENSMUSG00000047215.15	ENSMUST00000120094.5	680	7	-20	1011	-1	-572	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5084	junction_4	3071.29715063522	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAGGACAGGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65548743	65546831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_65546954_65547730_65547827_65548081_65548198_65548288_65548336_65548718
tx.14346	chr5	+	1598	11	FSM	ENSMUSG00000029199.12	ENSMUST00000122026.6	1668	11	56	14	9	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_10	33.1264244976726	647	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGATTTATTTTTATTTGC	6942	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65548895	65566536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_65549017_65549562_65549733_65551283_65551378_65552707_65552789_65554945_65555103_65555173_65555232_65557189_65557319_65559953_65560100_65561510_65561582_65562672_65562785_65566077
tx.14347	chr5	-	1142	5	FSM	ENSMUSG00000037822.13	ENSMUST00000139122.8	4560	5	458	2960	-61	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_4	15.1410039297267	582	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTTGGTTTAGAATCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65650285	65607146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_65607781_65610528_65610672_65617866_65617916_65625735_65625845_65650078
tx.14348	chr5	-	1008	5	FSM	ENSMUSG00000037822.13	ENSMUST00000121661.8	1056	5	47	1	47	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_4	163.329421721869	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTTGGTTTAGAATCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65650356	65607146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_65607781_65610528_65610672_65617866_65617916_65625735_65625845_65650283
tx.14349	chr5	+	893	6	FSM	ENSMUSG00000029203.17	ENSMUST00000202679.4	4682	6	5	3784	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	526	junction_1	338.408628731597	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGAAATACTTTTAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65694638	65752488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_65694890_65728874_65728934_65738728_65738812_65749218_65749319_65751762_65751892_65752217
tx.14350	chr5	+	991	7	NNC	ENSMUSG00000029203.17	novel	4893	7	NA	NA	5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	503.727025944277	3175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGAAATACTTTTAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65694638	65752488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_65694890_65723331_65723430_65728874_65728934_65738728_65738812_65749218_65749319_65751762_65751892_65752217
tx.14351	chr5	-	450	3	NNC	ENSMUSG00000029202.13	novel	2705	16	NA	NA	-8366	-227	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	79	junction_2	199.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGTTGTTTGGCTGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65863982	65823522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_65823655_65854105_65854281_65863839
tx.14352	chr5	+	856	2	NNC	ENSMUSG00000029205.13	novel	550	2	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGTTTGAGTTCAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66133238	66134669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_66133474_66134048
tx.14353	chr5	-	1238	4	ISM	ENSMUSG00000070780.12	ENSMUST00000113724.6	2186	5	54830	-233	28283	-150	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_3	4.02768199119819	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCACACCCGCGCATCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66183612	66176094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_66176780_66179970_66180177_66182295_66182503_66183472
tx.14355	chr5	+	579	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029207.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACACGTGCTTGTATCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66499841	66502880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_66499939_66500078_66500212_66502531
tx.14356	chr5	+	654	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029207.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	3.29983164553722	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACACGTGCTTGTATCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66499851	66502880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_66499939_66500078_66500212_66500896_66500982_66502531
tx.14357	chr5	+	747	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029207.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2.5	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACACGTGCTTGTATCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66499898	66502880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_66500212_66500896_66500982_66502531
tx.14358	chr5	-	750	4	FSM	ENSMUSG00000029207.17	ENSMUST00000161936.2	629	4	-118	-3	-6	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_3	18.624953392932	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACATGTGTGTTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66776133	66619253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_66619510_66649400_66649516_66700804_66700961_66775910
tx.14359	chr5	-	643	3	ISM	ENSMUSG00000029207.17	ENSMUST00000161936.2	629	4	-22	29899	-6	-29899	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_2	22.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGTTATCTAAATTAGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66776037	66649155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_66649516_66700804_66700961_66775910
tx.14361	chr5	+	1014	8	NIC	ENSMUSG00000029223.13	novel	1177	9	NA	NA	-3	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	178.588113506231	2237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGCTGGTTTTTATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66833581	66844574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_66833666_66834286_66834416_66837005_66837157_66839784_66839871_66839951_66840000_66841031_66841099_66842115_66842175_66844184
tx.14362	chr5	-	847	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000107300.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTATTGTATGGGAATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66847297	66844670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_66845383_66847162
tx.14363	chr5	+	1639	9	FSM	ENSMUSG00000037720.17	ENSMUST00000160352.8	5322	9	-18	3701	-17	1101	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_8	122.604483502847	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGATTTCTAATGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67418021	67445103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_67418150_67418306_67418377_67421072_67421168_67421612_67421801_67424644_67424713_67425853_67425988_67441482_67441567_67443438_67443560_67444352
tx.14364	chr5	+	1201	8	FSM	ENSMUSG00000037720.17	ENSMUST00000037918.12	6247	8	117	4929	-14	-127	multi-exon	FALSE	canonical	3	347	junction_1	43.3504937240909	604	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGAAATTTGTTTTACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67418024	67443875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_67418150_67418306_67418377_67421072_67421168_67421612_67421801_67424644_67424713_67425853_67425988_67441482_67441567_67443438
tx.14365	chr5	+	1093	7	FSM	ENSMUSG00000037720.17	ENSMUST00000161369.3	6164	7	142	4929	51	-127	multi-exon	FALSE	canonical	3	385	junction_4	35.264476932649	380	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGAAATTTGTTTTACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67418289	67443875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_67418377_67421072_67421168_67421612_67421801_67424644_67424713_67425853_67425988_67441482_67441567_67443438
tx.14366	chr5	+	597	4	FSM	ENSMUSG00000029208.17	ENSMUST00000125660.3	6321	4	1482	4242	1482	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_2	10.6144555520604	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGGTGTTCTCTGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69725548	69729074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_69725841_69726571_69726692_69728103_69728141_69728926
tx.14367	chr5	-	1852	7	FSM	ENSMUSG00000029209.16	ENSMUST00000031117.13	1894	7	44	-2	-3	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	104	junction_4	11.5998084275369	319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATCTCATTTTCTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69749639	69732341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_69733297_69735320_69735496_69736850_69737036_69742316_69742500_69743807_69743910_69747003_69747167_69749550
tx.14368	chr5	-	597	3	FSM	ENSMUSG00000049387.11	ENSMUST00000050129.6	542	3	-50	-5	-50	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_2	6	237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTTGTTGAAAACTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71705598	71600161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_71600613_71660793_71660857_71705515
tx.14369	chr5	-	515	2	ISM	ENSMUSG00000049387.11	ENSMUST00000050129.6	542	3	44691	-5	44691	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTTGTTGAAAACTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71660857	71600161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_71600613_71660793
tx.14370	chr5	-	1452	5	FSM	ENSMUSG00000029213.12	ENSMUST00000013693.11	3895	5	9	2434	9	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	313	junction_3	25.4889682019496	1599	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGTTGCTTGATTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72325523	72316351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_72317237_72318250_72318407_72320064_72320218_72322693_72322850_72325421
tx.14371	chr5	+	782	3	FSM	ENSMUSG00000046808.18	ENSMUST00000169617.3	761	3	-24	3	-24	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGGATGGGGTGTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72360647	72387815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_72360907_72384974_72385302_72387619
tx.14372	chr5	+	1469	6	FSM	ENSMUSG00000067219.10	ENSMUST00000087212.8	4206	6	-7	2744	-7	711	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAACTTTGCTC	2032	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72805130	72825677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_72805277_72816024_72816292_72818098_72818156_72820876_72820968_72824118_72824280_72824930
tx.14373	chr5	+	771	7	FSM	ENSMUSG00000029152.14	ENSMUST00000166823.5	3354	7	15	2568	1	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	746	junction_1	115.10683443364	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTATGTATACACTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73450150	73464140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_73450320_73451627_73451691_73452268_73452350_73458006_73458061_73460934_73460983_73461891_73462028_73463920
tx.14374	chr5	+	1432	10	NIC	ENSMUSG00000029152.14	novel	1523	9	NA	NA	-7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	159	junction_1	326.119874953224	410	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTGTCATTCACATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73450142	73471284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_73450320_73451308_73451354_73451627_73451691_73452268_73452350_73458006_73458061_73460934_73460983_73461891_73462028_73463920_73464097_73467616_73467770_73470785
tx.14375	chr5	+	1380	9	FSM	ENSMUSG00000029152.14	ENSMUST00000031038.11	1523	9	15	128	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	746	junction_1	106.002063659157	2265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTGTCATTCACATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73450149	73471284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_73450320_73451627_73451691_73452268_73452350_73458006_73458061_73460934_73460983_73461891_73462028_73463920_73464097_73467616_73467770_73470785
tx.14376	chr5	-	708	7	FSM	ENSMUSG00000029153.12	ENSMUST00000087195.9	2554	7	379	1467	-55	-320	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_6	41.8107508768844	357	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTAATTCTCTCACCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73495956	73481008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_73481191_73483623_73483742_73485005_73485054_73486609_73486664_73489446_73489544_73493162_73493289_73495873
tx.14377	chr5	+	4090	11	FSM	ENSMUSG00000051674.16	ENSMUST00000063882.12	4116	11	26	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	17.7721692542019	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGATTTGTGGGGTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73648401	73718133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_73648535_73668228_73668300_73668469_73668510_73677458_73677574_73679995_73680088_73688846_73688918_73691948_73692041_73701389_73701499_73712701_73712807_73714596_73714700_73714974
tx.14378	chr5	-	3086	8	NNC	ENSMUSG00000029156.12	novel	3786	6	NA	NA	-18602	-875	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	30.3052497641136	17	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTTTTACTAAATCCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73823735	73790966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_73793042_73796725_73796858_73797131_73797324_73798025_73798212_73801614_73801825_73817744_73817831_73823363_73823482_73823648
tx.14379	chr5	-	1256	6	FSM	ENSMUSG00000029156.12	ENSMUST00000081170.9	3786	6	53	2477	53	-2477	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_5	18.2756668824971	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACATTCTACTATATCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73805080	73792568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_73793042_73796725_73796858_73797131_73797324_73798025_73798212_73801614_73801825_73805017
tx.14380	chr5	-	1193	5	ISM	ENSMUSG00000029156.12	ENSMUST00000081170.9	3786	6	3307	2479	-15	-2479	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_3	13.7727085208393	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAACATTCTACTATATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73801826	73792570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_73793042_73796725_73796858_73797131_73797324_73798025_73798212_73801614
tx.14381	chr5	-	853	4	ISM	ENSMUSG00000029156.12	ENSMUST00000081170.9	3786	6	7045	2484	3723	-2484	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_3	3.55902608401044	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTTTTAACATTCTACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73798088	73792575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_73793042_73796725_73796858_73797131_73797324_73798025
tx.14382	chr5	-	771	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029155.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGGATGTAAGGCATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73823724	73817253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_73817831_73823363_73823482_73823648
tx.14383	chr5	+	1738	2	FSM	ENSMUSG00000106968.2	ENSMUST00000202711.2	848	2	1	-891	1	891	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGACTTTTATGTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74103724	74106610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_74103968_74105115
tx.14384	chr5	-	3159	9	NIC	ENSMUSG00000054814.15	novel	4557	9	NA	NA	6	-1312	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	126	junction_8	53.0377224247045	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTGCAGCTAATTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74226403	74160698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_74162799_74163345_74163425_74163815_74164014_74166484_74166569_74177320_74177398_74189801_74190032_74192964_74193179_74197693_74197775_74226307
tx.14385	chr5	-	3223	9	FSM	ENSMUSG00000054814.15	ENSMUST00000068058.14	4557	9	22	1312	11	-1312	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_8	42.7755771439732	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTGCAGCTAATTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74229070	74160698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_74162799_74163345_74163425_74163815_74164014_74166484_74166569_74177320_74177398_74189801_74190032_74192964_74193179_74197693_74197775_74228910
tx.14386	chr5	-	339	3	ISM	ENSMUSG00000054814.15	ENSMUST00000068058.14	4557	9	22	33694	11	-3104	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	162	junction_2	60.5	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGAAAACCTGTTGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74229070	74193080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_74193179_74197693_74197775_74228910
tx.14387	chr5	+	572	3	FSM	ENSMUSG00000106943.3	ENSMUST00000120364.2	575	3	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	23.5	651	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTTGTTCACTTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74253740	74254998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_74253801_74254018_74254081_74254548
tx.14388	chr5	+	325	2	FSM	ENSMUSG00000106943.3	ENSMUST00000117249.2	1036	2	36	675	36	-675	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	0	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCATTTAAAACTTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74253779	74254322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_74253801_74254018
tx.14389	chr5	+	750	2	NIC	ENSMUSG00000106943.3	novel	575	3	NA	NA	37	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	119	junction_1	0	315	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTTGTTCACTTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74253780	74254998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_74254081_74254548
tx.14390	chr5	+	1810	4	FSM	ENSMUSG00000049907.9	ENSMUST00000051937.9	1812	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	1.4142135623731	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGACTGGGTCTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74355948	74360142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_74356252_74356763_74356821_74357927_74358005_74358769
tx.14391	chr5	+	685	2	FSM	ENSMUSG00000049907.9	ENSMUST00000183995.2	334	2	-157	-194	2	194	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACCCAACCAAACAAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74355948	74357145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_74356252_74356763
tx.14392	chr5	-	2392	9	FSM	ENSMUSG00000062110.15	ENSMUST00000072857.13	3672	9	7	1273	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	6.19979838381862	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTCAAGCTGTCGCTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74692403	74366749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_74367057_74372911_74373032_74385975_74386111_74397099_74397246_74558314_74558565_74623220_74623397_74642810_74642939_74680144_74680314_74691442
tx.14393	chr5	+	2086	17	NIC	ENSMUSG00000029227.16	novel	4769	18	NA	NA	1	8	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	220	junction_12	176.742209428733	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGTCTTGTAATATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74696140	74756814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_74696423_74697461_74697507_74697602_74697643_74701592_74701651_74702669_74702774_74706072_74706138_74706713_74706822_74707355_74707487_74717700_74717811_74725179_74725288_74731759_74731854_74733089_74733247_74747663_74747719_74748805_74748862_74752434_74752655_74755734_74755873_74756499
tx.14394	chr5	+	2004	17	FSM	ENSMUSG00000029227.16	ENSMUST00000080164.12	4673	17	32	2637	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_9	134.520909155417	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGTCTTGTAATATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74696141	74756814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_74696423_74697461_74697507_74697602_74697643_74701592_74701651_74702669_74702774_74706072_74706138_74706713_74706822_74707355_74707487_74717700_74717811_74731759_74731854_74733089_74733247_74745706_74745734_74747663_74747719_74748805_74748862_74752434_74752655_74755734_74755873_74756499
tx.14395	chr5	+	2108	18	FSM	ENSMUSG00000029227.16	ENSMUST00000113536.8	4769	18	14	2647	1	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	259	junction_9	161.909389842069	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGTCTTGTAATATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74696145	74756814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_74696423_74697461_74697507_74697602_74697643_74701592_74701651_74702669_74702774_74706072_74706138_74706713_74706822_74707355_74707487_74717700_74717811_74725179_74725288_74731759_74731854_74733089_74733247_74745706_74745734_74747663_74747719_74748805_74748862_74752434_74752655_74755734_74755873_74756499
tx.14396	chr5	+	553	3	ISM	ENSMUSG00000029227.16	ENSMUST00000113535.9	1969	16	56413	-8	-2826	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	796	junction_2	10	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGTCTTGTAATATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74752554	74756814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_74752655_74755734_74755873_74756499
tx.14397	chr5	+	456	2	FSM	ENSMUSG00000029227.16	ENSMUST00000125129.3	584	2	351	-223	351	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	796	junction_1	0	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGTCTTGTAATATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74755731	74756814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_74755873_74756499
tx.14398	chr5	-	423	2	Intergenic	novelGene_1097	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTGGTGAATGTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75142401	75140804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_75141014_75142187
tx.14399	chr5	-	808	6	FSM	ENSMUSG00000029229.9	ENSMUST00000075452.7	9699	6	460	8431	7	4761	multi-exon	FALSE	canonical	3	625	junction_4	34.4290574950869	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGCAGCCTTTGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75204975	75167079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_75167425_75171891_75171952_75172113_75172171_75187728_75187885_75188021_75188077_75204840
tx.144	chr1	-	841	4	FSM	ENSMUSG00000079610.10	ENSMUST00000001172.12	2109	4	226	1042	0	224	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_3	11.5566238822398	244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGGGCAAAGATAAATTTC	7026	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36586300	36578216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_36578616_36580939_36581144_36581842_36581947_36586166
tx.14400	chr5	-	561	2	Intergenic	novelGene_1098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGATTTCACCGTGATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75227990	75225727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_75226189_75227890
tx.14401	chr5	+	989	2	Intergenic	novelGene_1099	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTGGGGGCAAGTAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75228036	75232672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_75228595_75232241
tx.14402	chr5	-	510	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035946.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCAACCCCGACCCCCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75236648	75232125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_75232311_75235914_75236041_75236449
tx.14403	chr5	+	1045	2	FSM	ENSMUSG00000035946.8	ENSMUST00000040477.4	1665	2	602	18	601	-18	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATATTTTTTAATTCGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75236863	75238536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_75236999_75237626
tx.14404	chr5	+	555	3	Intergenic	novelGene_1101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	4.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCATCTGCTTTAAGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75526606	75527651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_75526705_75526842_75526923_75527274
tx.14405	chr5	+	591	3	Intergenic	novelGene_1102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGTTTCATCTGCTTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75526621	75527647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_75526760_75526842_75526923_75527274
tx.14406	chr5	+	581	3	ISM	ENSMUSG00000005672.13	ENSMUST00000005815.7	5214	21	32	47277	32	-11504	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1259	junction_2	65	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCAAAAACGTGAAGCGCGC	798	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75735646	75770105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_75735779_75767685_75767959_75769929
tx.14407	chr5	+	1705	6	FSM	ENSMUSG00000029233.16	ENSMUST00000031143.13	1747	6	35	7	0	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_4	4.14728827066554	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGCACGCCCTGGACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76288152	76303319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_76288396_76295532_76295676_76297049_76297086_76297599_76297798_76301370_76301506_76302369
tx.14408	chr5	+	1049	4	ISM	ENSMUSG00000029234.14	ENSMUST00000031144.14	1897	6	20376	0	136	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1062	junction_1	85.1756355355737	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTTTTCCTCGTGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76352102	76357092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_76352130_76352483_76352664_76355648_76355755_76356356
tx.14409	chr5	+	835	2	ISM	ENSMUSG00000029234.14	ENSMUST00000031144.14	1897	6	23929	0	3689	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1259	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTTTTCCTCGTGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76355655	76357092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_76355755_76356356
tx.14410	chr5	-	739	4	NNC	ENSMUSG00000029238.12	novel	2287	3	NA	NA	8	2864	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_1	14.2361043360417	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTCTGTATACTTGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76452611	76416936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_76417402_76421805_76421891_76451270_76451350_76452501
tx.14411	chr5	-	1252	3	FSM	ENSMUSG00000029238.12	ENSMUST00000201052.2	2287	3	-3	1038	-3	-1038	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	14	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGGAAGGAAGGAAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76452622	76420838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_76421891_76451270_76451350_76452501
tx.14412	chr5	-	1240	3	ISM	ENSMUSG00000029238.12	ENSMUST00000075159.5	7478	23	72	60815	72	-1038	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	16.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAGGAAGGAAGGAAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76452323	76420838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_76421891_76451270_76451350_76452214
tx.14413	chr5	-	1158	6	FSM	ENSMUSG00000029235.15	ENSMUST00000031145.7	1181	6	16	7	-7	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	18.0554700852678	308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATTTTGTATGTGTGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76478987	76459980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_76460446_76465647_76465857_76466973_76467118_76472152_76472244_76472839_76472961_76478859
tx.14414	chr5	-	938	5	NIC	ENSMUSG00000029235.15	novel	1181	6	NA	NA	0	-11	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	6	junction_1	37.1483512420134	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGACATTTTGTATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76478980	76459984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_76460446_76466973_76467118_76472152_76472244_76472839_76472961_76478859
tx.14415	chr5	+	3372	19	FSM	ENSMUSG00000036435.14	ENSMUST00000087133.11	3371	19	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_10	33.5248203611431	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATATTCTTAAGCCTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76677156	76718141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_76677310_76680601_76680736_76683400_76683532_76685544_76685705_76689897_76690086_76691301_76691530_76691724_76691858_76693100_76693211_76697298_76697449_76701946_76702053_76705665_76705711_76706850_76707015_76707564_76707673_76708176_76708254_76709138_76709368_76711076_76711261_76714803_76715004_76715813_76716009_76717464
tx.14416	chr5	+	3315	18	FSM	ENSMUSG00000036435.14	ENSMUST00000049469.13	3272	18	-43	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_10	35.7889816992977	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTGATAATATTCTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76677161	76718134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_76677310_76680601_76680736_76683400_76683532_76685544_76685705_76689897_76690086_76691301_76691530_76691724_76691858_76693100_76693211_76697298_76697449_76701946_76702053_76706850_76707015_76707564_76707673_76708176_76708254_76709138_76709368_76711076_76711261_76714803_76715004_76715813_76716009_76717464
tx.14417	chr5	+	1157	4	ISM	ENSMUSG00000036435.14	ENSMUST00000049469.13	3272	18	33964	0	1948	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_2	13.9602610609146	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTGATAATATTCTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76711168	76718134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_76711261_76714803_76715004_76715813_76716009_76717464
tx.14418	chr5	+	940	4	ISM	ENSMUSG00000036403.16	ENSMUST00000049060.8	5313	25	46349	1317	46349	240	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_2	4.71404520791032	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTTATTTTAAAAGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76785909	76792995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_76786114_76786768_76786874_76788728_76788843_76792478
tx.14419	chr5	-	1349	5	NIC	ENSMUSG00000055923.17	novel	1080	5	NA	NA	14	136	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_4	26.7301328092473	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGCTGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77053320	77043952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_77044538_77049007_77049129_77049764_77050033_77052055_77052228_77053117
tx.14420	chr5	-	1152	6	ISM	ENSMUSG00000055923.17	ENSMUST00000146570.8	2264	13	11	13391	11	34	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_5	32.6521055982612	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAGTATGTGTTCTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77053323	77044054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_77044538_77049007_77049129_77049764_77050033_77052055_77052228_77052805_77052860_77053269
tx.14421	chr5	-	1870	11	FSM	ENSMUSG00000029246.15	ENSMUST00000140076.2	3981	11	355	1756	-58	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	550	junction_6	47.121226639382	723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGCATCTGAGGATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77099070	77062878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_77063253_77063791_77063913_77065880_77066103_77067217_77067346_77067602_77067755_77069316_77069390_77070057_77070204_77070301_77070415_77073520_77073728_77074637_77074705_77098803
tx.14422	chr5	+	2053	9	FSM	ENSMUSG00000029247.18	ENSMUST00000031160.16	2482	9	431	-2	-39	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3017	junction_4	215.03720608304	2389	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTCGCTGTGTGGTCTA	717	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77099584	77115354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_77099683_77104392_77104591_77107161_77107341_77108956_77109137_77109239_77109354_77110273_77110358_77112288_77112470_77114093_77114253_77114494
tx.14423	chr5	+	2046	9	NNC	ENSMUSG00000029247.18	novel	2482	9	NA	NA	-35	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	450	junction_1	967.654089796555	264	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTCGCTGTGTGGTCTA	721	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77099588	77115354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_77099683_77104395_77104591_77107161_77107341_77108956_77109137_77109239_77109354_77110273_77110358_77112288_77112470_77114093_77114253_77114494
tx.14424	chr5	+	1186	3	ISM	ENSMUSG00000029247.18	ENSMUST00000120912.8	2345	10	13108	2	-1701	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3340	junction_1	228	579	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTCGCTGTGTGGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77112302	77115354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_77112470_77114093_77114253_77114494
tx.14425	chr5	+	3600	18	NNC	ENSMUSG00000036323.15	novel	3625	19	NA	NA	-6	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	74.3394905927643	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACAATGTTTCGGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77122547	77147777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_77122680_77124244_77124366_77126429_77126554_77128134_77128279_77128361_77128506_77131964_77132090_77132180_77132239_77135713_77135846_77137147_77137277_77138119_77138193_77139836_77139902_77141988_77142085_77142474_77142579_77142682_77142761_77143624_77143763_77144498_77144537_77145269_77145430_77146038
tx.14426	chr5	+	3082	19	FSM	ENSMUSG00000036323.15	ENSMUST00000101087.10	3625	19	21	522	-3	-522	multi-exon	FALSE	canonical	3	245	junction_6	28.4995126663987	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGTTGAAACTTCTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77122550	77147262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_77122680_77124244_77124366_77126429_77126554_77128134_77128279_77128361_77128474_77130081_77130114_77131964_77132090_77132180_77132239_77135713_77135846_77137147_77137277_77138119_77138193_77139836_77139902_77141988_77142085_77142474_77142579_77142682_77142761_77143624_77143763_77144498_77144537_77145269_77145430_77146038
tx.14427	chr5	+	1765	15	ISM	ENSMUSG00000036323.15	ENSMUST00000101087.10	3625	19	25	4777	1	14	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	245	junction_6	31.8923572189262	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGAAAGAAAAAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77122554	77143007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_77122680_77124244_77124366_77126429_77126554_77128134_77128279_77128361_77128474_77130081_77130114_77131964_77132090_77132180_77132239_77135713_77135846_77137147_77137277_77138119_77138193_77139836_77139902_77141988_77142085_77142474_77142579_77142682
tx.14428	chr5	-	1106	3	FSM	ENSMUSG00000059325.15	ENSMUST00000113453.9	1113	3	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	1.5	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATGGAGTCTTTTTTTTT	3150	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77243117	77234834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_77235664_77242712_77242870_77242997
tx.14429	chr5	-	631	4	FSM	ENSMUSG00000053030.12	ENSMUST00000065216.11	631	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.63299316185545	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCCTCGTCTTTTCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77359318	77352953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_77353273_77354775_77354886_77357579_77357642_77359178
tx.14430	chr5	+	1897	4	FSM	ENSMUSG00000029249.16	ENSMUST00000080359.12	7004	4	50	5057	50	-5057	multi-exon	FALSE	canonical	3	740	junction_1	62.4731053245226	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTCTGAGTGCAAATCAA	3746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77413387	77429222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_77413636_77415778_77416671_77423080_77423165_77428549
tx.14431	chr5	+	1745	4	FSM	ENSMUSG00000029249.16	ENSMUST00000113449.2	6924	4	121	5058	121	-5058	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	347.74543690592	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAGTCTGAGTGCAAATCA	4522	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77414163	77429221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_77414261_77415778_77416671_77423080_77423165_77428549
tx.14432	chr5	+	1473	3	ISM	ENSMUSG00000029249.16	ENSMUST00000113449.2	6924	4	1910	5059	1910	-5059	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	814	junction_1	39.5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAGTCTGAGTGCAAATC	6311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77415952	77429220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_77416671_77423080_77423165_77428549
tx.14433	chr5	-	2267	7	FSM	ENSMUSG00000036285.11	ENSMUST00000047860.9	2288	7	26	-5	1	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_4	16.2138486760204	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATGTATCTGTGACCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77457905	77442023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_77442404_77444932_77445051_77447504_77447622_77452032_77452165_77454120_77454324_77455399_77455565_77456753
tx.14434	chr5	-	1621	3	FSM	ENSMUSG00000036285.11	ENSMUST00000150722.2	2815	3	24	1170	24	-543	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTTCACGGATGAATGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77457882	77453996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_77454324_77455399_77455565_77456753
tx.14435	chr5	+	3798	25	FSM	ENSMUSG00000029250.6	ENSMUST00000031167.6	4145	25	347	0	3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	372	junction_9	39.992360381564	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTGTTATCTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77458340	77497171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_77458478_77460997_77461071_77463696_77463848_77467810_77467924_77468057_77468278_77468801_77468961_77471400_77471566_77473585_77473783_77473894_77474015_77474381_77474569_77478979_77479124_77479796_77479937_77480033_77480146_77482263_77482419_77483480_77483680_77484273_77484443_77487167_77487265_77488221_77488317_77490376_77490628_77490707_77490798_77491016_77491125_77492638_77492753_77493097_77493259_77496069_77496266_77496926
tx.14436	chr5	+	1060	7	ISM	ENSMUSG00000029250.6	ENSMUST00000031167.6	4145	25	32488	0	2267	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	441	junction_6	18.6971477325643	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTGTTATCTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77490481	77497171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_77490628_77490707_77490798_77491016_77491125_77492638_77492753_77493097_77493259_77496069_77496266_77496926
tx.14437	chr5	+	441	2	ISM	ENSMUSG00000029250.6	ENSMUST00000031167.6	4145	25	38076	0	7855	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	441	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTGTTATCTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77496069	77497171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_77496266_77496926
tx.14438	chr5	-	1498	5	FSM	ENSMUSG00000036256.14	ENSMUST00000046746.10	1116	5	315	-697	314	697	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_4	2.29128784747792	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCGTTGTCAAACTAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77555573	77496389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_77497347_77499074_77499202_77499759_77499877_77503408_77503519_77555386
tx.14439	chr5	-	787	5	NNC	ENSMUSG00000036256.14	novel	1116	5	NA	NA	46567	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.49106001094224	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTTAATGACAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77509320	77497086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_77497347_77499074_77499202_77499759_77499877_77503408_77503519_77509147
tx.14440	chr5	-	430	3	ISM	ENSMUSG00000036256.14	ENSMUST00000163898.6	1200	6	56080	-3	56080	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATTTTTTTTTAATGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77499807	77497091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_77497347_77499074_77499202_77499759
tx.14441	chr5	-	736	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037605.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	3.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCATTTATGTCGTAAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81703966	81701722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_81702330_81703680_81703745_81703901
tx.14442	chr5	-	5160	32	NNC	ENSMUSG00000035898.14	novel	6590	33	NA	NA	-14	-1444	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_29	24.1545922926499	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGAAGGAAAG	7074	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86320676	86258589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_86260648_86265882_86265978_86267191_86267280_86268386_86268515_86270163_86270358_86272169_86272288_86274327_86274400_86275558_86275629_86276534_86276599_86276686_86276739_86279071_86279201_86280300_86280382_86280476_86280567_86282832_86282939_86284167_86284350_86285675_86285754_86288214_86288296_86289406_86289486_86290263_86290332_86292193_86292338_86294933_86295001_86295663_86295741_86296727_86296791_86297868_86297973_86300425_86300550_86300684_86300808_86302212_86302294_86307062_86307175_86308137_86308255_86312548_86312651_86318413_86318477_86320526
tx.14443	chr5	-	1702	17	NNC	ENSMUSG00000035898.14	novel	4177	29	NA	NA	22	-16871	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_14	31.0074965734095	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGAAAATAATGATCTTT	7110	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86320640	86285570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_86285754_86288214_86288296_86289406_86289486_86290263_86290332_86292193_86292338_86294933_86295001_86295663_86295741_86296727_86296791_86297868_86297973_86300425_86300550_86300684_86300808_86302212_86302294_86307062_86307175_86308137_86308255_86312548_86312651_86318413_86318477_86320526
tx.14444	chr5	-	493	5	NNC	ENSMUSG00000035898.14	novel	4177	29	NA	NA	29	-38371	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	56.3449199129788	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATCAGGTTAGTATTTTG	7117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86320633	86307070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_86307175_86308137_86308255_86312548_86312651_86318413_86318477_86320526
tx.14445	chr5	-	251	3	ISM	ENSMUSG00000035898.14	ENSMUST00000147734.2	4177	29	-56	43891	8	-43891	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	132	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAAGTGGTATGGGTGGTC	7096	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86320654	86312590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_86312651_86318413_86318477_86320526
tx.14446	chr5	+	2378	14	ISM	ENSMUSG00000035851.15	ENSMUST00000038384.8	2960	17	12468	-2	1377	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_10	56.8493285259039	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTGTATTTCCTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86964890	86984518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_86965193_86967944_86968035_86968491_86968546_86969110_86969206_86970454_86970564_86970649_86970768_86974585_86974671_86975813_86975981_86978412_86978496_86979522_86979560_86979631_86979696_86979806_86979870_86981366_86981502_86983542
tx.14447	chr5	+	1336	6	ISM	ENSMUSG00000035851.15	ENSMUST00000156363.8	4346	17	26056	0	-1211	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	183	junction_2	43.0190655407576	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTGTATTTCCTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86978410	86984518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_86978496_86979522_86979560_86979655_86979696_86979806_86979870_86981366_86981502_86983542
tx.14448	chr5	+	322	3	Fusion	ENSMUSG00000007457.4_ENSMUSG00000007907.5	novel	1603	3	NA	NA	-1	0	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	1	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACTGTGTGTGACATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88117316	88129403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr5_+_88117416_88118497_88118572_88129254
tx.14449	chr5	+	1041	7	NNC	ENSMUSG00000029291.12	novel	3703	13	NA	NA	-351	10626	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	49.095145720665	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATGATATGTATGCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88712547	88776162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_88712730_88762799_88762974_88764320_88764439_88765193_88765296_88769159_88769284_88775079_88775142_88775883
tx.14450	chr5	+	855	6	ISM	ENSMUSG00000029291.12	ENSMUST00000196686.2	2077	14	31143	12633	31143	10618	internal_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_3	9.64572444143	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAGAACATATGATATGT	4156	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88762795	88776154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_88762974_88764320_88764439_88765193_88765296_88769159_88769284_88775079_88775142_88775883
tx.14451	chr5	-	2316	10	FSM	ENSMUSG00000044221.15	ENSMUST00000113234.8	2286	10	-20	-10	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_9	165.873073593064	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGTATATTTTCTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88823545	88807306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_88808319_88810393_88810470_88810978_88811115_88811922_88812045_88813615_88813801_88818034_88818171_88819020_88819165_88820463_88820620_88821551_88821709_88823353
tx.14452	chr5	-	2011	9	ISM	ENSMUSG00000044221.15	ENSMUST00000113234.8	2286	10	1922	-2	1448	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	466	junction_8	37.9570069288926	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCAAAGTTCTGTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88821603	88807314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_88808319_88810393_88810470_88810978_88811115_88811922_88812045_88813615_88813801_88818034_88818171_88819020_88819165_88820463_88820620_88821551
tx.14453	chr5	-	1916	8	ISM	ENSMUSG00000044221.15	ENSMUST00000113234.8	2286	10	2952	-5	-1309	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	476	junction_5	32.7258245402119	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAAGTTCTGTATATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88820573	88807311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_88808319_88810393_88810470_88810978_88811115_88811922_88812045_88813615_88813801_88818034_88818171_88819020_88819165_88820463
tx.14454	chr5	-	967	2	Intergenic	novelGene_1104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGTAATAATGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88868634	88863614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_88863964_88868016
tx.14455	chr5	+	1593	6	FSM	ENSMUSG00000006262.16	ENSMUST00000006424.8	2705	6	10	1102	10	-1102	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_3	7.75628777186613	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTTGATATTGACTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88868739	88904746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_88868981_88891162_88891330_88892915_88893010_88897383_88897518_88901018_88901183_88903953
tx.14456	chr5	+	988	4	FSM	ENSMUSG00000006262.16	ENSMUST00000125171.2	891	4	-95	-2	11	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_3	8.64098759787715	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTTGGGTATGTTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88868740	88897870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_88868981_88891162_88891330_88892915_88893010_88897383
tx.14457	chr5	+	2895	7	FSM	ENSMUSG00000029366.11	ENSMUST00000031311.10	3078	7	160	23	160	-23	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_6	17.3052657368277	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATTTAAATTTCTTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88913014	88931117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_88913206_88917462_88917579_88920488_88920683_88921940_88922089_88924715_88924832_88926220_88926312_88929078
tx.14458	chr5	+	2629	6	ISM	ENSMUSG00000029366.11	ENSMUST00000031311.10	3078	7	4683	23	320	-23	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	177	junction_5	13.6586968631711	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATTTAAATTTCTTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88917537	88931117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_88917579_88920488_88920683_88921940_88922089_88924715_88924832_88926220_88926312_88929078
tx.14459	chr5	+	834	5	ISM	ENSMUSG00000029366.11	ENSMUST00000031311.10	3078	7	7632	1779	3269	-1779	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	177	junction_4	14.5666571319572	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAGTCTGGAGGTAGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88920486	88929361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_88920683_88921940_88922089_88924715_88924832_88926220_88926312_88929078
tx.14460	chr5	-	2786	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060961.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGAAATTGTATCCCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89356998	89354144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_89356493_89356560
tx.14461	chr5	-	1311	6	FSM	ENSMUSG00000035505.15	ENSMUST00000118816.6	1307	6	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_3	54.1833922895199	473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCTGGTGAGATAATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90371835	90362582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_90363035_90365375_90365484_90366770_90366896_90367218_90367383_90370089_90370191_90371474
tx.14462	chr5	-	1310	6	FSM	ENSMUSG00000035505.15	ENSMUST00000048363.10	1333	6	23	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_3	53.4714877294432	475	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCTGGTGAGATAATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90371837	90362582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_90363035_90365375_90365484_90366770_90366893_90367218_90367383_90370089_90370191_90371474
tx.14463	chr5	+	314	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055204.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGCTGAATCCTGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90394659	90395335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_90394781_90395142
tx.14464	chr5	-	769	4	ISM	ENSMUSG00000055204.16	ENSMUST00000218526.2	4938	27	412	45144	412	-6046	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	45	junction_3	45.4386032649185	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAAGGAATCTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90513632	90446195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_90446547_90447847_90448005_90451770_90451925_90513525
tx.14465	chr5	+	587	3	FSM	ENSMUSG00000029373.8	ENSMUST00000031320.8	588	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGTCATAAAGTCAAGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90920294	90921242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_90920538_90920770_90920904_90921031
tx.14466	chr5	-	1363	9	FSM	ENSMUSG00000029397.16	ENSMUST00000031345.15	1967	9	223	381	-110	-284	multi-exon	FALSE	canonical	3	292	junction_5	17.5926120857592	490	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCTTTTCTTTTCTCTCT	1558	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92110704	92097143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92097724_92099679_92099801_92100799_92100827_92100911_92100971_92101072_92101118_92103393_92103473_92105393_92105510_92105736_92105857_92110488
tx.14467	chr5	+	400	2	NNC	ENSMUSG00000102644.6	novel	1337	5	NA	NA	-7	-2595	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCAGGCTCGTCTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92110755	92111862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_92110835_92111541
tx.14468	chr5	+	1849	4	NNC	ENSMUSG00000102644.6	novel	1996	4	NA	NA	-8	378	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	15	junction_3	5.24933858267454	23	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTGTTTCATAGTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92110740	92118822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_92110835_92112954_92113164_92114310_92114434_92117399
tx.14469	chr5	+	3033	5	NNC	ENSMUSG00000102644.6	novel	650	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_2	9.28372231381357	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTGTGGGTTTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92110762	92119925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_92110835_92111541_92111645_92112954_92113164_92114310_92114434_92117399
tx.14470	chr5	-	1929	12	FSM	ENSMUSG00000029405.17	ENSMUST00000169094.8	2716	12	5	782	5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	261	junction_11	559.822935407495	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATGCCCACTGAGTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92231367	92202357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92202913_92203242_92203362_92204127_92204257_92205826_92205930_92211195_92211295_92212183_92212365_92213610_92213714_92214350_92214442_92216183_92216358_92218215_92218298_92221018_92221138_92231193
tx.14471	chr5	-	1946	12	FSM	ENSMUSG00000029405.17	ENSMUST00000202258.4	1884	12	-61	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	524	junction_5	444.293682188997	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATGCCCACTGAGTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92231578	92202357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92202913_92203242_92203362_92204127_92204257_92205826_92205930_92211195_92211295_92212183_92212365_92213610_92213714_92214350_92214442_92216183_92216358_92218215_92218298_92221018_92221138_92231387
tx.14472	chr5	-	1826	11	FSM	ENSMUSG00000029405.17	ENSMUST00000167918.8	4232	11	52	2354	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	261	junction_10	456.056180749697	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACATGCCCACTGAGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92231364	92202358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92202913_92203242_92203362_92204127_92204257_92205826_92205930_92212183_92212365_92213610_92213714_92214350_92214442_92216183_92216358_92218215_92218298_92221018_92221138_92231193
tx.14473	chr5	-	1847	11	FSM	ENSMUSG00000029405.17	ENSMUST00000113127.7	4182	11	0	2335	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1117	junction_4	208.26764030929	566	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATGCCCACTGAGTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92231578	92202357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92202913_92203242_92203362_92204127_92204257_92205826_92205930_92212183_92212365_92213610_92213714_92214350_92214442_92216183_92216358_92218215_92218298_92221018_92221138_92231387
tx.14474	chr5	+	539	4	NNC	ENSMUSG00000029407.11	novel	3549	13	NA	NA	-26	-30462	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	221.052532720668	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTAAGATTTTGATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92285770	92301452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_92286023_92300299_92300387_92300710_92300776_92301317
tx.14475	chr5	+	3904	24	NNC	ENSMUSG00000029407.11	novel	3898	24	NA	NA	3	2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_12	100.480471444838	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGTCATTGTTCCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92285799	92350659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_92286023_92300299_92300387_92300710_92300776_92306262_92306340_92314389_92314491_92314884_92314988_92315136_92315193_92318531_92318653_92321784_92321964_92325293_92325435_92328400_92328490_92329198_92329358_92329756_92329969_92335093_92335205_92335556_92335676_92335801_92335984_92337081_92337204_92340571_92340711_92341870_92342035_92343206_92343294_92346194_92346294_92347675_92347784_92348993_92349210_92349715
tx.14476	chr5	-	1836	11	FSM	ENSMUSG00000029413.15	ENSMUST00000113102.10	2414	11	-11	589	-11	185	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_5	5.44885309033011	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCTAGCTGTGAAGAGAAAA	9187	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92426040	92406106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92406803_92407412_92407491_92409210_92409240_92410367_92410435_92411268_92411332_92411449_92411623_92412939_92413017_92415900_92415992_92420302_92420430_92424777_92424943_92425770
tx.14477	chr5	-	2290	22	FSM	ENSMUSG00000029415.5	ENSMUST00000031364.5	5020	22	35	2695	0	36	multi-exon	FALSE	canonical	3	262	junction_13	31.6626205793221	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTGTAGCAATTTGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92457848	92434563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92434730_92436325_92436488_92437598_92437684_92437779_92437971_92438116_92438212_92438871_92438999_92439565_92439643_92439744_92439843_92440511_92440589_92441821_92441881_92443869_92443928_92444978_92445083_92446050_92446121_92447920_92448023_92449670_92449746_92450497_92450556_92451524_92451626_92451742_92451815_92452831_92452943_92453062_92453162_92453591_92453697_92457650
tx.14478	chr5	-	680	5	ISM	ENSMUSG00000029415.5	ENSMUST00000201143.2	2156	22	19558	-33	5841	33	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	305	junction_4	33.9448081449874	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACATTTGTAGCAATTTGG	5429	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92438195	92434566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_92434730_92436325_92436488_92437598_92437684_92437779_92437971_92438116
tx.14479	chr5	-	921	9	ISM	ENSMUSG00000029415.5	ENSMUST00000201143.2	2156	22	-95	13321	0	1573	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	301	junction_1	29.698484809835	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGGCTGTGCCTGAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92457848	92447920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_92448023_92449670_92449746_92450497_92450556_92451524_92451626_92451742_92451815_92452831_92452943_92453062_92453162_92453591_92453697_92457650
tx.14480	chr5	-	2270	12	FSM	ENSMUSG00000034826.15	ENSMUST00000038514.15	2352	12	77	5	-19	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	487	junction_1	63.2088235288462	336	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAATTCTGTCTGGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92583001	92563403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92564198_92565311_92565423_92565639_92565760_92567375_92567484_92570340_92570435_92570835_92570891_92572132_92572330_92573481_92573670_92575958_92576186_92578659_92578813_92578897_92578982_92582862
tx.14481	chr5	-	826	4	FSM	ENSMUSG00000034826.15	ENSMUST00000122893.2	631	4	-104	-91	24	91	multi-exon	FALSE	canonical	3	581	junction_1	53.8908361618395	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTGTGTATGATTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92583054	92575788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92576186_92578659_92578813_92578897_92578982_92582862
tx.14482	chr5	-	2032	12	FSM	ENSMUSG00000029426.9	ENSMUST00000031377.9	4698	12	-9	2675	-9	-2675	multi-exon	TRUE	canonical	3	99	junction_7	16.1496104397404	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGGTTGGGCCCTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92653505	92591847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_92592144_92594162_92594322_92596403_92596456_92597729_92597804_92599205_92599325_92601898_92602069_92602590_92602711_92607900_92607993_92608612_92608802_92609795_92609944_92633055_92633214_92653050
tx.14483	chr5	+	536	4	ISM	ENSMUSG00000029381.17	ENSMUST00000113051.9	6435	10	108	25180	108	-327	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_1	15.5134350376268	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGACCAGCTAGGCCACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93045959	93087987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_93046080_93067503_93067636_93081612_93081745_93087835
tx.14484	chr5	-	435	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029381.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGGCACTTCACCCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93072849	93072113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_93072414_93072714
tx.14485	chr5	+	537	4	ISM	ENSMUSG00000058013.12	ENSMUST00000201700.4	3478	9	-1	14824	0	-2768	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	742	junction_1	14.9666295470958	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAACGTTCTCTCTTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93241295	93302793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_93241457_93287307_93287423_93296245_93296442_93302728
tx.14486	chr5	-	2260	7	FSM	ENSMUSG00000063015.13	ENSMUST00000058550.15	2804	7	540	4	473	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	340	junction_6	48.6052694902746	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTGGTTTGTGTAGGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93353814	93329795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_93331280_93335446_93335678_93335938_93336080_93337005_93337081_93337422_93337552_93350163_93350322_93353772
tx.14487	chr5	+	2661	7	FSM	ENSMUSG00000029385.15	ENSMUST00000121127.2	2570	7	-90	-1	-90	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_2	9.62057979310787	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTATTCCTATTTCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93416082	93424084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_93416619_93417123_93417262_93418652_93418904_93419059_93419139_93419221_93419321_93421196_93421403_93422732
tx.14488	chr5	-	1112	4	FSM	ENSMUSG00000034724.19	ENSMUST00000152490.8	3040	4	721	1207	721	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	4.78423336480244	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCAAATACAAGATTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96234071	96224641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_96225252_96227791_96227995_96230728_96230957_96234000
tx.14489	chr5	+	1109	9	FSM	ENSMUSG00000029486.14	ENSMUST00000036437.13	3431	9	29	2293	0	-2293	multi-exon	FALSE	canonical	3	666	junction_1	44.6738178355063	1410	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGGCTCCTCATGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96358002	96412275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_96358053_96361645_96361770_96371629_96371892_96374143_96374228_96375538_96375611_96379539_96379652_96386697_96386805_96409920_96410003_96412059
tx.14490	chr5	+	1540	13	FSM	ENSMUSG00000029484.13	ENSMUST00000031447.12	1595	13	52	3	-4	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.64991582276861	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCTGGGTGCTTCTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96941295	96993822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_96941423_96945259_96945313_96958908_96958997_96960700_96960796_96964199_96964314_96968260_96968352_96972745_96972826_96976206_96976264_96976555_96976650_96978251_96978348_96982633_96982693_96986151_96986275_96993359
tx.14491	chr5	-	2329	2	FSM	ENSMUSG00000046000.6	ENSMUST00000060265.6	3424	2	-1	1096	-1	-1096	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTTGTCAATATGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97540239	97531152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_97532729_97539486
tx.14492	chr5	+	214	2	ISM	ENSMUSG00000097516.8	ENSMUST00000180634.2	2530	4	-27	192630	3	-192630	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTACCTTTTTGTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97540278	97543354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_97540367_97543228
tx.14493	chr5	-	1473	15	NNC	ENSMUSG00000029334.15	novel	4968	19	NA	NA	-25595	-270	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	6.04067843196171	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCGCCGCCGCTGTGCCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99140210	99079848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_99079965_99082187_99082255_99090012_99090076_99091272_99091396_99095229_99095394_99114370_99114513_99115585_99115676_99117795_99117933_99119733_99119865_99120966_99121066_99124294_99124364_99127624_99127720_99128944_99129023_99136145_99136210_99140175
tx.14494	chr5	+	736	6	FSM	ENSMUSG00000105078.3	ENSMUST00000198837.3	677	6	-53	-6	-4	6	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.03960780543711	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCTCTGCACCCAATAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100054121	100098957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_100054265_100067054_100067126_100070875_100070973_100072700_100072803_100089084_100089247_100098796
tx.14495	chr5	+	432	3	NNC	ENSMUSG00000105078.3	novel	677	6	NA	NA	7123	16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAATAACTGTGAGCTCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100074189	100098967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_100074289_100089084_100089247_100098796
tx.14496	chr5	-	426	2	ISM	ENSMUSG00000000568.16	ENSMUST00000112939.10	1670	8	16309	4	2142	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4376	junction_1	0	947	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTGGCTCTTTTATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100110467	100108860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100109193_100110373
tx.14497	chr5	-	357	2	ISM	ENSMUSG00000029328.16	ENSMUST00000128187.8	2752	8	3026	1144	-128	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	572	junction_1	0	302	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCGTCAGGTACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100184055	100182579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100182844_100183962
tx.14498	chr5	-	529	3	ISM	ENSMUSG00000029328.16	ENSMUST00000128187.8	2752	8	2569	1144	72	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	572	junction_1	273	569	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCGTCAGGTACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100184512	100182579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100182844_100183962_100184055_100184339
tx.14499	chr5	-	578	4	ISM	ENSMUSG00000029328.16	ENSMUST00000128187.8	2752	8	2310	1144	-187	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	572	junction_1	260.749347501048	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCGTCAGGTACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100184771	100182579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100182844_100183962_100184055_100184339_100184511_100184720
tx.145	chr1	-	1758	11	NNC	ENSMUSG00000046337.18	novel	1659	10	NA	NA	40	16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	62	junction_8	39.9335698379196	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCTAATTTTCTTAACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36722224	36639040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_36639302_36639488_36639666_36639947_36640033_36647497_36647613_36671500_36671586_36674247_36674354_36683290_36683444_36695891_36696015_36698444_36698507_36699815_36700131_36721948
tx.1450	chr10	-	1755	3	FSM	ENSMUSG00000020108.5	ENSMUST00000020308.5	1755	3	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	721	junction_1	4.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGAGTCTCATCGGCGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59787656	59785490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_59786852_59787138_59787395_59787518
tx.14500	chr5	-	1296	8	FSM	ENSMUSG00000029328.16	ENSMUST00000128187.8	2752	8	312	1144	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	572	junction_1	185.830183616271	1301	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCGTCAGGTACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100186769	100182579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100182844_100183962_100184055_100184339_100184511_100184720_100184836_100184943_100185076_100185426_100185589_100185671_100185841_100186578
tx.14501	chr5	-	2050	8	NIC	ENSMUSG00000029328.16	novel	2149	9	NA	NA	-15	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	230	junction_1	297.206243239284	288	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTGCGTCAGGTACTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100186769	100182580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_100183599_100183962_100184055_100184339_100184511_100184720_100184836_100184943_100185076_100185426_100185589_100185671_100185841_100186578
tx.14502	chr5	-	2415	7	FSM	ENSMUSG00000029328.16	ENSMUST00000153442.8	2374	7	-41	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	934	junction_3	92.4764234218046	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCGTCAGGTACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100186769	100182579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100184055_100184339_100184511_100184720_100184836_100184943_100185076_100185426_100185589_100185671_100185841_100186578
tx.14503	chr5	-	1401	9	FSM	ENSMUSG00000029328.16	ENSMUST00000086900.11	2149	9	754	-6	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	230	junction_2	358.236915322807	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCGTCAGGTACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100186769	100182579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100182844_100183493_100183599_100183962_100184055_100184339_100184511_100184720_100184836_100184943_100185076_100185426_100185589_100185671_100185841_100186578
tx.14504	chr5	+	1456	7	FSM	ENSMUSG00000029326.14	ENSMUST00000031268.8	1420	7	-35	-1	24	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_6	172.72618021983	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGTTTCATACAGACGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100187867	100216620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_100188162_100206998_100207101_100208832_100209027_100210001_100210135_100211617_100211742_100215657_100215801_100216154
tx.14505	chr5	+	1802	6	FSM	ENSMUSG00000029326.14	ENSMUST00000169390.8	1833	6	32	-1	-27	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	460	junction_1	20.2918702932973	911	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGTTTCATACAGACGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100187875	100216620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_100188162_100206998_100207101_100208832_100209027_100210001_100210135_100211617_100211742_100215657
tx.14506	chr5	+	521	3	FSM	ENSMUSG00000100157.7	ENSMUST00000188902.2	508	3	-16	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACCCCCATTCGACTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100358550	100364597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_100358887_100363664_100363725_100364472
tx.14507	chr5	-	1298	6	NIC	ENSMUSG00000035325.17	novel	4228	28	NA	NA	-96	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	466	junction_5	127.023462399669	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTTAGTCTTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100521439	100509507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_100510090_100511235_100511308_100511686_100511807_100513589_100513854_100516152_100516212_100521238
tx.14508	chr5	-	579	2	ISM	ENSMUSG00000035325.17	ENSMUST00000094578.11	4228	28	0	46018	0	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	798	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTATTTATTTACCTTACA	8108	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100564093	100555525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100555973_100563961
tx.14509	chr5	-	387	4	ISM	ENSMUSG00000097772.8	ENSMUST00000181873.8	626	5	329	-3	169	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	348	junction_3	11.0453610171873	345	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAGAATGTTGTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100577065	100568697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100568832_100569826_100569901_100574594_100574664_100576955
tx.1451	chr10	-	1377	5	FSM	ENSMUSG00000020107.11	ENSMUST00000020307.11	1379	5	-2	4	-2	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_3	152.559004978402	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGATCGCTGTGCGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59838935	59823733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_59824661_59826654_59826730_59832269_59832437_59838239_59838290_59838777
tx.14510	chr5	-	610	5	FSM	ENSMUSG00000097772.8	ENSMUST00000181873.8	626	5	19	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	343	junction_4	12.3389626792531	3299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTAGAATGTTGTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100577375	100568697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100568832_100569826_100569901_100574594_100574664_100576955_100577098_100577184
tx.14511	chr5	+	1616	10	FSM	ENSMUSG00000035297.15	ENSMUST00000045993.15	1755	10	126	13	-8	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	1193	junction_9	105.134834062424	2414	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTTTAATTAGTGAGGTG	5399	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100666300	100695656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_100666417_100675839_100675920_100676404_100676557_100677912_100678017_100681107_100681262_100681377_100681529_100685163_100685335_100689402_100689519_100691704_100691790_100695169
tx.14512	chr5	-	734	5	FSM	ENSMUSG00000029322.13	ENSMUST00000031264.12	744	5	7	3	7	-1	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0.82915619758885	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGTTTTGTTTTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100720104	100701593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100701855_100704345_100704462_100707617_100707743_100710490_100710629_100720010
tx.14513	chr5	-	729	3	NNC	ENSMUSG00000035266.17	novel	442	3	NA	NA	108	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	46.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTCTGGGTGATTAAGTCT	1975	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100914571	100910011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_100910503_100912806_100912942_100914468
tx.14514	chr5	-	625	2	FSM	ENSMUSG00000035266.17	ENSMUST00000139203.2	984	2	362	-3	362	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCGCTCTGGGTGATTAAGT	3604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100912942	100910013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100910503_100912806
tx.14515	chr5	-	720	3	NNC	ENSMUSG00000035266.17	novel	442	3	NA	NA	581	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	45.5	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGCGCTCTGGGTGATTA	2448	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100914098	100910016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_100910503_100912806_100912942_100913999
tx.14516	chr5	-	1114	2	ISM	ENSMUSG00000035266.17	ENSMUST00000151201.2	1628	8	-19	13072	2	-4480	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCGAATGAGCAAGAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100946462	100944117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100944929_100946159
tx.14517	chr5	+	518	6	FSM	ENSMUSG00000016833.15	ENSMUST00000016977.15	638	6	116	4	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1615	junction_5	130.796636042369	13683	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATTTGAGTGGAAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100946608	100952333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_100946727_100947417_100947480_100949773_100949858_100950918_100950977_100951835_100951896_100952197
tx.14518	chr5	-	536	2	ISM	ENSMUSG00000035234.19	ENSMUST00000153302.8	1582	9	14767	0	1153	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTAATATCTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100954039	100953057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100953318_100953763
tx.14519	chr5	-	1360	6	ISM	ENSMUSG00000035234.19	ENSMUST00000200657.5	1668	10	8741	0	-4873	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_1	42.030465141371	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTAATATCTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100960065	100953057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100953318_100953763_100954356_100954644_100954757_100957424_100957510_100957621_100957742_100959874
tx.1452	chr10	-	848	4	FSM	ENSMUSG00000020107.11	ENSMUST00000182898.8	1852	4	22	982	-2	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	296	junction_3	30.5650490302604	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGAGACAGTCCTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59838935	59824212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_59824661_59826654_59826730_59832269_59832437_59838777
tx.14520	chr5	-	2129	9	FSM	ENSMUSG00000035234.19	ENSMUST00000055245.13	2139	9	10	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_2	23.2725025512943	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTAATATCTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100968821	100953057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100954356_100954644_100954757_100957424_100957510_100957621_100957742_100959874_100960069_100963027_100963095_100965827_100965865_100966382_100966474_100968696
tx.14521	chr5	-	1690	10	FSM	ENSMUSG00000035234.19	ENSMUST00000200657.5	1668	10	-22	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	36.8299395118217	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTAATATCTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100968828	100953057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100953318_100953763_100954356_100954644_100954757_100957424_100957510_100957621_100957742_100959874_100960069_100963027_100963095_100965827_100965865_100966382_100966474_100968696
tx.14522	chr5	-	382	2	FSM	ENSMUSG00000035234.19	ENSMUST00000131857.2	358	2	-13	-11	-6	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAGAAAAGAAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100968819	100966214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100966474_100968696
tx.14523	chr5	+	2928	13	FSM	ENSMUSG00000029314.15	ENSMUST00000031255.15	2884	13	-44	0	-44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_3	3.86939558874797	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGTTGCATTATTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100994040	101046965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_100994228_100994520_100994815_101005007_101005075_101031055_101031327_101032183_101032259_101032825_101032916_101033791_101033886_101037968_101038085_101039508_101039565_101040166_101040253_101040937_101041067_101041298_101041379_101045582
tx.14524	chr5	+	844	3	NNC	ENSMUSG00000092354.8	novel	619	3	NA	NA	-59	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAATTTCCTTTGGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101987961	101992198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_101988034_101989616_101989940_101991749
tx.14525	chr5	+	906	3	NIC	ENSMUSG00000092354.8	novel	619	3	NA	NA	-57	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	132	junction_1	6	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAATTTCCTTTGGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101987963	101992198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_101988098_101989616_101989940_101991749
tx.14526	chr5	+	774	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043940.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGATGCTGTATTATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102031904	102033396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_102032069_102032187_102032415_102033013
tx.14527	chr5	+	584	2	NNC	ENSMUSG00000105426.2	novel	350	2	NA	NA	1023	27752	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTAACATCATTTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103495482	103523917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_103496029_103523879
tx.14528	chr5	-	498	2	Intergenic	novelGene_1105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGTATGTTAGTCCAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103537955	103495505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_103495777_103537728
tx.14529	chr5	+	2145	12	ISM	ENSMUSG00000034573.15	ENSMUST00000048957.11	7915	48	76175	56873	-27890	-4	internal_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_2	6.95558518668675	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGTCATGCGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103649541	103689296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_103649779_103664193_103664290_103665353_103665436_103671432_103671656_103673619_103673695_103673799_103673981_103674861_103675016_103676629_103676769_103677513_103677667_103681084_103681268_103684579_103684743_103688837
tx.1453	chr10	+	1464	11	FSM	ENSMUSG00000044475.15	ENSMUST00000050516.14	1450	11	-14	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	221	junction_7	12.5797456254091	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGCTGTGGTCTGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59838646	59935808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_59838730_59840616_59840750_59843548_59843649_59848283_59848382_59849417_59849597_59877942_59878080_59885573_59885694_59898281_59898407_59900144_59900231_59933914_59934037_59935527
tx.14530	chr5	+	453	4	NNC	ENSMUSG00000034573.15	novel	7915	48	NA	NA	50381	-14890	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	8.5764535535124	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGGATGTTAGGAAGTTG	4813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103727812	103731279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_103727978_103728535_103728619_103730604_103730643_103731112
tx.14531	chr5	+	379	3	NNC	ENSMUSG00000034573.15	novel	7915	48	NA	NA	50383	-15432	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	5.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATAAGTCCTGTTGTTGTTG	4815	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103727814	103730737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_103727978_103728535_103728619_103730604
tx.14532	chr5	+	940	4	ISM	ENSMUSG00000029313.19	ENSMUST00000126335.2	1613	7	-18	32258	-18	-27425	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	248	junction_2	15.6418242755334	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTGTGGCCAAGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103840221	103932036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_103840470_103863215_103863272_103930989_103931111_103931521
tx.14533	chr5	+	1389	7	FSM	ENSMUSG00000029313.19	ENSMUST00000126335.2	1613	7	45	179	45	-179	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_2	18.46994555728	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTGACCGTCTGCCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103840284	103964115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_103840470_103863215_103863272_103930989_103931111_103931521_103932380_103958928_103958974_103962847_103962935_103964078
tx.14534	chr5	-	1234	2	ISM	ENSMUSG00000029312.13	ENSMUST00000131843.2	2283	7	21978	-11	10057	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAACTACTAGTCTTTTC	9980	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104012178	104009934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_104011058_104012067
tx.14535	chr5	-	1427	3	ISM	ENSMUSG00000029312.13	ENSMUST00000131843.2	2283	7	18696	-11	6775	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_2	5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAACTACTAGTCTTTTC	6740	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104015460	104009934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_104011058_104012067_104012270_104015358
tx.14536	chr5	-	1205	7	FSM	ENSMUSG00000029311.17	ENSMUST00000031251.16	1825	7	-38	658	-38	-658	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.86744175568088	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCTGTATCTTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104169823	104138285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_104138461_104140683_104140801_104151037_104151176_104156444_104156552_104157660_104157793_104166039_104166148_104169395
tx.14537	chr5	+	1485	8	NIC	ENSMUSG00000029310.14	novel	995	6	NA	NA	28	-10	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	64	junction_1	99.0728447730687	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTGGTGACTTGTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104194419	104213235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_104194705_104198443_104198684_104202137_104202234_104203355_104203443_104205972_104206085_104207501_104207649_104209539_104209625_104212802
tx.14538	chr5	+	666	3	ISM	ENSMUSG00000029310.14	ENSMUST00000031250.14	1488	8	12766	10	12014	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	355	junction_1	1	505	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTGGTGACTTGTGTTTC	4884	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104207500	104213235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_104207649_104209539_104209625_104212802
tx.14539	chr5	+	1407	7	FSM	ENSMUSG00000029304.15	ENSMUST00000031243.15	1410	7	3	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5474	junction_3	341.773032223953	10090	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGTCTGGTGGTGTCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104582986	104588916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_104583063_104584240_104584309_104584406_104584443_104585520_104585602_104586091_104586134_104587130_104587413_104588094
tx.14540	chr5	+	2753	4	Intergenic	novelGene_1107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_1	10.4243305140746	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTGTGTGTTGAATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104719541	104732486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_104719638_104728353_104728481_104728722_104728784_104730017
tx.14541	chr5	+	2702	3	Intergenic	novelGene_1106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_2	30.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTGTGTGTTGAATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104719531	104732486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_104719638_104728353_104728481_104730017
tx.14542	chr5	+	297	2	Intergenic	novelGene_1108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACACTTTGGTCTTTTTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104757285	104872199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_104757425_104872041
tx.14543	chr5	-	2802	4	NIC	ENSMUSG00000072774.11	novel	2904	5	NA	NA	54	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	193	junction_3	15.5134350376268	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATATGAGGAATTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105007882	104961037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_104963302_104964564_104964626_104964862_104964990_105007532
tx.14544	chr5	-	410	2	Intergenic	novelGene_1109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAACTTGACTAA	1601	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105082183	105081142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_105081397_105082027
tx.14545	chr5	+	349	3	Intergenic	novelGene_1111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTCTACATGCCTTAACT	5564	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105799197	105805674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_105799256_105804081_105804206_105805507
tx.14546	chr5	+	182	2	Intergenic	novelGene_1110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATCCATCCTTAAATTAT	5564	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105799197	105804205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_105799256_105804081
tx.14547	chr5	+	880	3	Intergenic	novelGene_1112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTTGGAGACTTGTTATT	5564	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105799197	105806365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_105799256_105804081_105804206_105805667
tx.14548	chr5	+	1137	4	Intergenic	novelGene_1113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTAGTACTTGGAGACTTG	5569	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105799202	105806360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_105799256_105804081_105804206_105804534_105804642_105805507
tx.14549	chr5	+	3381	3	FSM	ENSMUSG00000046079.17	ENSMUST00000120847.8	3929	3	71	477	-6	-477	multi-exon	FALSE	canonical	3	312	junction_1	122	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGCAGTTTTTTGGTTTT	4962	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105848725	105962599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_105848952_105880095_105880241_105959589
tx.14550	chr5	-	1109	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094708.2	novel	1002	1	NA	NA	-74	194	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGATGTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106011642	106010372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_106011284_106011444
tx.14551	chr5	+	857	6	ISM	ENSMUSG00000029290.13	ENSMUST00000031227.11	2667	12	-21	24595	-18	3192	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	2.65329983228432	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATGCAAATATTTATTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106024412	106039089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_106024565_106026614_106026660_106034052_106034089_106034182_106034295_106036299_106036706_106038983
tx.14552	chr5	+	1038	7	ISM	ENSMUSG00000029290.13	ENSMUST00000031227.11	2667	12	-24	19242	-21	71	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	3.39934634239519	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTGAAAAATATGGAGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106024409	106044442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_106024565_106026614_106026660_106034052_106034089_106034182_106034295_106036299_106036706_106038983_106039183_106044357
tx.14553	chr5	+	1510	4	ISM	ENSMUSG00000029290.13	ENSMUST00000150440.8	1365	12	15	27154	4	-405	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	1.88561808316413	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCGTGCTTACCTTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106024445	106035492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_106024565_106026614_106026660_106034052_106034089_106034182
tx.14554	chr5	+	760	4	Intergenic	novelGene_1114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGTGTGCTTTGGAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106138851	106151717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_106138948_106148295_106148435_106151071_106151163_106151283
tx.14555	chr5	-	461	2	FSM	ENSMUSG00000099061.2	ENSMUST00000124394.3	449	2	-5	-7	-5	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTTCTGTGTGTTTGACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106722589	106705597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_106705923_106722453
tx.14556	chr5	-	1982	4	FSM	ENSMUSG00000049606.17	ENSMUST00000112695.4	1915	4	-62	-5	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	43.2897216438267	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCCTCTAATGTGAAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106844525	106764604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_106766295_106767405_106767509_106814650_106814712_106844397
tx.14557	chr5	-	1941	3	FSM	ENSMUSG00000049606.17	ENSMUST00000125895.2	836	3	124	-1229	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	58.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGCCTCTAATGTGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106844547	106764606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_106766295_106767405_106767509_106844397
tx.14558	chr5	-	944	2	FSM	ENSMUSG00000049606.17	ENSMUST00000155495.8	518	2	3	-429	3	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAGAGAAAAATGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106844513	106785673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_106786502_106844397
tx.14559	chr5	-	1009	3	FSM	ENSMUSG00000049606.17	ENSMUST00000142391.8	1484	3	-6	481	-6	290	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCAGTGGACTAGGATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106844038	106838166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_106838744_106843508_106843566_106843663
tx.14560	chr5	-	524	3	FSM	ENSMUSG00000049606.17	ENSMUST00000148192.2	642	3	17	101	17	-101	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTATTATGTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106844393	106838570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_106838744_106843508_106843566_106844099
tx.14561	chr5	-	1097	5	NIC	ENSMUSG00000043410.17	novel	5018	40	NA	NA	-2	-14837	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	5	junction_2	3.96074487943871	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTAGTTAGCCGTAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107074126	107064773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_107065494_107066242_107066356_107070678_107070777_107072696_107072799_107074062
tx.14562	chr5	-	1221	6	NIC	ENSMUSG00000043410.17	novel	1440	10	NA	NA	-12	-14837	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_2	4.22374241638858	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTAGTTAGCCGTAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107074136	107064773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_107065494_107066242_107066356_107068828_107068943_107070678_107070777_107072696_107072799_107074062
tx.14563	chr5	+	2848	11	FSM	ENSMUSG00000029283.18	ENSMUST00000117196.9	2864	11	25	-9	25	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_7	74.2377262582846	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACTTATTTAAAGAGTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107112212	107132306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_107112292_107112798_107112981_107116723_107116808_107117024_107117161_107120612_107120707_107120790_107120934_107121642_107121887_107123350_107123527_107124495_107124579_107127160_107127311_107130829
tx.14564	chr5	+	1094	4	ISM	ENSMUSG00000029283.18	ENSMUST00000117196.9	2864	11	25	14524	25	-5285	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	268	junction_1	14.522013940528	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTGTGTTTCAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107112212	107117773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_107112292_107112798_107112981_107116723_107116808_107117024
tx.14565	chr5	+	2936	12	FSM	ENSMUSG00000029283.18	ENSMUST00000031221.12	2961	12	25	0	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_8	37.8828119074671	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATCAGAATACTTATTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107112212	107132298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_107112292_107112798_107112981_107116723_107116808_107117024_107117161_107120612_107120707_107120790_107120934_107121642_107121887_107122466_107122563_107123350_107123527_107124495_107124579_107127160_107127311_107130829
tx.14566	chr5	+	1159	7	FSM	ENSMUSG00000033805.13	ENSMUST00000049146.12	1279	7	120	0	120	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2.26691175145591	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTGTAATTCTTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107551481	107577901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_107551642_107553897_107553984_107560881_107561040_107561363_107561493_107567641_107567746_107574665_107574815_107577528
tx.14567	chr5	+	1526	3	ISM	ENSMUSG00000111375.5	ENSMUST00000162298.4	1408	6	-67	18536	-67	-18536	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_1	1	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGCCTGCCTATTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107585795	107600969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_107586012_107593728_107593924_107599854
tx.14568	chr5	+	1073	4	ISM	ENSMUSG00000111375.5	ENSMUST00000162298.4	1408	6	-42	9712	-42	-9712	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_3	7.58653778449403	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTGTATTGGATACACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107585820	107609793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_107586012_107593728_107593924_107599854_107600052_107609303
tx.14569	chr5	+	784	3	NNC	ENSMUSG00000089798.11	novel	5249	3	NA	NA	8	-7739	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACGTGTGATGGACTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107682593	107688504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_107682675_107686995_107687090_107687895
tx.14570	chr5	+	783	6	FSM	ENSMUSG00000089798.11	ENSMUST00000239050.2	795	6	14	-2	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	1.2	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGGTTGAATGGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107682590	107696245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_107682675_107686995_107687090_107691785_107691880_107693553_107693723_107694066_107694146_107695982
tx.14571	chr5	+	1146	5	NIC	ENSMUSG00000089798.11	novel	797	6	NA	NA	-9	-88	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_3	1.6583123951777	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTGTATTATTAAAAAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107682613	107696800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_107682675_107686995_107687090_107691785_107691880_107694066_107694146_107695982
tx.14572	chr5	-	2004	18	NNC	ENSMUSG00000029276.14	novel	2015	19	NA	NA	8	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	67.2317172637169	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTACTAGAAAAATTGCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107745497	107696839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_107697042_107697256_107697340_107698837_107698962_107705147_107705212_107705783_107705891_107706327_107706413_107708741_107708816_107708918_107708961_107709707_107709798_107710581_107710671_107717995_107718184_107720145_107720249_107721550_107721789_107723097_107723207_107726316_107726434_107741618_107741745_107744653_107744729_107745409
tx.14573	chr5	-	1983	19	FSM	ENSMUSG00000029276.14	ENSMUST00000078021.13	2015	19	8	24	8	-22	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_15	25.8010551033179	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTACAGAAATTTTACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107745497	107696856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_107697042_107697256_107697340_107698837_107698962_107705147_107705212_107705783_107705891_107706327_107706413_107708741_107708816_107708918_107708961_107709707_107709798_107710110_107710142_107710616_107710671_107717995_107718184_107720145_107720249_107721550_107721789_107723097_107723207_107726316_107726434_107741618_107741745_107744653_107744729_107745409
tx.14574	chr5	-	1071	7	ISM	ENSMUSG00000029276.14	ENSMUST00000078021.13	2015	19	12	23094	12	219	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	217	junction_3	24.4267612807483	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGGTCTTGAAAATGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107745493	107719926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_107720249_107721550_107721789_107723097_107723207_107726316_107726434_107741618_107741745_107744653_107744729_107745409
tx.14575	chr5	+	2300	13	FSM	ENSMUSG00000033773.15	ENSMUST00000065422.12	2268	13	-30	-2	9	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	138	junction_1	12.1951720866178	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTTCAGAAGCTGACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107745570	107809706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_107745727_107746387_107746434_107749596_107749712_107751391_107751491_107751686_107751753_107754770_107754860_107766006_107766043_107767687_107768622_107771567_107771663_107773753_107773835_107780928_107780998_107803022_107803177_107809346
tx.14576	chr5	+	183	2	ISM	ENSMUSG00000033773.15	ENSMUST00000147284.8	425	3	-22	3427	3	-3255	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAACGAGGAGATGCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107745564	107746408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_107745727_107746387
tx.14577	chr5	+	1979	7	ISM	ENSMUSG00000033773.15	ENSMUST00000112654.8	2914	12	-15	23377	6	12557	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_1	9.8952850725316	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTGAGTAGGATAGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107745567	107767411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_107745727_107746387_107746434_107749596_107749712_107751391_107751491_107751686_107751753_107754770_107754860_107766006
tx.14578	chr5	+	1846	8	ISM	ENSMUSG00000033773.15	ENSMUST00000112654.8	2914	12	-12	21862	9	14072	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_1	9.29559913428425	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCCACTGGATGTATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107745570	107768926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_107745727_107746387_107746434_107749596_107749712_107751391_107751491_107751686_107751753_107754770_107754860_107766006_107766043_107767687
tx.14579	chr5	-	1762	5	ISM	ENSMUSG00000011831.17	ENSMUST00000155897.8	2149	8	13923	-80	3687	80	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_3	8.40758586040012	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGTTGTGAGTATTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107943725	107895061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_107896324_107912541_107912638_107936064_107936161_107938227_107938375_107943564
tx.14580	chr5	+	1055	8	FSM	ENSMUSG00000058558.13	ENSMUST00000082223.13	2045	8	37	953	-33	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	7026	junction_3	385.215126750691	4741	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCTGTGTTAAGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108048404	108055918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_108048513_108049735_108049806_108049887_108050004_108051134_108051270_108051531_108051735_108052582_108052761_108055054_108055144_108055762
tx.14581	chr5	-	1770	5	FSM	ENSMUSG00000029270.11	ENSMUST00000031198.11	2721	5	40	911	-12	739	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_2	18.0883249639097	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATGATTTACTGTGTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108134911	108056829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_108058083_108059477_108059655_108062211_108062320_108072450_108072586_108134814
tx.14582	chr5	-	1741	5	NNC	ENSMUSG00000029270.11	novel	2721	5	NA	NA	14	739	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	72.3165783206036	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATGATTTACTGTGTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108134937	108056829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_108058028_108059477_108059655_108062211_108062320_108072450_108072586_108134814
tx.14583	chr5	+	3135	15	NNC	ENSMUSG00000029267.18	novel	718	8	NA	NA	-4934	-94	intron_retention	FALSE	canonical	3	616	junction_3	357.553592386612	89	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTAGAGTTGTCTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108208605	108256041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_108208730_108228690_108228890_108229002_108229089_108234864_108234961_108235161_108235263_108235806_108235956_108239926_108240023_108241203_108241273_108241990_108242115_108246984_108247053_108248678_108248850_108251885_108251992_108252131_108252185_108252291_108252397_108254453
tx.14584	chr5	+	705	7	ISM	ENSMUSG00000029267.18	ENSMUST00000198662.5	2675	16	9777	3422	946	9	internal_fragment	FALSE	canonical	3	1473	junction_1	110.170700884279	379	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAAAAAATCTGTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108235807	108251914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108235956_108239926_108240023_108241203_108241273_108241990_108242115_108246984_108247053_108248678_108248850_108251885
tx.14585	chr5	+	2530	10	ISM	ENSMUSG00000029267.18	ENSMUST00000198662.5	2675	16	9777	-707	946	-92	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1473	junction_1	115.345321577759	218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTAGAGTTGTCTTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108235807	108256043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108235956_108239926_108240023_108241203_108241273_108241990_108242115_108246984_108247053_108248678_108248850_108251885_108251992_108252131_108252185_108252291_108252397_108254453
tx.14586	chr5	-	1450	4	FSM	ENSMUSG00000063406.12	ENSMUST00000002837.11	3800	4	32	2318	-5	-884	multi-exon	FALSE	canonical	3	224	junction_1	14.1656862405839	311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAGAAAGAAAAGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108280454	108271810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_108272626_108273766_108273951_108277883_108277982_108280101
tx.14587	chr5	+	623	3	ISM	ENSMUSG00000056531.12	ENSMUST00000047677.9	5336	29	-102	97363	-63	-3310	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	80	junction_2	6.5	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGATGAGTGTTTTGTCT	1041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108280677	108284131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108280865_108283287_108283431_108283838
tx.14588	chr5	+	1054	8	ISM	ENSMUSG00000056531.12	ENSMUST00000047677.9	5336	29	-101	75043	-62	-2908	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	64	junction_4	10.1619538535879	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTTCAAGAAAAGTGTAAT	1042	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108280678	108306451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108280865_108283287_108283431_108283838_108284011_108286779_108286939_108288724_108288832_108296776_108296906_108303624_108303722_108306390
tx.14589	chr5	+	1165	4	ISM	ENSMUSG00000056531.12	ENSMUST00000047677.9	5336	29	-95	94045	-56	8	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	80	junction_2	5.90668171555645	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCCGCAAGAATCTTTGG	1048	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108280684	108287449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108280865_108283287_108283431_108283838_108284011_108286779
tx.14590	chr5	+	2302	11	ISM	ENSMUSG00000056531.12	ENSMUST00000047677.9	5336	29	-89	64838	-50	-4998	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	64	junction_4	9.50841732361385	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGTACTTAAAAGAATAA	1054	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108280690	108316656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108280865_108283287_108283431_108283838_108284011_108286779_108286939_108288724_108288832_108296776_108296906_108303624_108303722_108306390_108306513_108309332_108309625_108311513_108311639_108315874
tx.14591	chr5	+	1158	9	ISM	ENSMUSG00000056531.12	ENSMUST00000047677.9	5336	29	-107	72125	-68	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	64	junction_4	10.4522724801834	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATGATTATGGCAATGAA	1036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108280672	108309369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108280865_108283287_108283431_108283838_108284011_108286779_108286939_108288724_108288832_108296776_108296906_108303624_108303722_108306390_108306513_108309332
tx.14592	chr5	+	3065	3	FSM	ENSMUSG00000029265.5	ENSMUST00000031190.5	3085	3	20	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_1	9	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTTTATATTTAATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108416782	108428392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_108417676_108423434_108423599_108426384
tx.14593	chr5	-	170	2	ISM	ENSMUSG00000050856.17	ENSMUST00000123184.2	563	3	582	7	582	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3979	junction_1	0	222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGTGGCTTCCTCTCTCT	6135	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108581681	108581118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_108581204_108581596
tx.14594	chr5	-	242	3	FSM	ENSMUSG00000050856.17	ENSMUST00000123184.2	563	3	314	7	314	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	3979	junction_1	613.5	550	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGTGGCTTCCTCTCTCT	5867	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108581949	108581118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_108581204_108581596_108581696_108581891
tx.14595	chr5	-	313	4	FSM	ENSMUSG00000050856.17	ENSMUST00000049628.16	371	4	49	9	-2	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	3979	junction_1	506.673026275877	12970	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTGTGGCTTCCTCTCTCT	5551	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108582265	108581118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_108581204_108581596_108581696_108581891_108581947_108582191
tx.14596	chr5	+	1575	11	FSM	ENSMUSG00000033623.14	ENSMUST00000046975.12	7708	11	27	6106	27	4580	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_9	9.83666610188635	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTTGCAGCAATGCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108609124	108648736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_108609318_108619937_108619978_108620242_108620384_108621654_108621773_108622975_108623073_108626168_108626225_108634005_108634114_108635701_108635791_108643699_108643838_108647492_108647574_108648222
tx.14597	chr5	+	1219	8	FSM	ENSMUSG00000033623.14	ENSMUST00000112597.8	2169	8	45	905	-36	-905	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_2	4.29047354790892	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGTATCCCTGTCTATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108609142	108636185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_108609318_108619937_108619978_108620242_108620384_108621654_108621773_108622975_108623073_108626168_108626225_108634005_108634114_108635701
tx.14598	chr5	-	2127	4	FSM	ENSMUSG00000033615.10	ENSMUST00000046892.10	2189	4	57	5	33	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	1.4142135623731	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTGTGGCTATTCCTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108697833	108666424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_108668193_108673257_108673434_108696371_108696476_108697754
tx.14599	chr5	-	2028	9	ISM	ENSMUSG00000062234.15	ENSMUST00000046603.15	4453	28	45450	0	-3332	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	348	junction_7	23.0837469878701	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTGGCTTGTAAAGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108732155	108717279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_108717823_108718005_108718183_108719254_108719401_108719739_108719953_108724428_108724546_108728772_108728896_108729979_108730151_108730535_108731016_108732097
tx.146	chr1	+	509	4	FSM	ENSMUSG00000061518.12	ENSMUST00000193210.6	865	4	63	293	-63	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	7132	junction_3	70.6588045940962	39075	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGCTAGTCTTATGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36730627	36732469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_36730771_36731291_36731366_36731531_36731632_36732277
tx.14600	chr5	-	867	3	ISM	ENSMUSG00000062234.15	ENSMUST00000156110.8	2269	11	20136	3	334	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	377	junction_1	18.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTGGCTTGTAAAGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108719401	108717279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_108717823_108718005_108718183_108719254
tx.14601	chr5	+	1283	8	FSM	ENSMUSG00000013495.16	ENSMUST00000146207.6	1686	8	35	368	-27	-368	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_1	14.7149791792207	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGGGGTTTTAAGCAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108777670	108791528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_108777767_108786102_108786357_108786532_108786572_108787337_108787436_108789687_108789740_108789982_108790019_108790561_108790646_108790904
tx.14602	chr5	+	1411	10	NIC	ENSMUSG00000013495.16	novel	3956	11	NA	NA	-25	-14	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	19	junction_1	36.7544403968948	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTTGCATCTGACACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108777672	108792968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_108777767_108786138_108786357_108786532_108786572_108787337_108787436_108789687_108789740_108789982_108790019_108790561_108790646_108790904_108791070_108792033_108792113_108792422
tx.14603	chr5	+	2447	11	FSM	ENSMUSG00000013495.16	ENSMUST00000063272.13	3956	11	-20	1529	-20	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_10	21.559220765139	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAAAGAATTTCTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108777677	108795119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_108777767_108786102_108786357_108786532_108786572_108787337_108787436_108789687_108789740_108789982_108790019_108790561_108790646_108790904_108791070_108792033_108792113_108792422_108792559_108793704
tx.14604	chr5	+	1438	10	ISM	ENSMUSG00000013495.16	ENSMUST00000063272.13	3956	11	-16	3680	-16	-14	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	99	junction_1	13.0251418797514	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTTGCATCTGACACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108777681	108792968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108777767_108786102_108786357_108786532_108786572_108787337_108787436_108789687_108789740_108789982_108790019_108790561_108790646_108790904_108791070_108792033_108792113_108792422
tx.14605	chr5	-	622	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000008090.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAGACTCTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108841932	108831768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_108832160_108841701
tx.14606	chr5	+	1526	3	ISM	ENSMUSG00000008090.15	ENSMUST00000013633.12	2329	7	10598	-51	26	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_1	1	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTCTGGTGTTTTTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108852965	108854813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108853006_108853084_108853439_108853681
tx.14607	chr5	+	599	4	Intergenic	novelGene_1116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	8.52447456836295	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTGACAGGTATCTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109614941	109624648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_109615053_109618707_109618865_109624129_109624257_109624444
tx.14608	chr5	+	412	4	Intergenic	novelGene_1117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	6.94422221866655	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTCAGTGTGATACAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109614941	109625167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_109615053_109624129_109624257_109624444_109624506_109625054
tx.14609	chr5	+	439	3	Intergenic	novelGene_1118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	8.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTGACAGGTATCTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109614944	109624648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_109615053_109624129_109624257_109624444
tx.1461	chr10	+	811	4	FSM	ENSMUSG00000020098.8	ENSMUST00000020298.8	789	4	-21	-1	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_3	1.24721912892465	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCTTCTAGAACCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60925116	60930104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_60925196_60927842_60927975_60928382_60928464_60929585
tx.14610	chr5	+	756	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033467.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCATTTTATTTGAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109697363	109702585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_109697470_109701178_109701634_109702390
tx.14611	chr5	-	667	2	ISM	ENSMUSG00000033467.13	ENSMUST00000198960.2	812	5	896	-6	896	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	615	junction_1	0	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGGCCAGCCATCATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109703443	109702574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_109702937_109703138
tx.14612	chr5	-	523	3	ISM	ENSMUSG00000033467.13	ENSMUST00000198960.2	812	5	891	-6	891	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	516	junction_2	49.5	2458	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGGCCAGCCATCATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109703448	109702574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_109702937_109703138_109703224_109703372
tx.14613	chr5	-	1042	5	NNC	ENSMUSG00000033467.13	novel	1405	8	NA	NA	-253	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	255.05918430827	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGGCCAGCCATCATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109704592	109702574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_109702937_109703138_109703224_109703372_109703494_109703884_109704048_109704281
tx.14614	chr5	-	493	4	FSM	ENSMUSG00000072763.3	ENSMUST00000092720.4	3341	4	206	2642	206	-2642	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	21.5148527508066	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAATCAATGTGGTAAAGC	6337	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109838701	109825052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_109825258_109826379_109826441_109826628_109826756_109838601
tx.14615	chr5	-	2597	4	FSM	ENSMUSG00000072762.10	ENSMUST00000112547.8	2001	4	-121	-475	-121	475	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	29.0631496343164	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATAGCCATATGCCTTTTT	7825	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109899584	109883380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_109885666_109886815_109886877_109887064_109887192_109899460
tx.14616	chr5	-	431	3	FSM	ENSMUSG00000072762.10	ENSMUST00000100937.4	599	3	168	0	-121	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_2	15.5	484	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTTGATTAAATTCTCA	7825	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109899584	109886696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_109886877_109887064_109887192_109899460
tx.14617	chr5	-	2021	4	NNC	ENSMUSG00000105471.2	novel	665	2	NA	NA	-2	-12826	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	44	junction_1	67.6214955961983	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTCTTGGTCTTGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109944166	109930098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_109931814_109932961_109933023_109933207_109933335_109944048
tx.14618	chr5	-	725	4	Intergenic	novelGene_1119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	60.4997704311531	245	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAATTCATACTGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109992912	109983043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_109983468_109984614_109984676_109984863_109984991_109992799
tx.14619	chr5	-	428	3	Intergenic	novelGene_1120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_2	23	355	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTTGATTAAATTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109992921	109984496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_109984676_109984863_109984991_109992799
tx.14620	chr5	+	778	2	Intergenic	novelGene_1121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGACTGTTTTGCTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110014576	110018027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_110014679_110017351
tx.14621	chr5	+	1348	4	FSM	ENSMUSG00000090015.9	ENSMUST00000112544.8	2417	4	243	826	243	-826	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	50.6315667894601	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTACAAGTGTGATCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110071508	110090976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110071633_110088291_110088419_110088605_110088667_110089940
tx.14622	chr5	+	454	3	ISM	ENSMUSG00000090015.9	ENSMUST00000112544.8	2417	4	247	2990	247	142	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_1	62	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGCCAGGTGTCTCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110071512	110088812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_110071633_110088291_110088419_110088605
tx.14623	chr5	-	623	2	FSM	ENSMUSG00000097863.2	ENSMUST00000181488.2	589	2	-27	-7	-27	7	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACCGTGTTGTGTCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110144291	110143369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110143686_110143984
tx.14624	chr5	+	469	3	FSM	ENSMUSG00000066613.15	ENSMUST00000099484.9	451	3	-13	-5	-12	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_1	18.5	620	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGGTGTCTGATTTGTGT	8358	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110144374	110155338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110144500_110154809_110154937_110155121
tx.14625	chr5	+	2082	4	FSM	ENSMUSG00000066613.15	ENSMUST00000112540.8	2081	4	-10	9	-10	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_3	47.4856703531591	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGAGTTGCCTTGGTCAT	8360	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110144376	110158268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110144500_110154809_110154937_110155121_110155183_110156497
tx.14626	chr5	-	1219	4	NNC	ENSMUSG00000090963.3	novel	1776	4	NA	NA	-11557	-537	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_1	6.94422221866655	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCGACTACATGAAAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110205909	110194634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_110195551_110196887_110196949_110197131_110197259_110205794
tx.14627	chr5	+	378	2	Intergenic	novelGene_1122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	49	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTCTTAGCTCCATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110223273	110223750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_110223459_110223557
tx.14628	chr5	-	574	4	FSM	ENSMUSG00000109771.2	ENSMUST00000210052.2	3523	4	-30	2979	-30	159	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	10.7082522694727	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTACAAATGTGATCAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110242316	110226980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110227247_110228349_110228411_110228603_110228731_110242196
tx.14629	chr5	+	721	3	ISM	ENSMUSG00000064247.15	ENSMUST00000086687.10	1346	8	2249	-2	1014	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCGGATGTTTTTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110250083	110251683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_110250198_110250311_110250496_110251260
tx.14630	chr5	-	478	3	ISM	ENSMUSG00000033434.16	ENSMUST00000127628.6	1481	7	2561	-3	694	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_1	18.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGCCTGGTTTTGTATAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110252507	110251841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_110252035_110252133_110252287_110252375
tx.14631	chr5	-	1616	10	FSM	ENSMUSG00000033434.16	ENSMUST00000077220.14	1617	10	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_7	48.631900316511	237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGCCTGGTTTTGTATAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110256063	110251841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110252035_110252133_110252287_110252375_110252525_110252755_110252965_110253064_110253224_110254131_110254203_110254518_110254650_110254735_110254807_110254925_110255064_110255721
tx.14632	chr5	+	3094	5	FSM	ENSMUSG00000023284.16	ENSMUST00000112528.8	3158	5	45	19	45	-19	multi-exon	TRUE	canonical	3	28	junction_1	12.7744862910412	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTCTATTTTAACCAGCA	1994	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110258002	110277641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110258184_110259762_110259933_110271625_110271747_110272218_110272312_110275112
tx.14633	chr5	+	1135	8	ISM	ENSMUSG00000014668.16	ENSMUST00000197010.5	2135	16	-11	16621	0	5233	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	248	junction_2	41.954786158824	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGGCGTCTGCTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110283714	110299646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_110283801_110283916_110284061_110288219_110288320_110291416_110291527_110292456_110292517_110292637_110292854_110294335_110294501_110299392
tx.14634	chr5	+	3158	18	FSM	ENSMUSG00000014668.16	ENSMUST00000112519.9	3159	18	0	1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_2	36.3883322871989	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGTGTTGTACTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110283714	110319836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110283801_110283916_110284061_110288219_110288320_110291416_110291527_110292456_110292517_110292637_110292854_110294335_110294501_110299392_110299553_110300201_110300357_110300983_110301147_110302702_110302849_110306664_110306785_110308023_110308108_110310576_110310648_110311871_110311960_110315989_110316098_110317007_110317081_110318727
tx.14635	chr5	+	931	8	ISM	ENSMUSG00000014668.16	ENSMUST00000199672.5	1774	15	10	17186	-1	74	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_2	125.841980601199	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGATGAAAGGAGGTTAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110283724	110294487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_110283801_110283916_110284061_110287982_110288056_110288219_110288320_110291416_110291527_110292456_110292517_110292637_110292854_110294335
tx.14636	chr5	-	2016	6	FSM	ENSMUSG00000029500.17	ENSMUST00000059229.16	2044	6	23	5	-10	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_2	111.169420255752	265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTGTTTATTTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110417730	110407025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110408304_110413377_110413509_110413605_110413695_110413776_110413903_110414952_110415132_110417517
tx.14637	chr5	-	2019	6	FSM	ENSMUSG00000029500.17	ENSMUST00000112505.9	2098	6	49	30	-10	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	275	junction_2	153.77594090104	191	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTGTTTATTTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110417730	110407025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110408304_110413377_110413512_110413605_110413695_110413776_110413903_110414952_110415132_110417517
tx.14638	chr5	-	1053	5	FSM	ENSMUSG00000029499.12	ENSMUST00000031472.12	1041	5	-21	9	-21	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	476	junction_4	29.6004645233821	1896	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAATGGGTGTGGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110434073	110422156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110422495_110425520_110425641_110429062_110429226_110431511_110431620_110433749
tx.14639	chr5	+	745	6	FSM	ENSMUSG00000007080.15	ENSMUST00000112482.2	747	6	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	245	junction_5	26.0967430918113	526	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTGTGTTCTGTTTTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110434208	110439101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110434316_110437098_110437241_110437647_110437729_110438091_110438137_110438270_110438364_110438824
tx.14640	chr5	+	984	6	FSM	ENSMUSG00000007080.15	ENSMUST00000141506.2	1723	6	756	-17	756	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_1	32.7865826215542	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTATGCTTCCACACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110482107	110485319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110482159_110482288_110482483_110483705_110483907_110484239_110484366_110484823_110484914_110484997
tx.14641	chr5	+	692	4	FSM	ENSMUSG00000072754.10	ENSMUST00000100924.5	692	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	4.71404520791032	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGTCCAGTCCATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110501961	110503960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110502160_110502356_110502483_110502590_110502717_110503718
tx.14642	chr5	+	669	4	FSM	ENSMUSG00000072754.10	ENSMUST00000190963.2	545	4	-62	-62	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	12.2565175405668	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTTGTCCAGTCCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110501961	110503959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110502160_110502378_110502483_110502590_110502717_110503718
tx.14643	chr5	+	903	3	NIC	ENSMUSG00000072754.10	novel	692	4	NA	NA	-17	-3	intron_retention	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACCTTGTCCAGTCCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110501944	110503957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_110502483_110502590_110502717_110503718
tx.14644	chr5	-	2573	3	NNC	ENSMUSG00000043323.18	novel	976	3	NA	NA	-4292	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	43	junction_2	277.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGTCTTATTATTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110585479	110577740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_110580012_110580766_110580968_110585378
tx.14645	chr5	+	1180	3	Intergenic	novelGene_1123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	4	30	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGAGAGACAAGGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110615121	110625311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_110615829_110622235_110622403_110625005
tx.14646	chr5	-	802	2	Intergenic	novelGene_1124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTACAGTGGCTGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110617080	110615616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_110615676_110616337
tx.14647	chr5	-	1636	14	ISM	ENSMUSG00000033294.12	ENSMUST00000042147.6	2075	15	363	167	205	-167	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	589	junction_9	55.8291985280464	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGTTTTTTAGTGTGGTT	9204	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110800920	110796450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_110796850_110796931_110797046_110797197_110797281_110797398_110797560_110797669_110797781_110797937_110797999_110798200_110798313_110798399_110798451_110798810_110798846_110798977_110799078_110799177_110799328_110799544_110799653_110800178_110800286_110800876
tx.14648	chr5	-	1877	15	FSM	ENSMUSG00000033294.12	ENSMUST00000042147.6	2075	15	31	167	-6	-167	multi-exon	FALSE	canonical	3	589	junction_9	55.5126847059778	582	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGTTTTTTAGTGTGGTT	8872	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110801252	110796450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110796850_110796931_110797046_110797197_110797281_110797398_110797560_110797669_110797781_110797937_110797999_110798200_110798313_110798399_110798451_110798810_110798846_110798977_110799078_110799177_110799328_110799544_110799653_110800178_110800286_110800876_110800998_110801088
tx.14649	chr5	+	2547	15	FSM	ENSMUSG00000029504.6	ENSMUST00000031478.6	4846	15	1	2298	1	327	multi-exon	TRUE	canonical	3	94	junction_7	18.2382195693885	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATTCCCGATAGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110801317	110806064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_110801655_110801743_110801878_110802333_110802485_110802734_110802881_110802957_110803030_110803172_110803280_110803430_110803540_110803625_110803772_110803905_110804099_110804196_110804313_110804390_110804508_110804681_110804784_110804953_110805018_110805116_110805252_110805446
tx.14650	chr5	+	879	4	ISM	ENSMUSG00000029504.6	ENSMUST00000031478.6	4846	15	3405	2298	-6	327	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_2	7.03957069398096	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAAATTCCCGATAGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110804721	110806064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_110804784_110804953_110805018_110805116_110805252_110805446
tx.14651	chr5	-	2284	5	FSM	ENSMUSG00000029505.18	ENSMUST00000146458.9	3673	5	-4	1393	-4	-995	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_3	2.77263412660235	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTATTGTTGCTGTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110918455	110886930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110887548_110888047_110888156_110889835_110889927_110903262_110904633_110918357
tx.14652	chr5	-	1092	3	ISM	ENSMUSG00000029507.17	ENSMUST00000112426.8	1389	4	4342	3	4342	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	530	junction_2	20.5	197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTCTTTGCCTATTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110923491	110921535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_110921846_110922387_110923080_110923401
tx.14653	chr5	-	1455	5	ISM	ENSMUSG00000029507.17	ENSMUST00000031483.15	1814	6	698	3	69	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	492	junction_3	32.6448694284416	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTCTTTGCCTATTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110927764	110921535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_110921846_110922387_110923080_110923401_110923505_110925479_110925618_110927552
tx.14654	chr5	-	1799	6	FSM	ENSMUSG00000029507.17	ENSMUST00000031483.15	1814	6	12	3	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	282	junction_5	100.055184773204	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTCTTTGCCTATTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110928450	110921535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110921846_110922387_110923080_110923401_110923505_110925479_110925618_110927552_110927764_110928105
tx.14655	chr5	-	1508	6	FSM	ENSMUSG00000029507.17	ENSMUST00000170468.8	1510	6	0	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_5	177.715052823333	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTCTTTGCCTATTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110928481	110921535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110921846_110922387_110923080_110923401_110923505_110925479_110925618_110927552_110927764_110928427
tx.14656	chr5	+	936	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029507.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGCTCCTGTCCTCCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110927710	110928996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_110928022_110928371
tx.14657	chr5	-	2006	3	ISM	ENSMUSG00000029512.12	ENSMUST00000196094.5	783	5	731	-1511	7	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	980	junction_2	93.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTGGTGTCAATTTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110935080	110932354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_110934094_110934165_110934302_110934949
tx.14658	chr5	-	794	6	FSM	ENSMUSG00000043510.13	ENSMUST00000056937.12	804	6	1	9	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	311	junction_3	42.8691030930203	1417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGCTTCTGCTAATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110987642	110976944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_110977078_110978801_110978850_110982520_110982666_110983845_110983936_110984172_110984270_110987361
tx.14659	chr5	-	594	3	ISM	ENSMUSG00000043510.13	ENSMUST00000056937.12	804	6	3	6782	3	-6771	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	372	junction_2	33.5	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTGTTCTTTGTAAATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110987640	110983717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_110983936_110984172_110984270_110987361
tx.14660	chr5	+	694	4	ISM	ENSMUSG00000029521.8	ENSMUST00000199937.5	2190	14	2	25337	2	-1097	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_1	91.2249965744039	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCTTTTCTTAACTTCCT	9184	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110987850	110996662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_110987915_110989071_110989410_110996254_110996380_110996495
tx.14661	chr5	+	824	5	NIC	ENSMUSG00000029521.8	novel	2190	14	NA	NA	2	-1097	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	57	junction_1	123.00076219276	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCTTTTCTTAACTTCCT	9184	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110987850	110996662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_110987915_110988276_110988407_110989071_110989410_110996254_110996380_110996495
tx.14662	chr5	+	621	3	ISM	ENSMUSG00000029521.8	ENSMUST00000200630.2	634	4	-239	1097	-239	-1097	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	312	junction_1	1.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCTTTTCTTAACTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110989080	110996662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_110989410_110996254_110996380_110996495
tx.14663	chr5	+	1518	10	ISM	ENSMUSG00000029521.8	ENSMUST00000066160.3	2276	15	15727	5	-10544	-5	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	198	junction_1	24.6711707599511	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTAGTAGTTTGTTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111003592	111022006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_111003700_111006239_111006294_111008728_111008791_111011123_111011224_111013387_111013475_111014128_111014293_111014803_111014920_111015873_111015960_111019892_111019974_111021345
tx.14664	chr5	+	622	3	NNC	ENSMUSG00000033209.18	novel	10780	24	NA	NA	-1062	29571	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.5	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGATTGTGGCTTTTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111026606	111091753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_111026683_111040697_111040977_111091486
tx.14665	chr5	+	2782	10	NNC	ENSMUSG00000050017.12	novel	2761	12	NA	NA	-21	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	435.84582164673	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGTGCTCCTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111478607	111536225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_111478727_111486148_111486299_111494348_111494449_111495646_111495722_111497356_111497441_111519177_111519256_111528057_111528169_111530853_111530977_111533385_111533471_111534368
tx.14666	chr5	+	2774	11	NNC	ENSMUSG00000050017.12	novel	2761	12	NA	NA	-9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	374.982999614649	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGTGCTCCTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111478619	111536225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_111478700_111483360_111483392_111486148_111486299_111494348_111494449_111495646_111495722_111497356_111497441_111519177_111519256_111528057_111528169_111530853_111530977_111533385_111533471_111534368
tx.14667	chr5	+	2685	10	NNC	ENSMUSG00000050017.12	novel	2632	11	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	432.941361182115	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGTGTGCTCCTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111478623	111536225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_111478700_111483360_111483392_111486148_111486299_111494348_111494449_111495646_111495722_111497356_111497441_111519177_111519256_111528057_111528169_111530853_111530977_111534368
tx.14668	chr5	-	1910	5	NNC	ENSMUSG00000085271.8	novel	906	5	NA	NA	-2	606	intron_retention	FALSE	canonical	2	8	junction_4	1.08972473588517	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATTTTTTCCTCATGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111909593	111881543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_111883050_111886992_111887080_111887701_111887776_111895707_111895859_111909501
tx.14669	chr5	-	755	5	FSM	ENSMUSG00000085271.8	ENSMUST00000129065.8	729	5	4	-30	4	11	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.54950975679639	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGGAGCTTCCTCAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111909587	111882138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_111882496_111886992_111887080_111887701_111887776_111895707_111895859_111909501
tx.14670	chr5	+	402	2	Intergenic	novelGene_1126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGAAACTGTCATGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111913735	111914252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_111913843_111913957
tx.14671	chr5	-	425	2	NNC	ENSMUSG00000066975.13	novel	754	4	NA	NA	3660	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAACTGTGTCCCCTCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112395368	112394357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_112394685_112395270
tx.14672	chr5	+	903	6	NIC	ENSMUSG00000029344.16	novel	1835	7	NA	NA	-1	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	57	junction_2	115.943779479539	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGAGTGAGTAGCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112424571	112463222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_112424638_112451765_112451838_112457554_112457754_112459549_112459601_112461107_112461157_112462756
tx.14673	chr5	+	1816	7	FSM	ENSMUSG00000029344.16	ENSMUST00000239473.2	1813	7	-2	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_1	59.7847992571876	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGAGTGAGTAGCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112424570	112463222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_112424638_112451765_112451838_112455431_112456344_112457554_112457754_112459549_112459601_112461107_112461157_112462756
tx.14674	chr5	+	927	6	NIC	ENSMUSG00000029344.16	novel	442	5	NA	NA	-39	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	57	junction_2	128.790372310977	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGAGTGAGTAGCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112436588	112463222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_112436679_112451765_112451838_112457554_112457754_112459549_112459601_112461107_112461157_112462756
tx.14675	chr5	+	1838	7	NIC	ENSMUSG00000029344.16	novel	442	5	NA	NA	-38	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	101	junction_1	87.1615677284942	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGAGTGAGTAGCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112436589	112463222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_112436679_112451765_112451838_112455431_112456344_112457554_112457754_112459549_112459601_112461107_112461157_112462756
tx.14676	chr5	+	3529	14	FSM	ENSMUSG00000029345.14	ENSMUST00000031288.14	3560	14	31	0	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_4	15.3503464486856	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGAAGTATATGGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112474254	112485939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_112474340_112475350_112475537_112475827_112476049_112477231_112477386_112477612_112477770_112478956_112479085_112479733_112479887_112480829_112481358_112481440_112481548_112482182_112482352_112482725_112482970_112483438_112483582_112483880_112484047_112484851
tx.14677	chr5	+	2447	12	ISM	ENSMUSG00000029345.14	ENSMUST00000031288.14	3560	14	1730	685	1596	115	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_2	15.0503287902363	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGATGAATAACGTCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112475953	112485254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_112476049_112477231_112477386_112477612_112477770_112478956_112479085_112479733_112479887_112480829_112481358_112481440_112481548_112482182_112482352_112482725_112482970_112483438_112483582_112483880_112484047_112484851
tx.14678	chr5	-	445	3	ISM	ENSMUSG00000029346.13	ENSMUST00000155756.8	871	5	1657	-1	1567	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	113	junction_1	13	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGGTTTACAGTGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112486231	112485256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_112485608_112485867_112485914_112486183
tx.14679	chr5	-	1012	7	FSM	ENSMUSG00000029346.13	ENSMUST00000146510.8	1064	7	53	-1	51	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_3	14.8884742894182	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGGTTTACAGTGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112490833	112485256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_112485608_112485867_112485914_112486183_112486339_112487584_112487684_112487762_112487990_112488961_112489003_112490740
tx.14680	chr5	-	791	5	FSM	ENSMUSG00000029346.13	ENSMUST00000155756.8	871	5	78	2	-12	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_3	40.1154583670684	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGCTTGGTTTACAGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112487810	112485259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_112485608_112485867_112485914_112486183_112486434_112487584_112487684_112487762
tx.14681	chr5	+	413	2	ISM	ENSMUSG00000042328.14	ENSMUST00000112359.9	3345	14	18	34021	1	-354	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTTTGAAGTATCTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112490966	112492259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_112491030_112491909
tx.14682	chr5	+	2807	14	FSM	ENSMUSG00000042328.14	ENSMUST00000035279.4	2836	14	28	1	23	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	24	junction_1	21.6682900317355	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTGAGTGATCAGCTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112490988	112526279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_112491030_112492406_112492915_112494459_112494551_112497150_112497295_112510974_112511083_112511411_112511529_112512386_112512482_112514764_112514838_112516801_112516839_112517320_112517418_112517811_112518611_112522745_112522879_112523218_112523328_112525824
tx.14683	chr5	+	694	2	NNC	ENSMUSG00000042328.14	novel	820	2	NA	NA	22	-354	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTTTGAAGTATCTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112490987	112492259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_112491030_112491607
tx.14684	chr5	-	765	3	ISM	ENSMUSG00000058153.16	ENSMUST00000200575.5	4998	15	49373	2363	49373	295	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTCTAAAAGGTCTTTAC	4295	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112573620	112569383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_112569905_112572488_112572592_112573479
tx.14685	chr5	-	1053	2	ISM	ENSMUSG00000058153.16	ENSMUST00000200575.5	4998	15	49973	2363	49973	295	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTCTAAAAGGTCTTTAC	4895	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112573020	112569383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_112569905_112572488
tx.14686	chr5	+	519	3	NNC	ENSMUSG00000104807.2	novel	613	3	NA	NA	-37486	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGGTCAAGGTGTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112785754	112828453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_112785898_112824588_112824815_112828303
tx.14687	chr5	-	355	2	ISM	ENSMUSG00000072720.10	ENSMUST00000182189.2	2510	11	73703	-2	73703	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTGTGTGGTTTCTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112840094	112836741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_112836964_112839961
tx.14688	chr5	-	2392	21	FSM	ENSMUSG00000042249.12	ENSMUST00000065167.9	6533	21	0	4141	0	1487	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_7	10.5322124931089	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTATGTCTGGCAGGGAGC	539	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113163380	113062488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_113062941_113063915_113064030_113066691_113066829_113067873_113068037_113071814_113071911_113073261_113073329_113076521_113076623_113077538_113077606_113085574_113085683_113089498_113089594_113092783_113092915_113094452_113094532_113101691_113101792_113103029_113103122_113105180_113105233_113109452_113109515_113114777_113114853_113117033_113117136_113121372_113121447_113133630_113133708_113163232
tx.14689	chr5	-	1420	12	ISM	ENSMUSG00000042249.12	ENSMUST00000065167.9	6533	21	6	30812	-5	19250	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_1	10.4391190534245	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGAGTGTCAGAGGGCGT	545	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113163374	113089159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_113089594_113092783_113092915_113094452_113094532_113101691_113101792_113103029_113103122_113105180_113105233_113109452_113109515_113114777_113114853_113117033_113117136_113121372_113121447_113133630_113133708_113163232
tx.1469	chr10	-	892	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037171.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGACAGTATTTAGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61253832	61223503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_61224196_61253632
tx.14690	chr5	+	1111	2	Intergenic	novelGene_1128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCACTGTTTGTTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113387382	113388984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_113388068_113388558
tx.14691	chr5	-	1112	5	FSM	ENSMUSG00000042216.14	ENSMUST00000112324.2	1102	5	-10	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_3	10.6389614154766	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGAGAGTGGTGTCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113428463	113421817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_113422223_113423899_113424039_113426998_113427132_113427322_113427487_113428192
tx.14692	chr5	-	960	6	NNC	ENSMUSG00000042216.14	novel	1102	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	17	junction_5	27.2176413379264	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGAGAGTGGTGTCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113428467	113421817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_113422223_113423899_113424039_113426998_113427132_113427322_113427487_113428192_113428261_113428416
tx.14693	chr5	-	1406	9	ISM	ENSMUSG00000042216.14	ENSMUST00000154248.8	2123	18	-58	15888	-16	-2565	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_8	3.99804639792987	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGAGCTGGGTAGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113458621	113430040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_113430583_113432845_113432978_113433144_113433291_113433492_113433561_113434640_113434794_113435090_113435254_113436689_113436766_113458413_113458458_113458539
tx.14694	chr5	-	1298	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000104705.2	novel	1200	1	NA	NA	-2682	6	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGTTTTCAGCCTATCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113472201	113468313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_113469309_113471898
tx.14695	chr5	+	527	2	Intergenic	novelGene_1129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCTGGCTTGGGTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113478372	113480470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_113478686_113480256
tx.14696	chr5	-	832	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000063430.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	204	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATGTCTATGTGCAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113734534	113711249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_113711932_113734384
tx.14697	chr5	-	294	2	Intergenic	novelGene_1134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_1	0	410	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGGGGTTCTATCGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113734538	113734148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_113734289_113734384
tx.14698	chr5	+	3139	3	FSM	ENSMUSG00000053334.7	ENSMUST00000065698.7	3133	3	1	-7	1	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_2	4.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCGTTGTCTCATCCAGGA	716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113873864	113878668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_113874111_113874881_113875234_113876127
tx.14699	chr5	-	3645	19	NIC	ENSMUSG00000018974.8	novel	4447	19	NA	NA	-14	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	34	junction_15	91.6478768621147	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGTGCATTGCAGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113909713	113880504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_113881365_113882604_113882796_113883107_113883261_113883640_113884093_113884684_113884854_113885983_113886061_113886822_113886936_113889263_113889374_113890274_113890334_113890451_113890530_113891658_113891767_113892293_113892433_113893430_113893587_113896199_113896325_113897281_113897388_113899155_113899341_113900889_113900995_113902133_113902261_113909381
tx.147	chr1	-	2119	11	FSM	ENSMUSG00000037351.10	ENSMUST00000043951.10	3248	11	42	1087	-19	-1087	multi-exon	FALSE	canonical	3	484	junction_1	31.3043128019128	391	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCGGTGTGTGGCTCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36749047	36738281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_36739260_36739417_36739459_36739616_36739679_36740214_36740390_36740501_36740595_36740765_36740983_36741139_36741265_36741555_36741682_36745950_36746027_36747271_36747337_36748886
tx.1470	chr10	+	560	3	Intergenic	novelGene_90	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_1	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCACCTGTCTCTGCCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61252255	61253446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_61252425_61252865_61252988_61253177
tx.14700	chr5	-	3593	19	FSM	ENSMUSG00000018974.8	ENSMUST00000019118.8	4447	19	856	-2	-16	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	367	junction_17	27.7084133944819	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGTGCATTGCAGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113909715	113880504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_113881365_113882604_113882796_113883107_113883261_113883640_113884093_113884684_113884854_113885983_113886061_113886822_113886936_113889263_113889374_113890274_113890334_113890451_113890530_113891658_113891767_113892293_113892433_113893430_113893587_113896199_113896325_113897281_113897334_113899155_113899341_113900889_113900995_113902133_113902261_113909381
tx.14701	chr5	+	290	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105031.2	novel	204	1	NA	NA	-24	101	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGCTGGGCTTGGGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113905159	113905488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_+_113905232_113905270
tx.14702	chr5	+	329	1	FSM	ENSMUSG00000105031.2	ENSMUST00000199823.2	204	1	-24	-101	-24	101	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	15	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGCTGGGCTTGGGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113905159	113905488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_113905200_113905500
tx.14703	chr5	+	330	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105031.2_ENSMUSG00000025825.13	novel	204	1	NA	NA	-24	-189	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTTCTAAACCCATTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113905159	113915670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_+_113905469_113915649
tx.14704	chr5	+	872	5	FSM	ENSMUSG00000025825.13	ENSMUST00000026937.12	957	5	68	17	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	687	junction_1	28.9179874818425	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTTTCTGTACTGAACCT	3663	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113910876	113916332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_113911006_113912323_113912438_113913278_113913390_113914831_113914911_113915893
tx.14705	chr5	+	715	4	ISM	ENSMUSG00000025825.13	ENSMUST00000145592.2	431	5	446	-432	446	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	735	junction_2	15.3260852434302	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCTGTACTGAACCTGA	5140	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113912353	113916334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_113912438_113913278_113913390_113914831_113914911_113915893
tx.14706	chr5	+	628	3	ISM	ENSMUSG00000025825.13	ENSMUST00000145592.2	431	5	1374	-432	1374	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	735	junction_1	16.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCTGTACTGAACCTGA	6068	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113913281	113916334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_113913390_113914831_113914911_113915893
tx.14707	chr5	+	1381	2	ISM	ENSMUSG00000025825.13	ENSMUST00000145592.2	431	5	2061	-430	2061	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	768	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTTTCTGTACTGAACCT	6755	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113913968	113916332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_113914911_113915893
tx.14708	chr5	-	1827	2	FSM	ENSMUSG00000048163.14	ENSMUST00000100874.6	1855	2	26	2	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCTGAGTCCTTCATGTGC	6304	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113968536	113956609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_113958310_113968409
tx.14709	chr5	-	2214	2	ISM	ENSMUSG00000004530.13	ENSMUST00000164980.8	3136	9	63364	0	2279	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	905	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGTGTGCTGTGCTTCTTT	9007	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113983402	113980496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_113982530_113983221
tx.1471	chr10	+	1784	3	FSM	ENSMUSG00000037171.7	ENSMUST00000049339.7	2095	3	311	0	311	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_2	2.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTCTCACAATGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61254061	61261117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_61254275_61258760_61259477_61260262
tx.14710	chr5	-	3336	10	ISM	ENSMUSG00000004530.13	ENSMUST00000004646.13	3491	11	26608	0	281	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	905	junction_1	47.6610978357987	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGTGTGCTGTGCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114020211	113980496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_113982530_113983221_113983468_113984206_113984265_113985494_113985641_113986587_113986693_113987589_113987710_113988711_113988894_113990231_113990362_114003699_114003823_114020018
tx.14711	chr5	-	3445	11	FSM	ENSMUSG00000004530.13	ENSMUST00000004646.13	3491	11	46	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	905	junction_1	46.3810306051946	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGTGTGCTGTGCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114046773	113980496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_113982530_113983221_113983468_113984206_113984265_113985494_113985641_113986587_113986693_113987589_113987710_113988711_113988894_113990231_113990362_114003699_114003823_114020018_114020219_114046671
tx.14712	chr5	-	1049	4	NNC	ENSMUSG00000004530.13	novel	456	3	NA	NA	-11	-6262	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	463.048113650791	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCTGCTTTCATCATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114046777	113992934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_113993555_114003699_114003823_114020018_114020219_114046671
tx.14713	chr5	-	187	1	Intergenic	novelGene_1135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAATAAATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114025179	114024992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_114025000_114025200
tx.14714	chr5	-	3306	14	NNC	ENSMUSG00000042121.17	novel	3164	14	NA	NA	-6209	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	116	junction_13	82.9598177489967	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTGATTTGTGTTAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114111026	114080250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_114081527_114084336_114084890_114088446_114088648_114089939_114090087_114091313_114091361_114093778_114093908_114095444_114095539_114096774_114096970_114098660_114098727_114099410_114099480_114104240_114104363_114104769_114104835_114108431_114108536_114110788
tx.14715	chr5	+	716	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042121.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGGGCTGGAGAGATGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114080936	114085968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_114081005_114083596_114083712_114085435
tx.14716	chr5	+	339	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042121.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATTTATTTTATGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114084752	114085615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_114084912_114085435
tx.14717	chr5	-	1385	9	NNC	ENSMUSG00000042121.17	novel	3164	14	NA	NA	-6048	6139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	116	junction_8	98.9980271268069	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAACAAAAACAAAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114110865	114093314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_114093908_114095444_114095539_114096774_114096970_114098660_114098727_114099410_114099480_114104240_114104363_114104769_114104835_114108431_114108536_114110788
tx.14718	chr5	-	2358	9	NNC	ENSMUSG00000042078.15	novel	1682	15	NA	NA	-106	-55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.52126570633944	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTATGGGATTTAAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114181048	114165025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_114166526_114168153_114168248_114169621_114169704_114170769_114170882_114173213_114173322_114176596_114176674_114179884_114179959_114180248_114180378_114180866
tx.14719	chr5	+	496	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042078.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.88561808316413	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGGGAAGCACTTATCCAA	5217	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114181130	114197246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_114181180_114195284_114195467_114196575_114196674_114197079
tx.14720	chr5	+	752	3	FSM	ENSMUSG00000029592.12	ENSMUST00000162506.2	588	3	-17	-147	-17	147	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCCTAGTCTCATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114203504	114227674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_114203830_114224730_114224981_114227497
tx.14721	chr5	+	1234	5	ISM	ENSMUSG00000029592.12	ENSMUST00000031588.12	4604	13	19188	2532	8375	1092	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_2	4.9180788932265	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCTTTGTTTCCCATTGT	9289	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114257563	114260249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_114257711_114258258_114258340_114258453_114258674_114259092_114259214_114259584
tx.14722	chr5	-	744	3	ISM	ENSMUSG00000044339.13	ENSMUST00000053657.13	1073	4	435	0	435	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	542	junction_2	7.5	1271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGGGGGGGGTGTGTGCA	8455	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114265802	114261986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_114262316_114263592_114263792_114265586
tx.14723	chr5	-	1022	4	NIC	ENSMUSG00000044339.13	novel	1073	4	NA	NA	8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	43	junction_3	238.844905511692	184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGGGGGGGGTGTGTGCA	7986	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114266271	114261986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_114262316_114263592_114263792_114265586_114265831_114266021
tx.14724	chr5	-	902	4	FSM	ENSMUSG00000044339.13	ENSMUST00000112279.2	899	4	6	-9	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	267	junction_3	133.312498372141	1824	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGGGGGGGGTGTGTGCA	7984	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114266273	114261986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114262316_114263592_114263792_114265586_114265831_114266143
tx.14725	chr5	-	1077	4	NNC	ENSMUSG00000044339.13	novel	1073	4	NA	NA	-2542	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	100	junction_3	211.98480029369	257	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGGGGGGGGTGTGTGCA	5436	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114268821	114261986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_114262316_114263592_114263792_114265586_114265831_114268516
tx.14726	chr5	+	1968	7	FSM	ENSMUSG00000029591.15	ENSMUST00000031587.13	1985	7	14	3	14	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	427	junction_1	117.255656106172	329	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGTGTGCCGACTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114268460	114277381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_114268687_114269379_114269575_114270241_114270338_114273924_114274023_114274407_114274497_114275213_114275393_114276296
tx.14727	chr5	+	1890	6	FSM	ENSMUSG00000029591.15	ENSMUST00000102584.11	2136	6	245	1	-58	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	690	junction_3	32.487536071546	610	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGTGTGCCGACTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114269231	114277381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_114269575_114270241_114270338_114273924_114274023_114274407_114274497_114275213_114275393_114276296
tx.14728	chr5	+	1295	9	NNC	ENSMUSG00000042010.17	novel	8482	52	NA	NA	-9707	8070	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	9.836157786453	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTGTATAGGCCTGAATA	4780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114328132	114336469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_114328247_114328390_114328473_114329215_114329315_114329912_114330023_114330134_114330246_114333284_114333495_114333695_114333867_114334720_114334887_114336237
tx.14729	chr5	+	1627	4	ISM	ENSMUSG00000042010.17	ENSMUST00000143276.2	6680	41	48489	-2	-65	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_1	12.0369800568452	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCTGGCCTTGATTTATT	5495	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114386328	114388822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_114386380_114386644_114386816_114386935_114387073_114387554
tx.14730	chr5	+	1867	3	NIC	ENSMUSG00000042010.17	novel	8788	53	NA	NA	-40	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	80	junction_1	3	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCTGGCCTTGATTTATT	5520	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114386353	114388822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_114386816_114386935_114387073_114387554
tx.14731	chr5	-	1168	7	FSM	ENSMUSG00000001098.16	ENSMUST00000001125.6	1026	7	-13	-129	-7	129	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_4	38.0379927032025	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGATTGCTTCTGTGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114518557	114503553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114503928_114505269_114505466_114506402_114506456_114507001_114507092_114508119_114508290_114512956_114513171_114518486
tx.14732	chr5	-	3084	7	FSM	ENSMUSG00000001098.16	ENSMUST00000102581.11	3103	7	14	5	-5	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_4	16.3401346383682	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCACGCCGCCTTCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114518555	114501632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114503928_114505269_114505466_114506402_114506456_114507001_114507089_114508119_114508290_114512956_114513171_114518486
tx.14733	chr5	+	1434	7	ISM	ENSMUSG00000029577.14	ENSMUST00000130169.8	4888	27	3	30051	3	-1042	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	262	junction_4	21.8911448358057	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTATTTTGCCTGTAACGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114518889	114529178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_114519037_114522375_114522464_114525154_114525340_114525441_114525563_114526783_114526844_114527125_114527231_114528450
tx.14734	chr5	-	430	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029577.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATAAACTAGGTGTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114556689	114554810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_114555085_114556235_114556346_114556643
tx.14735	chr5	-	1006	9	FSM	ENSMUSG00000029575.18	ENSMUST00000031560.14	3020	9	36	1978	-3	188	multi-exon	TRUE	canonical	3	162	junction_1	19.5604032422647	288	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTTGGGCTTTCTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114582085	114571072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114571420_114573338_114573399_114574539_114574605_114574770_114574869_114575110_114575184_114575878_114575937_114576581_114576676_114580821_114580884_114581936
tx.14736	chr5	-	1171	8	FSM	ENSMUSG00000029575.18	ENSMUST00000123256.3	1277	8	-32	138	-3	-138	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_4	16.4738506458581	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAATCCTTCCTTCTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114582085	114572826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114573399_114574539_114574605_114574770_114574869_114575110_114575184_114575878_114575937_114576581_114576676_114580821_114580884_114581936
tx.14737	chr5	+	1683	11	FSM	ENSMUSG00000041939.15	ENSMUST00000043760.15	1660	11	-23	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_10	13.5410487038486	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGGGCCCTGTGGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114582343	114598652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_114582425_114583448_114583541_114584219_114584368_114588337_114588483_114588766_114588923_114590425_114590530_114590940_114590987_114593457_114593549_114593950_114594068_114596955_114597110_114598103
tx.14738	chr5	+	996	7	ISM	ENSMUSG00000041939.15	ENSMUST00000043760.15	1660	11	-20	7439	0	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	117	junction_1	10.1063786238637	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGGCTGTCTGTCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114582346	114591213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_114582425_114583448_114583541_114584219_114584368_114588337_114588483_114588766_114588923_114590425_114590530_114590940
tx.14739	chr5	-	525	2	Intergenic	novelGene_1136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTCCTGTTCTGGAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114623949	114623296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_114623687_114623814
tx.1474	chr10	+	1334	11	FSM	ENSMUSG00000020089.9	ENSMUST00000020286.7	1364	11	30	0	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3777	junction_3	128.102654148929	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCTTAGGATAGTTTCT	2082	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61484360	61509947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_61484571_61487338_61487398_61495227_61495282_61496690_61496811_61499468_61499556_61501118_61501246_61502689_61502818_61503363_61503450_61506196_61506267_61508169_61508213_61509597
tx.14740	chr5	-	755	3	ISM	ENSMUSG00000014158.13	ENSMUST00000071968.9	3228	16	22	17865	19	-3885	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	12	junction_1	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGACTCCTGCATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114796460	114778077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_114778358_114782574_114782992_114796402
tx.14741	chr5	-	1343	2	ISM	ENSMUSG00000011884.14	ENSMUST00000012028.14	1762	5	16775	5	16699	-5	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	1407	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCATGTGTCTGTGGCGC	1683	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114812270	114807463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_114808651_114812114
tx.14742	chr5	-	1719	5	FSM	ENSMUSG00000011884.14	ENSMUST00000012028.14	1762	5	38	5	-5	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1353	junction_4	27.6541136180497	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCATGTGTCTGTGGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114829007	114807463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114808651_114812114_114812266_114814325_114814460_114815681_114815741_114828819
tx.14743	chr5	+	238	2	Intergenic	novelGene_1138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	34	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCAGAGTCATATTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114835207	114836759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_114835295_114836608
tx.14744	chr5	+	2887	13	NNC	ENSMUSG00000002486.16	novel	2882	13	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	17.5404294892305	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCAGGCTGTCACTGCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114845819	114860388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_114846022_114846714_114846904_114847367_114847579_114849313_114849371_114851484_114851554_114852688_114852863_114853613_114853727_114853895_114853963_114855497_114855671_114856439_114856522_114857639_114857826_114858185_114858330_114859168
tx.14745	chr5	+	662	5	NNC	ENSMUSG00000002486.16	novel	3138	12	NA	NA	0	-412	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	27.6710588883042	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAGGTATGGAATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114845879	114851547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_114846022_114846714_114846904_114847367_114847579_114849313_114849371_114851484
tx.14746	chr5	+	1545	3	ISM	ENSMUSG00000002486.16	ENSMUST00000112199.3	2156	8	4623	0	-100	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_2	2.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCAGGCTGTCACTGCTGC	3930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114857644	114860388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_114857826_114858185_114858330_114859168
tx.14747	chr5	-	691	5	ISM	ENSMUSG00000041890.18	ENSMUST00000153756.8	2091	12	-11	17210	-11	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_4	20.2036506602149	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGTCTGCTCAGTTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114911567	114902589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_114902735_114904512_114904619_114905156_114905270_114907677_114907812_114911374
tx.14748	chr5	-	1303	2	FSM	ENSMUSG00000072694.9	ENSMUST00000112160.4	1333	2	28	2	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATCCTGTCTGCTGTTCTGT	747	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114952009	114946258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114947393_114951840
tx.14749	chr5	-	582	2	FSM	ENSMUSG00000072694.9	ENSMUST00000061251.6	579	2	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_1	0	692	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTTTTGGCGTCCTTCT	747	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114952009	114950853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114951267_114951840
tx.14750	chr5	-	946	2	FSM	ENSMUSG00000072694.9	ENSMUST00000234046.2	947	2	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	282	junction_1	0	2124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTCTTGTGGGTGAT	9594	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114961528	114959995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114960787_114961373
tx.14751	chr5	+	2138	6	FSM	ENSMUSG00000041827.16	ENSMUST00000112143.4	2181	6	40	3	40	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	3.38230690505755	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGAGTGGTCCTCATTTGT	7898	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115061362	115075971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_115061669_115066081_115066365_115067898_115068063_115070781_115071024_115073979_115074128_115074976
tx.14752	chr5	+	275	3	FSM	ENSMUSG00000029559.16	ENSMUST00000140090.2	368	3	-39	132	-12	-132	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_1	5	2816	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCCAAGAAACTGGGAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115080250	115084144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_115080415_115083844_115083888_115084076
tx.14753	chr5	+	1339	6	FSM	ENSMUSG00000029559.16	ENSMUST00000031538.9	2607	6	34	1234	-12	765	multi-exon	FALSE	canonical	3	243	junction_3	24.1909073827337	773	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGCCCTGGTCAGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115080250	115086608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_115080415_115083844_115083888_115084076_115084176_115084349_115084424_115085221_115085313_115085740
tx.14754	chr5	-	1848	10	FSM	ENSMUSG00000029545.14	ENSMUST00000031524.11	1870	10	22	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	425	junction_3	13.7822573362984	369	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGCCTGTGTCTGTCTT	9796	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115257383	115248357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_115249066_115249152_115249210_115249377_115249474_115249695_115249834_115249915_115250087_115250298_115250451_115250823_115250936_115251122_115251273_115255623_115255788_115257283
tx.14755	chr5	+	846	2	Intergenic	novelGene_1139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	241	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGCTGGCAAACCTTTCT	652	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115341971	115343351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_115342214_115342747
tx.14756	chr5	+	763	5	ISM	ENSMUSG00000060152.15	ENSMUST00000081497.13	1025	6	2182	19	-14	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	535	junction_1	139.257629952545	1831	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCACTTGCCTTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115376076	115379031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115376129_115376193_115376337_115378220_115378371_115378531_115378616_115378697
tx.14757	chr5	+	718	4	ISM	ENSMUSG00000060152.15	ENSMUST00000081497.13	1025	6	2292	19	81	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	770	junction_1	71.2242156073964	359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCACTTGCCTTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115376186	115379031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115376337_115378220_115378371_115378531_115378616_115378697
tx.14758	chr5	+	545	3	ISM	ENSMUSG00000060152.15	ENSMUST00000128830.5	575	4	2150	-28	-156	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	776	junction_1	74	233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCACTTGCCTTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115378243	115379031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115378371_115378531_115378616_115378697
tx.14759	chr5	-	981	7	ISM	ENSMUSG00000041740.17	ENSMUST00000112096.9	3112	17	25614	0	-1206	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1633	junction_2	42.0304122696358	3286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCGCCTTCCCGACAAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115385340	115379828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_115380121_115380451_115380611_115380692_115380751_115382079_115382181_115383907_115384064_115384938_115385041_115385227
tx.1476	chr10	+	756	7	FSM	ENSMUSG00000020088.11	ENSMUST00000020285.10	2613	7	7	1850	7	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1130	junction_5	94.5492229241233	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACAGCTTCCTCATGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61516095	61527226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_61516193_61520658_61520733_61520844_61520965_61521332_61521399_61522153_61522258_61525552_61525685_61527063
tx.14760	chr5	+	2007	7	FSM	ENSMUSG00000041733.11	ENSMUST00000040421.11	2037	7	28	2	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	495	junction_4	23.5442845152137	370	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCCTCAGATGTCACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115417752	115435029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_115417974_115421624_115421775_115422449_115422672_115428992_115429100_115432885_115432975_115433724_115433837_115433923
tx.14761	chr5	+	1587	5	ISM	ENSMUSG00000041733.11	ENSMUST00000040421.11	2037	7	4774	2	792	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	495	junction_2	14.7033159525326	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCCTCAGATGTCACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115422498	115435029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115422672_115428992_115429100_115432885_115432975_115433724_115433837_115433923
tx.14762	chr5	-	653	3	FSM	ENSMUSG00000009013.6	ENSMUST00000009157.4	2030	3	65	1312	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3784	junction_1	210.5	53849	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTCTGCTAGTTTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115438993	115436480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_115436893_115438571_115438710_115438890
tx.14763	chr5	+	1468	2	NNC	ENSMUSG00000086368.3	novel	1851	2	NA	NA	12511	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATGCTGACTTCTGCAGA	861	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115451776	115455656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_115453119_115455530
tx.14764	chr5	+	641	3	NNC	ENSMUSG00000086368.3	novel	1851	2	NA	NA	12549	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATGCTGACTTCTGCAGA	899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115451814	115455656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_115452228_115453016_115453119_115455530
tx.14765	chr5	+	1036	4	FSM	ENSMUSG00000029538.15	ENSMUST00000031513.14	1162	4	126	0	-92	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1733	junction_1	69.0700127889569	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCGTGCAGTTGTCTTTG	260	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115465361	115471139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_115465559_115468556_115468718_115470175_115470349_115470634
tx.14766	chr5	+	755	3	ISM	ENSMUSG00000029538.15	ENSMUST00000142318.3	1237	5	2923	0	4	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1851	junction_1	23	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCGTGCAGTTGTCTTTG	158	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115468640	115471139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115468718_115470175_115470349_115470634
tx.14767	chr5	+	610	2	ISM	ENSMUSG00000029538.15	ENSMUST00000149510.2	767	4	1607	-71	1607	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1897	junction_1	0	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCGTGCAGTTGTCTTTG	1761	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115470243	115471139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115470349_115470634
tx.14768	chr5	+	1063	2	FSM	ENSMUSG00000029535.5	ENSMUST00000031508.5	1088	2	9	16	9	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_1	0	968	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTGCTCCCAAAACCCT	2423	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115479292	115481612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_115479477_115480733
tx.14769	chr5	-	536	3	FSM	ENSMUSG00000041697.10	ENSMUST00000040154.10	571	3	23	12	23	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	7177	junction_2	62.5	67134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGTCCGTGAGCTGGACG	4877	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115487017	115483712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_115483986_115486623_115486767_115486897
tx.14770	chr5	+	576	8	ISM	ENSMUSG00000054256.12	ENSMUST00000151444.8	2636	11	1135	1803	229	1490	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_1	9.67217764560615	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTCAGTGGCTCAGATTCC	3624	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115568892	115585243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115568948_115571910_115571953_115573512_115573606_115576771_115576821_115578543_115578627_115579386_115579505_115583453_115583535_115585188
tx.14771	chr5	-	405	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000054256.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCACATACCTTTAATCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115583636	115582214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_115582508_115583524
tx.14772	chr5	+	793	5	NNC	ENSMUSG00000029522.13	novel	557	4	NA	NA	-1159	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	2118	junction_4	157.856540884437	4706	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGGTTTTGGTGATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115603161	115612776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_115603279_115604200_115604380_115608840_115609001_115610051_115610180_115612567
tx.14773	chr5	-	1406	4	ISM	ENSMUSG00000029524.17	ENSMUST00000112067.8	1645	5	1177	-4	-264	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_3	4.54606056566195	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGGACTGTGAACTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115621179	115616064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_115616468_115617660_115617872_115618289_115618585_115620682
tx.14774	chr5	+	368	2	NIC	ENSMUSG00000029528.20	novel	3761	10	NA	NA	-5	-28905	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATTACATACATTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115644764	115654037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_115644928_115653832
tx.14775	chr5	+	1099	7	FSM	ENSMUSG00000067274.11	ENSMUST00000086519.12	1358	7	47	212	-23	-212	multi-exon	FALSE	canonical	3	6763	junction_6	6310.78692266926	73576	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCGGTCTGGATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115697572	115701574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_115697599_115697845_115697948_115698799_115699064_115699157_115699305_115699391_115699578_115700484_115700626_115701341
tx.14776	chr5	+	1064	3	ISM	ENSMUSG00000041638.19	ENSMUST00000094427.7	3857	22	14341	-6	5165	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	434	junction_1	129.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCAGGAGTTTGTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115758095	115760713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115758311_115759559_115759779_115760083
tx.14777	chr5	+	1625	2	ISM	ENSMUSG00000029518.16	ENSMUST00000031492.15	2820	6	11690	581	11457	-581	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACCTGTCTCTCCACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115781656	115785214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115781759_115783691
tx.14778	chr5	-	1602	3	FSM	ENSMUSG00000041609.17	ENSMUST00000121746.8	1568	3	-31	-3	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTTGTGCCTCAGTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115791071	115786235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_115787629_115789877_115789999_115790983
tx.14779	chr5	-	597	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083833.5	novel	483	1	NA	NA	-47	130	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATTTAAAAAGGGTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115940265	115939605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_115939720_115939782
tx.1478	chr10	+	682	5	ISM	ENSMUSG00000020085.16	ENSMUST00000105455.9	1512	10	27	10341	3	391	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_1	28.6050694807756	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTTGTTTGATTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61551068	61564091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_61551132_61561634_61561834_61562143_61562260_61563425_61563546_61563907
tx.14780	chr5	+	453	4	NIC	ENSMUSG00000029516.20	novel	1671	11	NA	NA	2	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_3	25.3026129524645	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGGTGTTTCAGTGTGGG	8486	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115983341	115992749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_115983383_115984405_115984526_115989210_115989353_115992599
tx.14781	chr5	+	2089	11	FSM	ENSMUSG00000029516.20	ENSMUST00000147330.8	1671	11	5	-423	2	416	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	12.568213874692	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGGCAAACA	8486	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115983341	116064184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_115983383_115984405_115984526_115989210_115989353_115997256_115997433_116001016_116001119_116011910_116012054_116013947_116014039_116022924_116023129_116024712_116024867_116046696_116046881_116063452
tx.14782	chr5	+	453	3	FSM	ENSMUSG00000029516.20	ENSMUST00000153407.2	293	3	-155	-5	-65	5	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	28	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGGTGTTTCAGTGTGGG	9509	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115984364	115992749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_115984526_115989210_115989353_115992599
tx.14783	chr5	-	2069	7	FSM	ENSMUSG00000029513.15	ENSMUST00000031486.14	2089	7	17	3	6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_6	10.0788557551606	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTTTGACTCGGCACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116162504	116151647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_116152786_116152972_116153042_116156006_116156141_116158062_116158178_116158432_116158527_116159541_116159706_116162149
tx.14784	chr5	-	1978	8	FSM	ENSMUSG00000029513.15	ENSMUST00000111999.8	2026	8	48	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_7	27.0313499024932	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACTTTTGACTCGGCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116162519	116151648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_116152786_116152972_116153042_116156006_116156141_116158062_116158178_116158432_116158527_116159541_116159706_116162149_116162319_116162423
tx.14785	chr5	+	858	2	FSM	ENSMUSG00000086655.2	ENSMUST00000127792.2	1599	2	-13	754	-13	-754	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGAGGAGAATGCTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116261659	116266415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_116261887_116265784
tx.14786	chr5	-	792	3	ISM	ENSMUSG00000043913.15	ENSMUST00000050178.13	3522	14	154770	1123	154748	-1123	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTCAAGGTGTGGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116272274	116263822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_116264237_116269082_116269273_116272086
tx.14787	chr5	-	431	2	Intergenic	novelGene_1140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCGGGTATTTGGTGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116485488	116484264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_116484578_116485370
tx.14788	chr5	-	1815	3	FSM	ENSMUSG00000041548.5	ENSMUST00000036991.5	1816	3	-2	3	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_2	24.5	1383	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGTTGTGCTTCATTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116560925	116546552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_116547550_116553465_116553530_116560171
tx.14789	chr5	+	459	4	FSM	ENSMUSG00000086219.8	ENSMUST00000126959.5	3360	4	-7	2908	-7	481	multi-exon	FALSE	canonical	3	257	junction_3	60.4281023659982	1792	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGTTGTTGTTGTTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116576771	116600638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_116576898_116577427_116577496_116599782_116599863_116600453
tx.14790	chr5	+	520	4	NNC	ENSMUSG00000086219.8	novel	3360	4	NA	NA	-7	481	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	130	junction_3	120.252512101272	974	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGTTGTTGTTGTTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116576771	116600638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_116576898_116577427_116577496_116599782_116599924_116600453
tx.14791	chr5	-	677	2	ISM	ENSMUSG00000066900.12	ENSMUST00000202713.2	9778	3	9412	750	3822	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	651	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCTTGGGCTTCTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117233054	117230499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_117231097_117232974
tx.14792	chr5	-	723	3	ISM	ENSMUSG00000066900.12	ENSMUST00000086471.12	2425	12	17686	756	499	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	651	junction_1	24	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTGCCTTGGGCTTCTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117236377	117230500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_117231097_117232974_117233060_117236335
tx.14793	chr5	-	1656	4	ISM	ENSMUSG00000066900.12	ENSMUST00000086471.12	2425	12	16585	0	-602	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	565	junction_3	55.4336440159664	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCACGTGGTCTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117237478	117229744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_117231097_117232974_117233060_117236335_117236442_117237365
tx.14794	chr5	-	1215	4	FSM	ENSMUSG00000032959.13	ENSMUST00000036951.13	1240	4	28	-3	-14	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1275.14783456664	18887	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCGGGTATTTCCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117425662	117420715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_117421531_117423785_117423887_117424199_117424310_117425473
tx.14795	chr5	+	805	3	FSM	ENSMUSG00000066894.15	ENSMUST00000128524.2	572	3	-92	-141	-23	141	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	2	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTGTCCTCACACATGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117457333	117463406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_117457569_117461564_117461646_117462917
tx.14796	chr5	+	2313	9	FSM	ENSMUSG00000029364.16	ENSMUST00000031309.16	2421	9	108	0	107	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	560	junction_4	52.4760361974873	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTCTCTGTTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117495476	117516666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_117495539_117501655_117501825_117508755_117509001_117509153_117509286_117512177_117512279_117513833_117514007_117514561_117514673_117514755_117514864_117515454
tx.14797	chr5	-	1747	11	FSM	ENSMUSG00000029363.15	ENSMUST00000086461.13	2796	11	7	1042	5	472	multi-exon	TRUE	canonical	3	1613	junction_7	125.046431376509	1840	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGTGCTGGGCTGTCTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117527105	117517209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_117517972_117518831_117518887_117519900_117519979_117520400_117520531_117520843_117520926_117521459_117521620_117522595_117522670_117523452_117523533_117524786_117524924_117525933_117525999_117526981
tx.14798	chr5	+	791	2	FSM	ENSMUSG00000086075.2	ENSMUST00000140833.2	3492	2	-17	2718	-17	196	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGCAGTAGACTCATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117527186	117528845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_117527351_117528218
tx.14799	chr5	+	952	3	ISM	ENSMUSG00000029361.19	ENSMUST00000102557.10	4591	29	82463	-469	30402	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	6.5	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGTTAATCCCACCCACGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118087641	118092443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_118087894_118090829_118090949_118091862
tx.148	chr1	+	1956	12	NNC	ENSMUSG00000026117.11	novel	1338	6	NA	NA	329	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.0288908414713	32	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTATTCTCATCTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36810401	36821899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_36810669_36810869_36811031_36817233_36817373_36817460_36817546_36817627_36817672_36817831_36817884_36818197_36818394_36818765_36818973_36819917_36820111_36820199_36820341_36820426_36820540_36821541
tx.14800	chr5	+	2388	12	FSM	ENSMUSG00000032898.10	ENSMUST00000035579.10	3883	12	-14	1509	-4	129	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_9	49.846707161818	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTTTTTTTGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118114834	118146756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_118115105_118115922_118116059_118117805_118117901_118124163_118124286_118126842_118126990_118127188_118127326_118128867_118129005_118132546_118132727_118133434_118133568_118138402_118138594_118140079_118140238_118146074
tx.14801	chr5	+	2396	12	FSM	ENSMUSG00000032898.10	ENSMUST00000202447.4	3959	12	53	1510	-1	129	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_9	98.2366008780135	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTTTTTTTGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118114847	118146756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_118115105_118115922_118116059_118117805_118117901_118124163_118124286_118126842_118126990_118127188_118127326_118128867_118129005_118132546_118132727_118133434_118133568_118138381_118138594_118140079_118140238_118146074
tx.14802	chr5	+	2120	11	ISM	ENSMUSG00000032898.10	ENSMUST00000035579.10	3883	12	1072	1509	542	129	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	306	junction_8	51.2035155043089	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTTTTTTTGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118115920	118146756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_118116059_118117805_118117901_118124163_118124286_118126842_118126990_118127188_118127326_118128867_118129005_118132546_118132727_118133434_118133568_118138402_118138594_118140079_118140238_118146074
tx.14803	chr5	+	1687	8	ISM	ENSMUSG00000032898.10	ENSMUST00000202447.4	3959	12	12147	1510	9553	129	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	123	junction_5	117.890298366658	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTTTTTTTGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118126941	118146756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_118126990_118127188_118127326_118128867_118129005_118132546_118132727_118133434_118133568_118138381_118138594_118140079_118140238_118146074
tx.14804	chr5	+	2300	3	ISM	ENSMUSG00000032898.10	ENSMUST00000035579.10	3883	12	23602	192	21062	-192	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	438	junction_1	4.5	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCCAAAAGTTTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118138450	118148073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_118138594_118140079_118140238_118146074
tx.14805	chr5	+	916	8	NIC	ENSMUSG00000029359.14	novel	785	8	NA	NA	-31	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_1	22.6445470302252	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCATCTGTCCCTCACAT	4337	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118174064	118199943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_118174195_118184379_118184450_118191648_118191730_118192894_118193035_118194441_118194504_118194601_118194710_118197506_118197555_118199666
tx.14806	chr5	-	1794	3	ISM	ENSMUSG00000032867.9	ENSMUST00000049474.9	5000	11	85054	1647	85016	-1647	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	357	junction_1	8.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGTGTGTGCTGCTCCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118208475	118204676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_118206295_118206669_118206781_118208410
tx.14807	chr5	-	889	3	ISM	ENSMUSG00000032867.9	ENSMUST00000201545.2	1937	8	59864	1	59864	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	370	junction_1	14.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCGGTCCAGATTTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118233627	118215117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_118215770_118230560_118230768_118233597
tx.14808	chr5	+	1052	5	FSM	ENSMUSG00000032840.8	ENSMUST00000049138.8	5649	5	22	4575	22	-4575	multi-exon	FALSE	canonical	3	164	junction_3	13.6633634219397	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTTGCTCTCATTTCCTGA	1661	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118383313	118399583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_118383524_118393734_118393892_118397040_118397193_118397439_118397554_118399164
tx.14809	chr5	+	636	3	ISM	ENSMUSG00000032840.8	ENSMUST00000049138.8	5649	5	13798	4575	13798	-4575	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_1	18.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTTGCTCTCATTTCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118397089	118399583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_118397193_118397439_118397554_118399164
tx.14810	chr5	+	1514	3	NNC	ENSMUSG00000082365.3	novel	758	2	NA	NA	-2037	669	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTGTTTCCCTCTAGTAA	1158	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118638867	118642234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_118638948_118639594_118639671_118640876
tx.14811	chr5	-	520	2	Intergenic	novelGene_1142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCATTTGGCCTTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119447071	119446373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_119446647_119446824
tx.14812	chr5	+	459	2	NNC	ENSMUSG00000085345.2	novel	464	2	NA	NA	12535	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTCTTTTGTTGTGTTGTT	63	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119796733	119797330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_119796944_119797081
tx.14813	chr5	+	418	2	ISM	ENSMUSG00000018604.19	ENSMUST00000121021.8	4777	8	131	13139	-25	-2078	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCGAGAACCTTGCGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119809057	119809650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_119809123_119809297
tx.14814	chr5	+	2719	3	NIC	ENSMUSG00000018604.19	novel	485	2	NA	NA	-22	48	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	538	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACAAAAAAAAAACCCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119818291	119822674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_119818361_119818459_119819131_119820695
tx.14815	chr5	+	2782	2	ISM	ENSMUSG00000018604.19	ENSMUST00000018748.9	4856	8	9252	108	21	55	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1076	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACCCAAGAAGGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119818334	119822681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_119819131_119820695
tx.14816	chr5	-	1809	4	NNC	ENSMUSG00000086847.2	novel	1345	3	NA	NA	-25	393	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_2	1.4142135623731	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTCAGTGATGTTTTTAA	2678	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119829308	119822766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_119824120_119826288_119826463_119828572_119828619_119829072
tx.14817	chr5	-	1554	3	FSM	ENSMUSG00000086847.2	ENSMUST00000135385.2	1345	3	-32	-177	-32	177	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	0.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGCTCCCTTCGCCGGAG	2671	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119829315	119822982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_119824120_119826288_119826463_119829072
tx.14818	chr5	+	495	2	FSM	ENSMUSG00000029594.13	ENSMUST00000202388.2	455	2	-19	-21	-19	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTTTACGTTGTTTGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120254562	120257067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_120254715_120256724
tx.14819	chr5	-	1228	8	ISM	ENSMUSG00000029596.14	ENSMUST00000031594.13	1476	9	5476	-1	26	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.82946406783796	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGTGGCTCCCTGGGTTCT	7179	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120605399	120596265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_120596617_120597509_120597635_120597820_120598049_120598671_120598761_120600041_120600182_120600910_120600951_120601096_120601291_120605338
tx.14820	chr5	-	980	4	ISM	ENSMUSG00000029598.13	ENSMUST00000031597.7	4208	12	16124	1965	16100	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	256	junction_2	20.757863302587	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGAGGGCCTTGAGTCTT	8719	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120625566	120623311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_120623904_120624104_120624268_120624712_120624866_120625494
tx.14821	chr5	+	2462	12	NIC	ENSMUSG00000032754.15	novel	2898	16	NA	NA	-29	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	59.5266451902281	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAAGAGTCCCACAGGGT	1837	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120651178	120672089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_120651398_120657694_120657848_120657930_120657984_120658667_120658726_120658838_120658952_120659032_120659201_120659818_120659927_120665805_120665928_120667574_120667729_120668380_120668462_120669145_120669214_120670924
tx.14822	chr5	+	622	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032741.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCCCTCTTTATAGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120672219	120672886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_120672418_120672462
tx.14823	chr5	-	396	3	ISM	ENSMUSG00000032741.10	ENSMUST00000046426.10	4712	28	50721	1898	50642	-1898	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_2	1.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGTATGGGAACCATGTGT	9739	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120676017	120674115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_120674290_120675625_120675707_120675876
tx.14824	chr5	-	1118	4	NIC	ENSMUSG00000029600.11	novel	712	3	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	2	6	junction_2	29.8923996285938	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTTCAGTCCTGATACTC	6317	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120750652	120740168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_120740583_120742274_120742313_120749442_120749795_120750338
tx.14825	chr5	-	1561	3	FSM	ENSMUSG00000029600.11	ENSMUST00000031599.9	1573	3	12	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_2	1.5	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGGTAGTGTGTTACTTTTT	6327	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120750642	120747122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_120748028_120749442_120749795_120750338
tx.14826	chr5	+	2981	20	FSM	ENSMUSG00000029599.14	ENSMUST00000031598.11	4322	20	376	965	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	468	junction_5	36.9159410499192	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCAGGAGTGTGGCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120751179	120765692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_120751372_120755023_120755154_120756204_120756276_120756664_120756854_120756940_120756991_120757669_120757712_120757828_120757925_120758322_120758445_120758536_120758599_120758691_120758824_120759679_120759891_120761245_120761381_120761636_120761874_120761956_120762031_120762602_120762795_120763766_120763910_120763990_120764105_120764465_120764571_120764898_120765015_120765124
tx.14827	chr5	+	906	4	ISM	ENSMUSG00000029599.14	ENSMUST00000031598.11	4322	20	13186	963	4598	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	562	junction_2	12.2292908852294	232	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGAGTGTGGCTTCCTCA	9874	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120763989	120765694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_120764105_120764465_120764571_120764898_120765015_120765124
tx.14828	chr5	-	1595	3	ISM	ENSMUSG00000094282.2	ENSMUST00000177908.2	921	7	2772	333	2772	-333	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAAAAAAAAATCTGTG	8118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120769528	120766732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_120767866_120768072_120768295_120769288
tx.14829	chr5	+	1352	6	NNC	ENSMUSG00000029602.12	novel	486	2	NA	NA	-3827	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	10.6282642044691	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCGTGACGTGTTAAAATCG	152	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120812830	120817662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_120813041_120813454_120813593_120813670_120813807_120814852_120814974_120816687_120816759_120816986
tx.14830	chr5	-	1755	5	ISM	ENSMUSG00000029603.16	ENSMUST00000145174.8	2961	8	12270	-1	-218	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_3	13.57156954814	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGCCTTTTTCTGCCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120821198	120818266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_120819538_120820185_120820276_120820368_120820531_120820644_120820804_120821125
tx.14831	chr5	+	577	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029603.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAAGGGGGCTGGGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120832693	120833442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_120832906_120833077
tx.14832	chr5	+	480	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032690.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	74	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGTTTTGAAACTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120872943	120874531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_120873222_120874329
tx.14833	chr5	-	1526	5	NIC	ENSMUSG00000001166.18	novel	2291	7	NA	NA	1	-11	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.56195171219375	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAACTCAAAACTAGTTTAT	4881	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120950578	120938269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_120939129_120940105_120940260_120940886_120941123_120943468_120943666_120950498
tx.14834	chr5	-	450	3	ISM	ENSMUSG00000066861.15	ENSMUST00000161809.2	769	4	1166	-222	1166	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	316	junction_2	26.5	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGTGTGAACTCTGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121016500	121014784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_121015091_121015245_121015273_121016383
tx.14835	chr5	+	2026	7	NNC	ENSMUSG00000032623.10	novel	2021	6	NA	NA	-25816	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_1	52.429052590673	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAATGAATTAATTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121026782	121059711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_121026866_121052672_121053130_121053724_121054014_121054901_121055099_121057064_121057298_121057959_121058114_121059098
tx.14836	chr5	-	448	3	ISM	ENSMUSG00000052776.11	ENSMUST00000080322.8	1885	7	9088	463	9088	-463	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	208	junction_1	231.5	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGTGTGAACTCTGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121036496	121034781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_121035088_121035242_121035270_121036381
tx.14837	chr5	-	1410	7	FSM	ENSMUSG00000052776.11	ENSMUST00000080322.8	1885	7	12	463	12	-463	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_1	161.447015732372	735	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGTGTGAACTCTGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121045572	121034781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_121035088_121035242_121035270_121036381_121036536_121037135_121037369_121039932_121040118_121043658_121043948_121045356
tx.14838	chr5	-	615	4	ISM	ENSMUSG00000043733.15	ENSMUST00000148871.2	737	5	531	-2	531	2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	96	junction_3	2.05480466765633	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACAGATCTGATTTTTTTT	NA	False	NA	-102	True	NA	NA	NA	121281167	121271900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_121272210_121272798_121272890_121275479_121275593_121281065
tx.14839	chr5	-	994	7	ISM	ENSMUSG00000043733.15	ENSMUST00000100770.9	5599	16	12	23926	12	-20619	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_1	7.38617326872011	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAACAGATACAAAAACA	864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121329448	121292521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_121292590_121300771_121300886_121301200_121301318_121302557_121302751_121305911_121306107_121310043_121310167_121329264
tx.14840	chr5	+	952	7	FSM	ENSMUSG00000029614.14	ENSMUST00000031617.13	1270	7	44	274	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	7748	junction_1	3319.97705815367	23290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTGTCCTTTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121342587	121347030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_121342616_121343468_121343727_121343816_121343919_121344729_121344874_121345209_121345259_121346453_121346639_121346844
tx.14841	chr5	+	926	6	ISM	ENSMUSG00000029614.14	ENSMUST00000031617.13	1270	7	923	274	-5	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14010	junction_2	1238.46727853424	25460	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTGTCCTTTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121343466	121347030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_121343727_121343816_121343919_121344729_121344874_121345209_121345259_121346453_121346639_121346844
tx.14842	chr5	-	2476	12	FSM	ENSMUSG00000042726.15	ENSMUST00000042312.14	2503	12	27	0	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	8.79894809640935	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGTGATTCTTTCTATAG	3596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121523668	121509787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_121510476_121510665_121510739_121511200_121511538_121512009_121512131_121513078_121513310_121513858_121513936_121515800_121516008_121516558_121516965_121517478_121517533_121517608_121517745_121522102_121522168_121523587
tx.14843	chr5	+	2651	22	ISM	ENSMUSG00000042719.18	ENSMUST00000042163.15	5447	24	46	3592	-12	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	302	junction_8	46.1734873028366	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAACGAGCATCATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121536044	121576880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_121536126_121545255_121545342_121546259_121546399_121547148_121547268_121551069_121551145_121552551_121552660_121552864_121552944_121555439_121555552_121555989_121556080_121558525_121558696_121559353_121559467_121561597_121561806_121562576_121562667_121564033_121564215_121564789_121564890_121568667_121568820_121569522_121569649_121572888_121573133_121573522_121573647_121574721_121574788_121575670_121575769_121576790
tx.14844	chr5	+	912	7	ISM	ENSMUSG00000042719.18	ENSMUST00000151458.4	2910	24	37016	-213	-4397	213	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	374	junction_1	39.668067202166	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGACCCTCATCTGGGTT	5369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121573083	121578207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_121573133_121573522_121573647_121574721_121574788_121575670_121575769_121576790_121576902_121577397_121577545_121577890
tx.14845	chr5	-	1265	3	FSM	ENSMUSG00000029616.10	ENSMUST00000130451.2	5204	3	10	3929	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	820	junction_1	20.5	2030	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTTTTCTTTTTAGATA	3222	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121590559	121582815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_121583636_121585203_121585343_121590253
tx.14846	chr5	+	1371	11	FSM	ENSMUSG00000029452.19	ENSMUST00000094357.11	1366	11	22	-27	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	4.13400532171888	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCGTCATTTGCAAGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121601236	121633484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_121601334_121601849_121601897_121602861_121602926_121605916_121606049_121620395_121620501_121625812_121625863_121627310_121627395_121629138_121629278_121631693_121631839_121632266_121632341_121633050
tx.14847	chr5	+	1113	10	ISM	ENSMUSG00000029452.19	ENSMUST00000094357.11	1366	11	20	943	20	6	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_1	4.29469957557504	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACCAGTACTTCTGGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121601234	121632514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_121601334_121601849_121601897_121602861_121602926_121605916_121606049_121620395_121620501_121625812_121625863_121627310_121627395_121629138_121629278_121631693_121631839_121632266
tx.14848	chr5	-	756	3	ISM	ENSMUSG00000029454.16	ENSMUST00000152270.8	436	4	-15	0	-15	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	155	junction_2	24.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATTGCTTAAAGTTGCTA	8724	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121665264	121663114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_121663303_121663725_121663831_121664801
tx.14849	chr5	-	433	2	ISM	ENSMUSG00000029455.15	ENSMUST00000196694.2	845	3	2147	-172	2147	172	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	713	junction_1	0	363	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACGGGGTCAGTTCTCTA	4364	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121707103	121705768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_121706087_121706988
tx.1485	chr10	+	547	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000058806.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	20	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCCAACTGTAAAATGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61670316	61710001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_61670501_61698165_61698280_61709752
tx.14850	chr5	-	1954	13	FSM	ENSMUSG00000029455.15	ENSMUST00000031411.15	3867	13	234	1679	-8	172	multi-exon	TRUE	canonical	3	476	junction_10	93.9036148872283	850	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACGGGGTCAGTTCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121731653	121705768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_121706087_121706988_121707104_121708666_121708825_121710079_121710245_121710738_121710924_121711485_121711589_121713153_121713268_121713958_121714088_121714519_121714632_121716405_121716486_121717666_121717808_121718676_121718782_121731424
tx.14851	chr5	-	3618	21	FSM	ENSMUSG00000029456.13	ENSMUST00000111770.2	3626	21	10	-2	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	12.9348366823861	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGTTCTGAGCTAGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121798567	121759088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_121759443_121760052_121760131_121760741_121760886_121764110_121764284_121765327_121765487_121767963_121768055_121768160_121768299_121768707_121768849_121769339_121769741_121770551_121770726_121772739_121772886_121775306_121775458_121777186_121777369_121780674_121780744_121783431_121783574_121784764_121784925_121785897_121786057_121787416_121787612_121790018_121790168_121794076_121794277_121798355
tx.14852	chr5	+	772	2	ISM	ENSMUSG00000042605.17	ENSMUST00000159928.2	1468	4	5875	-216	-6	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCAGTTAGTGTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121949516	121953013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_121949676_121952400
tx.14853	chr5	+	940	3	ISM	ENSMUSG00000042605.17	ENSMUST00000162327.8	2343	14	27548	-230	-5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	113	junction_1	24.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCAGTTAGTGTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121949517	121953013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_121949676_121951447_121951617_121952400
tx.14854	chr5	+	705	2	ISM	ENSMUSG00000042605.17	ENSMUST00000162327.8	2343	14	29555	-230	1955	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	162	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCAGTTAGTGTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121951524	121953013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_121951617_121952400
tx.14855	chr5	+	2310	3	FSM	ENSMUSG00000044134.10	ENSMUST00000198271.5	2335	3	-5	30	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	19.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGGCTGGGTGTATTATTG	5408	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121987041	121992665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_121987188_121989230_121989343_121990613
tx.14856	chr5	+	2384	4	FSM	ENSMUSG00000044134.10	ENSMUST00000056654.8	2368	4	-11	-5	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	9.62635271879577	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGGGTGTATTATTGTT	5413	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121987046	121992667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_121987188_121988532_121988610_121989230_121989343_121990613
tx.14857	chr5	+	776	7	FSM	ENSMUSG00000013936.13	ENSMUST00000014080.13	662	7	-114	0	-114	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	1.91485421551268	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTGACCATTGGCTCAT	3491	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122238899	122244917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_122239093_122239811_122239902_122240758_122240835_122241893_122241999_122242889_122242969_122243050_122243100_122244733
tx.14858	chr5	+	2116	7	FSM	ENSMUSG00000004455.17	ENSMUST00000102528.11	2384	7	262	6	-53	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2504	junction_1	178.873092815363	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACTTGTTCGTGTCTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122296602	122313330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_122296679_122306237_122306370_122306981_122307213_122309884_122309990_122310794_122311019_122311208_122311344_122312117
tx.14859	chr7	+	1245	2	FSM	ENSMUSG00000100153.3	ENSMUST00000207161.2	1437	2	190	2	-12	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	469	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119339338	119341447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_119340294_119341157
tx.14860	chr7	+	1289	1	FSM	ENSMUSG00000100153.3	ENSMUST00000118909.2	972	1	281	-598	281	-529	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGTGATTCCTTCCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119339631	119340920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_119339600_119340900
tx.14861	chr5	+	2920	8	NIC	ENSMUSG00000064267.14	novel	2805	7	NA	NA	5	-25	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	35	junction_1	18.6153327191565	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGCTGTCATGGGGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122344871	122380335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_122345220_122348404_122348456_122354294_122354427_122371482_122371756_122375743_122375849_122376468_122376701_122378276_122378390_122378669
tx.14862	chr5	+	2637	8	FSM	ENSMUSG00000064267.14	ENSMUST00000072602.14	2790	8	129	24	-51	-24	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	20.2887321698825	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTGTCATGGGGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122347920	122380336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_122347985_122348404_122348456_122354294_122354427_122371482_122371756_122375743_122375849_122376468_122376701_122378276_122378390_122378669
tx.14863	chr5	-	4013	13	NNC	ENSMUSG00000038593.19	novel	5717	14	NA	NA	5	-1650	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	11.1952370824978	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTTTGGTAAGTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122402473	122377560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_122379899_122380668_122380789_122383563_122383727_122384547_122384689_122385594_122385681_122385982_122386109_122386911_122387064_122389674_122389785_122392546_122392647_122395532_122395685_122396897_122397029_122399469_122399591_122402200
tx.14864	chr5	-	1624	11	FSM	ENSMUSG00000038569.14	ENSMUST00000049009.7	1631	11	9	-2	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_9	5.37494186015067	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTGGTCATTTTATATA	10001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122492287	122463568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_122464043_122469531_122469761_122471358_122471479_122472324_122472390_122472472_122472580_122477794_122477902_122482260_122482361_122489321_122489437_122489623_122489774_122490606_122490678_122492201
tx.14865	chr5	-	565	2	ISM	ENSMUSG00000038569.14	ENSMUST00000049009.7	1631	11	22672	0	19733	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTGTGGTCATTTTATA	9944	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122469624	122463570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_122464043_122469531
tx.14866	chr5	+	983	4	FSM	ENSMUSG00000029462.19	ENSMUST00000155671.8	2716	4	36	1697	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1453	junction_1	367.656844837078	6944	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTCTTGAAAACCTGTG	715	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122492467	122501350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_122492540_122498075_122498268_122500098_122500335_122500867
tx.14867	chr5	+	912	3	ISM	ENSMUSG00000029462.19	ENSMUST00000118830.8	1014	5	5627	-1	2385	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2105	junction_2	106	887	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTCTTGAAAACCTGTG	6322	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122498074	122501350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_122498268_122500098_122500335_122500867
tx.14868	chr5	-	1387	7	NNC	ENSMUSG00000029463.6	novel	1388	7	NA	NA	5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	102.787266829225	719	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAATTTTAAATTATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122510422	122502642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_122502983_122504376_122504460_122505410_122505583_122505657_122505792_122507579_122507702_122508577_122508637_122509945
tx.14869	chr5	+	873	7	FSM	ENSMUSG00000029465.15	ENSMUST00000102525.11	899	7	26	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	554	junction_4	26.4638117687784	4689	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACACTGTACCGTGTATG	4514	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122529966	122544242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_122530061_122534879_122534980_122539709_122539787_122541421_122541491_122542186_122542314_122543146_122543242_122543931
tx.14870	chr5	+	2271	11	FSM	ENSMUSG00000029466.12	ENSMUST00000031422.10	2751	11	20	460	-17	-460	multi-exon	FALSE	canonical	3	226	junction_7	29.6310647800581	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCTTTGAGACTCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122560526	122582515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_122560742_122566193_122566381_122567548_122567669_122570803_122570916_122571446_122571601_122573581_122573725_122576191_122576310_122577381_122577579_122578148_122578374_122579352_122579504_122581866
tx.14871	chr5	-	1340	3	ISM	ENSMUSG00000029467.16	ENSMUST00000031423.10	4486	20	44015	-12	43407	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1133	junction_2	3	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTCTTGTTCTTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122596273	122594390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_122595490_122595574_122595693_122596150
tx.14872	chr5	-	2558	18	NIC	ENSMUSG00000029469.15	novel	2950	19	NA	NA	-4	-288	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_16	14.5402436403627	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTTGTGTCAAGATTGT	1239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122752585	122688558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_122689267_122693559_122693606_122697217_122697304_122697759_122697832_122698721_122698809_122705323_122705414_122706973_122707103_122710702_122710853_122729142_122729290_122731112_122731209_122732587_122732752_122738502_122738588_122740330_122740442_122740747_122740814_122745030_122745121_122747235_122747417_122749005_122749171_122752500
tx.14873	chr5	+	1985	12	FSM	ENSMUSG00000029470.16	ENSMUST00000031429.14	2702	12	23	694	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_5	9.63207451716048	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATCCTTGTCTGTGCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122845629	122867107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_122845851_122852461_122852610_122856375_122856448_122856563_122856637_122857192_122857290_122862656_122862738_122863052_122863195_122863292_122863430_122865260_122865355_122865461_122865528_122865807_122865904_122866349
tx.14874	chr5	+	1836	11	NIC	ENSMUSG00000029470.16	novel	2702	12	NA	NA	0	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_1	28.3167794778997	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATCCTTGTCTGTGCTGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122845631	122867108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_122845851_122856375_122856448_122856563_122856637_122857192_122857290_122862656_122862738_122863052_122863195_122863292_122863430_122865260_122865355_122865461_122865528_122865807_122865904_122866349
tx.14875	chr5	-	2008	13	ISM	ENSMUSG00000029471.14	ENSMUST00000199830.5	3139	14	40	2732	23	-2732	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	28	junction_4	15.8190725251374	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTGGAATGTCACTCAGT	4673	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122917422	122881413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_122882021_122882120_122882195_122883770_122883825_122884312_122884513_122886016_122886106_122886240_122886263_122888077_122888115_122891761_122891896_122894665_122894718_122895622_122895677_122897015_122897064_122901836_122902366_122917314
tx.14876	chr5	-	781	4	ISM	ENSMUSG00000029471.14	ENSMUST00000196742.2	1084	5	15252	0	-208	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_1	8.28653526310404	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGAGTTAGCAGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122902136	122894338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_122894718_122895622_122895677_122897015_122897064_122901836
tx.14877	chr5	-	1104	5	FSM	ENSMUSG00000029471.14	ENSMUST00000196742.2	1084	5	-20	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	7.3824115301167	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGAGTTAGCAGTGTCTT	4687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122917408	122894338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_122894718_122895622_122895677_122897015_122897064_122901836_122902366_122917314
tx.14878	chr5	-	334	2	ISM	ENSMUSG00000029472.14	ENSMUST00000199130.2	687	4	5191	-193	5191	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1940	junction_1	0	12864	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTGGGTTTTTTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122926401	122925784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_122926082_122926364
tx.14879	chr5	-	404	2	Intergenic	novelGene_1143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCGTCCAATTGATGTAAT	6445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122988003	122987512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_122987809_122987895
tx.14880	chr5	+	1541	3	ISM	ENSMUSG00000029474.8	ENSMUST00000031434.8	4440	6	125	6109	16	887	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	187	junction_1	1.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAACCAAAAAC	639	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122988235	123003245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_122988362_122999751_122999971_123002049
tx.14881	chr5	+	1969	6	FSM	ENSMUSG00000029474.8	ENSMUST00000031434.8	4440	6	125	2346	16	-2346	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_1	16.3389106124001	200	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTAGTTTAATATTGTT	639	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122988235	123007008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_122988362_122999751_122999971_123002049_123002458_123004864_123004970_123005182_123005385_123006099
tx.14882	chr5	+	1411	2	ISM	ENSMUSG00000029474.8	ENSMUST00000031434.8	4440	6	11657	6097	11548	899	internal_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCAAAAACAACAAAAAAAGT	4667	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122999767	123003257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_122999971_123002049
tx.14883	chr5	+	1035	6	ISM	ENSMUSG00000054434.15	ENSMUST00000111619.10	1256	11	37781	-319	14206	319	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_4	9.30806102257608	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTACCTGTGTTGTCTCTTG	58	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123252169	123255391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_123252231_123252630_123252693_123253162_123253256_123253723_123253789_123254264_123254334_123254706
tx.14884	chr5	+	1364	6	FSM	ENSMUSG00000029440.16	ENSMUST00000100729.9	2597	6	62	1171	-6	433	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_2	18.6868938028769	850	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGTGCTGTCAGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123366314	123387023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_123366508_123372656_123372760_123377604_123377814_123379894_123379997_123384256_123384346_123386355
tx.14885	chr5	+	845	5	NIC	ENSMUSG00000029440.16	novel	2597	6	NA	NA	-6	17	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	15	junction_1	81.8183964643649	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGCCATAGCCTGTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123366314	123386607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_123366508_123377604_123377814_123379894_123379997_123384256_123384346_123386355
tx.14886	chr5	+	1198	6	FSM	ENSMUSG00000029438.10	ENSMUST00000031391.9	4718	6	24	3496	24	-2586	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	4.53431361950185	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTCTGCTTTCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123482534	123509559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_123482785_123489929_123490012_123494003_123494101_123499253_123499422_123507395_123507518_123509080
tx.14887	chr5	-	1350	6	FSM	ENSMUSG00000029433.17	ENSMUST00000111587.10	1576	6	29	197	-4	-197	multi-exon	FALSE	canonical	3	603	junction_3	53.1902246658162	968	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTCTTCAGGCTGTCCT	8951	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123662210	123649964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_123650771_123655799_123655897_123656017_123656129_123658103_123658236_123661317_123661445_123662133
tx.14888	chr5	-	748	5	FSM	ENSMUSG00000029433.17	ENSMUST00000031385.7	681	5	-16	-51	-6	51	multi-exon	FALSE	canonical	3	603	junction_2	56.3493566955294	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATAATCGAAATATCTGAC	8949	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123662212	123655597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_123655897_123656017_123656129_123658103_123658236_123661317_123661445_123662133
tx.14889	chr5	-	2919	7	ISM	ENSMUSG00000029434.13	ENSMUST00000031388.13	4235	13	14266	443	247	-443	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	140	junction_1	15.6489261257407	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTGTCTCAATTTACAC	6752	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123696835	123667164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_123669285_123669887_123670057_123671920_123672059_123673276_123673415_123674595_123674664_123685064_123685192_123696676
tx.14890	chr5	-	3076	13	FSM	ENSMUSG00000029434.13	ENSMUST00000031388.13	4235	13	31	1128	-28	-1128	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_1	30.3840007240653	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAGTTGGGTATTTAAAA	9998	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123711070	123667849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_123669285_123669887_123670057_123671920_123672059_123673276_123673415_123674595_123674664_123685064_123685192_123696676_123696877_123701488_123701664_123703021_123703139_123707482_123707670_123708917_123709046_123709539_123709606_123710942
tx.14891	chr5	-	1378	6	ISM	ENSMUSG00000029422.16	ENSMUST00000182948.8	1609	8	3145	-22	2060	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	495	junction_2	15.7784663386528	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGCTGTTTGGTTTGGGA	2283	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123877751	123866764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_123867420_123868517_123868608_123869099_123869333_123871618_123871699_123874621_123874745_123877554
tx.14892	chr5	-	1862	10	FSM	ENSMUSG00000029422.16	ENSMUST00000182309.8	1595	10	20	-287	-5	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	403	junction_7	46.2523939987681	524	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTGTTAATTTAAGTTAC	4341	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123887457	123866782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_123867420_123868517_123868608_123869099_123869333_123871618_123871699_123874621_123874745_123877554_123877759_123878734_123878926_123881700_123881742_123883017_123883175_123887351
tx.14893	chr5	+	686	2	FSM	ENSMUSG00000029414.12	ENSMUST00000199838.2	347	2	5	-344	5	344	multi-exon	FALSE	canonical	3	399	junction_1	0	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTACCTGCTGTCTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123887783	123892467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_123887888_123891885
tx.14894	chr5	+	390	3	ISM	ENSMUSG00000029414.12	ENSMUST00000197265.2	859	9	7659	2	-495	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	548	junction_2	3.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGATGTTGGTTTCTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123957114	123959652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_123957205_123957932_123958024_123959443
tx.14895	chr5	+	1012	7	NNC	ENSMUSG00000023106.16	novel	2339	8	NA	NA	-11	459	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	572.327630528762	2834	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGATTTTTTTTTTTCTCTT	9061	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124045320	124065655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_124045430_124046162_124046278_124055243_124055348_124060242_124060327_124062793_124062911_124065060_124065201_124065312
tx.14896	chr5	+	993	7	NIC	ENSMUSG00000023106.16	novel	2339	8	NA	NA	-11	459	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	116	junction_2	529.179684879237	305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGATTTTTTTTTTTCTCTT	9061	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124045320	124065655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_124045430_124046162_124046278_124055262_124055348_124060242_124060327_124062793_124062911_124065060_124065201_124065312
tx.14897	chr5	+	1013	7	NNC	ENSMUSG00000023106.16	novel	2339	8	NA	NA	-9	459	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	572.327630528762	920	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGATTTTTTTTTTTCTCTT	9063	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124045322	124065655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_124045430_124046162_124046278_124055240_124055348_124060242_124060327_124062793_124062911_124065060_124065201_124065312
tx.14898	chr5	+	425	2	ISM	ENSMUSG00000023106.16	ENSMUST00000023869.15	2339	8	19881	1243	19567	459	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1586	junction_1	0	549	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGATTTTTTTTTTTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124065118	124065655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124065201_124065312
tx.14899	chr5	+	596	3	FSM	ENSMUSG00000061882.13	ENSMUST00000166983.3	622	3	20	6	20	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATGAAGTGTGTGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124068771	124074702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124068924_124072134_124072328_124074451
tx.149	chr1	+	1248	6	FSM	ENSMUSG00000026117.11	ENSMUST00000190128.2	1338	6	93	-3	93	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	6.93974062915899	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTATTCTCATCTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36818157	36821899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_36818394_36818765_36818973_36819917_36820111_36820199_36820341_36820426_36820540_36821541
tx.14900	chr5	+	774	2	ISM	ENSMUSG00000061882.13	ENSMUST00000166983.3	622	3	3053	6	3053	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATGAAGTGTGTGTGTTC	1150	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124071804	124074702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124072328_124074451
tx.14901	chr5	+	1676	6	ISM	ENSMUSG00000000915.16	ENSMUST00000000939.15	6735	32	27371	2358	400	1512	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_4	6.46838465151849	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGCCCTAGTGAGGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124139061	124141263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124139156_124139268_124139375_124139487_124139612_124139693_124139756_124139850_124140058_124140180
tx.14902	chr5	-	2355	3	ISM	ENSMUSG00000066278.7	ENSMUST00000199306.2	922	4	852	-1495	852	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	154	junction_2	1.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGCTGTGTTTCTCTCAT	3911	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124148924	124142703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_124144802_124145671_124145755_124148750
tx.14903	chr5	-	2500	4	FSM	ENSMUSG00000066278.7	ENSMUST00000040967.9	2522	4	22	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_3	15.8394724940223	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGCTGTGTTTCTCTCAT	2258	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124170311	124142703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_124144802_124145671_124145755_124148750_124148923_124170164
tx.14904	chr5	+	1585	7	FSM	ENSMUSG00000023707.14	ENSMUST00000024470.13	1596	7	6	5	6	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	59	junction_5	17.423642940939	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCCTCTGTTTGCTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124250365	124253541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124250530_124250851_124250909_124251280_124251395_124251491_124251592_124252127_124252256_124252450_124252709_124252777
tx.14905	chr5	+	1484	7	FSM	ENSMUSG00000023707.14	ENSMUST00000119269.6	1474	7	-6	-4	-6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_5	31.3421973277773	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCTGTTTGCTATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124250377	124253543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124250530_124250851_124250909_124251280_124251395_124251491_124251592_124252127_124252256_124252541_124252709_124252777
tx.14906	chr5	+	1442	6	FSM	ENSMUSG00000023707.14	ENSMUST00000198770.2	818	6	-111	-513	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_4	30.8506077735918	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTCTGTTTGCTATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124250382	124253543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124250530_124250851_124250909_124251280_124251395_124251491_124251592_124252450_124252709_124252777
tx.14907	chr5	+	1023	6	NIC	ENSMUSG00000029404.16	novel	1192	5	NA	NA	-10	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_1	229.659399981799	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCCTGTTGTGTTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124254141	124256259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_124254308_124254496_124254675_124254977_124255257_124255333_124255452_124255892_124255963_124256047
tx.14908	chr5	+	1199	5	FSM	ENSMUSG00000029404.16	ENSMUST00000031351.11	1192	5	-7	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	507	junction_1	46.874833333037	1020	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCCTGTTGTGTTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124254154	124256259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124254675_124254977_124255257_124255333_124255452_124255892_124255963_124256047
tx.14909	chr5	+	1138	5	NNC	ENSMUSG00000029404.16	novel	1192	5	NA	NA	3	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	22	junction_1	256.087265399902	92	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCCTGTTGTGTTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124254154	124256259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_124254675_124255038_124255257_124255333_124255452_124255892_124255963_124256047
tx.14910	chr5	+	349	3	ISM	ENSMUSG00000029404.16	ENSMUST00000145667.2	753	4	643	-162	11	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	598	junction_2	13	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCCTGTTGTGTTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124255384	124256259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124255452_124255892_124255963_124256047
tx.14911	chr5	-	889	2	ISM	ENSMUSG00000038126.18	ENSMUST00000149933.8	1197	6	-33	9160	-15	-9160	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTGGTAATCTAAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124465948	124462411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_124463201_124465848
tx.14912	chr5	+	1637	3	FSM	ENSMUSG00000047635.7	ENSMUST00000077376.3	1677	3	40	0	40	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	7.5	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCATCGAGGAAGCTGTGG	5438	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124466200	124479907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124466293_124476689_124476999_124478671
tx.14913	chr5	+	1547	2	ISM	ENSMUSG00000047635.7	ENSMUST00000077376.3	1677	3	10527	0	10527	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCATCGAGGAAGCTGTGG	1159	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124476687	124479907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124476999_124478671
tx.14914	chr5	-	962	3	FSM	ENSMUSG00000029394.12	ENSMUST00000111473.8	715	3	77	-324	77	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1213	junction_1	38.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCTTTGAGGTCTTAAGT	8748	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124488240	124483482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_124484218_124486663_124486791_124488140
tx.14915	chr5	-	1000	4	FSM	ENSMUSG00000029394.12	ENSMUST00000031341.11	1315	4	295	20	295	-20	multi-exon	FALSE	canonical	3	1091	junction_3	81.9308651648856	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTATTACGATGTGGAA	4549	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124492439	124483499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_124484218_124486663_124486791_124488140_124488236_124492379
tx.14916	chr5	-	539	5	ISM	ENSMUSG00000038095.16	ENSMUST00000200474.5	2413	17	25549	4	-2922	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	437	junction_3	18.3081266108797	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGTATAGATCCAGATTC	2981	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124538107	124531016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_124531070_124531863_124532059_124533957_124534110_124536474_124536573_124538066
tx.14917	chr5	-	2414	17	NIC	ENSMUSG00000038095.16	novel	10161	32	NA	NA	-5	-7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	243	junction_15	68.5428413019916	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAGTATAGATCCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124563661	124531019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_124531070_124531863_124532059_124533957_124534110_124536474_124536573_124538066_124538250_124538770_124538925_124539024_124539131_124539203_124539340_124540124_124540287_124542022_124542114_124542251_124542386_124543631_124543793_124545153_124545251_124546539_124546641_124548132_124548446_124552461_124552591_124563509
tx.14918	chr5	-	2517	18	ISM	ENSMUSG00000038095.16	ENSMUST00000199808.5	10161	32	14	24249	-3	-7	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	126	junction_15	113.969157486276	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAGTATAGATCCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124563659	124531019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_124531070_124531863_124532059_124533957_124534110_124536474_124536573_124538066_124538250_124538770_124538925_124539024_124539131_124539203_124539340_124540124_124540287_124542022_124542114_124542251_124542386_124543631_124543793_124545153_124545251_124546539_124546641_124548132_124548446_124551247_124551353_124552461_124552591_124563509
tx.14919	chr5	+	605	2	Intergenic	novelGene_1144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTCTTTGTGACCTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124565027	124568949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_124565134_124568450
tx.1492	chr10	-	491	3	Intergenic	novelGene_91	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTGCCATTGTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61848124	61845744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_61845911_61846630_61846875_61848043
tx.14920	chr5	+	2584	7	FSM	ENSMUSG00000049327.18	ENSMUST00000199798.5	1789	7	-20	-775	17	-22	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_1	269.798330033544	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATTGCCAGGCAAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124578009	124600349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124578079_124585276_124585434_124588723_124588944_124589348_124589437_124595121_124595182_124597837_124598029_124598550
tx.14921	chr5	+	785	2	ISM	ENSMUSG00000049327.18	ENSMUST00000199798.5	1789	7	-6	13568	-6	-2841	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAGAAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124578023	124586006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124578079_124585276
tx.14922	chr5	-	1388	4	FSM	ENSMUSG00000029401.9	ENSMUST00000031347.8	1391	4	-5	8	-5	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	3.55902608401044	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTGGGAATACAACGCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124616434	124601335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_124601875_124606649_124606755_124607760_124607913_124615842
tx.14923	chr5	+	1102	2	FSM	ENSMUSG00000029402.9	ENSMUST00000031349.9	1115	2	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_1	0	323	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTTGAGGTGGGGTTTGT	2233	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124621209	124629187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124621310_124628185
tx.14924	chr5	+	1116	2	FSM	ENSMUSG00000029402.9	ENSMUST00000111453.2	1181	2	82	-17	82	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTTGAGGTGGGGTTTGT	2626	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124621602	124629187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124621717_124628185
tx.14925	chr5	-	1341	5	ISM	ENSMUSG00000029392.13	ENSMUST00000062153.12	2249	7	15795	0	-853	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_4	4.32290411644765	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTTCCTGTGTGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124653659	124631142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_124631908_124639902_124639996_124641617_124641797_124652581_124652807_124653580
tx.14926	chr5	-	402	2	ISM	ENSMUSG00000029392.13	ENSMUST00000062153.12	2249	7	15795	21341	-853	-20757	internal_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAATGTGTTTTTGTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124653659	124652483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_124652807_124653580
tx.14927	chr5	+	1964	4	FSM	ENSMUSG00000029390.14	ENSMUST00000060226.11	2074	4	107	3	107	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	3477	junction_2	89.3395520223577	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTTGTGTTTTATATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124678864	124688566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124679105_124681034_124681228_124684958_124685067_124687143
tx.14928	chr5	+	1492	2	ISM	ENSMUSG00000029390.14	ENSMUST00000135464.2	1630	4	3853	-5	3853	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3561	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTATTTTGTGTTTTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124684995	124688564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124685067_124687143
tx.14929	chr5	+	2102	14	FSM	ENSMUSG00000029389.18	ENSMUST00000071057.14	2799	14	10	687	5	-687	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_5	12.5669803088427	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGTGTGTAATTCCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124690936	124707036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124691103_124692605_124692657_124692733_124692821_124694819_124694912_124695024_124695088_124696084_124696235_124697190_124697381_124698780_124698864_124699968_124700101_124700652_124700746_124704443_124704559_124704896_124705066_124705897_124706191_124706618
tx.14930	chr5	-	1518	9	NIC	ENSMUSG00000029388.15	novel	2013	9	NA	NA	3	-440	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	226.339761199839	937	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATACGGTATTGCCTCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124717135	124708715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_124709418_124709823_124709950_124711140_124711217_124711748_124711818_124712656_124712774_124714860_124714978_124715078_124715216_124716499_124716602_124717063
tx.14931	chr5	+	1822	13	FSM	ENSMUSG00000029387.11	ENSMUST00000031333.4	2672	13	11	839	9	254	multi-exon	FALSE	canonical	3	570	junction_1	79.1684210331928	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATTTTCCTTAGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124717213	124734904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124717265_124720510_124720591_124721996_124722104_124722198_124722366_124726687_124726751_124727433_124727464_124728412_124728442_124728931_124729007_124730543_124730598_124732825_124732895_124733615_124733752_124733865_124733903_124733980
tx.14932	chr5	+	1812	12	NNC	ENSMUSG00000029387.11	novel	2672	13	NA	NA	9	254	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	223.001463879863	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATTTTCCTTAGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124717213	124734904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_124717265_124720510_124720591_124721996_124722104_124722198_124722366_124726687_124726751_124727433_124727464_124728912_124729007_124730543_124730598_124732825_124732895_124733615_124733752_124733865_124733903_124733980
tx.14933	chr5	+	2424	18	NNC	ENSMUSG00000118662.2	novel	2735	18	NA	NA	0	-280	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	12.5364520402618	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTAGTGTTAAGTGAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124736846	124765523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_124737020_124737197_124737306_124737769_124737847_124740077_124740278_124741810_124741912_124745798_124745996_124746581_124746706_124748332_124748475_124750706_124750773_124753213_124753349_124754531_124754610_124757093_124757172_124758176_124758289_124761069_124761177_124762380_124762538_124763745_124763872_124763959_124764049_124765169
tx.14934	chr5	+	1667	11	NNC	ENSMUSG00000118662.2	novel	2913	17	NA	NA	12448	-280	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.8865711297128	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTAGTGTTAAGTGAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124749302	124765523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_124749604_124750642_124750773_124753213_124753349_124754531_124754610_124757093_124757172_124758176_124758289_124761069_124761177_124762380_124762538_124763745_124763872_124763959_124764049_124765169
tx.14935	chr5	+	1088	7	ISM	ENSMUSG00000118662.2	ENSMUST00000239505.1	2913	17	20217	280	20174	-280	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_1	5.79271573232759	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTAGTGTTAAGTGAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124757028	124765523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124757172_124758176_124758289_124761069_124761177_124762380_124762538_124763745_124763872_124763959_124764049_124765169
tx.14936	chr5	+	3524	20	FSM	ENSMUSG00000038023.13	ENSMUST00000037865.13	5345	20	15	1806	2	510	multi-exon	TRUE	canonical	3	142	junction_14	17.8821937464506	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTTCAGGTTAGCTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124767131	124799713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124767356_124770817_124770897_124773952_124774051_124775423_124775562_124777132_124777222_124779407_124779535_124782904_124782988_124783884_124783979_124784543_124784757_124789272_124789424_124789764_124789902_124790144_124790333_124790431_124790523_124791177_124791297_124793368_124793580_124794949_124795070_124795502_124795623_124796112_124796231_124796914_124797087_124798761
tx.14937	chr5	+	995	4	FSM	ENSMUSG00000079215.9	ENSMUST00000111417.9	4092	4	11	3086	11	67	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_3	10.2089285540757	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCTACAAGTGCCCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124939765	124962608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_124939947_124940417_124940573_124961771_124961837_124962014
tx.14938	chr5	+	340	3	ISM	ENSMUSG00000079215.9	ENSMUST00000111417.9	4092	4	71	3859	-2	-536	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_2	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGGTAGGGGTCGGGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124939825	124961835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124939947_124940417_124940573_124961771
tx.14939	chr5	-	1812	5	NIC	ENSMUSG00000029478.17	novel	3589	18	NA	NA	-159	5	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_4	42.8740889116025	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGGGTGTCTTAGTCTCTG	5628	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125135634	125124860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_125125599_125126405_125126460_125127974_125128123_125132796_125132940_125134905
tx.14940	chr5	-	545	3	NNC	ENSMUSG00000105039.2	novel	764	4	NA	NA	32539	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	0.5	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGCCTGTTGGCTTTAA	9020	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125317340	125315377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_125315796_125316932_125317002_125317282
tx.14941	chr5	-	1093	4	ISM	ENSMUSG00000037936.16	ENSMUST00000111390.8	2367	12	53598	-2	-796	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	487	junction_1	96.6413760019773	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGGCTTCTGTGACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125364537	125354150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_125354930_125360962_125361110_125361744_125361797_125364422
tx.14942	chr5	-	2513	13	FSM	ENSMUSG00000037936.16	ENSMUST00000086075.13	2521	13	8	0	8	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	188	junction_1	171.680966232913	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGGCTTCTGTGACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125418150	125354150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_125354930_125358168_125358298_125360962_125361110_125361744_125361797_125364422_125364497_125366700_125366820_125371061_125371229_125374289_125374406_125375696_125375793_125377400_125377605_125380145_125380288_125381258_125381417_125417820
tx.14943	chr5	+	1048	3	Intergenic	novelGene_1145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	9	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAGAATGCTGTCATTTC	9031	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125451148	125456623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_125451412_125454603_125454786_125456020
tx.14944	chr5	-	2350	2	FSM	ENSMUSG00000008348.10	ENSMUST00000136312.2	2618	2	260	8	260	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	916	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCTTCATTTGTGTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125466818	125463036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_125465329_125466760
tx.14945	chr5	+	1142	3	FSM	ENSMUSG00000037905.14	ENSMUST00000049040.14	6473	3	59	5272	59	372	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_1	23.5	383	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTTTGAAGGGAACGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125518690	125532162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_125518957_125528733_125528837_125531389
tx.14946	chr5	+	3207	18	FSM	ENSMUSG00000029482.5	ENSMUST00000031445.5	3239	18	27	5	27	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_4	14.7470013373196	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTGCAGTACGCGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125552904	125594469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_125553174_125559893_125559998_125561600_125561722_125566846_125566961_125571970_125572069_125580246_125580362_125580612_125580695_125583212_125583361_125585740_125585822_125586842_125586968_125588703_125588769_125588909_125589033_125589688_125589803_125590165_125590292_125590982_125591053_125591232_125591292_125591991_125592195_125593279
tx.14947	chr5	+	1394	2	ISM	ENSMUSG00000029482.5	ENSMUST00000031445.5	3239	18	39113	5	-316	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTGCAGTACGCGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125591990	125594469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_125592195_125593279
tx.14948	chr5	+	331	2	Intergenic	novelGene_1146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTGTGTCTTAGTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126657383	126659436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_126657492_126659213
tx.14949	chr5	+	1783	12	FSM	ENSMUSG00000049971.18	ENSMUST00000118139.3	3413	12	-30	1660	-30	-1660	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_6	12.1383212585269	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGGTGGTCATTCCTCTT	8671	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127709295	127784778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_127709416_127721382_127721532_127727746_127727853_127734150_127734203_127740405_127740443_127741715_127741773_127754268_127754365_127755154_127755205_127766900_127766945_127768053_127768175_127771290_127771390_127783926
tx.14950	chr5	+	354	3	ISM	ENSMUSG00000049971.18	ENSMUST00000137157.8	1713	11	-42	41147	-42	-39116	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	42	junction_2	9	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGTCATGGGGAAAGTTC	8659	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127709283	127727819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_127709416_127721382_127721532_127727746
tx.14951	chr5	+	770	7	NNC	ENSMUSG00000049971.18	novel	1713	11	NA	NA	-32	-22131	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_6	12.7986544431653	91	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTCTTGGTCATGGTGTC	8669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127709293	127744804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_127709416_127721382_127721532_127727746_127727853_127734150_127734203_127740405_127740443_127741715_127741773_127744557
tx.14952	chr5	+	920	10	ISM	ENSMUSG00000049971.18	ENSMUST00000118139.3	3413	12	-10	18156	-10	-684	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_6	11.5758369027902	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTCTGTGTGGTCGTAC	8691	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127709315	127768282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_127709416_127721382_127721532_127727746_127727853_127734150_127734203_127740405_127740443_127741715_127741773_127754268_127754365_127755154_127755205_127766900_127766945_127768053
tx.14953	chr5	-	403	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000049971.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTTTATTTCTCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127760506	127733936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_127734238_127760404
tx.14954	chr5	-	355	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000049971.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	51	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTCTCCTCCTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127760510	127748941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_127749191_127760404
tx.14955	chr5	+	727	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034310.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCGAGACACAATCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127921543	127924511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_127921656_127922359_127922491_127924027
tx.14956	chr5	+	1685	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034310.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.91547594742265	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCTCAAAGGGGTACCAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127921560	127951977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_127921799_127922359_127922500_127930006_127930122_127940421_127940682_127951045
tx.14957	chr5	-	597	4	NIC	ENSMUSG00000072591.11	novel	2429	6	NA	NA	0	-2	intron_retention	FALSE	canonical	2	5	junction_1	3.55902608401044	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCAAGTCTGTCCTTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128677751	128656171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_128656350_128661227_128661361_128662335_128662471_128677600
tx.14958	chr5	-	471	3	NIC	ENSMUSG00000072591.11	novel	2429	6	NA	NA	-1	-2	intron_retention	FALSE	canonical	2	6	junction_2	3	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCAAGTCTGTCCTTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128677758	128656171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_128656350_128662335_128662471_128677600
tx.14959	chr5	-	971	2	ISM	ENSMUSG00000072591.11	ENSMUST00000091324.11	2403	7	12	15805	12	-10753	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTATTTATTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128677739	128671996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_128672829_128677600
tx.14960	chr5	+	1650	4	ISM	ENSMUSG00000029423.11	ENSMUST00000086056.8	4016	22	14868	0	13552	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_2	2.86744175568088	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTTGTGGGCGTCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128828105	128832538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_128828200_128829646_128829773_128831004_128831153_128831256
tx.14961	chr5	+	1079	7	FSM	ENSMUSG00000029430.14	ENSMUST00000031383.14	2377	7	141	1157	8	-1157	multi-exon	FALSE	canonical	3	11744	junction_1	1335.32560531962	33873	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTGAATCATCCCTTGCT	483	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129097273	129100230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129097343_129097591_129097639_129097747_129097833_129097929_129098056_129099066_129099255_129099438_129099610_129099837
tx.14962	chr5	+	1053	6	FSM	ENSMUSG00000029430.14	ENSMUST00000111343.2	2423	6	213	1157	213	-1157	multi-exon	FALSE	canonical	3	14794	junction_4	293.478040064329	7045	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTGAATCATCCCTTGCT	758	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129097548	129100230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129097639_129097747_129097833_129097929_129098056_129099066_129099255_129099438_129099610_129099837
tx.14963	chr5	-	521	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060419.9	novel	441	1	NA	NA	-53	78	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGACTTGTTTAAAAGGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129205634	129205062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_129205432_129205482
tx.14964	chr5	-	472	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060419.9	novel	441	1	NA	NA	-55	77	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	338	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGACTTGTTTAAAAGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129205636	129205063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_129205438_129205538
tx.14965	chr5	+	3194	12	ISM	ENSMUSG00000044017.17	ENSMUST00000056617.14	5163	26	65843	0	65836	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_2	8.40306909693916	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGAGTCTTGAGCGTCACA	4620	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129239656	129281663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_129239733_129248869_129248994_129255112_129255217_129256232_129256345_129256606_129256761_129265389_129265457_129266696_129266764_129275681_129275774_129277743_129277871_129278195_129278238_129278519_129278613_129279527
tx.14966	chr5	+	569	2	Intergenic	novelGene_1147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGACAGGGGGTTCCCTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129298528	129305651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_129298647_129305200
tx.14967	chr5	+	730	3	FSM	ENSMUSG00000029439.15	ENSMUST00000200500.2	437	3	-210	-83	-1	83	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	33	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGCCTTAGTGATCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129578302	129581528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129578661_129581046_129581217_129581326
tx.14968	chr5	+	654	3	ISM	ENSMUSG00000029439.15	ENSMUST00000053737.9	3313	18	24	66490	-1	6	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_1	4	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGGGGAAGGAAGGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129578308	129581958	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_129578661_129581046_129581217_129581826
tx.14969	chr5	+	811	4	FSM	ENSMUSG00000034211.15	ENSMUST00000042191.12	832	4	22	-1	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	460	junction_1	196.309845793724	1296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGGCAGCTTGATTTTT	782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129792588	129795545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129792614_129792747_129792828_129793790_129793931_129794979
tx.14970	chr5	+	788	3	FSM	ENSMUSG00000034211.15	ENSMUST00000119985.2	859	3	105	-34	-15	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	517	junction_1	192.5	1167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGGCAGCTTGATTTTT	939	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129792745	129795545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129792828_129793790_129793931_129794979
tx.14971	chr5	+	2005	10	FSM	ENSMUSG00000029432.13	ENSMUST00000086046.10	2112	10	29	78	-7	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	290	junction_9	37.917389085507	1118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCAGATGTCTAATTTTTA	7796	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129802155	129835313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129802286_129816535_129816676_129816781_129816828_129821768_129821864_129822279_129822351_129823390_129823532_129825065_129825098_129830289_129830385_129831905_129831990_129834142
tx.14972	chr5	+	2198	14	FSM	ENSMUSG00000029447.14	ENSMUST00000201414.5	2588	14	376	14	376	-14	multi-exon	TRUE	canonical	3	3618	junction_3	465.957308149311	4585	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTACTGGATCATTCACACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129864437	129875198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129864640_129865297_129865362_129866116_129866252_129866880_129867055_129867647_129867752_129868532_129868644_129868845_129869006_129869082_129869166_129870698_129870796_129871414_129871563_129872181_129872316_129873810_129873914_129874423_129874497_129874588
tx.14973	chr5	+	679	2	ISM	ENSMUSG00000029447.14	ENSMUST00000201414.5	2588	14	10366	14	4184	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5544	junction_1	0	1675	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTACTGGATCATTCACACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129874427	129875198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_129874497_129874588
tx.14974	chr5	+	1637	9	FSM	ENSMUSG00000025538.16	ENSMUST00000171300.8	2264	9	8	619	8	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	460	junction_6	14.1371629049113	495	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGATTTATTTATTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129875834	129892272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129875928_129878741_129878899_129881714_129881827_129882863_129882909_129883528_129883680_129887080_129887137_129888677_129888763_129888910_129889056_129891479
tx.14975	chr5	-	2383	8	ISM	ENSMUSG00000025537.13	ENSMUST00000026617.13	2374	10	4957	0	-21	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_6	2.74791200881019	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGATTTATTGACCTCATAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129902967	129892261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_129893531_129893815_129893942_129894757_129894912_129895036_129895128_129895702_129895867_129898301_129898368_129902056_129902112_129902509
tx.14976	chr5	-	279	2	ISM	ENSMUSG00000070493.4	ENSMUST00000131645.2	2069	3	4804	0	4804	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6367	junction_1	0	2376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGGTAGCGTCCTTAT	7065	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129911310	129909999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_129910238_129911269
tx.14977	chr5	-	643	3	ISM	ENSMUSG00000070493.4	ENSMUST00000094280.4	915	4	3283	3	3086	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6134	junction_2	116.5	1945	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGGTAGCGTCCTTAT	5347	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129913028	129909999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_129910238_129911269_129911421_129912774
tx.14978	chr5	-	731	4	FSM	ENSMUSG00000070493.4	ENSMUST00000094280.4	915	4	181	3	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5311	junction_3	452.984424554409	74611	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGGTAGCGTCCTTAT	2245	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129916130	129909999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_129910238_129911269_129911421_129912774_129913025_129916038
tx.14979	chr5	+	1128	3	FSM	ENSMUSG00000066735.9	ENSMUST00000051758.11	3112	3	129	1855	-10	312	multi-exon	FALSE	canonical	3	775	junction_1	60.5	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCTGCAGAACTTACTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129970939	130011732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129971207_130007359_130007470_130010981
tx.14980	chr5	+	941	3	FSM	ENSMUSG00000066735.9	ENSMUST00000073945.6	650	3	14	-305	14	305	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	420.5	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATCCACCCCTGCAGAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129970981	130011725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_129971069_130007359_130007470_130010981
tx.14981	chr5	-	578	2	ISM	ENSMUSG00000025534.18	ENSMUST00000111307.2	932	3	2018	0	1965	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTCGCTATTGTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130029704	130028439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_130028911_130029597
tx.14982	chr5	-	1553	17	FSM	ENSMUSG00000025533.16	ENSMUST00000161094.8	1824	17	31	240	-5	-3	multi-exon	FALSE	canonical	1	102	junction_3	46.3975686324187	806	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATATGCTTCTGCCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130053191	130040338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_130040542_130040705_130040813_130040890_130040972_130041497_130041582_130041837_130041898_130042009_130042095_130042241_130042357_130042803_130042867_130043519_130043573_130044937_130045016_130045136_130045215_130047150_130047249_130047388_130047446_130047673_130047758_130048502_130048698_130052882_130052938_130053134
tx.14983	chr5	+	1396	5	FSM	ENSMUSG00000025532.14	ENSMUST00000202163.4	931	5	-8	-457	4	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_3	138.212472302611	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCCACCATACCTGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130058134	130089633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_130058249_130063752_130063790_130066660_130066760_130077766_130077825_130088545
tx.14984	chr5	+	1484	6	FSM	ENSMUSG00000025532.14	ENSMUST00000026608.11	1492	6	9	-1	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	269	junction_4	51.2382669496149	444	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGCCACCATACCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130058139	130089631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_130058249_130063752_130063790_130066660_130066760_130071046_130071142_130077766_130077825_130088545
tx.14985	chr5	+	1934	6	FSM	ENSMUSG00000034118.16	ENSMUST00000040721.9	2050	6	117	-1	117	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_2	10.899541274751	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAATGGTCCCGTTTTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130108327	130164571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_130108503_130130430_130131377_130143308_130143508_130158348_130158400_130163299_130163340_130164048
tx.14986	chr5	+	1215	5	ISM	ENSMUSG00000034118.16	ENSMUST00000040721.9	2050	6	22768	-5	8549	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_1	12.1346610995116	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTCCCGTTTTCAGTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130130978	130164575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_130131377_130143308_130143508_130158348_130158400_130163299_130163340_130164048
tx.14987	chr5	+	772	4	ISM	ENSMUSG00000034118.16	ENSMUST00000040721.9	2050	6	35138	0	-19449	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_2	7.76029781788188	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAATGGTCCCGTTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130143348	130164570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_130143508_130158348_130158400_130163299_130163340_130164048
tx.14988	chr5	+	2665	9	NIC	ENSMUSG00000025340.15	novel	2690	9	NA	NA	-3	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	67	junction_3	37.9637985454564	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGATTGGTTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130200661	130243178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_130200736_130216241_130216428_130219717_130219885_130226787_130226958_130235849_130235932_130237526_130237660_130239264_130239357_130240702_130240960_130241674
tx.14989	chr5	+	2660	9	FSM	ENSMUSG00000025340.15	ENSMUST00000119797.8	2690	9	23	7	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_3	33.6962535009458	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTGATTGGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130200661	130243176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_130200736_130216241_130216428_130219717_130219885_130226790_130226958_130235849_130235932_130237526_130237660_130239264_130239357_130240702_130240960_130241674
tx.14990	chr5	+	1392	7	FSM	ENSMUSG00000053094.16	ENSMUST00000065329.13	3607	7	-78	2293	-78	-2194	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	200.953283681114	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTCCTGTGATGCACGTG	6348	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130248506	130270313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_130248761_130258289_130258468_130260595_130260882_130265643_130265795_130267087_130267272_130269188_130269333_130270118
tx.14991	chr5	+	850	5	ISM	ENSMUSG00000053094.16	ENSMUST00000111298.6	3570	7	9530	2194	9530	-2194	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	519	junction_2	21.1231508066387	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTCCTGTGATGCACGTG	3655	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130260705	130270313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_130260882_130265643_130265795_130267087_130267272_130269188_130269333_130270118
tx.14992	chr5	+	525	3	ISM	ENSMUSG00000053094.16	ENSMUST00000111298.6	3570	7	15913	2191	15913	-2191	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	542	junction_1	17	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTGTGATGCACGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130267088	130270316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_130267272_130269188_130269333_130270118
tx.14993	chr5	-	1226	4	ISM	ENSMUSG00000025337.11	ENSMUST00000026387.11	1548	5	1462	1	17	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	778	junction_1	49.815214097257	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGGCTTGCATTTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130282909	130274572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_130275303_130277126_130277292_130279654_130279856_130282779
tx.14994	chr5	-	1506	5	FSM	ENSMUSG00000025337.11	ENSMUST00000026387.11	1548	5	41	1	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	697	junction_4	74.8765650921568	2599	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGGCTTGCATTTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130284330	130274572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_130275303_130277126_130277292_130279654_130279856_130282779_130282910_130284050
tx.14995	chr5	+	1307	7	ISM	ENSMUSG00000056310.15	ENSMUST00000100662.10	1867	8	1	2804	1	-2804	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	273	junction_6	27.5479380151925	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGTGTCTGCACTTTGTGT	4929	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130285876	130303786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_130286035_130287773_130287896_130291659_130291783_130295823_130295926_130296735_130296931_130298006_130298289_130303461
tx.14996	chr5	+	2634	16	FSM	ENSMUSG00000056310.15	ENSMUST00000040213.13	3044	16	4	406	4	-406	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_10	31.6406208676266	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACTGGCTTTGTCCTTAC	4932	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130285879	130369998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_130286035_130287773_130287896_130291659_130291783_130295823_130295926_130296735_130296931_130298006_130298289_130303461_130303585_130306773_130306892_130310621_130310675_130316083_130316203_130317693_130317804_130325464_130325643_130328744_130328881_130354439_130354551_130364086_130364255_130369459
tx.14997	chr5	+	2480	15	ISM	ENSMUSG00000056310.15	ENSMUST00000040213.13	3044	16	1897	406	2	-406	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	235	junction_9	32.6402781100597	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACTGGCTTTGTCCTTAC	6825	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130287772	130369998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_130287896_130291659_130291783_130295823_130295926_130296735_130296931_130298006_130298289_130303461_130303585_130306773_130306892_130310621_130310675_130316083_130316203_130317693_130317804_130325464_130325643_130328744_130328881_130354439_130354551_130364086_130364255_130369459
tx.14998	chr5	+	1351	7	ISM	ENSMUSG00000056310.15	ENSMUST00000040213.13	3044	16	30218	406	28323	-406	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	235	junction_1	30.9125109516088	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACTGGCTTTGTCCTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130316093	130369998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_130316203_130317693_130317804_130325464_130325643_130328744_130328881_130354439_130354551_130364086_130364255_130369459
tx.14999	chr5	-	485	3	Intergenic	novelGene_1148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATTTCTAATGTCGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130882351	130881509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_130881653_130881844_130881957_130882121
tx.15	chr1	+	648	2	ISM	ENSMUSG00000051285.18	ENSMUST00000061280.17	5232	6	142	52942	-42	-40216	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGTAACTATGTCTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159285	7190910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_7159441_7190417
tx.150	chr1	-	1362	4	ISM	ENSMUSG00000026116.12	ENSMUST00000027290.12	6546	41	144327	6	15336	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	291	junction_2	56.5115524079418	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGAATTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36834281	36831277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_36832287_36833124_36833280_36833884_36833983_36834181
tx.1500	chr10	-	1418	7	ISM	ENSMUSG00000037031.11	ENSMUST00000047883.11	3638	8	28013	1961	-1461	352	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	245	junction_1	10.975983884018	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTGTTGTTTGGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62039017	62023135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_62023942_62024421_62024539_62025592_62025641_62027246_62027364_62029645_62029742_62037556_62037632_62038858
tx.15000	chr5	+	1221	2	Fusion	ENSMUSG00000106172.2_ENSMUSG00000058905.6	novel	611	2	NA	NA	-41	-440	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCAGTCTCTCTCTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133503920	133549121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr5_+_133504602_133548581
tx.15001	chr5	-	1197	3	ISM	ENSMUSG00000061979.9	ENSMUST00000076228.3	2321	11	20861	16	12347	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	313	junction_2	7.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGTCTTGTAAAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134184752	134176908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_134177846_134182962_134183049_134184578
tx.15002	chr5	-	1622	7	ISM	ENSMUSG00000061979.9	ENSMUST00000076228.3	2321	11	10056	0	1542	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	313	junction_2	29.8742735848459	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGACTTGATCATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134195557	134176892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_134177846_134182962_134183049_134184578_134184753_134186429_134186518_134192462_134192645_134194177_134194263_134195503
tx.15003	chr5	-	1628	8	ISM	ENSMUSG00000061979.9	ENSMUST00000076228.3	2321	11	8539	16	25	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	313	junction_2	27.7613738412028	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGTCTTGTAAAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134197074	134176908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_134177846_134182962_134183049_134184578_134184753_134186429_134186518_134192462_134192645_134194177_134194263_134195503_134195556_134197050
tx.15004	chr5	-	1128	2	ISM	ENSMUSG00000060261.17	ENSMUST00000172553.2	490	5	2846	-1009	1480	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	516	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATTCTTTTCCTGCTGTC	8577	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134268419	134266687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_134267747_134268350
tx.15005	chr5	-	1369	6	ISM	ENSMUSG00000060261.17	ENSMUST00000172904.8	3274	25	37140	-9	-314	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	411	junction_3	36.6464186517591	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATTCTTTTCCTGCTGTC	5417	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134271579	134266687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_134267747_134268350_134268426_134269096_134269139_134269726_134269769_134270984_134271014_134271457
tx.15006	chr5	+	544	3	Fusion	ENSMUSG00000072576.6_ENSMUSG00000106969.2	novel	506	4	NA	NA	883	78	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTTGTCTAGGAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134485726	134492381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr5_+_134485873_134486216_134486315_134492081
tx.15007	chr5	+	1449	11	FSM	ENSMUSG00000023104.10	ENSMUST00000023867.8	4995	11	69	3477	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1115	junction_7	96.2091991443646	2187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGCTATGCTTAATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134611612	134627182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_134611741_134615751_134615822_134617785_134617828_134618208_134618316_134619729_134619832_134619972_134620074_134622042_134622201_134623062_134623129_134624136_134624218_134625735_134625850_134626702
tx.15008	chr5	-	1892	2	ISM	ENSMUSG00000040731.14	ENSMUST00000036125.10	2367	6	17280	-1	17235	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2190	junction_1	0	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTATGCTTGTCTTTCTGGC	6636	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134650921	134648729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_134650503_134650802
tx.15009	chr5	-	2354	6	FSM	ENSMUSG00000040731.14	ENSMUST00000036125.10	2367	6	14	-1	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1750	junction_2	182.920310517996	1119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTATGCTTGTCTTTCTGGC	2194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134668187	134648729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_134650503_134650802_134650941_134654219_134654317_134654394_134654460_134656441_134656630_134668094
tx.15010	chr5	-	2414	7	FSM	ENSMUSG00000040731.14	ENSMUST00000202622.4	2726	7	157	155	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	761	junction_3	647.667803224256	487	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTATGCTTGTCTTTCTGGC	2194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134668187	134648729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_134650503_134650802_134650941_134653294_134653355_134654219_134654317_134654394_134654460_134656441_134656630_134668094
tx.15011	chr5	-	1281	4	FSM	ENSMUSG00000040731.14	ENSMUST00000200874.2	896	4	-34	-351	11	351	multi-exon	FALSE	canonical	3	2106	junction_3	61.0482504981829	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGATCTCTTTGTGTGTGT	2191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134668190	134653384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_134654317_134654394_134654460_134656441_134656630_134668094
tx.15012	chr5	-	2521	10	ISM	ENSMUSG00000029674.14	ENSMUST00000111233.8	3109	15	9061	-1	-768	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	14	junction_3	1.82574185835055	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCGTGTGTGTGTCTGAG	5777	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134698041	134684892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_134686240_134686346_134686505_134686762_134686819_134688700_134688858_134690646_134690713_134690956_134691017_134693038_134693171_134694060_134694148_134694683_134694868_134697767
tx.15013	chr5	-	618	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040557.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCGCTTCCTCCCTCGCTC	4670	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134961839	134961030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_134961243_134961433
tx.15014	chr5	+	1437	6	FSM	ENSMUSG00000040557.15	ENSMUST00000111218.8	1387	6	-18	-32	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	38.4988311510882	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAGTGTGTACTGTAACA	3418	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134961227	134970088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_134961303_134961475_134961702_134962326_134962456_134963142_134963279_134964632_134964726_134969310
tx.15015	chr5	+	1376	5	ISM	ENSMUSG00000040557.15	ENSMUST00000111218.8	1387	6	216	-32	84	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_4	6.17960354715414	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAGTGTGTACTGTAACA	3652	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134961461	134970088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_134961702_134962326_134962456_134963142_134963279_134964632_134964726_134969310
tx.15016	chr5	+	1117	6	FSM	ENSMUSG00000040532.15	ENSMUST00000046999.12	1493	6	371	5	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	445	junction_1	65.8634952003004	1922	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGGATCCGTTTTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135038523	135041024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135038694_135038835_135038972_135039740_135039915_135040063_135040235_135040337_135040520_135040740
tx.15017	chr5	+	1250	5	FSM	ENSMUSG00000040532.15	ENSMUST00000154469.8	1473	5	223	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	552	junction_3	34.8926926447358	377	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGGATCCGTTTTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135038532	135041024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135038972_135039740_135039915_135040063_135040235_135040337_135040520_135040740
tx.15018	chr5	-	407	3	NNC	ENSMUSG00000085042.9	novel	594	3	NA	NA	5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.5	31	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGGACCCTCTCCGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135041637	135040975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_135041187_135041298_135041405_135041547
tx.15019	chr5	-	428	3	FSM	ENSMUSG00000085042.9	ENSMUST00000222613.2	363	3	-1	-64	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	6.5	226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGGACCCTCTCCGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135041643	135040975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135041187_135041283_135041405_135041547
tx.15020	chr5	+	921	7	ISM	ENSMUSG00000007207.11	ENSMUST00000150838.2	2167	10	-10	8084	-10	-2591	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_4	1.60727512683216	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGGGAGGGGACCAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135052403	135071870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_135052465_135065979_135066058_135066329_135066430_135070090_135070166_135070784_135070859_135070962_135071072_135071446
tx.15021	chr5	+	1641	4	NNC	ENSMUSG00000007207.11	novel	2114	7	NA	NA	1319	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_3	6.84754619472471	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCCTCTGTTTGGAACAT	7201	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135071438	135079955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_135071521_135074450_135074589_135077564_135077711_135078680
tx.15022	chr5	-	707	5	FSM	ENSMUSG00000005378.18	ENSMUST00000134180.8	465	5	134	-376	28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	942	junction_2	42.1218470630147	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGTCCCTGGCCCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135085739	135081810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135082279_135082402_135082493_135084881_135084941_135085192_135085239_135085695
tx.15023	chr5	-	1295	12	ISM	ENSMUSG00000005378.18	ENSMUST00000085984.11	1516	13	569	0	-7	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	942	junction_2	58.9567708278386	1004	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGTCCCTGGCCCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135092951	135081810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_135082279_135082402_135082493_135084881_135084941_135085192_135085239_135085695_135085782_135086473_135086525_135087960_135088058_135089587_135089685_135089926_135090010_135090102_135090199_135092737_135092776_135092867
tx.15024	chr5	+	1526	7	FSM	ENSMUSG00000005374.14	ENSMUST00000153183.8	7488	7	28	5934	-1	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_3	17.4610678049451	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCTCTCTCTCTGTTTCTC	9518	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135178538	135188680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135178719_135181788_135181911_135183167_135183353_135185221_135185374_135186385_135186513_135187457_135187611_135188073
tx.15025	chr5	+	573	3	FSM	ENSMUSG00000029681.13	ENSMUST00000111187.10	564	3	-9	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_2	118	430	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAAAGTGTCTATTTTTG	8766	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135197233	135202302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135197453_135199940_135200017_135202024
tx.15026	chr5	+	1652	6	FSM	ENSMUSG00000029681.13	ENSMUST00000031692.12	1758	6	103	3	-3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	254	junction_5	29.6445610525776	290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTTGACAGCTTCTTTCT	8772	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135197239	135210706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135197453_135199940_135200017_135205982_135206080_135208803_135208975_135209369_135209450_135209691
tx.15027	chr5	-	1437	9	FSM	ENSMUSG00000040013.12	ENSMUST00000044972.11	1447	9	10	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	793	junction_1	94.8445273856114	2394	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATGCAGTACAATTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135378888	135320557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135320966_135366468_135366562_135368331_135368442_135368775_135368971_135373502_135373623_135374943_135375147_135376730_135376821_135378471_135378590_135378788
tx.15028	chr5	-	1317	8	FSM	ENSMUSG00000040013.12	ENSMUST00000201791.4	1297	8	-20	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_4	339.384075967639	237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATGCAGTACAATTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135378888	135320557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135320966_135366468_135366562_135368331_135368442_135368775_135368971_135374943_135375147_135376730_135376821_135378471_135378590_135378788
tx.15029	chr5	-	1276	8	FSM	ENSMUSG00000040013.12	ENSMUST00000201534.2	1287	8	8	3	8	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	922	junction_1	63.5022095067951	1000	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTGAAGTCATTAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135378889	135366222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135366562_135368331_135368442_135368775_135368971_135373502_135373623_135374943_135375147_135376730_135376821_135378471_135378590_135378788
tx.15030	chr5	+	1985	7	NNC	ENSMUSG00000053388.11	novel	1456	6	NA	NA	-1401	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_2	2.86744175568088	23	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCCTGTGCTTCCCAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135380747	135396857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_135380916_135382136_135382549_135387708_135387805_135392581_135392813_135392903_135392927_135395394_135395520_135395927
tx.15031	chr5	+	1976	6	NNC	ENSMUSG00000053388.11	novel	1803	6	NA	NA	-1384	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.70454411370329	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGCCCTGTGCTTCCCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135380764	135396856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_135380916_135382136_135382549_135387708_135387805_135392581_135392813_135395362_135395520_135395927
tx.15032	chr5	+	1585	10	FSM	ENSMUSG00000000916.16	ENSMUST00000000940.15	2243	10	3	655	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	253	junction_9	22.1966519552993	568	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAGATCACAGTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135398809	135404997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135398931_135399044_135399168_135400094_135400270_135400351_135400461_135402807_135402947_135403037_135403154_135403780_135403960_135404128_135404340_135404408_135404553_135404729
tx.15033	chr5	-	953	3	ISM	ENSMUSG00000039959.14	ENSMUST00000202643.2	6224	19	22466	3539	17412	-3539	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	49	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGCTCGGTTTAAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135441536	135438927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_135439727_135440041_135440124_135441464
tx.15034	chr5	-	1586	13	NIC	ENSMUSG00000039959.14	novel	3253	13	NA	NA	-7	8	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	166	junction_11	29.2616311157727	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGAATTTGTTATCATAAC	9603	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135518119	135464960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_135465364_135467388_135467487_135468875_135469017_135469102_135469179_135473588_135473647_135478537_135478679_135480427_135480490_135481653_135481731_135483918_135484000_135485892_135485950_135486953_135487097_135489260_135489325_135517934
tx.15035	chr5	+	1905	4	FSM	ENSMUSG00000039917.11	ENSMUST00000043707.7	4207	4	74	2228	-12	-379	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_1	25.703436864876	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGTGTGGCATACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135661545	135673002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135661773_135664848_135665257_135667943_135668095_135671883
tx.15036	chr5	+	2024	5	FSM	ENSMUSG00000039917.11	ENSMUST00000136748.6	4363	5	39	2300	-11	-379	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_1	101.030626544628	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGTGTGGCATACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135661546	135673002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135661773_135663957_135664078_135664848_135665257_135667943_135668095_135671883
tx.15037	chr5	+	2488	16	NNC	ENSMUSG00000005514.15	novel	2636	16	NA	NA	31	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	67.5220457825936	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCCTGGTGTTGATTGAGT	2054	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135718042	135764181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_135718107_135744725_135744918_135757515_135757565_135758252_135758382_135759082_135759233_135759697_135759823_135759946_135760041_135760416_135760516_135761336_135761454_135761539_135761659_135762355_135762538_135762626_135762777_135762880_135763152_135763236_135763383_135763474_135763561_135763666
tx.15038	chr5	+	988	4	ISM	ENSMUSG00000005514.15	ENSMUST00000005651.13	2636	16	45021	-1	876	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	260	junction_1	22.3755819291179	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCCTGGTGTTGATTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135762910	135764181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_135763152_135763236_135763383_135763474_135763561_135763666
tx.15039	chr5	-	1362	12	FSM	ENSMUSG00000039886.9	ENSMUST00000043378.9	1559	12	197	0	-43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	674	junction_10	35.0345756018723	651	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGATGGACTGTGGATGTG	5260	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135773105	135764338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135764660_135764750_135764820_135764923_135764989_135765107_135765201_135765294_135765357_135765450_135765517_135765599_135765690_135765771_135765868_135766043_135766104_135770819_135770937_135771134_135771254_135772901
tx.15040	chr5	-	348	3	ISM	ENSMUSG00000039886.9	ENSMUST00000043378.9	1559	12	201	6569	-39	-4846	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	674	junction_1	15.5	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGGCTGCACAGGAGCTG	5264	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135773101	135770907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_135770937_135771134_135771254_135772901
tx.15041	chr5	-	318	2	ISM	ENSMUSG00000039886.9	ENSMUST00000043378.9	1559	12	202	6796	-38	-5073	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	705	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGGGGGGTGACGGCTTG	5265	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135773100	135771134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_135771254_135772901
tx.15042	chr5	+	1298	9	FSM	ENSMUSG00000019179.11	ENSMUST00000019323.11	1456	9	158	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4657	junction_8	277.596267085853	8802	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTCTGTAGATTTCCTTT	611	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135807491	135819245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135807656_135812158_135812328_135813037_135813122_135814782_135814893_135815086_135815213_135816394_135816473_135818054_135818155_135818479_135818632_135818930
tx.15043	chr5	+	496	3	FSM	ENSMUSG00000004951.11	ENSMUST00000005077.7	903	3	406	1	307	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2181	junction_2	11	574	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTGACTCCAGAGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135917178	135918416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_135917289_135917902_135917967_135918094
tx.15044	chr5	-	3542	2	FSM	ENSMUSG00000051391.10	ENSMUST00000055808.6	3520	2	-22	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	925	junction_1	0	251	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCGGCGGTGCCCAGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135963475	135937262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135940506_135963176
tx.15045	chr5	-	1154	3	FSM	ENSMUSG00000029699.14	ENSMUST00000054895.4	1191	3	38	-1	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTTAACTGAGGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135991143	135989076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135990063_135990742_135990821_135991053
tx.15046	chr5	-	1073	2	FSM	ENSMUSG00000029699.14	ENSMUST00000111150.2	459	2	-15	-599	-15	0	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTTAACTGAGGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135991140	135989076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135990063_135991053
tx.15047	chr5	+	1315	8	FSM	ENSMUSG00000004948.13	ENSMUST00000005073.13	1323	8	8	0	8	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_4	3.97953950776689	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGAGTGTGGTTTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136008960	136017478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136009297_136011492_136011612_136013015_136013120_136013201_136013386_136014398_136014517_136016108_136016201_136016325_136016463_136017253
tx.15048	chr5	+	2637	11	FSM	ENSMUSG00000004947.16	ENSMUST00000111142.9	2650	11	11	2	0	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	47	junction_6	35.5758344947803	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGTTGGGAAGTTTTGT	8470	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136023664	136061724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136023821_136025143_136025307_136038867_136039211_136040864_136041502_136050608_136050713_136055323_136055462_136057352_136057427_136057917_136058077_136059333_136059496_136060039_136060130_136061113
tx.15049	chr5	+	2493	10	FSM	ENSMUSG00000004947.16	ENSMUST00000111145.10	2493	10	8	-8	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_5	18.5279235376575	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTGGGAAGTTTTGTGT	8478	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136023672	136061726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136023821_136025143_136025307_136038867_136039211_136040864_136041502_136050608_136050713_136057352_136057427_136057917_136058077_136059333_136059496_136060039_136060130_136061113
tx.15050	chr5	+	697	4	FSM	ENSMUSG00000006143.13	ENSMUST00000139549.2	671	4	-16	-10	-16	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATACCTGGGTTCATCTC	4793	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136088885	136093174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136089136_136090036_136090114_136090360_136090482_136092925
tx.15051	chr5	+	578	4	FSM	ENSMUSG00000039771.14	ENSMUST00000041366.14	646	4	68	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1103	junction_2	77.5471182930453	8419	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGCAGTGTGTGGACTG	9280	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136145552	136151801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136145660_136148848_136148939_136150942_136151118_136151595
tx.15052	chr5	-	2167	15	FSM	ENSMUSG00000029703.11	ENSMUST00000006301.11	2473	15	12	294	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	342	junction_8	23.380722043284	397	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCAGTGGGAAATGAGTGT	6696	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136164916	136151919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_136152170_136152256_136152367_136152453_136152610_136152720_136152813_136159074_136159216_136159316_136159390_136159827_136160036_136160306_136160417_136160965_136161081_136161159_136161283_136161828_136161934_136162158_136162300_136162787_136162905_136163352_136163588_136164725
tx.15053	chr5	-	288	2	ISM	ENSMUSG00000029703.11	ENSMUST00000139908.2	2723	4	11	2951	11	-1594	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	356	junction_1	0	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTAACCTGGGCCTGTCCC	6707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136164905	136163479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_136163588_136164725
tx.15054	chr5	+	1773	3	FSM	ENSMUSG00000039754.11	ENSMUST00000041100.4	1773	3	3	-3	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_2	0.5	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATTTCTCCTTTTCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136165010	136170469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136165149_136168191_136168390_136169032
tx.15055	chr5	-	913	6	FSM	ENSMUSG00000039737.12	ENSMUST00000151786.8	3893	6	24	2956	24	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	446	junction_2	42.6164287569946	4087	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTTGTCCACACGTGCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136227793	136209936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_136210351_136218405_136218474_136220753_136220840_136223150_136223252_136226633_136226713_136227628
tx.15056	chr5	-	823	5	NIC	ENSMUSG00000039737.12	novel	3893	6	NA	NA	25	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	9	junction_2	235.670718376297	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGTCTTGTCCACACGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136227792	136209939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_136210351_136218405_136218474_136223150_136223252_136226633_136226713_136227628
tx.15057	chr5	-	2875	23	FSM	ENSMUSG00000029705.18	ENSMUST00000176745.8	2831	23	-44	0	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_13	14.4244970693081	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGGGTCTTTTATTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136596162	136276988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_136277835_136278021_136278087_136279377_136279459_136280224_136280282_136281396_136281481_136282920_136283038_136285085_136285199_136285653_136285721_136286766_136286895_136343160_136343258_136344852_136344902_136348634_136348694_136355603_136355787_136361477_136361583_136368942_136368992_136388855_136388923_136392112_136392190_136398971_136399096_136402175_136402314_136421168_136421248_136436833_136436882_136514594_136514706_136596031
tx.15058	chr5	+	1367	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000004415.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	3.09120616516523	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGCTGATCTTGGCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136743313	136778890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_136743490_136774222_136774384_136777293_136777375_136777941
tx.15059	chr5	+	773	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000004415.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0.816496580927726	30	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTCATACTCCAATCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136766555	136778337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_136766691_136774222_136774384_136777293_136777375_136777941
tx.15060	chr5	+	1495	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000004415.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	4.03112887414927	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGCTGATCTTGGCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136766566	136778890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_136766691_136773793_136773974_136774222_136774384_136777293_136777375_136777941
tx.15061	chr5	+	905	5	FSM	ENSMUSG00000007987.13	ENSMUST00000200157.5	3071	5	6	2160	6	63	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_4	11.0989864402116	465	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCTAGCACTGTGTTTTC	4061	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136937009	136942098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136937125_136939977_136940055_136940155_136940246_136940542_136940746_136941678
tx.15062	chr5	+	727	4	FSM	ENSMUSG00000007987.13	ENSMUST00000200153.5	670	4	-44	-13	8	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_3	7.34846922834953	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCATAGAGGTATGAATTAG	4063	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136937011	136940989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136937125_136939977_136940055_136940155_136940246_136940542
tx.15063	chr5	+	625	4	FSM	ENSMUSG00000097908.8	ENSMUST00000197095.5	617	4	-6	-2	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_3	17.326921891156	494	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTCATCTATGGTCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136948199	136962541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136948286_136951160_136951282_136954557_136954750_136962315
tx.15064	chr5	+	419	2	ISM	ENSMUSG00000097908.8	ENSMUST00000197095.5	617	4	6351	-2	6302	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	566	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTCATCTATGGTCTAC	865	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136954556	136962541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_136954750_136962315
tx.15065	chr5	+	946	5	FSM	ENSMUSG00000019054.14	ENSMUST00000111094.8	948	5	4	-2	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_1	181.92443486239	1854	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTGTGTGTGAGCGAGCA	4055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136982132	136995088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136982445_136991852_136991986_136993946_136994024_136994418_136994525_136994770
tx.15066	chr5	+	812	4	FSM	ENSMUSG00000019054.14	ENSMUST00000111097.8	601	4	-126	-85	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	234.963827003222	819	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTGTGTGTGAGCGAGCA	4056	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136982133	136995088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136982445_136993946_136994024_136994418_136994525_136994770
tx.15067	chr5	+	768	5	FSM	ENSMUSG00000019054.14	ENSMUST00000019198.7	786	5	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	370	junction_1	76.6823806359714	2098	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTGTGTGTGAGCGAGCA	3286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136990948	136995088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_136991083_136991852_136991986_136993946_136994024_136994418_136994525_136994770
tx.15068	chr5	-	331	2	ISM	ENSMUSG00000059518.15	ENSMUST00000085941.12	740	5	4277	4	4205	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	316	junction_1	0	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCTGCTCATTCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137011478	137011047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_137011272_137011371
tx.15069	chr5	-	647	4	ISM	ENSMUSG00000059518.15	ENSMUST00000085941.12	740	5	1850	4	1778	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	303	junction_3	5.31245915016974	701	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCTGCTCATTCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137013905	137011047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_137011272_137011371_137011542_137011721_137011802_137013732
tx.15070	chr5	-	695	5	FSM	ENSMUSG00000059518.15	ENSMUST00000085941.12	740	5	41	4	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_4	104.169033306449	1206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCTGCTCATTCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137015714	137011047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137011272_137011371_137011542_137011721_137011802_137013732_137013904_137015664
tx.15071	chr5	-	729	5	FSM	ENSMUSG00000059518.15	ENSMUST00000156963.8	1208	5	449	30	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	134.024251536802	1091	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCCTGCTCATTCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137016426	137011047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137011272_137011371_137011542_137011721_137011802_137013732_137013904_137016342
tx.15072	chr5	+	2806	19	FSM	ENSMUSG00000004846.11	ENSMUST00000004968.11	3280	19	368	106	9	-106	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	18.3673926051335	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAGTCCGTGAGTCCAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137016240	137025396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_137016658_137016970_137017063_137017188_137017326_137017425_137017590_137017736_137017850_137017979_137018044_137018451_137018550_137018750_137018853_137019004_137019131_137019271_137019394_137019598_137019704_137019812_137019939_137020153_137020296_137020397_137020512_137020625_137020695_137022062_137022168_137022996_137023144_137023786_137023913_137024959
tx.15073	chr5	+	789	3	NNC	ENSMUSG00000087244.2	novel	944	6	NA	NA	1070	258	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	4	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGTGTGTTTTT	1983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137027309	137028406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_137027514_137027633_137027818_137028005
tx.15074	chr5	+	667	2	NNC	ENSMUSG00000087244.2	novel	944	6	NA	NA	1312	258	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAAAGTGTGTTTTT	2225	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137027551	137028406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_137027818_137028005
tx.15075	chr5	-	1221	4	ISM	ENSMUSG00000004849.15	ENSMUST00000111080.8	1353	5	2892	5	2164	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	760	junction_1	7.11805216802087	535	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGACTTTGCCTTGGCTTT	172	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137072097	137063851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_137064646_137066271_137066410_137070622_137070732_137071917
tx.15076	chr5	-	1283	5	FSM	ENSMUSG00000004849.15	ENSMUST00000111080.8	1353	5	65	5	-28	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	639	junction_4	57.0586321252096	2873	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGACTTTGCCTTGGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137074924	137063851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137064646_137066271_137066410_137070622_137070732_137071917_137072097_137074861
tx.15077	chr5	+	490	2	Intergenic	novelGene_1151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAAATGATTTTAACAATG	8026	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137075007	137077225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_137075151_137076878
tx.15078	chr5	-	741	4	ISM	ENSMUSG00000023348.12	ENSMUST00000024119.11	2168	9	2367	244	2127	-244	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_2	7.31816613336672	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCAAGTCTGTTCTTTAT	3894	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137310299	137308159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_137308437_137308546_137308668_137308914_137309094_137310135
tx.15079	chr5	-	926	6	ISM	ENSMUSG00000023348.12	ENSMUST00000024119.11	2168	9	1614	244	1374	-244	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_2	5.89915248150105	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCAAGTCTGTTCTTTAT	3141	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137311052	137308159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_137308437_137308546_137308668_137308914_137309094_137310135_137310306_137310401_137310496_137310967
tx.15080	chr5	-	1761	9	FSM	ENSMUSG00000023348.12	ENSMUST00000024119.11	2168	9	163	244	-34	-244	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_6	14.9248115565993	308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCAAGTCTGTTCTTTAT	1690	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137312503	137308159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137308437_137308546_137308668_137308914_137309094_137310135_137310306_137310401_137310496_137310967_137311352_137311612_137311739_137311842_137311971_137312221
tx.15081	chr5	-	3304	14	FSM	ENSMUSG00000037344.15	ENSMUST00000039991.14	3330	14	26	0	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	4.75307437100782	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGCTGGTGGAGCACTGCT	6527	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137331833	137312819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137314100_137319655_137319803_137320657_137320833_137320977_137321171_137321308_137321434_137323584_137323668_137323778_137323937_137325632_137325745_137325858_137325967_137326698_137327008_137329204_137329337_137330387_137330523_137330717_137330941_137331709
tx.15082	chr5	+	826	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000106476.2	novel	277	1	NA	NA	-1002	326	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCTGAAATGATGTAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137430246	137431851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_+_137430399_137431177
tx.15083	chr5	-	797	2	FSM	ENSMUSG00000029715.6	ENSMUST00000031728.5	881	2	84	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	320	junction_1	0	2569	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGGGCTTCGAATGGCCTC	1723	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137500696	137499700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137500342_137500540
tx.15084	chr5	-	884	3	ISM	ENSMUSG00000029713.16	ENSMUST00000142252.8	1383	8	1710	-436	-269	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	706	junction_2	1.5	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTAGTCTCCTTGCTTAC	5853	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137527451	137526390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_137526872_137526952_137527170_137527265
tx.15085	chr5	-	1379	9	FSM	ENSMUSG00000029713.16	ENSMUST00000150063.9	1569	9	566	-376	168	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	641	junction_6	43.7428565596715	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTAGTCTCCTTGCTTACTG	4311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137528993	137526388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137526872_137526952_137527170_137527265_137527468_137527704_137527772_137527864_137528028_137528107_137528172_137528445_137528553_137528659_137528699_137528956
tx.15086	chr5	-	1569	10	FSM	ENSMUSG00000029713.16	ENSMUST00000031726.15	1860	10	289	2	10	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	634	junction_9	47.0030206541801	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTAGTCTCCTTGCTTAC	1821	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137531483	137526390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137526872_137526952_137527170_137527265_137527468_137527704_137527772_137527864_137528028_137528107_137528172_137528445_137528553_137528659_137528699_137528956_137529103_137531400
tx.15087	chr5	+	2633	17	ISM	ENSMUSG00000029716.14	ENSMUST00000198783.5	2973	18	575	0	-71	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_5	2.24913177693082	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAATTTAGCTTCCTCTTC	5107	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137569641	137585738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_137569786_137569875_137570054_137572648_137572790_137572869_137572982_137573075_137573199_137575719_137575837_137575927_137576068_137577140_137577305_137578428_137578549_137580850_137580934_137581019_137581084_137581180_137581249_137581335_137581413_137581492_137581578_137581666_137581895_137582187_137582329_137585090
tx.15088	chr5	+	790	2	ISM	ENSMUSG00000029716.14	ENSMUST00000199069.2	854	3	627	-474	627	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTTGTCCATACGCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137582173	137585725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_137582329_137585090
tx.15089	chr5	-	1547	8	ISM	ENSMUSG00000029718.15	ENSMUST00000031731.14	1626	9	808	2	23	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	423	junction_6	64.4265124789793	479	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGATCGTGTCTGAGGTTCT	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	137608941	137603366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_137603580_137603718_137603890_137603984_137604063_137605088_137605370_137605669_137605807_137606216_137606342_137607152_137607412_137608658
tx.15090	chr5	+	3034	18	FSM	ENSMUSG00000093445.8	ENSMUST00000031734.16	3078	18	34	10	3	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	234	junction_8	20.6479805391719	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGGTTGGTCCTCAGGTG	2218	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137627416	137639346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_137627689_137631833_137631979_137632110_137632238_137632405_137632512_137635000_137635138_137635246_137635360_137635474_137635575_137635806_137635898_137635987_137636065_137636166_137636229_137636327_137636445_137636554_137636624_137636700_137636805_137636916_137637001_137637383_137637461_137637611_137637750_137637839_137637918_137638209
tx.15091	chr5	+	1076	6	FSM	ENSMUSG00000079165.11	ENSMUST00000177466.8	1005	6	-37	-34	-37	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_1	39.5858560599616	482	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGTCTGCAGTGGGACAT	1064	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137639558	137641164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_137639819_137639983_137640079_137640171_137640276_137640357_137640497_137640602_137640701_137640784
tx.15092	chr5	+	1240	5	FSM	ENSMUSG00000079165.11	ENSMUST00000166099.3	1101	5	-139	0	-36	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_4	13.4976849866931	320	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGTCTGCAGTGGGACAT	1065	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137639559	137641164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_137640079_137640171_137640276_137640357_137640497_137640602_137640701_137640784
tx.15093	chr5	+	481	2	FSM	ENSMUSG00000079165.11	ENSMUST00000176075.2	576	2	160	-65	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_1	0	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGTCTGCAGTGGGACAT	2105	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137640599	137641164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_137640701_137640784
tx.15094	chr5	-	2921	13	FSM	ENSMUSG00000029722.16	ENSMUST00000100544.11	2858	13	-43	-20	3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_7	43.0686628794327	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCTCTGAGTGTCTTGTTT	1767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137682985	137648726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137650085_137650691_137650778_137652024_137652154_137653400_137653482_137653591_137653675_137653869_137653991_137658423_137658457_137659625_137659755_137661697_137661867_137662477_137662635_137665322_137665439_137665942_137666037_137682620
tx.15095	chr5	-	2871	12	NIC	ENSMUSG00000029722.16	novel	2893	12	NA	NA	1	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_7	39.6263540321879	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC	1765	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137682987	137648742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_137650085_137650691_137650778_137652024_137652154_137653400_137653482_137653591_137653675_137653869_137653991_137659625_137659752_137661697_137661867_137662477_137662635_137665322_137665439_137665942_137666037_137682620
tx.15096	chr5	-	2870	12	FSM	ENSMUSG00000029722.16	ENSMUST00000031736.16	2893	12	10	13	10	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_6	17.5678142969908	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGCTCTGA	1774	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137682978	137648737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137650085_137650691_137650778_137652024_137652154_137653400_137653482_137653591_137653675_137653869_137653991_137659625_137659755_137661697_137661867_137662477_137662635_137665322_137665439_137665942_137666037_137682620
tx.15097	chr5	-	2153	5	FSM	ENSMUSG00000029722.16	ENSMUST00000138604.2	1497	5	-32	-624	1	624	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_3	10.3289641300568	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACACTCACCAAAACCAGTT	1765	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137682987	137660447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137661867_137662477_137662635_137665322_137665439_137665942_137666037_137682620
tx.15098	chr5	-	840	2	NNC	ENSMUSG00000029722.16	novel	2893	12	NA	NA	15	-12076	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTGATTTAGCCTTATG	1779	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137682973	137673147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_137673635_137682620
tx.15099	chr5	+	642	2	ISM	ENSMUSG00000029723.17	ENSMUST00000129349.2	2989	3	63	5632	26	-5632	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	319	junction_1	0	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCGGAGCCCCAGGGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137744283	137745358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_137744677_137745109
tx.151	chr1	+	439	3	FSM	ENSMUSG00000050122.20	ENSMUST00000195450.2	462	3	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	16	613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCAGATTTCTCCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37174611	37180417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_37174647_37176810_37176969_37180171
tx.1510	chr10	-	2553	9	FSM	ENSMUSG00000020078.17	ENSMUST00000105447.11	2597	9	49	-5	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	953	junction_7	50.5010829091813	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAGTTTGTAGTTTAAAT	5247	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62322535	62291050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_62292638_62294702_62294846_62299469_62299539_62300410_62300518_62304068_62304234_62305679_62305837_62306838_62306915_62316336_62316487_62322436
tx.15100	chr5	+	2209	5	FSM	ENSMUSG00000029723.17	ENSMUST00000100539.10	3983	5	115	1659	115	201	multi-exon	FALSE	canonical	3	319	junction_1	32.7595405950694	260	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGAGGTTGGTGTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137744372	137758011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_137744677_137745109_137746122_137749469_137749631_137756945_137756995_137757328
tx.15101	chr5	+	1037	3	ISM	ENSMUSG00000029725.11	ENSMUST00000031739.6	956	4	10	0	10	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	301	junction_1	64	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCGAACTGTTCTTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137777175	137778372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_137777484_137777563_137777808_137777887
tx.15102	chr5	+	942	4	FSM	ENSMUSG00000029725.11	ENSMUST00000031739.6	956	4	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	301	junction_1	53.8970211504206	908	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCGAACTGTTCTTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137777179	137778372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_137777484_137777563_137777808_137777887_137778025_137778115
tx.15103	chr5	-	1034	4	FSM	ENSMUSG00000029726.17	ENSMUST00000132726.2	524	4	13	-523	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	65.2703778311588	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTGTCCAGCACTTTCTA	2687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137784964	137780167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_137780747_137780856_137780984_137781391_137781611_137784855
tx.15104	chr5	+	2132	16	NIC	ENSMUSG00000037108.14	novel	2222	17	NA	NA	0	-6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	8	junction_11	25.4046364972136	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGAGCTGTGCTTTGTGT	7077	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137786059	137820877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_137786208_137793752_137793808_137794833_137795079_137796159_137796236_137797769_137797864_137798247_137798406_137799235_137799359_137808277_137808395_137809074_137809196_137809836_137809913_137810263_137810363_137815719_137815787_137816059_137816155_137817225_137817287_137817703_137817839_137820415
tx.15105	chr5	+	440	3	ISM	ENSMUSG00000037108.14	ENSMUST00000035852.14	2222	17	2	25811	2	934	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	2	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAGGTCAGGGTCACACT	7079	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137786061	137795072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_137786208_137793752_137793808_137794833
tx.15106	chr5	+	2201	17	FSM	ENSMUSG00000037108.14	ENSMUST00000035852.14	2222	17	15	6	15	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_4	16.2498798072478	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGAGCTGTGCTTTGTGT	7092	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137786074	137820877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_137786208_137793752_137793808_137794833_137795079_137796159_137796236_137797769_137797864_137798247_137798406_137799235_137799359_137808277_137808395_137809074_137809196_137809836_137809913_137810263_137810363_137815154_137815239_137815719_137815787_137816059_137816155_137817225_137817287_137817703_137817839_137820415
tx.15107	chr5	+	1160	9	ISM	ENSMUSG00000037108.14	ENSMUST00000035852.14	2222	17	23055	6	24	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_3	11.5866302262565	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGAGCTGTGCTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137809114	137820877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_137809196_137809836_137809913_137810263_137810363_137815154_137815239_137815719_137815787_137816059_137816155_137817225_137817287_137817703_137817839_137820415
tx.15108	chr5	+	755	4	ISM	ENSMUSG00000037108.14	ENSMUST00000141642.2	806	8	6967	-294	6967	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_1	6.34209919681348	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGAGCTGTGCTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137816057	137820877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_137816155_137817225_137817287_137817703_137817839_137820415
tx.15109	chr5	+	2164	4	FSM	ENSMUSG00000037017.16	ENSMUST00000110960.9	2204	4	-9	49	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	50.6776303927307	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCGTCTCAGGACTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138115189	138132478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138115270_138123239_138123953_138124715_138124909_138131300
tx.1511	chr10	-	2480	8	NIC	ENSMUSG00000020078.17	novel	2597	9	NA	NA	-13	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	111	junction_6	333.910900983958	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAAGTTTGTAGTTTAAAT	5244	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62322538	62291050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_62292638_62294702_62294846_62299469_62299539_62300410_62300518_62304068_62304234_62305679_62305837_62316336_62316487_62322436
tx.15110	chr5	+	2143	4	FSM	ENSMUSG00000037017.16	ENSMUST00000080732.10	2134	4	-9	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	59.1626759217517	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGCGTCTCAGGACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138115189	138132476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138115251_138123239_138123953_138124715_138124909_138131300
tx.15111	chr5	+	2234	5	FSM	ENSMUSG00000037017.16	ENSMUST00000062350.15	2252	5	19	-1	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	46.7566840141599	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGCGTCTCAGGACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138115183	138132476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138115251_138116097_138116183_138123239_138123953_138124715_138124909_138131300
tx.15112	chr5	+	2248	5	FSM	ENSMUSG00000037017.16	ENSMUST00000110961.9	2310	5	13	49	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_1	38.7774096607806	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCGTCTCAGGACTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138115190	138132478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138115270_138116097_138116183_138123239_138123953_138124715_138124909_138131300
tx.15113	chr5	-	752	6	NNC	ENSMUSG00000037007.18	novel	6470	5	NA	NA	18	15633	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	6.6332495807108	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGGAGTCAGCTAACTAG	1729	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138153988	138122330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_138122600_138143932_138143975_138148868_138148996_138149466_138149559_138151106_138151232_138153891
tx.15114	chr5	-	2229	5	FSM	ENSMUSG00000037007.18	ENSMUST00000049393.15	6470	5	21	4220	-19	745	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	1.4790199457749	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGACCCCATCAAGGG	1732	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138153985	138142183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_138143975_138148868_138148996_138149466_138149559_138151106_138151232_138153891
tx.15115	chr5	+	1104	10	FSM	ENSMUSG00000019494.15	ENSMUST00000019638.15	1787	10	21	662	-8	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	3954	junction_1	284.410501446999	15365	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTTCCAGTGGCTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138159353	138162246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138159445_138159636_138159760_138159935_138160068_138160398_138160488_138160583_138160647_138160996_138161045_138161391_138161507_138161588_138161682_138161770_138161872_138161997
tx.15116	chr5	-	564	3	ISM	ENSMUSG00000029730.17	ENSMUST00000000505.16	2962	15	6393	4	-313	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2180	junction_1	164.5	606	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTCTGTAGAGTTTTTAG	8109	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138164291	138162848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_138163183_138163313_138163424_138164171
tx.15117	chr5	-	1646	10	ISM	ENSMUSG00000029730.17	ENSMUST00000000505.16	2962	15	3539	4	760	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1920	junction_7	148.02185357508	560	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTCTGTAGAGTTTTTAG	5255	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138167145	138162848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_138163183_138163313_138163424_138164171_138164341_138164944_138165029_138165307_138165702_138165812_138165897_138166102_138166235_138166319_138166435_138166594_138166745_138167071
tx.15118	chr5	-	2397	15	FSM	ENSMUSG00000029730.17	ENSMUST00000000505.16	2962	15	561	4	-43	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1644	junction_12	192.903605514278	2126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTCTGTAGAGTTTTTAG	2277	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138170123	138162848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_138163183_138163313_138163424_138164171_138164341_138164944_138165029_138165307_138165702_138165812_138165897_138166102_138166235_138166319_138166435_138166594_138166745_138167071_138167210_138167359_138167541_138167610_138167736_138167821_138167987_138168578_138168659_138169987
tx.15119	chr5	+	1623	15	FSM	ENSMUSG00000019518.12	ENSMUST00000019662.11	3479	15	117	1739	51	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	48	junction_6	9.89356624586021	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTCCTTCCTCCCTCACA	8194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138170380	138176952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138170511_138170610_138170700_138171048_138171156_138171233_138171331_138173011_138173123_138173205_138173287_138174173_138174237_138174313_138174381_138174471_138174526_138174873_138174981_138175078_138175174_138175417_138175463_138176184_138176236_138176330_138176443_138176538
tx.15120	chr5	-	2405	15	NNC	ENSMUSG00000036980.14	novel	2304	15	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	77	junction_14	167.30713843536	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGAGCCTCCCGCATCACA	1958	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138185482	138176878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_138177410_138177674_138177873_138178041_138178216_138179152_138179279_138179379_138179455_138180169_138180353_138180462_138180565_138180675_138180754_138180859_138181006_138181356_138181477_138181575_138181633_138181829_138181984_138182100_138182188_138182593_138182810_138185324
tx.15121	chr5	-	2386	15	NIC	ENSMUSG00000036980.14	novel	2304	15	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	170	junction_14	144.727259325383	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGAGCCTCCCGCATCACA	1956	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138185484	138176878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_138177410_138177674_138177873_138178041_138178216_138179152_138179279_138179379_138179455_138180169_138180353_138180462_138180565_138180675_138180754_138180859_138181006_138181356_138181477_138181575_138181633_138181829_138181984_138182100_138182188_138182593_138182810_138185345
tx.15122	chr5	-	2301	15	FSM	ENSMUSG00000036980.14	ENSMUST00000048698.14	2304	15	3	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	362	junction_14	100.146932869985	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGAGCCTCCCGCATCACA	1955	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138185485	138176878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_138177410_138177674_138177873_138178041_138178216_138179152_138179279_138179379_138179455_138180169_138180353_138180462_138180565_138180675_138180754_138180859_138181006_138181356_138181477_138181575_138181633_138181829_138181984_138182100_138182188_138182593_138182810_138185431
tx.15123	chr5	-	2509	15	NIC	ENSMUSG00000036980.14	novel	2304	15	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	40	junction_14	176.391146985028	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGAGCCTCCCGCATCACA	1955	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138185485	138176878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_138177410_138177674_138177873_138178041_138178216_138179152_138179279_138179379_138179455_138180169_138180353_138180462_138180565_138180675_138180754_138180859_138181006_138181356_138181477_138181575_138181633_138181829_138181984_138182100_138182188_138182593_138182810_138185223
tx.15124	chr5	+	1549	6	FSM	ENSMUSG00000036968.16	ENSMUST00000110934.9	1855	6	31	275	31	-275	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_5	26.1350339582714	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTGAGTCCCATTTCAA	5629	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138185777	138191905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138185983_138188531_138188659_138188754_138188852_138190099_138190223_138190822_138190941_138191026
tx.15125	chr5	+	603	4	FSM	ENSMUSG00000050552.9	ENSMUST00000062067.8	877	4	271	3	-78	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_1	67.9084350839832	3071	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGGATGTGTGCACAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138254014	138257654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138254066_138254514_138254596_138256916_138257035_138257301
tx.15126	chr5	+	552	3	FSM	ENSMUSG00000050552.9	ENSMUST00000160157.2	980	3	421	7	421	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	386	junction_1	14	1034	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGGATGTGTGCACAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138254513	138257653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138254596_138256916_138257035_138257301
tx.15127	chr5	+	942	2	FSM	ENSMUSG00000085227.2	ENSMUST00000141454.2	624	2	8	-326	-7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATGAGGACACAAGTTTAT	6194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138262323	138264920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138262364_138264018
tx.15128	chr5	+	721	3	FSM	ENSMUSG00000085227.2	ENSMUST00000124298.2	743	3	19	3	-7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	4	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATGAGGACACAAGTTTAT	6194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138262323	138264920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138262364_138264018_138264268_138264488
tx.15129	chr5	+	691	2	ISM	ENSMUSG00000085227.2	ENSMUST00000124298.2	743	3	1713	-6	212	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAGTTTATATTCCCAGT	1610	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138264017	138264929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_138264268_138264488
tx.15130	chr5	-	2589	10	FSM	ENSMUSG00000029510.16	ENSMUST00000161827.8	2586	10	-4	1	-4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	3.67507453523138	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTATGGCTCTCTGTGTGTGT	1717	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138278271	138271917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_138272832_138273716_138273887_138273968_138274109_138274190_138274338_138274469_138274601_138274845_138275009_138275668_138275750_138276476_138276800_138277100_138277260_138277910
tx.15131	chr5	+	1149	8	ISM	ENSMUSG00000036928.15	ENSMUST00000162245.8	4123	34	23575	2	-319	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_4	19.6894253188801	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTATGACTTGAGATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138302380	138310653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_138302453_138302635_138302765_138302846_138303005_138306730_138306918_138307088_138307191_138307460_138307534_138309995_138310068_138310297
tx.15132	chr5	+	774	3	NIC	ENSMUSG00000036928.15	novel	4211	34	NA	NA	-274	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	164	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTATGACTTGAGATTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138307188	138310654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_138307534_138309995_138310068_138310297
tx.15133	chr5	+	2281	5	FSM	ENSMUSG00000036898.17	ENSMUST00000100524.3	869	5	-61	-1351	0	1351	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	23.7276210354093	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCCGTTTCATTGACACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138439740	138455940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138439892_138443013_138443141_138445776_138445870_138453241_138453352_138454140
tx.15134	chr5	+	486	4	ISM	ENSMUSG00000036898.17	ENSMUST00000110912.8	886	5	-35	1216	5	-1216	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_1	1.88561808316413	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAAAGTGAATACATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138439745	138453361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_138439892_138443013_138443141_138445776_138445870_138453241
tx.15135	chr5	-	824	7	NNC	ENSMUSG00000058291.15	novel	4749	6	NA	NA	1	368	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	29.6910012555245	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAGTTGTATTCAGCAG	1755	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138617999	138602877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_138603025_138605961_138606084_138610085_138610176_138610300_138610428_138614731_138614828_138615316_138615430_138617870
tx.15136	chr5	-	2264	6	FSM	ENSMUSG00000058291.15	ENSMUST00000110905.9	4749	6	24	2461	1	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_4	14.2632394637403	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATCTTTGTTTGTTTATCA	1755	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138617999	138604374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_138606084_138610085_138610176_138610300_138610428_138614731_138614828_138615316_138615430_138617870
tx.15137	chr5	-	2169	5	FSM	ENSMUSG00000058291.15	ENSMUST00000085852.11	3318	5	21	1128	1	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	27.3530162870569	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTTTGTTTGTTTATCAA	1755	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138617999	138604373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_138606084_138610085_138610176_138610300_138610428_138615316_138615430_138617870
tx.15138	chr5	-	1047	6	NIC	ENSMUSG00000025856.16	novel	1363	8	NA	NA	-343	12	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_5	159.261294732901	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAACAAACCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138982185	138962684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_138962983_138964900_138965028_138971944_138972133_138974103_138974209_138979042_138979140_138981953
tx.15139	chr5	-	1093	6	FSM	ENSMUSG00000025856.16	ENSMUST00000076095.14	2060	6	53	914	-31	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	325	junction_5	43.6055042397173	520	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACAAAAACAAACCAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138980739	138962682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_138962983_138964900_138965028_138971944_138972133_138974103_138974209_138979042_138979140_138980463
tx.15140	chr5	-	441	3	ISM	ENSMUSG00000025856.16	ENSMUST00000144934.8	691	6	8045	-184	8045	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	426	junction_2	3	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAAAAAAATTAAAAAC	5199	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138971991	138962715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_138962983_138964900_138965028_138971944
tx.15141	chr5	-	1635	6	NNC	ENSMUSG00000025856.16	novel	2060	6	NA	NA	451	119	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_5	158.480787479114	25	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTACCTATCCATTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138979585	138962151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_138962983_138964900_138965028_138971944_138972133_138974103_138974209_138979042_138979140_138979298
tx.15142	chr5	+	260	3	ISM	ENSMUSG00000036817.15	ENSMUST00000135926.2	768	6	7189	801	-1645	281	internal_fragment	FALSE	canonical	3	760	junction_1	16	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCCAAAGGTAACCAGCAAG	1930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139219686	139220579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_139219750_139220269_139220329_139220441
tx.15143	chr5	+	1239	9	FSM	ENSMUSG00000025858.13	ENSMUST00000026976.12	2107	9	146	722	100	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1098	junction_8	59.685503893324	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTTGTCTCTGCTTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139238224	139255084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_139238375_139248235_139248315_139248624_139248707_139249233_139249384_139251381_139251521_139252758_139252900_139252981_139253058_139253157_139253231_139254735
tx.15144	chr5	+	622	4	ISM	ENSMUSG00000025858.13	ENSMUST00000110878.2	1180	9	13510	0	90	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1098	junction_3	53.2812245438193	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTTGTCTCTGCTTCCTTG	21	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	139252775	139255084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_139252900_139252981_139253058_139253157_139253231_139254735
tx.15146	chr5	-	781	3	FSM	ENSMUSG00000045438.13	ENSMUST00000049630.13	2461	3	49	1631	-7	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	183	junction_2	1.5	353	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTTTGGCTTTTGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139330939	139323574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_139324131_139328317_139328430_139330826
tx.15147	chr5	-	1462	5	FSM	ENSMUSG00000053553.12	ENSMUST00000066052.12	1429	5	-35	2	-10	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	675	junction_4	25.951878544722	525	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCCTGACTTTTTGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139446292	139345495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_139346486_139347061_139347144_139349727_139349919_139441171_139441302_139446223
tx.15148	chr5	-	1395	4	ISM	ENSMUSG00000053553.12	ENSMUST00000066052.12	1429	5	4953	3	-19	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	702	junction_2	18.8030730348939	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTCCTGACTTTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139441304	139345496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_139346486_139347061_139347144_139349727_139349919_139441171
tx.15149	chr5	-	344	3	FSM	ENSMUSG00000053553.12	ENSMUST00000196267.2	686	3	-25	367	-9	-367	multi-exon	FALSE	canonical	3	675	junction_2	36	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCAAGCCCTCGGCTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139446291	139349772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_139349919_139441171_139441302_139446223
tx.15150	chr5	-	3077	7	FSM	ENSMUSG00000053581.14	ENSMUST00000079996.13	3169	7	77	15	-8	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_6	14.7271480229163	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCACCCATTTTTTATTC	8754	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139470227	139456980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_139459310_139459484_139459551_139460607_139460760_139464221_139464354_139467720_139467816_139468456_139468553_139470020
tx.15151	chr5	-	981	6	ISM	ENSMUSG00000029547.11	ENSMUST00000198615.2	1634	7	1156	-3	1156	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	140	junction_5	55.8662688927764	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGGTGTCCTGTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139739457	139737036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_139737389_139737464_139737575_139737692_139737785_139737975_139738047_139738466_139738581_139739215
tx.15152	chr5	+	2831	3	FSM	ENSMUSG00000018143.11	ENSMUST00000018287.10	2849	3	15	3	-6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTCTGGTGTCTGGATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139777282	139788405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_139777468_139784893_139784974_139785839
tx.15153	chr5	-	1218	2	NNC	ENSMUSG00000036687.14	novel	4326	8	NA	NA	5330	1156	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTGCAGCAACACACGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139788405	139787083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_139787733_139787836
tx.15154	chr5	-	865	3	FSM	ENSMUSG00000029551.14	ENSMUST00000031531.14	883	3	1	17	1	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	166	junction_2	27	537	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGCCTTCTCAGTGATCC	7314	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139812639	139809363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_139809829_139811882_139812120_139812476
tx.15155	chr5	-	776	3	FSM	ENSMUSG00000029551.14	ENSMUST00000182602.2	733	3	-42	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_2	75.5	322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGCTGGCCTTCTCAGTGA	7313	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139812640	139809366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_139809829_139811882_139812120_139812563
tx.15156	chr5	-	699	2	ISM	ENSMUSG00000029551.14	ENSMUST00000182602.2	733	3	478	0	478	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	220	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTGGCCTTCTCAGTG	7833	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139812120	139809367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_139809829_139811882
tx.15157	chr5	+	497	3	Intergenic	novelGene_1154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAACGTTATGTATGCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139988243	139991511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_139988435_139988873_139989053_139991384
tx.15159	chr5	-	1219	6	ISM	ENSMUSG00000029554.16	ENSMUST00000199237.5	1603	7	42091	0	-17361	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_1	20.4254742906989	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGATTGTGTCCAAGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140118582	139994448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_139995030_140051568_140051760_140074384_140074593_140091269_140091361_140102991_140103081_140118523
tx.15160	chr5	-	2652	18	FSM	ENSMUSG00000029554.16	ENSMUST00000031534.9	2640	18	-18	6	-18	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_17	17.902078903461	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGGATTGTGTCCAAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140307325	139994449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_139995030_140051568_140051760_140074384_140074593_140091269_140091361_140102991_140103081_140118523_140118581_140129674_140129816_140179668_140179814_140247252_140247340_140281541_140281604_140285969_140286085_140286188_140286320_140288669_140288752_140289327_140289453_140293345_140293526_140296349_140296491_140300744_140300908_140307261
tx.15161	chr5	-	1420	3	FSM	ENSMUSG00000029557.8	ENSMUST00000031536.8	1443	3	13	10	13	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_2	12	236	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTCTGGCTTTTGTTTAC	3914	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140317640	140313438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_140314536_140316734_140317025_140317607
tx.15162	chr5	+	895	4	FSM	ENSMUSG00000036639.13	ENSMUST00000071881.10	952	4	57	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	90.7450641449256	328	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTGTGTGACTACAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140317671	140323892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_140317711_140320209_140320375_140321067_140321214_140323347
tx.15163	chr5	+	942	5	FSM	ENSMUSG00000036639.13	ENSMUST00000050205.12	954	5	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_1	49.2461927462418	657	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTGTGTGACTACAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140317675	140323892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_140317711_140318177_140318229_140320209_140320375_140321067_140321214_140323347
tx.15164	chr5	+	909	4	FSM	ENSMUSG00000036639.13	ENSMUST00000110826.8	606	4	26	-329	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	152	junction_1	28.5696031162882	450	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTGTGTGACTACAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140318175	140323892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_140318229_140320209_140320375_140321067_140321214_140323347
tx.15165	chr5	+	858	3	ISM	ENSMUSG00000036639.13	ENSMUST00000110826.8	606	4	2058	-329	-120	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_2	8	300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTGTGTGACTACAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140320207	140323892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_140320375_140321067_140321214_140323347
tx.15166	chr5	-	2616	11	NNC	ENSMUSG00000029560.13	novel	2627	11	NA	NA	-4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	62.5291132193637	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGTTTCCACGCTGCAGT	7737	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140375000	140326055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_140327398_140330040_140330191_140330463_140330611_140332031_140332101_140337887_140338021_140338785_140338951_140339187_140339269_140341714_140341837_140343811_140343930_140345946_140346138_140374902
tx.15167	chr5	+	1532	10	ISM	ENSMUSG00000056076.14	ENSMUST00000100507.8	2945	19	13607	-1	5845	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2626	junction_7	341.258129736291	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGCTGTCCTGATCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140418689	140429116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_140418890_140422002_140422076_140423039_140423163_140424070_140424150_140425667_140425807_140426740_140426867_140427491_140427570_140427878_140427988_140428074_140428192_140428628
tx.15168	chr5	+	1095	7	ISM	ENSMUSG00000056076.14	ENSMUST00000100507.8	2945	19	19031	-3	-1583	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2626	junction_4	403.685693193218	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTCCTGATCTCTTTGT	4688	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140424113	140429118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_140424150_140425667_140425807_140426740_140426867_140427491_140427570_140427878_140427988_140428074_140428192_140428628
tx.15169	chr5	+	606	2	ISM	ENSMUSG00000056076.14	ENSMUST00000100507.8	2945	19	22990	0	2376	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3947	junction_1	0	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGCTGTCCTGATCTCTT	8647	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140428072	140429115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_140428192_140428628
tx.15170	chr5	+	917	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105633.2	novel	404	1	NA	NA	-93016	307	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGCTGGAGAGATGGCTC	1854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140439173	140532900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_+_140439300_140532109
tx.15171	chr5	+	1788	2	FSM	ENSMUSG00000036599.11	ENSMUST00000043050.9	2331	2	57	486	32	-486	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGGCATTCCTGTGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140491361	140510993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_140491452_140509295
tx.15172	chr5	-	1641	11	ISM	ENSMUSG00000036555.15	ENSMUST00000041783.14	6037	23	73	23489	-5	-1506	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_4	6.58862656401165	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGGCCTCTGTGTGATCT	4484	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140688060	140671070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_140671850_140672082_140672156_140673539_140673611_140675567_140675619_140675710_140675825_140677354_140677426_140678548_140678684_140679169_140679299_140682762_140682809_140685439_140685488_140687936
tx.15173	chr5	-	388	5	ISM	ENSMUSG00000036555.15	ENSMUST00000041783.14	6037	23	57	31077	18	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	5.11737237261468	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGCTTACCTCGGAGCACG	4468	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140688076	140678658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_140678684_140679169_140679299_140682762_140682809_140685439_140685488_140687936
tx.15174	chr5	-	351	4	FSM	ENSMUSG00000036555.15	ENSMUST00000139382.2	472	4	-5	126	1	-126	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0.942809041582063	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGTGGAGGAGGGTGCT	4490	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140688054	140679159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_140679299_140682762_140682809_140685439_140685488_140687936
tx.15175	chr5	+	3321	14	FSM	ENSMUSG00000000148.18	ENSMUST00000041588.13	3333	14	12	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	10.6471097836719	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCTGTCTTCTCTTTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140690777	140705134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_140690831_140691707_140691852_140695892_140696048_140697260_140697409_140698259_140698633_140698807_140698928_140700047_140700140_140700321_140700441_140700514_140700702_140700893_140700968_140702446_140702550_140702683_140702783_140702898_140703075_140703656
tx.15176	chr5	+	1426	2	ISM	ENSMUSG00000050022.17	ENSMUST00000176035.2	2402	4	-4	8129	-4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCTGTGTCATGTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140735033	140739065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_140735087_140737692
tx.15177	chr5	-	586	2	ISM	ENSMUSG00000000149.11	ENSMUST00000198447.2	1306	3	19	24979	19	-24979	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	266	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGTTCCAGAAAGAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140815893	140770926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_140771368_140815748
tx.15178	chr5	-	360	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039683.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGCCTCAGTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142206767	142197108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_142197234_142203618_142203704_142206617
tx.15179	chr5	+	2806	17	NNC	ENSMUSG00000039623.14	novel	3689	17	NA	NA	-8	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	24.9210472041205	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGGTGGCACATGCCTT	8682	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142449790	142463560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_142449891_142452012_142452148_142452244_142452432_142453396_142453542_142453775_142453886_142454618_142454788_142455761_142455903_142456044_142456083_142456148_142456312_142457957_142458144_142459662_142459806_142460128_142460270_142460629_142460742_142461457_142461556_142462448_142462582_142462651_142462867_142462970
tx.15180	chr5	+	806	2	ISM	ENSMUSG00000039623.14	ENSMUST00000196055.2	2965	17	12822	249	2797	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGGTGGCACATGCCTT	8676	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142462650	142463560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_142462867_142462970
tx.15181	chr5	+	1819	12	FSM	ENSMUSG00000029578.16	ENSMUST00000036872.16	5171	12	22	3330	22	-229	multi-exon	FALSE	canonical	3	377	junction_9	31.2155926283724	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTGGAGTCTCCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142615318	142653013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_142615588_142623956_142624040_142641602_142641773_142643946_142644044_142644819_142644918_142645287_142645381_142646779_142646851_142648789_142648898_142650079_142650245_142651177_142651286_142651848_142652007_142652614
tx.15182	chr5	-	1992	4	NNC	ENSMUSG00000039477.17	novel	9342	25	NA	NA	8205	54	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_3	12.0277457017791	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTATGTCTTTGGAGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142714231	142710361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_142711943_142712732_142712808_142713595_142713833_142714132
tx.15184	chr5	-	2832	5	FSM	ENSMUSG00000066640.12	ENSMUST00000035985.8	2831	5	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	6.28490254498827	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTCTCCAGGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142880993	142857542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_142858276_142864412_142864632_142871293_142872838_142874423_142874631_142880864
tx.15185	chr5	-	1237	4	NIC	ENSMUSG00000066640.12	novel	7857	5	NA	NA	51	1	intron_retention	FALSE	canonical	1	2	junction_2	9.7410927974683	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTCTCCAGGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142880942	142857542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_142858276_142864412_142864632_142874423_142874631_142880864
tx.15186	chr5	-	320	2	FSM	ENSMUSG00000066640.12	ENSMUST00000156725.2	6769	2	205	6244	22	-6244	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGGTGGACGGGAGGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142880971	142874417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_142874631_142880864
tx.15187	chr5	+	474	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000066640.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTTTGTCTTGAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142881058	142883769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_142881223_142883459
tx.15188	chr5	-	1222	5	ISM	ENSMUSG00000029580.15	ENSMUST00000100497.11	1920	6	1045	612	112	-226	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4052	junction_3	83.3351666465004	727	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAGACAACATTGGCATG	9934	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142891464	142889481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_142889697_142889821_142890004_142890098_142890538_142890991_142891232_142891318
tx.15189	chr5	-	1279	6	FSM	ENSMUSG00000029580.15	ENSMUST00000100497.11	1920	6	29	612	0	-226	multi-exon	FALSE	canonical	3	4052	junction_3	78.6180640819907	18701	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAGACAACATTGGCATG	8918	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142892480	142889481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_142889697_142889821_142890004_142890098_142890538_142890991_142891232_142891318_142891448_142892406
tx.15190	chr5	+	2660	5	FSM	ENSMUSG00000029581.15	ENSMUST00000031565.15	2675	5	13	2	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2634	junction_2	132.012310032057	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGCCCGTGTGTGTCTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142946110	142958938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_142947036_142955659_142955817_142955921_142956044_142956272_142956441_142957650
tx.15192	chr5	-	1287	3	ISM	ENSMUSG00000039296.16	ENSMUST00000085733.9	1819	7	6631	-1	6631	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGATGGCTTTGTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143205006	143202069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_143202965_143204425_143204529_143204717
tx.15193	chr5	-	1274	7	ISM	ENSMUSG00000001844.11	ENSMUST00000001900.9	1364	8	685	0	-2	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	192	junction_6	30.739045022396	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTTTTCTCATCATTG	5954	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143314326	143302243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_143302588_143305985_143306231_143307523_143307650_143309886_143310066_143310639_143310714_143311853_143311979_143314145
tx.15194	chr5	-	1395	8	NIC	ENSMUSG00000001844.11	novel	1364	8	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_7	84.1580146425249	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTTTTCTCATCATTG	5305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143314975	143302243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_143302588_143305985_143306231_143307523_143307650_143309886_143310066_143310639_143310714_143311853_143311979_143314145_143314326_143314853
tx.15195	chr5	-	1548	9	NIC	ENSMUSG00000001844.11	novel	1364	8	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	33	junction_8	94.7198995723707	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTTTTCTCATCATTG	5305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143314975	143302243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_143302588_143305985_143306231_143307523_143307650_143309886_143310066_143310639_143310714_143311853_143311979_143314145_143314326_143314432_143314653_143314920
tx.15196	chr5	-	1330	8	FSM	ENSMUSG00000001844.11	ENSMUST00000001900.9	1364	8	34	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_7	40.248209492435	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTTTTCTCATCATTG	5303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143314977	143302243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_143302588_143305985_143306231_143307523_143307650_143309886_143310066_143310639_143310714_143311853_143311979_143314145_143314326_143314920
tx.15197	chr5	-	1272	8	NNC	ENSMUSG00000001844.11	novel	1364	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_6	87.5293536769354	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTTTTCTCATCATTG	5305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143314975	143302243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_143302588_143305985_143306231_143307523_143307650_143309886_143310066_143310639_143310714_143311853_143311979_143314201_143314326_143314920
tx.15198	chr5	-	847	7	ISM	ENSMUSG00000001844.11	ENSMUST00000001900.9	1364	8	35	3880	-1	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_6	36.85557397916	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGGCTTCTGCTGCCACCAT	5304	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143314976	143306123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_143306231_143307523_143307650_143309886_143310066_143310639_143310714_143311853_143311979_143314145_143314326_143314920
tx.15199	chr5	+	629	3	FSM	ENSMUSG00000089889.3	ENSMUST00000162890.2	600	3	-29	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGTCGAAGGCCTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143315052	143318456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_143315109_143316458_143316641_143318065
tx.152	chr1	-	613	3	FSM	ENSMUSG00000026112.8	ENSMUST00000027286.7	3863	3	52	3198	-51	-3198	multi-exon	FALSE	canonical	3	395	junction_2	27.5	1391	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCCATGATGAGATTGGCAT	6324	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37469132	37459362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_37459709_37467422_37467507_37468949
tx.15200	chr5	+	478	2	FSM	ENSMUSG00000089889.3	ENSMUST00000160231.2	501	2	20	3	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGTCGAAGGCCTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143315021	143318456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_143315109_143318065
tx.15201	chr5	+	297	2	ISM	ENSMUSG00000089889.3	ENSMUST00000162890.2	600	3	-19	1747	0	4	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTGTTCTGACTAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143315062	143316709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_143315109_143316458
tx.15202	chr5	-	620	2	NNC	ENSMUSG00000045345.8	novel	2631	2	NA	NA	-4185	-4715	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCATTAGTATTATTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143389503	143384158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_143384639_143389363
tx.15203	chr5	-	359	2	NNC	ENSMUSG00000093720.2	novel	1287	2	NA	NA	-9	-12315	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAATTTATTTGTGGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143389512	143388799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_143389010_143389363
tx.15204	chr5	+	1053	5	FSM	ENSMUSG00000079111.4	ENSMUST00000110731.4	1829	5	-12	788	-12	-788	multi-exon	FALSE	canonical	3	606	junction_2	10.3531396204243	608	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTTTCCAAAAGTGACGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143389580	143406868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_143389808_143398245_143398347_143403804_143403964_143405194_143405448_143406555
tx.15205	chr5	+	1228	4	ISM	ENSMUSG00000039206.14	ENSMUST00000045593.12	4651	15	27	30592	-2	8	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_3	7.34846922834953	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTGCCTTGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143450365	143461105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_143450532_143452707_143452860_143458701_143458874_143460367
tx.15206	chr5	-	763	5	ISM	ENSMUSG00000001847.15	ENSMUST00000145709.8	585	6	952	-303	378	303	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1143	junction_4	57.7775908116633	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTAAAGCCTTATTTTT	3611	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143502985	143492511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_143492861_143493081_143493242_143493850_143493914_143500423_143500542_143502912
tx.15207	chr5	-	454	2	ISM	ENSMUSG00000001847.15	ENSMUST00000145709.8	585	6	10749	-301	10175	301	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1302	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTCTTAAAGCCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143493188	143492513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_143492861_143493081
tx.15208	chr5	+	940	2	FSM	ENSMUSG00000118332.2	ENSMUST00000118121.2	919	2	-21	0	17	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	93	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCGGTGTTTTCCTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143534479	143537693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_143534890_143537163
tx.15209	chr5	+	2162	2	FSM	ENSMUSG00000118332.2	ENSMUST00000067145.12	2198	2	20	16	18	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTTTATTTTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143534480	143550264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_143534890_143548511
tx.15210	chr5	+	3723	13	FSM	ENSMUSG00000018001.19	ENSMUST00000116456.10	3738	13	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_12	7.06468132488807	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCCTAAGACTCAATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143608216	143696005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_143608429_143670150_143670234_143672227_143672293_143672732_143672800_143678302_143678422_143683470_143683552_143687073_143687187_143687351_143687501_143688568_143688681_143692838_143692916_143692993_143693066_143693149_143693305_143693587
tx.15212	chr5	+	960	9	ISM	ENSMUSG00000029613.16	ENSMUST00000100487.6	4325	15	7	19520	7	4252	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	166	junction_1	21.5431978823943	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTTGGGGAGTCTGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143803549	143821549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_143803764_143808680_143808840_143810568_143810703_143812477_143812516_143814393_143814494_143816252_143816334_143818970_143819071_143820790_143820849_143821473
tx.15213	chr5	+	2761	15	FSM	ENSMUSG00000029613.16	ENSMUST00000100487.6	4325	15	30	1534	-13	-1534	multi-exon	FALSE	canonical	3	166	junction_1	19.8185647866863	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATTGGACAAGTCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143803572	143839535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_143803764_143808680_143808840_143810568_143810703_143812477_143812516_143814393_143814494_143816252_143816334_143818970_143819071_143820790_143820849_143821473_143821799_143823667_143823780_143826213_143826315_143833982_143834095_143834292_143834376_143835831_143836066_143838602
tx.15214	chr5	+	1221	3	ISM	ENSMUSG00000029613.16	ENSMUST00000100487.6	4325	15	30769	1544	30610	-1544	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_2	15.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATATGGTACTTTATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143834311	143839525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_143834376_143835831_143836066_143838602
tx.15215	chr5	-	692	2	ISM	ENSMUSG00000029610.14	ENSMUST00000031613.11	1185	4	5070	0	5015	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	571	junction_1	0	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGTTTATTTTATTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143841587	143839521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_143840009_143841382
tx.15216	chr5	-	1166	4	FSM	ENSMUSG00000029610.14	ENSMUST00000031613.11	1185	4	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	560	junction_3	88.5023540176569	437	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGTTTATTTTATTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143846638	143839521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_143840009_143841382_143841615_143843366_143843574_143846398
tx.15217	chr5	-	1048	4	FSM	ENSMUSG00000029610.14	ENSMUST00000100483.3	1073	4	25	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_3	226.993881464286	210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGTTTATTTTATTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143846640	143839521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_143840009_143841382_143841615_143843366_143843574_143846518
tx.15218	chr5	+	925	4	FSM	ENSMUSG00000079109.12	ENSMUST00000154781.8	955	4	-19	49	2	-49	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	13.490737563232	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGGATGCTTTGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143846823	143851060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_143846898_143848738_143848879_143850219_143850307_143850436
tx.15219	chr5	+	1502	5	ISM	ENSMUSG00000079109.12	ENSMUST00000148011.8	5482	15	15467	2533	5852	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_2	11.6081867662439	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCTTTTTACCATGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143862248	143868253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_143862892_143864916_143865085_143865759_143865861_143865998_143866169_143867833
tx.1522	chr10	-	737	2	FSM	ENSMUSG00000047146.18	ENSMUST00000227494.2	553	2	120	-304	120	304	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTCAGTCCCCAGCCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62728645	62715347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_62715913_62728473
tx.15220	chr5	-	1802	15	FSM	ENSMUSG00000029617.11	ENSMUST00000031621.11	1769	15	-35	2	-11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	726	junction_9	71.895615943093	316	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGGTTTCCTGTTGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143951706	143924728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_143925068_143927455_143927584_143928289_143928449_143929326_143929445_143930043_143930078_143934980_143935093_143935361_143935424_143938194_143938277_143940860_143941037_143946020_143946105_143947848_143947897_143948269_143948348_143949620_143949715_143949811_143949910_143951516
tx.15221	chr5	-	940	2	FSM	ENSMUSG00000066621.13	ENSMUST00000136018.2	493	2	-22	-425	-22	425	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAATCTAAGGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144160398	144154712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_144155567_144160312
tx.15222	chr5	-	412	2	NNC	ENSMUSG00000087484.2	novel	2475	2	NA	NA	216	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATCTATTTATGAATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144192780	144178597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_144178901_144192671
tx.15223	chr5	+	619	3	FSM	ENSMUSG00000047843.17	ENSMUST00000056578.7	955	3	157	179	157	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	246	junction_1	16.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTAGCTTGTTCTGCTC	1786	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144192200	144201205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_144192330_144192619_144192723_144200818
tx.15225	chr5	+	508	2	Intergenic	novelGene_1159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGCAGTTTGCTGGGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144532273	144533196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_144532508_144532922
tx.15226	chr5	+	1070	2	Intergenic	novelGene_1161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGCTGTTGCTTTTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144616012	144640718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_144616659_144640294
tx.15227	chr5	-	481	2	ISM	ENSMUSG00000043388.9	ENSMUST00000061446.8	2805	8	35	19279	35	-2906	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTCTTGTTTATCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144698424	144692003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_144692327_144698266
tx.15228	chr5	-	540	3	ISM	ENSMUSG00000038780.15	ENSMUST00000110677.8	5420	19	84120	2609	4757	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	180	junction_2	28.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCCTTGGCACGGTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144818529	144815913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_144816267_144817434_144817520_144818427
tx.15229	chr5	+	1606	10	FSM	ENSMUSG00000029621.15	ENSMUST00000031625.15	1632	10	26	0	26	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	332	junction_5	31.8084545015595	1546	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTTTTTCTTTATACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145020665	145045571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_145020783_145027962_145028057_145029267_145029373_145032861_145033085_145034025_145034134_145037866_145038080_145041251_145041328_145041507_145041702_145043854_145043946_145045186
tx.15230	chr5	+	1543	10	FSM	ENSMUSG00000029622.17	ENSMUST00000085679.13	3105	10	41	1521	-2	90	multi-exon	FALSE	canonical	3	1600	junction_4	137.116333413962	4868	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATGTGAGCCGGGCGTGGT	8073	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145051065	145064988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_145051152_145058466_145058550_145059341_145059447_145060378_145060602_145061396_145061505_145062387_145062595_145062700_145062777_145063536_145063743_145064445_145064537_145064630
tx.15231	chr5	-	1272	6	FSM	ENSMUSG00000029623.15	ENSMUST00000031627.9	2353	6	196	885	-44	430	multi-exon	FALSE	canonical	3	415	junction_5	28.7708185493566	4959	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTGTTTGGCAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145076852	145066463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_145067186_145068174_145068327_145069668_145069791_145071874_145071983_145073711_145073804_145076776
tx.15232	chr5	+	849	6	FSM	ENSMUSG00000038722.18	ENSMUST00000162594.8	867	6	14	4	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	705	junction_1	67.372397908936	2909	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACATTCTTTCTTTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145077185	145084884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_145077253_145078114_145078247_145079257_145079378_145081708_145081832_145083252_145083420_145084644
tx.15233	chr5	+	1699	8	FSM	ENSMUSG00000029625.17	ENSMUST00000160629.8	1713	8	14	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	267	junction_6	186.36939400129	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTGTTTCATTACTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145104036	145118851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_145104270_145107324_145107376_145110116_145110270_145112366_145112463_145112920_145113015_145114039_145114113_145115645_145115739_145117945
tx.15234	chr5	+	1701	8	FSM	ENSMUSG00000029625.17	ENSMUST00000162244.8	1387	8	-26	-288	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	381	junction_6	148.975001327096	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTGTTTCATTACTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145104037	145118851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_145104270_145107324_145107376_145110116_145110270_145112366_145112463_145112920_145113015_145114039_145114113_145115642_145115739_145117945
tx.15235	chr5	+	331	2	NNC	ENSMUSG00000029625.17	novel	1606	7	NA	NA	4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTGTTTCATTACTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145104037	145118851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_145104103_145118585
tx.15236	chr5	+	1783	8	FSM	ENSMUSG00000029625.17	ENSMUST00000160422.8	1756	8	-26	-1	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_6	266.097419631784	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTGTTTCATTACTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145104030	145118851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_145104270_145107324_145107376_145110116_145110270_145112366_145112463_145112920_145113015_145114039_145114113_145115567_145115739_145117945
tx.15237	chr5	-	390	3	ISM	ENSMUSG00000038690.16	ENSMUST00000162360.8	607	5	4358	-2	4277	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5440	junction_1	441	9663	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTGCCTGGTGTAGTCA	8910	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145124044	145120513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_145120678_145121341_145121459_145123935
tx.15238	chr5	-	440	4	FSM	ENSMUSG00000038690.16	ENSMUST00000161741.8	955	4	509	6	-25	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	4948	junction_3	568.415341101909	40642	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTGCCTGGTGTAGTCA	8606	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145128363	145120513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_145120678_145121341_145121459_145123935_145124044_145128312
tx.15239	chr5	+	1897	2	ISM	ENSMUSG00000055991.16	ENSMUST00000031601.8	3469	4	14017	0	10117	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGACTTGAGGTTTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145155494	145158560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_145155694_145156862
tx.15240	chr5	+	1275	5	FSM	ENSMUSG00000007812.17	ENSMUST00000200039.5	1765	5	16	474	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_3	167.334059593377	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGTGTACTTTTTGTAG	1307	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145168540	145174658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_145168642_145170250_145170413_145172115_145172202_145172546_145172674_145173859
tx.15241	chr5	+	4092	4	FSM	ENSMUSG00000007812.17	ENSMUST00000167316.8	4104	4	8	4	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	281	junction_2	68.241401574769	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTCGTAGACTCTTTGTTT	1307	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145168540	145184108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_145168642_145170250_145170413_145179729_145179835_145180384
tx.15242	chr5	+	1197	4	FSM	ENSMUSG00000007812.17	ENSMUST00000085661.9	597	4	-25	-575	3	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	194.635271440941	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACTTTTTGTAGTAAAGAAAT	1308	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145168541	145174667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_145168642_145170250_145170413_145172546_145172674_145173859
tx.15243	chr5	+	2843	6	NNC	ENSMUSG00000070420.5	novel	1796	5	NA	NA	41	960	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	40	junction_2	6.67532770731145	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTAGTAACTTTCCTGTAA	2814	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145217350	145229048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_145217438_145220161_145220591_145223117_145223320_145224117_145224210_145225103_145225228_145227139
tx.15244	chr5	-	3326	5	FSM	ENSMUSG00000029634.16	ENSMUST00000161859.8	3452	5	118	8	-19	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_4	27.6348964173923	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTAAAGACTGTGTGCAAA	2299	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146158247	146146009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_146148743_146152906_146153003_146154710_146154907_146157211_146157295_146158029
tx.15245	chr5	+	2606	13	NIC	ENSMUSG00000029635.16	novel	2973	13	NA	NA	-65	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_1	32.5016025245936	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATGTATGGTGTCAACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146167974	146239680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_146168145_146196314_146196391_146205024_146205136_146208404_146208546_146220438_146220497_146222917_146223050_146229433_146229578_146231972_146232043_146233168_146233242_146235612_146235711_146236307_146236387_146236501_146236661_146238385
tx.15246	chr5	+	1537	3	ISM	ENSMUSG00000029635.16	ENSMUST00000159615.2	1976	6	4588	-55	3133	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_1	10.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATGGTGTCAACTATATT	4748	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146236307	146239684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_146236387_146236501_146236661_146238385
tx.15247	chr5	+	1830	10	FSM	ENSMUSG00000029636.12	ENSMUST00000016143.9	5196	10	282	3084	282	2275	multi-exon	TRUE	canonical	3	97	junction_1	19.5037191768236	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTGAGTATTTACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146322076	146407341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_146322149_146358727_146358816_146372134_146372278_146388680_146388816_146390125_146390280_146392353_146392472_146397774_146397951_146403607_146403875_146405024_146405390_146407029
tx.15248	chr5	+	631	4	ISM	ENSMUSG00000029636.12	ENSMUST00000016143.9	5196	10	283	21416	283	-16057	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_1	24.4994331000173	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCATAGTCATGCTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146322077	146389009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_146322149_146358727_146358816_146372134_146372278_146388680
tx.15249	chr5	+	778	6	FSM	ENSMUSG00000041453.13	ENSMUST00000035983.12	1856	6	32	1046	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6955	junction_1	2705.44403749181	1673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTTTTCCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146769731	146772796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_146769982_146770993_146771073_146771257_146771320_146771801_146771915_146772373_146772525_146772673
tx.15250	chr5	+	1099	6	FSM	ENSMUSG00000041453.13	ENSMUST00000099272.3	1067	6	-32	0	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_1	5077.72757835629	614	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTTTTCCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146769979	146772796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_146770551_146770993_146771073_146771257_146771320_146771801_146771915_146772373_146772525_146772673
tx.15251	chr2	+	213	1	FSM	ENSMUSG00000084383.2	ENSMUST00000121309.2	483	1	303	-33	303	33	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	967	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24876298	24876511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_24876300_24876500
tx.15252	chr5	-	223	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041453.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTTTGAGTGCTTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146772815	146772434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_146772513_146772670
tx.15253	chr5	-	210	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041453.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTTTGAGTGCTTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146772796	146772434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_146772532_146772683
tx.15254	chr5	+	1091	4	FSM	ENSMUSG00000029641.9	ENSMUST00000031646.8	1126	4	36	-1	36	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.816496580927726	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTGTTTTCTGAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146781916	146784537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_146782151_146782469_146782527_146782649_146782730_146783817
tx.15255	chr5	+	1263	9	FSM	ENSMUSG00000016503.19	ENSMUST00000146511.8	1298	9	28	7	-13	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	398	junction_8	56.9906790624572	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCGACTCTTTGCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146885494	146892417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_146885786_146887342_146887444_146887996_146888094_146888683_146888773_146889536_146889611_146890036_146890118_146890657_146890888_146891933_146891994_146892177
tx.15256	chr5	+	1440	8	FSM	ENSMUSG00000016503.19	ENSMUST00000132102.2	1426	8	-13	-1	-6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	430	junction_2	50.1141553997328	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCGACTCTTTGCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146885501	146892417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_146885786_146887342_146887444_146887996_146888094_146888683_146888773_146889536_146889611_146890036_146890118_146890657_146890888_146891933
tx.15257	chr5	-	1499	3	ISM	ENSMUSG00000016510.12	ENSMUST00000110564.8	1257	5	4471	-438	4465	-409	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_2	5	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGTAGTGAATCTGAC	1008	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146896088	146891738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_146892626_146893596_146893755_146895634
tx.15258	chr5	-	1572	4	FSM	ENSMUSG00000016510.12	ENSMUST00000066675.10	4927	4	-1	3356	-1	-409	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_3	27.6445694888204	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGTAGTGAATCTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146900596	146891738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_146892626_146893596_146893755_146895634_146896087_146900521
tx.15259	chr5	-	1572	4	FSM	ENSMUSG00000016510.12	ENSMUST00000110566.2	1134	4	0	-438	0	-409	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_3	16.996731711976	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGTAGTGAATCTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146900607	146891738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_146892626_146893596_146893755_146895634_146896087_146900532
tx.15260	chr5	+	690	2	FSM	ENSMUSG00000029642.12	ENSMUST00000050970.4	1196	2	506	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	451	junction_1	0	4462	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGAGTGGTTTCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147014365	147015896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_147014504_147015344
tx.15261	chr5	+	925	3	FSM	ENSMUSG00000029642.12	ENSMUST00000110557.5	1137	3	210	2	-8	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	400	junction_1	26.5	2102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGCTTTCCTCTTTTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147014365	147048169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_147014504_147038038_147038114_147047457
tx.15262	chr5	+	1263	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000107037.2_ENSMUSG00000057157.4	novel	460	1	NA	NA	-47	47	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGGTGGAAAGGGAAGG	2587	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147345744	147347236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_+_147346467_147346695
tx.15263	chr5	+	1086	3	FSM	ENSMUSG00000106820.2	ENSMUST00000201128.2	1081	3	-2	-3	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	30.5	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTTGTCTTGGTCATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147355408	147359857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_147355512_147357439_147357607_147359041
tx.15264	chr5	+	741	6	FSM	ENSMUSG00000029649.11	ENSMUST00000031654.10	1579	6	164	674	-3	171	multi-exon	FALSE	canonical	3	2983	junction_1	193.876661823954	14980	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATGTGTGTGGTTGGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147797434	147812592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_147797502_147799362_147799461_147805532_147805594_147806221_147806324_147809375_147809470_147812273
tx.15265	chr5	+	675	5	ISM	ENSMUSG00000029649.11	ENSMUST00000031654.10	1579	6	2091	674	1899	171	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3006	junction_2	190.255584674931	1383	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATGTGTGTGGTTGGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147799361	147812592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_147799461_147805532_147805594_147806221_147806324_147809375_147809470_147812273
tx.15266	chr5	-	1038	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029651.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	9.53356643071673	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGTAGTATACTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147943811	147941084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_147941718_147942673_147942827_147943327_147943469_147943700
tx.15267	chr5	-	1287	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029651.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	4.55521678957215	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGTAGTATACTCTTTC	8580	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147949153	147941084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_147941718_147942673_147942827_147943327_147943469_147943860_147944081_147949013
tx.15268	chr5	-	1193	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029651.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	8.86002257333467	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGTAGTATACTCTTTC	8595	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147949138	147941084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_147941718_147943327_147943469_147943860_147944081_147945259_147945334_147949013
tx.15269	chr5	+	751	4	FSM	ENSMUSG00000029651.17	ENSMUST00000085554.5	1009	4	9	249	9	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	28.87136220471	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTTAGTATAGTGAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148239992	148250561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_148240080_148240292_148240413_148243439_148243538_148250115
tx.1527	chr10	-	729	5	ISM	ENSMUSG00000020069.17	ENSMUST00000140743.8	1633	9	6882	-3	749	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	471	junction_3	17.2825779327044	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATGTTGCTACTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62853114	62851203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_62851494_62851580_62851674_62851858_62851955_62852185_62852322_62853000
tx.15270	chr5	+	843	4	FSM	ENSMUSG00000029651.17	ENSMUST00000152105.8	585	4	32	-290	23	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	27.4752413799932	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTTTTAGTATAGTGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148240006	148250560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_148240187_148240292_148240413_148243439_148243538_148250115
tx.15271	chr5	+	935	3	ISM	ENSMUSG00000029651.17	ENSMUST00000071878.12	1211	7	37918	-11	32	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_2	5.5	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATGTTTTAGTATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148240015	148250555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_148240413_148243439_148243538_148250115
tx.15273	chr5	-	463	3	ISM	ENSMUSG00000041313.15	ENSMUST00000048116.15	7179	13	38	24805	38	-62	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	442	junction_2	19.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCGCCTCCGTGCTGGCCG	5456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148336676	148289024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_148289260_148301971_148302062_148336538
tx.15274	chr5	-	2017	4	ISM	ENSMUSG00000001687.16	ENSMUST00000201688.4	551	5	25391	-1336	25391	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	361	junction_2	19.131126469709	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTAGTGCATTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148449009	148441451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_148442998_148443255_148443334_148446078_148446166_148448703
tx.15275	chr5	-	2344	5	FSM	ENSMUSG00000001687.16	ENSMUST00000079324.14	2537	5	186	7	186	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	361	junction_2	34.1641259217911	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTAGTGCATTTTGTTG	94	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148489286	148441451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_148442998_148443255_148443334_148446078_148446166_148448703_148448813_148488762
tx.15276	chr5	+	598	2	FSM	ENSMUSG00000086494.2	ENSMUST00000150265.2	550	2	-44	-4	-44	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATCTACCCTTTGACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148678605	148679953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_148678795_148679544
tx.15277	chr5	+	562	2	NNC	ENSMUSG00000086494.2	novel	550	2	NA	NA	-44	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	105	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATCTACCCTTTGACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148678605	148679953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_148678795_148679580
tx.15278	chr5	-	353	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085740.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAATGCAGCTCAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148727342	148708641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_148708728_148708825_148708974_148727223
tx.15279	chr5	-	595	2	Intergenic	novelGene_1165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTTGTCTGGAAGCAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148732056	148731115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_148731612_148731957
tx.15280	chr5	-	512	2	Intergenic	novelGene_1166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGCTCTTGGCAGAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148806311	148804956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_148805297_148806139
tx.15281	chr5	-	1692	11	FSM	ENSMUSG00000041298.16	ENSMUST00000047257.15	6157	11	-3	4468	-3	-369	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3.86781592116274	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAGGAATCTTCACTTGA	2440	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148865460	148812861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_148813147_148815667_148815795_148825688_148825824_148828438_148828566_148829319_148829479_148830492_148830599_148830958_148831087_148841376_148841540_148855405_148855567_148858046_148858223_148865335
tx.15282	chr5	-	590	2	FSM	ENSMUSG00000108207.3	ENSMUST00000204570.2	690	2	106	-6	82	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTCTGTATCATACGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148896408	148895401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_148895541_148895957
tx.15283	chr5	-	443	3	NNC	ENSMUSG00000108207.3	novel	546	5	NA	NA	79	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	6.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTCTGTATCATACGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148896411	148895401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_148895541_148895957_148896021_148896170
tx.15284	chr5	-	263	2	NNC	ENSMUSG00000106951.2	novel	3994	2	NA	NA	-3	5592	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCACGCTTGCTGTTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148932028	148921273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_148921436_148931927
tx.15285	chr5	-	356	2	FSM	ENSMUSG00000106951.2	ENSMUST00000152575.2	2541	2	-3	2188	-3	-2188	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAACAAAAACAACAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148932028	148930079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_148930335_148931927
tx.15286	chr5	-	1317	5	FSM	ENSMUSG00000066551.13	ENSMUST00000085546.13	2838	5	-5	1526	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5649	junction_4	1171.94720444225	4452	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTGTTGTCCTTTTCATA	6759	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148989855	148985037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_148985724_148986536_148986712_148987104_148987251_148987397_148987562_148989709
tx.15287	chr5	+	483	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000066551.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTGTCATAATCTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149049526	149052008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_149049602_149051600
tx.15288	chr5	-	939	2	NNC	ENSMUSG00000097191.3	novel	1740	4	NA	NA	-204	-61129	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTGAATCTCTGTGTGTC	6651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149121077	149117507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_149118217_149120847
tx.15289	chr5	+	659	4	ISM	ENSMUSG00000041264.17	ENSMUST00000100410.10	3148	10	1	21371	0	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_1	85.0215658916411	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAAGCTTCCCAGATACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149121476	149130870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_149121617_149124517_149124687_149125154_149125284_149130649
tx.15290	chr5	+	696	3	ISM	ENSMUSG00000041264.17	ENSMUST00000117878.8	2931	9	-49	21167	0	-61	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	149	junction_1	119.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGGCCCTGTGCTGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149121476	149131076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_149121617_149125154_149125284_149130649
tx.15291	chr5	+	2981	9	FSM	ENSMUSG00000041264.17	ENSMUST00000117878.8	2931	9	-49	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_8	110.241141934398	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTGGTTTCATTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149121476	149152244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_149121617_149125154_149125284_149130649_149131251_149135454_149135569_149138569_149138700_149141078_149141205_149146452_149146611_149150161_149150333_149150832
tx.15292	chr5	+	3649	9	FSM	ENSMUSG00000041264.17	ENSMUST00000050472.16	3757	9	107	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	191	junction_1	75.8798392196504	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTTGGTTTCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149121476	149152243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_149121617_149124517_149124687_149125154_149125284_149130649_149131251_149135454_149135569_149138569_149138700_149141078_149141205_149146452_149146611_149150161
tx.15293	chr5	+	3479	8	FSM	ENSMUSG00000041264.17	ENSMUST00000121416.8	3792	8	319	-6	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_1	82.9762690441658	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTGGTTTCATTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149121478	149152244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_149121617_149125154_149125284_149130649_149131251_149135454_149135569_149138569_149138700_149141078_149141205_149146452_149146611_149150161
tx.15294	chr5	+	1047	5	FSM	ENSMUSG00000060063.10	ENSMUST00000071130.5	1251	5	194	10	194	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	7.22841614740048	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTAACGTCTTCAAGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149201770	149224953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_149201993_149209190_149209291_149215985_149216057_149222153_149222236_149224381
tx.15295	chr5	+	726	3	ISM	ENSMUSG00000060063.10	ENSMUST00000200806.4	452	5	13828	-416	164	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	4.5	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTAACGTCTTCAAGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149215984	149224953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_149216057_149222153_149222236_149224381
tx.15296	chr5	+	614	2	Intergenic	novelGene_1168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACAATGGTAAGGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149286356	149288335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_149286776_149288140
tx.15298	chr5	+	682	2	NNC	ENSMUSG00000029658.18	novel	2482	23	NA	NA	28330	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_1	0	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGATTCTCGCTGTTCTTT	4903	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149533572	149535363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_149533852_149534960
tx.15299	chr5	-	1386	5	ISM	ENSMUSG00000029657.16	ENSMUST00000074846.14	3240	17	16205	-2	-831	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1387	junction_2	74.1805230501916	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGGCTTTGTCTCCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149543469	149540307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_149541176_149541851_149542014_149542210_149542331_149542425_149542534_149543341
tx.153	chr1	-	606	3	NNC	ENSMUSG00000026112.8	novel	3863	3	NA	NA	-48	-3234	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	192	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTCGATCAGATTACACA	6327	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37469129	37459398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_37459741_37467422_37467507_37468949
tx.1530	chr10	-	1447	10	FSM	ENSMUSG00000020069.17	ENSMUST00000020263.14	2213	10	5	761	5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	275	junction_6	80.8621750760186	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATGTTGCTACTTTTTAT	5786	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62859668	62851203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_62851494_62851580_62851674_62851858_62851955_62852185_62852322_62853000_62853117_62853302_62853390_62853819_62854005_62854538_62854678_62855171_62855307_62859498
tx.15300	chr5	-	3450	18	FSM	ENSMUSG00000029657.16	ENSMUST00000202361.4	3802	18	53	299	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1194	junction_12	107.653101726883	249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGGCTTTGTCTCCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149559750	149540307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_149541176_149541851_149542014_149542210_149542331_149542425_149542534_149543341_149543468_149544010_149544149_149546929_149547062_149548433_149548643_149550719_149550854_149551000_149551108_149552665_149552895_149553251_149553497_149553803_149553938_149554224_149554325_149554851_149554975_149555498_149555640_149557294_149557353_149559434
tx.15301	chr5	+	818	2	NNC	ENSMUSG00000106674.2	novel	299	2	NA	NA	-23	-3350	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTAGTGTGTTTTCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149565051	149567905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_149565217_149567252
tx.15302	chr5	+	1380	2	FSM	ENSMUSG00000106674.2	ENSMUST00000202583.2	299	2	-8	-1073	-8	1073	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACTGTTTGAGTCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149565066	149572328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_149565217_149571098
tx.15303	chr5	-	483	2	Intergenic	novelGene_1169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCTCAATTCCACAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149572451	149571328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_149571694_149572333
tx.15304	chr5	+	1946	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000080002.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACACGGGAGTTGGTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149578338	149585895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_149578509_149584119
tx.15305	chr5	+	1077	11	NNC	ENSMUSG00000051950.11	novel	4570	15	NA	NA	13	-9935	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	47	junction_10	165.154503420282	87	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAAATGAGTGTTTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149601707	149664665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_149601845_149619889_149619940_149626743_149626784_149632784_149632895_149648875_149648953_149650218_149650331_149653388_149653526_149656137_149656202_149658834_149658955_149662996_149663067_149664505
tx.15306	chr5	+	1842	15	FSM	ENSMUSG00000051950.11	ENSMUST00000100404.6	4570	15	13	2715	13	-723	multi-exon	FALSE	canonical	3	479	junction_13	51.6933659344471	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTGTTTTCTCCATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149601707	149683349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_149601845_149619889_149619940_149626743_149626784_149632784_149632895_149648875_149648953_149650218_149650331_149653388_149653526_149656137_149656202_149658834_149658955_149662996_149663067_149668890_149669005_149669969_149670070_149673895_149674016_149677529_149677675_149682903
tx.15307	chr5	+	591	2	FSM	ENSMUSG00000051950.11	ENSMUST00000201088.2	1437	2	122	724	122	-724	multi-exon	FALSE	canonical	3	529	junction_1	0	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTCTGTTTTCTCCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149677528	149683348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_149677675_149682903
tx.15308	chr5	-	441	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000053368.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGGTGCGGTTTTCTCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149985614	149984720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_149984981_149985101_149985205_149985536
tx.15309	chr5	+	1180	7	NIC	ENSMUSG00000056602.14	novel	592	4	NA	NA	-41	425	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_5	2.26691175145591	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTTTCTCTCTTCTCAAA	1234	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150119889	150269814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_150120201_150233734_150233935_150249595_150249650_150263817_150263958_150269017_150269109_150269315_150269396_150269510
tx.15310	chr5	+	393	2	Intergenic	novelGene_1170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCCTTGTTTGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150176672	150177807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_150176923_150177664
tx.15311	chr5	+	931	4	ISM	ENSMUSG00000041147.11	ENSMUST00000202975.4	2534	8	-30	5605	-28	-1031	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_1	8.9566858950296	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTCTTGCATGTGTTTAT	342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150446066	150454836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_150446362_150446639_150446745_150452934_150453163_150454533
tx.15312	chr5	+	2051	10	ISM	ENSMUSG00000041147.11	ENSMUST00000202313.2	10517	27	-30	32756	-16	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_1	8.45175122477183	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTTATTTACTCTGTAA	354	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150446078	150460456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_150446362_150446639_150446745_150452934_150453163_150454533_150454643_150455148_150455199_150455519_150455561_150455755_150455868_150458057_150458108_150458903_150459016_150459495
tx.15313	chr5	+	1230	3	ISM	ENSMUSG00000041147.11	ENSMUST00000202975.4	2534	8	-16	6663	-14	473	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_1	9.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTCTGTAACATTTATTAC	356	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150446080	150453778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_150446362_150446639_150446745_150452934
tx.15314	chr5	+	965	3	FSM	ENSMUSG00000041147.11	ENSMUST00000200686.4	937	3	-7	-21	-7	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	32.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGTTCACCATAGATTTA	363	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150446087	150453326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_150446556_150446639_150446745_150452934
tx.15315	chr5	-	1908	5	FSM	ENSMUSG00000041132.12	ENSMUST00000016279.11	1905	5	-2	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGGGTTTTCCATTGAAT	4561	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150517992	150495107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_150496458_150497464_150497542_150499714_150499804_150500104_150500233_150517728
tx.15316	chr5	-	1343	3	FSM	ENSMUSG00000041132.12	ENSMUST00000200840.2	1371	3	28	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	1.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATATGTCTTGTCTTTCAA	4588	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150517965	150515216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_150516025_150516604_150516903_150517728
tx.15317	chr5	-	1995	6	FSM	ENSMUSG00000029655.18	ENSMUST00000118316.8	8982	6	12	6975	12	53	multi-exon	FALSE	canonical	3	228	junction_5	18.6010752377383	307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGTTTTTATAATCTTTT	5449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150589065	150566411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_150566781_150570465_150570543_150570924_150571014_150574079_150574205_150584743_150585979_150588965
tx.15318	chr5	-	1206	5	ISM	ENSMUSG00000029655.18	ENSMUST00000118316.8	8982	6	3784	6979	-341	49	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	244	junction_2	15.8902485820707	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAATGTTTTTATAATC	9221	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150585293	150566415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_150566781_150570465_150570543_150570924_150571014_150574079_150574205_150584743
tx.15319	chr5	-	561	2	ISM	ENSMUSG00000029655.18	ENSMUST00000144378.2	3842	3	-14	13834	-14	373	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	228	junction_1	0	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGAAATCTAACTCCAAAA	5458	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150589056	150585508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_150585979_150588965
tx.15320	chr5	+	1260	8	NNC	ENSMUSG00000034021.16	novel	6598	35	NA	NA	18	-18584	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	78.5483082866453	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAGGATTAATGCTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150597309	150653494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_150597419_150639867_150639995_150643287_150643496_150645759_150645847_150645942_150646041_150646709_150646837_150652358_150652440_150653071
tx.15321	chr5	+	1396	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000107047.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCTATGAATTGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150794571	150807147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_150794665_150798972_150799086_150805957
tx.15322	chr5	+	1379	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000107047.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCTATGAATTGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150794578	150807147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_150794665_150798972_150799120_150806001
tx.15323	chr5	-	426	3	FSM	ENSMUSG00000033970.16	ENSMUST00000156667.2	503	3	81	-4	81	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	280	junction_1	34	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTGTGTTTGTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151568146	151566281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_151566569_151567175_151567246_151568077
tx.15324	chr5	-	1222	9	FSM	ENSMUSG00000033970.16	ENSMUST00000038131.10	1317	9	34	61	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	280	junction_1	24.5098832106561	1194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTGTGTTTGTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151574673	151566281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_151566569_151567175_151567246_151568077_151568177_151568254_151568392_151568982_151569165_151570903_151571002_151571709_151571778_151573336_151573475_151574530
tx.15325	chr6	+	1288	3	Intergenic	novelGene_1222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGGCTTAGGGCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3183224	3198510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_3183315_3196933_3197164_3197542
tx.15326	chr6	-	381	2	Intergenic	novelGene_1223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCGGTTTGTTGCATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3434543	3404756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_3405056_3434461
tx.15327	chr6	+	3545	28	NNC	ENSMUSG00000001376.18	novel	3788	28	NA	NA	9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_25	34.8382505832842	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGTGTGTGAGACTACTA	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3498412	3603315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_3498556_3504868_3504938_3516621_3516745_3517788_3517861_3519216_3519271_3520206_3520278_3522255_3522374_3522682_3522719_3524092_3524176_3532157_3532201_3533471_3533571_3536831_3536973_3545509_3545643_3551012_3551105_3554995_3555091_3555367_3555467_3562267_3562359_3565515_3565693_3567734_3567854_3571001_3571109_3578793_3578916_3588005_3588087_3592426_3592576_3594017_3594115_3594742_3594906_3598471_3598594_3600127_3600318_3602659
tx.15328	chr6	+	3077	4	ISM	ENSMUSG00000001376.18	ENSMUST00000184780.8	1587	6	-21	823	1	-823	intron_retention	FALSE	canonical	3	151	junction_1	11.8977121983832	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCGCCTTTAATTCCAGCAT	-15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3498404	3520522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_3498556_3504868_3504938_3516621_3516745_3517788
tx.15329	chr6	+	936	6	FSM	ENSMUSG00000001376.18	ENSMUST00000184780.8	1587	6	-18	669	4	-669	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_1	10.4575331699211	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAGAAAAGAAAAG	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3498407	3520676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_3498556_3504868_3504938_3516621_3516745_3517788_3517861_3519216_3519271_3520206
tx.15330	chr6	+	814	2	ISM	ENSMUSG00000001376.18	ENSMUST00000183532.8	1786	10	29466	0	6142	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGTGTGTGAGACTACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3600159	3603315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_3600318_3602659
tx.15331	chr6	+	466	2	Intergenic	novelGene_1224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGGTTGTCTGTGTGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3806081	3807425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_3806127_3807004
tx.15332	chr6	-	1466	4	FSM	ENSMUSG00000032757.7	ENSMUST00000049166.5	1516	4	30	20	-12	-20	multi-exon	FALSE	canonical	3	308	junction_1	40.3016404408335	1541	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTTTATAACTTCCTTAA	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4086942	4076918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_4078037_4079960_4080018_4082457_4082583_4086776
tx.15333	chr6	-	562	3	NNC	ENSMUSG00000004631.16	novel	1696	11	NA	NA	26929	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	13	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGGTAAAATTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4685099	4674349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_4674633_4678066_4678111_4684864
tx.15334	chr6	-	1626	11	FSM	ENSMUSG00000004631.16	ENSMUST00000115579.8	1696	11	70	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	4.92848861214064	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGGTAAAATTTCTTTC	9938	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4747134	4674349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_4674633_4678066_4678111_4689578_4689768_4690468_4690496_4691428_4691641_4694021_4694185_4707073_4707273_4711307_4711381_4717920_4718079_4719373_4719497_4746979
tx.15335	chr6	+	1289	2	FSM	ENSMUSG00000092035.9	ENSMUST00000176204.8	6667	2	-17	5395	-17	-5392	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAAAGCCCGATCCTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4747288	4755122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_4747579_4754123
tx.15336	chr6	-	844	7	NIC	ENSMUSG00000029759.10	novel	1837	9	NA	NA	-7	-656	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_4	15.5715195861619	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGGAACTGTAATTATTTAC	10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	5256242	5221507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_5221723_5230400_5230530_5230748_5230831_5232323_5232525_5246277_5246334_5254515_5254587_5256152
tx.15337	chr6	-	595	5	NNC	ENSMUSG00000029759.10	novel	606	2	NA	NA	-1	-3027	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	9	junction_1	14.497844667398	43	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGGTATCTGAATAGATA	18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	5256234	5239902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_5240123_5240812_5240979_5246277_5246334_5254515_5254587_5256152
tx.15338	chr6	-	1849	9	FSM	ENSMUSG00000032667.18	ENSMUST00000057792.9	2409	9	83	477	-42	-477	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_7	2.57087047515039	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTATTTGTTTGTTTGTTTA	97	False	5298402	NA	False	NA	NA	NA	5298372	5264623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_5265480_5266111_5266241_5266964_5267047_5268977_5269179_5272324_5272452_5273000_5273167_5277871_5277928_5289012_5289084_5298211
tx.15339	chr6	-	1319	6	ISM	ENSMUSG00000032667.18	ENSMUST00000057792.9	2409	9	104	4273	-21	1753	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	9	junction_4	2.03960780543711	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTCTCCTTATTTTTATG	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	5298351	5268419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_5269179_5272324_5272452_5273000_5273167_5277871_5277928_5289012_5289084_5298211
tx.15340	chr6	-	1506	4	ISM	ENSMUSG00000015112.16	ENSMUST00000015256.15	3067	18	164213	0	42298	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	629	junction_2	35.1883819210577	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGATTGCTTGCTCTTGTGT	3344	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6052905	6041217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_6042333_6042558_6042650_6042740_6042900_6052764
tx.15341	chr6	-	3080	18	NNC	ENSMUSG00000015112.16	novel	3067	18	NA	NA	-16	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	590	junction_13	48.4240210344906	171	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGATTGCTTGCTCTTGTGT	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6217134	6041217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_6042333_6042558_6042650_6042740_6042900_6052764_6052904_6073401_6073543_6095146_6095228_6096669_6096723_6109180_6109340_6109936_6110022_6113937_6114023_6114224_6114319_6114969_6115109_6117098_6117246_6131628_6131769_6152407_6152524_6180970_6181114_6191263_6191318_6216995
tx.15342	chr6	-	3071	18	FSM	ENSMUSG00000015112.16	ENSMUST00000015256.15	3067	18	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_9	125.074538329783	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGATTGCTTGCTCTTGTGT	16	False	6217138	NA	False	NA	NA	NA	6217122	6041217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_6042333_6042558_6042650_6042740_6042900_6052764_6052904_6073401_6073543_6095146_6095228_6096669_6096723_6109180_6109340_6109936_6110025_6113937_6114023_6114224_6114319_6114969_6115109_6117098_6117246_6131628_6131769_6152407_6152524_6180970_6181114_6191263_6191318_6216995
tx.15343	chr6	-	2198	15	NNC	ENSMUSG00000015112.16	novel	616	4	NA	NA	20	170	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	178.774698593349	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATGTGTTATTGTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6217153	6068096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_6068700_6073401_6073543_6095146_6095228_6096669_6096723_6109180_6109340_6109936_6110022_6113937_6114023_6114224_6114319_6114969_6115109_6117098_6117246_6131628_6131769_6152407_6152524_6180970_6181114_6191263_6191318_6216995
tx.15344	chr6	-	818	6	ISM	ENSMUSG00000015112.16	ENSMUST00000015256.15	3067	18	-2	75788	-2	-2018	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	590	junction_1	45.2972405340546	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACGTGATCATGTATATTA	18	False	6217138	NA	False	NA	NA	NA	6217120	6117005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_6117246_6131628_6131769_6152407_6152524_6180970_6181114_6191263_6191318_6216995
tx.15345	chr6	-	702	4	NIC	ENSMUSG00000015112.16	novel	3121	18	NA	NA	-25	83	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	53	junction_2	302.659324433705	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAAGTCTC	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6217143	6131384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_6131769_6152407_6152524_6191263_6191318_6216995
tx.15346	chr6	-	838	5	ISM	ENSMUSG00000015112.16	ENSMUST00000015256.15	3067	18	-17	90166	-17	84	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	691	junction_4	11.0792599030802	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTCTCT	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6217135	6131383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_6131769_6152407_6152524_6180970_6181114_6191263_6191318_6216995
tx.15347	chr6	-	342	3	ISM	ENSMUSG00000015112.16	ENSMUST00000015256.15	3067	18	-20	139751	-20	-49501	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	691	junction_2	1	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGTACTTCTAAATACCT	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6217138	6180968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_6181114_6191263_6191318_6216995
tx.15348	chr6	-	459	3	FSM	ENSMUSG00000042541.11	ENSMUST00000041111.10	1472	3	19	994	19	-994	multi-exon	FALSE	canonical	3	3186	junction_2	110.5	22896	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTTGGTTCAGATGTCT	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6578639	6558287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_6558492_6560407_6560502_6578478
tx.15349	chr6	+	985	2	NNC	ENSMUSG00000042505.7	novel	4323	2	NA	NA	4	-3322	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCATGTATGTTGGGTGA	-11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6956010	7039657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_6956205_7038866
tx.15350	chr6	+	1003	2	NNC	ENSMUSG00000042505.7	novel	4323	2	NA	NA	-1	-3322	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	697	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCATGTATGTTGGGTGA	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6956005	7039657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_6956205_7038853
tx.15351	chr6	+	1202	6	FSM	ENSMUSG00000061762.13	ENSMUST00000184986.2	691	6	-233	-278	-16	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.4	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTCACATTTTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7554862	7562978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_7555162_7555604_7555737_7556683_7556781_7557719_7557744_7559098_7559153_7562382
tx.15352	chr6	-	1963	12	FSM	ENSMUSG00000029752.13	ENSMUST00000031766.12	2001	12	38	0	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8132	junction_7	319.487761505924	7791	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTCCTGGTTGTGGGTAC	-2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7693216	7675168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_7675525_7675992_7676149_7676234_7676317_7677230_7677332_7677939_7678047_7680084_7680212_7681249_7681378_7681933_7682036_7682270_7682457_7685168_7685407_7689251_7689524_7693108
tx.15353	chr6	+	713	2	Intergenic	novelGene_1226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGACCTTCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7693275	7694048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_7693798_7693857
tx.15354	chr6	+	2021	4	FSM	ENSMUSG00000042460.6	ENSMUST00000040159.6	6092	4	429	3642	429	-3642	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_1	4.89897948556636	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTCTTGTATTTGGTAC	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7845270	7872045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_7845395_7863904_7864142_7866375_7867044_7871053
tx.15355	chr6	+	867	3	ISM	ENSMUSG00000042447.14	ENSMUST00000040017.8	3710	12	63	20828	63	-20822	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	329	junction_2	1.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACACAAGCCAGAAGATGT	45	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8209284	8215446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_8209412_8211579_8211639_8214765
tx.15356	chr6	+	3628	12	FSM	ENSMUSG00000042447.14	ENSMUST00000040017.8	3710	12	76	6	76	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	253	junction_5	31.0917065288484	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAAACTTTGAAACTTTTT	-23	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8209297	8236268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_8209412_8211579_8211639_8214765_8216100_8216371_8216471_8222460_8222716_8224554_8224725_8226843_8226910_8227968_8228128_8231160_8231314_8233049_8233255_8234231_8234362_8235384
tx.15357	chr6	+	1529	5	ISM	ENSMUSG00000042447.14	ENSMUST00000040017.8	3710	12	18740	15	1327	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	298	junction_2	19.7278356643601	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTAAAACGATAAACTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8227961	8236259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_8228128_8231160_8231314_8233049_8233255_8234231_8234362_8235384
tx.15358	chr6	-	638	4	FSM	ENSMUSG00000012483.5	ENSMUST00000012627.5	670	4	32	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1410	junction_2	59.4474557908074	7245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTTGGTCAATTGTTTT	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8259141	8255935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_8256248_8256694_8256804_8257686_8257762_8258999
tx.15359	chr6	+	1295	6	NNC	ENSMUSG00000089862.9	novel	2615	5	NA	NA	-13	10295	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	11.443775600736	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGTTTTGAGACTTTCT	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8259336	8289847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_8259494_8270472_8270582_8283220_8283395_8284664_8284843_8286449_8286651_8289371
tx.15360	chr6	+	572	2	ISM	ENSMUSG00000089862.9	ENSMUST00000161400.2	435	3	-106	8664	-12	-8664	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTGGTTTTTCCAACCAC	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8259337	8270888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_8259494_8270472
tx.15361	chr6	+	2080	4	FSM	ENSMUSG00000089862.9	ENSMUST00000159433.8	2025	4	-48	-7	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_2	5.43650214343336	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTTCATTGCATTAGTA	-38	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8259381	8428767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_8259494_8270472_8270582_8373905_8373968_8426970
tx.15362	chr6	-	1748	14	FSM	ENSMUSG00000062995.13	ENSMUST00000038403.12	2075	14	327	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_8	7.8401183423021	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTATTCACTCCTGTTTGGT	-23	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8778157	8630526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_8630798_8643972_8644243_8653496_8653536_8653629_8653693_8656361_8656409_8658219_8658315_8670693_8670793_8672297_8672424_8737016_8737216_8742254_8742379_8749694_8749768_8754588_8754752_8758365_8758459_8778071
tx.15363	chr6	-	1705	13	NIC	ENSMUSG00000062995.13	novel	2075	14	NA	NA	-53	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_12	19.7798649023586	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTATTCACTCCTGTTTGGT	337	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8778207	8630526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_8630798_8643972_8644243_8653496_8653536_8653629_8653693_8656361_8656409_8658219_8658315_8670693_8670793_8672297_8672424_8737016_8737216_8742254_8742379_8749694_8749768_8754588_8754752_8778071
tx.15364	chr6	-	507	4	FSM	ENSMUSG00000029632.8	ENSMUST00000204978.3	610	4	23	80	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8511	junction_2	453.262494465281	23799	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTGTCACTATTTAATGC	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11907459	11900370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_11900591_11905200_11905262_11906018_11906108_11907322
tx.15365	chr6	+	538	3	FSM	ENSMUSG00000029629.18	ENSMUST00000155037.4	478	3	35	-95	35	95	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	44	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAGGGAGAAGGACAAAG	-21	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11907842	11933504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_11908017_11926725_11926837_11933251
tx.15366	chr6	+	643	5	ISM	ENSMUSG00000029629.18	ENSMUST00000115511.9	3336	18	71129	7	6173	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_4	31.2759891929896	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTGTATTTGAAATTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11997043	12081197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_11997194_12006809_12006861_12006983_12007106_12047825_12047944_12080995
tx.15367	chr6	+	823	3	ISM	ENSMUSG00000029629.18	ENSMUST00000115510.8	3353	17	71168	403	6177	-403	internal_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_1	7.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTAGATAGAGTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11997047	12007609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_11997194_12006809_12006861_12006983
tx.15368	chr6	+	1854	9	FSM	ENSMUSG00000029571.15	ENSMUST00000031556.14	6002	9	-56	4204	24	3413	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	9.57127865021179	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTTTGATAAAGGTCAAATG	-31	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	13069781	13085064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_13069960_13070306_13070414_13071740_13071963_13075034_13075099_13078090_13078251_13081538_13081680_13082411_13082462_13083367_13083422_13084186
tx.15369	chr6	+	2013	8	ISM	ENSMUSG00000029571.15	ENSMUST00000031556.14	6002	9	468	3868	56	3749	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_4	6.34066886319204	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTACCCATCATCCTGAG	418	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13070305	13085400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_13070414_13071740_13071963_13075034_13075099_13078090_13078251_13081538_13081680_13082411_13082462_13083367_13083422_13084186
tx.15370	chr6	-	3919	5	FSM	ENSMUSG00000029569.10	ENSMUST00000031554.9	4587	5	61	607	5	-607	multi-exon	TRUE	canonical	3	155	junction_4	32.9194091684526	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTGCTTTTAGAGTTT	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	13608038	13581292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_13583334_13591268_13591544_13594942_13595086_13602236_13603487_13607828
tx.15371	chr6	-	1315	2	ISM	ENSMUSG00000029569.10	ENSMUST00000031554.9	4587	5	66	21691	-7	1004	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATCAACCACAGGGCAGAT	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	13608033	13602376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_13603487_13607828
tx.15372	chr6	-	1053	3	FSM	ENSMUSG00000052419.8	ENSMUST00000139231.2	3177	3	48	2076	-4	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_2	22	409	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATCAGTTCACCTATTGT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	13871469	13869809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_13870740_13871054_13871146_13871437
tx.15373	chr6	-	969	2	ISM	ENSMUSG00000052419.8	ENSMUST00000155856.2	1077	3	319	64	318	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGAGTATCTTCTCCTTG	1186	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13871146	13869862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_13870740_13871054
tx.15374	chr6	+	1525	3	FSM	ENSMUSG00000097616.8	ENSMUST00000181225.2	1499	3	-32	6	11	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	3.5	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGTATTACTGTTATGGA	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	13871535	13896415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_13871627_13881271_13881381_13895090
tx.15375	chr6	+	596	2	Intergenic	novelGene_1227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTCCATGGGTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15607124	15608201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_15607243_15607723
tx.15376	chr6	+	448	2	Intergenic	novelGene_1228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTAAGGGATACAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15853127	15884849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_15853247_15884520
tx.15377	chr6	+	684	4	Intergenic	novelGene_1230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.55777733351102	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTAAGGGATACAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15853135	15884849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_15853247_15874401_15874539_15878053_15878161_15884520
tx.15378	chr6	+	548	3	Intergenic	novelGene_1229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	1.5	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTAAGGGATACAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15853134	15884849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_15853247_15878053_15878161_15884520
tx.15379	chr6	+	1288	2	Intergenic	novelGene_1231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCTCTTAAATTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16734582	16752650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_16734890_16751669
tx.15380	chr6	+	2442	7	FSM	ENSMUSG00000029552.20	ENSMUST00000115467.11	2440	7	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_1	5.93717104351896	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTGTCTTTCTATGTCCT	-34	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	17065147	17105824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_17065313_17086135_17086222_17096126_17096380_17097259_17097590_17099702_17099919_17100280_17100440_17104591
tx.15381	chr6	+	1793	4	ISM	ENSMUSG00000029552.20	ENSMUST00000076654.9	2685	9	32182	3	32182	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_3	2.86744175568088	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTGTCTTTCTATGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17097404	17105824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_17097590_17099702_17099919_17100280_17100440_17104591
tx.15382	chr6	+	2227	10	FSM	ENSMUSG00000015733.14	ENSMUST00000015877.14	2537	10	52	258	0	-258	multi-exon	FALSE	canonical	3	1705	junction_7	87.4846018197234	2987	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCTTGAATTGTATAGAT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	17637033	17666713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_17637160_17648518_17648583_17650001_17650054_17654104_17654169_17656236_17656444_17657171_17657252_17660747_17660827_17662096_17662169_17665049_17665113_17665293
tx.15383	chr6	-	1757	13	FSM	ENSMUSG00000010796.12	ENSMUST00000010940.11	1736	13	-22	1	-18	-1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	5.42307313450798	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAAACTGTGCTCATTTGT	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	18109078	18050963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_18051403_18054526_18054641_18055433_18055540_18071963_18072074_18073760_18073818_18074824_18074901_18075759_18075885_18076503_18076639_18077151_18077264_18103498_18103611_18104774_18104898_18108401_18108502_18108930
tx.15384	chr6	+	760	4	FSM	ENSMUSG00000044155.12	ENSMUST00000056398.11	807	4	47	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	968	junction_1	14.522013940528	7467	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGTTTTCTTTTCTTTCCT	-24	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	18848624	18854052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_18848763_18849624_18849666_18851634_18851763_18853599
tx.15385	chr6	+	2587	12	FSM	ENSMUSG00000029670.13	ENSMUST00000031680.10	3800	12	74	1139	-4	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	20.5043837280255	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGACATCGTGATGTGGCA	-15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21949643	21974898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_21949793_21950036_21950109_21952127_21952229_21953761_21953828_21965732_21965830_21967625_21967698_21968883_21969004_21969276_21969435_21969912_21970107_21971105_21971308_21971809_21971849_21973581
tx.15386	chr6	+	2373	11	ISM	ENSMUSG00000029670.13	ENSMUST00000031680.10	3800	12	449	1222	0	-87	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_5	14.2562267097574	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGGCTATAGATGTTTGG	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21950018	21974815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_21950109_21952127_21952229_21953761_21953828_21965732_21965830_21967625_21967698_21968883_21969004_21969276_21969435_21969912_21970107_21971105_21971308_21971809_21971849_21973581
tx.15387	chr6	+	2448	10	NNC	ENSMUSG00000029670.13	novel	3800	12	NA	NA	0	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	49.1440311988052	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGACATCGTGATGTGGCA	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21950018	21974898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_21950109_21952127_21952229_21953761_21953828_21965732_21965830_21967625_21967698_21968883_21969004_21969276_21969435_21969912_21970107_21971105_21971339_21973581
tx.15388	chr6	-	1419	9	NNC	ENSMUSG00000029672.17	novel	2826	10	NA	NA	-14	20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	138.193704632302	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACAGTTTTTTTGTTGTTG	10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	22356111	22307860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_22308538_22309325_22309453_22318932_22319018_22321327_22321379_22322288_22322348_22328553_22328678_22339252_22339377_22343264_22343319_22355993
tx.15389	chr6	-	1424	10	FSM	ENSMUSG00000029672.17	ENSMUST00000165576.8	2826	10	52	1350	-16	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	400	junction_3	15.4416464292006	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAGCACAACAGTTTTTT	8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	22356113	22307868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_22308538_22309325_22309453_22318932_22319018_22321327_22321379_22322288_22322348_22328553_22328678_22329577_22329608_22339271_22339377_22343264_22343319_22355993
tx.15390	chr6	-	1422	7	NNC	ENSMUSG00000029695.14	novel	3701	24	NA	NA	42363	-327	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_6	2.92498812913071	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCTTGAGTTTTTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23085216	23072498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_23073090_23074526_23074704_23075160_23075250_23075739_23075856_23077077_23077174_23078826_23078995_23085031
tx.15391	chr6	-	1282	7	NNC	ENSMUSG00000029695.14	novel	3701	24	NA	NA	42136	-327	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4.28174419288838	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCTTGAGTTTTTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23085443	23072498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_23073090_23074526_23074704_23075160_23075250_23075739_23075856_23077077_23077174_23078826_23078995_23085398
tx.15392	chr6	-	393	4	ISM	ENSMUSG00000023089.13	ENSMUST00000141274.2	453	5	207	-5	207	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3472	junction_1	80.7148616358158	3476	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCCATGTTATTGACTT	711	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24527318	24518660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_24518824_24519190_24519257_24522657_24522775_24527271
tx.15393	chr6	-	434	5	FSM	ENSMUSG00000023089.13	ENSMUST00000023851.9	875	5	445	-4	2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	2597	junction_4	429.359042643799	13528	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCCATGTTATTGACTT	-2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	24527567	24518660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_24518824_24519190_24519257_24522657_24522775_24527271_24527317_24527524
tx.15394	chr6	-	319	4	FSM	ENSMUSG00000023089.13	ENSMUST00000118558.5	315	4	0	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_2	1436.47492920072	321	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCCATGTTATTGACTT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	24527569	24518660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_24518824_24519190_24519257_24527271_24527317_24527524
tx.15395	chr6	+	635	2	NNC	ENSMUSG00000107189.2	novel	404	2	NA	NA	353	19022	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTTCTGTATGAAAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24594881	24614259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_24595393_24614135
tx.15396	chr6	-	892	3	ISM	ENSMUSG00000029676.16	ENSMUST00000166445.8	1923	15	49693	-639	-2128	-205	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	142	junction_1	3.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTGTCTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25748323	25743940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_25744693_25745889_25745996_25748289
tx.15397	chr6	-	1260	6	ISM	ENSMUSG00000029676.16	ENSMUST00000166445.8	1923	15	44784	-639	-7037	-205	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	142	junction_1	6.79411510058521	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTGTCTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25753232	25743940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_25744693_25745889_25745996_25748289_25748382_25750048_25750138_25752358_25752495_25753147
tx.15398	chr6	-	2952	18	FSM	ENSMUSG00000029676.16	ENSMUST00000115330.8	3151	18	-4	203	-4	-203	multi-exon	TRUE	canonical	3	94	junction_8	16.939542404853	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTCTGTGTGTGTGTG	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	25809229	25743938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_25744693_25745889_25745996_25748289_25748382_25750048_25750138_25752358_25752495_25753147_25753354_25756161_25756319_25757223_25757287_25758816_25758903_25764250_25764424_25771517_25771674_25775523_25775815_25778837_25778969_25794558_25794674_25798007_25798055_25800282_25800510_25805873_25805941_25809173
tx.15399	chr6	-	2891	17	NIC	ENSMUSG00000029676.16	novel	3151	18	NA	NA	-2	-205	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_14	31.693847983481	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTGTCTGTGTGTGTG	8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	25809217	25743940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_25744693_25745889_25745996_25748289_25748382_25750048_25750138_25752358_25752495_25753147_25753354_25756161_25756319_25757223_25757287_25758816_25758903_25764250_25764424_25771517_25771674_25775523_25775815_25778837_25778969_25794558_25794674_25800282_25800510_25805873_25805941_25809173
tx.154	chr1	+	1061	6	FSM	ENSMUSG00000026111.16	ENSMUST00000114925.10	1094	6	36	-3	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_1	76.7739539166767	1806	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGACTGTTTATTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37469255	37478068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_37469364_37470373_37470658_37471631_37471753_37476242_37476383_37476457_37476560_37477762
tx.15400	chr6	-	1539	5	FSM	ENSMUSG00000039841.15	ENSMUST00000155494.2	703	5	-11	-825	-11	-102	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	12.1937483982572	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATGAAAAAAAGAACACACC	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	28261942	28243658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_28244663_28247139_28247284_28256429_28256526_28260716_28260836_28261766
tx.15401	chr6	+	1042	6	FSM	ENSMUSG00000020440.14	ENSMUST00000020717.12	1116	6	74	0	44	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1725	junction_4	143.712769091685	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCGGTGTTGTCTGTTGCCT	43	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	28423632	28426601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_28423755_28424288_28424370_28424720_28424831_28425171_28425244_28425737_28425864_28426070
tx.15403	chr6	+	3476	24	FSM	ENSMUSG00000001424.15	ENSMUST00000001460.14	3482	24	-5	11	-5	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	582	junction_3	55.1049865830108	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTACTGTCGTGGTGGAG	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	28480341	28888820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_28480642_28512833_28512984_28520143_28520265_28523725_28523805_28526051_28526213_28526907_28527000_28527575_28527735_28528911_28529019_28531407_28531499_28545483_28545598_28626098_28626189_28668556_28668658_28707032_28707144_28724907_28724981_28745183_28745326_28795827_28795938_28874859_28875049_28880195_28880338_28883256_28883381_28884186_28884257_28884954_28885069_28886412_28886617_28888077_28888123_28888233
tx.15404	chr6	-	868	3	ISM	ENSMUSG00000029701.16	ENSMUST00000169214.8	1923	12	26405	-124	2616	124	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	224	junction_1	22.5	234	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACCTTTTTAACATTTTT	NA	False	NA	-38	True	NA	NA	NA	29128685	29125016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_29125524_29127796_29127900_29128427
tx.15405	chr6	-	1204	6	NNC	ENSMUSG00000029701.16	novel	1923	12	NA	NA	-855	128	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	97.6565409995664	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTTTAACATTTTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29132156	29125012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_29125524_29127796_29127900_29128427_29128685_29131265_29131341_29131625_29131776_29132048
tx.15406	chr6	-	1456	8	ISM	ENSMUSG00000029701.16	ENSMUST00000169214.8	1923	12	16450	-125	-7339	125	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	180	junction_7	24.4857309551535	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACCTTTTTAACATTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29138640	29125015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_29125524_29127796_29127900_29128427_29128685_29131265_29131341_29131625_29131776_29135406_29135566_29137577_29137643_29138501
tx.15407	chr6	-	2708	19	FSM	ENSMUSG00000029701.16	ENSMUST00000007993.16	4465	19	315	1442	315	124	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_12	24.6131175505167	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACCTTTTTAACATTTTT	-10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29164690	29125016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_29125524_29127796_29127900_29128427_29128685_29131265_29131341_29131625_29131776_29135406_29135566_29137577_29137643_29138501_29138638_29139551_29139626_29143552_29143663_29152280_29152354_29154752_29154893_29155025_29155189_29157066_29157139_29158168_29158262_29158845_29158922_29159654_29159750_29160035_29160195_29164489
tx.15408	chr6	-	1013	3	ISM	ENSMUSG00000003500.14	ENSMUST00000160878.8	2314	13	9437	1	608	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_2	1	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGTGATCCTGTTTCTG	9650	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29202811	29200436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_29201219_29202445_29202530_29202664
tx.15409	chr6	-	2405	14	NNC	ENSMUSG00000003500.14	novel	2580	15	NA	NA	-13	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_10	64.2501582895847	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGTGATCCTGTTTCTG	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29212261	29200436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_29201219_29202445_29202530_29202664_29202809_29203100_29203246_29203347_29203492_29204277_29204374_29204567_29204659_29205049_29205250_29206064_29206153_29206304_29206512_29206917_29206997_29207093_29207196_29209218_29209268_29212067
tx.1541	chr10	-	1798	4	FSM	ENSMUSG00000075000.12	ENSMUST00000077839.13	1813	4	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_3	30.2691628926573	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTGTTGAGTATGACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67121069	67102467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_67103946_67105884_67105926_67111348_67111434_67120875
tx.15410	chr6	+	950	2	FSM	ENSMUSG00000043421.9	ENSMUST00000054445.9	982	2	32	0	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_1	0	588	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTGTCCTGTTGACATG	33	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29272656	29275445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_29272810_29274648
tx.15411	chr6	-	947	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043421.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCCCCTTCTGGGCGAGGC	5587	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29275445	29272656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_29272805_29274646
tx.15412	chr6	+	3192	7	FSM	ENSMUSG00000029767.17	ENSMUST00000031779.17	3229	7	30	7	17	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	608	junction_2	154.523730647863	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGGGCTTATGTGTCTTT	16	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29348134	29376667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_29348208_29356469_29356697_29361292_29361487_29366038_29366206_29366915_29366977_29372469_29372670_29374397
tx.15413	chr6	+	3188	7	FSM	ENSMUSG00000029767.17	ENSMUST00000090481.14	2670	7	21	-539	21	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	300	junction_2	301.970979105977	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGGGCTTATGTGTCTTT	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29348138	29376667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_29348208_29356469_29356697_29361558_29361753_29366038_29366206_29366915_29366977_29372469_29372670_29374397
tx.15414	chr6	+	2438	2	ISM	ENSMUSG00000029767.17	ENSMUST00000172607.2	648	3	-50	442	-50	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	898	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGGGCTTATGTGTCTTT	6376	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29372501	29376667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_29372670_29374397
tx.15415	chr6	+	656	2	FSM	ENSMUSG00000004285.13	ENSMUST00000004396.13	703	2	47	0	47	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1924	junction_1	0	12856	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTACTGGTATGGATACG	15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29467763	29470511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_29467974_29470065
tx.15416	chr6	+	2125	9	FSM	ENSMUSG00000029771.13	ENSMUST00000004392.12	2189	9	65	-1	-18	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_7	3.25720355519885	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTGCCCATTTATTGACT	4	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29526688	29537319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_29526774_29531124_29531331_29533950_29534141_29534533_29534593_29535039_29535074_29535251_29535510_29535723_29536117_29536202_29536322_29536538
tx.15417	chr6	-	3954	23	FSM	ENSMUSG00000012535.15	ENSMUST00000012679.15	4251	23	251	46	-2	-46	multi-exon	FALSE	canonical	3	521	junction_17	54.5301683125804	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAACCAGAAAAAAGAA	-10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29609635	29540871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_29541866_29543261_29543360_29551850_29551964_29554793_29554962_29555151_29555309_29556976_29557072_29558750_29558868_29560080_29560222_29561358_29561420_29562856_29562934_29565169_29565262_29565662_29565855_29568852_29568993_29571034_29571127_29572584_29572693_29575004_29575152_29578461_29578601_29579519_29579696_29582164_29582309_29586036_29586194_29588021_29588096_29589027_29589229_29609364
tx.15418	chr6	-	420	2	ISM	ENSMUSG00000012535.15	ENSMUST00000164325.2	3396	4	18	5718	-3	27	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	604	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAAGACTTGTCGCCTGTC	10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29609615	29589059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_29589229_29609364
tx.15419	chr6	+	648	2	Intergenic	novelGene_1235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACGTGTATAATGTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29639047	29642169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_29639206_29641679
tx.15420	chr6	+	542	2	Intergenic	novelGene_1234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACGTGTATAATGTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29639033	29642169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_29639206_29641799
tx.15421	chr6	+	933	2	FSM	ENSMUSG00000045709.12	ENSMUST00000141679.3	1003	2	70	0	-57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTGCTTAGCAGTCTTT	1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29985303	29993777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_29985466_29993006
tx.15422	chr6	+	1904	12	FSM	ENSMUSG00000058440.15	ENSMUST00000115206.8	1879	12	-29	4	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_11	119.561388499108	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATATGTATGGTTTGGGCT	-14	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30048000	30144855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_30048113_30088831_30088988_30089910_30090146_30095338_30095454_30098447_30098575_30102167_30102309_30115011_30115171_30116094_30116293_30117054_30117157_30118947_30119106_30126233_30126359_30144579
tx.15423	chr6	+	1912	13	NNC	ENSMUSG00000058440.15	novel	1879	12	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	178.740889433715	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATATGTATGGTTTGGGCT	15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30048029	30144855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_30048113_30088831_30088988_30089913_30090146_30090267_30090308_30095338_30095454_30098447_30098575_30102167_30102309_30115011_30115171_30116094_30116293_30117054_30117157_30118947_30119106_30126233_30126359_30144579
tx.15424	chr6	+	1897	12	NIC	ENSMUSG00000058440.15	novel	1879	12	NA	NA	7	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	122	junction_11	127.487870108467	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTATGGTTTGGGCTTTG	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30048007	30144858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_30048113_30088831_30088988_30089913_30090146_30095338_30095454_30098447_30098575_30102167_30102309_30115011_30115171_30116094_30116293_30117054_30117157_30118947_30119106_30126233_30126359_30144579
tx.15425	chr6	+	1925	13	NNC	ENSMUSG00000058440.15	novel	1879	12	NA	NA	-8	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	175.389309030574	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATATGTATGGTTTGGGCT	5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30048019	30144855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_30048113_30088831_30088988_30089910_30090146_30090267_30090308_30095338_30095454_30098447_30098575_30102167_30102309_30115011_30115171_30116094_30116293_30117054_30117157_30118947_30119106_30126233_30126359_30144579
tx.15426	chr6	+	2293	12	NIC	ENSMUSG00000058440.15	novel	3584	12	NA	NA	4	-28	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	218	junction_2	102.024061333144	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGATGAGGC	-21	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30047993	30140875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_30048113_30088831_30088988_30089913_30090146_30095338_30095454_30098447_30098575_30102167_30102309_30115011_30115171_30116094_30116293_30117054_30117157_30118947_30119106_30126233_30126359_30140214
tx.15427	chr6	+	2290	12	NIC	ENSMUSG00000058440.15	novel	3295	12	NA	NA	-2	-29	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	271	junction_11	90.9985923058862	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGATGAGG	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30047998	30140874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_30048113_30088831_30088988_30089910_30090146_30095338_30095454_30098447_30098575_30102167_30102309_30115011_30115171_30116094_30116293_30117054_30117157_30118947_30119106_30126233_30126359_30140214
tx.15428	chr6	+	976	6	ISM	ENSMUSG00000058440.15	ENSMUST00000069808.13	1658	10	25166	-1	-1060	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_5	161.775152603853	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATATGTATGGTTTGGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30115053	30144855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_30115171_30116094_30116293_30117054_30117157_30118947_30119106_30126233_30126359_30144579
tx.15429	chr6	-	983	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000103108.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCCTTGTCTTCTTGAA	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30174124	30169929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_30170467_30173678
tx.15430	chr6	-	573	5	ISM	ENSMUSG00000039159.17	ENSMUST00000102993.10	4657	7	43547	3508	-17189	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_3	60.503615594442	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTCTTGGTCATTTCTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30260991	30214795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_30215083_30221666_30221796_30241370_30241424_30242536_30242577_30260927
tx.15431	chr6	-	741	7	FSM	ENSMUSG00000039159.17	ENSMUST00000102993.10	4657	7	401	3515	384	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_3	56.6345497220753	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTTGATTTCTTGGTCAT	404	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30304137	30214802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_30215083_30221666_30221796_30241370_30241424_30242536_30242577_30260927_30261003_30262145_30262223_30304050
tx.15432	chr6	-	1817	10	NNC	ENSMUSG00000039130.19	novel	1824	10	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	332.681176852702	471	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTGCTGCTAGAGAATTG	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30391016	30366382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_30366745_30370263_30370471_30372736_30372950_30373241_30373483_30374763_30374919_30375937_30376066_30381779_30381864_30382535_30382690_30387419_30387532_30390855
tx.15433	chr6	+	1246	8	ISM	ENSMUSG00000029775.15	ENSMUST00000144272.8	1387	10	22738	-182	-3996	155	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_6	13.6665837064016	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGAGAAATTGTTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30439772	30450995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_30439865_30441775_30441931_30444425_30444575_30446616_30446702_30447409_30447477_30447939_30447988_30449489_30449630_30450485
tx.15434	chr6	+	509	2	NNC	ENSMUSG00000085470.2	novel	425	2	NA	NA	-284	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTGTGTCGATTTAATCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30459842	30463314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_30459997_30462959
tx.15435	chr6	+	520	2	NNC	ENSMUSG00000085470.2	novel	425	2	NA	NA	-277	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTGTCGATTTAATCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30459849	30463315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_30460014_30462959
tx.15436	chr6	-	2317	15	FSM	ENSMUSG00000029782.21	ENSMUST00000115160.10	3485	15	33	1135	-1	52	multi-exon	FALSE	canonical	3	776	junction_14	62.8738614129878	554	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGGGTTTTAGTTAAAT	-2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30509749	30482361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_30482985_30487373_30487448_30489291_30489390_30489474_30489590_30491085_30491184_30492595_30492722_30494736_30494834_30497165_30497238_30497816_30497993_30501899_30502102_30505731_30505974_30506784_30506917_30508452_30508512_30508664_30508802_30509683
tx.15437	chr6	-	2252	14	ISM	ENSMUSG00000029782.21	ENSMUST00000115157.8	2273	15	915	-52	901	52	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	922	junction_8	37.2406217097062	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGGGTTTTAGTTAAAT	945	False	NA	-49	True	NA	NA	NA	30508802	30482361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_30482985_30487373_30487448_30489291_30489390_30489474_30489590_30491085_30491184_30492595_30492722_30494736_30494834_30497165_30497238_30497816_30497993_30501899_30502102_30505731_30505974_30506784_30506917_30508452_30508512_30508664
tx.15438	chr6	-	1228	11	FSM	ENSMUSG00000029790.17	ENSMUST00000031810.15	3447	11	25	2194	-24	-119	multi-exon	TRUE	canonical	3	75	junction_8	9.18095855561934	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGCTCCCAACTTGGTCCTT	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30693723	30655649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_30655850_30656477_30656694_30657296_30657412_30658355_30658424_30658771_30658924_30660868_30661014_30666265_30666336_30667379_30667442_30671321_30671370_30680129_30680194_30693635
tx.15439	chr6	-	515	3	FSM	ENSMUSG00000029790.17	ENSMUST00000115130.3	485	3	-30	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	51	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTATTCCAGACATCTTA	-22	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30693729	30679086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_30679444_30680129_30680194_30693635
tx.15440	chr6	+	2560	12	FSM	ENSMUSG00000051855.16	ENSMUST00000163949.9	2561	12	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	246	junction_7	40.2939611577855	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGATTCCGGCTTCCCCTCC	-2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30738049	30748461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_30738335_30740668_30740824_30742139_30742220_30742526_30742605_30742714_30742852_30743012_30743072_30744352_30744394_30744860_30744932_30745080_30745183_30745828_30745906_30746260_30746325_30747050
tx.15441	chr6	-	3139	24	FSM	ENSMUSG00000025607.16	ENSMUST00000048774.13	3961	24	-27	849	-2	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_15	22.2825132553629	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCTATACTTGAAATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30873701	30748401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_30748987_30749404_30749504_30749759_30749899_30750536_30750635_30786493_30786666_30787265_30787406_30787859_30787923_30788527_30788654_30789678_30789783_30790645_30790722_30792865_30793110_30793677_30793774_30801302_30801492_30802561_30802630_30803072_30803207_30835672_30835831_30836822_30836910_30838302_30838396_30840469_30840546_30862514_30862595_30867535_30867608_30871781_30871863_30872476_30872530_30873595
tx.15442	chr6	-	652	5	ISM	ENSMUSG00000025607.16	ENSMUST00000131256.8	961	10	-23	26880	-5	9590	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_3	12.6293309403151	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATAAAGATTGTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30873688	30862241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_30862595_30867535_30867608_30871781_30871863_30872476_30872530_30873595
tx.15443	chr6	-	414	4	NNC	ENSMUSG00000025607.16	novel	333	4	NA	NA	-2	1463	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	102.009803450453	83	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGAGTTTTAATAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30873701	30870368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_30870543_30871781_30871863_30872476_30872530_30873595
tx.15444	chr6	-	237	2	FSM	ENSMUSG00000025607.16	ENSMUST00000134137.2	215	2	-18	-4	-2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATCTTCAGCTCTTCAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30873701	30873045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_30873177_30873595
tx.15445	chr6	-	945	3	FSM	ENSMUSG00000086212.8	ENSMUST00000144232.8	964	3	16	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTTTTTTTTAATACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31375692	31343822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_31344528_31372632_31372730_31375549
tx.15446	chr6	-	586	3	NNC	ENSMUSG00000086212.8	novel	964	3	NA	NA	2	-9653	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAAAGGCCTCTGAGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31375692	31371271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_31371618_31372632_31372730_31375549
tx.15447	chr6	+	2453	18	FSM	ENSMUSG00000025609.16	ENSMUST00000026699.15	11395	18	101	8841	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	225	junction_9	99.990726213583	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTATATTTTTCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31375770	31484905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_31375890_31395865_31395936_31403648_31403792_31405071_31405161_31408074_31408185_31409873_31410067_31426430_31426509_31428453_31428520_31435889_31436003_31445065_31445279_31451233_31451456_31454861_31454992_31466269_31466418_31467376_31467492_31469579_31469720_31473603_31473707_31476821_31476877_31484559
tx.15448	chr6	-	1527	8	FSM	ENSMUSG00000053768.14	ENSMUST00000066379.11	1550	8	15	8	-8	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	834	junction_3	29.0320020470023	1432	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGGCATTTTCTGACTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33037180	32769159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_32769862_32780824_32780961_32829079_32829151_32869226_32869311_32945135_32945254_32985417_32985500_33026271_33026360_33036934
tx.15449	chr6	+	3745	18	FSM	ENSMUSG00000029763.18	ENSMUST00000052266.15	4824	18	43	1036	0	-1036	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_11	15.4671210608191	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATCATAAAACTATTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33226062	33949878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_33226174_33242874_33243065_33254121_33254317_33273667_33273853_33282219_33282330_33309145_33309390_33324717_33324893_33415314_33415461_33418885_33418975_33556916_33557014_33734901_33735122_33792608_33792746_33815909_33816066_33838995_33839175_33887422_33887565_33895335_33895515_33898312_33898473_33948848
tx.15450	chr6	+	557	2	ISM	ENSMUSG00000029763.18	ENSMUST00000139132.2	1060	6	-18	53021	-10	-53021	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33226052	33243310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_33226174_33242874
tx.15451	chr6	+	3104	15	ISM	ENSMUSG00000029763.18	ENSMUST00000052266.15	4824	18	47793	1036	-35477	-1036	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_8	16.2951100715797	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATCATAAAACTATTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33273812	33949878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_33273853_33282219_33282330_33309145_33309390_33324717_33324893_33415314_33415461_33418885_33418975_33556916_33557014_33734901_33735122_33792608_33792746_33815909_33816066_33838995_33839175_33887422_33887565_33895335_33895515_33898312_33898473_33948848
tx.15452	chr6	+	1092	6	ISM	ENSMUSG00000029763.18	ENSMUST00000090381.11	2598	10	47751	34821	-35476	-34821	internal_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_1	15.1049660707994	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATGGTTGTCCTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33273813	33419263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_33273853_33282219_33282330_33309145_33309390_33324717_33324893_33415314_33415461_33418885
tx.15453	chr6	+	487	3	ISM	ENSMUSG00000029763.18	ENSMUST00000139132.2	1060	6	47745	-63	-35474	63	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_2	56.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTTCTCTCTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33273815	33296394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_33273853_33282219_33282330_33296054
tx.15454	chr6	+	888	2	Intergenic	novelGene_1237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCTGCATGTTGATTTTT	1887	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33975190	33976229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_33975790_33975940
tx.15455	chr6	-	3591	9	NIC	ENSMUSG00000018999.15	novel	6253	10	NA	NA	-27	845	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	1	2	junction_6	73.4536418430019	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATTTGTTTGTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34153932	34132812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_34135562_34136367_34136444_34137407_34137484_34138610_34138721_34140263_34140325_34140523_34140606_34144559_34144663_34147395_34147510_34153712
tx.15456	chr6	-	1437	10	FSM	ENSMUSG00000018999.15	ENSMUST00000019143.9	6253	10	121	4695	-20	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_2	11.5223882983853	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCAGAGCTTCTAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34153925	34135009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_34135562_34136367_34136444_34137407_34137484_34138610_34138721_34140263_34140325_34140523_34140606_34143308_34143359_34144559_34144663_34147395_34147510_34153712
tx.15457	chr6	-	1352	10	FSM	ENSMUSG00000001642.19	ENSMUST00000102980.11	1387	10	35	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	629	junction_4	199.673498924718	2100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGGTGGTGGTCCGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34294378	34280868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_34281275_34283474_34283558_34285913_34285998_34286510_34286593_34286895_34287003_34287447_34287571_34287859_34287938_34288856_34288974_34289574_34289743_34294274
tx.15458	chr6	+	1326	10	FSM	ENSMUSG00000029762.7	ENSMUST00000038406.7	1358	10	24	8	24	-8	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1.94999208608714	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAACACGTTCTGAAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34331077	34345390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_34331232_34333190_34333359_34334395_34334513_34335065_34335144_34340266_34340390_34340656_34340764_34341171_34341254_34342141_34342226_34342837_34342921_34345060
tx.15459	chr6	+	1349	10	FSM	ENSMUSG00000061758.14	ENSMUST00000038383.14	1371	10	21	1	-10	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_8	4.10960933531265	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATTTTCAACTGTCAGAA	3027	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34361173	34373884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_34361343_34364606_34364775_34365710_34365828_34366989_34367068_34368951_34369075_34369323_34369431_34369849_34369932_34370992_34371077_34371661_34371745_34373546
tx.15460	chr6	+	2144	2	FSM	ENSMUSG00000038871.6	ENSMUST00000135743.2	1861	2	-58	-225	-58	225	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGAAGAAGAGGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34453232	34466243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_34453358_34464224
tx.15461	chr6	+	1640	3	FSM	ENSMUSG00000038871.6	ENSMUST00000045372.6	2220	3	96	484	-53	-484	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_2	7.5	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCGCAAGGTGCCTCGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34453237	34482064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_34453358_34464224_34464886_34481205
tx.15462	chr6	+	1368	2	ISM	ENSMUSG00000038871.6	ENSMUST00000045372.6	2220	3	11235	484	10300	-484	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCGCAAGGTGCCTCGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34464376	34482064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_34464886_34481205
tx.15463	chr6	+	748	3	ISM	ENSMUSG00000029761.17	ENSMUST00000031775.13	2142	13	-192	27731	0	3755	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	208	junction_2	9	367	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAGAGGAGGAGCAAGAGA	1257	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34686376	34722898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_34686633_34718723_34718871_34722553
tx.15464	chr6	+	1563	4	FSM	ENSMUSG00000038836.16	ENSMUST00000115014.8	805	4	-121	-637	-80	562	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	0.816496580927726	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAAGCAATCTGTACTTA	1995	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34757702	34763216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_34757995_34759034_34759154_34760504_34760566_34762125
tx.15465	chr6	-	2649	15	FSM	ENSMUSG00000058486.12	ENSMUST00000081214.12	2682	15	34	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	55	junction_12	11.4653426304081	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTGTCTCTTTCTGGACT	5810	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34887777	34857359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_34857904_34861118_34861317_34863000_34863114_34863742_34863852_34865888_34866058_34866171_34866267_34868321_34868473_34869275_34869470_34873115_34873275_34881451_34881618_34882419_34882554_34883575_34883659_34885048_34885257_34886295_34886476_34887631
tx.15466	chr6	-	1379	3	ISM	ENSMUSG00000029847.14	ENSMUST00000201355.4	2003	12	39783	-657	-44	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	1.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGGGATGTAGCTCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34925556	34922212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_34923272_34925142_34925239_34925332
tx.15467	chr6	+	594	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029847.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAATTTCCATTGGTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34965153	34973549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_34965416_34973217
tx.15468	chr6	-	3339	11	FSM	ENSMUSG00000038784.14	ENSMUST00000202417.2	3296	11	2	-45	2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	41.7378724901018	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGATGCTAATGTTATATA	7648	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35110657	35021885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_35023294_35027996_35028495_35029776_35030027_35033145_35033204_35041832_35041958_35045522_35045649_35046304_35046407_35047151_35047239_35054915_35055114_35056895_35057162_35110436
tx.15469	chr6	+	628	3	FSM	ENSMUSG00000073155.13	ENSMUST00000152147.8	2521	3	36	1857	-26	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	978	junction_2	33.5	7818	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCTGGTGAATTAATCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35229624	35238574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_35229718_35237344_35237399_35238093
tx.15470	chr6	-	1420	4	FSM	ENSMUSG00000029840.9	ENSMUST00000031866.9	3960	4	68	2472	-21	-2472	multi-exon	FALSE	canonical	3	759	junction_3	9.97775303139718	569	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGAACAGTTGTCTTAGT	4216	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35516755	35488312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_35489253_35498834_35498919_35499616_35499731_35516473
tx.15471	chr6	-	584	3	ISM	ENSMUSG00000029840.9	ENSMUST00000031866.9	3960	4	17103	3016	17014	-3016	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	767	junction_1	8	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACCTTCTCAGCTCCCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35499720	35488856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_35489253_35498834_35498919_35499616
tx.15472	chr6	-	2084	4	ISM	ENSMUSG00000038648.6	ENSMUST00000041093.6	7082	12	105574	3867	-37	3170	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_3	10.3387082795139	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTCCTCTTTCATACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37313507	37308056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_37309436_37311297_37311518_37312762_37312890_37313149
tx.15473	chr6	-	2595	11	NNC	ENSMUSG00000038648.6	novel	7082	12	NA	NA	-40958	3170	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	17	junction_10	25.5556256037687	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTCCTCTTTCATACAA	8014	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37354428	37308056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_37309436_37311297_37311518_37312762_37312890_37313149_37313250_37330491_37330561_37331685_37331745_37332577_37332725_37335397_37335583_37339292_37339381_37340902_37341079_37354383
tx.15474	chr6	+	1296	3	Intergenic	novelGene_1238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTGTATTGCTTACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37419444	37424340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_37419605_37422999_37423146_37423350
tx.15475	chr6	+	1166	3	Intergenic	novelGene_1239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTGTATTGCTTACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37419444	37424340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_37419475_37422999_37423146_37423350
tx.15476	chr6	+	1336	3	Intergenic	novelGene_1240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACAGCGGACTCCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37718168	37725174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_37718469_37720836_37720919_37724220
tx.15477	chr6	+	1230	2	Intergenic	novelGene_1241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGGACTCCATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37718195	37725177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_37718469_37724220
tx.15478	chr6	+	510	2	Intergenic	novelGene_1242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGTTTCCGTGTCGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37802957	37813515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_37803094_37813141
tx.15479	chr6	+	2214	10	ISM	ENSMUSG00000029833.18	ENSMUST00000120238.2	3258	19	48733	-364	661	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	465	junction_1	57.5962961772138	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGGTTATTGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37926154	37943231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_37926334_37928386_37928561_37930428_37930565_37933337_37933411_37933938_37934108_37934443_37934773_37935496_37935630_37937715_37937791_37941637_37941788_37942435
tx.15480	chr6	+	566	3	FSM	ENSMUSG00000029829.5	ENSMUST00000031851.5	631	3	65	0	65	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.5	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTGGCTCTTTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38086254	38092744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_38086491_38091542_38091612_38092483
tx.15481	chr6	+	463	2	FSM	ENSMUSG00000019689.5	ENSMUST00000019833.5	479	2	15	1	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	741	junction_1	0	3373	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGTTTGGTTTTTGTGTGC	9944	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38511772	38516383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_38511946_38516093
tx.15482	chr6	+	816	2	NIC	ENSMUSG00000029823.17	novel	382	5	NA	NA	-13	18	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAACTAACATTTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38528764	38546518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_38528844_38545781
tx.15483	chr6	+	675	3	ISM	ENSMUSG00000029823.17	ENSMUST00000160430.3	3906	8	23322	2151	23322	-1165	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	3	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGCCTGTTTTCCACATT	202	False	NA	6	True	NA	NA	NA	38570358	38580810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_38570405_38575719_38575750_38580211
tx.15484	chr6	+	1063	3	ISM	ENSMUSG00000079598.5	ENSMUST00000114874.5	1431	5	13666	7	12854	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGAGTCTGCTGGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38653667	38657793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_38653899_38654443_38654545_38657062
tx.15485	chr6	-	1044	3	Intergenic	novelGene_1243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGGAGTGCTGAAGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39246775	39242283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_39242736_39243266_39243444_39246360
tx.15486	chr6	-	4190	17	NIC	ENSMUSG00000029924.13	novel	2878	16	NA	NA	-17	3	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	43	junction_14	89.544681584112	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTGCCCTTAAGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39354626	39311703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_39314219_39315682_39315749_39321186_39321339_39322228_39322277_39322828_39322931_39324222_39324365_39326273_39326453_39326983_39327069_39329587_39329685_39331910_39332057_39334333_39334418_39336883_39336977_39341436_39341546_39343822_39343981_39349012_39349072_39349780_39349862_39354552
tx.15487	chr6	-	2837	15	FSM	ENSMUSG00000029924.13	ENSMUST00000090243.8	4030	15	-19	1212	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_14	38.6108925098626	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCTGCTTAAGCTTGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39354628	39312918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_39314219_39315682_39315749_39321186_39321339_39322228_39322277_39322828_39322931_39324222_39324365_39326273_39326453_39326983_39327069_39329587_39329685_39331910_39332057_39334333_39334418_39336883_39336977_39341436_39341546_39343822_39343981_39354552
tx.15488	chr6	-	2687	14	FSM	ENSMUSG00000029924.13	ENSMUST00000201448.4	2669	14	-18	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_9	72.7375113825747	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCTGCTTAAGCTTGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39354624	39312918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_39314219_39315682_39315749_39321186_39321339_39322228_39322277_39322828_39322931_39324222_39324365_39326273_39326453_39326983_39327069_39329587_39329685_39334333_39334418_39336883_39336977_39341436_39341546_39343822_39343981_39354552
tx.15489	chr6	-	2098	13	ISM	ENSMUSG00000029924.13	ENSMUST00000090243.8	4030	15	-12	8846	-12	291	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_12	41.2501683498248	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTGACTGTATAATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39354621	39320552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_39321339_39322228_39322277_39322828_39322931_39324222_39324365_39326273_39326453_39326983_39327069_39329587_39329685_39331910_39332057_39334333_39334418_39336883_39336977_39341436_39341546_39343822_39343981_39354552
tx.1549	chr10	-	564	3	ISM	ENSMUSG00000019942.14	ENSMUST00000119827.8	1253	9	12062	-22	1888	22	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	2056	junction_1	93	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCACTGTGGTGGCTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69176671	69174131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_69174427_69176310_69176453_69176544
tx.15490	chr6	+	185	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000064900.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATGGATATGGTGCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39342760	39528080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_39342911_39528045
tx.15491	chr6	+	1375	4	FSM	ENSMUSG00000029923.5	ENSMUST00000031986.5	1575	4	200	0	200	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTGTTGTGTCACCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39358308	39367314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_39358444_39360841_39361055_39364942_39365127_39366471
tx.15492	chr6	-	1815	3	ISM	ENSMUSG00000029922.16	ENSMUST00000114823.8	2992	8	19317	20	4271	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1457	junction_1	58	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATTTAAAAAAAAAAAAAAAA	302	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39377393	39374757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_39376369_39376731_39376871_39377328
tx.15493	chr6	-	3013	8	FSM	ENSMUSG00000029922.16	ENSMUST00000031985.13	3046	8	20	13	20	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	1453	junction_3	1193.53149458715	222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAATTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39397376	39374750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_39376369_39376731_39376871_39377328_39377440_39378143_39378359_39381581_39381809_39382664_39382895_39387021_39387151_39397032
tx.15494	chr6	-	472	2	ISM	ENSMUSG00000029922.16	ENSMUST00000150575.2	773	5	4898	-145	4898	145	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1457	junction_1	0	206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAACTGTCAGACAGTTAG	929	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39376766	39375931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_39376369_39376731
tx.15495	chr6	-	895	3	FSM	ENSMUSG00000029922.16	ENSMUST00000114822.2	751	3	-144	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4055	junction_2	144.5	5332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCTCCGAATGCTGTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39397376	39382472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_39382895_39387021_39387151_39397032
tx.15496	chr6	-	769	3	ISM	ENSMUSG00000029922.16	ENSMUST00000122996.8	1485	5	7	4788	7	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	157	junction_2	2093.5	185	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGTCTCCGAATGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39396994	39382475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_39382895_39387021_39387151_39396773
tx.15498	chr6	+	435	2	FSM	ENSMUSG00000068601.3	ENSMUST00000090237.3	830	2	5	390	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATGTGTGGTAGCCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39397316	39397838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_39397587_39397673
tx.15499	chr6	+	395	3	NNC	ENSMUSG00000085058.3	novel	370	4	NA	NA	-11	1821	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	22	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTAGGCTTGTTTGGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39504435	39507029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_39504579_39506382_39506457_39506851
tx.155	chr1	+	1110	6	NIC	ENSMUSG00000026111.16	novel	1179	6	NA	NA	4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_1	188.928134485047	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGACTGTTTATTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37469261	37478068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_37469419_37470373_37470658_37471631_37471753_37476242_37476383_37476457_37476560_37477762
tx.15500	chr6	-	338	2	Intergenic	novelGene_1244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGTCCCCTTGTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39539695	39538117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_39538218_39539457
tx.15501	chr6	-	1099	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000046947.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAGGAAGGATGTCACCAA	6122	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39552040	39550340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_39551190_39551790
tx.15502	chr6	+	2529	8	FSM	ENSMUSG00000046947.13	ENSMUST00000140364.8	3542	8	-6	1019	-6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	10.7437689582647	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGTTTTCTTCTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39550800	39564684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_39552141_39553296_39553444_39556596_39556726_39557929_39558026_39560744_39560997_39562660_39562790_39563774_39563829_39564302
tx.15503	chr6	-	600	2	NNC	ENSMUSG00000086582.2	novel	388	2	NA	NA	-33	-3001	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTATTGTACTTTGACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39569751	39564026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_39564438_39569562
tx.15504	chr6	+	447	4	FSM	ENSMUSG00000002416.14	ENSMUST00000135671.8	4371	4	6	3918	-3	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	748	junction_3	834.773555456142	22888	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACTGAGTTATGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39569513	39576398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_39569647_39573384_39573530_39575199_39575296_39576325
tx.15505	chr6	-	1692	3	ISM	ENSMUSG00000002413.16	ENSMUST00000101497.4	2253	18	101530	-1298	19591	1298	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_2	3	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTAATGATAATTGAGTTT	7071	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39600597	39589747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_39591220_39592594_39592730_39600512
tx.15506	chr6	-	616	2	ISM	ENSMUSG00000029918.10	ENSMUST00000031978.9	1107	3	5375	368	429	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1666	junction_1	0	520	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTGTTAGGATTGGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39782547	39779105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_39779479_39782304
tx.15507	chr6	-	641	3	FSM	ENSMUSG00000029918.10	ENSMUST00000031978.9	1107	3	90	376	-5	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	1131	junction_2	267.5	4194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGGAATGGCTGTTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39787832	39779113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_39779479_39782304_39782546_39787797
tx.15508	chr6	-	527	3	FSM	ENSMUSG00000029918.10	ENSMUST00000114797.2	500	3	-15	-12	-7	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_1	481	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGGAATGGCTGTTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39787834	39779113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_39779479_39782420_39782546_39787797
tx.15509	chr6	-	557	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000057716.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCCCCTTGTGGAAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39856675	39851935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_39852302_39853365_39853506_39856624
tx.1551	chr10	-	1196	8	FSM	ENSMUSG00000019942.14	ENSMUST00000020099.13	4375	8	23	3156	-5	22	multi-exon	FALSE	canonical	3	2056	junction_1	102.156542539739	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCACTGTGGTGGCTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69188745	69174131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_69174427_69176310_69176453_69176544_69176709_69178369_69178541_69180890_69181015_69181904_69182062_69185925_69185989_69188665
tx.15510	chr6	+	856	4	ISM	ENSMUSG00000029916.12	ENSMUST00000201342.4	785	8	2	15873	0	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	547	junction_1	54.1130503873347	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTACAGTGTTAGTTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40302420	40329951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_40302465_40306426_40306534_40324345_40324386_40329286
tx.15511	chr6	+	2213	16	FSM	ENSMUSG00000029916.12	ENSMUST00000031977.12	2531	16	318	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	517	junction_15	44.4424221762146	301	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGTGTAATCTAAATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40302423	40373696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_40302465_40306426_40306534_40324345_40324386_40329286_40329367_40333978_40334055_40341208_40341302_40343674_40343708_40345514_40345610_40353155_40353226_40358137_40358218_40360693_40360752_40363747_40363896_40364377_40364476_40369586_40369658_40371547_40371633_40372658
tx.15512	chr6	+	2173	15	ISM	ENSMUSG00000029916.12	ENSMUST00000031977.12	2531	16	4320	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	517	junction_14	45.600360274266	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGTGTAATCTAAATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40306425	40373696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_40306534_40324345_40324386_40329286_40329367_40333978_40334055_40341208_40341302_40343674_40343708_40345514_40345610_40353155_40353226_40358137_40358218_40360693_40360752_40363747_40363896_40364377_40364476_40369586_40369658_40371547_40371633_40372658
tx.15513	chr6	+	637	7	FSM	ENSMUSG00000029911.15	ENSMUST00000114779.9	4398	7	56	3705	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1713	junction_1	435.133695929577	9743	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGGTTATATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40448341	40457929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_40448394_40449004_40449068_40451598_40451660_40453300_40453442_40453681_40453770_40454856_40454946_40457786
tx.15514	chr6	+	808	7	NNC	ENSMUSG00000029911.15	novel	933	7	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1038.11106502789	572	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGGTTATATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40448384	40457929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_40448608_40449004_40449068_40451598_40451660_40453300_40453442_40453681_40453770_40454856_40454946_40457786
tx.15515	chr6	+	960	7	FSM	ENSMUSG00000029911.15	ENSMUST00000117411.8	933	7	-24	-3	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	282	junction_1	935.620961358462	2297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGGTTATATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40448384	40457929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_40448760_40449004_40449068_40451598_40451660_40453300_40453442_40453681_40453770_40454856_40454946_40457786
tx.15516	chr6	+	586	6	FSM	ENSMUSG00000029911.15	ENSMUST00000121360.8	1188	6	602	0	544	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2472	junction_3	238.868666844356	8646	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGGTTATATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40449003	40457929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_40449068_40451598_40451660_40453300_40453442_40453681_40453770_40454856_40454946_40457786
tx.15517	chr6	+	1858	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029882.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	1	1	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGGTGAGAAGTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41007584	41013899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_41008737_41008896_41008992_41009181_41009305_41013411
tx.15518	chr6	+	939	8	FSM	ENSMUSG00000029864.8	ENSMUST00000031897.8	930	8	-2	-7	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	4.42165358301205	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATTTCTGGGTCTGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42222866	42227382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_42223028_42223483_42223566_42223744_42223874_42224417_42224519_42224667_42224704_42226312_42226430_42226772_42226867_42227163
tx.15519	chr6	+	1148	3	FSM	ENSMUSG00000071506.5	ENSMUST00000095987.4	1147	3	-7	6	4	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAATTCCAGTGCCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42238896	42241483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_42238961_42240177_42240440_42240661
tx.15520	chr6	+	1440	2	ISM	ENSMUSG00000071506.5	ENSMUST00000095987.4	1147	3	921	3	921	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATTCCAGTGCCTCCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42239824	42241486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_42240440_42240661
tx.15521	chr6	+	892	5	ISM	ENSMUSG00000029863.14	ENSMUST00000156829.8	1439	12	-163	11357	-28	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_1	10.1087833095779	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACAGGAGGTTGGATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42241890	42246069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_42242132_42244432_42244584_42244827_42244996_42245140_42245223_42245819
tx.15522	chr6	+	3482	11	FSM	ENSMUSG00000029863.14	ENSMUST00000031895.13	3529	11	47	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_8	18.1	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTGCCTGGTGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42241965	42259442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_42242132_42244432_42244584_42244827_42244996_42245140_42245223_42245819_42245915_42246213_42246391_42250850_42250980_42253628_42253720_42256710_42256861_42257017_42257128_42257279
tx.15523	chr6	+	1042	4	NNC	ENSMUSG00000029863.14	novel	3529	11	NA	NA	-14	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	46.6118725934355	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTGATTTTGTGCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42241975	42259435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_42242132_42244432_42244584_42244827_42244910_42258782
tx.15524	chr6	-	628	4	NNC	ENSMUSG00000036667.15	novel	457	3	NA	NA	-7	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGGACTCTTCTTTAGTT	6082	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42687013	42667240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_42667458_42667970_42668127_42684416_42684551_42686892
tx.15525	chr6	-	2479	7	ISM	ENSMUSG00000029735.18	ENSMUST00000067888.14	2671	9	54892	-8	14580	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	4.45969605341988	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGTGGTATTAAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43588320	43321926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_43323835_43400554_43400667_43445935_43446083_43465808_43465905_43500817_43500891_43536876_43536947_43588247
tx.15526	chr6	-	2594	9	FSM	ENSMUSG00000029735.18	ENSMUST00000067888.14	2671	9	85	-8	-18	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	3.903123748999	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGTGGTATTAAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43643127	43321926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_43323835_43400554_43400667_43445935_43446083_43465808_43465905_43500817_43500891_43536876_43536947_43588247_43588320_43642693_43642752_43643069
tx.15527	chr6	-	761	4	NNC	ENSMUSG00000029735.18	novel	2671	9	NA	NA	4	8681	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.09624744987	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCTTCTTTTCATGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43643149	43559843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_43560395_43588247_43588320_43642693_43642752_43643069
tx.15528	chr6	-	941	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039419.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	457	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGTGATTTATGTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47167374	47161078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_47161996_47167350
tx.15529	chr6	-	1041	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039419.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	22	junction_1	0	256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAATTAGGGAGCCCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47165943	47161095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_47161996_47165802
tx.15530	chr6	-	1044	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039419.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	11	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATTCTGCTGAATTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47167209	47161123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_47161996_47165802_47165943_47167177
tx.15531	chr6	-	1076	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039419.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	11	267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCCATTAGGTGATTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47167375	47161084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_47161996_47165802_47165943_47167350
tx.15532	chr6	-	332	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039419.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	414	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGATGGCGAGTGATGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47167375	47166901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_47167209_47167350
tx.15533	chr6	+	1396	4	NNC	ENSMUSG00000039419.18	novel	6279	4	NA	NA	-7	-255	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.542057635833	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTGTTTTTTATTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47221313	47276249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_47221488_47248073_47248314_47273652_47273734_47275348
tx.15534	chr6	+	1088	7	ISM	ENSMUSG00000029686.16	ENSMUST00000031697.9	3161	22	65394	8	18	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	535	junction_4	53.3898138432999	221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGCAAGTGTATATTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47496647	47503065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_47496714_47497726_47497820_47500011_47500060_47500137_47500221_47500632_47500739_47501450_47501565_47502487
tx.15535	chr6	+	636	2	ISM	ENSMUSG00000029686.16	ENSMUST00000149531.2	581	3	951	-294	951	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	644	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATTTGGTTTTGTTTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47501448	47503007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_47501565_47502487
tx.15536	chr6	-	661	5	ISM	ENSMUSG00000029687.17	ENSMUST00000092648.13	2115	18	43834	-267	1299	45	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	896	junction_4	82.5450634502149	2588	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTTGTCCTAGAACATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47510760	47507207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_47507536_47508674_47508760_47508918_47509000_47509835_47509918_47510675
tx.15537	chr6	-	2359	10	FSM	ENSMUSG00000025823.10	ENSMUST00000077290.9	2399	10	40	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1547	junction_7	244.688060423022	319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTTTGCCTTTTATTTT	8930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47790324	47773074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_47773838_47775298_47775533_47776119_47776277_47777871_47778024_47780364_47780524_47780638_47780845_47783439_47783579_47783939_47784146_47785108_47785278_47790150
tx.15538	chr6	+	2745	5	FSM	ENSMUSG00000045466.19	ENSMUST00000101445.11	2761	5	16	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	2.77263412660235	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCTGTCTTGCCTTGACC	9729	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47930339	47942234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_47930517_47932750_47933105_47934409_47934537_47939458_47939567_47940255
tx.15539	chr6	-	564	5	FSM	ENSMUSG00000068551.13	ENSMUST00000114566.8	543	5	-24	3	-24	-3	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1.78535710713571	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTGTAGACCGAATGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48420994	48404633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_48404814_48418880_48418995_48419558_48419673_48420345_48420422_48420914
tx.15540	chr6	+	2024	4	NNC	ENSMUSG00000107476.4	novel	1776	6	NA	NA	11	-7987	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.96655480858378	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGGTCATGGTATCTGTT	2577	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48481281	48493359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_48481485_48485205_48485318_48488748_48489066_48491967
tx.15541	chr6	-	2252	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000044211.10	novel	537	1	NA	NA	-20	2173	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	674	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGGCTGGAAAAATGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48502044	48499314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_48500391_48500868
tx.15542	chr6	+	1733	4	FSM	ENSMUSG00000039347.8	ENSMUST00000040361.8	1789	4	50	6	0	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_1	1.24721912892465	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAAATGTCTGGCCTCTGC	6254	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48514598	48518729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48514789_48516157_48516206_48516973_48517101_48517361
tx.15543	chr6	+	1298	3	FSM	ENSMUSG00000073096.12	ENSMUST00000203627.2	666	3	-36	-596	-3	596	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	6.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTCTCTCTCTCTTTCTCT	8276	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48531726	48546059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48531896_48533888_48534029_48545070
tx.15544	chr6	+	2815	3	FSM	ENSMUSG00000073096.12	ENSMUST00000146245.4	308	3	-13	-2494	-1	-6	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTATTAGTTGGTCTTGGTC	8281	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48531731	48547649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48531828_48533888_48534029_48545070
tx.15545	chr6	+	382	2	FSM	ENSMUSG00000052751.17	ENSMUST00000130896.2	656	2	-39	313	1	-313	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCGCTCATGTCTCCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48570834	48571954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48570987_48571724
tx.15546	chr6	+	2500	3	FSM	ENSMUSG00000007216.7	ENSMUST00000204095.3	4143	3	-36	1679	-36	-1679	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_2	4.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGTGTCACTGTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48578960	48598482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48579055_48590111_48590194_48596158
tx.15547	chr6	-	759	3	NNC	ENSMUSG00000107640.2	novel	767	3	NA	NA	2151	2829	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTGGATAAGGGCAATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48597140	48588077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_48588402_48590644_48590731_48596791
tx.15548	chr6	-	547	2	ISM	ENSMUSG00000107640.2	ENSMUST00000203998.2	767	3	2156	42	2156	-42	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGGGCAGAGCTCTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48597135	48590948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_48591152_48596791
tx.15549	chr6	-	731	3	NNC	ENSMUSG00000107640.2	novel	767	3	NA	NA	-56	-96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTAATGCCTGGCCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48599347	48591002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_48591152_48596791_48596967_48598940
tx.15550	chr6	+	313	2	NNC	ENSMUSG00000007216.7	novel	4083	2	NA	NA	9350	25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTAGCCAGGCTCTCTT	778	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48599463	48600186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_48599644_48600053
tx.15551	chr6	-	273	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000007216.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTAGGAAGGGCAGTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48600199	48599512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_48599637_48600050
tx.15552	chr6	+	1373	2	FSM	ENSMUSG00000051124.7	ENSMUST00000054050.5	1384	2	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTATGATTGACTTCTTG	1300	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48653073	48655633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48653189_48654375
tx.15553	chr6	-	1178	7	FSM	ENSMUSG00000029810.16	ENSMUST00000204073.3	986	7	3	-195	3	7	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	0.577350269189626	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTGGGCTCTGCATTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48818068	48810744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_48811074_48811440_48811561_48812378_48812610_48812839_48812897_48813160_48813272_48815105_48815297_48817929
tx.15554	chr6	+	1074	7	FSM	ENSMUSG00000023367.15	ENSMUST00000101426.11	1540	7	-38	504	-38	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.11476292340825	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCTTGCTTTGTCACACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48818407	48822299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48818524_48819137_48819336_48819522_48819634_48820718_48820776_48820894_48821114_48821601_48821713_48822037
tx.15555	chr6	+	364	2	Intergenic	novelGene_1246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCCTGACTGACTGAGAG	6018	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48866410	48866824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_48866593_48866642
tx.15556	chr6	-	661	3	Intergenic	novelGene_1247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	7	287	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCAGCTTGTGTGCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48999402	48995450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_48995945_48997387_48997456_48999303
tx.15557	chr6	+	514	3	ISM	ENSMUSG00000029815.13	ENSMUST00000128616.6	2819	4	37	3844	-16	-627	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	781	junction_1	9	1893	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGTGTGTGGACTTTGG	332	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49050765	49059841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_49051038_49052019_49052199_49059778
tx.15558	chr6	+	734	4	FSM	ENSMUSG00000029815.13	ENSMUST00000128616.6	2819	4	39	2046	-14	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	781	junction_1	29.2232783924049	3392	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCCCTTTGATATGACT	334	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49050767	49061639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_49051038_49052019_49052199_49059778_49059861_49061436
tx.15559	chr6	-	2472	15	NNC	ENSMUSG00000029814.11	novel	4345	15	NA	NA	-119	1158	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	185.530073473993	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTCCTAAGTCCAATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49191757	49063903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_49064375_49064697_49064816_49065359_49065496_49067909_49067985_49071073_49071191_49081107_49081234_49082503_49082640_49084275_49084399_49085859_49085995_49094085_49094368_49111628_49111693_49111780_49111833_49145403_49145453_49190200_49190262_49191230
tx.15560	chr6	-	1895	14	NNC	ENSMUSG00000029814.11	novel	4345	15	NA	NA	724	998	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	192.301261430935	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAAAGTGGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49190371	49064063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_49064375_49064697_49064816_49065359_49065496_49067909_49067985_49071073_49071191_49081107_49081234_49082503_49082640_49084275_49084399_49085859_49085995_49094085_49094368_49111628_49111693_49111780_49111833_49145403_49145453_49190200
tx.15561	chr6	-	943	5	ISM	ENSMUSG00000029814.11	ENSMUST00000031838.9	4345	15	62	49354	62	-27177	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	409	junction_4	50.4455151624007	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTTTTGACTCTATAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49191829	49111510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_49111693_49111780_49111833_49145403_49145453_49190200_49190262_49191230
tx.15562	chr6	-	831	4	FSM	ENSMUSG00000029814.11	ENSMUST00000203680.2	711	4	-121	1	-121	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	219.654273803175	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTGTGTGTGTGTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49191759	49144847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_49145040_49145403_49145453_49190200_49190262_49191230
tx.15563	chr6	-	972	3	ISM	ENSMUSG00000029817.12	ENSMUST00000203820.3	2090	9	18443	-3	18442	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	544	junction_2	21.5	859	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGTCTCTTTATTTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49222502	49220854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_49221666_49221801_49221870_49222409
tx.15564	chr6	-	1824	8	FSM	ENSMUSG00000029817.12	ENSMUST00000031841.9	1799	8	-19	-6	-16	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_7	100.796420409392	357	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATTGTCTCTTTATTTGAT	4574	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49240983	49220855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_49221666_49221801_49221870_49222409_49222545_49223782_49223899_49225919_49226109_49227796_49227957_49229315_49229450_49240771
tx.15565	chr6	+	2317	3	FSM	ENSMUSG00000050786.9	ENSMUST00000055559.8	2351	3	34	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_2	7.5	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGGTTATTTTTGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49296241	49318516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_49296415_49310844_49311232_49316759
tx.15566	chr6	+	2381	4	NIC	ENSMUSG00000050786.9	novel	2372	4	NA	NA	10	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_2	28.0515398666257	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTATTTTTGGTTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49296250	49318519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_49296415_49310844_49311232_49316196_49316267_49316759
tx.15567	chr6	+	1428	7	NNC	ENSMUSG00000047115.16	novel	2730	7	NA	NA	40	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_5	11.0867789130417	40	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATAGGGTCAGATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49344712	49366214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_49344908_49349501_49349676_49353037_49353229_49355329_49355537_49359896_49360014_49362309_49362390_49365750
tx.15568	chr6	+	1429	7	FSM	ENSMUSG00000047115.16	ENSMUST00000060561.15	2730	7	42	1259	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_5	5.75663867972351	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATAGGGTCAGATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49344714	49366214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_49344908_49349501_49349676_49353037_49353229_49355329_49355537_49359896_49360014_49362306_49362390_49365750
tx.15569	chr6	+	1346	6	FSM	ENSMUSG00000047115.16	ENSMUST00000121903.2	1304	6	-42	0	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	14.4360659460949	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATAGGGTCAGATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49344714	49366214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_49344908_49349501_49349676_49353037_49353229_49355329_49355537_49359896_49360014_49365750
tx.15570	chr6	+	947	8	NNC	ENSMUSG00000023403.15	novel	3237	24	NA	NA	-65	-45618	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	62	junction_6	86.4121590083814	37	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTGTTGTTTTTTACTTT	108	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49372472	49400668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_49372512_49374994_49375042_49375129_49375183_49381699_49381799_49383683_49383759_49385986_49386146_49398617_49398734_49400309
tx.15571	chr6	+	2386	20	NNC	ENSMUSG00000023403.15	novel	1251	10	NA	NA	-61	5	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	62	junction_6	56.8725064900417	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTCATATTCTTTGCAAT	112	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49372476	49446440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_49372512_49374994_49375042_49375129_49375183_49381699_49381799_49383683_49383759_49385986_49386146_49402629_49402753_49414283_49414467_49414906_49415024_49415382_49415503_49416032_49416165_49417790_49417893_49419164_49419246_49422101_49422228_49423027_49423154_49423324_49423412_49424177_49424328_49434589_49434713_49442402_49442472_49446061
tx.15572	chr6	+	1027	8	NIC	ENSMUSG00000023403.15	novel	2988	23	NA	NA	-38	-45618	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	62	junction_6	82.8418705136725	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTGTTGTTTTTTACTTT	135	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49372499	49400668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_49372619_49374994_49375042_49375129_49375183_49381699_49381799_49383683_49383759_49385986_49386146_49398617_49398734_49400309
tx.15573	chr6	+	613	4	FSM	ENSMUSG00000029819.7	ENSMUST00000031843.7	566	4	-44	-3	-44	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.471404520791032	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCTCAGTGAAGAATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49799645	49806490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_49799782_49800577_49800766_49804468_49804550_49806282
tx.15574	chr6	+	2052	13	FSM	ENSMUSG00000038388.15	ENSMUST00000036236.15	2161	13	98	11	-36	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	978	junction_6	79.6350617225576	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACATAAAGAAATGCGTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50087326	50175556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_50087445_50120698_50120765_50122753_50122873_50135661_50135815_50139565_50139716_50140401_50140630_50155368_50155501_50157155_50157256_50157570_50157640_50160689_50160852_50171505_50171709_50173493_50173623_50175133
tx.15575	chr6	+	1026	6	ISM	ENSMUSG00000038388.15	ENSMUST00000036225.15	1896	14	69812	-111	-105	-52	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1077	junction_2	68.7098246250127	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTCTAACTTTTTATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50157174	50175515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_50157256_50157570_50157640_50160689_50160852_50171505_50171709_50173493_50173623_50175133
tx.15576	chr6	-	2100	9	ISM	ENSMUSG00000029821.16	ENSMUST00000170142.8	2133	10	10255	-2	10233	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_4	6.36396103067893	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTTGGCTGTTCTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50228494	50184380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_50185187_50193329_50193404_50196216_50196419_50197968_50198097_50199715_50199881_50204258_50204380_50206265_50206438_50222909_50223103_50228255
tx.15577	chr6	-	2257	10	FSM	ENSMUSG00000029821.16	ENSMUST00000170142.8	2133	10	-122	-2	84	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_4	6.09998988058258	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTTGGCTGTTCTATGT	8644	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50238871	50184380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_50185187_50193329_50193404_50196216_50196419_50197968_50198097_50199715_50199881_50204258_50204380_50206265_50206438_50222909_50223103_50228255_50228494_50238713
tx.15578	chr6	-	1055	7	ISM	ENSMUSG00000029822.16	ENSMUST00000114466.8	2916	21	57608	0	-12356	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_6	2.13437474581095	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAATGTGTGGGTTACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50289690	50273784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_50274142_50276295_50276419_50277903_50278031_50279996_50280142_50285270_50285416_50286292_50286372_50289611
tx.15579	chr6	-	624	3	FSM	ENSMUSG00000063694.6	ENSMUST00000161401.2	3123	3	16	2483	16	191	multi-exon	FALSE	canonical	3	4909	junction_2	335	39461	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACCACGGCTCTCCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50543502	50542025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_50542366_50542471_50542649_50543395
tx.15580	chr6	-	898	2	NNC	ENSMUSG00000108236.2	novel	506	3	NA	NA	-2	-15	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGCATCACTTCCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51379015	51377960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_51378561_51378717
tx.15581	chr6	-	555	2	ISM	ENSMUSG00000004980.17	ENSMUST00000204188.3	1518	10	6302	0	-286	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7029	junction_1	0	3086	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51440450	51439739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_51440235_51440390
tx.15582	chr6	-	941	6	ISM	ENSMUSG00000004980.17	ENSMUST00000203220.3	1638	11	3574	0	39	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6471	junction_5	470.686562374581	1249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51443178	51439739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_51440235_51440390_51440474_51441068_51441192_51441407_51441528_51442158_51442222_51443121
tx.15583	chr6	-	1740	11	FSM	ENSMUSG00000004980.17	ENSMUST00000203220.3	1638	11	-102	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5712	junction_10	720.046137410652	8876	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGTAATTATAGACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51446854	51439739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_51440235_51440390_51440474_51441068_51441192_51441407_51441528_51442158_51442222_51443121_51443203_51443282_51443385_51443474_51443686_51443885_51444033_51444164_51444276_51446650
tx.15584	chr6	-	396	3	ISM	ENSMUSG00000004980.17	ENSMUST00000204188.3	1518	10	-102	4212	10	-1154	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5712	junction_2	1299	3527	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGCTGCAAGGCCCCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51446854	51443951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_51444033_51444164_51444276_51446650
tx.15585	chr6	+	1778	6	FSM	ENSMUSG00000029836.16	ENSMUST00000031862.14	1889	6	111	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	882	junction_5	643.207773584866	1473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGATGACTTTTTTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51447620	51460684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_51447720_51448795_51448849_51452210_51452354_51455417_51455581_51458703_51458799_51459459
tx.15586	chr6	+	667	3	ISM	ENSMUSG00000029836.16	ENSMUST00000031862.14	1889	6	111	7959	-22	504	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	2482	junction_2	1.5	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGATAGCCTTAAACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51447620	51452725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_51447720_51448795_51448849_51452210
tx.15587	chr6	+	2452	7	FSM	ENSMUSG00000038301.16	ENSMUST00000049152.15	2480	7	28	0	28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	298	junction_5	39.9433626804532	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTTCGATTTCTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51500908	51567659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_51501015_51538997_51539045_51552882_51552970_51556829_51556931_51557281_51557381_51565195_51565409_51565860
tx.15588	chr6	+	2448	7	FSM	ENSMUSG00000038301.16	ENSMUST00000179365.8	2464	7	25	-9	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	112.931272118144	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTTCGATTTCTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51521527	51567659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_51521630_51538997_51539045_51552882_51552970_51556829_51556931_51557281_51557381_51565195_51565409_51565860
tx.15589	chr6	-	492	2	ISM	ENSMUSG00000059182.9	ENSMUST00000205174.2	661	3	11845	61	11845	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	532	junction_1	0	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGACTTAGCCTGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51837064	51836144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_51836551_51836978
tx.1559	chr10	-	1485	7	FSM	ENSMUSG00000003923.15	ENSMUST00000092430.11	4167	7	210	2472	210	510	multi-exon	FALSE	canonical	3	350	junction_5	32.9212022191711	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTTTCTGAAATTATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71073900	71063765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_71064530_71064916_71064974_71069186_71069283_71070694_71070845_71071372_71071444_71072745_71072862_71073669
tx.15590	chr6	-	1700	13	NNC	ENSMUSG00000059182.9	novel	3382	13	NA	NA	4	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_1	141.475753713804	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGACTTAGCCTGGTAT	832	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51989525	51836144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_51836616_51836978_51837080_51851454_51851568_51856750_51856829_51884866_51885002_51885348_51885413_51886279_51886405_51898259_51898344_51899242_51899321_51972996_51973105_51980060_51980087_51980629_51980736_51989314
tx.15591	chr6	-	1635	13	FSM	ENSMUSG00000059182.9	ENSMUST00000204778.3	3382	13	4	1743	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	457	junction_9	27.4919180043073	1302	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGACTTAGCCTGGTAT	832	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51989525	51836144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_51836551_51836978_51837080_51851454_51851568_51856750_51856829_51884866_51885002_51885348_51885413_51886279_51886405_51898259_51898344_51899242_51899321_51972996_51973105_51980060_51980087_51980629_51980736_51989314
tx.15592	chr6	-	1635	12	NNC	ENSMUSG00000059182.9	novel	3382	13	NA	NA	4	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	152.322515605312	197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGACTTAGCCTGGTAT	832	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51989525	51836144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_51836551_51836978_51837080_51851454_51851568_51856750_51856829_51884866_51885002_51885348_51885413_51886279_51886405_51898259_51898344_51899242_51899321_51972996_51973131_51980629_51980736_51989314
tx.15593	chr6	+	935	3	FSM	ENSMUSG00000085412.8	ENSMUST00000125374.8	391	3	-4	-540	-4	540	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_2	38	1382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTACACAACTAAGATCCA	774	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52079924	52090048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_52080017_52083750_52083877_52089331
tx.15594	chr6	-	2694	2	FSM	ENSMUSG00000029844.10	ENSMUST00000000964.6	2251	2	-435	-8	-435	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATCTTGTGTATTTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52135732	52132561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_52134070_52134546
tx.15595	chr6	+	701	2	Fusion	ENSMUSG00000087658.3_ENSMUSG00000087626.2	novel	253	2	NA	NA	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTAAAAGTCTCTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52135389	52151039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr6_+_52135667_52150615
tx.15596	chr6	+	754	3	Fusion	ENSMUSG00002075580.1_ENSMUSG00000087658.3	novel	713	3	NA	NA	-23	29	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	1.5	51	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGTCTTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52135388	52139276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr6_+_52135667_52137680_52137791_52138910
tx.15597	chr6	+	641	2	FSM	ENSMUSG00002075580.1_ENSMUSG00000087658.3	ENSMUST00000159006.2	253	2	-111	-277	-19	30	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGTCTTGCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52135392	52139277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_52135667_52138910
tx.15598	chr6	+	599	2	NNC	ENSMUSG00000085696.9	novel	575	2	NA	NA	-9154	40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGAATTGTGCTCTTTCT	2429	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52168949	52170040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_52169013_52169504
tx.15599	chr6	-	679	2	FSM	ENSMUSG00000038253.7	ENSMUST00000048794.7	1877	2	674	524	674	-524	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAAGAGAAAAAAAAAC	9705	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52180893	52179257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_52179812_52180768
tx.156	chr1	+	1266	6	FSM	ENSMUSG00000026111.16	ENSMUST00000027285.13	1414	6	11	137	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	180	junction_1	129.498416978741	729	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGACTGTTTATTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37469261	37478068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_37469575_37470373_37470658_37471631_37471753_37476242_37476383_37476457_37476560_37477762
tx.15600	chr6	-	984	2	FSM	ENSMUSG00000038236.9	ENSMUST00000048715.9	2009	2	-34	1059	-34	196	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGAATCAGTTCCTACCC	9920	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52194519	52192536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_52193011_52194009
tx.15601	chr6	-	1898	3	FSM	ENSMUSG00000038227.16	ENSMUST00000114425.3	851	3	-23	-1024	-23	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	1	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTTGTGCGGCTCTGCTCTT	9710	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52203192	52200076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_52201463_52202507_52202598_52202770
tx.15602	chr6	-	2045	2	FSM	ENSMUSG00000038227.16	ENSMUST00000048680.8	3226	2	1181	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACGTTGTGCGGCTCTGCT	9733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52203169	52200079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_52201463_52202507
tx.15603	chr6	-	1817	2	FSM	ENSMUSG00000000938.12	ENSMUST00000121043.2	1436	2	358	-739	299	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTTTTTGACTTCTTAT	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	52217476	52208162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_52209761_52217257
tx.15604	chr6	-	1952	2	FSM	ENSMUSG00000000938.12	ENSMUST00000125581.2	2565	2	613	0	613	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTTAATTTCACCTCTT	7395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52211306	52208176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_52209761_52210938
tx.15605	chr6	-	1402	2	Intergenic	novelGene_1248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTTTTTTATATGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52409276	52405897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_52407226_52409202
tx.15606	chr6	-	1648	3	Intergenic	novelGene_1249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	1.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTTTTTTATATGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52423142	52405897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_52407226_52411545_52411647_52422923
tx.15607	chr6	-	1706	3	Intergenic	novelGene_1250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGCACTTTTTTATATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52439388	52405901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_52407226_52411545_52411647_52439107
tx.15608	chr6	-	277	2	Intergenic	novelGene_1251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTAGGTATCCGTCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52460039	52458055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_52458245_52459951
tx.15609	chr6	-	1784	8	FSM	ENSMUSG00000029776.12	ENSMUST00000031788.9	1825	8	39	2	-35	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	833	junction_5	85.7178570684555	1474	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTGGAGCTTTTTGTT	2878	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52617335	52523214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_52524048_52525799_52525957_52533422_52533500_52534763_52534898_52596961_52597084_52599835_52599946_52607173_52607335_52617145
tx.1561	chr10	-	747	3	FSM	ENSMUSG00000037710.9	ENSMUST00000045887.9	1084	3	99	238	99	-238	multi-exon	FALSE	canonical	3	1606	junction_1	82	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTACATTGTACTTGTCA	1352	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71180685	71166547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_71166957_71172043_71172250_71180553
tx.15610	chr6	+	3266	18	FSM	ENSMUSG00000004535.13	ENSMUST00000080723.11	3285	18	14	5	-7	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	527	junction_12	67.9651854701079	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAATGACCTTTGTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52690727	52743760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_52690841_52698282_52698452_52704183_52704287_52706265_52706454_52710175_52710335_52713834_52713984_52714066_52714158_52716528_52716715_52718935_52719161_52719676_52719824_52721206_52721340_52723654_52723756_52728069_52728196_52730289_52730362_52734538_52734714_52735197_52735341_52742005_52742089_52742857
tx.15611	chr6	+	1624	8	ISM	ENSMUSG00000004535.13	ENSMUST00000080723.11	3285	18	30610	0	3462	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	527	junction_2	35.2651762091333	383	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCTTTGTAAATGATTCG	1002	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52721323	52743765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_52721340_52723654_52723756_52728069_52728196_52730289_52730362_52734538_52734714_52735197_52735341_52742005_52742089_52742857
tx.15612	chr6	+	1606	7	ISM	ENSMUSG00000004535.13	ENSMUST00000080723.11	3285	18	32938	5	5790	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	527	junction_1	35.6728966521581	932	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAATGACCTTTGTAAATG	2240	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52723651	52743760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_52723756_52728069_52728196_52730289_52730362_52734538_52734714_52735197_52735341_52742005_52742089_52742857
tx.15613	chr6	+	603	4	NNC	ENSMUSG00000108175.2	novel	2065	5	NA	NA	26206	-9170	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	8.60232526704263	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTCTTGTTCTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53821933	53835998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_53822096_53834180_53834359_53835502_53835591_53835823
tx.15614	chr6	+	641	5	NNC	ENSMUSG00000108175.2	novel	2065	5	NA	NA	26204	-9170	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	6.80073525436772	42	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTCTTGTTCTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53821931	53835998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_53822096_53828082_53828119_53834180_53834359_53835502_53835591_53835823
tx.15615	chr6	-	1568	12	NNC	ENSMUSG00000052955.6	novel	1511	13	NA	NA	10369	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_4	2.01235851101624	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTTTTGAATGACAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53945278	53850259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_53850510_53873408_53873592_53902117_53902292_53903794_53903894_53908891_53909024_53909396_53909520_53924703_53924771_53929514_53929595_53930488_53930548_53931494_53931610_53944740_53944860_53945111
tx.15616	chr6	-	693	4	NNC	ENSMUSG00000086946.8	novel	770	5	NA	NA	-47	203	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAATTGTCTCTCTTTTTG	9959	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54231943	54224950	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_54225230_54226170_54226372_54231550_54231690_54231869
tx.15617	chr6	-	1496	8	FSM	ENSMUSG00000019124.11	ENSMUST00000019268.11	4810	8	96	3218	96	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_2	7.92824967172092	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCCTTGTGTCTAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54543378	54486092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_54486348_54489033_54489215_54497684_54497851_54499744_54499940_54502493_54502697_54511397_54511580_54525208_54525369_54543224
tx.15618	chr6	-	930	2	ISM	ENSMUSG00000019124.11	ENSMUST00000019268.11	4810	8	-16	41830	-16	3998	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAACAAAAAAAACCCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54543490	54524704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_54525369_54543224
tx.15619	chr6	-	2708	4	FSM	ENSMUSG00000038074.17	ENSMUST00000046520.13	2694	4	-15	1	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	2.16024689946929	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGTTTTGTACATGTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54570177	54554589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_54556672_54562787_54562916_54566257_54566410_54569831
tx.1562	chr10	+	1154	8	FSM	ENSMUSG00000019923.15	ENSMUST00000160337.2	1138	8	-16	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_7	327.562862014955	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTGTTGATGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72490711	72504997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_72490810_72491814_72491906_72492069_72492194_72492361_72492529_72492648_72492706_72492877_72493018_72493097_72493221_72504643
tx.15620	chr6	-	900	4	NIC	ENSMUSG00000038074.17	novel	754	2	NA	NA	-18	15	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8.9566858950296	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAGGAGGGATGTCTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54570180	54559683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_54559955_54562787_54562916_54566257_54566410_54569831
tx.15621	chr6	+	1663	14	NNC	ENSMUSG00000005225.16	novel	6739	14	NA	NA	274	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	75.9312987520793	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTGCCCTAGTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54572369	54618018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_54572457_54590076_54590194_54592199_54592360_54593617_54593743_54596178_54596338_54597256_54597298_54599105_54599264_54601059_54601217_54601537_54601624_54605830_54605890_54606804_54606936_54607488_54607560_54612694_54612757_54617768
tx.15622	chr6	+	1378	12	NNC	ENSMUSG00000005225.16	novel	1838	14	NA	NA	12149	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	82.225853045687	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTGCCCTAGTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54592280	54618018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_54592360_54593617_54593743_54596178_54596338_54597256_54597298_54599105_54599264_54601059_54601217_54601537_54601624_54605830_54605890_54606804_54606936_54607488_54607560_54612694_54612757_54617768
tx.15623	chr6	+	823	3	FSM	ENSMUSG00000038065.14	ENSMUST00000190641.7	5303	3	73	4407	-57	-1697	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_2	0.5	232	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAATGTATTAAGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54658681	54676429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_54658917_54665990_54666114_54675964
tx.15624	chr6	+	1723	5	FSM	ENSMUSG00000058446.15	ENSMUST00000079869.13	5886	5	397	3766	43	-3766	multi-exon	FALSE	canonical	3	557	junction_1	47.955057084733	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCTAATGGTTAAGAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54794297	54866719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_54794458_54840884_54840981_54855333_54855440_54861749_54861832_54865440
tx.15625	chr6	+	1676	5	NNC	ENSMUSG00000058446.15	novel	5886	5	NA	NA	7344	-3766	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_1	273.671792481432	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCTAATGGTTAAGAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54801776	54866719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_54801890_54840884_54840981_54855333_54855440_54861749_54861832_54865440
tx.15626	chr6	+	1452	3	ISM	ENSMUSG00000058446.15	ENSMUST00000079869.13	5886	5	61448	3766	60916	-3766	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	641	junction_2	24	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCTAATGGTTAAGAATAC	268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54855348	54866719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_54855440_54861749_54861832_54865440
tx.15627	chr6	-	2980	9	ISM	ENSMUSG00000038058.15	ENSMUST00000168172.4	4064	12	27202	-2	-1006	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_4	3.21859829739593	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTTCTAATGGCCAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54921444	54900931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_54901995_54905019_54905104_54907160_54907245_54910544_54910629_54911379_54911464_54914338_54914423_54915122_54915207_54916288_54916373_54920115
tx.15628	chr6	-	541	3	ISM	ENSMUSG00000002797.10	ENSMUST00000131475.2	3960	4	3488	3068	3162	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_2	32	972	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGGCCGTGGGTTCTCCT	6188	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54966447	54962632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_54962987_54963817_54963954_54966396
tx.15629	chr6	-	785	4	FSM	ENSMUSG00000002797.10	ENSMUST00000204301.3	431	4	-70	-284	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_2	52.7320269538984	426	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGGCCGTGGGTTCTCCT	2719	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54969916	54962632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_54962987_54963817_54963954_54966484_54966543_54969679
tx.1563	chr10	+	1799	8	FSM	ENSMUSG00000019923.15	ENSMUST00000020081.11	1834	8	35	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	928	junction_7	94.1772102940808	591	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTGTCCTTGTTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72490711	72510796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_72490810_72491814_72491906_72492069_72492194_72492361_72492529_72492648_72492706_72492877_72493018_72493097_72493221_72509797
tx.15630	chr6	-	873	4	FSM	ENSMUSG00000002797.10	ENSMUST00000131475.2	3960	4	19	3068	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_2	27.1947707391615	1056	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGGCCGTGGGTTCTCCT	2719	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54969916	54962632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_54962987_54963817_54963954_54966396_54966543_54969679
tx.15631	chr6	+	2342	17	NNC	ENSMUSG00000029777.11	novel	2380	17	NA	NA	40	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	747.261037786495	337	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATCTGTTGTGTTTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55015031	55056485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_55015219_55023398_55023501_55025051_55025155_55027304_55027447_55029160_55029250_55030113_55030191_55032734_55032881_55037893_55038044_55040075_55040239_55042432_55042598_55045045_55045163_55046332_55046472_55050323_55050410_55052366_55052477_55053939_55054034_55054567_55054759_55056204
tx.15632	chr6	+	1229	9	NNC	ENSMUSG00000029777.11	novel	2380	17	NA	NA	13115	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1030.38729824033	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTGTTGTGTTTCCATTT	2155	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55040194	55056487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_55040239_55042432_55042598_55045045_55045163_55046332_55046472_55050323_55050410_55052366_55052477_55053939_55054034_55054567_55054759_55056204
tx.15633	chr6	+	874	6	ISM	ENSMUSG00000029777.11	ENSMUST00000003572.10	2380	17	31368	0	19280	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2758	junction_1	257.218506332651	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATCTGTTGTGTTTCCAT	8320	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55046359	55056485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_55046472_55050323_55050410_55052366_55052477_55053939_55054034_55054567_55054759_55056204
tx.15634	chr6	+	456	2	ISM	ENSMUSG00000029777.11	ENSMUST00000003572.10	2380	17	39592	0	27504	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3507	junction_1	0	256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATCTGTTGTGTTTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55054583	55056485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_55054759_55056204
tx.15635	chr6	-	489	5	FSM	ENSMUSG00000091625.9	ENSMUST00000170382.5	494	5	5	0	-4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1056	junction_2	222.021395365402	5246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGATTTGATTTATTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56681672	56678047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_56678275_56679080_56679154_56679990_56680019_56680298_56680395_56681607
tx.15636	chr6	+	877	5	ISM	ENSMUSG00000029787.11	ENSMUST00000031805.11	6670	16	28543	4107	2557	3753	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_3	11.056672193748	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCTCTGAAGTTAGCCCT	5444	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56720454	56734790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_56720537_56723265_56723384_56730349_56730404_56730822_56730912_56734256
tx.15637	chr6	-	3623	4	FSM	ENSMUSG00000059486.12	ENSMUST00000114323.8	3816	4	193	0	193	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_3	4.02768199119819	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTTGGTTTTTTGGTTTT	9896	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56774528	56754508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_56757399_56758785_56758952_56766203_56766686_56774443
tx.15638	chr6	-	555	2	ISM	ENSMUSG00000059486.12	ENSMUST00000114323.8	3816	4	8034	4372	7045	-4371	internal_fragment	FALSE	canonical	3	177	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGCAGATGATAATAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56766687	56758880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_56758952_56766203
tx.15639	chr6	-	619	3	ISM	ENSMUSG00000059486.12	ENSMUST00000114323.8	3816	4	212	4372	212	-4371	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_2	0.5	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGCAGATGATAATAGCT	9915	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56774509	56758880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_56758952_56766203_56766686_56774443
tx.1564	chr10	-	1018	2	NIC	ENSMUSG00000085456.3	novel	1477	4	NA	NA	-26	-1115	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCCGAGATTGTAGAGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73162885	73119206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_73119940_73162600
tx.15640	chr6	+	2933	10	FSM	ENSMUSG00000029781.8	ENSMUST00000031795.8	3009	10	76	0	76	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	670	junction_6	57.9369602069757	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCTGGCTTTATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56809119	56856343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_56809413_56826622_56826769_56827547_56827738_56828346_56828493_56833217_56833408_56837640_56837787_56845704_56845892_56850351_56850498_56852653_56852818_56855018
tx.15641	chr6	+	1586	3	ISM	ENSMUSG00000029781.8	ENSMUST00000031795.8	3009	10	41357	0	24083	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	825	junction_2	8.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCTGGCTTTATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56850400	56856343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_56850498_56852653_56852818_56855018
tx.15642	chr6	+	1361	2	ISM	ENSMUSG00000029781.8	ENSMUST00000031795.8	3009	10	43738	0	26464	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	825	junction_1	0	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCTGGCTTTATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56852781	56856343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_56852818_56855018
tx.15643	chr6	-	1613	9	FSM	ENSMUSG00000029780.15	ENSMUST00000031793.8	1676	9	63	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_8	16.5486970786222	400	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTTGTCCAGATCATAT	1267	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56900854	56859384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_56860044_56860659_56860861_56861693_56861857_56863648_56863739_56865307_56865394_56866447_56866495_56868476_56868547_56869774_56869874_56900656
tx.15644	chr6	+	1940	11	NNC	ENSMUSG00000029798.12	novel	4767	23	NA	NA	27040	-1136	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_3	5.18555686498567	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGCTTGCAAAGCTTTCA	5036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57614850	57640481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_57614910_57623111_57623217_57624049_57624158_57629016_57629155_57631373_57631518_57634993_57635161_57636660_57636725_57637075_57637147_57639050_57639235_57639327_57639431_57639684
tx.15645	chr6	+	261	3	NNC	ENSMUSG00000029798.12	novel	4767	23	NA	NA	27045	-17466	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	2.5	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATGGTATGTATGTTTTC	5041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57614855	57624151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_57614910_57623111_57623217_57624049
tx.15646	chr6	+	1600	11	NNC	ENSMUSG00000029798.12	novel	4767	23	NA	NA	27053	-1539	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.36283507111677	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTGCTGCATTCTTAAC	5049	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57614863	57640078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_57614986_57623111_57623217_57624049_57624158_57629016_57629155_57631373_57631518_57634993_57635161_57636660_57636725_57637075_57637147_57639050_57639235_57639327_57639431_57639684
tx.15647	chr6	-	804	2	FSM	ENSMUSG00000043162.8	ENSMUST00000053386.6	3573	2	1	2768	1	-2768	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_1	0	1404	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTGTTTGTCTTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57669062	57666328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_57666864_57668793
tx.15648	chr6	+	3066	9	FSM	ENSMUSG00000062190.13	ENSMUST00000050077.15	2509	9	403	-960	-48	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	58	junction_1	7.80924932371864	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATGGAGTCTTAATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57680023	57716427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_57680249_57689972_57690091_57699481_57699690_57700473_57700622_57701530_57701678_57703401_57703585_57709180_57709358_57711001_57711075_57714640
tx.15649	chr6	+	2143	16	FSM	ENSMUSG00000029802.14	ENSMUST00000114294.8	2178	16	-25	60	-7	-60	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_1	24.9849732617205	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTGTTCTTTTCTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58617523	58669436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_58617613_58632622_58632842_58640598_58640659_58641428_58641544_58642088_58642242_58643866_58644025_58646171_58646324_58648994_58649100_58651552_58651804_58655260_58655344_58660214_58660305_58661317_58661443_58662651_58662807_58666539_58666630_58667515_58667605_58669227
tx.1565	chr10	-	1181	2	Intergenic	novelGene_92	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCGTTTCTTGTGGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74553852	74550610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_74551462_74553522
tx.15650	chr6	+	760	2	FSM	ENSMUSG00000049232.4	ENSMUST00000062626.4	3007	2	29	2218	29	-2218	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_1	0	748	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGACCCATGGTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59185883	59186800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_59186167_59186323
tx.15651	chr6	-	739	3	ISM	ENSMUSG00000025889.14	ENSMUST00000114268.5	1280	6	13320	-4	11872	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	14	junction_1	1.5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTCCTGGTTCCTTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60792668	60708558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_60709146_60710087_60710172_60792600
tx.15652	chr6	-	1152	6	FSM	ENSMUSG00000025889.14	ENSMUST00000114268.5	1280	6	132	-4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	4.2614551505325	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTCCTGGTTCCTTTTAC	7706	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60805856	60708558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_60709146_60710087_60710172_60792600_60792744_60795307_60795350_60804464_60804612_60805707
tx.15653	chr6	+	418	3	NIC	ENSMUSG00000039578.18	novel	790	3	NA	NA	-17	-670	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGCCAAGCATTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61762077	61788032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_61762193_61787614_61787693_61787807
tx.15654	chr6	-	451	2	Intergenic	novelGene_1254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGCTGGGCTTGGTGGTGC	8486	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65016266	65012132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_65012324_65016006
tx.15655	chr6	+	733	3	FSM	ENSMUSG00000029920.10	ENSMUST00000205118.3	600	3	-61	-72	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_2	73	492	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAGCAGAGCATTATGGA	1724	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65019589	65021187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_65019715_65020189_65020430_65020819
tx.15656	chr6	+	720	3	FSM	ENSMUSG00000029920.10	ENSMUST00000204696.3	734	3	14	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_2	64	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAGCAGAGCATTATGGA	1968	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65019833	65021187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_65019946_65020189_65020430_65020819
tx.15657	chr6	+	1019	7	NNC	ENSMUSG00000029920.10	novel	2821	10	NA	NA	5	28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	28	junction_6	143.665603244324	23	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTGTGCTGAATGTTTGG	1989	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65019854	65044450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_65019946_65020189_65020430_65029603_65029782_65033386_65033553_65035049_65035117_65044030_65044123_65044265
tx.15658	chr6	+	1622	11	FSM	ENSMUSG00000029913.15	ENSMUST00000031973.13	1488	11	-55	-79	-18	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	49.012753442344	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACGGCTCTTGACTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65755953	65913361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_65756178_65771283_65771368_65808232_65808356_65846164_65846250_65847295_65847454_65858032_65858127_65860506_65860668_65863068_65863163_65878757_65878844_65904900_65905006_65912953
tx.15659	chr6	+	1982	3	FSM	ENSMUSG00000029913.15	ENSMUST00000173538.2	1938	3	-54	10	-20	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_2	4.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65755951	65809904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_65756178_65771283_65771368_65808232
tx.1566	chr10	-	1088	2	Intergenic	novelGene_93	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCGTTTCTTGTGGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74555807	74550610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_74551462_74555570
tx.15660	chr6	+	835	4	NIC	ENSMUSG00000029913.15	novel	2155	15	NA	NA	-15	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	66.8048567762022	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACGGCTCTTGACTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65755956	65913360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_65756178_65771283_65771368_65808232_65808356_65912953
tx.15661	chr6	+	2165	15	FSM	ENSMUSG00000029913.15	ENSMUST00000031976.14	2155	15	-10	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_5	23.473389188611	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACGGCTCTTGACTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65755961	65913360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_65756178_65771283_65771368_65808232_65808356_65832932_65833108_65834626_65834802_65836340_65836463_65839898_65839979_65846164_65846250_65847295_65847454_65858032_65858127_65860506_65860668_65863068_65863163_65878757_65878844_65904900_65905006_65912953
tx.15662	chr6	+	1324	9	NIC	ENSMUSG00000029913.15	novel	1488	11	NA	NA	0	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_3	53.8468604005842	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTACGGCTCTTGACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65756005	65913358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_65756178_65771283_65771368_65808232_65808356_65858032_65858127_65860506_65860668_65863068_65863163_65878757_65878844_65904900_65905006_65912953
tx.15663	chr6	+	534	2	ISM	ENSMUSG00000029913.15	ENSMUST00000081219.14	984	6	148873	-3	-7196	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	149	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACGGCTCTTGACTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65904878	65913360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_65905006_65912953
tx.15664	chr6	-	395	2	NNC	ENSMUSG00000107479.2	novel	479	2	NA	NA	-13	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	282	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTGTGGCCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66442696	66431171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_66431365_66442494
tx.15665	chr6	+	1349	6	FSM	ENSMUSG00000029910.15	ENSMUST00000116605.8	7557	6	17	6191	17	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	769	junction_5	83.3273064487266	2591	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGCCTTGTGTTTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66512390	66518013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_66512584_66512941_66513089_66514552_66514674_66515948_66516053_66516754_66516935_66517409
tx.15666	chr6	+	1007	5	FSM	ENSMUSG00000029910.15	ENSMUST00000101343.2	1725	5	-58	776	-15	-776	multi-exon	FALSE	canonical	3	834	junction_4	68.2692280606717	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCTGTTAAAACGCTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66512393	66517199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_66512584_66512941_66513089_66514552_66514674_66515948_66516053_66516754
tx.15667	chr6	-	471	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000107176.2	novel	423	1	NA	NA	-27	59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTACAGAACTCCAAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66852754	66852245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_66852510_66852547
tx.15668	chr6	-	401	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000107176.2	novel	423	1	NA	NA	-27	61	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTACAGAACTCCAAATAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66852754	66852243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_66852599_66852708
tx.15669	chr6	+	776	4	NIC	ENSMUSG00000036402.14	novel	1876	4	NA	NA	-12	24	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	104.748375749804	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCTGTTCTTAATAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66873394	66994937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_66873500_66891436_66891495_66992708_66992832_66994447
tx.1567	chr10	+	1154	2	FSM	ENSMUSG00000040009.7	ENSMUST00000159991.2	3331	2	1182	995	1182	-995	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAATTAACACAGGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74827854	74851735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_74827973_74850699
tx.15670	chr6	+	706	3	NIC	ENSMUSG00000036402.14	novel	1876	4	NA	NA	-6	18	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTATATTCTGTTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66873400	66994931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_66873500_66992708_66992832_66994447
tx.15671	chr6	+	1035	5	NIC	ENSMUSG00000036402.14	novel	4248	5	NA	NA	-2	11	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	98.0535567942336	218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAATGAAAGAACGTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66873404	66995141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_66873512_66891436_66891495_66920808_66920862_66992708_66992832_66994447
tx.15672	chr6	+	981	4	NIC	ENSMUSG00000036402.14	novel	739	5	NA	NA	-1	11	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	122.055542912051	598	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAATGAAAGAACGTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66873405	66995141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_66873512_66891436_66891495_66992708_66992832_66994447
tx.15673	chr6	+	810	2	NIC	ENSMUSG00000036402.14	novel	739	5	NA	NA	118841	11	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAATGAAAGAACGTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66992715	66995141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_66992832_66994447
tx.15674	chr6	-	1313	3	NIC	ENSMUSG00000036390.9	novel	1223	4	NA	NA	0	-4	intron_retention	FALSE	canonical	3	118	junction_1	4	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTCATTTCTCAACGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67014390	67012083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_67012757_67013661_67014096_67014184
tx.15675	chr6	-	1220	4	FSM	ENSMUSG00000036390.9	ENSMUST00000043098.9	1223	4	0	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_1	3.77123616632825	333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCATTTCTCAACGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67014390	67012082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_67012757_67013661_67013900_67013993_67014096_67014184
tx.15676	chr6	+	685	2	FSM	ENSMUSG00000087231.8	ENSMUST00000147548.3	698	2	18	-5	18	5	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGTGTTGACAGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67013606	67040750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_67013920_67040378
tx.15677	chr6	+	1629	8	FSM	ENSMUSG00000036371.7	ENSMUST00000203077.3	1617	8	-20	8	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	3189	junction_3	1320.70455841276	7956	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGTTTAAAGCTTTCACT	5852	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67243974	67261287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_67244394_67248181_67248333_67248870_67249012_67249122_67249213_67249847_67249923_67254744_67254923_67258631_67258806_67260886
tx.15678	chr6	+	1672	8	FSM	ENSMUSG00000036371.7	ENSMUST00000042990.7	15474	8	369	13433	5	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2187	junction_4	1676.62542517001	3998	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGTTTAAAGCTTTCACT	5854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67243976	67261287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_67244394_67248181_67248333_67248870_67249012_67249122_67249213_67249802_67249923_67254744_67254923_67258631_67258806_67260886
tx.15679	chr6	+	1604	8	FSM	ENSMUSG00000036371.7	ENSMUST00000204293.3	1336	8	-15	-253	7	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	2743	junction_3	1435.93298973887	7232	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACCAGTTTAAAGCTTTC	5856	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67243978	67261284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_67244394_67248181_67248333_67248870_67249012_67249140_67249213_67249847_67249923_67254744_67254923_67258631_67258806_67260886
tx.1568	chr10	+	1059	5	ISM	ENSMUSG00000009681.11	ENSMUST00000218465.2	1460	8	3949	-2	1538	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_2	6.60965203320114	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGGGGCCACAGCCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75013745	75018616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_75013856_75015955_75016091_75016966_75017073_75017400_75017564_75018071
tx.15680	chr6	+	1650	8	FSM	ENSMUSG00000036371.7	ENSMUST00000203436.3	1667	8	12	5	7	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	2187	junction_4	1760.87005396161	3629	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACCAGTTTAAAGCTTTCA	5856	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67243978	67261285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_67244394_67248181_67248333_67248870_67249012_67249140_67249213_67249802_67249923_67254744_67254923_67258631_67258806_67260886
tx.15681	chr6	+	458	2	ISM	ENSMUSG00000036371.7	ENSMUST00000203077.3	1617	8	14758	4	9890	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6747	junction_1	0	26707	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTAAAGCTTTCACTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67258752	67261291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_67258806_67260886
tx.15682	chr6	-	1213	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000096086.2_ENSMUSG00000107508.2	novel	582	1	NA	NA	-56	40	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAATTAATAATAATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67395091	67391374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_67392139_67394642
tx.15683	chr6	+	235	2	Intergenic	novelGene_1256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGTAAAGAAACAAAGATAA	990	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67897141	67898492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_67897239_67898354
tx.15684	chr6	+	369	2	NNC	ENSMUSG00000105463.2	novel	362	2	NA	NA	-88	2142	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTTTAATTCTGTCTGGA	3841	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68155696	68158690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_68155838_68158462
tx.15685	chr6	-	1621	9	FSM	ENSMUSG00000053604.6	ENSMUST00000066134.6	1829	9	205	3	-24	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.992156741649222	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGATCCTTTGTCTTCTCTGC	8210	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70769011	70742706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_70743633_70747977_70748078_70750413_70750556_70751234_70751304_70752092_70752158_70754335_70754396_70760544_70760601_70762528_70762590_70768869
tx.15686	chr6	-	1734	3	ISM	ENSMUSG00000053604.6	ENSMUST00000066134.6	1829	9	223	16348	-6	12	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAGAAAAAAAAAG	8228	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70768993	70759051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_70760601_70762528_70762590_70768869
tx.15687	chr6	+	185	1	Intergenic	novelGene_1257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	16	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGGTACCAGTCGGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70945780	70945965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_70945800_70946000
tx.15688	chr6	+	387	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068396.10	novel	354	1	NA	NA	-33	53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71101560	71102000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_71101768_71101820
tx.15689	chr6	+	400	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068396.10	novel	354	1	NA	NA	-33	58	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71101560	71102005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_71101903_71101947
tx.15690	chr6	+	892	2	FSM	ENSMUSG00000108206.2	ENSMUST00000204123.2	456	2	-170	-266	-170	266	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCGGTCTGTCGTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71141612	71143369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_71141830_71142694
tx.15691	chr6	+	1674	3	FSM	ENSMUSG00000053012.18	ENSMUST00000204436.3	1687	3	13	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	170	junction_2	14.5	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTCTTTGTGTCAGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71248673	71262303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_71248825_71259134_71259302_71260947
tx.15692	chr6	+	1152	6	FSM	ENSMUSG00000053119.12	ENSMUST00000059462.12	2654	6	95	1407	0	353	multi-exon	FALSE	canonical	3	336	junction_5	32.5490399243972	1898	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATTGTAAATGTCACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71520875	71557156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_71521018_71529382_71529444_71537880_71538061_71551098_71551221_71554714_71554830_71556624
tx.15693	chr6	-	1647	3	ISM	ENSMUSG00000053470.14	ENSMUST00000205470.2	1718	11	56	8177	56	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_2	138	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAGAAATATATGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71586067	71579769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_71581133_71584385_71584591_71585988
tx.15694	chr6	+	713	6	NNC	ENSMUSG00000052852.9	novel	3339	9	NA	NA	0	-26721	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_5	12.5857061780418	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGCCAGTGGACAATTGT	1584	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71684853	71758573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_71684986_71733347_71733421_71738348_71738426_71750171_71750293_71757705_71757820_71758377
tx.15695	chr6	+	1213	7	FSM	ENSMUSG00000052852.9	ENSMUST00000121469.2	3924	7	299	2412	-10	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	4.12310562561766	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGTTACAGCTTTTGGCT	1574	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71684843	71785282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_71684986_71733347_71733421_71738348_71738426_71750171_71750293_71757705_71757820_71772130_71772309_71784774
tx.15696	chr6	-	765	4	FSM	ENSMUSG00000052962.4	ENSMUST00000065103.4	3721	4	24	2932	-23	234	multi-exon	FALSE	canonical	3	1437	junction_1	9.53356643071673	6369	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTGTGCATTATTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71800770	71792912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_71793272_71794588_71794734_71795652_71795843_71800699
tx.15697	chr6	+	2745	14	NNC	ENSMUSG00000052337.16	novel	2728	15	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	429.104185911608	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTCTATCCCTTTTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71808314	71852242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_71808500_71821622_71821697_71823269_71823460_71828755_71828865_71829713_71829852_71830156_71830253_71833895_71834033_71837986_71838091_71839328_71839465_71840124_71840265_71845555_71845788_71848410_71848543_71849777_71849908_71851300
tx.15698	chr6	+	1543	5	NNC	ENSMUSG00000052337.16	novel	2518	13	NA	NA	-389	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	638.208821625023	210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTCTATCCCTTTTCAAA	8697	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71840143	71852242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_71840259_71845563_71845788_71848410_71848543_71849777_71849908_71851300
tx.15699	chr6	+	1557	5	NNC	ENSMUSG00000052337.16	novel	2518	13	NA	NA	-389	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	638.208821625023	390	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTCTATCCCTTTTCAAA	8697	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71840143	71852242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_71840265_71845555_71845788_71848410_71848543_71849777_71849908_71851300
tx.157	chr1	+	549	3	ISM	ENSMUSG00000026111.16	ENSMUST00000118059.3	1179	6	6959	0	5817	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	515	junction_1	7	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGACTGTTTATTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37476241	37478068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_37476383_37476457_37476560_37477762
tx.1570	chr10	+	1535	10	FSM	ENSMUSG00000033427.15	ENSMUST00000039925.8	3042	10	25	1482	-22	-1482	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.993807989999907	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTTGTGTAGTGTAGAT	1604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75242769	75276031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_75242994_75248600_75248773_75250823_75250912_75260326_75260422_75264014_75264177_75265795_75265966_75271979_75272062_75272709_75272753_75273890_75274046_75275687
tx.15700	chr6	-	295	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052337.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCTCTGACTGAGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71845736	71840150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_71840265_71845555
tx.15701	chr6	-	2595	24	NNC	ENSMUSG00000063884.7	novel	2581	24	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	209.003948009491	437	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTGTAAGCGTGTACAT	3036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71885746	71857621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_71858216_71858489_71858649_71859171_71859214_71860427_71860577_71861523_71861606_71862288_71862384_71862481_71862561_71865540_71865648_71866324_71866350_71866573_71866671_71869452_71869504_71870365_71870511_71871270_71871357_71871804_71871866_71872888_71872977_71874096_71874153_71875323_71875440_71878179_71878304_71879839_71879945_71880409_71880479_71882081_71882128_71884636_71884674_71884777_71884831_71885617
tx.15702	chr6	-	2607	23	NNC	ENSMUSG00000063884.7	novel	2581	24	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	276.455969175133	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTGTAAGCGTGTACAT	3036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71885746	71857621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_71858216_71858489_71858649_71859171_71859214_71860427_71860577_71861523_71861606_71862288_71862384_71862481_71862561_71865540_71865648_71866324_71866350_71866573_71866671_71869452_71869504_71870365_71870511_71871270_71871357_71871804_71871866_71872888_71872977_71874096_71874153_71875323_71875440_71878179_71878304_71879839_71879945_71880409_71880479_71882081_71882128_71884728_71884831_71885617
tx.15703	chr6	-	2585	23	NNC	ENSMUSG00000063884.7	novel	2581	24	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	281.652355904894	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTGTAAGCGTGTACAT	3036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71885746	71857621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_71858216_71858489_71858649_71859171_71859214_71860427_71860577_71861523_71861606_71862288_71862384_71862481_71862561_71865540_71865648_71866558_71866671_71869452_71869504_71870365_71870511_71871270_71871357_71871804_71871866_71872888_71872977_71874096_71874153_71875323_71875440_71878179_71878304_71879839_71879945_71880409_71880479_71882081_71882128_71884636_71884674_71884777_71884831_71885617
tx.15704	chr6	+	2186	7	FSM	ENSMUSG00000056091.13	ENSMUST00000069994.11	2258	7	64	8	33	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_5	8.15304987242334	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTGACTTTGAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72074639	72131547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_72074767_72105247_72105372_72109035_72109148_72119123_72119468_72124052_72124240_72126002_72126162_72130414
tx.15705	chr6	-	2150	13	FSM	ENSMUSG00000056305.5	ENSMUST00000070345.5	2244	13	3	91	3	-91	multi-exon	FALSE	canonical	3	571	junction_6	46.7748745470139	205	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGCTGTTGTTTCATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72322164	72295751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72296223_72296722_72296810_72298238_72298375_72302628_72302772_72305500_72305690_72306432_72306501_72310092_72310171_72313242_72313469_72314684_72314838_72315375_72315513_72316949_72317045_72319881_72319952_72321867
tx.15706	chr6	+	1451	4	FSM	ENSMUSG00000058706.6	ENSMUST00000077783.5	4605	4	-15	3169	2	-638	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	6.54896090146283	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAGAAGAAGAAGATGA	8311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72324301	72326962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_72324499_72324575_72324695_72325511_72325664_72325979
tx.15707	chr6	+	1769	3	ISM	ENSMUSG00000058706.6	ENSMUST00000077783.5	4605	4	-17	3169	0	-638	intron_retention	FALSE	canonical	3	33	junction_1	8	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAAGAAGAAGAAGATGA	8309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72324299	72326962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_72324499_72324575_72324695_72325511
tx.15708	chr6	+	1540	8	FSM	ENSMUSG00000055912.9	ENSMUST00000069695.9	1546	8	2	4	2	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	17.1583263538524	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTGCAGTGTGTTCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72332431	72336741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_72332528_72333113_72333296_72333704_72333753_72334032_72334120_72334931_72335000_72335290_72335419_72335561_72335740_72335988
tx.15709	chr6	+	1446	7	ISM	ENSMUSG00000055912.9	ENSMUST00000069695.9	1546	8	682	4	0	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_4	15.4704018478297	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTGCAGTGTGTTCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72333111	72336741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_72333296_72333704_72333753_72334032_72334120_72334931_72335000_72335290_72335419_72335561_72335740_72335988
tx.1571	chr10	+	654	4	FSM	ENSMUSG00000020180.11	ENSMUST00000020397.11	3036	4	467	1915	4	48	multi-exon	FALSE	canonical	3	3512	junction_3	116.998575489904	5512	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGAGGCTTTTTTGTTT	1869	False	NA	-56	True	NA	NA	NA	75353851	75371300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_75353960_75355147_75355295_75368010_75368204_75371094
tx.15710	chr6	-	1395	5	FSM	ENSMUSG00000055850.13	ENSMUST00000069580.12	1434	5	39	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	875	junction_2	66.4266512779321	5237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCGTGTGGTTCTGCTGTGT	8447	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72339376	72336696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72337626_72337857_72337933_72338099_72338210_72338394_72338523_72339223
tx.15711	chr6	-	743	3	FSM	ENSMUSG00000050732.10	ENSMUST00000059983.10	820	3	72	5	72	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_1	0.5	3022	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTACGAGGCGCTTTACTC	8165	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72367614	72362210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72362637_72365244_72365404_72367456
tx.15712	chr6	-	2807	9	FSM	ENSMUSG00000053907.11	ENSMUST00000059472.10	2804	9	0	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	591	junction_1	84.6271233116192	338	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTCTATTACTTGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72416541	72409778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72411379_72411963_72412098_72412188_72412372_72412793_72413013_72413179_72413324_72413399_72413513_72413977_72414101_72414353_72414432_72416328
tx.15713	chr6	-	3392	8	FSM	ENSMUSG00000053907.11	ENSMUST00000205335.2	3387	8	-2	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	761	junction_3	40.6724095420862	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTCTATTACTTGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72416541	72409778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72412098_72412188_72412372_72412793_72413013_72413179_72413324_72413399_72413513_72413977_72414101_72414353_72414432_72416328
tx.15714	chr6	-	1407	9	FSM	ENSMUSG00000053907.11	ENSMUST00000206692.2	1400	9	-1	-6	-1	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	259.956697115116	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTCGCCATGAACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72416540	72411521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72411723_72411963_72412098_72412188_72412372_72412793_72413013_72413179_72413324_72413399_72413513_72413977_72414101_72414353_72414432_72416328
tx.15715	chr6	+	1208	10	FSM	ENSMUSG00000056737.15	ENSMUST00000071044.13	1247	10	34	5	34	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_1	22.7389913671443	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTCTCTTCCTGTGTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72521407	72539961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_72521450_72532255_72532292_72532459_72532633_72532733_72532889_72533067_72533236_72534693_72534844_72535147_72535241_72535721_72535855_72538010_72538100_72539792
tx.15716	chr6	+	1245	10	FSM	ENSMUSG00000056737.15	ENSMUST00000114071.8	1400	10	149	6	-10	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	14.6439217576592	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTCTCTTCCTGTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72526404	72539960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_72526485_72532255_72532292_72532459_72532633_72532733_72532889_72533067_72533236_72534693_72534844_72535147_72535241_72535721_72535855_72538010_72538100_72539792
tx.15717	chr6	-	2255	13	FSM	ENSMUSG00000056698.12	ENSMUST00000114069.8	2164	13	-91	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_12	16.532795690183	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCTTCCAAGATGAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72575416	72542904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72543847_72545797_72545926_72546243_72546321_72552623_72552755_72554236_72554360_72554547_72554672_72556606_72556699_72557283_72557353_72563427_72563498_72564593_72564669_72571722_72572004_72573418_72573450_72575304
tx.15718	chr6	+	1968	11	FSM	ENSMUSG00000056666.14	ENSMUST00000070597.13	3027	11	122	937	-31	46	multi-exon	FALSE	canonical	3	404	junction_1	54.9894535342915	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTGTTGTTAAGTCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72575579	72584471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_72575780_72577955_72578139_72578458_72578701_72579637_72579840_72580636_72580835_72581848_72581969_72582954_72583094_72583367_72583478_72583555_72583723_72583856_72584017_72584224
tx.15719	chr6	+	1723	10	ISM	ENSMUSG00000056666.14	ENSMUST00000070597.13	3027	11	2543	937	2390	46	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	424	junction_5	53.2144508360067	296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTGTTGTTAAGTCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72578000	72584471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_72578139_72578458_72578701_72579637_72579840_72580636_72580835_72581848_72581969_72582954_72583094_72583367_72583478_72583555_72583723_72583856_72584017_72584224
tx.1572	chr10	+	1148	7	ISM	ENSMUSG00000006345.11	ENSMUST00000006508.10	2167	13	7051	-11	-871	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	319	junction_2	18.46994555728	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGGACTTTAGTGTCTTG	6296	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75416332	75422027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_75416488_75417130_75417268_75420653_75420842_75420991_75421120_75421220_75421334_75421424_75421539_75421714
tx.15720	chr6	+	944	6	ISM	ENSMUSG00000056666.14	ENSMUST00000176364.8	1647	10	6237	-107	492	46	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	424	junction_1	63.6383532156513	398	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTGTTGTTAAGTCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72581847	72584471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_72581969_72582954_72583094_72583367_72583478_72583555_72583723_72583856_72584017_72584224
tx.15721	chr6	+	505	3	ISM	ENSMUSG00000056666.14	ENSMUST00000176364.8	1647	10	8014	-107	-3	46	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	568	junction_2	0.5	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTGTTGTTAAGTCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72583624	72584471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_72583723_72583856_72584017_72584224
tx.15722	chr6	-	1701	4	FSM	ENSMUSG00000056429.5	ENSMUST00000070524.5	5013	4	250	3062	250	-3062	multi-exon	FALSE	canonical	3	270	junction_1	25.9786236911983	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAAGTGTGTTCTTGCATA	4669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72593733	72588476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72589094_72591054_72591139_72592506_72593433_72593659
tx.15723	chr6	+	717	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055239.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTTAGTGCGCCGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72819496	72825310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_72820122_72825218
tx.15724	chr6	-	725	2	ISM	ENSMUSG00000055239.11	ENSMUST00000204598.3	1743	7	50965	-60	1086	60	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1196	junction_1	0	626	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTGCATGAGGTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72825310	72819491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_72820114_72825207
tx.15725	chr6	-	1016	3	ISM	ENSMUSG00000055239.11	ENSMUST00000204598.3	1743	7	49738	-60	-141	60	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1059	junction_2	68.5	477	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTGCATGAGGTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72826537	72819491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_72820114_72825207_72825491_72826426
tx.15726	chr6	-	1576	7	NNC	ENSMUSG00000055239.11	novel	3251	7	NA	NA	3	60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	423.275980366894	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTGCATGAGGTTTTTTG	8744	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72876683	72819491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_72820114_72825207_72825491_72826426_72826606_72827370_72827468_72835756_72835897_72838740_72838909_72876596
tx.15727	chr6	-	527	2	FSM	ENSMUSG00000079523.9	ENSMUST00000114049.2	690	2	164	-1	164	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	26814	junction_1	0	12561	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGGCGTGGTCTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72935121	72934334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72934636_72934895
tx.15728	chr6	-	476	3	FSM	ENSMUSG00000079523.9	ENSMUST00000114050.8	570	3	89	5	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	26814	junction_1	200.5	40185	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTGGCGTGGTCTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72935382	72934334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_72934636_72934895_72935008_72935319
tx.15729	chr6	+	1257	9	FSM	ENSMUSG00000052738.15	ENSMUST00000064740.9	1519	9	258	4	-12	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1222	junction_2	134.074081667562	4302	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCTGTGAAGACTTTTT	2573	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73225622	73253890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_73225737_73233153_73233258_73237457_73237575_73240790_73241004_73241212_73241271_73246297_73246382_73247953_73248106_73252183_73252373_73253664
tx.1573	chr10	+	630	2	ISM	ENSMUSG00000006344.18	ENSMUST00000218807.2	2051	11	20766	0	6286	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATTTGGTGGTTCTAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75446200	75451021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_75446373_75450563
tx.15730	chr6	+	286	2	ISM	ENSMUSG00000052738.15	ENSMUST00000203632.2	534	4	26670	-3	14970	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1568	junction_1	0	978	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCTGTGAAGACTTTTT	3648	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73252312	73253890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_73252373_73253664
tx.15731	chr6	+	1014	4	Intergenic	novelGene_1259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.6707311029399	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAACATTCTTTCATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78818554	78847535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_78818675_78820381_78820558_78833904_78833986_78846898
tx.15732	chr6	+	825	3	Intergenic	novelGene_1260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	12	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCTTTCATTATTTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78818572	78847540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_78818675_78833904_78833986_78846898
tx.15733	chr6	-	1210	6	NNC	ENSMUSG00000030045.11	novel	5000	5	NA	NA	12	526	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	269.009293519759	1598	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGCATGTCAGTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81942927	81938428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_81938566_81938746_81939144_81939296_81939479_81940914_81941050_81941219_81941339_81942687
tx.15734	chr6	-	1272	5	FSM	ENSMUSG00000030045.11	ENSMUST00000032124.9	5000	5	12	3716	12	407	multi-exon	FALSE	canonical	3	603	junction_3	40.9839907768875	2127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCTGAGAATGCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81942927	81938547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_81939144_81939296_81939479_81940914_81941050_81941219_81941339_81942687
tx.15735	chr6	+	1772	3	FSM	ENSMUSG00000035104.15	ENSMUST00000042974.15	1773	3	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	1.5	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGCTTCGTGTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82018603	82070079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_82018883_82048035_82048224_82068774
tx.15736	chr6	+	896	3	FSM	ENSMUSG00000035104.15	ENSMUST00000150691.2	881	3	-37	22	28	-22	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	2	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGGAGTCTGTTTAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82018631	82024109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_82018883_82021295_82021490_82023658
tx.15737	chr6	+	869	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030042.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CTGCAACAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82624262	82629148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_82625038_82629054
tx.15738	chr6	-	1133	4	FSM	ENSMUSG00000030042.16	ENSMUST00000095786.6	1769	4	55	581	-4	34	multi-exon	FALSE	canonical	3	735	junction_3	133.522365999941	6305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCAGTGTGTTGCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82629855	82624262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_82625018_82628417_82628460_82629063_82629149_82629604
tx.15739	chr6	-	934	4	NNC	ENSMUSG00000030042.16	novel	1769	4	NA	NA	16615	35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	78	junction_3	429.604727886254	647	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCAGTGTGTTGCTCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82665731	82624261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_82625018_82628417_82628460_82629063_82629149_82665680
tx.1574	chr10	-	3192	15	FSM	ENSMUSG00000006342.16	ENSMUST00000095541.11	3151	15	-42	1	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_6	11.246768243294	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGGTTCCCGTCTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75479867	75472540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_75473205_75473334_75473441_75473515_75473693_75473798_75474072_75474180_75474430_75475175_75475335_75475428_75475573_75475667_75475937_75476022_75476109_75476289_75476492_75476608_75476784_75477266_75477435_75477958_75478111_75478296_75478505_75479707
tx.15740	chr6	-	2942	4	ISM	ENSMUSG00000000628.11	ENSMUST00000000642.11	5513	18	43565	0	-4580	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	581	junction_1	7.36357401145817	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCAGTGTGTGATTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82707870	82702005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_82704436_82705692_82705927_82706525_82706682_82707748
tx.15741	chr6	-	2473	2	ISM	ENSMUSG00000000628.11	ENSMUST00000000642.11	5513	18	45691	9	-2454	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	581	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCAAAATATTCAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82705744	82702014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_82704436_82705692
tx.15742	chr6	+	442	2	Intergenic	novelGene_1261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAGGAAGGAAGTGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82823753	82850316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_82823887_82850007
tx.15743	chr6	+	630	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100291.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGCCATGTATGCATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82856651	82863898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_82856716_82863332
tx.15744	chr6	-	1803	5	FSM	ENSMUSG00000068335.7	ENSMUST00000089651.6	1807	5	4	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	5.31507290636732	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTCTGCGTATGAATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83010448	83007914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83009042_83009211_83009397_83009515_83009610_83009747_83010048_83010351
tx.15745	chr6	-	1972	4	NIC	ENSMUSG00000068335.7	novel	1807	5	NA	NA	1	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	31	junction_1	4.92160768674447	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCTCTGCGTATGAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83010448	83007915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_83009397_83009515_83009610_83009747_83010048_83010351
tx.15746	chr6	-	1726	5	NIC	ENSMUSG00000068335.7	novel	1807	5	NA	NA	5	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_1	11.7686022959398	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCTGCGTATGAATGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83010444	83007913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_83009042_83009285_83009397_83009515_83009610_83009747_83010048_83010351
tx.15747	chr6	-	1629	8	FSM	ENSMUSG00000068329.13	ENSMUST00000089645.13	1725	8	96	0	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	429	junction_7	63.5991913695225	1439	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGGGGTTGGATCTTCTCC	1993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83031456	83028246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83028616_83028722_83028819_83029453_83029524_83029678_83029785_83030018_83030052_83030309_83030505_83030593_83030799_83030901
tx.15748	chr6	-	1614	7	NNC	ENSMUSG00000068329.13	novel	1725	8	NA	NA	-33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	203.551522279305	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGGGGTTGGATCTTCTCC	1993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83031456	83028246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_83028616_83028722_83028819_83029453_83029524_83029678_83029803_83030309_83030505_83030593_83030799_83030901
tx.15749	chr6	-	1073	7	FSM	ENSMUSG00000068329.13	ENSMUST00000134606.8	883	7	12	-202	12	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	465	junction_4	56.9846470551499	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCAAAAGTGGGGGTTGG	2643	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83030806	83028255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83028616_83028722_83028819_83029453_83029524_83029678_83029785_83030018_83030052_83030309_83030505_83030593
tx.1575	chr10	-	1630	10	ISM	ENSMUSG00000020196.11	ENSMUST00000001712.8	7417	37	4	99166	4	4788	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_8	9.01986833004551	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAAAGTGGATTTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75600146	75581111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_75581232_75582321_75582609_75583659_75583810_75585877_75586008_75587269_75587451_75589210_75589346_75590084_75590199_75590645_75590739_75591202_75591335_75599858
tx.15750	chr6	+	1445	12	FSM	ENSMUSG00000068328.11	ENSMUST00000092618.10	1769	12	198	126	5	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	960	junction_10	78.8006166859286	1807	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTCTGTTGCCTCTTTGG	5411	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83031699	83034663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83031814_83031891_83032030_83032109_83032261_83032486_83032672_83032878_83032952_83033047_83033122_83033348_83033416_83033522_83033626_83033739_83033860_83033958_83034075_83034256_83034376_83034478
tx.15751	chr6	+	1226	4	ISM	ENSMUSG00000009145.7	ENSMUST00000077502.5	3257	12	6731	111	6478	-111	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_3	2.49443825784929	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAAAAAATGATTTTTCTA	2276	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83041555	83044188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_83041625_83041774_83041966_83043070_83043262_83043413
tx.15752	chr6	+	918	9	FSM	ENSMUSG00000069678.11	ENSMUST00000165164.9	918	9	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_1	14.5408906192159	948	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCATCTTCCTTCTTAC	106	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83055326	83057836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83055460_83055875_83055982_83056096_83056250_83056414_83056487_83056620_83056727_83056902_83056937_83057034_83057122_83057530_83057612_83057690
tx.15753	chr6	+	1057	8	ISM	ENSMUSG00000069678.11	ENSMUST00000092614.9	866	9	233	-8	-7	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	182	junction_2	10.5521058929254	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCATCTTCCTTCTTAC	94	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83055603	83057836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_83055982_83056096_83056250_83056414_83056487_83056620_83056727_83056902_83056937_83057034_83057122_83057530_83057612_83057690
tx.15754	chr6	-	868	3	NIC	ENSMUSG00000087578.2	novel	891	3	NA	NA	-2	48	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	1	1	junction_2	2	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTTTTTGTTTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83086037	83083540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_83084172_83084723_83084788_83085864
tx.15755	chr6	+	648	3	FSM	ENSMUSG00000030037.10	ENSMUST00000113938.5	695	3	47	0	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	747	junction_2	17.5	6695	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTATTTTTCTCAGGTTGT	7430	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83086067	83086920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83086185_83086294_83086408_83086502
tx.15756	chr6	-	1286	5	FSM	ENSMUSG00000030035.15	ENSMUST00000146328.4	981	5	-43	-262	-24	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	42	junction_4	48.7769156466458	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTGTGATTCTGGGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83098411	83096025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83096702_83096848_83097026_83097165_83097269_83097752_83097855_83098183
tx.15757	chr6	-	1289	5	FSM	ENSMUSG00000030035.15	ENSMUST00000032111.11	1419	5	129	1	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_4	18.4390889145858	324	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTGTGATTCTGGGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83098411	83096025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83096702_83096848_83097026_83097165_83097269_83097752_83097858_83098183
tx.15758	chr6	-	1188	4	FSM	ENSMUSG00000030035.15	ENSMUST00000113936.10	1314	4	125	1	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_3	56.6627449623354	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTGTGATTCTGGGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83098415	83096025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83096702_83096848_83097026_83097165_83097269_83098183
tx.15759	chr6	-	314	2	ISM	ENSMUSG00000030034.13	ENSMUST00000032109.5	1038	5	-165	2820	-165	-235	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	117	junction_1	0	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGCCAAGCCCCAACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83102175	83101628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_83101759_83101991
tx.15760	chr6	+	609	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030034.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGCCTTGGACATTGTG	316	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83101903	83106142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_83102373_83106002
tx.15761	chr6	+	2285	12	NIC	ENSMUSG00000034930.17	novel	653	6	NA	NA	-174	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	24	junction_1	15.2196045821291	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGCCTTCTTTCACTTGTC	1476	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83119198	83129558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_83119543_83122911_83123112_83124469_83124532_83124632_83124687_83124808_83124927_83125086_83125297_83126444_83126540_83126652_83126760_83126952_83127082_83127888_83128058_83128217_83128323_83128866
tx.15762	chr6	+	2093	11	NNC	ENSMUSG00000034930.17	novel	2191	12	NA	NA	-1980	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_5	21.0817456582703	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGCCTTCTTTCACTTGTC	1093	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83122835	83129558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_83123112_83124469_83124532_83124632_83124687_83124808_83124927_83125086_83125297_83126368_83126540_83126652_83126760_83126952_83127082_83127888_83128058_83128217_83128323_83128866
tx.15763	chr6	+	2008	11	ISM	ENSMUSG00000034930.17	ENSMUST00000087938.11	3080	12	8753	3	-1972	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_8	8.87693640846886	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATGCCTTCTTTCACTTGT	1101	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83122843	83129557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_83123112_83124469_83124532_83124632_83124687_83124808_83124927_83125086_83125297_83126444_83126540_83126652_83126760_83126952_83127082_83127888_83128058_83128217_83128323_83128866
tx.15764	chr6	+	796	2	ISM	ENSMUSG00000034930.17	ENSMUST00000133226.2	750	3	482	-368	-73	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATGCCTTCTTTCACTTGT	6475	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83128217	83129557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_83128323_83128866
tx.15765	chr6	-	1196	11	FSM	ENSMUSG00000030032.15	ENSMUST00000125894.9	1216	11	20	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	8	junction_10	9.65453261426984	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTTGTCTGAGCACTCAG	9902	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83133359	83129690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83129879_83129956_83130032_83130234_83130398_83130497_83130599_83131481_83131610_83131903_83131958_83132051_83132119_83132459_83132523_83132630_83132854_83133156_83133228_83133296
tx.15766	chr6	+	933	5	ISM	ENSMUSG00000031865.17	ENSMUST00000113907.2	4205	26	11553	0	485	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	464	junction_2	43.2319326424346	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTGTCTGTGTGGCTCTG	8532	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83174480	83177099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_83174607_83174737_83174931_83175563_83175644_83176169_83176260_83176655
tx.15767	chr6	+	1918	12	ISM	ENSMUSG00000068323.13	ENSMUST00000039212.8	5123	25	40008	1180	-10	288	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	368	junction_2	56.2057907078168	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGCCAGTGGTGGACTTA	5716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83254364	83280746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_83254554_83256945_83257147_83262804_83262919_83265271_83265434_83266128_83266308_83267755_83267829_83272852_83272922_83273553_83273728_83274200_83274366_83276407_83276493_83277452_83277521_83280307
tx.15768	chr6	+	1999	13	NNC	ENSMUSG00000068323.13	novel	5123	25	NA	NA	-10	285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	25	junction_11	174.270144698779	17	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGTGGCCAGTGGTGGAC	5716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83254364	83280743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_83254554_83256945_83257147_83262804_83262919_83265271_83265434_83266128_83266308_83267755_83267829_83272852_83272922_83273553_83273728_83274200_83274366_83276407_83276493_83276591_83276676_83277452_83277521_83280307
tx.15769	chr6	+	2191	11	NIC	ENSMUSG00000068323.13	novel	5123	25	NA	NA	-8	677	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	81	junction_2	130.075362770972	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGCCACATCTGGCTCTG	5718	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83254366	83281135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_83254554_83256945_83257147_83265271_83265434_83266128_83266308_83267755_83267829_83272852_83272922_83273553_83273728_83274200_83274366_83276407_83276493_83277452_83277521_83280307
tx.1577	chr10	-	664	3	NNC	ENSMUSG00000001666.9	novel	649	3	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_2	232.5	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGACTTCTTTGCTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75609250	75607063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_75607341_75608571_75608748_75609039
tx.15770	chr6	+	1113	8	ISM	ENSMUSG00000068323.13	ENSMUST00000039212.8	5123	25	51907	1184	1647	284	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	410	junction_5	38.841908778419	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAAGTGGCCAGTGGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83266263	83280742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_83266308_83267755_83267829_83272852_83272922_83273553_83273728_83274200_83274366_83276407_83276493_83277452_83277521_83280307
tx.15771	chr6	-	2063	8	NNC	ENSMUSG00000005667.9	novel	2085	8	NA	NA	9	-21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	900.061562520326	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGGAATGCGTTTCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83294579	83282693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_83283792_83285914_83286041_83286443_83286537_83287393_83287502_83288183_83288345_83288793_83288917_83290343_83290529_83294410
tx.15772	chr6	-	1276	3	ISM	ENSMUSG00000005667.9	ENSMUST00000005810.9	2085	8	8051	63	-248	-63	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2445	junction_1	23.5	335	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGGGTTTTTTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83286537	83282735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_83283792_83285914_83286041_83286443
tx.15773	chr6	-	912	2	FSM	ENSMUSG00000005667.9	ENSMUST00000141044.2	627	2	290	-575	290	-292	multi-exon	FALSE	canonical	3	2445	junction_1	0	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGAGTTGTGTGTCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83285999	83282964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83283792_83285914
tx.15774	chr6	-	1411	5	ISM	ENSMUSG00000005667.9	ENSMUST00000005810.9	2085	8	6366	66	353	-66	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2445	junction_1	123.51998826101	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGTTGGGTTTTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83288222	83282738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_83283792_83285914_83286041_83286443_83286537_83287393_83287502_83288191
tx.15775	chr6	-	1784	8	FSM	ENSMUSG00000005667.9	ENSMUST00000005810.9	2085	8	9	292	9	-292	multi-exon	FALSE	canonical	3	2400	junction_5	123.349677166756	3431	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGAGTTGTGTGTCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83294579	83282964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83283792_83285914_83286041_83286443_83286537_83287393_83287502_83288191_83288345_83288793_83288917_83290343_83290529_83294410
tx.15776	chr6	+	622	4	ISM	ENSMUSG00000043131.15	ENSMUST00000101245.4	2292	7	-42	8601	7	-232	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	304	junction_3	27.6043474836845	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTAACCCCGTGGAGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83303024	83311193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_83303250_83306848_83307016_83309435_83309530_83311057
tx.15777	chr6	+	4308	6	FSM	ENSMUSG00000043131.15	ENSMUST00000055261.11	4412	6	24	80	4	-79	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_4	40.3554209493595	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTTTGAAGTGTGTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83303021	83320678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83303250_83306848_83307016_83309435_83309530_83311057_83311192_83315262_83315427_83317157
tx.15778	chr6	+	542	4	FSM	ENSMUSG00000045160.15	ENSMUST00000136501.2	2312	4	30	1740	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	755	junction_1	124.478467571259	3054	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGTGCCATGCTTCAGG	379	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83326457	83335378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83326537_83328247_83328372_83330023_83330113_83335128
tx.15779	chr6	+	464	3	FSM	ENSMUSG00000045160.15	ENSMUST00000055875.14	709	3	225	20	225	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	998	junction_1	19	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGTGCCATGCTTCAGG	500	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83328246	83335378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83328372_83330023_83330113_83335128
tx.1578	chr10	-	646	3	FSM	ENSMUSG00000001666.9	ENSMUST00000001716.8	649	3	6	-3	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	462	junction_2	12	1526	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGACTTCTTTGCTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75609242	75607063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_75607341_75608571_75608748_75609049
tx.15780	chr6	-	1563	3	ISM	ENSMUSG00000034832.16	ENSMUST00000056191.2	2523	4	4	5005	1	1047	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCACCCCTGCTGGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83418656	83380425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_83381807_83418198_83418256_83418531
tx.15781	chr6	-	932	6	NIC	ENSMUSG00000014554.14	novel	1107	7	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	23	junction_5	77.3356321497406	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTTGTTCGTTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83483889	83457198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_83457419_83457824_83457925_83458328_83458445_83463965_83464114_83467402_83467591_83483729
tx.15782	chr6	-	952	6	FSM	ENSMUSG00000014554.14	ENSMUST00000113888.3	1007	6	55	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	78.3019795407498	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTTGTTCGTTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83483896	83457198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83457419_83458328_83458445_83463965_83464114_83467402_83467591_83473667_83473781_83483729
tx.15783	chr6	-	1053	7	FSM	ENSMUSG00000014554.14	ENSMUST00000014698.10	1107	7	54	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	197	junction_5	13.5369863706809	999	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTTGTTCGTTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83483897	83457198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83457419_83457824_83457925_83458328_83458445_83463965_83464114_83467402_83467591_83473667_83473781_83483729
tx.15784	chr6	-	2100	10	FSM	ENSMUSG00000006906.11	ENSMUST00000068054.9	2364	10	271	-7	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	7.14920352984241	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGAGTGATTTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83549440	83520198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83521019_83524212_83524313_83528925_83529039_83533256_83533395_83534418_83534544_83538656_83539024_83540804_83540901_83541162_83541239_83547284_83547502_83549392
tx.15785	chr6	-	1386	5	NNC	ENSMUSG00000085794.6	novel	1435	6	NA	NA	5437	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	41	junction_3	36.2724068680312	83	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTAGGCGGACTTTGCTT	2721	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83675088	83669785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_83670449_83671329_83671456_83672566_83672939_83673961_83674051_83674952
tx.15786	chr6	+	1270	3	FSM	ENSMUSG00000034777.3	ENSMUST00000037807.3	1242	3	-28	0	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_1	5	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCTTCTGTCCCTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83688217	83715295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83688526_83710080_83710269_83714521
tx.15787	chr6	-	667	2	FSM	ENSMUSG00000099354.7	ENSMUST00000189308.3	546	2	-121	0	-98	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATGGCTGGTGACCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83739945	83738737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83739043_83739583
tx.15788	chr6	-	698	2	NNC	ENSMUSG00000099354.7	novel	546	2	NA	NA	-98	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATGGCTGGTGACCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83739945	83738737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_83739074_83739583
tx.15789	chr6	-	1347	5	ISM	ENSMUSG00000014748.14	ENSMUST00000014892.8	2984	6	674	1519	619	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	526	junction_1	53.5397048927242	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACATTGGCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83752121	83747385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_83748286_83748428_83748532_83749223_83749292_83750691_83750846_83751999
tx.1579	chr10	-	1846	5	FSM	ENSMUSG00000001665.12	ENSMUST00000001715.10	1880	5	30	4	17	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	2.34520787991171	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAATGGTTTTGCTTCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75617218	75609952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_75610845_75611704_75611882_75612577_75612729_75613934_75614023_75616680
tx.15790	chr6	-	1424	6	FSM	ENSMUSG00000014748.14	ENSMUST00000014892.8	2984	6	37	1523	14	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	526	junction_1	47.9474712576169	1868	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAACATTGGC	9749	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83752758	83747389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83748286_83748428_83748532_83749223_83749292_83750691_83750846_83751999_83752080_83752635
tx.15791	chr6	+	1312	10	FSM	ENSMUSG00000034744.14	ENSMUST00000113851.8	1323	10	13	-2	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	71.6054001687955	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGGTGTCATCTTCCATA	9317	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83772022	83779538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83772231_83773888_83773974_83774158_83774258_83774937_83775080_83775525_83775637_83776252_83776366_83777252_83777341_83778072_83778171_83778479_83778559_83779249
tx.15792	chr6	+	1290	10	FSM	ENSMUSG00000034744.14	ENSMUST00000146117.8	1049	10	-19	-222	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	70.680816193489	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGGTGTCATCTTCCATA	9465	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83772170	83779538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83772357_83773888_83773974_83774158_83774258_83774937_83775080_83775525_83775637_83776252_83776366_83777252_83777341_83778072_83778171_83778479_83778559_83779249
tx.15793	chr6	+	1200	10	FSM	ENSMUSG00000034744.14	ENSMUST00000037376.14	1405	10	205	0	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	202	junction_1	21.8281729836116	687	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGGTGTCATCTTCCATA	9463	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83772168	83779538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83772265_83773888_83773974_83774158_83774258_83774937_83775080_83775525_83775637_83776252_83776366_83777252_83777341_83778072_83778171_83778479_83778559_83779249
tx.15794	chr6	+	1105	9	ISM	ENSMUSG00000034744.14	ENSMUST00000113851.8	1323	10	1878	-2	-126	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	237	junction_1	14.7648230602334	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGGTGTCATCTTCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83773887	83779538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_83773974_83774158_83774258_83774937_83775080_83775525_83775637_83776252_83776366_83777252_83777341_83778072_83778171_83778479_83778559_83779249
tx.15795	chr6	-	3297	5	FSM	ENSMUSG00000045896.15	ENSMUST00000058383.9	3982	5	28	657	0	-657	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_4	4.71036092035419	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTCCAGGTTATTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83808695	83783039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83785875_83786880_83787058_83791703_83791852_83808252_83808311_83808616
tx.15796	chr6	-	718	4	FSM	ENSMUSG00000045896.15	ENSMUST00000145593.8	649	4	-13	-56	-13	56	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_3	4.98887651569859	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCACTGTATCTTTCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83808708	83786637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_83787058_83791703_83791852_83808252_83808311_83808616
tx.15797	chr6	-	5397	22	FSM	ENSMUSG00000033769.17	ENSMUST00000160197.6	5439	22	43	-1	-2	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	201	junction_13	26.9684454901315	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTTGTCTTGTGAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85046452	84595467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_84598494_84602106_84602220_84723882_84723957_84768222_84768365_84812022_84812203_84820990_84821126_84825747_84825860_84828832_84828943_84830558_84830665_84831682_84831781_84832456_84832529_84835369_84835491_84837154_84837202_84837616_84837701_84867498_84867568_84885094_84885272_84966306_84966512_84980029_84980076_84980176_84980268_84981970_84982019_84988299_84988466_85046277
tx.15798	chr6	-	1039	8	ISM	ENSMUSG00000033769.17	ENSMUST00000046334.15	3540	17	-28	56264	-10	-496	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	217	junction_2	23.9863906992175	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGAGTTGTTATTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85046467	84867451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_84867568_84885094_84885272_84966306_84966512_84980029_84980076_84980176_84980268_84981970_84982019_84988299_84988466_85046277
tx.15799	chr6	-	2073	6	ISM	ENSMUSG00000033769.17	ENSMUST00000160783.4	1565	7	28	43096	1	-942	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	217	junction_1	24.1776756533791	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCTTAGTGCATGAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85046456	84964968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_84966512_84980029_84980076_84980176_84980268_84981970_84982019_84988299_84988466_85046277
tx.158	chr1	-	385	3	ISM	ENSMUSG00000060771.16	ENSMUST00000193669.2	1981	8	-32	15003	-26	-9212	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	3	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGGTGGACACTGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37904186	37888354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_37888528_37894325_37894455_37904103
tx.1580	chr10	-	1001	5	FSM	ENSMUSG00000001663.11	ENSMUST00000001713.10	1037	5	36	0	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	2.87228132326901	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTCCGTGTTGTTTCTTT	9612	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75634382	75619646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_75620068_75622628_75622806_75629910_75630062_75632876_75632965_75634218
tx.15800	chr6	-	953	7	NNC	ENSMUSG00000033769.17	novel	565	3	NA	NA	25	-8780	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	124.02071959511	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTCCAGTCTCCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85046414	84972806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_84973216_84974298_84974355_84980029_84980076_84980176_84980268_84981970_84982019_84988299_84988466_85046277
tx.15801	chr6	-	2147	5	ISM	ENSMUSG00000033769.17	ENSMUST00000160783.4	1565	7	-7	56575	4	3352	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	244	junction_3	17.9217047180228	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATAAAGTTATGGATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85046491	84978447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_84980076_84980176_84980268_84981970_84982019_84988299_84988466_85046277
tx.15802	chr6	-	594	3	FSM	ENSMUSG00000033769.17	ENSMUST00000162786.2	565	3	-21	-8	6	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	244	junction_1	24	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGAGTAGTCTGCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85046478	84981791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_84982019_84988299_84988466_85046277
tx.15803	chr6	-	1235	3	FSM	ENSMUSG00000033735.10	ENSMUST00000045986.8	1230	3	-5	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	345	junction_2	5	3657	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGAGTGTGCGTTGTCCTTC	7977	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85114753	85110659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_85111271_85113804_85114096_85114420
tx.15804	chr6	-	333	3	NIC	ENSMUSG00000033720.13	novel	638	3	NA	NA	-51	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	2	junction_1	4	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85310455	85295853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_85295952_85296503_85296573_85310289
tx.15805	chr6	+	2486	13	FSM	ENSMUSG00000033706.14	ENSMUST00000045693.8	2486	13	-6	6	-6	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	411	junction_7	60.725246442938	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTTTGCAACAATGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85408964	85423411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_85409083_85415089_85415199_85415731_85415872_85416638_85416758_85417087_85417158_85417621_85417727_85418541_85418605_85418719_85418791_85419092_85419200_85419580_85419638_85421224_85421320_85421899_85421971_85422050
tx.15806	chr6	-	606	2	ISM	ENSMUSG00000030008.10	ENSMUST00000032080.9	1038	5	3645	0	3563	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_1	0	288	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGGTTTGTGCCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85424620	85423791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_85424280_85424502
tx.15807	chr6	-	1017	5	FSM	ENSMUSG00000030008.10	ENSMUST00000032080.9	1038	5	21	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_4	18.9786063766547	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGGTTTGTGCCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85428244	85423791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_85424280_85424502_85424671_85424917_85425028_85425472_85425574_85428094
tx.15808	chr6	-	1024	5	FSM	ENSMUSG00000030008.10	ENSMUST00000126805.8	953	5	57	-128	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_4	38.4991883031318	320	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGGTTTGTGCCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85428895	85423791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_85424280_85424502_85424671_85424917_85425028_85425472_85425574_85428738
tx.15809	chr6	+	1848	12	FSM	ENSMUSG00000030007.9	ENSMUST00000032078.9	2441	12	505	88	0	-88	multi-exon	FALSE	canonical	3	5555	junction_1	301.70819463638	17381	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTGTGTTTTTCATAAA	5115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85429000	85445369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_85429110_85436096_85436251_85436923_85437031_85438026_85438153_85438489_85438543_85439007_85439180_85441761_85441927_85442881_85443071_85443605_85443704_85444008_85444142_85444560_85444768_85445034
tx.1581	chr10	-	941	5	FSM	ENSMUSG00000033318.8	ENSMUST00000038257.7	1370	5	427	2	9	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	6.29980158417708	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTCCTTTTTTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75670288	75667680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_75667929_75668228_75668403_75668494_75668646_75669485_75669574_75670008
tx.15810	chr6	+	533	2	ISM	ENSMUSG00000030007.9	ENSMUST00000204592.3	1544	11	15496	-105	5436	-88	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6547	junction_1	0	4317	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTGTGTTTTTCATAAA	2859	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85444569	85445369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_85444768_85445034
tx.15811	chr6	-	1017	2	FSM	ENSMUSG00000057103.12	ENSMUST00000161198.4	1021	2	2	2	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCTAATGCATGTGATGG	9866	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85892667	85887137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_85888003_85892515
tx.15812	chr6	+	1193	5	FSM	ENSMUSG00000054226.14	ENSMUST00000202803.4	716	5	-5	-472	-5	47	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_1	23.847169643377	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGCAACTTGGGTTTTTT	3404	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85892714	85905549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_85892773_85898404_85898494_85901341_85901505_85904222_85904346_85904789
tx.15813	chr6	+	877	6	FSM	ENSMUSG00000054226.14	ENSMUST00000067137.14	2103	6	-14	1240	-5	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_1	21.35790251874	1331	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACTCTAAGCCAGGTGTG	3404	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85892714	85906024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_85892773_85898404_85898494_85901341_85901505_85904222_85904346_85904789_85904967_85905757
tx.15814	chr6	+	820	5	ISM	ENSMUSG00000054226.14	ENSMUST00000067137.14	2103	6	5675	1240	5624	17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_3	15.6903632845132	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACTCTAAGCCAGGTGTG	9093	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85898403	85906024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_85898494_85901341_85901505_85904222_85904346_85904789_85904967_85905757
tx.15815	chr6	-	1190	9	FSM	ENSMUSG00000030002.16	ENSMUST00000032071.13	6435	9	10	5235	10	240	multi-exon	FALSE	canonical	3	240	junction_7	14.8070928949608	851	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCTGAACATTTTTAACT	7330	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85938639	85924484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_85924759_85926599_85926780_85926999_85927076_85927495_85927543_85929286_85929348_85930352_85930477_85935565_85935698_85936197_85936274_85938419
tx.15816	chr6	+	771	3	FSM	ENSMUSG00000030001.5	ENSMUST00000032070.4	759	3	-12	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGCTTGCTTGGAGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85994160	85997978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_85994440_85995560_85995714_85997639
tx.15817	chr6	+	1610	3	FSM	ENSMUSG00000057497.9	ENSMUST00000071492.9	1643	3	33	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1740	junction_2	62	1938	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTTTCTTATGGGTAGTG	8650	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86342660	86347040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_86342802_86343591_86343733_86345712
tx.15818	chr6	+	561	2	ISM	ENSMUSG00000057497.9	ENSMUST00000204893.2	448	3	-49	1773	29	6	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1864	junction_1	0	392	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCCTTAAAATGTATATTAA	8646	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86342656	86344007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_86342802_86343591
tx.15819	chr6	+	435	4	FSM	ENSMUSG00000057278.9	ENSMUST00000089558.7	1055	4	198	422	-40	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2623	junction_2	545.029866663796	14250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCGTTTCTGCTGTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86348483	86355888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_86348597_86352658_86352682_86353476_86353602_86355714
tx.1582	chr10	-	540	2	FSM	ENSMUSG00000033307.8	ENSMUST00000218267.2	600	2	155	-95	155	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	12818	junction_1	0	935	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGGTTGCCTCAGCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75695871	75695188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_75695378_75695520
tx.15820	chr6	-	3653	6	FSM	ENSMUSG00000029998.15	ENSMUST00000032065.15	4295	6	19	623	6	-623	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_3	15.4012986465428	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGGTCTGTTTCTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86374117	86363610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_86366354_86368657_86368811_86369118_86369331_86371390_86371566_86372895_86373103_86373954
tx.15821	chr6	-	898	3	ISM	ENSMUSG00000029998.15	ENSMUST00000204116.2	546	4	18	5373	-4	474	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_1	16.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86374105	86371025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_86371566_86372895_86373103_86373954
tx.15822	chr6	-	670	2	FSM	ENSMUSG00000029998.15	ENSMUST00000203960.2	485	2	-20	-165	2	165	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTAGCTATTTATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86374121	86372599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_86373103_86373954
tx.15823	chr6	-	570	3	NNC	ENSMUSG00000029998.15	novel	485	2	NA	NA	6	165	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	104.5	32	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTAGCTATTTATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86374117	86372599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_86372800_86372895_86373103_86373954
tx.15824	chr6	+	1779	13	FSM	ENSMUSG00000071337.12	ENSMUST00000095753.9	4477	13	64	2634	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_5	36.3397356744499	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCCAAACTTGTGCAAAGT	9745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86381264	86407753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_86381505_86390785_86390883_86393284_86393384_86395859_86395915_86396082_86396116_86397305_86397394_86401326_86401403_86401943_86402053_86402431_86402528_86402642_86402728_86403548_86403673_86404654_86404801_86407222
tx.15825	chr6	+	1746	12	FSM	ENSMUSG00000071337.12	ENSMUST00000095752.9	3130	12	-30	1414	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_4	49.110770393011	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGCCAAACTTGTGCAAAGT	9745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86381264	86407753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_86381505_86390785_86390883_86393284_86393384_86395859_86395915_86397305_86397394_86401326_86401403_86401943_86402053_86402431_86402528_86402642_86402728_86403548_86403673_86404654_86404801_86407222
tx.15826	chr6	+	799	7	NIC	ENSMUSG00000071337.12	novel	823	8	NA	NA	2	-56	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	50	junction_6	55.5230182496913	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTTTGTGTATCCTTCGA	9746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86381265	86400775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_86381505_86390785_86390883_86393284_86393384_86395859_86395915_86396082_86396116_86397305_86397394_86400587
tx.15827	chr6	+	645	2	ISM	ENSMUSG00000107539.2	ENSMUST00000204137.2	798	5	1048	14858	1048	-14858	internal_fragment	FALSE	canonical	3	183	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCAAACTTGTGCAAAGTC	327	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86404687	86407754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_86404801_86407222
tx.15828	chr6	+	534	2	NNC	ENSMUSG00000046679.17	novel	505	2	NA	NA	-11	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	81	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTCGGGTCTCAAATTAC	1760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86415662	86416476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_86415830_86416109
tx.15829	chr6	-	635	2	FSM	ENSMUSG00000101655.2	ENSMUST00000188135.2	527	2	-108	0	-85	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGTGAAATTTTTTTTTA	6911	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86465294	86460357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_86460682_86464983
tx.1583	chr10	-	571	3	FSM	ENSMUSG00000033307.8	ENSMUST00000038169.8	544	3	-29	2	-29	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	12818	junction_1	2119	55986	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGGTTGCCTCAGCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75696103	75695188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_75695378_75695520_75695694_75695894
tx.15830	chr6	-	760	2	FSM	ENSMUSG00000101655.2	ENSMUST00000189386.2	775	2	15	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGTGAAATTTTTTTTTA	7011	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86465194	86460357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_86460700_86464776
tx.15831	chr6	-	654	2	NIC	ENSMUSG00000101655.2	novel	775	2	NA	NA	80	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGTGAAATTTTTTTTTA	7099	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86465106	86460357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_86460682_86464776
tx.15832	chr6	-	470	2	NNC	ENSMUSG00000101655.2	novel	527	2	NA	NA	-9005	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGGTGAAATTTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86474214	86460357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_86460682_86474068
tx.15833	chr6	-	445	2	FSM	ENSMUSG00000107689.2	ENSMUST00000204288.2	429	2	-16	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGACTGGCCTTAACACC	4523	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86493271	86490872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_86491051_86493004
tx.15834	chr6	-	818	6	FSM	ENSMUSG00000001158.14	ENSMUST00000001186.11	885	6	3	64	-2	-64	multi-exon	FALSE	canonical	3	1763	junction_5	100.541732628794	8026	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTATTTGACAAATATCT	7649	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86661501	86652196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_86652563_86653203_86653269_86657888_86657969_86658572_86658686_86659837_86659959_86661428
tx.15835	chr6	-	1595	4	ISM	ENSMUSG00000001157.14	ENSMUST00000001185.14	2949	14	28808	0	12318	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	371	junction_2	22.0151463012778	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGCTCCTGTTTAAAGTGA	2962	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86681557	86668749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_86670034_86674430_86674519_86677493_86677640_86681480
tx.15836	chr6	-	1202	13	FSM	ENSMUSG00000029994.18	ENSMUST00000001187.15	2002	13	20	780	0	34	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_5	17.8737858950537	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTATTATCGTCTATAATT	4626	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86770546	86714602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_86714806_86718817_86718941_86720099_86720159_86721606_86721703_86725868_86725963_86728044_86728102_86729134_86729215_86730784_86730876_86731834_86731949_86734800_86734896_86737655_86737744_86742743_86742790_86770490
tx.15837	chr6	+	904	8	FSM	ENSMUSG00000029993.17	ENSMUST00000117583.8	950	8	48	-2	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2373	junction_7	253.923417669218	5901	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGCTTCCTCTCACGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86986865	87005443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_86986942_86989888_86989990_86992547_86992684_86996346_86996414_86997700_86997822_87000109_87000171_87002467_87002643_87005276
tx.15838	chr6	+	323	2	FSM	ENSMUSG00000029993.17	ENSMUST00000204103.2	829	2	506	0	506	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2373	junction_1	0	313	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGCTTCCTCTCACGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87002486	87005443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_87002643_87005276
tx.15839	chr6	+	1145	2	Intergenic	novelGene_1262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAAACGAGGATTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87419776	87421152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_87420670_87420900
tx.1584	chr10	-	1609	9	FSM	ENSMUSG00000000902.14	ENSMUST00000121304.2	1622	9	17	-4	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	799	junction_7	118.779206934547	1613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTGTGCAGTAGCATAAA	6881	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75757431	75732606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_75732923_75733278_75733411_75740217_75740409_75741863_75742031_75745987_75746116_75747352_75747491_75750897_75751028_75752633_75752746_75757136
tx.15840	chr6	-	1470	6	ISM	ENSMUSG00000030051.11	ENSMUST00000032130.8	1889	11	65	23469	1	-2127	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_1	10.2489023802552	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACATGATGTTTTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87649110	87630199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_87630875_87635414_87635548_87635822_87635971_87640666_87640840_87645397_87645470_87648841
tx.15841	chr6	-	1225	7	ISM	ENSMUSG00000089997.3	ENSMUST00000238521.2	3678	16	5	36432	5	-36432	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	8	junction_6	5.95585612840188	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACTTGTCCATCGACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87699778	87689006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_87689250_87690283_87690357_87691104_87691249_87694858_87695064_87695769_87695958_87698819_87699089_87699675
tx.15842	chr6	-	1885	3	NNC	ENSMUSG00000108079.2	novel	713	3	NA	NA	-308	816	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCCTGTGTAATTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87708438	87706129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_87707210_87707324_87707593_87707901
tx.15843	chr6	-	656	3	NNC	ENSMUSG00000108079.2	novel	713	3	NA	NA	-1606	24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGTACAATACCATACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87709736	87706921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_87707210_87707324_87707593_87709636
tx.15844	chr6	-	1114	3	FSM	ENSMUSG00000030055.17	ENSMUST00000078647.11	4605	3	189	3302	189	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGGTGCCGAGCCTTGTC	2883	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87788572	87769136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_87769823_87771595_87771780_87788328
tx.15845	chr6	-	1639	5	FSM	ENSMUSG00000030057.16	ENSMUST00000113619.8	1661	5	25	-3	4	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2802	junction_3	3497.63613030286	2693	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGACAGTTTGGACTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87828037	87820060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_87821139_87822103_87822303_87822446_87822540_87822658_87822776_87827885
tx.15846	chr6	-	1662	5	FSM	ENSMUSG00000030057.16	ENSMUST00000204653.3	2175	5	49	464	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	7593	junction_2	1716.19673988736	8466	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGACAGTTTGGACTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87828039	87820060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_87821139_87822103_87822303_87822446_87822540_87822637_87822776_87827885
tx.15847	chr6	+	928	5	NNC	ENSMUSG00000030058.18	novel	921	5	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	373.284408996679	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGCCTCTTACCCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87864906	87867741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_87865055_87866052_87866110_87866638_87866720_87866937_87867010_87867171
tx.15848	chr6	+	1247	9	ISM	ENSMUSG00000030058.18	ENSMUST00000113607.10	4140	24	16354	1047	-4604	18	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	791	junction_1	68.3418566838801	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTCTCATCCCTATGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87881149	87889530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_87881174_87881797_87881924_87882180_87882250_87884354_87884498_87884791_87884964_87885517_87885616_87886645_87886785_87887021_87887121_87889153
tx.15849	chr6	+	1224	8	ISM	ENSMUSG00000030058.18	ENSMUST00000113607.10	4140	24	17001	1047	-3957	18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	791	junction_2	67.1708148480197	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTCTCATCCCTATGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87881796	87889530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_87881924_87882180_87882250_87884354_87884498_87884791_87884964_87885517_87885616_87886645_87886785_87887021_87887121_87889153
tx.1585	chr10	+	645	4	FSM	ENSMUSG00000049422.8	ENSMUST00000058906.7	939	4	316	-22	316	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15821	junction_1	833.259196702256	16340	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCTGTGTGCCCATTTA	7262	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75771722	75773581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_75771839_75772071_75772280_75773140_75773289_75773408
tx.15850	chr6	+	1444	7	FSM	ENSMUSG00000030060.15	ENSMUST00000032141.14	1464	7	5	15	5	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	428.702078630629	1847	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGCTGGCAAGAGTTCT	2969	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87890921	87913596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_87890994_87891472_87891678_87894820_87894965_87898507_87898634_87902613_87902793_87910223_87910417_87913071
tx.15851	chr6	+	1373	6	FSM	ENSMUSG00000030060.15	ENSMUST00000113606.2	1572	6	184	15	184	-15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	461.093656430014	802	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGCTGGCAAGAGTTCT	3519	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87891471	87913596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_87891678_87894820_87894965_87898507_87898634_87902613_87902793_87910223_87910417_87913071
tx.15852	chr6	+	1005	4	ISM	ENSMUSG00000030060.15	ENSMUST00000113606.2	1572	6	7238	15	3620	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	494.201263544407	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGCTGGCAAGAGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87898525	87913596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_87898634_87902613_87902793_87910223_87910417_87913071
tx.15853	chr6	-	2224	7	NIC	ENSMUSG00000079477.10	novel	1657	8	NA	NA	-5	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	112	junction_6	799.58419749823	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCTGCTGTCTGTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88022232	87976089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_87977513_87981152_87981282_87981974_87982194_87989288_87989416_87990619_87990681_87992613_87992701_88022054
tx.15854	chr6	-	2137	6	FSM	ENSMUSG00000079477.10	ENSMUST00000113600.10	2159	6	20	2	-5	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1571	junction_1	157.281403859452	1293	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCTGCTGTCTGTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88022232	87976089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_87977513_87981152_87981282_87981974_87982194_87989288_87989416_87990619_87990681_88022054
tx.15855	chr6	+	2282	10	FSM	ENSMUSG00000030062.8	ENSMUST00000032143.8	3633	10	11	1340	11	577	multi-exon	FALSE	canonical	3	2268	junction_5	110.706262438987	312	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTTGCTGTACTGAAAAA	548	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88061474	88080946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_88061777_88065331_88065397_88066970_88067278_88070767_88070978_88072504_88072698_88076255_88076356_88077610_88077750_88077843_88077964_88078956_88079203_88080346
tx.15856	chr6	+	349	2	Intergenic	novelGene_1263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTTGGTCGCGTTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88129345	88131975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_88129564_88131844
tx.15857	chr6	+	1955	2	FSM	ENSMUSG00000015053.15	ENSMUST00000203579.2	841	2	147	-1261	147	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTCGCCTGTTGAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88181573	88184014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_88181691_88182176
tx.15858	chr6	-	590	2	ISM	ENSMUSG00000033216.10	ENSMUST00000203213.3	796	6	164899	-404	158220	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	434	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTGTGCCCATAGTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88258597	88234850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_88235374_88258530
tx.15859	chr6	-	1469	6	NIC	ENSMUSG00000033216.10	novel	2679	7	NA	NA	6	7	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	78	junction_2	158.228189650264	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGCCCATAGTCTGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88423503	88234847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_88235374_88258530_88258688_88332464_88332630_88335527_88335625_88353185_88353394_88423187
tx.1586	chr10	+	647	3	ISM	ENSMUSG00000049422.8	ENSMUST00000058906.7	939	4	547	-22	547	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16591	junction_2	626	1673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCTGTGTGCCCATTTA	7493	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75771953	75773581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_75772280_75773140_75773289_75773408
tx.15860	chr6	-	2134	7	FSM	ENSMUSG00000033216.10	ENSMUST00000165242.4	2679	7	12	533	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	371	junction_3	47.1643108952333	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGTGCCCATAGTCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88423509	88234848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_88235374_88258530_88258688_88274558_88275219_88332464_88332630_88335527_88335625_88353185_88353394_88423187
tx.15861	chr6	-	1015	5	NNC	ENSMUSG00000033216.10	novel	2679	7	NA	NA	0	-14467	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	202.243664919324	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGCCAAGCCCCAGTATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88423496	88289554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_88289791_88332464_88332630_88335527_88335625_88353185_88353394_88423187
tx.15862	chr6	+	1638	11	FSM	ENSMUSG00000030079.16	ENSMUST00000032165.16	1675	11	31	6	31	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1160	junction_1	83.5499850388975	1915	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCTGTAGGTTTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88442421	88474548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_88442651_88444547_88444635_88450058_88450192_88456108_88456261_88459099_88459190_88459944_88460095_88461389_88461454_88462694_88462894_88468497_88468601_88473389_88473482_88474209
tx.15863	chr6	+	716	4	ISM	ENSMUSG00000030079.16	ENSMUST00000032165.16	1675	11	20321	6	20003	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1291	junction_2	57.4630315942346	412	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCTGTAGGTTTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88462711	88474548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_88462894_88468497_88468601_88473389_88473482_88474209
tx.15864	chr6	-	3090	12	FSM	ENSMUSG00000030082.15	ENSMUST00000032168.7	3172	12	58	24	-19	-24	multi-exon	FALSE	canonical	3	923	junction_2	46.8136802778528	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCCTCGTCATCTTTGTA	9153	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88495829	88480584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_88482276_88483126_88483204_88483722_88483915_88484153_88484352_88485543_88485705_88489083_88489238_88489477_88489588_88491294_88491427_88492325_88492405_88492485_88492552_88495352_88495421_88495667
tx.15865	chr6	-	1081	5	FSM	ENSMUSG00000030082.15	ENSMUST00000130918.8	935	5	-66	-80	-11	80	multi-exon	FALSE	canonical	3	957	junction_4	50.4548065103811	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAATTTT	9161	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88495821	88490712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_88491427_88492325_88492405_88492485_88492552_88495352_88495421_88495667
tx.15866	chr6	-	2805	3	Intergenic	novelGene_1265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGCTTGTACACTGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88670422	88644044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_88646658_88653637_88653742_88670334
tx.15867	chr6	-	1714	2	Intergenic	novelGene_1266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCTCCCAATTGTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88670423	88645032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_88646658_88670334
tx.15868	chr6	+	1312	8	FSM	ENSMUSG00000033174.18	ENSMUST00000113585.9	3676	8	58	2306	0	64	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_6	2.55550625999976	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGCAAAGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88701451	88803036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_88701554_88702682_88702828_88741577_88741685_88784992_88785130_88786317_88786429_88795555_88795646_88800172_88800389_88802632
tx.1587	chr10	+	324	2	FSM	ENSMUSG00000049422.8	ENSMUST00000219435.2	405	2	84	-3	84	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16591	junction_1	0	368	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCTGTGTGCCCATTTA	8677	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75773137	75773581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_75773289_75773408
tx.15870	chr6	-	634	2	ISM	ENSMUSG00000030083.12	ENSMUST00000032169.8	1845	12	5280	1	2095	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	407	junction_1	0	273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGAGCCTGTTGTTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88813602	88812896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_88813435_88813506
tx.15871	chr6	-	1838	12	FSM	ENSMUSG00000030083.12	ENSMUST00000032169.8	1845	12	6	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_10	111.135015794021	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTGAGCCTGTTGTTGGGG	6970	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88818876	88812896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_88813435_88813506_88813708_88815099_88815268_88815361_88815461_88815619_88815739_88815826_88815944_88816166_88816213_88816312_88816473_88816608_88816754_88817691_88817748_88817819_88817883_88818750
tx.15872	chr6	-	1539	8	ISM	ENSMUSG00000030083.12	ENSMUST00000032169.8	1845	12	2318	2	7	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	333	junction_3	29.2665442484229	432	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTGAGCCTGTTGTTGGG	9282	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88816564	88812897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_88813435_88813506_88813708_88815099_88815268_88815361_88815461_88815619_88815739_88815826_88815944_88816166_88816213_88816312
tx.15873	chr6	-	706	2	ISM	ENSMUSG00000002870.9	ENSMUST00000058011.8	3371	16	14336	0	7471	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3402	junction_1	0	473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTTTGGTTCTGGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88861426	88860455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_88861093_88861357
tx.15874	chr6	+	1757	12	FSM	ENSMUSG00000002871.15	ENSMUST00000204765.3	1738	12	-19	0	-3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	57	junction_1	17.59319928714	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGTGTGAGCTGATGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88879295	88889213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_88879513_88882930_88883061_88884922_88885055_88885165_88885299_88886271_88886359_88886489_88886563_88886662_88886743_88887132_88887244_88887322_88887384_88887529_88887633_88887778_88887860_88888664
tx.15875	chr6	-	1695	2	FSM	ENSMUSG00000090013.2	ENSMUST00000159767.2	652	2	-1	-1042	-1	1042	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGGTCTTGTCTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89163008	89160611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_89162143_89162844
tx.15876	chr6	-	1102	8	FSM	ENSMUSG00000030086.17	ENSMUST00000032172.14	1121	8	15	4	15	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_4	25.4486277245203	790	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATTGGCACCCAGTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89572619	89360136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_89360331_89361585_89361722_89396729_89396801_89444371_89444456_89544568_89544714_89546324_89546395_89551349_89551573_89572440
tx.15877	chr6	-	1016	7	FSM	ENSMUSG00000030086.17	ENSMUST00000113550.6	1042	7	17	9	17	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	87.7648373021147	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATTGGCACCCAGTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89572617	89360136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_89360331_89361585_89361722_89396729_89396801_89544568_89544714_89546324_89546395_89551349_89551573_89572440
tx.15878	chr6	-	2765	4	NNC	ENSMUSG00000092247.3	novel	399	4	NA	NA	0	10395	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	0.471404520791032	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTATGAACAGAGTGGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90209799	90198314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_90200748_90201237_90201354_90202364_90202450_90209668
tx.15879	chr6	-	1427	3	NNC	ENSMUSG00000092247.3	novel	399	4	NA	NA	-3	8514	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGATATCTCATGCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90209802	90200195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_90201354_90202364_90202500_90209668
tx.1588	chr10	-	862	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000903.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGTCCTGTCTCCAAGA	3205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75786738	75784768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_75785445_75786552
tx.15880	chr6	-	937	4	NNC	ENSMUSG00000092247.3	novel	399	4	NA	NA	-3	8514	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0.471404520791032	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGATATCTCATGCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90209802	90200195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_90200748_90201237_90201354_90202364_90202500_90209668
tx.15881	chr6	-	857	4	FSM	ENSMUSG00000048794.15	ENSMUST00000134224.8	849	4	-12	4	-12	-4	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0.471404520791032	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATTTTGATCATATTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90405791	90397919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_90398048_90398190_90398383_90404419_90404526_90405360
tx.15882	chr6	-	779	3	FSM	ENSMUSG00000048794.15	ENSMUST00000135757.3	289	3	-482	-8	-80	8	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	1.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCCGTGAACGGTGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90405859	90403457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_90403632_90404419_90404526_90405360
tx.15883	chr6	+	1596	2	FSM	ENSMUSG00000030087.12	ENSMUST00000203607.2	2240	2	642	2	-76	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	353	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTCTACCATTTTTTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90444023	90452215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_90444506_90451101
tx.15884	chr6	+	607	2	NNC	ENSMUSG00000108111.2	novel	661	2	NA	NA	32409	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	187	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGGTGTGTAATTATACAA	9363	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90495783	90496469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_90495862_90495940
tx.15885	chr6	+	1432	6	ISM	ENSMUSG00000030089.16	ENSMUST00000032177.10	2324	10	16171	0	16171	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_4	8.27042925125413	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGGTGTCCTCCATCCTTC	2823	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90612299	90623394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_90612379_90613838_90613984_90617865_90617946_90619192_90619328_90621066_90621216_90622550
tx.15886	chr6	-	388	3	ISM	ENSMUSG00000030091.18	ENSMUST00000113509.2	6893	40	20	85559	-3	-12820	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	405	junction_2	12.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGTGAGCTCTATCTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91093781	91075610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_91075680_91078244_91078382_91093599
tx.15887	chr6	+	2597	10	FSM	ENSMUSG00000034245.11	ENSMUST00000041736.11	2653	10	47	9	47	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_9	4.60541817245838	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACTTAACCAGGGCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91133693	91151665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_91133830_91134378_91134528_91136142_91136244_91142542_91142660_91143224_91143268_91144785_91144863_91145790_91145854_91146376_91146474_91149146_91149326_91150030
tx.15888	chr6	+	907	3	FSM	ENSMUSG00000034245.11	ENSMUST00000154389.2	738	3	-38	-131	-38	131	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	6.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTCTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91133761	91136832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_91133830_91134378_91134528_91136142
tx.15889	chr6	+	1814	2	FSM	ENSMUSG00000034245.11	ENSMUST00000134154.2	815	2	410	-1409	410	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGCAGCTGCCCAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91149155	91151674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_91149326_91150030
tx.1589	chr10	-	1048	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000903.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGTCCTGTCTCCAAGA	3181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75786762	75784768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_75785445_75786390
tx.15890	chr6	+	488	2	FSM	ENSMUSG00000100680.2	ENSMUST00000186472.2	486	2	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGTCTACACTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91417966	91418737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_91418141_91418423
tx.15891	chr6	-	948	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100680.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGGCTCAAACTGATGACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91419953	91417969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_91418310_91419345
tx.15892	chr6	+	633	2	NNC	ENSMUSG00000100680.2	novel	486	2	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGTCTACACTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91417975	91418737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_91418295_91418423
tx.15893	chr6	-	1317	3	FSM	ENSMUSG00000034203.9	ENSMUST00000040835.9	3472	3	51	2104	-46	-2104	multi-exon	FALSE	canonical	3	1002	junction_1	28.5	4267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGAATGGCTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91450477	91441257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_91442296_91444664_91444764_91450297
tx.15894	chr6	+	2271	7	ISM	ENSMUSG00000030095.11	ENSMUST00000032183.6	2903	12	6178	6	3281	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_2	9.1104335791443	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTTGCCAGTCGTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91456862	91465439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_91456933_91457631_91457703_91458913_91459036_91459235_91459311_91459642_91459745_91462298_91462417_91463726
tx.15895	chr6	-	1051	2	ISM	ENSMUSG00000030094.9	ENSMUST00000032182.5	3634	16	24579	0	24486	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTGGCTGCAAATTTATT	5237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91468291	91466286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_91467249_91468202
tx.15896	chr6	-	3629	16	FSM	ENSMUSG00000030094.9	ENSMUST00000032182.5	3634	16	5	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_2	18.0017283120878	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTGGCTGCAAATTTATT	374	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91492865	91466286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_91467249_91468202_91468293_91469252_91469347_91469823_91469994_91470086_91470222_91473069_91473152_91475011_91475173_91476246_91477120_91477903_91477994_91480982_91481104_91481552_91481711_91482372_91482458_91483820_91483942_91485470_91485578_91487438_91487641_91492687
tx.15897	chr6	-	1308	2	ISM	ENSMUSG00000030094.9	ENSMUST00000150279.3	4347	13	15815	5326	15815	-5326	internal_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTGGTGGTTGACACACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91476962	91474580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_91475173_91476246
tx.15898	chr6	-	2509	10	ISM	ENSMUSG00000030094.9	ENSMUST00000150279.3	4347	13	-70	5326	19	-5326	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_8	18.5099239315189	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTGGTGGTTGACACACAA	392	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91492847	91474580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_91475173_91476246_91477120_91477903_91477994_91480982_91481104_91481552_91481711_91482372_91482458_91483820_91483942_91485470_91485578_91487438_91487641_91492687
tx.15899	chr6	+	638	4	FSM	ENSMUSG00000034192.6	ENSMUST00000206947.2	618	4	-18	-2	-17	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1484	junction_1	387.955610290089	12801	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTTTTTTTTTTAATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91493011	91499604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_91493061_91494029_91494141_91496530_91496627_91499222
tx.159	chr1	-	1204	7	FSM	ENSMUSG00000026088.16	ENSMUST00000027257.10	1231	7	27	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_5	18.2543754267908	1124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGGATCCACTCACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37929465	37917968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_37918445_37918640_37918702_37920013_37920130_37920779_37920867_37921642_37921780_37924295_37924398_37929240
tx.1590	chr10	-	885	2	NNC	ENSMUSG00000085662.2	novel	405	2	NA	NA	-49	520	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGGGGCTCTCTGCTA	7544	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75829875	75828004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_75828750_75829735
tx.15900	chr6	+	593	3	ISM	ENSMUSG00000034192.6	ENSMUST00000206947.2	618	4	996	-2	996	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1827	junction_2	298	1555	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTTTTTTTTTTAATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91494025	91499604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_91494141_91496530_91496627_91499222
tx.15901	chr6	-	597	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000108584.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAGGCAAAGGCTTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91499607	91494025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_91494135_91496525_91496634_91499227
tx.15902	chr6	+	1338	5	FSM	ENSMUSG00000030096.9	ENSMUST00000206835.2	1553	5	2	213	2	-213	multi-exon	FALSE	canonical	3	334	junction_1	28.2167946443249	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTGTTGAGCTCATGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91661077	91703699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_91661290_91675969_91676014_91700262_91700503_91701822_91701958_91702992
tx.15903	chr6	+	2625	15	NNC	ENSMUSG00000030096.9	novel	6186	15	NA	NA	3	2742	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	97.4735181200201	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCTGAATGCTGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91661052	91732501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_91661290_91675969_91676014_91700262_91700503_91701822_91701958_91702992_91703228_91712071_91712205_91716857_91716993_91717929_91718038_91718158_91718284_91721897_91722011_91725313_91725452_91726707_91726811_91727253_91727355_91729267_91729439_91731894
tx.15904	chr6	+	984	4	ISM	ENSMUSG00000030096.9	ENSMUST00000032185.9	6186	15	65672	3546	-459	2742	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	366	junction_1	9.41629792788369	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCTGAATGCTGGGTGG	487	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91726705	91732501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_91726811_91727253_91727355_91729267_91729439_91731894
tx.15905	chr6	+	1779	2	FSM	ENSMUSG00000034083.17	ENSMUST00000149546.2	370	2	-13	-1396	6	1396	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATTCAGTTTAGAAAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91855039	91858888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_91855168_91857237
tx.15906	chr6	+	885	3	FSM	ENSMUSG00000034083.17	ENSMUST00000138868.8	3980	3	15	3080	-4	1396	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_1	5	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATTCAGTTTAGAAAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91855048	91858888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_91855168_91857237_91857343_91858227
tx.15907	chr6	+	1740	11	FSM	ENSMUSG00000034083.17	ENSMUST00000037783.7	1752	11	12	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_7	17.7876361554873	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGAGGAACTTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91855045	91876824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_91855168_91857237_91857343_91858227_91858329_91862328_91862388_91865050_91865232_91867774_91867871_91869836_91869980_91870386_91870482_91872194_91872328_91875127_91875281_91876272
tx.15908	chr6	-	742	4	FSM	ENSMUSG00000014551.9	ENSMUST00000140438.2	6073	4	21	5310	21	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	811	junction_2	13.9124245031395	5307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGTAAGTGTGGCCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92160993	92151815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_92152190_92152689_92152778_92155690_92155798_92160820
tx.15909	chr6	-	1437	3	FSM	ENSMUSG00000005892.5	ENSMUST00000006046.5	1384	3	-53	0	-53	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	3.5	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGCTTTGCTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92221684	92219041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_92220107_92220652_92220869_92221528
tx.1591	chr10	+	208	2	FSM	ENSMUSG00000049764.9	ENSMUST00000061617.7	5097	2	2	4887	2	-41	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAGGAGAACCCATTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75868489	75874181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_75868584_75874067
tx.15910	chr6	+	847	5	NNC	ENSMUSG00000048636.8	novel	2239	5	NA	NA	-38	-4746	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGATTTTTTTTCCTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92793420	92815700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_92793642_92804897_92805085_92808917_92809046_92811419_92811468_92815437
tx.15911	chr6	+	720	3	NIC	ENSMUSG00000097462.8	novel	995	3	NA	NA	0	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTAGCATTTTCATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92917562	93088450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_92917791_93084047_93084141_93088051
tx.15912	chr6	+	1906	10	FSM	ENSMUSG00000045100.12	ENSMUST00000061118.11	1922	10	-1	17	-1	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_5	7.6610285226392	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATACTTCCTCTTTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94477310	94581636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_94477439_94484494_94484652_94487732_94487843_94511124_94511230_94512701_94512750_94553314_94553360_94569392_94569463_94575360_94575426_94576159_94576234_94580532
tx.15913	chr6	+	1309	4	ISM	ENSMUSG00000045100.12	ENSMUST00000203484.2	381	5	14230	-1077	14230	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_2	2.44948974278318	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTCCTCTTTCACATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94569400	94581640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_94569463_94575360_94575426_94576159_94576234_94580532
tx.15914	chr6	+	1133	2	ISM	ENSMUSG00000045100.12	ENSMUST00000203484.2	381	5	21034	-1073	21034	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATACTTCCTCTTTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94576204	94581636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_94576234_94580532
tx.15915	chr6	+	869	3	ISM	ENSMUSG00000030031.15	ENSMUST00000032107.10	4869	4	141	7488	1	412	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTGGAGAACCCTCCAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95094861	95099283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_95094956_95095503_95095715_95098719
tx.15916	chr6	+	4655	4	FSM	ENSMUSG00000030031.15	ENSMUST00000032107.10	4869	4	141	73	1	-73	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	4.18993502999218	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAAACTATCTCATGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95094861	95106698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_95094956_95095503_95095715_95098719_95099829_95103457
tx.15917	chr6	-	1689	7	ISM	ENSMUSG00000061838.8	ENSMUST00000079847.8	2518	11	103888	4	55015	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	467	junction_5	111.92519823525	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGCCTCACAGTTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95565975	95451126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_95452146_95474577_95474699_95543364_95543508_95546552_95546715_95556119_95556217_95563920_95564011_95565918
tx.15918	chr6	-	2231	11	FSM	ENSMUSG00000061838.8	ENSMUST00000204224.3	3367	11	-1	1137	-1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	467	junction_5	91.8564096838103	677	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGCCTCACAGTTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95695782	95451126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_95452146_95474577_95474699_95543364_95543508_95546552_95546715_95556119_95556217_95563920_95564011_95565918_95566072_95571640_95571732_95572634_95572735_95632438_95632581_95695669
tx.15919	chr6	-	2261	6	NNC	ENSMUSG00000046500.9	novel	2190	6	NA	NA	-72	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.72021504754765	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAGATCTTGTGATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97037446	96808168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_96809534_96820707_96820837_96840720_96840877_96991332_96991449_96996875_96997016_97037091
tx.1592	chr10	+	366	3	NNC	ENSMUSG00000049764.9	novel	5097	2	NA	NA	-15	36	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	26	junction_1	62	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAGGAAGATGCTGAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75868468	75874258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_75868584_75869448_75869509_75874067
tx.15920	chr6	-	991	3	NNC	ENSMUSG00000046500.9	novel	2190	6	NA	NA	-20	15574	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATATTTTGGTTTGGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97037394	97018014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_97018570_97021594_97021728_97037091
tx.15921	chr6	-	3998	19	NIC	ENSMUSG00000035245.13	novel	4424	18	NA	NA	-17	-6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	4	junction_17	11.1428712748068	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACATATCTGAACATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97125905	97086990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_97089168_97089641_97089745_97090803_97090924_97092961_97093024_97095841_97095911_97096923_97097011_97097104_97097177_97097672_97097766_97102480_97102585_97108312_97108420_97111239_97111345_97112136_97112232_97119786_97119896_97120900_97121002_97122221_97122446_97124355_97124413_97124837_97124970_97125151_97125220_97125792
tx.15922	chr6	-	2587	18	FSM	ENSMUSG00000035245.13	ENSMUST00000054344.11	4424	18	305	1532	6	416	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_9	6.4238957016875	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGTTGTTATTTGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97125838	97088516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_97089168_97089641_97089745_97090803_97090924_97092961_97093024_97095841_97095911_97096923_97097011_97097104_97097177_97097672_97097766_97102480_97102585_97108312_97108420_97111239_97111345_97112136_97112232_97119786_97119896_97120900_97121002_97122221_97122446_97124355_97124413_97124837_97125220_97125792
tx.15923	chr6	-	2146	17	ISM	ENSMUSG00000030061.17	ENSMUST00000089287.7	2257	18	300	-4	212	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	534	junction_12	65.1210411464682	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAAAGTATATCAATAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97182308	97160963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_97161827_97162301_97162357_97162443_97162508_97162610_97162712_97163029_97163112_97163197_97163235_97163623_97163678_97166489_97166604_97166714_97166818_97168053_97168210_97168486_97168552_97169701_97169746_97173797_97173879_97176199_97176283_97178877_97178959_97180434_97180556_97182266
tx.15924	chr6	-	2140	17	FSM	ENSMUSG00000030061.17	ENSMUST00000164744.8	2465	17	-8	333	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_16	154.413292315623	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAAAGTATATCAATAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97182529	97160963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_97161827_97162301_97162357_97162443_97162508_97162610_97162712_97163029_97163112_97163197_97163235_97163623_97163678_97166489_97166604_97166714_97166818_97168053_97168210_97168486_97168552_97169701_97169746_97173797_97173879_97176199_97176283_97178877_97178959_97180434_97180556_97182493
tx.15925	chr6	-	2184	18	FSM	ENSMUSG00000030061.17	ENSMUST00000089287.7	2257	18	77	-4	-2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	461	junction_17	79.0590861340176	508	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTAAAGTATATCAATAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97182531	97160963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_97161827_97162301_97162357_97162443_97162508_97162610_97162712_97163029_97163112_97163197_97163235_97163623_97163678_97166489_97166604_97166714_97166818_97168053_97168210_97168486_97168552_97169701_97169746_97173797_97173879_97176199_97176283_97178877_97178959_97180434_97180556_97182266_97182309_97182493
tx.15926	chr6	-	741	3	ISM	ENSMUSG00000030061.17	ENSMUST00000089287.7	2257	18	67	18937	-12	70	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	461	junction_2	53	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATGAAGAGGTTTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97182541	97179904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_97180556_97182266_97182309_97182493
tx.15927	chr6	-	1221	2	FSM	ENSMUSG00000030061.17	ENSMUST00000203215.2	1293	2	-16	88	-16	-88	multi-exon	FALSE	canonical	3	461	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTTTCTTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97182545	97181139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_97182309_97182493
tx.15928	chr6	+	1345	3	FSM	ENSMUSG00000035199.7	ENSMUST00000044681.7	1442	3	97	0	97	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	281	junction_2	50	762	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTGTCTATATGGCACAT	8545	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97187746	97210276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_97187958_97206497_97206716_97209360
tx.15929	chr6	-	1276	4	NNC	ENSMUSG00000030064.17	novel	4913	24	NA	NA	-93	-124826	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATAGTTTTTGTTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97594595	97498043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_97498595_97505690_97505813_97540828_97540987_97594150
tx.1593	chr10	+	721	2	NNC	ENSMUSG00000020229.5	novel	2055	15	NA	NA	40163	190	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCAGTGTGACTTCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76023447	76025289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_76023772_76024892
tx.15930	chr6	+	265	2	Intergenic	novelGene_1269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGGATGGTTGTGAGCCA	4109	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97933952	97934357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_97934147_97934286
tx.15931	chr6	+	4573	9	NNC	ENSMUSG00000035158.16	novel	2113	10	NA	NA	16096	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_5	19.3612854686872	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTGTTGACCAGTTGTG	4131	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97933974	97998310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_97934147_97970087_97970316_97971341_97971426_97973334_97973431_97980847_97980966_97983083_97983159_97987355_97987432_97990629_97990778_97994734
tx.15932	chr6	-	1164	2	Intergenic	novelGene_1270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGCCACCACTGCCTGTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100133321	100131995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_100133041_100133202
tx.15933	chr6	-	1365	5	FSM	ENSMUSG00000072872.4	ENSMUST00000101118.4	4503	5	149	2989	149	457	multi-exon	FALSE	canonical	3	260	junction_4	17.7552809045647	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTCTTACATGAAGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100264297	100208514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_100209387_100209827_100209927_100210023_100210201_100263443_100263570_100264206
tx.15934	chr6	+	600	2	Intergenic	novelGene_1271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTTTTCATTTTGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100371174	100372309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_100371375_100371909
tx.15935	chr6	+	693	3	ISM	ENSMUSG00000101553.2	ENSMUST00000187986.2	507	4	-9	-3	-9	3	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGACCTGCATGAATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100504351	100510390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_100504601_100506579_100506659_100510025
tx.15936	chr6	-	1959	11	NNC	ENSMUSG00000035378.18	novel	1990	11	NA	NA	5	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	80.3295711428861	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGGTGTAAATAATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100648113	100550041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_100550750_100588696_100588818_100607843_100607968_100609199_100609254_100613955_100614084_100625124_100625253_100632219_100632333_100641387_100641549_100642266_100642390_100646660_100646726_100647879
tx.15937	chr6	-	1993	11	FSM	ENSMUSG00000035378.18	ENSMUST00000170667.8	1990	11	-2	-1	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	64.1530201939083	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGGTGTAAATAATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100648120	100550041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_100550750_100588696_100588818_100607843_100607968_100609199_100609254_100613928_100614084_100625124_100625253_100632219_100632333_100641387_100641549_100642266_100642390_100646660_100646726_100647879
tx.15938	chr6	-	1661	8	FSM	ENSMUSG00000035378.18	ENSMUST00000089245.7	1638	8	-21	-2	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	71.8828411871905	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGGTGTAAATAATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100648121	100550041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_100550750_100588696_100588818_100625124_100625253_100632219_100632333_100641387_100641549_100642266_100642390_100646660_100646726_100647879
tx.15939	chr6	-	1071	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000079224.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGCACGCAGGGCCGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100582811	100581620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_100581814_100581933
tx.1594	chr10	-	2012	11	FSM	ENSMUSG00000020230.16	ENSMUST00000020452.12	2016	11	5	-1	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	2.63818119165458	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCATTTTGTTCTGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76073666	76043059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_76043628_76044245_76044418_76045171_76045309_76046231_76046362_76053147_76053324_76056831_76056997_76058282_76058445_76061121_76061305_76062023_76062150_76072545_76072656_76073583
tx.15940	chr6	+	1918	2	ISM	ENSMUSG00000052144.9	ENSMUST00000203580.2	1948	6	13343	-388	-206	388	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	608	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGAGTACATTTTTATC	3725	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100842880	100844971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_100843045_100843217
tx.15941	chr6	+	2237	9	FSM	ENSMUSG00000013736.17	ENSMUST00000113248.4	1398	9	-21	-818	4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	228	junction_1	232.818296907696	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCTTTGTCGTTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106746105	106759433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_106746153_106746790_106746965_106750245_106750440_106751366_106751506_106753079_106753207_106754878_106755073_106755748_106756003_106756146_106756429_106758607
tx.15942	chr6	+	2261	9	FSM	ENSMUSG00000013736.17	ENSMUST00000057578.16	2283	9	20	2	16	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	574	junction_1	132.149477392081	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCTTTGTCGTTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106746146	106759433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_106746218_106746790_106746965_106750245_106750440_106751366_106751506_106753079_106753207_106754878_106755073_106755748_106756003_106756146_106756429_106758607
tx.15943	chr6	+	2190	8	ISM	ENSMUSG00000013736.17	ENSMUST00000057578.16	2283	9	663	3	322	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	738	junction_7	88.0727899327063	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTCTTTGTCGTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106746789	106759432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_106746965_106750245_106750440_106751366_106751506_106753079_106753207_106754878_106755073_106755748_106756003_106756146_106756429_106758607
tx.15944	chr6	-	1502	7	ISM	ENSMUSG00000005362.15	ENSMUST00000013882.10	2072	11	9103	0	8071	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_5	19.5362910161235	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGCTCCTTAATGTCATT	3720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106767923	106757161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_106758072_106758663_106758796_106759423_106759489_106759871_106759988_106760385_106760471_106761377_106761441_106767792
tx.15945	chr6	-	2097	11	FSM	ENSMUSG00000005362.15	ENSMUST00000113239.10	2084	11	-13	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	188	junction_5	22.0871003076456	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGCTCCTTAATGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106777048	106757161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_106758072_106758663_106758796_106759423_106759489_106759871_106759988_106760385_106760471_106761377_106761441_106767792_106767953_106771148_106771299_106771955_106772159_106772842_106772959_106776951
tx.15946	chr6	-	1475	5	FSM	ENSMUSG00000005362.15	ENSMUST00000147087.2	2784	5	-28	1337	-12	-1337	multi-exon	FALSE	canonical	3	193	junction_4	25.0099980007996	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTTGTTTTGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106777050	106767045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_106767953_106771148_106771299_106771955_106772159_106772842_106772959_106776951
tx.15947	chr6	+	1636	2	FSM	ENSMUSG00000034639.8	ENSMUST00000049246.7	1612	2	-19	-5	-19	5	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCGATCTTATTACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108041986	108054088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_108042201_108052666
tx.15948	chr6	-	249	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000091845.2	novel	390	1	NA	NA	0	-6	multi-exon	FALSE	canonical	1	62	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATTTATTTGTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108117470	108117086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_108117217_108117351
tx.15949	chr6	-	591	2	Intergenic	novelGene_1273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGGGCTTCAGAGAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108189888	108189216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_108189735_108189815
tx.1595	chr10	-	1134	6	ISM	ENSMUSG00000001151.11	ENSMUST00000220395.2	6762	30	59837	1	-853	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	168	junction_5	28.9523746867161	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCCTGGCTACAGCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76192909	76187097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_76187614_76188742_76188871_76190006_76190146_76190892_76190970_76191997_76192231_76192868
tx.15950	chr6	+	861	4	ISM	ENSMUSG00000030102.12	ENSMUST00000032192.9	9870	62	2	309425	2	-136119	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_3	9.67241208569794	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGGGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108190058	108218645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_108190315_108191163_108191240_108213938_108214047_108218224
tx.15951	chr6	+	1566	3	ISM	ENSMUSG00000030102.12	ENSMUST00000203615.3	9761	62	310201	-1	4671	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_2	6.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCAGTGACTGGCTGGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108500363	108528071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_108500410_108518863_108519026_108526713
tx.15952	chr6	-	758	5	NNC	ENSMUSG00000087341.5	novel	544	4	NA	NA	-9177	116	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	19.0656759649376	26	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAAGTCTTGTGTCAGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108600133	108587177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_108587583_108589268_108589394_108590092_108590176_108590909_108590955_108600033
tx.15953	chr6	+	2962	5	FSM	ENSMUSG00000030103.12	ENSMUST00000032194.11	3113	5	-1	152	-1	-152	multi-exon	FALSE	canonical	3	205	junction_3	24.2899156029822	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAAATGGTCTCCTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108637588	108643734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_108637954_108638121_108638192_108638465_108638574_108639481_108639606_108641439
tx.15954	chr6	+	2725	7	FSM	ENSMUSG00000030105.9	ENSMUST00000032196.9	4443	7	-17	1735	-17	-1735	multi-exon	TRUE	canonical	3	458	junction_6	33.5480583972042	241	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGCATTGACAATTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108760042	108800504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_108760339_108790587_108790669_108791944_108792019_108792218_108792313_108795205_108795274_108795503_108795575_108798463
tx.15955	chr6	-	450	3	NNC	ENSMUSG00000044574.6	novel	2894	2	NA	NA	911	-1161	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	1.5	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTTCCCATGTGCTCCTT	6417	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112264886	112263978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_112264170_112264552_112264672_112264746
tx.15956	chr6	-	612	3	ISM	ENSMUSG00000034387.14	ENSMUST00000060847.6	1321	12	12289	-9	-14	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCAGTGTTCTCTTGTTT	295	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112352695	112336275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_112336598_112351739_112351848_112352513
tx.15957	chr6	-	654	3	FSM	ENSMUSG00000034387.14	ENSMUST00000123254.2	844	3	14	176	14	-176	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGGGGGCTTTGCCTCTT	323	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112352667	112346411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_112346804_112351739_112351848_112352513
tx.15958	chr6	-	2500	13	NIC	ENSMUSG00000030254.17	novel	2577	14	NA	NA	0	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	44	junction_1	58.64790182853	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATGCAATGTGTAATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112673631	112596934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_112597866_112605422_112605486_112621548_112621709_112626555_112626799_112642238_112642300_112649084_112649162_112652706_112652892_112656877_112656978_112658299_112658638_112663676_112663748_112664937_112665000_112670429_112670512_112673504
tx.15959	chr6	-	2494	12	FSM	ENSMUSG00000030254.17	ENSMUST00000077088.11	2577	12	25	58	9	37	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_1	49.718048005937	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATATTGCATTTGTCATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112673622	112596868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_112597866_112621548_112621709_112626555_112626799_112642238_112642300_112649084_112649162_112652706_112652892_112656877_112656978_112658299_112658638_112663676_112663748_112664937_112665000_112670429_112670512_112673504
tx.1596	chr10	-	365	2	ISM	ENSMUSG00000033126.6	ENSMUST00000049185.6	4522	5	253	8543	2	-745	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTCTTCTCGTACAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76304695	76303943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_76304221_76304607
tx.15960	chr6	-	3602	12	NIC	ENSMUSG00000030254.17	novel	3535	12	NA	NA	-8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	172	junction_1	27.9506649191301	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTATTTGTTGTTGTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112673617	112603375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_112605486_112621548_112621709_112626555_112626799_112642238_112642300_112649084_112649162_112652706_112652892_112656877_112656978_112658299_112658638_112663676_112663748_112664937_112665000_112670429_112670512_112673504
tx.15961	chr6	-	485	4	ISM	ENSMUSG00000030254.17	ENSMUST00000135092.2	2004	9	-26	22222	0	-22222	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	255	junction_1	2.94392028877595	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAATAAGGGTGATAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112673631	112663533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_112663748_112664937_112665000_112670429_112670512_112673504
tx.15962	chr6	+	1141	2	Intergenic	novelGene_1275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTTCTAGTGGCTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112679527	112681633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_112679839_112680803
tx.15963	chr6	+	726	4	NIC	ENSMUSG00000030264.15	novel	649	3	NA	NA	1	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	72	junction_3	301.439877919296	256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTGTTGTTGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113023276	113028000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_113023352_113024375_113024666_113026299_113026378_113027717
tx.15964	chr6	+	2067	10	FSM	ENSMUSG00000030264.15	ENSMUST00000032398.15	2163	10	96	0	6	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	600	junction_1	54.2445309298778	644	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTATGGAAGCGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113023281	113045234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113023352_113024375_113024666_113026299_113026378_113032599_113033077_113036915_113037047_113040061_113040132_113042504_113042621_113043716_113043828_113044228_113044353_113044634
tx.15965	chr6	+	1468	7	ISM	ENSMUSG00000030264.15	ENSMUST00000032398.15	2163	10	9575	0	-2150	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	639	junction_1	37.6017139089283	324	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTATGGAAGCGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113032760	113045234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_113033077_113036915_113037047_113040061_113040132_113042504_113042621_113043716_113043828_113044228_113044353_113044634
tx.15966	chr6	+	949	4	FSM	ENSMUSG00000030264.15	ENSMUST00000153310.2	692	4	120	-377	120	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	707	junction_1	22.905603390146	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTATGGAAGCGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113042506	113045234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113042621_113043716_113043828_113044228_113044353_113044634
tx.15967	chr6	-	1161	2	FSM	ENSMUSG00000086429.10	ENSMUST00000124246.4	1181	2	20	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGAATGACTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113054151	113047358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_113048397_113054028
tx.15968	chr6	-	1109	2	FSM	ENSMUSG00000086429.10	ENSMUST00000159544.3	822	2	89	-376	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGAATGACTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113054205	113047358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_113048397_113054134
tx.15969	chr6	+	1104	3	FSM	ENSMUSG00000034269.13	ENSMUST00000143998.8	2180	3	193	883	-3	359	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_2	21	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGTTATTGGATAGCCA	8036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113054518	113083639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113054674_113081895_113082083_113082877
tx.1597	chr10	+	620	3	ISM	ENSMUSG00000001150.8	ENSMUST00000170795.3	6427	29	42104	0	137	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	292	junction_1	14	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCGCCTTAGTTTTATGA	1415	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76346864	76351691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_76347058_76348251_76348403_76351415
tx.15970	chr6	+	2477	19	FSM	ENSMUSG00000030269.15	ENSMUST00000113146.9	2676	19	9	190	1	6	multi-exon	TRUE	canonical	3	298	junction_17	28.028204489649	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCATTAGCATTTCATCC	1977	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113214812	113258163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113215083_113217245_113217395_113226831_113226941_113230691_113230768_113231050_113231112_113232776_113232900_113233983_113234058_113237548_113237620_113238166_113238242_113242404_113242472_113242930_113243017_113243220_113243298_113243519_113243557_113245588_113245657_113246461_113246521_113246692_113246832_113247482_113247663_113254750_113254907_113257563
tx.15971	chr6	+	2318	18	NIC	ENSMUSG00000030269.15	novel	2676	19	NA	NA	4	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	55	junction_17	76.4492277859348	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCATTAGCATTTCATCC	1980	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113214815	113258163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_113215083_113217245_113217395_113226831_113226941_113230691_113230768_113231050_113231112_113232776_113232900_113233983_113234058_113237548_113237620_113238166_113238242_113242404_113242472_113242930_113243017_113243220_113243298_113243519_113243557_113245588_113245657_113246461_113246521_113246692_113246832_113247482_113247663_113257563
tx.15972	chr6	+	1545	7	FSM	ENSMUSG00000030271.15	ENSMUST00000032406.15	1549	7	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	196	junction_2	21.4534379529249	184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAGTGAAGAGTGAGAGGG	2312	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113303936	113311149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113304324_113305325_113305574_113306189_113306370_113308731_113308914_113310302_113310454_113310591_113310642_113310802
tx.15973	chr6	+	1629	7	FSM	ENSMUSG00000030271.15	ENSMUST00000136263.4	1601	7	-24	-4	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	81.0445693567572	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAGTGAAGAGTGAGAGGG	2311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113303935	113311149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113304324_113305325_113305574_113306106_113306370_113308731_113308914_113310302_113310454_113310591_113310642_113310802
tx.15974	chr6	+	1414	6	NIC	ENSMUSG00000030271.15	novel	1549	7	NA	NA	-16	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	21	junction_4	90.4464482442511	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAGTGAAGAGTGAGAGGG	2292	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113303916	113311149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_113304324_113305325_113305574_113306189_113306370_113308731_113308914_113310591_113310642_113310802
tx.15975	chr6	-	1735	9	FSM	ENSMUSG00000048930.13	ENSMUST00000032410.14	2848	9	495	618	-12	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_8	58.2875415504892	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCGCAAGTTTAGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113354349	113343603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_113344142_113347182_113347369_113347899_113348010_113349238_113349343_113349425_113349568_113351739_113351846_113351969_113352221_113352800_113353026_113354276
tx.15976	chr6	-	1948	10	NIC	ENSMUSG00000048930.13	novel	1708	10	NA	NA	-30	12	intron_retention	FALSE	canonical	3	134	junction_9	97.0713114476818	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCCGCAAGTTTAGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113354508	113343603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_113344142_113347182_113347369_113347899_113348010_113349238_113349343_113349425_113349568_113351739_113351846_113351969_113352221_113352800_113353026_113353852_113353907_113354276
tx.15977	chr6	+	1424	6	FSM	ENSMUSG00000079426.14	ENSMUST00000156898.5	2270	6	51	795	19	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	688	junction_1	248.294985853521	1169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTGTGCTCTGTGTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113355126	113366614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113355170_113357686_113357806_113358923_113359036_113361042_113361139_113362450_113362622_113365731
tx.15978	chr6	+	1382	5	ISM	ENSMUSG00000079426.14_ENSMUSG00000030276.20	ENSMUST00000204802.2	794	6	2155	-638	2155	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1123	junction_4	109.922700112397	402	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTGTGCTCTGTGTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113357685	113366614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_113357806_113358923_113359036_113361042_113361139_113362450_113362622_113365731
tx.15979	chr6	-	1274	9	FSM	ENSMUSG00000051169.15	ENSMUST00000113092.9	1269	9	-8	3	-8	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_2	15.858258889298	441	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGATGTTTACCAAGGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113396309	113392282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_113392684_113393267_113393408_113393749_113393874_113394101_113394187_113394264_113394373_113394807_113394908_113394991_113395037_113395770_113395911_113396178
tx.1598	chr10	+	638	6	NIC	ENSMUSG00000033105.13	novel	3969	16	NA	NA	2	1878	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_5	92.058676940308	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTGTATGCATTATGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76367442	76373435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_76367509_76367683_76367853_76369346_76369486_76371392_76371502_76372077_76372200_76373402
tx.15980	chr6	+	1022	2	NNC	ENSMUSG00000051256.11	novel	1201	2	NA	NA	5	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	177	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGCCTCGTGTTGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113419534	113425184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_113419591_113424218
tx.15981	chr6	+	1163	2	FSM	ENSMUSG00000051256.11	ENSMUST00000101070.5	1201	2	32	6	6	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	705	junction_1	0	1894	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGCCTCGTGTTGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113419561	113425184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113419759_113424218
tx.15982	chr6	+	2332	18	NIC	ENSMUSG00000030281.17	novel	2302	17	NA	NA	42	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	26	junction_5	8.17117899020487	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGTAGCACTCGTGTATC	5798	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113448429	113460101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_113448749_113449031_113449054_113449191_113449345_113449587_113449651_113449738_113449849_113451121_113451234_113451513_113451559_113453359_113453500_113453695_113453756_113455824_113455880_113455949_113456132_113456211_113456263_113457090_113457137_113457266_113457389_113457718_113457779_113458144_113458197_113459243_113459340_113459457
tx.15983	chr6	+	2064	10	FSM	ENSMUSG00000030284.12	ENSMUST00000032422.6	2306	10	247	-5	121	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	165	junction_1	17.0945085399441	218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCAGTCTTAACAACCCA	1704	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113460504	113470304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113461038_113461455_113461539_113465031_113465143_113465439_113465532_113466394_113466572_113466655_113466752_113468613_113468698_113468854_113468951_113469084_113469220_113469647
tx.15984	chr6	-	1941	3	NIC	ENSMUSG00000045009.10	novel	1903	3	NA	NA	4	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGTTGTGTTGTTTCTTG	4289	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113478888	113473227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_113474046_113474232_113475278_113478810
tx.15985	chr6	-	1956	8	FSM	ENSMUSG00000030286.7	ENSMUST00000032425.7	1985	8	18	11	-16	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_2	13.3386044002714	329	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGTGAAAGTGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113508595	113491845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_113492993_113494057_113494141_113494842_113494923_113496875_113496958_113497437_113497543_113499274_113499369_113499710_113499769_113508288
tx.15986	chr6	+	763	5	FSM	ENSMUSG00000034023.17	ENSMUST00000101051.5	2142	5	-8	1387	-8	-504	multi-exon	FALSE	canonical	3	329	junction_3	30.62984655528	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTTTGTCTGCCTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113508656	113514293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113508710_113510734_113510833_113512729_113512865_113513674_113513743_113513884
tx.15987	chr6	+	1947	16	ISM	ENSMUSG00000034023.17	ENSMUST00000204827.3	4707	43	-8	42006	-8	277	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	240	junction_9	45.6515303382288	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTTTTTGTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113508656	113531228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_113508710_113510734_113510833_113512729_113512865_113513674_113513743_113513884_113513989_113514567_113514629_113516221_113516275_113519167_113519247_113521970_113522096_113523553_113523642_113525302_113525408_113525810_113525912_113526261_113526371_113526553_113526590_113528720_113528865_113530640
tx.15988	chr6	+	855	3	FSM	ENSMUSG00000033940.9	ENSMUST00000035725.7	1095	3	-14	254	-14	-254	multi-exon	FALSE	canonical	3	441	junction_2	10.5	2104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGACTGTGGTGGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113581718	113593658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113581858_113592736_113592820_113593025
tx.15989	chr6	+	2749	3	FSM	ENSMUSG00000033933.14	ENSMUST00000035673.8	2792	3	43	0	43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_1	12	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACTGTGTTGTGTTACCT	201	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113600962	113608594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_113601340_113605052_113605176_113606345
tx.1599	chr10	+	3127	22	FSM	ENSMUSG00000033105.13	ENSMUST00000048678.7	4667	22	-5	1545	-5	701	multi-exon	FALSE	canonical	3	170	junction_9	27.7651309078683	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTGCCTTCCTGAGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76367435	76389768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_76367509_76367683_76367853_76369346_76369486_76371392_76371502_76372077_76372200_76374185_76374283_76375618_76375755_76376145_76376255_76376679_76376799_76377652_76377751_76378301_76378330_76379684_76379742_76380298_76380371_76381284_76381336_76381895_76382046_76382596_76382694_76383268_76383375_76385053_76385120_76385636_76385718_76386418_76386590_76388153_76388233_76388770
tx.15990	chr6	-	1250	8	ISM	ENSMUSG00000030298.11	ENSMUST00000032440.6	1353	9	2744	5	2728	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	959	junction_4	75.1336224635136	255	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTACTGTCATCCCACACA	4921	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113714960	113705027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_113705425_113706556_113706704_113707295_113707420_113707734_113707869_113711506_113711641_113712017_113712170_113713332_113713449_113714914
tx.15991	chr6	-	1309	9	FSM	ENSMUSG00000030298.11	ENSMUST00000032440.6	1353	9	39	5	23	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	942	junction_8	78.4968152220203	3631	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTACTGTCATCCCACACA	2216	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113717665	113705027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_113705425_113706556_113706704_113707295_113707420_113707734_113707869_113711506_113711641_113712017_113712170_113713332_113713449_113714914_113714960_113717605
tx.15992	chr6	-	931	4	ISM	ENSMUSG00000030302.18	ENSMUST00000205052.3	5658	20	86040	42412	-48485	13860	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	17.96292478041	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTTTTTTGGGACATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113782460	113766438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_113766957_113770626_113770842_113773199_113773359_113782421
tx.15993	chr6	+	471	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030302.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTGTATGTATGTGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113807679	113810280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_113807882_113810011
tx.15994	chr6	-	312	2	Intergenic	novelGene_1276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTTCTGCTATGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114374761	114333215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_114333380_114374613
tx.15995	chr6	+	2356	19	FSM	ENSMUSG00000030314.17	ENSMUST00000032457.17	3761	19	15	1390	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	29.6327313191359	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGGGCTCAGGTCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114620072	114836185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_114620112_114649934_114650102_114650608_114650664_114654900_114655019_114657122_114657201_114661361_114661479_114663030_114663181_114672583_114672673_114673991_114674114_114678117_114678209_114678885_114679031_114680288_114680448_114683093_114683289_114684464_114684666_114686054_114686171_114690253_114690330_114701854_114701936_114753917_114754041_114835951
tx.15996	chr6	+	2400	20	NIC	ENSMUSG00000030314.17	novel	2543	21	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	29	junction_1	29.4466041008941	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGGGCTCAGGTCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114620081	114836185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_114620112_114649751_114649805_114649934_114650102_114650608_114650664_114654900_114655019_114657122_114657201_114661361_114661479_114663030_114663181_114672583_114672673_114673991_114674114_114678117_114678209_114678885_114679031_114680288_114680448_114683093_114683289_114684464_114684666_114686054_114686171_114690253_114690330_114701854_114701936_114753917_114754041_114835951
tx.15997	chr6	-	1057	6	FSM	ENSMUSG00000030315.16	ENSMUST00000147639.8	1023	6	214	-248	214	118	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.489897948556636	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGGGGGGAGGGTGGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114945927	114839033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_114839398_114839716_114839841_114840844_114841041_114867577_114867768_114934896_114934973_114945820
tx.15998	chr6	-	1235	6	NIC	ENSMUSG00000030315.16	novel	1023	6	NA	NA	-3	118	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.489897948556636	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGGGGGGAGGGTGGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114946958	114839033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_114839398_114839716_114839841_114840844_114841041_114867577_114867768_114934896_114934973_114946673
tx.15999	chr6	-	821	7	NNC	ENSMUSG00000030316.14	novel	1168	8	NA	NA	-2293	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_6	166.976462080405	118	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTGTCACTCTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115011519	114981344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_114981481_114987767_114987831_114989118_114989285_114993043_114993190_115002234_115002386_115009180_115009274_115011453
tx.16	chr1	+	3873	6	NNC	ENSMUSG00000051285.18	novel	1153	5	NA	NA	-21352	86	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	64.5773954259538	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCAGTGGCCTGCCTCTTTT	6191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7196508	7242969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_7196560_7217860_7217964_7225303_7225496_7231115_7231288_7233471_7233596_7239738
tx.160	chr1	+	636	5	FSM	ENSMUSG00000026087.12	ENSMUST00000193673.6	662	5	0	26	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_1	367.71796257458	1671	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCGCTGATGGAGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37929612	37937419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_37929666_37933019_37933097_37934410_37934492_37936768_37936916_37937141
tx.1600	chr10	+	611	5	ISM	ENSMUSG00000033105.13	ENSMUST00000162475.8	3969	16	-3	12502	-3	643	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	218	junction_1	21.6448608219134	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGTCCTGTATGGCACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76367437	76372200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_76367509_76367683_76367853_76369346_76369486_76371392_76371502_76372077
tx.16000	chr6	-	1157	8	FSM	ENSMUSG00000030316.14	ENSMUST00000032461.12	1168	8	8	3	8	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	439	junction_6	13.6695699587494	855	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTGTCACTCTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115014829	114981344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_114981481_114987767_114987831_114989118_114989285_114993043_114993190_115002234_115002386_115009180_115009274_115011911_115012095_115014610
tx.16001	chr6	-	1070	2	FSM	ENSMUSG00000097486.3	ENSMUST00000181883.3	1048	2	-22	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATGGTTTCTACCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115111818	115104560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_115105388_115111575
tx.16002	chr6	-	529	3	NNC	ENSMUSG00000107704.2	novel	639	3	NA	NA	-2139	-7485	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAGAGCACATTCCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115516000	115513576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_115513925_115515501_115515577_115515894
tx.16003	chr6	-	652	4	NNC	ENSMUSG00000107704.2	novel	639	3	NA	NA	-7705	-7485	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.63299316185545	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCAGAGCACATTCCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115521566	115513576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_115513925_115515501_115515577_115515894_115516008_115521450
tx.16004	chr6	+	611	4	FSM	ENSMUSG00000042389.14	ENSMUST00000130425.8	638	4	27	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_1	54.9201440477192	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGGTCTCCCAGCCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115521651	115531233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_115521690_115524782_115524992_115526873_115526956_115530951
tx.16005	chr6	+	1787	12	FSM	ENSMUSG00000042389.14	ENSMUST00000040234.9	2106	12	27	292	-11	-292	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_1	38.6343314973604	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTTTGAGAGAATAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115521651	115555297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_115521690_115524782_115524992_115526873_115526956_115530951_115530989_115536553_115537062_115538340_115538419_115542837_115542889_115545656_115545796_115551523_115551561_115552822_115552935_115553856_115553947_115554891
tx.16006	chr6	+	947	8	ISM	ENSMUSG00000042389.14	ENSMUST00000040234.9	2106	12	15405	290	-14379	-290	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_4	25.7452194888801	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTGAGAGAATAAATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115537029	115555299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_115537062_115538340_115538419_115542837_115542889_115545656_115545796_115551523_115551561_115552822_115552935_115553856_115553947_115554891
tx.16007	chr6	+	918	7	ISM	ENSMUSG00000042389.14	ENSMUST00000040234.9	2106	12	16714	289	-13070	-289	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_3	26.574841903993	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGAGAGAATAAATGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115538338	115555300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_115538419_115542837_115542889_115545656_115545796_115551523_115551561_115552822_115552935_115553856_115553947_115554891
tx.16008	chr6	+	2278	8	FSM	ENSMUSG00000000439.10	ENSMUST00000000449.9	6230	8	14	3938	14	-3938	multi-exon	FALSE	canonical	2	438	junction_3	36.5396066911353	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTATTCCTGGCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115578876	115595647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_115578975_115586541_115586671_115587479_115587662_115588595_115588901_115590287_115590503_115591535_115591647_115594258_115594404_115594554
tx.16009	chr6	+	1334	3	ISM	ENSMUSG00000000439.10	ENSMUST00000000449.9	6230	8	12681	3945	3289	-3945	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	533	junction_1	1	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAAACCTGTATTCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115591543	115595640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_115591647_115594258_115594404_115594554
tx.1601	chr10	-	2153	16	FSM	ENSMUSG00000001120.16	ENSMUST00000001148.11	2013	16	-139	-1	-40	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_5	18.4407760742931	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTCTGACTTCTCTCTGC	1097	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76797761	76597689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_76598361_76599055_76599226_76603697_76603751_76606093_76606154_76606794_76606874_76617665_76617708_76620973_76621049_76624224_76624354_76625571_76625704_76633628_76633746_76634460_76634494_76635362_76635387_76636593_76636749_76661693_76661827_76728390_76728491_76797581
tx.16010	chr6	+	1016	4	Intergenic	novelGene_1277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGACCTTGGTGTGGATG	1740	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115678474	115694527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_115678622_115679388_115679491_115692624_115692840_115693975
tx.16011	chr6	+	409	3	Intergenic	novelGene_1278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGTTATCTGTGCATGA	1750	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115678484	115680918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_115678622_115679388_115679491_115680748
tx.16012	chr6	-	723	3	ISM	ENSMUSG00000059900.15	ENSMUST00000127728.4	894	8	3839	-12	3839	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0.5	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGACTAAATATTCCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115708073	115706091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_115706646_115707396_115707460_115707967
tx.16013	chr6	-	1147	10	NNC	ENSMUSG00000059900.15	novel	1554	12	NA	NA	-967	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_8	21.1029223884592	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCGACTAAATATTCCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115737199	115706091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_115706646_115707396_115707460_115707967_115708043_115708145_115708218_115710614_115710663_115710955_115710989_115711770_115711807_115713343_115713398_115719270_115719349_115737065
tx.16014	chr6	+	334	2	NNC	ENSMUSG00000030319.9	novel	5474	15	NA	NA	30974	1579	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCAATGCCTCTGGGTTTC	7886	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115782472	115784097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_115782643_115783933
tx.16015	chr6	-	346	2	ISM	ENSMUSG00000057841.6	ENSMUST00000203816.2	906	3	1194	0	1194	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17944	junction_1	0	13473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCGTATTTTCTATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115784115	115782472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_115782650_115783946
tx.16016	chr6	+	336	2	NNC	ENSMUSG00000030319.9	novel	5474	15	NA	NA	30974	1608	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGCTGAAGACACACAGGCAA	7886	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115782472	115784126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_115782643_115783960
tx.16017	chr6	-	461	3	FSM	ENSMUSG00000057841.6	ENSMUST00000203816.2	906	3	445	0	445	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17944	junction_1	6	12194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCGTATTTTCTATGTTTT	NA	False	NA	-93	True	NA	NA	NA	115784864	115782472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_115782650_115783946_115784129_115784762
tx.16018	chr6	-	510	4	FSM	ENSMUSG00000057841.6	ENSMUST00000081840.6	517	4	0	7	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14202	junction_3	1766.83093575915	118610	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCGTATTTTCTATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115785708	115782472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_115782650_115783946_115784129_115784762_115784864_115785658
tx.16019	chr6	-	328	3	NIC	ENSMUSG00000057841.6	novel	517	4	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	97	junction_1	7052.5	880	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCGTATTTTCTATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115785708	115782472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_115782650_115784762_115784864_115785658
tx.1602	chr10	-	1229	11	ISM	ENSMUSG00000001120.16	ENSMUST00000001148.11	2013	16	-133	19860	-34	8086	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_6	11.0742945599257	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATGTCTCCTACGTCTGT	1103	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76797755	76617550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_76617708_76620973_76621049_76624224_76624354_76625571_76625704_76633628_76633746_76634460_76634494_76635362_76635387_76636593_76636749_76661693_76661827_76728390_76728491_76797581
tx.16020	chr6	-	326	3	ISM	ENSMUSG00000057841.6	ENSMUST00000081840.6	517	4	0	1488	0	-1481	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14202	junction_2	1877	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACAAGTGAGTTGGGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115785708	115783953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_115784129_115784762_115784864_115785658
tx.16021	chr6	-	168	2	ISM	ENSMUSG00000057841.6	ENSMUST00000081840.6	517	4	-18	2298	-18	-2291	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14202	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTATGTGGTTCTGGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115785726	115784763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_115784864_115785658
tx.16022	chr6	+	815	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000101878.2	novel	387	1	NA	NA	-107	390	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	0	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAACCAAAACACCAAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116150590	116151474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_116150893_116150961
tx.16023	chr6	+	755	3	ISM	ENSMUSG00000024104.12	ENSMUST00000203802.3	4946	28	50807	-2	2457	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	377	junction_2	18.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGGTTTGTTCTTACTTA	9000	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116235973	116239628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_116236218_116237451_116237630_116239295
tx.16024	chr6	+	969	5	ISM	ENSMUSG00000042213.18	ENSMUST00000112900.9	3220	12	-3	41886	-3	-17458	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_4	4.43705983732471	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGTTTCCATTCATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116241179	116265373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_116241274_116250533_116250834_116261700_116261777_116262814_116262883_116264942
tx.16025	chr6	+	1152	2	ISM	ENSMUSG00000042213.18	ENSMUST00000220845.2	1163	7	-41	31255	-18	-31255	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAAGAGTGGGTGGAATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116241164	116251576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_116241274_116250533
tx.16028	chr6	-	2269	2	FSM	ENSMUSG00000059878.13	ENSMUST00000079749.6	3187	2	15	903	15	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTATCTATTTTACTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116605945	116601879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_116604095_116605891
tx.1603	chr10	-	1144	3	NNC	ENSMUSG00000001120.16	novel	2013	16	NA	NA	-57	-58135	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	11	junction_1	56.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTATGTTTCTCCCTCT	1080	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76797778	76691816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_76692664_76728390_76728491_76797581
tx.16030	chr6	+	1157	3	FSM	ENSMUSG00000059689.16	ENSMUST00000164472.8	1098	3	-58	-1	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	15	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGTATTTTTCATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117818144	117822917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_117818230_117820213_117820354_117821985
tx.16031	chr6	+	1204	3	FSM	ENSMUSG00000059689.16	ENSMUST00000136889.8	659	3	-2	-543	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	15.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGGTATTTTTCATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117818226	117822917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_117818359_117820213_117820354_117821985
tx.16034	chr6	+	2160	4	FSM	ENSMUSG00000042079.14	ENSMUST00000035493.14	2147	4	-10	-3	-5	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	2150	junction_1	1335.10981654028	1923	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCACAGCTTATGTACTC	3724	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117883745	117902583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_117883801_117894430_117894560_117896059_117896121_117900668
tx.16035	chr6	+	2323	4	ISM	ENSMUSG00000042079.14	ENSMUST00000179224.8	391	5	201	-1824	142	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	521	junction_1	2102.13325510592	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCACAGCTTATGTACTC	3930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117883951	117902583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_117884170_117894430_117894560_117896059_117896121_117900668
tx.16036	chr6	+	2178	4	NNC	ENSMUSG00000042079.14	novel	2280	3	NA	NA	958	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	602	junction_1	2063.97825139274	365	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCACAGCTTATGTACTC	4746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117884767	117902583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_117884841_117894430_117894560_117896059_117896121_117900668
tx.16037	chr6	+	2205	4	NNC	ENSMUSG00000042079.14	novel	2280	3	NA	NA	970	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	135	junction_1	2283.97154097856	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCACAGCTTATGTACTC	4758	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117884779	117902583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_117884880_117894430_117894560_117896059_117896121_117900668
tx.16038	chr6	+	2177	4	FSM	ENSMUSG00000042079.14	ENSMUST00000179478.8	956	4	19	-1240	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	625	junction_1	2053.14430948133	708	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCACAGCTTATGTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117893960	117902583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_117894033_117894430_117894560_117896059_117896121_117900668
tx.16039	chr6	+	2269	3	FSM	ENSMUSG00000042079.14	ENSMUST00000180020.8	2280	3	12	-1	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4878	junction_1	99	693	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCACAGCTTATGTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117894266	117902583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_117894560_117896059_117896121_117900668
tx.1604	chr10	+	1039	2	ISM	ENSMUSG00000001436.16	ENSMUST00000130703.8	356	3	-95	3730	-26	-2621	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGCAGCCGGTAATGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76869019	76875060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_76869182_76874183
tx.16040	chr6	-	554	9	ISM	ENSMUSG00000004988.10	ENSMUST00000203082.3	815	10	357	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_3	4.29389100932942	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGTGGTCTTGTGACCC	2519	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117914296	117910519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_117910710_117910804_117910843_117911275_117911313_117911386_117911462_117911969_117911994_117912115_117912149_117912814_117912884_117913698_117913742_117914251
tx.16041	chr6	+	2299	13	FSM	ENSMUSG00000030134.12	ENSMUST00000203482.2	2227	13	-60	-12	-60	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_10	5.92780641459291	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGAAAAGAAAAGAAAAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118043319	118067544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_118043424_118057318_118057523_118059974_118060098_118061381_118061520_118062224_118062447_118062733_118062809_118063177_118063271_118063987_118064091_118064167_118064248_118065069_118065262_118066063_118066188_118066395_118066469_118066776
tx.16043	chr6	-	2307	14	ISM	ENSMUSG00000030138.9	ENSMUST00000032237.8	4345	23	14717	0	14647	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	339	junction_13	47.6483668545452	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGCCTAGTGATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118381718	118360341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_118360837_118361199_118361362_118365716_118365893_118366199_118366348_118368118_118368242_118369278_118369338_118369504_118369686_118369763_118369953_118373087_118373268_118373723_118373798_118375034_118375117_118380049_118380208_118381216_118381319_118381540
tx.16044	chr6	-	4290	23	FSM	ENSMUSG00000030138.9	ENSMUST00000032237.8	4345	23	55	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	285	junction_22	59.9717047606688	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGCCTAGTGATTTATT	8340	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118396380	118360341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_118360837_118361199_118361362_118365716_118365893_118366199_118366348_118368118_118368242_118369278_118369338_118369504_118369686_118369763_118369953_118373087_118373268_118373723_118373798_118375034_118375117_118380049_118380208_118381216_118381319_118381540_118382302_118384971_118385112_118388442_118388637_118388915_118389038_118390039_118390183_118390691_118390881_118393423_118393504_118394348_118394540_118395369_118395579_118396248
tx.16045	chr6	-	1379	8	ISM	ENSMUSG00000030138.9	ENSMUST00000032237.8	4345	23	59	27978	-3	2475	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	285	junction_7	46.290564119814	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTTCTTTCCATTGAAC	8344	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118396376	118388319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_118388637_118388915_118389038_118390039_118390183_118390691_118390881_118393423_118393504_118394348_118394540_118395369_118395579_118396248
tx.16046	chr6	-	1655	11	ISM	ENSMUSG00000007827.11	ENSMUST00000112830.3	6930	34	-45	46780	-45	-5164	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_7	9.60468635614927	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCTGTGATAGATGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118539232	118525048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_118525337_118525790_118525921_118526346_118526499_118526598_118526660_118528929_118529003_118529706_118529741_118531164_118531227_118533156_118533264_118535898_118536073_118536231_118536347_118538773
tx.16047	chr6	+	1881	9	FSM	ENSMUSG00000041477.15	ENSMUST00000112777.9	3313	9	22	1410	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_6	11.8684192291981	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTCTGGGGGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119152235	119197167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_119152404_119157025_119157067_119160610_119160739_119175888_119175956_119177782_119177913_119183430_119183560_119191730_119192568_119194763_119194941_119196963
tx.16048	chr6	+	554	6	ISM	ENSMUSG00000041477.15	ENSMUST00000073909.6	1748	9	-13	13696	-13	-8358	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_4	5.12249938994628	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAGATGACCAATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119152235	119183450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_119152404_119157025_119157067_119160610_119160739_119175888_119175956_119177782_119177913_119183430
tx.16049	chr6	+	870	7	NIC	ENSMUSG00000041477.15	novel	3313	9	NA	NA	-13	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_6	17.625738755203	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTGGGGGTTTTGTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119152235	119197170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_119152404_119157025_119157067_119160610_119160739_119175888_119175956_119177782_119177913_119183430_119183560_119196963
tx.1605	chr10	+	584	3	NNC	ENSMUSG00000001436.16	novel	356	3	NA	NA	-10	-289	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	55	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTGTAAGTCAGAAAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76869035	76877392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_76869182_76874183_76874414_76877184
tx.16050	chr6	-	201	2	NNC	ENSMUSG00000030168.14	novel	4184	8	NA	NA	-42	-45872	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGAGCTCTGCTGTGGCA	7512	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119394478	119392983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_119393087_119394380
tx.16051	chr6	-	2004	4	ISM	ENSMUSG00000030170.15	ENSMUST00000117171.8	2174	5	1113	1	1113	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	2.44948974278318	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTCTCCCTCTCCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119425234	119409492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_119410818_119417242_119417536_119423295_119423544_119425096
tx.16052	chr6	-	2179	5	FSM	ENSMUSG00000030170.15	ENSMUST00000117171.8	2174	5	-6	1	-6	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	2.73861278752583	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTCTCCCTCTCCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119426353	119409492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_119410818_119417242_119417536_119423295_119423544_119425096_119425234_119426177
tx.16053	chr6	-	1471	2	ISM	ENSMUSG00000030170.15	ENSMUST00000117171.8	2174	5	8958	2	8958	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTTCTCTCCCTCTCCTTA	303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119417389	119409493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_119410818_119417242
tx.16054	chr6	-	1490	3	ISM	ENSMUSG00000030172.16	ENSMUST00000183880.8	4656	19	-31	222351	4	-24222	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_2	7.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAATAATATGTTGAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119825107	119773888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_119774285_119801346_119802171_119824837
tx.16055	chr6	+	1476	10	NNC	ENSMUSG00000030166.15	novel	1693	12	NA	NA	-4	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	19.9096725670814	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTTTGGCTTCAGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119879684	119899786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_119879797_119888008_119888103_119889962_119890065_119890859_119890954_119891130_119891199_119895547_119895748_119895889_119896039_119897070_119897152_119897767_119897990_119899432
tx.16056	chr6	+	646	3	ISM	ENSMUSG00000030166.15	ENSMUST00000162461.7	1693	12	17416	0	2037	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_2	19	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTCCTTTGGCTTCAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119897079	119899784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_119897152_119897767_119897990_119899432
tx.16057	chr6	-	2569	12	FSM	ENSMUSG00000030177.15	ENSMUST00000032283.12	2610	12	41	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_10	52.5397920824409	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAGGGCTCTACAAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120334349	120301283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_120302455_120306054_120306208_120306294_120306421_120308772_120308993_120311729_120311879_120315029_120315122_120316095_120316160_120318933_120319031_120325348_120325492_120327167_120327406_120330961_120331016_120334287
tx.16058	chr6	-	2517	12	FSM	ENSMUSG00000030177.15	ENSMUST00000112703.8	1887	12	82	-712	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	197	junction_10	38.004349468349	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAGGGCTCTACAAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120334351	120301283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_120302455_120306054_120306208_120306294_120306421_120308772_120308993_120311729_120311879_120315029_120315122_120316095_120316160_120318933_120319031_120325348_120325492_120327167_120327352_120330961_120331016_120334287
tx.16059	chr6	+	1471	5	ISM	ENSMUSG00000030180.16	ENSMUST00000135802.8	3665	21	-4	37499	-4	-6126	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	4.9180788932265	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGCTCCCATGGACTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120341080	120358935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_120341740_120343530_120343609_120345892_120346016_120351777_120351949_120358495
tx.1606	chr10	+	483	3	NNC	ENSMUSG00000001436.16	novel	356	3	NA	NA	-10	-2621	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	55	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGCAGCCGGTAATGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76869035	76875060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_76869182_76874183_76874414_76874953
tx.16060	chr6	+	1258	6	ISM	ENSMUSG00000030180.16	ENSMUST00000135802.8	3665	21	0	36461	0	-5088	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_5	5.74804314527997	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAAAGAAGGTAAAATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120341084	120359973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_120341740_120343530_120343609_120345892_120346016_120351777_120351949_120358495_120358631_120359877
tx.16061	chr6	+	2961	16	ISM	ENSMUSG00000030180.16	ENSMUST00000135802.8	3665	21	6	13287	-2	-7646	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_13	8.04708366773675	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTTGCCTCAGTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120341090	120383147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_120341740_120343530_120343609_120345892_120346016_120351777_120351949_120358495_120358631_120359877_120359984_120362582_120362675_120364970_120365130_120365890_120366011_120366513_120366673_120367614_120367797_120371047_120371211_120375898_120376019_120379466_120379662_120381925_120382108_120382820
tx.16062	chr6	-	1928	8	FSM	ENSMUSG00000058979.8	ENSMUST00000075303.7	1928	8	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_3	16.3245151817249	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTGTCTTGTGAGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120508280	120486454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_120487424_120487591_120487781_120491358_120491534_120494010_120494042_120495404_120495499_120498154_120498268_120500366_120500571_120508127
tx.16063	chr6	-	992	7	NNC	ENSMUSG00000058979.8	novel	1882	3	NA	NA	-1	-3354	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_1	80.8386596183341	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTTGTTGTTGTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120508281	120489808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_120490030_120491358_120491534_120494010_120494042_120495404_120495499_120498154_120498268_120500366_120500571_120508127
tx.16064	chr6	-	1246	9	FSM	ENSMUSG00000019210.11	ENSMUST00000019354.11	1312	9	66	0	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	841	junction_3	98.1488028454754	2750	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAGTTGTTGTTCCTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120799688	120772204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_120772726_120774837_120774926_120778003_120778099_120780268_120780338_120781003_120781094_120784546_120784614_120785322_120785433_120795294_120795361_120799548
tx.16065	chr6	+	3118	7	FSM	ENSMUSG00000009112.5	ENSMUST00000009256.4	6925	7	-25	3832	1	-3832	multi-exon	FALSE	canonical	3	188	junction_2	15.192286054296	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGATGTTTTGAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120813173	120865971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_120813319_120825416_120825578_120839815_120839924_120842528_120842686_120847726_120847797_120853163_120853308_120863638
tx.16066	chr6	-	1806	5	ISM	ENSMUSG00000004446.13	ENSMUST00000004560.12	2189	6	15063	265	-4222	-265	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	883	junction_1	61.0266335299597	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGGGAGAGCTGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120878751	120870079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_120871254_120872579_120872793_120874180_120874321_120877116_120877328_120878683
tx.16067	chr6	-	1907	6	FSM	ENSMUSG00000004446.13	ENSMUST00000004560.12	2189	6	17	265	0	-265	multi-exon	FALSE	canonical	3	795	junction_5	85.8011654932496	422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGGGAGAGCTGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120893797	120870079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_120871254_120872579_120872793_120874180_120874321_120877116_120877328_120878683_120878750_120893694
tx.16068	chr6	-	1839	6	NNC	ENSMUSG00000004446.13	novel	2189	6	NA	NA	-8	-265	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	75	junction_5	358.381137896514	40	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGGGAGAGCTGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120893822	120870079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_120871254_120872579_120872793_120874180_120874321_120877116_120877328_120878683_120878750_120893787
tx.1607	chr10	+	2325	6	FSM	ENSMUSG00000001436.16	ENSMUST00000105410.10	2347	6	19	3	19	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	40.1875602643405	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGCTTTTCTGTTGTGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76869064	76886262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_76869182_76874183_76874414_76877649_76878404_76878615_76878809_76880594_76880737_76885373
tx.16071	chr6	+	1040	5	Intergenic	novelGene_1279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.02336923485777	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGTAATTTTTCTCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121118580	121123720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_121118740_121119702_121119874_121119963_121120075_121123032_121123166_121123254
tx.16072	chr6	+	1535	5	NNC	ENSMUSG00000030137.9	novel	2263	5	NA	NA	-8383	-756	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	58	junction_1	2.06155281280883	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATGCCTCTTTCTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121179271	121203057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_121179441_121197342_121197566_121198259_121198409_121199692_121200374_121202744
tx.16073	chr6	+	664	2	ISM	ENSMUSG00000030108.15	ENSMUST00000064580.14	2234	15	36523	12	35968	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTTGCCAAATGCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121313708	121314680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_121313945_121314252
tx.16074	chr6	+	2253	7	FSM	ENSMUSG00000007458.15	ENSMUST00000007602.15	2515	7	260	2	-19	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1209	junction_5	55.6586820620906	2096	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTGGCTTTGTCGTTTGTG	2924	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122285938	122294637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_122286126_122289192_122289373_122290217_122290385_122292015_122292126_122292262_122292394_122293008_122293136_122293286
tx.16075	chr6	+	1765	5	ISM	ENSMUSG00000007458.15	ENSMUST00000007602.15	2515	7	4660	2	4381	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1209	junction_3	59.8430238206593	2747	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTGGCTTTGTCGTTTGTG	7324	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122290338	122294637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_122290385_122292015_122292126_122292262_122292394_122293008_122293136_122293286
tx.16076	chr6	-	580	2	ISM	ENSMUSG00000040669.15	ENSMUST00000081849.10	3683	13	17474	562	15604	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1144	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTAATCCAGTTTTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122296500	122295251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_122295607_122296275
tx.16077	chr6	-	2046	8	ISM	ENSMUSG00000040669.15	ENSMUST00000081849.10	3683	13	13839	7	11969	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	902	junction_5	80.0357063173324	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCCATTGTCTTACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122300135	122294696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_122295607_122296275_122296508_122296859_122297011_122297173_122297283_122297896_122298012_122298830_122299043_122299283_122299432_122299966
tx.16078	chr6	-	3897	15	FSM	ENSMUSG00000040669.15	ENSMUST00000161739.8	3893	15	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	590	junction_10	176.752392241987	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCCATTGTCTTACTGCA	9072	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122316621	122294696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_122295607_122296275_122296508_122296859_122297011_122297173_122297283_122297896_122298012_122298830_122299043_122299283_122299432_122299966_122300773_122302416_122302910_122309480_122309637_122310249_122310400_122311028_122311110_122311931_122312043_122313816_122313975_122316556
tx.16079	chr6	+	794	2	NNC	ENSMUSG00000040657.4	novel	817	2	NA	NA	-3983	2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGCGTTAGTCACTGGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122364354	122369648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_122364483_122368982
tx.1608	chr10	-	1502	3	ISM	ENSMUSG00000001435.16	ENSMUST00000105409.8	4791	41	58765	-837	5057	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	400	junction_1	13.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTTGGTTTATAAGCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76890774	76888012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_76889242_76889988_76890105_76890617
tx.16080	chr6	+	594	5	ISM	ENSMUSG00000030116.15	ENSMUST00000142896.8	425	9	8162	-297	-661	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	53.3479146733966	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGTTTGCTGATTTCTGGT	7070	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122498796	122505594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_122498888_122501445_122501470_122502909_122502998_122503745_122503820_122505277
tx.16081	chr6	+	557	5	NNC	ENSMUSG00000030116.15	novel	2491	4	NA	NA	338	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	67	junction_1	33.0331273118365	369	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGTTTGCTGATTTCTGGT	8069	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122499795	122505594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_122499850_122501445_122501470_122502909_122502998_122503745_122503820_122505277
tx.16082	chr6	+	505	4	FSM	ENSMUSG00000030116.15	ENSMUST00000126357.2	2491	4	1986	0	1986	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_1	13.9522996909709	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGTTTGCTGATTTCTGGT	9717	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122501443	122505594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_122501470_122502909_122502998_122503745_122503820_122505277
tx.16083	chr6	+	483	3	ISM	ENSMUSG00000030116.15	ENSMUST00000126357.2	2491	4	3448	0	3448	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_2	7	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGTTTGCTGATTTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122502905	122505594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_122502998_122503745_122503820_122505277
tx.16084	chr6	-	2115	8	FSM	ENSMUSG00000040613.15	ENSMUST00000112585.8	2127	8	-38	50	-22	-50	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	6.10453160549186	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAACAAAGGAAAAGAAA	8686	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122579368	122554809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_122555895_122557646_122557766_122558311_122558710_122565103_122565132_122568045_122568164_122573590_122573737_122577016_122577085_122579215
tx.16085	chr6	-	1231	2	FSM	ENSMUSG00000030117.6	ENSMUST00000032211.5	2125	2	50	844	50	-844	multi-exon	FALSE	canonical	3	704	junction_1	0	3874	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTGGCTTATGCTCTCTT	9897	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122586996	122583205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_122584095_122586654
tx.16086	chr6	+	823	4	FSM	ENSMUSG00000046323.9	ENSMUST00000049644.9	833	4	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	943	junction_3	656.420766141826	2083	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCGACTCTTTGTAATTTA	690	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122603378	122607231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_122603570_122605535_122605769_122606259_122606296_122606868
tx.16087	chr6	+	2185	4	FSM	ENSMUSG00000012396.13	ENSMUST00000012540.5	2211	4	26	0	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4116	junction_3	205.443152450718	1697	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTCTTATCTTTTGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122684552	122691592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_122684893_122688496_122688763_122689587_122689675_122690100
tx.16088	chr6	-	3718	10	FSM	ENSMUSG00000003153.11	ENSMUST00000032476.11	3959	10	226	15	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	8407	junction_1	739.604699221896	407	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTCATGTCACAAGCTTA	8916	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122719478	122704782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_122707100_122708351_122708556_122709329_122709432_122709728_122709834_122712381_122712570_122713537_122713701_122714016_122714258_122716791_122716953_122717346_122717440_122719334
tx.16089	chr6	+	1121	9	NNC	ENSMUSG00000030327.9	novel	2476	8	NA	NA	0	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_8	183.742176704207	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTTTTCATCTTTTAGT	863	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122851507	122865902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_122851623_122857371_122857473_122857616_122857722_122858459_122858542_122859226_122859336_122859772_122859957_122863710_122863814_122864298_122864364_122865645
tx.1609	chr10	-	433	3	NNC	ENSMUSG00000001435.16	novel	5063	42	NA	NA	36	-85037	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	180	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTGCGTTTCCAACCTGT	5971	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77002346	77001595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_77001884_77002123_77002195_77002272
tx.16090	chr6	+	2403	8	FSM	ENSMUSG00000030327.9	ENSMUST00000032477.6	2476	8	75	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	520	junction_7	29.158959137102	282	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTTTTCATCTTTTAGT	863	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122851507	122865902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_122851623_122857371_122857473_122857616_122857722_122858459_122858542_122859226_122859336_122859772_122859957_122863710_122863814_122864298
tx.16091	chr6	-	470	3	Intergenic	novelGene_1283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTGTATGCACGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122893863	122882014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_122882222_122882853_122882931_122893677
tx.16092	chr6	-	576	3	Intergenic	novelGene_1282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	2	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTGTATGCACGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122893854	122882014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_122882222_122882853_122882931_122893562
tx.16093	chr6	-	433	3	Intergenic	novelGene_1281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATGCACGTATTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122893807	122882011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_122882222_122882853_122882931_122893661
tx.16094	chr6	+	1605	7	NNC	ENSMUSG00000049037.9	novel	1558	6	NA	NA	-705	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	7.84573486395988	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTGATCTGATGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122898101	122911565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_122898238_122898882_122899039_122901675_122901790_122904922_122905025_122907635_122907788_122909107_122909224_122910736
tx.16095	chr6	-	457	3	Intergenic	novelGene_1284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAATGTGCCGGGCAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123673772	123671185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_123671411_123672160_123672303_123673682
tx.16096	chr6	-	3061	15	FSM	ENSMUSG00000005069.13	ENSMUST00000080557.12	3073	15	-3	15	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_8	13.6099078555564	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGACTGACGTGGGTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124392029	124373790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124375130_124375302_124375461_124375739_124375906_124376206_124376414_124376817_124376889_124377046_124377191_124380074_124380195_124380770_124380867_124381588_124381680_124382125_124382232_124390227_124390360_124390527_124390661_124390965_124391002_124391245_124391410_124391931
tx.16097	chr6	-	3276	16	FSM	ENSMUSG00000005069.13	ENSMUST00000035861.6	3139	16	-137	0	-107	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_9	30.6939009504422	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGACTGACGTGGGTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124392133	124373790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124375130_124375302_124375461_124375739_124375906_124376206_124376414_124376817_124376889_124377046_124377191_124380074_124380195_124380770_124380867_124381091_124381203_124381588_124381680_124382125_124382232_124390227_124390360_124390527_124390661_124390965_124391002_124391245_124391410_124391931
tx.16098	chr6	-	346	4	ISM	ENSMUSG00000005069.13	ENSMUST00000080557.12	3073	15	1	16833	1	-9337	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_3	12.9700509722291	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGACCTTCAAGATGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124392025	124390608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_124390661_124390965_124391002_124391245_124391410_124391931
tx.16099	chr6	-	1365	2	ISM	ENSMUSG00000008153.13	ENSMUST00000239139.2	1687	4	1153	177	1153	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGCTTGCTGTTTACCT	5751	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124409306	124407716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_124408692_124408916
tx.161	chr1	+	712	6	FSM	ENSMUSG00000026087.12	ENSMUST00000027256.12	969	6	60	197	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	545	junction_1	191.904559612324	5576	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCGCTGATGGAGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37929617	37937419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_37929666_37932023_37932105_37933019_37933097_37934410_37934492_37936768_37936916_37937141
tx.1610	chr10	-	513	2	NNC	ENSMUSG00000078444.4	novel	708	2	NA	NA	103	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCAGGAGTACCTCAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77094954	77093598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_77093821_77094663
tx.16100	chr6	+	534	2	Intergenic	novelGene_1285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTTCTTCTTCTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124451669	124452355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_124451845_124451996
tx.16101	chr6	+	1776	6	FSM	ENSMUSG00000038527.10	ENSMUST00000049124.10	3010	6	-15	1249	-15	-1249	multi-exon	TRUE	canonical	2	10	junction_3	3.13687742827162	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTCACTGATTCAGCAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124470056	124486353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_124470190_124470773_124471003_124482189_124482380_124483850_124483953_124484048_124484124_124485306
tx.16102	chr6	+	1121	2	ISM	ENSMUSG00000038527.10	ENSMUST00000049124.10	3010	6	13974	1253	13974	-1253	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGTCACTGATTCAGC	3520	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124484045	124486349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_124484124_124485306
tx.16103	chr6	+	420	1	ISM	ENSMUSG00000038527.10	ENSMUST00000049124.10	3010	6	15851	1260	15851	-1260	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGTCACTG	5397	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124485922	124486342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_124485900_124486300
tx.16104	chr6	+	1942	13	FSM	ENSMUSG00000004270.14	ENSMUST00000004381.14	2281	13	93	246	-52	155	multi-exon	TRUE	canonical	3	738	junction_2	58.4776785524946	475	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGCATCCCAGACTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124640082	124681135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_124640323_124675032_124675141_124676201_124676309_124676969_124677064_124677203_124677242_124677635_124677815_124678431_124678541_124679198_124679286_124679374_124679542_124679968_124680117_124680189_124680349_124680457_124680591_124680762
tx.16105	chr6	-	1012	6	FSM	ENSMUSG00000004268.12	ENSMUST00000004379.8	1034	6	23	-1	-14	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1245	junction_5	105.298433036774	5300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCAGACCTGATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124689118	124681342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124681622_124681901_124682052_124682120_124682180_124682477_124682620_124682703_124682806_124688838
tx.16106	chr6	+	500	3	FSM	ENSMUSG00000004264.18	ENSMUST00000143000.8	734	3	234	0	219	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1299	1066	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGTCTGAGTGTGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124692544	124693913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_124692623_124692916_124692994_124693568
tx.16107	chr6	-	2169	16	FSM	ENSMUSG00000004266.16	ENSMUST00000112484.10	2219	16	40	10	-4	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_10	22.1017847444248	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGCCTCCAAGTCTGTGC	8770	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124710077	124697679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124697872_124698042_124698186_124698538_124698631_124698725_124698878_124698973_124699042_124701919_124702075_124702189_124702322_124704347_124704498_124704678_124704759_124705074_124705172_124705299_124705414_124705510_124705628_124705743_124705934_124709262_124709458_124709700_124709824_124709908
tx.16108	chr6	-	556	3	FSM	ENSMUSG00000072772.4	ENSMUST00000004389.6	863	3	307	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	807	junction_1	71.5	7240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGTGTCAGTCATTTGT	9250	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124718030	124716145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124716377_124717481_124717659_124717882
tx.16109	chr6	-	1664	5	NIC	ENSMUSG00000004263.16	novel	4433	10	NA	NA	16	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_4	39.1431667088906	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTCTGTGACGTGTTTTT	9837	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124722572	124719506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_124720069_124720192_124720374_124720710_124720855_124721682_124722380_124722492
tx.1611	chr10	+	382	2	ISM	ENSMUSG00000020260.10	ENSMUST00000217993.2	7010	5	-17	8767	-17	-6164	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_1	0	1327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTATGAGCAGTTCATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77095134	77096636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_77095288_77096407
tx.16110	chr6	-	1297	4	FSM	ENSMUSG00000004267.17	ENSMUST00000146712.2	632	4	191	-856	155	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	8.48528137423857	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTTGTCTGAGGACTCTT	9418	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124740094	124737323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124738326_124738610_124738670_124739615_124739725_124739967
tx.16111	chr6	-	2370	12	FSM	ENSMUSG00000004267.17	ENSMUST00000004378.15	2795	12	119	306	-4	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_11	8.77449346328266	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTTGTCTGAGGACTCTT	9985	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124746517	124737323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124738326_124738610_124738670_124739615_124739725_124739967_124740170_124740689_124740888_124743067_124743291_124743493_124743628_124743995_124744066_124744502_124744562_124744663_124744760_124745200_124745301_124746399
tx.16112	chr6	-	560	2	ISM	ENSMUSG00000030125.12	ENSMUST00000032218.10	1470	8	8882	6	3774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTGTGTGACCGAGTT	9453	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124747799	124746831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_124747127_124747534
tx.16113	chr6	+	1171	3	FSM	ENSMUSG00000038451.14	ENSMUST00000143040.8	882	3	-6	-283	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	13	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTTTCATTATTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124785841	124787582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_124785919_124786189_124786933_124787231
tx.16114	chr6	+	1220	3	FSM	ENSMUSG00000038451.14	ENSMUST00000052727.5	1219	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	6.5	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTTTCATTATTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124785867	124787582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_124785994_124786189_124786933_124787231
tx.16115	chr6	-	1340	7	FSM	ENSMUSG00000023456.17	ENSMUST00000239432.2	1601	7	138	123	0	-123	multi-exon	FALSE	canonical	3	1828	junction_3	39.1652482012647	10632	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGTGGGTTGTCATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124791121	124787677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124788351_124788479_124788568_124788844_124788931_124789366_124789500_124789583_124789669_124789752_124789877_124790970
tx.16116	chr6	-	3102	20	FSM	ENSMUSG00000038429.11	ENSMUST00000122110.8	3076	20	-17	-9	-17	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	759	junction_16	54.5472424788812	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGGGCTGACTGGTTTCAG	7888	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124806415	124791991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124792623_124793946_124794032_124794280_124794435_124794629_124794776_124794850_124794995_124795506_124795630_124796335_124796425_124796949_124797125_124797374_124797529_124798039_124798166_124798283_124798372_124798848_124798921_124799488_124799683_124800415_124800511_124801094_124801280_124801518_124801665_124801814_124801949_124802074_124802142_124803261_124803388_124806247
tx.16117	chr6	+	1062	6	NNC	ENSMUSG00000023505.14	novel	1976	6	NA	NA	-17	-237	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	347.474660946665	3879	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGCAAAGCTACACCGGGT	1327	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124807162	124810258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_124807237_124807465_124807614_124808324_124808456_124809108_124809403_124809528_124809633_124809947
tx.16118	chr6	+	986	5	NNC	ENSMUSG00000023505.14	novel	1976	6	NA	NA	127	-240	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	388.333941344302	386	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAGAGCAAAGCTACACCG	1629	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124807464	124810255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_124807614_124808324_124808456_124809108_124809403_124809528_124809633_124809947
tx.16119	chr6	-	1451	7	ISM	ENSMUSG00000023191.10	ENSMUST00000023958.10	2850	15	7010	5	251	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_4	3.85861230093008	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAAGGCCTGGTCTGCTCT	1767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124827705	124818056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_124818803_124819034_124819176_124821978_124822055_124822164_124822283_124822470_124822622_124822904_124823007_124827588
tx.1612	chr10	+	2207	9	FSM	ENSMUSG00000020260.10	ENSMUST00000020493.9	2290	9	83	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_5	28.5938695352693	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCAGTCCTAGAAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77095134	77105409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_77095288_77096407_77096659_77098270_77098416_77099098_77099210_77100789_77100857_77101669_77101796_77102746_77102928_77103017_77103142_77104360
tx.16120	chr6	-	651	3	ISM	ENSMUSG00000030122.13	ENSMUST00000181150.2	629	4	550	-368	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	591	junction_2	78.5	301	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCGTCTCCTGCTTTCCCGC	NA	False	NA	-37	True	NA	NA	NA	124891637	124890643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_124891196_124891370_124891430_124891597
tx.16121	chr6	-	804	5	FSM	ENSMUSG00000030122.13	ENSMUST00000032216.7	1149	5	345	0	345	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	521	junction_3	90.7837402842601	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCGTCTCCTGCTTTCCCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124894564	124890643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124891196_124891370_124891430_124891597_124891677_124891880_124891953_124894522
tx.16122	chr6	+	1506	9	FSM	ENSMUSG00000030120.15	ENSMUST00000180095.4	1475	9	-30	-1	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3449	junction_8	252.103029533562	2459	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGATTCTGGCTGTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124908364	124913109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_124908550_124909061_124909140_124909373_124909501_124909739_124909776_124910916_124910971_124911253_124911383_124911548_124911709_124912195_124912409_124912585
tx.16123	chr6	+	680	2	ISM	ENSMUSG00000030120.15	ENSMUST00000180095.4	1475	9	3856	1	2664	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3449	junction_1	0	759	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGATTCTGGCTGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124912250	124913107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_124912409_124912585
tx.16124	chr6	-	1209	8	NIC	ENSMUSG00000030127.16	novel	1328	8	NA	NA	18	-36	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	167	junction_7	695.556714335461	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCCCTTTTGTCCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124942235	124935411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_124935736_124936761_124936914_124937053_124937160_124938120_124938324_124939320_124939410_124939584_124939661_124941686_124941892_124942181
tx.16125	chr6	-	1262	8	FSM	ENSMUSG00000030127.16	ENSMUST00000112439.9	1328	8	28	38	2	-38	multi-exon	FALSE	canonical	3	371	junction_1	503.213915644191	629	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGTCCCTTTTGTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124942473	124935413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_124935736_124936761_124936914_124937053_124937160_124938120_124938324_124939320_124939410_124939584_124939661_124941686_124941892_124942364
tx.16126	chr6	-	1714	8	NIC	ENSMUSG00000030127.16	novel	1817	8	NA	NA	11	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	167	junction_7	583.751379843669	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGGAACTGGGCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124942242	124935778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_124936601_124936761_124936914_124937053_124937160_124938120_124938324_124939320_124939410_124939584_124939661_124941686_124941892_124942181
tx.16127	chr6	-	1762	8	NIC	ENSMUSG00000030127.16	novel	1817	8	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	1123	junction_1	272.823034517369	1060	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGGAACTGGGCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124942473	124935778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_124936601_124936761_124936914_124937053_124937160_124938120_124938324_124939320_124939410_124939584_124939661_124941686_124941892_124942364
tx.16128	chr6	-	1923	7	ISM	ENSMUSG00000030127.16	ENSMUST00000112439.9	1328	8	28	403	2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1332	junction_6	190.502333027417	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGGAACTGGGCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124942473	124935778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_124936914_124937053_124937160_124938120_124938324_124939320_124939410_124939584_124939661_124941686_124941892_124942364
tx.16129	chr6	+	2158	6	FSM	ENSMUSG00000030329.12	ENSMUST00000032479.11	2250	6	92	0	-76	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	10.6094297678999	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTAGTTGCCTGTTTTGCCT	8122	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124973748	124980059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_124973903_124975880_124975941_124976197_124976704_124977616_124977699_124978389_124978612_124978925
tx.1613	chr10	-	906	6	FSM	ENSMUSG00000032977.10	ENSMUST00000045454.9	2394	6	-24	1512	-24	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	238	junction_3	11.7881296226331	327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGAGGACCATCTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77351643	77324006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_77324308_77325831_77325901_77333196_77333348_77339679_77339749_77350139_77350249_77351436
tx.16130	chr6	+	2826	2	ISM	ENSMUSG00000030329.12	ENSMUST00000162170.8	2053	6	921	0	-304	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTAGTTGCCTGTTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124976320	124980059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_124976704_124977616
tx.16131	chr6	+	1630	8	FSM	ENSMUSG00000030330.16	ENSMUST00000032480.14	1629	8	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_4	19.3527933964298	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGTGTGCGGTGATAGT	7107	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125016798	125026228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_125016861_125020916_125020989_125023866_125024034_125024173_125024289_125024444_125024551_125024755_125024904_125025138_125025201_125025330
tx.16132	chr6	+	1828	7	ISM	ENSMUSG00000108037.3	ENSMUST00000140883.7	3181	10	-2	2234	-2	-2234	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_4	20.4857674170793	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGTGTGCGGTGATAGT	7114	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125016805	125026228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_125016861_125020916_125020989_125023866_125024034_125024173_125024289_125024444_125024904_125025138_125025201_125025330
tx.16133	chr6	+	1254	5	FSM	ENSMUSG00000072770.10	ENSMUST00000112414.8	1498	5	244	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_4	12.3490890352285	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTTGTCGTTGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125026895	125031157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_125027016_125027396_125027613_125027809_125027905_125028205_125028324_125030452
tx.16134	chr6	+	1138	4	NIC	ENSMUSG00000072770.10	novel	1498	5	NA	NA	-16	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	6	junction_3	51.6978400580398	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTTGTCGTTGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125026893	125031157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_125027016_125027396_125027613_125027809_125027905_125030452
tx.16135	chr6	+	2369	2	FSM	ENSMUSG00000067714.14_ENSMUSG00000107761.2	ENSMUST00000088292.7	1393	2	4	-980	4	-577	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTTTGGTCTTTTTGTTGT	5042	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125044886	125060415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_125044940_125058099
tx.16136	chr6	+	569	4	ISM	ENSMUSG00000063870.13	ENSMUST00000112392.8	6652	39	127	29672	-54	393	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	200	junction_3	2.16024689946929	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCGGACCTAAGAAAGAGAAG	1735	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125073070	125077876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_125073224_125074049_125074229_125077430_125077553_125077761
tx.16137	chr6	+	396	3	ISM	ENSMUSG00000063870.13	ENSMUST00000112390.8	6537	39	-49	30055	-49	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_1	2	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGAAACCTCGAGACCCT	1740	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125073075	125077499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_125073224_125074049_125074229_125077430
tx.16138	chr6	+	2609	16	NNC	ENSMUSG00000038279.11	novel	2597	16	NA	NA	-9	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_7	206.283558885983	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTGTTGTGTTTTTTGA	5428	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125108862	125121716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_125108967_125109170_125109282_125110481_125110528_125110676_125110766_125111509_125111695_125113875_125113932_125114017_125114190_125114281_125114474_125114597_125114688_125116602_125116691_125116768_125116910_125117497_125117638_125117752_125117843_125117998_125118122_125118236_125118466_125120963
tx.16139	chr6	-	1108	7	ISM	ENSMUSG00000038252.14	ENSMUST00000043848.11	4629	32	20637	0	26	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	638	junction_5	33.9153357642232	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATCCTGTCCTGGCTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125148027	125144969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_125145283_125145552_125145712_125145825_125145953_125146777_125146962_125147096_125147178_125147689_125147785_125147878
tx.1614	chr10	+	2278	6	FSM	ENSMUSG00000009291.14	ENSMUST00000009435.12	2294	6	16	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	637	junction_4	46.3188946327522	573	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGATTTCTTTGTTTTGT	1307	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77417569	77434566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_77417762_77423084_77423138_77425467_77425577_77428679_77428852_77429697_77429745_77432861
tx.16140	chr6	+	820	3	FSM	ENSMUSG00000030335.7	ENSMUST00000136804.2	855	3	22	13	22	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_1	333	283	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATGCACTCTGACGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125168785	125170508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_125169172_125169478_125169590_125170185
tx.16141	chr6	+	672	3	FSM	ENSMUSG00000030335.7	ENSMUST00000032485.7	3427	3	31	2724	-21	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	716	junction_1	10	2946	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATGCACTCTGACGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125169158	125170508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_125169397_125169478_125169590_125170185
tx.16142	chr6	-	1507	5	FSM	ENSMUSG00000067702.6	ENSMUST00000088246.6	1509	5	-3	5	-3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	590	junction_2	43.4453679924569	1488	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGAGGCATTTCCTCTCT	3458	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125263008	125255241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_125255618_125257932_125258614_125259315_125259465_125259718_125259942_125262930
tx.16143	chr6	-	2078	10	FSM	ENSMUSG00000030339.8	ENSMUST00000032489.8	2107	10	29	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	2.62936879248872	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTTGGGTTTTATGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125290819	125283533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_125284435_125284892_125285110_125286156_125286183_125286421_125286530_125289005_125289086_125289232_125289330_125289714_125289874_125289956_125290083_125290352_125290450_125290552
tx.16144	chr6	+	2148	10	FSM	ENSMUSG00000030341.18	ENSMUST00000032491.15	2156	10	7	1	7	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	24	junction_1	4.54062594260057	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGCTGACCCTGGAAAGAGT	3783	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125326692	125339446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_125327026_125333787_125333942_125334275_125334405_125334683_125334834_125335016_125335096_125337459_125337537_125337672_125337787_125338054_125338084_125338261_125338548_125338649
tx.16145	chr6	+	541	3	ISM	ENSMUSG00000030341.18	ENSMUST00000130257.8	390	4	257	-28	-15	28	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCGGGATACAGTCTGCAG	3761	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125326670	125334307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_125327026_125333787_125333942_125334275
tx.16146	chr6	-	1071	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030341.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTTATAGTCAAGAGTAAAA	5489	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125338911	125336642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_125337460_125338657
tx.16148	chr6	-	881	2	ISM	ENSMUSG00000038167.7	ENSMUST00000042647.7	3299	17	17086	-7	17086	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGTTTGGTGAACACTG	9889	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125340670	125339615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_125339831_125340004
tx.16149	chr6	-	765	2	Intergenic	novelGene_1286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGATGGTGATGATGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125407711	125406346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_125406812_125407411
tx.1615	chr10	+	1815	3	FSM	ENSMUSG00000009291.14	ENSMUST00000167006.2	831	3	618	-1602	618	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	637	junction_1	17.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGATTTCTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77428788	77434566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_77428852_77429697_77429745_77432861
tx.16150	chr6	+	575	3	Intergenic	novelGene_1287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_2	85	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTCTGGTGATTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125409631	125435802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_125409775_125409999_125410201_125435571
tx.16151	chr6	+	453	3	Intergenic	novelGene_1288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_2	52.5	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTAAGAGTTGTGTTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125409642	125415343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_125409775_125409999_125410201_125415223
tx.16152	chr6	+	785	5	Intergenic	novelGene_1290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	59.9437236080643	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTCTGGTGATTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125409649	125435802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_125409775_125409999_125410201_125415223_125415345_125434610_125434718_125435571
tx.16153	chr6	+	683	4	Intergenic	novelGene_1289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	73.0585761944178	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTCTGGTGATTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125409644	125435802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_125409775_125409999_125410201_125415223_125415345_125435571
tx.16154	chr6	+	663	4	Intergenic	novelGene_1291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_2	60.7417118260224	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTCTGGTGATTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125409650	125435802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_125409775_125409999_125410201_125434610_125434718_125435571
tx.16155	chr6	-	1187	8	FSM	ENSMUSG00000030342.9	ENSMUST00000032492.9	1228	8	41	0	41	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5197	junction_4	437.363109779412	8092	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCGGGCTGATTGCTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125471713	125437228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_125437690_125438188_125438273_125439076_125439167_125439289_125439389_125440647_125440723_125441352_125441451_125449371_125449475_125471536
tx.16156	chr6	+	987	4	FSM	ENSMUSG00000101191.7	ENSMUST00000187542.7	782	4	-130	-75	-130	75	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.4142135623731	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAAGTGCTGTGTCTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125458195	125461716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_125458438_125459526_125459666_125460403_125460533_125461239
tx.16157	chr6	-	599	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000001930.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATAAATCTTTAAAAACAA	7580	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125565751	125560339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_125560818_125565630
tx.16158	chr6	+	1078	4	ISM	ENSMUSG00000001930.18	ENSMUST00000112253.6	2184	10	35366	300	-15221	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_3	6.84754619472471	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCCCGGGAAGCCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125565291	125569134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_125565597_125567141_125567265_125568112_125568225_125568596
tx.16159	chr6	+	226	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000118420.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTTTTAGATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126785304	126785920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_126785428_126785817
tx.1616	chr10	+	1754	2	ISM	ENSMUSG00000009291.14	ENSMUST00000167006.2	831	3	1525	-1602	1525	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	672	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGATTTCTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77429695	77434566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_77429745_77432861
tx.16160	chr6	-	1213	11	FSM	ENSMUSG00000000399.11	ENSMUST00000205002.3	1445	11	-1	233	-1	42	multi-exon	FALSE	canonical	3	1115	junction_7	83.3223259396904	4215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAAGTGTCTTTCTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126826089	126798916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_126799153_126801898_126801966_126804502_126804599_126809434_126809512_126811391_126811460_126813181_126813285_126817460_126817603_126819083_126819176_126821270_126821369_126821753_126821925_126826026
tx.16161	chr6	-	1112	5	ISM	ENSMUSG00000030345.17	ENSMUST00000078521.7	2252	15	36402	-2	-53	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_4	3.57071421427143	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGCTGTCAATCTATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126862400	126852980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_126853514_126854122_126854302_126857187_126857318_126860989_126861051_126862191
tx.16162	chr6	-	1874	9	FSM	ENSMUSG00000030346.17	ENSMUST00000112221.8	1871	9	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_4	48.7748334184751	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCATGCCTCGCCTAGTT	5262	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126916553	126900377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_126901304_126901880_126902031_126903321_126903481_126904500_126904654_126905103_126905191_126906955_126907066_126911676_126911813_126912915_126912972_126916456
tx.16163	chr6	+	2145	14	FSM	ENSMUSG00000030347.7	ENSMUST00000032497.7	2501	14	9	347	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_10	14.682034265643	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATGTGAAAATGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126916937	126952583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_126916990_126919274_126919470_126921754_126921901_126923439_126923622_126927020_126927121_126927237_126927360_126931697_126931805_126932097_126932296_126932811_126932941_126938928_126939004_126943842_126944046_126950518_126950577_126951449_126951518_126952073
tx.16164	chr6	-	1300	6	FSM	ENSMUSG00000038028.10	ENSMUST00000039913.9	3651	6	-3	2354	-3	411	multi-exon	FALSE	canonical	3	974	junction_4	62.3903838744401	1745	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAGTGTTCAGAGTGAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127086516	127064432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_127065266_127066155_127066267_127068146_127068225_127069583_127069706_127078811_127078850_127086398
tx.16165	chr6	+	1358	8	NIC	ENSMUSG00000037997.13	novel	3746	9	NA	NA	7	1851	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_3	15.8513502933488	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTTGTTCTGTTTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127430589	127468861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_127430786_127444994_127445116_127447664_127447794_127451198_127451275_127454806_127454880_127454961_127455093_127466888_127467041_127468381
tx.16166	chr6	+	3448	6	NIC	ENSMUSG00000037997.13	novel	3746	9	NA	NA	7	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_1	18.7125626251457	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTGGCTGCCTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127430589	127471201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_127430786_127451198_127451275_127454806_127454880_127454961_127455093_127466888_127467041_127468381
tx.16167	chr6	+	3819	9	FSM	ENSMUSG00000037997.13	ENSMUST00000039680.7	3746	9	-96	23	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_4	10.4403065089106	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTGGCTGCCTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127430589	127471201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_127430786_127444994_127445116_127447664_127447794_127448510_127448632_127451198_127451275_127454806_127454880_127454961_127455093_127466888_127467041_127468381
tx.16168	chr6	+	1773	7	FSM	ENSMUSG00000037997.13	ENSMUST00000112193.8	1725	7	-48	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_4	10.0443461155462	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTTGATTTCTGGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127430589	127456018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_127430786_127444994_127445116_127447664_127447794_127448510_127448632_127451198_127451275_127454806_127454880_127454961
tx.16169	chr6	-	925	4	ISM	ENSMUSG00000030352.16	ENSMUST00000112171.8	2584	9	170256	1061	364	44	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_3	4.92160768674447	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGGTTTGAGTTTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127943416	127940825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_127941463_127942200_127942285_127942661_127942794_127943344
tx.1617	chr10	+	1593	4	FSM	ENSMUSG00000020265.17	ENSMUST00000020501.15	2630	4	128	909	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1171	junction_3	110.14031454871	897	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTTGGCCTATGTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77442058	77453256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_77442176_77445645_77445775_77449813_77449886_77451981
tx.16170	chr6	-	1466	9	FSM	ENSMUSG00000030352.16	ENSMUST00000032503.12	1405	9	-17	-44	-14	44	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_5	10.9971587239614	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGGTTTGAGTTTCCTTT	6149	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128120540	127940825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_127941463_127942200_127942285_127942661_127942794_127943344_127943447_127943691_127943767_127944043_127944236_128011128_128011209_128060344_128060445_128120476
tx.16171	chr6	-	1510	4	NNC	ENSMUSG00000056771.8	novel	2346	2	NA	NA	-22	-1219	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.69967317119759	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTTGTCCCAAGTAGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128177608	128165999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_128166683_128167505_128167762_128176569_128176675_128177142
tx.16172	chr6	-	1611	11	FSM	ENSMUSG00000030353.16	ENSMUST00000112157.4	1909	11	296	2	221	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_7	24.4991836598692	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCAGAGGAGCTAGTTTG	1653	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128277480	128205145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_128205443_128205530_128205684_128207554_128207696_128219363_128219538_128220332_128220473_128223283_128223340_128223780_128223825_128228502_128228566_128228884_128228950_128247830_128248086_128277257
tx.16173	chr6	-	422	3	ISM	ENSMUSG00000001521.13	ENSMUST00000138313.6	2630	4	-11	2647	-1	134	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGGGTCTTTGTGAGAAA	7490	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128332815	128311305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_128311561_128314696_128314749_128332700
tx.16174	chr6	-	1068	2	FSM	ENSMUSG00000001521.13	ENSMUST00000157005.3	1053	2	-13	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTGTTGTTTAATAAGTT	7504	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128332801	128319201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_128320169_128332700
tx.16175	chr6	-	1312	4	NIC	ENSMUSG00000048668.17	novel	2015	4	NA	NA	8	37	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	55	junction_2	133.417473451652	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTCTTCTGCCTCGAACT	439	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128339866	128334285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_128335157_128336068_128336318_128339020_128339148_128339801
tx.16176	chr6	-	1174	3	FSM	ENSMUSG00000048668.17	ENSMUST00000112151.2	1108	3	-36	-30	7	25	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_2	100.5	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTATGCTTATTAGTCTT	438	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128339867	128334297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_128335157_128336068_128336318_128339801
tx.16177	chr6	+	1083	2	NNC	ENSMUSG00000097253.3	novel	2237	2	NA	NA	1356	519	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAGAAGAAACAAAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128334322	128336319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_128335159_128336072
tx.16178	chr6	-	2307	12	FSM	ENSMUSG00000001518.13	ENSMUST00000001559.11	2320	12	13	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	237	junction_3	19.6628609101919	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGCTCTCCAATCTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128401881	128386406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_128387381_128387455_128387630_128388527_128388646_128389661_128389754_128389919_128389974_128390065_128390164_128390487_128390637_128391107_128391248_128392858_128393028_128393219_128393262_128394579_128394676_128401680
tx.16179	chr6	-	1606	7	ISM	ENSMUSG00000030357.11	ENSMUST00000032508.11	2217	10	3856	0	2832	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5358	junction_6	157.124154731219	519	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGTGTCAGGCAACCCT	1923	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128411784	128407065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_128407844_128409384_128409625_128410068_128410255_128410488_128410573_128410665_128410757_128411267_128411425_128411714
tx.1618	chr10	+	1428	3	ISM	ENSMUSG00000020265.17	ENSMUST00000099538.6	1874	4	3289	0	22	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1171	junction_2	121.5	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTTGGCCTATGTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77445693	77453256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_77445775_77449813_77449886_77451981
tx.16180	chr6	-	2196	10	FSM	ENSMUSG00000030357.11	ENSMUST00000032508.11	2217	10	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5250	junction_7	195.172162050601	1141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGTGTCAGGCAACCCT	9290	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128415619	128407065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_128407844_128409384_128409625_128410068_128410255_128410488_128410573_128410665_128410757_128411267_128411425_128411714_128411836_128412676_128412820_128413532_128413678_128415368
tx.16181	chr6	+	1811	5	FSM	ENSMUSG00000059659.8	ENSMUST00000204081.2	907	5	-518	-386	64	386	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	4.26468052730799	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGTATTAATTAGAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128415783	128480630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_128416351_128416477_128416660_128465853_128466007_128479128_128479327_128479919
tx.16182	chr6	+	1418	5	NNC	ENSMUSG00000059659.8	novel	907	5	NA	NA	52	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_2	2.91547594742265	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAATTGTTATTCACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128415771	128480245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_128416351_128416477_128416660_128465853_128465987_128479128_128479327_128479919
tx.16183	chr6	+	753	4	NNC	ENSMUSG00000059659.8	novel	907	5	NA	NA	7001	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.12825877028341	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAATTGTTATTCACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128423302	128480245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_128423399_128465853_128465987_128479128_128479327_128479919
tx.16184	chr6	-	687	7	NIC	ENSMUSG00000030359.15	novel	4681	36	NA	NA	-33	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	3	junction_6	23.8799078725191	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTGGGTTTTTTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128464851	128460533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_128460690_128461826_128461869_128462520_128462624_128463080_128463150_128463855_128463947_128464365_128464497_128464756
tx.16185	chr6	-	595	6	ISM	ENSMUSG00000030359.15	ENSMUST00000112132.8	4681	36	39182	6	317	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	18.6225669551756	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCTGTGGGTTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128464501	128460535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_128460690_128461826_128461869_128462520_128462624_128463080_128463150_128463855_128463947_128464365
tx.16186	chr6	+	534	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000079298.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCATTGTAATTTCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128791417	128799482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_128791506_128797843_128798066_128799258
tx.16187	chr6	+	1773	4	FSM	ENSMUSG00000030161.9	ENSMUST00000032264.9	1820	4	32	15	-8	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_2	5.71547606649408	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGGACTCAGAATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129510154	129519294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_129510500_129514453_129514533_129515532_129515652_129518064
tx.16188	chr6	-	629	5	FSM	ENSMUSG00000030188.13	ENSMUST00000032307.12	767	5	13	125	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	356	junction_3	64.3059095262636	2654	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGGTTACATGGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131270194	131261475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_131261692_131262605_131262689_131264998_131265110_131266351_131266411_131270034
tx.16189	chr6	-	652	2	ISM	ENSMUSG00000030189.16	ENSMUST00000203157.2	1035	3	1153	-245	1153	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3275	junction_1	0	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGTGTAACTAGTGTGTA	8755	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131344828	131341817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_131342369_131344727
tx.1619	chr10	+	2002	6	FSM	ENSMUSG00000009293.18	ENSMUST00000174510.8	2031	6	32	-3	-6	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	276	junction_5	14.0427917452336	311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTGTGTGGTGCTCACTT	122	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77458140	77481830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_77458251_77466559_77466596_77466682_77466729_77477293_77477413_77479302_77479444_77480280
tx.16190	chr6	-	1296	7	ISM	ENSMUSG00000030189.16	ENSMUST00000032309.13	1853	10	7511	0	-2425	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2076	junction_5	443.679595353824	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGTGTAACTAGTGTGTA	9952	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131357890	131341817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_131342369_131344727_131344827_131345351_131345524_131347285_131347378_131352936_131353144_131356320_131356444_131357838
tx.16191	chr6	-	1089	6	ISM	ENSMUSG00000030189.16	ENSMUST00000087865.4	1684	9	7549	0	-2425	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	624	junction_4	963.279108047091	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGTGTAACTAGTGTGTA	9952	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131357890	131341817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_131342369_131344727_131344827_131345351_131345524_131347285_131347378_131356320_131356444_131357838
tx.16193	chr6	-	988	2	NNC	ENSMUSG00000107666.2	novel	1505	9	NA	NA	53541	-6524	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGAAACAAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134326837	134292437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_134293294_134326705
tx.16194	chr6	+	2168	6	FSM	ENSMUSG00000030200.14	ENSMUST00000111960.2	1578	6	22	-612	-15	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_3	10	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTGCTGGAAAAAGAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134391412	134415690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_134391599_134400573_134401026_134404258_134404424_134407028_134407100_134409108_134409376_134414663
tx.16195	chr6	+	1418	3	FSM	ENSMUSG00000042992.16	ENSMUST00000203234.2	485	3	-258	-675	36	675	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_1	7	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134617959	134663939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_134618221_134621291_134621436_134662926
tx.16196	chr6	+	1666	4	FSM	ENSMUSG00000042992.16	ENSMUST00000062755.10	1764	4	85	13	64	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_1	6.37704215656966	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGTAGCAGCTAAACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134617987	134688137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_134618221_134621291_134621436_134662926_134663085_134687006
tx.16197	chr6	+	1132	5	FSM	ENSMUSG00000032652.14	ENSMUST00000046303.12	3629	5	5	2492	5	279	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	2.06155281280883	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTTCTAGTTACTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134807121	134833402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_134807408_134826065_134826264_134828042_134828188_134829240_134829278_134832936
tx.16198	chr6	-	1647	4	FSM	ENSMUSG00000032641.19	ENSMUST00000046255.14	1610	4	-37	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	18.9267594221045	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCACTATTGATTATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134874858	134846070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_134847446_134864592_134864749_134874124_134874177_134874794
tx.16199	chr6	-	1608	4	NIC	ENSMUSG00000032641.19	novel	1711	5	NA	NA	-10	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	74	junction_3	8.64098759787715	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTTCACTATTGATTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134874860	134846072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_134847407_134864592_134864749_134874124_134874177_134874794
tx.162	chr1	+	665	5	FSM	ENSMUSG00000026087.12	ENSMUST00000194857.6	501	5	9	-173	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	895	junction_1	64.9514241568266	1015	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCGCTGATGGAGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37932022	37937419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_37932105_37933019_37933097_37934410_37934492_37936768_37936916_37937141
tx.1620	chr10	+	1221	5	ISM	ENSMUSG00000069581.13	ENSMUST00000092368.10	2169	10	1	16117	1	2903	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.95803989154981	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGTCTACTTAACTCCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77700457	77706738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_77700717_77702113_77702205_77703505_77703663_77705396_77705529_77706156
tx.16200	chr6	-	1535	2	ISM	ENSMUSG00000032641.19	ENSMUST00000165392.8	1643	4	9957	45	-26	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	94	junction_1	0	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCACTAAACTTCCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134864821	134846100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_134847407_134864592
tx.16201	chr6	-	587	2	FSM	ENSMUSG00000032641.19	ENSMUST00000152140.3	610	2	27	-4	-11	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCTCTATTTTTATATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134874861	134873656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_134874177_134874794
tx.16202	chr6	+	2507	3	FSM	ENSMUSG00000003031.15	ENSMUST00000003115.9	2393	3	-116	2	-116	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATTGAGTGCAACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134897247	134902474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_134898358_134898918_134899047_134901205
tx.16203	chr6	+	438	2	FSM	ENSMUSG00000098318.8	ENSMUST00000183867.7	5662	2	2	5222	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_1	0	645	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACTGTTTCTGGGCTCTGT	7967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134906056	134928539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_134906224_134928268
tx.16204	chr6	+	1752	12	FSM	ENSMUSG00000030204.11	ENSMUST00000032326.11	1764	12	8	4	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	485	junction_5	30.2182146373304	573	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGTGTGTCTGTGTGTG	6582	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134988582	135000735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_134988692_134989264_134989359_134992157_134992347_134992538_134992611_134992784_134992904_134993544_134993617_134994083_134994201_134995013_134995161_134995936_134996075_134997578_134997650_134998411_134998542_135000241
tx.16205	chr6	+	663	2	ISM	ENSMUSG00000046733.8	ENSMUST00000050104.8	2083	4	-29	5655	-29	-5655	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTGAGCTGCCTGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135042619	135056052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_135042774_135055543
tx.16206	chr6	+	2073	4	FSM	ENSMUSG00000046733.8	ENSMUST00000050104.8	2083	4	7	3	7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_1	5.71547606649408	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTTATTTATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135042655	135061704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_135042774_135055543_135056483_135060440_135060497_135060744
tx.16208	chr6	-	1015	4	FSM	ENSMUSG00000042770.9	ENSMUST00000045855.9	1058	4	41	2	18	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	260	junction_1	18.8738502225228	1792	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGAGACAGTTTTAAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135145172	135114521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_135115062_135129818_135130000_135132148_135132288_135145017
tx.16209	chr6	-	547	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082691.7	novel	342	1	NA	NA	-22	337	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAAGACAGGAAGGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135326769	135326068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_135326374_135326527
tx.1621	chr10	+	1257	5	NNC	ENSMUSG00000069581.13	novel	2169	10	NA	NA	0	2916	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4790199457749	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCCCACAGGGCAGAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77700456	77706751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_77700717_77702113_77702205_77703505_77703663_77705396_77705529_77706134
tx.16210	chr6	+	2641	5	FSM	ENSMUSG00000030208.16	ENSMUST00000032330.16	2721	5	80	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_2	1.6393596310755	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGTGTGACTGTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135340008	135360171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_135340101_135354175_135354287_135356898_135356996_135357098_135357240_135357971
tx.16214	chr6	+	605	2	ISM	ENSMUSG00000030213.13	ENSMUST00000032335.13	8059	15	23	50633	-16	136	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGACAACCCAGCCTCTGA	7071	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136495822	136537227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_136495962_136536761
tx.16215	chr6	-	2041	11	FSM	ENSMUSG00000030214.8	ENSMUST00000032336.7	2010	11	-31	0	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_2	4.98497743224581	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGGTCCTGCGTTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136638957	136589067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_136589347_136589734_136589842_136590789_136590976_136593924_136594066_136594199_136594401_136611428_136611574_136612489_136612631_136617114_136617254_136618128_136618213_136628728_136628949_136638559
tx.16216	chr6	-	1562	4	ISM	ENSMUSG00000030216.13	ENSMUST00000116514.4	2739	12	10207	0	3188	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1400	junction_3	128.288736839989	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTGTGTTTGTGTAATG	9392	False	NA	-35	True	NA	NA	NA	136795024	136790651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_136791640_136793048_136793232_136793941_136794236_136794927
tx.16217	chr6	-	2660	12	FSM	ENSMUSG00000030216.13	ENSMUST00000116514.4	2739	12	79	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1089	junction_11	207.479880534104	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTGTGTTTGTGTAATG	2911	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136805152	136790651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_136791640_136793048_136793232_136793941_136794236_136794927_136795030_136797504_136797697_136798174_136798375_136798526_136798661_136799791_136799989_136801327_136801422_136802513_136802546_136802998_136803108_136805017
tx.16218	chr6	-	2647	11	NNC	ENSMUSG00000030216.13	novel	2739	12	NA	NA	-11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	531.287125761579	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTGTGTTTGTGTAATG	2911	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136805152	136790651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_136791640_136793048_136793232_136793941_136794236_136794927_136795030_136797504_136797697_136798174_136798375_136798526_136798661_136799791_136799989_136801327_136801422_136802979_136803108_136805017
tx.16219	chr6	-	275	3	ISM	ENSMUSG00000030216.13	ENSMUST00000151333.2	2339	7	-11	5789	-11	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1089	junction_2	347	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTACGAATTTAGAAACATT	2911	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136805152	136802514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_136802546_136802998_136803108_136805017
tx.1622	chr10	+	1705	6	NIC	ENSMUSG00000020284.17	novel	1818	7	NA	NA	-33	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_1	21.8595516879921	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGTGTCCCAGGCCCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77814454	77821271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_77814616_77816334_77816382_77817417_77817648_77818703_77818876_77819349_77819426_77820252
tx.16220	chr6	-	522	3	Intergenic	novelGene_1292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTGAATACTGCAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136976901	136974795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_136975056_136976540_136976764_136976862
tx.16221	chr6	-	2029	4	ISM	ENSMUSG00000015766.15	ENSMUST00000100841.9	4151	21	80743	-198	29429	198	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	132	junction_2	4.08248290463863	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAGACTGCATTTGCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137467272	137454467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_137456128_137459149_137459280_137460539_137460721_137467214
tx.16222	chr6	-	2553	8	ISM	ENSMUSG00000015766.15	ENSMUST00000100841.9	4151	21	61757	9	10443	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	132	junction_2	15.1886101257166	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAACACCAGAATGTTTGC	961	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137486258	137454674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_137456128_137459149_137459280_137460539_137460721_137467214_137467438_137476579_137476724_137477532_137477642_137482385_137482520_137486079
tx.16224	chr6	+	1774	10	FSM	ENSMUSG00000030224.11	ENSMUST00000064910.7	2650	10	43	833	43	423	multi-exon	FALSE	canonical	3	757	junction_9	58.2073772423402	349	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCTCTTTTTTTGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137712118	137728097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_137712465_137713327_137713464_137716355_137716438_137716752_137716826_137718300_137718398_137718949_137719088_137722504_137722642_137725684_137725835_137726361_137726428_137727548
tx.16225	chr6	+	1284	8	ISM	ENSMUSG00000030224.11	ENSMUST00000064910.7	2650	10	4288	833	4288	423	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	757	junction_7	64.6485001483296	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCTCTTTTTTTGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137716363	137728097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_137716438_137716752_137716826_137718300_137718398_137718949_137719088_137722504_137722642_137725684_137725835_137726361_137726428_137727548
tx.16226	chr6	+	826	4	ISM	ENSMUSG00000030224.11	ENSMUST00000064910.7	2650	10	10505	833	543	423	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	757	junction_3	35.9753001686188	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCTCTTTTTTTGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137722580	137728097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_137722642_137725684_137725835_137726361_137726428_137727548
tx.16227	chr6	+	611	2	FSM	ENSMUSG00000030224.11	ENSMUST00000137235.2	331	2	143	-423	143	423	multi-exon	FALSE	canonical	3	757	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCTCTTTTTTTGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137726365	137728097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_137726428_137727548
tx.16228	chr6	+	1743	9	FSM	ENSMUSG00000030225.12	ENSMUST00000087675.9	1729	9	-16	2	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	541	junction_6	37.3511629671688	389	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTTATTTTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137731539	137814890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_137731637_137755121_137755220_137756507_137756656_137757727_137757824_137759926_137760062_137773751_137773881_137807190_137807304_137813731_137813882_137814113
tx.16229	chr6	+	957	4	FSM	ENSMUSG00000008540.12	ENSMUST00000008684.11	1167	4	210	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.24721912892465	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTGTTTTTTCTCTTT	2424	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138117523	138133753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_138117605_138124656_138124814_138127765_138127861_138133129
tx.1623	chr10	+	1086	5	NNC	ENSMUSG00000020284.17	novel	2238	6	NA	NA	-24	329	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	24.1285619132181	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCTGGGACAGGAAGCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77814463	77820642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_77814616_77817351_77817648_77818703_77818876_77819349_77819426_77820252
tx.16230	chr6	-	1284	2	Intergenic	novelGene_1293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGGCCAGAAACTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140254570	140244862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_140246027_140254450
tx.16231	chr6	+	1024	10	ISM	ENSMUSG00000030231.12	ENSMUST00000203517.3	3006	23	-59	42649	48	-9179	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_4	12.6588669943343	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGCCTTAGAAGCTGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140369827	140489576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_140369983_140370102_140370183_140372223_140372282_140470590_140470675_140471564_140471686_140472182_140472288_140474286_140474360_140480187_140480289_140482373_140482490_140489445
tx.16232	chr6	+	411	4	NNC	ENSMUSG00000030231.12	novel	2902	21	NA	NA	47	-78051	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_3	45.3063645271464	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTATTTCTAATTAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140369826	140420704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_140369983_140370102_140370183_140372223_140372282_140420587
tx.16233	chr6	+	1728	12	FSM	ENSMUSG00000041671.14	ENSMUST00000041852.8	2831	12	1	1102	1	104	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_5	7.76088944378656	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTTTAATGACTCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142291380	142307881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_142291534_142293283_142293365_142294248_142294369_142296787_142296917_142299250_142299325_142300350_142300512_142302208_142302310_142303105_142303239_142304124_142304238_142304761_142304885_142306584_142306723_142307479
tx.16234	chr6	+	526	2	ISM	ENSMUSG00000041671.14	ENSMUST00000137098.8	3011	10	15195	-104	7933	104	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTTTAATGACTCATTTG	3017	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142306598	142307881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_142306723_142307479
tx.16235	chr6	-	2835	15	FSM	ENSMUSG00000030243.17	ENSMUST00000111803.9	3389	15	10	544	-3	201	multi-exon	TRUE	canonical	3	113	junction_14	18.9118524546197	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTCAAATGTTTCCTCT	6190	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142332803	142307645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_142308596_142309272_142309403_142310161_142310382_142311241_142311334_142312392_142312532_142312999_142313118_142313206_142313356_142314198_142314281_142315016_142315184_142318541_142318741_142320545_142320653_142322506_142322687_142323878_142324077_142330254_142330303_142332747
tx.16236	chr6	+	1093	5	FSM	ENSMUSG00000030245.11	ENSMUST00000032372.7	2818	5	3	1722	3	426	multi-exon	FALSE	canonical	3	520	junction_3	45.9911676303179	371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTTGGAGCCAGATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142332949	142347862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_142333096_142338055_142338148_142339653_142339833_142341913_142341996_142347268
tx.16237	chr6	+	822	3	FSM	ENSMUSG00000030245.11	ENSMUST00000146508.2	367	3	-29	-426	3	426	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	306	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTTGGAGCCAGATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142332949	142347862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_142333096_142341913_142341996_142347268
tx.16238	chr6	+	1057	6	NNC	ENSMUSG00000030245.11	novel	2818	5	NA	NA	3	426	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_4	283.233190145505	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTTGGAGCCAGATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142332949	142347862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_142333096_142338055_142338148_142339653_142339729_142339832_142339901_142341913_142341996_142347268
tx.16239	chr6	-	890	5	ISM	ENSMUSG00000030246.13	ENSMUST00000239397.2	1287	8	9321	-3	2765	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	685	junction_1	46.3546114210873	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTGCCTGCCTTTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142444348	142435974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_142436331_142438218_142438343_142439825_142439944_142441293_142441468_142444230
tx.1624	chr10	+	1707	6	NNC	ENSMUSG00000020284.17	novel	1818	7	NA	NA	-22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	22.657449106199	37	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTGTGTCCCAGGCCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77814465	77821270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_77814630_77816334_77816382_77817417_77817648_77818703_77818876_77819349_77819426_77820252
tx.16240	chr6	-	1290	8	FSM	ENSMUSG00000030246.13	ENSMUST00000239397.2	1287	8	0	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	685	junction_1	65.6636450839754	1112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTGCCTGCCTTTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142453669	142435974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_142436331_142438218_142438343_142439825_142439944_142441293_142441468_142444230_142444405_142447065_142447184_142451137_142451273_142453578
tx.16241	chr6	+	1415	7	ISM	ENSMUSG00000030282.15	ENSMUST00000032419.9	1760	8	7600	5	-5680	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	681	junction_6	58.9559628498726	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAAGTTTCTGTACTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142710011	142721435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_142710156_142710279_142710436_142713529_142713664_142716248_142716344_142716891_142717064_142717840_142717995_142720875
tx.16242	chr6	+	989	4	ISM	ENSMUSG00000030282.15	ENSMUST00000032419.9	1760	8	13834	0	554	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	681	junction_3	41.5237549147741	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGTACTGTAAGACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142716245	142721440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_142716344_142716891_142717064_142717840_142717995_142720875
tx.16243	chr6	-	2203	5	FSM	ENSMUSG00000030283.8	ENSMUST00000032421.4	8991	5	56	6732	56	-45	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	3.11247489949718	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCTGATTATTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142910122	142774002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_142774997_142813579_142813673_142822373_142822484_142859749_142859895_142909261
tx.16244	chr6	+	1187	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000108094.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCATAGTGTGGCTGCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143054162	143061698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_143054237_143056864_143056934_143060654
tx.16245	chr6	-	526	2	Intergenic	novelGene_1294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGACTTTTATTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144930094	144907254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_144907643_144929956
tx.16246	chr6	-	2461	11	FSM	ENSMUSG00000030268.18	ENSMUST00000111742.8	2556	11	100	-5	100	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	3523	junction_3	257.484057758922	265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGGATTTGAATCTTAAT	8585	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145021810	144944878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_144946031_144950076_144950152_144953341_144953483_144955775_144955862_144961174_144961318_144964917_144965082_144978508_144978629_144980266_144980378_144985160_144985362_144993017_144993090_145021614
tx.16247	chr6	-	594	4	ISM	ENSMUSG00000030268.18	ENSMUST00000048252.11	1642	10	86	30423	86	-1668	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	4066	junction_2	115.20513105857	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGAACATTTGCATTCCC	8571	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145021824	144980266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_144980378_144985160_144985362_144993017_144993090_145021614
tx.16249	chr6	+	1357	3	FSM	ENSMUSG00000040370.14	ENSMUST00000111721.2	1336	3	-21	0	-5	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	42	junction_1	139.5	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTAAAGGAGTCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145156890	145162265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_145156971_145160909_145160998_145161076
tx.1625	chr10	-	959	6	ISM	ENSMUSG00000020277.11	ENSMUST00000020522.9	3730	22	19544	954	1913	-954	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1163	junction_2	47.9933328703061	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACTGGGACAACATGACC	997	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77826097	77823734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_77824192_77824508_77824615_77824698_77824799_77825399_77825512_77825723_77825786_77825975
tx.16250	chr6	+	1359	3	FSM	ENSMUSG00000040370.14	ENSMUST00000111726.10	1374	3	15	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	230	junction_1	45.5	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTAAAGGAGTCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145156896	145162265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_145156979_145160909_145160998_145161076
tx.16251	chr6	+	1503	3	NNC	ENSMUSG00000040370.14	novel	1618	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_1	145	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTAAAGGAGTCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145156900	145162265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_145157127_145160909_145160998_145161076
tx.16252	chr6	+	1278	2	ISM	ENSMUSG00000040370.14	ENSMUST00000111721.2	1336	3	3997	0	3983	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	321	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTAAAGGAGTCTTTATC	5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	145160908	145162265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_145160998_145161076
tx.16253	chr6	-	1787	5	FSM	ENSMUSG00000030265.15	ENSMUST00000032399.12	4678	5	119	2772	50	509	multi-exon	FALSE	canonical	3	862	junction_1	85.6661397519463	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGATGTTCGCTTCAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145195846	145165196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_145166451_145177820_145177981_145179973_145180153_145192420_145192543_145195774
tx.16254	chr6	-	1517	3	ISM	ENSMUSG00000030265.15	ENSMUST00000032399.12	4678	5	15888	2773	-3527	508	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	862	junction_1	24.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGATGTTCGCTTCAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145180077	145165197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_145166451_145177820_145177981_145179973
tx.16255	chr6	+	859	2	FSM	ENSMUSG00000086013.2	ENSMUST00000139612.2	899	2	49	-9	49	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATTCTGACTTGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145196303	145197584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_145196516_145196937
tx.16256	chr6	+	533	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000067344.8	novel	378	1	NA	NA	-77	62678	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTAGGATTTCCAGTTTT	814	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145212048	145275181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_145212564_145275163
tx.16258	chr6	+	1513	5	FSM	ENSMUSG00000067338.7	ENSMUST00000087445.7	1775	5	260	2	260	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1181	junction_3	43.6312674580971	810	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACATTTGCTTCCCTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145561742	145567203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_145561816_145563958_145564182_145564457_145564607_145564908_145565590_145566816
tx.16259	chr6	+	486	2	ISM	ENSMUSG00000067338.7	ENSMUST00000087445.7	1775	5	4009	1	4009	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1227	junction_1	0	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACATTTGCTTCCCTGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145565491	145567204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_145565590_145566816
tx.1626	chr10	-	2730	22	FSM	ENSMUSG00000020277.11	ENSMUST00000020522.9	3730	22	46	954	-25	-954	multi-exon	FALSE	canonical	3	1016	junction_15	83.2280695716646	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACTGGGACAACATGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77845595	77823734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_77824192_77824508_77824615_77824698_77824799_77825399_77825512_77825723_77825786_77825975_77826141_77826505_77826659_77827187_77827276_77827849_77827921_77828225_77828373_77829215_77829280_77829969_77830035_77831077_77831204_77832153_77832247_77833357_77833454_77835659_77835769_77835968_77836014_77836509_77836676_77837144_77837335_77837843_77837922_77841274_77841349_77845432
tx.16260	chr6	-	570	3	ISM	ENSMUSG00000030256.12	ENSMUST00000111703.2	744	5	-204	974	52	184	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_2	2.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTCTAACTTGTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145811232	145810204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_145810410_145810722_145810787_145810931
tx.16261	chr6	-	392	2	ISM	ENSMUSG00000040250.15	ENSMUST00000139979.8	1005	5	3959	0	-275	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCGGAGTGTTACTTTAG	7968	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146452174	146451129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_146451484_146452136
tx.16262	chr6	-	3004	18	FSM	ENSMUSG00000040250.15	ENSMUST00000032427.15	3059	18	55	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_2	56.6296167637544	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCGGAGTGTTACTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146479278	146451129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_146451484_146451584_146451663_146452136_146452273_146453869_146454010_146455481_146455713_146455989_146456145_146456425_146456597_146457628_146457808_146458748_146458839_146459030_146459121_146461623_146461709_146463226_146463356_146464924_146465016_146467125_146467207_146467990_146468194_146476199_146476275_146477722_146477959_146478798
tx.16263	chr6	-	2687	17	NIC	ENSMUSG00000040250.15	novel	3059	18	NA	NA	239	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	201	junction_1	24.9699819783675	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCGGAGTGTTACTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146479039	146451129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_146451484_146452136_146452273_146453869_146454010_146455481_146455713_146455989_146456145_146456425_146456597_146457628_146457808_146458748_146458839_146459030_146459121_146461623_146461709_146463226_146463356_146464924_146465016_146467125_146467207_146467990_146468194_146476199_146476275_146477722_146477959_146478798
tx.16264	chr6	+	1265	6	FSM	ENSMUSG00000040242.15	ENSMUST00000067404.13	2766	6	62	1439	0	428	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	164.658434342125	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGGTGTGGTTTTCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146479418	146499257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_146479707_146487179_146487317_146490237_146490356_146491391_146491535_146496673_146496788_146498792
tx.16265	chr6	+	1379	7	FSM	ENSMUSG00000040242.15	ENSMUST00000111663.9	2880	7	62	1439	0	428	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	146.964470385041	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGGTGTGGTTTTCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146479418	146499257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_146479707_146487179_146487317_146490237_146490356_146491391_146491535_146494131_146494246_146496673_146496788_146498792
tx.16266	chr6	+	917	5	FSM	ENSMUSG00000040242.15	ENSMUST00000058245.5	918	5	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	170.445005793658	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGTGTGCTTTTCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146479418	146494362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_146479707_146487179_146487317_146490237_146490356_146491391_146491535_146494131
tx.1627	chr10	+	1676	13	FSM	ENSMUSG00000000730.14	ENSMUST00000000746.12	1676	13	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_8	3.51484945149386	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTTCTGGTGTGGTGTGTG	5591	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77885675	77899456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_77885746_77885849_77886038_77886431_77886519_77886749_77886795_77887664_77887745_77887825_77887939_77888545_77888718_77889762_77889851_77890805_77890901_77892678_77892755_77893101_77893242_77895480_77895567_77899020
tx.16270	chr6	+	779	4	FSM	ENSMUSG00000030291.13	ENSMUST00000032429.9	814	4	32	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	254	junction_3	35.4902177445498	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTATGTGGTTTTTGTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146544076	146552097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_146544151_146549662_146549778_146550647_146550749_146551608
tx.16272	chr6	+	2327	14	NNC	ENSMUSG00000001630.14	novel	4550	14	NA	NA	-29	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	43.7078791320839	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTGATCAGTCAATGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146626463	146678054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_146626546_146659958_146660104_146661618_146661671_146667692_146667816_146668235_146668320_146668916_146669041_146669830_146669990_146670331_146670435_146670592_146670655_146673079_146673198_146673595_146673720_146674815_146674912_146676897_146676990_146677091
tx.16278	chr6	+	1072	8	FSM	ENSMUSG00000040112.10	ENSMUST00000036111.10	4162	8	0	3090	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	595	junction_4	51.0230040155958	296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTATTGTCTTACGTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146944261	146972399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_146944399_146947608_146947647_146949631_146949800_146951325_146951387_146957349_146957490_146961639_146961750_146962920_146962991_146972051
tx.1628	chr10	+	1672	12	FSM	ENSMUSG00000000730.14	ENSMUST00000151242.8	1657	12	-9	-6	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_7	3.67029622512479	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTTCTGGTGTGGTGTGTG	5699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77885783	77899456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_77886038_77886431_77886519_77886749_77886795_77887664_77887745_77887825_77887939_77888545_77888718_77889762_77889851_77890805_77890901_77892678_77892755_77893101_77893242_77895480_77895567_77899020
tx.16280	chr6	-	327	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040102.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAATGTTTGATTTGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146992941	146990079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_146990236_146992770
tx.16281	chr6	+	2437	13	FSM	ENSMUSG00000030301.18	ENSMUST00000032441.14	2459	13	22	0	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	9.07683253612673	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGATTGTCATGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147377390	147534110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_147377558_147409281_147409326_147412321_147412401_147435526_147435688_147437085_147437290_147438873_147438979_147464132_147464211_147476970_147477079_147491884_147491978_147492066_147492136_147493536_147493714_147508379_147508494_147533072
tx.16283	chr6	-	1716	14	FSM	ENSMUSG00000030304.12	ENSMUST00000136008.8	4174	14	342	2116	-10	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	798	junction_5	68.0164442351299	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCATATTAATATTAAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148113530	148082692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_148083238_148083385_148083469_148084543_148084707_148089530_148089629_148090983_148091083_148092327_148092384_148096692_148096789_148097495_148097598_148100853_148100895_148102913_148102985_148103993_148104041_148106273_148106383_148108030_148108174_148113467
tx.16284	chr6	-	1626	13	NIC	ENSMUSG00000030304.12	novel	4174	14	NA	NA	-2	10	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	36	junction_9	251.686423065599	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTGTTACAGCCATATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148113522	148082703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_148083238_148083385_148083469_148084543_148084707_148089530_148089629_148090983_148091083_148092327_148092384_148096692_148096789_148097495_148097598_148100853_148100895_148103993_148104041_148106273_148106383_148108030_148108174_148113467
tx.16285	chr6	-	1665	14	NIC	ENSMUSG00000030304.12	novel	4174	14	NA	NA	-2	8	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	44	junction_4	251.358274676846	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTGTGTTACAGCCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148113522	148082705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_148083238_148083385_148083469_148084543_148084707_148089530_148089599_148090983_148091083_148092327_148092384_148096692_148096789_148097495_148097598_148100853_148100895_148102913_148102985_148103993_148104041_148106273_148106383_148108030_148108174_148113467
tx.16286	chr6	+	900	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063171.5	novel	943	1	NA	NA	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGGTTGCATATGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148256153	148257096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_148256366_148256408
tx.16287	chr6	+	835	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063171.5	novel	943	1	NA	NA	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGGTTGCATATGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148256153	148257096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_148256583_148256690
tx.16288	chr6	-	667	4	NIC	ENSMUSG00000030309.17	novel	598	4	NA	NA	-20	99	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_1	34.4705993887867	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGTTTTTCTTCATTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148797680	148789069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_148789289_148792106_148792170_148796434_148796655_148797515
tx.16289	chr6	-	671	4	NNC	ENSMUSG00000030309.17	novel	598	4	NA	NA	-20	99	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	35.873233599564	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGGTTTTTCTTCATTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148797680	148789069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_148789293_148792106_148792170_148796434_148796655_148797515
tx.1629	chr10	-	1374	7	FSM	ENSMUSG00000053329.8	ENSMUST00000001242.9	1378	7	4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_5	5.05799696849784	783	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATGTCTCAGGCCTTGTG	4135	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78005612	77997899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_77998553_77999230_77999388_78000671_78000765_78003228_78003349_78004642_78004757_78005206_78005260_78005428
tx.16291	chr6	-	2654	6	FSM	ENSMUSG00000039985.15	ENSMUST00000054080.15	2697	6	21	22	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1893	junction_3	186.383046439315	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTCTCATGACTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148847944	148822554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_148824529_148827510_148827662_148830006_148830134_148832048_148832149_148834499_148834647_148847789
tx.16292	chr6	+	1145	2	FSM	ENSMUSG00000085355.3	ENSMUST00000154673.2	1747	2	602	0	602	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCAGTAATTCCGTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148846966	148848627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_148847919_148848434
tx.16293	chr6	+	1511	4	FSM	ENSMUSG00000039958.18	ENSMUST00000047531.16	1562	4	51	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	11.6141675934562	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGAACTCAAGTGTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149043061	149052669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_149043203_149045531_149045941_149048655_149048787_149051839
tx.16294	chr6	+	1615	5	FSM	ENSMUSG00000039958.18	ENSMUST00000134306.8	848	5	6	-773	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	6.86931583201704	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGAACTCAAGTGTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149043067	149052669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_149043203_149044103_149044214_149045531_149045941_149048655_149048787_149051839
tx.16295	chr6	-	747	5	NIC	ENSMUSG00000068250.14	novel	1457	7	NA	NA	0	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	9	junction_4	42.3932482831877	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATTGTCCCATATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149090210	149059076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_149059330_149068303_149068416_149070945_149071003_149072330_149072549_149090103
tx.16296	chr6	-	1016	7	FSM	ENSMUSG00000068250.14	ENSMUST00000111535.8	1457	7	8	433	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_5	14.7723465374402	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATTGTCCCATATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149090202	149059077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_149059330_149068303_149068416_149070945_149071003_149072330_149072549_149084891_149085037_149086489_149086623_149090103
tx.16297	chr6	-	888	6	NIC	ENSMUSG00000068250.14	novel	1457	7	NA	NA	3	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_5	34.1607962436475	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATTGTCCCATATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149090207	149059077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_149059330_149068303_149068416_149070945_149071003_149072330_149072549_149084891_149085037_149090103
tx.16299	chr6	+	1808	5	NIC	ENSMUSG00000032712.17	novel	1957	5	NA	NA	-1	-118	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	45	junction_2	64.3525446272329	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAATATACCTACAATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149210924	149228051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_149211403_149211819_149211858_149219132_149219207_149226229_149226299_149226902
tx.163	chr1	-	1076	5	FSM	ENSMUSG00000058407.13	ENSMUST00000162031.8	3381	5	101	2204	10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	675	junction_1	112.632976965008	4029	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACATGTCTGTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38036295	38026473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_38026861_38029283_38029539_38033072_38033192_38034713_38034923_38036189
tx.1630	chr10	-	1370	7	NNC	ENSMUSG00000053329.8	novel	1378	7	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.0443787951957	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTATGTCTCAGGCCTTGTG	4138	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78005609	77997899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_77998540_77999218_77999388_78000671_78000765_78003228_78003349_78004642_78004757_78005206_78005260_78005428
tx.16300	chr6	+	1661	3	ISM	ENSMUSG00000032712.17	ENSMUST00000046689.13	6066	5	26	9105	-2	-113	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_2	92	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACCTACAATCCTAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149210951	149228056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_149211403_149211819_149211876_149226902
tx.16301	chr6	+	1728	4	FSM	ENSMUSG00000032712.17	ENSMUST00000190785.7	4152	4	5	2419	5	-113	multi-exon	TRUE	canonical	3	39	junction_3	71.6286720990042	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACCTACAATCCTAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149210958	149228056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_149211403_149211819_149211876_149219132_149219207_149226902
tx.16302	chr6	+	1750	5	FSM	ENSMUSG00000032712.17	ENSMUST00000130664.8	1957	5	89	118	29	-118	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_3	55.879334283794	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAATATACCTACAATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149211000	149228051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_149211403_149211819_149211876_149219132_149219207_149226229_149226299_149226902
tx.16303	chr6	+	510	4	NIC	ENSMUSG00000096299.4	novel	291	3	NA	NA	-19	95	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	8	junction_1	4.54606056566195	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTACAAATGCAATCTATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149467568	149485249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_149467693_149483509_149483637_149483827_149483889_149485051
tx.16304	chr6	+	459	3	FSM	ENSMUSG00000096299.4	ENSMUST00000203729.3	1352	3	-57	950	-15	-950	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	5.5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCAGGTGTCTGATTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149467572	149484039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_149467693_149483509_149483637_149483827
tx.16305	chr7	-	2044	5	ISM	ENSMUSG00000054753.10	ENSMUST00000171749.3	3449	12	10530	0	5832	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	250	junction_4	6.64736790015417	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGACTTTATTTTTCTGTG	8497	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3208499	3204497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_3205949_3206105_3206215_3207744_3207912_3208057_3208270_3208394
tx.16306	chr7	-	3346	12	NIC	ENSMUSG00000054753.10	novel	3449	12	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	141	junction_11	34.6786904344431	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGACTTTATTTTTCTGTG	9606	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3218929	3204497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_3205949_3206105_3206215_3207744_3207912_3208057_3208270_3208394_3208498_3208594_3208735_3208891_3209115_3209268_3209382_3211070_3211249_3212041_3212201_3213722_3214125_3218840
tx.16307	chr7	-	3346	12	FSM	ENSMUSG00000054753.10	ENSMUST00000171749.3	3449	12	103	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_11	40.7771610034849	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGACTTTATTTTTCTGTG	9609	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3218926	3204497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_3205949_3206105_3206215_3207744_3207912_3208057_3208270_3208394_3208498_3208594_3208735_3208891_3209115_3209268_3209382_3211070_3211249_3212041_3212201_3213722_3214128_3218840
tx.1631	chr10	-	1153	8	ISM	ENSMUSG00000001211.16	ENSMUST00000105387.8	1316	9	7435	-11	66	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	446	junction_6	15.3981180933362	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTAGAGACTATTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78123793	78109433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_78109610_78109905_78110105_78113843_78113920_78118207_78118311_78118928_78119083_78120022_78120185_78120828_78120999_78123680
tx.16310	chr7	+	2780	3	FSM	ENSMUSG00000068566.14	ENSMUST00000096744.8	2813	3	28	5	-13	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	335	junction_1	308.5	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAACAGGAAGACTCATGC	258	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3339086	3347860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_3339156_3341727_3341816_3345237
tx.16311	chr7	+	2940	3	FSM	ENSMUSG00000068566.14	ENSMUST00000203566.3	4027	3	-6	1093	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	270	junction_1	341	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAAGACTCATGCTTTCT	265	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3339093	3347865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_3339318_3341727_3341816_3345237
tx.16312	chr7	+	2805	3	NNC	ENSMUSG00000068566.14	novel	2798	2	NA	NA	-94	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	97	junction_1	427.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAAGACTCATGCTTTCT	2696	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3341524	3347865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_3341614_3341727_3341816_3345237
tx.16313	chr7	+	2870	2	FSM	ENSMUSG00000068566.14	ENSMUST00000164553.8	2798	2	-45	-27	-45	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	952	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAAGACTCATGCTTTCT	2745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3341573	3347865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_3341816_3345237
tx.16314	chr7	+	1071	2	ISM	ENSMUSG00000078816.11	ENSMUST00000100301.11	3127	18	26330	0	1014	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGGATGTTTTCTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3378367	3379615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_3378485_3378661
tx.16315	chr7	-	653	2	FSM	ENSMUSG00000107585.2	ENSMUST00000204020.2	1092	2	0	439	0	-439	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTAGGGGCATGTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3471961	3470619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_3471101_3471789
tx.16318	chr7	+	350	4	FSM	ENSMUSG00000035674.14	ENSMUST00000076657.11	515	4	0	165	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2080	junction_1	661.918591839074	631	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATCTTTTCTTTCGTGGGT	255	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3620371	3623161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_3620407_3620615_3620691_3622428_3622507_3622999
tx.16319	chr7	+	315	3	ISM	ENSMUSG00000035674.14	ENSMUST00000148403.2	343	4	226	1	0	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3459	junction_2	24.5	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATCTTTTCTTTCGTGGGT	499	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3620615	3623161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_3620691_3622428_3622507_3622999
tx.1632	chr10	-	1094	5	NNC	ENSMUSG00000061032.10	novel	1984	13	NA	NA	638	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	391.552359206275	538	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGCTGCTTCTCCCATTT	3705	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78240934	78236219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_78236819_78237683_78237803_78238421_78238542_78239338_78239419_78240758
tx.16323	chr7	-	1127	6	FSM	ENSMUSG00000006335.17	ENSMUST00000108641.10	1166	6	39	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_1	47.3142684610044	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGTCTAGGTCACCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3632889	3623322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_3623474_3623745_3623983_3624061_3624132_3627597_3627669_3631826_3632086_3632550
tx.16324	chr7	-	1097	6	FSM	ENSMUSG00000006335.17	ENSMUST00000155592.8	1091	6	-6	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_1	68.2800117164606	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGTCTAGGTCACCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3632889	3623322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_3623474_3623775_3623983_3624061_3624132_3627597_3627669_3631826_3632086_3632550
tx.16325	chr7	-	892	4	FSM	ENSMUSG00000078813.4	ENSMUST00000019878.8	2222	4	370	960	370	-960	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_3	1.69967317119759	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGGTTTACCAAAAAATGTC	9073	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3668469	3664056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_3664360_3665769_3666024_3666680_3666861_3668314
tx.16326	chr7	-	651	4	ISM	ENSMUSG00000019734.17_ENSMUSG00000078813.4	ENSMUST00000136678.3	1529	6	3237	-167	-362	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_3	7.48331477354788	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGCGTTTTGAAACCCC	7298	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3670244	3668789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_3669008_3669100_3669180_3669817_3669974_3670046
tx.16327	chr7	-	1531	3	ISM	ENSMUSG00000035596.15	ENSMUST00000127106.8	1964	6	6152	-4	-1438	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	185	junction_2	22	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTTGTGAGTATAACTG	4601	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3688965	3680787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_3681849_3686807_3686985_3688672
tx.16329	chr7	+	461	4	ISM	ENSMUSG00000006333.15	ENSMUST00000108623.8	1347	5	0	974	0	-307	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	8457	junction_1	2925.97041832088	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGCAGCTGGGCCTGTA	1309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3707036	3708920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_3707064_3707325_3707448_3707644_3707768_3708731
tx.1633	chr10	-	1086	5	NNC	ENSMUSG00000061032.10	novel	1984	13	NA	NA	638	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	391.552359206275	694	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGCTGCTTCTCCCATTT	3705	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78240934	78236219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_78236819_78237683_78237801_78238427_78238542_78239338_78239419_78240758
tx.16330	chr7	+	880	6	NIC	ENSMUSG00000006333.15	novel	1347	5	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	206	junction_4	6461.44068764854	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTGGTGTGCCTCTGTA	1309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3707036	3709896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_3707064_3707325_3707448_3707644_3707768_3708731_3708919_3709006_3709181_3709649
tx.16331	chr7	+	706	5	FSM	ENSMUSG00000006333.15	ENSMUST00000006496.15	751	5	45	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8457	junction_1	2746.02161089457	3722	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTGGTGTGCCTCTGTA	1309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3707036	3709896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_3707064_3707325_3707448_3707644_3707768_3708731_3708919_3709649
tx.16332	chr7	+	681	4	FSM	ENSMUSG00000006333.15	ENSMUST00000108625.8	914	4	273	-40	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14286	junction_1	337.374503416538	4130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTGGTGTGCCTCTGTA	1596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3707323	3709896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_3707448_3707644_3707768_3708731_3708919_3709649
tx.16333	chr7	+	416	2	ISM	ENSMUSG00000006333.15	ENSMUST00000108625.8	914	4	1699	-40	135	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15019	junction_1	0	416	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTGGTGTGCCTCTGTA	3022	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3708749	3709896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_3708919_3709649
tx.16334	chr7	+	1372	11	ISM	ENSMUSG00000030428.17	ENSMUST00000206869.2	1491	13	1013	-4	-165	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_10	13.9513440212762	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTAGGTCCTTCTTATC	6262	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4128500	4137242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_4128743_4131168_4131265_4132299_4132373_4132656_4132733_4133579_4133636_4133795_4133889_4134289_4134383_4136073_4136217_4136355_4136402_4136661_4136738_4136864
tx.16335	chr7	+	658	5	NNC	ENSMUSG00000035545.14	novel	531	5	NA	NA	2	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_4	154.395595792108	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGAGTCACGGTTCTCT	94	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4140049	4143452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_4140151_4141694_4141788_4142417_4142590_4142934_4143043_4143268
tx.16336	chr7	-	694	2	FSM	ENSMUSG00000063838.7	ENSMUST00000140410.2	362	2	181	-513	181	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGACTGTCTATTCACTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4167260	4154261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4154787_4167091
tx.16337	chr7	-	867	3	FSM	ENSMUSG00000063838.7	ENSMUST00000076831.7	1025	3	155	3	155	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_2	5.5	492	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGACTGTCTATTCACTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4167704	4154261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4154787_4167091_4167187_4167457
tx.16338	chr7	-	3021	7	FSM	ENSMUSG00000008435.16	ENSMUST00000008579.14	3034	7	13	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_3	6.10100173924104	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAATTTGTCATTGTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4448635	4428665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4430802_4433392_4433495_4434420_4434634_4437992_4438098_4445592_4445749_4447201_4447321_4448445
tx.16339	chr7	+	727	2	ISM	ENSMUSG00000006154.14	ENSMUST00000164987.2	676	4	923	-160	923	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTGGCTCCTCGCTCTTC	804	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4481587	4482403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_4481751_4481839
tx.1634	chr10	-	1950	12	NNC	ENSMUSG00000061032.10	novel	1984	13	NA	NA	-13	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	278.451176781927	462	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGCTGCTTCTCCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78248839	78236219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_78236819_78237683_78237803_78238421_78238542_78239338_78239419_78240758_78241121_78241248_78241314_78241399_78241530_78244246_78244309_78244967_78245054_78246799_78246858_78247237_78247321_78248653
tx.16340	chr7	-	694	4	FSM	ENSMUSG00000064179.14	ENSMUST00000086502.5	485	4	-77	-132	-77	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	18.0800688297608	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGGTTGTTATTATGTGG	7253	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4511101	4507652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4507800_4510381_4510423_4510520_4510612_4510686
tx.16341	chr7	-	769	3	ISM	ENSMUSG00000064179.14	ENSMUST00000086502.5	485	4	-80	-129	-80	6	intron_retention	FALSE	canonical	3	51	junction_2	3	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCAGGGTTGTTATTATG	7250	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4511104	4507655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_4507800_4510381_4510423_4510520
tx.16342	chr7	-	692	4	ISM	ENSMUSG00000035458.16	ENSMUST00000098859.10	912	8	1288	0	-673	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_3	2.49443825784929	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACTGTGTGTCTGCTAAC	8205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4524239	4521303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_4521451_4522396_4522574_4523436_4523527_4523961
tx.16343	chr7	-	935	7	NNC	ENSMUSG00000035458.16	novel	912	8	NA	NA	-32	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	10.1762250149825	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACTGTGTGTCTGCTAAC	6885	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4525559	4521303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_4521451_4522396_4522574_4523436_4523527_4523961_4524094_4524343_4524386_4524814_4524902_4525299
tx.16344	chr7	-	1263	8	Fusion	ENSMUSG00000035458.16_ENSMUSG00000055809.8	novel	912	8	NA	NA	-347	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	10.842094834863	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACTGTGTGTCTGCTAAC	6304	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4526140	4521303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr7_-_4521451_4522396_4522574_4523436_4523527_4523961_4524094_4524343_4524386_4524814_4524902_4525299_4525441_4525693
tx.16345	chr7	-	968	3	ISM	ENSMUSG00000004961.8	ENSMUST00000065957.7	1750	8	4440	1	4440	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCCTGGCTCCAGTGCTCC	2403	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4545126	4542764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_4543298_4544078_4544213_4544825
tx.16346	chr7	-	1426	7	ISM	ENSMUSG00000063802.6	ENSMUST00000079970.6	1593	8	497	-6	90	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	470	junction_6	31.2663290671184	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTCTTGCATTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4687570	4663513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_4663845_4666379_4666492_4667518_4667616_4667701_4667858_4680705_4680931_4684842_4685048_4687270
tx.16347	chr7	-	1425	8	NIC	ENSMUSG00000063802.6	novel	1593	8	NA	NA	0	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	78	junction_7	161.654708864169	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTCTTGCATTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4687980	4663513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_4663845_4666379_4666492_4667518_4667616_4667701_4667858_4680705_4680931_4684842_4685048_4687270_4687482_4687892
tx.16348	chr7	-	1509	8	NIC	ENSMUSG00000063802.6	novel	1593	8	NA	NA	0	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	210	junction_7	116.504882966775	353	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTCTTGCATTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4687980	4663513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_4663845_4666379_4666492_4667518_4667616_4667701_4667858_4680705_4680931_4684842_4685048_4687270_4687566_4687892
tx.16349	chr7	-	1512	8	FSM	ENSMUSG00000063802.6	ENSMUST00000079970.6	1593	8	87	-6	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_7	148.934720667842	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTCTTGCATTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4687980	4663513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4663845_4666379_4666492_4667518_4667616_4667701_4667858_4680705_4680931_4684842_4685048_4687270_4687569_4687892
tx.1635	chr10	-	1946	12	NNC	ENSMUSG00000061032.10	novel	1984	13	NA	NA	-17	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	278.451176781927	422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGCTGCTTCTCCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78248843	78236219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_78236819_78237683_78237801_78238427_78238542_78239338_78239419_78240758_78241121_78241248_78241314_78241399_78241530_78244246_78244309_78244967_78245054_78246799_78246858_78247237_78247321_78248653
tx.16350	chr7	+	537	3	ISM	ENSMUSG00000035390.17	ENSMUST00000205666.2	1398	10	11886	0	-4849	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_2	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGTCTTCATTACGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4707127	4708425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_4707274_4707682_4707715_4708066
tx.16351	chr7	+	1547	6	ISM	ENSMUSG00000035390.17	ENSMUST00000048248.9	2996	19	16140	-2	-1910	2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	7	junction_3	4.35430821141545	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGCTGGCCTTTGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4710066	4718998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_4710485_4710896_4710946_4711047_4711172_4711816_4712016_4713420_4713511_4718331
tx.16352	chr7	+	2206	9	FSM	ENSMUSG00000059851.16	ENSMUST00000108583.9	2177	9	-29	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	456	junction_1	88.3026578025826	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGAGGTTTTTTTTTTTTTTT	624	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4743154	4750513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_4743239_4744778_4744981_4745120_4745287_4745617_4745728_4745945_4746110_4746245_4746266_4748800_4748938_4749075_4749261_4749375
tx.16353	chr7	+	1409	3	ISM	ENSMUSG00000059851.16	ENSMUST00000160480.2	1270	7	4003	-616	45	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	655	junction_1	29.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGAGGTTTTTTTTTTTTTTT	6321	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4748851	4750513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_4748938_4749075_4749261_4749375
tx.16354	chr7	-	485	4	FSM	ENSMUSG00000051811.15	ENSMUST00000063324.14	553	4	68	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	648	junction_1	73.0677007226099	2529	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTTTCTTTTCTCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4756025	4754790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4754975_4755059_4755161_4755722_4755849_4755951
tx.16355	chr7	-	442	4	FSM	ENSMUSG00000051811.15	ENSMUST00000182738.8	423	4	-17	-2	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	362.510076488303	516	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTTTCTTTTCTCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4756025	4754790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4754975_4755102_4755161_4755722_4755849_4755951
tx.16356	chr7	+	579	5	NNC	ENSMUSG00000030432.13	novel	1106	5	NA	NA	-26	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_1	2852.82127901486	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGTGCTCATTGAGCT	2783	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4795962	4797561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_4795998_4796252_4796409_4796501_4796626_4797062_4797182_4797416
tx.16357	chr7	+	513	5	FSM	ENSMUSG00000030432.13	ENSMUST00000032597.12	1106	5	89	504	-27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3938	junction_1	1160.31525888441	8287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGTGCTCATTGAGCT	2782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4795961	4797561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_4795998_4796319_4796409_4796501_4796626_4797062_4797182_4797416
tx.16358	chr7	+	833	4	FSM	ENSMUSG00000030432.13	ENSMUST00000078432.5	772	4	-25	-36	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6459	junction_1	109.515092820832	4473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGTGCTCATTGAGCT	2784	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4795963	4797561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_4796409_4796501_4796626_4797062_4797182_4797416
tx.16359	chr7	+	338	2	Intergenic	novelGene_1171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCACGTTCAGAGGACCAA	2966	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4815949	4818401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_4816051_4818164
tx.1636	chr10	+	570	3	FSM	ENSMUSG00000005054.8	ENSMUST00000005185.8	603	3	33	0	33	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	3631	junction_2	117.5	23876	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATTGTGTCCTTAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78261535	78263456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_78261692_78262760_78262863_78263144
tx.16360	chr7	+	365	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052605.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGGGTCCCAGTTGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4828588	4847984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_4828645_4844889_4844996_4847781
tx.16361	chr7	-	906	5	ISM	ENSMUSG00000052605.13	ENSMUST00000064547.13	1080	6	14701	0	-263	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_3	1.58113883008419	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACCGAACCATTATTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4854491	4847957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_4848365_4852448_4852567_4853753_4853825_4854022_4854233_4854391
tx.16362	chr7	-	1077	6	FSM	ENSMUSG00000052605.13	ENSMUST00000064547.13	1080	6	4	-1	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	2.13541565040626	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCGAACCATTATTGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4869188	4847956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4848365_4852448_4852567_4853753_4853825_4854022_4854233_4854391_4854533_4869059
tx.16363	chr7	+	228	2	NNC	ENSMUSG00000086784.3	novel	2244	6	NA	NA	-117	-1256	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTATTGCGTTTGTGGGGT	2915	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4880034	4898716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_4880155_4898608
tx.16364	chr7	-	782	2	FSM	ENSMUSG00000051550.11	ENSMUST00000160225.2	856	2	74	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCGAGTGAGGCTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4999083	4995850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4996552_4999002
tx.16365	chr7	-	2572	3	FSM	ENSMUSG00000061374.15	ENSMUST00000208944.2	2306	3	-50	-216	-50	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	199	junction_2	122.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTGTCTTGTTTTTTGAT	4222	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5016287	5010057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_5012205_5015676_5016022_5016207
tx.16366	chr7	-	2546	3	FSM	ENSMUSG00000061374.15	ENSMUST00000077385.15	2546	3	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_2	130	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTGTCTTGTTTTTTGAT	2832	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5017677	5010057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_5012205_5015676_5016022_5017623
tx.16367	chr7	-	807	2	ISM	ENSMUSG00000061374.15	ENSMUST00000077385.15	2546	3	10	5201	5	-9	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAGAAAGAAAGAAA	2842	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5017667	5015258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_5016022_5017623
tx.16368	chr7	+	1142	2	FSM	ENSMUSG00000051184.8	ENSMUST00000086349.5	1142	2	1	-1	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTGTGTGTTCAGTCA	2941	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5018469	5021487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_5018560_5020435
tx.16369	chr7	+	1054	2	FSM	ENSMUSG00000055633.7	ENSMUST00000069324.7	1096	2	42	0	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGGGTTCTTACTTGCA	2961	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5054578	5056722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_5054714_5055803
tx.1637	chr10	-	1449	11	FSM	ENSMUSG00000032788.16	ENSMUST00000041616.15	5124	11	-1	3676	-1	-3676	multi-exon	TRUE	canonical	3	285	junction_4	40.3910881259715	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTCTGCCTGTGTCGGCGC	6801	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78300810	78276253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_78276748_78276970_78277038_78279614_78279752_78280816_78280929_78282783_78282830_78283728_78283815_78285063_78285111_78286116_78286201_78287312_78287418_78289307_78289363_78300594
tx.16370	chr7	+	1350	6	NNC	ENSMUSG00000035228.16	novel	1534	5	NA	NA	-45	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	6.06630035524124	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGCCCCAGGTCTTACTA	15	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5059678	5063784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_5059797_5060497_5060659_5060797_5060903_5060990_5061168_5062494_5062705_5063205
tx.16371	chr7	+	2124	12	FSM	ENSMUSG00000030435.17	ENSMUST00000005041.15	2183	12	54	5	-48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1559	junction_7	130.155406157663	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATGGATCCTCATCTGT	126	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5065195	5082932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_5065336_5069401_5069538_5070208_5070254_5070542_5070647_5071030_5071183_5072442_5072560_5073360_5073500_5077579_5077660_5077733_5077857_5078139_5078227_5078466_5078716_5082180
tx.16372	chr7	+	2468	12	FSM	ENSMUSG00000035203.17	ENSMUST00000098845.10	2565	12	97	0	39	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	82	junction_1	31.9772646507711	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTGGCTCCCTTAAATTC	1405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5083330	5101177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_5083477_5085016_5085121_5086661_5086982_5092917_5093168_5095839_5095965_5096310_5096386_5096897_5096982_5097952_5098257_5098641_5098753_5098889_5098974_5100152_5100411_5100570
tx.16373	chr7	-	997	2	FSM	ENSMUSG00000046792.9	ENSMUST00000207957.2	880	2	-47	-70	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	164	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTCGAAGTTCATGCCGA	9624	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6158972	6145281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_6146150_6158843
tx.16374	chr7	-	551	3	FSM	ENSMUSG00000046792.9	ENSMUST00000207628.2	576	3	28	-3	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	37	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTCGAAGTTCATGCCGA	9628	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6158968	6145281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_6145619_6146060_6146150_6158843
tx.16375	chr7	-	637	4	NNC	ENSMUSG00000046792.9	novel	576	3	NA	NA	1	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	23	junction_1	65.7723346096214	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGACAACTCGAAGTTCA	9627	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6158969	6145287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_6145619_6145705_6145797_6146060_6146150_6158843
tx.16376	chr7	+	723	2	ISM	ENSMUSG00000044876.16	ENSMUST00000149540.3	701	3	-44	9782	7	-9174	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGGAAGATAAAGAAACC	2974	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6175518	6177648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_6175574_6176980
tx.16377	chr7	+	760	3	FSM	ENSMUSG00000044876.16	ENSMUST00000149540.3	701	3	-51	-8	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_2	5.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGAAGTCTGCTTTGCCTG	2967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6175511	6187438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_6175574_6176980_6177101_6186860
tx.16378	chr7	+	1522	4	FSM	ENSMUSG00000044876.16	ENSMUST00000054680.12	2467	4	13	932	2	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_1	90.9004339312464	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGAGTCTGACTCTCCGGT	2969	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6175513	6193416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_6175574_6186860_6187202_6191132_6191242_6192404
tx.16379	chr7	+	698	2	ISM	ENSMUSG00000044876.16	ENSMUST00000149540.3	701	3	1416	-6	6	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTGAAGTCTGCTTTGCC	4434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6176978	6187436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_6177101_6186860
tx.1638	chr10	+	290	2	ISM	ENSMUSG00000032763.12	ENSMUST00000218763.2	228	3	32	-3	6	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGTACGCTTTGTCTTCA	5900	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78410834	78412474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_78411066_78412415
tx.16380	chr7	+	1827	5	NIC	ENSMUSG00000058028.15	novel	1980	6	NA	NA	-23	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTCATTGATTGACTTA	3057	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6225253	6242420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_6225336_6233070_6233538_6234335_6234537_6236813_6236968_6241497
tx.16381	chr7	+	902	6	NNC	ENSMUSG00000053367.16	novel	684	11	NA	NA	-251	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	30.4854063446758	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGATTCAGTGCGTATT	2961	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6263283	6284860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_6263544_6266905_6266967_6277345_6277373_6280418_6280541_6282412_6282451_6284466
tx.16382	chr7	+	966	8	NNC	ENSMUSG00000053367.16	novel	957	16	NA	NA	-238	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	27.8333231496173	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGATTCAGTGCGTATT	2974	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6263296	6284860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_6263544_6266905_6266933_6269287_6269345_6269828_6269883_6277345_6277373_6280418_6280541_6282412_6282451_6284466
tx.16383	chr7	-	341	2	ISM	ENSMUSG00000108949.2	ENSMUST00000208604.2	317	3	-69	374	-69	-374	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGAGTACTCAGGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6286678	6286211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_6286420_6286545
tx.16384	chr7	+	3454	5	FSM	ENSMUSG00000054893.16	ENSMUST00000086327.12	3672	5	6	212	6	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	11.1214882097676	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATATACAAAGAGGTTCTT	2978	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6289583	6310670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_6289654_6292356_6292437_6293534_6293662_6296847_6296941_6307586
tx.16385	chr7	-	2547	5	FSM	ENSMUSG00000030443.17	ENSMUST00000062765.14	2550	5	0	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	5.61248608016091	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGTTGATTATTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6334284	6318661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_6320779_6326645_6326742_6328451_6328579_6332253_6332316_6334139
tx.16386	chr7	-	425	3	ISM	ENSMUSG00000030443.17	ENSMUST00000135435.2	577	5	-74	2159	0	-1705	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_2	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAACTCTATCCCTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6334277	6328353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_6328579_6332253_6332316_6334139
tx.16387	chr7	-	475	3	NNC	ENSMUSG00000030443.17	novel	2550	5	NA	NA	8	-3093	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	13	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGATCATATGTATCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6334269	6329741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_6330025_6332253_6332316_6334139
tx.16388	chr7	+	1212	4	ISM	ENSMUSG00000055150.16	ENSMUST00000207347.2	3883	5	-14	5279	-14	-1910	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_1	6.34209919681348	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCGTTCTCCTCATTGTCC	2940	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6366264	6379429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_6366347_6374304_6374396_6376125_6376253_6378517
tx.16389	chr7	+	1234	4	NIC	ENSMUSG00000055150.16	novel	2169	5	NA	NA	0	-1910	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_1	7.78888096369861	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCGTTCTCCTCATTGTCC	3010	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6366334	6379429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_6366439_6374304_6374396_6376125_6376253_6378517
tx.1639	chr10	+	2246	15	FSM	ENSMUSG00000032763.12	ENSMUST00000218885.2	2233	15	7	-20	6	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_8	19.815990244945	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATCTGTGTATACTGGTTT	5900	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78410834	78420333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_78411066_78412415_78412618_78412733_78412862_78412944_78413084_78413175_78413288_78414854_78414955_78415296_78415395_78415499_78415637_78416889_78417025_78418848_78418964_78419053_78419224_78419297_78419369_78419463_78419536_78419711_78419818_78419903
tx.16390	chr7	+	2059	5	NNC	ENSMUSG00000055150.16	novel	3883	5	NA	NA	-10	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.5841423566947	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCTAATACTCATTGTA	2996	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6366320	6382910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_6366363_6374304_6374396_6376125_6376253_6378517_6378614_6381207
tx.16391	chr7	-	671	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055150.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAGAAGAGTTACATAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6386123	6382919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_6383347_6385601_6385711_6385988
tx.16392	chr7	-	808	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055150.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATTAGAAGAGTTACATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6386170	6382921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_6383347_6383808_6383901_6385601_6385711_6385988
tx.16393	chr7	-	424	3	NNC	ENSMUSG00000002265.18	novel	4816	2	NA	NA	0	-4156	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	52	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTATGGTTTATTTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6733418	6729087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_6729265_6729488_6729574_6733256
tx.16394	chr7	-	669	2	FSM	ENSMUSG00000002265.18	ENSMUST00000155910.3	4816	2	-12	4159	-12	-4159	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATTGTATGGTTTATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6733442	6729090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_6729574_6733256
tx.16395	chr7	+	1209	7	FSM	ENSMUSG00000070837.7	ENSMUST00000208049.2	1401	7	192	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	56	junction_6	128.262751152988	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTTGCTTGAGTGAGTT	2903	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6998490	7006090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_6998712_6999266_6999301_6999517_6999710_7000512_7000652_7002977_7003127_7005355_7005531_7005791
tx.16396	chr7	-	2032	5	FSM	ENSMUSG00000062116.11	ENSMUST00000056246.8	2042	5	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_3	2.54950975679639	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTAATGACTCTTGAGGT	6246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7124477	7117688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_7119200_7119611_7119711_7120784_7120912_7122370_7122410_7124221
tx.16397	chr7	-	3031	4	FSM	ENSMUSG00000063535.8	ENSMUST00000032622.9	3028	4	-1	-2	-1	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_1	4.32049379893857	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGGTTGCGTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7139755	7133671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_7136168_7137165_7137250_7138290_7138418_7139431
tx.16398	chr7	+	2701	4	FSM	ENSMUSG00000034538.9	ENSMUST00000051435.8	2725	4	24	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	9.89949493661167	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTAATCAAGAGTTTCTA	2993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7174352	7186561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_7174558_7175135_7175175_7177553_7177681_7184231
tx.16399	chr7	-	2770	5	FSM	ENSMUSG00000066838.8	ENSMUST00000074455.9	2777	5	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_2	7.29725975966321	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTCATGACTATTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7212990	7205115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_7207359_7208511_7208599_7209244_7209372_7210523_7210563_7212716
tx.164	chr1	-	1041	5	FSM	ENSMUSG00000058407.13	ENSMUST00000195247.6	1699	5	659	-1	9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	195	junction_4	302.235318088406	994	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACATGTCTGTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38036315	38026473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_38026861_38029283_38029539_38033072_38033192_38034713_38034923_38036244
tx.1640	chr10	-	2214	7	FSM	ENSMUSG00000005355.10	ENSMUST00000005488.9	2336	7	122	0	122	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2.21108319357027	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTAGAATCTTTGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78554006	78547824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_78549276_78549823_78549928_78550081_78550232_78550768_78550995_78551094_78551245_78551653_78551721_78553940
tx.16400	chr7	-	1113	4	ISM	ENSMUSG00000000605.10	ENSMUST00000210061.2	2445	13	8147	-16	6185	16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_3	3.55902608401044	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTATTTGAATTTGAAACGA	5858	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7293658	7287037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_7287274_7290644_7290862_7291873_7292273_7293397
tx.16401	chr7	-	1028	2	ISM	ENSMUSG00000000605.10	ENSMUST00000210989.2	658	3	40	-6	16	6	intron_retention	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACCGCTGTGAAACGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7302516	7300993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_7301196_7301690
tx.16402	chr7	-	1061	5	Genic_Genomic	ENSMUSG00000109885.2	novel	390	1	NA	NA	-6634	-89	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.73205080756888	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGCCTTTTATATCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7544597	7537662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_7538198_7539361_7539449_7540595_7540722_7541866_7541905_7544322
tx.16403	chr7	-	2450	5	FSM	ENSMUSG00000092574.5	ENSMUST00000210322.2	1179	5	11	-1282	11	1282	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_4	6.74536878161602	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTGTCACTACTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8096029	8088042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_8089971_8091140_8091228_8091987_8092114_8093259_8093299_8095759
tx.16404	chr7	-	1544	6	NNC	ENSMUSG00000092574.5	novel	1179	5	NA	NA	5	280	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_4	17.1067238242745	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACCTTTTCAAAGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8096035	8089044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_8089971_8091140_8091228_8091987_8092114_8093259_8093299_8093374_8093465_8095759
tx.16405	chr7	-	2395	4	NIC	ENSMUSG00000092624.3	novel	909	5	NA	NA	-28	1326	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCATGACTATTGTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8292131	8283799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_8285708_8286871_8286959_8288132_8288259_8291857
tx.16406	chr7	-	2545	5	FSM	ENSMUSG00000092490.8	ENSMUST00000174729.2	825	5	-192	-1528	7	1098	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	6.67083203206317	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCACTTGTTTCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8865843	8857747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_8859771_8860940_8861028_8861801_8861928_8863073_8863113_8865573
tx.16407	chr7	-	2327	4	FSM	ENSMUSG00000030393.9	ENSMUST00000032551.8	4199	4	0	1872	0	-1872	multi-exon	TRUE	canonical	3	55	junction_1	5.43650214343336	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTTACTCTTAAGAGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10229321	10223027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_10224936_10226205_10226333_10228416_10228456_10229068
tx.16408	chr7	-	374	2	Intergenic	novelGene_1172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCATAACTGCATGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11168992	11159911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_11160082_11168788
tx.16409	chr7	-	374	2	Intergenic	novelGene_1173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCATAACTGCATGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11285367	11276293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_11276464_11285163
tx.1641	chr10	+	543	3	Intergenic	novelGene_96	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	1	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79333030	79354141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_79333161_79339891_79340107_79353943
tx.16410	chr7	+	1307	7	FSM	ENSMUSG00000030386.20	ENSMUST00000098822.10	4748	7	15	3426	3	-2744	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_4	11.513277359447	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAGATAATCTGTTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12212234	12226736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_12212634_12213590_12213674_12214361_12214419_12214861_12214954_12223496_12223624_12223875_12223972_12226283
tx.16411	chr7	+	840	5	NNC	ENSMUSG00000030386.20	novel	4748	7	NA	NA	22	363	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_4	49.6959505392542	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCCATCTCAGCTGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12212253	12218191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_12212634_12213590_12213674_12214361_12214419_12214861_12214954_12217963
tx.16412	chr7	+	904	6	NNC	ENSMUSG00000030386.20	novel	4069	8	NA	NA	22	363	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_5	56.8858506133116	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCCATCTCAGCTGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12212253	12218191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_12212634_12213590_12213674_12214361_12214419_12214861_12214954_12215044_12215109_12217963
tx.16413	chr7	+	1042	6	NNC	ENSMUSG00000030386.20	novel	4069	8	NA	NA	28	-1187	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	57.1363281984413	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGTATTTTGCCTGCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12212259	12216641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_12212634_12213590_12213674_12214361_12214419_12214861_12214954_12215044_12215109_12216269
tx.16414	chr7	-	766	2	ISM	ENSMUSG00000070822.6	ENSMUST00000211392.2	3709	7	31	6853	31	-2918	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAATTTATTCAGCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12514550	12508871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_12509586_12514498
tx.16415	chr7	-	2120	4	FSM	ENSMUSG00000057894.11	ENSMUST00000108546.2	2577	4	-15	472	-11	-467	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.8878405775519	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGACATTTCAGCTTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12552796	12539375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_12540520_12541838_12541901_12544732_12545594_12552743
tx.16416	chr7	-	679	4	NNC	ENSMUSG00000057894.11	novel	2577	4	NA	NA	-2	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	5.24933858267454	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12552787	12540011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_12540520_12541838_12541901_12545528_12545594_12552743
tx.16417	chr7	-	776	2	FSM	ENSMUSG00000057894.11	ENSMUST00000072222.8	6727	2	-2	5953	-2	-4838	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCCAAGAACTACAACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12552787	12544861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_12545594_12552743
tx.16418	chr7	+	2243	4	FSM	ENSMUSG00000060397.7	ENSMUST00000144578.2	3834	4	6	1585	6	-4	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	3.55902608401044	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGACCCTTGTTGTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12615109	12625764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_12615288_12618569_12618697_12618949_12619046_12623922
tx.16419	chr7	+	733	6	FSM	ENSMUSG00000012848.16	ENSMUST00000004554.14	761	6	28	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14799	junction_5	1601.25238485381	97374	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCCTGTGTGCTTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12656244	12660613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_12656316_12656899_12657009_12659318_12659529_12659663_12659793_12660322_12660422_12660498
tx.1642	chr10	+	527	3	Intergenic	novelGene_97	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79333043	79354141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_79333161_79339894_79340107_79353943
tx.16420	chr7	+	767	6	FSM	ENSMUSG00000012848.16	ENSMUST00000108539.8	794	6	28	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	946	junction_1	6466.78878578851	2461	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCCTGTGTGCTTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12656244	12660613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_12656350_12656899_12657009_12659318_12659529_12659663_12659793_12660322_12660422_12660498
tx.16421	chr7	+	309	3	ISM	ENSMUSG00000012848.16	ENSMUST00000137329.4	652	6	3334	-94	3334	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14799	junction_2	479.5	3861	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCCTGTGTGCTTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12659697	12660613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_12659793_12660322_12660422_12660498
tx.16422	chr7	+	212	2	ISM	ENSMUSG00000012848.16	ENSMUST00000137329.4	652	6	3961	-94	3961	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14799	junction_1	0	2005	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCCTGTGTGCTTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12660324	12660613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_12660422_12660498
tx.16423	chr7	-	1539	2	ISM	ENSMUSG00000049600.9	ENSMUST00000051390.9	2171	3	1983	-45	1953	45	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	196	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGCCTCGTAGGCTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12741774	12739592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_12740308_12740950
tx.16424	chr7	+	2596	17	FSM	ENSMUSG00000005566.15	ENSMUST00000005705.8	3245	17	650	-1	650	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3307	junction_7	380.550172242439	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATGCCTCAGCTGTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12758728	12764963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_12758989_12759230_12759344_12759570_12759704_12761543_12761680_12761759_12761877_12761947_12762063_12762334_12762482_12762590_12762706_12762807_12762915_12763014_12763052_12763133_12763180_12763269_12763523_12763602_12763923_12764009_12764134_12764215_12764303_12764381_12764520_12764615
tx.16425	chr7	+	1012	5	ISM	ENSMUSG00000005566.15	ENSMUST00000005705.8	3245	17	5528	0	-24	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3866	junction_2	266.303750442986	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCATGCCTCAGCTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12763606	12764962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_12763923_12764009_12764134_12764215_12764303_12764381_12764520_12764615
tx.16426	chr7	+	483	2	FSM	ENSMUSG00000005566.15	ENSMUST00000123778.2	565	2	85	-3	85	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4601	junction_1	0	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCATGCCTCAGCTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12764383	12764962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_12764520_12764615
tx.16427	chr7	-	913	6	FSM	ENSMUSG00000033916.6	ENSMUST00000210587.2	930	6	13	4	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_5	1091.38616447159	397	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACCAAGGCTGTGAGCTT	7104	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12768565	12765940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_12766130_12766215_12766278_12766361_12766493_12766568_12766749_12767755_12767970_12768428
tx.16428	chr7	-	904	6	FSM	ENSMUSG00000033916.6	ENSMUST00000005711.6	949	6	45	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2610	junction_5	213.695671458268	7499	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACCAAGGCTGTGAGCTT	6980	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12768689	12765940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_12766130_12766215_12766278_12766361_12766493_12766568_12766749_12767755_12767970_12768561
tx.16429	chr7	-	861	2	FSM	ENSMUSG00000070814.18	ENSMUST00000137574.2	4151	2	-22	3312	-8	611	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCTGACTGACCAGAAGA	1921	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13012370	13010594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_13011355_13012269
tx.1643	chr10	-	1630	6	FSM	ENSMUSG00000052151.13	ENSMUST00000063879.13	1654	6	19	5	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_5	6.89927532426414	205	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCCATGCATGTTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79369611	79362268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_79363083_79363283_79363461_79363648_79363707_79366331_79366607_79366710_79366863_79369457
tx.16430	chr7	+	646	6	NNC	ENSMUSG00000056394.21	novel	944	9	NA	NA	-1	-2765	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	535.999104476864	375	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAAGGTGAGGGAGCGGG	2628	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13012759	13022678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_13012890_13014073_13014148_13016378_13016469_13019182_13019319_13020483_13020611_13022589
tx.16431	chr7	+	3088	28	NNC	ENSMUSG00000056394.21	novel	3091	28	NA	NA	-1	1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	267.791767474326	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTGAGGAGGTCTACAT	2628	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13012759	13045351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_13012890_13014073_13014148_13016378_13016469_13019182_13019319_13020483_13020611_13022589_13022686_13023319_13023422_13025112_13025239_13025381_13025458_13026064_13026146_13026384_13026442_13029307_13029481_13030153_13030321_13030645_13030723_13032662_13032755_13032965_13033066_13034187_13034274_13034856_13034973_13035309_13035406_13037109_13037221_13037725_13037798_13039835_13039981_13040137_13040221_13041443_13041597_13042395_13042450_13043037_13043182_13044933_13045027_13045120
tx.16432	chr7	+	1777	16	ISM	ENSMUSG00000056394.21	ENSMUST00000165964.10	3166	28	17006	-1	-6541	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1124	junction_1	106.922318634709	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTGAGGAGGTCTACAT	62	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13030196	13045351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_13030321_13030645_13030723_13032662_13032755_13032965_13033066_13034187_13034274_13034856_13034973_13035309_13035406_13037109_13037221_13037725_13037798_13039835_13039981_13040137_13040221_13041443_13041597_13042395_13042450_13043037_13043182_13044933_13045027_13045120
tx.16433	chr7	+	846	7	ISM	ENSMUSG00000056394.21	ENSMUST00000165964.10	3166	28	26702	-1	-1219	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1312	junction_1	69.8299521854499	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTGAGGAGGTCTACAT	1871	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13039892	13045351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_13039981_13040137_13040221_13041443_13041597_13042395_13042450_13043037_13043182_13044933_13045027_13045120
tx.16434	chr7	+	501	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084102.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.24264068711928	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTCTAGAACTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13848701	13870883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_13848899_13866192_13866236_13869337_13869405_13870689
tx.16435	chr7	+	484	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084102.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTCTAGAACTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13848675	13870883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_13848899_13869337_13869405_13870689
tx.16436	chr7	+	503	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084102.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTCTAGAACTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13848705	13870883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_13848948_13869337_13869405_13870689
tx.16437	chr7	-	1354	3	FSM	ENSMUSG00000041583.9	ENSMUST00000108513.5	1344	3	-13	3	-13	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	9.5	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTGCCAGTTTTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15573616	15567168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_15567876_15568304_15568891_15573555
tx.16438	chr7	+	934	5	FSM	ENSMUSG00000074365.14	ENSMUST00000098801.9	934	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_3	373.339992500134	491	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACTGCTTTAAAAGAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15630048	15637945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_15630183_15631328_15631478_15632369_15632542_15636774_15636933_15637624
tx.16439	chr7	+	614	3	FSM	ENSMUSG00000074365.14	ENSMUST00000171280.3	571	3	-43	0	-43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	864	junction_1	106.5	4529	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACTGCTTTAAAAGAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15635527	15637945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_15635663_15636774_15636933_15637624
tx.1644	chr10	-	1439	5	FSM	ENSMUSG00000052151.13	ENSMUST00000218241.2	825	5	-22	-592	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	27.078589328102	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCCATGCATGTTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79369613	79362268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_79363083_79363283_79363461_79363648_79363707_79366331_79366607_79369498
tx.16440	chr7	-	681	6	FSM	ENSMUSG00000041571.11	ENSMUST00000044355.11	736	6	50	5	50	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1985	junction_1	35.4028247460566	2769	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAGGGAGATGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15656277	15651137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_15651465_15653772_15653872_15653967_15654043_15654229_15654284_15654373_15654399_15656176
tx.16441	chr7	-	666	5	NNC	ENSMUSG00000041571.11	novel	736	6	NA	NA	50	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	883.163206887606	395	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAGGGAGATGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15656277	15651137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_15651465_15653772_15653872_15653967_15654043_15654229_15654284_15656166
tx.16442	chr7	-	656	5	NIC	ENSMUSG00000041571.11	novel	736	6	NA	NA	50	-5	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	883.163206887606	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAAGGGAGATGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15656277	15651137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_15651465_15653772_15653872_15653967_15654043_15654229_15654284_15656176
tx.16443	chr7	-	1517	13	FSM	ENSMUSG00000041560.13	ENSMUST00000044158.13	3176	13	7	1652	7	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1334	junction_1	195.89089579548	5747	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTGGGGTCTTGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15679992	15671759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_15671815_15672098_15672156_15672276_15672354_15672835_15672903_15673013_15673190_15673378_15673580_15673653_15673759_15674062_15674159_15675664_15675736_15676099_15676300_15676713_15676823_15679214_15679280_15679754
tx.16444	chr7	+	1529	11	FSM	ENSMUSG00000006024.14	ENSMUST00000006181.7	2517	11	141	847	-9	389	multi-exon	TRUE	canonical	3	1130	junction_8	65.9754499795189	1255	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTTGAGCTGTCCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15832523	15851053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_15832700_15841477_15841558_15842975_15843093_15846508_15846556_15847036_15847115_15847274_15847331_15847400_15847486_15848045_15848151_15849127_15849197_15849524_15849576_15850388
tx.16445	chr7	+	1637	12	FSM	ENSMUSG00000006021.6	ENSMUST00000006178.5	1630	12	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_5	5.62609034427847	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTTTGTCTGGCAAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15853812	15861441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_15854107_15854414_15854498_15854636_15854722_15854794_15854850_15856959_15857036_15857124_15857199_15857696_15857807_15857879_15857958_15858641_15858718_15859637_15859774_15859861_15860033_15861042
tx.16446	chr7	-	1035	5	ISM	ENSMUSG00000041375.20	ENSMUST00000041010.16	2379	11	6585	4	-90	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_1	45.3176290200624	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACCCCACTGTGTCCTTG	5845	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16012399	16009392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_16010033_16010126_16010221_16010418_16010555_16010651_16010699_16012281
tx.16447	chr7	+	1257	2	FSM	ENSMUSG00000002083.14	ENSMUST00000147267.2	881	2	132	-508	132	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	237	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCTTTTTGTTAGCTTTA	964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16047573	16052130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_16047743_16051042
tx.16448	chr7	-	1910	9	FSM	ENSMUSG00000052833.10	ENSMUST00000094815.5	1875	9	-35	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2941	junction_6	113.453115316416	2699	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTTGTCTCCTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16121745	16060974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_16061855_16064537_16064608_16070618_16070764_16092960_16093067_16100731_16100832_16102433_16102577_16104211_16104386_16112289_16112402_16121565
tx.16449	chr7	+	581	3	FSM	ENSMUSG00000019158.10	ENSMUST00000019302.10	815	3	240	-6	56	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	728	junction_1	16.5	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTGAGTGATAGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16186943	16189421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_16187096_16188045_16188139_16189085
tx.1645	chr10	-	1585	6	FSM	ENSMUSG00000052151.13	ENSMUST00000163602.9	1609	6	17	7	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_5	21.5462293684997	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGCCATGCATGTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79369609	79362270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_79363083_79363283_79363461_79363648_79363707_79366331_79366607_79366710_79366863_79369498
tx.16450	chr7	+	614	3	FSM	ENSMUSG00000019158.10	ENSMUST00000209536.2	699	3	87	-2	87	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	359.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTGAGTGATAGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16186974	16189421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_16187096_16187981_16188139_16189085
tx.16451	chr7	+	495	2	ISM	ENSMUSG00000019158.10	ENSMUST00000209536.2	699	3	1092	-2	1092	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	761	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCTGAGTGATAGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16187979	16189421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_16188139_16189085
tx.16452	chr7	+	802	5	FSM	ENSMUSG00000008036.12	ENSMUST00000086112.8	836	5	34	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	580	junction_2	14.0423466699836	2405	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTGTCTGAGCCCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16472368	16483219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_16472464_16477143_16477294_16481185_16481300_16482613_16482674_16482836
tx.16455	chr7	-	724	5	NNC	ENSMUSG00000019370.11	novel	2290	6	NA	NA	-140	337	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1051.65904645945	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCATGACTGCTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16657894	16650731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_16650902_16650999_16651136_16651310_16651418_16651509_16651692_16657765
tx.16456	chr7	-	717	6	FSM	ENSMUSG00000019370.11	ENSMUST00000019514.10	2290	6	145	1428	-140	337	multi-exon	FALSE	canonical	3	2296	junction_1	82.9925297843125	2207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCATGACTGCTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16657894	16650731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_16650902_16650999_16651136_16651310_16651418_16651509_16651654_16653559_16653591_16657765
tx.16457	chr7	-	709	5	NNC	ENSMUSG00000019370.11	novel	2290	6	NA	NA	-140	337	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1051.65904645945	355	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCATGACTGCTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16657894	16650731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_16650902_16650999_16651136_16651310_16651418_16651509_16651654_16657742
tx.16458	chr7	-	743	3	ISM	ENSMUSG00000003099.12	ENSMUST00000142831.2	539	5	883	-460	883	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1100	junction_2	27.5	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCATCTCAAACCCACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16740125	16738576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_16739097_16739185_16739268_16739984
tx.16459	chr7	-	993	6	ISM	ENSMUSG00000003099.12	ENSMUST00000142597.2	1786	12	20623	-101	-103	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1050	junction_5	35.7468879764379	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCATCTCAAACCCACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16741111	16738576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_16739097_16739185_16739268_16739984_16740164_16740256_16740298_16740831_16740920_16741028
tx.1646	chr10	-	1474	5	NIC	ENSMUSG00000052151.13	novel	1654	6	NA	NA	-3	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_4	25.791229129299	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGCCATGCATGTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79369609	79362270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_79363083_79363283_79363461_79363648_79363707_79366331_79366607_79369457
tx.16460	chr7	-	1982	13	FSM	ENSMUSG00000003099.12	ENSMUST00000003183.12	2072	13	78	12	-29	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	1050	junction_5	57.0079794609686	226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCATCTCAAACCCACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16761763	16738576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_16739097_16739185_16739268_16739984_16740164_16740256_16740298_16740831_16740920_16741028_16741172_16741650_16741757_16742538_16742638_16742917_16742984_16743799_16743922_16749322_16749471_16756339_16756582_16761617
tx.16461	chr7	+	726	3	FSM	ENSMUSG00000030413.8	ENSMUST00000032573.8	694	3	-32	0	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	241	junction_2	21	764	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCTCCCTCCGGTGAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18618572	18624366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_18618899_18623202_18623325_18624088
tx.16462	chr7	+	589	5	FSM	ENSMUSG00000023118.16	ENSMUST00000137287.3	4760	5	-10	4181	-7	-4181	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_1	17.1810215063017	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCGCTGACTCCAAGGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18758337	18764854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_18758432_18762788_18762913_18763039_18763106_18764467_18764522_18764603
tx.16463	chr7	+	1144	6	ISM	ENSMUSG00000023118.16	ENSMUST00000146903.8	4781	23	-25	16627	-19	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_5	18.8403821617291	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATCATGAATCTTTAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18758325	18769051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_18758432_18762788_18762913_18763039_18763106_18764467_18764522_18764603_18764678_18768331
tx.16464	chr7	+	4089	27	FSM	ENSMUSG00000023118.16	ENSMUST00000023882.14	4116	27	27	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_24	19.2187654844311	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGAGGATGTGCCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18758328	18788542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_18758432_18762788_18762913_18763039_18763106_18764467_18764522_18764603_18764678_18768331_18768459_18769750_18770001_18770586_18770758_18771784_18772025_18774014_18774170_18774466_18774618_18776502_18776708_18777349_18777501_18778859_18779096_18779556_18779639_18779772_18779887_18780679_18780828_18781374_18781536_18782373_18782483_18782764_18782866_18783304_18783396_18783862_18783965_18786291_18786480_18787194_18787372_18787471_18787568_18787839_18788224_18788313
tx.16465	chr7	+	451	2	ISM	ENSMUSG00000023118.16	ENSMUST00000148861.8	1099	5	1740	-5	1643	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGAGGATGTGCCTGTGT	242	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18788001	18788542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_18788224_18788313
tx.16466	chr7	+	1365	2	ISM	ENSMUSG00000030410.17	ENSMUST00000108479.2	2388	4	4185	-5	2417	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	165	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGTTCCCTGGGGCAGG	1788	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18814367	18816706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_18815227_18816200
tx.16467	chr7	+	1434	3	ISM	ENSMUSG00000030410.17	ENSMUST00000146429.2	2080	4	2451	-1	2418	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_1	21	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTGTTTCTGTTCCCTGGG	1789	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18814368	18816701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_18815227_18815843_18815919_18816200
tx.16468	chr7	-	2055	7	FSM	ENSMUSG00000030407.3	ENSMUST00000032566.3	2710	7	47	608	47	-608	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_4	5.82380173655205	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGGCTGGCCTGGAACT	7251	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18883169	18874234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_18875225_18877110_18877228_18878584_18878685_18878808_18878962_18880794_18881077_18882300_18882445_18882900
tx.16469	chr7	+	511	3	FSM	ENSMUSG00000040824.4	ENSMUST00000049294.4	1420	3	97	812	-40	-812	multi-exon	FALSE	canonical	3	3249	junction_1	86	13636	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTCCAGTGGTCTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18883743	18886655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_18883820_18885142_18885323_18886400
tx.1647	chr10	-	1330	2	FSM	ENSMUSG00000042570.15	ENSMUST00000168601.2	931	2	277	-676	72	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_1	0	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTGTCTCATGGATTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79377722	79376078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_79377034_79377347
tx.16470	chr7	-	426	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040824.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACTCCTGGATAGAGAACC	3767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18886653	18885148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_18885314_18886392
tx.16471	chr7	+	382	2	ISM	ENSMUSG00000040824.4	ENSMUST00000049294.4	1420	3	1549	812	1412	-812	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3421	junction_1	0	2644	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTCCAGTGGTCTTCTC	501	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18885195	18886655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_18885323_18886400
tx.16477	chr7	-	2220	13	FSM	ENSMUSG00000030403.10	ENSMUST00000032561.9	2215	13	-5	0	-5	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1236	junction_9	117.461666323765	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCTCTGGAGTACTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19005747	18990853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_18991680_18991786_18991845_18992727_18992819_18992898_18992945_18993156_18993191_18993340_18993393_18994505_18994607_18994748_18994991_18995100_18995139_18995899_18995985_18998329_18998496_18998578_18998751_19005438
tx.1648	chr10	-	1786	7	ISM	ENSMUSG00000042570.15	ENSMUST00000062855.15	2562	14	10015	1	-306	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_2	34.2673313813609	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGGTGTCTCATGGATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79380910	79376079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_79377034_79377347_79377769_79378238_79378316_79378430_79378556_79380353_79380449_79380522_79380605_79380878
tx.16482	chr7	+	1060	10	FSM	ENSMUSG00000003549.10	ENSMUST00000003645.9	1375	10	315	0	-8	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	315	junction_9	39.5851948880006	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCAGTGGCTCTGCGTGTTT	1026	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19079017	19090449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_19079122_19079530_19079643_19082325_19082542_19084085_19084190_19084617_19084718_19086553_19086631_19088250_19088351_19089025_19089098_19089217_19089287_19090343
tx.16483	chr7	-	444	3	NNC	ENSMUSG00000047649.10	novel	489	2	NA	NA	13	2699	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	34	junction_1	107	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGATTTCACAGGCCTTCTGA	2171	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19093393	19087239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_19087461_19093014_19093157_19093312
tx.16484	chr7	-	1384	3	FSM	ENSMUSG00000047649.10	ENSMUST00000047036.10	2239	3	17	838	17	-838	multi-exon	FALSE	canonical	3	228	junction_1	10	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAGAAAGAAAAAAGA	2175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19093389	19090776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19091942_19093014_19093157_19093312
tx.16485	chr7	-	1306	2	ISM	ENSMUSG00000047649.10	ENSMUST00000047036.10	2239	3	250	839	250	-839	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	228	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAGAAAGAAAAAAG	2408	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19093156	19090777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_19091942_19093014
tx.16486	chr7	+	1218	5	ISM	ENSMUSG00000040734.15	ENSMUST00000047621.14	3130	13	14023	-7	6741	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_1	8.78564169540279	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCATTTTGATTCTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19109163	19112465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_19109307_19109409_19109544_19109649_19109817_19111412_19111613_19111891
tx.16487	chr7	+	713	2	ISM	ENSMUSG00000040734.15	ENSMUST00000047621.14	3130	13	16330	-4	9048	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACATCATTTTGATTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19111470	19112462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_19111613_19111891
tx.16488	chr7	-	1819	13	FSM	ENSMUSG00000040714.15	ENSMUST00000108459.9	1849	13	32	-2	-11	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_12	5.52959210872636	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGTGCGATCTGCTCAAT	6364	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19133814	19128362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19128647_19128809_19128874_19128985_19129093_19129163_19129205_19129289_19129381_19129724_19129899_19130206_19130309_19130431_19130520_19130796_19131017_19131325_19131396_19131886_19132118_19133208_19133475_19133733
tx.1649	chr10	+	1275	4	FSM	ENSMUSG00000020310.10	ENSMUST00000217748.2	944	4	-299	-32	-271	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	3.29983164553722	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTGGCATATTCTTTCG	2884	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79500121	79504371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_79500502_79500745_79501013_79501264_79501592_79504070
tx.16490	chr7	-	1806	13	FSM	ENSMUSG00000040714.15	ENSMUST00000108458.10	1823	13	14	3	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_12	5.99247212944893	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTGTGCGATCTGCTCA	2163	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19138015	19128364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19128647_19128809_19128874_19128985_19129093_19129163_19129205_19129289_19129381_19129724_19129899_19130206_19130309_19130431_19130520_19130796_19131017_19131325_19131396_19131886_19132118_19133208_19133475_19137945
tx.16491	chr7	+	767	6	FSM	ENSMUSG00000002043.18	ENSMUST00000002112.15	785	6	16	2	2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_1	62.2009646227452	1038	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGTGCAGTGCTTATCA	523	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19242652	19250068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_19242758_19248125_19248194_19248346_19248465_19248931_19249016_19249128_19249223_19249770
tx.16492	chr7	+	699	5	FSM	ENSMUSG00000002043.18	ENSMUST00000147114.2	719	5	18	2	2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	197.958802532244	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGTGCAGTGCTTATCA	523	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19242652	19250068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_19242758_19248346_19248465_19248931_19249016_19249128_19249223_19249770
tx.16493	chr7	+	430	3	ISM	ENSMUSG00000002043.18	ENSMUST00000002112.15	785	6	6341	2	633	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	563	junction_1	10.5	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGTGCAGTGCTTATCA	6848	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19248977	19250068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_19249016_19249128_19249223_19249770
tx.16494	chr7	+	398	2	ISM	ENSMUSG00000002043.18	ENSMUST00000135972.2	505	3	778	-7	778	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	584	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGTGCAGTGCTTATCA	6993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19249122	19250068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_19249223_19249770
tx.16495	chr7	-	818	2	FSM	ENSMUSG00000044709.7	ENSMUST00000051364.4	763	2	-52	-3	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTGCTGTGTGTGTGTGTG	2892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19307320	19298870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19299602_19307233
tx.16496	chr7	-	794	2	NIC	ENSMUSG00000044709.7	novel	1023	3	NA	NA	-7	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTGCTGTGTGTGTGTGTG	2457	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19307755	19298870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_19299602_19307692
tx.16498	chr7	+	1493	3	FSM	ENSMUSG00000011267.9	ENSMUST00000108453.2	1530	3	35	2	35	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_1	5.5	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCCTGGACTTTCTTGGG	762	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19311246	19314579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_19311554_19311741_19311886_19313537
tx.16499	chr7	-	469	8	ISM	ENSMUSG00000061028.8	ENSMUST00000207253.2	2018	11	3541	-1	13	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	161	junction_6	42.7718198283469	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACCACATGCTGTCCCCT	8198	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19319051	19314966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_19315084_19315305_19315331_19316156_19316240_19318079_19318127_19318208_19318268_19318394_19318456_19318708_19318749_19319014
tx.165	chr1	-	867	4	ISM	ENSMUSG00000058407.13	ENSMUST00000162031.8	3381	5	89	4848	-2	221	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	765	junction_3	81.3183046224321	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACACACCAGAAGAGGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38036307	38029117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_38029539_38033072_38033192_38034713_38034923_38036189
tx.1650	chr10	+	687	2	ISM	ENSMUSG00000020310.10	ENSMUST00000217748.2	944	4	785	-32	785	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTGGCATATTCTTTCG	3968	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79501205	79504371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_79501592_79504070
tx.16500	chr7	-	470	7	NNC	ENSMUSG00000061028.8	novel	4545	20	NA	NA	13	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	96.4722182231179	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACATGCTGTCCCCTTATT	8198	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19319051	19314962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_19315102_19316152_19316240_19318079_19318127_19318208_19318268_19318394_19318456_19318708_19318749_19319014
tx.16501	chr7	-	473	7	NNC	ENSMUSG00000061028.8	novel	2018	11	NA	NA	13	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	96.4722182231179	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCACATGCTGTCCCCTTAT	8198	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19319051	19314963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_19315084_19316130_19316240_19318079_19318127_19318208_19318268_19318394_19318456_19318708_19318749_19319014
tx.16502	chr7	-	466	7	NNC	ENSMUSG00000061028.8	novel	4545	20	NA	NA	13	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	96.4722182231179	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACATGCTGTCCCCTTATT	8198	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19319051	19314962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_19315102_19316156_19316240_19318079_19318127_19318208_19318268_19318394_19318456_19318708_19318749_19319014
tx.16503	chr7	-	1788	9	ISM	ENSMUSG00000002983.18	ENSMUST00000094762.10	2209	12	9712	0	8708	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	199	junction_4	23.832750575626	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGGGTCTTCTTTCTTCTT	5831	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19353651	19340141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_19340867_19345547_19345626_19345741_19345811_19346429_19346646_19347705_19347811_19349483_19349616_19350270_19350363_19351686_19351845_19353438
tx.16504	chr7	-	2462	14	FSM	ENSMUSG00000002981.11	ENSMUST00000055242.11	4143	14	11	1670	-1	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	1363	junction_5	136.704319631521	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCGCACCTCCTCTGCCT	5159	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19398947	19367165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19367888_19367980_19368149_19368802_19368939_19369232_19369329_19369585_19369777_19371002_19371097_19371393_19371639_19372041_19372163_19372856_19372943_19376976_19377095_19379766_19379926_19380640_19380765_19389642_19389756_19398858
tx.16505	chr7	-	431	4	FSM	ENSMUSG00000040564.15	ENSMUST00000045035.12	432	4	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	965	junction_3	145.90027035235	1876	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTCCCTGAAGTGCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19426584	19423405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19423562_19425812_19425961_19426335_19426412_19426533
tx.16506	chr7	-	1070	3	FSM	ENSMUSG00000002985.17	ENSMUST00000173739.8	1221	3	153	-2	-7	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	10421	junction_2	50	701	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGAGTCTCTGTGAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19432179	19430194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19431029_19431403_19431573_19432112
tx.16507	chr7	-	1113	4	FSM	ENSMUSG00000002985.17	ENSMUST00000174064.9	1408	4	134	161	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	8700	junction_3	835.854984764436	4252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGAGTCTCTGTGAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19432979	19430194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19431029_19431403_19431573_19432112_19432179_19432935
tx.16508	chr7	-	1411	4	ISM	ENSMUSG00000062300.15	ENSMUST00000075447.14	2735	9	28088	17	28048	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	314	junction_3	7.40870359029762	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTGTGTTTTCTGTGAGA	3834	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19455410	19450585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_19451713_19453120_19453208_19453357_19453422_19455277
tx.16509	chr7	-	2670	9	FSM	ENSMUSG00000062300.15	ENSMUST00000075447.14	2735	9	48	17	8	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	309	junction_4	306.654528745297	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTGTGTTTTCTGTGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19483450	19450585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19451713_19453120_19453208_19453357_19453422_19455277_19455432_19463962_19464112_19464536_19464655_19466839_19467137_19471936_19472300_19483139
tx.1651	chr10	+	1076	2	FSM	ENSMUSG00000020308.8	ENSMUST00000239401.2	1101	2	26	-1	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_1	0	277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCTTGCTGGTCACCTG	8032	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79505269	79511961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_79505618_79511233
tx.16510	chr7	-	1949	6	FSM	ENSMUSG00000062300.15	ENSMUST00000108450.5	1955	6	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	559	junction_1	167.41517255016	251	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCGGGGTGTTTTGTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19483452	19458085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19458795_19463962_19464112_19464536_19464655_19466839_19467137_19471936_19472300_19483139
tx.16511	chr7	+	407	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000062300.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTGTGTCCTTGTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19483820	19488876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_19483875_19488523
tx.16512	chr7	-	565	2	FSM	ENSMUSG00000002980.15	ENSMUST00000135632.2	307	2	161	-419	161	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	698	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTCCTACCGCCAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19490715	19490062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19490545_19490632
tx.16513	chr7	-	2390	15	FSM	ENSMUSG00000002980.15	ENSMUST00000003061.14	2429	15	32	7	-20	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	510	junction_11	49.5145824737624	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTCCTACCGCCAGGTT	3944	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19504440	19490062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19490545_19490632_19490751_19492348_19492494_19492583_19492729_19492884_19493022_19493971_19494114_19494218_19494338_19497964_19498122_19498577_19498715_19499258_19499442_19499537_19499635_19500613_19500685_19500760_19500987_19502376_19502499_19504331
tx.16515	chr7	-	2871	8	FSM	ENSMUSG00000040511.15	ENSMUST00000043517.8	2905	8	34	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_4	10.2359909243845	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCATTGTCCGAGCCTTTG	9965	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19655051	19637502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19639118_19639703_19639739_19643105_19643229_19644529_19644682_19648662_19648790_19650798_19651096_19652486_19652835_19654877
tx.16516	chr7	-	2875	7	NNC	ENSMUSG00000040511.15	novel	2905	8	NA	NA	21	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	40.8357142163028	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCATTGTCCGAGCCTTTG	9952	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19655064	19637502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_19639144_19643105_19643229_19644529_19644682_19648662_19648790_19650798_19651096_19652486_19652835_19654877
tx.16517	chr7	-	1485	2	FSM	ENSMUSG00000040511.15	ENSMUST00000159261.2	1794	2	-3	312	-3	-312	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCATTATATTTTATTTA	9975	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19655041	19651513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19652835_19654877
tx.16518	chr7	+	454	2	NNC	ENSMUSG00000090075.2	novel	338	2	NA	NA	-63	156	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	26	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTTTGCCTTAATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19654590	19661688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_19654715_19661358
tx.16519	chr7	+	551	2	FSM	ENSMUSG00000090075.2	ENSMUST00000162649.2	338	2	-57	-156	-57	156	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTTTGCCTTAATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19654596	19661688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_19654818_19661358
tx.1652	chr10	+	890	2	FSM	ENSMUSG00000020308.8	ENSMUST00000219585.2	368	2	7	-529	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCTTGCTGGTCACCTG	8486	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79505723	79511961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_79505886_79511233
tx.16521	chr7	+	254	2	ISM	ENSMUSG00000052675.12	ENSMUST00000215113.2	2628	4	-170	4934	-170	-4934	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGGAAGCTGTACCGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23817623	23821727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_23817809_23821658
tx.16522	chr7	+	877	3	ISM	ENSMUSG00000047603.10	ENSMUST00000205680.2	1332	5	-22	3394	0	636	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	44	junction_2	1	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGAGAGTGTGTGTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23833598	23836975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_23833913_23834682_23834741_23836470
tx.16524	chr7	-	2693	4	FSM	ENSMUSG00000087598.10	ENSMUST00000086006.12	6402	4	1	3708	1	427	multi-exon	TRUE	canonical	3	37	junction_1	10.4986771653491	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTCTTTTTTATTGTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23907573	23897079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_23899468_23902794_23902922_23906482_23906541_23907453
tx.16525	chr7	+	666	2	Intergenic	novelGene_1176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTTGCCTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23968228	23969171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_23968442_23968718
tx.16526	chr7	+	2570	4	FSM	ENSMUSG00000055305.16	ENSMUST00000108438.10	3508	4	-38	976	-38	-9	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_2	2.44948974278318	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGAAAAGGATTCTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23969806	23976243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_23970107_23971037_23971096_23972672_23972800_23974158
tx.16527	chr7	-	2130	6	NIC	ENSMUSG00000050605.18	novel	2480	7	NA	NA	-96	-6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_4	15.3310143173894	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGTATCATGTGGATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23998922	23990469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_23991930_23992769_23992860_23994379_23994507_23995403_23995450_23997698_23997801_23998617
tx.16528	chr7	-	2324	7	FSM	ENSMUSG00000050605.18	ENSMUST00000077780.14	2480	7	148	8	110	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	4.81028989655394	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCGTATCATGTGGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23998952	23990471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_23991930_23992769_23992860_23994379_23994507_23995403_23995450_23996997_23997164_23997698_23997801_23998617
tx.16529	chr7	+	2203	14	NNC	ENSMUSG00000002210.12	novel	2242	14	NA	NA	28	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	30	junction_3	34.9034170348701	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTGGGGTTTGTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24099071	24122201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_24099317_24102816_24102973_24104951_24105027_24105121_24105378_24105459_24105558_24106945_24107059_24114363_24114476_24115923_24116020_24116345_24116432_24119438_24119546_24120000_24120109_24120237_24120367_24120544_24120690_24121724
tx.1653	chr10	+	840	2	NNC	ENSMUSG00000020308.8	novel	368	2	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	13	junction_1	0	54	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCTTGCTGGTCACCTG	8482	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79505719	79511961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_79505832_79511233
tx.16530	chr7	+	904	3	FSM	ENSMUSG00000064264.15	ENSMUST00000071361.13	1182	3	263	15	203	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	407	junction_2	41.5	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGGCTCCGCATATGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24206757	24215092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_24206862_24209970_24210179_24214500
tx.16531	chr7	+	939	3	FSM	ENSMUSG00000064264.15	ENSMUST00000177205.2	1159	3	207	13	207	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	276	junction_2	107	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGGCTCCGCATATGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24206761	24215092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_24206862_24209970_24210179_24214461
tx.16532	chr7	+	2105	17	FSM	ENSMUSG00000051768.10	ENSMUST00000063249.9	2155	17	48	2	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	337	junction_4	31.1527862919194	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAACGGTTTCTCTCTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24246622	24272861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_24246785_24247214_24247308_24259160_24259278_24264960_24265120_24265643_24265719_24265813_24265926_24266282_24266393_24266463_24266570_24266738_24266998_24267234_24267352_24269640_24269735_24269873_24270004_24270296_24270352_24270439_24270577_24271633_24271725_24272478_24272555_24272649
tx.16533	chr7	+	1032	9	ISM	ENSMUSG00000051768.10	ENSMUST00000063249.9	2155	17	20303	2	91	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	355	junction_3	24.0048823158957	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAACGGTTTCTCTCTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24266877	24272861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_24266998_24267234_24267352_24269640_24269735_24269873_24270004_24270296_24270352_24270439_24270577_24271633_24271725_24272478_24272555_24272649
tx.16534	chr7	+	971	7	ISM	ENSMUSG00000064254.7	ENSMUST00000077191.7	1484	8	6332	0	6332	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_1	14.7384606462894	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGAGTTCTGCTTGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24293299	24308350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_24293437_24293842_24293988_24294424_24294574_24305629_24305760_24307292_24307383_24307776_24307894_24308147
tx.16535	chr7	-	1078	6	FSM	ENSMUSG00000062773.7	ENSMUST00000078001.7	1059	6	-19	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	1.72046505340853	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGCGCGTGCATGCATG	983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24371494	24367431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_24367828_24367933_24368066_24369138_24369325_24369757_24369899_24370003_24370109_24371376
tx.16536	chr7	+	1010	6	NNC	ENSMUSG00000054169.8	novel	1048	4	NA	NA	-5549	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	5	junction_4	10.0598210719674	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGGCTCCTTCGACTCTA	777	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24471081	24484081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_24471221_24473674_24473740_24474864_24474981_24477550_24477687_24480294_24480655_24483887
tx.16537	chr7	+	593	7	FSM	ENSMUSG00000040952.17	ENSMUST00000129847.8	593	7	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	397	junction_3	8759.20174096298	2380	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGGTCTGGATCTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24584057	24589231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_24584093_24584560_24584632_24584876_24584978_24585531_24585613_24587706_24587891_24588331_24588387_24589165
tx.16538	chr7	+	512	6	FSM	ENSMUSG00000040952.17	ENSMUST00000108430.10	774	6	262	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8873	junction_5	7497.54368843557	99613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGGTCTGGATCTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24584057	24589231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_24584093_24584560_24584632_24584876_24584978_24587706_24587891_24588331_24588387_24589165
tx.16539	chr7	+	554	6	FSM	ENSMUSG00000040952.17	ENSMUST00000108429.8	633	6	79	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	279	junction_1	10447.7852504729	836	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGGTCTGGATCTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24584217	24589231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_24584295_24584560_24584632_24584876_24584978_24587706_24587891_24588331_24588387_24589165
tx.1654	chr10	+	1264	7	FSM	ENSMUSG00000023175.16	ENSMUST00000179781.8	1261	7	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6175	junction_5	429.072416835304	4881	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTCACTACTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79540321	79547803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_79540419_79545504_79545662_79545891_79545975_79546093_79546237_79546471_79546755_79547089_79547115_79547327
tx.16540	chr7	+	478	5	ISM	ENSMUSG00000040952.17	ENSMUST00000108429.8	633	6	421	0	218	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8873	junction_4	7833.34750840916	3563	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGGTCTGGATCTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24584559	24589231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_24584632_24584876_24584978_24587706_24587891_24588331_24588387_24589165
tx.16541	chr7	+	735	3	ISM	ENSMUSG00000003379.8	ENSMUST00000003469.8	1457	5	2087	339	2087	-339	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTTGGCAGGAGTCATGG	4985	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24598892	24601283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_24599131_24600657_24600727_24600855
tx.16542	chr7	-	822	5	FSM	ENSMUSG00000003380.12	ENSMUST00000076961.9	899	5	79	-2	-37	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	706	junction_2	24.5051015096857	1575	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTCCTGGTATTTTCTC	4574	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24672100	24669174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_24669435_24669511_24669614_24671185_24671284_24671526_24671740_24671951
tx.16543	chr7	+	3091	2	FSM	ENSMUSG00000045252.12	ENSMUST00000179556.2	4140	2	38	1011	38	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	224	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTTTGTCAGGCCTAGC	4993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24776667	24781906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_24776812_24778959
tx.16544	chr7	+	3146	2	FSM	ENSMUSG00000045252.12	ENSMUST00000053410.11	3145	2	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTTTGTCAGGCCTAGC	5034	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24776708	24781906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_24776908_24778959
tx.16545	chr7	+	725	2	ISM	ENSMUSG00000074274.8	ENSMUST00000186424.2	493	3	357	-404	357	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGATCTGGTTGTGTGTGTTT	939	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24854850	24856048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_24855046_24855518
tx.16546	chr7	-	1681	5	FSM	ENSMUSG00000054499.10	ENSMUST00000206750.2	4594	5	-12	2925	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_4	29.7237278954037	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCCAGGCTCTCCGGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24919296	24902264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_24903357_24910573_24910724_24916969_24917093_24918225_24918457_24919211
tx.16547	chr7	+	1054	5	ISM	ENSMUSG00000005442.14	ENSMUST00000165239.3	3500	14	2038	5090	178	568	internal_fragment	TRUE	canonical	3	46	junction_2	2.54950975679639	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTACTGAGCACTTACTACA	2528	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24984272	24985677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_24984424_24984503_24984739_24984834_24984965_24985058_24985242_24985322
tx.16548	chr7	-	398	2	ISM	ENSMUSG00000005447.13	ENSMUST00000140093.2	833	3	512	0	512	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	415	junction_1	0	233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGTTTTCTGCTTTATG	7215	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24995615	24994473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_24994802_24995545
tx.16549	chr7	-	999	5	FSM	ENSMUSG00000005447.13	ENSMUST00000148150.8	859	5	170	-310	170	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	385	junction_2	17.4570902500961	456	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGTTTTCTGCTTTATG	8773	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24997137	24994473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_24994802_24995545_24995669_24995745_24995863_24996510_24996601_24996796
tx.1655	chr10	+	747	3	ISM	ENSMUSG00000023175.16	ENSMUST00000180235.2	836	4	570	-259	570	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6175	junction_1	150	4517	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTCACTACTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79546508	79547803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_79546755_79547089_79547115_79547327
tx.16550	chr7	-	849	6	FSM	ENSMUSG00000005447.13	ENSMUST00000005583.12	901	6	52	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	245	junction_5	66.0714764478591	771	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGTTTTCTGCTTTATG	8551	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24997359	24994473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_24994802_24995545_24995669_24995745_24995863_24996510_24996601_24996796_24996896_24997267
tx.16551	chr7	+	1344	3	FSM	ENSMUSG00000058741.5	ENSMUST00000080288.5	1240	3	-98	-6	-98	6	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTTCAGTGAGTGGCTGT	2027	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25000737	25003563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_25000900_25002297_25002923_25003006
tx.16552	chr7	-	344	2	ISM	ENSMUSG00000063651.12	ENSMUST00000167591.8	698	5	1612	0	1612	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCACCTATAAGTTTTTAT	9380	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25067516	25067044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_25067263_25067390
tx.16553	chr7	+	1462	6	FSM	ENSMUSG00000057229.12	ENSMUST00000077338.12	1465	6	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_1	20.2938414303453	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTGGCCTTTCCTCCCA	1742	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25318841	25324976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_25318886_25320320_25320518_25321768_25321850_25323223_25323364_25323451_25323615_25324139
tx.16554	chr7	+	1419	5	ISM	ENSMUSG00000057229.12	ENSMUST00000085953.5	2387	6	1402	-3	-1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_4	15.0332963783729	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTGGCCTTTCCTCCCA	3220	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25320319	25324976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_25320518_25321768_25321850_25323223_25323364_25323451_25323615_25324139
tx.16555	chr7	-	799	3	ISM	ENSMUSG00000060376.8	ENSMUST00000071329.8	1899	9	27501	0	263	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	277	junction_2	15.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGCTTCCTTCGTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25330905	25329370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_25329859_25330424_25330597_25330766
tx.16556	chr7	-	1677	9	FSM	ENSMUSG00000060376.8	ENSMUST00000071329.8	1899	9	222	0	222	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	232	junction_4	24.6373699895098	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGCTTCCTTCGTCTCTG	9904	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25358184	25329370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_25329859_25330424_25330597_25330766_25330909_25331062_25331270_25332664_25332827_25337586_25337696_25340881_25340969_25341068_25341252_25358057
tx.16557	chr7	+	1001	6	FSM	ENSMUSG00000061286.8	ENSMUST00000079634.8	1020	6	19	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1190	junction_2	58.9528625259198	2995	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGGTGTCTGGAGAGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25358607	25367457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_25358809_25362561_25362676_25363751_25363874_25364845_25364987_25365677_25365768_25367124
tx.16558	chr7	-	560	3	FSM	ENSMUSG00000061702.11	ENSMUST00000150306.2	912	3	-33	385	14	-385	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25374577	25369853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_25370061_25372849_25373086_25374460
tx.16559	chr7	+	996	4	FSM	ENSMUSG00000063439.8	ENSMUST00000205658.2	995	4	3	-4	3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_2	1.69967317119759	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCCTCCTTGTATCCGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25380207	25385987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_25380404_25380807_25380900_25382715_25382842_25385405
tx.1656	chr10	-	749	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000023175.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATACTTGCCATTGGCTTCAG	7304	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79547803	79546507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_79546775_79547321
tx.16560	chr7	-	2973	5	FSM	ENSMUSG00000002608.9	ENSMUST00000002683.3	3032	5	53	6	10	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_3	5.52268050859363	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCATCCATTCATCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25418460	25410536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_25412539_25413777_25413908_25414175_25414446_25415159_25415613_25418342
tx.16562	chr7	-	2652	9	FSM	ENSMUSG00000040703.12	ENSMUST00000043314.10	2745	9	95	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_7	4.7368238303741	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGACCCCCTCTGCCTGTGT	1699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25515983	25501897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_25503185_25503340_25503483_25505295_25505484_25507468_25507611_25508603_25508784_25508862_25509024_25511026_25511177_25514309_25514476_25515747
tx.16563	chr7	+	948	3	NNC	ENSMUSG00000108415.2	novel	605	3	NA	NA	2	386	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCATACATGAGCATTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25559566	25569694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_25559652_25563155_25563191_25568866
tx.16564	chr7	+	587	2	NIC	ENSMUSG00000108415.2	novel	605	3	NA	NA	-4	54	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTACTTATTCATGCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25559560	25569362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_25559652_25568866
tx.16565	chr7	-	2141	10	NNC	ENSMUSG00000040650.9	novel	2189	9	NA	NA	-24741	-250	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_9	17.7332776384533	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCATGTGTGTTTTTCAT	NA	False	NA	-57	True	NA	NA	NA	26410603	26364901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_26365540_26372149_26372292_26372461_26372650_26373780_26373923_26374420_26374598_26378817_26378979_26380739_26380890_26381021_26381185_26389739_26389834_26410317
tx.16566	chr7	-	490	2	Intergenic	novelGene_1177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGGCTGGCCTCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26721963	26718800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_26719123_26721795
tx.16567	chr7	+	1619	9	FSM	ENSMUSG00000078787.10	ENSMUST00000108385.3	1631	9	18	-6	18	6	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	2.78107443266087	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTATTTCTTGGCTGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26854524	26858099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_26854729_26855057_26855221_26855581_26855732_26855940_26856102_26856642_26856820_26856895_26857038_26857138_26857327_26857576_26857719_26857807
tx.16568	chr7	-	1181	8	FSM	ENSMUSG00000053291.16	ENSMUST00000093040.13	1192	8	10	1	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	670	junction_1	28.7402157263998	1410	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCGGCCTCTGTCATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26878311	26867849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_26868230_26872061_26872193_26872288_26872385_26873846_26874002_26874140_26874204_26875203_26875319_26875582_26875664_26878151
tx.16569	chr7	-	573	4	FSM	ENSMUSG00000089661.10	ENSMUST00000121848.2	572	4	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_1	9.2736184954957	907	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTCTCTTTGGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26880582	26879167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_26879260_26879593_26879705_26880124_26880259_26880346
tx.1657	chr10	-	728	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000023175.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATACTTGCCATTGGCTTCA	7304	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79547803	79546508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_79546755_79547321
tx.16570	chr7	-	1259	7	FSM	ENSMUSG00000061479.16	ENSMUST00000080356.10	1365	7	106	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1453	junction_6	315.533102683203	3306	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCAGTGTTGTCTGCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26895590	26886431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_26886790_26888290_26888380_26888783_26888958_26891028_26891206_26892294_26892468_26894868_26894982_26895415
tx.16571	chr7	-	1257	7	FSM	ENSMUSG00000061479.16	ENSMUST00000122202.8	1336	7	80	-1	-12	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	597	junction_6	627.600567417065	1454	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTGTTGTCTGCTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26895590	26886430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_26886790_26888290_26888380_26888783_26888958_26891028_26891206_26892294_26892468_26894868_26894982_26895418
tx.16572	chr7	-	1278	6	FSM	ENSMUSG00000061479.16	ENSMUST00000163311.9	1288	6	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2141	junction_5	100.882902416614	1221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCAGTGTTGTCTGCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26895175	26886431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_26886790_26888290_26888380_26888783_26888958_26891028_26891206_26892294_26892468_26894868
tx.16573	chr7	+	1533	6	NNC	ENSMUSG00000078786.10	novel	1748	7	NA	NA	96	349	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_2	6.8585712797929	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATGTGAGTAAACTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26896643	26904094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_26896792_26899978_26900124_26900444_26900570_26901832_26901963_26902051_26902123_26903180
tx.16574	chr7	+	952	6	ISM	ENSMUSG00000078786.10	ENSMUST00000179391.8	1748	7	1435	159	93	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	9	junction_4	4.47213595499958	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGACATTTTCAGTCCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26896640	26903586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_26896792_26899978_26900048_26900444_26900570_26901832_26901963_26902051_26902123_26903180
tx.16576	chr7	+	2178	15	FSM	ENSMUSG00000003762.14	ENSMUST00000003860.13	2181	15	-2	5	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	74	junction_1	14.7544528041883	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCAGTTCTTTTCTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26932445	26957370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_26932599_26932889_26932998_26933126_26933247_26933365_26933433_26936802_26936881_26939221_26939345_26939464_26939551_26941403_26941545_26941636_26941719_26942727_26942822_26949711_26949854_26949960_26950069_26951685_26951752_26956036_26956124_26956647
tx.16577	chr7	+	2111	15	NNC	ENSMUSG00000003762.14	novel	2276	14	NA	NA	-16	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_1	26.4262547247148	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCAGTTCTTTTCTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26932621	26957370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_26932708_26932889_26932998_26933126_26933247_26933365_26933433_26936802_26936881_26939221_26939345_26939464_26939551_26941403_26941545_26941636_26941719_26942727_26942822_26949711_26949854_26949960_26950069_26951685_26951752_26956036_26956124_26956647
tx.16578	chr7	+	981	3	ISM	ENSMUSG00000003762.14	ENSMUST00000142910.8	1228	5	1973	-2	1771	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_1	5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCAGTTCTTTTCTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26951580	26957370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_26951752_26956036_26956124_26956647
tx.16579	chr7	+	2031	4	ISM	ENSMUSG00000063160.13	ENSMUST00000134215.2	3153	9	12553	-160	12553	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_2	6.79869268479038	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACTGGGAAATCAAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26973355	26981566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_26973570_26976051_26976358_26978928_26979052_26980178
tx.16580	chr7	-	1612	8	ISM	ENSMUSG00000040488.19	ENSMUST00000121175.8	5118	30	22976	1	-9	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	513	junction_4	58.3896132781808	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCGGCCTCTGCCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27010112	27004565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_27004976_27005491_27005645_27005986_27006368_27007192_27007346_27008345_27008493_27008710_27008840_27009605_27009678_27009945
tx.16582	chr7	-	696	3	ISM	ENSMUSG00000089832.9	ENSMUST00000148933.8	1140	6	2191	-5	-490	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	354	junction_2	21	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTATAGTCTTGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27042836	27041557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_27041970_27042070_27042186_27042667
tx.16583	chr7	-	2309	18	FSM	ENSMUSG00000089832.9	ENSMUST00000003857.7	2358	18	49	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	272	junction_5	29.8825845289775	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTATAGTCTTGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27055395	27041557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_27041970_27042070_27042186_27042667_27042847_27044064_27044162_27044597_27044754_27046426_27046598_27047756_27047874_27047958_27048047_27049916_27050033_27051120_27051312_27051404_27051496_27052019_27052182_27053796_27053878_27054150_27054210_27054638_27054713_27054825_27054872_27054997_27055052_27055295
tx.16584	chr7	-	1040	6	NNC	ENSMUSG00000089832.9	novel	2358	18	NA	NA	-39	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_5	134.878612092503	35	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTATAGTCTTGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27045066	27041557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_27041970_27042070_27042186_27042667_27042847_27044064_27044162_27044597_27044754_27044985
tx.16585	chr7	-	1050	6	ISM	ENSMUSG00000089832.9	ENSMUST00000132684.8	2506	16	8651	-4	362	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_5	40.0749298190278	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTATAGTCTTGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27046517	27041557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_27041970_27042070_27042186_27042667_27042847_27044064_27044162_27044597_27044754_27046426
tx.16586	chr7	-	1200	2	ISM	ENSMUSG00000011751.17	ENSMUST00000108362.8	4861	18	34632	0	34632	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCGCTGGTTTGTTCGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27059299	27055807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_27056876_27059167
tx.16587	chr7	+	841	5	FSM	ENSMUSG00000040466.17	ENSMUST00000037399.16	1028	5	30	157	-24	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	274	junction_1	67.0834368529222	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCCTCTCTCTGTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27147432	27165412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27147622_27158680_27158846_27158987_27159078_27161991_27162121_27165144
tx.16588	chr7	+	567	4	ISM	ENSMUSG00000040466.17	ENSMUST00000108357.8	782	5	6923	-3	6897	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	359	junction_2	41.8754767800386	319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCCTCTCTCTGTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27158765	27165412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_27158846_27158987_27159078_27161991_27162121_27165144
tx.16589	chr7	-	1632	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082016.4	novel	765	1	NA	NA	-69	904	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGTAAATCTGAAAGAAAG	8888	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27170029	27168291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_27169781_27169886
tx.16590	chr7	+	1338	2	FSM	ENSMUSG00000055200.8	ENSMUST00000068641.8	1329	2	-8	-1	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATTGTAATTAAATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27173184	27176790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27173297_27175564
tx.16591	chr7	+	1190	2	FSM	ENSMUSG00000008384.9	ENSMUST00000008528.8	1233	2	43	0	43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTGCTTCTTTGCAT	6632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27186377	27189741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27186504_27188677
tx.16593	chr7	-	1882	12	ISM	ENSMUSG00000003363.16	ENSMUST00000117095.8	2282	14	10414	4	-53	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	435	junction_11	36.0309784069025	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGTGGTATGAGATGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27242223	27231428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_27231911_27231999_27232100_27233070_27233237_27235213_27235354_27237004_27237206_27238774_27238903_27238979_27239095_27240509_27240694_27241110_27241254_27241338_27241414_27241513_27241607_27242168
tx.16594	chr7	-	2068	13	ISM	ENSMUSG00000003363.16	ENSMUST00000117095.8	2282	14	7945	4	-2522	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	379	junction_12	43.7978309965231	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGTGGTATGAGATGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27244692	27231428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_27231911_27231999_27232100_27233070_27233237_27235213_27235354_27237004_27237206_27238774_27238903_27238979_27239095_27240509_27240694_27241110_27241254_27241338_27241414_27241513_27241607_27242168_27242330_27244612
tx.16595	chr7	-	2132	14	NIC	ENSMUSG00000003363.16	novel	2282	14	NA	NA	-27	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_13	126.954541554455	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGTGGTATGAGATGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27252468	27231428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_27231911_27231999_27232100_27233070_27233237_27235213_27235354_27237004_27237206_27238774_27238903_27238979_27239095_27240509_27240694_27241110_27241254_27241338_27241414_27241513_27241607_27242168_27242330_27244612_27244711_27252422
tx.16596	chr7	-	2112	14	FSM	ENSMUSG00000003363.16	ENSMUST00000117095.8	2282	14	166	4	-30	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	277	junction_13	66.1410542194063	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGTGGTATGAGATGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27252471	27231428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_27231911_27231999_27232100_27233070_27233237_27235213_27235354_27237004_27237206_27238774_27238903_27238979_27239095_27240509_27240694_27241110_27241254_27241338_27241414_27241513_27241607_27242168_27242330_27244612_27244688_27252422
tx.16598	chr7	+	430	2	FSM	ENSMUSG00000049643.16	ENSMUST00000190903.2	426	2	-4	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTGTTTGTGTGTTTGTT	429	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27252690	27253496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27252779_27253154
tx.16599	chr7	+	2669	10	FSM	ENSMUSG00000049643.16	ENSMUST00000067386.14	2701	10	32	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	300	junction_8	25.2899238218224	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGTGTCTGTGTATGT	428	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27252689	27281524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27252779_27255838_27255960_27259976_27260029_27263910_27263999_27264084_27264200_27265071_27265154_27270988_27271127_27274015_27274166_27278137_27278209_27279761
tx.166	chr1	+	1082	4	ISM	ENSMUSG00000026083.13	ENSMUST00000192548.6	5788	22	-5	32487	-5	-25906	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	590	junction_2	48.3758433747901	662	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGGTCATGGCCACAGAAG	1403	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38037204	38058615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_38037406_38056886_38057013_38057105_38057191_38057945
tx.16601	chr7	+	3019	14	FSM	ENSMUSG00000004056.16	ENSMUST00000108344.9	4544	14	150	1375	-44	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	377	junction_6	55.340153093199	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCCCAGTCCACATTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27291126	27338876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27291305_27308047_27308179_27315665_27315795_27317632_27317745_27328261_27328416_27328720_27328853_27331842_27331909_27332623_27332693_27333986_27334110_27335463_27335593_27335688_27335904_27336347_27336436_27336516_27336620_27337486
tx.16603	chr7	+	879	3	FSM	ENSMUSG00000007944.9	ENSMUST00000008088.9	2052	3	35	1138	35	-1138	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	3	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCCTTTGTGTGGTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27353374	27355633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27353773_27354336_27354520_27355335
tx.16604	chr7	-	1062	2	Intergenic	novelGene_1178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTCTCTGCCCTGACAA	7874	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27388718	27387553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_27388097_27388199
tx.16605	chr7	+	480	5	ISM	ENSMUSG00000057093.15	ENSMUST00000120004.8	4612	6	1865	3995	-708	-1578	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	18.3762754659371	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTACTTTTAGTGATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27390629	27401914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_27390721_27391906_27391960_27392906_27393034_27398077_27398177_27401804
tx.16606	chr7	+	630	5	FSM	ENSMUSG00000037640.16	ENSMUST00000108336.8	5896	5	0	5266	0	-110	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	38.9422649572415	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGTGGGAAGTGCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27430813	27447861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27430896_27436360_27436414_27437727_27437855_27440381_27440481_27447592
tx.16607	chr7	+	375	3	FSM	ENSMUSG00000109143.2	ENSMUST00000208208.2	632	3	14	243	14	99	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	10	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGGTTTGGTGTCCCATG	2449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27465111	27470154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27465209_27468664_27468718_27469929
tx.16608	chr7	+	541	5	FSM	ENSMUSG00000020420.9	ENSMUST00000205534.2	3511	5	6	2964	6	-1706	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	11.4127122105133	307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGATCTCAAGATTTGC	3333	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27560015	27577286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27560182_27561961_27562015_27562813_27562941_27564994_27565094_27577190
tx.16609	chr7	-	519	6	NIC	ENSMUSG00000063047.10	novel	3940	6	NA	NA	0	-2086	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	31	junction_4	18.9166593245213	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAAAGCAATTAATAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27678596	27664218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_27664295_27671047_27671147_27673143_27673271_27674177_27674231_27676176_27676259_27678514
tx.1661	chr10	-	1523	9	FSM	ENSMUSG00000035890.10	ENSMUST00000047203.9	1639	9	92	24	50	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	909	junction_4	92.4302946819927	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCATGGCTTGGCGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79602694	79594372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_79595071_79596624_79596741_79596822_79596917_79597263_79597334_79597398_79597468_79597918_79598164_79598315_79598380_79598480_79598540_79602586
tx.16610	chr7	-	530	6	FSM	ENSMUSG00000063047.10	ENSMUST00000206685.2	3940	6	-23	3433	1	-2086	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	22.29798197147	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAAAGCAATTAATAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27678595	27664218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_27664295_27671047_27671147_27673143_27673271_27674177_27674231_27676164_27676259_27678514
tx.16611	chr7	-	3877	6	NNC	ENSMUSG00000096916.8	novel	6163	6	NA	NA	-49	1482	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_5	56.2259726461001	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCCTCTACAGTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27713589	27686654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_27689948_27704643_27704743_27706738_27706866_27707808_27707862_27711760_27711922_27713445
tx.16612	chr7	-	3797	6	NNC	ENSMUSG00000096916.8	novel	6163	6	NA	NA	-41	1456	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	85	junction_5	28.6454184818445	38	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTCAGTACTCATGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27713581	27686680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_27689948_27704643_27704743_27706738_27706866_27707808_27707862_27711760_27711876_27713445
tx.16613	chr7	-	4150	7	NNC	ENSMUSG00000096916.8	novel	6163	6	NA	NA	-49	1641	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	46	junction_3	44.8578000154067	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTGAATTGTGAGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27713589	27686495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_27689948_27704643_27704743_27704891_27705052_27706738_27706866_27707808_27707862_27711760_27711876_27713445
tx.16614	chr7	-	667	5	ISM	ENSMUSG00000030603.17	ENSMUST00000135482.8	1883	11	7097	-10	4063	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2243	junction_3	88.9648807114358	11813	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTCTTAGGTGTTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27742384	27741131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_27741346_27741525_27741582_27741763_27741933_27742074_27742152_27742233
tx.16615	chr7	-	1405	11	FSM	ENSMUSG00000030603.17	ENSMUST00000032824.10	1440	11	35	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2113	junction_5	109.082033351052	3004	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTCTTAGGTGTTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27749491	27741131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_27741346_27741525_27741582_27741763_27741933_27742074_27742152_27742233_27742402_27746410_27746505_27746597_27746708_27746790_27746938_27748217_27748405_27748528_27748628_27749407
tx.16616	chr7	+	1030	3	ISM	ENSMUSG00000078776.10	ENSMUST00000150948.2	7895	19	32568	-16	32568	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_2	2.5	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTCTCCTGCTGTCT	1205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27861808	27864236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_27862400_27863693_27863966_27864069
tx.16617	chr7	+	1187	9	FSM	ENSMUSG00000046865.8	ENSMUST00000042405.8	1197	9	10	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2081	junction_3	279.620725269069	5123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCTGTCTGGTGCCTATT	8541	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27869144	27878694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_27869244_27873928_27874112_27874209_27874318_27874408_27874504_27875279_27875451_27876567_27876701_27877629_27877743_27878322_27878469_27878555
tx.16618	chr7	+	1007	8	ISM	ENSMUSG00000046865.8	ENSMUST00000042405.8	1197	9	4879	-4	-283	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2081	junction_2	289.060970900534	1607	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTGGTGCCTATTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27874013	27878698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_27874112_27874209_27874318_27874408_27874504_27875279_27875451_27876567_27876701_27877629_27877743_27878322_27878469_27878555
tx.16619	chr7	+	882	7	ISM	ENSMUSG00000046865.8	ENSMUST00000042405.8	1197	9	5102	-4	-60	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2081	junction_1	254.102341587007	719	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTGGTGCCTATTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27874236	27878698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_27874318_27874408_27874504_27875279_27875451_27876567_27876701_27877629_27877743_27878322_27878469_27878555
tx.16620	chr7	-	843	6	NNC	ENSMUSG00000046750.19	novel	1267	6	NA	NA	312	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGTGTCAGCGTCTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27990299	27984076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_27984189_27987330_27987468_27987546_27987622_27987725_27987780_27987895_27987921_27989859
tx.16621	chr7	-	602	3	ISM	ENSMUSG00000003436.12	ENSMUST00000108315.4	2618	9	7593	159	-164	-113	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_2	1	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAGGCTGAGAACTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27994070	27993136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_27993352_27993465_27993551_27993768
tx.16622	chr7	-	1494	11	FSM	ENSMUSG00000003438.18	ENSMUST00000081946.5	1515	11	16	5	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	2125	junction_9	150.487341660354	1788	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTAGCTGCCGTGTGTGGC	2672	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28011481	28004945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28005456_28005847_28005955_28006246_28006404_28006977_28007077_28007169_28007275_28007572_28007693_28007778_28007838_28009503_28009526_28009720_28009753_28010293_28010445_28011349
tx.16623	chr7	-	1493	10	NNC	ENSMUSG00000003438.18	novel	1515	11	NA	NA	1	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	755.088188782943	750	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTAGCTGCCGTGTGTGGC	2673	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28011480	28004945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_28005456_28005847_28005955_28006246_28006404_28006977_28007077_28007169_28007275_28007572_28007693_28007778_28007838_28009698_28009753_28010293_28010445_28011349
tx.16624	chr7	-	1471	10	NIC	ENSMUSG00000003438.18	novel	1515	11	NA	NA	1	-5	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	24	junction_7	747.656057453502	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTAGCTGCCGTGTGTGGC	2673	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28011480	28004945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_28005456_28005847_28005955_28006246_28006404_28006977_28007077_28007169_28007275_28007572_28007693_28007778_28007838_28009720_28009753_28010293_28010445_28011349
tx.16625	chr7	-	1480	9	NNC	ENSMUSG00000003438.18	novel	1515	11	NA	NA	0	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	800.856065407511	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGCCTAGCTGCCGTGTGT	2672	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28011481	28004948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_28005456_28005847_28005955_28006246_28006404_28006977_28007077_28007169_28007275_28007572_28007693_28007778_28007838_28010250_28010445_28011349
tx.16626	chr7	+	574	5	FSM	ENSMUSG00000037563.16	ENSMUST00000082134.6	1109	5	76	459	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19383	junction_3	806.134294023024	57592	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTTTTTGTGTTGGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28050152	28052121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28050277_28050416_28050519_28051601_28051699_28051787_28051836_28051918
tx.16627	chr7	-	1793	2	FSM	ENSMUSG00000044786.7	ENSMUST00000051241.7	2790	2	998	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAAATTTGTCTTTTTCG	6671	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28078680	28076207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28077919_28078598
tx.16628	chr7	-	664	4	FSM	ENSMUSG00000003444.9	ENSMUST00000003536.9	1281	4	27	590	27	-590	multi-exon	FALSE	canonical	3	529	junction_2	10.3387082795139	3386	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGTGGTTCCTGTTGCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28092106	28086160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28086450_28090236_28090322_28090514_28090574_28091875
tx.16629	chr7	+	649	7	FSM	ENSMUSG00000060791.16	ENSMUST00000108292.9	657	7	11	-3	11	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	339	junction_1	45.6070170039655	2593	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGTATCTGCAAAATCTG	1826	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28136882	28145974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28137000_28140858_28140956_28141093_28141144_28142644_28142695_28144277_28144361_28145341_28145416_28145796
tx.16630	chr7	-	399	2	Intergenic	novelGene_1179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACACCAGTAAGTGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28182657	28179945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_28180257_28182569
tx.16631	chr7	-	1400	6	FSM	ENSMUSG00000047586.5	ENSMUST00000239002.2	1531	6	131	0	131	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	2.92574776766556	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTGCTCAGAGGCTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28246548	28243020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28243698_28243846_28243986_28244663_28244760_28245580_28245633_28245714_28245778_28246175
tx.16632	chr7	-	1104	2	ISM	ENSMUSG00000030602.14	ENSMUST00000032823.5	2611	8	7974	0	7974	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	711	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTGTGTATGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28259688	28258245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_28259231_28259569
tx.16633	chr7	+	2010	6	NIC	ENSMUSG00000037463.15	novel	1946	6	NA	NA	-61	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	31	junction_1	12.2637677734047	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTCATATCTTTTTCTT	8784	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28392212	28398763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_28392398_28392694_28393076_28394155_28394268_28394430_28394527_28396064_28396201_28397663
tx.16634	chr7	+	1271	3	ISM	ENSMUSG00000037463.15	ENSMUST00000108280.2	2031	5	1048	-3	1048	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_2	5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTCATATCTTTTTCTT	1452	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28394491	28398763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_28394527_28396064_28396201_28397663
tx.16635	chr7	+	1649	7	FSM	ENSMUSG00000030598.16	ENSMUST00000108279.9	1563	7	-86	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_6	37.5340586075574	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCAATTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28416211	28437569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28416464_28424039_28424153_28431837_28432298_28432853_28432966_28434701_28434798_28435492_28435629_28437089
tx.16636	chr7	+	1855	8	FSM	ENSMUSG00000030598.16	ENSMUST00000108278.9	1806	8	-43	-6	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_7	33.4310133418242	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCAATTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28416213	28437569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28416464_28424039_28424153_28431837_28432298_28432853_28432966_28434701_28434798_28435492_28435629_28436763_28436972_28437089
tx.16637	chr7	+	1226	4	ISM	ENSMUSG00000030598.16	ENSMUST00000108279.9	1563	7	16154	0	527	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_3	48.5615302705982	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCAATTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28432451	28437569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_28432966_28434701_28434798_28435492_28435629_28437089
tx.16638	chr7	+	1429	5	ISM	ENSMUSG00000030598.16	ENSMUST00000108278.9	1806	8	16200	-6	532	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_4	39.6169155790806	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCAATTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28432456	28437569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_28432966_28434701_28434798_28435492_28435629_28436763_28436972_28437089
tx.16639	chr7	-	841	2	FSM	ENSMUSG00000045948.9	ENSMUST00000171183.2	883	2	42	0	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	939	junction_1	0	5926	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCAGTGTGCGGTGTCTGTC	1736	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28441153	28439065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28439665_28440911
tx.16640	chr7	-	716	3	FSM	ENSMUSG00000045948.9	ENSMUST00000056078.9	722	3	7	-1	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	503	junction_2	218	5168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCAGTGTGCGGTGTCTGTC	1651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28441238	28439065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28439665_28440911_28440980_28441189
tx.16641	chr7	+	1864	16	FSM	ENSMUSG00000070699.6	ENSMUST00000094632.6	1868	16	-12	16	-2	-16	multi-exon	TRUE	canonical	3	180	junction_5	21.0516824347446	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTCTGGATCCATGAGCA	266	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28441414	28453280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28441708_28443666_28443763_28445876_28445907_28446165_28446307_28446383_28446439_28446911_28446976_28447256_28447363_28448379_28448428_28449001_28449111_28449305_28449352_28449435_28449524_28449606_28449717_28451666_28451761_28451850_28451944_28452027_28452094_28452855
tx.16642	chr7	-	199	2	ISM	ENSMUSG00000030595.16	ENSMUST00000085851.12	1243	6	6651	11	6651	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	539	junction_1	0	829	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGACTGACCCTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28459288	28458467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_28458630_28459251
tx.16643	chr7	-	592	4	ISM	ENSMUSG00000030595.16	ENSMUST00000085851.12	1243	6	4842	11	4842	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	539	junction_1	24.2624538467705	523	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGACTGACCCTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28461097	28458467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_28458630_28459251_28459522_28459601_28459691_28461026
tx.16644	chr7	-	1213	6	FSM	ENSMUSG00000030595.16	ENSMUST00000085851.12	1243	6	19	11	19	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	539	junction_1	23.6761483354029	1869	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGACTGACCCTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28465920	28458467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28458630_28459251_28459522_28459601_28459691_28461026_28461361_28461450_28461557_28465668
tx.16645	chr7	+	1791	15	FSM	ENSMUSG00000015149.15	ENSMUST00000122915.8	1828	15	37	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_1	14.0365775815931	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGACTTGTGTGGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28466196	28488085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28466293_28471235_28471285_28471519_28471634_28476282_28476325_28476420_28476528_28476615_28476673_28478346_28478416_28482193_28482324_28484804_28484865_28485088_28485145_28485230_28485308_28485389_28485442_28487007_28487079_28487186_28487254_28487341
tx.16646	chr7	+	1668	12	ISM	ENSMUSG00000015149.15	ENSMUST00000170068.9	1585	13	9906	1	-136	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_1	8.12708968677346	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGACTTGTGTGGCCTCT	8246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28476146	28488085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_28476325_28476420_28476528_28476615_28476673_28478346_28478416_28482193_28482324_28484804_28484865_28485088_28485145_28485230_28485308_28485389_28485442_28487007_28487079_28487186_28487254_28487341
tx.16647	chr7	+	2103	5	ISM	ENSMUSG00000051735.8	ENSMUST00000059857.8	2871	12	7017	2	-952	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_1	3.11247489949718	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATGGAGGTGCAGACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28495410	28498386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_28495772_28496077_28496372_28496534_28496667_28496984_28497149_28497234
tx.16648	chr7	+	1928	13	FSM	ENSMUSG00000015165.17	ENSMUST00000172529.8	1898	13	-30	0	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	1654.75498983653	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTGCTGGGGCTCCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28508202	28521674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28508285_28512703_28512823_28513278_28513517_28513626_28513713_28514523_28514621_28514704_28514778_28517885_28517958_28518068_28518350_28519577_28519700_28519969_28520172_28520640_28520699_28520816_28520913_28521272
tx.16649	chr7	+	1073	6	ISM	ENSMUSG00000015165.17	ENSMUST00000174882.8	1850	13	5387	0	898	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4757	junction_1	533.031931501294	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTGCTGGGGCTCCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28518156	28521674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_28518350_28519577_28519700_28519969_28520172_28520640_28520699_28520816_28520913_28521272
tx.1665	chr10	+	2828	13	FSM	ENSMUSG00000006498.17	ENSMUST00000165704.8	3169	13	2	339	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	638	junction_7	276.779833782898	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACTCCTGCCTGTCATTGG	1587	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79690464	79700266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_79690556_79692337_79692369_79694585_79694659_79694785_79695106_79695185_79695357_79695435_79695547_79695614_79695790_79696657_79696804_79697847_79697882_79698282_79698376_79698486_79698704_79698811_79698890_79698978
tx.16650	chr7	+	896	5	ISM	ENSMUSG00000015165.17	ENSMUST00000174882.8	1850	13	6807	-15	-1061	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5524	junction_3	325.157942391079	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAAGGGTGGGTTGTCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28519576	28521689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_28519700_28519969_28520172_28520640_28520699_28520816_28520913_28521272
tx.16651	chr7	+	1176	10	FSM	ENSMUSG00000053898.13	ENSMUST00000066264.13	1267	10	92	-1	-40	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	645	junction_5	36.3137901908447	2371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGGTGTCTTTACTGCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28524733	28531673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28524838_28525298_28525504_28525609_28525699_28529224_28529350_28529426_28529476_28529638_28529704_28530641_28530713_28530813_28530886_28531141_28531293_28531428
tx.16652	chr7	+	708	4	NNC	ENSMUSG00000053964.18	novel	519	2	NA	NA	2505	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.49691252107735	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTCTTGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28537865	28541126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_28538107_28540288_28540378_28540569_28540733_28540911
tx.16653	chr7	+	545	4	FSM	ENSMUSG00000053522.12	ENSMUST00000081457.5	754	4	211	-2	-15	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	2.49443825784929	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCCTGTGTCCTTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28563864	28565711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28563912_28564255_28564345_28564958_28565161_28565504
tx.16654	chr7	+	497	3	ISM	ENSMUSG00000053522.12	ENSMUST00000081457.5	754	4	602	-1	376	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	3	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGCCTGTGTCCTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28564255	28565710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_28564345_28564958_28565161_28565504
tx.16655	chr7	-	1732	6	ISM	ENSMUSG00000054808.16	ENSMUST00000144909.8	2581	14	9506	-399	314	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1402	junction_2	86.8456101366097	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGACTCTGGTGTCATCT	854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28597304	28592678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_28593813_28593925_28594085_28594856_28594938_28595513_28595661_28596300_28596481_28597273
tx.16656	chr7	-	891	8	NIC	ENSMUSG00000053565.11	novel	774	8	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	86	junction_6	1203.94528318274	211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATTGTCTCTTGCCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28681231	28670796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_28670864_28671956_28672083_28673573_28673652_28674027_28674095_28676625_28676701_28677294_28677416_28679743_28679968_28681098
tx.16657	chr7	-	770	8	FSM	ENSMUSG00000053565.11	ENSMUST00000066070.7	774	8	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2641	junction_1	370.651715060852	9311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATTGTCTCTTGCCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28681235	28670796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28670864_28671956_28672083_28673573_28673652_28674027_28674095_28676625_28676701_28677294_28677416_28679868_28679968_28681098
tx.16658	chr7	+	349	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000053565.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCGGAAGAGAGGTGTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28679741	28681223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_28679964_28681096
tx.16659	chr7	+	1601	19	ISM	ENSMUSG00000037337.12	ENSMUST00000085835.8	2724	32	8153	-1	8120	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_4	25.3179778023443	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCGGAGGAGAGATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28690405	28702704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_28690472_28690572_28690617_28690705_28690751_28692614_28692658_28693392_28693556_28693629_28693713_28694889_28694914_28695513_28695599_28697876_28697954_28698037_28698099_28699197_28699307_28699388_28699448_28699615_28699720_28700359_28700535_28701031_28701095_28701173_28701264_28701344_28701416_28701772_28701829_28702521
tx.16660	chr7	+	684	5	FSM	ENSMUSG00000037337.12	ENSMUST00000208784.2	523	5	-156	-5	-156	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_2	9.82344135219425	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCGGAGGAGAGATTTTT	6806	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28700810	28702704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28701095_28701173_28701264_28701344_28701416_28701772_28701829_28702521
tx.16661	chr7	-	767	7	NNC	ENSMUSG00000030592.19	novel	15358	106	NA	NA	37808	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_6	5.14511634681104	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGTGTTGGTCATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28708300	28702764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_28702979_28703158_28703211_28703849_28703951_28704207_28704273_28704919_28705077_28707808_28707944_28708257
tx.16662	chr7	+	553	3	NNC	ENSMUSG00000109017.2	novel	698	3	NA	NA	-36	-185	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTTGTGTGATACCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28728411	28729490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_28728531_28728944_28729078_28729189
tx.16663	chr7	+	280	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030592.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGAGGTTTTCACAGTCA	4186	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28746180	28746558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_28746292_28746389
tx.16664	chr7	-	664	4	NIC	ENSMUSG00000030592.19	novel	15358	106	NA	NA	5315	4757	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.85861230093008	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGGTGCATACCTGT	952	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28766187	28763666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_28764093_28764241_28764303_28765919_28766042_28766132
tx.16665	chr7	-	393	2	ISM	ENSMUSG00000030592.19	ENSMUST00000207783.2	2366	5	1	4519	1	3926	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAAGGCTCTGGAGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28824603	28818126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_28818306_28824389
tx.16666	chr7	+	1855	14	NIC	ENSMUSG00000030589.16	novel	2296	17	NA	NA	2562	0	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	3	10	junction_1	14.4868844989255	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACTGCCAGTCACACTCC	415	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28837059	28851046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_28837151_28839666_28839799_28839912_28840067_28842390_28842565_28844556_28844674_28845232_28845509_28847791_28847873_28847968_28848074_28848198_28848318_28848411_28848557_28849223_28849261_28849346_28849482_28849603_28849717_28850870
tx.16667	chr7	-	1202	7	NIC	ENSMUSG00000030590.16	novel	1293	8	NA	NA	-7	0	intron_retention	TRUE	canonical	3	18	junction_6	105.086868827651	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGATCTTGTTTCTGTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28855615	28851934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_28852273_28852746_28852915_28853843_28853961_28854040_28854119_28854576_28854783_28855099_28855235_28855455
tx.16668	chr7	-	1272	8	FSM	ENSMUSG00000030590.16	ENSMUST00000164589.9	1293	8	21	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	257	junction_3	23.9565934002925	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGATCTTGTTTCTGTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28855638	28851934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28852273_28852746_28852915_28853843_28853961_28854040_28854119_28854576_28854783_28855099_28855235_28855309_28855456_28855554
tx.16669	chr7	-	1226	2	ISM	ENSMUSG00000030590.16	ENSMUST00000153251.8	791	5	1510	-44	1394	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	299	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGATCTTGTTTCTGTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28853634	28851934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_28852273_28852746
tx.16670	chr7	-	1290	7	FSM	ENSMUSG00000030591.18	ENSMUST00000182328.8	1391	7	37	64	-34	-64	multi-exon	FALSE	canonical	3	1581	junction_5	143.933626678719	2465	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGAAACTGACTTTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28879940	28873676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28874173_28874835_28874948_28875497_28875599_28876490_28876657_28878343_28878447_28878567_28878641_28879701
tx.16671	chr7	+	1124	8	FSM	ENSMUSG00000030588.13	ENSMUST00000108238.8	1126	8	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	755	junction_1	273.775194535329	2244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGCCTCCACTTCTGACC	6039	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28937755	28946954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28937862_28943494_28943728_28943823_28943929_28944019_28944099_28944206_28944265_28945090_28945247_28945325_28945420_28946661
tx.16672	chr7	+	1128	8	FSM	ENSMUSG00000030588.13	ENSMUST00000032809.10	1111	8	-17	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	488	junction_1	365.371993833067	1378	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGCCTCCACTTCTGACC	6044	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28937760	28946954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28937871_28943494_28943728_28943823_28943929_28944019_28944099_28944206_28944265_28945090_28945247_28945325_28945420_28946661
tx.16673	chr7	+	1153	8	NIC	ENSMUSG00000030588.13	novel	1153	8	NA	NA	4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	150	junction_1	482.335940174142	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCAGCCTCCACTTCTGACC	6185	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28937901	28946954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_28938037_28943494_28943728_28943823_28943929_28944019_28944099_28944206_28944265_28945090_28945247_28945325_28945420_28946661
tx.16674	chr7	-	402	3	FSM	ENSMUSG00000030587.6	ENSMUST00000151339.2	443	3	92	-51	92	51	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_2	5	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGGTTTATTGTTGCGGGT	2003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28947671	28946945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28947160_28947321_28947391_28947552
tx.16675	chr7	-	448	4	FSM	ENSMUSG00000030587.6	ENSMUST00000032808.6	1466	4	56	962	56	49	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_3	7.36357401145817	413	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCAGGTTTATTGTTGCGG	1839	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28947835	28946947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28947160_28947321_28947391_28947552_28947666_28947781
tx.16676	chr7	-	1135	7	FSM	ENSMUSG00000074227.13	ENSMUST00000098604.12	1384	7	249	0	247	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	452.801066204084	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTACTATGTAGTTTGGTTT	716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28981088	28955765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28956263_28957592_28957632_28957851_28958014_28958823_28958878_28959795_28959856_28963019_28963191_28980936
tx.16677	chr7	-	884	6	NNC	ENSMUSG00000074227.13	novel	1211	6	NA	NA	242	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	491.498931840141	53	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTACTATGTAGTTTGGTTT	711	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28981093	28955765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_28956178_28957592_28957632_28957851_28958014_28958823_28958878_28959795_28959856_28980936
tx.16678	chr7	-	971	6	FSM	ENSMUSG00000074227.13	ENSMUST00000108236.5	1211	6	240	0	240	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	398.697679953119	1085	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTACTATGTAGTTTGGTTT	709	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28981095	28955765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_28956263_28957592_28957632_28957851_28958014_28958823_28958878_28959795_28959856_28980936
tx.16679	chr7	-	956	5	NNC	ENSMUSG00000074227.13	novel	1211	6	NA	NA	244	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	445.694612374886	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTACTATGTAGTTTGGTTT	713	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28981091	28955765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_28956263_28957823_28958014_28958823_28958878_28959795_28959856_28980936
tx.1668	chr10	-	1820	8	FSM	ENSMUSG00000035781.15	ENSMUST00000045628.15	1898	8	76	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_7	14.1608831731957	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCCTGTCCCCGTGTTTG	9758	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79752764	79745887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_79746974_79747775_79747832_79747908_79747995_79748229_79748316_79748482_79748604_79749058_79749181_79749390_79749546_79752656
tx.16680	chr7	+	547	4	FSM	ENSMUSG00000037166.6	ENSMUST00000048187.6	950	4	-6	409	-2	-409	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_2	2.05480466765633	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTGTCCGGATTTTCCT	4001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28988730	28992817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_28988961_28990934_28991016_28991475_28991509_28992614
tx.16681	chr7	-	318	2	ISM	ENSMUSG00000030583.17	ENSMUST00000182702.8	537	3	90	33728	4	-33655	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCTCCCTCAGAGATAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29217976	29134019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_29134251_29217889
tx.16683	chr7	+	2942	5	FSM	ENSMUSG00000046185.11	ENSMUST00000032802.5	4113	5	25	1146	25	-1146	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_4	7.79021822544144	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATTACACATTATATACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29468001	29478100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_29468121_29470763_29470829_29474762_29474890_29475329_29475417_29475556
tx.16684	chr7	+	1540	4	NIC	ENSMUSG00000047473.15	novel	3707	4	NA	NA	1	-2122	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	12	junction_3	6.97614984548545	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTATTTGTATGGTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29483448	29489215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_29484327_29485643_29485729_29487473_29487601_29488765
tx.16685	chr7	-	2773	5	FSM	ENSMUSG00000050855.17	ENSMUST00000085792.5	2764	5	-5	-4	-5	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_4	10.6624340560681	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGACTTTGTGGTGTTCG	3439	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29553078	29543356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_29545674_29545893_29545990_29546258_29546386_29550366_29550443_29552921
tx.16686	chr7	-	2862	5	NNC	ENSMUSG00000050855.17	novel	2764	5	NA	NA	-2	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_4	9.83298021964857	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGACTTTGTGGTGTTCG	3421	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29553096	29543356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_29545674_29545893_29545990_29546258_29546386_29550366_29550443_29552850
tx.16687	chr7	+	2503	4	FSM	ENSMUSG00000058402.15	ENSMUST00000074876.13	2537	4	-8	42	-8	-42	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	4.02768199119819	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATGTAAAAGCACTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29559395	29575888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_29559519_29560440_29560494_29572316_29572359_29573603
tx.16688	chr7	-	683	3	NIC	ENSMUSG00000062040.15	novel	430	3	NA	NA	-9	377	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_2	18.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAACAGAGATCACCACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29605538	29599284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_29599764_29603324_29603469_29605478
tx.16689	chr7	+	996	5	FSM	ENSMUSG00000063623.5	ENSMUST00000239012.2	809	5	227	-414	152	-8	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	40.4722126896961	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACATATATGGAGTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29653314	29665187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_29653382_29656384_29656460_29660317_29660445_29662570_29662667_29664556
tx.1669	chr10	-	1833	8	NNC	ENSMUSG00000035781.15	novel	1898	8	NA	NA	2	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	8	junction_3	56.5190955630511	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCCTGTCCCCGTGTTTG	9763	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79752759	79745887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_79746974_79747775_79747832_79747908_79748013_79748229_79748316_79748482_79748604_79749058_79749181_79749390_79749546_79752656
tx.16690	chr7	+	1015	4	NIC	ENSMUSG00000074221.13	novel	4005	10	NA	NA	2	247	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	234	junction_3	16.0485374896143	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAATATTCATGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29683381	29688924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_29683654_29684684_29684752_29687006_29687232_29688473
tx.16691	chr7	+	2257	10	NIC	ENSMUSG00000074221.13	novel	4005	10	NA	NA	13	-278	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	169	junction_6	29.7138617525039	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACACTGGTGATAGACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29683392	29722794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_29683654_29684684_29684752_29687006_29687232_29688473_29688533_29697174_29697302_29697539_29697636_29713264_29713315_29714490_29714615_29716591_29716688_29721642
tx.16692	chr7	-	1946	6	NIC	ENSMUSG00000053985.11	novel	3411	5	NA	NA	2	167	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_3	3.65513337649941	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGGAAACGTTTAGCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29750803	29737310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_29738842_29742954_29743082_29744144_29744234_29745163_29745265_29749864_29749929_29750769
tx.16693	chr7	-	419	5	FSM	ENSMUSG00000053985.11	ENSMUST00000207072.2	2835	5	4	2412	4	-1250	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	6.81909084849293	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTCTTAGTGATGATCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29750794	29738727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_29738842_29742954_29743082_29744144_29744234_29749864_29749929_29750769
tx.16694	chr7	-	2125	6	NNC	ENSMUSG00000053985.11	novel	3411	5	NA	NA	1	348	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_5	6.15142259969188	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATACACTTGTATTATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29750804	29737129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_29738842_29742954_29743082_29744144_29744234_29745163_29745265_29749864_29749926_29750769
tx.16695	chr7	-	492	5	NIC	ENSMUSG00000053985.11	novel	3411	5	NA	NA	868	-1255	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_3	3.67423461417477	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTTCTGGTCTTAGTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29749930	29738732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_29738842_29742954_29743082_29744144_29744234_29745163_29745265_29749864
tx.16696	chr7	-	1686	4	FSM	ENSMUSG00000078768.3	ENSMUST00000088785.6	1709	4	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	16.2685791225499	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCTGTGTGGCAGTGTAA	9946	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29789929	29776761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_29778044_29780515_29780643_29786524_29786585_29789712
tx.16697	chr7	+	3636	3	FSM	ENSMUSG00000049421.14	ENSMUST00000050735.12	4006	3	362	8	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_1	24	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCTGATCCTTTGTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29794580	29807039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_29794637_29798952_29799148_29803654
tx.16698	chr7	+	636	2	FSM	ENSMUSG00000049421.14	ENSMUST00000149302.2	641	2	5	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTTTACATCTGTACTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29794591	29799543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_29794637_29798952
tx.16699	chr7	+	2927	2	ISM	ENSMUSG00000049421.14	ENSMUST00000134365.8	594	4	4338	670	1359	-665	internal_fragment	FALSE	canonical	3	137	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATCAGAGTGAAGAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29798940	29806374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_29799148_29803654
tx.167	chr1	+	1293	5	ISM	ENSMUSG00000026083.13	ENSMUST00000192548.6	5788	22	-5	30217	-5	-23636	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	579	junction_4	48.9948976935354	1502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGAGGTATGTCTTATAC	1403	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38037204	38060885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_38037406_38056886_38057013_38057105_38057191_38057945_38058616_38060674
tx.1670	chr10	+	1400	10	FSM	ENSMUSG00000035754.9	ENSMUST00000045247.9	3911	10	0	2511	0	81	multi-exon	FALSE	canonical	3	1673	junction_5	33.7828943493195	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGCGCCTTGGTTGTTCT	2286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79795985	79803526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_79796207_79796835_79796947_79800759_79800894_79801043_79801186_79801813_79801958_79802039_79802105_79802178_79802304_79802393_79802561_79803153_79803223_79803304
tx.16700	chr7	+	2384	5	FSM	ENSMUSG00000074220.11	ENSMUST00000098596.11	2117	5	-8	-259	-8	259	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_4	7.82224392358101	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATTGTTACTATATGTT	5251	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29821358	29834634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_29821502_29825192_29825267_29830125_29830253_29830956_29831050_29832687
tx.16701	chr7	+	303	3	NNC	ENSMUSG00000074220.11	novel	325	3	NA	NA	4	-663	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_2	23	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGATGTATTTTCTCCGTG	5263	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29821370	29829578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_29821502_29825192_29825267_29829480
tx.16702	chr7	-	981	5	NNC	ENSMUSG00000037029.9	novel	585	3	NA	NA	2	3247	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	11.6404467268228	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCACCGCTAAATATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29869173	29857446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_29857940_29858818_29858943_29859451_29859583_29862510_29862654_29869083
tx.16703	chr7	-	2828	2	FSM	ENSMUSG00000037029.9	ENSMUST00000062181.9	2029	2	-19	-780	4	780	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCTTAAATCCTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29869171	29859913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_29862654_29869083
tx.16704	chr7	+	366	4	FSM	ENSMUSG00000074218.4	ENSMUST00000098594.4	393	4	27	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	920	junction_1	139.802241279125	3575	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGCTCCAGCCTGTGTGT	5701	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29883595	29885455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_29883671_29884509_29884597_29884699_29884785_29885336
tx.16705	chr7	-	1346	10	ISM	ENSMUSG00000001794.14	ENSMUST00000126116.3	1429	11	988	-1	-279	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1106	junction_9	168.3138602598	372	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGTAACTTGGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29893485	29886366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_29886959_29887095_29887155_29889476_29889594_29889903_29889983_29890083_29890153_29891586_29891652_29891744_29891803_29891927_29892018_29892291_29892326_29893302
tx.16706	chr7	-	1455	11	FSM	ENSMUSG00000001794.14	ENSMUST00000126116.3	1429	11	-25	-1	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	766	junction_10	279.009032111866	466	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGTAACTTGGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29894498	29886366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_29886959_29887095_29887155_29889476_29889594_29889903_29889983_29890083_29890153_29891586_29891652_29891744_29891803_29891927_29892018_29892291_29892326_29893302_29893527_29894430
tx.16707	chr7	-	264	2	ISM	ENSMUSG00000006095.13	ENSMUST00000169358.8	396	3	2481	-2	2481	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	871	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCAAGTCTCTTGATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29923944	29923555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_29923773_29923897
tx.16708	chr7	-	557	4	ISM	ENSMUSG00000006095.13	ENSMUST00000006254.6	1416	6	4594	0	-617	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	871	junction_1	17.7200451466693	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCAAGTCTCTTGATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29927103	29923555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_29923773_29923897_29923971_29926268_29926461_29927028
tx.16709	chr7	-	918	6	FSM	ENSMUSG00000006095.13	ENSMUST00000006254.6	1416	6	498	0	498	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	839	junction_4	26.4529771481397	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCAAGTCTCTTGATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29931199	29923555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_29923773_29923897_29923971_29926268_29926461_29927028_29927126_29930550_29930695_29931004
tx.16710	chr7	+	445	6	FSM	ENSMUSG00000019738.16	ENSMUST00000019882.16	819	6	371	3	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1146	junction_5	44.9239357136037	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGTGTTTCCCGTGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29931743	29932812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_29931830_29931906_29931962_29932174_29932249_29932331_29932407_29932491_29932544_29932709
tx.16711	chr7	+	933	7	FSM	ENSMUSG00000042831.14	ENSMUST00000060834.12	982	7	49	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	231	junction_5	88.8144132446981	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTTTTGGATTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30008190	30013729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_30008260_30008905_30008985_30009410_30009480_30011264_30011326_30011661_30011814_30012015_30012133_30013343
tx.16712	chr7	-	981	6	ISM	ENSMUSG00000006651.9	ENSMUST00000208792.2	2472	16	8434	-6	-52	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	430	junction_4	31.3496411462715	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCCGTGTTTCTGTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30136480	30134406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30134817_30134900_30135045_30135170_30135234_30135397_30135469_30135603_30135628_30136211
tx.16713	chr7	-	1631	10	NNC	ENSMUSG00000036915.18	novel	3352	15	NA	NA	1996	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	12.3057750168542	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGTGTGTTGTCCAGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30153911	30147498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_30147880_30149261_30149328_30149802_30149904_30150222_30150326_30152105_30152326_30152478_30152580_30152836_30152970_30153060_30153189_30153438_30153588_30153662
tx.16714	chr7	+	1843	13	NNC	ENSMUSG00000006649.18	novel	4608	30	NA	NA	-3920	24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	17.6137178232069	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAAAGGATGCCCCAGTGG	126	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30170012	30186672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_30170187_30170272_30170430_30170516_30170669_30173701_30173814_30173895_30174078_30177283_30177345_30180805_30180926_30181066_30181092_30181165_30181242_30181401_30181496_30181889_30182006_30186009_30186175_30186263
tx.16715	chr7	+	849	5	ISM	ENSMUSG00000006649.18	ENSMUST00000149086.2	752	9	3875	-354	-3175	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_2	4.89897948556636	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTGTTCCAAGCCAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30181164	30186660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_30181242_30181401_30181496_30181889_30182006_30186009_30186175_30186263
tx.16716	chr7	+	1283	3	FSM	ENSMUSG00000036854.15	ENSMUST00000123355.8	1298	3	16	-1	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	8.5	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGCCTTATGTCTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30251964	30254865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_30252153_30253686_30253810_30253893
tx.16717	chr7	-	666	4	FSM	ENSMUSG00000036835.8	ENSMUST00000043898.8	708	4	42	0	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	560	junction_3	125.517595048131	2229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGAGTTCTTGGGATCTT	1332	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30262624	30261289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_30261560_30261748_30261854_30262220_30262364_30262476
tx.16718	chr7	+	874	8	FSM	ENSMUSG00000078765.12	ENSMUST00000043273.16	884	8	9	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	411	junction_1	81.3154602866678	871	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTGTGGTTTCCTTCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30262754	30264789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_30262825_30262956_30263045_30263354_30263422_30263506_30263557_30263627_30263727_30263898_30264033_30264127_30264224_30264519
tx.16719	chr7	-	965	5	NIC	ENSMUSG00000006310.11	novel	1775	6	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_4	27.8960122598195	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACGAGTCCAGACTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30298334	30289105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_30289633_30289780_30289946_30290057_30290127_30290220_30290295_30298204
tx.16720	chr7	-	979	4	ISM	ENSMUSG00000006313.6	ENSMUST00000006476.6	1421	8	5817	-8	5817	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_3	10.6144555520604	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGAGCTTGTTCTGTTCTG	7724	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30306455	30302508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30303068_30303196_30303281_30304485_30304666_30306299
tx.16721	chr7	-	487	4	FSM	ENSMUSG00000036751.8	ENSMUST00000075738.6	618	4	18	113	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5624	junction_1	329.368419183679	24451	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACATTGTGTGTATTACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30325558	30316398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_30316588_30322839_30322941_30323924_30324039_30325475
tx.16722	chr7	+	216	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036751.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATGCAAACAGAGTGGGAA	276	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30322838	30324040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_30322943_30323928
tx.16723	chr7	-	520	3	ISM	ENSMUSG00000006311.9	ENSMUST00000108147.3	1048	6	1062	-10	1062	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	1	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCGTGTCTGGTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30334215	30333030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30333260_30333413_30333527_30334037
tx.16724	chr7	-	1620	10	FSM	ENSMUSG00000036733.17	ENSMUST00000042726.14	1784	10	164	0	-9	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	640	junction_5	133.345925331332	397	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCTGACTGGACTTAGAAA	3775	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30349578	30340425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_30340646_30340732_30340928_30343923_30344042_30344250_30344584_30345091_30345268_30345343_30345410_30346984_30347060_30347155_30347241_30349008_30349145_30349362
tx.16725	chr7	-	1533	9	FSM	ENSMUSG00000036733.17	ENSMUST00000108141.2	1526	9	-9	2	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	345	junction_5	209.790818435889	236	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCTGACTGGACTTAGAAA	3775	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30349578	30340425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_30340646_30340732_30340928_30343923_30344042_30344250_30344584_30345091_30345247_30346984_30347060_30347155_30347241_30349008_30349145_30349362
tx.16726	chr7	-	847	7	FSM	ENSMUSG00000006315.10	ENSMUST00000006478.10	870	7	27	-4	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	739	junction_6	21.1850314032233	2242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTATGTCCATCTCTCT	9284	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30428938	30427125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_30427329_30427411_30427534_30427629_30427715_30427856_30427994_30428081_30428142_30428626_30428697_30428768
tx.16727	chr7	+	1098	7	Fusion	ENSMUSG00000097320.9_ENSMUSG00000046056.16	novel	1276	6	NA	NA	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	6.02771377334171	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTGGCTCACTGTGCTTCT	551	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30429028	30455559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr7_+_30429280_30431838_30432187_30434128_30434194_30435240_30435388_30454233_30454306_30454426_30454472_30455389
tx.16728	chr7	+	562	2	NNC	ENSMUSG00000097320.9	novel	1276	6	NA	NA	11	-6865	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGAGCTTTCTGTGTTTGG	537	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30429014	30430059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_30429280_30429762
tx.16729	chr7	+	458	6	FSM	ENSMUSG00000074199.8	ENSMUST00000098559.3	470	6	0	12	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_5	10.9105453575887	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCTCCTGAATCTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30487329	30490510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_30487448_30488929_30488969_30489137_30489180_30489336_30489382_30489992_30490041_30490344
tx.16730	chr7	+	400	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000044453.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATGTCCATTCCGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30530552	30565299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_30530844_30565190
tx.16731	chr7	-	1187	4	ISM	ENSMUSG00000030577.15	ENSMUST00000189718.7	3672	13	10525	-6	5495	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0.471404520791032	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTATTGGTGATTGATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30567349	30565247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30566088_30566442_30566528_30566886_30567006_30567206
tx.16732	chr7	-	1201	6	ISM	ENSMUSG00000058239.14	ENSMUST00000167285.8	1968	7	735	740	9	582	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_3	22.5707775674654	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTGTGTCCATGTTGG	5390	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30654866	30645416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30646095_30646175_30646305_30646389_30646485_30654168_30654228_30654530_30654619_30654714
tx.16733	chr7	-	1446	9	FSM	ENSMUSG00000058239.14	ENSMUST00000108119.10	849	9	-14	-583	-14	577	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_6	40.847085269331	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTCTGTCTGTGTGTCCAT	8787	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30656205	30645421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_30646095_30646175_30646305_30646389_30646485_30654168_30654228_30654530_30654619_30654714_30654866_30655573_30655693_30655806_30655854_30656120
tx.16734	chr7	-	325	2	ISM	ENSMUSG00000001247.17	ENSMUST00000205961.2	2021	10	15136	-4	15136	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_1	0	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTAAGCCTCTTGTTTTGCT	7381	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30657611	30657199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30657327_30657413
tx.16735	chr7	-	1903	10	FSM	ENSMUSG00000001247.17	ENSMUST00000205961.2	2021	10	122	-4	122	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	74	junction_7	47.1029867208513	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTAAGCCTCTTGTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30672625	30657199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_30657327_30657413_30658046_30658174_30658307_30658399_30658460_30658577_30658740_30661522_30661670_30662235_30662293_30665393_30665514_30671292_30671638_30672504
tx.16736	chr7	-	1860	9	FSM	ENSMUSG00000001247.17	ENSMUST00000108116.10	2071	9	213	-2	108	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_6	34.291945118351	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTAAGCCTCTTGTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30672639	30657199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_30657327_30657413_30658046_30658174_30658307_30658399_30658460_30658577_30658740_30661522_30661670_30665393_30665514_30671292_30671638_30672504
tx.16737	chr7	-	1706	2	ISM	ENSMUSG00000001247.17	ENSMUST00000205961.2	2021	10	129	12842	129	-12359	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGGTTTTGGAGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30672618	30670045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30671638_30672504
tx.16738	chr7	-	479	4	ISM	ENSMUSG00000009687.15	ENSMUST00000205301.2	593	5	1420	-2	1420	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_1	3.85861230093008	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCTCTGTCTTCTGTGAA	8280	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30735943	30732152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30732444_30734633_30734709_30734810_30734841_30735860
tx.16739	chr7	-	514	5	NNC	ENSMUSG00000009687.15	novel	593	5	NA	NA	891	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	10	junction_4	35.9513560244951	78	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCTCTGTCTTCTGTGAA	7751	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30736472	30732152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_30732444_30734633_30734709_30734810_30734841_30735860_30735942_30736435
tx.16740	chr7	-	516	5	NNC	ENSMUSG00000009687.15	novel	593	5	NA	NA	872	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	42	junction_4	22.1923410211721	212	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCTCTGTCTTCTGTGAA	7732	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30736491	30732152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_30732444_30734633_30734709_30734810_30734841_30735860_30735942_30736452
tx.16741	chr7	-	479	7	NNC	ENSMUSG00000057092.13	novel	439	7	NA	NA	-124	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	0.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGGTGCCAGAGACTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30771838	30769959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_30770146_30770276_30770315_30770586_30770624_30770716_30770792_30771499_30771524_30771605_30771639_30771752
tx.16742	chr7	-	1176	7	ISM	ENSMUSG00000001248.16	ENSMUST00000001280.14	2713	19	15363	0	-1451	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_6	52.4640088272162	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCTTGTACCTGTGGGG	1467	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30835144	30829551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30830010_30831965_30832087_30832182_30832291_30833415_30833504_30833582_30833757_30833838_30833943_30835021
tx.16743	chr7	-	1274	8	ISM	ENSMUSG00000001248.16	ENSMUST00000001280.14	2713	19	15182	0	-1632	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_6	49.7561400169643	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCTTGTACCTGTGGGG	1286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30835325	30829551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30830010_30831965_30832087_30832182_30832291_30833415_30833504_30833582_30833757_30833838_30833943_30835021_30835165_30835247
tx.16744	chr7	-	2646	18	NNC	ENSMUSG00000001248.16	novel	2713	19	NA	NA	-6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_16	76.1130101324254	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGCTTGTACCTGTGGGG	5748	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30850445	30829551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_30830010_30831965_30832087_30832182_30832291_30833415_30833504_30833582_30833757_30833838_30833943_30835021_30835165_30835247_30835367_30837538_30837683_30838176_30838376_30838821_30838973_30839181_30839295_30840554_30840636_30841792_30841889_30841975_30842080_30842228_30842314_30843065_30843299_30850320
tx.16745	chr7	+	634	2	Intergenic	novelGene_1180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAGTGCATGCTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30874555	30877016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_30874861_30876687
tx.16746	chr7	-	2559	17	NNC	ENSMUSG00000052997.16	novel	2579	17	NA	NA	18	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	386.788858543974	1008	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCTCTGTTGCCCTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33867982	33840118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_33840892_33842162_33842300_33843914_33844021_33845629_33845727_33846940_33847101_33850212_33850326_33850419_33850514_33853908_33854070_33855309_33855410_33856667_33856790_33857403_33857472_33858242_33858365_33860961_33861063_33862578_33862644_33863809_33863881_33864826_33864911_33867797
tx.16747	chr7	-	1164	7	FSM	ENSMUSG00000002635.12	ENSMUST00000002710.10	1295	7	-1	132	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	638	junction_2	61.3994209165599	2839	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGTGTTTACCTTATTT	5731	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33896087	33884055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_33884237_33885718_33885868_33888773_33888882_33892160_33892532_33895490_33895552_33895696_33895864_33895960
tx.16748	chr7	-	2042	18	FSM	ENSMUSG00000036427.6	ENSMUST00000038027.6	2884	18	39	803	-8	26	multi-exon	FALSE	canonical	3	1600	junction_15	166.521152162862	1471	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTCAGTACTTTTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33929722	33901557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_33901975_33902061_33902129_33902239_33902316_33903453_33903583_33904992_33905070_33905230_33905361_33907030_33907184_33907281_33907326_33907674_33907736_33915380_33915435_33917722_33917768_33918455_33918528_33920038_33920186_33920267_33920352_33926542_33926663_33928352_33928422_33928707_33928799_33929516
tx.16749	chr7	+	714	2	FSM	ENSMUSG00000085105.3	ENSMUST00000127010.2	4175	2	4	3457	4	1198	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGGAGCTTTAAAAGTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33933805	33936175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_33933921_33935576
tx.1675	chr10	+	348	2	NNC	ENSMUSG00000035722.16	novel	6696	47	NA	NA	17034	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGCCACGGCTGAGTTTG	9587	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79850482	79851406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_79850564_79851139
tx.16750	chr7	+	753	3	NNC	ENSMUSG00000085105.3	novel	4175	2	NA	NA	-21	1194	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTATAGGAGCTTTAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33933844	33936171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_33933921_33934477_33934560_33935576
tx.16751	chr7	-	1419	3	ISM	ENSMUSG00000066568.13	ENSMUST00000205519.2	647	7	19746	-1232	2101	-43	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	635	junction_2	30.5	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTGGCCACTTTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34050819	34044130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_34045384_34047350_34047408_34050710
tx.16752	chr7	-	1887	5	ISM	ENSMUSG00000066568.13	ENSMUST00000085585.12	2944	11	35892	18	-239	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	572	junction_4	46.1573396113771	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGATCCAAAGATTTCAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34053220	34044088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_34045384_34047350_34047408_34050710_34050943_34052814_34052987_34053089
tx.16753	chr7	-	400	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085124.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGGTGGTGTACTTCTT	4572	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34163977	34155711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_34155999_34163864
tx.16755	chr7	+	289	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060402.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTATTTTTTTGAGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34443342	34446808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_34443485_34446661
tx.16757	chr7	+	1850	15	FSM	ENSMUSG00000063931.15	ENSMUST00000075068.14	1881	15	30	1	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	282	junction_1	31.3925930429327	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTCTGCCCATCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34611833	34744132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_34611880_34620753_34620938_34623805_34623934_34634106_34634171_34642063_34642112_34645011_34645074_34653982_34654028_34668929_34669006_34671081_34671129_34720389_34720459_34721117_34721196_34730767_34730917_34740095_34740281_34743114_34743307_34743655
tx.16758	chr7	+	1806	14	ISM	ENSMUSG00000063931.15	ENSMUST00000075068.14	1881	15	8949	0	8949	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	314	junction_11	25.1198311530902	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTCTGCCCATCTTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34620752	34744133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_34620938_34623805_34623934_34634106_34634171_34642063_34642112_34645011_34645074_34653982_34654028_34668929_34669006_34671081_34671129_34720389_34720459_34721117_34721196_34730767_34730917_34740095_34740281_34743114_34743307_34743655
tx.16759	chr7	-	1566	2	FSM	ENSMUSG00000056216.10	ENSMUST00000070191.10	914	2	-195	-457	-152	38	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAACAAAAAGAAAAGCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34755560	34749282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_34750358_34755069
tx.1676	chr10	-	475	3	ISM	ENSMUSG00000004667.19	ENSMUST00000143438.8	2403	4	2897	0	372	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2552	junction_2	131.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGTGCAATCCTAGAGA	8497	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79872647	79871782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_79872136_79872360_79872433_79872597
tx.16760	chr7	-	838	2	FSM	ENSMUSG00000056216.10	ENSMUST00000130491.3	4709	2	169	3702	169	191	multi-exon	FALSE	canonical	3	425	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCTTTTGTAGGAATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34755829	34749548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_34750358_34755800
tx.16761	chr7	-	424	2	ISM	ENSMUSG00000063808.15	ENSMUST00000079693.12	3065	20	36961	0	3840	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCTTCTTGATTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34980904	34975960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_34976237_34980756
tx.16762	chr7	-	3052	20	FSM	ENSMUSG00000063808.15	ENSMUST00000079693.12	3065	20	13	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_17	13.3084023611853	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCTTCTTGATTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35017852	34975960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_34976237_34980756_34980906_34982995_34983094_34984140_34984249_34986547_34986762_34987941_34988106_34988464_34988602_34991150_34991279_34993079_34993259_34994679_34994977_34996908_34997114_34998645_34998726_35001002_35001151_35002653_35002897_35005354_35005414_35006613_35006712_35007603_35007765_35008725_35008812_35009864_35010000_35017765
tx.16763	chr7	-	1919	11	ISM	ENSMUSG00000063808.15	ENSMUST00000079693.12	3065	20	20788	0	-12333	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	149	junction_2	10.8830142883302	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCTTCTTGATTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34997077	34975960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_34976237_34980756_34980906_34982995_34983094_34984140_34984249_34986547_34986762_34987941_34988106_34988464_34988602_34991150_34991279_34993079_34993259_34994679_34994977_34996908
tx.16764	chr7	+	3367	15	FSM	ENSMUSG00000030494.14	ENSMUST00000032705.13	3508	15	139	2	-21	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_1	11.3992928531124	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCTTTTTTCTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35033733	35091712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_35033837_35053156_35053273_35060404_35060534_35063041_35063118_35070133_35070212_35070539_35070665_35071729_35071897_35075584_35075773_35076398_35076556_35078989_35079110_35080761_35080957_35083393_35083471_35084062_35084210_35084751_35084908_35090179
tx.16765	chr7	-	1087	3	ISM	ENSMUSG00000030493.14	ENSMUST00000032704.12	1857	4	1480	126	1352	27	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	143	junction_2	2.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGAACATGACTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35094781	35091702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_35092517_35094399_35094553_35094661
tx.16766	chr7	-	1704	4	FSM	ENSMUSG00000030493.14	ENSMUST00000032704.12	1857	4	27	126	27	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_2	4.92160768674447	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGAACATGACTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35096234	35091702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_35092517_35094399_35094553_35094661_35094802_35095637
tx.16767	chr7	+	1467	12	NNC	ENSMUSG00000023072.15	novel	2610	19	NA	NA	6	958	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_11	40.0712175924172	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGGGTCATCCCACGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35096485	35121617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_35096632_35097414_35097522_35102434_35102594_35105042_35105221_35109005_35109118_35113568_35113598_35115841_35115885_35117066_35117286_35117643_35117787_35119671_35119723_35120299_35120455_35121492
tx.16768	chr7	+	688	4	ISM	ENSMUSG00000023072.15	ENSMUST00000125041.8	1990	5	-45	5132	7	-3769	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_1	9.10433352249844	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATGGGATTCTTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35096486	35105319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_35096632_35097414_35097522_35102434_35102594_35105042
tx.16769	chr7	+	1396	12	NNC	ENSMUSG00000023072.15	novel	2610	19	NA	NA	7	959	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_11	38.1133585396715	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGGTCATCCCACGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35096486	35121618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_35096632_35097414_35097522_35102434_35102594_35105042_35105221_35109005_35109118_35113568_35113598_35115841_35115885_35117066_35117286_35117643_35117787_35119671_35119723_35120299_35120384_35121492
tx.1677	chr10	-	1070	7	FSM	ENSMUSG00000004667.19	ENSMUST00000004786.10	1148	7	78	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2552	junction_2	153.800375667797	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGTGCAATCCTAGAGA	5593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79875551	79871782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_79872136_79872360_79872433_79872597_79872677_79872748_79872808_79873021_79873219_79874272_79874448_79875416
tx.16770	chr7	+	2607	19	NNC	ENSMUSG00000023072.15	novel	2610	19	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_12	36.9808091706169	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGCATGTTTATTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35096486	35138114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_35096632_35097414_35097522_35102434_35102594_35105042_35105221_35109005_35109118_35113568_35113598_35115841_35115885_35117066_35117286_35117643_35117787_35119671_35119723_35120299_35120384_35122724_35122833_35124081_35124198_35127024_35127206_35127624_35127793_35128581_35128724_35131942_35132033_35134898_35135069_35137752
tx.16771	chr7	+	547	2	ISM	ENSMUSG00000023072.15	ENSMUST00000150421.2	712	4	7135	-6	7135	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_1	0	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTTGCATGTTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35134881	35138112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_35135069_35137752
tx.16772	chr7	-	1573	12	FSM	ENSMUSG00000030491.17	ENSMUST00000032701.14	1620	12	31	16	-21	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_6	48.0311538018523	649	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAGAATTCTTGCTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35237139	35193052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_35193363_35193695_35193757_35200814_35200896_35203578_35203656_35204400_35204496_35208200_35208391_35210639_35210726_35211356_35211413_35221344_35221465_35223362_35223500_35228537_35228697_35236938
tx.16773	chr7	-	1447	3	FSM	ENSMUSG00000034875.6	ENSMUST00000040962.6	2298	3	844	7	-266	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	351	junction_1	2	1577	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCAAGTTGTATTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35254885	35246616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_35247549_35250878_35251087_35254578
tx.16774	chr7	-	1322	3	FSM	ENSMUSG00000034875.6	ENSMUST00000142930.2	733	3	-260	-329	-260	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	165.5	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCAAGTTGTATTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35254879	35246616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_35247549_35250878_35250968_35254578
tx.16775	chr7	+	1914	12	FSM	ENSMUSG00000034867.17	ENSMUST00000186245.7	1926	12	0	12	0	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	240	junction_4	23.6388110621019	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAGAGTGAATTTGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35285674	35308527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_35285795_35291176_35291308_35299739_35299851_35300914_35301072_35301852_35302008_35302979_35303040_35303123_35303178_35303260_35303327_35303637_35303715_35305207_35305330_35306525_35306605_35307745
tx.16776	chr7	+	252	2	ISM	ENSMUSG00000034867.17	ENSMUST00000188906.7	405	3	0	9760	0	-9760	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	311	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTCTACCGGCCTTCACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35285674	35291308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_35285795_35291176
tx.16777	chr7	+	1285	2	ISM	ENSMUSG00000034867.17	ENSMUST00000190503.7	4086	27	50253	1	17051	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	310	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTCGTGCCATTTTTGT	1636	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35335954	35338650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_35336028_35337438
tx.16778	chr7	-	624	6	FSM	ENSMUSG00000030417.16	ENSMUST00000118501.8	684	6	28	32	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1740	junction_2	86.0883267348135	4159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTTGGGTGTTTCAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35346918	35341438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_35341611_35342039_35342112_35343048_35343141_35343775_35343838_35345568_35345607_35346730
tx.16779	chr7	+	632	1	FSM	ENSMUSG00000066543.9	ENSMUST00000119541.2	555	1	-37	-40	-37	40	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	52	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGAATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35817661	35818293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_35817700_35818300
tx.1678	chr10	+	840	7	FSM	ENSMUSG00000075706.12	ENSMUST00000105372.9	959	7	119	0	119	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7423	junction_5	743.006878987148	2844	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTGTGTGTCTTTGGGTC	774	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79889440	79892273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_79889550_79890347_79890443_79890533_79890679_79890801_79890954_79891756_79891782_79891873_79891934_79892019
tx.16780	chr7	-	670	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000066543.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGAATTCTTGAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35838731	35817661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_35818313_35838712
tx.16781	chr7	+	636	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000066543.9	novel	555	1	NA	NA	-37	20481	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTTCAACATGGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35817661	35838734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_+_35818281_35838717
tx.16782	chr7	+	1652	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043456.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAACTTCTATTGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37178853	37181238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_37178931_37179528_37179678_37179812
tx.16783	chr7	+	1747	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043456.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	5.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTATTGTTCTTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37178953	37181243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_37179121_37179528_37179678_37179812
tx.16784	chr7	+	1667	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043456.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTTCTATTGTTCTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37179439	37181241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_37179678_37179812
tx.16785	chr7	-	1728	2	FSM	ENSMUSG00000030421.10	ENSMUST00000205918.2	366	2	-53	-1309	-53	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGAGCCTGCTTTATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37662006	37659416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_37661029_37661890
tx.16786	chr7	-	2369	4	ISM	ENSMUSG00000030421.10	ENSMUST00000205927.2	2630	6	4115	3	264	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	929	junction_2	18.8561808316413	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTTGAGCCTGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37664938	37659420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_37661123_37661890_37662135_37662817_37662958_37664655
tx.16787	chr7	-	1758	2	ISM	ENSMUSG00000030421.10	ENSMUST00000205927.2	2630	6	7028	82	-72	-82	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	969	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCTCCTTGTGGAACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37662025	37659499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_37661123_37661890
tx.16788	chr7	-	1523	5	ISM	ENSMUSG00000030421.10	ENSMUST00000205927.2	2630	6	2274	949	-1577	-300	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	929	junction_2	35.0669003477638	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTTTCTAAAATGTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37666779	37660366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_37661123_37661890_37662135_37662817_37662958_37664655_37665005_37666745
tx.16789	chr7	-	812	2	ISM	ENSMUSG00000002068.17	ENSMUST00000108023.10	2000	12	8385	0	220	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	871	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTGTTCTTAACTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37798574	37797408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_37798063_37798416
tx.1679	chr10	+	895	4	FSM	ENSMUSG00000003072.16	ENSMUST00000003156.15	931	4	31	5	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2420	junction_3	40.5983031938802	1061	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGAGTGTTCTGTTTCTAAC	4476	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79978179	79981647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_79978441_79979665_79979820_79981052_79981142_79981256
tx.16790	chr7	-	1841	12	NNC	ENSMUSG00000002068.17	novel	2000	12	NA	NA	-288	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	29	junction_11	244.136054738215	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTGTTCTTAACTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37806621	37797408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_37798063_37798416_37798575_37798671_37798784_37798892_37799028_37799213_37799310_37799979_37800127_37802210_37802347_37802470_37802620_37805703_37805773_37806020_37806109_37806211_37806255_37806567
tx.16791	chr7	-	1859	12	FSM	ENSMUSG00000002068.17	ENSMUST00000108023.10	2000	12	141	0	109	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	563	junction_4	98.4049652714874	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTGTTCTTAACTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37806818	37797408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_37798063_37798416_37798575_37798671_37798784_37798892_37799028_37799213_37799310_37799979_37800127_37802210_37802347_37802470_37802620_37805703_37805773_37806020_37806109_37806211_37806255_37806746
tx.16792	chr7	-	1872	12	NNC	ENSMUSG00000002068.17	novel	2000	12	NA	NA	-959	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	14	junction_11	248.089093567427	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTGTTCTTAACTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37807918	37797408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_37798063_37798416_37798575_37798671_37798784_37798892_37799028_37799213_37799310_37799979_37800127_37802210_37802347_37802470_37802620_37805703_37805773_37806020_37806109_37806211_37806255_37807833
tx.16793	chr7	+	2156	3	FSM	ENSMUSG00000054676.18	ENSMUST00000178876.10	3282	3	150	976	-45	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_1	1.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTTCATATCTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37883227	37896016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_37883325_37888030_37888202_37894128
tx.16794	chr7	-	1538	2	FSM	ENSMUSG00000074170.6	ENSMUST00000098513.6	5263	2	24	3701	24	-3701	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_1	0	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTTTGATTGTTAAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37927416	37920096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_37921583_37927364
tx.16795	chr7	-	1242	7	FSM	ENSMUSG00000030423.8	ENSMUST00000032585.8	2113	7	52	819	-2	-819	multi-exon	FALSE	canonical	3	243	junction_2	18.1567251085284	719	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTCAAATTCCTGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37970795	37962238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_37962734_37963751_37963854_37965323_37965386_37965550_37965629_37966792_37967020_37968325_37968379_37970570
tx.16796	chr7	+	1354	6	NNC	ENSMUSG00000108621.2	novel	208	2	NA	NA	5	748	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	26.9562608683029	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACGCACACTTGGGGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39193830	39215382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_39193929_39194422_39194505_39213125_39213253_39213425_39213487_39214290_39214506_39214611
tx.16798	chr7	+	770	6	FSM	ENSMUSG00000108621.2	ENSMUST00000188038.3	16021	6	-17	15268	-16	111	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	12.1819538662728	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATCCAGTAAAGCTCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39201907	39214745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_39202036_39202651_39202757_39213125_39213253_39213425_39213487_39214290_39214506_39214611
tx.16799	chr7	-	658	3	NNC	ENSMUSG00000100650.2	novel	471	3	NA	NA	22778	164	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATGAGTCACTTCCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40095886	40022561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_40022808_40091618_40091758_40095613
tx.168	chr1	+	1352	6	ISM	ENSMUSG00000026083.13	ENSMUST00000192548.6	5788	22	-5	29806	-5	-23225	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	510	junction_5	62.9558575511445	2002	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAGAACGGTTAAAAAAA	1403	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38037204	38061296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_38037406_38056886_38057013_38057105_38057191_38057945_38058616_38060674_38060893_38061244
tx.16800	chr7	-	2929	5	FSM	ENSMUSG00000056383.11	ENSMUST00000205338.2	2071	5	9	-867	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_4	16.2845785944863	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTTTTTTCTGACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41042794	41022346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_41024799_41025914_41025973_41026169_41026297_41037531_41037680_41042650
tx.16801	chr7	+	714	2	FSM	ENSMUSG00000091864.2	ENSMUST00000170929.2	906	2	198	-6	198	6	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAACTGTGCTGAATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41043319	41046877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_41043445_41046288
tx.16803	chr7	-	398	4	FSM	ENSMUSG00000074166.8	ENSMUST00000098509.5	3411	4	467	2546	4	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	6.97614984548545	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGACATCATCGCATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41148847	41130843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_41130924_41131989_41132051_41132256_41132384_41148717
tx.16805	chr7	-	2831	4	FSM	ENSMUSG00000090744.8	ENSMUST00000073410.12	1430	4	-7	-1394	-7	1394	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_3	48.9285192909003	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGTTTCTTTTTTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41210260	41193703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_41196224_41197139_41197201_41197407_41197535_41210137
tx.16806	chr7	-	2835	4	NNC	ENSMUSG00000090744.8	novel	1430	4	NA	NA	0	1391	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	110.605404730309	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTAGTCGTTTCTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41210253	41193706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_41196224_41197139_41197201_41197407_41197549_41210137
tx.16807	chr7	+	1243	6	NNC	ENSMUSG00000091474.3	novel	4004	6	NA	NA	-11	368	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	85.5453096317969	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGAGATTACCTCTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41248673	41275318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_41248825_41261232_41261350_41261794_41261922_41262579_41262676_41274146_41274257_41274676
tx.16808	chr7	+	4002	6	FSM	ENSMUSG00000091474.3	ENSMUST00000163475.3	4004	6	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_1	46.5403051128804	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGGGGTAATGAATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41248686	41277957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_41248825_41261099_41261350_41261794_41261922_41262579_41262676_41274146_41274257_41274676
tx.16809	chr7	+	985	5	FSM	ENSMUSG00000074165.11	ENSMUST00000140964.8	1169	5	-3	187	-1	-187	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	14.5150783669948	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAAGCCTTATAAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41282978	41298234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_41283119_41284103_41284135_41296906_41297042_41297242_41297304_41297616
tx.16810	chr7	+	997	5	NIC	ENSMUSG00000074165.11	novel	3177	6	NA	NA	6	-262	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	14	junction_2	14.5344418537486	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACGGGTGCCTACAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41282960	41298159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_41283119_41292756_41292857_41296906_41297042_41297242_41297304_41297616
tx.16811	chr7	+	972	4	FSM	ENSMUSG00000074165.11	ENSMUST00000045720.14	3058	4	-29	2115	4	-181	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	14.6363322667334	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTTATAAATGTCATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41282958	41298240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_41283119_41296914_41297042_41297242_41297304_41297616
tx.16812	chr7	+	1485	6	NIC	ENSMUSG00000074165.11	novel	3177	6	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_2	16.5963851485798	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAATGTGGTAAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41282954	41298421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_41283119_41284103_41284324_41292756_41292857_41296906_41297042_41297242_41297304_41297616
tx.16813	chr7	+	1143	4	NIC	ENSMUSG00000074165.11	novel	1169	5	NA	NA	-1	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	5	junction_1	18.4028983224563	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATGTGGTAAGTCCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41282978	41298423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_41283119_41296906_41297042_41297242_41297304_41297616
tx.16814	chr7	+	1265	6	FSM	ENSMUSG00000074165.11	ENSMUST00000098508.9	3775	6	-24	2534	-3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	16.2677595261302	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAACAATGTGGTAAGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41282976	41298420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_41283119_41284103_41284135_41292756_41292857_41296914_41297042_41297242_41297304_41297616
tx.16815	chr7	+	1108	6	FSM	ENSMUSG00000074165.11	ENSMUST00000100275.10	3177	6	7	2062	7	-181	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	15.7733953225043	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTTATAAATGTCATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41282961	41298240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_41283119_41284103_41284135_41292756_41292857_41296906_41297042_41297242_41297304_41297616
tx.16816	chr7	+	971	5	NIC	ENSMUSG00000074165.11	novel	3775	6	NA	NA	-3	-264	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	11	junction_2	15.3683928893037	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTACGGGTGCCTACAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41282976	41298157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_41283119_41292756_41292857_41296914_41297042_41297242_41297304_41297616
tx.16817	chr7	+	1017	5	NIC	ENSMUSG00000074165.11	novel	3775	6	NA	NA	0	-146	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_2	17.8044938147649	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCAGGGATCACTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41282979	41298275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_41283119_41284103_41284135_41296914_41297042_41297242_41297304_41297616
tx.16818	chr7	-	3770	7	FSM	ENSMUSG00000092416.3	ENSMUST00000174407.3	4069	7	-22	321	-8	-321	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_4	65.4285021140549	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAATGAACTACATATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42155172	42123130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_42126108_42126528_42126639_42137893_42137975_42138858_42138986_42139432_42139701_42150781_42150850_42155033
tx.16819	chr7	-	1165	7	NNC	ENSMUSG00000092416.3	novel	4069	7	NA	NA	-3	133	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	96	junction_4	78.7541886011292	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAGTCAGTGTACTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42155167	42125700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_42126108_42126528_42126639_42137893_42137975_42138858_42138986_42139462_42139701_42150781_42150850_42155033
tx.16820	chr7	+	368	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000108491.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	5.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCGGCTGCAGACTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42155235	42158298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_42155413_42157017_42157122_42158211
tx.16821	chr7	+	631	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000108491.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.7410927974683	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCGGCTGCAGACTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42155229	42158298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_42155413_42155960_42156218_42157017_42157122_42158211
tx.16822	chr7	+	338	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000108491.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCGGCTGCAGACTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42155249	42158298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_42155397_42157017_42157122_42158211
tx.16823	chr7	+	611	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000108491.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	10	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCGGCTGCAGACTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42155236	42158298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_42155657_42157017_42157122_42158211
tx.16824	chr7	-	400	3	NIC	ENSMUSG00000092335.2	novel	1425	4	NA	NA	-5	-903	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	30	junction_2	106	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTATTTAAAGCTCAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42241976	42230109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_42230333_42232070_42232132_42241860
tx.16825	chr7	-	516	4	FSM	ENSMUSG00000092335.2	ENSMUST00000173283.2	1425	4	-12	921	-12	-921	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_3	19.6129209111409	255	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAATGAATGTGATAAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42241983	42230127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_42230333_42232070_42232132_42232329_42232457_42241860
tx.16826	chr7	-	508	4	Fusion	ENSMUSG00000074158.10_ENSMUSG00000092335.2	novel	1425	4	NA	NA	-6	-921	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_3	104.041658323321	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAATGAATGTGATAAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42292018	42230127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr7_-_42230333_42232070_42232132_42232329_42232457_42291903
tx.16827	chr7	-	512	4	FSM	ENSMUSG00000074158.10	ENSMUST00000098503.9	1976	4	-51	1515	-10	-1515	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_3	11.7284080571728	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAATGAATGTGATAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42292022	42263442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_42263648_42265396_42265458_42265656_42265784_42291903
tx.16828	chr7	-	3197	4	FSM	ENSMUSG00000069727.6	ENSMUST00000107992.2	3148	4	-49	0	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	231	junction_3	55.1784982277215	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCGTGTCCTGTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42342191	42309528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_42312421_42314181_42314243_42314441_42314569_42342074
tx.16829	chr7	-	993	4	FSM	ENSMUSG00000092225.2	ENSMUST00000174558.2	4073	4	-12	3092	-12	-3092	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_3	34.9888871246603	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATACTGGTGAGAAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42516670	42469344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_42470028_42471782_42471844_42472041_42472168_42516547
tx.1683	chr10	+	742	2	ISM	ENSMUSG00000045193.14	ENSMUST00000105365.9	1321	7	2919	0	470	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	285	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCGCTCTGACCATTTCCC	9048	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80006530	80007489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_80006599_80006815
tx.16830	chr7	+	928	4	FSM	ENSMUSG00000064194.11	ENSMUST00000202535.4	3112	4	0	2184	0	271	multi-exon	FALSE	canonical	3	311	junction_1	65.2226954364813	401	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGAGTAATCTCCGAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42827011	42839349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_42827128_42836593_42836721_42836916_42836978_42838725
tx.16831	chr7	+	709	4	NNC	ENSMUSG00000064194.11	novel	3112	4	NA	NA	0	274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	195.192782198068	622	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTAATCTCCGAATACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42827011	42839352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_42827128_42836593_42836721_42836916_42836978_42838947
tx.16832	chr7	+	700	4	NNC	ENSMUSG00000064194.11	novel	3112	4	NA	NA	0	274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	195.192782198068	113	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTAATCTCCGAATACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42827011	42839352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_42827128_42836593_42836721_42836916_42836978_42838956
tx.16833	chr7	+	1888	4	FSM	ENSMUSG00000074887.5	ENSMUST00000206405.2	1428	4	-13	-447	-13	447	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_3	24.5356882927706	382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGGGACACTCTTTGTA	9985	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42863449	42876713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_42863572_42872998_42873126_42873324_42873386_42875135
tx.16834	chr7	+	1952	5	FSM	ENSMUSG00000074887.5	ENSMUST00000205748.2	1492	5	-13	-447	-13	447	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	99.780697031039	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGGGACACTCTTTGTA	9985	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42863449	42876713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_42863572_42870265_42870330_42872998_42873126_42873324_42873386_42875135
tx.16835	chr7	+	2784	5	Intergenic	novelGene_1181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	56.6629287982893	75	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTCAGTATTGACATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42903168	42915069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_42903292_42906867_42906982_42910109_42910237_42910431_42910493_42912710
tx.16836	chr7	-	4220	5	FSM	ENSMUSG00000012640.17	ENSMUST00000107986.9	4184	5	-36	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_4	14.2894191624432	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTGTTCATATTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42962715	42945946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_42949601_42950593_42950690_42951034_42951162_42960454_42960610_42962527
tx.16837	chr7	-	4266	5	NIC	ENSMUSG00000012640.17	novel	4363	6	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_4	30.589009464185	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTGTTCATATTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42962696	42945946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_42949601_42950593_42950690_42951034_42951162_42960454_42960675_42962527
tx.16838	chr7	+	1445	4	ISM	ENSMUSG00000039013.17	ENSMUST00000122423.8	2607	9	3906	56	3766	5	3prime_fragment	TRUE	canonical	2	6	junction_1	2.62466929133727	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGCAGCAATTCTGCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43004737	43008899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_43005054_43005323_43005424_43005724_43005861_43008006
tx.16839	chr7	+	1595	2	FSM	ENSMUSG00000118553.2	ENSMUST00000239023.2	558	2	-33	-1004	-33	1004	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTTTGTGTGGGTTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43077076	43079260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43077145_43077733
tx.1684	chr10	+	652	3	FSM	ENSMUSG00000035595.7	ENSMUST00000041882.7	678	3	0	26	0	-26	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	13	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGAGACCTCCCCCTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80008777	80010954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80009009_80010042_80010160_80010650
tx.16840	chr7	+	833	6	FSM	ENSMUSG00000004610.5	ENSMUST00000004729.5	893	6	41	19	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1745	junction_1	117.194539121923	11753	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGCCTCTTTCCTCAT	1949	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43093547	43107205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43093629_43101764_43101924_43102222_43102382_43103941_43104005_43105902_43106062_43106993
tx.16841	chr7	+	374	2	ISM	ENSMUSG00000004610.5	ENSMUST00000004729.5	893	6	12393	19	-25	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1875	junction_1	0	3070	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGCCTCTTTCCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43105899	43107205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_43106062_43106993
tx.16842	chr7	-	508	5	FSM	ENSMUSG00000108695.2	ENSMUST00000205521.2	457	5	-39	-12	-39	9	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	1.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTCTTAGCCTCTATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43168433	43160579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_43160731_43164995_43165102_43165734_43165829_43166203_43166292_43168364
tx.16843	chr7	+	573	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000004609.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTCTTGGTCTCTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43171765	43197497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_43171888_43193603_43193842_43197284
tx.16844	chr7	+	3265	4	FSM	ENSMUSG00000030469.11	ENSMUST00000058104.8	4494	4	45	1184	16	-1184	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	1.24721912892465	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTGGCTGGATAGTAATA	7312	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43229078	43241475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43229191_43233491_43233721_43235777_43235905_43238678
tx.16845	chr7	+	2431	5	FSM	ENSMUSG00000055102.16	ENSMUST00000032661.14	2362	5	-80	11	-24	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	20.1416856295594	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAGTACAAATACCCACAT	2812	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43256568	43267698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43256699_43259209_43259403_43261406_43261534_43261970_43262064_43265810
tx.16846	chr7	+	2232	4	FSM	ENSMUSG00000055102.16	ENSMUST00000120935.2	2156	4	-7	-69	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	36.4630711207319	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCACATTCATCCATTGC	2829	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43256585	43267709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43256699_43261406_43261534_43261970_43262064_43265810
tx.16847	chr7	-	441	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030472.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCATAGCCAGAATCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43296521	43294837	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_43295169_43296411
tx.16848	chr7	+	2477	3	FSM	ENSMUSG00000038888.9	ENSMUST00000038332.9	2475	3	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_1	1	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTTTTTGGTCTGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43321437	43327722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43321500_43324527_43325071_43325850
tx.16849	chr7	+	1113	6	FSM	ENSMUSG00000054046.8	ENSMUST00000066834.8	1809	6	-84	780	-84	-780	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	24.8161237907938	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTCCCCTACTGTGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43361906	43376178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43362129_43363215_43363307_43370390_43370581_43370691_43370961_43373178_43373316_43375974
tx.1685	chr10	+	483	2	ISM	ENSMUSG00000035595.7	ENSMUST00000041882.7	678	3	1203	26	1203	-26	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGAGACCTCCCCCTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80009980	80010954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_80010160_80010650
tx.16850	chr7	+	1072	6	NNC	ENSMUSG00000054046.8	novel	718	3	NA	NA	-305	-780	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_1	19.3245957266899	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTCCCCTACTGTGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43362517	43376178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_43362686_43363202_43363307_43370390_43370581_43370691_43370961_43373178_43373316_43375974
tx.16851	chr7	+	1053	6	NNC	ENSMUSG00000054046.8	novel	718	3	NA	NA	-299	-780	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	29	junction_1	15.8694675399019	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTCCCCTACTGTGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43362523	43376178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_43362686_43363215_43363307_43370390_43370581_43370691_43370961_43373178_43373316_43375974
tx.16852	chr7	+	916	5	ISM	ENSMUSG00000054046.8	ENSMUST00000066834.8	1809	6	1211	769	379	-769	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_2	9.8488578017961	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGCCTCTCTCACTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43363201	43376189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_43363307_43370390_43370581_43370691_43370961_43373178_43373316_43375974
tx.16853	chr7	+	1331	6	FSM	ENSMUSG00000067616.12	ENSMUST00000080211.12	1312	6	-19	0	-19	0	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_4	3.00665927567458	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTCTGTTGAGTGTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43424008	43428687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43424226_43425903_43425979_43426304_43426462_43426911_43427178_43427753_43427891_43428208
tx.16854	chr7	+	939	2	ISM	ENSMUSG00000067616.12	ENSMUST00000171458.2	1260	5	1681	-8	1530	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTTGAGTGTCAACTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43427433	43428690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_43427891_43428208
tx.16855	chr7	+	1368	6	FSM	ENSMUSG00000030693.11	ENSMUST00000014058.11	1373	6	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	31	junction_4	14.5134420452214	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCAATGTGTGTGCCTCT	360	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43430463	43434834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43430571_43430922_43431050_43432159_43432344_43432880_43433156_43433739_43433874_43434293
tx.16856	chr7	+	920	3	NIC	ENSMUSG00000030693.11	novel	1373	6	NA	NA	1640	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	36.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCCAATGTGTGTGCCTCT	10	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43432098	43434834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_43432344_43433739_43433874_43434293
tx.16857	chr7	+	869	5	FSM	ENSMUSG00000064023.5	ENSMUST00000085461.4	1322	5	453	0	434	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_4	3.90512483795333	585	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCGACTGTGCTTTGACC	3330	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43447453	43453246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43447557_43448047_43448208_43448488_43448752_43451503_43451638_43453037
tx.16858	chr7	+	947	5	NIC	ENSMUSG00000030713.7	novel	1895	6	NA	NA	150	-550	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTGAACCAAGTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43460867	43465233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_43460918_43461346_43461452_43461783_43461926_43462653_43462791_43464720
tx.16859	chr7	+	1460	6	NIC	ENSMUSG00000074155.3	novel	1239	5	NA	NA	-166	-6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.4	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCGTGTTGATATTTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43491228	43500599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_43491492_43491728_43491813_43494591_43494857_43496407_43496665_43496864_43496999_43500142
tx.16860	chr7	+	1338	6	NNC	ENSMUSG00000055193.5	novel	845	5	NA	NA	-2067	447	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.5298221281347	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTAAAGCAGCTGGGCAG	1015	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43581096	43589510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_43581146_43583166_43583235_43586828_43586980_43587764_43588049_43588168_43588306_43588861
tx.16861	chr7	+	1739	4	ISM	ENSMUSG00000055193.5	ENSMUST00000068625.5	845	5	3094	-394	3041	394	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.82842712474619	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACACCATTTTAGATCATTT	6176	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43586257	43589457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_43586980_43587764_43588049_43588168_43588306_43588861
tx.16862	chr7	+	1052	3	ISM	ENSMUSG00000055193.5	ENSMUST00000068625.5	845	5	4627	-455	4574	455	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCTGGGCAGCAGATACC	7709	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43587790	43589518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_43588049_43588168_43588306_43588861
tx.16863	chr7	+	953	5	FSM	ENSMUSG00000060177.7	ENSMUST00000077528.7	855	5	-95	-3	-95	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCAAGGTCTGACATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43762001	43766349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43762172_43764119_43764280_43765255_43765537_43765632_43765770_43766144
tx.16864	chr7	-	1446	6	Fusion	ENSMUSG00000062073.7_ENSMUSG00000038782.8	novel	1078	4	NA	NA	4	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.87054001888146	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCAGTGTCTGACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896115	43870437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr7_-_43871149_43871897_43872045_43875770_43875902_43880749_43880897_43881779_43881981_43896006
tx.16865	chr7	+	907	5	FSM	ENSMUSG00000063903.6	ENSMUST00000075162.5	954	5	47	0	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	17.0934929139717	382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCAAGTTCTGACATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43874830	43879042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43874949_43876944_43877105_43877951_43878239_43878334_43878472_43878837
tx.16866	chr7	+	789	4	ISM	ENSMUSG00000063903.6	ENSMUST00000206144.2	755	5	2077	-74	2077	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_1	5.90668171555645	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCAAGTTCTGACATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43876943	43879041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_43877105_43877951_43878239_43878334_43878472_43878837
tx.16867	chr7	-	1225	5	NIC	ENSMUSG00000038782.8	novel	1166	5	NA	NA	22	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.95803989154981	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGTATCTGACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896097	43879352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_43880066_43880266_43880340_43880749_43880897_43881779_43881981_43896006
tx.16868	chr7	-	1162	4	NIC	ENSMUSG00000038782.8	novel	1306	5	NA	NA	12	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1.24721912892465	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGTATCTGACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896107	43879352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_43880066_43880749_43880897_43881779_43881981_43896006
tx.16869	chr7	-	1144	4	NNC	ENSMUSG00000038782.8	novel	1306	5	NA	NA	4	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.62466929133727	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGTATCTGACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896115	43879352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_43880066_43880749_43880897_43881779_43881955_43896006
tx.16870	chr7	-	1374	6	NNC	ENSMUSG00000038782.8	novel	1166	5	NA	NA	1	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.5298221281347	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGTATCTGACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896118	43879352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_43880066_43880266_43880340_43880749_43880897_43881779_43881981_43890596_43890725_43896006
tx.16871	chr7	-	1064	4	NNC	ENSMUSG00000038782.8	novel	1306	5	NA	NA	22	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.86744175568088	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGTATCTGACTGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896097	43879350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_43880066_43880749_43880807_43881779_43881981_43896006
tx.16872	chr7	+	2231	8	NNC	ENSMUSG00000045411.17	novel	2092	7	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	337.565594532744	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGGGTGTGCTGTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896210	43901739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_43896233_43896661_43896841_43897333_43897488_43897675_43897720_43898965_43899024_43899444_43899484_43899732_43899765_43900036
tx.16873	chr7	+	2248	8	NNC	ENSMUSG00000045411.17	novel	2092	7	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	327.388554024301	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGGTGTGCTGTTTGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896210	43901741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_43896248_43896661_43896841_43897333_43897488_43897675_43897720_43898965_43899024_43899444_43899484_43899732_43899765_43900036
tx.16874	chr7	+	2081	7	NIC	ENSMUSG00000045411.17	novel	2092	7	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	54	junction_1	293.703743402921	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGGGTGTGCTGTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896208	43901739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_43896248_43896674_43896841_43897675_43897720_43898965_43899024_43899444_43899484_43899732_43899765_43900036
tx.16875	chr7	+	1901	6	FSM	ENSMUSG00000045411.17	ENSMUST00000137702.8	784	6	57	-1174	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	108	junction_1	258.311904487579	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGGGTGTGCTGTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896208	43901740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43896233_43897675_43897720_43898965_43899024_43899444_43899484_43899732_43899765_43900036
tx.16876	chr7	+	2218	8	NNC	ENSMUSG00000045411.17	novel	988	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	340.047415661344	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGGGTGTGCTGTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896210	43901739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_43896233_43896674_43896841_43897333_43897488_43897675_43897720_43898965_43899024_43899444_43899484_43899732_43899765_43900036
tx.16877	chr7	+	1913	6	FSM	ENSMUSG00000045411.17	ENSMUST00000055858.14	1982	6	65	4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_1	215.342889364845	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGGGTGTGCTGTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896210	43901739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43896248_43897675_43897720_43898965_43899024_43899444_43899484_43899732_43899765_43900036
tx.16878	chr7	+	4587	4	NIC	ENSMUSG00000045411.17	novel	2092	7	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	709	junction_2	50.8745734352852	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGGGTGTGCTGTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896210	43901739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_43899024_43899444_43899484_43899732_43899765_43900036
tx.16879	chr7	-	1155	5	ISM	ENSMUSG00000008028.16	ENSMUST00000107933.8	913	6	224	-4	224	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_3	8.55496931613434	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCTCGGCAAAGTCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44024230	44009462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44009806_44010473_44010608_44012075_44012197_44012366_44012440_44023746
tx.1688	chr10	+	381	2	FSM	ENSMUSG00000020156.17	ENSMUST00000126917.8	663	2	283	-1	283	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	518	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTGTCATAGTCATTGCA	2061	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80077654	80079735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80077720_80079419
tx.16880	chr7	-	510	2	ISM	ENSMUSG00000008028.16	ENSMUST00000150886.2	820	5	12380	-194	12380	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTTCTCTCGGCAAAGT	5473	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44010644	44009466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44009806_44010473
tx.16881	chr7	-	1104	4	FSM	ENSMUSG00000008028.16	ENSMUST00000137946.2	973	4	-75	-56	-75	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	6.79869268479038	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTTCTCTCGGCAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44024013	44009466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44009806_44010473_44010608_44012075_44012440_44023746
tx.16882	chr7	+	1178	5	ISM	ENSMUSG00000030731.14	ENSMUST00000120262.2	2096	10	10353	-267	10353	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	1.4790199457749	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCACCTGTCTCCCTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44044644	44049454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_44044955_44045062_44045235_44045326_44045460_44048509_44048578_44048959
tx.16883	chr7	+	1016	6	FSM	ENSMUSG00000038695.14	ENSMUST00000118493.8	922	6	-63	-31	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	23.6016948543955	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGCCTGGGCTCAGCTC	4771	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44117432	44121076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44117615_44117729_44117842_44118230_44118394_44119835_44119962_44120536_44120732_44120838
tx.16884	chr7	+	906	5	FSM	ENSMUSG00000038695.14	ENSMUST00000118628.8	864	5	-38	-4	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	14.4460202131937	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGCCTGGGCTCAGCTC	4769	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44117430	44121076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44117615_44118230_44118394_44119835_44119962_44120536_44120732_44120838
tx.16885	chr7	+	337	2	FSM	ENSMUSG00000038695.14	ENSMUST00000206210.2	1557	2	0	1220	0	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTGCAAGAGGTGACTGCC	4768	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44117429	44118382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44117615_44118230
tx.16886	chr7	-	1598	7	FSM	ENSMUSG00000008140.19	ENSMUST00000239015.2	1855	7	72	185	-13	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	638	junction_1	150.719386056782	1671	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCAGCTCACTTCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44145865	44139546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44140395_44141378_44141473_44141567_44141750_44141977_44142083_44142613_44142724_44144231_44144305_44145679
tx.16887	chr7	-	1688	8	FSM	ENSMUSG00000008140.19	ENSMUST00000118515.9	1662	8	-38	12	-16	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_1	346.110162950988	420	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCAGCTCACTTCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44145868	44139546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44140395_44140586_44140674_44141378_44141473_44141567_44141750_44141977_44142083_44142613_44142724_44144231_44144305_44145679
tx.16888	chr7	+	788	5	FSM	ENSMUSG00000051113.10	ENSMUST00000107927.5	862	5	68	6	-9	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.78535710713571	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGAAGCCCTGGTTCTTT	5473	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44146072	44150558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44146155_44146338_44146458_44146926_44147058_44149573_44149863_44150391
tx.16889	chr7	-	430	3	ISM	ENSMUSG00000038670.12	ENSMUST00000165208.4	3611	28	19541	18	3963	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	5.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGTGTCCATCTTTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44154539	44151140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44151267_44153060_44153248_44154422
tx.1689	chr10	+	759	8	FSM	ENSMUSG00000020153.15	ENSMUST00000020361.7	758	8	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1255	junction_1	343.259525783067	5164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTGTGTTCTGTGTGGAC	9692	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80085285	80092627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80085326_80088230_80088268_80088907_80088992_80089493_80089618_80090673_80090854_80090923_80090971_80091757_80091847_80092469
tx.16891	chr7	-	3414	27	FSM	ENSMUSG00000038644.15	ENSMUST00000049343.15	3454	27	37	3	28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	875	junction_26	151.95728923444	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTGTGTGTTGTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44198234	44182172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44182319_44182627_44182726_44182796_44182850_44183107_44183222_44183308_44183442_44183808_44183912_44183987_44184141_44184440_44184617_44185122_44185261_44185354_44185451_44187031_44187180_44187415_44187530_44187750_44187868_44188027_44188117_44188196_44188389_44188477_44188589_44188785_44188927_44189948_44190054_44190267_44190435_44190698_44190829_44190913_44190996_44191077_44191247_44191322_44191449_44191527_44191675_44192188_44192303_44192664_44192861_44198178
tx.16892	chr7	-	682	2	ISM	ENSMUSG00000060601.14	ENSMUST00000208322.2	1450	6	1775	-11	1153	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	684	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCATTCCTGAGCCCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44199894	44199044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44199556_44199723
tx.16893	chr7	-	1038	2	ISM	ENSMUSG00000030739.19	ENSMUST00000208044.2	1438	7	7018	-2	7018	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_1	0	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGGCTGCGTTTCTAATT	634	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44256531	44255226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44255788_44256054
tx.16894	chr7	-	1459	7	FSM	ENSMUSG00000030739.19	ENSMUST00000208044.2	1438	7	-19	-2	-19	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	22	junction_6	22.8837642591132	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGGCTGCGTTTCTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44263568	44255226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44255788_44256054_44256228_44257858_44257968_44260946_44261156_44262858_44262983_44263065_44263155_44263374
tx.16896	chr7	+	697	7	NIC	ENSMUSG00000066500.6	novel	704	7	NA	NA	30	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.70782512765993	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTGTACATTCCCTGTGG	218	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44358195	44369272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_44358399_44358479_44358555_44359678_44359766_44359934_44359956_44362421_44362503_44364751_44364876_44369166
tx.16897	chr7	+	1760	15	FSM	ENSMUSG00000002205.17	ENSMUST00000002275.15	1969	15	209	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_1	19.1081775420785	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGGAGAGTTCAGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44398045	44426939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44398076_44401538_44401601_44403239_44403380_44407169_44407320_44409123_44409319_44410301_44410367_44412414_44412482_44413548_44413634_44414206_44414313_44416545_44416639_44417866_44418000_44418956_44419078_44420287_44420347_44424799_44424960_44426645
tx.16898	chr7	+	1732	14	ISM	ENSMUSG00000002205.17	ENSMUST00000002275.15	1969	15	3700	0	-2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	134	junction_4	12.2624167236856	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGGAGAGTTCAGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44401536	44426939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_44401601_44403239_44403380_44407169_44407320_44409123_44409319_44410301_44410367_44412414_44412482_44413548_44413634_44414206_44414313_44416545_44416639_44417866_44418000_44418956_44419078_44420287_44420347_44424799_44424960_44426645
tx.16899	chr7	+	2494	2	FSM	ENSMUSG00000109511.2	ENSMUST00000057195.17	2722	2	226	2	14	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	986	junction_1	0	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTGCTGTGAGTATGGGT	301	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44465737	44480234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44465908_44477910
tx.169	chr1	+	410	2	ISM	ENSMUSG00000026083.13	ENSMUST00000192548.6	5788	22	21215	30209	21215	-23628	internal_fragment	FALSE	canonical	3	579	junction_1	0	427	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTCTTATACTGGTAGTG	9171	False	NA	-5	True	NA	NA	NA	38058424	38060893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_38058616_38060674
tx.1690	chr10	+	720	7	ISM	ENSMUSG00000020153.15	ENSMUST00000020361.7	758	8	2944	-1	-919	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2110	junction_6	98.5387684563233	534	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTGTGTTCTGTGTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80088229	80092627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_80088268_80088907_80088992_80089493_80089618_80090673_80090854_80090923_80090971_80091757_80091847_80092469
tx.16900	chr7	+	1513	2	ISM	ENSMUSG00000074141.14	ENSMUST00000118125.9	2275	9	-67	7331	-58	528	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	316	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44465752	44482897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_44465908_44481539
tx.16901	chr7	-	1331	10	ISM	ENSMUSG00000038520.16	ENSMUST00000047085.16	8750	17	4686	6405	-65	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_4	30.0287927673047	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGCTGGCATCAGGACAC	2618	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44493813	44490451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44490845_44490966_44491054_44491406_44491524_44491626_44491725_44492044_44492145_44492239_44492341_44492418_44492536_44492855_44492951_44493507_44493612_44493694
tx.16902	chr7	-	2172	17	FSM	ENSMUSG00000038520.16	ENSMUST00000047085.16	8750	17	173	6405	-7	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_4	26.4359485360371	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGCTGGCATCAGGACAC	7876	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44498326	44490451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44490845_44490966_44491054_44491406_44491524_44491626_44491725_44492044_44492145_44492239_44492341_44492418_44492536_44492855_44492951_44493507_44493612_44493694_44493824_44494435_44494598_44494680_44494793_44495298_44495507_44496184_44496309_44497693_44497766_44497859_44497959_44498272
tx.16903	chr7	+	1505	5	FSM	ENSMUSG00000011096.18	ENSMUST00000107882.8	1160	5	337	-682	-41	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	107.27622057101	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCGTGTTGTGTGTGAGTG	2142	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44499389	44504842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44499431_44501994_44502384_44503203_44503282_44503362_44503533_44504015
tx.16904	chr7	+	1464	4	ISM	ENSMUSG00000011096.18	ENSMUST00000107880.9	1757	5	2564	3	0	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	274	junction_1	24.1246761636296	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCGTGTTGTGTGTGAGTG	4747	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44501994	44504842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_44502384_44503203_44503282_44503362_44503533_44504015
tx.16905	chr7	+	1676	16	FSM	ENSMUSG00000002963.18	ENSMUST00000003044.14	2184	16	166	342	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_9	24.7059147214229	453	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACAGCCATCTTGCTGGG	9501	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44506748	44512074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44506979_44507586_44507634_44507876_44508174_44509146_44509227_44509311_44509370_44509500_44509609_44509783_44509856_44510286_44510336_44510412_44510484_44510570_44510664_44510741_44510839_44510923_44510986_44511072_44511183_44511617_44511706_44511789_44511852_44511922
tx.16906	chr7	+	399	4	ISM	ENSMUSG00000002963.18	ENSMUST00000208385.2	624	8	794	-58	-35	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	212	junction_2	32.4448249597169	286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACAGCCATCTTGCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44511085	44512074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_44511183_44511617_44511706_44511789_44511852_44511922
tx.16907	chr7	-	542	5	ISM	ENSMUSG00000038502.18	ENSMUST00000207416.2	657	7	283	1	178	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	386	junction_1	168.058583535623	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTGTCCCTCCCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44514081	44512491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44512619_44512802_44512869_44512958_44513157_44513806_44513912_44514035
tx.16908	chr7	-	726	4	ISM	ENSMUSG00000038502.18	ENSMUST00000046575.17	1883	12	5131	0	178	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	742	junction_3	24.5356882927706	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTGTCCCTCCCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44514081	44512491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44512869_44512958_44513157_44513806_44513912_44514035
tx.16909	chr7	-	194	2	ISM	ENSMUSG00000038502.18	ENSMUST00000208687.2	631	3	528	-1	528	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	386	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTGTCCCTCCCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44512869	44512491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44512619_44512802
tx.1691	chr10	-	941	6	FSM	ENSMUSG00000020150.14	ENSMUST00000105363.8	988	6	44	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_3	3.91918358845308	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGTGGGTTGGTTGGCAGT	9293	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80096802	80093987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80094292_80094773_80094885_80095010_80095079_80095434_80095499_80095601_80095748_80096554
tx.16910	chr7	-	510	2	ISM	ENSMUSG00000038502.18	ENSMUST00000207303.2	2932	5	3107	0	306	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	802	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTGTCCCTCCCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44513091	44512491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44512869_44512958
tx.16911	chr7	-	389	3	FSM	ENSMUSG00000038502.18	ENSMUST00000208687.2	631	3	243	-1	243	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	386	junction_1	208	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTGTCCCTCCCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44513154	44512491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44512619_44512802_44512869_44512958
tx.16912	chr7	-	630	6	ISM	ENSMUSG00000038502.18	ENSMUST00000207416.2	657	7	103	1	-2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	386	junction_1	163.728311540796	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTGTCCCTCCCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44514261	44512491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44512619_44512802_44512869_44512958_44513157_44513806_44513912_44514035_44514094_44514185
tx.16913	chr7	-	814	5	ISM	ENSMUSG00000038502.18	ENSMUST00000046575.17	1883	12	4951	0	-2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	742	junction_3	35.6124978062477	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTGTCCCTCCCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44514261	44512491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44512869_44512958_44513157_44513806_44513912_44514035_44514094_44514185
tx.16914	chr7	-	1959	15	ISM	ENSMUSG00000002968.10	ENSMUST00000003049.8	2619	18	6448	1	-1554	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	744	junction_9	65.4079817884075	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCGGCTCCCGTGACTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44535688	44528808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44528939_44529350_44529529_44529675_44529895_44529990_44530063_44530346_44530536_44532182_44532291_44532391_44532450_44532522_44532609_44533542_44533672_44533986_44534181_44534256_44534345_44534503_44534635_44534762_44534926_44535207_44535329_44535595
tx.16915	chr7	-	265	2	ISM	ENSMUSG00000002968.10	ENSMUST00000207278.2	2287	16	12357	-5	1246	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	805	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCGGCTCCCGTGACTGA	4819	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44529486	44528809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44528939_44529350
tx.16916	chr7	-	2228	17	NIC	ENSMUSG00000002968.10	novel	2619	18	NA	NA	-4	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	109	junction_3	203.468018064265	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCGGCTCCCGTGACTGA	6972	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44541819	44528809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_44528939_44529350_44529529_44529675_44529895_44530346_44530536_44532182_44532291_44532391_44532450_44532522_44532609_44533542_44533672_44533986_44534181_44534256_44534345_44534503_44534635_44534762_44534926_44535207_44535329_44535595_44535695_44541206_44541332_44541522_44541569_44541654
tx.16917	chr7	-	2303	18	FSM	ENSMUSG00000002968.10	ENSMUST00000003049.8	2619	18	314	2	3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	744	junction_9	66.5493546850497	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCGGCTCCCGTGACTGA	6969	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44541822	44528809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44528939_44529350_44529529_44529675_44529895_44529990_44530063_44530346_44530536_44532182_44532291_44532391_44532450_44532522_44532609_44533542_44533672_44533986_44534181_44534256_44534345_44534503_44534635_44534762_44534926_44535207_44535329_44535595_44535695_44541206_44541332_44541522_44541569_44541654
tx.16918	chr7	-	3339	23	NNC	ENSMUSG00000060279.15	novel	3449	24	NA	NA	15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	144.442358888666	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTATTGACTGCCCACCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44578871	44549796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_44550240_44550410_44550546_44550660_44550731_44550807_44550925_44551014_44551137_44552165_44552263_44552397_44552481_44552567_44552625_44553164_44553326_44553412_44553581_44553660_44553893_44554076_44554175_44555108_44555292_44555494_44555633_44555734_44555904_44556257_44556409_44557147_44557257_44558643_44558746_44559122_44559253_44565264_44565459_44565586_44565730_44565825_44565895_44578703
tx.16919	chr7	+	778	2	FSM	ENSMUSG00000087138.2	ENSMUST00000152595.2	704	2	-75	1	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCGGCTACAGACTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44636321	44641751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44636795_44641446
tx.1692	chr10	+	498	4	FSM	ENSMUSG00000063457.15	ENSMUST00000068408.14	500	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5732	junction_1	1157.99510649513	8337	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGGGTTTTTGTTTTTTT	6344	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80128288	80129948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80128318_80128608_80128695_80129475_80129711_80129800
tx.16920	chr7	+	1569	8	FSM	ENSMUSG00000003184.16	ENSMUST00000003284.16	2031	8	4	458	4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	81	junction_5	29.0601066054199	231	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTGCTGTCGACTGCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44647075	44651814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44647333_44648128_44648302_44649315_44649488_44649577_44649649_44649795_44649971_44650068_44650447_44651096_44651213_44651587
tx.16921	chr7	+	925	6	FSM	ENSMUSG00000038387.10	ENSMUST00000044111.10	995	6	69	1	-53	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	253	junction_4	17.1860408471527	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGAGATGCTTTTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44667453	44671070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44667593_44669523_44669612_44669726_44669830_44669913_44670023_44670510_44670630_44670703
tx.16922	chr7	-	1218	6	FSM	ENSMUSG00000007837.12	ENSMUST00000209920.2	876	6	-23	-319	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	10.7962956610126	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCTTTCTGGGCGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44711152	44703007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44703622_44703942_44704072_44706166_44706309_44709395_44709436_44710164_44710317_44711011
tx.16923	chr7	-	1402	7	FSM	ENSMUSG00000007837.12	ENSMUST00000007981.9	1295	7	-78	-29	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_5	9.01233722306385	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCTTTCTGGGCGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44711154	44703007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44703622_44703942_44704072_44706166_44706309_44709395_44709436_44709628_44709811_44710164_44710317_44711011
tx.16924	chr7	+	1107	9	FSM	ENSMUSG00000003421.14	ENSMUST00000003513.11	1814	9	16	691	-1	103	multi-exon	FALSE	canonical	3	417	junction_1	63.7582102556212	616	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCGGCGTGAACCTGTGGG	3101	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44711895	44726943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44711956_44722913_44722989_44723405_44723512_44724029_44724112_44725492_44725653_44725733_44725853_44725975_44726164_44726244_44726354_44726735
tx.16925	chr7	+	949	9	FSM	ENSMUSG00000003421.14	ENSMUST00000107829.9	972	9	48	-25	4	25	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_6	164.802912595621	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGCGACAGAAGGAGTGGG	3106	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44711900	44726865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44711956_44722913_44722989_44723405_44723512_44724029_44724112_44725492_44725653_44725733_44725853_44726050_44726164_44726244_44726354_44726735
tx.16926	chr7	+	672	5	ISM	ENSMUSG00000003421.14	ENSMUST00000003513.11	1814	9	13625	791	-327	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	428	junction_4	34.97409755805	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGGCGCCTCATTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44725504	44726843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_44725653_44725733_44725853_44725975_44726164_44726244_44726354_44726735
tx.16927	chr7	-	516	4	ISM	ENSMUSG00000003429.12	ENSMUST00000003521.10	661	5	886	5	-25	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18027	junction_3	5503.46620069772	14607	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACAGGCTTGGAGTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44772977	44771807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44771983_44772252_44772383_44772586_44772663_44772842
tx.16928	chr7	-	589	5	FSM	ENSMUSG00000003429.12	ENSMUST00000003521.10	661	5	67	5	-21	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	18027	junction_3	5229.01092463957	252020	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACAGGCTTGGAGTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44773796	44771807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44771983_44772252_44772383_44772586_44772663_44772842_44772975_44773720
tx.16929	chr7	-	816	8	FSM	ENSMUSG00000074129.15	ENSMUST00000209626.2	734	8	-1	-81	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1166	junction_7	5527.98350879137	4418	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGCCTGGCCTGCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44778160	44775345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44775457_44775538_44775662_44775901_44775962_44776132_44776219_44776414_44776517_44776632_44776699_44776919_44776993_44777965
tx.1693	chr10	+	470	3	FSM	ENSMUSG00000063457.15	ENSMUST00000062674.7	572	3	129	-27	129	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7729	junction_2	373	4742	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGGGTTTTTGTTTTTTT	6663	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80128607	80129948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80128695_80129475_80129711_80129800
tx.16930	chr7	-	658	8	FSM	ENSMUSG00000074129.15	ENSMUST00000150350.9	1047	8	25	364	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11064	junction_7	2170.0381732747	206139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGCCTGGCCTGCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44778160	44775345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44775457_44775538_44775662_44775901_44775962_44776132_44776219_44776414_44776517_44776632_44776699_44776919_44776993_44778123
tx.16931	chr7	+	1066	10	FSM	ENSMUSG00000003423.16	ENSMUST00000210139.2	1077	10	11	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_1	50.5151242478703	1348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCCAGACAATGATGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44803737	44809489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44803845_44805729_44805824_44806155_44806223_44807026_44807207_44807864_44807927_44808010_44808093_44808413_44808544_44808676_44808753_44809104_44809249_44809365
tx.16932	chr7	+	1058	10	NNC	ENSMUSG00000003423.16	novel	1077	10	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	125.1727694917	79	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCCAGACAATGATGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44803737	44809489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_44803845_44805729_44805824_44806155_44806223_44807026_44807207_44807872_44807927_44808010_44808093_44808413_44808544_44808676_44808753_44809104_44809249_44809365
tx.16933	chr7	+	1176	10	FSM	ENSMUSG00000003423.16	ENSMUST00000085375.13	1185	10	10	-1	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_1	85.8518678298646	437	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCCAGACAATGATGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44803747	44809489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44803965_44805729_44805824_44806155_44806223_44807026_44807207_44807864_44807927_44808010_44808093_44808413_44808544_44808676_44808753_44809104_44809249_44809365
tx.16934	chr7	-	451	2	ISM	ENSMUSG00000030792.9	ENSMUST00000210741.2	662	4	1623	0	1623	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCAATCTCCTTTTGGTAT	9989	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44859613	44856948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44857323_44859536
tx.16935	chr7	+	2092	12	FSM	ENSMUSG00000030796.18	ENSMUST00000033060.14	2140	12	38	10	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_1	60.1724793633042	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGCCAAAAACCCAAAGGGG	5468	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44865214	44883058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44865257_44866636_44866875_44867504_44867570_44868567_44868631_44869861_44869970_44870066_44870126_44873104_44873170_44875076_44875220_44878062_44878237_44880732_44880895_44881606_44881760_44882238
tx.16936	chr7	+	2053	11	FSM	ENSMUSG00000030796.18	ENSMUST00000107801.10	3396	11	1359	-16	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_7	23.9883304963059	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGCCAAAAACCCAAAGGGGA	6888	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44866634	44883059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44866875_44867504_44867570_44868567_44868631_44869861_44869970_44870066_44870126_44873104_44873170_44875076_44875220_44878062_44878237_44880732_44880895_44881606_44881760_44882238
tx.16937	chr7	+	1274	4	ISM	ENSMUSG00000030796.18	ENSMUST00000097216.5	1948	11	11465	-1	-2633	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	318	junction_1	32.2524762184584	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCAAAAACCCAAAGGGGAT	8890	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44878099	44883060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_44878237_44880732_44880895_44881606_44881760_44882238
tx.16938	chr7	-	1214	8	FSM	ENSMUSG00000030798.16	ENSMUST00000098461.10	1227	8	12	1	12	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	15.6426940630769	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTTGGTAAAA	4431	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44888252	44883056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44883403_44884107_44884192_44884830_44885068_44885538_44885644_44886425_44886501_44886583_44886709_44887923_44887997_44888083
tx.16939	chr7	+	1256	5	NNC	ENSMUSG00000094152.6	novel	1241	4	NA	NA	-83	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_2	5.35607132140714	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGCGTGAGGCTCGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44917490	44922789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_44917623_44917871_44918074_44918141_44918357_44921914_44922078_44922245
tx.1694	chr10	+	213	2	ISM	ENSMUSG00000063457.15	ENSMUST00000062674.7	572	3	1167	-27	1167	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7729	junction_1	0	4527	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGGGTTTTTGTTTTTTT	7701	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80129645	80129948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_80129711_80129800
tx.16940	chr7	+	1321	4	FSM	ENSMUSG00000094152.6	ENSMUST00000210163.2	1241	4	-80	0	-80	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	2.05480466765633	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGCGTGAGGCTCGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44917493	44922789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_44917623_44917871_44918357_44921914_44922078_44922245
tx.16941	chr7	-	810	4	FSM	ENSMUSG00000038260.11	ENSMUST00000210639.2	625	4	-34	-151	-34	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_2	7.25718035235908	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCACATGCTTGGCTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44954662	44952776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_44953117_44954032_44954139_44954218_44954292_44954371
tx.16942	chr7	-	762	5	ISM	ENSMUSG00000038260.11	ENSMUST00000211743.2	3673	23	28258	-5	-23	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_4	15.2151240547029	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCACATGCTTGGCTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44954822	44952776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44953117_44954032_44954139_44954218_44954292_44954371_44954505_44954712
tx.16943	chr7	+	272	2	ISM	ENSMUSG00000038239.12	ENSMUST00000085351.7	2411	6	3259	-1	3202	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTCCCGAGTGGGGTG	1059	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44987972	44988399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_44988150_44988304
tx.16944	chr7	-	1161	3	ISM	ENSMUSG00000003863.19	ENSMUST00000211098.2	1467	4	389	-1	-9	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	0.5	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTAGCTTTTGTTCTTAA	7375	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44990195	44988549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44989442_44989612_44989685_44989998
tx.16945	chr7	-	744	5	ISM	ENSMUSG00000003872.10	ENSMUST00000003971.10	735	6	267	0	-1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_1	2.06155281280883	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGAGTGTCTTGTGTGTCTG	8209	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45019740	45017314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_45017423_45017727_45017892_45018564_45018775_45019338_45019411_45019550
tx.16946	chr7	-	755	6	FSM	ENSMUSG00000003872.10	ENSMUST00000003971.10	735	6	-20	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	1.93907194296653	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGAGTGTCTTGTGTGTCTG	7922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45020027	45017314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45017423_45017727_45017892_45018564_45018775_45019338_45019411_45019550_45019670_45019945
tx.16947	chr7	-	1397	5	NIC	ENSMUSG00000003872.10	novel	735	6	NA	NA	11	0	intron_retention	FALSE	canonical	2	8	junction_1	1.22474487139159	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGAGTGTCTTGTGTGTCTG	7953	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45019996	45017314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_45017423_45017727_45018775_45019338_45019411_45019550_45019670_45019945
tx.16948	chr7	+	1458	3	FSM	ENSMUSG00000074121.4	ENSMUST00000058879.8	1963	3	-18	523	-18	-523	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	4	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGTGTTGTGGTATGTAC	619	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45063100	45066080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_45063213_45064154_45064279_45064858
tx.16949	chr7	+	1786	3	NNC	ENSMUSG00000074121.4	novel	989	3	NA	NA	-28	-523	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	11	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGTGTTGTGGTATGTAC	818	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45063299	45066080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_45063740_45064154_45064279_45064858
tx.1695	chr10	-	366	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020135.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGCCTGTTTCTGAGCCCTG	481	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80140891	80138618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_80138804_80140710
tx.16950	chr7	+	894	3	ISM	ENSMUSG00000003865.17	ENSMUST00000003964.17	3678	16	-5	18138	-5	-13346	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_1	16.5	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCAGTTTCATTTCCTCTA	1022	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45084262	45087905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_45084595_45085955_45086138_45087525
tx.16951	chr7	+	3710	16	FSM	ENSMUSG00000003865.17	ENSMUST00000003964.17	3678	16	-32	0	-32	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	89	junction_1	61.1041369757855	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGGCTGGACATAAGCTC	995	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45084235	45106043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_45084595_45085955_45086138_45087525_45087718_45088902_45089089_45089328_45089474_45091846_45091965_45092339_45092461_45092951_45093059_45094055_45094116_45094202_45094282_45097321_45097436_45097676_45097804_45100986_45101083_45101174_45101339_45104245_45104327_45104464
tx.16952	chr7	+	816	2	ISM	ENSMUSG00000003865.17	ENSMUST00000003964.17	3678	16	1684	17888	1651	-13096	internal_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGGATGCCTTAGGACAAA	2711	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45085951	45088155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_45086138_45087525
tx.16953	chr7	+	2252	7	NIC	ENSMUSG00000003865.17	novel	480	5	NA	NA	-26	16	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	13	junction_1	83.740505266103	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTTGTGGTGTGGTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45097002	45106059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_45097078_45097321_45097436_45097676_45097804_45100986_45101083_45101174_45101339_45104245_45104327_45104464
tx.16954	chr7	+	2169	6	ISM	ENSMUSG00000003865.17	ENSMUST00000003964.17	3678	16	13046	0	159	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_3	11.2605506082074	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGGCTGGACATAAGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45097313	45106043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_45097436_45097676_45097804_45100986_45101083_45101174_45101339_45104245_45104327_45104464
tx.16955	chr7	-	923	4	FSM	ENSMUSG00000050708.17	ENSMUST00000094434.13	968	4	45	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	56898	junction_1	7359.57672393974	42119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTGTTTTTTCTATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45109263	45107367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45107708_45107958_45108085_45108507_45108655_45108953
tx.16956	chr7	-	1118	3	ISM	ENSMUSG00000030824.18	ENSMUST00000211765.2	4853	13	15616	2644	4048	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	497	junction_1	23.5	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCCTCTTCCAAGCCCTG	9967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45144214	45142525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_45143374_45143540_45143638_45144041
tx.16957	chr7	-	2199	13	FSM	ENSMUSG00000030824.18	ENSMUST00000211765.2	4853	13	6	2648	6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	464	junction_7	37.8483817355511	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCTGCCCTCTTCCAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45159824	45142529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45143374_45143540_45143638_45144041_45144213_45144476_45144570_45144645_45144739_45144978_45145038_45147823_45147915_45148148_45148335_45149225_45149330_45151006_45151140_45152601_45152710_45159129_45159272_45159746
tx.16958	chr7	+	931	6	ISM	ENSMUSG00000023467.19	ENSMUST00000107762.10	1883	14	5879	-5	3777	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_5	28.8679753360017	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGTTAGTGTACAAAATA	5061	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45169008	45172023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_45169268_45170163_45170279_45170366_45170466_45171267_45171440_45171646_45171773_45171863
tx.16959	chr7	+	802	5	ISM	ENSMUSG00000023467.19	ENSMUST00000085331.14	1525	10	4986	0	3780	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_2	4.38748219369606	322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTTCTGTGCGTTTGGA	5064	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45169011	45171806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_45169268_45170163_45170279_45170366_45170466_45171267_45171440_45171646
tx.1696	chr10	-	1196	2	FSM	ENSMUSG00000020133.9	ENSMUST00000020341.9	1649	2	-1	454	-1	-454	multi-exon	FALSE	canonical	3	349	junction_1	0	385	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTTCTCCCTTAAGCCA	8716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80156372	80154541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80155382_80156016
tx.16960	chr7	-	1610	2	FSM	ENSMUSG00000040435.13	ENSMUST00000167273.2	2809	2	1204	-5	-1173	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	424	junction_1	0	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTACGTGTGTTCTTTAT	5187	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45174366	45172340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45172747_45173162
tx.16961	chr7	-	254	2	ISM	ENSMUSG00000040435.13	ENSMUST00000042105.11	2333	3	44	2451	44	-2446	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	356	junction_1	0	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCCCAGCATGTCCTGCA	3905	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45175648	45174791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_45174816_45175418
tx.16962	chr7	-	763	4	NNC	ENSMUSG00000110144.2	novel	530	2	NA	NA	-9802	52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.4142135623731	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGGTGCAATCATTACTG	1288	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45210841	45199905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_45200412_45208810_45208870_45210564_45210704_45210782
tx.16963	chr7	+	1372	9	FSM	ENSMUSG00000030825.20	ENSMUST00000107752.12	1400	9	26	2	-18	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_3	205.455591308682	273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTTGGAGTGGTCGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45204342	45216743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_45204491_45205478_45205518_45205736_45205820_45207031_45207099_45208804_45208897_45212338_45212444_45215378_45215447_45215543_45215641_45216070
tx.16964	chr7	+	1216	5	ISM	ENSMUSG00000030825.20	ENSMUST00000210997.2	1315	9	3156	-1	-6	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	557	junction_3	22.2864869371554	1182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTTGGAGTGGTCGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45208623	45216743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_45208897_45212338_45212444_45215378_45215447_45215543_45215641_45216070
tx.16965	chr7	+	818	3	NIC	ENSMUSG00000044562.13	novel	3202	12	NA	NA	8857	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	49	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACTTGTCAAGATTTGG	3281	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45285768	45288516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_45286006_45286143_45286317_45288108
tx.16966	chr7	+	652	3	ISM	ENSMUSG00000044562.13	ENSMUST00000057927.10	3202	12	9309	1	9309	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_2	2	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACTTGTCAAGATTTGG	3733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45286220	45288516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_45286317_45287293_45287442_45288108
tx.16967	chr7	-	485	2	NNC	ENSMUSG00000110357.2	novel	1542	2	NA	NA	-5673	-2965	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGAGGTGGTCTATCTCC	4349	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45293862	45288068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_45288304_45293612
tx.16968	chr7	-	2984	6	FSM	ENSMUSG00000057342.16	ENSMUST00000072836.7	2968	6	3	-19	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_5	32.4678302324008	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGACATCCCTTTCAGTTA	5960	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45364628	45359689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45361236_45361481_45361598_45361680_45361776_45361879_45362030_45362683_45363153_45364020
tx.16969	chr7	-	2684	7	FSM	ENSMUSG00000057342.16	ENSMUST00000107737.11	3548	7	64	800	-36	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_6	23.5141801189552	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCGACATCCCTTTCAGTT	3226	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45367362	45359690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45361236_45361481_45361598_45361680_45361776_45361879_45362030_45362683_45363153_45366416_45366488_45367124
tx.1697	chr10	+	1936	5	FSM	ENSMUSG00000035504.17	ENSMUST00000105357.2	2127	5	191	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	489	junction_4	47.9921868641136	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGTGTGTCCGCTAAGCTG	7218	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80165977	80172275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80166180_80169336_80169431_80169522_80169662_80169799_80169969_80170943
tx.16970	chr7	+	644	6	FSM	ENSMUSG00000059070.17	ENSMUST00000072503.13	679	6	31	4	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6098	junction_1	973.20817916826	130175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCTCTGTGTTCATTCA	5953	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45367525	45370255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_45367564_45368676_45368764_45368952_45369061_45369343_45369443_45369717_45369912_45370137
tx.16971	chr7	+	287	2	FSM	ENSMUSG00000059070.17	ENSMUST00000209723.2	450	2	164	-1	164	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7563	junction_1	0	5989	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCCTCTGTGTTCATTCA	8170	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45369742	45370255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_45369912_45370137
tx.16972	chr7	+	1189	9	NIC	ENSMUSG00000062044.17	novel	4997	15	NA	NA	-382	799	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.21834929310112	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCGTGGCCTCAACCTTGA	1835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45436789	45442809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_45436895_45437069_45437179_45437327_45437447_45440298_45440387_45440718_45440868_45441734_45441820_45441900_45442023_45442114_45442265_45442547
tx.16973	chr7	-	721	6	ISM	ENSMUSG00000003269.18	ENSMUST00000211783.2	1983	11	3265	-94	275	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_4	129.55246041662	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCAGATGCCCTCATTT	6860	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45460037	45457010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_45457273_45457356_45457512_45457599_45457672_45457796_45457874_45459550_45459663_45459994
tx.16974	chr7	-	569	4	ISM	ENSMUSG00000003269.18	ENSMUST00000211783.2	1983	11	5426	-94	2436	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	463	junction_2	13.5973853695808	157	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCAGATGCCCTCATTT	9021	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45457876	45457010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_45457273_45457356_45457512_45457599_45457672_45457796
tx.16975	chr7	-	1550	12	FSM	ENSMUSG00000003269.18	ENSMUST00000107729.10	2519	12	19	950	-5	22	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_4	92.1110540651432	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCAGATGCCCTCATTT	3181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45463716	45457010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45457273_45457356_45457512_45457599_45457672_45457796_45457874_45459550_45459663_45459994_45460144_45460277_45460391_45460952_45461034_45461603_45461723_45462270_45462338_45462432_45462581_45463521
tx.16976	chr7	-	1903	7	FSM	ENSMUSG00000053801.19	ENSMUST00000107723.9	1898	7	-8	3	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	447	junction_1	34.207292919623	389	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACAAGTCCTCTGAGCTT	8626	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45480221	45474653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45475518_45476564_45476763_45476949_45477093_45477203_45477418_45479405_45479569_45479715_45479834_45480018
tx.16977	chr7	+	1541	5	FSM	ENSMUSG00000002778.15	ENSMUST00000002855.14	1599	5	52	6	-1	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	208	junction_1	16.5378354085412	1666	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTCTTTGCTGTTCCCTG	3996	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45522247	45533150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_45522526_45523182_45523284_45523466_45523626_45530923_45531177_45532400
tx.16978	chr7	-	820	4	FSM	ENSMUSG00000040231.17	ENSMUST00000120299.4	722	4	-37	-61	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	18.0616229121921	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTCCTGTCTGTTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45546131	45536268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45536550_45538035_45538274_45545114_45545316_45546031
tx.16979	chr7	+	570	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040212.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTGCTTTCAGATCTCAT	4	True	NA	89	True	NA	NA	NA	45566919	45567963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_45567034_45567507
tx.1698	chr10	+	561	4	FSM	ENSMUSG00000035504.17	ENSMUST00000153167.2	848	4	-51	338	2	-338	multi-exon	FALSE	canonical	3	516	junction_3	38.0029238641216	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGAGCATTGGACCTAGC	7221	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80165980	80169928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80166180_80169336_80169431_80169522_80169662_80169799
tx.16980	chr7	-	570	4	ISM	ENSMUSG00000040212.13	ENSMUST00000164119.3	784	5	446	-1	-285	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_2	6.68331255192114	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGACTCGGCTCCTCTTC	5357	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45569829	45567450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_45567660_45568741_45568883_45569358_45569462_45569712
tx.16981	chr7	+	2639	2	NNC	ENSMUSG00000040189.19	novel	1078	5	NA	NA	7	2996	intron_retention	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGGTGTC	3140	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45573646	45577487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_45574014_45575215
tx.16982	chr7	-	325	2	FSM	ENSMUSG00000030834.8	ENSMUST00000210962.2	257	2	-68	0	-68	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATTCCTCATCCTAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45622811	45616982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45617145_45622648
tx.16983	chr7	+	1222	7	ISM	ENSMUSG00000030835.7	ENSMUST00000033121.7	4257	31	38836	4	-10111	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	300	junction_1	20.2271819314725	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGCATAGTGTGGGGTGC	717	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45721957	45733632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_45722064_45725498_45725583_45727449_45727561_45728914_45729017_45730818_45730939_45732658_45732752_45733026
tx.16984	chr7	-	904	6	ISM	ENSMUSG00000030838.21	ENSMUST00000176371.2	1865	20	28479	-297	-65	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.56070170039655	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGCTTCTGGGGGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45851259	45844777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_45845159_45846619_45846676_45847776_45847887_45850397_45850498_45850792_45850847_45851056
tx.16986	chr7	-	1441	11	FSM	ENSMUSG00000030839.13	ENSMUST00000033127.12	1465	11	7	17	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_10	7.18609768928867	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGATTCCCTGGAGAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46289224	46092594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_46092960_46165091_46165129_46240030_46240198_46264041_46264201_46268119_46268183_46270984_46271099_46275632_46275694_46282083_46282179_46283178_46283335_46284844_46284981_46289136
tx.16987	chr7	-	1513	12	FSM	ENSMUSG00000006763.15	ENSMUST00000143082.4	4728	12	19	3196	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	340	junction_6	40.4362573576105	876	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGCATCGGGATGATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46360085	46338727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_46338880_46339226_46339320_46342202_46342400_46348787_46348977_46349059_46349143_46351204_46351386_46351825_46351942_46352044_46352105_46353437_46353518_46356416_46356501_46358287_46358402_46359921
tx.16988	chr7	-	499	3	FSM	ENSMUSG00000040026.9	ENSMUST00000211660.2	494	3	-4	-1	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_2	3.5	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTCGCTGTCACTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46363177	46361421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_46361689_46362012_46362152_46363084
tx.16989	chr7	-	463	3	NNC	ENSMUSG00000040026.9	novel	555	4	NA	NA	-14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	9.5	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTCGCTGTCACTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46363187	46361421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_46361689_46362012_46362152_46363130
tx.1699	chr10	+	1996	6	FSM	ENSMUSG00000035504.17	ENSMUST00000186864.7	2015	6	20	-1	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	273.806939283868	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGTGTGTCCGCTAAGCTG	7239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80165998	80172275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80166180_80169336_80169431_80169522_80169662_80169799_80169969_80170546_80170628_80170943
tx.16990	chr7	-	924	3	ISM	ENSMUSG00000014418.17	ENSMUST00000138480.2	839	6	4073	-313	3516	52	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_1	4	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTTTCCAGTATGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46414371	46410350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_46410875_46412366_46412638_46414242
tx.16991	chr7	+	1586	8	FSM	ENSMUSG00000063229.16	ENSMUST00000048209.16	1588	8	2	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6684	junction_1	674.726490316405	10510	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTCTGCTCTTTTATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46495264	46505051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_46495342_46497019_46497170_46498396_46498515_46499601_46499776_46500308_46500483_46501300_46501419_46503406_46503531_46504400
tx.16992	chr7	-	1434	10	NIC	ENSMUSG00000014402.16	novel	1949	10	NA	NA	-10	214	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	163	junction_7	331.9070969227	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCTTTCTTGGACTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46569702	46539119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_46539453_46540669_46540910_46542105_46542309_46550774_46550867_46553269_46553337_46556798_46556926_46558652_46558740_46560492_46560559_46563125_46563211_46569568
tx.16993	chr7	-	1356	8	NIC	ENSMUSG00000014402.16	novel	1949	10	NA	NA	10	213	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	40	junction_3	409.120460280842	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTCTTTCTTGGACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46569707	46539120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_46539453_46540669_46540910_46542105_46542309_46556798_46556926_46558652_46558817_46560492_46560559_46563125_46563211_46569568
tx.16994	chr7	-	1513	10	FSM	ENSMUSG00000014402.16	ENSMUST00000014546.15	1949	10	12	424	12	213	multi-exon	FALSE	canonical	3	992	junction_2	86.0289931030289	767	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTCTTTCTTGGACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46569705	46539120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_46539453_46540669_46540910_46542105_46542309_46550774_46550867_46553269_46553337_46556798_46556926_46558652_46558817_46560492_46560559_46563125_46563211_46569568
tx.16995	chr7	-	1650	11	ISM	ENSMUSG00000043262.17	ENSMUST00000094398.13	4616	12	54	3844	-1	-3521	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	49	junction_9	11.4699607671517	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGTATTGTGTGTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46608221	46576807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_46577293_46580736_46580801_46587638_46587813_46589880_46590052_46593535_46593639_46594978_46595098_46597660_46597797_46600575_46600740_46604771_46604838_46605365_46605451_46608138
tx.16996	chr7	+	329	2	FSM	ENSMUSG00000109118.2	ENSMUST00000208046.2	334	2	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGGTATACCTGAGTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46658297	46658756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_46658342_46658471
tx.16997	chr7	+	1814	3	FSM	ENSMUSG00000010307.8	ENSMUST00000010451.8	1831	3	15	2	15	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	1	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGGCTTCCTGACTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46700363	46704523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_46700550_46702597_46702863_46703160
tx.16998	chr7	-	504	2	FSM	ENSMUSG00000046179.18	ENSMUST00000136142.2	1913	2	-37	1446	0	-1446	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTATTTTTAAAGTCCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48530789	48530026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_48530150_48530408
tx.16999	chr7	+	1296	6	NIC	ENSMUSG00000039745.9	novel	1418	6	NA	NA	-10	20	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	26	junction_1	93.7861397009174	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTGTGTTGTTCTAGTT	9870	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49408852	49423743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_49408894_49409289_49409542_49411807_49411916_49420557_49420696_49422323_49422386_49423048
tx.17	chr1	-	556	3	NNC	ENSMUSG00000097797.7	novel	1193	3	NA	NA	-50	34771	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTTTTGTTGGTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7468143	7384858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_7385157_7452250_7452307_7467941
tx.170	chr1	+	390	3	ISM	ENSMUSG00000026083.13	ENSMUST00000192548.6	5788	22	21287	29805	21287	-23224	internal_fragment	FALSE	canonical	3	510	junction_2	34.5	781	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAACGGTTAAAAAAAG	9243	False	NA	67	True	NA	NA	NA	38058496	38061297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_38058616_38060674_38060893_38061244
tx.1700	chr10	-	1050	8	FSM	ENSMUSG00000043822.19	ENSMUST00000105352.2	989	8	-59	-2	-59	2	multi-exon	TRUE	canonical	2	6	junction_5	4.16986271980755	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGCCTCCCCTCAGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80184305	80178570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80178855_80179432_80179561_80180666_80180776_80180876_80180938_80181155_80181248_80181346_80181538_80183390_80183460_80184189
tx.17000	chr7	+	1240	6	NIC	ENSMUSG00000039745.9	novel	1418	6	NA	NA	-10	20	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	34	junction_1	90.6598036618214	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTGTGTTGTTCTAGTT	9870	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49408852	49423743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_49408894_49409345_49409542_49411807_49411916_49420557_49420696_49422323_49422386_49423048
tx.17001	chr7	+	1377	6	FSM	ENSMUSG00000039745.9	ENSMUST00000207895.2	1338	6	-19	-20	5	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	54.5688555863141	206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTGTGTTGTTCTAGTT	9899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49408881	49423743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_49409060_49409345_49409542_49411807_49411916_49420557_49420696_49422323_49422386_49423048
tx.17002	chr7	+	1328	5	ISM	ENSMUSG00000039745.9	ENSMUST00000207895.2	1338	6	316	-20	316	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	230	junction_1	21.9928965804871	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTGTGTTGTTCTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49409216	49423743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_49409542_49411807_49411916_49420557_49420696_49422323_49422386_49423048
tx.17004	chr7	+	2289	9	NIC	ENSMUSG00000030498.16	novel	3158	10	NA	NA	-76	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	17	junction_1	15.4008928312614	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACACATTATTTGTCTCT	941	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51512098	51644201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_51512394_51514029_51514118_51537659_51537825_51546998_51547121_51576150_51576293_51586301_51586366_51593397_51593540_51602941_51603050_51643038
tx.17005	chr7	-	458	4	FSM	ENSMUSG00000074093.5	ENSMUST00000098414.5	3053	4	161	2434	-9	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_2	8.05536398239638	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGTAATATTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51655605	51649352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_51649526_51653093_51653208_51653682_51653734_51655485
tx.17006	chr7	-	1726	3	ISM	ENSMUSG00000074093.5	ENSMUST00000098414.5	3053	4	140	4755	-30	1657	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_1	9	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAGGAAGGAAGAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51655626	51651673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_51653208_51653682_51653734_51655485
tx.17007	chr7	-	517	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000099647.2	novel	321	1	NA	NA	-46	266	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_1	0	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAACTTCAGTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54062272	54061639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_54062012_54062127
tx.17008	chr7	-	569	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000099647.2	novel	321	1	NA	NA	-46	265	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAACTTCAGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54062272	54061640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_54062012_54062074
tx.17009	chr7	+	984	9	ISM	ENSMUSG00000030447.16	ENSMUST00000173497.8	3849	28	-57	46637	-13	1146	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	513	junction_1	48.818381527863	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATTTATCCAAAATCGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55491940	55528897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_55492056_55521606_55521725_55521814_55521905_55523193_55523272_55523404_55523507_55524654_55524837_55527438_55527536_55527626_55527756_55528824
tx.17010	chr7	+	4375	31	FSM	ENSMUSG00000030447.16	ENSMUST00000032629.16	6440	31	161	1904	-18	200	multi-exon	FALSE	canonical	3	493	junction_19	46.6292707308284	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGCGTTTGTTCATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55491979	55580446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_55492056_55521606_55521725_55521814_55521905_55523193_55523272_55523404_55523507_55524654_55524837_55527438_55527536_55527626_55527756_55528824_55528930_55536473_55536566_55537569_55537688_55541736_55541860_55542867_55542994_55544728_55544896_55546415_55546564_55547985_55548140_55549662_55549820_55550251_55550349_55553936_55554014_55554121_55554231_55557066_55557187_55558112_55558313_55563187_55563276_55569167_55569312_55572494_55572586_55573622_55573754_55574121_55574195_55574859_55574955_55576035_55576275_55577934_55578083_55579745
tx.17011	chr7	+	1184	4	ISM	ENSMUSG00000030447.16	ENSMUST00000173267.8	5111	15	28038	-201	-3772	201	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	563	junction_3	60.301096360035	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGCGTTTGTTCATTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55574859	55580447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_55574955_55576035_55576275_55577934_55578083_55579745
tx.17012	chr7	-	2995	7	NIC	ENSMUSG00000030452.17	novel	3197	7	NA	NA	3	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	33	junction_6	69.789564644962	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGACTTTGGGGTTTCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55612221	55581037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_55583296_55585545_55585707_55587319_55587411_55592727_55592785_55594228_55594458_55611199_55611321_55612143
tx.17013	chr7	-	3173	7	FSM	ENSMUSG00000030452.17	ENSMUST00000032635.14	3197	7	22	2	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_5	25.3837218179946	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACTTTGGGGTTTCCCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55612202	55581036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_55583296_55585545_55585707_55587319_55587411_55592727_55592785_55594228_55594458_55611199_55611321_55611947
tx.17014	chr7	-	3034	6	FSM	ENSMUSG00000030452.17	ENSMUST00000117812.8	3039	6	-12	17	-1	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_5	82.412620392753	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTCAAAGCTTTTGGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55612199	55581051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_55583296_55585545_55585707_55587319_55587411_55592727_55592785_55594228_55594458_55611947
tx.17015	chr7	-	2874	6	NIC	ENSMUSG00000030452.17	novel	3197	7	NA	NA	3	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	11	junction_5	84.7924524943111	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGACTTTGGGGTTTCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55612221	55581037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_55583296_55585545_55585707_55587319_55587411_55592727_55592785_55594228_55594458_55612143
tx.17016	chr7	-	3293	8	NIC	ENSMUSG00000030452.17	novel	3925	7	NA	NA	0	-5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	8	junction_6	93.4351242787186	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGACTTTGGGGTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55612198	55581039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_55583296_55585545_55585707_55587319_55587411_55592727_55592785_55594228_55594458_55594706_55594834_55611199_55611321_55611947
tx.17017	chr7	+	463	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000078087.6	novel	399	1	NA	NA	-83	32	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTTTGCATCTGCTAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55663680	55664194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_+_55663726_55663776
tx.1702	chr10	-	974	8	NNC	ENSMUSG00000043822.19	novel	989	8	NA	NA	-39	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	6.04067843196171	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGCCTCCCCTCAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80184285	80178571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_80178855_80179432_80179506_80180666_80180776_80180876_80180938_80181155_80181248_80181346_80181538_80183390_80183460_80184189
tx.17020	chr7	+	566	4	NNC	ENSMUSG00000033676.14	novel	4348	9	NA	NA	0	-150008	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	16.5193489244852	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTGAACAGTCAATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57240265	57265521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_57240397_57241228_57241321_57241518_57241587_57265246
tx.17021	chr7	+	782	3	ISM	ENSMUSG00000025326.13	ENSMUST00000202207.4	3586	6	-20	15249	0	96	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	99	junction_1	58.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGGAAGGAAAAGATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58878549	58921961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_58879020_58896920_58896966_58921694
tx.17022	chr7	+	3086	11	FSM	ENSMUSG00000025326.13	ENSMUST00000107537.5	4911	11	54	1771	3	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_1	51.6876194073591	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAGTTAAAAAATAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58878552	58954704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_58879020_58896920_58896966_58921694_58921985_58925515_58926763_58934427_58934573_58935801_58936008_58936615_58936781_58938153_58938310_58938454_58938529_58953415_58953560_58954557
tx.17023	chr7	-	1324	10	FSM	ENSMUSG00000102252.6	ENSMUST00000059305.17	1932	10	-11	619	-11	-612	multi-exon	FALSE	canonical	3	1774	junction_5	121.666210044805	1706	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGGGTTTTTCTTTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59654870	59632861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_59633026_59633116_59633243_59634772_59634912_59635578_59635732_59636519_59636632_59637159_59637312_59638349_59638496_59645153_59645303_59649065_59649162_59654783
tx.17024	chr7	+	708	2	Intergenic	novelGene_1186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAAATTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59805933	59813708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_59806578_59813644
tx.17025	chr7	-	648	5	FSM	ENSMUSG00000030525.9	ENSMUST00000208304.2	2814	5	47	2119	-9	-2119	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	6.86931583201704	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTGGGTGGTAGGATCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62862270	62791291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_62791544_62798330_62798441_62809284_62809330_62861855_62861996_62862169
tx.17026	chr7	-	363	3	Intergenic	novelGene_1187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTGTGGGACTGAATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63452704	63419340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_63419421_63420543_63420656_63452533
tx.17027	chr7	-	412	3	Intergenic	novelGene_1188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTGTGGGACTGAATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63452707	63419340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_63419421_63420543_63420702_63452533
tx.17029	chr7	-	502	2	NNC	ENSMUSG00000052040.11	novel	6396	2	NA	NA	1203	37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCCACAAATTGCACAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63587460	63541093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_63541546_63587410
tx.1703	chr10	-	660	2	ISM	ENSMUSG00000035478.15	ENSMUST00000105347.2	914	6	2445	-443	1896	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1097	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGACTTGTCACTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80229108	80228372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80228853_80228928
tx.17030	chr7	+	373	2	NIC	ENSMUSG00000108313.2	novel	405	3	NA	NA	-36	16	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAAGTTAAAAAATGAAAC	5862	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63611951	63617508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_63612072_63617255
tx.17031	chr7	+	1921	10	FSM	ENSMUSG00000030523.19	ENSMUST00000205960.2	1992	10	72	-1	-6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	724	junction_5	65.6911967719673	307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGACTGAGTTTTCAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63835200	63861176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_63835372_63847024_63847105_63848910_63849107_63851634_63851849_63852753_63852879_63854169_63854342_63858023_63858199_63858616_63858741_63859704_63859778_63860585
tx.17032	chr7	+	1878	4	ISM	ENSMUSG00000030523.19	ENSMUST00000205960.2	1992	10	80	8102	2	1240	intron_retention	FALSE	canonical	3	741	junction_3	69.0362223763728	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAAATCTCCTGTTGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63835208	63853073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_63835372_63847024_63847105_63848910_63849107_63851634
tx.17033	chr7	+	446	3	ISM	ENSMUSG00000030523.19	ENSMUST00000205960.2	1992	10	83	12059	5	85	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	864	junction_1	19.5	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGGGGTGCTGTACAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63835211	63849116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_63835372_63847024_63847105_63848910
tx.17034	chr7	+	2699	16	FSM	ENSMUSG00000030522.15	ENSMUST00000032736.11	5205	16	-6	2512	-6	265	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_5	5.98739416515139	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTTGCCAACTTCTATT	721	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63937411	63988042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_63937590_63938086_63938148_63947207_63947345_63949286_63949360_63950287_63950431_63957875_63957967_63963831_63964013_63967838_63967927_63968006_63968096_63969162_63969294_63970312_63970383_63970910_63970982_63976399_63976570_63983059_63983231_63986459_63986643_63987180
tx.17035	chr7	-	956	7	ISM	ENSMUSG00000030521.12	ENSMUST00000032735.8	2248	11	6516	49	-1233	-49	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	635	junction_4	71.4516153304691	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTCCTGTTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64035500	64026323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_64026553_64026915_64027144_64028485_64028594_64030677_64030789_64032638_64032777_64034049_64034118_64035426
tx.17036	chr7	-	1767	10	ISM	ENSMUSG00000030521.12	ENSMUST00000032735.8	2248	11	2406	49	2374	-49	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	635	junction_4	64.9474621483101	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTCCTGTTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64039610	64026323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_64026553_64026915_64027144_64028485_64028594_64030677_64030789_64032638_64032777_64034049_64034118_64035426_64035569_64037196_64037366_64038613_64038772_64039194
tx.17037	chr7	-	2168	11	FSM	ENSMUSG00000030521.12	ENSMUST00000032735.8	2248	11	31	49	-1	-49	multi-exon	FALSE	canonical	3	635	junction_4	61.7421250039226	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTCCTGTTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64041985	64026323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_64026553_64026915_64027144_64028485_64028594_64030677_64030789_64032638_64032777_64034049_64034118_64035426_64035569_64037196_64037366_64038613_64038772_64039194_64039880_64041853
tx.17038	chr7	-	737	2	FSM	ENSMUSG00000030521.12	ENSMUST00000205516.2	2276	2	-21	1560	11	-1560	multi-exon	FALSE	canonical	3	724	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCAGATGGTGAAGAGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64042005	64039294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_64039880_64041853
tx.17039	chr7	+	387	2	FSM	ENSMUSG00000033429.11	ENSMUST00000206882.2	391	2	2	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCATGTATTTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64042489	64061867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_64042592_64061582
tx.1704	chr10	-	1473	7	FSM	ENSMUSG00000035478.15	ENSMUST00000092295.10	1662	7	189	0	61	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	303	junction_6	355.847657791302	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGACTTGTCACTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80235195	80228372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80228853_80228928_80229115_80229726_80229905_80230399_80230491_80230897_80231036_80231269_80231430_80234955
tx.17040	chr7	+	565	3	FSM	ENSMUSG00000033429.11	ENSMUST00000206194.2	532	3	-35	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	108	junction_2	103	436	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCATGTATTTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64042487	64061867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_64042592_64049916_64050093_64061582
tx.17041	chr7	+	727	3	FSM	ENSMUSG00000033429.11	ENSMUST00000037205.11	828	3	95	6	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	203	junction_2	55.5	923	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCATGTATTTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64042487	64061867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_64042592_64049916_64050255_64061582
tx.17042	chr7	+	562	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030518.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTCTCCATTTGATTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64714649	64715877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_64714843_64715508
tx.17043	chr7	+	551	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030518.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTCTCCATTTGATTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64714675	64715877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_64714858_64715508
tx.17044	chr7	+	1372	9	ISM	ENSMUSG00000030515.10	ENSMUST00000126941.2	2709	13	2697	7307	2697	-7307	internal_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_7	9.82264602843857	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATGGGTGATCTGGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65297342	65326255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_65297417_65302007_65302132_65305431_65305554_65308607_65308726_65310866_65310932_65312048_65312128_65313620_65313768_65314628_65314728_65325711
tx.17045	chr7	+	2806	17	ISM	ENSMUSG00000030515.10	ENSMUST00000032728.9	3192	19	2580	0	2580	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_7	7.84991042942529	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCGGTATGTTCCATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65297225	65341839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_65297417_65302007_65302132_65305431_65305554_65308607_65308726_65310866_65310932_65312048_65312128_65313620_65313768_65314628_65314728_65325711_65325879_65327743_65327907_65332514_65332653_65333555_65333634_65333809_65333911_65336185_65336291_65338626_65338700_65339715_65339831_65340918
tx.17046	chr7	+	863	5	FSM	ENSMUSG00000078681.11	ENSMUST00000032726.14	908	5	49	-4	-10	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	473	junction_3	21.6333076527839	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAACCCAGAACTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65343204	65351654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_65343318_65344890_65345076_65347443_65347619_65348839_65348916_65351340
tx.17047	chr7	+	1042	9	FSM	ENSMUSG00000030512.14	ENSMUST00000153609.8	1248	9	203	3	-3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2395	junction_6	274.913622798144	5013	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACTGTGTGCTGTGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65710288	65724332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_65710441_65711871_65712020_65713514_65713594_65718914_65718962_65719171_65719275_65719866_65719947_65720337_65720414_65720979_65721074_65724069
tx.17048	chr7	+	961	8	FSM	ENSMUSG00000030512.14	ENSMUST00000032723.9	955	8	-3	-3	-3	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_5	1022.69418095299	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGACTGTGTGCTGTGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65710288	65724331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_65710441_65711871_65712020_65713514_65713594_65718914_65718962_65719171_65719275_65720337_65720414_65720979_65721074_65724069
tx.17049	chr7	+	1181	6	FSM	ENSMUSG00000075701.11	ENSMUST00000101801.8	1191	6	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	410	junction_5	18.3804243694209	660	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACAGTCTCTGGTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65729406	65739153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_65729538_65730079_65730215_65733147_65733255_65736694_65736785_65736940_65737020_65738514
tx.1705	chr10	-	1392	7	FSM	ENSMUSG00000035478.15	ENSMUST00000105349.8	1566	7	174	0	46	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	918	junction_6	141.458376288653	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGACTTGTCACTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80235210	80228372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80228853_80228928_80229115_80229726_80229905_80230399_80230491_80230897_80231036_80231269_80231430_80235051
tx.17050	chr7	-	994	4	NIC	ENSMUSG00000015133.18	novel	1559	3	NA	NA	-19	171	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATACTTTGTGTTTGCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66038074	65991246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_65991755_65992509_65992674_66031199_66031415_66037967
tx.17052	chr7	-	1500	7	ISM	ENSMUSG00000015134.16	ENSMUST00000015278.15	3443	13	40	17621	40	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_3	2.80871659105879	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGACTCTGGCCTACAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66077225	66058258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_66059028_66061249_66061379_66062105_66062168_66062648_66062779_66068850_66068992_66071958_66072064_66077061
tx.17053	chr7	-	437	2	Intergenic	novelGene_1190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGGGCTGTGTTGCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66142798	66141664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_66141811_66142507
tx.17054	chr7	-	2152	5	NIC	ENSMUSG00000030509.18	novel	2137	6	NA	NA	-17	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	50	junction_1	11.9687092035858	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTTGTTCATCTTAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66339312	66326770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_66327994_66328827_66329090_66331452_66331557_66338570_66338669_66338847
tx.17055	chr7	+	1408	3	ISM	ENSMUSG00000053091.17	ENSMUST00000128486.8	1419	5	-8	669	-8	-669	intron_retention	FALSE	canonical	3	70	junction_2	8	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGATAGTTTTTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66339688	66358981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_66339772_66345923_66346055_66357787
tx.17056	chr7	+	2918	3	FSM	ENSMUSG00000043831.13	ENSMUST00000058771.13	2898	3	-13	-7	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	19.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGATTCTCCCTCTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66872342	66878211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_66872378_66873356_66873640_66875611
tx.17057	chr7	+	557	3	FSM	ENSMUSG00000043831.13	ENSMUST00000208698.2	551	3	-6	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	14	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTGTGGTTTATCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66872355	66874375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_66872378_66873356_66873640_66874123
tx.17058	chr7	+	953	3	ISM	ENSMUSG00000043831.13	ENSMUST00000179106.3	3319	4	-8	3836	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_2	6	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTGTGGTTTATCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66872368	66874375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_66872787_66873356_66873640_66874123
tx.17059	chr7	+	537	2	ISM	ENSMUSG00000043831.13	ENSMUST00000208698.2	551	3	993	0	-2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTGTGGTTTATCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66873354	66874375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_66873640_66874123
tx.1706	chr10	-	1469	6	NIC	ENSMUSG00000035478.15	novel	1566	7	NA	NA	45	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	918	junction_5	149.282818837266	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGACTTGTCACTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80235211	80228372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_80229115_80229726_80229905_80230399_80230491_80230897_80231036_80231269_80231430_80235051
tx.17061	chr7	-	1269	9	NIC	ENSMUSG00000030556.14	novel	2923	10	NA	NA	-17	-468	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	21	junction_4	20.648471493067	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGACGTGTTGTCTTCTGTGT	555	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67294996	67164621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_67164927_67179333_67179494_67181362_67181539_67195113_67195217_67267740_67267879_67268821_67268860_67278042_67278084_67290851_67291089_67294925
tx.17062	chr7	+	2209	11	FSM	ENSMUSG00000030555.17	ENSMUST00000107471.8	2216	11	8	-1	8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	12.2429571591181	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTTTGTGTGTTTGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67297180	67376325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_67297594_67312074_67312275_67316910_67317035_67319445_67319597_67319799_67319926_67328641_67328820_67347971_67348078_67359071_67359200_67361101_67361252_67374981_67375065_67375775
tx.17063	chr7	+	2012	10	FSM	ENSMUSG00000030555.17	ENSMUST00000126093.8	1991	10	-17	-4	8	4	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_1	24.6671671620895	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGTGTGTTTGAAATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67297180	67376328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_67297594_67316910_67317035_67319445_67319597_67319799_67319926_67328641_67328820_67347971_67348078_67359071_67359200_67361101_67361252_67374981_67375065_67375775
tx.17064	chr7	-	1001	5	FSM	ENSMUSG00000030553.4	ENSMUST00000207874.2	677	5	8	-332	8	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	2.12132034355964	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTGTTTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67913973	67886354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_67886871_67887389_67887617_67888819_67888943_67908984_67909038_67913891
tx.17065	chr7	+	557	5	NNC	ENSMUSG00000074071.12	novel	2815	9	NA	NA	-25	-28165	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_4	58.8451357377991	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGGTCATGGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67925717	67975229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_67925790_67950580_67950712_67954299_67954400_67971567_67971654_67975061
tx.17066	chr7	+	2658	8	NIC	ENSMUSG00000074071.12	novel	2815	9	NA	NA	-40	-14	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_4	44.7788215247215	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTTAATAGCTTAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67925702	68012821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_67925790_67950580_67950712_67954299_67954400_67971567_67971654_67999981_68000165_68003356_68003492_68007932_68008037_68010989
tx.17067	chr7	+	2823	9	FSM	ENSMUSG00000074071.12	ENSMUST00000210558.2	2815	9	-36	28	-36	-23	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_5	20.4328167417025	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTTCCACATGTTAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67925706	68012812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_67925790_67950580_67950712_67954299_67954400_67971567_67971654_67978969_67979148_67999981_68000165_68003356_68003492_68007932_68008037_68010989
tx.17068	chr7	-	1085	5	FSM	ENSMUSG00000042659.16	ENSMUST00000118110.3	1129	5	-37	81	16	-81	multi-exon	FALSE	canonical	3	754	junction_4	68.2289344779764	433	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGATTGCAAATGTGATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68398973	68391339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_68391650_68392319_68392423_68394529_68394678_68394892_68394960_68398516
tx.1707	chr10	-	279	2	ISM	ENSMUSG00000020163.13	ENSMUST00000138428.8	520	3	2511	0	2511	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4161	junction_1	0	1488	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCTGGCTCCTTCCTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80240089	80238830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80238990_80239969
tx.17070	chr7	-	645	5	FSM	ENSMUSG00000101970.9	ENSMUST00000187421.7	519	5	102	-228	102	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_4	79.8780320238299	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCAGTTTGGGCCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73207619	73193783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_73194131_73199344_73199401_73205002_73205082_73205602_73205669_73207522
tx.17071	chr7	-	648	5	FSM	ENSMUSG00000101970.9	ENSMUST00000184587.5	5140	5	257	4235	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_4	46.3384289763906	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCAGTTTGGGCCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73207886	73193783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_73194131_73199344_73199401_73205002_73205082_73205602_73205669_73207786
tx.17072	chr7	+	1119	2	Intergenic	novelGene_1192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACCTGGTCATGGTGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73502152	73519409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_73502460_73518597
tx.17073	chr7	+	1271	4	ISM	ENSMUSG00000066406.17	ENSMUST00000208187.2	1381	6	-4	22917	-4	8	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_3	3.29983164553722	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCCTGTTTCTGTCCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75105300	75230132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_75105497_75184555_75184600_75219631_75219780_75229249
tx.17074	chr7	-	1402	3	FSM	ENSMUSG00000097415.3	ENSMUST00000181224.2	656	3	-22	-724	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	6.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGGTAGTGGTCTTGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75431869	75418785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_75419986_75430372_75430505_75431799
tx.17076	chr7	-	593	3	Intergenic	novelGene_1193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTCATTTTCTTTGGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77722771	77714890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_77715297_77717348_77717410_77722645
tx.17077	chr7	+	414	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000059146.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTTTGGTAATATTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78151656	78152168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_78151861_78151958
tx.17078	chr7	+	594	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000052629.6	novel	2205	1	NA	NA	-24	-1510	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGAGCTATTTCCTGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78228553	78229272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_+_78228734_78228858
tx.17079	chr7	-	984	4	FSM	ENSMUSG00000030612.7	ENSMUST00000032841.7	1134	4	45	105	45	-105	multi-exon	FALSE	canonical	3	446	junction_2	24.7296493213219	1459	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGATTTGTCCTTGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78432792	78425088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_78425474_78430185_78430360_78431147_78431335_78432554
tx.1708	chr10	+	417	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020163.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.5	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGTGCAGACGTATAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80238830	80242634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_80238986_80239963_80240124_80242532
tx.17080	chr7	+	834	6	FSM	ENSMUSG00000030611.11	ENSMUST00000032840.5	1056	6	222	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	364	junction_2	39.2153031353833	1186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGCTGTGAGTTTTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78433088	78442737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_78433172_78433320_78433429_78438422_78438522_78440384_78440515_78441621_78441688_78442389
tx.17081	chr7	-	2240	5	FSM	ENSMUSG00000030610.14	ENSMUST00000032839.13	2269	5	32	-3	32	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_2	8.89873586527884	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGTCTCTTCCTTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78496979	78477218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_78477861_78483858_78484051_78489752_78489941_78492919_78494013_78496854
tx.17082	chr7	+	2113	4	FSM	ENSMUSG00000030609.19	ENSMUST00000107425.8	4956	4	16	2827	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	272	junction_1	184.819431397844	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACTGGTCCTTTCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78545690	78558130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_78545763_78551977_78552579_78555590_78555792_78556891
tx.17083	chr7	+	1995	4	FSM	ENSMUSG00000030609.19	ENSMUST00000107421.8	2007	4	13	-1	-4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_1	165.023903992388	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACTGGTCCTTTCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78545694	78558130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_78545763_78552091_78552579_78555590_78555792_78556891
tx.17084	chr7	+	2046	3	ISM	ENSMUSG00000030609.19	ENSMUST00000107423.2	2230	4	6216	-4	-136	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	660	junction_1	4	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAACTGGTCCTTTCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78551972	78558130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_78552579_78555590_78555792_78556891
tx.17085	chr7	-	1497	6	FSM	ENSMUSG00000030605.16	ENSMUST00000206338.2	2330	6	833	0	97	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1186	junction_2	28.6733325583198	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTGTGCCTCCTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78792701	78783515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_78784295_78784399_78784550_78786404_78786590_78791392_78791538_78792149_78792303_78792616
tx.17086	chr7	-	2003	9	FSM	ENSMUSG00000030605.16	ENSMUST00000107409.5	2008	9	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	790	junction_6	144.155948541848	805	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTGTGCCTCCTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78798796	78783515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_78784295_78784399_78784550_78786404_78786590_78791392_78791538_78792149_78792303_78792616_78792799_78794994_78795127_78795369_78795493_78798642
tx.17087	chr7	-	2116	10	FSM	ENSMUSG00000030605.16	ENSMUST00000032825.14	2125	10	10	-1	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	296	junction_6	379.595691346581	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTGTGCCTCCTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78798798	78783515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_78784295_78784399_78784550_78786404_78786590_78791392_78791538_78792149_78792303_78792616_78792799_78793025_78793137_78794994_78795127_78795369_78795493_78798642
tx.17088	chr7	-	1123	2	NNC	ENSMUSG00000108387.2	novel	239	2	NA	NA	-103	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTCCTCTGTAATCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78922662	78921435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_78922092_78922195
tx.17089	chr7	-	1007	3	NNC	ENSMUSG00000108387.2	novel	239	2	NA	NA	99	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTCCTCTGTAATCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78922684	78921435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_78922092_78922195_78922308_78922445
tx.1709	chr10	-	415	3	FSM	ENSMUSG00000020163.13	ENSMUST00000020372.6	445	3	30	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4161	junction_1	104.5	35298	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCTGGCTCCTTCCTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80242634	80238830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80238990_80239969_80240121_80242529
tx.17090	chr7	+	2052	11	FSM	ENSMUSG00000039202.13	ENSMUST00000037315.13	6877	11	0	4825	0	-4825	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_5	6.39140047250992	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGAGTTTTCCTTCTCCTT	2722	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78922946	79010431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_78923088_78944255_78944356_78946755_78946956_78973216_78973393_78975181_78975350_78998007_78998192_79000498_79000592_79003737_79003849_79005549_79005620_79007812_79007898_79009707
tx.17091	chr7	+	420	3	ISM	ENSMUSG00000039202.13	ENSMUST00000135333.3	4426	6	-34	48164	21	-48164	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTTCACTGTCCTGCCT	2743	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78922967	78946955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_78923088_78944255_78944356_78946755
tx.17092	chr7	-	1556	5	ISM	ENSMUSG00000039194.17	ENSMUST00000053718.15	2134	9	5079	-11	2232	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	2.1650635094611	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGAACTTAGGTCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79031628	79024607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_79025467_79025644_79025756_79026974_79027134_79029706_79029886_79031380
tx.17093	chr7	-	1805	8	ISM	ENSMUSG00000039194.17	ENSMUST00000179243.3	2142	9	2267	-21	-669	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_7	3.8703477668983	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTTATTTAGAGTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79034529	79024596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_79025467_79025644_79025756_79026974_79027134_79029706_79029886_79031380_79031586_79033359_79033489_79033681_79033711_79034406
tx.17094	chr7	-	1774	9	NNC	ENSMUSG00000039194.17	novel	2142	9	NA	NA	-121	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	6.8818148042504	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACTCTTTCATGATGAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79036474	79024618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_79025467_79025644_79025711_79026974_79027134_79029706_79029886_79031380_79031586_79033359_79033489_79033681_79033711_79034406_79034528_79036436
tx.17095	chr7	-	1851	9	FSM	ENSMUSG00000039194.17	ENSMUST00000179243.3	2142	9	293	-2	-150	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_8	4.45638586749397	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTCATGATGAACTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79036503	79024615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79025467_79025644_79025756_79026974_79027134_79029706_79029886_79031380_79031586_79033359_79033489_79033681_79033711_79034406_79034528_79036436
tx.17096	chr7	+	630	4	NNC	ENSMUSG00000039187.17	novel	1301	10	NA	NA	2	-2210	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_3	166.391105531516	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATCTCACTATGTAGCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79042057	79049424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_79042140_79045640_79045744_79048883_79048957_79049052
tx.17098	chr7	-	598	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039187.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATCTAAGGTTATTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79048135	79046137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_79046493_79047892
tx.17099	chr7	-	814	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039187.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	5.71547606649408	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGATTATAAATGGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79048153	79046110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_79046493_79047177_79047262_79047383_79047471_79047892
tx.171	chr1	+	1141	6	FSM	ENSMUSG00000026078.11	ENSMUST00000027247.11	3914	6	2181	592	-52	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	825	junction_1	70.5532423067856	3307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACAGTGCAAAAAATGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39026869	39035727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_39026931_39030326_39030457_39033995_39034087_39034325_39034470_39034815_39035025_39035221
tx.1710	chr10	+	497	2	Intergenic	novelGene_99	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCAGCGAGTAATGGTGT	1365	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80286704	80287605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_80286773_80287176
tx.17100	chr7	-	712	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039187.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	2	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGGTTATTTCTGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79048157	79046132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_79046493_79047383_79047471_79047892
tx.17101	chr7	-	1297	5	ISM	ENSMUSG00000039176.18	ENSMUST00000149444.8	4247	23	13970	-179	-130	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	269	junction_4	57.974132162543	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTTGTCTACTGATATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79101958	79099131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_79099786_79100232_79100394_79101289_79101499_79101607_79101777_79101854
tx.17102	chr7	-	1607	2	ISM	ENSMUSG00000039176.18	ENSMUST00000149444.8	4247	23	-33	14346	-15	7	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79115961	79113656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_79115120_79115817
tx.17103	chr7	+	2041	4	FSM	ENSMUSG00000097023.9	ENSMUST00000182317.2	479	4	-230	-1332	-27	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.16024689946929	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTTCTTGTTTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79164952	79182339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_79165421_79173664_79173725_79177510_79177618_79180933
tx.17104	chr7	-	1089	6	ISM	ENSMUSG00000030549.7	ENSMUST00000032766.5	2090	11	17871	0	-4857	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	11	junction_1	3.87814388593306	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGGGGAGTGGATGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79249534	79243110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_79243549_79244529_79244737_79248288_79248363_79248717_79248843_79249104_79249242_79249426
tx.17105	chr7	-	2005	11	FSM	ENSMUSG00000030549.7	ENSMUST00000032766.5	2090	11	85	0	85	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_10	3.38969025133566	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGGGGAGTGGATGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79267320	79243110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79243549_79244529_79244737_79248288_79248363_79248717_79248843_79249104_79249242_79249426_79249565_79250241_79250409_79251334_79251483_79253487_79253639_79257292_79257480_79267087
tx.17106	chr7	+	2011	7	NIC	ENSMUSG00000046591.11	novel	3655	20	NA	NA	1	9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_6	91.3699744020005	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAGGCAAATTTCCATAT	1951	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79309970	79325470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_79310751_79315410_79315688_79317407_79317647_79319195_79319431_79320613_79320744_79325019_79325157_79325257
tx.17107	chr7	-	2088	2	FSM	ENSMUSG00000030545.10	ENSMUST00000150606.2	1044	2	84	-1128	33	-4	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGACTCCTGCGTCTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79392795	79385708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79387659_79392657
tx.17108	chr7	-	2237	3	FSM	ENSMUSG00000030545.10	ENSMUST00000032761.8	2241	3	0	4	0	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	20	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGACTCCTGCGTCTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79392828	79385708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79387659_79389912_79390029_79392657
tx.17109	chr7	+	850	5	NIC	ENSMUSG00000039099.8	novel	2285	18	NA	NA	29157	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_1	5.09901951359278	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGGTGCGGTTCATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79422067	79435698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_79422269_79425259_79425324_79426377_79426535_79426860_79427054_79435463
tx.1711	chr10	-	1310	2	ISM	ENSMUSG00000047417.19	ENSMUST00000057910.16	5250	15	9	9119	9	-2717	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	427	junction_1	0	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAAGACCCAGCCAGGCC	9430	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80397385	80385877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80386900_80397097
tx.17110	chr7	+	1444	2	FSM	ENSMUSG00000030543.11	ENSMUST00000107394.3	1944	2	500	0	500	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTGCTTCTGATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79460974	79463187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_79461508_79462276
tx.17111	chr7	-	942	2	ISM	ENSMUSG00000063801.8	ENSMUST00000075657.8	5813	6	38095	4435	38042	2751	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	250	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGTTCAGTGCTGTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79532302	79529507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_79530361_79532213
tx.17112	chr7	-	1366	6	FSM	ENSMUSG00000063801.8	ENSMUST00000075657.8	5813	6	12	4435	12	2751	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_1	30.5653398476117	296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGTTCAGTGCTGTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79570385	79529507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79530361_79532213_79532322_79559582_79559655_79564894_79565007_79565763_79565856_79570256
tx.17114	chr7	-	1704	6	FSM	ENSMUSG00000039043.6	ENSMUST00000048731.6	2277	6	67	506	67	-506	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	5.76194411635517	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTAGTGCTCCATGCTTGCT	9960	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79585040	79575614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79576599_79577373_79577538_79577919_79578127_79579320_79579454_79581550_79581627_79584900
tx.17115	chr7	+	793	2	ISM	ENSMUSG00000048897.16	ENSMUST00000166250.8	3606	6	-2	10144	-2	517	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	198	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGGCACTACCTGGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79674579	79731434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_79674735_79730796
tx.17116	chr7	+	2260	4	ISM	ENSMUSG00000048897.16	ENSMUST00000166250.8	3606	6	-5	4979	-5	5	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	198	junction_1	67.6214955961983	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGTTGAGTGCTGTGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79674576	79736599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_79674735_79730796_79732289_79735698_79735891_79736181
tx.17117	chr7	-	1694	11	FSM	ENSMUSG00000030541.17	ENSMUST00000107384.10	1745	11	51	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1495	junction_5	201.26112391617	1382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCTTGATGTGTTTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79765089	79744593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79744952_79745368_79745462_79745546_79745645_79745770_79745884_79747551_79747704_79747883_79748021_79748518_79748663_79748745_79748907_79750490_79750657_79752869_79752962_79764909
tx.17118	chr7	-	851	7	FSM	ENSMUSG00000030538.16	ENSMUST00000065163.15	1047	7	187	9	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	721	junction_2	48.5546656414763	2224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCCTTGTATGATGGTAGC	2238	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79882374	79876903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79877135_79877741_79877831_79877909_79878029_79878145_79878297_79880063_79880173_79882091_79882127_79882257
tx.17119	chr7	-	717	5	FSM	ENSMUSG00000030538.16	ENSMUST00000071457.12	702	5	-14	-1	-14	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_4	297.709904941035	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTCCTTGTATGATGGTA	2226	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79882386	79876905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79877135_79877741_79877831_79877909_79878029_79878145_79878297_79882257
tx.1712	chr10	-	593	2	ISM	ENSMUSG00000003346.15	ENSMUST00000003436.12	1468	5	6016	0	2299	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	405	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGTTGCTTGGCTCCTTTGT	1702	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80420159	80419487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80419898_80419976
tx.17120	chr7	+	1919	2	FSM	ENSMUSG00000050973.12	ENSMUST00000062915.9	4189	2	20	2250	20	-2250	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTGTTGTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79882632	79889559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_79882954_79887961
tx.17121	chr7	+	1317	3	FSM	ENSMUSG00000047084.9	ENSMUST00000117989.2	1317	3	1	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	448	junction_2	14	232	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTTGCTTGGTTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79910963	79915123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_79911172_79911568_79911680_79914125
tx.17122	chr7	+	2565	23	FSM	ENSMUSG00000030534.14	ENSMUST00000032749.12	2574	23	7	2	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_6	14.9188576657057	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTTTGTTTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79919403	79941325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_79919828_79923976_79924058_79924371_79924434_79925793_79925844_79926145_79926214_79929719_79929766_79932232_79932328_79933175_79933281_79933727_79933825_79934031_79934110_79934289_79934364_79934765_79934853_79934997_79935089_79935303_79935379_79935581_79935647_79935758_79935814_79936855_79936903_79937525_79937659_79938147_79938222_79939729_79939832_79940015_79940092_79940195_79940313_79940862
tx.17126	chr7	+	3054	15	FSM	ENSMUSG00000038943.17	ENSMUST00000174172.8	3008	15	-41	-5	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_13	238.868890688544	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTTTTGTCTTCAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79944211	79966007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_79944340_79950048_79950182_79950784_79950908_79954108_79954343_79954428_79954600_79955665_79955816_79956122_79956271_79957306_79957444_79959140_79959237_79960488_79960636_79960817_79960929_79961964_79962076_79962779_79962957_79963274_79963317_79964861
tx.1713	chr10	-	686	3	NNC	ENSMUSG00000003346.15	novel	1468	5	NA	NA	1807	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_2	200.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGTTGCTTGGCTCCTTTGT	1210	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80420651	80419487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_80419898_80419976_80420157_80420555
tx.17131	chr7	+	1030	4	NNC	ENSMUSG00000030532.7	novel	1510	4	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_3	46.7784375778224	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCTGTTCTTCCTTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79992866	79995850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_79992998_79993286_79993343_79993463_79993705_79995248
tx.17132	chr7	+	878	4	FSM	ENSMUSG00000030532.7	ENSMUST00000032747.7	1510	4	20	612	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_1	13.490737563232	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCTGTTCTTCCTTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79992871	79995850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_79992998_79993286_79993343_79993463_79993705_79995395
tx.17133	chr7	-	952	5	ISM	ENSMUSG00000053158.11	ENSMUST00000206728.2	2707	18	7372	-15	389	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_1	2.77263412660235	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATATTGACATGTGTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80029795	80027505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_80027823_80028289_80028413_80028525_80028684_80029358_80029483_80029565
tx.17134	chr7	-	492	2	FSM	ENSMUSG00000030528.13	ENSMUST00000206948.2	485	2	295	-302	295	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	415	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTAGTGGCCATTGTTTC	6618	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80108706	80104838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_80105185_80108560
tx.17135	chr7	-	777	3	ISM	ENSMUSG00000030528.13	ENSMUST00000081314.11	4598	22	-9	57913	-9	-38768	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	378	junction_1	9.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGAGGGGGCGGACTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80184876	80162653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_80163243_80164336_80164439_80184790
tx.17136	chr7	-	1779	13	ISM	ENSMUSG00000030536.11	ENSMUST00000206149.2	3629	14	-28	2296	-10	-2296	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	539	junction_12	46.862313097935	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGGCCCTCTTGTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80453039	80401420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_80401778_80401937_80402102_80405927_80406013_80407151_80407316_80407921_80408007_80409505_80409685_80410562_80410677_80412245_80412314_80415042_80415120_80416632_80416711_80418056_80418214_80449597_80449698_80452888
tx.17137	chr7	-	1553	8	FSM	ENSMUSG00000025722.17	ENSMUST00000026816.15	2114	8	31	530	-4	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_7	16.071269840486	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAGCAATTTACTTAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80550986	80541000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_80541658_80542723_80543090_80543396_80543562_80547670_80547736_80548250_80548340_80550095_80550185_80550391_80550460_80550932
tx.17138	chr7	-	701	3	FSM	ENSMUSG00000025723.13	ENSMUST00000026817.11	705	3	0	4	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	1.5	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAATGTCTGGGCCTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80554824	80551979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_80552252_80553881_80554055_80554568
tx.17139	chr7	-	941	6	FSM	ENSMUSG00000025724.13	ENSMUST00000026818.12	1345	6	219	185	-16	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	936	junction_3	43.4391528462515	2261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCAGTGTTTGTATTTTG	1604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80597309	80565309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_80565653_80565922_80565981_80572848_80572969_80577484_80577635_80584774_80584885_80597149
tx.1714	chr10	-	1302	4	ISM	ENSMUSG00000003346.15	ENSMUST00000003436.12	1468	5	3310	0	-407	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	372	junction_3	33.2565782966318	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGTTGCTTGGCTCCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80422865	80419487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80419898_80419976_80420157_80421441_80421637_80422348
tx.17140	chr7	+	463	4	ISM	ENSMUSG00000038763.13	ENSMUST00000107348.2	6369	14	-4	28615	-4	-21821	5prime_fragment	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.63299316185545	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGGGGCCGGCATGGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80707343	80726745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_80707521_80713696_80713736_80717626_80717749_80726620
tx.17141	chr7	+	1981	9	ISM	ENSMUSG00000025726.12	ENSMUST00000119083.2	2899	18	27008	0	27008	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_1	7.38135319572231	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTGTGTGTACAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80791605	80820164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_80791793_80803147_80803274_80810712_80810844_80814018_80814188_80814273_80814472_80817713_80817796_80818711_80818811_80818914_80819027_80819287
tx.17142	chr7	-	533	5	NNC	ENSMUSG00000061787.16	novel	494	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5415.43370262253	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTCTGTATTGTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80994980	80992480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_80992598_80993421_80993549_80994058_80994165_80994604_80994757_80994949
tx.17143	chr7	-	478	5	FSM	ENSMUSG00000061787.16	ENSMUST00000080813.5	494	5	16	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8882	junction_4	1855.19963548401	44273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTCTGTATTGTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80994986	80992480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_80992598_80993482_80993549_80994058_80994165_80994604_80994757_80994949
tx.17144	chr7	-	1295	8	ISM	ENSMUSG00000062444.16	ENSMUST00000147624.2	1459	9	492	0	492	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_7	13.4255315708237	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGCTCACCTTTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81114551	81110146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_81110550_81110675_81110815_81112651_81112750_81112988_81113074_81113431_81113661_81113838_81113946_81114189_81114251_81114378
tx.17145	chr7	-	583	3	ISM	ENSMUSG00000061877.14	ENSMUST00000144156.2	640	6	2475	-3	2465	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGATGTTGGAGGTTCTC	5759	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81145554	81144019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_81144127_81144873_81145122_81145326
tx.17146	chr7	+	744	4	FSM	ENSMUSG00000097277.8	ENSMUST00000180879.8	725	4	-11	-8	-3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	29.9777695412228	307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGGGTATTATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81173307	81181250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_81173425_81178534_81178689_81179094_81179276_81180958
tx.17147	chr7	+	758	4	NIC	ENSMUSG00000097277.8	novel	725	4	NA	NA	22	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	11	junction_1	41.2148840428633	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGGGTATTATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81173340	81181250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_81173472_81178534_81178689_81179094_81179276_81180958
tx.17148	chr7	-	1800	7	ISM	ENSMUSG00000038663.8	ENSMUST00000042318.6	3985	13	17925	1044	17925	-1044	3prime_fragment	TRUE	canonical	1	1	junction_1	2.40947204913349	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGCCAGCCCCCAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81198767	81184099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_81184997_81186878_81187056_81190059_81190193_81191787_81191922_81194707_81194859_81195604_81195740_81198594
tx.17149	chr7	-	1389	4	ISM	ENSMUSG00000025813.15	ENSMUST00000098326.3	10982	9	78529	8858	4469	391	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_1	3.09120616516523	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAGCAGAACTTAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81264184	81259086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_81260190_81261053_81261135_81262008_81262120_81264090
tx.1715	chr10	+	1804	7	FSM	ENSMUSG00000113949.2	ENSMUST00000079883.12	1804	7	1	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	584	junction_5	41.6239781322684	595	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGGCCTTTATCTGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80438714	80451618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80438784_80444636_80444685_80445163_80445293_80445474_80445632_80446861_80446964_80448175_80448294_80450437
tx.17150	chr7	+	1402	3	FSM	ENSMUSG00000038646.14	ENSMUST00000042166.11	1452	3	49	1	49	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	441	junction_1	195	2811	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTTTTAGTTTTGACAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81412721	81419238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_81412805_81417274_81417472_81418116
tx.17151	chr7	-	766	5	NNC	ENSMUSG00000025102.15	novel	504	4	NA	NA	0	1899	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	126.089254102005	463	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAGCCTACAACAAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81439213	81430030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_81430319_81432778_81432887_81435824_81435953_81438197_81438325_81439098
tx.17152	chr7	-	865	5	NNC	ENSMUSG00000025102.15	novel	504	4	NA	NA	0	1899	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	98	junction_4	96.0325465662553	158	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAGCCTACAACAAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81439213	81430030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_81430319_81432778_81432887_81435824_81435953_81438197_81438325_81438999
tx.17153	chr7	-	878	5	NNC	ENSMUSG00000025102.15	novel	887	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	120.296508677517	771	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTAGCAGTTTCGAGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81439213	81431929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_81432330_81432778_81432887_81435824_81435953_81438197_81438325_81439098
tx.17154	chr7	-	973	5	NIC	ENSMUSG00000025102.15	novel	887	5	NA	NA	0	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	98	junction_4	83.5852857864349	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATGGCTAGCAGTTTCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81439213	81431933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_81432330_81432778_81432887_81435824_81435953_81438197_81438325_81438999
tx.17155	chr7	-	2195	5	ISM	ENSMUSG00000025103.9	ENSMUST00000026093.9	3001	8	23576	0	-5362	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	689	junction_4	19.536824204563	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATTTGTCACCTCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81455603	81441821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_81443475_81443905_81444053_81446743_81446832_81450705_81450899_81455489
tx.17156	chr7	-	564	4	ISM	ENSMUSG00000025103.9	ENSMUST00000026093.9	3001	8	28359	1439	-579	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	701	junction_1	16.391054470859	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGAGTGTCTTGAGTATT	4675	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81450820	81443260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_81443475_81443905_81444053_81446743_81446832_81450705
tx.17157	chr7	+	2228	10	FSM	ENSMUSG00000038623.10	ENSMUST00000041890.8	2226	10	371	-373	221	10	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_7	3.33703498170693	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGACTTAACAGCCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81509119	81534192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_81509289_81512897_81513002_81514994_81515093_81518388_81518493_81520444_81520528_81521116_81521239_81523479_81523585_81525471_81525565_81525722_81525843_81532962
tx.17158	chr7	+	1762	10	FSM	ENSMUSG00000038623.10	ENSMUST00000119543.2	1066	10	-51	-645	-51	-7	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.07565471755214	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGATAAACTTTATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81512383	81533812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_81512467_81512897_81513002_81514994_81515093_81518388_81518493_81520444_81520528_81521116_81521239_81523479_81523585_81525471_81525565_81525722_81525843_81532962
tx.17159	chr7	-	1263	2	Intergenic	novelGene_1194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	81	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTATCTGCATTAATCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81814540	81761686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_81762785_81814375
tx.1716	chr10	+	1409	2	FSM	ENSMUSG00000113640.2	ENSMUST00000038411.5	1411	2	2	0	2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	56	junction_1	0	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCGTTTGCACTCAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80438715	80443488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80438784_80442147
tx.17160	chr7	+	1559	9	NNC	ENSMUSG00000030638.14	novel	763	4	NA	NA	37652	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	23	junction_1	107.755437797821	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGGTTATTTTCAATGTC	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	81862633	81956627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_81862770_81909339_81909409_81917487_81917561_81919980_81920125_81923068_81923203_81925334_81925494_81933262_81933367_81934228_81934339_81955997
tx.17161	chr7	+	1426	8	ISM	ENSMUSG00000030638.14	ENSMUST00000032874.14	1647	9	84793	0	-10757	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	252	junction_2	38.8686957615519	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGGTTATTTTCAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81909336	81956627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_81909409_81917487_81917561_81919980_81920125_81923068_81923203_81925334_81925494_81933262_81933367_81934228_81934339_81955997
tx.17162	chr7	+	954	4	ISM	ENSMUSG00000030638.14	ENSMUST00000177895.8	1486	9	100686	0	5290	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	343	junction_2	12.5698050899765	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGGTTATTTTCAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81925383	81956627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_81925494_81933262_81933367_81934228_81934339_81955997
tx.17163	chr7	+	428	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000038570.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACGACGTGGCTTCCGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82295382	82297742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_82295674_82297605
tx.17164	chr7	-	430	2	FSM	ENSMUSG00000038570.16	ENSMUST00000126478.2	430	2	-13	13	-13	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGCTCTGCCTTCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82297749	82295388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_82295669_82297599
tx.17165	chr7	+	1081	5	NNC	ENSMUSG00000038563.15	novel	3610	20	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_4	60.1139542868376	39	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGTGGCCTGTGGCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82297824	82308234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_82297887_82298733_82298840_82301088_82301157_82307264_82307350_82307474
tx.17166	chr7	+	1023	4	NNC	ENSMUSG00000038563.15	novel	1537	3	NA	NA	389	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_3	67.3415836529621	30	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAGTGGCCTGTGGCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82298729	82308234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_82298840_82301088_82301157_82307264_82307350_82307474
tx.17167	chr7	-	591	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000038563.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTCAGTTCAGTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82384207	82381398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_82381580_82382904_82383105_82383390_82383438_82384044
tx.17168	chr7	-	544	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000038563.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTCAGTTCAGTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82384207	82381398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_82381580_82382904_82383105_82384044
tx.17169	chr7	+	785	3	ISM	ENSMUSG00000038563.15	ENSMUST00000039881.4	3610	20	114528	8	92940	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	9	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTCCAAACCGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82412376	82427052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_82412623_82421664_82421850_82426698
tx.1717	chr10	+	1406	7	ISM	ENSMUSG00000003345.17	ENSMUST00000085435.7	1825	12	8803	-409	189	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	651	junction_4	48.6121269735124	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGTTGGCCTGGGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80474292	80476580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_80474463_80474539_80474626_80474713_80474799_80474918_80475068_80475413_80475498_80475601_80475709_80475855
tx.17170	chr7	+	1703	3	ISM	ENSMUSG00000046027.18	ENSMUST00000150174.8	897	5	-40	3457	17	1147	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_2	9.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGTTTGTTTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83281183	83283826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_83281348_83281943_83281994_83282337
tx.17171	chr7	+	1231	6	FSM	ENSMUSG00000046027.18	ENSMUST00000075418.15	2483	6	41	1211	0	-1211	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_5	19.4566184112245	415	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTTGTGATCTCTTCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83281207	83290325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_83281348_83281943_83281994_83282337_83282471_83285958_83286077_83286811_83286906_83289629
tx.17172	chr7	+	1920	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063902.14	novel	1378	1	NA	NA	-81	522	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGGATTCACTAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83405030	83407011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_+_83406483_83406543
tx.17173	chr7	+	1898	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063902.14	novel	1378	1	NA	NA	-57	522	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	132	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTGGATTCACTAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83405054	83407011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_+_83406475_83406533
tx.17174	chr7	+	1886	3	FSM	ENSMUSG00000038503.16	ENSMUST00000094215.10	4492	3	255	2351	-75	1101	multi-exon	FALSE	canonical	3	1312	junction_2	6.5	2697	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATAGGTATATTCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83541462	83548389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_83541684_83544737_83544971_83546957
tx.17175	chr7	-	1840	3	FSM	ENSMUSG00000038459.11	ENSMUST00000117085.2	2238	3	398	0	175	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1379	junction_1	80.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCGTGGGCTTATGTGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83800703	83758563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_83760010_83763458_83763639_83800489
tx.17176	chr7	-	1502	14	FSM	ENSMUSG00000030630.17	ENSMUST00000032865.17	1585	14	77	6	39	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_9	7.3524942432914	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAAATCTCTGTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84255073	84234372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_84234553_84238038_84238157_84238781_84238884_84241589_84241637_84242393_84242470_84243920_84244052_84244665_84244766_84246241_84246295_84246385_84246484_84248261_84248353_84249984_84250035_84250240_84250363_84251288_84251400_84254850
tx.17177	chr7	-	1544	7	FSM	ENSMUSG00000030629.16	ENSMUST00000178385.9	1538	7	3	-9	3	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_6	230.002475832085	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTACGTTTCCCTCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84328597	84264252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_84265177_84267057_84267172_84270075_84270121_84281863_84281965_84283092_84283202_84283446_84283618_84328517
tx.17178	chr7	-	1735	8	FSM	ENSMUSG00000030629.16	ENSMUST00000209165.2	967	8	28	-796	28	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_6	270.713795702534	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTACGTTTCCCTCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84339063	84264252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_84265177_84267057_84267172_84270075_84270121_84281863_84281965_84283092_84283202_84283446_84283618_84302089_84302251_84338953
tx.17179	chr7	-	1584	7	FSM	ENSMUSG00000030629.16	ENSMUST00000209117.2	2955	7	92	1279	18	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	577	junction_5	69.5045961709648	254	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTACGTTTCCCTCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84339073	84264252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_84265177_84267057_84267172_84270075_84270121_84281863_84281965_84283092_84283202_84283446_84283618_84338953
tx.1718	chr10	+	917	3	FSM	ENSMUSG00000003345.17	ENSMUST00000220025.2	624	3	183	-476	-60	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	668	junction_1	5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGTTGGCCTGGGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80475412	80476580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80475498_80475601_80475709_80475855
tx.17180	chr7	-	629	6	ISM	ENSMUSG00000030629.16	ENSMUST00000209117.2	2955	7	92	4115	18	-1943	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	577	junction_4	75.8435231249182	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCATGTGCAGGAAGAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84339073	84267088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_84267172_84270075_84270121_84281863_84281965_84283092_84283202_84283446_84283618_84338953
tx.17181	chr7	-	301	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000090949.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTAAGAGGGTTCTGTCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86468016	86449390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_86449619_86467943
tx.17182	chr7	-	903	3	Intergenic	novelGene_1195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTTGGATAATTATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86750516	86546658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_86547282_86699777_86699849_86750307
tx.17183	chr7	+	556	3	NNC	ENSMUSG00000030562.18	novel	1159	3	NA	NA	26	-38266	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTGTTTAATGAACGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86895882	86898923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_86896111_86896695_86896792_86898691
tx.17184	chr7	+	1887	7	FSM	ENSMUSG00000030560.18	ENSMUST00000032779.12	2493	7	30	576	-19	-576	multi-exon	FALSE	canonical	3	323	junction_5	18.6100331362771	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATAGTCTTTCTATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87927322	87959520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_87927583_87930594_87930741_87946290_87946458_87948652_87948806_87951392_87951509_87957220_87957353_87958607
tx.17185	chr7	+	1460	3	FSM	ENSMUSG00000030559.9	ENSMUST00000107256.4	1577	3	4	113	4	-113	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	4.5	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTGTTTCTGATATTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88079484	88140667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_88079812_88099688_88099970_88139815
tx.17186	chr7	-	3372	15	FSM	ENSMUSG00000039428.12	ENSMUST00000041968.11	3700	15	8	320	8	-320	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_2	15.7941154115276	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAAAGGTGCATTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88987987	88789241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_88791179_88792988_88793057_88793864_88793964_88797177_88797255_88800620_88800685_88803235_88803404_88805634_88805705_88808076_88808224_88814332_88814375_88845320_88845368_88893128_88893195_88929174_88929209_88953888_88953982_88956344_88956473_88987655
tx.17187	chr7	-	651	2	NNC	ENSMUSG00000039428.12	novel	756	9	NA	NA	-76	-42554	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGAAATATTTGTAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89053506	88997228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_88997654_89053280
tx.17188	chr7	+	615	4	ISM	ENSMUSG00000030621.18	ENSMUST00000032853.9	1130	9	19355	-1	19355	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.816496580927726	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTGTCTCTGTGGTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89497844	89501171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_89497959_89498801_89498976_89499540_89499640_89500943
tx.17189	chr7	-	798	4	FSM	ENSMUSG00000062797.15	ENSMUST00000208357.2	806	4	24	-16	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	430	junction_3	356.664485974642	2694	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACATGTGTAACCTTTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89590383	89567895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_89568216_89569280_89569400_89572771_89572924_89590176
tx.1719	chr10	+	752	2	FSM	ENSMUSG00000003345.17	ENSMUST00000220431.2	473	2	206	-485	206	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	678	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGAATGTTGGCCTGGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80475678	80476577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80475709_80475855
tx.17190	chr7	-	1041	5	FSM	ENSMUSG00000062797.15	ENSMUST00000153470.9	2224	5	24	1159	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	695	junction_3	227.142026054185	3880	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACATGTGTAACCTTTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89590388	89567895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_89568216_89569280_89569400_89572771_89572924_89584934_89585173_89590176
tx.17191	chr7	-	1628	12	FSM	ENSMUSG00000030619.11	ENSMUST00000238792.2	1503	12	135	-260	-8	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	1777	junction_2	230.503903625897	2299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTTTTTGTAATGTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89629775	89603884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_89604272_89604738_89604813_89605462_89605622_89611463_89611570_89613936_89614071_89616920_89617013_89618778_89618861_89619513_89619640_89620747_89620814_89621438_89621532_89626104_89626258_89629619
tx.17192	chr7	-	1531	12	NIC	ENSMUSG00000030619.11	novel	2060	12	NA	NA	-9	-26	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	461	junction_2	565.94251087883	768	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTACCATATCTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89629776	89603893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_89604272_89604738_89604813_89605551_89605622_89611463_89611570_89613936_89614071_89616920_89617013_89618778_89618861_89619513_89619640_89620747_89620814_89621438_89621532_89626104_89626258_89629619
tx.17193	chr7	-	499	3	FSM	ENSMUSG00000097162.3	ENSMUST00000209164.2	432	3	-52	-15	-52	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAAAATGTCTGACGCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779244	89774023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_89774241_89776135_89776253_89779079
tx.17194	chr7	-	367	2	FSM	ENSMUSG00000097162.3	ENSMUST00000209166.2	271	2	-78	-18	-34	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATGTCTGACGCTCGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779226	89774020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_89774241_89779079
tx.17195	chr7	+	570	3	NNC	ENSMUSG00000039361.12	novel	700	4	NA	NA	-16	-13789	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGGTGATGGGTTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779686	89799465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_89779911_89798243_89798437_89799312
tx.17196	chr7	+	1883	3	FSM	ENSMUSG00000051451.7	ENSMUST00000107206.3	891	3	-62	-930	-62	644	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	21.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGTCTTACTATTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90092814	90095956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_90093296_90093507_90093586_90094632
tx.17197	chr7	-	768	5	FSM	ENSMUSG00000030615.13	ENSMUST00000032844.7	799	5	26	5	5	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	739	junction_4	32.5297940356222	3550	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTGTCTGCAACATTAAAA	1671	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90106411	90099912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_90100144_90100750_90100866_90101914_90102109_90104631_90104728_90106279
tx.17198	chr7	-	746	5	FSM	ENSMUSG00000030615.13	ENSMUST00000136652.8	756	5	5	5	5	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_2	308.308591349641	370	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTTGTCTGCAACATTAAAA	1671	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90106411	90099912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_90100144_90100750_90100866_90101936_90102109_90104631_90104728_90106279
tx.17199	chr7	-	867	5	FSM	ENSMUSG00000030614.9	ENSMUST00000032843.9	2259	5	7	1385	1	1100	multi-exon	FALSE	canonical	3	210	junction_1	24.1389208540896	626	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTTCTTTCTTTCTTCA	6027	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90125202	90118030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_90118370_90118777_90118890_90119972_90120167_90121805_90121928_90125102
tx.172	chr1	+	1083	5	ISM	ENSMUSG00000026078.11	ENSMUST00000027247.11	3914	6	5635	592	3378	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	894	junction_3	53.7959106252511	657	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACAGTGCAAAAAATGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39030323	39035727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_39030457_39033995_39034087_39034325_39034470_39034815_39035025_39035221
tx.1720	chr10	-	2680	4	FSM	ENSMUSG00000003348.11	ENSMUST00000003438.11	2682	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_3	9.97775303139718	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCGGGCTGCTCCTTGTTG	9119	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80537687	80521086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80523008_80525685_80525889_80526902_80527402_80537630
tx.17200	chr7	+	1254	9	FSM	ENSMUSG00000030613.14	ENSMUST00000032842.13	1596	9	342	0	342	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_4	17.8658193207029	1064	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCATTGTAAATGTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92210698	92231502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_92210844_92216829_92216950_92217679_92217784_92221746_92221849_92223829_92223872_92223951_92224024_92224536_92224591_92227631_92227747_92231002
tx.17201	chr7	-	2703	9	ISM	ENSMUSG00000041328.17	ENSMUST00000151177.2	4731	13	5388	-548	5388	-169	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_7	31.850971335267	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTTTGTATTTCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92307357	92292919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_92293986_92295197_92295234_92295637_92295731_92296135_92296292_92297149_92297334_92298133_92298240_92298663_92298784_92302357_92302458_92306515
tx.17202	chr7	-	1652	2	FSM	ENSMUSG00000074024.6	ENSMUST00000182408.2	669	2	33	-1016	33	1016	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGTCTCAACTTTCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92390634	92388897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_92390185_92390269
tx.17203	chr7	+	1559	5	FSM	ENSMUSG00000030643.15	ENSMUST00000032879.15	9456	5	6	7891	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	4.32290411644765	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGAGTCAGCAGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92390816	92485852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_92391051_92469190_92469292_92473005_92473090_92478733_92478918_92484896
tx.17204	chr7	-	3443	7	FSM	ENSMUSG00000030641.11	ENSMUST00000208356.2	840	7	21	-2624	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_4	58.4648517392193	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTTTTTTGTTATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92523424	92506732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_92509521_92510607_92510726_92511532_92511695_92515778_92515908_92517319_92517407_92521969_92522053_92523348
tx.17205	chr7	-	3368	6	FSM	ENSMUSG00000030641.11	ENSMUST00000032877.11	3387	6	19	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_4	35.6168499449348	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTTTTTTGTTATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92523436	92506732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_92509521_92510607_92510726_92511532_92511695_92515778_92515908_92521969_92522053_92523348
tx.17206	chr7	+	2350	9	FSM	ENSMUSG00000061119.8	ENSMUST00000076052.8	2967	9	45	572	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_2	10.1665812837945	320	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCATTTATTGAAAAAGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92524504	92583219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_92524709_92550366_92550508_92554318_92554421_92559342_92559525_92566876_92567035_92568209_92568380_92576887_92577053_92577812_92578001_92582179
tx.17207	chr7	-	642	2	NNC	ENSMUSG00000087412.5	novel	849	2	NA	NA	-24	20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	464	junction_1	0	346	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGTTTACTGGCCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92828876	92828169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_92828742_92828806
tx.17208	chr7	-	534	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048078.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATGTCATCAGTTCACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96551493	96523804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_96524004_96526045_96526128_96551240
tx.17209	chr7	+	2497	14	FSM	ENSMUSG00000018995.13	ENSMUST00000044466.12	3778	14	19	1262	3	524	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_6	11.3976017408833	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAGAAGTTATTTTTAAA	7361	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96600730	96712703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_96601152_96605150_96605261_96607281_96607403_96608877_96609019_96622688_96622770_96652004_96652100_96672824_96672958_96680544_96680644_96680752_96680791_96684437_96684505_96689105_96689244_96706654_96706753_96708992_96709020_96711775
tx.1721	chr10	-	350	2	FSM	ENSMUSG00000003348.11	ENSMUST00000218439.2	314	2	-24	-12	3	12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCATCTCTCTTTTTTTTT	9120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80537686	80535649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80535944_80537630
tx.17210	chr7	+	2013	13	FSM	ENSMUSG00000035704.18	ENSMUST00000098300.6	2039	13	0	26	0	-26	multi-exon	TRUE	canonical	3	93	junction_8	19.8289560996034	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCAAAGTGTTTTGGGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97020812	97041366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_97020940_97022875_97022955_97027307_97027502_97029014_97029125_97029447_97029516_97031780_97031908_97032125_97032230_97032892_97033014_97036008_97036149_97037655_97037796_97039448_97039547_97040095_97040169_97040734
tx.17211	chr7	+	845	2	ISM	ENSMUSG00000035704.18	ENSMUST00000098300.6	2039	13	8	17791	8	-17255	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	132	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAACTTCTCTTACCTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97020820	97023601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_97020940_97022875
tx.17212	chr7	+	604	3	FSM	ENSMUSG00000030647.9	ENSMUST00000032882.9	683	3	74	5	-26	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	2164	junction_2	233	23121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATCTGTTCCTTTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97049283	97057004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_97049565_97056072_97056217_97056825
tx.17213	chr7	-	1118	2	FSM	ENSMUSG00000035686.9	ENSMUST00000043077.8	1277	2	162	-3	-49	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCATGTTGGTCTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97066775	97062141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_97062723_97066238
tx.17214	chr7	+	3187	23	FSM	ENSMUSG00000025133.10	ENSMUST00000026126.10	3240	23	57	-4	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	369	junction_9	43.027187253819	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTCTAGTTTCTGGTCC	990	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97130219	97190605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_97130358_97134123_97134319_97136558_97136677_97140137_97140245_97144863_97145050_97148755_97148807_97150176_97150266_97150934_97151056_97155270_97155343_97156922_97157098_97158797_97159004_97162733_97162877_97165432_97165549_97166828_97166963_97168254_97168413_97175835_97175930_97178420_97178502_97179506_97179638_97179958_97180019_97183577_97183738_97184347_97184492_97187106_97187228_97190218
tx.17215	chr7	-	673	3	FSM	ENSMUSG00000035642.17	ENSMUST00000138060.3	467	3	-4	-202	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	14	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAAGTTGAGAGCATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97228693	97199546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_97199949_97214357_97214508_97228572
tx.17216	chr7	-	873	5	FSM	ENSMUSG00000035642.17	ENSMUST00000154853.8	883	5	10	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_3	23.5902522241709	298	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAAGTTGAGAGCATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97228693	97199546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_97199949_97207337_97207434_97214357_97214508_97224794_97224899_97228572
tx.17217	chr7	-	769	4	FSM	ENSMUSG00000035642.17	ENSMUST00000136757.8	789	4	11	9	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_3	30.4740326617051	314	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAAGTTGAGAGCATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97228693	97199546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_97199949_97207337_97207434_97214357_97214508_97228572
tx.17218	chr7	+	1476	7	FSM	ENSMUSG00000025439.6	ENSMUST00000026506.5	1504	7	27	1	27	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1088	junction_4	64.1950153828161	2954	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATCGCTGTGATTTTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97345867	97368085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_97346077_97354795_97354933_97360906_97361006_97361833_97361942_97363113_97363288_97365657_97365747_97367425
tx.17219	chr7	-	1108	3	FSM	ENSMUSG00000042797.10	ENSMUST00000206389.2	3737	3	258	2371	-93	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	4.5	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCATTAGTAACTGTGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97387238	97375583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_97375912_97378177_97378295_97386575
tx.1722	chr10	+	970	7	NNC	ENSMUSG00000055862.8	novel	1196	10	NA	NA	-68	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	9.3407708461347	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATGAGGAACAATTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80538489	80541207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_80538794_80538882_80538964_80539042_80539115_80539563_80539591_80539686_80539763_80539872_80539921_80540845
tx.17220	chr7	+	1897	15	FSM	ENSMUSG00000030774.14	ENSMUST00000206984.2	2794	15	271	626	271	-25	multi-exon	TRUE	canonical	3	118	junction_1	35.6279671159656	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCCTCTTCTCCTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97438018	97560464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_97438182_97503642_97503857_97514678_97514780_97515268_97515417_97520781_97520820_97532678_97532796_97535504_97535680_97538163_97538228_97543171_97543221_97547731_97547845_97549546_97549665_97552843_97552944_97553844_97554042_97557014_97557153_97560302
tx.17221	chr7	+	1925	15	FSM	ENSMUSG00000030774.14	ENSMUST00000033040.12	3065	15	13	1127	13	-28	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	56.3067853960129	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATGTCCTCTTCTCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97492154	97560461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_97492349_97503642_97503857_97514678_97514780_97515268_97515417_97520781_97520820_97532678_97532796_97535504_97535680_97538163_97538228_97543171_97543221_97547731_97547845_97549546_97549665_97552843_97552944_97553844_97554042_97557014_97557153_97560302
tx.17222	chr7	+	2330	10	ISM	ENSMUSG00000030774.14	ENSMUST00000033040.12	3065	15	40557	7	-10423	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	198	junction_9	21.715898482761	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCTACAGGAAGTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97532698	97561581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_97532796_97535504_97535680_97538163_97538228_97543171_97543221_97547731_97547845_97549546_97549665_97552843_97552944_97553844_97554042_97557014_97557153_97560302
tx.17223	chr7	+	1034	6	ISM	ENSMUSG00000030774.14	ENSMUST00000207017.2	952	7	4608	-179	4608	179	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	198	junction_5	13.979985693841	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGAAACAGAATCTCAGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97547729	97560668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_97547845_97549546_97549665_97552843_97552944_97553844_97554042_97557014_97557153_97560302
tx.17224	chr7	-	684	2	ISM	ENSMUSG00000035547.15	ENSMUST00000107112.2	2232	13	37039	-227	36907	227	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTCCACCTCCTCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97774510	97772640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_97773263_97774448
tx.17225	chr7	-	3540	13	FSM	ENSMUSG00000035547.15	ENSMUST00000040971.14	4498	13	60	898	60	-898	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_9	14.761765552339	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACAATTGAGTTATCAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97827421	97771663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_97773263_97774448_97774586_97775035_97775152_97775452_97775650_97777679_97777803_97778450_97778647_97780397_97780476_97780882_97781077_97782039_97782233_97784966_97785176_97801018_97801151_97811122_97811318_97827250
tx.17227	chr7	+	477	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030760.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTCCGAGGTGTACTGG	581	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97831573	97858643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_97831686_97857003_97857086_97858360
tx.17228	chr7	-	606	3	ISM	ENSMUSG00000030760.15	ENSMUST00000151258.8	1440	12	85532	-27	2892	27	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	186	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTTGACTGTGAGCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97873203	97865622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_97866098_97867262_97867309_97873118
tx.17229	chr7	-	1299	11	FSM	ENSMUSG00000030760.15	ENSMUST00000033020.14	11340	11	3	10038	3	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	186	junction_1	20.7511445467473	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCATATCCAGATGGTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97958742	97865633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_97866098_97867262_97867309_97873118_97873224_97875605_97875708_97893155_97893215_97901096_97901133_97906902_97906985_97908611_97908665_97910793_97910847_97915343_97915455_97958554
tx.1723	chr10	+	779	2	ISM	ENSMUSG00000061589.15	ENSMUST00000149394.2	2820	7	3244	529	853	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGACTCCGTCCCGGTG	5423	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80628140	80629652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_80628608_80629340
tx.17230	chr7	-	1528	2	ISM	ENSMUSG00000030760.15	ENSMUST00000137899.2	441	5	5	12984	5	-12984	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAGAGAGAGAGAGAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97958708	97914080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_97915455_97958554
tx.17232	chr7	+	1222	4	ISM	ENSMUSG00000015957.13	ENSMUST00000165240.2	1395	5	7600	-244	-1308	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_2	10.1980390271856	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGTGTGTGAAATAAATGC	1639	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98495704	98503022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_98495817_98496380_98496495_98499433_98499727_98502319
tx.17233	chr7	-	1131	2	Intergenic	novelGene_1197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	44	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTGTTCTTACAGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98521661	98518932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_98519811_98521408
tx.17234	chr7	-	2263	8	FSM	ENSMUSG00000030747.6	ENSMUST00000033001.6	2262	8	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_4	10.965623464226	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGAGTTGTTGCTTAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98831927	98802864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_98803908_98806183_98806387_98807359_98807535_98808039_98808245_98813841_98813913_98814288_98814397_98818904_98819034_98831598
tx.17235	chr7	-	1252	3	ISM	ENSMUSG00000052396.8	ENSMUST00000064231.8	1780	6	15451	0	15426	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	113	junction_1	1.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCTTCTTTTCTCTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98872375	98868290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_98869167_98871459_98871660_98872199
tx.17236	chr7	-	1738	5	ISM	ENSMUSG00000052396.8	ENSMUST00000064231.8	1780	6	5880	0	5855	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_3	4.43705983732471	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCTTCTTTTCTCTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98881946	98868290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_98869167_98871459_98871660_98872199_98872375_98872707_98872913_98881664
tx.17237	chr7	-	1778	6	FSM	ENSMUSG00000052396.8	ENSMUST00000064231.8	1780	6	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_3	4.4	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCTTCTTTTCTCTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98887824	98868290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_98869167_98871459_98871660_98872199_98872375_98872707_98872913_98881664_98881844_98887681
tx.17238	chr7	+	1369	3	FSM	ENSMUSG00000055407.15	ENSMUST00000127492.2	4920	3	872	2679	15	-2679	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_2	24	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCACCGCACTTCCTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98917567	98966880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_98918521_98964895_98965110_98966678
tx.17239	chr7	+	1444	2	NNC	ENSMUSG00000055407.15	novel	3233	3	NA	NA	60032	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGTGTCTCTGGCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98978370	98986344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_98978662_98985191
tx.1724	chr10	-	892	6	FSM	ENSMUSG00000035278.10	ENSMUST00000036805.7	1260	6	368	0	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	943	junction_2	140.821021158064	3032	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATGTCGGAATGAGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80634092	80631932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80632357_80632424_80632489_80632565_80632657_80633606_80633674_80633743_80633812_80633914
tx.17240	chr7	-	2087	5	FSM	ENSMUSG00000070436.13	ENSMUST00000094154.6	2215	5	89	39	-36	-33	multi-exon	FALSE	canonical	3	1409	junction_4	114.233313879971	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTGTGTGAAAGCAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99002357	98994634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_98995630_98996131_98996365_98996472_98996572_98998009_98998672_99002259
tx.17241	chr7	-	268	2	ISM	ENSMUSG00000030744.14	ENSMUST00000208532.2	489	6	4165	0	4163	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4974	junction_1	0	32486	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCTGACTGGATTGTGTCC	3068	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99128678	99128088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_99128159_99128480
tx.17242	chr7	-	835	7	FSM	ENSMUSG00000030744.14	ENSMUST00000032998.13	1908	7	87	986	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4974	junction_1	3419.39811549083	161520	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCTGACTGGATTGTGTCC	8422	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99132858	99128088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_99128159_99128480_99128678_99129082_99129271_99130903_99130999_99131467_99131562_99131776_99131908_99132798
tx.17243	chr7	+	1965	16	NNC	ENSMUSG00000018909.16	novel	434	6	NA	NA	6528	516	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3	junction_1	5.82485097568074	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTGTGTGTGTGTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99228798	99250878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_99229065_99231467_99231499_99232866_99232928_99236421_99236467_99237204_99237402_99238101_99238162_99238857_99238926_99240469_99240606_99241710_99241796_99242196_99242270_99243827_99243966_99245229_99245314_99246242_99246267_99247697_99247769_99249007_99249060_99250304
tx.17244	chr7	-	2685	3	FSM	ENSMUSG00000035239.7	ENSMUST00000036331.7	3341	3	17	639	17	-639	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTGTTTGTTTTTTTG	6042	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99477607	99461284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_99463515_99472528_99472741_99477364
tx.17245	chr7	-	1495	5	FSM	ENSMUSG00000035227.8	ENSMUST00000036274.8	2909	5	80	1334	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	1599	junction_2	370.901856964885	9120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGGAGTCTTGAAAGAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99508104	99488109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_99489091_99493906_99494042_99497505_99497667_99498182_99498267_99507970
tx.17246	chr7	-	3003	12	FSM	ENSMUSG00000030726.17	ENSMUST00000032969.14	3069	12	64	2	-35	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	502	junction_4	47.2898570362863	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTCTGGTGCGAGTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99770708	99731319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_99733062_99737270_99737350_99738858_99738963_99742578_99742689_99745579_99745743_99748670_99748744_99749626_99749889_99755769_99755903_99757718_99757759_99761476_99761580_99768880_99768937_99770570
tx.17247	chr7	+	800	3	NNC	ENSMUSG00000030725.5	novel	1663	2	NA	NA	285	279	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	41	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAATGTCTCAAGTTTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99808850	99810140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_99808955_99809380_99809666_99809729
tx.17248	chr7	+	1092	5	ISM	ENSMUSG00000051048.18	ENSMUST00000208565.2	1215	9	11714	-464	11714	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_2	1.4790199457749	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCTAACAGCGACTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99962501	99968908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_99962573_99963814_99963878_99966248_99966318_99967188_99967286_99968116
tx.17249	chr7	+	344	2	ISM	ENSMUSG00000047248.21	ENSMUST00000156559.8	1909	10	-26	32827	9	-32827	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAGCCTCCTACTTCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100021461	100023572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_100021704_100023470
tx.1725	chr10	+	1740	9	NNC	ENSMUSG00000020211.16	novel	2213	9	NA	NA	-115	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	103	junction_1	429.244230450451	57	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCTGTCTGCTGTGTGTTT	4771	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80634450	80640758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_80634586_80637029_80637193_80637289_80637362_80638231_80638279_80638625_80638736_80639293_80639344_80639416_80639558_80639653_80639723_80639805
tx.17250	chr7	-	490	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047248.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCAGGACTGTATAAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100030441	100027934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_100028302_100030318
tx.17251	chr7	+	1573	8	FSM	ENSMUSG00000033685.14	ENSMUST00000126534.8	3988	8	21	2394	4	324	multi-exon	TRUE	canonical	3	366	junction_1	56.4938140012529	1233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCTTCTTTCTCATATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100142564	100148833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_100142673_100143420_100143583_100145932_100146156_100146301_100146513_100147284_100147480_100147554_100147657_100147942_100148124_100148442
tx.17252	chr7	+	760	4	ISM	ENSMUSG00000033685.14	ENSMUST00000126534.8	3988	8	4849	2395	45	323	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	444	junction_1	36.3532055746884	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTCTTCTTTCTCATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100147392	100148832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_100147480_100147554_100147657_100147942_100148124_100148442
tx.17253	chr7	-	688	3	ISM	ENSMUSG00000030708.15	ENSMUST00000054923.9	847	7	6964	-68	6964	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_2	3	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGAAGTGAGTTGGAGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100154024	100152217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_100152518_100153122_100153200_100153713
tx.17254	chr7	-	978	7	ISM	ENSMUSG00000030708.15	ENSMUST00000130534.8	1159	8	1594	-7	-24	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_5	19.1020650425259	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGGGAAGTGAGTTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100161012	100152220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_100152518_100153122_100153200_100153713_100153828_100155288_100155403_100156582_100156741_100159901_100160064_100160956
tx.17255	chr7	-	829	6	ISM	ENSMUSG00000030708.15	ENSMUST00000154516.3	905	7	2982	-67	-33	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_4	7.5736384915046	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGGGAAGTGAGTTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100161021	100152220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_100152518_100153122_100153200_100153713_100153828_100155288_100155403_100159901_100160064_100160956
tx.17256	chr7	+	843	2	FSM	ENSMUSG00000044881.8	ENSMUST00000054310.4	1391	2	-9	557	-9	33	multi-exon	FALSE	canonical	3	255	junction_1	0	331	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAAGTGCCTCTATCTTTC	7562	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100186297	100189019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_100186400_100188278
tx.17257	chr7	+	875	2	FSM	ENSMUSG00000044881.8	ENSMUST00000120454.3	742	2	-103	-30	29	30	multi-exon	FALSE	canonical	2	17	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACATAAGTGCCTCTATCT	7600	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100186335	100189016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_100186473_100188278
tx.17258	chr7	-	921	8	FSM	ENSMUSG00000030706.18	ENSMUST00000150042.8	4285	8	-2	3366	-2	120	multi-exon	FALSE	canonical	3	320	junction_4	76.5855530682877	1425	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTTTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100232311	100198323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_100198590_100199746_100199837_100201785_100201889_100208954_100209125_100214400_100214487_100220458_100220497_100223668_100223722_100232196
tx.17259	chr7	-	1807	7	FSM	ENSMUSG00000030701.18	ENSMUST00000107044.10	1806	7	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	4.3365372770859	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACTGGCTTTGCTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100307663	100293105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_100294277_100294776_100294877_100302860_100302901_100303808_100303912_100304455_100304609_100305941_100306018_100307499
tx.1726	chr10	+	1735	9	FSM	ENSMUSG00000020211.16	ENSMUST00000148665.8	2213	9	478	0	-56	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1171	junction_7	118.037004261376	639	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCTGTCTGCTGTGTGTTT	4830	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80634509	80640758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80634640_80637029_80637193_80637289_80637362_80638231_80638279_80638625_80638736_80639293_80639344_80639416_80639558_80639653_80639723_80639805
tx.17260	chr7	+	511	2	FSM	ENSMUSG00000108866.2	ENSMUST00000208164.2	525	2	0	14	0	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAAAAGAAATTGCTA	4876	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100324294	100326953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_100324371_100326518
tx.17262	chr7	+	1178	8	FSM	ENSMUSG00000029461.18	ENSMUST00000207875.2	4077	8	-86	2985	-1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	35	junction_2	3.48173074484398	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGAGCCTCCCCTCGTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100355840	100485404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_100356101_100436010_100436099_100462126_100462208_100473338_100473465_100480534_100480678_100483215_100483391_100484533_100484665_100485230
tx.17263	chr7	-	2080	17	FSM	ENSMUSG00000047767.18	ENSMUST00000122116.8	2083	17	4	-1	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_10	7.54750579661917	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGCCTCTTTGAAGCAT	8398	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100951274	100938822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_100939142_100939376_100939479_100939569_100939618_100939788_100939939_100940693_100940800_100941085_100941207_100941314_100941387_100941560_100941632_100942579_100942686_100943082_100943192_100945327_100945442_100945714_100945781_100945963_100946216_100946366_100946441_100948212_100948316_100949318_100949419_100951107
tx.17264	chr7	-	1528	12	ISM	ENSMUSG00000047767.18	ENSMUST00000122116.8	2083	17	5352	1	-7	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_10	7.43900819835592	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCTTGCCTCTTTGAAGC	9118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100945926	100938824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_100939142_100939376_100939479_100939569_100939618_100939788_100939939_100940693_100940800_100941085_100941207_100941314_100941387_100941560_100941632_100942579_100942686_100943082_100943192_100945327_100945442_100945714
tx.17265	chr7	+	2997	21	FSM	ENSMUSG00000032812.19	ENSMUST00000098243.4	3693	21	2	694	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	25.1838738084513	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGTGCTGAGGCCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101043576	101061099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101043675_101043940_101044116_101045267_101045403_101047502_101047639_101047902_101048006_101048685_101048882_101049189_101049242_101049334_101049499_101049598_101049812_101050089_101050196_101050596_101050745_101050829_101050917_101050998_101051068_101051265_101051384_101053171_101053286_101053486_101053633_101057253_101057337_101058320_101058372_101058497_101058562_101060126_101060277_101060510
tx.17266	chr7	+	1526	11	ISM	ENSMUSG00000032812.19	ENSMUST00000098243.4	3693	21	7117	692	-296	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_1	10.6658333007787	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGCTGAGGCCTGTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101050691	101061101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_101050745_101050829_101050917_101050998_101051068_101051265_101051384_101053171_101053286_101053486_101053633_101057253_101057337_101058320_101058372_101058497_101058562_101060126_101060277_101060510
tx.17267	chr7	+	2155	16	FSM	ENSMUSG00000001829.18	ENSMUST00000001884.14	4627	16	118	2354	-6	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	662	junction_8	67.7342519622745	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACCTTGCCCTCATGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101312957	101437021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101313421_101316454_101316507_101336494_101336582_101355689_101355794_101371911_101372041_101400440_101400539_101412787_101412903_101422286_101422365_101423398_101423455_101427778_101427824_101428408_101428571_101434534_101434692_101435306_101435381_101435493_101435614_101435852_101435958_101436711
tx.17268	chr7	-	861	2	ISM	ENSMUSG00000032737.14	ENSMUST00000165052.8	4730	29	14187	8	890	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAAGGAAAACCATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101472823	101471853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_101472611_101472719
tx.17269	chr7	+	750	3	NNC	ENSMUSG00000073985.3	novel	1310	3	NA	NA	-51	4700	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGGTTTGACCCTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101487037	101496678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_101487379_101488008_101488227_101496487
tx.1727	chr10	-	1666	2	ISM	ENSMUSG00000020216.14	ENSMUST00000020435.11	955	5	1618	0	1618	0	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCATCTACTCCTTTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80646101	80644329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80644874_80644979
tx.17270	chr7	-	923	4	FSM	ENSMUSG00000001827.13	ENSMUST00000106981.8	960	4	21	16	21	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	303	junction_2	18.9267594221045	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCCTTATGAATTATTTG	8119	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101513331	101507553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_101507952_101508303_101508440_101508572_101508762_101513131
tx.17271	chr7	-	1202	5	ISM	ENSMUSG00000001827.13	ENSMUST00000106986.9	1286	7	1979	14	-37	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	257	junction_4	35.4788669492136	267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTTATGAATTATTTGGG	3539	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101517911	101507551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_101507952_101508303_101508440_101508572_101508762_101513131_101513302_101517604
tx.17272	chr7	-	1234	6	ISM	ENSMUSG00000001827.13	ENSMUST00000106986.9	1286	7	1341	15	-18	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_5	113.141327550988	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCCTTATGAATTATTTGG	2901	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101518549	101507552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_101507952_101508303_101508440_101508572_101508762_101513131_101513302_101517604_101517759_101518363
tx.17273	chr7	+	750	5	FSM	ENSMUSG00000030649.19	ENSMUST00000106973.8	650	5	-37	-63	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	224.489420686143	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGTCTATTCCCTGTTTGT	7788	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101545585	101548750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101545658_101547148_101547279_101547760_101547821_101548106_101548245_101548400
tx.17274	chr7	+	980	5	FSM	ENSMUSG00000030649.19	ENSMUST00000032884.16	937	5	-38	-5	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	304	junction_1	120.728000066265	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGTCTATTCCCTGTTTGT	7799	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101545596	101548750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101545658_101546939_101547025_101547148_101547279_101547760_101547821_101548106
tx.17275	chr7	+	823	6	FSM	ENSMUSG00000030649.19	ENSMUST00000144207.9	3103	6	-25	2305	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	304	junction_1	109.312396369305	1031	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTCTATTCCCTGTTTGTT	7801	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101545598	101548751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101545658_101546939_101547025_101547148_101547279_101547760_101547821_101548106_101548245_101548400
tx.17276	chr7	+	820	6	NNC	ENSMUSG00000030649.19	novel	2797	5	NA	NA	-104	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	40	junction_1	204.430330430687	96	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTATTCCCTGTTTGTTG	8168	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101545965	101548752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_101546021_101546939_101547025_101547148_101547279_101547760_101547821_101548106_101548245_101548400
tx.17277	chr7	+	764	5	FSM	ENSMUSG00000030649.19	ENSMUST00000178851.2	2797	5	-63	2096	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	447	junction_4	71.736932607967	222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGTCTATTCCCTGTTTGT	9141	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101546938	101548750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101547025_101547148_101547279_101547760_101547821_101548106_101548245_101548400
tx.17278	chr7	+	1111	5	FSM	ENSMUSG00000030842.13	ENSMUST00000033131.12	1119	5	5	3	5	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	733	junction_4	69.0230939613692	592	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACCTGCTCTGTCCTGCCC	7032	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101555115	101561107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101555248_101558870_101559017_101559235_101559314_101559626_101559754_101560479
tx.17279	chr7	-	1030	4	NIC	ENSMUSG00000064307.14	novel	939	3	NA	NA	3	0	intron_retention	FALSE	canonical	2	8	junction_3	3.09120616516523	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAAGTCCCCTGTACCTTG	2539	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101583061	101562195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_101562791_101564768_101564975_101569843_101569982_101582970
tx.1728	chr10	+	1114	4	NIC	ENSMUSG00000035242.16	novel	1044	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	7082	junction_2	297.278021761149	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGCTGTGTCTTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80662519	80665119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_80662740_80664070_80664217_80664294_80664468_80664544
tx.17280	chr7	-	813	5	FSM	ENSMUSG00000064307.14	ENSMUST00000106966.8	821	5	9	-1	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3.93700393700591	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAAGTCCCCTGTACCTTG	2534	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101583066	101562195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_101562420_101562641_101562791_101564768_101564975_101569843_101569982_101582970
tx.17281	chr7	-	2192	9	NIC	ENSMUSG00000070426.13	novel	2249	9	NA	NA	3	7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_6	120.056692337412	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACACGCATTTGCCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101714362	101668351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_101669700_101672518_101672621_101673219_101673354_101678218_101678340_101680700_101680809_101684513_101684623_101688756_101688899_101691833_101691872_101714272
tx.17282	chr7	-	2349	9	FSM	ENSMUSG00000070426.13	ENSMUST00000089052.11	2344	9	4	-9	4	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_8	114.601483410993	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGCATTTGCCTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101714672	101668349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_101669700_101672518_101672621_101673219_101673354_101678218_101678340_101680700_101680809_101684513_101684669_101688756_101688899_101691833_101691872_101714473
tx.17283	chr7	-	2233	9	FSM	ENSMUSG00000070426.13	ENSMUST00000096639.12	2249	9	4	12	4	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	288	junction_4	49.7203114933927	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGACACGCATTTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101714361	101668355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_101669700_101672518_101672621_101673219_101673354_101678218_101678340_101680700_101680809_101684513_101684669_101688756_101688899_101691833_101691872_101714272
tx.17284	chr7	+	2099	11	FSM	ENSMUSG00000099481.7	ENSMUST00000094130.4	2298	11	-255	454	-8	36	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	17.4482090771517	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAATGAGTCTTGAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101714709	101731834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101715012_101719103_101719199_101720393_101720569_101722381_101722524_101725003_101725160_101726955_101727135_101727939_101728026_101728211_101728385_101729735_101729812_101730689_101730818_101731247
tx.17285	chr7	+	3095	11	Fusion	ENSMUSG00000099481.7_ENSMUSG00000100254.2	novel	2298	11	NA	NA	20	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	7	junction_1	28.9048438847194	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTATGTGTTGCCGATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101714984	101732967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr7_+_101715150_101719103_101719199_101720393_101720569_101722381_101722524_101725003_101725160_101726955_101727135_101727939_101728026_101728211_101728385_101729735_101729812_101730689_101730818_101731247
tx.17286	chr7	+	954	3	ISM	ENSMUSG00000030996.9	ENSMUST00000033300.4	1425	5	5235	5	5235	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAATTTTTGCAATGATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101756184	101760358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_101756640_101757933_101757976_101759901
tx.17287	chr7	+	2014	7	FSM	ENSMUSG00000030990.19	ENSMUST00000156529.8	2034	7	17	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_5	43.1689188601655	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGAGGTAGGTATGTTGC	611	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101872251	101887771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101872358_101872585_101872698_101875477_101875653_101885300_101885554_101885654_101885750_101886328_101886438_101886607
tx.17288	chr7	+	2026	7	FSM	ENSMUSG00000030990.19	ENSMUST00000033292.14	1201	7	-24	-801	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_5	27.0657635317306	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGAGGTAGGTATGTTGC	611	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101872251	101887771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_101872358_101872585_101872698_101875477_101875653_101885300_101885554_101885654_101885762_101886328_101886438_101886607
tx.17289	chr7	+	1914	6	NIC	ENSMUSG00000030990.19	novel	1201	7	NA	NA	0	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	29	junction_1	55.9692772867401	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGAGGTAGGTATGTTGC	611	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101872251	101887771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_101872358_101875477_101875653_101885300_101885554_101885654_101885762_101886328_101886438_101886607
tx.1729	chr10	+	1018	5	NIC	ENSMUSG00000035242.16	novel	1044	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	460	junction_4	2987.93005272881	367	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGCTGTGTCTTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80662519	80665119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_80662740_80664070_80664217_80664294_80664468_80664544_80664631_80664726
tx.17290	chr7	-	1263	2	FSM	ENSMUSG00000073982.12	ENSMUST00000098230.11	1269	2	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGGCTCCTCCCTATGTG	6366	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101899324	101888329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_101889520_101899251
tx.17291	chr7	+	3037	19	NNC	ENSMUSG00000030978.11	novel	3997	19	NA	NA	-69	244	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	227.118069038883	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGTGGTACTAAACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102091020	102118133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_102091251_102092193_102092283_102095756_102095935_102097007_102097109_102098401_102098462_102099242_102099283_102100107_102100275_102103702_102103845_102105677_102105762_102106358_102106521_102106766_102106847_102108595_102108798_102109497_102109648_102109836_102110059_102110813_102110891_102112852_102112989_102114924_102115021_102116084_102116274_102117501
tx.17292	chr7	+	883	3	ISM	ENSMUSG00000030978.11	ENSMUST00000033283.10	3997	19	24057	845	2030	244	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	945	junction_2	69	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGTGGTACTAAACTTGT	7811	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102114958	102118133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_102115021_102116084_102116274_102117501
tx.17293	chr7	+	781	2	ISM	ENSMUSG00000030978.11	ENSMUST00000209630.2	747	4	3196	-244	3196	244	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	945	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGTGGTACTAAACTTGT	8977	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102116124	102118133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_102116274_102117501
tx.17294	chr7	-	325	2	Intergenic	novelGene_1198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGCTTTGTCTTGGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102662710	102653604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_102653827_102662607
tx.17295	chr7	-	512	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083854.4	novel	351	1	NA	NA	-115	98	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAGATTGAGAGAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103532326	103531762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_103532157_103532208
tx.17296	chr7	+	3540	9	NNC	ENSMUSG00000072244.12	novel	3827	8	NA	NA	-1	-248	intron_retention	TRUE	canonical	0	0	junction_3	304.950995038547	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGGAGTCTTCTTACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103867998	103884111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_103868091_103874713_103875188_103876015_103876116_103877352_103877584_103879934_103879958_103880995_103881097_103881319_103881347_103881573_103882780_103882825
tx.17298	chr7	+	1299	4	NNC	ENSMUSG00000072244.12	novel	1490	3	NA	NA	8	15	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_3	346.935472706701	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGGAGAAGGAAGGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103868009	103876955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_103868091_103874713_103875188_103876015_103876366_103876561
tx.17299	chr7	+	1480	3	FSM	ENSMUSG00000072244.12	ENSMUST00000144538.2	1490	3	23	-13	21	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	703	junction_1	31	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGGAGAAGGAAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103868022	103876953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_103868091_103874713_103875188_103876015
tx.173	chr1	+	372	3	ISM	ENSMUSG00000026077.16	ENSMUST00000056815.9	4236	21	106467	50086	-40876	25535	internal_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_2	3	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGCGTTTGGATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39339759	39352231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_39339815_39350921_39351043_39352035
tx.1730	chr10	+	1041	5	NIC	ENSMUSG00000035242.16	novel	1044	6	NA	NA	0	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	6566	junction_4	420.790624895565	14769	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGTGTCTTGTGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80662519	80665120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_80662740_80664070_80664217_80664294_80664468_80664544_80664631_80664704
tx.17300	chr7	+	3574	9	NNC	ENSMUSG00000072244.12	novel	1506	8	NA	NA	-20	-251	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_3	322.606934790621	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGATGGAGTCTTCTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103868615	103884108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_103868745_103874713_103875188_103876015_103876116_103877352_103877584_103879934_103879958_103880995_103881097_103881319_103881347_103881573_103882780_103882825
tx.17301	chr7	-	1894	2	FSM	ENSMUSG00000062369.3	ENSMUST00000076501.2	1407	2	-85	-402	14	347	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGTCGTCTTCCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104491796	104489116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_104490898_104491683
tx.17302	chr7	-	642	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094685.3	novel	375	1	NA	NA	-195	751	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGGGAAAAAGGTCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104599691	104598370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_104598581_104599259
tx.17303	chr7	-	1309	4	ISM	ENSMUSG00000044465.20	ENSMUST00000137158.8	3414	12	15758	0	-107	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	167	junction_3	18.6607133363712	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTGCTCATTCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105033434	105027816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_105028337_105030286_105030450_105030605_105030785_105032987
tx.17304	chr7	+	1733	3	ISM	ENSMUSG00000030898.16	ENSMUST00000033189.6	2573	5	8407	0	8321	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAAGGCTCAGATTATTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105083344	105085546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_105083452_105083726_105083903_105084096
tx.17305	chr7	-	1080	2	FSM	ENSMUSG00000037060.4	ENSMUST00000047040.4	1662	2	60	522	60	-522	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGACTCAATGAGAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105131447	105129811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_105130427_105130982
tx.17306	chr7	+	2378	6	FSM	ENSMUSG00000037049.10	ENSMUST00000046983.10	2412	6	32	2	32	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_2	5.53534100123922	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGTTCCTATTTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105203598	105207594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_105204045_105204428_105205202_105205713_105205886_105206124_105206202_105206556_105206703_105206830
tx.17307	chr7	+	708	2	FSM	ENSMUSG00000037049.10	ENSMUST00000210934.2	2359	2	-34	1685	32	-1259	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCCCCGGTGCCCCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105203598	105204690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_105204045_105204428
tx.17308	chr7	-	1146	6	ISM	ENSMUSG00000037032.17	ENSMUST00000188368.7	1970	14	3128	0	-144	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_3	12.5857061780418	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTCTTCCTGTGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105214856	105207690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_105208258_105208338_105208516_105208649_105208766_105214178_105214263_105214507_105214593_105214739
tx.17309	chr7	-	2638	14	FSM	ENSMUSG00000037032.17	ENSMUST00000189378.7	2878	14	259	-19	-40	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_6	14.1718113410527	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTCTTCCTGTGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105230439	105207690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_105208258_105208338_105208516_105208649_105208766_105214178_105214263_105214507_105214593_105214739_105214855_105215257_105215386_105215754_105215905_105216289_105216354_105216460_105216547_105216634_105216692_105216784_105216961_105222888_105223624_105230341
tx.1731	chr10	+	1527	2	FSM	ENSMUSG00000035242.16	ENSMUST00000179894.2	2526	2	1000	-1	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7170	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGCTGTGTCTTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80663515	80665119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80664468_80664544
tx.17310	chr7	-	1153	6	ISM	ENSMUSG00000036989.17	ENSMUST00000147044.4	2972	12	16004	-2	545	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_5	2.93938769133981	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGCTAGGTTCTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105266688	105259854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_105260418_105260535_105260677_105261813_105261885_105262104_105262274_105262455_105262624_105266647
tx.17311	chr7	-	819	2	ISM	ENSMUSG00000030881.16	ENSMUST00000127853.8	1354	4	1046	-3	1046	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCAGTGAGGTCAATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105286063	105284827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_105285601_105286017
tx.17312	chr7	-	1807	8	FSM	ENSMUSG00000030881.16	ENSMUST00000131446.8	3275	8	50	1418	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_3	9.16515138991168	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCCAGTGAGGTCAATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105289573	105284827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_105285601_105286017_105286193_105286327_105286486_105287025_105287248_105287415_105287535_105288215_105288313_105288531_105288673_105289451
tx.17313	chr7	+	671	4	FSM	ENSMUSG00000089847.9	ENSMUST00000058333.10	694	4	26	-3	26	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	108	junction_3	126.499011853848	295	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTGCTTTCTTGTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105289680	105291053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_105289830_105289968_105290065_105290234_105290436_105290828
tx.17314	chr7	+	564	3	FSM	ENSMUSG00000089847.9	ENSMUST00000106783.8	3273	3	424	2285	32	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	351	junction_1	22.5	916	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGTCTATGGGTACCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105289686	105290559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_105289830_105289968_105290065_105290234
tx.17315	chr7	-	2302	7	FSM	ENSMUSG00000030888.15	ENSMUST00000033179.14	3053	7	274	477	-134	197	multi-exon	FALSE	canonical	3	246	junction_4	21.202725191719	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTCGTTGATCTCACT	9853	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105385714	105381413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_105382351_105382558_105382656_105382738_105382846_105382974_105383105_105383206_105383661_105383896_105384264_105385504
tx.17316	chr7	+	1719	13	FSM	ENSMUSG00000030890.17	ENSMUST00000033182.10	1795	13	75	1	-4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	265	junction_1	33.4937805171846	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCGTGTGGGGACAGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105385873	105392131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_105385924_105386307_105386445_105389383_105389550_105389719_105389816_105389977_105390075_105390166_105390251_105390354_105390441_105390580_105390691_105390786_105390915_105390993_105391116_105391203_105391304_105391413_105391545_105391719
tx.17317	chr7	+	1670	12	ISM	ENSMUSG00000030890.17	ENSMUST00000163389.9	1749	13	375	-2	-1	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	270	junction_7	30.9136360294609	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCGTGTGGGGACAGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105386306	105392131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_105386445_105389383_105389550_105389719_105389816_105389977_105390075_105390166_105390251_105390354_105390441_105390580_105390691_105390786_105390915_105390993_105391116_105391203_105391304_105391413_105391545_105391719
tx.17318	chr7	+	1533	11	ISM	ENSMUSG00000030890.17	ENSMUST00000163389.9	1749	13	3451	-2	-12	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	270	junction_6	30.6047381952534	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCGTGTGGGGACAGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105389382	105392131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_105389550_105389719_105389816_105389977_105390075_105390166_105390251_105390354_105390441_105390580_105390691_105390786_105390915_105390993_105391116_105391203_105391304_105391413_105391545_105391719
tx.17319	chr7	-	489	4	FSM	ENSMUSG00000043866.12	ENSMUST00000131683.8	601	4	111	1	111	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1257	junction_1	50.2084543567006	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGGGGCTGATCCCTCCCA	6829	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105393178	105392103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_105392271_105392432_105392548_105392634_105392700_105393036
tx.1732	chr10	-	470	4	FSM	ENSMUSG00000035215.10	ENSMUST00000035775.9	468	4	-1	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2872	junction_3	751.769616009822	10585	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTGCTCTGTAACTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80691044	80688657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80688935_80689591_80689664_80690451_80690543_80691014
tx.17320	chr7	-	2429	13	FSM	ENSMUSG00000030894.6	ENSMUST00000033184.6	3558	13	18	1111	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	275	junction_12	25.3212690571912	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGCTTGAGTGATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105401424	105395128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_105395980_105396149_105396276_105396593_105396753_105396865_105396987_105397788_105397859_105398089_105398279_105398431_105398631_105398743_105398920_105399066_105399195_105399386_105399538_105400796_105400937_105401188_105401261_105401377
tx.17321	chr7	-	881	3	FSM	ENSMUSG00000030879.11	ENSMUST00000124482.3	7300	3	44	6375	-27	76	multi-exon	FALSE	canonical	3	2255	junction_2	27.5	6003	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTAGGTCTAGTTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105460262	105458787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_105459352_105459656_105459726_105460014
tx.17322	chr7	-	476	2	Intergenic	novelGene_1199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	92	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTCTGTTTCTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106838166	106836988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_106837208_106837909
tx.17323	chr7	+	984	4	NNC	ENSMUSG00000057215.7	novel	1294	6	NA	NA	-11	-4402	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_3	8.98146239020499	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATTGTGTGTTTGTCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106842217	106895201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_106842336_106883988_106884145_106884819_106884938_106894609
tx.17324	chr7	+	1493	3	NNC	ENSMUSG00000051041.9	novel	1685	3	NA	NA	-13831	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCACTGCCTTAAGTATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107152821	107190301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_107153079_107170243_107170533_107189354
tx.17325	chr7	+	1977	3	FSM	ENSMUSG00000051041.9	ENSMUST00000120990.2	1685	3	-19	-273	-19	273	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATATTAGTTACATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107166633	107190574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_107167102_107170243_107170533_107189354
tx.17326	chr7	-	1219	9	FSM	ENSMUSG00000048065.9	ENSMUST00000208217.2	1178	9	-40	-1	-4	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_8	13.026415470113	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCACAATGTGTGGATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107357243	107349170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_107349604_107350373_107350474_107351537_107351624_107352422_107352507_107353052_107353183_107353910_107354018_107356117_107356191_107356391_107356519_107357164
tx.17327	chr7	+	991	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060759.5	novel	972	1	NA	NA	-1912	-416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGTAGCCAAGTTGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108141821	108144289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_+_108142213_108143689
tx.17328	chr7	+	1006	8	FSM	ENSMUSG00000031029.7	ENSMUST00000033342.7	2514	8	248	1260	248	683	multi-exon	FALSE	canonical	3	2245	junction_2	107.423632105296	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATCTGATGCGAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108533871	108540898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_108534015_108536952_108537024_108537242_108537323_108537615_108537754_108539396_108539489_108539850_108539988_108540100_108540215_108540667
tx.17329	chr7	+	792	6	ISM	ENSMUSG00000031029.7	ENSMUST00000033342.7	2514	8	3619	1260	-359	683	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2258	junction_1	102.873514570078	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATCTGATGCGAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108537242	108540898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_108537323_108537615_108537754_108539396_108539489_108539850_108539988_108540100_108540215_108540667
tx.1733	chr10	+	584	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020219.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGCCGGGGCACCACGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80735742	80736632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_80736103_80736408
tx.17331	chr7	+	448	3	ISM	ENSMUSG00000031029.7	ENSMUST00000033342.7	2514	8	6261	1260	370	683	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2450	junction_2	62.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATCTGATGCGAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108539884	108540898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_108539988_108540100_108540215_108540667
tx.17332	chr7	+	327	2	ISM	ENSMUSG00000031029.7	ENSMUST00000033342.7	2514	8	6495	1260	604	683	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2450	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTATCTGATGCGAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108540118	108540898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_108540215_108540667
tx.17333	chr7	-	2343	5	ISM	ENSMUSG00000048330.15	ENSMUST00000055993.13	5281	6	25387	2704	-120	932	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_4	4.58257569495584	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTGTTTCCTTCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108657151	108636222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_108638091_108647157_108647304_108653571_108653666_108655950_108656024_108656989
tx.17334	chr7	-	1708	4	ISM	ENSMUSG00000048330.15	ENSMUST00000133876.2	3258	5	25340	1363	-147	-1363	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_3	5.24933858267454	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAATTGCATCATTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108657178	108645951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_108647304_108653571_108653666_108655950_108656024_108656989
tx.17335	chr7	-	1909	5	FSM	ENSMUSG00000048330.15	ENSMUST00000133876.2	3258	5	-14	1363	-3	-1363	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_3	4.55521678957215	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAATTGCATCATTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108682532	108645951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_108647304_108653571_108653666_108655950_108656024_108656989_108657217_108682369
tx.17336	chr7	-	1099	2	FSM	ENSMUSG00000048330.15	ENSMUST00000129629.2	469	2	-28	-602	-2	602	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACCTTCTGGGCTAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108682540	108679348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_108680277_108682369
tx.17337	chr7	-	894	4	NNC	ENSMUSG00000036111.9	novel	1282	4	NA	NA	25656	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	28.9942523039768	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGACTGCATTGTTCACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108744063	108737775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_108738184_108739788_108739915_108742662_108742877_108743917
tx.17338	chr7	-	914	4	FSM	ENSMUSG00000036111.9	ENSMUST00000207178.2	912	4	103	-105	103	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_1	6.37704215656966	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATGACTGCATTGTTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108774311	108737776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_108738184_108739788_108739915_108742662_108742877_108774144
tx.17339	chr7	-	1749	11	NNC	ENSMUSG00000031027.16	novel	1304	11	NA	NA	51220	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	34	junction_10	9.45568612000208	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCACGTGTCCTTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108986804	108878419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_108879064_108911477_108911628_108920003_108920090_108920667_108920781_108924887_108924964_108926798_108926887_108928739_108928829_108930675_108930815_108935247_108935353_108937526_108937641_108986659
tx.1734	chr10	-	596	3	FSM	ENSMUSG00000020219.8	ENSMUST00000020440.7	1225	3	170	459	-14	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	3643	junction_2	39.5	26946	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGCGTGTCACCTCACTG	5618	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80736633	80735742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80736094_80736315_80736385_80736457
tx.17340	chr7	-	1509	9	NNC	ENSMUSG00000031027.16	novel	1304	11	NA	NA	51230	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_6	19.1861766644634	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTCACGTGTCCTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108986794	108878421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_108879064_108911477_108911628_108920003_108920090_108920667_108920781_108924887_108924964_108926798_108926887_108935247_108935353_108937526_108937641_108986659
tx.17341	chr7	+	563	5	FSM	ENSMUSG00000046364.15	ENSMUST00000143107.2	1158	5	0	595	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	7451	junction_1	3855.66202972978	5735	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTTGCATCCTTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109118353	109120979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_109118430_109118791_109118856_109119124_109119201_109119674_109119850_109120807
tx.17342	chr7	+	733	5	NIC	ENSMUSG00000046364.15	novel	526	4	NA	NA	8	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6920.42061582965	575	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTCTTTGCATCCTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109118434	109120977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_109118683_109118791_109118856_109119124_109119201_109119674_109119850_109120807
tx.17343	chr7	+	1427	4	ISM	ENSMUSG00000046364.15	ENSMUST00000143107.2	1158	5	82	11	9	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12965	junction_3	1855.24883027108	263	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGATTGTCTACATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109118435	109121563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_109118856_109119124_109119201_109119674_109119850_109120807
tx.17344	chr7	-	661	4	NIC	ENSMUSG00000031024.14	novel	553	4	NA	NA	-8	109	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	65	junction_3	69.5237769080158	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCTGGGTATCCGAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109302820	109156278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_109156669_109169213_109169319_109216264_109216355_109302744
tx.17345	chr7	+	1024	6	FSM	ENSMUSG00000031023.6	ENSMUST00000033335.6	1028	6	1	3	1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	170	junction_1	91.1249691357972	423	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTCATTTTATTGCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109302897	109311393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_109302984_109303152_109303378_109304157_109304239_109306604_109306719_109308147_109308229_109310956
tx.17346	chr7	+	1068	5	ISM	ENSMUSG00000031023.6	ENSMUST00000033335.6	1028	6	126	3	64	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	347	junction_1	28.0624304008046	474	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTCATTTTATTGCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109303022	109311393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_109303378_109304157_109304239_109306604_109306719_109308147_109308229_109310956
tx.17347	chr7	-	1687	5	FSM	ENSMUSG00000031021.14	ENSMUST00000033333.13	1703	5	16	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_4	15.7698287879102	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAATGTTTCTGTTCTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109351470	109335040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_109336199_109342753_109342889_109344516_109344626_109349219_109349312_109351277
tx.17348	chr7	-	401	2	Intergenic	novelGene_1200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAGAACATGAATAATTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109389019	109388260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_109388571_109388928
tx.17349	chr7	-	1134	4	ISM	ENSMUSG00000007279.15	ENSMUST00000132113.8	2473	17	34687	-391	1991	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0.942809041582063	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGACTAGAAAGAATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109405447	109397909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_109398613_109399780_109399861_109403814_109403968_109405249
tx.1735	chr10	+	1284	4	FSM	ENSMUSG00000015312.10	ENSMUST00000015456.10	1284	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_3	10.2089285540757	1016	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGTTCTCGTTGTATTTTA	248	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80765906	80768038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80766194_80766281_80766384_80766862_80767086_80767366
tx.17350	chr7	-	2349	7	FSM	ENSMUSG00000047554.15	ENSMUST00000094097.12	3840	7	189	1302	-3	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	346	junction_6	24.644133852366	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATATTGTATCTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109585469	109572695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_109574159_109575801_109575941_109577916_109578022_109578595_109578690_109580195_109580325_109581862_109581981_109585168
tx.17352	chr7	+	1300	5	NNC	ENSMUSG00000066232.5	novel	4763	25	NA	NA	21263	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	46	junction_4	362.773603642823	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTTGTGTTGTGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109650535	109655816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_109650735_109651917_109652125_109653206_109653324_109654223_109654345_109655160
tx.17353	chr7	+	3011	16	NNC	ENSMUSG00000061079.15	novel	3003	16	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	72.8924931358199	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTTTGTTTGTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109660915	109694601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_109660987_109668694_109668810_109669684_109669778_109670578_109670663_109671325_109671410_109673274_109673472_109674847_109674923_109676263_109676384_109679474_109679551_109680998_109681125_109682397_109682578_109685319_109685548_109687934_109688084_109690971_109691134_109692276_109692424_109693497
tx.17354	chr7	+	3007	16	NNC	ENSMUSG00000061079.15	novel	2631	16	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	73.5768683456666	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTTTGTTTGTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109660916	109694601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_109660987_109668694_109668810_109669684_109669778_109670578_109670663_109671328_109671410_109673274_109673472_109674847_109674923_109676263_109676384_109679474_109679551_109680998_109681125_109682397_109682578_109685319_109685548_109687934_109688084_109690971_109691134_109692276_109692424_109693497
tx.17355	chr7	+	2248	9	ISM	ENSMUSG00000061079.15	ENSMUST00000169638.4	2914	15	15379	0	-14528	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	220	junction_6	18.2444340827552	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTTTGTTTGTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109676307	109694601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_109676384_109679474_109679551_109680998_109681125_109682397_109682578_109685319_109685548_109687934_109688084_109690971_109691134_109692276_109692424_109693497
tx.17356	chr7	+	496	2	Intergenic	novelGene_1201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAAGCATTTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109764195	109767039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_109764339_109766686
tx.17357	chr7	+	604	4	FSM	ENSMUSG00000031015.9	ENSMUST00000210513.2	1670	4	-37	1103	7	-1103	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_3	8.83176086632785	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGCCTTTCTGCATGGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109820924	109863183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_109821117_109842590_109842732_109854941_109855116_109863086
tx.17358	chr7	+	3941	12	FSM	ENSMUSG00000031015.9	ENSMUST00000033325.9	4027	12	16	70	-4	-70	multi-exon	FALSE	canonical	3	251	junction_6	36.1790771003727	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTTTGGTTTCTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109820933	109882643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_109821117_109842590_109842732_109854941_109855116_109863086_109863315_109865042_109865190_109866988_109867098_109869106_109869289_109872466_109872575_109873841_109874009_109878386_109878586_109879773_109879871_109880437
tx.17359	chr7	+	1394	4	FSM	ENSMUSG00000030790.16	ENSMUST00000033054.10	1390	4	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.24721912892465	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTCTCGGTTCATGCAT	5109	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110226863	110229027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_110227029_110227463_110227584_110227731_110227882_110228068
tx.1736	chr10	+	952	3	FSM	ENSMUSG00000015312.10	ENSMUST00000220246.2	732	3	332	-552	-319	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_2	12.5	434	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGTTCTCGTTGTATTTTA	668	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80766326	80768038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80766384_80766862_80767086_80767366
tx.17360	chr7	-	1923	6	NIC	ENSMUSG00000030788.17	novel	4032	6	NA	NA	-5	79	intron_retention	FALSE	canonical	3	12	junction_4	41.252393869932	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTGACTTGATTCAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110443614	110414710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_110416058_110420460_110420569_110424423_110424606_110432943_110433053_110436369_110436478_110443545
tx.17361	chr7	-	2031	6	FSM	ENSMUSG00000030788.17	ENSMUST00000177236.8	4032	6	28	1973	15	79	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_3	5.45527267879434	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTGACTTGATTCAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110443636	110414710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_110416058_110420460_110420569_110424423_110424606_110432943_110433053_110436283_110436478_110443545
tx.17362	chr7	-	1941	5	ISM	ENSMUSG00000030788.17	ENSMUST00000106682.10	1101	6	6855	-1167	258	79	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_3	5.71729831301464	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTGACTTGATTCAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110436478	110414710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_110416058_110420460_110420569_110424423_110424606_110432943_110433053_110436283
tx.17363	chr7	+	671	3	ISM	ENSMUSG00000005609.17	ENSMUST00000152019.2	2987	16	-21	13593	-21	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_2	2	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAATCGCATTCGTCCTC	522	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110628180	110633261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_110628389_110629420_110629520_110632897
tx.17364	chr7	+	1139	2	FSM	ENSMUSG00000005609.17	ENSMUST00000146709.2	765	2	-18	-356	0	356	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCCTAATGTTACCTTGAT	543	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110628201	110630372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_110628389_110629420
tx.17365	chr7	-	3685	21	ISM	ENSMUSG00000005610.18	ENSMUST00000161051.8	3548	22	1	0	1	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	1102	junction_8	1132.63140517999	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGTTGTACATGACTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110682223	110671138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_110671965_110673035_110673158_110673244_110673457_110673546_110673752_110673886_110674146_110674232_110674449_110674543_110674649_110674793_110674920_110675902_110676064_110676144_110676284_110676431_110676531_110676615_110676700_110676843_110676955_110677231_110677384_110677479_110677547_110677628_110677761_110678499_110678603_110679388_110679530_110680105_110680172_110680713_110680841_110681991
tx.17366	chr7	-	3802	22	FSM	ENSMUSG00000005610.18	ENSMUST00000162415.9	7995	22	11	4182	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4823	junction_9	518.544999107863	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAGTTGTACATGACTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110682226	110671138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_110671965_110673035_110673158_110673244_110673457_110673546_110673752_110673886_110674146_110674232_110674449_110674543_110674649_110674793_110674920_110675486_110675601_110675902_110676064_110676144_110676284_110676431_110676531_110676615_110676700_110676843_110676955_110677231_110677384_110677479_110677547_110677628_110677761_110678499_110678603_110679388_110679530_110680105_110680172_110680713_110680841_110681991
tx.17367	chr7	-	256	2	ISM	ENSMUSG00000005610.18	ENSMUST00000162394.2	716	3	-179	1181	11	-683	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5111	junction_1	0	888	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATCCATTAATATTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110682213	110680806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_110680841_110681991
tx.17368	chr7	+	2545	9	ISM	ENSMUSG00000059263.10	ENSMUST00000106653.4	5540	28	69682	-2	2480	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	328	junction_8	23.3438964185502	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTTATCTTAGTCATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111692392	111710593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_111692694_111700944_111701121_111701645_111701727_111703156_111703273_111703556_111703676_111705985_111706117_111707642_111707691_111707780_111707912_111709151
tx.17369	chr7	-	2701	3	ISM	ENSMUSG00000030772.7	ENSMUST00000033036.7	3359	8	38535	5	38535	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	5.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGTCCATGGTATGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111719729	111715228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_111717638_111718554_111718712_111719594
tx.1737	chr10	+	892	2	FSM	ENSMUSG00000015312.10	ENSMUST00000219449.2	667	2	217	-442	217	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	0	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCGTGTTCTCGTTGTATT	1204	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80766862	80768035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80767086_80767366
tx.17370	chr7	-	2296	7	ISM	ENSMUSG00000030772.7	ENSMUST00000033036.7	3359	8	620	990	620	-990	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_5	9.03234926989282	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAACAATCTGTAGTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111757644	111716213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_111717638_111718554_111718712_111719594_111719740_111720796_111720890_111748167_111748252_111749817_111749956_111757389
tx.17371	chr7	+	1539	13	FSM	ENSMUSG00000030770.16	ENSMUST00000033030.14	4454	13	197	2718	-2	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_2	5.24603024517905	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTGCTCAAGTTCATTAGG	3526	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112027109	112188181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_112027308_112143383_112143474_112143939_112144011_112146717_112146821_112159135_112159277_112166969_112167086_112172077_112172137_112174561_112174582_112175606_112175669_112176142_112176212_112178862_112178965_112180156_112180230_112187746
tx.17372	chr7	-	1570	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055116.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGGCCCCTTTCTCTGTTC	NA	False	NA	90	True	NA	NA	NA	112862067	112858842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_112860233_112861887
tx.17373	chr7	-	359	2	NNC	ENSMUSG00000109959.2	novel	296	2	NA	NA	-359	19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAAGATATGCCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112894903	112892131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_112892418_112894830
tx.17374	chr7	+	1702	9	NNC	ENSMUSG00000055116.9	novel	2554	17	NA	NA	-9956	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	30.5245802591944	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACTGTTCCCAATTGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112894670	112913333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_112894801_112898393_112898641_112900757_112900865_112902547_112902699_112903530_112903620_112905224_112905338_112907822_112907917_112912000_112912104_112912665
tx.17375	chr7	-	1738	6	ISM	ENSMUSG00000038187.15	ENSMUST00000117577.8	2384	8	14567	18	-1409	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_3	21.2471174515509	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTCTGACCAACTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112931925	112914850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_112915947_112921886_112921998_112924984_112925183_112927545_112927667_112929061_112929165_112931816
tx.17376	chr7	-	1251	3	ISM	ENSMUSG00000038187.15	ENSMUST00000117577.8	2384	8	21464	18	5488	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	202	junction_2	6.5	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTCTGACCAACTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112925028	112914850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_112915947_112921886_112921998_112924984
tx.17377	chr7	-	2593	11	FSM	ENSMUSG00000038187.15	ENSMUST00000047091.14	2581	11	-30	18	23	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_8	39.4138300600183	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTCTGACCAACTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112968576	112914850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_112915947_112921886_112921998_112924984_112925183_112927545_112927667_112929061_112929165_112931816_112932103_112934528_112934726_112950987_112951146_112964111_112964177_112968078_112968166_112968405
tx.17378	chr7	-	2435	10	NIC	ENSMUSG00000038187.15	novel	2581	11	NA	NA	23	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	63	junction_7	47.410734836931	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTCTGACCAACTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112968576	112914850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_112915947_112921886_112921998_112924984_112925183_112927545_112927667_112929061_112929165_112931816_112932103_112934528_112934726_112964111_112964177_112968078_112968166_112968405
tx.17379	chr7	-	2372	9	FSM	ENSMUSG00000038187.15	ENSMUST00000119278.8	2394	9	23	-1	23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_7	50.6814500088543	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTGACCAACTTTATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112968576	112914848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_112915947_112921886_112921998_112924984_112925183_112927545_112927667_112929061_112929165_112931816_112932103_112934528_112934726_112968078_112968166_112968405
tx.1738	chr10	-	496	4	FSM	ENSMUSG00000048240.15	ENSMUST00000092285.10	3362	4	8	2858	-4	230	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	3.68178700572909	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGGGATCTTCCTGACCT	4452	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80850751	80787315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80787581_80788664_80788781_80833825_80833879_80850689
tx.17380	chr7	+	788	5	ISM	ENSMUSG00000030759.17	ENSMUST00000123845.8	1218	6	-2	2816	-2	108	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	399	junction_2	10.6183802907977	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTCTGCATATCCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113113065	113146896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_113113145_113125194_113125246_113138479_113138674_113139742_113139919_113146608
tx.17381	chr7	+	2262	9	ISM	ENSMUSG00000030759.17	ENSMUST00000033018.15	4962	13	7	18355	7	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	366	junction_6	25.4162226737177	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGTTTGTGTTGATGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113113047	113152363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_113113145_113125194_113125246_113138479_113138674_113139742_113139919_113146608_113146789_113149172_113149351_113150279_113150325_113150441_113150561_113151141
tx.17382	chr7	+	4296	13	NNC	ENSMUSG00000030759.17	novel	4962	13	NA	NA	13	396	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	120.194633823645	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAATAAATGAATCCCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113113053	113170061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_113113145_113125194_113125246_113138479_113138674_113139742_113139919_113146608_113146789_113149172_113149351_113150279_113150325_113150441_113150561_113151141_113151210_113152848_113153021_113160582_113160717_113165591_113165720_113167301
tx.17383	chr7	+	1675	11	NNC	ENSMUSG00000030759.17	novel	4962	13	NA	NA	-8188	168	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	130.989465225262	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTGGAGTAAATTATGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113138477	113167580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_113138674_113139742_113139919_113146608_113146789_113149172_113149351_113150279_113150325_113150441_113150561_113151141_113151210_113152848_113153021_113160582_113160717_113165591_113165720_113167301
tx.17384	chr7	-	805	2	ISM	ENSMUSG00000055723.7	ENSMUST00000210075.2	3534	6	67342	784	67342	-784	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	204	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGTTATCATGCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113649657	113646803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_113647487_113649535
tx.17385	chr7	-	1993	6	FSM	ENSMUSG00000055723.7	ENSMUST00000069449.7	2275	6	282	0	265	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_1	27.4779911929529	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGACGCTTGACGGCTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113716734	113646016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_113647487_113649535_113649655_113657774_113657884_113658161_113658265_113659566_113659655_113716630
tx.17386	chr7	-	1151	10	FSM	ENSMUSG00000030751.19	ENSMUST00000033008.10	1201	10	48	2	-3	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	2548	junction_6	196.061655709387	20371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTGTCAAGTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113875305	113863842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_113864192_113865668_113865780_113866355_113866436_113868955_113869086_113869567_113869639_113870288_113870378_113873046_113873151_113873260_113873363_113873650_113873696_113875235
tx.17387	chr7	-	1645	5	FSM	ENSMUSG00000030670.17	ENSMUST00000032908.15	1627	5	-32	14	-32	-14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.58602010819715	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACTGTTTAAAATAGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114162239	114149414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_114149683_114150987_114151318_114151955_114152589_114153825_114153968_114161967
tx.17388	chr7	-	962	5	FSM	ENSMUSG00000030669.14	ENSMUST00000032906.11	994	5	32	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_2	7.39932429347437	794	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGAGTCTTTGCTGTTACT	2066	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114235560	114230712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_114231141_114231650_114231835_114233702_114233844_114234361_114234457_114235446
tx.17389	chr7	-	852	4	FSM	ENSMUSG00000030669.14	ENSMUST00000032907.9	830	4	-20	-2	-20	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	40.2022663816634	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAACCATGGTGGTCATT	2059	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114235567	114232525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_114233021_114233702_114233844_114234361_114234457_114235446
tx.1739	chr10	-	648	2	ISM	ENSMUSG00000048240.15	ENSMUST00000118465.8	875	3	44977	295	44977	230	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGGGATCTTCCTGACCT	9829	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80789047	80787315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80787581_80788664
tx.17390	chr7	-	888	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000086583.4	novel	1019	1	NA	NA	1	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	397	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAAGTTCTCAGACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114305469	114304436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_114304872_114305016
tx.17391	chr7	-	629	4	FSM	ENSMUSG00000087621.8	ENSMUST00000140689.8	633	4	0	4	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAACTGTATACAATTAAGC	5801	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115692394	115680997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_115681322_115685861_115685991_115688347_115688426_115692296
tx.17392	chr7	-	195	2	Intergenic	novelGene_1203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATAAGCTTTAAAAATCCT	9325	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115713414	115685283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_115685456_115713391
tx.17393	chr7	+	1450	5	FSM	ENSMUSG00000030663.13	ENSMUST00000032899.12	1479	5	29	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1664	junction_2	78.2527954772224	7495	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATTGTGATGCCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115692564	115704445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_115692761_115698674_115698759_115701178_115701240_115702445_115702556_115703446
tx.17394	chr7	-	1055	5	NNC	ENSMUSG00000045659.19	novel	5257	25	NA	NA	-407	-6218	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	113.005530838097	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATAATATTGTGAGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115908018	115786696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_115787000_115788504_115788589_115907159_115907218_115907306_115907384_115907485
tx.17395	chr7	-	472	4	NNC	ENSMUSG00000045659.19	novel	5149	27	NA	NA	0	-89991	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	124.389174234202	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTGTGAGATGAGGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115907590	115870469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_115870702_115907159_115907218_115907306_115907384_115907485
tx.17396	chr7	-	568	6	FSM	ENSMUSG00000090862.4	ENSMUST00000170953.3	589	6	16	5	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	4075.24362952695	13376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGTGTTTTGTGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115933414	115930744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_115930819_115931613_115931715_115932163_115932334_115932930_115933010_115933134_115933184_115933319
tx.17397	chr7	-	1430	2	ISM	ENSMUSG00000030660.10	ENSMUST00000205767.2	3849	5	12	28204	12	-28204	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGCTTATTTTTTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116042662	116016510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_116017817_116042538
tx.17398	chr7	+	1684	14	FSM	ENSMUSG00000030659.15	ENSMUST00000032895.15	1685	14	5	-4	5	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	11.132340009308	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACGTTTTTATCTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116103608	116139823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_116103720_116108689_116108861_116121071_116121216_116123533_116123642_116125195_116125323_116125534_116125639_116126871_116127058_116127234_116127326_116128052_116128112_116128209_116128303_116132306_116132397_116135096_116135268_116139179_116139262_116139676
tx.17399	chr7	+	824	8	ISM	ENSMUSG00000030659.15	ENSMUST00000032895.15	1685	14	23363	-4	-1080	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_3	7.86363368258451	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACGTTTTTATCTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116126966	116139823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_116127058_116127234_116127326_116128052_116128112_116128209_116128303_116132306_116132397_116135096_116135268_116139179_116139262_116139676
tx.174	chr1	+	494	5	FSM	ENSMUSG00000073702.12	ENSMUST00000086535.12	1049	5	14	541	14	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	7651	junction_1	2133.80345568658	24351	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGTTTGGTTTTCCTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39406936	39410451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_39407016_39407229_39407337_39409094_39409221_39410034_39410148_39410382
tx.1740	chr10	+	560	2	NNC	ENSMUSG00000087114.2	novel	379	2	NA	NA	-6218	-128	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTTTTAATTTTTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80854426	80862273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_80854492_80861778
tx.17400	chr7	+	445	2	Intergenic	novelGene_1205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGTGAAGTTCTTGCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116325377	116331561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_116325577_116331315
tx.17401	chr7	-	1067	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000107383.2	novel	1342	1	NA	NA	9	91	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAATGGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116425077	116423653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_116423916_116424272
tx.17402	chr7	-	435	4	FSM	ENSMUSG00000008683.17	ENSMUST00000106590.5	637	4	307	-105	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8104	junction_2	1380.96640879575	6308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGGGTCAGTCCTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117714470	117708286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_117708417_117709155_117709242_117714007_117714088_117714331
tx.17403	chr7	-	460	5	FSM	ENSMUSG00000008683.17	ENSMUST00000131374.8	5179	5	27	4692	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7367	junction_4	1521.10568337641	88764	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGGGTCAGTCCTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117715384	117708286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_117708417_117709155_117709242_117714007_117714088_117714331_117714470_117715358
tx.17404	chr7	-	2073	6	FSM	ENSMUSG00000030654.10	ENSMUST00000032888.10	2171	6	86	12	0	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	2173	junction_1	168.469106960297	9350	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTTTGTCTCACTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117728799	117718125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_117719634_117720383_117720469_117721148_117721267_117725618_117725739_117726356_117726491_117728691
tx.17405	chr7	-	869	6	FSM	ENSMUSG00000030652.12	ENSMUST00000032887.4	914	6	45	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	921	junction_3	42.5234053198941	4655	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTGGTTTTCTTGTGCT	6670	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118132534	118124284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_118124518_118125046_118125116_118126559_118126700_118127526_118127642_118128781_118128961_118132401
tx.17406	chr7	-	335	2	NIC	ENSMUSG00000042246.6	novel	389	3	NA	NA	-11	16	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAAGTGCTTAGTTCTGAT	4183	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118183920	118170653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_118170895_118183826
tx.17407	chr7	+	584	2	FSM	ENSMUSG00000109284.2	ENSMUST00000208859.2	510	2	-37	-37	-37	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTCTGTTTTGTTATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118191513	118196061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_118191684_118195647
tx.17408	chr7	-	1551	6	FSM	ENSMUSG00000033917.16	ENSMUST00000038791.15	1582	6	20	11	2	-11	multi-exon	TRUE	canonical	3	428	junction_5	40.804901666344	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGGGCAAACTGTGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118304981	118287778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_118288374_118290805_118291018_118293715_118293809_118294258_118294365_118297777_118297954_118304612
tx.17409	chr7	+	742	5	ISM	ENSMUSG00000033904.17	ENSMUST00000106557.8	5073	16	1	15512	1	-10950	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	88	junction_3	7.03562363973514	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCGAACACTGTACTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118311775	118320735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_118311972_118313328_118313472_118314582_118314738_118317189_118317319_118320616
tx.1741	chr10	-	1420	4	FSM	ENSMUSG00000046822.15	ENSMUST00000117276.11	3796	4	121	2255	3	-2252	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_3	7.58653778449403	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTGTGGCCATGTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80873139	80866626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80867535_80869445_80869768_80870751_80870840_80873037
tx.17412	chr7	-	1535	5	FSM	ENSMUSG00000030980.18	ENSMUST00000116280.9	5382	5	314	3533	0	-254	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	263.543639650059	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTGATCAGTTGCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118454907	118444977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_118445318_118447671_118447798_118449843_118449913_118451625_118452564_118454845
tx.17413	chr7	-	933	2	ISM	ENSMUSG00000030980.18	ENSMUST00000126792.9	3253	4	308	8680	0	293	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	591	junction_1	0	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAGAAGAAGAAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118454907	118451692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_118452564_118454845
tx.17414	chr7	-	316	2	FSM	ENSMUSG00000008734.10	ENSMUST00000207614.2	686	2	41	329	41	-329	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTCCCTGGCTGTGTCTT	8741	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118575964	118574339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_118574427_118575735
tx.17416	chr7	-	756	2	Intergenic	novelGene_1206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTTTGCCTTCTTCCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118622953	118610807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_118611350_118622739
tx.17417	chr7	-	2670	4	FSM	ENSMUSG00000030942.9	ENSMUST00000033236.9	2689	4	19	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	902	junction_1	48.9239773072014	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGGCATTCTTTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119320002	119314315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_119316293_119317244_119317494_119318349_119318525_119319733
tx.17418	chr7	-	502	3	ISM	ENSMUSG00000030942.9	ENSMUST00000033236.9	2689	4	19	3120	-15	599	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	927	junction_2	44.5	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAAGGGTTATTCTACGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119320002	119317435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_119317494_119318349_119318525_119319733
tx.17419	chr7	+	1263	2	FSM	ENSMUSG00000100153.3	ENSMUST00000207161.2	1437	2	187	-13	-15	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	469	junction_1	0	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACGTGGAGCTTGGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119339335	119341462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_119340294_119341157
tx.1742	chr10	-	996	2	ISM	ENSMUSG00000004937.7	ENSMUST00000005067.6	1969	12	13925	-3	3621	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	934	junction_1	0	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGCTTCCTGTGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80882087	80879905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80880838_80882023
tx.17420	chr7	-	997	9	FSM	ENSMUSG00000030929.18	ENSMUST00000106523.8	973	9	-18	-6	-3	6	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	25.2128439490669	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCACAAGTCAGGACATCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119393208	119367895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_119368116_119385961_119386051_119386626_119386709_119386956_119387058_119389456_119389614_119390323_119390452_119391487_119391572_119391653_119391722_119393140
tx.17421	chr7	-	1436	11	NNC	ENSMUSG00000030929.18	novel	1241	10	NA	NA	1	32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	34.3476345619316	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGTATCATCGGGACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119393204	119371128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_119371568_119371767_119371843_119372998_119373148_119385961_119386051_119386626_119386709_119386956_119387058_119389456_119389614_119390323_119390452_119391487_119391572_119391653_119391722_119393140
tx.17422	chr7	-	3473	9	FSM	ENSMUSG00000030929.18	ENSMUST00000150844.3	3564	9	80	11	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	8.7571399440685	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACATGTAGAACATCAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119393201	119383064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_119385768_119385961_119386051_119386626_119386709_119386956_119387058_119389456_119389614_119390323_119390452_119391487_119391572_119391653_119391722_119393140
tx.17423	chr7	+	1020	2	ISM	ENSMUSG00000030924.17	ENSMUST00000137015.2	2010	4	-29	15075	3	-15075	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGACTCCAGGCATTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119393344	119405004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_119393726_119404365
tx.17424	chr7	-	2354	3	FSM	ENSMUSG00000048787.14	ENSMUST00000059851.14	5985	3	17	3614	17	-597	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_2	16	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCCACGTTGTCACTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119494951	119455632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_119457280_119458602_119459139_119494780
tx.17425	chr7	+	388	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048787.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTTAATCGTGGTACCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119461051	119473463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_119461193_119471499_119471610_119473326
tx.17426	chr7	+	1029	4	FSM	ENSMUSG00000030922.13	ENSMUST00000208202.2	936	4	-9	-84	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	24.5356882927706	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTTGTTTTGTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119495083	119515977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_119495114_119508893_119509186_119513395_119513489_119515363
tx.17427	chr7	+	772	3	NIC	ENSMUSG00000030922.13	novel	875	4	NA	NA	-37	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	5	junction_1	31.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATATTTGTTGTTTTGTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119495046	119515975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_119495114_119513395_119513489_119515363
tx.17428	chr7	+	920	4	FSM	ENSMUSG00000030922.13	ENSMUST00000106518.9	875	4	-24	-21	-24	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	16.3095064303001	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTTGTTTTGTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119495059	119515977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_119495114_119509026_119509186_119513395_119513489_119515363
tx.17429	chr7	+	1114	5	FSM	ENSMUSG00000030922.13	ENSMUST00000054440.11	752	5	-41	-321	-20	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	26.343879744639	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTTGTTTTGTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119495063	119515977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_119495114_119499333_119499532_119509026_119509186_119513395_119513489_119515363
tx.1743	chr10	-	1974	12	FSM	ENSMUSG00000004937.7	ENSMUST00000218208.2	1964	12	-5	-5	-2	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	688	junction_11	105.465203223192	459	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGCTTCCTGTGTCAG	4767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80896017	80879905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80880838_80882023_80882147_80882308_80882399_80883472_80883511_80884213_80884277_80884671_80884811_80885086_80885192_80885615_80885716_80886832_80886918_80887056_80887164_80887949_80888086_80895961
tx.17430	chr7	+	999	3	ISM	ENSMUSG00000030922.13	ENSMUST00000106516.2	1069	4	9563	2	9540	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	6	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTTGTTTTGTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119508893	119515977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_119509186_119513395_119513489_119515363
tx.17431	chr7	+	586	2	NNC	ENSMUSG00000030922.13	novel	5845	5	NA	NA	4916	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAACGTTTTCCAACAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119541096	119551023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_119541428_119550768
tx.17432	chr7	+	1397	5	FSM	ENSMUSG00000030917.14	ENSMUST00000033210.13	1484	5	23	64	-19	-64	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_3	8.8423695919137	265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGCCTGTGCGATGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119701598	119720145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_119701739_119703852_119704053_119714608_119714778_119715442_119715582_119719396
tx.17433	chr7	+	1251	4	ISM	ENSMUSG00000030917.14	ENSMUST00000118737.3	1395	6	2146	70	1741	-64	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_2	8.60232526704263	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGCCTGTGCGATGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119703858	119720145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_119704053_119714608_119714778_119715442_119715582_119719396
tx.17434	chr7	-	1280	8	FSM	ENSMUSG00000030905.6	ENSMUST00000033198.6	1383	8	97	6	97	-6	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	2.55550625999976	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTGTCCTTTGACAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119801237	119785608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_119785922_119788948_119789034_119789674_119789797_119794547_119794732_119796872_119796975_119798470_119798534_119800299_119800451_119800977
tx.17435	chr7	+	1031	3	NIC	ENSMUSG00000051900.13	novel	3551	11	NA	NA	14	-47795	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCGGTCTTTACTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120008883	120031127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_120008990_120026352_120026481_120030330
tx.17436	chr7	+	1611	14	FSM	ENSMUSG00000030884.13	ENSMUST00000033176.7	1896	14	39	246	-25	-246	multi-exon	FALSE	canonical	3	1087	junction_9	72.1248916810278	2406	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTGCATTCTTTCTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120234437	120258501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_120234546_120236884_120236969_120237070_120237221_120239456_120239522_120240901_120240959_120242248_120242374_120244373_120244472_120248568_120248627_120250056_120250153_120250407_120250608_120253203_120253285_120255323_120255401_120256739_120256894_120258243
tx.17437	chr7	+	1226	3	FSM	ENSMUSG00000046096.8	ENSMUST00000060175.8	4831	3	104	3501	55	-128	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_2	55.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATACAGTGTGTATATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120276957	120330576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_120277094_120325342_120325556_120329699
tx.17438	chr7	+	359	2	NNC	ENSMUSG00000046096.8	novel	813	2	NA	NA	58	-32159	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAATGGATGGTTTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120276960	120293736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_120277094_120293510
tx.17439	chr7	+	689	2	FSM	ENSMUSG00000046096.8	ENSMUST00000208454.2	813	2	118	6	58	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	191	junction_1	0	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTTAGGTGAAGGCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120276960	120325898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_120277094_120325342
tx.1744	chr10	-	1967	12	FSM	ENSMUSG00000004937.7	ENSMUST00000005067.6	1969	12	5	-3	5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_9	245.943486083912	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGCTTCCTGTGTCAG	4777	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80896007	80879905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80880838_80882023_80882147_80882308_80882399_80883472_80883511_80884213_80884277_80884671_80884811_80885086_80885192_80885615_80885716_80886832_80886921_80887056_80887164_80887949_80888086_80895961
tx.17440	chr7	+	3101	18	FSM	ENSMUSG00000035064.18	ENSMUST00000047875.16	6580	18	30	3449	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_5	8.32971086202773	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTGGCCTTTATACATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120442083	120503224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_120442324_120457566_120457886_120472531_120472633_120475654_120475716_120479036_120479075_120479527_120479700_120483880_120484031_120484644_120484778_120485032_120485161_120485808_120486011_120487081_120487150_120488412_120488491_120488911_120488975_120490818_120490954_120491087_120491277_120494406_120494532_120498590_120498770_120502504
tx.17441	chr7	+	1737	9	ISM	ENSMUSG00000035064.18	ENSMUST00000106488.3	2537	18	35423	-509	-1312	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_5	9.07950989866744	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCCTTTATACATGCGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120485834	120503228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_120486011_120487081_120487150_120488412_120488491_120488911_120488975_120490818_120490954_120491087_120491277_120494406_120494532_120498590_120498770_120502504
tx.17442	chr7	+	1475	7	ISM	ENSMUSG00000035064.18	ENSMUST00000106488.3	2537	18	38013	-503	1278	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_3	10.3722385883344	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTTTGGCCTTTATACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120488424	120503222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_120488491_120488911_120488975_120490818_120490954_120491087_120491277_120494406_120494532_120498590_120498770_120502504
tx.17443	chr7	+	2637	21	FSM	ENSMUSG00000030880.15	ENSMUST00000033173.15	4194	21	-33	1590	7	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	284	junction_16	33.3787357459805	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGGTTTAATATTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120516973	120545065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_120517134_120522121_120522192_120523444_120523496_120526166_120526245_120527110_120527227_120527650_120527734_120530101_120530210_120530483_120530534_120531356_120531477_120532529_120532616_120532908_120532954_120533055_120533148_120533995_120534117_120536825_120536908_120538218_120538279_120538361_120538520_120538971_120539034_120539524_120540049_120541712_120541791_120543769_120543896_120544698
tx.17444	chr7	+	1765	7	ISM	ENSMUSG00000030880.15	ENSMUST00000106483.4	3001	22	21239	3	4180	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	284	junction_2	45.1863425777696	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTGGCGTCATAGTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120538232	120545469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_120538279_120538361_120538520_120538971_120539034_120539524_120540049_120541712_120541791_120543769_120543896_120544698
tx.17445	chr7	+	1722	6	ISM	ENSMUSG00000030880.15	ENSMUST00000106483.4	3001	22	21368	0	4309	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	284	junction_1	47.5840309347579	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCGTCATAGTGCTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120538361	120545472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_120538520_120538971_120539034_120539524_120540049_120541712_120541791_120543769_120543896_120544698
tx.17446	chr7	+	484	2	ISM	ENSMUSG00000030880.15	ENSMUST00000207481.2	2545	20	26812	-21	9726	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	411	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGGTTTAATATTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120543778	120545065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_120543896_120544698
tx.17447	chr7	+	1584	5	NNC	ENSMUSG00000030876.8	novel	1823	5	NA	NA	236	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	66	junction_4	108.278287297131	27	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGCACCATGTTCTTCT	9663	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120633903	120676058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_120634199_120647060_120647252_120651309_120651520_120656437_120656623_120675355
tx.17448	chr7	+	1606	5	FSM	ENSMUSG00000030876.8	ENSMUST00000033163.8	1823	5	217	0	217	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	223	junction_4	46.4435140789325	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGCACCATGTTCTTCT	9644	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120633884	120676058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_120634199_120647060_120647252_120651309_120651520_120656437_120656623_120675352
tx.17449	chr7	+	870	2	ISM	ENSMUSG00000030876.8	ENSMUST00000207351.2	740	5	21625	-618	-18051	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	223	junction_1	0	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGCACCATGTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120656458	120676058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_120656623_120675352
tx.1745	chr10	+	2441	13	FSM	ENSMUSG00000004929.13	ENSMUST00000005057.7	2832	13	52	339	-40	-339	multi-exon	TRUE	canonical	3	459	junction_3	51.2387521532504	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGCCTGGTCCTCTCTCT	5502	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80905920	80918054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_80906113_80908986_80909200_80911344_80911494_80912776_80912885_80913746_80913850_80914303_80914465_80915291_80915428_80915704_80916072_80916246_80916449_80916860_80917048_80917140_80917270_80917433_80917571_80917697
tx.17450	chr7	-	2892	17	FSM	ENSMUSG00000034951.11	ENSMUST00000057576.8	2902	17	13	-3	-4	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	174	junction_8	14.1585607937389	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGTGTTTCCTTCTTCTCTG	8937	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121580921	121522058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_121522692_121524646_121524791_121528409_121528525_121529752_121529837_121534880_121535022_121536176_121536364_121540392_121540459_121543000_121543118_121548967_121549123_121550385_121550514_121555152_121555352_121562360_121562484_121563423_121563507_121570502_121570672_121576489_121576607_121576838_121576988_121580639
tx.17451	chr7	-	1551	5	ISM	ENSMUSG00000030872.15	ENSMUST00000144779.2	2351	10	5126	0	1684	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	830	junction_4	23.3920392441531	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCCTGGTGTTGAGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121596588	121587987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_121589025_121589646_121589758_121590716_121590887_121594066_121594225_121596513
tx.17452	chr7	-	2024	9	FSM	ENSMUSG00000030871.12	ENSMUST00000033159.4	2046	9	187	-165	-6	165	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_5	13.5317912709294	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCCAGTGCGTCATTACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121666299	121637878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_121638382_121638934_121639071_121643524_121643656_121643735_121643890_121645846_121645956_121647324_121647798_121654781_121654972_121662151_121662308_121666127
tx.17453	chr7	-	2310	4	ISM	ENSMUSG00000030871.12	ENSMUST00000147397.2	3222	8	-6	7962	-6	-7962	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_1	8.83176086632785	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCAGTAGATGAGGGAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121666299	121646005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_121647798_121654781_121654972_121662151_121662308_121666127
tx.17454	chr7	+	367	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030871.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121651646	121652302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_121651952_121652240
tx.17455	chr7	+	988	6	ISM	ENSMUSG00000030870.13	ENSMUST00000033158.6	4849	7	694	3346	422	237	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	672	junction_3	19.7281524730523	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTATACTCTTAAGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121667091	121678071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_121667217_121668003_121668213_121670924_121670991_121671132_121671239_121675330_121675414_121677672
tx.17456	chr7	-	708	5	FSM	ENSMUSG00000030869.12	ENSMUST00000033157.10	3479	5	40	2731	5	324	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_1	2248.42489311963	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGTAGTGCCTGCCATCA	6398	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121701069	121687356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_121687562_121690808_121690909_121692839_121692928_121695831_121695955_121700877
tx.17457	chr7	-	638	5	FSM	ENSMUSG00000030869.12	ENSMUST00000123296.8	1416	5	3	775	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4604	junction_1	400.950978923858	4690	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTTTCTCAATTAGTTT	6396	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121701071	121690053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_121690187_121690808_121690909_121692839_121692928_121695831_121695955_121700877
tx.17458	chr7	+	469	2	Intergenic	novelGene_1208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCTAAGATTTTGTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121701115	121701953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_121701368_121701736
tx.17459	chr7	-	3738	13	FSM	ENSMUSG00000044702.14	ENSMUST00000098068.10	3750	13	10	2	10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_9	28.0835806121655	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTTGGCTTGTTCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121732159	121706486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_121706952_121709904_121710054_121711167_121711256_121712472_121712590_121713531_121713694_121716492_121716579_121720276_121720439_121722859_121722932_121723479_121724151_121726271_121727667_121728145_121728240_121728896_121728957_121731942
tx.1746	chr10	-	1399	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035011.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATCCTGTTTCCTGCCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80976159	80974658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_80975023_80975124
tx.17460	chr7	-	1667	11	NIC	ENSMUSG00000044702.14	novel	3750	13	NA	NA	-10	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	28	junction_8	41.0980534818865	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTGGCTTGTTCTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121732152	121706484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_121706952_121709904_121710054_121711167_121711256_121712472_121712590_121713531_121713694_121716492_121716579_121720276_121720439_121722859_121722932_121728145_121728240_121728896_121728957_121731942
tx.17461	chr7	-	702	4	FSM	ENSMUSG00000044702.14	ENSMUST00000130149.3	3216	4	-7	2521	-7	-2521	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_1	6.34209919681348	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATTCTAGGACTCCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121732149	121727325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_121727667_121728145_121728240_121728896_121728957_121731942
tx.17462	chr7	+	1511	6	FSM	ENSMUSG00000030868.7	ENSMUST00000033156.5	1532	6	19	2	6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_5	42.3008274150755	723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGGTTTAGGCTCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121732282	121748265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_121732405_121733391_121733461_121734274_121734394_121737470_121737583_121743007_121743111_121747279
tx.17463	chr7	+	2174	10	FSM	ENSMUSG00000030867.8	ENSMUST00000033154.8	2199	10	29	-4	29	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1108	junction_2	92.3724345606776	319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTTTCTCTTTTTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121758690	121769100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_121759174_121759758_121759928_121760729_121760875_121761615_121761710_121763242_121763463_121766819_121766976_121767788_121767867_121768051_121768207_121768303_121768487_121768609
tx.17464	chr7	+	811	3	ISM	ENSMUSG00000030867.8	ENSMUST00000033154.8	2199	10	9408	-4	9266	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1128	junction_1	24.5	973	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTTTCTCTTTTTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121768069	121769100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_121768207_121768303_121768487_121768609
tx.17465	chr7	-	281	2	Intergenic	novelGene_1210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTGGGAATTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122561820	122560848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_122561015_122561705
tx.17466	chr7	+	737	3	FSM	ENSMUSG00000109814.2	ENSMUST00000211504.2	662	3	-43	-32	-43	32	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	0.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGGTGGGGAAAAAAAGCC	1693	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122630594	122665694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_122630774_122660895_122661022_122665262
tx.17467	chr7	+	256	3	ISM	ENSMUSG00000052707.9	ENSMUST00000206888.2	3625	9	-78	33890	1	-18861	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_2	15.5	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ACGACAAGAAAAAGAAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122723400	122743025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_122723556_122723890_122723939_122742972
tx.17468	chr7	-	3395	20	NNC	ENSMUSG00000030766.16	novel	3336	20	NA	NA	-26	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_19	53.0955862029814	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGCTAATTCTTAGAGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122969164	122878493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_122879340_122885720_122886237_122891258_122891429_122893694_122893929_122895632_122895790_122896717_122896810_122899711_122899826_122902918_122903000_122905597_122905680_122906190_122906303_122907508_122907637_122913636_122913719_122913866_122913936_122917609_122917722_122920810_122920888_122921101_122921214_122922835_122922910_122926461_122926567_122930448_122930489_122968972
tx.17469	chr7	+	421	2	NNC	ENSMUSG00000030763.8	novel	1369	11	NA	NA	-19	-5231	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGCTTTGTCTTGGTTCCTT	6879	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122977259	122995469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_122977479_122995267
tx.1747	chr10	-	1734	11	FSM	ENSMUSG00000004934.15	ENSMUST00000005064.14	2571	11	178	659	-31	310	multi-exon	FALSE	canonical	3	608	junction_2	40.6104666311531	296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCAGCCTGCACGCCACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81003579	80989758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_80990207_80990281_80990413_80991424_80991586_80991666_80991741_80992845_80992952_80993060_80993190_80993270_80993362_80993484_80993527_80993766_80993852_80999618_81000025_81003518
tx.17470	chr7	+	1311	11	NIC	ENSMUSG00000030763.8	novel	1369	11	NA	NA	-19	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_5	88.7783757454483	1048	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGCTACATCTGTACAAT	6879	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122977259	123029574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_122977479_122999660_122999753_123000666_123000789_123002057_123002135_123003645_123003712_123009946_123010050_123017440_123017562_123020760_123020863_123021929_123022022_123027316_123027415_123029355
tx.17471	chr7	+	1505	6	FSM	ENSMUSG00000030762.12	ENSMUST00000033023.10	1487	6	-23	5	-23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	2.57681974534503	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAGGTGTCTGTTGACTT	4353	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123061490	123067222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_123061682_123061796_123062042_123063411_123063539_123064331_123064547_123065808_123065944_123066630
tx.17472	chr7	+	301	2	Intergenic	novelGene_1211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGATGGAAACGATGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125005557	125008033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_125005684_125007858
tx.17473	chr7	-	535	5	NNC	ENSMUSG00000108814.2	novel	494	4	NA	NA	-450	8449	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	5	junction_2	2.69258240356725	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGTGTTATTTCTTTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125017736	125007716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_125007862_125016649_125016844_125017022_125017107_125017219_125017292_125017696
tx.17474	chr7	-	485	5	NNC	ENSMUSG00000108814.2	novel	494	4	NA	NA	-455	5206	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3.34477204006491	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTTTGTTGGGCAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125017741	125010959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_125011050_125016649_125016844_125017022_125017107_125017219_125017292_125017696
tx.17475	chr7	-	707	5	NNC	ENSMUSG00000108814.2	novel	494	4	NA	NA	-461	157	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	5	junction_1	2.8613807855649	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACCCTTTTTATTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125017747	125016008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_125016315_125016649_125016844_125017022_125017107_125017219_125017292_125017696
tx.17476	chr7	+	2414	8	FSM	ENSMUSG00000030752.9	ENSMUST00000033010.9	2389	8	-15	-10	-15	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_7	4.74664220738176	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTCTTTAACCAGACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125043832	125061451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_125043965_125051399_125051901_125054262_125054430_125055604_125055738_125056135_125056181_125059046_125059197_125060086_125060180_125060258
tx.17477	chr7	-	933	7	ISM	ENSMUSG00000030750.14	ENSMUST00000033006.14	1120	8	5111	4	4914	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	915	junction_1	63.0951662173894	1211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGGGCTTGTGTGAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125085657	125066815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_125067016_125067450_125067572_125068200_125068318_125070284_125070432_125071046_125071125_125071279_125071402_125085509
tx.17478	chr7	-	963	8	FSM	ENSMUSG00000030750.14	ENSMUST00000033006.14	1120	8	153	4	-44	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	553	junction_7	177.832872698624	2455	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGGGCTTGTGTGAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125090615	125066815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_125067016_125067450_125067572_125068200_125068318_125070284_125070432_125071046_125071125_125071279_125071402_125085509_125085657_125090584
tx.17479	chr7	-	1145	4	ISM	ENSMUSG00000032777.10	ENSMUST00000205444.2	3337	20	34	36317	-31	-5358	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_1	25.3026129524645	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAATATGGAAAGGTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125306880	125297758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_125298265_125298515_125298693_125303002_125303213_125306628
tx.1748	chr10	-	858	2	FSM	ENSMUSG00000004934.15	ENSMUST00000129549.2	1178	2	-36	356	-36	-356	multi-exon	FALSE	canonical	3	682	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGACAGGCTTTCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81003584	80999232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81000025_81003518
tx.17480	chr7	-	498	2	ISM	ENSMUSG00000032777.10	ENSMUST00000205444.2	3337	20	0	41559	0	-10600	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCTTGGAGGAGACACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125306914	125303000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_125303213_125306628
tx.17481	chr7	+	1621	3	ISM	ENSMUSG00000032743.16	ENSMUST00000205462.2	4185	15	42996	0	7392	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	5.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGTGTGGTACACTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125471834	125473965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_125472020_125472103_125472193_125472618
tx.17482	chr7	-	1199	12	NIC	ENSMUSG00000030742.8	novel	1235	12	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_9	13.1689592452595	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGTCGTTGTCTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125968712	125962998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_125963214_125963367_125963473_125963569_125963633_125963730_125963794_125967047_125967143_125967217_125967279_125967357_125967388_125967470_125967536_125967666_125967713_125967973_125968009_125968113_125968142_125968319
tx.17483	chr7	-	1231	11	FSM	ENSMUSG00000030742.8	ENSMUST00000206793.2	1215	11	-19	3	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	13.9071923837991	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGTCGTTGTCTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125968732	125962998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_125963214_125963367_125963473_125963569_125963633_125963730_125963794_125967047_125967143_125967217_125967279_125967470_125967536_125967666_125967755_125967973_125968009_125968113_125968142_125968319
tx.17484	chr7	-	1271	12	FSM	ENSMUSG00000030742.8	ENSMUST00000032997.8	1235	12	-36	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_9	5.32264769756525	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGTCGTTGTCTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125968742	125962998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_125963214_125963367_125963473_125963569_125963633_125963730_125963794_125967047_125967143_125967217_125967279_125967357_125967388_125967470_125967536_125967666_125967755_125967973_125968009_125968113_125968142_125968319
tx.17485	chr7	-	465	2	ISM	ENSMUSG00000030741.16	ENSMUST00000126810.8	3251	10	6559	0	1710	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	507	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGACTGACTGCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125970024	125969238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_125969586_125969906
tx.17486	chr7	-	2185	12	FSM	ENSMUSG00000030741.16	ENSMUST00000032994.15	2219	12	27	7	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	348	junction_9	48.6508899292612	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGACTGACTGCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125976595	125969238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_125969586_125969906_125970079_125970349_125970449_125970712_125970779_125971129_125971320_125971583_125971740_125971916_125972063_125972941_125973009_125973093_125973246_125974238_125974376_125975845_125975912_125976008
tx.17487	chr7	-	3190	8	FSM	ENSMUSG00000030722.8	ENSMUST00000075671.5	3388	8	9	189	9	-189	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_7	21.1920277655614	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGCCAACTCCCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125995900	125982214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_125984312_125986573_125986684_125986783_125986929_125989557_125989745_125989834_125989916_125990442_125990567_125995113_125995187_125995527
tx.17488	chr7	-	564	3	ISM	ENSMUSG00000030722.8	ENSMUST00000075671.5	3388	8	1	8431	1	-6408	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	215	junction_2	26	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAAGAGTTTCCGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125995908	125990456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_125990567_125995113_125995187_125995527
tx.17489	chr7	+	2223	12	NIC	ENSMUSG00000030727.13	novel	2234	13	NA	NA	0	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_9	55.1880331980083	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTTGCCTTGTGCCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126028237	126045074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_126028329_126028747_126028958_126034831_126034990_126037541_126037653_126037733_126038079_126039337_126039434_126039519_126039619_126041008_126041165_126043301_126043480_126043694_126043751_126043991_126044109_126044468
tx.1749	chr10	+	3074	14	FSM	ENSMUSG00000034994.11	ENSMUST00000047864.11	3089	14	15	0	15	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	5618	junction_10	706.418033369635	4045	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTCGCAACTCTGTTTT	2196	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81012479	81018332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81012564_81013498_81013714_81013886_81014069_81014514_81014727_81014914_81015094_81015179_81015286_81015377_81015631_81015715_81015912_81015986_81016246_81016398_81016507_81016637_81016992_81017061_81017245_81017326_81017460_81017722
tx.17490	chr7	+	1265	3	FSM	ENSMUSG00000030727.13	ENSMUST00000141764.2	742	3	-33	-490	0	490	multi-exon	FALSE	canonical	3	185	junction_2	11	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGTGCATATATTTCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126028237	126035795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126028329_126028747_126028958_126034831
tx.17491	chr7	+	1271	7	NIC	ENSMUSG00000030727.13	novel	2279	12	NA	NA	-91	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	69.3221144769514	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCAGTTGCCTTGTGCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126039373	126045073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_126039434_126039519_126039619_126041008_126041165_126043301_126043480_126043694_126043751_126043991_126044109_126044468
tx.17492	chr7	+	857	4	NIC	ENSMUSG00000030727.13	novel	2279	12	NA	NA	-568	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	92.4373661820082	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTTGCCTTGTGCCTGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126043403	126045076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_126043480_126043694_126043751_126043991_126044109_126044468
tx.17493	chr7	+	1686	10	FSM	ENSMUSG00000073838.11	ENSMUST00000098048.6	1679	10	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	611	junction_6	33.4490583749803	585	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCAGCTTGTCTTGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126086525	126089899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126086663_126086759_126086955_126087431_126087599_126087821_126087927_126088008_126088174_126088291_126088425_126088507_126088613_126088723_126088876_126088963_126089084_126089492
tx.17494	chr7	-	327	4	ISM	ENSMUSG00000032637.16	ENSMUST00000179818.3	682	7	640	1565	640	-1565	internal_fragment	FALSE	canonical	3	800	junction_3	74.028523031479	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAACTGTTGTGTCAAGAA	7882	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126100632	126099886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126100046_126100274_126100347_126100427_126100485_126100593
tx.17495	chr7	-	646	3	FSM	ENSMUSG00000030717.10	ENSMUST00000032961.4	829	3	184	-1	-17	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3716	junction_2	16	5562	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTTGGCGTGTGTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126224664	126222419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126222752_126224061_126224206_126224494
tx.17496	chr7	+	1160	10	FSM	ENSMUSG00000030714.15	ENSMUST00000032956.10	1312	10	6	146	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	419	junction_3	31.8433666561813	493	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGTCTCCTGGGCCTCAC	117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126248486	126271951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126248650_126260223_126260321_126263100_126263177_126264087_126264161_126269801_126269867_126270709_126270840_126270905_126271053_126271209_126271246_126271327_126271491_126271741
tx.17497	chr7	+	382	3	FSM	ENSMUSG00000047721.9	ENSMUST00000130498.2	1266	3	520	364	-10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2284	junction_2	148	11577	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTGGTCTCAGTGTGCT	1131	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126295127	126295866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126295272_126295354_126295453_126295726
tx.17498	chr7	-	866	5	ISM	ENSMUSG00000030707.16	ENSMUST00000106364.8	1747	11	2995	1	2	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_2	3	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTCAGACTCCGGTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126300397	126298945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126299158_126299428_126299645_126299755_126299814_126299911_126300058_126300163
tx.17499	chr7	-	720	4	NIC	ENSMUSG00000030707.16	novel	1747	11	NA	NA	2	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_3	7.36357401145817	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTCAGACTCCGGTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126300397	126298945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_126299158_126299428_126299645_126299755_126299814_126300163
tx.175	chr1	+	491	5	FSM	ENSMUSG00000073702.12	ENSMUST00000178079.8	487	5	-2	-2	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1086	junction_1	4596.75456164455	9423	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCAGGGTTTGGTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39407007	39410447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_39407088_39407229_39407337_39409094_39409221_39410034_39410148_39410382
tx.1750	chr10	+	965	4	ISM	ENSMUSG00000034994.11	ENSMUST00000047864.11	3089	14	4488	0	68	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7305	junction_1	399.251243649354	7197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTCGCAACTCTGTTTT	6669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81016952	81018332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81016992_81017061_81017245_81017326_81017460_81017722
tx.17500	chr7	+	1774	9	FSM	ENSMUSG00000063065.14	ENSMUST00000057669.16	1800	9	23	3	23	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_5	18.155147341732	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGCCTGCCTCTGTCTGTG	5239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126358795	126364988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126358991_126359902_126360086_126362206_126362397_126362569_126362687_126362912_126363028_126363405_126363538_126363705_126363816_126363894_126364050_126364411
tx.17501	chr7	+	1121	10	FSM	ENSMUSG00000030703.9	ENSMUST00000032944.9	1148	10	27	0	27	0	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_3	2.43938871112224	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGTTCATGGAACAAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126365532	126374817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126365782_126366073_126366117_126366346_126366483_126366562_126366609_126366738_126366858_126366934_126367025_126367741_126367876_126370159_126370220_126370333_126370386_126374625
tx.17503	chr7	+	1424	4	FSM	ENSMUSG00000042675.16	ENSMUST00000106357.8	1594	4	166	4	20	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_1	13.6381816969859	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGCCCCTGGCTCACATG	8433	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126376338	126379682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126377126_126377225_126377270_126377477_126377587_126379198
tx.17504	chr7	-	1383	9	FSM	ENSMUSG00000030697.8	ENSMUST00000032936.8	1359	9	-24	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1828	junction_8	282.244574792856	1682	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGGTTCTGTCAGGTTTG	5046	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126391692	126385037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126385464_126385543_126385734_126386391_126386519_126386608_126386783_126387288_126387391_126387555_126387607_126388195_126388248_126391232_126391396_126391594
tx.17505	chr7	-	1440	9	FSM	ENSMUSG00000030695.17	ENSMUST00000032934.12	1511	9	71	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19253	junction_4	564.678448322583	7577	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTTGTTCATGTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126398355	126394405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126394687_126394784_126394985_126395121_126395297_126395388_126395473_126395766_126395928_126396025_126396081_126396508_126396721_126396815_126396949_126398216
tx.17506	chr7	+	2053	7	FSM	ENSMUSG00000042606.10	ENSMUST00000037248.10	2766	7	465	248	-2	211	multi-exon	FALSE	canonical	3	171	junction_2	39.0498257216199	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTCCCAAACCGTCATGC	1941	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126461608	126464301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126461689_126461771_126461893_126461989_126462099_126462340_126463423_126463491_126463658_126463734_126463834_126463905
tx.17507	chr7	+	1397	4	ISM	ENSMUSG00000042606.10	ENSMUST00000037248.10	2766	7	1543	248	-328	211	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	257	junction_1	7.34846922834953	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTCCCAAACCGTCATGC	3019	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126462686	126464301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_126463423_126463491_126463658_126463734_126463834_126463905
tx.17508	chr7	-	572	4	ISM	ENSMUSG00000060538.15	ENSMUST00000120007.8	1087	5	601	1	53	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	3.55902608401044	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTGTAAGGTACTTACT	7672	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126495995	126485390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126485488_126488062_126488233_126490774_126491005_126495920
tx.17509	chr7	-	890	5	FSM	ENSMUSG00000060538.15	ENSMUST00000120007.8	1087	5	196	1	196	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	3.20156211871642	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTGTAAGGTACTTACT	7267	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126496400	126485390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126485488_126488062_126488233_126490774_126491005_126495920_126496111_126496197
tx.1751	chr10	+	729	2	ISM	ENSMUSG00000034994.11	ENSMUST00000219497.2	651	3	456	-464	456	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7978	junction_1	0	22467	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTCGCAACTCTGTTTT	7057	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81017340	81018332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81017460_81017722
tx.17510	chr7	-	930	6	FSM	ENSMUSG00000060538.15	ENSMUST00000032926.12	941	6	12	-1	-11	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_5	14.8781719307178	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTGTAAGGTACTTACT	6231	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126497436	126485390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126485488_126488062_126488233_126490774_126491005_126495920_126496111_126496197_126496400_126497395
tx.17511	chr7	-	930	6	FSM	ENSMUSG00000060538.15	ENSMUST00000121532.8	915	6	-14	-1	9	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_5	16.451139778143	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGTGTAAGGTACTTACT	6228	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126497439	126485390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126485488_126488062_126488233_126490774_126491005_126495920_126496111_126496197_126496397_126497395
tx.17512	chr7	+	1672	6	FSM	ENSMUSG00000030685.6	ENSMUST00000032924.6	1676	6	3	1	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_2	8.49470423263812	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCTGACTCTCGGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126528053	126544802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126528471_126529804_126529975_126540504_126540595_126540682_126540736_126541318_126541515_126544056
tx.17513	chr7	+	1247	5	ISM	ENSMUSG00000030685.6	ENSMUST00000032924.6	1676	6	1756	7	714	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_1	5.53962995154008	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGGTCTGCTGCTGACTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126529806	126544796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_126529975_126540504_126540595_126540682_126540736_126541318_126541515_126544056
tx.17514	chr7	-	599	5	NIC	ENSMUSG00000097075.4	novel	981	6	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGAGATGGTGGCAGTGTT	9608	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126575268	126571796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_126572080_126573624_126573683_126574111_126574257_126574478_126574564_126575240
tx.17515	chr7	-	684	5	NIC	ENSMUSG00000097075.4	novel	845	5	NA	NA	35	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.82915619758885	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGTGGCAGTGTTCTGGA	9687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126575189	126571791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_126572080_126573624_126573683_126574111_126574257_126574478_126574564_126575081
tx.17516	chr7	+	1881	6	FSM	ENSMUSG00000030682.5	ENSMUST00000032920.5	1974	6	430	-337	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	352	junction_2	28.9344085821708	400	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTTTTCTCAGAGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126575515	126579671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126575979_126576089_126576225_126577433_126577588_126578086_126578169_126578493_126578576_126578706
tx.17517	chr7	-	1020	5	ISM	ENSMUSG00000030681.19	ENSMUST00000165096.9	2837	15	24740	4	21984	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_4	10.7004672795163	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTATGTTTCTTTTTCCCTC	5971	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126589053	126586035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126586287_126586648_126586838_126587489_126587617_126587997_126588115_126588717
tx.17518	chr7	-	1366	3	FSM	ENSMUSG00000107068.2	ENSMUST00000202798.2	1412	3	32	14	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	276	junction_2	10	1058	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGGCGTGGTGGCGCACG	9462	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126616492	126614236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126614642_126615371_126615455_126615614
tx.17519	chr7	-	1718	4	NNC	ENSMUSG00000030678.8	novel	2650	6	NA	NA	-20	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	387	junction_1	176.98775852207	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGAGTTCCTAAGTTAT	1630	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126624324	126621301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_126622341_126622648_126622879_126623615_126623788_126624047
tx.1752	chr10	+	828	2	ISM	ENSMUSG00000034949.19	ENSMUST00000144087.2	436	3	6	3197	6	-3197	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	5	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAGAAAACGCTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81068994	81070190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81069077_81069444
tx.17520	chr7	-	1333	4	NIC	ENSMUSG00000030678.8	novel	2650	6	NA	NA	167	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	53	junction_3	303.870952141786	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGAGTTCCTAAGTTAT	497	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126625457	126621301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_126622341_126623615_126623788_126624047_126624112_126625399
tx.17521	chr7	-	2199	13	NIC	ENSMUSG00000030677.9	novel	2115	14	NA	NA	-18	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	712	junction_7	45.9422191453569	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGAGCCTGGTTTTTGAGG	7969	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126641599	126626900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_126627013_126627102_126627163_126627241_126627455_126628086_126628149_126628506_126628673_126630100_126630270_126631800_126631937_126632053_126632565_126632640_126632851_126633049_126633205_126633295_126633424_126634919_126635113_126641515
tx.17522	chr7	-	2085	14	FSM	ENSMUSG00000030677.9	ENSMUST00000032915.8	2115	14	32	-2	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	689	junction_8	49.8885147636753	410	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGAGCCTGGTTTTTGAGG	7957	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126641611	126626900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126627013_126627102_126627163_126627241_126627455_126628086_126628149_126628506_126628673_126630100_126630270_126631800_126631937_126632053_126632208_126632333_126632565_126632640_126632851_126633049_126633205_126633295_126633424_126634919_126635113_126641515
tx.17523	chr7	+	1885	2	FSM	ENSMUSG00000045165.7	ENSMUST00000056288.7	1932	2	47	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	0	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTTTGTATGACCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126690577	126693158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126690645_126691340
tx.17524	chr7	-	1399	4	FSM	ENSMUSG00000030674.6	ENSMUST00000032912.6	2050	4	180	471	-5	-471	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_2	9.46337971105226	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACAAGCTGCTAGCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126721218	126706756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126707414_126707505_126707638_126707880_126708417_126721144
tx.17525	chr7	-	804	3	ISM	ENSMUSG00000030674.6	ENSMUST00000032912.6	2050	4	13318	656	13110	-656	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_2	7	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAATGAGTGGTTGGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126708080	126706941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126707414_126707505_126707638_126707880
tx.17526	chr7	-	684	3	ISM	ENSMUSG00000042502.11	ENSMUST00000035771.5	1309	7	1362	7	931	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	601	junction_2	17	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTCCATAGCTCCTTTTG	6945	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126793685	126792836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126793103_126793186_126793294_126793374
tx.17527	chr7	-	1327	7	FSM	ENSMUSG00000042502.11	ENSMUST00000166791.8	3284	7	-54	2011	-4	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	356	junction_6	93.763295353542	328	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCTTCTCCATAGCTC	5404	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126795226	126792842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126793103_126793186_126793294_126793374_126793814_126793915_126794074_126794194_126794331_126794532_126794634_126795100
tx.17528	chr7	-	1204	6	ISM	ENSMUSG00000042502.11	ENSMUST00000035771.5	1309	7	410	14	-21	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	578	junction_3	18.2274518241031	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGGGCTTCTCCATAGCT	5993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126794637	126792843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126793103_126793186_126793294_126793374_126793814_126793915_126794074_126794194_126794331_126794532
tx.17529	chr7	-	1352	7	NIC	ENSMUSG00000042502.11	novel	1309	7	NA	NA	0	-14	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	67	junction_6	200.670058110876	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGGGCTTCTCCATAGCT	5520	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126795110	126792843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_126793103_126793186_126793294_126793374_126793814_126793915_126794074_126794194_126794331_126794532_126794634_126794958
tx.1753	chr10	+	1847	13	FSM	ENSMUSG00000004933.18	ENSMUST00000105328.10	2228	13	-2	383	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_9	3.36237350030534	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGTCTGATGCCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81093130	81098816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81093409_81094313_81094374_81095010_81095122_81095216_81095333_81095420_81095641_81095922_81096017_81096741_81096808_81097276_81097377_81097464_81097550_81097628_81097703_81097794_81097991_81098281_81098369_81098456
tx.17530	chr7	+	734	7	FSM	ENSMUSG00000030672.13	ENSMUST00000032910.13	766	7	22	10	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	683.213892000318	711	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGGCAATTTCAGTGTG	2982	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126810801	126813460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126810936_126812032_126812126_126812336_126812413_126812589_126812695_126812781_126812861_126813106_126813156_126813262
tx.17531	chr7	+	718	7	NIC	ENSMUSG00000030672.13	novel	268	4	NA	NA	-89	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	184	junction_1	671.232365793612	885	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGGCAATTTCAGTGTG	3942	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126811761	126813460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_126811880_126812032_126812126_126812336_126812413_126812589_126812695_126812781_126812861_126813106_126813156_126813262
tx.17532	chr7	+	731	6	ISM	ENSMUSG00000030672.13	ENSMUST00000032910.13	766	7	1122	10	51	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	600	junction_1	477.333007448678	836	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGGCAATTTCAGTGTG	4082	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126811901	126813460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_126812126_126812336_126812413_126812589_126812695_126812781_126812861_126813106_126813156_126813262
tx.17533	chr7	+	539	5	ISM	ENSMUSG00000030672.13	ENSMUST00000032910.13	766	7	1525	10	19	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1768	junction_4	19.9311314279947	4969	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGGCAATTTCAGTGTG	4485	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126812304	126813460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_126812413_126812589_126812695_126812781_126812861_126813106_126813156_126813262
tx.17534	chr7	+	483	4	ISM	ENSMUSG00000030672.13	ENSMUST00000032910.13	766	7	1758	10	252	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1768	junction_3	20.2155056000751	636	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGGCAATTTCAGTGTG	4718	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126812537	126813460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_126812695_126812781_126812861_126813106_126813156_126813262
tx.17535	chr7	-	621	3	ISM	ENSMUSG00000000486.14	ENSMUST00000106313.8	1285	10	2896	-201	-282	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	342	junction_2	15	186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCCGGAGTCTTCTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126814579	126813613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126814017_126814120_126814212_126814452
tx.17536	chr7	-	1189	8	ISM	ENSMUSG00000000486.14	ENSMUST00000106313.8	1285	10	608	-201	536	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_7	43.3942533579021	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCCGGAGTCTTCTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126816867	126813613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126814017_126814120_126814212_126814452_126814619_126814830_126814928_126815039_126815142_126815861_126815980_126816072_126816208_126816790
tx.17537	chr7	-	1468	11	FSM	ENSMUSG00000000486.14	ENSMUST00000106314.8	1486	11	38	-20	11	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	221	junction_10	48.9043965303734	409	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCCGGAGTCTTCTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126817632	126813613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126814017_126814120_126814212_126814452_126814619_126814830_126814928_126815039_126815142_126815861_126815980_126816072_126816208_126816790_126816915_126817142_126817230_126817312_126817404_126817578
tx.17538	chr7	+	3011	2	FSM	ENSMUSG00000045598.11	ENSMUST00000106312.4	3342	2	195	136	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	192	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTGTGGTTATGTGTA	8303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126832427	126837215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126832659_126834435
tx.17539	chr7	-	649	3	FSM	ENSMUSG00000042462.5	ENSMUST00000035276.5	676	3	27	0	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3852	junction_1	65	18595	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTCGATTTTTCTTGAGT	2517	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126859854	126856130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126856509_126858529_126858641_126859694
tx.1754	chr10	-	588	3	FSM	ENSMUSG00000034932.5	ENSMUST00000046114.5	604	3	8	8	-2	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	958	junction_1	11.5	7154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACGCACATGTGTGTCAT	3102	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81102760	81100554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81100832_81101484_81101642_81102606
tx.17540	chr7	-	2550	2	FSM	ENSMUSG00000047371.8	ENSMUST00000060783.7	2356	2	-194	0	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATTCGTCCTTAAGATGT	5127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126944789	126941966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126944048_126944320
tx.17541	chr7	-	1027	3	FSM	ENSMUSG00000045251.14	ENSMUST00000106300.2	1015	3	-12	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	2.5	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGTGTTTTGTGTTAAGA	6906	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127021218	127018138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127018814_127020576_127020691_127020980
tx.17542	chr7	-	2005	3	FSM	ENSMUSG00000048921.12	ENSMUST00000053392.11	3621	3	12	1604	12	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	4.5	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATATGGGTGTGTTCTTCT	4369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127048318	127042911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127044310_127047534_127047649_127047825
tx.17543	chr7	+	1117	2	FSM	ENSMUSG00000086502.2	ENSMUST00000147487.2	1142	2	8	17	4	-17	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACTGGCTTACTCTGAGA	907	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127047815	127056340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127048744_127056151
tx.17544	chr7	+	2816	2	FSM	ENSMUSG00000086502.2	ENSMUST00000144796.2	1778	2	19	-1057	19	1057	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127047830	127060589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127048744_127058686
tx.17545	chr7	+	2094	12	ISM	ENSMUSG00000030822.16	ENSMUST00000106292.8	2175	13	643	-1	-5	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	50.8389126685683	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGACTCCTTTGTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127070185	127075932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127070292_127071077_127071150_127071269_127071439_127072766_127072889_127072968_127073159_127073550_127073595_127073685_127073892_127074223_127074798_127074928_127074999_127075078_127075171_127075393_127075466_127075555
tx.17546	chr7	+	2416	11	FSM	ENSMUSG00000030822.16	ENSMUST00000033095.10	2402	11	-13	-1	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_10	17.7132718603876	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTGACTCCTTTGTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127070648	127075931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127071150_127071269_127071439_127072766_127072889_127072968_127073159_127073550_127073595_127073685_127073892_127074223_127074798_127074928_127074999_127075078_127075171_127075393_127075466_127075555
tx.17547	chr7	+	1845	4	ISM	ENSMUSG00000053877.13	ENSMUST00000189136.7	1960	6	-16	2101	3	767	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_2	2.05480466765633	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTCTTCTTTTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127111157	127119908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127111511_127113336_127113413_127115113_127115374_127118752
tx.17548	chr7	+	2009	10	NIC	ENSMUSG00000053877.13	novel	2048	10	NA	NA	-3	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	20	junction_9	13.2282899242868	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTTCAGTTATTGAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127111195	127128493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_127111511_127113336_127113413_127115113_127115374_127118752_127119005_127120647_127120834_127121160_127121302_127124464_127124688_127124802_127125078_127127567_127127662_127128306
tx.17549	chr7	+	1986	3	FSM	ENSMUSG00000030815.12	ENSMUST00000151908.8	1918	3	-54	-14	10	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	14	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127172521	127178472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127172629_127173025_127173139_127176706
tx.1755	chr10	+	2047	11	FSM	ENSMUSG00000004931.12	ENSMUST00000057798.9	2106	11	49	10	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_1	25.7441255435099	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGTGGTCAGAAGCTTGA	1369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81104054	81109070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81104154_81104612_81105296_81105378_81105419_81106801_81106948_81107029_81107117_81107198_81107361_81107495_81107667_81108018_81108232_81108417_81108538_81108655_81108794_81108882
tx.17550	chr7	+	1610	10	FSM	ENSMUSG00000030815.12	ENSMUST00000033086.8	1570	10	-41	1	-17	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_3	31.2018517968975	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCATGTCTGCTGTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127172534	127182478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127172629_127173025_127173139_127176706_127176883_127177146_127177202_127178838_127178905_127178981_127179146_127181294_127181386_127181465_127181620_127181690_127181817_127181907
tx.17551	chr7	+	1503	9	NIC	ENSMUSG00000030815.12	novel	1570	10	NA	NA	11	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_3	33.5016324229134	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCATGTCTGCTGTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127172522	127182478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_127172629_127173025_127173139_127176706_127176819_127178838_127178905_127178981_127179146_127181294_127181386_127181465_127181620_127181690_127181817_127181907
tx.17552	chr7	-	1158	9	FSM	ENSMUSG00000057176.5	ENSMUST00000072155.5	2536	9	402	976	-24	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	3.80788655293195	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACGAGCACCTTCTGGGT	8688	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127187365	127182530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127182762_127183992_127184086_127184164_127184226_127184316_127184434_127184625_127184697_127185446_127185617_127185994_127186061_127186735_127186768_127187048
tx.17553	chr7	-	1367	8	NIC	ENSMUSG00000057176.5	novel	2536	9	NA	NA	-43	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	22	junction_2	2.18529407725405	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCACGAGCACCTTCTGG	8669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127187384	127182532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_127182762_127183992_127184086_127184164_127184226_127184316_127184697_127185446_127185617_127185994_127186061_127186735_127186768_127187048
tx.17554	chr7	-	845	2	NNC	ENSMUSG00000030814.18	novel	6235	5	NA	NA	45266	14054	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGGTCTCTCGTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127261210	127246573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_127247313_127261104
tx.17555	chr7	-	548	4	ISM	ENSMUSG00000030814.18	ENSMUST00000061468.9	1132	6	1399	0	-230	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	496	junction_2	24.9577420631132	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGTCATGTCATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127306706	127304149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_127304348_127304898_127304985_127306347_127306510_127306604
tx.17556	chr7	-	635	5	ISM	ENSMUSG00000030814.18	ENSMUST00000061468.9	1132	6	974	0	116	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	471	junction_4	32.6993883734849	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGTCATGTCATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127307131	127304149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_127304348_127304898_127304985_127306347_127306510_127306604_127306714_127307051
tx.17557	chr7	-	790	6	FSM	ENSMUSG00000030814.18	ENSMUST00000061468.9	1132	6	342	0	48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	471	junction_4	29.8971570554794	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGTCATGTCATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127307763	127304149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127304348_127304898_127304985_127306347_127306510_127306604_127306714_127307051_127307131_127307607
tx.17558	chr7	+	2043	2	ISM	ENSMUSG00000030811.15	ENSMUST00000206893.2	3449	10	19073	6	19073	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGGGGCCGCTGACTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127366518	127368649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127366836_127366923
tx.17559	chr7	+	1852	2	FSM	ENSMUSG00000043964.15	ENSMUST00000061587.13	1996	2	2	142	2	-142	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCCTATGGCTATGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127368988	127374180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127369389_127372728
tx.1756	chr10	+	2603	9	FSM	ENSMUSG00000034889.9	ENSMUST00000050867.8	2715	9	112	0	112	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_2	15.2786615905975	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTTCTGATCTGAGTCA	5581	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81157048	81162076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81157281_81158271_81158840_81158954_81159101_81159452_81159616_81159743_81159859_81160136_81160330_81160702_81160823_81160923_81161211_81161297
tx.17560	chr7	+	1189	4	ISM	ENSMUSG00000042308.15	ENSMUST00000047157.13	5927	19	19935	-7	18747	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	51	junction_2	1.88561808316413	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGGTCAGTATCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127396495	127399294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127396610_127396775_127396896_127398262_127398401_127398477
tx.17561	chr7	+	1828	7	FSM	ENSMUSG00000042289.12	ENSMUST00000046863.12	1828	7	-1	1	-1	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	65	junction_6	10.2794292967395	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGTCTACCTTTTACCC	1883	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127399774	127402973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127399887_127400246_127400419_127400632_127400789_127401005_127401115_127401185_127401286_127401407_127401571_127401957
tx.17562	chr7	+	1440	11	FSM	ENSMUSG00000030805.15	ENSMUST00000033075.14	1456	11	9	7	9	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	172	junction_3	24.7872951327893	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGAGCCAGCTGTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127440944	127448184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127441241_127441435_127441538_127441616_127441717_127441855_127441931_127442743_127442815_127445191_127445301_127445371_127445449_127445659_127445798_127447559_127447671_127447740_127447840_127447922
tx.17563	chr7	+	475	3	ISM	ENSMUSG00000030805.15	ENSMUST00000033075.14	1456	11	6621	7	-6	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_2	11.5	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGAGCCAGCTGTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127447556	127448184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127447671_127447740_127447840_127447922
tx.17564	chr7	-	2147	3	FSM	ENSMUSG00000049728.15	ENSMUST00000054415.12	5768	3	675	2946	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_2	4	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTCTTCTGTATTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127475325	127465164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127466536_127466927_127467597_127475218
tx.17565	chr7	+	1665	2	ISM	ENSMUSG00000049739.11	ENSMUST00000050383.8	6310	3	5107	0	3497	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTACTGGTGTGGTTATATC	632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127481979	127485168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127483091_127484614
tx.17566	chr7	-	749	3	FSM	ENSMUSG00000096145.3	ENSMUST00000033074.8	748	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	262	junction_2	18.5	3287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGTAGCATATGTCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127494790	127492234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127492664_127493676_127493787_127494580
tx.17567	chr7	+	1802	12	FSM	ENSMUSG00000030802.15	ENSMUST00000071056.14	3405	12	5	1598	5	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	550	junction_9	38.261820946588	632	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGGGAGGGCAGGCGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127503258	127507795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127503342_127503934_127504298_127504393_127504463_127504541_127504653_127504920_127504969_127505044_127505165_127505243_127505343_127505520_127505595_127506390_127506520_127506613_127506704_127507092_127507252_127507338
tx.17568	chr7	+	1515	11	FSM	ENSMUSG00000030801.11	ENSMUST00000033070.9	1579	11	1	63	1	-63	multi-exon	FALSE	canonical	3	295	junction_2	15.0053323855222	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAGAGATGCCAAAGGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127511688	127524946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127511915_127514399_127514475_127514550_127514727_127519407_127519462_127519593_127519759_127521330_127521421_127523549_127523691_127523775_127523870_127523967_127524119_127524280_127524436_127524758
tx.17569	chr7	-	1179	2	ISM	ENSMUSG00000030800.11	ENSMUST00000032988.10	1852	6	3105	1	3096	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCTGTACACATATTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127526171	127524888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_127525813_127525916
tx.1757	chr10	+	1906	8	ISM	ENSMUSG00000034889.9	ENSMUST00000050867.8	2715	9	1800	0	-533	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_1	15.1266759907989	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTTCTGATCTGAGTCA	7269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81158736	81162076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81158840_81158954_81159101_81159452_81159616_81159743_81159859_81160136_81160330_81160702_81160823_81160923_81161211_81161297
tx.17570	chr7	-	1808	5	NNC	ENSMUSG00000030800.11	novel	1852	6	NA	NA	3	-49	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_4	13.1244047484067	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCAGTGCACCAGCAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127529273	127524936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_127525813_127525916_127526084_127526170_127526443_127526980_127527144_127528943
tx.17571	chr7	-	1163	5	NIC	ENSMUSG00000070371.12	novel	3028	15	NA	NA	8	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	21	junction_3	30.0863341070327	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTGGCTTTGTGGCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127534678	127531809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_127532287_127532542_127532665_127532738_127533005_127533561_127533800_127534618
tx.17572	chr7	-	1044	5	FSM	ENSMUSG00000070371.12	ENSMUST00000153110.8	1016	5	-28	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	32.1820990614348	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTGGCTTTGTGGCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127534679	127531809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127532287_127532542_127532665_127532738_127533005_127533681_127533800_127534618
tx.17573	chr7	-	907	4	NIC	ENSMUSG00000070371.12	novel	1052	5	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	17	junction_2	36.3409777890836	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTGGCTTTGTGGCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127534688	127531809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_127532287_127532542_127532665_127533561_127533800_127534618
tx.17574	chr7	+	1837	15	FSM	ENSMUSG00000030795.19	ENSMUST00000106251.10	5536	15	30	3669	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	619	junction_3	208.17746550205	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTTTCCCCCAGTTTAC	1180	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127566658	127581204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127566750_127568733_127568759_127568888_127569044_127571009_127571155_127571288_127571477_127571725_127571943_127573571_127573607_127575059_127575093_127576389_127576494_127577312_127577443_127579063_127579166_127579294_127579419_127580362_127580464_127580582_127580728_127580962
tx.17575	chr7	+	1235	10	ISM	ENSMUSG00000030795.19	ENSMUST00000077609.12	1831	15	5062	0	677	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1038	junction_2	118.98874311318	535	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTTTCCCCCAGTTTAC	6245	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127571723	127581204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127571943_127573571_127573607_127575059_127575093_127576389_127576494_127577312_127577443_127579063_127579166_127579294_127579419_127580362_127580464_127580582_127580728_127580962
tx.17576	chr7	+	578	4	ISM	ENSMUSG00000030795.19	ENSMUST00000121616.9	1102	9	12649	0	-27	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1177	junction_2	94.595043327979	463	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTTTCCCCCAGTTTAC	5460	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127579328	127581204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127579419_127580362_127580464_127580582_127580728_127580962
tx.17577	chr7	+	299	2	ISM	ENSMUSG00000030795.19	ENSMUST00000121616.9	1102	9	13991	0	1283	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1395	junction_1	0	1698	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTTTCCCCCAGTTTAC	6802	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127580670	127581204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127580728_127580962
tx.17578	chr7	-	755	3	FSM	ENSMUSG00000030793.5	ENSMUST00000033056.5	3800	3	120	2925	120	-993	multi-exon	FALSE	canonical	3	1219	junction_2	45	9717	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGGGATGTTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127592919	127591804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127592138_127592286_127592344_127592554
tx.17579	chr7	-	575	3	FSM	ENSMUSG00000030785.9	ENSMUST00000033049.9	680	3	-74	179	-74	-179	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	3.5	640	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTCCTCTGGCTCTTTGG	5309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127805633	127804785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127804985_127805071_127805209_127805394
tx.1758	chr10	+	1599	6	ISM	ENSMUSG00000034889.9	ENSMUST00000050867.8	2715	9	2574	0	175	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_1	11.0381157812373	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTTCTGATCTGAGTCA	8043	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81159510	81162076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81159616_81159743_81159859_81160136_81160330_81160702_81160823_81160923_81161211_81161297
tx.17580	chr7	+	3078	6	FSM	ENSMUSG00000042178.7	ENSMUST00000044660.6	3834	6	755	1	755	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	5.30659966456864	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGCTGTGTGGGGTCGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127837283	127844271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_127837762_127839053_127839162_127839254_127840042_127841351_127841849_127842511_127842645_127843196
tx.17581	chr7	+	957	4	NNC	ENSMUSG00000030781.14	novel	2277	14	NA	NA	215	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.74165738677394	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTTGTGGCTGAAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127869960	127871602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_127870125_127870206_127870423_127870940_127871051_127871135
tx.17582	chr7	+	976	4	ISM	ENSMUSG00000030781.14	ENSMUST00000118169.8	2277	14	5114	0	216	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2.82842712474619	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTTGTGGCTGAAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127869961	127871602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127870125_127870206_127870423_127870920_127871051_127871135
tx.17583	chr7	-	2578	13	FSM	ENSMUSG00000030780.16	ENSMUST00000033044.16	2627	13	49	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_4	13.6897670623799	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCGCTTCATACTGCAGGC	1155	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127897293	127870550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127871788_127872643_127872722_127872822_127872967_127873804_127873876_127875257_127875316_127875399_127875585_127875666_127875738_127884284_127884387_127887435_127887542_127887630_127887664_127889761_127889808_127896633_127896749_127896961
tx.17584	chr7	-	937	5	ISM	ENSMUSG00000030780.16	ENSMUST00000126263.8	1625	13	-11	15618	2	21	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	151	junction_1	12.9107513336754	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACAGACTCTCCCATGTT	1170	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127897278	127887115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_127887542_127887630_127887664_127889761_127889808_127896633_127896749_127896961
tx.17585	chr7	+	515	3	Intergenic	novelGene_1213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1.5	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTGACTCCTGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127901994	127902928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_127902082_127902265_127902341_127902575
tx.17586	chr7	+	430	2	Intergenic	novelGene_1214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTGACTCCTGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127902263	127902928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_127902341_127902575
tx.17587	chr7	+	559	2	NNC	ENSMUSG00000108608.2	novel	828	2	NA	NA	-29	268	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127942161	127942797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_127942499_127942575
tx.17588	chr7	-	511	2	ISM	ENSMUSG00000030846.16	ENSMUST00000133444.8	953	6	968	71	968	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	264	junction_1	0	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGACTATAAATTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128045661	128044003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_128044384_128045530
tx.17589	chr7	-	908	6	ISM	ENSMUSG00000030846.16	ENSMUST00000033135.9	1580	12	15622	0	-28	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	187	junction_2	26.4529771481397	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGACTATAAATTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128047457	128044003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_128044384_128045530_128045671_128046004_128046129_128046336_128046422_128046535_128046632_128047374
tx.1759	chr10	+	974	2	ISM	ENSMUSG00000034889.9	ENSMUST00000050867.8	2715	9	4079	0	1680	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTTCTGATCTGAGTCA	297	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81161015	81162076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81161211_81161297
tx.17590	chr7	-	1829	12	FSM	ENSMUSG00000030846.16	ENSMUST00000033135.9	1580	12	-249	0	48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_7	29.2730095977351	350	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGACTATAAATTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128063328	128044003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_128044384_128045530_128045671_128046004_128046129_128046336_128046422_128046535_128046632_128047374_128047484_128047918_128047995_128049844_128049933_128050065_128050121_128050344_128050444_128056659_128056757_128062848
tx.17591	chr7	+	343	2	NIC	ENSMUSG00000108668.2	novel	496	4	NA	NA	192	4	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCTTGGTCTTGGTGCTA	5215	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128076133	128077299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_128076352_128077174
tx.17592	chr7	-	959	3	ISM	ENSMUSG00000108626.2	ENSMUST00000205319.2	1174	5	5483	235	5483	-235	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCCTTGGTCATGGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128096428	128089903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_128090063_128090663_128090776_128095740
tx.17593	chr7	+	2594	4	FSM	ENSMUSG00000030847.9	ENSMUST00000033136.9	2562	4	-32	0	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_2	8.2192186706253	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTTTGTGGTTTCTAA	7110	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128125307	128148705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_128125769_128141696_128142036_128143530_128143933_128147313
tx.17594	chr7	+	967	3	ISM	ENSMUSG00000030847.9	ENSMUST00000033136.9	2562	4	-20	4996	-20	-4996	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_2	10	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGACCCACTACCCAGCTC	7122	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128125319	128143709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_128125769_128141696_128142036_128143530
tx.17595	chr7	+	706	4	ISM	ENSMUSG00000042105.19	ENSMUST00000098007.11	1906	10	6	7855	6	-4804	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	55	junction_3	6.16441400296898	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGACTTTGATTGACGTGG	7150	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128213057	128265491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_128213416_128237881_128237963_128260739_128260877_128265361
tx.17596	chr7	+	665	2	ISM	ENSMUSG00000055319.9	ENSMUST00000042942.10	4505	19	0	34349	0	109	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	135	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCTACAGCAGTGTCAGATG	1931	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128346666	128352211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_128346903_128351782
tx.17597	chr7	+	3441	19	FSM	ENSMUSG00000055319.9	ENSMUST00000042942.10	4505	19	15	1049	15	-1049	multi-exon	TRUE	canonical	3	121	junction_10	14.275615919341	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATGCAATATGTTATTTT	1946	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128346681	128385511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_128346903_128351782_128352310_128354429_128354641_128355773_128355968_128357039_128357130_128359486_128359608_128363139_128363230_128364113_128364256_128365664_128365874_128367107_128367227_128367849_128368003_128369290_128369387_128373888_128374087_128378494_128378651_128379007_128379111_128380152_128380339_128380786_128380950_128381359_128381462_128385151
tx.17598	chr7	+	570	3	ISM	ENSMUSG00000055319.9	ENSMUST00000042942.10	4505	19	34174	1050	33697	-1050	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_2	4	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAATGCAATATGTTATTT	4532	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128380840	128385510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_128380950_128381359_128381462_128385151
tx.17599	chr7	+	329	2	Intergenic	novelGene_1215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTGTGCATCTCTCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128444675	128447093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_128444830_128446918
tx.176	chr1	+	629	4	FSM	ENSMUSG00000073702.12	ENSMUST00000179954.8	630	4	133	-132	-87	131	multi-exon	FALSE	canonical	3	8615	junction_3	1758.8270712798	6464	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAGAAGTCACTTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39407142	39410578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_39407337_39409094_39409221_39410034_39410148_39410382
tx.1760	chr10	+	1370	2	ISM	ENSMUSG00000034881.9	ENSMUST00000105325.4	1765	3	3871	-2	3871	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGGAGCACTCCCCTAAG	404	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81168435	81171008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81169090_81170292
tx.17600	chr7	+	859	5	Intergenic	novelGene_1216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	0.82915619758885	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCTCATAAATAAATGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129025007	129051531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_129025243_129030706_129030854_129048286_129048443_129049648_129049692_129051253
tx.17601	chr7	+	1182	4	NNC	ENSMUSG00000042055.14	novel	4550	29	NA	NA	3354	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	84.3682404699778	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTTGTTTGAGTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129234110	129237462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_129234146_129234433_129234580_129235373_129235456_129236543
tx.17602	chr7	-	2433	12	FSM	ENSMUSG00000030850.18	ENSMUST00000094017.5	1938	12	379	-874	-29	661	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_11	68.2405807383271	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTGGTGTTTGTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130121720	129995413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_129996467_130020177_130020299_130065860_130065961_130068985_130069168_130083412_130083446_130106423_130106553_130109211_130109430_130110736_130110989_130112540_130112645_130115491_130115555_130117834_130117899_130121606
tx.17603	chr7	-	1805	12	FSM	ENSMUSG00000030850.18	ENSMUST00000035458.15	4685	12	-12	2892	-12	-40	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_5	43.8843333177548	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAGCCCTTTAATTGGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130121272	129996114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_129996467_130020177_130020299_130065860_130065961_130068985_130069168_130083412_130083446_130105451_130105581_130109211_130109430_130110736_130110989_130112540_130112645_130115491_130115555_130117834_130117899_130121085
tx.17604	chr7	-	1806	12	FSM	ENSMUSG00000030850.18	ENSMUST00000033139.15	4735	12	41	2888	-9	-36	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_5	49.9651117950737	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTTTAATTGGGACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130121269	129996110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_129996467_130020177_130020299_130065860_130065961_130068985_130069168_130083412_130083446_130106423_130106553_130109211_130109430_130110736_130110989_130112540_130112645_130115491_130115555_130117834_130117899_130121085
tx.17605	chr7	-	940	4	ISM	ENSMUSG00000040331.17	ENSMUST00000160289.9	1435	11	11270	-3	-138	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1333	junction_1	73.4982993000518	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGATCGTTTTTATTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130137841	130134252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_130134423_130135306_130135397_130135499_130135592_130137253
tx.17606	chr7	-	1918	10	ISM	ENSMUSG00000040331.17	ENSMUST00000160289.9	1435	11	537	-1	537	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1333	junction_1	60.961635375491	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACGTGATCGTTTTTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130148574	130134254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_130134423_130135306_130135397_130135499_130135592_130137253_130137303_130138712_130138808_130139891_130139983_130140740_130140841_130141543_130141696_130144409_130144541_130147624
tx.17607	chr7	-	1214	11	FSM	ENSMUSG00000040331.17	ENSMUST00000160289.9	1435	11	221	0	221	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1333	junction_1	62.2636330453018	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACGTGATCGTTTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130148890	130134255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_130134423_130135306_130135397_130135499_130135592_130137253_130137303_130138712_130138808_130139891_130139983_130140740_130140841_130141543_130141696_130144409_130144541_130147624_130147703_130148721
tx.17609	chr7	+	3531	13	NIC	ENSMUSG00000040268.18	novel	3777	13	NA	NA	1	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	137	junction_12	38.4154012806785	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTCACGTCCCCTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130467617	130515035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_130467714_130479463_130479625_130484059_130484117_130487132_130487179_130493910_130494009_130499054_130499181_130502246_130502391_130503906_130503976_130506599_130506665_130507120_130507185_130510065_130510156_130511317_130511359_130512561
tx.1761	chr10	-	1606	9	FSM	ENSMUSG00000020232.18	ENSMUST00000020454.11	1621	9	20	-5	20	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	490	junction_7	50.249222630803	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAATATTTGTGGCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81186238	81181879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81182312_81182393_81182527_81182674_81182891_81183269_81183343_81183819_81183867_81184329_81184451_81184719_81184924_81185213_81185323_81185967
tx.17610	chr7	+	1795	9	FSM	ENSMUSG00000006205.14	ENSMUST00000006367.8	2041	9	244	2	244	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_3	16.015617378047	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTTGGCGTGCTTCTTTT	6866	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130538176	130587388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_130538474_130563242_130563343_130563702_130563908_130581030_130581226_130581681_130581715_130583386_130583502_130583966_130584025_130585389_130585486_130586692
tx.17611	chr7	-	1764	6	NNC	ENSMUSG00000040177.11	novel	6773	6	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	35.7737333807921	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGATATTTGGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130964441	130944914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_130945534_130952379_130952832_130959184_130959396_130962617_130962691_130963461_130963666_130964236
tx.17612	chr7	+	1120	6	FSM	ENSMUSG00000063179.14	ENSMUST00000075610.13	1135	6	15	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_2	32.2713495224479	602	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGATTTGGATAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130972884	130989568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_130973119_130975264_130975560_130975793_130975993_130985653_130985730_130986228_130986323_130989346
tx.17613	chr7	+	825	5	NIC	ENSMUSG00000063179.14	novel	1135	6	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	70	junction_1	59.6547357717726	294	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGATTTGGATAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130972884	130989568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_130973119_130975793_130975993_130985653_130985730_130986228_130986323_130989346
tx.17614	chr7	-	650	4	NNC	ENSMUSG00000040167.17	novel	278	3	NA	NA	-4	482	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.1754981536767	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTTTCTGTCAGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131012254	130989898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_130990044_130995483_130995667_130998397_130998581_131012115
tx.17615	chr7	-	2714	4	FSM	ENSMUSG00000040167.17	ENSMUST00000046306.15	4430	4	7	1709	7	7	multi-exon	TRUE	canonical	3	63	junction_1	6.97614984548545	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGTGTACCTTGCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131012243	130992089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_130994310_130995483_130995667_130998397_130998581_131012115
tx.17616	chr7	+	3309	11	FSM	ENSMUSG00000030861.16	ENSMUST00000015829.15	6081	11	34	2738	34	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_4	19.6022957839127	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGAGAATTCTCCCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131012363	131047935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_131012517_131026200_131026361_131027503_131027605_131030157_131030365_131031675_131031847_131033665_131033792_131035998_131036092_131039130_131039221_131042930_131043069_131045197_131045298_131045965
tx.17617	chr7	+	1126	8	ISM	ENSMUSG00000030861.16	ENSMUST00000117518.2	2466	10	-57	7236	45	8	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	100	junction_4	21.0402917648739	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTCCTGTGTGTAAAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131012374	131039256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_131012517_131026200_131026361_131027503_131027605_131030157_131030365_131031675_131031847_131033665_131033792_131035998_131036092_131039130
tx.17618	chr7	+	857	2	FSM	ENSMUSG00000066979.7	ENSMUST00000208848.2	832	2	-11	-14	0	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	1386	junction_1	0	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGTAAGAAAGAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131162108	131163220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_131162184_131162438
tx.17619	chr7	+	1345	8	FSM	ENSMUSG00000066979.7	ENSMUST00000084502.7	2218	8	158	715	0	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	1325	junction_6	52.1422700554033	361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGGTGTTTGTAAACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131162108	131172906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_131162184_131162438_131162634_131163265_131163336_131165062_131165215_131167921_131168081_131169912_131170091_131170233_131170451_131172607
tx.1762	chr10	-	1442	10	FSM	ENSMUSG00000020232.18	ENSMUST00000105323.8	1463	10	23	-2	-13	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_9	133.860992944542	184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAATATTTGTGGCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81186291	81181879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81182312_81182393_81182527_81182674_81182891_81183269_81183343_81183819_81183867_81184329_81184451_81184719_81184924_81185213_81185323_81185967_81186024_81186240
tx.17620	chr7	+	391	2	ISM	ENSMUSG00000066979.7	ENSMUST00000209131.2	4015	6	8223	715	7920	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1412	junction_1	0	450	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGGTGTTTGTAAACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131170358	131172906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_131170451_131172607
tx.17621	chr7	-	2132	10	FSM	ENSMUSG00000030934.10	ENSMUST00000084500.8	2152	10	20	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	402	junction_6	42.9636653837854	578	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATGATGTGAATCTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132178107	132159206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_132160060_132161374_132161520_132162480_132162595_132163512_132163642_132164315_132164439_132165935_132166064_132168497_132168594_132168794_132169020_132171634_132171870_132178023
tx.17622	chr7	+	1609	7	FSM	ENSMUSG00000030946.14	ENSMUST00000033241.6	1612	7	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	290	junction_6	19.9979165581484	397	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGACTCAGCCTTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132212370	132308149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_132212560_132232210_132232399_132235729_132235884_132243252_132243317_132244215_132244309_132251986_132252079_132307320
tx.17623	chr7	+	1011	3	ISM	ENSMUSG00000030946.14	ENSMUST00000210168.2	1733	8	21701	-3	12119	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	290	junction_2	13.5	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGACTCAGCCTTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132244218	132308149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_132244309_132251986_132252079_132307320
tx.17624	chr7	-	575	2	FSM	ENSMUSG00000087348.2	ENSMUST00000132849.2	1581	2	287	719	287	-719	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCTTCCTCTTCAGTAG	9082	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132261326	132259825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_132260173_132261098
tx.17625	chr7	-	1073	6	FSM	ENSMUSG00000030960.17	ENSMUST00000033257.15	1107	6	34	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_3	60.7651215747982	806	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTTTTTGGTTTTTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132454368	132429185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_132429612_132433088_132433306_132438828_132438937_132452323_132452439_132453154_132453221_132454227
tx.17626	chr7	+	2876	9	FSM	ENSMUSG00000030965.20	ENSMUST00000084497.12	2892	9	16	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	195	junction_8	19.6273883896967	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGATATTTTAGTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132460969	132486840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_132461063_132466691_132466783_132470761_132470799_132473300_132473368_132476555_132476747_132478326_132478447_132480257_132480343_132482495_132482611_132484763
tx.17627	chr7	-	2057	10	FSM	ENSMUSG00000030970.17	ENSMUST00000166439.8	1997	10	-60	0	-42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_8	235.790763073148	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAGAACAAAAGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132724955	132589312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_132590081_132591718_132591837_132592159_132592288_132592767_132592899_132593290_132593506_132596887_132597095_132600535_132600681_132600919_132601075_132683485_132683590_132724869
tx.17628	chr7	-	2182	11	FSM	ENSMUSG00000030970.17	ENSMUST00000033269.15	2321	11	150	-11	-33	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	550	junction_8	136.177861636905	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACAAAAAAACAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132724946	132589338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_132590081_132591718_132591837_132592159_132592288_132592767_132592899_132593290_132593506_132596887_132597095_132600535_132600681_132600919_132601075_132627441_132627602_132683485_132683590_132724869
tx.17629	chr7	-	1851	8	ISM	ENSMUSG00000030970.17	ENSMUST00000169570.8	3604	9	15902	23	15902	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	751	junction_6	77.2758113539299	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAAAAAAAAAAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132601075	132589329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_132590081_132591718_132591837_132592159_132592288_132592767_132592899_132593290_132593506_132596887_132597095_132600535_132600681_132600919
tx.1763	chr10	+	2091	10	FSM	ENSMUSG00000034854.9	ENSMUST00000044844.9	3971	10	81	1799	20	-1799	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_9	22.6077666104176	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTAGCCCAGGCTGCCTCCG	903	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81193405	81200260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81193721_81195915_81196127_81196932_81197072_81197147_81197334_81197858_81197952_81198038_81198132_81198521_81198693_81198766_81198862_81199386_81199518_81199603
tx.17630	chr7	-	2039	10	NNC	ENSMUSG00000030970.17	novel	1997	10	NA	NA	111	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	29	junction_9	330.945036651029	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGGAAAAGAACAAAAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132724784	132589313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_132590081_132591718_132591837_132592159_132592288_132592767_132592899_132593290_132593506_132596887_132597095_132600535_132600681_132600919_132601075_132683485_132683590_132724715
tx.17631	chr7	-	2215	11	NNC	ENSMUSG00000030970.17	novel	2321	11	NA	NA	-76	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	33	junction_10	265.033658239855	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAACAAAAAAACAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132724420	132589338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_132590081_132591718_132591837_132592159_132592288_132592767_132592899_132593290_132593506_132596887_132597095_132600535_132600681_132600919_132601075_132627441_132627602_132683485_132683590_132724310
tx.17632	chr7	-	2256	11	NNC	ENSMUSG00000030970.17	novel	2321	11	NA	NA	47	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	29	junction_10	266.085625316363	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGGAAAAGAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132724848	132589320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_132590081_132591718_132591837_132592159_132592288_132592767_132592899_132593290_132593506_132596887_132597095_132600535_132600681_132600919_132601075_132627441_132627602_132683485_132683590_132724715
tx.17633	chr7	-	859	5	Intergenic	novelGene_1217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.4790199457749	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGACG	7794	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133178635	133171726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_133171824_133172127_133172464_133174533_133174656_133176050_133176155_133178435
tx.17634	chr7	-	655	3	Intergenic	novelGene_1218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGACG	7772	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133178657	133171726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_133171824_133172127_133172464_133178435
tx.17635	chr7	-	1572	10	FSM	ENSMUSG00000030979.14	ENSMUST00000033276.11	1762	10	200	-10	-12	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_9	13.5163367087644	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATCTGAGTATGGTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133310810	133288083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_133288846_133291310_133291410_133292236_133292323_133292814_133292896_133299397_133299473_133300872_133300948_133302542_133302640_133303567_133303652_133304058_133304199_133310737
tx.17636	chr7	+	1236	7	FSM	ENSMUSG00000030983.5	ENSMUST00000033282.5	1244	7	8	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1578	junction_1	47.9215214931895	4855	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTGAAGTGTTCATGTCC	1315	False	NA	-81	True	NA	NA	NA	133311069	133322874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_133311258_133315916_133315992_133316627_133316709_133318589_133318680_133319327_133319516_133320832_133321008_133322435
tx.17637	chr7	+	888	4	ISM	ENSMUSG00000030983.5	ENSMUST00000151711.2	825	6	2123	-204	-514	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1595	junction_2	37.7094152699296	617	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTGAAGTGTTCATGTCC	8839	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133318593	133322874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_133318680_133319327_133319516_133320832_133321008_133322435
tx.17638	chr7	-	2857	11	ISM	ENSMUSG00000030986.14	ENSMUST00000140593.9	2998	12	252	-4	-188	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	326	junction_7	30.1875802276367	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTCAATGGGTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133361746	133322670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_133323126_133323877_133324060_133324770_133324959_133326128_133326279_133326932_133327125_133335696_133335856_133335937_133336038_133338917_133339164_133344157_133344531_133350571_133350766_133361128
tx.17639	chr7	-	2942	12	FSM	ENSMUSG00000030986.14	ENSMUST00000033290.12	2955	12	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	247	junction_11	48.5725154403017	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTCAATGGGTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133378519	133322670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_133323126_133323877_133324060_133324770_133324959_133326128_133326279_133326932_133327125_133335696_133335856_133335937_133336038_133338917_133339164_133344157_133344531_133350571_133350766_133361128_133361643_133378330
tx.1764	chr10	-	1624	4	FSM	ENSMUSG00000020234.11	ENSMUST00000020456.5	691	4	22	-955	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAATGCATGCTCTCCAA	423	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81201628	81198902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81200071_81200375_81200502_81200575_81200815_81201537
tx.17640	chr7	+	1294	11	FSM	ENSMUSG00000053111.14	ENSMUST00000065359.12	2004	11	24	686	-6	7	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.56904651573303	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATGTGGTCTCATCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133378613	133482575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_133378700_133454894_133455073_133463831_133463957_133469846_133469929_133471006_133471082_133471750_133471817_133478476_133478643_133481607_133481752_133482000_133482079_133482172_133482218_133482326
tx.17641	chr7	+	1998	11	NIC	ENSMUSG00000053111.14	novel	515	5	NA	NA	-32	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	4	junction_8	2.00249843945008	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACAGGAGTGGACTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133391181	133483260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_133391287_133454894_133455073_133463831_133463957_133469846_133469929_133471006_133471082_133471750_133471817_133478476_133478643_133481607_133481752_133482000_133482079_133482172_133482218_133482326
tx.17642	chr7	+	1001	6	NNC	ENSMUSG00000054612.5	novel	2894	5	NA	NA	-28	-2078	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_2	98.1150345258055	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGATGTGGCTGCCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136496314	136729917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_136496417_136521584_136521742_136552996_136553134_136687677_136687839_136723217_136723358_136729613
tx.17643	chr7	+	844	5	FSM	ENSMUSG00000054612.5	ENSMUST00000081510.4	2894	5	-28	2078	-28	-2078	multi-exon	FALSE	canonical	3	172	junction_1	21.7887585695009	896	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGATGTGGCTGCCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136496314	136729917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_136496417_136552996_136553134_136687677_136687839_136723217_136723358_136729613
tx.17644	chr7	+	678	4	NIC	ENSMUSG00000054612.5	novel	2894	5	NA	NA	-23	-2078	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	7	junction_2	91.8634251968045	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGATGTGGCTGCCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136496319	136729917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_136496417_136552996_136553134_136723217_136723358_136729613
tx.17645	chr7	+	743	4	ISM	ENSMUSG00000054612.5	ENSMUST00000081510.4	2894	5	56653	2078	56653	-2078	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	204	junction_1	10.1980390271856	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGATGTGGCTGCCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136552995	136729917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_136553134_136687677_136687839_136723217_136723358_136729613
tx.17646	chr7	-	1286	5	FSM	ENSMUSG00000040139.15	ENSMUST00000117404.8	699	5	-21	-566	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	88.1373218336024	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTCTGGCTTGGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137012485	136977299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_136978081_136978683_136978847_136989099_136989163_136989268_136989431_137012368
tx.17647	chr7	-	1123	4	FSM	ENSMUSG00000040139.15	ENSMUST00000068996.13	1126	4	6	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_1	38.0292285252044	767	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTCTGGCTTGGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137012485	136977299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_136978081_136989099_136989163_136989268_136989431_137012368
tx.17648	chr7	-	896	2	FSM	ENSMUSG00000040139.15	ENSMUST00000145881.8	895	2	2	-3	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTCTGGCTTGGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137012483	136977299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_136978081_137012368
tx.17649	chr7	-	1306	5	NNC	ENSMUSG00000040139.15	novel	699	5	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	92.2506775042872	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCTGTCTGGCTTGGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137012485	136977301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_136978081_136978661_136978847_136989099_136989163_136989268_136989431_137012368
tx.1765	chr10	-	2346	14	FSM	ENSMUSG00000020235.17	ENSMUST00000140901.8	3057	14	58	653	5	223	multi-exon	FALSE	canonical	3	644	junction_9	52.0083061185946	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGGTCGGTCTCCTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81214292	81202708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81203385_81203474_81203568_81203964_81204070_81204356_81204591_81204907_81205093_81205171_81205275_81205804_81205871_81206031_81206216_81206298_81206382_81206530_81206659_81206788_81206853_81206928_81207055_81207178_81207289_81214103
tx.17650	chr7	+	1244	11	FSM	ENSMUSG00000031068.9	ENSMUST00000064404.8	1685	11	34	407	-7	-407	multi-exon	FALSE	canonical	3	3305	junction_4	243.181434324251	15575	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTGCGTGTAGAATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137039376	137069916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_137039501_137046707_137046817_137054425_137054501_137055141_137055344_137060851_137061025_137061209_137061272_137063074_137063133_137064689_137064743_137065826_137065867_137066143_137066237_137069661
tx.17651	chr7	-	1135	4	Intergenic	novelGene_1219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATCAGCGAGAGCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137255761	137253225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_137253915_137254812_137255039_137255428_137255593_137255705
tx.17652	chr7	-	830	3	Intergenic	novelGene_1220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTGTGAGCCTTGCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138257650	138253098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_138253778_138256211_138256276_138257563
tx.17653	chr7	-	1528	2	FSM	ENSMUSG00000041775.8	ENSMUST00000075667.5	1502	2	-16	-10	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	0	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCAACTTGTTTTGGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138448005	138437551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_138438760_138447685
tx.17654	chr7	+	1440	5	NIC	ENSMUSG00000041769.14	novel	2081	9	NA	NA	-3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	18	junction_1	304.918431715762	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCACTGCAGTCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138448320	138484786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_138448434_138474729_138474781_138475848_138476014_138478184_138478447_138483937
tx.17655	chr7	+	1566	5	NIC	ENSMUSG00000041769.14	novel	2081	9	NA	NA	-2	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	26	junction_1	301.471806310308	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCACTGCAGTCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138448321	138484786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_138448434_138474602_138474781_138475848_138476014_138478184_138478447_138483937
tx.17656	chr7	+	1938	8	FSM	ENSMUSG00000041769.14	ENSMUST00000155672.8	1938	8	3	-3	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	482	junction_3	92.005767343628	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCACTGCAGTCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138448326	138484786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_138448434_138470138_138470237_138471418_138471585_138472118_138472232_138474602_138474781_138475848_138476014_138478184_138478447_138483937
tx.17657	chr7	+	1834	8	NIC	ENSMUSG00000041769.14	novel	2081	9	NA	NA	-12	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	46	junction_4	223.507658636987	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCACTGCAGTCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138448303	138484786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_138448434_138470138_138470237_138471418_138471585_138472118_138472232_138474729_138474781_138475848_138476014_138478184_138478447_138483937
tx.17658	chr7	+	1778	7	NIC	ENSMUSG00000041769.14	novel	2081	9	NA	NA	-3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	74	junction_2	229.285423774726	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCACTGCAGTCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138448320	138484786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_138448434_138470138_138470237_138472118_138472232_138474602_138474781_138475848_138476014_138478184_138478447_138483937
tx.17659	chr7	-	1538	5	NIC	ENSMUSG00000078566.9	novel	1756	6	NA	NA	-3	-128	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	23	junction_3	120.771219667601	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGTTTATATTTACATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138511227	138492692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_138493690_138496108_138496259_138496338_138496446_138500409_138500558_138511091
tx.1766	chr10	+	461	2	FSM	ENSMUSG00000085327.2	ENSMUST00000156260.2	401	2	-57	-3	-57	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGACACAGCAGACATGCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81245351	81247416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81245600_81247203
tx.17660	chr7	-	1628	6	FSM	ENSMUSG00000078566.9	ENSMUST00000106112.2	1756	6	0	128	0	-128	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_2	24.8628236529965	373	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGTTTATATTTACATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138511235	138492692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_138493690_138496108_138496259_138496338_138496446_138499724_138499807_138500409_138500558_138511091
tx.17661	chr7	+	2640	14	FSM	ENSMUSG00000025478.16	ENSMUST00000026551.15	3552	14	0	912	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_6	3.36181128975572	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTCTGGGTTAGAAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138665916	138681708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_138666078_138669425_138669515_138670074_138670260_138671777_138671943_138673521_138673584_138673676_138673758_138674309_138674379_138674772_138674894_138676083_138676241_138676582_138676725_138677737_138677909_138678385_138678566_138679655_138679822_138680817
tx.17662	chr7	-	902	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000015980.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTTGTTTTATGTGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138814503	138813134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_138813720_138813864_138814030_138814247_138814309_138814412
tx.17663	chr7	+	491	2	NNC	ENSMUSG00000015980.15	novel	2113	11	NA	NA	3308	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTCTCTTCTGTCGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138821836	138822896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_138821967_138822535
tx.17664	chr7	-	951	2	ISM	ENSMUSG00000041309.18	ENSMUST00000097974.9	1907	4	1231	-3	1224	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTCCGCAGGCGCCTTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139161482	139159288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_139159538_139160780
tx.17665	chr7	-	1056	3	FSM	ENSMUSG00000041309.18	ENSMUST00000106095.3	1299	3	222	21	222	-21	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_2	2	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTCGGAGCCGTGGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139162484	139161156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_139161605_139161796_139161970_139162049
tx.17666	chr7	+	1194	2	FSM	ENSMUSG00000047751.10	ENSMUST00000168457.3	1227	2	33	0	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	805	junction_1	0	3130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTGTGAATGAATTCGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139523734	139525025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_139524343_139524439
tx.17667	chr7	-	1139	6	FSM	ENSMUSG00000073795.12	ENSMUST00000210254.2	952	6	-43	-144	-7	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.16619037896906	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGGTATGTGCAGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139558675	139552210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_139552521_139555890_139556042_139556387_139556587_139556984_139557136_139557946_139558059_139558459
tx.17668	chr7	-	2866	18	FSM	ENSMUSG00000025474.10	ENSMUST00000211638.2	3060	18	287	-93	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	194	junction_17	64.0289186395126	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTGGCTCAATGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139616295	139575867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_139576080_139576694_139576859_139577884_139578014_139578681_139578826_139579139_139579261_139580927_139581057_139581338_139581512_139584711_139584893_139585182_139585364_139585927_139586074_139586764_139586955_139587339_139587540_139587799_139588008_139609739_139609900_139610923_139611101_139612031_139612161_139613525_139613712_139616259
tx.17669	chr7	+	1016	6	NNC	ENSMUSG00000025470.12	novel	1076	6	NA	NA	0	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	44	junction_4	120.382058463876	50	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCATCTGTTCTTCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139616324	139620514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_139616520_139616732_139616807_139617132_139617335_139617428_139617495_139619238_139619359_139620155
tx.1767	chr10	-	2878	14	FSM	ENSMUSG00000020238.15	ENSMUST00000118498.8	2841	14	-38	1	-22	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	153	junction_4	76.7224306246012	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGCCTCCAGGTGTCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81332198	81322291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81323440_81323513_81323593_81323680_81323735_81324028_81324190_81324261_81324301_81324382_81324471_81325635_81325955_81326060_81326150_81327003_81327108_81327810_81327892_81328661_81328757_81328896_81329042_81329182_81329374_81331913
tx.17670	chr7	+	1075	6	FSM	ENSMUSG00000025470.12	ENSMUST00000168194.3	1076	6	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	304	junction_1	28.032837887021	618	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCATCTGTTCTTCTTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139616325	139620515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_139616520_139616732_139616807_139617132_139617335_139617428_139617554_139619238_139619359_139620155
tx.17671	chr7	-	795	2	ISM	ENSMUSG00000025468.16	ENSMUST00000211044.2	1029	6	11270	4	11270	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGGTCGTGGTTTCTCTT	9309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139650870	139649797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_139649947_139650224
tx.17672	chr7	+	712	5	FSM	ENSMUSG00000025467.9	ENSMUST00000026540.9	620	5	-90	-2	-90	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_4	1.08972473588517	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAATGCGTGTCTTTAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139673217	139677115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_139673382_139674944_139675012_139676062_139676116_139676586_139676694_139676794
tx.17673	chr7	-	651	6	FSM	ENSMUSG00000025466.20	ENSMUST00000026539.14	685	6	34	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	247	junction_5	86.8506764510214	1197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTCTTGTGGTGAGTTCC	1505	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139682320	139679382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_139679620_139679791_139679866_139681002_139681102_139681244_139681316_139681513_139681583_139682219
tx.17674	chr7	-	1057	5	ISM	ENSMUSG00000025465.14	ENSMUST00000155647.2	2474	6	4598	-8	4598	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1613	junction_2	77.4156799363023	374	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTGTGTGTTTTTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139691704	139685622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_139686291_139687996_139688065_139689899_139690020_139690451_139690557_139691608
tx.17675	chr7	-	1502	8	FSM	ENSMUSG00000025465.14	ENSMUST00000026538.13	1557	8	55	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1613	junction_2	95.2071854602651	2614	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTGTGTGTTTTTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139696334	139685622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_139686291_139687996_139688065_139689899_139690020_139690451_139690557_139691608_139691709_139692331_139692460_139692848_139693047_139696219
tx.17676	chr7	+	1751	7	FSM	ENSMUSG00000025464.16	ENSMUST00000026537.13	4655	7	14	2890	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_2	25.7552583627758	287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTGTGTAGAGTACTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139705583	139714247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_139705796_139706238_139706729_139707420_139707621_139708930_139709184_139711559_139711673_139712293_139712452_139713922
tx.17677	chr7	+	1375	11	NNC	ENSMUSG00000039018.16	novel	1595	11	NA	NA	-33	168	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	150.393783116191	823	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTCTCTGGCTTCTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139717528	139730528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_139717687_139718231_139718297_139720105_139720214_139723650_139723732_139724253_139724311_139724542_139724634_139725910_139725973_139726723_139726821_139727165_139727248_139729660_139729774_139730067
tx.17678	chr7	+	1364	11	NNC	ENSMUSG00000039018.16	novel	1595	11	NA	NA	-23	168	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	150.393783116191	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTCTCTGGCTTCTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139717538	139730528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_139717687_139718231_139718312_139720121_139720214_139723650_139723732_139724253_139724311_139724542_139724634_139725910_139725973_139726723_139726821_139727165_139727248_139729660_139729774_139730067
tx.17679	chr7	+	563	3	NIC	ENSMUSG00000025461.12	novel	3454	14	NA	NA	3660	3	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	1	2	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCAATTGTCAGTCTGTTA	8501	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139808515	139811052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_139808732_139810212_139810389_139810881
tx.1768	chr10	-	2884	14	FSM	ENSMUSG00000020238.15	ENSMUST00000020463.14	3118	14	24	210	24	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	251	junction_4	53.9264236863306	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGAGCCTCCAGGTGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81332202	81322292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81323440_81323513_81323593_81323680_81323735_81324028_81324193_81324261_81324301_81324382_81324471_81325635_81325955_81326060_81326150_81327003_81327108_81327810_81327892_81328661_81328757_81328896_81329042_81329182_81329374_81331913
tx.17680	chr7	-	1473	13	FSM	ENSMUSG00000025480.6	ENSMUST00000026553.6	1460	13	-13	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_11	16.7779617355625	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCTATATTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140367778	140357141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_140357646_140357829_140357912_140358047_140358159_140358221_140358346_140358422_140358490_140358977_140359042_140359249_140359340_140359506_140359562_140359795_140359844_140360369_140360445_140360787_140360848_140361939_140362003_140367648
tx.17681	chr7	-	1436	13	NNC	ENSMUSG00000025480.6	novel	1460	13	NA	NA	-30	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	11	junction_12	46.3269629913294	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCTATATTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140367795	140357141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_140357646_140357829_140357912_140358047_140358159_140358221_140358346_140358422_140358490_140358977_140359042_140359249_140359340_140359506_140359562_140359795_140359844_140360369_140360445_140360787_140360848_140361939_140362003_140367702
tx.17682	chr7	+	701	4	FSM	ENSMUSG00000025481.13	ENSMUST00000106050.8	719	4	102	-84	102	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	242	junction_1	5.43650214343336	1273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGAACCTATCATTGGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140415032	140417884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140415172_140415524_140415665_140416659_140416796_140417598
tx.17683	chr7	+	565	3	FSM	ENSMUSG00000025481.13	ENSMUST00000026554.11	890	3	330	-5	-15	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	251	junction_1	2	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGAACCTATCATTGGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140415521	140417884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140415665_140416659_140416796_140417598
tx.17684	chr7	+	2365	10	FSM	ENSMUSG00000025485.14	ENSMUST00000026558.7	3406	10	454	587	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_2	23.6648408268052	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGTTTAACATTCATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140437323	140443056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140437468_140437757_140437806_140437894_140438486_140438775_140438868_140439351_140439503_140440789_140440886_140440985_140441131_140441208_140441354_140441752_140441873_140442223
tx.17685	chr7	+	278	3	ISM	ENSMUSG00000025485.14	ENSMUST00000210708.2	2577	11	-32	5414	-3	-267	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	213	junction_2	15	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCGCAGCTGCCTGGACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140437331	140437988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140437468_140437757_140437806_140437894
tx.17686	chr7	-	1413	7	FSM	ENSMUSG00000025486.18	ENSMUST00000106048.10	1416	7	8	-5	8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_6	42.0135560133737	291	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCTGTCTCTTTGGGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140461774	140443577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_140443997_140444887_140445098_140449401_140449564_140456266_140456368_140457562_140457796_140457869_140458059_140461675
tx.17687	chr7	-	1302	6	ISM	ENSMUSG00000025486.18	ENSMUST00000106048.10	1416	7	3736	-5	14	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_4	7.05974503788912	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCTGTCTCTTTGGGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140458046	140443577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_140443997_140444887_140445098_140449401_140449564_140456266_140456368_140457562_140457796_140457869
tx.17688	chr7	+	1557	13	FSM	ENSMUSG00000025487.16	ENSMUST00000026560.14	1989	13	432	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1065	junction_10	109.792987025584	1902	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTTGGTGCTTCTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140462312	140478555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140462480_140463412_140463492_140466300_140466336_140466423_140466480_140466714_140466759_140466931_140467019_140469217_140469390_140470244_140470325_140470407_140470534_140474393_140474457_140477329_140477411_140477520_140477638_140478105
tx.17689	chr7	+	538	2	ISM	ENSMUSG00000025487.16	ENSMUST00000163610.9	1382	12	15173	-30	3122	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1248	junction_1	0	756	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTTGGTGCTTCTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140477549	140478555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140477638_140478105
tx.1769	chr10	-	1384	3	ISM	ENSMUSG00000020238.15	ENSMUST00000151701.8	844	4	395	-641	215	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	446	junction_2	13	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCTCCAGGTGTCCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81323836	81322290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_81323440_81323513_81323593_81323680
tx.17690	chr7	-	326	2	FSM	ENSMUSG00000025488.10	ENSMUST00000026561.10	360	2	37	-3	37	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTCGTGCAGATTCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140480322	140478854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_140479003_140480144
tx.17691	chr7	+	583	2	ISM	ENSMUSG00000062031.14	ENSMUST00000079403.11	2981	14	8	4852	8	-300	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCTCCCAAAATGAGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140521501	140522725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140521557_140522197
tx.17692	chr7	+	2980	14	FSM	ENSMUSG00000062031.14	ENSMUST00000079403.11	2981	14	-3	4	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	11.3032434995212	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGAGTGTGTGATGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140521490	140527573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140521557_140522197_140522479_140522898_140523110_140523189_140523626_140524557_140524678_140524863_140524996_140525150_140525263_140525367_140525441_140525538_140525676_140525792_140525927_140526019_140526116_140526243_140526342_140526414_140526627_140526701
tx.17693	chr7	-	645	2	FSM	ENSMUSG00000060591.10	ENSMUST00000081649.10	655	2	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9574	junction_1	0	25597	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGACTCACTGTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140535890	140534749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_140535087_140535582
tx.17694	chr7	+	654	2	FSM	ENSMUSG00000025491.15	ENSMUST00000026564.9	736	2	80	2	80	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1139	junction_1	0	2647	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGACTAGTCCTGTGTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140548032	140549736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140548352_140549401
tx.17695	chr7	-	646	2	FSM	ENSMUSG00000025492.7	ENSMUST00000026565.7	678	2	29	3	29	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1854	junction_1	0	7588	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTATGACTGCTTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140590654	140589501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_140589803_140590309
tx.17696	chr7	-	614	2	Intergenic	novelGene_1221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGTTTTGCCTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140640775	140638368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_140638918_140640710
tx.17697	chr7	+	1616	7	ISM	ENSMUSG00000055629.6	ENSMUST00000209546.2	3076	16	3849	0	-1932	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	132	junction_1	32.7503180646133	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTTCTGTGAGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140648255	140652313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140648675_140650323_140650608_140650700_140650855_140650954_140651028_140651120_140651275_140651549_140651677_140651908
tx.17698	chr7	+	1283	6	ISM	ENSMUSG00000055629.6	ENSMUST00000209546.2	3076	16	5831	0	50	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	186	junction_1	17.8706463229509	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTTCTGTGAGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140650237	140652313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140650608_140650700_140650855_140650954_140651028_140651120_140651275_140651549_140651677_140651908
tx.17699	chr7	+	933	5	ISM	ENSMUSG00000055629.6	ENSMUST00000209546.2	3076	16	6274	0	166	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_2	15.6584641647896	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTTCTGTGAGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140650680	140652313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140650855_140650954_140651028_140651120_140651275_140651549_140651677_140651908
tx.177	chr1	+	720	4	ISM	ENSMUSG00000003135.16	ENSMUST00000195567.2	635	5	-49	4	-49	-4	intron_retention	FALSE	canonical	3	776	junction_1	19.2930615046504	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTAGATGTTTCCCATGGA	165	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39579065	39584478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_39579157_39581480_39581684_39583972_39584070_39584149
tx.1770	chr10	-	1048	2	FSM	ENSMUSG00000034792.9	ENSMUST00000147908.2	1046	2	-9	7	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_1	0	597	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATCAGGGAACTGAGGAAG	6411	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81344016	81338146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81338940_81343761
tx.17700	chr7	+	523	2	ISM	ENSMUSG00000055629.6	ENSMUST00000209546.2	3076	16	7152	0	1044	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTTCTGTGAGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140651558	140652313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140651677_140651908
tx.17701	chr7	+	1445	7	FSM	ENSMUSG00000054065.13	ENSMUST00000160403.8	1425	7	-17	-3	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_3	7.83156008298049	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCAGCTCCGTGTGTTTC	597	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140668041	140670423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140668315_140668393_140668565_140668651_140668838_140669157_140669312_140669481_140669675_140669768_140669857_140670043
tx.17702	chr7	+	1416	7	NNC	ENSMUSG00000054065.13	novel	2848	13	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.5255862921022	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCAGCTCCGTGTGTTTC	613	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140668057	140670423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_140668302_140668393_140668565_140668651_140668838_140669157_140669312_140669481_140669675_140669768_140669857_140670043
tx.17703	chr7	-	1785	10	NIC	ENSMUSG00000025494.9	novel	1990	10	NA	NA	-115	0	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	3	90	junction_9	19.9616917069288	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGGCTTATTTCTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140676767	140671087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_140671415_140671715_140671906_140672067_140672219_140672293_140672397_140672498_140672643_140672890_140673032_140673112_140673244_140673639_140673839_140674694_140674859_140676532
tx.17704	chr7	-	1974	9	FSM	ENSMUSG00000025494.9	ENSMUST00000210167.2	1897	9	-77	0	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_8	41.6921380478382	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGGCTTATTTCTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140680514	140671087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_140671906_140672067_140672219_140672293_140672397_140672498_140672643_140672890_140673032_140673112_140673244_140673639_140673839_140674694_140674859_140680391
tx.17705	chr7	-	1664	10	FSM	ENSMUSG00000025494.9	ENSMUST00000209294.2	1612	10	-50	-2	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_9	39.3474550920669	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGGCTTATTTCTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140680505	140671087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_140671415_140671715_140671906_140672067_140672219_140672293_140672397_140672498_140672643_140672890_140673032_140673112_140673244_140673639_140673839_140674694_140674859_140680391
tx.1771	chr10	-	678	3	FSM	ENSMUSG00000034781.6	ENSMUST00000146984.2	1547	3	576	293	576	-293	multi-exon	FALSE	canonical	3	379	junction_1	9	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAAAGATACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81367273	81366413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81366820_81366925_81367080_81367155
tx.17710	chr7	+	2141	12	FSM	ENSMUSG00000025495.16	ENSMUST00000026568.10	3624	12	35	1448	20	556	multi-exon	FALSE	canonical	3	293	junction_1	17.146910185967	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTCTGGCTGCCCTTTGCC	6845	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140711233	140736071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140711431_140715221_140715324_140723005_140723089_140726993_140727062_140731562_140731698_140732104_140732156_140732687_140732802_140732887_140733007_140734265_140734381_140734469_140734616_140734723_140734910_140735246
tx.17711	chr7	+	830	5	NIC	ENSMUSG00000038618.13	novel	1525	6	NA	NA	-18	0	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	3	36	junction_2	126.772187407175	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCAGTGTGTCCTGAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140795754	140798571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_140795854_140796633_140796765_140797798_140797931_140798002_140798082_140798182
tx.17712	chr7	+	1520	6	FSM	ENSMUSG00000038618.13	ENSMUST00000046890.12	1525	6	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	288	junction_1	23.1395764870492	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCAGTGTGTCCTGAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140795777	140798571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140795854_140796633_140796765_140796912_140797626_140797798_140797931_140798002_140798082_140798182
tx.17713	chr7	+	1822	3	ISM	ENSMUSG00000038618.13	ENSMUST00000046890.12	1525	6	8	41	-7	-38	intron_retention	FALSE	canonical	3	288	junction_1	28.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCGCCCCGACAACCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140795780	140798530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140795854_140796633_140796765_140796912
tx.17714	chr7	+	1235	4	ISM	ENSMUSG00000038611.18	ENSMUST00000106027.9	5248	18	-15	24252	-10	18	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_2	17.9071680247511	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGTCAAAATAAGAGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140808686	140818287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140808805_140811139_140811256_140812331_140812455_140817409
tx.17715	chr7	-	316	2	ISM	ENSMUSG00000038580.14	ENSMUST00000210928.2	617	3	382	0	382	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTTAGCTCATGGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140858654	140858242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_140858435_140858530
tx.17717	chr7	-	814	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025505.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCTGAGGGCTAAGGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140918790	140916010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_140916535_140918500
tx.17718	chr7	+	1254	8	FSM	ENSMUSG00000025503.6	ENSMUST00000026576.5	1229	8	-25	0	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3267	junction_3	222.11993450864	981	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTTTCATTTCACCGTC	3815	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140972086	140982881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_140972232_140975961_140976086_140978407_140978516_140980200_140980333_140981493_140981670_140981784_140981983_140982096_140982243_140982656
tx.1772	chr10	+	1116	7	FSM	ENSMUSG00000054452.11	ENSMUST00000002518.9	1411	7	97	198	97	107	multi-exon	FALSE	canonical	3	2772	junction_6	274.064925397858	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTGTTTATGATTTCTTT	154	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81395424	81401998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81395503_81397052_81397151_81399928_81399993_81400506_81400552_81400681_81400745_81401125_81401201_81401305
tx.17724	chr7	+	452	5	FSM	ENSMUSG00000025508.14	ENSMUST00000084434.11	964	5	277	235	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11307	junction_1	1806.73116428538	43430	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCCTTTAAACATTTTGT	2394	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141027559	141031263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_141027621_141027820_141027945_141028638_141028688_141030916_141031016_141031144
tx.17725	chr7	+	432	5	NNC	ENSMUSG00000025508.14	novel	964	5	NA	NA	17	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	213	junction_1	6078.86463494623	1637	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCCTTTAAACATTTTGT	2395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141027560	141031263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_141027602_141027820_141027945_141028638_141028688_141030916_141031016_141031144
tx.17726	chr7	+	195	2	FSM	ENSMUSG00000025508.14	ENSMUST00000134636.2	399	2	200	4	200	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	11523	junction_1	0	643	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGAGTGGCCTTTAAACAT	5769	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141030934	141031258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_141031016_141031144
tx.17727	chr7	+	1071	4	ISM	ENSMUSG00000048200.13	ENSMUST00000053670.12	1698	10	3999	0	-1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_3	1.63299316185545	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTTGGCTCTTGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141045005	141046526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_141045270_141045431_141045599_141045678_141045751_141045958
tx.17728	chr7	+	1756	8	FSM	ENSMUSG00000025510.15	ENSMUST00000177840.9	1708	8	-30	-18	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_1	29.0537854500854	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCTTGCTGACAGGACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141047304	141051394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_141047380_141048331_141048460_141049167_141049259_141049378_141049571_141049849_141049925_141050033_141050139_141050222_141050382_141050463
tx.17729	chr7	+	1873	8	FSM	ENSMUSG00000025510.15	ENSMUST00000106000.10	1865	8	0	-8	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_1	68.1968938187848	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGCTTGCTGACAGGACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141047305	141051394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_141047498_141048331_141048460_141049167_141049259_141049378_141049571_141049849_141049925_141050033_141050139_141050222_141050382_141050463
tx.1773	chr10	+	1023	6	FSM	ENSMUSG00000054452.11	ENSMUST00000219870.2	1410	6	191	196	17	108	multi-exon	FALSE	canonical	3	2772	junction_5	277.977984739799	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGTTTATGATTTCTTTC	813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81397068	81401999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81397151_81399928_81399993_81400506_81400552_81400681_81400745_81401125_81401201_81401305
tx.17730	chr7	-	403	2	FSM	ENSMUSG00000038489.9	ENSMUST00000043870.9	1650	2	-7	1254	-7	-1254	multi-exon	FALSE	canonical	3	1072	junction_1	0	3427	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGTGCTCCATGTCCATGT	7993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141055052	141053026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_141053318_141054940
tx.17731	chr7	+	1426	8	FSM	ENSMUSG00000025511.16	ENSMUST00000026585.14	1466	8	40	0	40	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_1	68.6787850082111	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGGAAGTTCTTTCATTT	3531	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141055192	141073340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_141055411_141062399_141062480_141069464_141069657_141070674_141070750_141071484_141071587_141071686_141071819_141071892_141071977_141072797
tx.17732	chr7	+	1287	8	FSM	ENSMUSG00000025511.16	ENSMUST00000117634.2	1281	8	-2	-4	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	83.3289522657899	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTGAGGAAGTTCTTTCAT	4649	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141056310	141073338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_141056392_141062399_141062480_141069464_141069657_141070674_141070750_141071484_141071587_141071686_141071819_141071892_141071977_141072797
tx.17733	chr7	+	1641	7	FSM	ENSMUSG00000025511.16	ENSMUST00000239217.2	1157	7	-10	-474	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_2	25.1241362482817	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGGAAGTTCTTTCATTT	644	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141061966	141073340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_141062480_141069464_141069657_141070674_141070750_141071484_141071587_141071686_141071819_141071892_141071977_141072797
tx.17735	chr7	-	1158	11	ISM	ENSMUSG00000025512.16	ENSMUST00000153191.8	4182	13	9552	2790	2670	122	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	185	junction_5	14.1636859609355	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCCAGGATTTGAATCGGA	7637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141110177	141075838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_141076060_141076283_141076327_141076513_141076595_141093646_141093803_141095314_141095417_141102521_141102615_141106344_141106407_141107511_141107619_141108375_141108421_141109481_141109615_141110062
tx.17736	chr7	-	1604	13	FSM	ENSMUSG00000025512.16	ENSMUST00000153191.8	4182	13	-12	2590	4	322	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_12	22.800310670398	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTAAGCCTGACAGGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141119741	141075638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_141076060_141076283_141076327_141076513_141076595_141093646_141093803_141095314_141095417_141102521_141102615_141106344_141106407_141107511_141107619_141108375_141108421_141109481_141109615_141110062_141110213_141112731_141112887_141119685
tx.17737	chr7	-	1050	3	ISM	ENSMUSG00000025512.16	ENSMUST00000064642.12	1696	17	36276	-850	29809	151	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_2	7.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAACTAGGCTTTTACCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141076571	141075110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_141076060_141076283_141076327_141076513
tx.17739	chr7	+	837	5	ISM	ENSMUSG00000002957.12	ENSMUST00000003038.12	4646	22	67036	1310	66679	-1310	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	701	junction_3	56.4507528736331	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGAATCCAGAAACAGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141209121	141211614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_141209227_141209971_141210089_141210197_141210268_141210349_141210485_141211204
tx.1774	chr10	-	549	4	FSM	ENSMUSG00000034758.13	ENSMUST00000129282.8	469	4	-79	-1	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	8.25967446224258	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATTTGTCCTTTACCCAG	2926	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81428628	81426737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81426974_81427093_81427171_81427719_81427874_81428546
tx.17740	chr7	-	3695	6	FSM	ENSMUSG00000025139.15	ENSMUST00000001950.12	3788	6	76	17	4	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_2	12.1556571192182	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTGAGGAAATGTTTACTA	2773	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141456148	141435336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_141438319_141443243_141443335_141444438_141444592_141445720_141445904_141446476_141446627_141456012
tx.17741	chr7	-	1499	5	FSM	ENSMUSG00000025147.8	ENSMUST00000084418.4	1490	5	6	-15	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_3	10.8857705285386	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGCCATTTCATATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141614796	141562271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_141563316_141563989_141564115_141569815_141569910_141570081_141570243_141614721
tx.17742	chr7	-	1286	3	FSM	ENSMUSG00000045777.15	ENSMUST00000105988.2	824	3	-48	-414	-48	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCAGCCTCTGTCCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141927538	141909244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_141909852_141924594_141925048_141927312
tx.17743	chr7	-	1981	9	FSM	ENSMUSG00000007891.17	ENSMUST00000151120.9	2127	9	141	5	-40	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1941	junction_4	107.727593377927	738	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTATTGGTGTGCTCTGT	8825	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141941634	141929652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_141930476_141930569_141930669_141930762_141930908_141931069_141931193_141934502_141934730_141936328_141936448_141937154_141937279_141939195_141939356_141941473
tx.17744	chr7	+	1432	11	NNC	ENSMUSG00000018819.11	novel	1695	11	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.34813380855664	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCATTTGGATCTCCTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142014582	142048337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_142014704_142038215_142038363_142040083_142040247_142042155_142042253_142042584_142042678_142042865_142042910_142043061_142043144_142043636_142043772_142044081_142044160_142044295_142044403_142047972
tx.17745	chr7	+	568	5	FSM	ENSMUSG00000037772.14	ENSMUST00000038675.7	692	5	124	0	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	973	junction_1	229.96847610053	394	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTGGACACTTTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142086872	142094484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_142086932_142088741_142088865_142089806_142089890_142091003_142091078_142094255
tx.17746	chr7	-	1444	2	ISM	ENSMUSG00000009248.7	ENSMUST00000009392.6	1605	3	436	-4	-111	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCAGTGCCTTGTACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142522565	142520561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_142521077_142521636
tx.17747	chr7	-	1641	3	FSM	ENSMUSG00000009248.7	ENSMUST00000009392.6	1605	3	-33	-3	-33	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	4	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGCAGTGCCTTGTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142523034	142520562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_142521077_142521636_142522437_142522707
tx.17748	chr7	+	1570	9	FSM	ENSMUSG00000000244.18	ENSMUST00000009396.13	1582	9	12	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	3.07205143186113	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGTAGAATCCTTTCTT	3181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142558794	142573223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_142558913_142559640_142559756_142560644_142560743_142564770_142564846_142568695_142568798_142569317_142569405_142570937_142571022_142571315_142571411_142572427
tx.17749	chr7	+	1695	8	FSM	ENSMUSG00000000244.18	ENSMUST00000075172.12	1876	8	23	158	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_6	2.66496544373966	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGTAGAATCCTTTCTT	3784	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142559397	142573223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_142559756_142560644_142560743_142564770_142564846_142568695_142568798_142569317_142569405_142570937_142571022_142571315_142571411_142572427
tx.1775	chr10	-	919	5	ISM	ENSMUSG00000034758.13	ENSMUST00000153379.8	1246	8	1111	-1	940	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_4	8.01171017948103	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATTTGTCCTTTACCCAG	1416	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81430138	81426737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_81426974_81427093_81427171_81427719_81427874_81428546_81428689_81429828
tx.17750	chr7	+	1492	7	NNC	ENSMUSG00000000244.18	novel	478	2	NA	NA	1780	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.42216638714053	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGTAGAATCCTTTCTT	5831	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142561444	142573223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_142561698_142564770_142564846_142568695_142568798_142569317_142569405_142570937_142571022_142571315_142571411_142572427
tx.17751	chr7	-	993	4	NNC	ENSMUSG00000059277.13	novel	2219	4	NA	NA	23	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.74165738677394	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAGAGAATGGCTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142607391	142587007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_142587664_142591017_142591119_142598231_142598394_142607317
tx.17752	chr7	-	1004	4	FSM	ENSMUSG00000059277.13	ENSMUST00000155952.8	2219	4	247	968	-22	-305	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1.69967317119759	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCCTCTATTAGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142607176	142587325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_142587664_142591017_142591119_142598231_142598394_142606773
tx.17753	chr7	+	1482	8	FSM	ENSMUSG00000037706.18	ENSMUST00000037941.10	1533	8	47	4	-8	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	5787	junction_4	310.433666383802	884	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGACTGCCAGACCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142606522	142621667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_142606804_142616229_142616345_142618945_142619044_142619679_142619755_142619984_142620090_142620397_142620500_142620883_142620971_142621048
tx.17754	chr7	+	800	3	FSM	ENSMUSG00000037706.18	ENSMUST00000132303.2	943	3	468	-325	468	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	6204	junction_1	94.5	199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGACTGCCAGACCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142620405	142621667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_142620500_142620883_142620971_142621048
tx.17755	chr7	+	1420	2	ISM	ENSMUSG00000045752.14	ENSMUST00000105920.8	895	4	65	-6	9	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	160	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTGGCTTTTTCCGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142623169	142624830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_142623251_142623491
tx.17756	chr7	+	1324	3	FSM	ENSMUSG00000045752.14	ENSMUST00000177841.8	1364	3	46	-6	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_2	18	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTGGCTTTTTCCGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142623150	142624830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_142623251_142623491_142623558_142623672
tx.17757	chr7	+	1352	3	FSM	ENSMUSG00000045752.14	ENSMUST00000060433.10	1519	3	167	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_2	1	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTGGCTTTTTCCGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142623152	142624830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_142623251_142623491_142623588_142623672
tx.17758	chr7	+	1507	2	FSM	ENSMUSG00000045752.14	ENSMUST00000133410.3	1091	2	127	-543	44	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAATTGTGTGGCTTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142623204	142624826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_142623558_142623672
tx.17759	chr7	+	1506	11	FSM	ENSMUSG00000000154.17	ENSMUST00000052348.12	1525	11	19	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	2.44131112314674	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCTTTGGGCTTTGCCTAG	875	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143027491	143053071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_143027575_143029806_143030043_143033021_143033120_143033456_143033618_143034126_143034260_143044548_143044662_143045482_143045591_143046578_143046680_143050687_143050790_143051046_143051168_143052821
tx.1776	chr10	-	1793	11	NIC	ENSMUSG00000034758.13	novel	1855	11	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	25	junction_10	15.7445228571716	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATTTGTCCTTTACCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81433198	81426737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_81426974_81427093_81427171_81427719_81427874_81428546_81428689_81429828_81430077_81430160_81430420_81431041_81431080_81431156_81431240_81431313_81431390_81431678_81432090_81433129
tx.17760	chr7	-	739	2	FSM	ENSMUSG00000010760.6	ENSMUST00000010904.5	757	2	15	3	15	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_1	0	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGTGTGGTCTGTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143056263	143055284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_143055554_143055793
tx.17761	chr7	-	2289	16	FSM	ENSMUSG00000059119.10	ENSMUST00000072727.7	2285	16	-8	4	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	502	junction_2	192.287354411741	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGATTGGTTTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143102837	143067319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_143068375_143072586_143072623_143074120_143074178_143075137_143075168_143077897_143078018_143078430_143078454_143080902_143081049_143083154_143083295_143086045_143086118_143088022_143088155_143089387_143089475_143089634_143089777_143091953_143092054_143093924_143093984_143095484_143095516_143102778
tx.17762	chr7	-	2253	15	FSM	ENSMUSG00000059119.10	ENSMUST00000208190.2	2259	15	6	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	471	junction_1	167.71624785905	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGATTGGTTTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143102837	143067319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_143068375_143074120_143074178_143075137_143075168_143077897_143078018_143078430_143078454_143080902_143081049_143083154_143083295_143086045_143086118_143088022_143088155_143089387_143089475_143089634_143089777_143091953_143092054_143093924_143093984_143095484_143095516_143102778
tx.17764	chr7	-	2469	22	FSM	ENSMUSG00000010755.18	ENSMUST00000105909.4	2462	22	-5	-2	-5	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	1234	junction_21	93.4109735380392	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTGGTCTGCCCTCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143153798	143111441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_143111744_143112864_143112949_143113385_143113446_143115595_143115664_143116697_143116779_143118720_143118803_143122051_143122121_143122669_143122860_143123136_143123235_143123569_143123674_143123756_143123887_143124278_143124408_143125220_143125334_143128249_143128372_143129654_143129744_143130322_143130464_143138384_143138535_143139435_143139535_143140151_143140249_143140841_143140931_143142228_143142321_143153718
tx.17765	chr7	-	684	7	FSM	ENSMUSG00000010751.16	ENSMUST00000146692.8	2298	7	5	1609	-4	924	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	62.0232931154811	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTAGCTTCCTTTTATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143203393	143192070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_143192174_143192981_143193027_143193638_143193713_143194488_143194601_143197012_143197142_143198517_143198609_143203263
tx.17766	chr7	-	647	6	FSM	ENSMUSG00000010751.16	ENSMUST00000075588.13	4170	6	-3	3526	-3	924	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_4	22.3338308402298	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTAGCTTCCTTTTATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143203401	143192070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_143192174_143193638_143193713_143194488_143194601_143197012_143197142_143198517_143198609_143203263
tx.17767	chr7	-	2635	21	FSM	ENSMUSG00000031090.15	ENSMUST00000033415.15	2641	21	1	5	1	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_5	7.20416546173115	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAATAAGCTTATTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143376577	143349325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_143349794_143351561_143351739_143352191_143352321_143352777_143352848_143353527_143353660_143356932_143357040_143357750_143357887_143359651_143359821_143360616_143360720_143361123_143361173_143361721_143361847_143362528_143362604_143364905_143365038_143366226_143366345_143366499_143366589_143367126_143367179_143369322_143369413_143369910_143369965_143372829_143372947_143374908_143374970_143376395
tx.17768	chr7	+	2367	8	ISM	ENSMUSG00000058454.16	ENSMUST00000124340.8	2556	9	588	0	-20	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	394	junction_5	16.39686381163	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTATGTTGTACTGTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143383950	143402147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_143384003_143390374_143390467_143391498_143391722_143394169_143394261_143394894_143395109_143396850_143397056_143399177_143399310_143400789
tx.17769	chr7	+	2320	7	ISM	ENSMUSG00000058454.16	ENSMUST00000141916.8	2752	9	6556	0	-18	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	394	junction_4	15.8324561160506	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTATGTTGTACTGTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143390369	143402147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_143390467_143391498_143391722_143394169_143394261_143394894_143395109_143396850_143397056_143399177_143399310_143400789
tx.1777	chr10	-	2006	14	FSM	ENSMUSG00000034758.13	ENSMUST00000142948.8	1961	14	-45	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_8	19.8357158000858	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATTTGTCCTTTACCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81436754	81426737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81426974_81427093_81427171_81427719_81427874_81428546_81428689_81429828_81430077_81430160_81430420_81431041_81431080_81431156_81431210_81431313_81431390_81431678_81432090_81434444_81434491_81434910_81434973_81435868_81435950_81436631
tx.17770	chr7	-	2908	17	FSM	ENSMUSG00000031078.16	ENSMUST00000033407.13	2913	17	4	1	4	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	340	junction_7	190.956545694956	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGTGTGATCTTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144024478	143989470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_143990839_143991685_143991758_143992502_143992669_143993745_143993836_143995435_143995585_143999539_143999610_144003296_144003353_144005763_144005875_144006284_144006396_144008412_144008524_144010177_144010233_144011405_144011517_144014915_144015046_144017039_144017114_144017648_144017736_144019690_144019785_144024425
tx.17771	chr7	-	3026	18	FSM	ENSMUSG00000031078.16	ENSMUST00000103079.4	3286	18	261	-1	-3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	258.149054338875	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGTGTGATCTTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144024485	143989470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_143990839_143991685_143991758_143992502_143992669_143993745_143993836_143995435_143995585_143999539_143999610_144003296_144003353_144004714_144004826_144005763_144005875_144006284_144006396_144008412_144008524_144010177_144010233_144011405_144011517_144014915_144015046_144017039_144017114_144017648_144017736_144019690_144019785_144024425
tx.17772	chr7	-	1507	2	FSM	ENSMUSG00000031077.8	ENSMUST00000033394.8	3903	2	22	2374	22	-2374	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTGGCTGGGTGTGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144136178	144133428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_144134598_144135840
tx.17773	chr7	+	1138	3	FSM	ENSMUSG00000031074.15	ENSMUST00000105898.2	2299	3	71	1090	71	627	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_2	3.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTGGGATACAGACTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144392402	144397083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_144392665_144394407_144394512_144396311
tx.17775	chr7	+	1983	5	FSM	ENSMUSG00000031072.15	ENSMUST00000033388.12	2015	5	26	6	-10	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_3	3.69966214673719	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCAGTAGTCTGTCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144468897	144474865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_144469067_144470164_144470271_144471346_144471418_144472960_144473079_144473346
tx.17776	chr7	+	424	4	FSM	ENSMUSG00000031072.15	ENSMUST00000147460.2	807	4	299	84	299	-84	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_2	2.44948974278318	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTGTTCTGTGGGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144470171	144473482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_144470271_144471346_144471418_144472960_144473079_144473346
tx.17777	chr7	+	257	2	ISM	ENSMUSG00000031072.15	ENSMUST00000147460.2	807	4	3085	84	999	-84	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTGTTCTGTGGGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144472957	144473482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_144473079_144473346
tx.17778	chr7	-	1499	5	FSM	ENSMUSG00000070348.6	ENSMUST00000093962.5	3740	5	1	2240	1	1027	multi-exon	FALSE	canonical	3	335	junction_3	35.5316760088797	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAGCAAACCATTGTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144493605	144485907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_144486509_144487752_144487902_144491030_144491191_144491623_144491840_144493232
tx.17779	chr7	-	1995	5	NNC	ENSMUSG00000070348.6	novel	3740	5	NA	NA	5	1461	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	23	junction_1	163.518347594391	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTTGTTTTGTTGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144493601	144485473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_144486575_144487752_144487902_144491030_144491191_144491623_144491840_144493232
tx.1778	chr10	-	1991	14	FSM	ENSMUSG00000034758.13	ENSMUST00000072020.9	2015	14	25	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_10	15.2183321404185	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGATTTGTCCTTTACCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81436709	81426737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81426974_81427093_81427171_81427719_81427874_81428546_81428689_81429828_81430077_81430160_81430420_81431041_81431080_81431156_81431240_81431313_81431390_81431678_81432090_81434444_81434491_81434910_81434973_81435868_81435950_81436631
tx.17780	chr8	+	216	2	ISM	ENSMUSG00000004568.14	ENSMUST00000130587.2	354	3	-67	1804	0	-1804	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	218	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGATCTGGGGTGCGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3443005	3477467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_3443103_3477348
tx.17781	chr8	+	1367	8	ISM	ENSMUSG00000004568.14	ENSMUST00000131773.8	3843	12	29	10746	-3	10255	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	218	junction_1	23.932728849926	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGTTTTCAAGTTTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3443034	3489894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_3443103_3477348_3477491_3479231_3479345_3479498_3479640_3482618_3482870_3484871_3484998_3486981_3487100_3489486
tx.17782	chr8	-	1127	5	FSM	ENSMUSG00000069633.13	ENSMUST00000004686.13	2870	5	32	1711	-3	-1708	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	4.14578098794425	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGTGTGCATGAGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3517648	3508815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_3509435_3510271_3510335_3513921_3514101_3515782_3515972_3517571
tx.17783	chr8	+	919	6	ISM	ENSMUSG00000004567.17	ENSMUST00000004683.13	2065	14	10105	0	-105	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	311	junction_2	19.3742096612997	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGGTGGTCTAATTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3560561	3565232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_3560690_3560813_3560916_3561687_3561811_3562649_3562866_3564782_3564914_3565013
tx.17784	chr8	+	755	5	ISM	ENSMUSG00000065952.14	ENSMUST00000136592.2	1621	6	-25	4251	-17	1928	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_4	8.46684711093805	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGTGCGATATTCTCACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3617972	3630525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_3618097_3623120_3623222_3627840_3628046_3629722_3629922_3630399
tx.17785	chr8	+	836	2	FSM	ENSMUSG00000065952.14	ENSMUST00000138454.2	637	2	-13	-186	-13	186	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCTGCCTCTGCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3617976	3623836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_3618097_3623120
tx.17786	chr8	+	989	5	ISM	ENSMUSG00000044433.17	ENSMUST00000208064.2	3241	10	4546	-19	291	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_1	15.4171171105366	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTAAGCCTGACCAAGTT	821	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3656628	3659062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_3656821_3657790_3657891_3658188_3658302_3658393_3658513_3658597
tx.17787	chr8	-	354	2	ISM	ENSMUSG00000019470.13	ENSMUST00000159909.8	2916	16	10771	-3	10739	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	478	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCGGTCTTGACCTCCTTC	9993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3660531	3660086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_3660220_3660310
tx.17788	chr8	-	782	6	ISM	ENSMUSG00000019470.13	ENSMUST00000159909.8	2916	16	9795	-3	9763	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	392	junction_4	57.7982698702998	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCGGTCTTGACCTCCTTC	9017	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3661507	3660086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_3660220_3660310_3660421_3660544_3660675_3660846_3661019_3661113_3661237_3661393
tx.17789	chr8	-	1818	13	ISM	ENSMUSG00000019470.13	ENSMUST00000019614.13	2677	19	6926	0	6880	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	374	junction_12	51.5236596138124	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCGGTCTTGACCTCCTTC	7937	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3664390	3660086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_3660220_3660310_3660421_3660544_3660675_3660846_3661019_3661113_3661237_3661393_3661585_3661671_3661835_3662962_3663077_3663158_3663291_3663367_3663500_3663589_3663710_3663798_3663951_3664244
tx.1779	chr10	-	1727	7	ISM	ENSMUSG00000034748.17	ENSMUST00000042923.9	1891	8	1018	0	478	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	197	junction_1	19.2353840616713	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTGTTACATTTATGTA	1844	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81462613	81457620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_81458514_81458582_81458707_81459825_81459907_81459980_81460077_81460890_81460951_81461549_81461733_81462323
tx.17790	chr8	-	2663	19	FSM	ENSMUSG00000019470.13	ENSMUST00000019614.13	2677	19	14	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	374	junction_12	44.2084358744927	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCGGTCTTGACCTCCTTC	1025	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3671302	3660086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_3660220_3660310_3660421_3660544_3660675_3660846_3661019_3661113_3661237_3661393_3661585_3661671_3661835_3662962_3663077_3663158_3663291_3663367_3663500_3663589_3663710_3663798_3663951_3664244_3664390_3665993_3666159_3666249_3666385_3668054_3668253_3668542_3668667_3668944_3669094_3671227
tx.17791	chr8	+	329	4	FSM	ENSMUSG00000087687.4	ENSMUST00000156380.4	1193	4	1	863	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	539	junction_1	68.3715340376876	1348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCTAGTGCCAAGTGTT	5588	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3671551	3673372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_3671612_3672341_3672429_3672592_3672626_3673223
tx.17792	chr8	+	308	3	NNC	ENSMUSG00000087687.4	novel	1193	4	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	269.5	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCTAGTGCCAAGTGTT	5588	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3671551	3673372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_3671612_3672341_3672441_3673223
tx.17793	chr8	+	270	3	ISM	ENSMUSG00000087687.4	ENSMUST00000207389.2	363	4	739	0	739	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	673	junction_2	10	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCTAGTGCCAAGTGTT	6377	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3672340	3673372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_3672429_3672592_3672626_3673223
tx.17794	chr8	+	1876	19	FSM	ENSMUSG00000004626.15	ENSMUST00000160708.8	2908	19	183	849	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	307	junction_10	31.5352536413174	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCTCACCTCATTTTC	4570	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3681137	3692795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_3681205_3682219_3682270_3682499_3682582_3683290_3683368_3683847_3683927_3684019_3684124_3684474_3684624_3685445_3685531_3685615_3685747_3685831_3685940_3686180_3686239_3686355_3686422_3686493_3686575_3687115_3687255_3689507_3689618_3691110_3691207_3691734_3691821_3691897_3692056_3692645
tx.17795	chr8	+	1362	13	ISM	ENSMUSG00000004626.15	ENSMUST00000160708.8	2908	19	3575	849	-886	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	307	junction_4	30.7146363951926	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCTCACCTCATTTTC	7962	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3684529	3692795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_3684624_3685445_3685531_3685615_3685747_3685831_3685940_3686180_3686239_3686355_3686422_3686493_3686575_3687115_3687255_3689507_3689618_3691110_3691207_3691734_3691821_3691897_3692056_3692645
tx.17796	chr8	+	773	7	ISM	ENSMUSG00000004626.15	ENSMUST00000160708.8	2908	19	5586	849	-625	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	310	junction_3	34.4500443476573	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCTCACCTCATTTTC	9973	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3686540	3692795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_3686575_3687115_3687255_3689507_3689618_3691110_3691207_3691734_3691821_3691897_3692056_3692645
tx.17798	chr8	-	381	2	FSM	ENSMUSG00000089665.3	ENSMUST00000159364.3	392	2	14	-3	14	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	0	259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGATGTCTTTCTATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3722348	3721184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_3721397_3722179
tx.17799	chr8	+	654	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000109277.2	novel	525	1	NA	NA	-296	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTGAGTCAGTGTCTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3722133	3722954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_+_3722638_3722804
tx.178	chr1	+	630	3	ISM	ENSMUSG00000003135.16	ENSMUST00000195567.2	635	5	2364	5	2364	-5	intron_retention	FALSE	canonical	3	811	junction_2	5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTAGATGTTTCCCATGG	2578	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39581478	39584477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_39581684_39583972_39584070_39584149
tx.1780	chr10	-	1675	8	FSM	ENSMUSG00000034748.17	ENSMUST00000042923.9	1891	8	216	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	197	junction_1	20.6723713873254	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTGTTACATTTATGTA	9874	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81463415	81457620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81458514_81458582_81458707_81459825_81459907_81459980_81460077_81460890_81460951_81461549_81461733_81462323_81462452_81463305
tx.17800	chr8	-	734	2	NNC	ENSMUSG00000108888.2	novel	1064	2	NA	NA	-2675	-2453	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTGATGGCGTCGTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3729629	3726487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_3726610_3729017
tx.17801	chr8	+	709	2	FSM	ENSMUSG00000040236.5	ENSMUST00000044857.4	2546	2	211	1626	0	-1291	multi-exon	FALSE	canonical	3	198	junction_1	0	946	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGTGTTGTGTCTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3726509	3729629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_3726604_3729014
tx.17802	chr8	-	2004	6	NNC	ENSMUSG00000040197.5	novel	1802	6	NA	NA	-8328	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	2.72763633939717	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAGATGGACTGCTTTTG	5580	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3912637	3897962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_3899238_3901179_3901290_3902741_3902894_3903179_3903273_3903559_3903650_3912353
tx.17803	chr8	-	1173	6	FSM	ENSMUSG00000051906.16	ENSMUST00000156276.8	1150	6	-21	-2	-21	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	2.31516738055805	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTCTGATGTGTCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4155563	4152790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_4153250_4153621_4153735_4154101_4154254_4154484_4154572_4154822_4154892_4155270
tx.17804	chr8	+	1550	11	FSM	ENSMUSG00000011832.17	ENSMUST00000239400.2	1542	11	-8	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_10	5.9464274989274	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGTGCTCCGGATGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4216558	4243701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_4216764_4233487_4233671_4235960_4236151_4237240_4237466_4237575_4237651_4238286_4238413_4241236_4241381_4241584_4241675_4243119_4243218_4243305_4243367_4243548
tx.17805	chr8	+	3411	11	FSM	ENSMUSG00000002948.20	ENSMUST00000110998.9	3497	11	78	8	-11	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	271	junction_7	24.9617707705203	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTCCGAGTCTGGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4288817	4297888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_4289034_4293303_4293446_4293552_4293620_4293742_4293857_4293950_4294071_4294228_4294337_4294426_4294607_4294694_4294776_4294860_4295004_4295542_4295589_4295694
tx.17806	chr8	+	1525	5	FSM	ENSMUSG00000011837.5	ENSMUST00000011981.5	1536	5	11	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_3	11.3880419739304	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGATTCCCCCTTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4303090	4306220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_4303305_4304281_4304402_4304550_4304620_4304991_4305374_4305480
tx.17807	chr8	-	1190	2	FSM	ENSMUSG00000048644.9	ENSMUST00000053252.9	1212	2	10	12	10	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGTGAAGCAGATTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4309264	4307671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_4308648_4309050
tx.17808	chr8	-	585	2	FSM	ENSMUSG00000002949.16	ENSMUST00000148672.2	496	2	164	-253	164	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	541	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGAACGGTTTGAAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4310571	4309730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_4310256_4310511
tx.17809	chr8	-	1782	13	FSM	ENSMUSG00000002949.16	ENSMUST00000003029.14	1790	13	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	458	junction_5	35.4920765805553	205	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGAACGGTTTGAAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4325905	4309730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_4310256_4310511_4310623_4311907_4311998_4315225_4315277_4316555_4316681_4316769_4316863_4317254_4317341_4317636_4317777_4317863_4318014_4318299_4318381_4319854_4320026_4324136_4324233_4325842
tx.1781	chr10	-	1342	9	NIC	ENSMUSG00000034748.17	novel	1891	8	NA	NA	-11	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	72.0017360901805	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTGTTACATTTATGTA	9878	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81463411	81457620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_81457913_81458241_81458514_81458582_81458707_81459825_81459907_81459980_81460077_81460890_81460951_81461549_81461733_81462323_81462452_81463305
tx.17810	chr8	-	2365	6	FSM	ENSMUSG00000040028.11	ENSMUST00000098950.6	5743	6	417	2961	90	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1349	junction_5	146.904594890698	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTGTTTTGTTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4374996	4338342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_4339925_4345335_4345562_4351684_4351839_4354926_4355031_4361598_4361787_4374885
tx.17811	chr8	+	493	3	NNC	ENSMUSG00000023235.15	novel	485	3	NA	NA	4	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_2	7	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGGATGTTTGTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4375213	4384812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_4375289_4377756_4377894_4384531
tx.17812	chr8	+	556	4	NNC	ENSMUSG00000023235.15	novel	362	3	NA	NA	6	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_2	4.49691252107735	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGGATGTTTGTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4375215	4384812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_4375289_4377756_4377851_4383122_4383231_4384531
tx.17813	chr8	+	1144	7	NIC	ENSMUSG00000023235.15	novel	867	8	NA	NA	6	9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_2	6.71854812358213	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAATGACTGACAGTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4375215	4410007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_4375289_4377756_4377851_4399771_4399895_4403882_4404001_4404090_4404204_4407592_4407690_4409481
tx.17814	chr8	+	599	4	NNC	ENSMUSG00000023235.15	novel	362	3	NA	NA	6	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_2	5.79271573232759	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGGATGTTTGTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4375215	4384812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_4375289_4377756_4377894_4383122_4383231_4384531
tx.17815	chr8	+	1599	11	FSM	ENSMUSG00000008206.17	ENSMUST00000008350.16	9475	11	253	7623	-1	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_6	6.51459898996093	236	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTGCGCCAGAGCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4543451	4574057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_4543591_4565554_4565729_4566872_4566991_4568239_4568359_4568602_4568661_4569462_4569514_4570215_4570309_4570553_4570683_4571173_4571281_4573353_4573511_4573603
tx.17816	chr8	+	1270	9	ISM	ENSMUSG00000008206.17	ENSMUST00000008350.16	9475	11	23690	7623	23313	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_4	6.53715343249644	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTGCGCCAGAGCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4566888	4574057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_4566991_4568239_4568359_4568602_4568661_4569462_4569514_4570215_4570309_4570553_4570683_4571173_4571281_4573353_4573511_4573603
tx.17817	chr8	+	1689	4	NNC	ENSMUSG00000058748.10	novel	2364	4	NA	NA	-30	169	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	94.1948335455118	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAATGTGGTAAAGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4663136	4679549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_4663256_4675839_4675967_4676163_4676225_4678167
tx.17818	chr8	+	1710	4	FSM	ENSMUSG00000058748.10	ENSMUST00000202692.5	2364	4	-28	682	-28	169	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_1	17.1075032271418	349	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAATGTGGTAAAGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4663138	4679549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_4663279_4675839_4675967_4676163_4676225_4678167
tx.17819	chr8	+	1807	5	NNC	ENSMUSG00000058748.10	novel	2364	4	NA	NA	-7	169	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	48	junction_2	75.6405975650642	100	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCAATGTGGTAAAGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4663159	4679549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_4663279_4674903_4675022_4675839_4675967_4676163_4676225_4678167
tx.1782	chr10	+	592	3	NIC	ENSMUSG00000054708.18	novel	3161	15	NA	NA	0	235	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCTCAAGCTTGATCTT	7966	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81469532	81471967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_81469590_81470903_81470993_81471521
tx.17820	chr8	+	678	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048484.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGAAGTCTCTCTCCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4725601	4728208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_4725739_4727667
tx.17821	chr8	-	663	3	ISM	ENSMUSG00000022322.9	ENSMUST00000022945.9	2156	13	39871	0	6741	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	306	junction_2	6	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGTGTGAAATGTGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4789683	4785975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_4786408_4789124_4789267_4789594
tx.17822	chr8	-	1595	10	ISM	ENSMUSG00000022322.9	ENSMUST00000022945.9	2156	13	14608	0	14530	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	204	junction_9	42.166337284616	254	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGTGTGAAATGTGGATT	3778	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4814946	4785975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_4786408_4789124_4789267_4789594_4789682_4791847_4791967_4794446_4794579_4798704_4798826_4799291_4799461_4799551_4799786_4804219_4804313_4814880
tx.17823	chr8	-	2169	13	FSM	ENSMUSG00000022322.9	ENSMUST00000022945.9	2156	13	-13	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_9	39.0672497112351	340	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGTGTGAAATGTGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4829567	4785975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_4786408_4789124_4789267_4789594_4789682_4791847_4791967_4794446_4794579_4798704_4798826_4799291_4799461_4799551_4799786_4804219_4804313_4814880_4815090_4817906_4818023_4818143_4818312_4829420
tx.17824	chr8	-	981	4	ISM	ENSMUSG00000022322.9	ENSMUST00000208856.2	2365	12	-10	28304	-2	78	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_2	23.7205958328763	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTCTTAATTTGATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4829561	4814533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_4815090_4817906_4818023_4818143_4818312_4829420
tx.17825	chr8	-	1106	3	ISM	ENSMUSG00000040459.12	ENSMUST00000048545.10	3197	4	6593	1501	-1665	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	754	junction_2	100.5	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTTTAAGCAATTTTTAT	NA	False	NA	-49	True	NA	NA	NA	8733928	8716575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_8717417_8731383_8731468_8733747
tx.17826	chr8	-	1271	4	FSM	ENSMUSG00000040459.12	ENSMUST00000048545.10	3197	4	425	1501	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	754	junction_2	83.8424448328861	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTTTAAGCAATTTTTAT	5680	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8740096	8716575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_8717417_8731383_8731468_8733747_8733974_8739976
tx.17827	chr8	-	1351	2	FSM	ENSMUSG00000031504.7	ENSMUST00000033900.7	1392	2	41	0	41	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGTTCTTGGGAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11528669	11503517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_11504527_11528327
tx.17828	chr8	+	1246	10	FSM	ENSMUSG00000031505.12	ENSMUST00000177955.8	1307	10	61	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_1	41.4568048294447	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGAGTTTGTGGTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11547566	11563287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_11547627_11552621_11552773_11554884_11554931_11555430_11555520_11556706_11556816_11559321_11559373_11559452_11559558_11560226_11560348_11561876_11561998_11562894
tx.17829	chr8	+	1330	10	FSM	ENSMUSG00000031505.12	ENSMUST00000033901.11	1359	10	29	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	63.9388210675343	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGAGTTTGTGGTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11547596	11563287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_11547741_11552621_11552773_11554884_11554931_11555430_11555520_11556706_11556816_11559321_11559373_11559452_11559558_11560226_11560348_11561876_11561998_11562894
tx.1783	chr10	+	788	4	ISM	ENSMUSG00000054708.18	ENSMUST00000154707.8	4635	18	10109	-3	9	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	24.7521042876493	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGTCGCAAGAGTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81479645	81483444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81479728_81482138_81482268_81482626_81482693_81482933
tx.17830	chr8	-	371	2	ISM	ENSMUSG00000056228.11	ENSMUST00000211172.2	2212	6	5698	5	1501	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_1	0	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAAGTGGGCCTATGCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11564688	11564016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_11564192_11564492
tx.17831	chr8	+	2019	2	FSM	ENSMUSG00000045969.9	ENSMUST00000054399.6	2814	2	784	11	739	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	454	junction_1	0	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAACACCATCCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11606849	11613240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_11607046_11611417
tx.17832	chr8	+	1947	2	FSM	ENSMUSG00000045969.9	ENSMUST00000209565.2	1971	2	25	-1	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_1	0	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGTTTATTTCCTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11608453	11613251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_11608567_11611417
tx.17833	chr8	-	2365	7	NIC	ENSMUSG00000031508.15	novel	2398	7	NA	NA	-83	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	43	junction_6	194.263280684287	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTCTCTGAAACTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11685119	11661580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_11662948_11665814_11665911_11669061_11669298_11670261_11670374_11678438_11678531_11682865_11683019_11684810
tx.17834	chr8	-	2395	7	FSM	ENSMUSG00000031508.15	ENSMUST00000210530.2	2398	7	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_4	160.305350988529	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTGTCTCTGAAACTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11685751	11661582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_11662948_11665814_11665911_11669061_11669298_11670261_11670374_11678438_11678531_11682865_11683019_11685410
tx.17835	chr8	-	2445	7	FSM	ENSMUSG00000031508.15	ENSMUST00000211174.2	2447	7	3	-1	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_4	195.638626610959	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTGTCTCTGAAACTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11685751	11661582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_11662948_11665814_11665911_11669061_11669298_11673696_11673859_11678438_11678531_11682865_11683019_11685410
tx.17836	chr8	-	2286	6	FSM	ENSMUSG00000031508.15	ENSMUST00000033905.13	2285	6	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_3	111.790876193006	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTGTCTCTGAAACTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11685754	11661582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_11662948_11665814_11665911_11669061_11669298_11678438_11678531_11682865_11683019_11685410
tx.17837	chr8	-	1779	5	FSM	ENSMUSG00000031508.15	ENSMUST00000169782.3	5156	5	6	3371	3	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_2	122.541829593001	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTTGCTCTGTCATAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11685751	11664953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_11665911_11669061_11669298_11678438_11678531_11682865_11683019_11685410
tx.17838	chr8	-	838	5	NNC	ENSMUSG00000031509.11	novel	1263	6	NA	NA	-2794	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.7650547796051	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATCTGATAGGGCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11715398	11705477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_11705682_11706108_11706190_11711671_11711756_11712585_11712692_11715035
tx.17839	chr8	-	779	6	NNC	ENSMUSG00000031509.11	novel	1263	6	NA	NA	-3536	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	19.4278151113294	118	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATCTGATAGGGCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11716140	11705477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_11705682_11706108_11706190_11711671_11711756_11712585_11712692_11715035_11715099_11715899
tx.1784	chr10	+	954	5	FSM	ENSMUSG00000054708.18	ENSMUST00000132458.2	829	5	11	-136	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	34.9070193514141	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGTCGCAAGAGTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81479647	81483444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81479728_81480809_81480978_81482138_81482268_81482626_81482693_81482933
tx.17840	chr8	+	1106	8	NNC	ENSMUSG00000031511.17	novel	4451	20	NA	NA	5	1291	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_7	32.945223555199	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGAGAATCTTCATTGTG	9633	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11808358	11852250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_11808518_11831154_11831240_11832524_11832656_11835712_11835915_11841455_11841545_11850459_11850555_11850772_11850869_11852001
tx.17841	chr8	+	1598	4	ISM	ENSMUSG00000031511.17	ENSMUST00000074856.13	4451	20	-1	48290	-1	714	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_3	10.4986771653491	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGACAAAAAAAAAAAGC	9627	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11808352	11836929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_11808518_11831154_11831240_11832524_11832656_11835712
tx.17843	chr8	+	747	3	NNC	ENSMUSG00000109772.2	novel	429	2	NA	NA	-4181	177	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTGTCTTGATTTCTTT	6848	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11919977	11944290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_11920098_11924137_11924331_11943856
tx.17844	chr8	+	841	3	NNC	ENSMUSG00000109772.2	novel	429	2	NA	NA	-4175	17157	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCAGGTTGGTGGCCATGA	6854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11919983	11961270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_11920098_11924137_11924331_11960736
tx.17845	chr8	+	630	2	Intergenic	novelGene_296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTGCAGCCTTGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12586924	12589204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_12587064_12588713
tx.17846	chr8	-	3658	22	FSM	ENSMUSG00000000759.15	ENSMUST00000000776.15	3797	22	137	2	12	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	142	junction_11	12.9206544206397	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTTTCATGTGGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12722111	12664278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_12665297_12666021_12666139_12671798_12671940_12674817_12674950_12675024_12675114_12682237_12682374_12686945_12687015_12687666_12687803_12689525_12689716_12690700_12690810_12691096_12691208_12698620_12698788_12699689_12699823_12700153_12700223_12703363_12703490_12704233_12704353_12705805_12705979_12707445_12707658_12708299_12708378_12711299_12711368_12713931_12714040_12721954
tx.17847	chr8	-	2234	14	NNC	ENSMUSG00000038542.15	novel	2860	14	NA	NA	-2	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_10	83.9467286702577	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCATTTGTGTTTTGTCCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13154833	13127186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_13128290_13128547_13128672_13129637_13129764_13129894_13129969_13131263_13131365_13135322_13135465_13136250_13136327_13140656_13140761_13144142_13144198_13145830_13145876_13147607_13147669_13148562_13148637_13150324_13150415_13154774
tx.1785	chr10	+	2419	4	FSM	ENSMUSG00000096795.5	ENSMUST00000200889.4	2384	4	-38	3	-38	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	8.5764535535124	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATATTTATACTGCCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81540620	81557807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81540735_81554752_81554880_81555078_81555140_81555690
tx.17850	chr8	+	1226	4	ISM	ENSMUSG00000031447.8	ENSMUST00000033824.8	2229	9	13425	7	-595	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2592	junction_1	216.043719855239	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTCTGGACGTGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13222585	13225331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_13222661_13223626_13223694_13223779_13223951_13224418
tx.17851	chr8	-	1246	8	FSM	ENSMUSG00000038515.11	ENSMUST00000210317.2	3013	8	7	1760	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	341	junction_2	30.9812319750826	256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTCTCCATTTTTTCCTA	3644	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13250613	13226921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_13227143_13229322_13229509_13229582_13229756_13236882_13236980_13239622_13239748_13242049_13242209_13250048_13250201_13250480
tx.17852	chr8	+	679	2	ISM	ENSMUSG00000099338.2	ENSMUST00000187595.2	856	3	-102	5917	-2	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGTGCCTCCATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13250717	13251790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_13251294_13251687
tx.17853	chr8	-	1473	7	FSM	ENSMUSG00000031448.13	ENSMUST00000033825.11	1372	7	-110	9	-110	-9	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	0.942809041582063	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAGAGAATATTTTTCCTC	2388	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13304272	13285663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_13285989_13292251_13292385_13292518_13292647_13295468_13295610_13296041_13296168_13298552_13298718_13303817
tx.17856	chr8	+	741	2	ISM	ENSMUSG00000038497.8	ENSMUST00000210063.2	2723	5	-254	5672	-254	1935	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCATCAGAGCCGTGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13337935	13341945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_13338388_13341656
tx.17857	chr8	+	2418	11	FSM	ENSMUSG00000038482.12	ENSMUST00000209396.2	2421	11	9	-6	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_2	290.39449030586	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTGTTTCTGTAACTC	2129	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13388776	13428448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_13388807_13389664_13389740_13415088_13415196_13419458_13419581_13420480_13420647_13420878_13421023_13421351_13421421_13422465_13422618_13422935_13423103_13423844_13423924_13427141
tx.17858	chr8	+	2501	12	FSM	ENSMUSG00000038482.12	ENSMUST00000209885.2	2511	12	10	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	547	junction_1	150.974903502547	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTGTTTCTGTAACTC	2113	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13388760	13428448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_13388807_13389664_13389740_13407042_13407110_13415088_13415196_13419458_13419581_13420480_13420647_13420878_13421023_13421351_13421421_13422465_13422618_13422935_13423103_13423844_13423924_13427141
tx.17859	chr8	+	1770	5	ISM	ENSMUSG00000038482.12	ENSMUST00000170909.2	1700	11	31682	-746	1891	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	995	junction_3	33.3119723222748	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTGTGTTTCTGTAACTC	7052	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13421355	13428448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_13421421_13422465_13422618_13422935_13423103_13423844_13423924_13427141
tx.1786	chr10	-	2758	4	NNC	ENSMUSG00000096718.3	novel	4067	4	NA	NA	-46	-1280	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	13	junction_1	2.35702260395516	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTATATACTGCCATCCA	4800	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81766360	81739024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_81741500_81742039_81742101_81742300_81742428_81766265
tx.17860	chr8	-	1599	2	ISM	ENSMUSG00000031453.17	ENSMUST00000137822.2	3023	10	13751	267	7756	-267	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGAGTGGTTTGGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13620287	13617216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_13618767_13620238
tx.17861	chr8	+	2281	18	FSM	ENSMUSG00000038416.16	ENSMUST00000043962.9	2301	18	17	3	16	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	559	junction_10	60.600055957127	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTTTCCAAGCTGGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13807692	13831935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_13807855_13808997_13809053_13809139_13809238_13810529_13810569_13810976_13811118_13812850_13813011_13813819_13813912_13814568_13814703_13816417_13816498_13817537_13817588_13818560_13818635_13819376_13819503_13821297_13821451_13823340_13823405_13825707_13825770_13827471_13827608_13829227_13829319_13831371
tx.17862	chr8	+	865	2	FSM	ENSMUSG00000038398.9	ENSMUST00000211643.2	1131	2	-13	279	-3	-279	multi-exon	FALSE	canonical	3	312	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGTATCCTTTGAAAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13835631	13836758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_13835885_13836146
tx.17863	chr8	+	1566	9	FSM	ENSMUSG00000038398.9	ENSMUST00000043767.9	2057	9	21	470	1	-470	multi-exon	FALSE	canonical	3	271	junction_6	38.5873603010105	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGGTTTTTTGTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13835635	13848723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_13835885_13836146_13836254_13837364_13837472_13841881_13841981_13842099_13842211_13845439_13845496_13845583_13845740_13846458_13846593_13848176
tx.17864	chr8	+	811	3	ISM	ENSMUSG00000038398.9	ENSMUST00000043767.9	2057	9	9995	470	9965	-470	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	317	junction_1	43.5	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGGTTTTTTGTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13845609	13848723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_13845740_13846458_13846593_13848176
tx.17865	chr8	+	2398	2	FSM	ENSMUSG00000047710.9	ENSMUST00000051870.8	4013	2	54	1561	-9	-1561	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGTAGCAGCCCACGGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13919694	13930078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_13919812_13927797
tx.17866	chr8	-	804	4	NNC	ENSMUSG00000031458.9	novel	793	4	NA	NA	-6	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	28	junction_2	294.415050943769	2849	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGCTCTGTCTGCGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13940274	13934788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_13935202_13935665_13935878_13937755_13937827_13940166
tx.17867	chr8	+	2046	10	NIC	ENSMUSG00000038365.9	novel	2012	10	NA	NA	-37	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	19	junction_7	29.6514734295483	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAATTTTTCTGCAACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13957765	13990522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_13957864_13964943_13965085_13970947_13971049_13971884_13971935_13973924_13974018_13976947_13977042_13979255_13979441_13981184_13981365_13985145_13985290_13989562
tx.17868	chr8	+	2045	10	FSM	ENSMUSG00000038365.9	ENSMUST00000043520.5	2012	10	-31	-2	-31	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_9	11.3572731903828	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTTTTCTGCAACAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13957771	13990524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_13957864_13964943_13965085_13970947_13971049_13971884_13971935_13973924_13974018_13976947_13977042_13979255_13979441_13981181_13981365_13985145_13985290_13989562
tx.17869	chr8	+	1153	3	ISM	ENSMUSG00000038365.9	ENSMUST00000043520.5	2012	10	23510	3	2019	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_2	7.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATAATTTTTCTGCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13981312	13990519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_13981365_13985145_13985290_13989562
tx.1787	chr10	+	2336	4	Genic_Genomic	ENSMUSG00000112790.2	novel	2758	1	NA	NA	-17472	-2659	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	10.7806410858642	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATATTTATACTGCCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81832834	81850405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_+_81832952_81847436_81847564_81847762_81847824_81848374
tx.17870	chr8	-	2431	3	NNC	ENSMUSG00000050052.13	novel	2463	3	NA	NA	20	-2	intron_retention	TRUE	canonical	3	30	junction_2	133	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCTTTAGTGTGTATATT	4834	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14024723	14002009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_14004136_14005719_14005818_14024516
tx.17871	chr8	-	2411	3	FSM	ENSMUSG00000050052.13	ENSMUST00000062613.12	2463	3	50	2	16	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	271	junction_2	12.5	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCTTTAGTGTGTATATT	4830	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14024727	14002009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_14004136_14005719_14005818_14024540
tx.17872	chr8	-	340	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000110058.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGGGTGGACTTGGTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14064386	14050917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_14051204_14064332
tx.17873	chr8	-	892	3	ISM	ENSMUSG00000051978.10	ENSMUST00000110813.5	1557	6	56861	-2	56839	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	274	junction_2	17	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATTTGTGATAAGATTAT	6882	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14083440	14077558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_14078154_14080592_14080785_14083335
tx.17874	chr8	-	1619	6	NNC	ENSMUSG00000051978.10	novel	1557	6	NA	NA	3	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	96	junction_5	79.7696684210233	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATATTTGTGATAAGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14140298	14077559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_14078154_14080592_14080785_14083335_14083765_14114204_14114340_14128769_14128917_14140176
tx.17875	chr8	-	1582	6	FSM	ENSMUSG00000051978.10	ENSMUST00000110813.5	1557	6	-24	-1	-24	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_5	39.1591624016653	323	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATATTTGTGATAAGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14140325	14077559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_14078154_14080592_14080785_14083335_14083765_14114204_14114340_14128769_14128917_14140240
tx.17876	chr8	+	2461	4	NIC	ENSMUSG00000026317.8	novel	6857	3	NA	NA	-146	2880	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	37	junction_2	81.7897032367495	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGAGGTATGATGCCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14938857	14947939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_14939119_14940491_14940624_14944571_14945231_14946530
tx.17877	chr8	+	2332	3	FSM	ENSMUSG00000026317.8	ENSMUST00000027554.8	6857	3	744	3781	-149	2880	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_1	24.5	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGAGGTATGATGCCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14938854	14947939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_14939119_14944571_14945231_14946530
tx.17878	chr8	+	496	4	Intergenic	novelGene_298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_2	4.96655480858378	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCAACCTACTACTGAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15898960	15915847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_15899117_15913082_15913163_15913239_15913280_15915627
tx.17879	chr8	+	536	3	Intergenic	novelGene_299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	0.5	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAACCTACTACTGAACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15898998	15915848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_15899117_15913082_15913280_15915627
tx.1788	chr10	-	1115	2	Intergenic	novelGene_101	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCATGGTCATGGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81883862	81882445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_81883421_81883722
tx.17880	chr8	-	729	2	Intergenic	novelGene_301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATATTATTTCATGATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18645128	18639121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_18639767_18645044
tx.17881	chr8	+	4252	14	FSM	ENSMUSG00000039842.16	ENSMUST00000039412.15	4662	14	410	0	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_4	12.6528524276628	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAGCAATAATTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18645556	18853205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_18645652_18646938_18647031_18657294_18657414_18672622_18672711_18675575_18675691_18677133_18677257_18679561_18679652_18681531_18682660_18691580_18691682_18718961_18719000_18721107_18721271_18738997_18739076_18838254_18838493_18851421
tx.17882	chr8	+	1249	8	FSM	ENSMUSG00000031467.11	ENSMUST00000149565.8	10779	8	221	9309	219	-1369	multi-exon	FALSE	canonical	3	636	junction_4	34.1778063804509	596	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTTTTTTTGTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18896513	18932068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_18896795_18911492_18911563_18918908_18919025_18920853_18920944_18926055_18926147_18928022_18928185_18929620_18929745_18931753
tx.17883	chr8	-	1254	7	NNC	ENSMUSG00000039814.16	novel	3911	7	NA	NA	-60	29093	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15.5857841210081	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATGGTCCAACAAATTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19001051	18953651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_18953881_18987242_18987355_18989079_18989254_18990628_18990839_18991960_18992146_18998574_18998759_19000891
tx.17884	chr8	-	2838	7	NNC	ENSMUSG00000039814.16	novel	2838	7	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	13.7315532826973	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTAGTGTTAGTATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19000987	18982744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_18984622_18987242_18987355_18989079_18989254_18990628_18990839_18991960_18992146_18998574_18998759_19000891
tx.17885	chr8	-	1265	6	NNC	ENSMUSG00000039814.16	novel	2838	7	NA	NA	7	-3830	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.038616957686	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTGTTTTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19000982	18986933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_18987355_18989079_18989254_18990628_18990839_18991960_18992146_18998574_18998759_19000891
tx.17886	chr8	+	612	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000053695.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATGTGTCATTGGAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19000344	19048665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_19000447_19039290_19039391_19048255
tx.17887	chr8	+	707	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081094.5	novel	591	1	NA	NA	-20	12087	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCAGTTCATCCAGAATT	7097	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19542931	19555629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_+_19543619_19555609
tx.17889	chr8	+	1403	5	Fusion	ENSMUSG00000110669.2_ENSMUSG00000071793.13	novel	948	5	NA	NA	-25	-3596	multi-exon	FALSE	canonical	3	606	junction_2	335.627770007191	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGTCTCAGTGTTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19834736	20042292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr8_+_19834867_20030550_20030924_20035860_20036160_20039783_20039904_20041811
tx.1789	chr10	+	2363	4	FSM	ENSMUSG00000061371.8	ENSMUST00000210325.2	2360	4	-2	-1	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_2	1.24721912892465	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAGTTTTATCTATATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81883954	81897416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81884064_81894203_81894331_81894516_81894578_81895350
tx.17890	chr8	+	695	2	Fusion	ENSMUSG00000110669.2_ENSMUSG00000071793.13	novel	948	5	NA	NA	-25	-14773	multi-exon	FALSE	canonical	3	1220	junction_1	0	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAACAAGAATGATCTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19834736	20031115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr8_+_19834867_20030550
tx.17891	chr8	+	1298	5	Fusion	ENSMUSG00000110669.2_ENSMUSG00000071793.13	novel	948	5	NA	NA	-27	-3536	multi-exon	FALSE	canonical	3	906	junction_2	214.058403245469	286	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAAAACTCCCCCACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19834734	20042352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr8_+_19834867_20030550_20030757_20035860_20036160_20039783_20039904_20041811
tx.17892	chr8	+	1318	5	NNC	ENSMUSG00000071793.13	novel	4009	6	NA	NA	9	-3598	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	882	junction_1	265.429369136123	166	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCTGTCTCAGTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20016474	20042290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_20016689_20030550_20030757_20035860_20036160_20039783_20039904_20041811
tx.17893	chr8	+	794	2	ISM	ENSMUSG00000071793.13	ENSMUST00000140111.8	4009	6	13	24364	13	-14754	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	882	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGTCATTAAAAAGAGAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20016478	20031134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_20016689_20030550
tx.17894	chr8	+	2047	5	ISM	ENSMUSG00000071793.13	ENSMUST00000140111.8	4009	6	9	12646	9	-3036	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	606	junction_2	352.991147197773	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGCAATAATTGTTCAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20016474	20042852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_20016689_20030550_20030924_20035860_20036160_20039783_20039904_20041811
tx.17895	chr8	+	856	2	NNC	ENSMUSG00000110649.2	novel	422	2	NA	NA	-21081	-7168	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATCCAGTCTTCTCCTCCT	5308	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20555618	20577169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_20555835_20576529
tx.17896	chr8	+	1099	4	NNC	ENSMUSG00000110649.2	novel	422	2	NA	NA	-21083	3973	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	25	junction_2	4.49691252107735	77	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGTCTGTTAACAACAGT	5306	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20555616	20588310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_20555835_20576529_20576922_20584150_20584338_20588008
tx.17897	chr8	+	1176	4	Fusion	ENSMUSG00000096401.3_ENSMUSG00000110458.2	novel	930	5	NA	NA	-97	288	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_3	226.010324247957	236	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGGGCATTCAAAGTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20697887	20727554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr8_+_20698090_20711891_20712098_20717197_20717493_20727081
tx.17898	chr8	+	1343	4	Fusion	ENSMUSG00000096401.3_ENSMUSG00000110458.2	novel	930	5	NA	NA	-97	288	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_3	241.687125570781	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTGGGCATTCAAAGTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20697887	20727554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr8_+_20698090_20711891_20712265_20717197_20717493_20727081
tx.17899	chr8	+	2164	5	Fusion	ENSMUSG00000096401.3_ENSMUSG00000110458.2	novel	930	5	NA	NA	-99	-2778	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_3	419.28212458916	54	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATGTGTTTATGAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20697885	20724488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr8_+_20698090_20711891_20712098_20717197_20717493_20721120_20721241_20723149
tx.179	chr1	-	165	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000102471.2	novel	589	1	NA	NA	535	496	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACATGTACATCTTAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39636638	39636088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_39636200_39636584
tx.1790	chr10	+	756	5	NNC	ENSMUSG00000112160.2	novel	2726	4	NA	NA	-38	11708	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	29	junction_4	9.08295106229247	333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCATTGTTTCCTTGCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81919148	81958758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_81919247_81943643_81943771_81943972_81944034_81944572_81944605_81958320
tx.17900	chr8	+	1357	4	NNC	ENSMUSG00000095403.9	novel	955	5	NA	NA	-17384	314	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_3	55.8350745997134	23	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCATTCAAAGTTAGGGC	5828	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21090228	21123101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_21090445_21107448_21107822_21112754_21113050_21122628
tx.17901	chr8	+	1187	4	NNC	ENSMUSG00000095403.9	novel	955	5	NA	NA	-17381	314	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_3	111.931526687822	150	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGCATTCAAAGTTAGGGC	5831	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21090231	21123101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_21090445_21107448_21107655_21112754_21113050_21122628
tx.17902	chr8	+	442	2	FSM	ENSMUSG00000074442.5	ENSMUST00000098896.5	377	2	-65	0	-65	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTTGTGTTCACATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21681564	21682565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_21681802_21682360
tx.17903	chr8	+	391	2	FSM	ENSMUSG00000074446.4	ENSMUST00000098899.4	411	2	19	1	19	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTTTGTGTTCACATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21545081	21546031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_21545269_21545827
tx.17904	chr8	+	1158	3	ISM	ENSMUSG00000063362.14	ENSMUST00000072572.13	4960	4	-12	5763	-12	417	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_2	11	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGAATTACTTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22550724	22555880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_22550787_22551901_22552133_22555015
tx.17905	chr8	+	1634	4	FSM	ENSMUSG00000063362.14	ENSMUST00000072572.13	4960	4	-9	3335	-9	-1587	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_2	9.93310961716756	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTCCTAAATTTATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22550727	22558308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_22550787_22551901_22552133_22555015_22555948_22557896
tx.17906	chr8	-	588	2	ISM	ENSMUSG00000031478.17	ENSMUST00000151371.2	614	4	2878	-403	2878	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTGTGTGCTGGTTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22619440	22618298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_22618807_22619360
tx.17907	chr8	-	891	4	FSM	ENSMUSG00000031478.17	ENSMUST00000151371.2	614	4	126	-403	126	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	5.73488351136175	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTGTGTGCTGGTTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22622192	22618298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_22618807_22619360_22619485_22621221_22621354_22622065
tx.17908	chr8	-	2039	16	FSM	ENSMUSG00000031478.17	ENSMUST00000033865.16	2021	16	-18	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_15	6.34350061086148	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTGTGTGCTGGTTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22656446	22618298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_22618807_22619360_22619485_22621221_22621354_22622065_22622210_22623008_22623112_22632905_22632956_22636946_22637020_22638498_22638700_22639876_22639932_22646991_22647079_22647165_22647234_22648642_22648727_22650207_22650306_22650385_22650474_22652339_22652511_22656393
tx.17909	chr8	-	2297	9	NNC	ENSMUSG00000037725.9	novel	2593	9	NA	NA	304	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	41	junction_8	79.0283770236995	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTCATTGATTGACTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22675531	22658461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_22658991_22659728_22659964_22663277_22663348_22665016_22665188_22665770_22665976_22666789_22667596_22667682_22667756_22669529_22669612_22675405
tx.1791	chr10	-	2136	4	FSM	ENSMUSG00000062931.16	ENSMUST00000156218.2	2124	4	-8	-4	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_1	59.275252471462	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTATTTATGTTGTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82077122	82060683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_82062428_82063278_82063426_82063632_82063760_82077004
tx.17910	chr8	-	2301	9	FSM	ENSMUSG00000037725.9	ENSMUST00000046916.9	2593	9	8	284	8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_6	17.1973835219198	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCATTGATTGACTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22675827	22658459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_22658991_22659728_22659964_22663277_22663348_22665016_22665188_22665770_22665976_22666789_22667596_22667682_22667756_22669529_22669612_22675699
tx.17911	chr8	-	1210	5	ISM	ENSMUSG00000037725.9	ENSMUST00000046916.9	2593	9	9860	286	-93	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	274	junction_1	13.2735639524583	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTCATTGATTGACTTAT	5692	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22665975	22658461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_22658991_22659728_22659964_22663277_22663348_22665016_22665188_22665770
tx.17912	chr8	-	1865	6	ISM	ENSMUSG00000037725.9	ENSMUST00000046916.9	2593	9	8	6441	8	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_3	10.2683981223947	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTTTAGAAAATAGATACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22675827	22664616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_22665188_22665770_22665976_22666789_22667596_22667682_22667756_22669529_22669612_22675699
tx.17913	chr8	+	547	6	ISM	ENSMUSG00000031479.10	ENSMUST00000033866.9	3574	14	20	12923	20	-10712	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	316	junction_5	36.7564960245125	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACCGATAAAAACATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22682844	22697936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_22682983_22688913_22688983_22692289_22692361_22695682_22695798_22696792_22696883_22697872
tx.17914	chr8	+	1328	14	FSM	ENSMUSG00000031479.10	ENSMUST00000033866.9	3574	14	20	2226	20	-15	multi-exon	TRUE	canonical	3	316	junction_5	36.370219952707	835	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTCATCTCTCCCAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22682844	22708633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_22682983_22688913_22688983_22692289_22692361_22695682_22695798_22696792_22696883_22697872_22697960_22700284_22700318_22700404_22700483_22701553_22701689_22703510_22703577_22706527_22706593_22707140_22707226_22708227_22708305_22708414
tx.17915	chr8	-	2286	7	FSM	ENSMUSG00000031482.10	ENSMUST00000033871.8	3430	7	33	1111	-20	35	multi-exon	FALSE	canonical	3	211	junction_4	26.1002341411379	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGACCCCACATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22888580	22866677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_22867998_22869299_22869459_22870853_22871024_22873222_22873361_22879829_22880089_22885728_22885844_22888455
tx.17916	chr8	+	1298	7	FSM	ENSMUSG00000031533.5	ENSMUST00000033934.5	1515	7	32	185	-5	-185	multi-exon	FALSE	canonical	3	683	junction_2	48.7100263463968	1704	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCCTGTGTTGATCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22901408	22919496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_22901601_22904731_22905020_22909742_22909902_22911325_22911467_22914362_22914437_22917763_22917908_22919196
tx.17917	chr8	+	787	5	ISM	ENSMUSG00000031533.5	ENSMUST00000033934.5	1515	7	8397	185	8360	-185	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	696	junction_3	42.7668095606862	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCCTGTGTTGATCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22909773	22919496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_22909902_22911325_22911467_22914362_22914437_22917763_22917908_22919196
tx.17918	chr8	-	1067	3	NIC	ENSMUSG00000031534.16	novel	1402	4	NA	NA	180	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	14	junction_1	106.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCTGCCTTGCATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22966691	22952633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_22953392_22963457_22963597_22966521
tx.17919	chr8	-	1181	4	FSM	ENSMUSG00000031534.16	ENSMUST00000033935.16	1402	4	220	1	193	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_1	20.3960780543711	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTGCCTTGCATCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22966678	22952631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_22953392_22961464_22961590_22963457_22963597_22966521
tx.1792	chr10	-	2058	4	FSM	ENSMUSG00000062931.16	ENSMUST00000041264.15	2035	4	-23	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	52.6898683071254	191	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTATTTATGTTGTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82077130	82060683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_82062428_82063364_82063426_82063632_82063760_82077004
tx.17920	chr8	+	711	2	NIC	ENSMUSG00000037656.10	novel	3566	11	NA	NA	-22	-51885	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAGTTGTTTCTTTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22966781	22973352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_22966942_22972801
tx.17921	chr8	+	1850	4	ISM	ENSMUSG00000037656.10	ENSMUST00000067786.9	3566	11	84478	0	22487	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	566	junction_3	18.9267594221045	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTACTTCTGACGTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23051281	23059628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_23051495_23054044_23054231_23055629_23055715_23058262
tx.17922	chr8	-	1357	9	FSM	ENSMUSG00000008892.13	ENSMUST00000009036.11	1354	9	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2053	junction_8	117.712573669936	4789	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCATCTGACTTCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23083777	23067101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_23067619_23068058_23068117_23069007_23069159_23070355_23070584_23072098_23072152_23073599_23073753_23077568_23077619_23078741_23078811_23083699
tx.17923	chr8	-	604	5	ISM	ENSMUSG00000031536.7	ENSMUST00000033938.7	1201	14	13415	2	13415	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	196	junction_1	10.256095748383	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTCTTAACAAATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23130019	23118143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_23118386_23120358_23120499_23121470_23121536_23127083_23127171_23129949
tx.17924	chr8	-	1152	14	NNC	ENSMUSG00000031536.7	novel	1201	14	NA	NA	-8	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_4	51.8827763829876	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTCTTAACAAATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23143442	23118143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_23118386_23120358_23120499_23121470_23121536_23127083_23127116_23129949_23130021_23130374_23130448_23130528_23130584_23132320_23132373_23135060_23135111_23137428_23137488_23138197_23138273_23140504_23140572_23143075_23143134_23143329
tx.17925	chr8	-	1211	14	FSM	ENSMUSG00000031536.7	ENSMUST00000033938.7	1201	14	-12	2	5	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_8	16.1157058899497	274	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTCTTAACAAATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23143446	23118143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_23118386_23120358_23120499_23121470_23121536_23127083_23127171_23129949_23130021_23130374_23130448_23130528_23130584_23132320_23132373_23135060_23135111_23137428_23137488_23138197_23138273_23140504_23140572_23143075_23143134_23143329
tx.17926	chr8	-	619	3	FSM	ENSMUSG00000031537.16	ENSMUST00000150214.2	601	3	-37	19	1	-19	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	54.5	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTTTTTTAAAGAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23196578	23192486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_23192890_23196097_23196221_23196485
tx.17927	chr8	-	1466	9	FSM	ENSMUSG00000031539.7	ENSMUST00000210656.2	3373	9	0	1907	0	-1907	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	1.96452920568771	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCCGGGCTCCATCTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23295638	23279276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_23279470_23280896_23281042_23281260_23281469_23282733_23282868_23283081_23283168_23287097_23287236_23289656_23289829_23293775_23294119_23295591
tx.17928	chr8	-	1517	2	ISM	ENSMUSG00000031545.7	ENSMUST00000211260.2	2316	7	-111	10363	-110	-9712	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	217	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAATGCACAGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23698472	23680349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_23681709_23698314
tx.17929	chr8	-	1322	8	FSM	ENSMUSG00000031546.7	ENSMUST00000033950.7	1349	8	0	27	0	-27	multi-exon	FALSE	canonical	3	605	junction_1	23.2914103462707	1518	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACCTCAAATACTAAGCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23727675	23716658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_23717192_23717264_23717356_23719431_23719521_23719621_23719720_23722620_23722735_23724769_23724857_23726995_23727116_23727485
tx.1793	chr10	-	407	3	ISM	ENSMUSG00000062931.16	ENSMUST00000156218.2	2124	4	-14	2582	-14	-2582	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_1	4.5	1213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTGTGAGGAGTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82077128	82063269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_82063426_82063632_82063760_82077004
tx.17930	chr8	-	1946	5	FSM	ENSMUSG00000015341.18	ENSMUST00000121783.7	1945	5	6	-7	6	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1223	junction_2	41.2946727799119	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTCTTGTCTTAGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23747031	23731361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_23732648_23734746_23734810_23735878_23735981_23740264_23740418_23746689
tx.17931	chr8	-	1793	6	FSM	ENSMUSG00000015341.18	ENSMUST00000051094.9	1792	6	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	715	junction_5	234.329170185873	385	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTCTTGTCTTAGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23747091	23731361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_23732648_23734746_23734810_23735878_23735981_23740264_23740418_23746689_23746823_23747035
tx.17932	chr8	+	2344	3	FSM	ENSMUSG00000031548.8	ENSMUST00000033952.8	4372	3	367	1661	367	-1661	multi-exon	FALSE	canonical	3	1172	junction_2	95.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGTTAATTTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23901884	23937987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_23902345_23907345_23907424_23936181
tx.17934	chr8	+	1233	4	FSM	ENSMUSG00000031556.7	ENSMUST00000033961.7	1281	4	48	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_1	26.3185612575358	549	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGCTGTGTGAGTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25507274	25513276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_25507609_25508081_25508170_25510454_25510571_25512581
tx.17935	chr8	-	3191	12	FSM	ENSMUSG00000031557.17	ENSMUST00000064883.14	5176	12	296	1689	74	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_11	35.6008635794598	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGTGTGTTTTGGTTTT	9984	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25592096	25530848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_25533055_25533640_25533719_25542375_25542440_25547309_25547381_25547748_25547818_25549149_25549297_25549849_25549991_25552390_25552489_25553953_25554003_25562014_25562072_25578357_25578522_25592049
tx.17936	chr8	-	3239	12	FSM	ENSMUSG00000031557.17	ENSMUST00000128715.8	3463	12	225	-1	11	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	42.7701912106826	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAACTTTTGTGTGTTTT	5836	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25591776	25530854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_25533055_25533640_25533719_25542375_25542440_25547309_25547381_25547748_25547818_25549149_25549297_25549849_25549991_25552390_25552489_25553953_25554003_25562014_25562072_25578357_25578522_25591675
tx.17938	chr8	-	2635	6	ISM	ENSMUSG00000031557.17	ENSMUST00000128715.8	3463	12	42703	-5	32064	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_1	9.98799279134702	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AACTTTTGTGTGTTTTGGTT	6874	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25549298	25530850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_25533055_25533640_25533719_25542375_25542440_25547309_25547381_25547748_25547818_25549149
tx.17939	chr8	-	1469	11	NIC	ENSMUSG00000065954.12	novel	6471	11	NA	NA	16	-1589	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	13	junction_10	20.3492014585339	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATCAGCAGTTTTACTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25730901	25649333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_25649837_25651210_25651332_25654404_25654512_25655476_25655638_25657377_25657422_25657530_25657608_25659212_25659339_25661287_25661341_25665157_25665282_25667949_25668011_25730809
tx.1794	chr10	+	425	4	NIC	ENSMUSG00000073427.5	novel	1531	7	NA	NA	-1	20	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	64.8194072447099	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTACATCTTCTTCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82190091	82236700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_82190216_82204404_82204532_82204731_82204793_82236587
tx.17940	chr8	-	645	3	ISM	ENSMUSG00000065954.12	ENSMUST00000084512.11	6471	11	37039	4767	-1839	-1590	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_1	4.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATCAGCAGTTTTACTGA	7051	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25654426	25649334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_25649837_25651210_25651332_25654404
tx.17943	chr8	+	2078	6	NIC	ENSMUSG00000031570.18	novel	1419	7	NA	NA	8	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	21	junction_2	21.0047613649858	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACTGTGTGTGTGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26210071	26214914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_26210179_26210293_26210363_26210581_26210673_26211200_26211265_26211688_26212628_26214106
tx.17944	chr8	+	539	5	ISM	ENSMUSG00000031570.18	ENSMUST00000133117.8	2099	6	-11	3050	-8	51	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_2	16.7107749670684	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26210079	26211864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_26210179_26210293_26210403_26210581_26210673_26211200_26211265_26211688
tx.17945	chr8	+	1461	7	FSM	ENSMUSG00000031570.18	ENSMUST00000068916.16	1483	7	22	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_2	15.9269164205337	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACTGTGTGTGTGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26210085	26214914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_26210179_26210293_26210403_26210581_26210673_26211200_26211265_26211688_26211814_26212456_26212628_26214106
tx.17946	chr8	+	1415	7	FSM	ENSMUSG00000031570.18	ENSMUST00000124764.8	1419	7	4	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_2	20.3141986469235	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACTGTGTGTGTGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26210091	26214914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_26210179_26210293_26210363_26210581_26210673_26211200_26211265_26211688_26211814_26212456_26212628_26214106
tx.17947	chr8	-	548	4	ISM	ENSMUSG00000061313.11	ENSMUST00000033975.9	4246	18	11	25401	11	1373	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_3	20.2868320729373	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGAATCTCCAAACAGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26244297	26240773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_26240820_26242126_26242318_26242974_26243201_26244212
tx.17948	chr8	-	667	4	ISM	ENSMUSG00000061313.11	ENSMUST00000211009.3	2509	13	21	16397	21	1450	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	18	junction_3	21.2289111041209	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACTAAGGAAACCCAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26244420	26240696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_26240820_26242126_26242318_26242974_26243201_26244293
tx.17949	chr8	-	737	3	ISM	ENSMUSG00000061313.11	ENSMUST00000211009.3	2509	13	-6	17661	-6	186	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	18	junction_2	23	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTCTAGAAATGGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26244447	26241960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_26242318_26242974_26243201_26244293
tx.1795	chr10	+	763	5	FSM	ENSMUSG00000073427.5	ENSMUST00000211099.2	490	5	7	-280	3	280	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	62.9816441512922	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTATGATGCCTGAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82190095	82236960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_82190216_82204404_82204532_82204731_82204793_82219596_82219679_82236587
tx.17950	chr8	-	2191	5	FSM	ENSMUSG00000037316.10	ENSMUST00000038498.10	4876	5	83	2602	-6	2371	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_2	10.356157588604	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCTTTCTTAAGAAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26275232	26257167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_26258438_26259309_26259565_26261106_26261362_26267450_26267556_26274926
tx.17951	chr8	-	941	2	FSM	ENSMUSG00000037316.10	ENSMUST00000209948.2	2506	2	-18	1583	-18	-1583	multi-exon	FALSE	canonical	3	405	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAATAAAAATAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26275244	26266932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_26267556_26274926
tx.17952	chr8	+	1209	4	FSM	ENSMUSG00000037296.8	ENSMUST00000038421.8	2663	4	16	1438	16	413	multi-exon	FALSE	canonical	3	365	junction_2	35.9660333586504	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAGTTTCTGGTGGAGAGT	8456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26275331	26292565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_26275746_26282184_26282254_26283704_26283821_26291955
tx.17953	chr8	-	2326	16	FSM	ENSMUSG00000031575.19	ENSMUST00000110610.8	2337	16	8	3	8	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	3119	junction_12	186.058007680998	3111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGGTACTTGGCTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26337714	26306906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_26307537_26307631_26307692_26308573_26308673_26309653_26309747_26312722_26312917_26313166_26313335_26317201_26317420_26318793_26318888_26321300_26321377_26322667_26322764_26323778_26323875_26324987_26325083_26326027_26326117_26329770_26329917_26330039_26330104_26337606
tx.17954	chr8	-	2113	14	ISM	ENSMUSG00000031575.19	ENSMUST00000166078.9	2234	15	235	9	235	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3119	junction_12	189.074888891855	300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGGTACTTGGCTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26329875	26306906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_26307537_26307631_26307692_26308573_26308673_26309653_26309747_26312722_26312917_26313166_26313335_26317201_26317420_26318793_26318888_26321300_26321377_26322667_26322764_26323778_26323875_26324987_26325083_26326027_26326117_26329770
tx.17955	chr8	+	1593	9	NNC	ENSMUSG00000031576.17	novel	3536	27	NA	NA	-1364	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	2.72717802865893	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAAGTTCATTGCTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26400343	26427962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_26400459_26400877_26400975_26403611_26403837_26408316_26408504_26409611_26409690_26411447_26411588_26422267_26422463_26424432_26424550_26427523
tx.17956	chr8	-	2784	5	FSM	ENSMUSG00000037251.6	ENSMUST00000061850.5	3613	5	8	821	8	-821	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_4	28.3681159050086	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTGTGGTGCTGGCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26484153	26471452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_26473673_26476273_26476561_26477522_26477669_26479677_26479770_26484114
tx.17957	chr8	-	954	4	ISM	ENSMUSG00000015994.11	ENSMUST00000209664.2	966	7	6712	-407	41	154	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1014	junction_2	40.5736641458745	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCATAGTGTTTGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26494563	26488993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_26489593_26489796_26489969_26490997_26491061_26494443
tx.17958	chr8	-	1638	9	FSM	ENSMUSG00000015994.11	ENSMUST00000016138.11	1930	9	48	244	48	154	multi-exon	FALSE	canonical	3	814	junction_5	99.1573875210516	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCATAGTGTTTGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26505630	26488993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_26489593_26489796_26489969_26490997_26491061_26494443_26494593_26497214_26497342_26499692_26499798_26501117_26501233_26503497_26503584_26505408
tx.17959	chr8	+	345	2	Intergenic	novelGene_302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGGGGGGTGTCTTTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26505713	26506167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_26505804_26505912
tx.1796	chr10	+	3398	4	FSM	ENSMUSG00000073427.5	ENSMUST00000210381.2	3330	4	-63	-5	-2	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_3	14.0554457615387	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTTATGTTGTCATCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82190086	82215475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_82190216_82204404_82204532_82204731_82204793_82212394
tx.17960	chr8	-	2947	22	FSM	ENSMUSG00000037234.18	ENSMUST00000037182.14	12836	22	12	9877	12	354	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_6	10.5632744184703	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGTTCTTATATGAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609240	26521325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_26522059_26524958_26525031_26525160_26525266_26528049_26528151_26529696_26529780_26534267_26534303_26538279_26538368_26549267_26549409_26551404_26551475_26557877_26557966_26558586_26558698_26560101_26560304_26561085_26561227_26562284_26562449_26563627_26563712_26564895_26564959_26572541_26572610_26578087_26578221_26583684_26583736_26585785_26585859_26600763_26600850_26608985
tx.17961	chr8	-	373	2	ISM	ENSMUSG00000037234.18	ENSMUST00000037182.14	12836	22	4	89291	4	-23708	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATGGTCTTACGTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609248	26600739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_26600850_26608985
tx.17962	chr8	+	1166	8	FSM	ENSMUSG00000013878.19	ENSMUST00000209707.2	1000	8	11	-177	11	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	23.7469654344916	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATCATTCACCCAAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609426	26631172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_26609629_26610472_26610592_26613874_26614016_26615931_26616008_26619074_26619184_26625656_26625731_26629007_26629119_26630838
tx.17963	chr8	+	1560	8	FSM	ENSMUSG00000013878.19	ENSMUST00000014022.15	3929	8	104	2265	-4	281	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_2	13.0243100800474	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTTGACCTCATTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609499	26631634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_26609629_26610467_26610592_26613874_26614016_26615931_26616008_26619074_26619184_26625656_26625731_26629007_26629119_26630838
tx.17964	chr8	+	974	5	FSM	ENSMUSG00000013878.19	ENSMUST00000110575.8	966	5	10	-18	10	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_2	16.3152535990097	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTAAAATGTATATTCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609513	26619592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_26609629_26610467_26610592_26613874_26614016_26615931_26616008_26619074
tx.17965	chr8	+	703	6	ISM	ENSMUSG00000013878.19	ENSMUST00000014022.15	3929	8	104	8119	-4	-5215	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_2	14.7729482500955	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTAGGGCTTCTTTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609499	26625780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_26609629_26610467_26610592_26613874_26614016_26615931_26616008_26619074_26619184_26625656
tx.17966	chr8	+	1268	8	NIC	ENSMUSG00000013878.19	novel	741	5	NA	NA	0	23	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	4	junction_1	26.1799112890407	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATTCACCCAAATATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609691	26631175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_26609988_26610467_26610592_26613874_26614016_26615931_26616008_26619074_26619184_26625656_26625731_26629007_26629119_26630838
tx.17967	chr8	+	1723	8	NIC	ENSMUSG00000013878.19	novel	741	5	NA	NA	-2	280	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.4226184016042	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATTTGACCTCATTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609689	26631633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_26609988_26610472_26610592_26613874_26614016_26615931_26616008_26619074_26619184_26625656_26625731_26629007_26629119_26630838
tx.17968	chr8	+	1036	3	FSM	ENSMUSG00000037214.13	ENSMUST00000036807.13	2295	3	54	1205	-38	171	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_1	13	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTGTTTGTAATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26648222	26652974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_26648550_26650802_26650999_26652461
tx.17969	chr8	+	3912	12	FSM	ENSMUSG00000031483.9	ENSMUST00000033873.9	4838	12	27	899	19	-899	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_9	30.3309568287708	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGTAAAATTTACCAGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27513853	27529457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_27513935_27515084_27515207_27517196_27517279_27518926_27518974_27519366_27519429_27519571_27519698_27521725_27521800_27521954_27522014_27522261_27522354_27523413_27523504_27526041_27526122_27526460
tx.1797	chr10	+	482	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000063320.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGGGGACGGAAAGGGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82455688	82458660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_82456045_82458534
tx.17970	chr8	+	1407	5	FSM	ENSMUSG00000031485.16	ENSMUST00000209525.2	5767	5	34	4326	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_4	15.0416089564913	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAGAGTGTCTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27532622	27540269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_27532742_27535055_27535164_27535425_27535462_27535951_27536028_27539201
tx.17971	chr8	+	1993	8	FSM	ENSMUSG00000031485.16	ENSMUST00000033875.10	3603	8	46	1564	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_4	11.5881713089561	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGTGTGATGAGTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27532628	27544596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_27532742_27535055_27535164_27535425_27535462_27535951_27536028_27539201_27539337_27541286_27541430_27542263_27542363_27543313
tx.17972	chr8	-	1850	4	FSM	ENSMUSG00000031487.6	ENSMUST00000033877.6	1899	4	38	11	-10	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	8.9938250421547	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTCTATTGTATAAAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27618670	27613402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_27614649_27615847_27616170_27617487_27617548_27618448
tx.17973	chr8	-	834	3	ISM	ENSMUSG00000031487.6	ENSMUST00000033877.6	1899	4	20	2244	-6	19	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_2	1	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCCTGTTAGCCAGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27618688	27615635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_27616170_27617487_27617548_27618448
tx.17974	chr8	-	2146	5	FSM	ENSMUSG00000031488.15	ENSMUST00000033878.14	3217	5	3	1068	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_1	8.6421930087218	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTCCCAGCGTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27664671	27633053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_27633423_27640722_27640832_27644173_27644964_27646254_27646698_27664236
tx.17975	chr8	-	768	5	ISM	ENSMUSG00000039720.8	ENSMUST00000038174.8	1356	9	2954	-1	-876	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_3	17.6139149538085	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTGCTATGTTCTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27689621	27687485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_27687710_27687955_27688099_27688420_27688587_27689294_27689446_27689537
tx.17976	chr8	-	1003	7	ISM	ENSMUSG00000039720.8	ENSMUST00000038174.8	1356	9	2198	0	-1632	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_6	21.4294708805939	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATTGCTATGTTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27690377	27687486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_27687710_27687955_27688099_27688420_27688587_27689294_27689446_27689537_27689631_27689865_27689976_27690260
tx.17977	chr8	-	1602	10	NIC	ENSMUSG00000039720.8	novel	1356	9	NA	NA	0	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	68	junction_6	20.0831604418561	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTGCTATGTTCTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27713856	27687485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_27687710_27687955_27688099_27688420_27688587_27689294_27689446_27689537_27689631_27689865_27689976_27690260_27690373_27690749_27690932_27692399_27692680_27713715
tx.17978	chr8	-	1073	3	NNC	ENSMUSG00000031489.16	novel	2795	4	NA	NA	898	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_1	60.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTCCCCTGCTCGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27717624	27715803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_27716469_27716753_27716822_27717284
tx.17979	chr8	-	1013	3	NNC	ENSMUSG00000031489.16	novel	2795	4	NA	NA	900	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	51	junction_1	38.5	47	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTCCCCTGCTCGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27717622	27715803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_27716411_27716753_27716822_27717284
tx.1798	chr10	-	693	3	FSM	ENSMUSG00000063320.12	ENSMUST00000079648.12	716	3	19	4	13	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	302	junction_2	73.5	3330	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGTCTTACTATACATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82459011	82455688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_82456052_82458541_82458659_82458798
tx.17980	chr8	-	1102	3	FSM	ENSMUSG00000031489.16	ENSMUST00000121838.2	1864	3	987	-225	898	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_1	27.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTCCCCTGCTCGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27717624	27715803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_27716498_27716753_27716822_27717284
tx.17981	chr8	+	815	3	FSM	ENSMUSG00000031490.7	ENSMUST00000033880.7	1997	3	35	1147	35	29	multi-exon	FALSE	canonical	3	14377	junction_1	319.5	27157	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGGCCCTGTCTGAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27750391	27765555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_27750579_27763350_27763531_27765107
tx.17982	chr8	+	1788	6	FSM	ENSMUSG00000039328.12	ENSMUST00000217278.2	1726	6	-28	-34	-18	34	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3.55527776692624	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTTTTGGCTTGTGGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31601829	31619695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_31602201_31608458_31608616_31614879_31614926_31615193_31615236_31618279_31618363_31618606
tx.17983	chr8	+	2163	7	FSM	ENSMUSG00000031577.11	ENSMUST00000209851.2	3133	7	5	965	4	-965	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_5	19.2476549798208	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTATCTCTTCTATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31640347	31650117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_31641528_31643536_31643724_31644241_31644335_31645541_31645730_31645805_31645950_31648620_31648784_31649909
tx.17984	chr8	+	1897	5	ISM	ENSMUSG00000031577.11	ENSMUST00000209851.2	3133	7	5	5028	4	-5028	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_1	15.352117117844	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGTTTCACTCTCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31640347	31646054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_31641528_31643536_31643724_31644241_31644335_31645541_31645730_31645805
tx.17985	chr8	-	1372	4	ISM	ENSMUSG00000031578.6	ENSMUST00000033983.6	1902	10	5657	0	5587	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	742	junction_2	38.7900330841141	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGGTCTTGAGAATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31653135	31649490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_31650606_31650786_31650853_31651749_31651864_31653058
tx.17986	chr8	-	1900	10	FSM	ENSMUSG00000031578.6	ENSMUST00000033983.6	1902	10	2	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	742	junction_2	38.8285245790727	506	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGGTCTTGAGAATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31658790	31649490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_31650606_31650786_31650853_31651749_31651864_31653058_31653134_31654745_31654801_31656089_31656242_31656401_31656467_31656550_31656661_31656737_31656788_31658692
tx.17987	chr8	+	1580	7	FSM	ENSMUSG00000009630.11	ENSMUST00000009774.11	1469	7	249	-360	249	360	multi-exon	FALSE	canonical	3	909	junction_3	33.4398298772919	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTTTAACTGTGATGTA	9114	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34089901	34109829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_34090047_34100682_34100893_34101775_34101950_34105477_34105568_34105693_34105856_34107054_34107174_34109149
tx.17988	chr8	+	918	3	ISM	ENSMUSG00000009630.11	ENSMUST00000009774.11	1469	7	16083	-359	16083	359	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	939	junction_2	14.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTTTTAACTGTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34105735	34109828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_34105856_34107054_34107174_34109149
tx.17989	chr8	-	1647	8	FSM	ENSMUSG00000052906.8	ENSMUST00000095349.6	2808	8	-6	1167	-6	-1167	multi-exon	FALSE	canonical	3	227	junction_7	19.9335631229219	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGTCTTAAGGTATCTTT	4664	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34132001	34110780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_34111729_34113189_34113265_34116351_34116394_34119264_34119403_34123529_34123656_34125316_34125388_34128507_34128631_34131877
tx.1799	chr10	-	594	3	FSM	ENSMUSG00000063320.12	ENSMUST00000183363.2	406	3	-17	-171	-11	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_2	131	2697	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGTCTTACTATACATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82459041	82455688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_82456052_82458541_82458659_82458927
tx.17991	chr8	+	2173	13	FSM	ENSMUSG00000031584.17	ENSMUST00000033992.9	2673	13	499	1	499	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1474	junction_4	147.314360580811	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCTGTCAGTGTATTTT	901	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34143764	34188190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_34143808_34159180_34159208_34159920_34160010_34161550_34161621_34164114_34164263_34170290_34170346_34171492_34171593_34172620_34172708_34175571_34175731_34179368_34179481_34183826_34183959_34185026_34185161_34187173
tx.17992	chr8	+	1739	7	ISM	ENSMUSG00000031584.17	ENSMUST00000033992.9	2673	13	28229	1	12465	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1640	junction_6	140.478250590221	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCTGTCAGTGTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34171494	34188190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_34171593_34172620_34172708_34175571_34175731_34179368_34179481_34183826_34183959_34185026_34185161_34187173
tx.17993	chr8	+	1618	6	ISM	ENSMUSG00000031584.17	ENSMUST00000033992.9	2673	13	29376	3	13612	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1640	junction_5	105.246377609873	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTGCTGTCAGTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34172641	34188188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_34172708_34175571_34175731_34179368_34179481_34183826_34183959_34185026_34185161_34187173
tx.17994	chr8	+	1563	8	FSM	ENSMUSG00000031585.14	ENSMUST00000170705.8	1634	8	76	-5	76	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	438	junction_1	317.681974204855	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAATGCTTTGTTTTAAA	5101	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34221936	34267197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_34222017_34225761_34225935_34242468_34242561_34245879_34245988_34248583_34248767_34252037_34252132_34265971_34266088_34266480
tx.17995	chr8	+	1544	8	FSM	ENSMUSG00000031585.14	ENSMUST00000167264.8	1566	8	27	-5	27	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	804	junction_1	195.585463338633	842	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAATGCTTTGTTTTAAA	5261	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34222096	34267197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_34222158_34225761_34225935_34242468_34242561_34245879_34245988_34248583_34248767_34252037_34252132_34265971_34266088_34266480
tx.17996	chr8	+	1485	7	ISM	ENSMUSG00000031585.14	ENSMUST00000171010.8	1664	8	3393	4	2289	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1161	junction_5	81.0440552347234	341	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAATGCTTTGTTTTAAA	8924	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34225759	34267197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_34225935_34242468_34242561_34245879_34245988_34248583_34248767_34252037_34252132_34265971_34266088_34266480
tx.17997	chr8	-	881	9	NNC	ENSMUSG00000031586.18	novel	2547	9	NA	NA	-46	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_8	592.596603411629	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTTTAAGAAATGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34419466	34274091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_34274215_34279419_34279524_34285109_34285179_34296744_34296879_34324331_34324483_34353013_34353077_34354360_34354400_34356354_34356433_34419346
tx.17998	chr8	-	795	8	FSM	ENSMUSG00000031586.18	ENSMUST00000053251.12	2466	8	250	1421	192	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	696	junction_1	308.820996959833	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTTTAAGAAATGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34419641	34274091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_34274215_34285109_34285179_34296744_34296879_34324331_34324483_34353013_34353077_34354360_34354400_34356354_34356433_34419503
tx.17999	chr8	-	895	9	FSM	ENSMUSG00000031586.18	ENSMUST00000182987.8	1385	9	210	280	199	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	376	junction_1	473.977962963469	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAGAAATGTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34419634	34274088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_34274215_34279419_34279524_34285109_34285179_34296744_34296879_34324331_34324483_34353013_34353077_34354360_34354400_34356354_34356433_34419503
tx.18	chr1	-	380	3	FSM	ENSMUSG00000097797.7	ENSMUST00000193106.6	256	3	-124	0	-50	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	3	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTTTGGGTCATGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7468143	7446109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_7446232_7452250_7452307_7467941
tx.180	chr1	-	436	3	Intergenic	novelGene_20	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTGAGGTGCTGACCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39904413	39900480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_39900721_39902886_39902939_39904269
tx.1800	chr10	-	566	3	FSM	ENSMUSG00000063320.12	ENSMUST00000185168.8	469	3	-10	-87	-10	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_2	174.5	641	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGTCTTACTATACATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82459072	82455688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_82456052_82458541_82458659_82458986
tx.18000	chr8	-	837	7	FSM	ENSMUSG00000031586.18	ENSMUST00000033995.14	1039	7	203	-1	203	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	456	junction_1	404.856524654791	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTACAGCGTTTTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34419630	34293965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_34294211_34296744_34296879_34324331_34324483_34353013_34353077_34354360_34354400_34356354_34356433_34419503
tx.18001	chr8	+	1360	2	Intergenic	novelGene_305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCAGTAGTATCCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34495331	34496820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_34496145_34496273
tx.18002	chr8	-	924	7	FSM	ENSMUSG00000031516.12	ENSMUST00000033913.11	1249	7	328	-3	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	293	junction_6	39.9485780584101	732	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTGCCTCAATTTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34575622	34557573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_34557997_34559664_34559808_34560782_34560831_34562037_34562127_34564342_34564449_34573495_34573561_34575572
tx.18003	chr8	-	678	4	FSM	ENSMUSG00000031513.9	ENSMUST00000033910.9	2879	4	240	1961	240	-1961	multi-exon	FALSE	canonical	3	354	junction_3	12.9614813968157	861	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGGCTGGTTTCCCACTT	9026	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34613947	34604686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_34604993_34606007_34606195_34607914_34607991_34613838
tx.18004	chr8	+	1861	6	FSM	ENSMUSG00000031532.8	ENSMUST00000033933.8	1860	6	17	-18	17	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_1	37.2633868562695	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGAAGCGTGTTTCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34621746	34637993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_34621991_34628348_34628528_34632294_34632695_34634872_34635012_34635610_34635766_34637249
tx.18005	chr8	+	971	3	ISM	ENSMUSG00000031532.8	ENSMUST00000239436.2	1897	6	13228	1	9310	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	223	junction_1	44.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGCGTGTTTCGTGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34634944	34637998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_34635012_34635610_34635766_34637249
tx.18006	chr8	+	907	2	ISM	ENSMUSG00000031532.8	ENSMUST00000211664.2	2351	5	13773	-26	9973	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	312	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGCGTGTTTCGTGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34635607	34637998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_34635766_34637249
tx.18008	chr8	+	485	4	FSM	ENSMUSG00000100605.2	ENSMUST00000188318.2	418	4	-66	-1	-66	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	5.71547606649408	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACTTACTCTTTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34683946	34693300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_34684111_34688020_34688119_34691015_34691123_34693184
tx.18009	chr8	+	417	2	FSM	ENSMUSG00000046794.10	ENSMUST00000070481.8	4221	2	-47	3851	-45	-3841	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTAGACAACATCGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35842847	35851442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_35842960_35851137
tx.1801	chr10	+	2971	10	FSM	ENSMUSG00000034674.19	ENSMUST00000092266.11	2959	10	-10	-2	-10	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	369.308195427446	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTAGTATACAGGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82465651	82486160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_82465774_82474534_82474711_82477149_82477392_82477854_82477925_82480003_82480140_82480284_82480368_82480448_82480544_82483055_82483228_82483786_82483913_82484411
tx.18010	chr8	+	542	2	FSM	ENSMUSG00000046794.10	ENSMUST00000210337.2	4349	2	-34	3841	-34	-3841	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTAGACAACATCGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35842858	35851442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_35843096_35851137
tx.18011	chr8	+	397	2	ISM	ENSMUSG00000046794.10	ENSMUST00000211648.2	4386	3	904	3846	2	-3841	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTAGACAACATCGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35843815	35851442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_35843908_35851137
tx.18012	chr8	-	1843	7	FSM	ENSMUSG00000031527.8	ENSMUST00000033927.8	5079	7	17	3219	17	-3219	multi-exon	FALSE	canonical	3	346	junction_2	28.274939827031	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGCAAGTTGATGTAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35962670	35935625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_35936525_35941550_35941666_35943612_35943723_35945713_35945798_35949669_35949881_35958354_35958534_35962425
tx.18013	chr8	-	1533	6	ISM	ENSMUSG00000031527.8	ENSMUST00000033927.8	5079	7	4182	3256	3701	-3256	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	346	junction_2	30.9425273693019	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCATTTAGGGAATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35958505	35935662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_35936525_35941550_35941666_35943612_35943723_35945713_35945798_35949669_35949881_35958354
tx.18014	chr8	+	1595	4	NIC	ENSMUSG00000109704.2	novel	1488	4	NA	NA	-8	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTGCCTTGGTCATGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36623155	36628741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_36623366_36623480_36623563_36626900_36627001_36627538
tx.18015	chr8	+	477	3	FSM	ENSMUSG00000109704.2	ENSMUST00000211253.2	1405	3	-57	985	-57	-431	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTTCGCCATCTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36626575	36627757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_36626734_36626900_36627001_36627538
tx.18016	chr8	-	1136	2	Intergenic	novelGene_306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37012870	37008642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_37009658_37012749
tx.18018	chr8	-	674	3	FSM	ENSMUSG00000031523.17	ENSMUST00000145245.2	616	3	-43	-15	26	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	11.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTGATAAATTTGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37081071	37060369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_37060613_37066522_37066595_37080712
tx.18019	chr8	+	351	2	Intergenic	novelGene_307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTTGTCTTGGTTCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37937529	37947717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_37937645_37947481
tx.1802	chr10	+	2941	10	FSM	ENSMUSG00000034674.19	ENSMUST00000151390.8	3502	10	46	515	29	-40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	366.010456573289	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCAGTCTGAGCGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82465738	82486118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_82465873_82474534_82474711_82477149_82477392_82477854_82477925_82480003_82480140_82480284_82480368_82480448_82480544_82483055_82483228_82483786_82483913_82484411
tx.18020	chr8	+	1702	10	FSM	ENSMUSG00000118664.1	ENSMUST00000239508.1	2747	10	16	1029	16	183	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_1	15.2153269054433	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTTTGTTATTCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39473014	39618338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_39473355_39513668_39513839_39530344_39530463_39534775_39534917_39538529_39538671_39564078_39564169_39593682_39593747_39597896_39597972_39610300_39610392_39617866
tx.18021	chr8	+	793	5	ISM	ENSMUSG00000118664.1	ENSMUST00000239508.1	2747	10	91079	1029	91014	183	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_1	13.3299474867683	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTTTGTTATTCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39564077	39618338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_39564169_39593682_39593747_39597896_39597972_39610300_39610392_39617866
tx.18022	chr8	+	555	2	ISM	ENSMUSG00000118664.1	ENSMUST00000239510.1	1264	8	137247	-183	137245	183	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	175	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTTTGTTATTCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39610308	39618338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_39610392_39617866
tx.18023	chr8	-	2584	7	FSM	ENSMUSG00000031601.17	ENSMUST00000034012.10	2615	7	30	1	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	422	junction_2	67.4388612003495	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGTTGTGACTGATGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40964765	40945581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_40947157_40948845_40948957_40952335_40952481_40953792_40953955_40960495_40960690_40963055_40963268_40964580
tx.18024	chr8	-	728	3	FSM	ENSMUSG00000031601.17	ENSMUST00000146280.2	726	3	1	-3	1	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	487	junction_2	66.5	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTTAGTTATAGAGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40964762	40960355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_40960690_40963055_40963268_40964580
tx.18025	chr8	+	1791	12	FSM	ENSMUSG00000031600.12	ENSMUST00000098817.4	6002	12	0	4211	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	191	junction_7	12.6869491086687	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTAGCTAATTTTTAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40964823	40999587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_40965275_40979967_40980043_40981358_40981474_40982149_40982251_40989910_40990137_40992350_40992422_40993719_40993848_40993929_40993989_40994065_40994135_40996850_40996995_40997984_40998066_40999316
tx.18027	chr8	+	736	6	ISM	ENSMUSG00000031600.12	ENSMUST00000098817.4	6002	12	28915	4208	-2726	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_1	13.6879509058149	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTAATTTTTAATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40993738	40999590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_40993848_40993929_40993989_40994065_40994135_40996850_40996995_40997984_40998066_40999316
tx.18028	chr8	-	2067	11	ISM	ENSMUSG00000039431.17	ENSMUST00000048898.17	2488	14	37398	-6	-6864	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	264	junction_1	14.7203940164657	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAATCATTTTATTTTTCC	6156	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41050421	41004135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_41004955_41007311_41007439_41008816_41008958_41011196_41011398_41013897_41013948_41015610_41015737_41017000_41017111_41034455_41034589_41040090_41040226_41043452_41043582_41050325
tx.18029	chr8	-	2488	14	FSM	ENSMUSG00000039431.17	ENSMUST00000048898.17	2488	14	6	-6	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	263	junction_13	15.5985130530912	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAATCATTTTATTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41087813	41004135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_41004955_41007311_41007439_41008816_41008958_41011196_41011398_41013897_41013948_41015610_41015737_41017000_41017111_41034455_41034589_41040090_41040226_41043452_41043582_41050325_41050484_41059801_41059965_41061936_41062060_41087740
tx.1803	chr10	+	405	2	FSM	ENSMUSG00000034674.19	ENSMUST00000142658.2	773	2	335	33	335	-33	multi-exon	FALSE	canonical	3	474	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGGCTATTTATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82483073	82484037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_82483228_82483786
tx.18030	chr8	+	1542	6	FSM	ENSMUSG00000031595.10	ENSMUST00000034004.10	1548	6	3	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.632455532033676	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGCTAAGTACTTGTGTC	4412	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41379272	41443819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_41379463_41391126_41391425_41429987_41430140_41438570_41438865_41441841_41441982_41443351
tx.18032	chr8	-	1292	7	NNC	ENSMUSG00000045636.17	novel	3964	10	NA	NA	-2175	-1863	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_5	48.5580980773433	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTTGGCCTGTATTAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41455417	41445951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_41446671_41447584_41447683_41451383_41451501_41452472_41452569_41452679_41452754_41453791_41453904_41455341
tx.18035	chr8	-	993	6	NNC	ENSMUSG00000031594.10	novel	1120	8	NA	NA	5755	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_3	3.55527776692624	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCATGGCCATGGTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41662435	41644472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_41644718_41649994_41650183_41650350_41650440_41652688_41652787_41653481_41653642_41662222
tx.18036	chr8	+	411	3	ISM	ENSMUSG00000031592.11	ENSMUST00000210862.2	691	4	-41	1420	-28	-1420	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_1	7.5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGGTGTAGCAAGTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41692760	41710883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_41693001_41709032_41709148_41710827
tx.18037	chr8	+	456	2	ISM	ENSMUSG00000031592.11	ENSMUST00000210862.2	691	4	-141	3155	-128	-3155	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGATGTTTTACTCTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41692660	41709148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_41693001_41709032
tx.18038	chr8	-	2192	14	FSM	ENSMUSG00000031591.15	ENSMUST00000034000.15	2773	14	116	465	-22	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	999	junction_6	169.669117600863	907	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAGCAGTCATGCATGCT	7617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41827694	41793698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_41794723_41795921_41795979_41796555_41796680_41796766_41796899_41799143_41799226_41799332_41799388_41799967_41800113_41801124_41801171_41802586_41802662_41804930_41805010_41807050_41807138_41807863_41807955_41813289_41813337_41827546
tx.18039	chr8	-	1068	9	FSM	ENSMUSG00000031590.9	ENSMUST00000033999.8	1039	9	-32	3	-32	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	814	junction_1	88.4737778949221	2118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACAGAGTTCTCGAGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41870143	41850498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_41850682_41851992_41852104_41852601_41852694_41853798_41853904_41860681_41860797_41863300_41863359_41864259_41864386_41867839_41867911_41869936
tx.1804	chr10	+	2027	3	ISM	ENSMUSG00000034674.19	ENSMUST00000092266.11	2959	10	17412	0	335	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	237	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGCTTAGTATACAGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82483073	82486158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_82483228_82483786_82483913_82484411
tx.18040	chr8	-	1471	7	NNC	ENSMUSG00000031651.6	novel	1850	6	NA	NA	-38816	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	83	junction_4	56.917093702644	27	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCTGTTTATTGCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43633339	43582844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_43583726_43589312_43589411_43589573_43589597_43591603_43591838_43593679_43593776_43595725_43595759_43633233
tx.18041	chr8	+	1549	8	FSM	ENSMUSG00000091490.4	ENSMUST00000209200.2	1519	8	-10	-20	-10	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	424	junction_1	49.9477277781891	543	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGCTCTCTGCATGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43633567	43646921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_43633650_43636158_43636403_43636739_43636836_43638315_43638496_43640607_43640749_43643105_43643129_43643305_43643407_43646239
tx.18042	chr8	+	1234	3	ISM	ENSMUSG00000091490.4	ENSMUST00000209200.2	1519	8	-7	9251	-7	-2750	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	424	junction_1	9	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACACAAACACAAACACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43633570	43637650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_43633650_43636158_43636403_43636739
tx.18043	chr8	-	1820	4	FSM	ENSMUSG00000051176.7	ENSMUST00000082120.5	1772	4	-44	-4	-44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2952	junction_3	637.888356654639	4003	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTTCAATTTCTGGGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43760061	43748099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_43749574_43753664_43753743_43757512_43757597_43759877
tx.18044	chr8	+	999	4	Intergenic	novelGene_310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	38.1313519298752	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTCTATGGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43806966	43824716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_43807132_43809132_43809201_43811094_43811168_43824023
tx.18045	chr8	+	309	3	Intergenic	novelGene_308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	27	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGCATCACCTTGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43806963	43811167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_43807132_43809132_43809201_43811094
tx.18046	chr8	+	1175	5	Intergenic	novelGene_309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	30.1775993080961	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTCTATGGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43806964	43824716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_43807132_43809132_43809201_43811094_43811168_43818030_43818205_43824023
tx.18047	chr8	+	1132	5	Intergenic	novelGene_311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	30.2572305408145	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTCTATGGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43806966	43824716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_43807091_43809132_43809201_43811094_43811168_43818030_43818205_43824023
tx.18048	chr8	-	968	3	FSM	ENSMUSG00000110231.2	ENSMUST00000209210.2	936	3	-26	-6	-26	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	4	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAACTGACTCTTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45618282	45613524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_45614092_45614492_45614559_45617947
tx.18049	chr8	+	925	2	NIC	ENSMUSG00000110260.2	novel	1048	3	NA	NA	24	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAATGTTGCAGTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45639801	45649580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_45640060_45648913
tx.1805	chr10	+	2374	14	ISM	ENSMUSG00000020246.14	ENSMUST00000020478.14	3422	15	113	2950	-91	-1917	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_7	9.81666256450355	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTATATGGATTCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82534953	82575312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_82535141_82536752_82536902_82538276_82538438_82544842_82545052_82545797_82545883_82547668_82547776_82547883_82548073_82559452_82559621_82560177_82560231_82564086_82564262_82568436_82568511_82570183_82570316_82574112_82574299_82574813
tx.18051	chr8	+	1589	12	FSM	ENSMUSG00000031634.14	ENSMUST00000034051.7	1640	12	0	51	0	47	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_6	20.6765727613893	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTGAATATTCTTTTAA	8860	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46428564	46449944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_46428626_46432245_46432333_46433351_46433530_46433609_46433677_46436559_46436718_46437077_46437271_46438358_46438506_46444784_46444950_46445144_46445270_46447051_46447129_46448574_46448700_46449738
tx.18052	chr8	+	1529	11	ISM	ENSMUSG00000031634.14	ENSMUST00000034051.7	1640	12	3680	51	3630	47	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	163	junction_5	21.503720608304	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTGAATATTCTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46432244	46449944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_46432333_46433351_46433530_46433609_46433677_46436559_46436718_46437077_46437271_46438358_46438506_46444784_46444950_46445144_46445270_46447051_46447129_46448574_46448700_46449738
tx.18053	chr8	+	332	2	FSM	ENSMUSG00000031634.14	ENSMUST00000151983.2	694	2	409	-47	409	47	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTGAATATTCTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46448573	46449944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_46448700_46449738
tx.18054	chr8	-	927	5	FSM	ENSMUSG00000050914.17	ENSMUST00000053558.10	927	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_4	16.393596310755	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGTGCATTCTTTACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46452904	46449938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_46450163_46450650_46450858_46451433_46451526_46452287_46452441_46452653
tx.18055	chr8	-	718	5	NNC	ENSMUSG00000050914.17	novel	927	5	NA	NA	-33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	34	junction_4	13.6083614002568	155	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGTGCATTCTTTACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46452937	46449938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_46450163_46450650_46450858_46451433_46451526_46452287_46452441_46452895
tx.18057	chr8	-	1725	10	ISM	ENSMUSG00000038291.17	ENSMUST00000176410.8	3275	17	62236	-6	1986	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	50	junction_2	6.34404552160898	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGTGCTCAAAGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46507503	46486302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_46486860_46487438_46487540_46488574_46488757_46491491_46491559_46494353_46494472_46497004_46497170_46498222_46498337_46500327_46500469_46502402_46502535_46507355
tx.18058	chr8	+	1204	2	ISM	ENSMUSG00000031631.16	ENSMUST00000034048.13	4619	5	33	24894	-8	-99	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAAATATTAAGTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46616720	46623733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_46616787_46622595
tx.18059	chr8	+	1432	3	FSM	ENSMUSG00000031631.16	ENSMUST00000145080.8	1430	3	4	-6	4	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTGGAGTATCATTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46616732	46623838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_46616787_46617798_46617934_46622595
tx.1806	chr10	-	1249	8	FSM	ENSMUSG00000020248.19	ENSMUST00000130911.8	2554	8	2	1303	2	470	multi-exon	FALSE	canonical	3	756	junction_4	63.4932103071032	1873	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGAATGAAAGTTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82599976	82585837	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_82586282_82586571_82586652_82587217_82587300_82588240_82588439_82590798_82590930_82592535_82592630_82597666_82597748_82599837
tx.18060	chr8	+	1167	2	ISM	ENSMUSG00000031631.16	ENSMUST00000110376.8	2043	6	-50	25040	-7	106	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACAGAGTTTTGCTCCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46616721	46623583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_46616901_46622595
tx.18061	chr8	-	528	2	ISM	ENSMUSG00000031633.5	ENSMUST00000034049.5	1925	4	2807	376	2553	-376	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7531	junction_1	0	603	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTATCTCCCTGCCCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46661514	46660209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_46660658_46661434
tx.18062	chr8	-	1295	4	FSM	ENSMUSG00000031633.5	ENSMUST00000034049.5	1925	4	254	376	0	-376	multi-exon	FALSE	canonical	3	7531	junction_1	145.363911156334	962	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTATCTCCCTGCCCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46664067	46660209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_46660658_46661434_46661576_46662058_46662546_46663848
tx.18063	chr8	-	907	4	FSM	ENSMUSG00000047171.9	ENSMUST00000058636.9	1541	4	602	32	-80	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCAATAAATATTTTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46747106	46745107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_46745767_46746204_46746302_46746521_46746627_46747060
tx.18064	chr8	+	3884	21	FSM	ENSMUSG00000018796.14	ENSMUST00000034046.13	3897	21	4	9	4	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	339	junction_9	34.1571368823559	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTGGAGAATGTCTTTC	2210	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46924077	46989079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_46924268_46945836_46946064_46958685_46958804_46961369_46961435_46964396_46964499_46966327_46966428_46966609_46966789_46971304_46971338_46971485_46971538_46971997_46972072_46974304_46974383_46977979_46978115_46979280_46979416_46980226_46980323_46981616_46981690_46983423_46983513_46984006_46984124_46984824_46984969_46986402_46986505_46986601_46986674_46987376
tx.18068	chr8	+	1552	13	FSM	ENSMUSG00000031629.15	ENSMUST00000034045.15	2931	13	11	1368	1	261	multi-exon	FALSE	canonical	3	263	junction_11	27.7942589995368	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATAGAATGATCCTGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47005073	47031674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_47005163_47007049_47007099_47009116_47009229_47012903_47013007_47014812_47014874_47015452_47015681_47021644_47021715_47023005_47023115_47025786_47025866_47026467_47026516_47026883_47026946_47029260_47029418_47031289
tx.18069	chr8	+	981	6	FSM	ENSMUSG00000031629.15	ENSMUST00000211217.2	997	6	10	6	-7	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	283	junction_2	30.0865418418269	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGAATGACTCCTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47005082	47016028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_47005163_47007049_47007099_47009116_47009229_47012903_47013007_47014812_47014874_47015452
tx.1807	chr10	-	636	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000112286.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	9341	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82613883	82606949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_82607412_82607620_82607688_82612535_82612592_82613832
tx.18070	chr8	+	1081	8	ISM	ENSMUSG00000031629.15	ENSMUST00000135432.8	3010	14	10420	1368	747	261	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	263	junction_6	12.2690917449051	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATAGAATGATCCTGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47015509	47031674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_47015681_47021644_47021715_47023005_47023115_47025786_47025866_47026467_47026516_47026883_47026946_47029260_47029418_47031289
tx.18075	chr8	+	2488	7	FSM	ENSMUSG00000031628.10	ENSMUST00000211115.2	2601	7	113	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	221	junction_1	22.2816566310098	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTGTATTTGAGGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47070438	47092724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_47070537_47082768_47082837_47085351_47085477_47087232_47087362_47088411_47088588_47089236_47089358_47090953
tx.18076	chr8	-	478	2	Intergenic	novelGene_312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATTATGGCATTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47789594	47788337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_47788598_47789376
tx.18077	chr8	-	479	3	Intergenic	novelGene_313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATTATGGCATTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47790144	47788337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_47788598_47789376_47789456_47790004
tx.18078	chr8	-	2069	11	ISM	ENSMUSG00000038102.16	ENSMUST00000123958.8	3932	23	19274	0	5605	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	114	junction_2	18.0930926046378	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTGTCGTAAATACCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47958778	47943162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_47943954_47946273_47946442_47948037_47948172_47949953_47950046_47951688_47951801_47954587_47954745_47954842_47954909_47956346_47956467_47956916_47957039_47958368_47958518_47958620
tx.18079	chr8	-	1328	6	NIC	ENSMUSG00000038102.16	novel	4332	30	NA	NA	0	183	intron_retention	FALSE	canonical	3	108	junction_5	19.61224107541	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTACAGACAGCCGCCT	4054	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47986502	47977508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_47978106_47979974_47980090_47980994_47981066_47982363_47982534_47983686_47983913_47986353
tx.1808	chr10	+	924	3	NNC	ENSMUSG00000056821.14	novel	1056	3	NA	NA	-83	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_2	23	38	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTTTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82647873	82660085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_82647970_82654864_82654958_82659350
tx.18080	chr8	+	1041	7	NIC	ENSMUSG00000031568.17	novel	2921	8	NA	NA	-11	-342	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_6	72.1795600491503	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTCAGAGTACTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47986687	48003972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_47986979_47990313_47990395_47995726_47995837_47995916_47996065_47997145_47997264_48000823_48000874_48003729
tx.18081	chr8	-	914	2	FSM	ENSMUSG00000063049.5	ENSMUST00000125536.2	628	2	-51	-235	-51	235	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTTAATTTTCTGCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48128642	48121554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_48122372_48128545
tx.18082	chr8	-	1018	2	FSM	ENSMUSG00000063049.5	ENSMUST00000080353.3	2812	2	449	1345	449	232	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_1	0	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGACCTTAATTTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48127744	48121557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_48122372_48127540
tx.18083	chr8	-	2579	3	FSM	ENSMUSG00000038069.7	ENSMUST00000038738.7	3464	3	3	882	2	-781	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	33.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTTGTGTTTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48166964	48163260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_48165330_48165953_48166054_48166554
tx.18084	chr8	-	2613	3	FSM	ENSMUSG00000038069.7	ENSMUST00000212175.2	3393	3	-1	781	0	-781	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	31	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTTGTGTTTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48166967	48163260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_48165330_48165922_48166054_48166554
tx.18085	chr8	-	1312	8	NNC	ENSMUSG00000031563.9	novel	8678	23	NA	NA	135942	-4511	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3	junction_7	86.9447396632024	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGGTAATCTGGTCCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48307644	48281504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_48281820_48284646_48284775_48295899_48296143_48299181_48299275_48300428_48300594_48302340_48302525_48304939_48305062_48307582
tx.18086	chr8	-	3139	7	ISM	ENSMUSG00000031563.9	ENSMUST00000057561.9	8678	23	138613	2534	138613	-2534	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	221	junction_4	19.2909017126958	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAAACTTAGAATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48304973	48279527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_48281820_48284646_48284775_48295899_48296143_48299181_48299275_48300428_48300594_48302340_48302525_48304939
tx.18087	chr8	+	1681	4	FSM	ENSMUSG00000031562.17	ENSMUST00000173991.8	786	4	1	-896	1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	319	junction_1	45.0209827623619	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCCATAAAGACTGGAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48563200	48591622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_48563284_48564693_48564826_48565002_48565139_48590292
tx.18088	chr8	+	1891	6	FSM	ENSMUSG00000031562.17	ENSMUST00000170263.10	2096	6	205	0	1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	319	junction_1	42.4480859403578	435	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGTTTGCTTTTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48563197	48594700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_48563284_48564693_48564826_48565002_48565139_48590292_48590410_48591816_48591914_48593377
tx.18089	chr8	+	874	5	ISM	ENSMUSG00000031562.17	ENSMUST00000174818.9	2493	6	8	3075	5	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_4	162.647625251646	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCATAAAGACTGGAAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48563204	48591623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_48563284_48564693_48564826_48565002_48565139_48590292_48590410_48591213
tx.1809	chr10	-	1374	3	NNC	ENSMUSG00000112375.2	novel	646	4	NA	NA	-97	514	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACTGGAGGTCCCAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82694939	82681052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_82681831_82692875_82693092_82694559
tx.18090	chr8	+	1997	6	NIC	ENSMUSG00000031562.17	novel	1126	5	NA	NA	114	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	56	junction_1	132.43775896624	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTGTTTGCTTTTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48563359	48594700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_48563552_48564693_48564826_48565002_48565139_48590292_48590410_48591816_48591914_48593377
tx.18092	chr8	-	1158	2	ISM	ENSMUSG00000031561.17	ENSMUST00000110346.9	2267	10	214231	-447	-40983	447	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAAAAAAAACTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48794117	48787780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_48788810_48793988
tx.18093	chr8	-	323	2	NNC	ENSMUSG00000031561.17	novel	2267	10	NA	NA	81	108858	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACCGTTGGCTTTTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49008267	48990437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_48990681_49008187
tx.18094	chr8	+	399	2	Intergenic	novelGene_314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTTGCATATATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50036762	50040357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_50036947_50040142
tx.18095	chr8	+	1943	2	NNC	ENSMUSG00000110013.2	novel	763	4	NA	NA	0	-42825	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTGTTGCATCTTTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52809645	52813549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_52809842_52811802
tx.18096	chr8	+	2253	2	ISM	ENSMUSG00000110013.2	ENSMUST00000210977.2	763	4	0	42643	0	-42643	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGACCGTTTCTCGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52809645	52813731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_52809842_52811674
tx.18097	chr8	-	463	2	Intergenic	novelGene_315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCTTGTCTTGGCTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52909486	52908662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_52908953_52909313
tx.18098	chr8	+	1266	9	FSM	ENSMUSG00000031521.6	ENSMUST00000033920.6	1181	9	-1	-84	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_3	34.8440723079264	819	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTTGTCTACTTCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53964760	53976457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_53964967_53966576_53966731_53967271_53967385_53968978_53969092_53970788_53970904_53971950_53972027_53973271_53973380_53974084_53974219_53976210
tx.18099	chr8	-	1822	5	ISM	ENSMUSG00000039396.12	ENSMUST00000047768.11	2253	10	68	19430	-31	18	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_3	2.95803989154981	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGGCCCTTTATCAGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54092032	54059331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_54060438_54061749_54061964_54062438_54062574_54076652_54076778_54091790
tx.181	chr1	+	1581	10	ISM	ENSMUSG00000026074.16	ENSMUST00000192509.6	3918	31	109327	-44	3164	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_1	23.079572497485	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCGGTGCTAGGAGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40049716	40064129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_40049838_40053265_40053384_40053686_40053858_40056269_40056414_40058703_40058839_40060243_40060345_40061864_40062015_40062519_40062680_40063469_40063610_40063788
tx.1810	chr10	-	834	3	NIC	ENSMUSG00000112375.2	novel	646	4	NA	NA	-77	305	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGAGTATTATGTAATCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82694919	82681261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_82681831_82692955_82693092_82694790
tx.18100	chr8	+	2031	7	FSM	ENSMUSG00000031520.7	ENSMUST00000033919.6	2449	7	-227	645	-227	-645	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_4	8.69386757049665	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATGAAGTTCAGTCTTTT	794	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54530413	54639486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_54530961_54609992_54610195_54612327_54612519_54622059_54622212_54633736_54633844_54634121_54634456_54638988
tx.18101	chr8	+	1823	8	NNC	ENSMUSG00000031520.7	novel	2449	7	NA	NA	-238	-787	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_3	18.4678429842198	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGACTATATAATTTATTT	783	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54530402	54639344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_54530961_54609992_54610195_54612327_54612372_54612448_54612519_54622059_54622212_54633736_54633844_54634121_54634456_54638988
tx.18102	chr8	+	1781	7	NIC	ENSMUSG00000031520.7	novel	2449	7	NA	NA	-98	-645	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_2	19.6044212700435	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATGAAGTTCAGTCTTTT	923	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54530542	54639486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_54530961_54609992_54610195_54612448_54612519_54622059_54622212_54633736_54633844_54634121_54634456_54638988
tx.18103	chr8	+	1165	5	ISM	ENSMUSG00000031520.7	ENSMUST00000033919.6	2449	7	81804	645	81631	-645	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_2	9.75961064797157	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATGAAGTTCAGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54612444	54639486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_54612519_54622059_54622212_54633736_54633844_54634121_54634456_54638988
tx.18104	chr8	+	757	2	ISM	ENSMUSG00000031520.7	ENSMUST00000033919.6	2449	7	103556	645	103383	-645	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATGAAGTTCAGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54634196	54639486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_54634456_54638988
tx.18105	chr8	+	442	2	Intergenic	novelGene_316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCTAATAAATTATGATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56705713	56706769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_56705932_56706545
tx.18106	chr8	+	1690	7	FSM	ENSMUSG00000031613.10	ENSMUST00000034026.10	1683	7	0	-7	0	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	3.18416219575713	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCTATTCCTTTCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56747619	56774085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_56747748_56747973_56748098_56751390_56751498_56760628_56760726_56770784_56770862_56772027_56772192_56773092
tx.18107	chr8	+	1277	4	ISM	ENSMUSG00000031613.10	ENSMUST00000034026.10	1683	7	13063	-7	13063	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_2	3.2659863237109	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCTATTCCTTTCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56760682	56774085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_56760726_56770784_56770862_56772027_56772192_56773092
tx.18108	chr8	-	1767	12	NIC	ENSMUSG00000038215.16	novel	1690	11	NA	NA	3	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	11	junction_11	55.4532041566551	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGCCGATTTTCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57003904	56984550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_56984768_56985511_56985550_56985810_56985936_56991645_56991719_56992730_56992938_56993900_56994069_56995940_56996064_56997152_56997300_56998439_56998588_57000422_57000560_57003097_57003157_57003579
tx.18109	chr8	-	1624	12	NIC	ENSMUSG00000038215.16	novel	1690	11	NA	NA	3	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_11	54.5031654247927	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGCCGATTTTCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57003904	56984550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_56984768_56985511_56985550_56985810_56985936_56991645_56991719_56992730_56992938_56993900_56994069_56995940_56996064_56997152_56997300_56998439_56998588_57000422_57000560_57003097_57003157_57003722
tx.1811	chr10	+	3405	15	FSM	ENSMUSG00000020250.12	ENSMUST00000219962.3	2297	15	-1	-1107	-1	0	multi-exon	TRUE	canonical	1	267	junction_3	142.059218034492	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGTGCCTTCTGACTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82695039	82733546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_82695135_82696357_82696465_82710446_82710570_82711457_82711531_82713099_82713220_82715039_82715183_82715583_82715700_82717556_82717783_82719747_82719841_82720318_82720396_82720775_82720933_82721019_82721128_82723006_82723103_82726217_82726353_82731810
tx.18110	chr8	-	1703	11	FSM	ENSMUSG00000038215.16	ENSMUST00000040330.15	1690	11	-12	-1	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_10	43.9777216326631	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTATATGTGCCGATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57003904	56984555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_56984768_56985511_56985550_56985810_56985936_56991645_56991719_56992730_56992938_56993900_56994069_56995940_56996064_56997152_56997300_56998439_56998588_57000422_57000560_57003579
tx.18111	chr8	-	1561	11	NIC	ENSMUSG00000038215.16	novel	1690	11	NA	NA	3	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	61	junction_10	38.0914688611505	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATATGTGCCGATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57003904	56984554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_56984768_56985511_56985550_56985810_56985936_56991645_56991719_56992730_56992938_56993900_56994069_56995940_56996064_56997152_56997300_56998439_56998588_57000422_57000560_57003722
tx.18112	chr8	-	366	3	ISM	ENSMUSG00000038215.16	ENSMUST00000123493.8	1204	10	12574	-1	1684	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	199	junction_2	4	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTATATGTGCCGATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56985926	56984555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_56984768_56985511_56985550_56985810
tx.18113	chr8	+	1449	4	NIC	ENSMUSG00000038206.14	novel	3571	6	NA	NA	0	-93	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	28.3940525853958	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAAATGTGTCAGAATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57004143	57045335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_57004412_57041041_57041161_57043092_57043290_57044470
tx.18114	chr8	+	1903	6	FSM	ENSMUSG00000038206.14	ENSMUST00000040218.13	3571	6	24	1644	5	-98	multi-exon	TRUE	canonical	3	53	junction_4	8.56504524214554	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAATATAAAAATGTGTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57004148	57045330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_57004412_57017592_57017930_57022318_57022446_57041041_57041161_57043092_57043290_57044470
tx.18115	chr8	+	1172	3	FSM	ENSMUSG00000038206.14	ENSMUST00000211294.2	441	3	85	-816	85	-104	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	7	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATTGAGAATATAAAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57041039	57045324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_57041161_57043092_57043290_57044470
tx.18116	chr8	-	777	4	FSM	ENSMUSG00000031609.4	ENSMUST00000034022.4	1178	4	403	-2	403	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1617	junction_3	52.2961651451508	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTGCTTCAGCCTGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57940491	57935738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_57936085_57938075_57938175_57938543_57938670_57940285
tx.18117	chr8	+	1125	5	FSM	ENSMUSG00000054717.8	ENSMUST00000067925.8	2628	5	-7	1510	-7	1280	multi-exon	FALSE	canonical	3	4513	junction_1	1044.37167114969	9308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCATTGTGTTTGTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57964933	57967523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_57965040_57965608_57965783_57966095_57966242_57966323_57966499_57966999
tx.18118	chr8	+	1023	4	ISM	ENSMUSG00000054717.8	ENSMUST00000067925.8	2628	5	664	1510	23	1280	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6480	junction_3	312.16377467961	1326	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCATTGTGTTTGTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57965604	57967523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_57965783_57966095_57966242_57966323_57966499_57966999
tx.18119	chr8	-	3460	12	FSM	ENSMUSG00000031608.14	ENSMUST00000110316.3	3413	12	-40	-7	-11	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_6	28.2342620537355	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAGAAAAGCAATGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58106077	57977726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_57979286_57984635_57984765_57985661_57985761_57989616_57989836_57991119_57991243_57993053_57993172_57995868_57996052_57998362_57998443_57998702_57998834_58005477_58005645_58036800_58037262_58105886
tx.1812	chr10	+	3309	14	FSM	ENSMUSG00000020250.12	ENSMUST00000020484.9	3325	14	16	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	113	junction_1	208.745903123884	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGTGCCTTCTGACTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82695028	82733546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_82695135_82710446_82710570_82711457_82711531_82713099_82713220_82715039_82715183_82715583_82715700_82717556_82717783_82719747_82719841_82720318_82720396_82720775_82720933_82721019_82721128_82723006_82723103_82726217_82726353_82731810
tx.18120	chr8	-	3461	12	FSM	ENSMUSG00000031608.14	ENSMUST00000034021.12	4313	12	-6	858	-5	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_6	43.6895509190027	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCAATGTGGTGAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58106071	57977719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_57979286_57984635_57984765_57985661_57985761_57989616_57989836_57991119_57991243_57993053_57993172_57995545_57995729_57998362_57998443_57998702_57998834_58005477_58005645_58036800_58037262_58105886
tx.18121	chr8	-	611	2	ISM	ENSMUSG00000031608.14	ENSMUST00000156907.2	2042	6	-6	41808	-6	-41808	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	187	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGGACCGCAGCGTCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58106072	58036836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_58037262_58105886
tx.18122	chr8	+	610	4	NIC	ENSMUSG00000038005.16	novel	1000	7	NA	NA	13	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	57	junction_1	388.477655585091	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTTCTAGTGTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61343464	61360613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_61343571_61357033_61357122_61358581_61358755_61360370
tx.18123	chr8	+	1204	8	FSM	ENSMUSG00000038005.16	ENSMUST00000037190.15	1191	8	-13	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	724	junction_4	79.3373062516324	3780	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCTAGTGTTTCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61343471	61360614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_61343571_61346734_61346895_61348494_61348685_61349771_61349871_61353117_61353269_61357033_61357122_61358581_61358755_61360370
tx.18124	chr8	+	747	5	NIC	ENSMUSG00000038005.16	novel	1191	8	NA	NA	1	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	26	junction_1	382.667610335654	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCTAGTGTTTCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61343479	61360614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_61343571_61353117_61353269_61357033_61357122_61358581_61358755_61360370
tx.18125	chr8	+	1107	7	ISM	ENSMUSG00000038005.16	ENSMUST00000037190.15	1191	8	3247	1	3209	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	724	junction_3	85.6361813461784	536	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTTCTAGTGTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61346731	61360613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_61346895_61348494_61348685_61349771_61349871_61353117_61353269_61357033_61357122_61358581_61358755_61360370
tx.18126	chr8	-	4016	12	FSM	ENSMUSG00000004319.16	ENSMUST00000093490.9	5518	12	14	1488	0	19	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_11	42.8184713366008	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTTTTAATAGACTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61436320	61364910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_61366210_61372373_61372591_61375823_61376223_61380265_61380453_61382104_61382651_61383714_61383796_61386114_61386322_61387518_61387642_61390333_61390522_61391581_61391682_61394290_61394449_61435809
tx.18127	chr8	-	5643	13	FSM	ENSMUSG00000004319.16	ENSMUST00000110301.2	4099	13	-13	-1531	-8	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_11	50.7408995672021	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGGTTTGGCTTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61436286	61363425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_61366210_61372373_61372591_61375823_61376223_61380265_61380453_61382104_61382651_61383714_61383796_61386114_61386322_61387518_61387642_61390333_61390522_61391581_61391682_61394290_61394449_61428765_61428942_61435809
tx.18128	chr8	-	1012	4	ISM	ENSMUSG00000004319.16	ENSMUST00000056508.12	5684	12	27813	2580	-4460	-1046	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	202	junction_1	29.0095769627128	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAATACAAGGCGAGCTTT	965	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61380454	61366002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_61366210_61372373_61372591_61375823_61376223_61380265
tx.18129	chr8	+	1155	7	ISM	ENSMUSG00000031644.20	ENSMUST00000154313.2	3102	9	-45	10473	1	-9932	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_2	9.04464236747676	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGTGATTGCTCAACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61446229	61473161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_61446798_61459662_61459811_61460192_61460290_61465126_61465225_61469256_61469341_61472876_61472945_61473069
tx.1813	chr10	+	2309	6	ISM	ENSMUSG00000020250.12	ENSMUST00000219442.3	3531	14	24184	-2	-2361	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	702	junction_1	67.8781260790249	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGTGCCTTCTGACTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82720318	82733546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_82720396_82720775_82720933_82721019_82721128_82723006_82723103_82726217_82726353_82731810
tx.18130	chr8	+	3167	3	ISM	ENSMUSG00000031642.10	ENSMUST00000209611.2	4416	11	-13	54859	-13	-32806	intron_retention	FALSE	canonical	3	58	junction_2	4	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAGAAGAAAAAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61677264	61784816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_61677381_61678865_61679353_61782252
tx.18131	chr8	+	2443	5	ISM	ENSMUSG00000031642.10	ENSMUST00000209611.2	4416	11	1	35760	1	-13707	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_3	6.25999201277446	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACATAATCCAGGTTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61677278	61803915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_61677381_61678865_61679353_61782252_61782529_61782956_61783053_61802433
tx.18132	chr8	-	834	2	Intergenic	novelGene_317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGTGATAATTTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61933567	61913910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_61914543_61933365
tx.18133	chr8	+	1099	5	FSM	ENSMUSG00000031641.15	ENSMUST00000034058.14	4309	5	0	3210	0	95	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_4	10.8483869768736	696	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGTTGCTAAGAGTATTT	2566	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61940767	61956518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_61941025_61942973_61943095_61944578_61944713_61948101_61948237_61956066
tx.18134	chr8	-	1402	7	ISM	ENSMUSG00000058056.17	ENSMUST00000121200.9	4193	12	58858	1799	1557	1693	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_4	8.35497190632952	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAACACCAAAATCATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61985318	61966265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_61966559_61968236_61968371_61968902_61969069_61969568_61969777_61975917_61976051_61978101_61978197_61984945
tx.18135	chr8	-	1663	8	ISM	ENSMUSG00000058056.17	ENSMUST00000121200.9	4193	12	57524	1580	223	-1580	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_4	7.79848232226067	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGGTGCTATAGCATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61986652	61966046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_61966559_61968236_61968371_61968902_61969069_61969568_61969777_61975917_61976051_61978101_61978197_61984945_61985096_61986387
tx.18136	chr8	-	1022	6	ISM	ENSMUSG00000058056.17	ENSMUST00000121200.9	4193	12	65984	1802	8683	1690	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_4	9.14330356052997	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAACACCAAAATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61978192	61966268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_61966559_61968236_61968371_61968902_61969069_61969568_61969777_61975917_61976051_61978101
tx.18137	chr8	-	531	2	ISM	ENSMUSG00000058056.17	ENSMUST00000136825.2	680	3	240	6658	240	-6658	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACCTCTCTCTCGATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61986635	61984812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_61985096_61986387
tx.18138	chr8	+	700	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000058056.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTTGTTTCTATCTTGTT	521	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62002625	62014142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_62002793_62007452_62007602_62013758
tx.18139	chr8	-	1830	6	FSM	ENSMUSG00000031604.11	ENSMUST00000034015.11	2044	6	214	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	690	junction_2	21.3822356174466	1681	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAATGGTTCTGTTTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65186612	65171172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_65172216_65173375_65173531_65175497_65175625_65176621_65176771_65180657_65180943_65186541
tx.1814	chr10	+	2232	5	ISM	ENSMUSG00000020250.12	ENSMUST00000219442.3	3531	14	24641	-2	-1904	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	751	junction_2	62.7315709989794	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGTGCCTTCTGACTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82720775	82733546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_82720933_82721019_82721128_82723006_82723103_82726217_82726353_82731810
tx.18140	chr8	-	845	3	ISM	ENSMUSG00000031604.11	ENSMUST00000132013.2	2766	5	-8	5029	-5	409	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	705	junction_1	24.5	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTCGGATCTTTTCTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65186620	65176289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_65176771_65180657_65180943_65186541
tx.18141	chr8	+	1082	6	FSM	ENSMUSG00000025521.16	ENSMUST00000026595.13	1122	6	40	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	529	junction_4	36.201657420621	364	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTTTTGTATGTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65399876	65421685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_65399986_65409037_65409185_65411996_65412262_65416849_65416985_65418190_65418294_65421362
tx.18142	chr8	-	971	3	FSM	ENSMUSG00000079042.11	ENSMUST00000124790.8	945	3	-23	-3	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	429	junction_2	5	1424	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGAGTTTATTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65489847	65481068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_65481644_65488316_65488407_65489541
tx.18143	chr8	+	954	5	Intergenic	novelGene_318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.82915619758885	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTCGCCATGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65498702	65532282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_65498801_65502783_65502947_65525544_65525659_65528983_65529156_65531875
tx.18144	chr8	-	599	3	ISM	ENSMUSG00000025591.7	ENSMUST00000143972.2	3150	7	6066	2116	6066	-2116	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	751	junction_2	20.5	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGAATTTGCTATTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66933083	66929097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_66929562_66930666_66930710_66932991
tx.18145	chr8	-	1005	7	FSM	ENSMUSG00000025591.7	ENSMUST00000026681.7	4328	7	-5	3328	-3	-2116	multi-exon	FALSE	canonical	3	650	junction_5	98.3165239870129	2225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGAATTTGCTATTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66939176	66929097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_66929562_66930666_66930710_66932991_66933141_66934114_66934200_66935157_66935196_66936709_66936823_66939063
tx.18146	chr8	-	1058	7	FSM	ENSMUSG00000025591.7	ENSMUST00000143972.2	3150	7	-28	2120	-4	-2120	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_5	270.629153804406	470	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATGTAAGAATTTGCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66939177	66929101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_66929562_66930666_66930710_66932991_66933141_66934114_66934200_66935157_66935252_66936709_66936823_66939063
tx.18147	chr8	+	1789	2	FSM	ENSMUSG00000025588.5	ENSMUST00000212171.2	1208	2	-38	-543	-38	519	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGATCAAAGGCTTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67933534	67945275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_67933668_67943619
tx.18148	chr8	+	2640	9	FSM	ENSMUSG00000053886.5	ENSMUST00000066594.4	2718	9	85	-7	85	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_7	6.37867541108654	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68729303	68800353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_68729525_68734684_68735064_68746954_68747112_68749305_68749478_68781903_68782013_68783686_68783889_68787716_68787848_68798604_68798826_68799305
tx.18149	chr8	+	2365	3	FSM	ENSMUSG00000031864.17	ENSMUST00000145140.2	2328	3	-24	-13	-6	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	700	junction_1	15.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTTCAGTTAAGAAAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69246601	69251466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_69246801_69247262_69247331_69249368
tx.1815	chr10	-	688	2	Intergenic	novelGene_102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGCCTACTGTGTGGACT	7410	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82756735	82753704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_82754279_82756621
tx.18150	chr8	+	2431	17	FSM	ENSMUSG00000031864.17	ENSMUST00000034328.13	4201	17	21	1749	-6	160	multi-exon	FALSE	canonical	3	438	junction_4	79.6960779696843	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATTTTTAGTTTCAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69246601	69280313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_69246801_69247262_69247331_69249368_69249473_69250410_69250551_69254967_69255050_69255534_69255676_69257465_69257638_69260113_69260284_69261027_69261162_69263230_69263385_69264562_69264646_69266217_69266371_69266908_69267018_69271939_69272020_69273306_69273470_69274808_69274903_69279928
tx.18151	chr8	+	1431	4	FSM	ENSMUSG00000031864.17	ENSMUST00000146322.8	1408	4	-10	-13	-10	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	644	junction_3	36.0030862874591	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCTTCAGTTAAGAAAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69246597	69251466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_69246801_69247262_69247331_69249368_69249473_69250410
tx.18152	chr8	+	1310	9	ISM	ENSMUSG00000031864.17	ENSMUST00000110241.8	2322	16	24	13893	3	-5994	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	438	junction_4	90.4087074069749	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAATTAAGTGTAAGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69246610	69261270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_69246801_69247262_69247331_69249368_69249473_69250410_69250551_69254967_69255050_69255534_69255676_69257465_69257638_69260113_69260284_69261027
tx.18153	chr8	+	2434	17	NNC	ENSMUSG00000031864.17	novel	4201	17	NA	NA	-6	160	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	51	junction_9	163.936296697833	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTATTTTTAGTTTCAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69246601	69280313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_69246801_69247262_69247331_69249368_69249473_69250410_69250551_69254967_69255050_69255534_69255676_69257465_69257638_69260113_69260284_69261027_69261162_69263227_69263385_69264562_69264646_69266217_69266371_69266908_69267018_69271939_69272020_69273306_69273470_69274808_69274903_69279928
tx.18154	chr8	+	2073	10	FSM	ENSMUSG00000015568.17	ENSMUST00000015712.15	4115	10	134	1908	-32	-1908	multi-exon	TRUE	canonical	3	87	junction_5	14.4871164560059	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGTAACCAGGAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69333276	69357678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_69333493_69340094_69340256_69345246_69345427_69347278_69347391_69348313_69348548_69349250_69349494_69352068_69352190_69353799_69353983_69354935_69355038_69357157
tx.18155	chr8	+	1172	5	ISM	ENSMUSG00000015568.17	ENSMUST00000015712.15	4115	10	16106	1908	5853	-1908	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_3	9.78199877325692	185	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGTAACCAGGAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69349248	69357678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_69349494_69352068_69352190_69353799_69353983_69354935_69355038_69357157
tx.18156	chr8	-	862	3	NNC	ENSMUSG00000110594.2	novel	527	2	NA	NA	-26186	19	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	5	junction_2	3.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATTCTACTAGTATAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69480521	69423777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_69424161_69454172_69454288_69480157
tx.18157	chr8	-	950	4	NNC	ENSMUSG00000110594.2	novel	527	2	NA	NA	-26170	21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.09901951359278	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTCTACTAGTATAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69480505	69423775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_69424161_69454172_69454288_69454986_69455089_69480157
tx.18158	chr8	-	929	4	NNC	ENSMUSG00000110594.2	novel	527	2	NA	NA	-26153	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_3	2.16024689946929	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGATATATTCTACTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69480488	69423782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_69424161_69454172_69454288_69460610_69460716_69480157
tx.18159	chr8	-	1738	7	NNC	ENSMUSG00000036330.13	novel	3115	17	NA	NA	29361	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1.5723301886761	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAGTATATGCTGTTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69498799	69490358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_69491558_69492892_69493027_69493233_69493354_69493629_69493694_69495365_69495418_69496576_69496656_69498709
tx.1816	chr10	-	636	2	Intergenic	novelGene_103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	0	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGCCTACTGTGTGGACT	7410	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82756735	82753704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_82754279_82756673
tx.18160	chr8	+	2707	14	FSM	ENSMUSG00000006273.15	ENSMUST00000006435.8	2825	14	118	0	-4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1214	junction_12	88.1479391228044	543	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGAAATGACTCTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69541415	69566363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_69541581_69548871_69548928_69554016_69554116_69554587_69554682_69554815_69554894_69555102_69555243_69555413_69555516_69556031_69556130_69556296_69556421_69558460_69558612_69560233_69560317_69560934_69561040_69562531_69562662_69565081
tx.18161	chr8	+	2067	8	ISM	ENSMUSG00000006273.15	ENSMUST00000006435.8	2825	14	14124	0	-358	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1214	junction_6	59.4100245784174	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGAAATGACTCTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69555421	69566363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_69555516_69556031_69556130_69556296_69556421_69558460_69558612_69560233_69560317_69560934_69561040_69562531_69562662_69565081
tx.18162	chr8	+	1409	2	ISM	ENSMUSG00000006273.15	ENSMUST00000006435.8	2825	14	21237	0	6755	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1247	junction_1	0	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGAAATGACTCTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69562534	69566363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_69562662_69565081
tx.18163	chr8	+	3004	5	NNC	ENSMUSG00000059897.6	novel	3001	4	NA	NA	13	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	46.5053760333147	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGCCATGACCCTTGTCCT	7223	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69661712	69683185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_69661812_69670165_69670195_69678994_69679122_69679323_69679382_69680494
tx.18164	chr8	+	1518	4	FSM	ENSMUSG00000059897.6	ENSMUST00000212681.2	3001	4	20	1463	10	93	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	2.49443825784929	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTTGCTGTTCACAATTA	7220	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69661709	69681725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_69661812_69678994_69679122_69679323_69679382_69680494
tx.18165	chr8	+	591	2	NIC	ENSMUSG00000079038.4	novel	508	4	NA	NA	-1	200	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTGCCAAATTCATTCTAG	7146	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69723730	69767059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_69723844_69766581
tx.18166	chr8	+	605	5	NIC	ENSMUSG00000079038.4	novel	2002	6	NA	NA	-2	-919	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	14	junction_4	0.82915619758885	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAATACATACTGGAGA	7159	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69723743	69754895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_69723844_69743913_69743975_69752904_69753032_69753409_69753474_69754642
tx.18167	chr8	-	750	5	FSM	ENSMUSG00000110444.3	ENSMUST00000213012.2	7778	5	-17	7045	0	-27	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	16.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTATGAGTCTAAGCAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69848191	69826206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_69826560_69827709_69827771_69827957_69828085_69829137_69829248_69848092
tx.18168	chr8	-	642	4	FSM	ENSMUSG00000110444.3	ENSMUST00000072427.7	7668	4	-22	7048	-5	-30	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_3	3.85861230093008	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACCTATGAGTCTAAGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69848196	69826209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_69826560_69827709_69827771_69827957_69828085_69848092
tx.18169	chr8	-	581	2	NNC	ENSMUSG00000110444.3	novel	7668	4	NA	NA	0	1063	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTGTCTCAATGCAGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69848191	69846200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_69846683_69848092
tx.1817	chr10	+	1520	2	NIC	ENSMUSG00000112134.2	novel	603	4	NA	NA	-130	1130	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAAAAAAATTTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83180246	83188073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_83180563_83186869
tx.18170	chr8	-	2457	5	FSM	ENSMUSG00000060427.16	ENSMUST00000121886.8	2259	5	5	-203	2	203	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_4	33.7083075813663	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGTGCCTCCCATACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70078194	70063304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70065107_70066044_70066106_70066398_70066526_70071964_70072323_70078085
tx.18171	chr8	-	2265	5	NNC	ENSMUSG00000060427.16	novel	2259	5	NA	NA	356	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_4	46.3215662515852	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTTAGTACTCATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70077840	70063500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_70065107_70066044_70066106_70066398_70066526_70071964_70072323_70077727
tx.18172	chr8	-	905	2	FSM	ENSMUSG00000060427.16	ENSMUST00000140522.2	914	2	20	-11	20	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAACACAACAAAACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70078176	70071508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70072323_70078085
tx.18173	chr8	-	944	2	NNC	ENSMUSG00000060427.16	novel	914	2	NA	NA	332	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAAACACAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70077864	70071515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_70072323_70077727
tx.18174	chr8	-	3180	5	FSM	ENSMUSG00000054648.9	ENSMUST00000238418.2	3180	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_4	9.33742469849155	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTTTGTCAATGTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70169552	70157786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70160345_70160760_70160822_70160988_70161116_70163335_70163635_70169417
tx.18175	chr8	+	1579	2	FSM	ENSMUSG00000031861.17	ENSMUST00000238452.2	1350	2	-11	-218	-11	218	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCCCTGGTTGTTATTTTT	478	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70275222	70277643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70275362_70276203
tx.18176	chr8	+	2572	2	ISM	ENSMUSG00000031861.17	ENSMUST00000164890.8	5800	4	1130	2976	975	-2976	intron_retention	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACGGAAAACGTCTCTTTCT	1464	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70276208	70280775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70276946_70278940
tx.18177	chr8	+	671	4	NIC	ENSMUSG00000031860.18	novel	823	5	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	9	junction_2	13.4246870437348	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTGTTTTCAATACAG	2242	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70285309	70324942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_70285502_70311729_70311804_70323227_70323335_70324644
tx.18178	chr8	+	1076	7	FSM	ENSMUSG00000031860.18	ENSMUST00000156319.8	1101	7	25	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	13.7446959466795	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTGTTTTCAATACAG	2244	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70285311	70324942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70285502_70311729_70311804_70317547_70317665_70319117_70319254_70322678_70322833_70323227_70323335_70324644
tx.18179	chr8	+	961	6	FSM	ENSMUSG00000031860.18	ENSMUST00000134777.10	931	6	-30	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	11.2178429299041	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTGTTTTCAATACAG	2242	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70285309	70324942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70285502_70311729_70311804_70319117_70319254_70322678_70322833_70323227_70323335_70324644
tx.1818	chr10	+	1191	4	FSM	ENSMUSG00000020255.9	ENSMUST00000020488.9	123179	4	11	121977	11	-121977	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	5.24933858267454	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGAATGCCTCCAGTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83196095	83202392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_83196238_83197910_83197998_83200242_83200380_83201567
tx.18180	chr8	+	785	5	NIC	ENSMUSG00000031860.18	novel	931	6	NA	NA	-8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_3	14.9059551857638	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTGTTTTCAATACAG	2264	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70285331	70324942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_70285502_70311729_70311804_70319117_70319254_70323227_70323335_70324644
tx.18181	chr8	+	1132	7	NIC	ENSMUSG00000031860.18	novel	1560	8	NA	NA	-10	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	8	junction_3	12.3659478676997	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTGTTTTCAATACAG	2262	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70285329	70324942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_70285502_70311729_70311804_70317473_70317665_70319117_70319254_70322678_70322833_70323227_70323335_70324644
tx.18182	chr8	+	562	3	ISM	ENSMUSG00000031860.18	ENSMUST00000134777.10	931	6	37336	0	3741	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	3.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTGTTTTCAATACAG	6834	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70322675	70324942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70322833_70323227_70323335_70324644
tx.18183	chr8	-	502	4	ISM	ENSMUSG00000036199.10	ENSMUST00000110167.5	1251	5	908	-11	908	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6124	junction_2	115.905133622286	19010	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGACTCTATCGTGGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70354300	70346818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_70347061_70347153_70347226_70347891_70347971_70354191
tx.18184	chr8	+	2080	14	FSM	ENSMUSG00000011306.8	ENSMUST00000011450.8	2681	14	213	388	-8	-388	multi-exon	FALSE	canonical	3	384	junction_4	56.2515483021626	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCATTCCAGTTCCTGCTG	2370	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70495675	70524609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70495731_70501158_70501331_70505240_70505342_70509035_70509255_70511931_70512056_70512402_70512504_70513185_70513310_70517486_70517849_70522101_70522209_70522645_70522824_70522980_70523088_70523763_70523910_70524171_70524302_70524455
tx.18185	chr8	+	334	3	ISM	ENSMUSG00000011306.8	ENSMUST00000011450.8	2681	14	28395	390	28159	-390	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	576	junction_1	9	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGCATTCCAGTTCCTGC	9782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70523857	70524607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70523910_70524171_70524302_70524455
tx.18186	chr8	+	1187	5	NNC	ENSMUSG00000071078.7	novel	1161	5	NA	NA	4	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	248.840310239318	2249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCCATTTGTGGTACTCT	451	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70583986	70586402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_70584250_70584567_70584659_70585061_70585168_70585236_70585309_70585747
tx.18187	chr8	-	721	2	NNC	ENSMUSG00000036120.11	novel	3282	5	NA	NA	1875	673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAACCTGCAATGGAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70586402	70585242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_70585310_70585748
tx.18188	chr8	-	1241	9	FSM	ENSMUSG00000036120.11	ENSMUST00000075724.9	3609	9	-92	2460	-92	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	42	junction_5	11.7626261948597	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTTCAGGGTGCCTCCCA	9453	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70591896	70585915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70586114_70586875_70586957_70587261_70587329_70587688_70587815_70587940_70588042_70588215_70588282_70588859_70588941_70590678_70590874_70591570
tx.18189	chr8	+	777	4	FSM	ENSMUSG00000002345.19	ENSMUST00000123976.2	756	4	-7	-14	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	180	junction_1	5.79271573232759	725	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGCCTTTGACCAGTCTG	8814	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70592349	70598199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70592423_70594513_70594627_70595123_70595189_70597673
tx.1819	chr10	+	1053	3	ISM	ENSMUSG00000020255.9	ENSMUST00000020488.9	123179	4	1824	121975	1824	-121975	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_2	1	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAATGCCTCCAGTTCTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83197908	83202394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_83197998_83200242_83200380_83201567
tx.18190	chr8	+	614	6	FSM	ENSMUSG00000002345.19	ENSMUST00000002418.15	810	6	201	-5	-7	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	86	junction_5	44.6183818621877	516	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGTCTCTTTCCATGCTGGG	8814	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70592349	70599911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70592423_70594513_70594627_70595123_70595189_70597673_70597785_70598460_70598541_70599739
tx.18191	chr8	+	2103	11	FSM	ENSMUSG00000002342.18	ENSMUST00000182980.8	2080	11	-14	-9	-11	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	59.2504008425259	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACCATGGTGCCAGTGTGG	5855	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70625043	70635509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70625091_70629494_70629576_70629890_70629989_70630101_70630259_70631516_70631669_70633188_70633250_70633355_70633500_70633585_70633700_70633798_70633974_70634079_70634177_70634532
tx.18192	chr8	+	2199	12	FSM	ENSMUSG00000002342.18	ENSMUST00000002413.15	3018	12	0	819	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	38.6768771547844	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGGTGCCAGTGTGGTCT	5866	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70625054	70635512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70625091_70626952_70627057_70629494_70629576_70629890_70629989_70630101_70630259_70631516_70631669_70633188_70633250_70633355_70633500_70633585_70633700_70633798_70633974_70634079_70634177_70634532
tx.18193	chr8	+	2154	11	ISM	ENSMUSG00000002342.18	ENSMUST00000002413.15	3018	12	1897	829	-1	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_1	15.5935884260166	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCCTTACCATGGTGCC	7763	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70626951	70635502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70627057_70629494_70629576_70629890_70629989_70630101_70630259_70631516_70631669_70633188_70633250_70633355_70633500_70633585_70633700_70633798_70633974_70634079_70634177_70634532
tx.18194	chr8	+	2050	10	ISM	ENSMUSG00000002342.18	ENSMUST00000182980.8	2080	11	4436	-2	-1	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_4	12.2474487139159	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCCTTACCATGGTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70629493	70635502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70629576_70629890_70629989_70630101_70630259_70631516_70631669_70633188_70633250_70633355_70633500_70633585_70633700_70633798_70633974_70634079_70634177_70634532
tx.18195	chr8	+	1566	6	ISM	ENSMUSG00000002342.18	ENSMUST00000149105.2	2093	11	6235	11	-1	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	210	junction_4	8.37615663654877	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTACCATGGTGCCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70633187	70635506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70633250_70633355_70633500_70633585_70633700_70633798_70633974_70634079_70634177_70634532
tx.18196	chr8	-	2229	8	FSM	ENSMUSG00000002343.12	ENSMUST00000019679.12	2263	8	27	7	10	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_3	11.6741472616082	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAAAGCTTCTCATTTTT	4695	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70687089	70672828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70673528_70674755_70674894_70675167_70675300_70676193_70676340_70677549_70678124_70682177_70682261_70683929_70684057_70686759
tx.18197	chr8	-	1412	4	FSM	ENSMUSG00000002343.12	ENSMUST00000135931.2	1414	4	4	-2	4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_3	12.0830459735946	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGAGCCTTGTCTGCCTTGTC	4689	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70687095	70677257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70678124_70682177_70682261_70683929_70684057_70686759
tx.18198	chr8	+	2264	3	ISM	ENSMUSG00000036054.16	ENSMUST00000136758.2	3517	6	-40	10206	-34	1654	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_1	11.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAAAAG	1449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70687232	70697207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70687303_70689317_70689445_70695140
tx.18199	chr8	+	2401	10	FSM	ENSMUSG00000003573.16	ENSMUST00000110124.9	2445	10	36	8	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_9	38.9171326009065	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGTGAGATCTGGCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70735684	70747003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70735751_70737883_70737966_70738043_70738201_70738580_70738713_70742043_70742152_70742701_70742824_70743656_70743814_70743967_70744079_70744166_70744254_70745624
tx.182	chr1	+	1284	8	ISM	ENSMUSG00000026073.14	ENSMUST00000027243.13	1419	9	17698	6	16411	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_5	1.35526185435788	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGAGAGTGACCCATGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40141555	40164385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_40141698_40144423_40144683_40151114_40151296_40154183_40154359_40157114_40157178_40160068_40160205_40162281_40162425_40164200
tx.1820	chr10	+	625	2	ISM	ENSMUSG00000034560.7	ENSMUST00000217842.2	5014	33	203	48173	14	-40939	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	360	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTTGTTAAGCTACATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83379818	83383125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_83379967_83382648
tx.18200	chr8	+	680	5	FSM	ENSMUSG00000003573.16	ENSMUST00000087467.12	880	5	211	-11	4	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_4	81.1202810646018	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGCTTTGGTGTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70735687	70739191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70735751_70737883_70737966_70738043_70738201_70738580_70738713_70738945
tx.18201	chr8	+	1760	9	ISM	ENSMUSG00000003573.16	ENSMUST00000110124.9	2445	10	42	2014	7	609	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_8	37.4814537471534	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTTTTTGTTTTTCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70735690	70744997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70735751_70737883_70737966_70738043_70738201_70738580_70738713_70742043_70742152_70742701_70742824_70743656_70743814_70743967_70744079_70744166
tx.18202	chr8	+	554	5	NNC	ENSMUSG00000003573.16	novel	880	5	NA	NA	-5	1167	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_4	102.587767301955	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTTTTTCTATTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70735678	70740347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_70735751_70737883_70737966_70738043_70738201_70738580_70738713_70740236
tx.18203	chr8	-	379	3	ISM	ENSMUSG00000057788.14	ENSMUST00000127094.2	599	6	1669	-135	1669	135	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	294	junction_1	13	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGACTTGAGAATGGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70746718	70746100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_70746338_70746477_70746550_70746648
tx.18204	chr8	-	1534	13	FSM	ENSMUSG00000057788.14	ENSMUST00000008004.10	2137	13	18	585	-8	135	multi-exon	TRUE	canonical	3	250	junction_9	19.6148682268211	419	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGACTTGAGAATGGGGT	9949	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70755121	70746100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70746338_70746477_70746550_70746648_70746738_70747336_70747412_70748016_70748115_70748224_70748302_70749032_70749109_70749552_70749694_70749780_70749969_70750525_70750648_70750730_70750817_70753628_70753753_70754972
tx.18205	chr8	+	1051	10	FSM	ENSMUSG00000055681.15	ENSMUST00000066469.14	1300	10	250	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1246	junction_3	49.1055803823899	4770	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGCCTGATACCCACCAG	702	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70755417	70765641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70755583_70757283_70757347_70758284_70758386_70759148_70759302_70760599_70760654_70761144_70761227_70762985_70763142_70764277_70764347_70765355_70765431_70765508
tx.18206	chr8	+	1395	2	FSM	ENSMUSG00000109523.2	ENSMUST00000207684.2	1349	2	-51	5	-51	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCCATTGCGTTGGCGCAG	5067	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70782415	70784232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70782927_70783348
tx.18207	chr8	-	733	5	NNC	ENSMUSG00000003575.14	novel	870	4	NA	NA	-50	552	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_1	29.1247317584214	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGTGTGGGTGTCCTATC	5163	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70892279	70856946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_70857166_70857908_70857971_70858727_70858866_70861544_70861662_70892082
tx.18208	chr8	-	848	5	NNC	ENSMUSG00000003575.14	novel	870	4	NA	NA	-63	547	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	30.8261252835967	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCACACAGTGTGGGTGTC	5150	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70892292	70856951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_70857273_70857908_70857971_70858727_70858866_70861544_70861662_70892082
tx.18209	chr8	-	965	5	NNC	ENSMUSG00000003575.14	novel	870	4	NA	NA	-38	543	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	29.1247317584214	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACTGCACACAGTGTGGG	5175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70892267	70856955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_70857419_70857908_70857971_70858727_70858866_70861544_70861662_70892082
tx.1821	chr10	+	1188	13	ISM	ENSMUSG00000034560.7	ENSMUST00000038388.7	5858	33	15	36044	15	-27771	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	259	junction_12	27.7603834427569	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCAGCAGCTGCCAAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83379819	83396293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_83379967_83382648_83382789_83385325_83385380_83385462_83385529_83386127_83386174_83386744_83386813_83390597_83390681_83391436_83391480_83391876_83391981_83392666_83392788_83394461_83394586_83394681_83394810_83396229
tx.18210	chr8	-	1442	4	FSM	ENSMUSG00000003575.14	ENSMUST00000125613.8	870	4	-36	-536	-32	536	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_2	6.48074069840786	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATATAGTAACTGCACACA	5181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70892261	70856962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70857971_70858727_70858866_70861544_70861662_70892082
tx.18211	chr8	-	620	4	FSM	ENSMUSG00000058833.12	ENSMUST00000133683.8	632	4	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_3	338.518340222013	946	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTCCCATCAGCTCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70959064	70956944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70957160_70957633_70957711_70958405_70958611_70958941
tx.18212	chr8	-	660	5	FSM	ENSMUSG00000058833.12	ENSMUST00000075175.12	671	5	11	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	754	junction_4	53.0518614188041	5288	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTCCCATCAGCTCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70959391	70956944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70957160_70957633_70957711_70958405_70958611_70959146_70959230_70959311
tx.18213	chr8	-	518	4	FSM	ENSMUSG00000090137.9	ENSMUST00000125184.8	711	4	193	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14257	junction_3	3914.7897346686	36697	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGTCTAGAGTGACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70963038	70960912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_70961179_70961945_70962033_70962170_70962285_70962987
tx.18214	chr8	-	587	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000019428.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTGTGGGAGGTGGGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70987976	70987135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_70987261_70987514
tx.18215	chr8	+	1164	4	ISM	ENSMUSG00000070002.8	ENSMUST00000093454.8	3072	12	-11	12937	-11	-1720	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_2	25.31578339473	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCTCTCTCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70992326	71032571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70992492_71025512_71025561_71031486_71031609_71031742
tx.18216	chr8	+	1551	3	ISM	ENSMUSG00000070002.8	ENSMUST00000093454.8	3072	12	51033	0	51033	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTCTGTGGTTTGAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71043370	71045508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_71043516_71044019_71044065_71044147
tx.18217	chr8	+	1850	11	FSM	ENSMUSG00000019139.11	ENSMUST00000019283.10	1836	11	-12	-2	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	300	junction_1	49.1426495012225	354	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTCCTTGTGTGCTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71047118	71049940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71047194_71047269_71047399_71047472_71047635_71047788_71047922_71048010_71048205_71048354_71048505_71048599_71048816_71048897_71049063_71049145_71049260_71049343_71049562_71049646
tx.18218	chr8	+	1788	10	FSM	ENSMUSG00000019139.11	ENSMUST00000210005.2	1914	10	126	0	117	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_3	42.074302294634	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTCCTTGTGTGCTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71047256	71049940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71047399_71047472_71047635_71047788_71047922_71048010_71048205_71048354_71048505_71048599_71048816_71048897_71049063_71049145_71049260_71049343_71049562_71049646
tx.18219	chr8	-	1444	17	FSM	ENSMUSG00000070003.8	ENSMUST00000049908.11	1475	17	36	-5	9	5	multi-exon	TRUE	canonical	3	428	junction_1	289.200298236361	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTGCTGATGTCTTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71060928	71050134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71050419_71050662_71050771_71050855_71050885_71051188_71051268_71051351_71051423_71051503_71051559_71051642_71051679_71051767_71051814_71052023_71052095_71052174_71052246_71052337_71052408_71052489_71052550_71053045_71053136_71054881_71054967_71055050_71055113_71055223_71055297_71060774
tx.1822	chr10	-	2745	21	NIC	ENSMUSG00000020263.15	novel	3020	21	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_1	21.7591360122593	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTATTGTGGTTAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83484541	83435896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_83436692_83437746_83437795_83438621_83438763_83438989_83439027_83441623_83441799_83444563_83444617_83444800_83444960_83446841_83446931_83447006_83447064_83447313_83447357_83448575_83448765_83450007_83450167_83453210_83453294_83456561_83456709_83457392_83457452_83457575_83457618_83460482_83460571_83464092_83464165_83464637_83464698_83476869_83476969_83484391
tx.18220	chr8	-	417	3	ISM	ENSMUSG00000070003.8	ENSMUST00000211134.2	1549	16	10067	-3	243	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	428	junction_1	321	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTACTGCTGATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71050885	71050139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_71050419_71050662_71050771_71050855
tx.18221	chr8	+	886	2	ISM	ENSMUSG00000049988.6	ENSMUST00000052437.6	1906	3	966	589	966	-589	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTCTCGGTTCTGCACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71070459	71073544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_71071015_71073213
tx.18222	chr8	-	1088	2	FSM	ENSMUSG00000038508.8	ENSMUST00000003808.8	1545	2	457	0	457	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	308	junction_1	0	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGCGTCTCAGTGACCTTG	1472	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71084288	71082042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71082825_71083982
tx.18223	chr8	-	1314	3	NNC	ENSMUSG00000038508.8	novel	1380	3	NA	NA	34	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	77	junction_2	115.5	22	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGCGTCTCAGTGACCTTG	688	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71085072	71082042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_71082825_71083982_71084242_71084799
tx.18224	chr8	-	1383	4	NNC	ENSMUSG00000038508.8	novel	1380	3	NA	NA	-165	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	33	junction_3	120.610484158256	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGCGTCTCAGTGACCTTG	489	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71085271	71082042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_71082825_71083982_71084242_71084799_71085030_71085159
tx.18225	chr8	+	451	2	Intergenic	novelGene_319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAGCGGCAGGCCAGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71085341	71090555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_71085460_71090222
tx.18226	chr8	+	558	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000056204.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGTTGCTGGAAAATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71102177	71104146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_71102367_71103777
tx.18227	chr8	-	1428	5	FSM	ENSMUSG00000056204.9	ENSMUST00000070173.9	4883	5	13	3442	13	301	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_1	24.3554408705735	191	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGGTATTTGTTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71112375	71102526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71103436_71103831_71104065_71105054_71105172_71110077_71110131_71112259
tx.18228	chr8	-	2444	5	NNC	ENSMUSG00000056204.9	novel	4883	5	NA	NA	-42	1087	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	10	junction_4	80.0199193951106	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCGCCACATGGAGATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71113080	71101740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_71103436_71103831_71104065_71105054_71105172_71110077_71110131_71112734
tx.18229	chr8	-	387	3	ISM	ENSMUSG00000056204.9	ENSMUST00000211715.2	676	4	-56	2108	31	-962	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_2	20.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGGTGTACTCAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71112357	71104935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_71105172_71110077_71110131_71112259
tx.1823	chr10	-	1560	10	ISM	ENSMUSG00000020263.15	ENSMUST00000147582.8	3377	14	-24	7915	-19	699	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_4	6.21825270205921	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACACATAGTGCCTTGCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83484558	83449423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_83450167_83453210_83453294_83456561_83456709_83457392_83457452_83457575_83457618_83460482_83460571_83464092_83464165_83464637_83464698_83476869_83476969_83484391
tx.18230	chr8	+	794	5	FSM	ENSMUSG00000031848.16	ENSMUST00000034311.15	925	5	131	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2963	junction_1	310.191070148707	16003	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGCTGTTCTTCTGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71126028	71131402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71126108_71129204_71129247_71130427_71130527_71130603_71130785_71131009
tx.18231	chr8	-	970	5	FSM	ENSMUSG00000035559.10	ENSMUST00000038626.10	980	5	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	649	junction_3	27.2304976083802	1313	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGACTGCGTGTGGGTGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71213582	71211294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71211671_71211754_71211884_71212036_71212114_71213013_71213185_71213365
tx.18232	chr8	-	981	7	FSM	ENSMUSG00000031838.11	ENSMUST00000222087.4	980	7	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	181	junction_6	19.0065778087482	1567	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTTTTTCCTAGAGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71219307	71215417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71215686_71215772_71215827_71216371_71216525_71217191_71217285_71217363_71217439_71217563_71217747_71219152
tx.18233	chr8	-	1669	6	NNC	ENSMUSG00000002910.12	novel	2355	8	NA	NA	707	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	41.0385184917779	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGGCCGTCTTTTCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71291455	71287772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_71288639_71288863_71289022_71289501_71289665_71289753_71290011_71290087_71290191_71291333
tx.18234	chr8	+	1148	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000002908.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCAGGAATCCTCCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71304885	71306118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_71305241_71305325
tx.18235	chr8	-	295	2	ISM	ENSMUSG00000002908.18	ENSMUST00000212414.2	613	3	-27	6565	-27	-6565	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTAACTCGGCGGGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71315678	71314209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_71314418_71315591
tx.18236	chr8	-	629	5	FSM	ENSMUSG00000045128.10	ENSMUST00000213053.2	576	5	-17	-36	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_4	13769.0618144447	305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTGTTTGCTTCTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71350056	71348022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71348152_71348243_71348354_71348559_71348690_71348776_71348957_71349976
tx.18237	chr8	-	810	4	FSM	ENSMUSG00000045128.10	ENSMUST00000212019.2	795	4	-15	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16397	junction_3	7846.8208565989	408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTGTTTGCTTCTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71350057	71348022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71348152_71348243_71348690_71348776_71348957_71350002
tx.18238	chr8	-	605	5	FSM	ENSMUSG00000045128.10	ENSMUST00000054220.10	1260	5	-2	657	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16397	junction_4	7934.97659101777	36791	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTGTTTGCTTCTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71350058	71348022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71348152_71348243_71348354_71348559_71348690_71348776_71348957_71350002
tx.18239	chr8	-	360	3	ISM	ENSMUSG00000045128.10	ENSMUST00000212494.2	473	4	-1	522	-1	-477	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16397	junction_2	1536.5	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTGTGAGTCTCCAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71350057	71348564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_71348690_71348776_71348957_71350002
tx.1824	chr10	-	583	4	ISM	ENSMUSG00000020263.15	ENSMUST00000150685.8	774	9	-116	7356	19	-3423	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_2	4.78423336480244	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGTTTCCTGGTTTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83484583	83463932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_83464165_83464637_83464698_83476869_83476969_83484391
tx.18240	chr8	+	852	3	NIC	ENSMUSG00000019261.4	novel	4635	5	NA	NA	-4	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	7	junction_1	161.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTCTTACTGTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71358621	71370173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_71358772_71368994_71369219_71369695
tx.18241	chr8	+	3266	7	FSM	ENSMUSG00000019261.4	ENSMUST00000019405.4	3314	7	50	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	269	junction_1	20.5236990384829	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTCTTACTGTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71358625	71370173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71358772_71363588_71363694_71364489_71364573_71365156_71365298_71365549_71367639_71368994_71369219_71369695
tx.18242	chr8	+	1177	6	NIC	ENSMUSG00000019261.4	novel	3323	8	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	118.685129649843	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTCTTACTGTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71358625	71370173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_71358772_71363588_71363694_71364489_71364573_71365156_71365298_71368994_71369219_71369695
tx.18243	chr8	+	765	3	ISM	ENSMUSG00000019261.4	ENSMUST00000213083.2	4635	5	8939	0	3114	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_1	27	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTCTTACTGTCTTAT	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	71367575	71370173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_71367639_71368994_71369219_71369695
tx.18244	chr8	-	1581	11	FSM	ENSMUSG00000035439.14	ENSMUST00000035960.13	2013	11	433	-1	-23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	458	junction_6	24.6578587878185	490	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACAGTGTGATGCGTTTGT	571	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71725145	71703767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71704189_71705714_71705899_71707164_71707307_71708050_71708210_71708290_71708357_71708651_71708765_71709102_71709199_71709999_71710070_71715695_71715749_71721869_71721929_71724927
tx.18245	chr8	+	850	7	NNC	ENSMUSG00000002395.15	novel	854	8	NA	NA	7	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	312.764954345378	697	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACATGTCTTCAGTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71819867	71822375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_71820014_71820287_71820338_71820413_71820493_71820602_71820773_71821493_71821522_71821775_71821948_71822170
tx.18246	chr8	+	773	6	NNC	ENSMUSG00000002395.15	novel	1000	8	NA	NA	-66	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	341.95344712402	547	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACATGTCTTCAGTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71820218	71822375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_71820338_71820413_71820493_71820602_71820773_71821493_71821522_71821775_71821948_71822170
tx.18247	chr8	+	703	4	FSM	ENSMUSG00000002396.9	ENSMUST00000002469.9	1611	4	377	531	370	203	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_2	9.2736184954957	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTGTGCAGCTACCTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71824359	71825802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71824630_71825111_71825278_71825392_71825447_71825589
tx.18248	chr8	+	532	3	FSM	ENSMUSG00000002396.9	ENSMUST00000110051.2	2179	3	423	1224	375	203	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	15.5	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTGTGCAGCTACCTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71824364	71825802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71824630_71825392_71825447_71825589
tx.18249	chr8	-	665	3	NIC	ENSMUSG00000034911.9	novel	2438	13	NA	NA	1868	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCCTTTGTCCCTGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71840110	71838012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_71838438_71838559_71838683_71839993
tx.1825	chr10	+	689	6	NIC	ENSMUSG00000087651.4	novel	1194	6	NA	NA	-28	132	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_4	34.6098251945889	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGCCTCTTGTCTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83558761	83598159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_83558899_83573772_83573798_83593308_83593345_83593997_83594078_83595461_83595495_83597781
tx.18250	chr8	-	1562	8	NNC	ENSMUSG00000034911.9	novel	2438	13	NA	NA	-937	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3.14934395500694	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCTTTGTCCCTGGCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71843867	71838010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_71838438_71838559_71838683_71838830_71838917_71839993_71840222_71841399_71841650_71842664_71842830_71843284_71843426_71843725
tx.18251	chr8	-	460	2	Intergenic	novelGene_320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAAGTGTGTGGGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71858607	71857991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_71858364_71858519
tx.18252	chr8	-	1524	4	ISM	ENSMUSG00000007950.10	ENSMUST00000008094.10	1978	5	1947	0	1914	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_3	4.96655480858378	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCCTCCAATTTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71914352	71909348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_71910022_71910681_71910899_71911021_71911193_71913889
tx.18253	chr8	-	1977	5	FSM	ENSMUSG00000007950.10	ENSMUST00000008094.10	1978	5	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_3	6.41774882649672	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCCTCCAATTTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71916298	71909348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71910022_71910681_71910899_71911021_71911193_71913889_71914617_71916109
tx.18254	chr8	-	608	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034880.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCCTTGACAATGCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71918391	71917589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_71917698_71917891
tx.18255	chr8	+	620	2	FSM	ENSMUSG00000034880.8	ENSMUST00000048914.8	607	2	-13	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	904	junction_1	0	3443	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTACGTATGTATTAACT	8907	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71917589	71918391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71917712_71917893
tx.18256	chr8	+	924	5	FSM	ENSMUSG00000074247.11	ENSMUST00000124745.8	1933	5	3	1006	3	118	multi-exon	FALSE	canonical	2	515	junction_4	131.476946648452	1085	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGGCGTCTTTGCTCCGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71921845	71927736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71921970_71924680_71924762_71924838_71924891_71926418_71926481_71927131
tx.18257	chr8	+	2054	9	FSM	ENSMUSG00000007610.16	ENSMUST00000007754.13	2800	9	622	124	-3	-124	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	23.9892554073694	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTGTGTAGTAGCATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71941368	71945920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71941485_71941714_71941963_71942071_71942159_71942978_71943182_71943538_71943612_71943709_71943854_71944068_71944235_71944720_71945000_71945182
tx.18258	chr8	-	905	4	ISM	ENSMUSG00000034845.7	ENSMUST00000048452.6	1987	6	4028	0	4028	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_3	3.77123616632825	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGGTTTGTATTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71960368	71950408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_71951050_71959480_71959563_71959663_71959722_71960244
tx.18259	chr8	-	966	4	NNC	ENSMUSG00000034845.7	novel	1987	6	NA	NA	4038	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	7.07106781186548	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGGTTTGTATTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71960358	71950408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_71951050_71959480_71959563_71959663_71959722_71960173
tx.1826	chr10	+	679	5	NNC	ENSMUSG00000087651.4	novel	1194	6	NA	NA	-26	130	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	48.7570507721704	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATTGCCTCTTGTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83558763	83598157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_83558918_83593308_83593345_83593997_83594078_83595461_83595495_83597781
tx.18260	chr8	+	333	3	NNC	ENSMUSG00000007610.16	novel	2052	11	NA	NA	9492	42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCTTCTAGGTCGACAGA	502	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71951594	71952269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_71951635_71951849_71951909_71952035
tx.18261	chr8	+	487	2	NNC	ENSMUSG00000007610.16	novel	2052	11	NA	NA	9553	42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCTTCTAGGTCGACAGA	563	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71951655	71952269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_71951909_71952035
tx.18262	chr8	-	795	5	FSM	ENSMUSG00000046718.9	ENSMUST00000051672.9	792	5	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	305	junction_3	21.2176223927187	2250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTTGCTTCTAAGTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71990103	71986898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_71987125_71987315_71987437_71988429_71988470_71989002_71989079_71989771
tx.18263	chr8	+	1070	9	FSM	ENSMUSG00000031813.9	ENSMUST00000034272.9	1062	9	-8	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	346	junction_1	32.3177582762171	2029	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGGAGTGTATTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71995565	72000670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71995702_71995776_71995876_71996030_71996128_71997867_71997995_71998190_71998311_71998393_71998501_71999616_71999679_72000221_72000279_72000405
tx.18264	chr8	+	1588	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034829.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCCTCTCCGTGGGTGTGA	3268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72011814	72015881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_72011962_72014440
tx.18265	chr8	+	893	5	FSM	ENSMUSG00000031807.11	ENSMUST00000034264.11	893	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	546	junction_2	58.7132864009502	1122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATTGTTTCTGTGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72044819	72048913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72045149_72046727_72046836_72047312_72047415_72047704_72047846_72048700
tx.18266	chr8	+	308	2	ISM	ENSMUSG00000031807.11	ENSMUST00000143441.2	1062	5	2816	0	2816	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	560	junction_1	0	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATTGTTTCTGTGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72047750	72048913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72047846_72048700
tx.18267	chr8	+	1766	8	NNC	ENSMUSG00000043243.16	novel	696	4	NA	NA	633	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_1	4.56696210375594	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTTACTTTGTATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72055627	72060580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_72056191_72056280_72056472_72056564_72056724_72057381_72057499_72057571_72057680_72058250_72058363_72059304_72059389_72060148
tx.18268	chr8	+	2145	3	ISM	ENSMUSG00000034807.10	ENSMUST00000212706.2	2860	4	1629	-5	1629	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	971	junction_2	17.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTTGGGTTTGGTGCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72074955	72077555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72075475_72075733_72075941_72076136
tx.18269	chr8	-	954	8	FSM	ENSMUSG00000034799.17	ENSMUST00000176777.8	944	8	2	-12	2	12	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	16.3682120998886	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAAGTTGTTGGCTTCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72124383	72112972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_72113294_72114462_72114496_72115124_72115180_72115483_72115573_72115806_72115931_72116802_72116921_72118622_72118723_72124269
tx.1827	chr10	+	676	5	NNC	ENSMUSG00000087651.4	novel	1194	6	NA	NA	-16	132	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	44.1418169086865	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGCCTCTTGTCTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83558773	83598159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_83558918_83593308_83593345_83593997_83594078_83595456_83595495_83597781
tx.18270	chr8	-	926	8	NIC	ENSMUSG00000034799.17	novel	944	8	NA	NA	0	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	45	junction_6	3.4166459266004	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTGTGTTATATATAACAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72124385	72112987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_72113294_72114462_72114496_72115124_72115180_72115498_72115573_72115806_72115931_72116802_72116921_72118622_72118723_72124269
tx.18271	chr8	-	419	2	ISM	ENSMUSG00000034799.17	ENSMUST00000175780.2	2569	7	6166	-17	-3421	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAAGTTGTTGGCTTCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72114560	72112972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_72113294_72114462
tx.18272	chr8	+	1529	6	ISM	ENSMUSG00000031805.18	ENSMUST00000110013.10	4009	24	178	8154	-78	96	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_4	16.5939748101532	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCAGCTACTGCCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72129117	72133046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72129228_72130972_72131166_72131320_72131445_72131621_72131734_72131845_72131992_72132202
tx.18273	chr8	+	1047	4	ISM	ENSMUSG00000031805.18	ENSMUST00000130624.2	4049	22	8231	-353	8231	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_3	65.8229949688304	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTTTCCCCCCTGGGAA	562	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72139209	72143221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72139617_72139882_72139994_72140683_72140807_72142815
tx.18274	chr8	+	500	3	NNC	ENSMUSG00000031805.18	novel	4009	24	NA	NA	8403	-245	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	142	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCGCGGTTGTCAGCACCTC	734	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72139381	72140955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_72139499_72139882_72139994_72140683
tx.18275	chr8	+	538	2	ISM	ENSMUSG00000031805.18	ENSMUST00000130624.2	4049	22	9694	-351	9694	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTTTTTTTCCCCCCTGGG	2025	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72140672	72143219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72140807_72142815
tx.18276	chr8	-	2515	2	ISM	ENSMUSG00000031803.9	ENSMUST00000034260.9	3055	3	7902	456	7902	-456	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	159	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCCCGGTAATATTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72146531	72143855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_72145800_72145960
tx.18277	chr8	-	2654	3	FSM	ENSMUSG00000031803.9	ENSMUST00000034260.9	3055	3	-55	456	-55	-456	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_2	27	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCCCGGTAATATTTCTGT	8466	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72154488	72143855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_72145800_72145960_72146544_72154361
tx.18278	chr8	-	718	4	ISM	ENSMUSG00000070000.14	ENSMUST00000093444.13	3073	26	11427	254	1226	12	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	139	junction_2	29.0172362570938	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGAATCCTCTTTCCGGTTC	430	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72162524	72161284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_72161476_72161569_72161735_72161973_72162030_72162218
tx.18279	chr8	+	460	6	Intergenic	novelGene_322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.77359245282264	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTGTCTGGATATATCA	5045	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72194683	72277355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_72194752_72196787_72196847_72250741_72250776_72276279_72276397_72277067_72277118_72277223
tx.1828	chr10	+	682	6	FSM	ENSMUSG00000087651.4	ENSMUST00000150459.3	1194	6	45	467	-16	132	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_4	8.16333265278342	426	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGCCTCTTGTCTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83558773	83598159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_83558899_83573772_83573798_83593308_83593345_83593997_83594078_83595456_83595495_83597781
tx.18280	chr8	+	727	3	FSM	ENSMUSG00000056019.13	ENSMUST00000188374.7	717	3	-152	142	-90	-142	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	1	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGCTTTGAGTATGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72635772	72641764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72636053_72641107_72641235_72641444
tx.18281	chr8	+	2933	4	FSM	ENSMUSG00000066880.16	ENSMUST00000119003.2	2920	4	-12	-1	-12	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_3	7.78888096369861	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTAGTGTTCTATTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72676683	72688474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72676817_72682045_72682173_72682981_72683043_72685862
tx.18282	chr8	+	2538	2	FSM	ENSMUSG00000052446.18	ENSMUST00000144807.2	701	2	-25	-1812	-11	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCCAGTTTGTAGAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72704898	72724174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72705005_72721742
tx.18283	chr8	+	356	3	ISM	ENSMUSG00000052446.18	ENSMUST00000109997.10	2713	4	6	4089	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	359	junction_2	51	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTTTTGTTTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72704920	72720088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72705005_72719637_72719765_72719943
tx.18284	chr8	+	2707	4	FSM	ENSMUSG00000052446.18	ENSMUST00000109997.10	2713	4	6	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	347	junction_3	51.1468474101777	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTTTGTAGAGACTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72704920	72724177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72705005_72719637_72719765_72719943_72720005_72721742
tx.18285	chr8	+	2658	3	FSM	ENSMUSG00000052446.18	ENSMUST00000136516.9	601	3	-2	-2055	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_2	182.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTTTGTAGAGACTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72704908	72724177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72705005_72719637_72719765_72721742
tx.18286	chr8	+	2777	4	FSM	ENSMUSG00000052446.18	ENSMUST00000145256.8	504	4	7	-2280	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_2	168.256418071413	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTTTGTAGAGACTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72704920	72724177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72705005_72719637_72719835_72719943_72720005_72721742
tx.18287	chr8	-	483	3	NNC	ENSMUSG00000003484.5	novel	1702	13	NA	NA	3529	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAGCCTCACCAAACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72743230	72742325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_72742582_72742903_72742987_72743086
tx.18288	chr8	-	639	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031799.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	5.31245915016974	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTCTTGGCTTCATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72889589	72872238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_72872370_72872694_72872839_72878142_72878379_72889461
tx.18289	chr8	-	424	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031799.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	5	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTCTTGGCTTCATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72889610	72872238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_72872370_72872694_72872839_72889461
tx.1829	chr10	-	855	4	NNC	ENSMUSG00000097076.2	novel	1334	4	NA	NA	-1014	1077	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	13.4246870437348	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGCGTTTTTGACTGTGTG	8445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84390216	84382203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_84382384_84383922_84384062_84385079_84385495_84390095
tx.18290	chr8	+	2126	8	FSM	ENSMUSG00000031799.11	ENSMUST00000003575.11	2158	8	30	2	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	688	junction_1	35.3714978074559	341	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTGGATTTATTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72889102	72906984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72889298_72892431_72892566_72897293_72897412_72898521_72898593_72900295_72900372_72900900_72900964_72901041_72901112_72905585
tx.18291	chr8	+	2019	8	FSM	ENSMUSG00000031799.11	ENSMUST00000238492.2	2044	8	25	0	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_1	228.433708510092	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTGGATTTATTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72889676	72906984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72889765_72892431_72892566_72897293_72897412_72898521_72898593_72900295_72900372_72900900_72900964_72901041_72901112_72905585
tx.18292	chr8	+	1643	5	ISM	ENSMUSG00000031799.11	ENSMUST00000238492.2	2044	8	8906	0	8906	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	704	junction_1	29.3033701133504	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTGGATTTATTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72898557	72906984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72898593_72900295_72900372_72900900_72900964_72901041_72901112_72905585
tx.18293	chr8	+	1608	4	ISM	ENSMUSG00000031799.11	ENSMUST00000238492.2	2044	8	10644	0	10644	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	724	junction_1	24.3447461820136	405	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTGGATTTATTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72900295	72906984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72900372_72900900_72900964_72901041_72901112_72905585
tx.18294	chr8	+	1784	8	FSM	ENSMUSG00000003037.17	ENSMUST00000003121.9	4550	8	140	2626	-19	-2626	multi-exon	FALSE	canonical	3	900	junction_6	72.9808473617062	966	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCACCTGCCCTCCCCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72915183	72935122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72915327_72922270_72922332_72925083_72925145_72928369_72928448_72929683_72929774_72930166_72930233_72931463_72931515_72933888
tx.18295	chr8	+	1351	3	ISM	ENSMUSG00000003037.17	ENSMUST00000003121.9	4550	8	15121	2628	14962	-2628	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	900	junction_1	18.5	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTCACCTGCCCTCCCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72930164	72935120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72930233_72931463_72931515_72933888
tx.18296	chr8	+	1781	6	NNC	ENSMUSG00000062007.14	novel	1824	6	NA	NA	5	-106	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	3.38230690505755	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTCCAGGTGTTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72943486	72955265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_72943532_72947282_72947498_72950639_72950730_72951582_72951749_72952211_72952332_72954120
tx.18297	chr8	+	1866	6	FSM	ENSMUSG00000062007.14	ENSMUST00000072097.14	1824	6	-39	-3	-39	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	2.28035085019828	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGCATCATTTGCGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72943442	72955374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72943532_72947282_72947430_72950639_72950730_72951582_72951749_72952211_72952332_72954120
tx.18298	chr8	-	616	3	ISM	ENSMUSG00000074240.6	ENSMUST00000098630.5	585	5	5368	-42	5368	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_2	0.5	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGGATCTCTGCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72961295	72958179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_72958275_72959406_72959603_72960970
tx.18299	chr8	+	1159	4	FSM	ENSMUSG00000003039.10	ENSMUST00000003123.10	2564	4	15	1390	15	-402	multi-exon	FALSE	canonical	3	920	junction_3	34.4705993887867	2705	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAATGTTGTCTGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72973588	72976872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72973705_72973784_72973927_72975771_72975826_72976025
tx.183	chr1	+	1385	11	FSM	ENSMUSG00000060679.15	ENSMUST00000057208.13	1418	11	34	-1	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	624	junction_3	42.3685024517034	2118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCCCTTTTTTTTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42890426	42944843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_42890587_42901628_42901809_42918914_42918978_42919055_42919087_42926866_42926947_42934509_42934578_42935252_42935329_42937599_42937769_42938600_42938710_42942454_42942625_42944564
tx.1830	chr10	-	1321	3	NNC	ENSMUSG00000097076.2	novel	1334	4	NA	NA	-1014	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.5	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAGTCAAGCATCTGTAG	8445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84390216	84383276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_84384062_84385079_84385495_84390095
tx.18300	chr8	+	2026	12	FSM	ENSMUSG00000003033.16	ENSMUST00000003117.15	2084	12	58	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	513	junction_9	40.3802177244139	358	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGTCTTCTCTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72993919	73011229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72994088_73000482_73000640_73002956_73003025_73003592_73003724_73004524_73004673_73005586_73005714_73006678_73006822_73007052_73007125_73007318_73007478_73009540_73009667_73009950_73010027_73010578
tx.18301	chr8	+	205	2	ISM	ENSMUSG00000055148.8	ENSMUST00000067912.8	1847	3	29	2114	29	-2114	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	2987	junction_1	0	210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCCGCAGCCCCCGCCGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73072905	73073386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_73072994_73073269
tx.18302	chr8	+	696	2	NIC	ENSMUSG00000055148.8	novel	1847	3	NA	NA	29	-305	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	215	junction_1	0	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACGGTAGTGGTGTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73072905	73075195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_73072994_73074587
tx.18303	chr8	-	886	9	ISM	ENSMUSG00000006276.11	ENSMUST00000212590.2	3376	16	-18	9379	-13	-9379	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	316	junction_1	27.8702350187436	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTAAAACCTTACTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73175317	73140640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_73140933_73143251_73143312_73145733_73145860_73150077_73150141_73150745_73150842_73152849_73152898_73153520_73153611_73154035_73154078_73175248
tx.18304	chr8	+	412	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000019732.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATTTGCAAGCAGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73175510	73181739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_73175625_73181441
tx.18305	chr8	-	1663	9	FSM	ENSMUSG00000019732.15	ENSMUST00000019876.12	1769	9	118	-12	118	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	4.64858849544676	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTTTTACTTTTAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73197596	73178007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_73178600_73179610_73179704_73181005_73181138_73181913_73182010_73185216_73185406_73188633_73188729_73192275_73192480_73197238_73197341_73197436
tx.18306	chr8	+	1518	3	ISM	ENSMUSG00000052794.14	ENSMUST00000121902.2	2373	8	-28	10481	24	-8491	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_1	1.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGTCTGAAAGGTGATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73197747	73204004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_73197834_73198593_73199315_73203293
tx.18307	chr8	+	2412	8	FSM	ENSMUSG00000052794.14	ENSMUST00000064853.13	2887	8	15	460	15	-100	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	11.7334338276463	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTGTGTCTGCTTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73197738	73214385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_73197834_73198593_73199315_73203293_73203586_73205202_73205277_73208957_73209412_73211816_73211913_73212446_73212614_73213872
tx.18308	chr8	+	2312	7	ISM	ENSMUSG00000052794.14	ENSMUST00000064853.13	2887	8	875	460	823	-100	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_3	11.6285090283416	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTGTGTCTGCTTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73198598	73214385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_73199315_73203293_73203586_73205202_73205277_73208957_73209412_73211816_73211913_73212446_73212614_73213872
tx.18309	chr8	+	857	4	ISM	ENSMUSG00000052794.14	ENSMUST00000121902.2	2373	8	11555	100	-2403	-100	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_3	11.9536140513607	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTGTGTCTGCTTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73209330	73214385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_73209412_73211816_73211913_73212446_73212614_73213872
tx.1831	chr10	-	2336	2	NNC	ENSMUSG00000097076.2	novel	1334	4	NA	NA	-1014	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTAAGTCAAGCATCTG	8445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84390216	84383279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_84385495_84390095
tx.18310	chr8	-	969	2	ISM	ENSMUSG00000052488.8	ENSMUST00000079510.6	3713	18	13588	-6	6800	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	623	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTCTAGCTGTGGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73215375	73214326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_73215200_73215279
tx.18311	chr8	-	476	3	NNC	ENSMUSG00000052488.8	novel	3713	18	NA	NA	3	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	314.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTCTAGCTGTGGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73228976	73214326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_73214554_73228455_73228630_73228901
tx.18312	chr8	-	1853	2	FSM	ENSMUSG00000052488.8	ENSMUST00000212586.2	912	2	26	-967	0	967	multi-exon	FALSE	canonical	3	629	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACATACCTGGAAATGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73228979	73226854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_73228630_73228901
tx.18313	chr8	+	2102	2	FSM	ENSMUSG00000097000.3	ENSMUST00000181452.2	2994	2	-11	903	-11	-903	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACAGCCCATCCTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73246766	73258440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_73246895_73256466
tx.18314	chr8	-	1109	5	FSM	ENSMUSG00000044600.15	ENSMUST00000167290.8	2892	5	26	1757	0	542	multi-exon	FALSE	canonical	3	388	junction_4	37.7582772382427	648	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTTATTGTTGCTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73324906	73320788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_73321653_73322699_73322791_73323809_73323863_73324717_73324760_73324847
tx.18315	chr8	+	2159	6	FSM	ENSMUSG00000031791.9	ENSMUST00000034244.9	2124	6	-37	2	-19	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_3	8.51821577561874	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGCTCTTTTTCTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73325879	73341124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_73326072_73333406_73333564_73333803_73333989_73335028_73335117_73338543_73338662_73339705
tx.18316	chr8	+	1967	5	FSM	ENSMUSG00000031791.9	ENSMUST00000211914.2	820	5	-48	-1099	-12	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	20.2484567313166	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGCTCTTTTTCTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73325886	73341124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_73326072_73333406_73333564_73335028_73335117_73338543_73338662_73339705
tx.18317	chr8	+	1223	3	ISM	ENSMUSG00000031791.9	ENSMUST00000212763.2	882	5	-4	5327	-4	-5327	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_2	5.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTAGTTGACTAGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73325894	73334692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_73326072_73333406_73333564_73333803
tx.18318	chr8	+	416	2	NNC	ENSMUSG00000031791.9	novel	882	5	NA	NA	-1	-11404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATTTGCTTATTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73325897	73328615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_73326072_73328373
tx.18319	chr8	+	177	2	Intergenic	novelGene_323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTGGCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73410546	73410914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_73410692_73410882
tx.1832	chr10	+	803	4	ISM	ENSMUSG00000034453.9	ENSMUST00000213263.2	1387	12	84	27014	84	-23619	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_1	14.8548533034381	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTGGTCAAAGTGTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84458240	84465041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_84458403_84464113_84464147_84464346_84464404_84464490
tx.18320	chr8	+	1022	7	FSM	ENSMUSG00000031622.17	ENSMUST00000109950.5	1024	7	3	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	644	junction_5	27.2197844713485	2495	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTTATGTGCAGCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73449915	73466535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_73450037_73450671_73450779_73452164_73452319_73457708_73457907_73459972_73460117_73465996_73466117_73466357
tx.18321	chr8	+	287	2	ISM	ENSMUSG00000031622.17	ENSMUST00000109950.5	1024	7	16095	-1	-1471	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	664	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTTATGTGCAGCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73466007	73466535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_73466117_73466357
tx.18322	chr8	+	1305	5	NIC	ENSMUSG00000034518.15	novel	3989	12	NA	NA	-1	231	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	38	junction_1	24.8432586429397	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAGGGAAGACAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75720305	75728167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_75720378_75726187_75726337_75726440_75726520_75726626_75726742_75727277
tx.18323	chr8	+	2226	5	ISM	ENSMUSG00000034518.15	ENSMUST00000041759.14	4191	11	318	29505	-5	1159	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_4	27.9419040152957	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGTATAAACTCAGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75720301	75729095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_75720378_75725462_75725567_75726187_75726337_75726440_75726520_75727277
tx.18324	chr8	+	1417	6	ISM	ENSMUSG00000034518.15	ENSMUST00000145919.2	3989	12	-2	30432	-2	238	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_2	17.0926884953772	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGGAAGACAAAGACAGAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75720304	75728174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_75720378_75725462_75725567_75726187_75726337_75726440_75726520_75726626_75726742_75727277
tx.18325	chr8	+	1403	7	FSM	ENSMUSG00000034518.15	ENSMUST00000109940.2	2656	7	32	1221	32	-1221	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	40.0489284084689	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGGTGCCACCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75742881	75757320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_75743035_75746871_75746954_75748430_75748496_75749826_75749933_75750625_75750796_75756115_75756239_75756616
tx.18326	chr8	+	2531	6	ISM	ENSMUSG00000034518.15	ENSMUST00000109940.2	2656	7	4020	-58	-2613	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_2	14.5272158378679	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTATAGTCCAGTCTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75746869	75758599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_75746954_75748430_75748496_75749826_75749933_75750625_75750796_75756115_75756239_75756616
tx.18327	chr8	+	829	2	ISM	ENSMUSG00000034518.15	ENSMUST00000109940.2	2656	7	13264	1221	6631	-1221	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	135	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGGTGCCACCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75756113	75757320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_75756239_75756616
tx.18328	chr8	+	1189	3	ISM	ENSMUSG00000042870.16	ENSMUST00000212299.2	469	5	-33	1059	-7	-873	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	248	junction_1	43	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAACAGTAGCAAAATTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75760325	75777791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_75760456_75774620_75774706_75776817
tx.18329	chr8	+	2267	15	FSM	ENSMUSG00000042870.16	ENSMUST00000165630.3	2267	15	-6	6	-6	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_1	29.4884965464743	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCATGATCTGCTCTGGCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75760326	75796743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_75760456_75774620_75774706_75776817_75776897_75778135_75778286_75778550_75778686_75778777_75778925_75781204_75781322_75783782_75783917_75785068_75785103_75785440_75785535_75787060_75787182_75791021_75791098_75794149_75794210_75795723_75795764_75795877
tx.1833	chr10	+	3226	9	FSM	ENSMUSG00000035620.16	ENSMUST00000095385.5	2909	9	-319	2	-279	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_2	11.5325625946708	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCCATCTGTGTGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84753200	84852309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_84753690_84761409_84761458_84783275_84783885_84793879_84793975_84805726_84805956_84806592_84806689_84815911_84816057_84827983_84828129_84850939
tx.18330	chr8	+	1570	5	FSM	ENSMUSG00000005413.9	ENSMUST00000005548.8	1569	5	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	104.358456772798	348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGAAGTGCATTCATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75820248	75827218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_75820401_75822483_75822605_75823477_75823970_75825393_75825494_75826513
tx.18331	chr8	+	2618	17	FSM	ENSMUSG00000005410.7	ENSMUST00000212426.2	2604	17	-10	-4	-3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	635	junction_1	269.284113147712	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGTGTGAATACAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75836193	75854325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_75836226_75836327_75836503_75836717_75836845_75836927_75837057_75839171_75839345_75840792_75840949_75842479_75842647_75844149_75844322_75845884_75845997_75847407_75847552_75847839_75847906_75848165_75848343_75849619_75849733_75850468_75850598_75851428_75851572_75852864_75852993_75853850
tx.18332	chr8	+	2640	17	FSM	ENSMUSG00000005410.7	ENSMUST00000164309.3	3381	17	-1	742	-1	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	795	junction_1	234.54782794507	259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGTGTGAATACAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75836195	75854325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_75836250_75836327_75836503_75836717_75836845_75836927_75837057_75839171_75839345_75840792_75840949_75842479_75842647_75844149_75844322_75845884_75845997_75847407_75847552_75847839_75847906_75848165_75848343_75849619_75849733_75850468_75850598_75851428_75851572_75852864_75852993_75853850
tx.18333	chr8	+	2682	16	FSM	ENSMUSG00000005410.7	ENSMUST00000212811.2	2653	16	-20	-9	-20	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1402	junction_7	114.72564374774	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGTGTGAATACAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75836231	75854325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_75836503_75836717_75836845_75836927_75837057_75839171_75839345_75840792_75840949_75842479_75842647_75844149_75844322_75845884_75845997_75847407_75847552_75847839_75847906_75848165_75848343_75849619_75849733_75850468_75850598_75851428_75851572_75852864_75852993_75853850
tx.18334	chr8	+	1463	9	ISM	ENSMUSG00000005410.7	ENSMUST00000212811.2	2653	16	9657	-9	-1619	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1485	junction_3	110.722626413936	326	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGTGTGAATACAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75845908	75854325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_75845997_75847407_75847552_75847839_75847906_75848165_75848343_75849619_75849733_75850468_75850598_75851428_75851572_75852864_75852993_75853850
tx.18335	chr8	+	942	5	ISM	ENSMUSG00000005410.7	ENSMUST00000212811.2	2653	16	13414	-9	-29	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1697	junction_2	23.1016774282735	545	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGTGTGAATACAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75849665	75854325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_75849733_75850468_75850598_75851428_75851572_75852864_75852993_75853850
tx.18336	chr8	+	324	3	Intergenic	novelGene_324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78265247	78267872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_78265360_78265850_78265948_78267757
tx.18337	chr8	+	1231	4	ISM	ENSMUSG00000037134.18	ENSMUST00000210040.2	2688	12	22623	0	8415	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_1	6.84754619472471	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAGTGTATGTAACATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78298705	78307966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_78299356_78303966_78304121_78307254_78307378_78307662
tx.18338	chr8	-	2664	10	FSM	ENSMUSG00000031617.17	ENSMUST00000034030.15	2678	10	18	-4	18	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_5	10.9927024053615	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTACGTGTCTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78337264	78322606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_78323810_78324437_78324610_78325182_78325283_78326285_78326399_78328043_78328138_78329486_78329562_78331250_78331457_78332792_78332830_78332915_78333047_78336731
tx.18339	chr8	-	125	2	Intergenic	novelGene_325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGTTAGTGGAGGCTGGAG	9328	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78427316	78427146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_78427204_78427248
tx.1834	chr10	-	1977	2	FSM	ENSMUSG00000050035.8	ENSMUST00000059383.8	3402	2	-13	1438	-13	256	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATAATTCTCAGCTGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84938372	84933588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_84935353_84938159
tx.18340	chr8	+	293	3	Intergenic	novelGene_326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_2	7	195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTGATTCTAGAGCACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78792935	78800227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_78793056_78799076_78799137_78800114
tx.18341	chr8	-	436	2	Intergenic	novelGene_327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTTAGCTCCGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78868380	78866491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_78866711_78868163
tx.18342	chr8	+	1207	3	FSM	ENSMUSG00000037101.17	ENSMUST00000124713.2	673	3	18	-552	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGGTTATTTTCATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79117628	79120955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_79118107_79119699_79119767_79120293
tx.18343	chr8	-	1692	2	FSM	ENSMUSG00000037070.11	ENSMUST00000049245.10	1695	2	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_1	0	416	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTGTCTTGATTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79235524	79231897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_79233493_79235427
tx.18344	chr8	-	1637	2	NNC	ENSMUSG00000037070.11	novel	1695	2	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	23	junction_1	0	78	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTGTCTTGATTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79235524	79231897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_79233438_79235427
tx.18345	chr8	-	1650	2	FSM	ENSMUSG00000037070.11	ENSMUST00000211719.2	1622	2	-20	-8	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	608	junction_1	0	725	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTGTCTTGATTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79235528	79231897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_79233447_79235427
tx.18346	chr8	+	1038	6	NNC	ENSMUSG00000031684.12	novel	3485	10	NA	NA	-20	-43829	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_5	52.3159631470166	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGGCTCTCTTTCTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79235954	79330891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_79236304_79242214_79242298_79251790_79251928_79257711_79257788_79305347_79305387_79330537
tx.18347	chr8	+	1630	12	FSM	ENSMUSG00000031684.12	ENSMUST00000034111.10	3595	12	2	1963	2	402	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_5	15.4524062690615	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCGCACACTTTGATTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79235998	79458669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_79236304_79242214_79242298_79251790_79251928_79257711_79257788_79305347_79305387_79389615_79389652_79413213_79413298_79423794_79423961_79425148_79425201_79433503_79433578_79456246_79456393_79458237
tx.18348	chr8	-	321	2	FSM	ENSMUSG00000031683.17	ENSMUST00000126174.2	473	2	155	-3	155	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1217	junction_1	0	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGTCTCAGTCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79536684	79534662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_79534875_79536575
tx.18349	chr8	-	532	4	ISM	ENSMUSG00000031683.17	ENSMUST00000130325.8	3792	5	1053	3169	1053	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	766	junction_3	195.196197595024	316	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGTCTCAGTCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79546716	79534662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_79534875_79536575_79536690_79539604_79539710_79546615
tx.1835	chr10	+	3469	3	FSM	ENSMUSG00000060935.7	ENSMUST00000095383.6	3616	3	148	-1	32	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_1	7	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGAATGTTTCATAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84938638	84953450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_84938862_84946662_84946730_84950271
tx.18350	chr8	-	597	5	FSM	ENSMUSG00000031683.17	ENSMUST00000130325.8	3792	5	26	3169	26	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	636	junction_4	242.43865203387	2742	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGTCTCAGTCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79547743	79534662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_79534875_79536575_79536690_79539604_79539710_79546615_79546715_79547676
tx.18351	chr8	-	501	4	FSM	ENSMUSG00000031683.17	ENSMUST00000051867.7	2107	4	23	1583	23	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	383	junction_3	374.138417641861	1994	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATGTCTCAGTCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79547746	79534662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_79534875_79536575_79536690_79539604_79539710_79547676
tx.18352	chr8	-	369	2	ISM	ENSMUSG00000037022.4	ENSMUST00000210231.2	1685	8	25488	-1	25488	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_1	0	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTAGAGTTTCCCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79995821	79994535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_79994845_79995761
tx.18353	chr8	-	1360	7	FSM	ENSMUSG00000037022.4	ENSMUST00000048718.4	5650	7	-19	4309	-19	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_6	17.5214154679352	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTAGAGTTTCCCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80021585	79994535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_79994845_79995761_79995912_79997518_79997605_80000732_80000904_80004830_80004954_80007805_80008284_80021542
tx.18354	chr8	-	770	5	NIC	ENSMUSG00000037022.4	novel	5650	7	NA	NA	-30	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_4	28.7782469931718	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTAGAGTTTCCCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80021596	79994535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_79994845_79995761_79995912_79997518_79997605_80000732_80000904_80021542
tx.18355	chr8	+	699	3	FSM	ENSMUSG00000097174.3	ENSMUST00000181030.3	3784	3	-86	3171	-86	-5	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	0.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAATTGTCCCAGGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80021665	80032419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_80022137_80023240_80023281_80032231
tx.18356	chr8	+	516	2	NNC	ENSMUSG00000097174.3	novel	333	2	NA	NA	60	23469	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTCTACTTCTTTCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80021811	80059059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_80022137_80058868
tx.18357	chr8	-	3548	18	FSM	ENSMUSG00000058355.9	ENSMUST00000080536.8	3793	18	63	182	-7	-182	multi-exon	FALSE	canonical	3	1167	junction_10	93.0334984503433	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGCTTACCGGTGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80438306	80410272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_80411907_80412573_80412686_80414069_80414193_80414292_80414436_80414523_80414635_80415753_80415813_80415936_80415997_80416865_80417088_80420052_80420175_80425975_80426066_80427214_80427312_80427541_80427612_80427743_80427882_80428402_80428521_80429632_80429731_80433862_80433949_80435051_80435182_80438171
tx.18358	chr8	-	913	5	ISM	ENSMUSG00000058355.9	ENSMUST00000211509.2	3030	16	-15	15230	-15	6636	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1188	junction_1	118.083392143011	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATAGTTCTCTCAAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80438314	80428064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_80428521_80429632_80429731_80433862_80433949_80435051_80435182_80438171
tx.18359	chr8	+	829	5	NIC	ENSMUSG00000036977.9	novel	2801	5	NA	NA	-40	14	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	195	junction_1	137.767920794356	1232	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAATCTTTAAATTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80438408	80501985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_80438474_80439781_80439909_80446286_80446378_80455758_80455880_80501560
tx.1836	chr10	-	1519	3	FSM	ENSMUSG00000049038.4	ENSMUST00000214193.2	337	3	-13	-1169	-13	-8	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	23	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGGAACTATTATTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84963872	84955304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_84956679_84962231_84962330_84963825
tx.18360	chr8	+	911	5	FSM	ENSMUSG00000036977.9	ENSMUST00000048147.9	2801	5	-22	1912	-22	66	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_1	177.95698216142	579	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAAGATATATATACTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80438426	80502037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_80438474_80439733_80439909_80446286_80446378_80455758_80455880_80501560
tx.18361	chr8	+	884	5	FSM	ENSMUSG00000036977.9	ENSMUST00000210812.2	4591	5	-2	3709	-2	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	166.717388115337	568	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAAGTCAATCTTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80438477	80501979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_80438604_80439781_80439909_80446286_80446378_80455758_80455880_80501560
tx.18362	chr8	+	834	4	ISM	ENSMUSG00000036977.9	ENSMUST00000048147.9	2801	5	1282	1945	1251	33	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	499	junction_2	11.4697670227235	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTATATTAAAAGAAAACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80439730	80502004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_80439909_80446286_80446378_80455758_80455880_80501560
tx.18363	chr8	-	1380	4	ISM	ENSMUSG00000064325.5	ENSMUST00000079038.4	9074	13	466	77569	466	-77569	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_2	1.24721912892465	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATGTCCTGTTCACGTCA	4772	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80784169	80770050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_80770777_80771679_80771837_80778056_80778250_80783865
tx.18364	chr8	-	816	5	ISM	ENSMUSG00000031715.15	ENSMUST00000043359.9	6113	24	33969	2328	5333	-2328	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1419	junction_2	118.560902071467	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTCATTTGATTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81432157	81427463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_81427758_81428756_81428865_81431233_81431447_81431847_81431967_81432075
tx.18365	chr8	-	737	4	ISM	ENSMUSG00000031715.15	ENSMUST00000043359.9	6113	24	34157	2328	5521	-2328	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1419	junction_2	79.9013280379132	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTCATTTGATTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81431969	81427463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_81427758_81428756_81428865_81431233_81431447_81431847
tx.18366	chr8	-	3963	10	NNC	ENSMUSG00000031714.10	novel	4870	10	NA	NA	21248	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	380	junction_6	37.5443770345651	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAGCTGTGTTACTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81585877	81491064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_81493117_81496279_81496403_81501178_81501303_81501562_81501657_81511255_81511560_81511729_81511816_81515118_81515724_81518017_81518244_81526729_81527025_81585823
tx.18367	chr8	-	1005	4	NNC	ENSMUSG00000031714.10	novel	4870	10	NA	NA	21249	2898	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	454	junction_3	12.9614813968157	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTCGGCCACCAAAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81585876	81515292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_81515724_81518017_81518244_81526729_81527025_81585823
tx.18368	chr8	-	575	3	NNC	ENSMUSG00000031714.10	novel	4870	10	NA	NA	21248	173	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	454	junction_2	15	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACATGGTACATGCTAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81585877	81518017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_81518244_81526729_81527025_81585823
tx.18369	chr8	-	1977	2	ISM	ENSMUSG00000038250.10	ENSMUST00000042724.8	4707	10	29762	0	29747	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCCTACTGTCCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81711795	81707361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_81708610_81711066
tx.1837	chr10	-	1547	3	FSM	ENSMUSG00000049038.4	ENSMUST00000050813.4	1567	3	12	8	12	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	4.5	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGGAACTATTATTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84963879	84955304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_84956679_84962231_84962351_84963825
tx.18370	chr8	-	4686	10	FSM	ENSMUSG00000038250.10	ENSMUST00000042724.8	4707	10	21	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_4	8.95392871906924	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCCTACTGTCCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81741536	81707361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_81708610_81711066_81712430_81714115_81714223_81716635_81716730_81719824_81720019_81722310_81722470_81727681_81727784_81731960_81732091_81738795_81738932_81740383
tx.18371	chr8	+	407	3	ISM	ENSMUSG00000037940.18	ENSMUST00000216387.2	585	6	39776	49253	-6186	5	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCATGTGGTGTTTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82610761	82629576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_82610874_82617339_82617413_82629354
tx.18372	chr8	-	2112	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037940.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTGGACTCCTAAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82624828	82622032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_82623965_82624648
tx.18373	chr8	-	1845	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000109893.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCATGCCTTCAATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83481681	83474899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_83476566_83481502
tx.18374	chr8	-	1641	9	NIC	ENSMUSG00000031711.8	novel	1675	10	NA	NA	0	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_7	168.735693838026	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTTTTGGTACTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83500774	83490248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_83491121_83491483_83491602_83492640_83492688_83493297_83493403_83493841_83493969_83495948_83496029_83497429_83497501_83499508_83499641_83500685
tx.18375	chr8	-	1665	10	FSM	ENSMUSG00000031711.8	ENSMUST00000034147.4	1675	10	11	-1	-4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	422	junction_3	43.069567612422	816	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTTTTGGTACTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83500778	83490248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_83491121_83491483_83491602_83492640_83492688_83493297_83493403_83493841_83493969_83495948_83496029_83497429_83497501_83497967_83497988_83499508_83499641_83500685
tx.18376	chr8	-	4305	9	FSM	ENSMUSG00000035151.13	ENSMUST00000053902.4	4319	9	9	5	9	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_4	7.29297607290741	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAAGCCTTTCTGTGGATG	8179	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84059106	84039655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84043091_84043429_84043564_84044359_84044429_84046042_84046177_84048061_84048192_84049295_84049394_84055740_84055770_84057739_84057888_84058978
tx.18377	chr8	-	346	4	ISM	ENSMUSG00000035151.13	ENSMUST00000053902.4	4319	9	39	9672	39	1528	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_3	4.32049379893857	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACATCTGCTCCGAGAAGG	8209	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84059076	84049322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84049394_84055740_84055770_84057739_84057888_84058978
tx.18378	chr8	+	677	5	ISM	ENSMUSG00000002190.14	ENSMUST00000109831.3	2293	15	-22	26737	-11	-26737	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_2	6.59545297913646	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTAAGACTTTCTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84116484	84126723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_84116730_84122071_84122222_84123630_84123708_84124277_84124337_84126577
tx.18379	chr8	-	1774	4	FSM	ENSMUSG00000063253.12	ENSMUST00000167525.3	1764	4	12	-22	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_2	125.913550590166	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTGTGTGTGTGTTTT	7429	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84169124	84161122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84162670_84164181_84164263_84164613_84164686_84169050
tx.1838	chr10	-	701	2	ISM	ENSMUSG00000020038.11	ENSMUST00000020227.11	3026	13	51921	0	11298	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	261	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCGTGTACTTGTGTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84969007	84967563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_84968172_84968914
tx.18380	chr8	-	1787	4	FSM	ENSMUSG00000063253.12	ENSMUST00000212031.2	409	4	0	-1378	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	281	junction_1	12.1928941054479	598	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTGTGTGTGTGTTTT	7419	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84169134	84161122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84162670_84164181_84164266_84164613_84164686_84169050
tx.18381	chr8	+	550	3	FSM	ENSMUSG00000033938.6	ENSMUST00000036996.6	623	3	73	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2087	junction_2	87.5	14727	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATCTGTGCTACTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84293372	84298255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_84293560_84297458_84297628_84298061
tx.18382	chr8	-	919	10	ISM	ENSMUSG00000031708.18	ENSMUST00000238997.2	1334	12	1387	-2	-202	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3555	junction_3	206.230962458461	516	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACTGTGTGTTCTTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84300084	84298326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84298565_84298641_84298688_84298860_84298950_84299026_84299085_84299177_84299222_84299309_84299383_84299469_84299576_84299656_84299773_84299848_84299953_84300039
tx.18383	chr8	-	1157	13	FSM	ENSMUSG00000031708.18	ENSMUST00000019382.17	1158	13	3	-2	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3555	junction_3	302.48290814891	7222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACTGTGTGTTCTTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84321103	84298326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84298565_84298641_84298688_84298860_84298950_84299026_84299085_84299177_84299222_84299309_84299383_84299469_84299576_84299656_84299773_84299848_84299953_84300039_84300085_84300499_84300552_84301106_84301158_84320968
tx.18384	chr8	-	1112	12	FSM	ENSMUSG00000031708.18	ENSMUST00000165740.9	1120	12	10	-2	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	487	junction_9	1051.54616581631	1978	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACTGTGTGTTCTTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84321103	84298326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84298565_84298641_84298688_84298860_84298950_84299026_84299085_84299177_84299222_84299309_84299383_84299469_84299576_84299656_84299773_84299848_84299953_84300499_84300552_84301106_84301158_84320968
tx.18385	chr8	+	1276	3	FSM	ENSMUSG00000005483.11	ENSMUST00000005620.10	2996	3	40	1680	40	-1680	multi-exon	FALSE	canonical	3	562	junction_2	45.5	1035	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGACTACAGTGGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84334861	84337602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_84335172_84336442_84337024_84337217
tx.18386	chr8	+	951	2	ISM	ENSMUSG00000005483.11	ENSMUST00000212300.2	2854	3	1273	1683	1273	-1683	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	562	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTAGACTACAGTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84336454	84337599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_84337024_84337217
tx.18387	chr8	+	1634	7	FSM	ENSMUSG00000019433.10	ENSMUST00000019577.10	1522	7	-17	-95	-17	95	multi-exon	FALSE	canonical	3	964	junction_1	101.245027312731	755	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCTGCTCTCCCTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84379288	84391418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_84379367_84387587_84387910_84388583_84388770_84388863_84389045_84389677_84389791_84390548_84390631_84390746
tx.18388	chr8	-	914	7	ISM	ENSMUSG00000057672.17	ENSMUST00000128523.8	3070	9	3249	-37	-538	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	265	junction_4	26.1114066177132	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCAGCCTCTGTGTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84398947	84396718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84396998_84397367_84397449_84397550_84397659_84397927_84398071_84398345_84398423_84398535_84398599_84398784
tx.18389	chr8	-	1633	14	ISM	ENSMUSG00000057672.17	ENSMUST00000144258.8	2995	22	12962	-1	491	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	231	junction_13	30.2514120165338	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCAGCCTCTGTGTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84407727	84396718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84396998_84397367_84397449_84397550_84397659_84397927_84398071_84398345_84398423_84398535_84398599_84398784_84398962_84399930_84400023_84400109_84400186_84400259_84400340_84404152_84404247_84404334_84404477_84404559_84404636_84407582
tx.1839	chr10	-	1391	7	ISM	ENSMUSG00000020038.11	ENSMUST00000020227.11	3026	13	38626	0	-1997	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	240	junction_6	13.29995822884	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCGTGTACTTGTGTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84982302	84967563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_84968172_84968914_84969023_84969105_84969178_84978879_84979033_84979502_84979706_84980017_84980170_84982207
tx.18390	chr8	-	608	4	ISM	ENSMUSG00000057672.17	ENSMUST00000128523.8	3070	9	4123	-31	336	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	278	junction_3	18.1169043222683	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCATTTTCAGCCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84398073	84396724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84396998_84397367_84397449_84397550_84397659_84397927
tx.18391	chr8	+	1529	11	FSM	ENSMUSG00000005481.19	ENSMUST00000019576.15	1656	11	56	71	-35	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2216	junction_5	95.6715736256073	3937	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATGGCTCCAGCCCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84441861	84449906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_84441967_84446015_84446228_84446440_84446569_84447177_84447271_84447585_84447770_84448362_84448482_84448858_84448991_84449077_84449188_84449277_84449423_84449515_84449664_84449753
tx.18392	chr8	-	1201	6	ISM	ENSMUSG00000002885.15	ENSMUST00000075843.13	3000	20	16169	2	-191	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	183	junction_3	19.2520128817742	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGCACGTTTGCTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84451629	84449992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84450532_84450607_84450707_84450820_84450990_84451066_84451159_84451246_84451317_84451397
tx.18393	chr8	-	787	4	Intergenic	novelGene_330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	0.471404520791032	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAGTATGTTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84617193	84613700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_84614187_84616536_84616646_84616915_84616940_84617025
tx.18394	chr8	+	1608	4	FSM	ENSMUSG00000005470.9	ENSMUST00000005607.9	1788	4	178	2	-29	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	543	junction_2	3.39934634239519	1479	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTGTTTTGCTTTTTTCTC	5894	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84682313	84696824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_84682567_84691659_84691776_84694462_84694640_84695762
tx.18395	chr8	-	619	3	FSM	ENSMUSG00000074217.9	ENSMUST00000190457.2	1351	3	726	6	-21	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_2	17	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGCTTCAGTGCAAGCT	8259	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84738061	84736856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84737122_84737339_84737402_84737769
tx.18396	chr8	-	369	2	ISM	ENSMUSG00000074217.9	ENSMUST00000190457.2	1351	3	1344	6	597	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGCTTCAGTGCAAGCT	8877	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84737443	84736856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84737122_84737339
tx.18397	chr8	+	2467	7	FSM	ENSMUSG00000047986.13	ENSMUST00000055077.7	2452	7	-7	-8	-7	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	39.9110121255887	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTATTTATTAATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84748092	84756932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_84748158_84750980_84751030_84752822_84752904_84753377_84753521_84753628_84753714_84754754_84754801_84754934
tx.18398	chr8	+	2431	5	ISM	ENSMUSG00000047986.13	ENSMUST00000055077.7	2452	7	4645	-8	41	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	94	junction_2	4.49305018890286	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTATTTATTAATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84752744	84756932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_84752904_84753377_84753521_84753628_84753714_84754754_84754801_84754934
tx.18399	chr8	-	2624	14	FSM	ENSMUSG00000005465.10	ENSMUST00000005601.9	2664	14	23	17	3	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_12	6.10848667572056	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAATCTTTTTTTTCTTAA	5282	False	NA	91	True	NA	NA	NA	84769195	84756939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84757822_84757941_84758051_84758147_84758239_84758645_84758772_84760579_84760739_84760820_84760923_84762713_84762903_84762991_84763176_84765924_84765999_84766106_84766264_84767302_84767461_84767560_84767719_84768715_84768834_84769078
tx.184	chr1	+	379	2	FSM	ENSMUSG00000060679.15	ENSMUST00000202358.2	687	2	308	0	308	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	692	junction_1	0	875	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCCCTTTTTTTTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42942524	42944843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_42942625_42944564
tx.1840	chr10	-	612	2	Intergenic	novelGene_105	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGCACTGTTTAAAAATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85034324	85024180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_85024670_85034201
tx.18400	chr8	-	761	2	FSM	ENSMUSG00000005465.10	ENSMUST00000210790.2	527	2	-45	-189	4	189	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTGTAGCGCTTGTAAT	5263	False	NA	72	True	NA	NA	NA	84769214	84768208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84768834_84769078
tx.18401	chr8	-	932	2	FSM	ENSMUSG00000045232.5	ENSMUST00000061923.5	634	2	-29	-269	-29	269	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_1	0	310	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCACGCGTGCGTATCAT	2819	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84771658	84769288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84769961_84771398
tx.18402	chr8	-	598	3	ISM	ENSMUSG00000037103.9	ENSMUST00000210279.2	2199	13	6781	2	6780	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_1	11.5	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCCTGGTGTCCTGTTCT	7637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84824611	84823702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84824138_84824365_84824482_84824564
tx.18403	chr8	-	2205	13	FSM	ENSMUSG00000037103.9	ENSMUST00000210279.2	2199	13	-8	2	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_7	21.0218140669797	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCCTGGTGTCCTGTTCT	9254	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84831400	84823702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84824138_84824365_84824482_84824564_84824670_84824827_84824914_84824990_84825120_84825207_84825300_84825386_84825822_84828304_84828476_84828560_84828701_84828792_84828900_84829374_84829511_84829584_84829683_84831245
tx.18404	chr8	-	643	3	NNC	ENSMUSG00000056155.7	novel	434	2	NA	NA	-7479	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACAAGGTGGTATGAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84919325	84900351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_84900602_84918311_84918445_84919065
tx.18405	chr8	-	704	2	ISM	ENSMUSG00000019362.9	ENSMUST00000019506.9	616	3	1	-3	1	3	intron_retention	FALSE	canonical	3	1856	junction_1	0	542	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTGCTGTTTGGTGCT	9835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84976347	84972863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84973323_84976102
tx.18406	chr8	+	604	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000019362.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGAGGCGGGGCCACGTGC	1629	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84972864	84976348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_84973325_84976204
tx.18407	chr8	-	619	3	FSM	ENSMUSG00000019362.9	ENSMUST00000019506.9	616	3	0	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1764	junction_2	46	11524	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTGCTGTTTGGTGCT	9834	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84976348	84972863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84973323_84976102_84976159_84976244
tx.18408	chr8	-	460	2	ISM	ENSMUSG00000004996.10	ENSMUST00000126435.8	2819	5	3234	1574	2323	-458	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	199	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCATCTTCACCCACACTC	5463	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84980719	84978108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84978341_84980491
tx.18409	chr8	-	633	3	ISM	ENSMUSG00000004996.10	ENSMUST00000126435.8	2819	5	2972	1575	2061	-459	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_2	3.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTCATCTTCACCCACACT	9938	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84980981	84978109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84978341_84980491_84980717_84980804
tx.1841	chr10	+	2558	15	FSM	ENSMUSG00000001785.14	ENSMUST00000001836.11	2572	15	17	-3	17	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	284	junction_1	18.5957258639765	350	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACCTCACTTTGACTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85707711	85724963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_85707879_85710141_85710201_85710312_85710498_85712161_85712248_85712349_85712447_85714342_85714454_85715125_85715257_85715693_85715756_85717866_85717964_85718734_85718797_85720326_85720439_85721473_85721565_85721660_85721783_85723086_85723193_85723893
tx.18410	chr8	-	1629	10	FSM	ENSMUSG00000004994.13	ENSMUST00000098578.10	2119	10	-14	504	-14	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_9	31.8437543540021	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCTTGTTTCTAAACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84997023	84984927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84985556_84985741_84985881_84986922_84987096_84987171_84987315_84988368_84988430_84989621_84989678_84990490_84990574_84990937_84990992_84993464_84993704_84996970
tx.18411	chr8	-	1578	9	ISM	ENSMUSG00000004994.13	ENSMUST00000098578.10	2119	10	3303	505	-239	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	198	junction_2	18.3847763108502	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCTTGTTTCTAAACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84993706	84984928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_84985556_84985741_84985881_84986922_84987096_84987171_84987315_84988368_84988430_84989621_84989678_84990490_84990574_84990937_84990992_84993464
tx.18412	chr8	-	1090	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034656.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATGTACCTTGTTTGGACA	7763	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85328657	85309550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85310375_85328391
tx.18413	chr8	+	359	3	ISM	ENSMUSG00000034656.19	ENSMUST00000143215.8	740	4	-96	10035	-96	-10035	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	2.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGTGGGGGAATTGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85327963	85328674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_85328135_85328384_85328451_85328552
tx.18414	chr8	-	575	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034656.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAATTGATTACATTTATT	9035	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85356361	85350569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85350992_85356208
tx.18415	chr8	-	617	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034656.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAATTGATTACATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85369283	85350569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85350992_85369088
tx.18416	chr8	-	673	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034656.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAATTGATTACATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85369261	85350569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85350992_85364362_85364441_85369088
tx.18417	chr8	+	568	2	Intergenic	novelGene_331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTGTTTATTTACAGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85369089	85369905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_85369464_85369711
tx.18418	chr8	+	739	2	Intergenic	novelGene_332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATAATTAGTGCTGACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85391731	85396044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_85391899_85395472
tx.18419	chr8	+	2102	17	FSM	ENSMUSG00000001909.17	ENSMUST00000109767.9	2138	17	36	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_1	116.091541869983	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGTCATTTTGAATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85415911	85426416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85415979_85416260_85416538_85417145_85417202_85417439_85417577_85417880_85418069_85421850_85421967_85422056_85422170_85423455_85423605_85423743_85423831_85423897_85423968_85424053_85424189_85424274_85424361_85424813_85424923_85425021_85425099_85425767_85425888_85425969_85426100_85426231
tx.1842	chr10	-	1983	12	FSM	ENSMUSG00000001783.4	ENSMUST00000001834.4	2009	12	27	-1	27	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1317	junction_1	96.7988457003782	2923	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTCTTCTCTTCCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85793660	85774499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_85774984_85777762_85777883_85778351_85778463_85779072_85779262_85779678_85779855_85782054_85782215_85783040_85783198_85785329_85785487_85787218_85787319_85789300_85789369_85791582_85791662_85793478
tx.18420	chr8	+	2129	17	FSM	ENSMUSG00000001909.17	ENSMUST00000001974.11	2567	17	417	21	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_1	103.16006979447	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGTCATTTTGAATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85415911	85426416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85416006_85416260_85416538_85417145_85417202_85417439_85417577_85417880_85418069_85421850_85421967_85422056_85422170_85423455_85423605_85423743_85423831_85423897_85423968_85424053_85424189_85424274_85424361_85424813_85424923_85425021_85425099_85425767_85425888_85425969_85426100_85426231
tx.18421	chr8	+	2034	17	FSM	ENSMUSG00000001909.17	ENSMUST00000109768.9	2044	17	11	-1	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	132.785409001705	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGTCATTTTGAATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85415903	85426416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85415979_85416336_85416538_85417145_85417202_85417439_85417577_85417880_85418069_85421850_85421967_85422056_85422170_85423455_85423605_85423743_85423831_85423897_85423968_85424053_85424189_85424274_85424361_85424813_85424923_85425021_85425099_85425767_85425888_85425969_85426100_85426231
tx.18422	chr8	+	2053	17	NIC	ENSMUSG00000001909.17	novel	2567	17	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	129	junction_1	113.375964714749	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGTCATTTTGAATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85415911	85426416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_85416006_85416336_85416538_85417145_85417202_85417439_85417577_85417880_85418069_85421850_85421967_85422056_85422170_85423455_85423605_85423743_85423831_85423897_85423968_85424053_85424189_85424274_85424361_85424813_85424923_85425021_85425099_85425767_85425888_85425969_85426100_85426231
tx.18423	chr8	+	309	2	FSM	ENSMUSG00000001909.17	ENSMUST00000177260.2	339	2	166	-136	166	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	635	junction_1	0	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTGTCATTTTGAATTGG	4397	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85425975	85426416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85426100_85426231
tx.18424	chr8	-	1010	4	ISM	ENSMUSG00000001911.17	ENSMUST00000099070.10	1728	10	76366	-429	-9910	427	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCGGACTTCGTCTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85450607	85434815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_85435307_85440394_85440487_85448271_85448448_85450356
tx.18425	chr8	+	740	2	FSM	ENSMUSG00000074203.5	ENSMUST00000098571.5	721	2	-17	-2	-17	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTGGCTCACATCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85449618	85453475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85449901_85453017
tx.18426	chr8	+	374	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000001911.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTACCCATGTTCGATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85456800	85458334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_85456987_85458146
tx.18427	chr8	+	732	2	FSM	ENSMUSG00000033751.6	ENSMUST00000036734.6	2494	2	751	1011	751	-1011	multi-exon	FALSE	canonical	3	736	junction_1	0	1542	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATTCTCCCTCAAGTTGT	3425	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85558901	85561100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85559270_85560736
tx.18428	chr8	-	4008	8	NIC	ENSMUSG00000003813.16	novel	1842	9	NA	NA	-6	1212	intron_retention	TRUE	canonical	3	614	junction_2	257.950161299205	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAACAAAAAACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85567276	85559435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_85562549_85564088_85564223_85564317_85564397_85564635_85564764_85564901_85564958_85565097_85565280_85565422_85565585_85567122
tx.18429	chr8	-	1813	9	FSM	ENSMUSG00000003813.16	ENSMUST00000109761.9	1842	9	10	19	10	-19	multi-exon	FALSE	canonical	3	614	junction_3	246.139156525328	341	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAATGGTTCATGCCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85567284	85561558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_85562304_85562383_85562549_85564088_85564223_85564317_85564397_85564635_85564764_85564901_85564958_85565097_85565280_85565422_85565585_85567122
tx.1843	chr10	+	1909	9	FSM	ENSMUSG00000001786.15	ENSMUST00000130320.8	5388	9	-65	3544	-65	6	multi-exon	TRUE	canonical	3	208	junction_3	24.7878498462452	372	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGACTTTTTTTAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85857770	85884193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_85858009_85860279_85860575_85864872_85865101_85866791_85866934_85869097_85869185_85878785_85878882_85880286_85880464_85882636_85882675_85883585
tx.18430	chr8	-	1814	9	FSM	ENSMUSG00000003813.16	ENSMUST00000003911.13	2074	9	-18	278	6	-19	multi-exon	FALSE	canonical	3	805	junction_3	189.238440862315	592	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATAATGGTTCATGCCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85567288	85561558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_85562304_85562383_85562549_85564088_85564220_85564317_85564397_85564635_85564764_85564901_85564958_85565097_85565280_85565422_85565585_85567122
tx.18431	chr8	-	1878	9	FSM	ENSMUSG00000003814.9	ENSMUST00000003912.7	2184	9	65	241	-39	-241	multi-exon	FALSE	canonical	3	1093	junction_6	113.438791314964	3708	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTATTGTGTCTCCTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85573498	85568719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_85569474_85569572_85569666_85570693_85570838_85571006_85571121_85571202_85571413_85571499_85571595_85572490_85572695_85572878_85572981_85573336
tx.18432	chr8	+	771	5	FSM	ENSMUSG00000003824.13	ENSMUST00000136026.8	1686	5	90	825	8	-50	multi-exon	FALSE	canonical	3	1047	junction_2	374.154045815357	1531	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGTCATACTTTATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85598829	85614025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85598883_85599348_85599462_85610059_85610214_85612563_85612753_85613763
tx.18433	chr8	+	616	4	FSM	ENSMUSG00000003824.13	ENSMUST00000003922.6	685	4	9	60	9	-50	multi-exon	FALSE	canonical	3	832	junction_2	470.355184940062	1950	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGTCATACTTTATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85598830	85614025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85598883_85599348_85599462_85612563_85612753_85613763
tx.18434	chr8	+	582	3	ISM	ENSMUSG00000003824.13	ENSMUST00000003922.6	685	4	509	60	264	-50	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	832	junction_1	576	578	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGTCATACTTTATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85599330	85614025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_85599462_85612563_85612753_85613763
tx.18435	chr8	-	1042	5	ISM	ENSMUSG00000003809.15	ENSMUST00000003907.14	2167	11	3026	191	1775	-191	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	269	junction_3	10.3531396204243	549	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGACTGGACTAGGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85617520	85613212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_85613683_85615155_85615317_85615890_85616017_85616210_85616315_85617339
tx.18436	chr8	+	790	2	ISM	ENSMUSG00000054191.10	ENSMUST00000067060.10	1530	3	1313	0	1313	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTGTCTGCCTCACTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85629869	85631920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_85630132_85631392
tx.18437	chr8	-	1194	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000003812.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCAACCCGTCTGCTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85638098	85636760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85637822_85637965
tx.18438	chr8	-	1042	8	FSM	ENSMUSG00000052926.17	ENSMUST00000109738.10	2044	8	-55	1057	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1021	junction_5	82.5459674041917	3464	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGACCGAGTGCTTTGTGG	8228	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85692695	85684295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_85684494_85684594_85684719_85686404_85686493_85686595_85686734_85691759_85691848_85691945_85692073_85692199_85692272_85692488
tx.18439	chr8	+	949	6	FSM	ENSMUSG00000005161.16	ENSMUST00000005292.15	1500	6	34	517	34	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	3496	junction_3	236.69169820676	22554	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTGTGTTGGTGTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85696273	85700946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85696392_85696868_85696974_85697064_85697219_85697915_85698039_85698190_85698322_85700628
tx.1844	chr10	+	1743	9	NIC	ENSMUSG00000001786.15	novel	5388	9	NA	NA	-49	8	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	23	junction_1	77.6434156899347	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGACTTTTTTTAAGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85857786	85884195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_85858009_85860431_85860575_85864872_85865101_85866791_85866934_85869097_85869185_85878785_85878882_85880286_85880464_85882636_85882675_85883585
tx.18440	chr8	-	1262	7	NNC	ENSMUSG00000052456.10	novel	1256	7	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	52	junction_3	703.697062346828	4183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGTTTGTCAGTGGATG	8398	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85751912	85744559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_85744885_85745150_85745349_85745439_85745548_85746146_85746302_85746388_85746538_85750806_85750955_85751733
tx.18441	chr8	-	811	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041203.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCAAAGGACGTCGGGAAA	3395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85756915	85753511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85753909_85756501
tx.18442	chr8	-	418	2	Intergenic	novelGene_333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTCTGCCTGAGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85763336	85759936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_85760031_85763012
tx.18443	chr8	+	1865	10	FSM	ENSMUSG00000008167.15	ENSMUST00000095220.4	1907	10	42	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	54	junction_4	11.5864970366477	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGTGTGAGCTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85786725	85793750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85787166_85788574_85788715_85788800_85788930_85791012_85791126_85791209_85791302_85792449_85792599_85792684_85792799_85792901_85792992_85793073_85793140_85793218
tx.18444	chr8	+	1949	9	FSM	ENSMUSG00000008167.15	ENSMUST00000139721.8	1993	9	41	3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_1	8.18535277187245	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGTGTGAGCTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85786725	85793750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85787166_85788574_85788715_85788800_85788930_85791012_85791302_85792449_85792599_85792684_85792799_85792901_85792992_85793073_85793140_85793218
tx.18445	chr8	-	602	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060038.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATACATATAGTAATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85798742	85796618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85796901_85797091_85797271_85798601
tx.18446	chr8	-	512	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060038.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATACATATAGTAATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85798742	85796618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85796901_85797181_85797271_85798601
tx.18447	chr8	-	842	7	ISM	ENSMUSG00000005150.17	ENSMUST00000093357.12	1238	9	562	0	-269	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_6	14.5420845212171	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTAGTCTTCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85806813	85801663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_85801973_85802451_85802567_85802652_85802762_85802845_85802914_85806209_85806337_85806417_85806467_85806748
tx.18448	chr8	-	1192	9	FSM	ENSMUSG00000005150.17	ENSMUST00000093357.12	1238	9	46	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_6	13.3410784796432	754	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTAGTCTTCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85807329	85801663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_85801973_85802451_85802567_85802652_85802762_85802845_85802914_85806209_85806337_85806417_85806467_85806748_85806855_85806941_85807063_85807141
tx.18449	chr8	+	695	4	FSM	ENSMUSG00000059355.14	ENSMUST00000079764.14	922	4	222	5	-11	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	586	junction_1	13.7679176187089	5105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCACTGTTGCTTCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85807590	85808963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_85807693_85807801_85807908_85808405_85808504_85808574
tx.1845	chr10	+	2031	4	ISM	ENSMUSG00000020044.14	ENSMUST00000020234.14	4722	5	38008	2081	35526	-2081	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_3	2.05480466765633	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGATTATTTTAAGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86174243	86183289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_86174320_86179796_86179909_86180417_86180540_86181568
tx.18450	chr8	-	3189	17	FSM	ENSMUSG00000031696.10	ENSMUST00000034131.10	3474	17	285	0	-48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1260	junction_3	108.704875695619	361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGATTATCTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86026146	85987020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_85987939_85988623_85988768_85989939_85990180_85990772_85990953_85997321_85997445_86000100_86000257_86001448_86001657_86005332_86005482_86005588_86005686_86007864_86007975_86008469_86008554_86010621_86010836_86012969_86013153_86014324_86014449_86016334_86016432_86021487_86021587_86026083
tx.18451	chr8	+	1044	6	FSM	ENSMUSG00000031697.13	ENSMUST00000170141.3	1466	6	219	203	-15	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_1	361.716463545689	361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGTGTATGAGTATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86026536	86034704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_86026622_86029424_86029589_86029990_86030081_86031837_86031951_86032845_86032948_86034214
tx.18452	chr8	+	1013	6	NIC	ENSMUSG00000031697.13	novel	1287	7	NA	NA	-15	7	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	109	junction_2	378.03089820807	374	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATGAGTATTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86026536	86034707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_86026622_86027737_86027868_86029990_86030081_86031837_86031951_86032845_86032948_86034214
tx.18453	chr8	+	1177	7	FSM	ENSMUSG00000031697.13	ENSMUST00000034132.13	1287	7	117	-7	-15	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	862	junction_2	81.7626986399598	2630	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATGAGTATTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86026536	86034707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_86026622_86027737_86027868_86029424_86029589_86029990_86030081_86031837_86031951_86032845_86032948_86034214
tx.18454	chr8	-	1475	4	FSM	ENSMUSG00000036934.10	ENSMUST00000047749.7	1587	4	17	95	-2	-95	multi-exon	FALSE	canonical	3	253	junction_1	19.3045763140937	1567	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTAAGTAGTGTGGTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86159445	86135482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_86136520_86138741_86138925_86153488_86153586_86159287
tx.18455	chr8	-	558	3	ISM	ENSMUSG00000036934.10	ENSMUST00000047749.7	1587	4	9	3242	-3	242	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	281	junction_2	9.5	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCACGATTCATTTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86159453	86138629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_86138925_86153488_86153586_86159287
tx.18456	chr8	+	430	2	Intergenic	novelGene_334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGAAATTTGAACTTAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86194848	86198577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_86195018_86198316
tx.18457	chr8	+	437	2	Intergenic	novelGene_335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGCTGCCTTCTTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86200152	86201386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_86200287_86201083
tx.18458	chr8	+	1979	12	FSM	ENSMUSG00000031700.12	ENSMUST00000034136.12	3639	12	0	1660	0	220	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	271.645643020279	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATTCTCTGAATCGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86219204	86252529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_86219319_86219533_86219799_86229893_86229984_86232207_86232317_86235807_86235939_86238741_86238986_86242786_86242867_86244605_86244743_86246076_86246252_86247967_86248124_86249884_86249998_86252164
tx.18459	chr8	+	789	4	FSM	ENSMUSG00000031700.12	ENSMUST00000143846.2	628	4	41	-202	41	202	multi-exon	FALSE	canonical	3	925	junction_1	34.3931517731203	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCTCGGCAGATGTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86246078	86252511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_86246252_86247967_86248124_86249884_86249998_86252164
tx.1846	chr10	+	564	3	FSM	ENSMUSG00000097412.3	ENSMUST00000218095.2	1622	3	0	1058	0	267	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	95.5	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGTCTTACTATACATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86521388	86524760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_86521473_86521743_86521861_86524397
tx.18460	chr8	-	1596	7	ISM	ENSMUSG00000031701.7	ENSMUST00000034138.7	2919	9	2029	993	151	-993	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	694	junction_1	59.8843793395981	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTGTCACATTTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86279944	86265254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_86266037_86266678_86266807_86266936_86267082_86273141_86273339_86275192_86275327_86275510_86275592_86279815
tx.18461	chr8	-	1923	9	FSM	ENSMUSG00000031701.7	ENSMUST00000034138.7	2919	9	3	993	3	-993	multi-exon	FALSE	canonical	3	694	junction_1	52.4486355875918	1118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTGTCACATTTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86281970	86265254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_86266037_86266678_86266807_86266936_86267082_86273141_86273339_86275192_86275327_86275510_86275592_86279815_86280040_86280545_86280606_86281798
tx.18462	chr8	-	2849	16	NNC	ENSMUSG00000031703.9	novel	3306	18	NA	NA	4438	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	82.0708636890503	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTGTGGCAAGCAACTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86563112	86444198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_86445557_86449259_86449378_86452142_86452226_86452790_86452920_86459001_86459081_86462753_86462798_86464745_86464855_86466856_86467008_86490863_86491037_86493586_86493682_86502768_86502851_86507144_86507207_86537173_86537269_86557811_86557887_86561649_86561708_86562974
tx.18463	chr8	-	2188	18	NNC	ENSMUSG00000031703.9	novel	3306	18	NA	NA	161	-961	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	77.7157450213369	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGGCCAGGGCGTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86567389	86445167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_86445557_86449259_86449378_86452142_86452226_86452790_86452920_86459001_86459081_86462753_86462798_86464745_86464855_86466856_86467008_86490863_86491037_86493586_86493682_86502768_86502851_86507144_86507207_86537173_86537269_86557811_86557887_86561649_86561708_86562974_86563121_86565556_86565630_86567162
tx.18464	chr8	+	1047	8	FSM	ENSMUSG00000036879.16	ENSMUST00000159882.8	1013	8	-32	-2	-15	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	24.1356709507919	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTGAAAGGAGCAAGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86567604	86649047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_86567733_86569632_86569742_86602262_86602353_86604738_86604878_86606339_86606440_86623058_86623167_86628505_86628587_86648755
tx.18465	chr8	+	4219	7	ISM	ENSMUSG00000047866.21	ENSMUST00000034141.18	2859	15	18	71975	18	-71975	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_5	25.8827484372635	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGATGTGTCAGTAGGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87350689	87371284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_87351045_87358013_87358249_87360496_87360629_87361424_87361548_87363106_87363271_87364530_87364626_87368169
tx.18466	chr8	+	2837	15	FSM	ENSMUSG00000047866.21	ENSMUST00000034141.18	2859	15	27	-5	27	4	multi-exon	TRUE	canonical	3	174	junction_5	34.038693468775	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGTCTCCAGTGGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87350698	87443264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_87351045_87358013_87358249_87360496_87360629_87361424_87361548_87363106_87363271_87364530_87364626_87368169_87368429_87378803_87378946_87392318_87392470_87394340_87394468_87399563_87399698_87435560_87435704_87439939_87440148_87440530_87440722_87442877
tx.18467	chr8	+	312	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000066362.6	novel	538	1	NA	NA	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAATCTCAGACACTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87774321	87774854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_+_87774444_87774664
tx.18468	chr8	+	610	5	NIC	ENSMUSG00000097248.10	novel	682	4	NA	NA	-23	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	30	junction_1	79.1023861839831	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTGTGTCCATTCCTCCT	175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88199416	88252182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_88199589_88240436_88240525_88248363_88248442_88250923_88251056_88252042
tx.18469	chr8	+	522	4	FSM	ENSMUSG00000097248.10	ENSMUST00000182174.8	498	4	-23	-1	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_1	31.0590834807897	459	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTGTGTCCATTCCTCCT	175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88199416	88252182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_88199589_88248363_88248442_88250923_88251056_88252042
tx.1847	chr10	+	640	3	FSM	ENSMUSG00000097412.3	ENSMUST00000220419.2	1665	3	-33	1058	-23	267	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	104.5	346	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGTCTTACTATACATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86521441	86524760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_86521602_86521743_86521861_86524397
tx.18470	chr8	+	463	4	FSM	ENSMUSG00000097248.10	ENSMUST00000182758.2	447	4	-16	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	69.6866000191014	492	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTGTGTCCATTCCTCCT	211	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88199745	88252182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_88199859_88248363_88248442_88250923_88251056_88252042
tx.18471	chr8	+	548	5	NIC	ENSMUSG00000097248.10	novel	447	4	NA	NA	5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	4	junction_1	86.1434124004848	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTGTGTCCATTCCTCCT	214	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88199748	88252182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_88199859_88240436_88240525_88248363_88248442_88250923_88251056_88252042
tx.18472	chr8	-	371	2	NNC	ENSMUSG00000045333.16	novel	4334	6	NA	NA	140827	-482	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCCATGCTCAGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88389624	88388921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_88389136_88389467
tx.18473	chr8	+	1748	6	FSM	ENSMUSG00000036810.17	ENSMUST00000095214.10	1731	6	-13	-4	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_2	26.3256528883901	368	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGTGGTTAGAGATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88845383	88861738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_88845498_88846407_88846480_88851709_88851784_88856322_88856433_88856974_88857030_88860415
tx.18474	chr8	+	3248	15	FSM	ENSMUSG00000031657.17	ENSMUST00000034079.14	3251	15	3	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	239	junction_7	19.6926641267291	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTGTGTCATACAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88864485	88898655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_88864786_88864902_88865076_88866519_88866608_88868299_88868410_88871156_88871267_88874174_88874316_88876719_88876998_88883089_88883181_88883297_88883456_88883680_88883764_88884756_88884894_88888505_88888595_88891515_88891660_88893623_88893801_88897486
tx.18475	chr8	-	2163	17	FSM	ENSMUSG00000031660.14	ENSMUST00000034085.8	3625	17	210	1252	30	476	multi-exon	TRUE	canonical	3	463	junction_12	36.2439650148821	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTCGCTGGTGTGTCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89088612	89058938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_89059172_89059508_89059653_89060365_89060510_89060732_89060845_89063708_89063766_89066036_89066149_89069362_89069499_89070209_89070318_89071776_89071853_89072457_89072582_89073501_89073687_89078427_89078539_89081256_89081402_89084164_89084223_89084527_89084658_89088129_89088339_89088533
tx.18476	chr8	-	230	2	ISM	ENSMUSG00000031660.14	ENSMUST00000135471.2	511	4	24	4034	24	-4034	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	543	junction_1	0	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGGAAGAAAGGCGAGAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89088618	89088193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_89088339_89088533
tx.18477	chr8	-	541	2	Intergenic	novelGene_337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGCACTGTTGAAATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89676770	89671873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_89672277_89676632
tx.18478	chr8	-	904	2	Intergenic	novelGene_336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTGTCTAATCTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89677392	89671494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_89672277_89677270
tx.18479	chr8	+	505	3	Intergenic	novelGene_338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCTTGGGGGCTGTGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89678358	89693667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_89678483_89681488_89681805_89693602
tx.1848	chr10	+	582	2	FSM	ENSMUSG00000097412.3	ENSMUST00000218536.2	204	2	-116	-262	-8	262	multi-exon	FALSE	canonical	3	262	junction_1	0	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAAGATAGTCTTACTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86521636	86524755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_86521861_86524397
tx.18480	chr8	+	427	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031665.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	0	66	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCCTTCATAAATAATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89768286	89784300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_89768425_89784011
tx.18481	chr8	+	361	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031665.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	4	42	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGCTGTAATGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89768318	89795961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_89768425_89784011_89784080_89795774
tx.18482	chr8	+	624	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031665.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	10	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGTAATGCCTCTGGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89769617	89795968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_89769980_89784011_89784080_89795774
tx.18483	chr8	-	2411	5	Intergenic	novelGene_340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	27.8511669414407	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGTCCATTTTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779671	89772259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_89774095_89774349_89774422_89775330_89775532_89776215_89776356_89779508
tx.18484	chr8	-	2348	5	Intergenic	novelGene_339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_4	28.6574597618142	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGTCCATTTTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779668	89772259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_89774095_89774349_89774422_89775330_89775532_89776215_89776356_89779568
tx.18485	chr8	-	1320	3	Intergenic	novelGene_341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_2	28.5	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAATTTTTTGTCATGTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779671	89774454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_89775532_89776215_89776356_89779568
tx.18486	chr8	-	1376	3	Intergenic	novelGene_342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_1	12	218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATTTTTTGTCATGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779668	89774455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_89775532_89776215_89776356_89779508
tx.18487	chr8	-	1022	2	Intergenic	novelGene_343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAGCAAACCTGGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779663	89775488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_89776356_89779508
tx.18488	chr8	+	407	2	Intergenic	novelGene_344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCCTTCATAAATAATCCT	3408	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779838	89784300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_89779957_89784011
tx.18489	chr8	+	381	3	Intergenic	novelGene_345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	7.5	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTAATGCCTCTGGCATG	3408	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89779838	89795969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_89779957_89784011_89784080_89795774
tx.1849	chr10	-	404	2	ISM	ENSMUSG00000020048.14	ENSMUST00000129178.8	3222	13	10225	631	3978	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3805	junction_1	0	443	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGTGCTTATTTTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86527607	86526703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_86526993_86527492
tx.18490	chr8	+	545	2	Intergenic	novelGene_346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGTTCTGTCTAACTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89894055	89895555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_89894206_89895160
tx.18491	chr8	-	1003	2	NNC	ENSMUSG00000110332.2	novel	979	2	NA	NA	-8391	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCGGCTGGCGTGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91552412	91542772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_91543613_91552249
tx.18492	chr8	-	970	2	NNC	ENSMUSG00000110332.2	novel	979	2	NA	NA	-8110	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCGGCTGGCGTGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91552131	91542772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_91543613_91552001
tx.18493	chr8	+	704	2	NNC	ENSMUSG00000056608.15	novel	2279	5	NA	NA	-60	41349	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAAGCTTTGTGGCGCAC	4115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91635181	91659498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_91635264_91658876
tx.18494	chr8	+	716	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000089179.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91787371	91788708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_91787736_91788356
tx.18495	chr8	-	1758	10	NNC	ENSMUSG00000031667.17	novel	2079	10	NA	NA	11	-309	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	86	junction_1	118.014228060397	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGCTCCTTTTCAATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91860640	91850505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_91851310_91851450_91851512_91852444_91852553_91852652_91852752_91852825_91852915_91853301_91853403_91853492_91853558_91856227_91856434_91857668_91857781_91860527
tx.18496	chr8	-	1836	11	FSM	ENSMUSG00000031667.17	ENSMUST00000120213.9	2200	11	-15	379	11	-309	multi-exon	TRUE	canonical	3	60	junction_9	146.200581394193	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGCTCCTTTTCAATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91860640	91850505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_91851307_91851450_91851512_91852444_91852553_91852652_91852752_91852825_91852915_91853301_91853403_91853492_91853558_91856227_91856434_91857668_91857781_91858550_91858632_91860527
tx.18497	chr8	-	1822	11	NIC	ENSMUSG00000031667.17	novel	2200	11	NA	NA	11	-319	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	13	junction_9	155.801283691759	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGGAAAGTAATGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91860640	91850515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_91851307_91851450_91851512_91852444_91852553_91852652_91852752_91852825_91852915_91853301_91853403_91853492_91853558_91856227_91856434_91857668_91857777_91858550_91858632_91860527
tx.18498	chr8	-	1741	10	FSM	ENSMUSG00000031667.17	ENSMUST00000109609.9	1171	10	11	-581	11	-319	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_9	96.0081015100057	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGGAAAGTAATGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91860640	91850515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_91851307_91851450_91851512_91852444_91852553_91852652_91852752_91852825_91852915_91853301_91853403_91853492_91853558_91856227_91856434_91857668_91857777_91860527
tx.18499	chr8	-	1832	11	NNC	ENSMUSG00000031667.17	novel	2200	11	NA	NA	8	-319	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	60	junction_9	165.560985742415	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGGAAAGTAATGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91860643	91850515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_91851310_91851450_91851512_91852444_91852553_91852652_91852752_91852825_91852915_91853301_91853403_91853492_91853558_91856227_91856434_91857668_91857781_91858550_91858632_91860527
tx.185	chr1	-	1730	3	ISM	ENSMUSG00000070939.10	ENSMUST00000095014.8	5607	13	-25	27599	-10	-317	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTAGGGCTCATTCTTGGT	7758	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43137807	43113958	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_43115113_43136011_43136210_43137429
tx.1850	chr10	+	415	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020048.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGTGACATCCACAACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86526703	86527614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_86526995_86527490
tx.18500	chr8	-	1752	10	FSM	ENSMUSG00000031667.17	ENSMUST00000125257.3	2079	10	12	315	8	-315	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_9	63.7020456287233	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAAGTAATGCTCCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91860643	91850511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_91851307_91851450_91851512_91852444_91852553_91852652_91852752_91852825_91852915_91853301_91853403_91853492_91853558_91856227_91856434_91857668_91857781_91860527
tx.18501	chr8	-	1744	10	NNC	ENSMUSG00000031667.17	novel	1171	10	NA	NA	11	-319	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	86	junction_1	135.177889199362	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGGAAAGTAATGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91860640	91850515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_91851310_91851450_91851512_91852444_91852553_91852652_91852752_91852825_91852915_91853301_91853403_91853492_91853558_91856227_91856434_91857668_91857777_91860527
tx.18502	chr8	-	1306	7	NNC	ENSMUSG00000033282.15	novel	404	3	NA	NA	11	12324	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.51306185941475	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACCAGCAAACACATGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92039879	92022292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_92022767_92025856_92026001_92027405_92027509_92031346_92031646_92034669_92034815_92036965_92037058_92039830
tx.18503	chr8	-	480	3	ISM	ENSMUSG00000033282.15	ENSMUST00000139113.8	5046	26	-38	88901	2	132	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	3	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTATGTCTAAAGTTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92039888	92034484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_92034815_92036965_92037058_92039830
tx.18504	chr8	+	1151	6	ISM	ENSMUSG00000055932.16	ENSMUST00000136802.8	3751	7	-32	13338	1	6062	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	247	junction_3	27.7229147096765	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGCTCCTCAGGAAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92040163	92201081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_92040249_92128434_92128513_92135850_92136470_92168290_92168435_92194944_92195025_92200936
tx.18505	chr8	+	3546	9	FSM	ENSMUSG00000055932.16	ENSMUST00000069718.15	3564	9	12	6	2	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	202	junction_7	44.2492937796752	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTAAGAGCGTCCGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92040164	92395061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_92040249_92128434_92128513_92135850_92136470_92168290_92168435_92194944_92195025_92200936_92201081_92211786_92211907_92249399_92249525_92392909
tx.18506	chr8	+	443	4	ISM	ENSMUSG00000055932.16	ENSMUST00000136802.8	3751	7	96200	13338	19213	6062	internal_fragment	FALSE	canonical	3	247	junction_1	32.4448249597169	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGCTCCTCAGGAAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92136395	92201081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_92136470_92168290_92168435_92194944_92195025_92200936
tx.18507	chr8	-	1226	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055932.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTCTTGAACTCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92327971	92325572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_92326535_92326924_92326999_92327781
tx.18508	chr8	+	433	1	FSM	ENSMUSG00000110073.2	ENSMUST00000211333.2	360	1	-73	0	-73	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAATGGGGTCAGTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92416307	92416740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_92416300_92416700
tx.18509	chr8	-	1108	6	NIC	ENSMUSG00000031736.12	novel	1238	7	NA	NA	4	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.31413210223457	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTTGTTTGTGTAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93082493	93052660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_93053091_93071480_93071668_93072977_93073092_93073411_93073547_93077318_93077383_93082315
tx.1851	chr10	-	2779	18	FSM	ENSMUSG00000020048.14	ENSMUST00000020238.14	2825	18	46	0	46	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2860	junction_11	342.987041630793	1523	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGTGCTTATTTTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86541327	86526703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_86526993_86527492_86527613_86528003_86528160_86528249_86528329_86529240_86529378_86529777_86530024_86530213_86530484_86531340_86531407_86531523_86531602_86531689_86531828_86532582_86532700_86534182_86534303_86534447_86534560_86537560_86537893_86538772_86538890_86539323_86539466_86540157_86540261_86541170
tx.18510	chr8	-	1041	3	NNC	ENSMUSG00000110714.2	novel	1003	7	NA	NA	-356	-3678	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGTAATCTTGCTAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93881100	93871636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_93872376_93880491_93880697_93881003
tx.18511	chr8	+	444	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000110534.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGAACAGAGACTTTCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94212403	94330369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_94212580_94330101
tx.18512	chr8	-	628	2	NNC	ENSMUSG00000058019.14	novel	987	4	NA	NA	6896	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAGGGAACACAATTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94226500	94225690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_94226238_94226419
tx.18513	chr8	-	1091	7	FSM	ENSMUSG00000031754.11	ENSMUST00000034204.11	5010	7	10	3909	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2190	junction_4	118.898649651242	9277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCGAGGATCCTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94763649	94746032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_94746333_94749402_94749518_94751169_94751246_94755462_94755553_94757771_94757836_94758929_94759131_94763404
tx.18514	chr8	+	2011	13	FSM	ENSMUSG00000033009.16	ENSMUST00000109556.9	5310	13	48	3251	8	-3251	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_2	14.2971928091574	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCTTCGTTCTGTAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94763873	94791298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_94764071_94765592_94765739_94773899_94773947_94778702_94778804_94781231_94781349_94781880_94781973_94782163_94782293_94782671_94782786_94784343_94784424_94784677_94784992_94789594_94789718_94790096_94790156_94790806
tx.18515	chr8	+	654	3	ISM	ENSMUSG00000033009.16	ENSMUST00000060632.8	5214	13	25696	3251	7928	-3251	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_2	5.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCTTCGTTCTGTAGTAA	8441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94789614	94791298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_94789718_94790096_94790156_94790806
tx.18516	chr8	-	710	2	FSM	ENSMUSG00000031755.7	ENSMUST00000170208.2	491	2	-29	-190	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTTGTTGTTTATAAATT	5601	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94796870	94794581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_94795011_94796589
tx.18517	chr8	+	393	3	FSM	ENSMUSG00000031757.8	ENSMUST00000034207.8	398	3	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGGTGGCTCAGAGTAT	6286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94863829	94865659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_94863901_94864858_94864925_94865403
tx.18518	chr8	+	389	3	FSM	ENSMUSG00000031762.8	ENSMUST00000034214.8	511	3	118	4	-78	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13494	junction_2	132	128944	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGCTTGTCTCTGTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94899409	94900192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_94899504_94899754_94899821_94899963
tx.18519	chr8	+	434	3	FSM	ENSMUSG00000031765.9	ENSMUST00000034215.8	549	3	115	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14682	junction_2	74.5	184030	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGGTTTTCTTGGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94905824	94906955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_94905967_94906450_94906517_94906729
tx.1852	chr10	-	1065	7	ISM	ENSMUSG00000020048.14	ENSMUST00000020238.14	2825	18	46	7497	46	3609	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	3024	junction_4	197.189418242122	693	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACCAAAAACTAAGAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86541327	86534200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_86534303_86534447_86534560_86537560_86537893_86538772_86538890_86539323_86539466_86540157_86540261_86541170
tx.18520	chr8	+	300	2	ISM	ENSMUSG00000031765.9	ENSMUST00000034215.8	549	3	733	0	574	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14682	junction_1	0	2478	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGGTTTTCTTGGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94906442	94906955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_94906517_94906729
tx.18521	chr8	+	1936	8	FSM	ENSMUSG00000031770.17	ENSMUST00000161576.8	1952	8	5	11	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	396	junction_6	55.7864002152818	545	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCATTGTCCTGGCAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95113070	95121994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_95113367_95115983_95116062_95116148_95116224_95117345_95117477_95118359_95118483_95118801_95119153_95120423_95120530_95121218
tx.18522	chr8	+	823	3	NNC	ENSMUSG00000034361.11	novel	2342	16	NA	NA	5679	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCTTTTTCTAAGTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95294956	95297018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_95295123_95295218_95295456_95296598
tx.18523	chr8	-	1766	8	NNC	ENSMUSG00000031774.9	novel	2873	8	NA	NA	0	717	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_3	171.915855070118	79	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTTAGAGAAGCAAACTTAC	3886	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95328329	95301567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_95302486_95306027_95306093_95309511_95309641_95313958_95314074_95314630_95314730_95315403_95315542_95315938_95316036_95328124
tx.18524	chr8	-	1782	8	NNC	ENSMUSG00000031774.9	novel	2873	8	NA	NA	0	717	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_3	171.915855070118	362	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTTAGAGAAGCAAACTTAC	3886	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95328329	95301567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_95302486_95306027_95306093_95309511_95309641_95313942_95314074_95314630_95314730_95315403_95315542_95315938_95316036_95328124
tx.18525	chr8	-	1718	9	NNC	ENSMUSG00000031774.9	novel	2873	8	NA	NA	-8	717	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	197.424036023986	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTTAGAGAAGCAAACTTAC	3853	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95328362	95301567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_95302486_95306027_95306093_95309511_95309641_95313942_95314074_95314630_95314730_95315403_95315542_95315938_95316036_95328124_95328213_95328309
tx.18526	chr8	+	2442	15	FSM	ENSMUSG00000050079.11	ENSMUST00000060389.10	3852	15	4	1406	4	-884	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_1	22.9280151245375	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCACAAACATCTCTAACCAG	8115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95328568	95385497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_95329059_95349461_95349964_95355683_95355737_95356377_95356491_95358683_95358811_95359733_95359793_95362052_95362120_95363251_95363384_95364890_95365007_95366150_95366295_95373211_95373324_95376380_95376484_95376822_95376976_95380854_95380960_95385331
tx.18527	chr8	+	933	2	FSM	ENSMUSG00000050079.11	ENSMUST00000121101.2	3092	2	-32	2191	9	-2191	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGATGGGTTAGTGCTGG	8120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95328573	95349909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_95329059_95349461
tx.18528	chr8	+	2109	15	FSM	ENSMUSG00000050079.11	ENSMUST00000211983.2	3397	15	-105	1393	-4	-871	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	38.5556184529014	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCAGTTGTACGCACATT	8135	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95328588	95385510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_95328733_95349461_95349964_95355683_95355737_95356377_95356491_95358683_95358811_95359733_95359793_95362052_95362120_95363251_95363384_95364890_95365007_95366150_95366295_95373211_95373324_95376380_95376484_95376822_95376976_95380854_95380960_95385331
tx.18529	chr8	+	1618	6	ISM	ENSMUSG00000050079.11	ENSMUST00000212729.2	2800	14	37615	-8	10978	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_3	5.11468474101777	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGAATTGTTGACTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95366207	95386389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_95366295_95373211_95373324_95376380_95376484_95376822_95376976_95380854_95380960_95385331
tx.1853	chr10	-	608	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000056366.6	novel	402	1	NA	NA	-39	280	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTTCACCACAAACAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86568291	86567570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_-_86567888_86568000
tx.18530	chr8	+	1930	6	FSM	ENSMUSG00000031776.18	ENSMUST00000034228.16	2063	6	133	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	229	junction_5	11.4612390255155	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTTGATGTGCATTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95393360	95401053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_95393530_95394224_95394287_95396948_95397056_95397922_95398009_95398689_95398787_95399644
tx.18531	chr8	+	3120	3	FSM	ENSMUSG00000031778.14	ENSMUST00000034230.7	3315	3	195	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGGAACTTTTCTCTGGG	2374	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95498831	95509055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_95498963_95504655_95504777_95506187
tx.18532	chr8	-	1558	9	FSM	ENSMUSG00000031781.15	ENSMUST00000162538.9	4359	9	51	2750	-42	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	1341	junction_8	171.134997881789	1757	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGTGAGTGTGTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95564935	95549181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_95549836_95550280_95550360_95551843_95551960_95553262_95553337_95554904_95555068_95555781_95555859_95558400_95558554_95559142_95559329_95564879
tx.18533	chr8	-	1503	8	ISM	ENSMUSG00000031781.15	ENSMUST00000034233.15	1807	9	5563	-6	-7	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1537	junction_1	133.441265838463	1785	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTGTGAGTGTGTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95559330	95549182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_95549836_95550280_95550360_95551843_95551960_95553262_95553337_95554904_95555068_95555781_95555859_95558400_95558554_95559142
tx.18534	chr8	+	1711	9	FSM	ENSMUSG00000031782.16	ENSMUST00000034234.15	1789	9	78	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_5	12.7322179921646	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTGTTGTTTTGTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95565026	95581523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_95565126_95569245_95569397_95571404_95571541_95576752_95576896_95577142_95577228_95578478_95578584_95579742_95579899_95580232_95580287_95580741
tx.18535	chr8	+	1182	9	FSM	ENSMUSG00000031783.11	ENSMUST00000109521.4	1580	9	68	330	0	171	multi-exon	FALSE	canonical	3	1933	junction_5	86.4056566435323	10336	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATGCGTCATCGTGCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95584145	95590540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_95584270_95584374_95584425_95586871_95586941_95587071_95587125_95588338_95588468_95588809_95588862_95589148_95589318_95589437_95589513_95590079
tx.18536	chr8	-	255	2	ISM	ENSMUSG00000063605.6	ENSMUST00000077955.6	2304	9	26	10776	26	-80	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGCTGGCTGAGTCTCCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95644700	95640272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_95640437_95644609
tx.18537	chr8	+	2570	20	FSM	ENSMUSG00000031787.9	ENSMUST00000034239.9	3777	20	55	1152	55	-1152	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_1	16.4357221924964	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCTTATGAGAGGAATAT	864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95807868	95825687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_95807933_95809225_95809522_95813915_95814047_95816587_95816706_95820143_95820245_95820541_95820584_95821107_95821192_95821347_95821464_95821800_95821873_95821979_95822131_95822233_95822425_95822516_95822648_95822983_95823035_95823839_95823917_95824026_95824147_95824242_95824393_95824582_95824660_95824733_95824809_95824946_95825064_95825281
tx.18538	chr8	+	664	4	NNC	ENSMUSG00000031787.9	novel	3777	20	NA	NA	61	-6797	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_3	67.6609192961491	23	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTTAGTGAAAGCTTGGT	870	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95807874	95814666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_95807933_95809225_95809522_95813915_95814047_95814487
tx.18539	chr8	+	694	7	ISM	ENSMUSG00000090206.9	ENSMUST00000161029.9	968	8	1538	0	1451	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5723301886761	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAGGCCCTAGGCTCGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96039680	96047957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_96039808_96046303_96046366_96046613_96046789_96047109_96047172_96047277_96047343_96047533_96047567_96047787
tx.1854	chr10	-	3207	11	NIC	ENSMUSG00000035365.16	novel	3594	11	NA	NA	23	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	53	junction_4	10.555093557141	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGGGTGGTTTATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87982772	87927293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_87929049_87929456_87929590_87946160_87946243_87947457_87947637_87950382_87950564_87960669_87960825_87962018_87962190_87968955_87969061_87975727_87975959_87979801_87979958_87982713
tx.18540	chr8	+	1745	7	FSM	ENSMUSG00000031792.16	ENSMUST00000034245.16	1758	7	15	-2	-4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_6	19.6185852927495	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTGTCTTATTTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96058926	96074137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_96059094_96059995_96060163_96065261_96065446_96069749_96069804_96070584_96070691_96071916_96072001_96073154
tx.18541	chr8	+	2613	4	ISM	ENSMUSG00000031790.9	ENSMUST00000034243.7	5135	10	17847	787	244	-787	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	4.24264068711928	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTTGTCTACAGGGGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96096742	96100921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_96096900_96097323_96097475_96097633_96097750_96098732
tx.18542	chr8	-	1263	6	FSM	ENSMUSG00000031796.8	ENSMUST00000034249.8	1295	6	32	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	468	junction_1	23.7200337267888	1197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATCTTTACTTTTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96161465	96146876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_96147298_96147763_96147875_96148685_96148875_96149410_96149523_96151244_96151325_96161115
tx.18543	chr8	-	1185	5	FSM	ENSMUSG00000031796.8	ENSMUST00000212684.2	1023	5	-9	-153	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_4	193.603977231874	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATCTTTACTTTTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96161467	96146876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_96147298_96147763_96147875_96148685_96148875_96149410_96149523_96161115
tx.18544	chr8	-	488	2	ISM	ENSMUSG00000046707.10	ENSMUST00000056919.9	3773	12	35437	1876	7324	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_1	0	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGATGGAGCGTATTTAGT	NA	False	NA	-98	True	NA	NA	NA	96180018	96174599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_96175047_96179977
tx.18545	chr8	+	1288	9	FSM	ENSMUSG00000036598.5	ENSMUST00000041569.5	1288	9	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	2.77263412660235	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGGTCCTCTCACTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96260712	96285518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_96260901_96263092_96263220_96264719_96264882_96267426_96267583_96269249_96269331_96272521_96272678_96277824_96277933_96283818_96283975_96285364
tx.18546	chr8	+	593	4	NNC	ENSMUSG00000036598.5	novel	1288	9	NA	NA	14138	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.90668171555645	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGGTCCTCTCACTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96274850	96285518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_96275026_96277824_96277933_96283818_96283975_96285364
tx.18547	chr8	+	632	4	NNC	ENSMUSG00000036598.5	novel	1288	9	NA	NA	14138	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5.43650214343336	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGGTCCTCTCACTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96274850	96285518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_96275065_96277824_96277933_96283818_96283975_96285364
tx.18548	chr8	+	2396	3	FSM	ENSMUSG00000031669.11	ENSMUST00000034094.11	2519	3	60	63	-41	-63	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_2	2	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTTAGCATAAAATTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96360140	96371625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_96360412_96364437_96364672_96369734
tx.18549	chr8	+	1370	7	NIC	ENSMUSG00000031671.12	novel	1707	7	NA	NA	-7	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	22	junction_1	132.221720353856	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTTCAAACTTTCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96442535	96445635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_96442592_96442980_96443123_96443234_96443430_96443548_96443670_96444548_96444730_96444820_96444964_96445103
tx.1855	chr10	-	2945	11	FSM	ENSMUSG00000035365.16	ENSMUST00000048518.16	3594	11	37	612	-26	-612	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_10	14.3666279968544	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGAAAAATCCCCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87982766	87927905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_87929049_87929456_87929590_87946160_87946243_87947457_87947637_87950382_87950564_87960669_87960825_87962018_87962190_87968955_87969061_87975727_87975959_87979801_87979958_87982357
tx.18550	chr8	+	728	3	NIC	ENSMUSG00000031671.12	novel	1707	7	NA	NA	-4	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	6	junction_1	211	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTTCAAACTTTCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96442538	96445635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_96442592_96444820_96444964_96445103
tx.18551	chr8	+	676	2	ISM	ENSMUSG00000031671.12	ENSMUST00000154593.2	774	4	1183	-136	1183	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	428	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTTCAAACTTTCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96444819	96445635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_96444964_96445103
tx.18552	chr8	-	1535	11	ISM	ENSMUSG00000036550.17	ENSMUST00000212228.2	2925	13	29	2982	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1066	junction_5	84.9173716032238	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAGGGCAATTTACCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96534061	96491561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_96491779_96496128_96496240_96496371_96496499_96497169_96497339_96498598_96498803_96500059_96500115_96500198_96500268_96501257_96501357_96501906_96502015_96515257_96515533_96533960
tx.18553	chr8	-	368	2	ISM	ENSMUSG00000036550.17	ENSMUST00000212323.2	3277	9	-12	19851	-12	-19851	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1302	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAGCAGGAAATACAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96534073	96515277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_96515533_96533960
tx.18554	chr8	-	355	3	FSM	ENSMUSG00000110489.2	ENSMUST00000212289.2	338	3	-21	4	-8	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	187	2056	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGTTCAAATAGTACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96544327	96535183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_96535388_96539051_96539129_96544253
tx.18555	chr8	-	2212	5	ISM	ENSMUSG00000036534.7	ENSMUST00000040481.4	3333	12	9723	0	37	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	259	junction_3	48.9974489131832	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTCTCCTTTATCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96570444	96562547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_96564300_96567041_96567097_96568149_96568350_96568803_96568952_96570387
tx.18556	chr8	-	3267	11	ISM	ENSMUSG00000036534.7	ENSMUST00000040481.4	3333	12	630	0	613	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	251	junction_7	40.918944267906	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTCTCCTTTATCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96579537	96562547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_96564300_96567041_96567097_96568149_96568350_96568803_96568952_96570387_96570503_96570731_96570790_96571515_96571615_96572426_96572572_96572760_96572960_96575008_96575397_96579429
tx.18557	chr8	-	3293	12	FSM	ENSMUSG00000036534.7	ENSMUST00000212270.2	3315	12	26	-4	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_11	48.4964001390441	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTCTCCTTTATCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96580141	96562547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_96564300_96567041_96567097_96568149_96568350_96568803_96568952_96570387_96570503_96570731_96570790_96571515_96571615_96572426_96572572_96572760_96572960_96575008_96575397_96579429_96579536_96580113
tx.18558	chr8	-	2385	10	FSM	ENSMUSG00000031672.9	ENSMUST00000034097.8	2530	10	144	1	-11	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	353	junction_1	94.2456731822753	650	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGTCTGCTTTTCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96615031	96590762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_96591880_96593448_96593600_96596099_96596266_96597402_96597554_96598518_96598624_96598803_96598966_96601031_96601092_96602373_96602503_96604340_96604498_96614844
tx.18559	chr8	+	725	3	Intergenic	novelGene_349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGATCTATACCTGTGTG	9194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99425786	99427678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_99426284_99427258_99427339_99427530
tx.1856	chr10	-	1518	4	ISM	ENSMUSG00000035365.16	ENSMUST00000168163.8	825	6	8	12732	8	-5811	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_3	26.1661358757205	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGTAGTGGTTGAATAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87982787	87974823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_87975959_87979801_87979958_87982357_87982511_87982713
tx.18560	chr8	-	358	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063696.8	novel	954	1	NA	NA	-73	94	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGATGTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103592503	103591382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_-_103591551_103592313
tx.18561	chr8	-	1036	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063696.8	novel	954	1	NA	NA	-73	84	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103592503	103591392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_-_103591858_103591932
tx.18562	chr8	-	922	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063696.8	novel	954	1	NA	NA	-74	79	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103592504	103591397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_-_103591780_103591964
tx.18563	chr8	-	2390	10	FSM	ENSMUSG00000035824.8	ENSMUST00000050211.7	2406	10	1	15	1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_4	11.1055541659718	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGATGTAAATTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104975189	104953331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_104954984_104955844_104955926_104957176_104957257_104957791_104957881_104963403_104963478_104965375_104965466_104967747_104967802_104970016_104970092_104974278_104974317_104975032
tx.18564	chr8	-	2312	9	FSM	ENSMUSG00000035824.8	ENSMUST00000211995.2	2312	9	1	-1	1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	19.1012924955355	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGTAAATTCATTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104975182	104953328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_104954984_104955844_104955926_104957176_104957257_104957791_104957881_104965375_104965466_104967747_104967802_104970016_104970092_104974278_104974317_104975032
tx.18565	chr8	-	482	3	ISM	ENSMUSG00000035824.8	ENSMUST00000211995.2	2312	9	1	16468	1	-4352	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_2	5.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATGGACTGTTCACATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104975182	104969797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_104970092_104974278_104974317_104975032
tx.18566	chr8	+	855	2	FSM	ENSMUSG00000054400.17	ENSMUST00000212433.2	1304	2	21	428	0	-428	multi-exon	FALSE	canonical	3	282	junction_1	0	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAAAAGAAAGATCCTTT	4834	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104977534	104984578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_104977728_104983916
tx.18567	chr8	+	625	4	FSM	ENSMUSG00000054400.17	ENSMUST00000034342.13	667	4	42	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_3	21.1397466609439	1575	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTCTGCAGATCTCCTT	4834	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104977534	104990079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_104977728_104983916_104984076_104988105_104988202_104989902
tx.18568	chr8	+	1631	6	FSM	ENSMUSG00000031875.8	ENSMUST00000212081.2	850	6	-59	-722	-59	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	15.7784663386528	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGGAGTGCGCCTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105066890	105074304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_105066992_105067311_105067528_105070389_105070546_105071408_105071505_105071903_105072025_105073363
tx.18569	chr8	+	1582	5	NNC	ENSMUSG00000031875.8	novel	1616	5	NA	NA	31	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	14.1686273153048	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGGAGTGCGCCTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105067256	105074304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_105067528_105070389_105070546_105071408_105071505_105071903_105072025_105073366
tx.1857	chr10	+	1259	10	FSM	ENSMUSG00000035351.17	ENSMUST00000052355.15	1267	10	13	-5	13	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	484	junction_1	64.7921653547559	1986	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCTATTGTGTTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87982866	88014257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_87982935_87984023_87984242_87989385_87989511_87994719_87994793_87996737_87996833_88007856_88007948_88010247_88010430_88010744_88010796_88012934_88013029_88013995
tx.18570	chr8	+	1522	5	FSM	ENSMUSG00000031875.8	ENSMUST00000034343.5	1616	5	94	0	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	6.68954408012983	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGGAGTGCGCCTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105067319	105074304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_105067528_105070389_105070546_105071408_105071505_105071903_105072025_105073363
tx.18571	chr8	-	1648	13	FSM	ENSMUSG00000035770.9	ENSMUST00000041769.8	4627	13	228	2751	-75	-36	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_6	10.797054639525	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGTGTGAGATGCACATTT	1996	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105169451	105147062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_105147315_105148918_105149036_105149744_105149863_105150217_105150260_105152070_105152131_105152590_105152703_105154677_105154814_105156046_105156141_105157032_105157203_105163994_105164226_105167105_105167223_105169105_105169180_105169326
tx.18572	chr8	-	446	3	ISM	ENSMUSG00000035770.9	ENSMUST00000212230.2	1407	10	17363	38	211	-38	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_1	9	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGAGTGTGAGATGCACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105149823	105147064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_105147315_105148918_105149036_105149744
tx.18573	chr8	-	1684	19	ISM	ENSMUSG00000031878.19	ENSMUST00000034349.10	1808	20	4139	0	-2251	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	645	junction_15	54.0858085948433	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTCTTGTTGTCTGGAA	7472	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105257130	105237659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_105237900_105239831_105239882_105239972_105240088_105242760_105242854_105243279_105243367_105244538_105244579_105244819_105244896_105246176_105246311_105246395_105246456_105249278_105249371_105249793_105249858_105250207_105250271_105250966_105251077_105252911_105253022_105253714_105253795_105254009_105254082_105254818_105254850_105256687_105256749_105257024
tx.18574	chr8	-	1797	19	NNC	ENSMUSG00000031878.19	novel	1808	20	NA	NA	-4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_16	181.135683404649	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTCTTGTTGTCTGGAA	3352	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105261250	105237659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_105237900_105239831_105239882_105239972_105240088_105242760_105242854_105243279_105243367_105244538_105244579_105244819_105244896_105246176_105246311_105246395_105246456_105249278_105249371_105249793_105249858_105250207_105250271_105250966_105251077_105252911_105253022_105253714_105253795_105254009_105254121_105256687_105256749_105257024_105257129_105261143
tx.18575	chr8	-	1715	19	FSM	ENSMUSG00000031878.19	ENSMUST00000162466.8	1735	19	20	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_15	163.229558869982	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTCTTGTTGTCTGGAA	3354	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105261248	105237659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_105237900_105239831_105239882_105239972_105240088_105242760_105242854_105243279_105243367_105244538_105244579_105244819_105244896_105246176_105246311_105246395_105246456_105249278_105249371_105249793_105249858_105250207_105250271_105250966_105251077_105252911_105253022_105253714_105253795_105254818_105254850_105256687_105256749_105257024_105257129_105261143
tx.18576	chr8	-	1789	20	FSM	ENSMUSG00000031878.19	ENSMUST00000034349.10	1808	20	19	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	645	junction_15	52.7352662859429	630	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTCTTGTTGTCTGGAA	3352	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105261250	105237659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_105237900_105239831_105239882_105239972_105240088_105242760_105242854_105243279_105243367_105244538_105244579_105244819_105244896_105246176_105246311_105246395_105246456_105249278_105249371_105249793_105249858_105250207_105250271_105250966_105251077_105252911_105253022_105253714_105253795_105254009_105254082_105254818_105254850_105256687_105256749_105257024_105257129_105261143
tx.18577	chr8	-	1713	18	NNC	ENSMUSG00000031878.19	novel	1735	19	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_15	185.532283912268	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTCTTGTTGTCTGGAA	3354	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105261248	105237659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_105237900_105239831_105239882_105239972_105240088_105242760_105242854_105243279_105243367_105244538_105244579_105244819_105244896_105246176_105246311_105246395_105246456_105249278_105249371_105249793_105249858_105250207_105250271_105250966_105251077_105252911_105253022_105253714_105253795_105256658_105256749_105257024_105257129_105261143
tx.18578	chr8	+	1695	9	NNC	ENSMUSG00000031883.14	novel	592	3	NA	NA	-224	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0.661437827766148	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGTTCTCCCTGTGTGCCT	3040	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105267716	105276975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_105267866_105270041_105270240_105272855_105272916_105273173_105273241_105274318_105274438_105274817_105274914_105275016_105275080_105275568_105275725_105276188
tx.18579	chr8	+	2178	2	FSM	ENSMUSG00000048371.9	ENSMUST00000059588.8	5692	2	17	3497	17	-3497	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCCAGTTGCAGATTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105318099	105322161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_105318228_105320111
tx.1858	chr10	+	1313	10	FSM	ENSMUSG00000035351.17	ENSMUST00000169309.3	1277	10	-29	-7	21	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	172.048514547568	352	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCTATTGTGTTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87982909	88014257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_87983032_87984023_87984242_87989385_87989511_87994719_87994793_87996737_87996833_88007856_88007948_88010247_88010430_88010744_88010796_88012934_88013029_88013995
tx.18580	chr8	-	665	5	NNC	ENSMUSG00000031879.15	novel	918	5	NA	NA	-16	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	327.680484618782	1978	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTATGCCTTAGCGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105368349	105366474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_105366719_105367151_105367198_105367599_105367726_105367942_105368021_105368178
tx.18581	chr8	+	389	2	Intergenic	novelGene_350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTACGGGGCGTTCCTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105734817	105738487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_105735166_105738446
tx.18582	chr8	+	2594	6	NNC	ENSMUSG00000031885.15	novel	395	2	NA	NA	-195	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	76.1876630433038	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATGACTCTTTATTGATA	3551	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105897110	105944621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_105897202_105897937_105898025_105905224_105905342_105921106_105921224_105929083_105929180_105942535
tx.18583	chr8	+	2605	6	NNC	ENSMUSG00000031885.15	novel	395	2	NA	NA	-179	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	72.45798782743	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGTCATGACTCTTTATT	3567	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105897126	105944617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_105897202_105897937_105898025_105905224_105905342_105921106_105921224_105929083_105929211_105942535
tx.18584	chr8	+	2626	6	FSM	ENSMUSG00000031885.15	ENSMUST00000052209.9	2883	6	257	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_5	43.0748186299142	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATGACTCTTTATTGATA	4003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105897562	105944621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_105897686_105897937_105898025_105905224_105905342_105921106_105921224_105929083_105929180_105942535
tx.18585	chr8	+	2665	6	FSM	ENSMUSG00000031885.15	ENSMUST00000109392.9	2891	6	234	-8	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_5	26.6578318698277	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATGACTCTTTATTGATA	3995	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105897554	105944621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_105897686_105897937_105898025_105905224_105905342_105921106_105921224_105929083_105929211_105942535
tx.18586	chr8	+	2521	5	FSM	ENSMUSG00000031885.15	ENSMUST00000109395.8	2709	5	196	-8	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_4	76.5714535580983	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATGACTCTTTATTGATA	4012	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105897571	105944621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_105897686_105897937_105898025_105905224_105905342_105921106_105921224_105942535
tx.18587	chr8	+	2293	3	ISM	ENSMUSG00000031885.15	ENSMUST00000109392.9	2891	6	23823	-8	22948	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_2	39.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATGACTCTTTATTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105921143	105944621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_105921224_105929083_105929211_105942535
tx.18588	chr8	+	2874	16	FSM	ENSMUSG00000031889.10	ENSMUST00000034361.10	2916	16	42	0	-19	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	239	junction_9	14.7126551724093	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAGCTGTTGATTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105951818	105979685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_105952119_105957759_105957843_105961113_105961198_105965054_105965099_105966302_105966383_105966609_105966705_105967472_105967571_105967658_105967772_105973052_105973187_105973469_105973554_105974727_105974811_105975374_105975419_105976050_105976095_105976228_105976288_105977350_105977424_105978229
tx.18589	chr8	+	2898	17	NNC	ENSMUSG00000031889.10	novel	2916	16	NA	NA	15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_4	88.3637501679846	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAGCTGTTGATTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105951852	105979685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_105952119_105957759_105957843_105961113_105961198_105965054_105965099_105966142_105966201_105966302_105966383_105966609_105966705_105967472_105967571_105967658_105967772_105973052_105973187_105973469_105973554_105974727_105974811_105975374_105975419_105976050_105976095_105976228_105976288_105977350_105977424_105978229
tx.1859	chr10	+	1193	9	ISM	ENSMUSG00000035351.17	ENSMUST00000169309.3	1277	10	1083	-7	1055	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	491	junction_2	63.2672901268894	638	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCTATTGTGTTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87984021	88014257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_87984242_87989385_87989511_87994719_87994793_87996737_87996833_88007856_88007948_88010247_88010430_88010744_88010796_88012934_88013029_88013995
tx.18590	chr8	-	1361	4	ISM	ENSMUSG00000031887.14	ENSMUST00000034359.10	1689	5	3927	281	-562	-281	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_1	4.96655480858378	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGAGATGCTGAGGTCTAG	4432	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105987314	105985198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_105985928_105986068_105986262_105986341_105986620_105987153
tx.18591	chr8	-	1405	5	FSM	ENSMUSG00000031887.14	ENSMUST00000034359.10	1689	5	0	284	0	-284	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_4	9.66953980290686	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCGGAGATGCTGAGGTC	505	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105991241	105985201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_105985928_105986068_105986262_105986341_105986620_105987153_105987313_105991192
tx.18592	chr8	+	805	3	ISM	ENSMUSG00000014776.8	ENSMUST00000014920.8	3176	4	274	2216	274	-2216	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	11	junction_1	1.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCCGGAACCCGAACCCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106003045	106006355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106003246_106005605_106005903_106006047
tx.18593	chr8	+	984	4	FSM	ENSMUSG00000014776.8	ENSMUST00000014920.8	3176	4	317	1875	317	-1875	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	2.05480466765633	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGAGGGTGAGCGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106003088	106006696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106003246_106005605_106005903_106006047_106006408_106006526
tx.18594	chr8	-	3528	8	FSM	ENSMUSG00000014837.16	ENSMUST00000171788.8	3552	8	26	-2	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_6	10.3628063333269	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGGCTTCTGTCTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106016134	106007039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106008777_106009618_106009717_106009806_106010113_106011297_106011431_106011661_106011806_106011887_106012502_106015400_106015798_106016035
tx.18596	chr8	-	1858	7	FSM	ENSMUSG00000014837.16	ENSMUST00000014981.8	3492	7	364	1270	4	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_6	11.0302614051829	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTTTGGGTGTCTGGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106016132	106008310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106008777_106009618_106009717_106009806_106010113_106011297_106011431_106011661_106011806_106011887_106012502_106016035
tx.18597	chr8	-	601	2	NNC	ENSMUSG00000014837.16	novel	3313	7	NA	NA	5796	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGATGGCTTTGGGTGTCT	1560	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106009886	106008315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_106008777_106009746
tx.18598	chr8	-	1293	7	NNC	ENSMUSG00000014837.16	novel	3492	7	NA	NA	25	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_6	14.1037819986934	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGATGGCTTTGGGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106016111	106008315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_106008777_106009618_106009717_106009806_106010113_106011297_106011431_106011661_106011806_106011887_106011963_106016035
tx.18599	chr8	-	649	3	ISM	ENSMUSG00000014837.16	ENSMUST00000212219.2	2044	7	5814	2	5786	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_2	1.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGATGGCTTTGGGTGTCT	1550	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106009896	106008315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_106008777_106009618_106009717_106009806
tx.186	chr1	+	3423	4	FSM	ENSMUSG00000010290.8	ENSMUST00000010434.8	3458	4	34	1	34	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_3	24.6080384337223	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGAGCAGGCCTGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43137903	43155106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_43138023_43139874_43140042_43150157_43150534_43152345
tx.1860	chr10	+	838	7	FSM	ENSMUSG00000020056.17	ENSMUST00000182183.8	838	7	3	-3	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_4	103.215658803411	759	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGTTTGTTGACCAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88037016	88081871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_88037155_88037673_88037773_88049508_88049575_88051828_88051937_88055114_88055223_88070255_88070321_88081617
tx.18600	chr8	-	815	3	ISM	ENSMUSG00000014837.16	ENSMUST00000171788.8	3552	8	21	5146	-3	2358	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_1	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATAGTACTGGCCGGCGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106016139	106012187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_106012502_106015400_106015798_106016035
tx.18601	chr8	+	1948	10	FSM	ENSMUSG00000014859.10	ENSMUST00000015003.10	1993	10	45	0	-9	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	369.398142461925	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGATCTGGTTCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106024339	106032002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106024508_106024912_106025023_106025166_106025329_106025627_106025672_106026689_106026752_106026950_106027249_106027884_106028098_106030816_106030865_106031064_106031110_106031204
tx.18602	chr8	+	1670	8	ISM	ENSMUSG00000014859.10	ENSMUST00000015003.10	1993	10	872	0	818	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	395.215466936863	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGATCTGGTTCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106025166	106032002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106025329_106025627_106025672_106026689_106026752_106026950_106027249_106027884_106028098_106030816_106030865_106031064_106031110_106031204
tx.18603	chr8	-	1613	2	ISM	ENSMUSG00000041679.10	ENSMUST00000070508.8	1922	5	-19	9482	-17	-9475	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATGTTTTGTTTTCTTTTT	6310	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106052927	106048454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_106049999_106052858
tx.18604	chr8	+	801	6	FSM	ENSMUSG00000014856.13	ENSMUST00000153146.9	801	6	2	-2	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_4	152.856010676715	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCCGTGTGGGTGATGATG	261	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106052995	106055689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106053107_106053682_106053779_106054801_106054862_106054953_106055117_106055239_106055325_106055403
tx.18605	chr8	+	770	6	FSM	ENSMUSG00000014856.13	ENSMUST00000015000.12	785	6	15	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	269	junction_4	56.0556865982391	2054	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCCGTGTGGGTGATGATG	266	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106053000	106055689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106053107_106053682_106053779_106054801_106054862_106054953_106055091_106055239_106055325_106055403
tx.18606	chr8	+	921	5	FSM	ENSMUSG00000014856.13	ENSMUST00000126705.9	895	5	-21	-5	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	392	junction_2	13.1909059582729	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCCGTGTGGGTGATGATG	264	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106052998	106055689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106053107_106053682_106053779_106054801_106054862_106054953_106055325_106055403
tx.18608	chr8	-	994	4	FSM	ENSMUSG00000014846.13	ENSMUST00000014990.13	1127	4	134	-1	134	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	3.55902608401044	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACTGACTCAGTCTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106198024	106194123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106194657_106194787_106194942_106195071_106195266_106197911
tx.18609	chr8	-	1298	8	ISM	ENSMUSG00000039199.7	ENSMUST00000044286.6	1737	11	7137	-47	3248	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3.04389653609465	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTAATGCTTTTGC	7088	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106203845	106199065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_106199514_106199622_106199702_106199837_106199932_106200115_106200199_106202655_106202769_106203002_106203162_106203245_106203371_106203648
tx.1861	chr10	+	836	7	FSM	ENSMUSG00000020056.17	ENSMUST00000020248.16	1052	7	67	149	8	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	318	junction_4	34.2377309736236	2181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGTTTGTTGACCAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88037021	88081871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_88037155_88037673_88037773_88049508_88049575_88051828_88051937_88055111_88055223_88070255_88070321_88081617
tx.18610	chr8	-	1348	7	ISM	ENSMUSG00000013160.8	ENSMUST00000013304.8	1629	8	26572	-1	1	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	556	junction_1	26.8762596604017	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCTGTCTGTCTGCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106266107	106251095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_106251697_106251788_106251867_106251954_106252132_106252255_106252334_106255805_106255886_106257446_106257626_106265952
tx.18611	chr8	-	1644	8	FSM	ENSMUSG00000013160.8	ENSMUST00000013304.8	1629	8	-13	-2	-13	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	556	junction_1	38.5115938016444	502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTGTCTGTCTGCTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106292692	106251094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106251697_106251788_106251867_106251954_106252132_106252255_106252334_106255805_106255886_106257446_106257626_106265952_106266125_106292414
tx.18612	chr8	+	1477	4	NNC	ENSMUSG00000104168.2	novel	766	2	NA	NA	-144	4159	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1.69967317119759	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTCTATATTTTATCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106292811	106308900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_106292907_106293000_106293103_106304178_106304486_106307927
tx.18613	chr8	+	3384	10	ISM	ENSMUSG00000005698.16	ENSMUST00000005841.16	3782	12	27314	0	-12118	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_8	80.3768899898749	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGAAGACTCCGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106390524	106409554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106391176_106391487_106391659_106393290_106393425_106396862_106396984_106397922_106398073_106401500_106401662_106402627_106402811_106403846_106403983_106406702_106406892_106408066
tx.18614	chr8	+	1747	3	ISM	ENSMUSG00000005698.16	ENSMUST00000132679.8	1554	10	40710	-1275	1267	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_1	91.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGAAGACTCCGTCTTTT	3857	False	NA	-7	True	NA	NA	NA	106403909	106409554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106403983_106406705_106406892_106408066
tx.18615	chr8	+	1743	3	ISM	ENSMUSG00000005698.16	ENSMUST00000005841.16	3782	12	40706	0	1274	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_1	103	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGAAGACTCCGTCTTTT	3864	False	NA	0	True	NA	NA	NA	106403916	106409554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106403983_106406702_106406892_106408066
tx.18616	chr8	-	1427	11	FSM	ENSMUSG00000038000.11	ENSMUST00000042608.8	3154	11	-11	1738	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_7	13.7637204272682	321	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGAGAGAGATTCAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106427727	106424788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106424961_106425039_106425132_106425245_106425596_106426026_106426124_106426210_106426363_106426492_106426528_106426635_106426681_106426913_106426991_106427078_106427173_106427334_106427472_106427551
tx.18617	chr8	-	1367	10	NIC	ENSMUSG00000038000.11	novel	3154	11	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	22	junction_8	60.9681155286196	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGAGAGAGATTCAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106427717	106424788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_106424961_106425039_106425132_106425245_106425596_106426026_106426124_106426210_106426363_106426492_106426528_106426635_106426681_106426913_106427035_106427334_106427472_106427551
tx.18618	chr8	+	1502	2	ISM	ENSMUSG00000005699.17	ENSMUST00000098444.9	1273	3	-17	-1	-11	1	intron_retention	FALSE	canonical	2	20	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTGGTCCTTCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106427768	106430126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106427950_106428805
tx.18619	chr8	+	1274	3	FSM	ENSMUSG00000005699.17	ENSMUST00000098444.9	1273	3	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_1	3	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTGGTCCTTCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106427785	106430126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106427950_106428805_106429029_106429239
tx.1862	chr10	-	1078	2	NNC	ENSMUSG00000020057.3	novel	372	4	NA	NA	16	-26501	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACTTATTTCATAACTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88214926	88202925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_88203954_88214876
tx.18620	chr8	+	1245	3	FSM	ENSMUSG00000005699.17	ENSMUST00000212634.2	678	3	4	-571	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTGGTCCTTCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106427783	106430126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106427919_106428805_106429029_106429239
tx.18621	chr8	+	1273	3	FSM	ENSMUSG00000005699.17	ENSMUST00000212352.2	1234	3	-35	-4	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	20	junction_1	6.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTGGTCCTTCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106427783	106430126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106427950_106428805_106429029_106429242
tx.18622	chr8	+	1241	3	NIC	ENSMUSG00000005699.17	novel	1234	3	NA	NA	-1	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTGGTCCTTCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106427784	106430126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_106427919_106428805_106429029_106429242
tx.18623	chr8	+	1248	3	FSM	ENSMUSG00000005699.17	ENSMUST00000212430.2	1261	3	14	-1	14	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	9	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTGGTCCTTCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106428294	106430126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106428436_106428805_106429029_106429242
tx.18624	chr8	-	1379	8	NNC	ENSMUSG00000013155.11	novel	1275	7	NA	NA	-9	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	34	junction_7	49.3529562003563	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGTTCCATAGGAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106434786	106430280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_106430654_106430744_106430882_106430982_106431147_106431266_106431393_106433197_106433371_106434180_106434376_106434455_106434556_106434675
tx.18625	chr8	-	1304	8	NNC	ENSMUSG00000013155.11	novel	1275	7	NA	NA	18	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	44	junction_7	45.9436211734623	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGTTCCATAGGAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106434824	106430280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_106430654_106430744_106430882_106430982_106431147_106431266_106431393_106433197_106433371_106434180_106434376_106434455_106434556_106434788
tx.18626	chr8	-	1431	7	FSM	ENSMUSG00000013155.11	ENSMUST00000013299.11	1275	7	-155	-1	57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_2	11.5854314646552	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTGTGTTCCATAGGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106434720	106430282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106430654_106430744_106430882_106430982_106431147_106431266_106431393_106433197_106433371_106434180_106434376_106434455
tx.18627	chr8	-	645	4	NNC	ENSMUSG00000013155.11	novel	1673	6	NA	NA	-9	-2848	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	34	junction_3	67.1432961822863	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCATGTGTGTGCGTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106434786	106433131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_106433371_106434180_106434376_106434455_106434556_106434675
tx.18628	chr8	-	2056	3	FSM	ENSMUSG00000013150.16	ENSMUST00000013294.16	4352	3	39	2257	5	1306	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	4	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATCATGGTGTGTGGTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106485257	106442742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106444283_106454619_106454964_106485085
tx.18629	chr8	-	723	3	NNC	ENSMUSG00000013150.16	novel	4352	3	NA	NA	-11	2655	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_1	14	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCATGTCTATATATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106485239	106451077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_106451303_106454619_106454964_106485085
tx.1863	chr10	+	1169	8	FSM	ENSMUSG00000020059.10	ENSMUST00000125612.2	1169	8	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_4	7.98212288268514	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTGGTTTCAGTATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88295525	88309098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_88295575_88298322_88298466_88299224_88299289_88299697_88299733_88302300_88302419_88303144_88303245_88305407_88305507_88308537
tx.18630	chr8	-	550	3	NNC	ENSMUSG00000013150.16	novel	4352	3	NA	NA	-5	-12028	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCTTGTCTCAAACTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106485267	106465760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_106466063_106468385_106468452_106485085
tx.18631	chr8	-	1356	3	ISM	ENSMUSG00000036672.6	ENSMUST00000212431.2	1762	12	5818	-4	517	4	intron_retention	FALSE	canonical	3	238	junction_1	6.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGCGATATTGTATTTCT	646	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106572815	106571300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_106571628_106571705_106571811_106571891
tx.18632	chr8	-	1776	13	FSM	ENSMUSG00000036672.6	ENSMUST00000040776.6	1814	13	46	-8	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_3	25.0593739391514	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGCGATATTGTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106578640	106571300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106571628_106571705_106571811_106571891_106572069_106572947_106573024_106573279_106573433_106573615_106573811_106575382_106575532_106575644_106575688_106575818_106575956_106576056_106576154_106576257_106576346_106576464_106576556_106578502
tx.18633	chr8	+	917	5	FSM	ENSMUSG00000008450.9	ENSMUST00000008594.9	948	5	45	-14	14	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	2641	junction_1	453.90775494587	629	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTTTTAATTAGTTAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106587256	106605976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106587338_106602165_106602291_106602985_106603058_106603141_106603241_106605436
tx.18634	chr8	+	1442	7	ISM	ENSMUSG00000036270.17	ENSMUST00000119261.8	4645	29	9687	-10	370	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	433	junction_3	21.9905282640807	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTTAGTTTGTCTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106617269	106619850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106617310_106617396_106617513_106617599_106617766_106617850_106618038_106618127_106618348_106618898_106619063_106619301
tx.18635	chr8	+	671	3	FSM	ENSMUSG00000044287.7	ENSMUST00000060167.6	617	3	-58	4	-58	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.5	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAAGTTGGTTCCTTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106620140	106621651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106620300_106620997_106621113_106621254
tx.18636	chr8	+	2699	2	ISM	ENSMUSG00000048310.9	ENSMUST00000049699.9	3255	3	12654	-19	12654	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGACCACGCTGACTGTGC	3434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106639726	106658429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106640279_106656282
tx.18637	chr8	-	635	3	FSM	ENSMUSG00000031897.10	ENSMUST00000212938.2	646	3	24	-13	22	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	246	junction_1	9	553	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAAGGCTGTGTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106663635	106662362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106662538_106662627_106662780_106663327
tx.18638	chr8	-	544	4	FSM	ENSMUSG00000031897.10	ENSMUST00000212686.2	554	4	15	-5	2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_3	46.7784375778224	1214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAAGGCTGTGTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106663655	106662362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106662538_106662627_106662780_106663327_106663387_106663497
tx.18639	chr8	+	522	2	NNC	ENSMUSG00000110457.3	novel	3186	3	NA	NA	-1529	-10484	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGGCGTGATGTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106698199	106700141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_106698309_106699728
tx.1864	chr10	+	930	8	FSM	ENSMUSG00000020059.10	ENSMUST00000123244.8	927	8	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	38.7767024521326	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTGGTTTCAGTATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88295522	88309098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_88295575_88298322_88298466_88299224_88299289_88299697_88299733_88303144_88303245_88305407_88305507_88308537_88308643_88308766
tx.18640	chr8	-	1713	10	FSM	ENSMUSG00000031898.10	ENSMUST00000034371.9	1698	10	-21	6	-21	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_5	8.79955105476592	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCCAAGTGTCTGAGCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106706082	106700150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106700484_106701326_106701463_106701813_106701890_106702751_106702837_106703892_106704070_106704191_106704262_106704531_106704674_106704773_106704904_106705343_106705471_106705645
tx.18641	chr8	+	1886	16	FSM	ENSMUSG00000031901.13	ENSMUST00000034375.11	1860	16	-19	-7	-19	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_9	22.4047613987146	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCTTCAACCTTACATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106738119	106780458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106738211_106742455_106742598_106752537_106752584_106756983_106757076_106758329_106758374_106760354_106760416_106762609_106762658_106768455_106768522_106768657_106768729_106771429_106771517_106772532_106772702_106775284_106775407_106776948_106777099_106778433_106778522_106779637_106779712_106779923
tx.18642	chr8	+	804	4	FSM	ENSMUSG00000031901.13	ENSMUST00000141374.2	777	4	-15	-12	0	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_1	8.05536398239638	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTTATTATATGTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106738138	106757527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106738211_106742455_106742598_106752537_106752584_106756983
tx.18643	chr8	+	1209	2	FSM	ENSMUSG00000086390.8	ENSMUST00000145343.2	984	2	-27	-198	-27	198	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTGGTATTTTGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106863669	106865355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106863983_106864459
tx.18644	chr8	+	2735	6	FSM	ENSMUSG00000031903.8	ENSMUST00000034377.8	2706	6	-29	0	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_2	8.49941174435031	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCCTTGTCCTGCTCTGA	6168	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106877001	106891347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106877246_106881499_106881657_106886794_106886914_106887212_106887312_106887715_106887941_106889456
tx.18645	chr8	+	3045	10	FSM	ENSMUSG00000031904.6	ENSMUST00000034378.5	3750	10	12	693	-6	168	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_7	138.200159010825	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTGCAAGAGGCCTGGA	1844	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106895500	106924645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106895587_106905733_106906293_106916248_106916375_106918970_106919116_106919782_106919907_106920124_106920229_106921052_106921150_106921993_106922144_106922484_106922669_106923175
tx.18646	chr8	+	2854	11	FSM	ENSMUSG00000031904.6	ENSMUST00000212377.2	2672	11	-4	-178	-4	178	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	147.708801362681	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCCTGGAATGTTCTACA	1846	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106895502	106924655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106895587_106905733_106905920_106906118_106906293_106916248_106916375_106918970_106919116_106919782_106919907_106920124_106920229_106921052_106921150_106921993_106922144_106922484_106922669_106923175
tx.18647	chr8	+	2342	2	ISM	ENSMUSG00000031904.6	ENSMUST00000213020.2	3200	9	0	16144	0	1703	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	200	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAACAAAAAAAACAA	1850	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106895506	106907995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106895587_106905733
tx.18648	chr8	+	3211	10	NIC	ENSMUSG00000031904.6	novel	3750	10	NA	NA	9	178	intron_retention	FALSE	canonical	3	12	junction_1	155.192671966491	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCCTGGAATGTTCTACA	1870	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106895526	106924655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_106895769_106905733_106906293_106916248_106916375_106918970_106919116_106919782_106919907_106920124_106920229_106921052_106921150_106921993_106922144_106922484_106922669_106923175
tx.18649	chr8	+	2961	9	ISM	ENSMUSG00000031904.6	ENSMUST00000034378.5	3750	10	10243	693	749	168	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_6	145.968104392706	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTGCAAGAGGCCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106905731	106924645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106906293_106916248_106916375_106918970_106919116_106919782_106919907_106920124_106920229_106921052_106921150_106921993_106922144_106922484_106922669_106923175
tx.1865	chr10	+	1045	9	FSM	ENSMUSG00000020059.10	ENSMUST00000020252.10	1139	9	95	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_4	7.47391296443837	764	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTGGTTTCAGTATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88295525	88309098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_88295575_88298322_88298466_88299224_88299289_88299697_88299733_88302300_88302419_88303144_88303245_88305407_88305507_88308537_88308643_88308766
tx.18650	chr8	-	831	2	ISM	ENSMUSG00000033106.7	ENSMUST00000035925.7	1246	5	8581	-276	8573	276	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	127	junction_1	0	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCAAGCAGTTCTTTTTT	6605	False	NA	-50	True	NA	NA	NA	106928984	106927072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_106927782_106928862
tx.18651	chr8	-	1612	4	ISM	ENSMUSG00000033106.7	ENSMUST00000035925.7	1246	5	0	-279	0	279	intron_retention	FALSE	canonical	3	127	junction_1	3.29983164553722	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGCAGTTCTTTTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106937565	106927069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_106927782_106928862_106928984_106930962_106931173_106936996
tx.18652	chr8	-	1525	5	FSM	ENSMUSG00000033106.7	ENSMUST00000035925.7	1246	5	0	-279	0	279	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_1	2.91547594742265	703	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGCAGTTCTTTTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106937565	106927069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_106927782_106928862_106928984_106930962_106931173_106936996_106937264_106937350
tx.18653	chr8	+	2285	18	FSM	ENSMUSG00000060098.12	ENSMUST00000071592.12	3472	18	87	1100	0	-1100	multi-exon	FALSE	canonical	3	978	junction_13	68.9507622326015	610	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTGTGGCTCAATGGGG	1906	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106937654	106978326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106937715_106939007_106939204_106943875_106943913_106946551_106946702_106953842_106953952_106961479_106961593_106963425_106963668_106963853_106964035_106967817_106967946_106968742_106968879_106969926_106970011_106970433_106970482_106971288_106971379_106973694_106973857_106974980_106975056_106976939_106977101_106977828_106977926_106978110
tx.18654	chr8	+	3336	4	FSM	ENSMUSG00000031907.10	ENSMUST00000034382.8	2632	4	2	-706	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	5.09901951359278	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATCTTAACTCAGTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107141972	107153227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_107142403_107145702_107145830_107146146_107146243_107150544
tx.18655	chr8	+	853	2	ISM	ENSMUSG00000000303.13	ENSMUST00000167688.2	3203	17	-13	64400	-13	-48957	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	854	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAGCTCTGACTCATACAT	5064	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107329997	107331594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_107330175_107330918
tx.18656	chr8	+	3831	18	FSM	ENSMUSG00000041949.7	ENSMUST00000048359.5	4409	18	4	574	4	-574	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_2	14.9330686662985	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTCACCGAGCTGGTTG	1117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107409703	107577497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_107409888_107415283_107415925_107419198_107419316_107422080_107422229_107423235_107423373_107425587_107425751_107426796_107426880_107443240_107443354_107444601_107444779_107447285_107447416_107451725_107451918_107462317_107462453_107468644_107469104_107473925_107473984_107508325_107508467_107533672_107533825_107545087_107545202_107576810
tx.18657	chr8	-	2886	4	FSM	ENSMUSG00000046691.15	ENSMUST00000177068.8	2931	4	29	16	29	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	308	junction_2	18.5472369909914	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTTGTTCTGTTTACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107620196	107610510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_107613159_107613551_107613670_107613932_107613989_107620132
tx.18658	chr8	-	246	3	ISM	ENSMUSG00000046691.15	ENSMUST00000177068.8	2931	4	27	3051	27	-792	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	308	junction_1	3	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGCTTTTCTTTCCCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107620198	107613545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_107613670_107613932_107613989_107620132
tx.18659	chr8	+	2242	17	FSM	ENSMUSG00000041438.9	ENSMUST00000047629.7	2232	17	-7	-3	-7	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	1046	junction_1	100.936996902771	448	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGACATTTTAAATTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107620275	107649723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_107620345_107621222_107621384_107624691_107624884_107625073_107625159_107627477_107627568_107630864_107631077_107632756_107632929_107633021_107633114_107634836_107634934_107637573_107637639_107638857_107638981_107639979_107640137_107642787_107642895_107644213_107644310_107645251_107645438_107648803_107648915_107649496
tx.1866	chr10	-	796	4	FSM	ENSMUSG00000060002.15	ENSMUST00000073783.6	852	4	55	1	19	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_1	64.2201076160903	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGTTTTCTTCCATATCT	4224	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88339732	88322904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_88323125_88324243_88324386_88325442_88325591_88339446
tx.18660	chr8	+	2173	16	ISM	ENSMUSG00000041438.9	ENSMUST00000047629.7	2232	17	938	-1	0	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1116	junction_3	91.8083995189014	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTAGACATTTTAAATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107621220	107649721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_107621384_107624691_107624884_107625073_107625159_107627477_107627568_107630864_107631077_107632756_107632929_107633021_107633114_107634836_107634934_107637573_107637639_107638857_107638981_107639979_107640137_107642787_107642895_107644213_107644310_107645251_107645438_107648803_107648915_107649496
tx.18661	chr8	+	1428	11	ISM	ENSMUSG00000041438.9	ENSMUST00000047629.7	2232	17	12479	-3	11541	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1133	junction_3	90.3628795468582	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGACATTTTAAATTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107632761	107649723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_107632929_107633021_107633114_107634836_107634934_107637573_107637639_107638857_107638981_107639979_107640137_107642787_107642895_107644213_107644310_107645251_107645438_107648803_107648915_107649496
tx.18662	chr8	+	2084	11	FSM	ENSMUSG00000031913.10	ENSMUST00000034388.10	2178	11	95	-1	95	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_10	19.6532440070335	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTACTGGAGTCGTCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107757948	107772388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_107758124_107763268_107763381_107763474_107763623_107765559_107765622_107765721_107765842_107767505_107767663_107768823_107768973_107769245_107769328_107769543_107769764_107771086_107771228_107771670
tx.18663	chr8	-	1460	2	FSM	ENSMUSG00000078931.5	ENSMUST00000055316.10	1306	2	77	-231	77	231	multi-exon	FALSE	canonical	3	275	junction_1	0	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTACTGGTAGCCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107775169	107772920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_107773904_107774692
tx.18664	chr8	-	2051	5	FSM	ENSMUSG00000031916.18	ENSMUST00000095517.12	4476	5	5	2420	0	-2414	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_4	10.356157588604	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCACTCGCCTGCTGTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107783316	107775340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_107775763_107776773_107776943_107778844_107779673_107780653_107780862_107782892
tx.18665	chr8	+	1125	5	FSM	ENSMUSG00000031917.13	ENSMUST00000034392.13	3036	5	19	1892	-5	373	multi-exon	FALSE	canonical	3	714	junction_4	51.2688989544344	2785	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCATATGTGTGAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107783527	107785671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_107783623_107783724_107783812_107783904_107784044_107784678_107784820_107785008
tx.18666	chr8	-	415	2	ISM	ENSMUSG00000031919.7	ENSMUST00000034393.7	871	4	1902	0	1902	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTTCTGCTGCTGATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107790374	107788107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_107788457_107790308
tx.18667	chr8	-	656	3	ISM	ENSMUSG00000031919.7	ENSMUST00000034393.7	871	4	1413	0	1413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTTCTGCTGCTGATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107790863	107788107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_107788457_107790308_107790458_107790705
tx.18668	chr8	+	880	3	Intergenic	novelGene_351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTATCTCTTTTTTTTGG	3779	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107850625	107853422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_107850822_107851935_107852072_107852874
tx.18669	chr8	+	944	5	FSM	ENSMUSG00000031924.5	ENSMUST00000034400.5	4316	5	2	3370	2	-1889	multi-exon	FALSE	canonical	3	1441	junction_2	30.906107810593	2238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATTTTGTCATTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107877273	107910733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_107877506_107896442_107896572_107897022_107897053_107906045_107906075_107910209
tx.1867	chr10	-	701	4	ISM	ENSMUSG00000020061.19	ENSMUST00000238199.2	3650	27	78655	-57	-3092	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.63299316185545	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTTGTGCTGTCCTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88362232	88354143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_88354432_88358828_88359016_88360830_88360968_88362143
tx.18670	chr8	+	938	4	NNC	ENSMUSG00000031924.5	novel	4316	5	NA	NA	2	-1889	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	681.425140585686	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATTTTGTCATTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107877273	107910733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_107877506_107896442_107896572_107897022_107897076_107910209
tx.18671	chr8	+	924	3	NNC	ENSMUSG00000031924.5	novel	4316	5	NA	NA	3	-1889	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	725	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATTTTGTCATTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107877274	107910733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_107877506_107896442_107896572_107910169
tx.18672	chr8	-	1554	6	FSM	ENSMUSG00000003849.9	ENSMUST00000003947.9	1553	6	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_5	9.8264947972306	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGTGGCGCATGCCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108129838	108114855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_108115757_108117676_108117779_108118753_108118868_108119272_108119404_108119479_108119645_108129697
tx.18673	chr8	-	1071	4	ISM	ENSMUSG00000003848.15	ENSMUST00000003946.9	1658	9	6864	-3	481	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	419	junction_2	50.9923741575368	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTGTTTTATTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108144817	108139117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_108139816_108142737_108142883_108143625_108143724_108144687
tx.18674	chr8	-	1663	9	FSM	ENSMUSG00000003848.15	ENSMUST00000003946.9	1658	9	-2	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	419	junction_2	34.7902195307819	462	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTGTTTTATTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108151683	108139117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_108139816_108142737_108142883_108143625_108143724_108144687_108144859_108144945_108145075_108145331_108145404_108148113_108148245_108151369_108151503_108151597
tx.18675	chr8	-	1209	4	ISM	ENSMUSG00000039067.6	ENSMUST00000044106.6	1581	7	3506	-1	3500	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2410	junction_2	156.923194234915	870	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTGTCCTAGTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108311590	108307011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_108307952_108309013_108309106_108310804_108310886_108311494
tx.18676	chr8	-	1567	7	FSM	ENSMUSG00000039067.6	ENSMUST00000044106.6	1581	7	15	-1	9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2367	junction_5	170.70409745782	6460	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTGTCCTAGTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108315081	108307011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_108307952_108309013_108309106_108310804_108310886_108311494_108311593_108312336_108312430_108313256_108313349_108314910
tx.18677	chr8	+	687	2	Intergenic	novelGene_352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGAAGTGCCTTTTATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108323730	108325883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_108323854_108325319
tx.18678	chr8	-	1563	2	Intergenic	novelGene_353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACCTGGAATCTTCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108408878	108405378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_108406853_108408789
tx.18679	chr8	+	1160	5	NNC	ENSMUSG00000097393.9	novel	1351	6	NA	NA	7	-531	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.58602010819715	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCATTTTGCTTACATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109801861	109954159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_109802377_109904324_109904447_109905930_109905959_109949765_109949812_109953710
tx.1868	chr10	-	1681	5	NIC	ENSMUSG00000004359.17	novel	646	6	NA	NA	-16	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	169	junction_4	139.833829955415	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTTGCTTCTTGGTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88520893	88510636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_88511933_88513361_88513471_88514385_88514499_88515720_88515818_88520827
tx.18680	chr8	-	1540	3	Intergenic	novelGene_355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTAGCTTCACTGATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110185377	110182179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_110182606_110183802_110183912_110184372
tx.18681	chr8	+	1891	4	FSM	ENSMUSG00000031723.9	ENSMUST00000034159.8	1890	4	-10	9	-10	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	19.3045763140937	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCACTGTCAGCAGGGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110292513	110300674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_110292696_110295521_110295730_110298002_110298155_110299325
tx.18682	chr8	-	798	2	FSM	ENSMUSG00000031730.19	ENSMUST00000124138.2	490	2	188	-496	188	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	471	junction_1	0	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAGAATATATTGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110321394	110320108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_110320764_110321251
tx.18683	chr8	-	894	3	ISM	ENSMUSG00000031730.19	ENSMUST00000123605.9	2039	9	13629	0	-44	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	150	junction_2	160.5	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAGAATATATTGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110321626	110320108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_110320764_110321251_110321412_110321547
tx.18684	chr8	-	1767	8	ISM	ENSMUSG00000031730.19	ENSMUST00000123605.9	2039	9	2203	0	-188	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	150	junction_2	112.923307910226	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAGAATATATTGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110333052	110320108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_110320764_110321251_110321412_110321547_110321702_110322278_110322393_110322661_110322850_110328054_110328138_110329934_110330135_110332839
tx.18685	chr8	-	1814	9	FSM	ENSMUSG00000031730.19	ENSMUST00000123605.9	2039	9	225	0	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	150	junction_2	108.396191699709	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAGAATATATTGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110335030	110320108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_110320764_110321251_110321412_110321547_110321702_110322278_110322393_110322661_110322850_110328054_110328138_110329934_110330135_110332839_110333053_110334983
tx.18686	chr8	-	1574	4	ISM	ENSMUSG00000031729.7	ENSMUST00000034164.6	2304	10	15660	0	-6	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	462	junction_2	50.6578939773677	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGTGTTGGTCAAATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110404232	110397956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_110399274_110402007_110402057_110403389_110403483_110404117
tx.18687	chr8	-	2324	10	FSM	ENSMUSG00000031729.7	ENSMUST00000034164.6	2304	10	-20	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	462	junction_2	71.0226880807973	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGTGTTGGTCAAATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110419912	110397956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_110399274_110402007_110402057_110403389_110403483_110404117_110404319_110405486_110405598_110406055_110406140_110408738_110408827_110409229_110409411_110410307_110410411_110419815
tx.18688	chr8	-	2235	6	NIC	ENSMUSG00000031729.7	novel	6990	7	NA	NA	2	-5489	intron_retention	FALSE	canonical	3	617	junction_4	22.3302485431757	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATAAAAATCTATAGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110419890	110403893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_110405598_110406055_110406140_110408738_110408827_110409229_110409411_110410307_110410411_110419815
tx.18689	chr8	-	1081	7	FSM	ENSMUSG00000031729.7	ENSMUST00000212562.2	6990	7	-25	5934	-12	-5489	multi-exon	FALSE	canonical	3	544	junction_1	46.2508258184531	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATAAAAATCTATAGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110419904	110403893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_110404319_110405486_110405598_110406055_110406140_110408738_110408827_110409229_110409411_110410307_110410411_110419815
tx.1869	chr10	-	1752	6	FSM	ENSMUSG00000004359.17	ENSMUST00000138734.2	646	6	-16	-1090	-16	-28	multi-exon	FALSE	canonical	3	380	junction_4	47.5815090134813	587	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGCTGAATAAACCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88520893	88510661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_88511933_88513361_88513471_88514385_88514499_88515720_88515818_88516340_88516437_88520827
tx.18690	chr8	-	693	4	NNC	ENSMUSG00000069895.5	novel	7526	4	NA	NA	-6	240	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_1	11.5854314646552	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACATCCGGGAATCCACTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110464360	110459907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_110460378_110461936_110461996_110462091_110462158_110464262
tx.18691	chr8	-	594	3	FSM	ENSMUSG00000069895.5	ENSMUST00000212605.2	7439	3	3	6842	3	219	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	6.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAGCGTCTTCACTGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110464351	110459928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_110460375_110461936_110461996_110464262
tx.18692	chr8	-	657	4	FSM	ENSMUSG00000069895.5	ENSMUST00000212726.2	461	4	16	-212	-1	212	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_3	4.32049379893857	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTAATGTAGCGTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110464355	110459935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_110460375_110461936_110461996_110462091_110462158_110464262
tx.18693	chr8	-	417	3	ISM	ENSMUSG00000069895.5	ENSMUST00000212726.2	461	4	5	1601	5	-1601	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_2	5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCAACACCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110464366	110461748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_110461996_110462091_110462158_110464262
tx.18694	chr8	-	501	2	NIC	ENSMUSG00000069895.5	novel	7526	4	NA	NA	4	-1597	intron_retention	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCAACACCCCAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110464350	110461744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_110462158_110464262
tx.18695	chr8	-	347	2	ISM	ENSMUSG00000069895.5	ENSMUST00000212605.2	7439	3	-7	8661	-7	-1600	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCAACACCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110464361	110461747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_110461996_110464262
tx.18696	chr8	+	1196	3	FSM	ENSMUSG00000031731.17	ENSMUST00000173200.2	466	3	-257	-473	86	473	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	71.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTACCTGTTTCTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110505271	110532773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_110505595_110529578_110529783_110532104
tx.18697	chr8	+	3941	23	FSM	ENSMUSG00000031731.17	ENSMUST00000034171.9	3692	23	-244	-5	108	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_1	23.6531408988355	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCACATTGTACTTTATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110505293	110587995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_110505595_110529578_110529783_110545549_110545675_110553225_110553368_110554869_110554967_110556230_110556308_110559348_110559445_110559821_110559903_110560099_110560199_110564374_110564431_110565550_110565665_110569984_110570126_110570956_110571012_110576252_110576376_110577672_110577763_110578331_110578460_110580173_110580279_110581297_110581440_110581614_110581742_110581977_110582086_110582204_110582366_110585430_110585530_110586725
tx.18698	chr8	+	1871	6	ISM	ENSMUSG00000031731.17	ENSMUST00000034171.9	3692	23	75778	13	-3764	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_2	11.3243101335137	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACGGTTAAAGAAATCGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110581315	110587977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_110581440_110581614_110581742_110581977_110582086_110582204_110582366_110585430_110585530_110586725
tx.18699	chr8	+	1689	3	ISM	ENSMUSG00000031731.17	ENSMUST00000034171.9	3692	23	76682	-179	-2860	179	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_2	13.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTAAGAGTGCCGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110582219	110588169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_110582366_110585430_110585530_110586725
tx.187	chr1	-	1539	6	FSM	ENSMUSG00000008136.15	ENSMUST00000008280.14	1563	6	25	-1	25	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.4	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTGTGGACTAATGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43203096	43162232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_43162826_43167403_43167591_43170811_43170982_43180857_43181033_43192235_43192415_43202861
tx.1870	chr10	+	1939	2	NNC	ENSMUSG00000111919.2	novel	326	2	NA	NA	-201	3030	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAAACCTGTTTCCTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88540255	88543967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_88540492_88542264
tx.18700	chr8	-	1367	3	FSM	ENSMUSG00000001672.15	ENSMUST00000001722.14	1330	3	-28	-9	7	9	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTCTGCTGGACCACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110688828	110674536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_110675295_110686344_110686473_110688347
tx.18701	chr8	-	1198	2	Intergenic	novelGene_356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAGAAGGAGAAGGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110740303	110736813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_110737835_110740126
tx.18702	chr8	+	1473	9	NNC	ENSMUSG00000095941.4	novel	1649	10	NA	NA	234	53	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	7.68114574786861	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACCGATTGTGTGTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110828072	110838646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_110828167_110835615_110835754_110836017_110836077_110836409_110836623_110836712_110836955_110837152_110837295_110837438_110837593_110837930_110838005_110838289
tx.18703	chr8	+	1469	9	NNC	ENSMUSG00000095941.4	novel	1649	10	NA	NA	234	53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	7.68114574786861	9	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACCGATTGTGTGTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110828072	110838646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_110828167_110835615_110835750_110836017_110836077_110836409_110836623_110836712_110836955_110837152_110837295_110837438_110837593_110837930_110838005_110838289
tx.18704	chr8	-	1442	11	FSM	ENSMUSG00000003657.10	ENSMUST00000003754.8	1431	11	-8	-3	-4	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_9	44.1960405466372	432	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCACCCGTTTCTTGTCGTGG	7608	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110894846	110869166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_110869833_110872283_110872356_110873932_110873987_110874246_110874287_110874674_110874731_110875145_110875224_110875987_110876045_110879261_110879343_110881284_110881375_110883551_110883629_110894675
tx.18705	chr8	-	1158	9	NNC	ENSMUSG00000003657.10	novel	1431	11	NA	NA	15127	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	87	junction_8	57.2319840648566	181	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCACCCGTTTCTTGTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110879711	110869168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_110869833_110872283_110872356_110873932_110873987_110874246_110874287_110874674_110874731_110875145_110875224_110875987_110876045_110879261_110879343_110879655
tx.18706	chr8	+	1413	2	FSM	ENSMUSG00000046441.6	ENSMUST00000056972.6	3545	2	-31	2163	-31	1109	multi-exon	TRUE	canonical	3	60	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTCCAATATTGGTTGTAGT	3609	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110944589	110948955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_110944719_110947671
tx.18707	chr8	-	503	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000059854.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAGTTTTGTCATAATTT	6958	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111171042	111163455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_111163780_111170863
tx.18708	chr8	-	654	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00002075592.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_2	70.5	311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACATGAGGTATTTGGTC	9536	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111248602	111221983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_111222416_111227500_111227611_111248490
tx.18709	chr8	-	654	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00002075592.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_2	25.5	616	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACATGAGGTATTTGGTCA	9330	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111248808	111221982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_111222416_111227500_111227611_111248697
tx.1871	chr10	+	1783	6	NNC	ENSMUSG00000060904.15	novel	2080	6	NA	NA	301	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	489.878107287925	2108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGATGTCTTTAGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88567230	88579956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_88567427_88569404_88569543_88571759_88571842_88572952_88573065_88577768_88577952_88578884
tx.18710	chr8	+	1037	5	ISM	ENSMUSG00000059854.9	ENSMUST00000043141.7	15783	87	247111	84506	69599	38126	internal_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_2	2.48746859276655	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATGACCTTGTGTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111240719	111252379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_111240920_111241461_111241636_111245712_111245934_111249703_111249842_111252075
tx.18711	chr8	+	735	4	NNC	ENSMUSG00000059854.9	novel	15783	87	NA	NA	70452	38132	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	7.07106781186548	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGTGTCTCTCTAGCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111241572	111252385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_111241636_111245709_111245934_111249703_111249842_111252075
tx.18712	chr8	+	402	2	ISM	ENSMUSG00000059854.9	ENSMUST00000043141.7	15783	87	256137	84504	78625	38128	internal_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGACCTTGTGTCTCTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111249745	111252381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_111249842_111252075
tx.18713	chr8	+	536	3	ISM	ENSMUSG00000059854.9	ENSMUST00000043141.7	15783	87	256139	82089	78627	40543	internal_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	2.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGCAGTAACAGCAGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111249747	111254796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_111249842_111252075_111252260_111254538
tx.18714	chr8	-	487	3	NNC	ENSMUSG00000031750.16	novel	675	2	NA	NA	75	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGATGGTGAACCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111469255	111468460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_111468637_111468828_111468965_111469080
tx.18715	chr8	-	1460	6	ISM	ENSMUSG00000031750.16	ENSMUST00000076846.11	1709	7	50343	-11	-12862	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	39	junction_4	2.0591260281974	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGATGGTGAACCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111482192	111468460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_111469081_111469275_111469412_111474874_111475037_111475294_111475373_111476056_111476191_111481862
tx.18716	chr8	-	1756	7	NNC	ENSMUSG00000031750.16	novel	1709	7	NA	NA	-13290	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_6	7.54247233265651	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGCTTGCATCTCTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111482620	111468471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_111469081_111469275_111469412_111474874_111475037_111475294_111475373_111476056_111476191_111481862_111482283_111482403
tx.18717	chr8	+	811	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031750.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.24721912892465	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAACAAAAAACCTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111487039	111507688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_111487185_111495900_111496052_111506580_111506761_111507353
tx.18718	chr8	-	4285	26	FSM	ENSMUSG00000033732.11	ENSMUST00000042012.7	4525	26	-13	253	-2	-253	multi-exon	FALSE	canonical	3	597	junction_23	101.482656646345	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGCGTGTGTAGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111573421	111537123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_111537714_111538022_111538128_111538610_111538755_111539597_111539697_111540254_111540468_111541161_111541288_111542534_111542692_111542786_111542993_111544175_111544351_111547338_111547494_111548099_111548223_111550006_111550151_111550796_111550953_111552133_111552290_111552726_111552879_111558115_111558189_111560411_111560508_111562180_111562347_111563923_111564028_111564843_111564982_111566503_111566617_111567741_111567884_111568402_111568576_111569319_111569647_111571094_111571232_111573306
tx.18719	chr8	-	1118	5	ISM	ENSMUSG00000033732.11	ENSMUST00000212515.2	2957	13	-6	16455	-6	-322	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	597	junction_2	69.7293876353435	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTTTGTTCCGTGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111573425	111567521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_111567884_111568402_111568576_111569319_111569647_111571094_111571232_111573306
tx.1872	chr10	-	2147	14	ISM	ENSMUSG00000004356.9	ENSMUST00000004470.9	8821	62	68463	0	7259	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	182	junction_11	29.9322706857059	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCTGCCTGAAAGACTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88594203	88582468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_88582922_88583137_88583284_88584087_88584215_88585121_88585404_88586513_88586586_88587206_88587395_88588768_88588902_88589497_88589630_88590338_88590522_88590612_88590683_88591049_88591130_88592886_88592998_88593718_88593851_88594165
tx.18720	chr8	-	577	3	ISM	ENSMUSG00000033732.11	ENSMUST00000212515.2	2957	13	0	18253	0	-2120	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	689	junction_2	52	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAGTGTCTTCCTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111573419	111569319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_111569647_111571094_111571232_111573306
tx.18721	chr8	+	666	2	FSM	ENSMUSG00000031753.17	ENSMUST00000174702.2	577	2	-13	-76	2	76	multi-exon	FALSE	canonical	3	419	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACTTTGGCTTTAGACTC	9620	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111573657	111576981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_111573842_111576499
tx.18722	chr8	+	2741	19	FSM	ENSMUSG00000031753.17	ENSMUST00000034203.17	2737	19	-6	2	4	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	332	junction_8	32.668367302671	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGCCATTGTGTTGGGTCC	9622	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111573659	111608857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_111573842_111576499_111576583_111577967_111578083_111578917_111579093_111580301_111580496_111584568_111584675_111585168_111585327_111586517_111586577_111589882_111590017_111592608_111592728_111593192_111593360_111594833_111595000_111600777_111600841_111605637_111605755_111606264_111606358_111607226_111607311_111607506_111607609_111608002_111608132_111608362
tx.18723	chr8	+	1544	11	ISM	ENSMUSG00000031753.17	ENSMUST00000174398.8	2292	18	-27	15087	3	124	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	332	junction_8	35.2981585921985	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGTCTTATTTGTTTC	9621	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111573658	111593410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_111573842_111576499_111576583_111577967_111578083_111578917_111579093_111580301_111580496_111584568_111584675_111585168_111585327_111586517_111586577_111589882_111590017_111592608_111592728_111593192
tx.18724	chr8	+	628	2	FSM	ENSMUSG00000031753.17	ENSMUST00000172497.2	538	2	382	-472	382	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	462	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTGTGTTGGGTCCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111608001	111608860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_111608132_111608362
tx.18725	chr8	-	708	2	ISM	ENSMUSG00000033703.10	ENSMUST00000041382.7	3838	24	19143	5	16184	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGTCTTCAGAAAACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111609948	111609099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_111609719_111609859
tx.18726	chr8	-	2563	12	FSM	ENSMUSG00000015023.8	ENSMUST00000040416.8	2547	12	-11	-5	-11	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	259	junction_8	46.4642402265948	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGTGTACACTTGAGGC	7675	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111724443	111701622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_111702723_111703060_111703253_111703599_111703763_111705099_111705338_111705667_111705846_111707184_111707300_111707622_111707726_111710212_111710306_111716105_111716242_111717108_111717160_111719688_111719738_111724298
tx.18727	chr8	-	826	7	FSM	ENSMUSG00000015023.8	ENSMUST00000173183.2	731	7	-41	-54	-11	54	multi-exon	FALSE	canonical	3	259	junction_3	37.1786228900426	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACTGTGTGTCATGGGCT	7675	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111724443	111707050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_111707300_111707622_111707726_111710212_111710306_111716105_111716242_111717108_111717160_111719688_111719738_111724298
tx.18728	chr8	-	1796	12	FSM	ENSMUSG00000033658.17	ENSMUST00000040241.15	6612	12	-8	4824	-8	-1353	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_11	90.8713558047041	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCATCTTTTTTTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111754404	111734643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_111734944_111735281_111735474_111735812_111735976_111737352_111737591_111737916_111738095_111739385_111739501_111742196_111742300_111747260_111747354_111747591_111747728_111749032_111749087_111750597_111750647_111754229
tx.18729	chr8	-	1741	12	FSM	ENSMUSG00000033658.17	ENSMUST00000065784.6	3104	12	10	1353	10	-1353	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_11	90.7354705715175	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCATCTTTTTTTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111758373	111734643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_111734944_111735281_111735474_111735812_111735976_111737352_111737591_111737916_111738095_111739385_111739501_111742196_111742300_111747260_111747354_111747591_111747728_111749032_111749087_111750597_111750647_111758253
tx.1873	chr10	+	362	2	Intergenic	novelGene_106	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTACCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88662719	88666784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_88662808_88666510
tx.18730	chr8	+	3326	21	NIC	ENSMUSG00000031960.15	novel	5750	21	NA	NA	-3	-2095	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	881	junction_1	574.494062197339	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTGATGTCATGCGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111760507	111782201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_111760541_111763540_111763706_111766763_111766953_111767228_111767375_111768109_111768302_111768872_111769018_111769294_111769441_111769864_111769974_111770274_111770426_111771509_111771635_111772158_111772304_111773562_111773742_111774543_111774658_111776330_111776538_111776976_111777162_111779044_111779154_111779822_111779937_111780520_111780641_111780756_111780844_111781140_111781255_111781650
tx.18731	chr8	+	1706	10	ISM	ENSMUSG00000031960.15	ENSMUST00000034441.8	5750	21	13103	2095	-907	-2095	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2613	junction_8	305.658164589541	244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTGATGTCATGCGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111773636	111782201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_111773742_111774543_111774658_111776330_111776538_111776976_111777162_111779044_111779154_111779822_111779937_111780520_111780641_111780756_111780844_111781140_111781255_111781650
tx.18732	chr8	-	4448	13	FSM	ENSMUSG00000033596.6	ENSMUST00000038739.5	4443	13	-5	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	323	junction_9	43.0880074833925	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCCAGTGTCTTCCGCCTG	5491	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112026859	111997575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_111999796_112000442_112000655_112002851_112003067_112004826_112005004_112006517_112006669_112009148_112009378_112009906_112010022_112014689_112014782_112014860_112015044_112017502_112017571_112020622_112020808_112023766_112024275_112026766
tx.18733	chr8	-	1436	6	ISM	ENSMUSG00000033596.6	ENSMUST00000212958.2	4082	9	-20	8367	11	-8367	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	323	junction_2	45.4708697959474	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAAAGCTGCCTGGCTAG	5507	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112026843	112014366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_112014782_112014860_112015044_112017502_112017571_112020622_112020808_112023766_112024275_112026766
tx.18734	chr8	-	946	10	ISM	ENSMUSG00000031959.16	ENSMUST00000211981.2	3618	27	19458	34882	-11776	1762	internal_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_5	6.65740096842011	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGGCAGAGTTATACACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112229161	112211721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_112211847_112211969_112212103_112213547_112213628_112216923_112217081_112219326_112219405_112220879_112220997_112223438_112223528_112225203_112225242_112227668_112227750_112229113
tx.18735	chr8	-	1717	5	ISM	ENSMUSG00000031959.16	ENSMUST00000211981.2	3618	27	-114	49639	-9	-12995	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	55	junction_4	3.41869858279434	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAAAAGACCCTGAAGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112248733	112226478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_112227750_112229113_112229200_112230966_112231103_112232523_112232574_112248559
tx.18736	chr8	+	556	3	Intergenic	novelGene_357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCAAATCTAGCCTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112248950	112257393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_112249022_112249155_112249232_112256984
tx.18737	chr8	+	583	4	ISM	ENSMUSG00000033545.15	ENSMUST00000173922.2	559	5	2544	-124	-4	113	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_3	33.1595469745224	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGTTTTCCCTTGTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112335923	112349718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_112336021_112345837_112345944_112348227_112348320_112349430
tx.18738	chr8	-	1817	7	ISM	ENSMUSG00000031958.17	ENSMUST00000070004.4	2273	11	1150	2	-637	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_4	3.60555127546399	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGTCCCATCCCTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112355856	112352904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_112353823_112353909_112354022_112354119_112354211_112354730_112354859_112354941_112355071_112355152_112355353_112355617
tx.18739	chr8	+	1854	4	FSM	ENSMUSG00000055835.11	ENSMUST00000077791.8	1811	4	-44	1	-18	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_2	17.3076733143296	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGAGTGTTTTTGGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112370093	112397642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_112370245_112385017_112385074_112392709_112392837_112396122
tx.1874	chr10	-	3027	11	FSM	ENSMUSG00000074802.12	ENSMUST00000105298.3	6305	11	20	3258	7	-62	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	9.03382532485547	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAACCAAGTAAGTTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89279809	89248382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_89250355_89252881_89252990_89257318_89257458_89258076_89258141_89262269_89262412_89264891_89265008_89266745_89266915_89269626_89269675_89270154_89270224_89272364_89272472_89279716
tx.18740	chr8	+	1763	4	FSM	ENSMUSG00000055835.11	ENSMUST00000211926.2	1409	4	-28	-326	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_2	24.1430919496424	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATGAGTGTTTTTGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112370140	112397640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_112370245_112385017_112385074_112392751_112392837_112396122
tx.18741	chr8	-	1240	7	FSM	ENSMUSG00000031954.7	ENSMUST00000034432.7	1178	7	-46	-16	-46	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	1827	junction_5	79.8013157786261	4838	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAAGGGTGCCGTGCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112580969	112495106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_112495420_112505882_112506042_112557501_112557622_112566989_112567118_112568414_112568623_112571725_112571844_112580775
tx.18742	chr8	-	2896	7	FSM	ENSMUSG00000031951.9	ENSMUST00000034429.9	2984	7	85	3	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	251	junction_1	6.79256129077161	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACGTTTCCCTTGGCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112660428	112638645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_112640742_112641120_112641227_112641888_112641971_112644922_112645067_112645459_112645589_112659991_112660162_112660259
tx.18743	chr8	+	965	4	FSM	ENSMUSG00000031950.8	ENSMUST00000034428.8	1677	4	15	697	15	173	multi-exon	FALSE	canonical	3	2738	junction_1	80.3838015744189	10798	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACGGTGTGACCATGTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112667349	112679547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_112667485_112667791_112667848_112669133_112669307_112678946
tx.18744	chr8	-	315	2	NNC	ENSMUSG00000031949.18	novel	3159	10	NA	NA	29	-20231	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACAGGATTCTGGGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112718905	112718415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_112718638_112718812
tx.18745	chr8	-	2155	15	FSM	ENSMUSG00000031948.15	ENSMUST00000093120.13	2131	15	-24	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	198	junction_14	463.92143951408	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATGCAGTGTTACTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112737922	112720074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_112720339_112721495_112721640_112723091_112723219_112724207_112724294_112724921_112725008_112725153_112725328_112725431_112725595_112726701_112726822_112728115_112728242_112728332_112728520_112729142_112729237_112729906_112730073_112732263_112732421_112734838_112735019_112737841
tx.18746	chr8	-	1975	14	FSM	ENSMUSG00000031948.15	ENSMUST00000034426.14	2008	14	33	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1149	junction_10	189.523538373557	1065	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATGCAGTGTTACTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112737922	112720074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_112720339_112721495_112721640_112723091_112723219_112724207_112724294_112724921_112725008_112725153_112725328_112725431_112725595_112726701_112726822_112728115_112728242_112728332_112728520_112729142_112729237_112729906_112730073_112732263_112732421_112737841
tx.18747	chr8	+	2229	3	FSM	ENSMUSG00000033430.11	ENSMUST00000052138.11	3560	3	4	1327	0	-1327	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_1	1.5	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGCATTTTCTTTGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112738033	112745833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_112738775_112741968_112742094_112744470
tx.18748	chr8	+	757	3	FSM	ENSMUSG00000031767.14	ENSMUST00000134593.2	707	3	-52	2	16	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTGTTTAATGTCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114860329	114875126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_114860441_114863077_114863232_114874634
tx.18749	chr8	+	1060	4	FSM	ENSMUSG00000031767.14	ENSMUST00000073521.12	3543	4	51	2432	-10	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	2.05480466765633	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTGCAATATTCATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114860347	114879047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_114860441_114863077_114863232_114874634_114874794_114878393
tx.1875	chr10	-	3989	18	NNC	ENSMUSG00000069539.12	novel	4817	18	NA	NA	-9	106	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	8.10057881651859	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGTTTCAAGTATAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89522156	89475424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_89476979_89477852_89477973_89481323_89481420_89481538_89481606_89482620_89482722_89485826_89485946_89486689_89486823_89488804_89488919_89489960_89490089_89492569_89492747_89493671_89493798_89495100_89495218_89495996_89496219_89498177_89498328_89502578_89502724_89505506_89505665_89514139_89514345_89521899
tx.18750	chr8	+	1009	2	FSM	ENSMUSG00000046844.7	ENSMUST00000124143.2	4244	2	1701	1534	1701	-1534	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCCTTTGTAGTTACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115096556	115099276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_115096676_115098386
tx.18751	chr8	+	798	6	NNC	ENSMUSG00000004637.16	novel	2244	9	NA	NA	14	84543	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	49.0363130751079	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCATTTGCAGGTGCTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115166408	115325571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_115166619_115171207_115171273_115172079_115172138_115174899_115175079_115215637_115215745_115325392
tx.18752	chr8	+	1148	8	ISM	ENSMUSG00000004637.16	ENSMUST00000160862.8	1715	9	-15	6428	-15	5927	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_7	25.2303671905787	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGTGTGCGGCTTCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115166419	115438991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_115166619_115171207_115171273_115172079_115172138_115174899_115175079_115215637_115215745_115406526_115406616_115432940_115433127_115438726
tx.18753	chr8	+	663	4	ISM	ENSMUSG00000004637.16	ENSMUST00000160005.2	3781	5	-13	5309	-6	-5309	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	123	junction_1	3.39934634239519	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGTGTTACAGTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115166428	115175249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_115166619_115171207_115171273_115172079_115172138_115174899
tx.18754	chr8	-	2258	7	FSM	ENSMUSG00000031758.11	ENSMUST00000109102.4	2411	7	130	23	130	-23	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_6	26.9670580935745	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAACAGAAGAACA	1899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117459600	117301161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_117302027_117305906_117306051_117309745_117309957_117315988_117316162_117321700_117321919_117350522_117351106_117459536
tx.18755	chr8	-	609	4	FSM	ENSMUSG00000014633.16	ENSMUST00000148235.8	1459	4	17	833	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	303	junction_2	17.3076733143296	3312	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGCCTCCCTTTCTTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117648177	117616256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_117616599_117620826_117620899_117637866_117637974_117648089
tx.18756	chr8	+	1227	2	FSM	ENSMUSG00000031756.6	ENSMUST00000212578.2	447	2	-8	-772	-8	772	multi-exon	FALSE	canonical	3	221	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACAAACAAACCACTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117648460	117650231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_117648523_117649066
tx.18757	chr8	+	1787	12	FSM	ENSMUSG00000031756.6	ENSMUST00000034205.5	1768	12	-18	-1	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	221	junction_1	41.3065540194129	421	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCAGTTCCTTTGGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117648460	117668243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_117648523_117649066_117649181_117652820_117653002_117655274_117655321_117657816_117657877_117658332_117658410_117660025_117660203_117661433_117661536_117662932_117662991_117663900_117664014_117667182_117667310_117667573
tx.18758	chr8	+	1726	11	ISM	ENSMUSG00000031756.6	ENSMUST00000034205.5	1768	12	587	-1	0	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_2	38.2446074630137	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCAGTTCCTTTGGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117649065	117668243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_117649181_117652820_117653002_117655274_117655321_117657816_117657877_117658332_117658410_117660025_117660203_117661433_117661536_117662932_117662991_117663900_117664014_117667182_117667310_117667573
tx.18759	chr8	-	1231	5	FSM	ENSMUSG00000034424.6	ENSMUST00000040484.6	1443	5	50	162	50	-162	multi-exon	FALSE	canonical	3	1952	junction_3	87.9982244139051	8398	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGATTGTGATTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117720226	117708710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_117709466_117710546_117710679_117714051_117714116_117715862_117715943_117720026
tx.1876	chr10	+	367	2	ISM	ENSMUSG00000097383.2	ENSMUST00000181598.2	3027	3	1	11499	1	-11499	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTCCTATTTATTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89522233	89525229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_89522382_89525010
tx.18760	chr8	+	362	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034416.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTGGTAATGGTTTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117785976	117786483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_117786121_117786265
tx.18761	chr8	+	1244	7	ISM	ENSMUSG00000034330.11	ENSMUST00000081232.9	4298	33	112469	0	112469	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	152	junction_3	15.2797978462486	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTTCTGTACCTGATCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118337498	118361881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_118337682_118339642_118339789_118340906_118341022_118341953_118342122_118347913_118348003_118361012_118361198_118361523
tx.18762	chr8	-	595	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034330.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCGGAGTGCAAAGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118384261	118359011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_118359357_118380924_118381030_118384116
tx.18763	chr8	+	1275	5	FSM	ENSMUSG00000031844.9	ENSMUST00000034304.9	1320	5	46	-1	46	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.69258240356725	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCTTATTTTGAAATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118428688	118485767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_118429003_118461232_118461446_118469070_118469257_118479924_118480063_118485343
tx.18764	chr8	-	1067	5	FSM	ENSMUSG00000031843.3	ENSMUST00000034303.3	1068	5	4	-3	4	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	669	junction_1	47.4572175754121	4458	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTGAAGTAATTTTAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118528678	118518380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_118519058_118519417_118519516_118521319_118521411_118525782_118525896_118528590
tx.18765	chr8	+	528	4	NNC	ENSMUSG00000031839.8	novel	1208	4	NA	NA	-13	-83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	885.438121308692	253	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGTCAAACGTTTTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120071241	120074999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_120071360_120071674_120071742_120072354_120072473_120074774
tx.18766	chr8	+	1282	9	ISM	ENSMUSG00000031837.15	ENSMUST00000098363.10	1976	13	7627	1	1914	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_2	2.75850956133924	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTCGTGTCTCTGTCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120181084	120199378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_120181196_120189299_120189437_120191640_120191760_120191891_120191972_120194329_120194384_120195007_120195121_120197646_120197725_120198478_120198571_120198880
tx.18767	chr8	+	609	3	ISM	ENSMUSG00000031837.15	ENSMUST00000098363.10	1976	13	24244	5	18531	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTGTGTCGTGTCTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120197701	120199374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_120197725_120198478_120198571_120198880
tx.18768	chr8	-	1406	6	ISM	ENSMUSG00000031835.17	ENSMUST00000212601.2	6789	22	38384	-5	-4478	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	437	junction_5	32.5613267542955	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGCATGTGTCGTGCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120247060	120234889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_120235715_120236992_120237124_120240612_120240740_120242316_120242449_120244877_120245019_120247010
tx.18769	chr8	-	911	2	ISM	ENSMUSG00000031835.17	ENSMUST00000212685.2	6624	22	-23	38932	-23	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	394	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCTTTCCCTATTGGGAA	8118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120285497	120273826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_120274625_120285384
tx.1877	chr10	-	1708	11	FSM	ENSMUSG00000019948.5	ENSMUST00000020109.5	1705	11	-2	-1	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	269	junction_5	22.702422778197	655	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATCTGTTTAATGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89568159	89547831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_89548423_89550731_89550871_89552934_89553107_89560861_89560941_89561032_89561132_89561463_89561521_89561629_89561766_89562498_89562623_89564015_89564085_89564761_89564880_89568035
tx.18770	chr8	-	3148	5	FSM	ENSMUSG00000034189.6	ENSMUST00000036049.6	3141	5	4	-11	2	11	multi-exon	TRUE	canonical	3	107	junction_4	18.9274932307477	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGAGGGTCTTTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120301918	120288716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_120290877_120292382_120292611_120292767_120293214_120294504_120294731_120301830
tx.18771	chr8	-	1429	4	NIC	ENSMUSG00000031832.16	novel	3474	14	NA	NA	0	-2487	intron_retention	FALSE	canonical	3	55	junction_1	6.16441400296898	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTTAGGCG	1080	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120331945	120328853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_120329987_120330119_120330205_120330978_120331118_120331873
tx.18772	chr8	-	1596	3	NIC	ENSMUSG00000031832.16	novel	3309	15	NA	NA	-18	-2487	intron_retention	FALSE	canonical	3	64	junction_1	3	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAACCTTAGGCG	1046	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120331979	120328853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_120330205_120330978_120331118_120331873
tx.18773	chr8	-	2326	2	NIC	ENSMUSG00000031832.16	novel	3474	14	NA	NA	0	-2497	intron_retention	FALSE	canonical	3	70	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	1080	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120331945	120328863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_120331118_120331873
tx.18774	chr8	+	1960	10	FSM	ENSMUSG00000024266.9	ENSMUST00000098361.4	1926	10	-32	-2	-32	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_8	9.71571210608852	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTCTGCGTGTTGGGATG	4249	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120339453	120343665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_120339872_120340833_120340975_120341482_120341531_120341641_120341768_120341850_120342002_120342078_120342247_120342349_120342580_120342671_120342916_120343147_120343269_120343352
tx.18775	chr8	+	524	2	ISM	ENSMUSG00000024266.9	ENSMUST00000098361.4	1926	10	3572	-2	3572	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTCTGCGTGTTGGGATG	7853	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120343057	120343665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_120343269_120343352
tx.18776	chr8	-	639	2	NNC	ENSMUSG00000045246.12	novel	1875	4	NA	NA	1988	-7297	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATTTGTATTTCTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120360097	120357889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_120358056_120359624
tx.18777	chr8	+	561	3	NNC	ENSMUSG00000034112.10	novel	3222	27	NA	NA	55641	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATCTCTCTCTCTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120482449	120484457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_120482518_120482713_120482856_120484106
tx.18778	chr8	-	1629	4	FSM	ENSMUSG00000031827.14	ENSMUST00000034285.14	1596	4	-28	-5	-28	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	203	junction_1	12.9185482500507	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGTTGGGTTGTCTGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120567311	120535955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_120537095_120549392_120549551_120566880_120566964_120567062
tx.18779	chr8	-	1079	3	ISM	ENSMUSG00000031827.14	ENSMUST00000211873.2	826	4	-65	12497	-18	-11872	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	224	junction_2	5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAAATCTGAATTTATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120567301	120548793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_120549551_120566880_120566964_120567062
tx.1878	chr10	-	564	5	ISM	ENSMUSG00000019948.5	ENSMUST00000020109.5	1705	11	-3	13805	-3	-151	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	288	junction_3	8.61321658847611	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATTCGGTGAGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89568160	89561637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_89561766_89562498_89562623_89564015_89564085_89564761_89564880_89568035
tx.18780	chr8	+	1102	4	NIC	ENSMUSG00000031828.10	novel	2181	5	NA	NA	2	-6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_2	7.03957069398096	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATTATCTTGTTTGAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120589012	120603728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_120589187_120591741_120591819_120601113_120601272_120603035
tx.18781	chr8	+	2369	3	FSM	ENSMUSG00000031828.10	ENSMUST00000212636.2	1354	3	1	-1016	1	1016	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	1	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATATCTCATGGGCCCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120589005	120598471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_120589187_120591741_120591819_120596360
tx.18782	chr8	+	576	4	ISM	ENSMUSG00000031826.21	ENSMUST00000108988.9	3274	14	-14	16139	-14	17	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	740	junction_3	442.529848334174	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCCCTGGGTACTACAGT	8813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120637538	120668160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_120637679_120658587_120658657_120663269_120663328_120667851
tx.18783	chr8	+	3290	14	FSM	ENSMUSG00000031826.21	ENSMUST00000144458.8	3726	14	441	-5	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	816	junction_3	215.032734538435	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTTTCTTGGTGTGCT	8814	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120637539	120684299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_120637679_120658587_120658657_120663269_120663328_120667848_120668878_120673813_120673906_120674439_120674550_120675156_120675213_120675417_120675522_120677097_120677198_120678659_120678838_120679918_120680085_120681527_120681673_120682936_120683003_120683321
tx.18784	chr8	+	579	4	ISM	ENSMUSG00000031826.21	ENSMUST00000143615.8	2129	11	-33	11206	-14	17	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	816	junction_3	406.879452527267	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCCCTGGGTACTACAGT	8813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120637538	120668160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_120637679_120658587_120658657_120663269_120663328_120667848
tx.18785	chr8	+	3275	14	FSM	ENSMUSG00000031826.21	ENSMUST00000108988.9	3274	14	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	740	junction_3	231.479471146212	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTTTCTTGGTGTGCT	8826	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120637551	120684299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_120637679_120658587_120658657_120663269_120663328_120667851_120668878_120673813_120673906_120674439_120674550_120675156_120675213_120675417_120675522_120677097_120677198_120678659_120678838_120679918_120680085_120681527_120681673_120682936_120683003_120683321
tx.18786	chr8	+	1625	6	ISM	ENSMUSG00000031826.21	ENSMUST00000108988.9	3274	14	39553	0	-1596	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1352	junction_1	66.3644483138374	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTTTCTTGGTGTGCT	4358	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120677105	120684299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_120677198_120678659_120678838_120679918_120680085_120681527_120681673_120682936_120683003_120683321
tx.18787	chr8	+	1356	4	ISM	ENSMUSG00000031826.21	ENSMUST00000108988.9	3274	14	42365	0	-96	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1459	junction_3	24.7790233867277	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTTTCTTGGTGTGCT	7170	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120679917	120684299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_120680085_120681527_120681673_120682936_120683003_120683321
tx.18788	chr8	+	1177	3	ISM	ENSMUSG00000031826.21	ENSMUST00000108988.9	3274	14	43987	0	-1405	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1459	junction_2	25.5	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTTTCTTGGTGTGCT	8792	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120681539	120684299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_120681673_120682936_120683003_120683321
tx.18789	chr8	-	1058	5	FSM	ENSMUSG00000031821.12	ENSMUST00000034278.6	3900	5	211	2631	-59	280	multi-exon	FALSE	canonical	3	1091	junction_3	31.7125763696361	5273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTAGAACGGGTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121315832	121308002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_121308551_121308820_121308948_121312831_121312932_121315463_121315579_121315664
tx.1879	chr10	+	443	2	NNC	ENSMUSG00000019951.11	novel	1924	7	NA	NA	21	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATACTTTTAGGGCTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89580873	89654278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_89580990_89653951
tx.18790	chr8	-	990	5	FSM	ENSMUSG00000031819.14	ENSMUST00000034277.14	4942	5	34	3918	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1135	junction_3	55.4301362076623	2615	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGTACACGGTGTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121394826	121384570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_121384988_121385266_121385362_121385743_121385814_121387522_121387600_121394495
tx.18791	chr8	+	689	5	FSM	ENSMUSG00000031818.13	ENSMUST00000034276.13	745	5	56	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8115	junction_1	456.952609687263	62606	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTGTGGTTCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121395016	121400946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_121395095_121396047_121396122_121399463_121399632_121399959_121400092_121400709
tx.18792	chr8	+	697	5	FSM	ENSMUSG00000031818.13	ENSMUST00000181586.8	765	5	68	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	240	junction_1	3735.25865904893	851	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTGTGGTTCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121395028	121400946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_121395115_121396047_121396122_121399463_121399632_121399959_121400092_121400709
tx.18793	chr8	+	614	4	ISM	ENSMUSG00000031818.13	ENSMUST00000034276.13	745	5	1084	0	970	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8471	junction_2	387.458671631211	3757	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTGTGGTTCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121396044	121400946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_121396122_121399463_121399632_121399959_121400092_121400709
tx.18794	chr8	+	1564	9	FSM	ENSMUSG00000041515.11	ENSMUST00000047737.10	2847	9	0	1283	0	7	multi-exon	TRUE	canonical	3	23	junction_1	7.56637297521078	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGGCCTTTCTGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121463096	121482150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_121463149_121466555_121466731_121470444_121470629_121472358_121472448_121473941_121474048_121475037_121475086_121480091_121480473_121481126_121481243_121481737
tx.18795	chr8	+	1514	8	ISM	ENSMUSG00000041515.11	ENSMUST00000162001.8	2270	9	1176	170	1176	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_2	5.97272713153339	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGGCCTTTCTGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121466553	121482150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_121466731_121470444_121470629_121472358_121472448_121473941_121474048_121475037_121475086_121480091_121480473_121481126_121481243_121481737
tx.18796	chr8	+	1192	7	NNC	ENSMUSG00000041515.11	novel	764	4	NA	NA	-676	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	15.0489940601431	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGGCCTTTCTGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121471542	121482150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_121471582_121472358_121472448_121473941_121474048_121475037_121475086_121480091_121480473_121481126_121481243_121481737
tx.18797	chr8	+	1199	6	ISM	ENSMUSG00000041515.11	ENSMUST00000162001.8	2270	9	6929	176	88	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	4.84148737476408	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTAATGGCTGGCCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121472306	121482144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_121472448_121473941_121474048_121475037_121475086_121480091_121480473_121481126_121481243_121481737
tx.18798	chr8	-	1300	10	FSM	ENSMUSG00000031816.16	ENSMUST00000133037.8	1060	10	51	-291	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_2	18.6494629717802	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAAGCTGCTTGTATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121835080	121824298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_121824665_121825446_121825511_121825737_121825892_121827857_121827984_121828162_121828276_121829652_121829744_121831130_121831245_121832312_121832427_121833608_121833713_121835026
tx.18799	chr8	-	722	5	NIC	ENSMUSG00000031816.16	novel	358	4	NA	NA	-4	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_1	27.9776696670756	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTGCGGCTTACAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121835086	121830589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_121830920_121831130_121831245_121832312_121832427_121833608_121833713_121835026
tx.188	chr1	-	1155	6	ISM	ENSMUSG00000057363.13	ENSMUST00000076997.13	1921	15	62798	17	62073	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_2	16.1195533436879	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATGGGTTTTGAGCTACA	7800	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43804103	43788688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_43789523_43792876_43792981_43794858_43794917_43796131_43796193_43799680_43799725_43804049
tx.1880	chr10	-	1650	5	FSM	ENSMUSG00000019979.13	ENSMUST00000161987.8	2710	5	-314	1374	27	124	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_4	12.1449578014911	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGAAGGATTTCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90918605	90902627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_90903127_90913395_90913594_90915308_90915499_90915748_90915951_90918044
tx.18800	chr8	-	480	2	Intergenic	novelGene_360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	111	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCAGCTGTGTGGTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122106318	122105706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_122106116_122106247
tx.18801	chr8	-	1107	7	FSM	ENSMUSG00000031809.11	ENSMUST00000183280.2	959	7	-100	-48	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	3.09569593683445	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCAGCCACTGACAAAAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122268708	122257518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_122257781_122258436_122258654_122260433_122260471_122262161_122262309_122266605_122266747_122267267_122267320_122268457
tx.18803	chr8	-	631	2	ISM	ENSMUSG00000052934.15	ENSMUST00000059018.14	4358	9	24503	2574	4796	1985	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	328	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGAGCTGAATGACCGGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122281042	122278752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_122279185_122280843
tx.18804	chr8	+	1708	4	FSM	ENSMUSG00000031812.17	ENSMUST00000034270.17	2532	4	103	721	-13	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	2350	junction_2	129.422649571944	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCTGTCCTGAGTGATGT	9948	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122317202	122324778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_122317304_122320228_122320285_122322724_122322832_122323334
tx.18805	chr8	-	483	2	FSM	ENSMUSG00000040263.17	ENSMUST00000174206.2	911	2	442	-14	442	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTCTTTCTTCTACAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122523725	122523068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_122523483_122523656
tx.1881	chr10	+	3279	3	FSM	ENSMUSG00000019975.13	ENSMUST00000020149.6	3232	3	-46	-1	-46	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_2	27	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAGAGAGTACTGTCCATT	709	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90918872	90934520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_90919159_90929000_90929119_90931645
tx.18810	chr8	-	931	3	ISM	ENSMUSG00000025317.8	ENSMUST00000057653.8	1249	7	20973	-16	3543	16	intron_retention	FALSE	canonical	3	94	junction_1	2	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGTTGTTGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122650670	122642848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_122643247_122644726_122644883_122650293
tx.18815	chr8	-	745	6	FSM	ENSMUSG00000006519.12	ENSMUST00000017604.10	744	6	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	631	junction_1	96.6531944635044	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGACAAGAAATTCTCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123159669	123151513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_123151827_123152924_123153007_123153674_123153759_123153967_123154043_123154393_123154464_123159548
tx.18816	chr8	+	1680	15	FSM	ENSMUSG00000049482.17	ENSMUST00000116412.8	3066	15	41	1345	-25	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_5	16.7624458787116	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTACAGTACTTGTGGGAA	8903	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123202922	123208486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_123203035_123203253_123203329_123203644_123203724_123203915_123203976_123204923_123204985_123205415_123205526_123205631_123205934_123206015_123206152_123206328_123206461_123206881_123206974_123207640_123207745_123207824_123207964_123208069_123208137_123208209_123208269_123208334
tx.1882	chr10	+	1230	3	FSM	ENSMUSG00000019975.13	ENSMUST00000020150.10	1328	3	104	-6	-13	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_2	32.5	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCTCCATAATATTTTT	742	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90918905	90938475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_90919159_90929000_90929119_90937616
tx.18820	chr8	-	783	4	NNC	ENSMUSG00000006589.9	novel	849	5	NA	NA	-17	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	665.62518648928	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCTTCTCCTCAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123303427	123301374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_123301767_123301875_123301955_123302140_123302275_123303249
tx.18821	chr8	-	872	5	NNC	ENSMUSG00000006589.9	novel	849	5	NA	NA	1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	617.095414016342	6977	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCTTCTCCTCAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123303647	123301374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_123301767_123301875_123301955_123302140_123302275_123303249_123303361_123303491
tx.18822	chr8	+	600	5	FSM	ENSMUSG00000015013.10	ENSMUST00000015157.10	1659	5	-12	1071	-6	-1071	multi-exon	FALSE	canonical	3	528	junction_1	75.9884859699152	1248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTACGTTGTCCTGTGTC	5510	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123338372	123342328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_123338433_123339804_123339978_123340659_123340748_123341046_123341127_123342129
tx.18825	chr8	-	1171	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000738.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTACTATGTAGTCCTAGC	1725	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123792195	123790773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_123791755_123791878_123791991_123792117
tx.18826	chr8	+	754	6	FSM	ENSMUSG00000000740.13	ENSMUST00000000756.6	780	6	26	0	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17818	junction_5	2681.35350895774	22420	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGGTTTCTTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123829114	123831983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_123829185_123829391_123829502_123829583_123829726_123829921_123830096_123830636_123830694_123831782
tx.18827	chr8	+	1809	9	ISM	ENSMUSG00000034796.15	ENSMUST00000037900.9	2398	15	9051	-1	-88	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	7.1894019222742	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCTGTGCCTTTCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123853167	123861922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_123853474_123854091_123854179_123854471_123854532_123855316_123855451_123856281_123856337_123856792_123856845_123856911_123857046_123860347_123860585_123861178
tx.18828	chr8	+	2332	9	NIC	ENSMUSG00000034796.15	novel	2398	15	NA	NA	-79	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_1	6.93609219950254	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCTGTGCCTTTCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123853176	123861922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_123853474_123853559_123854179_123854471_123854532_123855316_123855451_123856281_123856337_123856792_123856845_123856911_123857046_123860347_123860585_123861178
tx.18829	chr8	-	1175	7	NIC	ENSMUSG00000000739.15	novel	3805	7	NA	NA	-6	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	43	junction_6	23.3380947522857	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGACTCTGTCCCAGGCT	9733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123885019	123869585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_123869886_123872080_123872262_123874789_123874885_123875048_123875176_123875957_123876173_123884177_123884342_123884926
tx.1883	chr10	-	1345	8	NNC	ENSMUSG00000061904.13	novel	1612	8	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	16	junction_7	1443.65631333098	20011	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTATGAGTTTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90959867	90952652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_90952987_90953074_90953186_90953905_90954079_90954560_90954743_90955388_90955569_90957783_90957906_90959419_90959569_90959773
tx.18830	chr8	-	1160	7	FSM	ENSMUSG00000000739.15	ENSMUST00000000755.15	3805	7	-10	2655	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_6	18.7764628073435	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGACTCTGTCCCAGGCT	9733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123885019	123869585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_123869886_123872080_123872262_123874789_123874885_123875048_123875176_123875957_123876173_123884177_123884327_123884926
tx.18831	chr8	-	2149	6	NNC	ENSMUSG00000000743.10	novel	2140	7	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	190.847163982072	59	2	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTCAGACTTTTTTTTTT	9741	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123939503	123931002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_123932486_123932882_123933071_123934211_123934341_123934702_123934850_123935759_123935838_123939379
tx.18832	chr8	-	2143	6	NNC	ENSMUSG00000000743.10	novel	2140	7	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	190.847163982072	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTCAGACTTTTTTTTTT	9742	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123939502	123931002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_123932486_123932882_123933071_123934211_123934341_123934702_123934850_123935759_123935858_123939404
tx.18833	chr8	-	2149	6	NNC	ENSMUSG00000000743.10	novel	2140	7	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	190.847163982072	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTCAGACTTTTTTTTTT	9741	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123939503	123931002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_123932486_123932882_123933071_123934211_123934341_123934702_123934850_123935759_123935838_123939379
tx.18834	chr8	+	426	3	NIC	ENSMUSG00000048478.8	novel	486	3	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	3	junction_1	4	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGGATCCTTTCCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123939561	123948784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_123939610_123939826_123939977_123948556
tx.18835	chr8	+	544	3	FSM	ENSMUSG00000048478.8	ENSMUST00000060133.8	491	3	-52	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	0.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGGATCCTTTCCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123939570	123948784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_123939737_123939826_123939977_123948556
tx.18836	chr8	+	420	2	FSM	ENSMUSG00000048478.8	ENSMUST00000212637.2	569	2	148	1	148	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGGATCCTTTCCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123939784	123948784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_123939977_123948556
tx.18837	chr8	+	1597	13	FSM	ENSMUSG00000033862.8	ENSMUST00000213005.2	1580	13	-13	-4	-1	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	49.2958754190788	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGTTTGGCAATCCTTTA	2136	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123951591	123958993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_123951670_123953085_123953159_123953684_123953757_123954161_123954265_123954398_123954481_123955067_123955136_123955586_123955640_123955850_123955921_123957006_123957067_123957332_123957457_123957530_123957671_123958098_123958152_123958372
tx.18838	chr8	+	1631	13	FSM	ENSMUSG00000033862.8	ENSMUST00000036880.8	1642	13	15	-4	3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	205	junction_10	22.2279853638006	335	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGTTTGGCAATCCTTTA	2140	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123951595	123958993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_123951708_123953085_123953159_123953684_123953757_123954161_123954265_123954398_123954481_123955067_123955136_123955586_123955640_123955850_123955921_123957006_123957067_123957332_123957457_123957530_123957671_123958098_123958152_123958372
tx.18839	chr8	-	477	3	ISM	ENSMUSG00000032815.17	ENSMUST00000211934.2	701	4	654	-219	654	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	169	junction_2	13.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGTCTGGCCTTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123995815	123995038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_123995289_123995483_123995577_123995681
tx.1884	chr10	-	729	2	FSM	ENSMUSG00000019961.18	ENSMUST00000215801.2	654	2	44	-119	44	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	887	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTATGACTTATTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90987651	90984972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_90985621_90987570
tx.18840	chr8	-	565	3	ISM	ENSMUSG00000032815.17	ENSMUST00000150318.2	895	6	5230	-3	32	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTGTGCATGTCTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124040069	124039018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_124039397_124039759_124039856_124039978
tx.18841	chr8	-	911	6	FSM	ENSMUSG00000032815.17	ENSMUST00000150318.2	895	6	-14	-2	2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_3	15.8795465930234	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTGTGCATGTCTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124045313	124039019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_124039397_124039759_124039856_124039978_124040113_124043101_124043196_124044800_124044911_124045213
tx.18842	chr8	+	649	5	ISM	ENSMUSG00000010154.8	ENSMUST00000212404.2	2158	14	12811	-1	12811	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_1	4.30116263352131	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATACATTGTCTCTTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124089800	124096255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_124089893_124090061_124090130_124093574_124093603_124095416_124095533_124095910
tx.18843	chr8	+	657	4	ISM	ENSMUSG00000010154.8	ENSMUST00000212404.2	2158	14	12974	-3	12974	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_1	3.68178700572909	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATTGTCTCTTTCCCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124089963	124096257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_124090130_124093574_124093603_124095416_124095533_124095910
tx.18844	chr8	+	2627	18	FSM	ENSMUSG00000001472.18	ENSMUST00000212571.2	2649	18	31	-9	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_17	98.3685253625717	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTGATATGGCCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124100522	124130554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_124100804_124108138_124108301_124109265_124109341_124110063_124110183_124111087_124111154_124115303_124115387_124116403_124116535_124117517_124117618_124118319_124118414_124119660_124119754_124119870_124119977_124122289_124122450_124123745_124123834_124124721_124124881_124125254_124125346_124126003_124126084_124127363_124127437_124129888
tx.18845	chr8	+	2217	18	FSM	ENSMUSG00000001472.18	ENSMUST00000057934.10	2738	18	-40	561	0	100	multi-exon	TRUE	canonical	3	157	junction_17	92.4052680533628	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCACCCGTGTCTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124100522	124128070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_124100804_124108138_124108301_124109265_124109341_124110063_124110183_124111087_124111154_124115303_124115387_124116403_124116535_124117517_124117618_124118319_124118414_124119660_124119754_124119870_124119977_124122289_124122450_124123745_124123834_124124721_124124881_124125254_124125346_124126003_124126084_124127363_124127437_124127814
tx.18846	chr8	+	2630	18	FSM	ENSMUSG00000001472.18	ENSMUST00000108840.4	2582	18	-39	-9	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_17	99.4416940675849	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTGATATGGCCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124100522	124130554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_124100804_124108138_124108301_124109265_124109341_124110063_124110183_124111087_124111154_124115303_124115387_124116403_124116535_124117517_124117618_124118319_124118414_124119660_124119754_124119870_124119977_124122289_124122450_124123745_124123834_124124721_124124881_124125254_124125346_124126003_124126084_124127363_124127437_124129885
tx.18847	chr8	+	1739	4	FSM	ENSMUSG00000062380.5	ENSMUST00000071134.4	1868	4	124	5	-42	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	7.03957069398096	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGCCTGGTATTGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124138286	124148749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_124138402_124144831_124144941_124145678_124145790_124147345
tx.18848	chr8	+	3139	12	FSM	ENSMUSG00000001482.16	ENSMUST00000065534.10	3127	12	-12	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_1	53.2429330273546	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTACTAGTCTGCCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124169712	124190009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_124169791_124174526_124174652_124176039_124176138_124179483_124179634_124180967_124181110_124182152_124182318_124183144_124183273_124183409_124183524_124185089_124185171_124186255_124186397_124186555_124186666_124188202
tx.18849	chr8	+	1507	12	NNC	ENSMUSG00000001482.16	novel	3127	12	NA	NA	-17	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_11	88.9284232560654	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTTATCCCTCTCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124169707	124187255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_124169791_124174526_124174652_124176039_124176138_124179483_124179634_124180967_124181110_124182152_124182318_124183144_124183273_124183409_124183524_124185089_124185171_124186255_124186397_124186555_124186666_124187085
tx.1885	chr10	-	3508	15	FSM	ENSMUSG00000019988.8	ENSMUST00000020163.7	3534	15	27	-1	11	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_9	20.2858400398517	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGTCTGAGCTTGAACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92558255	92520606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_92522158_92522581_92522649_92525496_92525654_92526489_92526647_92527695_92527899_92528749_92528798_92530841_92530971_92534031_92534228_92534587_92534790_92536581_92536812_92547032_92547174_92549935_92550053_92552027_92552123_92555347_92555492_92558184
tx.18850	chr8	+	1322	8	ISM	ENSMUSG00000031967.16	ENSMUST00000001520.13	4227	17	-26	13604	-26	374	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	631	junction_4	49.623891546763	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCTGTTGTTTGTTTTTCT	7469	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124204615	124217051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_124204787_124207087_124207176_124207809_124207885_124211341_124211428_124212627_124212778_124214097_124214167_124214939_124215065_124216493
tx.18851	chr8	+	2511	17	FSM	ENSMUSG00000031967.16	ENSMUST00000001520.13	4227	17	-22	1738	-22	563	multi-exon	FALSE	canonical	3	631	junction_4	44.0414843499853	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACGTCTCAGATAAGACC	7473	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124204619	124228917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_124204787_124207087_124207176_124207809_124207885_124211341_124211428_124212627_124212778_124214097_124214167_124214939_124215065_124216493_124216765_124219279_124219418_124219613_124219768_124220566_124220675_124221544_124221671_124225326_124225438_124226730_124226847_124227971_124228173_124228253_124228449_124228586
tx.18852	chr8	+	2049	13	ISM	ENSMUSG00000031967.16	ENSMUST00000001520.13	4227	17	8032	1738	5569	563	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	663	junction_1	37.52360368266	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACACGTCTCAGATAAGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124212673	124228917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_124212778_124214097_124214167_124214939_124215065_124216493_124216765_124219279_124219418_124219613_124219768_124220566_124220675_124221544_124221671_124225326_124225438_124226730_124226847_124227971_124228173_124228253_124228449_124228586
tx.18853	chr8	+	1638	11	FSM	ENSMUSG00000040220.11	ENSMUST00000093043.7	1681	11	43	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_4	6.18789140176199	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTCTGTCGTTGTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124245615	124263389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_124245692_124247342_124247430_124249676_124249875_124250816_124251024_124252357_124252413_124253203_124253410_124254650_124254819_124255116_124255204_124257565_124257776_124259991_124260058_124263111
tx.18854	chr8	+	638	2	FSM	ENSMUSG00000039960.6	ENSMUST00000136615.2	782	2	136	8	136	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAAAAAACCAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124380803	124382716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_124380956_124382230
tx.18855	chr8	-	677	3	NNC	ENSMUSG00000097203.3	novel	3536	3	NA	NA	522	-2355	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACCAGGCAGTGGTGGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124480943	124473724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_124474108_124474603_124474751_124480796
tx.18856	chr8	+	1371	8	NNC	ENSMUSG00000019478.18	novel	1419	8	NA	NA	18	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	159.435483721121	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACACTGTCCTGCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124532741	124562030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_124532906_124550552_124550634_124554062_124554178_124555734_124555798_124557009_124557131_124559541_124559638_124560753_124560887_124561432
tx.18857	chr8	+	1408	8	NNC	ENSMUSG00000019478.18	novel	1419	8	NA	NA	19	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	133.326360361884	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACACTGTCCTGCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124532742	124562030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_124532906_124550552_124550634_124554062_124554178_124555734_124555798_124556971_124557131_124559541_124559638_124560753_124560887_124561432
tx.18858	chr8	+	688	7	NNC	ENSMUSG00000019478.18	novel	1080	7	NA	NA	23	-418	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	169.222486685428	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGACAGCTGCGGTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124532746	124560806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_124532906_124550552_124550634_124554062_124554178_124555734_124555798_124557009_124557131_124559541_124559638_124560753
tx.18859	chr8	+	1344	8	NNC	ENSMUSG00000019478.18	novel	1419	8	NA	NA	23	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	53	junction_4	134.59569086713	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTACACTGTCCTGCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124532746	124562029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_124532906_124550552_124550634_124554062_124554178_124555734_124555798_124557009_124557110_124559541_124559638_124560753_124560887_124561432
tx.1886	chr10	-	364	2	ISM	ENSMUSG00000019988.8	ENSMUST00000216086.2	391	4	12	8053	12	-8053	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_1	0	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACTGATAAAAATAATCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92558254	92555197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_92555492_92558184
tx.18860	chr8	-	384	4	ISM	ENSMUSG00000039509.9	ENSMUST00000044795.8	5808	26	43037	2173	9407	-2173	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	464	junction_1	7.78888096369861	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCTGGATCAACCTGAAGT	6371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124632967	124626034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_124626250_124629337_124629427_124631290_124631356_124632952
tx.18861	chr8	-	3653	26	FSM	ENSMUSG00000039509.9	ENSMUST00000044795.8	5808	26	-6	2161	-6	-2161	multi-exon	TRUE	canonical	3	328	junction_14	43.1434815470425	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGAAGTCTGTTTTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124676010	124626022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_124626250_124629337_124629427_124631290_124631356_124632952_124633034_124634494_124634614_124636622_124636759_124638487_124638647_124641236_124641371_124641913_124642166_124643022_124643123_124644168_124644292_124645510_124645736_124647586_124647682_124649087_124649252_124653868_124653961_124655982_124656141_124657594_124657743_124660105_124660254_124662825_124662897_124663569_124663726_124664873_124665045_124665778_124665914_124667773_124667882_124670993_124671098_124673231_124673351_124675736
tx.18863	chr8	+	1685	4	ISM	ENSMUSG00000031976.15	ENSMUST00000034457.9	5853	9	14950	0	14950	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	168	junction_2	16.8720676464584	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGTATTCTGCTGGGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124765082	124775244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_124765143_124767904_124767993_124771817_124771958_124773847
tx.18865	chr8	+	2793	18	FSM	ENSMUSG00000031979.18	ENSMUST00000034460.11	2825	18	32	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_7	26.4246660485719	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGAGTTATGTATCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125247537	125278747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_125247691_125252369_125252532_125253838_125253905_125255714_125255796_125256636_125256741_125259167_125259277_125259952_125260133_125262137_125262263_125264521_125264649_125267711_125267852_125269627_125269690_125270748_125270901_125271867_125272042_125272758_125272832_125273289_125273433_125275255_125275396_125276905_125277090_125278129
tx.18866	chr8	+	1203	6	ISM	ENSMUSG00000031979.18	ENSMUST00000034460.11	2825	18	24491	0	10049	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	215	junction_1	20.370567002418	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGAGTTATGTATCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125271996	125278747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_125272042_125272758_125272832_125273289_125273433_125275255_125275396_125276905_125277090_125278129
tx.18868	chr8	+	728	5	ISM	ENSMUSG00000031981.8	ENSMUST00000093033.6	2330	20	37556	0	227	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_3	0.707106781186548	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTACCATCTGTGTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125340405	125345470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_125340629_125341286_125341366_125342891_125343009_125344171_125344231_125345220
tx.18869	chr8	-	1246	5	ISM	ENSMUSG00000037300.20	ENSMUST00000117624.9	2970	20	46607	-5	145	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	335	junction_2	18.1159460144923	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCAGTTTGGTCGTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125402096	125398065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_125398937_125400186_125400267_125400395_125400475_125401100_125401181_125401960
tx.1887	chr10	-	942	4	ISM	ENSMUSG00000020014.19	ENSMUST00000168080.8	1160	5	-7	3785	-7	1841	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGTATTATTATTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92917487	92900783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_92901115_92902568_92902713_92905690_92905797_92917126
tx.18870	chr8	-	367	4	ISM	ENSMUSG00000037300.20	ENSMUST00000117624.9	2970	20	38148	8659	-1286	-450	internal_fragment	FALSE	canonical	3	392	junction_2	36.2981481009094	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGTAAGCCTCCAGTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125410555	125406729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_125406811_125408805_125408899_125409921_125410055_125410495
tx.18871	chr8	-	1475	12	ISM	ENSMUSG00000037300.20	ENSMUST00000041614.15	3038	18	0	8654	0	-448	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_8	104.246529165125	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTAAGCCTCCAGTTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125448711	125406727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_125406811_125408805_125408899_125409921_125410055_125410495_125410627_125411216_125411374_125415269_125415445_125415595_125415738_125417015_125417099_125436641_125436713_125439355_125439432_125440927_125441023_125448475
tx.18872	chr8	-	796	6	ISM	ENSMUSG00000037300.20	ENSMUST00000118134.3	3148	21	11	23405	0	921	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	213	junction_2	100.720603651884	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTCACTGGTTTCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125448711	125421478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_125421680_125422374_125422492_125436641_125436713_125439355_125439432_125440927_125441023_125448475
tx.18873	chr8	-	974	8	ISM	ENSMUSG00000037300.20	ENSMUST00000214828.2	3301	23	6	23388	0	940	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_2	154.949629735285	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125448711	125421459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_125421680_125422374_125422492_125424732_125424826_125426394_125426461_125436641_125436713_125439355_125439432_125440927_125441023_125448475
tx.18874	chr8	-	1672	5	NNC	ENSMUSG00000037300.20	novel	2409	4	NA	NA	1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	56	junction_1	180.045133230532	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTAAAGTCATTTAATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125448710	125434716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_125435912_125436641_125436713_125439355_125439432_125440927_125441023_125448475
tx.18875	chr8	+	1167	6	NNC	ENSMUSG00000031982.6	novel	1165	6	NA	NA	-6	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_5	37.0113496106262	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAGTAACTAAGGTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125448891	125460855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_125449082_125451994_125452115_125455067_125455222_125457530_125457756_125458535_125458681_125460522
tx.18876	chr8	+	1144	6	FSM	ENSMUSG00000031982.6	ENSMUST00000034463.4	1165	6	14	7	-6	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_5	35.5111250173801	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAGTAACTAAGGTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125448891	125460855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_125449082_125451994_125452115_125455067_125455222_125457530_125457756_125458535_125458681_125460545
tx.18877	chr8	+	1315	5	ISM	ENSMUSG00000031982.6	ENSMUST00000034463.4	1165	6	21	1694	1	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_2	14.0890028036054	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGGCTGCTGTTTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125448898	125459168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_125449082_125451994_125452115_125455067_125455222_125457530_125457756_125458535
tx.18878	chr8	-	1359	7	FSM	ENSMUSG00000031984.9	ENSMUST00000034465.9	2340	7	114	867	8	-867	multi-exon	FALSE	canonical	3	1367	junction_2	144.59416385948	2213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGACTGTTAAGTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125589745	125566093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_125566706_125567186_125567246_125568032_125568120_125568425_125568522_125569101_125569159_125587684_125588011_125589623
tx.18879	chr8	-	422	2	FSM	ENSMUSG00000031984.9	ENSMUST00000212808.2	3663	2	-45	3286	4	-3286	multi-exon	FALSE	canonical	3	1845	junction_1	0	424	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAAGTCAGATGAAGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125589749	125587714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_125588011_125589623
tx.1888	chr10	-	2100	5	FSM	ENSMUSG00000008398.17	ENSMUST00000008542.12	4212	5	198	1914	32	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_3	2.48746859276655	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACATGTTCCAAAGTGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93146799	93085189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_93085971_93090550_93090674_93100741_93101543_93120630_93120840_93146613
tx.18880	chr8	+	2959	16	FSM	ENSMUSG00000031985.10	ENSMUST00000034466.10	2984	16	20	5	-19	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	573	junction_6	36.0101220337961	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATACCCAATGGTCTTA	5140	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125589791	125616791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_125590052_125597514_125597698_125600071_125600249_125600957_125601088_125603658_125603787_125604173_125604250_125605251_125605404_125605522_125605654_125606867_125607092_125610094_125610338_125611703_125611784_125612533_125612675_125613421_125613519_125613591_125613686_125614496_125614559_125616010
tx.18881	chr8	+	873	3	ISM	ENSMUSG00000031985.10	ENSMUST00000161628.2	908	6	3402	-504	-712	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	609	junction_2	13.5	754	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATACCCAATGGTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125613655	125616791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_125613686_125614496_125614559_125616010
tx.18882	chr8	+	843	2	FSM	ENSMUSG00000031985.10	ENSMUST00000159864.2	538	2	129	-434	129	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	609	junction_1	0	1171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATACCCAATGGTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125614496	125616791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_125614559_125616010
tx.18883	chr8	-	1024	5	FSM	ENSMUSG00000031987.7	ENSMUST00000034469.7	3594	5	948	1622	948	-1622	multi-exon	FALSE	canonical	3	265	junction_4	22.6605383872493	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTGTTGCCAGTGAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125675115	125636947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_125637503_125638479_125638548_125640755_125640893_125642399_125642520_125674971
tx.18884	chr8	+	440	2	ISM	ENSMUSG00000056820.8	ENSMUST00000212603.2	2169	5	-9	16645	-9	-16645	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	396	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTATTCTAAACATTCCG	5237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125739778	125740515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_125739952_125740248
tx.18885	chr8	+	1332	5	FSM	ENSMUSG00000056820.8	ENSMUST00000212603.2	2169	5	-7	844	-7	-844	multi-exon	FALSE	canonical	3	396	junction_1	23.7631542519086	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCCTCTAGTGTGTCTAT	5239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125739780	125756316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_125739952_125740248_125740354_125742393_125742509_125751245_125751377_125755506
tx.18886	chr8	+	2349	6	FSM	ENSMUSG00000056820.8	ENSMUST00000075896.7	2391	6	45	-3	-7	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	396	junction_1	21.35790251874	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTCTGGTTAAGCTTTTA	5239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125739780	125760934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_125739952_125740248_125740354_125742393_125742509_125751245_125751377_125755506_125755635_125759235
tx.18887	chr8	+	2091	6	NNC	ENSMUSG00000056820.8	novel	2169	5	NA	NA	10	13	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_5	175.789647021661	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAATTTTCCTTATTAA	5256	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125739797	125757173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_125739952_125740248_125740354_125742393_125742509_125751245_125751377_125755506_125756583_125756663
tx.18888	chr8	+	1141	5	ISM	ENSMUSG00000043051.18	ENSMUST00000121953.2	2676	14	34099	125193	342	33077	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.79021822544144	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGGGGATCTGAGTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125815067	125862694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_125815188_125817111_125817182_125851231_125851380_125858801_125858923_125862012
tx.18889	chr8	+	737	2	ISM	ENSMUSG00000043051.18	ENSMUST00000126111.2	804	3	345	11886	345	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125815070	125817731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_125815188_125817111
tx.1889	chr10	-	949	4	NNC	ENSMUSG00000008398.17	novel	1653	6	NA	NA	33	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	21.1712593442672	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTTCCAAAGTGCACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93146798	93085186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_93085398_93101198_93101543_93120630_93120840_93146613
tx.18890	chr8	+	409	3	FSM	ENSMUSG00000043051.18	ENSMUST00000126111.2	804	3	348	47	348	-47	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	2	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGGTTCTTCTGTCACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125815073	125829570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_125815188_125817111_125817182_125829345
tx.18891	chr8	-	1681	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043051.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTACTTTCTCTTTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125903985	125902244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_125902311_125902370
tx.18892	chr8	+	999	3	Intergenic	novelGene_361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACATGGCTCTGTTATGTTT	8860	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126431428	126442914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_126431679_126435770_126435839_126442233
tx.18893	chr8	+	1507	4	FSM	ENSMUSG00000031851.15	ENSMUST00000065135.12	1497	4	-10	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	41.4273125150814	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCATGTCTAATTAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126460966	126465918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_126461089_126462806_126462970_126464061_126464159_126464793
tx.18894	chr8	+	1120	5	FSM	ENSMUSG00000031851.15	ENSMUST00000034313.13	1155	5	33	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_2	22.4388056723169	466	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACAGGAGTCCTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126460974	126474972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_126461089_126462806_126462970_126464061_126464159_126471974_126472185_126474436
tx.18895	chr8	+	1115	5	NNC	ENSMUSG00000031851.15	novel	1155	5	NA	NA	-2	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_2	25.0499500997507	45	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACAGGAGTCCTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126460974	126474972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_126461089_126462806_126462965_126464061_126464159_126471974_126472185_126474436
tx.18896	chr8	+	295	2	Intergenic	novelGene_362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTTTGTCTCGACTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126687039	126691425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_126687171_126691261
tx.18897	chr8	+	2121	3	FSM	ENSMUSG00000033998.10	ENSMUST00000046765.10	2235	3	114	0	114	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_2	9	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTGGTTTATTACAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126722022	126757424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_126722554_126751750_126752147_126756230
tx.18898	chr8	+	757	2	FSM	ENSMUSG00000051671.8	ENSMUST00000059093.7	747	2	-10	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	239	junction_1	0	993	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTGCGTGCTTCTGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127149243	127152172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_127149570_127151741
tx.18899	chr8	-	2003	3	ISM	ENSMUSG00000090290.3	ENSMUST00000170518.3	6383	30	47194	0	47194	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_2	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTTTATATAATGATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127154610	127152067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_127153880_127154161_127154299_127154556
tx.189	chr1	-	2020	15	FSM	ENSMUSG00000057363.13	ENSMUST00000126008.8	4620	15	34	2566	-4	-20	multi-exon	FALSE	canonical	3	170	junction_12	17.2527726254451	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGACATGGGTTTTGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43866926	43788691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_43789523_43792876_43792981_43794858_43794917_43796131_43796193_43799680_43799725_43804049_43804170_43810840_43810963_43813976_43814037_43819224_43819330_43829623_43829805_43836404_43836466_43844512_43844557_43844785_43844835_43846509_43846538_43866774
tx.1890	chr10	+	684	2	FSM	ENSMUSG00000111531.2	ENSMUST00000213849.2	585	2	-97	-2	-97	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGTGTTAGTTAATTTTCA	7820	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93153167	93158589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_93153596_93158333
tx.18900	chr8	-	1016	5	FSM	ENSMUSG00000093904.3	ENSMUST00000179857.3	4902	5	-1	3887	-1	432	multi-exon	FALSE	canonical	3	5050	junction_1	881.47603484156	8533	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGAAAATGTGCGGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127672591	127661303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_127661810_127663789_127663933_127666621_127666704_127667928_127667976_127672353
tx.18901	chr8	-	1566	11	FSM	ENSMUSG00000033931.10	ENSMUST00000045994.8	3424	11	6	1852	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_8	10.5470374987482	362	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGTTCAAATGGTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127697815	127675773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_127676294_127677449_127677569_127678051_127678092_127679913_127679978_127680115_127680200_127686291_127686336_127688661_127688722_127692131_127692373_127696732_127696879_127697487_127697660_127697739
tx.18902	chr8	+	218	1	Intergenic	novelGene_364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGGGTAATTCCTGAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127711133	127711351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_127711100_127711400
tx.18903	chr8	+	529	2	ISM	ENSMUSG00000025812.19	ENSMUST00000161348.3	1124	6	21127	0	15923	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTAGTGGCTGTTGACGA	4265	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128153052	128159622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_128153235_128159275
tx.18904	chr8	+	1884	4	FSM	ENSMUSG00000025812.19	ENSMUST00000159940.2	746	4	-21	-1117	-21	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	28.2410261066335	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTATTAACAAAAAAGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128306183	128338446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_128306285_128319541_128319663_128329539_128329668_128336912
tx.18905	chr8	+	1667	2	ISM	ENSMUSG00000025812.19	ENSMUST00000159940.2	746	4	23354	-1141	23354	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGACATGTATTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128329558	128338470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_128329668_128336912
tx.18906	chr8	+	444	4	FSM	ENSMUSG00000025809.16	ENSMUST00000135281.2	651	4	-75	282	38	-282	multi-exon	FALSE	canonical	3	539	junction_1	28.1582827759238	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTCACCAATCGCAGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129412275	129436859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_129412441_129431893_129431961_129433554_129433641_129436733
tx.18908	chr8	+	2299	7	ISM	ENSMUSG00000025809.16	ENSMUST00000090006.12	3815	16	34417	3	-4262	-3	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	537	junction_6	28.7614711414806	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGATTTGTTTTGGCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129446551	129459678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_129446614_129446755_129446956_129448864_129449104_129449290_129449514_129450676_129450910_129452500_129452668_129458503
tx.18909	chr8	+	1916	5	ISM	ENSMUSG00000025809.16	ENSMUST00000090006.12	3815	16	36850	4	-1829	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	537	junction_4	29.4310635213884	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTGATTTGTTTTGGCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129448984	129459677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_129449104_129449290_129449514_129450676_129450910_129452500_129452668_129458503
tx.1891	chr10	+	2023	18	NNC	ENSMUSG00000015889.9	novel	2029	19	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	112.25036894692	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAAAGTGTCATTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93289272	93320737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_93289531_93295678_93295810_93297171_93297293_93300306_93300376_93301810_93301916_93302973_93303027_93304617_93304691_93304909_93305068_93307157_93307229_93307715_93307828_93308760_93308906_93310337_93310442_93310779_93310851_93314308_93314364_93316552_93316649_93318111_93318195_93318823_93318929_93320524
tx.18910	chr8	+	974	3	ISM	ENSMUSG00000025809.16	ENSMUST00000124826.2	2906	15	38453	7	-123	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	537	junction_2	39.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGTTCAAGTCCATTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129450690	129459091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_129450910_129452500_129452668_129458503
tx.18911	chr8	+	1308	2	ISM	ENSMUSG00000025809.16	ENSMUST00000090006.12	3815	16	40400	3	1721	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	537	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGATTTGTTTTGGCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129452534	129459678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_129452668_129458503
tx.18912	chr8	-	458	2	Intergenic	novelGene_366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	282	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTTAGCTCCGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129480221	129473043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_129473263_129479982
tx.18913	chr8	-	644	3	NIC	ENSMUSG00000071302.11	novel	2337	4	NA	NA	7	391	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_2	29	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTATGAGTGTAATCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129960520	129946184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_129946633_129948024_129948086_129960385
tx.18914	chr8	-	630	4	FSM	ENSMUSG00000071302.11	ENSMUST00000189965.2	343	4	-8	-279	-8	279	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	25.9358182185692	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCATAAAAGAATACATACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129960895	129946296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_129946633_129948024_129948086_129948304_129948432_129960789
tx.18915	chr8	-	1005	4	FSM	ENSMUSG00000071302.11	ENSMUST00000186619.7	2337	4	-24	1356	4	622	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	18.4451137763426	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACACATACCGGAGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129960523	129945953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_129946633_129948024_129948086_129948304_129948432_129960385
tx.18916	chr8	+	217	2	ISM	ENSMUSG00000110605.2	ENSMUST00000212145.2	3767	3	-56	4300	-49	-4300	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGGTCTCTCATGATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129990072	129994049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_129990206_129993965
tx.18917	chr8	+	683	4	NNC	ENSMUSG00000110605.2	novel	1134	4	NA	NA	-38	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	25	junction_3	15.5777619273972	56	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGATCAGTGTGTTAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129990083	130009329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_129990206_130007503_130007631_130007817_130007879_130008956
tx.18918	chr8	+	600	4	FSM	ENSMUSG00000110605.2	ENSMUST00000212180.2	1134	4	-36	570	-36	-570	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	15.5777619273972	313	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGTGTGGTAAAGCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129990085	130008755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_129990206_130007503_130007631_130007817_130007879_130008463
tx.18919	chr9	-	1235	5	NNC	ENSMUSG00000042360.13	novel	1128	4	NA	NA	-13	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_3	4.41588043316392	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGTGTCAGTCTCAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3199812	3190267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_3190806_3192311_3192413_3192819_3193049_3197276_3197368_3199536
tx.1892	chr10	+	2030	19	FSM	ENSMUSG00000015889.9	ENSMUST00000016033.9	2029	19	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	348	junction_6	42.1416262935671	278	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAAAGTGTCATTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93289272	93320737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_93289531_93295678_93295810_93297171_93297293_93300306_93300376_93301810_93301916_93302973_93303027_93304617_93304691_93304909_93305051_93306661_93306686_93307157_93307229_93307715_93307828_93308760_93308906_93310337_93310442_93310779_93310851_93314308_93314364_93316552_93316649_93318111_93318195_93318823_93318929_93320524
tx.18920	chr9	-	1129	4	FSM	ENSMUSG00000042360.13	ENSMUST00000188577.2	1128	4	1	-2	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_3	6.12825877028341	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAGTGTCAGTCTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3199798	3190268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_3190806_3192311_3192413_3192819_3193049_3199536
tx.18921	chr9	+	3492	12	NNC	ENSMUSG00000025899.15	novel	7674	12	NA	NA	0	39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	21.1745988477618	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATCATGTTCTTTAAAAAA	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3335477	3386968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_3335595_3338455_3338592_3343014_3343253_3344587_3344720_3345780_3345877_3347803_3347909_3349419_3349491_3359483_3359591_3367863_3368016_3369657_3369919_3382693_3382844_3385041
tx.18922	chr9	+	2863	12	NNC	ENSMUSG00000025899.15	novel	3603	12	NA	NA	1	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	22.9717757114865	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTATACTTTCTCACTGCAT	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3335478	3386186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_3335749_3338455_3338592_3343014_3343253_3344587_3344720_3345780_3345877_3347803_3347909_3349419_3349491_3359483_3359591_3367863_3368016_3369657_3369919_3382693_3382844_3385041
tx.18923	chr9	+	3856	18	FSM	ENSMUSG00000025898.7	ENSMUST00000027027.7	4446	18	484	106	-12	-106	multi-exon	TRUE	canonical	3	200	junction_7	32.0504576240346	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTACTGAATCTGTAGCAT	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3404075	3479130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_3404191_3409965_3410077_3411328_3411452_3417868_3417983_3418655_3418776_3421285_3421377_3428667_3428784_3430437_3431088_3441054_3441146_3442960_3443048_3447236_3447354_3450013_3450152_3454539_3454753_3456732_3456850_3458733_3458890_3460050_3460132_3475482_3475585_3477816
tx.18924	chr9	+	432	2	ISM	ENSMUSG00000025898.7	ENSMUST00000212644.2	2085	3	-10	2915	-10	-2915	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	318	junction_1	0	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAACCAAAATACTA	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3404077	3410284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_3404191_3409965
tx.18925	chr9	+	305	3	FSM	ENSMUSG00000025898.7	ENSMUST00000212644.2	2085	3	-10	1790	-10	-1790	multi-exon	FALSE	canonical	3	277	junction_2	20.5	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAGAAATGTCAGAAACAGAG	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3404077	3411409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_3404191_3409965_3410077_3411328
tx.18926	chr9	+	1132	3	ISM	ENSMUSG00000041624.11	ENSMUST00000213060.2	2897	5	-536	178277	-426	9	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTACATTGCAGAGGAATG	27	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3532351	3582900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_3533100_3579517_3579580_3582578
tx.18927	chr9	-	900	5	NNC	ENSMUSG00000025894.12	novel	2843	6	NA	NA	-2	-1615	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	38	junction_3	348.214732600446	239	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTTTTAAAGACACAAATT	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4309473	4296579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_4296840_4299297_4299370_4302469_4302632_4308733_4308920_4309253
tx.18928	chr9	-	717	4	NIC	ENSMUSG00000025894.12	novel	2843	6	NA	NA	-5	-1615	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	71	junction_3	376.029549666276	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTTTTAAAGACACAAATT	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4309476	4296579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_4296840_4299297_4299370_4302469_4302632_4309253
tx.18929	chr9	-	1069	6	FSM	ENSMUSG00000025894.12	ENSMUST00000051589.9	2843	6	-13	1787	-9	-1615	multi-exon	FALSE	canonical	3	643	junction_4	99.1576522513517	3779	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATTTTTAAAGACACAAATT	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4309480	4296579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_4296840_4299297_4299370_4302469_4302632_4303093_4303216_4308693_4308920_4309253
tx.1893	chr10	+	1941	18	NIC	ENSMUSG00000015889.9	novel	2029	19	NA	NA	6	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	56	junction_16	100.405509988178	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAAAGTGTCATTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93289278	93320737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_93289531_93295678_93295810_93297171_93297293_93300306_93300376_93301810_93301916_93302973_93303027_93304617_93304691_93304909_93305051_93306661_93306686_93307157_93307229_93307715_93307828_93308760_93308906_93310337_93310442_93310779_93310851_93314308_93314364_93316552_93316649_93318823_93318929_93320524
tx.18930	chr9	+	691	3	FSM	ENSMUSG00000025893.9	ENSMUST00000049648.9	2231	3	-119	1659	-119	-1638	multi-exon	TRUE	canonical	3	30	junction_1	14.5	262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTGCATTTGTTATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4309713	4330073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_4309935_4316826_4317072_4329848
tx.18931	chr9	+	791	4	FSM	ENSMUSG00000025893.9	ENSMUST00000212221.2	2313	4	-116	1638	-114	-1638	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	18.4571575998762	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTGCATTTGTTATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4309718	4330073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_4309935_4313701_4313807_4316826_4317072_4329848
tx.18932	chr9	+	2807	3	FSM	ENSMUSG00000041124.12	ENSMUST00000212075.2	2800	3	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	13	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCTGTCTGAAAGTTTA	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4376554	4386870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_4376624_4383536_4384143_4384738
tx.18933	chr9	+	1077	8	FSM	ENSMUSG00000032002.11	ENSMUST00000215683.2	2421	8	176	1168	145	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	895	junction_7	57.310824564343	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGATGTCCGTTGAGTG	155	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7184695	7207037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_7184883_7186767_7186860_7188745_7188817_7189161_7189254_7203262_7203372_7203450_7203556_7205297_7205401_7206719
tx.18934	chr9	+	1801	11	NNC	ENSMUSG00000049723.15	novel	3607	10	NA	NA	-38640	-203	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_7	1.84390889145858	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTTAATTTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7305740	7358685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_7305828_7347490_7347539_7348584_7348833_7349722_7349872_7350011_7350138_7352887_7353050_7353445_7353570_7354721_7354856_7355311_7355472_7357804_7357909_7358226
tx.18935	chr9	+	2818	5	FSM	ENSMUSG00000050912.16	ENSMUST00000052865.16	2907	5	89	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_1	14.5086181285469	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTAGTGTTTTGTTGAA	13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7764130	7794334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_7764314_7768290_7768342_7790842_7791110_7791311_7791466_7792171
tx.18936	chr9	+	3497	4	ISM	ENSMUSG00000050912.16	ENSMUST00000052865.16	2907	5	116	0	-8	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	248	junction_1	16.4181471413663	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTAGTGTTTTGTTGAA	40	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7764157	7794334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_7764314_7768290_7768342_7790842_7791110_7791311
tx.18937	chr9	-	1140	4	ISM	ENSMUSG00000057367.13	ENSMUST00000074246.7	3130	7	14155	-8	14155	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	127	junction_2	25.8241919309954	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGATGTGATTCATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7821101	7818228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_7818945_7819021_7819064_7819307_7819563_7820974
tx.18938	chr9	-	885	3	NIC	ENSMUSG00000057367.13	novel	3130	7	NA	NA	14155	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	27	junction_2	80.5	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGATGTGATTCATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7821101	7818228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_7818945_7819021_7819064_7820974
tx.18939	chr9	-	3333	8	FSM	ENSMUSG00000057367.13	ENSMUST00000190341.7	3331	8	-3	1	-3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_2	22.0352222681815	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGATGTGATTCATGAG	-23	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7837061	7818228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_7818945_7819021_7819064_7819307_7819563_7820974_7821221_7825615_7825665_7826931_7827011_7833505_7835381_7836990
tx.1894	chr10	-	329	3	ISM	ENSMUSG00000020018.7	ENSMUST00000020203.7	861	4	1583	364	1583	-364	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2231	junction_1	178.5	876	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGACTTGTGGACTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93423985	93419254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_93419393_93419891_93419957_93423859
tx.18940	chr9	-	3095	7	NIC	ENSMUSG00000057367.13	novel	3331	8	NA	NA	-13	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	27	junction_2	57.8234861933761	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGATGTGATTCATGAG	-40	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7837078	7818228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_7818945_7819021_7819064_7820974_7821221_7825615_7825665_7826931_7827011_7833505_7835381_7836990
tx.18941	chr9	-	1186	2	ISM	ENSMUSG00000057367.13	ENSMUST00000190341.7	3331	8	-3	16038	-3	519	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	177	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATTATACAGGTGTGAAT	-23	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7837061	7834265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_7835381_7836990
tx.18942	chr9	-	1173	4	ISM	ENSMUSG00000032000.18	ENSMUST00000013949.15	2667	9	18537	0	5839	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_2	7.31816613336672	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGCTGGGCAGGTTTAT	9789	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7854488	7848699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_7849458_7849672_7849715_7850920_7851173_7854367
tx.18943	chr9	-	2537	9	FSM	ENSMUSG00000032000.18	ENSMUST00000013949.15	2667	9	130	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	6.89202437604511	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATGCTGGGCAGGTTTAT	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7872895	7848699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_7849458_7849672_7849715_7850920_7851173_7854367_7854608_7857390_7857440_7858701_7858781_7860263_7860364_7860463_7861409_7872823
tx.18944	chr9	-	1846	7	FSM	ENSMUSG00000053070.6	ENSMUST00000065291.2	1592	7	-47	-207	-47	207	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	2.38047614284762	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTAAATTCTTATTATATA	-38	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8042871	8021465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_8022546_8023900_8023968_8025962_8026136_8027101_8027269_8037460_8037537_8042409_8042492_8042670
tx.18945	chr9	-	420	3	ISM	ENSMUSG00000053070.6	ENSMUST00000215478.2	533	4	-55	15083	-45	-15083	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	1.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTAGTGATTTGTATCAG	-36	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8042869	8037397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_8037537_8042409_8042492_8042670
tx.18946	chr9	+	544	2	Intergenic	novelGene_1297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGCTATTTTAATAATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8134534	8135907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_8134643_8135471
tx.18947	chr9	-	949	10	ISM	ENSMUSG00000050730.18	ENSMUST00000182617.2	1868	16	192471	-3	192270	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_2	7.88027698955429	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGACTCCCTTGAGTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9046635	9011235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_9011443_9015300_9015360_9016144_9016230_9016964_9017040_9018204_9018268_9029423_9029464_9030794_9030874_9033471_9033582_9035509_9035611_9046505
tx.18948	chr9	+	1159	3	FSM	ENSMUSG00000079084.13	ENSMUST00000169961.3	2369	3	-6	1216	-6	1014	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	5	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAGGAATTCATTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13246603	13253208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_13246677_13251695_13252424_13252850
tx.18949	chr9	+	760	4	FSM	ENSMUSG00000031918.17	ENSMUST00000156801.8	617	4	-143	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_3	108.542874273513	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTTGGGAGGCAGCGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13660471	13697471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_13660697_13693572_13693679_13694901_13695007_13697147
tx.1895	chr10	-	449	4	FSM	ENSMUSG00000020018.7	ENSMUST00000020203.7	861	4	48	364	48	-364	multi-exon	FALSE	canonical	3	2132	junction_3	195.841772867792	28195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGACTTGTGGACTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93425520	93419254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_93419393_93419891_93419957_93423859_93423986_93425400
tx.18950	chr9	-	2417	10	FSM	ENSMUSG00000031922.13	ENSMUST00000147115.8	2262	10	-125	-30	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_3	63.5314639653475	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAGCTAACAAAGGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13738376	13719090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_13720137_13721155_13721301_13721922_13722159_13724705_13724817_13727350_13727429_13728182_13728300_13729618_13729741_13730154_13730335_13732822_13732980_13738151
tx.18951	chr9	-	2500	11	FSM	ENSMUSG00000031922.13	ENSMUST00000034398.12	2523	11	22	1	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_4	39.1587793476763	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAGCTAACAAAGGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13738381	13719090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_13720137_13721155_13721301_13721922_13722159_13723928_13724007_13724705_13724817_13727350_13727429_13728182_13728300_13729618_13729741_13730154_13730335_13732822_13732980_13738151
tx.18952	chr9	-	978	7	ISM	ENSMUSG00000031922.13	ENSMUST00000034398.12	2523	11	17	5638	17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	207	junction_3	26.5	284	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGTCAAAACCACCAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13738386	13724727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_13724817_13727350_13727429_13728182_13728300_13729618_13729741_13730154_13730335_13732822_13732980_13738151
tx.18953	chr9	+	3672	10	FSM	ENSMUSG00000037808.14	ENSMUST00000059579.12	3702	10	19	11	0	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_7	15.6165470962654	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGCTGTAATGAATGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13739030	13757826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_13739358_13740055_13740121_13741020_13741076_13742277_13742434_13744267_13744468_13747180_13747229_13747398_13747480_13748132_13748269_13750935_13751038_13755324
tx.18954	chr9	+	2624	12	NNC	ENSMUSG00000037808.14	novel	3760	11	NA	NA	1	-1250	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_9	66.2421054083097	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCGTGCTTATGTCTGAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13739031	13756587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_13739358_13740055_13740121_13741020_13741076_13742277_13742434_13742929_13743064_13744267_13744468_13747180_13747229_13747398_13747480_13747954_13748013_13748132_13748269_13750935_13751038_13755324
tx.18955	chr9	+	2022	10	FSM	ENSMUSG00000032009.9	ENSMUST00000208222.2	9125	10	140	6963	140	321	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_6	6.49976257875985	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGCTCAAGCAGTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14187736	14237434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_14187926_14217494_14217561_14219756_14219955_14221543_14221727_14225791_14226029_14227361_14227537_14231590_14231710_14232367_14232559_14233858_14234004_14236915
tx.18956	chr9	+	1288	6	ISM	ENSMUSG00000032009.9	ENSMUST00000209187.2	1700	9	39524	-318	29	318	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_2	3.76297754444536	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTCGCTCAAGCAGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14225886	14237431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_14226029_14227361_14227537_14231590_14231710_14232367_14232559_14233858_14234004_14236915
tx.18957	chr9	+	849	7	FSM	ENSMUSG00000004096.10	ENSMUST00000213913.2	831	7	-4	-14	-4	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	320.421423891863	612	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTTTTTTGGTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14411938	14421675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_14412040_14413211_14413351_14414109_14414223_14414893_14414983_14416128_14416237_14419146_14419266_14421495
tx.18958	chr9	+	1028	7	FSM	ENSMUSG00000004096.10	ENSMUST00000004200.9	1111	7	57	26	27	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	777	junction_1	58.5484130157826	10550	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTGTCCCCAACTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14411969	14421847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_14412078_14413211_14413351_14414109_14414223_14414893_14414983_14416128_14416237_14419146_14419266_14421495
tx.18959	chr9	+	439	4	ISM	ENSMUSG00000004096.10	ENSMUST00000004200.9	1111	7	54	6904	24	753	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	777	junction_1	61.5485355002231	539	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCTCACAGACGTATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14411966	14414969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_14412078_14413211_14413351_14414109_14414223_14414893
tx.1896	chr10	-	1975	11	FSM	ENSMUSG00000036112.16	ENSMUST00000047910.15	4424	11	14	2435	8	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	2022	junction_3	150.158882521148	1119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATACATTTTAATGTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93725662	93696785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_93697465_93698238_93698355_93698791_93698896_93701268_93701366_93704728_93704824_93705978_93706161_93707349_93707512_93715401_93715505_93715934_93716001_93722855_93722964_93725399
tx.18960	chr9	+	527	2	FSM	ENSMUSG00000111085.2	ENSMUST00000214920.2	518	2	-140	131	-140	-131	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTATTTAGTTTATGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14574177	14576264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_14574497_14576056
tx.18961	chr9	-	2177	2	FSM	ENSMUSG00000031931.5	ENSMUST00000034406.4	1753	2	0	-424	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_1	0	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCAGTGTTTGTCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14694260	14691080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_14692908_14693910
tx.18962	chr9	-	2241	3	FSM	ENSMUSG00000031931.5	ENSMUST00000216037.2	1037	3	0	-1204	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_2	53	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCAGTGTTTGTCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14695822	14691080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_14692908_14693910_14694259_14695756
tx.18963	chr9	-	2218	3	FSM	ENSMUSG00000031931.5	ENSMUST00000216372.2	2679	3	294	167	-12	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_2	58.5	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCAGTGTTTGTCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14695858	14691080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_14692908_14693910_14694259_14695815
tx.18964	chr9	+	2588	20	FSM	ENSMUSG00000031928.16	ENSMUST00000034405.11	3286	20	16	682	-6	-682	multi-exon	TRUE	canonical	3	154	junction_1	46.9081733954962	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTCCGTTGTTCATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14695965	14745260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_14696054_14696726_14696825_14698173_14698307_14701868_14702030_14707066_14707155_14708338_14708481_14710851_14710967_14714059_14714246_14716651_14716824_14721099_14721181_14723125_14723253_14726463_14726568_14728091_14728266_14730711_14730775_14736436_14736654_14737830_14737912_14740652_14740712_14742192_14742258_14743936_14744013_14744902
tx.18965	chr9	+	2575	20	NIC	ENSMUSG00000031928.16	novel	3286	20	NA	NA	31	-682	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	118	junction_1	53.5567113407824	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTCCGTTGTTCATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14696028	14745260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_14696104_14696726_14696825_14698173_14698307_14701868_14702030_14707066_14707155_14708338_14708481_14710851_14710967_14714059_14714246_14716651_14716824_14721099_14721181_14723125_14723253_14726463_14726568_14728091_14728266_14730711_14730775_14736436_14736654_14737830_14737912_14740652_14740712_14742192_14742258_14743936_14744013_14744902
tx.18966	chr9	+	691	2	FSM	ENSMUSG00000090023.2	ENSMUST00000159268.2	428	2	-198	-65	-198	65	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTCAAATGACAGCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14756710	14759196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_14757143_14758937
tx.18967	chr9	-	1720	5	FSM	ENSMUSG00000031934.15	ENSMUST00000164273.9	5732	5	355	3657	355	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	8.13557004763649	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACACCCTCTGTGCCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14956419	14917080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_14917514_14918656_14919316_14921331_14921553_14932677_14932818_14956152
tx.18968	chr9	-	1498	5	NIC	ENSMUSG00000031934.15	novel	5732	5	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	2	junction_4	28.0223125384041	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACACCCTCTGTGCCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14955092	14917080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_14917514_14918656_14919316_14921331_14921553_14932677_14932818_14955047
tx.18969	chr9	+	2035	4	FSM	ENSMUSG00000031937.8	ENSMUST00000034413.8	1991	4	-39	-5	-39	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	3.68178700572909	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGTTTGTTTTTCAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15150301	15170717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_15150655_15168525_15168853_15168946_15169088_15169503
tx.1897	chr10	-	757	2	ISM	ENSMUSG00000036112.16	ENSMUST00000181894.2	3034	3	1616	1098	1547	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2160	junction_1	0	3556	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATACATTTTAATGTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93698316	93696785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_93697465_93698238
tx.18970	chr9	-	2429	12	FSM	ENSMUSG00000031935.10	ENSMUST00000034411.10	3964	12	17	1518	-11	138	multi-exon	TRUE	canonical	3	139	junction_7	15.3563726777577	291	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCCCAAGTATTTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15191210	15173164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_15173735_15174899_15175060_15176647_15176766_15178709_15178848_15181638_15181824_15182906_15183038_15183802_15183956_15185580_15185666_15185744_15185882_15187141_15187362_15188852_15189020_15190845
tx.18971	chr9	-	2649	9	FSM	ENSMUSG00000031938.16	ENSMUST00000178977.9	2650	9	-1	2	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	3.64005494464026	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTTTTTTTTCTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15217464	15194636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_15196288_15198651_15198769_15201962_15202113_15203295_15203473_15205727_15205830_15205981_15206056_15209138_15209238_15212662_15212810_15217332
tx.18972	chr9	-	919	8	ISM	ENSMUSG00000031938.16	ENSMUST00000178977.9	2650	9	31	4064	1	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_5	3.32584192194938	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAAGGCTCCCTTGGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15217432	15198698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_15198769_15201962_15202113_15203295_15203473_15205727_15205830_15205981_15206056_15209138_15209238_15212662_15212810_15217332
tx.18973	chr9	+	358	3	ISM	ENSMUSG00000031939.17	ENSMUST00000164079.9	1005	6	-37	3067	13	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	288	junction_1	109	1651	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAATATGAGCCAAAAT	9085	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15217522	15220027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_15217580_15219023_15219118_15219820
tx.18974	chr9	+	1346	6	FSM	ENSMUSG00000031939.17	ENSMUST00000164079.9	1005	6	-34	-307	16	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	288	junction_1	106.167791726116	1190	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCTTAAGTGCTTAGCCC	9088	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15217525	15223401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_15217580_15219023_15219118_15219820_15220212_15221154_15221331_15221653_15221706_15222822
tx.18975	chr9	+	1254	12	FSM	ENSMUSG00000031939.17	ENSMUST00000213763.2	1216	12	-30	-8	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_9	145.029663537447	583	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTATAGTTTGTATGTA	9088	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15217525	15228274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_15217580_15219023_15219118_15219820_15220212_15221154_15221331_15221653_15221706_15222822_15222992_15224069_15224133_15225285_15225329_15225526_15225561_15226397_15226428_15226678_15226737_15228184
tx.18976	chr9	-	3070	6	ISM	ENSMUSG00000046111.19	ENSMUST00000098979.12	7188	27	34	27550	34	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_3	15.4064921380566	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAGTAATATCTTTGAATA	9741	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15269050	15255942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_15258333_15262106_15262201_15262986_15263112_15264194_15264396_15265901_15266033_15268921
tx.18977	chr9	-	542	4	ISM	ENSMUSG00000046111.19	ENSMUST00000098979.12	7188	27	39	34633	39	-5146	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_1	14.522013940528	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAATCAAAAAGAAATGT	9746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15269045	15263025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_15263112_15264194_15264396_15265901_15266033_15268921
tx.18978	chr9	+	866	3	FSM	ENSMUSG00000058173.13	ENSMUST00000215907.2	994	3	131	-3	131	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGGTGTTTCTCTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15404858	15456556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_15404926_15436923_15437001_15455834
tx.18979	chr9	+	802	2	ISM	ENSMUSG00000058173.13	ENSMUST00000178999.3	820	3	4766	0	4766	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGGTGTTTCTCTTGTTTG	2294	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15436920	15456556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_15437001_15455834
tx.1898	chr10	-	418	3	FSM	ENSMUSG00000036112.16	ENSMUST00000181104.2	931	3	-39	552	8	-552	multi-exon	FALSE	canonical	3	2075	junction_1	110	518	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAGAAGAAGAGAGGACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93725662	93715953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_93716001_93722855_93722964_93725399
tx.18981	chr9	+	1135	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000090602.4	novel	852	1	NA	NA	-42	322	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGGAAAAGGACATCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16941298	16942514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_16941899_16941979
tx.18982	chr9	-	1609	2	Intergenic	novelGene_1298	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATAGAAGAAAACTTCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17467614	17444008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_17445515_17467511
tx.18983	chr9	+	2203	11	FSM	ENSMUSG00000001774.9	ENSMUST00000001825.9	5789	11	145	3441	-30	1988	multi-exon	FALSE	canonical	3	795	junction_1	72.6983493622792	590	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTTCTGTCATGTGTTT	8510	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18203565	18225297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_18203757_18206595_18206646_18212301_18212359_18213321_18213480_18215578_18215683_18216588_18216648_18220045_18220117_18221128_18221235_18223207_18223328_18223725_18223789_18224073
tx.18984	chr9	+	2920	9	FSM	ENSMUSG00000057551.11	ENSMUST00000208694.2	3988	9	-37	1105	-11	251	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_2	38.1313519298752	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTAAGGTTTGGTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19533386	19559922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_19533582_19540392_19540503_19543629_19543685_19552361_19552551_19553259_19553400_19553893_19554021_19554904_19555001_19556520_19556604_19557997
tx.18985	chr9	+	3972	8	NIC	ENSMUSG00000057551.11	novel	3988	9	NA	NA	-13	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	124	junction_2	34.0665614972351	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGGGACTGATATTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19533384	19561027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_19533582_19540392_19540503_19552361_19552551_19553259_19553400_19553893_19554021_19554904_19555001_19556520_19556604_19557997
tx.18986	chr9	+	706	3	Intergenic	novelGene_1300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTAGTTGTCTTGGTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19972034	19983239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_19972150_19972242_19972544_19982949
tx.18987	chr9	-	626	3	FSM	ENSMUSG00000045519.16	ENSMUST00000143992.3	608	3	43	-61	43	61	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0.5	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATTATTGTGAACATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20296430	20263815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20264138_20265359_20265546_20296312
tx.18988	chr9	-	521	3	ISM	ENSMUSG00000059475.14	ENSMUST00000163427.8	720	8	-16	14902	-1	-9603	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_2	4	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTGTGTATTTTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20404043	20397328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_20397734_20403681_20403748_20403993
tx.18989	chr9	+	851	5	ISM	ENSMUSG00000058192.17	ENSMUST00000115557.10	12974	6	26	13836	26	2785	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	4.06201920231798	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACAAAACCTGTTCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20492646	20502869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_20492975_20499130_20499220_20499804_20499932_20502108_20502181_20502634
tx.1899	chr10	-	1142	2	ISM	ENSMUSG00000036099.17	ENSMUST00000047711.13	4479	12	61791	1586	551	-1586	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGATGTGTGCTGGGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93809819	93805547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_93806567_93809696
tx.18990	chr9	+	2637	6	FSM	ENSMUSG00000058192.17	ENSMUST00000115557.10	12974	6	115	10222	-85	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	3.8262252939418	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTACAGCAGCTGAGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20492735	20506483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_20492975_20499130_20499220_20499804_20499932_20502108_20502181_20502634_20502718_20504456
tx.18991	chr9	-	1811	3	FSM	ENSMUSG00000066892.15	ENSMUST00000086459.6	2086	3	278	-3	-215	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	69	junction_2	12	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGTTGCACTTATTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20553824	20549081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20550495_20553319_20553393_20553499
tx.18992	chr9	-	1785	4	FSM	ENSMUSG00000066892.15	ENSMUST00000131343.8	761	4	-9	-1015	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	34.3446583263767	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGTTGCACTTATTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20556063	20549081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20550495_20553319_20553393_20555490_20555595_20555868
tx.18993	chr9	-	2070	3	FSM	ENSMUSG00000066892.15	ENSMUST00000086458.10	2056	3	-11	-3	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_2	23	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTGTTGCACTTATTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20556074	20549081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20550495_20553319_20553393_20555490
tx.18994	chr9	+	448	5	FSM	ENSMUSG00000084786.10	ENSMUST00000129414.9	2114	5	1489	177	-14	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	1046	junction_4	63.2114507031756	9618	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATACTTGTGTGAGAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20556102	20558083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_20556190_20556488_20556556_20556701_20556786_20556917_20556956_20557911
tx.18995	chr9	+	430	4	NNC	ENSMUSG00000084786.10	novel	2114	5	NA	NA	-14	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	532.355770764877	724	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCATACTTGTGTGAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20556102	20558081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_20556190_20556488_20556556_20556701_20556786_20557889
tx.18996	chr9	+	935	4	FSM	ENSMUSG00000032171.8	ENSMUST00000034689.8	3843	4	15	2893	15	-2893	multi-exon	FALSE	canonical	3	2626	junction_2	73.4892282356174	13214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTGGTCCTGTATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20563405	20574987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_20563494_20566657_20566877_20573593_20573705_20574470
tx.18997	chr9	-	1831	6	FSM	ENSMUSG00000032172.9	ENSMUST00000215999.2	1895	6	64	0	64	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	2.92574776766556	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCCTGGGTTGTTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20657581	20578988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20580081_20582995_20583103_20583430_20583651_20583922_20584070_20586869_20587020_20657466
tx.18998	chr9	-	1082	5	ISM	ENSMUSG00000038742.8	ENSMUST00000043726.8	1582	6	1501	-2	1501	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_4	28.1646942110153	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTGTCTGTCTTCCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20789522	20785101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_20785369_20786461_20786733_20786809_20786998_20787687_20787866_20789344
tx.18999	chr9	+	1585	11	FSM	ENSMUSG00000004100.13	ENSMUST00000004203.6	1670	11	85	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	766	junction_9	65.2172523186925	1146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTGAGTCTTCACTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20799555	20803474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_20799614_20799702_20799874_20800633_20800736_20800929_20800981_20801066_20801238_20801934_20802012_20802200_20802309_20802378_20802503_20802582_20802662_20802746_20803044_20803127
tx.19	chr1	-	437	3	NNC	ENSMUSG00000097797.7	novel	256	3	NA	NA	-54	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTTTGGGTCATGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7468147	7446109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_7446232_7452197_7452307_7467941
tx.190	chr1	-	783	7	NNC	ENSMUSG00000057363.13	novel	449	7	NA	NA	-4	2266	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	70.068418944153	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCCATCTTCTTCATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43866938	43827524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_43827781_43829623_43829805_43836404_43836466_43844512_43844557_43844785_43844835_43846509_43846538_43866774
tx.1900	chr10	-	2947	12	FSM	ENSMUSG00000036099.17	ENSMUST00000119818.8	11138	12	23	8168	7	-1590	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_7	12.5467719993354	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAACCGATGTGTGCTGGGG	3418	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93871656	93805551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_93806567_93809696_93809905_93810306_93810408_93816175_93816370_93820023_93820356_93826001_93826150_93829378_93829529_93832699_93832976_93836212_93836386_93839854_93839945_93842821_93842957_93871531
tx.19000	chr9	+	851	4	ISM	ENSMUSG00000004100.13	ENSMUST00000004203.6	1670	11	2904	0	441	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	766	junction_2	51.1142511112769	442	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTGAGTCTTCACTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20802374	20803474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_20802503_20802582_20802662_20802746_20803044_20803127
tx.19001	chr9	+	694	3	ISM	ENSMUSG00000004100.13	ENSMUST00000147780.2	1834	9	3031	0	678	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	766	junction_1	62	703	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTGAGTCTTCACTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20802611	20803474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_20802662_20802746_20803044_20803127
tx.19002	chr9	+	576	2	ISM	ENSMUSG00000004100.13	ENSMUST00000147780.2	1834	9	3234	0	881	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	890	junction_1	0	2089	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTTGAGTCTTCACTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20802814	20803474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_20803044_20803127
tx.19003	chr9	-	837	8	ISM	ENSMUSG00000070319.7	ENSMUST00000004206.10	1101	11	700	0	659	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2349	junction_1	165.383413525625	3592	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTCCTGCTTATTTTCT	5839	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20809219	20805644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_20805739_20805928_20806036_20806128_20806266_20806384_20806493_20807123_20807314_20807411_20807517_20809002_20809063_20809183
tx.19004	chr9	-	1084	11	FSM	ENSMUSG00000070319.7	ENSMUST00000004206.10	1101	11	17	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2112	junction_10	212.212370044727	5054	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTCCTGCTTATTTTCT	5156	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20809902	20805644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20805739_20805928_20806036_20806128_20806266_20806384_20806493_20807123_20807314_20807411_20807517_20809002_20809063_20809183_20809273_20809379_20809464_20809673_20809721_20809839
tx.19005	chr9	-	2791	2	FSM	ENSMUSG00000043895.7	ENSMUST00000054197.7	6394	2	9	3594	9	2294	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCTGGTGGTTATGTGT	8103	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20888068	20877250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20879867_20887893
tx.19006	chr9	+	1118	9	FSM	ENSMUSG00000003299.11	ENSMUST00000003386.7	1288	9	162	8	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	832	junction_5	79.3851371479574	1942	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAAAATGAGCTGGTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20914195	20920127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_20914294_20914379_20914447_20914549_20914701_20917429_20917482_20918122_20918241_20918729_20918837_20918926_20919037_20919118_20919196_20919789
tx.19007	chr9	+	2532	7	FSM	ENSMUSG00000037405.9	ENSMUST00000086399.6	2535	7	0	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	355	junction_3	34.8456915876586	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCTTGTGAGTTTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20927280	20940110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_20927398_20930214_20930476_20936839_20937155_20937607_20937896_20938373_20938632_20938727_20938977_20939066
tx.19008	chr9	+	925	3	FSM	ENSMUSG00000001014.7	ENSMUST00000001040.7	971	3	45	1	-36	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTGCCTTACGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20940713	20941890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_20941120_20941232_20941539_20941677
tx.19009	chr9	-	870	3	FSM	ENSMUSG00000079677.3	ENSMUST00000216484.2	633	3	73	-310	57	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	331	junction_1	2.5	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCGACATGTTTTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20984745	20978814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20979222_20979325_20979414_20984370
tx.1901	chr10	-	645	4	ISM	ENSMUSG00000036099.17	ENSMUST00000123201.8	668	5	60	6659	1	1623	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_3	6.64997911442	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGCTGGAAAATAGTTATAA	3471	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93871603	93836037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_93836386_93839854_93839945_93842821_93842957_93871531
tx.19010	chr9	-	878	4	FSM	ENSMUSG00000079677.3	ENSMUST00000215631.2	681	4	-21	-176	-5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_3	51.1881062574327	286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCGACATGTTTTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20984823	20978814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20979222_20979325_20979414_20984370_20984615_20984684
tx.19011	chr9	-	800	5	FSM	ENSMUSG00000079677.3	ENSMUST00000010348.7	812	5	13	-1	-9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	216	junction_3	56.6171352154098	1712	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCGACATGTTTTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20984827	20978814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20979222_20979325_20979414_20984370_20984478_20984559_20984615_20984684
tx.19012	chr9	-	3460	13	FSM	ENSMUSG00000010205.12	ENSMUST00000115487.3	3470	13	9	1	9	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	416	junction_7	41.8140725912541	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCAGAGCTGGCTGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21003295	20985454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20986793_20986880_20986965_20987259_20987404_20987862_20987938_20990504_20990811_20990896_20991109_20991379_20991468_20992000_20992114_20992270_20992401_20992479_20992672_20997540_20998011_21001545_21001613_21003054
tx.19013	chr9	-	1602	4	ISM	ENSMUSG00000032175.12	ENSMUST00000214864.2	1662	5	2531	-11	-1366	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_1	2.94392028877595	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTCTGTTGTTGTTGCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21040008	21034743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21035855_21036159_21036278_21038419_21038640_21039855
tx.19014	chr9	-	1613	8	FSM	ENSMUSG00000019471.11	ENSMUST00000019615.11	7851	8	29	6209	-11	1522	multi-exon	FALSE	canonical	3	1564	junction_6	89.7352113903194	2544	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCGCTGGTTCAGTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21061249	21050726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21051260_21052053_21052126_21052248_21052432_21053306_21053430_21053508_21053625_21053717_21053827_21054242_21054522_21061051
tx.19015	chr9	+	423	2	Intergenic	novelGene_1303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTTGTTGTTGTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21064749	21066452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_21064968_21066247
tx.19016	chr9	+	1626	4	ISM	ENSMUSG00000032177.18	ENSMUST00000003395.10	2524	10	8048	-14	8048	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	2.62466929133727	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGCTGTAGATGCTCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21116048	21122937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21116421_21116586_21116710_21117440_21117624_21121989
tx.19017	chr9	-	1642	4	ISM	ENSMUSG00000003308.16	ENSMUST00000164812.8	3614	5	5197	-228	3577	-108	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_3	10.4029910228848	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTCCCAGCCTACCGAGT	5024	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21144912	21141134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21142165_21142545_21142723_21142992_21143199_21144683
tx.19018	chr9	-	2926	6	FSM	ENSMUSG00000003308.16	ENSMUST00000049567.10	3172	6	231	15	-27	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_5	30.9993548319961	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCTGGGACATTGGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21150136	21141041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21142165_21142545_21142723_21142992_21143199_21144683_21145370_21148366_21149053_21150088
tx.19019	chr9	-	1518	3	ISM	ENSMUSG00000003308.16	ENSMUST00000049567.10	3172	6	7169	3	5291	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	142	junction_1	1	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGGTGTGGCTCTGAATTA	6738	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21143198	21141029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21142165_21142545_21142723_21142992
tx.1902	chr10	+	957	3	ISM	ENSMUSG00000020021.5	ENSMUST00000020208.5	8044	21	101854	3337	4692	2131	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	4.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATAACTGTTTCTGAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93973716	93977864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_93974275_93975600_93975750_93977614
tx.19020	chr9	-	931	2	FSM	ENSMUSG00000003308.16	ENSMUST00000193247.2	317	2	-564	-50	-564	50	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATGTACTGATCTTGTGT	883	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21149053	21147368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21147613_21148366
tx.19021	chr9	-	966	3	NIC	ENSMUSG00000003308.16	novel	317	2	NA	NA	-27	38	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	10	junction_1	25	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGTGTGTATACATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21150136	21147380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_21147613_21148366_21149053_21150088
tx.19022	chr9	-	926	3	NNC	ENSMUSG00000003308.16	novel	3151	6	NA	NA	-27	-636	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	9	junction_1	25.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCCTTTAGTTTCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21150136	21148054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21148247_21148366_21149053_21150088
tx.19023	chr9	+	1922	10	FSM	ENSMUSG00000002820.7	ENSMUST00000065005.5	5951	10	7	4022	4	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	441	junction_8	36.048663953599	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGGCGTTGTTGACATTT	8641	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21176595	21185046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21177014_21178034_21178119_21178202_21178377_21179546_21179824_21179900_21179966_21182015_21182147_21183763_21183843_21183931_21184009_21184086_21184207_21184549
tx.19024	chr9	+	1888	10	NNC	ENSMUSG00000002820.7	novel	5951	10	NA	NA	2	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_8	152.03800694417	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCGTTGTTGACATTTC	8649	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21176603	21185047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_21177014_21178034_21178119_21178202_21178377_21179546_21179824_21179900_21179966_21182015_21182147_21183763_21183843_21183931_21184009_21184113_21184207_21184549
tx.19025	chr9	-	1773	10	ISM	ENSMUSG00000035047.10	ENSMUST00000038671.10	2598	19	7478	2	-5098	-2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	95	junction_7	29.9295469023134	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTTTCCCCATCCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21191787	21184754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21185545_21186564_21186664_21186732_21186798_21187139_21187271_21187350_21187478_21187680_21187770_21187855_21187932_21190656_21190828_21191459_21191556_21191658
tx.19026	chr9	-	1203	2	FSM	ENSMUSG00000096472.3	ENSMUST00000215619.2	1423	2	171	49	16	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_1	0	739	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTGTGTGATTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21202433	21199754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21200629_21202104
tx.19027	chr9	-	1721	11	FSM	ENSMUSG00000003309.15	ENSMUST00000003397.9	1706	11	-12	-3	-7	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_6	5.23545604508337	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGAGTGTGCTTCTTGGGT	1333	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21223619	21206753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21207151_21207728_21207805_21209495_21209622_21210574_21210734_21213751_21213824_21213918_21214062_21216577_21216705_21216788_21217068_21220662_21220731_21220931_21221089_21223502
tx.19028	chr9	-	473	2	NNC	ENSMUSG00000111172.2	novel	636	2	NA	NA	-30	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGTATTTCAGTCATTA	7381	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21231943	21229365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21229781_21231885
tx.19029	chr9	+	3451	22	FSM	ENSMUSG00000057193.9	ENSMUST00000217461.2	3478	22	27	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	41.7821257447013	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGACCTGGTATGCTTAATA	6607	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21232020	21266324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21232148_21249736_21249786_21253074_21253149_21253234_21253320_21253478_21253564_21253690_21253802_21253893_21253955_21254038_21254163_21254259_21254344_21254430_21254544_21256127_21256260_21256588_21256689_21256774_21256868_21257204_21257290_21257984_21258248_21258330_21258426_21259178_21259283_21259370_21259445_21259623_21259695_21259833_21259923_21263762_21263848_21264977
tx.1903	chr10	+	536	4	FSM	ENSMUSG00000020022.18	ENSMUST00000179990.8	566	4	31	-1	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3293	junction_3	309.018877524767	21463	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTCTTGTGCGTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94034896	94056811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_94034993_94035811_94035895_94039149_94039238_94056542
tx.19030	chr9	+	1321	10	FSM	ENSMUSG00000002825.9	ENSMUST00000002902.8	1316	10	-2	-3	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	687	junction_5	65.5845510263914	1529	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGCTCTTGTGTCTGTCTTC	2367	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21323130	21331573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21323394_21323528_21323598_21323688_21323828_21328360_21328440_21328567_21328684_21329579_21329719_21330586_21330663_21330734_21330845_21330920_21331009_21331331
tx.19031	chr9	+	853	7	ISM	ENSMUSG00000002825.9	ENSMUST00000002902.8	1316	10	5227	-5	-892	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	687	junction_2	76.6480049751242	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTTGTGTCTGTCTTCTT	7596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21328359	21331575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21328440_21328567_21328684_21329579_21329719_21330586_21330663_21330734_21330845_21330920_21331009_21331331
tx.19032	chr9	+	3517	20	NIC	ENSMUSG00000033335.18	novel	3510	21	NA	NA	8	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	2	224	junction_13	132.11218266634	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTACGTGTGTGGGCCTTTT	5850	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21336211	21418434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_21336553_21368798_21368873_21376877_21377028_21378827_21379032_21382638_21382738_21383908_21384070_21385827_21385971_21387768_21387905_21389576_21389645_21391702_21391842_21392628_21392716_21396946_21397018_21401038_21401091_21405799_21405914_21410553_21410664_21411553_21411666_21414837_21415003_21415725_21415959_21416759_21417012_21417628
tx.19033	chr9	-	1320	4	FSM	ENSMUSG00000032180.12	ENSMUST00000034698.9	1378	4	58	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	533	junction_2	14.8548533034381	1948	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGCCTGGTGACTGGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21421490	21418850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21419688_21420226_21420411_21420549_21420648_21421289
tx.19034	chr9	+	2405	11	ISM	ENSMUSG00000032185.16	ENSMUST00000130032.8	3336	17	33369	-9	5243	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1074	junction_6	66.6334000333166	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCAGGGTAGTCTCCAGG	273	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21491642	21500772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21491783_21494334_21494426_21494806_21494889_21497462_21497549_21497740_21497831_21498196_21498335_21498420_21498511_21498586_21498700_21498803_21498882_21499146_21499216_21499344
tx.19035	chr9	+	2118	9	ISM	ENSMUSG00000032185.16	ENSMUST00000130032.8	3336	17	36575	5	-3665	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1074	junction_4	72.3252203591527	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAGCCTGCAAAACAGCA	3479	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21494848	21500758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21494889_21497462_21497549_21497740_21497831_21498196_21498335_21498420_21498511_21498586_21498700_21498803_21498882_21499146_21499216_21499344
tx.19036	chr9	-	2018	9	ISM	ENSMUSG00000032182.16	ENSMUST00000078572.9	1894	10	24	0	24	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	66	junction_4	11.9032558571174	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCACGCCCATGGTGACCA	6148	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21504044	21499977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21500855_21500930_21501057_21501141_21501325_21501406_21501574_21501651_21501769_21502722_21502811_21503195_21503277_21503356_21503515_21503823
tx.19038	chr9	-	1922	10	FSM	ENSMUSG00000032182.16	ENSMUST00000078572.9	1894	10	-28	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_9	21.338541031039	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCACGCCCATGGTGACCA	6096	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21504096	21499977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21500855_21500930_21501057_21501141_21501325_21501406_21501574_21501651_21501769_21502722_21502811_21503195_21503277_21503356_21503515_21503823_21503885_21504032
tx.19039	chr9	+	639	3	ISM	ENSMUSG00000032187.17	ENSMUST00000174008.8	5405	34	84659	-1	65156	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	777	junction_1	40.5	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTGGCTCCCTGGACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21612218	21614663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21612283_21612383_21612527_21614231
tx.1904	chr10	-	1747	3	NNC	ENSMUSG00000097164.3	novel	6566	3	NA	NA	-16	-4793	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	9	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTATCAGTAATTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94524454	94511679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_94512992_94514192_94514310_94524136
tx.19040	chr9	+	575	2	ISM	ENSMUSG00000032187.17	ENSMUST00000174008.8	5405	34	84824	-1	65321	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	858	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTGGCTCCCTGGACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21612383	21614663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21612527_21614231
tx.19041	chr9	+	491	3	ISM	ENSMUSG00000032193.10	ENSMUST00000214359.2	1739	7	-58	6115	-16	-6115	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	305	junction_1	13	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACGAACAAGGCTGTCGTA	1873	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21634878	21643713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21635141_21643042_21643166_21643607
tx.19042	chr9	-	1037	5	NNC	ENSMUSG00000074476.7	novel	1366	5	NA	NA	-4	-205	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1095.95221154939	427	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAACAAACAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21671603	21666942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21667592_21668412_21668490_21668585_21668696_21668980_21669126_21671547
tx.19043	chr9	-	772	5	NNC	ENSMUSG00000074476.7	novel	1366	5	NA	NA	7	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	944.135186294844	469	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTATGAATGTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21671591	21667311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21667592_21668412_21668490_21668585_21668696_21668997_21669126_21671414
tx.19044	chr9	-	878	5	NNC	ENSMUSG00000074476.7	novel	1366	5	NA	NA	0	83	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	944.135186294844	462	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGGTGGTTCTGAGCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21671598	21667220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21667592_21668412_21668490_21668585_21668687_21668980_21669126_21671414
tx.19045	chr9	-	791	5	NNC	ENSMUSG00000074476.7	novel	1366	5	NA	NA	5	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	944.135186294844	8183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTATGAATGTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21671593	21667311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21667592_21668412_21668490_21668585_21668696_21668980_21669126_21671414
tx.19046	chr9	-	728	5	NNC	ENSMUSG00000074476.7	novel	1366	5	NA	NA	1	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	944.135186294844	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTTATCTACTTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21671597	21667388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21667592_21668412_21668490_21668585_21668687_21668961_21669126_21671414
tx.19048	chr9	-	603	3	ISM	ENSMUSG00000032198.10	ENSMUST00000034728.9	6467	49	50893	0	2259	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	246	junction_2	18	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGTGGTGTGCTGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21713038	21711475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21711696_21712466_21712629_21712817
tx.19049	chr9	-	635	4	ISM	ENSMUSG00000032198.10	ENSMUST00000034728.9	6467	49	50765	0	2131	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	62	junction_3	96.3512094140782	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGTGGTGTGCTGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21713166	21711475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21711696_21712466_21712629_21712817_21712925_21713020
tx.1905	chr10	-	3895	3	FSM	ENSMUSG00000097164.3	ENSMUST00000181906.3	6566	3	-16	2687	-16	-2687	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	6	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGACCACATATCTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94524454	94509573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_94512992_94514192_94514310_94524094
tx.19050	chr9	-	374	2	ISM	ENSMUSG00000032198.10	ENSMUST00000034728.9	6467	49	51311	0	2677	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	282	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGTGGTGTGCTGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21712620	21711475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21711696_21712466
tx.19051	chr9	-	1881	15	FSM	ENSMUSG00000032198.10	ENSMUST00000213296.2	1868	15	-10	-3	-8	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	50.5494807094989	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTGCCTCTGTTCTCTTTT	6265	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21763922	21748641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21748848_21750046_21750210_21750438_21750533_21750648_21750777_21750920_21751069_21751167_21751249_21752788_21752939_21753205_21753273_21754228_21754315_21755502_21755716_21756739_21756870_21757056_21757126_21757794_21757971_21758480_21758569_21763840
tx.19052	chr9	-	1347	6	FSM	ENSMUSG00000032198.10	ENSMUST00000213775.2	1324	6	-15	-8	4	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	199	junction_1	8.83176086632785	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTGGGTAATGCAGGTAG	6260	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21763927	21754918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21755716_21756739_21756870_21757056_21757126_21757794_21757971_21758480_21758569_21763840
tx.19053	chr9	-	2264	5	FSM	ENSMUSG00000019066.14	ENSMUST00000115351.10	3835	5	42	1529	-11	-378	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_4	8.45576726264388	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTTCTTAAGATTCAGC	2275	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21829446	21820315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21821968_21825940_21826066_21826158_21826278_21827000_21827240_21829317
tx.19054	chr9	-	188	2	FSM	ENSMUSG00000019066.14	ENSMUST00000154019.2	429	2	-29	270	-11	-270	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAACTTTGACTACATGTT	2275	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21829446	21827180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21827240_21829317
tx.19055	chr9	-	707	4	FSM	ENSMUSG00000040883.19	ENSMUST00000046831.11	785	4	80	-2	80	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_3	45.9879211194514	940	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCATGGTCATTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21838678	21832302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21832646_21837286_21837451_21837544_21837654_21838587
tx.19056	chr9	-	615	3	ISM	ENSMUSG00000040883.19	ENSMUST00000214569.2	879	4	665	-84	-39	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_2	6	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGCCATGGTCATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21837654	21832304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21832646_21837286_21837451_21837544
tx.19057	chr9	+	1526	13	FSM	ENSMUSG00000006241.17	ENSMUST00000006403.7	1531	13	-1	6	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_12	2.13924960883224	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTGGACTTTTGCACCTG	3125	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21838765	21847162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21839025_21840388_21840523_21840603_21840831_21842605_21842640_21842994_21843084_21843160_21843243_21844099_21844287_21844841_21844910_21844991_21845069_21845413_21845530_21845730_21845814_21846825_21846925_21847091
tx.19058	chr9	+	2622	10	NIC	ENSMUSG00000040563.14	novel	2626	10	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_8	8.37692303332034	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGGCCTTCTGCCTGCCT	88	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21848319	21860203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_21848455_21849690_21849861_21850594_21850675_21851980_21852170_21852297_21852434_21854646_21854919_21855691_21855869_21858241_21858349_21858676_21858729_21858899
tx.19059	chr9	+	1838	2	FSM	ENSMUSG00000051238.7	ENSMUST00000053583.7	1838	2	2	-2	2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGACTCTGGTGGTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21867052	21869562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21867301_21867972
tx.1906	chr10	+	2830	16	NNC	ENSMUSG00000020024.8	novel	3639	16	NA	NA	235	146	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_13	58.1305045183297	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTGTTTAATTTTCCT	9803	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94524814	94626201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_94524909_94554713_94554982_94555453_94555605_94561508_94561602_94564452_94564585_94573634_94573887_94575918_94576051_94584802_94584918_94586120_94586266_94586371_94586522_94602303_94602380_94604680_94604839_94606806_94606941_94622605_94622710_94624508_94624699_94625565
tx.19061	chr9	-	725	4	ISM	ENSMUSG00000039632.14	ENSMUST00000115336.10	2103	13	10821	-1	10821	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_3	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGTATTCACCTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21903012	21901165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21901541_21901692_21901778_21902097_21902254_21902903
tx.19062	chr9	-	899	3	FSM	ENSMUSG00000039632.14	ENSMUST00000214420.2	903	3	7	-3	7	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	2	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTAGTGTTAATGTTGGT	4211	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21913923	21908864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21909260_21909340_21909463_21913541
tx.19063	chr9	+	2022	18	FSM	ENSMUSG00000003402.15	ENSMUST00000003493.9	2012	18	-10	0	-10	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	461	junction_11	125.012497645132	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTGGCTGTTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21914303	21925518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21914385_21914694_21914834_21914972_21915090_21915793_21915890_21915986_21916045_21917835_21917954_21919539_21919670_21921452_21921538_21921819_21921899_21922462_21922550_21922733_21922872_21922969_21923067_21923329_21923400_21923514_21923605_21923974_21924050_21924131_21924232_21924311_21924463_21925207
tx.19064	chr9	+	2042	18	FSM	ENSMUSG00000003402.15	ENSMUST00000115331.10	1983	18	-56	-3	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	290	junction_11	154.653737577573	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGGCTGTTTTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21914305	21925519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21914385_21914694_21914834_21914972_21915090_21915793_21915890_21915986_21916045_21917835_21917954_21919539_21919670_21921452_21921538_21921819_21921899_21922462_21922550_21922733_21922893_21922969_21923067_21923329_21923400_21923514_21923605_21923974_21924050_21924131_21924232_21924311_21924463_21925207
tx.19065	chr9	+	960	8	ISM	ENSMUSG00000003402.15	ENSMUST00000003493.9	2012	18	8492	0	5942	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	461	junction_1	163.707055437449	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTGGCTGTTTTTTAAT	NA	False	NA	-31	True	NA	NA	NA	21922805	21925518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21922872_21922969_21923067_21923329_21923400_21923514_21923605_21923974_21924050_21924131_21924232_21924311_21924463_21925207
tx.19066	chr9	+	980	8	ISM	ENSMUSG00000003402.15	ENSMUST00000115331.10	1983	18	8446	-3	5944	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	290	junction_1	219.797866324531	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGGCTGTTTTTTAATT	NA	False	NA	-29	True	NA	NA	NA	21922807	21925519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21922893_21922969_21923067_21923329_21923400_21923514_21923605_21923974_21924050_21924131_21924232_21924311_21924463_21925207
tx.19067	chr9	+	896	7	ISM	ENSMUSG00000003402.15	ENSMUST00000115331.10	1983	18	8606	-2	6104	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	812	junction_3	71.2540447195027	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTGGCTGTTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21922967	21925518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21923067_21923329_21923400_21923514_21923605_21923974_21924050_21924131_21924232_21924311_21924463_21925207
tx.19068	chr9	+	1390	3	NNC	ENSMUSG00000096981.3	novel	1415	3	NA	NA	-11	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTATGTGAAATGGCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21982286	21997427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_21982386_21987545_21987648_21996238
tx.19069	chr9	+	686	3	NNC	ENSMUSG00000096981.3	novel	567	4	NA	NA	-14	-8381	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTACACACCTGAAATCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21982313	21988095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_21982386_21987315_21987380_21987545
tx.1907	chr10	-	1148	3	FSM	ENSMUSG00000045867.11	ENSMUST00000217809.2	1115	3	-33	0	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	28	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCCTCTTTCAATGAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95159460	95011126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_95011841_95158447_95158752_95159330
tx.19070	chr9	-	860	5	ISM	ENSMUSG00000066839.13	ENSMUST00000179422.8	1462	8	10600	0	10600	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	217	junction_4	14.7542366796795	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTGGCCCTGTGGCTTC	6000	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21986098	21983541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21983877_21984277_21984384_21984721_21984871_21984978_21985037_21985886
tx.19071	chr9	-	1075	6	ISM	ENSMUSG00000066839.13	ENSMUST00000179422.8	1462	8	8972	0	8972	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	217	junction_4	15.0811140172071	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTGGCCCTGTGGCTTC	4372	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21987726	21983541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21983877_21984277_21984384_21984721_21984871_21984978_21985037_21985886_21986111_21987523
tx.19072	chr9	-	1408	7	ISM	ENSMUSG00000066839.13	ENSMUST00000179422.8	1462	8	7137	0	7137	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	217	junction_4	13.832329280831	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTGGCCCTGTGGCTTC	2537	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21989561	21983541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21983877_21984277_21984384_21984721_21984871_21984978_21985037_21985886_21986111_21987523_21987942_21989443
tx.19073	chr9	-	1677	9	FSM	ENSMUSG00000066839.13	ENSMUST00000098937.10	1673	9	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_8	44.5222907654132	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTGGCCCTGTGGCTTC	5892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21996727	21983541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21983877_21984277_21984384_21984721_21984871_21984978_21985037_21985886_21986111_21987523_21987942_21989443_21989562_21995318_21995505_21996644
tx.19074	chr9	-	1669	9	FSM	ENSMUSG00000066839.13	ENSMUST00000180180.8	1676	9	7	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_8	49.2772767104677	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTGGCCCTGTGGCTTC	5892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21996727	21983541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_21983877_21984277_21984384_21984721_21984871_21984978_21985037_21985886_21986111_21987523_21987942_21989443_21989562_21995318_21995505_21996652
tx.19075	chr9	+	188	2	Intergenic	novelGene_1305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGAAGAATCAAAGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21987027	22178602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_21987175_22178561
tx.19076	chr9	+	1530	7	FSM	ENSMUSG00000001349.6	ENSMUST00000001384.6	2381	7	-52	903	0	393	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.49071198499986	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGAGTCTTGGGGCCAGTT	7076	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22010511	22020023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_22010715_22012436_22012559_22015601_22015669_22016665_22016804_22016965_22017077_22019046_22019194_22019281
tx.19077	chr9	-	881	3	FSM	ENSMUSG00000013822.8	ENSMUST00000013966.8	888	3	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	357	junction_2	52.5	1270	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCGCCGCTGTACTTCTT	7951	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22028461	22024286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_22024976_22025103_22025240_22028405
tx.19078	chr9	-	1347	5	NNC	ENSMUSG00000001348.16	novel	1356	5	NA	NA	-6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	56	junction_4	83.7048385698222	53	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTGTGTCATCAAGGTTA	9068	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22042955	22038022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_22038559_22038970_22039317_22040826_22040955_22041158_22041426_22042885
tx.19079	chr9	-	1409	5	FSM	ENSMUSG00000001348.16	ENSMUST00000069330.14	1356	5	-53	0	-37	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_4	52.4374627532645	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTGTGTCATCAAGGTTA	8859	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22043164	22038022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_22038559_22038970_22039317_22040826_22040955_22041158_22041426_22043032
tx.1908	chr10	-	801	2	NNC	ENSMUSG00000045867.11	novel	1613	2	NA	NA	134354	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	44	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTGCCTCTTTCAATGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95024473	95011127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_95011841_95024385
tx.19080	chr9	+	675	2	FSM	ENSMUSG00000010607.9	ENSMUST00000123680.2	695	2	2	18	2	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	566	junction_1	0	2617	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCTTCATCCAAAGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22068143	22069636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_22068210_22069027
tx.19081	chr9	-	726	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000010607.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGCCTGTAGGAGTCCGG	6780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22069635	22068204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_22068321_22069025
tx.19082	chr9	+	736	2	FSM	ENSMUSG00000010607.9	ENSMUST00000148088.2	676	2	-37	-23	-37	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_1	0	789	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCAAAGACTGTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22068204	22069644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_22068324_22069027
tx.19083	chr9	+	1554	4	NNC	ENSMUSG00000109765.3	novel	1468	3	NA	NA	-2718	-137	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.471404520791032	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTGTGTGTGTGTATA	5030	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22076056	22081811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_22076282_22078776_22078904_22079092_22079151_22080667
tx.19084	chr9	+	346	2	NNC	ENSMUSG00000109765.3	novel	1468	3	NA	NA	1	139397	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACATTCTCTCGTGAGTTC	7749	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22078775	22221345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_22078904_22221127
tx.19085	chr9	+	1569	5	FSM	ENSMUSG00000057982.9	ENSMUST00000215618.2	1313	5	-38	-218	0	-32	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_4	21.3717102731625	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTCGTCTTGTGCTGGC	740	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22137009	22150957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_22137129_22146315_22146443_22147497_22147591_22148970_22149081_22149837
tx.19086	chr9	+	979	2	FSM	ENSMUSG00000057982.9	ENSMUST00000213350.2	597	2	-9	-373	0	-339	multi-exon	FALSE	canonical	3	166	junction_1	0	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGTTGCTGTGGTCATGGT	740	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22137009	22147175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_22137129_22146315
tx.19087	chr9	-	220	2	ISM	ENSMUSG00000062794.9	ENSMUST00000086281.5	3574	5	-13	10674	-13	-10674	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAGGACCCTGTACAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22171204	22169399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_22169468_22171052
tx.19088	chr9	-	1358	8	NNC	ENSMUSG00000066829.8	novel	3238	8	NA	NA	-41	388	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.6844914455178	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACATCACAGGACTCATACGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22218985	22189974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_22190573_22191744_22191856_22194463_22194557_22195312_22195440_22201834_22201939_22209712_22209806_22216807_22216899_22218844
tx.1909	chr10	+	1818	2	FSM	ENSMUSG00000112593.2	ENSMUST00000218132.2	1056	2	-348	-414	-348	414	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTAGACACTTATAAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95153760	95160634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_95154552_95159607
tx.19091	chr9	+	1144	2	NNC	ENSMUSG00000036411.11	novel	2223	7	NA	NA	-22588	-10080	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGACTAGAAGACACTAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22300220	22336321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_22300452_22335408
tx.19092	chr9	+	1042	2	NNC	ENSMUSG00000036411.11	novel	2223	7	NA	NA	-9275	-10073	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGACACTAGTCTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22313533	22336328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_22313656_22335408
tx.19093	chr9	+	1138	2	ISM	ENSMUSG00000036411.11	ENSMUST00000058868.9	2223	7	18	19650	-17	-10074	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGACACTAGTCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22322826	22336327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_22323046_22335408
tx.19094	chr9	+	1792	7	NIC	ENSMUSG00000036411.11	novel	2223	7	NA	NA	2	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.8151743807532	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCAGTTCTTATTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22322845	22355982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_22323046_22335807_22336104_22341651_22341796_22342971_22343105_22346390_22346697_22351162_22351261_22355367
tx.19095	chr9	-	797	4	ISM	ENSMUSG00000032239.11	ENSMUST00000034763.10	1134	6	10877	0	10699	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	365	junction_2	10.2306728354819	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGTCATTATTAATACAG	7535	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22368767	22359606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_22360151_22361097_22361160_22365074_22365167_22368668
tx.19096	chr9	-	1134	6	FSM	ENSMUSG00000032239.11	ENSMUST00000034763.10	1134	6	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	365	junction_2	10.1311401135312	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGTCATTATTAATACAG	9510	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22379644	22359606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_22360151_22361097_22361160_22365074_22365167_22368668_22368799_22370006_22370038_22379369
tx.19097	chr9	+	976	2	NNC	ENSMUSG00000100002.3	novel	921	3	NA	NA	-247	-7347	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGAGTTCTGTGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25063162	25079510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_25063484_25078855
tx.19098	chr9	+	2375	13	NIC	ENSMUSG00000001833.18	novel	2533	14	NA	NA	13	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	380.283474310064	1159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGCAGTGTCTTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25163884	25219864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_25163996_25176689_25176793_25188839_25188947_25197963_25198065_25199479_25199615_25204980_25205099_25207690_25207784_25209107_25209205_25210787_25210840_25212707_25212834_25215012_25215149_25217421_25217562_25218808
tx.19099	chr9	+	1878	9	ISM	ENSMUSG00000001833.18	ENSMUST00000165594.4	2516	14	35806	0	-11079	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1099	junction_2	112.269694820107	206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGTGCAGTGTCTTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25199552	25219862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_25199615_25204980_25205099_25207690_25207784_25209107_25209205_25210787_25210840_25212707_25212834_25215012_25215149_25217421_25217562_25218808
tx.191	chr1	-	456	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041763.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGGCTATTCTAGTTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43973058	43971378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_43971575_43972798
tx.1910	chr10	-	1606	2	ISM	ENSMUSG00000045867.11	ENSMUST00000217809.2	1115	3	-38	146154	-38	329	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATACTACCAGTAAATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95159465	95157280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_95158752_95159330
tx.19100	chr9	-	351	2	Intergenic	novelGene_1306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTGGCTTCATCATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25762004	25761231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_25761449_25761870
tx.19101	chr9	-	1098	5	ISM	ENSMUSG00000031969.17	ENSMUST00000129490.8	3188	7	11741	1019	-1357	222	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_2	13.7727085208393	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGGATTTTTTATTTGG	6387	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26890608	26886449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_26887057_26888851_26888955_26889606_26889760_26890280_26890379_26890471
tx.19102	chr9	-	1227	6	ISM	ENSMUSG00000031969.17	ENSMUST00000129490.8	3188	7	5461	1019	5461	222	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	224	junction_5	15.0811140172071	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGGATTTTTTATTTGG	107	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26896888	26886449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_26887057_26888851_26888955_26889606_26889760_26890280_26890379_26890471_26890608_26896758
tx.19103	chr9	-	1846	11	FSM	ENSMUSG00000031969.17	ENSMUST00000060513.8	2859	11	5	1008	5	224	multi-exon	FALSE	canonical	3	181	junction_10	23.6862829502647	224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGATTTTTTATTTGGGA	9253	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26910840	26886447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_26887057_26888851_26888955_26889606_26889760_26890280_26890379_26890471_26890608_26896758_26896897_26901415_26901493_26901878_26901989_26902535_26902706_26903455_26903557_26910689
tx.19104	chr9	-	1866	11	NIC	ENSMUSG00000031969.17	novel	2859	11	NA	NA	11	222	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	47	junction_10	61.1735236846791	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGGATTTTTTATTTGG	9259	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26910834	26886449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_26887057_26888851_26888955_26889606_26889760_26890280_26890379_26890471_26890608_26896758_26896897_26901415_26901493_26901878_26901989_26902535_26902706_26903455_26903585_26910689
tx.19105	chr9	+	805	7	FSM	ENSMUSG00000035443.11	ENSMUST00000213770.2	775	7	-26	-4	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	323	junction_6	112.305634567263	1427	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGGAAGTGTTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26910979	26918630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_26911062_26911246_26911353_26914892_26915075_26916441_26916511_26916852_26916946_26917647_26917744_26918453
tx.19106	chr9	+	935	8	FSM	ENSMUSG00000035443.11	ENSMUST00000039161.10	918	8	-17	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_7	172.705955134082	676	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGGAAGTGTTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26911000	26918630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_26911062_26911246_26911353_26914892_26915075_26916441_26916511_26916852_26916946_26917647_26917744_26918096_26918248_26918453
tx.19107	chr9	+	801	7	NNC	ENSMUSG00000035443.11	novel	918	8	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	53	junction_1	220.761560663687	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGGAAGTGTTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26911002	26918630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_26911081_26911246_26911353_26914892_26915075_26916441_26916511_26916852_26916946_26917647_26917744_26918453
tx.19108	chr9	+	947	6	NIC	ENSMUSG00000035443.11	novel	918	8	NA	NA	-1	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	323	junction_5	122.182486470034	451	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGGAAGTGTTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26911022	26918630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_26911353_26914892_26915075_26916441_26916511_26916852_26916946_26917647_26917744_26918453
tx.19109	chr9	+	1063	7	FSM	ENSMUSG00000035443.11	ENSMUST00000213683.2	1107	7	42	2	34	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_6	186.06510210736	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGGAAGTGTTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26911057	26918630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_26911353_26914892_26915075_26916441_26916511_26916852_26916946_26917647_26917744_26918096_26918248_26918453
tx.1911	chr10	+	504	3	NNC	ENSMUSG00000100550.3	novel	642	3	NA	NA	3090	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	6	141	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGAGGTTGGGAAGTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95193839	95199077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_95193983_95194128_95194221_95198808
tx.19110	chr9	-	1783	3	ISM	ENSMUSG00000031988.11	ENSMUST00000034470.11	3575	6	17255	713	17220	-713	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	183	junction_1	4.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCTTTCAGTTCATGTAG	84	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26924106	26919779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_26921334_26921659_26921803_26924020
tx.19111	chr9	+	574	4	ISM	ENSMUSG00000035024.17	ENSMUST00000216677.2	5149	35	80	50663	80	-7304	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	212	junction_3	15.9373774505092	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAAAACCACCTAGAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26942024	26955945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_26942127_26948280_26948436_26952688_26952852_26955791
tx.19112	chr9	+	648	5	ISM	ENSMUSG00000035024.17	ENSMUST00000216677.2	5149	35	80	50219	80	-6860	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	212	junction_3	16.0682139642214	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTTTCTGGCCGGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26942024	26956389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_26942127_26948280_26948436_26952688_26952852_26955791_26955977_26956346
tx.19113	chr9	-	2002	9	NNC	ENSMUSG00000031990.16	novel	1942	9	NA	NA	4335	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	52	junction_8	53.8573056789884	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATGTTTGTATTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27033511	27008679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_27009698_27010007_27010063_27010140_27010271_27011378_27011479_27012533_27012737_27013159_27013313_27016802_27016917_27017644_27017711_27033348
tx.19114	chr9	-	1952	9	FSM	ENSMUSG00000031990.16	ENSMUST00000034472.16	1942	9	-10	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_8	42.8396355610082	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATGTTTGTATTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27066699	27008679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_27009698_27010007_27010063_27010140_27010271_27011378_27011479_27012533_27012737_27013159_27013313_27016802_27016917_27017644_27017711_27066586
tx.19115	chr9	+	648	3	ISM	ENSMUSG00000034275.19	ENSMUST00000115247.8	2857	15	-14	18423	10	-18423	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTACGTAAATCTTTTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27210509	27223008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_27210814_27220699_27220898_27222862
tx.19117	chr9	-	349	2	Intergenic	novelGene_1308	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTGTCTTAGTCTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30940837	30940268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_30940444_30940663
tx.19118	chr9	+	3137	6	FSM	ENSMUSG00000047412.17	ENSMUST00000115222.10	8861	6	165	5559	165	93	multi-exon	FALSE	canonical	3	240	junction_5	55.0694107468021	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTTTGTTTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30942106	30981622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_30942255_30964535_30965610_30973336_30973422_30975474_30975639_30977954_30978039_30980040
tx.19119	chr9	-	1028	3	ISM	ENSMUSG00000031995.10	ENSMUST00000034478.3	3259	19	40247	5	11314	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	647	junction_2	21.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAATTTGTTTTTCTTGCT	1301	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31002902	31000702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_31001324_31001697_31001835_31002632
tx.1912	chr10	-	1423	5	NIC	ENSMUSG00000020027.19	novel	4242	5	NA	NA	32	-109	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	22	junction_3	175.888281303787	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGATTTCGGTCACTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95252687	95223637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_95224258_95224751_95224905_95226426_95226508_95250692_95251054_95252479
tx.19120	chr9	-	1216	4	ISM	ENSMUSG00000031995.10	ENSMUST00000034478.3	3259	19	36134	7	7201	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	647	junction_2	18.2391520270726	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGTAATTTGTTTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31007015	31000704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_31001324_31001697_31001835_31002632_31002908_31006830
tx.19121	chr9	-	1404	6	ISM	ENSMUSG00000031995.10	ENSMUST00000034478.3	3259	19	34939	5	6006	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	541	junction_4	52.6938326562037	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAATTTGTTTTTCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31008210	31000702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_31001324_31001697_31001835_31002632_31002908_31006830_31007018_31007770_31007894_31008149
tx.19122	chr9	-	1804	9	ISM	ENSMUSG00000031995.10	ENSMUST00000034478.3	3259	19	31583	5	2650	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	541	junction_4	43.0950983291604	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAATTTGTTTTTCTTGCT	7169	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31011566	31000702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_31001324_31001697_31001835_31002632_31002908_31006830_31007018_31007770_31007894_31008149_31008264_31008368_31008480_31008852_31008958_31011435
tx.19123	chr9	-	1714	4	FSM	ENSMUSG00000031996.18	ENSMUST00000216921.2	1877	4	165	-2	165	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1185	junction_2	69.5621225156974	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACCTTGTGTTCCTGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31064776	31060852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_31062269_31063132_31063289_31063608_31063684_31064709
tx.19124	chr9	-	1019	5	NNC	ENSMUSG00000031996.18	novel	3504	17	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	613.489201208954	74	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACCTTGTGTTCCTGACCA	8714	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31123112	31060852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_31061309_31083271_31083343_31088313_31088438_31089200_31089375_31122918
tx.19125	chr9	+	573	3	ISM	ENSMUSG00000042185.15	ENSMUST00000131540.8	645	4	-7	2457	0	-2457	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_2	4.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCATGACGAGTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31297492	31303584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_31297567_31300172_31300346_31303258
tx.19127	chr9	-	903	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041444.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGATGATATATGATATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32047599	32046598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_32046898_32046995
tx.19128	chr9	-	1603	6	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032036.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	6.40624695121879	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGCTGTCTCATCAGAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34899964	34889330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_34890279_34894916_34895038_34895356_34895445_34895840_34895961_34896290_34896441_34899788
tx.19129	chr9	-	1565	6	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032036.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	7.55248303539968	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGCTGTCTCATCAGAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34901376	34889330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_34890279_34894916_34895038_34895356_34895445_34895840_34895970_34896290_34896441_34901247
tx.1913	chr10	-	1681	3	FSM	ENSMUSG00000020027.19	ENSMUST00000020215.16	2222	3	9	532	9	398	multi-exon	FALSE	canonical	3	447	junction_2	23.5	917	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAACGAAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95252710	95247883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_95248973_95250692_95251054_95252479
tx.19130	chr9	-	1570	6	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032036.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_5	6.15142259969188	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGCGCTGTCTCATCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34901173	34889334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_34890279_34894916_34895038_34895356_34895445_34895840_34895970_34896290_34896441_34901035
tx.19132	chr9	-	1458	5	ISM	ENSMUSG00000032038.8	ENSMUST00000034537.8	2095	11	63466	0	2387	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	169	junction_1	11.8638105177047	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACTTGTGGGGCTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34964703	34957871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_34958816_34959114_34959259_34963535_34963680_34964373_34964564_34964667
tx.19133	chr9	-	2074	11	FSM	ENSMUSG00000032038.8	ENSMUST00000034537.8	2095	11	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_1	8.15107354892593	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACTTGTGGGGCTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35028148	34957871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_34958816_34959114_34959259_34963535_34963680_34964373_34964564_34964667_34964764_34965358_34965420_34965730_34965829_34965997_34966079_34966493_34966579_34966869_34966946_35027993
tx.19134	chr9	-	1219	6	FSM	ENSMUSG00000032040.16	ENSMUST00000034539.12	1274	6	53	2	-15	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	621	junction_4	33.1083071146804	1752	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGATGGTGTAGCCCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35087304	35035705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_35036141_35037602_35037714_35040756_35040871_35047639_35047786_35082372_35082548_35087066
tx.19135	chr9	+	974	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032040.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGAAGAAGCCTCCGCCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35086279	35087293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_35086354_35086393
tx.19136	chr9	-	2312	7	FSM	ENSMUSG00000032041.16	ENSMUST00000176685.8	1783	7	52	-581	10	22	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_5	13.6065752079239	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAGCCAAGAAA	7987	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35111214	35098058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_35099227_35099952_35100592_35102313_35102473_35102616_35102679_35102869_35102993_35110516_35110616_35111152
tx.19137	chr9	-	2210	11	FSM	ENSMUSG00000039048.16	ENSMUST00000127996.8	2289	11	79	0	4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	179	junction_9	18.9747200242849	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGCCTCTTGAGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35122272	35115503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_35116420_35116600_35116706_35116884_35117015_35117155_35117317_35117518_35117596_35118774_35118877_35119187_35119283_35120333_35120453_35120711_35120826_35121240_35121462_35122102
tx.19138	chr9	+	2971	14	FSM	ENSMUSG00000032042.12	ENSMUST00000034541.12	2993	14	18	4	18	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	518	junction_4	138.528744373691	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCTCTTAGGTTCATATT	5530	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35122468	35128306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_35122702_35123287_35123372_35123643_35123808_35124015_35124177_35124425_35124583_35124678_35124833_35125042_35125132_35125232_35125352_35125482_35125570_35125855_35126029_35126113_35126328_35126762_35126927_35127010_35127110_35127233
tx.19139	chr9	+	622	4	ISM	ENSMUSG00000032042.12	ENSMUST00000034541.12	2993	14	20	4152	20	11	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	967	junction_3	36.5726066278513	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGGGCCAAAAAGGAAGGT	5532	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35122470	35124158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_35122702_35123287_35123372_35123643_35123808_35124015
tx.1914	chr10	-	1111	2	NNC	ENSMUSG00000112261.2	novel	660	3	NA	NA	7789	561	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCTTCAGAAACCCTAAG	9342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95289297	95280616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_95281620_95289189
tx.19140	chr9	+	1638	5	ISM	ENSMUSG00000032042.12	ENSMUST00000034541.12	2993	14	3490	4	-254	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	822	junction_1	93.5227245112117	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCTCTTAGGTTCATATT	9002	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35125940	35128306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_35126029_35126113_35126328_35126762_35126927_35127010_35127110_35127233
tx.19141	chr9	-	1624	8	FSM	ENSMUSG00000050471.18	ENSMUST00000059057.14	1860	8	25	211	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_5	33.1724006256	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGGCTCTACTTTGAAGA	6389	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35179076	35128526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_35129044_35129224_35129285_35132675_35132962_35134909_35135039_35138459_35138688_35146526_35146780_35155909_35156003_35179018
tx.19142	chr9	-	1396	7	FSM	ENSMUSG00000050471.18	ENSMUST00000063782.12	1662	7	0	266	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_4	50.0954644209988	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGGCTCTACTTTGAAGA	6389	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35179076	35128526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_35129044_35129224_35129285_35132675_35132962_35134909_35135039_35146526_35146780_35155909_35156003_35179018
tx.19143	chr9	-	1622	8	NNC	ENSMUSG00000050471.18	novel	1860	8	NA	NA	-1	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	61	junction_2	45.5246064883417	68	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGGCTCTACTTTGAAGA	6388	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35179077	35128526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_35129044_35129224_35129282_35132675_35132962_35134909_35135039_35138459_35138688_35146526_35146780_35155909_35156003_35179018
tx.19144	chr9	+	1818	7	FSM	ENSMUSG00000032044.5	ENSMUST00000034543.5	1821	7	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_6	10.6052921799554	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTTAATTTTTTGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35179163	35187261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_35179375_35179697_35179864_35181260_35181463_35183829_35183924_35183997_35184143_35184763_35184862_35186359
tx.19145	chr9	+	1051	2	ISM	ENSMUSG00000032044.5	ENSMUST00000034543.5	1821	7	3	6724	3	-4521	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	165	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATATTTTAGTTGGAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35179163	35180537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_35179375_35179697
tx.19146	chr9	-	1713	12	FSM	ENSMUSG00000032101.7	ENSMUST00000034612.7	6934	12	21	5200	21	-5200	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_11	3.32533475603125	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTGAGGGCTCTTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35469803	35453142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_35453356_35454893_35455083_35457109_35457273_35458076_35458315_35462580_35462759_35464132_35464248_35465602_35465706_35465812_35465906_35468061_35468198_35468677_35468726_35468980_35469048_35469633
tx.19147	chr9	+	1627	2	ISM	ENSMUSG00000032103.11	ENSMUST00000121246.2	2016	3	10	471	10	-471	intron_retention	FALSE	canonical	3	104	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAGAACCATTGGCTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35470771	35477664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_35470814_35476079
tx.19148	chr9	+	1755	4	FSM	ENSMUSG00000032103.11	ENSMUST00000034615.10	2019	4	6	258	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_3	6.68331255192114	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTTCTTTTTCAAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35470761	35478439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_35470814_35476079_35476494_35476585_35477152_35477716
tx.19149	chr9	-	1678	4	FSM	ENSMUSG00000050555.10	ENSMUST00000115110.5	1973	4	295	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_2	23.2808934536456	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTTTGAACCTTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35481399	35472115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_35473401_35475358_35475474_35479750_35479802_35481172
tx.1915	chr10	-	1197	3	FSM	ENSMUSG00000112261.2	ENSMUST00000219379.2	660	3	24	-561	24	561	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	4.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTCTTCAGAAACCCTAAG	1577	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95297062	95280616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_95281620_95296475_95296588_95296980
tx.19150	chr9	+	1705	3	ISM	ENSMUSG00000032103.11	ENSMUST00000034615.10	2019	4	5322	258	5316	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_2	5.5	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTTCTTTTTCAAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35476077	35478439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_35476494_35476585_35477152_35477716
tx.19151	chr9	+	1795	2	ISM	ENSMUSG00000032103.11	ENSMUST00000135768.2	2144	4	6189	-5	5318	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGTTCTTTTTCAAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35476079	35478439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_35477152_35477716
tx.19152	chr9	+	944	5	NIC	ENSMUSG00000074452.14	novel	1690	11	NA	NA	0	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_2	4.49305018890286	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGCCTCATATATTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35481579	35557756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_35481827_35485525_35485684_35518890_35519016_35523067_35523168_35557442
tx.19153	chr9	-	2398	13	FSM	ENSMUSG00000032113.17	ENSMUST00000034625.12	3397	13	43	956	-30	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	297	junction_12	54.0685650098301	449	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGGGGTCCTGTATTCCTT	691	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36637911	36620733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_36621727_36623337_36623440_36624616_36624749_36624978_36625157_36625720_36625830_36627721_36627818_36629626_36629732_36630799_36630989_36633899_36633970_36634056_36634122_36635092_36635317_36637092_36637175_36637858
tx.19154	chr9	-	1127	3	ISM	ENSMUSG00000032113.17	ENSMUST00000174105.8	2142	12	13232	-1	9392	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	430	junction_2	28	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTGGGGTCCTGTATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36624649	36620734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_36621727_36623337_36623440_36624616
tx.19155	chr9	-	2579	12	FSM	ENSMUSG00000032113.17	ENSMUST00000172702.9	3797	12	262	956	-249	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	367	junction_7	38.0821209215597	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTGGGGTCCTGTATTCCTT	1194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36637408	36620733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_36621727_36623337_36623440_36624616_36624749_36624978_36625157_36625720_36625830_36627721_36627818_36629626_36629732_36630799_36630989_36633899_36633970_36634056_36634122_36635092_36635317_36637092
tx.19156	chr9	-	855	3	ISM	ENSMUSG00000032116.19	ENSMUST00000120381.9	5867	18	32139	3068	19327	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1820	junction_2	88.5	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGAGTGCTGTTTCTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36646836	36643707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_36644259_36645610_36645727_36646648
tx.19157	chr9	-	961	4	ISM	ENSMUSG00000032116.19	ENSMUST00000120381.9	5867	18	26086	3068	13274	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1678	junction_3	130.4922305052	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGAGTGCTGTTTCTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36652889	36643707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_36644259_36645610_36645727_36646648_36646838_36652784
tx.19158	chr9	-	2739	18	FSM	ENSMUSG00000032116.19	ENSMUST00000120381.9	5867	18	60	3068	0	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	1637	junction_6	106.765013773661	419	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGAGTGCTGTTTCTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36678915	36643707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_36644259_36645610_36645727_36646648_36646838_36652784_36652888_36653009_36653127_36654711_36654901_36655291_36655448_36657849_36657942_36659220_36659377_36660848_36661030_36662477_36662643_36663625_36663733_36666101_36666193_36670017_36670164_36670498_36670621_36674632_36674694_36676349_36676477_36678845
tx.19159	chr9	-	1885	9	ISM	ENSMUSG00000062762.18	ENSMUST00000239021.2	2104	11	7191	-4	393	4	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	488	junction_2	33.8784592329698	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTATAATGTTTGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36701173	36690450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_36691566_36693636_36693712_36694028_36694141_36695763_36695876_36696828_36696949_36697231_36697357_36697778_36697846_36699488_36699550_36701075
tx.1916	chr10	-	630	5	ISM	ENSMUSG00000062981.6	ENSMUST00000075829.3	666	6	1404	-1	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3807	junction_1	222.820555604729	2519	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAGTGTGTATTTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95336385	95316666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_95316840_95326107_95326275_95329492_95329578_95332685_95332750_95336244
tx.19160	chr9	-	2140	11	FSM	ENSMUSG00000062762.18	ENSMUST00000238932.2	2220	11	84	-4	-36	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	488	junction_2	34.4551882885582	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTATAATGTTTGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36708605	36690450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_36691566_36693636_36693712_36694028_36694141_36695763_36695876_36696828_36696949_36697231_36697357_36697778_36697846_36699488_36699550_36701075_36701222_36704535_36704646_36708508
tx.19161	chr9	-	2121	11	NNC	ENSMUSG00000062762.18	novel	2220	11	NA	NA	27	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	17	junction_10	160.762060200782	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTATAATGTTTGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36708630	36690450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_36691566_36693636_36693712_36694028_36694141_36695763_36695876_36696828_36696949_36697231_36697357_36697778_36697846_36699488_36699550_36701075_36701222_36704535_36704646_36708552
tx.19162	chr9	+	1727	10	FSM	ENSMUSG00000032118.17	ENSMUST00000034630.15	1794	10	67	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_5	5.61743318211757	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTCATGGTTTTTGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36744046	36790220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_36744208_36754957_36755314_36761642_36761743_36772107_36772195_36774792_36774962_36778991_36779264_36780143_36780225_36781776_36781853_36787592_36787659_36789861
tx.19163	chr9	+	361	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035934.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGTGGTCAGTCCTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36802071	36802910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_36802283_36802760
tx.19164	chr9	+	1070	4	NNC	ENSMUSG00000032121.10	novel	2619	4	NA	NA	-18	-1502	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	17	junction_1	19.2527054375915	91	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCTGGCTGCAGCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37119500	37134494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_37119637_37129561_37129673_37130497_37130601_37133774
tx.19165	chr9	+	1026	4	FSM	ENSMUSG00000032121.10	ENSMUST00000034632.10	2619	4	91	1502	91	-1502	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	7.40870359029762	243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCTGGCTGCAGCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37119609	37134494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_37119702_37129561_37129673_37130497_37130601_37133774
tx.19166	chr9	+	934	3	ISM	ENSMUSG00000032121.10	ENSMUST00000034632.10	2619	4	10041	1504	10041	-1504	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_2	7	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCCCTGGCTGCAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37129559	37134492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_37129673_37130497_37130601_37133774
tx.19167	chr9	-	2641	18	FSM	ENSMUSG00000032122.16	ENSMUST00000115068.10	5943	18	301	3001	-23	-74	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_1	7.12469267230106	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTGCTTATCCTTGGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37166733	37141881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_37142953_37144605_37144671_37144915_37145014_37145137_37145217_37145453_37145528_37145688_37145738_37146380_37146467_37146776_37146840_37148174_37148266_37148595_37148749_37149032_37149071_37149511_37149679_37150426_37150504_37150914_37151051_37152387_37152467_37152584_37152679_37153174_37153257_37166594
tx.19168	chr9	-	1827	5	NNC	ENSMUSG00000034303.9	novel	1669	4	NA	NA	2	4135	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_1	6.17960354715414	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGACCTCCCTGTATCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37259675	37248570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_37249764_37253731_37253918_37255179_37255330_37259033_37259220_37259563
tx.19169	chr9	+	1806	3	FSM	ENSMUSG00000042138.10	ENSMUST00000213411.2	742	3	106	-1170	106	26	multi-exon	FALSE	canonical	3	228	junction_2	2.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGACTTCTTGGGTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37428510	37435472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_37428769_37430022_37430084_37433985
tx.1917	chr10	-	663	6	FSM	ENSMUSG00000062981.6	ENSMUST00000218893.2	661	6	1	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2875	junction_5	503.887924046608	10237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAAGTGTGTATTTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95337801	95316666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_95316840_95326107_95326275_95329492_95329578_95332685_95332750_95336244_95336385_95337767
tx.19171	chr9	+	1074	4	ISM	ENSMUSG00000001943.9	ENSMUST00000215957.2	851	5	211	-4	208	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.08248290463863	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTCCTTTCTAGTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37450797	37455501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_37451323_37451589_37451798_37453884_37454030_37455305
tx.19172	chr9	+	1179	5	NIC	ENSMUSG00000001943.9	novel	1166	7	NA	NA	219	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.39116499156263	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCGTTCTCCTTTCTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37450808	37455497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_37451323_37451589_37451798_37453650_37453771_37453884_37454030_37455305
tx.19173	chr9	-	836	3	NNC	ENSMUSG00000053310.12	novel	1453	4	NA	NA	201	47	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACCAAGTCCTTTCGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37463999	37456202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_37456645_37457243_37457471_37463832
tx.19174	chr9	-	438	3	NIC	ENSMUSG00000001948.11	novel	696	5	NA	NA	0	-4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGTGTTGTGGTTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37525018	37514589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_37514783_37517088_37517167_37524851
tx.19175	chr9	+	682	4	NNC	ENSMUSG00000001942.9	novel	1498	7	NA	NA	-38	-4081	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_3	21.6024689946929	39	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGAGTACTTTTATATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37525084	37534947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_37525223_37528095_37528258_37534194_37534371_37534741
tx.19176	chr9	+	2076	10	FSM	ENSMUSG00000001942.9	ENSMUST00000215474.2	4947	10	145	2726	-12	-58	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_7	7.87400787401181	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGCTATGCAAGTTTCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37525110	37558225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_37525223_37528095_37528258_37534194_37534371_37538995_37539135_37542644_37542901_37544253_37544364_37544916_37545051_37553935_37554094_37556047_37556244_37557592
tx.19177	chr9	+	683	5	ISM	ENSMUSG00000001942.9	ENSMUST00000002007.5	3339	9	11394	1784	-9632	-516	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_2	4.20565096031518	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGTTGCCAGCTCCTCCC	5071	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37544343	37557767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_37544364_37544916_37545051_37553935_37554094_37556047_37556244_37557592
tx.19178	chr9	+	1126	4	ISM	ENSMUSG00000001942.9	ENSMUST00000002007.5	3339	9	11966	1322	-9060	-54	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0.471404520791032	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCAAGTTTCCATGTGTT	5643	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37544915	37558229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_37545051_37553935_37554094_37556047_37556244_37557592
tx.19179	chr9	-	1488	9	FSM	ENSMUSG00000011114.19	ENSMUST00000117654.3	1984	9	72	424	-3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1493	junction_6	94.6836839165017	4460	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCGGTTATTTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37568536	37560482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_37560800_37561326_37561470_37562244_37562356_37562585_37562684_37563910_37564058_37564328_37564466_37565511_37565733_37566317_37566389_37568293
tx.1918	chr10	+	1225	4	FSM	ENSMUSG00000074781.6	ENSMUST00000099329.5	3867	4	-8	2650	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1883	junction_3	164.877732476726	3653	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGCCTTTGTACAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95350998	95378869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_95351100_95377066_95377314_95377499_95377641_95378133
tx.19180	chr9	+	2170	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000097946.2_ENSMUSG00000059252.6	novel	994	1	NA	NA	-76	211	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCCCCCCAAAAAAAATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37597160	37608537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_37598489_37607695
tx.19182	chr9	-	1343	4	ISM	ENSMUSG00000038112.16	ENSMUST00000119722.8	4224	20	12390	625	-311	-625	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.471404520791032	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGTGTTGGTCTTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39502593	39499430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_39500422_39500938_39501066_39501896_39502028_39502499
tx.19183	chr9	-	698	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025602.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	17.1464281994822	100	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGTAAATTGAAAATTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40151205	40107047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_40107440_40108832_40108959_40121021_40121120_40151123
tx.19184	chr9	+	1171	4	ISM	ENSMUSG00000032024.11	ENSMUST00000034522.8	4154	7	86438	2186	-1644	662	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0.816496580927726	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTCTACTTTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40683745	40694429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_40683825_40685658_40685782_40692408_40692551_40693602
tx.19185	chr9	-	939	3	ISM	ENSMUSG00000087135.8	ENSMUST00000149386.8	819	4	523	6	-197	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_2	1	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTCTGTGTGTGACTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40694954	40692043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_40692492_40694218_40694287_40694531
tx.19186	chr9	+	2105	9	FSM	ENSMUSG00000015656.18	ENSMUST00000015800.16	2394	9	289	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3928	junction_3	6050.21958150074	953	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGTTGTCCTGACTGAGT	2456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40712568	40716496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_40712645_40713213_40713424_40713713_40713920_40714034_40714188_40714269_40714826_40715035_40715239_40715460_40715660_40715758_40715992_40716227
tx.19187	chr9	+	450	3	ISM	ENSMUSG00000015656.18	ENSMUST00000140984.2	1152	4	-12	796	-1	22	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16906	junction_2	154	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GACAAAGATGAAGGAAATTG	2458	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40712570	40713879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_40712645_40713213_40713424_40713713
tx.19188	chr9	+	1425	5	ISM	ENSMUSG00000015656.18	ENSMUST00000117557.8	2019	9	1707	0	667	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17245	junction_1	1783.23559506309	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGTTGTCCTGACTGAGT	4192	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40714304	40716496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_40714826_40715035_40715239_40715460_40715660_40715758_40715992_40716227
tx.19189	chr9	+	597	2	ISM	ENSMUSG00000100837.8	ENSMUST00000188499.2	301	3	227	-290	227	-134	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTGTTACATCAAGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41128470	41129152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_41128671_41128755
tx.1919	chr10	-	2571	2	ISM	ENSMUSG00000020029.7	ENSMUST00000020217.7	3210	5	14284	0	14284	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	708	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGTTTATTTTTAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95385724	95382868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_95385353_95385637
tx.19190	chr9	-	592	2	ISM	ENSMUSG00000049313.9	ENSMUST00000060989.9	10715	48	154490	3523	4780	1496	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	765	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGACGGAGTGCATTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41881103	41879538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_41879967_41880939
tx.19191	chr9	-	1675	6	FSM	ENSMUSG00000032018.15	ENSMUST00000052725.15	4787	6	-21	3133	-21	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_5	23.9198662203617	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTTCCATAATTCAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42175573	42166023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_42167094_42167402_42167504_42169876_42170010_42170977_42171196_42173346_42173428_42175501
tx.19192	chr9	-	1071	2	FSM	ENSMUSG00000037287.16	ENSMUST00000142775.2	2327	2	44	1212	44	473	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGTTTTGTTGTTGGTGT	4398	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42339490	42326497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_42327446_42339367
tx.19193	chr9	-	425	2	Intergenic	novelGene_1309	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2421	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAGTTTTCAGATCCCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42600843	42600321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_42600590_42600686
tx.19194	chr9	-	2240	6	ISM	ENSMUSG00000059495.15	ENSMUST00000072767.7	10059	42	205	60516	205	-13	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	9.91160935469109	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAGAAATTGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43016576	42935654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_42937526_42938492_42938592_42951835_42951893_42953886_42953973_42955559_42955584_43016473
tx.19195	chr9	-	542	5	NIC	ENSMUSG00000059495.15	novel	10752	41	NA	NA	205	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	9	junction_2	5.11737237261468	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCACCTTTGTTCTTGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43016576	42937295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_42937526_42938492_42938592_42953886_42953973_42955559_42955584_43016473
tx.19196	chr9	-	957	3	NIC	ENSMUSG00000048503.8	novel	3503	3	NA	NA	-3	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_1	11.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGTCTGCCTTCGTATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43027842	43019947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_43020634_43024755_43024956_43027771
tx.19198	chr9	+	503	3	NNC	ENSMUSG00000095385.4	novel	431	2	NA	NA	46	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCTCTAAAGGATGAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43176621	43191365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_43176784_43185526_43185653_43191150
tx.19199	chr9	-	1063	2	NNC	ENSMUSG00000111334.2	novel	984	2	NA	NA	1835	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGGTTGGTTTAAATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43654916	43650155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_43650956_43654653
tx.192	chr1	+	3988	29	FSM	ENSMUSG00000041763.15	ENSMUST00000188313.7	4631	29	-18	661	-10	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	286	junction_23	40.426725727682	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTCAGTGGCGTGTGGCT	3294	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43973156	44041499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_43973414_43979269_43979399_43988471_43988568_43990266_43990372_43992416_43992542_43993736_43993901_43995630_43995786_43996595_43996673_43999243_43999372_44000027_44000128_44008041_44008191_44009560_44009677_44010723_44010893_44011689_44011848_44012603_44012681_44014575_44014683_44016366_44016522_44017572_44017690_44017894_44017996_44019467_44019565_44020889_44021028_44022231_44022477_44022673_44022753_44029670_44029823_44030422_44030520_44031423_44031555_44038787_44038996_44040478_44040599_44041263
tx.1920	chr10	-	534	3	NNC	ENSMUSG00000020029.7	novel	3210	5	NA	NA	12651	-2085	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	194	junction_2	257	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGTGGAATTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95387357	95384953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_95385353_95385637_95385726_95387310
tx.19200	chr9	+	1725	4	FSM	ENSMUSG00000032011.6	ENSMUST00000114840.2	1735	4	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	3.74165738677394	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGGTGTCTGTCTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43954690	43959876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_43954774_43957253_43957316_43957910_43958250_43958635
tx.19201	chr9	+	469	3	ISM	ENSMUSG00000032011.6	ENSMUST00000114840.2	1735	4	22	1630	22	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	3	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTGAGACTGGTTCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43954702	43958246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_43954774_43957253_43957316_43957910
tx.19202	chr9	+	1581	2	ISM	ENSMUSG00000032011.6	ENSMUST00000114840.2	1735	4	3227	2	667	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCCTGGTGTCTGTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43957907	43959874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_43958250_43958635
tx.19203	chr9	+	2306	13	FSM	ENSMUSG00000032010.16	ENSMUST00000034508.14	3867	13	-27	1588	-27	46	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_2	11.1654228162962	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTTGATACAGCCTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43978290	44005336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_43978518_43986662_43987520_44000428_44000480_44001326_44001451_44002300_44002413_44002508_44002620_44003132_44003198_44003381_44003486_44003572_44003654_44003773_44003853_44003998_44004107_44004423_44004545_44005070
tx.19205	chr9	-	2093	10	FSM	ENSMUSG00000032119.6	ENSMUST00000216508.2	5333	10	7	3233	7	434	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_7	6.83852557930183	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTTCTTAAGTTTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44216961	44206969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_44207878_44208989_44209115_44209195_44209335_44209420_44209542_44209630_44209709_44210169_44210323_44210509_44210622_44210859_44211090_44213706_44213885_44216912
tx.19206	chr9	+	1903	9	FSM	ENSMUSG00000032123.6	ENSMUST00000054708.5	2205	9	8	294	8	-288	multi-exon	FALSE	canonical	3	223	junction_1	28.7920887571569	238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTAGCATCCCCTCCCTCT	3782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44238149	44244903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_44238503_44238848_44238970_44239249_44239464_44240287_44240435_44242414_44242500_44243200_44243390_44243859_44243948_44244112_44244269_44244353
tx.19207	chr9	+	1570	8	ISM	ENSMUSG00000032123.6	ENSMUST00000054708.5	2205	9	687	294	-451	-288	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	234	junction_1	26.2880433750745	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTAGCATCCCCTCCCTCT	4461	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44238828	44244903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_44238970_44239249_44239464_44240287_44240435_44242414_44242500_44243200_44243390_44243859_44243948_44244112_44244269_44244353
tx.19208	chr9	-	1556	14	FSM	ENSMUSG00000032126.17	ENSMUST00000077353.15	1605	14	40	9	40	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	699	junction_4	86.0870620274656	1549	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTCTGAGACCTTTCTG	1448	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44255485	44247644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_44248143_44248222_44248310_44248414_44248469_44248652_44248773_44248948_44248988_44249211_44249326_44250774_44250851_44250944_44251023_44251984_44252063_44252372_44252429_44252511_44252562_44252922_44252996_44253314_44253369_44255306
tx.19209	chr9	-	603	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060467.5	novel	438	1	NA	NA	-76	172	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAGAAAAACAAATAAAAT	2014	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44286554	44285868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_-_44286344_44286426
tx.1921	chr10	-	594	4	ISM	ENSMUSG00000020029.7	ENSMUST00000020217.7	3210	5	11596	2085	11596	-2085	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	479	junction_2	106.565577097965	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATGTGGAATTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95388412	95384953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_95385353_95385637_95385723_95387310_95387356_95388347
tx.19210	chr9	-	838	4	FSM	ENSMUSG00000032112.11	ENSMUST00000213747.2	935	4	36	61	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	851	junction_3	13.0213499897497	1804	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTCTCTCCTAACTGAT	2003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44318367	44315055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_44315396_44315630_44315758_44316539_44316644_44318100
tx.19211	chr9	-	979	5	FSM	ENSMUSG00000032112.11	ENSMUST00000034623.8	1220	5	241	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	556	junction_4	135.857462069626	2817	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTCTCTCCTAACTGAT	1714	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44318656	44315055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_44315396_44315630_44315758_44316539_44316644_44318100_44318276_44318423
tx.19212	chr9	+	526	5	FSM	ENSMUSG00000009927.10	ENSMUST00000080300.9	1280	5	519	235	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5317	junction_4	3059.10970504492	44377	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATGGGTGCATCTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44318954	44321489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_44319055_44319284_44319381_44319982_44320167_44321250_44321350_44321442
tx.19213	chr9	-	871	3	ISM	ENSMUSG00000074397.6	ENSMUST00000215980.2	676	4	-215	226	-94	-226	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	2.5	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGACCTGGACCCTGGG	9120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44352527	44347077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_44347400_44347500_44347576_44352053
tx.19214	chr9	-	1073	5	FSM	ENSMUSG00000041523.4	ENSMUST00000047740.4	1083	5	5	5	5	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	1.4790199457749	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCATCTCCGACCATGTCT	8958	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44366268	44364016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_44364407_44364779_44364851_44365091_44365231_44365358_44365491_44365927
tx.19215	chr9	+	818	4	ISM	ENSMUSG00000032098.14	ENSMUST00000150822.2	745	7	1530	-289	1530	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTACATAGTCAAAATGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44596122	44597602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_44596344_44596565_44596679_44596923_44596978_44597172
tx.19216	chr9	-	1623	3	NNC	ENSMUSG00000048537.17	novel	3485	16	NA	NA	3949	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	18	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGAGTGTGGAAGTCTGAG	1578	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44603779	44597604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_44598996_44599913_44600000_44603633
tx.19217	chr9	-	2070	2	ISM	ENSMUSG00000032096.17	ENSMUST00000034607.10	4072	10	22232	579	4895	-579	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1181	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGATGTTTACTGGACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44656910	44653439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_44655314_44656714
tx.19218	chr9	-	2157	3	ISM	ENSMUSG00000032096.17	ENSMUST00000034607.10	4072	10	17444	578	107	-578	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1046	junction_2	67.5	217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGTTTACTGGACTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44661698	44653438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_44655314_44656714_44656920_44661621
tx.19219	chr9	-	3478	10	FSM	ENSMUSG00000032096.17	ENSMUST00000034607.10	4072	10	18	576	18	-576	multi-exon	FALSE	canonical	3	910	junction_6	81.8426674920987	258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTTTACTGGACTCTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44679124	44653436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_44655314_44656714_44656920_44661621_44661731_44662512_44662661_44663406_44663573_44668416_44668582_44669857_44670064_44670177_44670358_44671258_44671523_44678966
tx.1922	chr10	-	789	5	FSM	ENSMUSG00000020029.7	ENSMUST00000020217.7	3210	5	319	2102	319	-2102	multi-exon	FALSE	canonical	3	479	junction_2	92.7937902017156	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTTAAGATGCCAAAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95399689	95384970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_95385353_95385637_95385723_95387310_95387356_95388347_95388459_95399523
tx.19220	chr9	-	2801	7	ISM	ENSMUSG00000032096.17	ENSMUST00000034607.10	4072	10	9152	578	1399	-578	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	910	junction_6	83.7496268648404	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGTTTACTGGACTCTA	2269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44669990	44653438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_44655314_44656714_44656920_44661621_44661731_44662512_44662661_44663406_44663573_44668416_44668582_44669857
tx.19221	chr9	+	1568	12	FSM	ENSMUSG00000002031.14	ENSMUST00000238800.2	1059	12	-194	-315	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_2	11.1058022211458	535	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCTGGCTCATTAGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44684255	44702192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_44684471_44684984_44685082_44689858_44689936_44693396_44693531_44695027_44695103_44695256_44695351_44695628_44695758_44697590_44697713_44698134_44698202_44700863_44700925_44701187_44701274_44701781
tx.19222	chr9	-	484	3	FSM	ENSMUSG00000038717.10	ENSMUST00000043675.9	544	3	27	33	-8	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	4613	junction_2	56	10193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTACTGCAGTCATAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44832013	44824547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_44824765_44825948_44826110_44831907
tx.19223	chr9	-	785	4	ISM	ENSMUSG00000059890.17	ENSMUST00000117506.9	6039	20	18	29537	0	285	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	24.1430919496424	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAACAGAAAACTTCTAT	5340	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44876858	44863961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_44864414_44871276_44871438_44874634_44874731_44876782
tx.19224	chr9	-	1013	7	FSM	ENSMUSG00000002033.15	ENSMUST00000002101.12	1023	7	10	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_5	2.73353657780945	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCTCTATCCAAATAGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44891719	44880869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_44881216_44881988_44882072_44882560_44882605_44884803_44884936_44885460_44885689_44886544_44886569_44891563
tx.19225	chr9	+	671	5	FSM	ENSMUSG00000032094.9	ENSMUST00000034602.9	1617	5	26	920	26	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2.48746859276655	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCAGGCGCCTGTGTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44893109	44897717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_44893239_44896267_44896487_44896901_44897034_44897354_44897399_44897570
tx.19226	chr9	+	348	3	ISM	ENSMUSG00000032094.9	ENSMUST00000034602.9	1617	5	3793	920	-244	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	1.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCAGGCGCCTGTGTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44896876	44897717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_44897034_44897354_44897399_44897570
tx.19227	chr9	-	514	3	NNC	ENSMUSG00000032093.8	novel	2550	4	NA	NA	-13	1746	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTTGCTCCTTCTTTGTC	4724	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44920938	44916510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_44916825_44920622_44920748_44920863
tx.19228	chr9	+	2971	6	FSM	ENSMUSG00000032092.6	ENSMUST00000034600.5	3107	6	136	0	-135	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	426	junction_5	54.042205728486	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGATTTTTATTATTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44953858	44965313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_44954093_44954997_44955165_44955450_44955662_44958461_44958610_44960949_44961023_44963175
tx.19229	chr9	+	2871	6	NNC	ENSMUSG00000032092.6	novel	3107	6	NA	NA	-120	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_5	211.37171050072	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATGATTTTTATTATTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44953873	44965313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_44954093_44954997_44955165_44955450_44955662_44958461_44958610_44960949_44961023_44963260
tx.1923	chr10	-	309	2	ISM	ENSMUSG00000112289.2	ENSMUST00000218396.2	989	3	2173	343	2173	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGTCTTGGTTCCATTGT	7999	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95556178	95555337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_95555519_95556050
tx.19230	chr9	+	3412	6	FSM	ENSMUSG00000070305.11	ENSMUST00000114664.8	3424	6	8	4	6	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	3.70944739819828	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTACCCTTTTCGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44966491	44988730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_44966617_44973338_44973506_44977636_44977848_44979504_44979671_44981953_44982018_44986051
tx.19231	chr9	+	1772	3	NNC	ENSMUSG00000037129.8	novel	3245	13	NA	NA	26006	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	2.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTTGTTGGGTGCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45256403	45258879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_45256433_45256523_45256677_45257289
tx.19232	chr9	+	1553	8	FSM	ENSMUSG00000066705.8	ENSMUST00000085939.8	1788	8	235	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	400	junction_2	224.259325108142	737	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTCTGAGTGGCTTTTC	603	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45281717	45307453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_45281787_45301285_45301346_45301931_45301971_45302074_45302150_45302858_45302896_45303512_45303563_45303973_45304024_45306280
tx.19233	chr9	+	1550	8	FSM	ENSMUSG00000066705.8	ENSMUST00000217381.2	1789	8	235	4	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	728	junction_2	116.890320124361	1410	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTCTGAGTGGCTTTTC	603	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45281717	45307453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_45281787_45301285_45301346_45301934_45301971_45302074_45302150_45302858_45302896_45303512_45303563_45303973_45304024_45306280
tx.19234	chr9	+	1538	7	NNC	ENSMUSG00000066705.8	novel	1788	8	NA	NA	-22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	385.118776771819	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTCTGAGTGGCTTTTC	603	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45281717	45307453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_45281787_45301285_45301370_45302074_45302150_45302858_45302896_45303512_45303563_45303973_45304024_45306280
tx.19235	chr9	+	589	6	FSM	ENSMUSG00000059412.8	ENSMUST00000041005.6	632	6	43	0	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_5	6.73498329619309	530	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGTGAGTGCTTATCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45314478	45321576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_45314599_45319403_45319443_45319597_45319673_45320810_45320848_45321000_45321032_45321289
tx.19236	chr9	+	831	3	NNC	ENSMUSG00000032087.12	novel	902	5	NA	NA	-3228	17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCCATCTTTGTGGTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45580906	45584264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_45581121_45581293_45581570_45583923
tx.19237	chr9	-	559	4	ISM	ENSMUSG00000043987.19	ENSMUST00000117194.8	5541	30	28	42797	-24	8327	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_3	3.85861230093008	974	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAACAAGAAGGACAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45739961	45721040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_45721207_45729275_45729388_45734943_45735063_45739799
tx.19238	chr9	-	1745	9	ISM	ENSMUSG00000042790.17	ENSMUST00000161203.8	3294	15	34951	867	343	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_3	19.1796604505919	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGTTCCATTTCTCCCAC	4480	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45783216	45775589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_45776297_45777863_45777960_45778244_45778350_45778797_45778931_45779036_45779414_45780476_45780576_45780751_45780843_45782843_45782933_45783168
tx.19239	chr9	-	2655	14	FSM	ENSMUSG00000042790.17	ENSMUST00000058720.13	3964	14	473	836	3	-46	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_13	9.64395754655542	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGGATATTCTGTTTTAT	9593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45817702	45775642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_45776297_45777863_45777960_45778797_45778931_45779036_45779414_45780476_45780576_45780751_45780843_45782843_45782933_45783168_45783266_45802101_45802242_45807382_45807524_45809729_45809790_45811043_45811555_45816103_45816218_45817649
tx.1924	chr10	+	696	3	FSM	ENSMUSG00000112188.2	ENSMUST00000219583.2	670	3	-16	-10	-16	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	1	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATCTAGGTGTTTATTCA	3204	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95567072	95575225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_95567365_95570676_95570791_95574935
tx.19240	chr9	-	988	4	ISM	ENSMUSG00000032085.6	ENSMUST00000034590.4	1595	5	4295	372	3811	-372	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATATAAATATATATATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45843061	45841288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_45841814_45842130_45842234_45842597_45842776_45842879
tx.19241	chr9	-	1566	2	ISM	ENSMUSG00000034908.17	ENSMUST00000159033.2	221	3	1896	-1448	1896	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTGGGAGGTGCAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45850810	45849154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_45850615_45850704
tx.19242	chr9	-	1343	6	FSM	ENSMUSG00000003131.8	ENSMUST00000172450.3	6873	6	207	5323	-9	502	multi-exon	FALSE	canonical	3	321	junction_5	34.2169548615887	305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTTTGTTCCTCTCAAT	4119	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45896142	45879479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_45880265_45884239_45884363_45886378_45886496_45887338_45887429_45889939_45890028_45896002
tx.19243	chr9	-	1309	6	FSM	ENSMUSG00000003131.8	ENSMUST00000214179.2	794	6	-16	-499	-16	499	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_5	143.058869001541	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTGAGTTTGTTCCTCTC	9695	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45896708	45879482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_45880265_45884239_45884363_45886378_45886496_45887338_45887429_45889939_45890028_45896599
tx.19244	chr9	+	1676	8	NNC	ENSMUSG00000034135.16	novel	2330	13	NA	NA	-25320	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	35.2089969949125	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGGGGAAACTGTGGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46105548	46114185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_46105580_46106117_46106229_46106463_46106608_46107090_46107173_46107281_46107392_46109444_46109599_46109849_46110006_46113297
tx.19245	chr9	+	1310	4	ISM	ENSMUSG00000034135.16	ENSMUST00000153152.2	5465	21	40603	21301	-23589	2	internal_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_3	4.78423336480244	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGGGGAAACTGTGGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46107279	46114185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_46107392_46109444_46109599_46109849_46110006_46113297
tx.19246	chr9	+	1206	3	ISM	ENSMUSG00000034135.16	ENSMUST00000153152.2	5465	21	42767	21294	-21425	9	internal_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_2	4.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAACTGTGGGTGTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46109443	46114192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_46109599_46109849_46110006_46113297
tx.19247	chr9	-	868	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034135.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTTGGCTCGTCACAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46121949	46119763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_46120556_46121873
tx.19248	chr9	+	1843	14	FSM	ENSMUSG00000032078.18	ENSMUST00000156440.8	2984	14	102	1039	-27	120	multi-exon	FALSE	canonical	3	619	junction_8	51.2505159448701	321	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGCCTCTGCGTTCATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46184463	46192902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_46184666_46184775_46184938_46185353_46185445_46185954_46186026_46186661_46186749_46187028_46187152_46187497_46187546_46187709_46187777_46188089_46188161_46188943_46189034_46189601_46189713_46190966_46191054_46191213_46191280_46192335
tx.19249	chr9	+	1316	10	ISM	ENSMUSG00000032078.18	ENSMUST00000156440.8	2984	14	2301	1039	-92	120	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	619	junction_4	46.2756101933344	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGCCTCTGCGTTCATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46186662	46192902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_46186749_46187028_46187152_46187497_46187546_46187709_46187777_46188089_46188161_46188943_46189034_46189601_46189713_46190966_46191054_46191213_46191280_46192335
tx.1925	chr10	+	1052	3	NNC	ENSMUSG00000112400.2	novel	858	3	NA	NA	43	117	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	66.5	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTGGAGGACCGAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95729347	95733236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_95729523_95729937_95730152_95732573
tx.19250	chr9	+	2212	10	FSM	ENSMUSG00000032077.6	ENSMUST00000074957.5	2539	10	0	327	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_1	15.5737988261228	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTCCTAACTGGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46194305	46210081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_46194472_46197640_46197732_46198314_46198400_46198959_46199734_46201423_46201642_46202605_46202709_46202992_46203132_46203363_46203549_46203745_46203828_46209712
tx.19251	chr9	+	614	3	ISM	ENSMUSG00000032077.6	ENSMUST00000213932.2	978	5	740	145	740	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_1	0.5	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTCCTAACTGGGTATT	6297	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46203385	46210081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_46203549_46203745_46203828_46209712
tx.19252	chr9	-	875	3	Intergenic	novelGene_1311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGTGATTCTGTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46429232	46426015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_46426365_46426516_46426694_46428883
tx.19253	chr9	-	465	4	NNC	ENSMUSG00000109844.3	novel	751	5	NA	NA	369	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGAGGTTTTCTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47279545	47171991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_47172115_47181941_47182098_47272034_47272185_47279509
tx.19254	chr9	-	505	4	NIC	ENSMUSG00000109844.3	novel	1294	6	NA	NA	233	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGAGGTTTTCTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47279681	47171992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_47172115_47181941_47182098_47272034_47272185_47279604
tx.19255	chr9	+	1862	9	ISM	ENSMUSG00000032076.21	ENSMUST00000114547.8	4444	10	257712	2335	257596	16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_7	61.313614923604	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGAAAAAAAAAAGAAAAAA	1846	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47699266	47762343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_47699416_47700994_47701148_47708704_47708843_47710669_47710829_47721341_47721442_47725070_47725244_47730031_47730116_47759464_47759597_47761569
tx.19256	chr9	+	530	3	ISM	ENSMUSG00000032076.21	ENSMUST00000151624.2	1112	7	269008	2	269008	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	324	junction_1	7	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAATCAGTTGGTCTC	1779	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47710678	47725350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_47710829_47721341_47721442_47725070
tx.19257	chr9	+	955	6	ISM	ENSMUSG00000032076.21	ENSMUST00000114547.8	4444	10	269124	2793	269008	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_4	70.5934841185785	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCTGCTGTTTGACACCT	1779	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47710678	47761885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_47710829_47721341_47721442_47725070_47725244_47730031_47730116_47759464_47759597_47761569
tx.19258	chr9	+	876	2	ISM	ENSMUSG00000032076.21	ENSMUST00000085909.9	2126	11	317939	-15	317823	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	309	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAGAAAAAAAAAAGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47759493	47762342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_47759597_47761569
tx.19259	chr9	-	1059	7	FSM	ENSMUSG00000032026.8	ENSMUST00000034524.5	1077	7	18	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1058	junction_4	53.1959167188193	3277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTCGGCACCCTCTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48391893	48379811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_48380247_48383119_48383174_48384331_48384441_48385701_48385814_48386419_48386498_48390609_48390694_48391706
tx.1926	chr10	+	921	3	NNC	ENSMUSG00000112400.2	novel	858	3	NA	NA	49	117	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	59.5	133	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTGGAGGACCGAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95729353	95733236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_95729523_95730062_95730152_95732573
tx.19260	chr9	-	609	5	NIC	ENSMUSG00000032026.8	novel	693	4	NA	NA	1	13	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	484.35388663662	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTTAGTGTTAGTAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48391892	48384772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_48384922_48385701_48385814_48386419_48386498_48390609_48390694_48391706
tx.19261	chr9	-	1901	6	NNC	ENSMUSG00000042396.11	novel	1867	6	NA	NA	-13	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	182.483314305719	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTCTTTATTTTGACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48406612	48399996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_48401289_48402147_48402239_48404706_48404795_48405318_48405482_48405578_48405688_48406454
tx.19262	chr9	-	1795	5	FSM	ENSMUSG00000042396.11	ENSMUST00000170000.4	1773	5	-18	-4	-16	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	400	junction_3	15.188400179084	792	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTCTTTATTTTGACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48406615	48399996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_48401289_48402147_48402239_48404706_48404795_48405318_48405482_48406454
tx.19263	chr9	-	988	3	FSM	ENSMUSG00000032271.14	ENSMUST00000034808.12	1043	3	42	13	-34	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_2	2.5	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGTGTCTCTGAATGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48516411	48503189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_48503663_48514653_48514862_48516104
tx.19264	chr9	+	595	5	ISM	ENSMUSG00000032267.9	ENSMUST00000213874.2	4109	24	-32	38566	-3	35	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	642	junction_4	107.597630085425	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTGGCAACACATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48896681	48915244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_48896838_48911650_48911729_48912807_48912941_48914290_48914397_48915122
tx.19265	chr9	+	2110	16	NNC	ENSMUSG00000032267.9	novel	4133	24	NA	NA	-3	1440	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_15	202.720563008952	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTGGTGGTATTAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48896681	48938634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_48896838_48911650_48911729_48912807_48912941_48914290_48914397_48915122_48915283_48919728_48919816_48920395_48920534_48921542_48921617_48922562_48922643_48926401_48926551_48927981_48928110_48929671_48929768_48935205_48935386_48937067_48937289_48938118_48938190_48938381
tx.19266	chr9	+	4213	24	FSM	ENSMUSG00000032267.9	ENSMUST00000047349.8	4133	24	-80	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	612	junction_8	78.9995812484415	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATGTAGCATGACCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48896684	48953810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_48896838_48911650_48911729_48912807_48912941_48914290_48914397_48915122_48915283_48919728_48919816_48920395_48920534_48921542_48921617_48922562_48922643_48926401_48926551_48927981_48928110_48929671_48929768_48935205_48935386_48937067_48937289_48938118_48938190_48939372_48939602_48942026_48942222_48943513_48943654_48946892_48947072_48947181_48947261_48948476_48948557_48949067_48949192_48950281_48950478_48952673
tx.19267	chr9	+	885	2	FSM	ENSMUSG00000032267.9	ENSMUST00000216607.2	379	2	-1	-505	-1	505	multi-exon	FALSE	canonical	3	897	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAGTTCAAAACAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48896683	48912381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_48896838_48911650
tx.19268	chr9	+	528	2	ISM	ENSMUSG00000032264.10	ENSMUST00000215706.2	1272	5	-147	3988	22	-3988	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	314	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGATGGATTATTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48966934	48969317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_48967088_48968942
tx.19269	chr9	+	1490	5	FSM	ENSMUSG00000032264.10	ENSMUST00000215706.2	1272	5	-199	-19	-30	19	multi-exon	FALSE	canonical	3	254	junction_4	30.2189923723476	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCATTTTCTGTTTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48966882	48973324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_48967088_48968942_48969078_48971869_48971972_48972167_48972246_48972354
tx.1927	chr10	+	1520	3	NNC	ENSMUSG00000112400.2	novel	858	3	NA	NA	43	616	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	59	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATTAGAAACTCAGAATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95729347	95733735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_95729523_95729968_95730152_95732573
tx.19270	chr9	+	2896	16	FSM	ENSMUSG00000032264.10	ENSMUST00000034803.10	2863	16	-32	-1	-32	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_12	29.9965923990635	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGAGTGTCTTTAATAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48966880	48990073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_48967088_48968942_48969078_48971869_48971972_48972167_48972246_48972354_48972515_48973492_48973646_48975309_48975502_48977978_48978143_48979959_48980143_48980873_48981113_48982881_48982954_48984502_48984673_48985318_48985450_48986204_48986337_48988751_48988955_48989498
tx.19271	chr9	+	913	3	ISM	ENSMUSG00000032264.10	ENSMUST00000213787.2	2013	9	8195	2	8195	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	316	junction_2	15	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGAGTGTCTTTAATAAC	729	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48986201	48990073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_48986337_48988751_48988955_48989498
tx.19272	chr9	-	1976	4	ISM	ENSMUSG00000039542.17	ENSMUST00000166811.9	3088	18	278735	-1032	22893	1032	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_3	16.0069429380573	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTAGAGCCCAGAATCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49431437	49415315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_49416864_49419888_49420006_49421004_49421213_49431334
tx.19273	chr9	-	931	2	FSM	ENSMUSG00000039542.17	ENSMUST00000217121.2	914	2	-3	-14	0	14	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGATGAA	8517	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49710225	49552875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_49553559_49709977
tx.19274	chr9	-	206	2	Intergenic	novelGene_1313	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTTTGGACATGATGTC	9059	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49789893	49787444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_49787550_49789792
tx.19275	chr9	+	1345	4	FSM	ENSMUSG00000032068.15	ENSMUST00000114474.8	1689	4	0	344	0	-344	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	3.39934634239519	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCGAAATGTGCTAAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50405824	50416438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_50406047_50410394_50410600_50412372_50412429_50415576
tx.19276	chr9	-	1153	7	NIC	ENSMUSG00000032067.7	novel	589	7	NA	NA	-13	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	38	junction_6	39.4574313518872	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCGTTTTCAGGATTTATT	7939	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50439971	50432916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_50433637_50433828_50433900_50436022_50436080_50436561_50436585_50438169_50438250_50439445_50439533_50439856
tx.19277	chr9	-	1084	6	FSM	ENSMUSG00000032067.7	ENSMUST00000034570.7	1046	6	-38	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_5	16.1294761229248	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCGTTTTCAGGATTTATT	7921	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50439989	50432916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_50433637_50433828_50433900_50436022_50436080_50436561_50436585_50438169_50438250_50439856
tx.19278	chr9	+	1055	6	NNC	ENSMUSG00000039217.14	novel	885	6	NA	NA	-33	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.489897948556636	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTCCAGCCCAATTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50466093	50493141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_50466278_50476668_50476827_50486567_50486663_50489060_50489193_50490586_50490721_50492789
tx.19279	chr9	-	1018	5	NNC	ENSMUSG00000032065.7	novel	895	5	NA	NA	6	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.3319891598859	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCTATTTTTTTATTTT	6968	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50472619	50468114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_50468792_50469544_50469601_50469686_50469799_50470519_50470599_50472525
tx.1928	chr10	+	850	2	ISM	ENSMUSG00000112400.2	ENSMUST00000218392.2	858	3	660	-117	660	117	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTGGAGGACCGAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95729964	95733236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_95730152_95732573
tx.19280	chr9	-	1262	4	NNC	ENSMUSG00000000171.6	novel	1231	4	NA	NA	-12	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	646.50186903571	5880	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATTGTACTTTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50515124	50507641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_50508551_50510056_50510206_50511847_50511965_50515037
tx.19281	chr9	+	509	2	FSM	ENSMUSG00000039016.6	ENSMUST00000044051.6	518	2	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1341	junction_1	0	11710	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTGTTCTTCTAAATCCC	8822	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50515218	50516620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_50515340_50516232
tx.19282	chr9	-	486	2	NNC	ENSMUSG00000059820.15	novel	3316	6	NA	NA	11944	1315	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGCGCGGTGGCAGCGCACC	NA	False	NA	-84	True	NA	NA	NA	50516620	50515224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_50515332_50516241
tx.19283	chr9	+	652	2	FSM	ENSMUSG00000000167.15	ENSMUST00000155773.2	450	2	-174	-28	10	28	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCTAATGCAACTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50528646	50530145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_50528899_50529745
tx.19284	chr9	-	2637	14	FSM	ENSMUSG00000000168.11	ENSMUST00000034567.4	4035	14	251	1147	251	748	multi-exon	FALSE	canonical	3	1156	junction_6	75.3673449604703	592	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGTTGTAGAAGTGGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50570829	50547079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_50547855_50548755_50548893_50549220_50549384_50551523_50551640_50555325_50555434_50555740_50555834_50556338_50556407_50560931_50561074_50562050_50562239_50564921_50565049_50569144_50569299_50569464_50569590_50569987_50570090_50570490
tx.19285	chr9	-	2024	17	NNC	ENSMUSG00000032064.18	novel	364	4	NA	NA	37	-2492	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	14.0039057051952	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTAGTCTCATATAGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50639330	50590495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_50590663_50592786_50592854_50593332_50593501_50595024_50595097_50595173_50595267_50595653_50595708_50596127_50596233_50598660_50598712_50599902_50599957_50601159_50601250_50604842_50604992_50606770_50606884_50613219_50613328_50614421_50614654_50617424_50617551_50622142_50622273_50639085
tx.19286	chr9	-	2030	7	ISM	ENSMUSG00000032064.18	ENSMUST00000117646.8	5719	20	53	29844	-39	868	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	1.77169096878911	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATGAGTACTTAATGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50639314	50603899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_50604992_50606770_50606884_50613219_50613328_50614421_50614654_50617424_50617551_50622142_50622273_50639085
tx.19287	chr9	-	1265	4	FSM	ENSMUSG00000032062.4	ENSMUST00000034564.4	1257	4	-8	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	2.16024689946929	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGATTGATTGTTCCTG	2108	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50657844	50650990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_50652050_50652595_50652661_50653560_50653599_50657741
tx.19288	chr9	-	1122	2	ISM	ENSMUSG00000032062.4	ENSMUST00000239417.2	1242	4	5161	2	5151	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGGTGATTGATTGTTCC	7292	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50652660	50650992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_50652050_50652595
tx.19289	chr9	-	563	2	FSM	ENSMUSG00000038086.5	ENSMUST00000217159.2	552	2	-11	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTTGTGCTGCTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50663665	50662377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_50662752_50663476
tx.1929	chr10	+	1439	8	NIC	ENSMUSG00000019943.11	novel	1249	4	NA	NA	249	188	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	223	junction_6	12.7022414862697	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGTGTTACAGGGGAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98750516	98830617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_98750656_98804555_98804987_98815565_98815764_98822752_98823008_98823102_98823229_98826923_98827065_98829728_98829768_98830507
tx.19290	chr9	-	903	4	FSM	ENSMUSG00000037971.11	ENSMUST00000042468.9	2082	4	289	890	-3	9	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_2	3.74165738677394	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTATTTGTTTACTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50679463	50675017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_50675317_50675523_50675591_50675995_50676227_50679157
tx.19291	chr9	+	2494	15	FSM	ENSMUSG00000032059.14	ENSMUST00000034561.11	2873	15	395	-16	47	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_3	29.092042533578	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAATGTTTCAGTCTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50686713	50754844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_50686819_50687843_50687980_50690269_50690405_50694557_50694629_50699452_50699542_50700796_50700933_50703362_50703451_50703601_50703708_50711418_50711542_50713237_50713393_50716601_50716732_50717521_50717670_50719976_50720107_50733884_50734016_50754033
tx.19292	chr9	+	3220	15	FSM	ENSMUSG00000032058.15	ENSMUST00000114437.9	3430	15	26	184	0	-184	multi-exon	FALSE	canonical	3	496	junction_13	51.8120622627431	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGTAAATGCTTTTAAGT	13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	50768262	50792547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_50768399_50769135_50769227_50770150_50770252_50772830_50773064_50773665_50773814_50777743_50777900_50778127_50778243_50778625_50778697_50778962_50779098_50781362_50781537_50784946_50785008_50789337_50789493_50789997_50790141_50790509_50790602_50791138
tx.19293	chr9	+	2057	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000111162.2_ENSMUSG00000110825.2	novel	1007	1	NA	NA	-75	92	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATAATAATAGGATGAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51533969	51568853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_51535272_51568098
tx.19294	chr9	-	906	4	FSM	ENSMUSG00000032051.10	ENSMUST00000034552.8	875	4	-31	0	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	440	junction_2	28.5929284186765	455	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGAGTGTGTTTGGTGAT	1006	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51874877	51854605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_51854950_51859876_51860007_51868372_51868498_51874570
tx.19295	chr9	+	2503	2	ISM	ENSMUSG00000032050.19	ENSMUST00000000590.16	4380	14	37146	-3	36990	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	758	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGAGGTCCGCTGTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51996560	52000032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_51996646_51997614
tx.19296	chr9	+	903	2	Intergenic	novelGene_1315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAACATAAAGTAACTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52714535	52725978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_52714783_52725322
tx.19297	chr9	-	919	4	ISM	ENSMUSG00000053289.9	ENSMUST00000065630.8	3128	18	90786	0	90786	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	364	junction_1	10.2306728354819	1508	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTATTGTTTTTATTGTAT	NA	False	NA	-19	True	NA	NA	NA	53068567	53009934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_53010563_53028452_53028590_53060802_53060860_53068470
tx.19298	chr9	-	3187	18	FSM	ENSMUSG00000053289.9	ENSMUST00000065630.8	3128	18	-59	0	-59	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_8	33.3641956320396	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTATTGTTTTTATTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53159412	53009934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_53010563_53028452_53028590_53060802_53060860_53068470_53068633_53071197_53071318_53115358_53115831_53118765_53118855_53120988_53121077_53124535_53124638_53134959_53135045_53136772_53136936_53140424_53140552_53145127_53145318_53146562_53146684_53147699_53147859_53149347_53149479_53151776_53151838_53159117
tx.19299	chr9	+	442	3	NNC	ENSMUSG00000034584.4	novel	5957	6	NA	NA	-169	-17610	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTTCCTTGCTTTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53212800	53249324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_53212883_53212984_53213152_53249131
tx.193	chr1	+	1406	7	FSM	ENSMUSG00000041763.15	ENSMUST00000186028.2	1389	7	-1	-16	0	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_5	33.8070505466932	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAATACTTTATACTCATT	3311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43973173	43996177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_43973414_43979269_43979399_43988471_43988568_43990266_43990372_43992416_43992542_43993736_43993901_43995630
tx.1930	chr10	+	1286	6	NIC	ENSMUSG00000019943.11	novel	1249	4	NA	NA	253	2738	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	240	junction_3	8.61626369141521	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTAGGTGTGGCGGTTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98750520	98827064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_98750656_98804555_98804987_98815565_98815764_98822752_98823008_98823102_98823229_98826923
tx.19300	chr9	-	469	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034487.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGGCCCATTTCACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53309751	53307339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_53307669_53309611
tx.19301	chr9	+	1019	6	ISM	ENSMUSG00000005131.5	ENSMUST00000005262.2	1237	9	9051	-3	9039	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.09544511501033	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCTTCAAATACAGTTTT	3888	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53325636	53344106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_53325693_53332868_53333070_53334187_53334319_53336822_53336994_53339434_53339491_53343702
tx.19302	chr9	-	1457	9	ISM	ENSMUSG00000034218.17	ENSMUST00000232179.2	9787	64	4	79114	4	3365	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	29.3428015022424	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTGTCATTTCAATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53448036	53429781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_53429970_53431291_53431456_53433347_53433587_53435646_53435813_53438472_53438638_53442930_53443077_53444959_53445073_53445164_53445267_53447862
tx.19303	chr9	-	1308	7	FSM	ENSMUSG00000034218.17	ENSMUST00000132403.2	1243	7	-58	-7	9	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	25.1837690233655	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTGGCATTTCCTGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53448031	53433139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_53433587_53435646_53435813_53438472_53438638_53442930_53443077_53444959_53445073_53445164_53445267_53447862
tx.19304	chr9	-	775	5	ISM	ENSMUSG00000034218.17	ENSMUST00000132403.2	1243	7	-63	5251	4	96	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_4	8.07774721070176	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGACGACTCAGAGTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53448036	53438397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_53438638_53442930_53443077_53444959_53445073_53445164_53445267_53447862
tx.19305	chr9	-	1024	7	ISM	ENSMUSG00000032047.6	ENSMUST00000034547.6	3405	12	18282	1837	-8343	128	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	149	junction_5	12.3153021346074	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTAAACTTAAACAGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53503400	53493658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_53493966_53494736_53494895_53496139_53496205_53498752_53498867_53500477_53500574_53502606_53502758_53503267
tx.19306	chr9	-	725	5	ISM	ENSMUSG00000032047.6	ENSMUST00000034547.6	3405	12	21115	1846	-5510	119	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_3	3.20156211871642	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTTTTTTGTAAACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53500567	53493667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_53493966_53494736_53494895_53496139_53496205_53498752_53498867_53500477
tx.19307	chr9	-	1530	12	FSM	ENSMUSG00000032047.6	ENSMUST00000034547.6	3405	12	29	1846	-23	119	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_5	11.4912830779187	223	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTTTTTTGTAAACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53521653	53493667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_53493966_53494736_53494895_53496139_53496205_53498752_53498867_53500477_53500574_53502606_53502758_53503267_53503412_53505705_53505807_53505993_53506090_53506582_53506701_53509384_53509433_53521512
tx.19308	chr9	-	3033	19	FSM	ENSMUSG00000032030.17	ENSMUST00000034529.14	3585	19	421	131	-18	-131	multi-exon	FALSE	canonical	3	311	junction_17	44.7831882587348	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATGAGCAGGAGAGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53578390	53528454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_53529311_53532459_53532584_53533157_53533277_53534081_53534244_53534934_53535111_53535457_53535582_53537162_53537295_53540474_53540608_53543572_53543638_53545031_53545140_53545284_53545416_53546271_53546366_53553817_53553899_53553980_53554127_53555786_53555929_53557966_53558144_53566571_53566672_53569870_53569981_53578337
tx.19309	chr9	-	2376	2	FSM	ENSMUSG00000055069.4	ENSMUST00000068449.4	2971	2	11	584	11	-584	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTAAGGCTCTTATTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53617521	53595993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_53598037_53617188
tx.1931	chr10	-	738	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000112346.2	novel	2290	1	NA	NA	1293	1919	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTGGAGGTAAGAGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98942649	98939733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_-_98939923_98942100
tx.19310	chr9	+	2372	8	FSM	ENSMUSG00000042195.10	ENSMUST00000048670.10	2558	8	189	-3	189	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_1	9.10931346681706	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAGAATCACAATGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53679010	53725441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_53679179_53705121_53705298_53708294_53708423_53713901_53714062_53715329_53715487_53716969_53717023_53718158_53718314_53724066
tx.19311	chr9	+	2176	7	ISM	ENSMUSG00000042195.10	ENSMUST00000048670.10	2558	8	26325	0	-12854	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	166	junction_5	8.97527467855751	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAAGTAGAATCACAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53705146	53725438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_53705298_53708294_53708423_53713901_53714062_53715329_53715487_53716969_53717023_53718158_53718314_53724066
tx.19312	chr9	-	1200	3	Intergenic	novelGene_1316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	8.5	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTGAAGAGAAGGCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53788490	53775945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_53776927_53777088_53777180_53788362
tx.19313	chr9	-	960	6	FSM	ENSMUSG00000037493.7	ENSMUST00000041901.7	1433	6	-1	474	-1	-474	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.4	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGGTTGTGAAGAGCAGGA	6915	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54467503	54452551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_54452769_54453172_54453369_54455616_54455765_54457064_54457177_54461770_54461806_54467251
tx.19314	chr9	+	1717	11	FSM	ENSMUSG00000032279.12	ENSMUST00000167866.2	2403	11	-33	719	-3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1656	junction_1	98.4146330583008	3343	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCCATAATGAATGATGTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54493761	54511226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_54493828_54497141_54497205_54499677_54499762_54502449_54502565_54503285_54503474_54504118_54504253_54505676_54505780_54505882_54505948_54506876_54506962_54508345_54508499_54510565
tx.19315	chr9	-	871	2	ISM	ENSMUSG00000032281.12	ENSMUST00000034822.12	2880	14	52578	6	33866	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTACCGGATGTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54516576	54512166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_54512761_54516299
tx.19316	chr9	-	1247	10	NNC	ENSMUSG00000061559.16	novel	1290	11	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	359.322957316007	200	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCATTTGTGAACGTGCT	5453	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54641771	54624442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_54624720_54626534_54626614_54627543_54627637_54630117_54630212_54631334_54631429_54631609_54631759_54634872_54635046_54635453_54635560_54638658_54638722_54641652
tx.19317	chr9	-	1146	10	ISM	ENSMUSG00000061559.16	ENSMUST00000051822.13	1187	11	3079	-1	3044	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	904	junction_6	95.3750232593859	303	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATTTGTGAACGTGCTG	8502	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54638722	54624441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_54624720_54626534_54626614_54627543_54627637_54630117_54630212_54631334_54631429_54631609_54631759_54634872_54635046_54635453_54635560_54637917_54637946_54638670
tx.19318	chr9	-	1268	11	FSM	ENSMUSG00000061559.16	ENSMUST00000121204.8	1290	11	28	-6	6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	544	junction_10	185.351584832717	1875	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATTTGTGAACGTGCTG	5449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54641775	54624441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_54624720_54626534_54626614_54627543_54627637_54630117_54630212_54631334_54631429_54631609_54631759_54634872_54635046_54635453_54635560_54637917_54637946_54638670_54638722_54641652
tx.19319	chr9	-	1183	11	FSM	ENSMUSG00000061559.16	ENSMUST00000051822.13	1187	11	5	-1	5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	455	junction_10	209.060852385137	989	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATTTGTGAACGTGCTG	5428	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54641796	54624441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_54624720_54626534_54626614_54627543_54627637_54630117_54630212_54631334_54631429_54631609_54631759_54634872_54635046_54635453_54635560_54637917_54637946_54638670_54638722_54641758
tx.1932	chr10	-	647	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000112346.2	novel	2290	1	NA	NA	1149	1919	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTGGAGGTAAGAGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98942793	98939733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_-_98939923_98942100_98942288_98942522
tx.19320	chr9	+	771	4	FSM	ENSMUSG00000032291.9	ENSMUST00000034830.9	802	4	31	0	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_3	35.3679076125361	1831	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCGGGCTCTTTCTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54672062	54680394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_54672256_54672766_54672946_54675667_54675782_54680109
tx.19321	chr9	+	2447	16	ISM	ENSMUSG00000032293.9	ENSMUST00000034843.9	5770	22	-82	11758	-82	-3215	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	193	junction_6	41.0542188926898	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAATTTTTATGGCTGAGT	2544	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54770990	54808056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_54771181_54772590_54772681_54788636_54788803_54789602_54789741_54791180_54791400_54793158_54793229_54793773_54793958_54794551_54794692_54798286_54798459_54799758_54799857_54802662_54802780_54803723_54803884_54804770_54804907_54806671_54806757_54807233_54807391_54807731
tx.19322	chr9	+	1029	5	ISM	ENSMUSG00000032293.9	ENSMUST00000034843.9	5770	22	-36	28143	-36	-19600	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_4	11.2333209693305	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTAATAGTTTTTTTTTG	2590	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54771036	54791671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_54771181_54772590_54772681_54788636_54788803_54789602_54789741_54791180
tx.19323	chr9	+	846	4	ISM	ENSMUSG00000032293.9	ENSMUST00000034843.9	5770	22	-43	29773	-43	-21230	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	205	junction_3	10.3387082795139	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTTTGAGTCAGGATATT	2583	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54771029	54790041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_54771181_54772590_54772681_54788636_54788803_54789602
tx.19324	chr9	+	418	3	ISM	ENSMUSG00000032293.9	ENSMUST00000034843.9	5770	22	-54	31012	-54	-22469	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	221	junction_2	4.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTGACAGCATTGTATT	2572	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54771018	54788802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_54771181_54772590_54772681_54788636
tx.19325	chr9	+	5830	22	FSM	ENSMUSG00000032293.9	ENSMUST00000034843.9	5770	22	-62	2	-62	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	193	junction_6	38.4690587449917	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTGACTCGTTGTGTTTT	2564	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54771010	54819812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_54771181_54772590_54772681_54788636_54788803_54789602_54789741_54791180_54791400_54793158_54793229_54793773_54793958_54794551_54794692_54798286_54798459_54799758_54799857_54802662_54802780_54803723_54803884_54804770_54804907_54806671_54806757_54807233_54807391_54807731_54807857_54811174_54811280_54811378_54811522_54813852_54814001_54814084_54814208_54816025_54816212_54816914
tx.19326	chr9	+	2301	15	ISM	ENSMUSG00000032293.9	ENSMUST00000034843.9	5770	22	23475	2498	-10209	-2498	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	222	junction_7	25.0127518498473	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTGTTGAAGATTCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54794547	54817316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_54794692_54798286_54798459_54799758_54799857_54802662_54802780_54803723_54803884_54804770_54804907_54806671_54806757_54807233_54807391_54807731_54807857_54811174_54811280_54811378_54811522_54813852_54814001_54814084_54814208_54816025_54816212_54816914
tx.19327	chr9	+	1154	9	FSM	ENSMUSG00000032301.14	ENSMUST00000034848.14	1165	9	12	-1	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1650	junction_8	116.746252616519	4738	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGGTGAAAGGATACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54858085	54865315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_54858188_54859365_54859393_54859624_54859668_54859962_54860126_54861946_54862025_54862164_54862254_54863540_54863672_54864094_54864219_54864918
tx.19328	chr9	+	1154	8	NNC	ENSMUSG00000032301.14	novel	1165	9	NA	NA	-3	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	658.455552247617	420	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGTGAAAGGATACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54858085	54865316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_54858188_54859598_54859668_54859962_54860126_54861946_54862025_54862164_54862254_54863540_54863672_54864094_54864219_54864918
tx.19329	chr9	-	1093	2	Intergenic	novelGene_1317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTAGCCTGGGTCACACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55009630	55007560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_55008563_55009539
tx.1933	chr10	-	429	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000112346.2	novel	2290	1	NA	NA	1106	1919	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTGGAGGTAAGAGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98942836	98939733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_-_98939923_98942100_98942288_98942783
tx.19330	chr9	+	2083	7	NNC	ENSMUSG00000032309.16	novel	2112	7	NA	NA	-28	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	369.828526331987	1963	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGTTGTAATTATTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55116241	55131717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_55116473_55116636_55116780_55121192_55121281_55122186_55122283_55125598_55125764_55128305_55128472_55130523
tx.19331	chr9	+	1834	6	NNC	ENSMUSG00000032309.16	novel	2112	7	NA	NA	181	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	392.751626349274	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGTTGTAATTATTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55116654	55131717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_55116780_55121192_55121281_55122186_55122283_55125598_55125764_55128305_55128472_55130523
tx.19332	chr9	+	1420	3	ISM	ENSMUSG00000032313.12	ENSMUST00000034862.5	2408	11	103396	2	97144	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATCTGGCTAGTAGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55337628	55345627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_55337749_55342474_55342538_55344390
tx.19333	chr9	-	560	5	ISM	ENSMUSG00000032314.15	ENSMUST00000034866.9	1392	12	26904	-5	2174	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1606	junction_4	62.5639672655115	477	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATCAGAAACATGCCTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55392623	55361786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_55362047_55368903_55368985_55372077_55372144_55389556_55389640_55392553
tx.19334	chr9	-	575	6	ISM	ENSMUSG00000032314.15	ENSMUST00000034866.9	1392	12	25526	-5	796	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1606	junction_4	55.9621300523845	1010	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATCAGAAACATGCCTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55394001	55361786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_55362047_55368903_55368985_55372077_55372144_55389556_55389640_55392553_55392623_55393985
tx.19335	chr9	-	1334	12	FSM	ENSMUSG00000032314.15	ENSMUST00000034866.9	1392	12	63	-5	-60	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1517	junction_8	89.5680174619608	2210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATCAGAAACATGCCTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55419464	55361786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_55362047_55368903_55368985_55372077_55372144_55389556_55389640_55392553_55392623_55393985_55394088_55394683_55394795_55396113_55396214_55402845_55402929_55403025_55403108_55407301_55407449_55419314
tx.19336	chr9	-	2556	15	ISM	ENSMUSG00000034007.11	ENSMUST00000037408.9	5158	31	110420	366	-16875	-366	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_4	8.18410604994429	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAGTATCAAGTATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55716469	55457532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_55458156_55460754_55460807_55463368_55463561_55487490_55487641_55493502_55493738_55510049_55510206_55517125_55517359_55563188_55563313_55593163_55593280_55650826_55650954_55665276_55665343_55669511_55669649_55714296_55714405_55714889_55715043_55716385
tx.19337	chr9	-	858	3	ISM	ENSMUSG00000034007.11	ENSMUST00000037408.9	5158	31	363338	366	236043	-366	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAGTATCAAGTATTTTCT	6750	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55463551	55457532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_55458156_55460754_55460807_55463368
tx.19338	chr9	+	1998	7	FSM	ENSMUSG00000032320.8	ENSMUST00000114276.3	2024	7	23	3	-5	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	320	junction_5	26.0666879795309	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAACGTGCACCTGAGACA	983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55949163	55966358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_55949489_55949858_55949965_55952415_55952613_55960190_55960305_55963442_55963540_55964710_55964854_55965342
tx.19339	chr9	-	1462	6	ISM	ENSMUSG00000032324.12	ENSMUST00000034876.10	1716	7	13475	0	12960	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	718	junction_1	25.9028955910338	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGTACATTTTAATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56054866	56043167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_56044020_56052772_56052857_56053058_56053212_56053797_56053900_56054369_56054445_56054670
tx.1934	chr10	+	2899	12	FSM	ENSMUSG00000019952.16	ENSMUST00000020113.15	2862	12	49	-86	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_11	10.2158522093674	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAATGTCTTCTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98942946	99033936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_98943086_98943653_98943739_98960692_98960865_98965344_98965525_98980096_98980205_98980340_98980457_98988662_98988797_98990930_98991000_98992063_98992214_99000730_99000812_99028643_99028860_99032487
tx.19340	chr9	-	1643	7	FSM	ENSMUSG00000032324.12	ENSMUST00000034876.10	1716	7	73	0	-64	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	718	junction_1	24.1522945769824	357	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATGTACATTTTAATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56068268	56043167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_56044020_56052772_56052857_56053058_56053212_56053797_56053900_56054369_56054445_56054670_56054863_56068083
tx.19341	chr9	-	524	4	ISM	ENSMUSG00000032324.12	ENSMUST00000216317.2	2129	6	-64	2457	-64	-668	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	748	junction_2	20.0055547841649	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCGTGCTATTGACTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56068268	56053827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_56053900_56054369_56054445_56054670_56054863_56068083
tx.19342	chr9	+	1994	9	FSM	ENSMUSG00000032329.5	ENSMUST00000215269.2	1700	9	171	-465	0	465	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_3	23.7276210354093	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATGAAGGTAGATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56326098	56398074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_56326216_56374641_56374735_56381814_56381960_56384465_56384679_56388881_56389015_56389891_56389924_56394899_56394976_56395897_56396114_56397105
tx.19343	chr9	+	940	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000118653.2	novel	988	1	NA	NA	-29	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGAAAACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56344711	56345724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_56344777_56344849
tx.19344	chr9	+	939	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000118653.2	novel	988	1	NA	NA	-30	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAACATATGGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56344710	56345730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_56344777_56344857
tx.19345	chr9	+	1271	7	ISM	ENSMUSG00000032329.5	ENSMUST00000215269.2	1700	9	55935	0	55749	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_1	6.66874967458085	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCTCTTCCCTGATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56381862	56397609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_56381960_56384465_56384679_56388881_56389015_56389891_56389924_56394899_56394976_56395897_56396114_56397105
tx.19346	chr9	+	462	3	NNC	ENSMUSG00000097870.3	novel	2655	3	NA	NA	-2	-2177	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCATACTGTACCCCAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56513974	56519580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_56514031_56516243_56516370_56519300
tx.19347	chr9	+	1313	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000032288.10	novel	924	1	NA	NA	11	4553	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTTTCTTCATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56844769	56850235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_56845378_56849530
tx.19348	chr9	+	1361	9	FSM	ENSMUSG00000055334.5	ENSMUST00000068856.5	1391	9	30	0	30	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	166	junction_1	20.9105236663265	477	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTGCTTGTGGTTATTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56858191	56890490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_56858238_56864297_56864461_56870279_56870428_56877537_56877643_56877873_56877971_56882496_56882595_56885302_56885381_56888128_56888210_56889945
tx.19349	chr9	+	1316	8	ISM	ENSMUSG00000055334.5	ENSMUST00000068856.5	1391	9	6135	0	6135	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	194	junction_5	16.2468207250979	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTGCTTGTGGTTATTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56864296	56890490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_56864461_56870279_56870428_56877537_56877643_56877873_56877971_56882496_56882595_56885302_56885381_56888128_56888210_56889945
tx.1935	chr10	-	795	2	Intergenic	novelGene_108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTGGATTTTGCTCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99049644	99047984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_99048666_99049530
tx.19350	chr9	-	1136	3	FSM	ENSMUSG00000074284.7	ENSMUST00000128125.2	1241	3	-160	265	-1	-265	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCACTGTGTCCTACCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56979251	56964178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_56964423_56964552_56965086_56978892
tx.19351	chr9	-	839	4	NNC	ENSMUSG00000074284.7	novel	1241	3	NA	NA	-2	-265	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2.16024689946929	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCACTGTGTCCTACCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56979252	56964178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_56964423_56964949_56965086_56965225_56965303_56978870
tx.19352	chr9	-	963	2	FSM	ENSMUSG00000074284.7	ENSMUST00000135527.2	957	2	2	-8	2	8	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTATTCAGAACTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56979248	56964478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_56965086_56978892
tx.19353	chr9	+	1291	2	NNC	ENSMUSG00000042557.15	novel	5086	21	NA	NA	-26	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGAAATAAGTAACATAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56983633	57035638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_56983760_57034473
tx.19354	chr9	+	1918	7	ISM	ENSMUSG00000042557.15	ENSMUST00000049169.6	4845	20	24214	399	-2666	-397	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	329	junction_4	20.317616876877	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTAGCTCCCATGGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57018078	57035251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_57018437_57020829_57021000_57024665_57024840_57025353_57025447_57026376_57026472_57032452_57032661_57034431
tx.19355	chr9	+	582	5	NIC	ENSMUSG00000032295.16	novel	545	5	NA	NA	-14	105	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_4	94.8376902924149	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCAGTGTATATTTAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57038037	57041544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_57038174_57038442_57038566_57038815_57038940_57040805_57040877_57041416
tx.19356	chr9	+	1820	15	ISM	ENSMUSG00000032295.16	ENSMUST00000161182.8	2909	24	7209	-3	-48	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	160	junction_6	39.7589676702512	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATAATGGTGCCTTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57045278	57049491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_57045350_57045680_57045805_57046131_57046254_57046352_57046439_57046529_57046686_57046894_57046993_57047153_57047249_57047482_57047588_57047665_57047823_57047918_57048063_57048384_57048495_57048589_57048670_57048847_57048997_57049089_57049200_57049278
tx.19357	chr9	-	1654	9	FSM	ENSMUSG00000032298.14	ENSMUST00000034842.5	1170	9	-26	-458	-26	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_8	5.10973335899242	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTGGTACTTCTTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57054344	57050081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57050611_57050734_57050898_57051041_57051104_57051262_57051291_57051470_57051599_57051921_57052022_57052228_57052293_57052381_57052502_57053884
tx.19358	chr9	-	799	7	FSM	ENSMUSG00000032299.11	ENSMUST00000214072.2	1941	7	1138	4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	898	junction_5	106.241470245851	822	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTATGGGTCTTGCTTGC	7469	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57064423	57062322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57062565_57062695_57062873_57063185_57063267_57063455_57063576_57063799_57063840_57064058_57064125_57064350
tx.19359	chr9	-	838	8	FSM	ENSMUSG00000032299.11	ENSMUST00000065358.9	858	8	20	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	701	junction_7	157.218553197095	2252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTATGGGTCTTGCTTGC	6297	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57065595	57062322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57062565_57062695_57062873_57063185_57063267_57063455_57063576_57063799_57063840_57064058_57064125_57064350_57064423_57065555
tx.1936	chr10	+	1275	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000091101.3	novel	927	1	NA	NA	-11273	273	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATTCTAGAGTCATAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100165424	100177897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_+_100165494_100176691
tx.19360	chr9	+	1325	2	Intergenic	novelGene_1318	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTCTTGTAGTCATGCTA	6328	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57117197	57120700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_57117312_57119489
tx.19361	chr9	-	1667	7	FSM	ENSMUSG00000063849.7	ENSMUST00000216365.2	1665	7	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_2	15.2059929706094	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACTGTGTCCTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57347392	57321243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57322010_57322368_57322756_57327445_57327575_57328408_57328505_57342185_57342369_57344699_57344766_57347352
tx.19362	chr9	-	3177	6	NIC	ENSMUSG00000040722.8	novel	1025	7	NA	NA	7	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	62	junction_5	39.9669863762581	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTCCCTCTGTGTTACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57375334	57348610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_57351148_57352654_57352773_57353354_57353457_57358638_57358768_57359262_57359318_57375098
tx.19363	chr9	-	3087	6	NNC	ENSMUSG00000040722.8	novel	3225	7	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_2	58.262852659306	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCCTCTGTGTTACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57375343	57348609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_57351148_57352654_57352790_57353354_57353457_57358638_57358768_57359262_57359318_57375215
tx.19364	chr9	-	3040	6	FSM	ENSMUSG00000040722.8	ENSMUST00000215734.2	675	6	-4	-2361	-4	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_3	25.4715527598927	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGACCCTGTATGTCCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57375324	57348620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57351148_57352654_57352773_57353354_57353457_57358638_57358768_57359262_57359318_57375215
tx.19365	chr9	-	1043	7	FSM	ENSMUSG00000040722.8	ENSMUST00000046587.8	3225	7	5	2177	5	107	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_3	41.0680329859288	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTATATGTCTATCCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57375336	57350786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57351148_57352654_57352773_57353354_57353457_57354359_57354517_57358638_57358768_57359262_57359318_57375215
tx.19366	chr9	-	3082	6	ISM	ENSMUSG00000040722.8	ENSMUST00000046587.8	3225	7	16023	18	-4643	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_3	44.5690475554504	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATCATTTGACCCTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57359318	57348627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_57351148_57352654_57352773_57353354_57353457_57354359_57354517_57358638_57358768_57359262
tx.19367	chr9	+	264	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040722.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAGTAATGTTAATAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57361069	57361817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_57361142_57361625
tx.19368	chr9	-	541	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000062309.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCGACTCAAGCCTGGTCC	9632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57411747	57411061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_57411351_57411495
tx.19369	chr9	+	1348	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000062309.9	novel	1423	1	NA	NA	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTCTTCAGTTTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57411313	57412731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_57411538_57411607
tx.1937	chr10	+	1257	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000112931.2	novel	910	1	NA	NA	-954	270	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGTATTCTAGAGTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100180879	100183013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_+_100180949_100181825
tx.19370	chr9	+	681	5	FSM	ENSMUSG00000000088.8	ENSMUST00000000090.8	645	5	-35	-1	-30	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	7868	junction_4	746.021908190369	28519	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGGTCTTGTGATGTTGTC	342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57428526	57439710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57428699_57436238_57436356_57437523_57437646_57438951_57439076_57439564
tx.19371	chr9	+	670	5	NNC	ENSMUSG00000000088.8	novel	645	5	NA	NA	-29	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3847.76476509414	645	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGGTCTTGTGATGTTGTC	343	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57428527	57439710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_57428699_57436238_57436356_57437523_57437646_57438961_57439076_57439564
tx.19372	chr9	+	268	2	ISM	ENSMUSG00000000088.8	ENSMUST00000000090.8	645	5	10392	-1	10338	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7868	junction_1	0	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGGTCTTGTGATGTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57438953	57439710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_57439076_57439564
tx.19373	chr9	+	1867	4	FSM	ENSMUSG00000032305.16	ENSMUST00000093833.6	3001	4	46	1088	11	-1088	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_3	8.73053390247253	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTGCCTGGCCTCTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57444856	57449377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57445118_57445306_57445395_57446093_57446172_57447937
tx.19374	chr9	-	1761	8	FSM	ENSMUSG00000032306.15	ENSMUST00000034856.15	1780	8	11	8	11	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_3	33.2393914333151	363	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTGAAGAGCAGTCAGCC	8962	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57460035	57451546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57452222_57452477_57452687_57453676_57453851_57455810_57455994_57456319_57456462_57457855_57458057_57459429_57459558_57459986
tx.19375	chr9	+	2340	9	FSM	ENSMUSG00000040188.11	ENSMUST00000045791.11	2340	9	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	243	junction_4	15.3927742788621	258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTGGCCCTGATGTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57468225	57496078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57468394_57484475_57484545_57484921_57485021_57486715_57486834_57488066_57488196_57488772_57488933_57490134_57490237_57494362_57494484_57494704
tx.19376	chr9	-	1217	4	ISM	ENSMUSG00000032312.8	ENSMUST00000213660.2	652	5	509	-672	509	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_1	9.46337971105226	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGCCTCGGCGCTTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57535535	57533928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_57534787_57534999_57535087_57535160_57535357_57535459
tx.19377	chr9	-	1234	5	FSM	ENSMUSG00000032312.8	ENSMUST00000213660.2	652	5	90	-672	90	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	9.78199877325692	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGCCTCGGCGCTTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57535954	57533928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57534787_57534999_57535087_57535160_57535357_57535459_57535534_57535935
tx.19378	chr9	+	1994	8	NNC	ENSMUSG00000038957.14	novel	5708	7	NA	NA	-5	-1240	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	13	junction_7	86.0609655762609	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTTCCTAGAGTGAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57615844	57657446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_57615983_57620663_57620845_57623230_57623551_57634468_57634805_57647172_57647327_57651867_57652086_57655443_57655716_57657071
tx.19379	chr9	+	3348	7	FSM	ENSMUSG00000038957.14	ENSMUST00000043990.14	5708	7	23	2337	-4	-1241	multi-exon	FALSE	canonical	3	211	junction_3	27.6189347288333	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGCTTCCTAGAGTGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57615845	57657445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57615983_57620663_57620845_57623230_57623551_57634468_57634805_57647172_57647327_57651867_57652086_57655443
tx.1938	chr10	-	1257	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000096640.4	novel	914	1	NA	NA	-996	266	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGTATTCTAGAGTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100219418	100217242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_-_100218428_100219346
tx.19380	chr9	+	481	3	ISM	ENSMUSG00000038957.14	ENSMUST00000043990.14	5708	7	22	36390	-5	129	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	224	junction_1	10	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGTAGTGCCCCTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57615844	57623392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_57615983_57620663_57620845_57623230
tx.19381	chr9	+	3027	6	FSM	ENSMUSG00000038957.14	ENSMUST00000137245.8	4277	6	10	1240	-2	-1240	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	95.7613700820952	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTTCCTAGAGTGAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57615847	57657446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57615983_57620663_57620845_57634468_57634805_57647172_57647327_57651867_57652086_57655443
tx.19382	chr9	-	1762	13	FSM	ENSMUSG00000032316.9	ENSMUST00000065330.8	2496	13	734	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	232	junction_10	47.1024297556813	210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCTGGTACCAGTGTGTC	9802	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57672409	57657991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57658405_57659019_57659111_57659397_57659478_57659927_57660011_57660553_57660684_57660783_57660879_57661784_57661952_57662534_57662652_57665566_57665634_57665909_57666007_57668106_57668324_57668998_57669151_57672356
tx.19383	chr9	-	2015	8	FSM	ENSMUSG00000004661.16	ENSMUST00000098686.4	1969	8	-43	-3	-43	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_2	15.8603600340019	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTTTCTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57744119	57701966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57702318_57703389_57703636_57703754_57704072_57705324_57705509_57717447_57717521_57717691_57717764_57740898_57741516_57743964
tx.19384	chr9	-	279	2	NNC	ENSMUSG00000004661.16	novel	3119	8	NA	NA	-11	-27759	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGTGAATTGCTTGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57744087	57743171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_57743328_57743964
tx.19385	chr9	+	1316	11	FSM	ENSMUSG00000055720.11	ENSMUST00000216925.2	1319	11	4	-1	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	82.3315856764583	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCGTGTCCAGTGCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57818265	57837252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57818291_57819920_57820134_57821836_57821957_57826591_57826675_57827321_57827407_57827786_57827845_57828909_57829044_57829258_57829309_57829733_57829902_57830437_57830561_57836995
tx.19386	chr9	+	1423	12	NIC	ENSMUSG00000055720.11	novel	1319	11	NA	NA	-2	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_1	95.5400482857649	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCCGTGTCCAGTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57818266	57837251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_57818291_57818999_57819109_57819920_57820134_57821836_57821957_57826591_57826675_57827321_57827407_57827786_57827845_57828909_57829044_57829258_57829309_57829733_57829902_57830437_57830561_57836995
tx.19387	chr9	+	1364	11	FSM	ENSMUSG00000055720.11	ENSMUST00000163329.2	1364	11	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_1	59.3140792729686	504	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCCGTGTCCAGTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57818268	57837251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57818343_57819920_57820134_57821836_57821957_57826591_57826675_57827321_57827407_57827786_57827845_57828909_57829044_57829258_57829309_57829733_57829902_57830437_57830561_57836995
tx.19388	chr9	+	1466	12	NIC	ENSMUSG00000055720.11	novel	1364	11	NA	NA	7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	57	junction_1	84.997131696865	184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCCGTGTCCAGTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57818275	57837251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_57818343_57818999_57819109_57819920_57820134_57821836_57821957_57826591_57826675_57827321_57827407_57827786_57827845_57828909_57829044_57829258_57829309_57829733_57829902_57830437_57830561_57836995
tx.19389	chr9	+	1406	11	NIC	ENSMUSG00000055720.11	novel	880	9	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	134	junction_1	54.7233039938197	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCCGTGTCCAGTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57818992	57837251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_57819109_57819920_57820134_57821836_57821957_57826591_57826675_57827321_57827407_57827786_57827845_57828909_57829044_57829258_57829309_57829733_57829902_57830437_57830561_57836995
tx.1939	chr10	-	2442	14	FSM	ENSMUSG00000036676.15	ENSMUST00000058154.15	5993	14	47	3504	23	772	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_8	14.4496677957759	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGTTTTGAAAAGATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100323165	100283267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_100283606_100284685_100284913_100286100_100286271_100287243_100287348_100292909_100293022_100294776_100294898_100296821_100296971_100301882_100302136_100307190_100307364_100307776_100307893_100310236_100310337_100312418_100312638_100313666_100313885_100323023
tx.19390	chr9	+	1553	2	FSM	ENSMUSG00000097604.2	ENSMUST00000181289.2	2169	2	4	612	4	-612	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTATTATTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57905327	57914122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57905602_57912843
tx.19391	chr9	+	1137	2	NNC	ENSMUSG00000097604.2	novel	2169	2	NA	NA	5597	-1364	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAACCATTTCAAGACAT	373	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57910920	57913370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_57911531_57912843
tx.19392	chr9	+	1870	9	FSM	ENSMUSG00000032323.14	ENSMUST00000034874.14	2120	9	248	2	-78	-2	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	1.85404962177392	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACCGTTTGTATCTGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57922201	57934304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57922582_57923556_57923713_57925476_57925677_57926575_57926780_57927991_57928150_57932360_57932528_57932810_57932890_57933367_57933566_57933976
tx.19393	chr9	-	3962	9	FSM	ENSMUSG00000036986.17	ENSMUST00000085673.11	4481	9	54	465	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_4	53.0057485090061	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCATGTCTGTAATTTTGC	2205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58157015	58125823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_58127853_58128997_58129149_58136637_58136691_58137110_58137370_58137773_58137912_58140435_58140531_58141635_58142217_58154257_58154722_58156823
tx.19394	chr9	-	620	2	ISM	ENSMUSG00000036986.17	ENSMUST00000153820.8	2652	8	20379	249	720	-249	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	356	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATCTACTCTTGACCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58136690	58128581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_58129149_58136637
tx.19395	chr9	-	686	2	ISM	ENSMUSG00000036986.17	ENSMUST00000153820.8	2652	8	24	25925	24	93	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	387	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGGAGCATCCTGGAG	2175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58157045	58154257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_58154722_58156823
tx.19396	chr9	+	1912	7	FSM	ENSMUSG00000032333.7	ENSMUST00000034883.7	1984	7	72	0	44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_1	85.7729561108861	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGAAGTGCAGCTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58160518	58169803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_58160683_58162216_58162324_58163922_58164073_58164303_58164508_58167509_58167706_58168080_58168297_58168928
tx.19397	chr9	+	2189	8	FSM	ENSMUSG00000032333.7	ENSMUST00000216877.2	2236	8	47	0	47	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_3	134.059079269902	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGAAGTGCAGCTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58160521	58169803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_58160683_58162216_58162324_58162816_58163097_58163922_58164073_58164303_58164508_58167509_58167706_58168080_58168297_58168928
tx.19398	chr9	-	1632	7	FSM	ENSMUSG00000032334.11	ENSMUST00000061799.10	3297	7	802	863	802	-863	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_6	4.22952584681651	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTGCTGTGCCCTGTGGT	7374	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58219667	58195883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_58196201_58198037_58198154_58199851_58199948_58200855_58201013_58201641_58201780_58204903_58205013_58218968
tx.19399	chr9	-	1195	6	ISM	ENSMUSG00000032334.11	ENSMUST00000061799.10	3297	7	15195	863	15195	-863	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_1	4.02988833592198	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTGCTGTGCCCTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58205274	58195883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_58196201_58198037_58198154_58199851_58199948_58200855_58201013_58201641_58201780_58204903
tx.194	chr1	+	4669	30	FSM	ENSMUSG00000041763.15	ENSMUST00000087933.10	4649	30	7	-27	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_23	82.0288369004111	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCACAATTGGTCTTAAT	3311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43973173	44042158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_43973414_43979269_43979399_43988471_43988568_43990266_43990372_43992416_43992542_43993736_43993901_43995630_43995786_43996595_43996673_43999243_43999372_44000027_44000128_44008041_44008191_44009560_44009677_44010723_44010893_44011689_44011848_44012603_44012681_44014575_44014683_44016366_44016522_44017572_44017690_44017894_44017996_44019467_44019565_44020889_44021028_44022231_44022477_44022673_44022753_44024575_44024615_44029670_44029823_44030422_44030520_44031423_44031555_44038787_44038996_44040478_44040599_44041263
tx.1940	chr10	+	1329	12	NIC	ENSMUSG00000019971.11	novel	8211	54	NA	NA	15	28	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	24	junction_1	4.07775663491015	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGTTTATTATTGAAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100323434	100336085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_100323615_100324140_100324271_100324423_100324502_100325181_100325252_100326008_100326056_100328509_100328654_100330762_100330817_100331684_100331838_100332550_100332734_100333801_100333892_100334923_100335047_100336008
tx.19400	chr9	-	959	4	ISM	ENSMUSG00000032334.11	ENSMUST00000061799.10	3297	7	1458	5323	1458	-5323	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_3	2.49443825784929	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAAGAAAAGAAATAG	8030	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58219011	58200343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_58201013_58201641_58201780_58204903_58205013_58218968
tx.19401	chr9	+	743	2	NIC	ENSMUSG00000097651.3	novel	843	3	NA	NA	-20	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAACTGTGGCTGATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58362384	58376915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_58362640_58376427
tx.19402	chr9	+	856	3	FSM	ENSMUSG00000097651.3	ENSMUST00000181967.3	843	3	-16	3	-16	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	1.5	286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAACTGTGGCTGATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58362388	58376915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_58362640_58374083_58374201_58376427
tx.19403	chr9	-	683	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000066607.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAGCACTTGGAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58397238	58394204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_58394788_58397138
tx.19404	chr9	+	1546	2	FSM	ENSMUSG00000066607.6	ENSMUST00000216294.2	1601	2	55	0	55	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATCCGGGGCCCACAGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58396945	58407063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_58397676_58406247
tx.19405	chr9	+	2004	7	NNC	ENSMUSG00000032336.18	novel	2024	8	NA	NA	21	1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_5	144.809836989373	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAATAATACTCTTTAT	558	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58489595	58560162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_58489810_58530969_58531139_58535116_58535212_58547951_58548086_58550811_58551108_58558540_58558616_58559141
tx.19406	chr9	+	1979	7	NNC	ENSMUSG00000032336.18	novel	2024	8	NA	NA	-39	1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_5	144.809836989373	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAATAATACTCTTTAT	580	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58489617	58560162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_58489810_58530969_58531139_58535116_58535212_58547951_58548086_58550811_58551086_58558521_58558616_58559141
tx.19407	chr9	+	1982	8	FSM	ENSMUSG00000032336.18	ENSMUST00000085651.12	2024	8	43	-1	-39	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	310	junction_5	36.1815151813233	233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAATAATACTCTTTAT	580	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58489617	58560162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_58489810_58530969_58531139_58535116_58535212_58547951_58548086_58550811_58551086_58557779_58557802_58558540_58558616_58559141
tx.19408	chr9	+	1992	7	NNC	ENSMUSG00000032336.18	novel	2024	8	NA	NA	-38	1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_5	144.809836989373	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAATAATACTCTTTAT	581	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58489618	58560162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_58489810_58530969_58531139_58535116_58535212_58547951_58548086_58550811_58551086_58558507_58558616_58559141
tx.19409	chr9	-	282	2	ISM	ENSMUSG00000074269.11	ENSMUST00000175792.8	516	3	1483	28	1483	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	644	junction_1	0	300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTATCAATGTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58565092	58560160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_58560390_58565039
tx.1941	chr10	+	625	6	ISM	ENSMUSG00000019971.11	ENSMUST00000220346.2	8211	54	23	80880	23	-7420	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	5.2	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGGTTAATGAACAAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100323442	100328637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_100323615_100324140_100324271_100324423_100324502_100325181_100325252_100326008_100326056_100328509
tx.19410	chr9	-	879	6	FSM	ENSMUSG00000074269.11	ENSMUST00000098674.6	883	6	-18	22	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	244.73054570282	2331	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTATCAATGTTTTATT	9032	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58648860	58560160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_58560390_58565039_58565127_58567456_58567655_58573115_58573200_58619298_58619389_58648669
tx.19411	chr9	-	795	5	NIC	ENSMUSG00000074269.11	novel	883	6	NA	NA	-18	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	25	junction_3	258.205828749081	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTATCAATGTTTTATT	9032	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58648860	58560160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_58560390_58565039_58565127_58567456_58567655_58619298_58619389_58648669
tx.19412	chr9	+	618	4	NNC	ENSMUSG00000111846.2	novel	531	4	NA	NA	-11558	-38278	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCTTTTCTTAGGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58874975	58902861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_58875092_58880700_58880774_58887085_58887271_58902617
tx.19413	chr9	-	1346	3	Intergenic	novelGene_1319	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGGTCATGGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59168116	59164296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_59165546_59166266_59166325_59168077
tx.19414	chr9	-	1467	3	Intergenic	novelGene_1320	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAGGTTGCCTTGGTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59177189	59164303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_59165546_59166266_59166325_59177022
tx.19415	chr9	-	605	2	Intergenic	novelGene_1321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAAGTATCAGTATTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59182500	59181493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_59181892_59182293
tx.19416	chr9	-	896	2	Intergenic	novelGene_1322	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAAGTATCAGTATTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59182513	59181493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_59182170_59182293
tx.19417	chr9	-	2462	16	FSM	ENSMUSG00000025235.9	ENSMUST00000026265.8	2518	16	56	0	-3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	108	junction_2	13.5581054068119	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGATCACTGTCTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59260735	59229272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_59230266_59230670_59230873_59231319_59231462_59232072_59232143_59234469_59234642_59234738_59234892_59235862_59235932_59237700_59237756_59240762_59240891_59243646_59243701_59247093_59247167_59248369_59248482_59249770_59249835_59251342_59251423_59253082_59253135_59260692
tx.19418	chr9	-	2091	5	ISM	ENSMUSG00000025234.12	ENSMUST00000165322.2	1431	14	80519	-1470	-34	1289	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	371	junction_2	32.4065965507025	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGGTGGTGGTTTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59313111	59299106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_59300662_59302160_59302274_59303633_59303895_59310650_59310709_59313007
tx.19419	chr9	-	2129	14	FSM	ENSMUSG00000025234.12	ENSMUST00000171975.8	6971	14	504	4338	-27	517	multi-exon	FALSE	canonical	3	295	junction_6	43.7741649239926	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTATGTCTATTTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59393393	59299878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_59300662_59302160_59302274_59303633_59303895_59310650_59310709_59313007_59313139_59315158_59315231_59315657_59315701_59319707_59319815_59322052_59322120_59333405_59333462_59333896_59333990_59344053_59344199_59361684_59361753_59393261
tx.1942	chr10	-	2356	7	FSM	ENSMUSG00000046567.11	ENSMUST00000054471.10	2564	7	139	69	-8	-69	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_5	5.07991688470939	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTGTTTGTCTGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100425118	100408195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_100409623_100411578_100411749_100413022_100413221_100414176_100414294_100419775_100419872_100422052_100422171_100424888
tx.19420	chr9	+	1854	14	FSM	ENSMUSG00000025232.9	ENSMUST00000026262.8	1996	14	142	0	142	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1100	junction_8	84.5408762866438	1215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGTTTGGGTTGCTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59446964	59472392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_59447260_59461415_59461509_59462621_59462688_59464154_59464202_59464570_59464682_59465316_59465419_59466606_59466740_59468179_59468361_59469225_59469310_59469578_59469652_59470149_59470334_59470506_59470598_59471165_59471271_59472103
tx.19421	chr9	+	2247	11	NNC	ENSMUSG00000032294.18	novel	2432	11	NA	NA	-19	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	5360.55493862343	7833	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTTGTGTTTTGTTTTGT	1850	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59563836	59586655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_59563933_59572482_59572650_59573145_59573238_59575831_59575964_59576195_59576383_59577749_59578021_59578857_59579013_59579203_59579357_59582850_59583018_59585326_59585509_59586010
tx.19422	chr9	+	1380	6	NNC	ENSMUSG00000032294.18	novel	2432	11	NA	NA	-926	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6756.1383348774	1369	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTTGTGTTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59577942	59586655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_59578021_59578857_59579013_59579203_59579357_59582850_59583018_59585326_59585509_59586010
tx.19423	chr9	+	1259	12	NIC	ENSMUSG00000074259.11	novel	1368	11	NA	NA	2	20	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	21	junction_1	6.71251452435445	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGTTTTTATCAGTTGA	1638	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59587428	59623727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_59587536_59615282_59615379_59616734_59616793_59617144_59617221_59617784_59617889_59618448_59618548_59618827_59618900_59619366_59619430_59621078_59621224_59621459_59621557_59623205_59623311_59623490
tx.19424	chr9	-	2372	4	FSM	ENSMUSG00000051705.14	ENSMUST00000217093.2	1663	4	7	-716	-4	716	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	6.59966329107444	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAAATGGGAG	6436	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59657914	59643036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_59645152_59647222_59647316_59657544_59657655_59657860
tx.19425	chr9	-	1461	2	FSM	ENSMUSG00000051705.14	ENSMUST00000051039.5	3682	2	11	2210	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCGGGTGTGTGGTGCAT	6429	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59657921	59643751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_59645152_59657860
tx.19426	chr9	+	1080	2	ISM	ENSMUSG00000039585.16	ENSMUST00000136740.8	12252	44	37	148657	37	-105155	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTCAAAATGTATGATAACC	592	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59658215	59687492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_59658629_59686825
tx.19427	chr9	-	444	2	NNC	ENSMUSG00000110803.2	novel	1387	4	NA	NA	41	-113308	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCTCCTGCCTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59848319	59846847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_59847245_59848272
tx.19428	chr9	-	544	3	NNC	ENSMUSG00000110803.2	novel	1387	4	NA	NA	37	-113309	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGGTCTCCTGCCTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59848323	59846848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_59847245_59847355_59847453_59848272
tx.19429	chr9	-	1864	5	FSM	ENSMUSG00000032292.9	ENSMUST00000130831.8	2686	5	770	52	130	-52	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	3.35410196624968	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGCTGTATTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59856547	59850105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_59850803_59854244_59854351_59854595_59854837_59855645_59855804_59855885
tx.1943	chr10	-	635	4	ISM	ENSMUSG00000046567.11	ENSMUST00000054471.10	2564	7	139	5976	-8	112	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_2	5.18544972870135	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTTAATCTAGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100425118	100414102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_100414294_100419775_100419872_100422052_100422171_100424888
tx.19430	chr9	-	2013	8	FSM	ENSMUSG00000032292.9	ENSMUST00000034831.3	2037	8	-30	54	-30	-54	multi-exon	TRUE	canonical	1	3	junction_6	3.8438925848782	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACTTTGCTGTATTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59857430	59850107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_59850803_59854244_59854351_59854595_59854837_59855645_59855804_59855885_59856108_59856207_59856312_59856464_59856592_59857070
tx.19431	chr9	+	2035	3	FSM	ENSMUSG00000034839.6	ENSMUST00000038407.6	2440	3	139	266	139	-266	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAAGTCCTTTATCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60620410	60645818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_60620689_60631429_60631641_60644272
tx.19433	chr9	+	1015	3	NNC	ENSMUSG00000111147.2	novel	3468	7	NA	NA	20156	208	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_2	2	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTCATTTTTATCTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60959649	60966606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_60959709_60960349_60960452_60965752
tx.19434	chr9	+	960	2	NIC	ENSMUSG00000111147.2	novel	3468	7	NA	NA	20854	210	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCATTTTTATCTTATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60960347	60966608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_60960452_60965752
tx.19435	chr9	+	592	4	Intergenic	novelGene_1323	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCAAGCCTGGTTTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61761790	61767595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_61761909_61765417_61765489_61766485_61766650_61767356
tx.19436	chr9	-	497	3	FSM	ENSMUSG00000007892.9	ENSMUST00000008036.9	499	3	3	-1	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	11557	junction_2	345.5	162566	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGACTGGTCTCACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61821821	61820564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_61820804_61821169_61821245_61821638
tx.19437	chr9	-	503	3	Intergenic	novelGene_1325	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCAAGTTTCAGTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61951382	61947296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_61947500_61949415_61949538_61951204
tx.19438	chr9	-	4887	5	FSM	ENSMUSG00000032252.15	ENSMUST00000185675.7	4850	5	-37	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_3	11.5974135047432	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTACTTGGATATTTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62029929	61964529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_61968318_61975666_61975913_61977296_61977896_61995710_61995802_62029766
tx.19439	chr9	-	1971	3	FSM	ENSMUSG00000032252.15	ENSMUST00000185510.2	1922	3	-46	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	70	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATATGGTGTCTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62029937	61987598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_61989308_61995710_61995802_62029766
tx.1944	chr10	+	1417	5	ISM	ENSMUSG00000019894.15	ENSMUST00000179636.3	3543	12	-88	24003	-63	-1786	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	35.7596140918774	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGTATCATTTATAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103203580	103231233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_103204015_103224887_103225203_103229251_103229410_103229761_103229889_103230850
tx.19440	chr9	+	1098	7	FSM	ENSMUSG00000032249.15	ENSMUST00000085519.13	2113	7	23	992	23	39	multi-exon	FALSE	canonical	3	492	junction_5	26.6546848081575	3780	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTATTTCCCCCCCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62248633	62285102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_62248837_62279001_62279152_62279343_62279467_62280766_62280960_62281935_62282034_62284581_62284646_62284835
tx.19441	chr9	+	308	2	ISM	ENSMUSG00000032249.15	ENSMUST00000145679.2	629	4	3884	-39	3884	39	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	527	junction_1	0	1745	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTATTTCCCCCCCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62284604	62285102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_62284646_62284835
tx.19442	chr9	-	411	2	Intergenic	novelGene_1328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTTGGATAACTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62322740	62321620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_62321731_62322439
tx.19443	chr9	+	439	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041729.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCCTGTAAACATTTCAG	5402	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62426719	62430398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_62427022_62430261
tx.19444	chr9	+	778	3	ISM	ENSMUSG00000032246.15	ENSMUST00000034777.14	864	5	10567	3	10537	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	28	371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGTGGAATTGGTGTTTC	3018	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62775952	62783200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_62776100_62778547_62778737_62782758
tx.19445	chr9	+	722	2	ISM	ENSMUSG00000032246.15	ENSMUST00000163820.3	699	4	13054	-4	13041	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_1	0	441	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGTGGAATTGGTGTTTC	5522	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62778456	62783200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_62778737_62782758
tx.19446	chr9	-	2865	14	NIC	ENSMUSG00000032405.11	novel	5564	14	NA	NA	0	-1586	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	43	junction_1	23.8180976391468	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGAAATAGTTATGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62888165	62787354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_62788546_62792053_62792092_62794589_62794733_62799407_62799589_62800410_62800542_62803112_62803274_62810040_62810115_62820031_62820138_62826632_62826768_62827739_62827831_62830562_62830611_62830852_62830938_62859037_62859483_62888129
tx.19447	chr9	-	2179	13	ISM	ENSMUSG00000032405.11	ENSMUST00000098651.6	5564	14	28681	3351	-202	1161	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_1	15.7768730178772	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAGAAAAAACAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62859480	62789000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_62789544_62792053_62792092_62794589_62794733_62799407_62799589_62800410_62800542_62803112_62803274_62810040_62810115_62820031_62820138_62826632_62826768_62827739_62827831_62830562_62830611_62830852_62830938_62859037
tx.19448	chr9	-	2212	14	FSM	ENSMUSG00000032405.11	ENSMUST00000098651.6	5564	14	-4	3356	0	1156	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	15.6049605221996	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAGAAAAAGAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62888165	62789005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_62789544_62792053_62792092_62794589_62794733_62799407_62799589_62800410_62800542_62803112_62803274_62810040_62810115_62820031_62820138_62826632_62826768_62827739_62827831_62830562_62830611_62830852_62830938_62859037_62859483_62888129
tx.19449	chr9	-	2078	20	NNC	ENSMUSG00000058444.9	novel	2310	22	NA	NA	199	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.7081019111975	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTCTCAGCAAGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63284960	63071045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_63071473_63101483_63101530_63104592_63104655_63142522_63142601_63164258_63164331_63169425_63169477_63170395_63170470_63188300_63188350_63193680_63193743_63200805_63200888_63200977_63201047_63210402_63210443_63229484_63229550_63237189_63237239_63245366_63245435_63246362_63246404_63250668_63250739_63265274_63265343_63279018_63279068_63284404
tx.1945	chr10	+	2003	5	NIC	ENSMUSG00000019894.15	novel	3543	12	NA	NA	-43	-1310	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	40	junction_1	32.0341614530488	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACTGCCACTGTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103203600	103231709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_103204015_103224757_103225203_103229251_103229410_103229761_103229889_103230850
tx.19450	chr9	-	533	3	ISM	ENSMUSG00000058444.9	ENSMUST00000034920.11	2310	22	180528	0	105769	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_1	8.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCGTTTGTCTCAGCAAGT	4667	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63104656	63071049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_63071473_63101483_63101530_63104592
tx.19451	chr9	-	2087	22	FSM	ENSMUSG00000058444.9	ENSMUST00000034920.11	2310	22	223	0	198	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_19	9.60607328677695	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCGTTTGTCTCAGCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63284961	63071049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_63071473_63101483_63101530_63104592_63104655_63124274_63124308_63124620_63124648_63142570_63142601_63164258_63164331_63169425_63169477_63170395_63170470_63188300_63188350_63193680_63193743_63200805_63200888_63200977_63201047_63210402_63210443_63229484_63229550_63237189_63237239_63245366_63245435_63246362_63246404_63250668_63250739_63265274_63265343_63279018_63279068_63284404
tx.19452	chr9	-	2281	19	ISM	ENSMUSG00000058444.9	ENSMUST00000034920.11	2310	22	226	52497	201	6	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_16	8.30309328050043	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63284958	63123546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_63124308_63124620_63124648_63142570_63142601_63164258_63164331_63169425_63169477_63170395_63170470_63188300_63188350_63193680_63193743_63200805_63200888_63200977_63201047_63210402_63210443_63229484_63229550_63237189_63237239_63245366_63245435_63246362_63246404_63250668_63250739_63265274_63265343_63279018_63279068_63284404
tx.19453	chr9	-	977	5	FSM	ENSMUSG00000058444.9	ENSMUST00000216999.2	1150	5	176	-3	176	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	28.3372546306095	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCATTTTATTTTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63284983	63247504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_63247716_63250668_63250739_63265274_63265343_63279018_63279068_63284404
tx.19454	chr9	-	438	2	FSM	ENSMUSG00000032403.9	ENSMUST00000168665.3	595	2	157	0	157	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTGTTTCTAGAGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63306366	63301728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_63301958_63306157
tx.19455	chr9	+	1193	7	ISM	ENSMUSG00000037257.9	ENSMUST00000041551.9	5294	10	-14	7683	-14	-3423	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_6	65.4032364132948	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTATTGATTCTTTGTG	9200	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63509927	63544187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_63510054_63523967_63524159_63524269_63524367_63524789_63524880_63526429_63526514_63542586_63542670_63543665
tx.19456	chr9	+	728	6	NNC	ENSMUSG00000037257.9	novel	5294	10	NA	NA	4	-7119	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_5	153.651033188846	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATGCGCCTCTGACTTCC	9218	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63509945	63540491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_63510054_63523967_63524159_63524269_63524367_63524789_63524880_63526429_63526514_63540333
tx.19457	chr9	+	2590	10	NNC	ENSMUSG00000037257.9	novel	5294	10	NA	NA	7	1566	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	162	junction_6	67.8911619914051	60	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGCTAATGTGTTTTGTT	9221	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63509948	63549176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_63510054_63523967_63524159_63524269_63524367_63524789_63524880_63526429_63526514_63542586_63542670_63543668_63543766_63546321_63546427_63546874_63546925_63547488
tx.19458	chr9	+	2587	10	FSM	ENSMUSG00000037257.9	ENSMUST00000041551.9	5294	10	13	2694	13	1566	multi-exon	FALSE	canonical	3	211	junction_6	53.7134601610168	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGCTAATGTGTTTTGTT	9227	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63509954	63549176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_63510054_63523967_63524159_63524269_63524367_63524789_63524880_63526429_63526514_63542586_63542670_63543665_63543766_63546321_63546427_63546874_63546925_63547488
tx.19459	chr9	-	912	2	NNC	ENSMUSG00000036867.8	novel	2971	4	NA	NA	40883	-165	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTTTCCTTTTTTAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63883386	63860522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_63861339_63883290
tx.1946	chr10	+	1215	5	NNC	ENSMUSG00000019894.15	novel	2395	3	NA	NA	376	-1786	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	11	junction_1	44.144648599802	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGTATCATTTATAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103204079	103231233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_103204182_103224757_103225203_103229251_103229410_103229761_103229889_103230850
tx.19460	chr9	-	425	2	Intergenic	novelGene_1331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTTGTTTCCTCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64002705	63995520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_63995856_64002615
tx.19461	chr9	-	2766	19	FSM	ENSMUSG00000032400.19	ENSMUST00000122091.8	2957	19	191	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	273	junction_16	368.954800838434	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGCCTGGTTTAATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64080195	64044425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_64045342_64047172_64047299_64051361_64051475_64054106_64054203_64054551_64054689_64056680_64056710_64057437_64057595_64060166_64060247_64060832_64060933_64062445_64062502_64063294_64063389_64065976_64066049_64068102_64068259_64068652_64068724_64069845_64070046_64071628_64071748_64072644_64072741_64075894_64075947_64080099
tx.19462	chr9	-	1703	9	ISM	ENSMUSG00000032400.19	ENSMUST00000122091.8	2957	19	19502	3	1900	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	728	junction_4	160.832162128723	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTGTTGCCTGGTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64060884	64044428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_64045342_64047172_64047299_64051361_64051475_64054106_64054203_64054551_64054689_64056680_64056710_64057437_64057595_64060166_64060247_64060832
tx.19463	chr9	+	1392	10	FSM	ENSMUSG00000032399.9	ENSMUST00000034966.9	1538	10	-1	147	-1	-147	multi-exon	FALSE	canonical	3	16882	junction_3	1427.06559842995	68863	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGTGTGACTCTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64080655	64085801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_64080716_64082105_64082278_64082475_64082583_64082865_64083005_64083373_64083499_64084222_64084353_64084602_64084760_64085002_64085087_64085178_64085300_64085504
tx.19464	chr9	+	1333	9	ISM	ENSMUSG00000032399.9	ENSMUST00000034966.9	1538	10	1448	147	1430	-147	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16882	junction_2	1403.52242144541	5365	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGTGTGACTCTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64082104	64085801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_64082278_64082475_64082583_64082865_64083005_64083373_64083499_64084222_64084353_64084602_64084760_64085002_64085087_64085178_64085300_64085504
tx.19465	chr9	+	1001	7	ISM	ENSMUSG00000032399.9	ENSMUST00000034966.9	1538	10	2261	147	-1499	-147	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17449	junction_3	1267.49627437541	15174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGTGTGACTCTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64082917	64085801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_64083005_64083373_64083499_64084222_64084353_64084602_64084760_64085002_64085087_64085178_64085300_64085504
tx.19466	chr9	+	409	2	ISM	ENSMUSG00000032399.9	ENSMUST00000213760.2	596	4	771	-249	771	-147	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19805	junction_1	0	35694	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGTGTGACTCTTAAAT	260	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64085187	64085801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_64085300_64085504
tx.19467	chr9	+	740	3	FSM	ENSMUSG00000032398.8	ENSMUST00000034965.8	1228	3	28	460	28	-460	multi-exon	FALSE	canonical	3	413	junction_2	26	2876	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTCTGCTACAATATA	1656	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64086583	64089954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_64086703_64087780_64087871_64089423
tx.19468	chr9	-	1648	8	ISM	ENSMUSG00000004936.9	ENSMUST00000005066.9	2436	11	48442	12	-9511	-12	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	469	junction_6	43.5463628135085	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAAGAGATTTCTGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64112471	64093063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_64094081_64094572_64094619_64094958_64095021_64098548_64098614_64098734_64098937_64100983_64101109_64111712_64111765_64112392
tx.19469	chr9	-	2414	11	FSM	ENSMUSG00000004936.9	ENSMUST00000005066.9	2436	11	8	14	8	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	469	junction_6	51.6454257412987	475	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACAAGAGATTTCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64160905	64093065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_64094081_64094572_64094619_64094958_64095021_64098548_64098614_64098734_64098937_64100983_64101109_64111712_64111765_64112392_64112471_64119865_64120013_64121680_64121892_64160494
tx.1947	chr10	+	1083	5	NNC	ENSMUSG00000019894.15	novel	2395	3	NA	NA	378	-1786	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	18	junction_1	41.1969355656461	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGTATCATTTATAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103204081	103231233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_103204182_103224887_103225203_103229251_103229410_103229761_103229889_103230850
tx.19470	chr9	+	1641	3	Intergenic	novelGene_1332	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGTTTGACTTGGTTTAT	1329	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64174732	64179948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_64174881_64176949_64177082_64178587
tx.19471	chr9	-	569	3	Intergenic	novelGene_1333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGTTTAAATTGGCACAT	6289	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64179821	64175427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_64175783_64176963_64177051_64179694
tx.19472	chr9	+	1209	8	NIC	ENSMUSG00000032397.8	novel	1211	8	NA	NA	-1	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	673	junction_1	630.170951862611	5304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCAGGATTTGAGTTTCT	9568	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64188887	64212076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_64188930_64195389_64195526_64196991_64197065_64197655_64197732_64201291_64201415_64201604_64201669_64208323_64208531_64211588
tx.19473	chr9	-	1029	5	FSM	ENSMUSG00000004771.13	ENSMUST00000172298.8	2336	5	2	1305	2	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	899	junction_3	39.0160223497988	2338	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATTGTTTACTCTTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64645038	64623885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_64624271_64632783_64632865_64633905_64634100_64635515_64635712_64644865
tx.19474	chr9	+	2506	13	FSM	ENSMUSG00000034263.14	ENSMUST00000170517.9	2820	13	-6	320	-6	-50	multi-exon	TRUE	canonical	3	115	junction_1	33.6860505254029	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGTTTTGATCTATCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64868180	64893940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_64868221_64868975_64869281_64871607_64871886_64873971_64874080_64879254_64879411_64879973_64880093_64880499_64880643_64882898_64882992_64885418_64885564_64887056_64887191_64889270_64889390_64891259_64891326_64893140
tx.19475	chr9	+	1256	5	ISM	ENSMUSG00000034263.14	ENSMUST00000037504.7	2837	13	17208	50	16456	-50	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_3	10.0623058987491	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGTTTTGATCTATCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64885426	64893940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_64885564_64887056_64887191_64889270_64889390_64891259_64891326_64893140
tx.19476	chr9	-	2726	11	FSM	ENSMUSG00000033629.7	ENSMUST00000036615.7	2709	11	-17	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	252	junction_1	24.7620677650313	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACTTGTGCTTAAACATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64928992	64894264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_64895812_64897598_64897731_64898255_64898363_64899538_64899652_64905476_64905605_64908262_64908374_64911538_64911591_64912889_64913055_64913842_64913917_64917755_64917799_64928738
tx.19477	chr9	+	2524	7	FSM	ENSMUSG00000032392.12	ENSMUST00000069000.9	2482	7	-42	0	-42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	17.0269394392142	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCAAGTTGTCTGTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65121929	65146500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65122146_65122630_65122915_65133334_65133473_65137087_65137295_65140950_65141123_65143922_65144065_65145135
tx.19478	chr9	+	2345	7	NNC	ENSMUSG00000032392.12	novel	2518	6	NA	NA	-74	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	9	junction_1	22.6255754991264	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCAAGTTGTCTGTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65122352	65146500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_65122390_65122630_65122915_65133334_65133473_65137087_65137295_65140950_65141123_65143922_65144065_65145135
tx.19479	chr9	+	2559	6	FSM	ENSMUSG00000032392.12	ENSMUST00000213396.2	2518	6	-47	6	-47	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_2	11.7915223783869	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCAAGTTGTCTGTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65122379	65146500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65122915_65133334_65133473_65137087_65137295_65140950_65141123_65143922_65144065_65145135
tx.1948	chr10	+	1223	2	FSM	ENSMUSG00000097550.8	ENSMUST00000181059.8	1246	2	-3	26	-3	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTATTCTGGAGTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104004372	104006818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_104004482_104005704
tx.19480	chr9	+	2432	13	FSM	ENSMUSG00000015357.11	ENSMUST00000113824.8	2809	13	-17	394	-17	-393	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_5	89.4905333292609	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGATCCCATTGTTTAGTG	6169	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65201559	65237546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65201848_65207182_65207347_65209129_65209248_65215749_65215905_65217433_65217594_65223925_65224103_65224610_65224776_65225944_65226034_65228100_65228266_65229825_65230126_65231488_65231582_65234063_65234171_65237095
tx.19481	chr9	+	2466	14	FSM	ENSMUSG00000015357.11	ENSMUST00000015501.11	2885	14	22	397	-13	-397	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_12	30.6779414999533	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTGGGATCCCATTGTTT	6173	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65201563	65237542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65201848_65207182_65207347_65209129_65209248_65215749_65215905_65217433_65217594_65219379_65219422_65223925_65224103_65224610_65224776_65225944_65226034_65228100_65228266_65229825_65230126_65231488_65231582_65234063_65234171_65237095
tx.19482	chr9	+	1249	3	ISM	ENSMUSG00000041837.5	ENSMUST00000048184.4	2419	5	10267	0	9717	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_1	31	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGCCCCTGATTTATT	842	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65263652	65266925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_65263764_65263999_65264088_65265875
tx.19483	chr9	+	1145	4	FSM	ENSMUSG00000086228.4	ENSMUST00000239433.2	846	4	-143	-156	-143	156	multi-exon	FALSE	canonical	3	844	junction_1	5.79271573232759	3440	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAGGTGTAGTGACACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65278984	65285487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65279411_65281031_65281242_65284190_65284293_65285080
tx.19484	chr9	+	949	4	ISM	ENSMUSG00000059183.13	ENSMUST00000132966.8	2563	8	-7	11683	-1	-6543	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_2	18.6607133363712	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGACTGGAATTGGGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65343062	65348016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_65343290_65344269_65344480_65346811_65346935_65347627
tx.19485	chr9	+	521	2	ISM	ENSMUSG00000059183.13	ENSMUST00000132966.8	2563	8	-6	15135	0	-9995	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_1	0	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTTTGTTTGTTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65343063	65344564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_65343290_65344269
tx.19486	chr9	+	1405	9	FSM	ENSMUSG00000059183.13	ENSMUST00000074792.7	2042	9	0	637	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_5	22.1472345903501	327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGCTTGTATCCTTTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65343063	65359699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65343290_65344269_65344480_65346811_65346935_65347627_65347731_65348894_65348971_65351160_65351253_65354505_65354585_65355977_65356061_65359286
tx.19487	chr9	+	1659	9	FSM	ENSMUSG00000032388.8	ENSMUST00000034955.8	2680	9	7	1014	1	-1014	multi-exon	FALSE	canonical	3	680	junction_7	65.1440711039769	526	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGTGGCTTCTGTGATGA	7183	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65368235	65394738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65368437_65372545_65372633_65376056_65376219_65380919_65381001_65383121_65383268_65387660_65387770_65389142_65389251_65391723_65391865_65394114
tx.19488	chr9	+	1565	4	ISM	ENSMUSG00000041064.15	ENSMUST00000131483.3	3309	13	6086	3	6081	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	112	junction_1	19.5959179422654	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAACTGTGCCTCCTGCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65500588	65503246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_65500632_65500738_65500885_65501668_65501861_65502062
tx.19489	chr9	+	1980	8	FSM	ENSMUSG00000032387.16	ENSMUST00000055844.10	1987	8	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1453	junction_4	112.168059042616	1018	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTCTGATTTTTGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65537847	65567808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65538180_65556630_65556709_65557248_65557288_65557843_65557907_65558214_65558366_65558828_65558987_65566416_65566487_65566719
tx.1949	chr10	+	1223	2	FSM	ENSMUSG00000097427.6	ENSMUST00000181287.5	1246	2	-3	26	-3	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTATTCTGGAGTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103987354	103989800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_103987464_103988686
tx.19490	chr9	+	1811	5	NIC	ENSMUSG00000040652.17	novel	1843	6	NA	NA	0	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	365	junction_4	22.3983816379666	853	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTGGTCTGTCTTTTTAT	4635	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65583860	65597580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_65584048_65593477_65593636_65595079_65595256_65596102_65596189_65596376
tx.19491	chr9	-	3293	12	FSM	ENSMUSG00000032386.16	ENSMUST00000122410.8	3915	12	-1	623	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	24	junction_1	56.3782972135042	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGGGTTGGAAGTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65792338	65739040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_65740731_65758648_65758741_65760107_65760233_65764605_65764794_65765527_65765655_65771485_65771702_65773753_65773884_65780380_65780460_65782112_65782326_65786356_65786491_65788172_65788343_65792209
tx.19492	chr9	-	2168	13	FSM	ENSMUSG00000032386.16	ENSMUST00000117083.2	1999	13	6	-175	5	175	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_4	28.3474229673332	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGGATGTCTGAGGAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65792332	65740262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_65740731_65746216_65746320_65758648_65758741_65760107_65760233_65764605_65764794_65765527_65765655_65771485_65771702_65773753_65773884_65780380_65780460_65782112_65782326_65786356_65786491_65788172_65788343_65792209
tx.19493	chr9	-	1595	8	ISM	ENSMUSG00000032386.16	ENSMUST00000117083.2	1999	13	0	24693	0	-18839	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	185	junction_2	15.7480157480236	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGAGCCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65792338	65765130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_65765655_65771485_65771702_65773753_65773884_65780380_65780460_65782112_65782326_65786356_65786491_65788172_65788343_65792209
tx.19494	chr9	+	961	4	FSM	ENSMUSG00000040204.7	ENSMUST00000045802.7	2188	4	83	1144	0	-1144	multi-exon	FALSE	canonical	3	794	junction_3	40.4722126896961	5439	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAAATCTCTTGTCATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65797601	65809404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65797757_65798013_65798092_65800653_65800817_65808839
tx.19495	chr9	+	905	5	FSM	ENSMUSG00000032383.8	ENSMUST00000034947.7	892	5	-15	2	-6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2090	junction_4	160.535626886994	16135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATAGCTTGGGTGTGGGCTGT	1559	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65967497	65973903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65967683_65968748_65968863_65970270_65970365_65972768_65972954_65973576
tx.19496	chr9	-	1995	15	NNC	ENSMUSG00000032382.15	novel	2073	15	NA	NA	-12	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	102.645615829316	435	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCACAGGACTGGGCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66032091	65995419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_65995852_65996399_65996472_65996809_65996891_65997868_65998013_66000440_66000647_66001640_66001735_66001903_66002018_66003839_66003916_66004680_66004760_66005612_66005755_66008622_66008667_66012154_66012219_66012802_66012931_66016794_66016911_66031888
tx.19497	chr9	+	1154	5	FSM	ENSMUSG00000032381.6	ENSMUST00000034945.6	1240	5	90	-4	90	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	677	junction_3	21.6376408140999	2374	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCACCTTAGGTTTTTACT	1473	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66033982	66046241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_66034253_66039808_66039974_66040713_66040764_66043583_66043630_66045618
tx.19498	chr9	-	2296	15	FSM	ENSMUSG00000032376.13	ENSMUST00000127569.8	5607	15	88	3223	-18	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_11	15.624418356521	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATTTCTTGTCTCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66500336	66425141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_66425861_66427378_66427447_66427554_66427669_66427890_66428010_66434220_66434302_66434396_66434504_66437525_66437673_66447343_66447458_66449794_66449909_66451227_66451311_66453025_66453108_66455153_66455238_66469835_66469968_66474124_66474186_66500065
tx.19499	chr9	-	1579	6	FSM	ENSMUSG00000032375.16	ENSMUST00000034934.15	4910	6	-306	3637	-306	354	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	4.70744091837593	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCGTAGCCCCTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66703078	66686120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_66686663_66691799_66691928_66696927_66697051_66697879_66697951_66701351_66701523_66702534
tx.195	chr1	-	1258	7	NIC	ENSMUSG00000026049.12	novel	1272	8	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	144	junction_6	127.50348579113	821	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGCCTTTGTTTTACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44141593	44125772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_44126224_44127002_44127209_44127635_44127688_44130520_44130752_44139007_44139162_44141059_44141118_44141487
tx.1950	chr10	+	1229	2	FSM	ENSMUSG00000097427.6	ENSMUST00000181287.5	1246	2	-3	20	-3	-20	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTGGAGTCATAAAGTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103987354	103989806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_103987464_103988686
tx.19500	chr9	-	1272	6	FSM	ENSMUSG00000053040.14	ENSMUST00000169282.8	5205	6	7	3926	7	364	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	3.03315017762062	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCGTAGCCCTTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66742001	66726201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_66726744_66729515_66729644_66735018_66735142_66735954_66736029_66740440_66740612_66741767
tx.19501	chr9	-	1152	6	FSM	ENSMUSG00000053040.14	ENSMUST00000057261.9	715	6	-73	-364	5	364	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	5.41848687365763	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCGTAGCCCTTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66742003	66726201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_66726744_66729515_66729644_66735018_66735142_66735954_66736029_66740440_66740612_66741889
tx.19502	chr9	-	1147	8	FSM	ENSMUSG00000036943.10	ENSMUST00000041139.9	4733	8	-11	3597	-11	-3597	multi-exon	FALSE	canonical	2	19	junction_5	12.9992150469455	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTTGGTAGATTTATTG	7740	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66826980	66754542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_66755094_66755879_66755931_66758615_66758682_66760208_66760299_66761949_66762028_66768118_66768180_66770704_66770766_66826791
tx.19503	chr9	+	493	4	FSM	ENSMUSG00000036781.14	ENSMUST00000040917.14	499	4	10	-4	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10808	junction_3	618.277355956765	58621	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCCTCCCTCTGCTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66853377	66856798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_66853463_66854112_66854222_66854868_66854980_66856610
tx.19504	chr9	+	408	3	ISM	ENSMUSG00000036781.14	ENSMUST00000143044.2	566	4	476	0	476	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10808	junction_2	670.5	8461	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCCTCCCTCTGCTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66854112	66856798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_66854222_66854868_66854980_66856610
tx.19505	chr9	-	1677	8	FSM	ENSMUSG00000032366.16	ENSMUST00000113695.8	1607	8	-68	-2	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_4	182.146722648058	197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGTGGTCCTGTCGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66951152	66929871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_66930724_66938310_66938381_66938733_66938797_66939232_66939309_66940075_66940147_66941157_66941276_66943276_66943411_66950859
tx.19506	chr9	-	1682	8	FSM	ENSMUSG00000032366.16	ENSMUST00000113696.8	1714	8	32	0	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	370	junction_1	100.853500541273	489	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGTGGTCCTGTCGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66951157	66929871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_66930724_66938310_66938381_66938733_66938797_66939747_66939824_66940075_66940147_66941157_66941276_66943276_66943411_66950859
tx.19507	chr9	-	1109	9	FSM	ENSMUSG00000032366.16	ENSMUST00000113684.8	887	9	-142	-80	32	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_1	167.222110903433	402	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCTATTCTTTTACTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66951157	66935249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_66935450_66936945_66937025_66938310_66938381_66938733_66938797_66939747_66939824_66940075_66940147_66941157_66941276_66943276_66943411_66950859
tx.19508	chr9	-	1095	9	NIC	ENSMUSG00000032366.16	novel	998	8	NA	NA	-18	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	173	junction_1	203.579683416592	274	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTATTCTTTTACTCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66951141	66935247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_66935450_66936945_66937025_66938310_66938381_66938733_66938797_66939232_66939309_66940075_66940147_66941157_66941276_66943276_66943411_66950859
tx.19509	chr9	-	1626	2	ISM	ENSMUSG00000032366.16	ENSMUST00000113686.8	998	8	-38	6839	28	-1027	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	619	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66951161	66942086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_66943411_66950859
tx.1951	chr10	+	1235	2	FSM	ENSMUSG00000090854.10	ENSMUST00000181615.8	1258	2	-3	26	-3	-26	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTATTCTGGAGTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104029899	104032357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_104030009_104031231
tx.19510	chr9	-	1230	3	ISM	ENSMUSG00000052698.16	ENSMUST00000215267.2	4999	33	100311	-250	4054	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_2	4	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCACTCAGCAAAGCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67134635	67127942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_67128801_67131257_67131384_67134389
tx.19511	chr9	+	599	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052698.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTTGGTCCTGCTTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67250221	67253298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_67250488_67251327_67251530_67253167
tx.19512	chr9	+	456	2	Intergenic	novelGene_1334	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTGGGATTTTAAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67541356	67546238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_67541587_67546012
tx.19513	chr9	+	424	5	ISM	ENSMUSG00000035284.11	ENSMUST00000217386.2	2669	27	-18	44919	-2	-44919	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_3	1.4790199457749	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTTTATTAATTAAGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67747675	67768173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_67747809_67759772_67759817_67760977_67761021_67766071_67766168_67768065
tx.19514	chr9	+	372	4	ISM	ENSMUSG00000035284.11	ENSMUST00000217386.2	2669	27	-70	46921	-54	-46921	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_3	1.63299316185545	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTTTACATTGTAATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67747623	67766171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_67747809_67759772_67759817_67760977_67761021_67766071
tx.19515	chr9	+	963	4	FSM	ENSMUSG00000032235.16	ENSMUST00000117246.8	1201	4	-20	258	-6	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_3	16.8588914885357	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAACCATTGTTTTCTAT	4663	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69305198	69314977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_69305336_69306227_69306370_69307758_69307864_69314398
tx.19516	chr9	+	1372	13	FSM	ENSMUSG00000032231.15	ENSMUST00000034756.15	1447	13	72	3	-24	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_7	12.0908022893437	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGCCGTTGCCTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69360973	69399074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_69361022_69371741_69371807_69374572_69374673_69383334_69383430_69386959_69387074_69390255_69390347_69391061_69391142_69392479_69392540_69393751_69393846_69394834_69394931_69395336_69395396_69396933_69397057_69398727
tx.19517	chr9	+	2360	10	FSM	ENSMUSG00000011958.18	ENSMUST00000085393.13	2328	10	-30	-2	8	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	219	junction_9	27.3933397330153	332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGGTCTTAATTACCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69896755	69915539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_69896972_69902702_69902810_69903399_69903468_69904362_69904540_69906375_69906553_69908124_69908228_69909261_69909394_69910660_69910748_69910850_69910950_69914345
tx.19518	chr9	+	754	5	FSM	ENSMUSG00000033543.18	ENSMUST00000118198.8	893	5	11	128	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	697	junction_3	95.7131129992124	5400	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGTGAGTAATACTTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69919842	69930020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_69919944_69922573_69922693_69924100_69924206_69926670_69926798_69929718
tx.19519	chr9	-	1906	10	NNC	ENSMUSG00000032224.16	novel	3703	9	NA	NA	186	-1649	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_9	89.1712182985043	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTGCCATACAGATTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70048674	69997441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_69998174_70000772_70000966_70003332_70003469_70006369_70006477_70010101_70010232_70017539_70017659_70032205_70032480_70033468_70033566_70037925_70037964_70048594
tx.1952	chr10	-	1968	12	FSM	ENSMUSG00000036009.17	ENSMUST00000046638.10	2033	12	7	58	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_11	25.2121576340063	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATAGTGTTTTCATTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105677232	105599107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_105599323_105601080_105601153_105601824_105601900_105615448_105615543_105629200_105629275_105630222_105630253_105633085_105633181_105659020_105659172_105661858_105662453_105665708_105665816_105668711_105668877_105676936
tx.19520	chr9	-	1641	9	FSM	ENSMUSG00000032224.16	ENSMUST00000034749.16	3703	9	179	1883	179	-1883	multi-exon	FALSE	canonical	3	198	junction_1	14.7118149798045	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATGTATTGCCCCTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70048681	69997675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_69998174_70000772_70000966_70003332_70003469_70006369_70006477_70010101_70010232_70017539_70017659_70032205_70032480_70033468_70033566_70048594
tx.19521	chr9	-	1278	7	ISM	ENSMUSG00000032224.16	ENSMUST00000034749.16	3703	9	16564	1879	16564	-1879	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	198	junction_1	8.73212459828649	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTGCCCCTCACCCTAC	8401	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70032296	69997671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_69998174_70000772_70000966_70003332_70003469_70006369_70006477_70010101_70010232_70017539_70017659_70032205
tx.19522	chr9	-	577	2	ISM	ENSMUSG00000032224.16	ENSMUST00000034749.16	3703	9	47965	1927	9463	-1927	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	198	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTGATTTTTCTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70000895	69997719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_69998174_70000772
tx.19523	chr9	+	2214	16	ISM	ENSMUSG00000032220.11	ENSMUST00000214767.2	2671	18	-12	12878	-12	-12878	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_9	20.0528191423439	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70114619	70254203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_70114986_70194193_70194338_70204548_70204639_70208974_70209070_70223873_70223962_70227350_70227441_70229673_70229806_70232114_70232250_70234425_70234559_70242396_70242594_70245010_70245092_70245998_70246086_70248562_70248650_70249263_70249432_70250325_70250412_70253968
tx.19524	chr9	+	1277	4	FSM	ENSMUSG00000032220.11	ENSMUST00000213863.2	1260	4	-2	-15	-2	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_2	2.16024689946929	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCCCTGTATTATCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70114629	70209661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_70114986_70194193_70194338_70204548_70204639_70208974
tx.19525	chr9	+	1286	3	ISM	ENSMUSG00000032220.11	ENSMUST00000034745.9	4625	28	176567	0	176567	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	228	junction_1	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTTGTTTCTTCATGACA	9866	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70291216	70307048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_70291288_70303057_70303228_70306003
tx.19526	chr9	-	1544	9	FSM	ENSMUSG00000032218.8	ENSMUST00000034742.8	1531	9	-9	-4	-9	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1324	junction_2	68.4557338723353	2481	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATCCTGTGTATATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70328838	70314969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_70315312_70316561_70316673_70317402_70317544_70317936_70318174_70320123_70320283_70320383_70320555_70326075_70326190_70326282_70326412_70328698
tx.19527	chr9	+	418	2	FSM	ENSMUSG00000032212.11	ENSMUST00000215714.2	1066	2	6	642	6	-642	multi-exon	FALSE	canonical	3	203	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTCTGCTCTTGTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70450081	70451387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_70450364_70451251
tx.19528	chr9	+	733	6	ISM	ENSMUSG00000032212.11	ENSMUST00000217593.2	3319	20	-15	19786	-5	-7186	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_1	16.4365446490435	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAAATAGTTTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70450146	70479547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_70450364_70451251_70451340_70466318_70466384_70469057_70469256_70470095_70470144_70479430
tx.19529	chr9	+	1571	6	ISM	ENSMUSG00000032212.11	ENSMUST00000049263.9	3691	21	41881	-4	3286	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	252	junction_2	38.3176199678425	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAATGTATTGAGAACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70492032	70499518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_70492160_70493205_70493371_70493916_70494232_70494332_70494478_70496238_70496400_70498860
tx.1953	chr10	-	398	2	NNC	ENSMUSG00000036009.17	novel	2033	12	NA	NA	5	-1341	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	159	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGTATTTTCAATATCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105677227	105676406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_105676514_105676936
tx.19530	chr9	+	1238	4	ISM	ENSMUSG00000032212.11	ENSMUST00000049263.9	3691	21	43804	-2	5209	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	286	junction_1	31.689465477067	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGCTAATGTATTGAGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70493955	70499516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_70494232_70494332_70494478_70496238_70496400_70498860
tx.19531	chr9	+	4662	16	FSM	ENSMUSG00000054693.15	ENSMUST00000067880.13	4593	16	-69	0	-69	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_13	22.3632635264971	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAGGTCTATGCTCTTTG	4881	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70586209	70687511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_70586542_70610568_70610720_70625939_70626059_70629894_70630054_70647356_70647458_70651132_70651286_70653515_70653609_70655364_70655549_70661443_70661608_70668864_70669049_70673233_70673385_70674153_70674338_70675090_70675200_70676073_70676295_70683654_70683782_70685281
tx.19532	chr9	+	1511	10	ISM	ENSMUSG00000054693.15	ENSMUST00000140205.8	2720	16	-65	16741	-65	13527	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_5	18.1747348716376	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCAATTACATCATGTATG	4885	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70586213	70668923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_70586542_70610568_70610720_70625939_70626059_70629894_70630054_70647356_70647458_70651132_70651286_70653515_70653609_70655364_70655549_70661443_70661608_70668864
tx.19533	chr9	-	1069	5	ISM	ENSMUSG00000032207.11	ENSMUST00000034731.10	1920	9	118030	41	117835	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_2	8.95823643358446	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGAGGGTGTGCTTTGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70724060	70705450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_70705691_70709354_70709574_70710978_70711097_70719951_70720195_70723811
tx.19534	chr9	-	606	3	ISM	ENSMUSG00000032207.11	ENSMUST00000034731.10	1920	9	118038	5565	117843	-5521	internal_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	7.5	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCCGGTGTGGCCCATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70724052	70710974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_70711097_70719951_70720195_70723811
tx.19535	chr9	+	2274	14	FSM	ENSMUSG00000013584.6	ENSMUST00000034723.6	2264	14	-17	7	-17	-7	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.4973358585766	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTTGGGACTGTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71123053	71203518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_71123246_71159879_71159985_71160197_71160339_71162315_71162446_71169012_71169075_71171068_71171198_71171314_71171429_71188885_71188989_71190659_71190845_71192135_71192301_71192397_71192556_71193201_71193277_71200887_71200977_71202892
tx.19536	chr9	-	1833	3	ISM	ENSMUSG00000032199.14	ENSMUST00000163972.2	2138	4	1237	-3	1237	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2231	junction_1	121	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCGAGCTCATGGCGATG	4684	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71391003	71385749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_71386823_71388623_71388829_71390448
tx.19537	chr9	+	1224	7	NIC	ENSMUSG00000032221.15	novel	5250	10	NA	NA	22	-3449	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_4	33.4535332795938	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCAGAATTAGTCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72345838	72365858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_72345962_72346521_72346744_72352124_72352253_72353488_72353592_72359862_72360121_72364059_72364186_72365594
tx.19538	chr9	+	902	3	ISM	ENSMUSG00000032221.15	ENSMUST00000034746.10	5250	10	13792	3449	13792	-3449	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	11.5	311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCAGAATTAGTCATTTTT	1832	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72359608	72365858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_72360121_72364059_72364186_72365594
tx.19539	chr9	-	1278	12	FSM	ENSMUSG00000090626.10	ENSMUST00000184125.8	2794	12	135	1381	-5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_11	31.4406169897191	446	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGGTGAAATAAACAGAAT	7871	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72399248	72368382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_72368561_72369137_72369273_72380939_72381075_72385018_72385193_72385621_72385705_72387878_72388058_72389728_72389812_72391350_72391397_72394061_72394142_72395293_72395358_72399020_72399101_72399207
tx.1954	chr10	+	995	4	FSM	ENSMUSG00000019897.9	ENSMUST00000020049.9	1813	4	411	407	-26	-407	multi-exon	FALSE	canonical	3	411	junction_3	54.9201440477192	1728	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAGCTCACAGTGAGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105677338	105683287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_105677517_105678402_105678710_105681210_105681311_105682877
tx.19540	chr9	-	1144	11	NIC	ENSMUSG00000090626.10	novel	2794	12	NA	NA	-6	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	37	junction_2	56.7235400869868	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTGGTGAAATAAACAGAAT	7870	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72399249	72368382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_72368561_72369137_72369273_72385018_72385193_72385621_72385705_72387878_72388058_72389728_72389812_72391350_72391397_72394061_72394142_72395293_72395358_72399020_72399101_72399207
tx.19541	chr9	-	1299	3	NNC	ENSMUSG00000096986.3	novel	1191	3	NA	NA	1487	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTTGTCACTCATAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72437653	72425544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_72426573_72429482_72429584_72437483
tx.19542	chr9	+	1427	7	FSM	ENSMUSG00000037674.16	ENSMUST00000184015.2	1554	7	64	63	64	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_3	16.2933183305987	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACTGATTACCTGGTTTT	1236	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72440080	72519705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_72440263_72484320_72484355_72499032_72499116_72500519_72500643_72514904_72515022_72517585_72517671_72518902
tx.19543	chr9	+	3739	29	NNC	ENSMUSG00000032216.16	novel	5499	29	NA	NA	-32	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	553.560943449088	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAGAGTAGTTCAATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72569687	72655443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_72569896_72577242_72577399_72578511_72578586_72584596_72584676_72584774_72584814_72593342_72593397_72616393_72616445_72617759_72617822_72619448_72619549_72625499_72625667_72628582_72628701_72628778_72628944_72632298_72632365_72633692_72633813_72638183_72638256_72638503_72638559_72638659_72638719_72639873_72639940_72642291_72642522_72643948_72644071_72644155_72644227_72646321_72646418_72646736_72646811_72647449_72647511_72648909_72648970_72649934_72650043_72650821_72650919_72653688_72653762_72654407
tx.19544	chr9	+	536	5	NNC	ENSMUSG00000032216.16	novel	660	8	NA	NA	-25	5359	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1214.2753754812	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAATGAAGAAATACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72569694	72584789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_72569896_72577231_72577399_72578511_72578586_72584596_72584676_72584774
tx.19545	chr9	+	514	3	NNC	ENSMUSG00000032216.16	novel	1260	3	NA	NA	-10	-728	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1476.5	38	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGGTACACAGTGAGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72569709	72578683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_72569896_72577242_72577399_72578511
tx.19546	chr9	+	502	5	NNC	ENSMUSG00000032216.16	novel	660	8	NA	NA	-2	5359	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1214.2753754812	22	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGAATGAAGAAATACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72569717	72584789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_72569896_72577242_72577399_72578511_72578586_72584596_72584676_72584774
tx.19547	chr9	+	485	4	NNC	ENSMUSG00000032216.16	novel	660	8	NA	NA	0	5245	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1348.65883998388	25	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGATTTAGCCAGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72569719	72584675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_72569896_72577242_72577399_72578511_72578586_72584596
tx.19548	chr9	+	498	4	NNC	ENSMUSG00000032216.16	novel	660	8	NA	NA	-2	5245	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1348.65883998388	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGATTTAGCCAGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72569717	72584675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_72569896_72577231_72577399_72578511_72578586_72584596
tx.19549	chr9	-	1332	4	NNC	ENSMUSG00000098294.2	novel	527	2	NA	NA	-3003	478	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGCATTTGGTAGTTT	4535	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72686510	72680866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_72681693_72683328_72683532_72684559_72684636_72686283
tx.1955	chr10	+	749	3	ISM	ENSMUSG00000019897.9	ENSMUST00000020049.9	1813	4	1542	408	1105	-408	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	411	junction_2	58	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGAGCTCACAGTGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105678469	105683286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_105678710_105681210_105681311_105682877
tx.19550	chr9	-	1177	3	NNC	ENSMUSG00000098294.2	novel	527	2	NA	NA	-2914	488	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTAGTTTGGGTTTTTTT	4624	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72686421	72680856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_72681693_72683328_72683532_72686283
tx.19551	chr9	-	702	2	FSM	ENSMUSG00000086158.3	ENSMUST00000124565.3	711	2	7	2	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_1	0	417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTTTTTTTGTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72892651	72887005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_72887479_72892422
tx.19552	chr9	-	759	3	NNC	ENSMUSG00000086158.3	novel	711	2	NA	NA	17	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTTTTTTTGTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72892641	72887005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_72887479_72889841_72889909_72892422
tx.19553	chr9	+	1564	2	ISM	ENSMUSG00000034563.17	ENSMUST00000085350.11	2969	9	26827	0	-2541	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTCTCTCAAGTCTGGCG	6939	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72919713	72923282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_72920609_72922613
tx.19554	chr9	-	1238	9	NNC	ENSMUSG00000079469.11	novel	694	2	NA	NA	29	-2235	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	1	2	junction_3	21.9416840739265	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTGGTGTAATCCTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72946904	72927127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_72927451_72928567_72928633_72929556_72929615_72936847_72936989_72939334_72939466_72941768_72941874_72943985_72944104_72945904_72946041_72946743
tx.19555	chr9	-	1529	10	NNC	ENSMUSG00000079469.11	novel	664	6	NA	NA	-13	-2240	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	3	21	junction_1	14.7103725897203	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGGTGTGGTGTAATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72946994	72927132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_72927451_72928567_72928633_72929556_72929769_72930510_72930563_72936847_72936989_72939334_72939466_72941768_72941874_72943985_72944104_72945904_72946041_72946743
tx.19556	chr9	+	491	2	FSM	ENSMUSG00000098332.3	ENSMUST00000184126.3	496	2	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	439	junction_1	0	4212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAGTTATTTATAAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72947004	72950061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_72947148_72949713
tx.19557	chr9	+	1632	3	FSM	ENSMUSG00000092622.9	ENSMUST00000034737.13	1681	3	52	-3	52	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	216	junction_2	18.5	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGGTGTGTATTTGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73009731	73011723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_73009958_73010111_73010292_73010497
tx.19558	chr9	+	1543	6	FSM	ENSMUSG00000032215.16	ENSMUST00000034738.14	1543	6	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	633	junction_5	127.855230632149	1579	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTACATATCTCTTATTT	8580	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73020729	73030615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_73020866_73022169_73022284_73023688_73023762_73025163_73025228_73028483_73028570_73029545
tx.19559	chr9	+	734	4	Intergenic	novelGene_1336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTACTACCCACATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73907214	73916886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_73907363_73916020_73916162_73916286_73916382_73916536
tx.1956	chr10	+	1574	10	ISM	ENSMUSG00000019907.11	ENSMUST00000219263.2	3355	25	-95	27884	-95	-3894	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_7	16.0831174424198	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAGAGGAAAGAAAAGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107997958	108085328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_107998498_108034693_108034825_108050248_108050368_108066297_108066458_108069859_108070005_108075965_108076041_108076639_108076729_108076981_108077140_108078866_108078992_108085295
tx.19560	chr9	+	583	3	NIC	ENSMUSG00000034858.17	novel	4065	13	NA	NA	40	11	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTGCATTTCATTCGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74860393	74861489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_74860561_74860995_74861113_74861190
tx.19561	chr9	+	411	4	FSM	ENSMUSG00000007656.14	ENSMUST00000168166.8	3944	4	62	3471	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3551	junction_1	1114.80232428096	13665	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTCCTCTACTGTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74944957	74964105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_74945002_74945188_74945244_74959514_74959638_74963916
tx.19562	chr9	+	369	3	FSM	ENSMUSG00000007656.14	ENSMUST00000007800.8	4046	3	187	3490	-12	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	5814	junction_2	96	12376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTCCTCTACTGTCCTTT	NA	False	NA	-50	True	NA	NA	NA	74945186	74964105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_74945244_74959514_74959638_74963916
tx.19563	chr9	+	314	2	FSM	ENSMUSG00000007656.14	ENSMUST00000166549.2	1747	2	180	1253	180	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	5814	junction_1	0	2576	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTCCTCTACTGTCCTTT	5944	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74959512	74964105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_74959638_74963916
tx.19564	chr9	+	1167	4	ISM	ENSMUSG00000033590.9	ENSMUST00000216788.2	4782	30	-57	40728	-1	-11496	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_2	8.9566858950296	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTACAGCTTGCAAAAGAA	5127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75139300	75154152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_75139458_75150043_75150155_75152251_75152418_75153419
tx.19565	chr9	+	1094	6	ISM	ENSMUSG00000033590.9	ENSMUST00000216788.2	4782	30	-57	36868	-1	-7636	intron_retention	FALSE	canonical	3	35	junction_4	10.2176318195558	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAAAAGCCTTAAACCT	5127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75139300	75158012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_75139458_75150043_75150155_75152251_75152418_75153419_75153565_75157014_75157172_75157654
tx.19566	chr9	+	1612	10	ISM	ENSMUSG00000033590.9	ENSMUST00000036555.8	6727	41	0	47057	0	28	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_4	9.15302014516399	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTGTGCGTTGAATAAATG	5128	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75139301	75165676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_75139458_75150043_75150155_75152251_75152418_75153419_75153565_75157014_75157172_75157654_75157799_75158722_75158805_75159805_75159914_75163112_75163220_75165240
tx.19567	chr9	-	934	2	FSM	ENSMUSG00000111348.2	ENSMUST00000216737.2	1377	2	444	-1	444	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGGTTGTCATGGGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75221709	75217615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_75218186_75221345
tx.19568	chr9	+	2101	11	FSM	ENSMUSG00000032192.10	ENSMUST00000215875.2	2105	11	11	-7	6	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	15	junction_6	3.38230690505755	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTATCTTGTCTTTATTT	386	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75221428	75253160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_75221666_75234414_75234552_75239154_75239197_75240090_75240168_75241450_75241584_75242932_75243077_75244552_75244645_75247469_75247519_75250789_75250887_75251762_75251930_75252234
tx.19569	chr9	-	4193	6	FSM	ENSMUSG00000042688.17	ENSMUST00000049355.11	4072	6	-5	-116	-5	114	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_5	19.2727787306346	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGGCTCCTGTTTGACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75317292	75294069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_75296430_75297448_75297651_75300646_75300812_75302791_75302937_75304860_75306034_75317144
tx.1957	chr10	+	2495	16	ISM	ENSMUSG00000019907.11	ENSMUST00000219263.2	3355	25	-90	16403	-90	7472	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	168	junction_12	22.3352238005851	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GGATAAAGAGAAACAAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107997963	108096809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_107998498_108034693_108034825_108050248_108050368_108066297_108066458_108069859_108070005_108075965_108076041_108076639_108076729_108076981_108077140_108078866_108078992_108085295_108085512_108086774_108086870_108087700_108087806_108088617_108088786_108089185_108089357_108095616_108095708_108096696
tx.19570	chr9	-	618	2	ISM	ENSMUSG00000042688.17	ENSMUST00000172946.2	3228	3	-14	4548	-5	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	266	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTGCAATGAACATCAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75317292	75305563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_75306034_75317144
tx.19571	chr9	+	2179	12	FSM	ENSMUSG00000042487.7	ENSMUST00000048937.6	2180	12	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	353	junction_2	48.4889013457617	323	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCCTATGCTTAAGAAAAC	927	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75348818	75373714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_75348918_75352516_75353276_75354383_75354489_75355583_75355679_75356638_75356785_75357769_75357855_75361905_75362001_75362922_75363058_75364339_75364476_75365356_75365544_75368287_75368386_75373475
tx.19572	chr9	+	864	6	ISM	ENSMUSG00000042487.7	ENSMUST00000048937.6	2180	12	13114	0	5570	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	409	junction_3	44.7240427510752	375	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCCTATGCTTAAGAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75361931	75373714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_75362001_75362922_75363058_75364339_75364476_75365356_75365544_75368287_75368386_75373475
tx.19573	chr9	+	480	3	ISM	ENSMUSG00000042487.7	ENSMUST00000048937.6	2180	12	16583	0	9039	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	450	junction_1	41	199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCCTATGCTTAAGAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75365400	75373714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_75365544_75368287_75368386_75373475
tx.19574	chr9	+	536	4	NNC	ENSMUSG00000109032.2	novel	1137	9	NA	NA	-70	-8600	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_1	6.64997911442	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTAGTTTATCTGTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75375827	75380298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_75375966_75377558_75377649_75379458_75379554_75380085
tx.19575	chr9	+	444	3	NNC	ENSMUSG00000109032.2	novel	1137	9	NA	NA	-68	-8600	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	4.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTAGTTTATCTGTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75375829	75380298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_75375966_75379458_75379554_75380085
tx.19576	chr9	+	2474	4	NIC	ENSMUSG00000109032.2	novel	505	4	NA	NA	-58	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	39	junction_1	3.2659863237109	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTTTATGTGTGTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75375839	75393963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_75375966_75388729_75388947_75390380_75390480_75391931
tx.19577	chr9	+	2592	5	NIC	ENSMUSG00000109032.2	novel	505	4	NA	NA	-43	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_1	17.0953209972788	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTTTATGTGTGTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75375854	75393963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_75375966_75386953_75387087_75388729_75388947_75390380_75390480_75391931
tx.19578	chr9	+	532	2	ISM	ENSMUSG00000109032.2	ENSMUST00000208434.2	1137	9	-175	11686	-175	-8600	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTAGTTTATCTGTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75379234	75380298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_75379554_75380085
tx.19579	chr9	-	2258	3	ISM	ENSMUSG00000058587.10	ENSMUST00000072232.9	3667	10	52199	409	-1275	-409	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	422	junction_2	33	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCAGACTGTTGGTCATT	7683	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75414740	75405397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_75407433_75412121_75412267_75414662
tx.1958	chr10	+	1373	3	ISM	ENSMUSG00000035873.9	ENSMUST00000218332.2	870	5	76695	-1082	76695	596	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	675	junction_1	3.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTATTTAGGGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108245372	108250697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_108245472_108247824_108247930_108249528
tx.19580	chr9	-	2182	2	ISM	ENSMUSG00000058587.10	ENSMUST00000072232.9	3667	10	54671	409	1197	-409	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	488	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCAGACTGTTGGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75412268	75405397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_75407433_75412121
tx.19581	chr9	-	3258	10	FSM	ENSMUSG00000058587.10	ENSMUST00000072232.9	3667	10	0	409	0	-409	multi-exon	FALSE	canonical	3	422	junction_2	36.4461381720248	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCAGACTGTTGGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75466939	75405397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_75407433_75412121_75412267_75414662_75414807_75416595_75416704_75418407_75418539_75422448_75422539_75423754_75423878_75436650_75436808_75439707_75439875_75466781
tx.19582	chr9	-	2884	9	ISM	ENSMUSG00000058587.10	ENSMUST00000072232.9	3667	10	-3	5475	-3	12	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	422	junction_1	38.5938385626514	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAGAAGAAGAAGAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75466942	75410463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_75412267_75414662_75414807_75416595_75416704_75418407_75418539_75422448_75422539_75423754_75423878_75436650_75436808_75439707_75439875_75466781
tx.19583	chr9	-	547	2	FSM	ENSMUSG00000058587.10	ENSMUST00000217459.2	3918	2	0	3371	0	-3371	multi-exon	FALSE	canonical	3	524	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTACCTTTGTGTAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75466939	75439485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_75439875_75466781
tx.19584	chr9	-	1520	10	FSM	ENSMUSG00000032186.16	ENSMUST00000098552.10	9871	10	157	8194	-6	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_9	3.42467444609388	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGTAGTTTGTCTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75518428	75481096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_75481406_75483927_75484073_75484390_75484535_75489111_75489220_75493329_75493461_75495171_75495259_75499844_75499968_75502202_75502360_75504491_75504685_75518305
tx.19585	chr9	+	1062	3	FSM	ENSMUSG00000032184.6	ENSMUST00000034702.6	1189	3	129	-2	111	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_2	3	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCATTTCTCTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75533151	75545055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_75533320_75542667_75543000_75544493
tx.19586	chr9	+	1350	3	FSM	ENSMUSG00000032184.6	ENSMUST00000213292.2	1241	3	-105	-4	-105	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	30.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCCTTCATTTCTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75533414	75545052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_75533874_75542667_75543000_75544493
tx.19587	chr9	-	2036	12	FSM	ENSMUSG00000032181.8	ENSMUST00000034699.8	2384	12	162	186	81	-10	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_7	2.00412797136805	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCCTTGACGCTCTGAGAA	7956	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75591176	75550656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_75551227_75558912_75558994_75568534_75568673_75570474_75570559_75572935_75573053_75576496_75576675_75582626_75582777_75583950_75584094_75589245_75589462_75589555_75589602_75590219_75590273_75590916
tx.19588	chr9	+	1326	2	NNC	ENSMUSG00000098894.2	novel	581	2	NA	NA	-7127	-4	intron_retention	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCATTTTGCAGACTTGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76219731	76228124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_76219851_76226917
tx.19589	chr9	+	633	3	NNC	ENSMUSG00000098894.2	novel	581	2	NA	NA	-7119	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	3	226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGCAGACTTGACAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76219739	76228128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_76219851_76226917_76227020_76227708
tx.1959	chr10	+	692	3	FSM	ENSMUSG00000020185.17	ENSMUST00000174857.8	2865	3	-7	2180	-7	-120	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	1.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATGGCATCATTTGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110581318	110590318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_110581541_110582192_110582286_110589941
tx.19590	chr9	+	2655	13	ISM	ENSMUSG00000032350.10	ENSMUST00000034905.9	3423	16	25026	8	13419	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	241	junction_2	17.3605555466664	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCAAAGGTAGTACGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77686842	77701759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_77686918_77688365_77688425_77688515_77688650_77692615_77692691_77693031_77693149_77693992_77694132_77694558_77694672_77695088_77695182_77695469_77695575_77698996_77699079_77699161_77699266_77699334_77699456_77700321
tx.19591	chr9	+	1568	2	ISM	ENSMUSG00000032350.10	ENSMUST00000034905.9	3423	16	37517	0	25910	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	264	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAGTACGTGTATGAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77699333	77701767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_77699456_77700321
tx.19592	chr9	+	2763	8	FSM	ENSMUSG00000032349.14	ENSMUST00000034904.14	2782	8	16	3	16	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	515	junction_6	44.3764048354804	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGCTGTGTCTTCTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77824661	77891798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_77824809_77864422_77864489_77868147_77868336_77883066_77883145_77884029_77884202_77887106_77887232_77888755_77888891_77889946
tx.19593	chr9	+	910	7	FSM	ENSMUSG00000032348.7	ENSMUST00000034903.7	977	7	67	0	67	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2717	junction_1	326.320735201155	25270	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCGTTGGAGAGGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78099295	78116631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_78099347_78105551_78105659_78106771_78106824_78111513_78111647_78113193_78113336_78115082_78115215_78116338
tx.19594	chr9	-	652	4	NNC	ENSMUSG00000060461.6	novel	619	3	NA	NA	19	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3484	junction_1	82858.6360227801	7976	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCGTCGTCATTAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78275440	78274333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_78274577_78274796_78274849_78275002_78275186_78275266
tx.19595	chr9	-	600	3	FSM	ENSMUSG00000060461.6	ENSMUST00000071991.6	619	3	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	178157	junction_1	1580.5	1233693	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCGTCGTCATTAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78275440	78274333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_78274577_78275002_78275186_78275266
tx.19596	chr9	-	523	3	NNC	ENSMUSG00000060461.6	novel	619	3	NA	NA	19	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	89078.5	1758	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGCGTCGTCATTAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78275440	78274333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_78274577_78275002_78275186_78275343
tx.19597	chr9	-	358	2	ISM	ENSMUSG00000060461.6	ENSMUST00000071991.6	619	3	19	668	19	-668	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	181318	junction_1	0	9746	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAGTCTCTAACAGGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78275440	78275001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_78275186_78275266
tx.19598	chr9	+	2487	8	NIC	ENSMUSG00000070291.5	novel	2207	17	NA	NA	16893	2	intron_retention	FALSE	canonical	3	58	junction_4	9.45666809339164	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGTTGAAATTTTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78319951	78330871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_78321607_78323944_78324033_78325318_78325447_78325614_78325725_78326493_78326633_78327870_78327959_78328979_78329121_78330733
tx.19599	chr9	+	1062	9	ISM	ENSMUSG00000070291.5	ENSMUST00000113367.2	2207	17	17979	-2	17979	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	10.4813823038758	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGTTGAAATTTTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78321037	78330871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_78321167_78321505_78321607_78323944_78324033_78325318_78325447_78325614_78325725_78326493_78326633_78327870_78327959_78328979_78329121_78330733
tx.196	chr1	-	1202	6	FSM	ENSMUSG00000026049.12	ENSMUST00000150911.8	960	6	6	-248	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_5	82.045353311446	2056	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGCCTTTGTTTTACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44141595	44125772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_44126224_44127002_44127209_44127635_44127688_44130520_44130752_44139007_44139162_44141487
tx.1960	chr10	+	889	6	FSM	ENSMUSG00000020186.8	ENSMUST00000020403.7	1384	6	387	108	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_1	20.350921355064	1573	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACCTTTCAGAGGAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110756036	110775375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_110756116_110767815_110767929_110771008_110771178_110773597_110773728_110774497_110774592_110775071
tx.19600	chr9	+	2364	12	FSM	ENSMUSG00000032342.14	ENSMUST00000034896.13	2366	12	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_9	10.2457409010559	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGTTAGGTGATTTTACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78355491	78381434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_78355793_78356700_78356901_78356999_78357118_78360045_78360336_78364491_78364605_78364697_78364889_78365198_78365330_78368114_78368320_78368801_78368974_78372165_78372285_78377912_78378074_78381071
tx.19601	chr9	+	1021	5	ISM	ENSMUSG00000032342.14	ENSMUST00000034896.13	2366	12	12623	1	-3868	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_2	14.8828760661372	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGTTAGGTGATTTTAC	2052	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78368112	78381433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_78368320_78368801_78368974_78372165_78372285_78377912_78378074_78381071
tx.19602	chr9	+	192	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000076138.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATTAAATTATTCTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78383419	78458341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_78383568_78458297
tx.19603	chr9	-	376	3	ISM	ENSMUSG00000032330.8	ENSMUST00000215933.2	477	4	671	0	671	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6129	junction_1	284.5	1319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGTCTCCCTTTTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79665862	79662687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_79662888_79663558_79663644_79665771
tx.19604	chr9	-	479	4	FSM	ENSMUSG00000032330.8	ENSMUST00000034881.8	659	4	135	45	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5621	junction_3	439.918426781855	58183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGTCTCCCTTTTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79667025	79662687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_79662888_79663558_79663644_79665771_79665862_79666921
tx.19605	chr9	+	635	7	FSM	ENSMUSG00000034252.15	ENSMUST00000176640.8	1150	7	534	-19	-23	19	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_1	86.6572110226392	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATCAGACCAAATGCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79974751	80021054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_79974855_79999548_79999695_80000818_80000924_80006167_80006189_80010975_80011047_80018592_80018736_80021008
tx.19606	chr9	+	659	2	ISM	ENSMUSG00000034252.15	ENSMUST00000176563.2	614	3	217	-169	217	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	376	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATTTGATATTCTTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80049543	80051456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_80049678_80050931
tx.19607	chr9	+	1101	9	ISM	ENSMUSG00000033577.19	ENSMUST00000184480.8	4139	36	-222	61503	-26	-20077	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_5	7.68114574786861	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAATCGTTCTTCGTCCTA	4828	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80072286	80153876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_80072512_80124897_80125040_80128299_80128370_80133473_80133548_80136139_80136270_80149446_80149553_80152416_80152473_80152921_80153020_80153676
tx.19608	chr9	+	1111	2	NNC	ENSMUSG00000079225.4	novel	638	2	NA	NA	-60	12	intron_retention	FALSE	canonical	3	1420	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAACTTCAAGGACTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81559590	81560742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_81560470_81560510
tx.19609	chr9	+	711	2	FSM	ENSMUSG00000079225.4	ENSMUST00000055820.7	638	2	-60	-13	-60	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	2455	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAACTTCAAGGACTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81559590	81560743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_81559913_81560354
tx.1961	chr10	+	882	5	ISM	ENSMUSG00000020186.8	ENSMUST00000020403.7	1384	6	12083	119	244	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	202	junction_1	3.56195171219375	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACCTCTTAATTAACCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110767732	110775364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_110767929_110771008_110771178_110773597_110773728_110774497_110774592_110775071
tx.19610	chr9	+	1583	4	NIC	ENSMUSG00000043289.13	novel	2670	5	NA	NA	-13	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	20.757863302587	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTGGTTGAATTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81745709	81908515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_81745971_81772174_81772421_81861178_81861311_81907571
tx.19611	chr9	+	2056	5	FSM	ENSMUSG00000043289.13	ENSMUST00000057067.10	2670	5	50	564	11	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_2	8.4372685153431	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTGGTTGAATTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81745772	81908515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_81745971_81772174_81772421_81809150_81809687_81861178_81861311_81907571
tx.19612	chr9	+	894	4	FSM	ENSMUSG00000032251.13	ENSMUST00000113245.9	2158	4	651	613	385	54	multi-exon	TRUE	canonical	3	114	junction_3	13.589211407093	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATACTGAATTTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82712243	82729127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_82712393_82719470_82719537_82728351_82728483_82728579
tx.19613	chr9	-	1543	10	ISM	ENSMUSG00000032253.14	ENSMUST00000187021.7	2623	17	-63	16874	27	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_4	6.55084576577052	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTATGTATTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82857542	82812005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_82812428_82814538_82814640_82814898_82815121_82827810_82827972_82841564_82841664_82841753_82841905_82856726_82856787_82856979_82857010_82857140_82857200_82857304
tx.19614	chr9	+	242	1	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000099188.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTCTCTATTTATAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82955200	82955442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_82955200_82955400
tx.19615	chr9	-	866	6	FSM	ENSMUSG00000066456.15	ENSMUST00000161796.9	862	6	2	-6	2	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	6.24179461373089	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACCTGTTTGTGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83028656	82991994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_82992483_82993086_82993160_82994272_82994324_82996825_82996856_83002425_83002477_83028483
tx.19616	chr9	-	907	6	FSM	ENSMUSG00000066456.15	ENSMUST00000162246.9	983	6	82	-6	2	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	12.1556571192182	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACCTGTTTGTGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83028656	82991994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_82992483_82993045_82993160_82994272_82994324_82996825_82996856_83002425_83002477_83028483
tx.19617	chr9	+	3515	4	FSM	ENSMUSG00000032261.17	ENSMUST00000113215.10	4565	4	-7	1057	-6	-1057	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_2	12.4988888395018	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCTGGAGTTGTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83430373	83482342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_83430557_83459488_83459675_83476710_83476792_83479277
tx.19618	chr9	+	493	2	ISM	ENSMUSG00000100155.2	ENSMUST00000189326.2	1409	3	234	821	234	-821	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGCATATTTTTTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83573761	83574455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_83573862_83574062
tx.19619	chr9	-	3026	6	FSM	ENSMUSG00000032262.14	ENSMUST00000034796.14	3001	6	-29	4	-4	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_4	3.49857113690718	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTCTGTCCGTCGTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83688334	83660748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_83662863_83665188_83665317_83667087_83667260_83670321_83670403_83672029_83672218_83687991
tx.1962	chr10	-	419	3	ISM	ENSMUSG00000035798.15	ENSMUST00000218981.2	564	4	-56	7775	-30	-7775	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_1	5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTAGCTTTCATGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110845894	110817760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_110817980_110821800_110821905_110845798
tx.19620	chr9	-	2480	4	ISM	ENSMUSG00000032262.14	ENSMUST00000034796.14	3001	6	17920	2	17920	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_2	1.24721912892465	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTCTGTCCGTCGTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83670385	83660746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_83662863_83665188_83665317_83667087_83667260_83670321
tx.19621	chr9	+	2898	22	FSM	ENSMUSG00000038379.16	ENSMUST00000070326.14	2871	22	-27	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	211	junction_10	27.5493373131652	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTACAGTGGTCAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83716743	83754439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_83716813_83717823_83717978_83721252_83721467_83721778_83721886_83725133_83725278_83725680_83725796_83725936_83726010_83726099_83726195_83727965_83728051_83729187_83729306_83732624_83732762_83735139_83735229_83736855_83736983_83739370_83739464_83744214_83744373_83744500_83744653_83745497_83745623_83747130_83747212_83750095_83750273_83750628_83750714_83751235_83751334_83754037
tx.19622	chr9	+	1473	11	FSM	ENSMUSG00000032263.15	ENSMUST00000034801.11	1472	11	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	595	junction_3	45.3898667105335	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGTGTGTGTGTCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83807202	84006293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_83807413_83834576_83834655_83835765_83835835_83870828_83870963_83871193_83871350_83873766_83873876_83892306_83892405_83894561_83894673_83951157_83951245_84004286_84004436_84006021
tx.19623	chr9	+	684	2	Intergenic	novelGene_1338	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTAGCGGAGGTCTCTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83824879	83825682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_83825261_83825379
tx.19624	chr9	+	607	4	ISM	ENSMUSG00000032263.15	ENSMUST00000190166.7	1398	11	63740	0	-23319	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	616	junction_3	42.2374241638857	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTGTGTGTGTGTCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83894573	84006293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_83894673_83951157_83951245_84004286_84004436_84006021
tx.19625	chr9	-	431	2	ISM	ENSMUSG00000035941.16	ENSMUST00000185353.2	3316	12	-7	23637	-7	-15527	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	208	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCCCCAAAGGGCCATCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85631374	85625872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_85626113_85631183
tx.19626	chr9	+	503	3	NNC	ENSMUSG00000035274.14	novel	3481	2	NA	NA	0	826	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	62.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTATTCTTTATCATTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85724917	85729919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_85725009_85725703_85725816_85729619
tx.19627	chr9	-	665	3	Intergenic	novelGene_1340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAAAGTTTCTCGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86029730	85917269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_85917721_86023154_86023216_86029577
tx.19628	chr9	-	1455	9	ISM	ENSMUSG00000032415.15	ENSMUST00000034986.14	1790	10	13060	5	13060	-5	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	19	junction_5	3.96862696659689	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCATGTGTTCTTTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86333943	86189363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_86189930_86254393_86254533_86304893_86305058_86307314_86307424_86309420_86309491_86317336_86317407_86322638_86322808_86330815_86330907_86333866
tx.19629	chr9	-	1782	10	FSM	ENSMUSG00000032415.15	ENSMUST00000034986.14	1790	10	3	5	3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_5	4.12160822022031	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCATGTGTTCTTTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86347000	86189363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_86189930_86254393_86254533_86304893_86305058_86307314_86307424_86309420_86309491_86317336_86317407_86322638_86322808_86330815_86330907_86333866_86334064_86346793
tx.1963	chr10	+	2756	2	FSM	ENSMUSG00000035759.5	ENSMUST00000040454.5	2744	2	-6	-6	-6	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAAGTTAATTGTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111134533	111137594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_111134769_111135073
tx.19630	chr9	-	1078	8	ISM	ENSMUSG00000032415.15	ENSMUST00000034986.14	1790	10	18	115519	18	-115083	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_3	4.4629998148038	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTCTGTTCCACGTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86346985	86304877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_86305058_86307314_86307424_86309420_86309491_86317336_86317407_86322638_86322808_86330815_86330907_86333866_86334064_86346793
tx.19631	chr9	-	2046	13	FSM	ENSMUSG00000056131.14	ENSMUST00000070064.11	2666	13	-4	624	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	372	junction_7	43.7311070317483	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCTTTCGATTGCTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86453884	86437053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_86437457_86438244_86438419_86439555_86439679_86440447_86440562_86441467_86441567_86443873_86443958_86444588_86444747_86446729_86446926_86447650_86447785_86449561_86449630_86451263_86451449_86452254_86452461_86453782
tx.19632	chr9	+	1232	3	FSM	ENSMUSG00000032417.11	ENSMUST00000185566.7	1054	3	-12	-166	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	7	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACTTGTCTCAAGTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86454031	86456952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_86454111_86454889_86455117_86456026
tx.19633	chr9	+	1388	3	FSM	ENSMUSG00000032417.11	ENSMUST00000034988.10	1355	3	-33	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	22.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACTTGTCTCAAGTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86454035	86456952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_86454271_86454889_86455117_86456026
tx.19634	chr9	-	3110	14	FSM	ENSMUSG00000032418.16	ENSMUST00000034989.15	3288	14	172	6	172	-6	multi-exon	TRUE	canonical	3	250	junction_5	30.9913139195733	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATAATACCGTAAATGTCA	9782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86577834	86463429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_86464961_86469015_86469115_86476496_86476671_86478108_86478252_86480771_86480878_86493905_86494020_86495593_86495692_86501777_86501888_86528363_86528468_86532920_86533083_86536695_86536772_86559916_86560067_86561871_86562006_86577725
tx.19635	chr9	-	1371	3	NNC	ENSMUSG00000032418.16	novel	1055	8	NA	NA	31086	-355	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	22	junction_2	172.5	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGCCTTTCCCAGGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86469671	86463813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_86464961_86469015_86469115_86469546
tx.19636	chr9	-	2119	6	ISM	ENSMUSG00000032418.16	ENSMUST00000189968.7	1055	8	6789	-1312	6789	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	250	junction_5	41.7708032003216	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATACCGTAAATGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86493968	86463426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_86464961_86469015_86469115_86476496_86476671_86478108_86478252_86480771_86480878_86493905
tx.19637	chr9	+	1213	2	Intergenic	novelGene_1341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATCTTGCTTTCTTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86607291	86609704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_86607367_86608566
tx.19638	chr9	+	2531	2	FSM	ENSMUSG00000033491.14	ENSMUST00000036426.13	3444	2	0	913	0	-742	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTCTTGTGGGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86625701	86639583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_86625860_86637210
tx.19639	chr9	+	2215	16	FSM	ENSMUSG00000032872.17	ENSMUST00000168529.9	2644	16	36	393	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	203	junction_12	173.734612428139	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCTGTGGTGGACGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86904102	86959434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_86904307_86908999_86909154_86911556_86911658_86914432_86914515_86920778_86920809_86922434_86922520_86923305_86923364_86924832_86924927_86929526_86929560_86931154_86931278_86937817_86937959_86939194_86939348_86940977_86941129_86941417_86941505_86948701_86948867_86958880
tx.1964	chr10	-	2288	4	Intergenic	novelGene_110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGATTAAGATTTATTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111213536	111207623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_111209451_111210511_111210577_111211615_111211745_111213269
tx.19640	chr9	-	1296	6	ISM	ENSMUSG00000056919.10	ENSMUST00000144137.2	3131	12	-38	17965	-38	-17965	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_2	7.17216843081644	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGTTTGATCTAGCTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87137379	87125738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_87126399_87128201_87128386_87128668_87128816_87130427_87130552_87135984_87136102_87137315
tx.19642	chr9	-	3098	28	FSM	ENSMUSG00000032422.19	ENSMUST00000165315.9	3109	28	10	1	10	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	141	junction_13	28.9754164757839	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCTTTTGTATTTACTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88320994	88258803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_88258993_88261562_88261620_88262222_88262315_88263534_88263631_88263772_88263938_88264130_88264255_88265811_88265932_88266022_88266064_88267772_88267885_88269263_88269365_88273814_88273899_88276419_88276622_88280291_88280425_88283972_88284032_88284196_88284322_88285317_88285474_88286356_88286472_88286563_88286645_88286751_88286797_88287292_88287369_88289378_88289536_88292610_88292696_88295533_88295622_88297724_88297769_88302303_88302383_88302801_88302879_88304950_88305072_88320720
tx.19643	chr9	-	2167	12	FSM	ENSMUSG00000032423.13	ENSMUST00000069221.12	9450	12	354	6929	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	723	junction_1	80.8280493004688	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTCTAAGTAGATTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88364258	88335990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_88336349_88338415_88338783_88343722_88343845_88344288_88344439_88345007_88345214_88346700_88346837_88358841_88359019_88359126_88359241_88361623_88361732_88361846_88361966_88362658_88362819_88364108
tx.19644	chr9	-	508	2	ISM	ENSMUSG00000092541.8	ENSMUST00000154586.3	547	4	-16	33311	-16	-33311	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCTCTAAGTAGATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88338570	88335992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_88336346_88338415
tx.19645	chr9	-	512	2	ISM	ENSMUSG00000032423.13	ENSMUST00000172828.8	1925	11	25631	2	24226	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	723	junction_1	0	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCTCTAAGTAGATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88338571	88335992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_88336349_88338415
tx.19646	chr9	-	1002	5	FSM	ENSMUSG00000097195.11	ENSMUST00000239369.2	1678	5	674	2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	405	junction_2	300.420122495148	811	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTATTCAATTCTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88404941	88403104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_88403502_88403702_88403770_88403970_88404029_88404359_88404435_88404536
tx.19647	chr9	-	738	6	FSM	ENSMUSG00000097195.11	ENSMUST00000182232.9	826	6	86	2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	405	junction_2	292.278634183205	709	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTATTCAATTCTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88404941	88403104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_88403502_88403702_88403770_88403970_88404029_88404359_88404435_88404536_88404640_88404903
tx.19648	chr9	-	938	4	NIC	ENSMUSG00000097195.11	novel	809	6	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	461	junction_1	319.66545011934	647	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTATTCAATTCTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88404944	88403104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_88403502_88403970_88404029_88404359_88404435_88404536
tx.19649	chr9	-	674	5	NIC	ENSMUSG00000097195.11	novel	809	6	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	461	junction_1	309.579553588411	945	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTATTCAATTCTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88404944	88403104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_88403502_88403970_88404029_88404359_88404435_88404536_88404640_88404903
tx.1965	chr10	-	961	5	Intergenic	novelGene_111	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.08972473588517	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTACCCAATTGTACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111214140	111208873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_111209451_111210511_111210577_111211615_111211745_111213269_111213392_111214072
tx.19650	chr9	+	1207	6	FSM	ENSMUSG00000032425.16	ENSMUST00000162827.8	3472	6	56	2209	-9	669	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	5.88557558782486	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTGTGTATTGTAGAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88430128	88450905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_88430562_88434768_88434915_88436428_88436598_88449211_88449339_88449560_88449654_88450666
tx.19651	chr9	+	1248	6	NIC	ENSMUSG00000032425.16	novel	3472	6	NA	NA	3	668	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_1	4.17612260356422	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATTGTGTATTGTAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88430140	88450904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_88430562_88434714_88434915_88436428_88436598_88449211_88449339_88449560_88449654_88450666
tx.19652	chr9	-	800	4	FSM	ENSMUSG00000079427.11	ENSMUST00000186863.7	725	4	12	-87	-5	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	43	junction_3	219.136182924378	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAGAAATCAATAGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88601628	88570657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_88571039_88597540_88597803_88598546_88598617_88601541
tx.19653	chr9	-	730	3	NIC	ENSMUSG00000079427.11	novel	725	4	NA	NA	-5	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	156	junction_2	185.5	450	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAGAAATCAATAGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88601628	88570657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_88571039_88597540_88597803_88601541
tx.19654	chr9	-	783	3	FSM	ENSMUSG00000079427.11	ENSMUST00000113110.5	801	3	15	3	15	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	319	junction_2	104	650	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAGAAATCAATAGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88601851	88570657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_88571039_88597540_88597803_88601711
tx.19656	chr9	-	1005	5	FSM	ENSMUSG00000097177.9	ENSMUST00000181448.3	602	5	3	-406	-1	406	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	50.4746223363781	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGACAATGATTTCACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88740920	88738878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_88739637_88739866_88739925_88740278_88740354_88740442_88740498_88740861
tx.19657	chr9	-	984	4	ISM	ENSMUSG00000097177.9	ENSMUST00000181448.3	602	5	391	-409	322	409	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	53.7649204097492	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAATGATTTCACATACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88740532	88738875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_88739637_88739866_88739925_88740278_88740354_88740442
tx.19658	chr9	+	737	2	FSM	ENSMUSG00000102037.2	ENSMUST00000098485.4	819	2	80	2	80	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTTTCATGATTTCAGTT	5341	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88839032	88844470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_88839524_88844224
tx.19659	chr9	+	1010	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100602.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	8.87411967464942	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACAATAAATTCATGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88948959	88958301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_88949021_88949384_88949440_88949528_88949604_88957256_88957340_88957565
tx.1966	chr10	+	1443	15	NNC	ENSMUSG00000058799.17	novel	1486	16	NA	NA	15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	635.455597446848	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGATGCTGTCTCGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111309117	111332745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_111309213_111317140_111317178_111321359_111321446_111322504_111322608_111325888_111326031_111326237_111326319_111326869_111326999_111327947_111328020_111328702_111328843_111329157_111329315_111330031_111330155_111330655_111330686_111331185_111331237_111331900_111331967_111332614
tx.19660	chr9	+	1035	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100602.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	14.9059551857638	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGACAATGATTTCACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88948970	88958324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_88949021_88949384_88949440_88949528_88949604_88957243_88957340_88957565
tx.19661	chr9	+	1092	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100602.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.976086121365	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAATGATTTCACATACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88949022	88958327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_88949127_88949384_88949440_88949528_88949604_88957243_88957340_88957565
tx.19662	chr9	+	975	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100602.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	10.1980390271856	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAATGATTTCACATACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88949384	88958327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_88949440_88949528_88949604_88957256_88957340_88957565
tx.19663	chr9	+	987	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100602.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	17.1464281994822	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACAATGATTTCACATACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88949384	88958326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_88949440_88949528_88949604_88957243_88957340_88957565
tx.19664	chr9	+	783	3	FSM	ENSMUSG00000066442.18	ENSMUST00000085256.8	816	3	15	18	15	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	175	junction_1	109	260	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAGAAATCAATAGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89093224	89122275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_89093365_89097261_89097524_89121894
tx.19665	chr9	+	804	4	FSM	ENSMUSG00000066442.18	ENSMUST00000117314.8	705	4	8	-107	5	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	167.420296127905	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAGAAATCAATAGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89093443	89122275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_89093535_89096464_89096535_89097261_89097524_89121894
tx.19666	chr9	+	730	3	NIC	ENSMUSG00000066442.18	novel	1406	4	NA	NA	-5	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	83	junction_1	155	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTTAGAAATCAATAGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89093447	89122275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_89093535_89097261_89097524_89121894
tx.19667	chr9	-	1291	3	FSM	ENSMUSG00000032353.10	ENSMUST00000058488.9	1346	3	57	-2	57	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_1	7.5	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGGAGTGATGTGTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89587064	89581256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_89582033_89584824_89585074_89586798
tx.19668	chr9	+	1384	12	FSM	ENSMUSG00000032359.15	ENSMUST00000034915.15	1617	12	231	2	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3.46648653907957	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGGGCGTAGGTCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89936550	89958140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_89936688_89942531_89942564_89943571_89943678_89944769_89944841_89946205_89946311_89946559_89946647_89947444_89947501_89949079_89949162_89950457_89950527_89953871_89953979_89956920_89957047_89957734
tx.1967	chr10	+	2099	15	FSM	ENSMUSG00000058799.17	ENSMUST00000217908.2	1350	15	16	-765	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	980	junction_10	363.653962004586	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGATGCTGTCTCGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111309118	111332745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_111309213_111317140_111317178_111321359_111321446_111322504_111322608_111325888_111326031_111326237_111326319_111326869_111326999_111327947_111328020_111328702_111328843_111329157_111329304_111329410_111329431_111330031_111330155_111330655_111330686_111331185_111331237_111331900
tx.19670	chr9	-	1819	13	FSM	ENSMUSG00000062270.15	ENSMUST00000085248.12	1882	13	59	4	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	323	junction_10	2408.59367105002	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATTGTGTGGCCGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89996709	89973721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_89974456_89975786_89975872_89976407_89976581_89977173_89977263_89978555_89978658_89979424_89979514_89979916_89979943_89982495_89982577_89984352_89984440_89985707_89985825_89989287_89989356_89992178_89992226_89996588
tx.19671	chr9	-	1738	12	FSM	ENSMUSG00000062270.15	ENSMUST00000169860.8	1824	12	82	4	6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3415	junction_7	1167.30044572017	825	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATTGTGTGGCCGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89996745	89973721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_89974456_89975786_89975872_89976407_89976581_89977173_89977263_89978555_89978658_89979424_89979514_89979916_89979943_89982495_89982577_89984352_89984440_89989287_89989356_89992178_89992226_89996588
tx.19672	chr9	-	1442	9	ISM	ENSMUSG00000062270.15	ENSMUST00000187771.8	1540	10	11926	-1	-4474	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3415	junction_7	1272.84207091846	360	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGATTGTGTGGCCGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89984416	89973722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_89974456_89975786_89975872_89976407_89976581_89977173_89977263_89978555_89978658_89979424_89979514_89979916_89979943_89982495_89982577_89984352
tx.19673	chr9	-	913	4	NNC	ENSMUSG00000037410.14	novel	3473	3	NA	NA	26	17	intron_retention	FALSE	canonical	3	8	junction_1	32.9679979508749	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTTTGTATTGGAACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90152796	90120315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_90120514_90123062_90123232_90131843_90131998_90152404
tx.19675	chr9	+	1533	9	NNC	ENSMUSG00000032369.14	novel	2302	9	NA	NA	-116	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	108.353515748221	392	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTGATGTTACTTTACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92132278	92154034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_92132414_92140100_92140128_92141326_92141408_92145085_92145335_92146698_92146742_92148443_92148665_92148764_92148927_92151867_92152030_92153581
tx.19676	chr9	+	343	2	ISM	ENSMUSG00000032374.15	ENSMUST00000160359.2	3663	20	-2	37130	-2	-20394	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATGGATTCCACAGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92424314	92453343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_92424622_92453307
tx.19677	chr9	+	1872	6	ISM	ENSMUSG00000032374.15	ENSMUST00000160359.2	3663	20	60724	-8	1646	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	8.31865373723417	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGTGCCTCTCTGTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92485040	92490481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_92485115_92486831_92486898_92487425_92487531_92488560_92488708_92488816_92488943_92489127
tx.19678	chr9	-	3544	28	NNC	ENSMUSG00000032407.15	novel	3111	28	NA	NA	-1	1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_13	167.860448931548	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGTTGTTTTTTTGCCCA	8301	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95393939	95343029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_95343597_95344755_95344933_95346415_95346535_95348598_95348710_95354095_95354256_95356473_95356541_95357254_95357351_95358159_95358317_95359452_95359576_95361319_95361408_95363705_95363786_95364144_95364308_95366222_95366387_95366456_95366528_95367613_95367719_95370798_95370843_95371752_95371965_95372142_95372309_95373143_95373227_95373320_95373354_95373434_95373530_95374376_95374445_95375150_95375285_95375755_95375871_95377887_95377987_95382740_95382873_95384592_95384638_95393869
tx.19679	chr9	-	631	7	ISM	ENSMUSG00000032407.15	ENSMUST00000217176.2	3111	28	0	30950	0	753	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	575	junction_1	112.375363057132	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTGGAACTTTTCAAAGAA	8302	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95393938	95374407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_95374445_95375150_95375285_95375755_95375871_95377887_95377987_95382740_95382873_95384592_95384638_95393869
tx.1968	chr10	+	1478	16	FSM	ENSMUSG00000058799.17	ENSMUST00000065917.16	1486	16	8	0	4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	684	junction_15	463.449884621364	321	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGATGCTGTCTCGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111309091	111332745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_111309213_111317140_111317178_111321359_111321446_111322504_111322608_111325888_111326031_111326237_111326319_111326869_111326999_111327947_111328020_111328702_111328843_111329157_111329304_111329410_111329431_111330031_111330155_111330655_111330686_111331185_111331237_111331900_111331967_111332614
tx.19680	chr9	-	594	6	ISM	ENSMUSG00000032407.15	ENSMUST00000217176.2	3111	28	0	31693	0	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	752	junction_1	76.6237561073588	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTCATTCTTACATAAT	8302	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95393938	95375150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_95375285_95375755_95375871_95377887_95377987_95382740_95382873_95384592_95384638_95393869
tx.19682	chr9	+	1134	2	Intergenic	novelGene_1342	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATGCCTATTTGCATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95470404	95476144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_95470620_95475225
tx.19683	chr9	+	1754	9	FSM	ENSMUSG00000015354.9	ENSMUST00000015498.9	4438	9	138	2546	138	867	multi-exon	FALSE	canonical	3	281	junction_3	14.5982661641717	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGCAGCCAGATAACCTT	8513	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95519791	95577603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_95519927_95520704_95520814_95552057_95552314_95560397_95560523_95563585_95563723_95568738_95568894_95574913_95574998_95576676_95576845_95577018
tx.19684	chr9	+	1254	6	ISM	ENSMUSG00000015354.9	ENSMUST00000015498.9	4438	9	40742	2548	-1963	865	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	299	junction_5	9.35093578204877	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAGGCAGCCAGATAACC	355	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95560395	95577601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_95560523_95563585_95563723_95568738_95568894_95574913_95574998_95576676_95576845_95577018
tx.19685	chr9	-	3695	16	FSM	ENSMUSG00000049493.14	ENSMUST00000093800.9	3704	16	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_4	11.5231168623	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGTTTATTTCATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95727330	95634694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_95636491_95636713_95636839_95643365_95643490_95643986_95644121_95647743_95647859_95651146_95651226_95655570_95655767_95657360_95657457_95658518_95658662_95658741_95658908_95664422_95664505_95666152_95666286_95667542_95667673_95668985_95669150_95677814_95677920_95727223
tx.19687	chr9	+	373	3	NNC	ENSMUSG00000032409.16	novel	4597	23	NA	NA	-5988	-2784	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	11	junction_2	42.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGTGAATCTATAACATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95779728	95783307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_95779796_95781089_95781204_95783115
tx.19688	chr9	+	543	4	ISM	ENSMUSG00000032409.16	ENSMUST00000034980.9	8056	47	87812	-2	8239	2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	129	junction_1	9.7410927974683	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTAGTAATCTGAAATCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95827461	95833699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_95827551_95829142_95829295_95832597_95832704_95833503
tx.19689	chr9	+	451	3	ISM	ENSMUSG00000032409.16	ENSMUST00000034980.9	8056	47	89494	0	9921	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_1	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATTAGTAATCTGAAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95829143	95833697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_95829295_95832597_95832704_95833503
tx.1969	chr10	+	2092	14	NNC	ENSMUSG00000058799.17	novel	1486	16	NA	NA	14	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_10	580.414726241392	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGATGCTGTCTCGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111309116	111332745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_111309213_111317140_111317178_111321359_111321446_111322504_111322608_111325888_111326031_111326237_111326319_111326869_111326999_111327947_111328020_111328702_111328843_111329157_111329315_111330031_111330155_111330655_111330686_111331185_111331237_111331900
tx.19691	chr9	+	2898	12	ISM	ENSMUSG00000032410.14	ENSMUST00000189612.7	3357	21	-60	21037	5	1024	intron_retention	FALSE	canonical	3	43	junction_4	6.10243143521397	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTAAAGACTTTTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95836824	95861410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_95836997_95846023_95846257_95849764_95849863_95851285_95851396_95851499_95851611_95852781_95852865_95855331_95855420_95855502_95855672_95856448_95856517_95856814_95856953_95859582_95859650_95859849
tx.19692	chr9	+	442	3	ISM	ENSMUSG00000032410.14	ENSMUST00000189612.7	3357	21	-60	32646	5	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	2	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAGAAAAGGGAGAAACACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95836824	95849801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_95836997_95846023_95846257_95849764
tx.19693	chr9	+	1838	13	ISM	ENSMUSG00000032410.14	ENSMUST00000189612.7	3357	21	-92	20897	-20	1164	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_4	6.13901457890434	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATTATGAATAATAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95836792	95861550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_95836997_95846023_95846257_95849764_95849863_95851285_95851396_95851499_95851611_95852781_95852865_95855331_95855420_95855502_95855672_95856448_95856517_95856814_95856953_95859582_95859650_95859849_95859956_95861187
tx.19694	chr9	+	456	3	ISM	ENSMUSG00000032410.14	ENSMUST00000190665.2	3093	24	51968	-6	-10633	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_1	1.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAAATTTCTTTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95888882	95893924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_95888901_95893263_95893354_95893576
tx.19695	chr9	+	440	2	ISM	ENSMUSG00000032410.14	ENSMUST00000190665.2	3093	24	56347	-6	-6254	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAAATTTCTTTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95893261	95893924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_95893354_95893576
tx.19697	chr9	+	1912	8	NIC	ENSMUSG00000032411.16	novel	2213	10	NA	NA	-746	-92	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	217	junction_1	71.8658046469322	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTTGTCTATAGTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96169663	96200839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_96169776_96177017_96177181_96179679_96179824_96182424_96182494_96188852_96189005_96192574_96192742_96199529_96199636_96199840
tx.19698	chr9	+	618	3	ISM	ENSMUSG00000032411.16	ENSMUST00000189606.7	1340	10	51640	-42	-167	38	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	407	junction_1	14.5	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGTCTTTAGTGTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96192451	96200062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_96192742_96199529_96199636_96199840
tx.19699	chr9	-	1849	7	FSM	ENSMUSG00000032412.9	ENSMUST00000034983.7	1994	7	127	18	127	-18	multi-exon	FALSE	canonical	3	621	junction_2	81.5754592727222	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTCAAACTGATTTAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96246368	96214725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_96215748_96217431_96217516_96220711_96220763_96222254_96222440_96225320_96225429_96227817_96227947_96246098
tx.197	chr1	-	572	4	ISM	ENSMUSG00000101104.7	ENSMUST00000134195.3	521	6	-98	15321	-98	-15321	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	326	junction_3	17.2111075245674	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTCTGTTTTGTTACAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44150048	44146044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_44146265_44146924_44147033_44149153_44149244_44149894
tx.1970	chr10	+	1147	6	ISM	ENSMUSG00000058799.17	ENSMUST00000218828.2	3934	14	12748	1266	-539	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	980	junction_1	408.770351175327	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGATGCTGTCTCGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111329225	111332745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_111329304_111329410_111329431_111330031_111330155_111330655_111330686_111331185_111331237_111331900
tx.19700	chr9	-	1178	3	FSM	ENSMUSG00000051234.7	ENSMUST00000057500.6	1232	3	50	4	-15	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1085	junction_1	10	1500	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATATGCTCTTTATTTGG	3763	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96360678	96352993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_96353906_96356010_96356059_96360460
tx.19701	chr9	-	838	8	NNC	ENSMUSG00000032413.13	novel	5813	24	NA	NA	7	-7967	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_1	17.5324771524745	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTAGTCTTTTTTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96513582	96461907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_96462029_96462539_96462613_96464795_96464880_96474002_96474080_96484765_96484861_96488145_96488250_96493434_96493553_96513416
tx.19702	chr9	-	1074	6	ISM	ENSMUSG00000032413.13	ENSMUST00000034984.8	5813	24	80	43021	-1	-10433	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_3	6.79411510058521	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATCATATACACCTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96513590	96464373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_96464880_96474002_96474080_96484765_96484861_96488145_96488250_96493434_96493553_96513416
tx.19705	chr9	+	580	2	Intergenic	novelGene_1343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAACTTAGTCTCATCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96682660	96686380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_96682809_96685948
tx.19707	chr9	-	2918	6	FSM	ENSMUSG00000043587.16	ENSMUST00000078478.8	2908	6	-2	-8	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	3.9293765408777	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTTACGGTGTGTATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96771484	96705388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_96707676_96710982_96711123_96721138_96721266_96722011_96722171_96738420_96738553_96771411
tx.19708	chr9	-	2505	8	NNC	ENSMUSG00000032449.14	novel	1203	8	NA	NA	29	1160	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	212	junction_4	351.164593073635	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGTGCAATGGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96993181	96959809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_96961293_96962245_96962536_96967109_96967177_96971543_96971647_96975129_96975231_96979155_96979234_96982127_96982293_96992963
tx.19709	chr9	-	2414	7	FSM	ENSMUSG00000032449.14	ENSMUST00000085206.11	5227	7	17	2796	17	1160	multi-exon	FALSE	canonical	3	263	junction_3	363.380272197353	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGTGCAATGGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96993193	96959809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_96961293_96962245_96962536_96967109_96967177_96975129_96975231_96979155_96979234_96982127_96982293_96992963
tx.1971	chr10	+	499	7	ISM	ENSMUSG00000058799.17	ENSMUST00000065917.16	1486	16	20142	0	-539	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	684	junction_6	509.790697792296	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGATGCTGTCTCGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111329225	111332745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_111329304_111329410_111329431_111330031_111330155_111330655_111330686_111331185_111331237_111331900_111331967_111332614
tx.19710	chr9	-	1243	6	ISM	ENSMUSG00000032449.14	ENSMUST00000085206.11	5227	7	29	4908	29	324	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	263	junction_2	330.679542760056	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATAGTAGTTTTAAGTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96993181	96961921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_96962536_96967109_96967177_96975129_96975231_96979155_96979234_96982127_96982293_96992963
tx.19711	chr9	-	730	4	FSM	ENSMUSG00000032449.14	ENSMUST00000148337.2	685	4	-143	98	27	-98	multi-exon	FALSE	canonical	3	669	junction_1	32.124756808418	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATGTGTCTCAGGGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96993183	96974963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_96975231_96979155_96979234_96982127_96982293_96992963
tx.19712	chr9	-	1757	3	ISM	ENSMUSG00000032449.14	ENSMUST00000148337.2	685	4	10747	-1148	-20	1148	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	669	junction_1	39	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTTGATGTTAGTGTAA	1948	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96982293	96973717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_96975231_96979155_96979234_96982127
tx.19713	chr9	-	477	3	ISM	ENSMUSG00000032449.14	ENSMUST00000148337.2	685	4	-143	4276	27	2214	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	717	junction_2	15	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAATAAGTAAGATTCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96993183	96979141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_96979234_96982127_96982293_96992963
tx.19714	chr9	+	608	2	Intergenic	novelGene_1344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTGACAGGTTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97157788	97163946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_97157969_97163518
tx.19715	chr9	+	771	4	FSM	ENSMUSG00000046402.11	ENSMUST00000052068.11	2652	4	1859	22	1859	-22	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_1	8.01387685344754	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGTTTTGGAGGAATTT	4744	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98306872	98328606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_98307105_98307505_98307685_98326642_98326745_98328348
tx.19716	chr9	+	313	2	ISM	ENSMUSG00000046402.11	ENSMUST00000052068.11	2652	4	21676	22	21676	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	115	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGTTTTGGAGGAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98326689	98328606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_98326745_98328348
tx.19718	chr9	+	3064	22	FSM	ENSMUSG00000032458.7	ENSMUST00000035033.7	3050	22	-14	0	-4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	669	junction_10	53.4673910412871	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTCTTGAGTTTCCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98445769	98470435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_98445877_98450045_98450184_98452358_98452446_98452635_98452763_98453546_98453696_98455487_98455635_98456118_98456219_98459010_98459154_98459380_98459581_98461033_98461145_98462134_98462224_98462310_98462418_98463187_98463332_98464324_98464456_98464742_98464951_98467035_98467147_98467984_98468200_98469092_98469186_98469277_98469459_98469604_98469674_98469813_98469883_98470097
tx.19719	chr9	+	2144	15	ISM	ENSMUSG00000032458.7	ENSMUST00000035033.7	3050	22	13292	0	-2928	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	669	junction_3	61.8683592602149	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTCTTGAGTTTCCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98459075	98470435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_98459154_98459380_98459581_98461033_98461145_98462134_98462224_98462310_98462418_98463187_98463332_98464324_98464456_98464742_98464951_98467035_98467147_98467984_98468200_98469092_98469186_98469277_98469459_98469604_98469674_98469813_98469883_98470097
tx.1972	chr10	+	1640	2	FSM	ENSMUSG00000020205.9	ENSMUST00000164773.2	1949	2	104	205	104	-205	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAGAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111342250	111344301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_111343510_111343920
tx.19720	chr9	-	1201	8	FSM	ENSMUSG00000032459.10	ENSMUST00000035034.10	1197	8	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	442	junction_2	42.1929484387994	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTCTGTAATTCGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98483717	98470782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_98470980_98472087_98472197_98474607_98474754_98476125_98476210_98476722_98476867_98478872_98479038_98480187_98480352_98483525
tx.19721	chr9	-	740	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000091080.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTGGGGTATGCTGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98725345	98723319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_98723530_98724815
tx.19722	chr9	+	1014	5	FSM	ENSMUSG00000032463.11	ENSMUST00000035038.8	1019	5	3	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_2	16.8430252627015	339	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGGTGGGTTTGGTTTCA	3547	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98868428	98884072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_98868566_98874153_98874287_98874565_98874795_98881019_98881070_98883607
tx.19723	chr9	+	1064	6	FSM	ENSMUSG00000032463.11	ENSMUST00000112911.9	803	6	9	-270	9	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	126.927695953247	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGGTGGGTTTGGTTTCA	3554	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98868435	98884072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_98868566_98872967_98873025_98874153_98874287_98874565_98874795_98881019_98881070_98883607
tx.19724	chr9	-	1346	5	FSM	ENSMUSG00000096316.8	ENSMUST00000178051.8	785	5	28	-589	28	589	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	2.6809513236909	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCCTTTATTTTATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99119264	99110839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_99111671_99114500_99114551_99116351_99116581_99118292_99118411_99119146
tx.19726	chr9	+	880	5	ISM	ENSMUSG00000056267.15	ENSMUST00000190715.7	1768	6	-46	1613	-27	249	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	228	junction_1	61.0384100382702	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGTAGATATGACTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99125467	99145368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_99125544_99128319_99128420_99136307_99136431_99144598_99144690_99144878
tx.19727	chr9	+	719	6	FSM	ENSMUSG00000056267.15	ENSMUST00000190715.7	1768	6	-26	1075	-7	91	multi-exon	FALSE	canonical	3	228	junction_1	56.4361586219332	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTGGAACAGTTCATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99125487	99145906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_99125544_99128319_99128420_99136307_99136431_99144598_99144690_99144878_99145003_99145681
tx.19728	chr9	+	1831	6	FSM	ENSMUSG00000056267.15	ENSMUST00000185799.7	740	6	68	-1159	-7	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	66	junction_1	121.109867475776	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCCCAAGGTGTTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99125487	99146974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_99125544_99128275_99128420_99136307_99136431_99144598_99144690_99144878_99145003_99145681
tx.19729	chr9	+	2613	18	FSM	ENSMUSG00000056267.15	ENSMUST00000093795.10	2606	18	-7	0	-7	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	165	junction_10	72.0150887688172	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTAAGTGTCCCTAGTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99125487	99182457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_99125544_99128319_99128420_99136307_99136431_99144598_99144690_99144878_99145003_99145681_99145863_99157630_99157801_99159441_99159499_99159989_99160072_99160162_99160252_99163080_99163156_99171248_99171355_99173577_99173749_99178079_99178227_99178328_99178498_99179631_99179747_99180555_99180636_99181780
tx.1973	chr10	+	2603	10	FSM	ENSMUSG00000063334.17	ENSMUST00000163048.8	5023	10	106	2314	-5	-776	multi-exon	FALSE	canonical	3	311	junction_6	38.1443004172444	321	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAGTAGTTTGTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111808674	111822023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_111808780_111811389_111811563_111812646_111812782_111813016_111813143_111813219_111813304_111814995_111815053_111815791_111815963_111818705_111818784_111818868_111818963_111820443
tx.19730	chr9	-	1389	6	NIC	ENSMUSG00000032470.18	novel	4701	6	NA	NA	-241	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	96	junction_5	168.084978507896	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCGAAGCCCCAAGTCTTT	2309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99302446	99270026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_99270558_99271785_99271866_99274998_99275099_99276521_99276676_99293445_99293656_99302132
tx.19731	chr9	-	1312	6	FSM	ENSMUSG00000032470.18	ENSMUST00000035045.15	4701	6	834	2555	379	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	447	junction_5	30.9644957976067	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCGAAGCCCCAAGTCTT	4073	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99318600	99270027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_99270558_99271785_99271866_99274998_99275099_99276521_99276676_99293445_99293656_99318362
tx.19732	chr9	-	1373	6	FSM	ENSMUSG00000032470.18	ENSMUST00000122384.9	1167	6	-253	47	202	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_5	190.404411713594	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCGAAGCCCCAAGTCTT	3441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99319232	99270027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_99270558_99271785_99271866_99274998_99275099_99276521_99276676_99293445_99293656_99318933
tx.19734	chr9	-	2838	12	FSM	ENSMUSG00000032468.12	ENSMUST00000185524.7	2820	12	-21	3	-3	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	193	junction_11	21.8011297000487	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATAGTTTTTATGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99450723	99400859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_99402636_99405191_99405393_99407405_99407467_99408943_99409035_99409131_99409208_99411383_99411465_99415150_99415244_99417847_99417946_99418215_99418359_99419740_99419813_99433595_99433673_99450654
tx.19739	chr9	-	1757	4	FSM	ENSMUSG00000032475.16	ENSMUST00000116522.8	4476	4	9	2710	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_2	6.34209919681348	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCAGATATTGCATCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100428178	100377055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_100377725_100379310_100380024_100390481_100390726_100428047
tx.1974	chr10	-	3080	16	ISM	ENSMUSG00000020130.10	ENSMUST00000020339.10	3752	17	10518	588	10304	-588	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	412	junction_10	39.7617348157189	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTAGTGTTTTCAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115076854	115034364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_115035670_115038408_115038496_115039022_115039140_115044801_115044900_115045461_115045562_115046100_115046202_115048595_115048713_115053466_115053562_115054455_115054560_115055056_115055186_115056115_115056314_115057487_115057591_115065029_115065241_115069024_115069164_115075176_115075252_115076753
tx.19741	chr9	+	390	3	FSM	ENSMUSG00000037286.16	ENSMUST00000144005.8	558	3	-24	192	-11	-173	multi-exon	FALSE	canonical	3	414	junction_1	2	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGGGTCGTCCTGGCCGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100525641	100594570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_100525850_100587205_100587308_100594490
tx.19744	chr9	-	1020	3	ISM	ENSMUSG00000032527.14	ENSMUST00000149322.8	2188	14	49601	4	333	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATACTTGGGTGTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100867329	100864088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_100864860_100866425_100866526_100867180
tx.19748	chr9	+	399	3	FSM	ENSMUSG00000035048.14	ENSMUST00000190279.7	589	3	7	183	7	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1105	junction_1	209.5	2839	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCCCACTTGGTTTTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102503501	102511441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_102503546_102506961_102507088_102511212
tx.19749	chr9	+	356	2	ISM	ENSMUSG00000035048.14	ENSMUST00000186693.2	595	3	3083	0	1250	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1524	junction_1	0	538	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCCCACTTGGTTTTCGT	878	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102506960	102511441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_102507088_102511212
tx.1975	chr10	-	3135	17	FSM	ENSMUSG00000020130.10	ENSMUST00000020339.10	3752	17	29	588	29	-588	multi-exon	FALSE	canonical	3	391	junction_16	42.5718143259129	215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTAGTGTTTTCAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115087343	115034364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_115035670_115038408_115038496_115039022_115039140_115044801_115044900_115045461_115045562_115046100_115046202_115048595_115048713_115053466_115053562_115054455_115054560_115055056_115055186_115056115_115056314_115057487_115057591_115065029_115065241_115069024_115069164_115075176_115075252_115076753_115076853_115087286
tx.19751	chr9	+	935	5	ISM	ENSMUSG00000032547.13	ENSMUST00000175883.8	2505	15	62308	275	-1330	-275	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	364	junction_1	29.029080247228	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATTTGGAATAGCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102774423	102784466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_102774534_102775657_102775768_102775889_102776050_102783235_102783373_102784048
tx.19752	chr9	+	716	3	ISM	ENSMUSG00000032547.13	ENSMUST00000175883.8	2505	15	63775	273	137	-273	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	399	junction_2	18	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGGAATAGCTGTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102775890	102784468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_102776050_102783235_102783373_102784048
tx.19753	chr9	+	1078	8	FSM	ENSMUSG00000032549.8	ENSMUST00000035155.8	5007	8	232	3697	232	-3697	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_5	2.35606035749581	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTGCTTTTTTGTTTGTT	465	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102989237	103058778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_102989426_103017580_103017640_103038018_103038073_103038262_103038369_103039740_103039853_103041008_103041103_103044304_103044372_103058380
tx.19754	chr9	+	700	5	ISM	ENSMUSG00000032549.8	ENSMUST00000035155.8	5007	8	49334	3697	49334	-3697	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	2.69258240356725	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTGCTTTTTTGTTTGTT	6870	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103038339	103058778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_103038369_103039740_103039853_103041008_103041103_103044304_103044372_103058380
tx.19755	chr9	+	540	3	ISM	ENSMUSG00000032549.8	ENSMUST00000035155.8	5007	8	52026	3693	52026	-3693	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTTTTTGTTTGTTTGTT	9562	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103041031	103058782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_103041103_103044304_103044372_103058380
tx.19756	chr9	-	1855	8	NNC	ENSMUSG00000032553.15	novel	3064	7	NA	NA	0	3	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	97.1596624119289	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTGAGTCAAATGATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103079328	103066285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_103066696_103066841_103067621_103068267_103068323_103069411_103069549_103074736_103074820_103075987_103076066_103078485_103078581_103079110
tx.19757	chr9	-	1751	8	NNC	ENSMUSG00000032553.15	novel	3064	7	NA	NA	0	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	97.1596624119289	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACTGAAAGCATTGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103079328	103066295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_103066653_103066892_103067621_103068267_103068323_103069411_103069549_103074736_103074820_103075987_103076066_103078485_103078581_103079110
tx.19758	chr9	-	1743	8	NNC	ENSMUSG00000032553.15	novel	3064	7	NA	NA	0	-11	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	97.1596624119289	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTATACTGAAAGCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103079328	103066299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_103066696_103066939_103067621_103068267_103068323_103069411_103069549_103074736_103074820_103075987_103076066_103078485_103078581_103079110
tx.19759	chr9	-	978	7	FSM	ENSMUSG00000032553.15	ENSMUST00000035157.10	3064	7	13	2073	5	296	multi-exon	FALSE	canonical	3	242	junction_6	16.5873110807294	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTCTTGAGTTCTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103079323	103067303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_103067621_103068267_103068323_103069411_103069549_103074736_103074820_103075987_103076066_103078485_103078581_103079110
tx.1976	chr10	-	1276	7	FSM	ENSMUSG00000020132.11	ENSMUST00000020343.9	4602	7	260	3066	260	-3066	multi-exon	FALSE	canonical	3	420	junction_4	15.542057635833	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTGTGAGGTGAATTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115151236	115126054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_115126817_115130775_115130865_115131333_115131389_115134732_115134797_115137427_115137536_115138636_115138697_115151098
tx.19760	chr9	+	2339	13	ISM	ENSMUSG00000032555.11	ENSMUST00000035164.10	5224	28	27751	0	237	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	578	junction_2	52.5422449082641	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTATTGATTTGTTCATTT	1275	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103210164	103227627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_103210254_103211254_103211379_103213010_103213158_103213262_103213366_103215378_103215572_103219126_103219348_103220746_103220896_103221123_103221236_103221989_103222154_103222940_103223079_103223882_103223973_103224125_103224288_103226980
tx.19761	chr9	+	2253	12	ISM	ENSMUSG00000032555.11	ENSMUST00000035164.10	5224	28	28838	0	1324	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	578	junction_1	51.941002768478	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTATTGATTTGTTCATTT	2362	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103211251	103227627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_103211379_103213010_103213158_103213262_103213366_103215378_103215572_103219126_103219348_103220746_103220896_103221123_103221236_103221989_103222154_103222940_103223079_103223882_103223973_103224125_103224288_103226980
tx.19762	chr9	-	694	5	FSM	ENSMUSG00000032803.16	ENSMUST00000072249.13	3787	5	337	2756	-74	60	multi-exon	FALSE	canonical	3	423	junction_1	33.7740654941036	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAGAGCACAGCTGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103242400	103233062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_103233229_103233478_103233639_103237074_103237218_103241173_103241251_103242252
tx.19764	chr9	-	352	3	ISM	ENSMUSG00000032803.16	ENSMUST00000116517.9	3741	5	4936	2820	4936	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	423	junction_1	47	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGCATCAGATGGAAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103237160	103233122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_103233229_103233478_103233639_103237074
tx.19765	chr9	-	809	2	FSM	ENSMUSG00000042757.17	ENSMUST00000186455.3	1591	2	-41	823	-2	-823	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAAGTTCAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103639030	103629434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_103630167_103638953
tx.19766	chr9	-	1491	12	FSM	ENSMUSG00000032557.14	ENSMUST00000035166.12	2404	12	17	896	17	155	multi-exon	FALSE	canonical	3	388	junction_1	40.2171790110061	191	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGAGTTGTTATGCTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103940316	103924693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_103924886_103926432_103926540_103926721_103926801_103927033_103927170_103931261_103931390_103931552_103931658_103932388_103932474_103933001_103933089_103934072_103934183_103937416_103937507_103937592_103937639_103939990
tx.19768	chr9	-	822	4	FSM	ENSMUSG00000032560.15	ENSMUST00000189299.2	568	4	-40	-214	-13	214	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_2	8.9566858950296	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAAACTGTAGACTCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104140142	104114505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_104114926_104115663_104115740_104123958_104124040_104139897
tx.19769	chr9	+	1519	10	FSM	ENSMUSG00000032563.17	ENSMUST00000035177.15	3972	10	29	2424	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	494	junction_1	31.6489229040682	301	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTGGTTGTGAAACAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104930466	104954663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_104930712_104931619_104931805_104932793_104932886_104934223_104934323_104939097_104939198_104941262_104941324_104948574_104948684_104950973_104951052_104952360_104952439_104954191
tx.1977	chr10	-	1322	7	FSM	ENSMUSG00000069520.7	ENSMUST00000092170.7	3012	7	33	1657	-3	1344	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_6	17.9017379665278	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCTCCCGTGTTCCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115198139	115178303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_115178575_115179602_115179813_115182936_115183192_115183550_115183689_115195558_115195673_115197713_115197865_115197956
tx.19770	chr9	-	1612	3	FSM	ENSMUSG00000032565.10	ENSMUST00000035179.9	1631	3	18	1	13	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	2	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCAGCTGTCTGGCTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105009005	105006531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_105007710_105008491_105008762_105008841
tx.19771	chr9	+	2548	6	NIC	ENSMUSG00000032567.17	novel	2349	6	NA	NA	-25	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	20	junction_4	18.4932420089069	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTATTTATTTATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105272565	105282666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_105272865_105273743_105275058_105278674_105278886_105279916_105279976_105280594_105280791_105282197
tx.19772	chr9	+	2489	5	FSM	ENSMUSG00000032567.17	ENSMUST00000035181.10	2755	5	-25	291	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_3	8.45576726264388	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTATTTATTTATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105272565	105282666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_105272865_105273743_105275058_105278674_105278886_105280594_105280791_105282197
tx.19773	chr9	+	2675	5	NIC	ENSMUSG00000032567.17	novel	2755	5	NA	NA	-23	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	19	junction_1	18.0138835346518	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTCTGTATTTATTTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105272567	105282665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_105273054_105273743_105275058_105278674_105278886_105280594_105280791_105282197
tx.19774	chr9	-	2118	11	ISM	ENSMUSG00000032570.18	ENSMUST00000112557.9	1514	12	1485	-744	1485	744	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	384	junction_10	34.7708211004572	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTTGTCATTTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105312298	105289377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_105290389_105291832_105291975_105295248_105295345_105295742_105295891_105297380_105297498_105298772_105298842_105300141_105300309_105301368_105301420_105308693_105308792_105309852_105310024_105312250
tx.19775	chr9	-	1192	2	ISM	ENSMUSG00000032570.18	ENSMUST00000177334.2	578	5	-47	4601	-47	-146	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	437	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCTCCCAGTCTCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105371910	105346451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_105347347_105371613
tx.19776	chr9	-	477	2	ISM	ENSMUSG00000032570.18	ENSMUST00000176787.2	1449	4	-79	25306	-51	-25306	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	385	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGCCCCTGGCAGATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105372383	105371611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_105371797_105372091
tx.19777	chr9	-	1124	7	ISM	ENSMUSG00000020253.16	ENSMUST00000076258.13	1811	10	1637	3	-417	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	111	junction_3	12.8937969582276	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTCTTTTCTCTCTCTT	5813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106074504	106072152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_106072670_106072985_106073138_106073248_106073357_106073566_106073631_106073791_106073911_106074002_106074088_106074425
tx.19778	chr9	-	780	3	ISM	ENSMUSG00000020253.16	ENSMUST00000076258.13	1811	10	2784	1	730	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_2	1	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCTTTTCTCTCTCTTTT	6960	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106073357	106072150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_106072670_106072985_106073138_106073248
tx.19779	chr9	+	1578	9	FSM	ENSMUSG00000023277.14	ENSMUST00000024047.12	1596	9	18	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	299	junction_8	33.0111250186963	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGAGCCTGGGTGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106080324	106092588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106080484_106084087_106084166_106088917_106089097_106089454_106089551_106089930_106090036_106090136_106090263_106091299_106091451_106091554_106091677_106092026
tx.1978	chr10	-	1261	7	NIC	ENSMUSG00000069520.7	novel	2799	7	NA	NA	-7	1344	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_6	71.1213751273132	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCTCCCGTGTTCCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115198413	115178303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_115178575_115179602_115179813_115182936_115183192_115183550_115183689_115195558_115195673_115197713_115197865_115198291
tx.19780	chr9	+	1481	7	ISM	ENSMUSG00000023277.14	ENSMUST00000188650.2	1508	8	4781	-2	-140	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	299	junction_6	32.8705372974374	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGAGCCTGGGTGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106088777	106092588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_106089097_106089454_106089551_106089930_106090036_106090136_106090263_106091299_106091451_106091554_106091677_106092026
tx.19781	chr9	+	1235	6	FSM	ENSMUSG00000023277.14	ENSMUST00000217523.2	819	6	-6	-410	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	299	junction_5	34.8906864363543	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGAGCCTGGGTGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106089381	106092588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106089551_106089930_106090036_106090136_106090263_106091299_106091451_106091554_106091677_106092026
tx.19782	chr9	-	2184	11	FSM	ENSMUSG00000032786.17	ENSMUST00000141118.9	3399	11	746	469	-38	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	139	junction_7	18.0612845611822	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATAGTCCTGGTTAGTGTG	8524	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106125107	106111125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_106111397_106112586_106112750_106113638_106113908_106115273_106115439_106115841_106116022_106116730_106116916_106118314_106118538_106118834_106118985_106120360_106120595_106123957_106124178_106124983
tx.19784	chr9	+	1410	11	FSM	ENSMUSG00000023345.18	ENSMUST00000072206.14	2337	11	287	640	-32	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	282	junction_9	19.0265603827912	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACATCTTACCCAGTCTG	9844	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106158546	106227080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106158656_106160050_106160136_106162079_106162252_106162591_106162772_106163978_106164087_106165189_106165306_106172339_106172474_106182463_106182533_106185139_106185233_106207071_106207216_106226880
tx.19785	chr9	+	749	4	FSM	ENSMUSG00000048758.15	ENSMUST00000150576.8	733	4	-16	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2142	junction_1	1217.38161642108	1373	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTGTCTGTTGTCATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106306636	106308767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106306776_106307168_106307214_106307506_106307572_106308267
tx.19786	chr9	+	1018	3	FSM	ENSMUSG00000048758.15	ENSMUST00000213448.2	845	3	7	-180	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3966	junction_1	565.5	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTGTCTGTTGTCATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106306760	106308767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106307214_106307506_106307572_106308267
tx.19787	chr9	+	857	4	FSM	ENSMUSG00000048758.15	ENSMUST00000217081.2	466	4	5	-396	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	2158.78427721613	238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTGTCTGTTGTCATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106306765	106308767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106307013_106307168_106307214_106307506_106307572_106308267
tx.19788	chr9	-	1430	15	FSM	ENSMUSG00000023262.14	ENSMUST00000024031.13	1529	15	90	9	-27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	198	junction_14	78.143510052117	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCTTAATACTGTGGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106315428	106310188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_106310445_106310560_106310622_106310765_106310846_106311728_106311798_106311883_106312029_106312163_106312214_106312294_106312369_106312666_106312724_106312813_106312904_106312982_106313060_106313324_106313420_106313894_106314000_106314087_106314153_106314827_106314937_106315331
tx.19789	chr9	-	1429	15	NIC	ENSMUSG00000023262.14	novel	1529	15	NA	NA	-30	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	284	junction_14	59.3909565025326	254	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCTTAATACTGTGGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106315431	106310188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_106310445_106310560_106310622_106310765_106310846_106311728_106311798_106311883_106312029_106312163_106312214_106312294_106312369_106312666_106312724_106312813_106312904_106312982_106313060_106313324_106313420_106313894_106314000_106314087_106314153_106314827_106314933_106315331
tx.1979	chr10	-	1414	6	FSM	ENSMUSG00000069520.7	ENSMUST00000217887.2	3084	6	13	1657	-3	1344	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_4	16.3291151015602	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCTCCCGTGTTCCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115198139	115178303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_115178575_115179602_115179813_115182936_115183192_115183550_115183689_115195558_115195673_115197713
tx.19790	chr9	-	1253	7	NNC	ENSMUSG00000042210.18	novel	1256	7	NA	NA	15	1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	104.893067242576	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGACGTTGTGTTTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106324862	106317251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_106317604_106317819_106318056_106321021_106321142_106321288_106321506_106322724_106322856_106322969_106323034_106324729
tx.19791	chr9	+	1480	4	FSM	ENSMUSG00000042073.16	ENSMUST00000048527.15	1745	4	265	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.4142135623731	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCTTTTGCTGTCTCCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106325838	106330122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106325909_106327202_106327431_106328591_106328834_106329182
tx.19792	chr9	+	2035	13	FSM	ENSMUSG00000023495.14	ENSMUST00000024260.14	2035	13	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_11	32.902212016148	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTGCAGTAATACTAGTG	1600	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106331040	106341211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106331207_106337203_106337349_106337474_106337499_106337595_106337629_106337849_106337967_106338191_106338324_106338463_106338593_106339047_106339123_106339267_106339313_106339387_106339452_106339560_106339614_106339706_106339877_106340329
tx.19793	chr9	+	2033	12	NNC	ENSMUSG00000023495.14	novel	2035	13	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	107.339193584351	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTGCAGTAATACTAGTG	1603	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106331043	106341211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_106331207_106337203_106337349_106337570_106337629_106337849_106337967_106338191_106338324_106338463_106338593_106339047_106339123_106339267_106339313_106339387_106339452_106339560_106339614_106339706_106339877_106340329
tx.19794	chr9	+	1563	15	FSM	ENSMUSG00000041506.16	ENSMUST00000047721.10	1586	15	21	2	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1203	junction_11	74.9465115388084	1155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCCCTTGTTCCTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106354488	106362621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106354634_106354869_106354953_106357894_106358005_106358354_106358423_106358511_106358554_106358958_106359086_106360110_106360236_106360317_106360411_106360755_106360857_106360945_106361081_106361164_106361228_106361409_106361556_106361638_106361719_106362275_106362350_106362450
tx.19795	chr9	+	1387	14	ISM	ENSMUSG00000041506.16	ENSMUST00000047721.10	1586	15	433	2	-23	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1203	junction_10	72.9335435526612	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCCCTTGTTCCTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106354900	106362621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_106354953_106357894_106358005_106358354_106358423_106358511_106358554_106358958_106359086_106360110_106360236_106360317_106360411_106360755_106360857_106360945_106361081_106361164_106361228_106361409_106361556_106361638_106361719_106362275_106362350_106362450
tx.19796	chr9	+	604	6	ISM	ENSMUSG00000041506.16	ENSMUST00000125630.8	1611	14	6491	-3	-45	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1203	junction_2	92.9201808005129	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTCTCCCTTGTTCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106361007	106362618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_106361081_106361164_106361228_106361409_106361556_106361638_106361719_106362275_106362350_106362450
tx.19797	chr9	+	237	2	FSM	ENSMUSG00000041506.16	ENSMUST00000131618.2	860	2	621	2	621	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1473	junction_1	0	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCCCTTGTTCCTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106362283	106362621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_106362350_106362450
tx.19798	chr9	+	640	2	NNC	ENSMUSG00000066382.5	novel	551	2	NA	NA	-2240	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCCGTATTCTCTGCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106389531	106393203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_106389717_106392748
tx.19799	chr9	-	1282	3	ISM	ENSMUSG00000023192.13	ENSMUST00000201681.2	2111	7	8389	-351	410	351	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_2	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGTTTTGTTAAAAAAAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106524892	106521732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_106522291_106522495_106522677_106524349
tx.198	chr1	-	2008	10	FSM	ENSMUSG00000026047.14	ENSMUST00000065767.9	2359	10	12	339	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	275	junction_6	34.7545183135931	310	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTCTGTTTTGTTACAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44157956	44146044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_44146265_44146924_44147033_44149153_44149244_44149894_44150105_44151804_44152043_44152162_44152336_44153600_44153679_44153853_44154060_44156197_44156404_44157477
tx.1980	chr10	-	1608	3	FSM	ENSMUSG00000020137.6	ENSMUST00000218842.2	4970	3	-317	3679	-309	-2611	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	6.5	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAAGGTTTGTTTCTTTGTTT	2051	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115220657	115207987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_115208852_115212256_115212453_115220109
tx.19800	chr9	-	1419	6	FSM	ENSMUSG00000040813.17	ENSMUST00000046735.11	1391	6	-22	-6	-10	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	285	junction_5	67.9187750183997	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGAGTTGGTTTTTGTCTG	7858	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106563136	106535944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_106536507_106539558_106539728_106550715_106550938_106559066_106559363_106562127_106562195_106563033
tx.19801	chr9	-	924	3	ISM	ENSMUSG00000040813.17	ENSMUST00000169068.8	1364	6	11971	2	-9754	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	459	junction_1	9.5	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTGAGTTGGTTTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106550910	106535946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_106536507_106539558_106539728_106550715
tx.19802	chr9	-	1582	6	FSM	ENSMUSG00000040813.17	ENSMUST00000169068.8	1364	6	-220	2	1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_5	120.179865202121	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTGAGTTGGTTTTTGTC	7893	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106563101	106535946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_106536507_106539558_106539728_106550715_106550938_106559066_106559363_106562127_106562195_106562833
tx.19803	chr9	-	279	3	ISM	ENSMUSG00000040813.17	ENSMUST00000046735.11	1391	6	-29	23310	-17	2867	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	285	junction_2	69	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCTTTGCTGGTTATTCA	7851	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106563143	106559260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_106559363_106562127_106562195_106563033
tx.19804	chr9	+	1348	3	ISM	ENSMUSG00000040325.17	ENSMUST00000161758.3	5539	23	36590	5	-8597	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	304	junction_2	68.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCCTTTCCTTGTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106742857	106758186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_106742899_106751254_106751508_106757132
tx.19805	chr9	-	865	4	FSM	ENSMUSG00000032575.17	ENSMUST00000159283.8	2247	4	39	1343	-23	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	771	junction_3	24.1660919471891	2489	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAGCTGGCACAGTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106769139	106765956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_106766425_106767359_106767502_106768269_106768398_106769012
tx.19806	chr9	-	734	2	NNC	ENSMUSG00000032577.17	novel	3729	9	NA	NA	1587	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAATGATTCCTGGGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107132904	107132131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_107132540_107132578
tx.19807	chr9	-	2791	11	FSM	ENSMUSG00000032577.17	ENSMUST00000035194.8	2816	11	19	6	19	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_10	23.3752005338992	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAATGATTCCTGGGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107167057	107132131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_107133535_107134260_107134342_107134613_107134700_107135528_107135654_107136012_107136089_107137243_107137368_107139076_107139157_107139621_107139687_107140823_107140964_107166318_107166596_107166723
tx.19808	chr9	-	2688	12	NNC	ENSMUSG00000032577.17	novel	2816	11	NA	NA	-14	3	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	60.0594746552762	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGATTCCTGGGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107166992	107132130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_107132540_107132578_107133535_107134260_107134342_107134613_107134700_107135528_107135654_107136012_107136089_107137243_107137368_107139076_107139157_107139621_107139687_107140823_107140964_107166318_107166596_107166723
tx.19809	chr9	-	1068	3	FSM	ENSMUSG00000032577.17	ENSMUST00000141596.2	1000	3	-66	-2	32	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	78.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGCTGGGTTTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107167044	107161870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_107162341_107166318_107166596_107166723
tx.1981	chr10	-	1417	2	FSM	ENSMUSG00000020137.6	ENSMUST00000020346.6	3681	2	-344	2608	-311	-2608	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTTGTTTCTTTGTTTTGT	2049	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115220659	115207984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_115208852_115220109
tx.19810	chr9	-	1205	10	NIC	ENSMUSG00000032579.15	novel	2192	11	NA	NA	3	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_9	55.2618905142583	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTTATTAACATTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107215546	107204888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_107205272_107205374_107205489_107205633_107205730_107206522_107206632_107207971_107208022_107208289_107208355_107208643_107208779_107213377_107213472_107213770_107213863_107215479
tx.19811	chr9	-	1572	11	FSM	ENSMUSG00000032579.15	ENSMUST00000035196.14	2192	11	1	619	1	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_9	21.6296093353532	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGAGCCAGTATTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107215548	107204901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_107205272_107205374_107205489_107205633_107205730_107206522_107206632_107207971_107208022_107208289_107208355_107208643_107208779_107213377_107213472_107213770_107213863_107214199_107214578_107215479
tx.19812	chr9	+	2071	2	FSM	ENSMUSG00000010045.3	ENSMUST00000010189.3	2194	2	104	19	104	-19	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	0	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCTGGGCTCCGTCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107411247	107415853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107412529_107415063
tx.19813	chr9	-	1140	4	FSM	ENSMUSG00000037190.13	ENSMUST00000195235.6	1162	4	38	-16	-28	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_2	4.08248290463863	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCAGAGTTGAGGATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107419354	107416757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_107417585_107418201_107418240_107418695_107418850_107419233
tx.19814	chr9	+	1433	11	FSM	ENSMUSG00000010057.9	ENSMUST00000010201.9	1441	11	8	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_4	11.6721891691319	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGAGTACTGCTTCAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107419432	107422905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107419653_107420180_107420273_107420366_107420536_107420705_107420815_107421349_107421487_107421578_107421677_107421796_107421834_107421945_107422040_107422112_107422231_107422443_107422587_107422689
tx.19815	chr9	+	1816	6	FSM	ENSMUSG00000010067.14	ENSMUST00000093786.9	1787	6	-36	7	-36	-3	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	27.6723688902848	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGGTTTTGGACTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107428717	107439459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107429046_107431336_107431444_107434651_107434757_107434968_107435267_107435385_107435502_107438597
tx.19816	chr9	+	1604	5	FSM	ENSMUSG00000010067.14	ENSMUST00000010211.7	1727	5	122	1	122	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_4	9.63068014212911	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGTTTTGGACTCTATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107431903	107439461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107432125_107434651_107434757_107434968_107435267_107435385_107435502_107438597
tx.19817	chr9	+	1626	3	FSM	ENSMUSG00000010054.5	ENSMUST00000010198.5	1665	3	37	2	37	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	242	junction_1	4.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACGAGAGTGGCGTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107440490	107443309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107440732_107441774_107441896_107442045
tx.19818	chr9	+	1883	4	FSM	ENSMUSG00000010047.13	ENSMUST00000010191.13	1893	4	6	4	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_3	7.31816613336672	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGCTTCTTGTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107446321	107449971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107446433_107447302_107448270_107448690_107448781_107449256
tx.19819	chr9	+	2193	4	FSM	ENSMUSG00000010051.16	ENSMUST00000010195.14	3014	4	-45	866	-14	550	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	10.4029910228848	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAACCAAACAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107454111	107457311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107454278_107454751_107455676_107456079_107456170_107456298
tx.1982	chr10	-	1057	2	NNC	ENSMUSG00000020137.6	novel	4970	3	NA	NA	-317	531	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGATGTTTGTTTTTAAAG	2043	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115220665	115219290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_115219792_115220109
tx.19820	chr9	+	1205	2	ISM	ENSMUSG00000010051.16	ENSMUST00000144392.2	1332	3	-54	804	-2	-804	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTCCTGACTTAAATACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107454134	107455813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107454278_107454751
tx.19822	chr9	+	1499	2	FSM	ENSMUSG00000079334.9	ENSMUST00000093785.6	2053	2	552	2	552	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTGTGACAGTTTATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107457867	107461247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107458135_107460015
tx.19823	chr9	+	1976	12	FSM	ENSMUSG00000010048.11	ENSMUST00000010192.11	2056	12	79	1	-5	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	631	junction_11	35.5716016363504	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGCCTTTATCCTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107464919	107470236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107465146_107467101_107467222_107467307_107467393_107467496_107467622_107467703_107467862_107467994_107468046_107468130_107468310_107468400_107468507_107468766_107468905_107469273_107469403_107469474_107469571_107469673
tx.19824	chr9	+	789	3	ISM	ENSMUSG00000010048.11	ENSMUST00000195746.2	601	5	967	-329	-11	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	631	junction_2	25	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGCCTTTATCCTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107469272	107470236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107469403_107469474_107469571_107469673
tx.19825	chr9	-	2890	17	ISM	ENSMUSG00000057969.16	ENSMUST00000102529.10	2875	18	238	-137	105	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_12	7.52054477747457	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTACGCTGGTTCCAGTGA	8396	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107482363	107475416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107476375_107476775_107476916_107477001_107477058_107477148_107477307_107477528_107477571_107477652_107477745_107478026_107478247_107478556_107478702_107478782_107478853_107478958_107479071_107479158_107479305_107480072_107480193_107480320_107480415_107480495_107480616_107481005_107481069_107481241_107481400_107482167
tx.19828	chr9	-	1463	4	ISM	ENSMUSG00000032562.14	ENSMUST00000055704.12	2215	9	18833	0	-22	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1026	junction_1	154.782284372455	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCGTGTTCTTTTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107493733	107491323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107492298_107492810_107493025_107493353_107493508_107493612
tx.19829	chr9	-	1984	9	FSM	ENSMUSG00000032562.14	ENSMUST00000055704.12	2215	9	231	0	176	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1026	junction_1	123.439193026364	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCGTGTTCTTTTCTCCT	5001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107512335	107491323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_107492298_107492810_107493025_107493353_107493508_107493612_107493743_107494133_107494263_107496895_107497057_107497245_107497388_107497618_107497662_107512298
tx.1983	chr10	-	1199	2	ISM	ENSMUSG00000020166.16	ENSMUST00000164088.8	2618	14	56795	0	7110	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	587	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAGTGTTGGCTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116328273	116321069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_116322192_116328196
tx.19830	chr9	-	1040	5	ISM	ENSMUSG00000032580.13	ENSMUST00000194801.6	2691	20	16241	0	-36	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	593	junction_1	1	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCCTGTGTCTTTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107621521	107617694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107618292_107619590_107619721_107619799_107619898_107621035_107621111_107621381
tx.19831	chr9	-	1186	5	ISM	ENSMUSG00000032580.13	ENSMUST00000192130.6	784	8	-24	5611	0	613	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	324	junction_4	25.5770893574699	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGAAGGTGGTTTGTTCC	9705	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107648195	107636904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107637591_107642693_107642850_107644741_107644908_107646759_107646826_107648083
tx.19832	chr9	-	949	4	FSM	ENSMUSG00000032580.13	ENSMUST00000182073.8	897	4	-5	-47	2	47	multi-exon	FALSE	canonical	3	324	junction_3	29.4278779391243	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAGAAGAAGAAGT	9707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107648193	107642242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_107642850_107644741_107644908_107646759_107646826_107648083
tx.19833	chr9	-	301	2	ISM	ENSMUSG00000032582.15	ENSMUST00000181986.8	2066	16	98120	-8	5658	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	441	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTAAAGTTTTTTTTT	7134	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107651842	107650757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107651007_107651790
tx.19834	chr9	-	478	3	ISM	ENSMUSG00000032582.15	ENSMUST00000181986.8	2066	16	94735	-8	2273	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	408	junction_2	16.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTAAAGTTTTTTTTT	9115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107655227	107650757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107651007_107651790_107651921_107655128
tx.19835	chr9	-	3077	19	ISM	ENSMUSG00000032582.15	ENSMUST00000183032.8	3716	21	19777	-4	-1611	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_18	55.8402980730663	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTAAAGTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107730243	107650757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107651007_107651790_107651921_107655128_107655227_107656772_107656848_107659808_107660064_107660888_107660985_107664450_107664598_107664977_107665064_107665306_107665389_107665528_107665572_107666806_107666905_107668203_107668365_107668950_107669218_107673675_107673737_107677897_107677973_107710632_107710707_107724466_107724537_107728113_107728204_107729323
tx.19836	chr9	-	2157	17	NIC	ENSMUSG00000032582.15	novel	3999	21	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	80	junction_15	79.7133291473264	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTAAAGTTTTTTTTT	7563	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107749970	107650757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_107651007_107651790_107651921_107655128_107655227_107656772_107656848_107659808_107660064_107660888_107660985_107664450_107664598_107664977_107665064_107665306_107665389_107665528_107665572_107666806_107666905_107668203_107668365_107668950_107669218_107673675_107673737_107677897_107677973_107737547_107737659_107749847
tx.19837	chr9	+	2082	6	FSM	ENSMUSG00000032583.8	ENSMUST00000035202.4	2042	6	-47	7	-16	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	6.62117814289874	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGTTGCCCTTTGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107765333	107780331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107765602_107775870_107776011_107777225_107777715_107778393_107779160_107779814_107779963_107780060
tx.19838	chr9	+	994	3	ISM	ENSMUSG00000032583.8	ENSMUST00000035202.4	2042	6	13206	5	13206	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_1	5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTGCCCTTTGTCATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107778586	107780333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107779160_107779814_107779963_107780060
tx.19839	chr9	+	1956	15	FSM	ENSMUSG00000032586.10	ENSMUST00000049348.9	2706	15	10	740	-1	5	multi-exon	TRUE	canonical	3	256	junction_7	39.1366001255571	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCTGGCTGTATAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107828164	107848729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107828372_107833063_107833122_107833544_107833629_107836014_107836055_107836637_107836766_107838176_107838272_107838740_107838855_107839452_107839541_107840029_107840120_107840527_107840617_107845792_107845949_107847202_107847252_107847667_107847818_107847906_107847958_107848172
tx.1984	chr10	-	2802	16	FSM	ENSMUSG00000020166.16	ENSMUST00000105267.8	2800	16	-1	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	333	junction_15	67.9643697503005	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAGTGTTGGCTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116417406	116321069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_116322192_116328196_116328342_116329597_116329699_116330727_116330778_116330864_116330927_116333990_116334148_116334242_116334364_116335246_116335372_116337096_116337223_116339939_116340020_116342133_116342317_116342945_116343094_116353221_116353289_116363731_116363855_116384937_116385081_116417357
tx.19840	chr9	+	609	2	ISM	ENSMUSG00000032586.10	ENSMUST00000049348.9	2706	15	19751	740	8474	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	389	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTCTGGCTGTATAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107847905	107848729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107847958_107848172
tx.19841	chr9	-	1065	2	FSM	ENSMUSG00000042106.6	ENSMUST00000048568.6	1025	2	-40	0	-40	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGGTCCCATACTCCTG	9716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107863118	107861421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_107862264_107862895
tx.19843	chr9	+	4017	5	ISM	ENSMUSG00000032594.12	ENSMUST00000035214.11	4559	6	21820	2	37	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_4	45.1795030959837	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTCTGTCCAAGTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107901519	107925979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107901650_107909197_107909409_107918103_107918286_107921923_107922100_107922661
tx.19844	chr9	+	1634	10	NIC	ENSMUSG00000070284.11	novel	1429	10	NA	NA	7	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_1	34.1655374700484	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCAGTCCTTGTTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107926474	107929116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_107926561_107926710_107926845_107926959_107927041_107927127_107927177_107927313_107927457_107927649_107927809_107927892_107927972_107928047_107928176_107928258_107928442_107928524
tx.19845	chr9	+	1466	10	FSM	ENSMUSG00000070284.11	ENSMUST00000047947.9	1429	10	-36	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	31.8309578326385	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGACTGGAAGTCAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107926487	107928902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107926620_107926710_107926845_107926959_107927041_107927127_107927177_107927313_107927457_107927649_107927809_107927892_107927972_107928047_107928176_107928258_107928442_107928524
tx.19846	chr9	+	1771	9	FSM	ENSMUSG00000070284.11	ENSMUST00000112295.9	2702	9	47	884	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_7	12.9807549857472	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCAGTCCTTGTTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107926487	107929116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107926845_107926959_107927041_107927127_107927177_107927313_107927457_107927649_107927809_107927892_107927972_107928047_107928176_107928258_107928442_107928524
tx.19847	chr9	+	1030	5	ISM	ENSMUSG00000070284.11	ENSMUST00000047947.9	1429	10	1234	-212	1104	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	94	junction_3	13.9530462623758	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGAAGCAGTCCTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107927757	107929113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107927809_107927892_107927972_107928047_107928176_107928258_107928442_107928524
tx.19848	chr9	+	715	2	ISM	ENSMUSG00000070284.11	ENSMUST00000137284.8	1853	8	1831	-1	1665	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	123	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGCAGTCCTTGTTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107928318	107929116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107928442_107928524
tx.19849	chr9	-	718	5	NNC	ENSMUSG00000041528.16	novel	4727	39	NA	NA	-325	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	34.6301891418456	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCTGGGCCCGCTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107930223	107928870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_107929160_107929233_107929320_107929412_107929508_107929643_107929787_107930118
tx.1985	chr10	+	702	2	FSM	ENSMUSG00000052291.9	ENSMUST00000219273.2	676	2	-26	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTCGCACCGAAAACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116417454	116419419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_116417628_116418890
tx.19850	chr9	+	2266	18	NNC	ENSMUSG00000032591.16	novel	2262	18	NA	NA	-3	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	12.4013058805616	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATAGAGTGCTTCTTAGT	6660	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107957631	107962199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_107957730_107958343_107958492_107958583_107958701_107958782_107958898_107958981_107959119_107959199_107959321_107959401_107959521_107959663_107959860_107960018_107960150_107960227_107960331_107960452_107960590_107960677_107960714_107960792_107960902_107961062_107961141_107961259_107961407_107961486_107961594_107961691_107961832_107961972
tx.19851	chr9	+	1603	13	ISM	ENSMUSG00000032591.16	ENSMUST00000035211.14	2262	18	1617	-1	1570	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_8	10.5944823165436	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAGTGCTTCTTAGTTTCT	8280	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107959251	107962203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107959321_107959401_107959521_107959663_107959860_107960018_107960150_107960227_107960331_107960452_107960590_107960677_107960714_107960792_107960902_107961062_107961141_107961259_107961407_107961486_107961594_107961691_107961832_107961972
tx.19852	chr9	-	2392	22	FSM	ENSMUSG00000032590.15	ENSMUST00000193254.6	2518	22	125	1	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_21	23.0064567492301	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGGTCTGTGCTGGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107971680	107962612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_107962877_107962959_107963067_107963148_107963252_107963337_107963529_107963621_107963711_107964221_107964303_107964379_107964464_107964921_107965061_107965459_107965549_107966716_107966769_107967287_107967386_107968441_107968503_107968966_107969089_107969169_107969211_107969286_107969379_107969474_107969613_107969752_107969917_107970005_107970082_107970179_107970274_107970820_107970948_107971425_107971559_107971633
tx.19853	chr9	-	1736	5	ISM	ENSMUSG00000032589.15	ENSMUST00000124763.2	7496	8	5495	2552	5495	-2552	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	14	junction_1	4.12310562561766	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGAGTTAATTGCAAACA	3798	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107982117	107975773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107977097_107980388_107980482_107980862_107980918_107981142_107981275_107981984
tx.19854	chr9	+	2123	6	NNC	ENSMUSG00000032606.8	novel	2133	6	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	43.9253912902321	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGTGTCAGCTGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108167641	108173697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_108167862_108170534_108170712_108171129_108171248_108171644_108171717_108172087_108172193_108172266
tx.19855	chr9	-	1934	2	ISM	ENSMUSG00000039461.13	ENSMUST00000044725.9	1668	3	27	0	-15	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTGGTGTGGTTATTCAA	7312	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108183162	108180156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_108181453_108182524
tx.19856	chr9	-	1668	3	FSM	ENSMUSG00000039461.13	ENSMUST00000044725.9	1668	3	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGTGGTGTGGTTATTCA	7284	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108183190	108180157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_108181453_108182524_108182628_108182920
tx.19857	chr9	-	1617	3	FSM	ENSMUSG00000039461.13	ENSMUST00000192886.6	1094	3	173	-696	3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_2	5	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTGGTGTGGTTATTCAA	7288	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108183186	108180156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_108181453_108182524_108182580_108182920
tx.19858	chr9	+	1594	6	FSM	ENSMUSG00000007815.14	ENSMUST00000007959.14	2197	6	247	356	-63	-356	multi-exon	FALSE	canonical	3	1457	junction_4	47.4535562418666	1671	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAAAATTCCCATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108183574	108214777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108183753_108192506_108192582_108204782_108204941_108208069_108208191_108212249_108212381_108213846
tx.19859	chr9	+	852	2	FSM	ENSMUSG00000063856.9	ENSMUST00000082429.8	1072	2	219	1	-3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	8868	junction_1	0	74456	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTTGTGTGTCCTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108216471	108217541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108216758_108216975
tx.1986	chr10	-	1727	11	FSM	ENSMUSG00000064181.7	ENSMUST00000219109.2	1844	11	120	-3	69	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	251	junction_7	35.031985384788	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGTGTGTCTTTCTTAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116786216	116742678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_116743024_116746029_116746100_116746186_116746287_116750001_116750115_116751748_116751878_116754666_116754871_116755478_116755557_116764093_116764190_116773301_116773561_116775105_116775387_116786164
tx.19860	chr9	-	838	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000063856.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCGCTCACAGGGCCCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108217541	108216474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_108216789_108217017
tx.19861	chr9	-	664	2	ISM	ENSMUSG00000047220.6	ENSMUST00000076592.4	2890	7	0	17356	0	-17356	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTAGTTTATTCATGACT	476	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108305683	108298165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_108298761_108305614
tx.19862	chr9	-	742	3	NNC	ENSMUSG00000047220.6	novel	2890	7	NA	NA	-3354	-17356	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	11.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTAGTTTATTCATGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108309037	108298165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_108298761_108305614_108305682_108308957
tx.19863	chr9	-	740	3	NNC	ENSMUSG00000047220.6	novel	2890	7	NA	NA	-3365	-17356	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_2	5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTAGTTTATTCATGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108309048	108298165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_108298761_108305614_108305682_108308970
tx.19864	chr9	-	2306	6	FSM	ENSMUSG00000032609.13	ENSMUST00000035232.13	1897	6	-387	-22	2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	5	junction_5	2.71293199325011	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGTGTGGGGTTTCTTTG	9989	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108329963	108324834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_108325685_108326024_108326127_108326265_108326491_108326819_108326985_108328074_108328591_108329515
tx.19865	chr9	+	1693	2	FSM	ENSMUSG00000049305.7	ENSMUST00000061209.7	3092	2	16	1383	8	-1251	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_1	0	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGCGGTCTCCTTGCTCA	203	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108337741	108341754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108337817_108340136
tx.19866	chr9	+	1240	6	ISM	ENSMUSG00000052911.10	ENSMUST00000065014.10	5629	33	8712	0	-308	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_1	16.6973051717934	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTGTTGTCTGGCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108365767	108367729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_108366074_108366365_108366574_108366651_108366794_108366975_108367153_108367244_108367405_108367482
tx.19867	chr9	+	532	3	ISM	ENSMUSG00000052911.10	ENSMUST00000065014.10	5629	33	9972	0	952	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_1	9	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTGTTGTCTGGCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108367027	108367729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_108367153_108367244_108367405_108367482
tx.19868	chr9	+	2444	24	FSM	ENSMUSG00000032604.17	ENSMUST00000006838.16	2800	24	352	4	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	468	junction_2	39.8133167299073	433	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCGTCTCTCTGTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108385256	108393136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108385399_108385581_108385730_108386075_108386186_108386347_108386424_108386639_108386705_108387293_108387348_108387486_108387548_108388337_108388410_108388529_108388616_108388730_108388818_108389681_108389782_108389898_108389978_108390058_108390168_108390264_108390396_108390484_108390578_108390867_108391006_108391091_108391180_108391263_108391408_108391488_108391594_108391741_108391835_108391944_108392073_108392165_108392233_108392305_108392432_108392994
tx.19869	chr9	+	1685	14	FSM	ENSMUSG00000062867.14	ENSMUST00000081111.14	1858	14	162	11	9	4	multi-exon	TRUE	canonical	3	1280	junction_13	396.993628196225	4998	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACAACTGATCTTTGAGT	1157	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108437646	108442772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108437831_108438232_108438282_108438795_108438898_108438981_108439057_108439372_108439580_108439990_108440079_108440334_108440535_108440619_108440711_108440794_108440891_108441833_108441978_108442064_108442210_108442300_108442445_108442525_108442610_108442696
tx.1987	chr10	-	467	3	ISM	ENSMUSG00000064181.7	ENSMUST00000219109.2	1844	11	40097	-2	9599	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	320	junction_1	34	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCGTGTGTCTTTCTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116746239	116742679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_116743024_116746029_116746100_116746186
tx.19870	chr9	-	692	5	FSM	ENSMUSG00000070283.5	ENSMUST00000074208.6	1487	5	471	324	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	428	junction_3	47.1301389770919	3620	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGTTGCTCAGTTTGGC	8614	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108444162	108443059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_108443275_108443357_108443459_108443539_108443607_108443754_108443951_108444049
tx.19871	chr9	+	1891	10	NIC	ENSMUSG00000019039.15	novel	1746	12	NA	NA	-1	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	128	junction_6	18.4357409183867	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGAGAGTGAGGCGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108447083	108449972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_108447275_108447348_108447645_108447762_108448014_108448090_108448171_108448243_108448373_108448644_108448719_108448811_108448874_108448980_108449497_108449591_108449661_108449749
tx.19872	chr9	-	1497	2	ISM	ENSMUSG00000066357.7	ENSMUST00000068700.7	4163	6	2	3019	2	-3019	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGTTAGCATCGGGCCC	5753	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108455936	108452528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_108453782_108455692
tx.19873	chr9	-	1286	3	ISM	ENSMUSG00000006675.11	ENSMUST00000006853.11	1841	9	16968	-31	-1142	31	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	1.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCCCGGCTAGTCTCATG	3791	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108457898	108456029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_108456508_108456914_108457039_108457214
tx.19874	chr9	-	1754	9	NNC	ENSMUSG00000006675.11	novel	1841	9	NA	NA	-8	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	18.7066164765304	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGGCGAGCTAAGCGCCCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108474787	108456072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_108456508_108456914_108457039_108457214_108457306_108457913_108458104_108459040_108459204_108460045_108460143_108460840_108461032_108474097_108474180_108474406
tx.19875	chr9	-	2181	16	FSM	ENSMUSG00000064145.13	ENSMUST00000013338.14	3924	16	15	1728	4	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	517	junction_5	114.47891605978	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATTTGACTTAGAATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108526564	108481868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_108482353_108482532_108482617_108484486_108484556_108485107_108485252_108485800_108485953_108486976_108486999_108487095_108487147_108488831_108488950_108490924_108491035_108492223_108492346_108493876_108494028_108494570_108494635_108497257_108497326_108521224_108521568_108522131_108522194_108526427
tx.19876	chr9	-	919	5	ISM	ENSMUSG00000064145.13	ENSMUST00000193190.6	2160	15	40642	-12	-60	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	834	junction_4	22.0510770711999	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGCTATTTGACTTAGAA	4592	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108485942	108481872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_108482353_108482532_108482617_108484486_108484556_108485107_108485252_108485800
tx.19877	chr9	+	1749	9	FSM	ENSMUSG00000032602.7	ENSMUST00000035222.6	1783	9	34	0	34	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	619	junction_8	102.171118717571	1015	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCGTGTGATATTTTCT	5111	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108539330	108561840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108539532_108546964_108547058_108549617_108549746_108554782_108554874_108557285_108557404_108559170_108559244_108559545_108559656_108560247_108560373_108561030
tx.19878	chr9	+	1313	4	FSM	ENSMUSG00000032599.13	ENSMUST00000192226.6	607	4	-57	-649	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_3	30.6847772609735	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCTTGTAGTTCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108661006	108675193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108661070_108673262_108673596_108673853_108673983_108674405
tx.19879	chr9	+	1991	2	FSM	ENSMUSG00000032599.13	ENSMUST00000193634.2	2820	2	-11	840	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCTTGTAGTTCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108661009	108675193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108661070_108673262
tx.1988	chr10	-	1093	8	ISM	ENSMUSG00000064181.7	ENSMUST00000219109.2	1844	11	22188	-2	-8310	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	251	junction_7	37.6145868361882	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCGTGTGTCTTTCTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116764148	116742679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_116743024_116746029_116746100_116746186_116746287_116750001_116750115_116751748_116751878_116754666_116754871_116755478_116755557_116764093
tx.19880	chr9	+	2660	21	FSM	ENSMUSG00000023259.18	ENSMUST00000188557.8	2552	21	-92	-16	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	10	junction_1	9.81121806912883	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCAGGCTCTGCTGTGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108731241	108742112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108731386_108732975_108733142_108733221_108733362_108733530_108733642_108733874_108734024_108734139_108734305_108734390_108734544_108734864_108734948_108735023_108735172_108735395_108735510_108735629_108735708_108736022_108736119_108736199_108736307_108736485_108736556_108737801_108737895_108737996_108738102_108738496_108738590_108739280_108739458_108739626_108739682_108741477_108741615_108741836
tx.19881	chr9	+	1587	13	FSM	ENSMUSG00000025651.15	ENSMUST00000026743.14	1653	13	66	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5755	junction_3	194.83802033142	12925	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTTGTCCTTCCTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108765766	108778691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108765856_108766083_108766225_108771151_108771239_108773111_108773242_108773757_108773957_108774427_108774508_108776005_108776122_108776403_108776548_108776665_108776827_108776923_108777010_108777612_108777702_108778006_108778083_108778502
tx.19882	chr9	+	1499	12	ISM	ENSMUSG00000025651.15	ENSMUST00000026743.14	1653	13	382	0	123	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5755	junction_2	199.673576594608	351	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTTGTCCTTCCTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108766082	108778691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_108766225_108771151_108771239_108773111_108773242_108773757_108773957_108774427_108774508_108776005_108776122_108776403_108776548_108776665_108776827_108776923_108777010_108777612_108777702_108778006_108778083_108778502
tx.19883	chr9	+	1622	3	FSM	ENSMUSG00000025648.19	ENSMUST00000198277.5	439	3	11	-1194	11	1194	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAGAAATCAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108821026	108829531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108821181_108827926_108828044_108828180
tx.19884	chr9	+	1821	6	FSM	ENSMUSG00000025647.17	ENSMUST00000026737.12	1834	6	8	5	8	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_2	42.9678949914934	317	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGCTTCCCCTTTCTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108867660	108886787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108867833_108869937_108870095_108880434_108880522_108885045_108885162_108885354_108885574_108885717
tx.19885	chr9	+	1821	6	FSM	ENSMUSG00000025647.17	ENSMUST00000112059.10	1910	6	31	58	-6	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_2	78.9186923358465	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGCTTCCCCTTTCTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108867663	108886787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108867833_108869937_108870095_108880431_108880522_108885045_108885162_108885354_108885574_108885717
tx.19886	chr9	+	1505	4	FSM	ENSMUSG00000025647.17	ENSMUST00000154184.5	1038	4	45	-512	-40	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	98.8005847935909	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGCTTCCCCTTTCTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108883975	108886787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108884076_108885045_108885162_108885354_108885574_108885717
tx.19887	chr9	-	2567	13	FSM	ENSMUSG00000025646.10	ENSMUST00000045011.9	2572	13	5	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_2	14.834971819619	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGTTTCCTGAGTCCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108903187	108888814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_108888977_108889330_108889581_108889696_108889778_108890177_108890270_108890599_108890737_108894195_108894868_108895033_108895161_108896084_108896187_108896820_108896979_108898346_108898466_108900785_108900957_108901674_108901806_108902822
tx.19888	chr9	-	936	3	ISM	ENSMUSG00000025646.10	ENSMUST00000045011.9	2572	13	-11	11718	-11	281	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_1	17	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCATTGTTTAAGTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108903203	108900532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_108900957_108901674_108901806_108902822
tx.19889	chr9	-	637	4	FSM	ENSMUSG00000091537.3	ENSMUST00000167504.3	944	4	206	101	-3	-101	multi-exon	FALSE	canonical	3	4656	junction_3	487.196743284134	19338	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCATTTGTGTGTGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108911449	108907055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_108907494_108911069_108911158_108911238_108911295_108911394
tx.1989	chr10	-	625	4	ISM	ENSMUSG00000034024.9	ENSMUST00000047672.9	1959	16	8832	-1	-81	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2581	junction_1	75.3171073971025	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGTCTTACTGATCTGTA	6045	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116890887	116886904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_116887182_116888920_116889063_116889944_116890045_116890781
tx.19890	chr9	+	1530	4	FSM	ENSMUSG00000025645.9	ENSMUST00000026735.9	1526	4	0	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_1	5.71547606649408	291	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTATATCAGACTCAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108911560	108921561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_108911636_108918404_108918716_108919908_108920074_108920582
tx.19891	chr9	+	1053	7	FSM	ENSMUSG00000032478.15	ENSMUST00000035053.12	1074	7	13	8	0	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	194	junction_1	146.935359937627	466	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCAGTACTCCTGTGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109661838	109672034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_109661876_109662263_109662364_109664385_109664483_109668675_109668779_109670543_109670584_109670994_109671156_109671519
tx.19892	chr9	+	1120	7	FSM	ENSMUSG00000032478.15	ENSMUST00000200005.5	719	7	38	-439	0	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	252	junction_1	126.972000413039	646	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTACTCCTGTGCAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109661854	109672036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_109661957_109662263_109662364_109664385_109664483_109668675_109668779_109670543_109670584_109670994_109671156_109671519
tx.19893	chr9	+	1024	6	FSM	ENSMUSG00000032478.15	ENSMUST00000200468.2	865	6	151	-310	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	493	junction_3	57.3431774494578	381	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTCCTGTGCAAGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109662260	109672039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_109662364_109664385_109664483_109668675_109668779_109670543_109670584_109670994_109671156_109671519
tx.19894	chr9	+	998	5	ISM	ENSMUSG00000032479.16	ENSMUST00000165876.8	5573	19	-45	55827	19	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	256	junction_1	35.7797079362032	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAAATCTGCTTTGGCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109760886	109857188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_109761009_109807917_109808160_109828839_109828909_109855168_109855292_109856746
tx.19895	chr9	+	897	6	NIC	ENSMUSG00000032479.16	novel	6091	19	NA	NA	19	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_5	120.044325147006	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTTTGGCTGGCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109760886	109857193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_109761009_109807917_109808160_109828839_109828909_109855168_109855292_109856746_109856861_109856966
tx.19896	chr9	+	364	2	ISM	ENSMUSG00000032479.16	ENSMUST00000169851.8	3446	4	19	26648	19	-24198	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	256	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGTAAGTGTTTAAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109760886	109808159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_109761009_109807917
tx.19897	chr9	+	876	7	NNC	ENSMUSG00000032479.16	novel	6091	19	NA	NA	20	8224	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_6	143.934784615194	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGAGGAAGGGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109760887	109865413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_109761009_109807917_109808160_109828839_109828909_109855168_109855292_109856746_109856861_109856966_109857053_109865292
tx.19898	chr9	-	226	3	ISM	ENSMUSG00000032480.18	ENSMUST00000196171.5	3885	23	1	28650	1	107	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	135	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAGGAATGGAACTGTACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109946504	109942038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_109942094_109944558_109944651_109946425
tx.19899	chr9	-	1495	2	FSM	ENSMUSG00000032480.18	ENSMUST00000196788.2	1424	2	-57	-14	0	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	279	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AGAAAAAGAAAAAAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109946499	109943229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_109944651_109946425
tx.199	chr1	+	3348	11	NIC	ENSMUSG00000041684.12	novel	3313	11	NA	NA	2	7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_1	12.9479728143057	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTATGAATTTTAATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44158118	44183677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_44158356_44159333_44159435_44165425_44166027_44166797_44166925_44167887_44167984_44168419_44168525_44168742_44168838_44176143_44176277_44177732_44177820_44180937_44181035_44182008
tx.1990	chr10	-	2052	16	NIC	ENSMUSG00000034024.9	novel	1959	16	NA	NA	16	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	239	junction_15	561.749291647677	199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATGTCTTACTGATCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116899264	116886903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_116887182_116888920_116889063_116889944_116890045_116890781_116890886_116891011_116891141_116891944_116892065_116893078_116893183_116893695_116893824_116894002_116894104_116896552_116896756_116897202_116897316_116897409_116897487_116897929_116898042_116898721_116898788_116898880_116898956_116899064
tx.19900	chr9	-	1130	3	ISM	ENSMUSG00000032480.18	ENSMUST00000198425.5	3968	23	9	29860	-2	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	243	junction_1	18	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ATGGAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109946481	109943247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_109944230_109944558_109944651_109946425
tx.19901	chr9	+	1157	8	ISM	ENSMUSG00000032481.18	ENSMUST00000197480.5	1949	15	0	19138	0	18107	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1285	junction_2	51.7063924520766	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTGTCACTCTGGCTTA	2502	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109961104	109994233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_109961377_109964636_109964757_109968616_109968703_109976112_109976195_109978998_109979092_109982840_109982911_109986343_109986414_109993869
tx.19902	chr9	+	3533	27	FSM	ENSMUSG00000032481.18	ENSMUST00000197984.5	3538	27	1	4	1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1122	junction_24	83.6874645091864	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACATGCATAGTTCCTGG	2503	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109961105	110064355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_109961377_109964636_109964757_109968616_109968703_109976112_109976195_109978998_109979092_109982840_109982911_109986343_109986414_109993869_109993946_109996672_109996799_110000013_110000136_110002948_110003074_110004109_110004170_110006535_110006574_110011989_110012112_110012884_110012957_110014890_110015005_110015825_110015980_110016947_110017062_110019970_110020031_110025220_110025480_110026696_110026859_110031570_110031627_110033279_110033395_110035066_110035222_110042576_110042712_110050959_110051225_110063944
tx.19903	chr9	+	1294	10	ISM	ENSMUSG00000032481.18	ENSMUST00000197480.5	1949	15	18	13041	18	-13041	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1205	junction_8	72.5595540841376	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAGAAAGAAAA	2520	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109961122	110000330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_109961377_109964636_109964757_109968616_109968703_109976112_109976195_109978998_109979092_109982840_109982911_109986343_109986414_109993869_109993946_109996672_109996799_110000013
tx.19904	chr9	+	680	5	ISM	ENSMUSG00000032481.18	ENSMUST00000197480.5	1949	15	15007	19138	15007	18107	internal_fragment	FALSE	canonical	3	1342	junction_4	37.5799148482271	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTGTCACTCTGGCTTA	5695	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109976111	109994233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_109976195_109978998_109979092_109982840_109982911_109986343_109986414_109993869
tx.19905	chr9	-	171	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000098973.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATAAATAAATAAATCTTT	1997	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110130384	110009366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_110009414_110130260
tx.19907	chr9	+	1014	5	ISM	ENSMUSG00000032481.18	ENSMUST00000197984.5	3538	27	72241	5	18546	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1122	junction_2	49.1477364687327	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGACATGCATAGTTCCTG	1143	False	NA	-8	True	NA	NA	NA	110033345	110064354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_110033395_110035066_110035222_110042576_110042712_110050959_110051225_110063944
tx.19908	chr9	+	669	2	ISM	ENSMUSG00000032481.18	ENSMUST00000197984.5	3538	27	89866	0	-13005	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1213	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCATAGTTCCTGGCTGT	5536	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110050970	110064359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_110051225_110063944
tx.19909	chr9	+	2097	4	FSM	ENSMUSG00000032482.10	ENSMUST00000199736.2	2107	4	7	3	7	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	35	junction_3	9.53356643071673	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACTTCCTTAGTGCCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110075139	110091640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_110076459_110080026_110080216_110085212_110085289_110091127
tx.1991	chr10	-	1683	13	ISM	ENSMUSG00000034024.9	ENSMUST00000047672.9	1959	16	1703	1	1264	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1936	junction_8	228.925691485736	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATGTCTTACTGATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116898016	116886906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_116887182_116888920_116889063_116889944_116890045_116890781_116890886_116891011_116891141_116891944_116892065_116893078_116893183_116893695_116893824_116894002_116894104_116896552_116896756_116897202_116897316_116897409_116897487_116897929
tx.19910	chr9	+	1283	7	FSM	ENSMUSG00000054836.13	ENSMUST00000199592.5	1304	7	23	-2	-8	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_6	18.4157239577729	255	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGGAGGTTGTCTTTTT	2205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110134263	110150393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_110134418_110139162_110139242_110141636_110141708_110143043_110143163_110144818_110145021_110148637_110148785_110149882
tx.19911	chr9	+	728	3	ISM	ENSMUSG00000054836.13	ENSMUST00000199592.5	1304	7	10710	-2	6236	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_2	1.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGGAGGTTGTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110144950	110150393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_110145021_110148637_110148785_110149882
tx.19912	chr9	-	748	3	NNC	ENSMUSG00000054792.16	novel	4530	10	NA	NA	-26	-35712	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGTTTTATTGTTTGTT	2036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110305684	110302141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_110302608_110302686_110302818_110305533
tx.19913	chr9	-	310	2	NNC	ENSMUSG00000054792.16	novel	4530	10	NA	NA	15	-36287	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTCAGAGTCAATGAAT	1978	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110305742	110302716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_110302818_110305533
tx.19914	chr9	+	1007	2	ISM	ENSMUSG00000044791.17	ENSMUST00000197399.2	767	6	15152	-466	-275	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTGCTCCCTCAAAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110446393	110447682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_110446604_110446885
tx.19915	chr9	-	677	2	ISM	ENSMUSG00000032491.15	ENSMUST00000196735.2	799	4	1409	-373	1409	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	130	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACTTGGCTCCTTGGACC	8259	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110450981	110450202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_110450806_110450907
tx.19916	chr9	-	1039	5	NIC	ENSMUSG00000032491.15	novel	1223	5	NA	NA	16	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	9	junction_3	51.265851207212	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACTTGGCTCCTTGGACC	8961	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110453483	110450202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_110450806_110450907_110451051_110451139_110451183_110452154_110452304_110453382
tx.19917	chr9	-	1195	5	FSM	ENSMUSG00000032491.15	ENSMUST00000035069.14	1223	5	28	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_3	3.96074487943871	300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACTTGGCTCCTTGGACC	8952	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110453492	110450202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_110450806_110450907_110451051_110451139_110451330_110452154_110452304_110453382
tx.19918	chr9	+	798	7	FSM	ENSMUSG00000019659.9	ENSMUST00000019803.9	834	7	23	13	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	695	junction_3	22.4258035902098	3022	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTGTTGTTTCATTTCCT	8505	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110485593	110540661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_110485727_110521383_110521452_110537513_110537594_110538961_110539024_110539194_110539230_110540153_110540231_110540318
tx.19919	chr9	+	910	7	FSM	ENSMUSG00000059741.14	ENSMUST00000079784.12	937	7	24	3	24	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1.10554159678513	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTCCTATCTCTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110592737	110598863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_110592969_110595546_110595575_110595688_110595839_110596975_110597150_110598169_110598248_110598482_110598521_110598652
tx.1992	chr10	-	1933	16	FSM	ENSMUSG00000034024.9	ENSMUST00000047672.9	1959	16	26	0	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1936	junction_8	229.468312990414	3868	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATGTCTTACTGATCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116899693	116886905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_116887182_116888920_116889063_116889944_116890045_116890781_116890886_116891011_116891141_116891944_116892065_116893078_116893183_116893695_116893824_116894002_116894104_116896552_116896756_116897202_116897316_116897409_116897487_116897929_116898042_116898721_116898788_116898880_116898956_116899610
tx.19920	chr9	+	1225	6	FSM	ENSMUSG00000047257.14	ENSMUST00000011391.12	1232	6	8	-1	8	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.35646599662505	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGCTGTCTCTCTTCTCTTT	1972	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110663663	110670379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_110663808_110665133_110665161_110667488_110667637_110668089_110668365_110669454_110669619_110669912
tx.19921	chr9	-	916	3	NNC	ENSMUSG00000096393.2	novel	499	3	NA	NA	-10693	347	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGTTTGCTAGTCCATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110756622	110743459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_110744095_110745519_110745666_110756487
tx.19922	chr9	-	1881	6	FSM	ENSMUSG00000032494.13	ENSMUST00000035075.13	1932	6	51	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3873	junction_3	373.6995584691	2269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGAGTAGTGCCTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110775175	110768670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_110769888_110771396_110771507_110771597_110771713_110772219_110772322_110773258_110773312_110774891
tx.19923	chr9	+	1516	6	NIC	ENSMUSG00000032495.9	novel	3657	9	NA	NA	-125	-1818	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	6	junction_2	112.634985683845	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTCAGTATACTGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110789776	110811316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_110790078_110791582_110791740_110799081_110799228_110808537_110808694_110809894_110810032_110810697
tx.19924	chr9	+	1406	6	NIC	ENSMUSG00000032495.9	novel	3657	9	NA	NA	-37	-1820	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	86	junction_1	83.1033092000553	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATATTTCAGTATACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110789864	110811314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_110790078_110795508_110795646_110799081_110799228_110808537_110808694_110809894_110810032_110810697
tx.19925	chr9	+	1560	7	ISM	ENSMUSG00000032495.9	ENSMUST00000035076.9	3657	9	9256	1819	-33	-1819	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_2	34.6959011347962	315	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATTTCAGTATACTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110789868	110811315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_110790078_110791582_110791740_110795508_110795646_110799081_110799228_110808537_110808694_110809894_110810032_110810697
tx.19926	chr9	-	988	4	NNC	ENSMUSG00000066319.7	novel	703	3	NA	NA	96	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5.79271573232759	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATTTTCTTTCCTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110819555	110814002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_110814212_110816134_110816383_110818512_110818732_110819243
tx.19927	chr9	+	1662	15	FSM	ENSMUSG00000032497.20	ENSMUST00000196981.5	1839	15	177	0	155	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	57.6262146270679	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGATTTGGATTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110947357	111053290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_110947458_110948707_110948780_110970257_110970401_110990370_110990458_111017829_111017875_111019235_111019353_111022114_111022187_111028732_111028904_111034822_111034916_111043208_111043342_111044996_111045047_111048749_111048871_111051225_111051306_111052333_111052439_111053017
tx.19928	chr9	+	358	2	ISM	ENSMUSG00000032497.20	ENSMUST00000196906.2	822	4	4116	-269	4116	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	222	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGATTTGGATTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111052353	111053290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_111052439_111053017
tx.19929	chr9	-	2533	19	NNC	ENSMUSG00000032498.10	novel	2754	19	NA	NA	-8	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	91.190277259512	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTATATAACCGCACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111100622	111057310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_111057695_111058907_111059022_111059310_111059404_111059964_111060134_111062390_111062455_111064974_111065084_111068790_111068940_111070292_111070676_111076317_111076472_111078287_111078382_111081931_111082045_111084695_111084785_111085160_111085204_111086467_111086560_111087556_111087630_111090546_111090621_111093934_111094034_111097285_111097377_111100476
tx.1993	chr10	-	1923	16	NNC	ENSMUSG00000034024.9	novel	1959	16	NA	NA	-23	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	620.236263227346	91	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATGTCTTACTGATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116899691	116886906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_116887182_116888920_116889063_116889944_116890045_116890781_116890886_116891011_116891141_116891944_116892065_116893078_116893183_116893695_116893824_116894002_116894104_116896552_116896756_116897202_116897309_116897409_116897487_116897929_116898042_116898721_116898788_116898880_116898956_116899610
tx.19930	chr9	-	670	4	NNC	ENSMUSG00000032498.10	novel	3762	18	NA	NA	-27	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	180.765655538385	368	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTATATAACCGCACATT	2781	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111060043	111057310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_111057695_111058907_111059022_111059310_111059404_111059964
tx.19931	chr9	-	586	3	FSM	ENSMUSG00000032498.10	ENSMUST00000200145.2	603	3	299	-282	299	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	343	junction_1	35.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTTTTTATATAACC	3419	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111059405	111057317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_111057695_111058907_111059022_111059310
tx.19932	chr9	+	729	2	NNC	ENSMUSG00000032500.11	novel	3005	5	NA	NA	47985	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	22	junction_1	0	170	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTGCCTTGTTCAATGGT	4019	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111316133	111318186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_111316269_111317592
tx.19933	chr9	+	1551	2	Intergenic	novelGene_1345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTCTTTGACAGTTTTT	1237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111353202	111361786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_111353258_111360290
tx.19934	chr9	-	1052	4	NNC	ENSMUSG00000110784.2	novel	664	4	NA	NA	-3033	-21554	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.942809041582063	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCCCTTTATGGTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113184470	113174872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_113175202_113180756_113180991_113181340_113181509_113184149
tx.19935	chr9	-	441	2	ISM	ENSMUSG00000111532.2	ENSMUST00000214286.2	464	3	9885	-1	9885	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCTAGCAATGTCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113239243	113235235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_113235537_113239103
tx.19936	chr9	-	828	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033392.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGGAAGAGAGGCGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113587673	113571289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_113571858_113587214_113587365_113587563
tx.19937	chr9	-	852	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033392.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGGAAGAGAGGCGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113587499	113571290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_113571858_113587214
tx.19938	chr9	+	1748	3	ISM	ENSMUSG00000009741.16	ENSMUST00000216891.2	3997	14	41223	203	3627	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	381	junction_1	24	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATTATTTTGAATTCATT	8567	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113801919	113806067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_113801962_113802586_113802639_113804413
tx.19939	chr9	-	2195	15	NIC	ENSMUSG00000032507.16	novel	3464	15	NA	NA	-8	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	6	junction_14	11.0628999408853	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATGTAGAATGGATGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113875267	113807101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_113808009_113808525_113808739_113813052_113813110_113813608_113813654_113814340_113814402_113815473_113815605_113818187_113818263_113818377_113818505_113819685_113819782_113819876_113819946_113829565_113829661_113832217_113832293_113832509_113832565_113847056_113847119_113875140
tx.1994	chr10	-	1392	7	FSM	ENSMUSG00000020171.9	ENSMUST00000020382.8	1327	7	16	-81	-1	80	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_4	39.2074256005444	1016	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGTGCTTTGATCATA	3387	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117060396	117051045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_117051742_117053116_117053205_117053333_117053427_117056237_117056333_117056436_117056504_117058078_117058199_117060163
tx.19940	chr9	-	2142	15	FSM	ENSMUSG00000032507.16	ENSMUST00000035090.14	3464	15	3	1319	3	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_13	8.10139821643304	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGATGTGGTTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113855826	113807093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_113808009_113808525_113808739_113813052_113813110_113813608_113813654_113814340_113814402_113815473_113815605_113818187_113818263_113818377_113818505_113819685_113819782_113819876_113819946_113829565_113829661_113832217_113832293_113832509_113832565_113847056_113847119_113855760
tx.19941	chr9	-	552	4	NNC	ENSMUSG00000032507.16	novel	1620	16	NA	NA	-8	-1778	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	9.93310961716756	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGGGCTCTCTCTTCTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113855805	113834287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_113834608_113835395_113835521_113847056_113847119_113855760
tx.19942	chr9	-	422	3	NNC	ENSMUSG00000032507.16	novel	1620	16	NA	NA	-3	-1778	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	11	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGGGCTCTCTCTTCTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113855800	113834287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_113834608_113847056_113847119_113855760
tx.19943	chr9	+	359	3	ISM	ENSMUSG00000074039.11	ENSMUST00000124664.8	1285	4	-43	8163	-43	-2098	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATGAAATCTAGATTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114197327	114198134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_114197553_114197911_114197968_114198056
tx.19944	chr9	+	1322	4	FSM	ENSMUSG00000074039.11	ENSMUST00000124664.8	1285	4	-29	-8	-29	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	6.12825877028341	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATGGTGAGACACACCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114197341	114206305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_114197553_114197911_114197968_114198056_114198132_114205325
tx.19945	chr9	+	405	3	NNC	ENSMUSG00000074039.11	novel	1285	4	NA	NA	-35	-2098	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	7	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATGAAATCTAGATTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114197335	114198134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_114197553_114197857_114197968_114198056
tx.19946	chr9	+	694	2	FSM	ENSMUSG00000074039.11	ENSMUST00000131898.2	2660	2	-132	2098	-19	-2098	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATGAAATCTAGATTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114197351	114198134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_114197968_114198056
tx.19947	chr9	-	975	5	ISM	ENSMUSG00000032431.7	ENSMUST00000084881.5	1674	7	5811	2	5811	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	595	junction_4	28.9169068193678	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGGTCTCTCCGTCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114213932	114204203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_114204651_114207107_114207192_114208977_114209124_114210653_114210783_114213763
tx.19948	chr9	-	655	3	ISM	ENSMUSG00000032431.7	ENSMUST00000084881.5	1674	7	10638	6	-1816	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	656	junction_2	3.5	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTGGTCTCTCCGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114209105	114204207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_114204651_114207107_114207192_114208977
tx.19949	chr9	+	2348	16	FSM	ENSMUSG00000045594.11	ENSMUST00000063042.11	2396	16	49	-1	17	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	295	junction_2	39.3725228497687	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGGTCCTGTCATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114230192	114303446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_114230338_114246028_114246199_114249420_114249572_114250756_114250818_114253012_114253108_114259380_114259562_114263468_114263528_114266806_114266929_114267008_114267050_114272076_114272190_114279664_114279740_114283255_114283346_114285498_114285616_114288661_114288794_114293111_114293367_114302905
tx.1995	chr10	+	537	4	Intergenic	novelGene_114	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	4.18993502999218	28	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTGAAGAGCAATAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117060421	117063906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_117060473_117062495_117062653_117063449_117063496_117063623
tx.19950	chr9	+	2174	15	NIC	ENSMUSG00000045594.11	novel	2396	16	NA	NA	21	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	112	junction_1	76.8975265651421	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGGTCCTGTCATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114230196	114303446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_114230338_114249420_114249572_114250756_114250818_114253012_114253108_114259380_114259562_114263468_114263528_114266806_114266929_114267008_114267050_114272076_114272190_114279664_114279740_114283255_114283346_114285498_114285616_114288661_114288794_114293111_114293367_114302905
tx.19951	chr9	+	3243	2	FSM	ENSMUSG00000079260.4	ENSMUST00000111820.4	2921	2	-6	-316	-6	316	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114230166	114236660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_114230338_114233588
tx.19952	chr9	+	878	3	ISM	ENSMUSG00000045594.11	ENSMUST00000063042.11	2396	16	58568	-1	58536	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	384	junction_2	34.5	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGGGTCCTGTCATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114288711	114303446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_114288794_114293111_114293367_114302905
tx.19953	chr9	+	531	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047898.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGGCTGGACTTTGGTGGT	355	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114330412	114332226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_114330572_114331854
tx.19954	chr9	+	514	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000056167.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTGTGGTCATGGTATT	2016	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114413029	114415479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_114413348_114415283
tx.19955	chr9	-	2718	19	NNC	ENSMUSG00000056167.9	novel	2853	20	NA	NA	-17	-135	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	162	junction_7	96.2047231971076	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGTTGTTGGTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114469269	114415168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_114415408_114420583_114420761_114422504_114422581_114426546_114426675_114427772_114427904_114430409_114430524_114439712_114439791_114442691_114442869_114444056_114444179_114446859_114447063_114448290_114448441_114451912_114452031_114454887_114454972_114455464_114455552_114456460_114456604_114458074_114458226_114460889_114461052_114461744_114461840_114468986
tx.19956	chr9	+	1123	4	ISM	ENSMUSG00000032435.10	ENSMUST00000047404.7	2601	13	-28	17630	-28	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	423	junction_3	1.69967317119759	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTCATTAGAGTGTGG	2098	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114517829	114535740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_114518096_114518276_114518351_114534121_114534239_114535074
tx.19957	chr9	+	2616	13	FSM	ENSMUSG00000032435.10	ENSMUST00000047404.7	2601	13	-2	-13	-2	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	336	junction_8	45.3210767744986	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACGTGTTGCCTTTTCTTA	2124	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114517855	114553383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_114518096_114518276_114518351_114534121_114534239_114535074_114535306_114538212_114538383_114542577_114542672_114544161_114544298_114544667_114544780_114546930_114546991_114548925_114548971_114549616_114549738_114550772_114550926_114552320
tx.19958	chr9	+	3355	4	FSM	ENSMUSG00000032434.10	ENSMUST00000035007.10	3383	4	28	0	28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	606	junction_3	12.8322510366134	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTTGTGCCTTCACAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114560268	114578412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_114560442_114566250_114566428_114569126_114569226_114575506
tx.19959	chr9	-	994	5	FSM	ENSMUSG00000032436.18	ENSMUST00000035009.16	993	5	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1122	junction_1	123.353911571543	3394	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTCCTTATTGCATGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114610918	114585903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_114586360_114587872_114587955_114590974_114591074_114592286_114592461_114610735
tx.1996	chr10	+	487	3	Intergenic	novelGene_115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	1.5	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTGAAGAGCAATAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117062494	117063906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_117062653_117063449_117063496_117063623
tx.19960	chr9	-	2817	9	NNC	ENSMUSG00000050627.14	novel	4391	8	NA	NA	41	-432	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	36	junction_1	29.0376910239089	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGAGCCTATTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114762906	114728840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_114730448_114731440_114731571_114732728_114732836_114733842_114734077_114739943_114740057_114743393_114743533_114746048_114746190_114749589_114749768_114762738
tx.19961	chr9	-	1468	7	ISM	ENSMUSG00000050627.14	ENSMUST00000146623.8	4391	8	13287	2607	-1346	1398	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_4	10.5895650944167	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTGTTTGAAGACCACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114749768	114731015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_114731571_114732728_114732836_114733842_114734077_114739943_114740057_114743393_114743533_114746048_114746190_114749589
tx.19962	chr9	+	554	3	Intergenic	novelGene_1349	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAAAGATCAATTGCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114795852	114798581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_114795930_114797550_114797758_114798311
tx.19963	chr9	+	1545	8	NNC	ENSMUSG00000040875.13	novel	2477	12	NA	NA	49371	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	21.4466590329	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGTTGGTATTTGTTGAA	10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	114998977	115061293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_114999099_115004995_115005151_115036581_115036732_115045616_115046098_115052660_115052848_115055748_115055932_115058927_115059082_115061179
tx.19964	chr9	+	2207	5	ISM	ENSMUSG00000040875.13	ENSMUST00000046627.6	1872	10	149228	-1048	95968	1046	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_2	2.54950975679639	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTCTTGTGTCTTGTGTTA	6043	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115045574	115062339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_115046098_115052660_115052848_115055748_115055932_115058927_115059082_115061179
tx.19965	chr9	-	643	4	ISM	ENSMUSG00000032437.11	ENSMUST00000035010.10	4221	16	59576	1216	59576	-1216	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	727	junction_2	45.7238085319527	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTTCTGATGTGTAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115079913	115072864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_115073114_115075112_115075326_115077572_115077687_115079846
tx.19966	chr9	-	453	2	Intergenic	novelGene_1350	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTTGGCCTAGCATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115187928	115181535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_115181817_115187756
tx.19967	chr9	-	556	3	Intergenic	novelGene_1351	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTTGGCCTAGCATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115191248	115181535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_115181817_115187756_115187928_115191144
tx.19968	chr9	-	666	3	Intergenic	novelGene_1353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTGTCATGCAACCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116232227	116231045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_116231428_116231526_116231699_116232115
tx.19969	chr9	+	1262	5	ISM	ENSMUSG00000039285.13	ENSMUST00000134433.8	2499	7	-58	8754	22	71	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_4	16.3783393541592	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGGGTTGTGTCTTAATT	9607	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117869588	117880798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_117870027_117876480_117876702_117878377_117878504_117878964_117879065_117880421
tx.1997	chr10	-	2271	11	FSM	ENSMUSG00000055531.13	ENSMUST00000176670.8	2227	11	-37	-7	4	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_6	215.998518513438	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAAGCTGTTCACGTTATT	4478	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117212871	117184939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_117185373_117191839_117192030_117194897_117195052_117196344_117196461_117196760_117197266_117197678_117197790_117197918_117198093_117198879_117199026_117201985_117202090_117203683_117203894_117212743
tx.19970	chr9	+	3116	8	FSM	ENSMUSG00000039285.13	ENSMUST00000044454.12	3396	8	21	259	21	-259	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	57.0105611411838	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGATGTGAAATACTGTCC	9606	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117869587	117892648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_117870027_117876480_117876702_117878377_117878504_117878964_117879065_117880421_117880571_117884883_117884979_117888124_117888244_117890781
tx.19971	chr9	+	2102	9	NIC	ENSMUSG00000039285.13	novel	3396	8	NA	NA	0	67	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_7	60.328139164075	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTATTGTTTCAAGTTTTA	9643	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117869624	117891624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_117870027_117876480_117876702_117878377_117878504_117878964_117879065_117880421_117880571_117884883_117884979_117888124_117888244_117888687_117888735_117890781
tx.19972	chr9	-	444	3	ISM	ENSMUSG00000039163.11	ENSMUST00000215799.2	531	4	34731	-6	34731	6	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	173	junction_1	11	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTTCTGATTTATTAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117944500	117894156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_117894417_117904189_117904281_117944407
tx.19973	chr9	-	517	4	FSM	ENSMUSG00000039163.11	ENSMUST00000044220.11	1169	4	85	567	71	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_1	9.03081145609604	1992	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTTCTGATTTATTAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117979160	117894156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_117894417_117904189_117904281_117944407_117944498_117979084
tx.19974	chr9	-	463	4	NNC	ENSMUSG00000098161.2	novel	388	4	NA	NA	-55	25888	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	10	junction_1	21.6384431561566	69	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCATTTGATTAAATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118235222	118207276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_118207408_118233371_118233493_118233797_118233891_118235104
tx.19975	chr9	-	719	4	NNC	ENSMUSG00000098161.2	novel	388	4	NA	NA	-50	260	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_2	17.5562587763516	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATGTTGCGTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118235217	118232904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_118233232_118233371_118233558_118233797_118233891_118235104
tx.19976	chr9	-	658	4	NNC	ENSMUSG00000098161.2	novel	388	4	NA	NA	-60	254	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	32	junction_1	11.8602979164381	54	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGGCTTTATTTATGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118235227	118232910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_118233232_118233371_118233493_118233797_118233891_118235104
tx.19977	chr9	+	1874	10	ISM	ENSMUSG00000038708.11	ENSMUST00000084820.6	7583	24	53035	0	-1059	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_9	30.9587539226702	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATAGTGTTCATTGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118388369	118411587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_118388852_118389369_118389492_118389809_118389941_118394624_118394736_118396026_118396048_118396248_118396318_118398031_118398108_118401985_118402090_118406209_118406297_118410916
tx.19978	chr9	+	1737	2	ISM	ENSMUSG00000039115.14	ENSMUST00000155437.2	506	4	15737	-1580	15737	1169	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCCCCAAAAAAAAAAACAGT	5191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118716873	118727960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_118716952_118726301
tx.19979	chr9	+	2716	20	FSM	ENSMUSG00000038775.15	ENSMUST00000051386.13	2909	20	0	193	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	8.09945109456443	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGGTGTGGCACGTGTGCC	4707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118881845	118900394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_118881897_118886850_118886923_118887072_118887148_118887378_118887585_118889412_118889522_118890544_118890656_118890962_118891163_118891509_118891589_118891673_118891773_118892315_118892452_118892669_118892771_118894526_118894665_118894927_118895087_118895768_118895949_118896478_118896625_118897379_118897525_118898950_118899137_118899345_118899418_118899624_118899883_118900201
tx.1998	chr10	-	702	2	ISM	ENSMUSG00000055531.13	ENSMUST00000176670.8	2227	11	20909	-190	36	187	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	577	junction_1	0	391	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCCCTTGATTTTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117191925	117184756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_117185373_117191839
tx.19980	chr9	+	1594	10	NIC	ENSMUSG00000038775.15	novel	1645	11	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	5.59982363037962	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGGTGTGGCACGTGTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118892552	118900394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_118892670_118894526_118894665_118894927_118895087_118895768_118895949_118896478_118896625_118897379_118897525_118898950_118899137_118899345_118899418_118899624_118899883_118900201
tx.19981	chr9	+	1446	9	NIC	ENSMUSG00000038775.15	novel	1645	11	NA	NA	-2	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	4	junction_6	9.33993442161132	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGCACGTGTGCCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118892519	118900399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_118892670_118894526_118894665_118894927_118895087_118895768_118895949_118896478_118896625_118897379_118897525_118899345_118899418_118899624_118899883_118900201
tx.19982	chr9	+	1341	5	ISM	ENSMUSG00000038060.16	ENSMUST00000124213.8	2318	12	4	12440	4	-12440	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.82915619758885	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTTCGGTAAATCTCCAAC	4881	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118931549	118941923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_118931994_118934869_118935021_118939168_118939280_118941124_118941313_118941476
tx.19983	chr9	-	1624	12	FSM	ENSMUSG00000010651.5	ENSMUST00000010795.5	1689	12	46	19	46	-19	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_6	59.9400526973023	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTTGCAGTCATTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118986115	118977109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_118977482_118977801_118977948_118978029_118978086_118978338_118978519_118978667_118978859_118979891_118979973_118980883_118980983_118982737_118982781_118982993_118983074_118984812_118984871_118985658_118985753_118985891
tx.19984	chr9	-	1311	7	NNC	ENSMUSG00000092212.4	novel	1458	6	NA	NA	7942	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	7	junction_2	1.89296944860009	25	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGTTGTACTGTCTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119052816	119049553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_119049990_119050186_119050403_119051512_119051622_119051804_119052020_119052238_119052334_119052418_119052540_119052697
tx.19985	chr9	+	1275	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000092212.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAACCTAAGGGCATTGAAT	658	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119053536	119058902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_119053682_119057772
tx.19986	chr9	-	944	4	ISM	ENSMUSG00000036737.13	ENSMUST00000040853.11	4647	18	265	45692	160	-41356	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	257	junction_1	13.4742552876052	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAATTTACTTTCTGCCAA	5837	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119151228	119113189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_119113754_119123480_119123590_119133870_119133984_119151070
tx.19987	chr9	-	1935	6	FSM	ENSMUSG00000032508.9	ENSMUST00000035092.7	1960	6	21	4	-18	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_3	6.61513416341649	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACTTGTGACTGACGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119169086	119165003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_119165966_119166400_119166577_119166819_119166912_119167071_119167253_119167641_119167777_119168697
tx.19988	chr9	+	1645	12	FSM	ENSMUSG00000036138.17	ENSMUST00000039784.12	1762	12	113	4	-7	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	245	junction_2	23.8777880116768	190	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGGTGCTTGTCATTTCC	7841	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119170472	119179361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_119170752_119170890_119170985_119171788_119171847_119173238_119173319_119173531_119173575_119175535_119175635_119176795_119176877_119177646_119177838_119177986_119178167_119178419_119178476_119178557_119178704_119179023
tx.19989	chr9	+	3115	18	FSM	ENSMUSG00000035769.10	ENSMUST00000215822.2	3134	18	16	3	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	17.3265002945415	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAAAATCCACCTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119186650	119222392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_119186774_119188297_119188381_119193562_119193644_119196554_119196642_119197137_119197267_119198685_119198752_119200981_119201055_119203365_119203485_119207309_119207392_119209051_119209093_119209649_119209766_119210567_119210684_119211319_119211394_119212402_119212500_119215384_119215444_119217746_119217835_119219495_119219591_119220806
tx.1999	chr10	-	2347	10	FSM	ENSMUSG00000055531.13	ENSMUST00000069168.13	6526	10	0	4179	0	187	multi-exon	FALSE	canonical	3	507	junction_5	44.0656076524286	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCCCTTGATTTTGATA	4474	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117212875	117184756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_117185373_117191839_117192030_117194897_117195052_117196344_117196461_117196760_117197266_117197918_117198093_117198879_117199026_117201985_117202090_117203683_117203894_117212743
tx.19990	chr9	+	3219	19	FSM	ENSMUSG00000035769.10	ENSMUST00000039610.10	3383	19	170	-6	-18	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_3	12.9909750249458	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAAAATCCACCTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119186616	119222392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_119186774_119188297_119188381_119190179_119190250_119193562_119193644_119196554_119196642_119197137_119197267_119198685_119198752_119200981_119201055_119203365_119203485_119207309_119207392_119209051_119209093_119209649_119209766_119210567_119210684_119211319_119211394_119212402_119212500_119215384_119215444_119217746_119217835_119219495_119219591_119220806
tx.19991	chr9	+	1351	9	ISM	ENSMUSG00000061393.15	ENSMUST00000215746.2	3175	11	25520	1465	-2382	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_1	25.3167434714657	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTGTGTTTTGTTTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119257029	119262596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_119257143_119257266_119257419_119257490_119257635_119258930_119259075_119259285_119259435_119260289_119260405_119261554_119261694_119261778_119261910_119262332
tx.19992	chr9	+	2604	7	FSM	ENSMUSG00000042787.16	ENSMUST00000164213.5	2571	7	-32	-1	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	23.8706002345051	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACGCCTGACTGCATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119273993	119293305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_119274217_119274352_119274388_119276014_119276165_119277454_119277595_119278843_119278921_119281293_119281409_119291441
tx.19993	chr9	+	2686	8	NIC	ENSMUSG00000042787.16	novel	2624	7	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	31	junction_2	21.0092302358283	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACGCCTGACTGCATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119274025	119293305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_119274217_119274352_119274388_119274753_119274868_119276014_119276165_119277454_119277595_119278843_119278921_119281293_119281409_119291441
tx.19994	chr9	+	774	8	ISM	ENSMUSG00000032512.8	ENSMUST00000217472.2	2997	16	-7	12528	-7	5062	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	268	junction_5	18.2890621935179	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGAAGGTGTTTGGGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119723953	119738496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_119724024_119731351_119731493_119733343_119733423_119734268_119734352_119734433_119734564_119736193_119736283_119736751_119736854_119738416
tx.19995	chr9	+	3837	19	FSM	ENSMUSG00000032512.8	ENSMUST00000036561.8	3845	19	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_17	23.7904950415284	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCAGTGTGCTGGACATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119723951	119755652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_119724024_119731351_119731493_119733343_119733423_119734268_119734352_119734433_119734564_119736193_119736283_119736751_119736854_119738416_119738642_119740089_119740165_119741432_119741536_119742693_119742792_119745791_119745900_119746176_119746274_119747527_119747624_119748714_119748821_119749622_119749711_119751683_119751761_119753143_119753334_119753774
tx.19996	chr9	+	1168	2	ISM	ENSMUSG00000032512.8	ENSMUST00000215307.2	3776	19	29173	900	2781	-551	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	251	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGTGGTTCATGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119753144	119754753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_119753334_119753774
tx.19997	chr9	-	1968	4	ISM	ENSMUSG00000032513.9	ENSMUST00000035099.9	3906	9	7800	1331	3087	-1331	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_2	7.58653778449403	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTTGTAACTAAAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119758831	119755653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_119757103_119757292_119757446_119757878_119758030_119758616
tx.19998	chr9	-	2562	9	FSM	ENSMUSG00000032513.9	ENSMUST00000035099.9	3906	9	13	1331	-2	-1331	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_5	11.0898320546346	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTTGTAACTAAAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119766618	119755653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_119757103_119757292_119757446_119757878_119758030_119758616_119758828_119759038_119759170_119759285_119759373_119761686_119761891_119762327_119762409_119766523
tx.19999	chr9	-	2949	5	NIC	ENSMUSG00000032515.9	novel	2906	5	NA	NA	-56	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	17	junction_4	4.71036092035419	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGGTCTTCTTGGTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119813780	119800228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_119802278_119802429_119802745_119803219_119803480_119806067_119806312_119813699
tx.2	chr1	-	608	3	ISM	ENSMUSG00000033845.14	ENSMUST00000115538.5	910	5	3113	0	1940	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2059	junction_1	28	1666	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACTGCTCAGGTCTTTTG	4733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4852849	4846599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_4847025_4847747_4847872_4852790
tx.20	chr1	-	1757	2	Intergenic	novelGene_1	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCAGTGCAACTAGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9615443	9613146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_9614799_9615338
tx.200	chr1	+	3201	11	NNC	ENSMUSG00000041684.12	novel	3313	11	NA	NA	-5	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19.7139544485626	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTACTTTTAATCCTATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44158154	44183666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_44158356_44159333_44159435_44165525_44166027_44166797_44166925_44167887_44167984_44168419_44168525_44168742_44168838_44176143_44176277_44177732_44177820_44180937_44181035_44182008
tx.2000	chr10	-	2350	10	NIC	ENSMUSG00000055531.13	novel	6526	10	NA	NA	0	187	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	201	junction_2	131.387279764636	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCCCTTGATTTTGATA	4474	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117212875	117184756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_117185373_117191839_117192033_117194897_117195052_117196344_117196461_117196760_117197266_117197918_117198093_117198879_117199026_117201985_117202090_117203683_117203894_117212743
tx.20000	chr9	+	1031	7	FSM	ENSMUSG00000032518.7	ENSMUST00000035105.7	1938	7	98	809	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2998	junction_3	1065.2190176464	45858	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATGGTCCTCACTGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119956852	119960626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_119956897_119957522_119957689_119958223_119958343_119959183_119959430_119959833_119959963_119960065_119960232_119960465
tx.20001	chr9	+	1021	7	NNC	ENSMUSG00000032518.7	novel	1938	7	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1904.74457313543	448	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTATGGTCCTCACTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119956852	119960625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_119956897_119957522_119957689_119958223_119958343_119959183_119959430_119959833_119959963_119960074_119960232_119960465
tx.20002	chr9	+	892	4	FSM	ENSMUSG00000006941.6	ENSMUST00000007139.6	1035	4	140	3	140	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	407	junction_2	26.9608770051883	672	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCCAGCAATGCACTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120321696	120324393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_120321908_120323172_120323337_120323600_120323703_120323978
tx.20003	chr9	+	731	6	FSM	ENSMUSG00000025794.10	ENSMUST00000165532.3	1009	6	59	219	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10044	junction_1	2651.61525112525	58148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATGTGTGGACTCTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120400568	120403501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_120400608_120401161_120401264_120401833_120401929_120402641_120402742_120402829_120402884_120403160
tx.20004	chr9	+	693	5	FSM	ENSMUSG00000025794.10	ENSMUST00000213310.2	1271	5	581	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14823	junction_3	1143.83114466253	2884	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATGTGTGGACTCTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120401160	120403501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_120401264_120401833_120401929_120402641_120402742_120402829_120402884_120403160
tx.20005	chr9	-	1928	2	NNC	ENSMUSG00000111831.2	novel	790	2	NA	NA	6452	1530	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTTTTATCAGCGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120573757	120571125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_120572855_120573558
tx.20006	chr9	-	1922	2	FSM	ENSMUSG00000111831.2	ENSMUST00000215385.2	790	2	398	-1530	398	1530	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCTTTTATCAGCGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120579811	120571125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_120572855_120579618
tx.20007	chr9	+	3535	15	FSM	ENSMUSG00000006932.18	ENSMUST00000007130.15	3623	15	88	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	499	junction_2	74.0160283248135	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGTCATTTTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120762553	120789573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_120762705_120779238_120779300_120779587_120779816_120779959_120780214_120780332_120780572_120780651_120780854_120781924_120782070_120784213_120784318_120784394_120784734_120784879_120785039_120786172_120786293_120786582_120786734_120786824_120786947_120787657_120787719_120788374
tx.20008	chr9	+	1649	5	ISM	ENSMUSG00000006932.18	ENSMUST00000163844.8	2222	14	6887	-987	241	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	658	junction_2	26.9536639438871	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTTGTGTCATTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120786173	120789570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_120786293_120786582_120786734_120786824_120786947_120787657_120787719_120788374
tx.20009	chr9	+	1463	4	ISM	ENSMUSG00000006932.18	ENSMUST00000163844.8	2222	14	7366	-990	720	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	658	junction_1	29.4731516242608	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGTCATTTTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120786652	120789573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_120786734_120786824_120786947_120787657_120787719_120788374
tx.2001	chr10	-	1467	2	ISM	ENSMUSG00000055531.13	ENSMUST00000177145.8	3819	9	-36	12843	6	-470	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	603	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAGAAGAAGAAGAAGA	4480	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117212869	117202552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_117203894_117212743
tx.20010	chr9	+	1381	3	ISM	ENSMUSG00000006932.18	ENSMUST00000163844.8	2222	14	7537	-988	891	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	713	junction_2	6.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTTGTGTCATTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120786823	120789571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_120786947_120787657_120787719_120788374
tx.20011	chr9	-	677	4	ISM	ENSMUSG00000040936.16	ENSMUST00000164336.8	4629	34	-13	163562	-13	-105730	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_2	6.0184900284226	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAACTGTCTATGGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121106276	121095171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_121095414_121095579_121095680_121101938_121102123_121106125
tx.20012	chr9	+	151	2	NNC	ENSMUSG00000032536.13	novel	510	3	NA	NA	48	-45926	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCCTCCCCACTCCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121143351	121147247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_121143426_121147170
tx.20013	chr9	+	207	2	FSM	ENSMUSG00000032526.12	ENSMUST00000215966.2	2316	2	-12	2121	5	-2007	multi-exon	FALSE	canonical	3	377	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTCCAGTAAGTGCCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121539399	121539773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_121539538_121539704
tx.20014	chr9	+	569	3	FSM	ENSMUSG00000032526.12	ENSMUST00000035113.11	577	3	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	377	junction_1	21	707	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGTGTCCCATGTCAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121539402	121541987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_121539538_121539704_121539782_121541630
tx.20015	chr9	+	719	2	FSM	ENSMUSG00000032526.12	ENSMUST00000214535.2	1175	2	-11	467	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	419	junction_1	0	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGTGTCCCATGTCAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121539419	121541987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_121539782_121541630
tx.20016	chr9	-	514	4	FSM	ENSMUSG00000038412.9	ENSMUST00000060251.8	2232	4	746	972	-3	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2040	junction_3	82.3825763671475	7970	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACGGTATTGAATATTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121686682	121678600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_121678756_121679253_121679389_121681556_121681676_121686577
tx.20017	chr9	+	2530	4	FSM	ENSMUSG00000043773.6	ENSMUST00000063103.5	1642	4	-886	-2	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	3.2659863237109	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGTCATGATGT	6284	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121766314	121776082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_121767229_121768484_121768568_121769749_121769877_121774676
tx.20018	chr9	-	2363	2	FSM	ENSMUSG00000066235.8	ENSMUST00000084743.7	2365	2	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAAGTCTTTTTCTGATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121825089	121810674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_121812890_121824941
tx.20019	chr9	-	2613	13	FSM	ENSMUSG00000037949.9	ENSMUST00000042546.4	2653	13	27	13	-10	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	6.44797556515911	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCTCCAAGACTTGGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122123462	122004952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_122005545_122030836_122030954_122080212_122080342_122082001_122082194_122086121_122086305_122087982_122088058_122088600_122088657_122090149_122090720_122092735_122092856_122100264_122100400_122101432_122101631_122104576_122104730_122123369
tx.2002	chr10	+	2055	3	FSM	ENSMUSG00000020183.12	ENSMUST00000141991.2	2006	3	-38	-11	-38	11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTTGTGTAAATGCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117511759	117520850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_117511998_117515867_117516017_117519182
tx.20020	chr9	-	303	2	ISM	ENSMUSG00000037949.9	ENSMUST00000216670.2	2108	12	18710	23750	-11979	3503	internal_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCGGGCCTTCACCTATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122104730	122101481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_122101631_122104576
tx.20021	chr9	-	390	3	ISM	ENSMUSG00000037949.9	ENSMUST00000216670.2	2108	12	-17	23750	-5	3503	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	4.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGCGGGCCTTCACCTATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122123457	122101481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_122101631_122104576_122104730_122123369
tx.20022	chr9	+	542	3	Intergenic	novelGene_1357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGGCCTGCTTTATAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122142452	122149148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_122142659_122146870_122146956_122148897
tx.20023	chr9	+	1346	7	FSM	ENSMUSG00000032540.17	ENSMUST00000156520.8	3157	7	119	1692	-3	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_5	12.9925192151313	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGATTTTTCAGCTGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122180791	122208897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_122180905_122194200_122194287_122196953_122197327_122204970_122205126_122206923_122207036_122207886_122208074_122208577
tx.20024	chr9	+	2927	6	ISM	ENSMUSG00000032540.17	ENSMUST00000156520.8	3157	7	13526	0	1481	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_4	13.1392541645255	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGTGGGTGAGCTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122194198	122210589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_122194287_122196953_122197327_122204970_122205126_122206923_122207036_122207886_122208074_122208577
tx.20025	chr9	+	3030	11	FSM	ENSMUSG00000046603.17	ENSMUST00000052740.14	3049	11	17	2	-5	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	5.03984126734166	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTGCGTTCCAGGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122634620	122665397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_122634754_122637831_122637902_122640822_122640959_122643496_122643654_122647838_122648092_122653527_122653651_122655257_122655356_122655911_122656004_122660684_122660924_122662590_122662723_122663800
tx.20026	chr9	-	1215	7	NNC	ENSMUSG00000047036.9	novel	1220	6	NA	NA	-5	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	53.3835700900151	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCGGTCATGTTCTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122695055	122673587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_122673709_122683771_122683883_122685763_122685891_122686167_122686227_122686534_122686704_122690773_122691325_122694978
tx.20027	chr9	-	1328	7	NIC	ENSMUSG00000047036.9	novel	1220	6	NA	NA	5	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_1	51.4025507365366	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGAGCGGTCATGTTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122695045	122673588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_122673712_122683771_122683883_122685763_122685891_122686131_122686227_122686534_122686704_122690773_122691410_122694978
tx.20028	chr9	+	2017	4	FSM	ENSMUSG00000057895.12	ENSMUST00000051667.14	2010	4	-10	3	-10	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_1	7.71722460186015	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGACTTTGTTTTAACTG	4864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122752126	122760090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_122752284_122754072_122754362_122755374_122755520_122758664
tx.20029	chr9	-	908	3	FSM	ENSMUSG00000032551.8	ENSMUST00000035154.4	3361	3	5	2448	5	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	10	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTGTCTTAGTCACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122780060	122776601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_122777174_122777989_122778135_122779869
tx.2003	chr10	-	3121	11	NNC	ENSMUSG00000020184.16	novel	3145	12	NA	NA	17	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	157.605488483111	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATTTGTCTTACACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117546180	117524796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_117526691_117527049_117527128_117528486_117528643_117530809_117530974_117531857_117531955_117532285_117532345_117537469_117537520_117538106_117538241_117541059_117541130_117545600_117545690_117545850
tx.20030	chr9	+	460	3	FSM	ENSMUSG00000066233.7	ENSMUST00000213514.2	631	3	-38	209	11	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGAATTTGAGGGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122850401	122852561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_122850636_122851230_122851378_122852482
tx.20031	chr9	+	1030	3	FSM	ENSMUSG00000066233.7	ENSMUST00000084733.7	1041	3	15	-4	15	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	1.5	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGATATGGAATTTGAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122850405	122852556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_122850636_122851230_122851378_122851903
tx.20032	chr9	+	2335	3	ISM	ENSMUSG00000025787.7	ENSMUST00000128572.2	1027	5	4461	-1430	4461	1430	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTTGTGTGTGTTTAAA	30	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122873957	122879530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_122874162_122875548_122875668_122877518
tx.20034	chr9	+	1025	8	FSM	ENSMUSG00000025785.6	ENSMUST00000026891.5	1053	8	28	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1140	junction_3	103.377058995362	1785	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTGTTGTTAGCATCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122942307	122965194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_122942388_122947955_122948058_122948305_122948401_122956870_122957037_122959588_122959660_122959891_122960016_122960949_122961106_122964963
tx.20035	chr9	+	827	6	ISM	ENSMUSG00000025785.6	ENSMUST00000026891.5	1053	8	6042	0	5955	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1140	junction_1	108.904361712468	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTGTTGTTAGCATCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122948321	122965194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_122948401_122956870_122957037_122959588_122959660_122959891_122960016_122960949_122961106_122964963
tx.20036	chr9	+	771	3	NNC	ENSMUSG00000035202.9	novel	3894	21	NA	NA	-21	-1300	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	30	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCATTGGTCTGGGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123195970	123202873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_123196173_123200919_123201169_123202553
tx.20037	chr9	+	1013	5	ISM	ENSMUSG00000035202.9	ENSMUST00000038863.9	3894	21	6	67346	3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_4	7.58287544405155	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTGGTCCTTTAGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123195997	123224383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_123196173_123200919_123201169_123206765_123206895_123221847_123221940_123224015
tx.20038	chr9	+	3543	20	NNC	ENSMUSG00000025240.11	novel	3558	20	NA	NA	19	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	65.5828756109947	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCTGTTGGTACTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123358842	123421665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_123358987_123371408_123371507_123376048_123376124_123377926_123378055_123381732_123381883_123388289_123388350_123389630_123389665_123395455_123395558_123397988_123398079_123399013_123399101_123399561_123399631_123406041_123406122_123408013_123408113_123411312_123411452_123414151_123414222_123414349_123414423_123415408_123415503_123415626_123415720_123416609_123416668_123419865
tx.20039	chr9	-	590	3	ISM	ENSMUSG00000025245.15	ENSMUST00000168921.2	739	7	10467	-401	6011	401	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_1	9	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAATTTATCTAATCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123531223	123528716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_123529169_123529934_123530039_123531189
tx.2004	chr10	-	3034	12	NNC	ENSMUSG00000020184.16	novel	3145	12	NA	NA	0	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	156.248795036676	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATTTGTCTTACACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117546616	117524796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_117526691_117527049_117527128_117528486_117528643_117530809_117530974_117531857_117531955_117532285_117532345_117537469_117537520_117538106_117538241_117541059_117541130_117545600_117545690_117545850_117545934_117546456
tx.20040	chr9	-	1331	9	ISM	ENSMUSG00000025245.15	ENSMUST00000026274.14	4070	10	2200	2640	2103	401	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_4	7.36439916082772	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAATTTATCTAATCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123544490	123528716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_123529169_123529934_123530039_123531189_123531367_123536973_123537052_123537137_123537204_123538618_123538691_123540100_123540162_123541494_123541690_123544364
tx.20041	chr9	-	1397	10	FSM	ENSMUSG00000025245.15	ENSMUST00000026274.14	4070	10	33	2640	-10	401	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_9	8.45905169363301	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAATTTATCTAATCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123546657	123528716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_123529169_123529934_123530039_123531189_123531367_123536973_123537052_123537137_123537204_123538618_123538691_123540100_123540162_123541494_123541690_123544364_123544490_123546590
tx.20042	chr9	-	516	4	FSM	ENSMUSG00000110834.2	ENSMUST00000214845.2	461	4	-49	-6	-49	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	43.70608907489	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCTATGAGTACTGGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124044818	124032981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_124033196_124033755_124033817_124033999_124034127_124044704
tx.20043	chr9	-	331	2	ISM	ENSMUSG00000110834.2	ENSMUST00000214845.2	461	4	10642	626	10642	-626	internal_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_1	0	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCAATGTCAGGTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124034127	124033613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_124033817_124033999
tx.20044	chr9	-	923	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000093803.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	70	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAAATCCTTGGCCCGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124198154	124195480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_124196190_124197940
tx.20045	chr9	-	612	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000093803.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGGGAGTGATGGCGTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124198445	124195693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_124196190_124198329
tx.20046	chr9	+	1446	12	NNC	ENSMUSG00000093803.6	novel	4016	11	NA	NA	-697	1097	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	98	junction_4	34.2887592115034	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGGGTGCACAGTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124197231	124202493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_124197351_124197648_124197753_124197928_124198032_124198703_124198779_124199151_124199239_124199674_124199832_124200091_124200141_124200416_124200507_124200880_124201057_124201276_124201396_124201794_124201908_124202239
tx.20047	chr9	+	1226	10	NNC	ENSMUSG00000093803.6	novel	385	3	NA	NA	-282	1097	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	57.5924377751879	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGGGTGCACAGTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124197646	124202493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_124197753_124198703_124198779_124199151_124199239_124199674_124199832_124200091_124200141_124200416_124200507_124200880_124201057_124201276_124201396_124201794_124201908_124202239
tx.20048	chr9	+	950	7	NNC	ENSMUSG00000093803.6	novel	4016	11	NA	NA	-734	1097	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	161	junction_1	10.1434160364686	31	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGGGTGCACAGTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124199682	124202493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_124199832_124200091_124200141_124200416_124200507_124200880_124201057_124201276_124201396_124201794_124201908_124202239
tx.20049	chr9	-	897	2	Intergenic	novelGene_1358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTATCGTACAATGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124239773	124202999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_124203757_124239633
tx.2005	chr10	-	773	5	NNC	ENSMUSG00000020184.16	novel	3007	10	NA	NA	48	825	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	230.280264026251	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCACAAACCTTTGAGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117546149	117537338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_117537520_117538106_117538241_117541059_117541130_117545600_117545690_117545850
tx.20050	chrUn_JH584304v1	-	511	2	Intergenic	novelGene_1359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	296	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATCTTCTGTCTTCCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53865	52186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrUn_JH584304v1_-_52368_53535
tx.20051	chrUn_JH584304v1	-	2660	6	Intergenic	novelGene_1360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_3	309.65464634008	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCATAGCTTTGAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59694	52668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrUn_JH584304v1_-_54480_54720_54868_55111_55249_55511_55702_58563_58836_59591
tx.20052	chrUn_JH584304v1	-	271	2	Intergenic	novelGene_1361	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	671	junction_1	0	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGCAAGTGAGCAAGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59723	58696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrUn_JH584304v1_-_58836_59591
tx.20053	chrUn_MU069435v1	+	248	3	Intergenic	novelGene_1362	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_1	109.5	313	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTAGCAGTTGTAGGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3309	7362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrUn_MU069435v1_+_3351_3591_3670_7233
tx.20054	chrUn_MU069435v1	+	211	2	Intergenic	novelGene_1363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	358	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTAGCAGTTGTAGGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3587	7362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrUn_MU069435v1_+_3670_7233
tx.20055	chrUn_MU069435v1	+	491	2	Intergenic	novelGene_1364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTCTCCAGCTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14904	22056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrUn_MU069435v1_+_15016_21676
tx.20056	chrUn_MU069435v1	-	1152	2	Intergenic	novelGene_1365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAACAAAAATGAATTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28442	27092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrUn_MU069435v1_-_27800_27997
tx.20057	chrUn_MU069435v1	-	965	2	Intergenic	novelGene_1366	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAAGAAAGAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28442	27284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrUn_MU069435v1_-_27805_27997
tx.20058	chrX	+	1813	2	FSM	ENSMUSG00000073295.5	ENSMUST00000103007.4	3036	2	864	359	864	-359	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTAGAAGTTACTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5960370	5966805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_5960459_5965080
tx.20059	chrX	-	1824	2	FSM	ENSMUSG00000073294.5	ENSMUST00000101698.4	1838	2	10	4	10	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTAGTCTCTTTGTTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5995463	5993276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_5994830_5995192
tx.2006	chr10	+	964	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060181.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTCATTATCTGCAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117564271	117571820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_117564404_117565890_117566224_117571321
tx.20060	chrX	-	1182	2	FSM	ENSMUSG00000073293.5	ENSMUST00000103006.4	1775	2	586	7	586	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAAATGCTGGAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6084483	6080756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_6081851_6084395
tx.20061	chrX	-	553	2	ISM	ENSMUSG00000004317.15	ENSMUST00000004428.14	8390	12	27273	5663	27232	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGTTTGTTCTTTAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7027680	7025711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_7026059_7027474
tx.20062	chrX	-	530	2	FSM	ENSMUSG00000063018.7	ENSMUST00000128571.2	540	2	14	-4	14	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_1	0	686	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTGGCTTATTATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7289213	7278337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_7278772_7289117
tx.20063	chrX	-	726	3	ISM	ENSMUSG00000063018.7	ENSMUST00000150671.2	885	4	15500	-7	-6655	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_1	10.5	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTGGCTTATTATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7295882	7278337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_7278772_7290368_7290524_7295745
tx.20064	chrX	+	1223	3	FSM	ENSMUSG00000039545.17	ENSMUST00000144719.9	3467	3	-367	2611	-367	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTTTGCAAACGGGAGTG	9706	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7439471	7444655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_7440149_7443926_7443964_7444146
tx.20065	chrX	-	2227	17	FSM	ENSMUSG00000031143.5	ENSMUST00000033483.5	2353	17	126	0	126	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	186	junction_12	25.3807721267498	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACGCTTAGGCATGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7471630	7460047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_7460407_7460768_7460844_7460922_7460983_7461198_7461295_7461534_7461643_7461724_7461827_7461943_7462061_7462141_7462262_7462732_7462853_7462969_7463033_7463776_7463972_7465396_7465576_7465672_7465740_7465867_7465975_7466859_7466993_7470398_7470577_7471482
tx.20066	chrX	+	217	2	NNC	ENSMUSG00000031144.16	novel	2591	7	NA	NA	5228	-1255	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTACCTTCACCCACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7515375	7518240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_7515428_7518075
tx.20067	chrX	+	2190	9	FSM	ENSMUSG00000031145.16	ENSMUST00000033485.14	2301	9	106	5	106	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_3	5.54526825320471	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTATTTTTATTGTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7523604	7534192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_7523740_7524859_7524946_7525774_7525959_7529703_7529818_7530091_7530230_7531168_7531373_7531465_7531653_7532510_7532811_7533350
tx.20068	chrX	+	891	2	FSM	ENSMUSG00000031145.16	ENSMUST00000153994.2	500	2	352	-743	352	-73	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGATCCAATGGTTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7532688	7534119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_7532811_7533350
tx.20069	chrX	-	1124	5	FSM	ENSMUSG00000031146.7	ENSMUST00000033486.6	1157	5	30	3	12	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2052	junction_4	105.587641322268	4513	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGAATAAGTTAACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7537599	7534182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_7534746_7535165_7535257_7535653_7535750_7535841_7535998_7537381
tx.2007	chr10	-	517	2	ISM	ENSMUSG00000052798.14	ENSMUST00000218576.2	3092	28	41175	0	9868	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1034	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAGAGTTTTCTCTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117587394	117586525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_117586873_117587224
tx.20070	chrX	+	3521	11	FSM	ENSMUSG00000031148.15	ENSMUST00000049896.13	3579	11	57	1	57	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	223	junction_9	32.218007387174	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTCGCATTTGTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7563426	7576500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_7563635_7564731_7564893_7564994_7565120_7568301_7568412_7569608_7569823_7571538_7571672_7572249_7572389_7572566_7572691_7572930_7573001_7574174_7574261_7574349
tx.20071	chrX	+	1575	11	FSM	ENSMUSG00000039382.13	ENSMUST00000043045.10	1609	11	16	18	2	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_1	40.4807361593141	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATGACTTGACCTCAAGG	4022	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7588471	7594427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_7588618_7590087_7590160_7590262_7590338_7590425_7590531_7592169_7592276_7592436_7592532_7592924_7593005_7593116_7593326_7593408_7593511_7593585_7593732_7593988
tx.20072	chrX	+	1221	3	FSM	ENSMUSG00000031149.8	ENSMUST00000033489.8	1339	3	118	0	118	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	755	junction_2	75.5	542	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGGCCTCCTGTGTGAAG	1288	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7594795	7597303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_7595002_7595954_7596173_7596506
tx.20073	chrX	+	1549	2	ISM	ENSMUSG00000031149.8	ENSMUST00000033489.8	1339	3	122	2	122	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	906	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTTTGGCCTCCTGTGTGA	1292	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7594799	7597301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_7595002_7595954
tx.20074	chrX	-	176	2	Intergenic	novelGene_1367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TTAAAAAAAAAAGAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7627670	7623612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_7623664_7627545
tx.20075	chrX	+	3268	10	FSM	ENSMUSG00000000134.18	ENSMUST00000077680.10	3277	10	9	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	227	junction_1	30.4046780026437	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGAGTCTCCCGTTCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7628905	7641441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_7629300_7631745_7631860_7632793_7633095_7633677_7633924_7634131_7634237_7635668_7635787_7637012_7637070_7637233_7637310_7638687_7638836_7639732
tx.20076	chrX	+	625	7	ISM	ENSMUSG00000031153.17	ENSMUST00000132456.8	2972	24	-17	19646	-5	5766	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_4	10.9949483349804	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGCTCTGGGAGCAGCTAC	3266	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7656239	7666549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_7656308_7658308_7658376_7658514_7658577_7660498_7660526_7661230_7661339_7665528_7665668_7666395
tx.20077	chrX	+	1216	6	ISM	ENSMUSG00000031154.16	ENSMUST00000115666.8	2471	9	647	2322	-102	-2322	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	410	junction_1	34.3592782229196	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCTTCAGTGATCCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7708741	7738777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_7708950_7722542_7722637_7733753_7733819_7733905_7734063_7734161_7734311_7738234
tx.20078	chrX	+	1833	9	FSM	ENSMUSG00000031154.16	ENSMUST00000033494.16	4259	9	678	1748	-96	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	377	junction_8	48.0999935031181	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCATGGCAACGTTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7708747	7741117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_7708950_7722542_7722637_7733753_7733819_7733905_7734063_7734161_7734311_7738234_7738439_7739792_7739995_7740078_7740193_7740471
tx.20079	chrX	-	492	3	ISM	ENSMUSG00000031157.11	ENSMUST00000115655.8	1148	7	3296	-63	3213	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	539	junction_2	23	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGAGGCTTGAGTGCTT	3882	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7761922	7760758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_7761107_7761403_7761468_7761842
tx.2008	chr10	-	3114	28	FSM	ENSMUSG00000052798.14	ENSMUST00000064848.7	3114	28	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	716	junction_19	68.4831139760951	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAGAGTTTTCTCTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117628610	117586525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_117586873_117587224_117587393_117593171_117593286_117593800_117593927_117595076_117595238_117597149_117597253_117597927_117598041_117599635_117599787_117600221_117600261_117601815_117601935_117602238_117602309_117606092_117606142_117606280_117606427_117607238_117607299_117608959_117609037_117609180_117609272_117610360_117610475_117612115_117612195_117613033_117613123_117613497_117613570_117616582_117616632_117617225_117617354_117617861_117617966_117620899_117621045_117623697_117623817_117625878_117625966_117626371_117626464_117628508
tx.20080	chrX	-	1003	6	FSM	ENSMUSG00000031157.11	ENSMUST00000115654.8	1374	6	562	-191	259	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	504	junction_3	27.695486996982	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGAGGCTTGAGTGCTT	928	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7764876	7760758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_7761107_7761403_7761468_7761842_7762122_7762231_7762345_7762539_7762652_7764789
tx.20081	chrX	-	1191	7	FSM	ENSMUSG00000031157.11	ENSMUST00000115655.8	1148	7	20	-63	20	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	349	junction_6	78.4950458450864	597	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGAGGCTTGAGTGCTT	606	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7765198	7760758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_7761107_7761403_7761468_7761842_7762122_7762231_7762345_7762539_7762652_7764789_7764876_7765009
tx.20082	chrX	-	1037	7	FSM	ENSMUSG00000031157.11	ENSMUST00000156741.8	763	7	0	-274	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_6	182.287014226345	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGAGGCTTGAGTGCTT	565	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7765239	7760758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_7761107_7761403_7761468_7761842_7762122_7762231_7762345_7762539_7762652_7764789_7764876_7765204
tx.20083	chrX	-	1093	7	FSM	ENSMUSG00000031157.11	ENSMUST00000033497.9	1104	7	10	1	10	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_6	154.654902569847	206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGAGGCTTGAGTGCTT	306	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7765498	7760758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_7761107_7761403_7761468_7761842_7762122_7762231_7762345_7762539_7762652_7764789_7764876_7765407
tx.20084	chrX	+	897	6	FSM	ENSMUSG00000031158.12	ENSMUST00000033498.10	2381	6	0	1484	0	-103	multi-exon	FALSE	canonical	3	843	junction_3	44.2511016812011	3287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTATGTCTGCCTTCAGT	1189	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7765595	7773106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_7765709_7767199_7767300_7769911_7769976_7772309_7772439_7772519_7772631_7772726
tx.20085	chrX	+	540	2	ISM	ENSMUSG00000039278.11	ENSMUST00000041096.4	2193	3	2481	1175	2481	-1175	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTTGTCTGAGCGCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7788541	7789474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_7788754_7789146
tx.20087	chrX	-	395	3	ISM	ENSMUSG00000031161.16	ENSMUST00000137499.8	5037	27	4	16818	4	52	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	285	junction_2	65	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGCTGAAGAGGACCTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7814073	7813180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_7813271_7813363_7813484_7813888
tx.20088	chrX	+	821	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031162.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTATGTCTTTTTCGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7818344	7843234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_7818511_7820013_7820112_7842677
tx.20089	chrX	-	978	4	NNC	ENSMUSG00000031163.3	novel	673	4	NA	NA	2658	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	19.4821855949366	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCTCACTCTTGGCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7882073	7870438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_7870742_7871941_7872098_7881456_7881548_7881645
tx.2009	chr10	-	2022	8	FSM	ENSMUSG00000052681.9	ENSMUST00000064667.9	2724	8	105	597	105	-597	multi-exon	FALSE	canonical	3	789	junction_2	110.417205107146	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAATAGGTGTTATTTTAC	8710	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117681835	117650372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_117651686_117653248_117653366_117654370_117654515_117656366_117656508_117657494_117657552_117658705_117658775_117660498_117660580_117681735
tx.20090	chrX	-	954	4	NNC	ENSMUSG00000031163.3	novel	673	4	NA	NA	2660	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_3	9.28559218478941	41	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTTCCTCACTCTTGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7882071	7870441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_7870742_7871941_7872098_7881456_7881595_7881711
tx.20091	chrX	+	695	3	ISM	ENSMUSG00000087193.8	ENSMUST00000188632.2	1177	4	-3	1767	-3	-1052	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	9.5	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCCAGGTGTTTTCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7917826	7937428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_7917897_7926454_7926526_7936874
tx.20092	chrX	+	1112	3	NIC	ENSMUSG00000087193.8	novel	1177	4	NA	NA	-3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	67	junction_1	23	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGGGCCACTGGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7917826	7939198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_7917897_7936874_7937304_7938585
tx.20093	chrX	-	2713	6	FSM	ENSMUSG00000039231.19	ENSMUST00000115638.10	3116	6	143	260	4	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_5	11.3947356265953	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGAGATTTGGGAGATTG	6996	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7940856	7927669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_7929223_7929934_7930065_7930149_7930297_7936826_7937490_7938561_7938708_7940782
tx.20094	chrX	-	1031	3	ISM	ENSMUSG00000039231.19	ENSMUST00000115636.4	2707	4	117	3026	9	-6	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_2	13	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGTATTCTGACCTCTG	7001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7940851	7936673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_7937490_7938561_7938708_7940782
tx.20095	chrX	-	3720	10	NIC	ENSMUSG00000031166.14	novel	1749	10	NA	NA	11	-63	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	9	junction_9	11.515957795625	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGTGACACTTTTGTCT	6895	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7999073	7989625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_7991969_7992319_7992439_7994049_7994192_7994272_7994454_7995207_7995516_7996241_7996373_7996494_7996605_7997623_7997865_7998525_7998606_7999008
tx.20096	chrX	-	1944	3	ISM	ENSMUSG00000031166.14	ENSMUST00000149257.2	958	4	-294	3	3	-3	intron_retention	FALSE	canonical	3	36	junction_2	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACCTTTAGCAAATGCAA	6924	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7999044	7995959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_7996373_7996494_7996605_7997623
tx.20097	chrX	+	414	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031166.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCCTGGAACATTCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7998402	7999370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_7998487_7999040
tx.20098	chrX	-	1158	7	FSM	ENSMUSG00000031167.17	ENSMUST00000115616.8	1225	7	72	-5	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	529	junction_2	255.122192945524	501	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATACTGATAATGCTTTT	6557	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8011940	8008601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_8009195_8009489_8009572_8009896_8009991_8010086_8010187_8010811_8010919_8011193_8011312_8011876
tx.20099	chrX	-	1157	7	FSM	ENSMUSG00000031167.17	ENSMUST00000115621.9	1338	7	177	4	-6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	764	junction_2	192.247597875471	670	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATACTGATAATGCTTTT	6555	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8011942	8008601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_8009195_8009489_8009569_8009896_8009991_8010086_8010187_8010811_8010919_8011193_8011312_8011876
tx.201	chr1	+	807	5	ISM	ENSMUSG00000026048.17	ENSMUST00000027214.4	3907	15	57	20103	-5	-687	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	40.0398239256868	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTGTGTTTCTCATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44187063	44200317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_44187311_44196096_44196273_44197303_44197420_44197964_44198052_44200136
tx.2010	chr10	-	1899	7	ISM	ENSMUSG00000052681.9	ENSMUST00000064667.9	2724	8	21359	622	-6136	-622	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	789	junction_2	118.228239717365	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAATATGGGTTTACCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117660581	117650397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_117651686_117653248_117653366_117654370_117654515_117656366_117656508_117657494_117657552_117658705_117658775_117660498
tx.20101	chrX	-	2384	6	FSM	ENSMUSG00000039201.11	ENSMUST00000239441.2	2648	6	257	7	-33	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_4	11.0018180315801	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTGGTATGTGTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8042163	8020717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_8022306_8022554_8022744_8022889_8023018_8038976_8039132_8040439_8040550_8041949
tx.20102	chrX	-	1030	4	ISM	ENSMUSG00000031168.15	ENSMUST00000033509.15	1743	5	3075	2	2461	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	751	junction_2	18.9912260443255	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTGAGAGATATTTAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8056676	8051569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_8052073_8052882_8053014_8053121_8053159_8056317
tx.20103	chrX	-	1105	5	FSM	ENSMUSG00000031168.15	ENSMUST00000033509.15	1743	5	636	2	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	751	junction_2	18.0190871022924	960	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTGAGAGATATTTAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8059115	8051569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_8052073_8052882_8053014_8053121_8053159_8056317_8056676_8059039
tx.20104	chrX	-	1833	13	FSM	ENSMUSG00000031169.14	ENSMUST00000089402.10	1839	13	8	-2	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	57	junction_2	6.61857655055493	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTCGGTTTTTTGGTTTTT	1996	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8072732	8060086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_8060517_8064213_8064325_8065305_8065392_8065469_8065534_8065624_8065702_8067414_8067516_8067682_8067809_8069397_8069529_8069607_8069790_8070030_8070075_8070434_8070628_8071803_8071973_8072613
tx.20105	chrX	-	1178	8	NIC	ENSMUSG00000031169.14	novel	1839	13	NA	NA	-5	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	7	junction_6	22.6841669137623	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACAGGCTCGGTTTTTTGGT	1971	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8072757	8060090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_8060517_8064213_8064325_8065305_8065392_8065469_8065534_8065624_8065702_8067414_8067516_8071803_8071973_8072613
tx.20107	chrX	-	1643	13	FSM	ENSMUSG00000031171.12	ENSMUST00000115595.8	1656	13	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_4	23.6231995198694	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATGCACGTTGCTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8118621	8106658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_8107070_8111298_8111341_8111522_8111712_8111790_8111889_8112574_8112659_8112770_8112874_8112965_8113020_8113107_8113161_8115217_8115297_8116634_8116726_8116807_8116878_8117118_8117277_8118410
tx.20108	chrX	+	853	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000072249.4	novel	847	1	NA	NA	-19452	-5	multi-exon	TRUE	canonical	3	217	junction_1	0	256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAGTATCAAATTGATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8909801	8930095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_8909865_8929305
tx.20109	chrX	+	854	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000072249.4_ENSMUSG00000083714.4	novel	847	1	NA	NA	-163	-5	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAGTATCAAATTGATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8909802	8930095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_8910012_8929450
tx.2011	chr10	+	1335	4	FSM	ENSMUSG00000020212.15	ENSMUST00000218011.2	690	4	-113	-532	0	532	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_3	22.6274169979695	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTCCTCTGGGGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117977715	117984576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_117977868_117978754_117978870_117982499_117982877_117983885
tx.20110	chrX	+	835	2	ISM	ENSMUSG00000015342.7	ENSMUST00000015486.7	5076	3	75	30823	75	-30823	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGGTGAGGAGGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9139069	9148666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_9139474_9148235
tx.20111	chrX	-	1150	2	Intergenic	novelGene_1368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGTGGTTGCGTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9198886	9195213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_9196165_9198687
tx.20112	chrX	-	2043	4	ISM	ENSMUSG00000031176.9	ENSMUST00000033519.3	2176	5	1980	0	-1393	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	262	junction_3	17.0163320241336	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTGGCTCTGGTTGATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9527262	9520505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_9522303_9522618_9522697_9523279_9523404_9527218
tx.20113	chrX	-	2115	5	FSM	ENSMUSG00000031176.9	ENSMUST00000033519.3	2176	5	61	0	61	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	232	junction_4	27.1523479647709	382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTGGCTCTGGTTGATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9529181	9520505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_9522303_9522618_9522697_9523279_9523404_9527218_9527261_9529107
tx.20114	chrX	-	2729	17	FSM	ENSMUSG00000031174.18	ENSMUST00000073392.11	2926	17	194	3	7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	17.609368067878	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATATGTGCTTGGAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10082965	10024457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_10025120_10028840_10028930_10030960_10031019_10032314_10032516_10044509_10044576_10048193_10048292_10061056_10061223_10062210_10062394_10065149_10065275_10068248_10068405_10072361_10072521_10074911_10075062_10076837_10076997_10078036_10078100_10078963_10079057_10079767_10079894_10082790
tx.20116	chrX	+	1769	8	FSM	ENSMUSG00000058254.13	ENSMUST00000076354.13	1733	8	-38	2	-38	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_5	9.20736173961258	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATGTTGTGGTTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10351358	10462842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_10351478_10445553_10445743_10448403_10448479_10450280_10450377_10451735_10451892_10456374_10456459_10461517_10461594_10461868
tx.20117	chrX	+	1900	2	FSM	ENSMUSG00000008035.13	ENSMUST00000008179.7	2019	2	128	-9	50	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	265	junction_1	0	298	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACAAGTGTGTGTTGCTCT	1607	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10583756	10585938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_10583944_10584225
tx.20118	chrX	-	1334	2	ISM	ENSMUSG00000040363.16	ENSMUST00000115513.9	6941	15	41484	2	41484	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	152	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAATTGAAGTACTTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11905308	11902980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_11904157_11905150
tx.20119	chrX	-	2283	7	ISM	ENSMUSG00000040363.16	ENSMUST00000115513.9	6941	15	32830	2	32830	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_3	14.7129950119689	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAATTGAAGTACTTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11913962	11902980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_11904157_11905150_11905308_11905488_11905567_11906623_11906770_11907740_11907908_11913094_11913353_11913661
tx.2012	chr10	+	2350	3	FSM	ENSMUSG00000020212.15	ENSMUST00000219087.2	1318	3	-103	-929	0	538	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGGGTGTTCTTAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117977715	117984582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_117977868_117978754_117978870_117982499
tx.20120	chrX	+	2037	9	FSM	ENSMUSG00000031007.3	ENSMUST00000033313.3	2324	9	-18	305	-18	-305	multi-exon	FALSE	canonical	3	980	junction_3	62.8369666279333	605	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTCACTGCAATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12454021	12482983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_12454175_12460999_12461131_12462394_12462527_12471105_12471202_12471356_12471495_12472519_12472574_12473169_12473320_12475073_12475194_12481920
tx.20121	chrX	+	1679	7	ISM	ENSMUSG00000031007.3	ENSMUST00000033313.3	2324	9	8429	305	8429	-305	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	980	junction_1	69.2042066801016	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTCACTGCAATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12462468	12482983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_12462527_12471105_12471202_12471356_12471495_12472519_12472574_12473169_12473320_12475073_12475194_12481920
tx.20122	chrX	+	1621	6	ISM	ENSMUSG00000031007.3	ENSMUST00000033313.3	2324	9	17066	305	17066	-305	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	988	junction_3	66.4006024069059	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTCACTGCAATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12471105	12482983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_12471202_12471356_12471495_12472519_12472574_12473169_12473320_12475073_12475194_12481920
tx.20123	chrX	+	1160	2	ISM	ENSMUSG00000031007.3	ENSMUST00000033313.3	2324	9	21059	303	21059	-303	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1126	junction_1	0	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTCACTGCAATTCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12475098	12482985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_12475194_12481920
tx.20124	chrX	-	2349	6	ISM	ENSMUSG00000044148.7	ENSMUST00000060108.7	2699	7	515	0	515	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	210	junction_4	23.2327355255467	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTACAGTTTTTAATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12539392	12521117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_12522726_12524100_12524264_12528888_12529069_12530738_12530889_12535765_12535886_12539264
tx.20125	chrX	-	2602	7	FSM	ENSMUSG00000044148.7	ENSMUST00000060108.7	2699	7	97	0	97	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	210	junction_4	24.9377001523575	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTACAGTTTTTAATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12539810	12521117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_12522726_12524100_12524264_12528888_12529069_12530738_12530889_12535765_12535886_12539264_12539400_12539564
tx.20126	chrX	+	1254	2	Intergenic	novelGene_1369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCATTTGTTGACTTCTG	3678	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12844101	12862149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_12844196_12860989
tx.20127	chrX	+	2233	11	ISM	ENSMUSG00000031010.18	ENSMUST00000089302.11	11887	45	84815	3610	-4528	-180	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1026	junction_7	67.7468818470636	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTGTATATAGTATATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13022567	13035957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_13022987_13023907_13024032_13024957_13025184_13026012_13026143_13026985_13027172_13027552_13027774_13027861_13027951_13030950_13031108_13031510_13031724_13032870_13032967_13035585
tx.20128	chrX	+	667	3	ISM	ENSMUSG00000031010.18	ENSMUST00000089302.11	11887	45	93759	3623	4416	-193	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1088	junction_1	53.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAATGGCAAAGGTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13031511	13035944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_13031724_13032870_13032967_13035585
tx.20129	chrX	-	1307	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084349.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCAGGTGTCTTTATAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13080985	13068784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_13070075_13080968
tx.2013	chr10	+	3095	14	FSM	ENSMUSG00000020212.15	ENSMUST00000020437.13	3074	14	-19	-2	2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_4	15.3152281412244	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGATGCTTCTGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117977717	118004904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_117977868_117978754_117978870_117982499_117982877_117983885_117984021_117986693_117986862_117987906_117988002_117988079_117988180_117993099_117993276_117994206_117994510_117995351_117995462_117995564_117995675_118000105_118000353_118002529_118002590_118003955
tx.20130	chrX	+	4568	17	FSM	ENSMUSG00000000787.13	ENSMUST00000000804.7	4692	17	52	72	0	-72	multi-exon	TRUE	canonical	3	179	junction_1	98.1322449554681	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACAGTCTCCTTTGTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13147260	13160219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_13147397_13150416_13150475_13151153_13151202_13152272_13152406_13153463_13153623_13153702_13153803_13154023_13154160_13154517_13154604_13154811_13154911_13155018_13155180_13155633_13155779_13156075_13156221_13156417_13156600_13156684_13156803_13157139_13157294_13157401_13157542_13157651
tx.20131	chrX	+	2843	13	ISM	ENSMUSG00000000787.13	ENSMUST00000000804.7	4692	17	6253	1424	-61	606	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	259	junction_2	77.4185952397025	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAAACAAATGGCTCCAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13153461	13158867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_13153623_13153702_13153803_13154023_13154160_13154517_13154604_13154811_13154911_13155018_13155180_13155633_13155779_13156075_13156221_13156417_13156600_13156684_13156803_13157139_13157294_13157401_13157542_13157651
tx.20132	chrX	+	2689	2	ISM	ENSMUSG00000000787.13	ENSMUST00000000804.7	4692	17	10215	69	3400	-69	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	520	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTCTCCTTTGTTGTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13157423	13160222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_13157542_13157651
tx.20133	chrX	+	1977	15	FSM	ENSMUSG00000025037.7	ENSMUST00000026013.6	4167	15	116	2074	116	-2074	multi-exon	FALSE	canonical	3	197	junction_7	23.3440330181188	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTGTAGCATCCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16486052	16551983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_16486153_16500420_16500516_16505302_16505441_16524806_16524912_16525683_16525776_16528555_16528698_16530889_16531040_16531890_16532051_16539085_16539183_16543793_16543848_16547052_16547111_16548439_16548538_16550202_16550315_16551220_16551284_16551470
tx.20134	chrX	+	1052	8	ISM	ENSMUSG00000025037.7	ENSMUST00000026013.6	4167	15	46057	2074	46057	-2074	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	240	junction_3	19.8761471238718	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTGTAGCATCCAATG	9075	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16531993	16551983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_16532051_16539085_16539183_16543793_16543848_16547052_16547111_16548439_16548538_16550202_16550315_16551220_16551284_16551470
tx.20135	chrX	+	646	3	ISM	ENSMUSG00000025037.7	ENSMUST00000026013.6	4167	15	64308	2074	64308	-2074	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	263	junction_1	17	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGTGTAGCATCCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16550244	16551983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_16550315_16551220_16551284_16551470
tx.20136	chrX	-	2281	14	NNC	ENSMUSG00000025038.8	novel	2554	15	NA	NA	68062	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	77	junction_13	14.945265027612	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTGACCATTTTATTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17117545	16998287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_16998612_17014510_17014617_17027489_17027583_17028929_17029128_17067284_17067416_17070991_17071189_17073918_17074062_17081896_17082063_17089326_17089466_17090177_17090292_17092576_17092829_17096739_17096964_17109665_17109817_17117502
tx.20137	chrX	+	2615	3	Intergenic	novelGene_1370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATGATGTAGGAGGGATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17300598	17304308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_17300700_17301448_17301508_17301853
tx.20138	chrX	-	1813	4	FSM	ENSMUSG00000025040.14	ENSMUST00000177213.8	1032	4	179	-960	162	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	209	junction_3	16.9901932498329	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATTGTGCTTATATATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17437701	17422802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_17424251_17424919_17425049_17434271_17434348_17437541
tx.20139	chrX	-	1869	5	FSM	ENSMUSG00000025040.14	ENSMUST00000026016.13	1983	5	114	0	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_3	21.435951110226	200	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGATTGTGCTTATATATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17438450	17422802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_17424251_17424919_17425049_17434271_17434348_17437541_17437699_17438391
tx.2014	chr10	+	2960	13	NIC	ENSMUSG00000020212.15	novel	3074	14	NA	NA	2	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	32	junction_3	21.2053452380919	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGATGCTTCTGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117977717	118004904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_117977868_117978754_117978870_117982499_117982877_117986693_117986862_117987906_117988002_117988079_117988180_117993099_117993276_117994206_117994510_117995351_117995462_117995564_117995675_118000105_118000353_118002529_118002590_118003955
tx.20140	chrX	+	973	4	Intergenic	novelGene_1371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGTGGTAGTAAGTATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17915124	17957191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_17915407_17951804_17951917_17954675_17954815_17956751
tx.20141	chrX	+	946	4	Intergenic	novelGene_1372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGGTAGTAAGTATCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17915150	17957193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_17915407_17951804_17951917_17954675_17954815_17956754
tx.20142	chrX	-	595	2	Intergenic	novelGene_1373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTATTTTTGTCTGGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18268628	18261742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_18262145_18268435
tx.20143	chrX	+	797	2	Intergenic	novelGene_1374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCTCCAAAGTTTTTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18404819	18415397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_18405121_18414901
tx.20144	chrX	-	692	2	NNC	ENSMUSG00000037341.15	novel	2512	17	NA	NA	-7	-59300	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCATTGTAGTATATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20158053	20090054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_20090292_20157598
tx.20145	chrX	+	751	2	ISM	ENSMUSG00000060090.17	ENSMUST00000033372.13	4417	5	70	23500	-8	-23500	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	410	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCGTGGTTCAAGACTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20230789	20243592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_20231068_20243119
tx.20146	chrX	+	3599	5	FSM	ENSMUSG00000060090.17	ENSMUST00000033372.13	4417	5	87	731	-7	-731	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_2	17.8395627749113	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTCAATGCTACTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20230806	20266361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_20231068_20243119_20243786_20247943_20248059_20263459_20263546_20263890
tx.20147	chrX	+	4778	13	FSM	ENSMUSG00000037315.16	ENSMUST00000115384.9	4866	13	88	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	19.6800801714717	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTCAGTGTGATGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20292014	20386178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_20292070_20295261_20295371_20301449_20301538_20326754_20326812_20328350_20328431_20345752_20345911_20355940_20356132_20360395_20360608_20365664_20365833_20368634_20368752_20377258_20377730_20378974_20379093_20383224
tx.20148	chrX	+	3395	3	ISM	ENSMUSG00000037315.16	ENSMUST00000043693.7	2472	10	50641	-2043	50641	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	148	junction_2	8	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTCAGTGTGATGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20377406	20386178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_20377730_20378974_20379093_20383224
tx.20149	chrX	-	586	3	FSM	ENSMUSG00000031059.10	ENSMUST00000116621.2	908	3	322	0	322	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2198	junction_1	70	7804	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGTTACTGCTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20483536	20481564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_20481782_20481952_20482084_20483298
tx.2015	chr10	+	1587	6	ISM	ENSMUSG00000020212.15	ENSMUST00000020437.13	3074	14	16662	-2	1482	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_5	8.86791971095815	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGATGCTTCTGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117994398	118004904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_117994510_117995351_117995462_117995564_117995675_118000105_118000353_118002529_118002590_118003955
tx.20150	chrX	-	768	4	NNC	ENSMUSG00000031059.10	novel	908	3	NA	NA	52	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	226	junction_3	964.303317887525	497	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGACTGGTTACTGCTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20483806	20481564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_20481782_20481952_20482084_20483298_20483521_20483608
tx.20151	chrX	+	1122	8	ISM	ENSMUSG00000031060.17	ENSMUST00000082089.14	2562	22	28250	-205	28250	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	371	junction_1	37.6742211435819	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCATTTCTACTTTCTC	NA	False	NA	-21	True	NA	NA	NA	20514586	20517128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_20514661_20515382_20515533_20515626_20515693_20515770_20515960_20516039_20516115_20516401_20516509_20516585_20516716_20516797
tx.20152	chrX	+	816	5	ISM	ENSMUSG00000031060.17	ENSMUST00000082089.14	2562	22	29450	-205	29450	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	385	junction_2	41.2492424172857	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCATTTCTACTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20515786	20517128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_20515960_20516039_20516115_20516401_20516509_20516585_20516716_20516797
tx.20153	chrX	+	540	3	ISM	ENSMUSG00000031060.17	ENSMUST00000082089.14	2562	22	30093	-205	30093	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	468	junction_2	4	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCATTTCTACTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20516429	20517128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_20516509_20516585_20516716_20516797
tx.20154	chrX	+	3566	26	FSM	ENSMUSG00000001924.16	ENSMUST00000001989.9	4071	26	30	475	30	-475	multi-exon	TRUE	canonical	3	2172	junction_1	357.223416925598	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTAGCCATCCTGGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20529166	20548943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_20529365_20534687_20534805_20534930_20534990_20535087_20535257_20535366_20535502_20536442_20536550_20536782_20536874_20536979_20537113_20537594_20537693_20537928_20538076_20538209_20538387_20538482_20538588_20538673_20538755_20539054_20539211_20541824_20541991_20542117_20542315_20544437_20544503_20544827_20545024_20545629_20545705_20545831_20546022_20547021_20547111_20547346_20547440_20547561_20547754_20548141_20548244_20548347_20548449_20548616
tx.20155	chrX	+	1431	10	ISM	ENSMUSG00000001924.16	ENSMUST00000001989.9	4071	26	15300	475	121	-475	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3123	junction_5	304.047551511679	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTAGCCATCCTGGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20544436	20548943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_20544503_20544827_20545024_20545629_20545705_20545831_20546022_20547021_20547111_20547346_20547440_20547561_20547754_20548141_20548244_20548347_20548449_20548616
tx.20156	chrX	+	2678	15	ISM	ENSMUSG00000031065.15	ENSMUST00000033380.7	3120	16	4959	0	-906	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1538	junction_14	86.1898710844321	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTGGTTATAAATCATCAA	2052	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20559615	20566119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_20559771_20560276_20560411_20560509_20560636_20560727_20560785_20560870_20560986_20561748_20561844_20561937_20562001_20562256_20562381_20562585_20562707_20562786_20562885_20562969_20563076_20563160_20563204_20563358_20563450_20564689_20564768_20564847
tx.20157	chrX	+	393	3	ISM	ENSMUSG00000031065.15	ENSMUST00000033380.7	3120	16	8758	992	731	-911	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1538	junction_2	21	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTTGATGTGTCTGTCTC	5851	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20563414	20565127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_20563450_20564689_20564768_20564847
tx.20158	chrX	+	290	2	NNC	ENSMUSG00000001127.13	novel	2439	17	NA	NA	-24	-18170	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGAGTTTGTCTGAGTC	1099	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20664028	20699786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_20664121_20699588
tx.20159	chrX	+	1569	6	ISM	ENSMUSG00000001127.13	ENSMUST00000136451.8	2439	17	-12	7597	-12	-4	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	74	junction_1	119.456100723236	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTATCTTTGTCCTTCAT	1111	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20664040	20719139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_20664121_20716165_20716322_20716483_20716588_20717704_20717808_20717896_20718052_20718168
tx.2016	chr10	-	1097	5	ISM	ENSMUSG00000020114.13	ENSMUST00000020315.13	7766	15	29999	3380	-1847	-3380	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	758	junction_4	26.7441582406327	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTGGTTTTGTAAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119045961	119038539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_119039111_119042620_119042729_119043931_119044097_119044177_119044348_119045878
tx.20160	chrX	+	1542	6	FSM	ENSMUSG00000001127.13	ENSMUST00000120356.8	1520	6	-13	-9	1	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	219	junction_1	64.9935381403413	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAACTATCTTTGTCCTTC	6295	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20714803	20719137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_20714859_20716165_20716322_20716483_20716588_20717704_20717808_20717896_20718052_20718168
tx.20161	chrX	+	867	6	FSM	ENSMUSG00000001131.12	ENSMUST00000009530.5	833	6	-36	2	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	257	junction_1	211.264384125673	683	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATATTTCTGTATAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20736423	20740972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_20736564_20737269_20737402_20739015_20739096_20739288_20739416_20739606_20739732_20740709
tx.20162	chrX	+	864	6	FSM	ENSMUSG00000001131.12	ENSMUST00000115342.10	883	6	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	578	junction_1	90.9382207875215	1139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATATTTCTGTATAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20736423	20740972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_20736564_20737272_20737402_20739015_20739096_20739288_20739416_20739606_20739732_20740709
tx.20163	chrX	-	529	3	ISM	ENSMUSG00000001128.8	ENSMUST00000001156.8	1636	9	3832	78	-109	-78	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	117	junction_2	8	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTCTAAGATTCTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20793962	20791770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_20791999_20793519_20793632_20793773
tx.20164	chrX	-	1544	9	FSM	ENSMUSG00000001128.8	ENSMUST00000001156.8	1636	9	14	78	14	-78	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_8	23.4837044564949	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTTCTAAGATTCTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20797780	20791770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_20791999_20793519_20793632_20793773_20793963_20794191_20794366_20794566_20794759_20794881_20795053_20795834_20796011_20797390_20797542_20797629
tx.20165	chrX	-	2787	6	FSM	ENSMUSG00000009406.14	ENSMUST00000009550.14	3548	6	0	761	0	-761	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_1	13.1666244725062	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGGTATTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20816847	20800394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_20801788_20801869_20801972_20802470_20802903_20803355_20803803_20807792_20808037_20816678
tx.20166	chrX	-	589	7	FSM	ENSMUSG00000001134.10	ENSMUST00000123836.2	875	7	25	261	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	501	junction_1	60.2699943771544	3156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACATAGTCCTTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20828231	20818161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_20818263_20818446_20818511_20825596_20825705_20825973_20826042_20826176_20826259_20827918_20828026_20828172
tx.20167	chrX	-	481	6	NIC	ENSMUSG00000001134.10	novel	875	7	NA	NA	-1	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	44	junction_2	227.721760049408	259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACATAGTCCTTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20828231	20818161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_20818263_20818446_20818511_20825973_20826042_20826176_20826259_20827918_20828026_20828172
tx.20168	chrX	-	634	7	FSM	ENSMUSG00000001134.10	ENSMUST00000001162.10	636	7	8	-6	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_5	225.323039705713	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACATAGTCCTTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20828231	20818161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_20818263_20818446_20818511_20825596_20825705_20825973_20826042_20826176_20826259_20827873_20828026_20828172
tx.20169	chrX	+	1040	5	NNC	ENSMUSG00000086877.8	novel	1412	4	NA	NA	0	612	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	91	junction_3	26.8048503073604	101	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCATGGTCATTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20828352	20853588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_20828835_20833967_20834048_20851664_20851705_20852228_20852400_20853321
tx.2017	chr10	-	605	2	ISM	ENSMUSG00000020228.12	ENSMUST00000154501.2	3095	12	-79	26114	43	-26114	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTACACCAAGGGAGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119948849	119946788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_119947134_119948589
tx.20170	chrX	-	3127	5	FSM	ENSMUSG00000054737.12	ENSMUST00000115334.8	3160	5	14	19	5	-19	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	3.67423461417477	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAACTATATTTAAAA	3250	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20928277	20895200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_20897892_20902575_20902711_20902866_20903012_20926741_20926797_20928176
tx.20171	chrX	-	675	3	Intergenic	novelGene_1375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGATTATGTTGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21112040	21099594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_21099704_21099857_21099960_21111576
tx.20172	chrX	-	2649	4	ISM	ENSMUSG00000036782.14	ENSMUST00000115316.9	3064	7	19271	-1	19271	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	906	junction_3	120.783552964245	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGCTCTGTGCCATGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23113770	23085523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_23087092_23094812_23094927_23101464_23102261_23113599
tx.20173	chrX	-	3221	8	ISM	ENSMUSG00000036782.14	ENSMUST00000115313.8	3251	9	3387	14	3358	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	772	junction_6	153.107671864193	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGCTCTGTGCCATGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23227934	23085523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_23087092_23094812_23094927_23101464_23102261_23113599_23113797_23114350_23114484_23127673_23127813_23181368_23181441_23227732
tx.20174	chrX	-	3224	9	FSM	ENSMUSG00000036782.14	ENSMUST00000115313.8	3251	9	13	14	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	241	junction_8	283.721694623446	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGCTCTGTGCCATGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23231308	23085523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_23087092_23094812_23094927_23101464_23102261_23113599_23113797_23114350_23114484_23127673_23127813_23181368_23181441_23227732_23227824_23231194
tx.20175	chrX	-	642	2	Intergenic	novelGene_1376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTGGAATATGGATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23396526	23374116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_23374494_23396261
tx.20176	chrX	+	1049	5	ISM	ENSMUSG00000036769.15	ENSMUST00000101670.3	4002	21	-45	48980	0	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	12.1449578014911	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGGAGTTTGAGGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23559289	23623284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_23559509_23559663_23559779_23598556_23598591_23616144_23616220_23622678
tx.20177	chrX	-	533	4	NNC	ENSMUSG00000082639.9	novel	892	9	NA	NA	26733	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26159890	26156181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_26156372_26156689_26156789_26159232_26159315_26159728
tx.20178	chrX	-	535	4	NNC	ENSMUSG00000082639.9	novel	892	9	NA	NA	26519	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26160104	26156181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_26156372_26156689_26156789_26159232_26159315_26159940
tx.20179	chrX	+	615	6	NNC	ENSMUSG00000073247.4	novel	924	9	NA	NA	9566	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.8262252939418	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGAGTTTGAAAGGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34340602	34353969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_34340656_34342138_34342265_34342573_34342638_34350827_34350910_34353360_34353460_34353778
tx.2018	chr10	+	933	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020227.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGTAGTTCATAAAGGTAC	3653	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119996620	120000764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_119996686_119999896
tx.20180	chrX	-	948	9	FSM	ENSMUSG00000095546.8	ENSMUST00000119362.8	867	9	-83	2	-83	-2	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0.992156741649222	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27380449	27357516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_27357709_27358027_27358127_27360575_27360658_27368857_27368922_27369230_27369357_27372451_27372487_27373025_27373093_27378700_27378824_27380289
tx.20181	chrX	-	617	6	NNC	ENSMUSG00000096457.8	novel	639	8	NA	NA	7940	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.2	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28378747	28365406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_28365599_28365917_28366017_28368465_28368548_28376745_28376810_28377118_28377245_28378693
tx.20182	chrX	-	936	6	NNC	ENSMUSG00000094624.2	novel	907	9	NA	NA	9570	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.2	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28064478	28051107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_28051300_28051618_28051718_28054166_28054249_28062445_28062510_28062821_28062948_28064105
tx.20183	chrX	+	627	6	NNC	ENSMUSG00000073245.11	novel	928	9	NA	NA	7929	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.8262252939418	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34677375	34690747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_34677440_34678902_34679029_34679340_34679405_34687606_34687689_34690137_34690237_34690555
tx.20184	chrX	+	617	6	NNC	ENSMUSG00000073247.4	novel	924	9	NA	NA	9560	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.8262252939418	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAACAGAGTTTGAAAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34340596	34353965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_34340656_34342138_34342265_34342573_34342638_34350827_34350910_34353360_34353460_34353778
tx.20185	chrX	+	619	6	NNC	ENSMUSG00000073247.4	novel	924	9	NA	NA	9563	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.8262252939418	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34340599	34353970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_34340656_34342138_34342265_34342573_34342638_34350827_34350910_34353360_34353460_34353778
tx.20186	chrX	-	627	6	NNC	ENSMUSG00000094759.8	novel	639	8	NA	NA	7929	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.2	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30533024	30519642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_30519835_30520153_30520253_30522701_30522784_30530981_30531046_30531357_30531484_30532960
tx.20187	chrX	-	530	3	Intergenic	novelGene_1377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGAAGTTGTAATTTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30862390	30861022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_30861258_30861627_30861847_30862314
tx.20188	chrX	+	744	7	NNC	ENSMUSG00000073247.4	novel	924	9	NA	NA	9567	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.74165738677394	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34340603	34353970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_34340656_34340845_34340975_34342138_34342265_34342573_34342638_34350827_34350910_34353360_34353460_34353778
tx.20189	chrX	+	630	6	NNC	ENSMUSG00000073247.4	novel	924	9	NA	NA	9556	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.8262252939418	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTGTCTCCTATGAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34340592	34353952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_34340678_34342138_34342265_34342573_34342638_34350827_34350910_34353360_34353460_34353778
tx.2019	chr10	-	931	6	ISM	ENSMUSG00000020227.11	ENSMUST00000143100.2	1171	8	-2	5233	-2	-5233	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	13	junction_4	2.65329983228432	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGTGTTCTCCTTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120037494	120006113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_120006288_120012135_120012288_120013972_120014028_120014600_120014705_120018430_120018614_120037231
tx.20190	chrX	+	617	6	NNC	ENSMUSG00000073257.4	novel	874	9	NA	NA	9525	20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.8262252939418	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29734957	29748301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_29735012_29736460_29736587_29736895_29736960_29745161_29745244_29747691_29747791_29748109
tx.20191	chrX	+	1477	8	NNC	ENSMUSG00000031093.15	novel	1725	14	NA	NA	18329	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	56.5645738992893	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCGAAGTGAAGGAAATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35323219	35340217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_35323324_35324846_35324961_35325933_35326081_35330522_35330734_35331312_35331504_35331982_35332084_35333500_35333644_35339751
tx.20192	chrX	+	592	2	NNC	ENSMUSG00000031093.15	novel	1725	14	NA	NA	28627	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCGAAGTGAAGGAAATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35333517	35340217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_35333644_35339751
tx.20193	chrX	+	2447	11	FSM	ENSMUSG00000017057.10	ENSMUST00000033418.8	3712	11	-21	1286	-21	-1286	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_2	4.27083130081252	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTGAGCCTGCAATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35375741	35433626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_35375929_35390297_35390438_35394256_35394396_35396616_35396738_35404865_35405051_35407663_35407816_35412302_35412351_35412631_35412765_35415670_35415768_35419195_35419281_35432466
tx.20194	chrX	+	2122	11	FSM	ENSMUSG00000016239.12	ENSMUST00000016383.10	2911	11	791	-2	-72	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_3	7.36478105580879	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCATACTTCTTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35592796	35625996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_35593053_35596168_35596288_35598864_35598988_35605275_35605520_35606294_35606386_35614654_35614770_35617494_35617617_35619698_35619858_35621138_35621302_35622258_35622409_35625416
tx.20195	chrX	+	1857	3	FSM	ENSMUSG00000006373.11	ENSMUST00000073339.7	1857	3	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	454	junction_1	42	1173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGTGAGGCTTTCATTTT	1668	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35861858	35869732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_35862268_35865773_35865930_35868440
tx.20196	chrX	-	591	3	ISM	ENSMUSG00000059708.13	ENSMUST00000133980.2	1370	6	-317	6730	-18	-6730	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_1	5.5	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAGGTAAGTGGGCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35909066	35882261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_35882387_35900125_35900228_35908702
tx.20197	chrX	+	1156	5	FSM	ENSMUSG00000037636.7	ENSMUST00000047655.7	1111	5	-3	-42	-3	42	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	2.69258240356725	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGATGAATATGGTGACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36007308	36040897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36007672_36015785_36016028_36021420_36021594_36039134_36039270_36040654
tx.20198	chrX	+	1895	4	NNC	ENSMUSG00000037636.7	novel	1111	5	NA	NA	3	-17111	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.83176086632785	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAATAGCTTAATTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36007314	36022827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_36007672_36015785_36016028_36021420_36021594_36021704
tx.20199	chrX	+	853	4	NIC	ENSMUSG00000037636.7	novel	1111	5	NA	NA	-15	21	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_1	5.71547606649408	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGGTAGAAGTGCAGCAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36007348	36040876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_36007672_36021420_36021594_36039134_36039270_36040654
tx.202	chr1	+	429	2	NNC	ENSMUSG00000056870.10	novel	539	6	NA	NA	-37	-72481	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTAACTACTATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44590815	44675311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_44591033_44675099
tx.2020	chr10	+	879	7	FSM	ENSMUSG00000020225.11	ENSMUST00000020446.11	904	7	20	5	-10	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	514	junction_6	43.3628104870214	3176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCATTCTGTGTTCTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120044674	120060817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_120044848_120051445_120051555_120053408_120053515_120056655_120056690_120057910_120058029_120059741_120059788_120060524
tx.20200	chrX	+	1243	4	FSM	ENSMUSG00000016319.4	ENSMUST00000016463.4	1240	4	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11014	junction_3	650.055895032625	8660	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTGTTCGTTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36059300	36062460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36059495_36060495_36060983_36061388_36061530_36062039
tx.20201	chrX	-	949	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084990.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTAAGAGCTGTTTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36080764	36078420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_36078984_36080378
tx.20202	chrX	-	1253	7	NIC	ENSMUSG00000006423.16	novel	678	3	NA	NA	22	8969	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	30	junction_1	75.5389891968968	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTAAGAGCTGTTTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36127869	36078420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_36078984_36116291_36116385_36116982_36117073_36117935_36118075_36120504_36120547_36127276_36127395_36127661
tx.20203	chrX	-	3281	7	FSM	ENSMUSG00000006423.16	ENSMUST00000115248.10	3340	7	54	5	-19	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_1	34.0999348321306	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAACTAGCTTGTTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36127845	36112200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_36114816_36116291_36116385_36116982_36117073_36117935_36118075_36120504_36120547_36127276_36127395_36127661
tx.20204	chrX	+	723	6	FSM	ENSMUSG00000016308.13	ENSMUST00000016452.11	1732	6	42	967	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	837	junction_1	46.7435557055729	7522	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTCTGTCTTCCCTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36137989	36146908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36138183_36138363_36138445_36138819_36138846_36145309_36145400_36146251_36146341_36146664
tx.20205	chrX	-	3263	3	FSM	ENSMUSG00000044149.8	ENSMUST00000057093.8	3264	3	5	-4	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTGCTGTAATTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36166547	36151192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_36154166_36155277_36155409_36166388
tx.20206	chrX	-	1240	5	NIC	ENSMUSG00000050379.16	novel	4673	11	NA	NA	55075	-801	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	21	junction_1	14.3069039278245	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTAGAGTCTTGATTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36198069	36179484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_36180199_36186492_36186684_36190434_36190568_36193751_36193921_36198036
tx.20207	chrX	-	2077	10	NNC	ENSMUSG00000050379.16	novel	4673	11	NA	NA	-27	-801	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_5	16.9538225414044	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTAGAGTCTTGATTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36253171	36179484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_36180199_36186492_36186684_36190434_36190568_36193751_36193921_36198036_36198134_36205734_36205870_36210220_36210408_36230248_36230445_36238715_36238831_36253031
tx.20208	chrX	-	2080	10	NIC	ENSMUSG00000050379.16	novel	4673	11	NA	NA	-3	-801	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	21	junction_1	11.2940495640649	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTAGAGTCTTGATTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36253147	36179484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_36180199_36186492_36186684_36190434_36190568_36193751_36193921_36198036_36198134_36205707_36205870_36210220_36210408_36230248_36230445_36238715_36238831_36253031
tx.20209	chrX	-	360	3	FSM	ENSMUSG00000079641.4	ENSMUST00000115231.4	612	3	217	35	-19	-35	multi-exon	FALSE	canonical	3	12849	junction_1	35	70485	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTTTCTGGTTTATAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36348838	36346207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_36346403_36347637_36347742_36348777
tx.2021	chr10	+	751	3	FSM	ENSMUSG00000020224.16	ENSMUST00000020444.16	1664	3	-4	917	-4	101	multi-exon	FALSE	canonical	3	990	junction_2	137	10968	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTATGCTGAAGTTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120062970	120067570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_120063029_120063878_120064109_120067107
tx.20210	chrX	+	1782	9	FSM	ENSMUSG00000016409.5	ENSMUST00000016553.5	4230	9	-7	2455	-7	-2455	multi-exon	TRUE	canonical	3	360	junction_3	33.4381425171914	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAAGTTATTTGAGGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36390440	36411944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36391029_36394630_36394712_36400164_36400236_36400404_36400546_36403329_36403394_36405290_36405401_36405489_36405566_36406557_36406708_36411443
tx.20211	chrX	+	813	4	ISM	ENSMUSG00000016409.5	ENSMUST00000016553.5	4230	9	-7	13922	-7	-5045	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	360	junction_3	31.947874212014	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAAAAGAAAACATAAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36390440	36400477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_36391029_36394630_36394712_36400164_36400236_36400404
tx.20212	chrX	-	417	3	FSM	ENSMUSG00000016427.8	ENSMUST00000016571.8	419	3	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2951	junction_1	110	14882	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATTTTTATTTTTATGAA	2314	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36454814	36451240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_36451395_36453526_36453617_36454641
tx.20213	chrX	-	820	4	ISM	ENSMUSG00000071773.5	ENSMUST00000115210.2	883	5	3928	-15	3928	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_3	6.34209919681348	597	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTTATTCATGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36481983	36477441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_36477701_36479202_36479249_36481305_36481649_36481811
tx.20214	chrX	+	849	5	FSM	ENSMUSG00000051827.12	ENSMUST00000173650.2	735	5	-21	-93	1	6	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_3	65.4618209340376	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTGTTTTGTGCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36508629	36513345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36508740_36508901_36509314_36510828_36510875_36511141_36511191_36513113
tx.20215	chrX	+	800	4	FSM	ENSMUSG00000051827.12	ENSMUST00000063340.12	795	4	1	-6	1	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_3	56.8174464598878	411	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTGTTTTGTGCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36508629	36513345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36508740_36508901_36509314_36510828_36510875_36513113
tx.20216	chrX	+	962	3	NIC	ENSMUSG00000051827.12	novel	795	4	NA	NA	1	6	intron_retention	FALSE	canonical	3	47	junction_2	1.5	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTGTTTTGTGCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36508629	36513345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_36509314_36510828_36510875_36513113
tx.20217	chrX	+	707	4	FSM	ENSMUSG00000095601.9	ENSMUST00000096459.11	828	4	123	-2	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATTGTCCCATGTGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36562163	36566143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36562222_36562471_36562842_36564717_36564764_36565910
tx.20218	chrX	+	803	4	FSM	ENSMUSG00000079638.9	ENSMUST00000115191.7	799	4	-2	-2	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	23.6126143312331	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTTTTGTGCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36593717	36598461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36593831_36593992_36594405_36595944_36595991_36598229
tx.20219	chrX	+	803	4	FSM	ENSMUSG00000095698.3	ENSMUST00000115179.4	685	4	-25	-93	-25	93	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	8.9938250421547	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTTTTGTGCTTCTTC	6864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36675055	36679369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36675169_36675331_36675744_36677299_36677346_36679137
tx.2022	chr10	+	685	2	ISM	ENSMUSG00000020224.16	ENSMUST00000130198.3	1463	3	801	401	801	106	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	990	junction_1	0	1018	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGAAGTTGTGATTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120063891	120067575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_120064109_120067107
tx.20220	chrX	+	800	4	FSM	ENSMUSG00000096788.9	ENSMUST00000072167.10	799	4	1	-2	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	24.1246761636296	195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTTTTGTGCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36712105	36723468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36712216_36712377_36712790_36720942_36720989_36723236
tx.20221	chrX	+	720	4	NNC	ENSMUSG00000096788.9	novel	799	4	NA	NA	-2	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	16	junction_3	23.6690139681023	59	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTTTTGTGCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36712102	36723468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_36712216_36712377_36712790_36720942_36720989_36723319
tx.20222	chrX	-	809	4	FSM	ENSMUSG00000079629.6	ENSMUST00000115169.4	795	4	-8	-6	-8	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	7.03957069398096	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTTTTGTGCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36825131	36820763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_36820996_36822809_36822856_36824438_36824851_36825012
tx.20223	chrX	-	594	3	ISM	ENSMUSG00000079628.4	ENSMUST00000115166.3	979	4	573	6	382	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	1	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGACTCATGTGTCTTTT	6941	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36832407	36828158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_36828390_36829677_36829724_36832090
tx.20224	chrX	-	972	4	NNC	ENSMUSG00000079628.4	novel	979	4	NA	NA	-2	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.80656320908194	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGACTCATGTGTCTTTT	6366	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36832982	36828158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_36828390_36829677_36829721_36832090_36832497_36832690
tx.20225	chrX	-	979	4	FSM	ENSMUSG00000079628.4	ENSMUST00000115166.3	979	4	-6	6	-6	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	1.24721912892465	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGACTCATGTGTCTTTT	6362	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36832986	36828158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_36828390_36829677_36829724_36832090_36832497_36832690
tx.20226	chrX	-	933	3	NIC	ENSMUSG00000079628.4	novel	979	4	NA	NA	-6	-6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGACTCATGTGTCTTTT	6362	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36832986	36828158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_36828390_36832090_36832497_36832690
tx.20227	chrX	-	660	3	ISM	ENSMUSG00000079627.3	ENSMUST00000115162.2	779	4	287	-6	-121	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_2	10.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTGTTTTGTGCTTCTTC	9516	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36854643	36850643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_36850876_36852672_36852719_36854261
tx.20228	chrX	-	809	4	FSM	ENSMUSG00000079627.3	ENSMUST00000115162.2	779	4	-24	-6	-24	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	11.2644968324772	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTGTTTTGTGCTTCTTC	9205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36854954	36850643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_36850876_36852672_36852719_36854261_36854674_36854835
tx.20229	chrX	-	827	5	Fusion	ENSMUSG00000106388.2_ENSMUSG00000081195.3	novel	322	3	NA	NA	-67	102	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.53962995154008	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGCCTCAGGTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36865151	36857920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chrX_-_36858142_36859175_36859222_36861051_36861185_36864533_36864809_36864999
tx.2023	chr10	-	844	5	FSM	ENSMUSG00000056758.15	ENSMUST00000072777.14	3710	5	171	2695	-6	-2695	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	7.32717544487642	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCTTAACTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120312203	120199874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_120200202_120210572_120210606_120298568_120298620_120309156_120309244_120311857
tx.20230	chrX	-	693	5	Fusion	ENSMUSG00000106388.2_ENSMUSG00000081195.3	novel	322	3	NA	NA	-77	104	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.53962995154008	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCCTCAGGTGTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36865161	36857918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chrX_-_36858142_36859175_36859222_36861051_36861185_36864679_36864809_36864999
tx.20231	chrX	-	827	5	Fusion	ENSMUSG00000106388.2_ENSMUSG00000081195.3	novel	322	3	NA	NA	-53	100	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.53962995154008	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTGCCTCAGGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36865137	36857922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chrX_-_36858142_36859175_36859222_36861051_36861201_36864533_36864809_36864999
tx.20232	chrX	+	882	6	FSM	ENSMUSG00000095180.11	ENSMUST00000184866.10	893	6	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2792	junction_1	493.533626007388	26560	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTTAGTGATTCGAGTAA	8516	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36891646	36897308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_36891707_36892583_36892653_36893274_36893357_36893532_36893891_36894500_36894547_36897041
tx.20233	chrX	+	822	5	ISM	ENSMUSG00000095180.11	ENSMUST00000239523.1	868	6	261	3	261	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3777	junction_4	167.307165118533	3608	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTTAGTGATTCGAGTAA	9453	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36892583	36897308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_36892653_36893274_36893357_36893532_36893891_36894500_36894547_36897041
tx.20234	chrX	+	600	3	ISM	ENSMUSG00000095180.11	ENSMUST00000239523.1	868	6	1281	3	-444	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3777	junction_2	76.5	2331	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTTAGTGATTCGAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36893603	36897308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_36893891_36894500_36894547_36897041
tx.20235	chrX	-	1619	4	NNC	ENSMUSG00000079626.3	novel	1091	8	NA	NA	6173	-4	intron_retention	FALSE	canonical	2	3	junction_3	3.29983164553722	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCCTCAGGTGTCTTCTG	9757	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36979936	36975319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_36975541_36976568_36976615_36978426_36979644_36979801
tx.20237	chrX	-	419	3	NNC	ENSMUSG00000079626.3	novel	1091	8	NA	NA	6155	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.5	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTGCCTCAGGTGTCTTCT	9739	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36979954	36975320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_36975541_36976568_36976615_36979801
tx.20238	chrX	-	902	4	FSM	ENSMUSG00000068048.9	ENSMUST00000089062.8	882	4	-20	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_2	21.013223349966	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTTGGCTCCATTATCTT	1058	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36990667	36987973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_36988177_36989156_36989203_36989828_36990289_36990474
tx.20239	chrX	-	818	4	NNC	ENSMUSG00000081133.3	novel	451	3	NA	NA	-97	208	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	2	junction_1	3.29983164553722	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGCTTCAATTGCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37034576	37029484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_37029729_37030445_37030512_37031396_37031443_37034114
tx.2024	chr10	-	555	4	ISM	ENSMUSG00000056758.15	ENSMUST00000072777.14	3710	5	177	13349	0	-13349	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	6	junction_1	6.12825877028341	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTCAAGCAAAATACATATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120312197	120210528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_120210606_120298568_120298620_120309156_120309244_120311857
tx.20240	chrX	+	718	3	FSM	ENSMUSG00000053909.9	ENSMUST00000115150.4	763	3	45	0	45	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTGTTTGTGTTTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37155396	37160568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_37155824_37158275_37158322_37160323
tx.20241	chrX	+	917	3	FSM	ENSMUSG00000050197.6	ENSMUST00000152730.4	876	3	-37	-4	-37	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_1	2	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTAATTTTATGTGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37210058	37218848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_37210700_37211950_37211997_37218618
tx.20242	chrX	+	629	4	NNC	ENSMUSG00000084009.2	novel	806	6	NA	NA	3385	103	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.43650214343336	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTGCCCCATGTGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37389129	37395008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_37389342_37390586_37390738_37391584_37391631_37394788
tx.20243	chrX	+	583	5	NNC	ENSMUSG00000084009.2	novel	806	6	NA	NA	3442	104	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.84767985741633	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCCCCATGTGTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37389186	37395009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_37389322_37389479_37389510_37390586_37390738_37391584_37391631_37394788
tx.20245	chrX	+	448	4	NNC	ENSMUSG00000084009.2	novel	806	6	NA	NA	3424	102	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	5.24933858267454	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGCCCCATGTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37389168	37395007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_37389322_37389479_37389510_37391584_37391631_37394788
tx.20246	chrX	-	1744	9	FSM	ENSMUSG00000016534.16	ENSMUST00000016678.14	1769	9	25	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_1	278.250982702667	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTGTTTCAATTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37545306	37493938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_37494449_37513143_37513309_37514239_37514304_37519794_37519918_37520726_37520939_37524272_37524432_37529007_37529222_37530901_37531018_37545125
tx.20247	chrX	-	3576	9	FSM	ENSMUSG00000016534.16	ENSMUST00000061755.9	3604	9	28	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	893	junction_3	45.9604109533411	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAATTTGCTCACATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37545303	37508383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_37510729_37513143_37513309_37514239_37514304_37519794_37519918_37520726_37520939_37524272_37524432_37529007_37529222_37530901_37531018_37545125
tx.20248	chrX	-	3461	6	ISM	ENSMUSG00000016534.16	ENSMUST00000061755.9	3604	9	33	8947	-7	1428	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	966	junction_1	32.2093154227158	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCGTTTTTTAAAGACAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37545298	37517330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_37519918_37520726_37520939_37524272_37524432_37529007_37529222_37530901_37531018_37545125
tx.20249	chrX	-	749	2	ISM	ENSMUSG00000031095.16	ENSMUST00000115118.8	3344	23	-3	38517	-3	-38217	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	600	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATCCTCAGCATGCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37665076	37660667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_37661356_37665015
tx.2025	chr10	-	982	4	NNC	ENSMUSG00000056758.15	novel	3389	2	NA	NA	7	8574	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8.28653526310404	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAAAGTGAATGCGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120312190	120297620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_120298132_120298568_120298620_120309156_120309244_120311857
tx.20250	chrX	-	806	2	ISM	ENSMUSG00000031095.16	ENSMUST00000050083.6	3090	23	-13	38216	0	-38216	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	112	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCTCAGCATGCTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37665073	37660666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_37661356_37664956
tx.20251	chrX	+	893	6	FSM	ENSMUSG00000000355.14	ENSMUST00000000365.3	783	6	-12	-98	-12	98	multi-exon	FALSE	canonical	3	489	junction_1	58.4486099064811	294	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATGACTCAATGTCCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37689519	37702401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_37689656_37690805_37690959_37691452_37691551_37694815_37694950_37700642_37700711_37702097
tx.20252	chrX	+	1292	6	NIC	ENSMUSG00000000355.14	novel	764	4	NA	NA	208	98	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_1	233.438985604376	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATGACTCAATGTCCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37689739	37702401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_37690275_37690805_37690959_37691452_37691551_37694815_37694950_37700642_37700711_37702097
tx.20253	chrX	-	1477	2	FSM	ENSMUSG00000048970.10	ENSMUST00000058265.8	1449	2	-34	6	-34	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGTGTTTCTATTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37723998	37719667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_37721001_37723854
tx.20255	chrX	+	666	2	ISM	ENSMUSG00000025860.16	ENSMUST00000126375.2	487	3	61	25649	24	501	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTGATCAACCTCCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41156818	41157784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_41156934_41157233
tx.2026	chr10	-	899	4	NNC	ENSMUSG00000056758.15	novel	3389	2	NA	NA	-4	8574	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	7.40870359029762	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAAAGTGAATGCGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120312201	120297620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_120298038_120298568_120298620_120309156_120309244_120311857
tx.20267	chrX	+	2509	15	FSM	ENSMUSG00000063785.13	ENSMUST00000080713.5	2507	15	-5	3	-5	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	320	junction_8	49.1840047833705	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTCGACTACCTTCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47345733	47371327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_47345846_47347216_47347293_47348599_47348671_47349462_47349528_47351771_47351915_47352353_47352510_47361676_47361797_47361898_47361994_47362566_47362691_47362775_47362854_47363677_47364066_47366098_47366497_47367243_47367438_47367544_47367645_47370938
tx.20269	chrX	-	438	2	ISM	ENSMUSG00000036932.15	ENSMUST00000156795.2	1025	6	7141	-1	7141	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1217	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGGTTGTTTTATTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47564632	47563820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_47564066_47564439
tx.2027	chr10	+	463	2	Intergenic	novelGene_116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAAATAATTTTATAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120351923	120357055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120352021_120356689
tx.20271	chrX	-	2124	16	FSM	ENSMUSG00000036932.15	ENSMUST00000037349.8	2237	16	113	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1039	junction_9	82.1482129378898	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGGTTGTTTTATTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47602327	47563820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_47564066_47564439_47564637_47566576_47566702_47569001_47569145_47570841_47570983_47571598_47571688_47572031_47572140_47573403_47573513_47574334_47574412_47575022_47575108_47583615_47583707_47585956_47586088_47586210_47586336_47588648_47588749_47593686_47593830_47602112
tx.20273	chrX	+	1353	10	NIC	ENSMUSG00000031105.17	novel	1760	11	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	86	junction_7	17.3254968040219	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTTGACTTTGTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47712625	47751171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_47712706_47718128_47718223_47719765_47719914_47723633_47723729_47726266_47726353_47729111_47729208_47740806_47740932_47742243_47742380_47749565_47749647_47750759
tx.20274	chrX	+	755	4	ISM	ENSMUSG00000031105.17	ENSMUST00000177710.2	1516	10	27967	-2	27967	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	6.84754619472471	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTTGACTTTGTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47740805	47751171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_47740932_47742243_47742380_47749565_47749647_47750759
tx.20275	chrX	+	555	5	ISM	ENSMUSG00000031107.7	ENSMUST00000033433.3	1747	6	44	1650	44	7	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	254	junction_1	56.9753236059261	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAGCATATTAAAACTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47783924	47797950	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_47783998_47784196_47784313_47786277_47786330_47795181_47795312_47797766
tx.20276	chrX	+	1701	6	FSM	ENSMUSG00000031107.7	ENSMUST00000033433.3	1747	6	46	0	46	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	254	junction_1	50.9768574943572	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGGCATTTGGTCCACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47783926	47799600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_47783998_47784196_47784313_47786277_47786330_47795181_47795312_47797766_47797951_47798452
tx.20277	chrX	+	1630	5	ISM	ENSMUSG00000031107.7	ENSMUST00000033433.3	1747	6	316	0	316	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	347	junction_4	19.8053023203384	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGGGCATTTGGTCCACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47784196	47799600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_47784313_47786277_47786330_47795181_47795312_47797766_47797951_47798452
tx.20278	chrX	-	587	3	ISM	ENSMUSG00000079606.2	ENSMUST00000114928.2	2122	21	-60	34711	-60	-34711	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_2	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTAAGCACTTTCTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47966650	47965053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_47965258_47965864_47965991_47966393
tx.20279	chrX	+	754	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031109.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAAGTCTACCCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47984903	48099211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_47985005_47989502_47989610_48098665
tx.2028	chr10	+	238	3	Intergenic	novelGene_124	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_1	3	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTTTTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120359249	120360215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120359328_120359405_120359477_120360126
tx.20281	chrX	-	407	4	ISM	ENSMUSG00000031109.17	ENSMUST00000137518.8	968	6	-42	15263	5	-10948	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_2	9.56846672960488	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCTGATCCAGCTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48377131	48169579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_48169629_48257517_48257662_48375721_48375782_48376977
tx.20282	chrX	-	213	2	ISM	ENSMUSG00000031109.17	ENSMUST00000137518.8	968	6	-41	221405	6	-217090	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTGAGTTTAAATATAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48377130	48375721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_48375782_48376977
tx.20283	chrX	-	3200	2	ISM	ENSMUSG00000085396.8	ENSMUST00000148530.3	716	6	17	12627	17	-12627	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAAACCCGGTACCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49724163	49717014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_49719873_49723821
tx.20284	chrX	+	3327	12	FSM	ENSMUSG00000031112.11	ENSMUST00000033444.11	3639	12	313	-1	-81	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	20	junction_11	5.29618605950164	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATCCTCGATGTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49930236	49981975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_49930424_49930555_49930713_49959132_49959364_49968365_49968423_49974465_49974575_49974663_49974822_49975527_49975714_49976737_49976887_49977892_49977987_49978565_49978629_49978709_49978847_49980176
tx.20285	chrX	-	3200	3	FSM	ENSMUSG00000050029.8	ENSMUST00000053593.8	3545	3	-34	379	-34	-379	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_1	4	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGGAGGCTTGTCTCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50106929	50093167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_50095628_50103847_50104161_50106502
tx.20286	chrX	-	1586	7	NNC	ENSMUSG00000036109.18	novel	4649	7	NA	NA	169	77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_6	8.78761755097604	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACTATATGTGACTGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50294540	50209251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_50209896_50212693_50212789_50217797_50217949_50218981_50219219_50220305_50220498_50228080_50228246_50294438
tx.20287	chrX	-	1557	7	FSM	ENSMUSG00000036109.18	ENSMUST00000114875.8	4649	7	-83	3175	75	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	9.88966913276453	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGCTATAGTGTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50294792	50209320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_50209896_50212693_50212789_50217797_50217949_50218981_50219219_50220305_50220498_50228080_50228246_50294650
tx.20288	chrX	-	1511	7	FSM	ENSMUSG00000036109.18	ENSMUST00000041495.14	1803	7	0	292	0	80	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	9.88966913276453	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATATGTGACTGAAAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50235292	50209248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_50209896_50212693_50212789_50217797_50217949_50218981_50219219_50220305_50220498_50228080_50228246_50235268
tx.2029	chr10	+	1252	8	Intergenic	novelGene_118	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_7	36.3778358176447	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGTCTTCAAATGATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120359239	120374524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120359328_120359405_120359477_120360126_120360189_120363521_120363638_120364338_120364520_120369971_120370079_120373440_120373621_120374077
tx.20290	chrX	-	313	4	ISM	ENSMUSG00000055780.11	ENSMUST00000069509.4	4120	8	62	43811	62	-43811	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_3	2.86744175568088	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAACAGAACTGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50889959	50886646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_50886704_50887371_50887431_50889689_50889806_50889878
tx.20291	chrX	-	1407	4	NIC	ENSMUSG00000031118.9	novel	1454	4	NA	NA	-24	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	60	junction_2	10.4029910228848	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGTTGCTCCGTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51061673	51057570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_51058747_51059091_51059163_51059858_51059953_51061607
tx.20292	chrX	-	1521	5	NIC	ENSMUSG00000031118.9	novel	1232	4	NA	NA	-21	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	7	junction_3	35.6195171219375	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGTTGCTCCGTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51061670	51057570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_51058747_51059091_51059163_51059359_51059477_51059858_51059953_51061607
tx.20293	chrX	-	2773	9	FSM	ENSMUSG00000031119.5	ENSMUST00000033450.3	2651	9	-119	-3	-119	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	220	junction_5	29.8493613834534	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGGAAAATTTCCATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51254248	51141894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_51142604_51142693_51142870_51143322_51143460_51145536_51145684_51145777_51145909_51151734_51151901_51163170_51163563_51180518_51180678_51253492
tx.20294	chrX	-	2268	8	FSM	ENSMUSG00000055653.14	ENSMUST00000069360.14	2216	8	-52	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_6	17.9398086582293	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGTTGGTCCTTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51702850	51361302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_51361832_51403713_51403874_51454598_51454720_51476985_51477112_51485949_51486084_51517316_51518012_51671673_51671836_51702509
tx.20295	chrX	-	1731	6	NNC	ENSMUSG00000055653.14	novel	1880	5	NA	NA	-46	11030	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	101.840267085274	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGCTATTGTTGTGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51702873	51465510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_51465761_51476985_51477112_51485949_51486084_51517316_51518012_51671673_51671836_51702509
tx.20296	chrX	-	858	2	ISM	ENSMUSG00000055653.14	ENSMUST00000114857.2	1880	5	-21	194776	-21	-194776	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGTGGATAGTATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51702848	51671316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_51671836_51702509
tx.20297	chrX	-	407	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083621.2	novel	408	1	NA	NA	-25	52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATACCTCGTGCTGCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51861651	51861166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_51861476_51861553
tx.20298	chrX	+	1545	2	FSM	ENSMUSG00000073207.2	ENSMUST00000101588.2	1536	2	-3	-6	-3	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGCCTGTGATTCTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51880073	51888351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_51880203_51886935
tx.20299	chrX	+	1525	2	NNC	ENSMUSG00000073207.2	novel	1536	2	NA	NA	1861	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGCCTGTGATTCTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51881937	51888351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_51882047_51886935
tx.203	chr1	+	2969	11	NNC	ENSMUSG00000056870.10	novel	3138	11	NA	NA	-22	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	6.4	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAACTGTATGATATGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44590830	44835993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_44591033_44728303_44728376_44747776_44747839_44783633_44783706_44793502_44793602_44805173_44805308_44812430_44812548_44813212_44813306_44820127_44820267_44827607_44827703_44834109
tx.2030	chr10	+	324	2	Intergenic	novelGene_120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTTTTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120359241	120360215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120359477_120360126
tx.20300	chrX	+	912	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081684.5	novel	882	1	NA	NA	-28	58	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAAGTCACGGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51987436	51988404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_51987748_51987803
tx.20301	chrX	+	1421	11	FSM	ENSMUSG00000025626.17	ENSMUST00000078944.13	4350	11	-9	2938	-9	-1960	multi-exon	FALSE	canonical	3	199	junction_10	29.4423164849507	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCCGACTCTTAGATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52001133	52042882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_52001314_52005429_52005614_52006042_52006145_52020449_52020584_52020857_52020902_52029101_52029269_52029413_52029558_52031440_52031546_52034760_52034895_52042328_52042456_52042782
tx.20302	chrX	+	1328	8	NNC	ENSMUSG00000025630.9	novel	1289	9	NA	NA	-31	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	818.20507882829	1180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTTTTTGAATTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52076982	52110537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_52077128_52087967_52088075_52090964_52091149_52097529_52097596_52105198_52105307_52108981_52109029_52109199_52109277_52109943
tx.20303	chrX	+	1293	8	NNC	ENSMUSG00000025630.9	novel	1289	9	NA	NA	2	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	818.20507882829	206	2	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTTTTTGAATTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52077015	52110537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_52077128_52087967_52088075_52090964_52091149_52097529_52097596_52105200_52105307_52108981_52109029_52109199_52109277_52109943
tx.20304	chrX	-	769	2	FSM	ENSMUSG00000087365.8	ENSMUST00000151099.2	770	2	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTTAGTTGTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52146067	52145070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_52145647_52145874
tx.20305	chrX	-	3578	9	FSM	ENSMUSG00000036022.16	ENSMUST00000114838.8	3536	9	-43	1	-43	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_3	8.54034542626936	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGATCGTAAAAGTCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52357940	52332302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_52335168_52342912_52343010_52347833_52347896_52348717_52348804_52349071_52349174_52349422_52349478_52349566_52349611_52354917_52354997_52357752
tx.20306	chrX	-	665	8	NNC	ENSMUSG00000036022.16	novel	2038	10	NA	NA	2719	-9063	intron_retention	FALSE	canonical	3	9	junction_7	26.1939391649975	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTCTCCATGGAGGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52355178	52342803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_52343010_52347833_52347896_52348717_52348804_52349071_52349174_52349422_52349478_52349566_52349611_52354917_52354997_52355147
tx.20307	chrX	-	2203	6	FSM	ENSMUSG00000023074.12	ENSMUST00000096447.9	1773	6	-20	-410	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_3	3.77359245282264	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTGTTCTCTCTCCGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52459399	52433474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_52434867_52436580_52436743_52444532_52444751_52446286_52446363_52446450_52446705_52459298
tx.2031	chr10	+	3247	7	Intergenic	novelGene_121	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_5	13.7285185734741	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTCCATGACTAGAGGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120359241	120372848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120359328_120359405_120359477_120360126_120360189_120363521_120363638_120364338_120364520_120369971_120370079_120370224
tx.20310	chrX	+	965	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000051851.6	novel	401	1	NA	NA	-122	703	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGTCTTACTTAGTATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52609876	52611102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_52610392_52610652
tx.20311	chrX	+	1454	5	FSM	ENSMUSG00000055555.2	ENSMUST00000069209.2	1427	5	-25	-2	-25	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_4	18.2397231338636	234	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGTTTACCTGTAGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52726767	52740410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_52727016_52729333_52729516_52735693_52735827_52738241_52738355_52739632
tx.20312	chrX	-	1237	9	FSM	ENSMUSG00000054727.3	ENSMUST00000067940.3	1224	9	-12	-1	-12	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1101	junction_5	153.190241203544	4418	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGACTTTAGTATATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52759810	52744866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_52745154_52745318_52745424_52747619_52747719_52748908_52749009_52749789_52749908_52751980_52752016_52752989_52753054_52753476_52753824_52759728
tx.20313	chrX	-	1260	3	NNC	ENSMUSG00000086711.2	novel	4529	2	NA	NA	52	15707	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTTGTTCTTTAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52976915	52955696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_52956397_52975320_52975490_52976524
tx.20314	chrX	+	1047	8	FSM	ENSMUSG00000031125.3	ENSMUST00000033458.3	1022	8	-25	0	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	16.2819544532076	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTGGCAAATAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55181906	55198858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_55181986_55183330_55183457_55183770_55183835_55184104_55184140_55192435_55192554_55193247_55193348_55198014_55198114_55198432
tx.20315	chrX	+	917	7	NIC	ENSMUSG00000031125.3	novel	1022	8	NA	NA	-21	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	6	junction_1	19.6864307469779	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTGGCAAATAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55181910	55198858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_55181986_55183770_55183835_55184104_55184140_55192435_55192554_55193247_55193348_55198014_55198114_55198432
tx.20316	chrX	+	1004	8	NNC	ENSMUSG00000031125.3	novel	1022	8	NA	NA	-30	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	20.1048273216323	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTGGCAAATAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55181901	55198858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_55181986_55183378_55183457_55183770_55183835_55184104_55184140_55192435_55192554_55193247_55193348_55198014_55198114_55198432
tx.20317	chrX	-	977	8	FSM	ENSMUSG00000073177.9	ENSMUST00000101561.8	951	8	-28	2	-28	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	4.42165358301205	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGTGATTTTTTGCAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55258269	55235188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_55235530_55239012_55239112_55241930_55242031_55242833_55242952_55246943_55246979_55247366_55247437_55248032_55248151_55258173
tx.20318	chrX	-	937	7	NIC	ENSMUSG00000073177.9	novel	951	8	NA	NA	-16	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	2	junction_4	8.67307455417179	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTGCAATGTTAATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55258257	55235181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_55235530_55239012_55239112_55241930_55242031_55242833_55242952_55247366_55247437_55248032_55248151_55258173
tx.20319	chrX	+	569	3	FSM	ENSMUSG00000085114.2	ENSMUST00000151426.2	547	3	-12	-10	-12	10	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCATTTCTTTTGGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55362955	55366034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_55363107_55364299_55364361_55365677
tx.2032	chr10	+	975	5	Intergenic	novelGene_122	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_3	11.8532695911297	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCAAGTCTCTTTGCCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120359243	120364980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120359328_120359405_120359477_120360126_120360189_120363521_120363638_120364338
tx.20320	chrX	+	3736	5	FSM	ENSMUSG00000073176.5	ENSMUST00000101560.4	3738	5	0	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	8.6421930087218	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCTCTTTCTGATTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55391759	55411032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_55391800_55393642_55394089_55398822_55399028_55407826_55407941_55408101
tx.20321	chrX	+	537	4	NNC	ENSMUSG00000054850.5	novel	2393	2	NA	NA	-48	-3	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_1	26.4491125665032	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACACATCCTGGCTGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55419897	55423156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_55419977_55420454_55420569_55421389_55421551_55422973
tx.20322	chrX	+	2435	2	FSM	ENSMUSG00000054850.5	ENSMUST00000068106.5	2393	2	-40	-2	-40	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCCTGGCTGCCTCCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55419905	55423161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_55420569_55421389
tx.20324	chrX	+	3767	17	FSM	ENSMUSG00000035967.16	ENSMUST00000039374.9	3766	17	3	-4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_10	18.8414436814168	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTAGGTGTATGTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55500239	55553203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_55500677_55500808_55500887_55524989_55525140_55525930_55526021_55526249_55526434_55526685_55526815_55529138_55529303_55530598_55530752_55534365_55534499_55538398_55538494_55541875_55542095_55543220_55543345_55544927_55545071_55547020_55547256_55550084_55550460_55551732_55551827_55552239
tx.20325	chrX	+	4005	17	NIC	ENSMUSG00000035967.16	novel	3766	17	NA	NA	-2	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	44	junction_9	15.57040461902	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCTAGGTGTATGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55500242	55553201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_55500887_55524989_55525140_55525930_55526021_55526249_55526434_55526685_55526815_55529138_55529303_55530598_55530752_55534365_55534499_55538398_55538494_55539492_55539604_55541875_55542095_55543220_55543345_55544927_55545071_55547020_55547256_55550084_55550460_55551732_55551827_55552239
tx.20326	chrX	-	4121	4	FSM	ENSMUSG00000061273.4	ENSMUST00000059899.3	4234	4	112	1	112	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_2	4.64279609239471	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACCTTGTGTTTGGTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55643317	55630872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_55634664_55636437_55636542_55640749_55640803_55643144
tx.20327	chrX	+	314	3	Intergenic	novelGene_1379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCTTTACAGAGATTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55643577	55644754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_55643663_55644417_55644515_55644622
tx.20328	chrX	+	2240	6	NIC	ENSMUSG00000023092.17	novel	2356	7	NA	NA	-76	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_5	48.3553513067582	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCACGCCTCCTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55777070	55838701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_55777229_55799694_55799752_55833348_55833531_55834503_55834679_55835236_55835407_55837203
tx.20329	chrX	+	2378	7	FSM	ENSMUSG00000023092.17	ENSMUST00000023854.10	2356	7	-25	3	-25	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_5	4.78423336480244	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACGCCTCCTGTCTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55777121	55838703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_55777229_55799694_55799752_55833348_55833531_55834503_55834679_55835236_55835407_55835823_55836011_55837203
tx.2033	chr10	+	398	4	Intergenic	novelGene_119	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_3	13.4246870437348	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGGAGGAGGTGGAGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120359240	120363699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120359328_120359405_120359477_120360126_120360189_120363521
tx.20330	chrX	+	1026	5	NNC	ENSMUSG00000067873.12	novel	1128	6	NA	NA	-19	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	258.472919277823	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCACTGGCTCACTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56099238	56102568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_56099559_56100857_56101043_56101404_56101453_56101859_56102015_56102250
tx.20331	chrX	+	2743	9	NNC	ENSMUSG00000067873.12	novel	2810	10	NA	NA	-24	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	165.287439026685	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGACTTGAGTTAACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56099233	56112543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_56099559_56100857_56101043_56101404_56101453_56101859_56102015_56104245_56104410_56105213_56105314_56109476_56109567_56110365_56110504_56111005
tx.20332	chrX	+	1641	2	ISM	ENSMUSG00000067873.12	ENSMUST00000088652.6	2810	10	11426	0	11143	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	502	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGACTTGAGTTAACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56110400	56112543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_56110504_56111005
tx.20333	chrX	-	2325	10	FSM	ENSMUSG00000031134.17	ENSMUST00000140384.8	2139	10	-4	-182	-4	182	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_8	6.66296193358442	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGGTGTTGGGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56438345	56428707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_56429922_56430492_56430582_56433420_56433504_56433881_56434008_56434104_56434220_56434778_56434932_56435423_56435596_56436631_56436739_56436926_56437059_56438211
tx.20334	chrX	-	382	2	ISM	ENSMUSG00000031134.17	ENSMUST00000140384.8	2139	10	3	7914	3	-1301	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGCAGATGTGCGCTGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56438338	56436803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_56437059_56438211
tx.20335	chrX	+	2167	17	NNC	ENSMUSG00000079584.3	novel	2156	17	NA	NA	-1	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	151.271641013774	393	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCCTGTCTGGCCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56454512	56534133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_56454734_56459619_56459688_56461126_56461221_56463018_56463147_56463508_56463639_56467202_56467331_56468624_56468741_56478568_56478649_56481769_56481879_56482743_56482877_56484923_56485044_56485247_56485306_56508440_56508601_56509625_56509775_56513777_56513890_56517713_56517886_56533944
tx.20336	chrX	+	2163	17	NNC	ENSMUSG00000079584.3	novel	2156	17	NA	NA	0	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	151.271641013774	425	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCCTGTCTGGCCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56454513	56534133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_56454734_56459619_56459688_56461126_56461221_56463018_56463147_56463508_56463639_56467202_56467331_56468624_56468741_56478571_56478649_56481769_56481879_56482743_56482877_56484923_56485044_56485247_56485306_56508440_56508601_56509625_56509775_56513777_56513890_56517713_56517886_56533944
tx.20337	chrX	+	357	2	ISM	ENSMUSG00000079584.3	ENSMUST00000114725.3	2156	17	63204	-6	63204	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	582	junction_1	0	469	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCCTGTCTGGCCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56517717	56534133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_56517886_56533944
tx.20338	chrX	+	3581	3	FSM	ENSMUSG00000067860.12	ENSMUST00000088627.11	3949	3	367	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	194	junction_2	9.5	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTTATAACTTTTTTT	9867	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57076369	57081918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_57077598_57078721_57078886_57079729
tx.20339	chrX	+	1950	3	FSM	ENSMUSG00000067860.12	ENSMUST00000088629.4	1951	3	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	99.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGTGATTATTGTTTTA	9867	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57076369	57087095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_57077598_57078721_57078886_57086537
tx.2034	chr10	+	655	3	Intergenic	novelGene_125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAGGAGGAGGAGGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120446178	120450662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120446391_120449665_120449827_120450380
tx.20340	chrX	+	1572	2	FSM	ENSMUSG00000046180.12	ENSMUST00000062542.5	1572	2	7	-7	7	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_1	0	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTTTGTTCTTTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57956827	57965671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_57956922_57964193
tx.20341	chrX	-	2529	5	FSM	ENSMUSG00000031137.18	ENSMUST00000033473.12	2499	5	-30	0	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_2	5.62916512459885	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAACTTCAATGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58179826	58107504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_58109030_58112760_58112960_58171253_58171358_58177199_58177311_58179236
tx.20342	chrX	-	1625	2	ISM	ENSMUSG00000031137.18	ENSMUST00000033473.12	2499	5	66936	0	65662	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAACTTCAATGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58112860	58107504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_58109030_58112760
tx.20343	chrX	-	4330	28	FSM	ENSMUSG00000031139.17	ENSMUST00000063507.11	4227	28	-103	0	-103	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_27	54.2283947104	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTCTGGTGTTCGTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59224552	59101315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_59102051_59105206_59105314_59107439_59107583_59108453_59108518_59109956_59110036_59112514_59112608_59122540_59122763_59128218_59128345_59129760_59129854_59152815_59152909_59154776_59154847_59155115_59155232_59155927_59155995_59158738_59158819_59160462_59160507_59166299_59166472_59168475_59168668_59170068_59170261_59172375_59172496_59174656_59174772_59175403_59175538_59178967_59179118_59180738_59180856_59181613_59181734_59198259_59198351_59200962_59201078_59205586_59205656_59223941
tx.20344	chrX	-	3812	28	NNC	ENSMUSG00000031139.17	novel	4227	28	NA	NA	828	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	198	junction_27	79.0220750182634	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTCTGGTGTTCGTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59223621	59101315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_59102051_59105206_59105314_59107439_59107583_59108453_59108518_59109956_59110036_59112514_59112608_59122540_59122763_59128218_59128345_59129760_59129854_59152815_59152909_59154776_59154847_59155115_59155232_59155927_59155995_59158738_59158819_59160462_59160507_59166299_59166472_59168475_59168668_59170068_59170261_59172375_59172496_59174656_59174772_59175403_59175538_59178967_59179118_59180738_59180856_59181613_59181734_59198259_59198351_59200962_59201078_59205586_59205656_59223528
tx.20347	chrX	+	1948	4	FSM	ENSMUSG00000045330.9	ENSMUST00000051414.2	1970	4	28	-6	28	6	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2.62466929133727	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTTCTGTTTGGAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61330775	61335690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_61330842_61332956_61333046_61333767_61333841_61333970
tx.20348	chrX	-	635	3	NNC	ENSMUSG00000085757.8	novel	594	3	NA	NA	4584	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_2	19	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGAGTTGATTTTTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61566033	61554137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_61554605_61558040_61558144_61565968
tx.20349	chrX	+	1649	4	FSM	ENSMUSG00000031179.15	ENSMUST00000033522.15	1649	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.69967317119759	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTATGTTTAGTCTCCCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63217153	63222384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_63217298_63219533_63219620_63220397_63220469_63221036
tx.2035	chr10	+	536	3	FSM	ENSMUSG00000087480.2	ENSMUST00000127564.2	2971	3	3	2432	3	-2432	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGGAAACTGTTCCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120693536	120696799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_120693667_120694852_120694965_120696505
tx.20350	chrX	+	919	3	FSM	ENSMUSG00000031181.3	ENSMUST00000033524.3	854	3	-65	0	-65	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTGAGTTACTGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64091184	64092620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_64091683_64092028_64092158_64092328
tx.20351	chrX	+	1679	9	NNC	ENSMUSG00000079577.2	novel	782	8	NA	NA	-884	716	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	35	junction_1	9.9365172470036	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATTGAAATTATCAAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66738419	66750672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_66738557_66739259_66739413_66739880_66739951_66740099_66740135_66741912_66742031_66742916_66743017_66743790_66743890_66749598_66749704_66749810
tx.20352	chrX	+	1674	9	NNC	ENSMUSG00000079577.2	novel	782	8	NA	NA	-881	714	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	35	junction_1	9.9365172470036	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAATTGAAATTATCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66738422	66750670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_66738557_66739259_66739413_66739880_66739951_66740099_66740135_66741912_66742031_66742916_66743017_66743790_66743890_66749598_66749704_66749810
tx.20353	chrX	+	2551	3	ISM	ENSMUSG00000000838.18	ENSMUST00000114653.2	4058	17	33528	0	494	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	826	junction_1	32	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTAGTCTGACAGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67755950	67761569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_67756020_67756846_67756930_67759170
tx.20354	chrX	+	778	5	FSM	ENSMUSG00000062170.13	ENSMUST00000069731.12	799	5	15	6	15	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	455	junction_2	146.787899705664	7587	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGAATCTGGATTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67805459	67848167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_67805838_67807537_67807616_67815650_67815748_67847210_67847300_67848031
tx.20355	chrX	+	700	4	FSM	ENSMUSG00000062170.13	ENSMUST00000114647.8	679	4	-27	6	15	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	331	junction_1	201.191451110627	5728	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGAATCTGGATTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67805459	67848167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_67805838_67815650_67815748_67847210_67847300_67848031
tx.20356	chrX	-	717	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082926.4	novel	750	1	NA	NA	-42	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGGCTTTCATTAATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68649893	68649061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_68649598_68649712
tx.20357	chrX	+	552	2	FSM	ENSMUSG00000059690.2	ENSMUST00000075654.2	525	2	-25	-2	-25	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGTCTCTGTGTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68988880	68989586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_68989057_68989210
tx.20358	chrX	+	1094	3	FSM	ENSMUSG00000045237.6	ENSMUST00000053981.6	1094	3	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	343	junction_1	1.5	562	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGAAGTGTCTAGCTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69429482	69433023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_69429758_69431499_69431773_69432477
tx.20359	chrX	-	1733	3	ISM	ENSMUSG00000073139.10	ENSMUST00000154400.8	736	6	7266	-1301	7266	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	237	junction_2	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGTGTATTTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69506519	69503358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_69504899_69505796_69505921_69506450
tx.2036	chr10	+	1258	5	Intergenic	novelGene_127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGCTCCTTTCAATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120847260	120865896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120847370_120858898_120859206_120859676_120859780_120861977_120862105_120865284
tx.20360	chrX	-	2493	7	FSM	ENSMUSG00000073139.10	ENSMUST00000114630.3	1307	7	20	-1206	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	188	junction_5	21.8587638158144	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGTGTATTTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69520766	69503358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_69504899_69505796_69505921_69506450_69506628_69508608_69508693_69510759_69510968_69513723_69513901_69520583
tx.20361	chrX	+	3347	15	NNC	ENSMUSG00000031337.17	novel	3379	15	NA	NA	-1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	89.0701683952556	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATTTCCAGGGCTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70258643	70358897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_70258689_70274996_70275068_70276677_70276751_70278457_70278553_70297856_70297968_70303330_70303433_70328206_70328291_70330757_70330908_70335354_70335544_70339769_70339960_70343173_70343381_70345339_70345433_70346106_70346221_70351305_70351483_70357251
tx.20362	chrX	+	2641	14	NNC	ENSMUSG00000031337.17	novel	3379	15	NA	NA	-2	-1507	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	92.2693510115611	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTGGAACCTTGTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70258631	70352410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_70258689_70274996_70275068_70276677_70276751_70278457_70278553_70297856_70297968_70303330_70303433_70328206_70328291_70330757_70330908_70335354_70335544_70339769_70339960_70343173_70343381_70345339_70345433_70346106_70346221_70351305
tx.20363	chrX	+	600	5	ISM	ENSMUSG00000031337.17	ENSMUST00000101501.10	770	7	14	6262	-8	-1753	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	300	junction_1	29.1236587674008	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTAGACTTGGATCTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70258625	70298154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_70258689_70274996_70275068_70276677_70276751_70278457_70278553_70297856
tx.20365	chrX	+	2298	13	NNC	ENSMUSG00000031337.17	novel	3379	15	NA	NA	-11	4506	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	96.0359813935497	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGAGTATGGTCACACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70258622	70346973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_70258689_70274996_70275068_70276677_70276751_70278457_70278553_70297856_70297968_70303330_70303433_70328206_70328291_70330757_70330908_70335354_70335544_70339769_70339960_70343173_70343381_70345339_70345433_70346106
tx.20366	chrX	+	1553	10	FSM	ENSMUSG00000031337.17	ENSMUST00000126208.8	2339	10	-5	791	0	-791	multi-exon	FALSE	canonical	3	300	junction_1	24.1844761962894	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTGTTAGAAACTATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70258636	70340395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_70258689_70274996_70275068_70276677_70276751_70278457_70278553_70297856_70297968_70303330_70303433_70328206_70328291_70330757_70330908_70335354_70335544_70339769
tx.20367	chrX	-	3406	10	FSM	ENSMUSG00000035776.15	ENSMUST00000037391.12	3600	10	186	8	-14	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_4	6.51683479938452	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCTTATGTCCTGATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70536269	70463673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_70466356_70467629_70467696_70472652_70472773_70473916_70473956_70481739_70481806_70484130_70484218_70484679_70484752_70493544_70493614_70494216_70494280_70536127
tx.20368	chrX	+	1548	5	FSM	ENSMUSG00000015217.12	ENSMUST00000072699.13	1571	5	0	23	0	-23	multi-exon	FALSE	canonical	3	598	junction_1	126.240593708997	687	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTGTATTACAACGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70599523	70604259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_70599615_70601658_70601814_70602038_70602179_70602703_70602879_70603272
tx.20369	chrX	+	1461	4	FSM	ENSMUSG00000015217.12	ENSMUST00000132145.2	847	4	267	-881	267	-22	multi-exon	FALSE	canonical	3	753	junction_3	86.723058576649	319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGTATTACAACGGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70601655	70604260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_70601814_70602038_70602179_70602703_70602879_70603272
tx.2037	chr10	+	961	3	Intergenic	novelGene_128	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGATTCTCGTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120847269	120850881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120847370_120847833_120847875_120850061
tx.20370	chrX	+	520	3	FSM	ENSMUSG00000073131.13	ENSMUST00000114576.9	4195	3	30	3645	-2	77	multi-exon	FALSE	canonical	3	286	junction_1	56.5	1820	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTTAAAGAGTCAGTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70860393	70864667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_70860547_70863673_70863784_70864410
tx.20371	chrX	-	1033	4	FSM	ENSMUSG00000031347.13	ENSMUST00000033713.11	1026	4	0	-7	0	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	611	junction_2	29.9146935282461	313	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTAAAGGATGAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71960462	71957302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_71957900_71958445_71958584_71959870_71960000_71960293
tx.20372	chrX	-	1094	5	FSM	ENSMUSG00000031347.13	ENSMUST00000114551.10	1286	5	27	165	27	7	multi-exon	TRUE	canonical	3	590	junction_4	36.4862987983161	1594	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTAAAGGATGAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71961990	71957302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_71957900_71958445_71958584_71959870_71960000_71960293_71960453_71961919
tx.20373	chrX	+	1761	8	FSM	ENSMUSG00000031349.5	ENSMUST00000033715.5	2168	8	31	376	31	-376	multi-exon	FALSE	canonical	3	334	junction_6	28.7537042866494	616	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTCTGGTGTGGTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71962193	72001744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_71962300_71969899_71970017_71973229_71973389_71992770_71992918_71996448_71996578_71998677_71998821_71999942_72000046_72000887
tx.20374	chrX	+	3511	19	FSM	ENSMUSG00000031351.16	ENSMUST00000164800.8	3557	19	21	25	0	-25	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_12	13.3427050397503	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTATTATAACTTCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72030965	72075124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_72031126_72040640_72040719_72040887_72041012_72041343_72041410_72042141_72042181_72042274_72042353_72042856_72042944_72043622_72043707_72044593_72044678_72045010_72045053_72046180_72046265_72046978_72047066_72056045_72056235_72059344_72059456_72060300_72060382_72061979_72062049_72064473_72064577_72072450_72072550_72073278
tx.20375	chrX	+	1408	12	ISM	ENSMUSG00000031351.16	ENSMUST00000164800.8	3557	19	21	27689	0	6449	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_6	15.1226391504933	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGCTTATAGGACAAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72030965	72047460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_72031126_72040640_72040719_72040887_72041012_72041343_72041410_72042141_72042181_72042274_72042353_72042856_72042944_72043622_72043707_72044593_72044678_72045010_72045053_72046180_72046265_72046978
tx.20376	chrX	-	1143	2	NNC	ENSMUSG00000050424.10	novel	2287	2	NA	NA	146	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTCTTTCTGGCGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72079563	72077588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_72077934_72078765
tx.20377	chrX	-	1592	9	FSM	ENSMUSG00000057836.13	ENSMUST00000074619.6	1645	9	55	-2	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	586	junction_7	340.598531081683	1176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTGGCATGAGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72140646	72129898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72130791_72130883_72130980_72133005_72133105_72134464_72134565_72135379_72135498_72136875_72136911_72137788_72137859_72138566_72138689_72140586
tx.20378	chrX	-	1175	9	FSM	ENSMUSG00000058328.14	ENSMUST00000078574.12	1650	9	4	471	4	303	multi-exon	TRUE	canonical	3	269	junction_2	77.2438306598009	410	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGTGCATGCTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72161304	72151711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72152123_72152218_72152324_72153534_72153634_72155020_72155121_72155796_72155918_72156950_72156986_72158152_72158223_72158740_72158878_72161207
tx.20379	chrX	-	1076	8	NIC	ENSMUSG00000058328.14	novel	1650	9	NA	NA	4	303	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	293	junction_4	76.0110088696878	584	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGTGCATGCTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72161304	72151711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_72152123_72152218_72152324_72155020_72155121_72155796_72155918_72156950_72156986_72158152_72158223_72158740_72158878_72161207
tx.2038	chr10	+	2242	10	FSM	ENSMUSG00000020218.12	ENSMUST00000020439.11	2294	10	44	8	-20	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	5.2704627669473	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTACTGTATGGGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120869908	120936547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_120870396_120870870_120871011_120911150_120911260_120918030_120918172_120919792_120919889_120920813_120920910_120926015_120926112_120931903_120932000_120932545_120932642_120935662
tx.20380	chrX	+	1120	9	NNC	ENSMUSG00000072479.11	novel	1652	9	NA	NA	-18	306	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	104	junction_1	165.884749148317	66	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGTGCATGCTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72192383	72202005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_72192426_72194831_72194969_72195486_72195557_72196723_72196759_72197791_72197913_72198588_72198689_72200075_72200175_72201393_72201499_72201594
tx.20381	chrX	+	1179	9	FSM	ENSMUSG00000072479.11	ENSMUST00000114518.9	1652	9	1	472	1	307	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_8	146.338167868127	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTGCATGCTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72192402	72202006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_72192503_72194831_72194969_72195486_72195557_72196723_72196759_72197791_72197913_72198588_72198689_72200075_72200175_72201393_72201499_72201594
tx.20382	chrX	+	1077	8	NIC	ENSMUSG00000072479.11	novel	1652	9	NA	NA	4	307	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	121	junction_7	152.49623615295	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTGCATGCTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72192405	72202006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_72192503_72194831_72194969_72195486_72195557_72196723_72196759_72197791_72197913_72198588_72198689_72201393_72201499_72201594
tx.20383	chrX	+	1080	8	FSM	ENSMUSG00000072479.11	ENSMUST00000097221.4	864	8	90	-306	90	306	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_7	155.610188009156	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGTGCATGCTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72194829	72202005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_72194969_72195486_72195557_72196723_72196759_72197791_72197913_72198588_72198689_72200075_72200175_72201393_72201499_72201594
tx.20384	chrX	-	902	2	NNC	ENSMUSG00000079566.2	novel	1015	2	NA	NA	339	25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGATGGGCTCAGGTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72220256	72218882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_72219726_72220197
tx.20385	chrX	+	1606	9	FSM	ENSMUSG00000073125.11	ENSMUST00000101486.5	1564	9	-32	-10	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	836	junction_5	296.174779479955	1169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTGGCATGAGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72235795	72246536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_72235856_72237775_72237913_72238605_72238676_72239547_72239583_72240958_72241077_72241891_72241992_72243351_72243451_72245455_72245552_72245645
tx.20386	chrX	+	1184	9	NIC	ENSMUSG00000067768.13	novel	1200	9	NA	NA	-8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	85	junction_1	78.4071903590481	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTGGCATGAGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72257946	72266059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_72258064_72258379_72258463_72258833_72258962_72259646_72259716_72261328_72261447_72262291_72262392_72263579_72263679_72265472_72265569_72265685
tx.20387	chrX	-	1603	9	FSM	ENSMUSG00000058147.2	ENSMUST00000080839.2	1584	9	-17	-2	-17	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	686	junction_5	383.166718772651	1015	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTGGCATGAGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72309013	72298143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72299035_72299128_72299225_72301241_72301341_72302698_72302799_72303613_72303732_72305110_72305146_72306028_72306099_72306921_72307059_72308956
tx.20389	chrX	-	3719	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000096966.3	novel	2298	1	NA	NA	-2994	1245	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCCAACTGTGTCTCACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72445336	72438799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_72442387_72445204
tx.2039	chr10	-	1616	11	ISM	ENSMUSG00000020115.4	ENSMUST00000219400.2	3005	21	26847	-5	4168	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	115	junction_10	17.2232401132888	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTGTGTGCTTTTGTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121395835	121382359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_121383094_121387155_121387228_121387391_121387499_121388104_121388202_121388312_121388415_121388933_121388974_121389649_121389727_121389807_121389930_121391891_121391971_121393106_121393209_121395751
tx.20390	chrX	-	1163	2	FSM	ENSMUSG00000031372.8	ENSMUST00000033738.8	1017	2	-146	0	-146	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTGGCCAGACTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72479096	72477310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72478280_72478902
tx.20391	chrX	-	1365	10	FSM	ENSMUSG00000031371.15	ENSMUST00000033737.15	1380	10	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	498	junction_3	42.8281089190294	950	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTTGCCTTCGGACTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72502635	72480920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72481172_72489415_72489531_72490533_72490744_72491565_72491663_72491797_72491957_72492416_72492509_72496604_72496667_72498472_72498541_72501579_72501696_72502440
tx.20392	chrX	+	260	2	ISM	ENSMUSG00000031383.9	ENSMUST00000019701.9	2722	4	-3	3288	-3	-3288	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	583	junction_1	0	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGAGAGTCTGAGTCGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72683021	72683832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_72683248_72683798
tx.20393	chrX	+	2737	4	FSM	ENSMUSG00000031383.9	ENSMUST00000019701.9	2722	4	-15	0	-15	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	583	junction_1	9.62635271879577	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGAGGTTGTTGCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72683009	72687120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_72683248_72683798_72684411_72684952_72685409_72685689
tx.20394	chrX	-	1505	12	FSM	ENSMUSG00000002012.14	ENSMUST00000114472.8	1532	12	30	-3	30	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_11	13.5176652099123	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGTGCTGAACTGGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72703693	72699597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72699993_72700275_72700421_72700517_72700606_72700676_72700756_72700836_72700950_72701043_72701120_72701325_72701450_72701624_72701764_72701859_72701935_72702293_72702426_72702785_72702856_72703624
tx.20396	chrX	+	2938	12	ISM	ENSMUSG00000019558.15	ENSMUST00000114465.9	3314	13	1944	19	222	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	360	junction_2	47.1901376445237	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACACTTCATTTTCCAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72719334	72726089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_72719376_72720255_72720506_72720926_72721060_72722241_72722377_72722471_72722576_72722669_72722795_72723290_72723404_72723524_72723663_72723737_72723841_72723937_72724039_72724110_72724282_72724565
tx.20397	chrX	+	1711	11	ISM	ENSMUSG00000019558.15	ENSMUST00000114467.9	2509	14	3406	345	-198	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	360	junction_1	48.0316562279503	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCACCAAAAATAGATGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72720253	72724901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_72720506_72720926_72721060_72722241_72722377_72722471_72722576_72722669_72722795_72723290_72723404_72723524_72723663_72723737_72723841_72723937_72724039_72724110_72724282_72724565
tx.20398	chrX	+	2460	9	FSM	ENSMUSG00000019558.15	ENSMUST00000170614.8	1613	9	555	-1402	-169	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	365	junction_5	43.9813525826571	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGCTCCTGTTTCTGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72722314	72726108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_72722377_72722471_72722576_72722669_72722795_72723290_72723404_72723524_72723663_72723737_72723841_72723937_72724039_72724110_72724282_72724565
tx.20399	chrX	-	1162	7	ISM	ENSMUSG00000002015.6	ENSMUST00000002091.6	1219	8	1246	0	1246	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2622	junction_2	169.828099363248	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTTTGTGTCTAACTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72758535	72729783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_72730202_72731442_72731544_72732265_72732387_72733152_72733289_72750602_72750751_72756050_72756152_72758398
tx.204	chr1	-	669	3	Intergenic	novelGene_21	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTCTTGGCTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44865337	44860066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_44860282_44861507_44861687_44865062
tx.2040	chr10	-	3002	21	FSM	ENSMUSG00000020115.4	ENSMUST00000020316.4	3024	21	22	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_12	17.7	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTGTGTGCTTTTGTACC	3900	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121422670	121382359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_121383094_121387155_121387228_121387391_121387499_121388104_121388202_121388312_121388415_121388933_121388974_121389649_121389727_121389807_121389930_121391891_121391971_121393106_121393209_121395751_121395844_121396145_121396205_121397481_121397679_121399830_121400011_121403933_121404045_121406535_121406697_121407747_121407930_121412178_121412309_121414484_121414626_121420100_121420247_121422599
tx.20400	chrX	-	1213	8	FSM	ENSMUSG00000002015.6	ENSMUST00000002091.6	1219	8	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2403	junction_7	231.225131040053	260	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTTTGTGTCTAACTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72759775	72729783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72730202_72731442_72731544_72732265_72732387_72733152_72733289_72750602_72750751_72756050_72756152_72758398_72758535_72759723
tx.20402	chrX	-	1316	12	NIC	ENSMUSG00000002010.18	novel	1331	13	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	1072	junction_10	144.485579365652	1123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGCCCTGTTCTTCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72830500	72822568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_72822778_72823071_72823133_72823219_72823315_72823582_72823730_72823818_72823922_72824179_72824314_72824503_72824637_72824757_72824819_72825282_72825396_72825611_72825710_72826280_72826323_72830380
tx.20403	chrX	+	810	6	FSM	ENSMUSG00000002014.13	ENSMUST00000166518.8	800	6	-8	-2	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1181	junction_1	165.944569058466	1886	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACACGGGGCTCCTGTGTCT	5424	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72830625	72834432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_72830913_72832440_72832560_72833405_72833481_72833636_72833727_72833964_72834031_72834259
tx.20404	chrX	+	807	6	FSM	ENSMUSG00000002014.13	ENSMUST00000002090.3	765	6	-42	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	426	junction_1	441.755135793575	666	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACACGGGGCTCCTGTGTCT	5424	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72830625	72834432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_72830913_72832443_72832560_72833405_72833481_72833636_72833727_72833964_72834031_72834259
tx.20405	chrX	-	922	8	FSM	ENSMUSG00000031388.15	ENSMUST00000033763.15	962	8	38	2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	198	junction_1	315.02562254068	496	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATAGTGGGGTATGCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72965512	72960480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72960802_72961448_72961534_72963107_72963153_72963359_72963476_72963568_72963615_72964588_72964648_72964877_72964977_72965361
tx.20406	chrX	-	1013	8	FSM	ENSMUSG00000031388.15	ENSMUST00000114389.10	1031	8	18	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	794	junction_1	110.126457923125	2042	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATAGTGGGGTATGCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72965512	72960480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72960893_72961448_72961534_72963107_72963153_72963359_72963476_72963568_72963615_72964588_72964648_72964877_72964977_72965361
tx.20407	chrX	-	849	6	ISM	ENSMUSG00000031387.15	ENSMUST00000155597.2	1310	11	1413	-18	-214	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1962	junction_4	112.379713471783	915	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTGTGTGCGCGCCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72972949	72965726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_72965870_72965956_72966045_72969821_72969954_72971418_72971595_72971884_72971967_72972721
tx.20408	chrX	-	1380	11	FSM	ENSMUSG00000031387.15	ENSMUST00000116578.8	1418	11	38	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1767	junction_7	141.190120050944	3378	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTGTGTGCGCGCCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72974418	72965726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_72965870_72965956_72966045_72969821_72969954_72971418_72971595_72971884_72971967_72972721_72972947_72973286_72973460_72973610_72973687_72973792_72973869_72974013_72974124_72974319
tx.20409	chrX	-	1213	3	ISM	ENSMUSG00000031392.19	ENSMUST00000148706.8	2812	12	6347	-17	855	17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	382	junction_1	3	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGAGTGTCTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73061085	73058394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_73059108_73060153_73060304_73060735
tx.2041	chr10	-	1109	7	ISM	ENSMUSG00000034667.9	ENSMUST00000039810.8	5992	25	23988	2240	-1515	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1158	junction_6	92.9362087073111	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTCTTTTCCGGAGTTA	820	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121438233	121425524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_121426126_121429571_121429629_121432088_121432161_121435491_121435540_121436696_121436813_121437147_121437265_121438135
tx.20410	chrX	-	1812	4	FSM	ENSMUSG00000031393.17	ENSMUST00000100750.10	10538	4	34	8692	-23	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_3	52.083266666624	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGAGTTTCGTGGCTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73129241	73078889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_73080101_73080587_73080939_73123514_73123639_73129115
tx.20411	chrX	-	1695	3	FSM	ENSMUSG00000031393.17	ENSMUST00000033770.13	1739	3	48	-4	27	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_2	51.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGAGTTTCGTGGCTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73129248	73078889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_73080101_73080587_73080939_73129115
tx.20412	chrX	-	1962	2	ISM	ENSMUSG00000031393.17	ENSMUST00000123362.8	1675	5	-24	42909	-24	2837	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGGAAAAGAAAAAGCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73129242	73121803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_73123639_73129115
tx.20413	chrX	-	940	3	ISM	ENSMUSG00000031328.17	ENSMUST00000144429.8	8233	47	21137	3	1218	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	765	junction_2	15	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGTAGCTTTCATGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73268867	73267069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_73267584_73268357_73268562_73268645
tx.20414	chrX	+	817	7	FSM	ENSMUSG00000008682.14	ENSMUST00000008826.14	799	7	-20	2	-20	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2920	junction_1	2439.95592514838	1277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTTTTGTTTCTGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73314397	73316739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_73314481_73314584_73314631_73315265_73315325_73315405_73315514_73315784_73315924_73316277_73316441_73316520
tx.20415	chrX	+	858	6	FSM	ENSMUSG00000008682.14	ENSMUST00000074085.12	855	6	-3	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7516	junction_1	832.521615335001	2106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTTGTTTCTGATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73314462	73316741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_73314631_73315265_73315325_73315405_73315514_73315784_73315924_73316277_73316441_73316520
tx.20416	chrX	-	1601	8	FSM	ENSMUSG00000019088.15	ENSMUST00000239458.2	1625	8	23	1	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	3.01018678652935	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATGTATGCTTAATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73325319	73316823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_73317298_73317383_73317633_73317711_73317825_73317973_73318075_73320084_73320163_73320251_73320341_73320644_73320949_73325126
tx.20417	chrX	+	2125	10	FSM	ENSMUSG00000019087.14	ENSMUST00000019231.12	2189	10	34	30	-12	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	647	junction_4	26.5934179176579	1354	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGGCTTCGTGTCACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73340736	73348297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_73340928_73341228_73341356_73343855_73343931_73344183_73344378_73344929_73344971_73345541_73345628_73345967_73346207_73346827_73346876_73346963_73347193_73347402
tx.20418	chrX	+	1376	13	FSM	ENSMUSG00000001962.9	ENSMUST00000114160.2	1383	13	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	663	junction_3	69.864700592566	1648	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATAAGAACCTGCGCTTTA	206	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73356645	73363755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_73356932_73358282_73358368_73358469_73358570_73359032_73359179_73361035_73361113_73361242_73361310_73361747_73361810_73361973_73362051_73362420_73362476_73362655_73362705_73362796_73362868_73362997_73363109_73363565
tx.20419	chrX	-	746	3	FSM	ENSMUSG00000015289.5	ENSMUST00000015433.4	761	3	10	5	10	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1433	junction_2	31	8387	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTATTTTCAGCCTCTAAA	4503	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73397214	73395771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_73396105_73396479_73396609_73396930
tx.2042	chr10	-	3754	25	NNC	ENSMUSG00000034667.9	novel	6005	25	NA	NA	-1	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_19	297.787649802674	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTCTTTTCCGGAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121462222	121425524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_121426126_121429571_121429629_121432088_121432161_121435491_121435540_121436696_121436813_121437147_121437265_121438135_121438326_121438933_121439220_121440250_121440490_121441486_121441557_121442145_121442241_121442625_121442746_121442903_121443049_121443415_121443541_121445028_121445092_121445601_121445641_121447380_121447618_121449127_121449297_121449391_121449577_121450905_121451129_121452519_121452590_121453036_121453094_121454997_121455081_121458762_121458897_121462009
tx.20420	chrX	-	778	3	FSM	ENSMUSG00000015289.5	ENSMUST00000114152.2	746	3	-33	1	10	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_1	662	669	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTCAGCCTCTAAATTT	4503	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73397214	73395768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_73396105_73396450_73396609_73396930
tx.20421	chrX	-	1948	4	NNC	ENSMUSG00000015290.16	novel	369	3	NA	NA	20	10264	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	817.362560651976	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCATAGGTGTTTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73412144	73399059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_73400570_73411306_73411516_73411758_73411865_73412021
tx.20422	chrX	-	2543	3	NIC	ENSMUSG00000015290.16	novel	2442	4	NA	NA	-18	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	1598	junction_1	100.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTGAATCCTGTGTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73412137	73409323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_73411193_73411306_73411865_73412021
tx.20423	chrX	-	625	4	FSM	ENSMUSG00000015290.16	ENSMUST00000155676.8	2442	4	134	1683	19	64	multi-exon	FALSE	canonical	3	1598	junction_1	83.5636816379513	7494	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGGCTCATAGTGATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73412145	73411006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_73411193_73411306_73411516_73411758_73411865_73412021
tx.20424	chrX	-	2260	12	ISM	ENSMUSG00000031400.11	ENSMUST00000004327.11	2652	13	1032	3	687	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	267	junction_8	20.780633068889	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACCTGTCTCCTTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73471768	73453091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_73453904_73454002_73454096_73454188_73454266_73454362_73454599_73454863_73455051_73455170_73455265_73455571_73455698_73455924_73456084_73457469_73457688_73458513_73458623_73458721_73458760_73471657
tx.20425	chrX	-	2379	13	FSM	ENSMUSG00000031400.11	ENSMUST00000004327.11	2652	13	270	3	-44	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	267	junction_8	19.8990507869653	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACCTGTCTCCTTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73472530	73453091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_73453904_73454002_73454096_73454188_73454266_73454362_73454599_73454863_73455051_73455170_73455265_73455571_73455698_73455924_73456084_73457469_73457688_73458513_73458623_73458721_73458760_73471657_73471786_73472428
tx.20426	chrX	-	1347	5	FSM	ENSMUSG00000031400.11	ENSMUST00000135894.2	580	5	-75	-692	-44	692	multi-exon	FALSE	canonical	3	313	junction_4	6.68954408012983	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAACTCAATTAAAGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73472530	73456717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_73457688_73458513_73458623_73458721_73458760_73471657_73471786_73472428
tx.20427	chrX	+	2825	10	FSM	ENSMUSG00000004221.17	ENSMUST00000114127.8	3332	10	32	475	-1	-475	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_7	10.8217887204986	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCTTATGTGTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73473308	73493417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_73473428_73476410_73476613_73477408_73477621_73480769_73480889_73482512_73482666_73483480_73483557_73486950_73487095_73487377_73487521_73491464_73491527_73491822
tx.20428	chrX	-	706	3	Intergenic	novelGene_1386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.5	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGCCTCTGCCTCTGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73520859	73519683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_73519986_73520244_73520374_73520584
tx.20429	chrX	-	641	3	Intergenic	novelGene_1385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	1.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGCCTCTGCCTCTGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73520857	73519683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_73519986_73520244_73520336_73520609
tx.2043	chr10	-	884	5	ISM	ENSMUSG00000034667.9	ENSMUST00000039810.8	5992	25	25418	2241	-85	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1275	junction_2	66.4398223959095	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCAAGTCTTTTCCGGAGTT	2250	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121436803	121425525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_121426126_121429571_121429629_121432088_121432161_121435491_121435540_121436696
tx.20430	chrX	-	938	3	FSM	ENSMUSG00000079536.2	ENSMUST00000114125.2	627	3	-141	-170	-141	170	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	3.5	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCATCTGATTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73525146	73523722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_73524038_73524213_73524343_73524652
tx.20432	chrX	+	929	3	FSM	ENSMUSG00000079532.2	ENSMUST00000114117.2	776	3	-132	-21	-132	21	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCATCTGATTTTACTT	9955	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73784400	73785815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_73784886_73785195_73785325_73785500
tx.20433	chrX	-	1734	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082910.2	novel	138	1	NA	NA	-1175	1022	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTTTCTTAGTTTTTTTT	4396	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73820603	73818268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_73819430_73819605_73819735_73820159
tx.20434	chrX	+	641	1	Intergenic	novelGene_1387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	18	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTGGCATGAGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73964120	73964761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_73964100_73964800
tx.20435	chrX	+	1175	9	NNC	ENSMUSG00000081357.2	novel	648	7	NA	NA	-924	305	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_7	23.0867927612304	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTGGGATGAGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73987644	73995955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_73987753_73988067_73988151_73988537_73988666_73989350_73989420_73991236_73991355_73992188_73992289_73993476_73993576_73995367_73995464_73995581
tx.20436	chrX	-	1714	3	FSM	ENSMUSG00000032750.14	ENSMUST00000127024.2	750	3	-22	-942	-22	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	2	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTTTCTTAGTTTTTTTT	2157	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74012753	74010445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_74011592_74011767_74011897_74012314
tx.20437	chrX	+	1516	14	ISM	ENSMUSG00000031403.15	ENSMUST00000033776.15	2804	15	207	1472	8	29	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1536	junction_9	504.788150537507	692	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTGTGAACCATGGGTGT	NA	False	NA	-58	True	NA	NA	NA	74139666	74151911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_74139734_74140439_74140508_74140888_74140976_74142067_74142160_74142368_74142554_74143635_74143701_74144038_74144166_74144595_74144727_74146027_74146172_74147945_74148067_74149259_74149379_74149883_74149988_74150777_74150857_74151784
tx.20438	chrX	+	2596	15	FSM	ENSMUSG00000031403.15	ENSMUST00000033776.15	2804	15	208	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1536	junction_9	499.509294922813	1376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGAATTTGCTTTTCCTT	NA	False	NA	-57	True	NA	NA	NA	74139667	74153383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_74139734_74140439_74140508_74140888_74140976_74142067_74142160_74142368_74142554_74143635_74143701_74144038_74144166_74144595_74144727_74146027_74146172_74147945_74148067_74149259_74149379_74149883_74149988_74150777_74150857_74151784_74151911_74152301
tx.20439	chrX	+	1982	8	ISM	ENSMUSG00000031403.15	ENSMUST00000033776.15	2804	15	5058	2	-36	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1536	junction_2	488.001714617262	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGAATTTGCTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74144517	74153381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_74144727_74146027_74146172_74147945_74148067_74149259_74149379_74149883_74149988_74150777_74150857_74151784_74151911_74152301
tx.2044	chr10	-	1289	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047642.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGGTTATGACTGCTTT	4723	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121493422	121489802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_121490799_121492206_121492422_121493344
tx.20440	chrX	+	1695	7	NNC	ENSMUSG00000031403.15	novel	610	3	NA	NA	-1812	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	454	junction_1	848.656143558744	75	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGAATTTGCTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74147742	74153383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_74147807_74147945_74148067_74149259_74149379_74149883_74149988_74150777_74150857_74151784_74151911_74152301
tx.20441	chrX	+	1831	6	ISM	ENSMUSG00000031403.15	ENSMUST00000033776.15	2804	15	8286	0	-1809	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2464	junction_5	150.861525910353	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGAATTTGCTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74147745	74153383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_74148067_74149259_74149379_74149883_74149988_74150777_74150857_74151784_74151911_74152301
tx.20442	chrX	-	929	4	ISM	ENSMUSG00000031402.13	ENSMUST00000114092.8	1378	12	17178	-374	4182	374	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	242	junction_2	9.80929264637477	1078	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGTGACCCTGTAACTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74157272	74153879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_74154450_74155532_74155608_74155804_74156008_74157191
tx.20443	chrX	-	1960	12	FSM	ENSMUSG00000031402.13	ENSMUST00000033775.9	2525	12	24	541	-6	374	multi-exon	FALSE	canonical	3	210	junction_6	19.4626151487859	338	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCGTGACCCTGTAACTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74174598	74153879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_74154450_74155532_74155608_74155804_74156008_74157191_74157273_74157839_74157921_74159661_74159769_74161361_74161559_74165040_74165110_74167501_74167588_74168976_74169056_74169342_74169487_74174330
tx.20444	chrX	+	842	5	FSM	ENSMUSG00000031198.5	ENSMUST00000033541.5	2562	5	15	1705	-8	426	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_1	30.589009464185	1458	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTATCTTGGTGTATG	552	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74426019	74438360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_74426058_74430707_74430859_74434389_74434466_74435245_74435378_74437915
tx.20445	chrX	+	806	4	ISM	ENSMUSG00000031198.5	ENSMUST00000033541.5	2562	5	4701	1705	-2	426	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	213	junction_3	13.0213499897497	354	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTATCTTGGTGTATG	1008	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74430705	74438360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_74430859_74434389_74434466_74435245_74435378_74437915
tx.20446	chrX	-	954	3	FSM	ENSMUSG00000090110.9	ENSMUST00000033543.14	992	3	38	0	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_2	10	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGGTTTGTTACTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74460133	74448451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_74448825_74453151_74453220_74459620
tx.20447	chrX	-	779	4	NNC	ENSMUSG00000090110.9	novel	507	4	NA	NA	15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_3	27.1825107171668	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGGTTTGTTACTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74460156	74448451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_74448825_74453151_74453220_74459620_74459820_74460017
tx.20448	chrX	-	689	4	FSM	ENSMUSG00000090110.9	ENSMUST00000149863.3	507	4	-2	-180	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_2	9.20144916122817	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGGTTTGTTACTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74460192	74448451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_74448825_74453151_74453220_74459620_74459820_74460143
tx.20449	chrX	-	1484	6	FSM	ENSMUSG00000031200.17	ENSMUST00000114081.2	980	6	4	-508	4	175	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	14.0370937162933	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGCTTTTGCGTTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74460190	74453874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_74454738_74454823_74454876_74454957_74455129_74455240_74455393_74459620_74459820_74460143
tx.2045	chr10	-	1717	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047642.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGGTGTC	4724	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121493421	121490296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_121490799_121492206
tx.20450	chrX	+	929	9	NNC	ENSMUSG00000031201.18	novel	2473	10	NA	NA	-8	-591	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	482.141819774016	882	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTAATATTTTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74460294	74493747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_74460448_74461997_74462072_74466384_74466507_74479072_74479159_74479711_74479801_74481541_74481598_74490761_74490894_74491408_74491453_74493574
tx.20451	chrX	+	923	9	NNC	ENSMUSG00000031201.18	novel	2473	10	NA	NA	-8	-591	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	482.141819774016	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTAATATTTTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74460294	74493747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_74460448_74462003_74462072_74466384_74466507_74479072_74479159_74479711_74479801_74481541_74481598_74490761_74490894_74491408_74491453_74493574
tx.20452	chrX	+	908	9	NNC	ENSMUSG00000031201.18	novel	2473	10	NA	NA	-6	-591	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	478.090145788428	533	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTAATATTTTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74460296	74493747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_74460448_74462016_74462072_74466384_74466507_74479072_74479159_74479711_74479801_74481541_74481598_74490761_74490894_74491408_74491453_74493574
tx.20453	chrX	+	1478	10	NNC	ENSMUSG00000031201.18	novel	4310	11	NA	NA	-6	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	490.737087337903	176	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTTAACATTGTCACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74460296	74494836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_74460448_74461997_74462072_74466384_74466507_74479072_74479159_74479711_74479801_74481541_74481598_74490761_74490894_74491408_74491453_74493574_74493752_74494289
tx.20454	chrX	+	547	6	ISM	ENSMUSG00000031201.18	ENSMUST00000124321.2	2614	7	1522	1083	1522	-591	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	978	junction_1	78.8923316932641	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTAATATTTTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74479105	74493747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_74479159_74479711_74479801_74481541_74481598_74490761_74490894_74491408_74491453_74493574
tx.20455	chrX	+	1561	6	FSM	ENSMUSG00000031197.12	ENSMUST00000033540.6	1595	6	29	5	11	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1794	junction_5	66.7580706731403	11311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTTGCCTGACAATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74557933	74578543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_74558035_74560694_74560820_74564968_74565036_74566865_74566965_74574690_74574830_74577513
tx.20456	chrX	-	960	2	FSM	ENSMUSG00000031202.6	ENSMUST00000033545.6	3401	2	-8	2449	-8	-2449	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTCAACGTTTGGATAATAAA	434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74621845	74618100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_74618614_74621398
tx.20457	chrX	-	3119	16	FSM	ENSMUSG00000016382.16	ENSMUST00000114059.10	3149	16	21	9	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	263	junction_13	28.3953047762008	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTCTCTACTCTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74918767	74829268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_74830506_74834567_74834693_74834890_74835015_74837194_74837329_74837782_74837898_74838912_74838992_74839939_74840136_74843000_74843097_74844107_74844251_74845181_74845348_74846130_74846213_74848745_74848879_74849356_74849487_74859689_74859854_74870478_74870560_74918653
tx.20458	chrX	+	2857	16	FSM	ENSMUSG00000025246.14	ENSMUST00000088217.12	5234	16	40	2337	40	903	multi-exon	FALSE	canonical	3	377	junction_1	40.4669412401448	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTTACTTATAAGAGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76554658	76704252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_76554876_76677151_76677247_76684999_76685114_76687016_76687163_76689813_76690076_76691397_76691531_76691857_76692000_76692259_76692324_76692428_76692527_76693478_76693540_76693974_76694097_76696369_76696445_76696819_76696948_76699011_76699178_76702306_76702409_76703320
tx.20459	chrX	+	2124	15	ISM	ENSMUSG00000025246.14	ENSMUST00000088217.12	5234	16	122533	2853	122332	387	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	437	junction_14	32.0239068860265	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAATGCTGTGATAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76677151	76703736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_76677247_76684999_76685114_76687016_76687163_76689813_76690076_76691397_76691531_76691857_76692000_76692259_76692324_76692428_76692527_76693478_76693540_76693974_76694097_76696369_76696445_76696819_76696948_76699011_76699178_76702306_76702409_76703320
tx.2046	chr10	-	1394	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047642.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGGTGTC	4723	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121493422	121490296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_121490799_121492206_121493021_121493344
tx.20460	chrX	+	1657	6	ISM	ENSMUSG00000025246.14	ENSMUST00000133893.2	3611	13	139042	-922	139042	922	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	437	junction_5	37.6319013604149	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCTGGAGTATTTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76693861	76704271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_76694097_76696369_76696445_76696819_76696948_76699011_76699178_76702306_76702409_76703320
tx.20461	chrX	+	1029	2	ISM	ENSMUSG00000025246.14	ENSMUST00000133893.2	3611	13	147492	-903	147492	903	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	437	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACTTACTTATAAGAGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76702311	76704252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_76702409_76703320
tx.20462	chrX	-	3038	7	NIC	ENSMUSG00000035725.14	novel	4146	9	NA	NA	-26	-612	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	19.7800404448525	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAATCCCCTCTTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76839604	76805628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_76807498_76807711_76807861_76808178_76808257_76808954_76809013_76825643_76825908_76829733_76829903_76839153
tx.20463	chrX	-	3229	9	FSM	ENSMUSG00000035725.14	ENSMUST00000036333.14	4146	9	302	615	-4	-615	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_4	6.21992765231236	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGAAATCCCCTCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76839582	76805631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_76807498_76807711_76807861_76808178_76808257_76808954_76809013_76814852_76814949_76816721_76816842_76825643_76825908_76829733_76829903_76839153
tx.20464	chrX	-	839	2	ISM	ENSMUSG00000035725.14	ENSMUST00000114044.2	2639	4	-247	14675	59	-14675	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGAGTTCCTGGCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76839825	76829735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_76829903_76839153
tx.20465	chrX	-	1725	3	FSM	ENSMUSG00000046942.18	ENSMUST00000114016.10	1725	3	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	241	junction_2	42	1738	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGCTCTCTTTTATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78679188	78666836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_78668390_78671446_78671527_78679096
tx.20466	chrX	-	1944	4	FSM	ENSMUSG00000046942.18	ENSMUST00000052283.7	1854	4	-90	0	-90	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_2	116.448367194316	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGCTCTCTTTTATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78715131	78666836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_78668390_78671446_78671527_78685326_78685395_78714888
tx.20467	chrX	-	1936	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082346.2_ENSMUSG00000081221.5	novel	999	1	NA	NA	-37	199	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ACAAAAAAAAAAAACTAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79240882	79237260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_79238617_79240302
tx.20468	chrX	-	1301	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081221.5	novel	999	1	NA	NA	-48781	200	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAAAAAAAAAACTAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79287239	79237259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_79238531_79287209
tx.20469	chrX	+	1545	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081205.5	novel	1068	1	NA	NA	-46	753	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAATAAGTAATAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79500301	79502168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_79501009_79501330
tx.2047	chr10	-	1553	2	Intergenic	novelGene_129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCAGCCTTGTAAATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121557194	121553596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_121554581_121556625
tx.20470	chrX	+	1539	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081205.5	novel	1068	1	NA	NA	-43	757	multi-exon	FALSE	canonical	2	69	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATAAGTAATAATGGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79500304	79502172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_79500994_79501322
tx.20471	chrX	+	1790	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081205.5	novel	1068	1	NA	NA	-30	755	multi-exon	TRUE	canonical	1	228	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATAATAAGTAATAATGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79500317	79502170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_79501141_79501203
tx.20472	chrX	+	1021	2	ISM	ENSMUSG00000025666.17	ENSMUST00000171953.8	1801	4	-44	10920	-37	-9965	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	169	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAAAATATCTTTCACAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80114266	80128417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_80114767_80127896
tx.20473	chrX	+	2684	3	FSM	ENSMUSG00000025666.17	ENSMUST00000026760.3	4007	3	-50	1373	-32	768	multi-exon	TRUE	canonical	3	148	junction_2	10.5	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAGTGGTGATAGACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80114271	80140105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_80114767_80127896_80128038_80138057
tx.20474	chrX	+	1560	2	ISM	ENSMUSG00000025666.17	ENSMUST00000171953.8	1801	4	13616	-169	13605	169	intron_retention	FALSE	canonical	3	148	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAAGTCTCAGTAGATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80127926	80139506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_80128038_80138057
tx.20475	chrX	-	734	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000045103.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	63.5	249	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACTCTGACATATCTCTG	1164	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83486712	83445448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_83445961_83473568_83473652_83486573
tx.20476	chrX	-	1009	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000045103.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	51.8737784327389	642	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTCAAGGGTTCTTCTTT	1165	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83486711	83458140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_83458730_83459197_83459397_83473568_83473652_83486573
tx.20477	chrX	-	368	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000045103.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_1	0	144	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTACCACTCAACCTAT	1162	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83486714	83473424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_83473652_83486573
tx.20478	chrX	+	1424	9	FSM	ENSMUSG00000045103.20	ENSMUST00000149433.2	1383	9	-29	-12	-2	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	282	junction_8	32.8916307744082	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGACTCACAGCAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84091898	84188029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_84092066_84097576_84097639_84133422_84133498_84148749_84148952_84151185_84151272_84153548_84153707_84182933_84183101_84185331_84185444_84187634
tx.20479	chrX	+	1772	14	NNC	ENSMUSG00000045103.20	novel	4438	18	NA	NA	7	17007	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_13	93.2551377140111	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATATAATTGTATTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84091907	84205026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_84092066_84097576_84097639_84133422_84133498_84148749_84148952_84151185_84151272_84153548_84153707_84182933_84183101_84185331_84185444_84187634_84187772_84188516_84188556_84192735_84192802_84193818_84193885_84196632_84196792_84204741
tx.2048	chr10	-	502	2	Intergenic	novelGene_131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAAAAGTCTGGTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121556015	121554147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_121554581_121555946
tx.20480	chrX	+	2076	17	NIC	ENSMUSG00000045103.20	novel	4438	18	NA	NA	-5	88	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	247	junction_13	44.1996535619907	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCCGCATGGTTTTTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84091895	84246192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_84092066_84097576_84097639_84133422_84133498_84148749_84148952_84151185_84151272_84153548_84153707_84182933_84183101_84185331_84185444_84187634_84187772_84188516_84188556_84192735_84192802_84193818_84193885_84196632_84196792_84221309_84221554_84222304_84222429_84234215_84234309_84246076
tx.20481	chrX	+	371	4	ISM	ENSMUSG00000045103.20	ENSMUST00000132333.8	2133	7	-32	35532	-8	-35532	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	317	junction_3	32.0312347560939	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACCAGCCCATGGATATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84091892	84148810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_84092066_84097576_84097639_84133422_84133498_84148749
tx.20482	chrX	-	3184	20	FSM	ENSMUSG00000025059.17	ENSMUST00000156390.8	4245	20	1	1060	1	-1060	multi-exon	TRUE	canonical	3	125	junction_19	13.2977827073068	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATACTTTATAATTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84820242	84746602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_84748003_84749843_84749931_84754656_84754738_84755947_84756092_84756204_84756326_84756879_84756965_84757947_84758045_84759270_84759350_84773807_84773889_84774488_84774532_84780438_84780507_84780919_84780956_84783900_84783968_84784672_84784783_84787319_84787458_84789830_84789908_84797937_84798016_84804180_84804288_84804939_84805014_84820031
tx.20483	chrX	-	2050	4	ISM	ENSMUSG00000025059.17	ENSMUST00000156390.8	4245	20	64212	662	50	-662	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_1	3.77123616632825	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATCTGCATTTCTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84756031	84746204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_84748003_84749843_84749931_84754656_84754738_84755947
tx.20484	chrX	+	1797	2	FSM	ENSMUSG00000025056.5	ENSMUST00000026036.5	1808	2	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	839	junction_1	0	2072	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGACTGGAGAGTTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85235380	85239553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_85236581_85238956
tx.20485	chrX	-	2446	3	FSM	ENSMUSG00000035427.19	ENSMUST00000113969.10	2403	3	-36	-7	-36	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTATTCTTTGCTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85299861	85293852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_85296089_85298945_85299028_85299733
tx.20486	chrX	-	2163	3	NNC	ENSMUSG00000035427.19	novel	2401	3	NA	NA	-18	-49163	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	13	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTATTCTTTGCTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85348717	85343024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_85344996_85347819_85347902_85348607
tx.20487	chrX	-	1507	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000080069.3	novel	1023	1	NA	NA	-9149	380	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAATGACTCAGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85398600	85388048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_85389457_85398501
tx.20488	chrX	-	1561	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000080069.3	novel	1023	1	NA	NA	-9147	380	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAATGACTCAGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85398598	85388048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_85389513_85398501
tx.20489	chrX	-	1617	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082450.2	novel	1041	1	NA	NA	-1854	414	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACAGAGTTGGATTTCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85444704	85441395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_85442910_85444601
tx.2049	chr10	-	611	2	Intergenic	novelGene_130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCCTCCCAAGTGCTGG	345	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121555312	121554079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_121554581_121555202
tx.20490	chrX	+	594	2	Intergenic	novelGene_1391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	0	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTTTCTGGTTGTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88052044	88080612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_88052327_88080300
tx.20491	chrX	+	1654	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094861.2	novel	1035	1	NA	NA	-969	473	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCAGTGTCTCTGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90435136	90437613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_90435200_90435916_90435973_90436078
tx.20492	chrX	+	1655	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094861.2	novel	1035	1	NA	NA	-970	473	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCAGTGTCTCTGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90435135	90437613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_90435200_90435916_90435973_90436078
tx.20493	chrX	+	533	2	FSM	ENSMUSG00000095110.2	ENSMUST00000088134.4	577	2	44	0	44	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATCTGTCTCTGAGAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92199803	92200479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_92199990_92200132
tx.20494	chrX	-	616	7	ISM	ENSMUSG00000006678.7	ENSMUST00000006856.3	5346	37	-1	299687	-1	18622	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	401	junction_2	32.1645076995678	318	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTACTGGGGCTTTGCTC	4276	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92675762	92648059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_92648106_92648956_92649020_92649453_92649570_92664110_92664192_92667424_92667522_92670093_92670219_92675674
tx.20495	chrX	+	2343	8	FSM	ENSMUSG00000035246.17	ENSMUST00000045898.4	4888	8	129	2416	129	-2416	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_6	4.01527694930148	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTGTCCCAGAAAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92718836	92791141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_92719083_92745690_92745791_92750163_92750281_92761390_92761543_92763784_92763864_92775282_92775426_92778370_92778560_92789824
tx.20496	chrX	-	2049	12	FSM	ENSMUSG00000035232.9	ENSMUST00000045748.7	2115	12	48	18	48	-18	multi-exon	FALSE	canonical	3	493	junction_5	23.1352473386711	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTGGAATTTCTCACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92875759	92808230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_92808862_92812494_92812635_92820914_92821029_92825072_92825184_92825751_92825854_92827385_92827463_92832499_92832578_92843719_92843810_92845814_92846000_92852476_92852549_92857532_92857675_92875452
tx.20497	chrX	-	849	3	ISM	ENSMUSG00000079509.11	ENSMUST00000113927.8	6933	8	262	23540	-13	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	52.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGTCCAGGTGTGATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93166751	93141777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_93142459_93145896_93145987_93166673
tx.20498	chrX	-	936	4	FSM	ENSMUSG00000079509.11	ENSMUST00000113925.8	879	4	-57	0	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_3	30.6920185064456	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTTGTCCAGGTGTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93166772	93141779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_93142459_93145896_93145987_93157801_93157870_93166673
tx.205	chr1	+	594	6	ISM	ENSMUSG00000025995.17	ENSMUST00000154436.8	3226	20	45	18157	-9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	530	junction_5	70.1843287351243	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGAATTCCCTTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45834653	45844607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_45834765_45838175_45838306_45840320_45840387_45841198_45841290_45843036_45843162_45844536
tx.2050	chr10	+	975	3	FSM	ENSMUSG00000053684.9	ENSMUST00000065600.8	3123	3	1	2147	0	-1665	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_1	1	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCTTAATTTTTGACAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121575842	121586623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_121576116_121581235_121581522_121586207
tx.20500	chrX	-	207	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043929.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	25	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAAATACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93305774	93207093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_93207220_93305693
tx.20501	chrX	-	3587	12	FSM	ENSMUSG00000035150.16	ENSMUST00000050328.15	3647	12	57	3	-1	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	1008	junction_2	64.9970120101527	391	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTAATTGTGCCCATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93256258	93232315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_93234529_93239877_93240051_93240893_93241064_93243319_93243465_93244495_93244591_93246419_93246555_93247555_93247715_93248654_93248750_93252934_93253057_93253141_93253270_93255324_93255389_93256170
tx.20502	chrX	-	739	5	ISM	ENSMUSG00000035150.16	ENSMUST00000050328.15	3647	12	11789	1996	11731	-1996	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1008	junction_2	53.8725347463807	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGACCTCTACTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93244526	93234308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_93234529_93239877_93240051_93240893_93241064_93243319_93243465_93244495
tx.20503	chrX	+	1148	5	NIC	ENSMUSG00000043929.17	novel	627	4	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	7	junction_1	18.9868375460475	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCAGCCTGGCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93278202	93297673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_93278260_93278826_93279027_93285550_93285602_93296020_93296733_93297545
tx.20504	chrX	+	1290	5	FSM	ENSMUSG00000043929.17	ENSMUST00000113911.9	1227	5	-63	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_4	15.1224171348366	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCAGCCTGGCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93278532	93297673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_93278732_93278826_93279027_93285550_93285602_93296020_93296733_93297545
tx.20505	chrX	+	1376	4	NIC	ENSMUSG00000043929.17	novel	1227	5	NA	NA	6	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	23	junction_3	13.4246870437348	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCAGCCTGGCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93278541	93297673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_93279027_93285550_93285602_93296020_93296733_93297545
tx.20506	chrX	+	1238	4	FSM	ENSMUSG00000043929.17	ENSMUST00000113908.8	1235	4	1	-4	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	24.3447461820136	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCAGCCTGGCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93278533	93297673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_93278732_93278826_93279027_93296020_93296733_93297545
tx.20507	chrX	+	2113	4	FSM	ENSMUSG00000043929.17	ENSMUST00000096369.10	3944	4	-70	1901	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_2	6.59966329107444	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCAGCCTGGCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93278522	93297673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_93278732_93278826_93279027_93285550_93285602_93296020
tx.20508	chrX	+	912	9	FSM	ENSMUSG00000079508.9	ENSMUST00000113898.8	784	9	4	-132	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	325	junction_1	51.8975854447969	295	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGCCTGCTTTCTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93410726	93460699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_93410769_93423531_93423640_93425716_93425837_93431270_93431326_93434350_93434447_93437794_93437887_93441727_93441809_93456065_93456132_93460447
tx.20509	chrX	+	799	8	ISM	ENSMUSG00000079508.9	ENSMUST00000113898.8	784	9	7	4294	7	-4294	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	325	junction_1	49.0588983794386	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAAGGCTCATGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93410729	93456273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_93410769_93423531_93423640_93425716_93425837_93431270_93431326_93434350_93434447_93437794_93437887_93441727_93441809_93456065
tx.2051	chr10	+	804	3	FSM	ENSMUSG00000053684.9	ENSMUST00000136432.2	2968	3	4	2160	4	-1665	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	61	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCTTAATTTTTGACAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121575846	121586623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_121576116_121581402_121581522_121586207
tx.20510	chrX	-	503	2	ISM	ENSMUSG00000025151.17	ENSMUST00000139375.8	1274	5	1677	-2	1406	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1688	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGTGTGCTTCTCATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93579764	93579079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_93579284_93579465
tx.20511	chrX	-	2718	13	FSM	ENSMUSG00000025151.17	ENSMUST00000026142.8	2821	13	103	0	-37	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1240	junction_10	166.264514821681	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGTGTGCTTCTCATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93585646	93579079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_93579284_93579465_93579852_93580479_93580595_93580899_93580963_93581147_93581191_93581281_93581362_93581579_93581672_93581789_93581870_93582050_93582115_93582212_93582888_93583460_93584154_93584856_93584931_93585497
tx.20512	chrX	-	1495	2	FSM	ENSMUSG00000050332.8	ENSMUST00000084535.6	8496	2	14	6987	14	-6987	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAGAAGAAGAAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94488464	94470910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_94472205_94488263
tx.20513	chrX	-	2535	13	FSM	ENSMUSG00000057421.13	ENSMUST00000079987.13	2530	13	9	-14	9	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	815	junction_5	66.9966831683148	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTGAGATGAGGGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95000510	94978926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_94979256_94980977_94981129_94983904_94984555_94990016_94990165_94990472_94990680_94991375_94991462_94993942_94994053_94994915_94994963_94995513_94995796_94996827_94996910_94998747_94998818_94999480_94999607_95000263
tx.20514	chrX	-	839	3	ISM	ENSMUSG00000057421.13	ENSMUST00000079987.13	2530	13	16256	-14	6798	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1010	junction_1	9	501	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTGAGATGAGGGATGT	NA	False	NA	35	True	NA	NA	NA	94984263	94978926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_94979256_94980977_94981129_94983904
tx.20515	chrX	+	1912	4	FSM	ENSMUSG00000031207.17	ENSMUST00000149985.8	1883	4	-15	-14	0	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	1220	junction_3	48.6095555306659	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGCCATATAGGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95139647	95197659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_95139850_95185470_95185555_95194225_95194322_95196129
tx.20516	chrX	+	3843	13	FSM	ENSMUSG00000031207.17	ENSMUST00000117399.2	3842	13	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	982	junction_10	94.3325971702724	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGACTCAGTCTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95139647	95212159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_95139850_95185470_95185555_95194225_95194322_95196129_95196405_95197900_95197985_95199069_95199217_95201452_95201550_95203693_95203858_95206972_95207104_95207355_95207517_95208980_95209074_95209530_95209756_95210075
tx.20517	chrX	+	3000	8	ISM	ENSMUSG00000031207.17	ENSMUST00000117399.2	3842	13	59524	-1	59469	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	982	junction_5	39.8133399856923	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGACTCAGTCTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95199171	95212159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_95199217_95201452_95201550_95203693_95203858_95206972_95207104_95207355_95207517_95208980_95209074_95209530_95209756_95210075
tx.20518	chrX	-	773	4	ISM	ENSMUSG00000045802.14	ENSMUST00000059003.5	1479	12	-163	21842	-163	-8688	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_2	5.31245915016974	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGAATTGCTACTATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95411688	95372970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_95373245_95382022_95382151_95400740_95400850_95411426
tx.2052	chr10	-	1446	6	FSM	ENSMUSG00000034620.18	ENSMUST00000140299.3	4793	6	201	3146	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_5	21.4513402844671	461	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATGTATTCATAAGTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121933075	121917164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_121917595_121924783_121924955_121926364_121926680_121930494_121930598_121931843_121932000_121932804
tx.20520	chrX	+	837	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000081135.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGTTTGTTTAGACGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96187543	96331956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_96187663_96308820_96308880_96315867_96315965_96331394
tx.20521	chrX	-	1217	8	NNC	ENSMUSG00000034457.11	novel	779	6	NA	NA	-8	38384	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	50.6117676080194	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTCTCAGTGTTCATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96420830	96339061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_96339435_96340422_96340518_96385233_96385399_96386897_96386984_96387501_96387681_96405366_96405465_96414764_96414862_96420706
tx.20522	chrX	-	2188	7	FSM	ENSMUSG00000034457.11	ENSMUST00000126283.8	2153	7	-17	-18	-17	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_5	9.18331820930394	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAATTGTATCTCATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96420839	96381378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_96382809_96385233_96385399_96386897_96386984_96387501_96387681_96405366_96405465_96414764_96414862_96420706
tx.20523	chrX	-	2352	5	NIC	ENSMUSG00000034457.11	novel	779	6	NA	NA	-14	16	intron_retention	FALSE	canonical	3	97	junction_3	8.69985632065266	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTTTCTGAGACTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96420836	96385135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_96386984_96387501_96387681_96405366_96405465_96414764_96414862_96420706
tx.20524	chrX	+	597	6	FSM	ENSMUSG00000047694.13	ENSMUST00000140479.2	1020	6	-16	439	-16	-39	multi-exon	FALSE	canonical	3	239	junction_3	12.2376468326227	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTAGTGTTGTTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97981796	97987202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_97981895_97983378_97983508_97983727_97983807_97984392_97984436_97986383_97986513_97987083
tx.20525	chrX	+	911	7	FSM	ENSMUSG00000047694.13	ENSMUST00000054697.7	5211	7	430	3870	-16	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_6	19.4736288919714	557	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGTCCTTTTCCTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97981796	97988753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_97981895_97983378_97983508_97983727_97983807_97984392_97984436_97986383_97986513_97987083_97987242_97988478
tx.20526	chrX	+	593	2	NNC	ENSMUSG00000031216.14	novel	4963	14	NA	NA	11	-19004	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTTCCCTCCTTCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98086197	98090274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_98086401_98089884
tx.20527	chrX	+	735	4	Intergenic	novelGene_1393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.471404520791032	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCGAGTGCCTGGCTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98499388	98501336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_98499476_98499985_98500034_98500399_98500510_98500846
tx.20528	chrX	+	828	3	FSM	ENSMUSG00000085553.2	ENSMUST00000129259.2	361	3	60	-527	60	527	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGCTCTTGCCTGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98502690	98504886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_98502763_98503182_98503300_98504247
tx.20529	chrX	-	1760	3	FSM	ENSMUSG00000034403.17	ENSMUST00000113790.8	2108	3	-24	372	-19	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_1	143.5	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGGCATCATTTGGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98514317	98509715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_98511189_98511728_98511921_98514222
tx.2053	chr10	+	2109	8	ISM	ENSMUSG00000034613.13	ENSMUST00000067918.12	6369	10	123646	3255	-8816	1091	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	4.03049599419025	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTCATTGTGATGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122638332	122778445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_122638485_122647351_122647465_122692966_122693052_122714413_122714533_122739996_122740061_122743411_122743520_122756598_122756751_122777129
tx.20530	chrX	-	2299	2	FSM	ENSMUSG00000034403.17	ENSMUST00000167246.2	2666	2	25	342	-18	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	379	junction_1	0	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGGCATCATTTGGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98514316	98509715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_98511921_98514222
tx.20531	chrX	-	2583	2	FSM	ENSMUSG00000034403.17	ENSMUST00000036354.7	2563	2	-16	-4	-16	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGGCATCATTTGGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98514314	98509715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_98512207_98514222
tx.20532	chrX	+	959	3	Intergenic	novelGene_1394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTGTGTCTGTGTGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98600900	98606152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_98601074_98602764_98602843_98605444
tx.20534	chrX	+	850	2	Intergenic	novelGene_1395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTGTGTCTGTGTGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98600931	98606152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_98601074_98605444
tx.20535	chrX	+	303	2	Intergenic	novelGene_1396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAAGTACAGTTTGAGGAC	7018	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98945232	98952308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_98945277_98952049
tx.20536	chrX	-	1768	9	NNC	ENSMUSG00000031220.15	novel	1984	8	NA	NA	-51450	-269	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_7	4.92442890089805	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTGCTCCAGCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99537773	99446100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_99446547_99446745_99446946_99447736_99447912_99448134_99448340_99448564_99448636_99449191_99449303_99467905_99468055_99488875_99489014_99537500
tx.20537	chrX	+	1337	6	FSM	ENSMUSG00000031221.8	ENSMUST00000033570.6	1518	6	60	121	-4	-121	multi-exon	FALSE	canonical	3	351	junction_5	20.4743742273116	2673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGGTATCCGCTGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99537956	99559610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_99538163_99538510_99538805_99546600_99546797_99548795_99548876_99549545_99549659_99559162
tx.20538	chrX	+	515	2	ISM	ENSMUSG00000031221.8	ENSMUST00000033570.6	1518	6	11695	121	11631	-121	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	351	junction_1	0	356	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGGTATCCGCTGGTTTT	6931	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99549591	99559610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_99549659_99559162
tx.20539	chrX	-	947	6	FSM	ENSMUSG00000015668.14	ENSMUST00000144643.8	1497	6	550	0	547	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	516	junction_1	29.9506260368627	259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACTGCTTGAATATAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99668994	99666488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_99667034_99667188_99667250_99667467_99667567_99668138_99668196_99668400_99668485_99668893
tx.2054	chr10	-	3151	21	FSM	ENSMUSG00000020124.11	ENSMUST00000020334.9	4666	21	20	1495	-6	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	255	junction_15	80.7788802843912	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTATGTTTTCTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123032838	122949135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_122949593_122955013_122955103_122957476_122957581_122959840_122959991_122960418_122960535_122960868_122960940_122961317_122961591_122961716_122961833_122963582_122963775_122963868_122963964_122964053_122964138_122966845_122967071_122967156_122967316_122968860_122969035_122982698_122982844_122999497_122999560_123004131_123004278_123007004_123007132_123011747_123011879_123017577_123017706_123032731
tx.20540	chrX	-	1062	7	FSM	ENSMUSG00000015668.14	ENSMUST00000059099.7	1041	7	4	-25	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_6	158.307366291724	661	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACTGCTTGAATATAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99669537	99666488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_99667034_99667188_99667250_99667467_99667567_99668138_99668196_99668400_99668485_99668893_99668994_99669421
tx.20541	chrX	-	1005	7	FSM	ENSMUSG00000015668.14	ENSMUST00000015812.12	1626	7	624	-3	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	301	junction_6	98.6728601659713	1289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTACTGCTTGAATATAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99669550	99666488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_99667034_99667188_99667250_99667467_99667567_99668138_99668196_99668400_99668485_99668893_99668994_99669491
tx.20542	chrX	+	4613	30	FSM	ENSMUSG00000034311.4	ENSMUST00000048962.4	4983	30	370	0	370	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	204	junction_20	20.3345386022518	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGAAGGAGATCCTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99669712	99770820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_99670195_99670309_99670425_99677444_99677636_99679289_99679383_99681889_99682057_99682282_99682378_99708341_99708459_99709278_99709455_99713514_99713577_99720892_99721026_99723451_99723511_99723614_99723721_99732663_99732721_99734119_99734306_99738476_99738581_99739603_99739749_99741036_99741148_99747647_99747732_99748395_99748510_99755397_99755554_99755667_99755769_99757483_99757614_99759186_99759358_99759876_99759985_99760936_99761015_99761542_99761642_99762099_99762277_99768247_99768365_99769733_99769857_99770064
tx.20543	chrX	+	1032	5	ISM	ENSMUSG00000034311.4	ENSMUST00000048962.4	4983	30	370	88780	370	2127	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	223	junction_2	17.2825779327044	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGAAGAATGACAAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99669712	99682040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_99670195_99670309_99670425_99677444_99677636_99679289_99679383_99681889
tx.20544	chrX	+	3366	12	FSM	ENSMUSG00000000881.13	ENSMUST00000151020.8	3316	12	-48	-2	-48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	11.5078126534158	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGGCTCAGAGGTCTTCT	651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99820842	99862016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_99820979_99840291_99840407_99850117_99850295_99850785_99850862_99851658_99851759_99855107_99855150_99856331_99856383_99856942_99857045_99857809_99857983_99858398_99858509_99858813_99858906_99859824
tx.20545	chrX	-	3284	30	FSM	ENSMUSG00000009670.12	ENSMUST00000009814.10	3250	30	-33	-1	-5	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	57	junction_17	8.2193472636908	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATTGATCAGCTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100103278	99882252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_99882667_99883306_99883472_99892654_99892776_99893874_99893984_99895431_99895582_99920141_99920215_99923582_99923700_99925849_99925921_99926528_99926616_99927967_99928009_99947363_99947421_99949724_99949811_99960131_99960257_99976993_99977097_99990261_99990400_99995170_99995257_99998305_99998458_100015699_100015779_100018785_100018868_100021229_100021326_100029298_100029354_100051308_100051395_100059149_100059231_100076103_100076224_100076306_100076388_100082652_100082733_100087046_100087132_100094064_100094187_100102961_100103024_100103118
tx.20546	chrX	-	2599	25	FSM	ENSMUSG00000009670.12	ENSMUST00000113716.3	2591	25	9	-17	9	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	14.9015286315047	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCTGAGCCTTTACAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100103264	99921470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_99921832_99923582_99923700_99925849_99925921_99926528_99926616_99927967_99928009_99947363_99947421_99949724_99949811_99960131_99960257_99976993_99977097_99990261_99990400_99995170_99995257_99998305_99998458_100015699_100015779_100018785_100018868_100021229_100021326_100029298_100029354_100051308_100051395_100059149_100059231_100076103_100076224_100076306_100076388_100082652_100082733_100087046_100087132_100094064_100094187_100102961_100103024_100103118
tx.20547	chrX	-	2253	12	FSM	ENSMUSG00000031297.15	ENSMUST00000073927.5	2232	12	-3	-18	-3	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1250	junction_11	82.5987012884915	222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTCCTGTTCTTTGCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100128981	100122809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_100123199_100123305_100123415_100123706_100123874_100124313_100124478_100125301_100125405_100125498_100125639_100125796_100126020_100126139_100126253_100126396_100126575_100126753_100126913_100127476_100127881_100128877
tx.20548	chrX	-	1096	6	FSM	ENSMUSG00000046032.17	ENSMUST00000156473.8	1114	6	19	-1	15	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	192	junction_2	126.702170462861	689	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCTCAGCTAGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100266140	100141390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_100141834_100145973_100146042_100257379_100257471_100258006_100258132_100259088_100259185_100265867
tx.20549	chrX	-	973	5	FSM	ENSMUSG00000046032.17	ENSMUST00000077876.4	1002	5	29	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_1	142.088880634622	391	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCCGTTTTTCTCCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100266140	100255564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_100255953_100257379_100257471_100258006_100258132_100259088_100259185_100265867
tx.2055	chr10	-	569	3	ISM	ENSMUSG00000020124.11	ENSMUST00000219937.2	1587	9	6290	4	-2114	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	594	junction_1	23	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATTATGTTTTCTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122957500	122949136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_122949593_122955013_122955103_122957476
tx.20550	chrX	-	2396	4	FSM	ENSMUSG00000046032.17	ENSMUST00000120389.8	2415	4	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	422	junction_3	23.8094285712381	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCCGTTTTTCTCCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100266136	100255564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_100257471_100258006_100258132_100259088_100259185_100265867
tx.20552	chrX	+	1549	2	FSM	ENSMUSG00000047797.15	ENSMUST00000119190.2	1585	2	36	0	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTGTTTTGAGTGTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100427377	100429235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_100427449_100427757
tx.20553	chrX	-	1135	6	ISM	ENSMUSG00000031310.17	ENSMUST00000120201.8	1859	7	1466	3	-653	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_4	21.6831731995112	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCCTCAGCCTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100461949	100458538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_100459013_100459366_100459545_100459772_100460068_100460514_100460588_100460892_100460937_100461878
tx.20554	chrX	+	2459	12	NIC	ENSMUSG00000031311.18	novel	2562	12	NA	NA	-52	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	146	junction_9	1051.63693731909	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTTCTGTGCTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100473288	100492195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_100473369_100474098_100474159_100480814_100480984_100483092_100483287_100485121_100485424_100486535_100486632_100486900_100487098_100487882_100487968_100488293_100488424_100488900_100488941_100489724_100489835_100491199
tx.20555	chrX	+	1436	5	ISM	ENSMUSG00000031311.18	ENSMUST00000033673.7	2562	12	130	6141	-50	19	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	3075	junction_4	432.2021373154	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTCCTCTTAGAATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100473290	100486056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_100473369_100474098_100474159_100480814_100480984_100483092_100483287_100485121
tx.20556	chrX	+	2430	12	FSM	ENSMUSG00000031311.18	ENSMUST00000033673.7	2562	12	130	2	-50	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3075	junction_4	297.011255595496	1712	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTTCTGTGCTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100473290	100492195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_100473369_100474098_100474159_100480814_100480984_100483092_100483287_100485121_100485424_100486535_100486632_100486900_100487098_100487882_100487968_100488293_100488397_100488900_100488941_100489724_100489835_100491199
tx.20557	chrX	+	1108	2	FSM	ENSMUSG00000031311.18	ENSMUST00000134783.2	631	2	294	-771	294	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3744	junction_1	0	598	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTTCTGTGCTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100489722	100492195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_100489835_100491199
tx.20558	chrX	+	804	5	NIC	ENSMUSG00000031312.6	novel	1314	11	NA	NA	-375	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.29903810567666	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACGTCTCATCTCTCCTC	991	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100495341	100497147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_100495451_100495559_100495631_100495720_100495821_100496079_100496194_100496737
tx.20559	chrX	+	1216	2	Intergenic	novelGene_1399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGACAGCTGTCTTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100565880	100567347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_100567027_100567277
tx.2056	chr10	-	535	2	FSM	ENSMUSG00000020124.11	ENSMUST00000218042.2	443	2	284	-376	284	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	594	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTTTTGATGAATTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122955102	122949146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_122949593_122955013
tx.20560	chrX	+	1000	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000031314.19	novel	7210	38	NA	NA	-5136	287	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCTCCCACCCTTCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100571203	100644927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_100571528_100644251
tx.20561	chrX	+	1334	5	FSM	ENSMUSG00000034160.14	ENSMUST00000155713.8	1317	5	-1	-16	1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_1	106.6123233965	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCAGAAGGACAAAGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100683666	100696499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_100683717_100683823_100683929_100686581_100686763_100687552_100687797_100695745
tx.20562	chrX	+	1310	5	ISM	ENSMUSG00000034160.14	ENSMUST00000119299.8	3840	23	-5	30047	-5	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_1	113.781589020368	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTCAGAAGGACAAAGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100683660	100696499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_100683717_100683823_100683929_100686611_100686763_100687552_100687797_100695745
tx.20563	chrX	+	1426	4	FSM	ENSMUSG00000034160.14	ENSMUST00000150161.8	3087	4	-33	1694	11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_1	65.0743164901996	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTCAGAAGGACAAAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100683680	100696498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_100683929_100686581_100686763_100687552_100687797_100695745
tx.20564	chrX	+	1295	5	Intergenic	novelGene_1401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	23.7526314331697	89	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAAAGAACAGATTCATAT	9258	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100739441	100748797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_100739530_100743172_100743346_100744532_100744567_100747004_100747092_100747884
tx.20565	chrX	+	568	3	Intergenic	novelGene_1402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTGGCCATGATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100789684	100794860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_100790021_100793833_100793960_100794754
tx.20566	chrX	-	382	2	ISM	ENSMUSG00000045010.15	ENSMUST00000124577.8	1190	7	2452	294	2452	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	308	junction_1	0	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTACTTTTGCAACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100834417	100833952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_100834130_100834212
tx.20567	chrX	-	2015	6	FSM	ENSMUSG00000045010.15	ENSMUST00000147742.9	1991	6	-23	-1	-23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_5	73.271003814606	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTACTTTTGCAACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100838052	100833952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_100834130_100834212_100834255_100834844_100834891_100835166_100835250_100835786_100835944_100836542
tx.20568	chrX	+	1047	8	NIC	ENSMUSG00000046774.18	novel	1050	9	NA	NA	-40	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	15	junction_1	107.73872401816	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTGTACTTTTGCAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100838221	100842247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_100838373_100839359_100839695_100840283_100840444_100840965_100841049_100841321_100841368_100841707_100841763_100841947_100841990_100842072
tx.20569	chrX	+	373	3	NIC	ENSMUSG00000046774.18	novel	1050	9	NA	NA	-43	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_1	140.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTACTTTTGCAACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100838218	100842249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_100838373_100841947_100841990_100842072
tx.2057	chr10	-	3224	22	FSM	ENSMUSG00000020124.11	ENSMUST00000220377.2	11525	22	63	8238	-5	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_15	99.6636747895759	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCTGTTTTGATGAATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123032837	122949148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_122949593_122955013_122955103_122957476_122957581_122959840_122959991_122960418_122960535_122960868_122960940_122961317_122961591_122961716_122961833_122963582_122963775_122963868_122963964_122964053_122964138_122966845_122967071_122967156_122967316_122968860_122969035_122982698_122982844_122988945_122989033_122999497_122999560_123004131_123004278_123007004_123007132_123011747_123011879_123017577_123017706_123032731
tx.20570	chrX	+	2037	7	FSM	ENSMUSG00000046774.18	ENSMUST00000163399.8	1991	7	-41	-5	-41	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_5	79.7050116924205	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTACTTTTGCAACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100838220	100842249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_100839695_100840283_100840444_100840965_100841049_100841321_100841368_100841707_100841763_100841947_100841990_100842072
tx.20571	chrX	+	2208	6	NIC	ENSMUSG00000046774.18	novel	1991	7	NA	NA	-27	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	236	junction_4	22.2656686403081	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTACTTTTGCAACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100838234	100842249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_100839695_100840283_100840444_100840965_100841049_100841321_100841368_100841707_100841990_100842072
tx.20572	chrX	+	817	8	NNC	ENSMUSG00000046774.18	novel	1991	7	NA	NA	-26	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	110.314393014341	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTGTACTTTTGCAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100838235	100842247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_100838373_100839575_100839695_100840283_100840444_100840965_100841049_100841321_100841368_100841707_100841763_100841947_100841990_100842072
tx.20573	chrX	+	366	2	ISM	ENSMUSG00000046774.18	ENSMUST00000149761.2	1050	9	3509	-3	3509	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	283	junction_1	0	190	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTACTTTTGCAACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100841800	100842249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_100841990_100842072
tx.20574	chrX	+	513	2	NNC	ENSMUSG00000079481.12	novel	475	2	NA	NA	-30	-35372	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCAGCGTTTGACTGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101048619	101080200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_101048750_101079817
tx.20575	chrX	+	471	4	FSM	ENSMUSG00000079480.4	ENSMUST00000113627.4	489	4	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1046	junction_3	75.7495874576225	3655	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAGTGTTTTCTATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101163070	101171275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_101163171_101165273_101165348_101170622_101170743_101171098
tx.20576	chrX	-	458	3	FSM	ENSMUSG00000031320.10	ENSMUST00000155028.2	558	3	232	-132	232	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	16896	junction_1	54.5	1793	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGGTTTGCTGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101230111	101228547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_101228738_101229108_101229267_101230001
tx.20577	chrX	-	797	5	ISM	ENSMUSG00000031320.10	ENSMUST00000033683.8	975	7	1394	1	-1263	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14744	junction_4	944.404938307715	1831	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGGTTTGCTGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101231606	101228547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_101228738_101229108_101229267_101230001_101230174_101230960_101231059_101231427
tx.20578	chrX	-	878	6	ISM	ENSMUSG00000031320.10	ENSMUST00000033683.8	975	7	1022	1	964	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14744	junction_4	846.047185445351	65468	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGGTTTGCTGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101231978	101228547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_101228738_101229108_101229267_101230001_101230174_101230960_101231059_101231427_101231609_101231899
tx.20579	chrX	-	872	6	NNC	ENSMUSG00000031320.10	novel	975	7	NA	NA	964	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6476.42229629909	1114	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGGTTTGCTGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101231978	101228547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_101228738_101229108_101229267_101230001_101230174_101230960_101231059_101231427_101231609_101231905
tx.2058	chr10	-	904	6	FSM	ENSMUSG00000025436.13	ENSMUST00000026504.13	903	6	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	67.2767418949521	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTGTTTGACACATTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126737225	126704295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_126704595_126727508_126727593_126730093_126730232_126734755_126734838_126735449_126735496_126736970
tx.20580	chrX	-	903	7	FSM	ENSMUSG00000031320.10	ENSMUST00000033683.8	975	7	71	1	13	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	11043	junction_6	2028.67992108716	130501	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGGTTTGCTGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101232929	101228547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_101228738_101229108_101229267_101230001_101230174_101230960_101231059_101231427_101231609_101231899_101231978_101232903
tx.20581	chrX	-	897	7	NNC	ENSMUSG00000031320.10	novel	975	7	NA	NA	13	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	5950.03962638532	1500	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGGTTTGCTGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101232929	101228547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_101228738_101229108_101229267_101230001_101230174_101230960_101231059_101231427_101231609_101231905_101231978_101232903
tx.20582	chrX	-	883	7	NNC	ENSMUSG00000031320.10	novel	975	7	NA	NA	13	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6005.39401057268	201	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGGTTTGCTGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101232929	101228547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_101228738_101229108_101229267_101230001_101230154_101230960_101231059_101231427_101231609_101231899_101231978_101232903
tx.20583	chrX	-	1205	7	ISM	ENSMUSG00000067567.13	ENSMUST00000087916.11	1936	11	72762	-1	72144	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	11.5710366384732	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCGTCCCACCGCTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101476203	101328243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_101328775_101351244_101351351_101446190_101446286_101449142_101449316_101471720_101471830_101472369_101472448_101476090
tx.20584	chrX	-	1444	10	NNC	ENSMUSG00000067567.13	novel	686	7	NA	NA	-21	13336	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_1	19.2700112437262	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATGTGTTAATGTCTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101548773	101435916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_101436253_101446190_101446286_101449142_101449316_101471720_101471830_101472369_101472448_101476090_101476204_101541736_101541879_101543427_101543559_101548004_101548058_101548559
tx.20585	chrX	-	1196	4	ISM	ENSMUSG00000034055.17	ENSMUST00000052012.14	6115	33	123406	1387	123406	-1387	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_2	17.2497987105808	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAGTTTAAGAATTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101564446	101558967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_101559822_101560382_101560584_101561048_101561103_101564359
tx.20586	chrX	-	308	2	ISM	ENSMUSG00000081443.3	ENSMUST00000122154.3	337	3	224	-6	224	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_1	0	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGACTGTGTGAAATTT	3851	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101730354	101729891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_101730044_101730198
tx.20587	chrX	-	475	3	FSM	ENSMUSG00000081443.3	ENSMUST00000122154.3	337	3	-134	-4	-134	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_2	7	619	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTTGACTGTGTGAAAT	3493	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101730712	101729893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_101730044_101730198_101730354_101730542
tx.20588	chrX	-	449	3	FSM	ENSMUSG00000079479.3	ENSMUST00000113610.3	420	3	-31	2	-31	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	3	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTTGACTTCGTGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101751272	101750497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_101750648_101750793_101750958_101751137
tx.20589	chrX	+	1471	7	FSM	ENSMUSG00000073027.11	ENSMUST00000101324.9	1200	7	-126	-145	-126	145	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.5723301886761	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAGTTGTTTGTGAAAAC	3738	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101751344	101758960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_101751533_101754965_101755124_101755540_101755600_101755900_101756038_101756834_101756896_101757072_101757251_101758270
tx.2059	chr10	-	533	2	ISM	ENSMUSG00000025436.13	ENSMUST00000168520.3	1043	6	9623	-1	9623	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	157	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTATTTTTTGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126727594	126723116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_126723564_126727508
tx.20590	chrX	-	2051	3	ISM	ENSMUSG00000031325.16	ENSMUST00000127012.9	685	4	-87	1348	-87	6	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAAAGTATCAGAAGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102355475	102274981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_102276548_102277627_102277876_102355238
tx.20591	chrX	+	2643	3	FSM	ENSMUSG00000031326.3	ENSMUST00000033689.3	1963	3	-60	-620	-60	620	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGTGTTTGTTAATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102364943	102374818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_102365662_102371614_102371761_102373039
tx.20592	chrX	+	1298	6	FSM	ENSMUSG00000031327.11	ENSMUST00000116547.3	7375	6	30	6047	30	-6047	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	5.41848687365763	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGTAAATATTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102400111	102433651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_102400496_102409819_102409875_102417204_102417361_102430860_102430918_102431592_102431653_102433065
tx.20593	chrX	+	822	7	NNC	ENSMUSG00000031329.5	novel	812	7	NA	NA	1	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.5619863451699	217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGTTTCTGTGTCACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102458073	102468193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_102458253_102459640_102459681_102460356_102460394_102461814_102461897_102464105_102464207_102465593_102465653_102467869
tx.20594	chrX	+	1536	2	NNC	ENSMUSG00000085715.3	novel	3263	2	NA	NA	0	171	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAATAATAACAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102491327	102526183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_102491561_102524880
tx.20595	chrX	+	1562	2	NIC	ENSMUSG00000085715.3	novel	4306	4	NA	NA	-3	177	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATAATAACAGCAGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102491324	102526189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_102491578_102524880
tx.20596	chrX	+	1138	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082746.2_ENSMUSG00000083502.2	novel	455	1	NA	NA	-35	30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTTCTTCGAGGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102530504	102533553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_102531078_102532988
tx.20597	chrX	+	1121	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082746.2_ENSMUSG00000083502.2	novel	455	1	NA	NA	-35	30	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTTCTTCGAGGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102530504	102533553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_102531078_102533005
tx.20598	chrX	-	2220	5	FSM	ENSMUSG00000056537.12	ENSMUST00000121153.8	7439	5	4	5215	4	-5215	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_4	53.7261575026541	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTCATTGCTTTCTTAG	2377	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103024886	103005983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_103007650_103008856_103008941_103010096_103010287_103022878_103022941_103024668
tx.20599	chrX	-	2210	5	FSM	ENSMUSG00000056537.12	ENSMUST00000070705.6	7429	5	4	5215	4	-5215	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_4	35.6300435026397	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTCATTGCTTTCTTAG	2377	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103024886	103005983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_103007650_103008856_103008941_103010096_103010287_103022878_103022941_103024678
tx.206	chr1	+	2623	21	FSM	ENSMUSG00000025995.17	ENSMUST00000027139.15	2953	21	332	-2	-5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	530	junction_5	51.2145243070752	363	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAAGCCTTGTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45834657	45862781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_45834765_45838175_45838306_45840320_45840387_45841198_45841290_45843036_45843162_45844536_45844608_45845832_45845953_45846830_45846920_45851200_45851360_45852204_45852265_45852349_45852466_45853700_45853877_45855636_45855795_45856422_45856604_45857329_45857425_45857981_45858078_45858648_45858819_45859290_45859351_45861607_45861755_45862042_45862135_45862467
tx.2060	chr10	-	1052	6	FSM	ENSMUSG00000025436.13	ENSMUST00000168520.3	1043	6	-8	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_1	12.3515181253156	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTATTTTTTGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126737225	126723116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_126723564_126727508_126727593_126730093_126730232_126734755_126734838_126735449_126735496_126736970
tx.20600	chrX	-	1497	3	NNC	ENSMUSG00000046449.16	novel	10891	5	NA	NA	116048	2764	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	25	junction_2	3	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAATGTGTTTTTATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103128675	103124555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_103124709_103126759_103126890_103127461
tx.20601	chrX	-	2713	16	FSM	ENSMUSG00000031333.8	ENSMUST00000033695.6	5667	16	-5	2959	-5	-2959	multi-exon	FALSE	canonical	3	253	junction_7	23.4516997725585	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGAAGTGTAGGGGTTTTT	10047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103457457	103327221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_103327865_103334728_103334837_103338073_103338178_103339436_103339609_103343374_103343505_103343655_103343820_103344376_103344535_103345399_103345575_103346557_103346646_103346734_103346824_103347737_103348007_103348875_103349009_103366939_103367060_103386099_103386187_103388530_103388609_103457262
tx.20602	chrX	-	773	5	ISM	ENSMUSG00000031333.8	ENSMUST00000033695.6	5667	16	114052	3239	114052	-3239	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	290	junction_3	15.1410039297267	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGGGTTGGATTTTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103343400	103327501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_103327865_103334728_103334837_103338073_103338178_103339436_103339609_103343374
tx.20603	chrX	-	2652	11	NIC	ENSMUSG00000033906.6	novel	5509	12	NA	NA	267	-2469	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	1	5	junction_8	30.7579258078304	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGAGGAGTGAAATAGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103714403	103583043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_103584775_103588433_103588511_103604290_103604395_103607426_103607554_103609307_103609441_103615259_103615381_103616110_103616144_103617774_103617845_103641697_103641793_103676189_103676217_103714269
tx.20604	chrX	-	2116	10	NIC	ENSMUSG00000033906.6	novel	5509	12	NA	NA	41	-3136	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_8	33.2903426473842	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCAGATATGCCACTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103714629	103583710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_103584775_103588433_103588511_103604290_103604395_103607426_103607554_103609307_103609441_103615259_103615381_103616110_103616144_103617774_103617845_103676189_103676217_103714269
tx.20605	chrX	-	1593	12	FSM	ENSMUSG00000033906.6	ENSMUST00000042070.6	5509	12	161	3755	161	-3755	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_8	6.78841989185253	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAGGTTTAAAAAGCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103714509	103584329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_103584775_103588433_103588511_103604290_103604395_103607426_103607554_103609307_103609441_103615259_103615381_103616110_103616144_103617774_103617845_103631906_103632028_103641697_103641793_103676189_103676217_103714269
tx.20606	chrX	-	1529	11	NNC	ENSMUSG00000033906.6	novel	5509	12	NA	NA	56	-3917	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	32.1448285109751	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGCCTTAGAGTCTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103714614	103584491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_103584775_103588433_103588511_103604290_103604395_103607426_103607554_103609307_103609441_103615259_103615381_103616110_103616144_103617774_103617845_103631906_103632028_103641697_103641813_103714269
tx.20607	chrX	+	491	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033906.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATGAGTCGCCTTAGTCT	8468	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103714509	103759717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_103714618_103724291_103724365_103759407
tx.20608	chrX	-	862	6	FSM	ENSMUSG00000087174.8	ENSMUST00000140954.8	3287	6	25	2400	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_2	25.9183332797462	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTGGATTTACATGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104113705	104087406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_104087718_104091514_104091617_104110364_104110484_104112069_104112235_104113216_104113282_104113605
tx.20609	chrX	-	768	6	FSM	ENSMUSG00000087174.8	ENSMUST00000144366.8	709	6	-57	-2	-4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_3	33.8904116233486	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTGGATTTACATGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104113718	104087406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_104087718_104091514_104091617_104110364_104110484_104112176_104112235_104113216_104113282_104113605
tx.2061	chr10	-	1181	6	FSM	ENSMUSG00000040521.12	ENSMUST00000040560.11	1206	6	18	7	18	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	855	junction_5	79.6728310027954	469	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTGCTTAATGTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126866691	126858207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_126858796_126860804_126860893_126864233_126864357_126865422_126865552_126866331_126866506_126866612
tx.20610	chrX	-	755	5	FSM	ENSMUSG00000087174.8	ENSMUST00000138460.8	3732	5	28	2949	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	38.5940409908058	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTGTGGATTTACATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104113702	104087408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_104087718_104110364_104110484_104112069_104112235_104113216_104113282_104113605
tx.20611	chrX	+	930	6	FSM	ENSMUSG00000031226.14	ENSMUST00000033577.11	2638	6	13	1695	-6	331	multi-exon	FALSE	canonical	3	1180	junction_1	116.642359372571	4374	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACTGATCTTAGAAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104123374	104127097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_104123450_104123559_104123626_104124976_104125037_104125543_104125685_104126299_104126412_104126621
tx.20612	chrX	+	852	5	ISM	ENSMUSG00000031226.14	ENSMUST00000033577.11	2638	6	197	1699	178	327	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1426	junction_1	33.618261406563	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAATGACTGATCTTAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104123558	104127093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_104123626_104124976_104125037_104125543_104125685_104126299_104126412_104126621
tx.20613	chrX	-	387	2	ISM	ENSMUSG00000031229.17	ENSMUST00000146193.3	691	3	283	807	283	-807	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	209	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTACCTATGTTTTGTCTT	NA	False	NA	-71	True	NA	NA	NA	104894849	104891149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_104891330_104894642
tx.20614	chrX	-	3793	2	FSM	ENSMUSG00000031229.17	ENSMUST00000200471.2	3124	2	-671	2	-381	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	261	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTTGTTGAAGCATTTA	NA	False	NA	-7	True	NA	NA	NA	104919582	104909153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_104911530_104918165
tx.20615	chrX	-	2700	9	NIC	ENSMUSG00000031229.17	novel	1920	11	NA	NA	0	603	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	69	junction_8	63.7397050510904	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAATCAACAGAAACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104972956	104919510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_104921180_104921972_104922041_104923514_104923625_104927912_104928027_104931320_104931446_104932598_104932652_104934522_104934579_104943486_104943600_104972564
tx.20616	chrX	-	2284	8	NIC	ENSMUSG00000031229.17	novel	1716	9	NA	NA	0	603	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_3	93.0330202516443	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAATCAACAGAAACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104972183	104919510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_104921180_104921972_104922041_104923514_104923625_104931320_104931446_104932598_104932652_104934522_104934579_104943486_104943600_104972093
tx.20617	chrX	-	1799	9	NIC	ENSMUSG00000031229.17	novel	1920	11	NA	NA	0	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	34	junction_8	72.3134453265781	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTATTTGTTAAACTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104972183	104920109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_104921180_104921972_104922041_104923514_104923625_104927912_104928027_104931320_104931446_104932598_104932652_104934522_104934579_104943486_104943600_104972093
tx.20618	chrX	-	1918	11	FSM	ENSMUSG00000031232.18	ENSMUST00000113566.10	1608	11	-48	-262	-48	262	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	64.6371410258839	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATGGCTCTTGTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105055440	105013821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_105014633_105015041_105015086_105017790_105017882_105023011_105023087_105027315_105027380_105027971_105028062_105032576_105032718_105032995_105033137_105036003_105036122_105040427_105040598_105055267
tx.20619	chrX	-	2075	10	FSM	ENSMUSG00000031232.18	ENSMUST00000238718.2	4524	10	66	2383	-47	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	195	junction_8	15.5404688745065	186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGGAAGGAAGGAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105055439	105014072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_105015086_105017790_105017882_105023011_105023087_105027315_105027380_105027971_105028062_105032576_105032718_105032995_105033137_105036003_105036122_105040427_105040598_105055267
tx.2062	chr10	-	1102	5	FSM	ENSMUSG00000040521.12	ENSMUST00000145476.2	656	5	122	-568	122	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	924	junction_2	62.6917059905056	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATAGTGCTTAATGTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126866506	126858208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_126858796_126860804_126860893_126864233_126864357_126865422_126865552_126866331
tx.20620	chrX	+	478	3	FSM	ENSMUSG00000031231.5	ENSMUST00000033582.5	1001	3	31	492	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7724	junction_1	851.5	44901	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTAGGCTTTGTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105059336	105065564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_105059477_105063184_105063310_105065351
tx.20621	chrX	+	1379	4	ISM	ENSMUSG00000033792.13	ENSMUST00000113557.8	4900	23	-40	38222	-40	-31614	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_3	10.5303793326209	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCATCCACGTGTCCCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105070841	105130301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_105070986_105113375_105113514_105128719_105129210_105129694
tx.20622	chrX	+	1779	11	FSM	ENSMUSG00000062070.13	ENSMUST00000081593.13	1825	11	46	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3907	junction_10	353.61602056468	6311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTCCTGTCATACTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105230751	105247305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_105230922_105235612_105235664_105237961_105238118_105238237_105238383_105240448_105240553_105241447_105241568_105243252_105243368_105243762_105243943_105246044_105246223_105246442_105246542_105246844
tx.20623	chrX	-	922	8	FSM	ENSMUSG00000047242.15	ENSMUST00000113495.9	2512	8	9	1581	9	-1581	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_7	5.73211504221111	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGTGTGTTTGGGCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105264755	105252069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_105252264_105253312_105253424_105259732_105259803_105261702_105261838_105261915_105262053_105262501_105262584_105263184_105263305_105264682
tx.20624	chrX	-	793	7	FSM	ENSMUSG00000047242.15	ENSMUST00000055497.15	2633	7	257	1583	257	-1583	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	4.34613493680177	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTTTGTGTGTTTGGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105263250	105252071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_105252264_105253312_105253424_105259732_105259803_105261702_105261838_105261915_105262053_105262501_105262584_105263184
tx.20625	chrX	+	1965	3	FSM	ENSMUSG00000049929.8	ENSMUST00000060576.8	4238	3	1	2272	1	-2272	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCCAGTAATTTTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105964231	105975234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_105964596_105967683_105967786_105973735
tx.20626	chrX	+	524	2	Intergenic	novelGene_1403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATATCTTTAGCTTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106341947	106384704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_106342093_106384325
tx.20627	chrX	-	1651	6	FSM	ENSMUSG00000031239.6	ENSMUST00000033591.6	1744	6	-6	99	-6	-99	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	8.06473806146238	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGTTTTATTTTCATCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106446988	106440803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_106441586_106441701_106441853_106442376_106442488_106442701_106442900_106443172_106443305_106446711
tx.20628	chrX	-	1209	8	FSM	ENSMUSG00000031242.8	ENSMUST00000120722.2	5842	8	42	4591	42	495	multi-exon	TRUE	canonical	3	41	junction_6	7.21958786771044	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTTCGCATAACCCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106859898	106830947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_106831460_106831871_106831945_106834341_106834386_106836504_106836613_106836698_106836768_106837113_106837261_106851397_106851496_106859740
tx.20629	chrX	+	617	3	NNC	ENSMUSG00000082354.2	novel	820	2	NA	NA	-421	2128	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTATCTGTTTTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107448872	107452502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_107448987_107449207_107449378_107452169
tx.2063	chr10	+	1353	6	FSM	ENSMUSG00000006732.15	ENSMUST00000006915.14	1791	6	24	414	-1	52	multi-exon	FALSE	canonical	3	356	junction_3	29.1245600825146	632	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGCTGTGTGTGGCTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126877824	126881820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_126877940_126878928_126879093_126880335_126880521_126880624_126880739_126880894_126880997_126881147
tx.20630	chrX	+	753	3	FSM	ENSMUSG00000086629.9	ENSMUST00000131640.8	546	3	7	-214	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	2.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGTTGTAACAGACAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107878269	107930503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_107878380_107879871_107879962_107929950
tx.20631	chrX	+	693	3	NIC	ENSMUSG00000086629.9	novel	1107	3	NA	NA	-2	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTTCTTGTCTGATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107878282	107918379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_107878380_107879871_107879962_107917873
tx.20632	chrX	+	570	4	NIC	ENSMUSG00000086629.9	novel	852	4	NA	NA	-1	-246	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_3	4.49691252107735	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTTTGAGACACAGATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107878283	107918130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_107878380_107879871_107879962_107915077_107915205_107917873
tx.20633	chrX	+	648	3	NNC	ENSMUSG00000086629.9	novel	546	3	NA	NA	-1	-1953	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	6	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATGTGATTTTCCAGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107878283	107928336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_107878380_107879871_107879962_107927874
tx.20634	chrX	+	796	4	NIC	ENSMUSG00000086629.9	novel	747	4	NA	NA	-2	-70	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_3	5.09901951359278	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAATGAAACATTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107878282	107930432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_107878380_107879871_107879962_107915077_107915205_107929950
tx.20635	chrX	-	1907	5	NNC	ENSMUSG00000031245.9	novel	1934	6	NA	NA	11	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	39.8151981032369	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTATGGTTTGCAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108056999	108048142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_108049678_108051767_108051903_108054159_108054214_108055010_108055052_108056857
tx.20636	chrX	-	1913	4	NNC	ENSMUSG00000031245.9	novel	1934	6	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	44.2894519672072	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGTTTGCAATATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108057008	108048139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_108049678_108051767_108051903_108054159_108054214_108056822
tx.20637	chrX	-	1935	6	FSM	ENSMUSG00000031245.9	ENSMUST00000033597.9	1934	6	-4	3	-4	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	41.3424721079908	221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTATGGTTTGCAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108057014	108048142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_108049678_108051767_108051903_108054159_108054214_108054462_108054493_108055027_108055052_108056857
tx.20638	chrX	+	2813	4	FSM	ENSMUSG00000031246.15	ENSMUST00000033598.9	2882	4	65	4	65	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	2.86744175568088	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATGTTTGATTACTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108139035	108206073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_108139244_108193520_108193707_108197911_108197993_108203735
tx.20639	chrX	-	4132	23	FSM	ENSMUSG00000025665.17	ENSMUST00000113428.9	4135	23	-4	7	-4	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_4	54.455987232393	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACAGCATCATTTAGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110372896	110297896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_110299609_110300783_110300916_110308277_110308396_110309904_110309967_110314374_110314537_110317152_110317312_110318341_110318432_110319029_110319153_110319546_110319678_110320231_110320335_110322401_110322461_110323234_110323324_110323534_110323606_110326794_110326938_110330608_110330647_110331366_110331474_110342310_110342391_110344013_110344095_110344883_110344966_110348849_110348967_110355927_110355988_110359988_110360052_110372546
tx.2064	chr10	-	981	2	ISM	ENSMUSG00000040502.6	ENSMUST00000040307.6	3037	4	2630	1043	2630	-1043	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	15	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCGCGTGGGGCCTCCTTTC	7932	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126893423	126891922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_126892781_126893300
tx.20640	chrX	-	4215	24	NIC	ENSMUSG00000025665.17	novel	4170	24	NA	NA	27	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	110	junction_23	62.1628144548264	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTAGTCTTGGTGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110373125	110297888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_110299609_110300783_110300916_110308277_110308396_110309904_110309982_110314374_110314537_110317152_110317312_110318341_110318432_110319029_110319153_110319546_110319678_110320231_110320335_110322401_110322461_110323234_110323324_110323534_110323606_110326794_110326938_110330608_110330647_110331366_110331474_110342310_110342391_110344013_110344095_110344883_110344966_110348849_110348967_110355927_110355988_110359988_110360052_110372546_110372799_110372967
tx.20641	chrX	-	4130	23	FSM	ENSMUSG00000025665.17	ENSMUST00000096348.10	4151	23	18	3	18	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	237	junction_4	39.3304500040447	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATCATTTAGTCTTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110372874	110297891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_110299609_110300783_110300916_110308277_110308396_110309904_110309982_110314374_110314537_110317152_110317312_110318341_110318432_110319029_110319153_110319546_110319678_110320231_110320335_110322401_110322461_110323234_110323324_110323534_110323606_110326794_110326938_110330608_110330647_110331366_110331474_110342310_110342391_110344013_110344095_110344883_110344966_110348849_110348967_110355927_110355988_110359988_110360052_110372546
tx.20642	chrX	+	989	9	FSM	ENSMUSG00000025525.13	ENSMUST00000026599.10	1359	9	47	323	15	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	334	junction_1	40.3205902734571	1872	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGTGGTAAAATCATAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111221077	111282129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_111221134_111243497_111243603_111255934_111256055_111259497_111259553_111260996_111261096_111263857_111263950_111273853_111273968_111274158_111274268_111281890
tx.20643	chrX	+	934	8	ISM	ENSMUSG00000025525.13	ENSMUST00000026599.10	1359	9	22466	323	22434	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	343	junction_6	34.4857261214325	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGTGGTAAAATCATAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111243496	111282129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_111243603_111255934_111256055_111259497_111259553_111260996_111261096_111263857_111263950_111273853_111273968_111274158_111274268_111281890
tx.20644	chrX	-	4016	15	FSM	ENSMUSG00000025531.15	ENSMUST00000026607.15	4868	15	16	836	8	-834	multi-exon	TRUE	canonical	3	145	junction_7	16.3001189428489	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCTTCCAGGTCATTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112095198	111951125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_111953333_111957032_111957194_111962758_111962858_111974543_111974641_111979275_111979340_111981613_111981719_111989834_111989913_112019872_112020099_112021625_112021747_112022245_112022363_112025712_112026128_112049032_112049158_112050410_112050484_112069200_112069268_112095137
tx.20645	chrX	+	1203	2	NNC	ENSMUSG00000025592.18	novel	475	4	NA	NA	-28	-217270	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTATTCATTTGCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112207920	112248726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_112208633_112248235
tx.20646	chrX	+	855	2	FSM	ENSMUSG00000050435.3	ENSMUST00000059509.3	743	2	-109	-3	-109	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTCATTTTTTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113814599	113815641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_113814900_113815086
tx.20647	chrX	-	878	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000050435.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTGGGTGTTCACATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113815641	113814575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_113814894_113815081
tx.20648	chrX	+	735	2	FSM	ENSMUSG00000047079.2	ENSMUST00000062695.2	743	2	10	-2	10	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTCATTTTCTTTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113817288	113818209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_113817472_113817657
tx.20649	chrX	+	441	2	Intergenic	novelGene_1407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGTCTTGTCTTCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117903462	117910730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_117903724_117910550
tx.2065	chr10	+	1368	8	FSM	ENSMUSG00000006728.13	ENSMUST00000006911.12	2053	8	50	635	-19	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	4641	junction_3	430.829906300927	1244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTCTTTATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126899452	126903154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_126899629_126900088_126900323_126900453_126900590_126900703_126900872_126901023_126901134_126901821_126901873_126901969_126902106_126902797
tx.20650	chrX	+	931	3	FSM	ENSMUSG00000079450.12	ENSMUST00000113343.8	3301	3	27	2343	-13	38	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTGGCAATGGTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122013218	122053005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_122013335_122027150_122027267_122052306
tx.20651	chrX	+	854	3	NNC	ENSMUSG00000079450.12	novel	3301	3	NA	NA	12	-24142	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	27	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAAGAAAGAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122013203	122028637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_122013335_122027150_122027267_122028030
tx.20652	chrX	+	559	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094015.2	novel	402	1	NA	NA	-118371	27	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAGAAAGAAAGATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122748599	122867399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_122748857_122867097
tx.20653	chrX	+	511	3	ISM	ENSMUSG00000034480.19	ENSMUST00000037854.15	3742	27	12	657007	-7	-238340	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_1	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTTGACCTCTAATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128650565	128704939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_128650866_128702143_128702177_128704761
tx.20654	chrX	-	1753	8	FSM	ENSMUSG00000067377.13	ENSMUST00000087557.12	1765	8	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_3	4.33777898591114	311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCGTTTTAATTTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132799166	132791816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_132792673_132793410_132793516_132795247_132795332_132795676_132795812_132796183_132796283_132797431_132797507_132797872_132798062_132798956
tx.20655	chrX	+	1952	14	FSM	ENSMUSG00000031256.12	ENSMUST00000113287.8	3661	14	124	1585	0	-1585	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_8	147.051615138335	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATATACATAATCCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132960059	132985210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_132960172_132961392_132961472_132961693_132961864_132962442_132962580_132963116_132963237_132963346_132963485_132967009_132967134_132970593_132970657_132973962_132974027_132974874_132975060_132975261_132975555_132981075_132981187_132981939_132982066_132984980
tx.20656	chrX	+	2610	11	FSM	ENSMUSG00000031256.12	ENSMUST00000113286.8	2717	11	107	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	451	junction_8	82.5556781814552	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCAAGTTTTGCTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132960070	132976612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_132960172_132961392_132961472_132961693_132961864_132962442_132962580_132963116_132963237_132963346_132963485_132967009_132967134_132970593_132970657_132973884_132974027_132974874_132975060_132975261
tx.20657	chrX	+	2004	14	FSM	ENSMUSG00000031256.12	ENSMUST00000033609.9	4502	14	140	2358	3	-1585	multi-exon	FALSE	canonical	3	451	junction_8	78.010695670871	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATATACATAATCCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132960085	132985210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_132960172_132961392_132961472_132961693_132961864_132962442_132962580_132963116_132963237_132963346_132963485_132967009_132967134_132970593_132970657_132973884_132974027_132974874_132975060_132975261_132975555_132981075_132981187_132981939_132982066_132984980
tx.20658	chrX	-	3081	13	NNC	ENSMUSG00000067369.13	novel	3119	13	NA	NA	-13	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	14.4132944032777	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACTATCTCTAGTCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133177689	133123843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_133125455_133138891_133138992_133139215_133139336_133140827_133140930_133141099_133141319_133141725_133141821_133143763_133143911_133162325_133162397_133163533_133163634_133164475_133164611_133167009_133167065_133168079_133168311_133177594
tx.20659	chrX	-	918	5	ISM	ENSMUSG00000067369.13	ENSMUST00000145066.2	3237	12	-13	39387	-13	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	5.7227615711298	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTCTCCGCATTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133177689	133163231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_133163634_133164475_133164611_133167009_133167065_133168079_133168311_133177594
tx.2066	chr10	-	1563	6	FSM	ENSMUSG00000006736.10	ENSMUST00000060991.6	1556	6	-16	9	-16	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	545	junction_1	41.1698919114442	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTCTTTGTCTTGTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126906149	126903157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_126904060_126904137_126904252_126904348_126904481_126904776_126904858_126905214_126905383_126905983
tx.20660	chrX	-	1774	4	NIC	ENSMUSG00000067369.13	novel	4099	12	NA	NA	-27	5	intron_retention	FALSE	canonical	3	48	junction_1	4.32049379893857	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTCTCCGCATTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133177703	133163231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_133164611_133167009_133167065_133168079_133168311_133177594
tx.20661	chrX	-	778	4	FSM	ENSMUSG00000067369.13	ENSMUST00000087540.4	822	4	49	-5	-8	5	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	24.2624538467705	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTCTCCGCATTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133177684	133163231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_133163634_133167009_133167065_133168079_133168311_133177594
tx.20662	chrX	+	1752	2	FSM	ENSMUSG00000033578.8	ENSMUST00000037687.8	1918	2	166	0	166	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACATGGTGTGGATATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133196139	133206718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_133196379_133205205
tx.20663	chrX	+	3102	22	FSM	ENSMUSG00000031262.13	ENSMUST00000101251.8	3085	22	-10	-7	-10	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	51.4515821537341	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCGAATTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133208893	133263392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_133208978_133209475_133209597_133210889_133211122_133212739_133212878_133218359_133218479_133218773_133218882_133225509_133225559_133225839_133225887_133236833_133236924_133237259_133237389_133237958_133238121_133238351_133238473_133239502_133239595_133240582_133240701_133241096_133241162_133243824_133243920_133247973_133248110_133249908_133250034_133251815_133251865_133251993_133252213_133261963_133262006_133262631
tx.20664	chrX	+	3168	23	FSM	ENSMUSG00000031262.13	ENSMUST00000081064.12	3227	23	61	-2	-10	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_9	42.2862392872416	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTCCGAATTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133208893	133263390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_133208978_133209314_133209383_133209475_133209597_133210889_133211122_133212739_133212878_133218359_133218479_133218773_133218882_133225509_133225559_133225839_133225887_133236833_133236924_133237259_133237389_133237958_133238121_133238351_133238473_133239502_133239595_133240582_133240701_133241096_133241162_133243824_133243920_133247973_133248110_133249908_133250034_133251815_133251865_133251993_133252213_133261963_133262006_133262631
tx.20665	chrX	+	2151	17	ISM	ENSMUSG00000031262.13	ENSMUST00000081064.12	3227	23	77	19140	6	-1654	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	156	junction_9	46.4320319795505	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGTGGATTTTGTTTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133208909	133244248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_133208978_133209314_133209383_133209475_133209597_133210889_133211122_133212739_133212878_133218359_133218479_133218773_133218882_133225509_133225559_133225839_133225887_133236833_133236924_133237259_133237389_133237958_133238121_133238351_133238473_133239502_133239595_133240582_133240701_133241096_133241162_133243824
tx.20666	chrX	-	1958	13	FSM	ENSMUSG00000009596.10	ENSMUST00000009740.9	1933	13	-19	-6	-19	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	4.16999866773227	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTCTCTAATTTCTAACAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133377258	133360860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_133361415_133365048_133365109_133366370_133366484_133366656_133366891_133367272_133367375_133367824_133367898_133368646_133368689_133370864_133370921_133371128_133371259_133372140_133372275_133372779_133372859_133373654_133373717_133376939
tx.20667	chrX	-	1201	2	FSM	ENSMUSG00000048007.5	ENSMUST00000054213.5	1421	2	220	0	220	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1175	junction_1	0	4285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTGACGAAGAGGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133442394	133438004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_133439017_133442205
tx.20668	chrX	+	466	5	FSM	ENSMUSG00000079435.10	ENSMUST00000113211.8	483	5	17	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10431	junction_4	1336.12412877696	38054	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGAAGTTTTTCTCCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133486419	133488805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_133486469_133486826_133486933_133487259_133487328_133488199_133488323_133488685
tx.20669	chrX	+	418	4	FSM	ENSMUSG00000079435.10	ENSMUST00000172023.8	812	4	388	6	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10431	junction_3	1438.31622237794	3790	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGAAGTTTTTCTCCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133486825	133488805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_133486933_133487259_133487328_133488199_133488323_133488685
tx.2067	chr10	+	408	2	FSM	ENSMUSG00000112639.2	ENSMUST00000217874.2	329	2	-72	-7	34	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTTAAATTTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126906277	126906977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_126906494_126906785
tx.20670	chrX	-	1411	7	FSM	ENSMUSG00000031266.8	ENSMUST00000239113.2	3015	7	26	1578	26	-1578	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_5	18.580904176062	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGCTTTTCAACATAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133501728	133490512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_133490877_133491694_133491893_133492813_133492976_133494382_133494475_133495928_133496107_133497023_133497199_133501486
tx.20671	chrX	+	2154	4	FSM	ENSMUSG00000033460.15	ENSMUST00000113198.8	2085	4	-59	-10	-9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_3	26.0895892391327	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTGTCTTTGTCCTTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133618702	133622667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_133618800_133619668_133619742_133620375_133620475_133620782
tx.20672	chrX	+	2211	5	NNC	ENSMUSG00000033460.15	novel	2228	5	NA	NA	-6	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	45	junction_1	54.8925085963467	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCCTTGGGTTCAGGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133618705	133622675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_133618800_133619474_133619568_133619668_133619742_133620375_133620475_133620823
tx.20673	chrX	-	2026	4	FSM	ENSMUSG00000050394.15	ENSMUST00000052431.12	2024	4	0	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	2.05480466765633	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGGGGCACTGGCCTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133652166	133649209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_133650975_133651299_133651380_133651689_133651783_133652078
tx.20674	chrX	-	3441	6	FSM	ENSMUSG00000033436.14	ENSMUST00000113193.9	3666	6	227	-2	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_5	6.60302960768767	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTTGTTCTGGTGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133709743	133704893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_133707763_133708010_133708077_133708202_133708263_133708369_133708475_133708983_133709249_133709667
tx.20675	chrX	-	2404	22	FSM	ENSMUSG00000009941.11	ENSMUST00000010085.4	2393	22	-10	-1	-10	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	6.66632652193486	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTATGTCTTGAAGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133865513	133845275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_133845538_133845640_133845702_133850435_133850634_133851095_133851169_133851717_133851761_133851850_133851967_133852078_133852138_133852238_133852347_133852497_133852554_133852635_133852891_133853240_133853278_133855976_133856087_133856257_133856366_133856471_133856561_133856713_133856784_133856913_133856995_133857111_133857217_133857340_133857425_133857798_133857953_133858216_133858320_133862672_133862768_133865376
tx.20676	chrX	-	2375	22	FSM	ENSMUSG00000009941.11	ENSMUST00000113189.8	2375	22	1	-1	1	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	15	junction_3	7.21770310384392	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTATGTCTTGAAGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133865502	133845275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_133845538_133845640_133845702_133850435_133850616_133851095_133851169_133851717_133851761_133851850_133851967_133852078_133852138_133852238_133852347_133852497_133852554_133852635_133852891_133853240_133853278_133855976_133856087_133856257_133856366_133856471_133856561_133856713_133856784_133856913_133856995_133857111_133857217_133857340_133857425_133857798_133857953_133858216_133858320_133862672_133862768_133865376
tx.20677	chrX	+	601	5	NIC	ENSMUSG00000086685.2	novel	636	6	NA	NA	1	64	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	7	junction_3	12.4197423483742	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGGCCCTTTTACTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134420340	134450129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_134420483_134421903_134421994_134423420_134423510_134428618_134428718_134449948
tx.20678	chrX	+	3833	5	FSM	ENSMUSG00000054994.3	ENSMUST00000068340.3	3698	5	26	-161	26	161	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_2	53.6516542149448	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTGGTTCTTCGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134395362	134405504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_134395469_134395666_134395786_134400016_134400317_134401619_134402205_134402781
tx.20679	chrX	-	501	5	FSM	ENSMUSG00000060726.11	ENSMUST00000113154.8	544	5	36	7	36	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_4	4.9180788932265	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTGGTTTTGGGCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134625974	134619422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_134619503_134620414_134620520_134621315_134621402_134624106_134624186_134625823
tx.2068	chr10	-	1369	5	ISM	ENSMUSG00000040462.14	ENSMUST00000164259.9	2627	15	22613	-2	22597	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_3	72.2028392793524	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATCAGGCTCTGTGGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126934387	126931518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_126932242_126932498_126932612_126932783_126932949_126933800_126933991_126934209
tx.20680	chrX	+	2828	4	NIC	ENSMUSG00000072969.3	novel	2779	4	NA	NA	-20	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	21	junction_1	31.6789449880446	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAACATTGTTCCAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134643461	134648071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_134643728_134644190_134644272_134645247_134645325_134645667
tx.20681	chrX	+	856	5	NIC	ENSMUSG00000043384.16	novel	837	6	NA	NA	-35	36	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	29	junction_1	13.3299474867683	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACAGTTTCCCCTCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134643446	134662775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_134643728_134645247_134645325_134649404_134649532_134652693_134652767_134662477
tx.20682	chrX	+	893	6	FSM	ENSMUSG00000043384.16	ENSMUST00000149595.8	837	6	-26	-30	-26	30	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_5	28.5629130167075	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCAACCACAGTTTCCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134643455	134662769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_134643728_134644311_134644364_134645247_134645325_134649404_134649532_134652693_134652767_134662477
tx.20683	chrX	+	2753	3	NIC	ENSMUSG00000072969.3	novel	2779	4	NA	NA	-26	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	29	junction_1	31	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAACATTGTTCCAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134643455	134648071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_134643728_134645247_134645325_134645667
tx.20684	chrX	+	916	6	NIC	ENSMUSG00000043384.16	novel	5640	10	NA	NA	-24	26	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	21	junction_1	15.9549365401433	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGCCAACCACAGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134643457	134662765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_134643728_134644190_134644272_134645247_134645325_134649404_134649532_134652693_134652767_134662477
tx.20685	chrX	+	2800	4	FSM	ENSMUSG00000072969.3	ENSMUST00000096321.3	2779	4	-21	0	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_3	8.05536398239638	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAACATTGTTCCAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134643460	134648071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_134643728_134644311_134644364_134645247_134645325_134645667
tx.20686	chrX	+	2770	5	NNC	ENSMUSG00000072964.15	novel	2812	5	NA	NA	23	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	89.3168517134365	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTACATTGTGTGTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134786624	134791824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_134786823_134787593_134787676_134788009_134788067_134789120_134789229_134789499
tx.20687	chrX	+	2752	5	NNC	ENSMUSG00000072964.15	novel	2823	5	NA	NA	63	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	89.3168517134365	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTGTGTTTGTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134786664	134791828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_134786841_134787593_134787676_134788009_134788067_134789120_134789229_134789499
tx.20688	chrX	-	831	3	Intergenic	novelGene_1409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGATCTGTCTTTTCTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134946478	134941985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_134942380_134945284_134945459_134946215
tx.20689	chrX	-	821	3	FSM	ENSMUSG00000042750.8	ENSMUST00000049130.8	903	3	80	2	80	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	901	junction_2	34	3709	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTTAGTAGTTCTTTAAA	4236	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134968905	134967314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_134967957_134968348_134968422_134968799
tx.2069	chr10	+	2447	11	FSM	ENSMUSG00000006731.11	ENSMUST00000006914.11	2395	11	-50	-2	-50	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_6	12.214745187682	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTACTTGTGTCTCTGTGGT	304	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127001043	127008201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_127001389_127001872_127002092_127002586_127002752_127002867_127002975_127003370_127003412_127003569_127003751_127005612_127005712_127005846_127006038_127006459_127006601_127006787_127007029_127007484
tx.20690	chrX	+	788	3	FSM	ENSMUSG00000047844.4	ENSMUST00000116527.2	837	3	49	0	49	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2369	junction_2	964	10753	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGCTCAGTCATCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135039793	135041192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_135039916_135040271_135040349_135040603
tx.20691	chrX	-	1130	3	FSM	ENSMUSG00000051579.11	ENSMUST00000060101.10	1250	3	120	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	703	junction_2	29	1635	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTGGTTAAGACTTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135072971	135070829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_135071799_135072384_135072455_135072880
tx.20692	chrX	-	811	3	FSM	ENSMUSG00000050071.9	ENSMUST00000058125.9	866	3	55	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4595	junction_1	588.5	20618	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCTGTACTCATCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135116207	135114720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_135115333_135115652_135115730_135116085
tx.20693	chrX	+	1002	3	FSM	ENSMUSG00000042712.11	ENSMUST00000048687.11	1019	3	14	3	14	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2732	junction_2	36	13418	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATCCAACAGCCCATCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135145841	135147885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_135145977_135146449_135146516_135147084
tx.20694	chrX	+	837	3	FSM	ENSMUSG00000046432.13	ENSMUST00000053540.11	930	3	35	58	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4289	junction_2	392	30499	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGTGTCCTTAAAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135171044	135172669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_135171151_135171558_135171632_135172011
tx.20695	chrX	+	1189	2	FSM	ENSMUSG00000049536.6	ENSMUST00000055104.6	2803	2	9	1605	9	-1605	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATGTTTCTTCTGAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135608739	135610622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_135608838_135609531
tx.20696	chrX	-	1802	4	FSM	ENSMUSG00000031422.17	ENSMUST00000080411.13	1859	4	68	-11	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2872	junction_1	198.526236721162	1602	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGGTGTTCTTTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135642033	135633690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_135635251_135636294_135636372_135640553_135640644_135641958
tx.20697	chrX	-	1820	4	FSM	ENSMUSG00000031422.17	ENSMUST00000113097.8	1825	4	5	0	1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	47	junction_3	1449.75867723639	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGGTGTTCTTTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135644434	135633690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_135635251_135636294_135636372_135640553_135640644_135644341
tx.20698	chrX	-	439	3	FSM	ENSMUSG00000089996.7	ENSMUST00000069803.5	450	3	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_2	19	1848	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGTGTAACTTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135858763	135856013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_135856232_135857483_135857589_135858647
tx.20699	chrX	-	430	3	NNC	ENSMUSG00000089768.3	novel	439	3	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	65.5	517	1	1	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGTGTAACTTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135877624	135874770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_135874979_135876146_135876252_135877507
tx.207	chr1	+	621	7	ISM	ENSMUSG00000025995.17	ENSMUST00000154436.8	3226	20	49	16901	-5	1256	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	530	junction_5	65.1425786682992	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGCAAAGAACAAGTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45834657	45845863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_45834765_45838175_45838306_45840320_45840387_45841198_45841290_45843036_45843162_45844536_45844608_45845832
tx.2070	chr10	-	1319	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000006731.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCTGTGGAGCTTGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127007037	127005483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_127006598_127006832
tx.20700	chrX	-	438	3	FSM	ENSMUSG00000089768.3	ENSMUST00000113071.2	439	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	50	282	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGTGTAACTTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135877622	135874770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_135874989_135876146_135876252_135877507
tx.20701	chrX	+	2267	4	FSM	ENSMUSG00000031428.12	ENSMUST00000101227.3	2045	4	33	-255	33	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACAACTACGGCAGGGGTG	7938	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135893940	135897120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_135894154_135894455_135894511_135894679_135894820_135895261
tx.20702	chrX	-	1699	6	NIC	ENSMUSG00000044348.15	novel	1740	7	NA	NA	0	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	7	junction_4	11.7813411800185	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGATTATCCCTAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135939051	135903528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_135904559_135916005_135916132_135916997_135917089_135928738_135928904_135933099_135933250_135938914
tx.20703	chrX	-	1779	7	FSM	ENSMUSG00000044348.15	ENSMUST00000123516.8	1740	7	-32	-7	-2	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_5	9.36304793679209	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTATCCCTAGTTTATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135939053	135903524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_135904559_135916005_135916132_135916997_135917089_135928738_135928904_135930774_135930849_135933099_135933250_135938914
tx.20704	chrX	-	1091	3	ISM	ENSMUSG00000023443.14	ENSMUST00000113066.9	1692	4	1369	0	1369	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_1	5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGCTTTGAGAGTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136019551	136016145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_136016755_136018006_136018053_136019115
tx.20705	chrX	-	1334	4	FSM	ENSMUSG00000023443.14	ENSMUST00000113066.9	1692	4	358	0	358	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_3	6.23609564462324	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGCTTTGAGAGTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136020562	136016145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_136016755_136018006_136018053_136019115_136019552_136020319
tx.20706	chrX	-	1407	5	FSM	ENSMUSG00000023443.14	ENSMUST00000074698.3	1600	5	193	0	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	18.0052075800308	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGCTTTGAGAGTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136020882	136016145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_136016755_136018006_136018053_136019115_136019552_136020319_136020446_136020692
tx.20707	chrX	+	1014	3	FSM	ENSMUSG00000051257.4	ENSMUST00000054534.4	1178	3	164	0	164	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2592	junction_2	198.5	11413	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTGTTTCACGTTAACGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138234595	138238918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_138235157_138237570_138237800_138238694
tx.20708	chrX	+	286	2	ISM	ENSMUSG00000051257.4	ENSMUST00000054534.4	1178	3	3306	0	3306	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2592	junction_1	0	3196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTTGTTTCACGTTAACGT	NA	False	NA	49	True	NA	NA	NA	138237737	138238918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_138237800_138238694
tx.20709	chrX	-	291	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000051257.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTCTTCTTCCTCTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138238918	138237737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_138237803_138238692
tx.2071	chr10	-	1309	11	NIC	ENSMUSG00000040441.13	novel	3130	18	NA	NA	-33	115	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.77359245282264	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCCCCACAGAACTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127012891	127008179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_127008446_127009143_127009251_127009350_127009406_127009492_127009576_127009777_127009895_127009967_127010038_127010152_127010260_127010674_127010771_127010853_127010932_127012440_127012555_127012675
tx.20710	chrX	-	828	3	NNC	ENSMUSG00000086807.9	novel	712	4	NA	NA	-21	175	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTTTGGAGAACGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138258508	138248064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_138248640_138255752_138255851_138258353
tx.20711	chrX	-	896	4	NNC	ENSMUSG00000086807.9	novel	712	4	NA	NA	-9	171	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.18241233033047	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTCCAGTTTGGAGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138258496	138248068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_138248640_138255752_138255851_138257038_138257123_138258353
tx.20712	chrX	-	1065	3	Intergenic	novelGene_1410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	13	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCTCTAGAGTTTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138300894	138296085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_138296298_138297305_138297544_138300279
tx.20713	chrX	-	994	4	FSM	ENSMUSG00000031434.16	ENSMUST00000146914.3	600	4	-212	-182	0	182	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_3	2.86744175568088	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCTGTGTTCAAATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138772371	138759328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_138759766_138765243_138765377_138771818_138771892_138772020
tx.20714	chrX	-	1691	7	NNC	ENSMUSG00000031433.16	novel	726	5	NA	NA	-2	23660	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10.8230720633695	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATTAATTAAAGTTAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138899302	138820461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_138821032_138855655_138855804_138868944_138869349_138894046_138894252_138894660_138894854_138895860_138895978_138899248
tx.20715	chrX	-	1999	9	FSM	ENSMUSG00000072944.12	ENSMUST00000101212.9	1996	9	0	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_8	135.330151850946	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCTGAACTGGGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138963317	138907550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_138908616_138922769_138922837_138925977_138926090_138928316_138928452_138928587_138928638_138928886_138929038_138935506_138935664_138939798_138939905_138963161
tx.20716	chrX	-	1880	9	NIC	ENSMUSG00000072944.12	novel	1996	9	NA	NA	-17	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	238	junction_8	106.849119673491	489	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGGCTGAACTGGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138963346	138907552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_138908616_138922769_138922837_138925977_138926090_138928316_138928452_138928587_138928638_138928886_138929038_138935506_138935664_138939798_138939905_138963307
tx.20717	chrX	-	1843	8	ISM	ENSMUSG00000072944.12	ENSMUST00000101212.9	1996	9	23411	-1	23136	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	477	junction_5	41.5038724527173	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGGCTGAACTGGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138939906	138907552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_138908616_138922769_138922837_138925977_138926090_138928316_138928452_138928587_138928638_138928886_138929038_138935506_138935664_138939798
tx.20718	chrX	-	491	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000093102.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTTTTTGTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139211796	139194548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_139194678_139200137_139200179_139211475
tx.20719	chrX	-	334	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000093102.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	0.816496580927726	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTTTTTGTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139211892	139194548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_139194678_139200137_139200179_139211475_139211546_139211798
tx.2072	chr10	-	996	4	NIC	ENSMUSG00000040415.16	novel	1944	6	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_1	54.0760780957922	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCACACCCGTCTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127031597	127026246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_127026909_127029598_127029673_127030278_127030504_127031562
tx.20720	chrX	+	1953	7	FSM	ENSMUSG00000031432.4	ENSMUST00000033809.4	1965	7	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1771	junction_6	191.019850626403	6334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGGGTGTACTGTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139357373	139376889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_139357613_139365979_139366164_139368420_139368520_139369583_139369709_139372745_139372920_139374527_139374688_139375917
tx.20721	chrX	+	1665	6	ISM	ENSMUSG00000031432.4	ENSMUST00000033809.4	1965	7	8667	0	8667	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1771	junction_5	169.841808751556	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGGGTGTACTGTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139366028	139376889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_139366164_139368420_139368520_139369583_139369709_139372745_139372920_139374527_139374688_139375917
tx.20722	chrX	-	1810	3	FSM	ENSMUSG00000031431.14	ENSMUST00000112995.3	1790	3	-20	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_2	112.5	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTGTGTGAGTGCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139443437	139440276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_139441857_139442853_139442906_139443259
tx.20723	chrX	-	1972	3	FSM	ENSMUSG00000031431.14	ENSMUST00000055738.12	1974	3	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_2	61	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTGTGTGAGTGCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139443934	139440276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_139441857_139442853_139442906_139443594
tx.20724	chrX	-	1367	5	FSM	ENSMUSG00000031429.15	ENSMUST00000112978.2	1390	5	25	-2	-14	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	228.562218006389	420	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCCAATTTCTCATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139857452	139849175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_139850059_139852974_139853063_139853153_139853301_139854548_139854648_139857302
tx.20725	chrX	-	1446	5	FSM	ENSMUSG00000031429.15	ENSMUST00000033805.15	1430	5	-14	-2	-14	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	522	junction_1	39.0024037720754	1779	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCCAATTTCTCATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139857452	139849175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_139850059_139852895_139853063_139853153_139853301_139854548_139854648_139857302
tx.20726	chrX	+	2126	13	FSM	ENSMUSG00000079418.6	ENSMUST00000112971.2	2202	13	0	76	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	18	junction_1	12.4707992259251	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTTTGGTTGAGAACTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139857655	139947190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_139857721_139887027_139887139_139888914_139888987_139890906_139891006_139893565_139893668_139893817_139893891_139895351_139895432_139896010_139896190_139896311_139896391_139941722_139941869_139943027_139943085_139945462_139945572_139946236
tx.20727	chrX	+	2536	5	FSM	ENSMUSG00000042271.14	ENSMUST00000112916.9	2532	5	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	188	junction_1	39.4865483424419	327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTCTCAAGTCTTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141009761	141022688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_141009928_141011286_141011378_141012519_141012607_141019779_141019925_141020641
tx.20728	chrX	+	2457	4	FSM	ENSMUSG00000042271.14	ENSMUST00000112914.8	2484	4	27	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	263	junction_3	9.93310961716756	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTCTCAAGTCTTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141011199	141022688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_141011378_141012519_141012607_141019779_141019925_141020641
tx.20729	chrX	-	4115	11	ISM	ENSMUSG00000031278.13	ENSMUST00000112907.8	5137	16	44844	0	-17475	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	142	junction_4	18.4380042303933	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTTTGTTTTTTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141128496	141100988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_141103831_141110971_141111130_141111843_141111959_141115187_141115380_141116665_141116741_141121879_141122053_141122945_141123086_141124330_141124403_141126069_141126194_141126302_141126454_141128423
tx.2073	chr10	-	3333	10	FSM	ENSMUSG00000025417.9	ENSMUST00000013970.9	3307	10	-30	4	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_3	43.7148447820759	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATTCACAGAAGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127047454	127032939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_127035014_127035181_127035286_127035457_127035726_127036052_127036167_127036708_127036748_127036907_127037055_127041543_127041688_127042482_127042580_127044738_127044837_127047206
tx.20730	chrX	-	5287	16	FSM	ENSMUSG00000031278.13	ENSMUST00000033634.5	5280	16	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_14	18.9168942717585	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGTTTGTTTTTTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141173538	141100988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_141103831_141110971_141111130_141111843_141111959_141115187_141115380_141116665_141116741_141121879_141122053_141122945_141123086_141124330_141124403_141126069_141126194_141126302_141126454_141128423_141128563_141131997_141132108_141133955_141134134_141134374_141134905_141143382_141143433_141173300
tx.20731	chrX	+	675	6	ISM	ENSMUSG00000047045.18	ENSMUST00000112889.8	1742	7	-8	9091	-8	-3835	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	22.0599184042009	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTTTTTGTTTTAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141464393	141617399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_141464553_141535035_141535086_141553962_141554030_141588985_141589065_141615496_141615598_141617180
tx.20732	chrX	+	1316	7	FSM	ENSMUSG00000047045.18	ENSMUST00000087333.9	5149	7	-3	3836	0	-3836	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	37.6592913133296	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGTTTTTGTTTTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141464410	141617398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_141464553_141465286_141465946_141535035_141535086_141553962_141554030_141588985_141589065_141615496_141615598_141617180
tx.20733	chrX	-	3554	13	FSM	ENSMUSG00000067276.6	ENSMUST00000087316.6	3561	13	2	5	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	5.06348584365444	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACCAGTCTTGACTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142610408	142585231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_142586823_142587352_142587490_142587670_142587793_142588390_142588594_142588758_142588882_142590241_142590429_142590522_142590601_142590836_142591031_142591613_142591807_142592290_142592500_142593840_142593973_142603291_142603473_142610204
tx.20734	chrX	+	605	5	FSM	ENSMUSG00000041718.17	ENSMUST00000144185.5	476	5	0	-129	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	353.473478495912	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTAAGTCCAGTTCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143101018	143107146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_143101118_143102998_143103058_143105007_143105147_143106350_143106524_143107011
tx.20735	chrX	+	1158	4	FSM	ENSMUSG00000041718.17	ENSMUST00000070801.11	1802	4	211	433	-3	-433	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_3	294.754511792818	251	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGAACTTGTGATCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143101010	143107760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_143101118_143102894_143103058_143105007_143105147_143107011
tx.20736	chrX	+	501	4	FSM	ENSMUSG00000041718.17	ENSMUST00000149330.8	479	4	17	-39	2	39	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_3	280.483313031077	786	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTATAAACCCATATATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143101015	143107212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_143101118_143102998_143103058_143105007_143105147_143107011
tx.20737	chrX	+	438	3	ISM	ENSMUSG00000041718.17	ENSMUST00000144185.5	476	5	-2	1732	-2	-1732	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	607	junction_1	91.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTCATTTGTTGCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143101016	143105285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_143101118_143102998_143103058_143105007
tx.20739	chrX	+	2044	7	FSM	ENSMUSG00000095872.8	ENSMUST00000178833.2	1350	7	-93	-601	-93	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	6.15539510420646	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTGTTTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146572630	146616452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_146572740_146589721_146589848_146590566_146590647_146594315_146595275_146608125_146608208_146609013_146609064_146615814
tx.2074	chr10	-	1937	4	ISM	ENSMUSG00000025417.9	ENSMUST00000013970.9	3307	10	-42	7270	-12	14	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	368	junction_1	18.0185090023194	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAGATAAATGAAGGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127047466	127040205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_127041688_127042482_127042580_127044738_127044837_127047206
tx.20740	chrX	+	2065	7	FSM	ENSMUSG00000079387.11	ENSMUST00000163338.2	2025	7	-40	0	-40	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	4.85626742811116	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTTTTTGTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147665531	147707135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_147665664_147686432_147686559_147687278_147687359_147690981_147691941_147698819_147698902_147699707_147699758_147706499
tx.20741	chrX	+	2045	7	FSM	ENSMUSG00000095621.2	ENSMUST00000178169.2	2028	7	-17	0	-17	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	6.67707520800338	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTTTTGTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148230595	148270780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_148230705_148247706_148247833_148248551_148248632_148252302_148253262_148262449_148262532_148263337_148263388_148270141
tx.20742	chrX	+	2045	7	FSM	ENSMUSG00000094885.8	ENSMUST00000177554.2	2028	7	-17	0	-17	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	5.58022301426107	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTTTTGTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147880930	147921148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_147881040_147898081_147898208_147898926_147899007_147902668_147903628_147912815_147912898_147913703_147913754_147920509
tx.20743	chrX	+	1086	6	NNC	ENSMUSG00000072929.7	novel	2026	7	NA	NA	23647	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	5.76194411635517	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTTTTGTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147097508	147137726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_147097618_147114647_147114774_147115492_147115573_147129389_147129472_147130277_147130328_147137087
tx.20744	chrX	+	1997	7	FSM	ENSMUSG00000072923.7	ENSMUST00000101181.5	1977	7	-20	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.06622805119022	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTTTTTGTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148377545	148419760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_148377658_148394767_148394894_148395612_148395693_148399354_148400266_148411437_148411520_148412325_148412376_148419124
tx.20745	chrX	+	2046	7	FSM	ENSMUSG00000094378.8	ENSMUST00000101180.8	2029	7	-17	0	-17	0	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_6	4.6785562825394	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTTTTTTGTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148567451	148609690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_148567561_148582582_148582709_148583428_148583509_148587159_148588119_148601122_148601205_148602010_148602061_148609050
tx.20746	chrX	+	1044	2	Intergenic	novelGene_1411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGTGTAGCCACTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148930343	148931511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_148930725_148930848
tx.20747	chrX	+	1049	3	Intergenic	novelGene_1412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	7.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGTGTTTTAGTCTCCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148930486	148935556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_148930725_148930848_148930931_148934827
tx.20748	chrX	-	871	3	FSM	ENSMUSG00000041353.13	ENSMUST00000148968.8	1316	3	3	442	-1	86	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_2	83.5	355	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTGTGGTTTTCCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149242147	149192015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_149192597_149203337_149203438_149241957
tx.20749	chrX	-	475	3	NNC	ENSMUSG00000041353.13	novel	1316	3	NA	NA	-1	-139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	131	530	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTGGCTTTTGTTTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149242147	149192305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_149192597_149203337_149203438_149242063
tx.2075	chr10	+	875	4	NNC	ENSMUSG00000025408.16	novel	890	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	321.555593949165	1960	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTCACTTTTTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127126661	127132157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_127126765_127129580_127129629_127131189_127131348_127131591
tx.20750	chrX	-	1879	6	FSM	ENSMUSG00000025269.17	ENSMUST00000026303.16	1884	6	6	-1	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	8.28009661779378	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCATGTTGAGTGGATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149371139	149354502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_149355679_149367460_149367531_149368196_149368344_149368860_149369042_149370038_149370123_149370918
tx.20751	chrX	+	2061	16	NIC	ENSMUSG00000025271.14	novel	1739	14	NA	NA	-10	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_2	17.6227126175286	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTCTTTCATTGTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149371241	149426874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_149371339_149371940_149372041_149372791_149373081_149391581_149391708_149394001_149394096_149395908_149395976_149396872_149396948_149403764_149403822_149405077_149405200_149408152_149408361_149411735_149411883_149417518_149417624_149422576_149422707_149424910_149424974_149426164_149426230_149426558
tx.20752	chrX	+	1974	16	NNC	ENSMUSG00000025271.14	novel	1739	14	NA	NA	-9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_1	17.7330827049958	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTCTTTCATTGTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149371242	149426874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_149371410_149371940_149372041_149372948_149373081_149391581_149391708_149394001_149394096_149395908_149395976_149396872_149396948_149403764_149403822_149405077_149405200_149408152_149408361_149411735_149411883_149417518_149417624_149422576_149422707_149424910_149424974_149426164_149426230_149426558
tx.20753	chrX	+	1904	16	NIC	ENSMUSG00000025271.14	novel	1739	14	NA	NA	-10	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	50	junction_2	10.2058806577385	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTCTTTCATTGTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149371241	149426874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_149371339_149371940_149372041_149372948_149373081_149391581_149391708_149394001_149394096_149395908_149395976_149396872_149396948_149403764_149403822_149405077_149405200_149408152_149408361_149411735_149411883_149417518_149417624_149422576_149422707_149424910_149424974_149426164_149426230_149426558
tx.20754	chrX	-	363	2	ISM	ENSMUSG00000025268.16	ENSMUST00000145342.8	2572	11	6031	0	5524	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTATTGCCATTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149589933	149589416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_149589552_149589705
tx.20755	chrX	-	2163	13	NIC	ENSMUSG00000025268.16	novel	2107	13	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	35	junction_12	45.1259810604342	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTATTGCCATTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149595964	149589416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_149589552_149589705_149590178_149590567_149590683_149591716_149591780_149592105_149592149_149592242_149592323_149592698_149592794_149593339_149593420_149593676_149593741_149593869_149594179_149594818_149595311_149595666_149595734_149595816
tx.20756	chrX	-	2236	12	ISM	ENSMUSG00000025268.16	ENSMUST00000112700.8	2107	13	749	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	154	junction_9	18.0545546095372	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTATTGCCATTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149595954	149589416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_149589552_149589705_149590178_149590567_149590683_149591716_149591780_149592105_149592149_149592242_149592323_149592698_149592794_149593339_149593420_149593676_149593741_149593869_149594179_149594818_149595311_149595666
tx.20757	chrX	-	2094	13	FSM	ENSMUSG00000025268.16	ENSMUST00000112700.8	2107	13	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_12	38.0929965858409	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTATTGCCATTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149596690	149589416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_149589552_149589705_149590178_149590567_149590683_149591716_149591780_149592105_149592149_149592242_149592323_149592698_149592794_149593339_149593420_149593676_149593741_149593869_149594179_149594818_149595311_149595666_149595734_149596611
tx.20758	chrX	+	854	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025266.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGATACATTAGAGTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149766136	149767149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_149766741_149766899
tx.20759	chrX	-	2584	16	FSM	ENSMUSG00000025266.12	ENSMUST00000112691.9	4869	16	17	2268	17	-2268	multi-exon	FALSE	canonical	3	473	junction_8	38.4461528201024	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTGAACAATAAAACAACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149800301	149768404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_149769183_149770834_149771058_149774131_149774260_149776644_149776782_149777006_149777150_149777243_149777419_149778006_149778095_149780181_149780327_149782692_149782800_149783598_149783735_149784033_149784118_149785169_149785287_149786529_149786638_149787240_149787282_149797016_149797086_149800196
tx.2076	chr10	-	2826	21	FSM	ENSMUSG00000040354.15	ENSMUST00000037290.12	2939	21	108	5	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1393	junction_15	206.401332360041	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGAGCCCTCTCCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127147547	127132094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_127132310_127132409_127132503_127132741_127132814_127133334_127133522_127133603_127133709_127133790_127133923_127135116_127135331_127135817_127135936_127136046_127136143_127136278_127136450_127138680_127138756_127140053_127140256_127141290_127141495_127141609_127141727_127144126_127144234_127144369_127144549_127144776_127144853_127145872_127146008_127146088_127146168_127146312_127146404_127147389
tx.20760	chrX	+	1667	12	ISM	ENSMUSG00000025265.15	ENSMUST00000026296.8	4001	18	25085	410	4872	-410	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	366	junction_4	32.9249083032415	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATGTTAATTTTTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149855250	149872107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_149855326_149855429_149855569_149861954_149862014_149862153_149862301_149862874_149862968_149863112_149863193_149868626_149868658_149869109_149869212_149869515_149869642_149869815_149869978_149870963_149871108_149871598
tx.20761	chrX	+	1043	2	ISM	ENSMUSG00000025265.15	ENSMUST00000026296.8	4001	18	40824	-6	1884	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	453	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCACTGCTATGGTCCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149870989	149872523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_149871108_149871598
tx.20762	chrX	-	1386	5	FSM	ENSMUSG00000025264.13	ENSMUST00000112683.9	3796	5	23	2387	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	302	junction_1	26.3201443765037	1388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTATCCATTGTCCTCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149879516	149872476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_149873411_149873600_149873778_149874671_149874764_149879160_149879252_149879424
tx.20763	chrX	-	1295	4	FSM	ENSMUSG00000025264.13	ENSMUST00000166010.2	1318	4	23	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_3	140.42158745087	243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTATCCATTGTCCTCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149879516	149872476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_149873411_149873600_149873778_149874671_149874764_149879424
tx.20765	chrX	+	603	2	NNC	ENSMUSG00000041245.14	novel	609	4	NA	NA	3139	-10975	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGGAGATTTTTTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149993884	149998685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_149993922_149998119
tx.20766	chrX	-	596	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083596.5	novel	483	1	NA	NA	-3989	42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCCCAGAGACAAATATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150002634	149998120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_149998687_150002604
tx.20767	chrX	-	582	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083596.5	novel	483	1	NA	NA	-3993	42	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCCCAGAGACAAATATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150002638	149998120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_149998669_150002604
tx.20768	chrX	-	688	5	NNC	ENSMUSG00000084771.9	novel	641	5	NA	NA	-13675	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.3166247903554	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTATCTTCTTGTCCTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150108077	150076213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_150076491_150076760_150076884_150078466_150078569_150094333_150094403_150107960
tx.20769	chrX	-	624	4	NNC	ENSMUSG00000084771.9	novel	676	4	NA	NA	-13676	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1.88561808316413	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTGTCCTCCTAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150108078	150076209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_150076491_150076760_150076884_150078466_150078569_150107960
tx.2077	chr10	+	1441	11	ISM	ENSMUSG00000040345.11	ENSMUST00000069548.7	1782	15	2313	-3	1746	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_5	5.18169856321265	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACATAGACTAAATACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127161937	127165815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_127162011_127162200_127162297_127162421_127162521_127162741_127162884_127162963_127163075_127163506_127163606_127163767_127163846_127163962_127164017_127164258_127164394_127164746_127164853_127165367
tx.20770	chrX	-	514	2	NNC	ENSMUSG00000084771.9	novel	3292	3	NA	NA	-13678	-1415	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCTTTTCTCAGCCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150108080	150097743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_150098138_150107960
tx.20772	chrX	+	725	3	ISM	ENSMUSG00000025261.19	ENSMUST00000131786.8	2627	19	-10	53471	10	215	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_1	5.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGTGCATGATTTTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150586332	150590071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_150586566_150589267_150589404_150589715
tx.20773	chrX	+	1071	6	ISM	ENSMUSG00000025261.19	ENSMUST00000112622.8	14168	81	94854	912	5844	-912	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	567	junction_3	37.6063824370279	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGTGTGTCCCAGCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150713097	150717501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_150713347_150713459_150713566_150714734_150714853_150715544_150715727_150715935_150716127_150717276
tx.20774	chrX	+	923	6	FSM	ENSMUSG00000025260.11	ENSMUST00000026289.10	962	6	39	0	39	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1359	junction_1	187.651165730459	8444	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGTGTGCAGTCTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150784879	150787438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_150784931_150785273_150785439_150786356_150786522_150786648_150786778_150786857_150786967_150787134
tx.20775	chrX	+	874	5	FSM	ENSMUSG00000025260.11	ENSMUST00000151200.8	1001	5	127	0	127	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1649	junction_4	99.7180399927716	1598	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGTGTGCAGTCTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150785271	150787438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_150785439_150786356_150786522_150786648_150786778_150786857_150786967_150787134
tx.20776	chrX	-	1173	5	ISM	ENSMUSG00000025257.6	ENSMUST00000026288.5	1508	8	8466	-2	8441	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_2	14.4460202131937	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGTGTCGTAAGAGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150790825	150787575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_150787807_150787914_150788310_150788734_150788854_150790211_150790557_150790742
tx.20777	chrX	-	1502	8	FSM	ENSMUSG00000025257.6	ENSMUST00000026288.5	1508	8	8	-2	8	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_7	14.6816559150582	219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGTGTCGTAAGAGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150799283	150787575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_150787807_150787914_150788310_150788734_150788854_150790211_150790557_150790742_150790825_150792520_150792638_150798776_150798865_150799158
tx.20778	chrX	+	964	3	FSM	ENSMUSG00000041115.17	ENSMUST00000146835.8	959	3	-3	-2	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGTCTGATGTATGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150961956	150977599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_150962087_150963992_150964089_150976861
tx.20779	chrX	+	827	2	FSM	ENSMUSG00000041115.17	ENSMUST00000128724.8	863	2	38	-2	38	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGTCTGATGTATGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150961997	150977599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_150962087_150976861
tx.2078	chr10	+	1491	11	NNC	ENSMUSG00000040345.11	novel	1782	15	NA	NA	1796	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	20.5951450589696	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACATAGACTAAATACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127161987	127165815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_127162111_127162200_127162297_127162421_127162521_127162741_127162884_127162963_127163075_127163506_127163606_127163767_127163846_127163962_127164017_127164258_127164394_127164746_127164853_127165367
tx.20780	chrX	-	747	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041115.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTAATCTCAGGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150992093	150990232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_150990586_150991699
tx.20781	chrX	+	783	4	ISM	ENSMUSG00000025332.15	ENSMUST00000154938.2	1872	7	-11	6612	-11	-6612	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	508	junction_2	11.8977121983832	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTATGAACGCATTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151016238	151023135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_151016707_151020628_151020707_151022625_151022749_151023021
tx.20782	chrX	-	3037	2	ISM	ENSMUSG00000087403.10	ENSMUST00000195280.3	4212	3	254	1091	222	-1091	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCAACTGCCCATATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151110237	151078914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_151081871_151110156
tx.20783	chrX	-	2772	3	FSM	ENSMUSG00000087403.10	ENSMUST00000148326.8	584	3	3	-2191	3	-1481	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_1	13.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCTTATGGCATTATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151110488	151079304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_151081871_151110156_151110236_151110361
tx.20784	chrX	-	313	2	NIC	ENSMUSG00000087403.10	novel	367	4	NA	NA	222	28	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAAAAACAACAAAAGCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151110237	151098183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_151098416_151110156
tx.20785	chrX	-	481	4	FSM	ENSMUSG00000087403.10	ENSMUST00000141922.8	367	4	0	-114	0	18	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	33.5360502544153	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAACAAAAAACAAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151110466	151098193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_151098416_151103205_151103281_151110156_151110236_151110361
tx.20786	chrX	-	1379	2	ISM	ENSMUSG00000041096.14	ENSMUST00000044509.7	2696	7	3033	0	2409	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCTCTTGGAGTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151122388	151119850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_151120562_151121720
tx.20787	chrX	-	2703	7	FSM	ENSMUSG00000041096.14	ENSMUST00000044509.7	2696	7	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_2	16.4189930669738	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCTCTTGGAGTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151125428	151119850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_151120562_151121720_151122389_151122628_151122724_151122857_151123004_151123081_151123194_151123298_151123377_151124535
tx.20788	chrX	-	2700	7	NIC	ENSMUSG00000041096.14	novel	2696	7	NA	NA	-1	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	44	junction_2	53.7339123211155	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCCTCTTGGAGTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151125422	151119850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_151120562_151121720_151122392_151122628_151122724_151122857_151123004_151123081_151123194_151123298_151123377_151124535
tx.20789	chrX	-	1038	3	FSM	ENSMUSG00000056679.14	ENSMUST00000137840.2	998	3	-40	0	-40	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCTGTGTTTATAGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151151740	151150011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_151150266_151150416_151150507_151151046
tx.2079	chr10	+	1369	10	ISM	ENSMUSG00000040345.11	ENSMUST00000069548.7	1782	15	2575	-3	2008	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_4	5.45916377623922	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACATAGACTAAATACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127162199	127165815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_127162297_127162421_127162521_127162741_127162884_127162963_127163075_127163506_127163606_127163767_127163846_127163962_127164017_127164258_127164394_127164746_127164853_127165367
tx.20790	chrX	+	1631	8	NIC	ENSMUSG00000025333.11	novel	1586	9	NA	NA	-70	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.8456146173787	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCATTTTGACATGGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151564846	151591647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_151565289_151568038_151568149_151573479_151573573_151576324_151576435_151578551_151578661_151580695_151580814_151581373_151581612_151591236
tx.20791	chrX	+	1705	9	FSM	ENSMUSG00000025333.11	ENSMUST00000026383.4	1586	9	-110	-9	-45	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_8	3.91910385164772	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTGACATGGATTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151564871	151591651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_151565289_151568038_151568149_151569121_151569217_151573479_151573573_151576324_151576435_151578551_151578661_151580695_151580814_151581373_151581612_151591236
tx.20792	chrX	+	836	4	ISM	ENSMUSG00000025333.11	ENSMUST00000026383.4	1586	9	13615	-10	13583	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_3	1.63299316185545	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGACATGGATTCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151578596	151591652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_151578661_151580695_151580814_151581373_151581612_151591236
tx.20793	chrX	-	483	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000095597.3	novel	651	1	NA	NA	0	11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151693151	151692489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_151692788_151692966
tx.20795	chrX	+	2210	11	NNC	ENSMUSG00000041658.13	novel	2258	11	NA	NA	-10	18258	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_10	82.4209318073995	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTGAATGAGTCATCTGT	3166	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151922966	151973197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_151923572_151924359_151924394_151926971_151927072_151931447_151931532_151933357_151933425_151936126_151936350_151941190_151941287_151943397_151943521_151946073_151946166_151953182_151953299_151972527
tx.20796	chrX	+	2256	11	FSM	ENSMUSG00000041658.13	ENSMUST00000039720.11	2258	11	0	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	216	junction_4	30.0765689532566	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCCAGTGTCTGTGTTTC	3176	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151922976	151954937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_151923572_151924359_151924394_151926971_151927072_151931447_151931532_151933357_151933425_151936126_151936350_151941190_151941287_151943397_151943521_151946073_151946166_151953182_151953299_151954211
tx.20797	chrX	+	624	4	NNC	ENSMUSG00000041649.14	novel	247	3	NA	NA	5	-116788	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	4.32049379893857	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTTTCATCTGTCATTC	3990	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152020466	152037111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_152020508_152020946_152021089_152035141_152035302_152036830
tx.20798	chrX	+	585	3	NNC	ENSMUSG00000041649.14	novel	4752	7	NA	NA	201	-116788	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	1	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTTTCATCTGTCATTC	4468	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152020944	152037111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_152021089_152035141_152035302_152036830
tx.20799	chrX	+	889	2	NNC	ENSMUSG00000041649.14	novel	4752	7	NA	NA	19	-116788	intron_retention	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTTTCATCTGTCATTC	4004	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152020480	152037111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_152021089_152036830
tx.208	chr1	+	1805	13	ISM	ENSMUSG00000025995.17	ENSMUST00000027139.15	2953	21	16892	0	-2620	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	558	junction_4	47.1757941698447	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTAAAGCCTTGTGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45851217	45862779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_45851360_45852204_45852265_45852349_45852466_45853700_45853877_45855636_45855795_45856422_45856604_45857329_45857425_45857981_45858078_45858648_45858819_45859290_45859351_45861607_45861755_45862042_45862135_45862467
tx.2080	chr10	+	645	3	ISM	ENSMUSG00000040345.11	ENSMUST00000069548.7	1782	15	4678	-3	4111	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_2	4.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACATAGACTAAATACAG	759	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127164302	127165815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_127164394_127164746_127164853_127165367
tx.20800	chrX	+	666	2	FSM	ENSMUSG00000048573.10	ENSMUST00000056754.4	666	2	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCACTCTGTCTCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152341588	152342425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_152341879_152342049
tx.20801	chrX	+	725	3	FSM	ENSMUSG00000086316.9	ENSMUST00000185492.7	1346	3	-3	624	-3	32	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_2	49	437	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTTAGAGCTATACGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152506602	152524292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_152506934_152508700_152508838_152524035
tx.20802	chrX	+	1409	3	FSM	ENSMUSG00000086316.9	ENSMUST00000149514.8	775	3	-23	-611	-6	611	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_1	3	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGATAAACTGTCTAAATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152506599	152512795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_152506934_152508700_152508838_152511857
tx.20803	chrX	+	803	4	FSM	ENSMUSG00000086316.9	ENSMUST00000140575.8	788	4	17	-32	-3	32	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_3	8.37987005998436	883	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTTAGAGCTATACGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152506602	152524292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_152506934_152508700_152508838_152511857_152511936_152524035
tx.20804	chrX	+	1328	2	FSM	ENSMUSG00000046550.9	ENSMUST00000049999.9	1309	2	-21	2	-21	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAGTCATCTAAAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152615267	152617237	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_152615545_152616186
tx.20805	chrX	-	1104	3	NNC	ENSMUSG00000072100.5	novel	1079	2	NA	NA	-23373	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTGTCAGAGTATATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153696636	153669797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_153670743_153694959_153695062_153696579
tx.20806	chrX	-	1755	5	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094196.3	novel	963	1	NA	NA	-9507	377	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	4.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTTAATCTCTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153742008	153731161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_153732567_153733511_153733601_153740339_153740441_153741158_153741264_153741953
tx.20807	chrX	-	1764	5	NNC	ENSMUSG00000079350.3	novel	1646	4	NA	NA	-9	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_3	13.4233937586588	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTAGTTTCTTGTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153778855	153768765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_153770173_153771107_153771197_153777179_153777280_153777995_153778100_153778791
tx.20808	chrX	-	1660	4	FSM	ENSMUSG00000079350.3	ENSMUST00000070141.7	1646	4	-9	-5	-9	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_3	17.6823829464998	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTAGTTTCTTGTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153778855	153768765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_153770173_153771107_153771197_153777179_153777280_153778791
tx.20809	chrX	-	1721	4	NNC	ENSMUSG00000055746.10	novel	1685	4	NA	NA	-16	23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	14.613540144522	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCACTGGTGCCCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153816304	153810173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_153811648_153812583_153812673_153814604_153814707_153816248
tx.2081	chr10	+	1855	8	ISM	ENSMUSG00000025404.16	ENSMUST00000169888.8	2906	15	25434	11	-362	5	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	211	junction_1	12.5860304808667	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGGCCATCAGTCGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127320797	127335241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_127320892_127321284_127321440_127323643_127323745_127328437_127328608_127330889_127331038_127333030_127333129_127333409_127333495_127334237
tx.20810	chrX	-	1607	3	NIC	ENSMUSG00000055746.10	novel	1685	4	NA	NA	-24	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	5	junction_2	13	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGCATTTGTAACACTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153816312	153810193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_153811648_153812583_153812673_153816248
tx.20811	chrX	-	1759	5	NNC	ENSMUSG00000079349.10	novel	1360	4	NA	NA	-8	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_3	19.2272592950738	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTTAGTTTCTTTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153846149	153836053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_153837456_153838390_153838480_153844474_153844576_153845292_153845397_153846086
tx.20812	chrX	+	1979	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082560.2	novel	702	1	NA	NA	-1032	1089	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAACTTGCCAGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153967642	153970465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_153967813_153968656
tx.20813	chrX	-	1097	6	FSM	ENSMUSG00000025283.16	ENSMUST00000026318.15	1162	6	59	6	-45	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1003	junction_1	103.839106313566	4863	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCAGCCTGAGCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153999386	153996133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_153996664_153996892_153996934_153997028_153997131_153998596_153998681_153998780_153998833_153999098
tx.20814	chrX	+	1694	15	FSM	ENSMUSG00000025287.16	ENSMUST00000026324.10	1752	15	52	6	-10	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	666	junction_2	111.349262068796	2941	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACGATTGTGAGTCTCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154045490	154080644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_154045671_154052654_154052750_154054947_154054994_154055967_154056139_154056387_154056426_154064606_154064691_154065046_154065151_154069284_154069362_154076904_154076973_154078158_154078271_154078417_154078509_154078678_154078765_154079320_154079409_154079576_154079728_154080341
tx.20815	chrX	-	973	7	FSM	ENSMUSG00000025289.16	ENSMUST00000026328.11	990	7	17	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	951	junction_2	71.6488349909163	3911	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGTTTGCCATTGTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154121446	154106913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_154107025_154109590_154109626_154111441_154111573_154113298_154113422_154115351_154115469_154117833_154117952_154121108
tx.20816	chrX	-	374	3	ISM	ENSMUSG00000071708.12	ENSMUST00000127089.2	3053	6	-19	7524	3	-534	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	430	junction_1	30.5	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGTTTTTTTTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156275059	156249393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_156249488_156252983_156253105_156274900
tx.20817	chrX	-	2491	10	NIC	ENSMUSG00000046873.19	novel	4797	11	NA	NA	7	-2114	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	97	junction_9	42.882267767562	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGCTTGTGATGTGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156381668	156332933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_156334147_156335911_156335988_156337878_156338075_156338592_156338688_156341880_156342062_156344378_156344498_156355854_156355983_156359079_156359184_156374349_156374552_156381491
tx.20818	chrX	-	812	3	FSM	ENSMUSG00000046873.19	ENSMUST00000152826.3	796	3	-31	15	5	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_1	4	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156381670	156374067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_156374552_156376720_156376870_156381491
tx.20819	chrX	+	2891	24	NNC	ENSMUSG00000031309.16	novel	755	2	NA	NA	-115	298	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.4676460017611	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGGATTAACAGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158038662	158147034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_158038716_158061105_158061200_158062162_158062200_158068261_158068319_158094459_158094577_158100916_158100999_158109836_158109918_158110767_158110848_158111366_158111474_158113553_158113592_158113782_158113926_158115146_158115218_158119690_158119780_158119958_158120024_158120181_158120285_158120913_158121039_158125580_158125707_158128335_158128426_158130011_158130171_158132247_158132410_158134359_158134437_158135311_158135430_158145637_158145779_158146358
tx.2082	chr10	+	934	4	FSM	ENSMUSG00000040280.11	ENSMUST00000035735.11	934	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_1	3.29983164553722	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCTGCGCCTGCTAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127350835	127353023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_127350908_127351267_127351357_127352133_127352195_127352311
tx.20820	chrX	+	925	7	FSM	ENSMUSG00000067194.7	ENSMUST00000087143.7	5172	7	23	4224	23	-4224	multi-exon	FALSE	canonical	3	2276	junction_6	179.511064344854	2173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGACTAAGCCCTGCCTT	5370	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158155196	158168700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_158155412_158159376_158159461_158160454_158160559_158161534_158161586_158162725_158162808_158165683_158165776_158168403
tx.20821	chrX	+	442	3	ISM	ENSMUSG00000067194.7	ENSMUST00000087143.7	5172	7	7581	4224	7581	-4224	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2276	junction_2	97.5	1201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGACTAAGCCCTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158162754	158168700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_158162808_158165683_158165776_158168403
tx.20822	chrX	+	1509	10	NNC	ENSMUSG00000041020.15	novel	3670	17	NA	NA	164	-1295	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	51.7124050833663	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGATTGAAAAACAGGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158197731	158272479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_158197889_158226918_158226997_158228930_158229095_158242373_158242480_158245109_158245225_158252958_158253090_158255820_158255946_158265073_158265373_158265955_158266083_158272272
tx.20823	chrX	+	275	2	ISM	ENSMUSG00000041020.15	ENSMUST00000043151.12	3087	13	23892	9102	23880	-1297	internal_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCATGATTGAAAAACAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158266012	158272477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_158266083_158272272
tx.20824	chrX	+	3957	8	ISM	ENSMUSG00000044150.13	ENSMUST00000057180.13	2513	11	-27	30451	24	10054	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	421	junction_5	81.1237402027902	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATAAATAGTGCTGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158315687	158344939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_158315832_158331234_158331312_158334746_158335371_158336239_158336891_158338470_158338647_158340438_158340554_158341330_158341395_158342833
tx.20825	chrX	+	3344	12	FSM	ENSMUSG00000044150.13	ENSMUST00000112464.8	3366	12	14	8	14	-8	multi-exon	TRUE	canonical	3	339	junction_9	109.675027103931	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGCAGTTGGTGAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158315677	158376069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_158315832_158331234_158331312_158334746_158335371_158336239_158336891_158338470_158338647_158340438_158340554_158341330_158341395_158342833_158342950_158349423_158349539_158350914_158351011_158357940_158358094_158375066
tx.20826	chrX	+	3360	13	NNC	ENSMUSG00000044150.13	novel	3366	12	NA	NA	24	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	151	junction_11	167.554634539172	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTGGCAGTTGGTGAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158315687	158376069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_158315832_158331234_158331312_158334746_158335371_158336239_158336891_158338470_158338647_158340438_158340554_158341330_158341395_158342833_158342950_158349423_158349539_158350914_158351011_158357940_158358094_158374327_158374354_158375066
tx.20828	chrX	+	1368	4	ISM	ENSMUSG00000044150.13	ENSMUST00000057180.13	2513	11	-44	38645	7	1860	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	487	junction_1	64.3238334954903	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGTAAAGAAGATTGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158315670	158336745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_158315832_158331234_158331312_158334746_158335371_158336239
tx.20829	chrX	-	2829	11	NNC	ENSMUSG00000031299.11	novel	2848	11	NA	NA	12	-11	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_5	435.563129752737	373	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTACTTTTACAGTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158921397	158905215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_158906944_158907514_158907624_158909189_158909258_158910286_158910359_158910568_158910725_158911456_158911554_158912405_158912498_158913104_158913232_158915064_158915239_158916168_158916229_158921251
tx.2083	chr10	-	2068	12	FSM	ENSMUSG00000025403.6	ENSMUST00000026470.6	2289	12	43	178	0	-178	multi-exon	FALSE	canonical	3	1501	junction_11	177.272820512796	2348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGTTCCTATTACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127358270	127353185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_127353786_127353893_127354002_127354093_127354250_127354339_127354440_127354660_127354827_127354989_127355130_127355257_127355381_127355498_127355581_127355839_127356041_127356206_127356287_127356786_127356985_127358156
tx.20831	chrX	+	957	9	ISM	ENSMUSG00000031295.14	ENSMUST00000033652.9	4133	33	75621	0	20268	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_2	14.2297004536287	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCATTTGTAGACTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	159361050	159374137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_159361074_159361588_159361691_159364156_159364276_159365962_159365993_159367459_159367514_159369774_159369946_159371960_159372015_159373163_159373365_159373934
tx.20834	chrX	+	1947	12	FSM	ENSMUSG00000031353.14	ENSMUST00000033720.12	2244	12	0	297	0	39	multi-exon	FALSE	canonical	3	2711	junction_3	173.446540695797	2468	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGTTTTGTTCTTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161543397	161561791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_161543704_161544570_161544716_161551847_161551994_161552759_161552934_161554048_161554165_161555200_161555362_161556191_161556319_161556436_161556515_161557548_161557626_161558731_161558790_161560767_161560879_161561343
tx.20835	chrX	+	1622	11	ISM	ENSMUSG00000031353.14	ENSMUST00000033720.12	2244	12	1192	297	528	39	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2711	junction_2	181.912176612782	1613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGTTTTGTTCTTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161544589	161561791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_161544716_161551847_161551994_161552759_161552934_161554048_161554165_161555200_161555362_161556191_161556319_161556436_161556515_161557548_161557626_161558731_161558790_161560767_161560879_161561343
tx.20836	chrX	-	3776	10	FSM	ENSMUSG00000038344.15	ENSMUST00000041370.11	3862	10	88	-2	88	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_4	53.4535681747934	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTTCTGTGTATTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161612362	161561912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_161564415_161565224_161565321_161567317_161567411_161569612_161569688_161570554_161570675_161573607_161573803_161580635_161580807_161590480_161590573_161594287_161594592_161612234
tx.20837	chrX	-	3626	11	FSM	ENSMUSG00000038344.15	ENSMUST00000112316.9	3715	11	87	2	87	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_9	58.6501491899211	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACAGCTTCTGTGTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161612363	161561916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_161564415_161565224_161565321_161567317_161567411_161569612_161569688_161570554_161570675_161573607_161573803_161580635_161580807_161590480_161590573_161594287_161594385_161594531_161594592_161612234
tx.20838	chrX	-	2565	6	FSM	ENSMUSG00000038344.15	ENSMUST00000112315.2	2525	6	87	-127	87	126	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_4	64.8382603097893	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTTCTTTGTTGGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161612363	161571786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_161573803_161580635_161580807_161590480_161590573_161594287_161594385_161594531_161594592_161612234
tx.20839	chrX	-	2733	5	ISM	ENSMUSG00000038344.15	ENSMUST00000041370.11	3862	10	66	9872	66	126	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_2	21.2132034355964	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTTCTTTGTTGGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161612384	161571786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_161573803_161580635_161580807_161590480_161590573_161594287_161594592_161612234
tx.2084	chr10	-	895	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000002147.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCTGTAAATTCTATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127489241	127484126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_127484385_127485942_127486154_127488815
tx.20840	chrX	-	2281	9	FSM	ENSMUSG00000031357.4	ENSMUST00000033723.4	2087	9	15	-209	15	209	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_1	15.2105021284637	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAATTGTACGTATTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161671428	161639843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_161641005_161642294_161642443_161642868_161642928_161646055_161646205_161655510_161655651_161661326_161661401_161665675_161665743_161665963_161666083_161671064
tx.20841	chrX	-	1157	3	ISM	ENSMUSG00000031357.4	ENSMUST00000033723.4	2087	9	17	25014	17	-24162	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	127	junction_1	5.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATCAAACACATGTTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161671426	161665066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_161665743_161665963_161666083_161671064
tx.20842	chrX	+	996	4	ISM	ENSMUSG00000031360.15	ENSMUST00000033727.14	3353	19	-30	118827	-3	-7527	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_1	24.1430919496424	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATCCTTCTGCCAGGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161684597	161696677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_161684744_161686429_161686635_161693004_161693176_161696203
tx.20843	chrX	-	385	2	ISM	ENSMUSG00000040808.5	ENSMUST00000038769.3	480	3	390	12	390	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTGAGTCTTGATTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161747205	161744999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_161745237_161747057
tx.20844	chrX	-	427	3	FSM	ENSMUSG00000040808.5	ENSMUST00000038769.3	480	3	30	23	30	-23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTTATCAAGTACTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161747565	161745010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_161745237_161747057_161747202_161747508
tx.20845	chrX	+	3203	5	FSM	ENSMUSG00000031367.16	ENSMUST00000112294.9	3199	5	-4	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_1	15.8192920195564	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTCTCATGTGAATGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162692136	162712542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_162692270_162694324_162694504_162699470_162699580_162700701_162700840_162709898
tx.20846	chrX	+	1820	5	FSM	ENSMUSG00000031367.16	ENSMUST00000033734.14	1785	5	-30	-5	-30	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	61.936963923008	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGTGTGCTTTTCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162692107	162716360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_162692270_162694324_162694504_162699470_162699580_162700701_162700840_162715128
tx.20847	chrX	+	2085	5	NNC	ENSMUSG00000031367.16	novel	3199	5	NA	NA	-1	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_4	59.8351903147303	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCATGTGAATGACTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162692136	162712547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_162692270_162694324_162694504_162699470_162699580_162700701_162700840_162711021
tx.20849	chrX	-	1693	5	FSM	ENSMUSG00000031370.13	ENSMUST00000090840.10	3867	5	-53	2227	10	978	multi-exon	FALSE	canonical	3	635	junction_1	78.6924392810389	564	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGCCTTGAAGATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162741647	162735608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_162736653_162737369_162737479_162739467_162739550_162740911_162740992_162741269
tx.2085	chr10	+	1531	5	ISM	ENSMUSG00000002147.19	ENSMUST00000092074.12	3775	22	15379	-4	-1035	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	216	junction_3	13.3229125944742	914	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCTACTGTACACAATCT	1039	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127494233	127496830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_127494331_127494497_127494570_127495301_127495368_127495457_127495587_127495663
tx.20850	chrX	-	1592	6	FSM	ENSMUSG00000031370.13	ENSMUST00000147928.8	460	6	-108	-1024	1	975	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_5	268.200372855818	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATCTTGCCTTGAAGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162741656	162735611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_162736653_162737369_162737479_162739467_162739550_162740911_162740992_162741269_162741416_162741522
tx.20851	chrX	-	1540	6	NIC	ENSMUSG00000031370.13	novel	460	6	NA	NA	-5	978	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	185	junction_5	227.558695724861	301	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGCCTTGAAGATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162741662	162735608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_162736653_162737369_162737479_162739467_162739550_162740911_162740992_162741269_162741416_162741583
tx.20852	chrX	-	1459	4	FSM	ENSMUSG00000031370.13	ENSMUST00000139166.2	504	4	23	-978	23	978	multi-exon	FALSE	canonical	3	635	junction_1	90.1566537878499	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGCCTTGAAGATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162741135	162735608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_162736653_162737369_162737479_162739467_162739550_162740911
tx.20853	chrX	-	620	4	ISM	ENSMUSG00000031370.13	ENSMUST00000147928.8	460	6	-105	769	4	-769	intron_retention	FALSE	canonical	3	708	junction_2	67.6477806156434	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGGAAGCTCGAAAACGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162741653	162737404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_162737479_162739467_162739550_162740911_162740992_162741269
tx.20854	chrX	-	1223	8	FSM	ENSMUSG00000031373.5	ENSMUST00000033739.5	3436	8	-52	2265	-52	-2265	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	1.92724822331886	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATTTTTTTCTTCCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162811045	162762082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_162762367_162770093_162770250_162771345_162771409_162773420_162773517_162774346_162774466_162783234_162783433_162797798_162797991_162810930
tx.20855	chrX	-	1679	3	ISM	ENSMUSG00000040749.12	ENSMUST00000037928.9	1783	4	451	-2	451	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	523	junction_1	14.5	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGGTTTTTCTCACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162858666	162853698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_162855224_162856285_162856347_162858573
tx.20856	chrX	-	1785	4	FSM	ENSMUSG00000040749.12	ENSMUST00000037928.9	1783	4	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_3	206.108385726216	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGGTTTTTCTCACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162859117	162853698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_162855224_162856285_162856347_162858573_162858666_162859010
tx.20857	chrX	-	1715	4	FSM	ENSMUSG00000040749.12	ENSMUST00000071667.9	1712	4	-1	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	301	junction_3	112.11402925395	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGGTTTTTCTCACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162859147	162853698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_162855224_162856285_162856347_162858573_162858666_162859110
tx.20858	chrX	+	1293	10	FSM	ENSMUSG00000031379.14	ENSMUST00000033749.9	1599	10	101	205	-15	-205	multi-exon	FALSE	canonical	3	253	junction_3	17.8270151493682	488	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTCAGAATGCATTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163052527	163155802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_163052674_163054598_163054728_163063124_163063218_163078910_163078995_163083219_163083427_163113010_163113096_163125469_163125515_163141143_163141227_163152041_163152109_163155448
tx.20859	chrX	+	3568	6	FSM	ENSMUSG00000031381.17	ENSMUST00000033754.15	3594	6	20	6	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_2	38.4052079801685	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTATTTTTGTCTCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163202802	163216906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_163202837_163205579_163206360_163210927_163211061_163211535_163211669_163211806_163212014_163214625
tx.2086	chr10	-	1466	5	ISM	ENSMUSG00000025402.13	ENSMUST00000099157.4	2311	6	2083	-1	932	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_1	18.389874931603	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGGCCCCCTTCCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127500418	127496786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_127497649_127499000_127499134_127499218_127499271_127499608_127499743_127500133
tx.20860	chrX	+	1105	2	ISM	ENSMUSG00000031381.17	ENSMUST00000208741.2	854	6	20	8182	0	-8182	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGAGATGGCTGTGCAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163202802	163206650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_163202837_163205579
tx.20861	chrX	+	3188	6	FSM	ENSMUSG00000031381.17	ENSMUST00000112257.10	3212	6	29	-5	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_2	78.77715404862	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGTCTCAGTTTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163202811	163216912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_163202837_163205579_163205983_163210927_163211061_163211535_163211669_163211806_163212014_163214625
tx.20862	chrX	+	3528	5	ISM	ENSMUSG00000031381.17	ENSMUST00000112255.8	3597	6	2674	10	-1	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_1	42.1337157155644	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATAGTCTTATTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163205578	163216899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_163206360_163210927_163211061_163211535_163211669_163211806_163212014_163214625
tx.20863	chrX	+	1146	6	NNC	ENSMUSG00000031382.15	novel	1445	7	NA	NA	7685	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.74355957741627	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTTTAATTTAGTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163228738	163242166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_163228805_163233450_163233559_163235947_163236046_163237383_163237519_163238792_163238985_163241619
tx.20865	chrX	-	2667	15	FSM	ENSMUSG00000061778.11	ENSMUST00000112247.9	2479	15	-39	-149	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	17.508598470699	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTGTCTCTAATTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163763332	163719164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_163720300_163722638_163722742_163726426_163726557_163727212_163727310_163727968_163728066_163730237_163730351_163731062_163731240_163734846_163734972_163739474_163739514_163741751_163741813_163745047_163745203_163746922_163747010_163747977_163748134_163762989_163763060_163763210
tx.20866	chrX	-	4058	15	FSM	ENSMUSG00000061778.11	ENSMUST00000004715.2	2015	15	-3	-2040	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_12	10.321366781822	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTGTCTCTAATTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163763334	163719164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_163721689_163722638_163722742_163726426_163726557_163727212_163727310_163727968_163728066_163730237_163730351_163731062_163731240_163734846_163734972_163739474_163739514_163741751_163741813_163745047_163745203_163746922_163747010_163747977_163748134_163762989_163763060_163763210
tx.20867	chrX	-	1343	7	FSM	ENSMUSG00000061778.11	ENSMUST00000146813.8	1322	7	-2	-19	-2	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_4	8.95203266799719	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGGTCACTACTGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163763326	163738815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_163739514_163741751_163741813_163745047_163745203_163746922_163747010_163747977_163748134_163762989_163763060_163763210
tx.20868	chrX	+	997	2	ISM	ENSMUSG00000047757.18	ENSMUST00000057150.8	2395	9	-30	13968	-30	-13965	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTCAAAATGGCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163763677	163766300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_163763807_163765432
tx.20869	chrX	+	2863	9	FSM	ENSMUSG00000047757.18	ENSMUST00000167446.8	2953	9	91	-1	-29	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	98	junction_5	7.72981241687015	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTCTTGTTTTCTTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163763678	163780266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_163763807_163765432_163766450_163769555_163769709_163770700_163770794_163774540_163774685_163775726_163775891_163778339_163778768_163778882_163779118_163779765
tx.2087	chr10	-	1663	6	ISM	ENSMUSG00000025402.13	ENSMUST00000026469.9	2582	7	2156	0	927	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_1	9.57914401186244	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGGCCCCCTTCCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127500423	127496786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_127497649_127498599_127498792_127499000_127499134_127499218_127499271_127499608_127499743_127500133
tx.20870	chrX	+	1379	6	NNC	ENSMUSG00000040621.15	novel	1389	5	NA	NA	-29	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	18.6719040271741	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTCCTACATTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164953420	164972818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_164953547_164959840_164959999_164960055_164960076_164961787_164961827_164963348_164963806_164972239
tx.20871	chrX	+	1283	5	FSM	ENSMUSG00000040621.15	ENSMUST00000087169.11	1928	5	-43	688	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	20.8371663140649	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTCCTACATTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164953447	164972818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_164953547_164961529_164961639_164961787_164961827_164963348_164963806_164972239
tx.20872	chrX	-	1257	3	FSM	ENSMUSG00000079316.11	ENSMUST00000112091.9	1447	3	184	6	-37	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	555	junction_2	7.5	1152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTACGTTGCAATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165262679	165240254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_165241340_165245310_165245339_165262535
tx.20873	chrX	-	4036	5	FSM	ENSMUSG00000051224.14	ENSMUST00000112188.8	4050	5	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_2	3.35410196624968	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTTATTCTCCAATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165293460	165282807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_165286402_165288701_165288833_165290704_165290743_165291901_165292003_165293288
tx.20874	chrX	-	2708	12	FSM	ENSMUSG00000000402.3	ENSMUST00000000412.3	2704	12	-5	1	-5	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_6	3.09892009982897	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACTGTTGAAACACTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165368721	165306003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_165306968_165310309_165310576_165314967_165315070_165319195_165319277_165321409_165321731_165329416_165329540_165331818_165331954_165335420_165335541_165339965_165340086_165345937_165346031_165351404_165351518_165368451
tx.20875	chrX	-	883	4	ISM	ENSMUSG00000000402.3	ENSMUST00000000412.3	2704	12	-5	33676	-5	-33676	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_3	4.96655480858378	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGTGTTGTCCTAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165368721	165339678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_165340086_165345937_165346031_165351404_165351518_165368451
tx.20876	chrX	-	559	2	ISM	ENSMUSG00000049775.17	ENSMUST00000112175.2	864	3	775	-199	775	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1191	junction_1	0	211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTGTGTCTGCTTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165991048	165990088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_165990532_165990932
tx.20877	chrX	-	617	3	FSM	ENSMUSG00000049775.17	ENSMUST00000112172.4	768	3	151	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1191	junction_1	25.5	3324	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTGTGTCTGCTTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165992160	165990088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_165990532_165990932_165991048_165992101
tx.20878	chrX	-	1727	7	FSM	ENSMUSG00000025742.6	ENSMUST00000026839.5	3699	7	16	1956	16	-1956	multi-exon	TRUE	canonical	3	187	junction_5	11.6535640709422	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTGCCACTTTGAAGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166165729	166131273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_166131995_166133510_166133671_166135131_166135306_166146540_166146666_166148114_166148214_166156998_166157183_166165465
tx.20879	chrX	-	645	3	FSM	ENSMUSG00000025742.6	ENSMUST00000145456.2	599	3	-41	-5	-2	5	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	111.5	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTCCTAAGATCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166165747	166155399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_166155579_166156998_166157183_166165465
tx.2088	chr10	-	2605	7	FSM	ENSMUSG00000025402.13	ENSMUST00000026469.9	2582	7	-23	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	9.00771274458111	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGGCCCCCTTCCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127502602	127496786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_127497649_127498599_127498792_127499000_127499134_127499218_127499271_127499608_127499743_127500133_127501008_127502244
tx.20880	chrX	-	2293	12	FSM	ENSMUSG00000031358.18	ENSMUST00000112137.2	2316	12	27	-4	27	4	multi-exon	TRUE	canonical	3	28	junction_9	6.17646827325928	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGAGGAGTTTTGCTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167456867	167437108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_167437965_167439958_167440044_167441610_167441711_167445426_167445537_167447038_167447302_167449938_167450098_167451626_167451788_167452485_167452612_167453215_167453308_167454138_167454240_167454790_167454887_167456723
tx.20881	chrX	-	2278	12	NNC	ENSMUSG00000031358.18	novel	2316	12	NA	NA	38	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_9	11.0191418723649	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGAGGAGTTTTGCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167456856	167437109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_167437965_167439958_167440044_167441610_167441711_167445426_167445537_167447038_167447302_167449938_167450098_167451626_167451788_167452485_167452612_167453215_167453305_167454138_167454240_167454790_167454887_167456723
tx.20882	chrX	-	2421	12	ISM	ENSMUSG00000031358.18	ENSMUST00000033725.16	2399	13	1357	3	-22	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_11	7.54928708800971	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAGCAAGAGGAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167455537	167437115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_167437965_167439958_167440044_167441610_167441711_167445426_167445537_167447038_167447302_167449938_167450098_167451626_167451788_167452485_167452612_167453215_167453308_167454138_167454240_167454790_167454887_167455258
tx.20883	chrX	-	2323	7	FSM	ENSMUSG00000031352.11	ENSMUST00000112115.2	2473	7	150	0	136	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_6	157.36096155725	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTTAGAGTGATTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168103140	168094525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_168096019_168096583_168096671_168098597_168098718_168099541_168099691_168099991_168100144_168102433_168102587_168102971
tx.20884	chrX	-	2149	6	ISM	ENSMUSG00000031352.11	ENSMUST00000033717.9	2320	7	688	7	688	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	489	junction_4	51.4470601686821	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGAAACTTCTTAGAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168102588	168094532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_168096019_168096583_168096671_168098597_168098718_168099541_168099691_168099991_168100144_168102433
tx.20885	chrX	-	371	2	FSM	ENSMUSG00000086695.2	ENSMUST00000124513.2	403	2	39	-7	39	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGAGAGTTCACTTCGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168769896	168768789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_168769003_168769738
tx.20886	chrX	+	617	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000086695.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATTGGGGCCTTCGGGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168769102	168769842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_168769153_168769275
tx.20887	chrX	-	324	2	Intergenic	novelGene_1418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCTGCCTTACACAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	169091434	169090870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_169091046_169091285
tx.20888	chrX	-	410	3	Intergenic	novelGene_1419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_2	8.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCTGCCTTACACAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	169092257	169090870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_169091046_169091285_169091434_169092170
tx.20889	chrX	-	505	4	Intergenic	novelGene_1420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_2	6.97614984548545	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCCCTGCCTTACACAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	169092616	169090870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_169091046_169091285_169091434_169092170_169092263_169092526
tx.2089	chr10	-	1128	4	NNC	ENSMUSG00000025402.13	novel	2311	6	NA	NA	-10	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	27.5237271377907	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCCATGGCCCCCTTCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127502589	127496788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_127497649_127499000_127499134_127499218_127499248_127502483
tx.20890	chrX_GL456233v2_random	-	1431	8	Intergenic	novelGene_1421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	354	junction_1	19.1641672431246	322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTTTAATACCTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134108	106805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_GL456233v2_random_-_107510_109039_109133_116592_116661_119836_119928_123935_124074_125547_125606_127389_127545_133984
tx.20891	chrX_GL456233v2_random	+	2258	8	Intergenic	novelGene_1423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_5	6.38557046817915	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAATCTGTGAGGGTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	251317	468926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_GL456233v2_random_+_251453_354605_354788_394862_395040_409324_409605_422004_422125_460904_461142_467193_467333_467938
tx.20892	chrY	+	440	2	Intergenic	novelGene_1425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	273	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60513157	60519912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrY_+_60513385_60519699
tx.20893	chrY	+	596	3	Intergenic	novelGene_1424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	6	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60513150	60519912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrY_+_60513385_60518877_60519027_60519699
tx.20894	chrY	+	2077	2	Intergenic	novelGene_1426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTTGGTCTGTGGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87788211	87792308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrY_+_87788667_87790686
tx.20896	chrY	-	538	3	Intergenic	novelGene_1427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTGTCACAGCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90788455	90779471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrY_-_90779682_90786939_90787085_90788272
tx.20897	chrY	+	353	3	NNC	ENSMUSG00000096768.9	novel	696	4	NA	NA	18	5937	intron_retention	FALSE	canonical	3	607	junction_1	705	33	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCAGATGTGTGTGTGTC	5080	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90797134	90833671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrY_+_90797249_90804564_90804687_90833554
tx.20898	chrY	+	408	2	NNC	ENSMUSG00000096768.9	novel	774	4	NA	NA	2676	5937	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	2017	junction_1	0	104	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCAGATGTGTGTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90804395	90833671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrY_+_90804687_90833554
tx.20899	ERCC-00096	+	500	2	Genic_Genomic	ERCC-00096A	novel	1091	1	NA	NA	0	0	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	0	1091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_ERCC-00096_+_114_704
tx.209	chr1	-	3278	8	FSM	ENSMUSG00000025993.11	ENSMUST00000027137.11	3370	8	0	92	0	-92	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1.82946406783796	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCTTTACTGAGTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45964742	45947319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_45948880_45950051_45950691_45951395_45951642_45957468_45957596_45958044_45958161_45960315_45960476_45963876_45963945_45964380
tx.2090	chr10	-	2405	6	FSM	ENSMUSG00000025402.13	ENSMUST00000099157.4	2311	6	-95	1	-17	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	16.4851448279959	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCCATGGCCCCCTTCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127502596	127496788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_127497649_127499000_127499134_127499218_127499271_127499608_127499743_127500133_127501008_127502244
tx.20900	SIRV1	-	1562	6	FSM	SIRV1A	SIRV101	1561	6	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1499	junction_5	1975.53128044078	822	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10787	1000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV1_-_1485_6337_6474_6560_6814_7552_7815_10282_10367_10444
tx.20901	SIRV1	-	985	3	NNC	SIRV1A	novel	973	3	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	452.5	348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10787	1000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV1_-_1485_7552_7809_10542
tx.20902	SIRV1	-	974	3	FSM	SIRV1A	SIRV106	973	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	497	junction_2	204	2534	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10787	1000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV1_-_1485_7552_7809_10553
tx.20903	SIRV1	-	1363	6	FSM	SIRV1A	SIRV103	1363	6	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1304	junction_5	2022.74937646758	2175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCGATGCATACTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10791	1000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV1_-_1485_6337_6474_6560_6814_7552_7815_10282_10367_10647
tx.20904	SIRV1	-	671	5	FSM	SIRV1A	SIRV105	670	5	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1547	junction_4	2187.81237769604	4820	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCCTGGAAGTCAAAAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10641	6449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV1_-_6474_6560_6814_7552_7815_10282_10367_10593
tx.20905	SIRV1	-	649	4	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	-1	109	-1	-109	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1547	junction_3	2077.98449357919	1977	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAGGTTTGTGAGAAGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10641	6558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_SIRV1_-_6814_7552_7815_10282_10367_10593
tx.20906	SIRV1	+	703	3	FSM	SIRV1B	SIRV108	702	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_1	13	3348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAAAGACATAGGGCGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10581	11606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV1_+_10792_10897_11188_11403
tx.20908	SIRV1	+	465	3	FSM	SIRV1B	SIRV109	464	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3494	junction_2	198.5	6554	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTCGGCTAATCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10710	11643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV1_+_10792_10882_11058_11434
tx.20909	SIRV2	-	741	3	FSM	SIRV2A	SIRV204	740	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2423	junction_1	198	1648	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTATCCTATATCGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4733	3643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4480_4687
tx.2091	chr10	+	1388	7	NNC	ENSMUSG00000040195.12	novel	1522	7	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	30	junction_3	49.7942990935933	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTGAGTTTGACTACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127512920	127531037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_127513097_127524101_127524218_127525093_127525168_127526729_127526803_127528836_127528931_127529352_127529468_127530297
tx.20910	SIRV2	-	686	5	FSM	SIRV2A	SIRV203	686	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2087	junction_4	259.923065540556	3854	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5895	3665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV2_-_3826_3966_4095_4338_4480_4687_4801_5751
tx.20911	SIRV3	-	481	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	5391	junction_1	17	6999	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1982	998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
tx.20912	SIRV3	+	2374	3	FSM	SIRV3A	SIRV306	2373	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	759	junction_2	1218.5	458	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACCTAACAGTAAAAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1943	8292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV3_+_2006_4003_4081_6057
tx.20913	SIRV3	+	2469	5	FSM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	-1	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1234	junction_3	576.603416569829	425	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1943	8940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV3_+_2006_4568_4780_6057_7989_8127_8208_8755
tx.20914	SIRV3	+	1808	2	FSM	SIRV3A	SIRV302	1807	2	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	834	junction_1	0	965	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTTAACAGGTTCTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1962	7822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV3_+_2006_6057
tx.20915	SIRV3	+	1091	8	NNC	SIRV3A	novel	1083	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1147.84278593564	2224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAGGTTAACGTCTCGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1962	8937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV3_+_2006_4003_4081_4568_4780_6057_6334_7270_7363_7861_7989_8124_8208_8755
tx.20916	SIRV3	+	792	5	NIC	SIRV3A	novel	1083	8	NA	NA	-1	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	1252	junction_4	815.49996167995	2296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1962	8940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_SIRV3_+_2006_4003_4081_4568_4780_6057_6334_8755
tx.20917	SIRV3	+	437	3	FSM	SIRV3A	SIRV305	436	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1609	junction_2	828.5	8516	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCGAATCTTAATAGACGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4002	6718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV3_+_4081_4568_4780_6570
tx.20918	SIRV3	-	591	3	FSM	SIRV3C	SIRV310	589	3	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1245	junction_2	66	10178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGGTTTTGGGTACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9914	8757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV3_-_8967_9189_9325_9667
tx.20919	SIRV3	-	796	3	FSM	SIRV3C	SIRV309	796	3	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1394	junction_2	16	1864	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCTCAAATATCTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9943	8797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV3_-_8976_9189_9299_9434
tx.2092	chr10	+	1915	9	FSM	ENSMUSG00000040195.12	ENSMUST00000048099.5	6002	9	-14	4101	-12	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_7	22.4499443206436	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATGTTCTTTACCCAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127512920	127532817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_127513097_127524101_127524218_127525093_127525314_127526729_127526803_127528836_127528931_127529352_127529468_127530297_127530524_127531237_127531412_127532096
tx.20920	SIRV4	+	1568	3	FSM	SIRV4C	SIRV409	1567	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1019	junction_2	11.5	2172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATATTGTAACCTGTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	999	3403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV4_+_1347_1678_1886_2389
tx.20921	SIRV4	+	951	2	FSM	SIRV4C	SIRV410	950	2	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1621	junction_1	0	4306	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1454	2771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV4_+_1886_2251
tx.20922	SIRV4	-	956	2	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	390	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAATTAAAGCGACTGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	2771	1454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_SIRV4_-_1882_2242
tx.20923	SIRV4	-	619	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2584	junction_1	0	4158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTAAAAATAGCCTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5158	3635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV4_-_4104_5007
tx.20924	SIRV4	-	593	4	FSM	SIRV4A	SIRV404	592	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	669	junction_3	2787.93595494747	17460	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14624	8322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13823_14592
tx.20925	SIRV4	-	675	4	NNC	SIRV4A	novel	670	4	NA	NA	-1	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3065.46367708958	10658	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15123	8322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8991_13672_13833_15019
tx.20926	SIRV4	-	575	5	NNC	SIRV4A	novel	570	5	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	2658.88059152719	11943	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTGATATTTAGAGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15123	8323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8748_8846_8991_13672_13833_15019
tx.20927	SIRV4	-	627	2	FSM	SIRV4A	SIRV405	626	2	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7498	junction_1	0	14152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTTCTCTTTTCAGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13938	8629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV4_-_8991_13672
tx.20928	SIRV5	+	1987	18	NNC	SIRV5A	novel	1984	18	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3642.47992539704	1075	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTTTACCGCCAAAAAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1019	10990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV5_+_1150_1985_2034_2119_2157_2270_2489_3298_3405_3483_3644_5380_5451_5543_5627_6111_6170_6327_6453_6658_6723_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8017_8277_8382_8454_8586_10858
tx.20929	SIRV5	+	533	6	FSM	SIRV5A	SIRV507	533	6	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3871	junction_1	2708.37786137754	14491	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGTAAGTGGTCAAGCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1027	3598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV5_+_1150_1925_2034_2119_2157_2270_2316_3298_3405_3483
tx.2093	chr10	+	1769	9	NNC	ENSMUSG00000040195.12	novel	6002	9	NA	NA	-12	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_3	43.8461443572864	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATGTTCTTTACCCAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127512920	127532817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_127513097_127524101_127524218_127525093_127525168_127526729_127526803_127528836_127528931_127529352_127529468_127530297_127530524_127531237_127531412_127532096
tx.20930	SIRV5	+	1413	10	ISM	SIRV5A	SIRV508	2085	17	4602	0	-2591	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2297	junction_3	2823.07206364684	280	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5610	10991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_SIRV5_+_5627_6111_6170_6327_6453_6658_6723_6826_6958_7144_7308_7681_7763_7870_8382_8454_8586_10858
tx.20931	SIRV5	+	564	3	ISM	SIRV5A	SIRV509	885	4	-234	875	-120	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9266	junction_1	1279.5	1561	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8081	10991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858
tx.20932	SIRV5	+	534	2	ISM	SIRV5A	SIRV503	526	3	-1	135	-1	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11825	junction_1	0	8371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGCAAGACCTCTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8200	11007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_SIRV5_+_8586_10858
tx.20933	SIRV5	+	887	4	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5079.78413802091	6514	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATAGTAACCTTGGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8315	11866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10992_11309
tx.20934	SIRV6	+	574	8	FSM	SIRV6A	SIRV602	574	8	0	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	8561	junction_3	5767.41567350754	4774	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1124	11279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
tx.20935	SIRV6	+	569	8	NNC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8378.86249890224	231	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1124	11279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1645_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11031_11109_11205
tx.20936	SIRV6	+	574	4	FSM	SIRV6A	SIRV607	574	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	10529.1711924538	6433	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGCAGTCAAGTCGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1130	2540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1736_1845_2027_2470
tx.20937	SIRV6	+	1088	9	FSM	SIRV6A	SIRV605	1088	9	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8239.38325968637	2203	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1130	11331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845_2027_2470_2621_2740_2829_3106_3165_10724_10819_11031
tx.20938	SIRV6	+	487	4	FSM	SIRV6A	SIRV609	485	4	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15063	junction_3	5493.41668626083	8126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1135	2120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_1845
tx.20939	SIRV6	+	455	3	FSM	SIRV6A	SIRV611	454	3	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2656	junction_1	12443	9224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTGGTGTTTATAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1302	1950	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV6_+_1382_1468_1535_1640
tx.2094	chr10	+	738	4	FSM	ENSMUSG00000025401.10	ENSMUST00000219882.2	1062	4	327	-3	327	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	2.62466929133727	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATATGCGTATTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127555523	127556807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_127555635_127555736_127555890_127556021_127556150_127556461
tx.20940	SIRV6	-	446	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	-130	242	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGCTCCTATGTCTAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1950	1302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_SIRV6_-_1430_1631
tx.20941	SIRV6	+	1163	5	FSM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12902	junction_1	2966.72052736688	4882	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAAAATGGGGTTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	2472	11690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_10724_11109_11205
tx.20942	SIRV6	+	462	5	FSM	SIRV6A	SIRV614	459	5	0	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2976	junction_3	7392.30118095847	5612	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGACTGTATCGGAGACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	2516	10818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV6_+_2621_2740_2829_3106_3165_7805_7924_10724
tx.20943	SIRV6	+	378	4	FSM	SIRV6A	SIRV608	377	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18415	junction_1	2118.18355095954	7832	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTATTAGCCTGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3022	11270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV6_+_3165_10724_10819_11031_11109_11205
tx.20944	SIRV6	+	783	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18822	junction_2	2138	5834	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10237	11330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
tx.20945	SIRV7	-	2466	5	FSM	SIRV7A	SIRV701	2462	5	-2	-2	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1923	junction_2	1231.81783860277	1086	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTGTTAATATGAATCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147925	1001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_SIRV7_-_2676_2993_3112_43028_43078_114680_114989_147608
tx.20946	SIRV7	+	376	2	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAATGCGATAAATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55849	78964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_SIRV7_+_56111_78849
tx.20947	SIRV7	-	430	3	NNC	SIRV7A	novel	428	3	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2472	9194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTTCGTATTTGCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114738	55849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV7_-_56098_78841_78966_114680
tx.20948	SIRV7	-	951	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1984.06911421956	3530	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTAAGAGATCGACGAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147957	56031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680_114989_147608
tx.20949	SIRV7	-	922	5	NNC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1736.72714825905	3223	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTAAGAGATCGACGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147957	56032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_SIRV7_-_56098_70883_70988_78841_78966_114680_114961_147608
tx.2095	chr10	+	681	6	NNC	ENSMUSG00000025400.12	novel	514	3	NA	NA	-16	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	36	junction_5	3.96988664825584	46	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACTGATGCAATAGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127563699	127567637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_127563897_127564039_127564146_127564315_127564346_127564982_127565037_127565344_127565419_127567417
tx.20950	chr1	+	785	3	ISM	ENSMUSG00000025903.15	ENSMUST00000137887.8	444	7	-58	11776	10	-11776	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	796	junction_1	38	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTCTAGAGCTCAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4878062	4899416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_4878206_4878677_4878710_4898806
tx.20951	chr1	+	3795	5	FSM	ENSMUSG00000051285.18	ENSMUST00000182114.8	770	5	119	-3144	-55	83	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	40.8495716011808	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATCCAGTGGCCTGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159272	7242966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_7159441_7217860_7217964_7231115_7231288_7233471_7233596_7239738
tx.20953	chr1	+	1660	12	NNC	ENSMUSG00000025911.15	novel	2022	13	NA	NA	6	-163	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	26.0923344558392	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTCTGTTTCATAAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9618285	9646963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_9618377_9620131_9620170_9623147_9623206_9623542_9623698_9625762_9625841_9627224_9627331_9628357_9628511_9630333_9630433_9633733_9633813_9634021_9634119_9637005_9637164_9646415
tx.20954	chr1	+	2019	5	NIC	ENSMUSG00000097893.9	novel	555	5	NA	NA	-26	1349	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.78535710713571	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACGTATTTTATTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9818785	9842830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_9818871_9820582_9820631_9822673_9822790_9840896_9841021_9841184
tx.20955	chr1	+	447	3	NNC	ENSMUSG00000056763.17	novel	454	4	NA	NA	-1	266	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	49	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGAGAGAGTCTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10109990	10118025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_10110105_10115300_10115410_10117801
tx.20956	chr1	+	1565	8	FSM	ENSMUSG00000057715.14	ENSMUST00000171690.9	6158	8	68	4525	61	655	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_7	6.29868791001389	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCAATGCATTGCAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11484396	11667510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_11484862_11582141_11582290_11588801_11588934_11615377_11615507_11633186_11633216_11658597_11658771_11666374_11666542_11667188
tx.20957	chr1	+	1664	4	NNC	ENSMUSG00000067813.4	novel	1926	4	NA	NA	-2721	-274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTATGTGTTGTTACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13736273	13771673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_13736383_13742349_13742989_13754279_13754501_13770978
tx.20958	chr1	-	887	7	NNC	ENSMUSG00000043716.14	novel	1163	7	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2415.49321510581	467	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCGGAGTCTTTGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16174627	16171518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_16171584_16171950_16172161_16172713_16172824_16172915_16173054_16173391_16173542_16173733_16173909_16174588
tx.20959	chr1	+	194	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100959.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTGCATGTCATCATTT	6803	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16716278	16787385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_16716427_16787339
tx.2096	chr10	+	485	5	ISM	ENSMUSG00000025400.12	ENSMUST00000026466.5	678	7	2775	0	323	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_4	3.76662979332984	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACTGATGCAATAGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127564038	127567637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_127564146_127564315_127564346_127564982_127565037_127565344_127565419_127567417
tx.20960	chr1	-	2769	2	ISM	ENSMUSG00000042686.6	ENSMUST00000038382.5	4809	5	-8	95023	-8	-95023	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTAGCTTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17168121	17160184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_17162282_17167449
tx.20961	chr1	+	952	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100398.2	novel	472	1	NA	NA	-130	1965	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGTCTCCACTCTTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17465051	17467618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_17465842_17467456
tx.20962	chr1	-	2456	3	FSM	ENSMUSG00000048874.16	ENSMUST00000188780.2	941	3	267	-1782	-46	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	46.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTATTTTTCTTTTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30912708	30868503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_30870641_30902067_30902337_30912658
tx.20963	chr1	-	477	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000004768.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTGGTTGTTTCTGTATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33759123	33758487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_33758702_33758860
tx.20964	chr1	-	1392	4	NIC	ENSMUSG00000042182.17	novel	382	3	NA	NA	33	682	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_1	17.4610678049451	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTAAGCCTATTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33946816	33912156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_33912993_33917340_33917519_33922521_33922730_33946646
tx.20965	chr1	+	925	3	Intergenic	novelGene_16	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTGAGCTAAGTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35980895	35994225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_35981314_35991760_35991870_35993827
tx.20966	chr1	+	435	2	FSM	ENSMUSG00000104201.2	ENSMUST00000192017.2	425	2	-9	-1	-9	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTATGTTGTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36050143	36050976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_36050277_36050674
tx.20967	chr1	-	490	3	Intergenic	novelGene_18	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTCTTTGGTCTCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36100213	36093218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_36093540_36099940_36100026_36100129
tx.20968	chr1	-	439	3	ISM	ENSMUSG00000037470.15	ENSMUST00000174716.8	3064	19	-192	52063	6	12971	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	419	junction_1	22.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCATCACGGTAAAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36283380	36269748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_36269822_36273887_36274024_36283150
tx.20969	chr1	+	2177	7	FSM	ENSMUSG00000037447.17	ENSMUST00000115032.8	4640	7	0	2463	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	6.46572158042361	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTGGGGTGTACAGCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36346834	36359609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_36346918_36355289_36355409_36356284_36356406_36356690_36356744_36357164_36357263_36357568_36357735_36358072
tx.2097	chr10	+	1552	13	FSM	ENSMUSG00000025395.15	ENSMUST00000026461.8	1583	13	22	9	-2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	2	393	junction_7	89.7794751970998	2286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGACTTCTGATGTGCTCG	1006	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127851062	127865897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_127851221_127851832_127851991_127853844_127853952_127854016_127854091_127855998_127856136_127857541_127857601_127858731_127858842_127859451_127859544_127859649_127859789_127862386_127862457_127862921_127863008_127865054_127865154_127865634
tx.20970	chr1	-	1158	6	ISM	ENSMUSG00000026082.12	ENSMUST00000194650.6	3576	18	32685	-5	-1197	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_4	9.52050418832953	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTACAGGTTTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38094528	38091871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_38092280_38092696_38092800_38092920_38093078_38093164_38093377_38093825_38093947_38094371
tx.20971	chr1	-	1391	2	ISM	ENSMUSG00000048234.14	ENSMUST00000062525.11	2492	7	21757	0	3109	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTCTATGTAACAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39594729	39590376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_39591597_39594558
tx.20972	chr1	-	1177	4	NNC	ENSMUSG00000101634.7	novel	536	5	NA	NA	-37571	683	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAGAGAAAGGTTTGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39924065	39880899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_39881717_39884387_39884500_39923329_39923430_39923917
tx.20973	chr1	+	582	3	ISM	ENSMUSG00000026074.16	ENSMUST00000195636.6	4082	31	122193	2	207	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	134	junction_1	1.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCATCGGTGCTAGGAGTG	3227	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40062576	40064127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_40062680_40063469_40063610_40063788
tx.20974	chr1	+	467	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094497.2	novel	483	1	NA	NA	-51	135	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGAGGCAGATGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43228264	43228933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_43228568_43228769
tx.20975	chr1	+	2207	3	ISM	ENSMUSG00000066877.12	ENSMUST00000086421.9	2772	5	87929	-3	111	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	156	junction_2	13.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTGTGTGTTTGTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43572839	43609678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_43572954_43593020_43593743_43608307
tx.20976	chr1	+	486	3	ISM	ENSMUSG00000041763.15	ENSMUST00000190401.7	4994	6	-22	7595	-15	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	333	junction_2	42	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAATGACATTCATTATCA	3289	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43973151	43988566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_43973414_43979269_43979399_43988471
tx.20977	chr1	+	3139	6	ISM	ENSMUSG00000041763.15	ENSMUST00000186028.2	1389	7	-2	-18	-1	18	intron_retention	FALSE	canonical	3	317	junction_5	35.1988636180204	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATACTTTATACTCATTGT	3310	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43973172	43996179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_43973414_43979269_43979399_43988471_43988568_43990266_43990372_43992416_43992542_43993736
tx.20978	chr1	+	1228	7	NNC	ENSMUSG00000026048.17	novel	4239	14	NA	NA	0	1973	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	42.8359272885118	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGACAGTGGTGGTCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44186903	44202977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_44187311_44196096_44196273_44197303_44197420_44197964_44198052_44200136_44200198_44200969_44201114_44202740
tx.20979	chr1	+	2992	11	FSM	ENSMUSG00000056870.10	ENSMUST00000074525.10	3138	11	146	0	-36	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_7	3.104834939252	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTATGATATGCTCACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44590816	44835998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_44591033_44728303_44728376_44747776_44747839_44783633_44783706_44793502_44793602_44805173_44805312_44812430_44812548_44813212_44813306_44820127_44820267_44827607_44827703_44834109
tx.2098	chr10	+	857	8	FSM	ENSMUSG00000061315.15	ENSMUST00000073868.9	885	8	28	0	28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9741	junction_1	845.476607528293	38202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCAGGTGCTAGATCTT	4940	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127871471	127884502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_127871553_127872357_127872430_127882036_127882123_127882597_127882676_127883526_127883674_127883867_127883997_127884113_127884237_127884361
tx.20980	chr1	-	1631	2	ISM	ENSMUSG00000018417.15	ENSMUST00000114541.8	4616	29	151570	-219	8724	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	308	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAATTCTCCGAAGTCTTC	2145	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51794905	51788928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_51790456_51794801
tx.20981	chr1	-	493	4	ISM	ENSMUSG00000018417.15	ENSMUST00000151525.8	3045	7	-23	23805	6	-22	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	305	junction_3	14.0791413879619	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCTCATTACTGGGGAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51955094	51873644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_51873703_51902477_51902594_51922241_51922386_51954919
tx.20982	chr1	+	2555	22	NNC	ENSMUSG00000062939.12	novel	2982	24	NA	NA	-2	-1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_11	9.63929975533714	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTGTTTCTGGTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52047782	52146346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_52047888_52050941_52051071_52052948_52053094_52104473_52104573_52107904_52107998_52111019_52111099_52113835_52113922_52115691_52115844_52117652_52117812_52118899_52118993_52121676_52121737_52122122_52122231_52135943_52136028_52137545_52137645_52139482_52139619_52141010_52141061_52141275_52141371_52141639_52141777_52142006_52142199_52144364_52144432_52144826_52144936_52146068
tx.20983	chr1	+	2071	8	FSM	ENSMUSG00000043015.16	ENSMUST00000188507.7	3247	8	-13	1189	-13	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	15.6466075086778	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGACATTTTGTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52669882	52689889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_52670011_52676523_52676640_52679987_52680220_52680329_52680403_52681477_52681572_52684419_52684646_52687908_52688086_52688864
tx.20984	chr1	-	719	4	ISM	ENSMUSG00000026102.10	ENSMUST00000027271.9	5767	6	18156	6227	-44	-1598	internal_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_3	0.942809041582063	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATCTAGCCTTTGCTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52838691	52830812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_52831022_52833628_52833830_52836199_52836261_52838443
tx.20985	chr1	-	822	3	ISM	ENSMUSG00000026098.14	ENSMUST00000142922.2	3054	5	-48	11818	0	408	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_2	10.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCATGTCTGGCTTATTT	6055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53336174	53313871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_53314412_53321099_53321252_53336044
tx.20986	chr1	+	1170	4	ISM	ENSMUSG00000026096.15	ENSMUST00000150115.2	1067	5	666	14	666	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	135	junction_1	8.37987005998436	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAGTCAAGAATCATTTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53359533	53365320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_53360370_53360654_53360727_53362325_53362430_53365162
tx.20987	chr1	-	837	4	NNC	ENSMUSG00000096141.3	novel	732	4	NA	NA	-44621	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.63299316185545	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGTGATTTGACTGGAT	884	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53790564	53737186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_53737688_53737790_53737854_53741176_53741240_53790354
tx.20988	chr1	+	595	4	Intergenic	novelGene_23	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTCTTGGTTCCATTTCT	259	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53750400	53785398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_53750533_53755452_53755509_53781651_53781755_53785094
tx.20989	chr1	+	598	2	NNC	ENSMUSG00000025983.12	novel	1204	7	NA	NA	35	-26931	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCATTTATGTATTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54289915	54291189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_54290045_54290720
tx.2099	chr10	+	776	7	ISM	ENSMUSG00000061315.15	ENSMUST00000073868.9	885	8	914	0	854	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10794	junction_5	661.048409725037	5803	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGCAGGTGCTAGATCTT	5826	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127872357	127884502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_127872430_127882036_127882123_127882597_127882676_127883526_127883674_127883867_127883997_127884113_127884237_127884361
tx.20990	chr1	-	805	5	ISM	ENSMUSG00000041303.8	ENSMUST00000041638.8	4582	18	-37	32762	-37	-1462	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	148	junction_2	12.49749974995	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGGTAATGACATTTTTCT	6663	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54478167	54467924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_54468113_54469657_54469782_54473212_54473398_54476990_54477103_54477971
tx.20991	chr1	-	869	3	Intergenic	novelGene_25	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCCAGGCCCCTAGTGTC	2737	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55007598	55004317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_55004566_55006037_55006282_55007221
tx.20992	chr1	+	866	3	Intergenic	novelGene_26	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55921102	55955017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_55921304_55954118_55954568_55954801
tx.20993	chr1	+	2495	14	FSM	ENSMUSG00000038305.16	ENSMUST00000167085.8	3929	14	5	1429	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_13	12.6939392890685	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGGCTTGCTCTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57814024	57986124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_57814184_57838463_57838514_57871211_57871297_57894622_57894684_57918666_57918776_57921864_57921915_57924861_57925109_57939792_57940000_57941247_57941384_57962524_57962584_57977070_57977181_57979531_57979635_57982179_57982401_57985226
tx.20994	chr1	-	1050	2	ISM	ENSMUSG00000054770.17	ENSMUST00000161608.8	2495	7	-526	12065	2	-3716	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGGTGCTGTTCCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58009209	58006476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_58006883_58008565
tx.20995	chr1	-	1297	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000051223.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAACAGATTTAAGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58432223	58426901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_58428127_58432151
tx.20996	chr1	-	3821	12	FSM	ENSMUSG00000038174.15	ENSMUST00000161600.8	8685	12	42	4822	-4	115	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	5.70486235990445	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTGAACAGAGAGGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58625440	58566786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_58569419_58574548_58574709_58578717_58578806_58579292_58579410_58583825_58583922_58585265_58585382_58587797_58587879_58591308_58591489_58596430_58596533_58597135_58597217_58605015_58605114_58625370
tx.20997	chr1	-	1026	10	ISM	ENSMUSG00000038174.15	ENSMUST00000097724.10	4581	13	-10	12536	-1	-10474	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_8	4.17517649512354	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTTTGTTTGTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58625435	58578715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_58578806_58579292_58579410_58583825_58583922_58585265_58585382_58587797_58587879_58591308_58591489_58596430_58596533_58597135_58597217_58605015_58605114_58625370
tx.20998	chr1	+	1552	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000059647.6	novel	552	1	NA	NA	-94	1094	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGGAGACGCAGTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58685752	58687492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_58685949_58686136
tx.20999	chr1	+	1916	4	ISM	ENSMUSG00000026031.16	ENSMUST00000140940.8	2064	10	1774	21114	-12	0	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.69967317119759	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTTTGTGCATTTGCTTT	3034	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58752440	58772386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_58752819_58765464_58765892_58770310_58770447_58771411
tx.21	chr1	-	564	3	Intergenic	novelGene_2	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGTTTCAGGCATGCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9615446	9614538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_9614799_9615067_9615264_9615338
tx.210	chr1	-	4972	10	FSM	ENSMUSG00000025986.7	ENSMUST00000027131.6	5498	10	526	0	526	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	237	junction_4	21.0736509753792	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGTGTGTTTTCATTGTC	454	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46892680	46846703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_46849272_46851145_46851337_46857222_46857304_46858224_46858594_46859682_46859804_46865252_46865442_46866502_46866673_46871715_46871924_46874286_46875312_46892630
tx.2100	chr10	+	1682	8	FSM	ENSMUSG00000071072.13	ENSMUST00000052798.14	2000	8	53	265	-4	29	multi-exon	FALSE	canonical	3	2953	junction_7	394.34461257812	2270	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTGTCTGTTTGCTGTAA	899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127894875	127912876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_127895156_127904540_127904655_127905084_127905155_127906002_127906102_127907936_127908027_127910090_127910154_127911206_127911232_127911935
tx.21000	chr1	-	1313	2	FSM	ENSMUSG00000026028.13	ENSMUST00000173719.2	828	2	-7	-478	-7	478	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCTCTCCTTTCT	1540	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59012596	58984582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_58985695_59012395
tx.21001	chr1	+	393	2	NNC	ENSMUSG00000073664.12	novel	15731	55	NA	NA	45	-4234	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGAGGAAATATTAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60220015	60220823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_60220207_60220621
tx.21002	chr1	+	2006	9	FSM	ENSMUSG00000026782.16	ENSMUST00000052332.15	5768	9	5	3757	5	97	multi-exon	TRUE	canonical	3	110	junction_7	24.0559244262198	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGATTGCTTAAGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60448782	60516560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_60449079_60473401_60473570_60476214_60476392_60483143_60483242_60486418_60486566_60487236_60487362_60492762_60492922_60509824_60509999_60515898
tx.21003	chr1	+	1246	8	ISM	ENSMUSG00000026782.16	ENSMUST00000052332.15	5768	9	67	10355	-9	-6117	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_7	24.3804873467555	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCACCGTGGGCGCCAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60448844	60509962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_60449079_60473401_60473570_60476214_60476392_60483143_60483242_60486418_60486566_60487236_60487362_60492762_60492922_60509824
tx.21004	chr1	-	3803	4	ISM	ENSMUSG00000026014.16	ENSMUST00000090293.11	2409	16	92	31961	88	3051	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_2	3.29983164553722	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATATACTTTCTTTTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60605836	60561795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_60565260_60566542_60566649_60572445_60572566_60605723
tx.21005	chr1	-	2143	4	FSM	ENSMUSG00000025959.14	ENSMUST00000114086.8	7662	4	184	5335	175	-5335	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	3.85861230093008	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCCTTGAGCCTCACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64160466	64073940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_64074924_64081472_64081597_64117865_64118494_64160058
tx.21006	chr1	-	1201	5	NIC	ENSMUSG00000025959.14	novel	7662	4	NA	NA	-1	-6216	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_4	5.02493781056044	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AACAACAAGAACAAAACACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64160651	64074821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_64074924_64081472_64081597_64117865_64118494_64160058_64160299_64160544
tx.21007	chr1	-	580	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084416.4	novel	654	1	NA	NA	-31	49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65033794	65033060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_65033603_65033756
tx.21008	chr1	+	1540	7	FSM	ENSMUSG00000025949.17	ENSMUST00000185317.7	1044	7	0	-496	0	28	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_1	20.9257948209593	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGCCCCGAGTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65225841	65245361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_65225938_65229477_65229659_65231303_65231454_65234814_65234934_65235770_65235943_65241874_65242083_65244747
tx.21009	chr1	+	1595	7	ISM	ENSMUSG00000025949.17	ENSMUST00000188799.7	4083	11	-10	19915	0	28	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	15.5536705207056	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGCCCCGAGTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65225841	65245361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_65225993_65229477_65229659_65231303_65231454_65234814_65234934_65235770_65235943_65241874_65242083_65244747
tx.2101	chr10	+	1256	3	ISM	ENSMUSG00000071072.13	ENSMUST00000052798.14	2000	8	15282	24	4964	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2953	junction_2	18.5	355	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGTACATTTTCACTCC	8056	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127910104	127913117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_127910154_127911206_127911232_127911935
tx.21010	chr1	+	302	2	ISM	ENSMUSG00000025949.17	ENSMUST00000185263.7	443	4	0	1688	0	-1688	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGATTACATCTTAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65225871	65229658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_65225993_65229477
tx.21011	chr1	-	1743	7	ISM	ENSMUSG00000026193.16	ENSMUST00000185408.7	4022	17	11957	-4	2758	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2421	junction_6	195.865316537212	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTGGACGTCATTTCTT	6332	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71636769	71624680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_71625443_71625988_71626103_71629256_71629364_71629925_71630052_71632229_71632395_71634822_71634962_71636439
tx.21012	chr1	-	1602	5	ISM	ENSMUSG00000026193.16	ENSMUST00000186879.2	2104	6	-94	2902	-66	-1736	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1661	junction_2	36.8408740395773	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAACCATTGATTCAGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71692425	71686537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_71687306_71688352_71688485_71689720_71689859_71690679_71690809_71691990
tx.21013	chr1	+	2276	7	NIC	ENSMUSG00000026176.14	novel	393	4	NA	NA	-59	-288	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_1	7.90393713425292	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCGCCTCTGTGGTTTTTG	3904	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74431261	74436153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_74431409_74432436_74432586_74432955_74433061_74433177_74433235_74433798_74433892_74433995_74434182_74434614
tx.2102	chr10	+	1765	10	FSM	ENSMUSG00000025393.13	ENSMUST00000026459.6	1916	10	33	118	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8904	junction_3	854.417771581948	5990	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATGTCTGTTTATGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127919174	127926142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_127919323_127919760_127919944_127920165_127920341_127920959_127921082_127921310_127921496_127921906_127922066_127922166_127922290_127924189_127924403_127924825_127925028_127925887
tx.21025	chr1	+	1090	4	ISM	ENSMUSG00000062590.14	ENSMUST00000153389.8	1024	6	-2	6854	0	-1360	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_1	5.24933858267454	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGCTAGCAAACACTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86082505	86091199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_86082566_86084639_86084728_86087716_86087846_86090386
tx.21026	chr1	+	864	4	ISM	ENSMUSG00000036480.10	ENSMUST00000044533.9	2180	13	3510	-7	3510	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGAGCTTTCTTGGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87114544	87116134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_87114771_87114867_87114931_87115217_87115325_87115666
tx.21027	chr1	-	196	2	Intergenic	novelGene_37	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATTCCCAACAACCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87270240	87230908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_87231076_87270211
tx.21028	chr1	+	707	3	FSM	ENSMUSG00000026258.6	ENSMUST00000027476.6	478	3	-229	0	-229	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTGCTCTCCTTTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87397763	87403204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_87398134_87402744_87402928_87403050
tx.21029	chr1	+	930	2	ISM	ENSMUSG00000026289.16	ENSMUST00000134603.2	1674	5	-37	7262	0	-7262	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGAGCCATGTCTGGTGTTG	7288	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87683777	87688443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_87684037_87687772
tx.2103	chr10	-	1592	2	FSM	ENSMUSG00000051346.10	ENSMUST00000061995.10	1583	2	-9	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	299	junction_1	0	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTCTGTCTATAAAATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128047685	128045776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128047261_128047577
tx.21030	chr1	-	442	3	Intergenic	novelGene_43	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88943747	88928881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_88929139_88930733_88930866_88943694
tx.21031	chr1	+	690	3	NNC	ENSMUSG00000092627.3	novel	1372	2	NA	NA	-78	683	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGACCCGATTCTTTGAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89857877	89860267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_89858176_89859728_89859871_89860017
tx.21032	chr1	+	964	2	Intergenic	novelGene_44	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAATGTCCACATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90471420	90472539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_90471480_90471634
tx.21033	chr1	-	1096	2	Intergenic	novelGene_45	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTTCTCGTTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90555993	90550810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_90551662_90555748
tx.21034	chr1	+	3647	8	FSM	ENSMUSG00000026305.16	ENSMUST00000097649.10	3645	8	3	-5	3	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_4	18.7823190848223	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACTGGTTGTTCTGGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90981178	91045042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_90981446_90996284_90996372_91028298_91028335_91028906_91029033_91032848_91033020_91035019_91035113_91039877_91040020_91042317
tx.21035	chr1	+	3736	9	NIC	ENSMUSG00000026305.16	novel	3645	8	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	55	junction_5	16.4088390814219	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCCTACTGGTTGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90981156	91045037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_90981446_90996284_90996372_91028298_91028335_91028906_91029033_91030968_91031041_91032848_91033020_91035019_91035113_91039877_91040020_91042317
tx.21036	chr1	+	3894	16	FSM	ENSMUSG00000070732.3	ENSMUST00000094698.2	3851	16	-39	-4	-25	4	multi-exon	TRUE	canonical	3	84	junction_2	27.1317771871533	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGTGCTTTCTGTAGTG	4225	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91072785	91098521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_91072892_91077804_91077896_91079886_91081383_91081615_91081675_91083106_91083278_91084376_91084561_91084639_91084663_91084785_91084871_91090079_91090195_91090773_91090903_91092635_91092716_91092816_91092888_91094520_91094807_91096414_91096561_91096678_91096819_91097809
tx.21037	chr1	-	1354	12	NNC	ENSMUSG00000026309.15	novel	1368	12	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	29	junction_8	186.161353633822	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATTTGAGTGACTGGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91326478	91303552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_91303805_91304039_91304122_91306187_91306308_91309572_91309695_91311025_91311114_91312286_91312381_91312961_91313069_91314936_91315064_91316076_91316187_91318328_91318386_91318830_91318920_91326372
tx.21038	chr1	-	1866	4	ISM	ENSMUSG00000034212.15	ENSMUST00000160548.8	3246	18	13867	14240	13867	-14240	internal_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3.29983164553722	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGCCTTTTGTCATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92816761	92812090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_92812988_92813857_92814017_92814344_92814562_92816168
tx.21039	chr1	+	691	2	NNC	ENSMUSG00000047067.8	novel	1314	2	NA	NA	-19	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCGAGTTGCTCTTTATG	2836	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92834683	92836157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_92835055_92835837
tx.2104	chr10	+	1029	4	FSM	ENSMUSG00000025389.8	ENSMUST00000026455.8	2144	4	-26	1141	-26	-1141	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACGACTGGTTAGTGCAA	338	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128061680	128066540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_128062111_128062916_128063082_128063501_128063583_128066187
tx.21040	chr1	-	493	2	FSM	ENSMUSG00000026274.12	ENSMUST00000148355.2	742	2	500	-251	500	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGAGTGTTTAAGTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93238566	93237555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_93237972_93238489
tx.21041	chr1	+	3269	13	FSM	ENSMUSG00000116048.2	ENSMUST00000168776.8	3267	13	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	258.994798317564	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTAGTCCTCTTTTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93406780	93437455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_93406903_93416845_93416877_93418878_93419000_93423300_93423388_93425062_93425187_93426733_93426869_93426994_93427113_93428179_93428282_93429228_93429375_93431156_93431241_93433265_93433324_93434684_93434805_93435434
tx.21042	chr1	-	876	5	ISM	ENSMUSG00000026277.15	ENSMUST00000151068.8	2821	11	-37	4850	-37	-902	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	169	junction_1	12.1037184369102	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTCCTAATCTTTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93563388	93554473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_93554856_93555375_93555433_93556755_93556987_93563019_93563106_93563268
tx.21043	chr1	+	559	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000026281.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAATGTTAGATGCAGCAGA	8561	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93728216	93729585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_93728623_93729432
tx.21044	chr1	+	2064	10	FSM	ENSMUSG00000073609.10	ENSMUST00000097633.10	3232	10	1	1167	1	-1167	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	12.154357040244	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCGCGAGGCTGCCACCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93752962	93778903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_93753042_93754006_93754363_93756927_93756986_93757478_93757619_93760317_93760512_93763008_93763178_93765661_93765806_93766542_93766686_93775824_93775991_93778288
tx.21045	chr1	-	2477	17	NNC	ENSMUSG00000040648.16	novel	5882	28	NA	NA	403	1848	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	68.1880442233094	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTTGAGGTTACTTTTCC	9237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97697733	97668047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_97668351_97668548_97668671_97668794_97668921_97671781_97671868_97672887_97672998_97673119_97673196_97674142_97674230_97675271_97675374_97677266_97677389_97678291_97678454_97680428_97680531_97682779_97682935_97683610_97683697_97684568_97684660_97686893_97687090_97689149_97689547_97697579
tx.21046	chr1	-	1416	3	ISM	ENSMUSG00000040648.16	ENSMUST00000042509.13	5882	28	352	52503	352	-16380	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	182	junction_1	15.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTATTGCTGTCTATTTC	9186	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97697784	97686275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_97687090_97689149_97689547_97697579
tx.21047	chr1	-	2325	7	ISM	ENSMUSG00000009905.6	ENSMUST00000010049.6	5518	10	11887	2866	11843	-2866	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	165	junction_2	14.8211560502771	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAGAACAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106675570	106651054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_106652752_106655358_106655461_106662276_106662361_106667060_106667145_106671398_106671591_106675217_106675314_106675500
tx.21048	chr1	+	813	2	NNC	ENSMUSG00000064302.14	novel	1855	12	NA	NA	-31	-107353	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAGCATGTGTGTCGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118317042	118318140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_118317252_118317536
tx.21049	chr1	-	3386	24	NNC	ENSMUSG00000026383.15	novel	6442	25	NA	NA	24	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	20.4752605574637	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGATAATGTTAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119576706	119475853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_119476926_119477616_119477748_119478251_119478294_119481935_119482011_119482781_119482873_119495525_119495591_119497774_119497904_119500535_119500634_119506643_119506808_119526734_119526882_119532957_119532986_119535716_119535824_119536846_119537017_119543075_119543146_119544130_119544220_119545093_119545182_119545283_119545405_119547896_119547950_119548404_119548450_119549615_119549695_119551655_119551699_119561274_119561380_119570206_119570389_119576514
tx.2105	chr10	-	529	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025389.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	0.5	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCGGCTCTGCAGACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128067898	128064984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_128065342_128066773_128066877_128067829
tx.21050	chr1	-	1628	7	Intergenic	novelGene_53	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	3.76017139089283	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCATTTCAGGGTCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120228558	120220217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_120221086_120221255_120221360_120222992_120223201_120223780_120223908_120224004_120224116_120228248_120228305_120228404
tx.21051	chr1	+	738	7	FSM	ENSMUSG00000036104.13	ENSMUST00000142662.2	854	7	-14	130	-1	-130	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	21.5619263208709	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAGAAATTTTCTATCATC	3044	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127796524	127831640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_127796567_127796661_127796718_127801816_127801893_127816892_127817026_127818754_127818834_127829315_127829436_127831408
tx.21052	chr1	+	502	2	ISM	ENSMUSG00000036104.13	ENSMUST00000186865.7	1950	5	5	13058	5	-13058	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATTTCATACTTATAAATA	3050	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127796530	127797127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_127796567_127796661
tx.21053	chr1	+	312	3	NNC	ENSMUSG00000036104.13	novel	1950	5	NA	NA	5	-13058	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	52	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATTTCATACTTATAAATA	3050	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127796530	127797127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_127796567_127796661_127796718_127796907
tx.21054	chr1	-	2727	3	FSM	ENSMUSG00000036086.17	ENSMUST00000124876.2	515	3	-29	-2183	-20	2183	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_2	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAAGAAGAAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128030220	127983409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_127985738_128019579_128019748_128029989
tx.21055	chr1	+	2365	3	ISM	ENSMUSG00000056211.14	ENSMUST00000188381.7	1130	9	-9	23957	-9	1846	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	283	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATCCTTCTTTGAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128031048	128082909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_128031221_128079480_128079690_128080925
tx.21056	chr1	+	2183	8	FSM	ENSMUSG00000056211.14	ENSMUST00000190288.2	6449	8	4269	-3	4269	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_7	13.5796967295042	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCACTTTGTCTTTTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128138997	128165475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_128139097_128144137_128144290_128149336_128149441_128151205_128151379_128159059_128159205_128162802_128162886_128163278_128163364_128164133
tx.21057	chr1	-	481	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100078.2	novel	1388	1	NA	NA	1196	342	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGATGGGAAGATGAGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128448001	128447467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_128447581_128447633
tx.21058	chr1	-	1822	2	FSM	ENSMUSG00000045382.7	ENSMUST00000052172.7	1805	2	-17	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGCTGTGTGCTATGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128520044	128515935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_128517639_128519925
tx.21059	chr1	-	2500	9	NNC	ENSMUSG00000026399.13	novel	2533	10	NA	NA	10	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.1094479230428	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACTGTTGTCTCCTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390458	130366765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_130368117_130376051_130376146_130377153_130377301_130380120_130380313_130384557_130384644_130385823_130385924_130387318_130387511_130389558_130389745_130390306
tx.2106	chr10	-	631	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039994.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	8.5	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCGGCTCTGCAGACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128068167	128064984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_128065342_128066773_128066877_128067996
tx.21060	chr1	-	913	3	ISM	ENSMUSG00000026399.13	ENSMUST00000140725.8	3133	8	26	12522	26	410	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_2	13.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTGTGTATGTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390442	130386919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_130387511_130389558_130389745_130390306
tx.21061	chr1	-	470	2	ISM	ENSMUSG00000026425.16	ENSMUST00000189892.2	1044	6	14598	-1	-87	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGTTGCCAGATCTCTTG	9464	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131224205	131222955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_131223278_131224057
tx.21062	chr1	+	673	2	ISM	ENSMUSG00000042268.11	ENSMUST00000049027.10	4739	21	23786	1704	17317	-1704	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGGAGTCTCTGTCTTTG	6768	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131695545	131697538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_131695619_131696938
tx.21063	chr1	-	706	2	ISM	ENSMUSG00000026442.15	ENSMUST00000186389.7	3476	26	34794	29413	2862	-1	internal_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTAGCCAATTTTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132530035	132527573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_132527953_132529708
tx.21064	chr1	+	1137	2	Intergenic	novelGene_62	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTTTGTTCTGCAAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132771832	132774340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_132772097_132773467
tx.21065	chr1	-	694	3	ISM	ENSMUSG00000054387.14	ENSMUST00000185418.2	496	5	-19	3131	-1	-3077	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	238	junction_1	78	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAAAGTCACAGCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132953087	132939965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_132940450_132946514_132946623_132952985
tx.21066	chr1	-	686	3	ISM	ENSMUSG00000054387.14	ENSMUST00000067398.13	1914	11	14	20878	-4	-3081	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	161	junction_1	116.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAAAGTCACAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132953080	132939969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_132940453_132946514_132946623_132952985
tx.21067	chr1	-	1383	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116158.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.63299316185545	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGGACCTGGGTTCAATT	922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133257624	133246266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_133246781_133247009_133247204_133249489_133249612_133257071
tx.21068	chr1	+	1431	9	NNC	ENSMUSG00000070645.6	novel	1592	9	NA	NA	-12760	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.72753437013566	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTTTCGGATGGGTTCT	9353	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133265487	133288058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_133265620_133281864_133282016_133282539_133282664_133283232_133283352_133284122_133284320_133286141_133286262_133286675_133286821_133287071_133287171_133287714
tx.21069	chr1	+	1122	3	ISM	ENSMUSG00000070644.14	ENSMUST00000129213.2	2074	7	11596	76	9641	-76	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_1	4.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGGGAGTCTGGTATAGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133304665	133307978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_133304790_133306186_133306261_133307054
tx.2107	chr10	-	402	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025389.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCACAGTCTCTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128067927	128066460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_128066662_128066773_128066877_128067829
tx.21070	chr1	+	472	3	Intergenic	novelGene_65	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATGTGGAGACTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133413601	133414529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_133413714_133413979_133414117_133414306
tx.21071	chr1	+	583	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000090553.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATATGCGTATAAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133537789	133542171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_133538184_133541982
tx.21072	chr1	+	508	3	Intergenic	novelGene_67	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAGTGTGATGTTCGATT	8896	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133619303	133620361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_133619395_133619849_133620048_133620142
tx.21073	chr1	+	682	2	ISM	ENSMUSG00000026455.15	ENSMUST00000133721.8	3118	3	-12	7608	-12	-7608	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAGTTGCTCACATTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134383256	134386700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134383404_134386165
tx.21074	chr1	+	731	2	ISM	ENSMUSG00000026455.15	ENSMUST00000027725.11	3408	12	6	31951	6	-7503	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GGAAAAAAAAAAAAAGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134383274	134386805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134383404_134386203
tx.21075	chr1	+	1612	7	FSM	ENSMUSG00000026426.11	ENSMUST00000027684.11	1713	7	101	0	101	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	419	junction_3	43.3720980457354	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTGTGTATGGTGCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135074662	135084007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_135074839_135080208_135080290_135080530_135080605_135081913_135082008_135082145_135082214_135082450_135082522_135082959
tx.21076	chr1	+	1171	2	ISM	ENSMUSG00000026426.11	ENSMUST00000141177.2	472	3	477	-939	477	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	526	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGGGTGTGTATGGTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135082396	135084005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_135082522_135082959
tx.21077	chr1	-	964	4	ISM	ENSMUSG00000041926.16	ENSMUST00000077340.14	2288	11	17046	-9	364	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	267	junction_3	13.9602610609146	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTATAGAATGACTCATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135194776	135190440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_135190868_135191790_135191934_135192920_135193146_135194607
tx.21079	chr1	+	1987	3	NNC	ENSMUSG00000041498.14	novel	4102	15	NA	NA	49	3	intron_retention	FALSE	canonical	3	13	junction_1	26.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTGTGCTGTGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136394129	136399462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_136394385_136395585_136396913_136399057
tx.2108	chr10	+	1741	13	ISM	ENSMUSG00000039994.16	ENSMUST00000105244.8	4341	29	-9	8023	0	899	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	289	junction_8	43.2845879679541	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACAGGGCAGCCCCAAGGT	6606	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128067948	128080698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_128068045_128075702_128075867_128076006_128076161_128076248_128076364_128076458_128076522_128077143_128077246_128077452_128077609_128078178_128078313_128078499_128078588_128079063_128079241_128079938_128080157_128080306_128080411_128080528
tx.21080	chr1	-	2320	6	ISM	ENSMUSG00000026398.15	ENSMUST00000192929.6	1756	9	22	93844	22	1678	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_5	15.471263684651	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTACCAGCATGCAGTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136881346	136867044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_136868788_136871024_136871167_136872696_136872816_136876459_136876598_136879839_136879903_136881231
tx.21081	chr1	-	3876	10	FSM	ENSMUSG00000026393.11	ENSMUST00000186017.7	5258	10	31	1351	-14	-114	multi-exon	TRUE	canonical	3	136	junction_1	7.19739321808962	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTTCTATTTTGTTATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138547456	138411963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_138414849_138426313_138426428_138430308_138430404_138443362_138443471_138444265_138444375_138460474_138460586_138462101_138462165_138471940_138472082_138489440_138489524_138547289
tx.21082	chr1	+	1218	2	ISM	ENSMUSG00000033964.13	ENSMUST00000200243.5	2127	9	-44	17689	-44	-17689	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGAGCATCCATGAAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139349981	139351906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_139350065_139350771
tx.21083	chr1	+	1929	3	Intergenic	novelGene_68	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGGAAGATAAAAAAGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140149621	140156106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_140150029_140152666_140152854_140154771
tx.21084	chr1	-	441	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000101795.3	novel	1270	1	NA	NA	-32839	81	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATTAAATAATTACACTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143055193	143021003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_143021423_143055171
tx.21085	chr1	+	2744	8	FSM	ENSMUSG00000023150.15	ENSMUST00000111887.10	2783	8	39	0	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	234	junction_7	396.626282743927	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACGTCTGTAGCCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151220298	151232550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_151220507_151225126_151225355_151226731_151226861_151227304_151227475_151227580_151227657_151229670_151229845_151230384_151230511_151230917
tx.21086	chr1	-	3070	8	NNC	ENSMUSG00000026484.14	novel	3160	7	NA	NA	2	-101	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_6	238.380762132983	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTAAGCAGAAAGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151376582	151345257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_151347169_151347388_151347561_151348822_151349096_151351890_151352107_151352622_151352784_151354287_151354377_151359481_151359617_151376469
tx.21087	chr1	+	1324	6	FSM	ENSMUSG00000026483.14	ENSMUST00000111875.2	1296	6	-32	4	12	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	183	junction_3	9.98799279134702	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCTGTGTGGTATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151447214	151565929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_151447336_151512154_151512286_151517178_151517311_151520625_151520741_151525029_151525195_151565269
tx.21088	chr1	+	451	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032666.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGCATCTAATGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151960585	151961365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_151960609_151960937
tx.21089	chr1	-	597	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042751.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTGTGTCCTGTACTTGGG	3068	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152868140	152866077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_152866430_152867236_152867319_152867977
tx.2109	chr10	+	1332	3	NNC	ENSMUSG00000047631.5	novel	1258	2	NA	NA	-5380	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	2	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCACAGTATTTATCATTCA	1565	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128098485	128106022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_128098581_128104560_128104639_128104863
tx.21090	chr1	-	573	2	ISM	ENSMUSG00000026478.15	ENSMUST00000027752.15	7622	28	109031	2332	5389	-2332	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1069	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCCTACCGGAACTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153099501	153096999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_153097476_153099404
tx.21091	chr1	+	252	1	FSM	ENSMUSG00000101433.2	ENSMUST00000191584.2	211	1	-39	-2	-39	2	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCCACTCTGTCTCATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154907445	154907697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_154907400_154907700
tx.21092	chr1	-	1554	9	ISM	ENSMUSG00000026469.15	ENSMUST00000111774.2	2753	14	-12	29864	-12	10240	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	12	junction_3	3.1224989991992	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAAGTGACCAGATAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155293173	155188277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_155188685_155188916_155189108_155200059_155200142_155204344_155204429_155206083_155206234_155207908_155208133_155221298_155221401_155260356_155260409_155292911
tx.21093	chr1	-	1794	8	FSM	ENSMUSG00000033557.18	ENSMUST00000086153.8	4414	8	179	2441	165	-2441	multi-exon	TRUE	canonical	3	86	junction_7	39.1298205610869	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATACTGTTCCTCCAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156546477	156508581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_156509213_156513760_156513821_156514925_156515118_156518046_156518219_156526296_156526407_156529968_156530056_156533237_156533738_156546435
tx.21094	chr1	-	879	3	NNC	ENSMUSG00000101768.2	novel	722	3	NA	NA	11694	-64866	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTCCTCTGAGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156869910	156865195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_156865751_156868883_156869083_156869785
tx.21095	chr1	-	695	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040782.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.59966329107444	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTGAGTGTCCCCATTCA	5523	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	159163164	159158692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_159158986_159159747_159159923_159162738_159162810_159163008
tx.21096	chr1	-	895	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040782.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTGAGTGTCCCCATTCA	5522	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	159163165	159158692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_159158986_159159747_159159923_159162738
tx.21097	chr1	-	1113	3	ISM	ENSMUSG00000043467.20	ENSMUST00000159250.9	2473	5	2805	374	2216	-210	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATGACTCATTTATCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160859613	160847202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_160847977_160857211_160857312_160859374
tx.21098	chr1	-	3195	6	NIC	ENSMUSG00000026709.11	novel	2126	14	NA	NA	-1	3742	intron_retention	FALSE	canonical	3	329	junction_1	40.4791304254427	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGCCCTGATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160898229	160886266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_160888430_160890351_160890448_160890816_160890919_160892794_160892862_160896649_160896750_160897562
tx.21099	chr1	-	2558	4	ISM	ENSMUSG00000026705.17	ENSMUST00000111611.8	4072	12	33144	0	-2743	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_3	6.12825877028341	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTGTGTTGGATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160925937	160915944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_160918082_160921250_160921358_160923098_160923308_160925832
tx.211	chr1	-	1220	3	ISM	ENSMUSG00000025986.7	ENSMUST00000027131.6	5498	10	517	25084	517	3012	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	284	junction_2	7	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTTTTAGTTGAAGATTTA	445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46892689	46871787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_46871924_46874286_46875312_46892630
tx.2110	chr10	-	1406	4	FSM	ENSMUSG00000025383.3	ENSMUST00000026449.3	1360	4	-47	1	-47	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	5.73488351136175	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTGGGTCTAAATTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128134000	128132008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128132845_128132946_128133094_128133358_128133461_128133679
tx.21100	chr1	-	4019	12	FSM	ENSMUSG00000026705.17	ENSMUST00000111611.8	4072	12	53	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_3	12.7525722571391	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTGTGTTGGATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160959028	160915944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_160918082_160921250_160921358_160923098_160923308_160925832_160925967_160926711_160926856_160929020_160929205_160930548_160930665_160932970_160933066_160934276_160934436_160936791_160937366_160957958_160958023_160958932
tx.21101	chr1	-	2049	2	NNC	ENSMUSG00000040323.14	novel	798	3	NA	NA	-198	727	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	37	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TACAAGAGAACACAGGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161555256	161553083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_161554584_161554707
tx.21102	chr1	-	1510	6	ISM	ENSMUSG00000040297.13	ENSMUST00000048377.11	6327	24	16	40220	16	-3505	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_1	10.8332820511607	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTTGTCTTTATTCTTTG	434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161704235	161683902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_161684541_161684912_161685051_161686918_161687074_161689760_161689872_161691482_161691595_161703879
tx.21103	chr1	-	739	5	ISM	ENSMUSG00000040225.16	ENSMUST00000028016.16	8815	35	12	47128	12	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_3	9.8488578017961	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGCAAATGATGAAAACTA	3432	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162568107	162548098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_162548176_162548998_162549109_162550678_162550851_162552272_162552439_162567893
tx.21104	chr1	+	1233	2	ISM	ENSMUSG00000026578.7	ENSMUST00000027867.7	1909	6	4648	4806	4648	-4806	internal_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATTGATTTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164107801	164110610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_164108384_164109959
tx.21105	chr1	+	705	6	ISM	ENSMUSG00000026575.16	ENSMUST00000191947.6	1635	13	39731	-6	2585	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_1	11.7405280971513	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACTTTGGTTTTATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164175372	164264869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_164175449_164206927_164206993_164208209_164208279_164213268_164213371_164230538_164230647_164264584
tx.21106	chr1	-	1061	7	FSM	ENSMUSG00000040848.12	ENSMUST00000192185.6	3798	7	-80	2817	37	550	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	27.3780122645081	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGATTCTTTCTCTTGCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165021970	165006256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_165006865_165009620_165009651_165011395_165011452_165011538_165011575_165012576_165012659_165015816_165015904_165021808
tx.21107	chr1	-	1028	6	NNC	ENSMUSG00000026571.13	novel	4110	19	NA	NA	9736	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_5	17.3965513823861	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAAATTTGACTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165169831	165157075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_165157573_165160857_165160964_165164313_165164403_165165756_165165914_165167453_165167593_165169791
tx.21108	chr1	-	2530	3	NNC	ENSMUSG00000040723.15	novel	5001	6	NA	NA	51022	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_2	12	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGTTGGTTCTTATTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165484595	165476513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_165477780_165482873_165483606_165484063
tx.21109	chr1	-	3923	5	ISM	ENSMUSG00000026564.10	ENSMUST00000085992.4	4018	6	686	-3	686	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_3	2.77263412660235	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTCTTCATTCTGGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165954779	165925718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_165928956_165935541_165935760_165937620_165937853_165939599_165939695_165954638
tx.2111	chr10	+	2901	11	FSM	ENSMUSG00000005683.9	ENSMUST00000005826.9	2926	11	20	5	20	-5	multi-exon	TRUE	canonical	3	1246	junction_9	132.722869167299	1417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGTTTGAGCTTGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128173622	128198343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_128173829_128185621_128185673_128186301_128186410_128187067_128187134_128188542_128188675_128188891_128189081_128194202_128194403_128195038_128195169_128195302_128195405_128195812_128196023_128196836
tx.2112	chr10	-	1308	5	FSM	ENSMUSG00000039914.7	ENSMUST00000220027.2	1307	5	3	-4	3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	35.9400542570542	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCATTTTTTGAGGGGG	7248	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128204557	128198964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128199661_128200273_128200376_128200891_128201085_128203875_128204023_128204387
tx.2113	chr10	-	891	5	ISM	ENSMUSG00000025374.14	ENSMUST00000164199.8	1371	6	890	0	5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	274	junction_1	30.4989753926259	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGAGTCTGTGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128244707	128237263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_128237793_128244022_128244090_128244184_128244267_128244403_128244476_128244566
tx.2114	chr10	-	1356	6	FSM	ENSMUSG00000025374.14	ENSMUST00000164199.8	1371	6	15	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_1	33.0732520324204	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGAGTCTGTGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128245582	128237263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128237793_128244022_128244090_128244184_128244267_128244403_128244476_128244566_128244706_128245115
tx.21140	chr10	-	3703	6	FSM	ENSMUSG00000079685.11	ENSMUST00000177585.9	3815	6	53	59	2	-59	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	15.4324333790883	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATTACTGGAGGGATTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7423585	7393096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_7395698_7396417_7396553_7397380_7397485_7406339_7406616_7406953_7407209_7423253
tx.21142	chr10	+	2709	5	ISM	ENSMUSG00000040021.14	ENSMUST00000217931.2	4186	7	10875	249	10875	-249	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	10.3772587902586	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTTTTGAAGATTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7577885	7589101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_7578885_7581223_7581807_7586228_7586412_7586612_7586720_7588264
tx.21147	chr10	+	1189	2	FSM	ENSMUSG00000090112.9	ENSMUST00000161858.2	3028	2	0	1839	0	-1839	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTATTTGGTTCCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11025216	11028431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_11025331_11027356
tx.21148	chr10	+	3066	2	ISM	ENSMUSG00000047648.14	ENSMUST00000070300.5	2492	3	7936	-714	7936	714	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	746	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTTTGACTTTTTGAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11165266	11171976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_11167317_11170960
tx.21149	chr10	-	925	3	NNC	ENSMUSG00000019820.12	novel	430	2	NA	NA	153	15465	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATGTGTATTTATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12744956	12721641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_12721941_12737311_12737480_12744498
tx.2115	chr10	-	1088	7	FSM	ENSMUSG00000025374.14	ENSMUST00000026439.14	1130	7	42	0	42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_1	32.5444140965679	576	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGAGTCTGTGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128245701	128237263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128237793_128244022_128244090_128244184_128244267_128244403_128244476_128244566_128244706_128245115_128245218_128245604
tx.21151	chr10	+	743	2	NNC	ENSMUSG00000091367.2	novel	237	2	NA	NA	-8	11692	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAGGGAGGGGACAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17887007	17898945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_17887588_17898782
tx.21152	chr10	-	2832	2	ISM	ENSMUSG00000019852.8	ENSMUST00000215836.2	14579	34	152106	5816	151910	1748	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTATACCCTAGTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18467591	18463402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_18465521_18466877
tx.21153	chr10	-	1559	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000045591.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTTTTGTACATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19233323	19231431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_19232800_19233132
tx.21154	chr10	-	1450	10	FSM	ENSMUSG00000020003.17	ENSMUST00000020182.16	8099	10	27	6622	-11	267	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_4	9.53874490281544	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTATGACATGTCAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19783408	19736267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_19736741_19745039_19745140_19760523_19760580_19762805_19762920_19764401_19764509_19769995_19770105_19770470_19770549_19780308_19780460_19781590_19781649_19783204
tx.21155	chr10	+	3783	18	FSM	ENSMUSG00000019996.18	ENSMUST00000020173.16	4252	18	469	0	-44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	234	junction_11	29.0770364453276	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTTCTATTTATTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20024685	20157268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_20024827_20106529_20106629_20109114_20109193_20121015_20121180_20122343_20122462_20126115_20126227_20132929_20133044_20137604_20137730_20142481_20142598_20142868_20143123_20145105_20145335_20149025_20149201_20149524_20149627_20149991_20150043_20150347_20150406_20151921_20152022_20153870_20154092_20155741
tx.21158	chr10	-	2278	2	NNC	ENSMUSG00000039166.17	novel	2321	2	NA	NA	8901	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTTTCTTCTTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25067155	25044988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_25047147_25067035
tx.21159	chr10	-	395	3	Intergenic	novelGene_89	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACATGGTTATGGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26344380	26262859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_26263006_26334187_26334367_26344310
tx.2116	chr10	+	2319	7	FSM	ENSMUSG00000025373.15	ENSMUST00000096386.13	3144	7	-91	916	-2	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_5	11.6535640709422	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTCTTATGCCCTTTCTT	224	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128247523	128275291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_128247695_128250987_128251171_128264459_128264573_128271181_128271454_128272336_128272473_128273176_128273281_128273951
tx.21160	chr10	-	603	2	NNC	ENSMUSG00000069682.7	novel	365	2	NA	NA	-1	11	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATAGACTTCCTATATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29575377	29574730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_29574942_29574985
tx.2117	chr10	+	354	3	ISM	ENSMUSG00000025373.15	ENSMUST00000217826.2	1984	6	6	10763	6	-10763	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_1	10	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACCTTATCTGCCCTATTT	288	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128247587	128264523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_128247695_128250987_128251171_128264459
tx.2118	chr10	+	833	8	NNC	ENSMUSG00000025369.16	novel	4533	28	NA	NA	0	-3140	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_7	35.9194109310363	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTTTGTGTGTGTGTGT	2621	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128295116	128301597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_128295307_128297220_128297341_128298849_128298936_128299560_128299643_128299735_128299829_128301025_128301096_128301305_128301376_128301475
tx.21183	chr10	+	2623	14	NNC	ENSMUSG00000004207.15	novel	2657	15	NA	NA	23	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	130	junction_8	249.821972115103	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATCTGGCCTTGTGTCTCTT	7013	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60113472	60138377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_60113605_60127420_60127555_60128284_60128360_60129128_60129255_60130312_60130511_60130744_60130889_60131725_60131783_60134876_60135009_60135245_60135339_60135557_60135838_60135926_60136085_60136316_60136398_60136552_60136661_60137472
tx.2119	chr10	+	928	7	ISM	ENSMUSG00000025369.16	ENSMUST00000105235.10	4032	28	-67	23627	6	-3139	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_2	10.4788146064121	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTTTGTGTGTGTGTGTT	2627	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128295122	128301598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_128295307_128297220_128297341_128298849_128298936_128299560_128299643_128299735_128299829_128301025_128301096_128301305
tx.21195	chr10	+	786	3	ISM	ENSMUSG00000006344.18	ENSMUST00000218807.2	2051	11	20417	-3	5937	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTGGTGGTTCTAAGCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75445851	75451024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_75446066_75446261_75446373_75450563
tx.21196	chr10	-	392	2	Intergenic	novelGene_94	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAGTCTGTCTGAGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75728775	75723011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_75723169_75728540
tx.21197	chr10	-	173	1	Intergenic	novelGene_95	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAAAAGGAGAGGGATC	6913	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75791668	75791495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_75791500_75791700
tx.21198	chr10	-	2012	11	FSM	ENSMUSG00000020230.16	ENSMUST00000099571.10	2052	11	36	4	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_10	3.8262252939418	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCATTTTGTTCTGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76073663	76043059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_76043628_76044245_76044418_76045171_76045309_76046231_76046362_76053147_76053324_76056831_76056997_76058282_76058445_76061121_76061305_76062023_76062150_76072545_76072659_76073583
tx.21199	chr10	+	1881	9	ISM	ENSMUSG00000001150.8	ENSMUST00000170795.3	6427	29	33765	0	-1596	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	231	junction_6	32.0117166050182	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCCGCCTTAGTTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76338525	76351691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_76338640_76339996_76340256_76340463_76340562_76342131_76342523_76343123_76343382_76344131_76344262_76346853_76347058_76348251_76348403_76351415
tx.212	chr1	-	799	2	ISM	ENSMUSG00000025986.7	ENSMUST00000027131.6	5498	10	501	27884	501	212	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	284	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGAAGAAAGAAAACTCGG	429	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46892705	46874587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_46875312_46892630
tx.2120	chr10	+	895	9	ISM	ENSMUSG00000025369.16	ENSMUST00000105235.10	4032	28	-50	20220	23	268	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_2	9.74358763495254	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGAGCTCTGCTCCTCCCT	2644	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128295139	128305005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_128295307_128297220_128297341_128298849_128298936_128299560_128299643_128299735_128299829_128301025_128301096_128301305_128301376_128304663_128304740_128304874
tx.21200	chr10	-	2150	16	NIC	ENSMUSG00000001120.16	novel	2544	19	NA	NA	-40	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	35	junction_5	23.7172229965202	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTCTGACTTCTCTCTGC	1097	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76797761	76597689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_76598361_76599055_76599226_76603697_76603751_76606093_76606154_76606794_76606871_76617665_76617708_76620973_76621049_76624224_76624354_76625571_76625704_76633628_76633746_76634460_76634494_76635362_76635387_76636593_76636749_76661693_76661827_76728390_76728491_76797581
tx.21201	chr10	-	1051	3	NNC	ENSMUSG00000112143.2	novel	2014	5	NA	NA	40272	-440	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACTGGCTTCTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76804131	76800926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_76801816_76802193_76802285_76804060
tx.21202	chr10	-	738	3	ISM	ENSMUSG00000001435.16	ENSMUST00000081654.13	5063	42	-11	43812	-11	-15265	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	360	junction_2	15.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACCTGTGCTGCCCTACTG	5924	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77002393	76931823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_76932370_77002123_77002195_77002272
tx.21203	chr10	-	380	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000009291.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAAGCTGTGGTCATTCCT	469	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77417784	77409391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_77409642_77417654
tx.21204	chr10	-	609	5	FSM	ENSMUSG00000060301.7	ENSMUST00000220220.2	799	5	-75	265	0	-265	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1.78535710713571	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACTTACTCAGGGACTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78933434	78904409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_78904563_78924120_78924214_78928245_78928339_78930264_78930392_78933291
tx.21205	chr10	+	547	4	Intergenic	novelGene_98	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.62466929133727	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79333045	79354141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_79333161_79339891_79340016_79342005_79342116_79353943
tx.21206	chr10	+	1717	5	FSM	ENSMUSG00000020310.10	ENSMUST00000020554.8	1436	5	-281	0	-281	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	3.08220700148449	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTGGCATATTCTTTCG	2874	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79500111	79504371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_79500502_79500745_79501013_79501264_79501592_79502172_79502605_79504070
tx.2121	chr10	+	1426	11	ISM	ENSMUSG00000025369.16	ENSMUST00000105235.10	4032	28	-19	19247	-6	1241	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_2	8.72696969170857	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGCCTCTGTCTTGTGTTTT	2675	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128295170	128305978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_128295307_128297220_128297341_128298849_128298936_128299560_128299643_128299735_128299829_128301025_128301096_128301305_128301376_128304663_128304740_128304874_128305007_128305110_128305227_128305533
tx.21211	chr10	-	865	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000063457.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGAAAAGGAAGTACGGGCT	9410	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80129948	80128301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_80128692_80129473
tx.21213	chr10	+	726	7	NNC	ENSMUSG00000055862.8	novel	475	9	NA	NA	-10	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	10.8282039138539	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATGAGGAACAATTCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80538130	80541209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_80538189_80538882_80538964_80539042_80539115_80539563_80539591_80539686_80539763_80539872_80539921_80540845
tx.21214	chr10	-	472	4	NIC	ENSMUSG00000035215.10	novel	468	4	NA	NA	-1	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	184	junction_3	2016.46428736594	393	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCCTGCTCTGTAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80691044	80688658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_80688935_80689591_80689664_80690451_80690546_80691014
tx.21215	chr10	+	520	3	FSM	ENSMUSG00000034949.19	ENSMUST00000144087.2	436	3	6	-90	6	66	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTGTGTTGTCTGCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81068994	81073477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_81069077_81069444_81069596_81073190
tx.21216	chr10	+	874	3	ISM	ENSMUSG00000004933.18	ENSMUST00000151660.8	1761	11	3515	-69	560	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGTCTGATGCCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81097563	81098816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81097991_81098281_81098369_81098456
tx.21217	chr10	+	1127	2	ISM	ENSMUSG00000054452.11	ENSMUST00000217807.2	747	4	525	-394	-132	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2772	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCACTGTGTCCCTGCTTC	4708	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81400963	81402195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_81401201_81401305
tx.21218	chr10	-	1708	8	NNC	ENSMUSG00000034748.17	novel	1891	8	NA	NA	16	0	intron_retention	FALSE	canonical	1	2	junction_6	79.6005332768517	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTTACATTTATGTATT	9905	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81463384	81457618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_81458514_81458582_81458707_81459825_81459907_81459980_81460077_81460890_81460951_81461549_81461733_81462261_81462452_81463305
tx.21219	chr10	+	1004	5	NIC	ENSMUSG00000054708.18	novel	3561	20	NA	NA	5	222	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.40832691319598	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGGGTCTCATTTGCCT	2812	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81464378	81471954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_81464475_81464573_81464760_81465382_81465583_81470903_81470993_81471521
tx.2122	chr10	-	646	6	FSM	ENSMUSG00000090841.3	ENSMUST00000164181.2	665	6	18	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2189	junction_3	223.361948415571	18530	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTTCTTTCTTTCTTT	8242	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128329726	128326729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128326903_128327927_128328006_128328097_128328272_128328470_128328615_128329407_128329436_128329677
tx.21220	chr10	+	819	5	NNC	ENSMUSG00000054708.18	novel	4635	18	NA	NA	-5	235	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.20483682299543	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCTCAAGCTTGATCTT	7961	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81469527	81471967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_81469590_81470500_81470592_81470698_81470830_81470903_81470993_81471521
tx.21221	chr10	-	358	2	Intergenic	novelGene_100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCCTGTACATTTACAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81883862	81880896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_81881115_81883722
tx.21223	chr10	-	1491	12	ISM	ENSMUSG00000020256.15	ENSMUST00000146640.8	3938	23	25338	939	63	-939	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_9	8.35968286005284	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGGTGCTGTATGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83343921	83326231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_83326499_83328338_83328539_83329292_83329399_83331732_83331899_83333335_83333435_83335702_83335803_83337757_83337852_83338305_83338394_83339805_83339912_83339989_83340061_83342461_83342613_83343878
tx.21225	chr10	-	1465	6	ISM	ENSMUSG00000020263.15	ENSMUST00000020500.14	3020	21	39984	0	254	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_1	14.150618361047	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTATTGTGGTTAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83444618	83435896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_83436906_83437746_83437795_83438621_83438763_83438989_83439027_83441623_83441799_83444563
tx.21226	chr10	-	2960	21	FSM	ENSMUSG00000020263.15	ENSMUST00000020500.14	3020	21	60	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	12.9324205004322	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTATTGTGGTTAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83484542	83435896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_83436906_83437746_83437795_83438621_83438763_83438989_83439027_83441623_83441799_83444563_83444617_83444800_83444960_83446841_83446931_83447006_83447064_83447313_83447357_83448575_83448765_83450007_83450167_83453210_83453294_83456561_83456709_83457392_83457452_83457575_83457618_83460482_83460571_83464092_83464165_83464637_83464698_83476869_83476969_83484391
tx.21227	chr10	+	2427	6	NNC	ENSMUSG00000034453.9	novel	4975	28	NA	NA	73898	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	87.6597969424981	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGTCAGAACGGTACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84548857	84563026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_84549214_84549492_84549597_84550108_84550276_84554273_84554388_84556207_84556382_84561514
tx.21228	chr10	+	984	4	Intergenic	novelGene_104	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTTAGATTATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84874208	84902404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_84874605_84875547_84875698_84898937_84899007_84902035
tx.21229	chr10	-	927	4	ISM	ENSMUSG00000059602.15	ENSMUST00000121789.2	4006	7	-33	115826	-19	-56274	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.4142135623731	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGGGATGAAAGGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86334779	86243282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_86243569_86284729_86284788_86302842_86303300_86334653
tx.2123	chr10	+	766	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039824.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAATTTGAATATTTTAAA	7112	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128329852	128338843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_128330053_128338277
tx.21230	chr10	+	623	2	FSM	ENSMUSG00000089881.2	ENSMUST00000162458.2	623	2	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCATTCTTTACTGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86744623	86745876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_86744697_86745326
tx.21231	chr10	-	3198	11	NNC	ENSMUSG00000035365.16	novel	3594	11	NA	NA	-20	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	15	junction_2	20.7605394920267	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGGGTGGTTTATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87982760	87927293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_87929049_87929456_87929593_87946160_87946243_87947457_87947637_87950382_87950564_87960669_87960825_87962018_87962190_87968955_87969061_87975727_87975959_87979801_87979958_87982713
tx.21232	chr10	-	1701	3	ISM	ENSMUSG00000035365.16	ENSMUST00000164803.2	545	5	-29	5813	26	-5813	intron_retention	FALSE	canonical	3	41	junction_2	17.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGGTAGTGGTTGAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87982769	87974825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_87975959_87979801_87979958_87982357
tx.21233	chr10	-	1359	3	ISM	ENSMUSG00000035365.16	ENSMUST00000164121.8	637	5	-43	12754	12	-5813	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_2	6	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGGTAGTGGTTGAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87982783	87974825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_87975959_87979801_87979958_87982713
tx.21234	chr10	-	1088	3	NNC	ENSMUSG00000112428.2	novel	960	2	NA	NA	-6107	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTGGTGGACCTCATGGCC	3964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88500199	88486005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_88486771_88493937_88494141_88500079
tx.21238	chr10	-	3439	14	ISM	ENSMUSG00000019988.8	ENSMUST00000020163.7	3534	15	2789	-1	2732	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_9	21.0406763002428	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAGTCTGAGCTTGAACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92555493	92520606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_92522158_92522581_92522649_92525496_92525654_92526489_92526647_92527695_92527899_92528749_92528798_92530841_92530971_92534031_92534228_92534587_92534790_92536581_92536812_92547032_92547174_92549935_92550053_92552027_92552123_92555347
tx.21239	chr10	+	2163	6	ISM	ENSMUSG00000020015.11	ENSMUST00000069965.9	3615	17	74547	-5	-3586	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	213	junction_5	19.70786644972	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTGGAGTCACTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93071298	93077195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_93071398_93071888_93071995_93072782_93072826_93073655_93073747_93074827_93074906_93075449
tx.2124	chr10	+	1025	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039824.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.86744175568088	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTTACAGGAGCAAATTT	7114	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128329854	128338831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_128330053_128335177_128335396_128337503_128337559_128338277
tx.21240	chr10	-	498	3	ISM	ENSMUSG00000015890.3	ENSMUST00000016034.3	2421	9	25	13136	25	-13136	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAAACTGCCCCCCCCAAA	4255	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93375870	93372335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_93372552_93373120_93373228_93375695
tx.21242	chr10	-	1766	6	ISM	ENSMUSG00000036099.17	ENSMUST00000118205.8	3705	12	-60	20923	-1	821	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	13.001538370516	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTGGCTGGATTTTTTT	3410	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93871664	93828557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_93829517_93832699_93832976_93836212_93836386_93839854_93839945_93842821_93842957_93871531
tx.21245	chr10	-	981	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020023.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCTCTTCATTCATAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94350661	94348140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_94348753_94350193_94350451_94350549
tx.21246	chr10	-	340	3	NNC	ENSMUSG00000097164.3	novel	6566	3	NA	NA	-11	-5963	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.5	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGAAGTCACTTGGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94524449	94512849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_94512992_94514192_94514310_94524368
tx.21247	chr10	+	1608	2	ISM	ENSMUSG00000019952.16	ENSMUST00000162704.2	669	3	21496	-987	-112	27	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTGTTTCCTCTTTTTTA	3225	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99028641	99033877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_99028860_99032487
tx.21248	chr10	-	681	4	ISM	ENSMUSG00000036676.15	ENSMUST00000099318.10	2794	13	12	26227	4	1016	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_1	11.5854314646552	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTAAGTCAAAAGGACCAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100323197	100310266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_100310337_100312418_100312638_100313666_100313885_100323023
tx.21249	chr10	+	463	4	ISM	ENSMUSG00000019971.11	ENSMUST00000220346.2	8211	54	9	84267	9	-10807	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	2.62466929133727	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAAATGTCTTGGGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100323428	100325250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_100323615_100324140_100324271_100324423_100324502_100325181
tx.21250	chr10	+	1296	2	Intergenic	novelGene_109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAATGGAAAATGCAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106227089	106228597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_106227297_106227508
tx.21251	chr10	+	821	4	Intergenic	novelGene_112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTTTTCAAGCCAACTC	9347	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111269492	111303382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_111269650_111286160_111286324_111294899_111295021_111303002
tx.21252	chr10	-	1075	5	ISM	ENSMUSG00000020132.11	ENSMUST00000020343.9	4602	7	13964	3066	13964	-3066	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	420	junction_4	18.9390469665187	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACTGTGAGGTGAATTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115137532	115126054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_115126817_115130775_115130865_115131333_115131389_115134732_115134797_115137427
tx.21253	chr10	-	453	2	ISM	ENSMUSG00000020137.6	ENSMUST00000218842.2	4970	3	-3	7925	-3	-6857	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTGTTTTAAATCCTATTA	2365	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115220343	115212233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_115212453_115220109
tx.21254	chr10	-	563	2	FSM	ENSMUSG00000054934.11	ENSMUST00000087965.5	1626	2	-137	1200	-124	-1200	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAGATTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116309464	116299750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_116299940_116309090
tx.21255	chr10	+	1057	4	FSM	ENSMUSG00000097104.2	ENSMUST00000181656.2	918	4	-38	-101	-38	101	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTTTTTTTTTTGTTCTG	1407	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116510457	116515309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_116510787_116511802_116511918_116514407_116514569_116514857
tx.21256	chr10	+	436	4	Intergenic	novelGene_113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	5.09901951359278	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTGAAGAGCAATAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117060409	117063906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_117060473_117062608_117062653_117063449_117063496_117063623
tx.21257	chr10	+	383	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055531.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATATGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117215868	117219678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_117215949_117216651_117216761_117219484
tx.21258	chr10	-	1348	6	NNC	ENSMUSG00000112796.2	novel	1502	2	NA	NA	-4287	-468	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.894427190999916	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATCTGAGTCTGGGGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117254096	117245244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_117246100_117249630_117249771_117251734_117251826_117252725_117252794_117253453_117253552_117254000
tx.21259	chr10	-	553	5	NNC	ENSMUSG00000020184.16	novel	3007	10	NA	NA	-4	818	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	230.280264026251	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCACAAACCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117545931	117537345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_117537520_117538106_117538241_117541059_117541135_117545600_117545690_117545850
tx.2126	chr10	-	724	2	ISM	ENSMUSG00000093674.8	ENSMUST00000177513.2	680	3	73	-3	37	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22347	junction_1	0	758	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTGTTACGTGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128384934	128383982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_128384299_128384526
tx.21260	chr10	-	1754	3	ISM	ENSMUSG00000052798.14	ENSMUST00000218810.2	1233	9	-4	11247	3	-8182	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	907	junction_1	1	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATTAATAGCATGATAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117628607	117624402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_117625966_117626371_117626464_117628508
tx.21262	chr10	-	2356	7	ISM	ENSMUSG00000020227.11	ENSMUST00000020448.11	3097	12	31186	5	-95	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	13	junction_2	4.19324854180304	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTGTTGTTTTGTTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120006378	119977557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_119979097_119981550_119981716_119981802_119981866_119982335_119982535_120000997_120001117_120002309_120002425_120006222
tx.21263	chr10	+	1705	7	Intergenic	novelGene_123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_6	29.3338068143605	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGTCTTCAAATGATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120359243	120374524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120359328_120359405_120359477_120360126_120360189_120363521_120363638_120364338_120364520_120369971_120370079_120373440
tx.21265	chr10	-	780	2	ISM	ENSMUSG00000020115.4	ENSMUST00000219400.2	3005	21	35481	-5	1153	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTGTGTGCTTTTGTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121387201	121382359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_121383094_121387155
tx.21266	chr10	-	1404	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047642.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTTGGTCATGGTGTCTG	4711	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121493434	121490294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_121490799_121492206_121493017_121493344
tx.21267	chr10	-	267	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047642.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCCCTTGTTCAGACGAT	4720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121493425	121492830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_121493017_121493344
tx.21268	chr10	+	1074	4	ISM	ENSMUSG00000020105.10	ENSMUST00000074807.8	4016	19	44707	124	-671	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_2	3.2659863237109	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACTGAAGTTTTTTCAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125846828	125851104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_125846929_125848878_125849023_125849120_125849391_125850544
tx.2127	chr10	-	503	3	FSM	ENSMUSG00000093674.8	ENSMUST00000177163.8	544	3	41	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15318	junction_2	3514.5	6547	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTGTTACGTGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128384981	128383982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128384299_128384526_128384550_128384817
tx.21270	chr10	+	1964	2	NNC	ENSMUSG00000078429.10	novel	4817	8	NA	NA	2252	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	168	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAGGACTGGGAGCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126833733	126835838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_126835253_126835393
tx.21271	chr10	+	1707	6	FSM	ENSMUSG00000006731.11	ENSMUST00000219523.2	1497	6	-210	0	-57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	9.6	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCAATTTTTTTGTTTTG	297	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127001036	127004392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_127001389_127001872_127002092_127002586_127002752_127002867_127002975_127003370_127003412_127003569
tx.21272	chr10	-	744	3	NNC	ENSMUSG00000019467.16	novel	2571	14	NA	NA	1002	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	25	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGGTTGTTGTCTTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127019811	127018393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_127018813_127019066_127019279_127019698
tx.21273	chr10	-	871	3	ISM	ENSMUSG00000019467.16	ENSMUST00000218654.2	2475	15	4881	2	1053	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_2	10.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTGAGGTTGTTGTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127019760	127018396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_127018813_127019066_127019279_127019517
tx.21275	chr10	-	2720	3	FSM	ENSMUSG00000025417.9	ENSMUST00000218386.2	2706	3	0	-14	0	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	393	junction_1	9.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAGATAAATGAAGGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127047454	127040205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_127042580_127044738_127044837_127047206
tx.2128	chr10	-	391	4	FSM	ENSMUSG00000093674.8	ENSMUST00000176010.8	582	4	191	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7075	junction_3	6241.33064516071	60607	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTGTTACGTGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128384983	128383982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128384299_128384526_128384550_128384817_128384843_128384956
tx.21280	chr10	-	1002	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000002147.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.39934634239519	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCCATTCTGTAAATTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127489322	127484130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_127484385_127485942_127486154_127486404_127486435_127488815
tx.21283	chr10	-	1192	5	FSM	ENSMUSG00000039914.7	ENSMUST00000220227.2	1434	5	246	-4	-60	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_4	16.3248277173145	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCATTTTTTGAGGGGG	7185	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128204620	128198964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128199661_128200273_128200376_128200891_128201085_128203875_128204023_128204566
tx.21284	chr10	+	2316	7	NNC	ENSMUSG00000025373.15	novel	3144	7	NA	NA	-15	-4	intron_retention	FALSE	canonical	3	10	junction_4	45.9190108294545	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTCTTATGCCCTTTCTT	211	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128247510	128275291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_128247695_128250987_128251171_128264459_128264573_128271181_128271438_128272336_128272473_128273176_128273281_128273951
tx.21285	chr10	+	945	3	ISM	ENSMUSG00000025369.16	ENSMUST00000105235.10	4032	28	-77	25745	-4	-5257	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_2	13.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAGAAGAAGAAGAAGAA	2617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128295112	128299480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_128295307_128297220_128297341_128298849
tx.21286	chr10	+	1344	6	ISM	ENSMUSG00000025369.16	ENSMUST00000099131.11	4562	29	24783	775	9890	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_5	17.805617091244	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAAAAGAACTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128319959	128325216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_128320084_128320165_128320333_128321428_128321564_128323123_128323506_128323802_128323887_128324764
tx.21287	chr10	+	1476	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000099292.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCTATTATGAGCCTCTC	7113	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128329853	128350489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_128330053_128348972_128349082_128349227_128349309_128349402
tx.21288	chr10	-	2423	5	FSM	ENSMUSG00000047090.14	ENSMUST00000051011.14	2335	5	-88	0	-88	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_4	8.20060973342836	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGGAGATGCGCCTCTA	5649	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128640327	128635904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128637099_128637219_128637381_128637804_128638387_128638966_128639227_128640101
tx.21289	chr10	-	538	2	ISM	ENSMUSG00000025352.7	ENSMUST00000026408.7	4062	3	5353	2872	5353	-2872	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGCAGATTATCTACGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128722234	128721035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_128721356_128722016
tx.2129	chr10	-	1640	12	FSM	ENSMUSG00000025364.14	ENSMUST00000131728.4	2483	12	-24	867	-24	-867	multi-exon	FALSE	canonical	3	1853	junction_11	115.182428067554	889	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCGTCAAGCCCCTCTTT	8668	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128401880	128394503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128394841_128394930_128394985_128395098_128395227_128395306_128395402_128395950_128396164_128396527_128396607_128396787_128396852_128398695_128398789_128398934_128399005_128399092_128399199_128399445_128399575_128401608
tx.21290	chr10	+	804	4	NNC	ENSMUSG00000112742.2	novel	415	3	NA	NA	-42	922	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	29.0095769627128	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAATGTGGTAAAGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130378173	130408584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_130378320_130407161_130407289_130407478_130407540_130408114
tx.21291	chr11	-	1186	5	NIC	ENSMUSG00000023764.19	novel	914	8	NA	NA	-6	8792	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_4	39.3025126423235	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAGAAAAGAAAAAA	7997	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3143445	3126775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_3127522_3129396_3129508_3136064_3136137_3137239_3137411_3143359
tx.21292	chr11	+	793	4	ISM	ENSMUSG00000020454.18	ENSMUST00000120721.9	2952	16	21020	14399	-3117	1	internal_fragment	FALSE	canonical	3	208	junction_3	14.3061758225833	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGAGCAATTTGGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3174649	3180187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_3174808_3177394_3177531_3177705_3177886_3179868
tx.21293	chr11	+	3362	5	FSM	ENSMUSG00000020453.18	ENSMUST00000093402.12	3173	5	-191	2	-173	-2	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_4	189.564467925822	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCTCTGCCTGCTCCCCCG	6279	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3240265	3259081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3241885_3243279_3243344_3249033_3249206_3256287_3256361_3257647
tx.21294	chr11	+	819	3	ISM	ENSMUSG00000034614.15	ENSMUST00000136474.2	617	4	24	7713	24	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	7	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3282474	3283979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_3282615_3283208_3283413_3283504
tx.21295	chr11	+	589	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087055.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGCTGCTGTGTTTACAT	9972	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3303254	3303974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_3303481_3303611
tx.21296	chr11	-	2533	5	NIC	ENSMUSG00000020448.17	novel	2787	7	NA	NA	14	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	6	junction_4	59.9140008679107	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGAGTGTGGAGCTTGTG	6829	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3402349	3365981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_3368088_3369861_3369980_3375281_3375337_3376565_3376679_3402208
tx.21297	chr11	-	3063	2	FSM	ENSMUSG00000048807.3	ENSMUST00000051207.2	3059	2	-3	-1	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTCTGTCATTCCTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3864667	3857020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3857985_3862568
tx.21298	chr11	+	1041	8	NNC	ENSMUSG00000019368.14	novel	3238	11	NA	NA	-8	4636	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	6.1145527311522	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTGTAAGAGTGTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3981774	4002660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_3981900_3985122_3985199_3989435_3989480_3989770_3989831_3989936_3990126_3991736_3991833_3992190_3992252_4002270
tx.21299	chr11	-	754	4	ISM	ENSMUSG00000051427.15	ENSMUST00000093381.11	5015	12	27	8739	-12	146	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.09120616516523	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATGTACCTCATCCTTT	8520	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4110264	4099861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_4100103_4101671_4101931_4102908_4103057_4110158
tx.213	chr1	-	3046	5	FSM	ENSMUSG00000026107.12	ENSMUST00000186684.7	2677	5	0	-369	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_2	4.09267638593623	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATATAGGAGTAACAGAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51517558	51508646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_51510571_51511487_51511540_51512164_51512241_51513692_51513765_51516636
tx.2130	chr10	-	436	4	FSM	ENSMUSG00000025362.7	ENSMUST00000026420.7	681	4	246	-1	23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	11844	junction_3	3964.03030036631	61145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGCATCGGAGTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128462370	128460404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128460506_128461075_128461207_128461931_128462110_128462344
tx.21300	chr11	+	2146	2	FSM	ENSMUSG00000058755.4	ENSMUST00000131764.2	773	2	-10	-1363	-10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTGTCAGTCTTTTATT	8283	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4186409	4191027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_4186914_4189385
tx.21301	chr11	+	1441	2	ISM	ENSMUSG00000034209.5	ENSMUST00000037218.2	1110	3	-96	5	-96	-5	intron_retention	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACAATTTAAGGGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5008031	5010380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_5008525_5009432
tx.21302	chr11	-	477	4	Intergenic	novelGene_138	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAGGCTCTGTGGCTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5428380	5417471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_5417720_5417836_5417905_5428146_5428183_5428255
tx.21303	chr11	+	1507	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000049680.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.05480466765633	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAAAAATTTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5667585	5672001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_5667789_5668035_5668211_5670762_5671397_5671506
tx.21304	chr11	-	1014	2	NNC	ENSMUSG00000041798.16	novel	2361	10	NA	NA	150	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGCCTGCTGATTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5851937	5850819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_5851815_5851918
tx.21305	chr11	-	1035	2	ISM	ENSMUSG00000041798.16	ENSMUST00000109823.9	2361	10	12994	6	-43	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAACATGGCCTGCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5852130	5850825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_5851815_5852084
tx.21306	chr11	+	1511	5	ISM	ENSMUSG00000002741.10	ENSMUST00000002818.9	2541	7	86	4092	86	487	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_4	16.5302752548165	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCTGAGTCTCTGAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5905778	5913688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_5906005_5909296_5909380_5911187_5911289_5912336_5912442_5912692
tx.21308	chr11	-	1681	3	ISM	ENSMUSG00000020427.12	ENSMUST00000020702.11	2421	5	4319	0	4319	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_2	7.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCTTTTGTCTGTTTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159578	7156085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_7157507_7158368_7158509_7159458
tx.2131	chr10	-	2329	4	FSM	ENSMUSG00000049858.9	ENSMUST00000054764.9	2497	4	168	0	168	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	1.88561808316413	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGGAATCTCTTGGGCC	8760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128509774	128505762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128507796_128507972_128508151_128508407_128508472_128509720
tx.21311	chr11	-	1131	4	ISM	ENSMUSG00000020176.18	ENSMUST00000093321.12	5061	17	9	36547	9	477	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	11.7756811551038	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAAGAACAATTTTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11987392	11917054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_11917686_11920422_11920643_11937595_11937675_11987191
tx.21312	chr11	-	1737	2	NNC	ENSMUSG00000020152.8	novel	3631	9	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGAATTTTGTCTTTTTCT	1342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20062907	20012303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_20013957_20062823
tx.21315	chr11	-	1755	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000078965.6_ENSMUSG00000083792.2	novel	1002	1	NA	NA	-73	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTTCATAGAATCCTGGC	4388	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20286086	20240061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_20240510_20284779
tx.21316	chr11	-	3929	9	FSM	ENSMUSG00000049659.16	ENSMUST00000035350.12	3998	9	73	-4	-61	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_7	17.066048165876	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTGTCTTTGTATCTA	9333	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20691516	20635079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_20636199_20642464_20642589_20648312_20648374_20653710_20653834_20658680_20658738_20659619_20659747_20662163_20662316_20675684_20677640_20691305
tx.21317	chr11	+	525	2	FSM	ENSMUSG00000092626.2	ENSMUST00000174568.2	663	2	138	0	138	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTGTGTACTTGATTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22809068	22811264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_22809169_22810839
tx.21318	chr11	-	1402	14	FSM	ENSMUSG00000020273.14	ENSMUST00000102863.3	2171	14	0	769	0	-769	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_5	10.6554428128756	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACTTGGAACGGAATGAA	1286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23845236	23820824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_23820863_23822426_23822481_23823227_23823313_23823789_23823911_23824474_23824548_23826319_23826459_23829873_23829964_23832182_23832295_23834060_23834115_23835163_23835274_23835490_23835573_23840228_23840296_23841742_23841905_23845021
tx.21319	chr11	+	1342	4	NNC	ENSMUSG00000020463.16	novel	2410	12	NA	NA	-64	161	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	144.362968474144	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTTCTACTCTTACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29122825	29138511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_29123448_29124672_29124733_29132446_29132546_29137950
tx.2132	chr10	+	2178	12	NIC	ENSMUSG00000025359.11	novel	2130	11	NA	NA	-32	-111	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_1	18.002295537739	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGGCTTTTGTTGCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128541016	128555996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_128541154_128542104_128542228_128549913_128550025_128550150_128550298_128551089_128551225_128551395_128551558_128551795_128552420_128553619_128553737_128553926_128554012_128554466_128554673_128554768_128554857_128555753
tx.21320	chr11	+	350	2	Intergenic	novelGene_152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTATGAGAACCACAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29246686	29247721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_29246770_29247454
tx.21321	chr11	+	1172	3	ISM	ENSMUSG00000020305.14	ENSMUST00000117883.2	2509	9	42	56343	13	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_2	1.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTCTGTGAATATAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30904460	30979761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_30904570_30948312_30948522_30978907
tx.21322	chr11	-	2136	2	Intergenic	novelGene_154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTGCATACCATCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31934750	31930693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_31932543_31934463
tx.21323	chr11	+	2985	3	FSM	ENSMUSG00000044949.5	ENSMUST00000051053.5	1012	3	48	-2021	48	2021	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_1	5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTTGTCTTTGCCATTA	4529	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32405417	32468708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_32405547_32449224_32449462_32466089
tx.21324	chr11	-	798	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020272.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACATTACGATTGGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32564063	32562182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_32562751_32563436_32563569_32563965
tx.21325	chr11	-	1145	2	FSM	ENSMUSG00000069910.3	ENSMUST00000148387.2	671	2	-60	-414	-11	414	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGCCTAAGATACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34724479	34720746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_34721727_34724314
tx.21326	chr11	-	513	5	FSM	ENSMUSG00000020330.17	ENSMUST00000127705.8	1080	5	6	561	6	-561	multi-exon	FALSE	canonical	3	653	junction_1	36.1939221417077	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTTGAGCTTCGTGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40624237	40614224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_40614414_40615699_40615748_40619253_40619334_40619948_40620048_40624140
tx.21327	chr11	-	555	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000044707.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATTGAACTCGGGGGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43459245	43455200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_43455539_43457386_43457431_43459072
tx.21328	chr11	+	1245	2	NNC	ENSMUSG00000044707.8	novel	2672	6	NA	NA	55673	-700	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCTTGTTTACATA	1435	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43475745	43477124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_43475985_43476118
tx.21329	chr11	-	467	3	Intergenic	novelGene_161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTTCTGTCGGGTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44316446	44313991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_44314108_44314504_44314589_44316179
tx.2133	chr10	-	896	4	ISM	ENSMUSG00000025357.9	ENSMUST00000026414.9	2834	24	22559	-2	9531	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_2	12.5521135891752	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCCGCAAGGTTCTGAGA	8848	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128557385	128556000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_128556376_128556585_128556647_128556820_128556942_128557046
tx.21330	chr11	-	366	2	Intergenic	novelGene_162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCCATTTCTTTTGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44409756	44409263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_44409535_44409661
tx.21331	chr11	+	782	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000080776.2	novel	813	1	NA	NA	-24	69	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGAATATTTCTTGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46618620	46619526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_+_46618843_46618966
tx.21332	chr11	+	2978	3	FSM	ENSMUSG00000020346.17	ENSMUST00000081794.7	2976	3	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	11	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGTGTGTGTGTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49135070	49153854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_49135167_49136019_49136445_49151397
tx.21333	chr8	-	431	2	Intergenic	novelGene_367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATTGCCTTAGCTCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129474932	129473048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_129473263_129474715
tx.21334	chr11	+	1112	6	NNC	ENSMUSG00000020366.19	novel	1302	11	NA	NA	20035	583	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_5	140.778407435231	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGATGTTTTAGGCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49765118	49774720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_49765163_49769057_49769241_49770528_49770654_49772045_49772110_49772957_49773027_49774093
tx.21335	chr11	+	2024	12	NNC	ENSMUSG00000020374.17	novel	2120	13	NA	NA	-5517	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.42916167561589	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGAGTGTCCATATGTCTG	2151	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49849094	49871050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_49849314_49849426_49849565_49851224_49851426_49851980_49852056_49858163_49858254_49860322_49860426_49860870_49860951_49861032_49861129_49862195_49862292_49866453_49866578_49869234_49869308_49870321
tx.21336	chr11	+	1959	11	NNC	ENSMUSG00000020374.17	novel	2120	13	NA	NA	-5495	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.00832179129826	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTGCACATGAGTGTCCA	2173	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49849116	49871042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_49849314_49849426_49849565_49851224_49851426_49851980_49852056_49858125_49858254_49860322_49860426_49860870_49860951_49861032_49861129_49862195_49862292_49866453_49866578_49870321
tx.21337	chr11	+	889	3	NNC	ENSMUSG00000097887.3	novel	611	2	NA	NA	-16	-4103	intron_retention	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGCTATGTTTTTTGTTTT	8222	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50127822	50175563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_50128207_50154027_50154212_50175242
tx.21338	chr11	+	764	3	Intergenic	novelGene_164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTTTTGTGCGTGGAGGA	3461	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50216759	50224623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_50216880_50217699_50217765_50224044
tx.21339	chr11	-	2238	6	FSM	ENSMUSG00000048728.16	ENSMUST00000050595.13	2059	6	-177	-2	31	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	5.56417109729742	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTTGTTTCTTTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50778447	50763544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_50765115_50768869_50768933_50774010_50774104_50774511_50774639_50777195_50777326_50778192
tx.2134	chr10	-	1947	5	NIC	ENSMUSG00000047090.14	novel	2335	5	NA	NA	-81	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_2	11.8189466535728	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGGAGATGCGCCTCTA	5656	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128640320	128635904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_128637099_128637219_128637381_128638273_128638387_128638966_128639227_128640101
tx.21340	chr11	-	564	5	NIC	ENSMUSG00000049321.18	novel	539	5	NA	NA	2	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_2	24.8394846967484	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAAGTTCTTTAATGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50806990	50796817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_50796985_50801262_50801353_50801576_50801704_50803106_50803232_50806935
tx.21341	chr11	+	2632	5	FSM	ENSMUSG00000020364.15	ENSMUST00000102766.10	2592	5	-46	6	-46	-6	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_3	1.29903810567666	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTGGAGATAGTCCACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50950037	50962183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_50950230_50950898_50950982_50951686_50951814_50952229_50952326_50960049
tx.21342	chr11	+	1153	5	NNC	ENSMUSG00000052563.14	novel	3426	4	NA	NA	-16	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.76208734813001	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGTGTCGTTCCTGACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51541764	51548505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_51542041_51544560_51544699_51544818_51544941_51545599_51545711_51547999
tx.21343	chr11	-	882	3	ISM	ENSMUSG00000036391.17	ENSMUST00000147255.2	2744	8	706	7416	-17	4078	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_1	18	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTTCAGCCAGGAGCTCC	3756	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51647282	51627310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_51627349_51634362_51634828_51646903
tx.21344	chr11	-	2435	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081297.2	novel	596	1	NA	NA	-1654	1199	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGTAGTTTCTGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52371584	52368135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_52368313_52369326
tx.21345	chr11	-	1032	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018239.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAATCTGGCAAAGTTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53226630	53220024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_53220691_53223155_53223380_53226488
tx.21346	chr11	-	343	2	NNC	ENSMUSG00000020380.17	novel	693	3	NA	NA	2751	3110	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTATTTTTATCTATGCA	3839	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53583076	53579637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_53579844_53582939
tx.21347	chr11	-	529	2	ISM	ENSMUSG00000020380.17	ENSMUST00000124352.2	2211	12	-20	22674	4	-14008	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	253	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGTGGTTGCTTATTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53598142	53596755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_53596896_53597753
tx.21348	chr11	-	432	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020333.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTTTATGGTGAATGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54203712	54202583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_54202920_54203616
tx.21349	chr11	+	975	9	ISM	ENSMUSG00000035992.16	ENSMUST00000046835.14	6255	18	3	27331	3	-11801	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	98	junction_5	6.89995470999629	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACAAGTTTGGAAAATGGG	1979	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54329027	54381730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_54329215_54356912_54357040_54366457_54366593_54371075_54371177_54371435_54371511_54373320_54373413_54378537_54378622_54380094_54380167_54381628
tx.2135	chr10	+	3025	7	FSM	ENSMUSG00000025354.6	ENSMUST00000217745.2	4133	7	2	1106	2	650	multi-exon	FALSE	canonical	3	291	junction_3	32.4242707448191	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTTCCTTCTCTTCTTTA	4018	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128641424	128654022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_128641553_128642036_128643490_128649906_128650014_128650434_128650555_128652580_128652742_128652826_128652930_128653069
tx.21350	chr11	+	1927	6	ISM	ENSMUSG00000035992.16	ENSMUST00000046835.14	6255	18	16	34426	16	-18896	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_5	8.63481325796916	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAGACAGACAAACAGA	1992	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54329040	54374635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_54329215_54356912_54357040_54366457_54366593_54371075_54371177_54371435_54371511_54373320
tx.21351	chr11	+	818	6	ISM	ENSMUSG00000037533.21	ENSMUST00000108895.8	1829	13	-41	66391	2	7022	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_2	10.9799817850486	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTTGACTGTTGGATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54413674	54459444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_54413945_54434404_54434476_54437198_54437256_54443615_54443700_54452150_54452221_54459178
tx.21352	chr11	+	1105	9	ISM	ENSMUSG00000020261.16	ENSMUST00000020499.14	1950	12	-31	7735	-5	4028	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	47	junction_5	8.39549730510349	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCATCACCCTCAACCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55095170	55116928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_55095315_55104755_55104901_55109833_55109925_55110405_55110495_55111201_55111298_55112822_55112908_55114424_55114644_55115780_55115880_55116791
tx.21353	chr11	-	1194	10	FSM	ENSMUSG00000018593.14	ENSMUST00000108858.8	2115	10	0	921	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_8	195.999685058956	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGTAAGAAAGAAACTAG	3858	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55310724	55286246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_55286440_55286626_55286776_55289373_55289523_55290017_55290152_55292776_55292898_55296005_55296128_55297335_55297424_55298045_55298103_55300753_55300824_55310613
tx.21354	chr11	-	1082	2	Intergenic	novelGene_170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTTCTCGTTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57450924	57445632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_57446486_57450695
tx.21355	chr11	-	1090	2	Intergenic	novelGene_171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGACCGTTTTCTCGTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57448780	57445634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_57446486_57448541
tx.21356	chr11	+	1017	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087165.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGAACCCTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57686466	57687678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_57687227_57687421
tx.21357	chr11	+	695	2	ISM	ENSMUSG00000020519.6	ENSMUST00000020826.6	1151	4	6067	0	6067	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	572	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTCGGTCAGGAGGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57698529	57701043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_57698949_57700767
tx.21358	chr11	+	868	2	ISM	ENSMUSG00000037331.16	ENSMUST00000071487.13	6614	19	38910	11640	6361	7378	internal_fragment	FALSE	canonical	3	712	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCTTAAGAACCCTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57938799	57941217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_57938973_57940522
tx.21359	chr11	+	1500	5	NNC	ENSMUSG00000013646.18	novel	2977	7	NA	NA	-2	7319	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_4	49.4690559845243	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTCATGGTCAAGAAATG	467	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58221573	58229654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_58221619_58222079_58222690_58228562_58228626_58228774_58228904_58229001
tx.2136	chr10	+	2217	6	ISM	ENSMUSG00000025354.6	ENSMUST00000219508.2	2298	7	1170	-648	-532	648	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	291	junction_2	34.2776895370735	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACATCTTCCTTCTCTTCTT	5308	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128642714	128654020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_128643490_128649906_128650014_128650434_128650555_128652580_128652742_128652826_128652930_128653069
tx.21361	chr11	+	324	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000050818.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACTTTCCAATTTGTAAC	287	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58421958	58422443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_58422134_58422294
tx.21362	chr11	+	1250	5	FSM	ENSMUSG00000020491.16	ENSMUST00000073924.10	3866	5	3	2613	3	-2613	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_3	8.74642784226795	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTGCCCAGACTCAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58758044	58771501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_58758136_58759640_58759833_58767519_58767647_58769601_58769695_58770754
tx.21363	chr11	-	2658	4	ISM	ENSMUSG00000049291.7	ENSMUST00000061481.7	1243	5	280	-1520	280	1520	3prime_fragment	TRUE	canonical	2	4	junction_3	4.10960933531265	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCTTCTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59266203	59261974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_59263997_59264251_59264395_59264991_59265264_59265982
tx.21364	chr11	+	1454	8	ISM	ENSMUSG00000005417.18	ENSMUST00000156111.2	2236	10	4713	1	4713	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	461	junction_7	35.0544765547941	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCGGCCCCTCTCATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59656286	59667048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_59656352_59657553_59657714_59658780_59658901_59660038_59660126_59660709_59660873_59662442_59662529_59662977_59663044_59666341
tx.21365	chr11	-	1860	9	NIC	ENSMUSG00000042709.16	novel	1813	8	NA	NA	-1	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_8	136.995209770269	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATCTTTGGTCTAAGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60307863	60291453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_60292365_60294662_60294779_60295205_60295319_60296601_60296683_60298119_60298218_60300085_60300232_60300411_60300457_60302492_60302556_60307576
tx.21366	chr11	+	1108	4	ISM	ENSMUSG00000018415.15	ENSMUST00000070681.7	4283	6	15116	2487	15116	-2487	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	383	junction_1	34.296096311712	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTATTTTTATGGTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60323203	60333616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_60323267_60327173_60327276_60329268_60329400_60332804
tx.21367	chr11	-	1294	9	ISM	ENSMUSG00000002812.5	ENSMUST00000002889.5	4060	30	10735	0	-1807	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	292	junction_8	23.5836277955704	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTACTTTTAATATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60607354	60604968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_60605274_60605414_60605481_60605856_60605963_60606109_60606217_60606286_60606416_60606491_60606553_60606628_60606784_60606917_60607159_60607230
tx.21368	chr11	+	2830	2	ISM	ENSMUSG00000018599.6	ENSMUST00000018743.5	2522	4	7	2	7	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	155	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATATGTGTAATTCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60619230	60623775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_60619394_60621108
tx.21369	chr11	+	2353	3	ISM	ENSMUSG00000018599.6	ENSMUST00000018743.5	2522	4	1884	0	1837	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_1	11.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGTGTAATTCTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60621107	60623777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_60621262_60621455_60621619_60621741
tx.2137	chr10	-	1010	3	ISM	ENSMUSG00000025353.6	ENSMUST00000219215.2	1051	4	1089	-67	1074	67	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	748	junction_2	69	568	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTCTCTACTCCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128656386	128654283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_128654885_128655822_128655975_128656129
tx.21370	chr11	-	3165	11	NIC	ENSMUSG00000010025.20	novel	3091	10	NA	NA	-16	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_2	38.2758409443868	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTGTTAATTTTGACCT	1375	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61157969	61135675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_61137148_61138754_61138868_61139687_61139924_61141768_61141869_61144449_61144617_61147564_61147707_61149566_61149685_61153044_61153254_61155071_61155158_61155889_61156122_61157679
tx.21372	chr11	-	1882	9	ISM	ENSMUSG00000010122.15	ENSMUST00000131723.8	2987	18	15109	-2	2697	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_5	2.98956518577535	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGGCTGTAGATTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61253781	61234225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61235355_61239484_61239558_61240270_61240366_61243487_61243621_61243891_61243962_61250177_61250254_61250345_61250455_61253512_61253581_61253652
tx.21373	chr11	-	1780	8	NIC	ENSMUSG00000010122.15	novel	2987	18	NA	NA	2729	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_7	9.61928335401853	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGGGCTGTAGATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61253749	61234227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_61235355_61239484_61239558_61240270_61240366_61243487_61243621_61243891_61243962_61250177_61250254_61250345_61250455_61253652
tx.21374	chr11	-	2192	11	ISM	ENSMUSG00000010122.15	ENSMUST00000131723.8	2987	18	14441	1	2029	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_10	6.64003012041361	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTGGGCTGTAGATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61254449	61234228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61235355_61239484_61239558_61240270_61240366_61243487_61243621_61243891_61243962_61250177_61250254_61250345_61250455_61253512_61253581_61253652_61253767_61253848_61253947_61254219
tx.21376	chr11	-	1381	4	NIC	ENSMUSG00000001034.18	novel	3134	7	NA	NA	-28	-5	intron_retention	FALSE	canonical	1	9	junction_3	107.654798107449	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGACTCTGCGTCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61385042	61379642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_61380097_61380189_61380324_61380674_61381331_61384905
tx.21377	chr11	+	798	7	NNC	ENSMUSG00000001039.13	novel	817	7	NA	NA	24	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	128.875478229525	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTCTGGGGCCTTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61395993	61403754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_61396098_61397169_61397239_61398453_61398574_61399897_61399995_61400295_61400359_61403197_61403266_61403477
tx.21378	chr11	-	4251	10	FSM	ENSMUSG00000001036.18	ENSMUST00000001063.15	4243	10	-8	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_6	113.072029921715	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGGTTTTGGCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61470519	61408074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_61410534_61412484_61412701_61413231_61413319_61413854_61414020_61423343_61423519_61424396_61424508_61425403_61425440_61426096_61426210_61436975_61437738_61470392
tx.21379	chr11	-	3844	9	ISM	ENSMUSG00000001036.18	ENSMUST00000001063.15	4243	10	33042	12	-101	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_6	119.219794392542	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTATCATGATGTGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61437469	61408086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61410534_61412484_61412701_61413231_61413319_61413854_61414020_61423343_61423519_61424396_61424508_61425403_61425440_61426096_61426210_61436975
tx.2138	chr10	-	1002	4	FSM	ENSMUSG00000025353.6	ENSMUST00000219524.2	724	4	30	-308	-9	67	multi-exon	FALSE	canonical	3	322	junction_3	240.049994792751	1305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTCTCTACTCCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128657484	128654283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128654885_128655822_128655975_128656129_128656305_128657410
tx.21380	chr11	+	3924	6	NIC	ENSMUSG00000042331.14	novel	2690	6	NA	NA	-16	1198	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_2	7.07106781186548	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGGTTTGAATTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61967854	62030547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_61968063_62008525_62010109_62019025_62019234_62022655_62022730_62023101_62023281_62028875
tx.21381	chr11	-	1710	4	FSM	ENSMUSG00000046417.15	ENSMUST00000143262.2	567	4	0	-1143	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	67.1532244613433	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGACTGTGCTTTATTAG	5944	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62538875	62495709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_62497073_62500028_62500142_62511259_62511389_62538770
tx.21382	chr11	+	1737	7	ISM	ENSMUSG00000090173.9	ENSMUST00000150989.8	3267	13	12843	-2	12834	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.13437474581095	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTGTTGGTTGTCCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62750791	62768290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_62750867_62753455_62753578_62758346_62758496_62759837_62759981_62764196_62764356_62765767_62766016_62767449
tx.21383	chr11	+	2773	25	FSM	ENSMUSG00000020549.15	ENSMUST00000071891.12	2771	25	-1	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_24	61.5767221304718	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTGACAACAGTTTGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64869862	64892896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_64870158_64870543_64870595_64870732_64870804_64871433_64871499_64872442_64872501_64873581_64873651_64874419_64874552_64876388_64876448_64878096_64878156_64878233_64878307_64878857_64878971_64880178_64880275_64883046_64883186_64883264_64883351_64885061_64885181_64886131_64886229_64888693_64888833_64889166_64889206_64889333_64889444_64889962_64890063_64890143_64890265_64890511_64890591_64891121_64891267_64891820_64892040_64892657
tx.21384	chr11	+	616	4	NNC	ENSMUSG00000033196.18	novel	6018	39	NA	NA	23387	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCACCTTGGGTTGGCCCTGT	7132	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67085432	67088340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_67085553_67085618_67085740_67085831_67085928_67088061
tx.21385	chr11	+	1077	6	NNC	ENSMUSG00000033044.13	novel	1108	7	NA	NA	9800	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.4	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCTGGCTCGTCTGTCCTC	3509	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67698912	67706828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_67699159_67700608_67700722_67702280_67702492_67703490_67703584_67705819_67705976_67706570
tx.21386	chr11	-	1387	4	NNC	ENSMUSG00000018736.15	novel	2382	9	NA	NA	-45	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	106.773904427377	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTCGAGATTGCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68743912	68712259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_68713272_68734668_68734801_68736152_68736251_68743767
tx.21387	chr11	-	3892	19	FSM	ENSMUSG00000032782.20	ENSMUST00000092973.6	3861	19	-35	4	-35	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	88	junction_15	16.162847964421	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTAATGTTTAAGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69214636	69190316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_69190817_69191068_69191142_69193677_69193793_69193919_69194091_69195083_69195148_69196312_69196456_69198768_69199028_69200173_69200337_69200803_69200930_69202160_69202295_69205536_69205684_69206015_69206253_69209771_69209871_69210178_69210296_69210683_69210801_69211643_69211801_69212181_69212246_69212674_69212760_69213515
tx.21388	chr11	+	1612	2	NNC	ENSMUSG00000043419.12	novel	2081	2	NA	NA	-8	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGAAAGACTGTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69231278	69233467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_69231408_69231984
tx.21389	chr11	+	437	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000005237.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCCTCCCGTCGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69319831	69322874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_69320085_69322690
tx.2139	chr10	-	1081	4	FSM	ENSMUSG00000025353.6	ENSMUST00000026409.5	1573	4	-21	513	-9	67	multi-exon	FALSE	canonical	3	462	junction_3	176.577335905703	2516	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTCTCTACTCCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128657484	128654283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128654885_128655822_128655975_128656129_128656384_128657410
tx.21390	chr11	-	1009	2	NIC	ENSMUSG00000005237.15	novel	13704	86	NA	NA	-12161	-11941	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCTGGCCCAAGTCATGT	1485	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69368681	69367376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_69368175_69368470
tx.21391	chr11	+	1168	3	Intergenic	novelGene_176	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCTTGCTGTCCGTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69749671	69756757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_69749710_69750734_69750853_69755745
tx.21392	chr11	-	2517	20	ISM	ENSMUSG00000001588.13	ENSMUST00000001631.7	2482	22	4208	1	-840	-1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	29	junction_17	7.4342920349514	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCTTTCTTAGTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69782157	69772393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_69772552_69772807_69772858_69773207_69773319_69773410_69773521_69774409_69774583_69775147_69775318_69775411_69775507_69775621_69775692_69776218_69776431_69776518_69776643_69777793_69777895_69777981_69778034_69780062_69780173_69780261_69780337_69780443_69780540_69780645_69780691_69780824_69781009_69781259_69781319_69781414_69781469_69781689
tx.21393	chr11	+	1527	13	ISM	ENSMUSG00000020888.17	ENSMUST00000019362.15	2968	15	220	1685	-6	357	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	488	junction_4	32.5444140965679	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCGGGGACCTCAGTGG	7355	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69891640	69899252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69891853_69895630_69895701_69895980_69896127_69896262_69896373_69896487_69896624_69896763_69896855_69896961_69897032_69897116_69897257_69897339_69897417_69898278_69898347_69898640_69898770_69898845_69898978_69899106
tx.21394	chr11	+	1827	8	ISM	ENSMUSG00000020888.17	ENSMUST00000019362.15	2968	15	5783	-1	-602	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	521	junction_4	27.6685926712611	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCCAAGCCTCTGGCTCCT	2172	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69897203	69900938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69897257_69897339_69897417_69898278_69898347_69898640_69898770_69898845_69898978_69899106_69899287_69899602_69899822_69899969
tx.21395	chr11	+	417	2	FSM	ENSMUSG00000040938.17	ENSMUST00000149880.2	558	2	141	0	141	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCTTGAGAGTTCCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70105784	70107239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70105925_70106962
tx.21396	chr11	-	352	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018286.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCTGCCAGATGGGAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70418479	70418007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_70418141_70418260
tx.21397	chr11	+	1076	5	FSM	ENSMUSG00000020817.17	ENSMUST00000179114.8	1264	5	146	42	-4	-42	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_4	19.8179211826064	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGCCTCCTGAGTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70735763	70784905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70735835_70765571_70765701_70775590_70775795_70777836_70777998_70784394
tx.21399	chr11	-	552	2	ISM	ENSMUSG00000057778.15	ENSMUST00000079681.6	2393	4	38	11740	23	3917	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCATGGTTTCTCATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72686644	72679797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_72680044_72686338
tx.214	chr1	-	1108	10	ISM	ENSMUSG00000018417.15	ENSMUST00000114537.9	4618	29	-7	47408	-7	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_4	20.3239201040316	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTAAGTTAGTGGACAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51955107	51836548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_51836695_51838690_51838795_51840342_51840442_51852161_51852226_51859299_51859347_51863255_51863361_51873607_51873703_51902477_51902594_51922241_51922386_51954919
tx.2140	chr10	+	878	8	FSM	ENSMUSG00000025351.15	ENSMUST00000026407.9	1063	8	192	-7	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3700	junction_1	227.971623726484	30059	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGATGGTCTCAGTTTATC	546	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128745759	128748691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_128745828_128746263_128746341_128747320_128747510_128747663_128747739_128747836_128747933_128748029_128748171_128748306_128748391_128748543
tx.21400	chr11	+	1510	3	ISM	ENSMUSG00000020788.16	ENSMUST00000108486.8	4540	22	27838	0	6910	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_2	6.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTAGTCTTTTCTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72879832	72883870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_72879914_72880300_72880374_72882514
tx.21401	chr11	-	1282	2	ISM	ENSMUSG00000005949.10	ENSMUST00000144658.8	715	4	-7	4236	-7	-3834	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGCCTCAGACCATGAGGCC	4479	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73089854	73086372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_73087544_73089743
tx.21402	chr11	-	1017	4	ISM	ENSMUSG00000001323.18	ENSMUST00000121738.8	3183	8	251	3709	6	-56	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_3	14.1656862405839	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCTTATGTCACGTGAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74816523	74801333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_74801973_74802094_74802222_74803787_74803960_74816444
tx.21403	chr11	+	1925	5	ISM	ENSMUSG00000018809.3	ENSMUST00000044530.3	3517	11	46	14363	-16	668	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_2	6.29980158417708	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCCGTCTTATATATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75239304	75282168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75239578_75240494_75240641_75273075_75273221_75278236_75278327_75280897
tx.21404	chr11	+	2929	10	NIC	ENSMUSG00000018809.3	novel	3517	11	NA	NA	5	-376	intron_retention	TRUE	canonical	1	2	junction_2	24.9701055832671	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	ATAAAAATAAGTAAAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75239325	75296155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_75239578_75240494_75240641_75278236_75278327_75280897_75282054_75290426_75290610_75291107_75291272_75292943_75293077_75293934_75294052_75294242_75294367_75295591
tx.21405	chr11	-	2188	9	NNC	ENSMUSG00000020847.16	novel	2199	9	NA	NA	-28796	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_8	4.18330013267038	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGACTGGGCGCAAGAGTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75858051	75721826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_75723041_75724227_75724375_75725588_75725703_75745129_75745305_75769774_75769862_75797343_75797474_75799736_75799881_75801775_75801886_75857984
tx.21406	chr11	-	2008	7	NIC	ENSMUSG00000020847.16	novel	988	8	NA	NA	-4	-35	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	6.97614984548545	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCTAAATAAACCTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75801892	75721859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_75723041_75724227_75724375_75725588_75725703_75745129_75745305_75797343_75797474_75799736_75799881_75801775
tx.21407	chr11	-	371	2	Intergenic	novelGene_179	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCCTCCTCTCTTCAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75882092	75880184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_75880440_75881976
tx.21408	chr11	-	1164	9	NNC	ENSMUSG00000017286.16	novel	1434	9	NA	NA	-19	52	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	248.496478848293	48	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCCAGACTGAGACAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76134520	76112567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_76112858_76123847_76123935_76124027_76124135_76124725_76124813_76125214_76125352_76128494_76128640_76130277_76130399_76131698_76131749_76134380
tx.21409	chr11	+	1463	4	NNC	ENSMUSG00000038046.5	novel	1510	4	NA	NA	23	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_1	62.7818091134331	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATATGAGTGTTTGCAGG	594	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76134584	76141445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_76134913_76135107_76135350_76138172_76138341_76140720
tx.2141	chr10	+	813	7	ISM	ENSMUSG00000025351.15	ENSMUST00000026407.9	1063	8	693	-7	-230	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3705	junction_4	220.245065526765	5765	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGATGGTCTCAGTTTATC	1047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128746260	128748691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_128746341_128747320_128747510_128747663_128747739_128747836_128747933_128748029_128748171_128748306_128748391_128748543
tx.21410	chr11	-	1210	4	ISM	ENSMUSG00000017291.14	ENSMUST00000017435.11	11813	19	40147	8424	40147	-8424	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_2	9.89949493661167	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGCTTAATTAGAAGGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77436185	77428411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_77429155_77430879_77431063_77432450_77432664_77436114
tx.21411	chr11	-	2470	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081543.2	novel	767	1	NA	NA	-127	102080	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTCAGTGTTTATAACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77535863	77432889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_77434465_77534968
tx.21412	chr11	-	1931	7	NNC	ENSMUSG00000017386.11	novel	2078	7	NA	NA	293	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	183.558725086975	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGATTCCAGCCTGTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78056049	78050230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_78051375_78051618_78051775_78051858_78052021_78052112_78052275_78052343_78052449_78053207_78053260_78055899
tx.21413	chr11	+	1494	11	ISM	ENSMUSG00000002055.10	ENSMUST00000045026.4	3887	24	13914	3	86	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_3	25.981531902488	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTTCCAGTCCACTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78206268	78213280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78206469_78206725_78206868_78210292_78210405_78210811_78210899_78211157_78211279_78211386_78211499_78211868_78211950_78212087_78212244_78212323_78212399_78212511_78212593_78212953
tx.21414	chr11	-	1500	2	Intergenic	novelGene_182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGCACGCCTTTGATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78326961	78322561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_78323805_78326704
tx.21415	chr11	-	1116	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000049489.6	novel	1224	1	NA	NA	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	11	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGTCTGCCTTATGGTA	6617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78642533	78641331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_78641766_78641851
tx.21416	chr11	-	1061	4	ISM	ENSMUSG00000018334.19	ENSMUST00000018478.11	5495	19	125648	2111	-349	1485	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	12.3917535302941	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGCTTCTAGACTGATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78911585	78906376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_78907090_78910387_78910522_78911180_78911317_78911507
tx.21417	chr11	-	683	4	NIC	ENSMUSG00000018334.19	novel	491	3	NA	NA	-377	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	11.5181016954473	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTGGCTCTTGCTTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78911613	78907855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_78908163_78910387_78910522_78911180_78911317_78911507
tx.21418	chr11	-	1224	4	Intergenic	novelGene_183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGCAGATGCGTGTCTCT	3824	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79083186	79073660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_79074571_79074985_79075021_79082823_79082942_79083025
tx.21419	chr11	+	3051	13	NIC	ENSMUSG00000017639.14	novel	677	3	NA	NA	-10	-4010	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	75	junction_1	20.8706332758097	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTCAGTTTGTTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79551377	79584839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_79551683_79571613_79571838_79574166_79574362_79575048_79575184_79575426_79575463_79575853_79575954_79576211_79576316_79577377_79577519_79580440_79580523_79581283_79581422_79581497_79581654_79582581_79582726_79583548
tx.2142	chr10	-	542	4	FSM	ENSMUSG00000090247.8	ENSMUST00000026405.10	550	4	9	-1	9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	559	junction_1	37.4788829431544	5502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTGTGTTTGAAGGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128759384	128755781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_128755977_128756427_128756561_128758522_128758596_128759243
tx.21420	chr11	-	701	2	NNC	ENSMUSG00000086474.3	novel	696	2	NA	NA	-9	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACCCCAGGTTGATTTTG	8486	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79696007	79672812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_79673383_79695876
tx.21421	chr11	+	2789	5	ISM	ENSMUSG00000017548.16	ENSMUST00000163272.2	4303	15	32112	20	23	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1908	junction_4	172.296981981693	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTCTTCTGCTTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79916043	79924928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_79916138_79916622_79916781_79919973_79920173_79920832_79920913_79922670
tx.21422	chr11	+	1832	7	FSM	ENSMUSG00000020697.17	ENSMUST00000173009.8	1785	7	-47	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_3	26.4601377337475	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAACTATTTGTGGCTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82671976	82681130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_82672103_82674171_82674726_82676140_82676285_82678453_82678655_82679589_82679742_82680372_82680540_82680642
tx.21423	chr11	-	3358	5	NNC	ENSMUSG00000020696.19	novel	3489	7	NA	NA	41	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	57.3476241879295	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGTCCCATCTGGTGTG	2784	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82761995	82694644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_82697016_82700818_82701045_82703225_82703637_82709241_82709430_82761833
tx.21424	chr11	+	1505	3	FSM	ENSMUSG00000018986.11	ENSMUST00000019130.8	1816	3	-15	326	-15	5	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	4.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGTGGTTACACTGCGGA	3779	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83082140	83105654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_83082235_83103369_83104440_83105313
tx.21425	chr11	+	232	2	ISM	ENSMUSG00000035152.15	ENSMUST00000132178.3	3576	12	-46	36315	-46	-8250	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAAGAAGGGTGAGTAGGGG	2133	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83193482	83199091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_83193664_83199040
tx.21426	chr11	+	852	2	FSM	ENSMUSG00000020680.16	ENSMUST00000152405.2	649	2	-7	-196	-7	196	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGGGTGTTCAGTTTGCA	8672	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83363929	83373508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_83364033_83372759
tx.21427	chr11	+	1566	6	ISM	ENSMUSG00000000976.14	ENSMUST00000125831.8	4067	20	21984	-7	1274	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_4	4.35430821141545	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTTTTCAAGAGTGTTT	1918	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83666523	83672854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_83666662_83667439_83667563_83668063_83668189_83669670_83669768_83670226_83670432_83671976
tx.21428	chr11	+	455	3	NNC	ENSMUSG00000034940.16	novel	3995	22	NA	NA	11841	63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	29	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCCTGCCACTGGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83929321	83931843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_83929445_83930036_83930148_83931622
tx.2143	chr10	+	497	3	FSM	ENSMUSG00000112742.2	ENSMUST00000218557.2	415	3	-35	-47	-35	47	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_1	6.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAATCTATGTACCTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130378180	130407709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_130378320_130407161_130407289_130407478
tx.21430	chr11	+	1451	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000082806.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTCTAGAAAAAGAATGAA	5441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84963267	85002667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_84963885_85001833
tx.21431	chr11	-	2322	5	ISM	ENSMUSG00000018481.10	ENSMUST00000018625.10	6463	13	34728	2868	34728	-2868	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	375	junction_2	21.4169909184274	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTGCCTGAACTTTTTGT	2896	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85091228	85080955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_85082726_85085400_85085567_85086891_85087083_85088891_85088978_85091119
tx.21432	chr11	+	179	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034297.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAGAAAGAA	7119	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86208553	86215730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_86208706_86215703
tx.21433	chr11	+	1566	8	ISM	ENSMUSG00000020513.16	ENSMUST00000069503.13	1871	9	3857	0	3857	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	8.77380144730519	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTCAGTCTGTTAAGTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86439673	86458186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_86439829_86440149_86440298_86443613_86443831_86445898_86446131_86448550_86448716_86452061_86452203_86456510_86456695_86457862
tx.21434	chr11	-	1851	7	ISM	ENSMUSG00000018425.19	ENSMUST00000018569.14	3813	18	135	27961	135	2780	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_4	10.1228564260401	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAGTGGATGTGCTCTCTC	8662	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86698437	86687632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_86688581_86689747_86689815_86690245_86690474_86691794_86691915_86695082_86695229_86697285_86697454_86698263
tx.21435	chr11	+	680	2	NIC	ENSMUSG00000034177.16	novel	3670	9	NA	NA	-34	-13295	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCATTTCTTCTTTTTCTTT	6744	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87590688	87595990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_87590950_87595571
tx.21436	chr11	+	1651	3	NIC	ENSMUSG00000018379.18	novel	896	4	NA	NA	1	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	275	junction_2	652.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGATGCATGGTTGTCCTTT	7467	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87939415	87942315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_87939501_87939868_87940922_87941802
tx.21437	chr11	+	378	2	ISM	ENSMUSG00000018379.18	ENSMUST00000172186.2	401	4	4	1784	4	512	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1580	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATTCGTTCAGCTTGTCT	7470	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87939418	87940164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_87939501_87939868
tx.21438	chr11	+	672	4	FSM	ENSMUSG00000018378.14	ENSMUST00000125297.2	805	4	56	77	56	-77	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0.816496580927726	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGGAAGAAGAAGGATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88078702	88083753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_88078914_88079608_88079668_88080880_88080952_88083422
tx.21439	chr11	+	637	3	NNC	ENSMUSG00000072553.11	novel	503	3	NA	NA	-23	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCATCTCTTTCCTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88965811	88983870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_88965916_88979381_88979550_88983505
tx.2144	chr10	+	494	4	NNC	ENSMUSG00000112742.2	novel	415	3	NA	NA	-17	1150	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	50	junction_3	7.25718035235908	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGGAGAGAAACCTTACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130378198	130408812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_130378320_130407161_130407289_130407478_130407540_130408627
tx.21441	chr11	-	751	2	ISM	ENSMUSG00000020541.13	ENSMUST00000154599.2	592	6	-6	13356	-6	-1188	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	271	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAACAAAGTCATTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90578420	90575303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_90575973_90578338
tx.21442	chr11	+	904	2	FSM	ENSMUSG00000020864.14	ENSMUST00000149867.2	753	2	447	-598	447	598	multi-exon	FALSE	canonical	3	477	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAGTTCCTCCAATTGTC	9893	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94224725	94226007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_94224876_94225253
tx.21443	chr11	-	1437	3	ISM	ENSMUSG00000076435.4	ENSMUST00000103164.4	3154	16	42895	0	4921	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_2	5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGATTGGACTGTAACTC	6662	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94449802	94447927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_94449184_94449465_94449535_94449690
tx.21444	chr11	-	3200	16	FSM	ENSMUSG00000076435.4	ENSMUST00000103164.4	3154	16	-46	0	-46	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_6	8.37615663654877	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGATTGGACTGTAACTC	7239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94492743	94447927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_94449184_94449465_94449535_94449690_94449802_94450288_94450431_94452065_94452218_94453636_94453745_94460135_94460213_94460766_94460859_94461128_94461287_94461439_94461536_94462096_94462263_94462387_94462507_94463051_94463106_94463347_94463477_94463858_94464055_94492468
tx.21445	chr11	-	1348	5	NNC	ENSMUSG00000081007.2	novel	370	3	NA	NA	-3072	512	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.08972473588517	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGGATCCTGTTCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94722828	94718499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_94719193_94719372_94719572_94719710_94719795_94720273_94720297_94722479
tx.21446	chr11	-	562	3	NNC	ENSMUSG00000001508.16	novel	1724	11	NA	NA	6401	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCGTTTCTAGTGCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94855101	94853616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_94853907_94854027_94854226_94855027
tx.21448	chr11	+	1034	2	NNC	ENSMUSG00000084856.2	novel	914	3	NA	NA	-65	-2056	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATAGTCTGGTGGAGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95513420	95518606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_95513605_95517756
tx.21449	chr11	-	834	2	ISM	ENSMUSG00000013418.9	ENSMUST00000038343.7	1722	11	47921	-279	47921	279	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTTATTTAAAGCCAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95757796	95756489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_95757103_95757575
tx.2145	chr11	+	575	2	NNC	ENSMUSG00000082286.12	novel	789	3	NA	NA	-2217	-3285	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGGCAAGTAAGCAAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3073686	3075924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_3074125_3075787
tx.21450	chr11	+	576	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000075586.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGACCCACAGTAACTGCTT	6163	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96338991	96351090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_96339120_96340036_96340112_96350717
tx.21451	chr11	-	2488	6	FSM	ENSMUSG00000001444.3	ENSMUST00000001484.3	2488	6	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1.26491106406735	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACGCCCTCCTTCTGTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97006157	96988896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_96990205_96990595_96990658_96990752_96990912_96992304_96992427_96992769_96992925_97005475
tx.21452	chr11	-	2941	14	ISM	ENSMUSG00000001441.14	ENSMUST00000001480.14	4215	23	42378	-2	-3178	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	299	junction_11	34.4447074283189	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGGCCTGGTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97129086	97096667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_97098095_97103105_97103154_97103857_97104014_97104596_97104705_97108616_97108674_97109333_97109477_97113776_97113997_97115484_97115620_97117554_97117695_97120655_97120720_97122714_97122825_97125880_97125942_97126890_97126996_97128919
tx.21453	chr11	-	2486	10	ISM	ENSMUSG00000001441.14	ENSMUST00000165489.8	2078	16	11973	-1079	2369	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	312	junction_6	37.0278507126063	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAATGTGAATTTGTTGG	6253	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97120719	97096679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_97098095_97103105_97103154_97103857_97104014_97104596_97104705_97108616_97108674_97109333_97109477_97113776_97113997_97115484_97115620_97117554_97117695_97120655
tx.21454	chr11	+	1222	3	ISM	ENSMUSG00000038485.7	ENSMUST00000045540.4	7015	10	25876	4904	10990	-4904	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTTAGTATTTACATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97279252	97284464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_97280074_97280391_97280543_97284214
tx.21455	chr11	+	293	2	NNC	ENSMUSG00000049807.17	novel	5816	24	NA	NA	16	-20650	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGTTGATTTATCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97306374	97314404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_97306494_97314230
tx.21456	chr11	-	445	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085860.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTGGTGTTATCTATTCT	1642	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97509390	97506181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_97506523_97509286
tx.21457	chr11	-	1826	4	NIC	ENSMUSG00000038352.16	novel	1571	6	NA	NA	31	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.85861230093008	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCACTTCTTATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97886724	97880403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_97881166_97884250_97884335_97885163_97885312_97885892
tx.21458	chr11	-	1144	2	ISM	ENSMUSG00000017400.11	ENSMUST00000017544.9	3050	11	101	6489	101	-3014	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTCATGCCCCTCTCCAA	5460	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97944187	97933937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_97934613_97943718
tx.21459	chr11	-	924	2	Intergenic	novelGene_195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGAGTTGCCTTGGTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98573246	98571354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_98572156_98573123
tx.2146	chr11	-	618	5	ISM	ENSMUSG00000023764.19	ENSMUST00000138126.8	2916	22	-21	44400	-3	6236	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_1	15.833114033569	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAATGTCTTGTTTCTGTT	8000	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3143442	3129331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_3129508_3136064_3136137_3137239_3137411_3138940_3139057_3143359
tx.21460	chr11	-	312	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000058756.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTGGTCCCATCATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98655237	98654225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_98654457_98655156
tx.21461	chr11	-	813	2	ISM	ENSMUSG00000020889.12	ENSMUST00000064941.7	2721	8	54	3952	54	-2537	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTATAACGGGAGCCCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98666105	98662709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_98662961_98665543
tx.21462	chr11	-	561	5	NNC	ENSMUSG00000075576.13	novel	680	4	NA	NA	321	134	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.82915619758885	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCAGCCTGTGGTGCGTG	7204	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98700563	98688398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_98688627_98689947_98690060_98692791_98692854_98696779_98696877_98700501
tx.21463	chr11	+	3244	9	FSM	ENSMUSG00000037992.17	ENSMUST00000107475.9	2469	9	2	-777	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_2	61.7220331405245	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATGCCTCTTGCCTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98828525	98865765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_98828706_98841070_98841622_98857172_98857322_98858870_98859013_98860982_98861144_98861318_98861496_98862407_98862613_98863337_98863497_98864245
tx.21464	chr11	-	637	3	ISM	ENSMUSG00000006777.8	ENSMUST00000006969.8	1565	8	11970	-1	11970	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTACAGTGTCCGGGGTCC	2909	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99371993	99368798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_99369118_99370869_99370902_99371707
tx.21465	chr11	+	1470	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000086163.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAATGACTGTTTGTTGTT	4036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100168686	100171056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_100168845_100169744
tx.21466	chr11	+	416	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000086163.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTCTACGCGTCTAGATG	4485	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100169135	100170080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_100169216_100169744
tx.21467	chr11	+	1809	2	ISM	ENSMUSG00000017837.13	ENSMUST00000017981.10	2097	4	2114	0	1979	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	332	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCCCGTCCCCTACCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100515815	100518433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_100516011_100516819
tx.21468	chr11	-	523	3	ISM	ENSMUSG00000004040.17	ENSMUST00000138438.2	2506	24	-20	19996	-20	-3021	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	586	junction_1	22	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGCAGTTTCTGCAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100830325	100799502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_100799631_100802059_100802211_100830081
tx.21469	chr11	-	3215	2	FSM	ENSMUSG00000004044.10	ENSMUST00000060792.6	3491	2	272	4	-64	-4	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGATTTGTGTGAGGTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100861441	100847562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100850152_100860815
tx.2147	chr11	-	839	5	FSM	ENSMUSG00000023764.19	ENSMUST00000118627.2	831	5	-4	-4	-4	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	37.5724300518346	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCTGCACTTTGTTATTT	8014	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3143428	3135563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3135975_3136064_3136137_3137239_3137411_3138940_3139057_3143359
tx.21470	chr11	-	3082	8	NNC	ENSMUSG00000017802.15	novel	3165	9	NA	NA	14	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	36.1809511274897	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAGAGACTGCTGTTTCG	9859	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101010655	100987347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_100989447_100989833_100989967_100990498_100990582_100991747_100991886_100992831_100992917_100993708_100993857_100997132_100997240_101010366
tx.21471	chr11	+	2028	5	ISM	ENSMUSG00000017119.21	ENSMUST00000071537.13	3239	21	18850	-934	-85	-5	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	215	junction_3	28.5875847178456	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAACCAAGCTGTTTATTG	359	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101465847	101472772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_101466243_101467128_101467236_101468019_101468078_101468757_101468864_101471410
tx.21472	chr11	-	370	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000118859.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACGGGAGAGAGTGCCAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101496187	101495675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_101495923_101496064
tx.21473	chr11	+	901	2	ISM	ENSMUSG00000034931.16	ENSMUST00000039152.14	4325	23	31826	0	12997	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	254	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGGTTTATTATGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101655601	101658184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_101655784_101657465
tx.21474	chr11	-	2148	12	ISM	ENSMUSG00000017724.15	ENSMUST00000017868.7	2395	13	728	-1	-152	1	3prime_fragment	TRUE	canonical	2	8	junction_11	4.66745369199761	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTATTTGCTCTTTGCTT	11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	101675469	101660571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101661417_101661794_101661897_101662153_101662327_101662514_101662584_101662706_101662782_101664434_101664704_101664906_101665072_101666143_101666271_101667918_101667973_101674792_101674841_101675055_101675150_101675342
tx.21475	chr11	-	989	3	ISM	ENSMUSG00000017724.15	ENSMUST00000132040.2	882	5	811	-607	811	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	4	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTATTTGCTCTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101662196	101660572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101661417_101661794_101661897_101662153
tx.21476	chr11	-	729	2	NNC	ENSMUSG00000078640.10	novel	818	3	NA	NA	1521	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGCTTCTTTTTTTTTTTT	8159	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102468424	102467220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_102467624_102468098
tx.21477	chr11	+	1825	2	FSM	ENSMUSG00000043372.13	ENSMUST00000130341.2	370	2	-542	-913	9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGAGTGGCTACAATTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103024148	103030018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_103024968_103029012
tx.21478	chr11	-	708	4	ISM	ENSMUSG00000034247.10	ENSMUST00000041272.10	5968	12	-18	30779	-18	-28437	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_3	16.0069429380573	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAATGGACACTCACCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103303531	103285879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_103286141_103287852_103288101_103294650_103294737_103303418
tx.21479	chr11	-	557	2	NNC	ENSMUSG00000034187.19	novel	3766	21	NA	NA	12	-21482	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATAGTTGTTGTGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103844870	103838455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_103838938_103844795
tx.2148	chr11	-	1534	9	FSM	ENSMUSG00000020457.14	ENSMUST00000020741.12	1546	9	-2	14	-2	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	1733	junction_5	106.427719016241	5751	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATGTGTCGTTATTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3216395	3199920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3200366_3202159_3202283_3202643_3202812_3204511_3204643_3206542_3206713_3209305_3209376_3212488_3212665_3214766_3214891_3216268
tx.21480	chr11	-	498	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018411.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104130029	104124387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_104124771_104129914
tx.21481	chr11	-	417	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018411.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTTGGTCATGGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104178114	104177044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_104177425_104178077
tx.21482	chr11	-	1101	2	ISM	ENSMUSG00000018412.17	ENSMUST00000106972.8	5427	15	477	90782	-112	654	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAGCAGGTGGAGAGACAT	8646	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104332640	104315108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_104316120_104332550
tx.21483	chr11	-	507	3	NNC	ENSMUSG00000018412.17	novel	5061	15	NA	NA	-593	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	66	junction_2	7	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAAGAGTCTTTGAAATT	9739	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104360280	104315763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_104316120_104358464_104358579_104360243
tx.21484	chr11	-	571	3	NNC	ENSMUSG00000086932.2	novel	730	5	NA	NA	-72	-982	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAAATTTATGTTCTCTCA	8252	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104456559	104449729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_104449858_104452394_104452554_104456275
tx.21485	chr11	+	3055	6	NNC	ENSMUSG00000001901.16	novel	3368	13	NA	NA	6354	1058	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.13541565040626	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTAATTTTCTTTTAACT	8974	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105910952	105926433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_105911570_105914550_105914745_105916623_105916705_105917541_105917699_105918382_105918564_105924608
tx.21486	chr11	+	1856	2	ISM	ENSMUSG00000001983.8	ENSMUST00000002048.8	1383	5	6518	-1214	6518	1214	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAGGCTTACCAGTGATG	7392	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105963404	105965652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_105963535_105963926
tx.21487	chr11	-	791	5	NNC	ENSMUSG00000020713.7	novel	862	5	NA	NA	148	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	0.866025403784439	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCCGGCTAGAGGTCTTTC	7205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106192543	106191092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_106191393_106191590_106191753_106191920_106192038_106192221_106192383_106192492
tx.21488	chr11	+	1411	10	ISM	ENSMUSG00000018372.14	ENSMUST00000018516.11	2696	20	21984	-8	-1067	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_3	12.0554275466834	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCTTTTGAATTTATAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106702084	106709687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_106702176_106703221_106703362_106704586_106704689_106705429_106705563_106706293_106706464_106706559_106706635_106707478_106707632_106708659_106708807_106709021_106709094_106709359
tx.21489	chr11	+	1105	8	ISM	ENSMUSG00000018372.14	ENSMUST00000018516.11	2696	20	24558	-5	-390	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	13.2818734847651	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTGCTTTTGAATTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106704658	106709684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_106704689_106705429_106705563_106706293_106706464_106706559_106706635_106707478_106707632_106708659_106708807_106709021_106709094_106709359
tx.2149	chr11	+	1847	4	FSM	ENSMUSG00000020453.18	ENSMUST00000101644.10	1853	4	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	164.248456782874	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGCCTGCTCCCCCGAG	5186	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3239172	3259083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3239348_3243279_3243344_3249033_3249206_3257647
tx.21490	chr11	+	388	2	Intergenic	novelGene_199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTCCCAAAACCAGTCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106876483	106877601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_106876680_106877409
tx.21492	chr11	-	2018	2	ISM	ENSMUSG00000040430.19	ENSMUST00000103064.10	6329	10	-21	128481	-21	-15744	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAATATGAGAAACATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107361546	107227198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_107228387_107360716
tx.21493	chr11	+	1024	2	FSM	ENSMUSG00000087113.2	ENSMUST00000136927.2	876	2	-145	-3	-145	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTCGTGCGTTGGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107318956	107326515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_107319311_107325845
tx.21494	chr11	-	201	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020721.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACATGGATGATTTAAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107523700	107486695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_107486875_107523678
tx.21495	chr11	+	632	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020723.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCAGCCGTAGTTGTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107617265	107626038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_107617519_107625659
tx.21498	chr11	-	1368	2	Intergenic	novelGene_202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAACGCTGCTCTCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109915232	109913805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_109915130_109915188
tx.21499	chr11	-	847	3	FSM	ENSMUSG00000075437.5	ENSMUST00000127337.2	870	3	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGTGCCTCACTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112689811	112683556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_112684094_112687265_112687370_112689605
tx.215	chr1	-	1128	3	ISM	ENSMUSG00000018417.15	ENSMUST00000151525.8	3045	7	-29	51951	0	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	305	junction_2	6	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAAAGATTATAAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51955100	51901790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_51902594_51922241_51922386_51954919
tx.2150	chr11	+	2632	3	FSM	ENSMUSG00000020453.18	ENSMUST00000094471.10	2930	3	298	0	-148	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_2	176	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGAGGCTTTGTGTGTTTT	6304	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3240290	3245429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3241885_3243279_3243344_3244455
tx.21500	chr11	+	279	2	Intergenic	novelGene_204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCAATATTTTATCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112745119	112748425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_112745274_112748300
tx.21501	chr11	-	813	3	ISM	ENSMUSG00000041654.16	ENSMUST00000042657.16	2781	11	-22	314118	-11	561	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	253	junction_2	101.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCCATAATCTTTAGCCT	7735	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113456616	113449796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_113450376_113452831_113452951_113456501
tx.21502	chr11	+	235	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041654.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATCTGTTGGCTGCACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113459153	113461490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_113459272_113461373
tx.21503	chr11	+	1387	8	FSM	ENSMUSG00000034706.17	ENSMUST00000144872.2	2247	8	28	832	28	-832	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.87139303460597	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGAGCCTCTCAGTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114627894	114644063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_114628021_114629441_114629585_114631242_114631357_114635126_114635267_114635880_114636004_114641163_114641388_114642611_114642748_114643682
tx.21504	chr11	+	1233	3	FSM	ENSMUSG00000034706.17	ENSMUST00000130692.2	597	3	88	-724	88	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTACTTGTCATGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114643589	114648712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_114643830_114645060_114645289_114647947
tx.21505	chr11	+	1781	3	ISM	ENSMUSG00000051043.17	ENSMUST00000152314.2	645	4	-1030	1511	-1030	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_1	4	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTTGCTTTGGGCTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114754287	114759922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_114755373_114757450_114757546_114759321
tx.21507	chr11	-	593	6	NNC	ENSMUSG00000034566.11	novel	625	6	NA	NA	21	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1306.77741027307	72	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCGTCTCTGAGTAGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115310767	115306516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_115306706_115306840_115306904_115307678_115307751_115308664_115308753_115309211_115309343_115310717
tx.21508	chr11	-	345	2	Intergenic	novelGene_211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGGTGCTGCACACCTT	7281	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115528970	115522454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_115522625_115528795
tx.21509	chr11	-	464	2	ISM	ENSMUSG00000034471.13	ENSMUST00000041684.11	4929	20	-7	12860	2	-5266	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGGCCGGTCCCTTGCTTC	4113	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115704463	115702868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_115703209_115704339
tx.2151	chr11	+	3248	4	FSM	ENSMUSG00000020453.18	ENSMUST00000057089.13	3118	4	-130	0	-130	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	276	junction_3	67.6576348652209	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGCCTGCTCCCCCGAG	6322	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3240308	3259083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3241885_3243279_3243344_3249033_3249206_3257647
tx.21510	chr11	+	897	7	ISM	ENSMUSG00000020782.19	ENSMUST00000177736.8	3612	26	29663	22	-15	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	765	junction_4	77.4532116829251	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTTGTTTCGTCTTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115744546	115746582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_115744808_115745018_115745182_115745372_115745402_115745637_115745686_115745888_115745932_115746017_115746080_115746291
tx.21511	chr11	+	951	4	NNC	ENSMUSG00000020770.14	novel	471	3	NA	NA	38	355	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.94392028877595	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCTAGTTTTTTATTAAT	8861	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115921186	115932231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_115921318_115929365_115929610_115931558_115931722_115931818
tx.21512	chr11	-	2520	4	ISM	ENSMUSG00000020792.16	ENSMUST00000126731.8	864	8	-72	6843	3	2087	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	180	junction_1	24.0554914035583	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAATCATTCGTTCCATTT	8930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116197550	116193350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_116195509_116195689_116195875_116197213_116197280_116197439
tx.21513	chr11	-	518	2	Intergenic	novelGene_213	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAACTTGTCTTGGCTCCGT	9989	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116797730	116796603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_116796841_116797449
tx.21514	chr11	+	1058	2	Intergenic	novelGene_215	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGACTCTCATATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116994398	116998630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_116994684_116997857
tx.21515	chr11	+	1131	5	ISM	ENSMUSG00000050106.19	ENSMUST00000119455.2	2736	16	8256	-38	-274	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_3	5.2618912949623	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGAATTTCTTGGACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117681739	117683947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_117681918_117682053_117682185_117682268_117682428_117682914_117682994_117683363
tx.21516	chr11	-	1205	6	NNC	ENSMUSG00000025574.14	novel	1440	7	NA	NA	5	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	425.922340339175	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGCCTGGGTTTCCCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117716688	117706338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_117706966_117707272_117707393_117707927_117708018_117712922_117713017_117715496_117715608_117716525
tx.21517	chr11	-	1479	4	ISM	ENSMUSG00000017713.10	ENSMUST00000033230.8	1770	7	2671	-3	1123	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.44948974278318	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACTGGTTACTTTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117761614	117758774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_117759569_117760185_117760379_117760496_117760635_117761260
tx.21518	chr11	-	687	3	NNC	ENSMUSG00000017132.18	novel	1592	14	NA	NA	78994	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATGTGTTGGAATTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118024574	118022840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_118023202_118024122_118024201_118024326
tx.21519	chr11	+	533	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025576.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAGTCTCAACTGTTAAC	8339	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118442183	118446742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_118442405_118446430
tx.2152	chr11	+	1137	2	ISM	ENSMUSG00000020453.18	ENSMUST00000136285.2	652	3	313	-534	313	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGAGGCTTTGTGTGTTTT	9194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3243180	3245429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_3243344_3244455
tx.21520	chr11	+	638	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025576.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTCAGTTCTCACTTTAG	8348	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118442192	118444338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_118442405_118443173_118443246_118443984
tx.21521	chr11	+	434	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025576.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGAGTGTGAGTCTCAACT	9353	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118443197	118446736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_118443246_118446350
tx.21522	chr11	+	873	5	NNC	ENSMUSG00000013483.15	novel	3958	22	NA	NA	-4786	-26711	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.87082869338697	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTCTTACGTATACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119193807	119209302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_119193893_119205534_119205727_119207617_119207727_119207830_119208143_119209127
tx.21523	chr11	+	411	2	ISM	ENSMUSG00000087675.2	ENSMUST00000135630.2	1705	4	19632	-2	19632	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGAACTAACCTCACTGGA	1822	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119459087	119459874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_119459263_119459638
tx.21524	chr11	+	919	2	Intergenic	novelGene_224	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	6415	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119463680	119466773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_119463957_119466130
tx.21525	chr11	-	1476	3	NNC	ENSMUSG00000085207.2	novel	493	3	NA	NA	-50	2793	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAAAATGTTCAATTTATG	3358	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119833574	119823835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_119825016_119829987_119830117_119833407
tx.21526	chr11	+	1869	13	NIC	ENSMUSG00000025372.17	novel	2394	14	NA	NA	-30	0	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	0	0	junction_9	12.5288555831018	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTAGTGTGTGGTCTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119833911	119897608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_119834075_119847927_119848004_119850982_119851070_119871614_119871677_119872218_119872291_119872814_119872953_119884521_119884675_119887348_119887574_119887714_119887917_119889459_119889529_119889960_119890124_119891377_119891413_119897184
tx.21527	chr11	-	1791	3	ISM	ENSMUSG00000061306.17	ENSMUST00000045402.14	4554	16	41888	490	869	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	392	junction_1	32.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCGAGTCGAGTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120000284	119995275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_119996863_119997259_119997437_120000257
tx.21528	chr11	-	1912	2	FSM	ENSMUSG00000025384.16	ENSMUST00000152346.2	747	2	6	-1171	6	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACGCTTAGAAGGAAAGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120269555	120266977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120268488_120269153
tx.21529	chr11	+	2491	4	ISM	ENSMUSG00000049957.15	ENSMUST00000058370.14	2778	6	1926	-10	240	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	99	junction_1	15.2825245151302	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTCTTGTTTCTGGTGAGG	588	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120350866	120355194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_120351091_120352541_120352625_120352831_120352912_120353090
tx.2153	chr11	+	1759	3	ISM	ENSMUSG00000020453.18	ENSMUST00000057089.13	3118	4	2754	0	325	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_2	71	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGCCTGCTCCCCCGAG	9206	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3243192	3259083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_3243344_3249033_3249206_3257647
tx.21530	chr11	-	367	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025135.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGCCTAATCACGAGGCGC	3325	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120490172	120489426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_120489694_120490072
tx.21531	chr11	+	904	2	Intergenic	novelGene_225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGGGTTTCTGTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120524575	120525957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_120525281_120525758
tx.21532	chr11	+	622	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025158.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGTAGTTGGGGTGGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120671570	120672329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_120672012_120672148
tx.21533	chr11	-	614	4	ISM	ENSMUSG00000025162.19	ENSMUST00000070575.14	3500	10	-26	11276	-26	-535	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	486	junction_1	77.1765652398591	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAACAAGAACCTCACAGGGA	988	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120881944	120863850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_120864021_120864646_120864796_120874058_120874170_120881760
tx.21534	chr11	-	1658	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039329.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAGACAGAGAAAATGAG	289	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121039142	121037351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_121037412_121037544
tx.21535	chr11	+	1618	8	FSM	ENSMUSG00000039307.17	ENSMUST00000128913.8	885	8	-312	-421	28	421	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_5	7.04794079059658	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAAACTAATTCATGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121095288	121111136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_121095669_121098464_121098602_121102867_121102978_121104808_121104897_121105585_121105751_121108913_121108986_121109368_121109565_121110666
tx.21536	chr11	+	3146	11	NNC	ENSMUSG00000000056.8	novel	4395	11	NA	NA	-39	-1292	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	31.4294447930599	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGGCATTGAAGGAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121128039	121145390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_121128178_121129244_121129348_121133326_121133471_121135419_121135553_121135761_121135897_121136163_121136283_121137751_121137882_121139954_121140019_121141118_121141257_121141585_121141744_121143506
tx.21537	chr11	+	986	6	FSM	ENSMUSG00000025175.13	ENSMUST00000026175.9	1047	6	54	7	0	-7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTAACTGGGCTACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121325792	121341310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_121325956_121328098_121328251_121330111_121330204_121330896_121330980_121339707_121339831_121340937
tx.21538	chr11	+	1193	10	FSM	ENSMUSG00000039230.15	ENSMUST00000155666.8	4832	10	3640	-1	251	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	272	junction_2	18.4357409183867	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCAGCCTCTGCCTATCTC	4798	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121492781	121507990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_121492867_121493813_121493973_121494059_121494199_121494440_121494563_121496088_121496167_121499397_121499488_121500165_121500254_121500806_121500917_121502489_121502575_121507753
tx.21539	chr12	+	770	6	NNC	ENSMUSG00000110250.2	novel	2298	13	NA	NA	429	-14846	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	5.41848687365763	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTCTCAGGAAAAGTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3222302	3236203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_3222379_3226321_3226499_3227690_3227771_3229463_3229582_3235500_3235634_3236017
tx.2154	chr11	+	1533	2	NNC	ENSMUSG00000034614.15	novel	2573	6	NA	NA	704	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCTTGCACCTTTTTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3285084	3292963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_3285177_3291522
tx.21540	chr12	-	1756	3	NNC	ENSMUSG00000097429.2	novel	1423	2	NA	NA	-94	14872	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTCAGGCTGTTTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3407247	3378943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_3380193_3394825_3394948_3406862
tx.21541	chr12	+	2817	8	FSM	ENSMUSG00000020668.11	ENSMUST00000020999.7	6791	8	1542	2432	1542	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	14.4066311262614	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATTTTCATTGACCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3416731	3454062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_3417532_3437551_3437654_3438134_3438258_3439622_3439742_3440437_3440555_3451682_3451792_3452433_3452607_3452788
tx.21542	chr12	+	2274	19	NNC	ENSMUSG00000071454.14	novel	2390	20	NA	NA	-11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	85.0941562746747	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTGTGTGTTCCTTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3622511	3831398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_3622648_3639170_3639239_3641905_3641987_3646648_3646867_3667605_3667692_3682809_3682965_3693916_3694023_3698222_3698390_3736737_3736863_3768411_3768490_3782617_3782708_3784938_3785027_3798424_3798511_3799469_3799584_3801810_3801908_3822586_3822747_3823550_3823641_3829618_3829655_3831105
tx.21543	chr12	+	4346	27	FSM	ENSMUSG00000066643.13	ENSMUST00000111113.3	4312	27	-32	-2	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_5	11.1856972283898	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGTAATGCTGTAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9024014	9078848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_9024180_9024933_9025052_9027362_9027435_9028597_9028691_9031031_9031161_9032760_9032895_9035628_9035795_9035966_9036113_9037277_9037404_9039904_9040091_9046068_9046130_9053996_9054142_9055762_9055833_9056719_9056774_9058001_9058112_9058478_9058690_9062660_9062742_9065969_9066107_9066436_9066641_9068085_9068233_9069877_9070011_9071729_9071841_9072718_9072884_9074193_9074335_9074885_9075043_9077482_9077724_9078005
tx.21544	chr12	-	3304	14	FSM	ENSMUSG00000051235.11	ENSMUST00000166117.4	5268	14	-47	2011	-12	639	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	6.04323672043149	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTCTTGAAATGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11315814	11290931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_11292578_11293190_11293335_11296289_11296352_11298215_11298347_11299130_11299212_11300052_11300090_11300714_11300866_11302004_11302094_11304351_11304426_11305157_11305269_11306838_11307016_11310882_11311070_11312407_11312595_11315587
tx.21545	chr12	-	1219	8	ISM	ENSMUSG00000051235.11	ENSMUST00000166117.4	5268	14	-41	11772	-6	-2951	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_5	6.82432623571211	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTTGTTATGATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11315808	11300692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_11300866_11302004_11302094_11304351_11304426_11305157_11305269_11306838_11307016_11310882_11311070_11312407_11312595_11315587
tx.21546	chr12	-	570	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000113009.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTCCCCTTTATTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12773611	12771932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_12772361_12773469
tx.21547	chr12	+	400	1	FSM	ENSMUSG00000066629.3	ENSMUST00000085720.3	315	1	-36	-49	-36	49	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTTTCAATGGACAGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12961986	12962386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_12962000_12962400
tx.21548	chr12	+	517	4	NNC	ENSMUSG00000113363.2	novel	491	5	NA	NA	8178	6998	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTGTCAATACGTACAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12923748	12931688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_12923870_12924577_12924691_12931319_12931399_12931484
tx.21549	chr12	+	814	2	Intergenic	novelGene_375	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTATGTGTCCTCATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14824744	14851997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_14825272_14851710
tx.2155	chr11	-	2274	16	FSM	ENSMUSG00000020451.18	ENSMUST00000101638.4	3514	16	21	1219	21	-1219	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_14	50.0611182012104	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGAGTCTGTTACTCGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3359153	3295474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3295885_3296234_3296393_3297051_3297108_3297573_3297749_3298593_3298660_3300391_3300449_3300641_3300774_3302290_3302378_3303276_3303464_3305272_3305470_3305810_3305917_3308109_3308299_3308994_3309105_3310450_3310587_3342916_3343017_3359045
tx.21550	chr12	-	456	3	Fusion	ENSMUSG00000113739.2_ENSMUSG00000113930.2	novel	361	2	NA	NA	93	107	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTCTGTGTTGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16065453	16026157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr12_-_16026491_16053772_16053846_16065403
tx.21551	chr12	-	2639	2	ISM	ENSMUSG00000020593.17	ENSMUST00000067124.6	5581	21	48753	369	21021	-84	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATATAATATTTCACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16591018	16586038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_16588574_16590914
tx.21552	chr12	-	820	4	ISM	ENSMUSG00000071398.9	ENSMUST00000095823.9	3437	5	149	3489	-24	332	5prime_fragment	TRUE	canonical	1	2	junction_1	0.816496580927726	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCTTGGTCTGTCTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17061579	17056808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_17057238_17058273_17058314_17061128_17061353_17061452
tx.21553	chr12	+	761	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000114062.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGGTGGTCTATTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17642207	17656811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_17642300_17656142
tx.21554	chr12	+	2615	4	Intergenic	novelGene_384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2.86744175568088	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGTATTTTTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19236577	19250661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_19236734_19246674_19246802_19247002_19247064_19248390
tx.21555	chr12	+	968	4	Genic_Genomic	ENSMUSG00000116558.2	novel	126	1	NA	NA	-308	230034	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	25.2234458831902	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTAGTGTCTTCGCTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20362207	20592675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_20362642_20568379_20568507_20568706_20568768_20592329
tx.21556	chr12	+	579	3	NNC	ENSMUSG00000092229.4	novel	619	3	NA	NA	32	713	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_2	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCCTGTGTTGCCACAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21092991	21099041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_21093335_21094725_21094832_21098911
tx.21557	chr12	-	3664	17	ISM	ENSMUSG00000052593.17	ENSMUST00000064536.13	4443	19	19679	289	-9724	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_12	14.39495897007	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTTAATTGTATTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21403954	21373806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_21375628_21376119_21376171_21378045_21378135_21379054_21379134_21380033_21380165_21382076_21382212_21382570_21382675_21383954_21384155_21386633_21386787_21390472_21390562_21390675_21390821_21392864_21392979_21395621_21395712_21397297_21397432_21399785_21399955_21401543_21401633_21403883
tx.21558	chr12	+	685	2	ISM	ENSMUSG00000097055.3	ENSMUST00000226634.2	721	3	-128	503	-128	-454	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGCATTTGCCCCAGATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21467749	21468567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_21468084_21468216
tx.21559	chr12	-	774	4	Intergenic	novelGene_385	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTGTCTTAGCTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21880361	21875098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_21875329_21876563_21876644_21877256_21877354_21879994
tx.2156	chr11	-	910	5	ISM	ENSMUSG00000020451.18	ENSMUST00000110029.9	2939	12	7438	1218	4114	-1218	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	202	junction_1	18.3354165483089	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGAGTCTGTTACTCGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3298703	3295473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_3295885_3296234_3296393_3297051_3297108_3297573_3297749_3298593
tx.21560	chr12	+	989	3	Intergenic	novelGene_386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGAGCACCAGGATCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22108618	22122218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_22108865_22112149_22112205_22121530
tx.21561	chr12	+	935	2	Intergenic	novelGene_387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCAGGATCCATCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22108622	22122223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_22108865_22121530
tx.21562	chr12	-	1136	4	NNC	ENSMUSG00000093846.2	novel	2857	5	NA	NA	19987	25462	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.739839372653	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCCTCAAGCACCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22186660	22140294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_22141142_22180145_22180207_22180406_22180534_22186559
tx.21563	chr12	-	915	4	Genic_Genomic	ENSMUSG00000113569.2	novel	1449	1	NA	NA	-8788	-912	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.73053390247253	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTATGAATGTGATCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22785379	22776054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_-_22776671_22778007_22778069_22778268_22778396_22785268
tx.21564	chr12	-	2029	4	Intergenic	novelGene_390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	18.9267594221045	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAATCCACGTGATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23455517	23444788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_23446506_23447833_23447895_23448096_23448224_23455393
tx.21565	chr12	-	1387	11	NNC	ENSMUSG00000020636.15	novel	1384	12	NA	NA	11446	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	2.7	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTCTTGATCTCCTGTTG	2391	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28621068	28603753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_28604047_28605262_28605388_28607340_28607450_28609237_28609312_28609868_28610025_28613369_28613503_28614233_28614314_28615395_28615525_28618000_28618089_28620608_28620660_28620919
tx.21566	chr12	+	579	2	Intergenic	novelGene_391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCATTTTCAGAGAGTACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28686034	28686734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_28686408_28686528
tx.21567	chr12	+	553	5	ISM	ENSMUSG00000002900.18	ENSMUST00000169088.8	5557	34	66	56990	3	3643	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	44.0929416120086	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGGAATCCATGCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31315298	31322502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_31315344_31315478_31315601_31316689_31316866_31319055_31319192_31322428
tx.21568	chr12	+	870	5	ISM	ENSMUSG00000002900.18	ENSMUST00000002979.16	5784	33	60984	-2	2756	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_3	11.9660979437743	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTTTCTTTTATTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31376275	31379645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_31376377_31376566_31376709_31377643_31377821_31379108_31379269_31379355
tx.21569	chr12	-	2017	7	NNC	ENSMUSG00000020659.17	novel	3900	6	NA	NA	0	-54	intron_retention	FALSE	canonical	2	3	junction_2	68.7614636907104	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTGATGCATTTTGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31549556	31536953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_31538314_31538935_31539131_31540466_31540541_31541510_31541595_31542077_31542179_31544580_31544749_31549521
tx.2157	chr11	-	1406	5	ISM	ENSMUSG00000020451.18	ENSMUST00000101638.4	3514	16	21	13091	21	905	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_3	84.1616747694579	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGAATTGATGTGGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3359153	3307346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_3308299_3308994_3309105_3310450_3310587_3342916_3343017_3359045
tx.21570	chr12	+	2685	6	ISM	ENSMUSG00000035933.6	ENSMUST00000036862.5	2997	23	8	249723	8	-238115	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_5	22.294393914166	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAGAGAGAAAACAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31704875	31737906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_31704983_31710715_31710856_31715463_31715522_31719768_31719824_31720314_31720385_31735651
tx.21571	chr12	+	2995	23	FSM	ENSMUSG00000035933.6	ENSMUST00000036862.5	2997	23	3	-1	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_22	24.2086317506725	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGTTTCTTCCTTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31704870	31987630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_31704983_31710715_31710856_31715463_31715522_31719768_31719824_31720314_31720385_31735651_31735773_31810845_31810977_31840845_31841012_31851981_31852095_31852404_31852483_31870123_31870206_31883180_31883386_31887193_31887356_31889753_31889854_31919417_31919529_31920070_31920134_31936203_31936308_31943969_31944208_31950895_31950973_31969649_31969777_31970552_31970633_31975643_31975791_31987175
tx.21572	chr12	+	795	3	NNC	ENSMUSG00000035983.5	novel	476	3	NA	NA	36	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCGCAATTTATGTTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40273463	40275243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_40273553_40273929_40274060_40274667
tx.21573	chr12	+	1587	4	Intergenic	novelGene_397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2.62466929133727	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAATTCTCTTATAATCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47631735	47667277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_47632438_47635289_47635341_47636900_47637008_47666550
tx.21574	chr12	+	1620	5	Intergenic	novelGene_399	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.26917420765551	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCAAAGCTCTGAAAATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47632165	47667547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_47632438_47635289_47635341_47636030_47636224_47636900_47637008_47666550
tx.21575	chr12	-	1920	9	NNC	ENSMUSG00000002688.9	novel	3653	19	NA	NA	260768	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.17052946998661	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGGTGTCATACTAATCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50435113	50388013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_50389004_50389836_50389923_50411294_50411563_50412392_50412496_50413084_50413247_50430182_50430290_50431925_50431999_50433998_50434052_50435035
tx.21576	chr12	-	2674	10	NNC	ENSMUSG00000020954.17	novel	2791	16	NA	NA	-4238	1002	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	114.280789135498	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTACCTGTATGTTGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51694819	51655412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_51657056_51657142_51657230_51666596_51666705_51668562_51668704_51669958_51670127_51673892_51674015_51674295_51674344_51674483_51674664_51676156_51676291_51694776
tx.21577	chr12	+	794	5	NNC	ENSMUSG00000020955.10	novel	1035	6	NA	NA	233	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	28.6749019178793	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGTGACGTTTGAGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51738052	51785715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_51738098_51763724_51763934_51767418_51767506_51769762_51769836_51785335
tx.21578	chr12	+	752	4	NNC	ENSMUSG00000020955.10	novel	1035	6	NA	NA	25902	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	32.4995726467629	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGTGACGTTTGAGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51763721	51785715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_51763934_51767418_51767506_51769762_51769836_51785335
tx.21579	chr12	+	1823	5	ISM	ENSMUSG00000035133.10	ENSMUST00000110725.2	5197	6	26410	-515	26410	-468	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	289	junction_4	22.7651048756644	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATACAGCAATAAAAATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52589269	52615150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_52589420_52604271_52604350_52606750_52606883_52609104_52609211_52613793
tx.2158	chr11	-	369	2	FSM	ENSMUSG00000020451.18	ENSMUST00000145223.2	400	2	18	13	3	-13	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCCTGAAAGGTATCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3359171	3346791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3347035_3359045
tx.21580	chr12	-	1325	4	ISM	ENSMUSG00000035105.6	ENSMUST00000039516.4	2662	5	18205	676	18205	-676	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_3	5.43650214343336	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAGTTCTTCCACATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54232441	54226442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_54227442_54228416_54228491_54230665_54230803_54232326
tx.21581	chr12	+	1166	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000112145.2	novel	628	1	NA	NA	-53	78511	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATGATTCTTTTAAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54669322	54748514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_54670032_54748057
tx.21582	chr12	+	1059	2	Intergenic	novelGene_405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54703477	54705275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_54703683_54704421
tx.21583	chr12	+	1235	3	NIC	ENSMUSG00000094103.3	novel	3863	5	NA	NA	-47	-2510	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	4	junction_2	60	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGTGGATTTCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55246329	55261443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_55246572_55252464_55252639_55260624
tx.21584	chr12	+	1041	4	NNC	ENSMUSG00000095595.3	novel	3922	5	NA	NA	9109	-2510	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	46.2913478836908	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGTGGATTTCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55180362	55186379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_55180420_55182452_55182520_55183902_55184001_55185560
tx.21585	chr12	+	1290	3	NNC	ENSMUSG00000112348.2	novel	1259	2	NA	NA	-1305	45	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTGAGTCAGGGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55543200	55546781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_55543363_55544565_55544736_55545823
tx.21586	chr12	+	828	2	ISM	ENSMUSG00000001497.19	ENSMUST00000152848.2	2309	3	4292	0	4292	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTGGTATGCTCTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56746805	56757131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_56746940_56756437
tx.21587	chr12	-	744	5	ISM	ENSMUSG00000020986.14	ENSMUST00000021375.12	4109	20	41	43451	41	4820	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	579	junction_2	49.2867882905754	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAAACAACTGCAGGTAAG	2719	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59058762	59048619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_59048842_59051275_59051363_59052044_59052103_59053775_59054022_59058631
tx.21588	chr12	+	1489	10	ISM	ENSMUSG00000021000.18	ENSMUST00000176617.8	1935	17	20746	-224	1269	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	389	junction_3	39.618863196559	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTTGTTTGGTATTAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59217042	59236962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_59217105_59217742_59217779_59219310_59219379_59220891_59220975_59223116_59223246_59226635_59226795_59230972_59231090_59232514_59232574_59235096_59235332_59236421
tx.21589	chr12	+	465	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000113948.2	novel	556	1	NA	NA	-37	45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67557492	67558130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_67557573_67557745
tx.2159	chr11	+	538	2	Intergenic	novelGene_135	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTGTGGTCATAGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3359324	3360207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_3359402_3359746
tx.21590	chr12	+	343	3	NNC	ENSMUSG00000113190.2	novel	523	2	NA	NA	11	-6398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATTCATTATCTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69274710	69278660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_69274771_69276405_69276501_69278472
tx.21591	chr12	+	785	4	ISM	ENSMUSG00000034601.18	ENSMUST00000149564.8	5763	30	57454	4	43868	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_1	3.39934634239519	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAGTCTGGCTGTTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71241075	71290073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_71241241_71262815_71262971_71265964_71266074_71289717
tx.21592	chr12	-	1339	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034574.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATATTCAGTATCTAAAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72036602	71997351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_71998347_72036258
tx.21594	chr12	-	387	2	NNC	ENSMUSG00000045690.9	novel	2979	2	NA	NA	38152	-321	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTTTGTTCTTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75678149	75677690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_75677819_75677890
tx.21595	chr12	-	672	3	ISM	ENSMUSG00000021056.9	ENSMUST00000218426.2	1980	9	29704	8286	12422	2214	internal_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_2	11.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATATTTCGTGTGTGTGTGT	1068	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76263816	76259045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_76259332_76261186_76261493_76263736
tx.21596	chr12	-	1873	4	NNC	ENSMUSG00000056459.15	novel	488	3	NA	NA	-23	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	38.6896483427918	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAACTTTAAGAGTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76416190	76395663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_76397048_76402662_76402843_76403833_76404060_76416107
tx.21597	chr12	+	922	2	FSM	ENSMUSG00000033454.7	ENSMUST00000042779.4	12190	2	308	10960	308	-10960	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCACCGAATAGTAGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76417347	76432764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_76417505_76431999
tx.21598	chr12	+	857	3	ISM	ENSMUSG00000052609.10	ENSMUST00000218427.2	4815	6	1057	4028	1057	-2222	internal_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	3	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAATCAGCGTTGTCTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76619380	76623234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_76619520_76620020_76620135_76622630
tx.21599	chr12	-	2512	2	FSM	ENSMUSG00000021062.16	ENSMUST00000143863.2	797	2	199	-1914	199	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGTGTGGGTCTGTATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76847409	76844733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_76847176_76847339
tx.216	chr1	+	2589	23	NNC	ENSMUSG00000062939.12	novel	2982	24	NA	NA	9	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	8.55089285367565	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTGTTTCTGGTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52047793	52146346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_52047888_52050941_52051071_52052948_52053094_52104473_52104573_52107904_52107998_52111019_52111099_52113835_52113922_52115691_52115844_52117652_52117812_52118899_52118993_52121676_52121737_52122122_52122231_52123237_52123283_52135943_52136028_52137545_52137645_52139482_52139619_52141010_52141061_52141275_52141371_52141639_52141777_52142006_52142199_52144364_52144432_52144826_52144936_52146068
tx.2160	chr11	-	2742	6	NIC	ENSMUSG00000020448.17	novel	2787	7	NA	NA	-3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	18	junction_4	55.8161267018771	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGAGTGTGGAGCTTGTG	6841	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3402337	3365981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_3368088_3369861_3369980_3375281_3375337_3376565_3376679_3382399_3382621_3402208
tx.21600	chr12	+	1870	4	NNC	ENSMUSG00000112392.2	novel	661	2	NA	NA	-27	69704	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_2	4.92160768674447	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTATAATTGGTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77600093	77686187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_77600570_77616271_77616486_77684209_77684294_77685091
tx.21601	chr12	-	549	2	NNC	ENSMUSG00000021120.12	novel	2339	4	NA	NA	-8623	-38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAATAAAGCTTATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79145048	79127475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_79127998_79145021
tx.21602	chr12	+	1248	3	ISM	ENSMUSG00000032705.10	ENSMUST00000038185.10	3310	9	120	16952	-5	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	212	junction_2	10.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTATGTGTATTGGTGTTT	2783	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80509988	80527944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_80510055_80522496_80522963_80527228
tx.21603	chr12	+	2695	6	FSM	ENSMUSG00000048833.10	ENSMUST00000217889.2	2155	6	-537	-3	90	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_2	11.4647285183732	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGACTCTTCTGGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80690746	80725131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_80691751_80709243_80709353_80713308_80713510_80719999_80720069_80722622_80722709_80723905
tx.21604	chr12	-	984	3	NNC	ENSMUSG00000112880.2	novel	1118	3	NA	NA	-740	23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.5	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGGAGAGAAAGGGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80992910	80989423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_80989717_80989815_80990004_80992407
tx.21605	chr12	+	1976	13	FSM	ENSMUSG00000021136.14	ENSMUST00000021564.11	3439	13	-20	1483	0	-1483	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_1	31.9699294476683	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTGTACAGGCATCGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81073581	81231701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_81073933_81151380_81151547_81152672_81152786_81182549_81182650_81184738_81184787_81197425_81197483_81199446_81199528_81214280_81214474_81215002_81215086_81216959_81217066_81226252_81226498_81230761_81230816_81231322
tx.21606	chr12	+	1957	4	FSM	ENSMUSG00000042700.17	ENSMUST00000222849.2	1831	4	-105	-21	-49	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_3	11.0855260988773	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGCAGACGCCACACACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82216144	82359819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_82216278_82216789_82216851_82281236_82281303_82358122
tx.21607	chr12	-	1828	2	ISM	ENSMUSG00000042628.9	ENSMUST00000048319.6	4036	12	2312	26973	777	17514	internal_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTCTTTCTTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83641684	83620595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_83621911_83641171
tx.21608	chr12	-	2752	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000099708.2	novel	2000	1	NA	NA	1780	8983	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGGATTAAGCAAAGCCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83678827	83669624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_-_83671757_83678207
tx.21609	chr12	-	1729	3	ISM	ENSMUSG00000021224.16	ENSMUST00000126943.2	429	4	-20	29577	-20	1366	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_1	24	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTTCACTTATTTTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83968684	83887641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_83889133_83923441_83923587_83968591
tx.2161	chr11	-	2766	6	NNC	ENSMUSG00000020448.17	novel	2787	7	NA	NA	-2	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	62.7279841856886	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAGTGTGGAGCTTGTGT	6842	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3402336	3365980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_3368088_3369861_3369980_3375281_3375337_3376565_3376679_3382375_3382621_3402208
tx.21610	chr12	+	1089	2	FSM	ENSMUSG00000072949.7	ENSMUST00000222591.2	2613	2	1524	0	-156	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTGTAACCGAAAATTGT	7717	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84061161	84064448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84061356_84063553
tx.21611	chr12	-	273	2	FSM	ENSMUSG00000042507.16	ENSMUST00000137562.2	425	2	219	-67	219	67	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCAGAACCAGGAGAACACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84201787	84199651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_84199806_84201668
tx.21612	chr12	+	603	2	FSM	ENSMUSG00000113052.2	ENSMUST00000223261.2	684	2	95	-14	95	14	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGTAATTTAATGGCTACTT	6256	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84242837	84246368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84243187_84246114
tx.21613	chr12	-	2101	15	FSM	ENSMUSG00000021236.17	ENSMUST00000120942.8	4881	15	-18	2798	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_13	11.8983792413685	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTGTCCTCAGTATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84455806	84423449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_84424155_84425953_84426070_84427094_84427152_84429005_84429147_84430992_84431095_84431921_84431984_84432570_84432651_84432911_84433001_84433511_84433548_84433753_84433830_84439179_84439324_84441397_84441478_84443452_84443733_84452179_84452250_84455743
tx.21614	chr12	-	1056	6	NNC	ENSMUSG00000021236.17	novel	4972	16	NA	NA	-366	11190	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	19.6102014268084	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTTTTATTGCATCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84452616	84438985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_84439324_84441397_84441478_84443452_84443733_84446113_84446187_84452179_84452250_84452401
tx.21615	chr12	+	2145	6	NNC	ENSMUSG00000085793.4	novel	2270	6	NA	NA	77	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	17	junction_5	52.6399088145107	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGAGGCCCAGGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84498272	84578345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_84498318_84503014_84503090_84504722_84504761_84506392_84506460_84509142_84509181_84576463
tx.21616	chr12	-	3141	7	ISM	ENSMUSG00000042350.14	ENSMUST00000163231.8	5262	19	44466	-2	17020	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_2	12.0381338531629	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTAAATGAGTGTTTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84973132	84964919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_84967355_84967453_84967630_84968031_84968122_84970633_84970693_84970769_84970900_84972467_84972594_84973007
tx.21617	chr12	+	2294	4	ISM	ENSMUSG00000012609.20	ENSMUST00000124701.8	2165	5	-43	-1	0	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	41	junction_3	6.34209919681348	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTTAATATGGTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85871751	85892457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_85871861_85873226_85873399_85878668_85878776_85890551
tx.21618	chr12	+	1990	4	ISM	ENSMUSG00000012609.20	ENSMUST00000177188.8	699	7	603	11722	187	1	internal_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_3	8.98146239020499	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTTAATATGGTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85872035	85892457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_85873399_85878668_85878776_85890551_85890635_85892020
tx.21619	chr12	+	618	3	Intergenic	novelGene_421	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCCTGCCTCAGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86879145	86886291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_86879275_86884769_86885037_86886069
tx.2162	chr11	-	2768	7	FSM	ENSMUSG00000020448.17	ENSMUST00000077078.12	2787	7	19	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_2	17.6391294821737	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGAGTGTGGAGCTTGTG	6834	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3402344	3365981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3368088_3369861_3369980_3375281_3375337_3376565_3376679_3378883_3378903_3382399_3382621_3402208
tx.21620	chr12	+	1872	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000113555.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGACTGTAAGCCTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86879570	86911200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_86879900_86884769_86885037_86886069_86886168_86910022
tx.21621	chr12	+	2543	4	FSM	ENSMUSG00000034157.13	ENSMUST00000187814.7	4098	4	5	1550	5	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_3	3.2659863237109	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATCCTTCCCTGTTCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86994121	87010586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_86994274_86999517_86999706_87007045_87007216_87008553
tx.21622	chr12	-	1416	9	NNC	ENSMUSG00000061533.17	novel	1806	8	NA	NA	-34	-4853	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	25.8139376112983	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTTTGTGTCTGGCTTTG	6118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91351217	91288717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_91289123_91292288_91292406_91300024_91300098_91305832_91305925_91314299_91314416_91315523_91315651_91336835_91336971_91348421_91348563_91351007
tx.21623	chr12	-	2066	9	FSM	ENSMUSG00000020962.15	ENSMUST00000021345.14	6064	9	31	3967	31	-541	multi-exon	FALSE	canonical	3	931	junction_7	74.7277349783867	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATTTTTACTTGTCACTC	1276	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91556752	91526002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_91526626_91529682_91529773_91534313_91534635_91534910_91535045_91536536_91536613_91539339_91539408_91542357_91542566_91553473_91553576_91556308
tx.21624	chr12	-	1426	12	FSM	ENSMUSG00000020964.15	ENSMUST00000167594.8	1402	12	-27	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	285	junction_8	33.3912444603607	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATGTCCTGTCTTCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91815931	91786757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_91786885_91790307_91790365_91791593_91791749_91792070_91792153_91793278_91793339_91793425_91793480_91797460_91797624_91798342_91798449_91799828_91799997_91808411_91808629_91809999_91810038_91815732
tx.21625	chr12	-	1322	5	ISM	ENSMUSG00000020964.15	ENSMUST00000167594.8	1402	12	-27	10994	0	1200	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	285	junction_1	49.1019347887637	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATAATGTGTGGAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91815931	91797748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_91798449_91799828_91799997_91808411_91808629_91809999_91810038_91815732
tx.21626	chr12	-	3533	17	NIC	ENSMUSG00000021003.11	novel	3832	17	NA	NA	253	456	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_16	9.17686459255012	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTCTGCAGTAATAAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98225304	98169598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_98170347_98173652_98173730_98174969_98175134_98179240_98179419_98180591_98180743_98182509_98182597_98188858_98188949_98193426_98193555_98197674_98197800_98200500_98200657_98208900_98209032_98212512_98212552_98218268_98218409_98220423_98220538_98222885_98222950_98223130_98223200_98224232
tx.21627	chr12	-	2281	2	ISM	ENSMUSG00000021009.16	ENSMUST00000222071.2	2341	3	710	-15	-22	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGGGAATTCAGTTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98700194	98679633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_98681453_98699732
tx.21628	chr12	-	1234	5	NNC	ENSMUSG00000033713.13	novel	7705	6	NA	NA	-5420	468	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_4	37.2516778145629	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAATTAACCATTGCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99328698	99162201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_99163073_99175719_99175826_99257495_99257561_99307680_99307794_99328619
tx.21629	chr12	-	1135	2	Intergenic	novelGene_424	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTCTCAATTATTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100147219	100145844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_100146935_100147174
tx.2163	chr11	-	2037	6	NNC	ENSMUSG00000020448.17	novel	2787	7	NA	NA	14	-753	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	62.7279841856886	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGGTGATTTTTCTAGA	6829	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3402349	3366734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_3368088_3369861_3369980_3375281_3375337_3376565_3376715_3382399_3382621_3402208
tx.21630	chr12	-	791	5	ISM	ENSMUSG00000021187.15	ENSMUST00000162735.8	5290	12	0	47607	0	-43970	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_4	2.38484800354236	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTATTTTTCTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101684782	101659308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_101659466_101660764_101660933_101672641_101672873_101675682_101675796_101684660
tx.21631	chr12	-	3111	11	ISM	ENSMUSG00000021188.15	ENSMUST00000021605.14	9873	21	136	50953	-8	1224	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	11	junction_10	3.89358446678636	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGATGAGTTTAAATACCA	7557	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101879390	101851254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_101852536_101853066_101853280_101855963_101856051_101856836_101856878_101859689_101860053_101860520_101860687_101861909_101861976_101865083_101865363_101868490_101868602_101872013_101872076_101878948
tx.21632	chr12	+	633	3	ISM	ENSMUSG00000021192.17	ENSMUST00000021609.10	3390	13	24560	0	9295	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_2	11	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGAGTGCTTTATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102460010	102464166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_102460119_102461958_102462023_102463705
tx.21633	chr12	-	905	5	FSM	ENSMUSG00000041669.16	ENSMUST00000074416.10	909	5	4	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.29903810567666	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTGTCTGTCTGTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103208405	103163166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_103163611_103168907_103169038_103201844_103201981_103207598_103207722_103208333
tx.21634	chr12	+	2783	6	NIC	ENSMUSG00000021203.16	novel	424	4	NA	NA	-44	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_1	32.5047688808888	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCAGTCTGGCTTCTTAA	8419	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103355199	103372604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_103355368_103366454_103366551_103367207_103367327_103369075_103369161_103369492_103369688_103370484
tx.21635	chr12	-	381	2	ISM	ENSMUSG00000079017.4	ENSMUST00000055071.9	463	4	685	0	685	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGCTGTGGTGGCTCTTT	6979	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103409254	103408425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_103408643_103409090
tx.21636	chr12	-	1971	4	FSM	ENSMUSG00000021265.4	ENSMUST00000021693.4	1976	4	4	1	4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	5.09901951359278	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGAAGCTCCTCTGTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108801805	108791799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_108793415_108793599_108793684_108797122_108797167_108801577
tx.21637	chr12	+	1953	7	NIC	ENSMUSG00000040877.17	novel	2657	7	NA	NA	4	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	5	junction_2	24.7638849940796	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCGTGGTCATGGTGTT	4854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108860201	108994380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_108860257_108863834_108863933_108946616_108946765_108958732_108958864_108990888_108991060_108992335_108992477_108993171
tx.21638	chr12	+	1633	5	FSM	ENSMUSG00000040856.18	ENSMUST00000109844.11	1703	5	-8	78	-8	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	4.02336923485777	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAGTTAAAGAAATAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109419372	109426548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_109419653_109420910_109420975_109421418_109421550_109423999_109424142_109425532
tx.21639	chr12	+	2364	8	FSM	ENSMUSG00000097451.12	ENSMUST00000238384.2	2352	8	-12	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	549	junction_5	36.3862499259469	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTGAAGTACAATTATTGA	889	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109616660	109628150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_109617534_109618292_109618373_109620719_109620867_109622282_109622369_109623221_109623275_109624486_109624556_109626156_109626242_109627179
tx.2164	chr11	+	1638	2	FSM	ENSMUSG00000034587.9	ENSMUST00000136038.2	407	2	9	-1240	9	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATAAGGACTGTAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3402373	3408339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3402435_3406762
tx.21641	chr12	+	998	2	Intergenic	novelGene_435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACCCCCATCAGCAACACACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110217643	110223929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_110218005_110223292
tx.21642	chr12	+	433	2	Intergenic	novelGene_436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTTTACTCCTTGTGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110251588	110252560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_110251747_110252285
tx.21644	chr12	-	1427	2	FSM	ENSMUSG00000096995.3	ENSMUST00000221597.2	1422	2	-1	-4	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGTTTCTGGCTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111540775	111538750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_111539709_111540306
tx.21645	chr12	-	2450	8	NIC	ENSMUSG00000021287.13	novel	2422	8	NA	NA	-12	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_5	27.6708053621096	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACACTTGCAAATTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111780319	111769625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_111771107_111771177_111771225_111771348_111771562_111774266_111774422_111776185_111776382_111777291_111777430_111778494_111778654_111780258
tx.21646	chr12	+	840	3	ISM	ENSMUSG00000054003.14	ENSMUST00000191808.6	3366	29	69754	-487	358	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_2	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCTTGGTTTCTGTTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112029945	112035271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_112030054_112034036_112034110_112034612
tx.21647	chr12	-	638	2	Intergenic	novelGene_441	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGCTACACTTGTGCCTTGG	5105	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112506063	112503976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_112504162_112505610
tx.21648	chr12	-	683	3	ISM	ENSMUSG00000042050.9	ENSMUST00000221748.2	2067	4	380	1180	380	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	7	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGTGAACATTTTAGTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116177110	116171061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_116171404_116175344_116175569_116176993
tx.21649	chr12	+	4505	28	NIC	ENSMUSG00000042029.8	novel	4684	29	NA	NA	-2	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	46	junction_1	49.3771077062245	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGATCTTGTTTAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116369051	116425228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_116369112_116370817_116370931_116375994_116376184_116376680_116376796_116378357_116378513_116379044_116379180_116382842_116382938_116384307_116384378_116386815_116386903_116388241_116388335_116389398_116389525_116390195_116390376_116391275_116391429_116393273_116393497_116393714_116393819_116398203_116398378_116401590_116401662_116402217_116402369_116402484_116402659_116403378_116403496_116403579_116403721_116404161_116404262_116406556_116406745_116407920_116408062_116411276_116411381_116413995_116414097_116415886_116415987_116424183
tx.2165	chr11	+	676	4	NIC	ENSMUSG00000075702.11	novel	707	5	NA	NA	-4	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_2	68.794379615392	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGGAGTCTCTTCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3464862	3467351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_3465074_3466260_3466297_3466841_3466921_3467001
tx.21650	chr12	+	2621	10	FSM	ENSMUSG00000021175.16	ENSMUST00000021592.16	2957	10	336	0	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_2	34.4673758792282	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGTTGTCACCTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117807585	117842441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_117807693_117828764_117828900_117833740_117833873_117835818_117836173_117837455_117837528_117837630_117837802_117838418_117838542_117839309_117839460_117840640_117840778_117841201
tx.21651	chr12	+	2523	9	ISM	ENSMUSG00000021175.16	ENSMUST00000021592.16	2957	10	21512	-6	21139	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_1	36.5547534528685	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCACCTGTCTGTGGCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117828761	117842447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_117828900_117833740_117833873_117835818_117836173_117837455_117837528_117837630_117837802_117838418_117838542_117839309_117839460_117840640_117840778_117841201
tx.21652	chr12	-	629	3	NIC	ENSMUSG00000113875.2	novel	884	4	NA	NA	61	2	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCTTGATGGCCTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118493867	118482029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_118482442_118492007_118492063_118493705
tx.21653	chr13	-	472	3	ISM	ENSMUSG00000021215.16	ENSMUST00000099946.6	3871	10	16	6411	16	-1820	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_2	87	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCACTATGGTCGGAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3943562	3938428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_3938523_3938870_3938979_3943292
tx.21654	chr13	-	992	4	NNC	ENSMUSG00000021215.16	novel	2680	12	NA	NA	-7	-6237	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	77.8888096369862	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTCACTTGTCGGCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3968185	3949211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_3949829_3957796_3957857_3962867_3962935_3967937
tx.21655	chr13	+	641	3	NNC	ENSMUSG00000071551.14	novel	5832	10	NA	NA	173	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTCGGTTGTTTGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4295499	4298359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_4295775_4296801_4296885_4298076
tx.21656	chr13	+	473	3	NNC	ENSMUSG00000071551.14	novel	5832	10	NA	NA	155	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCGGTTGTTTGTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4295481	4298360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_4295588_4296801_4296885_4298076
tx.21657	chr13	+	1300	3	ISM	ENSMUSG00000000078.8	ENSMUST00000222857.2	1115	5	3221	-549	84	549	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_1	1.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGAAAAACATGGAGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5914760	5917823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_5915344_5916637_5916762_5917230
tx.21658	chr15	-	215	1	Intergenic	novelGene_552	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GTTATTAACAAAATAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55740289	55740074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_55740100_55740300
tx.21659	chr13	-	2442	6	NNC	ENSMUSG00000021147.18	novel	3780	5	NA	NA	1	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_1	30.9283041888817	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATCTGTTACAAGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8921058	8900514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_8902368_8903705_8903771_8904035_8904132_8906867_8906965_8911123_8911302_8920905
tx.2166	chr11	+	709	5	FSM	ENSMUSG00000075702.11	ENSMUST00000094469.6	707	5	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_4	6.04152298679729	503	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGGAGTCTCTTCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3464864	3467351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3465074_3466260_3466297_3466485_3466521_3466841_3466921_3467001
tx.21660	chr13	-	678	6	ISM	ENSMUSG00000021156.18	ENSMUST00000110637.8	3770	14	18	10839	13	-537	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_3	47.9357903867246	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTCTTTGTAATTCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9814441	9745710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_9745863_9747679_9747773_9748663_9748742_9770808_9770969_9785367_9785503_9814381
tx.21661	chr13	+	1196	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094185.3	novel	480	1	NA	NA	-33	47007	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGGGTTTGCTTGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12393005	12440525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_+_12393602_12439925
tx.21662	chr13	+	417	2	ISM	ENSMUSG00000050244.10	ENSMUST00000222091.2	2482	17	13094	1392	3427	4	internal_fragment	FALSE	canonical	3	524	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTATTTGTCTTTATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12452715	12453778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_12452824_12453469
tx.21663	chr13	+	1225	4	ISM	ENSMUSG00000005397.9	ENSMUST00000222142.2	3803	14	-79	32875	37	-32875	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	695	junction_3	38.9386982604994	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGGAAACAGGAGTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13612172	13643174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_13612512_13638306_13638607_13639894_13640122_13642815
tx.21664	chr13	-	1798	5	FSM	ENSMUSG00000039233.13	ENSMUST00000160304.8	933	5	-37	-828	5	828	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	14.9059551857638	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAACAAACAAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14214218	14188108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_14189409_14194286_14194473_14202282_14202368_14203860_14203992_14214122
tx.21665	chr13	+	2545	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000113168.2	novel	328	1	NA	NA	-44312	721	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGCAAAAAATTAGAA	1834	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20888355	20933716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_+_20889629_20932444
tx.21666	chr13	+	1443	6	NNC	ENSMUSG00000021322.9	novel	2921	21	NA	NA	-74232	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	30.6241734582339	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGTGTGGGCATAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21120570	21208420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_21120623_21125983_21126076_21163633_21163717_21189200_21189298_21197281_21197359_21207378
tx.21667	chr13	-	703	3	Intergenic	novelGene_450	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGAAGCCCCTTAGATCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21407674	21400419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_21400811_21405458_21405604_21407507
tx.21668	chr13	+	2213	4	NIC	ENSMUSG00000036721.15	novel	2270	5	NA	NA	18	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	20	junction_1	22.9927524813074	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTCTGTATACTGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21547019	21553994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_21547346_21547749_21548222_21550784_21550927_21552721
tx.21669	chr13	-	2163	4	FSM	ENSMUSG00000022228.15	ENSMUST00000032820.15	3918	4	-63	1818	7	-1818	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	8.64098759787715	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCTCAAGGGTCTAACGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21637893	21628167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_21630000_21631955_21632065_21633610_21633687_21637747
tx.2167	chr11	+	691	4	NNC	ENSMUSG00000075702.11	novel	707	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	70.6745278646337	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGGAGTCTCTTCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3464866	3467351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_3465074_3466260_3466316_3466841_3466921_3467001
tx.21670	chr13	-	473	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000079941.2	novel	390	1	NA	NA	-24	100	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGAAGTTATGGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21685612	21685098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_-_21685445_21685485
tx.21671	chr13	-	930	3	NNC	ENSMUSG00000082396.5	novel	1234	2	NA	NA	-13	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCACATACCCTCTCTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21690716	21688469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_21688667_21688708_21689403_21690677
tx.21672	chr13	-	2228	6	FSM	ENSMUSG00000063894.16	ENSMUST00000045228.12	8805	6	31	6546	-16	2063	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	3.97994974842648	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTATATTTTGTCTTTCCT	6582	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21715259	21703937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_21705133_21705955_21706080_21706393_21706486_21709307_21709477_21710688_21711192_21715114
tx.21673	chr13	+	2735	6	FSM	ENSMUSG00000006720.17	ENSMUST00000176511.8	2703	6	-32	0	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	19.7949488506538	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTTTAAGTTTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22129231	22144655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_22129370_22129725_22129970_22131172_22131241_22133829_22133957_22134403_22134500_22142593
tx.21675	chr13	+	364	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060093.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTAGGAAGAATGGAAAAT	1182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23882065	23945141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_23882214_23944925
tx.21676	chr13	+	3403	5	FSM	ENSMUSG00000019132.12	ENSMUST00000019276.12	5849	5	235	2211	-128	1326	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_1	16.0370664399696	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGCTACTCAGATGGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24985874	24997969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_24987493_24988764_24988942_24989844_24989968_24993868_24994004_24996619
tx.21677	chr13	-	535	3	ISM	ENSMUSG00000048978.15	ENSMUST00000057866.13	2222	4	132	10003	20	5979	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTTGATGAGCTAGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25453933	25446025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_25446383_25452004_25452074_25453824
tx.21678	chr13	+	471	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000076431.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCTGCTCCCTGTTTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29136009	29142142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_29136210_29141871
tx.21679	chr13	+	565	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000076431.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGATTGCTGCTCCCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29137182	29142138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_29137481_29141871
tx.2168	chr11	+	502	4	ISM	ENSMUSG00000075702.11	ENSMUST00000094469.6	707	5	1392	0	1392	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_3	5.71547606649408	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCGGAGTCTCTTCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3466258	3467351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_3466297_3466485_3466521_3466841_3466921_3467001
tx.21680	chr13	+	715	4	FSM	ENSMUSG00000086363.8	ENSMUST00000140415.8	682	4	-22	-11	-22	11	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	1.24721912892465	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTATAGTTTCTTTGTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29200253	29212791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_29200375_29200692_29200863_29207158_29207196_29212404
tx.21681	chr13	+	887	6	NNC	ENSMUSG00000086363.8	novel	682	4	NA	NA	-14	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.0591260281974	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTATCGAGTTATAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29200261	29212781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_29200375_29200692_29200863_29207158_29207196_29207613_29207707_29208701_29208799_29212404
tx.21682	chr13	+	801	5	NIC	ENSMUSG00000086363.8	novel	682	4	NA	NA	-24	2	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	2	3	junction_1	0.82915619758885	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTATCGAGTTATAGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29200251	29212782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_29200375_29200692_29200863_29207158_29207196_29207613_29207707_29212404
tx.21684	chr13	+	2295	7	FSM	ENSMUSG00000069255.14	ENSMUST00000095914.7	3015	7	-41	761	-1	-761	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_6	5.61001089323561	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGAGAAGCCCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30844042	30894453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_30844130_30852787_30852822_30856375_30856459_30880218_30880269_30889608_30889684_30891912_30892085_30892659
tx.21685	chr13	-	672	5	NNC	ENSMUSG00000038372.15	novel	382	4	NA	NA	-2	-10146	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	37.0978436030991	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTGTTGTACAGCAACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32522609	32351458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_32351643_32409117_32409228_32411197_32411286_32418335_32418381_32522364
tx.21686	chr13	+	775	5	FSM	ENSMUSG00000085457.4	ENSMUST00000181800.2	777	5	5	-3	5	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.433012701892219	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTATGCTTTTTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34120019	34144167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_34120081_34137299_34137525_34138689_34138809_34142583_34142642_34143855
tx.21687	chr13	+	2872	12	ISM	ENSMUSG00000021413.10	ENSMUST00000222509.2	3648	16	12533	-201	-57	201	intron_retention	FALSE	canonical	3	139	junction_4	21.0316565803171	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTGTAGCCATTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35072126	35086859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_35072263_35073494_35073577_35074477_35074689_35076072_35076147_35077743_35077835_35078417_35078566_35079301_35079440_35079949_35080104_35083091_35083207_35083813_35083966_35084346_35084434_35085375
tx.21688	chr13	-	1127	7	ISM	ENSMUSG00000021416.12	ENSMUST00000021853.12	1347	9	3810	2	3788	-2	3prime_fragment	TRUE	canonical	2	6	junction_1	1.77169096878911	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAATACTGTAAAATTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35143983	35130598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_35131074_35132054_35132199_35132727_35132818_35136963_35137085_35138064_35138165_35140843_35140914_35143856
tx.2169	chr11	-	3309	21	FSM	ENSMUSG00000020439.18	ENSMUST00000020721.15	3335	21	28	-2	-12	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_20	9.90908673894825	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGACTTTTCTCTGCTGTC	8165	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3489264	3467520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3467828_3470751_3470917_3471816_3471969_3472460_3472579_3472774_3472949_3474632_3474727_3474882_3474946_3475041_3475207_3476164_3476241_3476327_3476481_3479439_3479613_3479766_3480283_3480369_3480442_3481044_3481118_3481201_3481523_3482410_3482509_3482597_3482677_3482760_3482855_3483374_3483524_3487322_3487437_3489111
tx.21691	chr13	+	1588	10	ISM	ENSMUSG00000021428.10	ENSMUST00000021866.10	2738	17	12078	4	614	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_7	16.3284195178412	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGGTAGTTTGCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38233048	38245405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_38233133_38234199_38234287_38234783_38234922_38236244_38236349_38236853_38236961_38240137_38240204_38241112_38241233_38242663_38242718_38243915_38244069_38244730
tx.21692	chr13	+	1536	5	Intergenic	novelGene_458	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.866025403784439	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCCATTGTAATTCCTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40078192	40090848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_40078492_40080558_40080662_40083914_40083968_40087708_40087776_40089834
tx.21694	chr13	-	828	2	Intergenic	novelGene_462	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCTCTCTCCAGCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41901158	41894783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_41894882_41900428
tx.21695	chr13	+	353	3	ISM	ENSMUSG00000021366.9	ENSMUST00000220525.2	501	4	-83	31397	-83	-31397	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAACCTTGTGTGACGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42205796	42276710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_42205932_42208875_42209019_42276635
tx.21696	chr13	-	253	2	Intergenic	novelGene_463	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTTGTGGCTGAATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42453253	42447090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_42447252_42453161
tx.21697	chr13	+	1711	5	FSM	ENSMUSG00000021367.9	ENSMUST00000021796.9	2139	5	-189	617	-189	-617	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	2.44948974278318	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAATTTTTAAGTTGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42454762	42460849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_42455435_42457032_42457202_42458421_42458581_42458730_42458845_42460252
tx.21698	chr13	-	589	2	NNC	ENSMUSG00000113252.2	novel	673	3	NA	NA	-126	-5379	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTGCTTAATTGAGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44172124	44169446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_44169788_44171876
tx.21699	chr13	-	855	3	Intergenic	novelGene_465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGGCTAGACAAGATCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44732871	44725744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_44726440_44727051_44727181_44732840
tx.217	chr1	-	814	2	Intergenic	novelGene_22	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAATCATTGGGGTAGAAT	1822	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52471113	52459010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_52459574_52470862
tx.2170	chr11	-	418	2	ISM	ENSMUSG00000020439.18	ENSMUST00000020718.10	1747	9	7074	-1	1691	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGACTTTTCTCTGCTGT	646	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3470863	3467521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_3467828_3470751
tx.21700	chr13	+	4120	12	ISM	ENSMUSG00000038518.16	ENSMUST00000173246.8	5997	18	171316	9	61804	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	687	junction_1	72.7590839519071	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGACATTTTGTCTGTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45056062	45075110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_45056735_45059708_45060212_45060969_45061063_45063818_45063938_45064012_45064084_45064641_45064757_45066656_45066763_45067126_45067310_45067721_45067853_45068239_45068424_45069892_45070001_45073275
tx.21701	chr13	+	443	2	Intergenic	novelGene_467	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACAAATCCAACCATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46162344	46164019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_46162429_46163660
tx.21702	chr13	+	653	4	ISM	ENSMUSG00000069237.9	ENSMUST00000099547.4	3664	5	1684	2280	15	1962	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_3	9.97775303139718	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGGGTCTGTTCTCAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46824681	46829252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_46824806_46827021_46827146_46827728_46827869_46828987
tx.21703	chr13	-	2517	2	ISM	ENSMUSG00000021375.12	ENSMUST00000223881.2	3917	16	33574	-1	-521	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCAAAGTGTTGATCGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46906540	46902569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_46904103_46905556
tx.21704	chr13	-	653	3	ISM	ENSMUSG00000021375.12	ENSMUST00000223881.2	3917	16	-89	29608	-89	191	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	9	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACATGGGAATAAACTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46940203	46932178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_46932470_46938721_46938869_46939988
tx.21705	chr13	+	635	2	ISM	ENSMUSG00000038080.18	ENSMUST00000037025.16	4987	21	-44	36958	-44	-5409	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATACTTTCAATCTTTTTT	1117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47196930	47201797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_47197147_47201378
tx.21706	chr13	-	756	3	ISM	ENSMUSG00000037989.16	ENSMUST00000162403.8	6147	26	104165	-7	17816	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGGTATTTCAAACTTCC	8970	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49196543	49189777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_49189982_49192567_49192680_49196103
tx.21707	chr13	-	1604	5	Intergenic	novelGene_470	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATGAAGCACGTGCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49334316	49322542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_49323595_49324202_49324413_49325589_49325745_49326522_49326583_49334189
tx.21708	chr13	+	1085	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000113255.2	novel	3272	1	NA	NA	287	-1771	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CACAACAATTTATAAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49647080	49648294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_+_49647517_49647645
tx.21709	chr13	+	560	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00002076947.1	novel	109	1	NA	NA	-588	370	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTATGGCCTCTGTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50271453	50272520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_+_50271520_50271923_50272118_50272220
tx.2171	chr11	+	1952	4	ISM	ENSMUSG00000034543.16	ENSMUST00000093389.9	5085	27	36163	-107	5295	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	450	junction_1	28.7556757682529	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTGCGTTCAGTACATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3635656	3640477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_3635883_3635975_3636070_3638110_3638300_3639034
tx.21710	chr13	+	2049	11	NIC	ENSMUSG00000021457.15	novel	2519	13	NA	NA	24	-1383	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	43	junction_6	14.0644943030313	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATACGTGCACCAGGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52737496	52796267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_52737642_52764831_52765289_52766330_52766492_52774836_52774976_52776715_52776798_52777280_52777313_52785692_52785781_52786923_52787102_52792073_52792284_52794640_52794831_52795900
tx.21711	chr13	+	1213	11	NNC	ENSMUSG00000021474.10	novel	2783	11	NA	NA	0	-1563	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	57	junction_1	264.208800004845	110	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACCCTTCTGGTAGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54225887	54260798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_54225945_54239467_54239643_54242907_54243079_54245241_54245341_54246391_54246468_54247019_54247106_54247872_54248001_54250749_54250800_54258820_54258871_54259766_54259815_54260525
tx.21712	chr13	-	1018	3	NNC	ENSMUSG00000113404.2	novel	2746	2	NA	NA	-3310	-5886	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAAAGCAGAGATTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54485209	54469809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_54470454_54481726_54481884_54484992
tx.21713	chr13	+	3343	7	FSM	ENSMUSG00000021481.12	ENSMUST00000021937.12	3333	7	-13	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_4	9.82202739877171	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTCATCCGATGTGTGC	6	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55253126	55282635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55253332_55260848_55260953_55261490_55261584_55263292_55263438_55270142_55270329_55278346_55278441_55280119
tx.21714	chr13	+	1146	3	ISM	ENSMUSG00000005320.10	ENSMUST00000005452.6	3324	18	14446	19	10969	-19	intron_retention	FALSE	canonical	3	7	junction_1	3.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGTGTGCCTGGTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55314898	55316553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_55314972_55315212_55315351_55315618
tx.21715	chr13	+	912	5	ISM	ENSMUSG00000021488.9	ENSMUST00000224973.2	9905	21	90006	5046	8820	-5046	internal_fragment	FALSE	canonical	3	230	junction_4	12.9687123493429	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCTTATATAGAAACAGAAAC	2208	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55447600	55458522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_55447774_55449539_55449657_55450651_55450794_55454748_55454856_55458149
tx.21716	chr13	-	203	2	Intergenic	novelGene_476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGAAATAGTATATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55538395	55538013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_55538158_55538336
tx.21717	chr13	+	433	2	FSM	ENSMUSG00000045767.10	ENSMUST00000057844.10	4652	2	42	4177	42	-4177	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCAATCGATCTGGTAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55840978	55847136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55841161_55846885
tx.21718	chr13	-	1632	4	FSM	ENSMUSG00000021508.12	ENSMUST00000021970.11	1827	4	195	0	-51	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_2	5.8878405775519	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTACTCCTGGGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56444169	56436455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_56437621_56440273_56440388_56443638_56443745_56443922
tx.21719	chr13	-	777	3	Intergenic	novelGene_477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAAATATCTGTGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56567558	56541377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_56541703_56558450_56558601_56567256
tx.2172	chr11	-	1881	9	ISM	ENSMUSG00000020432.13	ENSMUST00000109992.8	1945	10	201	0	201	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_3	10.0304224736548	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGACGTAGAGTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3881588	3867191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_3867710_3869289_3869406_3872010_3872177_3873395_3873583_3873701_3873875_3874940_3875103_3875999_3876170_3877389_3877583_3881392
tx.21720	chr13	-	1162	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000110477.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGCTAGAGTCTAGCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56581419	56579914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_56580864_56581206
tx.21721	chr13	+	2886	7	FSM	ENSMUSG00000035509.18	ENSMUST00000045428.7	1965	7	-19	-902	-2	790	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	3.77123616632825	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCACTCAGGATTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56670301	56686501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_56670436_56671322_56671417_56673454_56673586_56674727_56675095_56675530_56675654_56680105_56680278_56684636
tx.21722	chr13	+	1222	5	NNC	ENSMUSG00000021540.17	novel	1398	5	NA	NA	-5	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_2	35.856484769146	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAACTAGTCTTCTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56850859	56881028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_56850945_56871241_56871810_56875385_56875469_56876322_56876443_56880662
tx.21723	chr13	+	2259	7	FSM	ENSMUSG00000021540.17	ENSMUST00000069557.14	6584	7	59	4266	3	-882	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	16.5495887830752	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATTTCTCATTTACTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56850881	56885924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_56850945_56871241_56871810_56875216_56875469_56876322_56876443_56880662_56880885_56883612_56883870_56885147
tx.21724	chr13	-	1833	2	ISM	ENSMUSG00000014164.16	ENSMUST00000091583.6	6871	17	92999	3297	92999	-3297	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTCATACGCCCATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58157243	58151338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_58153019_58157090
tx.21725	chr13	-	894	2	FSM	ENSMUSG00000021557.16	ENSMUST00000163284.2	3158	2	13	2251	-3	-2251	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTAACGCTTTGTAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59733028	59730240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_59731045_59732938
tx.21727	chr13	-	557	4	NNC	ENSMUSG00000021466.13	novel	809	7	NA	NA	692	-67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	40	junction_3	29.7993288515027	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCGCATTTTTTTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63710937	63692739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_63692942_63693050_63693121_63695809_63696000_63710842
tx.21728	chr13	-	2898	14	FSM	ENSMUSG00000033102.16	ENSMUST00000109769.10	2886	14	6	-18	6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	22.3145877936915	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGACAGAGCCCATAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64396450	64343153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_64344490_64353084_64353232_64356920_64357019_64357739_64357900_64358008_64358148_64363313_64363545_64364025_64364114_64367699_64367763_64368493_64368561_64373385_64373463_64391447_64391541_64394338_64394415_64395041_64395133_64396218
tx.2173	chr11	-	1939	10	FSM	ENSMUSG00000020432.13	ENSMUST00000020710.11	1897	10	-42	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_9	45.2714719535328	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGACGTAGAGTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3882037	3867191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3867710_3869289_3869406_3872010_3872177_3873395_3873583_3873701_3873875_3874940_3875103_3875999_3876170_3877389_3877583_3881392_3881585_3881975
tx.21730	chr13	+	1827	3	NIC	ENSMUSG00000097101.4	novel	1024	3	NA	NA	-93	942	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCCCTAGCCAATGGCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64396420	64416904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_64397018_64414255_64414364_64415782
tx.21731	chr13	-	1946	2	ISM	ENSMUSG00000038212.17	ENSMUST00000148779.2	613	3	1849	-1544	1849	114	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	535	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATTTTAAGTTTCTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65215792	65212845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_65214676_65215676
tx.21732	chr13	-	514	3	Intergenic	novelGene_486	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGGCTCCTTGGTGGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65375736	65372738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_65373061_65373983_65374061_65375621
tx.21733	chr13	+	3031	4	FSM	ENSMUSG00000057396.8	ENSMUST00000052716.8	3482	4	-50	501	-49	-501	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	3.29983164553722	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTCAGACTGTGTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67276241	67289350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_67276379_67284781_67284909_67285373_67285470_67286679
tx.21734	chr13	+	2599	4	FSM	ENSMUSG00000058900.6	ENSMUST00000021997.8	2591	4	-8	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	10.6144555520604	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACATTGTATCTCATCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67321237	67332108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_67321318_67324511_67324639_67325128_67325225_67329812
tx.21735	chr13	+	2756	4	NNC	ENSMUSG00000051037.16	novel	2712	4	NA	NA	144	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.24721912892465	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGGTTTATTATTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67342742	67357362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_67342876_67346596_67346724_67347212_67347309_67354962
tx.21736	chr13	-	1657	4	FSM	ENSMUSG00000021510.12	ENSMUST00000012314.10	9455	4	-11	7809	-11	1086	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	10.6144555520604	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAAGAGTGTGGAAAGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67785921	67768690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67769969_67771586_67771683_67772153_67772281_67785765
tx.21737	chr13	+	2723	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000097906.2	novel	955	1	NA	NA	-12322	1648	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGAGATGTAATGTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67946042	67960967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_+_67946100_67958301
tx.21738	chr13	+	1432	4	ISM	ENSMUSG00000021532.12	ENSMUST00000221006.2	5134	6	4761	56	2213	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	65.0538238691624	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTAATTGTCCGTCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68735155	68740401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_68735954_68737341_68737509_68738224_68738340_68740049
tx.21739	chr13	-	1335	5	ISM	ENSMUSG00000021536.8	ENSMUST00000022013.8	4211	25	356911	17	356911	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_3	1.4142135623731	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTGTCTAGTGCCCGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68790749	68768178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_68768992_68773906_68774032_68779028_68779144_68788828_68788937_68790575
tx.2174	chr11	-	1945	10	FSM	ENSMUSG00000020432.13	ENSMUST00000109989.10	1949	10	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_9	32.7813557369218	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGACGTAGAGTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3882040	3867191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3867710_3869289_3869406_3872010_3872177_3873395_3873583_3873701_3873875_3874940_3875103_3875999_3876170_3877389_3877583_3881392_3881588_3881975
tx.21740	chr13	+	609	5	ISM	ENSMUSG00000017756.10	ENSMUST00000222253.2	3242	23	-4	22362	-4	-2615	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	715	junction_1	37.7988095050625	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGGTGCCAGCACCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73911821	73938115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_73912010_73932637_73932733_73933162_73933286_73936683_73936831_73938059
tx.21741	chr13	+	1938	3	ISM	ENSMUSG00000017756.10	ENSMUST00000220522.2	6987	20	46165	277	-2	-277	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	758	junction_2	28.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTCAGACTCCTGAGCCC	1451	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73958022	73964584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_73958204_73961657_73961792_73962961
tx.21742	chr13	-	2316	12	NNC	ENSMUSG00000021572.10	novel	3641	12	NA	NA	16	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_5	30.6737026303942	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGGTTCACTCTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74210402	74185750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_74186448_74188169_74188282_74191624_74191752_74195154_74195352_74197014_74197154_74198355_74198484_74199533_74199741_74200999_74201179_74203001_74203111_74206420_74206614_74207560_74207689_74210302
tx.21743	chr13	-	1628	3	ISM	ENSMUSG00000021572.10	ENSMUST00000223028.2	5205	10	-20	19461	18	-2135	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_2	11.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTGACCATGAACTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74210400	74205211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_74206614_74207560_74207689_74210302
tx.21744	chr13	-	3838	30	NIC	ENSMUSG00000021585.11	novel	2857	30	NA	NA	-14	-911	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	49	junction_27	26.473283146802	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAACAAACAAACAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74918782	74841397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_74842953_74844009_74844072_74847223_74847293_74848742_74848836_74849334_74849371_74850676_74850770_74852219_74852325_74861764_74861864_74869050_74869123_74869295_74869347_74872896_74872981_74873482_74873585_74875393_74875490_74876458_74876549_74879197_74879246_74880212_74880297_74883348_74883451_74884863_74884954_74885054_74885142_74885708_74885748_74886336_74886418_74887955_74888055_74889467_74889537_74892748_74892839_74894109_74894224_74894701_74894756_74896323_74896363_74896923_74896981_74902429_74902490_74918664
tx.21745	chr13	-	1446	12	ISM	ENSMUSG00000021585.11	ENSMUST00000223309.2	1529	17	8765	-408	6472	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_3	15.6167953665488	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCCTGCCTGAACTCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74873585	74842373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_74842953_74844009_74844072_74847223_74847293_74848742_74848836_74849334_74849371_74850676_74850770_74852219_74852325_74861764_74861864_74869050_74869123_74869295_74869347_74872896_74872981_74873482
tx.21746	chr13	+	1671	3	ISM	ENSMUSG00000064138.15	ENSMUST00000224888.2	3876	6	-24	77264	-5	1166	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_2	9	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAAGACAGGGTTTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77856823	77911376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_77856973_77907546_77907649_77909956
tx.21747	chr13	+	1432	10	FSM	ENSMUSG00000064138.15	ENSMUST00000091459.12	3892	10	15	2445	-5	135	multi-exon	TRUE	canonical	3	89	junction_7	8.92907582349531	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATGGCTTCAGCGGCCGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77856823	78311909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_77856973_77907546_77907649_77909956_77910058_77973441_77973508_77982628_77982821_78050772_78050995_78100103_78100224_78147704_78147822_78154506_78154592_78311631
tx.21748	chr13	-	939	2	FSM	ENSMUSG00000097793.2	ENSMUST00000181520.2	4608	2	-16	3685	-16	-3685	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTACTGAGCTAACCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81931884	81930576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_81931445_81931813
tx.21749	chr13	-	885	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000114750.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAGAAAAAAGATCGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87523086	87321733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_87322075_87522542
tx.2175	chr11	+	2125	15	FSM	ENSMUSG00000020430.13	ENSMUST00000020705.5	2911	15	3	783	3	-783	multi-exon	FALSE	canonical	3	864	junction_12	97.3847042006336	1452	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATTCTGTGTTCAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3913977	3929221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3914061_3918262_3918343_3919432_3919587_3920624_3920735_3923196_3923369_3923448_3923539_3925528_3925646_3925739_3925815_3926034_3926122_3926287_3926419_3926771_3926898_3927015_3927201_3927625_3927784_3927870_3928033_3928826
tx.21750	chr13	+	1588	16	FSM	ENSMUSG00000003992.16	ENSMUST00000042122.15	1633	16	35	10	-1	-10	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_4	12.5973542195706	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTATTTGAGAGCTTTCAT	2797	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91609244	91849345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_91609368_91672703_91672777_91687453_91687516_91712728_91712814_91812236_91812297_91817794_91817862_91818512_91818584_91823176_91823245_91828708_91828758_91831800_91831837_91833329_91833385_91836914_91836986_91838978_91839058_91841149_91841179_91842137_91842237_91848784
tx.21752	chr13	-	1365	6	FSM	ENSMUSG00000034334.9	ENSMUST00000040106.9	1152	6	0	-213	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1.62480768092719	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAGATGTACAGTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92620521	92586127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_92586761_92603484_92603621_92604452_92604671_92610470_92610637_92614335_92614462_92620435
tx.21758	chr13	+	435	3	Intergenic	novelGene_497	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCACCTAGCATTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95661855	95666035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_95661944_95664444_95664574_95665817
tx.21759	chr13	-	582	5	NNC	ENSMUSG00000021676.11	novel	632	5	NA	NA	-75	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	27.5952894530933	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGGACTTGGAAACGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96028578	95882809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_95883023_95886500_95886579_95899753_95899911_95974331_95974432_96028544
tx.2176	chr11	+	839	4	ISM	ENSMUSG00000020430.13	ENSMUST00000109985.8	2923	15	13102	783	13028	-783	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	864	junction_1	113.128245809789	897	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATTCTGTGTTCAGAAG	2036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3927076	3929221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_3927201_3927625_3927784_3927870_3928033_3928826
tx.21760	chr13	-	1524	4	NNC	ENSMUSG00000047117.14	novel	704	6	NA	NA	-126	-3172	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCATTACTGTGGCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96582651	96575623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_96576595_96578064_96578164_96580786_96580886_96582296
tx.21761	chr13	+	2290	13	NNC	ENSMUSG00000041817.15	novel	6013	13	NA	NA	-455	-2379	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	28	junction_1	73.6283837177545	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACCTTCCACTGGAACTTA	8262	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97207695	97263644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_97207887_97228325_97228461_97230098_97230199_97230569_97230656_97234047_97234220_97243461_97243642_97246530_97246660_97247803_97247911_97250146_97250187_97250616_97250768_97254882_97255040_97259199_97259401_97263003
tx.21762	chr13	+	1468	5	FSM	ENSMUSG00000021666.17	ENSMUST00000159321.2	2542	5	39	1035	39	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_4	25.8009205262138	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCCTAACAAATCTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97307995	97312959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_97308133_97309019_97309200_97309447_97309564_97311369_97311553_97312107
tx.21763	chr13	+	1103	2	NNC	ENSMUSG00000110235.2	novel	1297	3	NA	NA	18827	-188	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAACTGTAATTTTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97715360	97720314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_97715688_97719538
tx.21764	chr13	-	1136	3	NNC	ENSMUSG00000052485.8	novel	1161	4	NA	NA	2047	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCTGTGTTCCCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98829229	98822745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_98823028_98824855_98824992_98828511
tx.21765	chr13	-	1608	4	NNC	ENSMUSG00000052485.8	novel	1161	4	NA	NA	12	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCTGTGTTCCCATTTTT	9064	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98831330	98822745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_98823028_98824855_98824992_98828511_98829226_98830854
tx.21766	chr13	-	508	5	ISM	ENSMUSG00000041685.17	ENSMUST00000225840.2	944	9	73	24875	18	-13530	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	287	junction_4	28.7228132326901	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAATAGAAAAGGTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98951643	98925884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_98926024_98926239_98926382_98932800_98932876_98942813_98942906_98951583
tx.21767	chr13	-	3399	24	FSM	ENSMUSG00000009470.18	ENSMUST00000109401.8	8453	24	46	5008	16	3031	multi-exon	TRUE	canonical	3	248	junction_23	63.8650810868555	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGTGACATGCCGACGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99062846	98980534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_98981129_98982928_98983072_98983835_98983911_98985662_98985763_98986615_98986692_98989362_98989459_98989907_98990007_98991650_98991739_98991819_98992087_98993396_98993484_98994893_98995066_98996270_98996497_98997148_98997302_99000215_99000385_99000935_99000997_99001476_99001596_99003553_99003677_99006747_99006830_99012111_99012246_99015127_99015235_99021022_99021173_99024973_99025050_99027184_99027299_99062758
tx.21768	chr13	+	1456	2	FSM	ENSMUSG00000097027.3	ENSMUST00000181939.3	2481	2	22	1003	22	-1003	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAATATGAAAATTCTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99653158	99657265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_99653367_99656017
tx.21769	chr13	-	1613	10	ISM	ENSMUSG00000049658.14	ENSMUST00000109379.9	7567	38	-224	54636	8	793	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_2	4.08550584685561	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAAAGAGGAGGAGGAA	6767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100240570	100214448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_100214622_100215166_100215308_100220648_100220704_100225860_100225956_100228701_100228836_100229921_100230054_100234045_100234106_100234993_100235104_100235460_100235738_100240134
tx.2177	chr11	+	690	3	ISM	ENSMUSG00000020430.13	ENSMUST00000109985.8	2923	15	13676	783	13602	-783	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1053	junction_1	40.5	519	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATTCTGTGTTCAGAAG	2610	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3927650	3929221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_3927784_3927870_3928033_3928826
tx.21770	chr13	-	1803	4	ISM	ENSMUSG00000021636.16	ENSMUST00000225754.2	3111	7	15687	0	15687	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	1.69967317119759	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGTGTGTGCTCCTTA	7102	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100737523	100732466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_100733920_100734309_100734361_100736968_100737141_100737396
tx.21771	chr13	+	787	5	ISM	ENSMUSG00000042743.14	ENSMUST00000044385.14	3048	11	12	17270	12	-7522	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_2	11.9869720947369	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTCTTTATTTTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104246260	104260973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_104246478_104247577_104247698_104254831_104254936_104257974_104258045_104260697
tx.21772	chr13	+	3924	10	NNC	ENSMUSG00000021712.16	novel	3416	11	NA	NA	4471	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	57	junction_1	55.184538897533	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTATTCTAAAAATTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104320076	104339889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_104320549_104321233_104321356_104323908_104324188_104324568_104324752_104326170_104326387_104328524_104328660_104334497_104334628_104335101_104335213_104336576_104336702_104337738
tx.21773	chr13	+	1674	3	ISM	ENSMUSG00000021712.16	ENSMUST00000022225.12	3416	11	19845	301	19544	-301	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	208	junction_1	5.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTGCCATTTTTCAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104335149	104339224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_104335213_104336576_104336702_104337738
tx.21774	chr13	-	333	3	NNC	ENSMUSG00000021720.12	novel	3279	8	NA	NA	21321	30459	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCAGACATCTTTCAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105386226	105355894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_105356084_105383170_105383207_105386118
tx.21775	chr13	+	180	2	Intergenic	novelGene_502	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCAGGCGGACACCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106769199	106769470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_106769319_106769409
tx.21776	chr13	-	2474	15	ISM	ENSMUSG00000042590.18	ENSMUST00000186005.2	2484	22	21	21347	21	-21347	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	472	junction_4	37.2125719375063	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTACAAGAGGCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107073432	107018509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_107019456_107020033_107020082_107023174_107023266_107025870_107025915_107028123_107028277_107028930_107029124_107032312_107032384_107033723_107033773_107035426_107035486_107037192_107037326_107046707_107046912_107047251_107047325_107056031_107056133_107061520_107061665_107073267
tx.21777	chr13	+	177	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042590.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAAAAAGAATTATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107021222	107037742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_107021368_107037710
tx.21778	chr13	+	784	4	ISM	ENSMUSG00000021756.13	ENSMUST00000184276.8	3009	18	-150	24103	10	385	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	401	junction_2	6.68331255192114	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCATTTAGAAGCAACATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112600624	112616976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_112600785_112609120_112609208_112611564_112611644_112616518
tx.21779	chr13	-	2926	22	NNC	ENSMUSG00000021758.15	novel	3012	22	NA	NA	-62	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_19	12.5835079052629	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCATTTTTCATTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112788897	112734857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_112735566_112736151_112736269_112736385_112736657_112737945_112738046_112741020_112741167_112748508_112748676_112750230_112750361_112757149_112757305_112757741_112757895_112758698_112758842_112759191_112759240_112759332_112759381_112761314_112761357_112761878_112761960_112762855_112762958_112765371_112765432_112770418_112770470_112772501_112772580_112777683_112777777_112781042_112781101_112787865_112787953_112788809
tx.2178	chr11	-	2409	2	ISM	ENSMUSG00000004748.6	ENSMUST00000004868.6	1411	4	56	0	56	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	165	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCTTTTCATTTCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4045389	4041479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_4042300_4043800
tx.21780	chr13	+	3121	14	ISM	ENSMUSG00000047789.6	ENSMUST00000052514.6	8910	15	8819	5684	1214	-5678	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	26	junction_1	7.57916796107914	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGTAAGATGGTTT	4949	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112806118	112869599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_112806266_112822599_112822733_112825806_112825929_112826055_112826120_112826692_112826787_112831774_112831946_112834518_112834579_112837990_112838186_112840071_112840180_112850674_112850782_112859731_112859846_112862580_112862730_112865731_112865822_112868032
tx.21781	chr13	+	1849	3	FSM	ENSMUSG00000042417.6	ENSMUST00000038404.6	1875	3	26	0	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCCTGTGTGCGACAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113124361	113127311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_113124819_113125424_113125611_113126105
tx.21782	chr13	+	1102	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000114715.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCAGTGAGTAGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113660245	113713218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_113660665_113712535
tx.21783	chr13	+	491	1	Intergenic	novelGene_509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCACCATTTATAACTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113712535	113713026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_113712500_113713000
tx.21784	chr13	+	1317	4	ISM	ENSMUSG00000042348.11	ENSMUST00000091201.7	3364	5	9	188951	9	-186766	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	349	junction_1	12.0277457017791	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACATTGCCGTTCAGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113931049	114105046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_113931233_114058782_114058928_114070599_114070660_114104117
tx.21785	chr13	-	1115	7	ISM	ENSMUSG00000025453.19	ENSMUST00000109204.8	3198	14	-1	27942	-1	6015	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	169	junction_6	25.8585898042926	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTACTTAGTAACTGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119545534	119518208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_119518400_119523114_119523204_119525729_119525818_119531146_119531365_119533282_119533513_119541087_119541291_119545438
tx.21786	chr13	+	1445	11	FSM	ENSMUSG00000025451.16	ENSMUST00000026520.14	2551	11	181	925	-16	-26	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_1	70.3985795311241	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTGTATATATATATAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119565638	119593829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_119565697_119566695_119566866_119574504_119574691_119577294_119577408_119582272_119582385_119584250_119584377_119586439_119586547_119587231_119587350_119588327_119588383_119592231_119592326_119593523
tx.21787	chr13	+	586	2	ISM	ENSMUSG00000093930.3	ENSMUST00000226092.2	1747	4	-75	2064	8	396	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	428	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTCAGTGTCTGCGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120151922	120161658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_120152050_120161199
tx.21788	chr13	-	281	1	Intergenic	novelGene_515	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGATGGGGCAGGAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120650303	120650022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_120650000_120650300
tx.21789	chr14	+	281	2	ISM	ENSMUSG00000058317.13	ENSMUST00000176062.3	647	5	14	249809	14	-1897	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCAGCCGTTGTTAGCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3576016	3581432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_3576112_3581246
tx.2179	chr11	-	1385	4	FSM	ENSMUSG00000004748.6	ENSMUST00000004868.6	1411	4	26	0	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_3	5.18544972870135	759	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCTTTTCATTTCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4045419	4041479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_4042300_4043800_4044034_4044388_4044517_4045215
tx.21790	chr14	+	1470	2	ISM	ENSMUSG00000021786.14	ENSMUST00000112625.9	3434	3	530	1925	486	-66	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCAATATCCAATGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6226961	6229151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_6227973_6228692
tx.21791	chr14	-	346	2	Intergenic	novelGene_235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGACTGTGTTGTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7002362	6996472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_6996670_7002213
tx.21792	chr14	-	1885	13	NNC	ENSMUSG00000021733.12	novel	426	5	NA	NA	-1	-1753	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	26.4512129526543	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATTTGTAATTCCCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7766696	7704348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_7704511_7707240_7707416_7709421_7709529_7712331_7712479_7719240_7719329_7721139_7721298_7723679_7723796_7729849_7730039_7731418_7731580_7732255_7732395_7735894_7736042_7740479_7740562_7766482
tx.21793	chr14	-	2482	5	Intergenic	novelGene_236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.22474487139159	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGATTCTAGTGTGTTTGAG	5775	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7802537	7785960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_7787204_7788384_7788522_7799004_7799162_7799386_7799485_7801690
tx.21794	chr14	-	1717	12	NNC	ENSMUSG00000068758.9	novel	1614	12	NA	NA	-27	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_10	8.96273275917545	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTGTGCTGCTATCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8123372	8114269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_8114394_8114689_8114757_8117743_8117847_8118598_8118714_8118795_8118826_8118956_8119076_8119495_8119729_8120390_8120521_8120818_8120943_8121694_8121850_8122574_8122970_8123250
tx.21795	chr14	+	1036	2	NIC	ENSMUSG00000114883.2	novel	1104	3	NA	NA	-117	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTCTTGGTATTTTTAAA	4165	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8122381	8141762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_8122621_8140965
tx.21796	chr14	+	645	2	Intergenic	novelGene_238	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGAGTACTTTATCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10491012	10491809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_10491227_10491378
tx.21797	chr14	+	1154	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000045799.7	novel	336	1	NA	NA	-182	705	multi-exon	TRUE	canonical	1	276	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATTTTACAGTGTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13669255	13670478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_13669618_13669686
tx.21798	chr14	+	1784	3	ISM	ENSMUSG00000021747.13	ENSMUST00000225744.2	2390	13	149725	7176	149725	-7176	internal_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_1	3.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCTATATAATATTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13953258	13960176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_13953323_13954397_13954521_13958579
tx.21799	chr14	+	545	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033885.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATCTGGCTTAATGTGTAT	1164	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14329326	14330256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_14329755_14330139
tx.218	chr1	+	2270	9	FSM	ENSMUSG00000043015.16	ENSMUST00000165859.8	3396	9	21	1105	-13	85	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_5	7.49061913328932	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTGTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52669882	52689973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_52670011_52676523_52676640_52679987_52680220_52680329_52680403_52681477_52681572_52682280_52682396_52684419_52684646_52687908_52688086_52688864
tx.2180	chr11	-	2589	12	FSM	ENSMUSG00000003585.14	ENSMUST00000003681.8	2631	12	47	-5	-31	5	multi-exon	TRUE	canonical	3	7	junction_11	8.90816321700644	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTCATTGCCCATCGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4068784	4047033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_4048436_4053387_4053558_4053673_4053814_4053894_4054002_4058496_4058581_4058963_4059025_4059148_4059245_4061036_4061226_4061442_4061503_4061893_4061938_4066680_4066757_4068624
tx.21800	chr14	-	1999	5	NNC	ENSMUSG00000025278.10	novel	9100	46	NA	NA	56910	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	276.717703625915	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTCCCTGTCATTCTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14528122	14518184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_14519469_14521125_14521330_14523759_14523979_14527551_14527729_14528007
tx.21801	chr14	-	852	3	NNC	ENSMUSG00000094628.8	novel	1949	7	NA	NA	-241	-8977	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGAATGAATTGTTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17743239	17731256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_17731638_17738076_17738228_17742919
tx.21802	chr14	-	945	5	FSM	ENSMUSG00000091148.8	ENSMUST00000169364.8	997	5	55	-3	-8	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.1104335791443	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGTATGCTTCAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17987973	17979593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_17979922_17984993_17985178_17985853_17985986_17986940_17987104_17987835
tx.21803	chr14	-	1480	3	NNC	ENSMUSG00000079391.11	novel	1990	7	NA	NA	-192	-9936	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGACAGAATGTATTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18287389	18274813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_18275866_18282237_18282389_18287112
tx.21804	chr14	+	1909	5	NNC	ENSMUSG00000063277.8	novel	615	5	NA	NA	-14642	4718	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.6393596310755	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGATATTTTCTTTACT	7020	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14811158	14833596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_14811253_14826662_14826826_14827775_14827908_14828576_14828760_14832259
tx.21805	chr14	-	1134	2	NIC	ENSMUSG00000079402.10	novel	1933	7	NA	NA	19	-15368	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAAATGTCCTCATAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18817724	18811925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_18812974_18817638
tx.21806	chr14	-	1478	3	NNC	ENSMUSG00000096574.8	novel	1955	7	NA	NA	-235	-16375	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGAGAAATGTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19137381	19131348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_19132393_19135569_19135684_19137061
tx.21807	chr14	-	630	2	Intergenic	novelGene_242	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTCTTGGCTACATTC	7584	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20075598	20073856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_20074044_20075155
tx.21808	chr14	+	1043	7	ISM	ENSMUSG00000039599.17	ENSMUST00000224721.2	4483	8	-8	7843	-8	-1745	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	175	junction_5	36.4771618047969	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCCCAGTCAGTCATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20398319	20413567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_20398463_20401379_20401485_20402771_20402908_20406422_20406566_20408091_20408209_20409822_20409985_20413330
tx.21809	chr14	+	769	2	Intergenic	novelGene_243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20530212	20531235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_20530266_20530519
tx.2181	chr11	-	2605	11	NIC	ENSMUSG00000003585.14	novel	2631	12	NA	NA	-2	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_10	5.85149553533112	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTCATTGCCCATCGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4073417	4047033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_4048436_4053387_4053558_4053673_4053814_4053894_4054002_4058496_4058581_4058963_4059025_4059148_4059245_4061036_4061226_4061442_4061503_4061893_4061938_4073165
tx.21810	chr14	-	468	2	ISM	ENSMUSG00000021815.5	ENSMUST00000022353.5	1826	7	13256	3	13256	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATGGAAGTTAACATTACC	4466	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20533713	20532937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_20533310_20533617
tx.21811	chr14	-	2133	2	ISM	ENSMUSG00000021820.19	ENSMUST00000223863.2	663	4	1983	-1733	1953	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTGTGTTATTGCTGTTG	6571	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20787482	20784943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_20786921_20787326
tx.21812	chr14	-	1991	2	NNC	ENSMUSG00000114875.2	novel	1040	3	NA	NA	13159	-2071	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCCTGGCCATTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21508330	21502087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_21504060_21508311
tx.21813	chr14	+	1982	5	ISM	ENSMUSG00000021767.20	ENSMUST00000238837.2	6165	16	-249	48117	-125	779	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_4	9.69535971483266	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTTTTAACCTCTATAGA	5736	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21566693	21672824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_21567567_21659821_21659931_21668958_21669075_21669285_21669368_21672022
tx.21814	chr14	+	2939	2	ISM	ENSMUSG00000021767.20	ENSMUST00000238837.2	6165	16	147606	-128	38729	128	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	185	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAAAAAAAGCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21714548	21721069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_21714817_21718398
tx.21815	chr14	-	1111	5	ISM	ENSMUSG00000025280.9	ENSMUST00000026322.9	4687	31	33726	2	-2111	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_2	13.6106575888162	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGATATTAAGTGTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24503394	24498765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_24499291_24500762_24500896_24502260_24502393_24502578_24502744_24503238
tx.21816	chr14	-	628	4	ISM	ENSMUSG00000025280.9	ENSMUST00000026322.9	4687	31	0	34089	0	1018	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	137	junction_3	6.34209919681348	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGGGATGCCTAGAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24537120	24532852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_24533027_24534185_24534324_24534454_24534591_24536940
tx.21817	chr14	-	212	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025290.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCTATGAGAGAAGAGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24545927	24543452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_24543578_24545840
tx.21818	chr14	+	1250	3	ISM	ENSMUSG00000040726.11	ENSMUST00000035433.10	1141	4	317	-341	317	341	intron_retention	FALSE	canonical	3	134	junction_1	13.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAATCACTAAGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26722635	26724627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_26722834_26723328_26723529_26723775
tx.21819	chr14	+	966	5	ISM	ENSMUSG00000040717.7	ENSMUST00000035336.5	8280	13	41	18866	41	-829	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	9	junction_1	5.11737237261468	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACTAAGGGCTGGAGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26760938	26810377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_26761187_26798307_26798366_26804611_26804738_26809355_26809475_26809962
tx.2182	chr11	+	1922	9	FSM	ENSMUSG00000003581.15	ENSMUST00000003677.11	1874	9	-30	-18	-30	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_6	6.41165930161608	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCTGTGTGATGCTTTAA	7820	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4085171	4091190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_4085564_4085813_4085958_4086559_4086632_4086711_4086798_4087211_4087369_4089738_4089859_4089934_4090079_4090297_4090401_4090486
tx.21820	chr14	-	300	2	Intergenic	novelGene_247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGCCTTGGTTATGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27150641	27146778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_27146936_27150498
tx.21821	chr14	+	1133	4	NIC	ENSMUSG00000040640.12	novel	3339	8	NA	NA	4	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_2	17.7451088722749	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTATTGTCTGTTTATTT	2344	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27344402	27375762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_27344572_27345639_27345707_27374643_27375441_27375662
tx.21822	chr14	+	408	2	ISM	ENSMUSG00000091898.9	ENSMUST00000169169.8	721	6	2920	1	2900	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGTTTTCCTGGGGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30933188	30933685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30933374_30933462
tx.21823	chr14	-	1826	9	FSM	ENSMUSG00000021902.8	ENSMUST00000228930.2	1382	9	-330	-114	-21	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	10.3892973775901	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTCGGGTCTCCTTGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30973295	30959653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_30960111_30960293_30960440_30961587_30961695_30962815_30962941_30963682_30963785_30969999_30970092_30970951_30971005_30971564_30971675_30972661
tx.21824	chr14	+	1545	2	NNC	ENSMUSG00000046005.5	novel	3897	2	NA	NA	23062	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGACATTTTGATGTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31651546	31653686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_31651729_31652323
tx.21825	chr14	+	896	3	FSM	ENSMUSG00000021911.17	ENSMUST00000171279.2	804	3	-3	-89	-3	89	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	113.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAGACAACTCGAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31923924	31931279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_31924143_31930113_31930181_31930668
tx.21826	chr14	-	1504	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041408.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAAATGCAAAAAGATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34431301	34429373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_34430468_34430891
tx.21827	chr14	+	286	2	Intergenic	novelGene_255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41955800	41961650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_41955902_41961465
tx.21828	chr14	-	407	2	NNC	ENSMUSG00000090389.3	novel	827	2	NA	NA	438	-75	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGCCCTTAAACTTCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42979490	42978468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_42978541_42979155
tx.21829	chr14	-	639	3	NNC	ENSMUSG00000115294.2	novel	568	3	NA	NA	-3286	-10396	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGCTGAATCCTTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44453980	44439459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_44439834_44450367_44450512_44453859
tx.2183	chr11	+	2981	16	FSM	ENSMUSG00000002129.12	ENSMUST00000002198.4	4920	16	20	1919	15	1203	multi-exon	FALSE	canonical	3	694	junction_11	81.820834075979	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCTTCATGGAAGCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4110369	4130622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_4110551_4111045_4111168_4116495_4116704_4117632_4117891_4121061_4121137_4123079_4123231_4124031_4124220_4125035_4125154_4125394_4125581_4126269_4126392_4126480_4126727_4127412_4127621_4128070_4128226_4129140_4129243_4129353_4129426_4130033
tx.21830	chr14	-	514	4	FSM	ENSMUSG00000021830.15	ENSMUST00000153383.8	3691	4	92	3085	54	2182	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	5.31245915016974	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAACCCTCTGACCTAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45456767	45448568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_45448696_45450742_45450982_45456452_45456507_45456673
tx.21831	chr14	-	1605	14	NNC	ENSMUSG00000021831.10	novel	4418	16	NA	NA	33	1874	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	180.091199775798	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCATGTTTAATATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45555996	45523319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_45523546_45525189_45525324_45525432_45525520_45529818_45529889_45530387_45530635_45531760_45531854_45536467_45536541_45537298_45537420_45539149_45539224_45539305_45539380_45541005_45541045_45542705_45542790_45543968_45544089_45555833
tx.21832	chr14	+	554	4	Intergenic	novelGene_260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGAGAATTTTAGTGTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46628171	46634090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_46628321_46632867_46632900_46633187_46633251_46633780
tx.21833	chr14	-	687	4	ISM	ENSMUSG00000037572.18	ENSMUST00000111790.2	2962	14	-23	15457	2	-667	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	233	junction_1	30.8148593304522	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGATCCTAAGGATATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47514312	47510592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_47510681_47511369_47511522_47512200_47512313_47513977
tx.21834	chr14	-	959	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000114977.2	novel	1035	1	NA	NA	-24	8273	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACTTTGCAGTATACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47536023	47526691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_-_47527410_47534349_47534390_47535822
tx.21835	chr14	-	359	4	Intergenic	novelGene_264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_3	3.77123616632825	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGTGTGGTGGTCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47602641	47594604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_47594780_47600014_47600062_47601149_47601197_47602551
tx.21836	chr14	+	2949	2	FSM	ENSMUSG00000037536.15	ENSMUST00000043112.9	2937	2	-8	-4	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGTCTGGTCTTAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47710009	47769415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47710175_47766631
tx.21837	chr14	+	3213	5	NIC	ENSMUSG00000037536.15	novel	3418	7	NA	NA	4	-26	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	5	junction_3	35.4436171968946	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAACTTCAATAAAAAAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47710049	47769385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_47710175_47738250_47738328_47742442_47742590_47763661_47763772_47766631
tx.21838	chr14	+	441	3	NNC	ENSMUSG00000115310.2	novel	671	4	NA	NA	13194	42	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACGTCTAGCACGTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48055963	48060603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_48056058_48060150_48060257_48060362
tx.21839	chr14	+	1198	3	ISM	ENSMUSG00000021846.10	ENSMUST00000228519.2	1629	5	65499	0	51789	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	8	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGATCTCAACTGCCATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48487961	48494281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_48488162_48490033_48490223_48493472
tx.2184	chr11	+	1924	9	FSM	ENSMUSG00000034412.14	ENSMUST00000180088.2	1921	9	0	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	291	junction_8	26.2963875846094	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTGTGTATAGTTAGGAC	1582	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4136821	4165505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_4137100_4155756_4155857_4159925_4160034_4162140_4162248_4162784_4162900_4162977_4163044_4163556_4163747_4163836_4163992_4164700
tx.21840	chr14	+	2273	4	NIC	ENSMUSG00000016831.13	novel	5350	10	NA	NA	133	-45	intron_retention	FALSE	canonical	3	458	junction_1	42.0819306696935	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTCTGCATGTCAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52523323	52529769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_52524447_52524757_52524989_52528217_52528299_52528931
tx.21841	chr14	+	685	4	Fusion	ENSMUSG00000094619.3_ENSMUSG00000096329.3	novel	331	2	NA	NA	-110	1326	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTCAAACTGAATACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53310109	53317828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_+_53310272_53313234_53313324_53316193_53316232_53317432
tx.21842	chr14	+	705	2	Intergenic	novelGene_267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAGAGAATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53662480	53663666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_53662516_53662996
tx.21843	chr14	+	724	2	FSM	ENSMUSG00000096096.4	ENSMUST00000103663.6	361	2	-68	-295	-68	295	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTTGGGTCATTTTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53921035	53921929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_53921186_53921355
tx.21845	chr14	-	2284	12	NNC	ENSMUSG00000000958.11	novel	2278	12	NA	NA	923	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_9	54.9298576022034	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGAGTGGCTTTATTCT	7	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54654213	54606898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_54607344_54607549_54607734_54610396_54610547_54611298_54611396_54611670_54611775_54612004_54612129_54615222_54615368_54616452_54616579_54645959_54646506_54650180_54650242_54651336_54651471_54654045
tx.21846	chr14	-	1641	2	ISM	ENSMUSG00000022178.12	ENSMUST00000226463.2	2214	6	2549	-1	2549	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	430	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGTGAGTGTATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54806990	54804930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_54806514_54806932
tx.21847	chr14	+	1211	14	NIC	ENSMUSG00000112858.3	novel	1201	15	NA	NA	-26	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_6	6.9546289552589	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGTTGTATGAGGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55051571	55091565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_55051743_55053942_55054044_55056993_55057047_55057594_55057670_55075569_55075686_55076681_55076743_55079339_55079387_55079595_55079639_55079805_55079867_55080243_55080293_55086123_55086164_55086751_55086847_55087992_55088055_55091328
tx.2185	chr11	+	942	2	ISM	ENSMUSG00000034412.14	ENSMUST00000180088.2	1921	9	27033	-3	1380	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	291	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTGTGTATAGTTAGGAC	2748	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4163854	4165505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_4163992_4164700
tx.21850	chr14	+	1394	6	ISM	ENSMUSG00000075592.11	ENSMUST00000100529.10	6990	9	10233	4067	10233	-4067	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_3	6.40624695121879	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTGGAGGATCCACAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56101725	56107681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_56102591_56103415_56103547_56103667_56103765_56105477_56105580_56105870_56105973_56107584
tx.21851	chr14	+	568	2	ISM	ENSMUSG00000054509.8	ENSMUST00000161553.2	6387	35	30	75150	30	-75148	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATCCGGCTCACTGTGTG	1117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56813105	56822101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_56813188_56821615
tx.21852	chr14	-	1772	6	ISM	ENSMUSG00000040123.18	ENSMUST00000111285.9	5351	8	-40	6579	-40	19	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_4	28.2304799817502	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGAATTTGTTGTAATAA	8781	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57049213	57034623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_57035288_57036366_57036650_57041605_57041697_57041871_57042321_57048196_57048317_57049048
tx.21854	chr14	+	951	4	FSM	ENSMUSG00000096144.4	ENSMUST00000225045.2	2385	4	0	1434	0	-1434	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGTTGAATTCTTGTCA	2473	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57252590	57255005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_57252720_57253416_57253505_57253972_57254282_57254580
tx.21857	chr14	-	391	2	ISM	ENSMUSG00000114797.2	ENSMUST00000225572.2	3080	6	-3	8297	-3	-8297	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	271	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGAGAATGGTCTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60488858	60484771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_60484916_60488611
tx.21858	chr14	+	3808	14	FSM	ENSMUSG00000021987.10	ENSMUST00000022563.9	3813	14	6	-1	6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_3	13.0256915000032	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGAGTGTTTTTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60502682	60539820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_60502811_60514577_60514695_60517531_60517695_60519385_60519544_60522365_60522495_60526991_60527127_60529442_60529576_60530366_60530477_60530832_60530959_60533568_60533619_60534022_60534224_60535511_60535644_60536363_60536491_60537721
tx.21859	chr14	-	4241	10	FSM	ENSMUSG00000060548.14	ENSMUST00000111234.10	4051	10	-3	-187	-3	26	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_9	13.3813948598441	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTATGTGTCAAGTCAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61283921	61201297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_61203915_61208277_61208681_61209429_61209533_61210950_61211077_61212038_61212204_61234053_61234140_61242523_61242703_61261617_61261729_61262192_61262286_61283563
tx.2186	chr11	+	1151	2	ISM	ENSMUSG00000020424.4	ENSMUST00000020699.4	1574	9	4	2509	4	-2509	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAATCTGGGCCTTGAAT	7122	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4168228	4169900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_4168427_4168947
tx.21860	chr14	-	3344	2	NNC	ENSMUSG00000097589.10	novel	463	5	NA	NA	0	-1034	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGAGATTTTTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61886236	61881898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_61885073_61886066
tx.21861	chr14	+	689	2	Intergenic	novelGene_271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATGCTATTGATATGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61944462	61945627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_61944729_61945204
tx.21862	chr14	-	984	3	ISM	ENSMUSG00000035161.8	ENSMUST00000223585.2	10883	18	64297	7204	8083	-7204	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	534	junction_1	5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTGTGGTTTAGGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62934264	62930456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_62931124_62933147_62933242_62934041
tx.21863	chr14	+	1160	9	ISM	ENSMUSG00000014547.11	ENSMUST00000014691.10	6646	12	16	9493	16	-9493	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_8	4.86698058348295	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGTGACATGTGCTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63075142	63189465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_63075507_63123258_63123327_63137703_63137778_63162578_63162634_63167676_63167828_63171738_63171852_63181469_63181597_63186091_63186198_63189363
tx.21864	chr14	+	1670	14	NIC	ENSMUSG00000060012.10	novel	5603	40	NA	NA	-1	20202	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19.7232329287002	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATGACATAGCTCACATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64889989	64982411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_64890106_64907072_64907167_64951522_64951584_64952836_64952930_64954922_64955104_64959755_64959844_64962148_64962284_64964522_64964636_64965661_64965774_64973596_64973810_64974943_64975055_64975955_64976091_64979755_64979887_64982324
tx.21866	chr14	-	2395	7	NIC	ENSMUSG00000021972.15	novel	3396	11	NA	NA	-39252	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_3	13.9214063785077	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCAAGGCTGTCCGGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65098997	65049051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_65050869_65054465_65054586_65063049_65063142_65064220_65064317_65066034_65066118_65089333_65089488_65098964
tx.21867	chr14	-	439	2	NNC	ENSMUSG00000021978.10	novel	582	3	NA	NA	-36	-22821	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGGGAAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65387340	65338019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_65338377_65387258
tx.21868	chr14	-	1031	2	NNC	ENSMUSG00000021978.10	novel	582	3	NA	NA	-36	-32345	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAATAACAAACAAACAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65387340	65347543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_65348493_65387258
tx.21869	chr14	+	1090	2	NNC	ENSMUSG00000114693.2	novel	589	3	NA	NA	-38	-9667	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCGCCAAGAGCACAGGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65409765	65413118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_65409884_65412146
tx.2187	chr11	+	1571	9	FSM	ENSMUSG00000020424.4	ENSMUST00000020699.4	1574	9	4	-1	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_3	11.4229757506527	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGAGTGACAGCTGGCGT	7122	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4168228	4172410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_4168427_4168947_4169019_4170107_4170293_4170374_4170508_4170682_4170807_4171145_4171260_4171423_4171507_4171600_4171696_4171842
tx.21870	chr14	+	1534	3	ISM	ENSMUSG00000022032.15	ENSMUST00000069226.7	3262	8	-62	54132	-28	-53980	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_2	6.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAAGAAAGACAGAGA	790	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65903823	65928260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_65904196_65908005_65908124_65927216
tx.21871	chr14	+	2812	6	ISM	ENSMUSG00000022032.15	ENSMUST00000022610.15	3794	9	64509	0	54435	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_1	1.72046505340853	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGCTGATAAGTGGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65968360	66002275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_65968645_65975872_65975954_65977738_65977838_65979580_65979629_65997033_65997229_66000170
tx.21872	chr14	+	1094	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068165.4	novel	628	1	NA	NA	-132	387	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGAAAAGGAAAGAGAGGAGG	1302	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66282396	66283543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_66282641_66282693
tx.21873	chr14	+	408	2	Intergenic	novelGene_274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTACTGGCTGCTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67387605	67388696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_67387712_67388394
tx.21874	chr14	+	1016	4	FSM	ENSMUSG00000095463.9	ENSMUST00000184314.8	989	4	-30	3	-6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	92.0144916122817	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACTGTTGGAAGTGCCTGA	7295	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69574616	69587779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_69574738_69584934_69585044_69586521_69586720_69587191
tx.21875	chr14	-	907	3	FSM	ENSMUSG00000022090.11	ENSMUST00000129174.8	729	3	-47	-131	-47	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGTATTTTCTTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70405335	70401679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_70402243_70403538_70403657_70405109
tx.21876	chr14	+	388	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00002076268.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCTGTGGCTAATAGCACG	4775	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70526997	70538240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_70527147_70538001
tx.21877	chr14	-	1204	2	NNC	ENSMUSG00000022095.10	novel	4033	17	NA	NA	15161	1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCTGACTCTCCCCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70822114	70820734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_70821059_70821234
tx.21878	chr14	-	1193	2	NNC	ENSMUSG00000022095.10	novel	4033	17	NA	NA	15160	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACATGCTGACTCTCCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70822115	70820736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_70821059_70821244
tx.21879	chr14	-	1663	2	ISM	ENSMUSG00000022100.15	ENSMUST00000228346.2	4491	28	40912	-307	18434	284	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	450	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTTCAGCAGTCACGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70904563	70901973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70903535_70904461
tx.2188	chr11	+	2275	3	FSM	ENSMUSG00000058755.4	ENSMUST00000075221.3	2272	3	-2	-1	-2	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	46	junction_2	1.5	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTGTCAGTCTTTTATT	8291	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4186417	4191027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_4186914_4188405_4188543_4189385
tx.21880	chr14	-	608	6	ISM	ENSMUSG00000022100.15	ENSMUST00000226607.2	2769	22	-51	27674	27	-18636	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	395	junction_4	22.1214827712791	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTCCGAGACTCATCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71004041	70936442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70936487_70939159_70939226_70940662_70940830_70942103_70942198_70944726_70944874_71003951
tx.21881	chr14	-	1291	4	FSM	ENSMUSG00000033487.15	ENSMUST00000162922.8	1262	4	-6	-23	0	23	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_3	15.5134350376268	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAATAAAAGAAAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72947443	72835791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_72836583_72889455_72889532_72921073_72921212_72947157
tx.21882	chr14	-	1143	4	NNC	ENSMUSG00000033487.15	novel	1262	4	NA	NA	-699	16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	23	junction_3	53.2228021309163	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAGAAAATAAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72948142	72835798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_72836583_72889455_72889532_72921073_72921212_72947997
tx.21883	chr14	-	1698	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000057886.6	novel	552	1	NA	NA	-74	1106	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACCCTCCCAGAAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74193065	74191333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_-_74192826_74192859
tx.21885	chr14	-	3282	20	FSM	ENSMUSG00000068015.9	ENSMUST00000088970.7	4694	20	-1	1413	-1	39	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_4	23.7891243570067	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTTTTTTTCTGGATTC	578	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75185307	74993527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_74994584_75013020_75013099_75022930_75023069_75023720_75023831_75032350_75032432_75032736_75032810_75033477_75033532_75041660_75041698_75041800_75041891_75042908_75042993_75044913_75044982_75049039_75049156_75051045_75051152_75054508_75054573_75055931_75056060_75056933_75057071_75064037_75064144_75073088_75073216_75095416_75095562_75184823
tx.21886	chr14	+	308	2	Intergenic	novelGene_279	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTCCCCCTAGATAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76248409	76249543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_76248524_76249349
tx.21887	chr14	+	701	4	ISM	ENSMUSG00000034795.15	ENSMUST00000048208.10	1721	6	-20	20263	-20	-19754	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAATGTCCATTTATGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77274191	77329381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_77274412_77305299_77305394_77306276_77306390_77329107
tx.21888	chr14	+	1354	7	ISM	ENSMUSG00000058997.9	ENSMUST00000228904.2	2508	9	16041	751	16041	-751	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_4	9.68532681717842	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTTCCTGTCTGTGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79397401	79438999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_79397562_79401543_79401653_79418180_79418307_79420412_79420572_79434851_79434951_79435661_79435901_79438537
tx.2189	chr11	+	1939	3	NNC	ENSMUSG00000058755.4	novel	773	2	NA	NA	1240	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	20	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTGTCAGTCTTTTATT	788	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4187659	4191027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_4187820_4188405_4188543_4189385
tx.21890	chr14	-	2221	5	ISM	ENSMUSG00000022021.15	ENSMUST00000227666.2	3337	27	-28	263821	26	39857	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	183	junction_1	18.2002747232013	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTTTTAATTGTATTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87378634	87273317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_87275023_87310717_87310823_87328413_87328591_87352449_87352483_87378433
tx.21891	chr14	+	1757	7	ISM	ENSMUSG00000022019.17	ENSMUST00000168275.9	2657	14	68934	0	13666	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_5	17.764665303161	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTCTGGTTCACTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87723008	87782940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_87723136_87723627_87723785_87724597_87724724_87743194_87744043_87749080_87749207_87776832_87776958_87782692
tx.21892	chr14	-	802	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000062611.5	novel	792	1	NA	NA	-25	65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATGTTATATGAGATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88361269	88360387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_-_88360861_88360940
tx.21893	chr14	-	826	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000062611.5	novel	792	1	NA	NA	-24	65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATGTTATATGAGATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88361268	88360387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_-_88360861_88360915
tx.21894	chr14	+	1264	4	FSM	ENSMUSG00000005148.9	ENSMUST00000005279.8	3352	4	497	1591	34	-1591	multi-exon	FALSE	canonical	3	3464	junction_1	114.952163963972	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGCAAAGGAACTGGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99536623	99550881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_99536659_99538816_99539691_99540853_99540914_99550586
tx.21895	chr14	-	1664	7	NNC	ENSMUSG00000072294.6	novel	719	4	NA	NA	-75	-40873	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	8.78287475083693	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATAGCCTGGTTCTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100522190	100178509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_100179050_100179469_100179533_100224866_100225003_100260057_100260605_100347206_100347297_100387167_100387232_100521966
tx.21896	chr14	-	655	2	Intergenic	novelGene_288	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAGTGATATTTATTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100635743	100633405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_100633826_100635508
tx.21897	chr14	+	870	5	NNC	ENSMUSG00000033060.17	novel	6092	31	NA	NA	-24	-72024	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	9.28372231381357	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTAATAAGCCTCGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101967368	102046243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_101967480_101967590_101967662_102031676_102031748_102044889_102044960_102045696
tx.21898	chr14	+	762	3	ISM	ENSMUSG00000022125.8	ENSMUST00000022721.8	2445	4	93	4005	93	327	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	248	junction_2	5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCTGTGTATAGCTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103307744	103311059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_103307904_103309069_103309236_103310622
tx.21899	chr14	-	3348	5	FSM	ENSMUSG00000022124.16	ENSMUST00000145693.8	3352	5	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_4	32.5451609306207	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGTTGTATTTTTATAAC	9926	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103336431	103318469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_103320947_103326737_103326910_103329739_103329863_103332628_103332978_103336204
tx.219	chr1	+	3342	9	FSM	ENSMUSG00000043015.16	ENSMUST00000185483.7	2023	9	-37	-1282	7	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_5	9.4794184948234	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGGGCTCCGAGTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52669868	52691077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_52670011_52676523_52676640_52679987_52680220_52680329_52680403_52681477_52681572_52682326_52682396_52684419_52684646_52687908_52688086_52688864
tx.2190	chr11	-	617	5	FSM	ENSMUSG00000020419.12	ENSMUST00000130174.2	583	5	1	-35	1	35	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_4	8.69985632065266	666	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTAGACATTTTATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4391104	4374212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_4374308_4374755_4374820_4377243_4377386_4385001_4385090_4390876
tx.21900	chr14	-	1439	2	FSM	ENSMUSG00000048349.10	ENSMUST00000139505.2	799	2	-184	-456	-184	456	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTATGATCTGGGTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104702985	104700952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_104701981_104702574
tx.21901	chr14	-	1686	8	ISM	ENSMUSG00000091509.8_ENSMUSG00000022119.16	ENSMUST00000163545.8	3270	22	44851	-486	-1672	486	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_1	17.0353773551587	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAAAAAGAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105369445	105351914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_105352723_105354421_105354536_105358417_105358505_105362018_105362220_105366000_105366106_105367668_105367837_105368918_105368994_105369317
tx.21902	chr14	+	326	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060143.8	novel	384	1	NA	NA	-1	13	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAAATGACTGCAAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105919260	105919658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_105919338_105919409
tx.21903	chr14	+	354	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060143.8	novel	384	1	NA	NA	-1	15	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAATGACTGCAAGCATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105919260	105919660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_105919314_105919359
tx.21905	chr14	+	786	2	ISM	ENSMUSG00000058571.12	ENSMUST00000123239.2	4146	4	510336	2421	509715	-2421	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTGTTCAACCAGCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117673062	117862189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_117673456_117861796
tx.21908	chr14	+	713	2	FSM	ENSMUSG00000022139.18	ENSMUST00000227508.2	3789	2	22	3054	22	-3054	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCCAAAAGTTGCCAGGT	6912	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120513163	120562764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_120513318_120562205
tx.2191	chr11	-	507	5	NNC	ENSMUSG00000020419.12	novel	583	5	NA	NA	-93	35	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	25	junction_4	75.5326915977446	79	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTAGACATTTTATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4391198	4374212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_4374308_4374755_4374820_4377243_4377386_4385001_4385090_4391080
tx.21911	chr14	-	2329	11	FSM	ENSMUSG00000063410.9	ENSMUST00000079817.8	2676	11	349	-2	216	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_7	30.6098023515344	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTTGCATACTATTCTT	7652	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121616397	121523752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_121524777_121529391_121529529_121530832_121530902_121531601_121531726_121532066_121532213_121534546_121534733_121539597_121539756_121540158_121540268_121545426_121545484_121574833_121575065_121616309
tx.21912	chr14	+	1040	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115390.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTGAACTCCATGAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121743906	121751223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_121744091_121750367
tx.21914	chr14	+	1499	2	NIC	ENSMUSG00000025545.11	novel	1231	8	NA	NA	3	-29563	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAGATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122419118	122610076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_122419194_122608652
tx.21915	chr14	-	293	2	ISM	ENSMUSG00000041594.19	ENSMUST00000128969.2	842	7	24	33327	-11	52	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTGTCTTAATCCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123220663	123215485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_123215699_123220583
tx.21916	chr15	+	2068	4	Intergenic	novelGene_517	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACAATTCAATACAGCAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3053640	3066467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_3053726_3059863_3060405_3060496_3060745_3065273
tx.21917	chr15	-	842	8	NIC	ENSMUSG00000091119.3	novel	798	9	NA	NA	-21	126	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_3	10.4978131833565	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAATTGCATTTATTTTG	8075	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3333029	3309982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_3310232_3310504_3310589_3312299_3312428_3321861_3321927_3323334_3323404_3327582_3327689_3330586_3330676_3332977
tx.21918	chr15	-	1151	2	NNC	ENSMUSG00000022141.8	novel	9423	47	NA	NA	152325	134	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACAGGCTGACTTCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8321622	8319966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_8321075_8321579
tx.21919	chr15	+	2992	13	FSM	ENSMUSG00000022253.18	ENSMUST00000190591.10	4135	13	415	728	-6	303	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_7	89.5046553724069	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTACTTTGTTTTCTTATTT	68	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9071754	9110251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_9071846_9083349_9083439_9084241_9084331_9085804_9085887_9091254_9091339_9092802_9092940_9096102_9096182_9098897_9098964_9100194_9100291_9103070_9103127_9103413_9103468_9106816_9106941_9108306
tx.2192	chr11	-	2635	8	NNC	ENSMUSG00000034354.18	novel	5466	17	NA	NA	-4247	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_7	80.3383152546728	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTCTTAATTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4447565	4432551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_4432940_4435362_4435452_4437233_4438633_4439621_4439768_4440977_4441149_4441806_4441993_4442718_4442915_4447505
tx.21920	chr15	+	3260	18	FSM	ENSMUSG00000039704.9	ENSMUST00000227556.3	8098	18	-38	4876	-38	-238	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_6	5.43473386468287	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTCCAGACACACCAGAAG	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	9140598	9197693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_9140828_9149062_9149293_9149541_9149640_9151570_9151667_9156292_9156461_9157299_9157511_9165874_9165950_9171183_9171298_9172143_9172328_9175210_9175393_9175872_9176007_9177738_9177845_9178348_9178447_9182571_9182676_9183996_9184044_9186682_9186789_9194761_9194889_9196742
tx.21921	chr15	+	2600	7	ISM	ENSMUSG00000039704.9	ENSMUST00000090380.6	3210	18	-104	30440	11	1542	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	16	junction_6	7	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGCATGTGTCCTTGATC	43	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9140647	9167491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_9140828_9149062_9149293_9149541_9149640_9151570_9151667_9156292_9156461_9157299_9157511_9165874
tx.21922	chr15	-	579	5	NNC	ENSMUSG00000022249.15	novel	1483	12	NA	NA	41601	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTCGAGAGCACACCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10517135	10500190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_10500266_10502176_10502278_10509399_10509483_10515173_10515318_10516959
tx.21923	chr15	+	555	3	NIC	ENSMUSG00000096971.3	novel	2257	4	NA	NA	0	897	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAACCACTGAACGTCTAGT	103	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10714963	10719450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_10715091_10716733_10716861_10719149
tx.21924	chr15	+	1222	11	ISM	ENSMUSG00000039458.16	ENSMUST00000174160.3	4489	16	-41	12594	-8	-12348	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_5	37.0216153078171	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTCAACCCATTGCTTT	21	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12205162	12259732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_12205366_12230359_12230421_12232841_12232988_12233939_12234013_12236103_12236235_12238014_12238106_12245069_12245200_12251438_12251515_12257712_12257820_12258503_12258629_12259653
tx.21925	chr15	-	446	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115193.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATATCTGTGTTTTTAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23503269	23489954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_23490387_23503255
tx.21926	chr15	-	924	2	NNC	ENSMUSG00000097452.3	novel	2054	2	NA	NA	13283	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACACTTGGATATGCAACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25005197	25004215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_25004914_25004971
tx.21927	chr15	+	2634	6	ISM	ENSMUSG00000022270.17	ENSMUST00000228306.2	1430	7	21575	-1337	21575	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_3	5.19230199429887	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTTACCAGTATTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25964339	25973760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_25964437_25966718_25966804_25968492_25968631_25969881_25969947_25970183_25970311_25971638
tx.21928	chr15	-	514	3	NNC	ENSMUSG00000115138.2	novel	1237	5	NA	NA	494	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTTTGACTTGGCTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27463041	27459919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_27460254_27461348_27461420_27462932
tx.21929	chr15	-	1876	13	ISM	ENSMUSG00000039100.11	ENSMUST00000090227.6	6260	26	45100	2985	-13962	-2985	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_10	20.3652413576553	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGACCTGCTGTGATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31486099	31459021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_31459426_31462087_31462224_31465399_31465533_31467835_31467926_31469688_31469824_31471762_31471945_31475891_31475962_31478440_31478643_31480430_31480569_31482643_31482745_31482949_31483070_31485091_31485227_31486069
tx.2193	chr11	+	419	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000059534.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTTGCGTAGAACCCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4651974	4654335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_4652197_4654138
tx.21930	chr15	-	811	5	ISM	ENSMUSG00000039100.11	ENSMUST00000090227.6	6260	26	61415	3033	2353	-3033	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_2	11.7792189893897	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATCTTTAACAAATGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31469784	31459069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_31459426_31462087_31462224_31465399_31465533_31467835_31467926_31469688
tx.21931	chr15	+	1451	3	Intergenic	novelGene_528	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAATAGAAAGAAAGAAAA	143	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33221528	33223822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_33221824_33221952_33222054_33222767
tx.21932	chr15	+	1585	2	Intergenic	novelGene_529	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TAGAAAGAAAGAAAAGAAAG	143	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33221528	33223827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_33222054_33222767
tx.21933	chr15	+	1373	3	FSM	ENSMUSG00000022324.16	ENSMUST00000226766.2	3252	3	-5	1884	-2	-1884	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGACTTTACTAGAGGAAA	45	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34306820	34346110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_34307055_34316636_34316802_34345136
tx.21934	chr15	-	4289	10	FSM	ENSMUSG00000022280.10	ENSMUST00000022890.10	4277	10	-12	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_2	15.6946165182307	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTGTGTGCCCAGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36283305	36240078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_36242212_36244232_36244377_36245561_36245776_36247267_36247430_36247896_36248012_36253146_36253310_36254528_36254674_36260160_36260370_36265421_36266178_36283057
tx.21935	chr15	+	2149	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115127.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGATATGCTGGGGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36668109	36670783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_36668981_36669505
tx.21936	chr15	+	803	2	Intergenic	novelGene_540	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTGTAATTTTTACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36934235	36936641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_36934771_36936373
tx.21937	chr15	-	3983	3	NIC	ENSMUSG00000022292.17	novel	658	6	NA	NA	19	1782	intron_retention	FALSE	canonical	3	55	junction_1	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGAATT	7127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37961328	37943509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_37947096_37953842_37953999_37961087
tx.21938	chr15	+	832	3	ISM	ENSMUSG00000054196.8	ENSMUST00000067072.5	1166	4	3657	0	-3481	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTGTTTATTTGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38943983	38950516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_38944100_38947660_38947878_38950017
tx.21939	chr15	-	1095	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037386.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTTCTCGTTGGTGA	2109	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39110561	39105322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_39106174_39110317
tx.2194	chr11	-	512	3	FSM	ENSMUSG00000059534.9	ENSMUST00000151559.2	510	3	0	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	506	junction_1	31	2829	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGCTTTTGCACGAGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4654334	4651972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_4652221_4653903_4653990_4654156
tx.21940	chr15	+	2898	8	ISM	ENSMUSG00000022307.17	ENSMUST00000090095.13	4158	14	30838	-1	-10579	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	180	junction_1	39.2298303824619	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTTGGATTTTTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41683748	41724444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_41683975_41686722_41686892_41689285_41689449_41713854_41713981_41714770_41714924_41716717_41716814_41718316_41718391_41722553
tx.21941	chr15	+	586	4	Intergenic	novelGene_546	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	9.53356643071673	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCATCTACTGTCTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42811089	42817507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_42811196_42813761_42813895_42814164_42814368_42817363
tx.21942	chr15	-	381	3	NNC	ENSMUSG00000072592.3	novel	668	3	NA	NA	-7	50643	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAATGTCTGTTTCATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43340439	43243695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_43243950_43294696_43294748_43340363
tx.21945	chr15	+	1764	8	ISM	ENSMUSG00000022419.17	ENSMUST00000023056.8	3300	9	15904	1412	15887	-1412	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_6	6.43650304346789	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGGTTTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55012735	55116186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_55012916_55015183_55015308_55044260_55044440_55072126_55072313_55075587_55075723_55078883_55078955_55081564_55081670_55115402
tx.21946	chr15	+	876	2	ISM	ENSMUSG00000022419.17	ENSMUST00000023056.8	3300	9	84750	1408	84733	-1408	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGGTTTTACCAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55081581	55116190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_55081670_55115402
tx.21948	chr15	-	501	3	NNC	ENSMUSG00000060429.13	novel	4919	7	NA	NA	229864	-9988	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	2	junction_1	21.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTGTCATCTCTTCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55539842	55509771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_55509933_55511252_55511450_55539699
tx.21949	chr15	+	156	1	Intergenic	novelGene_553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATATGGAACACTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57102245	57102401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_57102200_57102400
tx.2195	chr11	-	427	2	FSM	ENSMUSG00000059534.9	ENSMUST00000058407.6	434	2	7	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8152	junction_1	0	46976	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGCTTTTGCACGAGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4654335	4651972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_4652221_4654156
tx.21950	chr15	+	1520	3	ISM	ENSMUSG00000051225.10	ENSMUST00000160942.8	2876	4	7417	304	6926	-304	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_2	2.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTTCCCTGGACCTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57856231	57874101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_57856471_57858609_57858735_57872945
tx.21951	chr15	-	2036	4	FSM	ENSMUSG00000022360.9	ENSMUST00000226649.2	2209	4	173	0	173	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	382	junction_3	7.84573486395988	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTTTCTAGTTCTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57961999	57957439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_57958968_57959972_57960102_57960647_57960782_57961754
tx.21952	chr15	+	3697	19	ISM	ENSMUSG00000037119.5	ENSMUST00000037270.5	5560	24	9373	1126	-7419	-1126	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	305	junction_12	32.3419232575925	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTTACGACAGTCCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58296689	58328463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_58296740_58298442_58298534_58298902_58298966_58301840_58301948_58302027_58302067_58302510_58302624_58303054_58303171_58304363_58304477_58304742_58304830_58306512_58306646_58313426_58313576_58314680_58314816_58315009_58315124_58319434_58319508_58320191_58320342_58321779_58321885_58322386_58322511_58324831_58324902_58326598
tx.21953	chr15	-	542	3	ISM	ENSMUSG00000022350.8	ENSMUST00000022976.6	4033	29	9	37184	9	-37184	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	429	junction_1	42	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCATAAATACATTGTAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59246007	59241029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_59241148_59241728_59242035_59245889
tx.21954	chr15	+	393	3	Intergenic	novelGene_561	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCCCATGTGGCTAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62826519	62834559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_62826597_62827088_62827222_62834376
tx.21955	chr15	+	1783	6	ISM	ENSMUSG00000015002.19	ENSMUST00000211878.2	2541	23	47297	-1321	23	-1237	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	469	junction_2	44.9310583004674	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGGAAGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65729379	65744428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_65729441_65733500_65733593_65737726_65737776_65738572_65738677_65739118_65739169_65743001
tx.21957	chr15	+	971	4	ISM	ENSMUSG00000022332.9	ENSMUST00000230847.2	1344	7	101018	-23	99647	21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	311	junction_3	23.6126143312331	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAACGATTTCATGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68901563	68965382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_68901760_68921227_68921311_68962982_68963042_68964749
tx.2196	chr11	+	792	6	NNC	ENSMUSG00000009076.11	novel	792	6	NA	NA	-9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	287	junction_1	154.183786436836	3939	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGGCCTGTCTCTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4654668	4687669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_4654713_4672357_4672512_4678584_4678648_4680186_4680268_4682066_4682179_4687331
tx.21960	chr15	-	713	2	Intergenic	novelGene_563	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAGAAAAATCGATAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73534291	73533081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_73533729_73534225
tx.21961	chr15	+	1597	5	FSM	ENSMUSG00000047728.14	ENSMUST00000185307.7	758	5	-48	-791	-48	80	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.73861278752583	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGACACCTATATGTTT	1182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75088176	75094590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_75088262_75088532_75088604_75089563_75089681_75092469_75092690_75093486
tx.21962	chr15	-	988	4	NIC	ENSMUSG00000022577.18	novel	906	4	NA	NA	13	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCCGGGTCTGAGCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75439091	75436595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_75437191_75437431_75437549_75437980_75438109_75438943
tx.21964	chr15	+	2333	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000044361.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCCTGGTGTATGTTGGCTC	5560	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76002330	76004985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_76002450_76002771
tx.21965	chr15	+	1599	6	ISM	ENSMUSG00000022564.8	ENSMUST00000023225.8	1725	7	1076	0	-213	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_5	6.71118469422501	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCTGCTTCTCCTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76132050	76134104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_76132378_76132458_76132569_76132648_76132850_76132971_76133101_76133177_76133322_76133416
tx.21966	chr15	+	2128	13	FSM	ENSMUSG00000022556.12	ENSMUST00000228371.2	2102	13	-24	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_9	120.605071756263	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACATACATACATATATA	7120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76361620	76385174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76361918_76380169_76380279_76380652_76380790_76381035_76381161_76381818_76381895_76381967_76382030_76382151_76382249_76382353_76382491_76382621_76382892_76383331_76383416_76384147_76384254_76384466_76384537_76384616
tx.21967	chr15	+	590	2	ISM	ENSMUSG00000022550.19	ENSMUST00000160296.2	843	3	-38	1498	-4	-1498	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	148	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAC	3119	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76460574	76472427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_76460695_76471957
tx.21968	chr15	+	2836	4	FSM	ENSMUSG00000033728.15	ENSMUST00000137649.8	2832	4	3	-7	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	33.8066397160216	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTAGTGTTGCTTTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76594845	76599291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76595731_76597066_76597421_76597600_76598186_76598279
tx.21969	chr15	+	1616	3	NIC	ENSMUSG00000033728.15	novel	4849	4	NA	NA	5	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTAGTGTTGCTTTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76594877	76599291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_76595128_76597066_76597421_76598279
tx.2197	chr11	+	751	5	ISM	ENSMUSG00000009076.11	ENSMUST00000009220.5	792	6	17677	0	-6230	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	609	junction_1	36.4374463979023	1105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGCTGGCCTGTCTCTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4672354	4687669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_4672512_4678584_4678648_4680186_4680268_4682066_4682179_4687331
tx.21970	chr15	-	507	3	FSM	ENSMUSG00000033697.17	ENSMUST00000176219.9	542	3	35	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	34	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAGCCCATGTTTTAAAT	8268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76702271	76642240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76642501_76649684_76649852_76702191
tx.21971	chr15	+	837	6	NNC	ENSMUSG00000003970.10	novel	851	6	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4542.52452277365	434	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGCGTGTGTGAGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76788284	76790514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_76788310_76788502_76788651_76788738_76788881_76789017_76789230_76790055_76790172_76790320
tx.21972	chr15	+	823	6	NNC	ENSMUSG00000003970.10	novel	851	6	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4459.97675330265	269	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGCGTGTGTGAGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76788284	76790514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_76788310_76788502_76788651_76788738_76788881_76789017_76789237_76790055_76790151_76790320
tx.21973	chr15	-	648	5	NNC	ENSMUSG00000054967.8	novel	635	5	NA	NA	-8	-1470	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.3077640640442	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGAAGTGAACGTCTGTCA	8477	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76809656	76797657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_76797891_76801489_76801604_76801834_76801962_76802168_76802262_76809575
tx.21974	chr15	-	193	2	Intergenic	novelGene_567	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGGTCATGGTGTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76956098	76954491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_76954610_76956023
tx.21975	chr15	-	738	5	ISM	ENSMUSG00000033565.19	ENSMUST00000227930.2	1218	10	55484	8	-8372	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_4	9.65336728815391	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGTGCATTTCCACGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76982272	76968003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_76968407_76969777_76969851_76970266_76970356_76978650_76978691_76982139
tx.21978	chr15	-	1430	3	ISM	ENSMUSG00000016552.14	ENSMUST00000016696.13	4793	9	19	12221	19	10	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	38	junction_2	15	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAAGAAAGAAAAAAG	8678	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77840903	77836942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_77837735_77839788_77840290_77840766
tx.21979	chr15	-	1201	2	ISM	ENSMUSG00000115867.2	ENSMUST00000229708.2	1561	3	0	890	0	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTGTTTTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78909982	78900418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_78901333_78909695
tx.2198	chr11	-	972	7	ISM	ENSMUSG00000009073.17	ENSMUST00000093374.11	1795	16	29218	0	-6071	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_1	134.225452959646	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCCCAGGCAATACAGGA	5992	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4741178	4729813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_4730035_4730577_4730623_4732186_4732353_4734435_4734564_4737443_4737550_4739664_4739883_4741090
tx.21981	chr15	-	347	2	ISM	ENSMUSG00000009035.16	ENSMUST00000229003.2	625	3	-7	1536	-7	57	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	271	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTACCTTGGTGTGATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79287483	79262665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_79262914_79287384
tx.21982	chr15	-	4544	13	FSM	ENSMUSG00000055065.8	ENSMUST00000229877.2	4726	13	182	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_12	13.0064086767511	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTGTGAATTTTTTATTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79430760	79411936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79414719_79415878_79416116_79420157_79420218_79421197_79421260_79421635_79421747_79422759_79422933_79423018_79423180_79423519_79423662_79424613_79424680_79425234_79425369_79426687_79426788_79427906_79428058_79430395
tx.21983	chr15	-	459	2	Intergenic	novelGene_573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCAGTGCCTGGCCAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80056238	80047354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_80047719_80056143
tx.21984	chr15	-	181	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047888.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGAGCGCCGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80809275	80804339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_80804375_80809129
tx.21985	chr15	-	2146	4	FSM	ENSMUSG00000042292.19	ENSMUST00000123243.8	849	4	-27	-1270	2	1270	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	7.40870359029762	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81074956	80909349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_80910919_80929489_80929556_81001591_81001854_81074707
tx.21989	chr15	-	729	2	FSM	ENSMUSG00000100552.2	ENSMUST00000186748.2	287	2	-167	-275	-49	216	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGTTTGTGTTTTTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82872080	82866709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_82867175_82871816
tx.2199	chr11	-	958	5	ISM	ENSMUSG00000009073.17	ENSMUST00000093374.11	1795	16	29218	2121	-6071	2	internal_fragment	FALSE	canonical	3	347	junction_3	17.8518206354422	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGACTTATGCCCAAGGCG	5992	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4741178	4731934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_4732353_4734435_4734564_4737443_4737550_4739664_4739883_4741090
tx.21990	chr15	-	3198	10	NNC	ENSMUSG00000041815.15	novel	3299	9	NA	NA	-9	10	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	199.638995176448	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGTCTTTTTTCATGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83033511	83010166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_83011492_83011528_83012257_83013394_83013462_83015681_83015812_83016777_83016856_83017347_83017528_83019494_83019591_83021668_83021756_83022332_83022724_83033395
tx.21991	chr15	-	3167	8	FSM	ENSMUSG00000041815.15	ENSMUST00000100375.11	3157	8	-8	-2	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_6	194.457277192347	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAGCTATAATGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83033540	83010176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83012257_83013394_83013462_83015681_83015812_83016777_83016856_83017347_83017528_83019494_83019591_83022332_83022724_83033395
tx.21994	chr15	-	4352	2	ISM	ENSMUSG00000016664.17	ENSMUST00000171436.8	3693	11	23	22166	-13	-7271	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	511	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAGTAAAGGAAA	7130	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83348784	83281973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_83286201_83348659
tx.21995	chr15	-	975	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000049414.8	novel	438	1	NA	NA	-80	595	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCCTTAGTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83290344	83289231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_83290113_83290250
tx.21999	chr15	+	1624	12	NNC	ENSMUSG00000022438.7	novel	3784	13	NA	NA	-4	-2153	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	23.3099843822519	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTCCTGAGTCTCAGAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84116262	84197736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_84116388_84155431_84155522_84157699_84157771_84166962_84167066_84174587_84174729_84176982_84177099_84179757_84179849_84187608_84187671_84188035_84188105_84193053_84193156_84196903_84196977_84197155
tx.22	chr1	+	1857	13	NNC	ENSMUSG00000025911.15	novel	2022	13	NA	NA	6	-163	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	21.4416197045735	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTCTGTTTCATAAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9618285	9646963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_9618377_9620131_9620170_9623147_9623206_9623542_9623698_9623847_9624045_9625762_9625841_9627224_9627331_9628357_9628511_9630333_9630433_9633733_9633813_9634021_9634119_9637005_9637164_9646415
tx.220	chr1	-	1492	5	ISM	ENSMUSG00000026102.10	ENSMUST00000027271.9	5767	6	18156	3984	-44	257	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1.6583123951777	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTCAAGTGGAATGACTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52838691	52828569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_52829377_52830846_52831022_52833628_52833830_52836199_52836261_52838443
tx.2200	chr11	+	1893	10	FSM	ENSMUSG00000034285.16	ENSMUST00000038570.9	1926	10	34	-1	-14	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1103	junction_6	68.3294488507475	2168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTGTGGTGTTGTCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4823984	4844201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_4824104_4833367_4833496_4833725_4833772_4834021_4834117_4838879_4838951_4839096_4839238_4839532_4839565_4839891_4839987_4841402_4841487_4843119
tx.22002	chr15	+	1474	11	NIC	ENSMUSG00000022386.13	novel	1526	11	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_4	15.6745015869724	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTGTCTGGGGCTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85763519	85781595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_85763660_85766874_85767041_85769286_85769394_85774405_85774529_85776822_85776941_85778026_85778081_85778154_85778222_85779126_85779228_85780560_85780706_85781035_85781119_85781225
tx.22003	chr15	+	1557	4	FSM	ENSMUSG00000054863.10	ENSMUST00000068088.8	2603	4	-42	1088	-42	-1086	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.09120616516523	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATATATTTAACAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87509388	87642477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_87509688_87565680_87565831_87604702_87604831_87641497
tx.22005	chr15	-	985	4	NNC	ENSMUSG00000022388.15	novel	2968	12	NA	NA	14043	-18811	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.816496580927726	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACAGGTGGTCAGTCGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88824219	88818682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_88819232_88820205_88820330_88823149_88823242_88823999
tx.2201	chr11	+	1262	3	ISM	ENSMUSG00000034285.16	ENSMUST00000038570.9	1926	10	15940	-1	6627	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1304	junction_1	1.5	595	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTGTGGTGTTGTCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4839890	4844201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_4839987_4841402_4841487_4843119
tx.22011	chr15	+	286	3	ISM	ENSMUSG00000059883.17	ENSMUST00000074936.10	2831	12	19365	1239	19336	-1239	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTTTACTTCTCGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94460888	94464948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_94460962_94464619_94464779_94464894
tx.22012	chr15	-	1208	2	Intergenic	novelGene_579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGATAGTAGTCTGTTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96184514	96177284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_96177875_96183896
tx.22014	chr15	-	1753	3	ISM	ENSMUSG00000022462.8	ENSMUST00000023099.8	4660	16	892	9199	-147	-6926	internal_fragment	FALSE	canonical	3	311	junction_2	2	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGATTGTGTGGTTTTTT	845	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96596719	96594471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_96595919_96596062_96596145_96596495
tx.22015	chr15	+	1172	4	Intergenic	novelGene_581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	0.816496580927726	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTTGGAAAAAAATTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96607727	96625837	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_96607852_96609539_96609620_96617836_96617930_96624962
tx.22018	chr15	+	187	2	Intergenic	novelGene_584	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAGGAAGAAGAAGAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97024525	97031004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_97024673_97030964
tx.22019	chr15	-	758	2	ISM	ENSMUSG00000033075.18	ENSMUST00000180657.2	3806	19	112	45135	112	1689	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGAATGCCTATTGGCAGAA	6573	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97991020	97984748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_97985015_97990528
tx.2202	chr11	+	2243	20	FSM	ENSMUSG00000034274.12	ENSMUST00000038237.8	2235	20	-6	-2	-6	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	228	junction_1	27.0805712775824	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTTTGTAGCTCCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4845336	4878867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_4845379_4849790_4849907_4851151_4851296_4852085_4852200_4852334_4852433_4854094_4854242_4855640_4855756_4860626_4860760_4862780_4862859_4864269_4864311_4864521_4864622_4865488_4865598_4868123_4868226_4869732_4869830_4870376_4870492_4871921_4872026_4872138_4872227_4874747_4874864_4876045_4876237_4878674
tx.22021	chr15	-	968	2	ISM	ENSMUSG00000003360.16	ENSMUST00000003450.15	3187	17	16470	-8	16439	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCCGAGCTCCATTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98544300	98543006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_98543899_98544224
tx.22022	chr15	+	645	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000059213.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATCCAGCCTCTTCTTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98703349	98704466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_98703724_98704195
tx.22023	chr15	+	1315	5	ISM	ENSMUSG00000023484.15	ENSMUST00000047104.15	1863	8	1392	4	597	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_4	5.61248608016091	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTACTGTGTTGGTCTG	691	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98954447	98956854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_98955040_98955138_98955360_98955448_98955499_98955696_98955777_98956482
tx.22026	chr15	+	549	2	FSM	ENSMUSG00000096111.8	ENSMUST00000177831.2	666	2	-54	171	-54	-171	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGTAAATGATGGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99832639	99850754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_99832800_99850365
tx.22027	chr15	+	1235	10	ISM	ENSMUSG00000023025.17	ENSMUST00000230956.2	2192	15	1	13225	0	4979	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	302	junction_1	109.838264937336	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCGGTAAGATCAAAAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99870717	99895354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99870865_99882797_99882937_99883918_99884075_99885283_99885360_99888173_99888311_99889605_99889710_99891203_99891315_99892544_99892599_99894347_99894558_99895253
tx.22028	chr15	+	516	4	ISM	ENSMUSG00000023025.17	ENSMUST00000229553.2	1420	6	-1	5014	0	-5014	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	323	junction_1	147.766332054663	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACAGAATCTTTTTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99870716	99885359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99870865_99882800_99882937_99883918_99884075_99885283
tx.22029	chr15	+	2239	6	NIC	ENSMUSG00000023027.14	novel	2365	7	NA	NA	23	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	34	junction_2	106.576920578519	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTAAGTTTTCGGAATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100125722	100159123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_100125964_100130613_100130713_100149949_100150081_100151974_100152155_100152234_100152395_100157695
tx.2203	chr11	+	3799	21	NNC	ENSMUSG00000009090.18	novel	4085	21	NA	NA	-10	-150	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	68.0619387029197	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGCACATTTCTTCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4936901	4992579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_4937052_4959529_4959593_4962881_4962988_4965605_4965746_4966605_4966852_4968015_4968207_4969280_4969503_4973096_4973218_4974371_4974468_4975593_4975710_4976244_4976411_4980961_4981061_4981629_4981890_4982417_4982620_4983686_4983843_4987631_4987778_4989124_4989255_4989518_4989604_4990093_4990181_4990266_4990422_4991717
tx.22030	chr15	+	2237	6	NIC	ENSMUSG00000023027.14	novel	2365	7	NA	NA	-23	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	7	junction_1	119.054609318581	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGTTTTCGGAATGCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100125728	100159125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_100125964_100143125_100143227_100149949_100150081_100151974_100152155_100152234_100152395_100157695
tx.22031	chr15	+	683	2	FSM	ENSMUSG00000023032.13	ENSMUST00000160256.2	421	2	-141	-121	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCAGTTTGGCTGTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100659627	100672965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_100659856_100672510
tx.22032	chr15	+	568	3	FSM	ENSMUSG00000023032.13	ENSMUST00000161564.2	445	3	-118	-5	4	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	12.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGGCTGTGATTTACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100659631	100672970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_100659856_100672510_100672593_100672708
tx.22034	chr15	+	2415	7	NNC	ENSMUSG00000023034.8	novel	893	2	NA	NA	1184	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_1	68.8486665730636	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTTTTTTCTGTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101165910	101172680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_101165971_101167963_101168851_101169616_101169747_101170033_101170186_101170598_101170802_101170895_101171075_101171876
tx.22035	chr15	+	2001	6	ISM	ENSMUSG00000023034.8	ENSMUST00000023779.8	2477	7	3587	0	-2428	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_2	16.6180624622728	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGAGTCTTTTTTTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101168313	101172676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_101168851_101169616_101169747_101170033_101170186_101170598_101170802_101170895_101171075_101171876
tx.22036	chr15	+	1464	5	ISM	ENSMUSG00000023034.8	ENSMUST00000023779.8	2477	7	4890	0	-1125	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_1	16.7984374273323	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGAGTCTTTTTTTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101169616	101172676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_101169747_101170033_101170186_101170598_101170802_101170895_101171075_101171876
tx.22037	chr15	+	590	3	ISM	ENSMUSG00000023046.7	ENSMUST00000023807.7	1112	4	3480	2	3480	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTACGTCTCTGCGTCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102056276	102057944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_102056414_102056536_102056660_102057614
tx.22039	chr15	-	2210	13	ISM	ENSMUSG00000001281.11	ENSMUST00000001327.11	2683	15	7360	0	7324	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_10	5.29150262212918	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGCCTCTACTTTACT	3208	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102133019	102124429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102124703_102124906_102125068_102125326_102125533_102125681_102125902_102126208_102126433_102126931_102127126_102127608_102127756_102130523_102130614_102130776_102130873_102131075_102131235_102131765_102132008_102132736_102132908_102132992
tx.2204	chr11	+	965	2	NNC	ENSMUSG00000009090.18	novel	3942	21	NA	NA	2063	-150	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGCACATTTCTTCCCTC	3869	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4990826	4992579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_4990930_4991717
tx.22040	chr15	-	1578	7	ISM	ENSMUSG00000001288.16	ENSMUST00000063339.14	2718	8	54	3667	54	1382	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_3	9.04464236747676	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTAGCTTCCTTTACTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102154881	102147041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102147399_102147824_102148030_102148292_102148470_102148562_102148724_102149492_102149635_102150270_102150420_102154494
tx.22044	chr15	-	2223	7	FSM	ENSMUSG00000000552.11	ENSMUST00000229551.2	2221	7	11	-13	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_6	27.1456974286698	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAAGGACTCAGACTGTCT	8827	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103231926	103222321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103223653_103223787_103223884_103224053_103224224_103224308_103224552_103226375_103226539_103228716_103228828_103231817
tx.22046	chr16	+	642	2	Intergenic	novelGene_594	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAGGAAAACACATCCAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3507592	3508361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_3507853_3507979
tx.22047	chr16	-	1538	3	FSM	ENSMUSG00000039789.8	ENSMUST00000090522.5	5668	3	23	4107	23	-345	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	9.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAATACAAGCCTTTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3690237	3683498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_3684595_3689013_3689141_3689922
tx.22048	chr16	+	753	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039738.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCTACCATTTAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3793771	3801504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_+_3794031_3801010
tx.22049	chr16	+	3216	18	NIC	ENSMUSG00000022517.18	novel	3138	17	NA	NA	-11	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	83	junction_12	136.27729719254	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTATGTGTGCCTTTGT	2913	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4704101	4756158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_4704338_4725231_4725351_4728583_4728673_4729185_4729333_4731553_4731672_4733616_4733684_4733968_4734019_4736729_4736778_4738176_4738246_4740457_4740618_4742286_4742397_4744172_4744239_4745538_4745766_4748554_4748679_4748976_4749020_4750063_4750163_4752058_4752104_4754759
tx.2205	chr11	+	1201	3	FSM	ENSMUSG00000034209.5	ENSMUST00000037218.2	1110	3	-96	5	-96	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	0.5	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACAATTTAAGGGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5008031	5010380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_5008525_5009432_5009558_5009797
tx.22050	chr16	+	3172	17	NIC	ENSMUSG00000022517.18	novel	3138	17	NA	NA	-10	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	83	junction_12	118.010592744889	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTATGTGTGCCTTTGTTC	2914	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4704102	4756160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_4704338_4725231_4725351_4728583_4728673_4729185_4729333_4731553_4731672_4733616_4733684_4733968_4734019_4736729_4736778_4738176_4738246_4740457_4740618_4742286_4742397_4744172_4744239_4745538_4745766_4748554_4748679_4748976_4749020_4750063_4750163_4754759
tx.22051	chr16	+	544	2	ISM	ENSMUSG00000022517.18	ENSMUST00000230990.2	2519	17	-131	27397	3	-8127	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	468	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAGCCATTATTGAATTGA	2930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4704118	4725556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_4704338_4725231
tx.22052	chr16	-	2075	4	ISM	ENSMUSG00000022536.15	ENSMUST00000115844.3	3292	16	30502	-7	30502	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1061	junction_2	69.0812725868757	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTATCATTGTACCCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4837219	4831765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_4833467_4836263_4836389_4836703_4836884_4837150
tx.22053	chr16	-	502	2	NNC	ENSMUSG00000039457.5	novel	6217	22	NA	NA	-43	-22246	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAATAATTCCTCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4950328	4937078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_4937398_4950145
tx.22054	chr16	+	1110	4	NNC	ENSMUSG00000091712.3	novel	5740	16	NA	NA	-150	-16284	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATAATTTTATCTCTTTCT	238	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4964822	4985514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_4965033_4965608_4965713_4983452_4983603_4984868
tx.22055	chr16	-	1449	2	Intergenic	novelGene_595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCACGTGGGAAGATGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8287078	8275977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_8277288_8286939
tx.22056	chr16	-	2954	7	NIC	ENSMUSG00000050908.13	novel	3315	7	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4.60675832036175	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTATTTCTCATAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10265225	10238420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_10240750_10242062_10242123_10243623_10243753_10244864_10244994_10245246_10245337_10264793_10264874_10265088
tx.22057	chr16	+	1954	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022500.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTCTTTGCCTACATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10826257	10832844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_+_10826593_10829816_10829861_10831269
tx.22058	chr16	-	1817	5	ISM	ENSMUSG00000022498.17	ENSMUST00000038424.14	3095	12	46119	4	-1179	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_1	7.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTCGAATGTCATTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10906395	10892778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_10893507_10897567_10897649_10902071_10902182_10902614_10902758_10905640
tx.22059	chr16	+	1433	3	NNC	ENSMUSG00000022545.14	novel	3480	11	NA	NA	7460	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	32	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGGTTTCTCAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12957714	12966598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_12957826_12962264_12962378_12965389
tx.2206	chr11	-	562	2	ISM	ENSMUSG00000009079.17	ENSMUST00000130118.2	649	3	513	-281	513	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4970	junction_1	0	1935	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCATCCTCCTCCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5020378	5019692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_5020104_5020227
tx.22060	chr16	+	1397	3	ISM	ENSMUSG00000009569.15	ENSMUST00000115809.8	667	5	6	5248	6	-5245	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	7.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCAGGGTGTAGCAGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13074375	13145538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_13074419_13082942_13083004_13144245
tx.22061	chr16	-	2724	10	ISM	ENSMUSG00000060657.9	ENSMUST00000090300.6	7751	27	66	32127	66	-333	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	10	junction_6	4.47213595499958	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTACACTCTTTGTGTGTG	9882	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13977065	13959163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_13959666_13959751_13959910_13960095_13960522_13963780_13963954_13964587_13964706_13966879_13967107_13969005_13969181_13969889_13970577_13971695_13971896_13977007
tx.22062	chr16	-	581	3	ISM	ENSMUSG00000060657.9	ENSMUST00000090300.6	7751	27	-14	43297	-14	-11503	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_2	4	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCACACGGGCTCACTCTT	9802	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13977145	13970333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_13970577_13971695_13971896_13977007
tx.22063	chr16	-	1217	5	ISM	ENSMUSG00000018830.11	ENSMUST00000090287.5	6549	41	88191	-7	88182	7	3prime_fragment	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.11803398874989	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGTTGGCTCTTCTGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14021045	14012391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_14013049_14018558_14018732_14018832_14018942_14019926_14020136_14020976
tx.22064	chr16	+	491	4	ISM	ENSMUSG00000023088.18	ENSMUST00000134776.8	614	6	-23	11007	0	-273	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_2	16.8193010820572	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCTTGAGATCTAAGATCAT	7156	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14179421	14211918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_14179508_14207670_14207848_14209181_14209308_14211816
tx.22065	chr16	+	726	2	ISM	ENSMUSG00000026181.14	ENSMUST00000027373.12	4922	8	110	23361	5	-11191	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACACTGTGGTACTAAGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16714442	16721867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_16714489_16721187
tx.22066	chr16	+	1565	3	ISM	ENSMUSG00000041774.17	ENSMUST00000231975.2	1623	4	27	2857	0	-2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_2	15.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGGCTGGTTTATAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16964839	16966708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_16965257_16965461_16965562_16965660
tx.22067	chr16	-	549	3	Intergenic	novelGene_599	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTTGGCAACCATGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17436173	17414976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_17415364_17435247_17435361_17436124
tx.22068	chr16	+	706	5	FSM	ENSMUSG00000041617.11	ENSMUST00000182344.8	409	5	-6	-291	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.26917420765551	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTAAGCTTCCTTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17464475	17468602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17464648_17465471_17465517_17465930_17465991_17468012_17468070_17468230
tx.22069	chr16	-	2643	5	FSM	ENSMUSG00000012114.18	ENSMUST00000232005.2	3118	5	6	469	-2	-469	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_1	28.3240180765371	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAATAATTATATGTAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17540766	17496299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17498626_17501022_17501053_17503316_17503369_17515470_17515559_17540619
tx.2207	chr11	-	1401	10	ISM	ENSMUSG00000009079.17	ENSMUST00000102930.10	2174	18	16754	-204	52	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2776	junction_9	631.157510031478	272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCATCCTCCTCCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5032288	5019692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_5020104_5020227_5020481_5020625_5020724_5020995_5021159_5021519_5021643_5022811_5022942_5028472_5028592_5028919_5028953_5029484_5029520_5032252
tx.22070	chr16	-	3498	3	FSM	ENSMUSG00000012114.18	ENSMUST00000232401.2	3475	3	-17	-6	-14	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_2	16.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAATCGCATAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17540793	17500132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17503369_17515470_17515559_17540619
tx.22071	chr16	+	1076	2	NNC	ENSMUSG00000116652.3	novel	1658	2	NA	NA	-127	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGTGGCATTACTAAGATG	4151	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17650857	17652872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_17651074_17652012
tx.22072	chr16	+	1007	2	Intergenic	novelGene_602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTGTTTCTTGTGGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17831673	17834855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_17831840_17834014
tx.22073	chr16	-	1561	9	NNC	ENSMUSG00000013539.15	novel	1622	9	NA	NA	-2094	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	80.7611253945857	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGTTGGCTTTTTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18151429	18118688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_18119417_18120549_18120655_18121546_18121701_18125833_18125905_18128732_18128848_18130502_18130623_18134509_18134599_18142220_18142315_18151344
tx.22074	chr16	-	1601	10	NNC	ENSMUSG00000013539.15	novel	1622	9	NA	NA	8	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	99.7663938074006	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGTTGGCTTTTTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18161788	18118688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_18119417_18120549_18120655_18121546_18121701_18125833_18125905_18128732_18128848_18130502_18130623_18134509_18134599_18142220_18142315_18161506_18161602_18161758
tx.22075	chr16	+	967	3	NNC	ENSMUSG00000087556.2	novel	672	3	NA	NA	-47	445	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTTATTTTGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18235384	18241192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_18235470_18239918_18240038_18240429
tx.22076	chr16	+	1135	3	FSM	ENSMUSG00000087556.2	ENSMUST00000150389.2	672	3	-18	-445	-18	445	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTTATTTTGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18235413	18241192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_18235667_18239918_18240038_18240429
tx.22077	chr16	+	288	2	NNC	ENSMUSG00000106567.2	novel	458	4	NA	NA	50087	147	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACATCTTCCTTTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18920203	18925646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_18920301_18925455
tx.22078	chr16	+	1863	7	ISM	ENSMUSG00000041215.17	ENSMUST00000090052.11	5997	30	1	60407	1	972	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	52.5959440768329	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGAAGACCATCATTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19959813	19990916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_19959986_19971658_19971757_19972886_19972980_19975636_19975883_19977886_19978003_19980725_19980888_19989940
tx.2208	chr11	-	2393	17	FSM	ENSMUSG00000009079.17	ENSMUST00000079949.13	2588	17	191	4	-8	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	2776	junction_9	796.06296616144	1000	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCATCCTCCTCCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5049075	5019692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_5020104_5020227_5020481_5020625_5020724_5020995_5021159_5021519_5021643_5022811_5022942_5028472_5028592_5028919_5028953_5029484_5029520_5032252_5032434_5033359_5033572_5035895_5036064_5037959_5038147_5041858_5041983_5043680_5043733_5043868_5043906_5049008
tx.22088	chr16	+	1502	5	NNC	ENSMUSG00000022877.10	novel	1734	7	NA	NA	4581	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.90512483795333	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAAGTGTAACTACTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22774430	22780400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_22774674_22774789_22774957_22776216_22776298_22777910_22778013_22779491
tx.2209	chr11	-	2396	17	NNC	ENSMUSG00000009079.17	novel	2588	17	NA	NA	-8	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	1342	junction_9	1044.5656674397	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCATCCTCCTCCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5049075	5019692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_5020104_5020227_5020481_5020625_5020724_5020995_5021159_5021519_5021643_5022811_5022942_5028472_5028592_5028919_5028953_5029484_5029523_5032252_5032434_5033359_5033572_5035895_5036064_5037959_5038147_5041858_5041983_5043680_5043733_5043868_5043906_5049008
tx.22090	chr16	-	660	2	Intergenic	novelGene_606	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGGGTTTGGATATTTTG	4301	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24212211	24211305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_24211858_24212103
tx.221	chr1	-	1810	6	FSM	ENSMUSG00000026102.10	ENSMUST00000027271.9	5767	6	-34	3991	-34	250	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1.49666295470958	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTACAGTTCAAGTGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52856881	52828576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_52829377_52830846_52831022_52833628_52833830_52836199_52836261_52838443_52838696_52856560
tx.2210	chr11	+	1874	9	FSM	ENSMUSG00000034175.14	ENSMUST00000101610.10	2333	9	461	-2	-46	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_2	51.4605431374369	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTCTCCTGAGTGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5049386	5056093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_5049567_5049747_5049899_5050396_5050588_5051868_5051906_5053160_5053350_5054020_5054405_5055184_5055348_5055432_5055718_5055799
tx.22103	chr16	+	126	2	Intergenic	novelGene_607	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGTGTTCTTGGGACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32971458	32972737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_32971561_32972713
tx.22105	chr16	+	1494	5	ISM	ENSMUSG00000035506.17	ENSMUST00000121925.8	2656	14	55	111581	55	-72775	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_1	9.39414711402797	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAGCATAGAAAATGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33337752	33372197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_33337866_33338649_33338747_33355233_33355381_33361221_33361414_33371252
tx.22106	chr16	-	3997	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000075254.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCTTCGCCGCCACCTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33545353	33541270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_33541464_33541549
tx.22107	chr16	+	579	2	ISM	ENSMUSG00000022833.8	ENSMUST00000232489.2	3156	9	-1	15370	-1	-12209	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTCTCTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34511078	34516416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_34511202_34515960
tx.2211	chr11	+	370	2	Intergenic	novelGene_137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCTTTTCCACTTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5407363	5412730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_5407536_5412532
tx.22110	chr16	-	859	4	NNC	ENSMUSG00000022838.15	novel	667	4	NA	NA	-31	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	5.8878405775519	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTATTTGTTGGTATTCT	8169	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36648654	36614111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_36614289_36620948_36621207_36628340_36628523_36648412
tx.22111	chr16	+	672	5	NIC	ENSMUSG00000034243.18	novel	11001	22	NA	NA	-7	18	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_2	16.3611582719562	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGAACTCCAGGAAAAGGA	1442	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36695494	36709781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_36695626_36705372_36705551_36707600_36707766_36707918_36708069_36709733
tx.22112	chr16	+	744	6	ISM	ENSMUSG00000034243.18	ENSMUST00000114812.9	11001	22	-14	43671	13	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_2	8.99777750336159	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAACATGAACTCCAGGAA	1463	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36695515	36709776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_36695626_36705372_36705551_36706492_36706591_36707600_36707766_36707918_36708069_36709733
tx.22113	chr16	-	2943	4	ISM	ENSMUSG00000022828.11	ENSMUST00000023525.9	3084	5	3595	5	3582	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	294	junction_2	12.5521135891752	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAAGAGGTGGTTATACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37356556	37330156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_37332182_37336080_37336323_37343112_37343315_37356082
tx.22114	chr16	+	1741	5	NNC	ENSMUSG00000075122.6	novel	1701	5	NA	NA	-36	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.08972473588517	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGGGGAGCAAGTTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38279258	38307295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_38279652_38294227_38294550_38299425_38299708_38302981_38303096_38306665
tx.22116	chr16	+	1673	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116684.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTTTTCTAGTCTGATT	8593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43531177	43547599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_+_43531347_43546095
tx.22117	chr16	-	3051	9	NNC	ENSMUSG00000022704.17	novel	3856	9	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	51.6876133614235	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCGCTGTGCATTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43710019	43681769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_43683665_43687772_43687891_43689308_43689461_43691979_43692184_43696991_43697205_43698319_43698397_43700661_43700718_43701330_43701577_43709929
tx.22118	chr16	-	1662	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036208.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.24721912892465	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTCTGATCCTTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44544882	44539461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_44540791_44540929_44540971_44544084_44544172_44544677
tx.22119	chr16	+	3193	9	NNC	ENSMUSG00000036208.14	novel	3743	6	NA	NA	219	-179	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	17.4982141945971	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTTCCATTACTCAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44544938	44557468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_44545613_44547390_44547546_44549604_44549685_44549944_44550077_44550482_44550561_44551694_44552060_44552420_44552483_44554903_44555161_44556078
tx.22120	chr16	-	2961	7	FSM	ENSMUSG00000022664.12	ENSMUST00000023344.10	4233	7	35	1237	-16	1136	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_3	4.7404875511093	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAATCTGTACTATGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44979034	44961172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_44962576_44963983_44964765_44967630_44967699_44971815_44971950_44972939_44973039_44977823_44978010_44978744
tx.22121	chr16	-	991	2	ISM	ENSMUSG00000033149.18	ENSMUST00000076333.12	5347	19	-131	78869	13	542	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGTTCCCTGGGCAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45664728	45645625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_45646459_45664570
tx.22122	chr16	+	746	2	FSM	ENSMUSG00000085781.2	ENSMUST00000152070.2	527	2	-28	-191	-28	191	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTACTTTTCTTGGACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45756657	45759833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_45756792_45759221
tx.22124	chr16	+	1207	8	NIC	ENSMUSG00000055447.20	novel	1358	11	NA	NA	8	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_7	27.9335947254505	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAATTGGAATCCCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49676026	49731444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_49676196_49688127_49688476_49704527_49704618_49714539_49714648_49715731_49715825_49716718_49716812_49718402_49718496_49731231
tx.22125	chr16	-	290	2	Intergenic	novelGene_610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCTCTTATGAGCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50753151	50748769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_50749039_50753130
tx.22127	chr16	-	2920	6	NNC	ENSMUSG00000075033.5	novel	6436	6	NA	NA	-88	-3244	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	4	junction_1	2.13541565040626	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACAAGTATTTCTTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55715736	55663559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_55665090_55669974_55670182_55680668_55680743_55686158_55686914_55710944_55711213_55715650
tx.22128	chr16	-	1558	4	NNC	ENSMUSG00000075033.5	novel	6436	6	NA	NA	-120	-20010	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	2.35702260395516	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGCTAGAGCTTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55715768	55680325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_55680743_55686158_55686914_55710944_55711213_55715650
tx.22129	chr16	+	2166	4	ISM	ENSMUSG00000022742.7	ENSMUST00000060077.7	3097	7	4110	-5	266	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	152	junction_1	24.7969532178631	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGTTTCCTTTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58494764	58500754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_58494885_58495604_58495824_58498307_58498413_58499032
tx.2213	chr11	+	1829	5	FSM	ENSMUSG00000020484.20	ENSMUST00000063084.16	2129	5	299	1	-37	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	876	junction_4	35.2801289680182	251	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCCTGTTCTGTGATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5470957	5475892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_5471201_5471922_5472020_5473332_5473468_5474238_5474385_5474684
tx.22130	chr16	-	3441	9	NIC	ENSMUSG00000022911.12	novel	3528	10	NA	NA	-22	7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	21	junction_1	12.6830349285965	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAATTTTAAAAGATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62667378	62614040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_62616072_62623082_62623200_62624199_62624426_62626904_62627011_62632211_62632415_62633521_62633628_62647526_62647777_62651105_62651177_62667047
tx.22131	chr16	-	2059	2	FSM	ENSMUSG00000047141.6	ENSMUST00000052588.5	4741	2	186	2496	186	-2496	multi-exon	FALSE	canonical	3	193	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTTCTTGTCCTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64606498	64603209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_64603640_64604869
tx.22132	chr16	+	1342	2	ISM	ENSMUSG00000008976.17	ENSMUST00000126031.8	586	6	4873	-1170	1416	284	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	593	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTTTGAATATTGCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84654343	84658487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_84654461_84657262
tx.22133	chr16	-	1092	3	ISM	ENSMUSG00000052299.10	ENSMUST00000039449.9	7743	30	51884	1495	51835	-1495	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_1	3	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAATAAATATTACTAAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87177616	87175033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_87175896_87176563_87176732_87177554
tx.22134	chr16	-	868	4	ISM	ENSMUSG00000002489.17	ENSMUST00000114124.9	5203	12	-69	121115	-69	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	9.10433352249844	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGCAAAGCAAAGCAA	7777	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89940726	89705113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_89705604_89752823_89752996_89863408_89863461_89940572
tx.22135	chr16	-	350	2	Intergenic	novelGene_617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCGCCTGTGTGGTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90305902	90300981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_90301280_90305850
tx.22136	chr16	-	462	3	ISM	ENSMUSG00000022973.19	ENSMUST00000118246.3	2743	19	47124	1	5408	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_2	11.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTAACGCATCTCCATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90760825	90757380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_90757566_90758261_90758419_90760705
tx.22137	chr16	-	955	2	FSM	ENSMUSG00000022973.19	ENSMUST00000156140.2	947	2	-5	-3	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTTTCGTTCATTTTTT	2441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90807956	90806198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_90807058_90807860
tx.22138	chr16	+	1167	3	FSM	ENSMUSG00000084866.3	ENSMUST00000231422.2	1151	3	-20	4	-20	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCATTCCTAGCCATTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91261892	91267012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_91262525_91264631_91264714_91266559
tx.22139	chr16	-	319	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022967.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAAAAGTCCCACGTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91293272	91291947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_91292210_91293215
tx.2214	chr11	+	912	4	ISM	ENSMUSG00000020484.20	ENSMUST00000239150.2	1116	6	-37	567	-37	-268	intron_retention	FALSE	canonical	3	908	junction_2	26.2339898266013	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGTAGTCTGATATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5470957	5474675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_5471201_5471922_5472020_5473332_5473468_5474238
tx.22140	chr16	-	347	3	ISM	ENSMUSG00000022964.15	ENSMUST00000023686.15	2347	7	93	8805	-43	-3106	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGGTGTGTTTTCCACGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91394595	91380195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_91380277_91383829_91383970_91394469
tx.22141	chr16	-	547	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022957.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTAGTTATCATACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91699294	91694331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_91694837_91699252
tx.22142	chr16	+	717	3	ISM	ENSMUSG00000022957.21	ENSMUST00000231735.2	1437	8	4708	4	-3180	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACTGTATTTTGGAGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91705666	91709220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_91705738_91706092_91706267_91708748
tx.22143	chr16	-	1818	12	NIC	ENSMUSG00000022948.17	novel	1816	12	NA	NA	-4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_11	40.1213036710482	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCAGACTGTCTTAGTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93400707	93380344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_93380573_93382066_93382191_93383124_93383206_93384706_93384789_93386798_93386974_93387761_93388192_93390134_93390224_93393185_93393224_93396099_93396196_93398525_93398687_93400024_93400085_93400453
tx.22144	chr16	+	879	5	ISM	ENSMUSG00000040785.20	ENSMUST00000119131.3	3781	11	-30	11424	1	-1598	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_3	4.32290411644765	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGACAAGCAAACACGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94171626	94186630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_94171721_94184770_94184926_94185204_94185248_94185642_94185794_94186194
tx.22145	chr16	+	981	10	FSM	ENSMUSG00000040785.20	ENSMUST00000145432.8	2973	10	17	1975	0	-1975	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	18.1720175605853	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCACCTTGGAGAATACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94171625	94195266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_94171721_94184770_94184926_94185642_94185794_94186194_94186283_94188195_94188250_94189123_94189245_94191060_94191147_94192873_94192969_94193970_94194034_94195193
tx.22146	chr16	+	505	4	ISM	ENSMUSG00000040785.20	ENSMUST00000122895.8	3579	32	63537	-5	-5775	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	10.1434160364686	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAACATGAAAGCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94235176	94243543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_94235232_94236334_94236406_94240043_94240209_94243329
tx.22147	chr16	+	2421	4	FSM	ENSMUSG00000023147.18	ENSMUST00000233566.2	2415	4	-5	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	163.242832069963	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTACTGTGGAAAGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95946607	95959047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_95946779_95953012_95953179_95955280_95955396_95957078
tx.22148	chr16	-	3526	2	FSM	ENSMUSG00000046962.17	ENSMUST00000063605.15	5463	2	6	1931	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAGTTTGGGATGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97763809	97750963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_97754294_97763613
tx.22149	chr16	-	3678	3	FSM	ENSMUSG00000046962.17	ENSMUST00000113734.9	6010	3	3	2329	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_2	13	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAGTTTGGGATGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97763818	97750963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_97754294_97757957_97758101_97763613
tx.2215	chr11	-	412	2	Intergenic	novelGene_139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCCTTGGTCATGGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5509713	5508363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_5508587_5509524
tx.22150	chr17	-	713	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068141.6	novel	720	1	NA	NA	-16	164	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATGTCTCTCTATACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3095024	3094124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_-_3094337_3094523
tx.22151	chr17	-	715	4	NNC	ENSMUSG00000116551.2	novel	654	2	NA	NA	-21323	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTATTTTATAGAAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5018412	4995431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_4995872_5007814_5007880_5012358_5012533_5018376
tx.22153	chr17	+	2108	9	NNC	ENSMUSG00000002365.11	novel	3331	18	NA	NA	77102	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	77.5129021518353	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCAGATTCCCAAAGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5968728	5982231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_5968790_5970345_5970450_5970844_5970949_5972404_5972483_5974879_5974957_5976346_5976437_5977480_5977596_5978479_5978572_5980844
tx.22154	chr17	+	847	5	ISM	ENSMUSG00000002365.11	ENSMUST00000002436.11	3331	18	83274	914	83251	-914	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_4	10.2713192920871	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATAACTCTTTCAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5974877	5981315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_5974957_5976346_5976437_5977480_5977596_5978479_5978572_5980844
tx.22155	chr17	-	901	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000023805.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGTTTGTGTGTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6086078	6082472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_6083170_6083748_6083819_6085944
tx.22156	chr17	+	798	4	ISM	ENSMUSG00000073471.4	ENSMUST00000097423.3	2189	8	28328	320	-1906	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_3	7.84573486395988	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTTTTCATTTATTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8192812	8198336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_8192973_8194876_8195040_8197549_8197637_8197948
tx.22157	chr17	+	551	2	NNC	ENSMUSG00000058159.15	novel	1755	11	NA	NA	-368	-50037	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTTGGGTTTTTTTGTTT	8216	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8590859	8591523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_8591114_8591226
tx.22158	chr17	+	362	2	NNC	ENSMUSG00000097350.3	novel	3174	2	NA	NA	23	-2583	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGACGTGGTCTGTGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12537762	12543554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_12537854_12543283
tx.22159	chr17	+	568	2	FSM	ENSMUSG00000078247.6	ENSMUST00000162826.3	607	2	39	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCTGTTTCAGCATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12960255	13049223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_12960312_13048711
tx.2216	chr11	-	610	3	FSM	ENSMUSG00000020477.11	ENSMUST00000020770.11	700	3	94	-4	69	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	2385	junction_2	231.5	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGGTCTCTCTCTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5657573	5654321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_5654733_5657297_5657410_5657486
tx.22160	chr17	-	547	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116895.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACGGGTTCTTTGGAAGTT	537	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15240214	15233027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15233378_15240017
tx.22161	chr17	-	974	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116895.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15244232	15239503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15240222_15243976
tx.22162	chr17	-	760	3	ISM	ENSMUSG00000079707.11	ENSMUST00000040746.8	720	4	-42	3193	-42	-3193	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAATAATTGGCTAGATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15261792	15250608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_15250927_15253608_15253816_15261557
tx.22168	chr17	-	3561	6	FSM	ENSMUSG00000002617.15	ENSMUST00000135840.2	759	6	-48	-2754	-47	345	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	4.4988887516808	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATTTCAGTGGCAAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23412273	23393504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23396339_23397248_23397376_23401121_23401207_23410318_23410483_23410650_23410777_23412048
tx.2217	chr11	-	645	4	NNC	ENSMUSG00000020477.11	novel	995	4	NA	NA	-5	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	67	junction_3	1216.61890317205	160	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGTCTCTCTCTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5657695	5654319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_5654733_5657297_5657410_5657486_5657556_5657644
tx.22173	chr17	-	2545	3	FSM	ENSMUSG00000023909.5	ENSMUST00000024702.5	2575	3	23	7	23	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	3.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTTCTCCCGCCTGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23959349	23955166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23956974_23957113_23957336_23958833
tx.22175	chr17	+	894	3	FSM	ENSMUSG00000039218.18	ENSMUST00000190568.2	597	3	113	-410	113	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_1	16	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAATTGGTCTGTAGTCTTT	4369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24042611	24043711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_24042879_24042989_24043095_24043189
tx.22176	chr17	-	365	3	NNC	ENSMUSG00000024137.10	novel	1377	2	NA	NA	-29	16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGATTTTTTTTTTTAAAAAT	7383	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24689194	24684415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_24684565_24685621_24685707_24689063
tx.22177	chr17	-	1429	12	ISM	ENSMUSG00000002496.11	ENSMUST00000227754.2	2357	18	6	8916	-1	-8916	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_11	24.8625976183218	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGTTCCTAGCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24851570	24840516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_24840739_24841498_24841643_24842449_24842577_24844241_24844316_24845219_24845346_24845668_24845718_24846964_24847083_24847915_24848061_24848842_24848954_24849886_24849974_24850918_24851086_24851511
tx.22178	chr17	-	305	3	ISM	ENSMUSG00000002496.11	ENSMUST00000227754.2	2357	18	6	18294	-1	1139	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_2	31.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGAGGAGGTGGGTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24851570	24849894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_24849974_24850918_24851086_24851511
tx.2218	chr11	-	657	4	FSM	ENSMUSG00000020477.11	ENSMUST00000154330.2	995	4	-1	339	-1	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1753	junction_3	448.803099612984	1578	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGGTCTCTCTCTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5657688	5654321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_5654733_5657297_5657410_5657486_5657556_5657623
tx.2219	chr11	+	582	2	ISM	ENSMUSG00000083844.9	ENSMUST00000131130.8	595	3	-16	1560	5	-1196	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAAGACATTTTCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5712133	5730680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_5712241_5730205
tx.22194	chr17	+	1109	7	ISM	ENSMUSG00000040276.16	ENSMUST00000231350.2	1368	8	545	6	545	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_1	9.7581874455363	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAGAGACAGCGTTTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27923975	27927660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_27924055_27924598_27924755_27924890_27925067_27925967_27926089_27926192_27926321_27926853_27927042_27927399
tx.22196	chr17	-	360	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037805.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTCTTAGCTAGAAGACACA	8882	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28550006	28549506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_28549678_28549817
tx.22198	chr17	-	1382	12	ISM	ENSMUSG00000024006.18	ENSMUST00000009138.13	3351	14	40	3439	3	-15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	678	junction_1	54.8244380569875	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCTTTTTTTTGAAGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29226929	29193292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_29193352_29193519_29193644_29194792_29194911_29196513_29196576_29198176_29198280_29201005_29201161_29203050_29203175_29207151_29207236_29210271_29210395_29211390_29211443_29218982_29219116_29226684
tx.22199	chr17	-	1606	12	FSM	ENSMUSG00000024012.19	ENSMUST00000095427.12	1952	12	346	0	-36	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	492	junction_4	200.604458475704	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCAAGCCTCTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29566562	29551045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29551753_29552487_29552564_29552748_29552817_29552931_29552980_29555140_29555286_29557715_29557776_29558764_29558817_29559041_29559100_29559394_29559473_29559764_29559872_29561796_29561882_29566440
tx.222	chr1	-	911	5	ISM	ENSMUSG00000026102.10	ENSMUST00000027271.9	5767	6	99	6227	-21	-1598	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_3	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATCTAGCCTTTGCTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52856748	52830812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_52831022_52833628_52833830_52836199_52836261_52838443_52838696_52856560
tx.2220	chr11	+	901	5	ISM	ENSMUSG00000083844.9	ENSMUST00000142942.8	1840	7	-4	4026	-4	-1192	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_2	33.1313673125635	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGACATTTTCCTTTCCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5712145	5730684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_5712241_5715508_5715572_5718885_5719073_5719166_5719244_5730205
tx.22202	chr17	+	854	2	NNC	ENSMUSG00000024030.8	novel	1372	3	NA	NA	0	-24034	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGCACCTTTGTTTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31276700	31278541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_31276831_31277817
tx.22203	chr17	+	1958	19	NIC	ENSMUSG00000041119.13	novel	2089	19	NA	NA	8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_17	17.2212365309324	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTCTGTATTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31605191	31695133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_31605331_31633074_31633146_31634253_31634332_31639218_31639263_31662139_31662195_31662811_31662883_31667340_31667426_31672375_31672455_31674027_31674103_31678048_31678136_31678874_31678980_31679152_31679236_31680544_31680702_31685328_31685443_31688767_31688873_31689654_31689784_31690732_31690857_31692131_31692254_31694898
tx.22205	chr17	-	3415	14	NNC	ENSMUSG00000024042.8	novel	4521	14	NA	NA	27	-1074	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_9	51.6911629909886	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTATTTTTTTCTATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32074740	32064297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_32065618_32066006_32066236_32066868_32067151_32067605_32067823_32067932_32068056_32068492_32068649_32068901_32069126_32069699_32069824_32069914_32070040_32070202_32070371_32070506_32070571_32073181_32073299_32073867_32074039_32074645
tx.22206	chr17	-	2359	3	ISM	ENSMUSG00000024042.8	ENSMUST00000234331.2	2554	12	23	5204	23	-701	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_2	5.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACCCAAAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32074744	32071209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_32073299_32073867_32074039_32074645
tx.22207	chr17	+	1767	12	NNC	ENSMUSG00000058392.14	novel	4874	16	NA	NA	0	153	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_10	202.128140356475	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAGAAGAAAACTATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32255376	32276158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_32255579_32264902_32264986_32266647_32266706_32267526_32267613_32268399_32268462_32268922_32269053_32270119_32270185_32270656_32270824_32271712_32271802_32272830_32272940_32274884_32274972_32275529
tx.22208	chr17	+	1143	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024045.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCCTCAGCGTTCGCTTT	914	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32522647	32539667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_32523550_32539426
tx.22209	chr17	+	583	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024050.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	22	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTTGGCTACATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32588606	32595382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_32588824_32594338_32594488_32595165
tx.2221	chr11	+	636	3	FSM	ENSMUSG00000083844.9	ENSMUST00000137510.8	1846	3	11	1199	-10	-1199	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_2	16.5	221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTAAAGACATTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5712139	5730677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_5712241_5715508_5715572_5730205
tx.22210	chr17	+	972	3	ISM	ENSMUSG00000091586.3	ENSMUST00000235238.2	650	6	-30	3605	-30	-3605	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	16	junction_2	7.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTCTTTCTTTCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32725405	32737493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_32725553_32725867_32726067_32736867
tx.22211	chr17	+	3475	3	NIC	ENSMUSG00000096910.3	novel	5788	4	NA	NA	-8	516	intron_retention	FALSE	canonical	3	48	junction_2	25	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATCTGAAAACTCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33508509	33523657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_33508644_33519554_33519977_33520738
tx.22212	chr17	+	3116	3	ISM	ENSMUSG00000096910.3	ENSMUST00000099414.5	5788	4	11036	2547	-1781	527	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_2	20.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATTCCTTCTTTCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33519553	33523668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_33519682_33519918_33519977_33520738
tx.22213	chr17	+	1860	12	ISM	ENSMUSG00000041354.17	ENSMUST00000047503.16	3252	18	3547	0	-796	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	99	junction_2	12.8930758532895	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGTCCCCATCCTTCAGT	6781	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34152102	34156661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34152235_34152324_34152429_34152514_34152600_34152685_34152755_34152870_34152946_34153948_34153982_34154107_34154230_34154333_34154430_34154518_34154631_34154713_34155008_34155836_34155952_34156038
tx.22214	chr17	+	727	3	ISM	ENSMUSG00000024319.19	ENSMUST00000173196.3	2014	19	9402	-517	3569	517	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	270	junction_2	12	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGACCGTGTCCTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34184290	34185464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34184367_34184634_34184754_34184932
tx.22215	chr17	+	2796	8	ISM	ENSMUSG00000034673.15	ENSMUST00000038149.13	3068	9	1135	-66	3	66	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_2	4.16986271980755	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACCAAAACTCCCCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34812371	34816440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34812620_34812840_34813089_34813211_34813403_34813555_34813692_34813774_34813929_34814238_34814328_34814601_34814689_34814797
tx.22216	chr17	+	526	3	ISM	ENSMUSG00000034254.18	ENSMUST00000173973.8	1105	7	18	1539	18	-273	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTATGGGATCCGAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34824852	34829878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34825146_34829418_34829619_34829845
tx.22217	chr17	+	2592	18	NNC	ENSMUSG00000015461.16	novel	2566	18	NA	NA	-11	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_9	89.1133176972076	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCGGCCACCTTCCTAGTG	9730	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34866108	34874048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_34866291_34866633_34866714_34867192_34867272_34867550_34867643_34868091_34868228_34869274_34869361_34869473_34869610_34869693_34869826_34869959_34870109_34870535_34870722_34870803_34870896_34871621_34871802_34871962_34872071_34872187_34872270_34872475_34872547_34872677_34872790_34872894_34872980_34873444
tx.22218	chr17	-	387	2	Intergenic	novelGene_654	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGTTTCTTTTATCAG	3266	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35216337	35215698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_35215736_35215987
tx.22219	chr17	-	1178	11	NIC	ENSMUSG00000007035.16	novel	2678	25	NA	NA	-33	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.26614580154031	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGCTTATTTTATTAAAA	1737	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35265754	35258117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_35258395_35260445_35260492_35261073_35261157_35262704_35262741_35263000_35263111_35263292_35263415_35264089_35264153_35264269_35264351_35264905_35265030_35265206_35265364_35265675
tx.2222	chr11	+	2101	13	FSM	ENSMUSG00000020476.15	ENSMUST00000102928.5	2295	13	-42	236	0	97	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_7	84.6740072277201	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAAGCTTAGGCTCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5738487	5750726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_5738643_5741791_5741848_5743649_5743763_5744236_5744312_5745447_5745595_5746745_5746824_5747023_5747176_5747283_5747336_5747626_5747721_5748015_5748112_5748215_5748326_5749233_5749340_5749859
tx.22220	chr17	+	1197	3	Intergenic	novelGene_659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTATTTCTCAGAGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35795173	35798808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_35795215_35795308_35795358_35797701
tx.22221	chr17	-	1264	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040312.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGACAAGTTTTTCTCT	9264	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35832083	35830453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_35831383_35831748
tx.22222	chr17	+	1432	2	FSM	ENSMUSG00000024409.9	ENSMUST00000025273.9	843	2	-589	0	-589	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTAGTCTGCTTTTTTTACC	1623	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35843508	35845544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35844192_35844795
tx.22223	chr17	-	831	3	FSM	ENSMUSG00000001524.15	ENSMUST00000159671.8	620	3	-34	-177	-12	177	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_2	12	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAATTGACTTAGAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35984607	35982461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35982990_35983577_35983721_35984447
tx.22224	chr17	-	2366	10	NNC	ENSMUSG00000003534.18	novel	3769	18	NA	NA	8967	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_9	12.3418389089439	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGGGTGTATTTCCTGG	6743	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35999896	35992458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_35993411_35993515_35993666_35994328_35994564_35994986_35995206_35995886_35996015_35996197_35996443_35998036_35998203_35999430_35999583_35999677_35999762_35999861
tx.22225	chr17	+	1253	2	ISM	ENSMUSG00000061607.16	ENSMUST00000082337.13	7335	16	127	14024	-34	-385	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGACTAGATAGAATATTG	9356	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36152533	36156538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_36152572_36155323
tx.22226	chr17	-	3181	16	ISM	ENSMUSG00000061665.8	ENSMUST00000024709.9	5364	18	30921	1934	-14438	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_3	41.1589871379535	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCAAGTAAAATAGAGCTG	1933	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43156359	43105775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_43107261_43109485_43109550_43116050_43116227_43118804_43118907_43119621_43119735_43126835_43126979_43127317_43127484_43131485_43131549_43133239_43133277_43135364_43135470_43136727_43136823_43137171_43137251_43140808_43140997_43145055_43145177_43149592_43149694_43156216
tx.22227	chr17	-	699	4	NNC	ENSMUSG00000023912.11	novel	2895	9	NA	NA	1	5662	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.49443825784929	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAATAGCTGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43978022	43971088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_43971279_43972504_43972590_43974964_43975157_43977790
tx.22228	chr17	+	522	3	Intergenic	novelGene_662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGCCTCTGTCTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45884290	45885710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_45884323_45884422_45884525_45885322
tx.22229	chr17	-	1572	3	Intergenic	novelGene_664	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTGGCTAAAAGCATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46037396	46034708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_46035836_46036244_46036563_46037269
tx.2223	chr11	+	2102	13	FSM	ENSMUSG00000020476.15	ENSMUST00000109845.8	2001	13	1	-102	1	102	multi-exon	FALSE	canonical	3	305	junction_7	40.5239126936183	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTAGGCTCTGTATTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5738488	5750731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_5738643_5741791_5741848_5743649_5743763_5744236_5744312_5745447_5745595_5746745_5746824_5747023_5747176_5747286_5747336_5747626_5747721_5748015_5748112_5748215_5748326_5749233_5749340_5749859
tx.22230	chr17	+	1657	2	ISM	ENSMUSG00000097727.9	ENSMUST00000233473.2	735	5	13613	-1317	13613	1312	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATCTATGTATCTCTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46091733	46093490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_46091900_46091999
tx.22231	chr17	+	815	2	Intergenic	novelGene_667	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGCTTGAATTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46136005	46137225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_46136084_46136488
tx.22232	chr17	+	562	2	Intergenic	novelGene_670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGAGTAGAAGGGGAGTCAT	172	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46163414	46165571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_46163656_46165250
tx.22233	chr17	-	1791	2	FSM	ENSMUSG00000023951.19	ENSMUST00000143985.2	550	2	250	-1491	250	-228	multi-exon	FALSE	canonical	3	464	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTCTCCTTTTTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46332048	46328146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46329806_46331916
tx.22234	chr17	-	1820	7	NNC	ENSMUSG00000023951.19	novel	3451	7	NA	NA	758	-670	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	45	junction_6	176.43884681857	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAGAGTAGGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46341524	46328588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_46329806_46331916_46332049_46334990_46335021_46335369_46335447_46336272_46336470_46339276_46339326_46341406
tx.22235	chr17	+	1123	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117287.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGAAGTGGAAGTTTCTGG	976	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46384786	46389372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_46384924_46388386
tx.22236	chr17	-	1397	9	NNC	ENSMUSG00000023953.10	novel	3238	11	NA	NA	-11	-9330	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	2	junction_1	8.56500875656295	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTGGCTTTTTTTCTTA	7135	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46513559	46492480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_46492630_46493610_46493735_46495615_46495736_46498952_46499057_46501532_46501703_46505127_46505343_46509559_46509695_46510317_46510461_46513322
tx.22237	chr17	-	722	4	ISM	ENSMUSG00000023953.10	ENSMUST00000024749.9	3238	11	20	22847	-3	-1639	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	4.89897948556636	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTTGTATAGCATCCTAT	7143	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46513551	46505127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46505343_46509559_46509695_46510317_46510461_46513322
tx.22238	chr17	-	700	2	ISM	ENSMUSG00000040327.17	ENSMUST00000182485.8	7848	41	49	42573	-38	-13584	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGGAGGTGGGGGAGGGG	1431	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46857265	46854103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46854710_46857171
tx.22239	chr17	-	1636	5	ISM	ENSMUSG00000023972.11	ENSMUST00000044442.10	4235	20	56780	4	226	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	477	junction_3	32.0575654097438	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGCCTGTTTGTTAGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46883650	46875400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46876422_46877028_46877208_46878850_46879003_46882528_46882610_46883447
tx.2224	chr11	+	917	2	ISM	ENSMUSG00000020476.15	ENSMUST00000109845.8	2001	13	10792	-87	10750	87	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	425	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGGGAGAAATCCAAGCTTA	8532	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5749279	5750716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_5749340_5749859
tx.22240	chr17	-	1885	6	ISM	ENSMUSG00000036568.8	ENSMUST00000233537.2	3685	12	20090	-3	-39	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_4	7.22772439983706	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTAAAGACTTTCTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47123150	47111574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_47112756_47117477_47117581_47118321_47118417_47119274_47119421_47120493_47120553_47122849
tx.22241	chr17	+	724	3	ISM	ENSMUSG00000064043.16	ENSMUST00000190080.9	7044	19	195	131138	-79	-87971	internal_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_1	14.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAATTTATTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47452062	47541745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_47452111_47452749_47452836_47541155
tx.22242	chr17	+	918	7	NNC	ENSMUSG00000064043.16	novel	3503	12	NA	NA	28301	8074	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	22.4474695431108	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAAGACTTTATTTTTGTA	2774	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47633295	47648536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_47633382_47634203_47634589_47635513_47635581_47637648_47637789_47637926_47638031_47639943_47640020_47648476
tx.22243	chr17	+	2121	7	FSM	ENSMUSG00000023266.12	ENSMUST00000113296.8	2144	7	22	1	-5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_5	11.8988794990677	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCAGTGAGTGCTCTCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48006144	48015210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_48006198_48008115_48008259_48009497_48009587_48010433_48010621_48012547_48012710_48013494_48013650_48013878
tx.22244	chr17	+	1355	4	Intergenic	novelGene_678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_2	2.05480466765633	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTGTGTCTTTTATCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48021929	48024700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_48022589_48022810_48022898_48023277_48023442_48024255
tx.22245	chr17	-	1344	3	NNC	ENSMUSG00000043939.17	novel	1144	3	NA	NA	10398	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGGCTGGGTTCATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48463968	48459063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_48460141_48463342_48463434_48463792
tx.22246	chr17	-	1495	10	FSM	ENSMUSG00000023994.14	ENSMUST00000046719.14	3645	10	29	2121	5	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	14.7832070227182	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGCACTTATGTTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48716764	48696044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_48696371_48698276_48698379_48698903_48699078_48699367_48699535_48700207_48700314_48700448_48700581_48702677_48702825_48706009_48706097_48707465_48707609_48716653
tx.22247	chr17	-	743	6	NIC	ENSMUSG00000023994.14	novel	880	8	NA	NA	-1	69	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_5	20.6358910638722	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCGCATCCTTAAGAGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48716759	48698974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_48699078_48699367_48699517_48700207_48700314_48700448_48700581_48702677_48702825_48716653
tx.2225	chr11	-	831	3	FSM	ENSMUSG00000020475.4	ENSMUST00000020768.4	840	3	11	-2	11	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	6	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCACGTTTCATATAGCTGA	8659	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5753722	5751637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_5751840_5752998_5753180_5753274
tx.22257	chr17	+	480	2	NNC	ENSMUSG00000044469.9	novel	2379	2	NA	NA	12	3844	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACACGTCATGGAGAGAGAA	425	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56469488	56484799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_56469607_56484437
tx.22259	chr17	+	674	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000013236.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAATTGAGTTCAGGAAG	5376	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56775657	56777117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_56776167_56776952
tx.2226	chr11	-	1538	10	ISM	ENSMUSG00000020471.12	ENSMUST00000102922.10	1646	11	1302	8	-226	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2224	junction_4	233.005219037612	477	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTGAACCTTGTTCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5826990	5822187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_5822419_5822669_5822772_5823026_5823155_5823408_5823567_5823688_5823770_5824023_5824223_5824314_5824430_5824760_5824885_5825053_5825176_5826712
tx.22260	chr17	+	1833	2	ISM	ENSMUSG00000071054.13	ENSMUST00000182031.2	1755	5	40	6395	40	-3592	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	514	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCGGGGGGGGGGGGTGAG	7868	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56891864	56897128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_56892351_56895781
tx.22263	chr17	-	2521	6	ISM	ENSMUSG00000007670.11	ENSMUST00000007814.10	3978	18	7347	8	30	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	703	junction_5	41.6816506391002	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAAACCTCCCTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57331141	57328058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57329971_57330058_57330137_57330212_57330414_57330504_57330594_57330826_57330937_57331010
tx.22264	chr17	-	1077	5	ISM	ENSMUSG00000011486.15	ENSMUST00000058661.14	1225	7	2884	-1	2877	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.433012701892219	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCTGTGTCTGAGATTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57345770	57339771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57340184_57340719_57340868_57341786_57341955_57345324_57345433_57345529
tx.22265	chr17	-	3399	6	NIC	ENSMUSG00000024228.13	novel	4113	7	NA	NA	-47	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	3	junction_3	21.1886762210384	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTTTGTGTATTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59320310	59307101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_59309287_59310323_59310524_59313498_59313613_59316849_59317440_59318037_59318250_59320212
tx.22266	chr17	-	889	2	ISM	ENSMUSG00000024228.13	ENSMUST00000174122.2	1244	5	-68	4090	36	-4090	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTACTTAATTTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59320331	59317479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_59318250_59320212
tx.22267	chr17	-	1914	6	ISM	ENSMUSG00000024083.17	ENSMUST00000024889.14	4345	8	3697	1867	3697	-1853	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_5	47.0616616791205	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATAATAATAAAAATACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64616329	64589867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_64590534_64593995_64594118_64594522_64594638_64596927_64597040_64599833_64600020_64615616
tx.22268	chr17	-	809	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117300.2	novel	570	1	NA	NA	4	416	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA	2798	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65745688	65744706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_-_65745052_65745224
tx.22269	chr17	+	712	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117140.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTCTCATATATTTTTGT	7514	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65807583	65828846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_65807729_65828279
tx.2227	chr11	-	1573	11	FSM	ENSMUSG00000020471.12	ENSMUST00000102922.10	1646	11	65	8	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	869	junction_10	541.870242770352	980	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTGAACCTTGTTCACTT	9570	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5828227	5822187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_5822419_5822669_5822772_5823026_5823155_5823408_5823567_5823688_5823770_5824023_5824223_5824314_5824430_5824760_5824885_5825053_5825176_5826712_5826990_5828191
tx.22270	chr17	-	845	3	ISM	ENSMUSG00000024098.7	ENSMUST00000024906.6	4086	5	54	14254	-35	-7629	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	279	junction_2	4	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAAAGCATGACAA	8748	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66258167	66244313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_66244896_66255652_66255810_66258061
tx.22271	chr17	+	1117	6	ISM	ENSMUSG00000035842.11	ENSMUST00000224497.2	4141	27	25441	721	5345	64	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_1	29.1506432176033	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTCTCCGTGTTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66456048	66458448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_66456095_66456207_66456309_66456962_66457048_66457325_66457405_66457568_66457724_66457797
tx.22272	chr17	+	1884	4	ISM	ENSMUSG00000035842.11	ENSMUST00000225687.2	4480	25	25483	251	5345	64	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_1	4.54606056566195	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTCTCCGTGTTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66456048	66458448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_66457048_66457325_66457405_66457568_66457724_66457797
tx.22274	chr17	+	1092	6	ISM	ENSMUSG00000024044.20	ENSMUST00000225977.2	3188	20	127803	80	2934	-80	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	30	junction_5	17.9041894538681	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTCATAGGTGACAAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69591642	69596239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_69591912_69592896_69593029_69593707_69593807_69594251_69594333_69594606_69594724_69595845
tx.22275	chr17	+	627	4	ISM	ENSMUSG00000024078.8	ENSMUST00000234568.2	2651	20	138515	-4	-5494	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_3	67.7462586092808	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTTGTGATGTTCTCA	491	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75163421	75170565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_75163602_75165003_75165116_75169040_75169142_75170331
tx.22276	chr17	+	823	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024070.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGTTGGAATAATAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79269711	79272822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_79269885_79271666_79271800_79271959_79272078_79272423
tx.22277	chr17	-	977	4	Intergenic	novelGene_690	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.471404520791032	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACTAAGATCTTTATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79684412	79671629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_79672116_79678766_79678802_79679937_79680252_79684270
tx.22278	chr17	-	1516	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117415.2	novel	1598	2	NA	NA	-1090	-2818	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGACCCCGCTCCAGTTT	-57	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	80290181	80287599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_-_80288858_80288973_80289130_80290079
tx.22279	chr17	-	1175	2	ISM	ENSMUSG00000024246.10	ENSMUST00000025093.6	1833	10	3	28534	3	-28534	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAAAAATGAAAACCCTC	8167	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81372493	81362294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_81363340_81372363
tx.2228	chr11	-	283	3	ISM	ENSMUSG00000020469.9	ENSMUST00000102921.4	590	7	1374	0	1374	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	94	junction_2	1.5	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGGTGTTGGCTTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5847408	5846636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_5846782_5847125_5847175_5847319
tx.22280	chr17	-	804	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117438.2	novel	885	1	NA	NA	-78	85	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAGAACAATTCTCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82718326	82717278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_-_82717747_82717990
tx.22281	chr17	-	226	2	ISM	ENSMUSG00000024251.11	ENSMUST00000234313.2	2397	11	-26	21042	-26	-21042	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAAATGCAGGTTGCTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84773659	84771841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_84771930_84773521
tx.22282	chr17	-	752	3	ISM	ENSMUSG00000024127.16	ENSMUST00000234036.2	1625	6	-25	5192	-15	-4700	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	151	junction_1	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGTGAGAACAAGACTGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85397684	85390678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_85390744_85395767_85396304_85397533
tx.22283	chr17	+	1145	3	FSM	ENSMUSG00000034998.19	ENSMUST00000134107.2	2892	3	-32	1779	-9	-1779	multi-exon	FALSE	canonical	3	279	junction_2	4.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAGTAAGATGATTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88748153	88783718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_88748313_88770140_88770692_88783283
tx.22284	chr17	-	1559	4	FSM	ENSMUSG00000066057.8	ENSMUST00000182639.2	1853	4	2	292	1	-292	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.0377492776186	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGAAACTTACTTGGAAACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95142225	95067663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_95069006_95126322_95126373_95127763_95127825_95142119
tx.22285	chr18	+	419	3	ISM	ENSMUSG00000024231.16	ENSMUST00000234414.2	618	6	-87	11852	-1	-11852	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	782	junction_1	44.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGGATAATATTGCTGTG	-20	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3383223	3405788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_3383398_3399845_3399987_3405684
tx.22286	chr18	+	1819	3	ISM	ENSMUSG00000033960.7	ENSMUST00000037029.7	6782	4	51	8970	51	-6910	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	15	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTACACTAAGCTCAGAAAG	-15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4634928	4673899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_4635032_4649074_4649406_4672514
tx.22287	chr18	+	992	2	ISM	ENSMUSG00000024236.19	ENSMUST00000129543.2	1732	5	3953	-69	3953	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTCATTGATCAGTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5118205	5119287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_5118256_5118345
tx.22288	chr18	-	1062	4	NIC	ENSMUSG00000050945.9	novel	3211	5	NA	NA	7	-246	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_1	6.54896090146283	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGAGAAAATTGTTATTC	369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5334432	5210369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_5211199_5245385_5245454_5288860_5288939_5334345
tx.2229	chr11	-	469	4	ISM	ENSMUSG00000020469.9	ENSMUST00000102921.4	590	7	755	0	755	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_3	8.80656320908194	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGGTGTTGGCTTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5848027	5846636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_5846782_5847125_5847175_5847319_5847399_5847831
tx.22290	chr18	-	516	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117519.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAGTCAATGTCTGGTTAC	-1	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6268588	6265952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_6266337_6268456
tx.22291	chr18	+	2338	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117428.2	novel	790	1	NA	NA	-3	176132	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTCTTTCTTTTTTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8051199	8228124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_+_8052205_8226791
tx.22292	chr18	-	2114	7	ISM	ENSMUSG00000049411.16	ENSMUST00000050228.15	2802	13	54251	460	7414	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_4	3.77123616632825	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTGTATGTTTATAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12200274	12114994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_12116651_12126620_12126686_12176270_12176365_12180621_12180692_12191982_12192018_12197260_12197297_12200116
tx.22293	chr18	-	1747	4	ISM	ENSMUSG00000024413.15	ENSMUST00000234044.2	2219	5	1185	1	48	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_3	1.24721912892465	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGAGGTCTTTTATTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12327279	12322749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_12324060_12324740_12324904_12326350_12326465_12327119
tx.22295	chr18	-	891	4	ISM	ENSMUSG00000056124.6	ENSMUST00000070080.6	5808	9	53887	3330	53887	-3330	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	269	junction_3	30.3461511379761	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCATGTAATTGGTTAT	6070	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20825574	20820985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_20821526_20821991_20822094_20822277_20822401_20825448
tx.22296	chr18	+	3834	13	FSM	ENSMUSG00000000420.16	ENSMUST00000000430.14	3977	13	-60	203	-60	-195	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	166.935283534934	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTTCAGATTTTTGTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24338340	24419672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_24338576_24365655_24365711_24371298_24371543_24379106_24379282_24387574_24387742_24397381_24397590_24400584_24400756_24402504_24402623_24404642_24404824_24405718_24405859_24413000_24413100_24415158_24415294_24417766
tx.22297	chr18	+	1715	7	ISM	ENSMUSG00000000420.16	ENSMUST00000178605.2	3796	12	34991	1170	-12407	-1170	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	536	junction_5	45.6024487646588	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATGGAGATTTACTCTG	3222	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24400644	24418697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_24400756_24402504_24402623_24404642_24404824_24405718_24405859_24413000_24413100_24415158_24415294_24417766
tx.22298	chr18	+	536	3	Intergenic	novelGene_715	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAATAAAGACAGACCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24508662	24526554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_24508840_24525996_24526137_24526335
tx.223	chr1	+	1708	14	FSM	ENSMUSG00000041426.13	ENSMUST00000044478.7	1830	14	-2	124	0	-119	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_5	8.39836557781919	263	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGTGTGTTGATGCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52884202	52960021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_52884304_52892826_52892870_52899186_52899325_52901426_52901512_52904707_52904789_52908064_52908118_52924261_52924341_52940346_52940493_52942005_52942093_52943800_52943860_52944529_52944612_52952889_52953010_52955795_52955830_52959421
tx.2230	chr11	-	739	6	ISM	ENSMUSG00000020469.9	ENSMUST00000102921.4	590	7	72	0	72	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_4	23.9115035077261	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGGTGTTGGCTTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5848710	5846636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_5846782_5847125_5847175_5847319_5847399_5847831_5847937_5848159_5848236_5848425
tx.22300	chr18	-	2758	9	ISM	ENSMUSG00000024270.12	ENSMUST00000070726.10	3882	10	2771	0	-1626	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_5	10.7055768177151	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCCTTGTTCTCTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24734103	24712937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_24714135_24715373_24715565_24717076_24717158_24718182_24718561_24722803_24722910_24729322_24729542_24730799_24730970_24732286_24732471_24733871
tx.22301	chr18	-	1159	6	NIC	ENSMUSG00000024269.12	novel	4159	7	NA	NA	31	-2568	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	108.691490007268	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCGACTAGTTATGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25301720	25271661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_25272197_25273502_25273664_25274577_25274695_25282170_25282300_25291300_25291381_25301583
tx.22302	chr18	+	769	4	ISM	ENSMUSG00000033632.17	ENSMUST00000161262.8	1021	5	3	6659	3	-6659	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_3	4.32049379893857	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTGCCTTGGTTATGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25302073	25315631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_25302144_25307743_25307780_25308399_25308543_25315111
tx.22303	chr18	-	2863	7	NIC	ENSMUSG00000024259.10	novel	4371	8	NA	NA	-5	-1421	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	15	junction_3	63.5883025581138	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTATTTTATGGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31742969	31714641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_31716823_31727629_31727688_31730091_31730149_31735775_31735854_31738805_31738864_31740274_31740318_31742581
tx.22304	chr18	+	1239	4	ISM	ENSMUSG00000024260.15	ENSMUST00000025109.8	4015	21	77225	-4	76429	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_2	6.0184900284226	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCAGTTTGCCTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31844660	31856118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_31844788_31848393_31848498_31853709_31853824_31855224
tx.22305	chr18	+	1849	10	NIC	ENSMUSG00000024395.10	novel	685	5	NA	NA	-18	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.62936879248872	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGGAGTGTCTGTGTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32055324	32091672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_32055530_32074792_32074953_32077191_32077259_32077488_32077610_32087488_32087639_32088310_32088462_32089310_32089404_32090005_32090055_32090290_32090367_32090895
tx.22306	chr18	-	323	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117481.2	novel	267	1	NA	NA	-2135	68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTTTGTGACCTGAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32247495	32245025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_-_32245169_32247315
tx.22307	chr18	+	785	5	ISM	ENSMUSG00000005871.16	ENSMUST00000066133.7	1185	9	-52	17645	-48	-3891	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	38.8868551055495	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCGTTGTTGTTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34380698	34405753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_34380788_34394057_34394211_34401350_34401433_34402108_34402308_34405491
tx.22308	chr18	-	2140	2	Intergenic	novelGene_721	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTCTTGGTCTTTGATTAT	7120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35251863	35249301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_35251219_35251640
tx.22309	chr18	-	582	2	Intergenic	novelGene_723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGAGATGTCTCAGTGAT	7410	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35251573	35250778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_35251219_35251431
tx.2231	chr11	+	2455	7	FSM	ENSMUSG00000002741.10	ENSMUST00000002818.9	2541	7	86	0	86	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	192	junction_4	17.3205080756888	341	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGTCTTGTGTTTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5905778	5917780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_5906005_5909296_5909380_5911187_5911289_5912336_5912442_5912692_5912759_5914560_5914663_5916008
tx.22310	chr18	+	829	4	ISM	ENSMUSG00000037815.8	ENSMUST00000236571.2	1124	5	13	959	9	273	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1651	junction_3	209.498342608135	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATGCTTTTGGTTTTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35251948	35307745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_35252035_35285653_35285761_35287397_35287594_35307305
tx.22311	chr18	-	1780	7	FSM	ENSMUSG00000024349.11	ENSMUST00000237919.2	2134	7	2	352	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	3.4960294939005	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTAGAATGGCCTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35873530	35867085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_35867752_35868155_35868343_35868931_35869171_35871733_35871843_35872092_35872274_35872403_35872631_35873359
tx.22312	chr18	+	1724	6	NNC	ENSMUSG00000091896.9	novel	2480	7	NA	NA	10	617	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	430.029115293372	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTGTGAATAGGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35904620	35939490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_35905066_35926517_35926599_35933004_35933083_35933162_35933269_35934326_35934421_35938570
tx.22313	chr18	+	2415	4	ISM	ENSMUSG00000091896.9	ENSMUST00000236235.2	8159	6	12631	-496	3	489	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1011	junction_2	86.0322936783366	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATATTAGGCTGGGAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35933007	35940710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_35933083_35933162_35933269_35934326_35934421_35938570
tx.22314	chr18	+	1389	2	Intergenic	novelGene_724	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTTTTAGAAGTCATTT	7828	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36374403	36376499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_36375209_36375915
tx.22315	chr18	-	1521	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000102827.2	novel	1420	1	NA	NA	-1684	-1164	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGTTTAACTTTATCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37788909	37786969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_-_37788422_37788840
tx.22316	chr18	-	746	7	ISM	ENSMUSG00000024456.17	ENSMUST00000025337.14	5596	28	-3	58486	-3	-5932	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_6	3.33749739908346	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGTGAGAGTTTCCCCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38068437	38035141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_38035202_38036116_38036204_38036379_38036511_38036808_38036911_38038056_38038213_38039440_38039468_38068254
tx.22317	chr18	-	1411	3	NIC	ENSMUSG00000097080.9	novel	886	4	NA	NA	-1	25	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTTCTCGATGTCAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383252	38371432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_38372243_38373891_38374007_38382766
tx.22318	chr18	+	558	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052102.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTATGTGTGTGTTTCTC	6897	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38471497	38472763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_38471677_38472384
tx.22319	chr18	-	1695	4	NIC	ENSMUSG00000024431.16	novel	6327	8	NA	NA	207	198	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	2	junction_3	30.0702880302504	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTTGTGTGTTAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39624145	39557290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_39557553_39561669_39561834_39619050_39620299_39624124
tx.2232	chr11	-	3404	6	FSM	ENSMUSG00000053838.15	ENSMUST00000066496.10	3927	6	229	294	229	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	343	junction_5	15.4090882274066	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCTGGTTCTGTCTGTGAC	9687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6150186	6055984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6058356_6063242_6063432_6075417_6075562_6100494_6100628_6143153_6143477_6149942
tx.22320	chr18	+	2162	3	ISM	ENSMUSG00000034653.12	ENSMUST00000201507.2	4290	17	31231	9	31041	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTATGAAGTTATTCAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45019342	45022782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_45019490_45020674_45020763_45020855
tx.22321	chr18	-	367	2	Intergenic	novelGene_729	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGGTGTGTCCTTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45691598	45691124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_45691359_45691465
tx.22322	chr18	-	1375	2	FSM	ENSMUSG00000024477.5	ENSMUST00000236205.2	1039	2	110	-446	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACTGATTTACAGATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46413903	46406557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_46407776_46413746
tx.22323	chr18	+	165	2	ISM	ENSMUSG00000024480.10	ENSMUST00000225415.2	417	5	20	24791	20	-24791	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	683	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGTCTAAGCGCGATGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46875028	46887482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_46875149_46887437
tx.22324	chr18	-	1956	3	ISM	ENSMUSG00000024505.17	ENSMUST00000139852.2	1911	8	10345	-659	10345	659	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	182	junction_2	20.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGAGTGCTATGATTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49856828	49829880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_49831568_49833325_49833455_49856688
tx.22325	chr18	+	574	2	FSM	ENSMUSG00000087020.2	ENSMUST00000149935.2	522	2	-47	-5	-47	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTCCTGCTTCATCTCTA	3884	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49888813	49890261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_49889264_49890137
tx.22326	chr18	+	2589	14	FSM	ENSMUSG00000001700.11	ENSMUST00000070166.6	2605	14	14	2	14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2.64910390118809	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAATGCTGTTTCCTGCAT	2625	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56565217	56636862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_56565430_56602604_56602725_56607090_56607203_56609674_56609742_56611920_56612025_56615692_56615789_56618283_56618356_56618447_56618529_56621822_56621935_56622686_56622810_56623742_56623831_56624966_56625072_56630391_56630486_56635659
tx.22327	chr18	-	1385	2	Intergenic	novelGene_734	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGAAATACAAGTTTATAG	8295	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56783199	56774324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_56775472_56782961
tx.22328	chr18	+	1675	5	ISM	ENSMUSG00000024590.9	ENSMUST00000025486.9	2843	11	32579	0	11951	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1280	junction_1	80.809575546466	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACTGTTCTTTTTAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56873463	56886496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_56873985_56876282_56876388_56881048_56881169_56882770_56882882_56885678
tx.22329	chr18	-	1058	2	ISM	ENSMUSG00000032656.15	ENSMUST00000035278.7	860	4	28900	-700	28900	700	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTACTGATGCAATACTCT	9324	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56916191	56908223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_56909181_56916090
tx.2233	chr11	-	480	2	ISM	ENSMUSG00000053838.15	ENSMUST00000066496.10	3927	6	229	87550	229	-70316	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	343	junction_1	0	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGACCCATGGCCTGGAGA	9687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6150186	6143240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_6143477_6149942
tx.22330	chr18	-	2386	2	ISM	ENSMUSG00000024613.17	ENSMUST00000177172.8	3229	20	-51	25670	2	-5017	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1295	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAACCCAGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60982041	60976771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_60978939_60981822
tx.22331	chr18	-	1263	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000098098.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGGCTATGAGTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61774053	61760679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_61761723_61773833
tx.22332	chr18	+	977	3	ISM	ENSMUSG00000045629.9	ENSMUST00000051720.6	4536	17	-130	47072	-130	-47072	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCCTCAGGTCTTGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62086015	62101714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_62086239_62094014_62094114_62101059
tx.22333	chr18	+	950	6	NNC	ENSMUSG00000044176.13	novel	480	7	NA	NA	-50	1520	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.4	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAATGTATTAGAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62779275	62788066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_62779414_62783341_62783403_62783920_62783995_62784818_62784851_62786487_62786604_62787537
tx.22334	chr18	-	578	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040560.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATCTCTTTCAAAATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64122849	64122227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_64122406_64122449
tx.22335	chr18	+	2664	3	FSM	ENSMUSG00000024521.9	ENSMUST00000236933.2	1012	3	-177	-1475	-117	-5	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	46	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCACTGGTCTTTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66591486	66598626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_66591709_66593913_66594070_66596340
tx.22336	chr18	+	2129	7	FSM	ENSMUSG00000024530.9	ENSMUST00000025411.9	1404	7	21	-746	3	746	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_6	3.34995854037363	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATTTTTGTGACTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67597956	67613651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_67598027_67605926_67606096_67606810_67606901_67609864_67609936_67610033_67610137_67611019_67611132_67612137
tx.22337	chr18	+	621	3	ISM	ENSMUSG00000024542.10	ENSMUST00000224921.2	3113	17	26605	0	370	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	194	junction_2	5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCCTTTTTGTATTTTA	6315	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68013818	68018241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_68013949_68014354_68014414_68017809
tx.22338	chr18	+	858	4	Intergenic	novelGene_737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.94392028877595	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTACGTGTATTGTTGCAT	6786	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68066489	68154923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_68066619_68138755_68138845_68152204_68152302_68154380
tx.22339	chr18	+	251	2	ISM	ENSMUSG00000053477.19	ENSMUST00000114980.8	2192	20	-96	335798	91	-9865	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAACAACAACCCTCCCCCA	3735	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69479334	69480498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_69479437_69480349
tx.2234	chr11	-	1930	14	FSM	ENSMUSG00000004393.11	ENSMUST00000004507.11	1956	14	25	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	937	junction_7	74.9654752883426	567	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGTGGTGTTGTCTGGCTCT	4514	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6217747	6208919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6209259_6209546_6209621_6211615_6211722_6212456_6212547_6212662_6212737_6213938_6214034_6214123_6214238_6214675_6214796_6215511_6215757_6216315_6216407_6216511_6216683_6216810_6216972_6217417_6217580_6217659
tx.22340	chr18	-	3299	6	NIC	ENSMUSG00000044906.7	novel	1715	9	NA	NA	-6	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	13	junction_1	81.2782873835319	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATGTTGTTACGTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70605557	70585282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_70586460_70597032_70597136_70600401_70601589_70602519_70602849_70604743_70605051_70605361
tx.22341	chr18	-	3244	9	NIC	ENSMUSG00000044906.7	novel	1715	9	NA	NA	-287	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	27	junction_5	68.2567533288831	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATGTTGTTACGTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70605867	70585282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_70586460_70589544_70589616_70591387_70591520_70597032_70597136_70600401_70600557_70601124_70601589_70602519_70602849_70604743_70605051_70605361
tx.22342	chr18	+	2321	16	NNC	ENSMUSG00000024561.12	novel	2838	16	NA	NA	-13	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_10	25.1153782018552	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACTGGCCTTATTACTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74401347	74415228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_74401505_74402473_74402610_74406279_74406395_74406483_74406729_74406805_74406889_74407086_74407128_74407485_74407633_74407715_74407845_74408218_74408330_74408413_74408489_74408977_74409143_74409477_74409787_74409872_74410011_74410371_74410501_74410587_74410650_74414949
tx.22343	chr18	+	405	2	Intergenic	novelGene_742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGGAGAATCTGTGTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74960165	74963823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_74960272_74963524
tx.22344	chr18	+	1446	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000102047.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTCTATACCCTGTGTGT	2035	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75426718	75439241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_75426819_75437895
tx.22345	chr18	-	786	3	ISM	ENSMUSG00000052928.10	ENSMUST00000165559.3	6031	12	225447	3697	165166	-3697	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCACCCGTCCTTGCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75605178	75567991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_75568481_75570241_75570296_75604935
tx.22346	chr18	+	2376	10	NIC	ENSMUSG00000024563.17	novel	8089	11	NA	NA	-133	427	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	15	junction_8	78.9769461595684	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGCAGCCGACCTTTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76374983	76438792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_76375051_76395510_76395799_76419930_76420021_76420998_76421193_76422109_76422245_76425980_76426056_76431518_76431573_76432853_76433067_76435453_76435599_76437677
tx.22347	chr18	-	1076	2	NNC	ENSMUSG00000097666.3	novel	1269	2	NA	NA	-153	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGATTCTTCTTTATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77820592	77817191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_77818179_77820503
tx.22348	chr18	+	467	2	Intergenic	novelGene_745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGATGCTTGTGTTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77912937	77916846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_77913155_77916596
tx.22349	chr18	+	2979	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117813.2	novel	534	1	NA	NA	-83572	1046	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAGAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79918648	80003800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_+_79919918_80002090
tx.2235	chr11	-	1642	5	FSM	ENSMUSG00000004394.13	ENSMUST00000004508.13	2003	5	17	344	12	-344	multi-exon	FALSE	canonical	3	418	junction_4	49.7663289785373	750	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGATGTGAAATAATAGATT	5355	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6224853	6220712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6221801_6223740_6223888_6224107_6224234_6224397_6224499_6224673
tx.22350	chr18	-	1351	4	FSM	ENSMUSG00000053950.11	ENSMUST00000066743.11	5012	4	7	3654	7	-3654	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_3	18.0800688297608	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTAAGCCCATGGGGCCC	5943	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80194690	80173179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_80174210_80180698_80180789_80185863_80185985_80194580
tx.22357	chr18	-	3180	4	FSM	ENSMUSG00000056153.16	ENSMUST00000145120.3	1004	4	14	-2190	14	114	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	77.821733611005	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTATGTCTGATACCAGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88912420	88886183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_88889043_88905115_88905177_88905332_88905458_88912285
tx.22358	chr18	+	1936	3	FSM	ENSMUSG00000110277.3	ENSMUST00000209969.3	1929	3	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	46.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTGTCTTGGTCATAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90597912	90610652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_90598024_90607079_90607207_90608954
tx.22359	chr19	+	714	2	ISM	ENSMUSG00000024900.6	ENSMUST00000238015.2	1012	7	10911	7595	10911	-1334	internal_fragment	FALSE	canonical	3	341	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTGTTGTTGTTTAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3402537	3406943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_3402625_3406316
tx.2236	chr11	+	4136	23	FSM	ENSMUSG00000020456.18	ENSMUST00000003461.15	4127	23	-9	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	535	junction_8	60.360778272973	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGCCTGCTGTCGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6241623	6306642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_6241694_6246951_6247200_6263787_6263980_6266977_6267081_6284532_6284649_6288557_6288713_6289108_6289256_6289837_6289929_6290442_6290623_6292494_6292624_6296514_6296695_6297097_6297251_6297828_6297932_6298234_6298364_6298657_6298809_6299099_6299228_6299314_6299494_6299841_6299914_6300605_6300735_6302125_6302199_6304928_6305093_6305290_6305446_6305553
tx.22360	chr19	-	659	3	Intergenic	novelGene_878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTCTGAACATGTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3793029	3775290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_3775567_3776211_3776398_3792832
tx.22363	chr19	+	645	4	NNC	ENSMUSG00000036908.18	novel	412	4	NA	NA	-2	613	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.0184900284226	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGAGTAAAGTCTTATTT	5223	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3985223	3987359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_3985353_3985761_3985904_3986268_3986423_3987139
tx.22366	chr19	-	945	5	ISM	ENSMUSG00000024862.17	ENSMUST00000025798.13	2940	16	2	5004	0	760	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_4	21.0282548015759	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCATGCTGAACATCCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5168326	5162777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5162969_5163808_5163879_5163968_5164200_5167221_5167498_5168149
tx.22369	chr19	-	837	2	ISM	ENSMUSG00000024906.11	ENSMUST00000126471.2	912	7	-99	1970	37	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGACATGGGTAGGGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5538393	5537485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5537945_5538015
tx.2237	chr11	+	813	2	FSM	ENSMUSG00000020456.18	ENSMUST00000125929.2	779	2	-26	-8	-18	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	605	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTATTTTTCTCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6241614	6247685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_6241694_6246951
tx.22378	chr19	-	1751	6	FSM	ENSMUSG00000024970.6	ENSMUST00000025924.4	3152	6	178	1223	105	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	309	junction_2	10.2293694820355	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTGTGTGGGCTATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7360181	7335050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_7335853_7351021_7351220_7351386_7351513_7351660_7351811_7351885_7352216_7360036
tx.2238	chr11	+	2524	12	ISM	ENSMUSG00000020456.18	ENSMUST00000081894.5	4114	23	54494	-50	54494	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	621	junction_2	61.611418926598	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGCCTGCTGTCGTGTGT	4211	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6297098	6306642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_6297251_6297828_6297932_6298234_6298364_6298657_6298809_6299099_6299228_6299314_6299494_6299841_6299914_6300605_6300735_6302125_6302199_6304928_6305093_6305290_6305446_6305553
tx.22382	chr19	-	2066	10	ISM	ENSMUSG00000024660.10	ENSMUST00000238129.2	3449	17	-22	10983	6	453	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	363	junction_6	38.0642731296539	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGGCCCTGAGTAGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9876847	9860670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_9861198_9861268_9861384_9861801_9861854_9862836_9862952_9863070_9863129_9864038_9864091_9870636_9871374_9872202_9872317_9872684_9872836_9876702
tx.22383	chr19	+	499	2	FSM	ENSMUSG00000118100.2	ENSMUST00000235814.2	472	2	-25	-2	-21	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGGCCATGGTGTCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9877032	9880027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_9877385_9879880
tx.22385	chr19	+	3545	10	NIC	ENSMUSG00000034820.5	novel	3500	10	NA	NA	-10	62	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	71	junction_5	59.2792096047006	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGTGAGCTGTTTACGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10502619	10525079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_10502692_10503315_10503425_10509144_10509364_10510183_10510288_10510656_10510803_10512467_10512883_10514162_10514282_10516983_10517153_10518044_10518213_10523055
tx.22387	chr19	-	1412	5	ISM	ENSMUSG00000067571.5	ENSMUST00000087923.4	1713	7	9953	-4	9884	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTCTCAATGTGGTGGC	8105	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10960661	10955666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_10956690_10957462_10957577_10957933_10958027_10958656_10958714_10960536
tx.22388	chr19	+	4204	19	FSM	ENSMUSG00000046139.9	ENSMUST00000061618.9	4216	19	15	-3	15	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	210	junction_1	27.8366043764299	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGATGTCCATCTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11889777	11922458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_11889942_11891711_11891824_11897541_11897760_11898168_11898250_11898732_11898928_11899830_11899933_11900750_11900841_11901164_11901383_11902500_11902591_11907238_11907420_11908896_11909021_11909501_11909600_11911043_11911104_11913042_11913192_11914583_11914744_11917047_11917204_11919992_11920085_11920188_11920339_11920694
tx.22389	chr19	+	146	2	Intergenic	novelGene_881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATGAGTGTTGTGTAGCT	7685	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11931637	11932190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_11931692_11932098
tx.2239	chr11	+	761	5	FSM	ENSMUSG00000071866.13	ENSMUST00000132846.2	1170	5	409	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36680	junction_4	732.852474922477	6208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTTGTTTGTATTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6365851	6369817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_6365980_6368100_6368132_6368225_6368315_6369112_6369286_6369477
tx.22390	chr19	+	2435	2	ISM	ENSMUSG00000024687.12	ENSMUST00000025590.11	4488	14	25654	-1	25654	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATTGTCTGATTTGCTTCT	3043	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11968958	11971477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_11969180_11969263
tx.22392	chr19	-	2548	15	FSM	ENSMUSG00000041491.9	ENSMUST00000047704.8	2548	15	1	-1	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_1	15.9123876785558	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATATTGAGTGATAAAATA	176	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15962352	15933136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_15933768_15936895_15937065_15938306_15938474_15939735_15939814_15946435_15946565_15947896_15947943_15948259_15948396_15951719_15951832_15952251_15952317_15953612_15953727_15956144_15956320_15958455_15958560_15958828_15958902_15958991_15959165_15961976
tx.22393	chr19	-	899	4	ISM	ENSMUSG00000041491.9	ENSMUST00000235718.2	2667	17	2	25129	2	-24921	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	142	junction_3	11.1455023315337	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCATGAATACTTGTTATT	193	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15962335	15958265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_15958560_15958828_15958902_15958991_15959165_15961976
tx.22394	chr19	+	2419	2	ISM	ENSMUSG00000097557.3	ENSMUST00000181731.3	938	3	-35	22021	-35	-22021	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGAGTTGTCATGGTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15962406	15966039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_15962657_15963870
tx.22395	chr19	-	1441	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117711.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTGCTCTTCCTGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16013482	16000493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_16001679_16005957_16006077_16013345
tx.22397	chr19	-	2214	4	NNC	ENSMUSG00000038843.19	novel	4606	3	NA	NA	13	55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	19.3964487013015	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATCCTTGTAAATAATTT	8047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17334018	17305977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_17307853_17310473_17310621_17313610_17313705_17333920
tx.22399	chr19	-	1910	5	ISM	ENSMUSG00000097930.3	ENSMUST00000181623.3	2057	7	-92	23275	-21	-23275	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTGAGTGCTCACATCTA	4869	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23053309	23038028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_23039444_23040703_23040803_23040913_23041034_23041720_23041808_23053120
tx.224	chr1	-	1116	2	FSM	ENSMUSG00000043629.13	ENSMUST00000050567.11	3641	2	-44	2569	-44	290	multi-exon	FALSE	canonical	3	220	junction_1	0	1548	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAACATAAAACAAAA	636	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52992047	52964051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_52964894_52991773
tx.2240	chr11	-	618	4	ISM	ENSMUSG00000041126.17	ENSMUST00000109737.9	1633	5	4989	909	4898	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3219	junction_3	43.6882898116494	999	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTGTGTCTCAGTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6389454	6378137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_6378433_6379095_6379226_6383723_6383838_6389375
tx.22401	chr19	+	1390	4	ISM	ENSMUSG00000032702.17	ENSMUST00000049400.15	5637	14	193276	-1	8012	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	5.43650214343336	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTTGCCCCTGCTTCAT	513	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25407614	25411861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_25407728_25408242_25408444_25410228_25410328_25410884
tx.22403	chr19	+	1166	5	ISM	ENSMUSG00000024924.15	ENSMUST00000025866.14	3253	18	26774	0	5458	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_2	8.94427190999916	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTGATTATTCCTCTAAG	4074	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27221631	27227163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_27221741_27222934_27223082_27224409_27224491_27225256_27225427_27226504
tx.22404	chr19	+	409	2	Intergenic	novelGene_892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTCACTTCCATGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28748133	28749607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_28748252_28749316
tx.22405	chr19	+	785	3	ISM	ENSMUSG00000024789.14	ENSMUST00000238009.2	3995	24	57201	0	57201	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_2	4.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTTTTCTTTCTTGCTCA	707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29287041	29289740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_29287113_29288327_29288442_29289140
tx.22407	chr19	-	2198	2	FSM	ENSMUSG00000046324.13	ENSMUST00000160907.2	1902	2	10	-306	10	306	multi-exon	FALSE	canonical	3	332	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGAAGGTGACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29625768	29621803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_29623669_29625435
tx.2241	chr11	-	681	5	FSM	ENSMUSG00000041126.17	ENSMUST00000109737.9	1633	5	43	909	43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3133	junction_4	74.0485482639599	8114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTGTGTCTCAGTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6394400	6378137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6378433_6379095_6379226_6383723_6383838_6389375_6389454_6394336
tx.22410	chr19	-	883	3	ISM	ENSMUSG00000024827.11	ENSMUST00000025778.9	3767	25	74549	0	44351	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1281	junction_2	56	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGAATTTCCCATTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30078280	30075846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_30076511_30077236_30077318_30078142
tx.22411	chr19	+	485	2	NNC	ENSMUSG00000097787.3	novel	1647	2	NA	NA	-4	-1052	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCTGCTCCTGTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32366611	32367538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_32366663_32367104
tx.22412	chr19	-	1477	6	NIC	ENSMUSG00000071573.15	novel	1597	7	NA	NA	10	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_4	7.02566722810012	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCGTTTTATAGCCTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33369685	33115143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_33115675_33145721_33145898_33179874_33180049_33359766_33359926_33368479_33368586_33369354
tx.22413	chr19	-	956	4	ISM	ENSMUSG00000071573.15	ENSMUST00000096114.13	1597	7	-30	244413	0	-244413	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	3.85861230093008	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCAGTGTTGTTTCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33369695	33359559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_33359926_33367316_33367460_33368479_33368586_33369354
tx.22414	chr19	-	2243	7	NNC	ENSMUSG00000033610.17	novel	7414	7	NA	NA	194	-392	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_6	45.0237591599023	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGAAGATTGTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34856661	34788686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_34789788_34791091_34791218_34798499_34798624_34799112_34799290_34804519_34804774_34818156_34818510_34856553
tx.22416	chr19	-	2753	2	FSM	ENSMUSG00000067279.4	ENSMUST00000087321.4	2725	2	-31	3	-31	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACCCGAGAATGTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36714084	36709133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_36711755_36713952
tx.22417	chr19	-	1399	15	ISM	ENSMUSG00000048612.17	ENSMUST00000223650.2	3066	27	-33	26861	8	4827	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	129	junction_5	9.2879118278787	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTGAGTTGCAAGTGTGC	8864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38031839	37963034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_37963076_37963305_37963375_37966097_37966202_37968796_37968924_37969670_37969787_37970325_37970357_37971407_37971459_37971536_37971600_37974408_37974538_37975096_37975264_37983869_37983958_37986663_37986773_38011000_38011093_38012789_38012846_38031683
tx.22419	chr19	-	457	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024998.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCGTCTGGCCTCCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38677708	38671909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_38672020_38672174_38672339_38677525
tx.2242	chr11	-	567	4	FSM	ENSMUSG00000041126.17	ENSMUST00000093346.6	519	4	-48	0	43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	328	junction_2	1363.86957669061	969	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTGTGTCTCAGTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6394400	6378137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6378433_6379095_6379226_6389375_6389454_6394336
tx.22420	chr19	+	269	3	NNC	ENSMUSG00000097792.3	novel	1098	3	NA	NA	-897	-3890	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAACCCAACAAAGCGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40576981	40579416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_40577064_40578298_40578352_40579282
tx.22421	chr19	-	1978	7	ISM	ENSMUSG00000025016.12	ENSMUST00000237871.2	3170	15	31508	17	31508	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1108	junction_5	55.4238717120661	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTTCCTGACCAAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41220911	41202247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_41203579_41205539_41205617_41205786_41205871_41206608_41206756_41209675_41209745_41211522_41211663_41220781
tx.22424	chr19	-	691	4	ISM	ENSMUSG00000042401.9	ENSMUST00000048630.8	2618	15	143576	497	-253	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_1	11.7756811551038	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCTTTGTGGAAAACTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42276646	42271970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_42272120_42272561_42272706_42275611_42275655_42276291
tx.22425	chr19	+	1468	2	ISM	ENSMUSG00000025184.11	ENSMUST00000160893.2	635	3	-27	12144	-3	-12144	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTGTGTCAGATGGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42507233	42552395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_42507297_42550990
tx.22426	chr19	+	2418	3	NNC	ENSMUSG00000090235.2	novel	2327	2	NA	NA	-913	123	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTCTCTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42766557	42770016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_42766727_42767671_42767783_42767878
tx.22427	chr19	-	2717	8	NIC	ENSMUSG00000040018.10	novel	4798	9	NA	NA	28	-1866	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	8	junction_5	140.673743253019	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCAGTCAGCTAACCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43741411	43723558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_43725292_43726475_43726590_43728275_43728431_43730271_43730354_43732055_43732224_43737228_43737352_43739782_43739974_43741260
tx.22428	chr19	-	854	5	ISM	ENSMUSG00000025198.17	ENSMUST00000112028.10	3136	12	8	26447	-2	-2338	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	111	junction_4	39.3732142452201	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGATGCATGTTATTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44058216	44049829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_44050344_44051457_44051505_44056038_44056121_44057710_44057835_44058129
tx.22429	chr19	-	3377	21	NNC	ENSMUSG00000025199.17	novel	3502	21	NA	NA	107	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_20	66.1814739938603	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGAATCTCTACTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44095614	44061773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_44062980_44063869_44063970_44065684_44065819_44066731_44066880_44067327_44067425_44070384_44070435_44071024_44071135_44072855_44072918_44075346_44075499_44076354_44076479_44077113_44077217_44079371_44079567_44084662_44084799_44085347_44085456_44085641_44085767_44085880_44085971_44087023_44087113_44088588_44088659_44090175_44090291_44092096_44092192_44095546
tx.2243	chr11	-	541	3	FSM	ENSMUSG00000085156.9	ENSMUST00000124818.3	771	3	230	0	227	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	446	junction_1	1	391	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGTTGATCGGGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6478536	6475590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6475818_6476354_6476438_6478305
tx.22430	chr19	-	1980	16	FSM	ENSMUSG00000025199.17	ENSMUST00000147423.8	2337	16	77	280	77	-280	multi-exon	FALSE	canonical	3	276	junction_3	19.8510005345379	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGGGAATTTAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44095831	44070133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44070435_44071024_44071135_44072855_44072918_44075346_44075499_44076354_44076479_44077113_44077217_44079371_44079567_44084662_44084799_44085347_44085456_44085641_44085767_44085880_44085971_44087023_44087113_44088588_44088659_44090175_44090291_44092096_44092192_44095726
tx.22431	chr19	+	508	2	NNC	ENSMUSG00000118217.2	novel	818	4	NA	NA	5087	-835	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTGACTGACTGATTGAT	2349	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44246042	44249050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_44246180_44248679
tx.22433	chr19	+	2714	5	FSM	ENSMUSG00000035342.15	ENSMUST00000178087.3	2694	5	-47	27	9	-27	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	34.0954542424646	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGCAATGGATAAAGAAACT	104	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45006603	45015514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_45006670_45009825_45010276_45011980_45012644_45013157_45013419_45014240
tx.22434	chr19	+	1060	4	ISM	ENSMUSG00000025213.12	ENSMUST00000026234.5	1380	5	745	2	745	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.63299316185545	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCACACTGCTGCGGACA	6600	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45065322	45067726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_45065653_45066734_45066896_45066999_45067148_45067305
tx.22436	chr19	-	796	2	ISM	ENSMUSG00000040913.12	ENSMUST00000161039.2	509	3	646	-543	646	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTCTTTGGTGGTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45567683	45566692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_45567365_45567559
tx.22437	chr19	+	471	3	NNC	ENSMUSG00000087367.2	novel	751	2	NA	NA	111	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTGTATCATATAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45738057	45740749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_45738117_45740168_45740245_45740413
tx.22439	chr19	+	3875	4	FSM	ENSMUSG00000047731.18	ENSMUST00000138302.9	3900	4	22	3	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	42.0898509804389	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATCTCCTGCCGCTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46587544	46645825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46587733_46632791_46632895_46640912_46641075_46642403
tx.2244	chr11	-	592	4	FSM	ENSMUSG00000085156.9	ENSMUST00000147762.9	611	4	19	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_3	5.24933858267454	3245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGTTGATCGGGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6478760	6475590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6475818_6476354_6476438_6478305_6478375_6478547
tx.22440	chr19	+	426	2	ISM	ENSMUSG00000025049.7	ENSMUST00000026027.7	3260	11	396	12258	396	-12258	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	300	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAATCTTAACGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47056580	47059660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_47056766_47059419
tx.22441	chr19	+	1596	8	ISM	ENSMUSG00000025047.10	ENSMUST00000072141.4	6761	36	36255	719	873	-105	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_1	24.0339895369292	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTGTGTGTAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47115461	47119585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_47115549_47115689_47115807_47116384_47116532_47116713_47116962_47117580_47117750_47118067_47118222_47118386_47118553_47119077
tx.22442	chr19	-	1894	5	FSM	ENSMUSG00000044948.18	ENSMUST00000159204.2	892	5	-48	-954	-27	954	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.4790199457749	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAGAAGAAGAAGAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47825848	47810438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_47811619_47814200_47814369_47818822_47818920_47824002_47824257_47825653
tx.22443	chr19	+	1293	9	FSM	ENSMUSG00000025069.16	ENSMUST00000056159.11	1351	9	42	16	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	0.992156741649222	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTAATTATCACGGGTCTG	-13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	47854247	47874747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_47854369_47858124_47858200_47858647_47858763_47860092_47860243_47860454_47860564_47863268_47863492_47864834_47864937_47873094_47873202_47874456
tx.22444	chr19	+	696	3	FSM	ENSMUSG00000025069.16	ENSMUST00000236449.2	685	3	-16	5	-5	-5	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGTTTAGATTCAAAAA	101	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47854210	47859110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_47854369_47858124_47858200_47858647
tx.22445	chr19	+	1867	2	FSM	ENSMUSG00000025025.15	ENSMUST00000237295.2	1249	2	188	-806	188	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	246	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCAGTCGAGTTGTGTGTT	1394	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53358641	53361719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_53358793_53360003
tx.22446	chr19	-	835	5	NNC	ENSMUSG00000097636.9	novel	3261	10	NA	NA	2329	-1077	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.29903810567666	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGTTTTAGTTTATTGTC	3882	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53437593	53433521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_53433776_53434771_53434915_53435206_53435319_53435586_53435745_53437425
tx.22447	chr19	-	520	4	NNC	ENSMUSG00000097636.9	novel	3261	10	NA	NA	2178	-1077	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGTTTTAGTTTATTGTC	3731	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53437744	53433521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_53433776_53435206_53435319_53435629_53435745_53437705
tx.22448	chr19	-	743	4	ISM	ENSMUSG00000097636.9	ENSMUST00000180489.9	3261	10	17394	1861	4102	-1077	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGTTTTAGTTTATTGTC	5655	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53435820	53433521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_53433776_53434771_53434915_53435206_53435319_53435586
tx.22449	chr19	-	603	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000118159.2	novel	870	1	NA	NA	-602	-587	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAGAAAAAGTATTAA	603	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53588444	53587559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_-_53587830_53588111
tx.2245	chr11	+	1834	10	FSM	ENSMUSG00000000378.16	ENSMUST00000000388.15	1858	10	24	0	1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	315	junction_9	41.5204843093617	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCAGTTGTCAAGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6496910	6546744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_6497030_6519963_6520138_6534519_6534604_6535033_6535218_6539431_6539569_6540752_6540889_6543066_6543125_6543601_6543741_6544147_6544287_6546080
tx.22450	chr19	+	424	2	FSM	ENSMUSG00000024975.14	ENSMUST00000237699.2	528	2	49	55	49	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGGCTGTGCCTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53882309	53884748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_53882417_53884431
tx.22451	chr19	+	619	2	NNC	ENSMUSG00000118099.2	novel	1560	3	NA	NA	-32	-14080	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTAGGTCTGATGTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55087901	55092167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_55087968_55091614
tx.22452	chr19	+	1712	9	ISM	ENSMUSG00000025078.10	ENSMUST00000071423.7	8591	11	22428	5853	-108	-5853	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_1	12.3028197987291	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTAAACAAATTTCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56559120	56586082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_56559304_56563189_56563312_56564586_56564717_56576601_56576702_56580007_56580240_56580824_56580948_56582091_56582299_56583231_56583452_56585687
tx.22453	chr19	+	1296	6	NNC	ENSMUSG00000025078.10	novel	8591	11	NA	NA	17853	-5853	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	44.8133908558591	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTAAACAAATTTCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56577081	56586082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_56577201_56580007_56580240_56580824_56580948_56582091_56582299_56583231_56583452_56585687
tx.22454	chr19	-	1024	7	ISM	ENSMUSG00000025085.17	ENSMUST00000111529.8	5927	17	10	28134	8	-60	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_2	8.18026079453868	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTGCTGAGAACAAAGGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57107431	57049455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_57049815_57052197_57052234_57056522_57056679_57057291_57057370_57068244_57068304_57071947_57072036_57107183
tx.22455	chr19	-	390	2	ISM	ENSMUSG00000033417.17	ENSMUST00000166712.9	1305	8	51472	-306	8048	306	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	221	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTTTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60517939	60517172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_60517526_60517902
tx.22456	chr1_GL456221v1_random	-	535	3	Intergenic	novelGene_80	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTGGATTGTGCATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34983	30376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_GL456221v1_random_-_30613_32159_32308_34832
tx.22457	chr2	+	1389	11	NIC	ENSMUSG00000026648.19	novel	2469	14	NA	NA	-5	5267	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	9.7082439194738	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAATGGATATTCATTCTT	1016	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3425181	3448510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_3425364_3426400_3426453_3430304_3430390_3434783_3434844_3438025_3438128_3438712_3438786_3438988_3439130_3441794_3441897_3444690_3444828_3445237_3445293_3448110
tx.22458	chr2	+	506	3	ISM	ENSMUSG00000026655.16	ENSMUST00000027965.11	3156	4	0	3582	0	-1057	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_1	10	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGCAGGTAGGGCTTGAA	944	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3714494	3779597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_3714674_3773832_3774017_3779454
tx.22459	chr2	-	3027	2	ISM	ENSMUSG00000039145.17	ENSMUST00000114987.4	1295	11	38	263962	38	2637	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGAAAAGAGATGAGAGAT	1215	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5680819	5567659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_5570592_5680724
tx.2246	chr11	+	1654	9	NIC	ENSMUSG00000000378.16	novel	1858	10	NA	NA	7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_1	133.856266196245	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCAGTTGTCAAGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6496916	6546744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_6497030_6534519_6534604_6535033_6535218_6539431_6539569_6540752_6540889_6543066_6543125_6543601_6543741_6544147_6544287_6546080
tx.22461	chr2	+	2075	6	NIC	ENSMUSG00000026730.13	novel	1232	6	NA	NA	-6	213	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	18.9525723847714	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTAAAATGCTTAATTGATG	4757	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12928896	13006883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_12929010_12979179_12979265_12982970_12983225_12985103_12985370_12999560_12999702_13005667
tx.22463	chr2	+	1150	9	NIC	ENSMUSG00000026718.18	novel	3981	13	NA	NA	37	9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	6	junction_8	77.975957833168	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACGTCTGCCAGAATTTG	4729	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14078955	14136210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_14079148_14107211_14107297_14120627_14120704_14120788_14120885_14122199_14122347_14133356_14133448_14133789_14133983_14135834_14135930_14136035
tx.22465	chr2	+	296	2	Intergenic	novelGene_747	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCCTAGGTCTTAGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17757171	17757565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_17757251_17757348
tx.22467	chr2	-	1673	2	NNC	ENSMUSG00000054074.10	novel	835	2	NA	NA	-15414	-438	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGCGAGAATCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18069276	18053392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_18055005_18069215
tx.22469	chr2	+	2182	4	NIC	ENSMUSG00000026743.17	novel	651	6	NA	NA	17	19011	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	26	junction_3	71.2242156073964	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTCCCCCAAAGAAAAGAAA	4659	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18069463	18089077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_18069650_18069845_18070006_18075935_18076016_18087321
tx.2247	chr11	+	246	2	NNC	ENSMUSG00000000378.16	novel	431	4	NA	NA	8	-15268	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTTTGCCTGTCATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6496917	6497684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_6497030_6497550
tx.22470	chr2	+	1042	3	FSM	ENSMUSG00000048550.18	ENSMUST00000102952.8	1679	3	-4	641	-4	456	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	24.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCATTTGCTTTATTTTAT	4795	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21210545	21218546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_21210657_21214695_21214853_21217772
tx.22471	chr2	-	1628	8	NNC	ENSMUSG00000026972.16	novel	1666	8	NA	NA	-6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	24.7559516653499	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGCGAGTGGCTGGCCT	9375	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24825206	24815363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_24815709_24815767_24816207_24816283_24816461_24816556_24816740_24816889_24817045_24817137_24817189_24817740_24817852_24825039
tx.22472	chr2	+	577	3	ISM	ENSMUSG00000036833.17	ENSMUST00000132082.8	2018	13	13046	0	-602	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_2	8	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGGCTATTTTACTCTG	7699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24942563	24944069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_24942650_24943406_24943511_24943682
tx.22473	chr2	+	459	2	Intergenic	novelGene_752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCACCTTCCTTTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25008128	25009506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_25008484_25009402
tx.22474	chr2	+	424	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036731.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTCTTTAGTGTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25130914	25131434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_25131062_25131157
tx.22475	chr2	-	949	7	ISM	ENSMUSG00000006471.19	ENSMUST00000148589.9	2362	12	5	1988	2	56	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_6	69.2501504210159	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGGGAACCAGGTGAGTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25145393	25139427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_25139539_25139805_25140016_25140107_25140210_25140291_25140391_25141732_25141831_25144875_25145040_25145228
tx.22477	chr2	+	2480	6	ISM	ENSMUSG00000026955.14	ENSMUST00000028329.13	3121	7	-12	730	-12	680	intron_retention	FALSE	canonical	3	90	junction_3	9.97196068985433	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCAGCACGTCTGCATCT	6645	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25262320	25267495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_25263011_25263427_25263530_25264963_25265077_25265696_25265844_25265979_25266088_25266175
tx.22478	chr2	-	1942	5	NIC	ENSMUSG00000026932.15	novel	6378	6	NA	NA	6	2074	intron_retention	FALSE	canonical	2	7	junction_4	16.3458710382775	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAAAAAAGCGAGAG	8940	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26012789	25949001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_25950486_25951584_25951683_25952203_25952310_25954465_25954631_26012700
tx.22479	chr2	-	382	4	ISM	ENSMUSG00000036281.14	ENSMUST00000035427.11	4363	23	18	14158	0	706	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_3	7.78888096369861	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTGATCCGGGAAAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26270647	26266943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_26267049_26268032_26268080_26268505_26268649_26270560
tx.2248	chr11	-	805	7	FSM	ENSMUSG00000041073.11	ENSMUST00000177391.2	1212	7	484	-77	-62	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1.88561808316413	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACCCTCTGGAGTCCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6549454	6547825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6547910_6548004_6548128_6548268_6548413_6548499_6548647_6548880_6548953_6549079_6549236_6549375
tx.22480	chr2	-	1268	3	ISM	ENSMUSG00000026927.18	ENSMUST00000136972.2	403	4	292	-762	-104	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	366	junction_2	15	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGACTGTCTTGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26275329	26272813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_26273707_26274693_26274834_26275094
tx.22481	chr2	-	1530	2	FSM	ENSMUSG00000026927.18	ENSMUST00000134737.2	672	2	-104	-754	-104	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	396	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGACTGTCTTGTCATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26275329	26272812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26273707_26274693
tx.22482	chr2	-	3326	10	FSM	ENSMUSG00000026925.17	ENSMUST00000145701.8	4147	10	11	810	-5	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	7.99228022593531	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAACTCTTTCTGGCCAAA	997	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26299201	26287070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_26287984_26288567_26288705_26289244_26289361_26289424_26289587_26290047_26290156_26290384_26290505_26290897_26291023_26291612_26291711_26292111_26292236_26297778
tx.22483	chr2	+	758	6	Intergenic	novelGene_755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.8	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACATGTGTCACATAACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26538355	26542114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_26538501_26539415_26539550_26539863_26539935_26540014_26540123_26541722_26541825_26541916
tx.22484	chr2	+	447	3	FSM	ENSMUSG00000015488.15	ENSMUST00000114004.8	2194	3	39	1708	39	-187	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_1	8	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGCTTTTATTTGATAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26899976	26905728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_26900118_26904104_26904178_26905495
tx.22485	chr2	-	536	3	ISM	ENSMUSG00000026918.17	ENSMUST00000130932.2	2893	8	-16	10459	4	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	266	junction_2	6	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGACACAGTCGTGGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27365681	27353466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_27353605_27353900_27354206_27365588
tx.22486	chr2	-	1679	2	Intergenic	novelGene_758	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGCACTATCAGGTTTGG	1947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27405079	27403154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_27404773_27405018
tx.22487	chr2	+	318	2	FSM	ENSMUSG00000085929.2	ENSMUST00000132898.2	549	2	-146	377	-143	-377	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTCGAGGCGTTTTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27430294	27432820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_27430533_27432740
tx.22488	chr2	+	340	3	Intergenic	novelGene_759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATCTAGGGTTGTCTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27463274	27468909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_27463344_27467600_27467704_27468741
tx.22489	chr2	+	2176	8	ISM	ENSMUSG00000015846.16	ENSMUST00000238913.2	1631	10	15275	-507	293	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_2	8.39825054668518	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCCCTGAGATATCACTC	5308	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27630505	27650207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_27631216_27631775_27631956_27638623_27638794_27642323_27642454_27644234_27644368_27646210_27646303_27647772_27647879_27649552
tx.2249	chr11	-	2316	12	FSM	ENSMUSG00000000384.16	ENSMUST00000000394.14	2290	12	-21	-5	3	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	438	junction_8	40.423788103394	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATCTTCCCAGGCTCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6576064	6566417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6566715_6567307_6567423_6567517_6567630_6567962_6568209_6568459_6568605_6568996_6569111_6569555_6569714_6569971_6570144_6570741_6571066_6573815_6574284_6575148_6575214_6575964
tx.22490	chr2	+	2163	6	ISM	ENSMUSG00000015846.16	ENSMUST00000238913.2	1631	10	23460	-1451	8478	-278	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_4	5.67802782663136	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCCTGTATCCCTTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27638690	27651151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_27638794_27642323_27642454_27644234_27644368_27646210_27646303_27647772_27647879_27649552
tx.22491	chr2	-	584	3	NNC	ENSMUSG00000087196.2	novel	655	3	NA	NA	-117750	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATCTTCTTATGTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28331812	28204951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_28205334_28218116_28218217_28331710
tx.22492	chr2	-	3135	5	FSM	ENSMUSG00000035666.15	ENSMUST00000037117.6	6941	5	-43	3849	23	-3849	multi-exon	FALSE	canonical	3	186	junction_4	18.8215302247187	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATCAGGTGACTATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28730341	28716165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_28716810_28717489_28717579_28720513_28720645_28723561_28725386_28729894
tx.22493	chr2	-	1790	2	ISM	ENSMUSG00000035666.15	ENSMUST00000037117.6	6941	5	-55	11738	11	1161	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	186	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGATTGAAAGCAGCGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28730353	28724054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_28725386_28729894
tx.22494	chr2	-	612	2	Intergenic	novelGene_763	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATTGGGCTATGTATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29371383	29361070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_29361459_29371159
tx.22495	chr2	+	334	3	Intergenic	novelGene_764	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAATGTTTTGTGAAGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29439734	29443394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_29439841_29442646_29442703_29443222
tx.22496	chr2	-	192	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039844.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCCCAAGGACAGCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29599115	29585536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_29585581_29598967
tx.22497	chr2	+	1875	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039826.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTAGTGTTTACACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29664695	29666610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_29666262_29666301
tx.22498	chr2	+	1648	5	ISM	ENSMUSG00000059316.3	ENSMUST00000080065.3	4054	13	8937	874	4573	-874	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_1	10.8253175473055	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTGTCTCCTGAATTATG	1785	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29701582	29706660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29701708_29702276_29702415_29702563_29702729_29702799_29702947_29705587
tx.22499	chr2	+	1876	12	FSM	ENSMUSG00000039678.13	ENSMUST00000044556.12	3595	12	-13	1732	-13	-1732	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	5.33195574495097	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTTGTGGCCGGTAGGGT	2684	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30023744	30040293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_30023925_30024808_30024883_30026684_30026726_30027132_30027195_30027293_30027394_30030486_30030570_30032273_30032434_30036663_30036875_30037373_30037538_30038634_30038796_30038942_30039001_30039711
tx.225	chr1	-	928	2	FSM	ENSMUSG00000043629.13	ENSMUST00000114492.8	3565	2	66	2571	66	288	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAACAACATAAAACAA	240	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52992443	52964053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_52964894_52992355
tx.2250	chr11	-	908	4	FSM	ENSMUSG00000000384.16	ENSMUST00000131815.8	853	4	-43	-12	2	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	235.927013195936	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTATTTGTGTGATTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6576065	6573187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_6573462_6573815_6574284_6575148_6575214_6575964
tx.22500	chr2	-	2739	14	NNC	ENSMUSG00000026853.16	novel	3833	14	NA	NA	-3	561	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_7	17.8620618753231	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGATTCAGCTGAGGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30305563	30291948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_30292806_30293500_30293639_30294539_30294603_30294949_30295086_30295177_30295301_30295396_30295517_30296379_30296481_30296963_30297147_30297717_30297893_30298067_30298234_30298752_30298807_30299968_30300088_30302994_30303259_30305323
tx.22501	chr2	-	487	3	FSM	ENSMUSG00000044320.15	ENSMUST00000130396.8	741	3	159	95	159	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	6	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTAGGTGCCTGATTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30686517	30685574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_30685818_30686156_30686296_30686412
tx.22502	chr2	+	927	4	NNC	ENSMUSG00000039476.14	novel	678	2	NA	NA	-3215	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.84754619472471	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCCACGAGGCTTCAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30766115	30771259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_30766229_30768421_30768604_30769503_30769683_30770806
tx.22503	chr2	-	392	2	NNC	ENSMUSG00000087269.2	novel	920	2	NA	NA	-2	-408	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTTTATGTTGTTTG	8884	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31042305	31041060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_31041263_31042115
tx.22504	chr2	+	618	3	ISM	ENSMUSG00000026842.17	ENSMUST00000028190.13	5794	11	27	25009	27	194	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	57	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGACTGGGACCTGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31649981	31669230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_31650128_31668345_31668520_31668932
tx.22505	chr2	+	1927	2	FSM	ENSMUSG00000051373.6	ENSMUST00000057423.6	1947	2	15	5	15	-5	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATCCTTGTCCTGTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31985554	32000827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_31986275_31999620
tx.22506	chr2	+	1152	3	ISM	ENSMUSG00000026820.6	ENSMUST00000028162.5	4978	7	4713	3033	3138	1163	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_2	10	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGGTCTGACAATGGTGC	2285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32290620	32292751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32291091_32291498_32291617_32292187
tx.22507	chr2	-	792	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000103175.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTCTCCTAACTGCTAG	8844	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32379394	32368556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_32369143_32379188
tx.22508	chr2	-	593	2	Intergenic	novelGene_769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTAGAACGGTCTCTGG	9099	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32484327	32482973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_32483193_32483953
tx.22509	chr2	+	2394	7	FSM	ENSMUSG00000026811.19	ENSMUST00000095044.10	2394	7	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_2	28.6225435627234	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGTTCTGTGTCTTTA	3369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32497037	32510818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32497124_32498053_32498109_32499237_32499329_32502235_32502416_32504792_32505200_32508508_32508617_32509351
tx.2251	chr11	+	1168	2	ISM	ENSMUSG00000041046.8	ENSMUST00000139540.2	1333	4	16156	-3	16156	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGGTATTTCTCATTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6624720	6627475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_6624896_6626482
tx.22510	chr2	-	1709	13	NNC	ENSMUSG00000038860.16	novel	3551	30	NA	NA	-210	-6339	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_12	31.3315602335196	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTATGTGAGTTCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33021876	32915659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_32916201_32921081_32921186_32924042_32924142_32924721_32924798_32931454_32931482_32935499_32935564_32936595_32936661_32942107_32942227_32944169_32944270_32954015_32954091_32975886_32975957_32994864_32995036_33021678
tx.22511	chr2	-	482	2	FSM	ENSMUSG00000038718.16	ENSMUST00000155423.3	2858	2	-181	2557	-53	-2557	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGCAATAAATCTGGAGTC	903	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34261985	34260680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_34260910_34261732
tx.22512	chr2	-	368	2	ISM	ENSMUSG00000026867.20	ENSMUST00000169207.2	2207	4	6	4149	6	-1546	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	198	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGGTAAAGACAAATTTTT	5922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34644431	34620478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_34620693_34644277
tx.22513	chr2	-	2373	3	ISM	ENSMUSG00000035949.16	ENSMUST00000091020.10	1838	8	163	5827	-1	673	internal_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_2	196	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGCAGTGACAGTGAAGCG	9359	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34716084	34701177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_34703022_34712569_34712988_34715973
tx.22514	chr2	-	988	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000081904.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGACCGTTTTGTGTTTTC	9284	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34723818	34719926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_34720775_34723678
tx.22515	chr2	+	1795	9	NNC	ENSMUSG00000057110.16	novel	1817	9	NA	NA	-14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	9	junction_8	33.7268439080801	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCTGAGTCTGTCTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35022231	35037683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_35022369_35023969_35024124_35025479_35025701_35027643_35027821_35030498_35030634_35033661_35033808_35034225_35034434_35035068_35035249_35037246
tx.22516	chr2	+	951	5	ISM	ENSMUSG00000057110.16	ENSMUST00000113037.10	5970	34	42941	3	-73	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_1	6.17960354715414	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCCGCAGGTTACCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35065186	35068831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_35065385_35065549_35065613_35066139_35066335_35068050_35068123_35068408
tx.22517	chr2	+	1022	4	ISM	ENSMUSG00000026883.18	ENSMUST00000065001.12	6392	14	-113	20936	-113	123	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	113.157707058188	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAACGCAACAGCTACCTGG	266	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35581892	35600068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_35582423_35597659_35597814_35598825_35598925_35599829
tx.22518	chr2	-	2505	3	ISM	ENSMUSG00000009030.15	ENSMUST00000009174.15	2858	4	64	3542	-15	-1458	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	163	junction_2	13.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAATTGGGGCTGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37249280	37243627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_37245830_37247215_37247393_37249154
tx.22519	chr2	+	2087	8	ISM	ENSMUSG00000035437.16	ENSMUST00000133434.8	1594	11	7	7231	1	192	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_1	55.4962767642468	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAGAAAGAAAGAAAATAG	1546	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37333297	37378370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_37333469_37359388_37359589_37362306_37362527_37363590_37363796_37365303_37365479_37373739_37373898_37377077_37377189_37377523
tx.2252	chr11	+	800	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000082579.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAATTAGCAAATGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6727746	6739505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_6727932_6738890
tx.22520	chr2	+	589	4	NNC	ENSMUSG00000035403.11	novel	6372	13	NA	NA	-4399	7639	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTGTGCTCTAGCTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37676783	37696754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_37676870_37677275_37677462_37677670_37677785_37696551
tx.22521	chr2	-	193	2	Intergenic	novelGene_777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACACCTTTTTTTTTTCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37847735	37826884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_37827055_37847712
tx.22522	chr2	-	1177	11	NIC	ENSMUSG00000026754.17	novel	4869	23	NA	NA	-4	22	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	34	junction_10	8.35463942968217	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACACATCTACAAGAGAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38955557	38931328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_38931365_38937034_38937147_38937608_38937779_38938321_38938451_38940170_38940204_38942015_38942114_38942967_38943043_38946071_38946163_38953253_38953517_38954686_38954736_38955436
tx.22523	chr2	-	2520	18	FSM	ENSMUSG00000035236.18	ENSMUST00000038874.12	10709	18	-12	8201	-12	350	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	3.37403068228235	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATATTTAGAATATGAGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39080758	38964426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_38965169_38970088_38970190_38970385_38970560_38973549_38973623_38984714_38984797_38989387_38989488_38992332_38992412_38993214_38993317_38993675_38993778_38996931_38997085_38997219_38997319_38998318_38998416_39011122_39011222_39013015_39013103_39015101_39015198_39022966_39023099_39080000_39080046_39080601
tx.22524	chr2	-	233	2	Intergenic	novelGene_778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTTTGGGCGAAAGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39900089	39897434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_39897616_39900037
tx.22525	chr2	-	2465	11	NIC	ENSMUSG00000036890.14	novel	2564	11	NA	NA	7	-5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_10	16.2061716639063	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGCATATTCATTTGCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44817662	44454431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_44455547_44460430_44460523_44461224_44461296_44465454_44465600_44481892_44482003_44525013_44525329_44642058_44642233_44646279_44646448_44715362_44715556_44750302_44750339_44817616
tx.22526	chr2	+	1656	11	ISM	ENSMUSG00000026764.16	ENSMUST00000028102.14	6856	26	-11	63746	-11	-19219	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	15	junction_6	6.56962708226274	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTGCCCCAGCTCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49509298	49601044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_49509800_49561763_49561855_49570176_49570251_49578664_49578770_49583705_49583755_49584011_49584068_49584779_49584868_49587991_49588117_49590512_49590618_49590968_49591118_49600731
tx.22527	chr2	+	3069	25	NNC	ENSMUSG00000036202.17	novel	8509	36	NA	NA	58	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_15	113.822893310909	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGTGAAACTGTCGGCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51963141	51997748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_51963266_51964258_51964338_51966092_51966190_51966992_51967121_51967204_51967300_51968342_51968533_51971237_51971331_51972676_51972816_51975038_51975191_51978659_51978778_51979535_51979701_51980185_51980297_51982053_51982117_51982291_51982393_51983514_51983606_51984600_51984675_51985833_51986015_51987928_51988037_51988368_51988519_51988864_51988965_51993444_51993710_51994557_51994601_51995446_51995650_51996912_51997013_51997649
tx.22528	chr2	+	510	3	NNC	ENSMUSG00000086447.3	novel	157	3	NA	NA	-6188	-1110	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52268571	52275452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_52268741_52274593_52274764_52275281
tx.22529	chr2	+	679	2	NNC	ENSMUSG00000085315.8	novel	1314	2	NA	NA	-725	-823	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTGCCTAGAAACGTTCTT	462	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52314298	52321082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_52314631_52320735
tx.2253	chr11	-	1109	4	FSM	ENSMUSG00000087512.3	ENSMUST00000122910.3	1007	4	-99	-3	-99	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAACGTTTATGCCTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7138668	7133149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_7133462_7134628_7134842_7136092_7136519_7138510
tx.22530	chr2	-	859	2	NNC	ENSMUSG00000054181.12	novel	1541	2	NA	NA	132	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCTGCTTGGAGATAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57128388	57126240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_57126985_57128273
tx.22531	chr2	-	993	2	NNC	ENSMUSG00000054181.12	novel	1541	2	NA	NA	-178	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCTGCTTGGAGATAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57128698	57126240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_57126985_57128449
tx.22532	chr2	+	702	6	ISM	ENSMUSG00000035168.17	ENSMUST00000112568.8	7422	27	38	74479	5	-1212	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	118	junction_5	17.7471124411832	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTGAAGACAAAAATGAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59442423	59601582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_59442541_59477112_59477217_59529691_59529772_59555004_59555194_59588808_59588914_59601475
tx.22533	chr2	-	693	3	FSM	ENSMUSG00000026987.17	ENSMUST00000151756.2	693	3	-2	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	9.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATCCATCTCTTATTATTG	9148	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60040147	60036471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_60036905_60037138_60037308_60040056
tx.22534	chr2	-	3117	5	NIC	ENSMUSG00000026980.16	novel	6901	35	NA	NA	-2	-62578	intron_retention	FALSE	canonical	3	533	junction_3	47.2969343615419	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCACATTTTTAAGATGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60213649	60186681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_60188923_60195354_60195520_60199102_60199274_60206201_60206574_60213481
tx.22535	chr2	-	2026	14	FSM	ENSMUSG00000026970.17	ENSMUST00000028347.13	4436	14	-68	2478	-68	51	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_13	80.5716264093541	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAGAAAAAAAAAGAGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60793604	60583014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_60583327_60584073_60584159_60585759_60585841_60586779_60586891_60589147_60589199_60592396_60592491_60592613_60592664_60593579_60593687_60610074_60610155_60612204_60612363_60623032_60623125_60628027_60628087_60672640_60672817_60793034
tx.22536	chr2	+	3165	7	NNC	ENSMUSG00000026893.5	novel	3330	8	NA	NA	35	-123	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	106.192827755299	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCTTTTTTAAATGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62494663	62524330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_62494804_62502620_62502795_62509499_62509570_62516308_62516353_62516620_62516769_62520304_62520471_62521907
tx.22537	chr2	+	1192	9	NNC	ENSMUSG00000027035.11	novel	7038	10	NA	NA	-1	13776	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_8	20.2727495668447	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGAGCTTGGTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68691812	68915661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_68692150_68764858_68764965_68777570_68777702_68833090_68833149_68877488_68877540_68881123_68881217_68898972_68899102_68901675_68901783_68915481
tx.22538	chr2	-	1303	5	NNC	ENSMUSG00000070883.4	novel	1844	9	NA	NA	3047	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.27760839478607	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGGTTTGATTCTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69609285	69588377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_69588810_69592065_69592231_69606473_69606614_69608403_69608561_69608876
tx.22539	chr2	-	785	4	NNC	ENSMUSG00000070883.4	novel	1844	9	NA	NA	3034	8866	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_3	0.471404520791032	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGAAGATTTGATTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69609298	69602402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_69602469_69606473_69606614_69608403_69608561_69608876
tx.2254	chr11	-	2125	5	FSM	ENSMUSG00000020427.12	ENSMUST00000020702.11	2421	5	296	0	296	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_4	11.7340317027013	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCTTTTGTCTGTTTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7163601	7156085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_7157507_7158368_7158509_7159458_7159579_7160018_7160246_7163384
tx.22540	chr2	+	412	2	ISM	ENSMUSG00000042155.4	ENSMUST00000053087.4	4617	4	119	12607	119	-279	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTGGAAGGCCTTGTAA	5591	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69652832	69654388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_69652987_69654130
tx.22541	chr2	+	680	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000047965.10	novel	579	1	NA	NA	-24	128	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAATAAAATGGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70289301	70290032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_70289925_70289975
tx.22542	chr2	+	588	7	ISM	ENSMUSG00000075302.11	ENSMUST00000136967.2	1865	11	-92	13722	-92	4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTCTGTGATGCTCACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70339711	70353869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_70339889_70339999_70340046_70343103_70343161_70351416_70351453_70352823_70352852_70353387_70353437_70353674
tx.22543	chr2	-	2479	18	FSM	ENSMUSG00000027010.17	ENSMUST00000151937.8	6351	18	196	3676	-20	-49	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_16	36.6501273382513	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCCTCCTGATGACTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71197897	71105082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_71105698_71106775_71106867_71106984_71107144_71109859_71109999_71112813_71112955_71123703_71123785_71124015_71124069_71127008_71127168_71128913_71128996_71138399_71138485_71141806_71141901_71142768_71142908_71145326_71145474_71154319_71154460_71163948_71164065_71174233_71174377_71196870_71196925_71197856
tx.22544	chr2	+	2771	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027010.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTCAAACAGAGAGACTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71178306	71181196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_71180936_71181054
tx.22545	chr2	-	1151	2	ISM	ENSMUSG00000027010.17	ENSMUST00000184169.8	2392	17	-17	90778	-17	-21578	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCAAAACAAACAAACAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71197894	71195811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_71196925_71197856
tx.22546	chr2	-	1942	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087570.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTTTTTTTGTTTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71575638	71567038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_71568487_71573802_71573967_71575308
tx.22547	chr2	-	1948	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087570.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTTTTTTTGTTTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71575641	71567038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_71568487_71573802_71573970_71575308
tx.22548	chr2	-	607	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087570.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACAGTCCCTTTGTGTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71575591	71568189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_71568487_71573802_71573967_71575445
tx.22549	chr2	+	1558	12	FSM	ENSMUSG00000004085.15	ENSMUST00000135469.8	6663	12	-6	5111	-6	3154	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_11	6.87671841784634	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTATTTCGTTTTTTTG	3319	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72116065	72232735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_72116200_72128531_72128725_72185901_72185990_72194971_72195074_72198744_72198811_72202070_72202100_72202214_72202353_72208977_72209065_72214474_72214550_72219813_72219921_72228633_72228770_72232332
tx.2255	chr11	+	750	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000081539.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0.816496580927726	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	905	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8723560	8793244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_8723962_8783857_8783936_8786315_8786401_8793058
tx.22550	chr2	-	887	5	NNC	ENSMUSG00000085427.8	novel	1014	6	NA	NA	-17513	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCGGTCTTTTTATGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72661574	72615017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_72615398_72617741_72617799_72618461_72618581_72630413_72630622_72661451
tx.22551	chr2	+	1155	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084213.2_ENSMUSG00000082455.4	novel	528	1	NA	NA	-72	48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGCAGGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72786169	72947667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_72786668_72947010
tx.22552	chr2	-	462	3	ISM	ENSMUSG00000075284.11	ENSMUST00000094681.11	4728	8	293	14707	38	135	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_2	8.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACCAGCTGCAGAGCTAGCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73359785	73274660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_73274919_73278192_73278282_73359670
tx.22553	chr2	-	2129	13	NNC	ENSMUSG00000056486.19	novel	4050	13	NA	NA	-27	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	102.859802104072	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTAATAGCTTTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73605438	73442679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_73443541_73444998_73445112_73448264_73448403_73454458_73454537_73455220_73455395_73462089_73462175_73490023_73490102_73509958_73510248_73537262_73537377_73540798_73540827_73546703_73546764_73551746_73551786_73605366
tx.22554	chr2	-	3016	12	FSM	ENSMUSG00000027104.19	ENSMUST00000112016.9	3943	12	21	906	-4	851	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_5	77.3989343681314	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTAGTAGATGTGTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73722962	73647758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_73649493_73653544_73653651_73658815_73659023_73660135_73660286_73672703_73672791_73680932_73681062_73681207_73681327_73684138_73684236_73693512_73693583_73704013_73704090_73710628_73710726_73722818
tx.22555	chr2	-	3159	12	FSM	ENSMUSG00000009207.16	ENSMUST00000134641.8	2120	12	4	-1043	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_8	78.2650719516906	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATGTCTGTGTCCAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74409271	74350633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_74352642_74359974_74360146_74360849_74360921_74362219_74362326_74367647_74367846_74378181_74378234_74378318_74378403_74381404_74381446_74399284_74399473_74401278_74401321_74403881_74403971_74409162
tx.22556	chr2	-	1855	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082152.2	novel	745	1	NA	NA	-159	1154	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTTGATGTCTTGAGAGT	3933	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75463885	75461827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_75463597_75463799
tx.22557	chr2	+	855	3	ISM	ENSMUSG00000042359.19	ENSMUST00000111930.9	3853	25	0	72151	0	-17085	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_2	10	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAACAAAAAAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76236901	76354789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_76237034_76329600_76329767_76354232
tx.2256	chr11	-	1214	8	FSM	ENSMUSG00000020413.12	ENSMUST00000020683.10	4640	8	49	3377	-14	826	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_5	37.6557988054094	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCTAAAATTTGAGTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8961142	8946513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_8946933_8948636_8948757_8950076_8950177_8955988_8956064_8957493_8957605_8960240_8960418_8960496_8960625_8961058
tx.22560	chr2	-	2292	5	ISM	ENSMUSG00000027014.15	ENSMUST00000128963.2	533	6	19	158	10	-102	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_4	126.903506649738	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTCCCCCACCTCCCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77776514	77759874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_77761890_77763042_77763108_77766936_77767067_77770645_77770707_77776493
tx.22561	chr2	-	1842	2	FSM	ENSMUSG00000034701.10	ENSMUST00000041099.5	2729	2	113	774	113	-774	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACCAACAAATTGCACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79286982	79283638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_79285393_79286894
tx.22562	chr2	+	723	3	Intergenic	novelGene_801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	2.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTTATTTATTATGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80836173	80941979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_80836475_80930568_80930650_80941638
tx.22563	chr2	-	3148	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000096337.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTCATTCATTCTTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83812248	83808479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_83808528_83809148
tx.22564	chr2	-	2492	5	ISM	ENSMUSG00000034101.15	ENSMUST00000111691.2	5380	19	41690	0	602	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_3	51.1486803348825	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGGGAGGTCTGTGTCA	3747	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84439419	84431126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_84433248_84433992_84434097_84435527_84435591_84438672_84438761_84439303
tx.22565	chr2	+	2448	13	NIC	ENSMUSG00000027074.15	novel	2621	6	NA	NA	15	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_1	9.67923034130297	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGCTTCTACCTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84766937	84788853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_84766989_84767866_84768214_84768566_84768697_84771324_84771372_84774585_84774663_84774861_84774955_84777183_84777324_84778678_84778777_84780316_84780536_84780764_84780885_84785774_84785962_84786615_84786731_84788029
tx.22566	chr2	+	2398	12	ISM	ENSMUSG00000027074.15	ENSMUST00000090726.6	2583	13	858	0	632	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_8	6.24301262305069	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGCTTCTACCTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84767865	84788853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_84768214_84768566_84768697_84771324_84771372_84774585_84774663_84774861_84774955_84777183_84777324_84778678_84778777_84780316_84780536_84780764_84780885_84785774_84785962_84786615_84786731_84788029
tx.22567	chr2	+	481	3	Intergenic	novelGene_803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAAATGGATGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90454899	90457187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_90454995_90456583_90456668_90456885
tx.22568	chr2	+	5075	36	ISM	ENSMUSG00000051329.14	ENSMUST00000057481.7	5684	37	2170	-18	2170	18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	459	junction_11	64.3521941969284	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTTTTAAGGAAACAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90509728	90566690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_90509853_90510115_90510228_90514265_90514477_90515316_90515540_90517637_90517717_90519449_90519565_90520410_90520570_90523396_90523475_90524175_90524274_90526983_90527069_90528203_90528273_90530459_90530544_90530756_90530928_90532356_90532457_90532724_90532891_90533402_90533531_90534154_90534316_90537266_90537401_90538476_90538548_90539166_90539327_90540376_90540447_90542288_90542388_90544117_90544238_90547937_90548034_90548157_90548253_90548342_90548440_90548531_90548638_90551533_90551695_90552373_90552435_90553680_90553792_90553955_90554080_90555945_90556048_90560022_90560165_90563124_90563251_90563449_90563555_90565758
tx.22569	chr2	+	897	2	ISM	ENSMUSG00000027253.16	ENSMUST00000151907.2	898	5	1325	-456	1325	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTAGTGTTTTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91307988	91309643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_91308097_91308854
tx.2257	chr11	-	4300	6	NNC	ENSMUSG00000020413.12	novel	4640	8	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	12	junction_5	75.3482581085986	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGAATTCATTTATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8961159	8943136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_8946933_8948636_8948757_8950076_8950177_8955988_8956064_8957493_8957602_8961058
tx.22571	chr2	-	1226	2	ISM	ENSMUSG00000075040.10	ENSMUST00000127702.8	746	3	-39	417	-3	-417	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAACAAACCACACAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91480127	91478777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_91479372_91479495
tx.22572	chr2	-	1076	2	ISM	ENSMUSG00000075040.10	ENSMUST00000099714.10	3469	5	-11	4768	1	-421	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACAAACCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91480135	91478781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_91479771_91480048
tx.22573	chr2	-	2027	3	FSM	ENSMUSG00000027244.15	ENSMUST00000139548.8	693	3	331	-1665	331	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_2	1	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCCTATTCCAAATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91509709	91504962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_91506809_91509071_91509201_91509657
tx.22574	chr2	-	2047	10	ISM	ENSMUSG00000027230.10	ENSMUST00000028663.5	2603	12	28889	0	28889	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_9	4.13058451009802	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGACTCTGTGTGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91825958	91812672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_91813353_91813509_91813778_91816505_91816633_91817380_91817481_91821051_91821121_91821253_91821313_91821470_91821621_91822231_91822390_91823615_91823695_91825601
tx.22575	chr2	+	1073	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027217.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCTGGGTTACAGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93083377	93089639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_93083437_93083539_93083679_93088764
tx.2258	chr11	-	1125	8	NNC	ENSMUSG00000020413.12	novel	4640	8	NA	NA	9	731	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	72	junction_5	46.4880937137979	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTGTTGTTTTGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8961151	8946608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_8946933_8948636_8948757_8950076_8950177_8955988_8956064_8957493_8957602_8960240_8960418_8960496_8960625_8961058
tx.22582	chr2	-	1454	4	NNC	ENSMUSG00000057234.10	novel	1894	6	NA	NA	113613	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_3	19.09624744987	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATTTATTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108995012	108922643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_108923643_108961829_108962009_108967685_108967878_108994928
tx.22583	chr2	-	160	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027115.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTCCAGGCAACTAGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109144824	109142678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_109142795_109144780
tx.22584	chr2	+	1806	3	ISM	ENSMUSG00000027162.8	ENSMUST00000151163.2	746	4	-12	8	5	-8	intron_retention	FALSE	canonical	3	366	junction_1	22.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAATCCCTTGAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109721202	109727075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_109721267_109724809_109724929_109725452
tx.22585	chr2	+	754	4	FSM	ENSMUSG00000027134.5	ENSMUST00000129503.2	732	4	111	-133	111	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	8.2192186706253	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGGTCCAGAGGGTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112075037	112077451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_112075141_112076140_112076240_112076619_112076777_112077056
tx.22586	chr2	-	1421	6	ISM	ENSMUSG00000041219.15	ENSMUST00000110947.2	3199	11	-372	8354	-8	-8354	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	288	junction_4	46.467192727773	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGACAAAGTGTTGGAGGT	6004	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113679014	113671959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_113672086_113672251_113672416_113673030_113673285_113673591_113673689_113675599_113675671_113678305
tx.22587	chr2	-	302	2	ISM	ENSMUSG00000040383.17	ENSMUST00000147191.8	504	4	5716	2642	6	-2642	internal_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGCTTTGTTTTACAATAT	7816	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114005813	114003167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_114003229_114005572
tx.22588	chr2	+	1161	2	ISM	ENSMUSG00000027324.2	ENSMUST00000028796.2	2706	3	17	2353	17	-2353	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	111	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAGCTCACTTAGTAGGAT	3272	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118865287	118867897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_118865950_118867398
tx.22589	chr2	+	1565	8	NIC	ENSMUSG00000027326.14	novel	5527	8	NA	NA	-10	7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_1	17.5963818173289	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATAATAGCCATACCAATA	7229	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118877617	118899759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_118877708_118887761_118887813_118888835_118888876_118890024_118890085_118892840_118892903_118894525_118894579_118896429_118896483_118898603
tx.2259	chr11	-	743	6	ISM	ENSMUSG00000020413.12	ENSMUST00000139877.8	2114	7	23	2668	-13	-1269	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_3	31.5936702521249	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATTGAAGCTTGATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8961141	8950007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_8950177_8955988_8956064_8957493_8957605_8960240_8960418_8960496_8960625_8961058
tx.22590	chr2	+	1539	7	FSM	ENSMUSG00000027296.8	ENSMUST00000028758.8	1818	7	279	0	279	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_1	9.41039614232874	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGCCTCCTCCCCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119573096	119581744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119573343_119579670_119579768_119579842_119580060_119580153_119580359_119580574_119580677_119580957_119581030_119581144
tx.22591	chr2	+	1646	2	Intergenic	novelGene_808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAACACTGCATTTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119670480	119686215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_119670643_119684731
tx.22592	chr2	+	2742	3	NNC	ENSMUSG00000033943.16	novel	11982	25	NA	NA	-24426	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	67	junction_1	16.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGAAAGAAAACTGAACTTGA	8226	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119703282	119748443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_119703365_119733086_119734215_119746911
tx.22593	chr2	+	679	2	FSM	ENSMUSG00000098488.8	ENSMUST00000130018.2	634	2	229	-274	229	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCTGCTGTACCAGGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119871679	119872445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_119871789_119871875
tx.22594	chr2	-	461	2	ISM	ENSMUSG00000027293.14	ENSMUST00000148073.2	541	4	-92	14483	52	-14483	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	252	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGTCGCTTTGGAAATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119985035	119967410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_119967557_119984720
tx.22595	chr2	-	520	3	ISM	ENSMUSG00000050211.15	ENSMUST00000136845.8	4424	17	17328	4722	17328	1039	internal_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	6.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACAGGCAGTTCTCTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120004367	120001614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120001793_120002198_120002307_120004133
tx.22596	chr2	-	4201	25	FSM	ENSMUSG00000027291.16	ENSMUST00000028752.8	4339	25	0	138	0	-138	multi-exon	FALSE	canonical	3	237	junction_15	25.6031410833385	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGGTGTGCATACTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120183606	120147079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_120148591_120149946_120150039_120151132_120151268_120151367_120151518_120152090_120152137_120152338_120152442_120153513_120153643_120154063_120154182_120154671_120154771_120155111_120155186_120155666_120155754_120155866_120156009_120156486_120156631_120159053_120159197_120163870_120164001_120168946_120169068_120169161_120169283_120169799_120169984_120172464_120172558_120173673_120173773_120174605_120174701_120176098_120176142_120176808_120176874_120180644_120180711_120183395
tx.22597	chr2	-	2882	4	NIC	ENSMUSG00000033808.17	novel	1578	16	NA	NA	0	-10611	intron_retention	TRUE	canonical	3	432	junction_1	2.94392028877595	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACAGTTAAAAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120234559	120222395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_120224957_120227842_120227929_120233190_120233252_120234385
tx.22598	chr2	-	3464	2	ISM	ENSMUSG00000027288.17	ENSMUST00000171215.8	6391	19	29226	-2787	2231	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1064	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTCATTTTGTTATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120341115	120337307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120340624_120340967
tx.22599	chr2	-	2019	8	NIC	ENSMUSG00000027288.17	novel	4375	10	NA	NA	-8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	389	junction_5	258.657365356298	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAAGTTTCATTGTTCCCT	9806	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120394303	120356743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_120357566_120358817_120358879_120358955_120359111_120360928_120360999_120362075_120362704_120376323_120376386_120385711_120385797_120394167
tx.226	chr1	-	807	7	NNC	ENSMUSG00000060715.10	novel	646	9	NA	NA	-8	184	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	19.3168032782055	110	6	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTATGGTGCCCTTGGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53226775	53197551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_53197948_53209506_53209618_53216928_53216987_53221001_53221055_53221653_53221704_53224373_53224450_53226712
tx.2260	chr11	-	758	6	NNC	ENSMUSG00000020413.12	novel	2114	7	NA	NA	1	-1269	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	72	junction_3	42.5704122601602	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATTGAAGCTTGATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8961159	8950007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_8950177_8955988_8956064_8957493_8957602_8960240_8960418_8960496_8960625_8961058
tx.22600	chr2	-	1630	9	ISM	ENSMUSG00000027284.17	ENSMUST00000110700.2	5996	28	7638	1663	575	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_7	5.2618912949623	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGATGGCTGTTCTCCCTGC	9475	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120554361	120548665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_120549409_120549621_120549730_120550904_120551087_120551214_120551279_120551362_120551471_120553090_120553240_120553419_120553499_120553672_120553737_120554228
tx.22601	chr2	-	1675	2	FSM	ENSMUSG00000027272.6	ENSMUST00000138824.2	1678	2	4	-1	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAAATGCAATGCTCATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120801169	120792593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_120794102_120801002
tx.22602	chr2	+	2910	19	FSM	ENSMUSG00000027263.13	ENSMUST00000138601.8	2915	19	0	5	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_18	57.833947056195	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCACGTCTGGCCTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121001689	121029245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121001953_121004038_121004168_121005820_121005944_121006251_121006306_121007008_121007066_121009150_121009231_121013969_121014172_121014814_121014981_121015182_121015308_121018612_121018664_121019005_121019112_121019842_121019951_121020307_121020447_121022713_121022892_121024422_121024558_121025890_121026008_121026583_121026724_121027215_121027352_121028644
tx.22603	chr2	+	911	8	ISM	ENSMUSG00000027263.13	ENSMUST00000110657.2	1992	15	-18	9834	4	-53	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	163	junction_4	30.3240996636036	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCGCTGAGGGTAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121001730	121014858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_121001953_121004038_121004168_121005820_121005944_121006251_121006306_121007008_121007066_121009150_121009231_121013969_121014172_121014814
tx.22604	chr2	-	404	2	ISM	ENSMUSG00000043909.17	ENSMUST00000147540.8	3983	18	36986	-2	5961	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	207	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGATGTCTTCATCTGTTTC	7556	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121029501	121028729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_121029089_121029456
tx.22605	chr2	-	456	3	NNC	ENSMUSG00000087704.2	novel	304	4	NA	NA	-363	130	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGTGGAAGGTTTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121126852	121124053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_121124287_121124927_121125054_121126755
tx.22606	chr2	-	1164	4	ISM	ENSMUSG00000033486.15	ENSMUST00000038073.5	2247	13	13	15367	13	504	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	2.16024689946929	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAAATCCCCCAGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121244260	121240202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_121240688_121240857_121241032_121242630_121242772_121243896
tx.22607	chr2	-	541	6	NNC	ENSMUSG00000027238.18	novel	3354	13	NA	NA	-5332	-3876	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	10.2097992144802	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTTGTTTCTTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121422246	121403303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_121403393_121404025_121404150_121406802_121406901_121416386_121416466_121416909_121416953_121422138
tx.22608	chr2	+	1160	2	ISM	ENSMUSG00000060227.16	ENSMUST00000126256.2	1282	10	57924	-840	26822	840	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAATTAATGTTAGTTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121756109	121765018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_121756210_121763958
tx.22609	chr2	+	705	2	NNC	ENSMUSG00000060227.16	novel	3475	8	NA	NA	35212	4929	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTGTAAAATAAAGATAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121764499	121771630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_121765019_121771444
tx.2261	chr11	+	1219	9	FSM	ENSMUSG00000020407.14	ENSMUST00000164791.8	1252	9	34	-1	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2502	junction_1	159.654656602932	9104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTGTGACTCTGCGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9068540	9086168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_9068661_9069373_9069450_9075632_9075699_9079487_9079606_9081629_9081789_9083233_9083349_9084721_9084932_9085163_9085311_9085960
tx.22610	chr2	+	1663	9	FSM	ENSMUSG00000033411.17	ENSMUST00000128883.8	1236	9	-3	-424	3	11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	138.556621999816	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGAAAAGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121786963	121824688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_121787099_121799550_121799761_121807811_121807951_121809372_121809523_121811632_121811846_121817429_121817509_121819270_121819383_121823826_121823914_121824150
tx.22611	chr2	-	1146	6	NNC	ENSMUSG00000033256.15	novel	1431	6	NA	NA	-840	-27	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_5	49.9199358973947	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACCGAGGAGAGCCTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122200483	122179635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_122180021_122184245_122184366_122184509_122184679_122187563_122187771_122189928_122190071_122200360
tx.22612	chr2	-	464	2	FSM	ENSMUSG00000033256.15	ENSMUST00000135848.2	403	2	289	-350	289	-26	multi-exon	TRUE	canonical	3	151	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCGAGGAGAGCCTGAGGA	1834	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122184323	122179634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_122180021_122184245
tx.22613	chr2	-	493	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027359.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCTTCTGTCTCATGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126395276	126394154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_126394521_126395149
tx.22614	chr2	-	1395	8	ISM	ENSMUSG00000027365.15	ENSMUST00000134408.2	2201	14	-54	13335	-10	-13332	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_2	22.3853085932789	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTAGCTTGTCTCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126718160	126686095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_126686395_126687993_126688166_126690416_126690542_126691818_126692033_126693262_126693462_126696562_126696602_126700332_126700413_126717893
tx.22615	chr2	-	1694	7	ISM	ENSMUSG00000027365.15	ENSMUST00000134408.2	2201	14	-30	14611	14	-14608	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_1	24.0601099101581	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126718136	126687371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_126688166_126690416_126690542_126691818_126692033_126693262_126693462_126696562_126696602_126700332_126700413_126717893
tx.22616	chr2	+	2663	8	FSM	ENSMUSG00000027367.17	ENSMUST00000110375.9	3116	8	454	-1	-21	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	326	junction_5	27.592515992122	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAAGAGTGTTCATTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127112602	127140853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_127112801_127126014_127126224_127126451_127126502_127132691_127132803_127132877_127132961_127134070_127134171_127137403_127137489_127139026
tx.22617	chr2	+	2674	22	NNC	ENSMUSG00000046338.5	novel	2628	22	NA	NA	-49	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	16	junction_1	60.6148017815066	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTGAAGTACATGTCCAAT	4952	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127267069	127278012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_127267142_127269160_127269292_127269412_127269527_127270165_127270240_127270604_127270710_127270916_127271046_127272774_127272875_127273202_127273337_127273582_127273683_127273777_127273991_127274291_127274415_127274569_127274653_127274894_127275011_127275505_127275577_127275651_127275911_127275997_127276147_127276307_127276386_127276711_127276844_127276926_127277048_127277130_127277197_127277394_127277451_127277764
tx.22618	chr2	-	1691	6	FSM	ENSMUSG00000027379.15	ENSMUST00000133943.2	1137	6	-51	-503	4	503	multi-exon	FALSE	canonical	3	636	junction_1	30.0759039764393	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAACTTGCTTCTTGGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127673775	127664864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_127665980_127667026_127667071_127669220_127669418_127671357_127671497_127671597_127671658_127673639
tx.22619	chr2	+	2824	19	NIC	ENSMUSG00000027380.11	novel	531	6	NA	NA	-134	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_11	2.77999911182151	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTACACAGGCGGAAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127680661	127965796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_127680903_127691112_127691210_127709202_127709287_127713181_127713269_127714029_127714129_127719663_127719779_127720676_127720764_127722345_127722419_127726325_127726459_127753349_127753385_127814451_127814569_127820592_127820747_127851996_127852087_127876732_127876843_127886263_127886376_127917766_127917855_127928278_127928350_127947596_127947699_127964867
tx.2262	chr11	-	2813	2	ISM	ENSMUSG00000035455.13	ENSMUST00000047689.11	2961	3	2741	86	2707	-86	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	630	junction_1	0	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACGGAGTTGCTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11756218	11750373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_11753064_11756095
tx.22620	chr2	+	2178	19	FSM	ENSMUSG00000014353.16	ENSMUST00000143398.3	2100	19	-13	-65	-13	12	multi-exon	FALSE	canonical	1	36	junction_11	26.3253621315648	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAGAAGAATCTATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128660209	128693724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_128660424_128665002_128665064_128666335_128666431_128668176_128668309_128670325_128670377_128672429_128672521_128673117_128673180_128673369_128673554_128676034_128676135_128679221_128679316_128682651_128682724_128683154_128683264_128683344_128683404_128684515_128684620_128687380_128687455_128688648_128688720_128690924_128690978_128692223_128692255_128693203
tx.22621	chr2	-	234	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000053552.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCCTGGCTGTCCTGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130192338	130183578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_130183704_130192229
tx.22622	chr2	+	556	3	NNC	ENSMUSG00000027301.8	novel	537	3	NA	NA	150	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGACTGGTGTCTAATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130418242	130418974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_130418419_130418510_130418713_130418796
tx.22623	chr2	-	1190	5	NNC	ENSMUSG00000027300.11	novel	3131	5	NA	NA	0	-234	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	113	junction_3	36.2034183468909	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGACATGTCTGAGGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130471947	130441938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_130442632_130444476_130444573_130446404_130446547_130470408_130470556_130471835
tx.22624	chr2	+	3056	15	FSM	ENSMUSG00000027330.17	ENSMUST00000079857.9	3004	15	-52	0	-43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_6	17.0899481137484	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATCTGTTTGTTATGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131028825	131040417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_131029301_131030025_131030148_131030998_131031051_131033064_131033107_131033269_131033307_131033515_131033687_131034476_131034609_131034987_131035069_131035158_131035333_131035514_131035608_131036034_131036098_131036258_131036358_131036545_131036680_131038896_131039009_131039148
tx.22625	chr2	+	1627	3	Intergenic	novelGene_817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAAGTGTGAATTTATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131684743	131696147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_131685177_131692277_131692392_131695067
tx.22626	chr2	+	1305	3	NIC	ENSMUSG00000079037.10	novel	319	4	NA	NA	-2	1012	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	27.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGTTTACATCCCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131751859	131761090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_131751924_131754114_131754213_131759947
tx.22627	chr2	-	522	4	ISM	ENSMUSG00000027346.16	ENSMUST00000140867.8	459	6	30	10411	0	147	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_3	36.8057966449127	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGGAAGGAAGAAAGAGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132420107	132406399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_132406632_132410539_132410637_132414104_132414178_132419987
tx.22628	chr2	+	337	2	ISM	ENSMUSG00000062098.12	ENSMUST00000091556.12	4657	5	-1	8311	-1	-8311	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATGGCTGCTGATATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138098483	138121031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_138098675_138120885
tx.22629	chr2	+	2158	5	FSM	ENSMUSG00000062098.12	ENSMUST00000091556.12	4657	5	-13	2512	-13	-2512	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	2.87228132326901	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACAGGTAAACCTCAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138098471	138126830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_138098675_138120885_138121178_138121668_138121760_138122292_138122412_138125377
tx.2263	chr11	-	2874	3	FSM	ENSMUSG00000035455.13	ENSMUST00000047689.11	2961	3	0	87	0	-87	multi-exon	FALSE	canonical	3	411	junction_2	109.5	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACGGAGTTGCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11758959	11750374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_11753064_11756095_11756216_11758894
tx.22630	chr2	-	469	3	NNC	ENSMUSG00000037259.16	novel	2038	6	NA	NA	-13	103	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACACATATATGTGCTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144369347	144364279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_144364487_144367499_144367614_144369199
tx.22631	chr2	+	2163	2	FSM	ENSMUSG00000027427.14	ENSMUST00000136999.2	2177	2	18	-4	12	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAACCAAACCAAAA	639	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144369679	144372619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_144369846_144370622
tx.22632	chr2	+	913	3	NNC	ENSMUSG00000001768.17	novel	1668	5	NA	NA	-1	-1346	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAATAGGCAATGCTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145517285	145555563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_145517505_145554374_145554499_145554993
tx.22633	chr2	+	2152	5	NNC	ENSMUSG00000074749.11	novel	2183	14	NA	NA	-20	-3627	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_4	57.1358031360372	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGGTGAACTAACCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146697808	146727588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_146697964_146703039_146703103_146705626_146705790_146712685_146712767_146725898
tx.22634	chr2	-	995	2	NNC	ENSMUSG00000082740.2	novel	678	2	NA	NA	-126	191	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAGGCAGAACTAAACAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150312211	150311139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_150311582_150311658
tx.22635	chr2	+	1517	6	ISM	ENSMUSG00000033068.17	ENSMUST00000094467.6	2540	14	15079	-1	14950	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_1	16.6060230037177	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTTTGCCTCATTAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150606040	150613596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_150606100_150607369_150607472_150608878_150609017_150610784_150610842_150612211_150612325_150612548
tx.22636	chr2	-	518	2	NIC	ENSMUSG00000087433.2	novel	433	3	NA	NA	-123	144	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGACTACCTTGTTACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151384391	151382506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_151382806_151384172
tx.22637	chr2	+	1316	3	ISM	ENSMUSG00000027463.15	ENSMUST00000109861.8	2590	5	-22	3098	-22	-3098	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_1	27	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGTCTCCCAGATGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151841762	151848044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_151841859_151845971_151846599_151847451
tx.22638	chr2	-	2102	2	Intergenic	novelGene_820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCCAGCTTTCCCTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151863077	151853524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_151855505_151862955
tx.22639	chr2	-	1401	2	Intergenic	novelGene_821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACACACACACACACAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151858172	151854377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_151855505_151857898
tx.2264	chr11	-	2727	2	FSM	ENSMUSG00000035455.13	ENSMUST00000171080.8	2844	2	29	88	-1	-88	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGACGGAGTTGCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11758933	11750375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_11753064_11758894
tx.22640	chr2	-	521	2	Intergenic	novelGene_822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTGGCTCCTGTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151863059	151861012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_151861430_151862955
tx.22641	chr2	-	2371	12	NNC	ENSMUSG00000027466.16	novel	2384	12	NA	NA	7	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	37	junction_11	165.622841479775	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGGGAAAGGTGTCATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152174325	152158256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_152158835_152160231_152160376_152160632_152160732_152161043_152161224_152164079_152164192_152165091_152165253_152166186_152166361_152166444_152166561_152168135_152168335_152169166_152169261_152172879_152173022_152173953
tx.22642	chr2	+	654	3	Intergenic	novelGene_823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATAGTACCATATATTACAT	3508	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152240244	152251183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_152240357_152248429_152248505_152250716
tx.22643	chr2	+	437	2	FSM	ENSMUSG00000044863.8	ENSMUST00000058086.6	468	2	31	0	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAGCCTACTCATCTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152446277	152454649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_152446466_152454400
tx.22644	chr2	+	340	2	ISM	ENSMUSG00000046020.14	ENSMUST00000123158.2	2413	3	-61	6823	-25	-6823	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	100	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTATTTCTGCTGACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153083427	153085679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_153083646_153085557
tx.22645	chr2	-	1591	2	FSM	ENSMUSG00000073236.5	ENSMUST00000139636.2	427	2	-13	-1151	-13	-327	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTTGCTAAAAAATTGCAT	8999	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153188006	153183403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_153184785_153187796
tx.22646	chr2	-	266	2	Intergenic	novelGene_825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAAGATGCCTTCCAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154134399	154127337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_154127582_154134377
tx.22647	chr2	-	1500	2	ISM	ENSMUSG00000027490.18	ENSMUST00000000894.6	2755	7	5342	2441	5342	-2441	internal_fragment	FALSE	canonical	3	1067	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAACAGGGATACAGACTCT	1799	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154406298	154403994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_154405011_154405814
tx.22648	chr2	-	403	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027596.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAGACTTGTGTGATCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154853431	154822989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_154823253_154853291
tx.22649	chr2	-	1844	3	ISM	ENSMUSG00000038369.15	ENSMUST00000109669.8	2379	6	7852	-4	7850	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_2	8	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTATTTATTCTTATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155274853	155262192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_155263790_155264730_155264860_155274735
tx.2265	chr11	-	1083	7	NNC	ENSMUSG00000020182.17	novel	1922	15	NA	NA	-3202	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	40.6734966942029	11	3	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTATTGAGTAAGCGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11789482	11764100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_11764518_11765210_11765429_11769290_11769393_11772194_11772294_11779084_11779179_11785741_11785810_11789397
tx.22650	chr2	+	1411	2	FSM	ENSMUSG00000085317.2	ENSMUST00000155884.2	674	2	-67	-670	-67	656	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGAGGTCTCCCTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155433733	155435427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155434089_155434371
tx.22651	chr2	+	2513	14	ISM	ENSMUSG00000074652.4	ENSMUST00000092995.6	6163	42	18151	100	303	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_5	10.8850910469592	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGTCCTTATTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155471282	155476127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_155471601_155472177_155472305_155472394_155472514_155472600_155472798_155472930_155473281_155473398_155473524_155473633_155473750_155474067_155474465_155474546_155474673_155474767_155474939_155475084_155475190_155475272_155475369_155475782_155475921_155475999
tx.22652	chr2	+	756	5	ISM	ENSMUSG00000074652.4	ENSMUST00000092995.6	6163	42	21622	-4	-617	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_1	1.92028643696715	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATCGGTTTATTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155474753	155476231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_155474939_155475084_155475190_155475272_155475369_155475782_155475921_155475999
tx.22653	chr2	+	1401	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027613.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTAACTAGCTTTCCGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155667083	155668604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_155668133_155668252
tx.22654	chr2	+	613	5	ISM	ENSMUSG00000038241.17	ENSMUST00000109618.2	1254	8	-26	3590	-4	-3590	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_1	12.5399362039845	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACAGTGGACTGGAGTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155798487	155806124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_155798583_155803791_155804075_155804819_155804877_155805632_155805716_155806029
tx.22655	chr2	+	1312	8	FSM	ENSMUSG00000038241.17	ENSMUST00000109618.2	1254	8	-54	-4	-18	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	9.61291648072041	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGTTAACTCATTCATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155798459	155809718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155798583_155803791_155804075_155804819_155804877_155805632_155805716_155806029_155806196_155806908_155807016_155807232_155807485_155809477
tx.22656	chr2	-	3692	3	NNC	ENSMUSG00000089824.11	novel	6667	3	NA	NA	197	2601	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_2	144.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCATTGTATGTACCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155953639	155936803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_155940293_155945268_155945350_155953517
tx.22657	chr2	-	2640	17	FSM	ENSMUSG00000027634.15	ENSMUST00000069600.13	2612	17	-28	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	53.8324948335111	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGCTGCTGGTGTTATTT	5899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156833991	156769264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_156770802_156771851_156771891_156773135_156773188_156773349_156773386_156776861_156776910_156779246_156779299_156779405_156779472_156780470_156780575_156782276_156782334_156785906_156785994_156786304_156786366_156787936_156788000_156790161_156790283_156791953_156792060_156800386_156800423_156811956_156812059_156833918
tx.22658	chr2	-	2052	10	NNC	ENSMUSG00000027635.16	novel	2080	11	NA	NA	20	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	67.6408452831371	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACACTATGTGACAGTGTGT	8154	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156848975	156837184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_156838202_156838652_156838741_156839526_156839675_156840639_156840718_156841055_156841116_156842753_156842845_156843602_156843676_156844608_156844683_156847087_156847412_156848876
tx.22659	chr2	-	702	2	NNC	ENSMUSG00000087547.2	novel	629	2	NA	NA	0	76	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	229	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTGACCCTGTGGTGGGA	8707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157439240	157437426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_157437903_157439014
tx.2266	chr11	+	1076	3	NNC	ENSMUSG00000086391.2	novel	1075	4	NA	NA	13995	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	3	37	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTGTAAATATTTTATTT	2714	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11832117	11835321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_11832389_11832956_11833080_11834639
tx.22660	chr2	+	446	2	NNC	ENSMUSG00000044349.17	novel	963	6	NA	NA	5185	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAATAATTTAAAAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158222866	158223520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_158222961_158223168
tx.22661	chr2	+	1533	2	NNC	ENSMUSG00000027652.16	novel	8383	30	NA	NA	17214	-764	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCCAGTGATTGGTTTGA	8498	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158336862	158338802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_158336964_158337370
tx.22662	chr2	+	1527	7	FSM	ENSMUSG00000027655.15	ENSMUST00000148359.8	654	7	-29	-844	0	844	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_6	4.02768199119819	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTGTGTGTCTGTGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158636781	158661169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_158636849_158643294_158643429_158648317_158648411_158648842_158648921_158657349_158657455_158659282_158659345_158660181
tx.22663	chr2	-	2274	2	ISM	ENSMUSG00000057133.15	ENSMUST00000125179.2	5051	5	-66	22752	5	-22752	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160950990	160899702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_160901895_160950908
tx.22664	chr2	+	1551	5	ISM	ENSMUSG00000016921.15	ENSMUST00000130411.7	3527	6	419	1773	286	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	865	junction_1	54.5361118892794	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTATTTTGTGCTGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162773866	162777268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_162774063_162775345_162775471_162775573_162775783_162776147_162776232_162776331
tx.22665	chr2	+	1098	5	FSM	ENSMUSG00000035268.15	ENSMUST00000099105.9	640	5	7	-465	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	187.314408148439	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTTATGATCTTTTCTT	8626	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163500341	163568073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_163500413_163501069_163501156_163545405_163545476_163563047_163563222_163567376
tx.22666	chr2	+	958	4	FSM	ENSMUSG00000017734.16	ENSMUST00000069385.15	1658	4	189	511	163	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.88561808316413	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTCACCTCATTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164328563	164332684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_164328608_164330161_164330309_164330487_164330626_164332055
tx.22667	chr2	+	1141	2	ISM	ENSMUSG00000017721.16	ENSMUST00000117066.8	1712	9	1	4336	1	-2855	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGTTTCACTTTAAAGCAT	5128	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164339455	164340704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_164339678_164339785
tx.22668	chr2	+	2499	13	NNC	ENSMUSG00000017721.16	novel	2611	13	NA	NA	5	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_12	51.0299476342623	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCGTTGCTTCCTTCCTAA	5117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164339444	164350221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_164339678_164339785_164339964_164341714_164341843_164342110_164342212_164342351_164342439_164343000_164343089_164343193_164343292_164343404_164343571_164344397_164344599_164348302_164348469_164348569_164348654_164349194_164349454_164349511
tx.22669	chr2	-	998	7	NNC	ENSMUSG00000086453.8	novel	676	6	NA	NA	0	4162	intron_retention	TRUE	canonical	1	2	junction_1	0.942809041582063	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATAGAAGCAGGAAAATCAT	2134	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164611544	164591999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_164592149_164592624_164592779_164594312_164594409_164595992_164596225_164601148_164601261_164609632_164609834_164611490
tx.2267	chr11	-	2465	17	FSM	ENSMUSG00000020176.18	ENSMUST00000093321.12	5061	17	-2	2598	-2	-12	multi-exon	TRUE	canonical	3	35	junction_14	7.38135319572231	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCGATGTTTACTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11987403	11883105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_11883610_11884198_11884293_11886717_11886806_11887000_11887068_11887806_11887924_11888409_11888485_11893881_11893981_11894815_11894927_11895494_11895633_11895963_11896033_11896686_11896803_11901502_11901660_11904743_11904909_11917531_11917686_11920422_11920643_11937595_11937675_11987191
tx.22670	chr2	-	1715	7	NNC	ENSMUSG00000086453.8	novel	676	6	NA	NA	16	1129	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_5	3.18416219575713	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTGTCATCGAAGTATAAT	2108	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164611570	164595032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_164595897_164595992_164596225_164601148_164601261_164604463_164604529_164604640_164604802_164609632_164609834_164611490
tx.22671	chr2	-	1857	11	ISM	ENSMUSG00000039834.18	ENSMUST00000041361.14	4587	28	15507	0	11415	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_7	17.0235131509333	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCTTTGTATATGTGCTA	7758	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164738170	164733801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_164734212_164734299_164734382_164734460_164734527_164734606_164734691_164734797_164734873_164735165_164735270_164735392_164735536_164735620_164735764_164736444_164736820_164736897_164737010_164737907
tx.22672	chr2	-	2180	5	ISM	ENSMUSG00000039804.16	ENSMUST00000122070.2	3117	8	-6	7550	-6	2207	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_4	19.4100489437817	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTATAGTTCTATGTGGG	3055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164876714	164849832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_164851370_164852370_164852508_164854755_164855083_164865065_164865133_164876602
tx.22673	chr2	-	908	3	ISM	ENSMUSG00000039804.16	ENSMUST00000122070.2	3117	8	-41	12106	0	528	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_2	7	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGGCATCTGGAACTGG	3020	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164876749	164854388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_164855083_164865065_164865133_164876602
tx.22674	chr2	+	483	4	ISM	ENSMUSG00000027678.18	ENSMUST00000109252.8	5757	23	-2	23514	-2	-4442	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_1	24.3447461820136	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAACACAGAGTCAGAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165834553	165889876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_165834679_165876804_165876884_165889375_165889481_165889702
tx.22675	chr2	+	802	7	ISM	ENSMUSG00000027678.18	ENSMUST00000109252.8	5757	23	-2	20115	-2	-1043	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_1	19.1956302897879	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATACATTTAATTGTCGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165834553	165893275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_165834679_165876804_165876884_165889375_165889481_165889702_165889876_165890374_165890476_165891985_165892161_165893231
tx.22676	chr2	+	1256	10	ISM	ENSMUSG00000027678.18	ENSMUST00000109252.8	5757	23	1	18636	0	436	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	215	junction_9	19.4466665396971	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAACTCTTCCGCAATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165834556	165894754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_165834679_165876804_165876884_165889375_165889481_165889702_165889876_165890374_165890476_165891985_165892161_165893231_165893418_165893533_165893627_165894274_165894416_165894673
tx.22677	chr2	-	460	2	Intergenic	novelGene_834	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGGGTCCTGGATCATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166197222	166194817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_166195192_166197136
tx.22678	chr2	+	554	3	Intergenic	novelGene_840	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCCAAGCAGAAAAGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166568047	166569149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_166568249_166568416_166568508_166568887
tx.22679	chr2	+	527	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000017969.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1.80277563773199	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	48	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167062882	167065658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_167062971_167063110_167063236_167063338_167063420_167065106_167065243_167065561
tx.2268	chr11	-	1418	10	ISM	ENSMUSG00000020176.18	ENSMUST00000093321.12	5061	17	1	14308	1	74	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_7	7.84730825911537	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTTGAGCTGGGACTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11987400	11894815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_11894927_11895494_11895633_11895963_11896033_11896686_11896803_11901502_11901660_11904743_11904909_11917531_11917686_11920422_11920643_11937595_11937675_11987191
tx.22681	chr2	+	2522	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000089739.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAGAAGAAGAAGAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167474101	167476925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_167474754_167475055
tx.22682	chr2	-	1274	3	NNC	ENSMUSG00000087648.2	novel	1309	2	NA	NA	-76	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	11	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATTAGCTACTTTATTTG	7053	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167996509	167994520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_167994845_167994957_167995672_167996273
tx.22683	chr2	-	3677	28	FSM	ENSMUSG00000027546.16	ENSMUST00000109175.9	3729	28	52	0	52	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_27	47.3339708993171	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGCAGGCTTTTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168576207	168476357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_168476829_168479420_168479625_168480989_168481048_168481801_168481911_168482550_168482616_168485781_168485938_168489604_168489670_168490474_168490620_168490710_168490801_168491448_168491548_168494487_168494659_168495413_168495498_168496095_168496189_168503848_168504011_168509925_168510139_168515396_168515510_168516711_168516855_168517120_168517282_168518061_168518139_168523895_168523972_168525632_168525714_168529260_168529356_168531218_168531271_168532885_168532945_168547042_168547152_168548114_168548229_168552751_168552897_168575940
tx.22684	chr2	-	1236	2	ISM	ENSMUSG00000027547.18	ENSMUST00000029061.12	5073	4	85	7438	1	411	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	532	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCGGTAAGCACAAGTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168609036	168597689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_168598721_168608831
tx.22685	chr2	-	1534	3	Intergenic	novelGene_848	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	3.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTGTGTCAGCTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	168812249	168802174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_168803291_168807800_168807975_168812005
tx.22686	chr2	-	804	2	Intergenic	novelGene_858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGAGCTCTTTTCTTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170026490	170019202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170019838_170026321
tx.22687	chr2	-	922	3	Intergenic	novelGene_859	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGAGGGGAGCTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170026542	170019208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_170019838_170024553_170024626_170026321
tx.22689	chr2	+	860	2	Intergenic	novelGene_873	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGGCCGTTGATACTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172699103	172702416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_172699370_172701822
tx.2269	chr11	+	1252	4	ISM	ENSMUSG00000048834.17	ENSMUST00000208926.2	1039	5	-367	18866	-28	-18662	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0.816496580927726	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATGTTCATTTTCTCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16207695	16213556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_16208087_16209854_16210022_16211437_16211489_16212913
tx.22690	chr2	-	421	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027513.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCATTGTGCCGCTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173001221	173000547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_173000732_173000984
tx.22691	chr2	+	308	2	NNC	ENSMUSG00000087600.2	novel	680	3	NA	NA	-24	-729	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTTTGTTATTTATTTTT	7615	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173118466	173119492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_173118613_173119330
tx.22692	chr2	+	3607	9	NIC	ENSMUSG00000027522.16	novel	3865	9	NA	NA	1	-117	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	11	junction_2	35.8599707194526	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAATCCAAAATGACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173918101	173941446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_173918176_173918916_173918983_173932413_173932522_173933274_173933416_173934194_173934361_173935226_173935319_173935721_173935866_173936852_173936934_173938711
tx.22693	chr2	+	2666	8	NIC	ENSMUSG00000027522.16	novel	3865	9	NA	NA	0	1013	intron_retention	FALSE	canonical	3	11	junction_1	29.7787761703546	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGATTTATCGACTCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	173918110	173939773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_173918983_173932413_173932522_173933274_173933416_173934194_173934361_173935226_173935319_173935721_173935866_173936852_173936934_173938711
tx.227	chr1	-	799	7	NNC	ENSMUSG00000060715.10	novel	646	9	NA	NA	-9	185	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.3168032782055	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGGTGCCCTTGGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53226776	53197550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_53197948_53209516_53209618_53216928_53216987_53221001_53221055_53221653_53221704_53224373_53224450_53226712
tx.2270	chr11	-	443	4	FSM	ENSMUSG00000078974.11	ENSMUST00000166950.8	754	4	309	2	-9	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	4864	junction_3	651.205207459386	21617	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATTTATCAAATTTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16458175	16451639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_16451808_16454735_16454839_16456372_16456473_16458103
tx.22700	chr2	-	1202	4	ISM	ENSMUSG00000038932.14	ENSMUST00000037877.11	2225	6	2351	0	1990	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_3	29.2384830127845	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTCCCAGTGAGTCGCTTT	7720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180282150	180263748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_180264508_180277046_180277189_180280196_180280441_180282093
tx.22701	chr2	-	1202	2	ISM	ENSMUSG00000038914.16	ENSMUST00000103055.8	4613	6	-46	9925	-46	-5959	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	159	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGGAGCAAACCTCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180351838	180332775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_180333842_180351702
tx.22702	chr2	-	1557	2	NNC	ENSMUSG00000038848.15	novel	3184	5	NA	NA	9427	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGTGTGTTCTTGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180552753	180546169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_180547462_180552488
tx.22703	chr2	-	1399	9	ISM	ENSMUSG00000038705.14	ENSMUST00000049032.13	4121	10	98	3342	79	-16	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_4	9.85837207656518	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATTGTATGCCCTTCAT	6274	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180929730	180896583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_180897058_180897287_180897426_180897664_180897737_180900776_180900935_180902087_180902192_180906773_180906902_180907607_180907706_180919741_180919915_180929676
tx.22704	chr2	+	411	3	ISM	ENSMUSG00000038685.19	ENSMUST00000146273.8	1966	16	34	25058	2	-1294	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	246	junction_1	12	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGCAGTTTCTTCCCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180961579	180964193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_180961650_180962598_180962851_180964104
tx.22705	chr2	-	1779	14	NNC	ENSMUSG00000089917.8	novel	1782	14	NA	NA	8	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_7	30.2142252636738	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCGTGTGGCAGAATGTAA	4555	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181223793	181210943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_181211184_181211260_181211418_181211488_181211597_181211701_181211825_181211925_181211989_181212101_181212196_181212292_181212349_181214866_181214929_181215007_181215198_181216004_181216077_181216161_181216333_181216443_181216551_181216639_181216831_181223648
tx.22706	chr2	-	2116	5	FSM	ENSMUSG00000038605.12	ENSMUST00000060173.9	2164	5	49	-1	35	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_4	9.60143218483576	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCAGTGTTGGGTCTCTG	1078	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181240956	181237009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_181238399_181238539_181238681_181238964_181239137_181239220_181239403_181240724
tx.22707	chr2	-	1555	5	FSM	ENSMUSG00000002458.14	ENSMUST00000108769.8	1460	5	-10	-85	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_4	23.2849200127464	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTTGTTCTTTCAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	181335733	181330214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_181331405_181331494_181331570_181333025_181333148_181333282_181333389_181335671
tx.22708	chr3	+	3695	3	FSM	ENSMUSG00000027499.13	ENSMUST00000028999.12	3617	3	-78	0	-77	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTCTCTCAAGAGTCAT	2596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7431651	7510426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_7431813_7502397_7502576_7507070
tx.22709	chr3	-	2221	5	FSM	ENSMUSG00000040289.9	ENSMUST00000042412.5	2423	5	200	2	-72	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	1.11803398874989	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTACTGTGTCTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8732116	8728420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_8730125_8731004_8731087_8731331_8731416_8731561_8731638_8731841
tx.2271	chr11	-	1135	5	NIC	ENSMUSG00000087060.8	novel	600	6	NA	NA	8	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	6	junction_3	9.28372231381357	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGGTGTATCGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16901110	16885153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_16885927_16886454_16886565_16887372_16887485_16900881_16900931_16901019
tx.22710	chr3	-	600	3	Intergenic	novelGene_910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGATTTGATTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9391755	9390127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_9390507_9390952_9391102_9391683
tx.22711	chr3	+	1730	7	ISM	ENSMUSG00000027550.15	ENSMUST00000169079.8	5638	19	-44	22140	-9	-5312	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_5	17.1464281994822	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGGTGTTTGCTGATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14598838	14611221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_14599083_14601058_14601265_14601533_14601600_14602269_14602438_14604688_14604865_14604970_14605175_14610555
tx.22712	chr3	+	1302	8	NNC	ENSMUSG00000027550.15	novel	3359	19	NA	NA	27	-5537	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_7	29.1890390386528	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACTATTTACTAGGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14598910	14610996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_14599083_14601058_14601265_14601533_14601600_14602269_14602438_14604688_14604865_14604970_14605175_14610555_14610753_14610883
tx.22713	chr3	+	1716	8	FSM	ENSMUSG00000027552.15	ENSMUST00000165922.3	1751	8	29	6	29	-6	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	75.6598186837988	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTATTGATCTTTGGGG	1981	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14643759	14671362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_14644084_14652369_14652480_14653199_14653362_14666059_14666107_14667707_14667773_14668697_14668966_14670184_14670230_14670667
tx.22715	chr3	+	394	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000057036.8	novel	444	1	NA	NA	-24	76	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCATTTAGTACCTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24387207	24387751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_24387401_24387550
tx.22716	chr3	-	2463	12	ISM	ENSMUSG00000027699.20	ENSMUST00000184113.8	3935	24	21974	-4	5260	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	667	junction_10	45.5088766202778	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTATGTGTCCTGTCAT	8175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27186025	27151370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_27152638_27154976_27155121_27156543_27156652_27169544_27169700_27171926_27172066_27176109_27176230_27176545_27176625_27178051_27178134_27181027_27181125_27181882_27181994_27184202_27184272_27185933
tx.22717	chr3	-	359	3	ISM	ENSMUSG00000027699.20	ENSMUST00000176535.8	712	6	-3	3027	-3	-2967	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	581	junction_2	82	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTAAGGAGTTGGGGTTTG	1857	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27207980	27203143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_27203222_27204177_27204330_27207851
tx.22718	chr3	-	437	3	NNC	ENSMUSG00000091329.3	novel	299	2	NA	NA	-14	17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGCCCTTAAAATTCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28835271	28792920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_28793112_28796264_28796387_28835147
tx.2272	chr11	-	942	4	FSM	ENSMUSG00000087060.8	ENSMUST00000139493.8	941	4	4	-5	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	8.73053390247253	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGGTGTATCGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16901114	16885153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_16885842_16886454_16886565_16900881_16900931_16901019
tx.22721	chr3	+	570	2	FSM	ENSMUSG00000027660.17	ENSMUST00000144756.8	4788	2	-12	4230	-9	-729	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAACAGAGTTGTACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31149197	31151312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_31149307_31150851
tx.22722	chr3	-	1803	4	ISM	ENSMUSG00000027663.13	ENSMUST00000029199.11	7797	6	20160	5430	19942	-5426	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_2	4.96655480858378	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGATGGAGTGTTATATG	9313	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32399667	32394370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_32395845_32397482_32397584_32397700_32397868_32399606
tx.22724	chr3	+	2851	18	FSM	ENSMUSG00000027668.14	ENSMUST00000091257.11	4562	18	151	1560	77	326	multi-exon	FALSE	canonical	3	429	junction_6	42.8432404539521	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGGCCTATCATTGTAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32583764	32631828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_32583845_32586046_32586166_32588386_32588523_32592418_32592582_32596954_32597080_32598215_32598325_32600736_32600845_32608303_32608458_32609622_32609691_32615613_32615736_32617160_32617288_32617523_32617629_32617941_32618045_32618224_32618455_32622405_32622559_32623636_32623834_32628382_32628518_32631211
tx.22725	chr3	+	1786	5	ISM	ENSMUSG00000027677.18	ENSMUST00000108210.9	2684	12	4201	-87	1912	87	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_3	64.0897807766574	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAAGTGATAAATTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33858600	33864180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_33858690_33858788_33858912_33860964_33861083_33861987_33862098_33862834
tx.22726	chr3	+	691	2	Intergenic	novelGene_917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATATGTTGTGAGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34745992	34747068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_34746271_34746655
tx.22727	chr3	+	589	2	Intergenic	novelGene_919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATAGTGGCTTAAGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34815638	34816361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_34816012_34816145
tx.22728	chr3	+	383	2	ISM	ENSMUSG00000037400.18	ENSMUST00000200445.5	3028	22	-25	51583	3	22094	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	472	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAAATTTATAGATAACCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35808257	35832254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_35808560_35832173
tx.2273	chr11	-	1030	4	FSM	ENSMUSG00000087060.8	ENSMUST00000123734.8	787	4	-75	-168	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	8.25967446224258	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGGTGTATCGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16901117	16885153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_16885927_16886454_16886565_16900881_16900931_16901019
tx.22731	chr3	-	1221	5	FSM	ENSMUSG00000050174.16	ENSMUST00000146324.8	1264	5	-24	67	1	5	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	11.0792599030802	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTAATCCTCACTGGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37474359	37459125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_37459644_37463656_37463712_37466508_37466565_37470849_37471054_37473971
tx.22732	chr3	+	2213	2	NIC	ENSMUSG00000037211.13	novel	2451	3	NA	NA	-52	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCGAGTGCATCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37694043	37698746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_37694214_37696703
tx.22734	chr3	+	1974	12	NNC	ENSMUSG00000037818.17	novel	4455	13	NA	NA	-4	-504	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	7.6568987960893	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCTTTTTGTGTGTGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40848707	40890238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_40848879_40859320_40859429_40860306_40860392_40864937_40865039_40871120_40871200_40871306_40871402_40877847_40877987_40884571_40884662_40885315_40885418_40887958_40888338_40889301_40889465_40889776
tx.22735	chr3	-	1374	2	FSM	ENSMUSG00000049940.8	ENSMUST00000124636.2	596	2	248	-1026	248	1026	multi-exon	FALSE	canonical	3	603	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCTCGAGTCGGACTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41024857	41021928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_41023160_41024714
tx.22736	chr3	+	3354	9	ISM	ENSMUSG00000025764.15	ENSMUST00000026865.15	5481	11	-8	10148	-8	21	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	683	junction_7	60.6727904418447	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTATTTAAGTTACTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41510157	41561151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_41510255_41535629_41535708_41543368_41543458_41546117_41546276_41548201_41548390_41551049_41551262_41554456_41554625_41555801_41555919_41558904
tx.22738	chr3	+	2443	4	Intergenic	novelGene_933	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	10.6770782520313	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACACAGGGTTTGCACTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51509159	51534753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_51509310_51518972_51519090_51532025_51532159_51532710
tx.22739	chr3	+	2091	4	FSM	ENSMUSG00000048332.14	ENSMUST00000059562.14	2108	4	19	-2	-12	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.16024689946929	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGAGTCACCGAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52948967	53169102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_52949196_52950539_52951113_53139150_53139250_53167911
tx.2274	chr11	-	1537	7	FSM	ENSMUSG00000020116.8	ENSMUST00000020317.8	1544	7	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1392	junction_5	81.0276016072438	1962	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGCAGTCTCTTTTTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17161561	17153197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_17154002_17154500_17154572_17158788_17158907_17159076_17159138_17159310_17159395_17160987_17161138_17161312
tx.22740	chr3	+	622	2	NNC	ENSMUSG00000085174.2	novel	1966	2	NA	NA	2581	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAAGTTCTTTAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53362620	53365218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_53362713_53364688
tx.22741	chr3	+	1783	7	FSM	ENSMUSG00000049504.13	ENSMUST00000141418.2	1519	7	-240	-24	26	24	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	7.95124029458437	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATTCCTAATCCATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53371112	53381624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_53371741_53374522_53374589_53376901_53376971_53377693_53377789_53378844_53378939_53379396_53379508_53380904
tx.22742	chr3	-	1428	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027796.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTTGACATTTGAAGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54693692	54685216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_54686439_54687703_54687821_54693603
tx.22743	chr3	+	660	2	ISM	ENSMUSG00000036580.16	ENSMUST00000199416.2	3239	6	-37	11825	-32	168	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	234	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTACAGCCCACAGGCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55019496	55024922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_55019639_55024404
tx.22744	chr3	+	420	5	ISM	ENSMUSG00000048655.18	ENSMUST00000118963.9	740	8	-10	13427	-10	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.6583123951777	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGTCTCGAAAGCCAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55047448	55064496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_55047594_55049661_55049742_55058132_55058244_55058325_55058367_55064453
tx.22746	chr3	+	439	3	NNC	ENSMUSG00000097725.5	novel	938	9	NA	NA	-82	-82303	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTCAGGTTTTTTAAAGAT	4210	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58599927	58613642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_58600043_58603474_58603548_58613391
tx.22747	chr3	-	1907	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027763.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTGGTCTGTGGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60402349	60397347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_60398819_60401913
tx.22749	chr3	+	1495	2	Intergenic	novelGene_938	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATCTTTAATAATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62414495	62416606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_62415525_62416140
tx.2275	chr11	+	2030	8	FSM	ENSMUSG00000078970.6	ENSMUST00000046955.7	2002	8	-22	-6	-22	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_1	21.86601127274	660	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGAGGCGTTGATTCTTT	2449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17161895	17183802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_17162147_17169013_17169115_17172196_17172328_17174548_17174651_17177160_17177277_17178140_17178276_17179768_17179867_17182706
tx.22750	chr3	+	1067	8	ISM	ENSMUSG00000034544.18	ENSMUST00000161726.2	3213	10	10505	1820	5500	17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	299	junction_2	31.8657899859484	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACACTCAGTAGTGTTTC	1078	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66903804	67263909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_66903924_66989868_66990043_67088161_67088199_67113758_67113811_67197679_67197749_67257241_67257349_67262806_67262960_67263553
tx.22751	chr3	+	214	2	Intergenic	novelGene_941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATGTTGTGAAAATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69168222	69178735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_69168307_69178605
tx.22752	chr3	-	1359	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000090941.2_ENSMUSG00000091315.2	novel	541	1	NA	NA	-35	33	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTAAATAATAACAATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69243128	69227344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_69228101_69242525
tx.22754	chr3	-	738	5	NNC	ENSMUSG00000034151.14	novel	2467	17	NA	NA	76410	17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1.92028643696715	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTATCAATGACTCTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74974600	74945196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_74945397_74947190_74947327_74959679_74959938_74968839_74968963_74974579
tx.22755	chr3	+	849	2	NNC	ENSMUSG00000102545.2	novel	508	2	NA	NA	15	-285	intron_retention	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGAGTCTATGCGACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79194713	79195826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_79194773_79195036
tx.22756	chr3	-	2548	10	NNC	ENSMUSG00000028020.17	novel	3029	10	NA	NA	-170	-384	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_9	12.2877033786216	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTTTTGGAATTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80821137	80751289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_80752565_80758214_80758508_80763091_80763245_80767467_80767609_80769009_80769093_80769198_80769429_80785315_80785384_80786932_80787040_80819274_80819426_80821090
tx.22757	chr3	-	1134	8	FSM	ENSMUSG00000028020.17	ENSMUST00000107743.8	1101	8	-33	0	28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_4	4.17475405605784	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCTGGTTTTGTATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80820868	80762935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_80763245_80767467_80767609_80769009_80769093_80769198_80769429_80785315_80785384_80786932_80787040_80819274_80819426_80820823
tx.22758	chr3	-	691	3	NNC	ENSMUSG00000033882.16	novel	2058	4	NA	NA	-38	-27515	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	2	junction_2	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCGAAGGTGTTGTGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82783828	82772639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_82772980_82773792_82773955_82783639
tx.22759	chr3	-	2906	3	FSM	ENSMUSG00000027995.11	ENSMUST00000029623.11	3014	3	108	0	108	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	5.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCGGTTTCTCTGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83748966	83743578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_83746097_83748195_83748444_83748826
tx.2276	chr11	+	1059	5	FSM	ENSMUSG00000000581.9	ENSMUST00000000594.9	2981	5	-20	1942	-5	610	multi-exon	FALSE	canonical	3	609	junction_3	54.4908249157599	3970	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGGTTGTATGTCCTGACT	7311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17207573	17217234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_17207659_17212647_17212795_17213608_17213676_17213950_17214007_17216530
tx.22760	chr3	-	2143	2	ISM	ENSMUSG00000028078.15	ENSMUST00000194452.2	2066	12	-16	105794	-11	-105794	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	242	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAAAACCCAAAAAAACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86827697	86812021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_86813524_86827056
tx.22761	chr3	-	1039	5	NNC	ENSMUSG00000041734.16	novel	7236	16	NA	NA	-8	-8511	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	21.4941852602047	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTATCCTAGGGGAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87082015	87000445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_87000711_87002943_87003094_87005048_87005214_87048283_87048430_87081702
tx.22762	chr3	-	1275	4	ISM	ENSMUSG00000041734.16	ENSMUST00000041732.9	2160	14	-255	10605	-58	-10605	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_3	12.684198393627	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCGTAAAACAAACAAACCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87082112	87002539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_87003094_87005048_87005214_87048283_87048430_87081702
tx.22763	chr3	+	396	4	ISM	ENSMUSG00000003382.19	ENSMUST00000119109.8	5309	5	188	10896	-12	-1771	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	12.5521135891752	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGAAAAGGTTTACTTACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87432901	87436567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_87432967_87434567_87434624_87435176_87435415_87436530
tx.22764	chr3	-	2224	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000019710.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATGTCGGGAATTGAAGG	3095	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87829220	87826801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_87827832_87828026
tx.22765	chr3	+	2458	11	ISM	ENSMUSG00000028060.15	ENSMUST00000029696.11	2981	14	3837	70	-3801	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	322	junction_8	35.2244233451734	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTGTCATTTCTCTTTTT	2846	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88596946	88620161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_88597011_88600382_88600436_88600727_88600892_88603871_88604084_88606155_88606217_88607257_88607316_88607567_88607822_88616086_88616249_88617136_88617250_88618067_88618160_88618936
tx.22766	chr3	+	785	3	ISM	ENSMUSG00000078684.9	ENSMUST00000135913.2	6190	19	-3	41088	-3	-41088	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_1	22.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGCTTTTTCTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88682519	88691806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_88682582_88684290_88684822_88691614
tx.22767	chr3	+	766	4	ISM	ENSMUSG00000042784.10	ENSMUST00000041142.4	2242	7	2442	0	28	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_2	0.942809041582063	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCAGCTGTGGTTTTTCAT	2187	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89138805	89140688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_89138942_89139069_89139192_89139272_89139423_89140330
tx.22769	chr3	+	180	1	Intergenic	novelGene_948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTCAGGTCATGAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90101688	90101868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_90101700_90101900
tx.2277	chr11	-	918	2	ISM	ENSMUSG00000016984.8	ENSMUST00000076661.7	4185	6	7813	1133	7813	-1133	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_1	0	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTTTTTTGTGTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17896062	17889888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_17890351_17895606
tx.22770	chr3	-	868	6	ISM	ENSMUSG00000027932.15	ENSMUST00000132041.2	2016	10	2365	-11	1682	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_5	14.0513344562002	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCGAGAGTCTGTGGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90294606	90292536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_90292841_90293556_90293688_90293786_90293885_90294054_90294254_90294370_90294462_90294561
tx.22771	chr3	-	2141	9	FSM	ENSMUSG00000027933.12	ENSMUST00000198562.2	2226	9	138	-53	45	53	multi-exon	FALSE	canonical	3	192	junction_4	14.517231140958	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAAGGCGGTGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90340791	90315155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_90315907_90317304_90317435_90318507_90318653_90320836_90320904_90322464_90322550_90322799_90322914_90329042_90329127_90331310_90331395_90340110
tx.22772	chr3	+	1686	4	NNC	ENSMUSG00000087411.2	novel	663	4	NA	NA	-695	711	intron_retention	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.24721912892465	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGGATGGTGTGATAATC	195	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90358194	90365113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_90358727_90362372_90362550_90363787_90363884_90364232
tx.22773	chr3	-	1895	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000102311.2	novel	1091	1	NA	NA	-1525	646	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTCTGTGGATTCTAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94067553	94064291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_94066063_94067429
tx.22774	chr3	+	925	5	ISM	ENSMUSG00000068874.14	ENSMUST00000090839.12	1712	12	-9	6351	-9	332	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	5.53962995154008	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTAGAGCACTTGCATAC	2645	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94840357	94845718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_94840474_94844007_94844065_94844205_94844319_94844518_94844705_94845265
tx.22776	chr3	+	1324	10	FSM	ENSMUSG00000005628.13	ENSMUST00000005769.13	1242	10	-84	2	-46	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.05409255338946	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGCCTGTCTCCTTGCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95031740	95036518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95031890_95032825_95032989_95033130_95033288_95033721_95033839_95034650_95034741_95034899_95035031_95035114_95035223_95035579_95035724_95035910_95036056_95036398
tx.22777	chr3	+	2426	3	FSM	ENSMUSG00000053769.6	ENSMUST00000066386.6	2394	3	-32	0	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	5.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATGCTTTAGTGGTTTTA	8579	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95041366	95046829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_95042308_95044935_95045298_95045706
tx.22778	chr3	+	1219	2	ISM	ENSMUSG00000053769.6	ENSMUST00000066386.6	2394	3	3807	-4	3807	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	7	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTAGTGGTTTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95045205	95046833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_95045298_95045706
tx.2278	chr11	+	428	2	FSM	ENSMUSG00000086468.2	ENSMUST00000148496.2	388	2	-30	-10	4	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCTATGCTGTGTTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17903973	17905108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_17904086_17904792
tx.22781	chr3	+	2852	14	FSM	ENSMUSG00000028101.19	ENSMUST00000107076.10	2858	14	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	28.3212760050852	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGAGCGTCATGGAGGGGA	2594	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96603705	96613278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_96603848_96606735_96607154_96607308_96607394_96607533_96607585_96607804_96607896_96608601_96608737_96608931_96609038_96609489_96609564_96609672_96609834_96610841_96610976_96611054_96611224_96611374_96611509_96611664_96611703_96612164
tx.22782	chr3	+	2826	14	FSM	ENSMUSG00000028101.19	ENSMUST00000064900.16	2931	14	2	103	2	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_1	24.6852374253431	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCGTCATGGAGGGGAAGGGA	3289	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96604400	96613283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_96604512_96606735_96607154_96607308_96607394_96607533_96607585_96607804_96607896_96608601_96608737_96608931_96609038_96609489_96609564_96609672_96609834_96610841_96610976_96611054_96611224_96611374_96611509_96611664_96611703_96612164
tx.22783	chr3	+	2501	9	FSM	ENSMUSG00000038298.15	ENSMUST00000058865.14	2406	9	-99	4	-99	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	6.6226410894748	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTTGGTAAAATCTATC	7620	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96737292	96778238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_96737473_96757543_96757756_96758806_96759057_96761849_96761987_96763170_96763367_96764510_96764708_96775623_96775849_96776256_96776548_96777425
tx.22784	chr3	+	1082	7	ISM	ENSMUSG00000038205.13	ENSMUST00000045743.13	5006	8	375	3768	373	-755	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	8.35995746932297	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCCTGGCCCCGCTGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97565902	97577360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_97566083_97569588_97569756_97570897_97570992_97571183_97571305_97573897_97574032_97574674_97574744_97577043
tx.22785	chr3	-	933	7	ISM	ENSMUSG00000038170.16	ENSMUST00000175751.8	4658	17	13415	5865	13415	11	internal_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_4	9.06305074954835	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAGCCAGGTGAGCCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97661832	97653997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_97654080_97654832_97654915_97655080_97655252_97659124_97659320_97660331_97660512_97661441_97661580_97661747
tx.22786	chr3	+	230	2	Intergenic	novelGene_950	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAAGGCCCTTATCTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100216814	100220271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_100216914_100220140
tx.22787	chr3	-	731	3	FSM	ENSMUSG00000008763.17	ENSMUST00000123442.2	508	3	-181	-42	14	42	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	61	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATAAGCTGAGGTTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100592805	100563334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_100563591_100591876_100592004_100592457
tx.22788	chr3	+	1596	2	Intergenic	novelGene_954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTGGGCCTTGGGCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103564528	103567321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_103564657_103565853
tx.22789	chr3	-	1730	3	FSM	ENSMUSG00000027848.13	ENSMUST00000029440.10	5465	3	1	3734	1	-1699	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTCCTCTCTGGTGTGTTT	750	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103645316	103642714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_103643980_103644267_103644554_103645137
tx.2279	chr11	-	302	2	Intergenic	novelGene_140	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCACTTGTCATGATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17933137	17932362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_17932481_17932953
tx.22790	chr3	+	352	2	NNC	ENSMUSG00000032952.12	novel	2692	11	NA	NA	11	-4826	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCGAGTTATTAGGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103716926	103717358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_103717104_103717183
tx.22791	chr3	+	1579	9	ISM	ENSMUSG00000058388.15	ENSMUST00000090685.11	3006	18	25379	1	-2595	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_3	15.2924613780778	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTCAGTTTCTAGGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103901140	103914805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_103901219_103903917_103904047_103904748_103905022_103905987_103906120_103906586_103906674_103910762_103910919_103911702_103911799_103912814_103912941_103914303
tx.22792	chr3	-	945	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000002233.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTACTGCAGGTGCAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104696700	104695224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_104695916_104696446
tx.22793	chr3	-	777	2	ISM	ENSMUSG00000062127.12	ENSMUST00000199002.2	3767	5	-50	32192	-21	-32192	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTATGTGAGTGCTGAG	1448	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104960291	104945602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_104946304_104960215
tx.22794	chr3	+	466	2	ISM	ENSMUSG00000056260.16	ENSMUST00000098751.10	929	3	-38	1266	-38	20	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTAACAGTTTTTAAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106592264	106641954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_106592450_106641673
tx.22795	chr3	-	2906	11	ISM	ENSMUSG00000027893.15	ENSMUST00000029490.15	3863	17	25315	0	-671	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	702	junction_5	35.0279888089511	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAGTAGTCGTGTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107578561	107570435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_107572430_107572831_107572953_107574457_107574537_107574955_107575025_107575382_107575482_107575565_107575661_107575982_107576054_107576408_107576498_107577207_107577272_107577519_107577637_107578453
tx.22796	chr3	-	1589	3	FSM	ENSMUSG00000048796.8	ENSMUST00000065664.7	4058	3	-31	2500	-31	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTCTCTCCCTGTTGCCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108108181	108105586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_108107032_108107440_108107479_108108075
tx.22797	chr3	-	1132	2	Intergenic	novelGene_958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTCGTCCAGGTCACAA	724	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108154165	108148216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_108149292_108154108
tx.22798	chr3	+	340	2	ISM	ENSMUSG00000040389.16	ENSMUST00000139626.3	1088	4	-49	5002	-12	-5002	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGCTTCACATTAGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108498655	108517274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_108498914_108517192
tx.22799	chr3	+	1408	7	NNC	ENSMUSG00000040389.16	novel	4222	15	NA	NA	13	-1210	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	20.0201287597147	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGTAATATTTATTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108498680	108530761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_108498914_108517192_108517360_108518671_108518756_108521648_108521734_108525805_108525980_108526066_108526609_108530638
tx.228	chr1	-	3051	13	FSM	ENSMUSG00000026098.14	ENSMUST00000027267.14	3054	13	3	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_1	15.4495145554804	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGTTTTCACGTCCAACC	6055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53336174	53228345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_53228658_53231258_53231420_53234086_53234218_53235981_53236462_53245720_53246572_53246734_53246879_53247121_53247245_53255389_53255507_53295787_53295952_53306986_53307090_53314228_53314412_53321099_53321252_53336044
tx.2280	chr11	-	1402	3	Intergenic	novelGene_141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTGACACAGGCTGGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19376534	19373054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_19374216_19374321_19374460_19376431
tx.22800	chr3	+	3476	10	FSM	ENSMUSG00000040322.11	ENSMUST00000029477.11	3431	10	-45	0	-45	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	3.55902608401044	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTGTTTTCTAATTGTC	4430	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109030419	109075773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_109030704_109043527_109043655_109056798_109056887_109062309_109062422_109064162_109064322_109065813_109065961_109066663_109066772_109068532_109068701_109070734_109070886_109073641
tx.22801	chr3	+	833	2	Intergenic	novelGene_959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCCACATTCACTTTCAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115538527	115539890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_115538566_115539095
tx.22802	chr3	-	1254	6	ISM	ENSMUSG00000027957.14	ENSMUST00000120120.8	1791	9	24829	-8	-10974	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_1	26.1044057584156	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGGGTTTTATATCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116481051	116466793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_116467368_116468819_116468954_116471511_116471631_116474753_116474926_116480710_116480834_116480919
tx.22803	chr3	-	593	2	ISM	ENSMUSG00000028007.14	ENSMUST00000198499.5	1314	8	45777	-298	30343	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGTGTCTATGATGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117594580	117575523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_117576026_117594489
tx.22804	chr3	-	936	4	ISM	ENSMUSG00000028007.14	ENSMUST00000169812.8	1588	8	31596	4	-6010	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	9.8770215933527	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGTGTCTATGATGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117630933	117575523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_117576026_117623225_117623313_117626488_117626689_117630786
tx.22805	chr3	-	497	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000106224.2	novel	1808	1	NA	NA	-41	5150	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCAGCATGAATTCAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121517092	121510093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_121510378_121514619_121514732_121516991
tx.22806	chr3	+	1515	4	FSM	ENSMUSG00000028121.9	ENSMUST00000197590.2	766	4	152	-901	152	901	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_3	59.3127305053477	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATGTGCACGATTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122213623	122266151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_122213833_122220093_122220404_122248701_122248742_122265195
tx.22807	chr3	-	533	2	NNC	ENSMUSG00000039701.12	novel	6185	16	NA	NA	21	-11472	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGTGGTTTGTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122778099	122772761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_122773126_122777930
tx.22809	chr3	+	705	3	ISM	ENSMUSG00000027999.16	ENSMUST00000061165.9	476	4	7695	-340	-3951	340	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	346	junction_1	2	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAAGGACTTTTCAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129682527	129688946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_129682607_129683916_129684083_129688486
tx.2281	chr11	-	458	2	Intergenic	novelGene_142	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATACTTACTTGTGTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19780778	19775633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_19776017_19780703
tx.22810	chr3	-	1243	2	ISM	ENSMUSG00000001052.16	ENSMUST00000001079.15	5128	24	263	57522	263	975	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTCAGAGTCATTATCCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129854293	129833929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_129835097_129854217
tx.22814	chr3	-	1434	5	FSM	ENSMUSG00000028266.18	ENSMUST00000121796.8	1417	5	-17	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	16.8281757775464	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGGGTTTAAACGCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143908174	143894290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_143895067_143899656_143899813_143900167_143900265_143907573_143907813_143908008
tx.22815	chr3	-	535	4	ISM	ENSMUSG00000037062.14	ENSMUST00000199854.5	1416	10	94	15252	-1	-14620	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	318	junction_2	5.35412613473634	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGTAGGAAAATGATCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144425872	144412358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_144412493_144414993_144415123_144418347_144418490_144425742
tx.22816	chr3	-	1075	2	ISM	ENSMUSG00000028195.5	ENSMUST00000029846.5	2019	5	1703	0	1703	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGAATGTATGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145354033	145352730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_145353724_145353951
tx.22817	chr3	+	319	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105388.2	novel	321	1	NA	NA	-33	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACGCTTCTCTCA	8268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145584741	145585145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_145584818_145584902
tx.22818	chr3	-	3465	4	ISM	ENSMUSG00000005034.16	ENSMUST00000106137.8	4061	10	23627	-293	-1007	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	142	junction_1	9.28559218478941	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGAGTCTTCTGTCCGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146452389	146435326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_146438469_146443688_146443854_146451014_146451138_146452354
tx.2282	chr11	-	437	2	Intergenic	novelGene_143	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTATTAATTTTAAAAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19778175	19775650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_19776017_19778104
tx.22820	chr3	-	938	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000047676.7	novel	885	1	NA	NA	-63	85	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATGATAGCTATAATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149779242	149778209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_149778400_149778494
tx.22822	chr3	+	3888	24	FSM	ENSMUSG00000025437.16	ENSMUST00000197748.5	4183	24	16	279	-7	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	245	junction_13	66.1683137664235	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAATGTTGAATTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152052141	152098975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_152052277_152063476_152063609_152063782_152063837_152064272_152064336_152065919_152066073_152067536_152067640_152069614_152069685_152071850_152071965_152072377_152072457_152073872_152074288_152075913_152076055_152079022_152079136_152080256_152080427_152080527_152080623_152081878_152081913_152084480_152084527_152085072_152085254_152086150_152086278_152087351_152087522_152088547_152088630_152089752_152089862_152095377_152095481_152097286_152097356_152097845
tx.22824	chr3	+	1249	10	ISM	ENSMUSG00000025437.16	ENSMUST00000117492.9	3886	24	36	24743	-1	99	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	415	junction_7	45.1461276247052	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGTTGACCTAAACAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152052150	152074227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_152052277_152063476_152063609_152063782_152063837_152064272_152064336_152065919_152066073_152067536_152067640_152069614_152069685_152071850_152071965_152072377_152072457_152073872
tx.22825	chr3	-	806	2	NNC	ENSMUSG00000052544.10	novel	437	2	NA	NA	40045	27	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153386588	153214486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_153215135_153386430
tx.22826	chr3	-	485	3	ISM	ENSMUSG00000053870.8	ENSMUST00000066568.6	3518	4	39	5036	4	-926	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_2	2.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTATGTGCAGTTTGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154799001	154795590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_154795842_154797027_154797196_154798935
tx.22827	chr3	-	1085	2	FSM	ENSMUSG00000053870.8	ENSMUST00000192959.2	686	2	0	-399	0	399	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAGAAAAAAAACAAAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154799005	154796180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_154797196_154798935
tx.22828	chr3	+	953	5	NNC	ENSMUSG00000028177.14	novel	1450	5	NA	NA	-5	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.82915619758885	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAGTCCAAAGCATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157630851	157643992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_157630984_157631739_157631884_157633999_157634088_157642572_157642711_157643541
tx.22829	chr4	+	2871	13	FSM	ENSMUSG00000042228.15	ENSMUST00000103010.4	3387	13	-4	520	-4	-520	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	11.3023473471468	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAGATTCTCAACTCTTG	1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3678122	3791092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_3678365_3738724_3738799_3742441_3742488_3743196_3743303_3745317_3745417_3745522_3745627_3746710_3746861_3748660_3748814_3756300_3756484_3758245_3758323_3780912_3781067_3782972_3783105_3789741
tx.2283	chr11	+	579	2	Intergenic	novelGene_144	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATCTTTCTTCATATCCC	6661	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19989801	19990563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_19989881_19990063
tx.22830	chr4	+	1579	9	NNC	ENSMUSG00000042228.15	novel	3463	13	NA	NA	-1	12414	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_8	15.6199991997439	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGTTGGTTCGTTTTCT	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3678113	3751590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_3678365_3738724_3738862_3742441_3742488_3743196_3743303_3745317_3745417_3745522_3745627_3746710_3746861_3748660_3748814_3751057
tx.22831	chr4	+	1414	2	Intergenic	novelGene_972	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGGTCGCGTCGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8133522	8136950	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_8133691_8135704
tx.22832	chr4	-	2854	14	NNC	ENSMUSG00000028207.19	novel	2884	14	NA	NA	-37	5	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_11	124.875606744325	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGTCATTATTTTGAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9669123	9575261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_9576974_9583811_9583857_9594662_9594699_9595376_9595416_9598268_9598302_9598732_9598781_9601306_9601364_9602468_9602502_9604515_9604630_9607796_9607872_9610842_9610939_9635896_9635970_9639197_9639348_9668780
tx.22833	chr4	+	1023	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081490.2	novel	561	1	NA	NA	-140	4628	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCAAGATGGCTGCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11144569	11149898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_11145265_11149570
tx.22834	chr4	+	1689	4	NNC	ENSMUSG00000028211.12	novel	5404	4	NA	NA	-29	2590	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	113.26174209424	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGTGACTCCACGATATG	1208	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11156401	11170604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_11156548_11164310_11164570_11165089_11165479_11169709
tx.22835	chr4	+	1152	5	ISM	ENSMUSG00000028212.17	ENSMUST00000108324.4	2908	12	53	9826	47	-183	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	208	junction_1	36.9484438102608	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTATGTAGCATTCCTGA	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11191782	11194856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_11191816_11192680_11192718_11192814_11192912_11192992_11193047_11193925
tx.22836	chr4	-	3243	19	FSM	ENSMUSG00000045205.17	ENSMUST00000084892.12	6754	19	0	3511	0	-3511	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_13	8.17176711475418	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGGTGCCTCACGCCTTT	-10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11322137	11264825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_11265943_11267612_11267772_11273006_11273140_11276863_11276947_11277928_11277986_11281003_11281125_11285053_11285174_11287474_11287634_11289669_11289744_11290190_11290290_11290390_11290523_11292553_11292689_11295935_11296060_11303311_11303458_11303946_11304069_11304299_11304391_11309365_11309491_11317072_11317181_11321999
tx.22837	chr4	-	2558	2	FSM	ENSMUSG00000049225.15	ENSMUST00000108297.3	4201	2	20	1623	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGACTGCTATGTTTAATTC	-18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11966432	11959806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_11962234_11966301
tx.22838	chr4	-	3443	28	FSM	ENSMUSG00000049488.15	ENSMUST00000050686.10	3456	28	13	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_10	5.81280927905584	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTTTGCGTTATTGAT	17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	12087944	12039354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_12039893_12040634_12040778_12043464_12043568_12045794_12045900_12046002_12046120_12047197_12047315_12047809_12047891_12051387_12051529_12053446_12053587_12053674_12053775_12054745_12054833_12055030_12055130_12057315_12057415_12058520_12058578_12061754_12061861_12063034_12063159_12063673_12063831_12068867_12068934_12069413_12069492_12070236_12070346_12070448_12070604_12073893_12073957_12075454_12075530_12075622_12075693_12077335_12077436_12079874_12079969_12085911_12086001_12087714
tx.22839	chr4	+	1821	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060989.9	novel	1119	1	NA	NA	732	4086	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAAGCTCTGAACTT	423	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12233564	12238037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_12233967_12236618
tx.2284	chr11	-	1267	9	FSM	ENSMUSG00000020152.8	ENSMUST00000000137.8	3631	9	-2	2366	-2	-2366	multi-exon	FALSE	canonical	3	719	junction_1	58.8430114796991	1042	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACGCCTCTAATGCTTTTT	1334	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20062915	20014669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_20014860_20022455_20022589_20027187_20027334_20030022_20030173_20030661_20030799_20041294_20041368_20044229_20044446_20050822_20050934_20062804
tx.22840	chr4	+	623	3	NNC	ENSMUSG00000085112.2	novel	1852	7	NA	NA	-96	-48740	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGTAACCTTGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16164013	16217485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_16164192_16210860_16210911_16217090
tx.22841	chr4	-	1426	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000083725.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGGTCGCGTCGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16249068	16246987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_16248235_16248889
tx.22842	chr4	-	460	4	ISM	ENSMUSG00000041058.16	ENSMUST00000108246.9	6440	25	-12	64886	-12	-63516	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_3	13.6381816969859	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCTAATCCAAAATGGGACG	171	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19709005	19673188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_19673295_19678344_19678436_19687790_19687887_19708838
tx.22843	chr4	+	473	4	ISM	ENSMUSG00000040455.18	ENSMUST00000125262.2	592	5	17	1808	-3	556	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	2.62466929133727	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC	-2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21776277	21783032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_21776318_21780340_21780451_21781735_21781909_21782882
tx.22844	chr4	-	2270	5	NIC	ENSMUSG00000040520.8	novel	4867	5	NA	NA	2	1122	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_4	23.7170824512628	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAGTTTATTAAGTGTTAA	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	26346889	26326922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_26328309_26329085_26329163_26336620_26336731_26340416_26340999_26346774
tx.22845	chr4	-	889	2	ISM	ENSMUSG00000040520.8	ENSMUST00000041374.8	4867	5	78	15821	41	133	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACAGTAATAGGTAATACC	10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	26346813	26340326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_26340999_26346596
tx.22846	chr4	+	795	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094344.2	novel	345	1	NA	NA	-24117	53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32940770	32965285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_32940996_32964715
tx.22847	chr4	+	1090	5	ISM	ENSMUSG00000028280.10	ENSMUST00000029947.6	2286	10	19794	1568	19794	-1568	internal_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_2	4.7169905660283	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTTGTTTTGCCTGCGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33152314	33162020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_33152637_33157059_33157143_33158036_33158178_33160116_33160270_33161629
tx.22848	chr4	+	1325	5	ISM	ENSMUSG00000028274.18	ENSMUST00000029942.8	2379	16	-22	170592	-5	4284	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	285	junction_2	15.7797338380595	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCCGTTGTAAGCACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33310305	33330322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_33310525_33320518_33320629_33324873_33324978_33325058_33325148_33329519
tx.22849	chr4	+	967	7	ISM	ENSMUSG00000028274.18	ENSMUST00000029942.8	2379	16	-3	162905	-3	-1168	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	238	junction_6	29.6521500063655	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGTGTAACACAGCTAATG	-22	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	33310324	33338009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_33310525_33320518_33320629_33324873_33324978_33325058_33325148_33329519_33329596_33330841_33331083_33337862
tx.2285	chr11	-	502	3	Intergenic	novelGene_145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	15	junction_2	26	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTTGTTTTTCTTTTTTA	264	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20089378	20087208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_20087398_20088488_20088566_20089142
tx.22850	chr4	+	557	4	Intergenic	novelGene_978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACTCTTGCTTGTGCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33532798	33578595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_33532954_33577281_33577331_33577758_33577849_33578332
tx.22851	chr4	-	1318	8	ISM	ENSMUSG00000028300.15	ENSMUST00000108127.4	3193	11	44	5567	-2	190	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_5	10.3706808073609	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTCTTTATTTTCTTAA	-13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	35225836	35196853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_35197209_35205767_35205885_35211291_35211365_35213008_35213074_35213548_35213645_35217212_35217273_35218413_35218917_35225787
tx.22852	chr4	+	365	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028411.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCCTCAGGTCCTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40703041	40715431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_40703292_40715316
tx.22853	chr4	-	2662	9	NIC	ENSMUSG00000028438.17	novel	5593	13	NA	NA	-3	395	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	20	junction_7	10.4215821735474	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGACTCATAACTATTTT	-36	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41464890	41402905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_41403896_41404676_41404799_41409731_41409820_41413828_41414045_41414901_41415000_41423451_41423636_41428344_41428983_41429266_41429412_41464709
tx.22854	chr4	-	1745	6	NIC	ENSMUSG00000028438.17	novel	1756	7	NA	NA	-4	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	20	junction_4	11.0815161417561	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTAGCTTGGATACATAG	-37	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	41464891	41413546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_41414045_41414901_41415000_41423451_41423636_41428344_41428983_41429266_41429412_41464709
tx.22855	chr4	-	838	2	ISM	ENSMUSG00000028444.18	ENSMUST00000102961.10	1995	10	37019	0	5611	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGGAGCTGAACCACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41658423	41657497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_41658153_41658240
tx.22856	chr4	+	579	6	NNC	ENSMUSG00000096826.3	novel	418	3	NA	NA	-4592	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	20.7980768341691	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCAAAAACTTCCGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42650658	42655998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_42650702_42650997_42651065_42651275_42651336_42654204_42654303_42655498_42655632_42655820
tx.22857	chr4	+	270	2	ISM	ENSMUSG00000036052.15	ENSMUST00000098112.9	3093	4	0	6153	0	-30	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGACAAGAACAAAGAGCCCA	-26	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	42949866	42953272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_42950005_42953140
tx.22858	chr4	+	2391	4	FSM	ENSMUSG00000036052.15	ENSMUST00000098112.9	3093	4	7	695	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	4.32049379893857	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCTCTGCGCAGAAGCAG	-19	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	42949873	42958730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_42950005_42953140_42953386_42956525_42957128_42957317
tx.22859	chr4	-	1016	5	NNC	ENSMUSG00000028454.17	novel	4239	10	NA	NA	-468	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_4	84.5310593805614	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGTAGCTAAGATCTGTGAG	5638	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43020174	43017635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_43018039_43018147_43018219_43019211_43019436_43019646_43019854_43020063
tx.2286	chr11	-	257	2	Intergenic	novelGene_146	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACAACATGTTGTTTTTCT	1652	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20087990	20087214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_20087398_20087916
tx.22860	chr4	+	1438	9	FSM	ENSMUSG00000028468.16	ENSMUST00000107886.9	5888	9	53	4397	33	-40	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.96452920568771	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACATGCCCACCATGGCAA	27	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	43578767	43583090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_43579004_43579374_43579510_43579886_43580024_43580295_43580380_43580476_43580627_43580863_43581011_43581187_43581316_43581486_43581677_43582859
tx.22861	chr4	+	533	3	ISM	ENSMUSG00000028468.16	ENSMUST00000030190.9	1292	9	2295	-9	39	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	4	junction_2	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTGGACTCCAGTGGGGG	2305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43581252	43583139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_43581316_43581486_43581677_43582859
tx.22862	chr4	-	972	2	NNC	ENSMUSG00000081329.2	novel	564	2	NA	NA	-117	284	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTTGTTTTGCTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43800372	43798611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_43799093_43799881
tx.22863	chr4	-	1752	6	FSM	ENSMUSG00000044813.16	ENSMUST00000061986.12	2244	6	492	0	492	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_2	2.71293199325011	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTATTAGTCGGGTTTTTT	946	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45529838	45423277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_45424124_45444678_45444799_45447505_45447678_45458126_45458343_45489054_45489176_45529561
tx.22864	chr4	-	1181	5	ISM	ENSMUSG00000035495.16	ENSMUST00000160008.2	1547	6	-36	1153	6	-1153	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_4	20.4633819296811	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGTCTAAGTACTGTGTG	-18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	46138449	46124557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_46125026_46129226_46129348_46131842_46132157_46135386_46135595_46138379
tx.22865	chr4	+	324	3	ISM	ENSMUSG00000028330.9	ENSMUST00000030014.9	3010	23	134	26935	134	-14631	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	363	junction_2	20.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGTGTATGTATGTAAAC	-7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	46138746	46145468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_46138887_46144784_46144874_46145373
tx.22866	chr4	-	313	2	ISM	ENSMUSG00000028329.14	ENSMUST00000132358.8	729	5	5323	1	5323	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACGATGCAGTCTTCACAG	3989	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46180326	46175222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_46175416_46180206
tx.22867	chr4	+	2099	5	ISM	ENSMUSG00000061455.14	ENSMUST00000064765.6	1531	9	33874	-887	33874	887	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_4	3.04138126514911	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAGTATTTATTTCTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48158808	48183118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_48159034_48166927_48167044_48167205_48167257_48180669_48180757_48181498
tx.22868	chr4	-	182	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039693.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATGATACATAAAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48579022	48558180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_48558238_48578897
tx.22869	chr4	+	1854	8	ISM	ENSMUSG00000028347.15	ENSMUST00000030032.13	2461	10	25268	0	24891	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	169	junction_2	128.805184329685	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTCTGCTTTGTGTGCTCA	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	48610441	48663131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_48610543_48614956_48614984_48617234_48617332_48636839_48636989_48638979_48639046_48650294_48650419_48658773_48658933_48662000
tx.2287	chr11	+	313	2	Intergenic	novelGene_147	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAAGAGGAAGACTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20087214	20088619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_20087395_20088486
tx.22870	chr4	+	3115	10	FSM	ENSMUSG00000028414.18	ENSMUST00000128667.8	6080	10	153	2812	-12	186	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	6.81501610008696	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCCAAAAAACCCCCAAAACA	-20	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	53714150	53762973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_53714196_53720006_53720210_53729979_53730040_53731131_53731336_53734849_53735128_53737526_53737660_53744618_53744749_53747008_53747143_53748368_53748497_53761173
tx.22871	chr4	+	1870	3	ISM	ENSMUSG00000028414.18	ENSMUST00000107638.4	3326	12	-14	36563	-14	-36563	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	9	junction_2	10.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	-22	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	53714148	53726224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_53714196_53720006_53720210_53724604
tx.22872	chr4	+	1069	2	ISM	ENSMUSG00000060206.12	ENSMUST00000079605.5	4684	11	67800	-296	67800	268	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACAGACTTTAATTACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55079279	55081626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_55079388_55080665
tx.22873	chr4	-	1172	3	FSM	ENSMUSG00000028431.12	ENSMUST00000171411.8	953	3	18	-237	18	237	multi-exon	FALSE	canonical	3	350	junction_1	22.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGTTATGTGCTACTAGC	87	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56757267	56750774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_56751720_56755303_56755380_56757116
tx.22874	chr4	-	3560	27	ISM	ENSMUSG00000028431.12	ENSMUST00000030140.3	6160	37	14493	1323	-8099	9	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	245	junction_24	39.7853151523919	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAGTGGTAAAGAGCGGTT	1374	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56787838	56751002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_56751720_56755303_56755380_56757116_56757272_56758212_56758341_56758963_56759076_56759800_56759915_56762248_56762310_56762840_56762904_56767814_56767877_56769013_56769216_56770980_56771079_56771432_56771557_56772380_56772530_56773015_56773102_56773198_56773337_56774521_56774602_56774687_56774767_56775016_56775091_56775424_56775541_56776689_56776796_56776884_56776939_56778958_56779063_56779656_56779764_56781025_56781218_56784537_56784638_56786587_56786753_56787740
tx.22875	chr4	+	1927	2	FSM	ENSMUSG00000038729.25	ENSMUST00000124581.2	784	2	-25	-1118	-25	-602	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACAACCCCTCCGAGGGC	-15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	57782154	57856320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_57782323_57854561
tx.22876	chr4	+	1067	2	NNC	ENSMUSG00000038729.25	novel	784	2	NA	NA	16	-29024	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTTTGAATGTCTGATGTC	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	57782195	57826025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_57782323_57825085
tx.22877	chr4	-	3391	4	FSM	ENSMUSG00000038668.15	ENSMUST00000055018.11	3512	4	115	6	-58	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_3	72.8941393772885	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGGCGATGTGTGGTTCT	-18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	58553242	58435260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_58437635_58486476_58487225_58504621_58504782_58553133
tx.22878	chr4	+	797	3	NNC	ENSMUSG00000038630.9	novel	2794	6	NA	NA	-23	-11069	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGAGAATGGGTTGAAAAAT	-2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	58943604	58947286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_58943659_58945999_58946530_58947073
tx.22879	chr4	+	2308	4	ISM	ENSMUSG00000038630.9	ENSMUST00000107554.2	2794	6	2855	3988	2855	-3988	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAACCTGGGTTCAATTT	2727	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58946482	58954367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_58946530_58948849_58948948_58951827_58951955_58952331
tx.2288	chr11	-	978	3	Intergenic	novelGene_148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	32	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACAACATGTTGTTTTTCT	264	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20089378	20087214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_20087398_20088488_20088566_20088660
tx.22880	chr4	-	3450	14	FSM	ENSMUSG00000028382.16	ENSMUST00000030076.12	6855	14	79	3326	-1	65	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_2	23.0463900573291	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAATTTTGTCCACCCCTTC	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59549285	59475193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_59477016_59477154_59477233_59481361_59481579_59482544_59482638_59485338_59485373_59485606_59485747_59488110_59488189_59493185_59493361_59494499_59494611_59501309_59501475_59514273_59514421_59517585_59517756_59524394_59524477_59549147
tx.22881	chr4	+	1535	4	ISM	ENSMUSG00000028383.18	ENSMUST00000030078.12	2611	11	27	23208	27	-5995	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_3	12.3648246606609	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACGTATGCTGAAGAGG	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59581589	59595481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_59581776_59592154_59592319_59593236_59593336_59594395
tx.22882	chr4	-	3592	4	FSM	ENSMUSG00000028389.13	ENSMUST00000221329.2	1776	4	-192	-1624	-107	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	10.3708994574027	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAAGTGGTATTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62126790	62107776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62110927_62122755_62122888_62123260_62123346_62126565
tx.22883	chr4	-	542	4	ISM	ENSMUSG00000028356.5	ENSMUST00000030041.5	1268	10	8832	3	8832	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_3	1.63299316185545	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATTCTGTGTGTTGGCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63063578	63061514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_63061638_63061903_63062078_63062387_63062556_63063501
tx.22884	chr4	+	876	7	NNC	ENSMUSG00000039196.3	novel	775	6	NA	NA	-1754	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTGCTCCCTTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63261042	63266401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_63261155_63262808_63262952_63263305_63263449_63263657_63263729_63264276_63264385_63264518_63264623_63266206
tx.22886	chr4	+	1324	3	Intergenic	novelGene_998	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	9	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGACCCGTTTCTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66820645	66825836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_66820891_66822704_66822938_66824990
tx.22887	chr4	+	1337	6	FSM	ENSMUSG00000095048.8	ENSMUST00000171348.9	1322	6	-11	-4	-11	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.49666295470958	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTGCTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73586579	73590637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_73586714_73587407_73587496_73587962_73588272_73588549_73588628_73589606_73589913_73590215
tx.22888	chr4	+	623	4	ISM	ENSMUSG00000028397.14	ENSMUST00000030102.12	4196	22	-38	124867	-38	7334	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_1	11.6714276000077	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAGCATTTATGATGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74170134	74199230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_74170324_74181045_74181207_74189430_74189607_74199133
tx.22889	chr4	+	2399	5	ISM	ENSMUSG00000028397.14	ENSMUST00000030102.12	4196	22	-38	105662	-38	26539	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_1	13.9888348335378	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTATGGAATGTATAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74170134	74218435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_74170324_74181045_74181207_74189430_74189607_74199133_74199249_74216677
tx.2289	chr11	-	500	2	NNC	ENSMUSG00000085035.2	novel	627	2	NA	NA	-7432	190	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	502	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTCTTGGCCTCCATTAT	9124	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20103776	20095376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_20095695_20103594
tx.22890	chr4	-	240	2	Intergenic	novelGene_1000	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTTGGTCATGGTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83429105	83426515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_83426645_83428994
tx.22891	chr4	+	1339	5	ISM	ENSMUSG00000052407.18	ENSMUST00000125077.9	4231	25	-63	309207	31	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_4	4.30116263352131	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGGTTTTTTTTTTTTT	8720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83443812	83473615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_83444008_83454026_83454175_83465070_83465207_83467839_83468015_83472930
tx.22892	chr4	-	988	5	ISM	ENSMUSG00000028496.18	ENSMUST00000078090.12	6069	11	18	71148	18	11	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_3	3.34477204006491	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATAGTTCCTAAGATGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87951583	87759309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_87759627_87792074_87792219_87798302_87798386_87949760_87949942_87951320
tx.22893	chr4	+	128	2	Intergenic	novelGene_1001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTTTCTTCAGCTCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87997536	88002679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_87997631_88002645
tx.22894	chr4	-	1816	3	NNC	ENSMUSG00000008489.19	novel	1552	6	NA	NA	-3	-15783	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	50	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAACTCTTTACACTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91260274	91168121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_91169555_91196847_91197089_91260132
tx.22895	chr4	-	1166	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100863.2	novel	1009	1	NA	NA	-16	213	multi-exon	FALSE	canonical	2	26	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91694808	91693570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_91694242_91694313
tx.22896	chr4	-	870	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100863.2	novel	1009	1	NA	NA	-30	213	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91694822	91693570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_91694307_91694688
tx.22897	chr4	-	978	7	NNC	ENSMUSG00000028563.17	novel	1027	7	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	212.976328888134	618	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTGACCTGTTATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98271493	98243606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_98243918_98246154_98246285_98253799_98253874_98258728_98258821_98263156_98263266_98268854_98268925_98271301
tx.22898	chr4	+	1574	2	ISM	ENSMUSG00000028560.12	ENSMUST00000091358.11	3527	9	9005	42	4787	-42	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	582	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAACTGGGAGGTCAATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98821120	98823738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_98821263_98822306
tx.22899	chr4	-	2226	18	ISM	ENSMUSG00000028556.16	ENSMUST00000205650.2	6297	48	-35	78358	-35	-7675	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	117	junction_9	10.0827029934427	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTGCTGTTTCATCTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99009034	98903852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_98904034_98904863_98905003_98908257_98908329_98911578_98911697_98943558_98943722_98945037_98945132_98949415_98949559_98952186_98952353_98953614_98953696_98958414_98958565_98960641_98960709_98967102_98967189_98967656_98967870_98967956_98968087_98970930_98971000_98971243_98971420_98977752_98977859_99008961
tx.229	chr1	-	516	4	NNC	ENSMUSG00000026098.14	novel	459	3	NA	NA	8	408	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	74.271274542869	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCATGTCTGGCTTATTT	6063	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53336166	53313871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_53313931_53314228_53314412_53321099_53321252_53336044
tx.2290	chr11	+	592	2	Intergenic	novelGene_149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCGGTTTGTTGTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20112213	20131953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_20112404_20131551
tx.22900	chr4	-	437	2	Intergenic	novelGene_1005	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCACCCCTTCCTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99457636	99455587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_99455942_99457553
tx.22901	chr4	-	830	3	NNC	ENSMUSG00000086592.2	novel	1081	5	NA	NA	37742	-9055	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGTTTCTTCACTGTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99563467	99559832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_99560326_99562462_99562572_99563239
tx.22902	chr4	+	1712	4	ISM	ENSMUSG00000073792.12	ENSMUST00000144805.8	3947	14	-37	22843	-36	-5	intron_retention	FALSE	canonical	3	166	junction_1	24.8506650928211	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAGAAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99603864	99627705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_99603944_99607267_99607471_99615099_99615185_99626360
tx.22903	chr4	+	1558	8	ISM	ENSMUSG00000028532.15	ENSMUST00000030257.15	5765	27	211418	973	-6518	340	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_1	18.2040587535319	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAACTTTCAAACTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100845289	100860768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_100845440_100845747_100845835_100846575_100846693_100848020_100848173_100849925_100850088_100851231_100851310_100851931_100852034_100860058
tx.22904	chr4	-	1296	7	ISM	ENSMUSG00000028530.15	ENSMUST00000102781.10	4906	25	9	27086	0	138	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	166	junction_1	21.0983148352869	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTGGGTGTGGGTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101122470	101036649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_101036992_101038976_101039141_101041533_101041688_101046275_101046400_101048671_101048871_101050979_101051061_101122238
tx.22905	chr4	+	1788	6	FSM	ENSMUSG00000028527.19	ENSMUST00000102780.8	4186	6	-52	2450	-52	766	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	98.0848612172133	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTGTCAGTGTTTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101276421	101321742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_101276568_101276925_101277163_101304356_101304477_101317696_101317870_101320145_101320265_101320749
tx.22906	chr4	+	766	3	NNC	ENSMUSG00000028527.19	novel	4186	6	NA	NA	4	-37946	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	11	junction_2	10	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTTCTTTCCTTCCGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101276489	101279832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_101276568_101276925_101277163_101279381
tx.22907	chr4	-	1050	2	ISM	ENSMUSG00000078626.3	ENSMUST00000106916.2	951	4	12878	-477	12878	477	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	20	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCTGGCTGGGTTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101825368	101824172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_101824980_101825125
tx.22908	chr4	-	1069	6	ISM	ENSMUSG00000035126.20	ENSMUST00000036557.15	3479	15	17	49145	17	-5273	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_3	2.31516738055805	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGATTTGTCCAGATAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102971479	102944406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_102944670_102947594_102947752_102952525_102952639_102953787_102953973_102960423_102960602_102971306
tx.22909	chr4	-	929	9	NNC	ENSMUSG00000028521.18	novel	663	6	NA	NA	-79	3966	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	16.0891073400609	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCATGGCCTCCAGAAAC	5579	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103072079	103054391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_103054576_103062302_103062396_103065306_103065410_103067725_103067795_103068499_103068572_103070361_103070430_103071067_103071155_103071255_103071290_103071860
tx.2291	chr11	+	1434	6	FSM	ENSMUSG00000020149.18	ENSMUST00000020358.12	2827	6	1	1392	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1848	junction_1	130.08397287906	6247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTATGGTGATAAGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20151432	20175464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_20151653_20165629_20165703_20168812_20168909_20173083_20173180_20174366_20174499_20174647
tx.22910	chr4	+	1248	8	NNC	ENSMUSG00000028519.17	novel	5278	15	NA	NA	-31	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.9547617694959	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGACTGTTGTAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104224755	104537579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_104224915_104312500_104312584_104336270_104336473_104462494_104462635_104470365_104470465_104535898_104536031_104536649_104536770_104537266
tx.22911	chr4	+	1662	6	ISM	ENSMUSG00000028519.17	ENSMUST00000146078.8	2462	15	-30	61414	-30	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	2.63818119165458	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGACTGTTGTAACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104224756	104537580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_104224915_104336270_104336473_104462494_104462635_104470365_104470465_104535898_104536031_104536649
tx.22912	chr4	+	1903	9	FSM	ENSMUSG00000034926.4	ENSMUST00000047973.4	4028	9	78	2047	78	-2047	multi-exon	FALSE	canonical	3	318	junction_6	36.7353287041235	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTAAGGGCTTCCACCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106418312	106444263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_106418595_106421597_106421754_106428608_106428715_106429421_106429541_106430924_106431189_106435386_106435531_106442986_106443185_106443541_106443721_106443808
tx.22913	chr4	+	1726	18	FSM	ENSMUSG00000061887.15	ENSMUST00000030367.15	3195	18	335	1134	-56	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	121	junction_13	39.9235428457496	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGGAAGAAAACCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106769001	106905757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_106769110_106770099_106770173_106770401_106770464_106772841_106772927_106866875_106866966_106884413_106884495_106885389_106885450_106888058_106888126_106888211_106888289_106894132_106894198_106894798_106894848_106895418_106895455_106895922_106895978_106897159_106897231_106903512_106903592_106904438_106904468_106904560_106904663_106905220
tx.22914	chr4	+	1484	7	NIC	ENSMUSG00000028621.18	novel	5471	9	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	6	junction_1	3.43592135468138	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCAGCCTCACGCTCAGTTT	937	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106924190	106942001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_106924239_106925808_106926021_106928066_106928216_106931069_106931158_106934872_106934978_106938087_106938292_106941323
tx.22915	chr4	+	1612	8	NNC	ENSMUSG00000028621.18	novel	5471	9	NA	NA	0	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_6	6.06428150765461	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATCAGCCTCACGCTCAGT	962	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106924215	106941999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_106924239_106925808_106926021_106928066_106928216_106931069_106931158_106934872_106934978_106938087_106938292_106940457_106940613_106941323
tx.22916	chr4	+	558	5	ISM	ENSMUSG00000028582.15	ENSMUST00000030320.13	3303	25	26	9160	26	-1043	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_2	11.7473401244707	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAGGCAGCCTGCCAACAG	3559	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108477162	108482160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_108477271_108478708_108478792_108480647_108480793_108481640_108481745_108482042
tx.22917	chr4	-	840	2	FSM	ENSMUSG00000028551.15	ENSMUST00000063531.5	1106	2	266	0	266	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACATTTTCCTGTGATTTT	8926	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109522303	109518072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_109518824_109522214
tx.22918	chr4	+	2470	13	NIC	ENSMUSG00000034401.17	novel	2466	13	NA	NA	3	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	7	junction_4	31.6318887973654	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTTTACCTCTGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111577183	111686330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_111577455_111603337_111603476_111604951_111605001_111624859_111624902_111625896_111626038_111631995_111632077_111636196_111636491_111637951_111638040_111641999_111642041_111656266_111656452_111663127_111663228_111679937_111680030_111685382
tx.22919	chr4	-	406	5	ISM	ENSMUSG00000078598.12	ENSMUST00000169631.8	4497	59	235958	239086	235958	129261	internal_fragment	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTTGATGCTGCTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113620742	113574173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_113574323_113588221_113588285_113599373_113599437_113614103_113614167_113620674
tx.2292	chr11	-	2622	7	FSM	ENSMUSG00000044066.15	ENSMUST00000050611.14	4804	7	6	2176	6	-2176	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_3	29.8756682863422	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGCAGATAAAATGTGTTG	3061	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20199412	20179212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_20179482_20180423_20180595_20186005_20186103_20188465_20188589_20189195_20190699_20191885_20192239_20199306
tx.22920	chr4	+	696	3	NIC	ENSMUSG00000085399.8	novel	1015	5	NA	NA	6	-21	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAATTTTTTATATGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114766459	114779143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_114766856_114773385_114773508_114778965
tx.22921	chr4	+	1565	3	ISM	ENSMUSG00000034210.15	ENSMUST00000132306.2	2368	4	-53	7173	-17	-7173	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	142	junction_2	18	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAACAAACAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115594923	115603956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_115596038_115597588_115597738_115603654
tx.22922	chr4	+	2260	2	ISM	ENSMUSG00000034210.15	ENSMUST00000132306.2	2368	4	-39	12381	-3	-12381	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGCTTAGAGAAGTTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115594937	115598748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_115596038_115597588
tx.22923	chr4	+	506	4	NIC	ENSMUSG00000028703.15	novel	584	5	NA	NA	-30	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	118.797680486148	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTATAATGCTCAAATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115932629	115940250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_115932805_115936585_115936673_115937745_115937817_115940077
tx.22924	chr4	+	1136	6	ISM	ENSMUSG00000028700.15	ENSMUST00000106494.3	2226	21	4676	-407	158	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	347	junction_5	41.2960046493604	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGGTGTATTTTGTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116013303	116017041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_116013419_116015089_116015155_116015348_116015394_116015619_116015756_116016179_116016290_116016376
tx.22925	chr4	+	414	2	NNC	ENSMUSG00000085920.2	novel	434	2	NA	NA	351	26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGGTGCTGATTGCTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116033793	116034955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_116033912_116034659
tx.22926	chr4	-	2206	12	FSM	ENSMUSG00000028538.13	ENSMUST00000106410.8	2225	12	24	-5	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_11	18.1899981599189	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCTGTTGTTTTCTCTGA	1886	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117992087	117789349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_117790334_117797206_117797354_117797550_117797698_117815624_117815812_117816271_117816368_117817194_117817259_117821526_117821622_117871901_117871995_117889036_117889080_117911846_117911895_117964745_117964891_117991930
tx.22927	chr4	-	1241	2	NIC	ENSMUSG00000033326.16	novel	3279	19	NA	NA	1	-27337	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATACACAAAATCCAAGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118036850	118033584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_118034774_118036798
tx.22928	chr4	-	1663	7	ISM	ENSMUSG00000033295.15	ENSMUST00000124758.2	4808	25	24021	-28	-1254	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	420	junction_6	38.3220998032902	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACATAAAAATATTTTTTTT	7605	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118069192	118066178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_118067087_118067565_118067702_118067813_118067969_118068197_118068324_118068555_118068683_118068896_118069076_118069160
tx.22929	chr4	+	854	7	FSM	ENSMUSG00000006395.17	ENSMUST00000106393.8	843	7	-11	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.6249253283145	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCATATGTGTATATTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118217184	118219941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_118217429_118218812_118218928_118219070_118219150_118219237_118219288_118219387_118219458_118219559_118219695_118219780
tx.2293	chr11	-	2778	3	FSM	ENSMUSG00000044066.15	ENSMUST00000162811.2	2788	3	11	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_1	11	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAGCTCAGTTGACT	3055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20199418	20188385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_20190699_20191885_20192239_20199306
tx.22930	chr4	-	2069	4	ISM	ENSMUSG00000033253.19	ENSMUST00000075406.12	10965	72	56	38117	56	-11727	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	4.54606056566195	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACAAAAAAACAAAAACC	3319	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118266414	118258056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_118259771_118260017_118260192_118262622_118262749_118266359
tx.22931	chr4	+	1197	7	ISM	ENSMUSG00000028641.17	ENSMUST00000081606.7	2820	15	10188	598	-1000	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	360	junction_2	46.5238887263546	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTTTGTTCCAAGAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119101216	119105572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_119101347_119101581_119101678_119102153_119102305_119103831_119103950_119104327_119104404_119104641_119104783_119105087
tx.22932	chr4	+	1481	3	FSM	ENSMUSG00000028641.17	ENSMUST00000127087.2	650	3	87	-918	87	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	452	junction_1	13.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTATGTGTGTGGTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119104145	119106169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_119104404_119104641_119104783_119105087
tx.22933	chr4	+	706	4	ISM	ENSMUSG00000066058.12	ENSMUST00000084309.12	924	5	1314	-6	1219	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCATCCTATCTGTTCCCA	4619	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119113924	119117058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_119114248_119114348_119114434_119116004_119116158_119116913
tx.22934	chr4	-	1604	5	FSM	ENSMUSG00000028637.17	ENSMUST00000238287.2	1789	5	-25	210	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	3.96074487943871	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTCTTGGCAGTTTATC	9717	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119272724	119250056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_119250855_119255364_119255437_119258196_119258348_119261270_119261462_119272332
tx.22935	chr4	-	3296	7	ISM	ENSMUSG00000049878.14	ENSMUST00000056635.13	6242	8	-10	6789	-10	-6789	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	168	junction_3	17.3557547292598	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	6454	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121072291	121009868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_121012195_121016388_121016526_121027814_121028018_121039802_121039936_121045411_121045494_121047300_121047456_121072031
tx.22937	chr4	-	2526	2	FSM	ENSMUSG00000043962.17	ENSMUST00000130477.2	578	2	-22	-1926	2	1926	multi-exon	FALSE	canonical	3	431	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAGTTATCAGACCCTTAA	6789	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126096438	126077931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_126080382_126096362
tx.22938	chr4	-	986	5	ISM	ENSMUSG00000028849.18	ENSMUST00000125981.8	2363	12	6461	0	-102	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_4	17.2481883106603	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACGTGTCCTTGGATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126127443	126125959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126126560_126126660_126126855_126126968_126127060_126127157_126127201_126127385
tx.22939	chr4	-	1226	7	ISM	ENSMUSG00000028849.18	ENSMUST00000125981.8	2363	12	5875	0	540	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	247	junction_5	23.5348441441385	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTACGTGTCCTTGGATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126128029	126125959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_126126560_126126660_126126855_126126968_126127060_126127157_126127201_126127385_126127440_126127685_126127791_126127890
tx.2294	chr11	-	2166	4	FSM	ENSMUSG00000044066.15	ENSMUST00000109596.8	2171	4	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	18.3726850393609	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGTAGCTCAGTTGACT	3060	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20199413	20188385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_20188589_20189195_20190699_20191885_20192239_20199306
tx.22940	chr4	+	472	2	Intergenic	novelGene_1026	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAAACTTTTTTGTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126634141	126635298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_126634383_126635067
tx.22941	chr4	+	672	3	NNC	ENSMUSG00000028830.15	novel	350	3	NA	NA	-15	-11692	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_2	3.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTAATTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126647321	126670435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_126647397_126650691_126650862_126670008
tx.22942	chr4	+	490	2	NNC	ENSMUSG00000042388.15	novel	2901	10	NA	NA	-3164	-13966	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGCACTTGGGAGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127093934	127094581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_127094130_127094286
tx.22943	chr4	-	679	3	NNC	ENSMUSG00000087459.9	novel	615	4	NA	NA	-189	-1120	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCATCCATCATGCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128058241	128028435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_128028703_128029765_128029841_128057904
tx.22944	chr4	-	1635	2	ISM	ENSMUSG00000061894.16	ENSMUST00000084276.12	3962	4	1782	1836	1782	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATGTCTTTACAAATGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128481973	128479167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_128480638_128481808
tx.22945	chr4	-	487	2	Intergenic	novelGene_1028	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCAGTGTCTGCAATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129019729	129015985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_129016337_129019593
tx.22946	chr4	-	691	3	ISM	ENSMUSG00000040928.16	ENSMUST00000117350.2	2241	5	-9	4885	-9	-253	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_2	19	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAAAATCCTGCCTCCCTT	1095	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129083428	129075845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_129076326_129077393_129077511_129083334
tx.22947	chr4	+	462	2	NNC	ENSMUSG00000087575.8	novel	412	2	NA	NA	-578	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGGTGTCAATCAAGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129156944	129158812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_129157134_129158539
tx.22948	chr4	+	2758	4	ISM	ENSMUSG00000001333.10	ENSMUST00000102599.4	2042	5	5543	-821	5529	821	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_3	3.2659863237109	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTATTGGTCTATTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129186952	129203173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_129188170_129200134_129200260_129200420_129200498_129201834
tx.22949	chr4	+	754	2	Intergenic	novelGene_1030	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTATTTATTTATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129254024	129344711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_129254676_129344608
tx.2295	chr11	-	1676	7	ISM	ENSMUSG00000020142.13	ENSMUST00000109594.8	3926	8	-12	4227	-12	-4202	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	286	junction_3	12.0646407139026	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCCAGTAGACCTGGTGC	7749	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20282725	20256406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_20256601_20257891_20258087_20258403_20258638_20263915_20264083_20268659_20268723_20270191_20270235_20281945
tx.22950	chr4	+	476	2	Intergenic	novelGene_1031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTTCTGAAGGTTGTAT	364	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129288094	129298877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_129288198_129298504
tx.22951	chr4	-	1432	3	ISM	ENSMUSG00000028790.14	ENSMUST00000066257.6	3738	9	22206	1047	-6270	-1047	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	707	junction_2	33.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAATCAAAGTAAATGTGA	10014	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129613883	129608658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_129609980_129612875_129612935_129613831
tx.22952	chr4	+	746	2	ISM	ENSMUSG00000028788.15	ENSMUST00000165853.2	3382	6	25755	1621	7312	-1596	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2484	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAACAAAAAAAACCAACA	NA	False	NA	-61	True	NA	NA	NA	129740255	129742175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_129740333_129741506
tx.22953	chr4	+	1277	4	FSM	ENSMUSG00000028580.16	ENSMUST00000122847.2	1273	4	-11	7	-4	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	442	junction_3	83.2119115404893	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GATAAGGAAAAAAAGAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390665	130446185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_130390779_130396235_130396610_130428352_130428422_130445464
tx.22954	chr4	+	5334	22	NIC	ENSMUSG00000028580.16	novel	5389	22	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	218	junction_8	114.255134797804	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTACTGCTCTCACTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390680	130508875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_130390779_130396235_130396610_130428352_130428422_130445464_130445574_130446483_130446663_130455308_130455476_130457588_130457860_130468773_130468868_130471000_130471106_130474288_130474441_130476722_130476862_130478736_130478881_130479886_130480184_130481252_130481490_130490064_130490333_130491375_130491506_130493231_130493361_130496126_130496265_130499182_130499309_130499939_130500062_130501722_130501916_130507082
tx.22955	chr4	+	537	2	Intergenic	novelGene_1037	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATGAATCAACCAGCCAGT	3928	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130685174	130697310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_130685524_130697122
tx.22956	chr4	-	678	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085804.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACGTTCCCTGCCTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130702540	130697042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_130697195_130701955_130701999_130702057
tx.22957	chr4	+	502	3	NNC	ENSMUSG00000085804.2	novel	607	4	NA	NA	500	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGGCTGATGGGGTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130702600	130728650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_130702899_130708978_130709050_130728517
tx.22958	chr4	+	1277	3	NNC	ENSMUSG00000085804.2	novel	607	4	NA	NA	500	43717	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTTGGTCAAGGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130702600	130772367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_130702899_130708978_130709050_130771459
tx.22959	chr4	+	391	3	ISM	ENSMUSG00000085804.2	ENSMUST00000143967.2	607	4	6830	0	6830	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGGCTGATGGGGTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130708930	130728650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_130709050_130721927_130722067_130728517
tx.2296	chr11	-	1859	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000078965.6	novel	1002	1	NA	NA	-110845	195	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAAGCCTTTAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20396858	20284816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_20286086_20396268
tx.22960	chr4	+	856	5	ISM	ENSMUSG00000028886.16	ENSMUST00000135299.8	1138	10	52	24176	-7	-22387	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_3	3.26917420765551	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGCCCATACACAGAAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132366349	132398018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_132366467_132384003_132384100_132389205_132389250_132394465_132394546_132397499
tx.22961	chr4	-	1268	8	ISM	ENSMUSG00000028860.14	ENSMUST00000030674.8	1951	15	5731	6	5670	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1.88441513689613	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACTGACTGCTTAACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132984693	132980406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_132980620_132980765_132980972_132982843_132982944_132983044_132983124_132983352_132983512_132983798_132983896_132984175_132984343_132984446
tx.22962	chr4	-	1765	4	ISM	ENSMUSG00000012117.14	ENSMUST00000105887.8	2038	9	-6	22742	-6	-12741	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_3	11.115554667022	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133728188	133720245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_133721616_133724132_133724250_133727579_133727705_133728035
tx.22963	chr4	-	529	3	ISM	ENSMUSG00000050966.10	ENSMUST00000051674.3	3505	4	-35	4600	-35	18	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGATCCAAAGGAGACAGG	8215	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133746187	133735240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_133735407_133745363_133745561_133746021
tx.22964	chr4	-	708	3	NNC	ENSMUSG00000050890.16	novel	1039	2	NA	NA	6	636	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	39	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTCTGTTCATATGTGGT	4311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134014544	134010248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_134010582_134011556_134011859_134014471
tx.22965	chr4	-	1885	2	ISM	ENSMUSG00000050890.16	ENSMUST00000061234.14	4686	3	-18	7948	-18	624	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTTCTAGTAGCTCTCTG	3631	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134015224	134010260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_134011859_134014937
tx.22966	chr4	-	728	3	NNC	ENSMUSG00000028838.12	novel	667	6	NA	NA	-17705	-20916	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGTCTCATGTGTTGTTA	741	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134128866	134110931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_134111233_134114343_134114640_134128735
tx.22967	chr4	+	1694	11	FSM	ENSMUSG00000037366.15	ENSMUST00000105869.9	2248	11	46	508	-4	-508	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_4	4.79687398208458	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGCTGAGTTCTCTCTC	1825	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134123676	134153295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_134123736_134130280_134130416_134131403_134131555_134132316_134132414_134138214_134138284_134139077_134139217_134140652_134140767_134145352_134145445_134147179_134147351_134149688_134149844_134152783
tx.22968	chr4	+	888	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087343.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGAGGCCTGTTTGTCTTG	8493	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134173050	134176568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_134173238_134173675_134173823_134176014
tx.22969	chr4	+	1674	5	NNC	ENSMUSG00000028801.15	novel	1507	9	NA	NA	28925	-99	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	6.02079728939615	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCGGGTTCTTTGTGATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135252222	135265015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_135252300_135252730_135252843_135256802_135256969_135260949_135261141_135263887
tx.2297	chr11	+	1619	2	FSM	ENSMUSG00000049800.14	ENSMUST00000109586.3	5515	2	-2	3898	-2	58	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATATATATCTATATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20581976	20599123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_20582274_20597801
tx.22970	chr4	+	1391	2	NNC	ENSMUSG00000028801.15	novel	2380	9	NA	NA	39344	-105	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAGAAGCCGGGTTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135262641	135265009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_135262911_135263887
tx.22971	chr4	+	1807	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00002075369.1	novel	101	1	NA	NA	-6163	406	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACCTCGTGTGTCTCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135304895	135311565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_135305168_135310030
tx.22972	chr4	+	1781	9	NIC	ENSMUSG00000041351.17	novel	3168	23	NA	NA	1526	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	35	junction_6	32.289462290351	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGGAGTTAAGAACAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137447708	137457173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_137447743_137449136_137449269_137452002_137452113_137452860_137452975_137454262_137454387_137454987_137455091_137455539_137455675_137455838_137455880_137456185
tx.22973	chr4	+	1717	8	ISM	ENSMUSG00000041351.17	ENSMUST00000097837.11	3168	23	14302	0	-2165	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_5	19.233262004843	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGGAGTTAAGAACAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137449134	137457172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_137449269_137452002_137452113_137452860_137452975_137454262_137454387_137454987_137455091_137455570_137455675_137455838_137455880_137456185
tx.22974	chr4	+	3291	13	FSM	ENSMUSG00000028759.14	ENSMUST00000030541.13	3311	13	-2	22	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	22.3320895176027	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGAACTACAGCTTAGTG	4563	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137943935	137970459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_137944052_137948836_137949035_137949399_137949500_137950800_137950961_137953199_137953360_137955954_137956099_137956990_137957069_137957674_137957827_137961553_137961645_137964458_137964619_137966847_137966960_137967931_137968049_137968756
tx.22975	chr4	+	674	2	FSM	ENSMUSG00000046447.4	ENSMUST00000050918.4	4444	2	801	2969	801	-2969	multi-exon	FALSE	canonical	3	239	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCAGTTGCAGCTATTTG	6545	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138182425	138184465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_138182663_138184028
tx.22976	chr4	+	973	5	ISM	ENSMUSG00000028750.13	ENSMUST00000124660.7	737	6	-37	7314	-37	-7314	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.08972473588517	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGTTGACTTTGCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138452598	138463691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_138452800_138453041_138453169_138458834_138458936_138461572_138461718_138463292
tx.22977	chr4	+	1123	2	ISM	ENSMUSG00000028750.13	ENSMUST00000124660.7	737	6	-22	17027	-22	-17027	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACTGCTTTAAAAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138452613	138453978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_138452800_138453041
tx.22978	chr4	-	1966	5	NIC	ENSMUSG00000041193.16	novel	2131	6	NA	NA	-7	-7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	9	junction_2	34.679785178112	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCCTGAATTCACATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138590767	138526566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_138527973_138528662_138528770_138533495_138533546_138546310_138546427_138590480
tx.22979	chr4	+	1293	7	ISM	ENSMUSG00000041143.17	ENSMUST00000050949.9	3318	17	285	60682	281	7765	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	8.09835374217089	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGGCTCCTTGTAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138700500	138725796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_138700599_138704518_138704634_138710931_138711077_138712442_138712562_138717852_138718032_138723708_138723884_138725334
tx.2298	chr11	-	1447	2	ISM	ENSMUSG00000049659.16	ENSMUST00000177543.8	3082	8	-109	40710	25	-17825	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAGAAAGCTGACTAAT	9285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20691564	20676451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_20677640_20691305
tx.22980	chr4	-	407	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041143.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATTTTGTTCGGCACACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138726923	138725961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_138726178_138726732
tx.22981	chr4	+	3409	23	FSM	ENSMUSG00000078517.13	ENSMUST00000042096.15	4706	23	-12	1309	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	332	junction_13	34.6303979591618	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCTTGTCTCTTGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139079908	139103238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_139080029_139081471_139081597_139082122_139082189_139082402_139082497_139084813_139084943_139086550_139086678_139087340_139087491_139087767_139087936_139088190_139088263_139088572_139088636_139089406_139089530_139090476_139090574_139090967_139091091_139092505_139092706_139092828_139092979_139093685_139093848_139094404_139094525_139097185_139097324_139098234_139098409_139098906_139099118_139101119_139101205_139102390_139102521_139102656
tx.22982	chr4	+	826	4	ISM	ENSMUSG00000066036.15	ENSMUST00000165860.8	15798	106	101819	-3	2098	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	416	junction_3	5.79271573232759	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGTCTAGCTGCTGCTTGC	2332	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139209788	139216844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_139209994_139212595_139212687_139213295_139213459_139216477
tx.22983	chr4	+	1850	4	ISM	ENSMUSG00000028737.16	ENSMUST00000146309.8	4142	15	20570	0	20355	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	214	junction_3	23.6126143312331	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATATTTTGATCGTGTGT	7167	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139370774	139376998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_139370854_139371422_139371545_139372289_139372409_139375468
tx.22984	chr4	+	1214	4	NNC	ENSMUSG00000086164.2	novel	594	3	NA	NA	-1704	355	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCAATTATTTTGGAAGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139868479	139872299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_139868906_139870344_139870589_139870791_139870952_139871915
tx.22985	chr4	+	864	4	NNC	ENSMUSG00000086164.2	novel	594	3	NA	NA	-957	360	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTTGGAAGCACCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139869226	139872304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_139869298_139870344_139870589_139870791_139870952_139871915
tx.22986	chr4	+	1748	3	ISM	ENSMUSG00000028919.12	ENSMUST00000006618.9	3414	17	11109	64	7052	-64	intron_retention	FALSE	canonical	3	67	junction_2	3.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACATCTTCCCTGTTTTG	3886	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140981288	140984811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_140981760_140982011_140982092_140983614
tx.22987	chr4	+	3981	17	FSM	ENSMUSG00000006445.4	ENSMUST00000006614.3	3913	17	-68	0	-68	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_7	17.9965274428152	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGCTTTCATTCCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141028482	141056695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_141028746_141033824_141033893_141035715_141036392_141043897_141044054_141044181_141044515_141045792_141045909_141046233_141046388_141047804_141047905_141048527_141048584_141048775_141048902_141049012_141049202_141049373_141049436_141049513_141049724_141049896_141050047_141050723_141050918_141051542_141051699_141055723
tx.22988	chr4	+	1418	7	FSM	ENSMUSG00000006218.5	ENSMUST00000006380.5	1433	7	14	1	14	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_5	7.90393713425292	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAACTTGACCTGGTCTT	7200	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141095544	141111485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_141095636_141106988_141107105_141107629_141107666_141107912_141108007_141109637_141109821_141110054_141110166_141110698
tx.22989	chr4	+	1273	3	ISM	ENSMUSG00000006218.5	ENSMUST00000006380.5	1433	7	13915	1	13915	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAACTTGACCTGGTCTT	2343	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141109445	141111485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_141109821_141110054_141110166_141110698
tx.2299	chr11	-	1265	4	FSM	ENSMUSG00000042363.15	ENSMUST00000144441.8	913	4	407	-759	407	759	multi-exon	FALSE	canonical	3	309	junction_3	21.6384431561566	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGGAACTTTTGTTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20780348	20775590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_20776516_20779268_20779447_20780037_20780127_20780275
tx.22990	chr4	-	749	5	NIC	ENSMUSG00000006216.11	novel	2370	20	NA	NA	-2986	-4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_2	45.1497508298772	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTAGTGTCCCCTCTCC	4149	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141135654	141131667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_141131944_141132063_141132151_141134399_141134534_141135114_141135329_141135616
tx.22991	chr4	-	2204	4	ISM	ENSMUSG00000006219.13	ENSMUST00000006381.11	3101	9	13500	4	11745	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1308	junction_2	120.63811816982	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCCTTGTGTCTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141312035	141303376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141305255_141308293_141308412_141310364_141310544_141312006
tx.22992	chr4	+	898	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028917.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAAGCCGGGCAGTGGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141350539	141354586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_141350591_141353739
tx.22993	chr4	-	1472	3	ISM	ENSMUSG00000040697.11	ENSMUST00000038014.11	5969	15	239	23342	239	-465	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_2	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTAGGGAGTTTGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141517963	141510841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_141512066_141516199_141516385_141517900
tx.22994	chr4	-	1033	3	NNC	ENSMUSG00000110067.3	novel	249	2	NA	NA	228927	-46429	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGACATGTCCTTGATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142571409	142371439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_142372174_142557065_142557224_142571268
tx.22995	chr4	-	486	2	ISM	ENSMUSG00000057637.14	ENSMUST00000105778.8	7304	10	100926	1655	82956	-1655	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTTCGTGCTTCTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142838349	142835615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_142835956_142838203
tx.22996	chr4	-	2692	2	NNC	ENSMUSG00000057637.14	novel	7304	10	NA	NA	61837	-20081	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTGAAAGGACTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142859468	142854041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_142855545_142858279
tx.22997	chr4	+	3594	5	FSM	ENSMUSG00000046862.15	ENSMUST00000059790.11	3886	5	289	3	-257	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_2	51.5866988670529	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACCTCTGTTTCACTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143139284	143147658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_143139662_143141918_143141984_143143209_143143523_143143942_143144531_143145407
tx.22998	chr4	+	1387	2	Intergenic	novelGene_1057	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATTATTGACGCCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143710577	143712028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_143710622_143710685
tx.22999	chr4	+	1405	7	FSM	ENSMUSG00000066026.15	ENSMUST00000171001.8	1349	7	-59	3	-59	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	68.47627326308	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCCTTCGTTCACGTGTT	5637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144619337	144654212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_144619481_144620154_144620280_144645220_144645365_144645954_144646075_144646410_144646650_144650475_144650602_144653704
tx.23	chr1	+	1890	14	NNC	ENSMUSG00000025911.15	novel	3239	14	NA	NA	14	-163	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	25.1132346823944	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTCTGTTTCATAAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9618293	9646963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_9618377_9620131_9620170_9621941_9621983_9623147_9623206_9623542_9623698_9623847_9624045_9625762_9625841_9627224_9627331_9628357_9628511_9630333_9630433_9633733_9633813_9634021_9634119_9637005_9637164_9646415
tx.230	chr1	-	1798	2	ISM	ENSMUSG00000026098.14	ENSMUST00000142922.2	3054	5	-47	17529	1	1523	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TATAAAAACAAACAAACAAA	6056	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53336173	53319582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_53321252_53336044
tx.2300	chr11	-	1341	5	FSM	ENSMUSG00000042363.15	ENSMUST00000047028.9	3362	5	11	2010	11	764	multi-exon	FALSE	canonical	3	286	junction_4	26.8269920043228	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTTTGTTTGCATTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20781045	20775585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_20776516_20779268_20779447_20780037_20780127_20780275_20780348_20780973
tx.23000	chr4	-	3817	10	FSM	ENSMUSG00000028599.11	ENSMUST00000030336.11	3818	10	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_7	11.2546286774228	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTTGCTTATCTGTTTGT	7832	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144973440	144940033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_144942671_144946298_144946507_144949523_144949559_144950072_144950151_144950821_144951055_144951381_144951476_144951899_144952053_144954037_144954167_144955573_144955677_144973293
tx.23001	chr4	+	850	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081595.2	novel	748	1	NA	NA	1	13037	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTAGCCACTGTGAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145995346	146009130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_+_145995513_146008446
tx.23002	chr4	+	3897	6	NIC	ENSMUSG00000067916.10	novel	2813	7	NA	NA	29	1159	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_4	82.4101935442455	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGCTGGATTAGGCCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147216523	147266195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_147216647_147219028_147219122_147224494_147224577_147260303_147260362_147261203_147261331_147262781
tx.23003	chr4	-	1665	8	ISM	ENSMUSG00000019055.16	ENSMUST00000019199.14	3243	19	15611	307	-60	-307	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_3	15.8088066389256	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATGAGAGATGCCTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148005613	147994516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_147995332_147997676_147997803_148000253_148000401_148001761_148001867_148002590_148002657_148003236_148003351_148004625_148004768_148005463
tx.23004	chr4	-	264	3	NNC	ENSMUSG00000019055.16	novel	3243	19	NA	NA	0	-342	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTGGCTCTCAGCCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148021182	148016487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_148016536_148017187_148017280_148021058
tx.23005	chr4	-	681	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041556.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGAGACTGGGTCCCCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148254242	148249953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_148250311_148250640_148250829_148254106
tx.23006	chr4	-	2571	3	FSM	ENSMUSG00000047719.3	ENSMUST00000156686.2	576	3	-4	-1991	-4	-3	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	43.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGTCAGTGGCTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148529222	148518954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148521100_148528384_148528587_148528998
tx.23007	chr4	-	509	2	Intergenic	novelGene_1062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCCTTGGCAAGTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148794446	148793593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_148793910_148794253
tx.23008	chr4	-	1927	3	ISM	ENSMUSG00000028992.14	ENSMUST00000030845.13	1238	5	27	3214	1	2659	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_2	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAATTATTTTATGTATGT	1679	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149569628	149556229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_149557926_149558884_149559053_149569565
tx.23009	chr4	-	250	2	ISM	ENSMUSG00000028992.14	ENSMUST00000030845.13	1238	5	9	5868	9	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGAGCGGCGACCCAGCTA	1661	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149569646	149558883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_149559053_149569565
tx.2301	chr11	-	2074	10	FSM	ENSMUSG00000001891.17	ENSMUST00000060895.6	2044	10	-30	0	-30	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	305	junction_7	61.1714853284106	423	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGCTGTCTAGTGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21321231	21271672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_21272130_21273198_21273304_21278870_21279114_21279724_21279923_21280833_21281132_21282415_21282550_21283624_21283811_21303348_21303457_21304278_21304407_21321014
tx.23010	chr4	+	824	3	ISM	ENSMUSG00000028988.14	ENSMUST00000105692.2	634	4	592	-306	592	306	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_2	8	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGCTTTGCAATATTTAT	828	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149630165	149649271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_149630289_149630858_149630950_149648661
tx.23011	chr4	-	432	3	NIC	ENSMUSG00000039936.19	novel	824	3	NA	NA	-34	31	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTCTTGCCACAGCGATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149783096	149758190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_149758419_149758532_149758652_149783011
tx.23012	chr4	+	988	2	FSM	ENSMUSG00000062064.7	ENSMUST00000133379.2	606	2	0	-382	0	382	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGGATGAATAAATAGATA	1362	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150242284	150243539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_150242665_150242931
tx.23013	chr4	+	1951	7	FSM	ENSMUSG00000039713.18	ENSMUST00000140085.2	2792	7	838	3	745	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_3	4.83045891539648	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGAAAGAGTCATGCGCTT	2413	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152192930	152199848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_152192998_152193134_152193255_152196564_152196698_152196779_152196896_152196975_152197158_152198254_152199026_152199286
tx.23014	chr4	+	352	3	NNC	ENSMUSG00000039713.18	novel	2792	7	NA	NA	748	2276	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	78	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGAATGTGTATATCTTTT	2416	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152192933	152194942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_152192998_152193134_152193255_152194774
tx.23015	chr4	-	1133	2	Intergenic	novelGene_1071	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCAAGAGAGTGTTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153642477	153638636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_153639557_153642264
tx.23016	chr4	-	1998	7	NNC	ENSMUSG00000029027.10	novel	2093	7	NA	NA	0	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_5	13.1497781983829	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGTCAAAATTTTTTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154059514	154048903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_154050071_154053549_154053651_154054397_154054569_154056037_154056118_154057236_154057398_154059025_154059153_154059323
tx.23017	chr4	-	1439	3	ISM	ENSMUSG00000029027.10	ENSMUST00000030893.3	2093	7	5013	0	2296	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATGTCAAAATTTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154054570	154048905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_154050071_154053549_154053651_154054397
tx.23018	chr4	-	1134	2	ISM	ENSMUSG00000029026.18	ENSMUST00000097762.11	2205	10	36498	-231	24647	231	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGTGGGGTCAGCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154145132	154142737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_154143784_154145044
tx.23019	chr4	+	312	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039410.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATGTAAAGTTCTTATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154475071	154476904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_154475181_154476701
tx.2302	chr11	-	499	3	ISM	ENSMUSG00000020321.17	ENSMUST00000239073.2	1958	9	12661	550	456	-455	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1348	junction_1	98.5	1385	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTCAGACTCTGTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21509273	21507241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_21507569_21508461_21508552_21509191
tx.23020	chr4	+	2302	2	FSM	ENSMUSG00000084987.2	ENSMUST00000144347.2	387	2	60	-1975	-58	1975	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCCTGTGTGTCTCATGT	2986	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154685713	154690634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_154685865_154688483
tx.23021	chr4	+	635	2	FSM	ENSMUSG00000078490.11	ENSMUST00000129481.2	689	2	58	-4	-10	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTGAATGTGACCTGGA	2322	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155493704	155500448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155494028_155500136
tx.23022	chr4	-	504	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082429.2	novel	391	1	NA	NA	-236	54	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAGAAGGAGGAGGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155587399	155586718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr4_-_155587197_155587373
tx.23023	chr4	+	2820	11	NIC	ENSMUSG00000029063.17	novel	3152	12	NA	NA	-3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	33	junction_1	208.120662116956	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAGTTAAGTAACAGCTTT	9695	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155648279	155675454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_155648437_155663767_155663852_155668593_155668724_155669608_155669718_155669820_155669907_155671185_155671289_155671813_155671954_155672141_155672242_155672317_155672476_155673066_155673150_155673784
tx.23024	chr4	+	4103	9	FSM	ENSMUSG00000042202.16	ENSMUST00000118607.2	2166	9	-59	-1878	-59	1107	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_6	4.43705983732471	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGATTTGGGGTATACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155686341	155705654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_155686620_155694295_155694777_155694957_155695094_155696072_155696201_155697073_155697195_155700025_155700080_155700639_155700713_155702071_155702218_155702968
tx.23025	chr4	+	1272	7	NNC	ENSMUSG00000023286.17	novel	1309	7	NA	NA	-4	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	66	junction_4	406.426602639804	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAATACTCTGTGTGTGTT	772	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156028302	156042166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_156028471_156033463_156033595_156035928_156035970_156039690_156039794_156039898_156040018_156040824_156040906_156041537
tx.23026	chr4	+	405	2	ISM	ENSMUSG00000029075.7	ENSMUST00000143576.2	1090	7	2248	3	1855	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTCTGTGACTGGCACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156100560	156101053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_156100731_156100818
tx.23027	chr4	+	2622	9	NIC	ENSMUSG00000059939.14	novel	2528	10	NA	NA	-4	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	69	junction_5	54.3310166939659	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTTGAGGTCATGATGTC	8251	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194434	156211722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_156194481_156198345_156198459_156201466_156201561_156203620_156203697_156206389_156206486_156206807_156206874_156207991_156208127_156208432_156208580_156209873
tx.23028	chr4	+	1284	3	ISM	ENSMUSG00000059939.14	ENSMUST00000072554.13	2528	10	1	9126	1	-1397	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_1	54	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACAATAATAACAGTAAATGA	8256	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194439	156202596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_156194481_156198345_156198459_156201466
tx.23029	chr4	+	2518	9	NNC	ENSMUSG00000059939.14	novel	2528	10	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	72.1871482675414	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTTGAGGTCATGATGTC	8256	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156194439	156211722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_156194481_156198345_156198459_156201466_156201561_156203620_156203697_156206389_156206486_156206807_156206874_156207991_156208127_156208432_156208459_156209851
tx.2303	chr11	-	1289	9	FSM	ENSMUSG00000020321.17	ENSMUST00000239073.2	1958	9	119	550	119	-455	multi-exon	FALSE	canonical	3	1237	junction_4	96.8522553944925	6417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTCAGACTCTGTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21521815	21507241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_21507569_21508461_21508552_21509191_21509306_21509698_21509876_21512864_21512988_21514040_21514217_21515823_21515921_21516619_21516719_21521729
tx.23030	chr4	-	2881	12	ISM	ENSMUSG00000041936.19	ENSMUST00000105574.9	7193	35	14449	0	2278	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	284	junction_11	61.9022156107571	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGGACTGTGTTTGTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156255909	156249746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_156251111_156251367_156251472_156251738_156251964_156253189_156253278_156253359_156253553_156253676_156253794_156254226_156254339_156254522_156254688_156254771_156254869_156255035_156255171_156255257_156255488_156255858
tx.23031	chr5	-	755	3	Intergenic	novelGene_1077	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTTTGCTGTGATCGCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3380288	3339980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_3340456_3364586_3364785_3380206
tx.23032	chr5	-	646	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040274.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCCGCTGGTGATGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3393390	3340178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_3340456_3364586_3364785_3380206_3380285_3393297
tx.23033	chr5	+	601	3	ISM	ENSMUSG00000005907.15	ENSMUST00000006061.13	4433	23	39308	129	203	-129	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGGACCTCATTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3685373	3687101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_3685513_3685779_3685911_3686770
tx.23034	chr5	+	460	2	FSM	ENSMUSG00000005907.15	ENSMUST00000199213.2	487	2	165	-138	165	-131	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGGTGGACCTCATTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3685779	3687099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_3685911_3686770
tx.23035	chr5	-	2365	6	NNC	ENSMUSG00000040351.12	novel	2572	19	NA	NA	-30983	-11075	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	26	junction_5	30.3934203405935	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGACTCTTTTTCATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3783115	3761625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_3763239_3772545_3772635_3777488_3777656_3779634_3779780_3782539_3782629_3782853
tx.23036	chr5	+	1563	3	NNC	ENSMUSG00000053178.6	novel	1368	2	NA	NA	8	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTACATTTATTTTGTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4242374	4247648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_4242419_4245994_4246201_4246335
tx.23037	chr5	-	945	2	Intergenic	novelGene_1080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAAGTATTTGGGATAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8053777	8045999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_8046846_8053678
tx.23038	chr5	-	2153	11	ISM	ENSMUSG00000002297.17	ENSMUST00000171808.8	2402	12	1322	0	1188	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	396	junction_3	43.2070596083557	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTCCTGAGAATAAAAATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8471394	8447010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_8448163_8449687_8449813_8453079_8453192_8453611_8453741_8454870_8454917_8455801_8455839_8458233_8458311_8458493_8458564_8460009_8460061_8462120_8462301_8471220
tx.23039	chr5	+	1482	12	NIC	ENSMUSG00000054099.12	novel	4467	12	NA	NA	6	-1231	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_2	16.2389186628557	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCAGCCACTTAGTACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8472878	8503505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_8473040_8474796_8474888_8477407_8477517_8478628_8478689_8480411_8480519_8490720_8490789_8492446_8492572_8493611_8493786_8497297_8497408_8499612_8499695_8502745_8502827_8503191
tx.23040	chr5	+	2118	14	ISM	ENSMUSG00000040584.9	ENSMUST00000047753.5	4997	28	-53	45412	-53	-20011	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_9	11.8421571679543	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTATTTGTGTGTATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8710023	8753163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_8710223_8710661_8710733_8714545_8714595_8724682_8724843_8733383_8733436_8735220_8735413_8736126_8736299_8744065_8744191_8748485_8748658_8751608_8751723_8751866_8751978_8752152_8752279_8752368_8752573_8752792
tx.23041	chr5	-	3703	18	FSM	ENSMUSG00000042508.17	ENSMUST00000071921.13	3806	18	36	67	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_6	37.7529760049699	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTTGAGCCATGCAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9211740	9168867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_9170139_9170349_9170495_9171084_9171463_9171781_9171938_9174441_9174528_9176539_9176750_9177956_9178109_9179147_9179377_9180367_9180478_9181275_9181309_9182455_9182614_9186065_9186143_9187125_9187241_9190385_9190481_9198899_9199023_9200375_9200493_9201797_9201919_9211613
tx.23042	chr5	-	665	4	FSM	ENSMUSG00000042508.17	ENSMUST00000185193.8	3029	4	-2	2366	1	1700	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_3	21.853044537445	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACCTGCTGCGGTAGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9211751	9198733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_9199023_9200375_9200493_9201797_9201919_9211613
tx.23043	chr5	+	332	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105705.2	novel	1107	2	NA	NA	863	87	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAATAAAAAAATTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11188108	11243644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_+_11188130_11243333
tx.23044	chr5	-	530	1	FSM	ENSMUSG00000062038.6	ENSMUST00000078246.6	319	1	-65	-146	-65	146	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGTACGGTCTTTATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13171798	13171268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_13171300_13171800
tx.23045	chr5	+	1056	4	Intergenic	novelGene_1082	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACATTTTAAATATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19258302	19299844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_19258442_19270311_19270406_19285910_19286025_19299135
tx.23046	chr5	-	2269	7	NIC	ENSMUSG00000039987.16	novel	2000	8	NA	NA	3	439	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_2	87.7884135609908	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTAGTTTAATTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21087072	20997860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_20999480_21006899_21007065_21010652_21010812_21012401_21012472_21018237_21018295_21060119_21060200_21086953
tx.23047	chr5	-	2382	2	Intergenic	novelGene_1083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAGAGAGAATGAATAGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23574722	23571193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_23573446_23574592
tx.23048	chr5	+	1453	9	ISM	ENSMUSG00000029004.16	ENSMUST00000196889.5	2061	13	3	7656	3	-6707	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	3.11247489949718	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTATCACTTGTCAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23639441	23683742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_23639782_23655149_23655335_23668013_23668129_23669700_23669931_23672105_23672187_23676745_23676805_23678478_23678652_23681483_23681523_23683511
tx.23049	chr5	-	537	3	NIC	ENSMUSG00000062604.12	novel	440	5	NA	NA	-14	-1303	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	29	junction_1	127	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGCTTTTTAAAAGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23880979	23821030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_23821389_23880717_23880773_23880855
tx.2305	chr11	+	344	3	ISM	ENSMUSG00000020319.10	ENSMUST00000020568.10	2792	18	312746	306	71582	-306	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	2.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATAATGTGTATGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21834980	21848683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_21835088_21836259_21836289_21848475
tx.23050	chr5	+	1806	4	FSM	ENSMUSG00000028999.16	ENSMUST00000112256.3	1761	4	-44	-1	-14	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	37.2051370407666	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTTTGGTTTTTATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23992694	24002056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_23992881_23993287_23993334_23999300_23999486_24000667
tx.23051	chr5	+	1478	6	NNC	ENSMUSG00000028999.16	novel	3363	14	NA	NA	-9	-4089	intron_retention	FALSE	canonical	1	2	junction_4	37.6542162313864	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGGCTTAGTTTTAGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23992699	24011079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_23992881_23993287_23993334_23999300_23999486_24005592_24005835_24006091_24006144_24010307
tx.23052	chr5	+	2255	2	ISM	ENSMUSG00000097180.6	ENSMUST00000181574.6	1375	4	1523	102	1519	-102	intron_retention	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGAGCTGTGCTTTTAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24057117	24059934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_24057154_24057715
tx.23054	chr5	+	619	3	ISM	ENSMUSG00000028962.15	ENSMUST00000115047.3	4264	22	11657	2	334	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_2	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTAGGCTTGGTCTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24645077	24645943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_24645249_24645401_24645576_24645669
tx.23055	chr5	-	1355	12	ISM	ENSMUSG00000028944.15	ENSMUST00000076306.12	2838	14	87301	836	0	192	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_11	38.9905688956947	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTACTTTTCATTTCAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25113450	25068581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_25068886_25071076_25071171_25074128_25074276_25076052_25076091_25076491_25076658_25078881_25079009_25080158_25080214_25081986_25082033_25083702_25083762_25085681_25085764_25094079_25094187_25113320
tx.23056	chr5	-	1105	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000105763.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGCTTAGGTTCTGCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25361009	25328852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_25329618_25360669
tx.23057	chr5	+	528	3	Intergenic	novelGene_1086	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTTGTTTTAATTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25704873	25709473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_25705025_25705574_25705645_25709166
tx.23058	chr5	+	2234	4	ISM	ENSMUSG00000045294.12	ENSMUST00000059155.11	2697	5	2213	1	-1090	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1125	junction_1	30.24345659257	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCTGTTGTATTCCTGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28278573	28283659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_28278670_28279479_28279647_28280059_28280160_28281788
tx.2306	chr11	+	1298	4	FSM	ENSMUSG00000049904.8	ENSMUST00000059319.8	1568	4	269	1	269	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_3	9.0921211313239	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGCTTATCTGTGTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22462356	22469233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_22462584_22467187_22467292_22467407_22467522_22468380
tx.23060	chr5	-	2588	8	ISM	ENSMUSG00000045302.14	ENSMUST00000074840.12	6300	9	81	4189	0	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	205	junction_7	29.9659670905758	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCAGCAGTCCTCTTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31117624	31112385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31113082_31113273_31113434_31113605_31113679_31115231_31115406_31115576_31115702_31115814_31115896_31116059_31116281_31116566
tx.23061	chr5	+	683	2	ISM	ENSMUSG00000053856.8	ENSMUST00000201740.4	581	4	12	2273	0	-2273	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTCCTTTTGACTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31265662	31266810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31265766_31266230
tx.23062	chr5	+	1829	2	ISM	ENSMUSG00000062761.8	ENSMUST00000202244.4	3045	13	24320	-5	11233	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	284	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTCTGGTCCTCCTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31634179	31639098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_31634224_31637313
tx.23063	chr5	-	1546	2	ISM	ENSMUSG00000053134.14	ENSMUST00000202421.2	3056	4	-216	5550	-174	-500	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGTTATTACTCCAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31684291	31679392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31680606_31683958
tx.23064	chr5	+	2112	4	FSM	ENSMUSG00000014956.16	ENSMUST00000202078.2	383	4	-17	-1712	-17	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	632.928291532479	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAACGTCTGAGTGATTAT	3057	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32616548	32650095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_32616752_32640769_32640809_32642602_32642675_32648297
tx.23065	chr5	+	548	7	ISM	ENSMUSG00000037426.19	ENSMUST00000139463.6	1219	8	-37	9009	-1	-19	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	38.3260862714795	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAATTTGCTGGCATCAGG	2025	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33021076	33036002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_33021166_33021920_33022044_33025317_33025406_33026164_33026212_33032625_33032712_33034413_33034498_33035971
tx.23066	chr5	+	1031	7	ISM	ENSMUSG00000037426.19	ENSMUST00000195980.5	1732	21	40074	5657	-443	535	internal_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_1	17.9783820802157	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCTGAGTTACATCCTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33061187	33075867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_33061256_33061618_33061681_33061802_33061877_33067800_33067871_33069552_33069590_33070443_33070565_33075268
tx.23067	chr5	-	1816	6	FSM	ENSMUSG00000037379.8	ENSMUST00000046186.8	2045	6	232	-3	-28	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.4142135623731	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGGTGACCTCCCACCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33375567	33371267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_33371997_33372892_33373068_33373676_33373869_33373940_33374165_33374587_33374808_33375291
tx.23068	chr5	-	2637	4	NIC	ENSMUSG00000019295.9	novel	2369	4	NA	NA	21	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_3	28.5773803324704	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATGTACTTCATTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33815222	33810563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_33811959_33812056_33812217_33812666_33813142_33814615
tx.23069	chr5	-	1008	6	ISM	ENSMUSG00000005299.7	ENSMUST00000005431.6	5272	14	34542	2644	5287	217	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	399	junction_4	30.0373101325668	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATTTTTAATTTTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33905619	33899660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_33899957_33900985_33901125_33902359_33902548_33903583_33903719_33904719_33904855_33905504
tx.2307	chr11	-	638	2	Intergenic	novelGene_150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGTCTTGGTTCCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22560579	22550330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_22550607_22560217
tx.23070	chr5	-	1275	8	ISM	ENSMUSG00000005299.7	ENSMUST00000005431.6	5272	14	30217	2644	962	217	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	350	junction_7	43.7996365654477	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATTTTTAATTTTCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33909944	33899660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_33899957_33900985_33901125_33902359_33902548_33903583_33903719_33904719_33904855_33905504_33905646_33906085_33906218_33909835
tx.23071	chr5	+	3800	15	FSM	ENSMUSG00000029106.15	ENSMUST00000114340.9	3761	15	-52	13	17	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	389	junction_14	43.2925501438664	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTTGTCTAAGGTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34731164	34789639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_34731258_34758667_34758883_34762033_34762197_34763171_34763324_34767535_34767617_34767833_34767984_34770631_34770776_34770862_34770962_34771527_34771705_34773906_34774159_34776693_34776796_34777388_34777479_34782622_34782780_34785758_34785858_34787813
tx.23072	chr5	-	536	2	ISM	ENSMUSG00000036553.17	ENSMUST00000129664.8	3411	12	16398	-7	16398	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATCTTCTAGGTGTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35857197	35854519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_35854913_35857054
tx.23073	chr5	+	945	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036553.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTGTGGTCATGGTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35856152	35859910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_35856270_35858551_35858760_35859290
tx.23074	chr5	-	1288	3	NNC	ENSMUSG00000029190.20	novel	2014	2	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	47	junction_1	14.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTGTATTATGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36853306	36828742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_36829428_36830091_36830587_36853198
tx.23075	chr5	-	1919	2	FSM	ENSMUSG00000029190.20	ENSMUST00000140653.2	2014	2	77	18	-10	-18	multi-exon	FALSE	canonical	2	76	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACAATTTTATTGTTAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36853291	36828760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_36830587_36853198
tx.23076	chr5	-	225	2	ISM	ENSMUSG00000039474.14	ENSMUST00000166339.8	3284	8	-56	16090	-56	-13696	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAGCAGGACAAGATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37146333	37139540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_37139642_37146209
tx.2308	chr11	+	564	2	NNC	ENSMUSG00000086256.2	novel	933	2	NA	NA	31	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGTTTGTAGCTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22567438	22568492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_22567831_22568320
tx.23082	chr5	+	613	5	ISM	ENSMUSG00000029176.14	ENSMUST00000031072.14	3854	28	109	25866	-5	-6688	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	360	junction_4	26.892145693492	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTATACCTTCCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52991462	52999273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_52991735_52993019_52993126_52996963_52997097_52999057_52999133_52999246
tx.23087	chr5	+	690	2	NNC	ENSMUSG00000029205.13	novel	550	2	NA	NA	-33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTGTTTGAGTTCAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66133205	66134669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_66133275_66134048
tx.23088	chr5	-	618	4	NNC	ENSMUSG00000029207.17	novel	629	4	NA	NA	23586	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	39	junction_3	30.8688984074406	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACATGTGTGTTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66752397	66619253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_66619510_66649400_66649516_66700804_66700961_66752306
tx.2309	chr11	-	777	2	Intergenic	novelGene_151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCTAGTTTCCCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22700280	22697462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_22698127_22700167
tx.23090	chr5	-	832	5	FSM	ENSMUSG00000072889.10	ENSMUST00000146761.2	798	5	-28	-6	8	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_4	15.8587515271537	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTATTGTTGGAAGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72717019	72707560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_72707766_72709985_72710096_72713514_72713689_72716356_72716612_72716931
tx.23091	chr5	+	321	2	FSM	ENSMUSG00000067219.10	ENSMUST00000197772.3	546	2	-46	271	1	-271	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCAGCGTTTTCATTGGC	2040	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72805138	72816207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_72805277_72816024
tx.23093	chr5	-	1924	13	ISM	ENSMUSG00000070733.14	ENSMUST00000101127.12	11340	63	-8	97880	-8	123	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	11.2875915155636	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTCATGTAGGTATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73413970	73275544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_73275929_73277160_73277260_73279206_73279300_73279555_73279725_73282025_73282107_73282857_73282938_73289813_73289911_73290588_73290729_73293664_73293719_73305359_73305566_73352328_73352457_73378250_73378416_73413742
tx.23094	chr5	+	4055	11	NIC	ENSMUSG00000051674.16	novel	1243	8	NA	NA	-8200	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	45	junction_1	34.4034881952397	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGATTTGTGGGGTCTT	8142	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73660010	73718130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_73660112_73668228_73668300_73668469_73668510_73677458_73677574_73679995_73680088_73688846_73688918_73691948_73692041_73701389_73701499_73712701_73712807_73714596_73714700_73714974
tx.23095	chr5	-	544	4	ISM	ENSMUSG00000029229.9	ENSMUST00000075452.7	9699	6	17625	8431	17172	4761	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	668	junction_3	26.4952825989835	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGCAGCCTTTGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75187810	75167079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_75167425_75171891_75171952_75172113_75172171_75187728
tx.23096	chr5	+	503	3	Intergenic	novelGene_1100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTGTTTGAGACTTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75475056	75476093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_75475108_75475548_75475608_75475700
tx.23097	chr5	+	1172	5	NNC	ENSMUSG00000005672.13	novel	5241	21	NA	NA	7	-9263	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	561.234075497916	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTCCCCATCTCTTTTTC	773	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75735621	75772346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_75735779_75767685_75767959_75769929_75770212_75771466_75771604_75772023
tx.23098	chr5	+	1725	5	NNC	ENSMUSG00000029233.16	novel	1747	6	NA	NA	-15	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.6475150877325	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCACGCCCTGGACTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76288137	76303321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_76288396_76295532_76295676_76297560_76297798_76301370_76301506_76302369
tx.23099	chr5	-	750	4	NNC	ENSMUSG00000029238.12	novel	2287	3	NA	NA	60	2864	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_3	15.3260852434302	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGTCTGTATACTTGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76452335	76416936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_76417402_76421805_76421891_76451270_76451350_76452214
tx.231	chr1	+	1847	4	FSM	ENSMUSG00000026097.10	ENSMUST00000027266.4	1910	4	-6	69	-6	-69	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_2	12.7104506432917	491	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTATTTTAAGTTTTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53336247	53349399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_53336348_53338130_53338312_53344613_53344766_53347985
tx.2310	chr11	-	2712	2	FSM	ENSMUSG00000051650.12	ENSMUST00000055549.4	2602	2	10	-120	10	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGTATAATAAGTGATACTC	3592	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22810478	22784744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_22787196_22810217
tx.23102	chr5	+	375	3	ISM	ENSMUSG00000036377.20	ENSMUST00000128112.8	583	4	19	18339	17	-18339	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGAGGGATCGGCTGGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76805548	76970389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_76805701_76907432_76907579_76970312
tx.23103	chr5	+	861	3	ISM	ENSMUSG00000036323.15	ENSMUST00000120550.2	2297	17	21943	-36	-324	36	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	287	junction_1	3	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTCGTGTGTGTGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77144496	77146699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_77144537_77145269_77145430_77146038
tx.23104	chr5	-	1316	3	FSM	ENSMUSG00000059325.15	ENSMUST00000081964.7	1261	3	-55	0	-55	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	12	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCATGGAGTCTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77263023	77234834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_77235664_77242712_77242870_77262693
tx.23106	chr5	+	876	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029245.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGCTTCAAGTTTATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84501203	84507204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_84501470_84506594
tx.23107	chr5	+	1998	2	Intergenic	novelGene_1103	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCTGGTCTGTGGTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85221967	85228979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_85222442_85227455
tx.23109	chr5	-	1655	16	NNC	ENSMUSG00000035898.14	novel	4177	29	NA	NA	9	-19392	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	31.7839931761606	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATTGTCTCTGGTCAGT	7097	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86320653	86288091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_86288296_86289406_86289486_86290263_86290332_86292193_86292338_86294933_86295001_86295663_86295741_86296727_86296791_86297868_86297973_86300425_86300550_86300684_86300808_86302212_86302294_86307062_86307175_86308137_86308255_86312548_86312651_86318413_86318477_86320526
tx.2311	chr11	+	1137	2	NNC	ENSMUSG00000092626.2	novel	663	2	NA	NA	937	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTGTGTACTTGATTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22809867	22811264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_22810580_22810839
tx.23111	chr5	-	596	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084111.5	novel	636	1	NA	NA	-37	55	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGAACCTAGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92288825	92288097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_92288162_92288293
tx.23112	chr5	+	712	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034826.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTCCTTCTGTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92582594	92583916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_92582842_92583451
tx.23113	chr5	+	270	2	ISM	ENSMUSG00000029381.17	ENSMUST00000172706.2	687	3	8346	342	-4884	-342	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	100	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCCACGAGCAGCATCGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93081611	93087972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_93081745_93087835
tx.23114	chr5	+	1512	5	ISM	ENSMUSG00000058013.12	ENSMUST00000201700.4	3478	9	-1	12055	0	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	719	junction_4	22.6867251933813	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATCATAGTACTTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93241295	93305562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_93241457_93287307_93287423_93296245_93296442_93302728_93302916_93304709
tx.23115	chr5	+	5027	10	FSM	ENSMUSG00000058013.12	ENSMUST00000074733.11	5028	10	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	652	junction_7	47.9165942028438	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTCTGTGTGCCCGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93241295	93322816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_93241457_93287307_93287423_93296245_93296442_93302728_93302916_93304709_93304872_93309008_93309106_93309982_93310152_93313107_93313241_93315358_93315547_93319197
tx.23116	chr5	+	4110	4	ISM	ENSMUSG00000058013.12	ENSMUST00000074733.11	5028	10	68686	1	13620	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	652	junction_1	39.3813266522205	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTCTGTGTGCCCGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93309981	93322816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_93310152_93313107_93313241_93315358_93315547_93319197
tx.23117	chr5	+	1276	3	ISM	ENSMUSG00000029385.15	ENSMUST00000149329.2	923	5	-413	2019	-19	1750	intron_retention	FALSE	canonical	3	45	junction_2	13.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCTTTGTTTTTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93416153	93419325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_93416619_93417123_93417262_93418652
tx.23118	chr5	-	893	4	ISM	ENSMUSG00000035325.17	ENSMUST00000182433.8	1195	7	7635	-1	-1579	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	742	junction_2	33.0689515339624	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTTAGTCTTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100513708	100509507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100510090_100511235_100511308_100511686_100511807_100513589
tx.23119	chr5	-	1776	7	ISM	ENSMUSG00000035325.17	ENSMUST00000094578.11	4228	28	-6	36843	-6	2951	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	714	junction_3	80.4749788581657	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCACTCCAGAAGAGGGCG	8102	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100564099	100546350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100547349_100550073_100550215_100551873_100551970_100553302_100553502_100555015_100555140_100555892_100555973_100563961
tx.2312	chr11	+	951	3	NNC	ENSMUSG00000092626.2	novel	663	2	NA	NA	939	20465	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGTCTCCTCATATCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22809869	22831729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_22810580_22810839_22810954_22831602
tx.23120	chr5	-	929	2	ISM	ENSMUSG00000029319.9	ENSMUST00000031262.9	1743	7	16287	0	6422	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	365	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCGACTCTTCATTACAG	7653	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100805863	100802588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100803338_100805683
tx.23121	chr5	-	1145	4	ISM	ENSMUSG00000029319.9	ENSMUST00000031262.9	1743	7	12375	0	2510	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	317	junction_3	19.7371617907833	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCGACTCTTCATTACAG	3741	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100809775	100802588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100803338_100805683_100805873_100808037_100808172_100809702
tx.23122	chr5	-	4025	3	FSM	ENSMUSG00000035234.19_ENSMUSG00000105607.2	ENSMUST00000145707.2	454	3	-15	-3556	3	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_1	27	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAGAAAGAAAGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100968828	100962062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_100965865_100966382_100966474_100968696
tx.23123	chr5	+	659	2	NNC	ENSMUSG00000106164.2	novel	1178	2	NA	NA	-5450	-1763	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGACATTCCAGGGTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101846001	101851953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_101846543_101851835
tx.23125	chr5	-	670	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000105954.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTTGAGAAGTGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104615055	104491029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_104491479_104614834
tx.23126	chr5	+	3119	7	ISM	ENSMUSG00000034462.10	ENSMUST00000086831.4	5219	15	31215	0	-2106	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_6	9.89388138643722	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATGGTGTTAAAAACACGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104638530	104653685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_104638631_104642758_104642858_104646306_104646429_104646623_104646742_104647035_104647200_104650157_104650306_104651317
tx.2313	chr11	-	780	3	FSM	ENSMUSG00000051355.19	ENSMUST00000159081.8	4508	3	123	3605	-7	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	2089	junction_1	53.5	8990	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCTCAAAGTCCAATCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22932259	22849740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_22850058_22906410_22906693_22932078
tx.23130	chr5	+	331	2	ISM	ENSMUSG00000029283.18	ENSMUST00000076467.13	2785	11	-28	19242	-28	-10002	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	268	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGGAAAAAAGAAATGTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107112218	107113056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_107112292_107112798
tx.23131	chr5	+	2077	7	ISM	ENSMUSG00000029283.18	ENSMUST00000076467.13	2785	11	-28	9291	-28	-51	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	259	junction_6	15.0489940601431	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAGTGTATCGGGAAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107112218	107123007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_107112292_107112798_107112981_107116723_107116808_107117024_107117161_107120612_107120707_107120790_107120934_107121642
tx.23139	chr5	+	2092	4	Intergenic	novelGene_1115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	8.25967446224258	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTTGGTCATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109614923	109627436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_109615053_109624129_109624257_109624444_109624506_109625661
tx.2314	chr11	+	1935	14	FSM	ENSMUSG00000007739.11	ENSMUST00000173867.8	2484	14	106	443	-1	186	multi-exon	FALSE	canonical	3	4673	junction_2	338.771431558561	5005	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTAACTTGTCATTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22940624	22953337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_22940881_22943266_22943320_22944297_22944388_22945929_22946039_22946314_22946458_22947032_22947155_22947602_22947736_22949032_22949173_22950857_22950955_22951361_22951473_22951559_22951691_22952166_22952402_22952816_22952931_22953136
tx.23141	chr5	-	470	2	Intergenic	novelGene_1125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTTTTTTTTTTTTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111911359	111909895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_111910287_111911280
tx.23142	chr5	+	2354	11	ISM	ENSMUSG00000029345.14	ENSMUST00000031288.14	3560	14	3006	685	2872	115	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_1	14.2954538228067	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGATGAATAACGTCTCTA	853	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112477229	112485254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_112477386_112477612_112477770_112478956_112479085_112479733_112479887_112480829_112481358_112481440_112481548_112482182_112482352_112482725_112482970_112483438_112483582_112483880_112484047_112484851
tx.23143	chr5	-	699	5	ISM	ENSMUSG00000029346.13	ENSMUST00000146510.8	1064	7	3076	-1	-12	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_3	15.0727402949829	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGGTTTACAGTGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112487810	112485256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_112485608_112485867_112485914_112486183_112486339_112487584_112487684_112487762
tx.23144	chr5	+	310	2	FSM	ENSMUSG00000042328.14	ENSMUST00000175718.2	820	2	17	493	17	-353	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTTGAAGTATCTGCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112490982	112492260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_112491030_112491997
tx.23145	chr5	+	588	4	Intergenic	novelGene_1127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGTGCCTTTAATGAGA	6980	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113371923	113373944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_113371980_113372498_113372595_113373380_113373428_113373555
tx.23146	chr5	+	1024	2	Intergenic	novelGene_1130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGTCTGCCTGCTTGCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113483007	113484314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_113483478_113483760
tx.23148	chr5	-	497	2	NNC	ENSMUSG00000042184.12	novel	706	3	NA	NA	10988	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGGCGTGGTGGTGCACA	1206	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113831521	113830482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_113830881_113831422
tx.23149	chr5	-	2960	2	ISM	ENSMUSG00000018974.8	ENSMUST00000019118.8	4447	19	25867	-2	-1048	2	intron_retention	FALSE	canonical	3	441	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGTGCATTGCAGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113884704	113880504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_113881365_113882604
tx.2315	chr11	+	975	2	FSM	ENSMUSG00000085665.2	ENSMUST00000128996.2	3105	2	-90	2220	-90	-2220	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTAGTGTGCCTCATTT	6919	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23017907	23023354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_23018407_23022878
tx.23152	chr5	+	1069	4	ISM	ENSMUSG00000029592.12	ENSMUST00000031588.12	4604	13	19903	2530	9090	1094	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_1	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTTGTTTCCCATTGTTG	10004	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114258278	114260251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_114258340_114258453_114258674_114259092_114259214_114259584
tx.23153	chr5	-	3014	6	ISM	ENSMUSG00000001098.16	ENSMUST00000102581.11	3103	7	5398	7	-2968	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_4	17.6567267634746	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTCACGCCGCCTTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114513171	114501634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_114503928_114505269_114505466_114506402_114506456_114507001_114507089_114508119_114508290_114512956
tx.23155	chr5	+	600	4	NNC	ENSMUSG00000002486.16	novel	3138	12	NA	NA	-1	1869	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	31.2836485510668	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGAACGAAGCCTCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114845878	114849370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_114846022_114846714_114846904_114847367_114847579_114849313
tx.23156	chr5	-	2765	20	NNC	ENSMUSG00000041890.18	novel	2984	20	NA	NA	-9	29	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	78.8896982345263	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTTGGATTTAAAAACAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114911565	114867901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_114868456_114869052_114869117_114871253_114871443_114871921_114872005_114875408_114875499_114877093_114877343_114881791_114881942_114883489_114883633_114886240_114886357_114887299_114887402_114887622_114887696_114890339_114890389_114891339_114891386_114899633_114899729_114902407_114902539_114902647_114902735_114904512_114904619_114905156_114905270_114907677_114907812_114911374
tx.23157	chr5	+	483	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000072694.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAAGGTATTTTCAAGTA	9918	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114952137	114953902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_114952309_114953590
tx.23158	chr5	-	1193	2	FSM	ENSMUSG00000029524.17	ENSMUST00000154729.2	733	2	-453	-7	-453	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGGACTGTGAACTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115618450	115616064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_115616468_115617660
tx.23159	chr5	+	1945	10	NIC	ENSMUSG00000029516.20	novel	1671	11	NA	NA	-50	423	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_9	15.7409586041568	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGGCAAACAGGTGACT	8431	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115983286	116064191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_115983361_115984405_115984526_115989210_115989353_115997256_115997433_116001016_116001119_116011910_116012054_116013947_116014039_116022924_116023129_116024712_116024867_116063452
tx.2316	chr11	+	4266	25	NNC	ENSMUSG00000020290.15	novel	6004	25	NA	NA	-31	206	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_7	441.486266223411	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATAAATTTTTTCTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23206009	23246439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_23206718_23211834_23211967_23217661_23217764_23221132_23221206_23226426_23226489_23227035_23227081_23228142_23228329_23228675_23228725_23228805_23228926_23230373_23230503_23231305_23231465_23232528_23232727_23234241_23234381_23234547_23234730_23234811_23234969_23235055_23235220_23235800_23235936_23236744_23236929_23237344_23237452_23239757_23239953_23241462_23241632_23243771_23243907_23243988_23244149_23244595_23244693_23245960
tx.23160	chr5	+	872	5	ISM	ENSMUSG00000029516.20	ENSMUST00000147330.8	1671	11	1	62356	1	320	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	18.4577219612822	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCGAGACAGGGGCTCATTA	8482	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115983337	116001405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_115983383_115984405_115984526_115989210_115989353_115997256_115997433_116001016
tx.23161	chr5	+	368	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000079278.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCTCAGAGTTATGTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116192631	116193102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_116192712_116192814
tx.23162	chr5	+	1237	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041548.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTGCCTAGTCCCAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116560210	116562293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_116560466_116561311
tx.23163	chr5	+	1486	4	ISM	ENSMUSG00000066894.15	ENSMUST00000145052.8	1691	5	0	3344	0	-3344	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	11	junction_3	9.10433352249844	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117457382	117473769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_117457569_117461564_117461646_117462917_117463200_117472832
tx.23164	chr5	+	1215	5	FSM	ENSMUSG00000066894.15	ENSMUST00000145052.8	1691	5	2	474	2	-474	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	7.88590514779375	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTCTCACTTCTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117457384	117476639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_117457569_117461564_117461646_117462917_117463200_117472832_117473133_117476271
tx.23165	chr5	+	2470	2	ISM	ENSMUSG00000066894.15	ENSMUST00000139026.2	2653	3	1658	9	1658	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAAAAACATACATTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117489632	117493061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_117489857_117490815
tx.23166	chr5	+	1981	7	ISM	ENSMUSG00000029364.16	ENSMUST00000111959.2	1526	8	7270	-794	-4860	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	560	junction_2	44.6691541595913	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTCTCTGTTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117508856	117516666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_117509001_117509153_117509286_117512177_117512279_117513833_117514007_117514561_117514673_117514755_117514864_117515454
tx.23167	chr5	-	1603	11	NIC	ENSMUSG00000032850.17	novel	4431	11	NA	NA	-31	90	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	6	junction_8	5.24976189936267	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCCAGGACTTTCTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118383090	118331546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_118331732_118339212_118339315_118339430_118339497_118340838_118340989_118366848_118367003_118370466_118370568_118372205_118372283_118375191_118375665_118380522_118380582_118380914_118381097_118383036
tx.23168	chr5	+	1724	3	NNC	ENSMUSG00000085708.2	novel	1701	4	NA	NA	1444	5	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGTTATGGATGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119765450	119772534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_119765704_119770194_119770284_119771152
tx.2317	chr11	+	461	3	ISM	ENSMUSG00000056342.17	ENSMUST00000137823.8	11363	80	-28	156062	-7	-86970	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	2.5	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAACTCTACAAGAACTTG	314	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23256887	23283682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_23257017_23270660_23270749_23283438
tx.23170	chr5	+	2582	13	NIC	ENSMUSG00000032754.15	novel	2898	16	NA	NA	-9	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_5	57.0079794609686	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAAGAGTCCCACAGGGTC	-13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	120649223	120672090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_120649349_120651184_120651398_120657694_120657848_120657930_120657984_120658667_120658726_120658838_120658952_120659032_120659201_120659818_120659927_120665805_120665928_120667574_120667729_120668380_120668462_120669145_120669214_120670924
tx.23171	chr5	+	646	2	ISM	ENSMUSG00000029601.14	ENSMUST00000094391.6	1673	5	16018	-2	16018	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCGTTTCAAACCACACTCA	8074	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120743105	120745185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_120743266_120744699
tx.23173	chr5	+	1349	2	ISM	ENSMUSG00000004455.17	ENSMUST00000134719.3	828	3	415	-594	415	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2938	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTTCGTGTCTTTCTGTC	2047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122311209	122313332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_122311344_122312117
tx.23174	chr5	-	481	3	ISM	ENSMUSG00000038593.19	ENSMUST00000177148.2	2790	4	2	6558	2	-6558	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_2	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGATCAGATCAATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122402476	122396944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_122397029_122399469_122399591_122402200
tx.23175	chr5	-	2322	13	NIC	ENSMUSG00000038569.14	novel	2371	13	NA	NA	30	-9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_11	5.40768486096921	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGACAAATATGAGTGCTT	9965	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122492253	122461294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_122462288_122463413_122463528_122463943_122464043_122469531_122469761_122471358_122471479_122472324_122472390_122472472_122472580_122477794_122477902_122482260_122482361_122489321_122489437_122489623_122489774_122490606_122490678_122492201
tx.23176	chr5	+	927	6	ISM	ENSMUSG00000029470.16	ENSMUST00000142664.3	1111	11	-85	3412	0	-354	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_5	9.26066952223218	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAGATTTATAAAAAAGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122845631	122862974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_122845851_122852461_122852610_122856375_122856448_122856563_122856637_122857192_122857290_122862656
tx.23177	chr5	-	698	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029474.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCGTCCAATTGATGTAAT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	122988510	122987512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_122987809_122988108
tx.23178	chr5	+	1298	2	FSM	ENSMUSG00000049686.15	ENSMUST00000121652.8	1875	2	283	294	19	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	186	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACACCTCTTCCTCATGTCT	5157	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123153419	123168225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_123153630_123167137
tx.23179	chr6	+	414	1	FSM	ENSMUSG00000095526.3	ENSMUST00000117571.2	333	1	-57	-24	-57	24	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGTAGATTTGTTAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48500394	48500808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48500400_48500800
tx.2318	chr11	-	1760	9	FSM	ENSMUSG00000020288.14	ENSMUST00000020529.13	3023	9	73	1190	-27	-154	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_2	27.6394193137265	621	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATCAAGTGTGCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23447957	23439736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_23440571_23440668_23440721_23441012_23441115_23441474_23441583_23442217_23442307_23443278_23443394_23444978_23445065_23446690_23446882_23447774
tx.23180	chr5	+	624	2	NNC	ENSMUSG00000086753.2	novel	1862	2	NA	NA	-16	-2230	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTCTAGCATGTGCTGAA	4678	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123646441	123649844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_123646583_123649361
tx.23181	chr5	-	1699	10	ISM	ENSMUSG00000049550.18	ENSMUST00000111564.8	5609	24	36413	44090	-32	-4179	internal_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_4	7.44029735234809	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAACGACATTGCAGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123785972	123759947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_123760016_123760818_123760903_123761275_123761334_123765356_123765474_123768515_123769233_123778556_123778618_123779840_123779945_123780481_123780680_123784145_123784369_123785903
tx.23182	chr5	-	2059	5	ISM	ENSMUSG00000038126.18	ENSMUST00000147737.8	5959	23	25	61671	25	848	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_3	8.36660026534076	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124465887	124452403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_124453960_124454144_124454235_124458907_124459018_124462936_124463201_124465848
tx.23183	chr5	-	1013	4	NNC	ENSMUSG00000029394.12	novel	1315	4	NA	NA	43	-20	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_3	590.799646430346	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTATTACGATGTGGAA	4297	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124492691	124483499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_124484218_124486663_124486791_124488140_124488236_124492618
tx.23184	chr5	-	1077	4	FSM	ENSMUSG00000029394.12	ENSMUST00000111474.8	1286	4	375	-166	375	-22	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_3	588.445975996664	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTGTATTACGATGTGG	7646	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124489342	124483501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_124484218_124486663_124486791_124488140_124488236_124489203
tx.23185	chr5	+	685	6	NNC	ENSMUSG00000049327.18	novel	1789	7	NA	NA	-1	22	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	323.436918115419	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTACACACTGTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124578028	124598028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_124578079_124585357_124585434_124588723_124588944_124589348_124589437_124595121_124595182_124597837
tx.23186	chr5	-	1312	4	ISM	ENSMUSG00000029392.13	ENSMUST00000062153.12	2249	7	2	21337	2	-20753	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	7.11805216802087	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTTTTGTTTTAATCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124669452	124652479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_124652807_124653580_124653700_124659313_124659465_124668737
tx.23187	chr5	+	1888	12	ISM	ENSMUSG00000118662.2	ENSMUST00000239505.1	2913	17	9731	-1	9688	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_2	7.27499964499729	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGATGGTGGTGATGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124746542	124765804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124746706_124748332_124748475_124750706_124750773_124753213_124753349_124754531_124754610_124757093_124757172_124758176_124758289_124761069_124761177_124762380_124762538_124763745_124763872_124763959_124764049_124765169
tx.23188	chr5	+	886	2	ISM	ENSMUSG00000038023.13	ENSMUST00000197931.2	663	6	-102	8065	2	-3999	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	183	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCCTGTACCTTGTATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124767131	124771479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_124767356_124770817
tx.23189	chr5	+	557	3	NNC	ENSMUSG00000079215.9	novel	4092	4	NA	NA	-6	-7692	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_2	108	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGGCTTGGAATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124939748	124945669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_124939947_124940417_124940573_124945465
tx.2319	chr11	-	1867	10	NNC	ENSMUSG00000020288.14	novel	3023	9	NA	NA	-50	-153	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	2	junction_5	110.100739504811	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCAAGTGTGCTTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23447980	23439735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_23440571_23440668_23440721_23441012_23441115_23441474_23441583_23442217_23442307_23442819_23442903_23443278_23443394_23444978_23445065_23446690_23446882_23447774
tx.23190	chr5	+	626	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034310.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCGAGACACAATCTTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127921553	127924513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_127921656_127922359_127922491_127924120
tx.23191	chr5	+	737	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034310.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCGAGACACAATCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127921583	127924511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_127921799_127922359_127922491_127924120
tx.23192	chr5	-	692	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060419.9	novel	441	1	NA	NA	-13062	80	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTGTTTAAAAGGCCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129218643	129205060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_129205636_129218526
tx.23193	chr5	+	1762	10	ISM	ENSMUSG00000029439.15	ENSMUST00000053737.9	3313	18	40169	7	-26	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_3	25.086516962969	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTAGCAGCCTGGGGCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129618453	129648441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_129618519_129619102_129619197_129620277_129620444_129626517_129626749_129627760_129627952_129631506_129631773_129637743_129637870_129646704_129646879_129647539_129647613_129648065
tx.23194	chr5	+	456	2	ISM	ENSMUSG00000029439.15	ENSMUST00000199692.2	1277	4	10317	0	-241	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGGGGCTCTCCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129647539	129648448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_129647613_129648065
tx.23195	chr5	+	2217	4	FSM	ENSMUSG00000034110.9	ENSMUST00000040616.9	4291	4	-655	2729	-655	583	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_2	1.88561808316413	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCAGTGTGCTCCTTGGTCTT	1200	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130173046	130181918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_130174068_130176894_130177065_130180511_130180691_130181071
tx.23196	chr5	+	247	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000058905.6	novel	414	1	NA	NA	174	68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133504135	133504443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_+_133504264_133504324
tx.23197	chr5	-	294	2	Intergenic	novelGene_1149	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCTTGGTCTCATTACT	7859	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134369134	134365886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_134366100_134369053
tx.23198	chr5	+	1679	4	ISM	ENSMUSG00000007207.11	ENSMUST00000156626.8	2114	7	1534	-1	1328	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	6.12825877028341	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGCCTCTGTTTGGAACA	7210	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135071447	135079954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_135071521_135074450_135074589_135077764_135077959_135078680
tx.23199	chr5	-	1477	4	FSM	ENSMUSG00000043614.14	ENSMUST00000067935.11	1544	4	67	0	67	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	2.86744175568088	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGCCCCGCCTCCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135107053	135101753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_135102838_135103247_135103331_135105311_135105484_135106915
tx.232	chr1	+	1285	7	NIC	ENSMUSG00000026096.15	novel	1868	8	NA	NA	-10	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	27	junction_2	47.461387815079	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATCATTTCGTGTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53352802	53365327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_53353018_53354014_53354259_53359101_53359456_53360238_53360370_53360654_53360727_53362325_53362430_53365162
tx.2320	chr11	-	1577	8	ISM	ENSMUSG00000020288.14	ENSMUST00000128372.8	2802	9	657	1188	657	-154	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	225	junction_2	25.5454776540081	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATCAAGTGTGCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23446881	23439736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_23440571_23440668_23440721_23441012_23441115_23441474_23441583_23442217_23442307_23443278_23443394_23444978_23445065_23446690
tx.23200	chr5	+	1806	5	ISM	ENSMUSG00000005373.14	ENSMUST00000201977.4	683	6	-3	415	-3	236	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	4.63680924774785	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAACAACAACAAAAACAAAA	3415	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135135752	135152132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_135136070_135142480_135142588_135150359_135150443_135150589_135150680_135150923
tx.23201	chr5	-	191	2	Intergenic	novelGene_1150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	264	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTAAATGAAAATTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135333033	135311163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_135311303_135332981
tx.23202	chr5	+	845	3	NNC	ENSMUSG00000053388.11	novel	1456	6	NA	NA	-1394	-8528	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_2	4	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTCTTCTTCTTGAGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135380754	135387980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_135380916_135382136_135382549_135387708
tx.23203	chr5	-	1783	2	ISM	ENSMUSG00000039959.14	ENSMUST00000202643.2	6224	19	23877	2639	18823	-2639	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCACTATCATTTTTAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135440125	135438027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_135439727_135440041
tx.23204	chr5	-	900	3	ISM	ENSMUSG00000019178.18	ENSMUST00000111162.8	726	7	-80	20504	-2	-11112	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATCATATGTGTCTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135807225	135797094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_135797770_135799109_135799214_135807104
tx.23205	chr5	+	698	4	ISM	ENSMUSG00000006143.13	ENSMUST00000156530.8	1035	6	2761	-1	-20	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.471404520791032	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATACCTGGGTTCATCTC	4789	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136088881	136093174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_136089136_136090036_136090114_136090360_136090482_136092928
tx.23206	chr5	+	660	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037344.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	5402	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137313177	137315157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_137313352_137314671
tx.23207	chr5	+	1134	2	ISM	ENSMUSG00000029710.16	ENSMUST00000166239.8	3741	18	21980	-204	21897	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	315	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTCAGTCCAGAGGGTGA	5182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137370671	137372776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_137370803_137371773
tx.23208	chr5	-	1282	7	ISM	ENSMUSG00000029713.16	ENSMUST00000150063.9	1569	9	1026	-374	-409	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	641	junction_6	43.5685921533187	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTAGTCTCCTTGCTTAC	4771	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137528533	137526390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_137526872_137526952_137527170_137527265_137527468_137527704_137527772_137527864_137528028_137528107_137528172_137528445
tx.23209	chr5	+	3272	5	NIC	ENSMUSG00000036898.17	novel	886	5	NA	NA	-2	-2031	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	27.6167974247558	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGAATGACGGCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138439738	138456925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_138439892_138443013_138443141_138445776_138445870_138453241_138453356_138454140
tx.2321	chr11	-	1469	9	NNC	ENSMUSG00000020288.14	novel	3023	9	NA	NA	-43	258	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	85.5306049025727	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGCCAGTTTCCAAGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23447973	23440062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_23440590_23440668_23440721_23441012_23441115_23441474_23441583_23442217_23442307_23443278_23443394_23444978_23445065_23446690_23446882_23447774
tx.23210	chr5	+	432	2	Intergenic	novelGene_1153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTATTGCCGTATGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139591755	139594022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_139591943_139593777
tx.23211	chr5	+	2753	4	NNC	ENSMUSG00000018143.11	novel	2849	3	NA	NA	-12	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_3	11.1455023315337	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCTGGTGTCTGGATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139777255	139788406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_139777468_139784893_139784974_139785839_139787746_139787851
tx.23212	chr5	+	1456	2	ISM	ENSMUSG00000106350.3	ENSMUST00000197549.3	2955	20	47196	-1181	47196	1181	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAGCTGCTTTTTCCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140478595	140482007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_140478770_140480725
tx.23213	chr5	-	534	2	Intergenic	novelGene_1155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAACTTGTCTTGGCTCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140491128	140488738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_140489179_140491034
tx.23214	chr5	+	1808	2	FSM	ENSMUSG00000036599.11	ENSMUST00000124142.2	766	2	43	-1085	43	-486	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGGCATTCCTGTGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140491372	140510993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_140491483_140509295
tx.23215	chr5	-	1040	2	ISM	ENSMUSG00000036586.7	ENSMUST00000042993.7	613	5	666	1	666	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTGGCTGCTGTGGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140550160	140548874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_140549050_140549295
tx.23216	chr5	-	608	5	FSM	ENSMUSG00000036586.7	ENSMUST00000042993.7	613	5	4	1	4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.11803398874989	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTGGCTGCTGTGGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140550822	140548874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_140549050_140549295_140549463_140550187_140550348_140550420_140550501_140550796
tx.23217	chr5	-	4672	17	NNC	ENSMUSG00000045078.13	novel	3704	17	NA	NA	-20	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	72.1455776537966	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTTGGCTCTGTTTGTCC	6110	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143098769	142976648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_142978721_142979252_142979327_143001378_143001602_143013700_143013799_143054071_143054151_143054600_143054750_143061481_143061620_143063181_143063233_143065978_143066119_143066717_143066833_143071625_143071791_143073269_143073377_143075497_143075575_143075874_143076685_143078749_143078881_143084133_143084261_143098653
tx.23218	chr5	+	579	3	Intergenic	novelGene_1156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCATTGTCTGTGTACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143151724	143154615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_143152054_143153653_143153818_143154529
tx.23219	chr5	-	1959	6	FSM	ENSMUSG00000039244.11	ENSMUST00000046418.3	2208	6	252	-3	23	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_3	6.98569967862919	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATTGTGGGGTTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143300863	143286958	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_143287759_143292520_143292561_143293370_143293896_143297465_143297632_143299932_143300155_143300657
tx.2322	chr11	-	848	2	ISM	ENSMUSG00000020283.6	ENSMUST00000130811.2	367	3	14844	-634	14665	634	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	429	junction_1	0	462	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTCCAGTGTTGAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23601008	23598821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_23599591_23600929
tx.23220	chr5	-	697	3	ISM	ENSMUSG00000051306.8	ENSMUST00000053287.6	5151	18	57	15976	57	-4648	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_2	17	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAATCAAAAAAATCCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143717978	143712055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_143712445_143713534_143713782_143717917
tx.23221	chr5	-	573	3	Intergenic	novelGene_1157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTATAACTTATCATTAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144416476	144413378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_144413761_144416179_144416258_144416363
tx.23222	chr5	-	1574	2	Intergenic	novelGene_1158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGTCTTATTATTCAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144482581	144475773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_144476067_144481300
tx.23223	chr5	+	400	2	Intergenic	novelGene_1160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTATTTTAAATACATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144587904	144588662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_144587947_144588304
tx.23224	chr5	+	601	3	Intergenic	novelGene_1162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAATGCTGTTGCTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144616020	144640717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_144616122_144616581_144616659_144640294
tx.23225	chr5	+	525	5	ISM	ENSMUSG00000045482.17	ENSMUST00000136379.2	2621	12	56	9922	56	857	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	9.03811374126261	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGCTTTGACAATTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144704957	144714795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_144705056_144707898_144708060_144708417_144708468_144713912_144714024_144714690
tx.23226	chr5	-	3114	4	ISM	ENSMUSG00000029634.16	ENSMUST00000169407.9	3276	5	411	4	411	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	117	junction_2	5.09901951359278	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTAAAGACTGTGTGCAAA	3246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146157300	146146009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_146148743_146152906_146153003_146154710_146154907_146157211
tx.23227	chr5	+	1819	10	NIC	ENSMUSG00000029636.12	novel	5196	10	NA	NA	287	2275	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_6	55.5139844465861	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTGAGTATTTACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146322081	146407341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_146322149_146358727_146358816_146372134_146372278_146388680_146388816_146390125_146390280_146392353_146392472_146402659_146402830_146403607_146403875_146405024_146405390_146407029
tx.23228	chr5	-	1333	5	ISM	ENSMUSG00000041313.15	ENSMUST00000048116.15	7179	13	-3	18029	-3	-3358	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	442	junction_4	24.3657033553312	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCAAATCATTGCAATGTCA	5415	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148336717	148282248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_148282770_148284962_148285122_148288875_148289260_148301971_148302062_148336538
tx.23229	chr5	-	2234	6	FSM	ENSMUSG00000001687.16	ENSMUST00000201595.4	2064	6	317	-487	190	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_5	118.120954957196	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTAGTGCATTTTGTTG	98	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148489282	148441451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_148442998_148443255_148443334_148446078_148446166_148448703_148448813_148488762_148488861_148488966
tx.2323	chr11	-	1748	4	FSM	ENSMUSG00000020283.6	ENSMUST00000020523.4	4146	4	55	2343	-52	634	multi-exon	FALSE	canonical	3	429	junction_1	13.1993265821489	754	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTCCAGTGTTGAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23615904	23598821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_23599591_23600929_23601056_23605435_23606131_23615746
tx.23230	chr5	-	661	3	NNC	ENSMUSG00000085971.5	novel	3488	4	NA	NA	12548	-798	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATTTTCTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148940046	148935949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_148936439_148936680_148936782_148939975
tx.23231	chr5	+	1416	4	NNC	ENSMUSG00000086610.2	novel	1379	4	NA	NA	9	7	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTGTGGTCATGATGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148943780	148949593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_148944109_148944695_148944865_148948383_148948518_148948808
tx.23232	chr5	-	478	4	NNC	ENSMUSG00000066551.13	novel	685	6	NA	NA	5	-40464	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.88561808316413	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGTGGATTCATATCTT	6434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149121294	149027646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_149027839_149028454_149028603_149029100_149029202_149121257
tx.23233	chr5	-	472	3	NNC	ENSMUSG00000097191.3	novel	377	2	NA	NA	-472	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAGATGTGCATGTGTGA	6383	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149121345	149056371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_149056640_149060106_149060223_149121257
tx.23234	chr5	-	1411	2	Intergenic	novelGene_1167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGACATGACTCTTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149159875	149154392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_149155563_149159634
tx.23235	chr5	+	1148	6	FSM	ENSMUSG00000029660.11	ENSMUST00000202920.4	1009	6	-35	-104	-11	104	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.16619037896906	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCATTGTTGATTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149363135	149394189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_149363253_149376758_149376925_149380282_149380428_149384285_149384463_149386581_149386744_149393808
tx.23236	chr5	+	942	5	NNC	ENSMUSG00000029658.18	novel	2482	23	NA	NA	-11816	-7225	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.5	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATATAGCATCTCCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149493426	149504456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_149493820_149497453_149497606_149502518_149502622_149504080_149504188_149504269
tx.23237	chr5	+	434	3	NNC	ENSMUSG00000034021.16	novel	6598	35	NA	NA	25	-53734	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTCTAAGCATGCATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150597316	150618344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_150597419_150617894_150617969_150618086
tx.23239	chr5	+	1396	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000107047.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGGCCCTATGAATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150794578	150807142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_150794665_150798972_150799176_150806035
tx.2324	chr11	+	3378	18	FSM	ENSMUSG00000020280.13	ENSMUST00000058163.11	3559	18	181	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	15.9356404539699	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGAGCATTGTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23616187	23682876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_23616454_23617277_23617415_23622507_23622757_23623237_23623325_23649929_23649965_23652889_23653002_23656884_23656947_23657522_23657569_23658757_23658823_23661195_23661282_23662199_23662326_23667561_23667619_23668575_23668653_23668748_23668805_23670103_23670222_23675431_23675575_23678974_23679075_23681320
tx.23240	chr6	-	563	5	FSM	ENSMUSG00000032667.18	ENSMUST00000123838.8	2691	5	-21	2149	-21	809	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	2.27760839478607	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTACTTTCCTCATTGTTCT	-12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	5298351	5272321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_5272452_5273000_5273167_5277871_5277928_5289012_5289084_5298211
tx.23241	chr6	+	764	3	NNC	ENSMUSG00000089862.9	novel	2015	3	NA	NA	11	19067	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCTGCCTATCCTTTCTTG	26	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8259360	8298619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_8259494_8270472_8270582_8298097
tx.23242	chr6	+	1983	3	NNC	ENSMUSG00000097616.8	novel	403	3	NA	NA	-17349	375	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAATCATGTAATTTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13854175	13896796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_13854344_13881271_13881381_13895090
tx.23244	chr6	-	1105	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000106874.2	novel	741	2	NA	NA	-293	3808	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTGTCACCCCAAAGCT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	18848499	18842100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_18842846_18848139
tx.23245	chr6	+	2402	11	ISM	ENSMUSG00000029670.13	ENSMUST00000115389.8	2546	12	386	2	23	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_5	47.52683452535	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACATCGTGATGTGGCAGT	16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21950041	21974900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_21950109_21952127_21952229_21953761_21953828_21965732_21965830_21967625_21967698_21968916_21969004_21969276_21969435_21969912_21970107_21971105_21971308_21971809_21971849_21973581
tx.23246	chr6	+	709	2	Intergenic	novelGene_1233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCTTGCTCAAGTAGAGTGT	3785	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22443920	22445294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_22444066_22444730
tx.23247	chr6	+	523	2	NNC	ENSMUSG00000107189.2	novel	404	2	NA	NA	380	60623	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTTTACACTTTCAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24594908	24655860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_24595360_24655788
tx.23248	chr6	+	1145	6	ISM	ENSMUSG00000001424.15	ENSMUST00000001460.14	3482	24	402909	11	3214	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	669	junction_2	42.1065315598424	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTACTGTCGTGGTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28883255	28888820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_28883381_28884186_28884257_28884954_28885069_28886412_28886617_28888077_28888123_28888233
tx.23249	chr6	-	1629	3	ISM	ENSMUSG00000012535.15	ENSMUST00000164325.2	3396	4	-196	3791	-11	1954	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	604	junction_2	11.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGACACACCAGAAGAGGGC	12	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29609829	29587132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_29588096_29589027_29589229_29609364
tx.2325	chr11	-	507	3	ISM	ENSMUSG00000020275.10	ENSMUST00000102864.5	7466	10	-41	20169	-41	-20169	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATTACATTAGTAACAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23721011	23707015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_23707048_23711012_23711156_23720679
tx.23250	chr6	+	184	2	Intergenic	novelGene_1236	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAATTACACAGGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30038745	30138339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_30038894_30138303
tx.23251	chr6	-	1813	10	NNC	ENSMUSG00000039130.19	novel	1824	10	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	332.681176852702	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTGCTGCTAGAGAATTG	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30391016	30366382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_30366745_30370263_30370471_30372736_30372950_30373241_30373483_30374763_30374919_30375937_30376066_30381779_30381864_30382535_30382671_30387404_30387532_30390855
tx.23252	chr6	+	1326	3	FSM	ENSMUSG00000029784.14	ENSMUST00000031797.11	1340	3	18	-4	18	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCTACTCATATGTTTTG	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	30509865	30520256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_30510291_30517503_30517559_30519410
tx.23253	chr6	-	810	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000086922.3	novel	685	1	NA	NA	-63	127	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAGTGGCAATTAATTGTT	7055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31119661	31118786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_31119139_31119203
tx.23254	chr6	+	2620	6	FSM	ENSMUSG00000025609.16	ENSMUST00000137621.8	3617	6	-15	1012	-14	-1012	multi-exon	FALSE	canonical	3	539	junction_3	38.0242028187311	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACACACCAGAAGAGGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31375748	31411940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_31375890_31395865_31395936_31403648_31403792_31405071_31405161_31408074_31408185_31409873
tx.23255	chr6	-	1715	6	ISM	ENSMUSG00000025608.10	ENSMUST00000026698.8	5379	8	37224	2684	-2446	820	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_2	8.86340792246413	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTCTGCTTCTGCTCCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31503692	31499106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_31500155_31501239_31501408_31501604_31501667_31501873_31502028_31503136_31503209_31503481
tx.23256	chr6	+	1043	2	ISM	ENSMUSG00000056215.14	ENSMUST00000101564.9	967	5	12	10127	12	-10127	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAAGGGGTTGGTGCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34006396	34014186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_34006689_34013435
tx.23257	chr6	-	2217	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029761.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAAATTGATGTTGATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34696103	34691965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_34693861_34695781
tx.23258	chr6	-	1884	2	ISM	ENSMUSG00000038784.14	ENSMUST00000044163.10	3337	11	82507	-333	5201	333	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCAGACCTTAATTCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35028143	35021556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_35023294_35027996
tx.23259	chr6	+	199	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000063455.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGAGGGTACCCAAGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38193572	38213010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_38193722_38212960
tx.2326	chr11	-	3751	22	FSM	ENSMUSG00000020273.14	ENSMUST00000020513.10	3747	22	-6	2	-6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_1	18.5612914946701	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTCTGTCTTTAATTTT	1263	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23845259	23812647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_23814057_23816410_23816468_23816629_23816696_23817197_23817419_23817501_23817591_23817956_23818127_23818358_23818481_23820192_23820303_23820742_23820863_23822426_23822481_23823227_23823313_23823789_23823911_23824474_23824548_23826319_23826459_23829873_23829964_23832182_23832295_23834060_23834115_23835163_23835274_23835490_23835573_23840228_23840296_23841742_23841905_23845021
tx.23260	chr6	-	1760	4	ISM	ENSMUSG00000029826.15	ENSMUST00000031850.10	3400	9	9	16830	9	-16830	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_2	5.35412613473634	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGCCAGGTACATCTACCC	9673	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38331529	38309432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_38310124_38313346_38313600_38317154_38317291_38330849
tx.23261	chr6	+	773	3	ISM	ENSMUSG00000029823.17	ENSMUST00000160511.5	2419	13	35074	5063	22613	-1164	internal_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_2	41	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCTGTTTTCCACATTT	2120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38569649	38580811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_38569731_38570312_38570405_38580211
tx.23262	chr6	+	3272	4	ISM	ENSMUSG00000029823.17	ENSMUST00000160430.3	3906	8	22613	-319	22613	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_2	20.8859335970941	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GTTTAAAAAAAAAAAAAGAA	2120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38569649	38583280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_38569731_38570312_38570405_38575719_38575750_38580211
tx.23263	chr6	-	2020	7	ISM	ENSMUSG00000038507.7	ENSMUST00000038398.7	3231	12	17908	2	-9348	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_2	4.53382350291181	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGAAGACTGGAGTTTATT	755	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39077375	39063345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_39064575_39065911_39066064_39067132_39067264_39068238_39068315_39070561_39070659_39073469_39073612_39077182
tx.23264	chr6	+	2260	10	FSM	ENSMUSG00000029860.17	ENSMUST00000203652.3	2605	10	178	167	-27	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_4	4.64545443563708	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTAGTACTTGATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42326939	42335329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_42327054_42327190_42327411_42327879_42328083_42328203_42328297_42328408_42328904_42332850_42332972_42333095_42333266_42333365_42333545_42334246_42334368_42334785
tx.23265	chr6	-	2953	8	NIC	ENSMUSG00000029735.18	novel	2671	9	NA	NA	-201	8	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_7	11.1721227405812	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGTGGTATTAAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43603101	43321926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_43323835_43400554_43400667_43445935_43446083_43465808_43465905_43500817_43500891_43536876_43536947_43588247_43588320_43602626
tx.23266	chr6	-	640	4	ISM	ENSMUSG00000029735.18	ENSMUST00000114644.8	2148	8	-51	214320	-7	31997	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_2	3.09120616516523	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAACTGGACTCCTAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43643160	43536527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_43536947_43588247_43588320_43642693_43642752_43643069
tx.23267	chr6	+	1525	2	FSM	ENSMUSG00000062519.14	ENSMUST00000146202.2	3656	2	36	2095	2	-2095	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCCCCCATATGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47812630	47818486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_47812855_47817185
tx.23268	chr6	+	2260	6	FSM	ENSMUSG00000062519.14	ENSMUST00000079881.11	2906	6	27	619	-4	-619	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	4.17612260356422	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGAGACATGCTTGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47812624	47844003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_47812855_47817185_47817582_47835862_47835990_47836352_47836467_47840037_47840152_47842724
tx.23269	chr6	+	1043	2	FSM	ENSMUSG00000045466.19	ENSMUST00000174790.2	577	2	-46	-420	9	420	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAAAGAAGGGCTGGATA	9722	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47930332	47933609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_47930517_47932750
tx.2327	chr11	+	864	2	FSM	ENSMUSG00000000861.16	ENSMUST00000124148.2	5885	2	-44	5065	-14	-5065	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGAGTCAGATGCAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24028102	24035841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_24028446_24035320
tx.23270	chr6	-	3133	6	NIC	ENSMUSG00000071477.11	novel	3111	6	NA	NA	0	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_5	38.9122088810183	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTTTCCTGTTTGCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48024728	48001133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_48002753_48006056_48006309_48014488_48014603_48018962_48019090_48020777_48021636_48024565
tx.23271	chr6	-	599	5	FSM	ENSMUSG00000068551.13	ENSMUST00000101443.10	599	5	-5	5	-5	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.17944947177034	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTCTGTAGACCGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48422403	48404635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_48404814_48418880_48418995_48419558_48419673_48420345_48420422_48422286
tx.23272	chr6	-	591	5	NIC	ENSMUSG00000068551.13	novel	543	5	NA	NA	3	-7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1.78535710713571	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGTTCTGTAGACCGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48422015	48404637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_48404814_48418880_48418995_48419558_48419673_48420345_48420422_48421904
tx.23273	chr6	-	348	3	ISM	ENSMUSG00000009281.7	ENSMUST00000204267.3	795	6	2393	0	2284	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGTGTTGTTCTCCCTCA	7428	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48547296	48546629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_48546740_48546874_48546994_48547177
tx.23274	chr6	+	1468	3	ISM	ENSMUSG00000053297.15	ENSMUST00000154570.2	3806	4	1448	1448	1448	-1444	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_1	3.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATCCCTTTCTCTTCAA	781	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48606316	48609175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_48606939_48607105_48607250_48608473
tx.23275	chr6	+	1315	4	ISM	ENSMUSG00000029816.11	ENSMUST00000031840.10	3701	11	33	12005	-17	-2174	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_1	2.05480466765633	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGGCTGCTGAATTCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49013581	49023111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_49013727_49019700_49019854_49020930_49021075_49022238
tx.23276	chr6	+	867	3	ISM	ENSMUSG00000029816.11	ENSMUST00000031840.10	3701	11	15261	1400	4452	-1400	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCTGTGTGATTATTATA	5832	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49028809	49033716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_49028961_49032554_49032649_49033094
tx.23279	chr6	-	561	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029836.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGAGTCACTAGCTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51484631	51459297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_51459567_51476659_51476702_51477163_51477294_51484511
tx.2328	chr11	-	641	5	NNC	ENSMUSG00000032985.16	novel	691	6	NA	NA	10	-2692	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTAAGTGTTATGATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26160559	25801988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_25802333_25936750_25936813_26042270_26042354_26072491_26072575_26160490
tx.23280	chr6	-	2083	3	FSM	ENSMUSG00000029844.10	ENSMUST00000120363.2	2043	3	-38	-2	-38	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	5.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTATGCCTAAGCATCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52135335	52132572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_52134070_52134546_52134642_52134844
tx.23282	chr6	+	773	4	ISM	ENSMUSG00000086040.9	ENSMUST00000163746.8	4102	7	32655	2598	-2368	-2595	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACCATTTTAGTCAGCTTT	2248	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54462522	54478155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_54462918_54464892_54465016_54473464_54473542_54477977
tx.23283	chr6	+	1117	2	FSM	ENSMUSG00000038065.14	ENSMUST00000185518.2	645	2	-108	-364	-60	364	multi-exon	TRUE	canonical	3	55	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCATAGTCCTCTGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54658678	54666869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_54658917_54665990
tx.23284	chr6	+	695	4	NNC	ENSMUSG00000029802.14	novel	701	4	NA	NA	-11	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	71.9737606508248	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGAATATGTTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58617519	58641761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_58617613_58632622_58632842_58640598_58640649_58641428
tx.23285	chr6	+	1803	4	Intergenic	novelGene_1252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.942809041582063	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAAGCAAAATTAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60388339	60430293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_60388388_60404292_60404456_60426629_60426686_60428757
tx.23286	chr6	+	517	2	Intergenic	novelGene_1253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCGAGGGGTGTGGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60552844	60554416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_60553029_60554083
tx.23287	chr6	+	1440	5	ISM	ENSMUSG00000029913.15	ENSMUST00000172638.2	1714	14	-65	77592	11	25612	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_3	4.84767985741633	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATCTATCTATCTATCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65756019	65835526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_65756178_65771283_65771368_65808232_65808356_65832932_65833108_65834626
tx.23288	chr6	+	1770	2	NNC	ENSMUSG00000029913.15	novel	2155	15	NA	NA	18420	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAACCAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65774504	65809905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_65774602_65808232
tx.23289	chr6	-	440	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000107176.2	novel	423	1	NA	NA	-27	59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTACAGAACTCCAAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66852754	66852245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_66852640_66852708
tx.2329	chr11	+	1656	14	FSM	ENSMUSG00000004018.10	ENSMUST00000004120.9	2724	14	1066	2	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_1	21.2544461064019	1163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGTCTAGTCATTAACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26337200	26421874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_26337311_26347745_26347805_26349648_26349710_26353321_26353379_26357547_26357649_26372407_26372505_26384431_26384501_26409685_26409837_26418334_26418419_26418671_26418718_26418800_26418883_26419651_26419769_26420876_26420949_26421324
tx.23290	chr6	+	901	3	NNC	ENSMUSG00000036402.14	novel	1876	4	NA	NA	-2	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	46	197	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGTAATGAAAGAACGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66873404	66995138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_66873500_66992716_66992832_66994447
tx.23291	chr6	+	794	4	NNC	ENSMUSG00000097603.4	novel	2041	6	NA	NA	-1841	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTGTCTTTGTGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67090815	67094022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_67091215_67093055_67093129_67093608_67093752_67093843
tx.23292	chr6	-	1185	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000096086.2_ENSMUSG00000107508.2	novel	582	1	NA	NA	-35	40	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAATAATTAATAATAATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67395070	67391374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_67392110_67394620
tx.23293	chr6	+	199	2	Intergenic	novelGene_1255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGTTCTTTGAGCTAAACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67633001	67648566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_67633174_67648539
tx.23294	chr6	+	335	2	NNC	ENSMUSG00000105463.2	novel	362	2	NA	NA	-88	2142	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGTTTAATTCTGTCTGGA	3841	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68155696	68158690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_68155838_68158496
tx.23295	chr6	+	386	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000076534.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCTGTGTGTGTTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68807005	68812290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_68807118_68808530_68808591_68812076
tx.23296	chr6	+	370	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068396.10	novel	354	1	NA	NA	-33	53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71101560	71102000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_71101737_71101806
tx.23297	chr6	+	2922	2	FSM	ENSMUSG00000073018.7	ENSMUST00000114185.4	2874	2	-49	1	-49	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTGTTGTGATGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71270699	71279863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_71270843_71277084
tx.23298	chr6	+	1155	7	NNC	ENSMUSG00000052852.9	novel	3339	9	NA	NA	0	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.7769323391806	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAACCCTTTTGTTGTTCTTG	1584	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71684853	71785236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_71684984_71733347_71733421_71738348_71738426_71750171_71750293_71757705_71757820_71772130_71772309_71784774
tx.23299	chr6	+	2711	14	NNC	ENSMUSG00000052337.16	novel	2728	15	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_10	457.116069058741	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTCTATCCCTTTTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71808314	71852242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_71808500_71821622_71821697_71823269_71823460_71828755_71828865_71829746_71829852_71830156_71830253_71833895_71834033_71837986_71838091_71839328_71839465_71840124_71840259_71845550_71845788_71848410_71848543_71849777_71849908_71851300
tx.233	chr1	+	1670	8	FSM	ENSMUSG00000026096.15	ENSMUST00000027265.10	1868	8	24	174	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_2	14.7537611946159	199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATCATTTCGTGTTTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53352806	53365328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_53353018_53354014_53354259_53357060_53357449_53359101_53359456_53360238_53360370_53360654_53360727_53362325_53362430_53365162
tx.2330	chr11	-	1806	13	NIC	ENSMUSG00000064090.15	novel	1889	13	NA	NA	-8	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_12	30.8175635348128	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTTTTAAGCATTCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26543630	26421400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_26421787_26426553_26426701_26433157_26433325_26436959_26437019_26439772_26439894_26448916_26449050_26484210_26484304_26485536_26485643_26497838_26497927_26499294_26499365_26500025_26500076_26541586_26541728_26543385
tx.23300	chr6	+	2738	14	NNC	ENSMUSG00000052337.16	novel	2728	15	NA	NA	4	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	429.104185911608	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTCTATCCCTTTTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71808320	71852242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_71808500_71821622_71821697_71823269_71823460_71828755_71828865_71829713_71829852_71830156_71830253_71833895_71834033_71837986_71838091_71839328_71839465_71840124_71840259_71845550_71845788_71848410_71848543_71849777_71849908_71851300
tx.23301	chr6	+	1551	5	NNC	ENSMUSG00000052337.16	novel	2518	13	NA	NA	-384	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	638.208821625023	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTCTATCCCTTTTCAAA	8702	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71840148	71852242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_71840259_71845550_71845788_71848410_71848543_71849777_71849908_71851300
tx.23302	chr6	+	667	4	ISM	ENSMUSG00000049553.12	ENSMUST00000205842.2	1492	6	-31	3569	-15	-3569	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	275	junction_3	20.8326666559997	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGACCAGCGTCTACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71886021	71894835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_71886224_71889859_71890065_71892004_71892155_71894725
tx.23303	chr6	+	3099	15	FSM	ENSMUSG00000053460.9	ENSMUST00000065906.9	2929	15	4	-174	4	174	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_7	7.03816128585544	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTACCTTTGAAGAAAGGAAG	1285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72391294	72407869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_72391433_72391654_72391826_72394837_72394997_72395283_72395450_72399398_72399478_72400916_72401024_72402768_72402933_72403343_72403610_72404024_72404157_72404880_72405033_72405440_72405611_72405779_72405911_72406115_72406264_72406426_72406623_72406949
tx.23304	chr6	+	886	7	ISM	ENSMUSG00000056737.15	ENSMUST00000114071.8	1400	10	6547	7	-159	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_5	12.9185482500507	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCTCTCTTCCTGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72532802	72539959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_72532889_72533067_72533236_72534693_72534844_72535147_72535241_72535721_72535855_72538010_72538100_72539792
tx.23305	chr6	-	437	3	ISM	ENSMUSG00000056698.12	ENSMUST00000141833.8	2509	11	-7	20061	-7	12	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_2	7.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACGTATCACCCATAAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72575385	72564593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_72564669_72571722_72572004_72575304
tx.23306	chr6	-	1582	7	NNC	ENSMUSG00000055239.11	novel	3251	7	NA	NA	2	60	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	423.275980366894	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTGCATGAGGTTTTTTG	8743	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72876684	72819491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_72820114_72825207_72825491_72826426_72826606_72827365_72827468_72835756_72835897_72838740_72838909_72876596
tx.23307	chr6	+	451	2	Intergenic	novelGene_1258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTCCTCTCTTTTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73500889	73501677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_73500985_73501321
tx.23308	chr6	-	5507	18	FSM	ENSMUSG00000000628.11	ENSMUST00000000642.11	5513	18	-2	8	-2	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	435	junction_14	56.0328005768445	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAAAATATTCAGTGTGT	9396	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82751437	82702013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_82704436_82705692_82705927_82706525_82706682_82707748_82707933_82708028_82708129_82709081_82709178_82711828_82711949_82712227_82712377_82713510_82713816_82715267_82715502_82716499_82716656_82719783_82719968_82720248_82720349_82720925_82721022_82721842_82721963_82726169_82726319_82737084_82737248_82750898
tx.23309	chr6	-	1625	2	ISM	ENSMUSG00000000628.11	ENSMUST00000000642.11	5513	18	-2	34156	-2	936	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	445	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCCCCCCCACACACACACA	9396	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82751437	82736161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_82737248_82750898
tx.2331	chr11	-	1637	13	FSM	ENSMUSG00000064090.15	ENSMUST00000078362.13	1889	13	255	-3	-43	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_12	13.1368332899862	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTTTTAAGCATTCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26543665	26421400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_26421787_26426553_26426701_26433157_26433325_26436959_26437019_26439772_26439894_26448916_26449050_26484210_26484304_26485536_26485643_26497838_26497927_26499294_26499365_26500025_26500076_26541586_26541728_26543589
tx.23310	chr6	+	2119	2	FSM	ENSMUSG00000030036.9	ENSMUST00000145403.3	684	2	112	-1547	112	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	345	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACCCCTTGCTTTAGACA	6305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83093608	83095879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_83093806_83093957
tx.23312	chr6	+	1505	4	NNC	ENSMUSG00000014747.7	novel	1739	6	NA	NA	437	-1500	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTTGGATTCTTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83740104	83743519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_83740429_83740543_83740744_83742149_83742315_83742703
tx.23313	chr6	-	951	10	NNC	ENSMUSG00000033720.13	novel	849	8	NA	NA	-3	1574	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_1	2.35702260395516	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATGGCACTTTCTGGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85310407	85244121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_85244523_85244853_85244920_85246079_85246137_85246891_85246946_85264031_85264058_85266158_85266214_85266743_85266771_85276521_85276600_85296503_85296573_85310289
tx.23314	chr6	+	1162	7	ISM	ENSMUSG00000071337.12	ENSMUST00000134142.8	3856	11	20044	3	519	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_4	25.0427412415033	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGCCAAACTTGTGCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86401329	86407751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_86401403_86401943_86402053_86402431_86402528_86402642_86402728_86403548_86403673_86404654_86404801_86407222
tx.23315	chr6	-	1823	3	FSM	ENSMUSG00000108079.2	ENSMUST00000205253.2	713	3	-305	-805	-305	805	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTTAAGGTGGTCTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87708435	87706140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_87707210_87707324_87707593_87707949
tx.23316	chr6	+	579	3	NNC	ENSMUSG00000084950.8	novel	1434	2	NA	NA	52	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCTTTGCTTAATCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87957916	87961175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_87958078_87959941_87960091_87960906
tx.23317	chr6	+	1953	2	NNC	ENSMUSG00000015053.15	novel	3135	6	NA	NA	299	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTCGCCTGTTGAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88181725	88184014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_88181841_88182176
tx.23318	chr6	+	309	2	Intergenic	novelGene_1264	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTGCATAGAGTCATTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88187391	88189281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_88187473_88189053
tx.23319	chr6	+	1055	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033182.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTCATGGATTTTGAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88565365	88569769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_88565676_88569024
tx.2332	chr11	+	2044	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069939.9_ENSMUSG00000082038.2	novel	1002	1	NA	NA	-34	194	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATAAATAAATAAATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26662870	26737828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_+_26663590_26736503
tx.23320	chr6	+	1754	2	FSM	ENSMUSG00000033174.18	ENSMUST00000151699.4	443	2	0	-1311	0	1311	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88701451	88704334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_88701554_88702682
tx.23321	chr6	+	805	4	NIC	ENSMUSG00000033174.18	novel	3676	8	NA	NA	3	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.64997911442	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGAGGACTCTGTGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88701478	88743691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_88701554_88702682_88702828_88741577_88741685_88743213
tx.23322	chr6	+	1429	7	NNC	ENSMUSG00000033174.18	novel	460	2	NA	NA	27764	61	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5.27309733985213	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGCAAAGC	4922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88729822	88803033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_88730190_88741577_88741685_88784992_88785130_88786317_88786429_88795555_88795646_88800172_88800389_88802632
tx.23323	chr6	-	1300	7	NNC	ENSMUSG00000045095.17	novel	745	5	NA	NA	-18	5006	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_6	17.7927888014592	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTGCTCTCATTTGCTTT	2647	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93890689	93745590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_93745854_93746488_93746525_93750587_93750671_93762425_93762628_93769327_93769535_93792686_93792807_93890300
tx.23324	chr6	-	1243	4	NNC	ENSMUSG00000045095.17	novel	745	5	NA	NA	-53	148	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.757863302587	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTGGCATGTTTTTCTTA	2612	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93890724	93762135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_93762628_93769327_93769535_93792686_93792807_93890300
tx.23325	chr6	+	1227	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000107900.2	novel	432	2	NA	NA	-315	251	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTTGATCATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95226966	95231747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_95227044_95230597
tx.23326	chr6	-	1216	2	Intergenic	novelGene_1268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAATCCTTTGAGTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97022626	97020652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_97021728_97022485
tx.23327	chr6	-	2974	7	ISM	ENSMUSG00000030075.11	ENSMUST00000032159.7	5183	22	258102	-2	-40364	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.37436854187255	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTCTACATTGTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102183526	102140264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_102142380_102145853_102146023_102147538_102147652_102164000_102164188_102176196_102176313_102180792_102181028_102183487
tx.23328	chr6	-	724	4	Intergenic	novelGene_1272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.471404520791032	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATAGTGTTGTTGCTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107257526	107086630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_107086991_107089349_107089433_107105814_107105912_107257342
tx.23329	chr6	+	805	3	Intergenic	novelGene_1274	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACACTGGTTATCAAATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108548093	108552627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_108548258_108550683_108550806_108552108
tx.2333	chr11	+	2064	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069939.9_ENSMUSG00000082038.2	novel	1002	1	NA	NA	-34	190	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAATAAATAAATAAATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26662870	26737824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_+_26663614_26736503
tx.23330	chr6	+	2916	6	Fusion	ENSMUSG00000090576.3_ENSMUSG00000030103.12	novel	3113	5	NA	NA	1764	-159	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	96.8677448896174	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGGAAGAGAAATGGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108635769	108643727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr6_+_108635950_108637807_108637954_108638121_108638192_108638465_108638574_108639481_108639606_108641439
tx.23331	chr6	+	862	3	ISM	ENSMUSG00000030103.12	ENSMUST00000163617.2	476	4	-225	747	20	618	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	261	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGGACCTACTTTATTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108637609	108638913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_108637954_108638121_108638192_108638465
tx.23332	chr6	-	1909	3	ISM	ENSMUSG00000030257.17	ENSMUST00000060215.12	2482	10	0	49311	0	-20455	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_2	4.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGGTTTTACCCAG	6453	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112924227	112792835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_112793715_112806399_112806593_112923390
tx.23333	chr6	+	1400	9	ISM	ENSMUSG00000030269.15	ENSMUST00000113146.9	2676	19	28129	190	-2	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	298	junction_7	32.918222537069	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCATTAGCATTTCATCC	5041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113242932	113258163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_113243017_113243220_113243298_113243519_113243557_113245588_113245657_113246461_113246521_113246692_113246832_113247482_113247663_113254750_113254907_113257563
tx.23334	chr6	-	1930	3	FSM	ENSMUSG00000045009.10	ENSMUST00000205170.2	1903	3	-26	-1	18	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGTTGTGTTGTTTCTTG	4303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113478874	113473227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_113474049_113474232_113475278_113478810
tx.23335	chr6	+	1762	6	NNC	ENSMUSG00000056952.14	novel	3096	8	NA	NA	-752	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.0591260281974	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCACATGTGGATATATATAA	7990	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113681025	113688030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_113681868_113684226_113684355_113686420_113686605_113686782_113686881_113687001_113687176_113687694
tx.23336	chr6	-	2338	12	NIC	ENSMUSG00000030302.18	novel	4586	24	NA	NA	36	13867	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	21	junction_4	6.72972928120791	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGGACATGGTTTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113868295	113766431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_113766957_113770626_113770842_113773199_113773359_113774070_113774113_113779446_113779507_113780707_113780741_113782421_113782548_113789745_113789872_113790747_113791006_113794108_113794307_113819092_113819607_113868213
tx.23337	chr6	+	1168	3	NNC	ENSMUSG00000030314.17	novel	3761	19	NA	NA	44379	-661	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	76	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114744439	114836912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_114744524_114753917_114754041_114835951
tx.23338	chr6	-	960	6	NNC	ENSMUSG00000107704.2	novel	639	3	NA	NA	-7687	-7484	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.46969384566991	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGAGCACATTCCATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115521548	115513575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_115513925_115515501_115515577_115515894_115516146_115521077_115521203_115521302_115521365_115521450
tx.2334	chr11	-	1937	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000080987.2	novel	524	1	NA	NA	-3	69826	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTATTTATTTTTTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26806913	26736560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_26737926_26806341
tx.23340	chr6	-	1398	11	FSM	ENSMUSG00000042129.9	ENSMUST00000035842.7	6460	11	111	4951	-32	1265	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	5.29528091794949	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAGTATGGCCAGCCTTGT	8717	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116650802	116614919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_116615260_116616401_116616500_116617193_116617316_116618388_116618441_116618645_116618748_116622056_116622218_116622846_116622939_116624527_116624671_116636485_116636562_116638803_116638898_116650684
tx.23341	chr6	+	1864	13	NNC	ENSMUSG00000030134.12	novel	2227	13	NA	NA	-27	-323	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	10.2912449306302	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTTAAAGAACCCAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118043352	118067138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_118043424_118057318_118057523_118059974_118060098_118061381_118061520_118062224_118062451_118062733_118062809_118063177_118063271_118063987_118064091_118064167_118064248_118065069_118065262_118066063_118066188_118066395_118066469_118066776
tx.23342	chr6	-	3648	6	FSM	ENSMUSG00000030145.15	ENSMUST00000069292.14	3683	6	24	11	-2	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_5	4.48998886412873	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCTTGGAATTTCATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118432465	118404290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_118407356_118409817_118409908_118410265_118410393_118430806_118430849_118431637_118431873_118432376
tx.23343	chr6	-	754	6	FSM	ENSMUSG00000072623.7	ENSMUST00000161170.2	3968	6	9	3205	9	1624	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.01980390271856	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCTGTCGTCTCTCACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118456272	118442115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_118442362_118442795_118442860_118443788_118443882_118444199_118444327_118454267_118454386_118456166
tx.23344	chr6	-	3022	9	ISM	ENSMUSG00000007827.11	ENSMUST00000112830.3	6930	34	43820	11	4829	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_5	10.1665812837945	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAGAATTTCATACATGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118495367	118478279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_118480118_118482686_118482733_118483336_118483566_118484598_118484814_118485450_118485742_118488526_118488657_118492741_118492855_118494856_118494951_118495301
tx.23345	chr6	-	273	3	ISM	ENSMUSG00000007827.11	ENSMUST00000112830.3	6930	34	43820	14473	4829	2374	internal_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_1	4.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGGTTTTACTGTTTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118495367	118492741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_118492855_118494856_118494951_118495301
tx.23346	chr6	-	1715	14	NNC	ENSMUSG00000007827.11	novel	389	3	NA	NA	-37	2701	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	14.8272099144159	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTGCAGTGGATCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118539224	118517183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_118517270_118517396_118517511_118519850_118519945_118525274_118525337_118525790_118525921_118526346_118526499_118526598_118526660_118528929_118529003_118529706_118529741_118531164_118531227_118533156_118533264_118535898_118536073_118536231_118536347_118538773
tx.23347	chr6	+	948	8	NIC	ENSMUSG00000041477.15	novel	1748	9	NA	NA	-16	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_6	20.0987358725237	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTCTGGGGGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119152232	119197167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_119152404_119157025_119157067_119160610_119160739_119175888_119175956_119177782_119177913_119183430_119183560_119194862_119194941_119196963
tx.23348	chr6	+	1044	8	NIC	ENSMUSG00000041477.15	novel	3313	9	NA	NA	-13	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_6	20.0987358725237	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTCTGGGGGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119152235	119197167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_119152404_119157025_119157067_119160610_119160739_119175888_119175956_119177782_119177913_119183430_119183560_119194763_119194941_119196963
tx.23349	chr6	+	1951	9	NNC	ENSMUSG00000041477.15	novel	3313	9	NA	NA	-14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_7	15.8981130955846	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGATGTCTGGGGGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119152234	119197167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_119152404_119157025_119157067_119160610_119160739_119175888_119175956_119177782_119177913_119183430_119183560_119191730_119192568_119194694_119194941_119196963
tx.2335	chr11	+	1983	11	FSM	ENSMUSG00000020467.16	ENSMUST00000020759.12	2037	11	48	6	8	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_10	1.00498756211209	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAATCTGCCATGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28803251	28876737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_28803325_28804464_28804555_28817465_28817515_28817652_28818040_28860609_28860733_28864587_28864708_28865660_28865781_28866849_28866970_28871402_28871527_28871610_28871807_28876156
tx.23350	chr6	-	383	2	ISM	ENSMUSG00000051586.18	ENSMUST00000205030.2	673	5	13079	-3	-6033	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATTTGTCCTTTAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120986146	120984198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_120984391_120985955
tx.23351	chr6	+	1335	4	NNC	ENSMUSG00000030137.9	novel	2263	5	NA	NA	-8367	-3311	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0.471404520791032	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACAATGGTTTCATTCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121179287	121200502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_121179441_121197342_121197566_121198259_121198409_121199692
tx.23352	chr6	-	2527	5	ISM	ENSMUSG00000040669.15	ENSMUST00000161054.8	3612	14	-6	13468	5	1354	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	760	junction_4	137.68691840549	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAAAAAACCCTCAAAATAA	9083	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122316610	122308276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_122310400_122311028_122311110_122311931_122312043_122313816_122313975_122316556
tx.23353	chr6	-	457	3	Intergenic	novelGene_1280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATGCACGTATTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122893525	122882011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_122882222_122882853_122882931_122893355
tx.23354	chr6	-	786	6	NNC	ENSMUSG00000005069.13	novel	3148	16	NA	NA	-6	-1436	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	48.6431906848225	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTATGTGTATATTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124392032	124382707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_124382928_124390227_124390360_124390527_124390661_124390965_124391002_124391245_124391410_124391931
tx.23355	chr6	-	577	4	ISM	ENSMUSG00000004263.16	ENSMUST00000088357.12	4433	10	191	6580	191	-1405	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_3	16.2138486760204	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATTTGAGTGGTCCTGCC	9406	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124733296	124726086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_124726313_124726424_124726563_124726709_124726885_124733258
tx.23356	chr6	+	1823	4	ISM	ENSMUSG00000030329.12	ENSMUST00000162170.8	2053	6	919	0	-306	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_3	7.1336448530109	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTAGTTGCCTGTTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124976318	124980059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_124976704_124977616_124977699_124978389_124978612_124978925
tx.23357	chr6	+	1152	5	ISM	ENSMUSG00000038271.18	ENSMUST00000135559.8	2868	9	6390	793	-932	-74	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_2	18.8065812948553	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCGTGTGAAGCAGATTCAT	6891	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125129378	125137946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_125129735_125130004_125130126_125130372_125130466_125136024_125136156_125137495
tx.23358	chr6	-	4598	32	FSM	ENSMUSG00000038252.14	ENSMUST00000043848.11	4629	32	31	0	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	436	junction_21	78.9640126675822	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATCCTGTCCTGGCTGGTC	3426	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125168633	125144969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_125145283_125145552_125145712_125145825_125145953_125146777_125146962_125147096_125147178_125147689_125147785_125147878_125148057_125148360_125148517_125148598_125148723_125148795_125148911_125149952_125150126_125150322_125150488_125150563_125150649_125150742_125150876_125151187_125151322_125153105_125153191_125153614_125153790_125154290_125154516_125154771_125154888_125156200_125156376_125156475_125156564_125156657_125156793_125157941_125158140_125160876_125161025_125161191_125161316_125161397_125161526_125162656_125162800_125163062_125163245_125163716_125163776_125164039_125164116_125166725_125166872_125168460
tx.23359	chr6	+	1061	5	FSM	ENSMUSG00000030337.17	ENSMUST00000063588.11	1400	5	78	261	78	-261	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.6393596310755	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTAGGTTCCGGCTCTTTG	428	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125192621	125217951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_125192691_125195536_125195664_125195873_125196033_125196548_125196601_125217297
tx.2336	chr11	+	2565	28	NNC	ENSMUSG00000020464.16	novel	2707	28	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_19	125.489275633577	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATTTTTATATCTTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29080745	29111680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_29080919_29082844_29082906_29083851_29083927_29084599_29084706_29085513_29085564_29087095_29087160_29087252_29087301_29088155_29088270_29088417_29088605_29089223_29089276_29089947_29090006_29091223_29091321_29091663_29091767_29095428_29095500_29096795_29096833_29097297_29097365_29097443_29097534_29098277_29098332_29103231_29103343_29104143_29104216_29104301_29104366_29104815_29104900_29105714_29105799_29106836_29106944_29107024_29107081_29109324_29109404_29110157_29110206_29111327
tx.23360	chr6	+	1428	5	NNC	ENSMUSG00000101191.7	novel	782	4	NA	NA	14	569	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1.87082869338697	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGAATTCAAAATCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125458339	125462210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_125458438_125459526_125459666_125460220_125460312_125460403_125460533_125461239
tx.23361	chr6	-	692	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000001930.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	7	1	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAAACCCTGTGCATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125561326	125560307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_125560818_125561144
tx.23366	chr6	-	1505	11	ISM	ENSMUSG00000030353.16	ENSMUST00000006311.13	3076	12	29709	1034	4473	4	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	52	junction_4	17.7087548969429	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGAGCTAGTTTGGCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128248067	128205139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_128205443_128205530_128205684_128207554_128207696_128219363_128219538_128220332_128220473_128223283_128223340_128223780_128223825_128224922_128225052_128228502_128228566_128228884_128228950_128247830
tx.23367	chr6	+	1031	3	NNC	ENSMUSG00000059659.8	novel	3694	3	NA	NA	46	-32569	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAGAAGAAACAGAAATGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128415765	128420011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_128416351_128416477_128416660_128419747
tx.23368	chr6	+	4148	13	FSM	ENSMUSG00000030207.16	ENSMUST00000111915.8	4221	13	69	4	-63	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	64	junction_6	10.7558123821495	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATACACGTGTGTCCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135175043	135213236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_135175100_135186030_135186430_135188832_135188932_135193883_135194076_135195676_135195808_135202137_135202286_135202653_135202796_135203847_135203992_135204150_135204233_135205410_135205567_135208618_135208737_135210253_135210475_135210976
tx.23369	chr6	+	943	2	FSM	ENSMUSG00000060032.7	ENSMUST00000203982.2	577	2	-89	-277	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGTCTTGACAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136785241	136787068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_136785713_136786596
tx.2337	chr11	+	686	6	ISM	ENSMUSG00000020464.16	ENSMUST00000154924.8	3368	27	25012	0	17569	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	581	junction_3	21.8229237271269	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATTTTTATATCTTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29105755	29111680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_29105799_29106836_29106944_29107024_29107081_29109324_29109404_29110157_29110206_29111327
tx.23373	chr6	+	2074	6	ISM	ENSMUSG00000030282.15	ENSMUST00000032419.9	1760	8	7601	2226	-5679	-1176	internal_fragment	FALSE	canonical	3	691	junction_2	57.9565354382058	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTATGGCTTAAACACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142710012	142719214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_142710156_142710279_142710436_142713529_142713664_142716248_142716344_142716891_142717064_142717840
tx.23374	chr6	-	1736	5	NNC	ENSMUSG00000030283.8	novel	8991	5	NA	NA	-25319	50	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.88960949469487	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGTTAAGTCTACTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142935497	142773907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_142774997_142813579_142813673_142822373_142822484_142859749_142859895_142935198
tx.23379	chr6	-	1716	4	ISM	ENSMUSG00000030265.15	ENSMUST00000032399.12	4678	5	3421	2773	3352	508	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	862	junction_1	97.5329004319397	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCGATGTTCGCTTCAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145192544	145165197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_145166451_145177820_145177981_145179973_145180153_145192420
tx.2338	chr11	+	691	2	ISM	ENSMUSG00000020463.16	ENSMUST00000102856.9	2410	12	-77	34913	-77	-13622	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	338	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGTAGTTGTTTATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29122812	29124728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_29123448_29124672
tx.23380	chr6	+	2273	3	FSM	ENSMUSG00000030255.14	ENSMUST00000032383.14	4431	3	32	2126	32	-2126	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAGAAAAAAAAAGGGGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145879879	145908823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_145880098_145901320_145901408_145906855
tx.23383	chr6	-	1754	3	FSM	ENSMUSG00000072662.3	ENSMUST00000100780.3	1125	3	47	-676	16	676	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACAGTTTCCTCAGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146988483	146975881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_146977263_146983083_146983219_146988245
tx.23384	chr6	+	2291	13	NIC	ENSMUSG00000030301.18	novel	2459	13	NA	NA	1	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	10	junction_1	22.1514672200286	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTGATTGTCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147377369	147534107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_+_147377394_147409281_147409326_147412321_147412401_147435526_147435688_147437085_147437290_147438873_147438979_147464132_147464211_147476970_147477079_147491884_147491978_147492066_147492136_147493536_147493714_147508379_147508494_147533072
tx.23385	chr6	-	669	4	ISM	ENSMUSG00000040029.16	ENSMUST00000145960.2	1262	10	-8	16048	-8	1339	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_3	12.7627931460511	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTTCATTTCTACTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148732932	148719461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_148719621_148723092_148723250_148725901_148725984_148732661
tx.23387	chr6	+	918	2	FSM	ENSMUSG00000032712.17	ENSMUST00000137983.2	466	2	-182	-270	-23	270	multi-exon	FALSE	canonical	3	211	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATTTTATTTTTTGCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149210888	149212223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_149211403_149211819
tx.23389	chr7	-	1943	4	ISM	ENSMUSG00000054753.10	ENSMUST00000205185.2	3361	10	6058	0	6058	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	263	junction_1	1.63299316185545	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGACTTTATTTTTCTGTG	8723	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3208273	3204497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_3205949_3206105_3206215_3207744_3207912_3208057
tx.2339	chr11	+	2338	12	NNC	ENSMUSG00000020463.16	novel	2410	12	NA	NA	76	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	94.9315542904465	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTTTTTATTCTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29122965	29159641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_29123448_29124672_29124733_29132446_29132546_29137950_29138575_29144572_29144651_29146173_29146291_29147092_29147210_29148792_29148925_29150700_29150804_29152866_29152909_29155545_29155705_29159316
tx.23390	chr7	-	1888	3	NIC	ENSMUSG00000054753.10	novel	3449	12	NA	NA	43	1295	intron_retention	FALSE	canonical	3	117	junction_2	68.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTTTTTTGGAGACAGGGT	9549	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3218986	3210863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_3212201_3213722_3214128_3218840
tx.23395	chr7	+	1470	7	Fusion	ENSMUSG00000109549.2_ENSMUSG00000035228.16	novel	1534	5	NA	NA	-622	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.86577664134866	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGCCCCAGGTCTTACTA	125	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5056848	5063784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr7_+_5057035_5057499_5057552_5060497_5060659_5060797_5060903_5060990_5061168_5062494_5062705_5063205
tx.23397	chr7	+	740	2	ISM	ENSMUSG00000035228.16	ENSMUST00000045543.8	1534	5	2348	0	2348	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGCCCCAGGTCTTACTA	282	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5062543	5063784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_5062705_5063205
tx.23398	chr7	+	1588	4	ISM	ENSMUSG00000044876.16	ENSMUST00000108566.8	1648	5	1467	0	6	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_1	65.0350332940297	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTCTGACTCTCCGGTGTTG	4434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6176978	6193420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_6177101_6186860_6187202_6191132_6191242_6192404
tx.234	chr1	-	797	3	ISM	ENSMUSG00000026095.16	ENSMUST00000027264.10	2442	6	5466	20	3989	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	502	junction_1	45	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGTAGTAGTTTCACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53386445	53383795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_53384139_53385738_53385921_53386173
tx.2340	chr11	+	5044	16	NNC	ENSMUSG00000020463.16	novel	5125	16	NA	NA	77	-8	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	84.3834106919127	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAACAGATTCACGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29122966	29170789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_29123448_29124672_29124733_29132446_29132546_29137950_29138575_29144572_29144651_29146173_29146291_29147092_29147210_29148792_29148925_29150700_29150804_29152866_29152909_29155545_29155705_29159316_29159487_29161115_29161256_29161606_29161792_29163593_29163797_29168455
tx.23400	chr7	+	1155	2	FSM	ENSMUSG00000109398.3	ENSMUST00000208865.2	1140	2	-9	-6	1	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAGAAAAAAAA	3013	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6346758	6350395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_6346862_6349343
tx.23401	chr7	+	1871	5	FSM	ENSMUSG00000055150.16	ENSMUST00000207347.2	3883	5	-30	2042	-30	176	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	5.71729831301464	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATCATTGGTGAGTTCTT	2924	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6366248	6382666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_6366347_6374304_6374396_6376125_6376253_6378517_6378614_6381207
tx.23404	chr7	+	473	2	Intergenic	novelGene_1174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCTCTGAATTTTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16489142	16490159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_16489214_16489757
tx.23405	chr7	+	1867	10	ISM	ENSMUSG00000030374.16	ENSMUST00000108495.9	3082	18	15193	2	411	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	416	junction_5	49.8429632712013	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGATAGGTTTTCCAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16565434	16574850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_16565506_16566850_16567027_16567102_16567151_16567799_16567922_16571486_16571658_16571773_16571915_16572194_16572294_16572487_16572575_16573665_16573898_16574130
tx.23406	chr7	+	1564	7	ISM	ENSMUSG00000030374.16	ENSMUST00000108495.9	3082	18	17570	-2	722	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	416	junction_2	55.6147462459373	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGGTTTTCCAGGCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16567811	16574854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_16567922_16571486_16571658_16571773_16571915_16572194_16572294_16572487_16572575_16573665_16573898_16574130
tx.23407	chr7	-	497	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030411.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGCGGGGCGTGGTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18692063	18691263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_18691587_18691889
tx.23408	chr7	-	613	2	ISM	ENSMUSG00000086533.3	ENSMUST00000206381.2	473	3	3	1233	3	-1233	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCCCCAGTCTATTTATTT	10	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18735128	18732418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_18732925_18735021
tx.2341	chr11	-	1566	10	FSM	ENSMUSG00000020462.15	ENSMUST00000020754.10	1664	10	98	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	210	junction_4	19.5037191768236	799	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGATGTTTTCTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29197311	29171531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_29171986_29172433_29172584_29172743_29172884_29175856_29175960_29179907_29179960_29180585_29180674_29184357_29184473_29194058_29194161_29195085_29195151_29197014
tx.23411	chr7	+	532	3	NNC	ENSMUSG00000090075.2	novel	338	2	NA	NA	-59	156	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTTTGCCTTAATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19654594	19661688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_19654715_19657086_19657134_19661323
tx.23412	chr7	-	932	3	FSM	ENSMUSG00000040498.8	ENSMUST00000207513.2	883	3	-48	-1	-37	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTAGGCTGTGGCTTAG	8191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19684718	19675571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_19675945_19678628_19678839_19684369
tx.23414	chr7	+	3206	5	NNC	ENSMUSG00000068962.8	novel	1037	4	NA	NA	-22	-6	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	3	junction_1	13.4047566184545	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23874462	23882607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_23874575_23874867_23874967_23875533_23875592_23877174_23877302_23879797
tx.23415	chr7	-	1029	2	Intergenic	novelGene_1175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTGCCTTGGCCATGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23968084	23966234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_23967003_23967823
tx.23418	chr7	-	1210	8	NIC	ENSMUSG00000040725.14	novel	1240	8	NA	NA	-19	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	462.561457582467	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCCACATCCGATTTCTTT	9523	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25454201	25436013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_25436187_25440252_25440366_25442351_25442452_25444517_25444658_25445772_25445847_25447747_25447902_25450289_25450416_25453871
tx.23419	chr7	+	614	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000092367.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCGTTGAGGAGTACGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27054160	27055658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_27054214_27054846_27054919_27055169
tx.2342	chr11	-	621	5	NNC	ENSMUSG00000020460.16	novel	791	6	NA	NA	20	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5966.04937856703	27985	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGTATTGTGCTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29497840	29495845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_29496030_29496290_29496423_29496702_29496789_29497201_29497261_29497680
tx.23423	chr7	-	3987	7	NNC	ENSMUSG00000096916.8	novel	6163	6	NA	NA	-40	1482	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	46	junction_3	46.6491038380041	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCCTCTACAGTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27713580	27686654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_27689948_27704643_27704743_27704891_27705052_27706738_27706866_27707808_27707862_27711760_27711876_27713440
tx.23424	chr7	+	1007	6	NNC	ENSMUSG00000037463.15	novel	1946	6	NA	NA	-20	994	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_5	22.9294570367464	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCCTTGGTCATGGTATC	8825	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28392253	28399757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_28392398_28392694_28393076_28394155_28394268_28394430_28394527_28396064_28396201_28399619
tx.23425	chr7	+	2362	4	NIC	ENSMUSG00000051735.8	novel	2898	12	NA	NA	-912	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	41	junction_1	2.86744175568088	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGACGAGCAATGGAGGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28495450	28498379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_28496372_28496534_28496667_28496984_28497149_28497234
tx.23426	chr7	-	1077	7	NNC	ENSMUSG00000030590.16	novel	1293	8	NA	NA	-7	0	intron_retention	FALSE	canonical	2	3	junction_5	136.022567572035	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGATCTTGTTTCTGTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28855635	28851934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_28852273_28852746_28852915_28853843_28853961_28854040_28854119_28854576_28854737_28855099_28855235_28855554
tx.23427	chr7	-	899	6	ISM	ENSMUSG00000030590.16	ENSMUST00000147561.8	2169	7	-22	1766	-2	-771	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	257	junction_1	26.5179184703476	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTGTCTTACCTGTATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28855630	28853702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_28853961_28854040_28854119_28854576_28854783_28855099_28855235_28855309_28855456_28855554
tx.23429	chr7	-	3693	5	NIC	ENSMUSG00000059975.16	novel	3711	5	NA	NA	-38	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_4	18.3626659284539	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGTGGATATTGCTCGTGG	5340	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29643218	29632215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_29635469_29637024_29637121_29637366_29637494_29642915_29642971_29643056
tx.2343	chr11	-	590	6	NNC	ENSMUSG00000020460.16	novel	791	6	NA	NA	-13	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	5362.30439270282	24441	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGTATTGTGCTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29497904	29495845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_29496030_29496290_29496423_29496702_29496789_29497201_29497261_29497680_29497746_29497840
tx.23430	chr7	-	3604	6	NNC	ENSMUSG00000059975.16	novel	3711	5	NA	NA	32	-305	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_5	15.0119952038362	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGAATAGTCTATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29653480	29632520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_29635469_29637024_29637121_29637366_29637494_29642915_29642971_29651138_29651316_29653279
tx.23431	chr7	+	1712	6	NIC	ENSMUSG00000074221.13	novel	4005	10	NA	NA	-31	9791	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	228	junction_5	18.2362276800878	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTTGTATGTTGTTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29683348	29698468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_29683654_29684684_29684752_29687006_29687232_29688473_29688533_29697174_29697302_29697539
tx.23432	chr7	-	608	2	ISM	ENSMUSG00000053985.11	ENSMUST00000207072.2	2835	5	4	13030	4	-11868	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATCTCTGTCTCTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29750794	29749345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_29749929_29750769
tx.23433	chr7	+	2111	5	NNC	ENSMUSG00000074220.11	novel	2117	5	NA	NA	6	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_4	11.4537111889553	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAAAATGAAGGCTTCAT	5265	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29821372	29834378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_29821502_29825192_29825267_29830125_29830253_29830956_29831050_29832690
tx.23434	chr7	-	1056	5	NNC	ENSMUSG00000037029.9	novel	585	3	NA	NA	-16	4039	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.0908022893437	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTGGGCTATTTGATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29869132	29856654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_29857264_29858818_29858943_29859451_29859583_29862510_29862654_29869083
tx.23435	chr7	-	2947	2	NIC	ENSMUSG00000037029.9	novel	585	3	NA	NA	4	777	intron_retention	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATATTCTTAAATCCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29869148	29859916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_29862799_29869083
tx.23438	chr7	+	1575	12	NNC	ENSMUSG00000036931.16	novel	2000	12	NA	NA	-5	-449	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	5.20965410250706	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGGGTCTTACATTAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30121825	30127721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_30121940_30122827_30122929_30123059_30123121_30123664_30123877_30124646_30124835_30124926_30125033_30125133_30125281_30125394_30125447_30125540_30125690_30126492_30126610_30126850_30127016_30127558
tx.23439	chr7	+	1379	2	ISM	ENSMUSG00000036854.15	ENSMUST00000044048.8	1363	3	710	3	93	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTGCCTTATGTCTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30253402	30254865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_30253810_30253893
tx.2344	chr11	+	1562	7	ISM	ENSMUSG00000020458.17	ENSMUST00000102841.8	4060	9	14888	0	-9901	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	386	junction_1	197.502250338797	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGTGTTTAGTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29658661	29692916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_29658771_29683632_29683841_29686359_29686499_29690980_29691051_29691499_29691547_29691694_29691754_29691986
tx.23441	chr7	+	781	5	NNC	ENSMUSG00000060962.13	novel	662	7	NA	NA	984	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTCTCTTGACTCCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30476809	30480489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_30477081_30477186_30477235_30477625_30477695_30479237_30479306_30480164
tx.23442	chr7	+	429	2	ISM	ENSMUSG00000060962.13	ENSMUST00000041703.10	662	7	3376	-1	3376	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTCTCTTGACTCCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30479201	30480489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_30479306_30480164
tx.23444	chr7	+	561	3	NNC	ENSMUSG00000086184.2	novel	617	2	NA	NA	205	195	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	0.5	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGGGGGCTCTGTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34088294	34094399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_34088434_34093931_34093981_34094026
tx.23445	chr7	-	2322	7	NNC	ENSMUSG00000030499.10	novel	2407	7	NA	NA	279	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_6	13.6065752079239	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGAGGCTCCGTCCTGTG	5967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34354655	34338439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_34339875_34341232_34341539_34344262_34344408_34349380_34349557_34350171_34350265_34352008_34352108_34354587
tx.23446	chr7	+	1871	9	ISM	ENSMUSG00000030494.14	ENSMUST00000032705.13	3508	15	67	14499	67	-3832	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_1	9.52299847737046	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCCGACTTATTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35033661	35077215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_35033837_35053156_35053273_35060404_35060534_35063041_35063118_35070133_35070212_35070539_35070665_35071729_35071897_35075584_35075773_35076398
tx.23447	chr7	+	3111	16	NNC	ENSMUSG00000030494.14	novel	3046	16	NA	NA	-59	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_15	29.2524642836577	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCTTTTTTCTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35033695	35091712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_35033837_35053156_35053273_35060404_35060534_35063041_35063118_35070133_35070212_35070539_35070665_35071729_35071897_35075584_35075773_35076398_35076556_35078989_35079110_35080761_35080957_35083393_35083471_35084062_35084210_35084751_35084908_35090179_35090736_35091029
tx.23448	chr7	+	1848	6	NNC	ENSMUSG00000030494.14	novel	3508	15	NA	NA	601	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	55.0003636351615	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCTTTTTTCTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35082590	35091712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_35082820_35083393_35083471_35084062_35084210_35084751_35084908_35090179_35090736_35091029
tx.23449	chr7	-	2887	6	FSM	ENSMUSG00000044452.11	ENSMUST00000187282.3	944	6	-17	-1926	2	-321	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_4	23.3957261054236	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCCATTCACTGATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35502409	35473472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_35475753_35475862_35475998_35487142_35487258_35491072_35491188_35500862_35500954_35502258
tx.2345	chr11	+	1623	7	FSM	ENSMUSG00000020458.17	ENSMUST00000060992.6	1773	7	150	0	150	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	322.410409605866	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGTGTTTAGTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29668712	29692916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_29668883_29683632_29683841_29686359_29686499_29690980_29691051_29691499_29691547_29691694_29691754_29691986
tx.23450	chr7	-	249	2	FSM	ENSMUSG00000044452.11	ENSMUST00000144656.2	640	2	-40	431	-5	-431	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGTAAGTCACTTACATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35502419	35500865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_35500954_35502258
tx.23451	chr7	+	525	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000066543.9	novel	555	1	NA	NA	-37	47	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAATTCCTTTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35817661	35818300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_+_35817801_35817914
tx.23452	chr7	+	1775	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043456.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTCAACTTCTATTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37178862	37181235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_37178931_37179528
tx.23453	chr7	+	1654	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043456.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	4	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCAACTTCTATTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37179202	37181236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_37179284_37179528_37179678_37179812
tx.23458	chr7	-	2750	4	FSM	ENSMUSG00000056383.11	ENSMUST00000071804.10	2671	4	-79	0	-27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_3	27.3901847788988	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTTTTTTCTGACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41042763	41022346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_41024799_41025914_41025973_41026169_41026297_41042650
tx.23459	chr7	-	375	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000099210.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGGACAGCATCAGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43107205	43105899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_43106047_43106977
tx.2346	chr11	-	1149	3	NNC	ENSMUSG00000044072.15	novel	8083	42	NA	NA	-6	-213363	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGTGACTCATGAAAAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29976039	29972705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_29972984_29974379_29975101_29975889
tx.23460	chr7	+	1193	6	FSM	ENSMUSG00000030713.7	ENSMUST00000032955.7	1895	6	151	551	151	-551	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.489897948556636	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGATTGAACCAAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43460868	43465232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_43460918_43461346_43461452_43461783_43461926_43462218_43462467_43462653_43462791_43464720
tx.23461	chr7	+	958	3	ISM	ENSMUSG00000066515.4	ENSMUST00000085450.4	889	5	2730	0	2730	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCAAGGTCTGACATTCTC	3278	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43850344	43851776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_43850963_43851061_43851199_43851573
tx.23462	chr7	-	941	3	NIC	ENSMUSG00000038782.8	novel	1306	5	NA	NA	32	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGTATCTGACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896087	43879352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_43880066_43880749_43880897_43896006
tx.23463	chr7	+	3154	6	NNC	ENSMUSG00000045411.17	novel	2092	7	NA	NA	0	1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	301.065707113912	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGGGTGTGCTGTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896210	43901740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_43897488_43897675_43897720_43898965_43899024_43899444_43899484_43899732_43899765_43900036
tx.23464	chr7	-	1984	10	NIC	ENSMUSG00000060601.14	novel	1988	10	NA	NA	0	7	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	1	2	junction_9	218.641823340321	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAAGCCATTCCTGAGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44203372	44199048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_44199556_44199723_44199933_44200168_44200269_44200741_44200922_44201023_44201284_44201378_44201661_44201930_44202045_44202120_44202179_44203002_44203133_44203228
tx.23465	chr7	+	716	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030739.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTGTGTGACTGAGTGT	2233	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44263696	44269610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_44263850_44269047
tx.23466	chr7	-	1072	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000066500.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCCATCTCTGAAGTGAG	1497	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44358352	44352735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_44353288_44353534_44353804_44358101
tx.23467	chr7	+	776	6	NIC	ENSMUSG00000066500.6	novel	490	6	NA	NA	-73	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.56124969497314	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGTCTGTACATTCCCTG	115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44358092	44369269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_44358399_44358479_44358555_44359678_44359766_44362421_44362503_44364751_44364876_44369166
tx.23468	chr7	-	437	4	NIC	ENSMUSG00000038502.18	novel	657	7	NA	NA	178	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	13	junction_3	322.267314852472	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGCTGTCCCTCCCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44514081	44512491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_44512619_44512802_44512869_44512958_44513157_44514035
tx.23469	chr7	-	550	4	ISM	ENSMUSG00000002968.10	ENSMUST00000003049.8	2619	18	12124	0	720	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	805	junction_1	71.6426316285678	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGGCTCCCGTGACTGACG	4293	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44530012	44528807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44528939_44529350_44529529_44529675_44529895_44529990
tx.2347	chr11	-	893	4	ISM	ENSMUSG00000020315.19	ENSMUST00000102838.10	9107	31	12	44818	12	-41655	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	341	junction_1	38.8615777114391	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCTAAGGATGCATTGCT	1832	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30148245	30101602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_30101648_30104228_30104403_30109293_30109446_30147723
tx.23470	chr7	-	1961	15	NIC	ENSMUSG00000002968.10	novel	2619	18	NA	NA	-1554	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	175	junction_9	192.847632040618	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCCGGCTCCCGTGACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44535688	44528809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_44528939_44529350_44529529_44529675_44529895_44529990_44530063_44530346_44530536_44532182_44532291_44532391_44532450_44532522_44532609_44533542_44533675_44533986_44534181_44534256_44534345_44534503_44534635_44534762_44534926_44535207_44535329_44535595
tx.23471	chr7	-	803	5	ISM	ENSMUSG00000060279.15	ENSMUST00000107857.11	3301	23	27793	-7	61	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	615	junction_3	61.1739323568462	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCAGCTATTGACTGCCCA	2871	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44551057	44549801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_44550240_44550410_44550546_44550660_44550731_44550807_44550925_44551014
tx.23472	chr7	-	384	2	Intergenic	novelGene_1183	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGAAGAAGAAGTGT	4691	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44865157	44864064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_44864400_44865108
tx.23473	chr7	+	1038	4	NIC	ENSMUSG00000094152.6	novel	2865	13	NA	NA	-83	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_2	8.01387685344754	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGCGTGAGGCTCGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44917490	44922789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_44917623_44917871_44918074_44918196_44918357_44922245
tx.23474	chr7	-	668	2	NNC	ENSMUSG00000110144.2	novel	530	2	NA	NA	134	153	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGCCTAATCCTGTCCC	9535	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45200905	45199804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_45200412_45200844
tx.23475	chr7	-	651	2	NNC	ENSMUSG00000110144.2	novel	530	2	NA	NA	-7915	53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGTGCAATCATTACTGT	3175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45208954	45199904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_45200412_45208810
tx.23476	chr7	-	728	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000109632.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGTATGTATGTGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45247074	45242503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_45242797_45246639
tx.23477	chr7	-	2613	6	FSM	ENSMUSG00000057342.16	ENSMUST00000210060.2	2577	6	-37	1	-37	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_5	47.003829631212	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCGACATCCCTTTCAGT	3225	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45367363	45359691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_45361236_45361481_45361598_45361680_45361776_45361879_45362030_45362683_45363153_45367124
tx.23478	chr7	+	756	3	NNC	ENSMUSG00000062044.17	novel	5051	16	NA	NA	12917	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGGCCTGTGTGTATTTGG	1098	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45450088	45453568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_45450194_45450335_45450474_45453055
tx.23479	chr7	-	877	2	NNC	ENSMUSG00000043262.17	novel	4616	12	NA	NA	30788	782	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGGAGACATAAGGCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46574997	46572181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_46572335_46574273
tx.2348	chr11	-	871	3	ISM	ENSMUSG00000020315.19	ENSMUST00000102838.10	9107	31	-11	47444	-11	-44281	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	375	junction_1	30	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGGAGCTTGGCCTAAAG	1809	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30148268	30104228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_30104403_30109293_30109446_30147723
tx.23480	chr7	+	1140	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000078636.5	novel	1232	1	NA	NA	-20	17	multi-exon	FALSE	canonical	2	157	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGAGGCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51396374	51397643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_+_51396454_51396582
tx.23481	chr7	-	2051	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000109086.2	novel	2421	1	NA	NA	374	830	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGAGAAAATGTACAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57530600	57527723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_57529230_57530055
tx.23482	chr7	-	420	2	Intergenic	novelGene_1185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTACATTATTTTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58579986	58579042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_58579356_58579879
tx.23483	chr7	+	942	5	ISM	ENSMUSG00000030523.19	ENSMUST00000206263.2	5493	27	41343	31758	-53	-4579	internal_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.29903810567666	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGGTTTGAATATGTAAAC	907	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63876642	63887747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_63876757_63879804_63880034_63884705_63884829_63885493_63885626_63887403
tx.23484	chr7	-	1740	3	NNC	ENSMUSG00000093405.2	novel	380	2	NA	NA	-14	1748	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	15	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATATATCATATATATTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65511754	65509005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_65510336_65510737_65510986_65511592
tx.23485	chr7	-	841	3	NNC	ENSMUSG00000093405.2	novel	380	2	NA	NA	-24	1052	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	16.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTGCCTGTGAGTTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65511764	65509701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_65510123_65510737_65510986_65511592
tx.23486	chr7	-	636	4	Intergenic	novelGene_1189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTATTTATTTTTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66142572	66125956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_66126288_66127398_66127505_66132217_66132320_66142475
tx.23487	chr7	-	4958	7	NIC	ENSMUSG00000030509.18	novel	4928	6	NA	NA	8	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	29	junction_2	17.1407571465077	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATACTGAATTTGTGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66339287	66294314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_66297674_66309397_66310004_66327904_66327994_66328827_66329090_66331452_66331557_66338570_66338669_66338847
tx.23488	chr7	-	623	2	ISM	ENSMUSG00000030553.4	ENSMUST00000032770.4	953	4	26481	1	26481	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGTTTGTTTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67887500	67886358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_67886871_67887389
tx.23489	chr7	+	2644	7	NIC	ENSMUSG00000074071.12	novel	2815	9	NA	NA	-43	-23	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	53.3627523028314	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTTCCACATGTTAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67925699	68012812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_67925790_67950580_67950712_67978969_67979148_67999981_68000165_68003356_68003492_68007932_68008037_68010989
tx.2349	chr11	-	716	3	NNC	ENSMUSG00000060923.6	novel	863	4	NA	NA	153	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14.5	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGTGTACTGTTGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30599434	30455990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_30456440_30582207_30582341_30599300
tx.23490	chr7	-	1796	2	FSM	ENSMUSG00000078671.12	ENSMUST00000200218.2	1387	2	-221	-188	0	188	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTGAAGTGTGGAATATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73191494	73189357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_73190653_73190993
tx.23491	chr7	-	420	2	Intergenic	novelGene_1191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGTTCGTAAAACACTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73333781	73332501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_73332848_73333707
tx.23492	chr7	+	918	4	NNC	ENSMUSG00000108448.3	novel	12456	4	NA	NA	-4098	-5877	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATTTACATTATGATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73462195	73482769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_73462267_73475699_73475780_73476586_73476730_73482145
tx.23493	chr7	-	522	3	NNC	ENSMUSG00000025789.10	novel	5368	6	NA	NA	23456	-10939	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTTTCATCTATTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73639966	73621537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_73621795_73626405_73626469_73639764
tx.23494	chr7	+	792	6	ISM	ENSMUSG00000039202.13	ENSMUST00000037315.13	6877	11	47	17195	-8	2942	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_5	6.57267069006199	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGACCCAGCTGGTCGTCGTG	2769	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78922993	78998061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_78923088_78944255_78944356_78946755_78946956_78973216_78973393_78975181_78975350_78998007
tx.23496	chr7	-	1106	3	ISM	ENSMUSG00000039176.18	ENSMUST00000149444.8	4247	23	-55	12159	-37	2194	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	262	junction_1	7	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCAGGGAACAGTATCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79115983	79111469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_79111642_79114351_79115120_79115817
tx.23497	chr7	-	783	2	FSM	ENSMUSG00000030545.10	ENSMUST00000139620.2	331	2	70	-522	70	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCATGTGAGCACCTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79390034	79386997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_79387659_79389912
tx.235	chr1	-	2370	6	FSM	ENSMUSG00000026095.16	ENSMUST00000027264.10	2442	6	51	21	51	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	502	junction_1	45.94344349306	911	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGTGTAGTAGTTTCACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53391860	53383796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_53384139_53385738_53385921_53386173_53387718_53389145_53389222_53390038_53390093_53391688
tx.2350	chr11	+	639	3	NNC	ENSMUSG00000087474.2	novel	1933	2	NA	NA	-946	-1450	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	1.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAACCAGTTCATTCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30699885	30704697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_30700269_30701058_30701181_30704563
tx.23501	chr7	-	383	3	ISM	ENSMUSG00000030536.11	ENSMUST00000205824.2	2307	11	-30	13233	-30	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	539	junction_2	51	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTCCCTGAAGAAAATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80453059	80418101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_80418214_80449597_80449698_80452888
tx.23503	chr7	+	487	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000108861.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAGGCATGAAAGTTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82835193	82836529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_82835309_82835651_82835791_82836296
tx.23504	chr7	+	1322	2	FSM	ENSMUSG00000030560.18	ENSMUST00000139159.2	634	2	-12	-676	-8	676	multi-exon	FALSE	canonical	3	380	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAATAAATAAATAAATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87927333	87931667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_87927583_87930594
tx.23506	chr7	-	422	2	ISM	ENSMUSG00000041343.20	ENSMUST00000118157.8	2782	12	46968	1	19890	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGATGTACTACTACTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92239382	92233391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_92233754_92239322
tx.23507	chr7	-	1056	5	Intergenic	novelGene_1196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.78535710713571	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATGATTACCTCATGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95853223	95831495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_95832116_95834950_95835050_95835874_95835964_95838095_95838196_95853075
tx.23508	chr7	+	702	5	NIC	ENSMUSG00000048078.17	novel	704	5	NA	NA	3	10	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8.16624148553054	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCCTACAGAGAAGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95859363	96148134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_95859617_96004562_96004619_96085966_96086066_96145450_96145548_96147937
tx.23509	chr7	+	397	3	NNC	ENSMUSG00000048078.17	novel	11021	33	NA	NA	-28049	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTACAGAGAAGGTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96143555	96148137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_96143656_96145450_96145548_96147937
tx.23510	chr7	-	1019	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000108442.2	novel	605	1	NA	NA	-36	188666	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGAAATTTTGACTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97244684	97055377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_97055656_97243943
tx.23511	chr7	-	640	3	NNC	ENSMUSG00000086433.2	novel	324	3	NA	NA	-2668	325	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGAGACTTTAGTCACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97296987	97247230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_97247763_97284137_97284182_97296923
tx.23512	chr7	-	1864	3	NNC	ENSMUSG00000086993.2	novel	3091	2	NA	NA	0	12949	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGAAAATTATGTCAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97345828	97329680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_97331143_97345318_97345675_97345782
tx.23513	chr7	-	2245	6	ISM	ENSMUSG00000035547.15	ENSMUST00000107112.2	2232	13	33050	-1228	32918	-874	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	154	junction_5	12.273548794053	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTTTTGGAACTGTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97778499	97771639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_97773263_97774448_97774586_97775035_97775152_97775452_97775650_97777679_97777803_97778450
tx.23514	chr7	+	682	3	NNC	ENSMUSG00000097749.3	novel	464	3	NA	NA	1112	3122	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTGTGACTCTAGAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97827559	97831730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_97827741_97828504_97828618_97831342
tx.23515	chr7	-	2567	2	FSM	ENSMUSG00000049580.13	ENSMUST00000206414.2	2310	2	-65	-192	-25	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTGAACTAGCATTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98010560	97999882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_98002338_98010448
tx.23516	chr7	-	943	3	FSM	ENSMUSG00000035401.10	ENSMUST00000206565.2	5267	3	-80	4404	-80	-4404	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	7.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACCCTGCTGACTCCTTT	3422	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98306070	98296667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_98297112_98303950_98304060_98305680
tx.23517	chr7	-	2470	8	ISM	ENSMUSG00000035354.10	ENSMUST00000037968.10	5157	15	136509	1726	12012	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	156	junction_1	9.98366011980351	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGATTTCCCCCCCAGCTT	2963	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98653839	98535953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_98537800_98555698_98555791_98589097_98589177_98628842_98629009_98637390_98637452_98638741_98638830_98641130_98641216_98653786
tx.2352	chr11	-	405	3	ISM	ENSMUSG00000020311.18	ENSMUST00000129593.9	977	9	13406	-149	13022	149	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	85	junction_1	5.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGTCTCACTTCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30885063	30881601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_30881849_30884671_30884748_30884981
tx.23521	chr7	+	2288	14	NNC	ENSMUSG00000030729.18	novel	8834	14	NA	NA	-5	-4815	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	2.95128093742321	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTGGATATGAGTCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99876877	99921801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_99877242_99899498_99899671_99901391_99901499_99902439_99902525_99904740_99904825_99909090_99909285_99910806_99910997_99911272_99911371_99912117_99912296_99915871_99915966_99916692_99916823_99917323_99917514_99919534_99919669_99921533
tx.23522	chr7	+	1935	4	ISM	ENSMUSG00000051048.18	ENSMUST00000208565.2	1215	9	3919	4503	3919	-4503	intron_retention	FALSE	canonical	3	12	junction_3	1.24721912892465	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTTTTCATAGTGATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99954706	99963941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_99954871_99955073_99955251_99959993_99960059_99962412
tx.23523	chr7	-	2430	14	NNC	ENSMUSG00000030718.10	novel	2772	14	NA	NA	-31	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_12	101.852195962999	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTGAGGAGCTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100021172	99975943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_99977090_99978241_99978310_99981064_99981130_99983134_99983180_99984254_99984385_99987576_99987701_99990237_99990304_99991052_99991144_99994158_99994314_99997011_99997064_99997328_99997387_100003915_100004007_100004472_100004569_100020929
tx.23524	chr7	-	1800	6	NNC	ENSMUSG00000030701.18	novel	931	6	NA	NA	9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.50881895447306	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACTGGCTTTGCTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100307654	100293105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_100294277_100294776_100294919_100303808_100303912_100304455_100304609_100305941_100306018_100307499
tx.23525	chr7	+	721	3	NNC	ENSMUSG00000108866.2	novel	338	3	NA	NA	0	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGGAAAAAAAAAGAAATT	4876	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100324294	100326949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_100324371_100325303_100325518_100326518
tx.2353	chr11	-	587	5	ISM	ENSMUSG00000020311.18	ENSMUST00000073192.14	2532	14	11053	828	4986	149	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	6.75925291729789	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGTCTCACTTCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30893099	30881601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_30881849_30884671_30884748_30884981_30885060_30889496_30889622_30893038
tx.23531	chr7	+	1467	10	ISM	ENSMUSG00000032812.19	ENSMUST00000098243.4	3693	21	7261	692	-152	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_1	9.56846672960488	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGCTGAGGCCTGTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101050835	101061101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_101050917_101050998_101051068_101051265_101051384_101053171_101053286_101053486_101053633_101057253_101057337_101058320_101058372_101058497_101058562_101060126_101060277_101060510
tx.23532	chr7	-	1104	4	FSM	ENSMUSG00000064307.14	ENSMUST00000106963.2	835	4	-85	-184	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.16441400296898	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATAAGTCCCCTGTACCTT	2478	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101583122	101562196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_101562791_101564768_101564975_101569843_101569982_101582956
tx.23533	chr7	-	456	2	NNC	ENSMUSG00000063550.9	novel	6694	33	NA	NA	-1	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGGTGGTATTGACTTT	10000	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101859353	101768606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_101768993_101859283
tx.23535	chr7	+	2487	5	FSM	ENSMUSG00000030898.16	ENSMUST00000033189.6	2573	5	86	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	1.6583123951777	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAAGGCTCAGATTATTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105075023	105085546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_105075383_105082789_105083042_105083201_105083452_105083726_105083903_105084096
tx.23536	chr7	-	1534	7	ISM	ENSMUSG00000036989.17	ENSMUST00000147044.4	2972	12	15424	0	-35	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_5	3	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTTGCTAGGTTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105267268	105259856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_105260418_105260535_105260677_105261813_105261885_105262104_105262274_105262455_105262624_105266647_105266752_105266948
tx.23539	chr7	-	947	2	ISM	ENSMUSG00000031022.16	ENSMUST00000106735.9	1957	6	7361	-12	4591	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTTTATTACGATAATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109315632	109311375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_109311743_109315052
tx.2354	chr11	-	1689	14	NNC	ENSMUSG00000020311.18	novel	2532	14	NA	NA	19	149	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	26.3771014194119	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGTCTCACTTCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30904133	30881601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_30881849_30884671_30884748_30884981_30885060_30889496_30889622_30893038_30893099_30893698_30893861_30898078_30898209_30898299_30898524_30899938_30899978_30900559_30900624_30900740_30900819_30901306_30901388_30902571_30902677_30903913
tx.23540	chr7	-	1407	3	ISM	ENSMUSG00000031021.14	ENSMUST00000033333.13	1703	5	6	8473	6	1047	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_2	10.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAATACTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109351480	109343513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_109344626_109349219_109349312_109351277
tx.23541	chr7	-	567	3	FSM	ENSMUSG00000101585.7	ENSMUST00000191157.7	617	3	22	28	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCTTGGCCTCCATTAT	3396	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109605831	109597610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_109597981_109602792_109602923_109605764
tx.23542	chr7	+	3115	4	ISM	ENSMUSG00000066232.5	ENSMUST00000208821.2	3867	17	-52	15129	-11	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	385.164899750743	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGGCAAAAATTTTTTGAATT	7187	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109617469	109633447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_109617716_109626277_109626360_109628897_109629052_109630814
tx.23543	chr7	+	4250	25	FSM	ENSMUSG00000066232.5	ENSMUST00000084731.5	4763	25	24	489	-17	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	191.489515052391	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTTGATCTGATTGCAAT	7222	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109617504	109655327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_109617716_109626277_109626360_109628897_109629052_109630814_109630974_109636150_109636308_109638370_109638461_109639812_109639908_109640019_109640105_109641187_109641323_109641992_109642093_109643615_109643693_109643824_109643942_109645368_109645459_109645884_109646051_109646193_109646355_109647335_109647465_109648000_109648068_109648151_109648278_109648802_109648901_109649986_109650083_109650219_109650441_109650528_109650735_109651917_109652125_109653206_109653324_109654223
tx.23546	chr7	-	1500	2	ISM	ENSMUSG00000110424.2	ENSMUST00000210788.2	547	3	-17	2082	-17	-470	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAGATGTGCATACCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110721908	110718924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_110720231_110721714
tx.23547	chr7	+	703	3	Intergenic	novelGene_1202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAATGTCCACTGTAACAG	8585	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112750660	112756923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_112750895_112756004_112756096_112756545
tx.23548	chr7	-	550	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055116.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACAGATGGTTGTGAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112887470	112886777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_112887165_112887307
tx.23549	chr7	-	1498	4	FSM	ENSMUSG00000030670.17	ENSMUST00000211506.2	1887	4	-92	481	-10	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.94392028877595	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACTAGAGCAATAACAAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114162217	114149397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_114149683_114150987_114151318_114151955_114152589_114161967
tx.2355	chr11	+	2036	11	NNC	ENSMUSG00000020305.14	novel	3330	11	NA	NA	4	138	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.0476137196133	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTGCTGGATGTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30904422	31051471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_30904570_30946533_30946603_30948312_30948522_30978907_30979067_31005457_31005571_31006101_31006238_31008821_31009000_31011388_31011587_31031361_31031623_31035000_31035132_31051036
tx.23550	chr7	-	686	8	ISM	ENSMUSG00000045659.19	ENSMUST00000216517.2	2601	19	-14	33035	8	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	245	junction_1	15.8552122376851	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCGCAAGTATTCCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115907582	115774967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_115775048_115776120_115776194_115779628_115779734_115780408_115780521_115788504_115788589_115907159_115907218_115907306_115907384_115907485
tx.23551	chr7	-	624	2	NNC	ENSMUSG00000118412.2	novel	549	5	NA	NA	-90	366	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGGTGTGAGCTTTGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117969030	117957026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_117957473_117968852
tx.23552	chr7	-	547	3	Intergenic	novelGene_1207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTGGTCTGTGGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119029672	119016860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_119017144_119024897_119025047_119029557
tx.23553	chr7	-	3410	8	ISM	ENSMUSG00000030929.18	ENSMUST00000150844.3	3564	9	1559	14	1460	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	8.82251294665401	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGACATGTAGAACATCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119391722	119383067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_119385768_119385961_119386051_119386626_119386709_119386956_119387058_119389456_119389614_119390323_119390452_119391487_119391572_119391653
tx.23554	chr7	-	1716	3	ISM	ENSMUSG00000030929.18	ENSMUST00000125595.8	6025	7	1476	7093	1460	-3172	internal_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_2	3.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAATAATAATAATGATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119391722	119388888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_119390452_119391487_119391572_119391653
tx.23555	chr7	-	738	2	NNC	ENSMUSG00000048787.14	novel	353	2	NA	NA	8	336	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTATCAAGTAGCAGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119494960	119458507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_119459139_119494853
tx.23556	chr7	-	824	2	ISM	ENSMUSG00000048787.14	ENSMUST00000207233.2	2917	4	375	3479	-5	336	internal_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTATCAAGTAGCAGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119494973	119458507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_119459139_119494780
tx.23557	chr7	+	575	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048787.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCCTTAATCGTGGTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119460745	119473461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_119461076_119471499_119471610_119473326
tx.23558	chr7	-	1782	2	FSM	ENSMUSG00000097343.3	ENSMUST00000180977.3	1812	2	38	-8	-12	8	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACGTTGGTCCAGTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120276755	120272949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_120274500_120276523
tx.23559	chr7	+	1435	3	NIC	ENSMUSG00000046096.8	novel	4831	3	NA	NA	71	-805	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_2	87.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTAGTACAATTCTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120276973	120332689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_120277094_120325342_120325556_120331587
tx.2356	chr11	+	1958	10	FSM	ENSMUSG00000020305.14	ENSMUST00000020551.13	3228	10	37	1233	13	138	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_7	7.49979423586054	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTGCTGGATGTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30904431	31051471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_30904570_30948312_30948522_30978907_30979067_31005457_31005571_31006101_31006238_31008821_31009000_31011388_31011587_31031361_31031623_31035000_31035132_31051036
tx.23560	chr7	+	901	4	ISM	ENSMUSG00000030880.15	ENSMUST00000207481.2	2545	20	22744	-13	5658	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	356	junction_2	22.8958996814325	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACGAAAATCATGGTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120539710	120545057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_120540049_120541712_120541791_120543769_120543896_120544698
tx.23561	chr7	-	612	3	NNC	ENSMUSG00000108811.2	novel	765	3	NA	NA	-19	1886	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACCTAGCCTCAGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121189078	121186612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_121186879_121188433_121188678_121188976
tx.23562	chr7	+	204	2	Intergenic	novelGene_1209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGGTGTGGCACCATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122535661	122536064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_122535809_122536007
tx.23563	chr7	-	1163	7	NNC	ENSMUSG00000032777.10	novel	712	6	NA	NA	-32	3045	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	79.9821160565841	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGATGTGTCCCCATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125306881	125287346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_125287505_125292310_125292435_125295632_125295730_125298120_125298265_125298515_125298693_125303002_125303213_125306628
tx.23564	chr7	+	178	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000131.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGGGAAAAGAAAA	6877	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125760610	125761923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_125760758_125761892
tx.23565	chr7	-	1223	13	NNC	ENSMUSG00000030742.8	novel	1235	12	NA	NA	-56	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_12	10.2510162097879	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCGTCGTTGTCTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125968798	125962998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_125963214_125963367_125963473_125963569_125963633_125963730_125963794_125967047_125967143_125967217_125967279_125967357_125967388_125967470_125967536_125967666_125967755_125967973_125968009_125968113_125968142_125968319_125968577_125968680
tx.23566	chr7	+	954	5	FSM	ENSMUSG00000042675.16	ENSMUST00000038614.12	973	5	17	2	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_2	12.73528562695	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCCCTGGCTCACATGGA	8238	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126376143	126379684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126376276_126376942_126377126_126377225_126377270_126377477_126377587_126379198
tx.23567	chr7	+	874	5	NNC	ENSMUSG00000042675.16	novel	785	5	NA	NA	26	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	86.9752119859446	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCTGGCTCACATGGAAT	8439	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126376344	126379686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_126376395_126376942_126377126_126377225_126377270_126377477_126377587_126379198
tx.23568	chr7	+	191	2	Intergenic	novelGene_1212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACGGGAGGCGGGGCCCCG	1340	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126396891	126398355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_126396953_126398225
tx.23569	chr7	-	640	3	FSM	ENSMUSG00000046378.12	ENSMUST00000106340.8	1647	3	594	413	594	9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGATTCTTTCCTTCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126547737	126545151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126545383_126545888_126546003_126547442
tx.2357	chr11	-	1291	2	FSM	ENSMUSG00000020309.7	ENSMUST00000020553.5	1018	2	-31	-242	-15	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTCTCTAAGTGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30936365	30926709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_30927747_30936111
tx.23570	chr7	+	3030	2	FSM	ENSMUSG00000045598.11	ENSMUST00000056232.7	3043	2	12	1	12	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTGTGTGGTTATGTGT	8314	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126832438	126837214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_126832690_126834435
tx.23571	chr7	-	1395	3	NNC	ENSMUSG00000030823.7	novel	3878	3	NA	NA	-12	5450	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTACTGTGAGTTGGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126986350	126975981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_126976858_126985691_126985806_126985945
tx.23572	chr7	+	1655	4	ISM	ENSMUSG00000053877.13	ENSMUST00000186672.7	4025	21	3	18500	3	767	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	26.2424592343528	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTCTTCTTTTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127111639	127119908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127111803_127113336_127113413_127115113_127115374_127118752
tx.23573	chr7	+	1422	4	ISM	ENSMUSG00000030816.9	ENSMUST00000033088.8	3906	18	8565	-1	673	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	426	junction_2	13.5728487143349	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGCAGAGAAGCCCGTCC	466	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127196655	127202758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_127196715_127199477_127199619_127199696_127199799_127201638
tx.23574	chr7	-	1662	3	ISM	ENSMUSG00000070371.12	ENSMUST00000153110.8	1016	5	850	0	800	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	62	junction_2	22	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTGGCTTTGTGGCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127533801	127531809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_127532287_127532542_127532665_127532738
tx.23575	chr7	+	620	2	ISM	ENSMUSG00000030847.9	ENSMUST00000033136.9	2562	4	-78	6896	-78	-6896	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	148	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCCATGAAGGCTCCGAGA	7064	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128125261	128141809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_128125769_128141696
tx.23576	chr7	+	1570	8	ISM	ENSMUSG00000042105.19	ENSMUST00000098007.11	1906	10	7	2767	7	79	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_6	9.98570406702931	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAGGTATGAATTTGTCTC	7151	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128213058	128270579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_128213416_128237881_128237963_128260739_128260877_128265361_128265491_128265700_128265869_128265972_128266030_128269320_128269520_128270137
tx.23577	chr7	+	3423	19	NNC	ENSMUSG00000055319.9	novel	4505	19	NA	NA	0	-1045	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_16	31.2793072450205	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAATATGTTATTTTTATT	1965	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128346700	128385515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_128346903_128351782_128352310_128354429_128354641_128355773_128355968_128357039_128357130_128359486_128359608_128363139_128363230_128364113_128364256_128365664_128365874_128367107_128367227_128367849_128368003_128369290_128369387_128373888_128374087_128378494_128378651_128379007_128379111_128380152_128380339_128380789_128380950_128381359_128381462_128385151
tx.23578	chr7	+	933	8	NNC	ENSMUSG00000040268.18	novel	2397	11	NA	NA	0	-3281	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	96.5105471660259	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGAAGCCTCTGTCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130467632	130503875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_130467731_130479463_130479625_130484059_130484117_130487132_130487179_130493910_130494009_130499054_130499181_130502246_130502391_130503672
tx.23579	chr7	+	1008	8	ISM	ENSMUSG00000040268.18	ENSMUST00000151119.9	2397	11	-18	7368	0	-2973	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_1	30.4007250182073	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTCCATCTTGATAGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130467614	130504183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_130467714_130479463_130479625_130484059_130484117_130487132_130487179_130493910_130494009_130499054_130499181_130502246_130502391_130503906
tx.2358	chr11	-	1327	3	FSM	ENSMUSG00000020309.7	ENSMUST00000101394.5	1315	3	-15	3	-15	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	6	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTCTCTAAGTGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30936365	30926709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_30927747_30929564_30929601_30936111
tx.23580	chr7	+	3542	13	FSM	ENSMUSG00000040268.18	ENSMUST00000075181.11	2301	13	-1	-1240	-1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	52.7225441975884	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCACGTCCCCTTTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130467626	130515038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_130467731_130479463_130479625_130484059_130484117_130487132_130487179_130493910_130494009_130499054_130499181_130502246_130502391_130503906_130503976_130506599_130506665_130507120_130507185_130510065_130510156_130511317_130511359_130512561
tx.23581	chr7	+	2811	5	ISM	ENSMUSG00000040268.18	ENSMUST00000075181.11	2301	13	38898	-1240	-108	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	137	junction_4	44.3931300991494	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCACGTCCCCTTTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130506525	130515038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_130506665_130507120_130507185_130510065_130510156_130511317_130511359_130512561
tx.23582	chr7	+	598	3	ISM	ENSMUSG00000030861.16	ENSMUST00000133277.4	632	4	-137	2724	37	-2724	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_1	7.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCAAAATAAACAAGACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131012366	131027791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_131012517_131026200_131026361_131027503
tx.23583	chr7	+	1209	5	FSM	ENSMUSG00000030965.20	ENSMUST00000144225.9	2620	5	-9	1420	3	-1420	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_3	16.5075740192192	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAACAAACAAACAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132460968	132477475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_132461063_132466691_132466783_132470761_132470799_132473300_132473368_132476555
tx.23584	chr7	+	2839	9	FSM	ENSMUSG00000030965.20	ENSMUST00000129552.2	2827	9	-9	-3	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_5	67.4532245337464	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGATATTTTAGTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132460968	132486840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_132461063_132466691_132466783_132470761_132470799_132473300_132473368_132476555_132476747_132478364_132478447_132480257_132480343_132482495_132482611_132484763
tx.23585	chr7	-	2251	10	NIC	ENSMUSG00000030979.14	novel	1644	10	NA	NA	-408	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_9	18.4477908610847	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATCTGAGTATGGTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133312209	133288083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_133288846_133291310_133291410_133292236_133292323_133292814_133292896_133299397_133299473_133300872_133300948_133302542_133302640_133303567_133303652_133304058_133304199_133311457
tx.23586	chr7	+	1412	4	ISM	ENSMUSG00000025478.16	ENSMUST00000121184.2	2727	13	8574	-18	8574	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_3	3.85861230093008	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGGGTTAGAAACTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138677736	138681711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_138677909_138678385_138678566_138679655_138679822_138680817
tx.23587	chr7	+	2448	9	NIC	ENSMUSG00000015980.15	novel	351	4	NA	NA	-9	994	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	2	junction_1	3.53553390593274	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGGAAGAAAGCTCAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138800517	138823889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_138800555_138801309_138801369_138803504_138803658_138805916_138806278_138807835_138807983_138810118_138810213_138816785_138816905_138818491_138818616_138822535
tx.23588	chr7	-	1087	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000015980.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	0.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTACTGAGTTCTTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138814530	138813121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_138814030_138814247_138814309_138814412
tx.23589	chr7	+	1354	2	ISM	ENSMUSG00000060260.14	ENSMUST00000093993.5	3057	3	7041	788	7036	26	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTCTCTGCTCCTTTGTCT	537	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138835438	138847103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_138836077_138846387
tx.2359	chr11	-	1802	4	FSM	ENSMUSG00000020303.3	ENSMUST00000020546.3	3940	4	-1	2139	-1	-1460	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_2	14.613540144522	237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCAAACAACTGGGTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31320075	31309445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_31310529_31315331_31315544_31317725_31317869_31319711
tx.23590	chr7	-	1505	4	NNC	ENSMUSG00000110115.2	novel	3816	2	NA	NA	-27	-257	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTGAGTGCTGTGTCTGT	9171	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138876808	138872989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_138874100_138874430_138874585_138876334_138876456_138876688
tx.23591	chr7	-	622	2	ISM	ENSMUSG00000041309.18	ENSMUST00000106095.3	1299	3	736	21	736	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTCGGAGCCGTGGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139161970	139161156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_139161605_139161796
tx.23592	chr7	+	1266	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083396.2	novel	1194	1	NA	NA	-114	187	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGTCCATTATCATGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140470685	140472180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_+_140470803_140471031
tx.23593	chr7	-	740	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055629.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTGCCTGAATGTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140641441	140638364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_140638918_140641254
tx.23594	chr7	+	358	2	ISM	ENSMUSG00000038611.18	ENSMUST00000106027.9	5248	18	-7	31152	-2	-6882	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	221	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTTATAGAAGTATAGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140808694	140811387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140808805_140811139
tx.23595	chr7	+	625	5	ISM	ENSMUSG00000038611.18	ENSMUST00000106027.9	5248	18	-3	21668	2	2602	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_2	20.7966343430854	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAAAGAAGGTAAGTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140808698	140820871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140808805_140811139_140811256_140812331_140812455_140817409_140817616_140820797
tx.23596	chr7	+	694	3	ISM	ENSMUSG00000038611.18	ENSMUST00000130687.2	1189	5	921	-1	-361	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	255	junction_1	27	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTATGGACTGATGCTT	5650	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140841230	140842661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140841456_140841688_140841818_140842321
tx.23597	chr7	-	1358	8	ISM	ENSMUSG00000058886.10	ENSMUST00000080553.9	2135	12	5613	2	-47	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_2	13.2649607490361	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAATGTTGTCAAGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140901972	140877094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_140877530_140881512_140881603_140890674_140890923_140893132_140893262_140894246_140894376_140894774_140894902_140901022_140901089_140901838
tx.23598	chr7	+	3282	22	FSM	ENSMUSG00000002957.12	ENSMUST00000003038.12	4646	22	68	1296	33	-1296	multi-exon	FALSE	canonical	3	504	junction_7	69.5768877620837	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCGCCATGTGCTTTTAGG	9664	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141142153	141211628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_141142340_141168198_141168268_141177385_141177529_141178614_141178809_141182145_141182276_141184821_141184924_141189719_141189829_141191248_141191397_141192541_141192711_141194111_141194250_141199363_141199547_141200384_141200483_141200704_141200937_141201027_141201202_141203530_141203695_141206020_141206104_141207806_141207897_141209102_141209227_141209971_141210089_141210197_141210268_141210349_141210485_141211204
tx.23599	chr7	+	442	3	FSM	ENSMUSG00000031097.16	ENSMUST00000211192.2	345	3	-18	-79	-18	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGTGTGGTCTAGTTCTGT	-2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	141997495	141998146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_141997566_141997642_141997820_141997951
tx.236	chr1	-	538	4	FSM	ENSMUSG00000117809.2	ENSMUST00000236737.2	300	4	-84	-154	-84	154	multi-exon	FALSE	canonical	3	541	junction_1	43.3999487966928	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTCTGGTCATGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53391862	53387483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_53387718_53389145_53389222_53390038_53390093_53391688
tx.2360	chr11	-	975	4	NNC	ENSMUSG00000020303.3	novel	544	2	NA	NA	0	731	intron_retention	FALSE	canonical	3	7	junction_1	66.9676538835479	27	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACTTGCCCCAACTGTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31320074	31314709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_31314967_31315331_31315544_31317725_31317869_31319711
tx.23600	chr7	-	2953	14	NIC	ENSMUSG00000037519.18	novel	5181	31	NA	NA	2876	0	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	0	0	junction_6	61.6522985553642	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAGAGTGCTGTGAACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144059834	144030494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_144031727_144032763_144032835_144034821_144034988_144035447_144035517_144035996_144036173_144038580_144038679_144038765_144038946_144045188_144045390_144045478_144045561_144052033_144052128_144052443_144052617_144053988_144054141_144058639_144058872_144059807
tx.23601	chr7	-	2092	8	NIC	ENSMUSG00000037519.18	novel	3444	18	NA	NA	-2222	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_6	82.3789154716528	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCCAGTTAAGAGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144045296	144030502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_144031727_144032763_144032835_144034821_144034988_144035447_144035517_144035996_144036173_144038580_144038679_144038765_144038946_144045188
tx.23602	chr7	+	854	2	ISM	ENSMUSG00000031074.15	ENSMUST00000105898.2	2299	3	2098	1090	2098	627	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTGGGATACAGACTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144394429	144397083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_144394512_144396311
tx.23603	chr7	-	1201	2	NNC	ENSMUSG00000096999.2	novel	2732	2	NA	NA	-3486	-1868	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGCCCCCCGCACACACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144454684	144450164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_144450337_144453655
tx.23604	chr7	+	837	3	FSM	ENSMUSG00000031072.15	ENSMUST00000093964.5	357	3	-33	-447	3	447	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_2	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAAGAAAAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144468874	144471885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_144469067_144470164_144470271_144471346
tx.23605	chr7	-	1439	10	ISM	ENSMUSG00000048677.10	ENSMUST00000208841.2	2852	24	-33	13521	-24	-6035	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_5	5.4997194092287	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTGTCCCCTCTAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144837692	144821321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_144821870_144822596_144822663_144823470_144823571_144826016_144826093_144827598_144827706_144830845_144830963_144832473_144832652_144833013_144833091_144833965_144834031_144837587
tx.23606	chr8	+	566	5	NNC	ENSMUSG00000012705.17	novel	1139	4	NA	NA	-458	-292	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTGGTCTCATACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3705311	3709818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_3705370_3706005_3706146_3706907_3706986_3707249_3707392_3709670
tx.23607	chr8	-	1336	5	NNC	ENSMUSG00000040459.12	novel	970	5	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_4	408.387913018982	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTTTAAGCAATTTTTAT	5256	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8740520	8716575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_8717417_8731383_8731468_8731840_8731949_8733747_8733974_8740443
tx.23608	chr8	-	2664	6	FSM	ENSMUSG00000031508.15	ENSMUST00000211445.2	1767	6	-75	-822	-75	822	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_5	197.58299521973	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAAGAGAAACTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11685111	11664140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_11665911_11669061_11669298_11670261_11670374_11678438_11678531_11682865_11683019_11684810
tx.23609	chr8	+	309	2	Intergenic	novelGene_295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGCTGTGTCCCGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12028916	12198298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_12029067_12198139
tx.2361	chr11	-	695	2	ISM	ENSMUSG00000020303.3	ENSMUST00000152094.2	447	3	-26	-4	1	4	intron_retention	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATGACATTTTCTTTCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31320073	31317994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_31318328_31319711
tx.23610	chr8	+	817	6	NNC	ENSMUSG00000010435.8	novel	907	7	NA	NA	6829	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.8	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCTGAGTTGAGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12629877	12650742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_12630145_12630943_12631001_12635636_12635749_12636434_12636540_12648943_12649047_12650569
tx.23611	chr8	-	1132	2	ISM	ENSMUSG00000000759.15	ENSMUST00000168657.8	2018	8	21847	0	21820	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTTTCATGTGGTTTCTG	6005	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12666135	12664278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_12665297_12666021
tx.23612	chr8	-	613	2	FSM	ENSMUSG00000086770.2	ENSMUST00000153095.2	406	2	8	-215	8	215	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGCTGGCCTCTTTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12965750	12962310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_12962596_12965422
tx.23615	chr8	+	685	7	ISM	ENSMUSG00000038416.16	ENSMUST00000043962.9	2301	18	21	18085	20	843	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	628	junction_1	53.1363549956357	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTGTGCTGAAGAACAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13807696	13813853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_13807855_13808997_13809053_13809139_13809238_13810529_13810569_13810976_13811118_13812850_13813011_13813819
tx.23616	chr8	+	625	6	ISM	ENSMUSG00000038416.16	ENSMUST00000043962.9	2301	18	21	18954	20	-23	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	628	junction_1	50	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACATGCTGACAGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13807696	13812984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_13807855_13808997_13809053_13809139_13809238_13810529_13810569_13810976_13811118_13812850
tx.23617	chr8	+	407	2	NNC	ENSMUSG00000038365.9	novel	2012	10	NA	NA	-62	-23245	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGTTGTTTGTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13957740	13958435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_13957864_13958151
tx.2362	chr11	+	1849	2	Intergenic	novelGene_153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACATGGTGTTGTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31495803	31499651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_31496002_31498000
tx.23620	chr8	+	444	2	Intergenic	novelGene_297	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCCTTAGTAATGGAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14067802	14069447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_14068105_14069305
tx.23621	chr8	+	392	3	Intergenic	novelGene_300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	5.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGTTTTTTATTCACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15899008	15915831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_15899117_15913082_15913163_15915627
tx.23622	chr8	+	2581	13	NIC	ENSMUSG00000039842.16	novel	4662	14	NA	NA	-12	-520	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_7	47.3133760743783	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGCATTGGCCTTGTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18645579	18852685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_18645652_18646938_18647031_18657294_18657414_18672622_18672711_18675575_18675691_18677133_18677257_18679561_18679652_18691580_18691682_18718961_18719000_18721107_18721271_18738997_18739076_18838254_18838493_18851421
tx.23623	chr8	-	466	4	NNC	ENSMUSG00000110463.2	novel	838	5	NA	NA	54738	-10914	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.43650214343336	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTGAAGCCTATCATCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19660600	19655829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_19656013_19657019_19657138_19659091_19659171_19660514
tx.23624	chr8	-	3610	7	NNC	ENSMUSG00000031482.10	novel	3430	7	NA	NA	248	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_6	86.8192566965033	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTGCTCTGGTCGTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22888312	22865567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_22867998_22869299_22869459_22870853_22871024_22873222_22873361_22879829_22880089_22885728_22885844_22887973
tx.23625	chr8	-	2040	7	NNC	ENSMUSG00000031482.10	novel	3430	7	NA	NA	51	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_4	87.5893194909567	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTAGGGTAGTATGTATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22888509	22866709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_22867998_22869299_22869459_22870853_22871024_22873222_22873361_22879972_22880089_22885728_22885844_22888455
tx.23626	chr8	+	3592	11	FSM	ENSMUSG00000037656.10	ENSMUST00000067786.9	3566	11	-22	-4	-22	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	459	junction_6	45.0493063209635	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGACGTCTTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22966781	23059632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_22966942_23025034_23025589_23028819_23028961_23030375_23030462_23035519_23035617_23048957_23049075_23050512_23050717_23050902_23051495_23054044_23054231_23055629_23055715_23058262
tx.23627	chr8	-	1346	6	FSM	ENSMUSG00000031539.7	ENSMUST00000210148.2	1351	6	11	-6	-7	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_4	1.89736659610103	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATGCAGTGAGTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23295627	23282296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_23282868_23283081_23283168_23287097_23287236_23289656_23289829_23293775_23294119_23295591
tx.23628	chr8	+	1734	3	ISM	ENSMUSG00000031540.15	ENSMUST00000044331.7	9113	18	-14	79822	0	-60208	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_2	3.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCCTAAATGTTATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23349550	23353453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_23349649_23351532_23351619_23351903
tx.23629	chr8	+	762	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000077399.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTATTTATTTATCTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23762559	23803238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_23762655_23802571
tx.2363	chr11	-	1012	3	ISM	ENSMUSG00000044502.17	ENSMUST00000058060.14	1394	4	2515	-1	2357	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	568	junction_1	11.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTGACGATCTTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31619370	31615179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_31615868_31616736_31616934_31619243
tx.23632	chr8	-	1608	3	NIC	ENSMUSG00000065954.12	novel	515	3	NA	NA	6	981	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	6	junction_2	13.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGGTTTTCAGAAATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25730911	25671556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_25672947_25690106_25690223_25730809
tx.23634	chr8	-	2314	16	NNC	ENSMUSG00000031575.19	novel	2337	16	NA	NA	8	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	874.359651402099	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTATGGTACTTGGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26337714	26306908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_26307537_26307631_26307692_26308573_26308673_26309653_26309747_26312722_26312917_26313166_26313335_26317201_26317420_26318793_26318866_26321288_26321377_26322667_26322764_26323778_26323875_26324987_26325083_26326027_26326117_26329770_26329917_26330039_26330104_26337606
tx.23635	chr8	-	950	5	NNC	ENSMUSG00000037251.6	novel	3613	5	NA	NA	4	-3468	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.6152386818265	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCTGACTTGGTGTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26484157	26474099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_26474482_26476273_26476561_26477522_26477669_26479677_26479770_26484114
tx.23636	chr8	-	1673	5	ISM	ENSMUSG00000037234.18	ENSMUST00000037182.14	12836	22	13	65563	13	20	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_2	8.16624148553054	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGTAAGAATAAAGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609239	26577011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_26578221_26583684_26583736_26585785_26585859_26600763_26600850_26608985
tx.23637	chr8	+	2489	13	NIC	ENSMUSG00000031483.9	novel	4838	12	NA	NA	22	1302	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_1	118.668627090548	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCACCTCAGTTTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27513856	27527943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_27513935_27514861_27514956_27515084_27515207_27517196_27517279_27518926_27518974_27519366_27519429_27519571_27519698_27521725_27521800_27521954_27522014_27522261_27522354_27523413_27523504_27526041_27526122_27526460
tx.2364	chr11	-	1174	4	FSM	ENSMUSG00000044502.17	ENSMUST00000058060.14	1394	4	220	0	62	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	568	junction_1	23.4141457717813	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTTTGACGATCTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31621665	31615180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_31615868_31616736_31616934_31619243_31619369_31621500
tx.23645	chr8	-	1204	7	ISM	ENSMUSG00000079057.5	ENSMUST00000095328.6	3808	11	12927	1891	12927	-1891	3prime_fragment	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.37436854187255	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTAGTGTTTTTCCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45773326	45759871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_45760146_45761416_45761597_45761693_45761829_45763219_45763323_45768571_45768758_45770703_45770831_45773127
tx.23646	chr8	+	1197	4	ISM	ENSMUSG00000031636.8	ENSMUST00000210422.2	1479	8	28211	-210	-1301	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATTGTGAAGTAGTAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46366767	46372585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_46366998_46368165_46368297_46370494_46370607_46371861
tx.23648	chr8	+	1982	5	FSM	ENSMUSG00000031631.16	ENSMUST00000034048.13	4619	5	57	2580	-7	-2576	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	7.58287544405155	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGCAGTGGTGACAATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46616744	46646047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_46616787_46622595_46623690_46634754_46635024_46644616_46644768_46645621
tx.23649	chr8	+	1538	3	FSM	ENSMUSG00000031631.16	ENSMUST00000145229.2	1166	3	-11	-361	-11	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	7	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTGGAGTATCATTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46616740	46623838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_46616901_46617798_46617934_46622595
tx.2365	chr11	-	2249	3	Intergenic	novelGene_156	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	13	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTGCATACCATCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31937016	31930693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_31932543_31934463_31934750_31936902
tx.23655	chr8	-	1117	2	ISM	ENSMUSG00000031561.17	ENSMUST00000145344.2	2526	9	22278	28	22278	-28	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCTGTAATTTTTAGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48730856	48728977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_48729940_48730701
tx.23656	chr8	-	289	2	NNC	ENSMUSG00000100510.8	novel	486	3	NA	NA	279	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGTGAGAGTGTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57758114	57757299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_57757468_57757993
tx.23657	chr8	-	776	3	ISM	ENSMUSG00000031608.14	ENSMUST00000139417.2	897	6	5730	-323	5730	323	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_1	13	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGGAGTAAGCAGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57985757	57978734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_57979286_57984635_57984765_57985661
tx.23658	chr8	-	2229	11	NIC	ENSMUSG00000031608.14	novel	4313	12	NA	NA	14	255	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	58.0589355741216	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCAGTTTGGTTTTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58106051	57978802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_57979286_57985661_57985761_57989616_57989836_57991119_57991243_57993053_57993172_57995545_57995729_57998362_57998443_57998702_57998834_58005477_58005645_58036800_58037262_58105886
tx.23659	chr8	+	1699	13	ISM	ENSMUSG00000031644.20	ENSMUST00000125717.8	2068	15	-4	609	1	-609	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_2	9.11805291105995	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGGAATTTATTGAGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61446229	61496968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_61446798_61459662_61459811_61460192_61460290_61465126_61465225_61469256_61469341_61472876_61472945_61473069_61473157_61475244_61475300_61481692_61481894_61487058_61487120_61488965_61489118_61496266_61496327_61496948
tx.2366	chr11	-	2192	3	Intergenic	novelGene_157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_2	7	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTGCATACCATCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31937018	31930693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_31932543_31934463_31934750_31936961
tx.23660	chr8	-	1949	7	ISM	ENSMUSG00000031605.9	ENSMUST00000034017.9	3412	15	95241	175	577	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_4	23.0554886210541	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCCTTGGTTTTACCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65207428	65192883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_65194009_65195988_65196133_65202065_65202207_65202728_65202858_65204762_65204865_65205682_65205881_65207318
tx.23662	chr8	-	839	5	NNC	ENSMUSG00000110594.2	novel	527	2	NA	NA	-26170	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4.32290411644765	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGATATATTCTACTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69480505	69423782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_69424161_69454172_69454288_69460610_69460716_69480157_69480317_69480423
tx.23663	chr8	+	2927	3	FSM	ENSMUSG00000059897.6	ENSMUST00000212312.2	493	3	15	-2449	13	7	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	43	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGTCCTGTAAATATTT	7223	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69661712	69683195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_69661812_69678994_69679122_69680494
tx.23664	chr8	-	671	4	NNC	ENSMUSG00000110444.3	novel	7668	4	NA	NA	-8	94158	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTTTTAAAAGGTAAAAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69848199	69725003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_69725359_69727930_69728102_69780882_69780921_69848092
tx.23665	chr8	-	910	3	NNC	ENSMUSG00000110444.3	novel	7668	4	NA	NA	-8	91825	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAATAGAACATCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69848199	69727336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_69728102_69780882_69780921_69848092
tx.23666	chr8	-	371	1	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000110434.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCCAACTTATAAAGAGGG	2416	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69993962	69993591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_69993600_69994000
tx.23668	chr8	+	823	5	FSM	ENSMUSG00000031860.18	ENSMUST00000132899.8	823	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15.6744218394172	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTGTTTTCAATACAG	2244	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70285311	70324942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70285502_70311729_70311804_70322678_70322833_70323227_70323335_70324644
tx.2367	chr11	-	1901	2	Intergenic	novelGene_155	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATTGCATACCATCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31937013	31930693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_31932543_31936961
tx.23672	chr8	-	723	2	NNC	ENSMUSG00000055707.14	novel	2919	3	NA	NA	6	-25283	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTTTTATTTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70929612	70928612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_70929223_70929499
tx.23673	chr8	+	2398	4	FSM	ENSMUSG00000031840.15	ENSMUST00000110092.6	1555	4	-790	-53	-5	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_3	4.96655480858378	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCCTTGCATCAAGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71207367	71211334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71208731_71209093_71209213_71209783_71209909_71210543
tx.23674	chr8	-	523	2	ISM	ENSMUSG00000031833.11	ENSMUST00000212001.2	322	5	-2	9159	-2	-9159	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAACAACTTCCCACCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71257631	71251655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_71252134_71257586
tx.23676	chr8	-	1263	4	NIC	ENSMUSG00000007950.10	novel	1978	5	NA	NA	-7	5	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_3	26.7124606795322	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAATTTGTGATTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71916306	71909343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_71910022_71910681_71910899_71911021_71911193_71916109
tx.23677	chr8	-	137	2	Intergenic	novelGene_321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGCGCCCCTTCCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72063129	72062933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_72062987_72063045
tx.23678	chr8	+	1621	2	ISM	ENSMUSG00000034807.10	ENSMUST00000212706.2	2860	4	2407	0	2407	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	971	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAAGTCTTTGGGTTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72075733	72077550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72075941_72076136
tx.23679	chr8	+	682	2	ISM	ENSMUSG00000031805.18	ENSMUST00000110012.2	3774	24	9633	3	8849	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	286	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAATAGAAAAGATGGTTTGT	1180	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72139827	72141199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72139994_72140683
tx.2368	chr11	-	2203	2	Intergenic	novelGene_158	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	12	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTAGTTGTCTTGGTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31937016	31932601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_31934750_31936961
tx.23680	chr8	+	300	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000110685.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTGTCTGGATATATCA	3795	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72577482	72578555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_72577601_72578267_72578318_72578423
tx.23681	chr8	+	555	2	ISM	ENSMUSG00000089857.10	ENSMUST00000110002.8	3152	3	-157	2966	-157	-195	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACTTAGAATCTAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72662294	72667232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72662583_72666965
tx.23682	chr8	+	2602	3	FSM	ENSMUSG00000052446.18	ENSMUST00000139781.8	416	3	-22	-2164	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	148.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTTTGTAGAGACTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72704898	72724177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_72705005_72719943_72720005_72721742
tx.23683	chr8	+	193	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000110443.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTAAGTTCCCAGACAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73031868	73047807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_73032033_73047778
tx.23684	chr8	-	2808	22	NIC	ENSMUSG00000006276.11	novel	3129	24	NA	NA	-14	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	75	junction_1	69.7814859566126	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGAGACTATCTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73175318	73094838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_73095369_73121747_73121831_73122555_73122617_73125529_73125667_73126869_73126921_73127666_73127791_73132834_73133000_73133952_73134151_73134737_73134900_73135260_73135334_73136170_73136257_73136523_73136681_73138610_73138769_73140704_73140933_73143251_73143312_73145733_73145860_73150077_73150141_73150745_73150842_73152849_73152898_73153520_73153611_73154035_73154078_73175248
tx.23686	chr8	-	1696	8	ISM	ENSMUSG00000019732.15	ENSMUST00000019876.12	1769	9	170	-1	170	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	18	junction_4	4.80645824036021	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAAAATATTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73197544	73178018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_73178600_73179610_73179704_73181005_73181138_73181913_73182010_73185216_73185406_73188633_73188729_73192275_73192480_73197238
tx.23687	chr8	-	3728	18	FSM	ENSMUSG00000052488.8	ENSMUST00000212991.2	3646	18	65	-147	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	416	junction_13	64.9317448394025	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTCTAGCTGTGGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73229005	73214326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_73215200_73215279_73215466_73215592_73215688_73215823_73215947_73216020_73216165_73216247_73216335_73216644_73216779_73216921_73217161_73217927_73218364_73220226_73220403_73221606_73221887_73222043_73222134_73222218_73222331_73223707_73223860_73223933_73224072_73224714_73224900_73228455_73228630_73228901
tx.23688	chr8	-	581	4	FSM	ENSMUSG00000052488.8	ENSMUST00000212016.2	779	4	-40	238	8	-238	multi-exon	FALSE	canonical	3	514	junction_1	50.0022221728417	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCCATCTCGGTGAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73228997	73223945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_73224072_73224714_73224900_73228455_73228630_73228901
tx.2369	chr11	+	2270	5	FSM	ENSMUSG00000020297.11	ENSMUST00000020537.9	2239	5	-32	1	-32	-1	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	2.06155281280883	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCCTGACTGTCTGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31950430	32009201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_31950597_31951730_31951881_31967650_31967735_32005012_32005124_32007442
tx.23690	chr8	+	1907	4	NIC	ENSMUSG00000031791.9	novel	820	5	NA	NA	-36	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	26.106618998935	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCTTTTTCTTTATTCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73325862	73341128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_73326072_73333406_73333564_73338543_73338662_73339705
tx.23692	chr8	-	1321	6	ISM	ENSMUSG00000037148.9	ENSMUST00000076316.6	3084	23	173200	-9	173030	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	4.12795348811006	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGGCCTAATATGGAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78071382	77976985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_77977637_77983954_77984047_77985685_77985839_78003776_78003937_78037359_78037511_78071268
tx.23693	chr8	+	1313	6	FSM	ENSMUSG00000031710.5	ENSMUST00000034146.5	1636	6	-77	400	-77	-400	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.26491106406735	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAACAGCTCCGTTGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84016903	84024681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_84017338_84018030_84018230_84020516_84020718_84020811_84020914_84021797_84021979_84024485
tx.23694	chr8	+	531	3	NNC	ENSMUSG00000013033.17	novel	5719	22	NA	NA	-4177	-291	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	34.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTGCGGACCCGCATCA	6554	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84645543	84656390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_84645663_84649627_84649742_84656092
tx.23695	chr8	-	1336	2	NNC	ENSMUSG00000074219.4	novel	2798	5	NA	NA	-4	-19124	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAATATATATC	6066	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84681838	84680300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_84681530_84681731
tx.23696	chr8	+	1262	5	FSM	ENSMUSG00000079003.4	ENSMUST00000095228.5	2265	5	1009	-6	86	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	513	junction_1	22.3941956765587	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCATTTTCTGTATGGAGG	2077	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84725138	84727044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_84725195_84725571_84725870_84725952_84726050_84726144_84726257_84726345
tx.23697	chr8	-	2313	13	FSM	ENSMUSG00000037103.9	ENSMUST00000041367.9	2312	13	-3	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	56.6688112339289	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGCCTGGTGTCCTGTTCT	9260	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84831394	84823702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_84824138_84824251_84824482_84824564_84824670_84824827_84824914_84824990_84825120_84825207_84825300_84825386_84825822_84828304_84828476_84828560_84828701_84828792_84828900_84829374_84829511_84829584_84829683_84831245
tx.23698	chr8	-	546	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034656.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAATTGATTACATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85365526	85350569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85350992_85365402
tx.23699	chr8	+	689	5	NNC	ENSMUSG00000034656.19	novel	2941	16	NA	NA	-9229	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_4	9.60468635614927	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGAATCCTAACTCCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85356390	85361171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_85356555_85359835_85359946_85360041_85360181_85360278_85360393_85361009
tx.237	chr1	-	2603	7	ISM	ENSMUSG00000026094.15	ENSMUST00000027263.14	3293	8	8543	541	8476	-541	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	57	junction_1	6.66874967458085	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATCTGAATAATAAGTATGCC	9229	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53815840	53795205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_53796930_53800140_53800321_53801747_53801797_53803190_53803318_53805079_53805225_53810768_53810982_53815675
tx.2370	chr11	+	809	5	FSM	ENSMUSG00000040767.11	ENSMUST00000039601.10	821	5	17	-5	-14	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	400	junction_3	16.768646337734	5514	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAAAGCCATAGTACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32155431	32158989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_32155664_32156959_32157051_32157556_32157663_32158333_32158409_32158684
tx.23700	chr8	-	4160	6	NIC	ENSMUSG00000001910.6	novel	4344	6	NA	NA	62	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	136	junction_5	189.167227605629	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCTGCTGTGCTCTGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85413720	85397107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_85399934_85401393_85401492_85401627_85401734_85402713_85402888_85402969_85403882_85413676
tx.23701	chr8	-	510	4	NNC	ENSMUSG00000001911.17	novel	1728	10	NA	NA	-8873	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.69967317119759	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGGTTCCTCAAAATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85449570	85435244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_85435307_85440394_85440487_85448271_85448448_85449390
tx.23702	chr8	+	380	2	FSM	ENSMUSG00000031700.12	ENSMUST00000143659.2	484	2	-32	136	1	-136	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCGCAGGGCCTGCGGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86219205	86219800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_86219319_86219533
tx.23703	chr8	-	1671	6	ISM	ENSMUSG00000031652.12	ENSMUST00000034074.8	6469	7	24356	3153	-8482	27	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	315	junction_2	34.9433827784317	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAGACTTCTTAAAGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87587530	87570919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_87571670_87573442_87573551_87575074_87575183_87578252_87578350_87579786_87579918_87587053
tx.23704	chr8	-	558	3	NNC	ENSMUSG00000045333.16	novel	746	4	NA	NA	445	-75774	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACAGCTTCCTGGCAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88670235	88585734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_88586113_88631116_88631177_88670115
tx.23705	chr8	+	631	4	ISM	ENSMUSG00000031657.17	ENSMUST00000034079.14	3251	15	-8	30297	-8	-17015	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_1	13.6381816969859	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGTAGAGAGCATAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88864474	88868358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_88864786_88864902_88865076_88866519_88866608_88868299
tx.23706	chr8	+	611	2	ISM	ENSMUSG00000036712.16	ENSMUST00000209742.2	1477	5	-16	10596	-2	-10596	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCTGGGGAAGAGAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89423672	89432409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_89423728_89431853
tx.23707	chr8	-	1745	10	NNC	ENSMUSG00000031667.17	novel	2079	10	NA	NA	8	-319	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	141.685445378482	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGGAAAGTAATGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91860643	91850515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_91851304_91851450_91851512_91852444_91852553_91852652_91852752_91852825_91852915_91853301_91853403_91853492_91853558_91856227_91856434_91857668_91857781_91860527
tx.23708	chr8	+	1046	6	ISM	ENSMUSG00000033192.6	ENSMUST00000209265.2	2238	13	-58	43042	-2	5723	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_4	2.8	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATACTGGTAATCTGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93581964	93602409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_93582254_93591528_93591669_93596275_93596494_93597765_93597879_93600860_93600920_93602182
tx.23709	chr8	+	468	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000058019.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGCTTGCCATGGAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94166294	94240911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_94166362_94240374_94240449_94240584
tx.2371	chr11	+	1069	4	FSM	ENSMUSG00000020287.16	ENSMUST00000020528.14	1737	4	-8	676	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	333	junction_1	11.8977121983832	1764	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAGTCTCAGCCAGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32176502	32182024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_32176718_32177751_32177950_32179848_32180054_32181573
tx.23710	chr8	-	711	2	ISM	ENSMUSG00000058019.14	ENSMUST00000080391.14	987	4	6935	-168	6935	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGTTCTCATAAATCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94226461	94225672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_94226238_94226315
tx.23711	chr8	+	705	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031755.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAATGGAAGGAAGGGAGGG	NA	False	NA	39	True	NA	NA	NA	94794581	94796868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_94795015_94796596
tx.23712	chr8	+	681	6	ISM	ENSMUSG00000074151.14	ENSMUST00000182409.9	4552	31	32213	-2	-19208	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_5	1.16619037896906	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGTGAGTAGAGTGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95228850	95233571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_95228931_95231008_95231093_95231733_95231824_95232089_95232156_95233123_95233208_95233294
tx.23713	chr8	-	583	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031778.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGGGGTGTCAAGGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95508593	95507477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_95507903_95508435
tx.23714	chr8	-	1684	8	ISM	ENSMUSG00000063605.6	ENSMUST00000077955.6	2304	9	4793	0	4216	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	12	junction_2	2.72554057547699	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGAGTTCTGAAAGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95639933	95629496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_95630020_95631884_95631989_95632559_95632731_95634342_95634553_95634901_95635019_95636371_95636481_95638055_95638283_95639710
tx.23715	chr8	+	1191	9	ISM	ENSMUSG00000031787.9	ENSMUST00000034239.9	3777	20	14720	1148	28	-1148	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	131	junction_4	13.128570942795	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATGAGAGGAATATCCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95822533	95825691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_95822648_95822983_95823035_95823839_95823917_95824026_95824147_95824242_95824393_95824582_95824660_95824733_95824809_95824946_95825064_95825281
tx.23716	chr8	-	1556	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000110447.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATTCAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96328129	96325512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_96326479_96326599_96327054_96327993
tx.23717	chr8	+	2745	14	FSM	ENSMUSG00000036564.18	ENSMUST00000080666.8	2738	14	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_5	6.1711295754251	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGTGTCGTGTTTCCTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96429683	96441584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_96429806_96432815_96432922_96433158_96433280_96433364_96433428_96433556_96433618_96435235_96435323_96435404_96435462_96435710_96435815_96436393_96436451_96436530_96436583_96437291_96437340_96437561_96437598_96437720_96437773_96439805
tx.23718	chr8	+	2053	3	ISM	ENSMUSG00000036564.18	ENSMUST00000080666.8	2738	14	7685	0	282	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	6.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGTGTCGTGTTTCCTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96437375	96441584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_96437598_96437720_96437773_96439805
tx.23719	chr8	-	2686	16	ISM	ENSMUSG00000036550.17	ENSMUST00000211887.2	8364	49	67553	698	-90	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1077	junction_10	231.11084401694	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGTCTGAAACTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96466539	96446783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_96447114_96447270_96447406_96448133_96448267_96449912_96450094_96451143_96451294_96452642_96452817_96454210_96454313_96455242_96455361_96455711_96455876_96457040_96457290_96459719_96459952_96460606_96460777_96460868_96460978_96462313_96462457_96462881_96463074_96466435
tx.2372	chr11	-	2105	13	FSM	ENSMUSG00000020289.16	ENSMUST00000020530.12	2865	13	54	706	5	266	multi-exon	TRUE	canonical	3	148	junction_6	11.6770786871831	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTTTGTGTGTATGTGTG	4621	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32217653	32182668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_32183117_32183903_32184097_32184731_32184922_32186787_32186918_32187299_32187407_32189796_32189954_32191797_32191936_32198144_32198227_32200124_32200279_32203874_32203950_32205438_32205569_32213024_32213095_32217422
tx.23720	chr8	-	2186	3	ISM	ENSMUSG00000036534.7	ENSMUST00000040481.4	3333	12	11639	0	-221	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	307	junction_1	40	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTCTCCTTTATCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96568528	96562547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_96564300_96567041_96567097_96568149
tx.23721	chr8	+	1055	3	Intergenic	novelGene_348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTACCTGTCACAAATACAAA	8993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99425585	99431849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_99426309_99427258_99427339_99431597
tx.23722	chr8	-	1052	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063696.8	novel	954	1	NA	NA	-71	105	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTTGGCCATTTCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103592501	103591371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_-_103591780_103591857
tx.23723	chr8	-	1065	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063696.8	novel	954	1	NA	NA	-74	84	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103592504	103591392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_-_103592029_103592075
tx.23724	chr8	-	598	2	NNC	ENSMUSG00000096188.2	novel	7734	4	NA	NA	40326	-6588	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGTATATGTCACAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105082113	105081410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_105081924_105082028
tx.23726	chr8	+	493	2	NNC	ENSMUSG00000048371.9	novel	5692	2	NA	NA	-41	1567	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGGCTCAATGGCCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105318041	105327225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_105318228_105326918
tx.23728	chr8	+	2634	6	NNC	ENSMUSG00000031885.15	novel	395	2	NA	NA	-245	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	74.3220021258846	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGACTCTTTATTGATAT	3501	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105897060	105944622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_105897160_105897937_105898025_105905224_105905342_105921106_105921224_105929083_105929211_105942535
tx.23729	chr8	+	2733	15	FSM	ENSMUSG00000031889.10	ENSMUST00000141957.8	2460	15	24	-297	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_6	68.2304019854935	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAGCTGTTGATTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105951861	105979685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_105952119_105957759_105957843_105961113_105961198_105965054_105965099_105966302_105966383_105966609_105966705_105967658_105967772_105973052_105973187_105973469_105973554_105974727_105974811_105975374_105975419_105976050_105976095_105976228_105976288_105977350_105977424_105978229
tx.2373	chr11	-	1001	7	ISM	ENSMUSG00000020289.16	ENSMUST00000020530.12	2865	13	72	9696	-6	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	159	junction_4	11.916375287813	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGCTCAGACATGACCTT	4639	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32217635	32191658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_32191936_32198144_32198227_32200124_32200279_32203874_32203950_32205438_32205569_32213024_32213095_32217422
tx.23730	chr8	-	1482	4	NIC	ENSMUSG00000031887.14	novel	1689	5	NA	NA	3	-278	intron_retention	FALSE	canonical	3	50	junction_3	7.78888096369861	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATGCTGAGGTCTAGACC	514	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105991232	105985195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_105985928_105986068_105986620_105987153_105987313_105991192
tx.23731	chr8	+	1081	3	NNC	ENSMUSG00000104168.2	novel	766	2	NA	NA	-136	329	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGGTCTGAGAGGTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106292819	106305070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_106292907_106293000_106293103_106304178
tx.23732	chr8	+	1448	2	ISM	ENSMUSG00000005699.17	ENSMUST00000212634.2	678	3	12	-571	6	1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTGGTCCTTCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106427791	106430126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_106427919_106428805
tx.23733	chr8	-	1247	2	ISM	ENSMUSG00000037415.8	ENSMUST00000212856.2	1426	3	-21	20693	-21	-20693	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCTTTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106553858	106551851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_106552822_106553581
tx.23734	chr8	+	4738	29	FSM	ENSMUSG00000036270.17	ENSMUST00000040254.16	4780	29	25	17	25	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	268	junction_16	54.5128121057194	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGTGTGTGATTTTAGTT	3281	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106607537	106619840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_106607791_106611132_106611290_106611664_106611777_106612065_106612166_106612414_106612605_106612719_106612868_106612950_106613056_106613381_106613492_106613585_106613670_106613749_106613846_106613932_106614036_106614137_106614319_106614413_106614487_106614585_106614678_106614752_106614941_106615019_106615151_106615230_106615388_106615735_106616173_106616256_106616362_106616450_106616604_106616692_106616730_106616871_106617050_106617153_106617310_106617396_106617513_106617599_106617766_106617850_106618038_106618127_106618348_106618898_106619063_106619301
tx.23735	chr8	+	2261	5	FSM	ENSMUSG00000031907.10	ENSMUST00000212874.2	2195	5	-66	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	7.8541390362025	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAGGCTTCTTGTAGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107141964	107152361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_107142119_107142335_107142403_107145702_107145830_107146146_107146243_107150544
tx.23736	chr8	-	1437	7	ISM	ENSMUSG00000031921.18	ENSMUST00000068388.15	1915	11	200	6387	-124	4	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	8.76387788342327	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTGAAGTTGGGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107822946	107802946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_107803629_107806000_107806102_107807724_107807872_107809614_107809702_107821453_107821585_107822560_107822657_107822753
tx.23737	chr8	-	352	3	ISM	ENSMUSG00000031921.18	ENSMUST00000116425.3	2471	7	257	19349	-100	-15429	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_2	3	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGACTCTATGGTTGAATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107822922	107821497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_107821585_107822560_107822657_107822753
tx.23739	chr8	-	674	3	Intergenic	novelGene_354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACTCTTGATGTTATTGA	205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108537647	108526882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_108527374_108533412_108533545_108537596
tx.2374	chr11	-	991	2	FSM	ENSMUSG00000020289.16	ENSMUST00000132856.2	406	2	-93	-492	14	492	multi-exon	FALSE	canonical	3	191	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGGGCTTCTCTCCCAGG	4630	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32217644	32212325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_32213095_32217422
tx.23740	chr8	-	1080	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000110528.2	novel	174	1	NA	NA	-44	905	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTACAACAGGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110067540	110066417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_-_110067412_110067454
tx.23741	chr8	-	1028	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000110528.2	novel	174	1	NA	NA	-44	891	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110067540	110066431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_-_110067151_110067231
tx.23742	chr8	-	2288	9	NIC	ENSMUSG00000031729.7	novel	2304	10	NA	NA	-34	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	212.348144270205	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTAGTGTTGGTCAAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110419926	110397957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_110399274_110403389_110403483_110404117_110404319_110405486_110405598_110406055_110406140_110408738_110408827_110409229_110409411_110410307_110410411_110419815
tx.23743	chr8	+	780	4	ISM	ENSMUSG00000031731.17	ENSMUST00000034171.9	3692	23	-251	34622	101	21068	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_1	34.0326640482673	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTGCACGAAGTTATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110505286	110553368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_110505595_110529578_110529783_110545549_110545675_110553225
tx.23744	chr8	+	1031	4	ISM	ENSMUSG00000044676.11	ENSMUST00000212754.2	4863	5	-10	7812	6	3771	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_2	7.1336448530109	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTATGTACACTCAGTGAT	941	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110806383	110811561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_110806637_110809309_110809375_110810288_110810416_110810975
tx.23745	chr8	-	671	2	NNC	ENSMUSG00000031750.16	novel	1709	7	NA	NA	72	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGCTTGCATCTCTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111469258	111468471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_111468965_111469080
tx.23746	chr8	+	2056	3	NNC	ENSMUSG00000090039.2	novel	2067	3	NA	NA	9	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111481632	111485604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_111481836_111482260_111482449_111483939
tx.23747	chr8	+	401	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031750.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACTGTAGTTGGGATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111486987	111496104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_111487185_111495900
tx.23748	chr8	-	1783	2	ISM	ENSMUSG00000033596.6	ENSMUST00000212958.2	4082	9	-12	16561	-12	-16561	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	446	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGAAGGGGTC	5515	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112026835	112022560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_112024275_112026766
tx.23749	chr8	-	935	3	Intergenic	novelGene_358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTGTGTGGACTTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112757542	112751565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_112752236_112753852_112753990_112757414
tx.2375	chr11	+	559	3	FSM	ENSMUSG00000069919.8	ENSMUST00000093209.4	699	3	161	-21	-139	21	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGCATGCCTGGTTCTCT	7158	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32233671	32234486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_32233802_32233923_32234129_32234262
tx.23750	chr8	+	1716	6	ISM	ENSMUSG00000031845.17	ENSMUST00000034308.16	2338	11	17329	7	17185	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.489897948556636	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGCTGGACTTTTGCTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117839921	117860452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_117840327_117844130_117844389_117854177_117854284_117855913_117856009_117857336_117857449_117859712
tx.23751	chr8	-	4223	23	FSM	ENSMUSG00000031835.17	ENSMUST00000081381.6	4195	23	-23	-5	-23	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	394	junction_22	51.0282088571954	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGCATGTGTCGTGCCCC	8118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120285497	120234889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_120235715_120236992_120237124_120240612_120240740_120242316_120242449_120244877_120245019_120247010_120247089_120247736_120247862_120248493_120248651_120249217_120249334_120251165_120251339_120252106_120252296_120255662_120255808_120257787_120257950_120260059_120260212_120262013_120262117_120264865_120264934_120265582_120265700_120268323_120268434_120268813_120268925_120269463_120269668_120272722_120272981_120274138_120274625_120285384
tx.23752	chr8	-	3067	4	ISM	ENSMUSG00000034189.6	ENSMUST00000212517.2	2215	5	1991	-816	1991	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	115	junction_3	15.8954920234218	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCCACCAGAGGGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120294743	120288722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_120290877_120292382_120292611_120292767_120293214_120294504
tx.23753	chr8	-	2974	7	NNC	ENSMUSG00000034105.10	novel	3085	8	NA	NA	4953	-61	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	12.2610494384997	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCCTGGCAAGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120500180	120486875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_120488570_120489030_120489211_120490674_120490794_120494804_120495234_120497973_120498125_120499112_120499344_120500010
tx.23754	chr8	-	1573	8	NNC	ENSMUSG00000034105.10	novel	3085	8	NA	NA	-6	-1504	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	12.363540870525	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCCTAACTCCTGCTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120505141	120488318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_120488570_120489030_120489211_120490674_120490794_120494804_120495234_120497973_120498125_120499112_120499344_120500010_120500180_120505098
tx.23755	chr8	-	715	4	NIC	ENSMUSG00000031816.16	novel	488	5	NA	NA	669	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	5	junction_2	8.98146239020499	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCTGCGGCTTACAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121833713	121830590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_121830920_121831130_121831298_121832456_121832571_121833608
tx.23759	chr8	+	841	4	ISM	ENSMUSG00000015016.9	ENSMUST00000212790.2	2171	10	26963	-4	26963	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_2	3.39934634239519	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCTGTGAGCTGTGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123529279	123544623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_123529381_123539733_123539869_123540298_123540411_123544130
tx.2376	chr11	+	755	3	FSM	ENSMUSG00000073063.4	ENSMUST00000101387.4	562	3	-6	-187	-6	130	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGGCTGGTCTCTCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32236958	32237914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_32237108_32237202_32237408_32237513
tx.23760	chr8	+	610	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000099881.2	novel	2137	1	NA	NA	172	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATGTTTTACCTGCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123769376	123771341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr8_+_123769620_123770974
tx.23761	chr8	-	551	4	ISM	ENSMUSG00000032815.17	ENSMUST00000155488.8	2994	26	-2	26926	-2	-832	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	111	junction_1	19.0262975904404	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCTGTCTTCCTTACTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124045301	124039853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_124040113_124043101_124043196_124044800_124044911_124045213
tx.23764	chr8	-	2338	4	ISM	ENSMUSG00000031974.9	ENSMUST00000075578.7	4306	13	24482	0	24482	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	39	junction_3	15.195028426722	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGTCTGTGTGTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124685379	124679197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_124681315_124681461_124681497_124682511_124682556_124685237
tx.23766	chr8	+	1173	6	ISM	ENSMUSG00000089704.10	ENSMUST00000034458.9	4113	16	102902	1780	38927	-1780	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_1	8.27042925125413	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTCCACAAAGCTGGCC	6885	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125061031	125070681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_125061141_125063312_125063406_125064000_125064085_125065181_125065309_125067557_125067678_125070041
tx.23767	chr8	-	2380	4	ISM	ENSMUSG00000050751.15	ENSMUST00000136892.3	1739	7	16664	-969	-1006	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_3	5.71547606649408	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCGGCTGTTAGTATGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125103291	125095792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_125097426_125098590_125098697_125100984_125101183_125102848
tx.23769	chr8	-	1085	2	Intergenic	novelGene_363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTATCTGAGTTAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127149097	127138545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_127139541_127149007
tx.2377	chr11	+	608	3	FSM	ENSMUSG00000020295.2	ENSMUST00000020535.2	604	3	-3	-1	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTGAGCCTGGTGTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32250065	32250874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_32250213_32250307_32250513_32250618
tx.23770	chr8	+	3170	5	NNC	ENSMUSG00000110605.2	novel	1134	4	NA	NA	-40	2274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_2	15.1657508881031	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGTCGTGGTATCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129990081	130011599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_129990206_129993965_129994181_130007503_130007631_130007817_130007879_130008956
tx.23771	chr9	-	1920	2	Intergenic	novelGene_1296	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTGGTCTGTGGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6785412	6780369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_6781894_6785016
tx.23772	chr9	+	1416	3	FSM	ENSMUSG00000110161.2	ENSMUST00000211167.2	545	3	-17	-854	-17	854	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTTCTTGATCATGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8004813	8010124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_8004885_8005927_8006106_8008957
tx.23773	chr9	-	398	2	ISM	ENSMUSG00000053070.6	ENSMUST00000215478.2	533	4	-64	19987	-54	-19987	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTTTGTTTTGTTTCTTA	-45	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8042878	8042301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_8042492_8042670
tx.23774	chr9	+	2199	3	NNC	ENSMUSG00000031925.18	novel	6404	5	NA	NA	39489	160	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_2	1	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13613244	13618801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_13613418_13613539_13613652_13616887
tx.23775	chr9	+	658	3	FSM	ENSMUSG00000031918.17	ENSMUST00000134530.2	442	3	-216	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_2	26.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTTGGGAGGCAGCGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13660468	13697471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_13660697_13693572_13693679_13697147
tx.23776	chr9	+	3023	15	FSM	ENSMUSG00000031918.17	ENSMUST00000034396.14	3788	15	764	1	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_2	44.4939803312121	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTTGTCCACAGTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13660469	13717776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_13660697_13693572_13693679_13697147_13697224_13699876_13699972_13700335_13700447_13703274_13703377_13704444_13704529_13706532_13706683_13707253_13707443_13710445_13710632_13711171_13711379_13713210_13713304_13714720_13714835_13716101_13716279_13716670
tx.23777	chr9	+	1879	6	ISM	ENSMUSG00000031918.17	ENSMUST00000134674.8	3106	16	49957	1	3177	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	385	junction_5	35.2681159122514	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTTGTCCACAGTTGTCT	1527	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13710449	13717776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_13710632_13711171_13711379_13713210_13713304_13714720_13714835_13716101_13716279_13716670
tx.23778	chr9	-	741	4	FSM	ENSMUSG00000031927.10	ENSMUST00000060330.5	688	4	0	-53	0	53	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATAATTGGCTCACCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14682326	14669433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_14669752_14672900_14673027_14678152_14678258_14682134
tx.23779	chr9	+	1082	3	ISM	ENSMUSG00000031928.16	ENSMUST00000034405.11	3286	20	27	46862	5	-2806	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	154	junction_1	76.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14695976	14699080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_14696054_14696726_14696825_14698173
tx.2378	chr11	+	1301	9	NNC	ENSMUSG00000020272.9	novel	5026	19	NA	NA	-14	-1088	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	19	junction_2	23.5889274872767	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTTAATTAGAATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32483290	32547440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_32483560_32505123_32505289_32524498_32524548_32527623_32527774_32537312_32537386_32538755_32538951_32539409_32539492_32546614_32546750_32547257
tx.23780	chr9	-	337	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000111534.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.49443825784929	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCATGTGTCCTTGTGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17467621	17433557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_17433599_17438342_17438424_17445409_17445515_17467511
tx.23781	chr9	+	199	2	Intergenic	novelGene_1299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTGTGTCTGCTGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17445408	17467608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_17445517_17467517
tx.23782	chr9	+	2125	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000111613.2	novel	1262	1	NA	NA	86	51898	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTCGAAGGTTTTCTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17644051	17697125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_17645519_17696467
tx.23783	chr9	-	2849	20	NNC	ENSMUSG00000043943.15	novel	2799	19	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.66435666324652	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTGTTAGCATCAAGAAACA	2072	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18297318	18234315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_18234920_18237471_18237565_18238659_18238742_18241930_18242196_18246223_18246315_18250686_18250779_18258749_18258818_18260145_18260210_18261729_18261794_18262145_18262229_18262331_18262452_18262705_18262792_18274437_18274537_18275416_18275511_18287718_18287906_18289903_18290030_18291207_18291310_18292090_18292278_18296340_18296453_18297088
tx.23784	chr9	+	1082	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000074500.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACATCCTAGAAGTTAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18384755	18389186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_18385081_18388429
tx.23785	chr9	-	775	2	ISM	ENSMUSG00000059475.14	ENSMUST00000169269.8	752	5	-54	11097	-9	-9603	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTGTGTATTTTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20404051	20397328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_20397734_20403681
tx.23786	chr9	-	285	3	NNC	ENSMUSG00000032172.9	novel	1895	6	NA	NA	82	-60570	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCCTCACAAGTGTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20657563	20644197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_20644281_20646405_20646511_20657466
tx.23787	chr9	+	693	4	Intergenic	novelGene_1301	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.05480466765633	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTTTTGTTGTTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21061282	21066451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_21061443_21064028_21064163_21064772_21064968_21066247
tx.23788	chr9	+	1589	2	FSM	ENSMUSG00000097439.7	ENSMUST00000193875.6	574	2	-225	-790	-225	790	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAGAAAAACATTAAAA	4931	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21136441	21138499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21136773_21137241
tx.23789	chr9	-	597	3	ISM	ENSMUSG00000003309.15	ENSMUST00000003397.9	1706	11	13986	-1	4662	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGAGTGTGCTTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21209621	21206755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21207151_21207728_21207805_21209495
tx.2379	chr11	+	430	2	ISM	ENSMUSG00000020272.9	ENSMUST00000102821.4	5026	19	-9	69298	-9	-43239	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGAGAGCGCCAGCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32483295	32505289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_32483560_32505123
tx.23790	chr9	+	3443	22	FSM	ENSMUSG00000057193.9	ENSMUST00000034697.8	3456	22	16	-3	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_21	32.3776608971381	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGACCTGGTATGCTTAATA	5752	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21249139	21266324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21249259_21249736_21249786_21253074_21253149_21253234_21253320_21253478_21253564_21253690_21253802_21253893_21253955_21254038_21254163_21254259_21254344_21254430_21254544_21256127_21256260_21256588_21256689_21256774_21256868_21257204_21257290_21257984_21258248_21258330_21258426_21259178_21259283_21259370_21259445_21259623_21259695_21259833_21259923_21263762_21263848_21264977
tx.23791	chr9	+	1449	3	FSM	ENSMUSG00000032178.15	ENSMUST00000215438.2	415	3	158	-1192	158	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	922	junction_2	562	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTCCGTACTTGAGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21311088	21313093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21311138_21311255_21311310_21311747
tx.23792	chr9	+	4484	18	FSM	ENSMUSG00000032193.10	ENSMUST00000034713.9	4627	18	143	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	262	junction_7	34.4140270749526	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTCATCCTTATGTGTG	1916	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21634921	21661215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_21635141_21643042_21643166_21643607_21643731_21644786_21645171_21646532_21646656_21648515_21648639_21649169_21649290_21650150_21650277_21650681_21650854_21650944_21651170_21653482_21653602_21653952_21654093_21655217_21655360_21655525_21655682_21657027_21657202_21657657_21657736_21658444_21658603_21659436
tx.23793	chr9	-	1888	15	NNC	ENSMUSG00000032198.10	novel	1868	15	NA	NA	-1	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	52.93955929903	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTGCCTCTGTTCTCTTTT	6274	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21763913	21748641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21748864_21750046_21750210_21750438_21750533_21750648_21750777_21750920_21751069_21751167_21751249_21752788_21752939_21753205_21753273_21754228_21754315_21755502_21755716_21756739_21756870_21757056_21757126_21757794_21757971_21758480_21758569_21763840
tx.23794	chr9	-	1030	2	Intergenic	novelGene_1304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTGCCTGTGATGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21771877	21770384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_21771349_21771811
tx.23795	chr9	+	1559	12	ISM	ENSMUSG00000006241.17	ENSMUST00000006403.7	1531	13	141	-2	0	2	intron_retention	FALSE	canonical	2	3	junction_10	1.8630819574472	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGCACCTGCTGGTTCA	3267	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21838907	21847170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21839025_21840388_21840523_21840603_21840831_21842605_21842640_21842994_21843084_21843160_21843243_21844099_21844287_21844841_21844910_21844991_21845069_21845413_21845530_21845730_21845814_21846825
tx.23796	chr9	+	967	5	ISM	ENSMUSG00000040563.14	ENSMUST00000046371.13	2626	10	-18	7519	-18	-6632	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	17	junction_3	4.74341649025257	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATACGTACATGCATGCACAC	79	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21848310	21852681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21848455_21849690_21849861_21850594_21850675_21851980_21852170_21852297
tx.23798	chr9	-	1268	5	ISM	ENSMUSG00000006235.7	ENSMUST00000006397.7	1761	8	1895	0	953	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_3	3.89711431702997	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTCTTATTTGTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21872907	21870192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21870967_21871056_21871145_21871819_21871908_21871985_21872140_21872743
tx.23799	chr9	-	1156	5	ISM	ENSMUSG00000038895.17	ENSMUST00000043922.7	2108	9	13450	0	13381	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	36	junction_2	9.24662100445346	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTAAGCCTGGATAATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21969191	21966755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_21967190_21967288_21967389_21967709_21967825_21968582_21968695_21968796
tx.238	chr1	-	2742	8	FSM	ENSMUSG00000026094.15	ENSMUST00000027263.14	3293	8	8	543	8	-543	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_1	6.25316246521123	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATCTGAATAATAAGTATG	694	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53824375	53795207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_53796930_53800140_53800321_53801747_53801797_53803190_53803318_53805079_53805225_53810768_53810982_53815675_53815839_53824232
tx.2380	chr11	+	624	3	NNC	ENSMUSG00000020272.9	novel	5026	19	NA	NA	-9	-38779	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	11	junction_2	15	128	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTAATTTTCTGTGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32483295	32509749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_32483560_32505123_32505289_32509554
tx.23800	chr9	+	1332	3	FSM	ENSMUSG00000109765.3	ENSMUST00000211082.3	1468	3	-1	137	-1	-137	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTGTGTGTGTGTATA	7747	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22078773	22081811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_22078904_22079092_22079151_22080667
tx.23801	chr9	-	3615	5	FSM	ENSMUSG00000062794.9	ENSMUST00000086281.5	3574	5	-39	-2	-39	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	12.747548783982	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTAGTCTGAGATGTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22171230	22158723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_22161837_22162823_22162928_22165150_22165244_22169340_22169468_22171052
tx.23802	chr9	-	872	4	ISM	ENSMUSG00000036777.9	ENSMUST00000040912.9	4605	24	78	44243	78	-8295	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	512	junction_1	19.8158185969358	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCAGCAGGAAGCTACAT	7261	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22300406	22287550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_22287819_22291345_22291652_22293466_22293624_22300265
tx.23803	chr9	+	1175	4	NNC	ENSMUSG00000100002.3	novel	921	3	NA	NA	-231	-7347	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGAGTTCTGTGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25063178	25079510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_25063484_25068253_25068368_25069396_25069498_25078855
tx.23804	chr9	-	3570	6	FSM	ENSMUSG00000031988.11	ENSMUST00000034470.11	3575	6	-18	23	-18	-23	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_3	12.273548794053	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCATTGTGCCCGTGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26941379	26919089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_26921334_26921659_26921803_26924020_26924197_26926452_26926618_26930613_26930771_26940694
tx.23805	chr9	+	885	4	Intergenic	novelGene_1307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGGGTGCTTTGCTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27069432	27079218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_27069617_27072475_27072603_27073021_27073138_27078760
tx.23806	chr9	+	1826	6	NNC	ENSMUSG00000042496.19	novel	1952	7	NA	NA	-126	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16.0324670590649	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTATGTCATGAGCATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31224722	31241909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_31224918_31227465_31227635_31229807_31229868_31236922_31237131_31238611_31238854_31240957
tx.23807	chr9	-	848	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032036.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	7.15891053163818	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTAGGCATACACCTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34900004	34894763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_34895038_34895356_34895445_34895840_34895961_34896290_34896441_34899788
tx.23808	chr9	-	1636	8	NNC	ENSMUSG00000050471.18	novel	1860	8	NA	NA	11	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	60.0611932846452	51	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGGCTCTACTTTGAAGA	6375	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35179090	35128526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_35129044_35129224_35129285_35132675_35132960_35134909_35135039_35138459_35138688_35146526_35146780_35155909_35156003_35179018
tx.23809	chr9	-	1649	4	FSM	ENSMUSG00000034303.9	ENSMUST00000216042.2	1669	4	10	10	3	-10	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	4.92160768674447	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTCCCATCCAGTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37259674	37252715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_37253918_37255179_37255330_37259033_37259220_37259563
tx.2381	chr11	-	998	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020272.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.63299316185545	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCACATTACGATTGGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32564700	32562182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_32562751_32563436_32563569_32563965_32564062_32564498
tx.23810	chr9	+	2819	9	ISM	ENSMUSG00000001942.9	ENSMUST00000215474.2	4947	10	148	3329	-9	-661	intron_retention	FALSE	canonical	3	33	junction_7	7.74495803732983	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTTCCAGCTCCTGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37525113	37557622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_37525223_37528095_37528258_37534194_37534371_37538995_37539135_37542644_37542901_37544253_37544364_37544916_37545051_37553935_37554094_37556047
tx.23811	chr9	-	5550	18	ISM	ENSMUSG00000040111.18	ENSMUST00000216821.2	7445	19	42638	1514	-255	-1505	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_6	4.94957269834415	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTGGCTTGTGTTAGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40245079	40206045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_40209376_40210897_40211016_40211284_40211393_40214793_40214885_40215618_40215823_40216361_40216466_40217627_40217771_40218035_40218155_40219151_40219296_40219588_40219779_40221193_40221351_40223053_40223170_40226262_40226344_40226983_40227080_40228160_40228265_40228804_40228890_40238713_40238735_40244740
tx.23812	chr9	-	1369	10	ISM	ENSMUSG00000040111.18	ENSMUST00000137454.8	2667	12	1607	4664	-1452	-21	internal_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_6	6.01438604565527	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATATATTATATACAGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40219743	40209192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_40209376_40210897_40211016_40211284_40211393_40214793_40214885_40215618_40215823_40216361_40216466_40217627_40217771_40218035_40218155_40219151_40219296_40219588
tx.23813	chr9	-	531	4	ISM	ENSMUSG00000040111.18	ENSMUST00000137454.8	2667	12	6463	4636	3404	7	internal_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	2.86744175568088	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGATAATGCCTATGTACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40214887	40209164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_40209376_40210897_40211016_40211284_40211393_40214793
tx.23814	chr9	-	677	4	FSM	ENSMUSG00000040111.18	ENSMUST00000150977.8	412	4	-252	-13	-252	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	1.63299316185545	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAGGAGAAAGCCCCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40245076	40228029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_40228265_40228804_40228890_40238713_40238735_40244740
tx.23815	chr9	+	1348	3	ISM	ENSMUSG00000032024.11	ENSMUST00000034522.8	4154	7	88079	2202	-3	646	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAGGAAACACATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40685386	40694413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_40685782_40692408_40692551_40693602
tx.23816	chr9	-	1051	6	ISM	ENSMUSG00000049313.9	ENSMUST00000060989.9	10715	48	144801	3755	-4909	1264	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	465	junction_3	110.837899655307	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAGGAAAAGAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41890792	41879770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_41879967_41880939_41881153_41885232_41885426_41887653_41887761_41888731_41888907_41890625
tx.23817	chr9	-	1119	2	NNC	ENSMUSG00000037287.16	novel	2327	2	NA	NA	34	478	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTTGTTGGTGTGTCTG	4388	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42339500	42326492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_42327446_42339334
tx.23818	chr9	-	682	3	ISM	ENSMUSG00000034342.10	ENSMUST00000205968.2	2809	16	-12	21840	0	112	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGTGAAAAGTAAGTCTCT	2967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44145293	44084559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_44084697_44112256_44112505_44144996
tx.23819	chr9	-	809	3	ISM	ENSMUSG00000032127.10	ENSMUST00000214510.2	3812	14	8953	166	5421	-166	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_1	3	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTTATGGAGACTTTCCA	4614	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44263988	44259390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_44259882_44260199_44260423_44263893
tx.2382	chr11	+	742	4	NNC	ENSMUSG00000020272.9	novel	5026	19	NA	NA	26166	-1712	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_1	21.9696760710454	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTATTGTGATCCTTGTG	1691	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32564760	32572875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_32564811_32565780_32565907_32567848_32567963_32572423
tx.23820	chr9	+	478	2	Intergenic	novelGene_1310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTAAATAGTTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44272673	44276169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_44272917_44275934
tx.23821	chr9	-	703	3	ISM	ENSMUSG00000059890.17	ENSMUST00000145657.9	3486	19	27777	96	27777	-96	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_2	2	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTGTGAAAATATTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44849046	44844364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_44844777_44846624_44846800_44848930
tx.23822	chr9	+	1788	2	FSM	ENSMUSG00000048534.8	ENSMUST00000215098.2	489	2	-221	-1078	-221	-3	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTTTTGGTTTTTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45014936	45019829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_45015572_45018676
tx.23823	chr9	+	656	3	ISM	ENSMUSG00000032087.12	ENSMUST00000239429.2	6336	33	29	302536	29	4858	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_2	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGGAATCGTGGGTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45341619	45361926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_45341811_45358962_45359281_45361779
tx.23824	chr9	-	782	2	ISM	ENSMUSG00000042790.17	ENSMUST00000162369.8	3517	13	39710	25	2826	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCCACAGTCCAAGAACAACA	9735	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45777961	45775612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_45776297_45777863
tx.23825	chr9	+	2289	4	NNC	ENSMUSG00000110767.2	novel	538	3	NA	NA	-30657	19496	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACTGATTTCATTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46413397	46474170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_46413612_46444054_46444268_46445205_46445267_46472369
tx.23827	chr9	+	2437	2	Intergenic	novelGene_1312	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGTTCCCGGTGTCTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48757683	48763172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_48758041_48761092
tx.23828	chr9	+	1479	13	NNC	ENSMUSG00000032267.9	novel	4109	24	NA	NA	6	-963	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_12	223.298551396008	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTGCTGCTTTCTTTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48896719	48934422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_48896838_48911650_48911729_48912807_48912941_48914290_48914397_48915122_48915283_48919728_48919816_48920395_48920534_48921542_48921617_48922562_48922643_48926401_48926551_48927981_48928110_48929671_48929768_48934290
tx.23829	chr9	+	1295	11	ISM	ENSMUSG00000032267.9	ENSMUST00000213874.2	4109	24	-36	25699	3	-7274	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	612	junction_8	93.0075803362285	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTATTGGTTCAAACACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48896677	48928111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_48896838_48911650_48911729_48912807_48912941_48914290_48914397_48915122_48915283_48919728_48919816_48920395_48920534_48921542_48921617_48922562_48922643_48926401_48926551_48927981
tx.2383	chr11	+	804	4	NNC	ENSMUSG00000020272.9	novel	5026	19	NA	NA	26178	-1712	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	27.0102861065105	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTATTGTGATCCTTGTG	1703	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32564772	32572875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_32564885_32565780_32565907_32567848_32567963_32572423
tx.23830	chr9	+	1182	8	ISM	ENSMUSG00000032267.9	ENSMUST00000213874.2	4109	24	-31	31943	-2	6658	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	642	junction_4	87.5391457624321	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGGTGTATGGTATGGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48896682	48921867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_48896838_48911650_48911729_48912807_48912941_48914290_48914397_48915122_48915283_48919728_48919816_48920395_48920534_48921542
tx.23831	chr9	+	352	3	ISM	ENSMUSG00000032267.9	ENSMUST00000213874.2	4109	24	-30	40883	-1	1051	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	897	junction_1	5.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTCTTAGCAAGTAGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48896683	48912927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_48896838_48911650_48911729_48912807
tx.23832	chr9	-	391	4	Intergenic	novelGene_1314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTTTGGACATGATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49803400	49787444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_49787550_49791679_49791732_49792951_49793125_49803339
tx.23833	chr9	-	1005	5	NNC	ENSMUSG00000032065.7	novel	1003	5	NA	NA	6	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.5199840255489	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCTATTTTTTTATTTT	6968	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50472619	50468114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_50468792_50469544_50469601_50469686_50469799_50470519_50470586_50472525
tx.23834	chr9	+	1222	6	FSM	ENSMUSG00000000167.15	ENSMUST00000000171.15	1256	6	37	-3	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.03960780543711	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTGGTGTTTTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50528657	50536300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_50528899_50529745_50529950_50531054_50531179_50532244_50532491_50532920_50533187_50536159
tx.23835	chr9	-	1673	2	ISM	ENSMUSG00000037971.11	ENSMUST00000176894.2	2761	6	270	9021	270	-4154	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	CAAAATCAAAAACAAAAACA	7257	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50686550	50684047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_50685347_50686176
tx.23836	chr9	+	2061	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000111162.2_ENSMUSG00000110825.2	novel	1007	1	NA	NA	-75	98	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAATAGGATGAAGCAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51533969	51568859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_51535325_51568153
tx.23838	chr9	-	2586	19	NIC	ENSMUSG00000032030.17	novel	5945	20	NA	NA	22	-667	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	65	junction_18	82.5942222891865	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGACTCTATTTTGCCAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53581292	53528990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_53529311_53532459_53532584_53533157_53533277_53534081_53534244_53534934_53535111_53535457_53535582_53537162_53537295_53540474_53540608_53543572_53543638_53545031_53545140_53545284_53545416_53546271_53546366_53553817_53553899_53553980_53554127_53555786_53555929_53557966_53558144_53566571_53566672_53569870_53569981_53581150
tx.2384	chr11	-	1281	11	FSM	ENSMUSG00000057113.14	ENSMUST00000075641.10	1633	11	129	223	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16927	junction_8	1838.26714326292	216500	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTGTTTCTATTTGCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33113077	33102509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_33102853_33103985_33104061_33106002_33106105_33106663_33106748_33106990_33107049_33109933_33109996_33110333_33110441_33110827_33110922_33111105_33111226_33111547_33111628_33112921
tx.23840	chr9	+	1627	13	FSM	ENSMUSG00000032307.17	ENSMUST00000059555.15	3456	13	699	1130	158	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	762	junction_1	63.2035402489449	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGGTTTAGAAATTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55056836	55113683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_55057111_55070251_55070354_55075486_55075592_55083474_55083532_55087756_55087898_55090385_55090471_55092187_55092249_55092953_55093045_55099125_55099185_55102270_55102320_55102707_55102804_55110984_55111052_55113243
tx.23841	chr9	-	1299	8	ISM	ENSMUSG00000034007.11	ENSMUST00000217647.2	4370	33	-27	340913	-18	-148051	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_7	7.32343178170074	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTTCCTAGATTCTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55845421	55798963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_55799573_55802565_55802667_55819323_55819519_55822183_55822255_55823270_55823389_55826807_55826872_55828549_55828623_55845353
tx.23842	chr9	+	1755	15	NNC	ENSMUSG00000032322.15	novel	1863	15	NA	NA	87	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.52903409343875	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGCACATTCTTCCTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55997346	56036166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_55997729_56021518_56021615_56022346_56022422_56027584_56027620_56027830_56027938_56030042_56030106_56030545_56030645_56031031_56031078_56031877_56031962_56032407_56032507_56033210_56033308_56033865_56033957_56034768_56034822_56035010_56035145_56035872
tx.23843	chr9	+	1278	13	NNC	ENSMUSG00000032322.15	novel	1863	15	NA	NA	-5225	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3.37474278855276	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGCACATTCTTCCTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56022345	56036166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_56022422_56027584_56027620_56027830_56027938_56030042_56030106_56030545_56030645_56031031_56031078_56031877_56031962_56032407_56032507_56033210_56033308_56033865_56033957_56034768_56034822_56035010_56035145_56035872
tx.23846	chr9	+	2079	9	NNC	ENSMUSG00000032329.5	novel	1700	9	NA	NA	4	471	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_3	70.4457903284504	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGGTAGATGGCTCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56325931	56398080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_56326216_56374641_56374735_56381814_56381960_56384553_56384679_56388881_56389015_56389891_56389924_56394899_56394976_56395897_56396114_56397105
tx.23847	chr9	-	1108	3	NNC	ENSMUSG00000074284.7	novel	1241	3	NA	NA	7	112	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGTCTTAGCTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56979243	56963801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_56964423_56964949_56965086_56978892
tx.23848	chr9	-	1404	2	FSM	ENSMUSG00000032300.8	ENSMUST00000214583.2	625	2	-20	-759	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGGATCTAGCTTTGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57169902	57160399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_57161613_57169711
tx.23849	chr9	-	2356	7	NIC	ENSMUSG00000063849.7	novel	2744	7	NA	NA	34	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_2	53.0251512649108	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGTGTCCTTCTTTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57347340	57321240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_57322010_57322368_57322538_57327445_57327575_57328408_57328505_57342185_57342369_57344699_57344766_57346396
tx.2385	chr11	-	1159	10	FSM	ENSMUSG00000057113.14	ENSMUST00000109354.10	1157	10	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2877	junction_1	5620.63509877489	23574	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGGATGTATGTGACAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33113077	33104924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_33105221_33106002_33106105_33106663_33106748_33106990_33107049_33109933_33109996_33110333_33110441_33110827_33110922_33111105_33111226_33111547_33111628_33112921
tx.23850	chr9	-	2661	2	ISM	ENSMUSG00000040722.8	ENSMUST00000215208.2	790	4	1898	-2284	1898	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	137	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCCTCTGTGTTACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57352777	57348609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_57351148_57352654
tx.23851	chr9	+	695	4	ISM	ENSMUSG00000038957.14	ENSMUST00000043990.14	5708	7	22	25258	-5	11261	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_3	13.5728487143349	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGGCCAGATGAAGAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57615844	57634524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_57615983_57620663_57620845_57623230_57623551_57634468
tx.23852	chr9	-	5221	8	FSM	ENSMUSG00000036986.17	ENSMUST00000114136.9	4343	8	24	-902	24	902	multi-exon	FALSE	canonical	3	178	junction_4	73.8752395624418	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATACACACTGTGTTCGG	2175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58157045	58124456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_58127853_58128997_58129149_58136637_58136691_58137110_58137370_58140435_58140531_58141635_58142217_58154257_58154722_58156823
tx.23853	chr9	-	658	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000066607.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTTTTGTTGTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58397245	58371603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_58371860_58374474_58374770_58397138
tx.23854	chr9	+	1674	3	ISM	ENSMUSG00000025236.12	ENSMUST00000214361.2	5148	6	21546	0	1481	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	314	junction_2	158	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAAGTCTAATTGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59220411	59223483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_59220520_59221035_59221135_59222016
tx.23855	chr9	-	2079	13	NIC	ENSMUSG00000025234.12	novel	6971	14	NA	NA	-34	528	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	22	junction_12	108.59593173268	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCTGTGCATTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59393400	59299867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_59300662_59302160_59302274_59303633_59303895_59310650_59310709_59313007_59313139_59315158_59315231_59315657_59315701_59319707_59319815_59322052_59322120_59333405_59333462_59333896_59333990_59344053_59344199_59393261
tx.23858	chr9	+	326	2	Intergenic	novelGene_1324	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCAAGCCTGGTTTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61766690	61767595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_61766778_61767356
tx.23859	chr9	-	639	3	ISM	ENSMUSG00000032252.15	ENSMUST00000185675.7	4850	5	-38	12982	7	238	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_1	8.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGTTTTCCTTCCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62029930	61977511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_61977896_61995710_61995802_62029766
tx.2386	chr11	-	562	2	ISM	ENSMUSG00000040594.20	ENSMUST00000037522.14	3950	12	-36	31916	-24	-18299	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	199	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAAGAAAAAGAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33463666	33454331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_33454829_33463601
tx.23860	chr9	+	562	2	Intergenic	novelGene_1326	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATACTGATAGGCTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62063236	62064309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_62063271_62063781
tx.23861	chr9	-	1547	2	FSM	ENSMUSG00000046846.5	ENSMUST00000056949.5	3042	2	-23	1518	-23	-1518	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTAGTTTTTTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62189513	62179528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_62180846_62189283
tx.23862	chr9	+	1794	4	Intergenic	novelGene_1329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	3.09120616516523	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCTCTGCTCTCATAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62557000	62562885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_62557281_62557826_62557945_62560928_62560991_62561551
tx.23863	chr9	+	1133	4	Intergenic	novelGene_1330	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.29983164553722	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTAGTGGGGCACTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62557008	62572113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_62557364_62557826_62557945_62560928_62560991_62571515
tx.23864	chr9	-	1408	2	ISM	ENSMUSG00000032405.11	ENSMUST00000214830.2	2492	14	0	67949	0	-27922	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAGAAGAAAGAAAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62888165	62858110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_62859483_62888129
tx.23865	chr9	-	388	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032399.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTTCTTGCTATCAAGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64085801	64085187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_64085282_64085507
tx.23866	chr9	+	1036	4	NNC	ENSMUSG00000032392.12	novel	2518	6	NA	NA	-32	-7867	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_3	34.0685583297366	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGGAGGCCTTGGGATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65122394	65137845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_65122915_65133334_65133473_65137087_65137295_65137674
tx.23867	chr9	+	1839	5	FSM	ENSMUSG00000041837.5	ENSMUST00000048184.4	2419	5	580	0	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	267	junction_1	28.3846349280733	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGCCCCTGATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65253965	65266925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_65254291_65261891_65262031_65263526_65263764_65263999_65264088_65265875
tx.23868	chr9	-	3320	6	FSM	ENSMUSG00000050721.10	ENSMUST00000068944.9	3273	6	-47	0	-47	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_5	5.23832034148352	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTCTGGCCCAAGCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65487369	65461665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_65464362_65465900_65466000_65466701_65466807_65471165_65471286_65480261_65480412_65487219
tx.23869	chr9	+	405	2	ISM	ENSMUSG00000032384.17	ENSMUST00000124688.8	2771	4	14	25373	14	-8371	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAATCTAAATGCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65816325	65857577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_65816451_65857297
tx.2387	chr11	+	538	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000053519.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTAGTAGAGTCCTGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33890262	33902777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_33890504_33902480
tx.23870	chr9	+	1745	12	FSM	ENSMUSG00000032380.10	ENSMUST00000034944.9	1772	12	27	0	15	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	2.90340353139478	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGGGTGTTTTAGAGCT	4161	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66065531	66179524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_66065623_66072619_66072718_66127815_66128038_66138994_66139134_66153698_66153829_66157618_66157668_66158356_66158384_66161752_66161906_66162612_66162659_66175960_66176051_66176148_66176233_66178908
tx.23871	chr9	+	432	6	NIC	ENSMUSG00000035284.11	novel	2669	27	NA	NA	2	-34617	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_3	1.32664991614216	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGGATACATTTCTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67747679	67778475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_67747809_67759772_67759817_67760977_67761021_67766071_67766168_67768065_67768168_67778457
tx.23872	chr9	+	4108	16	FSM	ENSMUSG00000032235.16	ENSMUST00000034761.15	4169	16	17	44	0	-44	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_3	13.7737270030865	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTTTGTCATTTCAGAAA	4669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69305204	69340360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_69305336_69306227_69306370_69307758_69307864_69314398_69314649_69315541_69315662_69317393_69317532_69318054_69318172_69318588_69318749_69319483_69319666_69322619_69323644_69324215_69324392_69328942_69329073_69332938_69333024_69334132_69334184_69335597_69335857_69339322
tx.23873	chr9	+	1140	3	ISM	ENSMUSG00000032235.16	ENSMUST00000117610.8	800	4	11	6332	7	-5817	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_1	16.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACATTCTTTTCTGTTATCTC	4690	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69305225	69308646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_69305336_69306227_69306370_69307758
tx.23874	chr9	+	2382	7	ISM	ENSMUSG00000032235.16	ENSMUST00000034761.15	4169	16	17813	44	-996	-44	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_5	12.1060131982233	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTTTGTCATTTCAGAAA	8207	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69323000	69340360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_69323644_69324215_69324392_69328942_69329073_69332938_69333024_69334132_69334184_69335597_69335857_69339322
tx.23875	chr9	+	575	3	ISM	ENSMUSG00000032220.11	ENSMUST00000213863.2	1260	4	-11	5032	-11	-5032	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	235	junction_2	2	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTCGAAATGTACCAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70114620	70204614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_70114986_70194193_70194338_70204548
tx.23876	chr9	+	4643	28	FSM	ENSMUSG00000032220.11	ENSMUST00000034745.9	4625	28	-18	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_9	20.3906969292862	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTTGTTTCTTCATGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70114631	70307048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_70114986_70194193_70194338_70204548_70204639_70208974_70209070_70223873_70223962_70227350_70227441_70229673_70229806_70232114_70232250_70234425_70234559_70242396_70242594_70245010_70245092_70245998_70246086_70248562_70248650_70249263_70249432_70250325_70250412_70253968_70254051_70260541_70260649_70266566_70266666_70269504_70269650_70274897_70275013_70275950_70276121_70277638_70277785_70283785_70283933_70285492_70285651_70286002_70286093_70291085_70291288_70303057_70303228_70306003
tx.23877	chr9	+	1580	12	ISM	ENSMUSG00000032212.11	ENSMUST00000216816.2	3755	21	36	12045	-4	-41	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_6	52.1523515154882	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAGAAAAGGTCATCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70450071	70487471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_70450364_70451251_70451340_70466318_70466384_70469057_70469256_70470095_70470144_70479430_70479459_70480792_70481208_70481857_70481908_70484003_70484123_70486563_70486714_70487233_70487338_70487448
tx.23878	chr9	+	1033	7	ISM	ENSMUSG00000054693.15	ENSMUST00000140205.8	2720	16	6	32056	6	-1788	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_5	11.1952370824978	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGGAACTTTAGTAGATC	4956	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70586284	70653608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_70586542_70610568_70610720_70625939_70626059_70629894_70630054_70647356_70647458_70651132_70651286_70653515
tx.23879	chr9	+	1907	9	ISM	ENSMUSG00000038535.18	ENSMUST00000184517.8	3919	20	30	27404	2	11	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_1	11.8103503334998	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACGAACTGACTGGCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72182190	72220971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_72182312_72202560_72202605_72203256_72203318_72205983_72206131_72208982_72209049_72209148_72209289_72215232_72215351_72219359_72219531_72219932
tx.2388	chr11	+	580	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020143.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAATCTGTTAATCCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34445029	34452099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_34445291_34447336_34447514_34451957
tx.23880	chr9	+	823	5	ISM	ENSMUSG00000037674.16	ENSMUST00000184851.2	5521	6	538	4320	46	-1656	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_4	90.3244153039476	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTTCTATTTTTTTCAC	1218	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72440062	72507981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_72440263_72484320_72484355_72499032_72499116_72500519_72500643_72507598
tx.23882	chr9	+	1672	7	NNC	ENSMUSG00000032216.16	novel	3329	10	NA	NA	-4	16428	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1369.92620441962	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGTGTGGTTCTGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72569715	72595858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_72569896_72577231_72577399_72578511_72578586_72584596_72584676_72584774_72584814_72593342_72593397_72594779
tx.23883	chr9	+	5410	29	NNC	ENSMUSG00000032216.16	novel	5499	29	NA	NA	-2	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	553.560943449088	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGGCTCCGTTACCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72569717	72657133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_72569896_72577231_72577399_72578511_72578586_72584596_72584676_72584774_72584814_72593342_72593397_72616393_72616445_72617759_72617822_72619448_72619549_72625499_72625667_72628582_72628701_72628778_72628944_72632298_72632365_72633692_72633813_72638183_72638256_72638503_72638559_72638659_72638719_72639873_72639940_72642291_72642522_72643948_72644071_72644155_72644227_72646321_72646418_72646736_72646811_72647449_72647511_72648909_72648970_72649934_72650043_72650821_72650919_72653688_72653762_72654407
tx.23884	chr9	+	1839	2	ISM	ENSMUSG00000092622.9	ENSMUST00000034737.13	1681	3	53	-5	53	5	intron_retention	FALSE	canonical	3	253	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTGTGTATTTGAATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73009732	73011725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_73009958_73010111
tx.23885	chr9	+	511	2	NNC	ENSMUSG00000034593.17	novel	11702	41	NA	NA	28324	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTGTCTTTGTCTATAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75129378	75130970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_75129444_75130524
tx.23886	chr9	+	650	2	Intergenic	novelGene_1337	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGTTTTTGTTTGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76594084	76605547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_76594307_76605119
tx.23887	chr9	+	353	2	ISM	ENSMUSG00000032261.17	ENSMUST00000113215.10	4565	4	-10	23744	-9	-19922	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGATCGATACTGTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83430370	83459655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_83430557_83459488
tx.23888	chr9	+	1840	8	ISM	ENSMUSG00000038379.16	ENSMUST00000186277.2	999	9	-43	-590	8	590	intron_retention	FALSE	canonical	3	220	junction_5	14.2427926635594	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAACGTTAATTGGCTGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83716750	83727070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_83716813_83717823_83717978_83721252_83721467_83721778_83721886_83725133_83725278_83725680_83725796_83725936_83726010_83726099
tx.23889	chr9	+	1056	2	Intergenic	novelGene_1339	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAGAGTCCACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85673848	85676706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_85673983_85675784
tx.2389	chr11	-	718	5	ISM	ENSMUSG00000020143.16	ENSMUST00000143540.8	3727	26	-17	234694	-17	-234694	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.82915619758885	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGGGGATTTGATTTGGT	9001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34674736	34622005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_34622414_34623167_34623224_34624257_34624299_34647025_34647110_34674607
tx.23890	chr9	+	374	3	ISM	ENSMUSG00000074139.9	ENSMUST00000135182.3	700	5	2481	3	2481	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGATATGTGTTTGGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92235618	92239926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_92235659_92236597_92236760_92239754
tx.23891	chr9	+	1213	2	ISM	ENSMUSG00000032409.16	ENSMUST00000189602.7	982	3	-1	1092	-1	691	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAACCTGGTCCAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95739701	95744499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_95739837_95743421
tx.23892	chr9	+	1959	12	NNC	ENSMUSG00000041440.19	novel	2815	16	NA	NA	4	-15253	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_11	20.4494943258218	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAATTAAGCTGATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96001418	96040265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_96001666_96011053_96011148_96015441_96015518_96019797_96019892_96022591_96022724_96027724_96027801_96032268_96032331_96032487_96032562_96032788_96032850_96035133_96035261_96037445_96037551_96039454
tx.23893	chr9	-	737	5	NNC	ENSMUSG00000032449.14	novel	685	4	NA	NA	27	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	35	junction_1	294.035712116743	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCTCACAGTAAATATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96993183	96971756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_96971930_96975129_96975231_96979155_96979234_96982127_96982293_96992963
tx.23894	chr9	+	2170	5	FSM	ENSMUSG00000032456.14	ENSMUST00000112935.8	2166	5	-10	6	-10	-6	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.53553390593274	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAAAGTTTCTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98178625	98293481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_98179034_98236071_98236218_98281508_98281693_98285586_98285667_98292129
tx.23895	chr9	+	881	5	NNC	ENSMUSG00000032456.14	novel	2166	5	NA	NA	-10	5276	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	4.60977222864644	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTTGTGTACTTAGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98178704	98286845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_98179034_98236071_98236218_98281508_98281693_98285586_98285667_98286703
tx.23896	chr9	-	698	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000090470.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAATAATTGGAACAGAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98747788	98743206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_98743813_98747696
tx.23897	chr9	-	877	3	ISM	ENSMUSG00000032462.15	ENSMUST00000035037.14	6478	24	-92	68469	-92	-3773	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	223	junction_2	10	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGGCAGTAACCATGGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99022232	98987175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_98987771_99004336_99004430_99022043
tx.239	chr1	-	689	3	NNC	ENSMUSG00000042807.16	novel	11263	29	NA	NA	39	-94509	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGTTTCATTTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54234288	54075163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_54075372_54079359_54079687_54234134
tx.2390	chr11	-	976	2	ISM	ENSMUSG00000069910.3	ENSMUST00000093191.3	2505	12	19996	-3	10306	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	148	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGTATTTTTTAATTCT	7459	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34704472	34700013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_34700670_34704152
tx.23903	chr9	+	4206	10	FSM	ENSMUSG00000032531.16	ENSMUST00000035121.14	4328	10	120	2	120	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	168	junction_1	19.0852538254079	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTCTGTCTGTCTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102594986	102610615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_102595102_102597279_102598076_102600767_102601063_102601885_102602031_102602301_102602395_102605515_102605812_102606466_102606778_102607166_102607376_102607991_102608169_102608846
tx.23904	chr9	-	720	3	ISM	ENSMUSG00000042757.17	ENSMUST00000049452.15	3574	5	193789	1489	-5407	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_2	7	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTTGCACTGATTGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103376217	103361634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_103361983_103366387_103366543_103376000
tx.23905	chr9	-	325	2	ISM	ENSMUSG00000032560.15	ENSMUST00000189299.2	568	4	-43	9243	-16	-9243	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAAGTAAGTATTCTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104140145	104123962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_104124040_104139897
tx.23906	chr9	-	2063	2	NIC	ENSMUSG00000032565.10	novel	1631	3	NA	NA	17	13	intron_retention	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AACAAAAACAAAAAAAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105009001	105006858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_105008762_105008841
tx.23907	chr9	+	2735	6	NIC	ENSMUSG00000032567.17	novel	2349	6	NA	NA	-23	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	19	junction_1	19.6916225842362	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTATTTATTTATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105272567	105282666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_105273054_105273743_105275058_105278674_105278886_105279916_105279976_105280594_105280791_105282197
tx.23908	chr9	+	2367	5	NNC	ENSMUSG00000032567.17	novel	2755	5	NA	NA	73	4	intron_retention	FALSE	canonical	1	5	junction_2	23.3933751305792	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATTTATTTATATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105272760	105282670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_105273054_105273743_105275058_105278794_105278886_105280594_105280791_105282197
tx.2391	chr11	-	2510	12	FSM	ENSMUSG00000069910.3	ENSMUST00000093191.3	2505	12	-2	-3	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_9	17.9669117367279	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGTATTTTTTAATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34724470	34700013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_34700670_34704152_34704502_34709949_34710138_34710604_34710715_34711716_34711858_34713007_34713119_34713200_34713300_34713386_34713537_34714156_34714355_34716189_34716367_34721551_34721727_34724314
tx.23910	chr9	-	2004	5	NNC	ENSMUSG00000020258.17	novel	4081	5	NA	NA	-1999	659	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_4	3.53553390593274	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTCTCAGCTCATCTCCC	3456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106037336	106032087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_106033307_106033607_106033784_106034343_106034496_106034687_106035104_106037295
tx.23911	chr9	-	649	2	ISM	ENSMUSG00000020253.16	ENSMUST00000076258.13	1811	10	3025	2	971	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTCTTTTCTCTCTCTTT	7201	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106073116	106072151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_106072670_106072985
tx.23912	chr9	-	1110	3	ISM	ENSMUSG00000023249.16	ENSMUST00000123555.8	2495	11	3170	0	-1188	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_2	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTCCTGTCCGACTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106350405	106347825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_106348602_106348958_106349115_106350227
tx.23913	chr9	-	1483	4	NIC	ENSMUSG00000040661.7	novel	9305	22	NA	NA	-2	2332	intron_retention	FALSE	canonical	3	32	junction_1	5.43650214343336	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGGTCCTTGGTCATCT	7311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106666377	106596772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_106597664_106599914_106600114_106631143_106631338_106666178
tx.23914	chr9	-	1063	2	ISM	ENSMUSG00000057969.16	ENSMUST00000102529.10	2875	18	5723	-139	1627	1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	49	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACGCTGGTTCCAGTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107476878	107475414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107476375_107476775
tx.23915	chr9	-	2299	2	FSM	ENSMUSG00000032582.15	ENSMUST00000182242.2	2282	2	-6	-11	5	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	307	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAAACTCCAGTCTACAT	7606	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107749927	107735439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_107737659_107749847
tx.23916	chr9	+	3064	11	FSM	ENSMUSG00000032936.14	ENSMUST00000035700.14	3277	11	205	8	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_4	7.3729234364667	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGCCACCCTCTTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107813077	107826882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_107813251_107822477_107822582_107822687_107822820_107822988_107823064_107823277_107823417_107823538_107823660_107823816_107823893_107823981_107824119_107824280_107824360_107824578_107824667_107824942
tx.23917	chr9	+	1267	2	ISM	ENSMUSG00000032594.12	ENSMUST00000177158.2	1244	5	-76	4185	-76	1042	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	292	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGTTCTATTCTTTGATA	2303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107909195	107919157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107909409_107918103
tx.23918	chr9	-	1310	3	ISM	ENSMUSG00000041528.16	ENSMUST00000047746.13	4722	39	15	25110	15	935	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_2	46	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GACACTGTCTCAAGAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107956485	107953985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_107954633_107954920_107955097_107955998
tx.23919	chr9	+	2078	8	ISM	ENSMUSG00000019039.15	ENSMUST00000019183.14	1746	12	-6	3	-6	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	128	junction_6	10.4803022234036	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGTGAGAGTGAGGCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108447078	108449970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_108447275_108447348_108447645_108447762_108448014_108448090_108448171_108448243_108448373_108448644_108448719_108448811_108448874_108448980
tx.2392	chr11	+	1627	7	FSM	ENSMUSG00000018846.9	ENSMUST00000018990.8	7376	7	312	5437	312	-5437	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_4	14.5191444498481	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTGTTTGAGTCTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35660622	35676675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_35660775_35666912_35667266_35668393_35668648_35669402_35669580_35672410_35672535_35674274_35674401_35676234
tx.23920	chr9	-	3868	15	FSM	ENSMUSG00000064145.13	ENSMUST00000193190.6	2160	15	32	-1740	-11	1	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_5	244.802388026901	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAAGCCTGTGGAGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108526552	108480144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_108482353_108482532_108482617_108484486_108484556_108485107_108485252_108485800_108485953_108487095_108487147_108488831_108488950_108490924_108491035_108492223_108492346_108493876_108494028_108494570_108494635_108497257_108497326_108521224_108521565_108522131_108522194_108526427
tx.23921	chr9	-	2173	16	NIC	ENSMUSG00000064145.13	novel	3924	16	NA	NA	4	11	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	359	junction_14	154.606683771002	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAGCTATTTGACTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108526564	108481873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_108482353_108482532_108482617_108484486_108484556_108485107_108485252_108485800_108485953_108486976_108486999_108487095_108487147_108488831_108488950_108490924_108491035_108492223_108492346_108493876_108494028_108494570_108494635_108497257_108497326_108521224_108521565_108522131_108522194_108526427
tx.23922	chr9	-	2044	4	ISM	ENSMUSG00000064145.13	ENSMUST00000194290.6	1688	6	-47	2857	4	-1840	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	672	junction_2	89.859149042636	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAATGACAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108526564	108495823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_108497326_108521224_108521568_108522131_108522194_108526427
tx.23923	chr9	+	456	3	ISM	ENSMUSG00000032598.9	ENSMUST00000035218.9	3360	13	46	7191	-7	48	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_1	7	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCTAGACAGCCCAATG	3196	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108685612	108688852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_108685854_108688244_108688355_108688747
tx.23924	chr9	+	317	2	NNC	ENSMUSG00000032477.15	novel	3632	15	NA	NA	4771	31479	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACACAATCACAAAACCCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109722674	109754442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_109722964_109754414
tx.23925	chr9	-	628	4	ISM	ENSMUSG00000032480.18	ENSMUST00000062368.13	3806	19	15886	0	-151	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	538	junction_2	48.1732982747358	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCTGCTGTCCTCCCAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109914269	109913387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_109913715_109913796_109913937_109914017_109914122_109914212
tx.23926	chr9	-	182	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032481.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	TAAAAAAAAAAAAAAAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109983361	109956273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_109956431_109983336
tx.23927	chr9	+	1738	5	FSM	ENSMUSG00000048752.8	ENSMUST00000051097.6	1456	5	-282	0	-282	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_3	2.54950975679639	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTCCTCCTTTCTGAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110686752	110693697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_110687528_110690327_110690491_110691329_110691614_110692797_110692965_110693348
tx.23928	chr9	-	381	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032497.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTTGTCTTGGTCATGGTGT	147	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110947119	110944082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_110944281_110946936
tx.23929	chr9	+	1584	14	FSM	ENSMUSG00000032497.20	ENSMUST00000098340.7	3191	14	157	1450	-153	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	68.9842619904487	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATGGATTTGGATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110947359	111053286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_110947458_110948707_110948780_110970257_110970401_110990370_110990458_111017829_111017875_111019235_111019353_111028732_111028904_111034822_111034916_111043208_111043342_111044996_111045047_111048749_111048871_111051225_111051306_111052333_111052439_111053017
tx.2393	chr11	+	1376	4	ISM	ENSMUSG00000018846.9	ENSMUST00000018990.8	7376	7	9247	4774	9247	-4774	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	9.89949493661167	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATTTGTCTTTCTGCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35669557	35677338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_35669580_35672410_35672535_35674274_35674401_35676234
tx.23930	chr9	+	2667	14	ISM	ENSMUSG00000032497.20	ENSMUST00000196981.5	1839	15	1524	-1102	-38	-343	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	59.3288897567055	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGATAATTGTCCCTTTT	373	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110948704	111054392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_110948780_110970257_110970401_110990370_110990458_111017829_111017875_111019235_111019353_111022114_111022187_111028732_111028904_111034822_111034916_111043208_111043342_111044996_111045047_111048749_111048871_111051225_111051306_111052333_111052439_111053017
tx.23931	chr9	+	352	2	Intergenic	novelGene_1347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTTATACCTCTCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111709170	111715045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_111709258_111714780
tx.23932	chr9	-	3187	18	FSM	ENSMUSG00000032504.16	ENSMUST00000035086.13	5951	18	35	2729	20	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	268	junction_2	35.4147936949624	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCATTGTTATGTTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113537292	113483540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_113484176_113485084_113485276_113486153_113486278_113488898_113488994_113490013_113490149_113491336_113491586_113500824_113500995_113501770_113501883_113503392_113503571_113507373_113507498_113509020_113509244_113514374_113514492_113516692_113516794_113518642_113518797_113520520_113520649_113526573_113526644_113529036_113529092_113536966
tx.23933	chr9	+	347	3	Intergenic	novelGene_1348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTCCTCATCATAACCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113556294	113557066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_113556365_113556682_113556777_113556883
tx.23934	chr9	+	1391	4	NNC	ENSMUSG00000074039.11	novel	1285	4	NA	NA	-45	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	6.37704215656966	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACATGGTGAGACACACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114197325	114206304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_114197553_114197857_114197968_114198056_114198132_114205325
tx.23935	chr9	+	3244	2	NNC	ENSMUSG00000079260.4	novel	2921	2	NA	NA	278	313	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114230450	114236657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_114230626_114233588
tx.23936	chr9	+	1409	11	ISM	ENSMUSG00000032435.10	ENSMUST00000047404.7	2601	13	-12	3634	-12	-3634	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	336	junction_8	46.8888046339422	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGAGCTCTGTCCCTTGG	2114	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114517845	114549736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_114518096_114518276_114518351_114534121_114534239_114535074_114535306_114538212_114538383_114542577_114542672_114544161_114544298_114544667_114544780_114546930_114546991_114548925_114548971_114549616
tx.23937	chr9	+	340	2	Intergenic	novelGene_1352	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATTGATTCCTTTATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115513249	115514554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_115513422_115514386
tx.23938	chr9	+	1021	7	ISM	ENSMUSG00000056880.14	ENSMUST00000069651.14	3722	15	51880	1825	50898	-1825	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.372677996249965	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTATCCTTGGAAACAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115789420	115903418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_115789542_115794672_115794738_115795309_115795392_115835566_115835767_115850847_115850900_115859808_115859899_115903007
tx.23939	chr9	+	1531	10	ISM	ENSMUSG00000061393.15	ENSMUST00000215746.2	3175	11	25034	1467	-2868	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_2	23.9773555724336	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAATTGTGTTTTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119256543	119262594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_119256729_119257032_119257143_119257266_119257419_119257490_119257635_119258930_119259075_119259285_119259435_119260289_119260405_119261554_119261694_119261778_119261910_119262332
tx.2394	chr11	-	973	6	ISM	ENSMUSG00000018848.5	ENSMUST00000018992.4	2109	15	17032	0	2635	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	858	junction_4	64.2806347199528	1002	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCAGGTGTGTTTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35708301	35699207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_35699419_35699921_35700170_35700454_35700628_35706465_35706572_35707463_35707574_35708176
tx.23940	chr9	+	862	5	ISM	ENSMUSG00000061393.15	ENSMUST00000035093.15	1729	10	27777	-94	-125	80	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_4	11.9373363863133	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGACTTTTATTATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119259286	119262661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_119259435_119260289_119260405_119261554_119261694_119261778_119261910_119262332
tx.23941	chr9	+	570	3	ISM	ENSMUSG00000042787.16	ENSMUST00000035094.14	3832	6	0	16917	0	-15638	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	32.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTTGTCTGTTTTTGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119274008	119277666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_119274217_119276014_119276165_119277454
tx.23942	chr9	+	2101	5	NIC	ENSMUSG00000042787.16	novel	2571	7	NA	NA	0	-320	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_4	33.8996681399686	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTACTTTCTCTCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119274025	119292984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_119274217_119276014_119276165_119277454_119277595_119278843_119278921_119291441
tx.23943	chr9	-	1327	9	NNC	ENSMUSG00000034115.11	novel	5899	27	NA	NA	11564	-40127	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	0.85695682505013	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTGAAGTGCAAGCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119641362	119622955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_119623241_119624723_119624854_119632401_119632576_119633438_119633637_119634724_119634867_119635992_119636060_119636813_119636988_119640181_119640280_119641303
tx.23944	chr9	-	3038	6	NNC	ENSMUSG00000032515.9	novel	2906	5	NA	NA	-81	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_4	12.9676520619579	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGGTCTTCTTGGTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119813805	119800228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_119802278_119802429_119802745_119803219_119803480_119806067_119806312_119813471_119813536_119813699
tx.23945	chr9	-	555	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032517.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAGAGCTTTCCTTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119989058	119988300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_119988729_119988931
tx.23946	chr9	-	1314	6	FSM	ENSMUSG00000061536.14	ENSMUST00000139193.2	938	6	-24	-352	-24	352	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_4	7.62627038597505	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGCTAGGTAAATTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121534069	121513264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_121513925_121514588_121514655_121517264_121517384_121519301_121519482_121524599_121524809_121533989
tx.23947	chr9	+	628	4	ISM	ENSMUSG00000032525.16	ENSMUST00000182904.9	8950	6	17	9571	17	-1068	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_2	0.942809041582063	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTGGTGTGACTATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121548263	121558011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_121548362_121548524_121548612_121556381_121556457_121557643
tx.23949	chrX	+	2239	2	ISM	ENSMUSG00000031148.15	ENSMUST00000129845.2	674	5	2081	-2054	2081	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	262	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTCGCATTTGTGTTAT	946	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7574172	7576500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_7574261_7574349
tx.2395	chr11	-	2108	15	FSM	ENSMUSG00000018848.5	ENSMUST00000018992.4	2109	15	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	825	junction_11	73.3093807511866	1741	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCAGGTGTGTTTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35725332	35699207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_35699419_35699921_35700170_35700454_35700628_35706465_35706572_35707463_35707574_35708176_35708356_35710700_35710806_35711922_35712053_35715222_35715344_35716813_35716936_35717303_35717405_35718184_35718294_35719451_35719641_35723998_35724134_35725263
tx.23953	chrX	-	1142	3	FSM	ENSMUSG00000039231.19	ENSMUST00000127617.2	1166	3	16	8	16	-8	multi-exon	TRUE	canonical	3	73	junction_2	20	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGAAGTATTCTGACCTC	7316	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7940536	7936675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_7937490_7938561_7938708_7940354
tx.23958	chrX	+	2257	2	FSM	ENSMUSG00000037347.8	ENSMUST00000044138.8	2206	2	-51	0	-51	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCTATCTAGTGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19925747	19963760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_19927448_19963203
tx.2396	chr11	-	984	2	ISM	ENSMUSG00000018849.7	ENSMUST00000018993.7	4531	23	140078	1	13105	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	308	junction_1	0	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTTCTTGTCATTTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35731276	35729227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_35730072_35731136
tx.23961	chrX	+	1051	5	NNC	ENSMUSG00000086877.8	novel	1412	4	NA	NA	0	612	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	82	junction_3	30.3016088681773	73	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCCATGGTCATTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20828352	20853588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_20828835_20833967_20834048_20851664_20851705_20852217_20852400_20853321
tx.23962	chrX	-	612	4	ISM	ENSMUSG00000054737.12	ENSMUST00000115334.8	3160	5	49	7183	0	-4537	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	4.24264068711928	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTGTTTGTTTGTTTG	3285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20928242	20902364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_20902711_20902866_20903012_20926741_20926797_20928176
tx.23964	chrX	-	614	6	NNC	ENSMUSG00000094759.8	novel	639	8	NA	NA	7964	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.2	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30532989	30519642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_30519835_30520153_30520253_30522701_30522784_30530981_30531046_30531357_30531484_30532938
tx.23965	chrX	-	744	7	NNC	ENSMUSG00000095887.8	novel	639	8	NA	NA	7939	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.11803398874989	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28725558	28712218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_28712411_28712729_28712829_28715278_28715361_28723560_28723625_28723933_28724060_28725187_28725317_28725506
tx.23966	chrX	-	617	6	NNC	ENSMUSG00000095152.2	novel	639	8	NA	NA	7952	123	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.4	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29543805	29530602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_29530795_29531113_29531213_29533446_29533529_29541794_29541859_29542169_29542296_29543751
tx.23967	chrX	-	634	6	NNC	ENSMUSG00000094759.8	novel	639	8	NA	NA	7944	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.2	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30533009	30519642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_30519835_30520153_30520253_30522701_30522784_30530981_30531046_30531357_30531484_30532938
tx.23969	chrX	-	835	5	Fusion	ENSMUSG00000106388.2_ENSMUSG00000081195.3	novel	322	3	NA	NA	-81	102	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.16441400296898	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGCCTCAGGTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36865165	36857920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chrX_-_36858142_36859175_36859222_36861051_36861185_36864533_36864803_36864999
tx.2397	chr11	-	1306	4	NNC	ENSMUSG00000018849.7	novel	4531	23	NA	NA	11300	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_3	143.815468183672	48	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCTTGTCATTTGTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35733081	35729225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_35730072_35731136_35731259_35732580_35732815_35732977
tx.23970	chrX	+	1606	4	NIC	ENSMUSG00000071767.5	novel	409	3	NA	NA	18	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.82842712474619	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGCCTCAGGTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36926746	36930150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_36926871_36927028_36928246_36928868_36928915_36929931
tx.23971	chrX	+	1932	2	FSM	ENSMUSG00000048047.4	ENSMUST00000115142.3	2567	2	-77	712	-58	-96	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCAAGTCTTTACAGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37278611	37282849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_37278786_37281091
tx.23974	chrX	-	3140	16	FSM	ENSMUSG00000031109.17	ENSMUST00000114918.9	3226	16	30	56	0	-56	multi-exon	TRUE	canonical	3	25	junction_4	10.7695042700313	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGACTGGGCTGTGAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48377089	48099390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_48100512_48102009_48102058_48102373_48102460_48107659_48107772_48111970_48112079_48114039_48114222_48129392_48129508_48140608_48140716_48142585_48142799_48145211_48145446_48151019_48151227_48158511_48158668_48169493_48169629_48257517_48257662_48375721_48375782_48376977
tx.23975	chrX	-	2521	4	ISM	ENSMUSG00000085396.8	ENSMUST00000148530.3	716	6	48	8938	6	-8938	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_2	17.6823829464998	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGAGAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49724132	49713325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_49715387_49716083_49716128_49719767_49719873_49723821
tx.23977	chrX	-	1691	8	NNC	ENSMUSG00000036109.18	novel	2243	8	NA	NA	174	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	9.59166304662544	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTCTTTCATGCTATAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50294535	50209327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_50209896_50212693_50212789_50217797_50217949_50218981_50219219_50220305_50220498_50228080_50228246_50253294_50253542_50294499
tx.23979	chrX	-	1079	2	ISM	ENSMUSG00000087365.8	ENSMUST00000129764.8	868	4	1093	-583	1093	422	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAATGATCAAAACCCGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52144944	52143500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_52144368_52144732
tx.2398	chr11	-	1355	3	ISM	ENSMUSG00000018849.7	ENSMUST00000018993.7	4531	23	138386	0	11413	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	308	junction_1	4	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCTTCTTGTCATTTGTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35732968	35729226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_35730072_35731136_35731259_35732580
tx.23980	chrX	-	1178	3	NNC	ENSMUSG00000061082.12	novel	1201	3	NA	NA	16107	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATCAGTTGGATGGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52282494	52158872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_52159766_52187295_52187368_52282281
tx.23981	chrX	-	1119	3	NNC	ENSMUSG00000086711.2	novel	4529	2	NA	NA	88	49690	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGCCAAGATATTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52976879	52921713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_52922309_52975320_52975490_52976524
tx.23982	chrX	-	626	3	Intergenic	novelGene_1378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTTATCATTTGAGCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54982979	54965336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_54965630_54982188_54982295_54982752
tx.23983	chrX	+	1302	4	NNC	ENSMUSG00000067873.12	novel	1128	6	NA	NA	-59	2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	251.735752107024	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCACTGGCTCACTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56099198	56102568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_56099559_56100857_56101043_56101404_56101453_56101859
tx.23984	chrX	+	522	4	NNC	ENSMUSG00000067835.5	novel	2051	12	NA	NA	-71539	-38778	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.12825877028341	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCTATTGCTTTGTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59529794	59812821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_59529869_59533307_59533431_59723839_59723918_59812574
tx.23985	chrX	+	1178	3	Intergenic	novelGene_1380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTACTATTCAAATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61223367	61225114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_61223520_61223860_61223947_61224174
tx.23986	chrX	-	1001	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081752.4	novel	1101	1	NA	NA	494	457	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAACTCTCAATTCTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61819797	61818733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_61819650_61819712
tx.23987	chrX	+	1054	2	Intergenic	novelGene_1381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTTCTCGTTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63977021	63982204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_63977270_63981398
tx.23988	chrX	+	1277	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000083912.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGAGTCTGTATCTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67359471	67363860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_67360024_67363135
tx.23989	chrX	-	2717	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00002075022.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTTCCTACTTTAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67721985	67711129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_67713474_67716924_67716982_67720619_67720732_67721781
tx.2399	chr11	-	1812	7	FSM	ENSMUSG00000042032.14	ENSMUST00000040167.11	1949	7	137	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	244	junction_6	119.767367100652	587	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGCTTTATTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40583464	40570140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_40571022_40571482_40571597_40573290_40573485_40575508_40575662_40576053_40576169_40578427_40578623_40583304
tx.23990	chrX	-	3382	6	NIC	ENSMUSG00000073139.10	novel	1307	7	NA	NA	-11	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	188	junction_4	22.0272558436134	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACTGTGTGTATTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69520759	69503360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_69505921_69506450_69506628_69508608_69508693_69510759_69510968_69513723_69513901_69520583
tx.23991	chrX	+	826	2	Intergenic	novelGene_1384	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGACAAGGAGGGACACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69756897	69760077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_69756984_69759337
tx.23992	chrX	+	3362	15	NNC	ENSMUSG00000031337.17	novel	3379	15	NA	NA	-8	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	117.208975243157	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATTTCCAGGGCTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70258625	70358897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_70258689_70274996_70275068_70276677_70276751_70278457_70278553_70297856_70297968_70303330_70303433_70328206_70328291_70330757_70330908_70335354_70335544_70339769_70339960_70343173_70343381_70345339_70345433_70346106_70346221_70351305_70351483_70357254
tx.23993	chrX	+	409	2	NNC	ENSMUSG00000031337.17	novel	770	7	NA	NA	0	-19321	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTTCTAGCTTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70258611	70260971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_70258689_70260639
tx.23994	chrX	+	2221	12	NNC	ENSMUSG00000031337.17	novel	3488	15	NA	NA	16304	4493	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	100.252656031261	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGCCACTAAAAACATGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70274994	70346960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_70275068_70276677_70276751_70278457_70278553_70297856_70297968_70303330_70303433_70328206_70328291_70330757_70330908_70335354_70335544_70339769_70339960_70343173_70343381_70345339_70345433_70346106
tx.23995	chrX	+	3401	6	ISM	ENSMUSG00000015214.15	ENSMUST00000130179.2	3355	7	6554	-526	6554	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_4	11.9766439372639	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGGTCTCTGTTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70444150	70462796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_70444333_70445333_70445541_70448477_70448571_70454338_70454453_70455810_70455988_70460168
tx.23996	chrX	+	1327	2	ISM	ENSMUSG00000031378.15	ENSMUST00000002084.14	3648	10	20528	0	20385	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGCCTCCTGAACTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72780730	72782140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_72780835_72780917
tx.23997	chrX	-	1205	8	NNC	ENSMUSG00000019088.15	novel	1625	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.13546137889432	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCATGTATGCTTAATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73325340	73316823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_73317298_73317548_73317633_73317711_73317825_73317973_73318075_73320084_73320163_73320251_73320341_73320644_73320697_73325126
tx.23998	chrX	+	1541	2	NNC	ENSMUSG00000004221.17	novel	622	4	NA	NA	-4	-31224	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTTGATTTGCTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73436891	73445250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_73437029_73443846
tx.23999	chrX	+	1092	2	NNC	ENSMUSG00000004221.17	novel	622	4	NA	NA	0	-31615	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTGGCATCCTTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73436895	73444859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_73437012_73443883
tx.24	chr1	+	642	2	Intergenic	novelGene_3	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAGCATAGAAAAGCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9770791	9772671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_9770855_9772092
tx.240	chr1	+	1154	7	FSM	ENSMUSG00000025983.12	ENSMUST00000161988.2	1204	7	79	-29	40	29	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	2.3392781412697	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTTGGGTAAGACCTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54289920	54318149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_54290045_54299082_54299247_54302602_54302824_54302932_54303112_54311636_54311706_54316812_54316930_54317869
tx.2400	chr11	-	1806	7	FSM	ENSMUSG00000042032.14	ENSMUST00000101347.10	2053	7	247	0	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	348	junction_6	83.011378068846	1249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTTGGCTTTATTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40585783	40570140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_40571022_40571482_40571597_40573290_40573485_40575508_40575662_40576053_40576169_40578427_40578623_40585629
tx.24000	chrX	+	2549	10	FSM	ENSMUSG00000004221.17	ENSMUST00000064407.10	4530	10	-7	1988	-7	426	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	31.82591536608	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCTTAGGTCTAAATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73473302	73493138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_73473428_73476410_73476613_73477408_73477621_73480772_73480889_73482512_73482666_73483480_73483557_73486950_73487095_73487377_73487521_73491464_73491527_73491822
tx.24001	chrX	-	1045	3	ISM	ENSMUSG00000032750.14	ENSMUST00000114104.2	1705	9	-177	37028	-29	-37026	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGTGGCTTTCATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74128540	74069337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_74069812_74076776_74077081_74128273
tx.24002	chrX	-	1246	8	NIC	ENSMUSG00000031196.14	novel	7295	25	NA	NA	-25	4437	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.07019667802706	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTGTATAGTTACAATTAT	2969	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74425947	74377450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_74377779_74378301_74378419_74381825_74381895_74397646_74397860_74409607_74409731_74411704_74411827_74423092_74423183_74425763
tx.24003	chrX	-	853	7	ISM	ENSMUSG00000016382.16	ENSMUST00000114059.10	3149	16	24	15936	24	-14819	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	263	junction_4	31.768258092351	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGCAGGAATGAAGGTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74918764	74845195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_74845348_74846130_74846213_74848745_74848879_74849356_74849487_74859689_74859854_74870478_74870560_74918653
tx.24004	chrX	+	483	3	Intergenic	novelGene_1388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACAGCTTTATGTCCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77994547	78012128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_77994647_77994730_77994890_78011903
tx.24005	chrX	+	398	2	Intergenic	novelGene_1389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGTCAATAAGGCTATAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81326339	81327821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_81326605_81327688
tx.24006	chrX	+	2149	7	FSM	ENSMUSG00000045103.20	ENSMUST00000132333.8	2133	7	1	-17	1	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_3	27.9011150713053	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTGTGCTTTGGAGGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84091925	84184359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_84092066_84097576_84097639_84133422_84133498_84148749_84148952_84151185_84151272_84153548_84153707_84182933
tx.24007	chrX	+	544	5	ISM	ENSMUSG00000045103.20	ENSMUST00000132333.8	2133	7	-24	33117	0	-33117	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	317	junction_3	32.4759526419165	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCATCATTTCTCTGTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84091900	84151225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_84092066_84097576_84097639_84133422_84133498_84148749_84148952_84151185
tx.24008	chrX	-	1865	19	NIC	ENSMUSG00000025059.17	novel	778	8	NA	NA	9	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	37.4737768395085	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTTGTTTCAGCAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84820221	84750602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_84750792_84754656_84754738_84755947_84756092_84756204_84756326_84756879_84756965_84757947_84758045_84759270_84759350_84773807_84773889_84774488_84774532_84780438_84780507_84780919_84780956_84783900_84783968_84784672_84784783_84787319_84787458_84789830_84789908_84797937_84798016_84804180_84804288_84804939_84805014_84820031
tx.24009	chrX	+	1373	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000091497.2	novel	993	1	NA	NA	-13822	209	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATATTTCATTTATTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89921925	89936949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_+_89922040_89935690
tx.2401	chr11	+	1577	4	FSM	ENSMUSG00000020328.11	ENSMUST00000020578.11	1577	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1122	junction_2	37.9326889224701	4077	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTACTTTTTCTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40624493	40630873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_40624982_40626844_40626894_40627319_40627472_40629985
tx.24010	chrX	-	1597	2	ISM	ENSMUSG00000025656.18	ENSMUST00000113882.8	2445	11	-18	112940	-18	-51937	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATATTTGCTTTTTTTATTT	2789	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94210124	94208074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_94209577_94210029
tx.24011	chrX	-	2928	11	NIC	ENSMUSG00000045802.14	novel	1479	12	NA	NA	-164	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	11	junction_1	7.69675256195754	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTTTCATGGCATCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95411689	95349782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_95351419_95356633_95356734_95358396_95358613_95363891_95364023_95364209_95364292_95365602_95365665_95365900_95365977_95373119_95373245_95382022_95382151_95400740_95400850_95411426
tx.24012	chrX	-	989	4	ISM	ENSMUSG00000031214.14	ENSMUST00000113826.8	2794	26	325986	-661	13640	661	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	3.2659863237109	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCCAAAGAATTGTTGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97608401	97601195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_97602012_97603191_97603234_97607235_97607287_97608321
tx.24013	chrX	+	1420	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031214.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGTGGAAAAGGGAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97787102	97794164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_97787291_97791546_97791598_97792983
tx.24014	chrX	+	697	3	Intergenic	novelGene_1392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGGCTCTGTTGCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98499384	98501342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_98499476_98500399_98500510_98500846
tx.24015	chrX	-	369	2	Intergenic	novelGene_1397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGGTCTGTGGTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99002821	98945232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_98945526_99002745
tx.24016	chrX	+	1820	3	NNC	ENSMUSG00000059327.10	novel	1877	2	NA	NA	-14	-242785	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTTCTATAAATAACTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99019197	99112120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_99019783_99021626_99021695_99110953
tx.24017	chrX	+	1761	2	NNC	ENSMUSG00000059327.10	novel	1877	2	NA	NA	-5	-242767	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAACTCTTGACGTTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99019206	99112138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_99019783_99110953
tx.24018	chrX	+	2232	11	NNC	ENSMUSG00000000881.13	novel	3316	12	NA	NA	0	-1077	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	28.8064228949031	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACTGTGTCAGCCTTTTC	699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99820890	99860935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_99820979_99840291_99840407_99850117_99850295_99850785_99850862_99851658_99851796_99856331_99856383_99856942_99857045_99857809_99857983_99858398_99858509_99858813_99858906_99859824
tx.24019	chrX	+	2752	7	ISM	ENSMUSG00000000881.13	ENSMUST00000151020.8	3316	12	34227	-2	3512	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_2	10.816653826392	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGGCTCAGAGGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99855117	99862016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_99855150_99856331_99856383_99856942_99857045_99857809_99857983_99858398_99858509_99858813_99858906_99859824
tx.2402	chr11	+	1363	4	FSM	ENSMUSG00000020328.11	ENSMUST00000141839.2	577	4	-223	-563	36	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	492.487788906712	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTACTTTTTCTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40624808	40630873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_40625083_40626844_40626894_40627319_40627472_40629985
tx.24020	chrX	-	3449	15	ISM	ENSMUSG00000031310.17	ENSMUST00000121520.8	5564	25	5920	1	925	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_5	11.8287094539911	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTGCTTTCTCTGGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100457600	100447990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_100449410_100449510_100449626_100450810_100451066_100452082_100452198_100452759_100452912_100453217_100453387_100453662_100453767_100454818_100454966_100455137_100455313_100455450_100455564_100455743_100455901_100455983_100456082_100456717_100456884_100457094_100457268_100457509
tx.24021	chrX	+	991	2	Intergenic	novelGene_1400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAGAATGTGAGTAGAGC	9238	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100739421	100744055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_100739530_100743172
tx.24022	chrX	-	1191	3	ISM	ENSMUSG00000118638.2	ENSMUST00000239206.2	2017	5	1922	-13	1922	13	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTTCTTTCTGCTTTTG	2255	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100863661	100861776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_100862058_100862488_100862535_100862797
tx.24023	chrX	-	1985	4	FSM	ENSMUSG00000031325.16	ENSMUST00000127012.9	685	4	-46	-1254	-46	1254	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	0.816496580927726	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTAATTAGATCTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102355434	102272379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_102273781_102276407_102276548_102277627_102277876_102355238
tx.24024	chrX	-	1563	2	ISM	ENSMUSG00000056537.12	ENSMUST00000070705.6	7429	5	4	20817	4	-185	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGGCTGATATTTTTCAG	2377	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103024886	103021585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_103022941_103024678
tx.24025	chrX	-	288	2	NNC	ENSMUSG00000046449.16	novel	11476	3	NA	NA	117831	2766	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGTGTTTTTATAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103126892	103124553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_103124709_103126759
tx.24026	chrX	-	1855	3	FSM	ENSMUSG00000031333.8	ENSMUST00000140333.2	593	3	5	-1267	-5	1267	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_2	20	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTTGACTAATAAAGGAG	10047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103457457	103384604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_103386187_103388530_103388609_103457262
tx.24027	chrX	+	2337	7	FSM	ENSMUSG00000073016.4	ENSMUST00000087867.6	2304	7	-35	2	-35	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	1.67497927018682	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAAGGTTTGTATGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103526388	103551094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_103526956_103539341_103539385_103541880_103541951_103543009_103543073_103545350_103545513_103547934_103548034_103549761
tx.24028	chrX	+	875	2	NNC	ENSMUSG00000082354.2	novel	820	2	NA	NA	-458	2128	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTATCTGTTTTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107448835	107452502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_107449378_107452169
tx.2403	chr11	-	366	2	ISM	ENSMUSG00000020326.8	ENSMUST00000020576.8	3512	6	4004	2189	2631	-1651	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	765	junction_1	0	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATTGTTGACTGGTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40642134	40641567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_40641887_40642087
tx.24030	chrX	-	3117	2	Intergenic	novelGene_1404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATGGAAAGCTTCATGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116231726	116226545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_116227411_116229474
tx.24031	chrX	-	1324	3	Intergenic	novelGene_1405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	27.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATGGAAAGCTTCATGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116231726	116226545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_116227411_116229474_116229708_116231500
tx.24032	chrX	+	422	4	NNC	ENSMUSG00000079450.12	novel	1787	4	NA	NA	-7	-24605	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGCTCCTGGTCATTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122013243	122028174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_122013335_122021730_122021802_122027150_122027267_122028030
tx.24033	chrX	-	764	3	Intergenic	novelGene_1408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGTTTCCGTGTCGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125456404	125443053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_125443345_125444032_125444168_125456066
tx.24037	chrX	+	3830	5	FSM	ENSMUSG00000094004.8	ENSMUST00000113173.8	3677	5	21	-174	21	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_2	39.7955713616478	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTGGTTCTTCGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134274053	134284149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_134274160_134274357_134274485_134278675_134278976_134280276_134280862_134281437
tx.2404	chr11	-	1281	6	FSM	ENSMUSG00000020326.8	ENSMUST00000020576.8	3512	6	41	2190	41	-1652	multi-exon	FALSE	canonical	3	618	junction_3	51.9422756528822	810	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAATTGTTGACTGGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40646097	40641568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_40641887_40642087_40642187_40642266_40642346_40642930_40643185_40644634_40644896_40645827
tx.24042	chrX	+	1873	12	NNC	ENSMUSG00000087368.8	novel	3201	10	NA	NA	9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	8.02269508105826	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGTCATTGTCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135642581	135704113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_135642700_135644151_135644210_135645241_135645458_135648071_135648198_135657242_135657370_135658849_135658946_135659308_135659508_135660604_135660668_135661166_135661325_135662739_135662842_135689269_135689367_135703600
tx.24043	chrX	+	1764	11	NIC	ENSMUSG00000087368.8	novel	3201	10	NA	NA	-6	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_9	7.99749960925288	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGTCATTGTCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135642588	135704113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_135642700_135644151_135644210_135645241_135645458_135648071_135648198_135657242_135657370_135658849_135658946_135659308_135659508_135660604_135660668_135661166_135661325_135689269_135689367_135703600
tx.24044	chrX	-	1190	4	NNC	ENSMUSG00000023443.14	novel	1692	4	NA	NA	1028	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	24.8506650928211	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTGGCTTTGAGAGTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136019892	136016145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_136016755_136018006_136018053_136019115_136019552_136019793
tx.24045	chrX	-	2103	7	FSM	ENSMUSG00000031433.16	ENSMUST00000033810.8	2787	7	-15	699	0	-699	multi-exon	TRUE	canonical	3	17	junction_1	6.26276474268531	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTATTATTATGACATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138899315	138845683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_138846653_138855655_138855804_138868944_138869349_138894046_138894252_138894660_138894854_138895860_138895978_138899248
tx.24046	chrX	-	2691	5	ISM	ENSMUSG00000031433.16	ENSMUST00000033810.8	2787	7	-2	22242	-2	1103	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_4	5.67890834580027	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAGCTTAAATCACCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138899302	138867226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_138869349_138894046_138894252_138894660_138894854_138895860_138895978_138899248
tx.24047	chrX	+	2045	7	FSM	ENSMUSG00000072930.4	ENSMUST00000112796.2	2028	7	-17	0	-17	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	7.43303437365925	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTGTTTGTGTGTGTG	1192	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146963702	147007706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_146963812_146980956_146981083_146981801_146981882_146985542_146986502_146999377_146999460_147000265_147000316_147007067
tx.24048	chrX	+	1955	16	NNC	ENSMUSG00000025271.14	novel	1739	14	NA	NA	-21	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	16	junction_2	17.171552702718	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTCTTTCATTGTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149371203	149426874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_149371339_149371940_149372041_149372935_149373081_149391581_149391708_149394001_149394096_149395908_149395976_149396872_149396948_149403764_149403822_149405077_149405200_149408152_149408361_149411735_149411883_149417518_149417624_149422576_149422707_149424910_149424974_149426164_149426230_149426558
tx.24049	chrX	-	1012	5	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081194.2	novel	988	2	NA	NA	-31779	5789	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.08972473588517	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACTTCAAAAAAATCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149740934	149701826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_149701994_149708729_149709193_149716317_149716396_149740295_149740429_149740763
tx.2405	chr11	+	299	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000058809.9	novel	1722	1	NA	NA	1682	97966	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAACTTGGCATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41391245	41489251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_+_41391514_41489220
tx.24050	chrX	-	803	6	NNC	ENSMUSG00000084771.9	novel	641	5	NA	NA	-13676	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.2	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTGTCCTCCTAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150108078	150076209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_150076491_150076760_150076884_150078466_150078569_150094333_150094403_150098027_150098138_150107960
tx.24051	chrX	-	893	3	NNC	ENSMUSG00000084771.9	novel	676	4	NA	NA	-13675	10	intron_retention	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTTGTCCTCCTAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150108077	150076209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_150076884_150078466_150078569_150107960
tx.24052	chrX	+	546	4	ISM	ENSMUSG00000025261.19	ENSMUST00000153687.8	4473	25	39	36764	21	993	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_3	49.815214097257	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAATGTAAAATACCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150586277	150619265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_150586566_150589715_150589857_150618219_150618289_150619217
tx.24053	chrX	-	766	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041115.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCAGTTCTAATCTCAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150992466	150990237	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_150990586_150991749_150991850_150992148
tx.24054	chrX	+	987	5	ISM	ENSMUSG00000025332.15	ENSMUST00000154938.2	1872	7	-23	4580	2	-4580	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	508	junction_2	14.4308696896618	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGAGTTCTTTTCTTCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151016226	151025167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_151016707_151020628_151020707_151022625_151022749_151023021_151023193_151025032
tx.24055	chrX	+	1125	6	NNC	ENSMUSG00000084885.8	novel	858	5	NA	NA	9	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.16619037896906	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCTTGGTACTATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151152032	151199703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_151152113_151152837_151153019_151186308_151186474_151191569_151191789_151193075_151193139_151199286
tx.24056	chrX	+	3287	5	NNC	ENSMUSG00000071665.11	novel	3210	4	NA	NA	-278	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.82915619758885	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGAGTTGATGTTTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151901503	151915860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_151901580_151901783_151901847_151902010_151902087_151909895_151909940_151912832
tx.24057	chrX	+	2507	22	NNC	ENSMUSG00000031309.16	novel	755	2	NA	NA	-120	40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_1	12.7339779727836	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCATTATTTTTATAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158038657	158146776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_158038716_158068261_158068319_158094459_158094577_158100916_158100999_158109836_158109918_158110767_158110848_158111366_158111474_158113553_158113592_158113782_158113926_158115146_158115218_158119690_158119780_158119958_158120024_158120181_158120285_158120913_158121039_158125580_158125707_158128335_158128426_158130011_158130171_158132247_158132410_158134359_158134437_158135311_158135430_158145637_158145779_158146358
tx.24058	chrX	-	716	2	Intergenic	novelGene_1413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGATGAAGTCTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158291843	158290349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_158290939_158291716
tx.24059	chrX	-	1153	4	Intergenic	novelGene_1414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1.4142135623731	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTCTGATGAAGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158305342	158290352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_158290939_158291716_158291858_158299394_158299576_158305097
tx.2406	chr11	-	684	5	FSM	ENSMUSG00000020415.17	ENSMUST00000121638.8	948	5	277	-13	277	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	8449	junction_1	727.283129186976	17914	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAATACTTAACCAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43316513	43311087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_43311236_43311933_43312093_43313719_43313814_43315545_43315725_43316409
tx.24060	chrX	+	4550	26	NNC	ENSMUSG00000000037.18	novel	517	3	NA	NA	14610	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	8	junction_16	103.266459220794	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTAAGCCTTGGATGTTA	4641	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	159921873	160041207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_159922056_159927758_159927837_159936828_159936907_159954485_159954532_159960242_159960314_159961032_159961268_159970259_159970349_159975199_159975444_159985009_159985094_159992190_159992266_159992604_159992680_159996236_159996321_159998175_159998260_160007456_160007541_160008872_160008957_160010368_160010453_160011672_160011757_160013086_160013171_160014395_160014480_160017608_160017693_160020475_160020754_160022745_160022861_160024983_160025188_160026361_160026545_160029252_160029364_160039561
tx.24061	chrX	+	575	2	Intergenic	novelGene_1415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGCAGATATGGAAATCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162024679	162025508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_162024768_162025021
tx.24062	chrX	+	451	1	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000082970.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTTGCCCTCAATGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162109854	162110305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_162109900_162110300
tx.24063	chrX	-	368	2	Intergenic	novelGene_1416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTCAAATGTTAGAGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162659821	162659341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_162659565_162659676
tx.24064	chrX	+	2898	6	FSM	ENSMUSG00000031381.17	ENSMUST00000208261.2	831	6	-25	-2042	-5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	93.3967879533338	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTTGTCTCAGTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163202777	163216910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_163202837_163205579_163205661_163210927_163211061_163211535_163211669_163211806_163212014_163214625
tx.24065	chrX	-	1080	10	ISM	ENSMUSG00000061778.11	ENSMUST00000004715.2	2015	15	18	9039	5	8586	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_7	8.49836585598797	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCAGGTAACAAAGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163763313	163730243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_163730351_163731062_163731240_163734846_163734972_163739474_163739514_163741751_163741813_163745047_163745203_163746922_163747010_163747977_163748134_163762989_163763060_163763210
tx.24066	chrX	-	908	4	NNC	ENSMUSG00000000402.3	novel	2704	12	NA	NA	46878	-8165	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	6.94422221866655	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTTCCCAAGTTATTTCC	5605	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165321838	165314167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_165314464_165314967_165315070_165319195_165319277_165321409
tx.24067	chrX_GL456233v2_random	+	644	2	Intergenic	novelGene_1422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTCAATAATCCACAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	251299	355096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_GL456233v2_random_+_251453_354605
tx.24068	SIRV5	-	531	2	Genic_Genomic	SIRV5B	novel	229	1	NA	NA	8	1169	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGGTCCTGGACTGCGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	2398	1008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_SIRV5_-_1158_2016
tx.24069	SIRV5	-	205	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTATGCTTCGGTCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	2150	1017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_SIRV5_-_1158_2085
tx.2407	chr11	+	2694	16	FSM	ENSMUSG00000020409.11	ENSMUST00000020681.10	3625	16	-24	955	-9	-955	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_1	28.1705914425349	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTTAAACGTTGGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43324561	43337853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_43324647_43328171_43328358_43328949_43329104_43329630_43329712_43329979_43330145_43331437_43331507_43332047_43332096_43332272_43332405_43332649_43332748_43332857_43332926_43333366_43333507_43334100_43334263_43335552_43335658_43336010_43336083_43336185_43336300_43336838
tx.24070	SIRV6	+	571	8	NIC	SIRV6A	novel	574	8	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	1095	junction_6	8705.74196160447	380	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	1124	11279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_SIRV6_+_1187_1468_1535_1640_1736_2780_2829_3106_3165_10724_10819_11034_11109_11205
tx.24071	chr1	+	3116	2	ISM	ENSMUSG00000051285.18	ENSMUST00000182306.2	419	4	52	10211	-10	-10211	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACGGGTGGTTGTGAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159379	7220915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_7159441_7217860
tx.24072	chr1	+	1802	12	NIC	ENSMUSG00000025911.15	novel	2022	13	NA	NA	3	-163	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_2	16.0808905637192	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTCTGTTTCATAAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9618282	9646963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_9618377_9620131_9620170_9623542_9623698_9623847_9624045_9625762_9625841_9627224_9627331_9628357_9628511_9630333_9630433_9633733_9633813_9634021_9634119_9637005_9637164_9646415
tx.24073	chr1	+	358	2	Intergenic	novelGene_4	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11399703	11413893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_11399870_11413701
tx.24074	chr1	+	2077	7	FSM	ENSMUSG00000057715.14	ENSMUST00000135014.8	6451	7	39	4335	39	655	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	4.57043640026736	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATCAATGCATTGCAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11484531	11667510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_11484862_11582141_11582290_11588801_11588934_11615377_11615507_11633186_11633216_11658597_11658771_11666374
tx.24075	chr1	-	1889	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000016918.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTCTCCTCTTTAACCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12884639	12866786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_12868340_12876134_12876266_12884434
tx.24076	chr1	+	628	4	NNC	ENSMUSG00000054493.3	novel	687	5	NA	NA	702	9525	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGGAGCTATTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14826379	14856680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_14826462_14844040_14844162_14845749_14845833_14856338
tx.24077	chr1	-	3120	12	FSM	ENSMUSG00000025920.20	ENSMUST00000128957.9	3907	12	-18	805	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_10	22.8368268627019	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTTGATTCATATAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16589489	16414514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_16416236_16436302_16436364_16439978_16440111_16444897_16445036_16460044_16460258_16462740_16462849_16464274_16464435_16510546_16510683_16533258_16533419_16556243_16556375_16579565_16579633_16589396
tx.24078	chr1	-	1331	4	ISM	ENSMUSG00000025920.20	ENSMUST00000127420.8	3081	12	-12	95149	-5	994	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_2	13.2245562832516	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTTGATGACCTCATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16589489	16509671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_16510683_16533258_16533419_16579565_16579633_16589396
tx.24079	chr1	-	791	8	ISM	ENSMUSG00000041670.20	ENSMUST00000097808.9	4926	33	272252	148600	-20943	26	internal_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_4	1.35526185435788	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGCTTCTGTATTAATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22572553	22507245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_22507403_22511805_22511919_22514768_22514816_22518515_22518640_22522234_22522335_22523722_22523834_22525668_22525734_22572479
tx.2408	chr11	+	2781	17	NIC	ENSMUSG00000020409.11	novel	3625	16	NA	NA	-8	-946	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	72	junction_1	62.6749738232893	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTGGATTTTCGTACACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43324562	43337862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_43324647_43327180_43327260_43328171_43328358_43328949_43329104_43329630_43329712_43329979_43330145_43331437_43331507_43332047_43332096_43332272_43332405_43332649_43332748_43332857_43332926_43333366_43333507_43334100_43334263_43335552_43335658_43336010_43336083_43336185_43336300_43336838
tx.24080	chr1	-	214	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000103364.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTACTCCCTGTCTGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34129731	34068803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_34068935_34129648
tx.24081	chr1	-	557	2	NNC	ENSMUSG00000096992.4	novel	1750	3	NA	NA	139	562	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTTTTTAAAGAGCCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34217213	34213549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_34213862_34216968
tx.24082	chr1	+	806	2	Intergenic	novelGene_17	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTCCTCCCTTGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36026664	36031884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_36026768_36031181
tx.24083	chr1	+	1998	2	FSM	ENSMUSG00000045216.8	ENSMUST00000088174.4	3719	2	326	1395	326	71	multi-exon	FALSE	canonical	3	381	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGGGTGTCCTTTCTGGG	2089	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36107806	36144132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_36108266_36142593
tx.24084	chr1	-	1357	4	NNC	ENSMUSG00000026116.12	novel	6546	41	NA	NA	15338	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	89	junction_2	135.521216051215	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGAATTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36834279	36831277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_36832287_36833124_36833277_36833884_36833983_36834181
tx.24085	chr1	+	1471	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037138.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.69967317119759	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCATCTCACTTGTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38548595	38558037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_38548687_38555226_38555342_38556233_38556309_38556847
tx.24086	chr1	-	481	3	FSM	ENSMUSG00000085894.2	ENSMUST00000146314.2	1832	3	1338	13	1338	-13	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTGTGGTTATTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39589745	39586663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_39586743_39588006_39588198_39589534
tx.24087	chr1	-	1990	7	NIC	ENSMUSG00000048234.14	novel	2492	7	NA	NA	-3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	12	junction_6	63.3157870431134	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTCTATGTAACAAATTT	4714	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39616489	39590376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_39591597_39594558_39594752_39597395_39597493_39599773_39599857_39603128_39603198_39604162_39604414_39616412
tx.24088	chr1	-	832	5	ISM	ENSMUSG00000041945.13	ENSMUST00000039672.6	3160	6	-14	9176	10	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	1.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCAGTATGGAAGCTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40829837	40820373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_40820751_40823536_40823667_40825326_40825371_40826689_40826778_40829644
tx.24089	chr1	-	1656	16	Fusion	ENSMUSG00000100764.2_ENSMUSG00000057363.13	novel	4620	15	NA	NA	-4	10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	52.7515771222898	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTAAAGACTTATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43866938	43782733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr1_-_43783057_43789390_43789523_43792876_43792981_43794858_43794917_43796131_43796193_43799680_43799725_43804049_43804170_43810840_43810963_43813976_43814037_43819224_43819330_43829623_43829805_43836404_43836466_43844512_43844557_43844785_43844835_43846509_43846538_43866774
tx.2409	chr11	+	1557	12	ISM	ENSMUSG00000020409.11	ENSMUST00000178622.3	3566	15	1808	1588	1776	1008	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	210	junction_10	23.3659355076736	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTGGAAAGTTTGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43329977	43337220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_43330145_43331437_43331507_43332047_43332096_43332272_43332405_43332649_43332748_43332857_43332926_43333366_43333507_43334100_43334263_43335552_43335658_43336010_43336083_43336185_43336300_43336838
tx.24090	chr1	-	3749	31	FSM	ENSMUSG00000018417.15	ENSMUST00000018561.14	4767	31	-7	1025	6	-1025	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_21	30.4396671028665	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATTATCAGAATAGTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51955094	51790177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_51790456_51794801_51794930_51796263_51796417_51797034_51797168_51799453_51799561_51801650_51801786_51803048_51803124_51805980_51806068_51807808_51807896_51808162_51808250_51809944_51810014_51812391_51812542_51813470_51813565_51815362_51815564_51817479_51817707_51818719_51818921_51821128_51821192_51823595_51823701_51832798_51832865_51833470_51833558_51836157_51836277_51836546_51836695_51838690_51838795_51840342_51840442_51852161_51852226_51859299_51859347_51863255_51863361_51873607_51873703_51902477_51902594_51922241_51922386_51954919
tx.24091	chr1	-	3247	12	ISM	ENSMUSG00000026103.15	ENSMUST00000114510.8	5596	15	17538	1489	-100	-313	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_8	51.1521793723929	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGTATTGTTGGGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52254853	52224751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_52226954_52227837_52227931_52228581_52228714_52230269_52230447_52235323_52235375_52235901_52235969_52238869_52238929_52239013_52239047_52246459_52246519_52251361_52251526_52253636_52253717_52254723
tx.24092	chr1	-	1376	3	NNC	ENSMUSG00000096141.3	novel	732	4	NA	NA	-44576	483	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTTATTAGATATTTTCT	929	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53790519	53736705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_53737854_53741176_53741240_53790354
tx.24093	chr1	-	468	4	NIC	ENSMUSG00000025977.16	novel	658	5	NA	NA	49	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	3	junction_3	13.2748718344933	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGGTGCTTATATAAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55402579	55385412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_55385612_55388039_55388095_55394806_55394899_55402457
tx.24094	chr1	+	1702	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000059647.6	novel	552	1	NA	NA	-94	1090	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGTAGGAGACGCAGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58685752	58687488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_58685979_58686012
tx.24095	chr1	+	1580	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000059647.6	novel	552	1	NA	NA	-92	1094	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGGAGACGCAGTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58685754	58687492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_58685979_58686136
tx.24096	chr1	+	1860	6	ISM	ENSMUSG00000026031.16	ENSMUST00000097722.9	1771	11	-83	20747	-40	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.54919333848297	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTGTGCATTTGCTTTTA	1220	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58750626	58772388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_58750752_58752729_58752819_58765464_58765892_58768214_58768321_58770310_58770447_58771411
tx.24097	chr1	-	790	2	Intergenic	novelGene_28	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTATCCATAAGTTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58808343	58806365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_58806855_58808042
tx.24098	chr1	-	980	4	NIC	ENSMUSG00000026018.13	novel	951	4	NA	NA	140	-7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.44948974278318	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATACGCAAAGCATGCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60082106	60059956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_60060544_60061736_60061810_60067226_60067396_60081955
tx.24099	chr1	+	506	3	Intergenic	novelGene_30	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAAGAATGTTTGTTTCAT	5236	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60898779	60901052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_60898879_60900124_60900175_60900695
tx.241	chr1	-	3020	18	FSM	ENSMUSG00000041303.8	ENSMUST00000041638.8	4582	18	-11	1573	-11	-1573	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_11	22.8358062796764	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGACAATATTGCCTTCTGA	6689	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54478141	54436735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_54437162_54438287_54438441_54442669_54442795_54444138_54444330_54444995_54445234_54455042_54455179_54455880_54455983_54456817_54457021_54458541_54458714_54459554_54459659_54462659_54462733_54463167_54463316_54466558_54466725_54467920_54468113_54469657_54469782_54473212_54473398_54476990_54477103_54477971
tx.2410	chr11	+	660	2	Intergenic	novelGene_160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATTCATGATTTAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43387452	43396764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_43387571_43396222
tx.24100	chr1	+	463	2	Intergenic	novelGene_31	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGGGTATCTTTAACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61209332	61211755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_61209575_61211534
tx.24101	chr1	+	1989	6	ISM	ENSMUSG00000025969.16	ENSMUST00000114155.8	6534	16	65278	2276	65278	57	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_5	6.67532770731145	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGACGGTCCAGTTGTGG	9733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62808138	62836197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_62808276_62810863_62811005_62822452_62822716_62824203_62824301_62825439_62825461_62834867
tx.24102	chr1	-	2040	10	NIC	ENSMUSG00000040865.16	novel	1979	10	NA	NA	114	6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_9	2.53859103528797	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACAAGAAGAAGAGACGGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63153712	63101316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_63101413_63104862_63104997_63107342_63107453_63113480_63113706_63118111_63118221_63124826_63125558_63132443_63132691_63132798_63132890_63144814_63144919_63153519
tx.24103	chr1	+	1302	2	NNC	ENSMUSG00000084799.8	novel	652	2	NA	NA	-99	178	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTAGAATTCCATTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63152137	63154668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_63152373_63153601
tx.24104	chr1	-	662	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084416.4	novel	654	1	NA	NA	-31	46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65033794	65033063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_65033683_65033751
tx.24105	chr1	-	1047	2	ISM	ENSMUSG00000026193.16	ENSMUST00000189160.2	2778	12	18400	0	-3100	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2093	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTTTTAAGCAGATGTCAA	8116	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71645103	71643255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_71644243_71645043
tx.24106	chr1	-	2469	5	FSM	ENSMUSG00000039395.9	ENSMUST00000048860.9	2284	5	24	-209	24	209	multi-exon	FALSE	canonical	3	578	junction_1	58.0215477215146	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGAGTGTGTGTTATATTT	4246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72251442	72198391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_72200179_72201480_72201645_72203230_72203322_72231201_72231362_72251175
tx.2411	chr11	-	508	4	NNC	ENSMUSG00000020405.5	novel	479	4	NA	NA	-9311	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.471404520791032	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTAGCCCCAGAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43501678	43486877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_43486993_43488291_43488382_43489396_43489573_43501551
tx.24114	chr1	-	797	2	Intergenic	novelGene_36	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTTGTTTTTTATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87141582	87140445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_87140952_87141291
tx.24115	chr1	-	3674	4	NNC	ENSMUSG00000044783.17	novel	4878	8	NA	NA	-25	-638	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	176.844564519241	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCGGTCTGCCCTGCGGAC	8621	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88197139	88190830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_88194001_88194052_88194381_88195669_88195749_88197042
tx.24116	chr1	+	1236	3	ISM	ENSMUSG00000036206.13	ENSMUST00000066279.11	4995	6	75112	1275	75074	-1275	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	112	junction_2	11.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTTTATGTTCTTTAAAG	2766	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89073248	89081515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_89073629_89079921_89080111_89080848
tx.24117	chr1	+	583	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000026301.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCCTCTGTTGTTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89974259	89975095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_89974555_89974807
tx.24118	chr1	+	1473	11	NIC	ENSMUSG00000026305.16	novel	2760	23	NA	NA	-35	801	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	26	junction_10	23.6366241244388	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGTAATTTTGTTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90981130	91051062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_90981446_90996284_90996372_91028298_91028335_91028906_91029033_91030968_91031041_91032848_91033020_91035019_91035113_91039877_91040020_91047862_91047913_91050143_91050262_91050799
tx.24119	chr1	-	1091	2	FSM	ENSMUSG00000097251.3	ENSMUST00000181575.3	1787	2	-3	699	-3	-699	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGATAACTTTCAACCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92838489	92836798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_92837701_92838300
tx.2412	chr11	-	1463	8	FSM	ENSMUSG00000041278.11	ENSMUST00000048578.3	1438	8	-20	-5	6	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	649	junction_5	59.12318513416	2894	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGACTATGTTGTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43638829	43620830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_43621435_43627245_43627301_43628693_43628843_43629623_43629661_43630543_43630657_43632587_43632649_43635911_43636275_43638748
tx.24120	chr1	+	801	6	ISM	ENSMUSG00000034066.14	ENSMUST00000122402.3	2816	13	0	13590	0	-13590	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2.03960780543711	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACATTCATTCTTTAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93439833	93495428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93439907_93456290_93456502_93487957_93488063_93488865_93488909_93491030_93491110_93495138
tx.24121	chr1	+	1493	8	ISM	ENSMUSG00000073609.10	ENSMUST00000112881.8	3459	10	1009	3959	0	-3959	internal_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	9.9693407556388	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAAAGCTTAACTTGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93754004	93776111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93754363_93756927_93756986_93757478_93757619_93760317_93760512_93763008_93763178_93765661_93765806_93766542_93766686_93775824
tx.24122	chr1	+	498	2	Intergenic	novelGene_48	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGAGTGTCCTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93893720	93896043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_93893836_93895660
tx.24123	chr1	-	792	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000089782.2	novel	489	1	NA	NA	-111	253	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAATGTAAATTCATGA	8432	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97877225	97876372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_97876961_97877021
tx.24124	chr1	-	607	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000089782.2	novel	489	1	NA	NA	-111	244	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAATGTA	8432	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97877225	97876381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_97876695_97876931
tx.24125	chr1	+	1086	8	ISM	ENSMUSG00000064302.14	ENSMUST00000189676.7	1855	12	86	31376	-16	-25926	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	231	junction_7	10.8946719799644	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTGAGTGGGAAAACCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118317159	118399567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_118317252_118347169_118347649_118387530_118387610_118388916_118389021_118390195_118390288_118392257_118392334_118395609_118395708_118399501
tx.24126	chr1	-	2392	17	ISM	ENSMUSG00000026383.15	ENSMUST00000052404.13	6442	25	-15	33152	-15	-52	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_15	8.83087623059003	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACTTGTATATTTGCAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119576681	119505918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_119506808_119526734_119526851_119527927_119527968_119532957_119532986_119535716_119535824_119536846_119537017_119543075_119543146_119544130_119544220_119545093_119545182_119545283_119545405_119547896_119547950_119548404_119548450_119549615_119549695_119551655_119551699_119561274_119561380_119570206_119570389_119576514
tx.24127	chr1	-	1570	7	Intergenic	novelGene_54	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.76017139089283	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCATTTCAGGGTCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120228558	120220217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_120221086_120221255_120221360_120223050_120223201_120223780_120223908_120224004_120224116_120228248_120228305_120228404
tx.24128	chr1	-	1418	7	Intergenic	novelGene_55	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.14996653266291	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGATCTGCATTTCAGGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120228558	120220221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_120220938_120221255_120221360_120223050_120223201_120223780_120223908_120224004_120224116_120228248_120228305_120228404
tx.24129	chr1	+	4505	11	FSM	ENSMUSG00000013275.10	ENSMUST00000086559.7	4697	11	190	2	190	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_4	13.4402380931292	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTTGTATCCCTGTGTGT	5392	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131755904	131776601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_131756132_131757748_131758729_131766852_131766961_131767914_131767987_131768592_131768738_131768865_131769013_131769722_131769871_131770686_131770767_131771656_131771792_131772075_131772225_131774287
tx.2413	chr11	-	1615	7	ISM	ENSMUSG00000041231.16	ENSMUST00000102795.4	2088	11	5043	2	-1430	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_5	17.6202219685855	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGGTTATCTGTTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44356282	44345399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_44346443_44347190_44347319_44349031_44349149_44351547_44351647_44352145_44352184_44354484_44354584_44356191
tx.24130	chr1	-	2779	6	ISM	ENSMUSG00000059149.18	ENSMUST00000159038.8	1957	10	14289	-1730	555	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_3	1.95959179422654	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTGTGTTATCCATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131981360	131964520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_131966712_131968277_131968399_131969595_131969667_131974043_131974192_131980117_131980292_131981286
tx.24131	chr1	-	803	4	ISM	ENSMUSG00000026442.15	ENSMUST00000186389.7	3476	26	31921	29413	-11	-1	internal_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	6.16441400296898	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTAGCCAATTTTGTCAT	9986	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132532908	132527573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_132527953_132529708_132529932_132531535_132531607_132532778
tx.24132	chr1	-	404	3	ISM	ENSMUSG00000026442.15	ENSMUST00000163770.8	3903	28	-20	72343	-5	22179	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGTTCTGTGCCCTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132669521	132570414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_132570597_132593216_132593326_132669408
tx.24133	chr1	-	604	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000026443.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTTCTGTCGGGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132845792	132842690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_132842981_132843305_132843376_132843553_132843675_132845669
tx.24134	chr1	-	642	2	ISM	ENSMUSG00000086264.10	ENSMUST00000165464.2	493	4	-62	2242	-50	-2242	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGTGAATCAAATTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136058971	136057698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_136058128_136058758
tx.24135	chr1	-	822	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041642.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCTGTCTATCTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136087725	136086811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_136087443_136087534
tx.24136	chr1	+	521	5	NNC	ENSMUSG00000097113.8	novel	413	3	NA	NA	-27	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTAACAGTTCCTTTCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136611106	136618533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_136611212_136614669_136614710_136616481_136616549_136617884_136617935_136618274
tx.24137	chr1	-	3545	9	NNC	ENSMUSG00000026398.15	novel	4733	9	NA	NA	497	187	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_8	15.8646619882051	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGTGTTTACATTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136880871	136771826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_136773449_136810001_136810150_136818420_136818541_136868146_136868788_136871024_136871167_136872696_136872816_136876459_136876598_136879839_136879903_136880319
tx.24138	chr1	-	3917	9	FSM	ENSMUSG00000018199.10	ENSMUST00000159879.2	8738	9	36	4785	36	273	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	6.34428877022476	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGTCCCAACAGATAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143652770	143631312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_143633633_143635680_143635828_143636090_143636205_143637007_143637125_143641170_143641309_143641511_143641659_143642327_143642549_143646163_143646765_143652658
tx.24139	chr1	+	3858	14	FSM	ENSMUSG00000026483.14	ENSMUST00000148810.8	6531	14	74	2599	-5	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_12	16.2156327524439	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAGACTTTACCAATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151447197	151595091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_151447336_151512154_151512286_151517178_151517311_151520625_151520741_151525029_151525195_151565269_151565386_151571440_151571546_151571875_151572039_151575859_151576048_151579452_151579615_151581737_151581849_151584847_151584956_151591410_151591523_151592979
tx.2414	chr11	-	2084	11	FSM	ENSMUSG00000041231.16	ENSMUST00000102795.4	2088	11	2	2	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	61	junction_9	50.7897627480184	330	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGGTTATCTGTTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44361323	44345399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_44346443_44347190_44347319_44349031_44349149_44351547_44351647_44352145_44352184_44354484_44354584_44356191_44356308_44356384_44356471_44356822_44356915_44357641_44357839_44361254
tx.24140	chr1	-	786	2	ISM	ENSMUSG00000026478.15	ENSMUST00000027752.15	7622	28	293	43353	293	-13658	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	756	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCATTTTCTTCCCTCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153208239	153138020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_153138441_153207873
tx.24141	chr1	+	1921	9	NIC	ENSMUSG00000042708.13	novel	2092	10	NA	NA	-80	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	0	0	junction_5	1.58113883008419	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGTCTTTCAATTAGTGG	62	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153300827	153328320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_153301333_153304305_153304456_153308920_153309136_153311508_153311596_153311663_153311883_153313270_153313377_153321543_153321698_153324646_153324770_153327958
tx.24142	chr1	-	226	1	Intergenic	novelGene_71	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTCAGGGCTCATGGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153376813	153376587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_153376600_153376800
tx.24143	chr1	+	2335	5	FSM	ENSMUSG00000026475.8	ENSMUST00000027748.8	2339	5	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCCAGGACAGTATGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153616098	153621214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_153616259_153616608_153616720_153617365_153617428_153617708_153617876_153619379
tx.24144	chr1	-	517	2	ISM	ENSMUSG00000060985.16	ENSMUST00000167528.9	3210	18	43550	99	3730	-99	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGTGTATATGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156087368	156082966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_156083416_156087300
tx.24145	chr1	-	2012	12	NIC	ENSMUSG00000026721.17	novel	2748	21	NA	NA	101	45488	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.7295172251486	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGCTAATAAACTTGCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160620407	160454532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_160454936_160509610_160509753_160528281_160528449_160529927_160530031_160537716_160537784_160549702_160549814_160551601_160551760_160561098_160561274_160563117_160563329_160566465_160566659_160568321_160568502_160620305
tx.24146	chr1	-	487	2	ISM	ENSMUSG00000040297.13	ENSMUST00000048377.11	6327	24	-4	47801	-4	-11086	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	137	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTACCTTAAATGGAATTGA	414	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161704255	161691483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_161691595_161703879
tx.24147	chr1	+	1483	2	FSM	ENSMUSG00000026698.9	ENSMUST00000028021.7	2196	2	7	706	7	-706	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCATTGTCTAGTATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161796763	161799193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_161796849_161797795
tx.24148	chr1	+	1469	2	NIC	ENSMUSG00000026698.9	novel	704	2	NA	NA	0	-706	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCATTGTCTAGTATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161796867	161799193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_161796939_161797795
tx.24149	chr1	-	2514	8	NIC	ENSMUSG00000026694.20	novel	4541	8	NA	NA	0	8	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	8	junction_6	30.8399422959306	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTTTATCTCAAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162376097	162361239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_162362120_162363410_162363543_162364687_162364901_162366400_162366569_162369826_162370023_162371754_162371955_162373796_162374097_162375672
tx.2415	chr11	-	1221	6	FSM	ENSMUSG00000011254.17	ENSMUST00000011398.13	2250	6	9	1020	-2	-1020	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_3	12.8	814	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGAGGAGTCATTTTTAG	6310	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45846312	45838689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_45839156_45841022_45841131_45842369_45842459_45843561_45843732_45844882_45845060_45846101
tx.24150	chr1	+	532	3	ISM	ENSMUSG00000040918.13	ENSMUST00000044021.12	3571	6	8034	3303	-5273	-1369	internal_fragment	FALSE	canonical	3	256	junction_2	5.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTTGGTCAACTTGGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164084648	164089651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_164084919_164088360_164088587_164089615
tx.2416	chr11	+	1346	2	ISM	ENSMUSG00000040489.6	ENSMUST00000049038.4	2997	5	11479	-3	11479	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGTTAAATGTTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45882615	45908824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_45882939_45907801
tx.24165	chr1	+	1234	2	ISM	ENSMUSG00000026634.17	ENSMUST00000123384.8	3261	7	38	8514	38	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGAAGAAAAGAATCTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	190660726	190670645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_190660956_190669640
tx.24167	chr1	-	1200	2	ISM	ENSMUSG00000026626.12	ENSMUST00000067976.9	3088	13	43108	-5	2532	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	447	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCTCTTTTGTCTCTGGA	9965	False	NA	-60	True	NA	NA	NA	191086130	191084166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_191085307_191086070
tx.2417	chr11	-	826	2	FSM	ENSMUSG00000069899.4	ENSMUST00000154156.2	784	2	-27	-15	-27	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_1	0	246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGACAGAGAGAGAGAGAAA	1760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45943175	45942179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_45942889_45943058
tx.24173	chr10	+	2232	2	ISM	ENSMUSG00000040021.14	ENSMUST00000217931.2	4186	7	10862	6907	10862	-6907	internal_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTACTTCATTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7577872	7582443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_7578885_7581223
tx.24174	chr10	-	830	2	NNC	ENSMUSG00000040006.14	novel	353	2	NA	NA	4	1482	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTGTTATGCAGTGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7668582	7665701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_7666221_7668271
tx.24175	chr10	-	2186	5	ISM	ENSMUSG00000019820.12	ENSMUST00000219003.2	5751	25	-20	103692	-20	-84816	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_4	27.0231382337433	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCTTAGTGGGAATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12424643	12361625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_12362399_12377121_12377252_12401081_12401239_12413784_12413958_12423690
tx.24176	chr10	-	622	3	NNC	ENSMUSG00000019820.12	novel	430	2	NA	NA	34	15465	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATGTGTATTTATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12743991	12721641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_12721941_12737311_12737480_12743836
tx.24177	chr10	+	315	3	NIC	ENSMUSG00000097352.8	novel	4535	3	NA	NA	10	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTTTCATTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22182612	22190095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_22182764_22183065_22183198_22190063
tx.24178	chr10	+	2674	13	NIC	ENSMUSG00000037455.17	novel	2837	14	NA	NA	3	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	35	junction_5	23.1336695460678	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATTCATTGTATTCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23672886	23703863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_23673082_23674643_23674784_23679655_23679752_23680085_23680160_23681790_23681939_23692190_23692328_23694957_23695060_23696711_23696804_23698820_23698917_23700583_23700659_23701844_23701939_23702040_23702094_23702491
tx.24179	chr10	+	3553	15	FSM	ENSMUSG00000039031.17	ENSMUST00000039557.9	3651	15	4	94	4	-94	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_6	3.14934395500694	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCTCTTGGAATTATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26648476	26794550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_26648693_26721927_26722125_26725870_26726107_26730869_26730934_26736552_26736729_26745916_26746083_26748668_26748761_26753152_26753231_26754886_26755047_26756683_26756767_26763776_26763984_26765727_26765869_26788602_26788728_26792388_26792451_26793000
tx.2418	chr11	-	620	2	NNC	ENSMUSG00000069899.4	novel	784	2	NA	NA	-28	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	42	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGACAGAGAGAGAGAGAAA	1759	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45943176	45942179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_45942682_45943058
tx.24188	chr10	-	1527	2	ISM	ENSMUSG00000020091.16	ENSMUST00000167087.2	1422	4	17553	-330	17553	330	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	205	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAACAATGTTTGT	2547	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61270884	61268268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_61269608_61270696
tx.2419	chr11	+	702	6	ISM	ENSMUSG00000011256.17	ENSMUST00000011400.8	6383	23	13	34404	13	-24709	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	440	junction_1	20.0059991002699	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTCGCAGAGTGAGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45946831	46003766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_45947038_45951749_45951836_45955838_45955910_45984689_45984769_45990679_45990757_46003583
tx.24197	chr10	-	2931	6	FSM	ENSMUSG00000033416.16	ENSMUST00000039796.14	3500	6	30	539	30	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_3	9.3893556754444	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTAGCACCCTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75353185	75342655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_75344804_75345425_75345668_75345865_75345958_75346954_75347121_75347905_75347991_75352987
tx.24198	chr10	-	1681	9	ISM	ENSMUSG00000001151.11	ENSMUST00000220395.2	6762	30	46886	2	-1193	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	168	junction_5	27.5632794674364	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTCCTGGCTACAGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76205860	76187098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_76187614_76188742_76188871_76190006_76190146_76190892_76190970_76191997_76192231_76192868_76192989_76203141_76203316_76204564_76204668_76205668
tx.24199	chr10	+	555	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033126.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATCTGGTGGCAATGCTA	5689	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76298844	76304350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_76298989_76302020_76302163_76304081
tx.242	chr1	-	667	3	ISM	ENSMUSG00000073678.5	ENSMUST00000185817.2	1408	12	-12	23581	-12	6738	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	3	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAAAACCCTCAAATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54596855	54587023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_54587274_54590135_54590290_54596592
tx.2420	chr11	+	1034	2	FSM	ENSMUSG00000020397.16	ENSMUST00000152119.2	381	2	22	-675	-2	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTCATTCTTGGAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46327773	46332360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_46327837_46331389
tx.24200	chr10	-	3946	32	NNC	ENSMUSG00000001119.8	novel	4100	35	NA	NA	144	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	14.0574116415631	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGTGCCTCTTTATCTACA	8586	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76561858	76544625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_76546016_76546179_76546210_76546795_76546974_76547116_76547301_76547408_76547519_76548101_76548236_76549014_76549056_76549459_76549496_76549706_76549773_76549947_76550011_76550247_76550284_76550491_76550543_76550828_76550892_76551104_76551168_76552094_76552158_76552552_76552616_76552962_76552999_76553095_76553150_76553233_76553297_76553628_76553692_76553892_76553947_76554206_76554252_76554350_76554378_76554812_76554840_76554958_76555004_76555456_76555511_76556794_76556877_76557236_76557366_76557649_76557810_76559209_76559411_76560772_76560903_76561653
tx.24201	chr10	+	2228	6	NIC	ENSMUSG00000001436.16	novel	2347	6	NA	NA	-2	-5	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	49.2178829288705	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGGCTTTTCTGTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76869043	76886260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_76869182_76874183_76874414_76877649_76878404_76878731_76878809_76880594_76880737_76885373
tx.24202	chr10	-	853	6	ISM	ENSMUSG00000001435.16	ENSMUST00000081654.13	5063	42	31	33202	31	-4655	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	324	junction_2	24.1445646057244	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGCTCCCTCAGCCACCTC	5966	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77002351	76921213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_76921231_76923209_76923264_76924703_76924791_76931824_76932370_77002123_77002195_77002272
tx.24203	chr10	+	1393	7	ISM	ENSMUSG00000069581.13	ENSMUST00000092368.10	2169	10	-7	11805	-7	7215	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.60874597374975	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTGGTGAGATCTATACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77700449	77711050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_77700717_77702113_77702205_77703505_77703663_77705396_77705529_77706156_77706384_77708927_77709115_77710718
tx.24205	chr10	+	1349	3	ISM	ENSMUSG00000020310.10	ENSMUST00000217748.2	944	4	-271	2345	-243	-2345	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGAGCTAGTACCTACTTC	2912	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79500149	79501994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_79500502_79500745_79501013_79501264
tx.24208	chr10	-	1628	5	ISM	ENSMUSG00000003344.15	ENSMUST00000126980.8	2449	9	11020	10	-842	-4	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	325	junction_4	62.461988440971	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAATCATCGAGTGCTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80481308	80478460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80479526_80479659_80479807_80480095_80480184_80480436_80480630_80481173
tx.24209	chr10	-	2386	3	NIC	ENSMUSG00000020190.14	novel	3065	12	NA	NA	3242	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	25	junction_1	247	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGCAGTGACAGCAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80504568	80501158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_-_80503167_80503799_80503965_80504355
tx.2421	chr11	+	1226	3	FSM	ENSMUSG00000020397.16	ENSMUST00000020665.13	1193	3	-21	-12	6	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_1	179.5	866	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTTGGAAAAAAAGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46327757	46332366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_46327837_46330632_46330803_46331389
tx.24210	chr10	-	1996	10	ISM	ENSMUSG00000035041.9	ENSMUST00000117422.2	2294	12	6215	5	-84	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.16595429884644	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGGGCTGCGGCTCAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80928493	80920162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_80920969_80921483_80921581_80921863_80921949_80922350_80922420_80924343_80924451_80925140_80925279_80925910_80926018_80926971_80927270_80927631_80927764_80928336
tx.24211	chr10	-	3361	10	FSM	ENSMUSG00000055053.19	ENSMUST00000020461.15	3348	10	-1	-12	-1	12	multi-exon	TRUE	canonical	3	18	junction_9	5.66557723732532	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCCATTATTTCCAAATTTG	3911	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81263008	81234959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_-_81236906_81239185_81239263_81240657_81240843_81241922_81242049_81243388_81243514_81243939_81244064_81244168_81244244_81245444_81245517_81256100_81256633_81262909
tx.24212	chr10	-	527	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000112286.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	9339	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82613885	82606949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_82607301_82607620_82607688_82612535_82612592_82613832
tx.24213	chr10	+	2495	10	FSM	ENSMUSG00000020034.8	ENSMUST00000020223.8	2725	10	226	4	-45	-4	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3.1308895119123	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATGGTAATCTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84412715	84450219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_84412877_84420611_84420920_84422967_84423104_84425747_84425869_84426951_84427173_84430511_84430649_84440370_84440553_84440749_84440932_84444328_84444502_84449345
tx.24214	chr10	+	779	2	ISM	ENSMUSG00000034453.9	ENSMUST00000077175.7	4975	28	98072	903	81268	-903	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCTTCCTTTAAATTTCC	1381	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84556227	84562139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_84556382_84561514
tx.24215	chr10	+	2494	5	FSM	ENSMUSG00000020042.16	ENSMUST00000156123.2	2806	5	308	4	308	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	37	junction_2	3.96074487943871	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTTTGCATCCTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85481374	85496152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_85481455_85483575_85483658_85487470_85487540_85490341_85490456_85494003
tx.24216	chr10	+	2475	5	FSM	ENSMUSG00000020044.14	ENSMUST00000020234.14	4722	5	163	2084	-19	-2084	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	4.15331193145904	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATAAGATTATTTTAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86136398	86183286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_86136839_86174236_86174320_86179796_86179909_86180417_86180540_86181568
tx.24217	chr10	-	1982	12	NNC	ENSMUSG00000069539.12	novel	4817	18	NA	NA	-1	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.34583084911164	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGTACTCGATATATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89522126	89486609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_89486823_89488804_89488919_89489960_89490089_89492569_89492747_89493671_89493798_89495100_89495218_89495996_89496219_89498177_89498328_89502578_89502724_89505506_89505665_89514139_89514345_89521899
tx.24218	chr10	+	1024	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000090610.4	novel	1060	1	NA	NA	-28	68	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAGTCAGACAGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93614493	93615649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_+_93615240_93615371
tx.24219	chr10	-	1666	4	Intergenic	novelGene_107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTGCCGTCCATCCTTTG	9175	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93656699	93651038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_93652374_93654709_93654819_93656236_93656331_93656571
tx.2422	chr11	+	1430	3	FSM	ENSMUSG00000020397.16	ENSMUST00000109232.4	2547	3	-15	1132	-2	62	multi-exon	FALSE	canonical	3	262	junction_1	137	753	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATGTGAAATTATAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46327785	46332416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_46328019_46330632_46330803_46331389
tx.24220	chr10	+	541	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000112261.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACCCACTCTCATCAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95292345	95293856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_95292423_95293392
tx.24221	chr10	-	1959	3	NNC	ENSMUSG00000074776.5	novel	1633	5	NA	NA	-61752	2082	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATCTTGTAGCTTGTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97580030	97515193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_97516648_97518423_97518521_97579622
tx.24222	chr10	-	434	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000112346.2	novel	2290	1	NA	NA	1083	1916	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAGGTGGAGGTAAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98942859	98939736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr10_-_98939923_98942100_98942288_98942798
tx.24223	chr10	+	2739	5	ISM	ENSMUSG00000019907.11	ENSMUST00000219263.2	3355	25	-95	41563	-95	-17573	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	206	junction_3	14.0445719051881	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTCCTTTGTGAGTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107997958	108071649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_107998498_108034693_108034825_108050248_108050368_108066297_108066458_108069859
tx.24224	chr10	+	2258	15	NIC	ENSMUSG00000019907.11	novel	3355	25	NA	NA	-14	7479	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	31	junction_12	54.0060937604758	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAGAAACAAGAAGAAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107998039	108096816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr10_+_107998498_108034693_108034825_108050248_108050368_108066297_108066458_108069859_108070005_108075965_108076041_108076639_108076729_108076981_108077140_108078866_108078992_108085295_108085512_108086774_108086870_108087700_108087806_108089185_108089357_108095616_108095708_108096696
tx.24225	chr10	-	514	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000089461.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAATGCGTGCACTCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110632579	110631097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_110631393_110632248_110632394_110632505
tx.24226	chr10	-	867	2	NNC	ENSMUSG00000112099.2	novel	788	2	NA	NA	-24	53	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAGAAAAAAGAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115436257	115434877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_115435661_115436173
tx.24228	chr10	-	2341	9	ISM	ENSMUSG00000064181.7	ENSMUST00000219109.2	1844	11	12823	-997	12772	4	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	251	junction_7	36.7423461417477	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTTGGGTTATTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116773513	116741684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_116743024_116746029_116746100_116746186_116746287_116750001_116750115_116751748_116751878_116754666_116754871_116755478_116755557_116764093_116764190_116773301
tx.24229	chr10	-	1851	6	ISM	ENSMUSG00000052681.9	ENSMUST00000064667.9	2724	8	23161	592	-4334	-592	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	789	junction_2	57.877111192595	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTGTTATTTTACACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117658779	117650367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_-_117651686_117653248_117653366_117654370_117654515_117656366_117656508_117657494_117657552_117658705
tx.2423	chr11	-	1282	8	FSM	ENSMUSG00000020354.16	ENSMUST00000077221.6	1617	8	69	266	69	-266	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.35526185435788	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGGTTTCAGTACAAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47270280	46869877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_46870264_46871637_46871762_46973605_46973679_47016361_47016482_47023424_47023513_47085857_47085960_47246011_47246201_47270080
tx.24230	chr10	-	775	3	NNC	ENSMUSG00000020228.12	novel	4554	13	NA	NA	-17	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCATCGCCCAGTCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119948909	119919518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_-_119919814_119946973_119947134_119948589
tx.24231	chr10	+	1684	10	Intergenic	novelGene_117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_8	31.8832747671337	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGTCTTCAAATGATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120359228	120374524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_120359328_120359405_120359477_120360126_120360189_120363521_120363638_120364338_120364520_120369971_120370079_120370224_120370312_120372451_120372613_120373440_120373794_120374077
tx.24232	chr10	-	380	2	Intergenic	novelGene_126	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGCCATGTTTATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120493254	120491203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_120491550_120493220
tx.24233	chr10	+	854	6	FSM	ENSMUSG00000034707.8	ENSMUST00000219216.2	3013	6	296	1863	296	-1859	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_5	7.34846922834953	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCGAGTCTGGATCTGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121219315	121231291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr10_+_121219349_121224005_121224108_121226528_121226637_121227275_121227387_121228585_121228747_121230952
tx.24234	chr10	-	549	2	Intergenic	novelGene_132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTTTAGAAAAATAAGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121563217	121562224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_-_121562552_121562995
tx.24235	chr10	+	1282	4	ISM	ENSMUSG00000034613.13	ENSMUST00000162969.2	811	5	8723	-732	8723	732	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_3	3.74165738677394	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGGTGTTTCATTGGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122739995	122778086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr10_+_122740061_122743411_122743520_122756598_122756751_122777129
tx.24236	chr10	+	432	2	NNC	ENSMUSG00000092593.2	novel	286	2	NA	NA	181	146	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGACCCAGTCCAGGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127124563	127125696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_127124628_127125328
tx.24237	chr10	+	263	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025403.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCTGCTCTTAGAACGCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127353180	127358255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_+_127353370_127358181
tx.24238	chr10	+	442	2	Intergenic	novelGene_133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTATTTGGGGGCTGGAGA	2580	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127457212	127459283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr10_+_127457349_127458977
tx.24239	chr10	+	360	2	NNC	ENSMUSG00000040195.12	novel	358	2	NA	NA	614	130	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTATGTGTTTGTTTCTTT	1932	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127503648	127504561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr10_+_127503734_127504286
tx.2424	chr11	+	1109	8	NNC	ENSMUSG00000020372.16	novel	1447	8	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_2	2299.38196665352	45744	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTTCTATATGTGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48691182	48696915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_48691400_48692489_48692666_48693099_48693248_48694230_48694327_48694684_48694796_48694982_48695124_48696371_48696483_48696806
tx.24240	chr10	-	972	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039994.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.01387685344754	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCCGGCTCTGCAGACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128068171	128064984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr10_-_128065342_128066491_128066662_128066773_128066877_128067829
tx.24241	chr11	-	236	2	Intergenic	novelGene_134	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAAAGAAAGAAAGAAAG	5173	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3099618	3098803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_3098904_3099482
tx.24242	chr11	+	1867	4	FSM	ENSMUSG00000034614.15	ENSMUST00000136474.2	617	4	26	-1276	26	-3	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	6.0184900284226	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACCTTTTTTGTGGTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3282476	3292968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3282615_3283208_3283413_3283504_3283584_3291522
tx.24243	chr11	+	1684	2	FSM	ENSMUSG00000034587.9	ENSMUST00000146456.2	1675	2	-8	-1	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATAAGGACTGTAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3402463	3408339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3402571_3406762
tx.24244	chr11	+	1957	5	ISM	ENSMUSG00000034543.16	ENSMUST00000093389.9	5085	27	35922	-2	5054	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	438	junction_1	29.5338788512447	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGCCCTGCATTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3635415	3640372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_3635527_3635657_3635883_3635975_3636070_3638110_3638300_3639034
tx.24245	chr11	-	2617	3	FSM	ENSMUSG00000020434.5	ENSMUST00000020712.5	2590	3	-28	1	-28	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCTCTGACTTATGTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3845126	3836088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_3838310_3840038_3840148_3844839
tx.24246	chr11	+	936	8	NNC	ENSMUSG00000019368.14	novel	3238	11	NA	NA	-13	199	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	6.1145527311522	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGCTGTTTTCTTGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3981769	3992668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_3981900_3985122_3985199_3989435_3989480_3989770_3989831_3989936_3990126_3991736_3991833_3992190_3992252_3992388
tx.24247	chr11	+	1743	12	FSM	ENSMUSG00000019368.14	ENSMUST00000019512.8	2956	12	-5	1218	-5	470	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_7	3.13603423830188	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAACCCCCCCCCCTTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3981777	3996806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_3981900_3985122_3985199_3989435_3989480_3989770_3989831_3989936_3990126_3991736_3991833_3992190_3992252_3993286_3993371_3993652_3993760_3993832_3993973_3994063_3994234_3996212
tx.24248	chr11	-	3072	4	FSM	ENSMUSG00000020396.9	ENSMUST00000093369.5	3994	4	922	0	922	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	3.09120616516523	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGGTTGTTTTTACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4897142	4888753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_4891416_4893850_4893976_4895110_4895311_4897057
tx.24249	chr11	-	1946	15	FSM	ENSMUSG00000034164.18	ENSMUST00000062821.13	1947	15	18	-17	1	17	multi-exon	TRUE	canonical	3	8	junction_2	4.11815294439988	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTGCCCAGGGCAGCCAG	7880	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5102239	5056247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_5056970_5060689_5060775_5066879_5066925_5078869_5078915_5079008_5079072_5079427_5079481_5079621_5079721_5080631_5080779_5081481_5081572_5081919_5082041_5084348_5084411_5085353_5085432_5093826_5093931_5094294_5094409_5102121
tx.2425	chr11	+	473	4	ISM	ENSMUSG00000020372.16	ENSMUST00000125166.2	637	6	705	-15	705	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5433	junction_3	652.991577281055	2760	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTTCTATATGTGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48694683	48696915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_48694796_48694982_48695124_48696371_48696483_48696806
tx.24250	chr11	+	591	3	Intergenic	novelGene_136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCTACTTTCTTTTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5211829	5218923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_5212083_5218470_5218625_5218739
tx.24251	chr11	+	1690	9	NIC	ENSMUSG00000000378.16	novel	1858	10	NA	NA	6	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	2	junction_4	144.667506717991	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCTCCAGTTGTCAAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6496915	6546742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_6497030_6519963_6520138_6534519_6534604_6535033_6535218_6540752_6540889_6543066_6543125_6543601_6543741_6544147_6544287_6546080
tx.24252	chr11	-	5015	7	FSM	ENSMUSG00000020413.12	ENSMUST00000152890.8	2792	7	-10	-2213	-10	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_5	37.7079419869195	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTACTTGGAATTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8961138	8943142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_8946933_8948636_8948757_8950076_8950177_8955988_8956064_8957493_8957605_8960240_8960418_8960496
tx.24253	chr11	-	1924	6	NIC	ENSMUSG00000020413.12	novel	2114	7	NA	NA	9	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	73.9053448676075	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGAAACCACAAGGAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8961151	8947339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_8948757_8950076_8950177_8955988_8956064_8957493_8957605_8960496_8960625_8961058
tx.24254	chr11	-	950	2	NNC	ENSMUSG00000020193.4	novel	4248	8	NA	NA	174755	-2866	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATACGGTGTCCTCATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11237653	11232491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_11232698_11236909
tx.24255	chr11	+	923	3	NNC	ENSMUSG00000086391.2	novel	1075	4	NA	NA	10240	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCCTTGTAAATATTTTAT	6526	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11828362	11835319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_11828483_11832956_11833080_11834639
tx.24256	chr11	+	2665	6	FSM	ENSMUSG00000033953.11	ENSMUST00000102880.5	2859	6	194	0	194	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	579	junction_5	55.0962793662149	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGAATGTATTGTGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17109456	17150375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_17109543_17132106_17132147_17142956_17143134_17144216_17144277_17144668_17144854_17148258
tx.24257	chr11	+	2798	4	ISM	ENSMUSG00000020134.14	ENSMUST00000101477.2	3703	6	7143	2	7143	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_2	9.67241208569794	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTATGCGAATTTGTCTG	57	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21092611	21100321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_21092658_21096914_21097113_21097257_21097447_21097956
tx.24258	chr11	+	678	3	ISM	ENSMUSG00000020128.16	ENSMUST00000109578.8	4273	23	-350	56376	-350	-27485	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	123	junction_2	99.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAATCTGACTTCTTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21188930	21214746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_21189372_21213198_21213355_21214665
tx.24259	chr11	+	391	2	FSM	ENSMUSG00000085165.2	ENSMUST00000138402.2	428	2	42	-5	42	5	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAATTTTGTATCCTGTTT	1385	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29465127	29467360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_29465367_29467208
tx.2426	chr11	+	3681	4	FSM	ENSMUSG00000046311.14	ENSMUST00000109198.8	3872	4	193	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	17.4547032821147	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGATGGCTTTTTATTAC	1359	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49094311	49109382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_49094366_49103521_49103604_49104416_49104470_49105890
tx.24260	chr11	-	1749	4	NNC	ENSMUSG00000040919.14	novel	990	6	NA	NA	-54	1057	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAGGAAATGTGTTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30421881	30374948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_30376365_30377053_30377170_30396226_30396381_30421818
tx.24261	chr11	-	1616	4	NNC	ENSMUSG00000044056.4	novel	754	4	NA	NA	-1045	-25	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAAAATGAACATGGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32483126	32472775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_32473703_32474391_32474515_32477384_32477553_32482728
tx.24262	chr11	-	213	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020271.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTCCAGATGCACAGGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32625373	32613143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_32613221_32625237
tx.24263	chr11	+	2763	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020159.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	10.7082522694727	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGTTGTCTACATTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33484758	33508649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_33484862_33490951_33491321_33505356_33505461_33506462
tx.24264	chr11	+	1477	2	Intergenic	novelGene_159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAAATGCAAAAAGATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37643500	37645189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_37643979_37644190
tx.24265	chr11	-	2276	12	FSM	ENSMUSG00000020362.14	ENSMUST00000020624.7	2498	12	237	-15	237	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	150	junction_7	24.0849049121664	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAAATTGAAAACAGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49603300	49565524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_49566233_49568126_49568330_49570747_49570979_49571967_49572123_49572865_49573021_49573951_49574110_49575913_49575983_49576089_49576180_49577673_49577760_49579991_49580179_49593367_49593482_49603180
tx.24266	chr11	-	366	3	ISM	ENSMUSG00000020362.14	ENSMUST00000020624.7	2498	12	233	14511	233	-8071	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_2	13	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTCCCATAATCAAATCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49603304	49580050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_49580179_49593367_49593482_49603180
tx.24267	chr11	-	1426	2	FSM	ENSMUSG00000044807.14	ENSMUST00000136333.2	381	2	15	-1060	15	1060	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAAATAAAAAGAAAAGTTA	311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50718536	50716042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_50717338_50718405
tx.24268	chr11	+	1950	14	NIC	ENSMUSG00000020385.17	novel	1949	13	NA	NA	-2	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	35	junction_4	49.8634822681421	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTTTGTGATTGAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51153998	51172591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_51154097_51157997_51158159_51161363_51161423_51162626_51162850_51163904_51163996_51164386_51164454_51166037_51166155_51166238_51166406_51166596_51166692_51166944_51167075_51168679_51168763_51171184_51171265_51171935_51172027_51172103
tx.24269	chr11	-	1784	9	NNC	ENSMUSG00000036391.17	novel	2744	8	NA	NA	-6	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	26.7438661191683	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGCCATCTAGGTGCCTATA	3767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51647271	51619886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_51620028_51620278_51620406_51622629_51622733_51624218_51624392_51624596_51624755_51625410_51625489_51627177_51627349_51634362_51634828_51646903
tx.2427	chr11	+	3101	4	FSM	ENSMUSG00000020346.17	ENSMUST00000167400.8	3151	4	55	-5	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	2	7	junction_1	35.4432253360529	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGTGTGTGTGTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49135072	49153854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_49135167_49136019_49136445_49142376_49142502_49151397
tx.24270	chr11	-	2810	11	NNC	ENSMUSG00000000782.17	novel	2059	11	NA	NA	172	78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	108	junction_1	46.9302674187991	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAAAGTCTGACTGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52173986	52143119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_52144790_52145925_52145999_52147084_52147134_52147566_52147675_52147775_52147939_52148510_52148631_52151357_52151449_52152339_52152452_52172948_52173074_52173538_52173606_52173754
tx.24271	chr11	+	1739	12	NIC	ENSMUSG00000037533.21	novel	1829	13	NA	NA	-1	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	4	junction_1	28.1436691940209	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTATGCTCATTATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54413735	54525836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_54413945_54437198_54437256_54443615_54443700_54452150_54452221_54459178_54459323_54501613_54501746_54510711_54510890_54513141_54513279_54516686_54516846_54517410_54517564_54522017_54522183_54525585
tx.24272	chr11	+	1266	2	ISM	ENSMUSG00000020522.14	ENSMUST00000020830.14	4839	3	-5	4757	-4	-32	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACCCCACAAATAAACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57409507	57419883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_57409575_57418684
tx.24273	chr11	-	1082	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000086962.5	novel	1462	9	NA	NA	35	-28109	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTGTGCCACCACTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57983925	57982757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_57983726_57983811
tx.24274	chr11	+	2188	4	NNC	ENSMUSG00000107677.3	novel	2719	3	NA	NA	-1305	-206	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.0184900284226	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATGTTATGTCAAGAAACT	1842	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58642254	58650291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_58642396_58644025_58644171_58647616_58647657_58648429
tx.24275	chr11	+	899	4	NNC	ENSMUSG00000020491.16	novel	424	4	NA	NA	22	401	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	17.8200885394982	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTTCTCCTTCTTCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58758063	58769231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_58758136_58759640_58759833_58767519_58767692_58768768
tx.24276	chr11	+	3508	4	NNC	ENSMUSG00000020455.17	novel	2301	7	NA	NA	8	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	42.4264068711929	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCTCTGCTTATCCTGTG	1697	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58868949	58882284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_58869471_58872066_58872167_58872818_58873050_58879628
tx.24277	chr11	+	1617	4	ISM	ENSMUSG00000036819.15	ENSMUST00000147163.8	4359	6	35	3807	35	-1346	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_3	6.12825877028341	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGATTATCTTCTCAGG	9516	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59340905	59345586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_59341339_59341500_59341667_59344336_59344472_59344703
tx.24278	chr11	+	1259	4	NNC	ENSMUSG00000032615.15	novel	1316	5	NA	NA	-40	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.0555074137902	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTGCTGTGGCCTTCTC	2605	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59730232	59767359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_59730583_59751575_59751637_59765378_59765498_59766630
tx.24279	chr11	+	1055	3	NNC	ENSMUSG00000032615.15	novel	1306	5	NA	NA	60	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGCCTGTGCTGTGGCCTTC	1810	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59738989	59767357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_59739199_59765378_59765498_59766630
tx.2428	chr11	+	2604	2	ISM	ENSMUSG00000020346.17	ENSMUST00000081794.7	2976	3	1225	0	240	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGTGTGTGTGTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49136297	49153854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_49136445_49151397
tx.24280	chr11	-	3790	19	FSM	ENSMUSG00000020538.16	ENSMUST00000020846.8	4299	19	-1	510	-1	-510	multi-exon	FALSE	canonical	3	238	junction_18	63.0911793643156	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTCAGTTTTGTTTATCT	3800	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60111431	60090424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60090978_60091251_60091364_60091460_60091662_60092071_60092238_60092405_60092539_60092621_60092732_60092984_60093088_60093587_60093757_60093924_60094092_60094171_60094434_60094624_60094804_60094896_60095093_60095212_60095428_60095947_60096060_60096681_60096904_60096998_60097137_60097220_60097400_60097663_60098084_60111278
tx.24281	chr11	+	1216	5	ISM	ENSMUSG00000018415.15	ENSMUST00000070681.7	4283	6	7509	2487	7509	-2487	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	383	junction_2	41.318125562518	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTATTTTTATGGTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60315596	60333616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_60315660_60323158_60323267_60327173_60327276_60329268_60329400_60332804
tx.24282	chr11	+	2025	5	ISM	ENSMUSG00000020536.13	ENSMUST00000108719.4	4268	21	11513	2	7161	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	316	junction_1	6.49519052838329	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATCTGCACACATGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60602183	60605010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_60602458_60602825_60603091_60603204_60603320_60603447_60603555_60603746
tx.24283	chr11	-	4027	30	NNC	ENSMUSG00000002812.5	novel	4060	30	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	67	junction_19	52.3939163762945	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTACTTTTAATATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60618059	60604968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_60605274_60605414_60605481_60605856_60605963_60606109_60606217_60606286_60606416_60606491_60606553_60606628_60606784_60606917_60607159_60607230_60607371_60607480_60607670_60607962_60608155_60608234_60608340_60608945_60609118_60609407_60609492_60609671_60609747_60609850_60609934_60610518_60610699_60610831_60611045_60611186_60611321_60611463_60611612_60611903_60611989_60612272_60612431_60612507_60612684_60613120_60613225_60613410_60613573_60613825_60613912_60614190_60614272_60615616_60615689_60615983_60616095_60617952
tx.24284	chr11	-	1319	3	FSM	ENSMUSG00000002812.5	ENSMUST00000137226.2	706	3	-5	-608	-5	608	multi-exon	FALSE	canonical	3	254	junction_2	17.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTGGGGATACAGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60618054	60614582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60615689_60615983_60616095_60617952
tx.24285	chr11	-	316	3	NIC	ENSMUSG00000001036.18	novel	4207	9	NA	NA	1	797	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	14	junction_2	122.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAAAGAGGCGAAAGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61470510	61424422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_61424508_61426096_61426210_61470392
tx.24286	chr11	-	623	4	NNC	ENSMUSG00000087120.2	novel	294	2	NA	NA	26	5806	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.29983164553722	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTATGGGTGTGGCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62441841	62435066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_62435277_62436422_62436568_62440872_62440986_62441686
tx.24287	chr11	+	456	2	ISM	ENSMUSG00000018507.17	ENSMUST00000102643.2	2650	15	21928	-4	16786	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAGTCTTCTAGAAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62488878	62491129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_62489140_62490934
tx.24288	chr11	-	3255	5	ISM	ENSMUSG00000047342.18	ENSMUST00000054654.13	3051	6	82	0	6	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	31	junction_3	12.1963109176505	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGCAGGTTTTTAGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62680206	62669212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_62671726_62674497_62674588_62675704_62675820_62678784_62678871_62679755
tx.24289	chr11	+	1848	2	Intergenic	novelGene_174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACGTGGTGCTGCGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62685587	62689374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_62685789_62687727
tx.2429	chr11	+	2736	3	FSM	ENSMUSG00000020346.17	ENSMUST00000156607.8	633	3	233	-2336	233	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	30.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGTGTGTGTGTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49136290	49153854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_49136445_49142376_49142502_49151397
tx.24290	chr11	-	1127	7	NNC	ENSMUSG00000005237.15	novel	13569	85	NA	NA	-2048	-7810	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.01732359773132	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTCTTTGGAGTGAAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69437430	69414642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_69414809_69414999_69415229_69420208_69420380_69423194_69423254_69430223_69430391_69435202_69435383_69437275
tx.24291	chr11	-	2005	2	FSM	ENSMUSG00000089876.4	ENSMUST00000051025.5	1933	2	-67	-5	-67	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGGAAAGTGTTTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69696517	69694423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_69695757_69695845
tx.24292	chr11	+	981	5	ISM	ENSMUSG00000018554.14	ENSMUST00000108601.3	1351	9	3593	-3	73	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_3	5.06828373317832	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTCCTGGTCTCTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69830745	69832426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69830985_69831153_69831258_69831415_69831594_69831871_69831957_69832051
tx.24293	chr11	+	680	3	ISM	ENSMUSG00000040963.16	ENSMUST00000179757.2	672	5	572	-331	572	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_2	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTGTAGCCTGGTTGTTT	7562	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69989089	69997013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69989200_69996201_69996309_69996550
tx.24294	chr11	-	2415	14	FSM	ENSMUSG00000018924.7	ENSMUST00000019068.7	2409	14	-3	-3	-3	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.421325044234743	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGCATCCAGATATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70242860	70234974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70235549_70235645_70235814_70235921_70236023_70236355_70236478_70236642_70236813_70236905_70236993_70237912_70238123_70238914_70239059_70240369_70240531_70240729_70240834_70240954_70241078_70241150_70241233_70241539_70241745_70242696
tx.24295	chr11	-	367	2	Intergenic	novelGene_177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTATGATGTTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72311397	72310901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_72311162_72311290
tx.24296	chr11	-	1955	6	ISM	ENSMUSG00000040447.16	ENSMUST00000045303.10	3241	13	33304	0	21	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.8	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGGCTCTCCAGTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72347426	72342463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_72343942_72344379_72344427_72344879_72345044_72345125_72345225_72347128_72347195_72347325
tx.24297	chr11	+	284	3	ISM	ENSMUSG00000017774.20	ENSMUST00000151174.8	2503	21	-23	11783	-23	156	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_1	108.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACAGCCGGCAGCATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75546951	75548630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75547028_75548317_75548474_75548578
tx.24298	chr11	-	249	2	NNC	ENSMUSG00000109010.2	novel	78	2	NA	NA	-15770	115	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACAAACAGGACAAAAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77107415	77090835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_77090980_77107310
tx.24299	chr11	+	2774	2	NNC	ENSMUSG00000083899.3	novel	2255	2	NA	NA	-5	516	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAATGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77184264	77187240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_77185736_77185937
tx.243	chr1	-	430	2	ISM	ENSMUSG00000052331.15	ENSMUST00000180327.8	2501	8	41	67586	8	-61681	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAAAACCCATGGAGTGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54965505	54867631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_54867855_54965298
tx.2430	chr11	+	2691	3	FSM	ENSMUSG00000020346.17	ENSMUST00000101293.11	2729	3	35	3	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	25.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAAGTGTGTGTGTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49141373	49153854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_49141483_49142376_49142502_49151397
tx.24300	chr11	-	1231	6	NNC	ENSMUSG00000044328.14	novel	1463	7	NA	NA	77	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	86.7815648625905	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGGAGTCGTTGGGAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77404119	77398930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_77399204_77399564_77399818_77399901_77400100_77400423_77400553_77403478_77403723_77403985
tx.24302	chr11	+	1360	6	ISM	ENSMUSG00000010277.8	ENSMUST00000010421.7	7443	39	26007	0	-181	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	682	junction_1	64.68817511725	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGTCCTTCCCTCCTCA	458	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78178584	78181449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78178621_78178757_78178894_78178990_78179122_78179766_78179869_78180111_78180247_78180629
tx.24303	chr11	+	1347	5	FSM	ENSMUSG00000002058.14	ENSMUST00000108295.8	1371	5	15	9	15	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	104.920207777148	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCGGCCAGCCTGTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78234346	78239981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78234613_78238043_78238158_78238622_78238726_78238912_78239086_78239290
tx.24305	chr11	-	2108	10	NNC	ENSMUSG00000018841.18	novel	3426	10	NA	NA	-26	941	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	2	junction_9	37.8593889720018	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGGTTGTTTATGGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82781466	82768621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_82769850_82770010_82770179_82772426_82772498_82772596_82772688_82773712_82773809_82774318_82774454_82774708_82774791_82780517_82780637_82780795_82780858_82781410
tx.24306	chr11	-	866	2	ISM	ENSMUSG00000069793.13	ENSMUST00000138797.2	2128	5	0	5655	0	-5655	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATATGAAAGACATAATTCC	8620	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82881963	82878464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_82879135_82881767
tx.24308	chr11	-	2133	5	NNC	ENSMUSG00000018405.8	novel	2477	5	NA	NA	31	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_4	41.1035278291292	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCTGGAGTTGATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84710310	84703886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_84705338_84705514_84705635_84705733_84705867_84709425_84709520_84709975
tx.24309	chr11	-	1131	7	ISM	ENSMUSG00000000804.15	ENSMUST00000108075.9	7053	34	218	71056	109	-5306	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_4	5.8878405775519	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTCGGGTCCGGGTCTTT	7703	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85030646	84946323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_84946700_84949953_84950086_84968090_84968251_84971956_84972076_84974614_84974721_84994724_84994853_85030536
tx.2431	chr14	+	453	2	Intergenic	novelGene_266	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	226	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATTGCCTTAGCTCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49839815	49846584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_49840055_49846370
tx.24310	chr11	+	1834	4	NNC	ENSMUSG00000085628.5	novel	635	4	NA	NA	-7	1685	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.05480466765633	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGTTCCTTGAGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85125989	85130815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_85126159_85128236_85128341_85128869_85128969_85129353
tx.24311	chr11	-	1135	8	NNC	ENSMUSG00000034329.17	novel	6931	20	NA	NA	10	38263	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	32.4408409765423	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCTCTCAGTGTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86092009	86047595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_86047699_86048413_86048705_86077790_86077920_86080557_86080686_86083640_86083815_86088694_86088807_86089697_86089821_86091934
tx.24312	chr11	+	1882	6	NIC	ENSMUSG00000018377.11	novel	4583	6	NA	NA	-166	-2885	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_3	44.5268458348444	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGGGTTAAAGTAAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87958938	87972670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_87959260_87963882_87964578_87965487_87965552_87966998_87967201_87969228_87969382_87972223
tx.24313	chr11	-	869	2	Intergenic	novelGene_191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCATTTAAGGCTCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88658406	88625187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_88625925_88658274
tx.24316	chr11	+	1021	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000010080.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGGCTGTCTCTCATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94381996	94386424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_94382230_94384645_94384745_94385735
tx.24317	chr11	+	1061	3	ISM	ENSMUSG00000001506.11	ENSMUST00000001547.8	5930	51	14274	1148	5130	-1148	intron_retention	FALSE	canonical	3	18	junction_2	10	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGCTTGGTCCTCTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94841323	94842720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_94841400_94841534_94841726_94841926
tx.24318	chr11	+	1667	3	FSM	ENSMUSG00000086552.4	ENSMUST00000156477.4	1664	3	1	-4	1	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGGCTCTAAACCAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95035878	95049877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95036101_95046176_95046332_95048587
tx.24319	chr11	+	2367	9	ISM	ENSMUSG00000057522.16	ENSMUST00000107722.8	3063	10	56421	392	-3800	-392	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_2	21.7108123984341	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTGGTATCTCTGGTCT	8605	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95361344	95383840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_95361492_95362048_95362171_95365056_95365209_95365310_95365439_95372739_95372918_95376117_95376174_95376662_95376786_95381110_95381254_95382522
tx.2432	chr11	+	2975	19	NNC	ENSMUSG00000020363.7	novel	2947	19	NA	NA	-13	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	112.895846789075	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCGACTTGTTTGAATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49684991	49729442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_49685071_49695778_49695887_49698521_49698621_49699860_49699987_49701790_49701850_49702496_49702632_49706106_49706169_49709406_49709487_49709963_49710082_49714038_49714207_49714560_49714657_49714767_49714866_49715158_49715280_49717570_49717729_49717957_49718073_49720566_49720695_49723687_49723856_49726438_49726601_49728547
tx.24320	chr11	+	666	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000120.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTGAGCCTGTGCCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95468794	95469546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_95468872_95468957
tx.24321	chr11	+	2169	4	NNC	ENSMUSG00000050860.7	novel	590	3	NA	NA	-16	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_3	15.1730755689881	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAAAGGGACTTGTTCTCT	2181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95715308	95722964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_95715536_95719491_95719602_95720551_95720678_95721258
tx.24323	chr11	-	2235	8	NNC	ENSMUSG00000020876.15	novel	2551	9	NA	NA	0	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_6	28.5249622153607	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGTTGTTGCAATTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96668357	96658700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_96660149_96661464_96661678_96661854_96661951_96663607_96663709_96663961_96664049_96665266_96665322_96667729_96667888_96668280
tx.24324	chr11	-	442	2	NNC	ENSMUSG00000087067.2	novel	5272	2	NA	NA	394	-4131	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTACATTTTCCTCTAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96916680	96915464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_96915753_96916526
tx.24325	chr11	-	266	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084368.2_ENSMUSG00000038517.16	novel	120	1	NA	NA	3	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTAAAATTAATTTATTTA	6087	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97042318	97007614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_97007851_97042288
tx.24326	chr11	+	1199	7	NNC	ENSMUSG00000049807.17	novel	5816	24	NA	NA	-11116	7813	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	23	junction_1	8.74483974822994	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTGGGCTTCCCAGCGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97295242	97342867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_97295357_97335009_97335172_97337334_97337378_97338995_97339092_97339270_97339350_97339478_97339534_97342217
tx.24327	chr11	+	508	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000098919.3	novel	139	1	NA	NA	10	1997	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGCCTCTGGAAGTCTGATC	5869	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97635732	97637858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_+_97636126_97637743
tx.24328	chr11	+	3273	7	NIC	ENSMUSG00000038366.16	novel	758	3	NA	NA	-2	-7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_1	237.309221621636	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCGGACTAGGCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97697133	97729583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_97697172_97697650_97697746_97706523_97706609_97715667_97715776_97724371_97724529_97724909_97725014_97726897
tx.24329	chr11	-	917	7	NNC	ENSMUSG00000017417.15	novel	2881	14	NA	NA	30444	3018	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_6	14.360439485692	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGCTTTGTAACATTTTCT	8767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97846781	97824650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_97824862_97829355_97829438_97831638_97831735_97844708_97844809_97845576_97845696_97846226_97846350_97846595
tx.2433	chr11	+	1507	6	ISM	ENSMUSG00000020363.7	ENSMUST00000020629.5	2947	19	32675	-1	32675	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	375	junction_2	70.8971085447072	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCGACTTGTTTGAATTT	4747	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49717688	49729441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_49717729_49717957_49718073_49720566_49720695_49723687_49723856_49726438_49726601_49728547
tx.24330	chr11	-	1143	5	NIC	ENSMUSG00000038352.16	novel	1571	6	NA	NA	24	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.39116499156263	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCACTTCTTATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97886731	97880403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_97881166_97884250_97884335_97885163_97885312_97885892_97885954_97886643
tx.24331	chr11	+	1495	2	ISM	ENSMUSG00000018167.11	ENSMUST00000154960.8	2170	16	20796	0	1071	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	151	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTGTGATGGTGCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98270052	98271938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_98270893_98271283
tx.24332	chr11	-	449	4	FSM	ENSMUSG00000075576.13	ENSMUST00000153181.8	680	4	365	-134	336	134	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCAGCCTGTGGTGCGTG	7219	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98700548	98688398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_98688627_98689947_98690060_98692791_98692854_98700501
tx.24333	chr11	+	2068	4	FSM	ENSMUSG00000017493.13	ENSMUST00000017637.13	3831	4	10	1753	10	719	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	1.69967317119759	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAAAGTGTCCAGATCAT	4239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98932079	98943465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_98932672_98939051_98939198_98939919_98940055_98942270
tx.24334	chr11	-	869	5	NNC	ENSMUSG00000053654.8	novel	1542	8	NA	NA	291	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_4	38.6328875441637	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTGAATTCATCATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100156513	100153712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_100153994_100154119_100154170_100155303_100155525_100155754_100155881_100156322
tx.24335	chr11	-	2006	8	FSM	ENSMUSG00000006931.16	ENSMUST00000066489.13	2178	8	161	11	161	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_5	9.9979589753844	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAACACCTGAGGCCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100305501	100299292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100299971_100300188_100300334_100301939_100302024_100302554_100302701_100303526_100303656_100304434_100304607_100304752_100304906_100305002
tx.24336	chr11	-	2434	2	FSM	ENSMUSG00000048732.6	ENSMUST00000056665.4	2393	2	-41	0	-41	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGTCTAGTTACTTGGCC	7653	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100363608	100353439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100355272_100363006
tx.24337	chr11	+	2458	6	FSM	ENSMUSG00000001751.10	ENSMUST00000001802.10	2560	6	82	20	82	-20	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	1.93907194296653	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGGCCTATTACATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100960919	100968478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_100961328_100961905_100962054_100962721_100962869_100963042_100963129_100964672_100964930_100967066
tx.24338	chr11	-	1585	13	ISM	ENSMUSG00000006920.15	ENSMUST00000107285.8	4193	21	24	9730	0	-1543	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_12	16.3783393541592	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAACACAGGCAAGGATTA	2642	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101117252	101091671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101091754_101094080_101094278_101094586_101094768_101098163_101098256_101098947_101099112_101100205_101100309_101101372_101101550_101104549_101104671_101106008_101106129_101107820_101107950_101108068_101108190_101109479_101109547_101117221
tx.24339	chr11	-	2224	7	NNC	ENSMUSG00000034993.8	novel	2766	6	NA	NA	31	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	126.514491923521	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTGACCAGATGTTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101357025	101349570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_101349909_101350419_101351103_101351202_101351445_101353023_101353114_101353215_101353387_101353734_101353943_101356533
tx.2434	chr11	+	2105	12	FSM	ENSMUSG00000020366.19	ENSMUST00000020634.14	4675	12	36	2534	18	577	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_7	40.7615521322656	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAATTTGTGATGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49737615	49774714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_49737803_49745039_49745210_49754370_49754501_49757809_49757869_49759998_49760138_49763560_49763727_49765090_49765163_49769057_49769241_49770528_49770654_49772045_49772110_49772957_49773027_49773973
tx.24340	chr11	+	456	2	ISM	ENSMUSG00000006575.15	ENSMUST00000107105.9	1861	11	7508	0	1053	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTGGGGAGACAGAGACAT	6530	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102291736	102292580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_102291827_102292214
tx.24344	chr11	-	676	2	ISM	ENSMUSG00000020937.15	ENSMUST00000128650.8	1952	11	7248	-13	704	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCACTTTATTCCCCAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102961872	102961116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102961756_102961835
tx.24345	chr11	-	1023	3	ISM	ENSMUSG00000020937.15	ENSMUST00000103077.2	3023	15	3	9527	3	722	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_2	6	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGAGAGACATTGGCTTTG	9412	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102992481	102970656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102971242_102971329_102971492_102992205
tx.24346	chr11	+	536	5	NNC	ENSMUSG00000110636.2	novel	228	2	NA	NA	-8944	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.82915619758885	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGGAGATTGACTTGGG	4276	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103303617	103312871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_103303664_103304087_103304253_103304489_103304599_103312556_103312639_103312737
tx.24348	chr11	+	238	2	Intergenic	novelGene_197	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CCAACCAACCAACCAAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103921225	103932971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_103921348_103932855
tx.24349	chr11	+	1903	7	NNC	ENSMUSG00000001901.16	novel	3368	13	NA	NA	6330	51	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGGGCTAGGTGTGTAAC	8950	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105910928	105925426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_105911148_105911316_105911570_105914550_105914745_105916623_105916705_105917541_105917699_105918382_105918564_105924608
tx.2435	chr11	+	2006	12	FSM	ENSMUSG00000020366.19	ENSMUST00000178543.8	4677	12	143	2528	1	583	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_7	121.043192891854	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGATGTTTTAGGCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49737720	49774720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_49737803_49745039_49745210_49754370_49754501_49757809_49757869_49759998_49760138_49763560_49763727_49764662_49764735_49769057_49769241_49770528_49770654_49772045_49772110_49772957_49773027_49773973
tx.24350	chr11	+	742	3	ISM	ENSMUSG00000049354.9	ENSMUST00000058438.9	5750	7	14914	4199	14886	-4199	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_2	13.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTGTCAGCTGTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105942611	105945951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_105942793_105944556_105944675_105945508
tx.24351	chr11	+	1299	4	NNC	ENSMUSG00000020721.17	novel	687	5	NA	NA	-1066	533	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	59	junction_1	46.783187863448	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACCAAGCCTTGCTACATA	9352	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107437689	107469515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_107437878_107440171_107440228_107465763_107465992_107468688
tx.24352	chr11	-	297	2	ISM	ENSMUSG00000020723.4	ENSMUST00000134076.2	422	3	5264	-86	5264	86	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGGAGTTCCTTAAGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107627641	107625936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_107626145_107627552
tx.24353	chr11	+	907	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020599.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGCACAGGAGATGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109148395	109149408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_109148571_109148676
tx.24354	chr11	-	301	2	Intergenic	novelGene_203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCCCTTTTTCTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109915230	109914870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_109915130_109915188
tx.24355	chr11	+	2173	2	FSM	ENSMUSG00000047904.7	ENSMUST00000146390.3	2143	2	-20	-10	-20	10	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGTTTTGTATTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113510147	113516864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_113510449_113514992
tx.24356	chr11	-	348	3	Intergenic	novelGene_205	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTCCAATTCTAGGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114139539	114134432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_114134572_114134897_114135034_114139466
tx.24357	chr11	-	638	5	Intergenic	novelGene_208	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.23606797749979	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGATCTGAGAGAGTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114447707	114408204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_114408422_114408536_114408594_114416736_114416921_114422839_114422893_114447580
tx.24358	chr11	+	737	5	ISM	ENSMUSG00000045980.14	ENSMUST00000156230.2	3147	9	-40	44117	0	4244	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	5.80409338312195	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATCCATCTGCCCGAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115078336	115092473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_115078425_115079035_115079149_115088061_115088184_115091645_115091728_115092141
tx.24359	chr11	-	1064	7	NNC	ENSMUSG00000057948.13	novel	991	7	NA	NA	30	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_6	13.9283882771841	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGAGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115968737	115966228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_115966712_115966933_115967001_115967095_115967156_115967267_115967376_115967577_115967614_115968273_115968485_115968638
tx.2436	chr11	+	1238	6	ISM	ENSMUSG00000020366.19	ENSMUST00000020634.14	4675	12	27525	2536	20021	575	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	274	junction_1	36.4713586256394	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTAAATTTGTGATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49765104	49774712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_49765163_49769057_49769241_49770528_49770654_49772045_49772110_49772957_49773027_49773973
tx.24360	chr11	-	3592	10	NNC	ENSMUSG00000020802.9	novel	5205	18	NA	NA	-634	-274	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	57.3710039895192	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATACTAATAACTCTTACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116435477	116428839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_116430538_116430624_116430683_116430757_116430962_116431908_116432050_116432164_116432865_116433616_116433707_116434233_116434363_116434445_116434559_116434691_116434847_116435173
tx.24361	chr11	-	461	4	ISM	ENSMUSG00000020806.16	ENSMUST00000126819.2	2489	8	3	2962	3	-2962	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_1	8.49836585598798	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGAAGAGTGTCAGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116515070	116497040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_116497059_116498053_116498254_116501129_116501306_116515003
tx.24362	chr11	-	1595	3	NNC	ENSMUSG00000020814.14	novel	2063	4	NA	NA	14227	-386	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	44.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAAGGTCCGTTTTTATTT	565	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116704602	116694273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_116695481_116702748_116702843_116704308
tx.24363	chr11	+	803	3	Intergenic	novelGene_214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGACTTAGAATTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116891264	116895192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_116891469_116891699_116891790_116894683
tx.24364	chr11	-	761	3	Intergenic	novelGene_219	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTCTCTCTATTCCGTCTG	6123	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117354436	117353395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_117353556_117353667_117353749_117353916
tx.24365	chr11	-	956	5	NNC	ENSMUSG00000109408.2	novel	4320	3	NA	NA	-297	439	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.866025403784439	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGCACTGTGTTCTTCT	9695	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119382421	119351587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_119351833_119355918_119356057_119368867_119368958_119379727_119379827_119382037
tx.24366	chr11	-	2388	3	FSM	ENSMUSG00000109408.2	ENSMUST00000207273.2	626	3	-16	-1746	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	9014	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119382077	119366877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_119368958_119379727_119379827_119381868
tx.24367	chr11	-	2808	10	NIC	ENSMUSG00000025377.15	novel	2770	13	NA	NA	18	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_6	33.0805227838727	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGCCACTTGGGCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119988068	119981356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_119982839_119983676_119983812_119984070_119984150_119984242_119984357_119984516_119984692_119984939_119985144_119986359_119986436_119986629_119986698_119987390_119987501_119987703
tx.24368	chr11	-	1066	3	NNC	ENSMUSG00000075389.4	novel	2615	2	NA	NA	-97	-253	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTTTTTTTTTCTCTCTGG	6046	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120080775	120078785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_120079158_120079314_120079499_120080265
tx.24369	chr11	+	383	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000043644.5	novel	619	2	NA	NA	624	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGAGGAGCTCAACGTCT	3619	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120240127	120242013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_+_120240280_120241782
tx.2437	chr11	+	1142	5	ISM	ENSMUSG00000020366.19	ENSMUST00000043321.6	1297	11	24020	-583	24020	583	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	358	junction_4	5.80409338312195	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGATGTTTTAGGCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49769103	49774720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_49769241_49770528_49770654_49772045_49772110_49772957_49773027_49773973
tx.24370	chr11	+	602	2	Intergenic	novelGene_229	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGCCTGGTCCTGGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120823777	120824582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_120823964_120824166
tx.24371	chr11	-	1646	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039329.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGGGGAGCTAGAAAGACA	286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121039145	121037362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_121037408_121037544
tx.24372	chr11	-	2942	6	ISM	ENSMUSG00000039294.15	ENSMUST00000106115.8	2239	7	39	0	-31	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	63	junction_1	5.41848687365763	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGCCTTTCTGTTTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121120092	121113413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_121115059_121115374_121115520_121116629_121116727_121117594_121117669_121118068_121118111_121119153
tx.24373	chr12	-	481	2	Intergenic	novelGene_369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAAGAGGTGGTGGTGGT	NA	False	NA	-90	True	NA	NA	NA	3575162	3573829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_3574094_3574945
tx.24374	chr12	+	2332	20	NNC	ENSMUSG00000071454.14	novel	2390	20	NA	NA	17	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	90.3998198218487	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGAGCCTGTGTGTGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3622491	3831395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_3622648_3639170_3639239_3641905_3641987_3646648_3646867_3667605_3667692_3682809_3682965_3693916_3694023_3698222_3698390_3736737_3736863_3768411_3768490_3782617_3782708_3784938_3785027_3798424_3798511_3799469_3799584_3801810_3801908_3822586_3822747_3823550_3823641_3824569_3824611_3829618_3829655_3831105
tx.24375	chr12	+	679	6	ISM	ENSMUSG00000020640.11	ENSMUST00000217672.2	5431	18	-25	29411	-25	7338	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_1	7.08237248385031	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAACTAGAAGATGAGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4684750	4700095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_4684798_4685580_4685731_4686546_4686688_4687738_4687827_4689654_4689795_4699982
tx.24376	chr12	-	1216	8	FSM	ENSMUSG00000079177.5	ENSMUST00000111154.4	3004	8	36	1752	36	127	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.30930734141595	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGACGTCTGTGTGGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4788383	4765421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_4765708_4768576_4768719_4781139_4781306_4781424_4781507_4782740_4782930_4784967_4785037_4787678_4787786_4788208
tx.24379	chr12	+	460	3	NNC	ENSMUSG00000112276.2	novel	1194	3	NA	NA	8479	-41372	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGACTTTAATTGAGCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8569679	8571290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_8569852_8570846_8570989_8571144
tx.2438	chr11	+	737	6	ISM	ENSMUSG00000020376.18	ENSMUST00000102776.5	1502	9	60394	18	-7932	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_5	49.4837347014148	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACCGTGTTGCTAAGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49976568	49995562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_49976640_49978205_49978289_49984549_49984647_49986602_49986808_49990072_49990167_49995375
tx.24380	chr12	+	353	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000066629.3	novel	315	1	NA	NA	-36	49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTTTCAATGGACAGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12961986	12962386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_12962163_12962209
tx.24381	chr12	-	585	2	NNC	ENSMUSG00000036523.17	novel	8058	35	NA	NA	-159	-60929	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTCCATTATTATGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16851046	16844207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_16844394_16850647
tx.24382	chr12	+	581	4	Intergenic	novelGene_379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGTGGTATACGTGTTC	5928	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17563644	17575752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_17563752_17568350_17568468_17574356_17574425_17575463
tx.24383	chr12	+	2141	5	Intergenic	novelGene_382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	16.5586080332859	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTTTCACAAATTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18777165	18924495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_18777287_18920412_18920540_18920741_18920803_18922243_18922627_18923046
tx.24384	chr12	+	2853	5	Genic_Genomic	ENSMUSG00000095470.2	novel	336	1	NA	NA	-228	23089	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATAGTCTCCATTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20004277	20027930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_20004632_20023640_20023768_20023969_20024031_20025367_20025826_20026077
tx.24385	chr12	-	889	4	NNC	ENSMUSG00000099759.2	novel	1735	2	NA	NA	20	32266	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGTGTGAGTTGTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20865760	20822115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_20822270_20834153_20834387_20848304_20848393_20865346
tx.24386	chr12	-	1318	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020649.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAAATTGTCAGTTCTTTT	8928	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24758676	24757252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_24758424_24758529
tx.24387	chr12	-	753	7	NNC	ENSMUSG00000020636.15	novel	1384	12	NA	NA	14146	-5531	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1.95078331845327	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGGTTGGGAAACTGCAAGA	5091	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28618368	28609284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_28609312_28609868_28610025_28613369_28613503_28614233_28614314_28615395_28615525_28618000_28618089_28618228
tx.24388	chr12	+	563	2	Intergenic	novelGene_392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCATTTTCAGAGAGTACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28686047	28686734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_28686408_28686531
tx.24389	chr12	-	758	5	ISM	ENSMUSG00000020659.17	ENSMUST00000064240.14	3937	6	-327	5659	-266	-3209	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_3	61.5726197266285	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGATAAGATGTGCCCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31549881	31540486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_31540541_31541510_31541595_31542077_31542179_31544589_31544749_31549521
tx.2439	chr11	+	326	3	ISM	ENSMUSG00000020376.18	ENSMUST00000102776.5	1502	9	70603	3	2277	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_2	7	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATCCTTCGCCAGCGTGTG	3666	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49986777	49995577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_49986808_49990072_49990167_49995375
tx.24390	chr12	-	769	3	NNC	ENSMUSG00000020648.4	novel	1773	7	NA	NA	-8	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGGTATGACTCGCCTGTA	9072	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31704813	31690048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_31690573_31702324_31702441_31704684
tx.24391	chr12	-	860	2	NNC	ENSMUSG00000097494.8	novel	1451	7	NA	NA	25216	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTATGTGTGTATGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32978566	32974949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_32975535_32978291
tx.24392	chr12	+	1022	4	NNC	ENSMUSG00000043153.7	novel	3122	5	NA	NA	2	-42057	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	9.39266853573691	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTCATGGAAAGGTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36431583	36486760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_36432024_36440344_36440622_36476287_36476438_36486605
tx.24393	chr12	+	461	3	ISM	ENSMUSG00000036095.12	ENSMUST00000220606.2	2240	14	105025	37819	105025	2	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCATGGGTATTTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38174203	38186841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_38174243_38177262_38177383_38186539
tx.24394	chr12	+	667	6	ISM	ENSMUSG00000004151.18	ENSMUST00000095767.11	6576	13	50	42652	50	-3384	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_3	7.00285656000464	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAACTCGGGTCTGCTTGCA	375	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38830130	38877831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_38830421_38830846_38830979_38831797_38831886_38833236_38833285_38843169_38843224_38877776
tx.24395	chr12	-	793	2	ISM	ENSMUSG00000046314.17	ENSMUST00000120531.8	4209	6	212803	2682	151655	-2682	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCAAGTCTGTACTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44908092	44901952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_44902661_44908007
tx.24396	chr12	+	1334	3	Intergenic	novelGene_398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAAGCATTAAACCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47631953	47667293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_47632438_47636900_47637008_47666550
tx.24397	chr12	+	199	2	ISM	ENSMUSG00000035293.14	ENSMUST00000119211.8	2926	16	-7	21828	-7	-12094	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTTGGTAAGTAACTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51395063	51398222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_51395228_51398187
tx.24398	chr12	+	1254	2	NNC	ENSMUSG00000035133.10	novel	2332	6	NA	NA	-39	-28392	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	82	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGAGAAGAATATATAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52551085	52564030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_52551171_52562861
tx.24399	chr12	-	2673	13	ISM	ENSMUSG00000020986.14	ENSMUST00000165134.2	2529	18	15011	-969	-9520	-352	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	521	junction_10	54.2992607889115	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTGCTTTTTTTGTTTTTTT	7114	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59039010	59005520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_59006873_59013765_59013832_59015598_59015755_59018025_59018113_59019666_59019829_59021367_59021446_59025247_59025402_59029353_59029461_59031917_59032008_59032876_59032958_59036135_59036260_59037758_59037875_59038910
tx.244	chr1	-	574	3	Intergenic	novelGene_24	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCAGGCCCCTAGTGTCC	2927	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55007408	55004316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_55004566_55006037_55006282_55007327
tx.2440	chr11	+	222	2	ISM	ENSMUSG00000020376.18	ENSMUST00000143607.2	561	3	2275	20	2275	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTGTTGCTAAGTATCCTT	3664	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49986775	49995565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_49986808_49995375
tx.24400	chr12	+	1999	2	ISM	ENSMUSG00000047227.6	ENSMUST00000220928.2	598	3	767	-1430	767	1430	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATAGTCTCCCAGCTTCTGT	975	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64970279	64972796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_64970416_64970933
tx.24401	chr12	+	1980	12	ISM	ENSMUSG00000035597.20	ENSMUST00000120580.8	4069	14	11	3441	10	2147	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_3	79.6963244587315	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATGTAACTTATTGATAAG	7518	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65083117	65106719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_65083243_65089234_65089582_65090005_65090132_65090779_65090899_65094886_65095055_65100059_65100226_65100744_65100853_65101929_65102095_65102411_65102539_65103024_65103294_65104502_65104688_65106644
tx.24402	chr12	+	2168	12	NIC	ENSMUSG00000051890.14	novel	2620	13	NA	NA	-38	-324	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3.78557505702855	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCTGTATTTTGGATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69288649	69331082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_69288788_69297526_69297598_69298144_69298263_69298701_69298821_69300465_69300545_69302948_69303033_69305342_69305402_69306274_69306388_69309922_69309996_69315015_69315101_69316599_69316653_69329906
tx.24403	chr12	-	1719	3	ISM	ENSMUSG00000034761.16	ENSMUST00000110567.8	4250	32	83728	9	9172	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_1	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTATAAAGTATTTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69856055	69850532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_69852126_69853971_69854028_69855985
tx.24404	chr12	-	705	6	ISM	ENSMUSG00000034761.16	ENSMUST00000110567.8	4250	32	77173	1268	2617	-1257	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	112	junction_5	14.0513344562002	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTCTAGTTCCAAGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69862610	69851791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_69852126_69853971_69854028_69855985_69856057_69858047_69858141_69859909_69859979_69862528
tx.24405	chr12	-	1841	4	ISM	ENSMUSG00000021067.9	ENSMUST00000021467.8	2524	5	2704	0	-41	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_3	2.49443825784929	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTGGTCCTTGAATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70031072	70011785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_70013122_70015843_70015988_70022741_70023013_70030982
tx.24406	chr12	-	1481	2	ISM	ENSMUSG00000021067.9	ENSMUST00000220735.2	3360	3	8668	-35	8668	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	149	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTCTGGTCCTTGAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70015989	70011786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_70013122_70015843
tx.24407	chr12	+	2754	13	ISM	ENSMUSG00000034601.18	ENSMUST00000149564.8	5763	30	349	80282	349	8134	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_6	8.91471941354422	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAAGGCCTCTTAGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71183970	71209795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_71184813_71186428_71186503_71187638_71187709_71188823_71188894_71195017_71195193_71197016_71197239_71199423_71199572_71201535_71201698_71203820_71203945_71205601_71205732_71206964_71207183_71207897_71207971_71209349
tx.24408	chr12	+	474	2	ISM	ENSMUSG00000034601.18	ENSMUST00000045907.16	4507	28	56509	4	43915	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAGTCTGGCTGTTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71241122	71290073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_71241241_71289717
tx.24409	chr12	+	610	2	NNC	ENSMUSG00000113630.2	novel	1271	6	NA	NA	-7314	-22115	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTTTCATCCACAGACGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71580066	71580792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_71580352_71580467
tx.2441	chr11	+	619	3	ISM	ENSMUSG00000036644.16	ENSMUST00000093138.13	4407	21	-27	31328	-27	134	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_2	1.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCTGCTGTGGTGCGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50022195	50031529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_50022384_50026651_50026763_50031209
tx.24410	chr12	+	450	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021094.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCACTTTGGGGTCCGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72711442	72713515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_72711641_72713263
tx.24411	chr12	-	388	2	NNC	ENSMUSG00000045690.9	novel	2979	2	NA	NA	38154	-322	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAATGTTTGTTCTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75678147	75677691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_75677902_75677969
tx.24412	chr12	+	284	2	NNC	ENSMUSG00000033454.7	novel	12190	2	NA	NA	879	-11541	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCACAGTACTGCACAACT	299	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76417918	76432183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_76418019_76431999
tx.24413	chr12	+	1280	3	NNC	ENSMUSG00000112392.2	novel	661	2	NA	NA	186	24525	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	9.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTAGTTCTCATAAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77600306	77641008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_77600570_77616271_77616542_77640261
tx.24414	chr12	+	1674	11	NIC	ENSMUSG00000021112.10	novel	5283	15	NA	NA	-56	-3603	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	104	junction_7	13.4833230325465	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGGAAAAAGGTTTTATATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78795624	78873069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_78795720_78841018_78841108_78843639_78844165_78856525_78856735_78864014_78864093_78864398_78864546_78865977_78866140_78867581_78867660_78871462_78871647_78872630_78872703_78873034
tx.24415	chr12	+	1614	10	NIC	ENSMUSG00000021112.10	novel	5283	15	NA	NA	-30	-3969	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	104	junction_7	13.4586701597571	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGACACTTATATTTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78795650	78872703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_78795720_78841018_78841108_78843639_78844165_78856525_78856735_78864014_78864093_78864398_78864546_78865977_78866140_78867581_78867660_78871462_78871647_78872630
tx.24416	chr12	-	3341	21	FSM	ENSMUSG00000015143.16	ENSMUST00000021554.16	3734	21	204	189	-76	-189	multi-exon	TRUE	canonical	3	154	junction_2	44.8659113358906	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTGCTTTTCAAAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80306941	80214509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_80215255_80215631_80215791_80217459_80217541_80218502_80218650_80219736_80219917_80220853_80220989_80221233_80221417_80222929_80223071_80223961_80224071_80225075_80225227_80228134_80228283_80230166_80230398_80231580_80231674_80239141_80239228_80240409_80240492_80243168_80243248_80243699_80243788_80245754_80245842_80251735_80251856_80256132_80256248_80306760
tx.24417	chr12	+	433	3	Intergenic	novelGene_413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTGTATATTGGAAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80345442	80353291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_80345504_80345997_80346110_80353031
tx.24418	chr12	+	3191	13	NNC	ENSMUSG00000021136.14	novel	3496	13	NA	NA	-7393	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_1	44.458470009162	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAACTTGGGCAGCTGGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81066188	81233176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_81066280_81151380_81151547_81152672_81152786_81182549_81182650_81184738_81184787_81197425_81197483_81199446_81199528_81214280_81214474_81215002_81215086_81216959_81217066_81226252_81226498_81230761_81230816_81231322
tx.24419	chr12	-	1069	2	ISM	ENSMUSG00000042628.9	ENSMUST00000048319.6	4036	12	85	47546	-23	882	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCGCCAGCCATTAAGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83643911	83641168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_83642097_83643770
tx.2442	chr11	+	1613	2	ISM	ENSMUSG00000036644.16	ENSMUST00000093138.13	4407	21	0	34754	0	-3182	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAAAAAAAAAAGCCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50022222	50028103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_50022384_50026651
tx.24420	chr12	+	2335	3	NNC	ENSMUSG00000021228.16	novel	3431	4	NA	NA	828	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTCTTGTTTCCTTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84100697	84107174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_84100850_84103682_84103886_84105194
tx.24421	chr12	-	176	2	Intergenic	novelGene_417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAATTGTTATTTTGCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84331984	84331501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_84331613_84331919
tx.24422	chr12	-	875	3	NNC	ENSMUSG00000021236.17	novel	827	3	NA	NA	6	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTCTTTTTATTGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84455797	84450163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_84450915_84452179_84452250_84455743
tx.24425	chr12	-	939	3	ISM	ENSMUSG00000020962.15	ENSMUST00000021345.14	6064	9	-33	20201	-33	11162	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	931	junction_1	7.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGACACACCAGAAGAGGGCA	1212	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91556816	91542236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_91542566_91553473_91553576_91556308
tx.24427	chr12	+	2566	17	FSM	ENSMUSG00000021012.17	ENSMUST00000110105.10	3514	17	43	905	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	883	junction_12	209.53098667023	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGCTGTTTAATATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98713290	98753107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_98713418_98713738_98713782_98719036_98719152_98722443_98722485_98723267_98723464_98724770_98725201_98725977_98726139_98726568_98726670_98730081_98730238_98740503_98740579_98745366_98745527_98746306_98746540_98749840_98749962_98751174_98751312_98751576_98751666_98751893_98752001_98752833
tx.2443	chr11	+	1142	7	FSM	ENSMUSG00000020381.11	ENSMUST00000020647.10	1142	7	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_2	8.63616427202108	673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTCTTGCTGCTACACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50065675	50090942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_50065779_50067653_50067714_50073318_50073408_50085034_50085111_50087770_50087920_50088445_50088531_50090362
tx.24430	chr12	+	219	2	Intergenic	novelGene_426	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAAGTCATGGTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100183531	100184227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_100183622_100184098
tx.24431	chr12	+	1186	3	NNC	ENSMUSG00000113679.2	novel	4791	4	NA	NA	8	10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGCTCTTTTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100256551	100263662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_100256684_100261887_100261990_100262710
tx.24432	chr12	-	612	3	ISM	ENSMUSG00000021188.15	ENSMUST00000177536.8	1876	11	-11	16015	6	10041	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_2	7	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGCAAGAGCTGGTTTTCG	7554	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101879393	101868493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_101868602_101872013_101872073_101878948
tx.24435	chr12	-	476	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000112954.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGGATTGAAGCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104487245	104484080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_104484399_104487087
tx.24436	chr12	+	2758	2	Intergenic	novelGene_429	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTCTGTCCCCCCAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105043741	105063081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_105043885_105060466
tx.24437	chr12	+	1591	3	Intergenic	novelGene_431	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGGAACGCCTGTTAAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105252475	105288208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_105252666_105253883_105253958_105286881
tx.24438	chr12	-	1126	2	ISM	ENSMUSG00000021263.12	ENSMUST00000021691.6	1287	3	9674	7	-454	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAGTCTATGTGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108658896	108656487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_108656870_108658152
tx.24439	chr12	+	718	3	ISM	ENSMUSG00000097391.9	ENSMUST00000181543.9	1300	8	8682	0	-138	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	20	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCTTGCGTGTCTGTATT	488	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109710096	109715892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_109710282_109714558_109714728_109715528
tx.2444	chr11	-	2002	8	NNC	ENSMUSG00000015837.16	novel	2673	8	NA	NA	0	-3	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	263.494104027287	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCCTGTGATCCGTACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50101618	50090981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_50091775_50093221_50093422_50093640_50093862_50096849_50096931_50097986_50098129_50098233_50098464_50098647_50098744_50101379
tx.24440	chr12	+	1022	5	NIC	ENSMUSG00000021275.17	novel	7778	20	NA	NA	1	469	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	9.39414711402797	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGATTCATTTTTTTAA	5384	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110855698	110893138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_110855761_110881083_110881213_110881780_110881913_110885302_110885461_110892597
tx.24441	chr12	+	706	4	NNC	ENSMUSG00000087075.3	novel	670	4	NA	NA	-65	-39	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.62466929133727	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTACGGGCACCTTCGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111373177	111378485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_111373312_111374958_111375046_111376620_111376778_111378157
tx.24442	chr12	-	1057	2	ISM	ENSMUSG00000001729.15	ENSMUST00000128300.9	1342	12	16333	-847	1742	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	361	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGTGGTTTGCTTTCTGG	7374	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112621665	112620259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_112621212_112621560
tx.24443	chr12	-	566	2	Intergenic	novelGene_442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATGGCCTCGTTAAATATC	9697	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113130437	113129699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_113130119_113130290
tx.24444	chr12	+	879	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000102991.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTTTGAAGTGTTTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114886209	114891324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_114886297_114890168_114890244_114890607
tx.24447	chr15	+	480	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060429.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55735204	55740289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_55735293_55738674_55738854_55740076
tx.24448	chr13	-	890	7	NIC	ENSMUSG00000021156.18	novel	987	10	NA	NA	5	-532	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	10	junction_6	56.2938717801503	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGTAATTCATACATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9815301	9745705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_9745863_9747679_9747773_9748663_9748742_9760181_9760344_9770808_9770969_9785367_9785503_9815196
tx.24449	chr13	+	1283	5	ISM	ENSMUSG00000005397.9	ENSMUST00000222142.2	3803	14	-68	28634	48	-28634	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	695	junction_3	34.889110048839	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGCTCCGTGCATGCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13612183	13647415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_13612512_13638306_13638607_13639894_13640122_13642815_13643193_13647364
tx.2445	chr11	-	1884	8	FSM	ENSMUSG00000015837.16	ENSMUST00000015981.12	2673	8	0	789	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_1	128.516496201532	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCCTGTGATCCGTACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50101618	50090981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_50091775_50093339_50093422_50093640_50093862_50096849_50096931_50097986_50098129_50098233_50098464_50098647_50098744_50101379
tx.24450	chr13	+	2330	9	ISM	ENSMUSG00000039242.11	ENSMUST00000221974.2	2439	13	-4	3574	0	-216	intron_retention	TRUE	canonical	3	178	junction_5	12.5673187275568	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGGCTTGGTTATAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14129205	14170114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_14129505_14140894_14141043_14145351_14145453_14150022_14150220_14155185_14155282_14161937_14162049_14165373_14165453_14165953_14166138_14168999
tx.24451	chr13	+	1388	8	ISM	ENSMUSG00000039242.11	ENSMUST00000221974.2	2439	13	14	7360	14	285	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_5	12.9614813968157	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTATGTTTTAATTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14129223	14166328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_14129505_14140894_14141043_14145351_14145453_14150022_14150220_14155185_14155282_14161937_14162049_14165373_14165453_14165953
tx.24452	chr13	-	963	5	NNC	ENSMUSG00000055313.16	novel	3225	5	NA	NA	0	-5081	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.90512483795333	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACAGGTGAGTGAGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21625228	21612444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_21612549_21614857_21614945_21617560_21617713_21618520_21618842_21624929
tx.24453	chr13	-	1195	5	NIC	ENSMUSG00000063894.16	novel	8805	6	NA	NA	-20	1150	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.39414711402797	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTGCGGTAAAGCCTTC	6578	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21715263	21704850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_21705133_21706393_21706486_21709307_21709477_21710688_21711192_21715114
tx.24454	chr13	+	1495	2	FSM	ENSMUSG00000086796.3	ENSMUST00000138447.2	1482	2	-13	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAACTGTGGAGTGTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25089565	25091263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_25089692_25089894
tx.24455	chr13	-	2104	4	FSM	ENSMUSG00000048978.15	ENSMUST00000057866.13	2222	4	119	-1	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.69967317119759	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGTGTGGTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25453946	25436021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_25437735_25446182_25446383_25452004_25452074_25453824
tx.24456	chr13	+	632	4	NNC	ENSMUSG00000086363.8	novel	682	4	NA	NA	-14	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.471404520791032	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTATCGAGTTATAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29200261	29212781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_29200375_29200692_29200798_29207158_29207196_29212404
tx.24457	chr13	-	2347	5	ISM	ENSMUSG00000006191.18	ENSMUST00000129231.2	694	6	7	-1039	-1	1039	intron_retention	FALSE	canonical	3	9	junction_1	98.2811655405042	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGTATAGAAATGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30039641	30019938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_30021054_30022497_30022686_30030210_30030324_30033921_30034092_30038880
tx.24458	chr13	-	1887	6	ISM	ENSMUSG00000021357.15	ENSMUST00000102946.8	4375	29	93531	1	69062	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_2	13.3176574516692	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTTGTGTTTGTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31040750	30997902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_30999375_31001980_31002041_31004560_31004623_31006614_31006738_31010021_31010078_31040636
tx.24459	chr13	-	438	3	ISM	ENSMUSG00000021357.15	ENSMUST00000220532.2	1441	6	-27	13057	-2	2078	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	115	junction_2	17	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGACTTTATCCTAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31158078	31122098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_31122276_31124592_31124754_31157978
tx.2446	chr11	+	1022	6	ISM	ENSMUSG00000036620.15	ENSMUST00000041725.14	2429	15	7999	0	-689	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	193	junction_5	13.6674796506159	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTGTCTCATAGGTGAAT	4560	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50124160	50125930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_50124211_50124290_50124485_50124909_50124989_50125070_50125159_50125236_50125350_50125432
tx.24460	chr13	-	1401	9	NIC	ENSMUSG00000038372.15	novel	1713	11	NA	NA	-6	-4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_7	29.2529378866465	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACAGAGTTTGCTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32522613	32003565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_32003962_32004124_32004194_32101602_32101700_32124466_32124586_32284339_32284468_32310982_32311088_32311889_32312083_32418335_32418381_32522364
tx.24461	chr13	+	400	3	Intergenic	novelGene_455	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCATGGTGTCTCTTCAAA	6288	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35747750	35750380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_35747866_35749296_35749450_35750248
tx.24462	chr13	+	506	2	NNC	ENSMUSG00000059288.15	novel	3470	10	NA	NA	-2883	115	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	95	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGCAGCCAGCTGTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35922412	36000188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_35922622_35999891
tx.24463	chr13	-	526	3	Intergenic	novelGene_457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATACACTCTCAGAGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40077338	40066114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_40066429_40075600_40075696_40077221
tx.24464	chr13	+	1196	2	NNC	ENSMUSG00000055732.2	novel	3005	2	NA	NA	398	-1910	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAATGTGCTAACACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40857878	40859515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_40858007_40858447
tx.24465	chr13	-	843	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021360.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCAGCTCCATTGTAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41041527	41040246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_41041017_41041454
tx.24469	chr13	+	3671	2	FSM	ENSMUSG00000067586.5	ENSMUST00000087978.5	4463	2	125	667	125	-667	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGGAGGCCTGTGTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51562799	51576166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_51562982_51572677
tx.2447	chr11	+	696	3	ISM	ENSMUSG00000036620.15	ENSMUST00000122977.2	652	4	224	-186	224	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_2	6	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTGTCTCATAGGTGAAT	5473	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50125073	50125930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_50125159_50125236_50125350_50125432
tx.24470	chr13	+	1119	5	ISM	ENSMUSG00000021457.15	ENSMUST00000120135.8	5363	14	283	25901	19	-1448	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_1	6.09815545882523	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTGGAATCATTAGCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52737491	52776927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_52737642_52764831_52765289_52766330_52766492_52774836_52774976_52776715
tx.24471	chr13	+	3664	13	NIC	ENSMUSG00000021457.15	novel	5363	14	NA	NA	-12	-1302	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	43	junction_6	14.4575528127458	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCGTTGTGGCGACTCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52737526	52801516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_52737642_52764831_52765289_52766330_52766492_52774836_52774976_52776715_52776798_52777280_52777313_52785692_52785781_52786923_52787102_52792073_52792284_52794640_52794831_52795900_52796042_52797075_52797189_52799758
tx.24472	chr13	+	1675	9	ISM	ENSMUSG00000005320.10	ENSMUST00000005452.6	3324	18	8802	19	5325	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_5	3.7395688254129	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGTGTGCCTGGTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55309254	55316553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_55309353_55309434_55309557_55313702_55313814_55313908_55314100_55314670_55314794_55314900_55314972_55315212_55315351_55315618_55315725_55315838
tx.24473	chr13	+	1064	3	NIC	ENSMUSG00000021540.17	novel	4534	7	NA	NA	13	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATACAACTAGTCTTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56851493	56881026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_56851626_56871241_56871810_56880662
tx.24474	chr13	-	505	2	Intergenic	novelGene_479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCCTTTCTCATTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57487534	57486798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_57487207_57487437
tx.24475	chr13	-	189	2	ISM	ENSMUSG00000021553.15	ENSMUST00000140760.2	757	4	4	10284	4	-2378	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTGTCCAGTGGGATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58706077	58703496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_58703631_58706022
tx.24476	chr13	-	885	2	NNC	ENSMUSG00000021557.16	novel	3158	2	NA	NA	-3	-2255	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACTTGTAACGCTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59733028	59730244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_59731040_59732938
tx.24477	chr13	+	768	5	NNC	ENSMUSG00000097502.3	novel	1348	3	NA	NA	916	10940	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.22474487139159	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCATTTTTAGAGAGATTT	6329	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59882379	59897939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_59882455_59882560_59882653_59890468_59890620_59891831_59891952_59897609
tx.24478	chr13	+	1886	11	ISM	ENSMUSG00000021470.20	ENSMUST00000067821.13	2743	14	68	15845	11	0	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	89	junction_9	12.0979337078693	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGTTGTTTTCTAAACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63963184	64001624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_63963332_63967444_63967870_63972622_63972743_63982409_63982604_63989237_63989400_63989775_63989984_63992359_63992501_63995154_63995269_63996554_63996675_64000764_64000837_64001441
tx.24479	chr13	-	2121	10	NIC	ENSMUSG00000033114.12	novel	2303	12	NA	NA	0	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_8	36.5817197821839	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTGGTTATGGTTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64277144	64244123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_64245499_64246128_64246212_64247083_64247163_64252546_64252615_64254828_64254922_64256138_64256242_64259329_64259399_64260743_64260816_64270132_64270167_64276999
tx.2448	chr11	-	626	5	NNC	ENSMUSG00000020377.16	novel	649	5	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1.22474487139159	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCTGGGTCTGAGAGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50128471	50127287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_50127540_50127843_50127926_50128020_50128092_50128167_50128268_50128350
tx.24480	chr13	+	1609	3	ISM	ENSMUSG00000097360.9	ENSMUST00000180908.9	1084	4	2	613	2	128	intron_retention	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCATTCATTATATTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67701354	67708738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_67701473_67701692_67701749_67707303
tx.24481	chr13	-	3563	4	FSM	ENSMUSG00000071281.13	ENSMUST00000073157.15	3957	4	5	389	5	-389	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	15.2970585407784	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAAACTGGAGTGAAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67877287	67853816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67857049_67858433_67858530_67858999_67859127_67877179
tx.24482	chr13	+	2411	4	NNC	ENSMUSG00000021608.16	novel	2141	14	NA	NA	-50	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	297.937726528362	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTACAGGCTCGAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73659017	73664535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_73659121_73659418_73659522_73661938_73662081_73662472
tx.24483	chr13	+	862	6	ISM	ENSMUSG00000021610.9	ENSMUST00000022102.9	2340	17	12003	0	-795	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	263	junction_3	12.2539789456323	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTTCTTAACCTCTAAT	406	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73764127	73768724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_73764165_73764933_73764969_73765696_73765753_73765837_73765883_73766520_73766637_73768151
tx.24484	chr13	-	1946	11	ISM	ENSMUSG00000021572.10	ENSMUST00000036456.8	3641	12	19	3398	-19	-2193	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_4	30.0348131340949	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGATATGATGATTACTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74210399	74188016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_74188282_74191624_74191752_74195154_74195352_74197014_74197154_74198178_74198484_74199533_74199741_74200999_74201179_74203001_74203111_74206420_74206614_74207560_74207689_74210302
tx.24485	chr13	-	1097	7	NNC	ENSMUSG00000021597.17	novel	1241	6	NA	NA	-19	-181	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	44.7042752119103	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTAATGTCATGTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77283611	77252919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_77253154_77254094_77254224_77260690_77260854_77273348_77273590_77274483_77274560_77274719_77274834_77283471
tx.24486	chr13	+	1615	5	ISM	ENSMUSG00000064138.15	ENSMUST00000224888.2	3876	6	-26	4817	-7	-4817	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_2	7.34846922834953	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACTCTAATTGTGATTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77856821	77983823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_77856973_77907546_77907649_77909956_77910058_77973441_77973508_77982628
tx.24487	chr13	-	1555	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000094277.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.35702260395516	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTCTGTATTTCCAAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90742264	90614830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_90615443_90622852_90623028_90697212_90697282_90741565
tx.24488	chr13	+	321	3	Intergenic	novelGene_494	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAAACTTCCATGAAAC	9412	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92620585	92622664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_92620645_92621452_92621528_92622477
tx.24489	chr13	-	556	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042043.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCCTACCTTTAAGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95005252	94977607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_94977771_94982789_94982856_94987799_94987975_95005100
tx.2449	chr11	-	641	5	FSM	ENSMUSG00000020377.16	ENSMUST00000102772.4	649	5	19	-11	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	0.82915619758885	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTCTGGGTCTGAGAGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50129340	50127287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_50127540_50127843_50127926_50128020_50128092_50128167_50128268_50129204
tx.24490	chr13	-	572	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042043.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGATGAATATCAGCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95005265	94977621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_94977771_94982789_94982856_94987799_94987992_95005100
tx.24491	chr13	+	1973	2	FSM	ENSMUSG00000041995.9	ENSMUST00000222456.2	650	2	-8	-1315	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGTGTTCTGCTTGCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95463266	95474350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_95463453_95472563
tx.24492	chr13	-	844	5	FSM	ENSMUSG00000021676.11	ENSMUST00000238261.2	632	5	-204	-8	34	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_2	6.44204936336256	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCTTGGACTTGGAAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96028469	95882811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_95883023_95886500_95886579_95899753_95899911_95974331_95974432_96028171
tx.24493	chr13	-	2962	14	NIC	ENSMUSG00000021668.16	novel	4225	15	NA	NA	24	-381	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	11.7920843975045	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCTGAATATTTTTTATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96679063	96617578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_96618763_96618965_96619000_96623352_96623488_96625689_96625787_96627444_96627478_96630336_96630504_96631915_96632041_96633110_96633351_96638026_96638181_96641018_96641151_96644719_96644873_96653146_96653267_96655536_96655696_96678834
tx.24494	chr13	+	1143	4	NNC	ENSMUSG00000021669.16	novel	3054	7	NA	NA	432	-38133	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_3	22.9927524813074	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATGAAGTATGTTACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96679694	96710114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_96679768_96685704_96685840_96708418_96708575_96709335
tx.24495	chr13	+	493	4	NNC	ENSMUSG00000021669.16	novel	3054	7	NA	NA	432	-37160	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	22.9927524813074	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTAAGTCTTAGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96679694	96711087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_96679768_96685704_96685840_96708418_96708536_96710919
tx.24496	chr13	-	2565	6	ISM	ENSMUSG00000021670.15	ENSMUST00000022176.15	4425	20	61	12141	0	-959	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	390	junction_5	38.6025905866433	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGTGATTGATTTGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96807383	96797615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_96799643_96801269_96801355_96802317_96802406_96802620_96802733_96803028_96803217_96807318
tx.24497	chr13	+	986	5	NIC	ENSMUSG00000109561.2	novel	5859	25	NA	NA	31	-40685	intron_retention	FALSE	canonical	2	8	junction_3	2.1650635094611	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGAAAAAAAGTAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96884810	96917244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_96885144_96888491_96888566_96889478_96889589_96910844_96910886_96916816
tx.24498	chr13	-	1272	4	FSM	ENSMUSG00000052485.8	ENSMUST00000064347.8	1161	4	-112	1	-112	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.816496580927726	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTGTGTTCCCATTTTTCT	8940	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98831454	98822743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_98823025_98824855_98824992_98828511_98829226_98831313
tx.24499	chr13	-	1340	14	NNC	ENSMUSG00000041685.17	novel	1927	15	NA	NA	-6	121	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	84.7171416116021	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTTTCATTTAGATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98951696	98888767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_98888854_98891587_98891755_98892065_98892134_98899339_98899365_98900197_98900271_98901012_98901058_98912328_98912426_98913896_98913996_98921283_98921389_98925870_98926024_98926239_98926382_98932800_98932876_98942813_98942906_98951583
tx.245	chr1	-	670	2	ISM	ENSMUSG00000025982.14	ENSMUST00000190175.2	3350	3	2977	1850	2977	-1850	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1607	junction_1	0	267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTGTGTTTTTTGAAT	181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55027297	55026181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_55026652_55027097
tx.2450	chr11	-	3722	15	NNC	ENSMUSG00000020368.16	novel	3779	15	NA	NA	21	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	418	junction_14	996.986871241829	22	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATGTCTGCAGGTTTCTC	8157	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50216479	50185293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_50187163_50187884_50187965_50188100_50188222_50188943_50189064_50189955_50190172_50191724_50191882_50192584_50192699_50195152_50195343_50198296_50198490_50199136_50199219_50199614_50199757_50201198_50201258_50201620_50201695_50202430_50202612_50216355
tx.24500	chr13	+	1879	3	FSM	ENSMUSG00000097848.3	ENSMUST00000224929.2	408	3	-62	-1409	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACGACTGGTCTTTAGCT	6933	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99237206	99244089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_99237334_99239172_99239321_99242485
tx.24501	chr13	+	379	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032621.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACGAAACAGGGTTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103910702	103913213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_103910893_103913024
tx.24502	chr13	-	627	3	FSM	ENSMUSG00000042655.6	ENSMUST00000223913.2	507	3	-120	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTTTGTTTGTTATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104999940	104982333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_104982572_104994796_104994955_104999709
tx.24503	chr13	+	824	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000059751.8	novel	795	1	NA	NA	-23	57	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGTTGTAGCATCTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108807113	108807988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_+_108807876_108807926
tx.24504	chr13	-	1114	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021699.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACACACTAAACACAGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109543295	109522198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_109522959_109535660_109535775_109538876_109538982_109543160
tx.24505	chr13	-	410	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021699.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGACTCACAACACTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109941553	109929776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_109929941_109936968_109937073_109938747_109938826_109941489
tx.24506	chr13	-	1268	5	FSM	ENSMUSG00000021700.11	ENSMUST00000167824.3	8444	5	-32	7208	3	-1209	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110416716	110197928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_110198537_110220663_110220789_110317512_110317632_110397012_110397241_110416528
tx.24507	chr13	+	481	2	NNC	ENSMUSG00000085204.2	novel	467	2	NA	NA	503	4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGCTCTCTATGTTAATA	9085	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111946177	111947577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_111946282_111947200
tx.24508	chr13	-	2572	6	FSM	ENSMUSG00000042258.14	ENSMUST00000036060.13	2516	6	-49	-7	-49	7	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.4	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAATGATTCAGGGTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116446274	116434809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_116436133_116438146_116438315_116439581_116439869_116441753_116442014_116444809_116445000_116445930
tx.24509	chr14	-	1096	6	ISM	ENSMUSG00000017485.12	ENSMUST00000017629.12	10335	36	57442	4683	-565	1951	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_4	27.7733685389439	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTGTGTTCTTAGACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6047142	6038983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_6039465_6040330_6040426_6041163_6041290_6044297_6044409_6045984_6046065_6046939
tx.2451	chr11	-	1565	3	ISM	ENSMUSG00000020368.16	ENSMUST00000146979.2	708	5	2003	-1246	944	-486	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3898	junction_2	74	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTGTGGCTTGTA	NA	False	NA	-53	True	NA	NA	NA	50188202	50185779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_50187163_50187884_50187965_50188100
tx.24510	chr14	-	619	2	NNC	ENSMUSG00000097898.9	novel	824	4	NA	NA	5824	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGACAAATGATATATCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13797503	13796461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_13796943_13797365
tx.24511	chr14	+	1162	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025277.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTGTGTTTTGTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14413540	14415760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_14413861_14414163_14414357_14415111
tx.24512	chr14	+	1453	4	NNC	ENSMUSG00000091617.9	novel	1817	6	NA	NA	-174896	-9966	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGGACAGAATGTATTGT	6976	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14811114	14993445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_14811253_14982611_14982726_14985916_14986068_14992395
tx.24513	chr14	-	597	2	Intergenic	novelGene_241	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGTCCATCCGAATCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17320744	17318766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_17319275_17320655
tx.24514	chr14	+	2001	6	Fusion	ENSMUSG00000079364.4_ENSMUSG00000091617.9	novel	2055	7	NA	NA	-93	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.4	3	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGTGTATGCTTCTGCG	7704	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14901113	15003411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_+_14901354_14917011_14917147_14996664_14996828_14997777_14997910_14998585_14998769_15002263
tx.24515	chr14	-	1209	2	NNC	ENSMUSG00000023243.10	novel	3392	5	NA	NA	4	-18279	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCGTGCACTTAGAAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20231873	20210498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_20211169_20231334
tx.24516	chr14	+	1717	9	NNC	ENSMUSG00000039599.17	novel	4483	8	NA	NA	27	474	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	104.07058902495	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAATAAAATATTTGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20398369	20418609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_20398463_20401379_20401485_20402771_20402908_20406422_20406566_20408091_20408209_20409822_20409985_20413128_20413206_20413330_20413519_20417913
tx.24517	chr14	-	3669	20	NIC	ENSMUSG00000021820.19	novel	1937	22	NA	NA	6	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	2	junction_4	10.4229131778775	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTGTGTTATTGCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20844111	20784943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_20786921_20787326_20787572_20788916_20789012_20789394_20789471_20791445_20791560_20792772_20792822_20794671_20794717_20805726_20805771_20810211_20810255_20810464_20810549_20814213_20814337_20814928_20815024_20815463_20815548_20815979_20816083_20816220_20816294_20820131_20820198_20821074_20821130_20829271_20829332_20842586_20842682_20843968
tx.24518	chr14	+	1239	2	ISM	ENSMUSG00000021770.12	ENSMUST00000144061.2	1613	6	3	17387	3	-17060	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTTTGATTATGAAAAACA	2634	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21800618	21825983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_21800905_21825030
tx.24519	chr14	+	1849	2	ISM	ENSMUSG00000007817.16	ENSMUST00000007961.15	5397	24	202179	7	4616	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGGCACAAGGAAAG	449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25661869	25665136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_25661946_25663363
tx.2452	chr11	-	1657	4	ISM	ENSMUSG00000020368.16	ENSMUST00000146979.2	708	5	1189	-1246	130	-486	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3898	junction_2	119.212229052038	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTGTGGCTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50189016	50185779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_50187163_50187884_50187965_50188100_50188222_50188943
tx.24520	chr14	-	713	4	NNC	ENSMUSG00000114753.2	novel	5711	2	NA	NA	5056	-171	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.55902608401044	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTCTTGGCTTCATTCT	1657	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26041053	26036336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_26036463_26036786_26036931_26040411_26040567_26040765
tx.24521	chr14	+	187	2	Intergenic	novelGene_245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTCATAGAAGAATTGAAA	6082	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26337152	26365263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_26337298_26365221
tx.24522	chr14	+	1495	2	ISM	ENSMUSG00000042323.18	ENSMUST00000090214.11	6212	30	91718	6	33025	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGGACTATTACAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30839185	30841992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30839374_30840685
tx.24523	chr14	+	818	5	NNC	ENSMUSG00000091898.9	novel	721	6	NA	NA	-3167	-14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.707106781186548	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGGTATCTTGCTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30927101	30933672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_30927311_30932016_30932164_30932520_30932636_30933236_30933374_30933462
tx.24524	chr14	-	703	3	ISM	ENSMUSG00000021902.8	ENSMUST00000226310.2	1809	11	11800	-1	777	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_2	13.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGGGTCTCCTTGTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30961174	30959651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_30960111_30960293_30960440_30961076
tx.24525	chr14	-	831	4	NNC	ENSMUSG00000021902.8	novel	2084	11	NA	NA	-190	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	13.0724477007517	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGGGTCTCCTTGTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30962141	30959651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_30960111_30960293_30960440_30961587_30961695_30962022
tx.24526	chr14	+	2018	5	ISM	ENSMUSG00000021901.11	ENSMUST00000190788.7	3855	16	5764	0	-189	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	365	junction_3	16.4012194668567	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTGGTTGCTATCTCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30979258	30981887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30979725_30979837_30979999_30980240_30980334_30980414_30980488_30980662
tx.24527	chr14	+	1607	2	ISM	ENSMUSG00000021900.11	ENSMUST00000090147.7	2324	4	24822	385	24822	-385	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATACTGGCTGGGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31387835	31390151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_31387989_31388697
tx.24528	chr14	+	1518	2	NNC	ENSMUSG00000046005.5	novel	3897	2	NA	NA	23095	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACATTTTGATGTCACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31651579	31653688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_31651729_31652319
tx.24529	chr14	-	2854	12	FSM	ENSMUSG00000021936.15	ENSMUST00000022504.12	2587	12	-10	-257	2	257	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.14655787270487	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTGAAATGATGTCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33169112	33102748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_33104277_33105830_33105909_33108518_33108583_33109128_33109254_33110756_33110940_33112198_33112271_33114898_33115065_33124580_33124720_33124821_33124881_33130004_33130135_33132812_33132982_33168971
tx.2453	chr11	-	2022	6	ISM	ENSMUSG00000020368.16	ENSMUST00000020637.9	3779	15	24674	486	-9	-486	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3898	junction_2	103.758180400391	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTGTGGCTTGTA	9106	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50191826	50185779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_50187163_50187884_50187965_50188100_50188222_50188943_50189064_50189955_50190172_50191724
tx.24530	chr14	-	2917	6	FSM	ENSMUSG00000021936.15	ENSMUST00000130539.8	2811	6	-16	-90	-16	90	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.72763633939717	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGATGTTCTGCAATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33169131	33112804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_33115065_33124580_33124720_33124821_33124881_33130004_33130135_33132812_33132982_33168971
tx.24531	chr14	-	474	3	FSM	ENSMUSG00000021936.15	ENSMUST00000132379.2	1619	3	-33	1178	-32	-1178	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAGTGTTCAAGTTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33169147	33130005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_33130135_33132812_33132982_33168971
tx.24533	chr14	+	1365	5	NNC	ENSMUSG00000094157.8	novel	1239	4	NA	NA	-25213	2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_3	25.0798724079689	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTCACTCTTAAGAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42106953	42147353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_42107078_42132167_42132331_42133285_42133418_42134097_42134279_42146588
tx.24534	chr14	-	1177	3	ISM	ENSMUSG00000115536.2	ENSMUST00000228838.2	1418	4	3309	-3	-2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTCACTCTTAAGAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44549659	44463673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_44464468_44470160_44470264_44549379
tx.24535	chr14	-	546	3	NNC	ENSMUSG00000092165.10	novel	1734	6	NA	NA	-2701	-20378	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGGTGCTTCTCTGCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44868096	44845137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_44845415_44865050_44865195_44867971
tx.24536	chr14	-	1261	5	NIC	ENSMUSG00000021830.15	novel	4069	24	NA	NA	-17	2525	intron_retention	FALSE	canonical	2	4	junction_3	14.5322916293336	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTTTGGCTTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45456899	45448225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_45448696_45450742_45450982_45455227_45455500_45456452_45456507_45456673
tx.24537	chr14	-	814	6	FSM	ENSMUSG00000037580.11	ENSMUST00000089959.7	2775	6	229	1732	229	-1732	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	5.3665631459995	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGAGCTTCCGCTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47426641	47393083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_47393382_47394865_47394951_47396319_47396352_47403932_47403989_47406668_47406779_47426408
tx.24538	chr14	+	382	2	NNC	ENSMUSG00000037536.15	novel	2937	2	NA	NA	7	-47412	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCAGTCTGATGATCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47710066	47716281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_47710175_47716007
tx.2454	chr11	-	3740	15	FSM	ENSMUSG00000020368.16	ENSMUST00000020637.9	3779	15	24	15	24	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	3893	junction_7	208.647160908319	359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAGCAAGAAATGAATACAT	8160	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50216476	50185308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_50187163_50187884_50187965_50188100_50188222_50188943_50189064_50189955_50190172_50191724_50191882_50192584_50192699_50195152_50195343_50198296_50198490_50199136_50199219_50199614_50199757_50201198_50201258_50201620_50201695_50202430_50202612_50216319
tx.24540	chr8	-	436	2	Intergenic	novelGene_365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTTAGCTCCGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129474932	129473043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_129473263_129474715
tx.24541	chr14	-	1879	12	ISM	ENSMUSG00000004558.16	ENSMUST00000004673.15	2099	16	2868	10	-45	2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	127	junction_6	9.90366824101551	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCATTGTTAATCCGGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52148019	52142737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_52143764_52143969_52144022_52144146_52144183_52144405_52144454_52144702_52144755_52145041_52145087_52145524_52145629_52145786_52145844_52146024_52146112_52146330_52146392_52147514_52147578_52147771
tx.24542	chr14	-	1320	8	NIC	ENSMUSG00000060373.16	novel	1683	9	NA	NA	-1	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	633	junction_2	1178.64943464794	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341465	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_52312618_52312711_52312870_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319284_52319361_52321571_52321849_52341345
tx.24543	chr14	-	1348	9	FSM	ENSMUSG00000060373.16	ENSMUST00000227458.2	1683	9	-7	342	-3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	633	junction_2	1099.6436638748	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8743	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341467	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_52312618_52312711_52312870_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319284_52319361_52321571_52321849_52335471_52335498_52341345
tx.24545	chr14	+	1206	2	FSM	ENSMUSG00000094914.6	ENSMUST00000199746.5	340	2	-266	-600	-266	600	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCATTGGTACTTTTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53129376	53130675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_53129689_53129781
tx.24547	chr14	-	849	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000082663.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAGTAAGTACCTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53968737	53963410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_53964162_53968639
tx.24548	chr14	+	613	4	NNC	ENSMUSG00000087666.4	novel	426	2	NA	NA	14	2094	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.24264068711928	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGCCTTAGTCTTTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54032827	54035514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_54032964_54033144_54033246_54034811_54034934_54035260
tx.24549	chr14	-	1172	2	Intergenic	novelGene_269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACAAACAGGTGATGGAAATG	7471	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54173768	54172382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_54173060_54173273
tx.2455	chr11	-	443	4	ISM	ENSMUSG00000020368.16	ENSMUST00000020637.9	3779	15	19	15938	19	-11567	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	4374	junction_3	72.5549600111682	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGACACTGATGATGAAATT	8155	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50216481	50201231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_50201258_50201620_50201695_50202430_50202612_50216319
tx.24550	chr14	+	989	2	ISM	ENSMUSG00000022229.4	ENSMUST00000007340.4	3950	23	-254	22089	-254	-13549	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAACAACTGCTCTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56602270	56603918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_56602747_56603405
tx.24551	chr14	-	2514	7	ISM	ENSMUSG00000064128.9	ENSMUST00000065302.8	4363	17	0	25486	0	19508	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_6	6.9860973050449	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGACTTCGATGATGAAAGA	2392	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56809303	56789703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_56791007_56791116_56791220_56792546_56792659_56796029_56796294_56801409_56801534_56802125_56802625_56809194
tx.24552	chr14	-	3012	9	NNC	ENSMUSG00000040123.18	novel	5351	8	NA	NA	-17	405	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	32.0614644082269	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTATTTTTGTTTTCTTGTG	8887	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57049107	57030379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_57031958_57034060_57034268_57035124_57035288_57036366_57036650_57041605_57041697_57041871_57042321_57043376_57043439_57048196_57048317_57049048
tx.24553	chr14	-	1409	4	ISM	ENSMUSG00000071350.13	ENSMUST00000095775.10	3034	15	28216	-2	-3006	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_1	7.48331477354788	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTTTGTGATTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59650110	59639457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_59639866_59644094_59644184_59646626_59646968_59649539
tx.24555	chr14	-	553	3	ISM	ENSMUSG00000021978.10	ENSMUST00000022550.8	5977	7	30	25753	29	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_2	10.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTTGCGTTTTGTCAGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65335525	65315261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_65315639_65317828_65317925_65335445
tx.24556	chr14	-	617	2	NNC	ENSMUSG00000034248.8	novel	4174	4	NA	NA	35	6855	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTTGTGTGATTTCTTGC	577	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69522526	69501292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_69501564_69522180
tx.24557	chr14	-	1008	4	Intergenic	novelGene_277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.4142135623731	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTGCTTGCTGAAGCAC	2760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70054232	70047622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_70047812_70050860_70051216_70053295_70053439_70053911
tx.24558	chr14	-	290	3	ISM	ENSMUSG00000033712.7	ENSMUST00000035612.7	3725	21	81	14205	81	-14205	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	6.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTATGTTGGGTGCTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70391179	70389821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70389914_70390112_70390207_70391075
tx.24559	chr14	-	1316	6	ISM	ENSMUSG00000033644.6	ENSMUST00000226229.2	962	7	-21	9055	-21	6320	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_4	6.99714227381436	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGGGCCTTCCTGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70666853	70657637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70658200_70658897_70659105_70660076_70660216_70660343_70660432_70663955_70664193_70666770
tx.2456	chr11	-	440	2	ISM	ENSMUSG00000020368.16	ENSMUST00000020637.9	3779	15	26	17033	26	-12662	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	4374	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGCTGGGCTAGAGAGG	8162	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50216474	50202326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_50202612_50216319
tx.24560	chr14	-	1384	6	ISM	ENSMUSG00000033644.6	ENSMUST00000048129.6	4916	23	-11	47724	-11	6308	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_5	25.263412279421	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAACTCAGAATCCTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70666554	70657649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70658200_70658897_70659105_70660076_70660216_70660343_70660432_70663955_70664193_70666391
tx.24561	chr14	+	1076	5	FSM	ENSMUSG00000033595.8	ENSMUST00000226548.2	1001	5	-74	-1	-32	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTGCAGCCATTTGCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70768235	70771169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_70768711_70769507_70769580_70770214_70770287_70770616_70770689_70770784
tx.24562	chr14	-	3289	5	NIC	ENSMUSG00000022100.15	novel	2769	22	NA	NA	12	-18643	intron_retention	FALSE	canonical	3	395	junction_3	24.6411748908204	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTCTTCTTTCCGAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71004056	70936449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_70939226_70940662_70940830_70942103_70942198_70944726_70944874_71003951
tx.24563	chr14	+	1705	4	ISM	ENSMUSG00000022102.14	ENSMUST00000022698.8	1795	5	1049	-3	-526	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2.05480466765633	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGGCCTGTAATGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71012792	71015938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_71013188_71013423_71013512_71014255_71014438_71014898
tx.24564	chr14	-	1606	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000057886.6	novel	552	1	NA	NA	-73	1093	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAACCAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74193064	74191346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_-_74192748_74192859
tx.24569	chr14	+	503	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000022126.7_ENSMUSG00000115512.2	novel	541	1	NA	NA	-37	-520	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAATATTTGACAAGTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103247644	103293489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_103248126_103293467
tx.2457	chr11	+	482	2	Intergenic	novelGene_163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCAGTCTTCTGGTCTGTT	3410	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50216708	50218010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_50216880_50217699
tx.24570	chr14	+	747	2	NNC	ENSMUSG00000115762.2	novel	486	3	NA	NA	39932	-6497	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTGGTTATAATTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103741418	103743558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_103741527_103742919
tx.24571	chr14	+	792	2	ISM	ENSMUSG00000115548.2	ENSMUST00000226670.2	1016	3	5849	81	5849	-81	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAACCTCTAGAACTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105670841	105675069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_105670949_105674384
tx.24572	chr14	+	395	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060143.8	novel	384	1	NA	NA	-1	64964	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGAGAGAGAGAAGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105919260	105984609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_105919616_105984569
tx.24573	chr14	-	615	3	Intergenic	novelGene_290	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTCAAACATCCCTAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107202735	107136785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_107136939_107188815_107188844_107202301
tx.24574	chr14	+	1845	9	NNC	ENSMUSG00000022131.4	novel	1875	9	NA	NA	5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	29	junction_1	53.8678939629164	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTAGCATTTGTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118374574	118400673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_118374753_118377173_118377308_118385496_118385698_118390980_118391162_118391288_118391339_118395308_118395467_118397404_118397597_118398968_118399047_118400000
tx.24575	chr14	+	2413	5	ISM	ENSMUSG00000022131.4	ENSMUST00000022728.4	1875	9	7	7689	7	-7689	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	152	junction_1	14.247806848775	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCAGTGTGTGATCTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118374576	118392984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_118374753_118377148_118377308_118385496_118385698_118390980_118391162_118391288
tx.24576	chr14	-	2083	4	ISM	ENSMUSG00000032849.15	ENSMUST00000226703.2	4592	31	176135	-1123	29169	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	291	junction_1	8.73053390247253	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGATCTGTTTGTTCGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118738208	118720099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_118721853_118727910_118728046_118737377_118737484_118738119
tx.24577	chr14	-	1762	4	Intergenic	novelGene_293	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	4.96655480858378	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGCCTCTACATTTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121035444	121006872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_121008256_121011802_121011957_121029923_121030020_121035315
tx.24578	chr14	+	410	2	Intergenic	novelGene_294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTGCTTTGGTCATGTTG	1821	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121059456	121060301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_121059768_121060202
tx.24579	chr14	-	359	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025555.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTCTTGGTCATGGTGTC	3187	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121300317	121295848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_121295980_121296420_121296549_121300217
tx.2458	chr11	+	2228	14	FSM	ENSMUSG00000007850.17	ENSMUST00000069304.14	2225	14	-2	-1	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	130	junction_1	115.462537790991	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTCTGTCTGTGCTTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50268543	50277355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_50268630_50269117_50269255_50270294_50270451_50270647_50270792_50272285_50272425_50273363_50273543_50273626_50273699_50273754_50273889_50274005_50274142_50274506_50274567_50274657_50274748_50275470_50275564_50275967_50276018_50276603
tx.24580	chr14	-	1543	2	ISM	ENSMUSG00000025558.20	ENSMUST00000211803.2	3667	18	46407	41	38689	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAAACACTGAATGTTTG	4044	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121783449	121779566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_121781038_121783377
tx.24581	chr14	-	1075	4	Fusion	ENSMUSG00000064052.4_ENSMUSG00000115263.2	novel	1284	5	NA	NA	-67	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTTTTACTTTGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122688594	122602649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_-_122603468_122605723_122605770_122624623_122624703_122688462
tx.24582	chr14	-	1218	3	NNC	ENSMUSG00000041625.16	novel	524	4	NA	NA	12550	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTTTGCTGTTGCTGTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123137947	123128282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_123129229_123130859_123131072_123137887
tx.24583	chr14	-	3297	18	NIC	ENSMUSG00000041594.19	novel	3416	18	NA	NA	17	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	23	junction_16	38.2839509410142	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCTTGGTTTCTTTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123220670	123156382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_123157556_123158644_123158715_123163375_123163489_123164963_123165079_123170231_123170374_123170508_123170617_123170739_123170820_123178716_123178849_123179226_123179399_123180566_123180770_123182085_123182251_123182919_123183013_123187900_123188005_123200709_123200798_123209151_123209369_123210581_123210698_123215579_123215699_123220583
tx.24584	chr15	-	668	5	NIC	ENSMUSG00000091119.3	novel	494	6	NA	NA	0	135	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	9	junction_3	10.2316909648406	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTATTTTGATAAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3330678	3309973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_3310232_3310504_3310589_3312299_3312428_3327582_3327689_3330586
tx.24585	chr15	+	870	7	FSM	ENSMUSG00000022155.10	ENSMUST00000226849.2	921	7	186	-135	186	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTGTCTTTGTCCTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4978149	4991689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_4978233_4978454_4978638_4980614_4980771_4981050_4981183_4981660_4981764_4982755_4982822_4991542
tx.24586	chr15	+	970	3	NNC	ENSMUSG00000054263.13	novel	2844	17	NA	NA	-2	556	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGCCTGATTTTTGGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159050	7162690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_7159308_7160381_7160500_7162095
tx.24587	chr15	+	2705	16	NIC	ENSMUSG00000054263.13	novel	2844	17	NA	NA	2	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_15	8.17964954424495	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACATGCGGCACAGGTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159054	7214825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_7159308_7183867_7184029_7186636_7186749_7188871_7189003_7194009_7194174_7196363_7196539_7198492_7198748_7202336_7202467_7202871_7203042_7205040_7205187_7206912_7207076_7207384_7207456_7208279_7208494_7211333_7211514_7214197_7214300_7214547
tx.24588	chr15	+	1298	2	ISM	ENSMUSG00000022142.9	ENSMUST00000230925.2	2419	6	4616	995	2357	793	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	312	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCAGGTGTTGTATATCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8185182	8187313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_8186277_8187109
tx.24589	chr15	-	1972	4	ISM	ENSMUSG00000005360.15	ENSMUST00000157065.2	728	5	-49	361	23	-361	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	21.7460085737335	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTACCCTGCTCCTGATCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8739942	8715860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_8717297_8717771_8717910_8738045_8738324_8739822
tx.2459	chr11	+	1253	7	ISM	ENSMUSG00000007850.17	ENSMUST00000069304.14	2225	14	5271	-1	43	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	385	junction_4	39.3728614939557	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTCTGTCTGTGCTTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50273816	50277355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_50273889_50274005_50274142_50274506_50274567_50274657_50274748_50275470_50275564_50275967_50276018_50276603
tx.24590	chr15	+	498	3	Intergenic	novelGene_520	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAGAAAAGAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8758606	8808537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_8758736_8793647_8793886_8808406
tx.24591	chr15	+	2724	10	ISM	ENSMUSG00000022253.18	ENSMUST00000190591.10	4135	13	14464	728	-76	303	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	112	junction_4	103.130027000558	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTACTTTGTTTTCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9085803	9110251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_9085887_9091254_9091339_9092802_9092940_9096102_9096182_9098897_9098964_9100194_9100291_9103070_9103127_9103413_9103468_9106816_9106941_9108306
tx.24592	chr15	+	1923	8	ISM	ENSMUSG00000039704.9	ENSMUST00000090380.6	3210	18	-117	25896	-2	6086	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	16	junction_6	6.56521445318632	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCCATTAGTATTATTT	30	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9140634	9172035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_9140828_9149062_9149293_9149541_9149640_9151570_9151667_9156292_9156461_9157299_9157511_9165874_9165950_9171183
tx.24593	chr15	-	389	2	NNC	ENSMUSG00000115409.2	novel	1208	4	NA	NA	-6760	-10561	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAAGAACTTTCTGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9268173	9261168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_9261455_9268070
tx.24594	chr15	-	1671	10	FSM	ENSMUSG00000072663.13	ENSMUST00000162780.8	1639	10	-32	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	3.74495545474505	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGGCATTTTATTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9748938	9704394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_9704628_9713186_9713375_9716417_9716607_9717536_9717724_9723679_9723745_9725200_9725342_9727496_9727668_9729702_9729956_9740597_9740701_9748797
tx.24595	chr15	-	353	3	FSM	ENSMUSG00000115076.2	ENSMUST00000228923.2	306	3	-11	-36	-11	36	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGCTGTAAATTGACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11630843	11626452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_11626641_11627138_11627182_11630721
tx.24596	chr15	+	559	3	Intergenic	novelGene_522	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGTTATTAAAGTAGGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12020093	12021603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_12020206_12020280_12020397_12021272
tx.24597	chr15	-	1790	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040452.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTGCACAACATGGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20746178	20744181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_20745788_20745994
tx.24598	chr15	+	1306	2	NIC	ENSMUSG00000115317.2	novel	1334	4	NA	NA	105	-2	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTGTGTGTCAGTGTCT	208	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32779154	32796150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_32779577_32795266
tx.24599	chr15	+	3757	20	NNC	ENSMUSG00000037646.11	novel	4568	29	NA	NA	0	-72444	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	8	junction_19	14.5875900659951	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATAGTCAACATTTATTCT	149	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35371694	35570654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_35371924_35372078_35372254_35379034_35379179_35417656_35417778_35422453_35422622_35423261_35423444_35430255_35430431_35438858_35439125_35445715_35445812_35446183_35446307_35446768_35446907_35447830_35447919_35448675_35448868_35452243_35452414_35455102_35455298_35456760_35456886_35472028_35472211_35533441_35533577_35534332_35534507_35569975
tx.246	chr1	-	1556	11	ISM	ENSMUSG00000025982.14	ENSMUST00000027127.14	6195	25	47	17986	30	-4	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	1138	junction_7	128.097970319596	1450	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAATGAAGTTGCTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55066593	55042313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_55042365_55042451_55042650_55044960_55045083_55045329_55045543_55046638_55046877_55051260_55051432_55053641_55053722_55055534_55055650_55055937_55056043_55058392_55058560_55066497
tx.2460	chr11	-	2376	18	FSM	ENSMUSG00000020375.10	ENSMUST00000020643.4	2688	18	310	2	310	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_10	7.873128931343	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTGCTGGCCTCCAGCTTG	4459	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50321642	50280114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_50280786_50281120_50281199_50282845_50282895_50285747_50285843_50288470_50288601_50289197_50289318_50292264_50292363_50295280_50295449_50297193_50297311_50298649_50298752_50301392_50301463_50305343_50305410_50307066_50307129_50308010_50308135_50310447_50310550_50311203_50311322_50312456_50312631_50321610
tx.24600	chr15	-	2264	2	ISM	ENSMUSG00000022280.10	ENSMUST00000022890.10	4277	10	38930	0	38881	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTGTGTGCCCAGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36244363	36240078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_36242212_36244232
tx.24601	chr15	-	2588	4	ISM	ENSMUSG00000022280.10	ENSMUST00000022890.10	4277	10	35929	0	35880	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	142	junction_2	8.64098759787715	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTGTGTGCCCAGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36247364	36240078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_36242212_36244232_36244377_36245561_36245776_36247267
tx.24602	chr15	-	2138	14	FSM	ENSMUSG00000013611.15	ENSMUST00000013755.12	2696	14	-32	590	-32	-240	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_13	8.19438399112971	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCTCGCCAATTTGAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36555750	36504797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_36505617_36507844_36507902_36517744_36517823_36523588_36523703_36525719_36525924_36527830_36527924_36530919_36530990_36534560_36534649_36537653_36537745_36539442_36539554_36545694_36545760_36546925_36547041_36555404_36555480_36555592
tx.24603	chr15	-	321	2	Intergenic	novelGene_533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCTGGTGCTCACTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36728086	36726157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_36726351_36727958
tx.24604	chr15	+	605	3	Intergenic	novelGene_535	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCCGTTGTATAGCTGGTAC	25	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36726347	36731109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_36726442_36728926_36729004_36730675
tx.24605	chr15	+	762	2	Intergenic	novelGene_536	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCGTTGTATAGCTGGTA	17	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36726883	36731108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_36727213_36730675
tx.24606	chr15	-	622	2	ISM	ENSMUSG00000115307.2	ENSMUST00000227099.2	638	3	1229	-1	1229	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTACAGTCTCTGATTGCT	977	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38254325	38239944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_38240215_38253973
tx.24607	chr15	-	4272	13	NNC	ENSMUSG00000037458.16	novel	4217	13	NA	NA	0	51	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	196.59151106348	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTTTGTGTATATTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38519510	38488430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_38490717_38491719_38491935_38492487_38492601_38493717_38493881_38494535_38494611_38495516_38495599_38497507_38497643_38498912_38499086_38500541_38500716_38501647_38501845_38507426_38507591_38514716_38514854_38519152
tx.24608	chr15	-	2328	7	FSM	ENSMUSG00000022299.10	ENSMUST00000227323.2	979	7	-62	-1287	-19	186	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	37.5307281511504	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGTTTGCTATAATATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38976130	38958176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_38959504_38960914_38961061_38961523_38961593_38963267_38963429_38965377_38965464_38969226_38969378_38975742
tx.24609	chr15	+	673	2	Intergenic	novelGene_541	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCACATCTAGAAACAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39585269	39588968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_39585678_39588703
tx.2461	chr11	-	783	7	ISM	ENSMUSG00000020375.10	ENSMUST00000129304.2	809	9	-59	6607	-59	-6607	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_6	15.9103390563774	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGCTCACTCCTCGCCAGT	746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50312877	50305341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_50305410_50307066_50307129_50308010_50308135_50310447_50310550_50311203_50311322_50312456_50312631_50312742
tx.24610	chr15	+	696	3	NNC	ENSMUSG00000094112.3	novel	2053	4	NA	NA	-30	8337	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAAGCATTTCAAGTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39997730	40021743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_39997784_40008214_40008366_40021251
tx.24611	chr15	+	2416	6	ISM	ENSMUSG00000022307.17	ENSMUST00000022918.15	4239	15	59160	-1	-1549	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_1	105.837611462088	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTTGGATTTTTTCAAT	1413	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41712070	41724444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_41712147_41713854_41713981_41714770_41714924_41716717_41716814_41718316_41718391_41722553
tx.24612	chr15	-	1266	6	NNC	ENSMUSG00000058656.14	novel	9019	5	NA	NA	46	17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.26491106406735	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCTTTTTAAGTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53765880	53324999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_53325613_53337720_53337808_53521745_53521887_53583010_53583141_53723499_53723679_53765764
tx.24613	chr15	-	1531	3	Intergenic	novelGene_556	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAATTTATTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57840441	57837903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_57838339_57839244_57839652_57839752
tx.24615	chr15	+	1597	2	FSM	ENSMUSG00000022346.18	ENSMUST00000160009.2	1765	2	282	-114	282	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAACTTGTGTTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61859552	61862216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_61860128_61861194
tx.24618	chr15	-	392	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000083380.2	novel	390	1	NA	NA	-24	62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGCTACTTCAGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73681769	73681293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_73681563_73681646
tx.2462	chr11	-	2101	6	FSM	ENSMUSG00000048728.16	ENSMUST00000163301.8	2090	6	-9	-2	-9	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	3.42928563989645	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTTGTTTCTTTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50778337	50763544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_50765115_50768869_50768933_50774010_50774104_50774511_50774639_50777195_50777326_50778219
tx.24621	chr15	+	1145	3	FSM	ENSMUSG00000099034.8	ENSMUST00000183928.8	1459	3	313	1	-33	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGATGGAGTCTGTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75514290	75519285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_75514361_75517197_75517294_75518306
tx.24622	chr15	+	970	2	NNC	ENSMUSG00000099034.8	novel	530	2	NA	NA	-6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTTGTTTGTCTTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75514317	75516328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_75514361_75515401
tx.24623	chr15	+	575	5	ISM	ENSMUSG00000022558.17	ENSMUST00000161683.8	4260	25	24003	0	89	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	112	junction_2	14.1133801762724	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGGTGACATTGTATCAAT	4577	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76336102	76337238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_76336161_76336243_76336379_76336446_76336550_76336627_76336694_76337025
tx.24624	chr15	-	1217	2	NIC	ENSMUSG00000116376.2	novel	945	5	NA	NA	400	3	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGAGGTTTCCTGTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76418731	76417409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_76418457_76418561
tx.24625	chr15	+	2546	10	ISM	ENSMUSG00000033819.17	ENSMUST00000135388.3	2827	12	18521	2	-239	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_3	12.1817511765918	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCTTCCCATGTGTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76574367	76579117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_76575353_76575896_76575968_76576054_76576201_76577036_76577141_76577213_76577339_76577426_76577553_76577638_76577715_76577794_76577925_76578067_76578231_76578497
tx.2463	chr11	-	3094	6	NNC	ENSMUSG00000049321.18	novel	3069	6	NA	NA	-6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	29	junction_5	19.4668949758301	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTTGGTCATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50806998	50789538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_50792119_50796916_50796985_50801262_50801353_50801532_50801704_50803106_50803229_50806935
tx.24634	chr15	-	1768	8	FSM	ENSMUSG00000033055.13	ENSMUST00000040676.11	1904	8	130	6	81	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_6	6.03391773769796	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGTTGTTGTTTTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78946955	78937299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_78938285_78938695_78938804_78939491_78939617_78939694_78939743_78940213_78940286_78942154_78942254_78945363_78945412_78946672
tx.24637	chr15	-	1543	6	FSM	ENSMUSG00000053411.17	ENSMUST00000109615.8	710	6	-5	-828	-5	828	multi-exon	FALSE	canonical	3	216	junction_5	106.136892737634	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGGTCCTGATTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79816746	79801482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79802678_79802953_79803027_79805572_79805640_79807672_79807739_79814786_79814831_79816648
tx.24638	chr15	+	1177	3	Intergenic	novelGene_571	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTGCCTCTTTCGACCAG	9593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79856620	79878349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_79856837_79873451_79873597_79877533
tx.24639	chr15	-	2601	16	FSM	ENSMUSG00000054277.9	ENSMUST00000067215.9	2619	16	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_9	11.3927852413515	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACGGTTGCCTGTGTTGTCA	3543	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83234430	83183939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83184904_83187303_83187426_83191081_83191173_83192253_83192378_83194450_83194586_83197669_83197814_83198540_83198670_83206774_83206915_83208304_83208352_83211805_83211866_83214719_83214808_83216886_83216971_83218678_83218811_83220854_83220928_83227222_83227342_83234281
tx.2464	chr11	-	2663	6	NNC	ENSMUSG00000049321.18	novel	501	6	NA	NA	-21	-58	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_3	22.9120055865915	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATATCTTTGTGTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50807013	50789943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_50792119_50796916_50796985_50801262_50801353_50801576_50801704_50803106_50803232_50806935
tx.24640	chr15	-	381	2	NNC	ENSMUSG00000100967.2	novel	8038	2	NA	NA	-3160	-5419	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTTGGTCATGGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84807399	84800057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_84800307_84807267
tx.24641	chr15	+	2106	5	ISM	ENSMUSG00000051864.11	ENSMUST00000063414.9	3229	13	137190	0	116144	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_4	8.95474734428616	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCTTTTTATTGCATT	971	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86235849	86382704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_86235965_86250805_86250882_86275277_86275406_86333392_86333489_86381013
tx.24642	chr15	-	2932	4	Intergenic	novelGene_575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGTGAATGCCATTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87785218	87781462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_87783440_87783846_87783896_87784027_87784246_87784530
tx.24643	chr15	-	428	2	NNC	ENSMUSG00000093394.2	novel	1234	2	NA	NA	-1500	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACAGAGGAGAGACCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88777228	88774698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_88775099_88777200
tx.24644	chr15	+	1155	3	ISM	ENSMUSG00000015365.16	ENSMUST00000156949.2	845	5	2	5866	2	-5866	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_2	9	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTGCTTGTGTCATTTG	2909	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88867113	88873408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_88867265_88869717_88869903_88872589
tx.24645	chr15	+	654	4	ISM	ENSMUSG00000015365.16	ENSMUST00000015509.11	4052	27	70438	-5	29819	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	3.77123616632825	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTCTCAGAATGCACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88937634	88939360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_88937689_88938429_88938568_88938713_88938834_88939018
tx.24646	chr15	-	2416	12	FSM	ENSMUSG00000053137.8	ENSMUST00000088823.5	2461	12	50	-5	50	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_8	5.74096487412616	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTCTGGATCCCATTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89033781	89026684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_89028021_89028343_89028518_89028595_89028675_89029298_89029379_89029577_89029650_89030004_89030120_89030205_89030254_89030341_89030372_89030474_89030587_89030673_89030733_89030911_89031042_89033600
tx.24647	chr15	-	2096	19	NIC	ENSMUSG00000015377.11	novel	4585	20	NA	NA	4	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	70	junction_7	13.724358808023	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGTCCCTGACTATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89080664	89069014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_89069313_89069394_89069470_89069564_89069668_89069740_89069851_89070196_89070251_89070374_89070465_89070565_89070631_89070956_89071023_89071158_89071447_89071534_89071658_89072355_89072412_89072661_89072725_89072813_89072894_89072976_89073083_89073639_89073721_89074443_89074557_89075076_89075120_89075192_89075232_89080421
tx.24648	chr15	-	1954	20	NIC	ENSMUSG00000015377.11	novel	4585	20	NA	NA	-5	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	8	junction_9	23.4946802489415	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTGGTCCCTGACTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89080673	89069016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_89069313_89069394_89069470_89069564_89069668_89069740_89069851_89070196_89070251_89070374_89070465_89070565_89070631_89070956_89071023_89071158_89071202_89071350_89071447_89071534_89071658_89072355_89072412_89072661_89072725_89072813_89072894_89072976_89073083_89073639_89073721_89074443_89074557_89075076_89075120_89075192_89075232_89080421
tx.24649	chr15	-	1600	9	NNC	ENSMUSG00000022621.17	novel	1640	9	NA	NA	2	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_3	16.755596080116	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGGGTCTCAGTTACCTT	1357	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89476087	89466733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_89467634_89467801_89467886_89468112_89468208_89468481_89468594_89470461_89470542_89471116_89471197_89472390_89472421_89474475_89474630_89476022
tx.2465	chr11	-	559	5	ISM	ENSMUSG00000049321.18	ENSMUST00000109128.8	2782	7	5	6931	5	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	26.0516314268416	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTTCTTTAATGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50806987	50796816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_50796985_50801262_50801353_50801576_50801704_50803106_50803229_50806935
tx.24650	chr15	+	316	3	NNC	ENSMUSG00000097068.3	novel	1619	4	NA	NA	11	-13175	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAGAAAGAAAGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92242250	92262809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_92242465_92261664_92261734_92262776
tx.24651	chr15	+	1932	4	NNC	ENSMUSG00000097068.3	novel	1619	4	NA	NA	11	-11174	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTGTGTTTATTTACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92242250	92264810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_92242465_92261664_92261734_92262776_92262994_92263378
tx.24652	chr15	+	1353	6	NIC	ENSMUSG00000036167.17	novel	3351	9	NA	NA	-19	321	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	13	junction_4	63.5282614274938	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGTTATTTGAATTGCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296258	93387616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_93296343_93308572_93308665_93321894_93321957_93339381_93339594_93362985_93363127_93386854
tx.24653	chr15	-	1042	3	Intergenic	novelGene_580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGATAGTAGTCTGTTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96184529	96177284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_96177875_96183896_96184045_96184225
tx.24654	chr15	-	641	3	Intergenic	novelGene_582	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTATCTATCCCACTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96983854	96967940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_96968444_96980507_96980562_96983770
tx.24655	chr15	+	1300	2	Intergenic	novelGene_591	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGCCTCTAACCCGAAAGCC	3824	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97365099	97367879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_97365252_97366731
tx.24656	chr15	-	1369	6	ISM	ENSMUSG00000033075.18	ENSMUST00000180657.2	3806	19	106	33801	106	9508	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_5	49.7489698385806	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTCTTACTAGCTACAGT	6567	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97991026	97973414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_97973862_97974430_97974591_97980123_97980209_97982850_97982982_97984966_97985015_97990528
tx.24657	chr15	+	591	4	Fusion	ENSMUSG00000022993.8_ENSMUSG00000091050.2	novel	2147	2	NA	NA	501	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCACTTTTGCATCCTGGGT	9318	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98465705	98487465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr15_+_98465856_98483150_98483274_98486433_98486579_98487292
tx.24658	chr15	+	1255	9	FSM	ENSMUSG00000023484.15	ENSMUST00000024249.5	1757	9	502	0	-287	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	6.35290287978653	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTACTGTGTTGGTCTG	501	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98953563	98956854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_98953645_98953984_98954046_98954221_98954318_98954649_98954818_98954913_98955040_98955138_98955360_98955448_98955499_98955696_98955777_98956482
tx.24659	chr15	-	2949	2	FSM	ENSMUSG00000023022.15	ENSMUST00000172119.2	506	2	326	-2769	326	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1088	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCAGTGTCCACACTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99681528	99676350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_99679172_99681400
tx.2466	chr11	-	611	5	ISM	ENSMUSG00000049321.18	ENSMUST00000116378.8	3069	6	-26	7278	-3	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_4	20.1308221391974	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTTCTTTAATGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50806995	50796816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_50796985_50801262_50801353_50801532_50801704_50803106_50803229_50806935
tx.24660	chr15	+	2804	3	ISM	ENSMUSG00000023025.17	ENSMUST00000231128.2	643	5	4350	-2405	4350	337	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	552	junction_2	63	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACTTGATAAGGATTAGAA	2541	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99905487	99912229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99905610_99908172_99908342_99909716
tx.24661	chr15	-	179	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000058655.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTTGCCACACATTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101987391	101985570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_101985731_101987372
tx.24663	chr16	-	2066	6	NNC	ENSMUSG00000022519.15	novel	5000	7	NA	NA	26995	-1737	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_5	11.1821285987955	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGAATCTTCTCCATGT	6778	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4313932	4299828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_4301149_4304140_4304375_4305356_4305474_4310157_4310254_4311642_4311745_4313735
tx.24668	chr16	+	815	6	ISM	ENSMUSG00000071669.15	ENSMUST00000096273.9	1622	14	225808	-1	184148	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	4	junction_3	2.92574776766556	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGCTGGGTCTCTGTCCTT	2010	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11449319	11573337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_11449439_11473999_11474056_11478409_11478492_11532777_11532919_11556157_11556298_11573060
tx.2467	chr11	-	617	5	NIC	ENSMUSG00000049321.18	novel	1407	5	NA	NA	-6	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	36	junction_4	17.9356488591854	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTTCTTTAATGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50806998	50796816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_50796985_50801262_50801353_50801532_50801704_50803106_50803232_50806935
tx.24671	chr16	+	645	4	NNC	ENSMUSG00000009569.15	novel	667	5	NA	NA	-4	5091	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	25.0377492776186	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTTTGCCTCAATATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13074365	13155877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_13074419_13082942_13083004_13144245_13144436_13155536
tx.24672	chr16	+	1514	2	NNC	ENSMUSG00000022679.14	novel	3089	4	NA	NA	23	-40965	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTATTGTCCTCCGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13721047	13723744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_13721145_13722327
tx.24673	chr16	+	2966	4	NNC	ENSMUSG00000022679.14	novel	3089	4	NA	NA	-10407	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	92.5250716772967	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGATGCAGAACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13748086	13767234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_13748333_13762529_13762601_13764421_13764452_13764615
tx.24675	chr16	-	2402	11	FSM	ENSMUSG00000022783.12	ENSMUST00000023468.6	2416	11	14	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.24722050542442	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGAATGGTCCCTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16647163	16570879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_16571742_16580885_16581032_16584832_16584950_16595186_16595379_16598484_16598638_16599608_16599783_16601598_16601805_16605078_16605263_16610360_16610528_16646883_16646980_16647058
tx.24676	chr16	+	834	5	ISM	ENSMUSG00000063358.18	ENSMUST00000115731.10	1747	8	62	12782	62	-936	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	618	junction_2	17.2264331769522	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGTAGTGTAAAGTAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16801492	16844122	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_16801604_16833761_16833945_16836149_16836340_16841315_16841433_16843889
tx.2468	chr11	-	872	4	NNC	ENSMUSG00000086646.8	novel	937	5	NA	NA	5308	15813	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	9.03081145609604	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGTTGCAGTTTCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51105045	51064846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_51065022_51080756_51081139_51089402_51089544_51104871
tx.24680	chr16	+	3027	15	ISM	ENSMUSG00000118669.2	ENSMUST00000239547.1	4232	17	4925	705	-2432	110	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	221	junction_5	27.3335407325797	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGTCTTCTGCCTTGGC	1418	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18215405	18225116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_18215692_18216576_18217077_18217711_18217896_18218405_18218524_18218834_18219004_18220316_18220389_18221357_18221486_18221649_18221801_18222075_18222275_18222377_18222490_18222583_18222672_18222884_18222939_18223209_18223296_18223851_18223972_18224356
tx.24688	chr16	-	1295	7	ISM	ENSMUSG00000022538.21	ENSMUST00000143170.9	2272	14	16248	-2	-3232	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	298	junction_4	71.4912582068605	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGATATTCTTATTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30390159	30380186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_30380681_30383463_30383638_30384247_30384328_30386528_30386653_30387922_30388067_30388146_30388249_30389982
tx.24689	chr16	-	2277	14	FSM	ENSMUSG00000022538.21	ENSMUST00000117363.9	3180	14	28	875	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	298	junction_4	64.525303508774	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGATATTCTTATTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30406382	30380186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_30380681_30383463_30383638_30384247_30384328_30386528_30386653_30387922_30388067_30388146_30388249_30389982_30390355_30392010_30392188_30393363_30393425_30399776_30399864_30400873_30400961_30401348_30401470_30404371_30404499_30406255
tx.2469	chr11	-	804	3	ISM	ENSMUSG00000086646.8	ENSMUST00000143209.8	937	5	6200	-10	5308	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_2	4.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTATGTGTGTTGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51105045	51080649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_51081139_51089402_51089544_51104871
tx.24693	chr16	-	862	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022807.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.29903810567666	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCAGCCACAGACATAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33071684	33063124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_33063607_33064328_33064499_33065136_33065244_33066695_33066759_33071644
tx.24694	chr16	+	1650	9	NNC	ENSMUSG00000022811.18	novel	9830	9	NA	NA	3	-2333	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_8	48.2077211139461	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCTTCAAGGGCATACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33201235	33322400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_33201398_33241690_33241773_33247563_33247700_33254995_33255345_33277245_33277372_33287224_33287349_33288469_33288554_33315714_33315834_33321932
tx.24695	chr16	+	895	5	NNC	ENSMUSG00000035506.17	novel	2656	14	NA	NA	134	-80127	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	23.983066943158	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATGTCCATGTGATGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33337831	33364845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_33337866_33338649_33338747_33355233_33355381_33361221_33361414_33364420
tx.24697	chr16	+	1204	3	NIC	ENSMUSG00000022803.13	novel	356	2	NA	NA	-46	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTCCCTTCAACTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38192313	38198578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_38192397_38194180_38194740_38198016
tx.24698	chr16	+	1144	3	ISM	ENSMUSG00000022793.18	ENSMUST00000114710.8	837	4	2370	-567	214	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	4	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCTTGGTCTTGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38583466	38589211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_38583554_38586276_38586382_38588259
tx.24699	chr16	-	1798	3	NNC	ENSMUSG00000036304.15	novel	5751	5	NA	NA	36	-5108	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_2	10	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTCTGCTGCTGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43800118	43794616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_43796109_43799270_43799441_43799982
tx.247	chr1	-	2260	12	NNC	ENSMUSG00000025980.15	novel	2423	12	NA	NA	167	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1850.97436034231	3064	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTGTGTTACCCTTTC	4622	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55127016	55116993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_55117600_55117687_55117867_55118214_55118390_55119260_55119507_55120231_55120332_55120818_55120988_55121216_55121311_55122221_55122322_55122883_55122967_55123691_55123945_55125924_55126101_55126937
tx.2470	chr11	-	970	5	FSM	ENSMUSG00000086646.8	ENSMUST00000143209.8	937	5	-27	-6	-27	6	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_3	6.29980158417708	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGATTCTGTATGTGTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51111272	51080653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_51081139_51089402_51089544_51104871_51105042_51110284_51110381_51111194
tx.24700	chr16	-	1626	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036208.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTGTCTGATCCTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44544888	44539462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_44540791_44544084_44544172_44544677
tx.24701	chr16	-	2061	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000048087.7	novel	2093	1	NA	NA	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATAAAAAAAAATAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45975440	45973343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr16_-_45975121_45975156
tx.24702	chr16	-	1297	3	NNC	ENSMUSG00000075033.5	novel	6436	6	NA	NA	-107	-25636	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTTTTTTTTTTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55715755	55685951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_55686914_55710944_55711175_55715650
tx.24703	chr16	-	1902	3	ISM	ENSMUSG00000022749.9	ENSMUST00000023431.8	3690	18	58353	0	5105	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_1	10	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGCCCTGGAGGATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56993514	56989224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_56990804_56991985_56992181_56993386
tx.24704	chr16	-	607	3	FSM	ENSMUSG00000022747.18	ENSMUST00000145283.2	810	3	203	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAGTCGTTACATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58343918	58323223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_58323610_58327810_58327978_58343864
tx.24705	chr16	+	2015	3	ISM	ENSMUSG00000022742.7	ENSMUST00000060077.7	3097	7	4981	-5	1137	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	169	junction_2	21	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGTTTCCTTTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58495635	58500754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_58495824_58498307_58498413_58499032
tx.24706	chr16	+	482	2	ISM	ENSMUSG00000053414.9	ENSMUST00000065856.8	5393	11	447	66815	447	-49286	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCGCAGATACATCCGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90183347	90229626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_90183605_90229401
tx.24707	chr16	-	889	2	Intergenic	novelGene_621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCATTTCTTTGTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91145784	91130919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_91131558_91145533
tx.24708	chr16	+	1208	2	Intergenic	novelGene_623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGGCTTGGCTTCATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92007308	92010000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_92007559_92009042
tx.24709	chr16	-	948	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116947.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTGGGGTGGGGAAGAGT	1385	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93815011	93811730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_93811966_93812284_93812391_93814404
tx.2471	chr11	-	540	4	NIC	ENSMUSG00000086646.8	novel	937	5	NA	NA	-26	165	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	10	junction_2	7.11805216802087	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGAGGAAGTCTTTAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51111271	51080912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_51081139_51089402_51089544_51110284_51110381_51111194
tx.24710	chr16	+	3852	3	ISM	ENSMUSG00000022897.16	ENSMUST00000023614.5	5754	12	114192	453	16203	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	142	junction_1	17	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTGGTTTTTAAAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94485957	94495923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_94486201_94487337_94487463_94492439
tx.24711	chr16	+	1756	8	FSM	ENSMUSG00000000159.17	ENSMUST00000081093.10	1554	8	-202	0	-76	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.04978131833565	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTTGTATTATCTTTTTC	6113	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96162791	96205231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_96163045_96165206_96165285_96174029_96174348_96187685_96187827_96192219_96192245_96197568_96197670_96199090_96199165_96204465
tx.24712	chr16	-	3429	2	NIC	ENSMUSG00000046962.17	novel	6010	3	NA	NA	0	-10	intron_retention	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTTTGAATTTTAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97763821	97750973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_97754294_97763712
tx.24713	chr16	-	645	2	FSM	ENSMUSG00000097874.4	ENSMUST00000183627.2	524	2	-57	-64	-57	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACCACTCAGTCTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97798225	97795798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_97796344_97798125
tx.24714	chr16	-	786	2	NNC	ENSMUSG00000097874.4	novel	720	2	NA	NA	-80	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACCACTCAGTCTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97798699	97795798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_97796344_97798458
tx.24715	chr17	+	1023	3	Intergenic	novelGene_631	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATCACTATAGTAGAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4958596	4963743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_4959075_4961921_4962148_4963424
tx.24716	chr17	-	624	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068120.5	novel	441	1	NA	NA	-60	168	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCACCATCCTGGGCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5866975	5866306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_-_5866393_5866437
tx.24717	chr17	+	3280	18	NNC	ENSMUSG00000002365.11	novel	3331	18	NA	NA	34	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	60.7811321115463	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGCAGATTCCCAAAGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5891660	5982231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_5891822_5937271_5937359_5940349_5940425_5942048_5942175_5949601_5949771_5952638_5952790_5955163_5955249_5958628_5958755_5958856_5958975_5968654_5968790_5970345_5970450_5970844_5970949_5972404_5972483_5974879_5974957_5976346_5976437_5977480_5977596_5978479_5978572_5980844
tx.24719	chr17	-	614	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000006818.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTACGTTTTGAGGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13261281	13257399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_13257758_13261025
tx.2472	chr11	-	334	3	NNC	ENSMUSG00000086646.8	novel	937	5	NA	NA	-5	-28015	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	11	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCACAGTCATGGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51111250	51109092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_51109275_51110284_51110381_51111194
tx.24720	chr17	-	554	4	Intergenic	novelGene_637	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCTAGATCAGCACTTC	2033	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13681471	13673776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_13673973_13678952_13679101_13679236_13679350_13681374
tx.24721	chr17	-	1135	3	ISM	ENSMUSG00000116780.2	ENSMUST00000097399.6	712	4	14	2753	14	-2753	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_1	6.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAATTGTGCTGGCTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15199038	15187256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_15187964_15190648_15190856_15198817
tx.2473	chr11	-	645	2	ISM	ENSMUSG00000045942.14	ENSMUST00000231433.2	855	4	1667	-146	1667	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCTGCCTCATTTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51145424	51144473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_51144880_51145185
tx.2474	chr11	+	387	2	FSM	ENSMUSG00000020385.17	ENSMUST00000133200.2	442	2	-16	71	-4	-71	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAACAATATCATAGGCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51153972	51158260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_51154097_51157997
tx.24740	chr17	+	1228	4	ISM	ENSMUSG00000040276.16	ENSMUST00000114872.9	972	6	257	-15	257	-6	intron_retention	FALSE	canonical	3	43	junction_3	6.64997911442	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAAGAAATACGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27924879	27927645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_27925067_27925967_27926089_27926192_27926321_27926853
tx.24741	chr17	-	1216	4	ISM	ENSMUSG00000024215.15	ENSMUST00000025054.10	1921	6	10510	94	-94	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.05480466765633	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCTCCAGTGTCTGGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27937417	27933419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_27934021_27936142_27936290_27936391_27936440_27936997
tx.24742	chr17	+	621	2	Intergenic	novelGene_643	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTGGCCTATTTGGGAC	354	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28300579	28301364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_28300853_28301016
tx.24743	chr17	+	3212	12	FSM	ENSMUSG00000053436.16	ENSMUST00000062694.16	3548	12	336	0	-62	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	310	junction_9	36.7805643969117	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTTTCTCAGGTTTATT	5413	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28910651	28967379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_28910830_28932747_28932878_28934356_28934416_28943717_28943830_28944466_28944497_28944770_28944819_28947330_28947446_28947877_28947950_28955984_28956065_28960761_28960841_28963956_28964131_28965244
tx.24744	chr17	+	694	3	ISM	ENSMUSG00000033826.11	ENSMUST00000235567.2	1174	4	1449	-18	1449	18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTCCCATATCACTATTCAC	5038	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31074937	31094256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_31075069_31090285_31090408_31093815
tx.24745	chr17	+	527	2	NNC	ENSMUSG00000033826.11	novel	14583	93	NA	NA	19958	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTGCTCGCCTGTCTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31093446	31094238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_31093551_31093815
tx.24746	chr17	-	762	4	FSM	ENSMUSG00000024028.8	ENSMUST00000024826.8	584	4	-183	5	-183	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAATTTTTATTTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31363439	31360027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_31360197_31361175_31361323_31362087_31362238_31363143
tx.24747	chr17	-	200	2	Intergenic	novelGene_648	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCTAGTCAAGTTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31916398	31861690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_31861867_31916374
tx.24748	chr17	-	924	4	ISM	ENSMUSG00000024325.9	ENSMUST00000025183.9	2034	7	25	1916	-3	1483	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_1	3.55902608401044	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGAGTGTTTGTTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34243629	34241681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_34242169_34242266_34242428_34243262_34243393_34243483
tx.24749	chr17	+	2969	11	FSM	ENSMUSG00000037321.18	ENSMUST00000170086.8	2953	11	-20	4	-20	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_8	3.91024295920343	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGCTTCTCCCGTTTCTT	6971	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34406506	34416195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34407380_34408151_34408267_34408403_34408535_34409536_34409743_34410302_34410501_34411810_34411940_34412101_34412291_34412458_34412633_34412854_34413018_34413817_34413955_34415541
tx.2475	chr11	+	1296	3	FSM	ENSMUSG00000020385.17	ENSMUST00000136587.8	832	3	-16	-448	-2	448	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_2	33	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATTGTGTTGTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51153974	51163639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_51154097_51157997_51158159_51162626
tx.24750	chr17	+	806	3	ISM	ENSMUSG00000024339.13	ENSMUST00000127543.8	2561	11	9978	-3	6839	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATGTTATGGTTACTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34433518	34435295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34433780_34434307_34434445_34434887
tx.24751	chr17	-	692	3	FSM	ENSMUSG00000036322.12	ENSMUST00000134042.3	687	3	9	-14	9	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTTAAATGTGCTCAGAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34563609	34561892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34562065_34562601_34562884_34563371
tx.24752	chr17	+	789	2	ISM	ENSMUSG00000062638.12	ENSMUST00000080254.7	2113	10	7228	0	6474	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGATATCATGGTTGCAC	4887	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34603333	34605002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34603362_34604241
tx.24753	chr17	+	1023	4	ISM	ENSMUSG00000015468.15	ENSMUST00000015612.14	6591	30	47	20712	17	2175	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	6.84754619472471	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATAAGCCAGGTGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34783288	34786765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34783484_34784274_34784357_34784446_34784743_34786315
tx.24754	chr17	+	785	2	FSM	ENSMUSG00000034673.15	ENSMUST00000173229.2	659	2	191	-317	191	-63	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTTTTAATTGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34814624	34815518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34814689_34814797
tx.24755	chr17	+	959	3	FSM	ENSMUSG00000092586.9	ENSMUST00000173478.2	962	3	0	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGCGTTGTGTTTATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35286300	35289023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35286421_35287842_35287954_35288295
tx.24756	chr17	+	1125	3	Fusion	ENSMUSG00000086076.2_ENSMUSG00000024399.6	novel	525	3	NA	NA	3667	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCGGCCCTTGCCAGTGTC	2494	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35403177	35415279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr17_+_35403387_35414025_35414342_35414679
tx.24757	chr17	+	1350	3	Fusion	ENSMUSG00000086076.2_ENSMUSG00000024399.6	novel	525	3	NA	NA	3679	1	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCGGCCCTTGCCAGTGTC	2506	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35403189	35415279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr17_+_35403624_35414025_35414342_35414679
tx.24758	chr17	-	284	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000091705.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCGCAGCGAGTGTGAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35561999	35561594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_35561826_35561946
tx.2476	chr11	+	1337	4	NIC	ENSMUSG00000020385.17	novel	742	7	NA	NA	2	448	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	44	junction_2	34.3737626039914	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATTGTGTTGTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51153992	51163639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_51154097_51157997_51158159_51161363_51161423_51162626
tx.24760	chr17	+	1062	2	Intergenic	novelGene_660	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGGTGTCTGTGTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41497820	41503645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_41498204_41502966
tx.24763	chr17	+	491	2	NNC	ENSMUSG00000097119.3	novel	2578	2	NA	NA	-23	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCACATTTGTGATTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45744733	45753464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_45745154_45753393
tx.24765	chr17	-	989	3	NNC	ENSMUSG00000094690.3	novel	518	2	NA	NA	-2840	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGATTTCATCTAGGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46047610	46043783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_46044049_46044511_46044667_46047041
tx.24766	chr17	-	192	2	Intergenic	novelGene_672	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTGATGAATATTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46508469	46496082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_46496252_46508446
tx.24767	chr17	+	566	2	Intergenic	novelGene_673	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTATGAGTATTTTCTGGT	2200	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46652851	46653768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_46652986_46653336
tx.24768	chr17	-	1923	7	ISM	ENSMUSG00000023972.11	ENSMUST00000044442.10	4235	20	55132	4	-1422	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	477	junction_3	30.7123753558724	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGCCTGTTTGTTAGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46885298	46875400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46876422_46877028_46877208_46878850_46879003_46882528_46882610_46883447_46883681_46884345_46884502_46885197
tx.24769	chr17	-	1777	7	NIC	ENSMUSG00000036568.8	novel	6575	11	NA	NA	-47	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	13	junction_6	45.4266808531433	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGATTTAAAGACTTTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47123158	47111576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_47112756_47117477_47117581_47118321_47118417_47119274_47119421_47120493_47120553_47122849_47122951_47123064
tx.2477	chr11	-	746	2	ISM	ENSMUSG00000020358.18	ENSMUST00000109103.4	1437	8	4955	-298	4955	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1943	junction_1	0	504	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAAGCCTGGGTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51492719	51491702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_51492306_51492576
tx.24770	chr17	-	626	2	Intergenic	novelGene_677	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTTGCCTGCATATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47450293	47446296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_47446803_47450173
tx.24771	chr17	-	834	2	Intergenic	novelGene_679	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCACATTGTTTGTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48116593	48115632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_48115982_48116108
tx.2478	chr11	-	680	2	ISM	ENSMUSG00000020358.18	ENSMUST00000074669.10	2370	7	4178	776	4178	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2171	junction_1	0	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAAGCCTGGGTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51493496	51491702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_51492306_51493419
tx.24780	chr17	-	3115	16	ISM	ENSMUSG00000024206.16	ENSMUST00000086801.7	3283	17	22723	2	22649	1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	178	junction_12	30.2475710686917	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCTGGTGTCCGTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57115290	57082898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57084075_57084431_57084475_57084838_57084993_57086879_57087089_57087754_57087905_57089250_57089349_57090606_57090762_57091299_57091413_57091647_57091767_57092296_57092413_57093608_57093729_57094578_57094761_57110477_57110740_57111325_57111397_57112357_57112448_57115233
tx.24781	chr17	-	293	3	NNC	ENSMUSG00000079414.4	novel	1560	3	NA	NA	-2	-9605	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCACCTTGACTGACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57412944	57409260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_57409372_57410349_57410485_57412897
tx.24782	chr17	-	1708	7	ISM	ENSMUSG00000023965.14	ENSMUST00000112840.2	3667	9	4868	1687	4868	-531	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	4.09945795874961	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACACTGTGTTCGCTTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63794880	63366463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_63367407_63387415_63387559_63532019_63532097_63663742_63663874_63691939_63692048_63778402_63778535_63794706
tx.24783	chr17	-	571	2	ISM	ENSMUSG00000023965.14	ENSMUST00000169134.2	2063	6	226607	21135	226607	-21135	internal_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCACGTTGACTTTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63532099	63387067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_63387559_63532019
tx.24784	chr17	-	643	4	ISM	ENSMUSG00000056515.10	ENSMUST00000070673.9	3473	7	50	46050	50	23487	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	11.2249721603218	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTTTTAAAACAAAATCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66079697	66004773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_66005058_66024476_66024559_66029002_66029083_66079500
tx.24785	chr17	-	1836	6	FSM	ENSMUSG00000023460.14	ENSMUST00000167962.2	2010	6	180	-6	-113	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	199	junction_3	22.1720544830649	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCCGTGTGTTTGTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66826485	66801500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_66802799_66804338_66804444_66805013_66805104_66807304_66807444_66813027_66813089_66826342
tx.24786	chr17	+	1212	4	Intergenic	novelGene_683	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCTCTCCCATATCCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67781981	67787290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_67782346_67783781_67783972_67784103_67784241_67786769
tx.24787	chr17	-	663	4	Intergenic	novelGene_687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.88561808316413	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTAGTCTGTGCTATCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69296587	69277741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_69277962_69288771_69288890_69293963_69294134_69296432
tx.24788	chr17	-	681	4	NNC	ENSMUSG00000117069.2	novel	1128	2	NA	NA	920	1456	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.16024689946929	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCTTTTGTATCAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69690283	69687742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_69688020_69688187_69688384_69689198_69689294_69690170
tx.24789	chr17	+	854	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000097154.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAATGTCAACTGTTCATT	2452	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71222658	71224883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_71222735_71223011_71223081_71224174
tx.2479	chr11	-	1208	6	ISM	ENSMUSG00000020358.18	ENSMUST00000074669.10	2370	7	466	776	466	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2171	junction_1	422.285969456718	804	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAAGCCTGGGTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51497208	51491702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_51492306_51493419_51493523_51495226_51495359_51495485_51495645_51496287_51496457_51497166
tx.24790	chr17	+	1587	6	NIC	ENSMUSG00000054469.15	novel	4467	6	NA	NA	3	141	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	51	junction_1	15.992498241363	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACCTGTTTCTGACAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73414991	73547507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_73415152_73468817_73468987_73476490_73476690_73494869_73495017_73503673_73503791_73546712
tx.24791	chr17	+	195	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024067.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGCAAAACAAGAAGAGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74614776	74623112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_74614885_74623025
tx.24792	chr17	-	536	2	FSM	ENSMUSG00000117648.2	ENSMUST00000234450.2	528	2	-1	-7	-1	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTGTGGCGAGACATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78507455	78506677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_78506781_78507022
tx.24793	chr17	-	763	3	ISM	ENSMUSG00000056121.17	ENSMUST00000234530.2	2001	10	-20	26577	-7	-4143	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	294	junction_1	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAACAAGTGTCTACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78725532	78711890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_78712274_78720292_78720402_78725261
tx.24794	chr17	-	1315	6	ISM	ENSMUSG00000035051.16	ENSMUST00000086555.11	4737	24	40144	-2	17843	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_5	8.19756061276768	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGTGTGGAGTAGACGTG	7286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80557428	80545737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_80546360_80549380_80549582_80553103_80553239_80554537_80554613_80555699_80555835_80557281
tx.24795	chr17	-	2168	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055817.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCAGGTACGGCAGTGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84057736	84044784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_84046890_84057673
tx.24796	chr17	-	757	4	Intergenic	novelGene_696	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCGCCTTGGTCATGGTGTC	5782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84182164	84178527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_84178857_84179109_84179309_84180690_84180797_84182041
tx.24797	chr17	-	2335	15	NIC	ENSMUSG00000024127.16	novel	2734	15	NA	NA	-15	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_14	52.4877050715067	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTTGTGTAATTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85397684	85371955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_85372162_85372469_85372544_85373059_85373184_85373575_85373726_85376312_85376530_85377855_85378032_85379339_85379538_85383293_85383480_85384036_85384254_85385916_85386053_85388491_85388699_85389399_85389467_85390620_85390744_85395767_85395871_85397533
tx.24798	chr17	-	2843	5	ISM	ENSMUSG00000024127.16	ENSMUST00000234036.2	1625	6	-6	18	4	-18	intron_retention	FALSE	canonical	3	151	junction_4	15.9765453086705	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGAAAGATCTATGCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85397665	85385504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_85386053_85388491_85388699_85389399_85389467_85390620_85390744_85395767
tx.24799	chr17	-	714	4	NNC	ENSMUSG00000036557.9	novel	847	7	NA	NA	-14	-2268	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCTTTTGGTTTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87735183	87727195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_87727416_87729941_87730200_87733070_87733131_87735007
tx.248	chr1	-	2347	12	NNC	ENSMUSG00000025980.15	novel	2423	12	NA	NA	89	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2413.92202384213	267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTGTGTTACCCTTTC	4325	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55127313	55116993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_55117600_55117687_55117867_55118214_55118390_55119260_55119507_55120231_55120332_55120818_55120988_55121216_55121311_55122221_55122322_55122883_55122967_55123691_55123945_55125924_55126101_55127147
tx.2480	chr11	-	1350	7	ISM	ENSMUSG00000020358.18	ENSMUST00000109103.4	1437	8	465	-298	465	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1798	junction_2	628.220414256723	447	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCCCAAGCCTGGGTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51497209	51491702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_51492306_51492576_51492718_51493419_51493523_51495226_51495359_51495485_51495645_51496287_51496457_51497166
tx.24800	chr17	-	944	4	NNC	ENSMUSG00000036557.9	novel	847	7	NA	NA	-10	-2273	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCAGTGGCTTTTGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87735179	87727200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_87727655_87729941_87730200_87733070_87733131_87735007
tx.24802	chr17	+	5008	5	NIC	ENSMUSG00000034998.19	novel	5085	6	NA	NA	8	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_4	115.789410137542	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCTTTGTTATTTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88748146	88797961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_88748313_88770140_88770692_88783283_88783379_88786703_88786769_88793830
tx.24803	chr17	+	1243	3	ISM	ENSMUSG00000024154.12	ENSMUST00000161481.2	743	4	-17	22000	2	-22000	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTCTCTCCCTCTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88976106	88980014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_88976160_88978621_88978724_88978926
tx.24804	chr17	-	455	3	NNC	ENSMUSG00000024109.19	novel	3719	2	NA	NA	-10	-2343	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGTTTTACTGTACTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90937465	90929818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_90929917_90930847_90931052_90937312
tx.24805	chr17	+	1609	2	Intergenic	novelGene_704	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTGGAGAAATTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94992871	94995337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_94993613_94994469
tx.24806	chr18	+	362	2	FSM	ENSMUSG00000033960.7	ENSMUST00000234494.2	1007	2	55	590	55	-590	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAACCGCATCAGCAGGCC	-11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4634932	4649337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_4635032_4649074
tx.24807	chr18	-	3193	7	FSM	ENSMUSG00000061013.7	ENSMUST00000079788.7	3650	7	1	456	1	-456	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_4	2.3392781412697	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTGATTAGATAAGTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7004779	6934973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_6937055_6937167_6937202_6992037_6992374_6992777_6992935_7000592_7000753_7002356_7002624_7004621
tx.24808	chr18	-	2155	10	FSM	ENSMUSG00000024293.17	ENSMUST00000115864.8	2148	10	-10	3	10	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	44.3206609568756	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTCTAAGTGATAAATGTA	235	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10610119	10566621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_10567647_10571954_10572143_10574874_10575019_10577000_10577091_10582054_10582187_10584247_10584363_10585977_10586042_10595675_10595876_10596338_10596442_10610025
tx.2481	chr11	+	748	4	FSM	ENSMUSG00000001056.4	ENSMUST00000127405.2	1042	4	17	277	17	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	5273	junction_1	70.8723421998235	37749	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAAGTGTGTGGGTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51510578	51514264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_51510805_51510908_51510979_51513311_51513418_51513918
tx.24813	chr18	-	1054	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117405.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAGCTACTGAATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24084569	24067026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_24067923_24084411
tx.24815	chr18	+	749	6	ISM	ENSMUSG00000039616.11	ENSMUST00000068006.9	2903	15	32933	-2	32746	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	3.65513337649941	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCTGCCATTATTGAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24819680	24834634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_24819763_24821994_24822120_24825574_24825681_24828930_24829070_24832909_24833015_24834442
tx.24816	chr18	+	487	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000057455.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGGAGCCTTGTCTTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31321016	31322279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_31321138_31321215_31321428_31322125
tx.24818	chr18	-	2264	5	FSM	ENSMUSG00000042834.16	ENSMUST00000237066.2	843	5	-1	-1420	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	20.2854627751008	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGCTTTGGCTCATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33596908	33570071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_33571893_33575868_33575947_33595073_33595141_33596430_33596473_33596652
tx.24819	chr18	-	426	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000092819.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGAACTGCGCTCCCACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33929039	33927943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_33928207_33928876
tx.2482	chr11	-	1933	10	FSM	ENSMUSG00000001054.10	ENSMUST00000001081.10	1946	10	16	-3	16	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	245	junction_3	13.1581078605222	288	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGATTGCATGGTCTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51526707	51514496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_51514974_51515055_51515211_51515301_51515405_51516495_51516662_51517562_51517730_51517825_51517927_51518448_51518590_51518706_51518853_51520302_51520489_51526416
tx.24820	chr18	-	581	2	Intergenic	novelGene_722	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGGAGATGTCTCAGTGAT	7429	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35251554	35250778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_35251237_35251431
tx.24821	chr18	-	786	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024483.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGGCTCCTCACTAATTC	7264	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36693294	36692204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_36692806_36692929_36693072_36693251
tx.24822	chr18	-	3083	2	FSM	ENSMUSG00000103956.2	ENSMUST00000194328.2	406	2	-30	-2647	-30	2647	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATTAGTATAAATTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37795715	37792357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_37795350_37795624
tx.24823	chr18	-	2588	20	FSM	ENSMUSG00000038524.14	ENSMUST00000043437.14	4270	20	-1	1683	-1	-1683	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_13	2.48875587737619	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCAGGGCCTGGGCCTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38102828	38092169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_38092708_38092830_38092887_38094299_38094388_38095625_38095847_38095972_38096091_38096180_38096265_38096345_38096475_38097060_38097223_38097366_38097472_38097843_38097964_38098703_38098800_38098951_38099075_38099493_38099623_38100415_38100480_38100590_38100728_38100812_38100949_38101266_38101335_38101802_38101849_38102407_38102506_38102758
tx.24824	chr18	-	963	3	NNC	ENSMUSG00000097080.9	novel	886	4	NA	NA	12	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTTTGGGTTTCCTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383239	38371473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_38372243_38373891_38374007_38383160
tx.24825	chr18	+	338	2	Intergenic	novelGene_727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAGTTTATTTGTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42618427	42619259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_42618537_42619030
tx.24826	chr18	+	1179	7	NNC	ENSMUSG00000039954.10	novel	5080	13	NA	NA	43144	-3139	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.372677996249965	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTATTTTTTATTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43434812	43448608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_43434968_43438064_43438163_43443484_43443602_43444984_43445111_43446454_43446584_43447076_43447142_43448119
tx.24827	chr18	-	1087	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034653.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	1443	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45031270	45007791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_45008613_45010663_45010792_45031132
tx.24829	chr18	-	860	6	ISM	ENSMUSG00000071855.6	ENSMUST00000072835.7	2801	10	173	8604	-18	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_2	10.1587400793602	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGTAATGGTAATTACAGC	2886	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46444822	46423821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_46424210_46424590_46424667_46426470_46426561_46429335_46429458_46432340_46432463_46444760
tx.2483	chr11	-	1288	7	ISM	ENSMUSG00000001054.10	ENSMUST00000001081.10	1946	10	8157	-4	-1905	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	245	junction_3	11.3834675443528	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGATTGCATGGTCTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51518566	51514495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_51514974_51515055_51515211_51515301_51515405_51516495_51516662_51517562_51517730_51517825_51517927_51518448
tx.24830	chr18	+	397	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000118002.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGATCGGATGCATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46491795	46493337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_46491905_46493049
tx.24831	chr18	+	195	2	ISM	ENSMUSG00000037416.14	ENSMUST00000180611.8	11319	43	7716	120401	7389	-88061	internal_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTCAGTATTTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49973452	49976920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_49973580_49976852
tx.24832	chr18	+	839	6	ISM	ENSMUSG00000024535.17	ENSMUST00000025417.9	994	8	0	5208	0	-5208	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_3	2.96647939483827	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGTGTATTTTTTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53378840	53518687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_53378925_53460483_53460568_53473201_53473307_53516141_53516237_53517688_53517722_53518249
tx.24837	chr18	-	1628	11	FSM	ENSMUSG00000046318.17	ENSMUST00000130300.3	6572	11	835	4109	0	-1291	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	3.55527776692624	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTGACTATTCATTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66424903	66194034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_66194592_66198939_66198976_66199653_66199690_66199799_66199940_66204271_66204393_66209378_66209483_66216165_66216319_66217808_66217944_66227068_66227122_66424202_66424284_66424691
tx.24838	chr18	-	816	3	ISM	ENSMUSG00000073542.4	ENSMUST00000236857.2	3354	11	15567	1184	15567	-1184	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_2	15	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAGATCTGTTACTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67756416	67752054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_67752443_67752605_67752824_67756206
tx.24839	chr18	+	2093	11	ISM	ENSMUSG00000024542.10	ENSMUST00000225077.2	2607	16	-39	10712	-12	-10712	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_4	13.3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAAGGTACAATA	95	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67933164	67952652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_67933257_67933724_67933896_67936058_67936227_67937435_67937565_67940327_67940477_67943146_67943200_67945396_67945518_67946942_67947071_67948924_67949067_67949803_67949932_67951840
tx.2484	chr11	-	2371	5	FSM	ENSMUSG00000001053.16	ENSMUST00000001080.16	2367	5	-25	21	-25	-21	multi-exon	FALSE	canonical	3	337	junction_4	13.2382022948737	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTGGTCTTATGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51541694	51533910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_51534976_51535101_51535357_51535999_51536513_51536753_51537102_51541504
tx.24840	chr18	+	1802	13	ISM	ENSMUSG00000024542.10	ENSMUST00000225077.2	2607	16	-29	6993	-2	-6993	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_4	14.0423466699836	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATGAAGAAGAATTCAATAA	105	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67933174	67956371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_67933257_67933724_67933896_67936058_67936227_67937435_67937565_67940327_67940477_67943146_67943200_67945396_67945518_67946942_67947071_67948924_67949067_67949803_67949932_67951840_67952202_67953359_67953504_67956345
tx.24842	chr18	+	731	3	Intergenic	novelGene_738	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACGTGTATTGTTGCATCT	6818	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68066521	68154925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_68066619_68138755_68138845_68154380
tx.24844	chr18	-	859	3	NNC	ENSMUSG00000060534.17	novel	10323	29	NA	NA	1083864	511	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAGTGAATGCTTGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71400224	71391549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_71392151_71395877_71396021_71400109
tx.2485	chr11	-	822	2	FSM	ENSMUSG00000007777.10	ENSMUST00000007921.9	813	2	-3	-6	-3	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	574	junction_1	0	2788	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATGAATGCTTTTCCT	5181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51579483	51576206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_51576920_51579374
tx.24850	chr18	-	2856	3	FSM	ENSMUSG00000056153.16	ENSMUST00000070116.12	6036	3	84	3096	21	-91	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_1	76	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTTGTATTTTCTTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88912362	88886388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_88889043_88905332_88905458_88912285
tx.2486	chr11	-	2124	11	FSM	ENSMUSG00000036391.17	ENSMUST00000109092.8	2094	11	-23	-7	-16	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	19.6611291639112	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTTTTTCAGAGCTAAA	3757	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51647281	51612509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_51612761_51614410_51614524_51617311_51617422_51620278_51620403_51622629_51622733_51624218_51624392_51624596_51624755_51625410_51625489_51627177_51627349_51634362_51634828_51646903
tx.24860	chr19	-	724	2	Intergenic	novelGene_879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAACTGAGTCAAGAGA	9750	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5088759	5087855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_5088318_5088497
tx.24867	chr19	-	1281	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060675.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAATGCTCACATCGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7553708	7550526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_7551691_7553591
tx.24868	chr19	-	1322	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060675.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGATCAATGCTCACATCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7553725	7550529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_7551691_7553564
tx.24869	chr19	+	2535	2	NNC	ENSMUSG00000100141.2	novel	1112	2	NA	NA	-287	1063	intron_retention	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9584180	9586803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_9584924_9585011
tx.2487	chr11	-	2117	11	FSM	ENSMUSG00000036391.17	ENSMUST00000064297.5	2104	11	-12	-1	-12	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_9	12.9015502944414	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTTTGTTTTTTTCAGA	3761	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51647277	51612515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_51612761_51614410_51614524_51617311_51617422_51620278_51620406_51622629_51622733_51624218_51624392_51624596_51624755_51625410_51625489_51627177_51627349_51634362_51634828_51646903
tx.24870	chr19	+	513	4	ISM	ENSMUSG00000034820.5	ENSMUST00000235162.2	3124	7	-19	5917	-19	-443	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	182	junction_3	45.1540572804802	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAGATCTAGAACTGGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10502610	10510287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_10502692_10503315_10503425_10509144_10509364_10510183
tx.24871	chr19	+	3522	10	FSM	ENSMUSG00000034820.5	ENSMUST00000038379.5	3500	10	-17	-5	-17	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	152	junction_5	38.5749230894635	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATACTGCATTGTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10502612	10525022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_10502692_10503315_10503425_10509144_10509364_10510183_10510288_10510656_10510830_10512467_10512883_10514162_10514282_10516983_10517153_10518044_10518213_10523055
tx.24872	chr19	+	2068	5	ISM	ENSMUSG00000034445.9	ENSMUST00000237581.2	2634	9	4765	-8	4244	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	4.96865172858795	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTCTCTTTTGTTCAGAC	4651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10559619	10567194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_10559861_10562545_10562755_10564054_10564210_10565185_10565343_10565888
tx.24873	chr19	+	2536	5	NIC	ENSMUSG00000048832.10	novel	2690	5	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	17	junction_1	44.7017896733453	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGGTCTGTGGTGTCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10666089	10691985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_10666174_10683573_10683673_10687633_10687806_10688634_10688718_10689887
tx.24874	chr19	-	1569	5	NNC	ENSMUSG00000024732.8	novel	3003	4	NA	NA	-6	-1319	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	114.6799895361	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTCTTCAGCTGTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10926636	10920163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_10920654_10920841_10920917_10922646_10922777_10925641_10926169_10926289
tx.24875	chr19	+	1378	7	FSM	ENSMUSG00000024639.6	ENSMUST00000025541.6	5644	7	555	3711	90	-3711	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_6	6.07590871118606	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTTTCCTTCTTCCTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16110749	16361116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_16110826_16196951_16197137_16293380_16293536_16309440_16309570_16312344_16312475_16355520_16355675_16360567
tx.24876	chr19	-	670	4	NNC	ENSMUSG00000046230.12	novel	2563	13	NA	NA	19313	7194	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.9053315024448	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACTTTTGTTTCAGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16701089	16692507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_16692835_16697692_16697832_16699758_16699877_16701003
tx.24877	chr19	-	1178	2	NNC	ENSMUSG00000046230.12	novel	10838	72	NA	NA	2	-26827	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTGTTTTAATAAACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16758274	16756510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_16757448_16758033
tx.24878	chr19	+	398	2	FSM	ENSMUSG00000024726.11	ENSMUST00000236401.2	215	2	-92	-91	-92	91	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGACATTGTTTCTATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18648600	18655250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_18648800_18655051
tx.24879	chr19	+	1414	2	FSM	ENSMUSG00000047044.8	ENSMUST00000055792.8	1631	2	218	-1	218	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTATGTATCAGTGACTAAT	9575	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18690817	18695793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_18691024_18694585
tx.2488	chr11	-	1344	2	ISM	ENSMUSG00000036391.17	ENSMUST00000154325.2	4273	3	7183	2470	-13	-2470	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATTAATTTCAAATGGTTG	3760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51647278	51633858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_51634828_51646903
tx.24880	chr19	+	1486	8	NIC	ENSMUSG00000074925.5	novel	12574	7	NA	NA	-29	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_7	7.20544012166771	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTTTTTAAATGATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23664763	23698326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_23664910_23671684_23671855_23680441_23680509_23683070_23683176_23686117_23686332_23695176_23695467_23697421_23697719_23698129
tx.24881	chr19	-	2573	15	FSM	ENSMUSG00000024867.15	ENSMUST00000025800.15	2573	15	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_9	5.473498303048	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGGTCATACATTGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24533236	24272157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_24272919_24281395_24281511_24323600_24323746_24327497_24327654_24332481_24332567_24335393_24335443_24335574_24335659_24337303_24337516_24356165_24356466_24359051_24359205_24367707_24367826_24374379_24374511_24416416_24416486_24420965_24421053_24533128
tx.24882	chr19	+	390	2	NNC	ENSMUSG00000117979.2	novel	254	2	NA	NA	-45	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATTGTTCTTAAAGTTTT	4467	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24533670	24534594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_24533749_24534282
tx.24883	chr19	+	1874	7	ISM	ENSMUSG00000032702.17	ENSMUST00000049400.15	5637	14	187262	0	1998	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	6.84754619472471	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGCTTGCCCCTGCTTCA	6278	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25401600	25411860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_25401748_25403260_25403349_25405340_25405561_25407584_25407728_25408242_25408444_25410228_25410328_25410884
tx.24884	chr19	-	553	2	Intergenic	novelGene_891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAGTCATTATCTGACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25582673	25582037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_25582361_25582443
tx.24885	chr19	+	646	3	ISM	ENSMUSG00000024935.12	ENSMUST00000161119.8	1762	10	1	12850	1	-12850	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTCTGTGCCGTGTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28812535	28870542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_28812733_28856412_28856554_28870234
tx.24886	chr19	-	431	2	NNC	ENSMUSG00000097855.9	novel	1145	4	NA	NA	-227	-17014	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTGTGAAATGTGCTAACA	751	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29499621	29498076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_29498370_29499483
tx.24887	chr19	-	2533	18	NNC	ENSMUSG00000024827.11	novel	3767	25	NA	NA	1773	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	309.802001731455	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAATTTCCCATTTGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30120858	30075844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_30076511_30077236_30077318_30078142_30078316_30080378_30080475_30088068_30088185_30091121_30091264_30092587_30092701_30093798_30093949_30095942_30096069_30102121_30102198_30109071_30109215_30110879_30110922_30111094_30111180_30111589_30111688_30113903_30113985_30114492_30114633_30116674_30116781_30120759
tx.24888	chr19	-	386	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00002075253.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTCAAGCTCTGTATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30244626	30233386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_30233601_30244454
tx.24889	chr19	-	1311	4	FSM	ENSMUSG00000024868.9	ENSMUST00000025803.9	2427	4	146	970	146	-970	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGGTTTACAGTTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30526919	30524232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_30524839_30524962_30525113_30526177_30526347_30526533
tx.2489	chr11	+	1195	7	FSM	ENSMUSG00000020386.6	ENSMUST00000020653.6	1201	7	7	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	666	junction_5	46.9006041183551	2635	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTGTTGGGCAGCTGTT	3572	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51654520	51682753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_51654619_51668313_51668389_51670515_51670636_51673598_51673665_51678976_51679081_51680023_51680156_51682153
tx.24890	chr19	-	2533	6	NNC	ENSMUSG00000040451.19	novel	3665	10	NA	NA	-3450	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	85.3899291485829	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGCTATTATATTGTGTT	4126	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32219676	32100126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_32101925_32102625_32102793_32106940_32107095_32120145_32120264_32200908_32200991_32219462
tx.24891	chr19	+	1069	2	NNC	ENSMUSG00000097787.3	novel	1647	2	NA	NA	1	-5	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAATTCTAACACTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32366616	32368585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_32367431_32368330
tx.24892	chr19	-	622	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000062456.5	novel	714	1	NA	NA	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAATGTTAGTAAAAATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32443976	32443264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_-_32443434_32443523
tx.24893	chr19	-	2469	12	NNC	ENSMUSG00000024766.16	novel	2839	11	NA	NA	-5228	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	30.1324898099835	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTTTTCTGTTTCTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33572936	33532562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_33533880_33534506_33534579_33535664_33535737_33536911_33537056_33557864_33557975_33560446_33560565_33562269_33562376_33565600_33565744_33567936_33568044_33568161_33568207_33568762_33568834_33572772
tx.24894	chr19	-	2858	9	ISM	ENSMUSG00000024781.17	ENSMUST00000178114.2	2965	10	2628	2	2565	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_7	5.71046189025021	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAACATCGGTGTGGTGTTT	8543	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34502246	34469719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_34471614_34472459_34472532_34477496_34477569_34478902_34479050_34484408_34484546_34486388_34486499_34488222_34488422_34500821_34500940_34502137
tx.24895	chr19	+	3041	2	ISM	ENSMUSG00000044026.4	ENSMUST00000054098.4	3474	3	4569	-4	4508	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	387	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCTCACGACTCGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38388996	38394062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_38389063_38391087
tx.24896	chr19	+	1032	2	NNC	ENSMUSG00000025176.15	novel	631	3	NA	NA	22719	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACATACAATGTCACGGAA	3964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42057008	42059410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_42057257_42058626
tx.24897	chr19	+	2505	4	ISM	ENSMUSG00000025178.10	ENSMUST00000235932.2	1939	10	24588	7	380	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	416	junction_3	19.94993734326	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTGACCTCTCTGTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42103496	42110463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_42103576_42104323_42104458_42104945_42105006_42108231
tx.24898	chr19	+	2607	12	NNC	ENSMUSG00000018820.14	novel	2573	12	NA	NA	-9	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_6	53.2019386958007	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTTGTCAGGTCTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42159023	42180157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_42159108_42159984_42160183_42165827_42165899_42167727_42167930_42169940_42170037_42171097_42171211_42171842_42172004_42172556_42172629_42174243_42174389_42177635_42177683_42177960_42178043_42178821
tx.24899	chr19	+	550	2	ISM	ENSMUSG00000118236.2	ENSMUST00000237632.2	1214	3	1248	-35	1248	35	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTGTATAGTCTTATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43635436	43641009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_43635654_43640676
tx.249	chr1	+	593	4	FSM	ENSMUSG00000073676.5	ENSMUST00000075242.7	774	4	181	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7281	junction_2	538.928154354136	68262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGACAGTCTTTGGTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55127471	55130466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_55127572_55128209_55128375_55129871_55129962_55130228
tx.2490	chr11	+	1833	3	FSM	ENSMUSG00000020392.9	ENSMUST00000102763.5	1832	3	-3	2	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1066	junction_1	20	2047	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTTAGGTTCAAGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51858484	51868159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_51858785_51860970_51861071_51866726
tx.24900	chr19	-	3413	21	FSM	ENSMUSG00000025199.17	ENSMUST00000026217.11	3502	21	90	-1	79	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	185	junction_2	31.5901883501824	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGAATCTCTACTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44095829	44061772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44062980_44063869_44063970_44065684_44065819_44066731_44066880_44067327_44067425_44070384_44070435_44071024_44071135_44072855_44072918_44075346_44075499_44076354_44076479_44077113_44077217_44079371_44079567_44084662_44084799_44085347_44085456_44085641_44085767_44085880_44085971_44087023_44087113_44088588_44088659_44090175_44090291_44092096_44092192_44095726
tx.24901	chr19	-	3356	21	NNC	ENSMUSG00000025199.17	novel	3502	21	NA	NA	109	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	90.1617851420434	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGAATCTCTACTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44095612	44061773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_44062980_44063869_44063970_44065684_44065819_44066731_44066880_44067327_44067425_44070384_44070435_44071024_44071135_44072855_44072918_44075346_44075499_44076354_44076479_44077113_44077217_44079390_44079567_44084662_44084799_44085347_44085456_44085641_44085767_44085880_44085971_44087023_44087113_44088588_44088659_44090175_44090291_44092096_44092192_44095546
tx.24902	chr19	-	1406	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036097.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAATCTCTTCTTAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44919992	44917196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_44918312_44919701
tx.24903	chr19	+	2776	5	FSM	ENSMUSG00000035342.15	ENSMUST00000039016.14	3062	5	331	-45	-4	-27	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_1	41.4517792139252	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTGCAATGGATAAAGAAACT	1583	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45003634	45015514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_45003763_45009825_45010276_45011980_45012644_45013157_45013419_45014240
tx.24904	chr19	-	677	7	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117848.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.06718737290547	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTCTTCCTTTACTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45063592	45049083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_45049247_45049461_45049529_45049674_45049787_45051255_45051371_45052282_45052333_45053870_45053909_45063460
tx.24905	chr19	-	3577	9	ISM	ENSMUSG00000025220.9	ENSMUST00000026243.5	5057	16	13345	20	1680	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	653	junction_7	99.7092648654076	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAATAAAACTTGAAGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45758645	45738717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_45740720_45743045_45743206_45746343_45746537_45746787_45746874_45749542_45749648_45750623_45750710_45753888_45754064_45755832_45756447_45758489
tx.24906	chr19	+	688	2	ISM	ENSMUSG00000006435.17	ENSMUST00000235290.2	1060	4	61396	-468	11636	468	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATATTGAGAGCCCAAACGA	129	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47228985	47230303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_47229111_47229740
tx.24907	chr19	+	604	2	ISM	ENSMUSG00000043639.16	ENSMUST00000161856.2	4663	7	16113	2588	16113	-888	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCACTGTGTTTCAAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53847753	53852923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_53847945_53852510
tx.24908	chr19	+	2479	6	ISM	ENSMUSG00000025078.10	ENSMUST00000071423.7	8591	11	39907	4653	17371	-4653	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	94	junction_1	11.3243101335137	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTGACTTCCGTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56576599	56587282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_56576702_56580007_56580240_56580824_56580948_56582091_56582299_56583231_56583452_56585687
tx.24909	chr19	+	565	2	ISM	ENSMUSG00000025078.10	ENSMUST00000071423.7	8591	11	46600	5842	24064	-5842	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	99	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTCATTTTAGCTGTGT	437	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56583292	56586093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_56583452_56585687
tx.2491	chr11	-	1005	6	FSM	ENSMUSG00000020390.13	ENSMUST00000020657.13	1792	6	26	761	21	409	multi-exon	FALSE	canonical	3	559	junction_4	76.342910607338	1333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGACTTTGTCACTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51891285	51877084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_51877638_51879438_51879528_51882220_51882311_51886200_51886227_51888644_51888726_51891119
tx.24910	chr19	+	568	3	NNC	ENSMUSG00000054843.10	novel	6586	29	NA	NA	27463	-489962	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_2	10.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAAGAGTTTTGGGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57626928	57631813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_57627013_57630851_57631061_57631538
tx.24911	chr19	-	1480	7	NNC	ENSMUSG00000025092.8	novel	1400	7	NA	NA	-9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.35889894354067	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTTCTGTCAGGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58849453	58808150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_58808836_58809431_58809549_58810495_58810601_58813682_58813870_58815987_58816113_58816684_58816771_58849278
tx.24912	chr1_GL456210v1_random	-	1504	2	Intergenic	novelGene_77	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACAGGATCTTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113811	112045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_GL456210v1_random_-_112591_112852
tx.24913	chr2	+	1637	11	NIC	ENSMUSG00000026648.19	novel	2469	14	NA	NA	2	5263	intron_retention	FALSE	canonical	3	20	junction_5	4.51774279923061	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAATCAATGGATATTCAT	1023	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3425188	3448506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_3425364_3426400_3426453_3430304_3430390_3434783_3434844_3437474_3437531_3438025_3438128_3438712_3439130_3441794_3441897_3444690_3444828_3445237_3445293_3448110
tx.24914	chr2	+	1194	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081070.2	novel	1069	1	NA	NA	-33	172	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAACAAAAAACAAAAAACA	1026	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3687365	3688639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_3688005_3688084
tx.24915	chr2	+	1891	6	FSM	ENSMUSG00000061186.16	ENSMUST00000114864.9	1901	6	43	-33	29	33	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	9.3936148526539	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGTACTGGGGAAGCAG	4732	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10377289	10443981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_10377428_10384995_10385047_10398075_10398218_10406799_10406895_10409248_10409490_10442757
tx.24916	chr2	+	1733	2	ISM	ENSMUSG00000061186.16	ENSMUST00000114864.9	1901	6	32199	-498	32185	498	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTGCTTTCCATCCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10409445	10444446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_10409490_10442757
tx.24917	chr2	+	394	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000026773.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGTGGCAAAAATCTCTC	7569	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11543284	11548400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_11543371_11545479_11545689_11548301
tx.24918	chr2	-	1167	4	FSM	ENSMUSG00000026707.16	ENSMUST00000191911.2	2420	4	24	1229	-8	-1229	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	28.0752955856608	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCATTCTCATTCTCATT	970	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15054099	15042474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_15043039_15047037_15047118_15051958_15052115_15053732
tx.24919	chr2	-	2480	3	ISM	ENSMUSG00000026737.13	ENSMUST00000006912.12	3477	10	150518	5	18512	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_2	13.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTAGTTTGGCTTCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18852419	18847070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_18849272_18850685_18850790_18852244
tx.2492	chr11	-	1009	5	NNC	ENSMUSG00000020390.13	novel	1792	6	NA	NA	21	409	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	308.507698445274	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGACTTTGTCACTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51891285	51877084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_51877638_51879438_51879528_51882220_51882311_51888614_51888726_51891119
tx.24920	chr2	+	974	4	ISM	ENSMUSG00000026787.4	ENSMUST00000028123.4	5744	16	51	68796	51	-4923	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.942809041582063	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTCCTTTTTTTTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22512267	22515090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_22512751_22513447_22513508_22513700_22513851_22514809
tx.24921	chr2	-	1760	6	ISM	ENSMUSG00000058835.15	ENSMUST00000114544.10	2790	8	16	15798	16	-5941	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_3	28.722116913626	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTGTGTCTGGCTTCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22930181	22846178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_22847131_22850718_22850860_22852412_22852514_22861094_22861272_22884534_22884703_22929960
tx.24922	chr2	+	1002	2	ISM	ENSMUSG00000026975.11	ENSMUST00000126909.8	1554	8	27	8314	-3	-2682	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGGAGTCTATTTTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24852460	24853859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_24852638_24853034
tx.24923	chr2	-	1379	2	FSM	ENSMUSG00000036770.12	ENSMUST00000155706.2	1329	2	-54	4	-54	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTTTATGTGTATGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25103717	25102222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_25103185_25103300
tx.24924	chr2	+	2794	4	FSM	ENSMUSG00000048707.10	ENSMUST00000114336.4	2787	4	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	10.4986771653491	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCTTTTGCCTTCTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25152622	25159897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_25154566_25158843_25159058_25159144_25159252_25159367
tx.24927	chr2	-	1749	11	NNC	ENSMUSG00000036352.17	novel	1852	10	NA	NA	2	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	243.631360871297	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTGTTACTTCATGGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25911757	25888552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_25889080_25895337_25895477_25896538_25896626_25897730_25897966_25898872_25898982_25899172_25899276_25900533_25900642_25904903_25904978_25906307_25906429_25911408_25911595_25911697
tx.24929	chr2	-	684	6	Intergenic	novelGene_756	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.489897948556636	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAATGGTGCCTGATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26724808	26672166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_26672384_26672500_26672603_26674764_26674873_26674955_26675030_26675747_26675882_26724759
tx.2493	chr11	-	1006	7	FSM	ENSMUSG00000020390.13	ENSMUST00000109086.8	585	7	-12	-409	-12	409	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_6	225.904662782039	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGACTTTGTCACTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51891601	51877084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_51877638_51879438_51879528_51882220_51882311_51886200_51886227_51888644_51888726_51891119_51891189_51891503
tx.24930	chr2	+	902	2	NNC	ENSMUSG00000109946.2	novel	509	2	NA	NA	-11	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTTTCTCATTTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27332503	27334234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_27332827_27333655
tx.24931	chr2	+	856	2	Intergenic	novelGene_760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27463287	27467124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_27463344_27466324
tx.24932	chr2	+	1433	7	NNC	ENSMUSG00000015846.16	novel	4905	10	NA	NA	4430	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.4548819311413	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCTGAGATATCACTCCA	9445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27634642	27650209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_27634788_27638623_27638794_27642323_27642454_27644234_27644368_27646210_27646303_27647772_27647879_27649552
tx.24933	chr2	+	1011	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000063611.6	novel	1675	1	NA	NA	-26678	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28369428	28397789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_28369616_28396965
tx.24934	chr2	-	1324	6	ISM	ENSMUSG00000026816.15	ENSMUST00000113889.9	2667	12	184	4494	-17	1470	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	147	junction_1	23.1723973727364	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAGGATGTCAGTGTTCGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28473017	28460816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_28461240_28462207_28462313_28463388_28463585_28467887_28468087_28469529_28469750_28472836
tx.24935	chr2	+	1466	11	ISM	ENSMUSG00000026812.17	ENSMUST00000133565.8	5103	23	-6	15947	-2	94	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	12.9676520619579	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTAGTTTCTGGGCTTCT	3450	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28531246	28562613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_28531332_28542180_28542244_28548616_28548803_28551593_28551698_28552472_28552626_28553511_28553657_28555019_28555175_28555567_28555642_28560880_28561057_28561777_28561894_28562404
tx.24936	chr2	+	1615	6	ISM	ENSMUSG00000043535.14	ENSMUST00000061578.9	10970	26	22884	23522	-9340	-3813	internal_fragment	FALSE	canonical	3	223	junction_2	26.5706605111728	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATCCTCGAATTTAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29037887	29048961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_29038734_29040019_29040120_29043949_29044109_29046999_29047233_29048109_29048278_29048852
tx.24938	chr2	+	1425	6	NNC	ENSMUSG00000001864.14	novel	3117	6	NA	NA	-26	500	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	12.8436754864019	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTGTCTCCATGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31840259	31861850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_31840394_31840540_31840603_31852226_31852294_31855082_31855125_31859620_31859805_31860914
tx.24939	chr2	+	1184	6	ISM	ENSMUSG00000026820.6	ENSMUST00000028162.5	4978	7	1746	3035	171	1161	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_5	7.57891812859857	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCTGGTCTGACAATGGT	8838	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32287653	32292749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32287748_32290061_32290121_32290414_32290565_32290889_32291091_32291498_32291617_32292187
tx.2494	chr11	-	2264	2	FSM	ENSMUSG00000020390.13	ENSMUST00000124699.2	516	2	37	-1785	37	1785	multi-exon	FALSE	canonical	3	670	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTGTAGCCACTGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51891269	51886611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_51888726_51891119
tx.24940	chr2	+	1490	10	FSM	ENSMUSG00000046854.17	ENSMUST00000055304.14	1577	10	87	0	-38	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2.21108319357027	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAAATGGAGGTTCACGGGA	9720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32465816	32473794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_32465907_32466662_32466864_32467883_32467938_32468120_32468276_32468491_32468617_32468947_32468983_32469069_32469126_32469952_32470066_32470290_32470442_32473284
tx.24941	chr2	+	357	3	ISM	ENSMUSG00000026811.19	ENSMUST00000113290.8	2402	6	65	8401	0	76	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	29	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGAGCAGCTCCTGAGGGG	3369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32497037	32502415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32497124_32499237_32499329_32502235
tx.24942	chr2	+	955	3	NNC	ENSMUSG00000026811.19	novel	438	3	NA	NA	4	583	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	48	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTAACTTTGCTACTGTC	3390	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32497058	32505564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_32497124_32502297_32502416_32504792
tx.24943	chr2	+	1030	4	ISM	ENSMUSG00000059013.13	ENSMUST00000113242.5	3107	11	23868	518	10082	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	11	junction_2	0.942809041582063	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTGTCCCATGAGGCCT	7375	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32641585	32645006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_32641698_32642625_32642738_32643000_32643208_32644407
tx.24944	chr2	-	1787	2	ISM	ENSMUSG00000026791.15	ENSMUST00000191777.6	3120	6	-2	7220	1	1276	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAATCTGCAGGAAA	3962	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32872082	32870221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_32871896_32871969
tx.24945	chr2	+	573	2	Intergenic	novelGene_773	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTGTTTGTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34024858	34027619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_34024947_34027134
tx.24946	chr2	-	2764	9	FSM	ENSMUSG00000038718.16	ENSMUST00000040638.15	2587	9	89	-266	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	7.22733526273688	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGCCATGTGTGTCTCTGT	921	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34261967	34061468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_34062986_34065876_34065967_34066760_34066874_34068188_34068355_34094791_34094928_34103263_34103455_34114416_34114659_34260835_34260910_34261732
tx.24947	chr2	+	1993	10	NIC	ENSMUSG00000038696.15	novel	3111	12	NA	NA	-11	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	38	junction_1	57.8179347628996	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTTGGTATGATGGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34296862	34513929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_34297267_34334269_34334419_34387712_34387886_34408684_34408862_34423799_34423910_34453066_34453175_34471203_34471345_34487434_34487573_34509856_34509955_34513434
tx.24948	chr2	+	1468	2	Intergenic	novelGene_774	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGCCTGCAACCCCACCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34560248	34561919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_34560870_34561072
tx.24949	chr2	-	1500	4	ISM	ENSMUSG00000026867.20	ENSMUST00000113101.8	2200	11	20179	-508	86	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	220	junction_3	9.17726659862414	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAGTGTCTCTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34574219	34566986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_34568190_34568444_34568643_34571646_34571720_34574193
tx.2495	chr11	+	1306	6	NIC	ENSMUSG00000020389.20	novel	1610	8	NA	NA	-33	3380	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.60768096208106	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTTTCTGTGTTTCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51895014	51913973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_51895245_51895739_51895920_51901957_51902153_51909103_51909283_51910556_51910670_51913564
tx.24950	chr2	-	555	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000083815.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATTTATAGTGTATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37151946	37081095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_37081359_37094146_37094210_37103089_37103140_37151767
tx.24951	chr2	-	2164	15	ISM	ENSMUSG00000026915.17	ENSMUST00000028279.10	16348	17	6276	13786	6210	-498	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	591	junction_8	57.5322890706974	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTACTGCCTGGTTCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37531021	37473665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_37474119_37476521_37476567_37480668_37480793_37486715_37486857_37489132_37489268_37490756_37490916_37492946_37493147_37493933_37494027_37514184_37514297_37514504_37514603_37515189_37515302_37516493_37516590_37517446_37517539_37525435_37525581_37530862
tx.24952	chr2	+	806	4	NNC	ENSMUSG00000026764.16	novel	729	7	NA	NA	-218	-17326	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	16.0277537068951	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGCGCCTAACATGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49590372	49602937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_49590618_49590968_49591118_49600731_49600881_49602674
tx.24953	chr2	-	879	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000026839.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTCCTTAATGTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58681326	58675281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_58675698_58679643_58679811_58680020_58680233_58681242
tx.24954	chr2	-	1696	3	ISM	ENSMUSG00000054580.15	ENSMUST00000128208.8	3593	13	10	78406	10	4363	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAAGAGCTAAGTCGCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60383642	60359858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_60360885_60365066_60365448_60383353
tx.24955	chr2	-	1132	3	Intergenic	novelGene_783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGCCTTTTGCATCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63378896	63357468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_63358412_63378630_63378695_63378771
tx.24956	chr2	-	1984	14	NNC	ENSMUSG00000026888.15	novel	1986	14	NA	NA	0	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.61947395569803	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGACTCGTGTTCTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64853126	64742821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_64743194_64745055_64745154_64747172_64747261_64747378_64747452_64747542_64747660_64753880_64753962_64760243_64760340_64760529_64760641_64763563_64763702_64766760_64766836_64768712_64768835_64783905_64784063_64851430_64851564_64852803
tx.24957	chr2	-	434	3	Intergenic	novelGene_784	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGAGCATTTAATGAGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65245510	65232283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_-_65232356_65233125_65233377_65245399
tx.24958	chr2	+	1647	6	NIC	ENSMUSG00000070880.11	novel	1197	9	NA	NA	-20	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3.40587727318528	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGGCTTGCTTCATTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70392365	70415463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_70392677_70394111_70394255_70403049_70403209_70404412_70404656_70409454_70409546_70414763
tx.24959	chr2	+	869	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027010.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGGGGAAAAAAAAGACTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71180221	71181321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_71180930_71181054_71181196_71181301
tx.2496	chr11	+	1744	9	NIC	ENSMUSG00000020389.20	novel	2051	13	NA	NA	-8	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.64575131106459	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGCCACAGAGTCCAGACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51895108	51918391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_51895245_51895739_51895920_51901957_51902153_51909103_51909283_51910556_51910670_51913564_51913705_51916665_51916755_51917585_51917746_51917839
tx.24962	chr2	-	2417	8	NNC	ENSMUSG00000041777.13	novel	2821	10	NA	NA	14	-762	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_4	30.3402473992039	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATGTCCTTAAGACTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73142897	73114210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_73115380_73116681_73116768_73117952_73118060_73134083_73134202_73136229_73136283_73136620_73137273_73140800_73140896_73142760
tx.24963	chr2	+	425	2	FSM	ENSMUSG00000086544.2	ENSMUST00000149231.2	538	2	123	-10	123	10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGATTTCTCTTACCCACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73427290	73429554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_73427364_73429202
tx.24964	chr2	-	3235	14	NNC	ENSMUSG00000009207.16	novel	3195	13	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_5	96.7151616097864	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTGTTTATTTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74409278	74350677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_74352642_74359974_74360146_74360849_74360921_74362219_74362326_74364958_74365013_74367647_74367846_74378181_74378234_74378318_74378403_74381404_74381446_74385331_74385391_74399284_74399473_74401278_74401321_74403881_74403971_74409162
tx.24965	chr2	+	1223	2	FSM	ENSMUSG00000050368.5	ENSMUST00000061745.5	1816	2	591	2	591	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTCCTTCTGCTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74522858	74525447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_74523069_74524434
tx.24966	chr2	+	1564	11	ISM	ENSMUSG00000042410.17	ENSMUST00000111952.9	2589	14	269	17073	-47	172	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	679	junction_7	52.2421285936934	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAGGAAGAAAGAAAA	768	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75662801	75708479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_75662856_75681837_75681928_75683065_75683157_75684513_75684635_75684874_75684950_75687360_75687433_75689242_75689323_75692277_75692359_75697090_75697217_75698648_75698758_75707814
tx.24967	chr2	-	3159	17	ISM	ENSMUSG00000042272.18	ENSMUST00000102660.8	8990	18	20679	5741	20679	474	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_7	12.0985536325629	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTAATGCTTTTATGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77075433	77016424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_77017605_77018843_77018966_77021304_77021497_77022042_77022166_77022842_77022925_77027166_77027327_77028632_77028748_77029209_77029405_77036549_77036673_77042703_77042916_77045405_77045462_77047266_77047365_77048432_77048547_77061007_77061122_77064992_77065084_77071956_77072066_77075360
tx.24968	chr2	+	1000	4	NNC	ENSMUSG00000080223.3	novel	929	6	NA	NA	-1135	-16404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGATTCTGGTTTGTTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90003305	90009092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_90003471_90004441_90004562_90007737_90007899_90008538
tx.24969	chr2	-	2203	9	NIC	ENSMUSG00000002105.16	novel	2469	10	NA	NA	-14	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	1	5	junction_5	17.0105665690476	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTCTTCCACATACTAGG	4331	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90900598	90892135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_90893324_90893408_90893509_90893664_90893798_90894000_90894052_90895059_90895150_90895926_90896046_90896357_90896472_90898775_90899085_90900499
tx.2497	chr11	+	1305	6	ISM	ENSMUSG00000020389.20	ENSMUST00000109076.2	1610	8	-67	4418	-8	3380	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.92574776766556	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTTTCTGTGTTTCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51895108	51913973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_51895338_51895739_51895920_51901957_51902153_51909103_51909283_51910556_51910670_51913564
tx.24970	chr2	-	1760	10	FSM	ENSMUSG00000002108.11	ENSMUST00000002177.9	1802	10	11	31	11	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	1.4229164972073	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTGCAGGGTTCTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91025450	91014436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_91014828_91014999_91015095_91015286_91015401_91020529_91020630_91020806_91020987_91021083_91021293_91022133_91022401_91022904_91023088_91023961_91024042_91025309
tx.24971	chr2	-	1086	7	ISM	ENSMUSG00000027249.16	ENSMUST00000028681.15	1988	14	6151	1	6132	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	11	junction_5	3.24893144826965	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATCTCAGTGTGCCCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91460608	91455665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_91455919_91456046_91456118_91458666_91458849_91459004_91459179_91459495_91459664_91460294_91460422_91460497
tx.24972	chr2	-	933	3	ISM	ENSMUSG00000075040.10	ENSMUST00000145582.8	663	5	-13	770	7	-422	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_2	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAACAAACCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91480117	91478782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_91479372_91479495_91479771_91480048
tx.24973	chr2	+	2875	14	NNC	ENSMUSG00000027247.17	novel	3201	14	NA	NA	-22	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_1	87.3500066894048	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATTTGGCTGTTTAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91480544	91502670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_91480598_91482093_91482169_91484417_91484553_91484780_91484877_91492642_91492731_91498541_91498674_91498830_91498918_91499073_91499173_91499530_91499639_91499729_91499807_91499996_91500075_91500490_91500620_91500810_91500915_91501056
tx.24974	chr2	+	2749	12	ISM	ENSMUSG00000027247.17	ENSMUST00000111330.3	3068	13	863	-23	863	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	319	junction_2	25.5992639356991	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATTTGGCTGTTTAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91484415	91502670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_91484553_91484780_91484877_91492642_91492731_91498541_91498674_91498830_91498918_91499073_91499173_91499530_91499639_91499729_91499807_91499996_91500075_91500490_91500620_91500810_91500915_91501056
tx.24975	chr2	-	2612	10	ISM	ENSMUSG00000027223.16	ENSMUST00000111279.9	3274	12	3434	-2	3434	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_2	10.4822012578407	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGAGTGGGTGTATTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92219642	92214018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_92214767_92215068_92215168_92215268_92215340_92215491_92215609_92215757_92215868_92216139_92216313_92216707_92216784_92216915_92217729_92217898_92217981_92219319
tx.24976	chr2	-	1554	6	ISM	ENSMUSG00000027215.14	ENSMUST00000111257.8	1003	10	22289	-719	-10103	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	10	junction_2	1.46969384566991	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTCTGAAGAGGCGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93260735	93249455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_93250288_93250584_93250669_93250899_93251101_93252171_93252274_93260289_93260365_93260475
tx.24977	chr2	-	1523	2	ISM	ENSMUSG00000027187.11	ENSMUST00000111168.4	779	6	23	20933	23	-20933	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	616	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAACAAACAAAAAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103315447	103305872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_103307266_103315317
tx.24978	chr2	-	3998	18	NNC	ENSMUSG00000027184.15	novel	4069	18	NA	NA	52	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	51	junction_9	440.218520760725	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTGTGGTTATGGTACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103627397	103595354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_103597209_103598750_103598815_103599147_103599249_103599779_103599975_103602041_103602193_103603013_103603164_103603318_103603430_103604078_103604141_103605761_103605844_103605954_103606111_103606278_103606366_103606449_103606503_103608307_103608446_103609508_103609592_103609677_103609917_103613300_103613388_103613487_103613551_103627075
tx.24979	chr2	-	552	4	FSM	ENSMUSG00000086687.2	ENSMUST00000143559.2	541	4	-10	-1	-10	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCGGATTCTTTTTCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103640977	103634795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_103635010_103636319_103636412_103636518_103636605_103640817
tx.2498	chr11	+	1709	7	FSM	ENSMUSG00000020349.5	ENSMUST00000020608.3	7102	7	354	5039	354	3047	multi-exon	TRUE	canonical	3	1809	junction_6	129.264586539908	1059	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTCTGGCAACTCCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51989861	52013566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_51989978_52003946_52004157_52008813_52008988_52009495_52009586_52009969_52010132_52011759_52011879_52012728
tx.24980	chr2	-	1559	3	ISM	ENSMUSG00000068373.16	ENSMUST00000156278.8	2415	11	39583	-23	39583	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGGGGTGTGTGTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104031945	104015308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_104016249_104022779_104022910_104031456
tx.24981	chr2	+	1006	4	ISM	ENSMUSG00000045106.13	ENSMUST00000111114.8	3944	18	0	72228	0	-24058	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_3	7.36357401145817	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGAAGATGTGAGGGAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104716668	104757854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_104716839_104737885_104738044_104745002_104745075_104757248
tx.24982	chr2	+	1203	8	NIC	ENSMUSG00000045106.13	novel	3944	18	NA	NA	7	792	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_6	17.7844233610684	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATGTTGATGTGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104716675	104782704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_104716839_104737885_104738044_104745002_104745075_104757248_104757321_104759867_104759904_104761319_104761395_104781851_104781988_104782213
tx.24983	chr2	+	1634	6	ISM	ENSMUSG00000033943.16	ENSMUST00000156510.2	6995	21	49937	-14	5487	14	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	162	junction_4	18.8933850857913	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTGGGGTCAGATGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119777722	119791289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_119778775_119781566_119781695_119783355_119783408_119788637_119788845_119790820_119790933_119791206
tx.24984	chr2	+	1127	5	ISM	ENSMUSG00000079110.13	ENSMUST00000110716.9	2764	22	-55	19309	-55	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_4	0.707106781186548	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACCAGTAGTTCCAGCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120307334	120316088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_120307712_120311163_120311234_120312590_120312710_120314971_120315106_120315661
tx.24985	chr2	-	1873	6	FSM	ENSMUSG00000027286.17	ENSMUST00000102496.8	1848	6	-25	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	68.2800117164606	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGTCTGGAAGTAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120439821	120434718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_120435740_120436428_120436615_120438279_120438549_120439153_120439293_120439398_120439505_120439669
tx.24986	chr2	-	3082	4	FSM	ENSMUSG00000043909.17	ENSMUST00000140285.8	3043	4	-25	-14	-16	14	multi-exon	TRUE	canonical	3	150	junction_2	12.2474487139159	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGCAACCAATGCGCTT	8093	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121101867	121097778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_121100470_121100699_121100791_121101004_121101190_121101752
tx.24987	chr2	-	1477	6	NIC	ENSMUSG00000033486.15	novel	2293	9	NA	NA	-16	-395	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	0	0	junction_2	7.08801805866774	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCAGTGGCATGTGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121244289	121223506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_121224066_121224827_121224969_121240618_121240688_121240857_121241032_121242630_121242772_121243896
tx.24988	chr2	-	914	5	NIC	ENSMUSG00000033486.15	novel	2247	13	NA	NA	-18	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.75925291729789	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGGTAAGTTCAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121244291	121224833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_121224969_121240618_121240688_121240857_121241032_121242630_121242772_121243896
tx.24989	chr2	+	692	3	ISM	ENSMUSG00000027359.17	ENSMUST00000141482.3	1478	10	24821	-327	16189	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	4.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTTCTCTCTCTACTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126422868	126430185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_126422924_126428171_126428303_126429679
tx.2499	chr11	+	1093	3	ISM	ENSMUSG00000020349.5	ENSMUST00000020608.3	7102	7	20488	5039	426	3047	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1809	junction_2	68.5	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTCTGGCAACTCCTTGG	5642	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52009995	52013566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_52010132_52011759_52011879_52012728
tx.24990	chr2	-	2647	16	NIC	ENSMUSG00000027366.13	novel	5616	15	NA	NA	175	1025	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	9	junction_4	7.10742960257473	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTTTTTCTGATCTT	8454	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126774980	126735158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_126736207_126746829_126746991_126750025_126750101_126754562_126754666_126755219_126755274_126755451_126755509_126759130_126759206_126759719_126759802_126761558_126761661_126762237_126762335_126765375_126765528_126767665_126767800_126768207_126768298_126768736_126768920_126769668_126769789_126774866
tx.24993	chr2	-	1266	2	FSM	ENSMUSG00000014355.11	ENSMUST00000110332.2	1214	2	-52	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	367	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTGAGTCAGTTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128529326	128526968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_128527981_128529072
tx.24996	chr2	+	1722	3	NNC	ENSMUSG00000056738.12	novel	346	2	NA	NA	-1611	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATTGTGTCATTTGGGTG	2321	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129068330	129075171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_129068508_129070022_129070125_129073728
tx.24998	chr2	-	1772	8	FSM	ENSMUSG00000037773.15	ENSMUST00000110277.2	1689	8	-91	8	-77	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	13.0868371321129	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGACATTCCTGTGTCGG	7557	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130266698	130260886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_130261254_130261549_130261811_130263809_130264057_130264144_130264296_130264385_130264625_130264732_130264813_130265331_130265473_130266412
tx.25	chr1	+	697	5	NNC	ENSMUSG00000097893.9	novel	264	4	NA	NA	-26	167	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.6583123951777	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAGAAATAATTTCATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9818785	9841143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_9818871_9820582_9820631_9822673_9822790_9834574_9834776_9840896
tx.250	chr1	+	1799	8	FSM	ENSMUSG00000025979.14	ENSMUST00000162364.8	2840	8	36	1005	7	-44	multi-exon	FALSE	canonical	3	402	junction_7	40.5985824624356	3131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCATACTTTGATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55170425	55193053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_55170519_55175835_55175899_55184282_55184384_55187477_55187521_55187706_55187794_55189304_55189385_55190129_55190242_55191833
tx.2500	chr11	+	1228	6	FSM	ENSMUSG00000036309.15	ENSMUST00000037324.12	1440	6	28	184	0	-184	multi-exon	FALSE	canonical	3	4483	junction_4	346.23483360286	20838	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGTATGTCATCTTTTTA	439	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52122863	52137501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_52122946_52127663_52127761_52133413_52133488_52134441_52134586_52135807_52135949_52136811
tx.25001	chr2	-	330	3	ISM	ENSMUSG00000048911.16	ENSMUST00000183902.2	1466	7	-8	5827	-8	4084	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	2	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAAATTGAATTACAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131194790	131150392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_131150438_131155082_131155233_131194655
tx.25003	chr2	+	865	7	FSM	ENSMUSG00000027357.17	ENSMUST00000028835.13	1924	7	427	632	405	266	multi-exon	FALSE	canonical	3	562	junction_2	81.1632442810305	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTAGGTTTTTGATTAATT	2049	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132689012	132708073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_132689046_132691785_132691924_132696812_132696943_132703128_132703215_132704254_132704324_132706009_132706102_132707756
tx.25005	chr2	+	848	5	NNC	ENSMUSG00000062098.12	novel	4657	5	NA	NA	-31	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	23.3706546763243	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTGCTTTTTTAGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138098550	138129342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_138098675_138120885_138121178_138121668_138121760_138122292_138122412_138129120
tx.25007	chr2	-	3098	8	ISM	ENSMUSG00000038844.11	ENSMUST00000230763.2	6404	27	188905	863	-9943	374	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_7	5.97272713153339	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTGTATGCTTCTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142554534	142460256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_142461837_142490347_142490432_142514208_142514299_142532498_142532622_142544542_142544594_142545861_142545959_142549178_142549332_142553614
tx.25008	chr2	+	2481	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000080870.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CCACAAAGAAAGGAAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146596434	146724936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_146597702_146723722
tx.25009	chr2	-	4110	8	NNC	ENSMUSG00000027438.15	novel	4412	11	NA	NA	25090	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6.8957247920841	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACCTTTTGACTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148549221	148535907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_148539427_148540102_148540154_148540850_148540920_148542292_148542398_148544980_148545066_148545185_148545246_148548865_148548944_148549078
tx.2501	chr11	-	355	3	Intergenic	novelGene_165	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGCTCAGAGGCACAACAGCA	8911	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52205108	52204016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_52204147_52204705_52204803_52204980
tx.25011	chr2	-	1052	9	ISM	ENSMUSG00000032046.16	ENSMUST00000138608.8	1334	10	-10	896	-10	-896	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	259	junction_1	23.9553621346036	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGTAGATAATGAAACTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150746592	150680174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_150680315_150680660_150680699_150681639_150681770_150684165_150684212_150685310_150685342_150688163_150688284_150690271_150690378_150700279_150700405_150746276
tx.25012	chr2	-	2527	8	ISM	ENSMUSG00000068115.14	ENSMUST00000109896.8	5093	24	59184	0	2578	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_7	7.72221814385119	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTTTTTAAAGTTTTAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150792134	150776438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_150777360_150778866_150778981_150779473_150779642_150781772_150781887_150782591_150782751_150786500_150786571_150787003_150787109_150791258
tx.25013	chr2	+	1185	5	FSM	ENSMUSG00000032852.4	ENSMUST00000042217.4	2371	5	-1	1187	-1	-1187	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.707106781186548	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTCTGTGACTCTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151684845	151715401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_151685073_151709675_151709865_151710490_151710632_151711688_151711875_151714959
tx.25015	chr2	+	4315	14	NNC	ENSMUSG00000074698.11	novel	4206	13	NA	NA	-1	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_1	52.761493041128	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAATGTCCATGCAGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152068757	152123767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_152068912_152090618_152090732_152092321_152092532_152096129_152096242_152099297_152099400_152099860_152099912_152100595_152100656_152102678_152102763_152105102_152105214_152114547_152114650_152116012_152116114_152117317_152117467_152118866_152118954_152120888
tx.25016	chr2	-	1367	2	ISM	ENSMUSG00000059361.7	ENSMUST00000079278.5	1455	3	2345	0	2345	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCGTGGCTTCCTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152216213	152210674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_152211844_152216015
tx.25017	chr2	-	496	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000038572.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCTCAAAGAGTGAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154066222	154063930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_154064353_154066148
tx.25018	chr2	+	518	2	Intergenic	novelGene_826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCATGTGGTTTGTGGTCCC	4969	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154262822	154267942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_154262961_154267562
tx.2502	chr11	-	592	2	Intergenic	novelGene_166	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCTATGCGTGTGAGACT	9420	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52249473	52248734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_52249171_52249317
tx.25021	chr2	+	701	2	FSM	ENSMUSG00000074652.4	ENSMUST00000154656.2	674	2	-23	-4	-23	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGTCCTTATTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155475347	155476127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155475921_155475999
tx.25022	chr2	+	1566	4	FSM	ENSMUSG00000027611.13	ENSMUST00000029140.12	1597	4	28	3	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAGCCCATACCCTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155593064	155597388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_155593385_155595264_155595523_155596159_155596448_155596688
tx.25023	chr2	-	198	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000038116.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACCCAAAAACTAATAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156041156	156012626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_156012801_156041132
tx.25024	chr2	-	3768	7	FSM	ENSMUSG00000027650.13	ENSMUST00000109522.2	3765	7	2	-5	2	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_3	11.8977121983832	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTTGATGAGAGATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157851280	157823726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_157824381_157834887_157834976_157835273_157835479_157837300_157837442_157838996_157839146_157842539_157842729_157848938
tx.25025	chr2	+	1224	6	ISM	ENSMUSG00000027651.17	ENSMUST00000103123.10	4504	7	-13	19395	-13	10102	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_3	31.2832223404176	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAAAAACTAGAAGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157870403	157900732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_157870966_157877915_157878046_157885325_157885460_157889838_157889949_157892006_157892134_157900571
tx.25026	chr2	+	1908	2	Intergenic	novelGene_831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACAGGGCCCTTTTTGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158020862	158023039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_158021061_158021329
tx.25027	chr2	-	1985	10	NNC	ENSMUSG00000037813.14	novel	3910	14	NA	NA	17308	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_6	2.51415744421884	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTTTGTTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158053834	158037667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_158038574_158042073_158042287_158042880_158043004_158044992_158045132_158046579_158046729_158047620_158047720_158050332_158050450_158052058_158052143_158053539_158053634_158053773
tx.25028	chr2	+	610	3	FSM	ENSMUSG00000044405.5	ENSMUST00000059889.4	632	3	18	4	18	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCCGATGTCCATTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	158344549	158350114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_158344790_158347711_158347842_158349874
tx.25029	chr2	-	1589	3	NNC	ENSMUSG00000048486.7	novel	3967	2	NA	NA	-25	-1941	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTGTATTAGTTGATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163314574	163310239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_163310334_163310795_163312039_163314322
tx.2503	chr11	+	1808	9	FSM	ENSMUSG00000020402.12	ENSMUST00000102758.8	2022	9	214	0	-61	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3003	junction_1	192.557742962988	3809	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCTTGTTGTTTTTGTTA	5345	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52251900	52280224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_52251980_52265125_52265196_52265744_52265795_52267217_52267371_52267474_52267528_52274676_52274905_52276409_52276561_52278242_52278301_52279258
tx.25030	chr2	-	3464	21	NNC	ENSMUSG00000017670.17	novel	3466	21	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_10	76.245983500772	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGCTTCCTATCCACACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165168399	165131074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_165132482_165134024_165134103_165136160_165136244_165136933_165137042_165137163_165137277_165137382_165137547_165138760_165138898_165139266_165139376_165139460_165139566_165140128_165140258_165140535_165140663_165143860_165143912_165146819_165146899_165150832_165150985_165152094_165152195_165153542_165153725_165156650_165156702_165157523_165157597_165157917_165157959_165158158_165158272_165168337
tx.25031	chr2	+	1274	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000118526.3	novel	577	8	NA	NA	32568	-23538	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTACTTATTGTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167989364	167991046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_+_167989554_167989961
tx.25035	chr2	+	2191	12	NIC	ENSMUSG00000023393.16	novel	2275	13	NA	NA	49	0	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	3	16	junction_8	63.6142818831128	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGTTGTTTTATTCAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180367104	180384073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_180367245_180373672_180373871_180374225_180374366_180375509_180375610_180377635_180377767_180378479_180378577_180378799_180378897_180379384_180379473_180381611_180381728_180382318_180382375_180382505_180382536_180383075
tx.25036	chr2	+	1856	9	NIC	ENSMUSG00000027575.20	novel	2714	14	NA	NA	7	7	intron_retention	FALSE	canonical	3	201	junction_1	27.9505702088526	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAACAAAAAGAAAGGAAGG	4052	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	180609044	180619324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_180609123_180609394_180609608_180612843_180612908_180613366_180613477_180613776_180613949_180614487_180615341_180615852_180615950_180618099_180618157_180619112
tx.25037	chr3	-	653	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000103034.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTGAATCAGAGTCTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5816163	5804890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_5805244_5815863
tx.25038	chr3	+	506	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000103461.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGGTGAAGGTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9098917	9116040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_9099143_9101427_9101512_9115843
tx.2504	chr11	+	1383	4	ISM	ENSMUSG00000020402.12	ENSMUST00000020673.3	891	8	9607	-874	-3327	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3141	junction_1	170.267110414457	461	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCTTGTTGTTTTTGTTA	8947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52274696	52280224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_52274905_52276409_52276561_52278242_52278301_52279258
tx.25041	chr3	+	180	2	Intergenic	novelGene_913	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCAAGCCTCCAACCAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21990974	21992765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_21991063_21992673
tx.25043	chr3	-	1076	3	Intergenic	novelGene_915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAGAAAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30910015	30907524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_30908399_30908507_30908628_30909933
tx.25044	chr3	+	2886	7	FSM	ENSMUSG00000027660.17	ENSMUST00000118470.8	6578	7	-41	3733	-41	-151	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	38.1113135725105	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTAATTTGAGCCTGTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31149165	31172989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_31149307_31150851_31152569_31165773_31165872_31167556_31167652_31170964_31171189_31171521_31171747_31172603
tx.25045	chr3	-	546	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000027671.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTTATAATCAGGCGGAT	1417	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32762649	32759340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_32759855_32762617
tx.25046	chr3	+	1478	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000074637.8	novel	2057	1	NA	NA	-360	0	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGCCTGAGTCTTTCATT	4247	False	NA	-8	True	NA	NA	NA	34704193	34706610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_34704430_34705368
tx.25047	chr3	+	223	2	ISM	ENSMUSG00000105265.6	ENSMUST00000197103.2	802	3	15001	116	-2861	-73	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGCTGGATCCTCCTGGTT	7377	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34707323	34729930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_34707434_34729817
tx.25048	chr3	+	1357	2	FSM	ENSMUSG00000105265.6	ENSMUST00000197697.2	2533	2	-12	1188	-12	661	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACACACACACACCCCACTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34719379	34730956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_34719598_34729817
tx.25049	chr3	-	1343	4	ISM	ENSMUSG00000027715.10	ENSMUST00000029270.10	2965	8	183	3288	-3	-2175	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1062	junction_3	36.1109401705356	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTATCTTCCTTCTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36626116	36622301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_36622961_36623128_36623239_36624884_36625129_36625786
tx.2505	chr11	+	1378	2	FSM	ENSMUSG00000036275.14	ENSMUST00000153855.2	1373	2	0	-5	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAGAAAAAAAAGGATCT	4558	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52287254	52295074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_52287431_52293872
tx.25050	chr3	-	824	4	NNC	ENSMUSG00000037325.11	novel	1288	4	NA	NA	0	359	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	15.542057635833	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATATATAGTAATTGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36667538	36663971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_36664505_36664714_36664800_36666160_36666227_36667398
tx.25051	chr3	+	2179	12	NIC	ENSMUSG00000037270.19	novel	3958	27	NA	NA	2	671	intron_retention	FALSE	canonical	3	50	junction_5	4.65859199102507	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTGTGTGGTAAAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36917306	36950283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_36917429_36918535_36918635_36924146_36924274_36928346_36928464_36929598_36929678_36931822_36931888_36939505_36939693_36941367_36941450_36941823_36942018_36943971_36944052_36944943_36945095_36949407
tx.25052	chr3	-	700	2	Intergenic	novelGene_926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTTTTTAGACTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40541677	40537180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_40537787_40541583
tx.25053	chr3	+	3813	19	FSM	ENSMUSG00000025757.14	ENSMUST00000204702.3	9479	19	14	5652	14	867	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_16	4.58930587290297	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTCCAGGGTTGGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40699875	40744886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_40700217_40705106_40705165_40707581_40707723_40711432_40711556_40714795_40714896_40715213_40715348_40721243_40721489_40721634_40721712_40722401_40722554_40723183_40723291_40724942_40725077_40726978_40727176_40733766_40733866_40735991_40736130_40738660_40738787_40739051_40739160_40739710_40739831_40741155_40741318_40743635
tx.25054	chr3	-	431	2	ISM	ENSMUSG00000049940.8	ENSMUST00000058578.8	3007	3	177	3954	177	-1760	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	569	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATCTTCATTTGGGGGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41037304	41024714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_41024871_41037029
tx.25057	chr3	+	1295	2	ISM	ENSMUSG00000044167.7	ENSMUST00000053764.7	8665	3	76864	6122	76864	-6122	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52252620	52254520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_52253812_52254416
tx.25058	chr3	-	1139	6	FSM	ENSMUSG00000042997.14	ENSMUST00000130348.2	4885	6	26	3720	0	-3720	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_4	7.03135833249878	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGAGTCATGTTTTCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53370718	53359728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_53360071_53360962_53361076_53363846_53363939_53365905_53366107_53369732_53369886_53370480
tx.25059	chr3	-	1541	3	Intergenic	novelGene_936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAATTATTGTCCATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53890041	53881703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_53882978_53883695_53883806_53889884
tx.2506	chr11	+	2459	3	FSM	ENSMUSG00000036275.14	ENSMUST00000109057.8	2472	3	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_1	2	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTTCTGTTAGTGTGTT	4571	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52287267	52299555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_52287431_52293872_52294385_52297771
tx.25060	chr3	+	1339	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000069014.5	novel	1488	1	NA	NA	-26	17	multi-exon	FALSE	canonical	1	269	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCAACATGCTTAGTCAT	5414	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54388832	54390363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_+_54389593_54389784
tx.25061	chr3	-	1427	8	NIC	ENSMUSG00000027793.7	novel	1560	9	NA	NA	5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3.99489470117416	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGGGGCTCTTTACTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54962471	54952889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_54953130_54954629_54954744_54955828_54956034_54957098_54957323_54957966_54958092_54958269_54958517_54961753_54961940_54962385
tx.25062	chr3	-	1430	8	NIC	ENSMUSG00000027793.7	novel	1560	9	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.0572763655761	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTGTTGGGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54962464	54952895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_54953130_54954629_54954744_54955828_54956034_54957098_54957323_54957966_54958092_54958269_54958517_54961753_54961940_54962369
tx.25063	chr3	-	2697	8	ISM	ENSMUSG00000034109.16	ENSMUST00000117242.8	4551	16	61972	197	-1895	99	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_7	6.5621051873462	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTATTTTTCTTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75802284	75783686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_75785485_75785952_75786025_75793581_75793651_75793979_75794148_75797828_75797939_75799195_75799279_75800089_75800344_75802141
tx.25064	chr3	-	1778	3	NNC	ENSMUSG00000028020.17	novel	1341	8	NA	NA	6278	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTTGCTCTTTACTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80758284	80750907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_80752565_80757734_80757786_80758214
tx.25066	chr3	+	1388	3	FSM	ENSMUSG00000027996.14	ENSMUST00000029625.8	2003	3	6	609	6	-609	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	5.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAACAGCTCGTTTTAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83673633	83681014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_83674351_83676632_83676714_83680424
tx.25067	chr3	-	2126	12	FSM	ENSMUSG00000028078.15	ENSMUST00000194452.2	2066	12	-55	-5	-50	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_7	39.3729781062936	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACACCTTTCTCTGTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86827736	86706222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_86706396_86706767_86706902_86712890_86713038_86713428_86713549_86720983_86721042_86722396_86722506_86723664_86723738_86731942_86732038_86739039_86739142_86743611_86743715_86813191_86813524_86827056
tx.25068	chr3	-	719	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000059994.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGCTGTATGATATCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87284714	87280255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_87280569_87283366_87283452_87284393
tx.25069	chr3	+	550	3	Intergenic	novelGene_946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGACTTAGCTCCACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87374844	87386232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_87375065_87385487_87385650_87386064
tx.2507	chr11	-	760	5	ISM	ENSMUSG00000020361.14	ENSMUST00000020630.8	4618	19	34409	1757	1193	1309	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1816	junction_4	84.8067656499173	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGTTGTCAACTTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53156875	53152397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_53152643_53153090_53153253_53153706_53153827_53155860_53155969_53156750
tx.25070	chr3	+	2970	14	FSM	ENSMUSG00000028060.15	ENSMUST00000198042.5	2567	14	-36	-367	-12	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_11	80.4603618093109	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAATGTGCATTGTTGTTTT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	88593097	88620236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_88593195_88593650_88593874_88596481_88596611_88596930_88597011_88600382_88600436_88600727_88600892_88603871_88604084_88606155_88606217_88607257_88607316_88607567_88607822_88616086_88616249_88617164_88617250_88618067_88618160_88618936
tx.25071	chr3	+	2124	15	NNC	ENSMUSG00000028060.15	novel	2567	14	NA	NA	4	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_14	121.805716832426	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGTGCATTGTTGTTTTT	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	88593124	88620237	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_88593195_88593650_88593874_88596481_88596611_88596930_88597011_88600382_88600436_88600727_88600892_88603871_88604084_88606155_88606217_88607257_88607316_88607567_88607822_88616086_88616249_88617164_88617250_88618067_88618160_88618936_88619045_88619864
tx.25074	chr3	+	1292	7	ISM	ENSMUSG00000027939.12	ENSMUST00000029548.9	5681	40	28	87364	26	-87364	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.687184270936277	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGGGGCTGGAGAAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90011466	90031960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_90011665_90014205_90014343_90022361_90022494_90025839_90025934_90027173_90027325_90029993_90030127_90031513
tx.25076	chr3	+	552	2	Intergenic	novelGene_949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAGAAAGAAAAAAAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94665574	94666223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_94665634_94665730
tx.25078	chr3	-	1144	4	ISM	ENSMUSG00000028108.17	ENSMUST00000029753.14	1895	11	3211	-1	-1338	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_2	2.35702260395516	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCGTTGTCTTTAGTGCG	8733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95643668	95641458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95641784_95642134_95642223_95642510_95642732_95643158
tx.25079	chr3	+	548	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028108.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTGGCTTCAAGTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95643854	95647282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_95644091_95646970
tx.2508	chr11	-	1086	8	ISM	ENSMUSG00000020361.14	ENSMUST00000020630.8	4618	19	30694	1757	-2522	1309	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1816	junction_4	182.057290825875	422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGTTGTCAACTTTGTTC	NA	False	NA	-68	True	NA	NA	NA	53160590	53152397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_53152643_53153090_53153253_53153706_53153827_53155860_53155969_53156750_53156877_53157792_53157946_53159316_53159413_53160514
tx.25080	chr3	-	1753	3	ISM	ENSMUSG00000028106.14	ENSMUST00000200164.5	7498	10	-279	25786	-48	-2159	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	109	junction_2	5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACTACTATTAAAGGAAA	9964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95726223	95693438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_95694697_95697411_95697542_95725858
tx.25081	chr3	+	2553	9	NIC	ENSMUSG00000038298.15	novel	531	2	NA	NA	-26	3	intron_retention	FALSE	canonical	2	4	junction_1	7.93626958967499	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTACTGTCGGAGGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96740515	96778065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_+_96740921_96757543_96757756_96758806_96759057_96761849_96761987_96763170_96763367_96764510_96764708_96775623_96775849_96776256_96776548_96777425
tx.25082	chr3	-	1189	10	ISM	ENSMUSG00000028089.6	ENSMUST00000197304.2	2941	16	6	18764	6	-18764	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	86.2914956541038	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTGGCCCAGGTTTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97517502	97497114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_97497319_97497869_97497963_97498520_97498677_97501323_97501487_97505007_97505090_97509337_97509370_97510324_97510440_97510975_97511083_97512413_97512527_97517378
tx.25083	chr3	-	1806	11	ISM	ENSMUSG00000038170.16	ENSMUST00000175751.8	4658	17	13415	134	13415	-134	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_8	8.90168523370715	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCCACAAGTCCCACGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97661832	97648266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_97648762_97649804_97649918_97650480_97650619_97650801_97650919_97653987_97654080_97654832_97654915_97655080_97655252_97659124_97659320_97660331_97660512_97661441_97661580_97661747
tx.25084	chr3	+	1230	6	NNC	ENSMUSG00000027876.5	novel	1021	6	NA	NA	82	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.4	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATGAGTGAGCGAGTTTC	2449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98129553	98144062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_98129812_98131972_98132157_98137099_98137195_98138463_98138602_98140320_98140427_98143613
tx.25085	chr3	+	2536	14	NNC	ENSMUSG00000027865.11	novel	3008	14	NA	NA	-35	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_1	26.8632301872778	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGCTGTCTTCTCAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100069798	100113969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_100069940_100077251_100077492_100078213_100078354_100085158_100085313_100085549_100085639_100089992_100090070_100093885_100094046_100095189_100095350_100098201_100098279_100098942_100099020_100101805_100101946_100103858_100103914_100109289_100109434_100113087
tx.25086	chr3	+	297	2	Intergenic	novelGene_951	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAGATTGTGGTGAGTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101207687	101209373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_+_101207827_101209215
tx.25087	chr3	-	694	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000105346.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTGGGTAAAATGACTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101991102	101964529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_101964717_101983860_101983964_101990051_101990218_101990864
tx.25088	chr3	-	3309	32	NIC	ENSMUSG00000027855.14	novel	3189	33	NA	NA	-40	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	35	junction_31	16.9376649901153	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTCTCATTGATTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102843456	102725811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_102726279_102726371_102726459_102727854_102727999_102748177_102748358_102752347_102752405_102758879_102758955_102759434_102759528_102760703_102760815_102761426_102761544_102772172_102772236_102772389_102772453_102783618_102783682_102786089_102786172_102800853_102800925_102803170_102803289_102806169_102806274_102807347_102807453_102816221_102816284_102820736_102820805_102822471_102822657_102823119_102823215_102827844_102827954_102829703_102829778_102830316_102830387_102832516_102832576_102836564_102836639_102838943_102839012_102841520_102841578_102841922_102841967_102842124_102842198_102842859_102842976_102843301
tx.25089	chr3	-	1976	3	FSM	ENSMUSG00000027845.16	ENSMUST00000063502.13	4113	3	-7	2144	4	136	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	24.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATTTGTTCCACTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103716701	103710064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_103711372_103714709_103714893_103716215
tx.2509	chr11	+	1259	4	FSM	ENSMUSG00000018239.10	ENSMUST00000018383.10	1267	4	3	5	3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	238	junction_3	30.2691628926573	734	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGGAATGATGTAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53215508	53224123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_53215569_53218095_53218255_53221513_53221559_53223128
tx.25090	chr3	+	948	2	ISM	ENSMUSG00000032952.12	ENSMUST00000047285.7	2799	10	11074	0	5644	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGTGCCTGTCGTCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103728017	103729341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_103728276_103728651
tx.25091	chr3	-	2526	7	ISM	ENSMUSG00000027893.15	ENSMUST00000144864.8	1689	10	1836	-1360	771	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	702	junction_5	35.2971512857467	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATTTAGTAGTCGTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107576054	107570438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_107572430_107572831_107572953_107574457_107574537_107574955_107575025_107575382_107575482_107575565_107575661_107575982
tx.25092	chr3	-	2267	6	NIC	ENSMUSG00000027881.15	novel	2508	7	NA	NA	-12	-441	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	21	junction_4	164.179170420611	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTTTTGTAGGTGTGA	6838	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108819055	108810903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_108812079_108812426_108812651_108815102_108815164_108815247_108815400_108815641_108815721_108818479
tx.25093	chr3	+	613	5	ISM	ENSMUSG00000027959.15	ENSMUST00000198386.5	1894	14	3	14107	3	2254	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_4	8.4372685153431	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTTTTTAAATTTAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116388633	116401144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_116388828_116397110_116397172_116398845_116398926_116399313_116399419_116400971
tx.25094	chr3	+	264	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033377.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCGCCTGTGTGGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116753540	116753922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_116753676_116753793
tx.25095	chr3	-	3062	14	FSM	ENSMUSG00000028134.12	ENSMUST00000029780.12	3364	14	50	252	-31	-252	multi-exon	TRUE	canonical	3	41	junction_1	15.6821233920295	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGGAGGTTTGATGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119576987	119512642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_119514110_119514255_119514334_119514437_119514655_119517742_119517836_119518260_119518295_119519714_119519855_119533963_119534160_119541240_119541352_119541438_119541604_119545512_119545657_119546592_119546766_119555351_119555428_119575152_119575184_119576850
tx.25096	chr3	-	230	2	ISM	ENSMUSG00000039865.9	ENSMUST00000039197.9	2620	15	119	72139	119	-11516	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTATGGCTGCTTGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121325934	121325315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_121325421_121325809
tx.25097	chr3	+	2491	3	ISM	ENSMUSG00000039831.17	ENSMUST00000198914.2	3758	12	17621	0	8264	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	5.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTCAGGTTCTTATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121804901	121809803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_121805230_121805713_121805823_121807749
tx.25098	chr3	-	3995	15	NIC	ENSMUSG00000039735.17	novel	5357	15	NA	NA	-9	-12	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	47	junction_1	12.9545910229319	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTCATGGTCAGTTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122413373	122332385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr3_-_122334574_122335773_122335933_122338192_122338342_122339948_122340044_122340591_122340725_122342804_122342915_122351551_122351756_122352668_122352816_122354481_122354611_122357483_122357589_122362401_122362465_122363243_122363392_122364539_122364594_122383776_122383893_122413178
tx.25099	chr3	-	1314	4	Intergenic	novelGene_963	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCGCATTTTCTTCATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122477898	122455318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_122456152_122457726_122457862_122459901_122459995_122477645
tx.251	chr1	-	765	5	NNC	ENSMUSG00000025978.15	novel	1870	8	NA	NA	7787	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_4	3.56195171219375	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCTACTACTATCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55237861	55210905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_55211242_55224108_55224188_55233402_55233507_55234674_55234797_55237737
tx.2510	chr11	-	485	2	FSM	ENSMUSG00000044894.15	ENSMUST00000061326.5	1521	2	5	1031	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5710	junction_1	0	39971	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGACTTTGTGTGCTT	2952	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53321649	53319779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_53319978_53321362
tx.25100	chr3	-	300	2	Intergenic	novelGene_966	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTGCGTGTAATTCTTT	1009	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123235136	123234750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr3_-_123234896_123234981
tx.25101	chr3	-	759	2	ISM	ENSMUSG00000028028.12	ENSMUST00000161239.2	829	3	51021	-292	79	292	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCGTCTCATCTTGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127523141	127517641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_127518179_127522919
tx.25102	chr3	-	592	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041220.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTGAGTGCTCTCCTGT	4552	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129328167	129326262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_-_129326668_129327980
tx.25103	chr3	+	994	3	NNC	ENSMUSG00000028030.13	novel	5195	3	NA	NA	2	-4227	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	41	junction_1	37	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGTTATCTAGTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132389906	132400663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_132390160_132392532_132392754_132400143
tx.25104	chr3	+	1274	5	ISM	ENSMUSG00000028161.18	ENSMUST00000070198.14	4758	13	232943	1845	-82	103	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_1	28.4165444767656	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	ATAAAAAATAAAAAAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136608827	136641643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_+_136608990_136611059_136611135_136627593_136627679_136634282_136634381_136640789
tx.25105	chr3	-	3106	11	NNC	ENSMUSG00000028158.15	novel	3963	18	NA	NA	17035	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	4	junction_5	5.11957029446808	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCTTTTGTCTTGGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137820103	137795614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_137796991_137798339_137798511_137800719_137800845_137808847_137809076_137810427_137810546_137810699_137810802_137812862_137813072_137814716_137814930_137817404_137817513_137818220_137818390_137819816
tx.25106	chr3	-	3510	14	FSM	ENSMUSG00000028149.13	ENSMUST00000029796.11	3383	14	-122	-5	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_10	15.970386796752	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGATTACTTGGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138780953	138631665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_138633474_138647490_138647620_138651423_138651551_138661082_138661223_138661954_138662081_138663170_138663306_138664314_138664447_138664796_138664941_138669585_138669712_138671628_138671758_138721306_138721433_138727573_138727697_138756241_138756350_138780796
tx.25107	chr3	-	636	5	ISM	ENSMUSG00000028149.13	ENSMUST00000196280.5	3598	15	-15	57801	-4	-26570	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_1	7.84219357067906	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTTGCTTTTTCTGTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138780913	138689467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_138689630_138721306_138721433_138727573_138727697_138756241_138756350_138780796
tx.25108	chr3	-	1271	4	FSM	ENSMUSG00000028266.18	ENSMUST00000121112.6	1447	4	278	-102	246	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	4.78423336480244	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGGGTTTAAACGCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143907815	143894290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_143895067_143899656_143899813_143900167_143900265_143907573
tx.25109	chr3	-	1042	2	ISM	ENSMUSG00000037033.10	ENSMUST00000159989.2	3361	14	24017	0	24017	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAGTATTTCCTTAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144531101	144528383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_144529296_144530971
tx.2511	chr11	-	409	3	FSM	ENSMUSG00000044894.15	ENSMUST00000109021.4	405	3	-4	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	885	junction_2	2412.5	6354	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTGACTTTGTGTGCTT	2943	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53321658	53319779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_53319978_53321362_53321530_53321614
tx.25110	chr3	-	932	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000047676.7	novel	885	1	NA	NA	-78	86	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAATGATAGCTATAATATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149779257	149778208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_149778400_149778516
tx.25111	chr3	-	981	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000047676.7	novel	885	1	NA	NA	-78	83	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAATGATAGCTATAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149779257	149778211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr3_-_149778430_149778494
tx.25112	chr3	-	2387	3	FSM	ENSMUSG00000028035.14	ENSMUST00000050073.13	2464	3	44	33	44	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGAGTCCTATAGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151899438	151889624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_-_151891018_151892051_151892621_151899013
tx.25113	chr3	+	4494	14	NNC	ENSMUSG00000039068.17	novel	7539	14	NA	NA	-4	227	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	83.4846830723595	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGATAGTATATATCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152102326	152165416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_+_152102399_152125651_152125778_152128256_152128409_152132913_152134470_152152435_152152575_152154415_152154564_152154649_152154766_152155281_152155354_152156246_152156349_152156939_152157036_152157627_152157781_152161456_152161592_152163505_152163607_152163890
tx.25114	chr3	+	440	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052544.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTGGTGGTGATTTCTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153067920	153068794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr3_+_153067971_153068404
tx.25115	chr3	-	3409	3	ISM	ENSMUSG00000053870.8	ENSMUST00000066568.6	3518	4	1843	6	995	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAAGTAGAAATTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154797197	154790560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr3_-_154793707_154795748_154795842_154797027
tx.25116	chr3	+	2601	3	FSM	ENSMUSG00000028182.15	ENSMUST00000195418.6	2148	3	-7	-446	-7	446	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGACCCTGATTCATTTTG	2778	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	154799063	154808709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr3_+_154799308_154804341_154804591_154806601
tx.25117	chr3	-	702	3	NNC	ENSMUSG00000105834.2	novel	661	2	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCAAATAGTGTGTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157239727	157233151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr3_-_157233732_157238409_157238451_157239646
tx.25118	chr4	+	2832	2	NNC	ENSMUSG00000083068.2	novel	579	2	NA	NA	-1207	601	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGGTTAAAACTTTACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8117412	8120337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_8118456_8118548
tx.25119	chr4	-	1535	14	NNC	ENSMUSG00000028207.19	novel	2884	14	NA	NA	-19	-1322	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	177.753702347447	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACTGTGTTGAACTGATG	9	False	9669114	NA	False	NA	NA	NA	9669105	9576588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_9576974_9580219_9580294_9583811_9583857_9594662_9594699_9595376_9595416_9598268_9598302_9601306_9601364_9602468_9602502_9604515_9604630_9607796_9607872_9610842_9610939_9635896_9635970_9639197_9639348_9668780
tx.2512	chr11	+	1189	3	ISM	ENSMUSG00000018398.19	ENSMUST00000117061.8	4563	10	17703	2186	5452	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_2	16	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGGACTTCTTTATGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53428329	53432737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_53428447_53428551_53428743_53431856
tx.25120	chr4	+	2163	3	NIC	ENSMUSG00000028212.17	novel	2908	12	NA	NA	6	-189	intron_retention	FALSE	canonical	3	208	junction_1	47	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGATTATGTAGCAT	321	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11191741	11194850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_11191816_11192680_11192912_11192992
tx.25121	chr4	-	3665	14	NIC	ENSMUSG00000040728.16	novel	3696	14	NA	NA	43	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_8	2.77776462850274	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCGCACTCTTCTTCTTG	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11386740	11331932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_11333474_11353294_11353464_11357459_11357659_11359737_11359957_11360953_11361256_11365003_11365047_11365143_11365277_11365373_11365485_11366907_11366963_11367084_11367184_11379290_11379406_11384348_11384463_11385646_11385776_11386304
tx.25122	chr4	+	2307	6	NNC	ENSMUSG00000028214.14	novel	2006	5	NA	NA	-9659	21	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.4	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAGACAAGTATGAGTCTT	7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	11694797	11714773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_11694903_11704281_11704567_11705904_11706242_11711138_11711216_11711969_11712175_11713475
tx.25123	chr4	+	959	7	NNC	ENSMUSG00000086587.8	novel	876	6	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	23.7726500182224	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATGGTACAGAATTTTTG	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	14930660	14953031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_14930771_14936440_14936540_14938138_14938221_14938483_14938558_14942199_14942276_14947438_14947546_14952620
tx.25124	chr4	-	576	2	ISM	ENSMUSG00000041135.16	ENSMUST00000183871.2	2804	12	39160	634	39160	-634	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTGTAGTTCAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16124483	16123374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_16123892_16124424
tx.25125	chr4	+	950	3	NNC	ENSMUSG00000028226.16	novel	853	4	NA	NA	182	-141811	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGGAGTTGTGTTTTAAA	8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	17853272	17854482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_17853488_17853645_17853853_17853954
tx.25126	chr4	-	3340	25	FSM	ENSMUSG00000041058.16	ENSMUST00000108246.9	6440	25	30	3070	30	-1700	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_17	21.4877225927324	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGAATTTGCTTTGCCTT	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	19708963	19611372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_19611814_19618284_19618358_19619155_19619253_19621927_19622033_19623101_19623223_19627632_19627774_19627871_19628006_19631045_19631206_19635253_19635343_19638604_19638677_19638774_19638851_19639951_19640081_19640194_19640280_19640360_19640416_19641733_19641909_19643365_19643462_19650115_19650441_19659562_19659748_19661965_19662033_19662121_19662260_19672418_19672544_19673155_19673295_19678344_19678436_19687790_19687887_19708838
tx.25127	chr4	-	1026	8	ISM	ENSMUSG00000041058.16	ENSMUST00000108246.9	6440	25	30	51200	30	-49830	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_3	14.6747040438814	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCCATTTGCTTTATTATA	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	19708963	19659502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_19659748_19661965_19662033_19662121_19662260_19672418_19672544_19673155_19673295_19678344_19678436_19687790_19687887_19708838
tx.25128	chr4	+	2317	8	ISM	ENSMUSG00000040455.18	ENSMUST00000108232.9	3977	19	-8	37706	-8	1505	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_5	4.80221037542046	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCCAATGTTAAGATGAATG	10	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	21776289	21800166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_21776318_21780340_21780451_21781735_21781909_21782882_21782987_21784692_21784794_21796785_21796929_21797294_21797391_21798604
tx.25129	chr4	+	2492	9	FSM	ENSMUSG00000040410.15	ENSMUST00000184455.8	2478	9	-11	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	22.7156333832011	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTTGTTAAGAATCTTT	-22	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	22357559	22434091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_22357682_22375660_22375771_22376495_22377078_22385906_22386253_22390713_22390922_22403531_22403746_22422716_22422789_22427149_22427463_22433566
tx.2513	chr11	+	1374	9	ISM	ENSMUSG00000018395.20	ENSMUST00000057330.15	2290	17	-9	14182	-9	28	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	61	junction_1	8.55496931613434	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAAGGGGTAAGTTTTGCTC	910	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53458196	53477750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_53458359_53461362_53461637_53469670_53469816_53469926_53470012_53470554_53470661_53474053_53474194_53474641_53474840_53475097_53475273_53477661
tx.25130	chr4	+	1900	6	NIC	ENSMUSG00000028282.13	novel	6557	11	NA	NA	-7	1352	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	27	junction_1	85.2089197208837	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAAGGAAGAAAAGAGGTTG	-5	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	32615443	32640853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_32615493_32630177_32630247_32631065_32631167_32631805_32631881_32634767_32634884_32639363
tx.25131	chr4	+	1551	9	ISM	ENSMUSG00000058006.13	ENSMUST00000071642.11	17970	102	-12	103619	-12	7418	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	9	junction_6	4.52596674755792	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTCACCTGCATAATCT	4330	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32657106	32671588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_32657353_32662832_32663060_32666392_32666618_32667090_32667199_32667271_32667465_32668798_32669042_32669462_32669595_32670566_32670671_32671515
tx.25132	chr4	-	1184	2	FSM	ENSMUSG00000040128.10	ENSMUST00000049357.10	1648	2	460	4	460	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTAGTCTTGGCTTTTTGTG	687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33248050	33245426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_33246508_33247947
tx.25133	chr4	-	1738	11	FSM	ENSMUSG00000028294.16	ENSMUST00000108136.8	1688	11	-45	-5	-17	5	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	1.88679622641132	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGTGTATTTTTTTCCTG	-29	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34730223	34711326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_34711596_34714394_34714536_34716304_34716504_34719044_34719165_34719572_34719782_34721415_34721575_34722607_34722797_34724814_34724906_34727904_34727989_34728795_34728909_34730059
tx.25134	chr4	-	557	5	NIC	ENSMUSG00000028294.16	novel	557	5	NA	NA	3	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.87228132326901	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGGGGTGTTTTGTTTTGTTT	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34730192	34723560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_34723697_34724814_34724906_34727904_34727989_34728795_34728909_34730059
tx.25135	chr4	-	3284	10	NIC	ENSMUSG00000028300.15	novel	3413	10	NA	NA	-19	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	67	junction_7	11.3627070327062	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATGTTTTAGTTCATTAT	-30	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	35225853	35191284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_35193295_35194136_35194195_35196972_35197209_35205767_35205885_35211291_35211365_35213008_35213074_35213548_35213645_35217212_35217273_35218413_35218917_35225787
tx.25136	chr4	+	1944	2	Intergenic	novelGene_982	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTTGTCACTATTCTTT	9292	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40898289	40900339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_40900137_40900242
tx.25137	chr4	+	405	4	NNC	ENSMUSG00000028415.5	novel	397	4	NA	NA	3501	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.62466929133727	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGTGAAGTGGCCCAGTC	3499	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40923554	40931391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_40923671_40924923_40924965_40929078_40929192_40931256
tx.25138	chr4	-	1608	5	ISM	ENSMUSG00000028438.17	ENSMUST00000108055.9	5593	13	-59	22802	-12	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_4	10.280442597476	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTAGCTTGGATACATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41464899	41413546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_41414045_41414901_41415000_41423451_41423636_41428344_41428983_41464709
tx.25139	chr4	-	288	3	Intergenic	novelGene_985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCCACTGCCTCCCTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42735142	42734528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_42734691_42734804_42734865_42735076
tx.2514	chr11	+	2299	17	FSM	ENSMUSG00000018395.20	ENSMUST00000057330.15	2290	17	-11	2	-11	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_9	19.4950915296646	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTGGAGAGAACTCCTTA	908	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53458194	53491930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_53458359_53461362_53461637_53469670_53469816_53469926_53470012_53470554_53470661_53474053_53474194_53474641_53474840_53475097_53475273_53477661_53477758_53484200_53484358_53484745_53484927_53485103_53485215_53485652_53485779_53488785_53488840_53489120_53489190_53489533_53489659_53491837
tx.25140	chr4	+	540	5	NNC	ENSMUSG00000028457.19	novel	670	9	NA	NA	2	-27673	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	3.03108891324554	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGTTTTGGGAGTTTGTT	2	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	43267186	43297211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_43267243_43271243_43271288_43291032_43291170_43291656_43291732_43296983
tx.25141	chr4	+	1390	2	ISM	ENSMUSG00000035969.16	ENSMUST00000131668.3	5093	10	10901	3	2006	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGCCATTTTCTTTGTGCC	9435	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43425596	43427085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_43426129_43426227
tx.25142	chr4	-	1494	8	NNC	ENSMUSG00000028465.17	novel	8393	57	NA	NA	13293	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	100.708713118375	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCAGCCTGGCTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43534354	43531517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_43532086_43532191_43532321_43532829_43533013_43533125_43533189_43533303_43533430_43533553_43533679_43533862_43533969_43534160
tx.25143	chr4	-	956	2	Intergenic	novelGene_991	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATGTTTTTATTAGTTGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53327961	53318487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_53319316_53327833
tx.25144	chr4	-	705	5	NNC	ENSMUSG00000028431.12	novel	6160	37	NA	NA	9901	-12620	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	132.720335668653	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGGCTTCATCTCAGAATT	9897	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56792430	56789085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_56789436_56790130_56790225_56790887_56791012_56792026_56792118_56792384
tx.25145	chr4	+	2749	2	FSM	ENSMUSG00000038729.25	ENSMUST00000102902.4	6993	2	401	3843	401	-3843	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAACAAAAAAACAAAGA	5401	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57854559	57893139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_57857038_57892868
tx.25146	chr4	-	3392	4	NNC	ENSMUSG00000038668.15	novel	3512	4	NA	NA	5637	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	30	junction_3	114.601725796585	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGATGTGTGGTTCTGGT	2947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58542764	58435257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_58437635_58486476_58487225_58504621_58504782_58542657
tx.25147	chr4	-	2109	12	NIC	ENSMUSG00000038578.16	novel	3295	17	NA	NA	275	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	9	junction_4	23.5308835222744	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGATTTGCATTTACCTT	27	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	59438358	59329209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_59329722_59332936_59333034_59349825_59350013_59351637_59351730_59379598_59379786_59380860_59380959_59390572_59390753_59411269_59411450_59412169_59412323_59423994_59424151_59427950_59428065_59438205
tx.25148	chr4	-	1349	11	FSM	ENSMUSG00000028391.17	ENSMUST00000107452.8	1437	11	-12	100	-3	-100	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	57	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTGTGTGGCTTTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62389136	62371970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_62372175_62374047_62374211_62375676_62375819_62377052_62377121_62378558_62378660_62378756_62378902_62380377_62380453_62381580_62381711_62382163_62382307_62387073_62387171_62389055
tx.25149	chr4	+	2171	6	FSM	ENSMUSG00000028392.16	ENSMUST00000107449.4	2167	6	-6	2	-6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_5	4.63033476111609	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATGTCTTTGCTGGTAAC	9550	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62398283	62415533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_62398675_62400854_62400954_62404649_62404881_62406422_62406449_62412969_62413095_62414234
tx.2515	chr11	+	964	9	ISM	ENSMUSG00000018395.20	ENSMUST00000057330.15	2290	17	19504	2	-7067	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	26.1435340954508	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTGGAGAGAACTCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53477709	53491930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_53477758_53484200_53484358_53484745_53484927_53485103_53485215_53485652_53485779_53488785_53488840_53489120_53489190_53489533_53489659_53491837
tx.25150	chr4	+	2645	7	NIC	ENSMUSG00000059810.19	novel	496	2	NA	NA	4	-2	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	2	7	junction_1	17.9071680247511	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTCTCTGTGTATTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62581862	62621253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_62582030_62607735_62608864_62615507_62615570_62618234_62618337_62618590_62618653_62619270_62619438_62620296
tx.25151	chr4	-	1251	2	Intergenic	novelGene_997	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGAAAAAACATACAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66556474	66555011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_66555778_66555989
tx.25152	chr4	+	1220	5	NNC	ENSMUSG00000038007.15	novel	4216	6	NA	NA	11616	-2919	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.76662979332984	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAGGTTCCAGAACTTTT	7700	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86804266	86836193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_86804506_86805260_86805403_86818718_86818857_86829852_86829991_86835630
tx.25153	chr4	-	2345	8	NNC	ENSMUSG00000028497.13	novel	4680	7	NA	NA	-5	-738	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	2.9277002188456	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGTCACCTGTATGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88357157	88329315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_88330895_88332483_88332584_88337935_88338062_88341227_88341335_88344972_88345086_88353175_88353304_88355696_88355801_88357069
tx.25154	chr4	+	523	4	NNC	ENSMUSG00000087366.8	novel	730	4	NA	NA	-593	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACTGTGGTCCTTATCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94940594	94955659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_94940620_94950823_94950941_94953849_94953982_94955410
tx.25155	chr4	-	1576	2	FSM	ENSMUSG00000044125.7	ENSMUST00000143332.2	665	2	24	-935	24	407	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTGTTTATTTTACGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95855248	95847544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_95848895_95855022
tx.25156	chr4	-	978	7	NNC	ENSMUSG00000028563.17	novel	1027	7	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	212.976328888134	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTGACCTGTTATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98271493	98243606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_98243918_98246154_98246285_98253799_98253874_98258728_98258821_98263156_98263266_98268854_98268930_98271306
tx.25157	chr4	+	1879	10	ISM	ENSMUSG00000061859.18	ENSMUST00000238306.2	7416	45	36030	221970	-5122	0	internal_fragment	FALSE	canonical	2	12	junction_2	3.62092683040007	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTCTTTTAAATTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98320057	98385870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_98320137_98325566_98325708_98329290_98329380_98331987_98332045_98344366_98344502_98353270_98353433_98357709_98357842_98379774_98379985_98383261_98383376_98385110
tx.25158	chr4	-	600	2	ISM	ENSMUSG00000028556.16	ENSMUST00000206128.2	1507	8	11392	4	4155	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	154	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTTTAATGAGTGGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98829287	98825094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_98825538_98829130
tx.25159	chr4	+	2958	11	FSM	ENSMUSG00000028550.16	ENSMUST00000030279.15	3178	11	220	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	14.1265707091282	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACACTTTTGTTTTGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99082390	99148024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_99082690_99100813_99100949_99104114_99104199_99106201_99106436_99109428_99109760_99111109_99111181_99112650_99112788_99116792_99116872_99117724_99117802_99123303_99123424_99146633
tx.2516	chr11	+	701	7	ISM	ENSMUSG00000018395.20	ENSMUST00000118353.9	2178	19	26451	-44	27	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_3	7.01585505994973	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTGGAGAGAACTCCTTA	5949	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53484803	53491930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_53484927_53485103_53485215_53485652_53485779_53488785_53488840_53489120_53489190_53489533_53489659_53491837
tx.25160	chr4	+	2561	10	NIC	ENSMUSG00000073792.12	novel	3079	15	NA	NA	3	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_3	60.5042596194579	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGTTTGCGTGTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99603904	99651695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_99603944_99607267_99607471_99615099_99615185_99632726_99632863_99634562_99634649_99636922_99637008_99638965_99639037_99641053_99641123_99641229_99641429_99650107
tx.25161	chr4	+	2249	6	ISM	ENSMUSG00000028532.15	ENSMUST00000030257.15	5765	27	212764	-15	-5172	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_3	16.252999723128	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGACGTGCTGTTTCTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100846635	100861756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_100846693_100848020_100848173_100849925_100850088_100851231_100851310_100851931_100852034_100860058
tx.25162	chr4	-	740	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028527.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCCAACGCTCTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101276855	101275975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_101276629_101276768
tx.25163	chr4	+	762	5	ISM	ENSMUSG00000028528.18	ENSMUST00000154120.9	1569	12	82	11605	65	-4402	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	22	junction_1	44.1644653539472	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTGGTGTTTTATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101353909	101464146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_101353961_101454997_101455149_101456147_101456198_101456291_101456441_101463785
tx.25164	chr4	-	1210	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028517.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCAGTACTCATTAGCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105015291	105010307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_105010841_105011329_105011614_105014898
tx.25165	chr4	+	2001	2	ISM	ENSMUSG00000028517.9	ENSMUST00000064139.8	3159	6	62017	8	62017	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACCAAGGCACTGGTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105076560	105089953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_105076702_105088093
tx.25166	chr4	+	499	2	Intergenic	novelGene_1009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGGGTTTCAAAGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105141259	105145441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_105141535_105145217
tx.25167	chr4	+	848	5	ISM	ENSMUSG00000034926.4	ENSMUST00000047973.4	4028	9	44	15235	44	-15235	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	351	junction_3	21.3585462988472	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCCGCGAGTCCCAGCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106418278	106431075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_106418595_106421597_106421754_106428608_106428715_106429421_106429541_106430924
tx.25168	chr4	+	821	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000054362.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATAAGTCTTATCTCTTG	8607	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106473066	106476860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_106473196_106475245_106475410_106476235_106476341_106476437
tx.25169	chr4	+	544	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028617.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAACAATCTGAAAGGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107090710	107093073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_107091180_107092998
tx.2517	chr11	-	587	3	ISM	ENSMUSG00000020380.17	ENSMUST00000124352.2	2211	12	-22	18742	2	-10076	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	253	junction_2	43.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGAATTTAAAACCTTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53598144	53592823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_53592936_53596811_53596896_53597753
tx.25170	chr4	-	1033	2	ISM	ENSMUSG00000028610.17	ENSMUST00000131508.2	704	3	1453	-612	1453	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGTGAAAGCTTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107536704	107533488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_107534267_107536449
tx.25171	chr4	+	534	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028597.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTCCTCTCTTGAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108240531	108262891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_108240742_108256265_108256381_108260235_108260329_108262775
tx.25172	chr4	+	3277	25	FSM	ENSMUSG00000028582.15	ENSMUST00000030320.13	3303	25	26	0	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_8	22.4730934798829	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTATGTAGCCATTTTTA	3559	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108477162	108491320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_108477271_108478708_108478792_108480647_108480793_108481640_108481745_108482042_108482202_108482604_108482731_108482851_108483012_108483177_108483351_108483497_108483574_108483676_108483788_108483870_108484002_108484244_108484318_108484490_108484616_108485027_108485146_108485226_108485400_108485779_108485906_108486770_108486830_108486913_108487031_108487288_108487363_108487474_108487534_108487740_108487793_108488792_108488893_108489031_108489123_108490367_108490501_108490719
tx.25173	chr4	-	285	2	ISM	ENSMUSG00000034557.15	ENSMUST00000042185.8	2170	16	34605	45611	34605	-45611	internal_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTTTTAGAGGCCTTATA	5947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108546468	108542066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_108542229_108546345
tx.25174	chr4	+	941	10	ISM	ENSMUSG00000028552.14	ENSMUST00000132165.9	2295	23	-101	63207	8	9047	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	134	junction_9	25.3113940087595	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATATGTGTGGTTGTCTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109137507	109179455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_109137642_109154383_109154426_109161947_109162038_109162873_109162922_109166321_109166418_109169500_109169567_109170074_109170201_109173041_109173102_109178324_109178415_109179266
tx.25175	chr4	-	1332	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000057977.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGCAACACTAGAGATAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114075869	114074113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_114074866_114075289
tx.25176	chr4	+	2793	11	FSM	ENSMUSG00000034210.15	ENSMUST00000106525.9	2792	11	-4	3	-4	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_6	11.0657128102983	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAGCCTCAGAATATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115594936	115631629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_115596038_115597588_115597738_115603654_115603801_115610117_115610217_115613629_115613741_115616005_115616093_115617066_115617259_115619414_115619496_115621768_115621881_115623589_115623710_115631034
tx.25177	chr4	+	2673	22	FSM	ENSMUSG00000028700.15	ENSMUST00000106498.8	2719	22	44	2	37	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	321	junction_9	36.7984644262092	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGGGGTGTATTTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116007758	116017039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_116007815_116008261_116008441_116009016_116009132_116009273_116009393_116009905_116009972_116010059_116010174_116010747_116010866_116011038_116011138_116011288_116011417_116011738_116011810_116012027_116012104_116012259_116012344_116012425_116012468_116012656_116012716_116012925_116012999_116013082_116013212_116013292_116013419_116015089_116015155_116015348_116015394_116015619_116015756_116016179_116016290_116016376
tx.25178	chr4	+	1241	5	NIC	ENSMUSG00000034035.19	novel	1908	12	NA	NA	-5	-190	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTGACTGAAACACTGAA	6270	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116454951	116457208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_116455159_116455696_116456023_116456157_116456362_116456485_116456865_116457083
tx.25179	chr4	+	2096	3	NIC	ENSMUSG00000034035.19	novel	2003	13	NA	NA	25	1	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAAACTGGCTGGCATTCA	6300	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116454981	116457420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_+_116456362_116456485_116456865_116457083
tx.2518	chr11	+	2129	10	FSM	ENSMUSG00000018899.18	ENSMUST00000108920.10	2136	10	8	-1	8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	9.82940913537621	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTGTGGCTTTTTATTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53660848	53668150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_53661105_53662109_53662202_53663664_53663765_53664481_53664659_53664751_53664802_53664887_53665021_53665171_53665295_53665879_53665930_53666743_53666880_53667138
tx.25180	chr4	+	2574	10	ISM	ENSMUSG00000033985.18	ENSMUST00000045542.13	3033	11	20827	-9	92	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_6	8.27460789418261	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGATTTTGCTGTATAGCT	2191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116598971	116661448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_116599116_116608301_116608424_116628996_116629046_116649284_116649432_116657729_116657813_116658356_116658442_116658645_116658730_116658916_116659004_116659420_116659539_116659793
tx.25181	chr4	+	1201	4	ISM	ENSMUSG00000046861.10	ENSMUST00000050067.10	4583	21	7358	1086	-181	742	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_1	3.2659863237109	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCTTTTGGGATCCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116859871	116861388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_116860009_116860130_116860213_116860315_116860388_116860478
tx.25182	chr4	-	699	3	ISM	ENSMUSG00000028680.15	ENSMUST00000147730.2	2161	15	3779	-2	3779	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	157	junction_2	18	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAAGGCCTTATCATTCC	7162	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116987217	116985851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_116986376_116986482_116986597_116987156
tx.25183	chr4	-	759	2	Intergenic	novelGene_1015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACTGGGGAATGCCAATAT	6449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117176501	117172210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_117172818_117176349
tx.25185	chr4	-	2029	12	NNC	ENSMUSG00000033326.16	novel	4663	22	NA	NA	1	-9361	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.1580544970325	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATGTGTATGTGTGTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118036850	118015608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_118015808_118017330_118017702_118018851_118019052_118019591_118019840_118021575_118021714_118022043_118022148_118023581_118023632_118025581_118025776_118027118_118027234_118032750_118032927_118034591_118034774_118036798
tx.25186	chr4	-	2681	10	FSM	ENSMUSG00000032870.9	ENSMUST00000043200.8	2905	10	220	4	220	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	186	junction_3	19.2841007882109	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTTTGCTCGGCTGTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120874224	120825517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_120826862_120829086_120829404_120830289_120830456_120831582_120831690_120832568_120832651_120834147_120834235_120839323_120839403_120840303_120840390_120842391_120842526_120873945
tx.25187	chr4	+	1756	8	ISM	ENSMUSG00000028894.19	ENSMUST00000094782.10	3809	24	49655	0	-3780	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	29.70260759528	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATGGTTCTCTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124685297	124695304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_124685410_124685985_124686149_124686966_124687203_124689148_124689263_124691617_124691703_124692044_124692173_124693560_124693673_124694498
tx.25188	chr4	+	620	2	Intergenic	novelGene_1024	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGTGTATAAAATGTGTCT	7784	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125060547	125087759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_125060672_125087263
tx.25189	chr4	-	1024	4	NIC	ENSMUSG00000085562.8	novel	3623	7	NA	NA	52	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.63299316185545	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGGTTCCTTTCAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125816158	125784205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_125784527_125786974_125787070_125812280_125812600_125815869
tx.2519	chr11	+	1255	4	ISM	ENSMUSG00000018899.18	ENSMUST00000019043.13	2069	10	3917	-1	1259	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_3	1.69967317119759	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTGTGGCTTTTTATTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53665237	53668150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_53665295_53665879_53665930_53666743_53666880_53667138
tx.25190	chr4	-	1252	6	NIC	ENSMUSG00000085562.8	novel	3623	7	NA	NA	-50	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.62480768092719	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTGTGGTTCCTTTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125816153	125784207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_125784527_125785276_125785384_125786974_125787070_125787635_125787764_125812280_125812600_125815869
tx.25191	chr4	-	1762	4	NNC	ENSMUSG00000043962.17	novel	378	4	NA	NA	8	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	291.823005718649	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGACTGTGTTTGTTGCTTG	6795	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126096432	126057874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_126059439_126080341_126080382_126088109_126088198_126096362
tx.25192	chr4	-	3679	7	FSM	ENSMUSG00000028833.14	ENSMUST00000030637.14	3681	7	-9	11	-9	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_6	31.1216252074913	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGAAGCCTCCTTTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126647211	126637553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_126639065_126640338_126640482_126640888_126641114_126642270_126642513_126643677_126644647_126645733_126645875_126646763
tx.25193	chr4	+	802	3	NNC	ENSMUSG00000028830.15	novel	406	3	NA	NA	-3	-11692	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_2	16.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTAATTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126647583	126670435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_126647789_126650691_126650862_126670008
tx.25194	chr4	-	2080	11	NNC	ENSMUSG00000028789.17	novel	2063	11	NA	NA	0	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	8.67698104181403	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAGTGGAATCATTCACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128856232	128825801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_128826285_128828249_128828465_128839849_128839963_128841251_128841412_128842584_128842751_128843382_128843518_128844392_128844566_128853576_128853751_128855155_128855353_128855876_128855998_128856089
tx.25195	chr4	-	700	3	ISM	ENSMUSG00000040928.16	ENSMUST00000106061.9	4426	7	68	34048	24	-253	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_2	62.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGGAAAATCCTGCCTCCCTT	1256	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129083267	129075845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_129076326_129077393_129077511_129083164
tx.25196	chr4	+	5239	22	NNC	ENSMUSG00000028580.16	novel	4017	22	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	176	junction_2	126.002609482391	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTACTGCTCTCACTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390677	130508875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_130390779_130396235_130396515_130428352_130428422_130445464_130445574_130446483_130446663_130455308_130455476_130457588_130457860_130468773_130468868_130471003_130471106_130474288_130474441_130476722_130476862_130478736_130478881_130479886_130480184_130481252_130481490_130490064_130490333_130491375_130491506_130493231_130493361_130496126_130496265_130499182_130499309_130499939_130500062_130501722_130501916_130507082
tx.25197	chr4	+	1740	3	Intergenic	novelGene_1038	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGTGATTCTTCGTGCCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131171048	131175677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_131171168_131173918_131174039_131174176
tx.25198	chr4	+	1006	4	NNC	ENSMUSG00000028874.15	novel	3363	13	NA	NA	20567	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.88561808316413	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTATCCCTTATTCCTGC	8740	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132724993	132728081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_132725155_132725278_132725356_132727218_132727351_132727445
tx.25199	chr4	+	772	5	ISM	ENSMUSG00000028862.7	ENSMUST00000134895.2	1062	7	695	-1	695	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_3	3.24037034920393	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTGTCTTGGCAACTTCA	1094	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132978854	132980240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_132979085_132979169_132979283_132979365_132979440_132979710_132979788_132979962
tx.252	chr1	-	584	5	FSM	ENSMUSG00000025977.16	ENSMUST00000159398.2	658	5	77	-3	-73	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	5.78791845139511	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGGTGCTTATATAAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55402551	55385412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_55385612_55388039_55388095_55394806_55394899_55399774_55399919_55402457
tx.2520	chr11	-	3160	10	FSM	ENSMUSG00000018900.8	ENSMUST00000019044.8	3062	10	-100	2	-100	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_7	3.67507453523138	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACCAATTGAATACAATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53782586	53755369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_53756723_53757062_53757199_53758348_53758532_53760047_53760263_53762393_53762495_53764493_53764621_53765760_53765933_53766834_53766990_53774486_53774591_53781972
tx.25200	chr4	-	937	4	NNC	ENSMUSG00000050890.16	novel	1039	2	NA	NA	0	7486	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	36.3073301445069	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATTATGCATGGATATGG	4305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134014550	133994826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_-_133994949_133995229_133995664_134011556_134011859_134014471
tx.25201	chr4	+	526	2	NNC	ENSMUSG00000036921.3	novel	683	2	NA	NA	-856	-12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTAGTTCACAGCACTGT	4331	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136336891	136340525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_136336998_136340105
tx.25202	chr4	+	665	2	FSM	ENSMUSG00000036921.3	ENSMUST00000046647.3	683	2	8	10	8	-10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGTTCACAGCACTGTAG	5195	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136337755	136340527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_136337999_136340105
tx.25203	chr4	+	2380	11	ISM	ENSMUSG00000043411.16	ENSMUST00000105839.8	2071	14	14	8016	-7	-6095	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	659	junction_9	186.595846684753	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCGCTCCAGAAGAGGGCGT	584	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137321531	137344586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_137321828_137331833_137331955_137333062_137333220_137333999_137334128_137335368_137335494_137336308_137336418_137338000_137338135_137339016_137339100_137340992_137341173_137343023_137343153_137343668
tx.25204	chr4	-	1253	4	ISM	ENSMUSG00000028756.13	ENSMUST00000030536.13	2375	8	8920	-3	-961	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_1	16.391054470859	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGTGTACACTGGAGCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138044698	138040719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_138041525_138042807_138043045_138043314_138043443_138044615
tx.25205	chr4	-	831	4	FSM	ENSMUSG00000028755.4	ENSMUST00000030535.4	846	4	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTGTTTTTGTTCTTAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138095288	138065838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_138066312_138070817_138070876_138078494_138078607_138095100
tx.25206	chr4	-	1237	2	Intergenic	novelGene_1050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAATAATGGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138145339	138135094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_-_138136181_138145188
tx.25207	chr4	+	887	3	Intergenic	novelGene_1053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGACCCGTTTCTTGTGG	1840	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138427578	138429264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_138427767_138427865_138427991_138428690
tx.25208	chr4	+	534	5	ISM	ENSMUSG00000078517.13	ENSMUST00000042096.15	4706	23	-12	19605	5	3167	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	392	junction_2	12.4599357943771	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGGCTGTCTTTTCCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139079908	139084942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_139080029_139081471_139081597_139082122_139082189_139082402_139082497_139084813
tx.25209	chr4	+	430	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040972.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTTCTCTTCCCTTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139778574	139780173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_139778700_139779329_139779534_139780072
tx.2521	chr11	-	1193	7	NNC	ENSMUSG00000020388.13	novel	1182	7	NA	NA	4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_4	81.0507385667905	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGCTAGTGTCTGGCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53959836	53945753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_53946066_53946182_53946301_53946615_53946780_53946968_53947166_53950763_53950843_53954460_53954613_53959665
tx.25210	chr4	+	557	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025328.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTTAAGAATCTGATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140515830	140517056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_140515905_140516127_140516331_140516414_140516525_140516886
tx.25211	chr4	+	537	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025328.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATCTGATTGATGGAGACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140515843	140517064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_+_140515905_140516127_140516316_140516414_140516525_140516886
tx.25212	chr4	-	1697	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000028927.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAAGAGTATTCCCTTGGT	5604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140660298	140656490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_140657770_140657865_140657970_140659377_140659613_140660219
tx.25213	chr4	+	446	4	Intergenic	novelGene_1056	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTACTCTGGTTTAAATTGG	3143	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141016952	141022764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_141017027_141017302_141017405_141021851_141021987_141022629
tx.25214	chr4	-	2693	5	FSM	ENSMUSG00000040740.8	ENSMUST00000038661.8	2670	5	-23	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGCAATTGCCCTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	141351155	141346134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_141347906_141348688_141348824_141349514_141349668_141349752_141349819_141350587
tx.25215	chr4	+	2114	4	FSM	ENSMUSG00000046435.8	ENSMUST00000078695.5	2106	4	-4	-4	-4	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTTTGTTTTGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143446020	143455732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_+_143446101_143452565_143452858_143453180_143453769_143454578
tx.25216	chr4	-	1342	1	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085101.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGAAATGGCAGAACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145160346	145159004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr4_-_145159000_145160300
tx.25218	chr4	-	1774	4	ISM	ENSMUSG00000019055.16	ENSMUST00000019199.14	3243	19	18777	307	3106	-307	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_3	19.7371617907833	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTATGAGAGATGCCTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148002447	147994516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_147995332_147997676_147997803_148000253_148000401_148001761
tx.25219	chr4	+	1269	2	ISM	ENSMUSG00000044496.7	ENSMUST00000103232.2	2731	3	4012	0	4012	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	528	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTACTGGTCTGTGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148029363	148031771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_148029919_148031057
tx.2522	chr11	-	1181	7	FSM	ENSMUSG00000020388.13	ENSMUST00000018755.10	1182	7	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_5	18.9245578254523	582	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGCTAGTGTCTGGCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53959839	53945753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_53946066_53946182_53946301_53946615_53946780_53946968_53947151_53950763_53950843_53954460_53954613_53959665
tx.25220	chr4	-	5187	23	FSM	ENSMUSG00000029016.14	ENSMUST00000030879.12	3306	23	-6	-1875	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_12	12.7042811811837	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTTGTCTCCACGGTGCT	7416	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148123276	148088715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr4_-_148091319_148093137_148093264_148093355_148093464_148095110_148095268_148095428_148095587_148097073_148097261_148098132_148098240_148098323_148098484_148098588_148098743_148098957_148099085_148101308_148101436_148101952_148102120_148102359_148102474_148103297_148103431_148104174_148104234_148105916_148105985_148107823_148107951_148108565_148108673_148110989_148111057_148113006_148113073_148113843_148113910_148122370_148122431_148123137
tx.25222	chr4	-	1140	2	ISM	ENSMUSG00000028980.15	ENSMUST00000030830.4	4745	5	165	15875	165	498	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGTCTTGAGGCAAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150093315	150079806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_150080839_150093207
tx.25223	chr4	+	889	2	NNC	ENSMUSG00000086665.2	novel	404	2	NA	NA	-800	-7248	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACAATGTAGTGTGTAGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150132669	150134185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr4_+_150132829_150133455
tx.25224	chr4	+	703	3	Intergenic	novelGene_1067	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTATTTTTTATTAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150343691	150352026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr4_+_150343864_150346861_150347085_150351718
tx.25225	chr4	+	564	2	ISM	ENSMUSG00000039713.18	ENSMUST00000140085.2	2792	7	842	6216	749	969	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	156	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGATCGAGTGTTTGTCTC	2417	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152192934	152193635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_+_152192998_152193134
tx.25226	chr4	-	1630	6	NIC	ENSMUSG00000058498.13	novel	2466	17	NA	NA	11	2	intron_retention	TRUE	canonical	3	14	junction_5	5.07543101617981	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGTACAGTGATCACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152397794	152391473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr4_-_152392074_152393294_152393361_152395840_152396281_152396527_152396714_152396846_152397034_152397643
tx.25227	chr4	-	1523	8	ISM	ENSMUSG00000058498.13	ENSMUST00000076183.12	2466	17	5028	-1	-177	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_7	5.57325977232319	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGAGTACAGTGATCACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152398037	152391474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr4_-_152392074_152393294_152393361_152395840_152395959_152396228_152396281_152396527_152396714_152396846_152397034_152397643_152397742_152397820
tx.2523	chr11	+	2216	16	FSM	ENSMUSG00000018906.15	ENSMUST00000093107.12	2263	16	51	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_12	14.6945190084225	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAATAGCCTTATTTTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53991800	54022482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_53991867_53992345_53992474_54001034_54001141_54001811_54001909_54002248_54002401_54004962_54005101_54008269_54008510_54009959_54010154_54010895_54011073_54015482_54015554_54015771_54015872_54016588_54016643_54017063_54017124_54019873_54019943_54020291_54020389_54022015
tx.25236	chr5	+	1106	9	ISM	ENSMUSG00000054099.12	ENSMUST00000066921.10	2784	12	56	7243	7	-2361	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	7.36439916082772	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTTCCTATCAATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8472905	8497554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_8473040_8477195_8477268_8477407_8477517_8478628_8478689_8480411_8480519_8490720_8490789_8492446_8492572_8493611_8493786_8497297
tx.25237	chr5	+	376	3	ISM	ENSMUSG00000079659.6	ENSMUST00000115365.3	1040	5	468	1443	468	-1381	internal_fragment	FALSE	canonical	3	350	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGTAGTGCTTAGACAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9151214	9167602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_9151396_9166479_9166531_9167458
tx.25238	chr5	-	3382	16	NIC	ENSMUSG00000042508.17	novel	3498	17	NA	NA	1	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_13	63.215469274186	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTTGAGCCATGCAATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9211751	9168866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_-_9170139_9170349_9170495_9171084_9171463_9171781_9171938_9174441_9174528_9177956_9178109_9179147_9179377_9180367_9180478_9181275_9181309_9182455_9182614_9186065_9186143_9187125_9187241_9190385_9190481_9200375_9200493_9201797_9201919_9211613
tx.25239	chr5	+	580	2	NNC	ENSMUSG00000056004.17	novel	1554	4	NA	NA	4	-51017	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATGTGAAATGTGCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9316121	9410476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_9316457_9410231
tx.2524	chr11	+	627	5	FSM	ENSMUSG00000018906.15	ENSMUST00000135596.9	610	5	6	-23	1	23	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_4	6.75925291729789	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCAGTAGTAACATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53991806	54002484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_53991867_53992345_53992474_54001034_54001141_54001811_54001909_54002248
tx.25240	chr5	-	2436	8	FSM	ENSMUSG00000039987.16	ENSMUST00000140147.2	2000	8	-2	-434	-2	434	multi-exon	TRUE	canonical	3	167	junction_2	38.2152870362805	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATGTGTAGTTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21087078	20997865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_20999480_21006899_21007065_21008182_21008349_21010652_21010812_21012401_21012472_21018237_21018295_21060119_21060200_21086953
tx.25241	chr5	+	2737	2	FSM	ENSMUSG00000039899.6	ENSMUST00000035799.6	3788	2	-1	1052	-1	-1052	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACTTTACAAAGAGCAAGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21577638	21582320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_21578307_21580251
tx.25242	chr5	+	1010	3	NNC	ENSMUSG00000047221.6	novel	1590	3	NA	NA	7	-577	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGGGAATTGGATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21630005	21639015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_21630579_21634721_21634832_21638688
tx.25243	chr5	+	1379	5	ISM	ENSMUSG00000023353.15	ENSMUST00000197513.2	1770	9	19902	-10	19483	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_1	10.7092249953019	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTGGTGCCTCAGTGCC	7567	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24704652	24707045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_24704811_24704912_24705004_24705120_24705344_24706007_24706264_24706394
tx.25244	chr5	+	1229	4	ISM	ENSMUSG00000023353.15	ENSMUST00000197513.2	1770	9	20160	-16	19741	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	161	junction_1	4.54606056566195	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCCTCAGTGCCCCTGAG	7825	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24704910	24707051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_24705004_24705120_24705344_24706007_24706264_24706394
tx.25245	chr5	-	636	5	ISM	ENSMUSG00000028949.14	ENSMUST00000030791.12	1735	13	7999	0	2836	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_4	23.6061432682258	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGCCTTGTGGTCATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24799011	24797619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_24797803_24798014_24798117_24798222_24798346_24798634_24798771_24798919
tx.25246	chr5	+	320	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105223.2	novel	481	1	NA	NA	143	5137	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTTCCTTGGTCATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28022630	28028105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_+_28022768_28027922
tx.25247	chr5	+	1699	4	ISM	ENSMUSG00000048271.15	ENSMUST00000030920.6	3955	7	19786	1905	19786	979	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	94	junction_3	19.0146142626022	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATATACATTGGTGTTCT	3493	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28541985	28558672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_28542049_28543993_28544307_28547392_28547513_28557469
tx.25248	chr5	+	1181	7	NIC	ENSMUSG00000029130.13	novel	1565	10	NA	NA	0	-40	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	2	3	junction_4	17.3949226308522	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGGTCTTTATTGCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29401003	29430439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_29401083_29401577_29401644_29402923_29403019_29403571_29403837_29411693_29411803_29429114_29429283_29430040
tx.25249	chr5	-	1553	6	ISM	ENSMUSG00000029151.15	ENSMUST00000031037.14	2089	8	3914	2	-1345	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_5	6.41872261435249	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTCTGCAGTCCAATTCC	7658	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31247045	31243451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31244263_31245300_31245436_31245648_31245755_31245951_31246151_31246662_31246817_31246897
tx.2525	chr11	+	2218	16	FSM	ENSMUSG00000018906.15	ENSMUST00000019050.12	2230	16	20	-8	3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_12	14.0816665680357	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTTATTTTGGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53991808	54022486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_53991867_53992345_53992474_54001034_54001141_54001811_54001909_54002248_54002401_54004962_54005101_54008269_54008510_54009959_54010154_54010895_54011073_54015482_54015554_54015771_54015872_54016588_54016643_54017171_54017238_54019873_54019943_54020291_54020389_54022015
tx.25250	chr5	-	1484	14	ISM	ENSMUSG00000038564.12	ENSMUST00000041565.11	5403	48	30585	2	722	1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	55	junction_9	16.2273054998968	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGCTGCATTCTTTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31417866	31410622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31410769_31410896_31410989_31411158_31411313_31411562_31411662_31411745_31411806_31411996_31412093_31412594_31412715_31412908_31413020_31413898_31414016_31414232_31414320_31414674_31414739_31414860_31414971_31415157_31415257_31417737
tx.25251	chr5	-	687	4	ISM	ENSMUSG00000038564.12	ENSMUST00000201426.4	742	5	118	21	118	-21	intron_retention	FALSE	canonical	3	93	junction_3	6.54896090146283	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAAGTTCTCTGAGTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31411879	31410644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_31410769_31410896_31410989_31411158_31411313_31411562
tx.25252	chr5	-	771	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000107015.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTGTTTCAAAATTAACTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31754240	31714208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_31714689_31735252_31735340_31736569_31736645_31754111
tx.25253	chr5	-	3328	2	Intergenic	novelGene_1093	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGGGATGGAGAGATGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33692848	33689450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_33689998_33690067
tx.25254	chr5	-	506	3	Intergenic	novelGene_1094	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTCAAATGAACATTCAAG	7270	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34493563	34488947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_34489287_34490155_34490225_34493465
tx.25255	chr5	+	283	2	NNC	ENSMUSG00000054520.16	novel	416	3	NA	NA	-30	-25283	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACAGATTGAGTCCTGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34683151	34683761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_34683246_34683572
tx.25256	chr5	+	883	3	FSM	ENSMUSG00000052783.17	ENSMUST00000148588.2	305	3	-576	-2	20	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTAGTTGTCTTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34817742	34832061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_34818349_34826453_34826547_34831877
tx.25257	chr5	-	3855	12	FSM	ENSMUSG00000029192.18	ENSMUST00000171385.8	3884	12	26	3	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_11	14.7609043598508	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATGTTCACTGTGTACTT	8810	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36687941	36647951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_36650459_36652361_36652621_36662368_36662479_36664921_36665051_36665703_36665776_36669797_36669893_36671382_36671464_36676616_36676724_36677787_36677906_36680270_36680354_36682273_36682393_36687766
tx.25258	chr5	-	1370	4	NNC	ENSMUSG00000029190.20	novel	2014	2	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	21.9241115365405	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTGTATTATGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36853284	36828742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_36829428_36830091_36830587_36850085_36850190_36853198
tx.25259	chr5	+	1259	7	NNC	ENSMUSG00000050248.12	novel	2796	12	NA	NA	-12	-28201	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	12.4988888395018	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATCAGGAACACAAGGGA	8830	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37495830	37516907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_37496072_37504783_37504853_37505931_37506119_37507682_37507793_37508464_37508519_37514743_37514879_37516444
tx.2526	chr11	+	1738	12	NNC	ENSMUSG00000018906.15	novel	1997	3	NA	NA	-53	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	24.5589188660203	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTTATTTTGGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54003975	54022486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_54004043_54004962_54005101_54008269_54008510_54009959_54010154_54010895_54011073_54015482_54015554_54015771_54015872_54016588_54016643_54017063_54017124_54019873_54019943_54020291_54020389_54022015
tx.25260	chr5	+	1847	12	NNC	ENSMUSG00000050248.12	novel	2796	12	NA	NA	-4	-4563	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.7233760268516	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAATAACCAGGAGGCGGCG	8838	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37495838	37540545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_37496072_37501121_37501176_37504783_37504853_37505931_37506119_37507682_37507793_37508464_37508519_37514743_37514879_37520860_37521001_37527867_37528193_37535526_37535767_37537753_37537930_37540421
tx.25261	chr5	-	1931	2	FSM	ENSMUSG00000048450.11	ENSMUST00000063116.10	1935	2	1	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATGTCTGTGGGTTTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37981926	37977831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_37979045_37981208
tx.25262	chr5	-	1666	6	FSM	ENSMUSG00000029127.16	ENSMUST00000143436.8	1654	6	-9	-3	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_4	15.2918278828922	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTATATTTTGTAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38377778	38357589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_38358658_38360839_38361002_38361088_38361172_38363232_38363307_38373790_38373958_38377666
tx.25265	chr5	+	640	3	Intergenic	novelGene_1095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTGAGTAGTCTTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52286587	52289297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_52286706_52287649_52287774_52288899
tx.2527	chr11	+	1106	8	ISM	ENSMUSG00000018906.15	ENSMUST00000019050.12	2230	16	19106	-8	-4604	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_4	18.7224627718924	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTTATTTTGGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54010894	54022486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_54011073_54015482_54015554_54015771_54015872_54016588_54016643_54017171_54017238_54019873_54019943_54020291_54020389_54022015
tx.25270	chr5	-	3032	2	NNC	ENSMUSG00000029207.17	novel	3037	2	NA	NA	23598	37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AACCCAAAAAAACCAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66752385	66698007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_66700961_66752306
tx.25271	chr5	-	1064	4	ISM	ENSMUSG00000070733.14	ENSMUST00000148433.8	1899	12	-206	28427	-12	354	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_2	5.31245915016974	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTTTTTTTTTAAGTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73413974	73305026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_73305566_73352328_73352457_73378250_73378416_73413742
tx.25272	chr5	+	659	2	Intergenic	novelGene_1096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACAAATTGATACTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73886881	73887641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_73886931_73887031
tx.25273	chr5	+	514	3	ISM	ENSMUSG00000036403.16	ENSMUST00000130651.2	5629	24	17	51570	14	-51570	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGTTAATGAAGCTCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76736561	76741185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_76736772_76739561_76739719_76741038
tx.25274	chr5	-	470	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036377.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGTTTGATTTGAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76927585	76922633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_76922969_76926525_76926630_76927554
tx.25275	chr5	-	3639	17	ISM	ENSMUSG00000035898.14	ENSMUST00000113373.2	3504	33	32124	-1613	32124	-1442	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_13	10.8712277940442	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAAGGAAAGTT	1029	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86288246	86258587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_86260648_86265882_86265978_86267191_86267280_86268386_86268515_86270163_86270358_86272169_86272288_86274327_86274400_86275558_86275629_86276534_86276599_86276686_86276739_86279071_86279201_86280300_86280382_86280476_86280567_86282832_86282939_86284167_86284350_86285675_86285754_86288214
tx.25276	chr5	+	2506	10	NNC	ENSMUSG00000029291.12	novel	619	2	NA	NA	-11887	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	30.6159000085468	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTATTGTGTTGGTTGTCTT	107	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88782662	88799251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_88782879_88783050_88783135_88785050_88785219_88786839_88786938_88790787_88790908_88791926_88792024_88793395_88793461_88795077_88795106_88796114_88796184_88797690
tx.25277	chr5	-	1197	4	ISM	ENSMUSG00000055204.16	ENSMUST00000197021.2	8067	34	105593	-2	-1686	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	159	junction_3	18.1169043222683	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTTTCTACTTGTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90382009	90376597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_90377201_90378664_90378830_90380099_90380279_90381759
tx.25278	chr5	+	431	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029426.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGTTGTCTTGGTTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92653593	92660306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_92653782_92659388_92659463_92660137
tx.25279	chr5	-	188	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000097516.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATGTACTTATTTGCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97547248	97546429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_97546574_97547204
tx.2528	chr11	+	1100	8	ISM	ENSMUSG00000018906.15	ENSMUST00000174616.8	2094	15	19094	2	-4604	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_4	19.6832053138855	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCCTTATTTTGGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54010894	54022486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_54011073_54015482_54015554_54015771_54015872_54016588_54016643_54017063_54017124_54019873_54019943_54020291_54020389_54022015
tx.25280	chr5	-	1357	8	ISM	ENSMUSG00000029334.15	ENSMUST00000031277.7	2618	19	12260	44434	12260	-28761	internal_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	4.09579176766613	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTTTGTTAGTGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99172634	99124012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_99124364_99127624_99127720_99128944_99129023_99136145_99136210_99140175_99140282_99142390_99142505_99145204_99145372_99172252
tx.25281	chr5	-	1709	3	ISM	ENSMUSG00000029319.9	ENSMUST00000031262.9	1743	7	13342	0	3477	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	346	junction_2	9.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGCGACTCTTCATTACAG	4708	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100808808	100802588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_100803338_100805683_100805873_100808037
tx.25282	chr5	-	1951	3	ISM	ENSMUSG00000049606.17	ENSMUST00000112698.8	5689	7	253	20050	-13	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_2	26	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGCCTCGAGGAGTCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106844443	106784657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_106786502_106814650_106814712_106844397
tx.25283	chr5	+	1441	6	FSM	ENSMUSG00000111375.5	ENSMUST00000162298.4	1408	6	-33	0	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	10.3266645147405	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTGTCTGCCAGACTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107585829	107619505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_107586012_107593728_107593924_107599854_107600052_107609303_107609422_107618573_107618664_107618846
tx.25284	chr5	+	4373	13	FSM	ENSMUSG00000029263.16	ENSMUST00000119014.8	4573	13	195	5	168	-5	multi-exon	TRUE	canonical	3	51	junction_6	9.64761052742537	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACATTAACTTTTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108460669	108497216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_108460945_108461824_108462031_108465128_108465339_108466690_108466880_108467761_108467904_108474682_108474896_108479840_108480059_108480549_108480832_108483969_108484428_108486420_108486613_108489660_108489971_108492089_108492254_108495702
tx.25285	chr5	+	864	5	ISM	ENSMUSG00000033623.14	ENSMUST00000046975.12	7708	11	24974	6106	-14	4580	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_3	14.3265487818944	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTTGCAGCAATGCTAT	4032	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108634071	108648736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_108634114_108635701_108635791_108643699_108643838_108647492_108647574_108648222
tx.25286	chr5	+	3203	14	NNC	ENSMUSG00000033540.19	novel	3373	14	NA	NA	-14	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	15.2699573553149	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCCTCCCAAGTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108817146	108832424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_108817384_108817984_108818126_108827364_108827451_108827569_108827678_108827976_108828073_108828160_108828364_108828436_108828617_108828726_108828944_108829245_108829459_108829537_108829660_108829767_108829898_108829965_108830043_108830918_108831020_108831132
tx.25287	chr5	+	3382	7	NIC	ENSMUSG00000064247.15	novel	3177	5	NA	NA	-48	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_4	0.763762615825973	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTCTTGGTCTCGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110248239	110253819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_110248367_110248881_110248972_110249253_110249391_110249665_110249795_110250041_110250198_110250311_110250496_110251260
tx.25288	chr5	+	1069	7	ISM	ENSMUSG00000029502.15	ENSMUST00000031477.9	4805	24	35370	46	35352	-46	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_1	5.31245915016974	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTCTGGTGGCTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110360114	110371021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_110360214_110364699_110364840_110365676_110365810_110365959_110366083_110368647_110368810_110369489_110369654_110370773
tx.25289	chr5	-	479	4	ISM	ENSMUSG00000029505.18	ENSMUST00000041558.15	10608	52	35074	64892	-27510	8407	internal_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_2	4.02768199119819	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTTAAATTTACAGAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110883319	110877130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_110877179_110877688_110877830_110881584_110881771_110883215
tx.2529	chr11	+	288	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018914.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATGCTTTCTGTCTGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54152585	54176100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_54152704_54152896_54152950_54175983
tx.25290	chr5	+	431	3	NNC	ENSMUSG00000104807.2	novel	613	3	NA	NA	-37427	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTCAAGGTGTCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112785813	112828455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_112785898_112824619_112824815_112828303
tx.25291	chr5	-	872	3	Intergenic	novelGene_1131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATATGGTGTATGATTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113545462	113543446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_113543944_113544272_113544434_113545248
tx.25292	chr5	+	681	4	Intergenic	novelGene_1132	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTCTTGTCATGCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113570077	113589062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_113570133_113581313_113581382_113584964_113585070_113588609
tx.25293	chr5	+	1090	2	Intergenic	novelGene_1133	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGATGTTGAAGAGCGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113734013	113735350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_113734163_113734409
tx.25294	chr5	-	874	2	ISM	ENSMUSG00000018974.8	ENSMUST00000197041.2	3261	17	-16	21212	-16	-8253	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	395	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTTCATGTACATGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113909715	113901720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_113902261_113909381
tx.25295	chr5	+	1744	3	NIC	ENSMUSG00000042010.17	novel	8788	53	NA	NA	-62	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	58	junction_1	14	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCTGGCCTTGATTTATT	5498	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114386331	114388822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_114386380_114386644_114387073_114387554
tx.25296	chr5	+	1320	10	FSM	ENSMUSG00000066952.12	ENSMUST00000196676.5	1256	10	-39	-25	9	25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.77081971672325	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATCTCAACCCGGCTGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114494884	114501406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_114495051_114495979_114496140_114496951_114497036_114497571_114497666_114497804_114497861_114498545_114498682_114499103_114499175_114499287_114499386_114500169_114500270_114501051
tx.25297	chr5	+	461	4	Intergenic	novelGene_1137	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTAGTATGCACTTTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114703143	114704912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_114703220_114703367_114703537_114703980_114704021_114704736
tx.25298	chr5	-	1479	6	ISM	ENSMUSG00000041890.18	ENSMUST00000153756.8	2091	12	10	16292	7	740	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	220	junction_1	23.8075618239248	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGGATAGCTTTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114911546	114901671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_114902539_114902647_114902735_114904512_114904619_114905156_114905270_114907677_114907812_114911374
tx.25299	chr5	-	1490	4	FSM	ENSMUSG00000041890.18	ENSMUST00000133096.2	1284	4	6	-212	1	212	multi-exon	FALSE	canonical	3	229	junction_3	23.2808934536456	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAATTAAAAAAAAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114911522	114903523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_114904619_114905156_114905270_114907677_114907812_114911374
tx.253	chr1	-	2061	4	FSM	ENSMUSG00000097519.3	ENSMUST00000181949.3	2052	4	3	-12	3	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	26.1576417557513	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTTATGTGTAACAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57416700	57398368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_57399823_57401724_57401923_57414406_57414679_57416563
tx.2530	chr11	+	2554	21	FSM	ENSMUSG00000020333.18	ENSMUST00000093106.12	5804	21	26	3224	26	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_10	11.8346947573649	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACTGATATATTGTACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54194649	54252358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_54194749_54210977_54211199_54214066_54214182_54214815_54214881_54215891_54215994_54216386_54216487_54217940_54218120_54219227_54219261_54220745_54220798_54225877_54225952_54227761_54227840_54229237_54229373_54229825_54229961_54231322_54231419_54232584_54232658_54236001_54236091_54236703_54236821_54241383_54241528_54242847_54242950_54243816_54243889_54251885
tx.25300	chr5	-	1420	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029564.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGGTCGCGTCGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115020270	115017888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_115019132_115020093
tx.25301	chr5	-	838	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000086054.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGAAAGAAAGGAATGTT	9036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115118487	115116905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_-_115117503_115118246
tx.25302	chr5	-	636	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000107121.2	novel	768	1	NA	NA	-16	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTCAAAGTTGACATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115769891	115769113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr5_-_115769583_115769724
tx.25303	chr5	-	1765	4	NNC	ENSMUSG00000041609.17	novel	595	4	NA	NA	1	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	14.4299072146089	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTGCCTCAGTTCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115791039	115786232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_115787629_115789877_115789999_115790685_115790878_115790983
tx.25304	chr5	-	823	4	ISM	ENSMUSG00000043913.15	ENSMUST00000050178.13	3522	14	152565	1127	152543	-1127	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGAATTCAAGGTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116274479	116263826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_116264237_116269082_116269273_116272086_116272219_116274388
tx.25305	chr5	+	2509	6	NNC	ENSMUSG00000032840.8	novel	5649	5	NA	NA	23	-2981	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	73.3255753472143	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGGCTGTGGAATGTGG	1662	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118383314	118401177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_118383524_118393734_118393892_118397040_118397193_118397439_118397554_118399164_118399994_118400129
tx.25306	chr5	+	675	3	Intergenic	novelGene_1141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTGTAGAGATCGACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118597636	118601290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_118597920_118600501_118600635_118601031
tx.25307	chr5	-	1022	2	FSM	ENSMUSG00000087516.8	ENSMUST00000200851.2	396	2	-530	-96	-530	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119709357	119708193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_119708436_119708577
tx.25308	chr5	-	253	2	FSM	ENSMUSG00000032741.10	ENSMUST00000202072.2	2622	2	-68	2437	11	1821	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCCGTTGTATCCTGAG	9194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120726727	120723400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_120723494_120726567
tx.25309	chr5	+	820	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000032690.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTTTATGAGTATACTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120872950	120874850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr5_+_120873250_120874329
tx.2531	chr11	+	2097	5	ISM	ENSMUSG00000035992.16	ENSMUST00000046835.14	6255	18	3	36079	3	-20549	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_3	7.53325958665968	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACGTACATCAGCTGTAA	1979	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54329027	54372982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_54329215_54356912_54357040_54366457_54366593_54371075_54371177_54371435
tx.25310	chr5	+	499	2	ISM	ENSMUSG00000029605.17	ENSMUST00000182725.2	558	3	-43	1165	-43	-1165	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGACTGTATTTCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120950656	120951485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_120950946_120951275
tx.25311	chr5	+	2168	8	NNC	ENSMUSG00000032623.10	novel	2021	6	NA	NA	-25832	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	64.2682515964555	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAAATGAATTAATTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121026766	121059711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_121026866_121051710_121051837_121052672_121053130_121053724_121054014_121054901_121055099_121057064_121057298_121057959_121058114_121059098
tx.25312	chr5	-	366	2	ISM	ENSMUSG00000043733.15	ENSMUST00000148871.2	737	5	8819	22	8819	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	99	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATTTTGTTTTTTTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121272879	121271924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_121272210_121272798
tx.25313	chr5	+	1445	11	NIC	ENSMUSG00000029452.19	novel	1424	10	NA	NA	-12	-5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_1	5.71051661410769	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCATATGTATGTGCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121590675	121633472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_121590859_121601849_121601897_121602861_121602926_121605916_121606049_121620395_121620501_121625812_121625863_121627310_121627395_121629138_121629278_121631693_121631839_121632266_121632341_121633050
tx.25314	chr5	+	1462	3	ISM	ENSMUSG00000004455.17	ENSMUST00000197730.2	923	7	14255	-177	116	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	2793	junction_1	72.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGTGTCTTTCTGTCAGCA	1748	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122310910	122313336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_122311019_122311208_122311344_122312117
tx.25317	chr5	-	3494	12	FSM	ENSMUSG00000029475.18	ENSMUST00000031435.14	3532	12	38	0	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	252	junction_11	40.2726246663991	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACACTGTGTTTGAGGGT	8632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123038380	123008730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_123009961_123016497_123016717_123017307_123017470_123017551_123017716_123018235_123018916_123019082_123019122_123019699_123019814_123020026_123020288_123020464_123020552_123021381_123021526_123026592_123026818_123038211
tx.2532	chr11	+	2050	14	ISM	ENSMUSG00000035992.16	ENSMUST00000046835.14	6255	18	27	15517	27	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_9	10.6159420143514	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGATGTTCAACAGTACA	2003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54329051	54393544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_54329215_54356912_54357040_54366457_54366593_54371075_54371177_54371435_54371511_54373320_54373413_54378537_54378622_54380094_54380167_54381628_54381765_54384018_54384221_54387427_54387514_54390236_54390384_54391345_54391516_54393084
tx.25320	chr5	+	1708	11	NNC	ENSMUSG00000118662.2	novel	2913	17	NA	NA	12407	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	14.8865711297128	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGATGGTGGTGATGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124749261	124765805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_124749386_124750706_124750773_124753213_124753349_124754531_124754610_124757093_124757172_124758176_124758289_124761069_124761177_124762380_124762538_124763745_124763872_124763959_124764049_124765169
tx.25324	chr5	+	2779	3	NNC	ENSMUSG00000066735.9	novel	3112	3	NA	NA	-42	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	9	junction_1	443.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTTGTGTTTTATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129970907	130013587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_129970971_130007359_130007470_130010981
tx.25325	chr5	+	1190	7	FSM	ENSMUSG00000053094.16	ENSMUST00000111298.6	3570	7	190	2190	190	-2190	multi-exon	FALSE	canonical	3	519	junction_4	20.4042479237372	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTGATGCACGTGCTTT	9207	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130251365	130270317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_130251414_130258289_130258468_130260595_130260882_130265643_130265795_130267087_130267272_130269188_130269333_130270118
tx.25326	chr5	-	500	3	FSM	ENSMUSG00000029673.20	ENSMUST00000159507.3	2060	3	-20	1580	15	-165	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTCTTCGAACCCGTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131566829	131505745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_131505863_131562659_131562712_131566498
tx.25327	chr5	-	1553	6	ISM	ENSMUSG00000061979.9	ENSMUST00000076228.3	2321	11	11347	19	2833	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	313	junction_2	31.669543728952	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATGGAGGTCTTGTAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134194266	134176911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_134177846_134182962_134183049_134184578_134184753_134186429_134186518_134192462_134192645_134194177
tx.25328	chr5	+	2138	10	NNC	ENSMUSG00000007207.11	novel	2162	10	NA	NA	-18	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_9	4.42495727816442	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCCTCTGTTTGGAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135052395	135079955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_+_135052465_135065979_135066058_135066329_135066430_135070090_135070166_135070784_135070859_135070962_135071072_135071446_135071521_135074450_135074589_135077564_135077711_135078680
tx.25329	chr5	-	310	2	NNC	ENSMUSG00000039959.14	novel	7835	31	NA	NA	13	-76706	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTATGCTGTTCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135573956	135564640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_135564785_135573790
tx.2533	chr11	+	1862	13	FSM	ENSMUSG00000037533.21	ENSMUST00000108895.8	1829	13	-33	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_8	14.7082743152735	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTATGCTCATTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54413682	54525835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_54413945_54434404_54434476_54437198_54437256_54443615_54443700_54452150_54452221_54459178_54459323_54501613_54501746_54510711_54510890_54513141_54513279_54516686_54516846_54517410_54517564_54522017_54522183_54525585
tx.25330	chr5	-	879	3	ISM	ENSMUSG00000019178.18	ENSMUST00000111164.9	1243	9	11	20639	-5	-11139	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTTTACTGCATTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135807228	135797121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_135797770_135799109_135799217_135807104
tx.25331	chr5	-	855	2	Intergenic	novelGene_1152	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGCCAGGACAGAACCACT	1723	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	137267015	137265193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_-_137265783_137266749
tx.25332	chr5	-	321	4	NNC	ENSMUSG00000036948.18	novel	2490	11	NA	NA	-23	-468	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	15.4560308258262	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCTCCAGTTCTGAAATGC	9193	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138262318	138260982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_138261007_138261108_138261239_138261328_138261425_138262247
tx.25333	chr5	+	756	3	NIC	ENSMUSG00000085227.2	novel	743	3	NA	NA	9	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGCATGAGGACACAAGTTTA	6210	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138262339	138264919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_138262416_138264018_138264268_138264488
tx.25334	chr5	+	946	2	FSM	ENSMUSG00000085227.2	ENSMUST00000144460.2	519	2	-20	-407	19	-25	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATAAAGTGTGTGCCACAC	-9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	138262349	138264898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_138262416_138264018
tx.25335	chr5	-	2260	6	FSM	ENSMUSG00000058291.15	ENSMUST00000063262.11	2254	6	3	-9	1	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	25.9584283037321	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTTTGTTTGTTTATCAAA	1755	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138617999	138604372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_138606084_138610085_138610176_138610300_138610428_138614731_138614822_138615316_138615430_138617870
tx.25336	chr5	-	755	6	NNC	ENSMUSG00000029560.13	novel	2590	10	NA	NA	404	-521	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	86.8456101366097	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGCTGATTCCCTCCAGG	1604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140338865	140327221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_140327398_140330040_140330191_140330463_140330611_140332031_140332101_140337887_140338021_140338785
tx.25337	chr5	-	1522	10	FSM	ENSMUSG00000036555.15	ENSMUST00000149674.8	2983	10	-40	1501	-16	-1501	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_6	8.3813431847316	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTGTGTGATCTCCCAG	4473	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140688071	140671065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_140671850_140672082_140672156_140673539_140673611_140675567_140675619_140675710_140675825_140677354_140677426_140679169_140679299_140682762_140682809_140685439_140685488_140687936
tx.25338	chr5	-	1012	5	NNC	ENSMUSG00000036526.9	novel	1299	6	NA	NA	3351	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.76085931090146	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTCTCACTAGCAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140864609	140858731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr5_-_140859285_140860095_140860212_140862151_140862277_140863717_140863898_140864571
tx.25339	chr5	-	1392	7	ISM	ENSMUSG00000036526.9	ENSMUST00000085786.7	4107	25	118099	0	-278	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_6	4.41273409829124	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTTCTTATCCCACAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140868238	140858744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_140859285_140860095_140860212_140862151_140862277_140863717_140863898_140866052_140866189_140867756_140867853_140868039
tx.2534	chr11	-	2947	5	ISM	ENSMUSG00000052298.13	ENSMUST00000064104.13	3069	6	31122	0	3786	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	549	junction_4	42.0081837265074	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTTGTTTGGATTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54647379	54608281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_54610551_54611068_54611184_54614399_54614502_54631063_54631377_54647231
tx.25340	chr5	-	1343	2	ISM	ENSMUSG00000029576.18	ENSMUST00000110784.8	3106	14	23314	-28	1224	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGGGATGTAGGATCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	142472100	142470593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_142471004_142471167
tx.25342	chr5	+	822	3	FSM	ENSMUSG00000075569.11	ENSMUST00000164604.2	341	3	-295	-186	-295	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCTGATTTGTTTCGAAA	7664	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143917674	143922532	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_143918034_143920721_143920921_143922268
tx.25343	chr5	-	805	2	ISM	ENSMUSG00000066621.13	ENSMUST00000153103.8	4329	24	27292	-14	1940	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144133073	144132154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_-_144132836_144132949
tx.25344	chr5	-	4190	25	FSM	ENSMUSG00000066621.13	ENSMUST00000085701.7	5106	25	17	899	8	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_17	9.68236871271121	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144160416	144132158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_144132836_144132949_144133070_144133169_144133277_144134709_144134803_144135372_144135509_144135946_144136128_144136547_144136605_144137632_144137713_144137829_144137927_144140225_144140329_144141442_144141571_144142982_144143141_144143234_144143385_144144211_144144368_144145412_144145559_144146677_144147184_144148222_144148369_144149390_144149493_144150873_144150975_144151062_144151238_144153070_144153197_144153720_144153844_144154043_144154227_144155331_144155567_144160312
tx.25345	chr5	+	2555	5	FSM	ENSMUSG00000059991.8	ENSMUST00000071782.8	2536	5	-19	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_1	16.768646337734	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGAGCTTCTTGTTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144482692	144494288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_+_144483294_144484928_144485146_144490209_144490455_144492106_144492287_144492976
tx.25346	chr5	-	3144	5	FSM	ENSMUSG00000029634.16	ENSMUST00000067837.10	2388	5	1	-757	1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_4	36.6401419211225	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CACTAAAGACTGTGTGCAAA	2761	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146157785	146146009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr5_-_146148743_146152906_146153003_146154710_146154907_146157211_146157295_146157749
tx.25347	chr5	+	1449	2	ISM	ENSMUSG00000029635.16	ENSMUST00000159615.2	1976	6	4791	-55	3336	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATGGTGTCAACTATATT	4951	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146236510	146239684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr5_+_146236661_146238385
tx.25348	chr5	+	801	2	Intergenic	novelGene_1163	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTTGATGGTCATTGAG	5671	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147965034	147965990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_147965207_147965361
tx.25349	chr5	+	595	2	Intergenic	novelGene_1164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTAGGCAGCTTTTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148336788	148338412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr5_+_148336925_148337953
tx.2535	chr11	-	2755	5	NIC	ENSMUSG00000052298.13	novel	3069	6	NA	NA	1	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	13	junction_3	267.149770727957	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTTGTTTGGATTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54678500	54608281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_54610551_54611068_54611184_54614399_54614502_54647231_54647386_54678385
tx.25350	chr5	+	1288	10	NIC	ENSMUSG00000056602.14	novel	592	4	NA	NA	-10	10084	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	13	junction_7	2.71256791460749	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGTAACTATGGGAGAAGC	1265	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150119920	150282554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr5_+_150120201_150233734_150233935_150249595_150249650_150263817_150263958_150269017_150269109_150269315_150269396_150269510_150269592_150277938_150278108_150282263_150282357_150282454
tx.25351	chr6	-	3759	11	FSM	ENSMUSG00000019577.7	ENSMUST00000019721.7	3484	11	-295	20	-295	-20	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_7	4.42831796509691	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATTTTTATTATAATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5496604	5483370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_5485593_5486677_5486792_5487063_5487175_5487378_5487478_5489134_5489212_5491069_5491148_5491590_5491678_5491829_5492015_5492705_5492778_5494889_5495032_5496032
tx.25352	chr6	-	314	2	Intergenic	novelGene_1225	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATGATGTCAAAATTCCAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7446723	7444906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_7445102_7446604
tx.25353	chr6	+	1842	4	FSM	ENSMUSG00000029571.15	ENSMUST00000136742.8	789	4	-59	-994	-24	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	9.89949493661167	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAACTATTGGTTGAATA	-22	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	13069790	13076378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_13069960_13070306_13070414_13071740_13071963_13075034
tx.25354	chr6	-	1255	3	Intergenic	novelGene_1232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTTTTTCTCTGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22392090	22389876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_22390865_22391622_22391816_22392016
tx.25356	chr6	-	4156	23	FSM	ENSMUSG00000012535.15	ENSMUST00000115251.8	3989	23	-220	53	-8	-53	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	140.778774050425	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAACCAGAA	15	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29609826	29540878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_29541866_29543261_29543360_29551850_29551964_29554793_29554980_29555151_29555309_29556976_29557072_29558750_29558868_29560080_29560222_29561358_29561420_29562856_29562934_29565169_29565262_29565662_29565855_29568852_29568993_29571034_29571127_29572584_29572693_29575004_29575152_29578461_29578601_29579519_29579696_29582164_29582309_29586036_29586194_29588021_29588096_29589027_29589229_29609364
tx.25357	chr6	-	875	2	NNC	ENSMUSG00000012535.15	novel	3989	23	NA	NA	-8	-13225	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGATGAAATAAAGTCATGC	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	29609641	29602311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_29602910_29609364
tx.25358	chr6	-	296	3	ISM	ENSMUSG00000039159.17	ENSMUST00000148744.2	803	5	391	39195	385	-39195	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	363	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGATTGTCCAGAAATTTT	405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30304136	30260869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_30261003_30262145_30262223_30304050
tx.25359	chr6	-	1445	11	NNC	ENSMUSG00000025607.16	novel	3961	24	NA	NA	-5	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	68.4046782025908	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCAAAGTTGCTATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30873688	30748409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_30748987_30749404_30749504_30749759_30749899_30750536_30750619_30838302_30838396_30840469_30840546_30862514_30862595_30867535_30867608_30871781_30871863_30872476_30872530_30873595
tx.2536	chr11	-	3074	6	FSM	ENSMUSG00000052298.13	ENSMUST00000064104.13	3069	6	-5	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	549	junction_4	66.5263857428013	221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTTGTTTGGATTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54678506	54608281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_54610551_54611068_54611184_54614399_54614502_54631063_54631377_54647231_54647386_54678385
tx.25360	chr6	-	1679	3	ISM	ENSMUSG00000025607.16	ENSMUST00000131256.8	961	10	-22	34967	-4	1503	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_1	16.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTGAGAAACAAAAGACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30873687	30870328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_30871863_30872476_30872530_30873595
tx.25361	chr6	-	747	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000086922.3	novel	685	1	NA	NA	-63	128	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTGGCAATTAATTGTTG	7055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31119661	31118785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_31119450_31119578
tx.25362	chr6	-	2366	4	NNC	ENSMUSG00000086212.8	novel	964	3	NA	NA	-2	1261	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGAATACAGTGGCCCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31375690	31342558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_31344528_31349168_31349328_31372632_31372730_31375549
tx.25363	chr6	-	1754	7	NNC	ENSMUSG00000025608.10	novel	5379	8	NA	NA	-2688	813	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3	junction_6	18.352262954621	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGGCCGTCTGCTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31503934	31499113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_31500155_31501239_31501408_31501604_31501667_31501873_31502028_31503136_31503209_31503481_31503691_31503886
tx.25364	chr6	+	861	4	FSM	ENSMUSG00000038836.16	ENSMUST00000115009.2	806	4	-159	104	-117	-65	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.62466929133727	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTCACTTTCTTTTTGCA	1958	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34757665	34762514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_34757995_34759034_34759154_34760504_34760529_34762125
tx.25365	chr6	-	1848	6	ISM	ENSMUSG00000029847.14	ENSMUST00000201355.4	2003	12	33258	-645	757	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	1.67332005306815	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAACAAACAAACTAGGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34932081	34922224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_34923272_34925142_34925239_34925332_34925442_34925739_34925905_34930699_34930954_34931904
tx.25366	chr6	-	1858	4	NNC	ENSMUSG00000029840.9	novel	3960	4	NA	NA	-24	-2030	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	365.396892281378	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTAAATTTGATGGCCTAC	4213	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35516758	35487870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_35489253_35498834_35498919_35499616_35499724_35516473
tx.25367	chr6	-	3379	12	FSM	ENSMUSG00000038648.6	ENSMUST00000041093.6	7082	12	-43	3746	-43	3291	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_10	9.34552529156102	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCTTACACTTTGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37419124	37307935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_37309436_37311297_37311518_37312762_37312890_37313149_37313250_37330491_37330561_37331685_37331745_37332577_37332725_37335397_37335583_37339292_37339381_37340902_37341079_37356746_37356964_37418633
tx.25368	chr6	+	629	2	ISM	ENSMUSG00000029823.17	ENSMUST00000160430.3	3906	8	28682	2152	28682	-1166	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGCCTGTTTTCCACAT	5211	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38575718	38580809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_38575750_38580211
tx.25369	chr6	-	2944	16	NIC	ENSMUSG00000029924.13	novel	4030	15	NA	NA	-3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_15	85.4180308834148	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCTGCTTAAGCTTGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39354612	39312918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_39314219_39315682_39315749_39321186_39321339_39322228_39322277_39322828_39322931_39324222_39324365_39326273_39326453_39326983_39327069_39329587_39329685_39331910_39332057_39334333_39334418_39336883_39336977_39341436_39341546_39343822_39343981_39344577_39344701_39354552
tx.2537	chr11	-	1308	4	ISM	ENSMUSG00000052298.13	ENSMUST00000064104.13	3069	6	-5	5500	-5	618	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	549	junction_2	69.1680722748742	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTTGTTGTGAACTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54678506	54613781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_54614502_54631063_54631377_54647231_54647386_54678385
tx.25370	chr6	-	2898	16	NIC	ENSMUSG00000029924.13	novel	4030	15	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	17	junction_14	84.3388930973658	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTCCCTGCTTAAGCTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39354609	39312919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_39314219_39315682_39315749_39321186_39321339_39322228_39322277_39322828_39322931_39324222_39324365_39326273_39326453_39326983_39327069_39329587_39329685_39331910_39332057_39334333_39334418_39336883_39336977_39341436_39341546_39343822_39343981_39349780_39349862_39354552
tx.25371	chr6	-	655	6	NNC	ENSMUSG00000002413.16	novel	4475	2	NA	NA	-3691	6735	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.9707362936728	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCCATTTTACCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39625411	39609490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_39609595_39616523_39616701_39617384_39617470_39620033_39620152_39621171_39621315_39625383
tx.25372	chr6	+	724	2	Intergenic	novelGene_1245	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACTTCATTGTCTACTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42009333	42010368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_42009458_42009768
tx.25373	chr6	+	596	2	ISM	ENSMUSG00000029860.17	ENSMUST00000203290.3	3076	6	7349	-3	2245	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCTAGTACTTGATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42334315	42335329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_42334368_42334785
tx.25374	chr6	-	2508	8	FSM	ENSMUSG00000029735.18	ENSMUST00000114644.8	2148	8	-83	-277	20	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15.0319387862467	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAATGCTGTGGTATTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43643192	43321930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_43323835_43400554_43400667_43465808_43465905_43500817_43500891_43536876_43536947_43588247_43588320_43642693_43642752_43643069
tx.25375	chr6	+	575	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029735.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTTTTAGTCGTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43359403	43369460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_43359522_43360549_43360617_43369070
tx.25376	chr6	+	1164	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000029735.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTTTGGTTGGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43586113	43627175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_43586489_43587233_43587334_43626486
tx.25377	chr6	-	2889	4	FSM	ENSMUSG00000051499.8	ENSMUST00000058844.6	3191	4	302	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	4.64279609239471	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATATGCGTTTGGGTTTGC	6022	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47807499	47796199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_47798636_47801974_47802131_47803895_47804023_47807329
tx.25378	chr6	+	5339	8	FSM	ENSMUSG00000025821.10	ENSMUST00000061890.8	5573	8	234	0	-218	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	24	junction_5	6.34388666033558	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTCCCTTAACTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47854371	47885419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_47854771_47856933_47857354_47866999_47867127_47867537_47867658_47869788_47869909_47874748_47874863_47875827_47875942_47881494
tx.25379	chr6	+	2658	5	NNC	ENSMUSG00000052763.8	novel	2801	5	NA	NA	140	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_4	63.3141966702571	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCACAGGGTGTTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47897549	47909573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_47897684_47903440_47903831_47903953_47904081_47905983_47906065_47907647
tx.2538	chr11	-	863	3	FSM	ENSMUSG00000052298.13	ENSMUST00000136059.8	801	3	-41	-21	-7	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	549	junction_1	84	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GCAAAACAAAGGATAGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54678508	54630790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_54631377_54647231_54647386_54678385
tx.25380	chr6	-	544	5	NNC	ENSMUSG00000068551.13	novel	543	5	NA	NA	25	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.17944947177034	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTCTGTAGACCGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48420945	48404635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_48404814_48418880_48418995_48419558_48419673_48420345_48420422_48420883
tx.25381	chr6	+	3089	3	FSM	ENSMUSG00000052751.17	ENSMUST00000118229.2	3138	3	49	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCTGGTGGTGTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48570873	48576016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48570987_48571724_48571911_48573226
tx.25382	chr6	+	1499	3	FSM	ENSMUSG00000090019.6	ENSMUST00000054368.7	1493	3	-1	-5	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGGTCGTGTCGTTCTT	7623	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48715986	48720729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_48716091_48718253_48718352_48719432
tx.25383	chr6	+	1357	4	NNC	ENSMUSG00000029816.11	novel	3701	11	NA	NA	24	-2298	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	34.2377309736236	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGATACTGTTCTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49013572	49022987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_49013727_49019700_49019854_49020930_49021075_49022081
tx.25384	chr6	-	2037	15	NNC	ENSMUSG00000029814.11	novel	4345	15	NA	NA	269	1002	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	214.615472462747	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAGTGGGGGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49190826	49064059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_49064375_49064697_49064816_49065359_49065496_49067909_49067985_49071073_49071191_49081107_49081234_49082503_49082640_49084275_49084399_49085859_49085995_49094085_49094368_49111628_49111693_49111780_49111833_49145403_49145453_49190200_49190262_49190578
tx.25385	chr6	-	965	3	NNC	ENSMUSG00000029817.12	novel	3040	7	NA	NA	18446	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	74	junction_2	256.5	50	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGTCTCTTTATTTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49222498	49220854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_49221666_49221801_49221867_49222409
tx.25386	chr6	-	1325	9	ISM	ENSMUSG00000029822.16	ENSMUST00000114466.8	2916	21	47228	-29	-22736	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_7	2.78388218141501	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTAACACTAATTTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50300070	50273755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_50274142_50276295_50276419_50277903_50278031_50279996_50280142_50285270_50285416_50286292_50286372_50289611_50289676_50297016_50297155_50299952
tx.25387	chr6	-	3223	23	NIC	ENSMUSG00000029822.16	novel	3307	22	NA	NA	162	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	2	5	junction_22	3.69861488480697	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAATGTGTGGGTTACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50432979	50273784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_50274142_50276295_50276419_50277903_50278031_50279996_50280142_50285270_50285416_50286292_50286372_50289611_50289676_50297016_50297155_50299952_50300204_50304354_50304449_50305649_50305785_50313194_50313326_50321853_50322011_50322990_50323084_50323307_50323412_50324345_50324470_50324950_50325119_50328823_50328938_50329763_50329818_50329964_50330082_50347102_50347339_50405308_50405401_50432804
tx.25388	chr6	+	761	2	NNC	ENSMUSG00000085776.9	novel	940	3	NA	NA	-6	-23390	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATGTCCACGGTATTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50543711	50548412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_50543795_50547734
tx.2539	chr11	-	805	5	FSM	ENSMUSG00000020268.15	ENSMUST00000144164.9	3431	5	315	2311	-9	422	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_4	23.1557228347551	432	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACAACGTTCCCCTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54751423	54731495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_54732029_54739404_54739487_54741170_54741242_54744052_54744126_54751377
tx.25391	chr6	-	1501	2	NNC	ENSMUSG00000055430.5	novel	630	2	NA	NA	-50	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACCTGTACTGTCATCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58884111	58882217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_58883072_58883464
tx.25392	chr6	-	450	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000107176.2	novel	423	1	NA	NA	-26	59	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCTACAGAACTCCAAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66852753	66852245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_66852430_66852487
tx.25393	chr6	+	411	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068396.10	novel	354	1	NA	NA	-32	75	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAGAAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71101561	71102022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_71101813_71101862
tx.25394	chr6	-	2045	9	FSM	ENSMUSG00000002222.15	ENSMUST00000002292.15	6165	9	404	3716	404	-1016	multi-exon	FALSE	canonical	3	172	junction_4	25.5828922328966	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATGTATGGTTTCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71417217	71369333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_-_71370173_71371608_71371764_71373835_71373939_71375344_71375511_71376110_71376278_71390233_71390335_71391768_71391904_71406001_71406145_71416981
tx.25395	chr6	+	1820	6	ISM	ENSMUSG00000049553.12	ENSMUST00000205517.2	4572	15	12558	5575	12558	-3115	internal_fragment	FALSE	canonical	3	330	junction_1	46.2151490314594	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGACTTAAGTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71951081	71956344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_71951196_71951727_71952004_71953002_71953204_71954317_71954436_71954927_71955093_71955398
tx.25396	chr6	-	1380	5	NNC	ENSMUSG00000055850.13	novel	1434	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	413.628154264189	220	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCGTGTGGTTCTGCTGTGT	8447	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72339376	72336696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_72337611_72337857_72337933_72338099_72338210_72338394_72338523_72339223
tx.25397	chr6	-	2612	12	NNC	ENSMUSG00000055799.14	novel	3042	12	NA	NA	124	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	127.052601848068	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTCTCTGGATGTTTCT	5249	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72765811	72603360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_72604777_72606938_72607015_72607994_72608103_72608197_72608358_72608942_72609080_72609909_72609994_72610198_72610302_72611082_72611216_72626102_72626187_72765193_72765322_72765544_72765609_72765692
tx.25398	chr6	+	2178	10	ISM	ENSMUSG00000035125.11	ENSMUST00000043195.11	4192	17	19306	819	1621	-160	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_2	8.30588070712478	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCTGGCCTTGGCTTCTT	8005	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81919955	81936077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_81919992_81920409_81920523_81921301_81921502_81923443_81923595_81925243_81925363_81926889_81926967_81928700_81928768_81930254_81930402_81933811_81933937_81934934
tx.25399	chr6	+	958	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081669.2	novel	528	1	NA	NA	-17462	351	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAAGAAAAGAAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85035711	85054052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_+_85035790_85053172
tx.254	chr1	-	973	3	ISM	ENSMUSG00000097519.3	ENSMUST00000181949.3	2052	4	11	2970	11	-2970	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_2	8.5	401	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGATTATGGCTACACAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57416692	57401350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_57401923_57414406_57414679_57416563
tx.2540	chr11	+	595	3	FSM	ENSMUSG00000020267.7	ENSMUST00000020504.6	636	3	36	5	36	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	4351	junction_2	227.5	75841	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGAGTGGATTTGTTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54757244	54761322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_54757427_54760673_54760779_54761014
tx.25400	chr6	-	1700	8	NIC	ENSMUSG00000030047.15	novel	2493	11	NA	NA	29	-4771	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.39970842444753	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGACCAAGAGAGCTACCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87473267	87441867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_87442680_87443454_87443577_87444894_87444969_87447494_87447628_87453124_87453333_87469159_87469248_87472894_87473095_87473204
tx.25402	chr6	-	970	3	NNC	ENSMUSG00000107622.2	novel	421	2	NA	NA	-862	206	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACCTCCAGTAGTCATTC	9658	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89263569	89261426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_89262028_89262965_89263089_89263323
tx.25406	chr6	+	644	3	Intergenic	novelGene_1267	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAGTCATTAGTCAACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94718596	94719449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_+_94718742_94718837_94718907_94719019
tx.2541	chr11	-	2742	18	NNC	ENSMUSG00000020400.18	novel	2973	19	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	72.1720838592133	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTGTGACTGGCTAATT	3602	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54846928	54801612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_54802324_54806322_54806414_54807621_54807814_54808081_54808148_54808625_54808752_54809431_54809564_54811586_54811716_54814919_54815056_54815201_54815268_54817529_54817620_54819920_54820045_54821590_54821686_54824814_54825007_54827286_54827368_54828772_54828892_54830423_54830562_54831536_54831709_54846846
tx.25410	chr6	+	579	4	NNC	ENSMUSG00000101553.2	novel	507	4	NA	NA	-23	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGACCTGCATGAATCCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100504337	100510393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_100504601_100506579_100506659_100510025_100510135_100510265
tx.25411	chr6	-	274	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000091845.2	novel	390	1	NA	NA	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTGTATTTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108117468	108117080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_108117192_108117305
tx.25412	chr6	-	2284	11	NIC	ENSMUSG00000030302.18	novel	4586	24	NA	NA	47	13866	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_3	9.96192752432982	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGGACATGGTTTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113868284	113766432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr6_-_113766957_113770626_113770842_113773199_113773359_113779446_113779507_113780707_113780741_113782421_113782548_113789745_113789872_113790747_113791006_113794108_113794307_113819092_113819607_113868213
tx.25413	chr6	-	518	4	NNC	ENSMUSG00000057841.6	novel	517	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8461.71256635178	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCGTATTTTCTATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115785708	115782472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_115782650_115783946_115784129_115784762_115784864_115785650
tx.25416	chr6	+	945	4	FSM	ENSMUSG00000041377.13	ENSMUST00000112711.9	853	4	-92	0	-92	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGAGTTAGTCTTGCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120070218	120177300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_120070420_120174863_120175096_120175603_120175789_120176973
tx.25417	chr6	+	1593	3	FSM	ENSMUSG00000030180.16	ENSMUST00000152293.6	1402	3	3	-194	3	194	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAAAAGTGGGCACCCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120341095	120346763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_120341740_120343530_120343609_120345892
tx.25418	chr6	-	1394	2	ISM	ENSMUSG00000058979.8	ENSMUST00000075303.7	1928	8	0	12875	0	-1577	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	241	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGGATAACACAAGTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120508280	120499329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_-_120500571_120508127
tx.25419	chr6	+	938	2	NNC	ENSMUSG00000040657.4	novel	817	2	NA	NA	-520	5	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTTAGTCACTGGGTCCTC	1906	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122367817	122369651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_122368087_122368982
tx.2542	chr11	-	2570	17	NNC	ENSMUSG00000020400.18	novel	2973	19	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	81.4876332641954	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTGTGACTGGCTAATT	3602	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54846928	54801612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_54802324_54806322_54806414_54807621_54807814_54808081_54808148_54808625_54808752_54809431_54809564_54811586_54811716_54814919_54815056_54815201_54815268_54817529_54817620_54819920_54820045_54821590_54821686_54824814_54825007_54827286_54827368_54828772_54828892_54830423_54830562_54846846
tx.25420	chr6	+	1513	2	ISM	ENSMUSG00000038451.14	ENSMUST00000052727.5	1219	3	2	3	2	-3	intron_retention	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACCTGTTTCATTATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124785870	124787579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_124785994_124786189
tx.25421	chr6	+	2059	5	ISM	ENSMUSG00000030329.12	ENSMUST00000162170.8	2053	6	426	0	224	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_1	6.9462219947249	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTAGTTGCCTGTTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124975825	124980059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_124975941_124976197_124976704_124977616_124977699_124978389_124978612_124978925
tx.25422	chr6	+	535	4	ISM	ENSMUSG00000001930.18	ENSMUST00000147101.2	2686	19	34305	-3	-2163	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_3	2.16024689946929	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGGCTGGTTGTGGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125660536	125663638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr6_+_125660609_125661055_125661096_125662772_125662871_125663313
tx.25423	chr6	+	864	1	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000106755.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCCAGGGCAACACAGGAGC	6171	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127159818	127160682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_127159800_127160700
tx.25424	chr6	+	1467	11	NNC	ENSMUSG00000037997.13	novel	3746	9	NA	NA	4	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_9	19.5714077163601	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGGCTGCCTGTGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127430586	127471202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_+_127430786_127444994_127445116_127447664_127447794_127448510_127448632_127451198_127451275_127454806_127454880_127454961_127455093_127466888_127467041_127468381_127468468_127468804_127468854_127470872
tx.25425	chr6	+	506	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030352.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACCTGCTTCCTCCTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128082043	128089607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_+_128082203_128082393_128082478_128088148_128088248_128089443
tx.25426	chr6	-	1478	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000108263.2	novel	696	1	NA	NA	-2444	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACTAATCAAATCTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134225773	134222634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr6_-_134224040_134225700
tx.25427	chr6	-	374	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000003031.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTTAAACAGAGGAGGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134902476	134897355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_134897587_134902333
tx.25428	chr6	+	800	2	FSM	ENSMUSG00000087277.2	ENSMUST00000126922.2	747	2	-45	-8	-45	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTAATTCTGGTTCATAT	8364	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145248832	145254685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_145249197_145254249
tx.25429	chr6	-	379	3	Intergenic	novelGene_1295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGCTTGTGCTTTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145294043	145287513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr6_-_145287664_145293589_145293775_145293999
tx.2543	chr11	-	971	7	NNC	ENSMUSG00000020400.18	novel	878	6	NA	NA	5	771	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_1	88.1880881349	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCAGACCCTTAGCCACGC	3605	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54846925	54824067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_54824258_54824814_54825007_54827286_54827368_54828772_54828892_54830423_54830562_54831536_54831709_54846846
tx.25430	chr6	-	804	4	NNC	ENSMUSG00000054966.14	novel	643	2	NA	NA	-1371	-41487	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAGCAATTTTTTTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	145561416	145417209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_145417711_145489170_145489231_145559616_145559685_145561241
tx.25433	chr6	+	1127	3	FSM	ENSMUSG00000040102.11	ENSMUST00000036003.8	6267	3	517	4623	517	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_2	10.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CGGTATTTAAAAGAAAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146993393	147009653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_146993866_147003063_147003258_147009192
tx.25434	chr6	-	834	4	NNC	ENSMUSG00000030306.15	novel	8383	20	NA	NA	87021	76937	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.86744175568088	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTGTTTGTGTTTATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	148256112	148235634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr6_-_148236141_148237140_148237245_148237748_148237831_148255970
tx.25435	chr6	+	1531	4	FSM	ENSMUSG00000039958.18	ENSMUST00000179873.8	1576	4	50	-5	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	12.0830459735946	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGAACTCAAGTGTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149043060	149052669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr6_+_149043203_149045512_149045941_149048655_149048787_149051839
tx.25436	chr6	-	2618	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000003452.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCGGTTGTTTCTTGGTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149467439	149440011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr6_-_149441861_149452397_149452508_149455860_149456077_149458223_149458443_149467215
tx.25437	chr7	+	902	1	FSM	ENSMUSG00000107470.3	ENSMUST00000203929.3	795	1	-22	-85	-22	85	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGATTAAAATTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3230819	3231721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_3230800_3231700
tx.2544	chr11	-	2489	26	FSM	ENSMUSG00000018340.14	ENSMUST00000108883.10	2489	26	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	343	junction_6	73.4786608478952	203	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGATGTGTGTGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54924271	54869933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_54870348_54872441_54872565_54874123_54874183_54875901_54875998_54876947_54877042_54877876_54877895_54882216_54882271_54883112_54883193_54885109_54885201_54885292_54885407_54885710_54885806_54887138_54887221_54889360_54889440_54890620_54890680_54892036_54892160_54894804_54894864_54895492_54895589_54895938_54896033_54896610_54896668_54898683_54898764_54899935_54900027_54901817_54901932_54902528_54902624_54904650_54904742_54912362_54912407_54924184
tx.25443	chr7	+	955	7	NNC	ENSMUSG00000086784.3	novel	2244	6	NA	NA	-111	-1256	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	0.763762615825973	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTATTGCGTTTGTGGGGT	2921	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4880040	4898716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_4880193_4894182_4894330_4894456_4894667_4894829_4894901_4894992_4895111_4898315_4898473_4898616
tx.25444	chr7	-	1084	2	FSM	ENSMUSG00000110221.2	ENSMUST00000210663.2	1279	2	-159	354	-159	-354	multi-exon	TRUE	canonical	2	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACAATCCAGAGCTCTGCT	2737	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4909674	4901802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_4902496_4909283
tx.25445	chr7	-	438	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030435.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCAACACGTAGGTACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5082932	5071473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_5071617_5082637
tx.25448	chr7	+	1464	3	ISM	ENSMUSG00000044876.16	ENSMUST00000108566.8	1648	5	11347	4	284	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	275	junction_2	6.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGAGTCTGACTCTCCGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6186858	6193416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_6187202_6191132_6191242_6192404
tx.25449	chr7	+	3559	6	NNC	ENSMUSG00000054893.16	novel	3498	5	NA	NA	0	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	20.0957706993288	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAGATTATATACAAAGAGG	2986	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6289591	6310665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_6289654_6290851_6290970_6292356_6292437_6293534_6293662_6296847_6296941_6307586
tx.2545	chr11	-	2478	25	FSM	ENSMUSG00000018340.14	ENSMUST00000102727.3	2471	25	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	220	junction_5	83.6892399827414	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGATGTGTGTGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54924278	54869933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_54870348_54872441_54872565_54874123_54874183_54875901_54875998_54876947_54877042_54882216_54882271_54883112_54883193_54885109_54885201_54885292_54885407_54885710_54885806_54887138_54887221_54889360_54889440_54890620_54890680_54892036_54892160_54894804_54894864_54895492_54895589_54895938_54896033_54896610_54896668_54898683_54898764_54899935_54900027_54901817_54901932_54902528_54902624_54904650_54904742_54912362_54912407_54924184
tx.25453	chr7	+	2947	5	NNC	ENSMUSG00000109176.2	novel	2801	5	NA	NA	-160	-27	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_3	7.34846922834953	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTTTCAAAATTTTTTCA	2994	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6980084	6994059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_6980472_6984231_6984357_6987994_6988152_6989101_6989202_6991881
tx.25456	chr7	+	859	2	ISM	ENSMUSG00000030376.9	ENSMUST00000168693.3	4171	9	-157	26057	-157	-26057	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCATCTTTGCCTATGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15864115	15868381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_15864347_15867753
tx.2546	chr11	-	1403	7	FSM	ENSMUSG00000049588.14	ENSMUST00000055040.13	1402	7	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2.51661147842358	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGGGTGTATTTCATTCT	4853	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54968933	54940555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_54941385_54941977_54942076_54943173_54943294_54943720_54943823_54945797_54945872_54951286_54951372_54968838
tx.25460	chr7	-	2139	2	FSM	ENSMUSG00000040891.7	ENSMUST00000036018.6	2037	2	-102	0	-102	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTTAGTGTCTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18757565	18747208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_18749056_18757273
tx.25463	chr7	+	305	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000062300.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTGTTCTGTTTGACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19483176	19489917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_19483456_19489891
tx.25464	chr7	-	1902	11	FSM	ENSMUSG00000057177.13	ENSMUST00000071739.12	2260	11	357	1	357	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	276	junction_10	34.6278789416851	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCCTGTCTGGCTGCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24936919	24927683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_24928356_24928889_24928998_24929275_24929466_24930029_24930126_24930209_24930308_24931059_24931167_24931258_24931390_24932998_24933110_24933252_24933337_24934977_24935166_24936802
tx.25465	chr7	+	1419	2	ISM	ENSMUSG00000058741.5	ENSMUST00000080288.5	1240	3	-97	2	-97	-2	intron_retention	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTCTTGATTTTCAGTGA	2028	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25000738	25003555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_25000900_25002297
tx.25466	chr7	-	2256	11	NNC	ENSMUSG00000040650.9	novel	2189	9	NA	NA	-24742	-267	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_9	20.9334660293034	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGGCCACAGTCAGAAATAT	NA	False	NA	-58	True	NA	NA	NA	26410604	26364918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_26365540_26372149_26372292_26372461_26372650_26373780_26373923_26374420_26374598_26378817_26378979_26380739_26380890_26381021_26381185_26385684_26385816_26389739_26389834_26410317
tx.25467	chr7	-	1966	9	NNC	ENSMUSG00000040650.9	novel	2189	9	NA	NA	-24735	-325	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_8	20.5453005575484	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTTTGGTGTCTTGTGCC	NA	False	NA	-51	True	NA	NA	NA	26410597	26364976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_26365540_26372149_26372292_26372461_26372650_26373780_26373923_26374420_26374598_26378817_26378979_26380739_26380890_26381021_26381185_26410317
tx.25468	chr7	+	1361	8	NIC	ENSMUSG00000078787.10	novel	1631	9	NA	NA	107	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.91662969499982	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAAACTTTTATTTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26854613	26858093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_26854729_26855581_26855732_26855940_26856102_26856642_26856820_26856895_26857038_26857138_26857327_26857576_26857719_26857807
tx.2547	chr11	+	2048	4	FSM	ENSMUSG00000000594.8	ENSMUST00000000608.8	4127	4	-52	2131	-52	-2131	multi-exon	FALSE	canonical	3	325	junction_3	15.195028426722	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGGGCTCCTTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54988888	55001724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_54989071_54994412_54994575_54999723_54999907_55000203
tx.25474	chr7	-	1902	5	FSM	ENSMUSG00000053985.11	ENSMUST00000207873.2	3411	5	-16	1525	-16	169	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.25861557047899	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGAAACGTTTAGCCTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29750821	29737308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_29738842_29742954_29743082_29744144_29744234_29745163_29745265_29750769
tx.25476	chr7	-	508	5	NNC	ENSMUSG00000057092.13	novel	469	6	NA	NA	-34	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	0.433012701892219	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGGTGCCAGAGACTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30771748	30769959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_30770146_30770276_30770315_30770586_30770624_30770716_30770821_30771605
tx.25477	chr7	-	1770	13	FSM	ENSMUSG00000001249.15	ENSMUST00000168884.8	1762	13	-12	4	-4	0	multi-exon	TRUE	canonical	2	2	junction_11	3.2945662334618	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTCTCTGCGTCTACAAA	9108	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30814719	30798153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_30798499_30798639_30798805_30798930_30799074_30799230_30799327_30801902_30802094_30802185_30802352_30802578_30802620_30802725_30802849_30802924_30803055_30808389_30808432_30808515_30808618_30814102_30814170_30814560
tx.25478	chr7	-	1017	4	ISM	ENSMUSG00000019194.16	ENSMUST00000098548.8	1573	6	3908	0	2325	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	2.35702260395516	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTATTCTCTCATTAAC	1307	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30822520	30815948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_30816562_30816648_30816721_30817130_30817273_30822330
tx.2548	chr11	-	752	3	ISM	ENSMUSG00000049491.16	ENSMUST00000128244.8	1841	12	21900	-6	21900	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGCATCTTTCTTAATTT	1227	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55020612	55015644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_55015988_55016428_55016599_55020373
tx.25483	chr7	+	997	3	NNC	ENSMUSG00000054676.18	novel	3282	3	NA	NA	-40	1439	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	21.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCATGGGTGTTTTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37883232	37889820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_37883325_37888030_37888202_37889086
tx.25485	chr7	+	564	2	NNC	ENSMUSG00000074903.6	novel	560	2	NA	NA	141	154	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCTTGATTTCTTGGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39238495	39239295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_39238783_39239018
tx.25486	chr7	+	870	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000108491.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.7410927974683	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCGGCTGCAGACTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42155235	42158299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_+_42155657_42155960_42156218_42157017_42157122_42158211
tx.25487	chr7	-	4096	5	NNC	ENSMUSG00000012640.17	novel	4184	5	NA	NA	-13	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_4	35.7657308047802	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTGTTCATATTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42962532	42945946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_42949601_42950593_42950690_42951034_42951162_42960454_42960610_42962468
tx.25488	chr7	+	1284	6	NNC	ENSMUSG00000055193.5	novel	845	5	NA	NA	-2066	399	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.22710574513201	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTAGATCATTTAGTTC	1016	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43581097	43589462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_43581146_43583166_43583235_43586828_43586980_43587764_43588049_43588168_43588301_43588861
tx.25489	chr7	-	1123	5	NNC	ENSMUSG00000038782.8	novel	1166	5	NA	NA	34	1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	3.11247489949718	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGTATCTGACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43896085	43879352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_43880066_43880266_43880340_43880749_43880807_43881779_43881981_43896006
tx.2549	chr11	-	761	4	ISM	ENSMUSG00000049491.16	ENSMUST00000128244.8	1841	12	20067	-6	20067	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_2	0.471404520791032	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGCATCTTTCTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55022445	55015644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_55015988_55016428_55016599_55020373_55020541_55022364
tx.25490	chr7	-	888	3	Intergenic	novelGene_1182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCCATCTCTGAAGTGAG	5200	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44354649	44352735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_44353288_44353534_44353804_44354582
tx.25491	chr7	-	2314	18	NIC	ENSMUSG00000002968.10	novel	2619	18	NA	NA	-3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	175	junction_9	180.66160609536	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGGCTCCCGTGACTGACG	6963	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44541828	44528807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_44528939_44529350_44529529_44529675_44529895_44529990_44530063_44530346_44530536_44532182_44532291_44532391_44532450_44532522_44532609_44533542_44533675_44533986_44534181_44534256_44534345_44534503_44534635_44534762_44534926_44535207_44535329_44535595_44535695_44541206_44541332_44541522_44541569_44541654
tx.25492	chr7	-	2358	3	NNC	ENSMUSG00000040364.9	novel	2470	4	NA	NA	19	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCAAATATTTACCCAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45343807	45327116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_45328949_45333603_45333716_45343393
tx.25493	chr7	-	343	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030851.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTCAAGGTTTTATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46510807	46505048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_46505190_46508289_46508386_46510701
tx.25497	chr7	+	2230	11	ISM	ENSMUSG00000033790.12	ENSMUST00000206789.2	3735	21	4	17553	1	602	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_7	5.8172158288996	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTTCTTGCTTATTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55443916	55459294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_55444089_55445645_55445700_55445786_55445896_55448579_55448677_55449210_55449291_55450376_55450513_55454328_55454444_55455042_55455133_55455800_55455895_55456330_55456578_55458258
tx.25498	chr7	+	910	4	ISM	ENSMUSG00000033790.12	ENSMUST00000205311.2	931	7	3949	-512	-689	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	6.16441400296898	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTCTACCTATTTCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55475339	55481195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_55475454_55475980_55476070_55479078_55479180_55480589
tx.25499	chr7	+	413	2	Intergenic	novelGene_1184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTGTCTTGGTCATGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56237250	56244296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_+_56237380_56244012
tx.255	chr1	+	2985	2	FSM	ENSMUSG00000038323.4	ENSMUST00000042734.3	3008	2	23	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATTTGGATGTGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57416801	57424582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_57417106_57421901
tx.2550	chr11	+	983	3	NNC	ENSMUSG00000085531.2	novel	520	2	NA	NA	-5594	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGCTTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55022275	55031020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_55022773_55023498_55023588_55030623
tx.25503	chr7	-	1412	4	FSM	ENSMUSG00000030518.18	ENSMUST00000133883.2	3842	4	2	2428	2	-2428	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.62466929133727	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GCAAATAAATCCACAATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64423398	64408288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_64409162_64411500_64411729_64417399_64417476_64423163
tx.25506	chr7	+	2563	7	NIC	ENSMUSG00000074071.12	novel	2815	9	NA	NA	-40	-23	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	10	junction_3	52.588813766174	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTTCCACATGTTAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67925702	68012812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_67925790_67950580_67950712_67954299_67954400_67999981_68000165_68003356_68003492_68007932_68008037_68010989
tx.25507	chr7	+	1821	2	ISM	ENSMUSG00000055652.15	ENSMUST00000092073.11	3385	3	18419	-3	18316	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTGGGTTCTGATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75516504	75523881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_75516890_75522445
tx.25509	chr7	+	743	4	NIC	ENSMUSG00000039099.8	novel	2285	18	NA	NA	29204	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.03957069398096	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGCGGTTCATCCTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79422114	79435702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_79422269_79426377_79426535_79426860_79427054_79435463
tx.2551	chr11	-	1343	2	ISM	ENSMUSG00000020264.6	ENSMUST00000039305.6	2429	10	22215	20	22215	-20	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGATGATGGCTTCCACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55053688	55049315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_55050442_55053471
tx.25511	chr7	-	1188	2	ISM	ENSMUSG00000025813.15	ENSMUST00000098326.3	10982	9	81578	8855	7518	394	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCAGAACTTAGTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81261135	81259083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_81260190_81261053
tx.25515	chr7	+	1096	9	ISM	ENSMUSG00000038540.15	ENSMUST00000163297.8	3621	19	-8	17190	-8	2017	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_6	2.08791163606126	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAACAAAAACATGTAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83234126	83250125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_83234389_83235493_83235641_83239847_83239924_83245268_83245351_83246654_83246762_83247407_83247507_83247607_83247751_83249155_83249304_83250093
tx.25518	chr7	-	1726	5	ISM	ENSMUSG00000041328.17	ENSMUST00000151177.2	4731	13	15475	-802	147	85	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	215	junction_4	23.3719917850405	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACAGTGTGAAACCTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92297270	92292665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_92293986_92295197_92295234_92295637_92295731_92296135_92296292_92297149
tx.25519	chr7	+	2171	14	NIC	ENSMUSG00000018995.13	novel	3778	14	NA	NA	-3	522	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_1	27.7429024987159	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGAAAGAAGTTATTTTTA	7396	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96600765	96712701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_96600863_96605150_96605261_96607281_96607403_96608877_96609019_96622688_96622770_96652004_96652100_96672824_96672958_96680544_96680644_96680752_96680791_96684437_96684505_96689105_96689244_96706654_96706753_96708992_96709020_96711775
tx.2552	chr11	-	947	7	ISM	ENSMUSG00000018593.14	ENSMUST00000213866.2	1366	11	13702	0	-4423	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	696	junction_1	26.3544219355226	767	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGTAAGAAAGAAACTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55297414	55286246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_55286440_55286626_55286776_55289373_55289523_55290017_55290152_55292776_55292898_55296005_55296128_55297335
tx.25520	chr7	+	2969	2	FSM	ENSMUSG00000044952.6	ENSMUST00000054107.6	2966	2	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACTTTGTGTCTGCTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96981530	96999420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_+_96981579_96996499
tx.25521	chr7	+	620	4	NNC	ENSMUSG00000097749.3	novel	464	3	NA	NA	227	3108	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGACTATCCATAAGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97826674	97831716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_97826696_97827628_97827741_97828504_97828618_97831342
tx.25522	chr7	+	1248	2	NNC	ENSMUSG00000055407.15	novel	3233	3	NA	NA	56854	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGTGTCTCTGGCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98975192	98986344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_98975288_98985191
tx.25525	chr7	-	2434	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000072244.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATTTTTCGACAGGACAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103884111	103881631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_103882758_103882803
tx.25526	chr7	-	4086	6	FSM	ENSMUSG00000048330.15	ENSMUST00000055993.13	5281	6	9	1186	0	-1186	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_4	4.1182520563948	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATTGAGGATTTTTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108682529	108634704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_108638091_108647157_108647304_108653571_108653666_108655950_108656024_108656989_108657217_108682369
tx.25528	chr7	+	891	6	ISM	ENSMUSG00000059263.10	ENSMUST00000215510.2	4697	29	-6	47148	-4	4486	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	330	junction_5	19.6529895944612	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGCAATTGAGACCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111622706	111662542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_111622954_111652423_111652628_111654048_111654163_111655681_111655821_111658178_111658276_111662452
tx.25529	chr7	-	847	2	Intergenic	novelGene_1204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTAAGAATCCATCATTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116173873	116170479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr7_-_116170691_116173237
tx.2553	chr11	-	1180	10	NNC	ENSMUSG00000018593.14	novel	1269	10	NA	NA	9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_9	234.825440815771	317	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGTAAGAAAGAAACTAG	3867	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55310715	55286246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_55286440_55286626_55286776_55289373_55289523_55290017_55290152_55292776_55292898_55296005_55296128_55297335_55297424_55298045_55298106_55300753_55300824_55310621
tx.25530	chr7	-	1344	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000107383.2	novel	1342	1	NA	NA	10	92	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGAATGGTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116425076	116423652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr7_-_116424457_116424536
tx.25531	chr7	-	1262	3	ISM	ENSMUSG00000008734.10	ENSMUST00000008878.10	4518	4	10583	3067	16	-326	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_1	4	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCCTGGCTGTGTCTTTCT	854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118583851	118574336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_118574427_118575735_118575894_118582837
tx.25532	chr7	+	2123	2	NNC	ENSMUSG00000100153.3	novel	1437	2	NA	NA	44	18	intron_retention	FALSE	canonical	3	208	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGGAGCTTGGGAATGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119339192	119341467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_119339946_119340097
tx.25533	chr7	+	1555	10	NNC	ENSMUSG00000051900.13	novel	3551	11	NA	NA	-15	-9056	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.09994388184574	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTAGAGTTTAATGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120008854	120069866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_120008990_120030330_120030473_120032565_120032826_120035058_120035180_120035872_120035991_120038391_120038566_120052179_120052362_120056273_120056409_120064907_120065026_120069696
tx.25534	chr7	+	1125	5	NIC	ENSMUSG00000051900.13	novel	3551	11	NA	NA	-9	-43398	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.82915619758885	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAAGCTGTATTTCAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120008860	120035524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_120008990_120026352_120026481_120030330_120030473_120032565_120032826_120035058
tx.25539	chr7	-	885	2	ISM	ENSMUSG00000030733.11	ENSMUST00000206664.2	2909	10	5015	-6	2141	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	321	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTGTGGCTGATATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126067225	126066164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_126066946_126067121
tx.2554	chr11	-	1197	10	FSM	ENSMUSG00000018593.14	ENSMUST00000018737.13	2300	10	182	921	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	577	junction_9	66.8521493786341	1464	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAGTAAGAAAGAAACTAG	3858	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55310724	55286246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_55286440_55286626_55286776_55289373_55289523_55290017_55290152_55292776_55292898_55296005_55296128_55297335_55297424_55298045_55298106_55300753_55300824_55310613
tx.25541	chr7	+	2487	4	NNC	ENSMUSG00000042759.13	novel	3685	4	NA	NA	-18	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.68178700572909	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGGTAAGGACTGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126184144	126188284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_+_126184241_126184547_126185817_126187068_126187335_126187428
tx.25543	chr7	-	2702	3	FSM	ENSMUSG00000054381.6	ENSMUST00000067425.6	2684	3	-13	-5	-13	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_2	4	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTTCTGCTCCTCATTTG	902	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	126975235	126971703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_126973871_126974560_126974675_126974814
tx.25545	chr7	-	2389	2	ISM	ENSMUSG00000049728.15	ENSMUST00000106261.8	2410	3	7219	-346	7219	70	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATGTGGCTTTGTTTAGC	3281	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127467599	127464818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_-_127466536_127466927
tx.25546	chr7	-	365	3	NNC	ENSMUSG00000049728.15	novel	5768	3	NA	NA	-18	2726	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCAGTGTCCATGTCACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127475324	127470215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_127470393_127473848_127473931_127475218
tx.25548	chr7	-	1303	6	FSM	ENSMUSG00000070371.12	ENSMUST00000156152.3	1132	6	-10	-161	-10	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	17	junction_5	34.92506263416	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACGTGGCTTTGTGGCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127534632	127531809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr7_-_127532287_127532542_127532665_127532738_127533005_127533310_127533453_127533561_127533800_127534574
tx.2555	chr11	-	478	4	FSM	ENSMUSG00000018585.10	ENSMUST00000108857.2	541	4	67	-4	25	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	2715	junction_3	136.123310110927	24336	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTCTGGTGTATGTTCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55351998	55337462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_55337611_55341282_55341452_55345706_55345783_55351913
tx.25551	chr7	-	1633	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000030852.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTGATATTTAGGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130246323	130238535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr7_-_130239966_130245871_130245954_130246202
tx.25552	chr7	+	3590	16	NIC	ENSMUSG00000030852.19	novel	3492	16	NA	NA	-31	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	48	junction_1	73.3327272702229	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTTCTTTGAGTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130247928	130366493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_+_130248161_130276331_130276470_130318432_130318570_130330252_130331559_130335235_130335297_130336678_130336881_130341541_130341604_130342569_130342686_130343859_130344032_130352919_130353064_130353563_130353641_130355347_130355392_130360894_130361056_130361263_130361371_130361644_130361766_130365983
tx.25555	chr7	-	1780	11	NNC	ENSMUSG00000030979.14	novel	1762	10	NA	NA	6	20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_9	25.9470614906582	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGACTTAAAAGTTCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133310817	133287951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr7_-_133288846_133291310_133291410_133292236_133292323_133292814_133292896_133299397_133299473_133300872_133300948_133302542_133302640_133303567_133303652_133304058_133304199_133306399_133306469_133310737
tx.25556	chr7	-	1464	9	NIC	ENSMUSG00000030979.14	novel	1762	10	NA	NA	0	-4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_3	23.9214208399083	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGACTGATCTGAGTATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133310788	133288088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr7_-_133288846_133291310_133291410_133292236_133292323_133299397_133299473_133300872_133300948_133302542_133302640_133303567_133303652_133304058_133304199_133310737
tx.25559	chr7	+	1620	10	ISM	ENSMUSG00000038611.18	ENSMUST00000106027.9	5248	18	-15	7313	-10	-2516	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_2	19.456186930551	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TCTTTAAAAAAAAAAGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140808686	140835226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_140808805_140811139_140811256_140812331_140812455_140817409_140817616_140820797_140820882_140823690_140823810_140826759_140826858_140827133_140827310_140828292_140828423_140834776
tx.2556	chr11	+	2362	12	FSM	ENSMUSG00000018583.6	ENSMUST00000018727.4	6703	12	20	4321	-13	-4321	multi-exon	TRUE	canonical	3	6361	junction_7	586.595613027527	726	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGGGGAACTGTAGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55360530	55391343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_55360628_55376451_55376565_55378304_55378387_55379844_55380019_55382789_55382881_55384273_55384368_55386078_55386278_55386969_55387072_55388476_55388589_55388738_55388868_55389383_55389494_55390284
tx.25565	chr7	+	2588	2	ISM	ENSMUSG00000050917.6	ENSMUST00000060336.5	3030	3	846	-5	846	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	677	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTGTCTGCTTTGTCTTT	8848	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	144415968	144418985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr7_+_144416073_144416501
tx.25568	chr8	-	1521	2	ISM	ENSMUSG00000005534.11	ENSMUST00000139504.2	1675	3	-44	46880	22	-46880	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGACTGTTTCTGTGGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3329595	3307980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_3308935_3329028
tx.25569	chr8	+	1472	11	ISM	ENSMUSG00000004567.17	ENSMUST00000004683.13	2065	14	6992	0	1670	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	278	junction_5	25.7604347789396	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGGTGGTCTAATTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3557448	3565232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_3557567_3558318_3558428_3558683_3558781_3559135_3559236_3560319_3560427_3560539_3560690_3560813_3560916_3561687_3561811_3562649_3562866_3564782_3564914_3565013
tx.2557	chr11	+	2349	9	ISM	ENSMUSG00000018583.6	ENSMUST00000018727.4	6703	12	19421	3955	19388	-3955	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6361	junction_4	595.702723155602	335	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCATCTGGCAATGTAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55379931	55391709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_55380019_55382789_55382881_55384273_55384368_55386078_55386278_55386969_55387072_55388476_55388589_55388738_55388868_55389383_55389494_55390284
tx.25570	chr8	+	917	4	FSM	ENSMUSG00000004567.17	ENSMUST00000159808.2	621	4	-107	-189	-107	189	multi-exon	FALSE	canonical	3	311	junction_2	11.323525167642	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3560559	3563211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_3560690_3560813_3560916_3561687_3561811_3562649
tx.25571	chr8	+	1984	14	NIC	ENSMUSG00000004565.16	novel	4438	34	NA	NA	7	61	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_13	63.2078378781522	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGAGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3566880	3575268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_3567165_3567324_3567408_3567557_3567656_3571274_3571416_3571507_3571668_3572100_3572182_3572276_3572406_3572587_3572669_3572758_3572925_3573257_3573342_3573757_3573868_3573998_3574167_3574251_3574330_3574947
tx.25573	chr8	+	2117	5	ISM	ENSMUSG00000011832.17	ENSMUST00000175650.8	2451	7	2123	-1	-231	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	6.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCTAAGGGATGCCGAATA	2364	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4255497	4258043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_4255728_4255823_4255971_4256055_4256152_4256231_4256328_4256495
tx.25574	chr8	-	1022	2	ISM	ENSMUSG00000040028.11	ENSMUST00000209010.2	2317	6	17056	788	17056	-788	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1686	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGGGAGTGTGTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4345563	4339130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_4339925_4345335
tx.25575	chr8	-	727	5	ISM	ENSMUSG00000040028.11	ENSMUST00000098950.6	5743	6	439	9988	112	-7027	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1349	junction_4	162.236517159362	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCCCTGTACACCACCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4374974	4345369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_4345562_4351684_4351839_4354926_4355031_4361598_4361787_4374885
tx.25579	chr8	-	421	2	ISM	ENSMUSG00000031448.13	ENSMUST00000033825.11	1372	7	11809	15	732	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTCCTAAGAGAATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13292353	13285669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_13285989_13292251
tx.2558	chr11	+	1503	2	ISM	ENSMUSG00000018583.6	ENSMUST00000018727.4	6703	12	28894	3966	28861	-3966	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7944	junction_1	0	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGGAAGAAAACTTCATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55389404	55391698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_55389494_55390284
tx.25580	chr8	+	1597	3	ISM	ENSMUSG00000031480.16	ENSMUST00000160585.2	3276	4	-36	16050	-4	-16048	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGATATTTTTCCTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22717324	22734345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_22717446_22728470_22728614_22733012
tx.25581	chr8	+	2323	2	ISM	ENSMUSG00000031480.16	ENSMUST00000160585.2	3276	4	15902	475	15885	-473	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATGATGCATTTTGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22733262	22749920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_22733973_22748307
tx.25582	chr8	-	546	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037492.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGCCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24643125	24640327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_24640808_24643059
tx.25583	chr8	+	1749	3	ISM	ENSMUSG00000054823.18	ENSMUST00000136107.9	3818	8	60928	6	-11224	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_1	6	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAATCCTTACATATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26153227	26164926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_26153273_26156045_26156173_26163349
tx.25584	chr8	+	1799	9	NNC	ENSMUSG00000054823.18	novel	2232	5	NA	NA	-24	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.7152971167234	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTATACGATCAGTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26188531	26204712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_26188650_26188760_26188964_26189938_26190052_26190478_26190749_26196551_26196669_26199089_26199232_26200699_26200807_26203384_26203587_26204185
tx.25585	chr8	-	2142	21	ISM	ENSMUSG00000037234.18	ENSMUST00000037182.14	12836	22	60	13534	60	3125	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_5	10.278496971834	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTGTTAGTGCCTGGTACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26609192	26524982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_26525031_26525160_26525266_26528049_26528151_26529696_26529780_26534267_26534303_26538279_26538368_26549267_26549409_26551404_26551475_26557877_26557966_26558586_26558698_26560101_26560304_26561085_26561227_26562284_26562449_26563627_26563712_26564895_26564959_26572541_26572610_26578087_26578221_26583684_26583736_26585785_26585859_26600763_26600850_26608985
tx.25586	chr8	+	767	2	Intergenic	novelGene_303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTCAGGTGTCATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29897317	29906745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_29897469_29906129
tx.25587	chr8	+	1689	2	ISM	ENSMUSG00000046152.17	ENSMUST00000066173.12	3183	5	49005	-10	35067	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTGGAGGAAGGAGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31726363	31751521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_31726459_31749927
tx.25588	chr8	-	1636	7	FSM	ENSMUSG00000062991.10	ENSMUST00000238826.2	1625	7	-34	23	-34	6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.86338998124982	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTTTTTCTTCATTGACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32499603	32327218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_32327757_32339337_32339468_32437011_32437063_32439944_32439996_32448539_32448662_32458035_32458214_32499037
tx.25589	chr8	-	1378	7	ISM	ENSMUSG00000031586.18	ENSMUST00000182987.8	1385	9	244	10554	-180	9604	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1115	junction_1	178.421473545709	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACCCACAAGAAACATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34419600	34284362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_34285179_34296744_34296879_34324331_34324483_34353013_34353077_34354360_34354400_34356354_34356433_34419503
tx.2559	chr11	-	2466	14	NNC	ENSMUSG00000020523.15	novel	2557	14	NA	NA	-16	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	45	junction_12	132.513346430646	34	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCGTGGTATTTAATAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57409459	57373818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_57374967_57378392_57378447_57380935_57381009_57382745_57382886_57383829_57383953_57390551_57390632_57396059_57396184_57397662_57397822_57398318_57398454_57400203_57400293_57404067_57404161_57404461_57404562_57405030_57405118_57409398
tx.25590	chr8	+	458	3	Intergenic	novelGene_304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTCTCACTGCTCTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34456794	34464314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_34456863_34457771_34457901_34464053
tx.25591	chr8	+	1119	6	NNC	ENSMUSG00000109714.2	novel	961	5	NA	NA	-404	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.0976176963403	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTTGCTCTCTGACCACC	2314	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36190924	36201931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_36190991_36191452_36191623_36191732_36191845_36192585_36192672_36198015_36198167_36201397
tx.25592	chr8	-	1704	8	ISM	ENSMUSG00000039633.8	ENSMUST00000239119.2	3930	12	19088	789	19088	-789	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_3	10.0974840268985	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCCATAGGGAGCGGACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36697582	36684006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_36684756_36686979_36687133_36689769_36689933_36690017_36690177_36692710_36692833_36696289_36696405_36697234_36697332_36697436
tx.25593	chr8	+	1056	5	ISM	ENSMUSG00000039620.18	ENSMUST00000135373.8	2573	7	89	7187	63	-5822	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_4	1.78535710713571	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCACAATCAGACAACTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36924790	36972923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_36925046_36925311_36925538_36956197_36956400_36965480_36965636_36972705
tx.25594	chr8	-	2374	13	NIC	ENSMUSG00000039431.17	novel	2799	15	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	6	junction_7	78.4022303395906	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAATCATTTTATTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41087832	41004135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_41004955_41007311_41007439_41008816_41008958_41011196_41011398_41013897_41013948_41015610_41015737_41017000_41017111_41040090_41040226_41043452_41043582_41050325_41050484_41059801_41059965_41061936_41062060_41087740
tx.25595	chr8	-	1329	8	FSM	ENSMUSG00000071103.11	ENSMUST00000098786.3	1340	8	17	-6	17	4	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	0.903507902905251	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGGGGTTGCTGACCTATA	1893	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46428272	46406638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_46406850_46409433_46409604_46415290_46415471_46420892_46420969_46421063_46421202_46423390_46423611_46426540_46426718_46428115
tx.25598	chr8	-	3432	5	NNC	ENSMUSG00000054408.10	novel	3466	5	NA	NA	14	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	423.496753234308	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCATTTTAAAGACTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54983019	54973483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_54976431_54977975_54978092_54979485_54979557_54981374_54981451_54982797
tx.25599	chr8	-	3839	6	ISM	ENSMUSG00000004319.16	ENSMUST00000110302.8	3768	13	25502	-1504	-6286	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	106.103722837608	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGGTTTGGCTTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61382280	61363425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_61366210_61367786_61367863_61372373_61372591_61375823_61376223_61380265_61380453_61382104
tx.256	chr1	-	1205	8	FSM	ENSMUSG00000048495.17	ENSMUST00000079998.13	1398	8	193	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_6	15.7025930524684	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTATTGGTGGAGTGGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57445640	57427398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_57427912_57429800_57429918_57430607_57430696_57432508_57432647_57433205_57433251_57435885_57435956_57440546_57440683_57445542
tx.2560	chr11	-	2022	9	ISM	ENSMUSG00000020523.15	ENSMUST00000020831.13	2557	14	10999	5	-190	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	449	junction_5	25.6746470277587	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTATAAGCGTGGTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57398444	57373823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_57374967_57378392_57378447_57380935_57381009_57382745_57382886_57383829_57383953_57390551_57390632_57396059_57396184_57397662_57397822_57398318
tx.25600	chr8	+	509	5	NIC	ENSMUSG00000079038.4	novel	2002	6	NA	NA	-9	-1036	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	14	junction_4	0.82915619758885	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTTATATGTCACAGTAG	7138	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69723722	69754778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_69723844_69743913_69743975_69752904_69753032_69753409_69753474_69754642
tx.25601	chr8	+	912	5	ISM	ENSMUSG00000031862.12	ENSMUST00000238491.2	4746	22	14390	-3	357	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	341	junction_1	24.2744721878767	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGCTGCCACTTATATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70258310	70260399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_70258493_70259410_70259554_70259646_70259759_70259841_70259986_70260068
tx.25602	chr8	+	1216	8	NNC	ENSMUSG00000031860.18	novel	1560	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	15.3157248790721	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCAGTGTTTTCAATACAG	2242	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70285309	70324942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_70285502_70311729_70311804_70316961_70317100_70317547_70317665_70319117_70319254_70322678_70322833_70323227_70323335_70324644
tx.25603	chr8	+	1542	10	FSM	ENSMUSG00000036151.16	ENSMUST00000110160.9	1446	10	-109	13	-109	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.28620410031003	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACATCACCACCTAAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70525464	70532703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_70525740_70526927_70527032_70527981_70528080_70528149_70528254_70528650_70528734_70530039_70530165_70530530_70530633_70530959_70531053_70531454_70531575_70532265
tx.25604	chr8	+	1359	5	FSM	ENSMUSG00000031840.15	ENSMUST00000110093.9	1442	5	10	73	10	-31	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	12.8646803302686	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTCTGCTGGCCCAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71207337	71211250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_71207518_71208502_71208731_71209093_71209213_71209783_71209909_71210543
tx.25605	chr8	+	1422	5	ISM	ENSMUSG00000000791.10	ENSMUST00000000808.8	2873	16	8393	0	3626	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_3	3.08220700148449	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGCCGTCGTGGTGCACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71269485	71274068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_71269684_71269855_71269991_71271968_71272066_71272325_71272408_71273158
tx.25606	chr8	+	2882	3	NIC	ENSMUSG00000066880.16	novel	2920	4	NA	NA	-24	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	14	junction_2	30	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTAGTGTTCTATTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72676671	72688472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_72676817_72682045_72682173_72685862
tx.25607	chr8	+	2563	2	ISM	ENSMUSG00000052446.18	ENSMUST00000136516.9	601	3	14726	-2055	12346	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGTTTGTAGAGACTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72719636	72724177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_72719765_72721742
tx.25608	chr8	-	844	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031799.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAGTTACTCCTAGCAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72889583	72884684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_72885156_72885593_72885723_72885844_72885967_72889461
tx.25609	chr8	+	1647	5	NIC	ENSMUSG00000062007.14	novel	1824	6	NA	NA	-19	-106	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.32290411644765	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTCCAGGTGTTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72943462	72955265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_72943532_72947282_72947430_72951582_72951749_72952211_72952332_72954120
tx.2561	chr11	-	2566	14	NNC	ENSMUSG00000020523.15	novel	2557	14	NA	NA	-10	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	272	junction_13	66.0623696698092	322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATAAGCGTGGTATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57409453	57373822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_57374967_57378392_57378447_57380935_57381009_57382745_57382886_57383829_57383953_57390551_57390632_57396059_57396184_57397662_57397822_57398318_57398454_57400203_57400293_57404067_57404161_57404461_57404562_57404920_57405118_57409398
tx.25610	chr8	-	3006	3	FSM	ENSMUSG00000045248.7	ENSMUST00000058534.7	2997	3	-3	-6	-3	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_2	2.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTGGAATCATTTCTCAT	3614	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73302117	73248398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_73250951_73251366_73251442_73301738
tx.25611	chr8	+	2606	7	NIC	ENSMUSG00000034518.15	novel	3989	12	NA	NA	-2	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	43.5829349886194	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATAGTCCAGTCTTAGCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75720304	75758603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_75720378_75746871_75746954_75748430_75748496_75749826_75749933_75750625_75750796_75756115_75756239_75756616
tx.25612	chr8	-	719	2	ISM	ENSMUSG00000037148.9	ENSMUST00000076316.6	3084	23	260551	0	260381	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTGTGTCCGGCCTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77984031	77976994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_77977637_77983954
tx.25613	chr8	-	1157	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000031684.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTTCCACCGCTGCCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79317933	79286232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_79287035_79289213_79289343_79315501_79315677_79317882
tx.25614	chr8	-	694	2	ISM	ENSMUSG00000064325.5	ENSMUST00000079038.4	9074	13	443	85401	443	-85401	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTCTTCTTTTTTATTGC	4749	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80784192	80777882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_80778250_80783865
tx.25615	chr8	-	1730	4	Intergenic	novelGene_328	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.88561808316413	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACCAATGAACATTATGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81095991	81054903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_81056334_81057072_81057172_81087494_81087590_81095885
tx.25616	chr8	+	838	4	Intergenic	novelGene_329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAAGTCTTGCTGGGCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81645447	81649894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_81645581_81646350_81646477_81647963_81648042_81649393
tx.25617	chr8	+	688	4	ISM	ENSMUSG00000002190.14	ENSMUST00000109831.3	2293	15	34203	0	34203	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_2	4.10960933531265	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGAGAGCCAAGAGATTCG	2397	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84150709	84153460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_84150828_84151199_84151363_84152153_84152255_84153154
tx.25618	chr8	+	2109	7	ISM	ENSMUSG00000008129.15	ENSMUST00000093375.5	2167	8	498	-1	498	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	2	6	junction_3	5.66911711723165	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTGATCTGTAGCTGTG	2608	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84875378	84899219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_84875515_84886073_84886237_84887841_84887921_84893209_84894320_84896983_84897082_84898446_84898540_84898789
tx.25619	chr8	-	614	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034656.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAATTGATTACATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85365516	85350569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_85350992_85364362_85364441_85365402
tx.2562	chr11	+	1903	3	FSM	ENSMUSG00000020522.14	ENSMUST00000108849.8	4827	3	6	2918	6	1371	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	35	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAAAAAGAGGACGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57409495	57421723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_57409539_57418684_57419116_57420294
tx.25620	chr8	-	1314	10	ISM	ENSMUSG00000031703.9	ENSMUST00000034140.9	3306	18	165	46425	165	-25216	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	275	junction_3	18.3121089264272	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGATATTTAAAACATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86567385	86490631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_86491037_86493586_86493682_86502768_86502851_86507144_86507207_86537173_86537269_86557811_86557887_86561649_86561708_86562974_86563121_86565556_86565630_86567162
tx.25621	chr8	-	1070	2	NIC	ENSMUSG00000031652.12	novel	6469	7	NA	NA	-8346	6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGTTGCTTCCTTAAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87587394	87570940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_87571670_87587053
tx.25622	chr8	-	2001	3	FSM	ENSMUSG00000031654.17	ENSMUST00000034076.16	2800	3	341	458	118	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAACGCTGACCCTGTGTTG	441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88198896	88195490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_88197080_88198319_88198440_88198604
tx.25623	chr8	+	553	3	Intergenic	novelGene_347	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTACGGTTGTTGGATTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89894059	89896981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_89894134_89895160_89895266_89896607
tx.25624	chr8	-	1322	3	FSM	ENSMUSG00000110212.2	ENSMUST00000211762.2	1425	3	-43	146	-43	-146	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TACAAAACAAAACAAAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91489267	91486236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_91487378_91488284_91488358_91489159
tx.25625	chr8	+	1480	3	FSM	ENSMUSG00000056608.15	ENSMUST00000211215.2	728	3	30	-782	10	585	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	4.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCACATGATTCTCACTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91555493	91599303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_91555543_91576261_91576388_91597998
tx.25626	chr8	+	511	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000089179.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91787392	91788708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_+_91787489_91787672_91787736_91788356
tx.25627	chr8	-	565	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055932.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTGTATGTATACACAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92131078	92129952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr8_-_92130373_92130933
tx.25628	chr8	+	433	1	FSM	ENSMUSG00000110073.2	ENSMUST00000211333.2	360	1	-73	0	-73	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	10	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGAATGGGGTCAGTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92416307	92416740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_92416300_92416700
tx.25629	chr8	-	1043	5	NIC	ENSMUSG00000031736.12	novel	1238	7	NA	NA	5	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_4	5.93190525885234	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTTGTTTGTGTAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93082492	93052660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_93053091_93071480_93071668_93072977_93073092_93073411_93073547_93082315
tx.2563	chr11	+	4368	2	NIC	ENSMUSG00000020522.14	novel	1258	2	NA	NA	0	-5	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTCAGAGTTGAATGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57409511	57424635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_57409539_57420294
tx.25630	chr8	-	802	3	NIC	ENSMUSG00000031736.12	novel	1238	7	NA	NA	-3	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTTGTTTGTGTAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93082500	93052660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_-_93053091_93071480_93071668_93082315
tx.25631	chr8	+	3004	13	FSM	ENSMUSG00000031740.9	ENSMUST00000034187.9	3078	13	74	0	74	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_9	5.63964143856288	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTTGGCTCTGTTTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93553992	93580048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_93554406_93557248_93557476_93558312_93558462_93559391_93559521_93559696_93559871_93562596_93562771_93563533_93563708_93565880_93566037_93567017_93567160_93570447_93570585_93572708_93572869_93576753_93576864_93579189
tx.25632	chr8	-	920	4	FSM	ENSMUSG00000110670.2	ENSMUST00000212930.2	1110	4	26	164	26	-164	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGAGTTGTTTCAGCCATG	200	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94153945	94149932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_94150064_94150168_94150242_94152733_94152830_94153325
tx.25633	chr8	+	854	8	ISM	ENSMUSG00000074151.14	ENSMUST00000182409.9	4552	31	30354	-3	18325	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.8070158058105	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGTGAGTAGAGTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95226991	95233572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_95227097_95227245_95227309_95228846_95228931_95231008_95231093_95231733_95231824_95232089_95232156_95233123_95233208_95233294
tx.25634	chr8	-	673	3	ISM	ENSMUSG00000063605.6	ENSMUST00000077955.6	2304	9	12121	0	11544	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	12	junction_2	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCAGAGTTCTGAAAGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95632605	95629496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_95630020_95631884_95631989_95632559
tx.25635	chr8	+	509	4	ISM	ENSMUSG00000090206.9	ENSMUST00000098480.9	660	7	8705	0	-135	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAGGCCCTAGGCTCGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96046930	96047957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_96047172_96047277_96047343_96047533_96047567_96047787
tx.25636	chr8	+	545	4	NNC	ENSMUSG00000036598.5	novel	1288	9	NA	NA	15813	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.90668171555645	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGGTCCTCTCACTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96276525	96285518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_96276653_96277824_96277933_96283818_96283975_96285364
tx.2564	chr11	+	1914	3	FSM	ENSMUSG00000020522.14	ENSMUST00000020830.14	4839	3	7	2918	7	1370	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_1	12.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACAAAAAAAGAGGACGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57409519	57421722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_57409575_57418684_57419116_57420294
tx.25640	chr8	+	1911	3	FSM	ENSMUSG00000033313.12	ENSMUST00000036221.12	1901	3	-12	2	-12	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCTGTGATCTCGAGTCAG	1518	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105991267	105995956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_105991393_105993326_105993798_105994641
tx.25644	chr8	-	567	2	ISM	ENSMUSG00000037993.9	ENSMUST00000042601.9	4463	27	15994	0	2257	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	151	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTGCATTTTAAATCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110276499	110274642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_-_110275116_110276405
tx.25646	chr8	+	727	4	ISM	ENSMUSG00000059854.9	ENSMUST00000043141.7	15783	87	247961	84508	70449	38124	internal_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	2.82842712474619	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCATGACCTTGTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111241569	111252377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_111241636_111245712_111245934_111249703_111249842_111252075
tx.2565	chr11	+	1862	2	ISM	ENSMUSG00000020522.14	ENSMUST00000108848.2	627	3	4893	-1371	4893	1371	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACAAAAAAAGAGGACGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57418682	57421723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_57419116_57420294
tx.25651	chr8	+	1710	4	FSM	ENSMUSG00000055835.11	ENSMUST00000212072.2	1930	4	108	112	3	-112	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_2	33.7671766990109	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATTATACTGAAAGTTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112370140	112397528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_112370245_112385017_112385074_112392692_112392837_112396122
tx.25652	chr8	+	423	3	Intergenic	novelGene_359	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGCTCTTTTGATTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113043302	113068274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_+_113043356_113044948_113045044_113067999
tx.25653	chr8	+	3352	5	FSM	ENSMUSG00000078908.11	ENSMUST00000035777.10	4998	5	-36	1682	-36	-309	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_3	4.52769256906871	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGTTCAAGACCCATTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114362430	114370129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_+_114362902_114364372_114364718_114365166_114365987_114366318_114366467_114368561
tx.25654	chr8	-	877	2	FSM	ENSMUSG00000031835.17	ENSMUST00000212813.2	849	2	-31	3	-31	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTTCCTTTCCCTATTG	8404	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120285211	120273830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr8_-_120274625_120285128
tx.25659	chr8	+	2470	7	NIC	ENSMUSG00000034796.15	novel	3018	14	NA	NA	-62	3	intron_retention	FALSE	canonical	3	10	junction_1	5.08811250749125	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTGCCTTTCTTGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123853193	123861924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr8_+_123854179_123854471_123854532_123855316_123855451_123856281_123856337_123856792_123857046_123860347_123860585_123861178
tx.2566	chr11	-	745	2	Intergenic	novelGene_167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCGTTTCTTGTGGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57446378	57433741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_57434199_57446090
tx.25660	chr8	+	2387	8	ISM	ENSMUSG00000034796.15	ENSMUST00000134235.8	3018	14	9097	-5	-46	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	4.85293935756087	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTGCCTTTCTTGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123853209	123861924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_123854179_123854471_123854532_123855316_123855451_123856281_123856337_123856792_123856845_123856911_123857046_123860347_123860585_123861178
tx.25661	chr8	+	742	2	NNC	ENSMUSG00000110599.2	novel	1434	4	NA	NA	3310	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCGTTTTGCATGTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	124464006	124466685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_+_124464227_124466163
tx.25662	chr8	+	1164	2	ISM	ENSMUSG00000089704.10	ENSMUST00000034458.9	4113	16	109424	1380	45449	-1380	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTATTGCTTTGGGTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125067553	125071081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_125067678_125070041
tx.25663	chr8	-	2285	5	NNC	ENSMUSG00000050751.15	novel	2824	7	NA	NA	-1006	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_4	40.5732362524855	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCGGCTGTTAGTATGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125103291	125095792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr8_-_125097426_125098590_125098697_125100984_125101183_125102848_125103030_125103124
tx.25664	chr8	+	988	5	ISM	ENSMUSG00000025812.19	ENSMUST00000161348.3	1124	6	4127	0	-1077	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_4	20.6397674405503	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTAGTGGCTGTTGACGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128136052	128159622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr8_+_128136189_128137209_128137255_128142050_128142279_128153002_128153235_128159275
tx.25665	chr9	+	2724	5	NNC	ENSMUSG00000050912.16	novel	2907	5	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	116.629756065937	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTAGTGTTTTGTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7764039	7794334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_7764129_7768290_7768342_7790842_7791110_7791311_7791466_7792171
tx.25666	chr9	-	1497	5	NIC	ENSMUSG00000053070.6	novel	1592	7	NA	NA	-37	208	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.26917420765551	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAATTCTTATTATATAG	-28	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	8042861	8021464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_8022546_8023900_8023968_8037460_8037537_8042409_8042492_8042670
tx.25667	chr9	+	3795	10	NNC	ENSMUSG00000037808.14	novel	540	3	NA	NA	-552	-19	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	46.2219551274334	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTGATTCTGCTGTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13738459	13757818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_13738918_13740055_13740121_13741020_13741076_13742277_13742434_13744267_13744468_13747180_13747229_13747398_13747480_13748132_13748269_13750935_13751038_13755324
tx.25668	chr9	-	1774	9	ISM	ENSMUSG00000046111.19	ENSMUST00000160946.8	4144	13	2524	5545	1110	539	internal_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_2	23.4517456706319	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAAAAGCCTCACTTCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15242164	15233755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_15234380_15234864_15235007_15235444_15235588_15236802_15237043_15237370_15237474_15237936_15238044_15239091_15239248_15241800_15241945_15242049
tx.25669	chr9	+	1134	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000090602.4	novel	852	1	NA	NA	-38	317	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACTTGGAAAAGGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16941302	16942509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_+_16941587_16941659
tx.2567	chr11	-	746	2	Intergenic	novelGene_168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCGTTTCTTGTGGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57446378	57433741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_57433907_57445797
tx.25670	chr9	-	700	2	FSM	ENSMUSG00000060510.15	ENSMUST00000213275.2	679	2	-7	-14	0	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAGATACTGACCCAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20432713	20431789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_20432416_20432639
tx.25671	chr9	-	1291	3	NIC	ENSMUSG00000032175.12	novel	4444	20	NA	NA	15904	-5595	intron_retention	FALSE	canonical	3	92	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGAATAGTTTTGA	5658	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21022738	21020960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_21021899_21022301_21022457_21022540
tx.25672	chr9	+	523	3	Intergenic	novelGene_1302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGTTGTTTTGGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21061323	21066456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_21061443_21064772_21064968_21066247
tx.25673	chr9	-	1418	9	NNC	ENSMUSG00000003309.15	novel	1706	11	NA	NA	3096	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	8.92240858737146	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGAGTGTGCTTCTTGGGT	4441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21220511	21206753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21207151_21207728_21207805_21209495_21209622_21210574_21210734_21213751_21213824_21213918_21214062_21216577_21216705_21216788_21217068_21220472
tx.25674	chr9	+	1567	3	ISM	ENSMUSG00000032185.16	ENSMUST00000132011.2	485	4	289	-1267	104	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1077	junction_1	17.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTGCAAAACAGCAGGGTA	7433	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21498802	21500763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_21498882_21499146_21499216_21499344
tx.25675	chr9	-	2199	5	NNC	ENSMUSG00000019066.14	novel	3835	5	NA	NA	-7	-442	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_4	14.6692706021806	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAGAGGAAAGACTCAATT	2279	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21829442	21820379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_21821968_21825940_21826066_21826158_21826278_21827000_21827243_21829317
tx.25676	chr9	-	1320	4	NIC	ENSMUSG00000006235.7	novel	1761	8	NA	NA	973	-6	intron_retention	FALSE	canonical	3	9	junction_3	2.82842712474619	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGACTTTGTCTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21872887	21870198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_21870967_21871056_21871145_21871819_21872140_21872743
tx.25677	chr9	-	1134	5	NNC	ENSMUSG00000032239.11	novel	1134	6	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	163.918424833818	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGTCATTATTAATACAG	9497	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22379657	22359606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_22360151_22361097_22361160_22365074_22365167_22368668_22368799_22379351
tx.25678	chr9	-	2497	16	ISM	ENSMUSG00000043067.16	ENSMUST00000115277.9	4747	23	25291	1466	25291	-1191	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	255	junction_7	20.2084690717091	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGTGTGTAGAGTGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24373919	24324537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_24325720_24332376_24332503_24333555_24333656_24334308_24334484_24336021_24336142_24337429_24337455_24341726_24341777_24343655_24343728_24345634_24345737_24349924_24350006_24350424_24350485_24352050_24352138_24359082_24359161_24361951_24362052_24365101_24365194_24373872
tx.25679	chr9	-	365	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000066809.2	novel	78	1	NA	NA	-39	288	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAACTCATGGTGAACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25012816	25012411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_-_25012451_25012490
tx.2568	chr11	-	1254	2	Intergenic	novelGene_169	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTTCTCGTTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57447737	57445632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_57446486_57447336
tx.25680	chr9	+	1058	6	ISM	ENSMUSG00000035024.17	ENSMUST00000214432.2	2077	12	13770	0	13743	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_3	15.9323570133235	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAGCATTTATTATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26999398	27006611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_26999493_26999728_26999863_27000595_27000674_27005696_27005769_27005856_27005918_27005992
tx.25681	chr9	+	478	2	ISM	ENSMUSG00000034275.19	ENSMUST00000115247.8	2857	15	-14	20558	10	-20558	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATGTGGACCCTGAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27210509	27220873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_27210814_27220699
tx.25682	chr9	+	2879	5	ISM	ENSMUSG00000047412.17	ENSMUST00000115222.10	8861	6	22594	5669	1	-17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	240	junction_4	54.687178570484	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTATGAAGCCACGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30964535	30981512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_30965610_30973336_30973422_30975474_30975639_30977954_30978039_30980040
tx.25683	chr9	+	1044	2	ISM	ENSMUSG00000032024.11	ENSMUST00000134153.2	616	4	6944	-662	6944	662	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTCTACTTTGACTT	4486	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40692333	40694429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_40692551_40693602
tx.25684	chr9	+	1114	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000111767.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAGGCCAAACTACCTGAG	7056	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42102069	42104212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_42102162_42103190
tx.25685	chr9	-	2083	2	NNC	ENSMUSG00000037287.16	novel	2327	2	NA	NA	6845	-181	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTAAGGGTGAAAGCCAAA	6272	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42332689	42325466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_42327446_42332585
tx.25686	chr9	-	1142	3	FSM	ENSMUSG00000048503.8	ENSMUST00000061833.6	3503	3	18	2343	-8	383	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCTGTTTCTTGTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43027847	43022287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_43023154_43024755_43024956_43027771
tx.25687	chr9	+	1662	7	ISM	ENSMUSG00000032135.16	ENSMUST00000034650.15	2989	16	5345	3	3046	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_3	2.98142396999972	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGATGCTGTGTTCCATT	3225	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44051203	44054021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_44051299_44051433_44051556_44051658_44051801_44051894_44051991_44052141_44052290_44052571_44052690_44053080
tx.25688	chr9	-	1264	2	FSM	ENSMUSG00000032120.12	ENSMUST00000213298.2	368	2	127	-1023	127	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGAGTGGCTGGTTATCCT	9150	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44225009	44221507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_44222565_44224802
tx.25689	chr9	-	3180	16	NNC	ENSMUSG00000032127.10	novel	3536	16	NA	NA	-9	-163	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	77.9168787875901	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATGGAGACTTTCCAGGT	6395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44272950	44259387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_44259882_44260199_44260423_44263893_44264066_44264205_44264409_44264511_44264652_44265133_44265296_44265399_44265589_44265705_44265853_44266260_44266448_44266995_44267148_44267524_44267727_44269365_44269614_44270434_44270599_44270908_44271045_44271135_44271271_44272724
tx.2569	chr11	+	746	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087165.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	0.816496580927726	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATGAGAGCAGGTGATCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57682081	57688566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_57682282_57685438_57685692_57687999_57688148_57688421
tx.25690	chr9	-	3813	21	NIC	ENSMUSG00000059890.17	novel	3415	20	NA	NA	6	330	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	34	junction_3	10.7396461766671	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCCTCGGTTTTCCTATTCT	5328	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44876870	44836815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_-_44837274_44840959_44841118_44843639_44843788_44844595_44844777_44846624_44846800_44848930_44849045_44849146_44849248_44851258_44851447_44852451_44852585_44853863_44854169_44856102_44856224_44857481_44857816_44859323_44859516_44860079_44860283_44861030_44861191_44862078_44862232_44863287_44863401_44864239_44864471_44871276_44871438_44874634_44874731_44876782
tx.25691	chr9	+	1032	4	ISM	ENSMUSG00000032087.12	ENSMUST00000213919.2	1739	8	234484	0	-11710	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_2	0.471404520791032	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGCTTTTGAGTTCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45572424	45584247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_45572578_45579286_45579566_45581293_45581570_45583923
tx.25692	chr9	-	983	5	ISM	ENSMUSG00000042790.17	ENSMUST00000162369.8	3517	13	-31	31691	3	12	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_4	6.10327780786685	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAG	9593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45817702	45807278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_45807524_45809729_45809790_45811043_45811555_45816103_45816218_45817649
tx.25693	chr9	+	877	4	NIC	ENSMUSG00000000167.15	novel	1157	6	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.35702260395516	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTGGTGTTTTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50528632	50536300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_50528899_50529745_50529950_50532920_50533187_50536159
tx.25694	chr9	+	2732	14	NIC	ENSMUSG00000032059.14	novel	463	5	NA	NA	23	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_1	59.440487865033	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATGTTTCAGTCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50686868	50754843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_50687284_50687843_50687980_50690269_50690405_50699452_50699542_50700796_50700933_50703362_50703451_50703601_50703708_50711418_50711542_50713237_50713393_50716601_50716732_50717521_50717670_50719976_50720107_50733884_50734016_50754033
tx.25695	chr9	+	370	4	ISM	ENSMUSG00000033054.8	ENSMUST00000035850.8	6062	18	0	24257	0	-17125	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	132	junction_2	22.4845626053867	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACCACACACTCTCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53448346	53461385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_53448489_53456467_53456587_53460209_53460271_53461337
tx.25696	chr9	+	681	2	FSM	ENSMUSG00000086914.2	ENSMUST00000146938.2	516	2	-100	-65	-100	65	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTGGTTCTGTTTCTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53578445	53592630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_53578656_53592159
tx.25697	chr9	-	1927	8	NNC	ENSMUSG00000032311.18	novel	1878	8	NA	NA	-8543	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_6	7.57277616039918	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGGAATTACTCTCTGTG	5543	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55199452	55127505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_55128693_55133899_55134039_55135136_55135223_55143723_55143804_55149344_55149492_55156379_55156454_55189834_55189901_55199304
tx.25698	chr9	-	1678	5	ISM	ENSMUSG00000032311.18	ENSMUST00000144939.8	721	6	210	-995	210	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	4.58257569495584	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTCATCCTGGAATTACTCT	457	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55149535	55127510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_55128693_55133899_55134039_55135136_55135223_55143723_55143804_55149344
tx.25699	chr9	-	570	2	NNC	ENSMUSG00000063849.7	novel	1814	4	NA	NA	11744	-43	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCTTGTGTCCCTGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57316857	57314803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_57315276_57316759
tx.257	chr1	-	1229	8	FSM	ENSMUSG00000048495.17	ENSMUST00000162686.8	1847	8	615	3	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_6	29.7341966257639	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTATTGGTGGAGTGGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57445645	57427398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_57427912_57429800_57429918_57430607_57430696_57432508_57432647_57433205_57433251_57435885_57435956_57440527_57440683_57445542
tx.2570	chr11	+	949	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000087165.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAAAAGGCACCGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57682094	57686399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_57682282_57685438_57685692_57685890
tx.25700	chr9	+	2286	9	NNC	ENSMUSG00000040188.11	novel	2340	9	NA	NA	-2	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	18	junction_6	82.6706568257444	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTGGCCCTGATGTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57468223	57496078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_57468394_57484475_57484545_57484921_57485021_57486715_57486834_57488066_57488196_57488772_57488933_57490190_57490237_57494362_57494484_57494704
tx.25701	chr9	+	2794	16	FSM	ENSMUSG00000032308.10	ENSMUST00000053230.7	2826	16	26	6	26	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_2	6.816320284598	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTATGCATTTCTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57496760	57503510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_57496970_57497606_57497748_57497943_57498065_57498496_57498602_57499276_57499421_57499613_57499697_57500101_57500258_57500444_57500551_57500740_57500782_57501033_57501137_57501264_57501330_57501416_57501496_57501566_57501608_57501889_57501938_57502065_57502133_57502225
tx.25702	chr9	-	548	2	ISM	ENSMUSG00000004661.16	ENSMUST00000167670.2	3057	3	-16	25660	7	-25660	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	253	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAACTCGCCAAGAACCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57744069	57741072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_57741516_57743964
tx.25703	chr9	+	1144	3	ISM	ENSMUSG00000032327.15	ENSMUST00000167479.8	2871	19	17242	-8	17097	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGTAAAGCTAATCTGAGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58059189	58061287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_58059326_58059727_58059884_58060435
tx.25705	chr9	+	1765	3	ISM	ENSMUSG00000025236.12	ENSMUST00000217570.2	2484	7	21483	-1	1393	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	305	junction_2	162.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAAGTCTAATTGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59220323	59223483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_59220520_59221035_59221135_59222013
tx.25706	chr9	-	1095	4	FSM	ENSMUSG00000049526.9	ENSMUST00000214580.2	1126	4	39	-8	39	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGAAATATATTTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59447091	59425960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_59426558_59426901_59427034_59427371_59427522_59446875
tx.25707	chr9	+	2702	11	FSM	ENSMUSG00000074259.11	ENSMUST00000098661.10	1368	11	-2	-1332	-2	-1118	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_7	5.61159513863928	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCCTTGTCTGTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59615044	59625039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_59615379_59616734_59616793_59617144_59617221_59617784_59617889_59618448_59618548_59618827_59618900_59619366_59619430_59621078_59621224_59621459_59621557_59623205_59623311_59623490
tx.2571	chr11	-	757	4	FSM	ENSMUSG00000087165.8	ENSMUST00000152790.8	714	4	-39	-4	-39	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	7.84573486395988	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTCTCAGTGATTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57692282	57686320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_57686621_57686851_57687000_57687137_57687224_57692059
tx.25711	chr9	+	323	2	NNC	ENSMUSG00000110826.2	novel	403	2	NA	NA	-10468	-2174	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTATTTTTAAAGGAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62138483	62149105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_62138653_62148951
tx.25712	chr9	+	204	1	Intergenic	novelGene_1327	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATAATTGTTAGTTGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62233711	62233915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_62233700_62233900
tx.25713	chr9	+	2079	7	FSM	ENSMUSG00000032245.13	ENSMUST00000034776.13	2142	7	60	3	53	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_1	5.87130498460285	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATGGGCCGTGGCTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62746126	62759285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_62746237_62751851_62751967_62753235_62753335_62754247_62754437_62754866_62754923_62756390_62756514_62757898
tx.25714	chr9	-	1737	20	NNC	ENSMUSG00000058444.9	novel	1294	11	NA	NA	189	16192	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.6180989419001	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGATGCTGCGTGTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63284970	63107360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_63107533_63124274_63124308_63124620_63124648_63142570_63142601_63164258_63164331_63169425_63169477_63170395_63170470_63188300_63188350_63193680_63193743_63200805_63200888_63200977_63201047_63210402_63210443_63229484_63229550_63237189_63237239_63245366_63245435_63246362_63246404_63250668_63250739_63265274_63265343_63279018_63279068_63284404
tx.25715	chr9	-	3221	17	FSM	ENSMUSG00000032396.18	ENSMUST00000168844.9	3575	17	101	253	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_16	6.60699203495812	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTGTACTTTTTTTTCTT	5188	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64248438	64214290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_64214631_64214711_64214887_64215561_64215708_64217448_64217628_64217723_64217879_64218727_64219262_64221215_64221309_64221834_64222083_64224969_64225132_64226364_64226535_64229683_64229864_64231903_64231983_64232989_64233167_64236714_64236851_64238068_64238198_64246760_64246915_64248274
tx.25716	chr9	-	1731	6	NNC	ENSMUSG00000053040.14	novel	5205	6	NA	NA	7	366	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	5.76194411635517	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGCGTAGCCCTTGTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66742001	66726199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_66726744_66729515_66729644_66735018_66735142_66735954_66736029_66740440_66740612_66741310
tx.25717	chr9	-	703	7	NNC	ENSMUSG00000052698.16	novel	12132	58	NA	NA	-74287	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_6	10.3185377947761	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAGAAGAAGGGACAGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67541272	67299834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_67299887_67300856_67300987_67302735_67302834_67304793_67304966_67367197_67367272_67466895_67466973_67541172
tx.25718	chr9	-	2239	13	FSM	ENSMUSG00000041361.14	ENSMUST00000093823.8	2283	13	46	-2	28	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.32024829314624	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGTCTCTTTTCTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71499596	71411626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_71412512_71422350_71422452_71432063_71432148_71453950_71454057_71456005_71456086_71457460_71457590_71459520_71459647_71462866_71463020_71466129_71466244_71468236_71468330_71471691_71471848_71486892_71486980_71499471
tx.25719	chr9	+	771	2	Intergenic	novelGene_1335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAAGTCTGAGTGAATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72095584	72102624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_72095893_72102161
tx.2572	chr11	+	574	4	FSM	ENSMUSG00000020519.6	ENSMUST00000020826.6	1151	4	577	0	577	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	543	junction_2	12.1197726417986	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTCGGTCAGGAGGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57693039	57701043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_57693116_57696869_57696993_57698849_57698949_57700767
tx.25720	chr9	+	4364	22	FSM	ENSMUSG00000038535.18	ENSMUST00000098576.10	4387	22	13	10	13	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_20	11.1161666503221	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATATTCAGATTCCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72182173	72271049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_72182312_72202560_72202605_72203256_72203318_72205983_72206131_72208982_72209049_72209148_72209289_72215232_72215351_72219359_72219531_72219932_72220043_72226373_72226598_72229734_72229893_72230281_72230383_72231289_72231437_72236309_72236445_72238147_72238456_72238574_72238716_72242328_72242392_72246027_72246147_72246293_72246331_72258806_72258853_72267567_72267624_72269215
tx.25721	chr9	+	726	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000062151.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTGTATACGTTGTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73474021	73542648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_73474267_73474530_73474587_73541345_73541469_73542139_73542270_73542476
tx.25722	chr9	+	628	3	FSM	ENSMUSG00000034858.17	ENSMUST00000215355.2	439	3	-166	-23	-24	23	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCGCTGTTTGTTTGGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74860141	74861501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_74860342_74860995_74861113_74861190
tx.25723	chr9	+	2168	11	NIC	ENSMUSG00000032192.10	novel	2105	11	NA	NA	-2	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_5	7.29657453878188	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTATCTTGTCTTTATTT	378	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75221420	75253160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_75221666_75234414_75234552_75239154_75239197_75240090_75240168_75241450_75241643_75242932_75243077_75244552_75244645_75247469_75247519_75250789_75250887_75251762_75251930_75252234
tx.25724	chr9	+	1470	6	ISM	ENSMUSG00000032192.10	ENSMUST00000215875.2	2105	11	21520	-7	1487	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_1	2.72763633939717	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGTATCTTGTCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75242937	75253160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_75243077_75244552_75244645_75247469_75247519_75250789_75250887_75251762_75251930_75252234
tx.25725	chr9	+	2792	3	NNC	ENSMUSG00000111839.2	novel	1009	4	NA	NA	11735	1969	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGGAGAAGTTGTGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82902390	82926625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_82902560_82909864_82910031_82924168
tx.25728	chr9	+	3608	19	FSM	ENSMUSG00000032374.15	ENSMUST00000070522.14	3649	19	41	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	58	junction_10	9.44264688775947	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGTGCCTCTCTGTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92424316	92490481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_92424622_92453307_92453400_92455523_92455661_92463254_92463419_92466543_92466657_92468891_92468956_92470653_92470752_92473352_92473455_92475797_92475924_92477314_92477437_92478388_92478494_92480640_92480767_92482793_92482936_92485000_92485115_92486831_92486898_92487425_92487531_92488560_92488708_92488816_92488943_92489127
tx.2573	chr11	-	1082	5	ISM	ENSMUSG00000086962.5	ENSMUST00000137124.3	933	7	2388	-269	2388	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATTTGCCTCCTTTGGCCA	2315	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57961354	57954379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_57954803_57956421_57956589_57956871_57956978_57957381_57957588_57961174
tx.25730	chr9	-	633	4	NNC	ENSMUSG00000043587.16	novel	395	3	NA	NA	0	1209	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.0277457017791	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTCGCTGTCGCCTGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96771486	96737313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_96737579_96738086_96738248_96738420_96738553_96771411
tx.25736	chr9	-	1162	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100039.2	novel	551	2	NA	NA	-756	1177	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGGAGTGTGCTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106330873	106328202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr9_-_106328408_106329916
tx.25738	chr9	+	1298	2	ISM	ENSMUSG00000010054.5	ENSMUST00000010198.5	1665	3	1410	0	1295	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	251	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACGAGAGTGGCGTCCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107441863	107443311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_107441896_107442045
tx.2574	chr11	+	2175	7	FSM	ENSMUSG00000020515.14	ENSMUST00000020822.12	2035	7	-140	0	-140	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	691	junction_3	50.6603614497787	1467	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATGAAGTGTGGTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57994838	58009420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_57995035_58000381_58000593_58002085_58002280_58003877_58004040_58004775_58004921_58006090_58006202_58008264
tx.25742	chr9	+	4737	28	FSM	ENSMUSG00000032481.18	ENSMUST00000088716.12	5717	28	13	967	13	-967	multi-exon	FALSE	canonical	3	994	junction_27	99.253261289205	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGCCTTAATCTGAGCC	2458	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109961060	110068279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_+_109961377_109964636_109964757_109968616_109968703_109976112_109976195_109978998_109979092_109982840_109982911_109986343_109986414_109993869_109993946_109996672_109996799_110000013_110000136_110002948_110003074_110004109_110004170_110006535_110006574_110011989_110012112_110012884_110012957_110014890_110015005_110015825_110015980_110016947_110017062_110019970_110020031_110025220_110025480_110026696_110026859_110031570_110031627_110033279_110033395_110035066_110035222_110042576_110042712_110050959_110051225_110063944_110064122_110066886
tx.25743	chr9	+	809	3	Intergenic	novelGene_1346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTACTCTATCTCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111561864	111569952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_111561982_111568485_111568700_111569474
tx.25744	chr9	+	3193	3	NIC	ENSMUSG00000032434.10	novel	3383	4	NA	NA	13	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	9	junction_1	298.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTTGTGCCTTCACAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114560253	114578412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_114560442_114569126_114569226_114575506
tx.25745	chr9	-	575	3	ISM	ENSMUSG00000032437.11	ENSMUST00000035010.10	4221	16	61802	1218	61802	-1218	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	727	junction_2	44	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTGTTTCTGATGTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115077687	115072866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_-_115073114_115075112_115075326_115077572
tx.25746	chr9	+	2492	5	ISM	ENSMUSG00000039285.13	ENSMUST00000130735.8	1407	7	2076	-1343	504	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	61.8925480167039	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGTAACAGCTGTATTTTG	8229	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117880458	117892900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr9_+_117880571_117884883_117884979_117888124_117888244_117888687_117888735_117890781
tx.25747	chr9	-	680	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039115.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.05480466765633	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGGGGGTCCAACAAAACTA	9144	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118692720	118679569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_-_118679921_118687184_118687326_118692324_118692461_118692668
tx.25748	chr9	+	693	2	Intergenic	novelGene_1354	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTCTAGTTTGCTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118693497	118694748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_+_118693596_118694153
tx.25749	chr9	+	969	9	NNC	ENSMUSG00000035769.10	novel	3383	19	NA	NA	0	11190	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_8	25.1864919153105	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTCTGCTTCCTGATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119186634	119201667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_119186774_119188297_119188381_119190179_119190250_119193562_119193644_119196554_119196642_119197137_119197267_119198685_119198752_119200981_119201055_119201426
tx.2575	chr11	+	1622	5	ISM	ENSMUSG00000020515.14	ENSMUST00000108843.8	2099	7	7177	0	-2621	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	691	junction_1	19.004933569997	305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCATGAAGTGTGGTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58002231	58009420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_58002280_58003877_58004040_58004775_58004921_58006090_58006202_58008264
tx.25750	chr9	+	3324	20	NNC	ENSMUSG00000035769.10	novel	3383	19	NA	NA	-2	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	25.4766201004991	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAAAATCCACCTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119186650	119222392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_119186774_119188297_119188381_119190179_119190250_119193562_119193644_119196554_119196642_119197137_119197267_119198685_119198752_119200981_119201055_119203365_119203485_119207309_119207392_119209051_119209093_119209376_119209516_119209649_119209766_119210567_119210684_119211319_119211394_119212402_119212500_119215384_119215444_119217746_119217835_119219495_119219591_119220806
tx.25751	chr9	+	1538	10	NIC	ENSMUSG00000061393.15	novel	3175	11	NA	NA	-2897	15	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	57	junction_2	42.6979052309491	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTGTGTTTTGTTTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119256514	119262596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_119256729_119257032_119257143_119257290_119257419_119257490_119257635_119258930_119259075_119259285_119259435_119260289_119260405_119261554_119261694_119261778_119261910_119262332
tx.25752	chr9	+	1165	7	NNC	ENSMUSG00000042787.16	novel	2571	7	NA	NA	-6	1196	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	3	junction_6	31.9409176797133	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGAGGTTTTGGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119274019	119295779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_+_119274217_119276014_119276165_119277454_119277595_119278843_119278921_119281293_119281409_119291441_119291595_119295446
tx.25753	chr9	+	280	3	NIC	ENSMUSG00000042787.16	novel	2571	7	NA	NA	-5	-18486	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	31	junction_2	14.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGTTTGAAGGCGTTTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119274036	119274818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr9_+_119274217_119274352_119274388_119274753
tx.25754	chr9	-	272	2	Intergenic	novelGene_1355	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACAATAGAAAGTGAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119955585	119955119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_119955258_119955451
tx.25755	chr9	-	304	2	Intergenic	novelGene_1356	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTAGAAAAAAATGACAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119955603	119955130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr9_-_119955258_119955426
tx.25756	chr9	-	1365	3	NNC	ENSMUSG00000100146.2	novel	644	3	NA	NA	25	536	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTTCCTGTCACTCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120744293	120742303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr9_-_120742571_120742946_120742999_120743247
tx.25757	chr9	+	614	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000111577.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTGTGTGTGTGTTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122538743	122541483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr9_+_122538865_122540990
tx.25759	chr9	-	2398	7	FSM	ENSMUSG00000025786.18	ENSMUST00000147563.9	6987	7	64	4525	6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	232	junction_1	22.8454955443445	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTTCTGCTCTGCTCTCT	8777	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122942206	122905899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr9_-_122907387_122909415_122909547_122912609_122912692_122913278_122913376_122918096_122918222_122929327_122929658_122942060
tx.2576	chr11	-	385	2	ISM	ENSMUSG00000037275.15	ENSMUST00000035604.13	4922	28	26	46421	26	-12682	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	186	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGTAATTGTGCATCCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58059339	58058536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_58058696_58059113
tx.25762	chrX	+	602	2	NIC	ENSMUSG00000039545.17	novel	3467	3	NA	NA	219	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTGCAAACGGGAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7440057	7444657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_7440149_7444146
tx.25763	chrX	+	2838	9	NIC	ENSMUSG00000000134.18	novel	6328	7	NA	NA	-3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	25	junction_1	123.340420686002	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCATTGAGTCTCCCGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7628795	7641436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_7628870_7631745_7631860_7632793_7633095_7633677_7633924_7635668_7635787_7637012_7637070_7637233_7637310_7638687_7638836_7639732
tx.25764	chrX	+	947	3	ISM	ENSMUSG00000031154.16	ENSMUST00000115668.10	2543	10	31469	430	17824	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	377	junction_2	72	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TCAACAAATCAAAAAGAATA	9905	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7739789	7741099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_7739995_7740078_7740193_7740471
tx.25766	chrX	-	1065	3	ISM	ENSMUSG00000031165.7	ENSMUST00000033505.7	2114	12	4246	-2	2513	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	2.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGCCACGTCGCCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7952491	7947689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_7948229_7951744_7951860_7952080
tx.25768	chrX	+	1619	3	FSM	ENSMUSG00000015342.7	ENSMUST00000015486.7	5076	3	121	3336	121	-3336	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	9.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTGTTTCGCATTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9139115	9176153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_9139474_9148235_9148499_9175155
tx.25769	chrX	-	503	2	NIC	ENSMUSG00000040363.16	novel	1534	5	NA	NA	-22	-2963	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCAAAGTTTTGTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12026616	12000694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_12001109_12026527
tx.2577	chr11	+	721	7	FSM	ENSMUSG00000020514.9	ENSMUST00000020820.2	722	7	2	-1	2	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	1080	junction_1	114.661821603066	7951	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTTCATTGAATTATTG	1483	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58062488	58070392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_58062540_58062619_58062669_58063858_58063977_58066102_58066169_58066957_58067036_58068042_58068113_58070103
tx.25770	chrX	-	1357	4	NNC	ENSMUSG00000037217.16	novel	3261	13	NA	NA	275	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	22.0151463012778	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTCTGTGCTTCTTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20786882	20726752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_20727729_20775575_20775668_20775763_20775822_20786651
tx.25771	chrX	-	590	2	NIC	ENSMUSG00000087586.2	novel	771	3	NA	NA	-90	-188	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTAATGCTCAAATGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21201056	21178636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_-_21178967_21200796
tx.25772	chrX	-	1555	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036769.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATAAAAGCAGTAAGGGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23560209	23478001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_23479083_23479732_23479937_23530986_23531147_23560099
tx.25773	chrX	-	948	9	FSM	ENSMUSG00000080725.10	ENSMUST00000119231.8	924	9	-24	0	-24	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTTTGAAAGGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26891021	26868042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_26868234_26868552_26868652_26871097_26871180_26879377_26879442_26879753_26879880_26883015_26883051_26883589_26883657_26889261_26889385_26890860
tx.25774	chrX	-	726	7	NNC	ENSMUSG00000094759.8	novel	907	9	NA	NA	7941	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.11803398874989	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTGTCTCCTATGAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30533012	30519660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_30519835_30520153_30520253_30522701_30522784_30530981_30531046_30531357_30531484_30532641_30532771_30532960
tx.25775	chrX	+	846	3	ISM	ENSMUSG00000016239.12	ENSMUST00000016383.10	2911	11	29188	-10	28325	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_2	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTTCTGTTTTAATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35621193	35626004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_35621302_35622258_35622409_35625416
tx.25776	chrX	-	849	5	ISM	ENSMUSG00000050379.16	ENSMUST00000115239.10	1845	10	55240	-6	55075	6	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	5	junction_1	21.1349828483488	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCAGGGGCCATTGTCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36198069	36178677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_36179001_36186492_36186684_36190434_36190568_36193751_36193921_36198036
tx.2578	chr11	+	900	7	NIC	ENSMUSG00000020514.9	novel	722	7	NA	NA	2	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	41	junction_2	483.207138698187	286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTTCATTGAATTATTG	1483	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58062488	58070392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_58062540_58062619_58062848_58063858_58063977_58066102_58066169_58066957_58067036_58068042_58068113_58070103
tx.25785	chrX	+	948	5	NNC	ENSMUSG00000073173.3	novel	205	3	NA	NA	-10636	307	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.433012701892219	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCACCTGTGTCCGCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55558305	55571099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_55558425_55566955_55567131_55568799_55568992_55570111_55570206_55570731
tx.25787	chrX	+	1334	7	NNC	ENSMUSG00000060681.16	novel	1061	9	NA	NA	-5	-5862	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	52.3558868599214	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATTTCTGTTTTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55655129	55674339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_55655181_55655322_55655552_55665685_55665886_55667970_55668049_55668347_55668425_55668719_55668833_55673753
tx.2579	chr11	+	671	6	ISM	ENSMUSG00000020514.9	ENSMUST00000020820.2	722	7	132	-1	104	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1268	junction_2	60.2229192251588	1657	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTTCATTGAATTATTG	1613	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58062618	58070392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_58062669_58063858_58063977_58066102_58066169_58066957_58067036_58068042_58068113_58070103
tx.25790	chrX	+	1144	3	Intergenic	novelGene_1382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCGTTTTCTCGTTGGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63977023	63982205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_63977270_63977673_63977765_63981398
tx.25791	chrX	+	899	2	Intergenic	novelGene_1383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTTCTCGTTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63977671	63982204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_+_63977765_63981398
tx.25795	chrX	-	1603	9	NNC	ENSMUSG00000057836.13	novel	1584	9	NA	NA	-17	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	496.010190797528	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTGGCATGAGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72140646	72129898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_72130791_72130883_72130980_72133005_72133105_72134464_72134565_72135379_72135498_72136875_72136911_72137788_72137859_72138555_72138689_72140586
tx.25796	chrX	-	1036	2	NNC	ENSMUSG00000079566.2	novel	1015	2	NA	NA	-116	24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGATGGGCTCAGGTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72220711	72218883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_72219726_72220517
tx.25799	chrX	-	534	2	NNC	ENSMUSG00000031393.17	novel	10538	4	NA	NA	15	-3404	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGCAGTGGCAATGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73129260	73128044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_73128434_73129115
tx.258	chr1	+	1069	5	FSM	ENSMUSG00000025971.7	ENSMUST00000027114.6	3540	5	423	2048	-8	-2048	multi-exon	FALSE	canonical	3	301	junction_4	18.5926732881531	2105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGCTAGTGTTCTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57445909	57455064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_57446382_57449070_57449143_57450881_57451009_57452398_57452547_57454814
tx.2580	chr11	+	2229	11	NIC	ENSMUSG00000037243.18	novel	1860	12	NA	NA	3	-5	intron_retention	FALSE	canonical	3	82	junction_1	26.5083005867973	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTATGCTTTGGTGCTACA	7676	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58197897	58205434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_58198083_58198337_58198588_58198798_58198831_58199620_58199885_58200217_58200267_58200353_58200999_58201081_58201160_58201243_58201323_58202281_58202397_58204791_58204892_58205002
tx.25800	chrX	+	984	2	ISM	ENSMUSG00000083847.2	ENSMUST00000121687.2	658	8	7792	-839	7792	839	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	314	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGATGAGTCATTTAATTG	9647	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73747444	73748521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_73747533_73747625
tx.25801	chrX	-	2143	10	FSM	ENSMUSG00000032750.14	ENSMUST00000037374.11	2153	10	-3	13	-3	-13	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5475986974649	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAACGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74128514	74032139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_74032443_74033659_74033777_74043570_74043707_74045416_74045499_74047929_74048138_74048921_74048978_74068383_74068863_74069594_74069812_74076776_74077081_74128273
tx.25802	chrX	+	2560	17	NIC	ENSMUSG00000025246.14	novel	5234	16	NA	NA	24	524	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	50	junction_1	145.192921228964	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTGTATTTTCTAGAACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76554642	76703873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_76554876_76628399_76628466_76677151_76677247_76684999_76685114_76687016_76687163_76689813_76690076_76691397_76691531_76691857_76692000_76692259_76692324_76692428_76692527_76693478_76693540_76693974_76694097_76696369_76696445_76696819_76696948_76699011_76699178_76702306_76702409_76703320
tx.25803	chrX	+	1094	3	ISM	ENSMUSG00000025246.14	ENSMUST00000133893.2	3611	13	144291	-896	144291	896	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	437	junction_2	48.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGACTTACTTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76699110	76704245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_76699178_76702306_76702409_76703320
tx.25804	chrX	-	1917	18	NNC	ENSMUSG00000025059.17	novel	778	8	NA	NA	-25	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	50.7092260396107	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTTGTTTCAGCAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84820284	84750602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_84750792_84754656_84754738_84755947_84756092_84756204_84756326_84756879_84756965_84757947_84758045_84759270_84759350_84773807_84773889_84780406_84780507_84780919_84780956_84783900_84783968_84784672_84784783_84787319_84787458_84789830_84789908_84797937_84798016_84804180_84804288_84804939_84805014_84820031
tx.25805	chrX	-	585	4	Intergenic	novelGene_1390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTGTGTGTATGTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85062193	85039605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_85039762_85040382_85040538_85060450_85060566_85062034
tx.25806	chrX	-	2342	4	NNC	ENSMUSG00000035427.19	novel	2403	3	NA	NA	-20	7	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	13.589211407093	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTATTCTTTGCTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85299845	85293852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_85294698_85294785_85296089_85298945_85299028_85299733
tx.25807	chrX	-	1708	4	Genic_Genomic	ENSMUSG00000078123.4	novel	1035	1	NA	NA	-1378	475	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.69967317119759	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGTGTCTCTGTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90977964	90975076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_90976614_90976719_90976776_90977133_90977190_90977905
tx.25808	chrX	+	663	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084007.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTCCAATGACATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93466101	93466886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_93466331_93466452
tx.25809	chrX	+	677	3	NNC	ENSMUSG00000071723.8	novel	1925	5	NA	NA	4852	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTGTAAGTTATGTTGG	9115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93684533	93686843	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_93684655_93685116_93685195_93686365
tx.2581	chr11	+	1951	12	FSM	ENSMUSG00000037243.18	ENSMUST00000049353.9	1860	12	-105	14	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	44.8549544883144	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTTGGTGCTACAGATAT	7671	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58197892	58205439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_58198083_58198337_58198588_58198798_58198831_58199620_58199885_58200217_58200267_58200353_58200492_58200779_58200999_58201081_58201160_58201243_58201323_58202281_58202397_58204791_58204892_58205002
tx.25810	chrX	-	2179	7	NNC	ENSMUSG00000034457.11	novel	2153	7	NA	NA	-17	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_6	41.1234591065597	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAATTGTATCTCATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96420839	96381378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_96382809_96385233_96385399_96386897_96386984_96387501_96387681_96405366_96405465_96414764_96414862_96420715
tx.25811	chrX	-	1394	5	ISM	ENSMUSG00000031214.14	ENSMUST00000113826.8	2794	26	312073	-655	-219	655	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_4	4.81534007106456	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGCGTCCAAAGAATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97622314	97601201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_97602012_97603191_97603234_97607235_97607287_97608321_97608488_97621989
tx.25812	chrX	-	1788	16	NNC	ENSMUSG00000031214.14	novel	2794	26	NA	NA	-130125	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	2	junction_15	5.49181208709839	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGTTTGTTTCTCCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97752220	97601856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_97602012_97603191_97603234_97607235_97607287_97608321_97608488_97621989_97622314_97640633_97640782_97670519_97670680_97684513_97684620_97685356_97685416_97688515_97688601_97739604_97739680_97741892_97741956_97742461_97742496_97745470_97745550_97748635_97748728_97752071
tx.25813	chrX	-	2044	3	Intergenic	novelGene_1398	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGTCTTTACTTGAACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99537795	99525624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_99527286_99529742_99529831_99537500
tx.25814	chrX	+	1213	7	ISM	ENSMUSG00000031314.19	ENSMUST00000149274.9	5954	39	52	56475	52	-47604	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_4	42.6523413451386	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATAATGAAGGTAAGCAACT	4167	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100576416	100586865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_100576608_100577100_100577216_100577350_100577468_100582673_100582794_100584365_100584608_100586069_100586289_100586656
tx.25815	chrX	-	1072	4	NNC	ENSMUSG00000034055.17	novel	6025	31	NA	NA	123412	-1387	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	34.0228681265345	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAAGTTTAAGAATTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101564440	101558967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_101559822_101560382_101560466_101561048_101561103_101564359
tx.25816	chrX	-	393	3	NNC	ENSMUSG00000046449.16	novel	10891	5	NA	NA	-431	2766	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	15.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGTGTTTTTATAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103245222	103124553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_-_103124709_103126759_103126890_103245114
tx.25817	chrX	-	3050	13	FSM	ENSMUSG00000025531.15	ENSMUST00000135821.8	3386	13	2	334	2	-334	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	51.3946468245694	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATATATGCTTGTATCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112095204	111972561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_-_111974057_111974543_111974641_111979275_111979340_111981613_111981719_111989834_111989913_112019872_112020099_112021625_112021747_112022245_112022363_112025712_112026128_112049032_112049158_112050410_112050484_112069200_112069268_112095137
tx.25818	chrX	-	1090	2	Intergenic	novelGene_1406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGATGGAAAGCTTCATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116231726	116226546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_116227411_116231500
tx.25819	chrX	+	2170	3	FSM	ENSMUSG00000079450.12	ENSMUST00000153946.8	1111	3	-192	-867	-152	867	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTATCATTTCTGCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122013039	122057551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_122013335_122027150_122027267_122055792
tx.2582	chr11	+	1876	12	FSM	ENSMUSG00000037243.18	ENSMUST00000153510.9	1887	12	6	5	6	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	49.3946830209872	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTATGCTTTGGTGCTACA	7679	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58197900	58205434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_58198083_58198399_58198588_58198798_58198831_58199620_58199885_58200217_58200267_58200353_58200492_58200779_58200999_58201081_58201160_58201243_58201323_58202281_58202397_58204791_58204892_58205002
tx.25820	chrX	-	1805	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000079450.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	9	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTTCTCGTTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122061340	122058838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_122059689_122060385
tx.25821	chrX	+	1617	1	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084047.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGGAAGGAAGCAAGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129301396	129303013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_+_129301400_129303000
tx.25823	chrX	+	3855	5	NNC	ENSMUSG00000096508.8	novel	3677	5	NA	NA	0	174	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	89.6392073815917	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTGGTTCTTCGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134334583	134344753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_134334711_134334908_134335040_134339279_134339580_134340880_134341466_134342041
tx.25824	chrX	+	1094	3	FSM	ENSMUSG00000044550.12	ENSMUST00000060904.11	1116	3	21	1	-7	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTATGGTATTGGCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135567144	135569126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_135567305_135567872_135567940_135568259
tx.25825	chrX	+	2176	4	FSM	ENSMUSG00000031428.12	ENSMUST00000113067.8	2259	4	83	0	-60	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGGCAGGGGTGTTCTATT	7984	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135893986	135897127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chrX_+_135894102_135894455_135894511_135894679_135894820_135895261
tx.25826	chrX	-	898	2	ISM	ENSMUSG00000031431.14	ENSMUST00000112995.3	1790	3	508	738	508	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTATTGGCATCGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139442909	139441014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_139441857_139442853
tx.25827	chrX	-	681	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041718.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTGTTTTTGACCAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143102554	143095777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chrX_-_143095862_143099092_143099560_143102424
tx.25828	chrX	-	1392	10	ISM	ENSMUSG00000031290.15	ENSMUST00000112819.9	4892	21	-13	38272	-13	-23979	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1.85259244450367	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTATAGTCTGCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	146337059	146291654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_146291714_146291814_146291913_146292105_146292218_146292700_146292789_146295048_146295183_146302033_146302171_146302255_146302362_146305508_146305636_146308269_146308415_146336673
tx.25829	chrX	+	2038	7	NNC	ENSMUSG00000079387.11	novel	2023	7	NA	NA	-4959	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	5	junction_3	4.81894409826699	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTATTTCTTTTTTTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	147660612	147707131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chrX_+_147660722_147686432_147686559_147687278_147687359_147690981_147691941_147698819_147698902_147699707_147699758_147706499
tx.2583	chr11	+	1147	2	ISM	ENSMUSG00000037243.18	ENSMUST00000049353.9	1860	12	-95	6149	8	-6135	intron_retention	FALSE	canonical	3	82	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAATGTCTGGGCATGGAG	7681	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58197902	58199304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_58198083_58198337
tx.25830	chrX	-	741	8	ISM	ENSMUSG00000025266.12	ENSMUST00000112691.9	4869	16	43	16556	43	-2423	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	496	junction_6	35.6009630688352	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGCTTTGAGTTAGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	149800275	149782692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_-_149782800_149783598_149783735_149784033_149784118_149785169_149785287_149786529_149786638_149787240_149787282_149797016_149797086_149800196
tx.25831	chrX	+	833	6	ISM	ENSMUSG00000025261.19	ENSMUST00000137816.8	1702	8	5	10120	5	2973	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	76	junction_1	23.9115035077262	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCAAACTATATCACACGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150586327	150626077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chrX_+_150586566_150589715_150589857_150618219_150618289_150623051_150623151_150623772_150623980_150625998
tx.25832	chrX	+	2179	10	NIC	ENSMUSG00000041658.13	novel	2258	11	NA	NA	-7	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	77	junction_3	67.8576942333489	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCCAGTGTCTGTGTTTC	3169	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151922969	151954937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chrX_+_151923572_151924359_151924394_151926971_151927072_151933357_151933425_151936126_151936350_151941190_151941287_151943397_151943521_151946073_151946166_151953182_151953299_151954211
tx.25833	chrX	-	1497	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094196.3	novel	963	1	NA	NA	-1102	377	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTTAATCTCTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153733603	153731161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chrX_-_153732567_153733511
tx.25836	chrX	-	858	3	Intergenic	novelGene_1417	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGGTCGTGTCGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164912319	164910024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chrX_-_164910181_164910728_164911264_164912152
tx.25837	SIRV6001	-	1300	2	Antisense	novelGene_SIRV6001A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6000	0	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_SIRV6001_-_447_5146
tx.25838	SIRV8002	-	365	2	Antisense	novelGene_SIRV8002A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8000	0	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_SIRV8002_-_33_7667
tx.2584	chr11	+	1113	7	ISM	ENSMUSG00000037243.18	ENSMUST00000049353.9	1860	12	2408	15	2408	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	58.7839736284947	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCTTTGGTGCTACAGATA	664	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58200405	58205438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_58200492_58200779_58200999_58201081_58201160_58201243_58201323_58202281_58202397_58204791_58204892_58205002
tx.2585	chr11	-	466	3	FSM	ENSMUSG00000049755.15	ENSMUST00000130217.2	423	3	-38	-5	-6	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	4	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTAAAGTATTCAACAGTC	609	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58214178	58210558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_58210781_58213394_58213556_58214095
tx.2586	chr11	-	442	3	FSM	ENSMUSG00000049755.15	ENSMUST00000135097.8	426	3	-45	29	-13	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_2	2.5	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTAAAGTATTCAACAGTC	602	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58214185	58210558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_58210781_58213425_58213556_58214095
tx.2587	chr11	+	2998	7	FSM	ENSMUSG00000013646.18	ENSMUST00000073128.7	2977	7	-22	1	4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	22.1716786313832	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATGTTTACTGTCTGTTA	447	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58221553	58238550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_58221619_58222079_58222690_58228562_58228626_58228774_58228904_58232111_58232274_58236137_58236312_58236755
tx.2588	chr11	+	2933	6	ISM	ENSMUSG00000013646.18	ENSMUST00000073128.7	2977	7	502	3	-23	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_1	8.42377587546108	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGATGTTTACTGTCTGT	971	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58222077	58238548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_58222690_58228562_58228626_58228774_58228904_58232111_58232274_58236137_58236312_58236755
tx.2589	chr11	+	2299	4	NNC	ENSMUSG00000107677.3	novel	2719	3	NA	NA	-1329	-188	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	4.18993502999218	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCTGAATATCTTTTAAG	1818	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58642230	58650309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_58642396_58643956_58644171_58647616_58647657_58648429
tx.259	chr1	+	2496	14	NIC	ENSMUSG00000038305.16	novel	3929	14	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	45	junction_5	8.58855713199065	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGGCTTGCTCTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57814020	57986124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_57814184_57838463_57838514_57871211_57871297_57894622_57894684_57918666_57918776_57921864_57921915_57924861_57925109_57939792_57940000_57941247_57941384_57962524_57962584_57977070_57977181_57979531_57979635_57982179_57982401_57985229
tx.2590	chr11	-	562	4	FSM	ENSMUSG00000049154.13	ENSMUST00000239007.2	561	4	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	3.29983164553722	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAGACTATGTCACAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58692786	58683627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_58683826_58687380_58687485_58689461_58689522_58692586
tx.2591	chr11	-	901	5	FSM	ENSMUSG00000037001.11	ENSMUST00000102703.2	3890	5	-19	3008	-19	-3008	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_4	4.94974746830583	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGGACTAAGAGGTTTCA	7165	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58795070	58781986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_58782373_58783787_58783881_58791390_58791518_58793568_58793734_58794940
tx.2592	chr11	-	1336	2	ISM	ENSMUSG00000020496.11	ENSMUST00000094151.6	1949	4	4683	0	4683	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	1240	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGTTTCCATACCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58825059	58823113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_58824223_58824832
tx.2593	chr11	-	648	2	FSM	ENSMUSG00000085379.2	ENSMUST00000131221.2	3201	2	31	2522	31	-2522	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTGTCCTGGTGTCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58868845	58859095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_58859406_58868507
tx.2594	chr11	+	2274	5	NNC	ENSMUSG00000020455.17	novel	2301	7	NA	NA	8	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	39.1176111233802	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCTCTGCTTATCCTGTG	1674	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58868926	58882284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_58869471_58872066_58872167_58872818_58873050_58879628_58879756_58881012
tx.2595	chr11	-	1961	3	FSM	ENSMUSG00000049287.6	ENSMUST00000054523.6	4021	3	3	2057	3	-2057	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	4.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTCAGACCTCTTGTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59054562	59048251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59049486_59049663_59050005_59054176
tx.2596	chr11	-	882	7	ISM	ENSMUSG00000020444.20	ENSMUST00000170895.3	743	8	853	-177	853	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	680	junction_6	63.6407015116025	483	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCACAGCCCTCCATACT	6534	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59077714	59074695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_59075014_59075261_59075348_59075854_59075940_59076019_59076159_59076767_59076865_59077225_59077268_59077599
tx.2597	chr11	-	962	8	FSM	ENSMUSG00000020444.20	ENSMUST00000170202.9	1078	8	121	-5	-19	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	619	junction_7	90.3745042609262	3272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCACAGCCCTCCATACT	1591	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59082657	59074695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59075014_59075261_59075348_59075854_59075940_59076019_59076159_59076767_59076865_59077225_59077268_59077599_59077714_59082576
tx.2598	chr11	+	408	2	NIC	ENSMUSG00000036860.15	novel	718	4	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCTGTCATTGTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59093317	59096714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_59093486_59096474
tx.2599	chr11	+	682	4	FSM	ENSMUSG00000036860.15	ENSMUST00000045697.12	940	4	12	246	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	484	junction_1	41.3467720088952	3095	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCTGTCATTGTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59093329	59096714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_59093486_59094997_59095082_59095381_59095584_59096474
tx.26	chr1	+	482	4	FSM	ENSMUSG00000097893.9	ENSMUST00000209020.2	264	4	-43	-175	-4	-169	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0.942809041582063	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTTCATGATTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9818807	9841151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_9818871_9820582_9820631_9822673_9822790_9840896
tx.260	chr1	-	2492	7	FSM	ENSMUSG00000054770.17	ENSMUST00000114410.10	2512	7	15	5	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_6	14.3372087784044	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGACTTTTCTGTGACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58009272	57994411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_57995980_57998301_57998405_58001059_58001155_58002226_58002421_58004487_58004700_58006655_58006883_58009179
tx.2600	chr11	+	701	4	FSM	ENSMUSG00000036860.15	ENSMUST00000108787.9	718	4	17	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_2	235.799820940465	388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCTGTCATTGTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59093331	59096714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_59093486_59094997_59095082_59095360_59095584_59096474
tx.2601	chr11	+	602	3	NIC	ENSMUSG00000036860.15	novel	718	4	NA	NA	-5	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	65	junction_1	260	277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCTGTCATTGTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59093325	59096714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_59093486_59095381_59095584_59096474
tx.2602	chr11	+	692	6	ISM	ENSMUSG00000020441.7	ENSMUST00000020719.7	1285	7	18	697	18	-697	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_5	14.2744527040444	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAGAAAGACAAAGAACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59099164	59100867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_59099500_59099645_59099692_59099794_59099878_59099953_59100027_59100133_59100220_59100798
tx.2603	chr11	+	1267	7	FSM	ENSMUSG00000020441.7	ENSMUST00000020719.7	1285	7	19	-1	19	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_6	17.464249196573	334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGTATATTATCTCGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59099165	59101565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_59099500_59099645_59099692_59099794_59099878_59099953_59100027_59100133_59100220_59100798_59100931_59101052
tx.2604	chr11	-	1761	5	FSM	ENSMUSG00000048076.15	ENSMUST00000061242.8	1800	5	40	-1	40	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1704	junction_4	263.796678333902	4914	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGGCTTGTGTGTCAGTG	1887	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59119056	59102238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59103522_59103646_59103772_59103968_59104080_59104165_59104350_59118998
tx.2605	chr11	-	1704	4	ISM	ENSMUSG00000048076.15	ENSMUST00000163300.8	1991	5	14637	2	14637	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2258	junction_1	47.7935374524864	561	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATGGGCTTGTGTGTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59104351	59102239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_59103522_59103646_59103772_59103968_59104080_59104165
tx.2606	chr11	-	1259	5	FSM	ENSMUSG00000049291.7	ENSMUST00000061481.7	1243	5	-9	-7	-9	7	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	3.57071421427143	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTCAGAGCTCCCATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59266492	59263487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59263997_59264251_59264395_59264991_59265264_59265982_59266146_59266320
tx.2607	chr11	-	726	3	NNC	ENSMUSG00000049291.7	novel	1243	5	NA	NA	1871	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_2	3.5	30	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTCAGAGCTCCCATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59264612	59263487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_59263997_59264251_59264395_59264538
tx.2608	chr11	-	1139	5	NNC	ENSMUSG00000049291.7	novel	1243	5	NA	NA	-4	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	4.24264068711928	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTCAGAGCTCCCATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59266487	59263487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_59263997_59264251_59264395_59264991_59265149_59265982_59266146_59266320
tx.2609	chr11	+	921	3	FSM	ENSMUSG00000086910.2	ENSMUST00000133698.2	659	3	164	-426	164	426	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGATCTCATTGGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59266450	59271157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_59266712_59269251_59269320_59270565
tx.261	chr1	-	603	3	FSM	ENSMUSG00000054770.17	ENSMUST00000162410.8	2261	3	-5	1663	0	-1627	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_2	11	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCCTGTAATCAGTTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58009243	58004387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_58004700_58006655_58006883_58009179
tx.2610	chr11	-	1912	5	FSM	ENSMUSG00000009894.16	ENSMUST00000010038.10	1896	5	-23	7	-15	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	264	junction_2	15.4110350074224	415	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGAGGAGCCGGGTCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59340848	59297966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59298637_59312350_59312476_59319166_59319640_59328803_59329340_59340740
tx.2611	chr11	+	1918	6	NNC	ENSMUSG00000036819.15	novel	4351	6	NA	NA	-14	-114	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	19.0326036053925	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTATGTATGTATGTATGCA	9467	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59340856	59346818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_59341339_59341500_59341667_59344336_59344506_59344617_59344886_59345758_59345906_59346132
tx.2612	chr11	+	1967	6	NNC	ENSMUSG00000036819.15	novel	4351	6	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	19.0326036053925	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGGAGTTCCTTTTTTATA	9481	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59340870	59346932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_59341339_59341500_59341667_59344336_59344472_59344634_59344886_59345758_59345906_59346132
tx.2613	chr11	+	1947	6	FSM	ENSMUSG00000036819.15	ENSMUST00000108777.10	4351	6	34	2370	34	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	13.8506317545446	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGGGGAGTTCCTTTTTT	9515	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59340904	59346929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_59341339_59341500_59341667_59344336_59344472_59344617_59344886_59345758_59345906_59346132
tx.2614	chr11	+	1869	6	FSM	ENSMUSG00000036819.15	ENSMUST00000147163.8	4359	6	29	2461	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_3	10.3614670775909	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGGAGTTCCTTTTTTATA	9510	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59340899	59346932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_59341339_59341500_59341667_59344336_59344472_59344703_59344886_59345758_59345906_59346132
tx.2615	chr11	-	3645	10	FSM	ENSMUSG00000020472.15	ENSMUST00000013262.15	4064	10	419	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	26.5236907846458	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTTTTCTTCTATCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59397051	59376345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59378644_59382940_59383055_59383996_59384108_59384540_59384674_59390369_59390447_59393745_59393927_59394209_59394637_59394973_59395081_59396653_59396789_59396989
tx.2616	chr11	+	1233	6	ISM	ENSMUSG00000005417.18	ENSMUST00000156111.2	2236	10	7203	1	7203	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	461	junction_5	38.6108792958669	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCGGCCCCTCTCATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59658776	59667048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_59658901_59660038_59660126_59660709_59660873_59662442_59662529_59662977_59663044_59666341
tx.2617	chr11	-	1788	2	FSM	ENSMUSG00000043648.8	ENSMUST00000125307.2	948	2	-34	-806	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGCTGCATGTCTACCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59678502	59674722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59676052_59678043
tx.2618	chr11	-	1541	5	ISM	ENSMUSG00000032633.13	ENSMUST00000091246.11	2768	13	13722	-40	13722	40	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	256	junction_3	17.4122801493658	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCGACTACATGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59686692	59682575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_59683638_59684911_59685018_59685098_59685231_59685966_59686091_59686575
tx.2619	chr11	-	2628	11	NNC	ENSMUSG00000032633.13	novel	3437	13	NA	NA	4795	40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	85.385244626926	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCGACTACATGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59695619	59682575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_59683638_59684911_59685018_59685098_59685231_59685966_59686091_59686575_59686690_59688880_59689072_59690179_59690272_59691868_59692030_59692954_59693177_59694574_59694722_59695342
tx.262	chr1	-	527	2	FSM	ENSMUSG00000054770.17	ENSMUST00000160130.2	4181	2	-62	3716	-13	-3716	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGGTGCTGTTCCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58009300	58006476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_58006883_58009179
tx.2620	chr11	-	2912	13	NNC	ENSMUSG00000032633.13	novel	3437	13	NA	NA	95	40	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	78.4245479567605	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCGACTACATGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59700655	59682575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_59683638_59684911_59685018_59685098_59685231_59685966_59686091_59686575_59686690_59688880_59689072_59690179_59690272_59691868_59692030_59692954_59693177_59694574_59694722_59695342_59695618_59698625_59698742_59700485
tx.2621	chr11	+	732	2	FSM	ENSMUSG00000087249.2	ENSMUST00000151825.2	771	2	-90	129	-90	-129	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCTGTAATGTCTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59700815	59709188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_59701088_59708728
tx.2622	chr11	-	1616	12	FSM	ENSMUSG00000019373.12	ENSMUST00000019517.10	1646	12	26	4	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	608	junction_5	45.2577558304642	1031	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATGTTAATGTGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59730638	59708624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59708935_59709244_59709326_59710830_59710945_59712125_59712213_59715100_59715275_59717115_59717257_59718671_59718852_59720972_59721066_59723709_59723760_59723857_59723971_59727716_59727847_59730495
tx.2623	chr11	+	1365	5	NNC	ENSMUSG00000032615.15	novel	1316	5	NA	NA	-45	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	31.6346329202664	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTGCTGTGGCCTTCTC	2600	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59730227	59767359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_59730583_59743616_59743718_59751575_59751637_59765378_59765498_59766630
tx.2624	chr11	+	1178	5	NNC	ENSMUSG00000032615.15	novel	1306	5	NA	NA	101	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	27.362154520432	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTGCTGTGGCCTTCTC	1851	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59739030	59767359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_59739199_59743616_59743718_59751575_59751637_59765378_59765498_59766630
tx.2625	chr11	+	1117	4	NNC	ENSMUSG00000032615.15	novel	1306	5	NA	NA	101	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	20.9814733091416	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTGCTGTGGCCTTCTC	1851	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59739030	59767359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_59739199_59743616_59743718_59765378_59765498_59766630
tx.2626	chr11	+	1200	5	NNC	ENSMUSG00000032615.15	novel	1387	5	NA	NA	189	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	32.0780298646909	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGCCTGTGCTGTGGCCTTC	1939	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59739118	59767357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_59739311_59743616_59743718_59751575_59751637_59765378_59765498_59766630
tx.2627	chr11	+	313	2	NNC	ENSMUSG00000085551.2	novel	274	2	NA	NA	0	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGCTCTGACGAAAGCTTG	2003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59812324	59812719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_59812469_59812550
tx.2628	chr11	-	520	2	FSM	ENSMUSG00000085260.8	ENSMUST00000146334.2	527	2	7	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGGAAGGTATATCTTAG	9285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59838961	59837714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59837923_59838649
tx.2629	chr11	+	819	2	FSM	ENSMUSG00000061650.7	ENSMUST00000081980.7	1920	2	19	1082	19	-1082	multi-exon	FALSE	canonical	3	425	junction_1	0	1309	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAACATTGTTTTGAAAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59839050	59851949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_59839305_59851384
tx.263	chr1	+	2011	3	NNC	ENSMUSG00000026039.10	novel	4939	9	NA	NA	-5471	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	149.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTATCTATCTATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58056403	58065056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_58057143_58058747_58058906_58063942
tx.2630	chr11	-	1611	2	FSM	ENSMUSG00000049892.8	ENSMUST00000062405.8	1611	2	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGCTTTGCTTTTAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59855770	59854006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59855193_59855345
tx.2631	chr11	-	993	7	FSM	ENSMUSG00000000301.17	ENSMUST00000102693.9	961	7	-35	3	-27	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_6	8.67307455417179	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTCTCTGGTCTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59937342	59861442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_59861702_59862009_59862085_59864893_59865006_59867664_59867811_59874268_59874385_59922538_59922647_59937165
tx.2632	chr11	-	900	6	NIC	ENSMUSG00000000301.17	novel	961	7	NA	NA	-42	-3	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	1	2	junction_5	14.8942942095287	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCTCTCTGGTCTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59937357	59861442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_59861702_59862009_59862085_59864893_59865006_59867664_59867811_59874268_59874385_59937165
tx.2633	chr11	+	1447	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000301.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTATTGAGTTTTTTTGCA	5227	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59892444	59897029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_59892686_59893383_59893690_59896129
tx.2634	chr11	-	626	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000062115.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTGTGAGGAAATAGAAAC	5929	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60031025	60022346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_60022730_60029146_60029242_60030877
tx.2635	chr11	+	1444	4	NIC	ENSMUSG00000062115.16	novel	6921	5	NA	NA	-50	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8.9566858950296	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGCGGCCTGTGGATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60066654	60090023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_60066788_60084764_60084859_60088614_60088665_60088856
tx.2636	chr11	-	1290	3	FSM	ENSMUSG00000020538.16	ENSMUST00000141161.2	540	3	286	-1036	286	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	425	junction_1	56	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCGATACACACAATCTTC	8429	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60091580	60089919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60090978_60091251_60091364_60091460
tx.2637	chr11	+	679	4	NNC	ENSMUSG00000056598.17	novel	2061	7	NA	NA	-127	-12946	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_3	4.64279609239471	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGCTCTCCCTGTTATAT	3294	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60244027	60249884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_60244259_60244927_60245027_60249443_60249643_60249734
tx.2638	chr11	-	1810	8	FSM	ENSMUSG00000042709.16	ENSMUST00000108721.9	1813	8	5	-2	-4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	286	junction_1	36.2902134443535	401	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGGTCTAAGCAGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60307872	60291449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60292365_60294662_60294779_60295205_60295319_60296601_60296683_60298119_60298218_60300085_60300232_60300411_60300457_60307576
tx.2639	chr11	-	1598	8	NIC	ENSMUSG00000042709.16	novel	949	8	NA	NA	3	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	55	junction_7	134.352870745478	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGGTCTAAGCAGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60307874	60291449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_60292365_60294662_60294779_60295205_60295319_60296601_60296704_60298119_60298218_60300085_60300232_60300411_60300457_60307811
tx.264	chr1	+	1160	2	NNC	ENSMUSG00000026039.10	novel	4939	9	NA	NA	-3017	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTTATCTATCTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58058857	58065054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_58058906_58063942
tx.2640	chr11	-	1591	8	NIC	ENSMUSG00000042709.16	novel	1849	8	NA	NA	-18	-5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	55	junction_7	105.029830553622	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGAATCTTTGGTCTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60307895	60291456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_60292365_60294662_60294779_60295205_60295319_60296601_60296683_60298119_60298218_60300085_60300232_60300411_60300457_60307811
tx.2641	chr11	-	1638	9	NIC	ENSMUSG00000042709.16	novel	719	8	NA	NA	0	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	37	junction_8	131.387249666777	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAATCTTTGGTCTAAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60307877	60291454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_60292365_60294662_60294779_60295205_60295319_60296601_60296683_60298119_60298218_60300085_60300232_60300411_60300457_60302492_60302556_60307811
tx.2642	chr11	-	1828	8	FSM	ENSMUSG00000042709.16	ENSMUST00000145532.9	949	8	-25	-854	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_4	104.174892192242	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGGTCTAAGCAGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60307869	60291449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60292365_60294662_60294779_60295205_60295319_60296601_60296704_60298119_60298218_60300085_60300232_60300411_60300457_60307576
tx.2643	chr11	-	477	3	FSM	ENSMUSG00000042709.16	ENSMUST00000156966.2	522	3	-5	50	1	-50	multi-exon	FALSE	canonical	3	293	junction_2	53.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTGGTAACAAACTTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60307867	60300090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60300232_60300411_60300457_60307576
tx.2644	chr11	+	1480	6	FSM	ENSMUSG00000018415.15	ENSMUST00000070681.7	4283	6	316	2487	316	-2487	multi-exon	FALSE	canonical	3	383	junction_3	37.1408131305711	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTATTTTTATGGTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60308403	60333616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_60308671_60315599_60315660_60323158_60323267_60327173_60327276_60329268_60329400_60332804
tx.2645	chr11	+	1762	13	FSM	ENSMUSG00000020537.10	ENSMUST00000018568.4	1788	13	12	14	12	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_10	43.4117879536576	1117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCCAGACCAGACTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60345428	60359566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_60345570_60347376_60347538_60350267_60350358_60350853_60350915_60351612_60351704_60352147_60352221_60352339_60352431_60352999_60353098_60353383_60353461_60354959_60355049_60355658_60355718_60358510_60358565_60358889
tx.2646	chr11	-	1124	8	ISM	ENSMUSG00000002812.5	ENSMUST00000002889.5	4060	30	10977	0	-1565	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	302	junction_7	20.8032572017961	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTACTTTTAATATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60607112	60604968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_60605274_60605414_60605481_60605856_60605963_60606109_60606217_60606286_60606416_60606491_60606553_60606628_60606784_60606917
tx.2647	chr11	+	2526	4	FSM	ENSMUSG00000018599.6	ENSMUST00000018743.5	2522	4	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_2	26.4701089281224	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGTGTAATTCTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60619219	60623777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_60619394_60621108_60621262_60621455_60621619_60621741
tx.2648	chr11	+	2329	3	NIC	ENSMUSG00000018599.6	novel	2522	4	NA	NA	-15	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_2	76.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGTGTAATTCTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60619253	60623777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_60619394_60621108_60621262_60621741
tx.2649	chr11	-	4234	19	FSM	ENSMUSG00000002814.16	ENSMUST00000002891.11	3741	19	92	-585	-8	585	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_8	18.9965071513323	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTCCAAGGTCTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60668099	60630298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60631528_60633261_60633951_60634758_60634882_60636642_60636787_60638691_60638858_60638937_60639052_60639991_60640122_60640229_60640416_60641401_60641610_60643108_60643192_60644712_60644788_60646769_60646871_60647103_60647275_60647430_60647575_60650122_60650232_60652557_60652634_60653293_60653368_60654191_60654252_60667747
tx.265	chr1	+	2547	12	NIC	ENSMUSG00000038242.13	novel	4973	35	NA	NA	12989	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.16420440680597	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACCAAGCCTCTGGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58292753	58307756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_58293155_58293298_58293491_58294633_58294862_58296373_58296470_58298200_58298330_58301723_58301799_58302501_58302555_58302992_58303108_58303500_58303567_58304117_58304304_58305786_58305955_58306918
tx.2650	chr11	-	810	2	ISM	ENSMUSG00000002814.16	ENSMUST00000002891.11	3741	19	34764	0	10077	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTGGTGGCATTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60633427	60630883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_60631528_60633261
tx.2651	chr11	-	1420	3	ISM	ENSMUSG00000002814.16	ENSMUST00000002891.11	3741	19	33346	0	8659	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_1	21.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTGGTGGCATTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60634845	60630883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_60631528_60633261_60633951_60634758
tx.2652	chr11	-	3528	18	FSM	ENSMUSG00000002814.16	ENSMUST00000102668.10	3542	18	17	-3	16	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_7	18.3744218184581	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAAGTAGATCTTTTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60668074	60632713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60633951_60634758_60634882_60636642_60636787_60638691_60638858_60638937_60639052_60639991_60640122_60640229_60640416_60641401_60641610_60643108_60643192_60644712_60644788_60646769_60646871_60647103_60647275_60647430_60647575_60650122_60650232_60652557_60652634_60653293_60653368_60654191_60654252_60667747
tx.2653	chr11	-	2016	12	FSM	ENSMUSG00000020534.15	ENSMUST00000018744.15	2858	12	60	782	60	15	multi-exon	TRUE	canonical	3	983	junction_2	78.1211180853749	1616	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGGTGGGTCCTGTAGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60702031	60679711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60680143_60680421_60680533_60680971_60681089_60683774_60683898_60685661_60685779_60688350_60688564_60689419_60689502_60692253_60692415_60692741_60692858_60695088_60695235_60697771_60697869_60701729
tx.2654	chr11	+	1246	7	FSM	ENSMUSG00000042569.14	ENSMUST00000042281.14	1553	7	33	274	-15	-274	multi-exon	FALSE	canonical	3	194	junction_1	30.3845721085919	1195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCATGTACAGGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60721489	60748975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_60721558_60734990_60735170_60739926_60740031_60742567_60742785_60743244_60743338_60746525_60746679_60748543
tx.2655	chr11	-	970	2	FSM	ENSMUSG00000043284.13	ENSMUST00000062677.12	1457	2	487	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	675	junction_1	0	4123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTGTTCTCTTTTCTGCC	7836	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60769611	60755277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60756175_60769538
tx.2656	chr11	-	1291	2	FSM	ENSMUSG00000042549.11	ENSMUST00000123544.2	1291	2	-10	10	-10	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	223	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAGACTTGTATTTATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60822703	60811752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_60812732_60822391
tx.2657	chr11	+	2167	12	FSM	ENSMUSG00000018932.10	ENSMUST00000019076.10	2198	12	21	10	0	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	361	junction_6	27.3405217988137	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGACTGACTGTGGCAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60822879	60843627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_60823098_60832705_60832773_60833130_60833180_60833976_60834091_60834312_60834433_60835490_60835608_60836336_60836389_60837469_60837598_60837936_60838015_60840746_60840887_60841983_60842030_60842589
tx.2658	chr11	+	661	2	Intergenic	novelGene_172	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCTTGCAACTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60997202	60999309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_60997355_60998800
tx.2659	chr11	+	2187	3	FSM	ENSMUSG00000010142.13	ENSMUST00000137832.8	764	3	5	-1428	5	-11	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	4.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACAAACTTGCATACAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61033291	61040187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_61033356_61037666_61037844_61038241
tx.266	chr1	+	2838	12	FSM	ENSMUSG00000051223.15	ENSMUST00000050552.15	3876	12	238	800	4	-800	multi-exon	FALSE	canonical	3	1694	junction_11	87.7965341283964	1258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTTATAGATCAGTCTTT	895	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58432294	58445712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_58432376_58433360_58433435_58436834_58437012_58438162_58438258_58439237_58439304_58439865_58440002_58440272_58440383_58440499_58440671_58442045_58442193_58442773_58442913_58443390_58443514_58444193
tx.2660	chr11	+	2157	2	ISM	ENSMUSG00000010142.13	ENSMUST00000123378.2	662	3	4148	-1608	4148	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	11	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCATACAGTATGCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61037638	61040193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_61037844_61038241
tx.2661	chr11	+	1415	9	ISM	ENSMUSG00000019102.11	ENSMUST00000019246.4	1729	11	4681	3	4681	-3	3prime_fragment	TRUE	canonical	2	6	junction_2	5.14629721255973	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGTGCATGCAATGCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61104251	61109244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_61104509_61105010_61105097_61105375_61105585_61106315_61106434_61107104_61107247_61107906_61108074_61108488_61108589_61108816_61108948_61109039
tx.2662	chr11	-	1693	2	ISM	ENSMUSG00000010025.20	ENSMUST00000074127.14	3091	10	18100	0	1925	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGTGTGTTAATTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61139911	61135678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61137148_61139687
tx.2663	chr11	-	3067	10	FSM	ENSMUSG00000010025.20	ENSMUST00000074127.14	3091	10	24	0	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	16.3435342295084	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTGTGTGTTAATTTTGA	1357	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61157987	61135678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_61137148_61139687_61139924_61141768_61141869_61144449_61144617_61147564_61147707_61149566_61149685_61153044_61153254_61155071_61155158_61155889_61156122_61157679
tx.2664	chr11	-	1966	12	NIC	ENSMUSG00000069855.10	novel	2377	17	NA	NA	5533	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_9	5.65393156562408	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGCTGAGAATATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61227877	61192452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_61193266_61193526_61193582_61194746_61194842_61198357_61198491_61199691_61199762_61200786_61200863_61201560_61201670_61203615_61203684_61204469_61204584_61216622_61216721_61219353_61219452_61227640
tx.2665	chr11	-	630	4	NNC	ENSMUSG00000069855.10	novel	278	3	NA	NA	5520	11398	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.88561808316413	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTGTTGCTTGAAAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61227890	61216328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_61216513_61216622_61216721_61219353_61219452_61227640
tx.2666	chr11	-	2643	17	FSM	ENSMUSG00000010122.15	ENSMUST00000010267.10	2639	17	-9	5	-9	-4	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_16	9.25675429078681	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTCTCTGGGCTGTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61268916	61234231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_61235355_61239484_61239558_61240270_61240366_61243487_61243621_61243891_61243962_61250177_61250254_61250345_61250455_61253512_61253581_61253652_61253767_61253848_61253947_61254219_61254318_61258498_61258544_61260076_61260120_61260943_61261093_61262581_61262651_61264180_61264283_61268738
tx.2667	chr11	-	1461	4	ISM	ENSMUSG00000010122.15	ENSMUST00000131723.8	2987	18	25239	-2	12827	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_3	2.49443825784929	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGGGCTGTAGATTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61243651	61234225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61235355_61239484_61239558_61240270_61240366_61243487
tx.2668	chr11	-	1807	8	ISM	ENSMUSG00000010122.15	ENSMUST00000131723.8	2987	18	15252	2	2840	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_5	2.99659670905758	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTCTGGGCTGTAGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61253638	61234229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61235355_61239484_61239558_61240270_61240366_61243487_61243621_61243891_61243962_61250177_61250254_61250345_61250455_61253512
tx.2669	chr11	-	1621	2	Intergenic	novelGene_173	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCAGTTTCATCGCTTCTT	8085	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61288486	61281953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_61283397_61288308
tx.267	chr1	+	2507	9	ISM	ENSMUSG00000051223.15	ENSMUST00000050552.15	3876	12	6105	800	5533	-800	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1694	junction_8	98.0264632637534	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTTATAGATCAGTCTTT	6762	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58438161	58445712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_58438258_58439237_58439304_58439865_58440002_58440272_58440383_58440499_58440671_58442045_58442193_58442773_58442913_58443390_58443514_58444193
tx.2670	chr11	+	1535	6	FSM	ENSMUSG00000042436.13	ENSMUST00000064783.10	1722	6	-8	195	-8	-195	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.26491106406735	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGCTTTGTGGACAGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61376248	61379531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_61376312_61376546_61376632_61376863_61377019_61377735_61377833_61377904_61378088_61378579
tx.2671	chr11	-	1131	3	ISM	ENSMUSG00000001034.18	ENSMUST00000152755.8	3255	6	3876	4	548	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	225	junction_2	11.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACTCTGCGTCATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61381216	61379641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61380097_61380189_61380324_61380674
tx.2672	chr11	-	2975	7	FSM	ENSMUSG00000001034.18	ENSMUST00000079080.13	3019	7	39	5	9	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_5	27.9861076647365	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGACTCTGCGTCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61385083	61379642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_61380097_61380189_61380324_61380674_61381331_61381433_61382513_61383729_61383896_61384472_61384781_61384905
tx.2673	chr11	+	787	7	FSM	ENSMUSG00000001039.13	ENSMUST00000102657.10	817	7	27	3	27	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_4	19.5739339144917	1886	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTCTGGGGCCTTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61395996	61403754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_61396098_61397169_61397239_61398453_61398566_61399897_61399995_61400295_61400359_61403197_61403266_61403477
tx.2674	chr11	-	4208	9	FSM	ENSMUSG00000001036.18	ENSMUST00000108713.8	4207	9	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	259	junction_6	30.1330383466387	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGGTTTTGGCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61470512	61408074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_61410534_61412484_61412701_61413231_61413319_61413854_61414020_61423343_61423519_61424396_61424508_61426096_61426210_61436975_61437738_61470392
tx.2675	chr11	-	2275	8	NIC	ENSMUSG00000001036.18	novel	4452	11	NA	NA	-1	-1170	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	14	junction_7	109.403204818185	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACAACGCATGATTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61470512	61409245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_61410534_61412484_61412701_61413231_61413319_61413854_61414020_61423343_61423519_61424396_61424508_61426096_61426210_61470392
tx.2676	chr11	-	1085	4	ISM	ENSMUSG00000001036.18	ENSMUST00000108713.8	4207	9	-1	16343	-1	802	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	259	junction_1	25.0377492776186	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGCGAAAGCTTGTTGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61470512	61424417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61424508_61426096_61426210_61436975_61437738_61470392
tx.2677	chr11	-	487	2	ISM	ENSMUSG00000001036.18	ENSMUST00000001063.15	4243	10	4	29291	4	-34	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	295	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAACTGGCGGCATGTATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61470507	61437365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61437738_61470392
tx.2678	chr11	-	1045	5	ISM	ENSMUSG00000042371.13	ENSMUST00000151780.8	1927	14	43543	5	43543	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.707106781186548	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGACGTCCACTGGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61567229	61563612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61563938_61564049_61564108_61564351_61564568_61564654_61564824_61566952
tx.2679	chr11	-	1479	9	ISM	ENSMUSG00000020528.15	ENSMUST00000004955.14	1837	12	6602	0	6552	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	149	junction_8	29.4976164291286	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTATGTGGATAGTTG	6844	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61646286	61620479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61621129_61622250_61622398_61625833_61625905_61627741_61627891_61631771_61631828_61635770_61635887_61639737_61639911_61643692_61643760_61646235
tx.268	chr1	-	1665	12	FSM	ENSMUSG00000026034.18	ENSMUST00000148330.8	1705	12	44	-4	44	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_9	47.751422461613	199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTATAGCTTGGTGTACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58463181	58451154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_58451500_58451805_58451897_58452105_58452186_58452548_58452632_58453530_58453661_58453748_58453844_58456171_58456339_58456425_58456543_58458825_58458893_58460241_58460468_58460932_58461094_58463078
tx.2680	chr11	-	1734	11	FSM	ENSMUSG00000020528.15	ENSMUST00000168115.8	1771	11	33	4	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_10	57.9565354382058	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTATGTGGATAGTTG	249	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61652881	61620479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_61621129_61622250_61622398_61625833_61625905_61627741_61627891_61631771_61631828_61635770_61635887_61639737_61639911_61643692_61643760_61646235_61646289_61647020_61647172_61652779
tx.2681	chr11	-	1839	12	FSM	ENSMUSG00000020528.15	ENSMUST00000004955.14	1837	12	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_11	44.7137821487915	241	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTATGTGGATAGTTG	240	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61652890	61620479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_61621129_61622250_61622398_61625833_61625905_61627741_61627891_61631771_61631828_61635770_61635887_61639737_61639911_61643692_61643760_61646235_61646289_61647020_61647172_61647407_61647504_61652779
tx.2682	chr11	-	2605	4	ISM	ENSMUSG00000004798.15	ENSMUST00000004920.4	5743	27	72948	0	21896	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	1.88561808316413	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTATTTCATATCATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61672951	61666474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_61668666_61670499_61670636_61672417_61672576_61672831
tx.2683	chr11	-	3476	15	FSM	ENSMUSG00000047804.16	ENSMUST00000102650.10	3874	15	33	365	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_4	17.9790127081323	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGTCAACTTCCTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61821045	61762497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_61763848_61768132_61768229_61768799_61768853_61777525_61777609_61781063_61781174_61784205_61784380_61787473_61787619_61791135_61791273_61794732_61794857_61795600_61795686_61800673_61800773_61805849_61806408_61806909_61807093_61813607_61813656_61820814
tx.2684	chr11	+	1854	2	FSM	ENSMUSG00000018500.3	ENSMUST00000018644.3	1845	2	-14	5	-14	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCAGCACGCACTGGCTTC	8709	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62139795	62157274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_62140263_62155887
tx.2685	chr11	-	738	4	NNC	ENSMUSG00000014243.6	novel	732	5	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_3	151.28853962618	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGATCAAGTTATTGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62172211	62158049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_62158433_62159529_62159635_62164537_62164659_62172082
tx.2686	chr11	-	746	5	FSM	ENSMUSG00000014243.6	ENSMUST00000072916.5	732	5	-14	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_4	57.8986182909402	1257	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGATCAAGTTATTGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62172215	62158049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_62158433_62159529_62159635_62164537_62164641_62167443_62167466_62172082
tx.2687	chr11	-	624	3	NIC	ENSMUSG00000014243.6	novel	732	5	NA	NA	-17	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	97	junction_2	132	932	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGATCAAGTTATTGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62172218	62158049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_62158433_62159529_62159635_62172082
tx.2688	chr11	+	2082	9	ISM	ENSMUSG00000042298.19	ENSMUST00000050646.13	3410	10	243	1176	243	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_1	27.7398630133604	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTATGGATTCTAATAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62172552	62206076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_62172715_62174422_62174534_62174956_62174996_62175828_62175886_62176649_62176712_62182949_62183045_62199867_62200020_62203841_62204005_62204835
tx.2689	chr11	+	1323	2	ISM	ENSMUSG00000042298.19	ENSMUST00000101075.11	2193	9	31615	-4	4055	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	196	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTATGGATTCTAATAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62203922	62206076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_62204005_62204835
tx.269	chr1	-	1064	7	FSM	ENSMUSG00000026035.16	ENSMUST00000114348.8	1033	7	-36	5	12	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_6	35.853482707015	454	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACATGTGAGTGTCCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58484629	58470157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_58470490_58473489_58473609_58477502_58477571_58480001_58480096_58481683_58481759_58483747_58483799_58484304
tx.2690	chr11	+	449	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018501.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATATGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62319875	62320431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_62320093_62320199
tx.2691	chr11	-	788	5	FSM	ENSMUSG00000018509.9	ENSMUST00000018653.8	1032	5	246	-2	-12	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1369	junction_4	69.2639877569867	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTATGACATATTTCTTT	8617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62429841	62415769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_62416114_62418317_62418433_62424710_62424781_62427107_62427207_62429681
tx.2692	chr11	-	817	4	NNC	ENSMUSG00000087120.2	novel	294	2	NA	NA	30	7746	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.29983164553722	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATGGTCTCTGCTTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62441837	62433126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_62433550_62436437_62436568_62440872_62440986_62441686
tx.2693	chr11	-	553	4	NNC	ENSMUSG00000087120.2	novel	294	2	NA	NA	66	4727	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.55902608401044	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAGGTTTTTAAAAAATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62441801	62436145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_62436341_62436437_62436568_62440872_62440986_62441686
tx.2694	chr11	+	1166	2	FSM	ENSMUSG00000019505.8	ENSMUST00000019649.4	1499	2	333	0	-172	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35417	junction_1	0	83905	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGGTGTCACTTGTGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62442329	62444039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_62442422_62442965
tx.2695	chr11	+	464	5	FSM	ENSMUSG00000086841.2	ENSMUST00000131787.2	462	5	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3662	junction_1	404.852056311932	61370	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCAGTGTTTTGGATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62493702	62495635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_62493850_62494060_62494109_62494422_62494473_62495228_62495293_62495480
tx.2696	chr11	-	1713	4	FSM	ENSMUSG00000046417.15	ENSMUST00000057194.9	1984	4	271	0	-203	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_3	14.7044966667419	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACGGACTGTGCTTTATTAG	5741	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62539078	62495709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_62497073_62500028_62500142_62511259_62511389_62538970
tx.2697	chr11	+	1329	3	NNC	ENSMUSG00000048497.12	novel	343	2	NA	NA	8	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGAGTCTGTGTCTGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62539497	62557182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_62539643_62555495_62556067_62556569
tx.2698	chr11	+	1228	3	NNC	ENSMUSG00000048497.12	novel	589	2	NA	NA	0	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGAGTCTGTGTCTGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62539638	62557182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_62539683_62555495_62556067_62556569
tx.2699	chr11	-	1805	6	FSM	ENSMUSG00000047342.18	ENSMUST00000054654.13	3051	6	28	1218	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_3	11.4262854856686	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGGGGTGTGTCTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62680260	62670430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_62671726_62674497_62674588_62675704_62675820_62678784_62678871_62679755_62679916_62680201
tx.27	chr1	-	616	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000046334.5	novel	357	1	NA	NA	-17	302	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAACAAACTGCTGGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9872795	9872119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_9872235_9872294
tx.270	chr1	-	814	7	NIC	ENSMUSG00000026035.16	novel	896	7	NA	NA	0	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	36	junction_6	60.3869467131212	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCACATGTGAGTGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58484645	58470159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_58470490_58473489_58473609_58477502_58477571_58480001_58480096_58481683_58481759_58483747_58483799_58484568
tx.2700	chr11	-	616	4	ISM	ENSMUSG00000047342.18	ENSMUST00000145474.8	641	5	318	-7	-111	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_2	13.5973853695808	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTTTTCACTCTCCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62679917	62674334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_62674588_62675704_62675820_62678784_62678871_62679755
tx.2701	chr11	+	2282	6	FSM	ENSMUSG00000047821.17	ENSMUST00000055006.12	3906	6	2	1622	2	-143	multi-exon	TRUE	canonical	3	37	junction_4	2.33238075793812	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCAGCGTTTGGAGTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62711058	62732140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_62711826_62719928_62720025_62724804_62725039_62727504_62727671_62728060_62728157_62731217
tx.2702	chr11	+	233	2	NNC	ENSMUSG00000090173.9	novel	3230	13	NA	NA	12834	9193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTTTCAAGAGAAATTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62750791	62751334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_62750867_62751176
tx.2703	chr11	+	361	3	NNC	ENSMUSG00000090173.9	novel	3230	13	NA	NA	12834	-11452	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAATAGTTGTGGTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62750791	62756127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_62750867_62753455_62753578_62755963
tx.2704	chr11	+	1750	7	FSM	ENSMUSG00000014177.11	ENSMUST00000014321.5	1784	7	35	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	376	junction_1	45.7666181111663	1838	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGATGTGTGGTCCCATTT	9276	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62770315	62786012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_62770422_62772762_62772846_62774452_62774598_62775901_62775992_62777014_62777147_62782767_62782897_62784947
tx.2705	chr11	+	1647	6	ISM	ENSMUSG00000014177.11	ENSMUST00000014321.5	1784	7	2479	-1	-1728	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	463	junction_3	15.2315462117278	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGATGTGTGGTCCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62772759	62786012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_62772846_62774452_62774598_62775901_62775992_62777014_62777147_62782767_62782897_62784947
tx.2706	chr11	+	664	2	NNC	ENSMUSG00000042200.4	novel	723	2	NA	NA	-10925	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTTCTTGTTTATACAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62831093	62883923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_62831222_62883387
tx.2707	chr11	-	1670	7	FSM	ENSMUSG00000042148.9	ENSMUST00000049091.9	2915	7	-2	1247	0	-1247	multi-exon	FALSE	canonical	3	230	junction_1	27.1272720502613	572	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGAATATTTCTTC	5005	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63970294	63854699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_63855355_63867069_63867303_63884711_63884783_63936052_63936178_63962343_63962663_63964362_63964497_63970161
tx.2708	chr11	-	1435	6	NIC	ENSMUSG00000042148.9	novel	2915	7	NA	NA	-2	-1251	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_1	106.914919445323	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGAATATTT	5003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63970296	63854703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_63855355_63884711_63884783_63936052_63936178_63962343_63962663_63964362_63964497_63970161
tx.2709	chr11	-	796	3	FSM	ENSMUSG00000042148.9	ENSMUST00000125702.2	706	3	-2	-88	-2	88	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_2	15.5	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTCCTTATGTTCACTAT	5003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63970296	63962135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_63962663_63964362_63964497_63970161
tx.271	chr1	-	733	6	FSM	ENSMUSG00000026035.16	ENSMUST00000114345.9	1175	6	-98	540	15	88	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_5	38.958439393795	249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTGTCATCTCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58484626	58473485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_58473609_58477502_58477571_58480001_58480096_58481683_58481759_58483747_58483799_58484304
tx.2710	chr11	+	1056	3	FSM	ENSMUSG00000087497.8	ENSMUST00000146333.2	959	3	-93	-4	5	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTCATGTTTCTTATTTA	4239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63970314	63974089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_63970604_63970684_63970841_63973478
tx.2711	chr11	+	893	2	FSM	ENSMUSG00000087497.8	ENSMUST00000135037.8	901	2	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGTTTCATGTTTCTTA	4242	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63970317	63974085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_63970604_63973478
tx.2712	chr11	+	2915	24	FSM	ENSMUSG00000020549.15	ENSMUST00000101049.9	2884	24	-26	-5	10	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	305	junction_18	22.4427858997362	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCAGTGTGGGGTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64869873	64892431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_64870158_64870543_64870595_64870732_64870804_64871433_64871499_64872442_64872501_64873581_64873651_64874419_64874552_64876388_64876448_64878096_64878156_64878233_64878307_64878857_64878971_64880178_64880275_64883046_64883186_64883264_64883351_64885061_64885181_64886131_64886229_64888693_64888833_64889166_64889206_64889333_64889444_64889962_64890063_64890143_64890265_64890511_64890591_64891121_64891267_64891820
tx.2713	chr11	+	380	2	ISM	ENSMUSG00000020549.15	ENSMUST00000071891.12	2771	25	22035	-1	737	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTTGACAACAGTTTGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64891898	64892896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_64892040_64892657
tx.2714	chr11	-	3403	11	FSM	ENSMUSG00000033352.12	ENSMUST00000046963.10	3695	11	-16	308	-16	-308	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_10	28.4703354388388	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTGCAGGGATATTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65679139	65579376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_65581631_65582553_65582600_65584247_65584397_65587113_65587192_65597809_65597938_65600757_65600810_65603003_65603124_65610309_65610430_65626017_65626193_65647094_65647198_65678961
tx.2715	chr11	+	2247	7	NNC	ENSMUSG00000018347.17	novel	2302	8	NA	NA	21	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	17	junction_5	10.077477638554	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCCTTGTAGCTGCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65698021	65720065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_65698088_65705190_65705678_65706743_65706952_65707314_65707407_65712755_65712841_65713653_65713765_65718867
tx.2716	chr11	+	2258	7	FSM	ENSMUSG00000018347.17	ENSMUST00000071465.9	2270	7	13	-1	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_5	5.11262055005932	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTCCTTGTAGCTGCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65698013	65720065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_65698088_65705190_65705678_65706743_65706952_65707314_65707407_65712755_65712841_65713650_65713765_65718867
tx.2717	chr11	-	896	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048070.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CACACACACACACACACACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66804953	66788719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_66789509_66804846
tx.2718	chr11	-	403	2	NNC	ENSMUSG00000072834.5	novel	731	4	NA	NA	32970	123	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTTATTTCACTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66804942	66796423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_66796731_66804846
tx.2719	chr11	+	1223	2	FSM	ENSMUSG00000048070.5	ENSMUST00000123434.3	4200	2	10	2967	10	-2967	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCAGGCTAAGAGGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66802816	66817735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_66802969_66816664
tx.272	chr1	-	488	6	FSM	ENSMUSG00000026035.16	ENSMUST00000185990.2	392	6	-4	-92	0	88	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_5	65.3066612222674	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCTGTCATCTCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58484645	58473485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_58473609_58477502_58477571_58480001_58480096_58481683_58481759_58483747_58483799_58484568
tx.2720	chr11	+	1598	6	FSM	ENSMUSG00000050270.13	ENSMUST00000061786.6	1597	6	5	-6	5	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	4.45421149026402	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTGGGGAGAATTACTAG	3923	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66915984	66926144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_66916098_66916734_66916765_66920791_66920853_66921887_66922012_66923006_66923067_66924934
tx.2721	chr11	-	1315	5	FSM	ENSMUSG00000020910.17	ENSMUST00000116363.2	1283	5	-39	7	-15	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_4	11.1579568022107	567	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTAAGTATTCTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66943435	66928873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_66929272_66931044_66931162_66932306_66932934_66942506_66942605_66943360
tx.2722	chr11	-	1413	2	FSM	ENSMUSG00000020910.17	ENSMUST00000136013.2	486	2	-711	-216	-711	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTACTCTTAAGTATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66932064	66928878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_66929272_66931044
tx.2723	chr11	+	1769	6	FSM	ENSMUSG00000069844.13	ENSMUST00000092996.5	2412	6	-18	661	-18	-420	multi-exon	FALSE	canonical	3	241	junction_2	26.3469163281019	352	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGGCTTTGCTTCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66943477	66955737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_66943743_66944600_66944692_66946556_66946755_66947340_66947434_66949152_66949269_66954731
tx.2724	chr11	+	480	4	ISM	ENSMUSG00000020908.15	ENSMUST00000108689.8	6031	41	22794	0	22794	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	1.24721912892465	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGGTTTGTTTTGTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66991919	66993112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_66992019_66992163_66992260_66992353_66992492_66992965
tx.2725	chr11	+	1040	8	ISM	ENSMUSG00000060180.13	ENSMUST00000081911.12	5817	39	37568	-88	-114	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_5	8.27092275778864	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCTCTGCTGTGTTTGTT	66	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67255496	67262416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_67255597_67255677_67255882_67257978_67258105_67258382_67258554_67259930_67260036_67260134_67260231_67261745_67261881_67262313
tx.2726	chr11	+	549	4	NIC	ENSMUSG00000060180.13	novel	5817	39	NA	NA	2726	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_1	43.8279464370496	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGCTCTGCTGTGTTTG	1095	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67258336	67262414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_67258554_67260134_67260231_67261745_67261881_67262313
tx.2727	chr11	+	632	5	ISM	ENSMUSG00000060180.13	ENSMUST00000081911.12	5817	39	40430	-86	2748	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_2	10.779030568655	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCATGCTCTGCTGTGTTTG	1117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67258358	67262414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_67258554_67259930_67260036_67260134_67260231_67261745_67261881_67262313
tx.2728	chr11	+	443	4	ISM	ENSMUSG00000060180.13	ENSMUST00000081911.12	5817	39	41998	-88	4316	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_1	11.7284080571728	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCTCTGCTGTGTTTGTT	2685	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67259926	67262416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_67260036_67260134_67260231_67261745_67261881_67262313
tx.2729	chr11	+	851	8	FSM	ENSMUSG00000020903.14	ENSMUST00000021285.14	4394	8	275	3268	-1	110	multi-exon	FALSE	canonical	3	260	junction_1	20.1626043021455	1410	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTGGTGTACCTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67857293	68094706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_67857344_67860597_67860698_67864058_67864154_67875388_67875500_67902140_67902266_67911731_67911825_68000102_68000205_68094531
tx.273	chr1	+	1471	7	FSM	ENSMUSG00000026036.18	ENSMUST00000087521.13	3769	7	367	1931	-110	141	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_3	28.6787765119473	788	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTTTGTTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58484676	58500684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_58484794_58486792_58487249_58489545_58489709_58491247_58491375_58494755_58494895_58496938_58497023_58500299
tx.2730	chr11	+	802	7	ISM	ENSMUSG00000020903.14	ENSMUST00000021285.14	4394	8	3578	3268	3265	110	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	280	junction_4	13.0309460729279	363	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTGGTGTACCTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67860596	68094706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_67860698_67864058_67864154_67875388_67875500_67902140_67902266_67911731_67911825_68000102_68000205_68094531
tx.2731	chr11	+	602	5	ISM	ENSMUSG00000020903.14	ENSMUST00000021285.14	4394	8	18373	3269	18060	109	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	280	junction_2	14.3243673507768	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTTGGTGTACCTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67875391	68094705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_67875500_67902140_67902266_67911731_67911825_68000102_68000205_68094531
tx.2732	chr11	-	2375	9	FSM	ENSMUSG00000018736.15	ENSMUST00000018880.14	2382	9	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	185	junction_5	15.9530561335438	281	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTCGAGATTGCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68743954	68712259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_68713492_68720740_68720893_68724179_68724272_68726975_68727150_68730696_68730834_68732845_68732995_68734646_68734801_68736152_68736251_68743767
tx.2733	chr11	+	534	4	FSM	ENSMUSG00000060938.15	ENSMUST00000073471.13	526	4	-7	-1	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	13360	junction_1	1585.12172683642	173199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTCTTGTGTGGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68792401	68795361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_68792451_68793095_68793269_68794004_68794146_68795190
tx.2734	chr11	+	677	4	NIC	ENSMUSG00000060938.15	novel	526	4	NA	NA	-7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	269	junction_1	7467.32754515741	1539	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTGTCTTGTGTGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68792445	68795360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_68792639_68793095_68793269_68794004_68794146_68795190
tx.2735	chr11	+	802	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052921.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAGAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68847779	68848936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_68847865_68848219
tx.2736	chr11	+	617	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052921.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTGTCTTAGCTGCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68848220	68853318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_68848631_68853111
tx.2737	chr11	-	826	5	FSM	ENSMUSG00000032892.15	ENSMUST00000038644.5	820	5	-6	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	482	junction_2	47.2989164780759	9663	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGTGCCTTCAAATCTA	7230	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68864675	68863309	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_68863568_68863768_68863855_68863942_68864100_68864266_68864384_68864467
tx.2738	chr11	-	595	2	NNC	ENSMUSG00000020899.17	novel	5144	16	NA	NA	4638	532	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCAATGGAAGTGTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68876794	68875990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_68876087_68876295
tx.2739	chr11	-	1616	12	NNC	ENSMUSG00000020899.17	novel	2129	11	NA	NA	2	-1946	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	133.957437424438	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATGTTTATACTTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68899284	68885753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_68885943_68888489_68888619_68888738_68888871_68890834_68890964_68891070_68891196_68891274_68891416_68891699_68891806_68891932_68892123_68892558_68892665_68893305_68893442_68894521_68894699_68899228
tx.274	chr1	+	1355	6	FSM	ENSMUSG00000026036.18	ENSMUST00000171597.2	2098	6	2	741	2	141	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_2	29.7119504576862	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTTTGTTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58486791	58500684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_58487249_58489545_58489709_58491247_58491375_58494755_58494895_58496938_58497023_58500299
tx.2740	chr11	-	1704	9	ISM	ENSMUSG00000020899.17	ENSMUST00000172987.2	2129	11	3	2506	3	-2506	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	373	junction_8	43.5773378604063	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTCCCGAGGAGATAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68899274	68890286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_68890964_68891070_68891196_68891274_68891416_68891699_68891806_68891932_68892123_68892558_68892665_68893305_68893442_68894521_68894699_68899228
tx.2741	chr11	+	625	3	ISM	ENSMUSG00000020898.19	ENSMUST00000161271.2	516	4	737	-290	737	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	458	junction_2	2.5	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACCTGTGTTCATCTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68926441	68927296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_68926497_68926592_68926720_68926853
tx.2742	chr11	+	1817	9	FSM	ENSMUSG00000020897.13	ENSMUST00000108666.8	1831	9	14	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	202.492592457107	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGTGGTGGTCTGAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68936486	68942490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_68936637_68936760_68936835_68938610_68938714_68938797_68938868_68938999_68939192_68939331_68939471_68939556_68939706_68941127_68941303_68941725
tx.2743	chr11	+	1942	8	FSM	ENSMUSG00000020897.13	ENSMUST00000021277.6	1950	8	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	581	junction_1	36.6756327936728	583	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGTGGTGGTCTGAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68936485	68942490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_68936835_68938610_68938714_68938797_68938868_68938999_68939192_68939331_68939471_68939556_68939706_68941127_68941303_68941725
tx.2744	chr11	+	774	5	FSM	ENSMUSG00000020895.15	ENSMUST00000075980.12	779	5	5	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	348	junction_4	23.6893963620857	1710	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGGCGTATACTATTTTT	4652	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68961636	68963856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_68961860_68962049_68962118_68962199_68962301_68963248_68963346_68963571
tx.2745	chr11	+	646	5	FSM	ENSMUSG00000020894.17	ENSMUST00000021273.13	2205	5	36	1523	4	171	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_4	21.4126131053639	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTACTAGAAGATTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68979351	68981687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_68979454_68979931_68980053_68980556_68980716_68980801_68980854_68981475
tx.2746	chr11	+	1001	4	ISM	ENSMUSG00000020894.17	ENSMUST00000021273.13	2205	5	140	1542	87	152	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_3	24.5809320861155	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGTCTGTTTGTAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68979455	68981668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_68980053_68980556_68980716_68980801_68980854_68981475
tx.2747	chr11	+	1057	2	ISM	ENSMUSG00000020893.18	ENSMUST00000102605.3	4537	22	4140	3666	4140	-2	internal_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCTGTGATTCTTCCCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68995487	68997120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_68995640_68996215
tx.2748	chr11	+	1448	7	ISM	ENSMUSG00000020892.11	ENSMUST00000021268.9	3019	15	8231	0	-15	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2.58198889747161	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTTTGTTTTGATGATG	4046	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69024952	69039941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69025194_69025282_69025370_69025831_69026002_69026697_69026820_69033011_69033113_69033672_69033844_69039385
tx.2749	chr11	+	828	3	ISM	ENSMUSG00000020892.11	ENSMUST00000021268.9	3019	15	16290	0	6647	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTTTGTTTTGATGATG	5033	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69033011	69039941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69033113_69033672_69033844_69039385
tx.275	chr1	-	2985	18	FSM	ENSMUSG00000026037.15	ENSMUST00000027198.12	3561	18	154	422	0	-422	multi-exon	FALSE	canonical	3	442	junction_12	52.5802073093293	388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTGGTCTGCACTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58544114	58502351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_58503450_58505153_58505273_58506809_58506872_58508826_58508999_58510098_58510246_58511463_58511561_58513967_58514101_58515592_58515703_58519409_58519509_58520118_58520313_58522801_58522863_58532015_58532048_58532819_58532910_58536534_58536625_58539399_58539544_58540481_58540586_58541000_58541050_58543930
tx.2750	chr11	+	589	4	ISM	ENSMUSG00000032807.6	ENSMUST00000036424.3	2431	15	10418	1	10418	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_3	8.17856276425687	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCGGTCTGAGAACGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69058232	69060617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69058304_69059603_69059705_69060043_69060215_69060371
tx.2751	chr11	-	1483	2	NNC	ENSMUSG00000032782.20	novel	3861	19	NA	NA	-27	-6381	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAGAAAAGACGAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69214628	69212398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_69212760_69213506
tx.2752	chr11	-	1487	2	ISM	ENSMUSG00000032782.20	ENSMUST00000092973.6	3861	19	-34	22080	-34	-6375	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGACGAGAAGAAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69214635	69212392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_69212760_69213515
tx.2753	chr11	+	760	5	FSM	ENSMUSG00000049299.15	ENSMUST00000102602.8	751	5	-9	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	239	junction_1	97.8682149627753	1643	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCCTGAGTGTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69214796	69216619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69214893_69214983_69215083_69215220_69215292_69215649_69215789_69216264
tx.2754	chr11	+	747	4	FSM	ENSMUSG00000049299.15	ENSMUST00000102601.10	759	4	12	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	452	junction_2	10.7082522694727	1388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCCTGAGTGTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69214900	69216619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69215083_69215220_69215292_69215649_69215789_69216264
tx.2755	chr11	+	2526	14	FSM	ENSMUSG00000018470.9	ENSMUST00000018614.3	2538	14	6	6	6	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	7.85293824331087	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCACGACCACGTCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69217089	69223862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69217750_69218945_69218990_69219076_69219115_69219334_69219415_69220675_69220721_69220808_69220854_69221008_69221053_69221222_69221310_69221565_69221652_69221876_69221998_69222087_69222183_69222285_69222407_69222561_69222651_69222891
tx.2756	chr11	+	1281	3	ISM	ENSMUSG00000018470.9	ENSMUST00000134561.2	750	7	1036	-893	1036	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	1	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCACGACCACGTCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69222185	69223862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69222407_69222561_69222651_69222891
tx.2757	chr11	+	1767	2	FSM	ENSMUSG00000043419.12	ENSMUST00000129321.2	2081	2	314	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	0	190	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTGAAAGACTGTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69231600	69233467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69231885_69231984
tx.2758	chr11	-	458	3	NNC	ENSMUSG00000018474.19	novel	6066	39	NA	NA	-4314	-3291	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_2	6	90	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAAAAGGAGGAAAAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69264546	69254840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_69254970_69255517_69255631_69264330
tx.2759	chr11	-	2549	4	FSM	ENSMUSG00000044795.13	ENSMUST00000051620.5	753	4	-109	-1687	-109	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	12.1197726417986	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGAGCCAAAGCCGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69286268	69282750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_69284695_69285453_69285673_69285797_69285875_69285959
tx.276	chr1	-	1017	5	ISM	ENSMUSG00000026037.15	ENSMUST00000027198.12	3561	18	157	34156	3	3419	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	463	junction_4	49.266494699745	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAAGTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58544111	58536085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_58536625_58539399_58539544_58540481_58540586_58541000_58541050_58543930
tx.2760	chr11	+	523	3	FSM	ENSMUSG00000059278.10	ENSMUST00000144531.2	671	3	145	3	-22	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	948	junction_1	166	8633	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGCCTGTGTCTGTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69286617	69287503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69286799_69287002_69287187_69287345
tx.2761	chr11	+	391	2	FSM	ENSMUSG00000059278.10	ENSMUST00000124932.2	404	2	10	3	10	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1280	junction_1	0	3506	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGCCTGTGTCTGTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69286953	69287503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69287187_69287345
tx.2762	chr11	-	295	2	ISM	ENSMUSG00000018476.8	ENSMUST00000094077.5	6654	23	13666	1117	4206	-1117	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATGGGAGACGGGGAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69290835	69290450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_69290676_69290765
tx.2763	chr11	+	717	3	NNC	ENSMUSG00000085178.2	novel	840	2	NA	NA	-1746	1	intron_retention	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACTAACCATGGATGAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69290592	69293527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_69290880_69290995_69291070_69293171
tx.2764	chr11	+	932	2	NNC	ENSMUSG00000086591.2	novel	859	2	NA	NA	3796	14	intron_retention	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	221	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGATGTCTAGAACTTGATTT	2369	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69343169	69344516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_69343301_69343715
tx.2765	chr11	-	704	4	ISM	ENSMUSG00000041346.12	ENSMUST00000155894.2	985	7	1073	1	1073	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_3	10.2740233382816	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGTCATTGTGTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69453675	69452584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_69452846_69452947_69453086_69453219_69453324_69453474
tx.2766	chr11	-	995	6	ISM	ENSMUSG00000041346.12	ENSMUST00000048139.12	1891	10	15628	0	226	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_5	25.3092868330975	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGTCATTGTGTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69454522	69452584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_69452846_69452947_69453086_69453219_69453324_69453474_69453684_69454129_69454263_69454372
tx.2767	chr11	-	1835	10	FSM	ENSMUSG00000041346.12	ENSMUST00000048139.12	1891	10	56	0	56	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_6	29.7960143162773	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGTCATTGTGTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69470094	69452584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_69452846_69452947_69453086_69453219_69453324_69453474_69453684_69454129_69454263_69454372_69454464_69454684_69454774_69468451_69468564_69469272_69469372_69469495
tx.2768	chr11	-	1104	5	ISM	ENSMUSG00000041346.12	ENSMUST00000048139.12	1891	10	15629	0	227	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	153	junction_4	13.7908484148003	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGTCATTGTGTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69454521	69452584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_69452846_69452947_69453086_69453219_69453324_69453474_69453684_69454129
tx.2769	chr11	-	2978	7	FSM	ENSMUSG00000041329.14	ENSMUST00000047889.13	2842	7	-134	-2	-21	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	185	junction_6	5.18544972870135	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGAGCCCTGTGTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69496789	69490559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_69492239_69492350_69492450_69493250_69493308_69493525_69493732_69493832_69493938_69494250_69494380_69496086
tx.277	chr1	-	1293	11	NNC	ENSMUSG00000038174.15	novel	421	5	NA	NA	-6	-7481	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_1	8.71837140755084	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTGTGTATCTTAAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58625442	58575722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_58575985_58578717_58578806_58579292_58579410_58583825_58583922_58585265_58585382_58587797_58587879_58591308_58591489_58596430_58596533_58597135_58597217_58605015_58605114_58625370
tx.2770	chr11	+	815	7	FSM	ENSMUSG00000069835.11	ENSMUST00000092969.2	800	7	-7	-8	-7	8	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2.7938424357067	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTTTGAAGCCCTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69512870	69514704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69512942_69513081_69513159_69513318_69513371_69513532_69513617_69513685_69513788_69513937_69513979_69514316
tx.2771	chr11	+	1166	2	FSM	ENSMUSG00000041287.6	ENSMUST00000047373.6	861	2	-308	3	-308	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_1	0	463	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTTATTGTCCCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69545831	69547550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69546726_69547278
tx.2772	chr11	-	1259	6	FSM	ENSMUSG00000018774.14	ENSMUST00000018918.12	1230	6	-29	0	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_5	17.4653943556966	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTTCTTTCCTCATTAA	3221	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69557008	69555038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_69555331_69555576_69555748_69555860_69555940_69556072_69556193_69556328_69556763_69556845
tx.2773	chr11	-	1773	11	FSM	ENSMUSG00000059796.17	ENSMUST00000163666.3	1774	11	0	1	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	9657	junction_10	1402.57834362292	16009	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGGGCTTCTTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69563143	69557762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_69558444_69558520_69558601_69558847_69558938_69559021_69559160_69559230_69559375_69559469_69559580_69559903_69560073_69560958_69561099_69561440_69561574_69561753_69561803_69563104
tx.2774	chr11	-	2385	11	FSM	ENSMUSG00000005204.13	ENSMUST00000005336.9	2313	11	-72	0	-72	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	762	junction_10	82.7371742326265	592	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCAAGTGGTGGTCTTCCTT	8458	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69572744	69563940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_69564463_69564872_69564924_69565027_69565112_69565294_69565433_69567915_69567994_69568798_69568847_69568962_69569111_69569447_69569560_69569647_69569888_69570968_69571677_69572488
tx.2775	chr11	+	881	4	NIC	ENSMUSG00000085890.8	novel	578	5	NA	NA	-109	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGTTCCTCTGTGGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69572854	69581967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_69572974_69574252_69574353_69575229_69575500_69581575
tx.2776	chr11	-	703	2	Intergenic	novelGene_175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGATATGCAGA	9591	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69596371	69594702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_69595166_69596131
tx.2777	chr11	-	818	2	ISM	ENSMUSG00000041189.10	ENSMUST00000045971.9	2155	11	10802	0	8679	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	234	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTTTGTCTATTTTTAA	9584	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69675967	69674861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_69675588_69675875
tx.2778	chr11	-	360	2	ISM	ENSMUSG00000051790.16	ENSMUST00000056484.10	5003	7	698	7302	108	-2380	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATTTTAATAATTGGA	10004	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69724977	69721249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_69721440_69724807
tx.2779	chr11	+	407	4	FSM	ENSMUSG00000070394.11	ENSMUST00000133967.8	421	4	19	-5	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_1	597.808404832927	1957	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTGTCTTTATTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69729358	69730444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69729400_69729745_69729778_69730013_69730095_69730191
tx.278	chr1	+	516	3	FSM	ENSMUSG00000026032.9	ENSMUST00000027193.9	763	3	216	31	216	-31	multi-exon	FALSE	canonical	3	979	junction_1	90.5	17718	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTCTTAAATAAAATTAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58625758	58635092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_58625830_58630248_58630409_58634807
tx.2780	chr11	+	426	4	NNC	ENSMUSG00000070394.11	novel	492	4	NA	NA	15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	44	junction_1	694.908307300723	431	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTGTCTTTATTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69729364	69730444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_69729425_69729745_69729778_69730013_69730095_69730191
tx.2781	chr11	-	558	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000070394.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACCAACACCGCCCTGACCA	5123	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69730441	69729368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_69729497_69730011
tx.2782	chr11	+	472	4	FSM	ENSMUSG00000070394.11	ENSMUST00000094065.5	492	4	20	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1210	junction_1	145.470119115767	11111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGTGTCTTTATTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69729369	69730444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69729476_69729745_69729778_69730013_69730095_69730191
tx.2785	chr11	+	1769	8	FSM	ENSMUSG00000019461.13	ENSMUST00000108633.9	2785	8	0	1016	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	4.6246897303539	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAAGCCGGATGTGATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69737442	69741868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69737518_69737733_69737902_69738160_69738400_69738482_69738526_69738628_69738850_69739039_69739202_69740837_69741000_69741169
tx.2786	chr11	+	1973	7	FSM	ENSMUSG00000019461.13	ENSMUST00000019605.4	1927	7	-45	-1	14	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_4	3.33749739908346	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCCGGATGTGATGGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69737456	69741870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69737902_69738160_69738400_69738482_69738526_69738628_69738850_69739039_69739202_69740837_69741000_69741169
tx.2787	chr11	-	404	2	ISM	ENSMUSG00000001588.13	ENSMUST00000001631.7	2482	22	-3	12944	-3	-5137	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGGGAATGCGTTAGAGT	9570	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69786368	69785336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_69785484_69786111
tx.2788	chr11	+	1193	11	FSM	ENSMUSG00000023170.15	ENSMUST00000116358.8	1159	11	-33	-1	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_1	67.5763272159711	444	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGCCTGAGTGCTGTTTA	4058	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69804842	69807417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69804897_69805098_69805260_69805577_69805688_69805758_69805872_69805964_69806045_69806133_69806217_69806456_69806611_69806690_69806781_69806858_69806939_69807023_69807120_69807245
tx.2789	chr11	+	1367	10	FSM	ENSMUSG00000023170.15	ENSMUST00000057884.6	1220	10	-147	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_9	31.9443961352292	348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGCCTGAGTGCTGTTTA	4086	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69804870	69807417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69805260_69805577_69805688_69805758_69805872_69805964_69806045_69806133_69806217_69806456_69806611_69806690_69806781_69806858_69806939_69807023_69807120_69807245
tx.279	chr1	+	551	3	NNC	ENSMUSG00000026031.16	novel	1100	2	NA	NA	-365	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCGCTCACTCTCAATAAGC	2681	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58752087	58756718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_58752250_58752729_58752819_58756418
tx.2790	chr11	-	1320	6	FSM	ENSMUSG00000078812.11	ENSMUST00000108613.10	1343	6	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20384	junction_3	507.007534460781	41272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCCCAACTCAGTTGTTTA	9964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69812189	69807545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_69808168_69808253_69808328_69808422_69808555_69808742_69808848_69809976_69810163_69811988
tx.2791	chr11	+	722	4	ISM	ENSMUSG00000018554.14	ENSMUST00000108601.3	1351	9	4025	-7	-192	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_2	5.43650214343336	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTGGTCTCTGGCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69831177	69832430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69831258_69831415_69831594_69831871_69831957_69832051
tx.2792	chr11	+	436	2	ISM	ENSMUSG00000018554.14	ENSMUST00000148395.2	679	3	523	-2	523	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGTTGTCCTGGTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69831892	69832423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_69831957_69832051
tx.2793	chr11	+	1254	4	FSM	ENSMUSG00000018569.13	ENSMUST00000018713.13	1335	4	81	0	81	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	113	junction_1	5.71547606649408	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTTTCCAGGCCGCTTTT	8824	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69856302	69858711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69856976_69857768_69857934_69858045_69858131_69858380
tx.2794	chr11	+	717	3	FSM	ENSMUSG00000018569.13	ENSMUST00000151515.2	373	3	-114	-230	-114	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_1	5.5	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGGTCTTTCCAGGCCGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69857629	69858708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69857934_69858045_69858131_69858380
tx.2795	chr11	+	1332	8	FSM	ENSMUSG00000018559.17	ENSMUST00000108593.8	1627	8	295	0	295	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_4	14.8020958251299	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCCCTAGACCCTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69872276	69881427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69872412_69875079_69875147_69875241_69875361_69875559_69875632_69879438_69879556_69879653_69879766_69880307_69880393_69880802
tx.2796	chr11	+	889	4	FSM	ENSMUSG00000018567.15	ENSMUST00000018711.15	1351	4	457	5	-39	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	795	junction_2	75.6350888587213	9124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAATTTGCCCTGTGTCAT	5185	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69882425	69885772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69882629_69883190_69883270_69883407_69883527_69885284
tx.2797	chr11	+	2961	15	FSM	ENSMUSG00000020888.17	ENSMUST00000019362.15	2968	15	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	488	junction_4	30.5160546571265	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCCAAGCCTCTGGCTCC	7142	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69891427	69900937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_69891853_69895630_69895701_69895980_69896127_69896262_69896373_69896487_69896624_69896763_69896855_69896961_69897032_69897116_69897257_69897339_69897417_69898278_69898347_69898640_69898770_69898845_69898978_69899106_69899287_69899602_69899822_69899969
tx.2798	chr11	+	903	4	NNC	ENSMUSG00000040963.16	novel	672	5	NA	NA	-69	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23.6267268622258	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGACTTGAAACTCGTGT	6921	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69988448	69997000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_69988649_69989053_69989200_69996201_69996309_69996550
tx.2799	chr11	+	1081	4	ISM	ENSMUSG00000040950.14	ENSMUST00000041550.12	1586	10	5817	0	1973	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_3	0.942809041582063	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTTAGCTCCATTTCT	137	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70026971	70028376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_70027164_70027266_70027419_70027495_70027603_70027746
tx.28	chr1	+	3337	17	FSM	ENSMUSG00000025915.15	ENSMUST00000171265.8	3680	17	28	315	-21	-242	multi-exon	TRUE	canonical	3	97	junction_4	18.6899036915657	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATATTGTATTTTTAAGA	9842	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9918524	9970753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_9918611_9935355_9935574_9938607_9938692_9941854_9941928_9942482_9942559_9947390_9947479_9949250_9949301_9950556_9950615_9951802_9951887_9951984_9952117_9954631_9954745_9954849_9954887_9955891_9955979_9956271_9956368_9959094_9959251_9961585_9961676_9968944
tx.280	chr1	-	1440	3	Intergenic	novelGene_27	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTCTTGGCCTCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58808280	58801128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_58801864_58806398_58806866_58808042
tx.2800	chr11	+	1220	3	ISM	ENSMUSG00000040950.14	ENSMUST00000108584.2	1307	8	1978	-255	1978	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTTAGCTCCATTTCT	142	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70026976	70028376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_70027164_70027266_70027419_70027495
tx.2801	chr11	-	1492	2	ISM	ENSMUSG00000044367.8	ENSMUST00000060010.3	2531	4	2043	0	1833	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTCTGATGGTCAAGCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70109777	70107614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_70108748_70109418
tx.2802	chr11	-	882	6	FSM	ENSMUSG00000020831.19	ENSMUST00000108576.10	576	6	-108	-198	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_1	159.443532324143	1738	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGTGCTGCCAGCTGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70128738	70126031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70126295_70126521_70126627_70126849_70127038_70127702_70127805_70128356_70128452_70128609
tx.2803	chr11	-	777	5	FSM	ENSMUSG00000020831.19	ENSMUST00000021181.13	779	5	2	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	264	junction_1	106.829303096107	1941	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGTGCTGCCAGCTGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70128738	70126031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70126295_70126849_70127038_70127702_70127805_70128356_70128452_70128609
tx.2804	chr11	-	804	5	NIC	ENSMUSG00000020831.19	novel	779	5	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	53	junction_1	190.587742260619	420	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGTGCTGCCAGCTGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70128738	70126031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_70126295_70126822_70127038_70127702_70127805_70128356_70128452_70128609
tx.2805	chr11	-	604	3	FSM	ENSMUSG00000093989.2	ENSMUST00000040428.4	611	3	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	718	junction_2	4	8282	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGCTGTCTGTGCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70130661	70128949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70129297_70129763_70129841_70130481
tx.2806	chr11	-	1949	8	FSM	ENSMUSG00000000320.11	ENSMUST00000108574.3	2314	8	-25	390	-13	-390	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_3	2.55550625999976	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATCTGAAAAACCCTGATGA	7389	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70146192	70140178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70141083_70142275_70142420_70143223_70143385_70143620_70143725_70143836_70143960_70144072_70144155_70145234_70145437_70145963
tx.2807	chr11	-	738	2	ISM	ENSMUSG00000018921.12	ENSMUST00000019065.10	3435	17	15671	-2	15671	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	725	junction_1	0	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTGCTGCTTTGGCTCT	NA	False	NA	-33	True	NA	NA	NA	70285183	70283706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_70283849_70284587
tx.2808	chr11	-	571	4	FSM	ENSMUSG00000018921.12	ENSMUST00000135148.2	562	4	-5	-4	-5	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	310.061284264901	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGATCTTTTAAGTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70300862	70293452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70293580_70296452_70296559_70297082_70297148_70300589
tx.2809	chr11	+	1411	16	FSM	ENSMUSG00000060216.16	ENSMUST00000102563.2	1352	16	-51	-8	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_15	64.7561580083315	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGCTTGGTCTGTGCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70323472	70331657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70323580_70326367_70326399_70326988_70327050_70327156_70327202_70327386_70327584_70327694_70327755_70328135_70328204_70328396_70328536_70328769_70328855_70329144_70329218_70329473_70329612_70330297_70330382_70330487_70330568_70330676_70330732_70330989_70331102_70331581
tx.281	chr1	-	815	2	Intergenic	novelGene_29	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTATCCATAAGTTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58808357	58806365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_58806866_58808042
tx.2810	chr11	+	1737	15	FSM	ENSMUSG00000060216.16	ENSMUST00000102564.11	1848	15	-8	119	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_13	22.0579015413562	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATGTGTATGTGTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70323470	70331501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70323580_70326367_70326399_70326988_70327050_70327156_70327202_70327386_70327584_70327694_70327755_70328135_70328204_70328396_70328536_70328769_70328855_70329144_70329218_70329473_70329612_70330297_70330382_70330487_70330568_70330676_70330732_70330989
tx.2811	chr11	+	1762	15	NIC	ENSMUSG00000060216.16	novel	1848	15	NA	NA	1	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	17	junction_1	65.7627538650745	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATGTGTATGTGTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70323471	70331501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_70323580_70326341_70326399_70326988_70327050_70327156_70327202_70327386_70327584_70327694_70327755_70328135_70328204_70328396_70328536_70328769_70328855_70329144_70329218_70329473_70329612_70330297_70330382_70330487_70330568_70330676_70330732_70330989
tx.2812	chr11	+	904	3	FSM	ENSMUSG00000018923.14	ENSMUST00000019067.8	902	3	-1	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_2	11	1035	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAAGAGTCTCTCTCTCGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70342743	70344554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70342890_70343033_70343165_70343927
tx.2813	chr11	-	1503	5	FSM	ENSMUSG00000018920.12	ENSMUST00000019064.9	2699	5	-8	1204	-8	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_4	7.17635004720366	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCCCCATTGACATTCA	7592	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70350818	70346012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70346271_70346480_70346889_70349570_70349654_70349854_70349994_70350203
tx.2814	chr11	+	1014	7	ISM	ENSMUSG00000040829.15	ENSMUST00000092958.4	2100	12	3273	-117	3273	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_6	0.942809041582063	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTTCACCTTCATGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70354663	70357033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_70354823_70355181_70355271_70355358_70355458_70355605_70355760_70355932_70355992_70356164_70356326_70356740
tx.2815	chr11	+	485	2	ISM	ENSMUSG00000040829.15	ENSMUST00000092958.4	2100	12	4738	-112	4738	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTGACTTCACCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70356128	70357028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_70356326_70356740
tx.2816	chr11	-	888	4	NNC	ENSMUSG00000020830.4	novel	672	3	NA	NA	-5783	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTGCTGTCCCCTTGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70411225	70404341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_70404692_70405006_70405123_70410173_70410340_70410969
tx.2817	chr11	+	1065	2	FSM	ENSMUSG00000046811.4	ENSMUST00000179000.2	794	2	-54	-217	-54	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCCGGCGTTATGTATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70410410	70411562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70410710_70410796
tx.2818	chr11	+	817	6	FSM	ENSMUSG00000018286.7	ENSMUST00000018430.7	798	6	-15	-4	4	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	5742	junction_5	304.149305440601	46378	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTTCTGTGTGAAGGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70416196	70418479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70416322_70416710_70416779_70417119_70417252_70417369_70417500_70418004_70418150_70418262
tx.2819	chr11	-	801	6	ISM	ENSMUSG00000014609.17	ENSMUST00000102556.10	1591	12	2015	2	-1482	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.489897948556636	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGAGGGGTTGTGTGGTCA	6624	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70508005	70505710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_70505955_70506033_70506141_70506225_70506413_70506486_70506602_70507780_70507896_70507972
tx.282	chr1	+	2061	9	FSM	ENSMUSG00000026029.15	ENSMUST00000027189.15	2585	9	35	489	35	6	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_6	4.14578098794425	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTATGTTTTGTTTTGCTTT	2959	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58834567	58886173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_58834898_58863073_58863407_58866365_58866472_58868031_58868171_58868254_58868309_58870764_58870827_58872791_58872934_58883502_58884005_58885780
tx.2820	chr11	-	1637	8	FSM	ENSMUSG00000014606.15	ENSMUST00000014750.15	1711	8	74	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	687	junction_5	58.5020495018625	2927	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTGTGTAAAGTCGTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70537810	70535021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70535748_70535864_70535917_70535995_70536096_70536175_70536267_70536355_70536447_70536609_70536817_70536901_70537055_70537593
tx.2821	chr11	+	1837	9	FSM	ENSMUSG00000040746.16	ENSMUST00000037534.8	1833	9	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	485	junction_5	18.8244355825082	858	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTAAGATCATCTTTACAC	9186	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70538108	70542247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70538779_70538854_70538936_70540046_70540173_70540270_70540359_70540500_70540592_70540737_70540844_70540951_70541046_70541589_70541671_70541747
tx.2822	chr11	+	820	5	ISM	ENSMUSG00000040746.16	ENSMUST00000037534.8	1833	9	2440	0	-209	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	485	junction_1	23.8051990119806	509	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTAAGATCATCTTTACAC	25	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70540552	70542247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_70540592_70540737_70540844_70540951_70541046_70541589_70541671_70541747
tx.2823	chr11	+	783	4	ISM	ENSMUSG00000040746.16	ENSMUST00000151034.9	937	7	1835	-330	-26	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	525	junction_3	9.39266853573691	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTAAGATCATCTTTACAC	208	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70540735	70542247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_70540844_70540951_70541046_70541589_70541671_70541747
tx.2824	chr11	-	855	3	FSM	ENSMUSG00000018293.5	ENSMUST00000018437.3	861	3	9	-3	9	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	9692	junction_2	172	19317	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACCTGTGTTGGTTTGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70545461	70542672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70543048_70543612_70543806_70545174
tx.2825	chr11	-	1020	7	FSM	ENSMUSG00000018287.13	ENSMUST00000018431.13	1159	7	122	17	-4	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	730	junction_3	39.5179284207392	4789	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCTGACTTGTACCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70560120	70554613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70555047_70555145_70555303_70555403_70555494_70555608_70555694_70555813_70555903_70556122_70556191_70560022
tx.2826	chr11	-	1070	7	FSM	ENSMUSG00000057054.12	ENSMUST00000108542.8	1080	7	3	7	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_5	4.07226390762354	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTTTCTGTGCGAGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70590978	70579193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70579576_70579810_70579971_70580571_70580766_70581008_70581049_70581264_70581379_70586689_70586775_70590883
tx.2827	chr11	-	991	6	NIC	ENSMUSG00000057054.12	novel	1080	7	NA	NA	-4	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4.66476151587624	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTGTTTCTGTGCGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70590985	70579194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_70579576_70579810_70579971_70580571_70580766_70581008_70581049_70581264_70581379_70590883
tx.2828	chr11	+	2009	2	FSM	ENSMUSG00000043602.6	ENSMUST00000060444.6	2061	2	52	0	52	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTCCTCTGGCCTTTCCTT	974	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70655086	70663754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70655376_70662034
tx.2829	chr11	+	1023	5	ISM	ENSMUSG00000020817.17	ENSMUST00000177731.8	3167	19	89479	-1	89429	1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	144	junction_1	15.7539677541881	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGGCCATTGGCTGTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70825229	70831767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_70825421_70825952_70826009_70828349_70828449_70830705_70830823_70831207
tx.283	chr1	+	1805	9	FSM	ENSMUSG00000026029.15	ENSMUST00000165549.8	1917	9	116	-4	-35	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.17960354715414	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTATGTTTTGTTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58841776	58886171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_58841853_58863073_58863407_58866365_58866472_58868031_58868171_58868254_58868309_58870764_58870827_58872791_58872934_58883502_58884005_58885780
tx.2830	chr11	-	2432	17	FSM	ENSMUSG00000040667.12	ENSMUST00000108530.2	2389	17	-18	-25	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	409	junction_6	121.230008016786	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGACTTTGCTTTACAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70860798	70833902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70834149_70834704_70834824_70834937_70835065_70835307_70835389_70835498_70835565_70835670_70835797_70836028_70836188_70838527_70838630_70840971_70841063_70842085_70842185_70845326_70845475_70846961_70847149_70849091_70849266_70852407_70852495_70856532_70856659_70858673_70858844_70860474
tx.2831	chr11	-	2442	17	FSM	ENSMUSG00000040667.12	ENSMUST00000108531.8	2453	17	6	5	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	352	junction_6	132.716744893024	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGACTTTGCTTTACAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70860793	70833902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70834149_70834704_70834824_70834937_70835065_70835307_70835389_70835498_70835565_70835670_70835812_70836028_70836188_70838527_70838630_70840971_70841063_70842085_70842185_70845326_70845475_70846961_70847149_70849091_70849266_70852407_70852495_70856532_70856659_70858673_70858844_70860474
tx.2832	chr11	+	805	7	FSM	ENSMUSG00000018449.13	ENSMUST00000018593.10	1100	7	267	28	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	224	junction_4	48.3922055248111	1511	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGGTGTTCTGATGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70861305	70868631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70861414_70862589_70862761_70863840_70863902_70864627_70864740_70864894_70864959_70865725_70865867_70868483
tx.2833	chr11	-	618	3	FSM	ENSMUSG00000018446.9	ENSMUST00000155371.2	703	3	85	0	85	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5159	junction_2	90	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGAAAGTTGAGGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70869612	70868673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70869071_70869253_70869377_70869514
tx.2834	chr11	-	859	5	ISM	ENSMUSG00000018446.9	ENSMUST00000078528.7	1175	6	706	14	687	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4814	junction_4	248.624717194409	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGGAAAGTTGAGGTTCT	NA	False	NA	-34	True	NA	NA	NA	70873146	70868675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_70869071_70869253_70869377_70869514_70869611_70870835_70870930_70872995
tx.2835	chr11	-	507	2	NNC	ENSMUSG00000018446.9	novel	703	3	NA	NA	6	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	38	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCCAGGAAAGTTGAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70873827	70868677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_70869071_70873713
tx.2836	chr11	-	1183	8	ISM	ENSMUSG00000040620.16	ENSMUST00000049048.13	2266	11	4879	2191	1493	-2191	internal_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_6	15.2261858222563	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATAATTCTATTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70890287	70879767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_70879980_70882933_70883138_70883484_70883613_70884435_70884525_70884682_70884843_70885964_70886077_70886713_70886900_70890195
tx.2837	chr11	-	1146	7	FSM	ENSMUSG00000018442.14	ENSMUST00000143850.8	3666	7	37	2483	3	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	526	junction_4	25.493463214453	703	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAAGCTTTCGTGTGATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70910092	70900750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70901253_70903935_70904027_70904268_70904465_70905375_70905470_70906552_70906627_70909137_70909204_70909969
tx.2838	chr11	+	2724	4	FSM	ENSMUSG00000040599.14	ENSMUST00000164220.8	1416	4	-13	-1295	-13	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	46.3057471835	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTCAGTATTTATGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70910423	70918187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70910550_70910831_70911016_70915375_70915538_70915935
tx.2839	chr11	+	2993	3	FSM	ENSMUSG00000040599.14	ENSMUST00000048807.12	3003	3	0	10	0	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_1	24	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTTCAGTATTTATGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70910436	70918187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70911016_70915375_70915538_70915935
tx.284	chr1	-	1375	10	ISM	ENSMUSG00000026028.13	ENSMUST00000027186.12	6189	16	69	15298	68	4149	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	6.93532734858988	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCAAGTCCGGCCCTTCTG	1616	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59012520	58954905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_58954983_58957930_58958006_58958379_58958511_58960232_58960312_58960838_58961049_58962680_58962798_58965809_58965887_58974904_58975100_58985405_58985695_59012395
tx.2840	chr11	+	2540	3	FSM	ENSMUSG00000040599.14	ENSMUST00000133413.8	344	3	-3	-2193	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	44	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATGTATTATTGCTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70910433	70918197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_70910550_70915375_70915538_70915935
tx.2841	chr11	-	1444	2	FSM	ENSMUSG00000018451.8	ENSMUST00000156068.3	1494	2	41	9	41	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCTGTATTCGTTTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70924298	70922775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_70923236_70923314
tx.2842	chr11	-	1663	7	NNC	ENSMUSG00000040554.11	novel	2309	6	NA	NA	-4795	1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_5	1.63299316185545	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTATTTGATTTTATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71933130	71919541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_71920283_71921032_71921175_71921251_71921429_71922242_71922432_71927437_71927618_71928188_71928286_71932993
tx.2843	chr11	-	363	3	NNC	ENSMUSG00000040554.11	novel	2309	6	NA	NA	-4790	-7941	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCATGCGGCTGGGCGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71933125	71927483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_71927618_71928188_71928286_71932993
tx.2844	chr11	+	1102	6	NNC	ENSMUSG00000020808.4	novel	1513	6	NA	NA	10	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	106.202448182704	142	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCATGTTTTTAGATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71933290	71938195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_71933361_71933842_71934164_71935806_71936089_71936504_71936601_71937165_71937220_71937916
tx.2845	chr11	+	1506	6	NNC	ENSMUSG00000020808.4	novel	1513	6	NA	NA	10	-1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_3	92.1316449435263	656	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGCATGTTTTTAGATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71933290	71938195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_71933361_71933842_71934164_71935806_71936089_71936504_71936601_71937165_71937220_71937512
tx.2846	chr11	+	1439	5	NNC	ENSMUSG00000020808.4	novel	1513	6	NA	NA	93	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	100.953887988527	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCATGTTTTTAGATATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71933840	71938196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_71934164_71935806_71936089_71936504_71936601_71937165_71937220_71937512
tx.2847	chr11	+	746	4	FSM	ENSMUSG00000020803.4	ENSMUST00000021158.4	981	4	10	225	10	-225	multi-exon	FALSE	canonical	3	1302	junction_3	85.4959388249264	17924	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAGTTTTTTAACACGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72098382	72100616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_72098595_72099078_72099161_72099555_72099632_72100240
tx.2848	chr11	-	626	4	FSM	ENSMUSG00000020801.9	ENSMUST00000021157.9	1161	4	539	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	203	junction_2	14.0079342596338	3255	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGCTCCACTTTGATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72105879	72102545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_72102904_72104602_72104700_72104963_72105042_72105786
tx.2849	chr11	-	989	4	ISM	ENSMUSG00000020805.15	ENSMUST00000137701.3	1746	11	-20	16442	-20	261	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	1.4142135623731	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTGCTAGACTTATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72157459	72150655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_72151209_72152438_72152576_72152848_72152978_72157289
tx.285	chr1	+	1300	7	FSM	ENSMUSG00000026027.14	ENSMUST00000114296.8	1348	7	54	-6	54	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_2	9.28110386155057	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTATGTCGTGTTTCTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59012734	59030677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_59013010_59016117_59016225_59019092_59019174_59024447_59024548_59027664_59027787_59028848_59028958_59030171
tx.2850	chr11	+	567	3	NNC	ENSMUSG00000086951.2	novel	1359	2	NA	NA	285	-418	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGGGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72157954	72158965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_72158183_72158271_72158352_72158706
tx.2851	chr11	+	543	2	FSM	ENSMUSG00000086951.2	ENSMUST00000154739.2	1359	2	397	419	397	-419	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGGGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72158066	72158964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_72158352_72158706
tx.2852	chr11	+	1888	5	NNC	ENSMUSG00000040483.16	novel	2597	6	NA	NA	-39	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	4.65698400254929	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAGAGCTGTGTCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72192415	72204557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_72192536_72194152_72194289_72199432_72199538_72202781_72202820_72203068
tx.2853	chr11	-	995	6	NNC	ENSMUSG00000020799.17	novel	1403	8	NA	NA	4496	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	29	junction_5	10.6320270880016	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTAGCACAGAGCTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72247626	72235547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_72235798_72236411_72236609_72242653_72242877_72245524_72245669_72246035_72246165_72247574
tx.2854	chr11	+	1490	2	FSM	ENSMUSG00000040471.18	ENSMUST00000108499.2	874	2	10	-626	10	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTGAGTGCCACTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72326369	72329233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_72326591_72327964
tx.2855	chr11	+	1805	9	ISM	ENSMUSG00000040463.17	ENSMUST00000045633.6	4358	26	6600	218	-262	-218	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2480	junction_1	171.638382580937	309	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGACGCCAATCTCTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72338780	72342376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_72338953_72339042_72339204_72339557_72339790_72339868_72340001_72340086_72340156_72340545_72340660_72340818_72340921_72341451_72341601_72341702
tx.2856	chr11	+	1965	6	FSM	ENSMUSG00000020794.14	ENSMUST00000021148.13	3815	6	-19	1869	-19	-1869	multi-exon	FALSE	canonical	3	783	junction_5	11.0453610171873	714	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCAAGTTGTTGGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72498089	72575438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_72498462_72553896_72554000_72563785_72563884_72568530_72568710_72570194_72570319_72574349
tx.2857	chr11	-	1817	4	FSM	ENSMUSG00000057778.15	ENSMUST00000079681.6	2393	4	38	538	23	-521	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_3	4.02768199119819	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCTATCTTGATCTCTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72686644	72668595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_72669779_72673473_72673661_72679902_72680044_72686338
tx.2858	chr11	-	2106	4	FSM	ENSMUSG00000057778.15	ENSMUST00000156294.8	2158	4	68	-16	20	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	3.55902608401044	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACATTGCTTTTTTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72686900	72668058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_72669779_72673473_72673661_72679902_72680044_72686842
tx.2859	chr11	+	1523	3	ISM	ENSMUSG00000020788.16	ENSMUST00000163326.8	4606	22	27838	-1	6910	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	39.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTAGTCTTTTCTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72879832	72883870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_72879914_72880300_72880387_72882514
tx.286	chr1	+	2312	12	FSM	ENSMUSG00000026027.14	ENSMUST00000027185.11	2960	12	55	593	55	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_7	10.2964328252857	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTCTTTTATATATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59012735	59034281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_59013010_59016117_59016225_59019092_59019174_59024447_59024548_59027664_59027787_59028848_59028958_59030171_59030296_59031362_59031535_59031809_59031915_59032051_59032297_59032719_59032763_59033451
tx.2860	chr11	+	2001	11	ISM	ENSMUSG00000020783.15	ENSMUST00000021135.5	12106	13	87	13027	0	-13027	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	251	junction_10	29.380946206683	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTTTCAGTATTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72938695	72967116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_72938909_72940684_72940751_72944248_72944355_72955813_72955940_72956396_72956526_72957508_72957586_72958528_72958638_72960539_72960640_72961623_72961728_72964051_72964347_72966440
tx.2861	chr11	+	2763	13	FSM	ENSMUSG00000020783.15	ENSMUST00000021135.5	12106	13	91	9252	1	-9252	multi-exon	FALSE	canonical	3	251	junction_10	28.6544305280857	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGTGTCATTATTTTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72938699	72970891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_72938909_72940684_72940751_72944248_72944355_72955813_72955940_72956396_72956526_72957508_72957586_72958528_72958638_72960539_72960640_72961623_72961728_72964051_72964347_72966440_72966596_72968680_72968843_72969766
tx.2862	chr11	+	813	5	ISM	ENSMUSG00000005947.12	ENSMUST00000006101.4	3845	31	47817	-2	47817	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_3	3.24037034920393	257	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATGTTGTTTGAGACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73029225	73038274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_73029338_73029592_73029689_73031492_73031589_73036366_73036478_73037876
tx.2863	chr11	+	2539	13	FSM	ENSMUSG00000005950.15	ENSMUST00000006104.10	2395	13	-146	2	-146	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	3.62476052848859	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTTCTGACCTGTGCCC	3222	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73051100	73063509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_73051560_73055681_73055833_73056365_73056438_73056968_73057045_73057130_73057228_73057387_73057469_73057738_73057878_73058319_73058454_73058704_73058799_73058914_73058981_73061241_73061325_73061908_73062077_73062590
tx.2864	chr11	-	657	2	FSM	ENSMUSG00000047260.5	ENSMUST00000054952.4	1332	2	10	665	10	152	multi-exon	FALSE	canonical	3	946	junction_1	0	6077	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTTAGCCAAGCTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73067853	73067009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_73067578_73067764
tx.2865	chr11	+	1283	4	FSM	ENSMUSG00000040158.13	ENSMUST00000040687.12	1523	4	135	105	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_1	3.09120616516523	203	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGGTTTCTGTTAGATG	4343	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73068043	73072873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_73068169_73071214_73071335_73071556_73071635_73071913
tx.2866	chr11	-	2552	11	FSM	ENSMUSG00000005949.10	ENSMUST00000006103.9	2570	11	12	6	-9	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_10	9.23525852372309	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTACACTCGGAACGTTT	4477	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73089856	73074427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_73075878_73076063_73076182_73077114_73077286_73078347_73078468_73078562_73078663_73079255_73079388_73079514_73079619_73082503_73082589_73083880_73083960_73087463_73087544_73089743
tx.2867	chr11	+	1800	2	ISM	ENSMUSG00000005951.14	ENSMUST00000131927.9	2856	8	18466	-4	18466	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATCCCTTTGATGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73108751	73115332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_73108826_73113606
tx.2868	chr11	-	568	4	ISM	ENSMUSG00000020745.16	ENSMUST00000102520.9	5789	11	40277	3607	39590	-3607	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	950	junction_3	68.644009206922	337	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGGATGTAGATTGAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74574407	74568382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_74568569_74570283_74570441_74573060_74573163_74574284
tx.2869	chr11	-	1918	11	FSM	ENSMUSG00000020745.16	ENSMUST00000021091.15	5803	11	317	3568	-18	-3567	multi-exon	FALSE	canonical	3	936	junction_5	79.0964600977819	1411	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTCATGCATGGTGAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74615179	74568342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_74568569_74570283_74570441_74573060_74573163_74574284_74574514_74575231_74575335_74576721_74576891_74579802_74580010_74581035_74581111_74581351_74581437_74590136_74590347_74614824
tx.287	chr1	-	1943	13	FSM	ENSMUSG00000072295.8	ENSMUST00000097080.4	2131	13	1	187	1	-187	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	3.19722101554181	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCGTGTGTACTGATCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59134058	59089851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_59090445_59091654_59091693_59097814_59097879_59099730_59099837_59101554_59101690_59105308_59105389_59106935_59107005_59107841_59107887_59108875_59109002_59114155_59114302_59115829_59115882_59117041_59117129_59133656
tx.2870	chr11	-	824	5	ISM	ENSMUSG00000020745.16	ENSMUST00000126341.8	8570	9	-7	15125	-7	11	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	947	junction_1	65.0595880712443	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATACGCATTGAGTGGTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74615168	74579899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_74580010_74581035_74581111_74581351_74581437_74590136_74590347_74614824
tx.2871	chr11	+	2712	10	FSM	ENSMUSG00000010554.15	ENSMUST00000141755.8	12584	10	15	9857	15	774	multi-exon	FALSE	canonical	3	325	junction_5	30.3892443611141	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATATAAGACTTAATAATTGA	8509	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74661670	74709494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_74661811_74664347_74664476_74674883_74675084_74678380_74678522_74683028_74683145_74686807_74686951_74694656_74694727_74696078_74696169_74707695_74707870_74707984
tx.2872	chr11	-	1046	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000010554.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGCCCAAAGATGAAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74708968	74707806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_74707864_74707979
tx.2873	chr11	+	1502	2	ISM	ENSMUSG00000010554.15	ENSMUST00000134571.2	656	3	8452	-1086	8452	703	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	390	junction_1	0	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGACAGCATTGTTTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74707806	74709423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_74707870_74707984
tx.2874	chr11	+	3378	15	FSM	ENSMUSG00000038335.14	ENSMUST00000045807.14	3389	15	9	2	9	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	655	junction_8	75.3882467968452	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTTGTCTGGATTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74788912	74800166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_74789042_74789202_74789307_74790007_74790228_74790334_74790470_74790978_74791404_74792314_74792475_74792834_74792993_74794645_74794840_74795654_74795818_74796031_74796143_74796716_74796850_74798160_74798278_74798649_74798791_74798871_74798947_74799053
tx.2875	chr11	+	2107	9	ISM	ENSMUSG00000038335.14	ENSMUST00000045807.14	3389	15	4029	2	394	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	655	junction_2	84.3184996012144	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTTGTCTGGATTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74792932	74800166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_74792993_74794645_74794840_74795654_74795818_74796031_74796143_74796716_74796850_74798160_74798278_74798649_74798791_74798871_74798947_74799053
tx.2876	chr11	+	2051	8	ISM	ENSMUSG00000038335.14	ENSMUST00000045807.14	3389	15	5738	2	-154	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	655	junction_1	87.4470101938124	851	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTTGTCTGGATTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74794641	74800166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_74794840_74795654_74795818_74796031_74796143_74796716_74796850_74798160_74798278_74798649_74798791_74798871_74798947_74799053
tx.2877	chr11	+	1692	6	ISM	ENSMUSG00000038335.14	ENSMUST00000153316.8	708	7	1234	-1026	-7	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	671	junction_1	81.7449692641694	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTTGTCTGGATTCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74796029	74800166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_74796143_74796716_74796850_74798160_74798278_74798649_74798791_74798871_74798947_74799053
tx.2878	chr11	-	1767	9	FSM	ENSMUSG00000001323.18	ENSMUST00000065211.9	3699	9	118	1814	2	-1354	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_8	25.2140833662459	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACAGCCCACAGTCTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74816506	74798998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_74799670_74799821_74800032_74800519_74800595_74801026_74801147_74801868_74801973_74802094_74802222_74803787_74803960_74810262_74810489_74816444
tx.2879	chr11	-	1558	8	FSM	ENSMUSG00000001323.18	ENSMUST00000121738.8	3183	8	245	1380	0	-1360	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_7	16.4527771987291	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTGAACTTACAGCCCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74816529	74799004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_74799670_74799821_74800032_74800519_74800595_74801026_74801147_74801868_74801973_74802094_74802222_74803787_74803960_74816444
tx.288	chr1	-	1810	12	NIC	ENSMUSG00000038079.15	novel	1823	13	NA	NA	15	6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_10	59.5276170368229	197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAACTGAAGGTTTTTCCTT	4355	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59158950	59139742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_59140358_59144704_59144827_59145702_59145794_59146612_59146687_59147196_59147389_59147833_59147958_59148197_59148356_59149146_59149265_59153239_59153378_59155031_59155089_59157133_59157166_59158861
tx.2880	chr11	+	765	2	ISM	ENSMUSG00000038290.16	ENSMUST00000045281.13	5848	19	-19	234891	-19	-62649	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_1	0	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGAAAAGGGGGAGGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74816629	74820383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_74816830_74819818
tx.2881	chr11	+	2079	4	ISM	ENSMUSG00000038290.16	ENSMUST00000130145.8	4078	17	225639	0	-3474	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	135	junction_1	8.49836585598797	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGACCTCTGCTGGTCTATT	8426	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75046984	75055274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75047141_75050001_75050214_75050650_75050733_75053645
tx.2882	chr11	-	896	2	FSM	ENSMUSG00000038268.5	ENSMUST00000071562.3	2670	2	20	1754	20	105	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_1	0	551	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTTTCTCCTGCTGCCCC	1657	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75069641	75068521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_75069214_75069437
tx.2883	chr11	-	2043	13	FSM	ENSMUSG00000078789.10	ENSMUST00000044949.11	2139	13	43	53	43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_12	23.7876893931854	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTTTCTCCTGCTGCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75081302	75068521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_75069214_75069750_75069858_75069998_75070140_75070551_75070631_75071386_75071488_75071613_75071771_75072118_75072188_75074027_75074150_75074294_75074453_75074993_75075116_75076610_75076675_75076788_75076942_75081224
tx.2884	chr11	-	2884	17	FSM	ENSMUSG00000000751.14	ENSMUST00000092907.12	5077	17	11	2182	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1486	junction_1	165.245638652734	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTCTTTGACTGTAAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75239139	75191173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_75192230_75193493_75193581_75196933_75197042_75197940_75198118_75200958_75201092_75203125_75203275_75203518_75203659_75203803_75203997_75204126_75204196_75205638_75205742_75206930_75207064_75209237_75209358_75219498_75219588_75231115_75231225_75231853_75231933_75232969_75233021_75239051
tx.2885	chr11	-	738	4	ISM	ENSMUSG00000000751.14	ENSMUST00000154894.2	716	7	-18	23839	-3	2099	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1885	junction_3	45.784519460427	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAAAAAATAAGGATGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75239139	75230704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_75231225_75231853_75231933_75232969_75233021_75239051
tx.2886	chr11	+	3133	11	FSM	ENSMUSG00000018809.3	ENSMUST00000044530.3	3517	11	46	338	-16	-338	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_7	9.20923449587424	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTGTCACTGATCTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75239304	75296193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_75239578_75240494_75240641_75273075_75273221_75278236_75278327_75280897_75282054_75290426_75290610_75291107_75291272_75292943_75293077_75293934_75294052_75294242_75294367_75295591
tx.2887	chr11	-	1368	7	ISM	ENSMUSG00000000753.16	ENSMUST00000000769.14	1832	8	4703	260	-2	35	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	25	junction_1	4.22952584681651	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGCTTCTTCCTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75308824	75300854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_75301220_75301659_75301871_75304732_75304876_75305746_75305951_75306400_75306557_75307055_75307255_75308734
tx.2888	chr11	-	1435	8	FSM	ENSMUSG00000000753.16	ENSMUST00000000769.14	1832	8	137	260	-9	35	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	3.91751691451488	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGCTTCTTCCTTCTCC	5515	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75313390	75300854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_75301220_75301659_75301871_75304732_75304876_75305746_75305951_75306400_75306557_75307055_75307255_75308734_75308823_75313321
tx.2889	chr11	+	1657	3	FSM	ENSMUSG00000085148.2	ENSMUST00000149940.2	1752	3	109	-14	4	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	6.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCTTTTATGAGTGTTTT	3947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75352473	75357516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_75352582_75354518_75354684_75356132
tx.289	chr1	-	1771	11	NIC	ENSMUSG00000038079.15	novel	1823	13	NA	NA	20	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	28	junction_10	51.7934358775318	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTAACTGAAGGTTTTTCC	4360	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59158945	59139744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_59140358_59144704_59144827_59145702_59145794_59146612_59146687_59147196_59147389_59147833_59147958_59148197_59148356_59149146_59149265_59153239_59153378_59155031_59155089_59158861
tx.2890	chr11	+	1402	5	FSM	ENSMUSG00000038217.14	ENSMUST00000043598.14	1153	5	-15	-234	-15	-8	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_4	12.2754836971909	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCATCAGTCTCTTGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75358889	75361717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_75359204_75359382_75359466_75359667_75359751_75360297_75360728_75361225
tx.2891	chr11	+	1895	4	ISM	ENSMUSG00000038217.14	ENSMUST00000108435.2	1112	5	-10	8	-10	-8	intron_retention	FALSE	canonical	3	27	junction_1	3.09120616516523	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCATCAGTCTCTTGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75358894	75361717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75359204_75359382_75359466_75359667_75359751_75360297
tx.2892	chr11	+	443	2	ISM	ENSMUSG00000020850.15	ENSMUST00000102510.8	7249	43	22020	2	16594	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	778	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTGTTTTCTTGCTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75399665	75400273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75399796_75399960
tx.2893	chr11	-	363	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081485.6	novel	192	1	NA	NA	-94	130	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTTTTACTAATGTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75490874	75490458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_75490563_75490615
tx.2894	chr11	+	717	3	ISM	ENSMUSG00000017781.18	ENSMUST00000179445.8	1665	12	32218	3	-334	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	631	junction_2	40.5	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATTGCATCTCTGGTTAA	1045	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75511162	75517553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75511203_75516290_75516357_75516942
tx.2895	chr11	-	661	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000017781.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_3	6.79869268479038	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCATTTATAATCTATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75521581	75516132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_75516409_75518486_75518577_75519066_75519211_75521430
tx.2896	chr11	-	783	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000017781.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	7.48331477354788	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCATTTATAATCTATCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75521584	75516131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_75516409_75518486_75518577_75519066_75519211_75521312
tx.2897	chr11	+	679	2	ISM	ENSMUSG00000017781.18	ENSMUST00000153768.2	384	3	4792	-421	4792	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	631	junction_1	0	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATTGCATCTCTGGTTAA	2723	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75516288	75517553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75516357_75516942
tx.2898	chr11	+	2591	12	FSM	ENSMUSG00000006127.10	ENSMUST00000006286.9	2679	12	12	76	12	-68	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_6	22.5527847321246	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTAGTGAGCTGTGGCTGTC	5451	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75521825	75539621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_75522024_75523894_75524003_75524288_75524398_75527769_75527887_75528235_75528412_75528970_75529083_75530281_75530392_75536253_75536444_75537611_75537750_75538018_75538103_75538227_75538333_75538477
tx.2899	chr11	+	2982	2	ISM	ENSMUSG00000017776.16	ENSMUST00000017920.14	3642	3	13197	-5	12914	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	225	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTGGCTTGGTGATCTTT	6149	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75583281	75596896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75583559_75594191
tx.29	chr1	+	2738	17	FSM	ENSMUSG00000025915.15	ENSMUST00000097826.6	2728	17	-13	3	-13	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	27.8654692226777	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGGTTGGTGTGAATGT	9926	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9918608	9970075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_9918774_9935355_9935574_9938607_9938692_9941854_9941928_9942482_9942559_9947390_9947479_9949250_9949301_9950556_9950615_9951802_9951887_9951984_9952117_9954631_9954745_9954849_9954887_9955891_9955979_9956271_9956368_9959094_9959251_9961585_9961676_9968944
tx.290	chr1	-	971	7	NIC	ENSMUSG00000038079.15	novel	1823	13	NA	NA	16	-224	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_5	73.2380062232415	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTGAGTACTTTTCATAA	4356	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59158949	59147577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_59147958_59148197_59148356_59149146_59149265_59153239_59153378_59155031_59155089_59157133_59157166_59158861
tx.2900	chr11	+	548	2	ISM	ENSMUSG00000017776.16	ENSMUST00000147718.2	852	3	12910	-74	12910	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATACCGTTCTTTTTGAGT	6145	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75583277	75591637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75583559_75591370
tx.2901	chr11	+	2822	2	ISM	ENSMUSG00000017776.16	ENSMUST00000108425.8	4290	3	13182	818	12924	25	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAGAAAGTAATCTTGAAAT	6159	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75583291	75596916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75583389_75594191
tx.2902	chr11	+	1788	6	FSM	ENSMUSG00000020849.14	ENSMUST00000067664.10	2100	6	47	265	3	-265	multi-exon	FALSE	canonical	3	8977	junction_5	918.346862574267	6639	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCATGCCTCCATCCTTTA	3038	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75623741	75656406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_75623918_75642706_75642907_75646399_75646507_75647642_75647850_75650117_75650255_75655445
tx.2903	chr11	-	1030	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020849.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTCTATGCAGGAAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75656397	75642710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_75642920_75655576
tx.2904	chr11	+	1608	5	ISM	ENSMUSG00000020849.14	ENSMUST00000067664.10	2100	6	19016	265	281	-265	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8977	junction_4	840.54312798333	515	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCATGCCTCCATCCTTTA	137	False	NA	-4	True	NA	NA	NA	75642710	75656406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_75642907_75646399_75646507_75647642_75647850_75650117_75650255_75655445
tx.2905	chr11	-	235	2	Intergenic	novelGene_178	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTTCTGGGTACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75858014	75854820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_75855026_75857984
tx.2906	chr11	+	876	2	NNC	ENSMUSG00000053783.6	novel	921	2	NA	NA	42	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAGGAAGCCGATGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75890779	75894395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_75891093_75893832
tx.2907	chr11	+	870	2	FSM	ENSMUSG00000053783.6	ENSMUST00000066408.6	921	2	51	0	51	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGAAGGAAGCCGATGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75890788	75894395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_75891093_75893829
tx.2908	chr11	-	1873	3	FSM	ENSMUSG00000020846.7	ENSMUST00000021207.7	3512	3	18	1621	18	-1621	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTGGACTCTGATAGTG	7905	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75918590	75911640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_75913067_75915773_75915884_75918253
tx.2909	chr11	-	646	2	FSM	ENSMUSG00000017288.16	ENSMUST00000129256.2	650	2	3	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTGTTTATGTGTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76070461	76067785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_76068209_76070238
tx.291	chr1	-	509	2	ISM	ENSMUSG00000026024.15	ENSMUST00000159166.8	2977	13	43133	0	25028	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTGGGCCCCATTAAGC	3958	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59233257	59230767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_59231211_59233191
tx.2910	chr11	+	2130	5	FSM	ENSMUSG00000069808.14	ENSMUST00000094014.10	2130	5	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_2	6.18465843842649	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTTATGTGCCCTGGC	3405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76092839	76100241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_76093082_76093377_76093462_76096079_76096282_76097953_76098050_76098735
tx.2911	chr11	+	1928	4	NIC	ENSMUSG00000069808.14	novel	2130	5	NA	NA	-1	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_2	24.0739601136904	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTTATGTGCCCTGGC	3405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76092839	76100241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_76093082_76093377_76093462_76097953_76098050_76098735
tx.2912	chr11	-	3438	2	FSM	ENSMUSG00000049396.7	ENSMUST00000102500.5	3540	2	102	0	-45	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	437	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGAGCCTTTCTCAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76108388	76101396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_76104750_76108303
tx.2913	chr11	+	568	2	FSM	ENSMUSG00000038057.5	ENSMUST00000040806.5	581	2	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGAGTGGAGTCTGTGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76108446	76109492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_76108575_76109052
tx.2914	chr11	-	1166	9	NNC	ENSMUSG00000017286.16	novel	1434	9	NA	NA	-19	57	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	241.913595111974	132	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGACTGAGACAACTATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76134520	76112562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_76112858_76123847_76123935_76124027_76124142_76124725_76124803_76125214_76125352_76128494_76128640_76130277_76130399_76131698_76131749_76134380
tx.2915	chr11	-	1172	9	FSM	ENSMUSG00000017286.16	ENSMUST00000017430.12	1434	9	31	231	-19	53	multi-exon	FALSE	canonical	3	653	junction_6	49.1602926659311	3663	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCCAGACTGAGACAACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76134520	76112566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_76112858_76123847_76123935_76124027_76124142_76124725_76124813_76125214_76125352_76128494_76128640_76130277_76130399_76131698_76131749_76134380
tx.2916	chr11	+	1474	4	FSM	ENSMUSG00000038046.5	ENSMUST00000040577.5	1510	4	36	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	6.53197264742181	339	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCATATGAGTGTTTGCAGG	586	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76134576	76141445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_76134913_76135104_76135350_76138172_76138341_76140720
tx.2917	chr11	+	811	3	ISM	ENSMUSG00000038046.5	ENSMUST00000040577.5	1510	4	34	3045	13	2690	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_1	8	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTGTACATGTGTATGT	584	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76134574	76138400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_76134913_76135104_76135350_76138172
tx.2918	chr11	-	1733	8	NNC	ENSMUSG00000020844.7	novel	2755	8	NA	NA	111685	-760	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_7	32.3412922387691	68	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTACTGTGTGCTTAGTT	1413	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76178209	76148783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_76149574_76152367_76152493_76153833_76154014_76163201_76163309_76164796_76164898_76165340_76165475_76169299_76169418_76178031
tx.2919	chr11	-	1657	8	NNC	ENSMUSG00000020844.7	novel	2755	8	NA	NA	111694	-760	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_7	33.6961210145704	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTTACTGTGTGCTTAGTT	1422	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76178200	76148783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_76149574_76152367_76152493_76153833_76154014_76163201_76163309_76164796_76164898_76165340_76165475_76169299_76169418_76178098
tx.292	chr1	+	1674	9	NIC	ENSMUSG00000047361.17	novel	933	5	NA	NA	-24	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3.23795846174715	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTTTGTTTTCTTTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59658548	59675576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_59658605_59664245_59664337_59666615_59666767_59667328_59667444_59669153_59669486_59671372_59671576_59672305_59672479_59673152_59673373_59675243
tx.2920	chr11	+	1065	4	FSM	ENSMUSG00000020843.16	ENSMUST00000021203.7	2817	4	32	1720	-16	243	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_1	9.62635271879577	1825	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGTTAGTATCTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76298000	76305398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_76298269_76300467_76300665_76301952_76302026_76304871
tx.2921	chr11	-	901	6	ISM	ENSMUSG00000010392.9	ENSMUST00000010536.9	4289	9	9127	3095	9115	-3095	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	228	junction_2	29.403401163811	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAACACTTGTGATGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76645278	76620522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_76621060_76625394_76625478_76628207_76628238_76639333_76639409_76641636_76641729_76645194
tx.2922	chr11	-	1191	9	FSM	ENSMUSG00000010392.9	ENSMUST00000010536.9	4289	9	8	3090	-4	-3090	multi-exon	FALSE	canonical	3	228	junction_2	27.7778576387741	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTTGTGATGAGTAATCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76654397	76620517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_76621060_76625394_76625478_76628207_76628238_76639333_76639409_76641636_76641729_76645194_76645303_76645538_76645627_76652060_76652182_76654345
tx.2923	chr11	+	2246	12	FSM	ENSMUSG00000020840.11	ENSMUST00000021197.10	2497	12	251	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	631	junction_4	56.5853410915431	1275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAAGCCGGCGTGTCTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76836580	76878205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_76836720_76837067_76837266_76840785_76840896_76841869_76842012_76843326_76843416_76845335_76845429_76856640_76856797_76857557_76857717_76857819_76857888_76859428_76859547_76862734_76862805_76877301
tx.2924	chr11	+	2110	11	ISM	ENSMUSG00000020840.11	ENSMUST00000021197.10	2497	12	735	0	171	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	631	junction_3	50.0640589644907	324	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAAGCCGGCGTGTCTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76837064	76878205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_76837266_76840785_76840896_76841869_76842012_76843326_76843416_76845335_76845429_76856640_76856797_76857557_76857717_76857819_76857888_76859428_76859547_76862734_76862805_76877301
tx.2925	chr11	-	1953	7	FSM	ENSMUSG00000037958.14	ENSMUST00000102494.8	3114	7	9	1152	9	-1152	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_6	27.2457947825593	376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTTGAGTTTTTTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76969252	76936269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_76937581_76939178_76939288_76940098_76940307_76941409_76941539_76945769_76945827_76967479_76967571_76969204
tx.2926	chr11	-	2786	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000083899.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	822	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACTCATTCTTAAGGTAC	1645	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77187252	77184264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_77185699_77185900
tx.2927	chr11	-	2783	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000083899.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	100	junction_1	0	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACTCATTCTTAAGGTAC	1647	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77187250	77184264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_77185682_77185884
tx.2928	chr11	-	1590	6	NIC	ENSMUSG00000044328.14	novel	1463	7	NA	NA	69	-6	intron_retention	FALSE	canonical	3	152	junction_1	15.3179633110933	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGGAGTCGTTGGGAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77404127	77398930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_77399204_77399282_77399818_77399901_77400100_77400423_77400553_77403478_77403792_77403985
tx.2929	chr11	-	1669	5	NIC	ENSMUSG00000044328.14	novel	1463	7	NA	NA	69	-6	intron_retention	FALSE	canonical	3	179	junction_4	7.43303437365925	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGGAGTCGTTGGGAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77404127	77398930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_77399818_77399901_77400100_77400423_77400553_77403478_77403792_77403985
tx.293	chr1	+	1699	8	NIC	ENSMUSG00000047361.17	novel	3595	20	NA	NA	-5317	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_6	2.91372543633873	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTTTGTTTTCTTTAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59664164	59675576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_59664337_59666615_59666767_59667328_59667444_59669153_59669486_59671372_59671576_59672305_59672479_59673152_59673373_59675243
tx.2930	chr11	-	1323	6	NIC	ENSMUSG00000044328.14	novel	1463	7	NA	NA	65	-6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	14	junction_5	68.0458668840364	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGGAGTCGTTGGGAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77404131	77398930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_77399204_77399282_77399818_77399901_77400100_77400423_77400553_77403478_77403521_77403985
tx.2931	chr11	-	1388	7	FSM	ENSMUSG00000044328.14	ENSMUST00000060417.11	1463	7	69	6	69	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	152	junction_1	13.984117975602	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGGAGTCGTTGGGAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77404127	77398930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_77399204_77399282_77399818_77399901_77400100_77400423_77400553_77403478_77403521_77403722_77403792_77403985
tx.2932	chr11	-	1484	6	NIC	ENSMUSG00000044328.14	novel	1463	7	NA	NA	52	-6	intron_retention	FALSE	canonical	3	179	junction_5	7.1386273190299	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGGAGTCGTTGGGAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77404144	77398930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_77399818_77399901_77400100_77400423_77400553_77403478_77403521_77403722_77403792_77403985
tx.2933	chr11	+	876	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000044328.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCAGGTTTTTTGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77399093	77400332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_77399214_77399576
tx.2934	chr11	+	759	2	FSM	ENSMUSG00000000631.21	ENSMUST00000100795.4	3040	2	-9	2290	-9	499	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTAAAAGATTCCCAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77654117	77668731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_77654206_77668060
tx.2935	chr11	-	1747	8	FSM	ENSMUSG00000017453.5	ENSMUST00000017597.5	1998	8	252	-1	252	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_3	30.9654184996286	709	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCGGTGGTCTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77784670	77771439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_77772081_77772326_77772403_77772943_77773103_77773442_77773590_77773954_77774138_77774604_77774819_77782937_77783087_77784492
tx.2936	chr11	+	463	2	Intergenic	novelGene_180	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTGCCTCCTCCTCCGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77794827	77798064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_77794941_77797714
tx.2937	chr11	+	1756	5	FSM	ENSMUSG00000020834.18	ENSMUST00000021187.12	1779	5	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	5.93190525885234	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTCTGGCTCCCGCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77923128	77928692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_77923325_77923410_77923530_77924838_77924963_77925100_77925413_77927687
tx.2938	chr11	+	1556	4	FSM	ENSMUSG00000020834.18	ENSMUST00000122342.2	1791	4	233	2	226	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_3	4.08248290463863	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGATGCTCTGGCTCCCGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77923410	77928688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_77923530_77924838_77924963_77925100_77925413_77927687
tx.2939	chr11	+	1114	8	ISM	ENSMUSG00000061981.15	ENSMUST00000072289.12	2621	11	20	2233	10	-2230	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	351	junction_3	25.6999960295399	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTTTGTCCAAGTCTGAT	NA	False	NA	89	True	NA	NA	NA	77928776	77949027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_77928939_77940303_77940386_77945610_77945702_77946582_77946707_77948087_77948207_77948313_77948428_77948527_77948648_77948725
tx.294	chr1	+	792	4	ISM	ENSMUSG00000047361.17	ENSMUST00000190490.2	933	5	2032	-4	2032	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_2	2.62466929133727	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTTCTTTAGGACTAC	673	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59671513	59675580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_59671576_59672305_59672479_59673152_59673373_59675243
tx.2940	chr11	+	2593	11	FSM	ENSMUSG00000061981.15	ENSMUST00000072289.12	2621	11	28	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	351	junction_3	23.4778619128744	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCATCGTATATTCTGT	NA	False	NA	97	True	NA	NA	NA	77928784	77951260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_77928939_77940303_77940386_77945610_77945702_77946582_77946707_77948087_77948207_77948313_77948428_77948527_77948648_77948725_77948941_77949332_77949517_77949770_77949921_77950020
tx.2941	chr11	+	2312	9	ISM	ENSMUSG00000061981.15	ENSMUST00000136353.2	2558	12	14526	0	14526	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	351	junction_1	25.7960752828798	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCATCGTATATTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77945655	77951260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_77945702_77946582_77946707_77948087_77948207_77948313_77948428_77948527_77948648_77948725_77948941_77949332_77949517_77949770_77949921_77950020
tx.2942	chr11	+	2273	8	ISM	ENSMUSG00000061981.15	ENSMUST00000136353.2	2558	12	15446	0	15446	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	354	junction_5	24.6195541994487	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCATCGTATATTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77946575	77951260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_77946707_77948087_77948207_77948313_77948428_77948527_77948648_77948725_77948941_77949332_77949517_77949770_77949921_77950020
tx.2943	chr11	-	2001	10	FSM	ENSMUSG00000020832.15	ENSMUST00000021183.4	2014	10	11	2	11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	178	junction_8	16.2890556304942	238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTCTTATCTTTTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77971198	77964203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_77965001_77965105_77965187_77965303_77965454_77966216_77966466_77966547_77966661_77966815_77966878_77967058_77967106_77968642_77968721_77969087_77969216_77970902
tx.2944	chr11	+	659	3	FSM	ENSMUSG00000037750.17	ENSMUST00000073705.12	3258	3	21	2578	21	-1953	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_2	31	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACACTGCAACACCCTCAG	2619	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77985506	78044948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_77985618_78033918_78034041_78044522
tx.2945	chr11	+	3122	3	FSM	ENSMUSG00000037750.17	ENSMUST00000100782.4	2473	3	-27	-622	21	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_2	46.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAGGAAAAATGCCTGCGTG	2619	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77985506	78047523	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_77985618_78033918_78034041_78044634
tx.2946	chr11	-	1977	7	FSM	ENSMUSG00000017386.11	ENSMUST00000017530.4	2078	7	96	5	23	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	457	junction_4	31.7525152109596	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGATTCCAGCCTGTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78056319	78050230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_78051375_78051618_78051775_78051858_78052021_78052112_78052275_78052343_78052449_78053207_78053260_78056123
tx.2948	chr11	+	1030	5	NIC	ENSMUSG00000019437.18	novel	457	4	NA	NA	-34	5	intron_retention	FALSE	canonical	3	12	junction_1	80.151419201409	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGAAGTCCTGTTCTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78068921	78071311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_78069063_78069863_78070048_78070195_78070279_78070365_78070449_78070772
tx.2949	chr11	+	778	3	FSM	ENSMUSG00000019437.18	ENSMUST00000108338.2	714	3	-62	-2	15	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_1	5	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGTTCCTCAGCTTCCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78069525	78070703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78069883_78070195_78070279_78070365
tx.295	chr1	-	1181	5	FSM	ENSMUSG00000026021.16	ENSMUST00000091374.9	1215	5	31	3	-11	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	3231	junction_1	432.6531520745	11350	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGAAGCTCCTTTTATT	620	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59709962	59678595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_59679428_59681576_59681649_59683675_59683754_59694616_59694692_59709838
tx.2950	chr11	+	1060	4	FSM	ENSMUSG00000019437.18	ENSMUST00000127587.8	1412	4	17	335	17	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_1	14.2672897060218	609	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGAAGTCCTGTTCTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78069527	78071311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78069883_78070195_78070279_78070365_78070449_78070772
tx.2951	chr11	-	536	5	FSM	ENSMUSG00000058546.9	ENSMUST00000102483.5	560	5	24	0	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10927	junction_1	3598.81438810061	17551	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGCTGCTTGTCATTTGT	5987	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78074386	78071760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_78071824_78071979_78072050_78072242_78072420_78073628_78073813_78074344
tx.2952	chr11	+	1372	11	FSM	ENSMUSG00000002059.19	ENSMUST00000002128.14	1368	11	-2	-2	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	27.8790243731735	259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTCTTTCTTTAAAGAT	6023	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78079253	78083016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78079338_78080003_78080217_78080396_78080489_78080955_78081022_78081114_78081217_78081303_78081369_78081510_78081563_78082033_78082116_78082190_78082282_78082400_78082509_78082599
tx.2953	chr11	+	1702	10	FSM	ENSMUSG00000002059.19	ENSMUST00000108322.9	1685	10	-14	-3	-14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_1	10.0443461155462	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTCTTTCTTTAAAGATT	6360	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78079590	78083017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78080217_78080396_78080489_78080955_78081022_78081114_78081217_78081303_78081369_78081510_78081563_78082033_78082116_78082190_78082282_78082400_78082509_78082599
tx.2954	chr11	+	444	2	ISM	ENSMUSG00000002059.19	ENSMUST00000156435.2	950	8	1526	3	1303	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_1	0	447	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTTCTTTCTTTAAAGAT	9251	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78082481	78083016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78082509_78082599
tx.2955	chr11	+	1305	4	FSM	ENSMUSG00000044122.16	ENSMUST00000108317.3	1359	4	-199	253	-169	6	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3.74165738677394	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCTATTCTCTGCCTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78085360	78096336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78085781_78092637_78092719_78094890_78095024_78095665
tx.2956	chr11	+	1144	3	FSM	ENSMUSG00000044122.16	ENSMUST00000060539.13	960	3	-146	-38	-146	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	1	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTACCGCTATTCTCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78085383	78096331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78085781_78092637_78092719_78095665
tx.2957	chr11	+	995	4	NNC	ENSMUSG00000044122.16	novel	1359	4	NA	NA	-9	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.29983164553722	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTACCGCTATTCTCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78085550	78096331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_78085666_78092637_78092719_78094890_78095024_78095665
tx.2958	chr11	+	1020	3	FSM	ENSMUSG00000002064.11	ENSMUST00000002133.9	1268	3	244	4	244	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_1	4	1446	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTGTGTGGTCATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78136815	78146318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78136997_78141841_78142039_78145676
tx.2959	chr11	+	1305	11	ISM	ENSMUSG00000010277.8	ENSMUST00000010421.7	7443	39	21	23382	21	-939	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	514	junction_1	44.650195968215	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAGTCTTAAGTTACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78152598	78158067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78152744_78153524_78153655_78154415_78154466_78154737_78154886_78155289_78155409_78156004_78156066_78156398_78156589_78157176_78157301_78157420_78157546_78157761_78157830_78157922
tx.296	chr1	+	2008	15	FSM	ENSMUSG00000026020.10	ENSMUST00000191142.7	9507	15	-35	7534	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1434	junction_3	210.570471503931	1435	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCAGTTTTGTGATCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59724132	59750669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_59724386_59729644_59729722_59731495_59731549_59735136_59735259_59737481_59737619_59740043_59740109_59741971_59742107_59743221_59743368_59743782_59743910_59744751_59744916_59745791_59745927_59746161_59746224_59748161_59748296_59749653_59749812_59750429
tx.2960	chr11	+	1126	4	ISM	ENSMUSG00000010277.8	ENSMUST00000010421.7	7443	39	26475	0	287	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	800	junction_1	33.189690501051	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGTCCTTCCCTCCTCA	57	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78179052	78181449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78179122_78179766_78179869_78180111_78180247_78180629
tx.2961	chr11	-	332	2	Intergenic	novelGene_181	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTAGTCTCTGGTGGTATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78192330	78190904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_78191037_78192130
tx.2962	chr11	+	711	5	ISM	ENSMUSG00000002055.10	ENSMUST00000045026.4	3887	24	19523	3	1126	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_2	23.7946947868637	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTTCCAGTCCACTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78211877	78213280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78211950_78212087_78212244_78212323_78212399_78212511_78212593_78212953
tx.2963	chr11	+	628	4	ISM	ENSMUSG00000002055.10	ENSMUST00000045026.4	3887	24	19744	3	1347	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_1	25.2498624858742	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTTCCAGTCCACTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78212098	78213280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78212244_78212323_78212399_78212511_78212593_78212953
tx.2964	chr11	+	485	3	ISM	ENSMUSG00000002055.10	ENSMUST00000045026.4	3887	24	19967	3	1570	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	228	junction_1	1.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTTCCAGTCCACTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78212321	78213280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78212399_78212511_78212593_78212953
tx.2965	chr11	+	1641	9	FSM	ENSMUSG00000017390.16	ENSMUST00000017534.15	2786	9	125	1020	-75	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_5	18.6547581061776	327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCGCTCTGTCTGTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78213918	78217587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78214049_78215215_78215340_78215429_78215642_78215734_78215790_78215874_78216036_78216154_78216239_78216467_78216643_78216760_78216961_78217087
tx.2966	chr11	+	2462	12	FSM	ENSMUSG00000041958.11	ENSMUST00000048073.9	2501	12	31	8	31	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	513	junction_10	36.2694234084327	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATGGATGACCATAACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78219271	78233600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78219335_78219557_78219698_78219800_78219913_78223775_78223866_78224492_78224585_78226252_78226461_78227513_78227657_78228614_78228730_78230168_78230315_78230834_78230936_78232050_78232262_78232559
tx.2967	chr11	+	2326	11	NIC	ENSMUSG00000041958.11	novel	2501	12	NA	NA	29	-6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	77	junction_1	151.766300607216	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGGATGACCATAACTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78219269	78233602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_78219335_78219800_78219913_78223775_78223866_78224492_78224585_78226252_78226461_78227513_78227657_78228614_78228730_78230168_78230315_78230834_78230936_78232050_78232262_78232559
tx.2968	chr11	+	1096	5	NNC	ENSMUSG00000002058.14	novel	1329	5	NA	NA	-4	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	102.793482283655	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGCCAGCCTGTGTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78234319	78239983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_78234399_78238043_78238158_78238622_78238726_78238912_78239086_78239356
tx.2969	chr11	+	1286	5	FSM	ENSMUSG00000002058.14	ENSMUST00000002127.14	1329	5	35	8	11	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_3	19.8557296516648	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGGCCAGCCTGTGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78234342	78239982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78234613_78238043_78238158_78238622_78238726_78238912_78239086_78239356
tx.297	chr1	+	376	2	ISM	ENSMUSG00000026020.10	ENSMUST00000188390.2	585	7	5808	-230	5808	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2320	junction_1	0	849	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCAGTTTTGTGATCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59749675	59750669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_59749812_59750429
tx.2970	chr11	+	954	2	ISM	ENSMUSG00000002058.14	ENSMUST00000100755.4	933	5	1266	-177	-3	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	266	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGGCCAGCCTGTGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78238757	78239982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78239086_78239356
tx.2971	chr11	-	1104	5	NIC	ENSMUSG00000001095.6	novel	2412	12	NA	NA	21314	-214	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	6.04152298679729	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCGGGTGTGTTTCCCGGTG	9778	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78291729	78288126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_78288682_78289116_78289255_78289857_78290020_78291301_78291391_78291569
tx.2972	chr11	-	1259	6	ISM	ENSMUSG00000001095.6	ENSMUST00000001122.6	2412	12	21280	215	21280	-215	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_4	5.41848687365763	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCGGGTGTGTTTCCCGGT	9744	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78291763	78288127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_78288682_78289116_78289255_78289857_78290020_78290909_78291032_78291301_78291391_78291569
tx.2973	chr11	+	1961	5	FSM	ENSMUSG00000020829.10	ENSMUST00000001126.4	1978	5	12	5	12	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	12.7549010188241	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTACTGGGCTTTGGGGCT	8349	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78356534	78362766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78356832_78357176_78358030_78359450_78359535_78361520_78361678_78362196
tx.2974	chr11	+	1108	4	FSM	ENSMUSG00000020829.10	ENSMUST00000146431.3	749	4	-41	-318	12	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	30.8796948747159	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTACTGGGCTTTGGGGCT	8349	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78356534	78362766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78356832_78359450_78359535_78361520_78361678_78362196
tx.2975	chr11	-	2429	4	FSM	ENSMUSG00000050132.14	ENSMUST00000153534.2	2497	4	-10	78	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_3	7.78888096369861	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAATGTCTGTCTTCAGTC	4403	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78374634	78364116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_78365859_78366032_78366155_78373982_78374173_78374259
tx.2976	chr11	-	1318	6	FSM	ENSMUSG00000051232.14	ENSMUST00000052566.8	1347	6	29	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	479	junction_5	35.6561355169065	1235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTATCTTTGGTCTTAAA	1660	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78402969	78397880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_78398632_78399144_78399258_78399478_78399522_78400550_78400641_78401173_78401248_78402722
tx.2977	chr11	+	1982	11	FSM	ENSMUSG00000001100.11	ENSMUST00000001127.11	2054	11	72	0	72	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1074	junction_9	50.3904752904753	857	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGAGTATTGTTCTTAA	1707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78403090	78413562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78403299_78404745_78404828_78405913_78406012_78407644_78407742_78408378_78408455_78408650_78408759_78408898_78409036_78409778_78409806_78410005_78410132_78411977_78412058_78412619
tx.2978	chr11	+	1045	3	ISM	ENSMUSG00000001100.11	ENSMUST00000001127.11	2054	11	7091	0	953	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1074	junction_1	38	244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGAGTATTGTTCTTAA	5393	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78410109	78413562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78410132_78411977_78412058_78412619
tx.2979	chr11	+	1024	2	ISM	ENSMUSG00000001100.11	ENSMUST00000001127.11	2054	11	8958	0	2820	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1150	junction_1	0	1365	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGAGTATTGTTCTTAA	7260	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78411976	78413562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78412058_78412619
tx.298	chr1	+	1367	4	ISM	ENSMUSG00000041040.13	ENSMUST00000036540.12	5532	8	56036	2974	-1638	857	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_2	6.12825877028341	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTATGTGATTTATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60008200	60021531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_60008257_60009644_60009871_60014041_60014163_60020567
tx.2980	chr11	+	1062	6	FSM	ENSMUSG00000001105.16	ENSMUST00000128788.8	1141	6	63	16	-4	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	238	junction_1	100.921751867474	817	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGTCTTTCTTCTATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78427249	78432547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78427403_78429335_78429565_78429659_78429789_78430785_78430872_78431720_78431825_78432186
tx.2981	chr11	+	832	5	FSM	ENSMUSG00000001105.16	ENSMUST00000108275.2	582	5	-18	-232	-3	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_1	91.1125677390337	1207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGTCTTTCTTCTATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78427250	78432547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78427403_78429659_78429789_78430785_78430872_78431720_78431825_78432186
tx.2982	chr11	+	472	2	ISM	ENSMUSG00000001105.16	ENSMUST00000128788.8	1141	6	4532	11	4420	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	426	junction_1	0	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTCTTCTATGGTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78431718	78432552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78431825_78432186
tx.2983	chr11	-	1332	3	FSM	ENSMUSG00000037278.10	ENSMUST00000103242.5	1375	3	43	0	43	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1037	junction_2	9	3094	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGGTTTGTTGTGTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78441560	78432642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_78433623_78434311_78434457_78441353
tx.2984	chr11	-	830	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000049489.6	novel	1224	1	NA	NA	47	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGTCTGCCTTATGGTA	6642	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78642508	78641331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_78641766_78642112
tx.2985	chr11	+	537	4	FSM	ENSMUSG00000072640.12	ENSMUST00000147875.9	8035	4	1	7497	1	98	multi-exon	FALSE	canonical	3	164	junction_1	44.0782133132559	1840	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTTGCTTCTTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78717410	78730199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_78717463_78726843_78726985_78728915_78729009_78729948
tx.2986	chr11	+	486	3	ISM	ENSMUSG00000072640.12	ENSMUST00000147875.9	8035	4	9433	7497	9388	98	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	230	junction_1	20.5	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTTGCTTCTTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78726842	78730199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_78726985_78728915_78729009_78729948
tx.2987	chr11	-	1473	10	FSM	ENSMUSG00000001123.16	ENSMUST00000108268.10	1520	10	43	4	21	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_9	3.82970843102535	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATGTGAGATGGCTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78875729	78853803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_78854368_78856517_78856681_78856823_78856913_78857702_78857745_78858269_78858321_78858823_78858860_78862142_78862254_78863813_78864016_78867438_78867528_78875603
tx.2988	chr11	-	1553	11	FSM	ENSMUSG00000001123.16	ENSMUST00000108269.10	1586	11	32	1	32	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_6	7.48398289682706	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACATGTGAGATGGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78875718	78853805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_78854368_78856517_78856681_78856823_78856913_78857702_78857745_78858269_78858321_78858823_78858860_78860539_78860633_78862142_78862254_78863813_78864016_78867438_78867528_78875603
tx.2989	chr11	-	2463	9	FSM	ENSMUSG00000017677.12	ENSMUST00000017821.12	2476	9	-1	14	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	217	junction_4	86.5338625914734	211	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACATTGCCGATATTTCTT	974	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79145498	79130211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_79131289_79131513_79131622_79132420_79132535_79132809_79132983_79135288_79135390_79136995_79137128_79139216_79139486_79141806_79141976_79145178
tx.299	chr1	-	996	4	NIC	ENSMUSG00000026018.13	novel	951	4	NA	NA	148	7	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.4142135623731	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTGGAGTTAATTTAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60082098	60059942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_60060544_60061736_60061810_60067226_60067406_60081955
tx.2990	chr11	-	464	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000017639.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCTGTCCTTCCTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79544216	79541940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_79542205_79544016
tx.2991	chr11	-	877	2	NIC	ENSMUSG00000086474.3	novel	696	2	NA	NA	-21	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTGATTTTGGTCTTGGTG	8474	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79696019	79672803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_79673383_79695721
tx.2992	chr11	-	2051	9	ISM	ENSMUSG00000035575.12	ENSMUST00000043152.6	3877	19	13429	846	-6697	-846	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	409	junction_5	35.9713427605921	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGGGTATTTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79839787	79825624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_79826936_79828498_79828572_79831719_79831787_79832703_79832814_79832952_79833034_79834056_79834237_79836604_79836683_79837031_79837112_79839716
tx.2993	chr11	-	3025	19	FSM	ENSMUSG00000035575.12	ENSMUST00000043152.6	3877	19	-1	853	-1	-853	multi-exon	FALSE	canonical	3	409	junction_5	33.8632416611651	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTGATACTGGGTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79853217	79825631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_79826936_79828498_79828572_79831719_79831787_79832703_79832814_79832952_79833034_79834056_79834237_79836604_79836683_79837031_79837112_79839716_79839902_79841595_79841678_79842424_79842507_79844402_79844481_79846436_79846556_79847562_79847627_79848166_79848215_79849611_79849705_79849934_79849977_79851572_79851658_79853043
tx.2994	chr11	+	1045	2	Intergenic	novelGene_184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	0	280	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTTGGTTGATCACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79864505	79866015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_79864672_79865136
tx.2995	chr11	+	1042	2	Intergenic	novelGene_185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTTTGGTTGATCACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79864544	79866015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_79864708_79865136
tx.2996	chr11	-	621	2	Intergenic	novelGene_186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	0	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGAGTTGCCCTTTGGGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79867140	79865566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_79865963_79866915
tx.2997	chr11	-	955	2	Intergenic	novelGene_187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGATCCCGGGAAAAACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79867140	79865689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_79866420_79866915
tx.2998	chr11	+	2476	3	ISM	ENSMUSG00000017548.16	ENSMUST00000144188.2	553	4	4016	-2103	4016	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1908	junction_2	11.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTTCTGCTTTTCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79920036	79924930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_79920173_79920832_79920913_79922670
tx.2999	chr11	-	2377	8	NNC	ENSMUSG00000017561.17	novel	2396	8	NA	NA	18	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	192.168081190846	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAATGTATTTTGTGGTTT	4506	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79971799	79937323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_79938564_79939417_79939531_79947273_79947411_79948617_79948841_79950025_79950204_79950923_79951012_79955017_79955226_79971609
tx.3	chr1	-	1025	5	FSM	ENSMUSG00000033845.14	ENSMUST00000156816.7	4203	5	12	3166	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2059	junction_1	113.670576667843	12097	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCACTGCTCAGGTCTTTTG	1632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4855950	4846599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_4847025_4847747_4847872_4852790_4852957_4854173_4854329_4855795
tx.30	chr1	+	1475	4	ISM	ENSMUSG00000025915.15	ENSMUST00000097826.6	2728	17	37648	3	2578	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	100	junction_2	14.1970262926979	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGGTTGGTGTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9956269	9970075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_9956368_9959094_9959251_9961585_9961676_9968944
tx.300	chr1	-	957	4	NNC	ENSMUSG00000026018.13	novel	951	4	NA	NA	165	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGCATTGGAGTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60082081	60059946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_60060544_60061736_60061792_60067226_60067406_60081955
tx.3000	chr11	+	1197	2	ISM	ENSMUSG00000017550.15	ENSMUST00000017694.7	7272	23	15	40862	15	-13579	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	100	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCTGCAGTTCCAGCCTGT	6014	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79980240	79985755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_79980663_79984980
tx.3001	chr11	+	2119	3	ISM	ENSMUSG00000017550.15	ENSMUST00000151815.8	4572	19	30949	16	29830	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	127	junction_2	17	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTTGGTGTGTTAAATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80023658	80026604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_80024133_80024854_80025014_80025118
tx.3002	chr11	-	1296	4	FSM	ENSMUSG00000046909.10	ENSMUST00000050207.10	1309	4	15	-2	15	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	265	junction_2	2.16024689946929	1173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCCTTCTTTGCTTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80032986	80027501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_80028106_80028743_80028894_80030691_80031150_80032902
tx.3003	chr11	-	1214	3	ISM	ENSMUSG00000046909.10	ENSMUST00000050207.10	1309	4	1850	-2	-416	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	265	junction_2	2.5	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCCTTCTTTGCTTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80031151	80027501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_80028106_80028743_80028894_80030691
tx.3004	chr11	+	1212	10	ISM	ENSMUSG00000020709.16	ENSMUST00000021050.14	1785	11	-35	1729	-35	-1729	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_2	3.01027048536535	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCGGGGCGTCTTGTCCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80044895	80068055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_80045136_80045815_80045947_80047770_80047863_80050988_80051069_80052973_80053087_80056498_80056646_80061503_80061588_80064913_80064977_80066881_80066960_80067871
tx.3005	chr11	+	1960	5	FSM	ENSMUSG00000020707.7	ENSMUST00000017839.3	1984	5	21	3	21	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_2	3.96074487943871	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTGTGTTGAGTTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80074697	80090580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_80075082_80080049_80080194_80084711_80084875_80087698_80087774_80089386
tx.3006	chr11	+	1834	4	NIC	ENSMUSG00000020707.7	novel	1984	5	NA	NA	3	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	23	junction_1	17.6131264181639	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTGTGTTGAGTTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80074679	80090580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_80075082_80084711_80084875_80087698_80087774_80089386
tx.3007	chr11	+	1797	4	NIC	ENSMUSG00000020707.7	novel	1984	5	NA	NA	21	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	5	junction_2	26.4491125665032	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTGTGTTGAGTTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80074697	80090580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_80075082_80080049_80080194_80087698_80087774_80089386
tx.3008	chr11	+	3148	20	FSM	ENSMUSG00000017686.18	ENSMUST00000055056.16	4260	20	15	1097	-14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_18	152.933077899418	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTTGAGGTTTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80099895	80157636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_80100150_80111083_80111143_80114728_80114811_80116411_80116456_80116888_80116943_80118105_80118159_80124207_80124317_80124754_80124857_80132846_80132946_80133398_80133508_80134195_80134317_80136827_80136913_80137492_80137639_80139263_80139365_80141033_80141165_80141868_80141953_80143792_80143913_80145485_80145689_80148339_80148463_80156567
tx.3009	chr11	+	3016	19	FSM	ENSMUSG00000017686.18	ENSMUST00000092857.13	3687	19	-3	674	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	336	junction_18	65.0695971182841	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGAGGTTTTTTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80099906	80157638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_80100150_80111083_80111143_80114728_80114811_80116411_80116456_80116888_80116943_80118105_80118159_80124207_80124317_80124754_80124857_80132846_80132946_80133398_80133508_80134195_80134317_80136827_80136913_80137492_80137639_80139263_80139365_80141033_80141165_80141868_80141953_80143792_80143913_80145485_80145689_80156567
tx.301	chr1	-	272	3	ISM	ENSMUSG00000026019.16	ENSMUST00000122038.8	2850	14	16010	1275	3626	-1275	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	924	junction_1	70.5	641	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCTTGTTGGGTCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60121295	60117301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_60117401_60119677_60119751_60121195
tx.3010	chr11	+	3109	20	FSM	ENSMUSG00000017686.18	ENSMUST00000017831.16	3029	20	-35	-45	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_18	134.011803341732	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGAGGTTTTTTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80099909	80157638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_80100150_80111083_80111143_80114728_80114811_80116411_80116456_80116888_80116943_80118105_80118159_80124207_80124317_80124754_80124857_80132846_80132946_80133398_80133508_80134195_80134317_80136827_80136913_80137492_80137639_80139263_80139365_80141033_80141165_80141868_80141953_80143792_80143913_80145485_80145689_80146687_80146784_80156567
tx.3011	chr11	+	357	2	ISM	ENSMUSG00000017686.18	ENSMUST00000134148.2	1326	11	-56	26022	7	-26022	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	587	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCAATGCCATCTTCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80099916	80111207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_80100150_80111083
tx.3012	chr11	+	1093	2	ISM	ENSMUSG00000017686.18	ENSMUST00000017831.16	3029	20	46772	0	1190	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGACCTTTTCAAGTATTTA	4883	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80146716	80157593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_80146784_80156567
tx.3013	chr11	-	1400	10	NNC	ENSMUSG00000057181.16	novel	4554	10	NA	NA	-3	340	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	30.825674724525	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTTCACCAGGTCCTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80268844	80254464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_80254845_80255661_80255766_80258887_80259025_80259353_80259419_80261156_80261277_80264465_80264518_80264885_80265044_80266332_80266459_80267628_80267710_80268667
tx.3014	chr11	+	2220	12	FSM	ENSMUSG00000017421.19	ENSMUST00000053740.15	1562	12	-78	-580	-12	-99	multi-exon	FALSE	canonical	3	261	junction_9	283.951136525079	257	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTTTTTATTCATAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80274144	80286972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_80274322_80276728_80276856_80278627_80278767_80279803_80279972_80280080_80280157_80280599_80280648_80282156_80282228_80282660_80282819_80283909_80284003_80285111_80285358_80285927_80286088_80286215
tx.3015	chr11	+	2144	11	FSM	ENSMUSG00000017421.19	ENSMUST00000017567.14	2245	11	16	85	-12	-82	multi-exon	FALSE	canonical	3	695	junction_8	108.208317610062	651	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGCTGTGGACCACTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80274144	80286989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_80274322_80276728_80276856_80278627_80278767_80279803_80279972_80280080_80280157_80280599_80280648_80282156_80282228_80282660_80282819_80285111_80285358_80285927_80286088_80286215
tx.3016	chr11	+	1048	3	ISM	ENSMUSG00000017421.19	ENSMUST00000017567.14	2245	11	11098	102	5270	-99	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	852	junction_1	101.5	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTTTTTATTCATAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80285226	80286972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_80285358_80285927_80286088_80286215
tx.3017	chr11	+	1565	14	FSM	ENSMUSG00000017428.17	ENSMUST00000017572.14	2848	14	1	1282	1	57	multi-exon	FALSE	canonical	3	918	junction_5	68.6804624122448	2747	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAAAGCTGTGCTCTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80319451	80362792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_80319582_80322530_80322633_80329076_80329202_80336067_80336140_80336739_80336798_80347065_80347261_80351421_80351567_80353436_80353498_80355839_80355903_80360627_80360754_80361208_80361245_80361451_80361504_80362277_80362421_80362535
tx.3018	chr11	+	1680	13	FSM	ENSMUSG00000017428.17	ENSMUST00000173938.8	1626	13	3	-57	1	57	multi-exon	FALSE	canonical	3	918	junction_5	64.9491253897148	393	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAAAGCTGTGCTCTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80319451	80362792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_80319582_80322530_80322633_80329076_80329202_80336067_80336140_80336739_80336798_80347065_80347261_80351421_80351567_80353436_80353498_80355839_80355903_80360627_80360754_80361208_80361245_80361451_80361504_80362277
tx.3019	chr11	+	389	2	ISM	ENSMUSG00000017428.17	ENSMUST00000148895.9	796	8	15095	-91	8848	57	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	930	junction_1	0	1045	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAAAGCTGTGCTCTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80362288	80362792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_80362421_80362535
tx.302	chr1	-	1639	13	FSM	ENSMUSG00000026019.16	ENSMUST00000027173.15	10012	13	15	8358	15	-1275	multi-exon	FALSE	canonical	3	863	junction_12	56.5618515923547	3327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCTTGTTGGGTCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60137052	60117301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_60117401_60119677_60119751_60121195_60121329_60121449_60121556_60121667_60121809_60122913_60123000_60124869_60124916_60126204_60126360_60127199_60127316_60128410_60128518_60130178_60130274_60133590_60133686_60136665
tx.3020	chr11	+	1449	7	FSM	ENSMUSG00000035413.9	ENSMUST00000040865.9	1633	7	191	-7	191	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	3.67045259092421	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACCGAGTCAAGTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80701191	80712866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_80701286_80703331_80703516_80705044_80705177_80706491_80706526_80708328_80708445_80710755_80710816_80712037
tx.3021	chr11	+	276	2	ISM	ENSMUSG00000035413.9	ENSMUST00000040865.9	1633	7	191	9346	191	-9346	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGTGAGTAGACTGTGATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80701191	80703513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_80701286_80703331
tx.3022	chr11	+	1350	6	ISM	ENSMUSG00000035413.9	ENSMUST00000040865.9	1633	7	2329	0	2329	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	2.65329983228432	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTAGTTACCGAGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80703329	80712859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_80703516_80705044_80705177_80706491_80706526_80708328_80708445_80710755_80710816_80712037
tx.3023	chr11	+	643	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020704.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAAGGATTGTGTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81132340	81133202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_81132468_81132686
tx.3024	chr11	-	708	5	ISM	ENSMUSG00000020698.12	ENSMUST00000021040.10	1787	14	24	34345	24	-34345	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_4	0.82915619758885	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGTGTGCACGTGACTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82655108	82644420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_82644564_82645787_82645962_82651175_82651311_82653013_82653078_82654916
tx.3025	chr11	-	638	3	NNC	ENSMUSG00000085175.8	novel	686	3	NA	NA	-69	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGTTCATTATGTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82671937	82670426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_82670762_82670960_82671125_82671798
tx.3026	chr11	+	1769	7	NNC	ENSMUSG00000020697.17	novel	1785	7	NA	NA	16	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	69.197784164909	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTATTTGTGGCTCCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82671983	82681132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_82672103_82674171_82674726_82676140_82676285_82678453_82678655_82679589_82679742_82680430_82680540_82680642
tx.3027	chr11	-	1600	6	NIC	ENSMUSG00000020696.19	novel	1719	6	NA	NA	20	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	66	junction_3	39.9769933836951	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGTGTGTTAATGTATC	2763	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82762016	82696432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_82697016_82699338_82699363_82700833_82701045_82703225_82703637_82709241_82709430_82761833
tx.3028	chr11	-	571	3	NNC	ENSMUSG00000020696.19	novel	3489	7	NA	NA	36	-24043	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	10.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTCACCAGGCAAATCTT	2779	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82762000	82727537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_82727798_82736577_82736722_82761833
tx.3029	chr11	-	430	2	NNC	ENSMUSG00000020696.19	novel	3489	7	NA	NA	33	-24043	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTTCACCAGGCAAATCTT	2776	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82762003	82727537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_82727798_82761833
tx.303	chr1	-	1506	14	FSM	ENSMUSG00000026019.16	ENSMUST00000117438.8	3251	14	470	1275	-29	-1275	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_13	218.809771208535	1131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCCTTGTTGGGTCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60137334	60117301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_60117401_60119677_60119751_60121195_60121329_60121449_60121556_60121667_60121809_60122913_60123000_60124869_60124916_60126204_60126360_60127199_60127316_60128410_60128518_60130178_60130274_60133590_60133686_60136665_60136887_60137301
tx.3030	chr11	-	2231	10	FSM	ENSMUSG00000018841.18	ENSMUST00000018985.15	3426	10	0	1195	0	843	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_4	12.9099444873581	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTTACCAACACTGTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82781440	82768719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_82769850_82770010_82770179_82772426_82772498_82772596_82772688_82773712_82773809_82774318_82774454_82774708_82774791_82780517_82780637_82780795_82780858_82781163
tx.3031	chr11	-	1752	13	FSM	ENSMUSG00000020692.15	ENSMUST00000103213.10	1783	13	29	2	29	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	193	junction_4	34.6180548590215	179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTTGCAGCTTCTTGTTC	8332	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82799208	82791595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_82791877_82792382_82792454_82792534_82792695_82793820_82794024_82794915_82794963_82795065_82795202_82795617_82795811_82796103_82796202_82796332_82796410_82797250_82797331_82798378_82798597_82798917_82799062_82799164
tx.3032	chr11	-	1709	12	ISM	ENSMUSG00000020692.15	ENSMUST00000103213.10	1783	13	175	2	106	-2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	193	junction_4	34.670825137318	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTTGCAGCTTCTTGTTC	8478	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82799062	82791595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_82791877_82792382_82792454_82792534_82792695_82793820_82794024_82794915_82794963_82795065_82795202_82795617_82795811_82796103_82796202_82796332_82796410_82797250_82797331_82798378_82798597_82798917
tx.3033	chr11	-	1758	12	NNC	ENSMUSG00000020692.15	novel	1783	13	NA	NA	28	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	77.987708291936	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTTGCAGCTTCTTGTTC	8331	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82799209	82791595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_82791877_82792382_82792454_82792534_82792695_82793820_82794024_82795013_82795202_82795617_82795811_82796103_82796202_82796332_82796410_82797250_82797331_82798378_82798597_82798917_82799062_82799164
tx.3034	chr11	-	1225	3	ISM	ENSMUSG00000020692.15	ENSMUST00000103213.10	1783	13	24	5971	24	-1817	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	212	junction_2	51	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACACATACAAAGTGGATGG	8327	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82799213	82797564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_82798597_82798917_82799062_82799164
tx.3035	chr11	-	864	2	ISM	ENSMUSG00000069793.13	ENSMUST00000138797.2	2128	5	2	5655	2	-5655	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATATGAAAGACATAATTCC	8622	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82881961	82878464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_82879135_82881767
tx.3036	chr11	-	1320	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082419.4	novel	498	1	NA	NA	-8950	62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	172	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGAAATGTAGGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82927773	82918263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_82918856_82927045
tx.3037	chr11	+	2017	4	FSM	ENSMUSG00000018986.11	ENSMUST00000214041.2	1966	4	-37	-14	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	4.49691252107735	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGGCACAATGATGTTTC	3760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83082121	83105980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_83082235_83084868_83085036_83103369_83104440_83105313
tx.3038	chr11	+	1421	4	FSM	ENSMUSG00000087107.9	ENSMUST00000143673.2	1428	4	-14	21	-14	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6.23609564462324	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGCCTTGCTCCTACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83114387	83117409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_83114478_83115035_83115137_83115277_83115458_83116359
tx.3039	chr11	+	1231	2	ISM	ENSMUSG00000087107.9	ENSMUST00000143673.2	1428	4	874	22	301	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGAGCCTTGCTCCTACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83115275	83117408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_83115458_83116359
tx.304	chr1	+	996	8	NIC	ENSMUSG00000026017.14	novel	2763	18	NA	NA	5	6204	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_3	2.54750778573243	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCCAATTAGTTTATGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60137427	60171340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_60137467_60144469_60144587_60147241_60147360_60148485_60148609_60164009_60164071_60165078_60165194_60167147_60167233_60171002
tx.3040	chr11	+	376	3	FSM	ENSMUSG00000093483.2	ENSMUST00000176545.2	356	3	-18	-2	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	166	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTTGTTTGGGTAAGATC	5851	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83182527	83185460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_83182660_83182799_83182924_83185340
tx.3041	chr11	+	512	2	FSM	ENSMUSG00000093483.2	ENSMUST00000176016.2	471	2	-39	-2	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	381	junction_1	0	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTATTTGTTTGGGTAAGA	5853	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83182529	83185458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_83182924_83185340
tx.3042	chr11	-	2157	3	FSM	ENSMUSG00000018733.11	ENSMUST00000176518.2	2501	3	342	2	340	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_2	7.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACCATTGACTTCTTGAAG	2813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83189381	83185903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_83187267_83188313_83188868_83189141
tx.3043	chr11	-	2390	4	FSM	ENSMUSG00000018733.11	ENSMUST00000108146.8	2389	4	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	16.4991582276861	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGACTTCTTGAAGTTTT	2426	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83189768	83185899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_83187267_83188313_83188868_83189141_83189380_83189537
tx.3044	chr11	-	2269	4	FSM	ENSMUSG00000018733.11	ENSMUST00000018877.9	2729	4	28	432	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_3	22.7596133534821	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGACTTCTTGAAGTTTT	2419	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83189775	83185899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_83187267_83188313_83188868_83189141_83189380_83189665
tx.3045	chr11	-	2212	4	NIC	ENSMUSG00000018733.11	novel	2389	4	NA	NA	-7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	26.8700576850888	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTGACTTCTTGAAGTTT	2403	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83189791	83185900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_83187267_83188313_83188868_83189141_83189380_83189737
tx.3046	chr11	+	618	5	ISM	ENSMUSG00000035152.15	ENSMUST00000132178.3	3576	12	-28	19917	-28	8148	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_1	19.4807597387782	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGCAAAACTCCATGATAT	2151	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83193500	83215489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_83193664_83199040_83199101_83207245_83207352_83212764_83212901_83215336
tx.3047	chr11	+	2052	16	FSM	ENSMUSG00000020680.16	ENSMUST00000021018.11	2068	16	16	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_5	25.2651714597168	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGAGTGCATTATTTGTC	8676	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83363933	83397569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_83364033_83372759_83372800_83375476_83375529_83375635_83375721_83375802_83375906_83378048_83378240_83379750_83379872_83388087_83388123_83388719_83388753_83389898_83390009_83391940_83392071_83393585_83393679_83395071_83395154_83395253_83395343_83395467_83395931_83397243
tx.3048	chr11	+	893	7	FSM	ENSMUSG00000020680.16	ENSMUST00000134185.8	881	7	6	-18	0	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_5	8.74960316560446	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTATATTGATTATATTATA	8660	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83363917	83380057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_83364033_83372759_83372800_83375476_83375529_83375635_83375721_83375802_83375906_83378048_83378240_83379750
tx.3049	chr11	+	681	2	ISM	ENSMUSG00000020680.16	ENSMUST00000133170.2	1260	11	15723	0	15723	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_1	0	318	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGAGTGCATTATTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83395575	83397569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_83395931_83397243
tx.305	chr1	+	1003	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082609.2	novel	431	1	NA	NA	-20	85861	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTAATTTTCTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60156393	60242705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_60156914_60242222
tx.3050	chr11	-	822	2	Intergenic	novelGene_188	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	687	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGGCCATGGTGGCATTT	4754	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83458255	83454494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_83455094_83458032
tx.3051	chr11	-	894	3	Intergenic	novelGene_189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50	543	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGGCCATGGTGGCATT	4748	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83458261	83454495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_83455094_83457579_83457647_83458032
tx.3052	chr11	-	1082	4	NNC	ENSMUSG00000019122.9	novel	3006	4	NA	NA	-3699	660	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	44	junction_3	12.9614813968157	129	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTGTCTGCCTCTTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83473161	83465483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_83466322_83466668_83466778_83467200_83467273_83473098
tx.3053	chr11	-	693	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000976.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	39	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	4569	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83644788	83643916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_83644015_83644193
tx.3054	chr11	-	347	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000976.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	4569	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83644788	83643916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_83644015_83644539
tx.3055	chr11	-	411	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000000976.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	4551	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83644806	83643916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_83644015_83644193_83644240_83644539
tx.3056	chr11	+	1678	13	ISM	ENSMUSG00000020677.8	ENSMUST00000049257.8	3194	15	90	5551	90	5376	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	267	junction_7	31.5527556465182	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATGCATCTAAACTTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83832977	83848363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_83833091_83834068_83834268_83835361_83835496_83836930_83837117_83839270_83839415_83840408_83840521_83842115_83842189_83842937_83843142_83844052_83844144_83845906_83846030_83846114_83846266_83846797_83846874_83848291
tx.3057	chr11	+	2200	15	FSM	ENSMUSG00000020677.8	ENSMUST00000049257.8	3194	15	96	898	96	-898	multi-exon	FALSE	canonical	3	267	junction_7	30.0713437392763	244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACTTGTGTGTATGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83832983	83853016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_83833091_83834068_83834268_83835361_83835496_83836930_83837117_83839270_83839415_83840408_83840521_83842115_83842189_83842937_83843142_83844052_83844144_83845906_83846030_83846114_83846266_83846797_83846874_83848291_83848364_83850272_83850360_83852575
tx.3058	chr11	+	802	2	ISM	ENSMUSG00000020677.8	ENSMUST00000049257.8	3194	15	96	19151	96	-8224	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	353	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CAAAAAAAATCAATTAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83832983	83834763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_83833091_83834068
tx.3059	chr11	-	1451	3	FSM	ENSMUSG00000018648.16	ENSMUST00000100705.11	1447	3	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_2	13.5	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTTTATTAATCATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83959187	83938866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_83940137_83941657_83941747_83959095
tx.306	chr1	+	720	5	ISM	ENSMUSG00000073664.12	ENSMUST00000160834.8	15731	55	-5	138142	-5	14288	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_2	5.58457697592217	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGGTGTGAATACATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60219752	60239345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_60219845_60220621_60220914_60233662_60233755_60234173_60234336_60239263
tx.3060	chr11	-	1487	3	FSM	ENSMUSG00000018648.16	ENSMUST00000164891.8	1454	3	-29	-4	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	42	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTTTATTAATCATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83959434	83938866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_83940137_83941657_83941747_83959306
tx.3061	chr11	-	1284	6	ISM	ENSMUSG00000018651.15	ENSMUST00000141852.2	891	8	3203	-716	-3139	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	510	junction_4	23.6169430706008	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGGGTGTGTCAGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83981477	83969745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_83970604_83972863_83972938_83975539_83975584_83976464_83976598_83977936_83978009_83981374
tx.3062	chr11	-	2152	16	FSM	ENSMUSG00000018651.15	ENSMUST00000018795.13	2151	16	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	409	junction_10	48.5691259958423	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGGGTGTGTCAGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84020427	83969745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_83970604_83972863_83972938_83975539_83975584_83976464_83976598_83977936_83978009_83981374_83981486_83982801_83982846_83984409_83984474_83993878_83993952_83995017_83995107_83997014_83997173_84000779_84000872_84009073_84009134_84011907_84012015_84017813_84017922_84020362
tx.3063	chr11	-	817	9	ISM	ENSMUSG00000018651.15	ENSMUST00000018795.13	2151	16	-1	14663	-1	-8152	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	409	junction_3	60.9045103009621	288	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTGTGGGAAAGCCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84020427	83984408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_83984474_83993878_83993952_83995017_83995107_83997014_83997173_84000779_84000872_84009073_84009134_84011907_84012015_84017813_84017922_84020362
tx.3064	chr11	-	1815	13	FSM	ENSMUSG00000018697.15	ENSMUST00000018841.3	1822	13	0	7	0	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	481	junction_8	26.3136793744665	364	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTTGTCACTGTCTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84404348	84313687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_84313846_84333391_84333464_84336452_84336534_84339945_84340014_84358286_84358371_84361389_84361555_84361913_84362113_84363877_84363993_84400484_84400623_84401024_84401244_84402308_84402405_84402966_84403156_84404117
tx.3065	chr11	-	310	3	ISM	ENSMUSG00000018697.15	ENSMUST00000127042.8	1009	9	45842	-19	3825	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	482	junction_2	14	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATCTGTTGTCACTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84336534	84313689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_84313846_84333391_84333464_84336452
tx.3066	chr11	-	1855	4	ISM	ENSMUSG00000018405.8	ENSMUST00000018549.8	2477	5	765	0	-16	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_1	8.65383665716478	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCTGGAGTTGATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84709576	84703886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_84705338_84705514_84705635_84705733_84705867_84709425
tx.3067	chr11	-	2491	5	FSM	ENSMUSG00000018405.8	ENSMUST00000018549.8	2477	5	-14	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	44.51404272811	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCTGGAGTTGATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84710355	84703886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_84705338_84705514_84705635_84705733_84705867_84709425_84709520_84709662
tx.3068	chr11	-	1451	7	FSM	ENSMUSG00000034449.8	ENSMUST00000047560.8	1254	7	-65	-132	-35	132	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_6	7.19760762722973	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCTTCAGAAGTATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84719855	84711549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_84712128_84712228_84712295_84712490_84712584_84713136_84713267_84713897_84713993_84716193_84716404_84719576
tx.3069	chr11	-	1403	7	NIC	ENSMUSG00000034449.8	novel	1254	7	NA	NA	-45	130	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_6	15.7585955380971	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTACCTTCAGAAGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84719865	84711551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_84712128_84712228_84712295_84712490_84712584_84713136_84713267_84713897_84713993_84716193_84716348_84719576
tx.307	chr1	+	300	2	ISM	ENSMUSG00000073664.12	ENSMUST00000160834.8	15731	55	-12	156665	-12	-4235	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTGAGGAAATATTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60219745	60220822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_60219845_60220621
tx.3070	chr11	-	2671	13	FSM	ENSMUSG00000020530.15	ENSMUST00000154915.9	2528	13	81	-224	81	-221	multi-exon	FALSE	canonical	3	231	junction_7	87.5523256242929	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTAGAATGTGGTGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84760947	84723407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_84724040_84725160_84725410_84727190_84727340_84727424_84727551_84728666_84728815_84730806_84731002_84731086_84731262_84732246_84732451_84744879_84744994_84749265_84749365_84751370_84751625_84753063_84753145_84760702
tx.3071	chr11	-	1771	11	ISM	ENSMUSG00000020530.15	ENSMUST00000154915.9	2528	13	64	3595	64	20	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	231	junction_5	95.5680385903153	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAAAAGCAAGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84760964	84727226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_84727340_84727424_84727551_84728666_84728815_84730806_84731002_84731086_84731262_84732246_84732451_84744879_84744994_84749265_84749365_84751370_84751625_84753063_84753145_84760702
tx.3072	chr11	-	1505	6	NIC	ENSMUSG00000020530.15	novel	386	4	NA	NA	74	550	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	79	junction_1	192.335748107314	302	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTCTGTTTTGTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84760954	84742657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_84743363_84744879_84744994_84749265_84749365_84751370_84751625_84753063_84753145_84760702
tx.3073	chr11	-	851	5	NNC	ENSMUSG00000020530.15	novel	386	4	NA	NA	110	2796	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	40	junction_1	230.740519848595	249	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAATATCTCAGTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84760918	84748748	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_84748950_84749265_84749365_84751370_84751625_84753063_84753145_84760702
tx.3074	chr11	-	1129	4	ISM	ENSMUSG00000020530.15	ENSMUST00000154915.9	2528	13	123	25142	123	2771	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	526	junction_2	34.7019051670398	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGTGATATAAAACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84760905	84748773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_84749365_84751370_84751625_84753063_84753145_84760702
tx.3075	chr11	+	743	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020530.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATCTTAAGGACAGATCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84760608	84762458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_84760923_84762029
tx.3076	chr11	+	618	2	Intergenic	novelGene_190	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTAAGGACAGATCGAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84761719	84762462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_84761905_84762029
tx.3077	chr11	-	989	5	FSM	ENSMUSG00000020526.13	ENSMUST00000103195.5	998	5	7	2	7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	360	junction_2	22.0609949911603	1385	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTATTGTTCCCTTAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84807185	84801777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_84802475_84804047_84804129_84805036_84805112_84806924_84806957_84807081
tx.3078	chr11	+	1111	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000082806.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATTCTAGAAAAAGAATGA	5441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84963267	85002666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_84963885_85002172
tx.3079	chr11	-	957	5	ISM	ENSMUSG00000000804.15	ENSMUST00000108075.9	7053	34	72	92635	2	4099	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_2	6.41774882649672	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTTGCTGCAGATTACC	7557	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85030792	84967902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_84968251_84971956_84972076_84974614_84974721_84994724_84994853_85030536
tx.308	chr1	+	715	5	ISM	ENSMUSG00000073664.12	ENSMUST00000160834.8	15731	55	0	138142	0	14288	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_2	5.58457697592217	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGGTGTGAATACATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60219757	60239345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_60219845_60220621_60220914_60233662_60233755_60234173_60234336_60239263
tx.3080	chr11	+	561	3	NNC	ENSMUSG00000018479.13	novel	687	5	NA	NA	6912	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.5	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGTGGTACTTTACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85068833	85071973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_85068937_85069082_85069279_85071711
tx.3081	chr11	+	544	3	NNC	ENSMUSG00000018479.13	novel	687	5	NA	NA	6901	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTACTTTACTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85068822	85071975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_85068907_85069082_85069279_85071711
tx.3082	chr11	-	1024	4	ISM	ENSMUSG00000018481.10	ENSMUST00000018625.10	6463	13	36990	4046	36990	-4046	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	375	junction_2	22.2311093340441	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTGCATTCTTATTATGT	5158	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85088966	85082133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_85082726_85085400_85085567_85086891_85087083_85088891
tx.3083	chr11	-	2165	13	FSM	ENSMUSG00000018481.10	ENSMUST00000018625.10	6463	13	252	4046	252	-4046	multi-exon	TRUE	canonical	3	360	junction_12	22.6180544894756	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTGCATTCTTATTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85125704	85082133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_85082726_85085400_85085567_85086891_85087083_85088891_85088978_85091119_85091245_85092241_85092348_85092428_85092497_85095059_85095150_85100765_85100935_85105061_85105186_85105935_85106088_85107261_85107351_85125497
tx.3085	chr11	+	1462	3	NIC	ENSMUSG00000085628.5	novel	635	4	NA	NA	4	939	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_2	1.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAGTTGCTCCATGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85126000	85130069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_85126159_85128236_85128341_85128869
tx.3086	chr11	-	644	4	NIC	ENSMUSG00000034329.17	novel	507	5	NA	NA	5	188	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	5	junction_1	49.0328687945364	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATTTCTGATCTGTCCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86091985	86085670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_86085994_86088694_86088807_86089697_86089821_86091899
tx.3087	chr11	-	631	4	NIC	ENSMUSG00000034329.17	novel	507	5	NA	NA	12	188	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	5	junction_1	45.365184888855	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATTTCTGATCTGTCCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86092007	86085670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_86085994_86088694_86088807_86089697_86089821_86091934
tx.3088	chr11	+	2794	2	FSM	ENSMUSG00000085208.4	ENSMUST00000128960.2	4423	2	-16	1645	-16	-1645	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCCGTCTCTGTTTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86092179	86100373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_86092379_86097778
tx.3089	chr11	+	706	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000064526.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTTAATAAGATCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86327230	86336346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_86327286_86334656_86334737_86335775
tx.309	chr1	+	2228	13	FSM	ENSMUSG00000049439.14	ENSMUST00000060608.13	2223	13	-5	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_1	9.38083151964686	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGAGGATTGTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60382476	60427219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_60382617_60391279_60391330_60392067_60392235_60393672_60393816_60402348_60402517_60405807_60405887_60410379_60410496_60411748_60411804_60415225_60415347_60418532_60418645_60421562_60421628_60426063_60426154_60426297
tx.3090	chr11	+	755	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000064526.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATAAGTAGCAAGCAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86327234	86336330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_86327286_86334656_86334806_86335775
tx.3091	chr11	+	1970	9	FSM	ENSMUSG00000020521.8	ENSMUST00000020827.7	4452	9	5	2477	5	-2477	multi-exon	TRUE	canonical	3	265	junction_2	21.9146070008111	666	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGTGGACCTGTTATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86375487	86387374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_86375626_86376886_86377332_86377481_86377559_86379892_86379994_86381183_86381338_86382504_86382664_86383986_86384053_86386053_86386156_86386646
tx.3092	chr11	+	809	2	ISM	ENSMUSG00000020521.8	ENSMUST00000020827.7	4452	9	10592	2477	10519	-2477	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	303	junction_1	0	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGTGGACCTGTTATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86386074	86387374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_86386156_86386646
tx.3093	chr11	-	2336	15	FSM	ENSMUSG00000020516.16	ENSMUST00000154617.8	5531	15	33	3162	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	211	junction_9	22.8179351227342	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACAGCTGTGGCTTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86435598	86392858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_86393789_86395091_86395205_86397616_86397725_86402414_86402493_86402650_86402714_86403631_86403740_86404125_86404217_86404372_86404464_86406916_86407018_86408408_86408467_86410717_86410866_86423597_86423667_86424851_86424973_86426236_86426287_86435391
tx.3094	chr11	+	1947	9	FSM	ENSMUSG00000020513.16	ENSMUST00000069503.13	1871	9	-36	-40	-36	40	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	8.83087623059003	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCAGGTGCTCTGTCCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86435780	86458226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_86436057_86439608_86439829_86440149_86440298_86443613_86443831_86445898_86446131_86448550_86448716_86452061_86452203_86456510_86456695_86457862
tx.3095	chr11	-	1192	6	NNC	ENSMUSG00000018171.10	novel	2787	12	NA	NA	-19022	237	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	66	junction_5	277.055517902098	345	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTCCGTTTTCTTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86512143	86475518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_86476278_86477321_86477425_86492833_86492896_86498001_86498119_86502167_86502249_86512073
tx.3096	chr11	-	1959	12	FSM	ENSMUSG00000018171.10	ENSMUST00000018315.10	2787	12	0	828	0	237	multi-exon	FALSE	canonical	3	615	junction_5	55.9317766244166	1172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTCCGTTTTCTTTAGT	9872	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86574662	86475518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_86476278_86477321_86477425_86492833_86492896_86498001_86498119_86502167_86502249_86526000_86526133_86534323_86534492_86551948_86552060_86554308_86554400_86555479_86555616_86556602_86556705_86574565
tx.3097	chr11	+	711	2	FSM	ENSMUSG00000072582.10	ENSMUST00000108022.8	3038	2	60	2267	60	-2267	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_1	0	3661	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTTCCCATGTTCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86574870	86581016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_86574950_86580384
tx.3098	chr11	-	2070	8	ISM	ENSMUSG00000047126.18	ENSMUST00000060766.16	6163	32	52692	-2	-1112	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1101	junction_5	59.7583569426887	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTAGAATTGCAGTTTTA	6731	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86595635	86585478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_86586517_86588090_86588167_86593034_86593257_86593426_86593598_86594489_86594601_86594696_86594829_86594905_86595056_86595465
tx.3099	chr11	-	2128	9	ISM	ENSMUSG00000047126.18	ENSMUST00000060766.16	6163	32	52554	-2	-1250	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1101	junction_5	58.1741727487379	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTAGAATTGCAGTTTTA	6593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86595773	86585478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_86586517_86588090_86588167_86593034_86593257_86593426_86593598_86594489_86594601_86594696_86594829_86594905_86595056_86595465_86595634_86595713
tx.31	chr1	+	1376	10	NNC	ENSMUSG00000046101.17	novel	2553	15	NA	NA	0	4	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	7	junction_9	8.26116902019605	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTATTTTTTGTTGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9978862	9992754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_9978916_9981899_9982038_9982134_9982266_9982338_9982399_9985698_9985895_9986540_9986664_9986774_9986880_9989244_9989371_9990659_9990898_9992548
tx.310	chr1	+	1824	10	ISM	ENSMUSG00000049439.14	ENSMUST00000060608.13	2223	13	11238	0	11238	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	8.62525719781127	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGAGGATTGTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60393719	60427219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_60393816_60402348_60402517_60405807_60405887_60410379_60410496_60411748_60411804_60415225_60415347_60418532_60418645_60421562_60421628_60426063_60426154_60426297
tx.3100	chr11	-	527	2	ISM	ENSMUSG00000047126.18	ENSMUST00000060766.16	6163	32	-65	42416	-1	-12873	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	828	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATAAAGGATTGTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86648392	86627896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_86628105_86648073
tx.3101	chr11	-	1540	9	ISM	ENSMUSG00000018425.19	ENSMUST00000018569.14	3813	18	18410	903	-57	-903	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_4	22.7252612746256	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTCAAGGCCTTCTTAT	8620	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86680162	86660574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_86661088_86661855_86662085_86662719_86662790_86664629_86664725_86666485_86666595_86667440_86667556_86675704_86675863_86676582_86676664_86679992
tx.3102	chr11	-	2787	18	FSM	ENSMUSG00000018425.19	ENSMUST00000018569.14	3813	18	127	899	127	-899	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_4	18.4312056730034	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAAGGCCTTCTTATTGCT	8654	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86698445	86660570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_86661088_86661855_86662085_86662719_86662790_86664629_86664725_86666485_86666595_86667440_86667556_86675704_86675863_86676582_86676664_86679992_86680176_86680311_86680399_86683987_86684088_86688448_86688581_86689747_86689815_86690245_86690474_86691794_86691915_86695082_86695229_86697285_86697454_86698263
tx.3103	chr11	-	1222	5	FSM	ENSMUSG00000018427.9	ENSMUST00000018571.5	4847	5	-45	3670	-45	504	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	6.94172168845741	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCTCGTGGCTTTTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86884578	86830920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_86831515_86835398_86835508_86836758_86836803_86862634_86862949_86884417
tx.3104	chr11	-	2368	10	FSM	ENSMUSG00000061666.7	ENSMUST00000020804.8	2336	10	-35	3	-35	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_6	8.73053390247253	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATGCTTGTGATTCCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86964923	86924695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_86926122_86926417_86926470_86928656_86928717_86932613_86932748_86935952_86936043_86936581_86936701_86947617_86947664_86950250_86950387_86954724_86954768_86964661
tx.3105	chr11	-	1040	2	ISM	ENSMUSG00000020495.14	ENSMUST00000020801.14	3218	4	5984	4	4592	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATACTTGGTATCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86971616	86968561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_86968977_86970991
tx.3106	chr11	-	3215	4	FSM	ENSMUSG00000020495.14	ENSMUST00000020801.14	3218	4	1	2	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_2	5.65685424949238	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATACTTGGTATCTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86977599	86968559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_86968977_86970991_86971865_86974425_86974572_86975820
tx.3107	chr11	-	746	5	ISM	ENSMUSG00000020493.9	ENSMUST00000051395.9	3824	10	-69	12291	-69	-12291	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	3.67423461417477	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTCCACCACCTTTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86999603	86992269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_86992472_86994012_86994136_86994365_86994517_86996834_86996968_86999466
tx.3108	chr11	+	758	4	FSM	ENSMUSG00000020492.12	ENSMUST00000020794.6	3037	4	24	2255	7	273	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_1	6.12825877028341	1124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCAGGTGTTGTTTGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87000083	87013206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_87000131_87006929_87007017_87008493_87008671_87012759
tx.3109	chr11	+	671	4	ISM	ENSMUSG00000018548.16	ENSMUST00000041282.13	5632	24	-2	80091	-2	-8725	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	425	junction_2	42.4290257043716	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAGACAAGTGCGTAGTTC	1914	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87017900	87031418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_87018321_87020541_87020644_87028415_87028457_87031310
tx.311	chr1	+	1230	5	ISM	ENSMUSG00000049439.14	ENSMUST00000060608.13	2223	13	32824	0	32824	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_2	7.22409163839994	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGAGGATTGTTTTGTTT	5518	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60415305	60427219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_60415347_60418532_60418645_60421562_60421628_60426063_60426154_60426297
tx.3110	chr11	+	884	6	ISM	ENSMUSG00000018548.16	ENSMUST00000041282.13	5632	24	3	75099	3	-3733	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	425	junction_2	41.6432467514242	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTAAGATTACTGTTACAT	1919	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87017905	87036410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_87018321_87020541_87020644_87028415_87028457_87031310_87031428_87033952_87034041_87036289
tx.3111	chr11	+	3460	25	NNC	ENSMUSG00000018548.16	novel	5632	24	NA	NA	101	30189	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	225	junction_24	67.5794671109502	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTTTTGTCATAATTTGT	2017	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87018003	87141698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_87018321_87020541_87020644_87028415_87028457_87031310_87031428_87033952_87034041_87036289_87036413_87037759_87037884_87040121_87040190_87050646_87050772_87054644_87054696_87057427_87057510_87058265_87058343_87068674_87068855_87073246_87073362_87075709_87075929_87077204_87077342_87080899_87080986_87087646_87087842_87092143_87092453_87096758_87096882_87097589_87097780_87100594_87100714_87107262_87107374_87109077_87109157_87141416
tx.3112	chr11	+	651	5	ISM	ENSMUSG00000018548.16	ENSMUST00000041282.13	5632	24	111	77473	111	-6107	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	425	junction_2	42.7960278530613	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGGTGAGCAGAACAAATG	2027	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87018013	87034036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_87018321_87020541_87020644_87028415_87028457_87031310_87031428_87033952
tx.3113	chr11	-	1517	7	ISM	ENSMUSG00000007646.14	ENSMUST00000007790.11	1632	9	3438	-544	2907	38	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_1	13.4618803375391	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTGTATATGTATCTGT	1712	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87292342	87269378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_87270314_87271657_87271719_87279444_87279506_87280659_87280727_87286091_87286224_87288449_87288584_87292215
tx.3114	chr11	-	2021	9	FSM	ENSMUSG00000007646.14	ENSMUST00000067692.13	3944	9	15	1908	-2	38	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_1	12.5940213990607	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTGTATATGTATCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87295334	87269378	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_87270314_87271657_87271719_87279444_87279506_87280659_87280727_87286091_87286224_87288449_87288584_87292215_87292383_87293423_87293683_87295129
tx.3115	chr11	+	964	2	ISM	ENSMUSG00000010342.17	ENSMUST00000060835.12	4763	31	-10	121167	-10	-50110	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTAGAGAAGTAGAGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87295880	87325482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_87295997_87324634
tx.3116	chr11	+	1523	3	NNC	ENSMUSG00000010342.17	novel	4763	31	NA	NA	2	-21627	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	37.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGTCACTCATCCTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87295892	87353965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_87295997_87324634_87324772_87352683
tx.3117	chr11	-	830	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000010342.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAAAAGAAATGATTCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87344394	87343347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_87343868_87344084
tx.3118	chr11	-	597	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000010342.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.94392028877595	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGTCTTAGCTGCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87373927	87368782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_87369013_87370717_87370815_87373550_87373748_87373854
tx.3119	chr11	-	688	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000010342.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGTTTTCGTGTCGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87378983	87376689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_87377295_87378900
tx.312	chr1	+	708	2	FSM	ENSMUSG00000026782.16	ENSMUST00000189649.2	362	2	-193	-153	-4	153	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGGATTTTATTAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60448773	60473804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_60449079_60473401
tx.3120	chr11	+	1342	11	NIC	ENSMUSG00000020486.20	novel	1678	12	NA	NA	-7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGGTGTCTCTGTATTTT	6975	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87469265	87481365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_87469364_87474746_87474841_87475224_87475312_87475943_87476068_87479543_87479679_87479793_87479912_87480000_87480103_87480293_87480391_87480481_87480645_87480781_87480882_87481141
tx.3121	chr11	+	713	5	FSM	ENSMUSG00000020485.15	ENSMUST00000093955.12	706	5	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	512	junction_3	25.7972866790289	4516	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAAGGGTACTGAGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87628370	87634443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_87628495_87628992_87629100_87633621_87633678_87633883_87633938_87634071
tx.3122	chr11	+	233	2	NNC	ENSMUSG00000084796.2	novel	269	2	NA	NA	-19	-1147	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAGGAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87646383	87646949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_87646440_87646772
tx.3123	chr11	+	2430	18	NNC	ENSMUSG00000034121.13	novel	2194	7	NA	NA	-5032	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	61	junction_1	31.5170080957562	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCTGTGGACTCTCGTTC	1424	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87739008	87754629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_87739055_87744562_87744673_87745803_87745875_87746297_87746454_87747388_87747487_87747633_87747763_87748012_87748118_87748686_87748805_87749428_87749486_87750440_87750484_87750902_87750969_87751539_87751611_87751935_87752006_87752094_87752203_87752810_87752945_87753393_87753477_87753566_87753665_87753762
tx.3124	chr11	+	2499	18	FSM	ENSMUSG00000034121.13	ENSMUST00000038196.7	2499	18	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_1	22.9555008070187	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCTGTGGACTCTCGTTC	6456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87744040	87754629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_87744156_87744562_87744673_87745803_87745875_87746297_87746454_87747388_87747487_87747633_87747763_87748012_87748118_87748686_87748805_87749428_87749486_87750440_87750484_87750902_87750969_87751539_87751611_87751935_87752006_87752094_87752203_87752810_87752945_87753393_87753477_87753566_87753665_87753762
tx.3125	chr11	+	1949	13	ISM	ENSMUSG00000034121.13	ENSMUST00000038196.7	2499	18	3593	0	245	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	152	junction_5	15.9850190282443	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCTGTGGACTCTCGTTC	2434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87747633	87754629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_87747763_87748012_87748118_87748686_87748805_87749428_87749486_87750440_87750484_87750902_87750969_87751539_87751611_87751935_87752006_87752094_87752203_87752810_87752945_87753393_87753477_87753566_87753665_87753762
tx.3126	chr11	-	1752	6	ISM	ENSMUSG00000052234.3	ENSMUST00000049768.4	2689	13	5248	-1	1480	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_4	6.99714227381436	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCCCGCTGTCTCTCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87761114	87754824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_87755231_87755520_87755734_87756230_87756469_87759376_87759548_87760072_87760329_87760646
tx.3127	chr11	-	701	3	FSM	ENSMUSG00000020483.15	ENSMUST00000020775.9	2476	3	37	1738	37	-1108	multi-exon	FALSE	canonical	3	615	junction_2	8	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGTTTAGTTGCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87878322	87872088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_87872397_87874697_87874837_87878068
tx.3128	chr11	-	473	3	NNC	ENSMUSG00000020483.15	novel	2476	3	NA	NA	28	-1108	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_2	300	38	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGTTTAGTTGCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87878331	87872088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_87872397_87874697_87874837_87878305
tx.3129	chr11	-	704	3	NNC	ENSMUSG00000020483.15	novel	2443	3	NA	NA	-44298	-1108	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	52	junction_2	289.5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGTTTAGTTGCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87922657	87872088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_87872397_87874697_87874837_87922400
tx.313	chr1	-	2084	14	NIC	ENSMUSG00000026014.16	novel	2241	16	NA	NA	52	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	23	junction_1	4.5573271518765	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGTTTTAAAGCTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60605872	60522343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_60522500_60532696_60532840_60534573_60534695_60535383_60535483_60537582_60537694_60538638_60538783_60539713_60539780_60540914_60541037_60541983_60542144_60542676_60542755_60564750_60565260_60566542_60566649_60572445_60572566_60605723
tx.3130	chr11	+	1480	2	FSM	ENSMUSG00000018379.18	ENSMUST00000132983.3	759	2	-279	-442	-279	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	275	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCATGGTTGTCCTTTTTCC	8010	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87939958	87942319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_87940922_87941802
tx.3131	chr11	+	1638	6	NNC	ENSMUSG00000018377.11	novel	4583	6	NA	NA	-13	-5022	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_5	40.4257343779924	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCACTTTTTTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87959091	87970533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_87959260_87963882_87964578_87965487_87965552_87967016_87967201_87969228_87969382_87970159
tx.3132	chr11	+	1995	6	FSM	ENSMUSG00000018377.11	ENSMUST00000018521.11	4583	6	-15	2603	-15	-2603	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_5	9.15641851380768	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATTATTTGTTTTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87959089	87972952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_87959260_87963882_87964578_87965487_87965552_87967016_87967201_87969228_87969382_87972223
tx.3133	chr11	+	1312	5	FSM	ENSMUSG00000023723.18	ENSMUST00000024486.14	1332	5	20	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	245	junction_1	23.6999472573253	690	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGCTCTCTATTTGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88095233	88102333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_88095312_88096014_88096186_88100678_88100757_88100929_88101057_88101475
tx.3134	chr11	+	1398	5	FSM	ENSMUSG00000023723.18	ENSMUST00000118784.8	1404	5	4	2	4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	110.143939915004	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTGGCTCTCTATTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88095240	88102331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_88095407_88096014_88096186_88100678_88100757_88100929_88101057_88101475
tx.3135	chr11	+	1232	4	ISM	ENSMUSG00000023723.18	ENSMUST00000118784.8	1404	5	777	3	744	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	277	junction_2	16.0485374896143	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTTGGCTCTCTATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88096013	88102330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_88096186_88100678_88100757_88100929_88101057_88101475
tx.3136	chr11	-	1104	10	NNC	ENSMUSG00000069769.14	novel	1855	14	NA	NA	-35517	-503	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_9	5.75422550054402	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAAATCTCCCTCAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88516490	88235217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_88235487_88237878_88237952_88239609_88239819_88257610_88257674_88276870_88276946_88285390_88285506_88304733_88304817_88370831_88370881_88480880_88480974_88516415
tx.3137	chr11	-	528	4	ISM	ENSMUSG00000069769.14	ENSMUST00000092794.12	1855	14	351282	561	223328	-561	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_3	5.90668171555645	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTTTGGTTCTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88257645	88235275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_88235487_88237878_88237952_88239609_88239819_88257610
tx.3138	chr11	-	961	10	NNC	ENSMUSG00000069769.14	novel	6436	14	NA	NA	-35486	-561	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_9	5.3356476460191	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTTTGGTTCTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88516459	88235275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_88235487_88237878_88237952_88239609_88239765_88257610_88257674_88276870_88276946_88285390_88285506_88304733_88304817_88370831_88370881_88480880_88480974_88516415
tx.3139	chr11	+	209	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000069769.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCACCACGGCAAGCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88510505	88514253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_88510597_88514135
tx.314	chr1	-	437	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000084799.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTTTCCAGTCCACTGT	336	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63178541	63171322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_63171583_63178364
tx.3140	chr11	-	1360	5	ISM	ENSMUSG00000018428.16	ENSMUST00000107903.8	3721	11	16307	0	6344	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	816	junction_2	63.171888526464	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGAGTCCATTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88726022	88721617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_88722656_88723133_88723197_88723967_88724042_88725487_88725556_88725905
tx.3141	chr11	-	3264	10	ISM	ENSMUSG00000018428.16	ENSMUST00000107903.8	3721	11	5942	0	-1063	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	816	junction_2	51.9631873493743	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGAGTCCATTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88736387	88721617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_88722656_88723133_88723197_88723967_88724042_88725487_88725556_88725905_88726057_88727837_88728016_88729755_88729884_88730450_88730578_88731994_88732129_88735084
tx.3142	chr11	-	3712	11	FSM	ENSMUSG00000018428.16	ENSMUST00000018572.11	3758	11	46	0	46	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	816	junction_2	49.6891336209437	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGAGTCCATTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88755366	88721617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_88722656_88723133_88723197_88723967_88724042_88725487_88725556_88725905_88726057_88727837_88728016_88729755_88729884_88730450_88730578_88731994_88732129_88735084_88736692_88755222
tx.3143	chr11	-	1236	2	ISM	ENSMUSG00000018428.16	ENSMUST00000018572.11	3758	11	65	13963	65	-5783	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	913	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGGACAAGACACCTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88755347	88735580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_88736692_88755222
tx.3144	chr11	-	2048	13	FSM	ENSMUSG00000000278.11	ENSMUST00000000287.9	2097	13	49	0	49	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2404	junction_3	148.297748540638	736	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACGGCTGAAAATTCTGTT	5250	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88846242	88814845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_88815551_88819990_88820155_88821033_88821172_88824273_88824388_88825403_88825498_88826648_88826778_88827839_88827878_88832109_88832183_88834622_88834698_88835200_88835357_88837970_88838061_88843231_88843381_88846119
tx.3145	chr11	-	852	2	FSM	ENSMUSG00000057534.14	ENSMUST00000061938.14	819	2	-33	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGCTCTCGCGTCATACT	6786	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88857776	88855483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_88856100_88857540
tx.3146	chr11	+	1164	3	NNC	ENSMUSG00000033983.15	novel	3120	11	NA	NA	1	-17540	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	527	253	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCCTATTTATTTAGCTT	9432	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88861078	88864240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_88861306_88861723_88861820_88863399
tx.3147	chr11	+	1026	2	NIC	ENSMUSG00000033983.15	novel	3120	11	NA	NA	-7	-17543	intron_retention	FALSE	canonical	3	1774	junction_1	0	1377	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCTTCCTATTTATTTAG	9424	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88861070	88864237	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_88861306_88863446
tx.3148	chr11	-	1098	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000081766.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCTGCTTCCCCATGCTGTC	322	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88864240	88861076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_88861374_88863439
tx.3149	chr11	+	1064	2	NNC	ENSMUSG00000033983.15	novel	3120	11	NA	NA	3	-17540	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCCTATTTATTTAGCTT	9434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88861080	88864240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_88861351_88863446
tx.315	chr1	+	1267	2	Intergenic	novelGene_32	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCT	413	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63178166	63179737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_63178431_63178734
tx.3150	chr11	-	652	3	NNC	ENSMUSG00000085152.2	novel	581	2	NA	NA	-18	256	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.5	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCTAGTATTTTTCCTAT	9021	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88887388	88883609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_88883706_88883908_88884304_88887227
tx.3151	chr11	-	753	2	FSM	ENSMUSG00000085152.2	ENSMUST00000128078.2	581	2	-18	-154	-18	154	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGATTTTTAATTTGTT	9021	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88887388	88883711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_88884304_88887227
tx.3152	chr11	+	2610	9	FSM	ENSMUSG00000000275.17	ENSMUST00000107896.10	5590	9	31	2949	31	-2949	multi-exon	TRUE	canonical	3	172	junction_5	154.213123630902	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCATCTCTTTGGTGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88890232	88908170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_88890909_88895554_88895651_88899944_88900179_88901630_88901800_88904301_88904365_88905992_88906017_88906358_88906458_88906544_88906644_88907020
tx.3153	chr11	+	699	4	NIC	ENSMUSG00000072553.11	novel	557	4	NA	NA	61	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTTCTGTGCATCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88964727	88983863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_88964832_88965814_88965916_88979381_88979518_88983505
tx.3155	chr11	-	1940	6	FSM	ENSMUSG00000020553.9	ENSMUST00000020864.9	2723	6	25	758	25	-758	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	5.78273291792038	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTGTGCTGTCTCCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89893695	89874248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_89875583_89876918_89876987_89878021_89878194_89879520_89879601_89881896_89882015_89893527
tx.3156	chr11	+	2636	7	FSM	ENSMUSG00000003948.18	ENSMUST00000004050.7	2677	7	25	16	25	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_6	11.2249721603218	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCATTGTCTGGAGCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90140326	90169399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_90140562_90148345_90148428_90150652_90150814_90155328_90155404_90156870_90156973_90158337_90158408_90167488
tx.3157	chr11	+	720	2	ISM	ENSMUSG00000110344.2	ENSMUST00000134929.8	2031	4	61839	-22	61839	22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAATTCACTTTCATCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90140348	90142103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_90140562_90141596
tx.3158	chr11	+	1226	4	FSM	ENSMUSG00000020544.15	ENSMUST00000020851.15	1224	4	3	-5	3	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	285	junction_3	41.2876091178294	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCTGACAACTTGATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90529001	90535762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_90529379_90531202_90531359_90534478_90534605_90535195
tx.3159	chr11	-	2070	16	FSM	ENSMUSG00000020541.13	ENSMUST00000020849.9	4308	16	13	2225	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_9	19.1849478034792	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTGTTGTTGTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90578420	90536515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_90537136_90537660_90537726_90540173_90540250_90540611_90540715_90542736_90542789_90547176_90547277_90548539_90548658_90548973_90549035_90552581_90552716_90561909_90562027_90563658_90563764_90564489_90564613_90565495_90565646_90574060_90574140_90575887_90575973_90578338
tx.316	chr1	-	2683	19	FSM	ENSMUSG00000025968.17	ENSMUST00000168099.9	2590	19	50	-143	8	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_18	163.056757519704	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTAAAGTGTGAAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63215841	63182750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_63183082_63186278_63186352_63186448_63186584_63187554_63187731_63189115_63189271_63190709_63190871_63191933_63192064_63195362_63195492_63196290_63196437_63198908_63199024_63200038_63200174_63202825_63203012_63203888_63204020_63204107_63204190_63205449_63205527_63208387_63208496_63209208_63209301_63210007_63210074_63215586
tx.3160	chr11	-	1895	14	FSM	ENSMUSG00000054079.13	ENSMUST00000066888.10	2613	14	14	704	14	-704	multi-exon	TRUE	canonical	3	770	junction_1	49.2161035848126	310	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTACATGATTTTTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93776578	93750772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_93750895_93751619_93751664_93752784_93752928_93757171_93757347_93759156_93759281_93760631_93760723_93761305_93761407_93766609_93766785_93766880_93767007_93768809_93768899_93770888_93770960_93772900_93773000_93774492_93774609_93776159
tx.3161	chr11	-	650	4	FSM	ENSMUSG00000020857.12	ENSMUST00000072566.5	734	4	87	-3	87	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6715	junction_3	620.302256072706	2756	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCAGTGTTCAGTACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93846522	93840639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_93840873_93842725_93842839_93843625_93843728_93846320
tx.3162	chr11	-	663	5	FSM	ENSMUSG00000020857.12	ENSMUST00000021217.11	1012	5	349	0	-127	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5665	junction_4	866.911327645452	18999	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCAGTGTTCAGTACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93846736	93840639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_93840873_93842725_93842839_93843625_93843728_93846320_93846451_93846651
tx.3163	chr11	-	699	5	FSM	ENSMUSG00000037601.12	ENSMUST00000135884.8	3181	5	234	2248	-15	245	multi-exon	FALSE	canonical	3	3315	junction_4	669.623401622136	15371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGCTGTACAGCTCTGCA	619	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93859113	93850052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_93850340_93851493_93851607_93854052_93854155_93856633_93856764_93859046
tx.3164	chr11	-	598	2	Intergenic	novelGene_192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTATGCATGATGGTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93944293	93894217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_93894485_93943962
tx.3165	chr11	+	1326	5	ISM	ENSMUSG00000020859.17	ENSMUST00000024979.15	6756	27	64142	2597	25719	-2594	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_2	4.76969600708473	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTAAAGTTTACGAAGCCT	2788	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93999332	94014312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_93999453_94002858_94002973_94004998_94005176_94007555_94007706_94013547
tx.3166	chr11	+	513	4	FSM	ENSMUSG00000086003.8	ENSMUST00000155965.2	473	4	-46	6	-29	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	38.4967531098403	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCGTATTAGTGTTTACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94024281	94046596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_94024382_94029312_94029490_94046281_94046324_94046402
tx.3167	chr11	+	353	3	ISM	ENSMUSG00000086003.8	ENSMUST00000155965.2	473	4	5047	4	2889	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_1	30	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTATTAGTGTTTACCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94029374	94046598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_94029490_94046281_94046324_94046402
tx.3168	chr11	+	2189	2	NNC	ENSMUSG00000037573.6	novel	2288	2	NA	NA	-1583	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCCTGTGGTCTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94100696	94106325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_94100872_94104311
tx.3169	chr11	-	1941	11	FSM	ENSMUSG00000020863.16	ENSMUST00000107821.9	2050	11	31	78	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	229	junction_1	26.33172990899	254	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGATTGTCTGTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94212783	94181964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_94182405_94183910_94184105_94186745_94186907_94187709_94187994_94188584_94188747_94190781_94190887_94192330_94192406_94194667_94194813_94197011_94197052_94200450_94200518_94212515
tx.317	chr1	-	2648	20	NIC	ENSMUSG00000025968.17	novel	2661	19	NA	NA	-11	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	163	junction_19	199.298478811329	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTAAAGTGTGAAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63215860	63182750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_63183082_63186278_63186352_63186448_63186584_63187554_63187731_63189115_63189271_63190709_63190871_63191933_63192064_63195362_63195492_63196290_63196437_63198908_63199024_63200038_63200174_63202825_63203012_63203888_63204020_63204107_63204190_63205449_63205527_63208387_63208496_63209208_63209301_63210007_63210074_63211312_63211417_63215744
tx.3170	chr11	-	959	4	ISM	ENSMUSG00000020863.16	ENSMUST00000107821.9	2050	11	24943	76	22	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_1	29.2384830127845	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGATTGTCTGTGTCATTG	NA	False	NA	16	True	NA	NA	NA	94187871	94181962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_94182405_94183910_94184105_94186745_94186907_94187709
tx.3171	chr11	-	993	8	ISM	ENSMUSG00000020863.16	ENSMUST00000021226.14	3373	11	42	5887	12	-11	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	230	junction_7	21.9981446341945	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAAAGAAAGAGCTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94212772	94187851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_94187994_94188584_94188747_94190781_94190887_94192330_94192406_94194667_94194813_94197011_94197052_94200450_94200518_94212515
tx.3172	chr11	+	1336	5	FSM	ENSMUSG00000020864.14	ENSMUST00000107818.9	3487	5	233	1918	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	454	junction_3	18.6061145863396	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGCTGGAAAGTAGTCTTGA	4227	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94219059	94230749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_94219214_94224726_94224876_94225253_94225734_94229165_94229348_94230378
tx.3173	chr11	-	1173	3	FSM	ENSMUSG00000020865.17	ENSMUST00000140985.2	567	3	-246	-360	-246	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_1	6	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGGTCACATGTTACCTT	689	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94242258	94234120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_94234602_94236772_94236968_94241761
tx.3174	chr11	-	963	4	NNC	ENSMUSG00000020865.17	novel	5005	31	NA	NA	-375	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_3	32.8937684067971	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGGTCACATGTTACCTT	560	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94242387	94234120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_94234602_94236772_94236968_94241761_94241929_94242267
tx.3175	chr11	-	1155	4	ISM	ENSMUSG00000020865.17	ENSMUST00000178136.8	5005	31	40866	0	-924	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	69	junction_3	10.6249183003395	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGGTCACATGTTACCTT	11	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94242936	94234120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_94234602_94236772_94236968_94241761_94241929_94242624
tx.3176	chr11	-	2132	9	FSM	ENSMUSG00000039096.11	ENSMUST00000040487.4	4143	9	-18	2029	-18	-2029	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	10.3319891598859	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATACTCTATGTATGTCTC	3233	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94440043	94432652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_94433474_94433706_94433811_94434119_94434175_94434380_94434529_94434930_94434995_94435245_94435612_94438984_94439190_94439296_94439431_94439808
tx.3177	chr11	+	2775	7	FSM	ENSMUSG00000020869.9	ENSMUST00000021239.7	2837	7	57	5	10	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	2480	junction_6	120.266371026983	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTCTGCCTTTCTCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94520649	94536037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_94520936_94522906_94522967_94525370_94525530_94525737_94525843_94529356_94529430_94532045_94532220_94534119
tx.3178	chr11	+	842	3	ISM	ENSMUSG00000020869.9	ENSMUST00000021239.7	2837	7	8809	1283	8762	-1283	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2480	junction_2	109.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGGAGGGCAGTGTGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94529401	94534759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_94529430_94532045_94532220_94534119
tx.3179	chr11	+	2096	2	ISM	ENSMUSG00000020869.9	ENSMUST00000021239.7	2837	7	11451	3	11404	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2480	junction_1	0	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTGCCTTTCTCCTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94532043	94536039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_94532220_94534119
tx.318	chr1	-	2541	19	FSM	ENSMUSG00000025968.17	ENSMUST00000027111.15	2661	19	121	-1	-11	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	367	junction_18	130.918608680223	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATATTAAAGTGTGAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63215860	63182753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_63183082_63186278_63186352_63186448_63186584_63187554_63187731_63189115_63189271_63190709_63190871_63191933_63192064_63195362_63195492_63196290_63196437_63198908_63199024_63200038_63200174_63202825_63203012_63203888_63204020_63204107_63204190_63205449_63205527_63208387_63208496_63209208_63209301_63210007_63210074_63215744
tx.3180	chr11	-	724	2	ISM	ENSMUSG00000039055.5	ENSMUST00000039949.5	2444	9	8035	0	4602	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGAGCTTGGAGGAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94536755	94535821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_94536432_94536641
tx.3181	chr11	-	883	3	ISM	ENSMUSG00000039055.5	ENSMUST00000039949.5	2444	9	6591	0	3158	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	233	junction_2	21.5	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGAGCTTGGAGGAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94538199	94535821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_94536432_94536641_94536832_94538116
tx.3182	chr11	-	2225	9	FSM	ENSMUSG00000039055.5	ENSMUST00000039949.5	2444	9	219	0	-74	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	178	junction_8	32.4422563950167	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGAGCTTGGAGGAAGAC	4622	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94544571	94535821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_94536432_94536641_94536832_94538116_94538233_94538453_94538575_94538769_94538889_94538968_94539056_94540833_94540965_94541048_94541850_94544521
tx.3183	chr11	+	749	4	FSM	ENSMUSG00000024414.14	ENSMUST00000025278.8	756	4	7	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	766	junction_3	47.8632310744781	5212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGAAAGGGACAGGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94544599	94550915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_94544668_94547312_94547445_94547808_94547877_94550434
tx.3184	chr11	+	658	3	ISM	ENSMUSG00000024414.14	ENSMUST00000025278.8	756	4	2743	0	2479	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	766	junction_2	51.5	989	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGAAAGGGACAGGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94547335	94550915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_94547445_94547808_94547877_94550434
tx.3185	chr11	-	2697	5	NNC	ENSMUSG00000075611.6	novel	375	3	NA	NA	-3419	1844	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_1	1.58113883008419	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTGTGTTTCTCTGTA	1924	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94652008	94645957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_94647982_94648187_94648387_94648522_94648622_94649100_94649124_94651656
tx.3186	chr11	-	812	4	NNC	ENSMUSG00000083227.2	novel	354	3	NA	NA	-4272	-179	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGCTGGTTGTTTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94692875	94688053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_94688411_94688551_94688636_94689121_94689145_94692527
tx.3187	chr11	-	761	4	NNC	ENSMUSG00000081478.2	novel	354	3	NA	NA	-4304	-179	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGCCGGTGGTTTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94708478	94703623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_94703927_94704122_94704207_94704693_94704717_94708127
tx.3188	chr11	-	817	4	NNC	ENSMUSG00000081478.2	novel	354	3	NA	NA	-4304	-179	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.942809041582063	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGCCGGTGGTTTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94708478	94703623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_94703983_94704122_94704207_94704693_94704717_94708127
tx.3189	chr11	+	1032	4	ISM	ENSMUSG00000001506.11	ENSMUST00000001547.8	5930	51	14174	1148	5030	-1148	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	9.67241208569794	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGCTTGGTCCTCTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94841223	94842720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_94841400_94841534_94841726_94841926_94842170_94842298
tx.319	chr1	-	772	5	ISM	ENSMUSG00000025968.17	ENSMUST00000027111.15	2661	19	26808	-3	-2291	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	868	junction_4	37.7690349360425	205	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATTAAAGTGTGAAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63189173	63182751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_63183082_63186278_63186352_63186448_63186584_63187554_63187731_63189115
tx.3190	chr11	-	2288	11	FSM	ENSMUSG00000038967.14	ENSMUST00000038431.8	2246	11	-42	0	-42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	6.12290780593665	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTGCCTGGCTTCCTTGC	6032	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94932222	94917083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_94918149_94918690_94918805_94919304_94919413_94919523_94919623_94919747_94919825_94920479_94920558_94920742_94920833_94922661_94922847_94923290_94923363_94930174_94930317_94931964
tx.3191	chr11	-	997	4	ISM	ENSMUSG00000038967.14	ENSMUST00000038431.8	2246	11	-33	5229	-33	427	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_3	1.69967317119759	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAATTATATTTATTTATTTA	6041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94932213	94922312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_94922847_94923290_94923363_94930174_94930317_94931964
tx.3192	chr11	-	1916	4	ISM	ENSMUSG00000038909.17	ENSMUST00000092766.12	3414	15	29179	0	1471	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	712	junction_2	46.1615520632581	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGACTGCTCTGAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95171249	95165084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_95166714_95167268_95167376_95168294_95168442_95171216
tx.3193	chr11	-	3428	14	FSM	ENSMUSG00000038909.17	ENSMUST00000107733.10	3470	14	42	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	281	junction_9	177.090656421269	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGACTGCTCTGAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95201030	95165084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95166714_95167268_95167376_95168294_95168442_95171216_95171311_95172326_95172468_95172664_95172755_95174854_95175047_95177155_95177267_95180597_95180697_95185388_95185472_95190804_95191045_95193958_95194136_95196874_95197023_95200860
tx.3194	chr11	-	3520	15	FSM	ENSMUSG00000038909.17	ENSMUST00000107734.10	3560	15	40	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	566	junction_10	130.748239149965	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGACTGCTCTGAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95201032	95165084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95166714_95167268_95167376_95168294_95168442_95171216_95171311_95172326_95172468_95172664_95172755_95174854_95175047_95177155_95177267_95180597_95180697_95182345_95182436_95185388_95185472_95190804_95191045_95193958_95194136_95196874_95197023_95200860
tx.3195	chr11	+	780	3	NNC	ENSMUSG00000085143.2	novel	630	3	NA	NA	-113	98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTACGGAGCTGCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95201141	95215420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_95201215_95210002_95210283_95214993
tx.3196	chr11	+	766	3	NNC	ENSMUSG00000085143.2	novel	630	3	NA	NA	-34	98	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTACGGAGCTGCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95201220	95215420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_95201280_95210002_95210283_95214993
tx.3197	chr11	+	1313	9	FSM	ENSMUSG00000020873.16	ENSMUST00000021243.16	1523	9	210	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_2	19.5923294939627	936	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCGAGACCCTGCTGCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95275727	95282602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95275940_95276626_95276731_95277311_95277443_95278036_95278068_95278595_95278754_95279905_95280033_95281103_95281211_95281350_95281505_95282313
tx.3198	chr11	+	1288	9	FSM	ENSMUSG00000020873.16	ENSMUST00000131193.3	1299	9	11	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_2	72.2789734293453	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCGAGACCCTGCTGCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95275727	95282602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95275940_95276626_95276731_95277336_95277443_95278036_95278068_95278595_95278754_95279905_95280033_95281103_95281211_95281350_95281505_95282313
tx.3199	chr11	+	2888	11	FSM	ENSMUSG00000057522.16	ENSMUST00000107724.9	2881	11	-16	9	-16	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	65.0422170593838	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTCTTCTGGGTCCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95304889	95384223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95304958_95305157_95305231_95361347_95361492_95362048_95362171_95365056_95365209_95365310_95365439_95372739_95372918_95376117_95376174_95376662_95376786_95381110_95381254_95382522
tx.32	chr1	+	1243	6	ISM	ENSMUSG00000046101.17	ENSMUST00000171802.8	2553	15	15557	2	-7925	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_3	2.03960780543711	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGCCTTGGTAAATGTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9994419	10011177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_9994488_10001005_10001173_10002226_10002407_10004147_10004291_10007220_10007331_10010602
tx.320	chr1	+	805	6	FSM	ENSMUSG00000025967.17	ENSMUST00000129339.8	1939	6	304	830	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2982	junction_1	199.182730175083	41041	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTGGCTCTTCATTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63216287	63218815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_63216451_63216912_63217036_63217597_63217725_63217990_63218058_63218406_63218533_63218616
tx.3200	chr11	+	2657	10	FSM	ENSMUSG00000057522.16	ENSMUST00000107722.8	3063	10	19	387	19	-387	multi-exon	FALSE	canonical	3	227	junction_3	21.694853460364	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTATCTCTGGTCTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95304942	95383845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95305231_95361347_95361492_95362048_95362171_95365056_95365209_95365310_95365439_95372739_95372918_95376117_95376174_95376662_95376786_95381110_95381254_95382522
tx.3201	chr11	-	2101	2	FSM	ENSMUSG00000046719.8	ENSMUST00000058866.8	2099	2	-9	7	-9	-7	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGTATTCTATTCTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95405405	95400677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95402359_95404985
tx.3202	chr11	-	3418	6	FSM	ENSMUSG00000000120.7	ENSMUST00000000122.7	3446	6	33	-5	33	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_2	5.88557558782486	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGATGCCAAGAGAATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95478528	95459638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95461922_95462645_95462807_95465016_95465270_95468799_95469160_95471778_95471921_95478309
tx.3203	chr11	+	925	3	FSM	ENSMUSG00000084856.2	ENSMUST00000156822.2	914	3	-239	228	-239	-228	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGATCTGAGTGTTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95513246	95520434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95513605_95515353_95515531_95520044
tx.3204	chr11	+	1020	7	FSM	ENSMUSG00000038845.12	ENSMUST00000125172.8	1799	7	43	736	0	329	multi-exon	FALSE	canonical	3	4384	junction_3	774.980806213935	9813	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATCAAGCGAAGCTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95557825	95570863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95557869_95558862_95558978_95562212_95562375_95565967_95566111_95566395_95566513_95568876_95568973_95570519
tx.3205	chr11	+	1697	6	ISM	ENSMUSG00000038845.12	ENSMUST00000125172.8	1799	7	1078	18	971	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4384	junction_2	706.937507846344	2757	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGACCTTCCAGCTGCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95558860	95571581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_95558978_95562212_95562375_95565967_95566111_95566395_95566513_95568876_95568973_95570519
tx.3206	chr11	-	2178	8	FSM	ENSMUSG00000018381.16	ENSMUST00000059026.10	4006	8	-146	1974	-79	-105	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_7	1.51185789203691	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGGGCAAAGGGGAATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95733381	95722873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95723703_95724034_95724161_95724465_95724627_95724828_95724925_95725131_95725218_95726603_95726781_95727895_95728064_95732846
tx.3207	chr11	+	350	2	FSM	ENSMUSG00000086015.2	ENSMUST00000146868.2	1269	2	5	914	5	-914	multi-exon	TRUE	canonical	3	111	junction_1	0	586	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGGCTATTGTATAAGTC	1031	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95749695	95750956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95749909_95750819
tx.3208	chr11	-	2556	11	FSM	ENSMUSG00000013418.9	ENSMUST00000038343.7	1722	11	17	-851	17	851	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_4	6.67907179179862	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGAAAGGGCATCAGATCC	2907	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95805700	95755917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95757103_95757575_95757796_95759175_95759317_95760059_95760248_95764687_95764775_95766923_95767105_95774768_95774807_95779632_95779740_95781798_95781937_95782583_95782800_95805645
tx.3209	chr11	-	865	3	ISM	ENSMUSG00000013418.9	ENSMUST00000038343.7	1722	11	-31	24622	-31	-24622	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	3	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATTTCAGTAAAACTGACAG	2859	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95805748	95781390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_95781937_95782583_95782800_95805645
tx.321	chr1	+	643	5	ISM	ENSMUSG00000025967.17	ENSMUST00000135877.8	691	6	608	-88	530	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3112	junction_1	185.727454890223	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTGGCTCTTCATTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63216911	63218815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_63217036_63217597_63217725_63217990_63218058_63218406_63218533_63218616
tx.3210	chr11	-	955	2	ISM	ENSMUSG00000013415.10_ENSMUSG00000093358.3	ENSMUST00000138513.2	690	4	1577	-716	1577	572	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	673	junction_1	0	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGCATGCCTTA	7560	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95857084	95853545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_95854419_95857002
tx.3211	chr11	-	2831	15	FSM	ENSMUSG00000013415.10	ENSMUST00000013559.3	8378	15	-5	5552	-5	721	multi-exon	FALSE	canonical	3	452	junction_5	71.7782867514933	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAAGCATGCCTTATGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95896771	95853540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95854419_95857002_95857117_95857476_95857609_95858374_95858450_95859188_95859309_95859624_95859748_95860674_95860811_95861494_95861618_95863870_95864006_95864764_95865047_95866085_95866150_95870107_95870160_95870446_95870496_95895048_95895110_95896284
tx.3212	chr11	-	1017	3	ISM	ENSMUSG00000013415.10_ENSMUSG00000093358.3	ENSMUST00000138513.2	690	4	1154	-715	1154	571	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	670	junction_2	1.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAAAAAAGCATGCCTT	7137	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95857507	95853546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_95854419_95857002_95857117_95857476
tx.3213	chr11	+	736	6	FSM	ENSMUSG00000014351.13	ENSMUST00000103157.10	652	6	-84	0	-84	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.56124969497314	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGGTGTCCATGGTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95915286	95921657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95915451_95916179_95916288_95917449_95917597_95919511_95919602_95920313_95920416_95921532
tx.3214	chr11	+	864	7	FSM	ENSMUSG00000006058.11	ENSMUST00000107700.4	849	7	-30	15	-16	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_6	239.545866635645	324	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCATTCCAAGTTATTTTT	3247	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95925760	95938241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95925894_95926144_95926196_95930104_95930244_95932450_95932556_95934229_95934303_95935986_95936129_95938020
tx.3215	chr11	+	939	8	FSM	ENSMUSG00000006058.11	ENSMUST00000006217.10	1004	8	50	15	-16	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	665	junction_5	23.859281341282	3025	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCATTCCAAGTTATTTTT	3247	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95925760	95938241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_95925894_95926144_95926196_95930104_95930244_95932450_95932556_95934229_95934303_95935986_95936129_95937105_95937181_95938020
tx.3216	chr11	-	716	5	FSM	ENSMUSG00000006057.16	ENSMUST00000107686.8	691	5	-24	-1	14	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_4	4410.8346149	863	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTGCCTGTGCCTGTCT	3544	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95966431	95963811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95964045_95964348_95964528_95964787_95964866_95965812_95965860_95966252
tx.3217	chr11	-	603	5	FSM	ENSMUSG00000006057.16	ENSMUST00000107684.2	596	5	-3	-4	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	5157	junction_4	2293.78611688187	32233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTGCCTGTGCCTGTCT	3527	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95966448	95963811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95964045_95964348_95964528_95964787_95964866_95965812_95965860_95966382
tx.3218	chr11	-	583	5	FSM	ENSMUSG00000006057.16	ENSMUST00000090541.12	4715	5	-2	4134	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2808	junction_4	3276.79938163751	27383	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTGCCTGTGCCTGTCT	3477	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95966498	95963811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_95964045_95964348_95964528_95964787_95964866_95965812_95965860_95966452
tx.3219	chr11	+	1384	2	FSM	ENSMUSG00000049604.4	ENSMUST00000062709.4	2206	2	-26	848	-26	-848	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCCTCTCAGATTCCTTT	3918	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96085115	96087425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_96085873_96086798
tx.322	chr1	+	1735	6	ISM	ENSMUSG00000025962.16	ENSMUST00000027103.7	4486	12	11	16368	11	440	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	308	junction_4	44.0545116872268	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACCTTGTCTGTTGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63769783	63777446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_63769851_63770558_63771381_63773890_63773995_63774621_63774731_63775003_63775128_63776937
tx.3220	chr11	+	1286	5	NNC	ENSMUSG00000078706.5	novel	1172	3	NA	NA	115	4385	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_4	6.48074069840786	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGGGCCCTAATTTATA	8390	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96142045	96160079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_96142640_96152437_96152590_96154999_96155212_96155549_96155672_96159873
tx.3221	chr11	+	791	4	NNC	ENSMUSG00000078706.5	novel	1172	3	NA	NA	-87	4379	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	9	junction_1	2.82842712474619	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTCCTTTTGGGCCCTAA	8727	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96142382	96160073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_96142640_96154999_96155212_96155549_96155672_96159873
tx.3222	chr11	-	2175	8	FSM	ENSMUSG00000020876.15	ENSMUST00000107661.10	2197	8	24	-2	-4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_6	17.839419776416	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGTTGTTGCAATTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96668361	96658700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_96660149_96661464_96661678_96661854_96661951_96663607_96663709_96663961_96664049_96665266_96665322_96667793_96667888_96668280
tx.3223	chr11	-	2260	9	FSM	ENSMUSG00000020876.15	ENSMUST00000021246.9	2551	9	-28	319	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_6	14.0529133990073	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTTGTTGCAATTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96668385	96658699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_96660149_96661464_96661678_96661854_96661951_96663607_96663709_96663961_96664049_96665266_96665322_96666199_96666260_96667793_96667888_96668280
tx.3224	chr11	+	566	3	ISM	ENSMUSG00000018666.14	ENSMUST00000018810.10	1824	4	10	2369	0	195	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	748	junction_1	2	916	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAGGTAAAGCTAGAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96679962	96692426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96680180_96691596_96691774_96692254
tx.3225	chr11	+	2194	5	ISM	ENSMUSG00000018666.14	ENSMUST00000093943.10	1251	6	-19	495	3	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	583	junction_4	77.1508263079534	386	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAATTCTTGATTTCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96679965	96698971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96680180_96691596_96691774_96692254_96692433_96693553_96693649_96697441
tx.3226	chr11	+	1160	6	NNC	ENSMUSG00000018666.14	novel	1251	6	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	188	junction_5	206.095705923243	1044	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGATTTCTGTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96679965	96698975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_96680180_96691596_96691774_96692254_96692433_96693553_96693649_96697441_96697591_96698628
tx.3227	chr11	+	1336	6	NNC	ENSMUSG00000018666.14	novel	2377	5	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	66	junction_4	289.614916742905	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGATTTCTGTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96679965	96698975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_96680180_96691596_96691774_96692254_96692433_96693553_96693825_96697441_96697591_96698628
tx.3228	chr11	+	1012	5	NNC	ENSMUSG00000018666.14	novel	2377	5	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	147	junction_4	247.637335634189	422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGATTTCTGTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96679964	96698975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_96680180_96691596_96691774_96692254_96692433_96693553_96693649_96698628
tx.3229	chr11	-	3471	3	ISM	ENSMUSG00000038615.18	ENSMUST00000167110.8	3547	4	1693	8	405	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1322	junction_1	36.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGTGCACTTTCTCCCCC	270	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96713146	96708247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_96711343_96712076_96712236_96712929
tx.323	chr1	+	2279	12	FSM	ENSMUSG00000025962.16	ENSMUST00000027103.7	4486	12	18	2189	-9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	308	junction_4	54.5943720043143	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCGTGGATCAGCTGGCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63769790	63791625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_63769851_63770558_63771381_63773890_63773995_63774621_63774731_63775003_63775128_63776937_63777078_63778340_63778514_63785000_63785165_63787116_63787330_63788844_63788930_63790422_63790538_63791455
tx.3230	chr11	-	3536	4	FSM	ENSMUSG00000038615.18	ENSMUST00000167110.8	3547	4	-6	17	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_3	463.171914327955	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTCAGCTTAAGTGCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96714845	96708256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_96711343_96712076_96712236_96712929_96713146_96714770
tx.3231	chr11	-	3900	4	NNC	ENSMUSG00000038615.18	novel	4219	4	NA	NA	12	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	150	junction_3	570.471345078397	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTCAGCTTAAGTGCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96714822	96708256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_96711343_96712076_96712236_96712929_96713146_96714383
tx.3232	chr11	-	456	2	ISM	ENSMUSG00000038615.18	ENSMUST00000081775.12	4654	5	4	10500	4	-181	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	711	junction_1	0	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAAGTGAATGTGGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96720790	96718739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_96719050_96720644
tx.3233	chr11	+	930	9	FSM	ENSMUSG00000018672.16	ENSMUST00000018816.14	930	9	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_8	11.8420595759353	311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTCCTTTCTTGACTTTG	775	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96740701	96752029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_96740823_96741498_96741568_96744260_96744343_96744883_96744976_96745409_96745466_96746081_96746160_96747497_96747550_96748378_96748418_96751688
tx.3234	chr11	+	495	6	ISM	ENSMUSG00000018672.16	ENSMUST00000018816.14	930	9	3	5870	-2	1180	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	218	junction_4	9.77752524926425	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGGAGGGGACTGGGAGA	778	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96740704	96746159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96740823_96741498_96741568_96744260_96744343_96744883_96744976_96745409_96745466_96746081
tx.3235	chr11	-	1882	14	FSM	ENSMUSG00000018669.15	ENSMUST00000103152.11	2250	14	14	354	14	36	multi-exon	FALSE	canonical	3	831	junction_13	105.723262738262	707	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGCTTGAAGTTGAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96807308	96798605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_96798949_96799055_96799228_96799539_96799746_96800766_96800856_96801482_96801565_96801905_96802008_96802377_96802523_96802698_96802836_96803042_96803222_96803831_96803881_96804207_96804309_96804490_96804623_96806976_96807023_96807209
tx.3236	chr11	-	1962	13	ISM	ENSMUSG00000018669.15	ENSMUST00000103152.11	2250	14	115	360	11	30	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	982	junction_6	81.183776430735	362	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTGAGCCTGCTTGAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96807207	96798611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_96798949_96799055_96799228_96799539_96799746_96800766_96800856_96801482_96801565_96801905_96802008_96802377_96802523_96802698_96802836_96803042_96803222_96803831_96803881_96804207_96804309_96804490_96804623_96806976
tx.3237	chr11	-	2011	7	FSM	ENSMUSG00000018659.13	ENSMUST00000018803.12	1994	7	-19	2	-19	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	181	junction_4	10.434983894999	428	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATGTTTAACTTGATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96834831	96828652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_96829910_96830080_96830152_96830473_96830603_96830841_96830896_96831681_96831782_96833235_96833361_96834556
tx.3238	chr11	+	978	4	ISM	ENSMUSG00000078700.11	ENSMUST00000135825.9	2801	6	-8	4984	-8	14	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_3	1.63299316185545	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAGGAAGAAAAAAGCAGC	4779	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96834982	96850902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96835041_96835670_96835920_96843406_96843555_96850379
tx.3239	chr11	+	1933	2	ISM	ENSMUSG00000078700.11	ENSMUST00000107628.8	1216	6	81	6373	-42	223	internal_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	TGAGAAAAAAAATAGCAAAA	4892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96835095	96844515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96835920_96843406
tx.3240	chr11	+	1258	3	ISM	ENSMUSG00000078700.11	ENSMUST00000186326.2	959	6	-75	10420	48	9	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGATTTCTGTTTAATTT	4859	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96835062	96844301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96835177_96835670_96835920_96843406
tx.3241	chr11	-	1512	2	ISM	ENSMUSG00000018678.14	ENSMUST00000107623.8	2907	7	12608	-131	12608	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	492	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAAGTCTGCGTTTGGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96846883	96844167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_96845397_96846600
tx.3242	chr11	-	1415	3	NNC	ENSMUSG00000018678.14	novel	3055	7	NA	NA	33	-6518	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATAACAGCAAGAATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96868504	96851562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_96852836_96854186_96854271_96868446
tx.3243	chr11	-	1412	3	NNC	ENSMUSG00000018678.14	novel	3055	7	NA	NA	33	-6518	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	150.5	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATATAACAGCAAGAATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96868504	96851562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_96852836_96854186_96854268_96868446
tx.3244	chr11	-	425	2	Intergenic	novelGene_193	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTCCGGCTGCTTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96888544	96883926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_96884229_96888421
tx.3245	chr11	+	1526	8	FSM	ENSMUSG00000020877.12	ENSMUST00000021249.11	1530	8	6	-2	6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_5	16.9597362320652	258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGATCTCAAGTCTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96920769	96924786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_96920882_96921241_96921416_96921705_96921888_96922914_96923115_96923580_96923797_96923889_96924056_96924144_96924326_96924491
tx.3246	chr11	+	917	5	ISM	ENSMUSG00000020877.12	ENSMUST00000021249.11	1530	8	2292	-2	2096	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_2	18.2208671582886	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGATCTCAAGTCTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96923055	96924786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96923115_96923580_96923797_96923889_96924056_96924144_96924326_96924491
tx.3247	chr11	+	1516	4	NIC	ENSMUSG00000001445.11	novel	1708	5	NA	NA	-16	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	40	junction_1	229.382262222305	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCCTATGTTTATATCT	892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96932404	96940036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_96932479_96937855_96938021_96938238_96938384_96938904
tx.3248	chr11	+	1684	5	FSM	ENSMUSG00000001445.11	ENSMUST00000001485.10	1708	5	21	3	-14	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	440	junction_1	35.8643276808586	1178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCCTATGTTTATATCT	894	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96932406	96940036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_96932479_96935353_96935524_96937855_96938021_96938238_96938384_96938904
tx.3249	chr11	+	1613	4	ISM	ENSMUSG00000001445.11	ENSMUST00000001485.10	1708	5	2967	3	2932	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	509	junction_1	9.39266853573691	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGCCTATGTTTATATCT	3840	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96935352	96940036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96935524_96937855_96938021_96938238_96938384_96938904
tx.325	chr1	-	1441	3	ISM	ENSMUSG00000025959.14	ENSMUST00000114086.8	7662	4	42443	5343	42434	-5343	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	4.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAGTATACCCCTTGAGC	4081	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64118207	64073948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_64074924_64081472_64081597_64117865
tx.3250	chr11	+	1606	6	ISM	ENSMUSG00000038534.20	ENSMUST00000168565.2	3535	24	14937	0	-1126	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_1	34.0141147172758	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGTGACCACTCATTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96956582	96959730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96956686_96957758_96957904_96958030_96958176_96958259_96958387_96958490_96958614_96958767
tx.3251	chr11	+	1365	4	ISM	ENSMUSG00000038534.20	ENSMUST00000143360.2	920	5	315	-633	315	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_3	12.5521135891752	283	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTGTGACCACTCATTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96958023	96959730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_96958176_96958259_96958387_96958490_96958614_96958767
tx.3252	chr11	-	1378	2	ISM	ENSMUSG00000001444.3	ENSMUST00000001484.3	2488	6	15498	-6	15498	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTTCTGTGGCTGGTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96990659	96988890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_96990205_96990595
tx.3253	chr11	-	1314	2	ISM	ENSMUSG00000001440.6	ENSMUST00000132633.2	643	3	706	-978	706	978	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1238	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGCCTTCTGTCCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97054342	97052357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_97053508_97054178
tx.3254	chr11	-	1415	3	FSM	ENSMUSG00000001440.6	ENSMUST00000132633.2	643	3	206	-978	206	978	multi-exon	FALSE	canonical	3	1118	junction_2	60	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGGCCTTCTGTCCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97054842	97052357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_97053508_97054178_97054341_97054739
tx.3255	chr11	-	2150	7	ISM	ENSMUSG00000001441.14	ENSMUST00000165489.8	2078	16	18699	-1085	1594	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	312	junction_6	43.2267921034577	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAATTTGTTGGCCTGGT	1336	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97113993	97096673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_97098095_97103105_97103154_97103857_97104014_97104596_97104705_97108616_97108674_97109333_97109477_97113776
tx.3256	chr11	-	984	3	FSM	ENSMUSG00000001441.14	ENSMUST00000171320.2	423	3	142	-703	142	453	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_2	17	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACACCCTCCCTCCCTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97103979	97097280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_97098095_97103105_97103154_97103857
tx.3257	chr11	-	4039	23	FSM	ENSMUSG00000001441.14	ENSMUST00000001480.14	4215	23	178	-2	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	268	junction_18	36.1553409289133	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGGCCTGGTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97171286	97096667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_97098095_97103105_97103154_97103857_97104014_97104596_97104705_97108616_97108674_97109333_97109477_97113776_97113997_97115484_97115620_97117554_97117695_97120655_97120720_97122714_97122825_97125880_97125942_97126890_97126996_97128919_97129085_97131754_97131870_97132629_97132664_97132776_97132874_97133428_97133630_97135253_97135362_97139027_97139150_97149099_97149178_97158420_97158506_97171026
tx.3258	chr11	+	442	2	NNC	ENSMUSG00000086680.3	novel	637	3	NA	NA	596	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTTGTTTCTTCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97171549	97173723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_97171677_97173408
tx.3259	chr11	+	1493	8	FSM	ENSMUSG00000018882.13	ENSMUST00000019026.10	2431	8	129	809	-63	-809	multi-exon	FALSE	canonical	3	2561	junction_3	172.211545276531	2639	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTGTTCTGTACATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97206670	97219937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_97206766_97207572_97207751_97212268_97212387_97214676_97214776_97216534_97216584_97217607_97217758_97218911_97219086_97219307
tx.326	chr1	-	1202	5	NIC	ENSMUSG00000025959.14	novel	7662	4	NA	NA	-25	-6214	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	2	junction_4	5.02493781056044	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACAAGAACAAAACACCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64161466	64074819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_64074924_64081472_64081597_64117865_64118494_64160058_64160299_64161360
tx.3260	chr11	+	1149	6	ISM	ENSMUSG00000018882.13	ENSMUST00000019026.10	2431	8	5798	809	5606	-809	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2561	junction_1	125.679910884755	401	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGTGTTCTGTACATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97212339	97219937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_97212387_97214676_97214776_97216534_97216584_97217607_97217758_97218911_97219086_97219307
tx.3261	chr11	+	623	4	FSM	ENSMUSG00000085860.2	ENSMUST00000131687.2	612	4	-13	2	-13	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_3	12.3917535302941	1466	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97489323	97513717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_97489494_97505749_97505855_97509262_97509326_97513432
tx.3262	chr11	+	1143	3	ISM	ENSMUSG00000085860.2	ENSMUST00000131687.2	612	4	-2	3578	-2	284	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_2	5.5	226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGTCCTTAAAGAATGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97489334	97510141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_97489494_97505749_97505855_97509262
tx.3263	chr11	-	1083	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000043439.6	novel	2314	1	NA	NA	1111	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCGAGGTCCTTGCCTCCG	6052	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97519417	97518209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_97518492_97518616
tx.3264	chr11	+	733	3	FSM	ENSMUSG00000078695.9	ENSMUST00000107583.3	737	3	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	940	junction_1	75.5	5722	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAACTGTTTCTGTGGTCAC	2456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97576782	97579447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_97577042_97577326_97577447_97579093
tx.3265	chr11	-	1385	10	FSM	ENSMUSG00000018537.17	ENSMUST00000169807.8	2347	10	-14	976	-14	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_9	43.2000800182158	622	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTATGGACCAACCAGATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97590488	97580624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_97581185_97581786_97581868_97582509_97582606_97582683_97582739_97582852_97582962_97583194_97583246_97583329_97583386_97583551_97583649_97584241_97584395_97590361
tx.3266	chr11	+	744	6	FSM	ENSMUSG00000069744.8	ENSMUST00000103147.5	766	6	23	-1	-12	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3867	junction_2	170.920566345891	11836	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGCCTGCCTGCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97594247	97604327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_97594317_97594613_97594799_97597623_97597732_97601927_97602106_97603262_97603358_97604218
tx.3267	chr11	+	676	5	ISM	ENSMUSG00000069744.8	ENSMUST00000103147.5	766	6	388	-1	353	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3867	junction_1	190.008552439094	3035	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGCCTGCCTGCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97594612	97604327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_97594799_97597623_97597732_97601927_97602106_97603262_97603358_97604218
tx.3268	chr11	-	2368	5	ISM	ENSMUSG00000018541.11	ENSMUST00000018685.9	3105	10	13276	-2	-570	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_2	14.8155323900291	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGTAGAGCGATCTACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97644106	97636438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_97638296_97638786_97638949_97641697_97641788_97643395_97643590_97644041
tx.3269	chr11	-	3127	10	FSM	ENSMUSG00000018541.11	ENSMUST00000018685.9	3105	10	-20	-2	-20	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_2	12.1969435556112	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTGTAGAGCGATCTACCA	7415	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97657402	97636438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_97638296_97638786_97638949_97641697_97641788_97643395_97643590_97644041_97644106_97644730_97644859_97646976_97647047_97648398_97648636_97654034_97654208_97657250
tx.327	chr1	-	1932	4	NIC	ENSMUSG00000025959.14	novel	7662	4	NA	NA	-32	-5251	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	7	junction_1	4.24264068711928	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGCTTATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64161473	64073856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_64074924_64081472_64081597_64117865_64118494_64161360
tx.3270	chr11	-	2213	3	FSM	ENSMUSG00000018541.11	ENSMUST00000124356.2	2450	3	237	0	237	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTCTTGGAGCAAGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97641759	97636306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_97638296_97638786_97638949_97641697
tx.3271	chr11	-	186	2	FSM	ENSMUSG00000071415.7	ENSMUST00000150955.2	480	2	331	-37	331	19	multi-exon	FALSE	canonical	3	13439	junction_1	0	10841	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTTTCCAATATCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97669130	97668844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_97668991_97669090
tx.3272	chr11	-	472	4	ISM	ENSMUSG00000071415.7	ENSMUST00000151118.2	728	5	388	-19	388	19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13439	junction_1	424.830423685603	10683	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTTTCCAATATCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97672714	97668844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_97668991_97669090_97669205_97672159_97672289_97672631
tx.3273	chr11	-	539	5	FSM	ENSMUSG00000071415.7	ENSMUST00000103146.5	1059	5	26	494	26	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	11120	junction_4	1307.0006455622	103543	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACCTTTTCCAATATCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97673237	97668846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_97668991_97669090_97669205_97672159_97672289_97672631_97672716_97673169
tx.3274	chr11	+	3438	7	FSM	ENSMUSG00000038366.16	ENSMUST00000043843.12	3540	7	101	1	-6	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	479	junction_6	89.534754270184	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTAGGCTTCTTCCTCTTT	4557	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97690491	97729589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_97690689_97697650_97697746_97706523_97706609_97715667_97715776_97724371_97724529_97724909_97725014_97726897
tx.3275	chr11	+	3455	6	ISM	ENSMUSG00000038366.16	ENSMUST00000148280.3	686	7	1418	-2643	108	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	479	junction_5	97.3829553874804	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACTAGGCTTCTTCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97697435	97729588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_97697746_97706523_97706609_97715667_97715776_97724371_97724529_97724909_97725014_97726897
tx.3276	chr11	+	1179	2	FSM	ENSMUSG00000050538.9	ENSMUST00000155954.3	2181	2	-33	1035	-33	21	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTCTTGTAATAATATT	5277	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97732092	97733890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_97732391_97733009
tx.3277	chr11	+	1163	2	FSM	ENSMUSG00000050538.9	ENSMUST00000170806.2	1118	2	-24	-21	-5	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATTTCTTGTAATAATATT	5305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97732120	97733890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_97732403_97733009
tx.3278	chr11	-	2032	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000086917.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGCCTTGGGTGGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97794565	97782720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_97784581_97794393
tx.3279	chr11	-	571	2	Intergenic	novelGene_194	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGATTCCTCACAATGGT	7342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97876788	97874994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_97875353_97876575
tx.3280	chr11	-	513	2	NNC	ENSMUSG00000017417.15	novel	2881	14	NA	NA	7	-5913	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGATTCCTCACAATGGT	6912	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97877218	97874994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_97875353_97877063
tx.3281	chr11	-	1300	6	NNC	ENSMUSG00000038352.16	novel	1571	6	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3.05941170815567	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCACTTCTTATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97886755	97880403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_97881166_97883107_97883260_97884250_97884316_97885163_97885312_97885892_97885954_97886643
tx.3282	chr11	-	1320	6	FSM	ENSMUSG00000038352.16	ENSMUST00000042971.16	1571	6	251	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2.57681974534503	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCTCACTTCTTATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97886756	97880403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_97881166_97883107_97883260_97884250_97884335_97885163_97885312_97885892_97885954_97886643
tx.3283	chr11	-	1021	7	NIC	ENSMUSG00000020882.18	novel	1880	13	NA	NA	553	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	22	junction_6	29.3636207273937	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGTCTGGTGTCTGTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97902824	97895750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_97896141_97896513_97896610_97900106_97900259_97900394_97900505_97900683_97900743_97901121_97901203_97902691
tx.3284	chr11	+	703	6	NNC	ENSMUSG00000017404.13	novel	751	6	NA	NA	-3	-10	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	6298.41575636287	616	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTTAGCAGTTTTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97917779	97921308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_97917817_97918648_97918756_97919179_97919295_97920220_97920342_97920600_97920712_97921096
tx.3285	chr11	+	714	6	FSM	ENSMUSG00000017404.13	ENSMUST00000017548.7	751	6	30	7	-3	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	9068	junction_1	2898.60244945732	24825	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTAGCAGTTTTGGCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97917779	97921311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_97917817_97918648_97918756_97919171_97919295_97920220_97920342_97920600_97920712_97921096
tx.3286	chr11	-	2510	15	NIC	ENSMUSG00000020883.19	novel	8601	15	NA	NA	-65	2388	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	15	junction_14	36.7548414137095	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTACCATCAGGGGACCC	2309	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98041294	97979528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_97980525_97981483_97981697_97982970_97983028_97983938_97983984_97985958_97986020_97987754_97987886_97989245_97989321_97990808_97990936_97992526_97992623_98000319_98000389_98001760_98001856_98004046_98004122_98006218_98006274_98019140_98019203_98040941
tx.3287	chr11	-	1390	10	FSM	ENSMUSG00000018160.16	ENSMUST00000129557.2	1372	10	-17	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	68.4675285747617	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGGACTTTGCATATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98084119	98060735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_98061267_98061773_98061848_98062521_98062597_98064046_98064119_98069937_98069967_98070842_98070976_98071079_98071135_98074667_98074747_98080007_98080115_98083884
tx.3288	chr11	+	1736	7	FSM	ENSMUSG00000061718.13	ENSMUST00000078694.13	2001	7	264	1	264	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2.21108319357027	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCTGAGACTCCTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98239493	98248621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_98240001_98241394_98241456_98241710_98241734_98242091_98242168_98246152_98246336_98247650_98247774_98247858
tx.3289	chr11	+	2067	15	FSM	ENSMUSG00000018167.11	ENSMUST00000018311.5	2070	15	16	-13	16	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	120	junction_11	11.573412528335	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGTGTGATGGTGCATTCCT	891	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98249209	98271938	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_98249335_98262895_98263169_98265905_98265984_98266301_98266380_98266500_98266555_98267315_98267434_98267577_98267677_98267890_98267947_98268275_98268369_98268981_98269045_98269160_98269257_98269563_98269644_98269719_98269825_98270798_98270893_98271283
tx.329	chr1	+	1758	8	FSM	ENSMUSG00000025958.15	ENSMUST00000087366.11	8364	8	-7	6613	3	240	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_3	12.7375389286621	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTAGTGTGGTGTTGGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64571970	64637094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_64572180_64590007_64590130_64597661_64597809_64605375_64605477_64609292_64609436_64613231_64613415_64615337_64615489_64636392
tx.3290	chr11	-	726	4	FSM	ENSMUSG00000002580.8	ENSMUST00000002655.8	747	4	9	12	9	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	749	junction_2	62.9567752950829	5408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGTGTCAACTGGCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98329808	98328545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_98328972_98329062_98329140_98329472_98329571_98329683
tx.3291	chr11	+	2219	15	FSM	ENSMUSG00000019312.11	ENSMUST00000019456.5	2397	15	178	0	-36	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	7.18736135624932	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGAGTCCTGTCTGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98337837	98346199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_98338076_98341591_98341749_98341853_98342005_98342131_98342289_98342420_98342543_98342667_98342746_98342944_98343095_98344006_98344118_98344320_98344420_98344618_98344700_98344797_98344915_98345046_98345108_98345223_98345312_98345408_98345503_98345684
tx.3292	chr11	-	992	3	NNC	ENSMUSG00000018168.9	novel	863	3	NA	NA	-110	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTTTGGCAGCATGCTT	4848	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98379956	98375091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_98375688_98376399_98376517_98379677
tx.3293	chr11	-	2058	4	FSM	ENSMUSG00000038150.8	ENSMUST00000052919.8	2184	4	123	3	123	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	195	junction_2	8.33999733546454	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTCTGGCCTCTGCTTC	1446	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98478071	98472084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_98473674_98473961_98474114_98474767_98474967_98477953
tx.3294	chr11	+	815	4	Fusion	ENSMUSG00000017204.5_ENSMUSG00000017211.15	novel	1314	9	NA	NA	3826	-1053	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1.24721912892465	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTTTGAGTCACTTCATT	503	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98546172	98567481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr11_+_98546389_98564503_98564547_98566698_98566773_98566999
tx.3295	chr11	+	922	4	ISM	ENSMUSG00000017204.5	ENSMUST00000017348.3	2726	12	8529	1053	8529	-1053	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0.471404520791032	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTTTGAGTCACTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98563705	98567481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_98563957_98564431_98564547_98566698_98566773_98566999
tx.3296	chr11	+	2135	12	FSM	ENSMUSG00000017221.15	ENSMUST00000017365.15	2148	12	12	1	1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1019	junction_3	95.9435956889203	1040	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCTTGTGCACGGTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98573391	98586804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_98573764_98576307_98576499_98576759_98576898_98578503_98578641_98581288_98581480_98581741_98581846_98584208_98584324_98584404_98584525_98584630_98584735_98584963_98585120_98586188_98586240_98586348
tx.3297	chr11	+	770	4	ISM	ENSMUSG00000017221.15	ENSMUST00000017365.15	2148	12	11248	1	3341	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1133	junction_1	76.1591900050297	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCTTGTGCACGGTGTCA	8704	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98584627	98586804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_98584735_98584963_98585120_98586188_98586240_98586348
tx.3298	chr11	-	393	2	ISM	ENSMUSG00000017210.15	ENSMUST00000144048.2	537	4	415	9871	-154	-9871	internal_fragment	TRUE	canonical	3	151	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATGAATATTACATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98619814	98619334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_98619524_98619610
tx.3299	chr11	+	2101	9	ISM	ENSMUSG00000058756.14	ENSMUST00000064187.12	2452	10	11634	0	-141	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_5	13.1808336231059	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGTGTGCCTCCTCCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98644270	98659832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_98644465_98646933_98647002_98647748_98647850_98651701_98651850_98652546_98652753_98653746_98653894_98654354_98654614_98655103_98655232_98658982
tx.33	chr1	-	204	2	ISM	ENSMUSG00000098234.8	ENSMUST00000182819.8	816	3	830	0	504	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	538	junction_1	0	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTGTGGGCAGTAATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10012618	10012247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_10012381_10012547
tx.330	chr1	+	1781	9	FSM	ENSMUSG00000025958.15	ENSMUST00000190348.2	1260	9	-63	-458	-1	240	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_4	27.9773904251272	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTAGTGTGGTGTTGGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64571989	64637094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_64572180_64590007_64590130_64597661_64597809_64598885_64598928_64605375_64605477_64609292_64609436_64613231_64613415_64615337_64615489_64636392
tx.3300	chr11	+	2047	9	NNC	ENSMUSG00000058756.14	novel	2452	10	NA	NA	-92	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	13.9233392187363	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGTGTGCCTCCTCCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98644319	98659832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_98644465_98646933_98647002_98647748_98647850_98651701_98651850_98652546_98652753_98653746_98653894_98654354_98654614_98655103_98655232_98658987
tx.3301	chr11	+	1571	5	ISM	ENSMUSG00000058756.14	ENSMUST00000064187.12	2452	10	19929	0	8154	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	14	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGTGTGCCTCCTCCAGG	5802	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98652565	98659832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_98652753_98653746_98653894_98654354_98654614_98655103_98655232_98658982
tx.3302	chr11	+	1306	3	NNC	ENSMUSG00000058756.14	novel	2452	10	NA	NA	9869	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	25	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGTGTGCCTCCTCCAGG	7517	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98654280	98659832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_98654614_98655103_98655232_98658987
tx.3303	chr11	+	1190	3	ISM	ENSMUSG00000058756.14	ENSMUST00000124072.2	1240	9	9873	-603	9873	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_2	16.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGTGTGCCTCCTCCAGG	7521	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98654284	98659832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_98654614_98655103_98655232_98659099
tx.3304	chr11	+	1303	3	ISM	ENSMUSG00000058756.14	ENSMUST00000064187.12	2452	10	21652	0	9877	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_2	2	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCGTGTGCCTCCTCCAGG	7525	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98654288	98659832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_98654614_98655103_98655232_98658982
tx.3305	chr11	+	1164	2	ISM	ENSMUSG00000058756.14	ENSMUST00000124072.2	1240	9	9884	3280	9884	12	internal_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAACAAAAACAAAAAG	7532	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98654295	98655949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_98654614_98655103
tx.3306	chr11	-	2680	8	FSM	ENSMUSG00000020889.12	ENSMUST00000064941.7	2721	8	41	0	41	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_7	7.40104791256493	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGCTTCTGTGATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98666118	98658757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_98659246_98659874_98660086_98660528_98660715_98661013_98661658_98662025_98662171_98662262_98662352_98662618_98662961_98665543
tx.3307	chr11	+	1441	5	ISM	ENSMUSG00000038013.15	ENSMUST00000037480.9	7011	8	-3	12186	-3	14	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_1	4.74341649025257	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGAACTCATTGTGGACA	939	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98754460	98783680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_98754729_98775799_98775931_98781525_98781659_98782321_98782439_98782888
tx.3308	chr11	+	2557	12	FSM	ENSMUSG00000017499.16	ENSMUST00000092706.13	4614	12	13	2044	13	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	550	junction_4	61.3919799860826	482	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTTGTCTGGGCTGCATTT	30	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98798639	98812718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_98798808_98799462_98799657_98801012_98801298_98801403_98801604_98802213_98802390_98802984_98803092_98804700_98804841_98805913_98806015_98807779_98807845_98810028_98810232_98811498_98811640_98811941
tx.3309	chr11	+	2423	8	FSM	ENSMUSG00000037992.17	ENSMUST00000107473.3	3238	8	35	780	35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_1	54.9043695521437	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTATACTGAAGGAATTTGT	7473	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98851272	98864988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_98851960_98857172_98857322_98858870_98859013_98860982_98861144_98861318_98861496_98862407_98862613_98863337_98863497_98864245
tx.331	chr1	-	1341	3	FSM	ENSMUSG00000025956.11	ENSMUST00000053469.2	2666	3	724	601	724	-601	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	2	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTAGGTTAGAAATTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64655603	64646239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_64647297_64654256_64654369_64655431
tx.3310	chr11	+	1828	8	NNC	ENSMUSG00000037992.17	novel	2380	9	NA	NA	4414	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_1	85.0267664938998	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAATTTGTGCTGTGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98855651	98864999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_98855733_98857172_98857322_98858870_98859013_98860982_98861144_98861318_98861496_98862407_98862613_98863337_98863497_98864245
tx.3311	chr11	-	825	5	ISM	ENSMUSG00000020914.18	ENSMUST00000068031.8	5221	36	-1	25627	-1	-1977	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1379	junction_1	89.0182565544844	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAAATCCTTTAACTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98915016	98909395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_98909768_98912536_98912601_98913165_98913257_98913665_98913819_98914871
tx.3312	chr11	-	638	3	FSM	ENSMUSG00000020914.18	ENSMUST00000129777.2	632	3	-12	6	-1	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1518	junction_2	50	333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAGAAGCAGTCCAATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98915016	98912916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_98913257_98913665_98913819_98914871
tx.3313	chr11	-	405	2	FSM	ENSMUSG00000037935.17	ENSMUST00000156160.2	610	2	204	1	204	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	763	junction_1	0	381	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATGTGGTCTGTGTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99104065	99100818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_99101104_99103945
tx.3314	chr11	-	1418	11	FSM	ENSMUSG00000037935.17	ENSMUST00000103133.4	2919	11	551	950	-20	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	598	junction_2	51.2922021363872	758	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGTTATGTGGTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99121292	99100822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_99101104_99103945_99104157_99104859_99104962_99105939_99106113_99110045_99110218_99110440_99110573_99111480_99111562_99115863_99115969_99119100_99119145_99119322_99119375_99121227
tx.3315	chr11	-	1314	10	NIC	ENSMUSG00000037935.17	novel	2919	11	NA	NA	-21	-5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	48	junction_7	198.840962568234	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTGTTATGTGGTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99121293	99100822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_99101104_99103945_99104157_99104859_99104962_99105939_99106113_99110045_99110218_99110440_99110573_99111480_99111562_99119100_99119145_99119322_99119375_99121227
tx.3316	chr11	-	2307	10	NIC	ENSMUSG00000037935.17	novel	2919	11	NA	NA	-14	-3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	18	junction_9	208.072874223562	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGGTCTCAGTGTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99121286	99099875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_99101104_99103945_99104157_99104859_99104962_99105939_99106113_99110045_99110218_99110440_99110573_99111480_99111562_99115863_99115969_99119100_99119145_99121227
tx.3317	chr11	-	1206	4	FSM	ENSMUSG00000035849.15	ENSMUST00000154622.2	757	4	221	-670	221	-383	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTTTATCTTAAAGCTTT	3052	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99129480	99125098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_99125974_99126962_99127096_99127290_99127368_99129359
tx.3318	chr11	-	1628	6	FSM	ENSMUSG00000035849.15	ENSMUST00000103132.10	3072	6	-68	1512	-50	-383	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.35646599662505	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTTTATCTTAAAGCTTT	6746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99134961	99125098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_99125974_99126962_99127096_99127290_99127368_99129359_99129581_99131318_99131448_99134768
tx.3319	chr11	-	568	2	ISM	ENSMUSG00000019761.11	ENSMUST00000103131.5	2094	8	3249	0	-18	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_1	0	944	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTGTCAGAATTATTATTTA	8321	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99276941	99276079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_99276463_99276756
tx.332	chr1	-	1410	4	FSM	ENSMUSG00000025956.11	ENSMUST00000114079.9	2030	4	12	608	12	-601	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_3	6.34209919681348	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTAGGTTAGAAATTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64656389	64646239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_64647297_64654256_64654369_64655431_64655604_64656320
tx.3320	chr11	-	879	4	ISM	ENSMUSG00000020912.5	ENSMUST00000017741.4	1852	8	3839	3	3839	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.62466929133727	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGAAGTGTGTGCCTCTCCT	9351	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99309246	99306494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_99306935_99307720_99307792_99308740_99308962_99309099
tx.3321	chr11	+	731	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000086688.5	novel	948	1	NA	NA	633	939	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACATGGAAAAATATTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99823620	99824874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_+_99824147_99824669
tx.3322	chr11	-	1423	6	FSM	ENSMUSG00000020911.15	ENSMUST00000007317.8	1576	6	153	0	153	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_5	2.56124969497314	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATACCTTGCTTATTTCAG	9752	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100036793	100031635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100031994_100032105_100032232_100032348_100032511_100032877_100033035_100033251_100033335_100036256
tx.3323	chr11	-	794	5	ISM	ENSMUSG00000035557.10	ENSMUST00000080893.7	1551	8	2480	0	2480	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_4	2.1650635094611	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGTGGACTGGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100149375	100147042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_100147323_100148145_100148172_100148258_100148480_100148568_100148695_100149234
tx.3324	chr11	-	1533	8	FSM	ENSMUSG00000035557.10	ENSMUST00000080893.7	1551	8	-28	46	-28	-46	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_4	2.1946130708196	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGCCTTTGTTCTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100151883	100147088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100147323_100148145_100148172_100148258_100148480_100148568_100148695_100149234_100149397_100149998_100150156_100150520_100150604_100151359
tx.3325	chr11	-	1024	5	FSM	ENSMUSG00000053654.8	ENSMUST00000107406.2	1062	5	33	5	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	11.3688170009021	265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTGAATTCATCATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100156771	100153712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100153994_100154119_100154170_100155303_100155525_100155754_100155881_100156425
tx.3326	chr11	-	1690	8	FSM	ENSMUSG00000053654.8	ENSMUST00000017270.8	1542	8	-144	-4	-144	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_5	18.9510648023497	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATTCATCATTTGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100160841	100153708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100153994_100154119_100154170_100155303_100155525_100155754_100155881_100156425_100156588_100157760_100157918_100158025_100158109_100160235
tx.3327	chr11	+	661	4	FSM	ENSMUSG00000035530.14	ENSMUST00000049385.14	1322	4	101	560	101	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	11207	junction_1	646.711854091312	80243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTAGTCTTGAAGTCCC	4058	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100210811	100212362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_100210987_100211491_100211656_100211773_100211876_100212142
tx.3328	chr11	+	587	3	FSM	ENSMUSG00000035530.14	ENSMUST00000139846.2	447	3	48	-188	48	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	12221	junction_1	273.5	5475	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTAGTCTTGAAGTCCCT	4638	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100211391	100212363	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_100211656_100211773_100211876_100212142
tx.3329	chr11	-	3108	13	NNC	ENSMUSG00000006930.16	novel	3316	12	NA	NA	-7	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	46	junction_2	196.783863385413	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCCTGTCTCAGTTGTG	2041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100246920	100238154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_100239306_100239477_100239686_100240062_100240446_100242035_100242128_100242243_100242379_100242668_100242732_100243010_100243142_100244369_100244437_100244513_100244614_100244782_100244962_100245071_100245189_100245497_100245575_100246515
tx.333	chr1	-	713	2	FSM	ENSMUSG00000087213.3	ENSMUST00000150749.2	711	2	3	-5	3	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_1	0	693	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGCTACCTATGTGGTTT	7930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64729815	64719024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_64719545_64729622
tx.3330	chr11	-	3649	11	FSM	ENSMUSG00000006930.16	ENSMUST00000103124.11	2120	11	1	-1530	1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	486	junction_1	44.9070150421958	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCCTGTCTCAGTTGTG	2049	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100246912	100238154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100240446_100242035_100242128_100242243_100242379_100242668_100242732_100243010_100243142_100244369_100244437_100244513_100244614_100244782_100244962_100245071_100245189_100245497_100245575_100246515
tx.3331	chr11	-	1727	3	NNC	ENSMUSG00000006930.16	novel	3316	12	NA	NA	2301	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	46	junction_2	6	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCCCTGTCTCAGTTGTG	8531	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100240430	100238154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_100239306_100239477_100239686_100240062
tx.3332	chr11	-	480	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000091478.3	novel	411	1	NA	NA	-32	115	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTGCCTGTGCCTGTCT	8044	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100252984	100252426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_-_100252836_100252913
tx.3333	chr11	-	1707	6	ISM	ENSMUSG00000001552.15	ENSMUST00000001592.15	3205	14	20630	0	-2994	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	472	junction_4	54.0014814611599	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGGCTGTTAAAAGCATT	6794	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100267945	100261444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_100262276_100263121_100263288_100263481_100263522_100264903_100265026_100265151_100265303_100267548
tx.3334	chr11	-	1534	7	ISM	ENSMUSG00000006931.16	ENSMUST00000066489.13	2178	8	728	13	728	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_5	10.1159939369957	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATCATAACACCTGAGGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100304934	100299294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_100299971_100300188_100300334_100301939_100302024_100302554_100302701_100303526_100303656_100304434_100304607_100304752
tx.3335	chr11	+	1564	5	ISM	ENSMUSG00000001555.11	ENSMUST00000001595.10	2584	10	6279	-13	-1062	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_1	4.63680924774785	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACAGATGTCTGGTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100312801	100315663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_100312916_100313451_100313645_100313910_100314054_100314261_100314426_100314713
tx.3336	chr11	+	1072	2	ISM	ENSMUSG00000001555.11	ENSMUST00000125616.2	767	3	435	-532	435	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTGGACAGATGTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100314298	100315658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_100314426_100314713
tx.3337	chr11	-	1354	8	FSM	ENSMUSG00000017176.18	ENSMUST00000107397.2	1348	8	-1	-5	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	485	junction_1	42.2470866040561	441	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCACGCGTCTTTAATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100331755	100320179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100320776_100321902_100322104_100323743_100323907_100325520_100325611_100326980_100327067_100330865_100330913_100331010_100331081_100331654
tx.3338	chr11	-	1381	9	FSM	ENSMUSG00000017176.18	ENSMUST00000092688.12	1399	9	17	1	1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_8	92.107868149252	1232	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCACGCGTCTTTAATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100331898	100320179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100320776_100321902_100322104_100323743_100323907_100325520_100325611_100326980_100327067_100330865_100330913_100331010_100331081_100331654_100331754_100331869
tx.3339	chr11	+	1309	4	NNC	ENSMUSG00000001558.6	novel	2017	5	NA	NA	-789	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	6.59966329107444	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAGTACTGGAAAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100331953	100347850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_100332042_100337946_100338565_100347109_100347260_100347397
tx.334	chr1	-	689	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084416.4	novel	654	1	NA	NA	-27	48	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65033790	65033061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_65033407_65033446
tx.3340	chr11	+	955	3	ISM	ENSMUSG00000001558.6	ENSMUST00000001599.4	2017	5	5470	-2	5460	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAGTACTGGAAAATGTT	3802	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100338212	100347850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_100338565_100347109_100347260_100347397
tx.3341	chr11	-	4263	28	FSM	ENSMUSG00000020917.18	ENSMUST00000007131.16	4393	28	131	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2198	junction_15	363.337822300204	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCGTGATGCTCTTTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100418695	100367180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100368165_100368840_100368918_100369153_100369237_100370009_100370124_100372202_100372347_100372522_100372674_100372970_100373126_100374534_100374629_100375425_100375554_100383330_100383442_100384362_100384445_100384709_100384907_100386685_100386791_100389010_100389180_100389446_100389589_100395028_100395120_100395680_100395836_100403701_100403820_100405101_100405164_100405787_100405925_100406727_100406847_100407601_100407733_100409914_100409995_100410440_100410632_100411116_100411180_100412807_100412931_100414265_100414448_100418620
tx.3342	chr11	-	1254	4	FSM	ENSMUSG00000020917.18	ENSMUST00000154151.2	601	4	219	-872	219	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3649	junction_3	158.779371736032	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTGATGCTCTTTTATGTT	7013	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100370118	100367179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100368165_100368840_100368918_100369153_100369237_100370009
tx.3343	chr11	-	588	5	ISM	ENSMUSG00000020917.18	ENSMUST00000107385.2	1741	15	-1	19083	-1	-19083	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	3763	junction_2	176.785887445803	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATTAAGAGACACCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100418696	100410487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_100410632_100411116_100411180_100412807_100412931_100414265_100414448_100418620
tx.3344	chr11	-	382	3	ISM	ENSMUSG00000020917.18	ENSMUST00000107385.2	1741	15	0	21401	0	-21401	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	4093	junction_2	23.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTCTTGGTGTAGTGATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100418695	100412805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_100412931_100414265_100414448_100418620
tx.3345	chr11	+	1259	7	ISM	ENSMUSG00000006784.15	ENSMUST00000092684.12	2240	12	8051	0	4111	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	3.53160335006952	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTTGAGTGACACTGTGC	2533	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100444483	100462789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_100444541_100444689_100444898_100452643_100452731_100454355_100454553_100457734_100457836_100460681_100460767_100462265
tx.3346	chr11	+	1396	6	NIC	ENSMUSG00000006784.15	novel	2240	12	NA	NA	4123	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	29	junction_1	2.60768096208106	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTTGAGTGACACTGTGC	2545	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100444495	100462789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_100444898_100452643_100452731_100454355_100454553_100457734_100457836_100460681_100460767_100462265
tx.3347	chr11	+	2292	4	FSM	ENSMUSG00000006782.17	ENSMUST00000103120.5	2357	4	65	0	65	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_2	8.2192186706253	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGTGCTATCACTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100465794	100472554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_100465895_100467061_100467732_100469738_100469879_100471172
tx.3348	chr11	+	1775	3	FSM	ENSMUSG00000006782.17	ENSMUST00000150414.8	2904	3	1129	0	762	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_1	6	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGTGCTATCACTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100467478	100472554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_100467732_100469738_100469879_100471172
tx.3349	chr11	-	1789	14	FSM	ENSMUSG00000014195.17	ENSMUST00000014339.15	2330	14	541	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2240	junction_1	249.671049855795	3823	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGTCCTTGGCTTTGGC	5923	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100510453	100473643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100473963_100474419_100474483_100475036_100475190_100475377_100475525_100475807_100475882_100480723_100480816_100481712_100481878_100482237_100482392_100483680_100483800_100486991_100487067_100489440_100489555_100490010_100490136_100492553_100492643_100510353
tx.335	chr1	-	578	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084416.4	novel	654	1	NA	NA	-31	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65033794	65033059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_65033603_65033759
tx.3350	chr11	+	1951	2	NNC	ENSMUSG00000017837.13	novel	1727	4	NA	NA	-36	-3626	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGTGCTATTGTGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100510033	100512078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_100510774_100510867
tx.3351	chr11	+	1986	5	NIC	ENSMUSG00000017837.13	novel	988	6	NA	NA	19	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	52	junction_3	123.71413621733	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCCCGTCCCCTACCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100513720	100518433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_100513835_100515017_100515126_100515768_100515843_100515934_100516011_100516819
tx.3352	chr11	+	2071	4	FSM	ENSMUSG00000017837.13	ENSMUST00000017981.10	2097	4	26	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	328	junction_1	10.0332779621949	347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCCCGTCCCCTACCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100513727	100518433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_100513835_100515017_100515126_100515768_100516011_100516819
tx.3353	chr11	-	2085	13	ISM	ENSMUSG00000020918.15	ENSMUST00000103118.4	3046	18	1863	0	1571	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_10	122.715004063163	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGATTGTTTTTTGGGGGG	8642	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100601428	100595571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_100596258_100596401_100596487_100596586_100596651_100596784_100596822_100596908_100597024_100597175_100597320_100597683_100597795_100599034_100599162_100599372_100599582_100599671_100599812_100599901_100600004_100600208_100600316_100601270
tx.3354	chr11	-	3034	18	FSM	ENSMUSG00000020918.15	ENSMUST00000103118.4	3046	18	12	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_10	104.829867108865	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGATTGTTTTTTGGGGGG	6791	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100603279	100595571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100596258_100596401_100596487_100596586_100596651_100596784_100596822_100596908_100597024_100597175_100597320_100597683_100597795_100599034_100599162_100599372_100599582_100599671_100599812_100599901_100600004_100600208_100600316_100601270_100601463_100601547_100601730_100601965_100602056_100602158_100602305_100602638_100602763_100602906
tx.3355	chr11	-	3040	18	FSM	ENSMUSG00000020918.15	ENSMUST00000006973.12	3043	18	0	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	387	junction_12	55.3609733498447	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGTGATTGTTTTTTGGG	6779	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100603291	100595574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100596258_100596401_100596487_100596586_100596651_100596784_100596822_100596908_100597024_100597175_100597320_100597683_100597795_100599034_100599162_100599372_100599582_100599671_100599809_100599901_100600004_100600208_100600316_100601270_100601463_100601547_100601730_100601965_100602056_100602158_100602305_100602638_100602763_100602906
tx.3356	chr11	-	1465	5	ISM	ENSMUSG00000019173.12	ENSMUST00000107364.8	1915	6	18102	257	10102	-255	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_2	16.3152535990097	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTTGTCTTCCTCGTCCTT	9248	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100610939	100606091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_100606989_100607583_100607678_100608667_100608791_100609256_100609409_100610740
tx.3357	chr11	-	1640	6	FSM	ENSMUSG00000019173.12	ENSMUST00000107364.8	1915	6	15	260	15	-258	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_2	14.961283367412	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCACGCTTGTCTTCCTCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100629026	100606094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100606989_100607583_100607678_100608667_100608791_100609256_100609409_100610740_100610995_100628903
tx.3358	chr11	-	822	3	NNC	ENSMUSG00000045471.5	novel	586	2	NA	NA	-713	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATGTTTCTGTGTGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100654470	100652516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_100652992_100653646_100653838_100654314
tx.3359	chr11	+	1751	5	NNC	ENSMUSG00000004043.15	novel	3888	20	NA	NA	1694	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	11.8400802362146	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACCAGTCTGCTTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100771538	100775992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_100771644_100771855_100772012_100772563_100772616_100772887_100772993_100774659
tx.3360	chr11	-	4350	24	FSM	ENSMUSG00000004040.17	ENSMUST00000103114.8	6042	24	-15	1707	-15	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_2	102.13864331127	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGGGGCTGGCTGGCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100830245	100777630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100779587_100780303_100780367_100780711_100780755_100783899_100784113_100784490_100784631_100784716_100784812_100784989_100785043_100785526_100785663_100785889_100785989_100787148_100787233_100789276_100789325_100789433_100789528_100789619_100789650_100793562_100793623_100794247_100794341_100794429_100794589_100795732_100795885_100796029_100796125_100796418_100796501_100796658_100796755_100798816_100798916_100799485_100799631_100802059_100802211_100830081
tx.3361	chr11	-	4413	24	FSM	ENSMUSG00000004040.17	ENSMUST00000127638.8	4516	24	101	2	-35	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	387	junction_2	54.0525544164325	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGCAGTGGGGGCTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100830265	100777637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100779587_100780303_100780417_100780711_100780755_100783899_100784113_100784490_100784631_100784716_100784812_100784989_100785043_100785526_100785663_100785889_100785989_100787148_100787233_100789276_100789325_100789433_100789528_100789619_100789650_100793562_100793623_100794247_100794341_100794429_100794589_100795732_100795885_100796029_100796125_100796418_100796501_100796658_100796755_100798816_100798916_100799485_100799631_100802059_100802211_100830081
tx.3362	chr11	-	1469	2	ISM	ENSMUSG00000004040.17	ENSMUST00000138438.2	2506	24	30	21429	30	-4454	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	630	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGCCAAAGAGAAAGTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100830275	100800935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_100802211_100830081
tx.3363	chr11	+	2086	10	FSM	ENSMUSG00000001755.13	ENSMUST00000001806.10	2138	10	52	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_1	26.2908705931015	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTGTGTGGTTTTCTGTT	3563	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100973442	100977445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_100973517_100973824_100974533_100975141_100975357_100975580_100975713_100975833_100976024_100976107_100976173_100976361_100976447_100976615_100976714_100976823_100976971_100977073
tx.3364	chr11	+	1810	8	FSM	ENSMUSG00000017801.16	ENSMUST00000107302.8	1826	8	12	4	-1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	91.1912097446562	492	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGGATTGTTTTAAGTCC	8235	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100978114	100983029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_100978194_100978579_100978617_100979061_100979152_100979423_100979531_100979758_100979859_100980044_100980145_100980493_100980696_100981934
tx.3365	chr11	+	1962	8	FSM	ENSMUSG00000017801.16	ENSMUST00000017945.15	1965	8	-2	5	-2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_1	39.4052726193346	203	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGGATTGTTTTAAGTC	8244	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100978123	100983028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_100978356_100978579_100978617_100979061_100979152_100979423_100979531_100979758_100979859_100980044_100980145_100980493_100980696_100981934
tx.3366	chr11	-	1003	7	FSM	ENSMUSG00000019303.15	ENSMUST00000126386.8	1030	7	11	16	11	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	369	junction_2	24.7571538482651	365	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGGATGATCAAACCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100986215	100982973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100983283_100983357_100983418_100983549_100983604_100983688_100983835_100984506_100984619_100985761_100985852_100985983
tx.3367	chr11	-	942	8	FSM	ENSMUSG00000019303.15	ENSMUST00000019447.15	1291	8	24	325	-12	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_7	41.1021624139417	1805	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGGATGATCAAACCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100986238	100982973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100983283_100983357_100983418_100983549_100983604_100983688_100983835_100984506_100984619_100985761_100985852_100985983_100986085_100986168
tx.3368	chr11	-	3111	9	FSM	ENSMUSG00000017802.15	ENSMUST00000017946.6	3165	9	52	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_5	11.6162601554889	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGCTGTTTCGTTGTGTA	9847	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101010667	100987340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_100989447_100989833_100989967_100990498_100990582_100991747_100991886_100992831_100992917_100993708_100993836_100994715_100994747_100997132_100997240_101010366
tx.3369	chr11	+	1621	11	FSM	ENSMUSG00000035198.10	ENSMUST00000043680.9	1802	11	181	0	181	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	373	junction_8	104.461715475096	1265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACCCCCCGGTCTCTGAA	1411	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101010944	101017245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_101011069_101011372_101011486_101011656_101011825_101013498_101013568_101014239_101014320_101014738_101014866_101015058_101015146_101015248_101015399_101015795_101015949_101016028_101016191_101016857
tx.337	chr1	-	697	3	FSM	ENSMUSG00000067299.12	ENSMUST00000045028.15	613	3	-54	-30	-54	30	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	4.5	664	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTATTTGCTTCTGTTTTTT	7566	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65102665	65101000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_65101342_65102217_65102461_65102552
tx.3370	chr11	-	558	2	ISM	ENSMUSG00000035172.16	ENSMUST00000139200.8	1410	6	1943	0	1647	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTCCTGTGGGAGTGTTG	8365	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101054503	101053504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101053891_101054331
tx.3371	chr11	-	2887	15	ISM	ENSMUSG00000006920.15	ENSMUST00000107285.8	4193	21	8	7033	0	489	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_14	16.7309135849706	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATGGGTTGAGTGTGGTA	2626	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101117268	101088974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101090210_101090771_101090813_101091661_101091754_101094080_101094278_101094586_101094768_101098163_101098256_101098947_101099112_101100205_101100309_101101372_101101550_101104549_101104671_101106008_101106129_101107820_101107950_101108068_101108190_101109479_101109547_101117221
tx.3372	chr11	-	419	4	ISM	ENSMUSG00000006920.15	ENSMUST00000107285.8	4193	21	24	25808	0	1471	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_3	16.6733320005331	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTTGTCTGCTGTCACC	2642	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101117252	101107749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101107950_101108068_101108190_101109479_101109547_101117221
tx.3373	chr11	+	1083	6	FSM	ENSMUSG00000078656.12	ENSMUST00000042477.13	1106	6	21	2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1136	junction_3	45.4682306671372	7273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCGGCCTGTTACTACTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101144553	101150373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_101144634_101144856_101145003_101145768_101145823_101146834_101146924_101147703_101147780_101149735
tx.3374	chr11	-	727	2	FSM	ENSMUSG00000017188.4	ENSMUST00000017332.4	886	2	159	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1870	junction_1	0	1800	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAAGCTAGTGTGTGGGGG	5661	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101169781	101168793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_101169279_101169539
tx.3375	chr11	-	2029	12	FSM	ENSMUSG00000035086.14	ENSMUST00000130916.8	4365	12	26	2310	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	365	junction_8	49.9747043451001	673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAGTGGTACGCCTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101193086	101179087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_101179808_101180608_101180752_101181264_101181326_101182208_101182359_101184826_101184974_101185795_101185991_101186120_101186258_101186359_101186451_101187083_101187143_101189834_101189903_101192553_101192683_101192957
tx.3376	chr11	+	2536	10	NIC	ENSMUSG00000078652.10	novel	2664	11	NA	NA	17	-6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	51	junction_3	427.085471539363	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCAGACCCTGGTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101207055	101214357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_101207315_101208006_101208040_101208154_101208218_101210281_101210331_101210737_101210851_101211036_101211106_101211222_101211291_101211386_101211442_101211552_101211640_101212617
tx.3377	chr11	+	2632	10	NNC	ENSMUSG00000078652.10	novel	2664	11	NA	NA	12	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	443.121949048335	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCAGACCCTGGTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101207050	101214357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_101207315_101208135_101208218_101208448_101208554_101210281_101210331_101210737_101210851_101211036_101211106_101211222_101211291_101211386_101211442_101211552_101211640_101212617
tx.3378	chr11	+	2639	11	FSM	ENSMUSG00000078652.10	ENSMUST00000019470.14	2664	11	19	6	19	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1173	junction_6	119.560068584791	948	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCAGACCCTGGTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101207057	101214357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_101207315_101208006_101208040_101208154_101208218_101208448_101208554_101210281_101210331_101210737_101210851_101211036_101211106_101211222_101211291_101211386_101211442_101211552_101211640_101212617
tx.3379	chr11	-	338	3	ISM	ENSMUSG00000075528.14	ENSMUST00000070395.9	1516	12	7906	0	4870	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	603	junction_1	58.5	470	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTTGTATACTGCCATT	1725	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101300535	101297664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101297851_101298956_101299052_101300478
tx.338	chr1	-	720	3	FSM	ENSMUSG00000025952.16	ENSMUST00000027089.15	783	3	57	6	57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGACTTCTGTTATTCTT	745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65112791	65110689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_65111031_65112320_65112564_65112655
tx.3380	chr11	-	361	4	ISM	ENSMUSG00000075528.14	ENSMUST00000070395.9	1516	12	7477	0	4441	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	563	junction_3	66.6149799636355	330	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTTGTATACTGCCATT	1296	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101300964	101297664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101297851_101298956_101299052_101300478_101300534_101300939
tx.3381	chr11	-	1314	12	FSM	ENSMUSG00000075528.14	ENSMUST00000070395.9	1516	12	202	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	448	junction_11	68.1448384565145	1980	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTTGTATACTGCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101308239	101297664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_101297851_101298956_101299052_101300478_101300534_101300939_101301032_101301179_101301247_101301586_101301718_101301908_101302026_101302119_101302277_101302765_101302824_101304762_101304923_101307928_101308061_101308175
tx.3382	chr11	-	719	5	ISM	ENSMUSG00000097487.8	ENSMUST00000107252.9	853	7	593	-1	156	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	8	junction_2	1.4790199457749	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCCTTCCCTTCCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101314902	101309636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101310013_101310500_101310555_101312690_101312781_101314605_101314705_101314802
tx.3383	chr11	-	1031	7	FSM	ENSMUSG00000097487.8	ENSMUST00000107252.9	853	7	-177	-1	-177	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_6	3.45205252953466	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCCTTCCCTTCCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101315672	101309636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_101310013_101310500_101310555_101312690_101312781_101314605_101314705_101314802_101314870_101314980_101315095_101315441
tx.3384	chr11	+	518	5	FSM	ENSMUSG00000063316.14	ENSMUST00000077856.13	614	5	96	0	-44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8302	junction_4	1985.8892844265	93474	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAAGTGTCTGCCTATTGC	2337	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101333219	101336355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_101333283_101333548_101333632_101334326_101334497_101336045_101336157_101336264
tx.3385	chr11	+	725	4	FSM	ENSMUSG00000063316.14	ENSMUST00000107249.8	732	4	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8302	junction_3	2031.83972465022	8266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAAGTGTCTGCCTATTGC	2396	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101333278	101336355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_101333632_101334326_101334497_101336045_101336157_101336264
tx.3386	chr11	-	2242	5	ISM	ENSMUSG00000034993.8	ENSMUST00000040430.8	2766	6	3118	-3	3118	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	328	junction_1	11.7127067751225	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGACCAGATGTTGTATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101353938	101349567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101351103_101351202_101351445_101353023_101353114_101353215_101353387_101353734
tx.3387	chr11	-	2748	6	FSM	ENSMUSG00000034993.8	ENSMUST00000040430.8	2766	6	23	-5	23	5	multi-exon	TRUE	canonical	3	320	junction_5	13.7462722219517	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACCAGATGTTGTATCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101357033	101349565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_101351103_101351202_101351445_101353023_101353114_101353215_101353387_101353734_101353943_101356533
tx.3388	chr11	-	465	6	ISM	ENSMUSG00000017146.13	ENSMUST00000017290.11	6572	23	0	43362	0	-43	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	286	junction_5	13.2725280184296	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTCTTGTGAGCGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101442705	101422951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101422986_101424764_101424854_101426353_101426432_101430806_101430861_101439840_101439940_101442594
tx.3389	chr11	-	680	4	NNC	ENSMUSG00000017146.13	novel	1917	9	NA	NA	15	-7540	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_3	141.930342852479	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACATAGCCATGTTGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101442690	101430448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_101430861_101439840_101439940_101441522_101441596_101442594
tx.339	chr1	-	853	4	NNC	ENSMUSG00000044816.11	novel	1156	8	NA	NA	12873	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_3	4.02768199119819	84	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGATGTCAGCTCTTTCTG	9992	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65149400	65144439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_65144910_65148620_65148736_65149035_65149124_65149220
tx.3390	chr11	+	1491	9	FSM	ENSMUSG00000034947.14	ENSMUST00000039581.14	2304	9	2	811	0	211	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	4.99843725578305	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGGTCCTCATCCTCCCAG	3690	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101473069	101481803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_101473152_101473450_101473531_101474383_101474611_101475271_101475336_101477064_101477219_101479678_101479820_101479923_101479968_101480760_101480815_101481158
tx.3391	chr11	+	1341	8	ISM	ENSMUSG00000034947.14	ENSMUST00000039581.14	2304	9	382	880	324	142	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_4	3.76883027379226	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTACTGTCTTGCTTTGATC	4070	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101473449	101481734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_101473531_101474383_101474611_101475271_101475336_101477064_101477219_101479678_101479820_101479923_101479968_101480760_101480815_101481158
tx.3392	chr11	+	1362	2	FSM	ENSMUSG00000034936.3	ENSMUST00000039388.3	1382	2	20	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTTTGATCTGGTAACT	2570	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101556386	101558658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_101556464_101557373
tx.3393	chr11	+	562	5	ISM	ENSMUSG00000034931.16	ENSMUST00000039152.14	4325	23	33	29591	33	2071	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_3	12.0830459735946	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTCCTTATGTCCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101623808	101628593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_101624015_101624981_101625068_101626203_101626277_101626634_101626721_101628482
tx.3394	chr11	+	368	4	ISM	ENSMUSG00000034931.16	ENSMUST00000039152.14	4325	23	66	31514	-13	148	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_3	11.4309521329882	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGGAACTCTTCCCCGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101623841	101626670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_101624015_101624981_101625068_101626203_101626277_101626634
tx.3395	chr11	+	1082	3	FSM	ENSMUSG00000034931.16	ENSMUST00000125409.2	675	3	99	-506	-11	506	multi-exon	FALSE	canonical	3	198	junction_1	2	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAGAATATGAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101623843	101627028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_101624015_101624981_101625068_101626203
tx.3396	chr11	+	2399	11	ISM	ENSMUSG00000034931.16	ENSMUST00000039152.14	4325	23	17963	0	-866	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_9	27.2361891607471	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGGTTTATTATGACTTT	1690	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101641738	101658184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_101641899_101642836_101643023_101643110_101643322_101643973_101644156_101645557_101645699_101648418_101648575_101653034_101653173_101654722_101654852_101654970_101655168_101655603_101655784_101657465
tx.3397	chr11	-	1318	6	ISM	ENSMUSG00000017724.15	ENSMUST00000164750.8	2336	13	11648	4	-1481	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_2	2.71293199325011	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTATTTGCTCTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101664488	101660571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101661417_101661794_101661897_101662153_101662327_101662514_101662584_101662706_101662782_101664434
tx.3398	chr11	-	2188	11	ISM	ENSMUSG00000017724.15	ENSMUST00000017868.7	2395	13	879	1	-1	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	11	junction_8	4.15210789840534	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTCTATTTGCTCTTTGC	162	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101675318	101660573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_101661417_101661794_101661897_101662153_101662327_101662514_101662584_101662706_101662782_101664434_101664704_101664906_101665072_101666143_101666271_101667918_101667973_101674792_101674841_101675055
tx.3399	chr11	-	769	4	NIC	ENSMUSG00000003518.14	novel	4311	4	NA	NA	0	7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_1	5.31245915016974	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTTCTCATTATTTGTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101875604	101864287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_101864469_101865571_101865766_101872442_101872670_101875437
tx.34	chr1	-	316	3	FSM	ENSMUSG00000098234.8	ENSMUST00000182819.8	816	3	500	0	174	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	538	junction_1	75	594	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTGTGGGCAGTAATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10012948	10012247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_10012381_10012547_10012617_10012834
tx.340	chr1	-	2200	9	FSM	ENSMUSG00000025950.17	ENSMUST00000097709.11	2302	9	95	7	95	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	773	junction_5	91.7393556495793	367	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAAGTGTTTATTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65218245	65197781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_65198715_65200208_65200372_65200958_65201100_65204258_65204411_65205265_65205444_65207657_65207764_65210117_65210410_65214389_65214528_65218148
tx.3400	chr11	-	1888	3	FSM	ENSMUSG00000003518.14	ENSMUST00000003612.13	4212	3	2	2322	2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	3.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACGTTCTCATTATTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101875623	101864290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_101865766_101872442_101872670_101875437
tx.3401	chr11	-	590	4	FSM	ENSMUSG00000017311.16	ENSMUST00000017455.15	555	4	-35	0	-35	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCGTGTGTTTTTTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101998693	101997501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_101997693_101997798_101997883_101997990_101998179_101998566
tx.3402	chr11	+	1285	5	ISM	ENSMUSG00000048217.12	ENSMUST00000147252.2	1709	6	519	3	519	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	2.69258240356725	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACACTTGTCTCAAAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102037710	102040300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_102037903_102038189_102038371_102038635_102038808_102038917_102039101_102039743
tx.3403	chr11	+	1087	3	ISM	ENSMUSG00000048217.12	ENSMUST00000147252.2	1709	6	1268	4	1268	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCACACTTGTCTCAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102038459	102040299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_102038808_102038917_102039101_102039743
tx.3404	chr11	-	1571	4	FSM	ENSMUSG00000020921.7	ENSMUST00000021296.7	1574	4	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_3	22.1710521977545	552	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTTTGCTTCTGTCT	4468	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102047227	102043371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102044421_102045382_102045530_102046549_102046731_102047033
tx.3405	chr11	-	1378	3	ISM	ENSMUSG00000020921.7	ENSMUST00000021296.7	1574	4	499	0	442	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_1	16	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTGTCTTTGCTTCTGTCT	4964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102046731	102043371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102044421_102045382_102045530_102046549
tx.3406	chr11	-	2205	5	FSM	ENSMUSG00000020922.12	ENSMUST00000021297.6	2256	5	36	15	1	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	919	junction_1	21.856063231973	1015	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTAACCATCACTGAT	6392	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102076086	102053337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102054994_102056185_102056313_102057912_102058023_102073683_102073818_102075908
tx.3407	chr11	+	1479	6	FSM	ENSMUSG00000034793.16	ENSMUST00000078975.8	1573	6	94	0	8	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	149	junction_4	4.31740662898458	543	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTTCTTGTCTGTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102080588	102084907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_102080970_102082860_102082968_102083298_102083390_102083574_102083694_102083910_102084053_102084268
tx.3408	chr11	-	711	6	ISM	ENSMUSG00000008855.18	ENSMUST00000124077.8	3872	28	32716	-2	-238	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	213	junction_1	20.976176963403	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACGTGTGCCGTGTGGGTC	9727	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102088249	102086572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102086695_102086777_102086944_102087063_102087149_102087364_102087499_102087884_102088004_102088164
tx.3409	chr11	-	1689	15	ISM	ENSMUSG00000008855.18	ENSMUST00000124077.8	3872	28	27971	-2	-1352	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	78	junction_13	45.4461443998974	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACGTGTGCCGTGTGGGTC	8325	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102092994	102086572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102086695_102086777_102086944_102087063_102087149_102087364_102087499_102087884_102088004_102088164_102088263_102088491_102088612_102089622_102089711_102089830_102089887_102090191_102090300_102090461_102090512_102090794_102090916_102091225_102091360_102092058_102092231_102092878
tx.341	chr1	-	727	3	ISM	ENSMUSG00000025950.17	ENSMUST00000097709.11	2302	9	95	12143	95	361	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	861	junction_2	70.5	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACATTTTCCCCAAATATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65218245	65209917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_65210410_65214389_65214528_65218148
tx.3410	chr11	+	2564	10	FSM	ENSMUSG00000034773.17	ENSMUST00000100392.5	2547	10	-22	5	-22	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_3	21.1502561056204	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGCCTCCGTCCCACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102139685	102156008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_102139919_102141504_102141556_102145779_102146848_102148712_102148797_102150145_102150287_102150659_102150769_102150904_102150991_102151316_102151443_102153008_102153127_102155460
tx.3411	chr11	+	1149	3	ISM	ENSMUSG00000034773.17	ENSMUST00000133930.8	2813	11	-25	9372	-25	-4799	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	313	junction_2	11.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTCTTCTGTTGAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102139682	102146641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_102139919_102141504_102141556_102145779
tx.3412	chr11	+	2089	3	ISM	ENSMUSG00000034768.5	ENSMUST00000036467.5	2843	5	7741	0	7741	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_2	14	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGTGGACATTGTAGGGTT	3456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102167309	102170288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_102167698_102168003_102168118_102168701
tx.3413	chr11	+	2254	3	FSM	ENSMUSG00000034757.16	ENSMUST00000156326.2	2249	3	-7	2	-7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_1	18.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGAGCCTCTTTGTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102176014	102180061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_102176545_102178133_102178698_102178901
tx.3414	chr11	-	2520	2	ISM	ENSMUSG00000059995.13	ENSMUST00000145484.2	3102	7	1531	0	1531	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCGGCCTGCCCACTCTCA	2538	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102182739	102180125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102182630_102182723
tx.3415	chr11	-	1533	8	ISM	ENSMUSG00000020923.18	ENSMUST00000079589.11	3286	20	7684	67	444	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	728	junction_2	57.4598351290815	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCGGCTGCCGTCTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102199822	102196816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102197593_102197681_102197826_102197904_102197977_102198069_102198118_102198774_102198965_102199054_102199144_102199524_102199636_102199719
tx.3416	chr11	-	880	2	ISM	ENSMUSG00000020923.18	ENSMUST00000079589.11	3286	20	9721	67	2481	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	921	junction_1	0	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCGGCTGCCGTCTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102197785	102196816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102197593_102197681
tx.3417	chr11	+	1404	8	ISM	ENSMUSG00000006575.15	ENSMUST00000006750.8	2046	11	4971	0	255	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_4	28.5778564198055	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTTTCATCTGTTGGAGA	3993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102289199	102293381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_102289289_102290020_102290111_102290208_102290290_102290440_102290607_102290713_102290872_102291486_102291625_102291719_102291827_102292806
tx.3418	chr11	-	1464	12	FSM	ENSMUSG00000018677.10	ENSMUST00000018821.9	1685	12	64	157	7	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	4398	junction_3	174.765959202208	2491	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGGCTGTAGTGTCTTG	7752	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102298306	102293967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102294362_102294458_102294540_102294616_102294699_102294856_102294967_102295277_102295452_102295620_102295746_102295837_102295906_102296518_102296653_102297031_102297077_102297187_102297248_102297380_102297481_102298215
tx.3419	chr11	+	2170	13	FSM	ENSMUSG00000034708.13	ENSMUST00000049460.12	2331	13	163	-2	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	528	junction_1	53.84932682959	607	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTATCTGATTTGTTGCGC	4301	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102321310	102327635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_102321367_102323790_102323936_102324050_102324177_102324311_102324397_102324761_102324872_102324967_102325104_102325225_102325336_102325528_102325653_102325884_102325983_102326071_102326318_102326534_102326769_102326849_102327075_102327160
tx.342	chr1	+	1685	8	NIC	ENSMUSG00000025949.17	novel	1790	10	NA	NA	-26	26	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_7	38.0740417221658	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCAGTGTTCTTAGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65225815	65248584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_65225938_65229477_65229659_65231303_65231454_65234814_65234934_65235770_65235943_65241874_65242083_65244747_65244838_65247941
tx.3420	chr11	+	2116	12	ISM	ENSMUSG00000034708.13	ENSMUST00000049460.12	2331	13	2641	-2	178	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	581	junction_5	45.6110034571005	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTATCTGATTTGTTGCGC	6779	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102323788	102327635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_102323936_102324050_102324177_102324311_102324397_102324761_102324872_102324967_102325104_102325225_102325336_102325528_102325653_102325884_102325983_102326071_102326318_102326534_102326769_102326849_102327075_102327160
tx.3421	chr11	-	428	2	ISM	ENSMUSG00000034664.14	ENSMUST00000134735.2	623	3	416	-3	416	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGCTGCCTTGGGGTCTGA	9900	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102346600	102344126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102344344_102346389
tx.3422	chr11	-	397	3	NNC	ENSMUSG00000034664.14	novel	623	3	NA	NA	92	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGCCATGCTGCCTTGGGG	9976	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102346924	102344131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_102344344_102346389_102346507_102346856
tx.3423	chr11	-	2201	8	FSM	ENSMUSG00000034621.15	ENSMUST00000143842.2	6871	8	4	4666	4	-3374	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_1	22.9658131018384	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGGAAGAAGAACAAATCATC	641	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102447021	102371406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102372914_102378325_102378457_102391628_102391773_102398268_102398356_102398969_102399038_102418919_102418993_102429107_102429183_102446905
tx.3424	chr11	-	646	7	NNC	ENSMUSG00000034621.15	novel	390	6	NA	NA	2	10088	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	58.3628496753048	45	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTCTAAGTGTAAAAGTAT	662	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102447000	102388231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_102388336_102391628_102391773_102398268_102398356_102398969_102399038_102418919_102418993_102429107_102429183_102446905
tx.3425	chr11	-	1031	6	ISM	ENSMUSG00000034621.15	ENSMUST00000143842.2	6871	8	39	24385	16	7194	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_4	11.61034021896	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGCCACTTTGTCTTAAT	676	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102446986	102391125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102391773_102398268_102398356_102398969_102399038_102418919_102418993_102429107_102429183_102446905
tx.3426	chr11	-	2376	2	FSM	ENSMUSG00000034621.15	ENSMUST00000125754.2	893	2	210	-1693	-6	803	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAAAAACGGGTCCC	654	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102447008	102426909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102429183_102446905
tx.3427	chr11	-	699	3	ISM	ENSMUSG00000078640.10	ENSMUST00000139829.2	796	4	411	-49	255	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_2	2	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGCTTCTTTTTTTTTTTT	8835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102469690	102467220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102467624_102467724_102467906_102469575
tx.3428	chr11	-	530	2	ISM	ENSMUSG00000078640.10	ENSMUST00000107080.2	585	3	243	-96	243	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGCTTCTTTTTTTTTTTT	8823	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102469702	102467220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102467624_102469575
tx.3429	chr11	-	816	3	FSM	ENSMUSG00000078640.10	ENSMUST00000107081.8	818	3	5	-3	5	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	3.5	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGCTTCTTTTTTTTTTTT	8243	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102470282	102467220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102467624_102469575_102469722_102470015
tx.343	chr1	+	617	3	ISM	ENSMUSG00000025949.17	ENSMUST00000185317.7	1044	7	0	13222	0	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	23	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATGTCTTGATTGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65225841	65231643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_65225938_65229477_65229659_65231303
tx.3430	chr11	-	2318	5	FSM	ENSMUSG00000020925.17	ENSMUST00000092569.13	2366	5	48	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	239.593405585379	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTTCTGTCTTGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102588560	102575511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102577323_102579626_102579686_102581026_102581163_102582936_102583025_102588336
tx.3431	chr11	-	991	4	FSM	ENSMUSG00000020925.17	ENSMUST00000153157.8	989	4	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	267.304237818175	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGGCTTCTTGTTGGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102588560	102579142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102579686_102581026_102581163_102582936_102583025_102588336
tx.3432	chr11	-	1346	3	FSM	ENSMUSG00000020925.17	ENSMUST00000138147.2	875	3	-60	-411	4	411	multi-exon	FALSE	canonical	3	524	junction_2	39	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAGAGGCCATGGATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102588556	102580124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102581163_102582936_102583025_102588336
tx.3433	chr11	-	1664	2	FSM	ENSMUSG00000034520.15	ENSMUST00000155089.2	3413	2	2898	-1149	2011	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	782	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGTCTGTTAAAGGGTAA	4017	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102693716	102690407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102692022_102693666
tx.3434	chr11	-	1906	4	NNC	ENSMUSG00000034520.15	novel	247	3	NA	NA	4	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_3	347.835529461203	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGTCTGTTAAAGGGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102710001	102690407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_102692022_102693666_102693743_102700471_102700572_102709885
tx.3435	chr11	-	1873	3	FSM	ENSMUSG00000034520.15	ENSMUST00000092567.11	1890	3	17	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	376	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGTTAAAGGGTAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102710509	102690404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102692022_102693666_102693743_102710329
tx.3436	chr11	-	1809	3	FSM	ENSMUSG00000034520.15	ENSMUST00000131164.2	247	3	35	-1597	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_2	360	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTGTTAAAGGGTAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102710001	102690404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102692022_102693666_102693743_102709885
tx.3437	chr11	-	3311	28	FSM	ENSMUSG00000020929.15	ENSMUST00000021306.14	3324	28	11	2	8	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	142	junction_26	264.162864923118	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGCCTTGGTTTGCTGCTT	8477	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102771782	102729300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102729723_102729975_102730084_102730245_102730400_102730849_102730945_102731089_102731209_102731995_102732084_102732226_102732354_102732507_102732595_102734175_102734259_102734965_102735068_102736921_102737063_102737410_102737523_102738783_102738978_102740009_102740138_102742582_102742719_102745604_102745696_102746049_102746114_102750827_102750953_102753436_102753604_102755533_102755617_102756395_102756487_102758671_102758708_102759412_102759479_102759920_102759997_102760993_102761073_102761845_102762012_102768435_102768545_102771720
tx.3438	chr11	-	1015	10	ISM	ENSMUSG00000020929.15	ENSMUST00000021306.14	3324	28	11	24058	8	80	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	142	junction_8	429.668864747416	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAACTTTTTGGTGTGTGTT	8477	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102771782	102753356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102753604_102755533_102755617_102756395_102756487_102758671_102758708_102759412_102759479_102759920_102759997_102760993_102761073_102761845_102762012_102768435_102768545_102771720
tx.3439	chr11	+	1348	5	NNC	ENSMUSG00000020930.10	novel	1841	5	NA	NA	8	-178	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.82915619758885	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTTATGTGTATGAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102772037	102775171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_102772528_102773177_102773258_102773370_102773523_102773899_102774033_102774678
tx.344	chr1	+	1155	3	ISM	ENSMUSG00000015222.19	ENSMUST00000156636.9	546	5	23	57310	-17	868	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAGATGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66214454	66362466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_66214655_66290820_66290872_66361562
tx.3440	chr11	-	3322	16	FSM	ENSMUSG00000051378.11	ENSMUST00000021311.10	3326	16	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	261	junction_10	31.928809700471	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCTGGAAAGTTAGTGCT	3728	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102815946	102796354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102797103_102797321_102797408_102797821_102797903_102798938_102799465_102799712_102799919_102803179_102803296_102803745_102803915_102804275_102804377_102804509_102804585_102805075_102805253_102805364_102805563_102805640_102805752_102805975_102806081_102806368_102806527_102807014_102807342_102815808
tx.3441	chr11	-	918	3	FSM	ENSMUSG00000085338.2	ENSMUST00000138424.2	1187	3	266	3	266	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGTCAGGCTCCTCCTCG	7736	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102854947	102849128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102849726_102852634_102852855_102854846
tx.3442	chr11	-	1730	5	FSM	ENSMUSG00000020935.9	ENSMUST00000021313.9	1744	5	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1121	junction_2	32.0965340808007	1129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGAATTCCACTTGGCCT	8207	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102907980	102884872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_102885999_102888178_102888267_102890469_102890674_102890975_102891183_102907875
tx.3443	chr11	+	221	2	ISM	ENSMUSG00000020936.9	ENSMUST00000135332.2	449	3	356	-33	-39	33	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1040	junction_1	0	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAAGGCAGCGACATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102919371	102934057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_102919529_102933993
tx.3444	chr11	+	1863	12	NNC	ENSMUSG00000020936.9	novel	4861	12	NA	NA	-38	-2801	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_8	292.275851814205	743	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCTAAATATCTTTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102919372	102956937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_102919529_102933993_102934103_102937204_102937350_102943031_102943151_102946023_102946116_102947208_102947326_102948190_102948362_102949030_102949144_102950903_102951075_102954633_102954802_102955555_102955694_102956573
tx.3445	chr11	-	1425	7	ISM	ENSMUSG00000020937.15	ENSMUST00000128650.8	1952	11	3365	-5	-3179	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_6	5.67646212197547	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTACCTTTCCACTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102965755	102961124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_102961756_102961835_102961986_102962080_102962217_102962466_102962634_102964553_102964671_102965384_102965536_102965682
tx.3446	chr11	+	1629	9	NIC	ENSMUSG00000056938.17	novel	2083	10	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	44	junction_1	32.3138902022025	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGCTGTCTGGGAACCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102993903	103003026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_102993972_102994351_102994471_102994725_102994847_102994918_102994999_102995258_102995380_102995628_102995716_102996070_102996305_102996920_102997061_103002367
tx.3447	chr11	+	1508	8	NIC	ENSMUSG00000056938.17	novel	2083	10	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	12	junction_2	49.0289377275694	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGCTGTCTGGGAACCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102993903	103003026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_102993972_102994351_102994471_102994918_102994999_102995258_102995380_102995628_102995716_102996070_102996305_102996920_102997061_103002367
tx.3448	chr11	-	1096	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048878.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAGCGTGGCCAACTAGC	4633	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103023721	103007560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_103008573_103023637
tx.3449	chr11	+	1228	3	FSM	ENSMUSG00000043372.13	ENSMUST00000107037.8	1221	3	7	-14	7	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	7	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATTGATTTCACTGGGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103024146	103030031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_103024249_103024860_103024968_103029012
tx.345	chr1	+	2386	6	FSM	ENSMUSG00000026005.16	ENSMUST00000027157.10	2692	6	11	295	11	-295	multi-exon	FALSE	canonical	3	708	junction_1	56.5840967056999	1379	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAAAAGTTTGTAAGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66740000	66758669	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_66740188_66745604_66745685_66753735_66753876_66754271_66754407_66755117_66755205_66756912
tx.3450	chr11	-	277	2	Intergenic	novelGene_196	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTTTTTTTTTTAATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103055421	103053224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_103053425_103055344
tx.3451	chr11	-	351	2	ISM	ENSMUSG00000020940.14	ENSMUST00000021323.11	1199	10	9056	-1	9030	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGCTGCGCCTAGTGGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103090318	103089768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_103089945_103090143
tx.3452	chr11	-	1747	3	ISM	ENSMUSG00000034255.19	ENSMUST00000041385.14	3512	16	11261	-3	-46	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGGCGAATGTACTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103224267	103222322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_103223867_103223976_103224083_103224170
tx.3453	chr11	-	752	5	ISM	ENSMUSG00000020946.14	ENSMUST00000021329.14	3266	6	8579	2245	8375	-161	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	264	junction_1	59.8456347614427	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTTTGTTTTCTGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103580145	103569919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_103570224_103574617_103574759_103577407_103577541_103578350_103578460_103580080
tx.3454	chr11	-	827	6	FSM	ENSMUSG00000020946.14	ENSMUST00000021329.14	3266	6	194	2245	-6	-161	multi-exon	FALSE	canonical	3	264	junction_1	54.6867442804927	650	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTTTGTTTTCTGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103588530	103569919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_103570224_103574617_103574759_103577407_103577541_103578350_103578460_103580080_103580146_103588455
tx.3455	chr11	-	690	5	FSM	ENSMUSG00000020946.14	ENSMUST00000107013.3	1044	5	-14	368	-10	-161	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	134.545531326759	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTTTGTTTTCTGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103588534	103569919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_103570224_103577407_103577541_103578350_103578460_103580080_103580146_103588455
tx.3456	chr11	+	873	2	ISM	ENSMUSG00000000125.6	ENSMUST00000000127.6	3076	5	38077	1550	38077	-1550	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACAGGCTGGGCTAGTGTG	5307	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103703052	103707233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_103703595_103706902
tx.3457	chr11	-	3734	21	FSM	ENSMUSG00000034187.19	ENSMUST00000103075.11	3766	21	32	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	278	junction_14	21.9246436687122	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGTATAGACCAGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103844850	103712607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_103714086_103714564_103714621_103718036_103718151_103719257_103719393_103737199_103737280_103738819_103738887_103749720_103749855_103752718_103752876_103754064_103754161_103762984_103763173_103763416_103763492_103763970_103764137_103773567_103773768_103801268_103801425_103804141_103804218_103804626_103804735_103807331_103807499_103816973_103817014_103819569_103819670_103821555_103821642_103844795
tx.3458	chr11	-	1147	9	FSM	ENSMUSG00000034187.19	ENSMUST00000145126.8	3212	9	-2	2067	-2	-2067	multi-exon	FALSE	canonical	3	278	junction_2	26.9973957077345	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCCTGGAGCAGTAGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103844852	103773410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_103773768_103801268_103801425_103804141_103804218_103804626_103804735_103807331_103807499_103816973_103817014_103819569_103819670_103821555_103821642_103844795
tx.3459	chr11	-	1818	8	ISM	ENSMUSG00000034187.19	ENSMUST00000145126.8	3212	9	-2	28897	-2	11	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	278	junction_1	26.1689955200923	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAACCAGACTCTAATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103844852	103800240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_103801425_103804141_103804218_103804626_103804735_103807331_103807499_103816973_103817014_103819569_103819670_103821555_103821642_103844795
tx.346	chr1	+	1005	7	NNC	ENSMUSG00000026005.16	novel	2724	7	NA	NA	15	203	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	299.940364443038	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTTTTAAATGTATCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66740004	66759167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_66740188_66745604_66745685_66753735_66753876_66754271_66754407_66755117_66755205_66756912_66757056_66758930
tx.3460	chr11	+	2246	5	FSM	ENSMUSG00000062421.14	ENSMUST00000057921.10	2242	5	-6	2	-6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_4	7.43303437365925	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATGGTCATGTTCTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103857558	103876161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_103857654_103859904_103860072_103863778_103863890_103872519_103872645_103874413
tx.3461	chr11	+	2154	4	ISM	ENSMUSG00000062421.14	ENSMUST00000063347.12	2660	5	2205	2	2205	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_3	5.79271573232759	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATGGTCATGTTCTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103859901	103876161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_103860072_103863778_103863890_103872519_103872645_103874413
tx.3462	chr11	-	216	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018411.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCCACCCCTCAGGTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104178117	104176444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_104176621_104178077
tx.3463	chr11	-	260	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018411.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAACTAACACACCCACCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104178117	104176454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_104176621_104177370_104177425_104178077
tx.3464	chr11	-	268	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018411.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTGTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104177218	104176493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_104176621_104177077
tx.3465	chr11	+	1010	5	NNC	ENSMUSG00000018411.18	novel	831	2	NA	NA	-8369	24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	49	junction_1	201.516128386787	45	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGCCAAAAAATTTCCTT	9487	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104200489	104219285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_104200551_104201094_104201361_104212176_104212259_104213253_104213367_104218797
tx.3466	chr11	+	1064	5	NNC	ENSMUSG00000018411.18	novel	831	2	NA	NA	-8369	24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	288	junction_1	100.158312186258	307	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGCCAAAAAATTTCCTT	9487	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104200489	104219285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_104200605_104201094_104201361_104212176_104212259_104213253_104213367_104218797
tx.3467	chr11	+	1116	5	NNC	ENSMUSG00000018411.18	novel	831	2	NA	NA	-8178	24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	84	junction_1	186.526640188473	248	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGCCAAAAAATTTCCTT	9678	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104200680	104219285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_104200848_104201094_104201361_104212176_104212259_104213253_104213367_104218797
tx.3468	chr11	+	951	4	NIC	ENSMUSG00000018411.18	novel	5253	10	NA	NA	-7766	24	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	463	junction_1	33.0386978489703	170	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGCCAAAAAATTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104201092	104219285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_104201361_104212176_104212259_104213253_104213367_104218797
tx.3469	chr11	+	631	2	FSM	ENSMUSG00000018411.18	ENSMUST00000126820.2	831	2	449	-249	449	24	multi-exon	FALSE	canonical	3	531	junction_1	0	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGGCCAAAAAATTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104213223	104219285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_104213367_104218797
tx.347	chr1	-	1387	8	ISM	ENSMUSG00000026003.6	ENSMUST00000027153.6	1916	11	10100	16	5154	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_4	13.9430327857789	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATGTGTAGACCGTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66892336	66870013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_66870687_66876120_66876208_66877437_66877566_66880780_66880895_66882239_66882342_66884326_66884492_66887558_66887626_66892285
tx.3470	chr11	-	1243	2	NNC	ENSMUSG00000018412.17	novel	5061	15	NA	NA	-583	-41600	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCCCTACCCACCCACTCC	9749	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104360270	104357362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_104358579_104360243
tx.3471	chr11	-	1139	4	FSM	ENSMUSG00000020687.14	ENSMUST00000135303.2	486	4	-9	-644	-9	644	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_3	91.8416511659546	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAGAACTTTTTAAAAA	2057	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104441455	104421918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_104422682_104425563_104425712_104427420_104427497_104441303
tx.3472	chr11	+	613	5	ISM	ENSMUSG00000061086.13	ENSMUST00000123074.8	677	6	3618	-6	-1021	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	17.5267652463311	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTCCGTTGATTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104474768	104478041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_104474954_104475264_104475439_104475762_104475841_104476552_104476598_104477910
tx.3473	chr11	+	562	4	ISM	ENSMUSG00000061086.13	ENSMUST00000123074.8	677	6	3980	-6	-659	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_3	1.69967317119759	421	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTCCGTTGATTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104475130	104478041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_104475439_104475762_104475841_104476552_104476598_104477910
tx.3474	chr11	+	1670	2	ISM	ENSMUSG00000020691.14	ENSMUST00000021030.8	1867	9	43	12088	-11	-7350	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	278	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105017293	105019132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_105017433_105017601
tx.3475	chr11	+	2289	8	NIC	ENSMUSG00000020691.14	novel	1867	9	NA	NA	-26	281	intron_retention	TRUE	canonical	3	226	junction_5	20.985903918233	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGGCTGAGTCAGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105017278	105031501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_105017694_105019566_105019902_105021272_105021323_105022398_105022460_105023266_105023407_105026163_105026271_105028544_105028611_105030386
tx.3476	chr11	+	2844	8	FSM	ENSMUSG00000020691.14	ENSMUST00000136214.8	2556	8	-5	-283	-5	283	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	88.9260183225015	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGCTGAGTCAGCACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105017299	105031503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_105018268_105019566_105019902_105021272_105021323_105022398_105022460_105023266_105023407_105026163_105026271_105028544_105028611_105030386
tx.3477	chr11	+	2563	9	FSM	ENSMUSG00000020691.14	ENSMUST00000021030.8	1867	9	54	-750	0	750	multi-exon	FALSE	canonical	3	226	junction_6	21.0698243941424	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCTTTTTGGTGGTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105017304	105031970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_105017433_105017601_105017694_105019566_105019902_105021272_105021323_105022398_105022460_105023266_105023407_105026163_105026271_105028544_105028611_105030386
tx.3478	chr11	+	160	2	ISM	ENSMUSG00000020694.18	ENSMUST00000092537.10	2743	20	176	92171	-13	-25567	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	500	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAGGTGAGTTATTCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105072794	105075114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_105072878_105075037
tx.3479	chr11	+	1938	9	ISM	ENSMUSG00000020694.18	ENSMUST00000126175.8	3086	20	73013	-1	2220	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	279	junction_6	25.0836101867335	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTCCTGGATTCTCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105145837	105173003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_105145890_105147695_105147778_105151086_105151179_105157978_105158069_105160451_105160622_105161924_105162064_105166662_105166775_105169943_105170052_105171910
tx.348	chr1	-	1587	11	FSM	ENSMUSG00000026003.6	ENSMUST00000027153.6	1916	11	-1	330	-1	-330	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_4	12.5315601582564	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTTTAATGTCTTACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66902437	66870327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_66870687_66876120_66876208_66877437_66877566_66880780_66880895_66882239_66882342_66884326_66884492_66887558_66887626_66892285_66892451_66893782_66893921_66896557_66896714_66902331
tx.3480	chr11	+	831	3	FSM	ENSMUSG00000020695.15	ENSMUST00000126931.2	831	3	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAAAGTGGCTCAGTGGAT	1497	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105183468	105217717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_105183728_105216327_105216730_105217547
tx.3481	chr11	-	2486	6	FSM	ENSMUSG00000019590.17	ENSMUST00000019734.11	2741	6	255	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_5	37.6690854680599	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTTGCCTTCTGTCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105834983	105824527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_105826394_105826577_105826736_105827007_105827112_105827380_105827480_105828454_105828667_105834936
tx.3482	chr11	-	2766	7	NIC	ENSMUSG00000019590.17	novel	2741	6	NA	NA	-19	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	25	junction_6	64.1320252811859	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTTGCCTTCTGTCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105834984	105824527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_105826394_105826577_105826736_105827007_105827112_105827380_105827480_105828454_105828667_105830925_105831205_105834936
tx.3483	chr11	-	2440	5	ISM	ENSMUSG00000019590.17	ENSMUST00000019734.11	2741	6	6570	1	-44	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_2	7.29297607290741	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCTTGCCTTCTGTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105828668	105824528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_105826394_105826577_105826736_105827007_105827112_105827380_105827480_105828454
tx.3484	chr11	-	2528	6	FSM	ENSMUSG00000019590.17	ENSMUST00000184086.8	1130	6	-17	-1381	-17	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	71.4898594207598	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCTTGCCTTCTGTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105834982	105824528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_105826394_105826577_105826780_105827007_105827112_105827380_105827480_105828454_105828667_105834936
tx.3485	chr11	+	1226	4	ISM	ENSMUSG00000020681.15	ENSMUST00000001964.8	2418	14	10338	-7	8941	0	intron_retention	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.69967317119759	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGAGTCTGTGTCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105876371	105880086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_105876544_105876815_105876915_105878841_105878965_105879254
tx.3486	chr11	+	859	4	ISM	ENSMUSG00000049354.9	ENSMUST00000058438.9	5750	7	11311	4190	11283	-4190	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_3	11.7284080571728	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTGTTGTGTTCATAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105939008	105945960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_105939088_105942582_105942793_105944556_105944675_105945508
tx.3487	chr11	+	698	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000085255.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGTTTCCAAGCAACCGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105955902	105956732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_105956125_105956256
tx.3488	chr11	-	349	2	NNC	ENSMUSG00000085255.2	novel	644	2	NA	NA	358	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCTGCTTGAAACTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105956773	105955905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_105956123_105956641
tx.3489	chr11	-	274	2	FSM	ENSMUSG00000085255.2	ENSMUST00000140736.2	644	2	370	0	370	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCTTGAAACTCTTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105956761	105955902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_105956123_105956707
tx.349	chr1	-	1267	9	ISM	ENSMUSG00000026003.6	ENSMUST00000027153.6	1916	11	8568	336	3622	-336	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_4	13.1997869300985	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGAGCCTTTTAATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66893868	66870333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_66870687_66876120_66876208_66877437_66877566_66880780_66880895_66882239_66882342_66884326_66884492_66887558_66887626_66892285_66892451_66893782
tx.3490	chr11	+	1367	5	FSM	ENSMUSG00000001983.8	ENSMUST00000002048.8	1383	5	0	16	0	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_3	5.93717104351896	203	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTGTTGCTGGTATGAC	874	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105956886	105964422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_105957345_105960331_105960439_105962692_105962821_105963356_105963535_105963926
tx.3491	chr11	-	1138	5	FSM	ENSMUSG00000040699.14	ENSMUST00000045923.10	2950	5	28	1784	28	274	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_1	24.7638849940796	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGACTCTCTTGTGTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106050940	106048865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_106049660_106049760_106049901_106049987_106050033_106050173_106050269_106050876
tx.3492	chr11	-	866	2	ISM	ENSMUSG00000040699.14	ENSMUST00000138094.2	908	3	403	-274	403	274	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGACTCTCTTGTGTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106049832	106048865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106049660_106049760
tx.3493	chr11	-	1235	5	NIC	ENSMUSG00000040699.14	novel	2950	5	NA	NA	340	274	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_4	112.144995430024	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGACTCTCTTGTGTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106051346	106048865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_106049660_106049760_106049901_106049987_106050033_106050173_106050269_106051185
tx.3494	chr11	-	1488	4	ISM	ENSMUSG00000040699.14	ENSMUST00000064545.11	798	5	395	-715	-123	598	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_1	26.9113771892525	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGCCTGGCTTCGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106050358	106048541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106049660_106049760_106049901_106049987_106050033_106050173
tx.3495	chr11	-	2083	11	NIC	ENSMUSG00000069631.15	novel	2099	13	NA	NA	0	14	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	3	51	junction_9	25.5305699113827	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTGTTTCCTTGTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106084398	106054141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_106055018_106055256_106055300_106055545_106055788_106058637_106058743_106059134_106059307_106061779_106061904_106061981_106062091_106064078_106064201_106064504_106064608_106077926_106078007_106084291
tx.3496	chr11	-	1338	5	ISM	ENSMUSG00000069631.15	ENSMUST00000007444.14	2099	13	25146	-25	25146	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_4	7.04893608993584	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGAATGGCACCAGTGTTTC	6722	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106059216	106054151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106055018_106055256_106055300_106055545_106055788_106058637_106058743_106059134
tx.3497	chr11	-	1815	2	ISM	ENSMUSG00000078622.9	ENSMUST00000106865.8	704	6	2266	-1425	743	1425	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	670	junction_1	0	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGTGCTGCTTTGACTT	5259	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106092988	106090179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106091843_106092836
tx.3498	chr11	-	3245	13	FSM	ENSMUSG00000078622.9	ENSMUST00000002043.10	5193	13	2	1946	2	1425	multi-exon	FALSE	canonical	3	609	junction_6	38.2117637500402	386	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGTGCTGCTTTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106107168	106090179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_106091843_106092836_106093005_106093209_106093320_106093553_106093613_106094363_106094450_106095746_106095858_106096185_106096288_106098831_106098898_106099020_106099143_106101113_106101289_106102498_106102607_106103906_106104188_106106974
tx.3499	chr11	+	2741	9	ISM	ENSMUSG00000020705.7	ENSMUST00000021046.6	4011	18	20069	-1	-1	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	440	junction_2	33.1339610520686	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTTTATCTTTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106127820	106139966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_106127950_106129333_106129434_106129961_106130010_106130827_106130926_106132376_106132654_106133700_106133928_106136152_106136264_106137601_106137704_106138317
tx.35	chr1	-	409	4	FSM	ENSMUSG00000098234.8	ENSMUST00000182580.8	473	4	0	64	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	370	junction_3	129.892263049036	11661	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTGTGGGCAGTAATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10014343	10012247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_10012381_10012547_10012617_10012834_10012943_10014244
tx.350	chr1	-	1183	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082769.4_ENSMUSG00000094191.2	novel	495	1	NA	NA	-36	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGGGGGGGGGGAAGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66988135	66888216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_66888854_66987589
tx.3500	chr11	-	634	3	ISM	ENSMUSG00000020706.14	ENSMUST00000021048.7	3144	21	6144	-1	763	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	787	junction_2	82	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTTTTCTGATAGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106140761	106139966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106140443_106140529_106140625_106140698
tx.3501	chr11	-	2885	21	FSM	ENSMUSG00000020706.14	ENSMUST00000021048.7	3144	21	260	-1	-15	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	632	junction_7	76.5847732907789	335	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTTTTCTGATAGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106146645	106139966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_106140443_106140529_106140625_106140698_106140883_106140980_106141081_106141173_106141260_106141387_106141663_106141731_106141850_106141979_106142162_106143028_106143165_106143253_106143404_106143491_106143573_106143725_106143827_106143906_106144012_106144114_106144231_106144307_106144503_106144587_106144688_106145432_106145513_106145611_106145659_106146145_106146252_106146410_106146504_106146586
tx.3502	chr11	+	1323	11	FSM	ENSMUSG00000020708.13	ENSMUST00000021049.9	1316	11	-5	-2	-5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2261	junction_6	178.766439803449	8747	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAACTCCAGTTTGTTAA	4531	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106146974	106153948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_106147041_106147673_106147746_106151678_106151749_106152010_106152109_106152248_106152537_106152731_106152859_106152943_106153135_106153229_106153329_106153406_106153518_106153622_106153710_106153834
tx.3503	chr11	+	1260	10	ISM	ENSMUSG00000020708.13	ENSMUST00000021049.9	1316	11	691	-2	691	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2261	junction_5	185.481621997344	385	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTACAACTCCAGTTTGTTAA	5227	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106147670	106153948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_106147746_106151678_106151749_106152010_106152109_106152248_106152537_106152731_106152859_106152943_106153135_106153229_106153329_106153406_106153518_106153622_106153710_106153834
tx.3504	chr11	+	500	5	ISM	ENSMUSG00000020708.13	ENSMUST00000021049.9	1316	11	6067	-3	6067	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2392	junction_2	138.157518796481	521	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACAACTCCAGTTTGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106153046	106153949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_106153135_106153229_106153329_106153406_106153518_106153622_106153710_106153834
tx.3505	chr11	-	1453	6	ISM	ENSMUSG00000078619.11	ENSMUST00000106843.8	2548	12	2566	-2	-297	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	510	junction_5	34.6028900527109	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGACCTGGTCATTGAAC	5515	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106156059	106154002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106154946_106155020_106155123_106155258_106155382_106155497_106155634_106155765_106155864_106156008
tx.3506	chr11	-	896	4	ISM	ENSMUSG00000020713.7	ENSMUST00000103071.4	862	5	152	-3	152	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCCGGCTAGAGGTCTTT	7209	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106192539	106191093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106191393_106191590_106191753_106191920_106192038_106192221
tx.3508	chr11	-	416	2	ISM	ENSMUSG00000001029.16	ENSMUST00000001055.15	1282	4	4059	0	2079	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGTGCCCGCCATGACTG	3418	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106269548	106268481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106268821_106269471
tx.3509	chr11	+	105	2	Intergenic	novelGene_198	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	320	junction_1	0	1829	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCGCTGGTGTCTTGTGTGT	4511	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106391740	106392037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_106391767_106391958
tx.351	chr1	-	1597	9	FSM	ENSMUSG00000026000.17	ENSMUST00000113979.10	4461	9	6	2858	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	327	junction_5	113.959902487673	445	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTCGAGTTTTTATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67078025	67042533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_67042717_67043497_67043571_67043948_67044126_67046026_67046210_67048386_67048534_67049069_67049206_67060016_67060225_67073282_67073401_67077653
tx.3510	chr11	-	585	4	ISM	ENSMUSG00000020718.13	ENSMUST00000021060.6	1506	8	5778	-41	113	41	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_2	4.08248290463863	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTTTTTATTGTCCTTTT	884	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106664563	106659037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106659298_106663477_106663579_106664210_106664292_106664420
tx.3511	chr11	-	1392	8	NIC	ENSMUSG00000020718.13	novel	1770	8	NA	NA	-11	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_7	16.8001457719623	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGTTTTGGACTTTTGTA	4308	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106670352	106659078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_106659298_106663477_106663579_106664210_106664292_106664420_106664562_106666252_106666427_106667968_106668075_106668260_106668388_106669909
tx.3512	chr11	-	1527	8	FSM	ENSMUSG00000020718.13	ENSMUST00000021060.6	1506	8	-21	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_7	14.9652659072089	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAGTTTTGGACTTTTGTA	4298	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106670362	106659078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_106659298_106663477_106663579_106664210_106664292_106664420_106664562_106666252_106666427_106667968_106668075_106668260_106668388_106669784
tx.3513	chr11	-	2330	13	FSM	ENSMUSG00000020719.15	ENSMUST00000021062.12	3559	13	38	1191	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3830	junction_8	158.443711526277	958	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGTGAAATTGTACTTTA	9654	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106679320	106672371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_106673083_106673294_106673520_106674784_106674845_106674926_106674989_106675239_106675351_106675705_106675879_106675961_106676123_106676220_106676363_106676892_106676959_106677051_106677186_106677273_106677371_106677734_106677901_106679098
tx.3514	chr11	-	2465	14	NIC	ENSMUSG00000020719.15	novel	3559	13	NA	NA	0	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	497	junction_13	995.534526816042	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAGTGAAATTGTACTTTA	8963	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106680011	106672371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_106673083_106673294_106673520_106674784_106674845_106674926_106674989_106675239_106675351_106675705_106675879_106675961_106676123_106676220_106676363_106676892_106676959_106677051_106677186_106677273_106677371_106677734_106677901_106679098_106679286_106679841
tx.3515	chr11	-	660	3	ISM	ENSMUSG00000018362.15	ENSMUST00000145331.8	1843	10	9093	0	2280	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3169	junction_2	131.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTGTTTTCTTAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106881173	106879454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106879806_106880149_106880300_106881014
tx.3516	chr11	-	1984	11	FSM	ENSMUSG00000018362.15	ENSMUST00000018506.13	2054	11	70	0	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2002	junction_5	417.039386629129	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTGTTTTCTTAATTGA	9736	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106890297	106879454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_106879806_106880149_106880300_106881014_106881198_106881464_106881699_106881894_106882159_106882238_106882334_106882683_106882953_106883428_106883518_106887334_106887473_106888063_106888162_106890184
tx.3517	chr11	+	1184	3	ISM	ENSMUSG00000078607.7	ENSMUST00000140447.4	1677	5	2458	-8	-84	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGGCTTTGCTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106918964	106921272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_106919095_106919191_106919384_106920410
tx.3518	chr11	-	1010	6	NIC	ENSMUSG00000040481.18	novel	12036	30	NA	NA	-28601	-18048	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	10	junction_5	8.03990049689671	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGAAAAAACAAGAGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106986632	106969421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_106969476_106971548_106971681_106972041_106972398_106973338_106973527_106985827_106986017_106986541
tx.3519	chr11	-	808	5	ISM	ENSMUSG00000040481.18	ENSMUST00000057892.15	11488	28	36129	45515	-28588	-18048	internal_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_4	9.17877987534291	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGAAAAAACAAGAGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106986619	106969421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_106969476_106971548_106971681_106972041_106972398_106973338_106973527_106986541
tx.352	chr1	-	1415	10	FSM	ENSMUSG00000026000.17	ENSMUST00000027149.12	4270	10	-3	2858	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_9	152.892845556037	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTCGAGTTTTTATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67078027	67042533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_67042717_67043497_67043571_67043948_67044126_67046026_67046210_67048386_67048534_67049069_67049206_67060016_67060225_67073282_67073401_67077653_67077751_67077934
tx.3520	chr11	+	262	2	ISM	ENSMUSG00000087596.2	ENSMUST00000129501.2	695	3	-10	1995	-10	-1995	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGAGGTGAGCACATGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107048223	107055981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_107048351_107055846
tx.3521	chr11	-	3020	18	FSM	ENSMUSG00000018433.15	ENSMUST00000106757.8	3098	18	81	-3	52	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_5	109.451004980994	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAAAATGTCTCTCTTT	1182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107080126	107057485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_107058468_107059107_107059216_107061917_107062011_107062440_107062520_107064035_107064228_107064429_107064556_107066391_107066574_107067608_107067684_107069401_107069488_107069794_107069919_107070867_107070945_107071738_107071928_107072564_107072710_107074398_107074457_107075565_107075715_107077460_107077518_107077634_107077749_107079942
tx.3522	chr11	-	3093	18	FSM	ENSMUSG00000018433.15	ENSMUST00000018577.8	3158	18	68	-3	39	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	283	junction_14	59.6645176908376	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGAAAATGTCTCTCTTT	1169	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107080139	107057485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_107058468_107059107_107059216_107061917_107062011_107062440_107062520_107064035_107064288_107064429_107064556_107066391_107066574_107067608_107067684_107069401_107069488_107069794_107069919_107070867_107070945_107071738_107071928_107072564_107072710_107074398_107074457_107075565_107075715_107077460_107077518_107077634_107077749_107079942
tx.3523	chr11	-	670	4	ISM	ENSMUSG00000018433.15	ENSMUST00000106757.8	3098	18	85	17907	56	1970	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	456	junction_3	16.779617264871	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCCTAATTAAATCCCACT	1186	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107080122	107075395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_107075715_107077460_107077518_107077634_107077749_107079942
tx.3524	chr11	-	2794	9	NIC	ENSMUSG00000040430.19	novel	6329	10	NA	NA	-21	-3548	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_6	20.8862245271854	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCGTCTCTTCGCTTCCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107361546	107102265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_107103485_107107503_107107623_107117056_107117121_107125172_107125329_107142847_107142944_107187024_107187097_107212412_107212502_107228237_107228387_107360716
tx.3525	chr11	-	1294	2	NNC	ENSMUSG00000040430.19	novel	5478	8	NA	NA	122220	-3542	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTCGCTTCCCCTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107106132	107102259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_107103485_107106063
tx.3526	chr11	+	1741	11	FSM	ENSMUSG00000020720.14	ENSMUST00000021063.13	1904	11	21	142	21	-142	multi-exon	FALSE	canonical	3	2673	junction_3	110.503800839609	4831	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCTGAAGTTGCCAGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107370330	107388857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_107370511_107376375_107376436_107376533_107376663_107377239_107377348_107379793_107379899_107382606_107382757_107382842_107382978_107384228_107384342_107385455_107385631_107386513_107386592_107388349
tx.3527	chr11	-	641	2	NNC	ENSMUSG00000059706.5	novel	861	2	NA	NA	15817	32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TGAAAAGAGCCAGAAAAAAA	4694	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107423382	107422550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_107422991_107423181
tx.3528	chr11	-	550	2	Intergenic	novelGene_200	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGCTGTTAAATGGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107437999	107437335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_107437494_107437607
tx.3529	chr11	+	1316	5	NNC	ENSMUSG00000020721.17	novel	687	5	NA	NA	-1023	536	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	59	junction_1	40.6232691938992	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAGCCTTGCTACATACTT	9395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107437732	107469518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_107437878_107440171_107440228_107446344_107446402_107465763_107465992_107468688
tx.353	chr1	-	1398	10	NIC	ENSMUSG00000026000.17	novel	1385	10	NA	NA	-5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	85	junction_9	146.548774167089	338	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTCGAGTTTTTATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67078036	67042533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_67042717_67043497_67043571_67043948_67044126_67046026_67046210_67048386_67048534_67049069_67049206_67060016_67060225_67073282_67073401_67077653_67077751_67077960
tx.3530	chr11	+	442	4	ISM	ENSMUSG00000020721.17	ENSMUST00000075012.8	6218	32	-27	108972	3	-185	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_1	35.3930313291567	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTTTGACTTTTTAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107438758	107468797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_107438808_107440171_107440228_107465763_107465992_107468688
tx.3531	chr11	+	509	5	FSM	ENSMUSG00000020721.17	ENSMUST00000141730.8	687	5	-2	180	-2	-180	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_1	30.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTTTTAAAAAAATCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107438753	107468802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_107438808_107440171_107440228_107446344_107446402_107465763_107465992_107468688
tx.3532	chr11	-	1775	7	ISM	ENSMUSG00000050965.15	ENSMUST00000059595.11	8409	17	362028	5341	-2261	-551	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_2	3.07769755210323	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGGGAGATGACTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107872726	107829553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_107830507_107842291_107842433_107844467_107844576_107852398_107852480_107869059_107869199_107870028_107870092_107872436
tx.3533	chr11	-	1842	8	ISM	ENSMUSG00000050965.15	ENSMUST00000059595.11	8409	17	359779	5341	-4510	-551	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_7	3.20076521462973	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTGGGAGATGACTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107874975	107829553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_107830507_107842291_107842433_107844467_107844576_107852398_107852480_107869059_107869199_107870028_107870092_107872436_107872529_107874710
tx.3534	chr11	+	741	5	NIC	ENSMUSG00000020728.18	novel	1437	6	NA	NA	-8	-608	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_4	23.4360832905159	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCTATTAAACGTTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108316083	108363011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_108316178_108324951_108325066_108328031_108328223_108331249_108331423_108362842
tx.3535	chr11	+	835	6	ISM	ENSMUSG00000020728.18	ENSMUST00000150863.9	3453	27	69	388424	-5	-602	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_4	6.34350061086148	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAACGTTTATTATTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108316086	108363017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_108316178_108324951_108325066_108328031_108328223_108331249_108331423_108361117_108361209_108362842
tx.3536	chr11	-	1050	12	ISM	ENSMUSG00000020599.14	ENSMUST00000106706.8	2313	17	-94	12974	-31	7971	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_11	8.5753827951086	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTTGTTTGATTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109188986	109138856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_109139004_109139804_109139867_109140852_109140883_109150661_109150725_109159748_109159831_109164101_109164179_109166086_109166146_109166404_109166457_109166645_109166753_109167395_109167447_109172274_109172372_109188763
tx.3537	chr11	-	989	12	NNC	ENSMUSG00000020599.14	novel	2313	17	NA	NA	8499	7970	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	9.52855647145737	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGTTTGTTTGATTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109180393	109138857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_109139004_109139804_109139867_109140852_109140883_109150661_109150725_109159748_109159831_109164101_109164179_109166086_109166146_109166404_109166457_109166645_109166753_109167395_109167447_109172274_109172372_109180230
tx.3538	chr11	-	980	12	NNC	ENSMUSG00000020599.14	novel	2313	17	NA	NA	8481	7970	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_1	5.1889902519383	34	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGTTTGTTTGATTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109180411	109138857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_109139004_109139804_109139867_109140852_109140883_109150661_109150725_109159748_109159831_109164101_109164179_109166086_109166146_109166404_109166457_109166645_109166753_109167395_109167447_109172274_109172372_109180257
tx.3539	chr11	-	340	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000099630.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGTGATGGACTTTGCTCTT	4532	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109242436	109231579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_109231808_109242324
tx.354	chr1	+	586	4	NNC	ENSMUSG00000053153.15	novel	1433	13	NA	NA	0	-28410	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.35702260395516	28	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGCCTCTTAATTTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69866128	69884509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_69866281_69882127_69882175_69883437_69883534_69884218
tx.3540	chr11	-	1458	2	FSM	ENSMUSG00000056687.10	ENSMUST00000070956.4	2765	2	459	848	15	-444	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCGTATGAGCTCCATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109254021	109246451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_109247820_109253931
tx.3541	chr11	+	1306	4	FSM	ENSMUSG00000020611.15	ENSMUST00000020930.14	6160	4	74	4780	74	-4780	multi-exon	TRUE	canonical	3	267	junction_2	46.1976430375211	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTTGTGTGTGTCTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109253730	109287415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_109254083_109256361_109256589_109283171_109283223_109286739
tx.3543	chr11	+	1017	3	FSM	ENSMUSG00000020611.15	ENSMUST00000106702.4	914	3	101	-204	101	204	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_2	132.5	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGATATACGTATACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109253757	109271505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_109254083_109256361_109256589_109271040
tx.3544	chr11	+	964	6	NNC	ENSMUSG00000020610.18	novel	1846	6	NA	NA	2	-890	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	68.0687887361014	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTGGTGTTTTCTGTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109316803	109320981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_109316857_109317311_109317402_109317795_109317924_109319627_109319911_109320489_109320668_109320749
tx.3545	chr11	+	1402	9	NNC	ENSMUSG00000020610.18	novel	2816	9	NA	NA	0	-229	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	57.7947607919611	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTCGTGGGTAGAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109316801	109327586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_109316857_109317311_109317402_109317795_109317924_109319627_109319911_109320489_109320668_109320749_109320879_109324715_109324880_109325405_109325583_109327388
tx.3546	chr11	+	1883	8	NNC	ENSMUSG00000020610.18	novel	2997	8	NA	NA	-44	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	59.1262916759282	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATTCTGTGTGGCCCTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109317001	109327812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_109317402_109317795_109317924_109319627_109319911_109320489_109320668_109320749_109320879_109324715_109324880_109325405_109325583_109327388
tx.3547	chr11	+	1215	5	NNC	ENSMUSG00000020610.18	novel	2997	8	NA	NA	-38	-890	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	74.3807770865564	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTGGTGTTTTCTGTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109317007	109320981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_109317402_109317795_109317924_109319627_109319911_109320489_109320668_109320749
tx.3548	chr11	+	250	2	FSM	ENSMUSG00000020610.18	ENSMUST00000154875.2	1152	2	-31	933	-31	-492	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCAAGTATTCTTAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109330950	109342706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_109331082_109342587
tx.3549	chr11	-	955	2	ISM	ENSMUSG00000041920.15	ENSMUST00000070872.13	2354	6	18147	-1	11212	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCAAAAAACAAAAAAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109345973	109343550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_109344221_109345688
tx.355	chr1	-	686	3	ISM	ENSMUSG00000026196.8	ENSMUST00000027393.8	5659	11	56406	2830	56406	-2830	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_2	2.5	236	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTTTGTTGTTGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71085899	71069486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_71070012_71070517_71070616_71085836
tx.3550	chr11	-	2207	6	FSM	ENSMUSG00000041920.15	ENSMUST00000070872.13	2354	6	148	-1	53	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_5	8.5463442476886	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCAAAAAACAAAAAAAACC	3022	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109363972	109343550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_109344221_109345688_109346505_109349302_109349432_109350624_109350769_109354135_109354375_109363763
tx.3551	chr11	-	2143	6	NNC	ENSMUSG00000041920.15	novel	4219	6	NA	NA	-1382	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_5	8.20731381147328	109	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCCAAAAAACAAAAAAAACC	1188	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109365806	109343550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_109344221_109345688_109346505_109349302_109349432_109350624_109350769_109354135_109354375_109365661
tx.3552	chr11	+	322	2	NNC	ENSMUSG00000020604.14	novel	430	4	NA	NA	-24	-11278	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATGTGTATTGATGTTT	391	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109364175	109369445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_109364248_109369195
tx.3553	chr11	+	1405	6	NNC	ENSMUSG00000020604.14	novel	3273	14	NA	NA	-10	740	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.51361950083609	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTGTTTTGCCTGTGTACA	405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109364189	109381565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_109364248_109369195_109369336_109374532_109374618_109376301_109376400_109376531_109376584_109380593
tx.3554	chr11	+	477	2	Intergenic	novelGene_201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATGTGTATTGATGTTT	474	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109364258	109369445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_109364486_109369195
tx.3555	chr11	-	2036	13	NNC	ENSMUSG00000041895.16	novel	2050	13	NA	NA	18	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	32.2541986930901	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGAGTTGTTTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109502240	109464156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_109464794_109467882_109467984_109468400_109468520_109469116_109469225_109470452_109470618_109473193_109473306_109473952_109474024_109474900_109474994_109475920_109476019_109487928_109488026_109494498_109494669_109496710_109496794_109502058
tx.3556	chr11	-	1724	12	NNC	ENSMUSG00000041895.16	novel	3338	12	NA	NA	5	-1613	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	33.682523609347	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCAGAGTTTCTGCCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109502253	109467570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_109467984_109468400_109468520_109469116_109469225_109470452_109470618_109473193_109473306_109473952_109474024_109474900_109474994_109475920_109476019_109487928_109488026_109494498_109494669_109496710_109496794_109502058
tx.3557	chr11	-	379	3	ISM	ENSMUSG00000041895.16	ENSMUST00000106689.2	1220	8	5	21670	5	7497	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	3	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAGGCACTGAGATCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109502253	109494567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_109494669_109496710_109496794_109502058
tx.3558	chr11	+	1483	11	FSM	ENSMUSG00000020612.17	ENSMUST00000049527.7	3359	11	15	1861	15	819	multi-exon	TRUE	canonical	3	1417	junction_9	119.858458191318	1312	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTGTCACCGCTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109541761	109558621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_109541900_109544604_109544788_109550824_109550996_109551860_109551953_109552113_109552176_109553101_109553149_109553774_109553934_109555584_109555646_109556690_109556813_109557469_109557552_109558255
tx.3559	chr11	+	477	3	ISM	ENSMUSG00000020612.17	ENSMUST00000049527.7	3359	11	15	9502	15	-1599	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1687	junction_1	34.5	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTACGTTAGAAAGGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109541761	109550980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_109541900_109544604_109544788_109550824
tx.356	chr1	-	903	4	ISM	ENSMUSG00000026196.8	ENSMUST00000027393.8	5659	11	179	47580	179	-47580	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_1	8.25967446224258	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGAAATAGACTTATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71142126	71114236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_71114640_71127267_71127411_71128629_71128687_71141826
tx.3560	chr11	+	1056	9	ISM	ENSMUSG00000020612.17	ENSMUST00000049527.7	3359	11	9184	1861	-5839	819	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1417	junction_7	94.0212741883453	298	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTGTCACCGCTTCTC	7215	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109550930	109558621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_109550996_109551860_109551953_109552113_109552176_109553101_109553149_109553774_109553934_109555584_109555646_109556690_109556813_109557469_109557552_109558255
tx.3561	chr11	+	431	2	ISM	ENSMUSG00000020612.17	ENSMUST00000049527.7	3359	11	15740	1861	717	819	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1447	junction_1	0	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTGTCACCGCTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109557486	109558621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_109557552_109558255
tx.3562	chr11	-	1371	7	ISM	ENSMUSG00000020614.14	ENSMUST00000020938.8	2541	11	43718	0	-2116	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.25830573921179	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGGCTTTCTCCAAGTC	4289	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109569364	109563751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_109564391_109565448_109565509_109565931_109566014_109566668_109566779_109567979_109568161_109568596_109568713_109569181
tx.3563	chr11	-	483	2	ISM	ENSMUSG00000020617.14	ENSMUST00000020941.11	919	5	33672	0	19724	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTATGGTGGTCCCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109685176	109682382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_109682621_109684931
tx.3564	chr11	-	826	5	NIC	ENSMUSG00000020617.14	novel	919	5	NA	NA	-29	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.22474487139159	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTATGGTGGTCCCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109704929	109682382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_109682621_109684931_109685106_109688103_109688238_109704384_109704573_109704837
tx.3565	chr11	-	619	4	FSM	ENSMUSG00000020617.14	ENSMUST00000143578.2	582	4	4	-41	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTATGGTGGTCCCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109704896	109682382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_109682621_109688103_109688238_109704384_109704573_109704837
tx.3566	chr11	-	436	3	NNC	ENSMUSG00000020617.14	novel	2035	6	NA	NA	-30	-13691	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTGTCTTACACGGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109704930	109696114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_109696270_109704384_109704573_109704837
tx.3567	chr11	+	2068	12	FSM	ENSMUSG00000020623.12	ENSMUST00000020949.12	2068	12	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_7	8.31308835611224	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGGCATAGTATTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110289947	110404467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_110290252_110373364_110373432_110380970_110381020_110381587_110381702_110383338_110383459_110383721_110383839_110385120_110385173_110387164_110387293_110388722_110388801_110390208_110390349_110397531_110397578_110403614
tx.3568	chr11	+	1588	9	ISM	ENSMUSG00000020623.12	ENSMUST00000020949.12	2068	12	91700	0	11783	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_4	9.25253343684853	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGGCATAGTATTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110381647	110404467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_110381702_110383338_110383459_110383721_110383839_110385120_110385173_110387164_110387293_110388722_110388801_110390208_110390349_110397531_110397578_110403614
tx.3569	chr11	-	2683	9	NIC	ENSMUSG00000041654.16	novel	2688	10	NA	NA	-15	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_5	193.3874026404	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCTGTGTTCCGTGCGAT	7731	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113456620	113135679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_113137322_113138545_113138705_113141293_113141393_113196710_113196781_113260553_113260725_113354776_113354922_113414291_113414451_113452831_113452951_113456501
tx.357	chr1	+	301	3	ISM	ENSMUSG00000026192.14	ENSMUST00000136443.2	2576	4	-34	3895	0	-648	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	629	junction_2	13.5	273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTGGTTGAGGGTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71596337	71598462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_71596434_71596655_71596783_71598384
tx.3570	chr11	-	2674	10	FSM	ENSMUSG00000041654.16	ENSMUST00000071539.10	2664	10	-11	1	1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_5	113.78341999899	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCTGTGTTCCGTGCGAT	7758	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113456593	113135679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_113137322_113138545_113138705_113141293_113141393_113196710_113196781_113260553_113260725_113354797_113354922_113414291_113414451_113450336_113450376_113452831_113452951_113456501
tx.3571	chr11	-	2705	10	NNC	ENSMUSG00000041654.16	novel	2688	10	NA	NA	-1	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	167.525785743237	40	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCTGTGTTCCGTGCGAT	7745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113456606	113135679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_113137322_113138545_113138705_113141293_113141393_113196710_113196781_113260553_113260725_113354776_113354922_113414291_113414451_113450336_113450376_113452831_113452948_113456501
tx.3572	chr11	-	2708	10	FSM	ENSMUSG00000041654.16	ENSMUST00000106633.10	2688	10	-21	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	154.822558728882	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCTGTGTTCCGTGCGAT	7745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113456606	113135679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_113137322_113138545_113138705_113141293_113141393_113196710_113196781_113260553_113260725_113354776_113354922_113414291_113414451_113450336_113450376_113452831_113452951_113456501
tx.3573	chr11	+	1856	3	FSM	ENSMUSG00000047904.7	ENSMUST00000106630.2	1537	3	-176	-143	-42	10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGTTTTGTATTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113510125	113516864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_113510449_113514992_113516076_113516414
tx.3574	chr11	+	1103	8	ISM	ENSMUSG00000018661.18	ENSMUST00000018805.15	3935	14	7307	546	-899	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	234	junction_1	25.9544341695446	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGTGCCTCTGCTCCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113547301	113553227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_113547475_113547828_113547976_113548200_113548363_113549304_113549433_113550094_113550204_113551768_113551879_113551965_113552045_113553032
tx.3575	chr11	+	536	5	ISM	ENSMUSG00000018661.18	ENSMUST00000063776.14	1476	8	9236	-2	-14	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	267	junction_2	20.4511613362176	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGTGCCTCTGCTCCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113549389	113553227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_113549433_113550094_113550204_113551768_113551879_113551965_113552045_113553032
tx.3576	chr11	-	1065	3	NNC	ENSMUSG00000041629.8	novel	2619	3	NA	NA	240	-1588	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	48	junction_2	675	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGTTTCCATGGGGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113574741	113553732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_113554370_113568129_113568230_113574413
tx.3577	chr11	-	874	3	FSM	ENSMUSG00000041629.8	ENSMUST00000120194.2	2619	3	157	1588	157	-1588	multi-exon	FALSE	canonical	3	1327	junction_2	35.5	573	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAGTTTCCATGGGGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113574824	113553732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_113554370_113568129_113568230_113574687
tx.3578	chr11	+	844	2	ISM	ENSMUSG00000041623.18	ENSMUST00000106621.4	2062	5	-13	6308	-6	126	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAACCCAGCCTCATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113575259	113579165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_113575538_113578599
tx.3579	chr11	+	2075	5	FSM	ENSMUSG00000041623.18	ENSMUST00000106621.4	2062	5	-13	0	-6	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	249	junction_1	30.335622624235	197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTCTTCTTCTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113575259	113585473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_113575538_113578599_113580048_113582554_113582660_113583220_113583329_113585337
tx.358	chr1	+	338	4	FSM	ENSMUSG00000026192.14	ENSMUST00000136443.2	2576	4	-34	2272	0	975	multi-exon	FALSE	canonical	3	629	junction_2	11.0855260988773	1588	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGCCAGGCTTGATTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71596337	71600085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_71596434_71596655_71596783_71598384_71598462_71600047
tx.3580	chr11	+	1373	4	ISM	ENSMUSG00000041623.18	ENSMUST00000106621.4	2062	5	3751	0	3112	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	278	junction_3	23.0988215187606	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTCTTCTTCTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113579023	113585473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_113580048_113582554_113582660_113583220_113583329_113585337
tx.3581	chr11	+	1204	3	ISM	ENSMUSG00000041623.18	ENSMUST00000106621.4	2062	5	6427	0	5788	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	278	junction_2	27.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTCTTCTTCTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113581699	113585473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_113582660_113583220_113583329_113585337
tx.3582	chr11	+	213	2	ISM	ENSMUSG00000041623.18	ENSMUST00000106621.4	2062	5	7979	0	7340	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	278	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTCTTCTTCTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113583251	113585473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_113583329_113585337
tx.3583	chr11	-	1331	8	NIC	ENSMUSG00000018727.20	novel	1375	8	NA	NA	-114	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	87	junction_7	41.9649999939211	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCATTGATTCCTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113600466	113588996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_113589493_113590661_113590809_113592881_113592922_113593238_113593333_113594096_113594193_113597242_113597396_113599629_113599681_113600212
tx.3584	chr11	-	967	3	Intergenic	novelGene_206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCGACTTTCATTATTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114383533	114379165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_114379649_114380732_114381093_114383409
tx.3585	chr11	+	694	2	Intergenic	novelGene_207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAAGTTTTGTTCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114392458	114394933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_114392569_114394349
tx.3586	chr11	-	1113	3	Intergenic	novelGene_209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGTTGCCTTGGTCATGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114413923	114411999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_114412940_114413360_114413439_114413828
tx.3587	chr11	-	479	3	Intergenic	novelGene_210	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGGAGTGTCGCGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114517053	114512816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_114512966_114515772_114515982_114516932
tx.3588	chr11	+	337	4	NIC	ENSMUSG00000057322.13	novel	364	5	NA	NA	-7	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	34	junction_1	8270.54101414573	745	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTGTGTCCTCAGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114559366	114563157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_114559453_114559731_114559793_114562559_114562683_114563090
tx.3589	chr11	+	332	5	FSM	ENSMUSG00000057322.13	ENSMUST00000106602.10	371	5	39	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6598	junction_1	5536.08152825625	35916	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTGTGTCCTCAGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114559388	114563157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_114559436_114559606_114559641_114559731_114559793_114562559_114562683_114563090
tx.359	chr1	+	2589	16	FSM	ENSMUSG00000026192.14	ENSMUST00000027384.6	2845	16	29	227	0	-227	multi-exon	TRUE	canonical	3	576	junction_4	38.3577313661217	624	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTTTGTGGTTACTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71596337	71618563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_71596434_71596655_71596783_71598384_71598462_71600047_71600115_71602917_71603007_71603564_71603717_71603969_71604127_71606972_71607099_71608121_71608230_71608998_71609085_71609998_71610089_71612066_71612196_71615199_71615293_71615775_71615959_71616944_71617101_71617710
tx.3590	chr11	+	321	5	FSM	ENSMUSG00000057322.13	ENSMUST00000077915.10	364	5	43	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5140	junction_1	6068.87239835375	6723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTGTGTCCTCAGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114559416	114563157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_114559453_114559606_114559641_114559731_114559793_114562559_114562683_114563090
tx.3591	chr11	+	346	5	FSM	ENSMUSG00000057322.13	ENSMUST00000082092.5	345	5	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1304	junction_1	7543.63564122102	1918	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTGTGTCCTCAGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114559450	114563157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_114559512_114559606_114559641_114559731_114559793_114562559_114562683_114563090
tx.3592	chr11	+	289	4	FSM	ENSMUSG00000057322.13	ENSMUST00000106599.8	457	4	168	0	151	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12129	junction_3	3589.14031799012	2797	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTGTGTCCTCAGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114559602	114563157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_114559641_114559731_114559793_114562559_114562683_114563090
tx.3593	chr11	+	630	3	NNC	ENSMUSG00000034706.17	novel	597	3	NA	NA	-1079	-832	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGAGCCTCTCAGTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114642422	114644063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_114642536_114642611_114642748_114643682
tx.3594	chr11	+	1381	5	NNC	ENSMUSG00000034706.17	novel	597	3	NA	NA	-1071	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTACTTGTCATGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114642430	114648712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_114642536_114642611_114642748_114643682_114643830_114645060_114645289_114647947
tx.3595	chr11	+	1377	4	ISM	ENSMUSG00000034706.17	ENSMUST00000092469.11	2799	13	22537	3	-991	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_2	1.69967317119759	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTACTTGTCATGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114642510	114648712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_114642748_114643682_114643830_114645060_114645289_114647947
tx.3596	chr11	+	1842	4	ISM	ENSMUSG00000051043.17	ENSMUST00000053361.12	3667	5	-19	3519	-19	2	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	8.2192186706253	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTGCTTTGGGCTTGTGGT	909	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114742648	114759924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_114742713_114754292_114755373_114757450_114757546_114759321
tx.3597	chr11	+	936	9	FSM	ENSMUSG00000020732.14	ENSMUST00000021076.6	2210	9	-19	1293	-19	-1293	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	1.36358901432946	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTACCCGTATGCCCCCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115044963	115051769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115045118_115047752_115047864_115048776_115048819_115049330_115049398_115049484_115049538_115050501_115050568_115051124_115051182_115051263_115051341_115051460
tx.3598	chr11	+	1809	3	ISM	ENSMUSG00000020732.14	ENSMUST00000021076.6	2210	9	6069	0	6023	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGACCGGTTTTTCCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115051051	115053062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_115051182_115051263_115051341_115051460
tx.3599	chr11	+	1901	5	NNC	ENSMUSG00000020733.4	novel	1925	6	NA	NA	0	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	65.5781975964573	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGCTCAAGCCTCTGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115054166	115072001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_115054778_115067176_115067339_115068049_115068227_115070832_115070923_115071140
tx.36	chr1	-	1287	8	FSM	ENSMUSG00000025917.10	ENSMUST00000027050.10	1698	8	182	229	0	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	713	junction_7	104.105715501119	6438	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGTCCTTCTGTGGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10108170	10095054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_10095289_10097327_10097477_10100823_10100936_10102563_10102650_10103482_10103549_10104232_10104362_10105153_10105389_10107894
tx.360	chr1	+	1247	4	ISM	ENSMUSG00000026192.14	ENSMUST00000027384.6	2845	16	18929	227	7213	-227	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	606	junction_2	52.083266666624	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTTTGTGGTTACTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71615237	71618563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_71615293_71615775_71615959_71616944_71617101_71617710
tx.3600	chr11	+	1923	6	FSM	ENSMUSG00000020733.4	ENSMUST00000021077.4	1925	6	0	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_1	12.6964561984831	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAAGCCTCTGTGTCCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115054166	115072005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115054778_115067176_115067339_115068049_115068204_115069875_115069917_115070832_115070923_115071140
tx.3601	chr11	-	1164	7	FSM	ENSMUSG00000015542.18	ENSMUST00000103038.8	1143	7	-21	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	51.0217818409179	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCCCTTGTTTGTTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115078179	115073657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115074092_115074180_115074276_115074450_115074511_115075308_115075453_115075832_115075943_115077574_115077661_115077944
tx.3602	chr11	-	1167	7	FSM	ENSMUSG00000015542.18	ENSMUST00000103040.11	1204	7	37	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_5	40.7553677446297	394	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCCCTTGTTTGTTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115078179	115073657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115074092_115074180_115074276_115074450_115074511_115075308_115075453_115075832_115075943_115077574_115077664_115077944
tx.3603	chr11	+	631	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000015542.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	46.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATGCGCGTAGAGGGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115075618	115078175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_115075939_115077570_115077667_115077960
tx.3604	chr11	-	645	3	FSM	ENSMUSG00000015542.18	ENSMUST00000134769.2	386	3	-74	-185	5	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	42.5	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTTGTTTAGGCCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115078176	115075618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115075943_115077574_115077664_115077944
tx.3605	chr11	+	1063	9	NNC	ENSMUSG00000045980.14	novel	3147	9	NA	NA	-1	22790	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_8	14.9033343584582	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCAAGGGGTGGTGTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115078335	115111019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_115078425_115079035_115079149_115088061_115088184_115091645_115091728_115092141_115092239_115092957_115093039_115095887_115095988_115096300_115096410_115110749
tx.3607	chr11	-	408	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000045980.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAATGAAATCTTCAAGCTG	5957	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115119973	115116366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_115116607_115119216_115119323_115119911
tx.3608	chr11	-	1361	6	FSM	ENSMUSG00000044788.11	ENSMUST00000056153.8	4951	6	-133	3723	16	-3723	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	1.6	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAGGCCTCAGCTGACTCC	296	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115188473	115174170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115174482_115175025_115175206_115176124_115176313_115176943_115177125_115187363_115187531_115188139
tx.3609	chr11	+	759	6	FSM	ENSMUSG00000018858.16	ENSMUST00000103036.5	749	6	-10	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_1	353.082766501	479	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGTTTCCAGTGAGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115294572	115301745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115294700_115297376_115297414_115300305_115300366_115300885_115300969_115301057_115301228_115301463
tx.361	chr1	-	876	2	ISM	ENSMUSG00000026193.16	ENSMUST00000185408.7	4022	17	22625	-5	4129	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2938	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTGGACGTCATTTCTTT	6024	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71626101	71624679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_71625443_71625988
tx.3610	chr11	+	842	6	FSM	ENSMUSG00000018858.16	ENSMUST00000153983.8	2596	6	-1	1755	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	944	junction_3	61.9825781974258	3083	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGTTTCCAGTGAGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115294576	115301745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115294787_115297376_115297414_115300305_115300366_115300885_115300969_115301057_115301228_115301463
tx.3611	chr11	+	782	5	FSM	ENSMUSG00000018858.16	ENSMUST00000106539.10	2522	5	-3	1743	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_2	428.298377302553	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGTTTCCAGTGAGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115294576	115301745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115294787_115297376_115297414_115300885_115300969_115301057_115301228_115301463
tx.3612	chr11	-	602	6	FSM	ENSMUSG00000034566.11	ENSMUST00000043931.9	625	6	21	2	21	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1974	junction_5	551.930285452792	16937	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCGTCTCTGAGTAGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115310767	115306516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115306706_115306840_115306904_115307678_115307751_115308664_115308762_115309211_115309343_115310717
tx.3613	chr11	-	471	5	NIC	ENSMUSG00000034566.11	novel	625	6	NA	NA	21	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	161	junction_4	1375.51172295986	251	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCGTCTCTGAGTAGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115310767	115306516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_115306706_115306840_115306904_115307678_115307751_115308664_115308762_115310717
tx.3614	chr11	+	1570	6	FSM	ENSMUSG00000016940.19	ENSMUST00000103035.10	1764	6	194	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_1	5.67097875150313	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCTGTGTCTCTCCTTCAT	3930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115311147	115322100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115311333_115312808_115312918_115315309_115315402_115318258_115318355_115320105_115320232_115321138
tx.3615	chr11	+	2270	3	FSM	ENSMUSG00000057219.12	ENSMUST00000035240.7	2260	3	-9	-1	-9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_2	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTGTGCTAGTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115366483	115381294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115366854_115366947_115367092_115379538
tx.3616	chr11	+	1437	3	FSM	ENSMUSG00000057219.12	ENSMUST00000136985.8	1009	3	-29	-399	2	399	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	10	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGAGTTGTTTTTCCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115366494	115375002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115366854_115366947_115367092_115374068
tx.3617	chr11	-	1379	4	NNC	ENSMUSG00000020737.13	novel	1375	5	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	825.422046928452	7358	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCACCGTGTTTTGTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115405211	115388178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_115389126_115392805_115392929_115393857_115394001_115405045
tx.3618	chr11	-	1357	4	NNC	ENSMUSG00000020737.13	novel	1375	5	NA	NA	2	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	825.422046928452	1308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGCACCGTGTTTTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115405211	115388181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_115389126_115392824_115392929_115393857_115394001_115405045
tx.3619	chr11	-	1021	4	FSM	ENSMUSG00000020738.17	ENSMUST00000153892.2	1051	4	30	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3819	junction_1	149.312498546579	4759	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTTCTCTTTATTCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115427072	115413927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115414596_115421171_115421244_115425377_115425510_115426923
tx.362	chr1	-	1198	5	ISM	ENSMUSG00000026193.16	ENSMUST00000185408.7	4022	17	16411	-7	-2085	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2521	junction_4	169.731221347164	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGACGTCATTTCTTTTT	9778	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71632315	71624677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_71625443_71625988_71626103_71629256_71629364_71629925_71630052_71632229
tx.3620	chr11	+	2089	19	NNC	ENSMUSG00000020739.12	novel	2230	19	NA	NA	38	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	80	junction_16	299.37137842857	77	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAATTGTTAATCCTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115455297	115474732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_115455389_115455979_115456074_115457426_115457590_115459188_115459260_115459504_115459549_115460527_115460598_115460824_115460947_115468755_115468891_115468989_115469113_115469314_115469447_115469615_115469723_115471329_115471414_115471555_115471622_115471746_115471899_115472567_115472686_115472764_115472866_115473910_115474039_115474151_115474254_115474546
tx.3621	chr11	+	2116	19	FSM	ENSMUSG00000020739.12	ENSMUST00000021085.11	2230	19	35	79	35	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	862	junction_16	81.0315439264927	664	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAATTGTTAATCCTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115455294	115474732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115455389_115455979_115456074_115457426_115457590_115459188_115459260_115459504_115459549_115460527_115460598_115460824_115460947_115468755_115468891_115468989_115469113_115469314_115469447_115469615_115469723_115471329_115471414_115471555_115471622_115471746_115471899_115472567_115472686_115472764_115472866_115473702_115473855_115474151_115474254_115474546
tx.3622	chr11	+	794	6	ISM	ENSMUSG00000020739.12	ENSMUST00000021085.11	2230	19	16504	79	-158	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	862	junction_3	118.829962551538	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAATTGTTAATCCTACC	3465	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115471763	115474732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_115471899_115472567_115472686_115472764_115472866_115473702_115473855_115474151_115474254_115474546
tx.3623	chr11	-	1773	3	ISM	ENSMUSG00000020740.14	ENSMUST00000123485.8	1221	8	2664	-1449	1636	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	362	junction_2	3.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGCATCTTTCAATACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115477217	115475080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_115476667_115476911_115477023_115477141
tx.3624	chr11	-	3664	17	FSM	ENSMUSG00000020740.14	ENSMUST00000019135.14	3816	17	152	0	-6	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	352	junction_6	42.6075385788712	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGCATCTTTCAATACAG	3533	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115494725	115475080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115476667_115476911_115477023_115477141_115477312_115477821_115478028_115478231_115478543_115478761_115478830_115479137_115479372_115479681_115479799_115479880_115479963_115481221_115481360_115481712_115481794_115482088_115482193_115482455_115482580_115483257_115483357_115485531_115485608_115485734_115485820_115494653
tx.3625	chr11	-	618	7	ISM	ENSMUSG00000020740.14	ENSMUST00000019135.14	3816	17	162	6645	-1	742	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	358	junction_1	40.4903966666446	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGTGAAGGAAGTGAGTG	3543	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115494715	115481725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_115481794_115482088_115482193_115482455_115482580_115483257_115483357_115485531_115485608_115485734_115485820_115494653
tx.3626	chr11	+	1262	5	FSM	ENSMUSG00000046756.11	ENSMUST00000058109.9	1962	5	32	668	32	367	multi-exon	TRUE	canonical	3	642	junction_4	47.0451910401053	2817	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCCATTCTGTGAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115494782	115498194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115495070_115495546_115495739_115495848_115495913_115496795_115496964_115497643
tx.3627	chr11	-	2455	6	FSM	ENSMUSG00000059923.14	ENSMUST00000021090.14	2709	6	161	93	140	-93	multi-exon	FALSE	canonical	3	859	junction_5	53.4714877294432	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAACCAACTATGTAC	4631	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115599262	115534963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115536781_115537535_115537705_115540596_115540720_115546183_115546282_115589977_115590183_115599219
tx.3628	chr11	-	640	2	ISM	ENSMUSG00000059923.14	ENSMUST00000106499.8	2333	4	52489	1379	52489	-774	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	878	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGGCTGGTATTTTCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115537644	115536249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_115536781_115537535
tx.3629	chr11	-	1127	5	FSM	ENSMUSG00000059923.14	ENSMUST00000106497.8	2683	5	177	1379	-50	-774	multi-exon	FALSE	canonical	3	861	junction_3	55.2149209906163	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGGCTGGTATTTTCTCTA	674	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115590183	115536249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115536781_115537535_115537705_115540596_115540720_115546183_115546282_115589977
tx.363	chr1	-	527	2	ISM	ENSMUSG00000026193.16	ENSMUST00000186879.2	2104	6	-57	7044	-29	-5878	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1755	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGGAAGGCAGTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71692388	71690679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_71690809_71691990
tx.3630	chr11	+	1939	11	NIC	ENSMUSG00000020781.15	novel	1979	11	NA	NA	-7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	6	junction_10	65.491678860753	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGTGGTTCAATACTTAC	5947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115705564	115713915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_115705646_115705740_115705906_115706000_115706065_115706152_115706237_115706523_115706623_115707878_115707932_115710950_115711050_115711204_115711834_115712481_115712543_115712824_115712922_115713408
tx.3631	chr11	+	1947	11	FSM	ENSMUSG00000020781.15	ENSMUST00000021134.10	1979	11	27	5	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_1	26.8730348118704	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGTGGTTCAATACTTAC	5959	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115705576	115713915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115705646_115705740_115705906_115706000_115706065_115706152_115706237_115706523_115706623_115707878_115707932_115710950_115711050_115711204_115711834_115712481_115712543_115712824_115712942_115713408
tx.3632	chr11	+	2020	10	NIC	ENSMUSG00000020781.15	novel	1979	11	NA	NA	2	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	180	junction_1	22.7063922038174	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCTGTGGTTCAATACTTAC	5981	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115705598	115713915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_115705906_115706000_115706065_115706152_115706237_115706523_115706623_115707878_115707932_115710950_115711050_115711204_115711834_115712481_115712543_115712824_115712942_115713408
tx.3633	chr11	+	1123	4	ISM	ENSMUSG00000020781.15	ENSMUST00000021134.10	1979	11	5844	7	-142	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	180	junction_3	29.1013554476229	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTGTGGTTCAATACTT	3319	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115711393	115713913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_115711834_115712481_115712543_115712824_115712942_115713408
tx.3634	chr11	+	809	6	ISM	ENSMUSG00000020782.19	ENSMUST00000103032.11	3551	26	-6	10135	-6	169	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	674	junction_1	80.564508314766	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCGTCTCAGTCAACCCC	6794	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115714868	115736471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_115715004_115725622_115725729_115734142_115734241_115735319_115735402_115735660_115735777_115736199
tx.3635	chr11	+	3530	26	FSM	ENSMUSG00000020782.19	ENSMUST00000103032.11	3551	26	-3	24	-3	-22	multi-exon	TRUE	canonical	3	630	junction_7	88.2626444199357	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTTGTTTCGTCTTCACT	6797	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115714871	115746582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115715004_115725622_115725729_115734142_115734241_115735319_115735402_115735660_115735777_115736199_115736359_115737746_115737910_115737996_115738130_115738414_115738470_115739011_115739167_115740341_115740560_115740636_115740705_115740821_115740976_115741063_115741169_115741452_115741746_115741833_115741985_115742942_115743100_115743856_115743974_115744093_115744261_115744542_115744808_115745018_115745182_115745372_115745402_115745637_115745686_115745888_115745932_115746017_115746080_115746291
tx.3636	chr11	+	1720	11	NNC	ENSMUSG00000034427.18	novel	2825	21	NA	NA	-2805	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_9	4.07430975749267	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGGTGTCACTCCTCTT	7645	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115774456	115778271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_115774734_115774823_115774912_115775005_115775232_115775901_115776015_115776219_115776280_115776846_115776923_115777016_115777136_115777216_115777336_115777409_115777556_115777687_115777800_115777887
tx.3637	chr11	+	697	2	FSM	ENSMUSG00000075420.7	ENSMUST00000132961.2	978	2	281	0	281	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGTTATCGTGAGCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115803123	115804746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115803283_115804208
tx.3638	chr11	+	1217	11	FSM	ENSMUSG00000020755.10	ENSMUST00000140991.2	3654	11	364	2073	9	-883	multi-exon	FALSE	canonical	3	284	junction_4	19.7585424563656	1013	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCATGTCAGGTGGACTGG	408	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115824471	115855478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115824608_115826191_115826302_115828835_115828884_115842792_115842836_115848186_115848276_115851325_115851418_115852181_115852243_115852564_115852617_115853319_115853379_115854768_115854854_115855036
tx.3639	chr11	-	1341	8	FSM	ENSMUSG00000020766.5	ENSMUST00000021114.5	1406	8	6	59	6	-59	multi-exon	FALSE	canonical	3	761	junction_4	62.9907670591006	3419	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACCTGCCTCCAGAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115903539	115899341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115899541_115899628_115899792_115899873_115900025_115900746_115900929_115901066_115901203_115901388_115901509_115901852_115902043_115903339
tx.364	chr1	+	483	2	ISM	ENSMUSG00000073652.11	ENSMUST00000097699.3	826	3	481	-1	-17	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGGTGTCAGTAGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71692476	71696617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_71692546_71696203
tx.3640	chr11	-	840	2	ISM	ENSMUSG00000016559.15	ENSMUST00000139623.2	874	3	733	-340	692	340	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13934	junction_1	0	313	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGGGGAGTCTTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115914607	115913678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_115914362_115914450
tx.3641	chr11	-	1099	4	FSM	ENSMUSG00000016559.15	ENSMUST00000016703.8	1993	4	3	891	3	341	multi-exon	FALSE	canonical	3	12160	junction_3	927.451466235416	38742	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGGGGAGTCTTGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115915327	115913677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115914362_115914450_115914605_115914707_115914846_115915204
tx.3642	chr11	-	1601	4	NNC	ENSMUSG00000016559.15	novel	1993	4	NA	NA	3	-381	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6290.62116699668	500	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTCAATTATGTATGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115915327	115913167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_115914354_115914450_115914605_115914707_115914846_115915204
tx.3643	chr11	+	823	3	FSM	ENSMUSG00000020770.14	ENSMUST00000176788.2	471	3	3	-355	3	355	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCCTAGTTTTTTATTAAT	8826	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115921151	115932231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_115921318_115929365_115929610_115931818
tx.3644	chr11	-	1197	6	ISM	ENSMUSG00000057948.13	ENSMUST00000155120.2	991	7	77	0	57	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_4	7.60526133673262	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGAGGATCAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115968710	115966222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_115966712_115966933_115967001_115967095_115967156_115967267_115967376_115967577_115967614_115968273
tx.3645	chr11	-	1278	3	FSM	ENSMUSG00000020773.12	ENSMUST00000127235.2	692	3	1	-587	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_2	17	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTCCCCCTTTCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115998565	115996577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115997468_115997757_115997830_115998249
tx.3646	chr11	-	1075	5	NNC	ENSMUSG00000020773.12	novel	1503	4	NA	NA	15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	54.7083174663597	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTCCCCCTTTCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115998930	115996577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_115996921_115997333_115997468_115997757_115997830_115998249_115998449_115998603
tx.3647	chr11	-	1457	4	FSM	ENSMUSG00000020773.12	ENSMUST00000141531.8	1503	4	46	0	-38	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_3	17.6131264181639	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTCCCCCTTTCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115998899	115996577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115997468_115997757_115997830_115998249_115998449_115998603
tx.3648	chr11	-	1651	6	FSM	ENSMUSG00000020773.12	ENSMUST00000106441.8	2192	6	541	0	541	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_4	39.5777715390849	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTCCCCCTTTCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116000522	115996577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_115997468_115997757_115997830_115998249_115998449_115998603_115998835_115999091_115999188_116000359
tx.3649	chr11	-	1347	9	FSM	ENSMUSG00000020775.14	ENSMUST00000106439.2	1411	9	60	4	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	763	junction_8	33.509093914936	2411	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCAATATGTCTTCACTTT	467	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116029634	116022646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_116022957_116023245_116023383_116023568_116023728_116025081_116025128_116025258_116025332_116025733_116025943_116026016_116026152_116029267_116029448_116029536
tx.365	chr1	-	397	2	Intergenic	novelGene_33	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTATGCTCTCTCTCTTTTT	5068	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71725979	71722558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_71722857_71725880
tx.3650	chr11	+	890	4	FSM	ENSMUSG00000020778.13	ENSMUST00000021130.7	902	4	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_3	16.0277537068951	1749	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGTGTGTGCTGATGCGG	9079	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116089692	116106144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116089810_116095670_116095806_116096436_116096595_116105664
tx.3651	chr11	+	1571	8	NNC	ENSMUSG00000092300.8	novel	915	7	NA	NA	-578	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2.76272565797339	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTGGTGTCAATCTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116106250	116111113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_116106386_116106818_116106945_116107236_116107315_116107385_116107507_116107596_116107768_116107857_116107960_116108919_116109124_116110479
tx.3652	chr11	+	1610	7	FSM	ENSMUSG00000092300.8	ENSMUST00000174177.2	915	7	-184	-511	-184	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	2.49443825784929	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTGGTGTCAATCTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116106644	116111113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116106945_116107236_116107315_116107385_116107507_116107596_116107768_116107857_116107960_116108919_116109124_116110479
tx.3653	chr11	-	2429	16	FSM	ENSMUSG00000020780.16	ENSMUST00000021133.16	2526	16	97	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	572	junction_9	48.1105209099031	619	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGTGTCTGGTTTTTGCA	9914	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116164946	116135991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_116136757_116137045_116137099_116137470_116137547_116138641_116138772_116139556_116139652_116141561_116141719_116143554_116143620_116145127_116145227_116151619_116151761_116152570_116152654_116153685_116153796_116154040_116154124_116156182_116156379_116159099_116159214_116162738_116162806_116164751
tx.3654	chr11	+	1636	2	FSM	ENSMUSG00000020793.6	ENSMUST00000055872.3	1940	2	316	-12	-231	12	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCTGTGATGTGTGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116172080	116174776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116172677_116173736
tx.3655	chr11	-	2093	18	FSM	ENSMUSG00000020792.16	ENSMUST00000106411.10	3205	18	7	1105	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_14	26.4175940114993	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGAGCCGGGTGAGTGTGAA	8927	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116197553	116179931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_116180112_116180350_116180485_116180775_116180818_116181032_116181097_116181964_116182061_116182279_116182401_116183344_116183411_116184797_116184865_116185232_116185296_116185567_116185667_116185999_116186153_116186369_116186516_116191091_116191260_116191929_116192153_116195402_116195509_116195689_116195875_116197213_116197280_116197439
tx.3656	chr11	+	1302	3	FSM	ENSMUSG00000050628.7	ENSMUST00000057676.7	1482	3	176	4	176	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	1535	junction_2	51	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTAGTTTGTGTTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116325095	116329899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116325255_116325384_116325448_116328819
tx.3657	chr11	+	1193	2	FSM	ENSMUSG00000050628.7	ENSMUST00000144310.2	343	2	1	-851	1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1535	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTAGTTTGTGTTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116325335	116329900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116325448_116328819
tx.3658	chr11	-	1796	10	FSM	ENSMUSG00000015869.17	ENSMUST00000106391.8	1841	10	40	5	6	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	803	junction_5	49.0028973696177	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCAGTCGGCTGCTGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116381134	116361675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_116362382_116363002_116363150_116363769_116363841_116368027_116368174_116368885_116368942_116369350_116369467_116370477_116370651_116376694_116376762_116378943_116378997_116380873
tx.3659	chr11	-	1018	4	FSM	ENSMUSG00000015869.17	ENSMUST00000142480.2	912	4	442	-548	442	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	859	junction_1	35.565276448931	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTCAGTCGGCTGCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116368123	116361677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_116362382_116363002_116363150_116363769_116363841_116368027
tx.366	chr1	-	443	4	Intergenic	novelGene_34	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTAATGCTTTTTCTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71743320	71740237	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_71740439_71741541_71741647_71741934_71742032_71743280
tx.3660	chr11	-	732	3	FSM	ENSMUSG00000015869.17	ENSMUST00000144154.2	738	3	19	-13	6	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	839	junction_2	49.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAAACCCTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116381134	116376343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_116376762_116378943_116378997_116380873
tx.3661	chr11	-	3653	19	NNC	ENSMUSG00000020806.16	novel	3593	19	NA	NA	-18	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_12	28.1429880747901	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGCCTTTTGCCTTAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116515091	116488990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_116490265_116490886_116491041_116491223_116491325_116491435_116491512_116491720_116491816_116491911_116491976_116492110_116492218_116492419_116492582_116492714_116492790_116493014_116493127_116494478_116494680_116494757_116494877_116495208_116495333_116495786_116495991_116496068_116496265_116496933_116497059_116498053_116498254_116501129_116501306_116515003
tx.3662	chr11	+	850	6	NNC	ENSMUSG00000020812.19	novel	865	6	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	64.6362127603405	137	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTAGCATTGTGGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116562493	116566624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_116562583_116562989_116563182_116563489_116563565_116564763_116564891_116565125_116565202_116566333
tx.3663	chr11	+	875	6	FSM	ENSMUSG00000020812.19	ENSMUST00000239281.2	857	6	-19	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_5	61.1901952930369	316	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTAGCATTGTGGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116562494	116566624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116562583_116562989_116563182_116563489_116563565_116564763_116564898_116565125_116565202_116566314
tx.3664	chr11	+	856	6	FSM	ENSMUSG00000020812.19	ENSMUST00000139934.8	865	6	9	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_5	27.7632851082144	1613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTAGCATTGTGGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116562494	116566624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116562583_116562989_116563182_116563489_116563565_116564763_116564898_116565125_116565202_116566333
tx.3665	chr11	-	2040	9	FSM	ENSMUSG00000057286.7	ENSMUST00000079545.6	3643	9	203	1400	-56	-814	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_5	7.34421541078419	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCTTTTCCACATTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116585491	116567528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_116568508_116569291_116569392_116570732_116570817_116572684_116572789_116575171_116575311_116575922_116576092_116576661_116576837_116581137_116581199_116585262
tx.3666	chr11	-	304	2	ISM	ENSMUSG00000020814.14	ENSMUST00000021170.9	2063	4	16064	1349	16021	-1349	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAGGATCTGCAATTTAT	2359	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116702808	116695236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_116695481_116702748
tx.3667	chr11	-	1445	5	ISM	ENSMUSG00000056962.12	ENSMUST00000047616.10	1668	6	567	0	-162	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	250	junction_2	32.8252951243397	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGGACAGCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116733708	116728257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_116728590_116729815_116729955_116731235_116731372_116731894_116732182_116733157
tx.3668	chr11	-	1583	6	FSM	ENSMUSG00000056962.12	ENSMUST00000047616.10	1668	6	85	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_2	32.356761271796	286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGGACAGCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116734190	116728257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_116728590_116729815_116729955_116731235_116731372_116731894_116732182_116733157_116733547_116733890
tx.3669	chr11	+	592	2	FSM	ENSMUSG00000090266.11	ENSMUST00000128784.2	585	2	-19	12	-13	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	529	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTTCTTTTTTGAATCAA	8932	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116734367	116736947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116734601_116736588
tx.367	chr1	+	1326	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000101496.2_ENSMUSG00000059483.6	novel	598	1	NA	NA	-32	62	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTAAACATTTATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72043414	72127675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_72044016_72126950
tx.3670	chr11	+	988	5	FSM	ENSMUSG00000090266.11	ENSMUST00000106370.10	1276	5	282	6	-1	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	13.3603892158874	1620	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTAGACTACTCCCAATC	8950	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116734385	116740560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116734601_116739079_116739185_116739726_116739965_116740041_116740127_116740215
tx.3671	chr11	+	1170	6	NIC	ENSMUSG00000090266.11	novel	1276	5	NA	NA	2	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	38	junction_2	44.7812460746684	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTAGACTACTCCCAATCAT	8953	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116734388	116740562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_116734601_116736588_116736772_116739079_116739185_116739726_116739965_116740041_116740127_116740215
tx.3672	chr11	-	1329	2	ISM	ENSMUSG00000034120.19	ENSMUST00000092404.13	1899	3	799	7	-76	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1858	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGAGAATGTGTCCTGGTCT	6802	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116743121	116740733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_116741788_116742846
tx.3673	chr11	-	978	3	FSM	ENSMUSG00000034120.19	ENSMUST00000176834.8	620	3	-356	-2	-223	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_1	811.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGTGTCCTGGTCTTTTG	6655	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116743268	116740729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_116741180_116741681_116741788_116742846
tx.3674	chr11	+	2334	14	NIC	ENSMUSG00000020818.17	novel	2952	14	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	62	junction_1	8.80424857096892	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAAAGAGTATTTACTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116744590	116765538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_116744730_116744825_116745000_116745468_116745525_116749299_116749408_116750124_116750205_116750322_116750420_116751884_116751944_116752348_116752494_116754731_116754773_116756716_116756783_116759359_116759486_116762119_116762295_116764069_116764206_116764606
tx.3675	chr11	+	1288	2	FSM	ENSMUSG00000020818.17	ENSMUST00000151944.3	419	2	-54	-815	-4	815	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAACAAAGATTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116744600	116746357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116745000_116745468
tx.3676	chr11	+	285	2	Intergenic	novelGene_212	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTATGACCTTGTTACACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116779944	116782084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_116780142_116781996
tx.3677	chr11	+	590	2	FSM	ENSMUSG00000086859.5	ENSMUST00000149822.3	600	2	10	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	615	junction_1	0	5670	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGTTTCCATTGTTCAAT	885	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116967618	116969781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_116968029_116969601
tx.3678	chr11	+	655	5	ISM	ENSMUSG00000020823.17	ENSMUST00000127090.8	3137	12	32	8771	28	-8771	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	338	junction_4	19.9921859735248	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGTGAGTGGCTTTCTTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117006025	117034240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_117006178_117007985_117008079_117032243_117032394_117032487_117032620_117034112
tx.3679	chr11	+	306	2	ISM	ENSMUSG00000020823.17	ENSMUST00000146585.2	1047	3	-48	11446	32	-11446	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	387	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCGCTCCTTGTTATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117006029	117008143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_117006178_117007985
tx.368	chr1	+	874	4	Intergenic	novelGene_35	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.82842712474619	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAAAATTGCATTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72275622	72304519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_72275688_72277024_72277083_72280529_72280663_72303901
tx.3680	chr11	+	2833	17	FSM	ENSMUSG00000020823.17	ENSMUST00000021177.15	2866	17	33	0	33	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	28	junction_16	82.8488599423673	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGAGTGTCCTTTTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117006030	117050091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_117006178_117007985_117008079_117032243_117032394_117032487_117032620_117034112_117034242_117034606_117034842_117035674_117035785_117037933_117038124_117039360_117039450_117039971_117040043_117040984_117041157_117041429_117041565_117043969_117044105_117046045_117046298_117047186_117047366_117047626_117047729_117049579
tx.3681	chr11	+	1130	3	FSM	ENSMUSG00000020823.17	ENSMUST00000146585.2	1047	3	-78	-5	2	5	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	191.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGAAGGAATAGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117005999	117019594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_117006178_117007985_117008079_117018735
tx.3682	chr11	+	4681	16	FSM	ENSMUSG00000020823.17	ENSMUST00000090433.6	4654	16	-32	5	-32	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	319	junction_5	24.9420662068455	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAAGAGTGTCCTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117006031	117050089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_117006178_117007985_117008079_117032243_117032394_117032487_117032620_117034112_117034242_117034606_117034842_117035674_117035785_117037933_117038124_117039360_117039450_117039971_117040043_117040984_117041157_117041429_117041565_117043969_117044105_117046045_117046298_117047186_117047366_117047626
tx.3683	chr11	+	1832	9	ISM	ENSMUSG00000020823.17	ENSMUST00000103026.10	2589	17	32032	-12	-7799	12	intron_retention	FALSE	canonical	3	320	junction_1	23.9970701336642	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTGATATTTTTCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117038095	117048397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_117038124_117039360_117039450_117039971_117040043_117040984_117041157_117041429_117041565_117043969_117044105_117046045_117046298_117047186_117047366_117047626
tx.3684	chr11	-	842	2	Intergenic	novelGene_216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAGAGTGCTGTGGCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117066051	117065113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_117065657_117065752
tx.3685	chr11	+	2918	10	NIC	ENSMUSG00000059248.14	novel	647	4	NA	NA	-5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	78	junction_1	178.114819397177	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTTCTGGAGTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117198974	117253139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_117199098_117242254_117242447_117242974_117243104_117243432_117243515_117243913_117244052_117245635_117245754_117247160_117247257_117247438_117247536_117250244_117250297_117251248
tx.3686	chr11	+	2944	10	NNC	ENSMUSG00000059248.14	novel	778	7	NA	NA	-22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_1	196.831569283656	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTTCTGGAGTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117217236	117253139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_117217386_117242254_117242447_117242974_117243104_117243432_117243515_117243913_117244052_117245635_117245754_117247160_117247257_117247438_117247536_117250244_117250297_117251248
tx.3687	chr11	+	1344	10	FSM	ENSMUSG00000059248.14	ENSMUST00000100193.8	2924	10	-17	1597	-17	-155	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	196.831569283656	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGCTCTTATTGGCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117222528	117251537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_117222680_117242254_117242447_117242974_117243104_117243432_117243515_117243913_117244052_117245635_117245754_117247160_117247257_117247438_117247536_117250244_117250297_117251248
tx.3688	chr11	+	2847	10	FSM	ENSMUSG00000059248.14	ENSMUST00000106349.2	2932	10	74	11	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_1	107.436803129406	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTTCTGGAGTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117223244	117253139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_117223297_117242254_117242447_117242974_117243104_117243432_117243515_117243913_117244052_117245635_117245754_117247160_117247257_117247438_117247536_117250244_117250297_117251248
tx.3689	chr11	+	2796	9	ISM	ENSMUSG00000059248.14	ENSMUST00000106349.2	2932	10	19083	11	-1752	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	610	junction_8	24.1062102994228	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTTCTGGAGTTCTCT	577	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117242253	117253139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_117242447_117242974_117243104_117243432_117243515_117243913_117244052_117245635_117245754_117247160_117247257_117247438_117247536_117250244_117250297_117251248
tx.369	chr1	-	1189	8	NNC	ENSMUSG00000026189.14	novel	1186	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	90.2958855030256	1769	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGGTTATCTTTTAAGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72323472	72298330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_72298593_72301110_72301223_72306565_72306677_72309435_72309533_72314044_72314127_72315320_72315491_72316445_72316580_72323251
tx.3690	chr11	-	755	4	Intergenic	novelGene_217	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	0.816496580927726	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCCTCTCTTCAGGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117302654	117298486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_117298870_117299291_117299429_117301886_117302033_117302565
tx.3691	chr11	-	714	4	Intergenic	novelGene_218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	1.69967317119759	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGTTTGAATTAATTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117302654	117298501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_117298870_117299317_117299429_117301886_117302033_117302565
tx.3692	chr11	+	303	2	NNC	ENSMUSG00000085336.2	novel	1742	5	NA	NA	-7	-6124	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTCTTGGCTACATTT	8189	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117316996	117323568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_117317082_117323350
tx.3693	chr11	-	554	3	Intergenic	novelGene_220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTATGTGTGTGTGCGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117383206	117381504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_117381657_117382671_117382825_117382957
tx.3694	chr11	+	994	3	Intergenic	novelGene_221	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGAATCAGTGAATATGCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117448668	117477998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_117448763_117461736_117461834_117477195
tx.3695	chr11	+	645	2	FSM	ENSMUSG00000054418.7	ENSMUST00000155384.2	1784	2	79	1060	79	-1060	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	291	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACATCGGTCTCAGAGCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117502151	117503623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_117502261_117503087
tx.3696	chr11	+	517	2	ISM	ENSMUSG00000025571.14	ENSMUST00000026658.13	8724	22	-64	62658	-64	-48522	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	10	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGCAGGAAGACAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117545050	117591605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_117545513_117591550
tx.3697	chr11	-	2911	20	FSM	ENSMUSG00000025572.19	ENSMUST00000026659.10	2865	20	-44	-2	-25	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	224	junction_9	41.6618095045227	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTGTGCTTCAGGATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117671509	117656811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_117657160_117658391_117658460_117659747_117659827_117659931_117660109_117660218_117660353_117661294_117661371_117661516_117661613_117663498_117663679_117663772_117663925_117664188_117664345_117665047_117665193_117665833_117666025_117666414_117666673_117666879_117666977_117667063_117667170_117669069_117669229_117669530_117669627_117669758_117669875_117669988_117670118_117671361
tx.3698	chr11	-	2900	20	NNC	ENSMUSG00000025572.19	novel	2865	20	NA	NA	-25	3	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	72	junction_9	62.8793418727409	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTGCTTCAGGATGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117671509	117656810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_117657160_117658391_117658460_117659747_117659827_117659931_117660109_117660218_117660353_117661294_117661371_117661516_117661613_117663498_117663679_117663772_117663925_117664200_117664345_117665047_117665193_117665833_117666025_117666414_117666673_117666879_117666977_117667063_117667170_117669069_117669229_117669530_117669627_117669758_117669875_117669988_117670118_117671361
tx.3699	chr11	+	1520	4	FSM	ENSMUSG00000048277.16	ENSMUST00000026649.14	1520	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	588	junction_1	45.536310297998	2114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGTTGTGCTGGGTGGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117700493	117705109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_117700630_117703284_117703523_117703871_117704012_117704103
tx.37	chr1	+	2196	7	FSM	ENSMUSG00000056763.17	ENSMUST00000117415.8	1272	7	-73	-851	-28	-7	multi-exon	FALSE	canonical	2	35	junction_1	34.3640639169597	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACAGCACTCCTGGGATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10108413	10138194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_10108570_10115300_10115410_10117648_10117752_10128944_10129049_10134557_10134639_10135547_10135647_10136650
tx.370	chr1	-	1474	6	NNC	ENSMUSG00000026189.14	novel	932	7	NA	NA	0	248	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_3	102.210762642688	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATGTTATATTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72323472	72305906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_72306677_72309435_72309533_72314044_72314127_72315320_72315491_72316445_72316580_72323251
tx.3700	chr11	-	1195	6	NIC	ENSMUSG00000025574.14	novel	1440	7	NA	NA	5	17	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	149	junction_5	366.911215418662	440	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGGGTTTCCCTAACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117716688	117706334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_117706966_117707272_117707393_117707927_117708018_117712922_117713017_117715496_117715608_117716539
tx.3701	chr11	-	1137	6	NIC	ENSMUSG00000025574.14	novel	1440	7	NA	NA	5	17	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	49	junction_2	399.354178643469	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGGGTTTCCCTAACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117716688	117706334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_117706966_117707272_117707393_117712922_117713017_117715496_117715608_117716426_117716459_117716539
tx.3702	chr11	-	1227	7	FSM	ENSMUSG00000025574.14	ENSMUST00000026661.4	1440	7	230	-17	5	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	796	junction_5	107.729084074615	2485	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGGGTTTCCCTAACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117716688	117706334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_117706966_117707272_117707393_117707927_117708018_117712922_117713017_117715496_117715608_117716426_117716459_117716539
tx.3703	chr11	-	1239	6	NNC	ENSMUSG00000025574.14	novel	1440	7	NA	NA	5	16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	425.922340339175	262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTGGGTTTCCCTAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117716688	117706335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_117706966_117707272_117707393_117707927_117708018_117712922_117713017_117715496_117715653_117716539
tx.3704	chr11	+	920	4	FSM	ENSMUSG00000017716.16	ENSMUST00000081387.11	947	4	34	-7	-34	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1683	junction_1	206.515536138729	14301	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTGTCTGTCTTGGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117740110	117746565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_117740288_117740579_117740690_117743488_117743607_117746050
tx.3705	chr11	-	2552	2	FSM	ENSMUSG00000053113.4	ENSMUST00000054002.4	2552	2	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1319	junction_1	0	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTTGAGCCTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117860012	117856904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_117859145_117859700
tx.3706	chr11	+	319	2	ISM	ENSMUSG00000017715.12	ENSMUST00000100185.10	1953	8	2648	18314	2648	-18314	internal_fragment	FALSE	canonical	3	294	junction_1	0	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTGAGCGCGGAGCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117894268	117896437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_117894346_117896195
tx.3707	chr11	+	886	3	NNC	ENSMUSG00000017715.12	novel	2863	10	NA	NA	2231	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	183.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGTGTTGCTCAAGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117905399	117914837	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_117905549_117910432_117910563_117914230
tx.3708	chr11	-	1243	5	ISM	ENSMUSG00000033987.17	ENSMUST00000084803.12	14889	81	102277	1355	62252	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_3	2.29128784747792	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCCCGTCTGATGCACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117917768	117913903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_117914324_117915419_117915646_117915928_117916073_117916343_117916527_117917498
tx.3709	chr11	-	3136	13	FSM	ENSMUSG00000017132.18	ENSMUST00000017276.14	3135	13	4	-5	4	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	8.05665701282003	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCATGTTCTGCTCTGCTG	8636	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118139382	118054995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_118056921_118059841_118059997_118061651_118061724_118068045_118068123_118073045_118073158_118073590_118073740_118074707_118074821_118075797_118075879_118076206_118076326_118076585_118076653_118083222_118083288_118084440_118084524_118139264
tx.371	chr1	+	2506	21	FSM	ENSMUSG00000026187.10	ENSMUST00000027379.10	2549	21	44	-1	44	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	464	junction_5	74.8852455427636	531	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTGTGTGAAGTCTCAT	366	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72346629	72434112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_72346727_72349593_72349708_72351566_72351751_72353312_72353362_72354617_72354741_72358157_72358350_72364232_72364348_72365374_72365514_72369084_72369198_72373794_72373858_72378118_72378257_72379147_72379239_72382167_72382302_72385386_72385584_72393401_72393496_72395975_72396046_72420777_72420888_72422516_72422614_72422860_72422929_72433054_72433127_72433866
tx.3710	chr11	-	1727	10	NNC	ENSMUSG00000017132.18	novel	545	6	NA	NA	-4	3873	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_1	11.5256022043466	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCCGAGTTTAGGTTTAC	8628	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118139390	118071924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_118072737_118073045_118073158_118073590_118073740_118074707_118074821_118075797_118075879_118076206_118076326_118076585_118076653_118083222_118083288_118084440_118084524_118139264
tx.3711	chr11	-	1050	8	ISM	ENSMUSG00000017132.18	ENSMUST00000017276.14	3135	13	-10	18349	-10	2448	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_5	3.37457480314792	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTATTTCTTTTTTCCTTAA	8622	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118139396	118073349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_118073740_118074707_118074821_118075797_118075879_118076206_118076326_118076585_118076653_118083222_118083288_118084440_118084524_118139264
tx.3712	chr11	-	1289	4	FSM	ENSMUSG00000033909.18	ENSMUST00000151433.2	1821	4	-68	600	40	-600	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_3	10.9848380355227	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTCTGGTTTTTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118180966	118175220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_118175907_118176563_118176826_118178492_118178650_118180782
tx.3713	chr11	-	821	5	FSM	ENSMUSG00000017466.10	ENSMUST00000155707.3	718	5	6	-109	6	109	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	12.913171570145	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTGGGTTCACGCTAGTG	2038	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118246560	118194417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_118194723_118201401_118201527_118208244_118208354_118210934_118211036_118246379
tx.3714	chr11	-	2824	5	FSM	ENSMUSG00000025575.15	ENSMUST00000106287.8	1476	5	10	-1358	10	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	67.913547985656	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTGTCTATGTTGGCTGT	9002	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118309868	118297111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_118298921_118299506_118299711_118301678_118302338_118308399_118308481_118309797
tx.3715	chr11	-	2206	3	ISM	ENSMUSG00000025575.15	ENSMUST00000164927.2	1379	4	4746	-1355	4746	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	163	junction_2	4.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCTCTTGTCTATGTTGGC	8765	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118301874	118297114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_118298921_118299506_118299711_118301678
tx.3716	chr11	-	2820	5	FSM	ENSMUSG00000025575.15	ENSMUST00000106288.8	2873	5	49	4	20	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_4	37.662979170533	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGTTCTCTTGTCTATGT	9041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118309829	118297118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_118298921_118299506_118299711_118301678_118302338_118308399_118308481_118309755
tx.3717	chr11	-	1087	3	ISM	ENSMUSG00000025575.15	ENSMUST00000106289.9	1600	6	-1	2957	-1	-2957	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_2	43.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTAGAAGTTTGTTTCCA	9020	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118309850	118301426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_118302338_118308399_118308481_118309755
tx.3718	chr11	-	1448	2	Intergenic	novelGene_222	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTTCTTGATTATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118364951	118359979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_118361302_118364825
tx.3719	chr11	+	2541	14	NIC	ENSMUSG00000033857.13	novel	4064	14	NA	NA	-11	11	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	25	junction_11	24.1545810765215	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGCTTCTTTTGAGAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118367755	118378610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_+_118367931_118369708_118369780_118369911_118370114_118372101_118372251_118372699_118372858_118373357_118373507_118373707_118373874_118375243_118375348_118375665_118375775_118375949_118376141_118376582_118376732_118377270_118377380_118377647_118377763_118377916
tx.372	chr1	+	1263	11	ISM	ENSMUSG00000026187.10	ENSMUST00000027379.10	2549	21	31587	-1	31587	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	542	junction_2	64.4624697013696	419	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTGTGTGAAGTCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72378172	72434112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_72378257_72379147_72379239_72382167_72382302_72385386_72385584_72393401_72393496_72395975_72396046_72420777_72420888_72422516_72422614_72422860_72422929_72433054_72433127_72433866
tx.3720	chr11	+	828	3	ISM	ENSMUSG00000033857.13	ENSMUST00000168689.2	1124	7	2045	-275	2045	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	4	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGCTTCTTTTGAGAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118377360	118378610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_118377380_118377647_118377763_118377916
tx.3721	chr11	+	810	2	ISM	ENSMUSG00000033857.13	ENSMUST00000168689.2	1124	7	2331	-275	2331	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_1	0	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGCTTCTTTTGAGAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118377646	118378610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_118377763_118377916
tx.3722	chr11	+	607	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025576.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGAGTGTGAGTCTCAACT	8339	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118442183	118446736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_118442405_118446350
tx.3723	chr11	+	692	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025576.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTCAGTTCTCACTTTAG	9063	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118442907	118444338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_+_118443246_118443984
tx.3724	chr11	-	1185	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025577.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	0.5	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTAGTCTGCCTCGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118914329	118903149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_118903967_118905071_118905209_118914098
tx.3725	chr11	+	3708	4	NNC	ENSMUSG00000025577.8	novel	3807	5	NA	NA	82	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	107.16135290092	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGCTGTTCTCTTCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118913869	118922096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_118914034_118915000_118915067_118917275_118917382_118918724
tx.3726	chr11	+	3872	6	NNC	ENSMUSG00000025577.8	novel	3807	5	NA	NA	118	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_4	102.4331977437	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGCTGTTCTCTTCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118913905	118922096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_118914007_118914083_118914128_118915000_118915067_118917275_118917382_118917503_118917687_118918724
tx.3727	chr11	+	3725	5	FSM	ENSMUSG00000025577.8	ENSMUST00000026662.8	3807	5	82	0	82	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	204	junction_1	10.9630059746403	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTGCTGTTCTCTTCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118913869	118922096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_118914007_118914083_118914128_118915000_118915067_118917275_118917382_118918724
tx.3728	chr11	-	1405	5	FSM	ENSMUSG00000025578.10	ENSMUST00000026663.8	3580	5	41	2134	-17	614	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_4	2.91547594742265	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTTCTTTTATTTAAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118931754	118929264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_118930346_118930757_118930825_118930919_118930986_118931173_118931218_118931607
tx.3729	chr11	+	655	2	Intergenic	novelGene_223	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTGTTGGCTCCTGTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118944024	118946286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_118944219_118945825
tx.373	chr1	+	418	4	FSM	ENSMUSG00000046330.11	ENSMUST00000059980.11	558	4	-2	142	-2	54	multi-exon	FALSE	canonical	2	9164	junction_1	3956.18005993998	91611	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTTTATTTTCGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72750446	72752830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_72750483_72750830_72750960_72751300_72751384_72752660
tx.3730	chr11	-	477	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039963.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTGGTGGAGACGACTCT	89	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119133707	119133010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_119133299_119133518
tx.3731	chr11	-	788	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039963.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGCGTGCATTATTATTATT	7492	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119143784	119142583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_119142994_119143272_119143468_119143601
tx.3732	chr11	-	472	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039963.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCACGGGCGTGCATTATTA	7937	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119143339	119142588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_119142994_119143272
tx.3733	chr11	-	1021	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039963.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGGCTCCACGGGCGT	7035	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119144241	119142597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_119142994_119143272_119143468_119143811
tx.3734	chr11	-	814	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000039963.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCACGGGCGTGCATTATT	7489	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119143787	119142589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr11_-_119142994_119143272_119143497_119143601
tx.3735	chr11	+	3491	20	FSM	ENSMUSG00000025579.15	ENSMUST00000106259.9	3633	20	143	-1	2	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	393	junction_7	40.3001893687597	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTCACGTCACCTCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119158855	119176281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_119159049_119160913_119161505_119163695_119163842_119164800_119164967_119165040_119165138_119165466_119165587_119165681_119165801_119165885_119166018_119167667_119167779_119168326_119168441_119168519_119168605_119169090_119169209_119169701_119169836_119171237_119171390_119171938_119172088_119173999_119174142_119174485_119174639_119174884_119175050_119175272_119175426_119175830
tx.3736	chr11	+	944	5	ISM	ENSMUSG00000025579.15	ENSMUST00000026666.13	3363	20	15265	2	4415	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	439	junction_1	39.4493345951487	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTTCTCACGTCACCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119174116	119176278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_119174142_119174485_119174639_119174884_119175050_119175272_119175426_119175830
tx.3737	chr11	-	434	3	FSM	ENSMUSG00000025580.16	ENSMUST00000129044.8	466	3	33	-1	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	960	junction_1	268	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGAGTGCAGATCTTTGT	6720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119179803	119179188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_119179386_119179485_119179614_119179694
tx.3738	chr11	-	1222	11	ISM	ENSMUSG00000025580.16	ENSMUST00000026667.15	1509	12	2237	0	2162	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	960	junction_1	152.08316803644	363	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGAGTGCAGATCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119188678	119179188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_119179386_119179485_119179614_119179694_119179803_119183644_119183761_119184384_119184524_119184717_119184860_119185150_119185232_119185396_119185530_119186298_119186362_119186892_119186960_119188630
tx.3739	chr11	-	1472	12	FSM	ENSMUSG00000025580.16	ENSMUST00000026667.15	1509	12	37	0	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	960	junction_1	150.634415963708	5501	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGAGTGCAGATCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119190878	119179188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_119179386_119179485_119179614_119179694_119179803_119183644_119183761_119184384_119184524_119184717_119184860_119185150_119185232_119185396_119185530_119186298_119186362_119186892_119186960_119188630_119188704_119190653
tx.3740	chr11	+	2660	17	FSM	ENSMUSG00000039908.15	ENSMUST00000050880.8	2695	17	11	24	11	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	16.3122605346408	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATACAATATTCTGTGGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119246393	119271881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_119246462_119247633_119247860_119248803_119248997_119250122_119250209_119253042_119253123_119254225_119254369_119259489_119259666_119260018_119260092_119261574_119261626_119263936_119263998_119265310_119265367_119265590_119265732_119267607_119267736_119267994_119268095_119268519_119268654_119270684_119270758_119271010
tx.3741	chr11	+	1086	4	ISM	ENSMUSG00000039908.15	ENSMUST00000050880.8	2695	17	31	21164	0	-2340	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	24.589970855344	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGGCATACTATTATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119246413	119250741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_119246462_119247633_119247860_119248803_119248997_119250122
tx.3742	chr11	+	1052	3	NNC	ENSMUSG00000039908.15	novel	2695	17	NA	NA	16472	-18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	43	32	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAAGATTTATTTATTGTA	1895	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119269946	119271857	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_119270079_119270684_119270758_119271010
tx.3743	chr11	+	1385	9	FSM	ENSMUSG00000039850.17	ENSMUST00000106244.9	5070	9	28	3657	0	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	7.28010988928052	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCATGGGTCACTCTTAC	6282	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119382200	119398592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_119382286_119382610_119382783_119390352_119390488_119390671_119390712_119391416_119391530_119393118_119393188_119393524_119393654_119395916_119395994_119398027
tx.3744	chr11	+	1453	8	FSM	ENSMUSG00000039850.17	ENSMUST00000106245.9	5126	8	2	3671	2	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_3	3.65892813567591	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCATGGGTCACTCTTAC	6539	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119382457	119398592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_119382783_119390352_119390488_119390671_119390712_119391416_119391530_119393118_119393188_119393524_119393654_119395916_119395994_119398027
tx.3745	chr11	+	1546	8	FSM	ENSMUSG00000025371.13	ENSMUST00000026434.13	1557	8	9	2	9	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	311	junction_5	11.6303613925986	646	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTGAGTTTAGTGTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119804644	119810372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_119804764_119806238_119806349_119806457_119806546_119806850_119806938_119807506_119807573_119807754_119807836_119808809_119808865_119809432
tx.3746	chr11	+	2070	14	FSM	ENSMUSG00000025372.17	ENSMUST00000026436.10	2394	14	324	0	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_13	8.07215976759687	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTAGTGTGTGGTCTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119833912	119897608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_119834075_119847927_119848004_119850982_119851070_119871614_119871677_119872218_119872291_119872814_119872953_119884521_119884675_119887348_119887574_119887714_119887917_119888314_119888517_119889459_119889529_119889960_119890124_119891377_119891413_119897184
tx.3747	chr11	-	602	4	ISM	ENSMUSG00000039781.15	ENSMUST00000106227.8	3578	26	21089	4	-770	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_3	4.89897948556636	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTCATGTCACCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119956564	119955259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_119955536_119955610_119955672_119956213_119956378_119956463
tx.3748	chr11	-	860	6	ISM	ENSMUSG00000039781.15	ENSMUST00000106227.8	3578	26	20096	4	1326	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_5	9.32952303175248	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCTTCATGTCACCTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119957557	119955259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_119955536_119955610_119955672_119956213_119956378_119956463_119956642_119956736_119956880_119957519
tx.3749	chr11	+	500	3	FSM	ENSMUSG00000078572.4	ENSMUST00000106223.4	781	3	0	281	0	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	883	junction_2	30.5	5473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTCTCTCCCAAGGACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119989753	119991250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_119989892_119989973_119990085_119990999
tx.375	chr1	+	387	3	FSM	ENSMUSG00000046330.11	ENSMUST00000212432.2	665	3	357	-79	-87	58	multi-exon	FALSE	canonical	2	15690	junction_1	1470.5	920	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATTTTCGAAAGATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72750829	72752834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_72750960_72751300_72751384_72752660
tx.3750	chr11	+	561	2	FSM	ENSMUSG00000078572.4	ENSMUST00000186913.2	401	2	-150	-10	5	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	883	junction_1	0	217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGTCTCTCCCAAGGACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119989774	119991250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_119990085_119990999
tx.3751	chr11	-	4041	16	FSM	ENSMUSG00000061306.17	ENSMUST00000045402.14	4554	16	26	487	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	392	junction_1	66.2227218474814	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGAGTCGAGTTGGTTTACC	5022	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120042146	119995272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_119996863_119997259_119997437_120000257_120000363_120000891_120001363_120001663_120001832_120007690_120007848_120019248_120019356_120020026_120020139_120023502_120023686_120025605_120025709_120028682_120028808_120029811_120029956_120031418_120031513_120032425_120032472_120038546_120038665_120041805
tx.3752	chr11	-	1624	2	FSM	ENSMUSG00000061306.17	ENSMUST00000146641.2	971	2	521	-1174	521	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	392	junction_1	0	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGAGTCGAGTTGGTTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119997293	119995272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_119996863_119997259
tx.3753	chr11	-	861	4	NNC	ENSMUSG00000075389.4	novel	646	3	NA	NA	-105	-251	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTCTCTCTGGCT	6038	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120080783	120078783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_120078913_120079176_120079269_120079380_120079503_120080265
tx.3754	chr11	-	1002	2	NNC	ENSMUSG00000075389.4	novel	646	3	NA	NA	-107	-251	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTCTCTCTGGCT	6036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120080785	120078783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_120079266_120080265
tx.3755	chr11	-	693	2	FSM	ENSMUSG00000043993.7	ENSMUST00000139014.2	1588	2	0	895	0	-895	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGCGTGGCAATCCTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120122411	120121522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120122125_120122320
tx.3756	chr11	-	555	2	NNC	ENSMUSG00000085501.2	novel	532	2	NA	NA	-1539	45	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTCTTTGTGCTCGAACT	8215	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120128487	120126014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_120126488_120128405
tx.3757	chr11	-	1902	6	FSM	ENSMUSG00000062825.16	ENSMUST00000071555.13	1952	6	50	0	-3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	5636	junction_4	454.292680988809	17786	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATTGTTTTTCTGGTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120239318	120236515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120237360_120237462_120237645_120237736_120238176_120238461_120238702_120238794_120238924_120239250
tx.3758	chr11	+	571	2	FSM	ENSMUSG00000043644.5	ENSMUST00000143813.2	619	2	48	0	48	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGGAGCTCAACGTCTAAA	3043	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120239551	120242016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120239689_120241582
tx.3759	chr11	-	3175	10	FSM	ENSMUSG00000025384.16	ENSMUST00000026448.10	3193	10	18	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	16	junction_4	19.8612470857816	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTCTGTGTTGTGCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120269572	120260387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120260879_120261109_120261246_120261520_120261608_120262935_120263053_120263932_120264070_120264707_120265478_120266242_120266400_120267531_120268488_120269153_120269273_120269367
tx.376	chr1	-	373	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000046330.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTTGACAGAGGAAAGGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72752832	72750829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_72750950_72751298_72751378_72752658
tx.3760	chr11	-	1715	2	ISM	ENSMUSG00000025384.16	ENSMUST00000154826.2	2934	4	-18	3134	10	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAACGCTTAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120269580	120266985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_120268488_120269367
tx.3761	chr11	-	1831	3	FSM	ENSMUSG00000025384.16	ENSMUST00000148520.2	1779	3	-41	-11	14	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_2	20.5	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAACGCTTAGAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120269576	120266984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120268488_120269153_120269273_120269367
tx.3762	chr11	-	783	2	FSM	ENSMUSG00000039670.3	ENSMUST00000137632.2	372	2	-127	-284	5	5	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGGGGCTTTTGTGTTGTCC	964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120348889	120347426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120347989_120348668
tx.3763	chr11	-	814	2	FSM	ENSMUSG00000039670.3	ENSMUST00000044007.3	813	2	3	-4	3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	0	472	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGGGGCTTTTGTGTTGTC	962	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120348891	120347427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120347989_120348638
tx.3764	chr11	+	2768	6	FSM	ENSMUSG00000049957.15	ENSMUST00000058370.14	2778	6	6	4	-5	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_3	16.7164589551735	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCATCAATGAGAACATTCT	214	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120348946	120355180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120349105_120349437_120349572_120350867_120351091_120352541_120352625_120352831_120352912_120353090
tx.3765	chr11	-	1350	5	NNC	ENSMUSG00000057594.13	novel	911	5	NA	NA	-6	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	70.9048658414922	497	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAATTGTCTTGGCCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120358297	120355695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_120356648_120356809_120356926_120357479_120357594_120358007_120358065_120358186
tx.3766	chr11	-	1317	5	NNC	ENSMUSG00000057594.13	novel	588	5	NA	NA	-6	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_4	74.6408065336917	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTGTCTTGGCCTGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120358297	120355693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_120356648_120356809_120356926_120357479_120357559_120358007_120358065_120358186
tx.3767	chr11	-	411	4	NNC	ENSMUSG00000057594.13	novel	429	4	NA	NA	-6	-56	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	81.6999932000541	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGGGCAGGATGAAGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120358297	120356796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_120356926_120357479_120357594_120358007_120358065_120358186
tx.3768	chr11	+	959	5	FSM	ENSMUSG00000039640.8	ENSMUST00000043627.8	1316	5	46	311	46	297	multi-exon	FALSE	canonical	3	1076	junction_2	33.5186515241887	5249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTGTCCTGAACCTTG	9001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120375484	120379580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120375595_120376068_120376256_120376481_120376569_120378922_120379061_120379143
tx.3769	chr11	+	1987	11	FSM	ENSMUSG00000025792.10	ENSMUST00000026899.4	2023	11	36	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_8	8.74356906531881	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGGGGGCTGGCAGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120382701	120390013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120382903_120385302_120385423_120385785_120385901_120385985_120386035_120386271_120386314_120387248_120387293_120387461_120387533_120387839_120387933_120388209_120388288_120388745_120388803_120388896
tx.3770	chr11	-	1192	5	FSM	ENSMUSG00000061111.9	ENSMUST00000034913.5	1205	5	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	334	junction_4	30.2861354418156	557	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGCTCCATGGCAGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120440540	120433713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120434575_120434729_120434832_120435506_120435626_120435702_120435755_120440482
tx.3771	chr11	-	2477	11	FSM	ENSMUSG00000025130.12	ENSMUST00000026122.11	2861	11	379	5	-33	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1798	junction_7	89.3174674965653	1408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCATTGTCACTGCTGCTTT	3746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120463700	120451128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120452087_120452986_120453074_120453189_120453372_120453480_120453602_120454030_120454232_120454428_120454555_120454641_120454747_120458743_120458882_120458999_120459134_120462346_120462554_120463482
tx.3772	chr11	-	1842	6	FSM	ENSMUSG00000025132.14	ENSMUST00000106197.10	1867	6	22	3	22	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	3168	junction_5	160.793780974265	4027	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATTGTGTGGTCTGTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120472428	120468932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120470257_120470341_120470406_120470493_120470571_120470792_120470877_120471007_120471220_120472347
tx.3773	chr11	-	488	2	ISM	ENSMUSG00000025134.3	ENSMUST00000155325.2	648	4	549	0	549	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4441	junction_1	0	722	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGCTGTCTGGTCCATC	7563	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120485934	120485334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_120485694_120485805
tx.3774	chr11	-	836	5	ISM	ENSMUSG00000025134.3	ENSMUST00000026125.3	3527	6	641	2388	507	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3877	junction_4	220.512329587259	376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGAGCTGTCTGGTCCATC	4947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120488550	120485334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_120485694_120485805_120485981_120486080_120486145_120486745_120486894_120488460
tx.3775	chr11	+	754	3	FSM	ENSMUSG00000025135.13	ENSMUST00000026128.10	3229	3	50	2425	31	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	903	junction_1	470.5	6669	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGGCCAAAACCTTCATC	3950	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120489296	120496599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120489431_120490067_120490195_120496106
tx.3776	chr11	+	836	3	FSM	ENSMUSG00000025135.13	ENSMUST00000093140.5	962	3	123	3	123	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1006	junction_1	419	6899	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGGCCAAAACCTTCATC	4134	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120489480	120496599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120489697_120490067_120490195_120496106
tx.3777	chr11	+	547	2	FSM	ENSMUSG00000044034.12	ENSMUST00000106195.3	542	2	1	-6	1	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGGGTTGCTGGAGGAGAT	1209	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120499303	120499925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120499566_120499640
tx.3778	chr11	-	1861	14	FSM	ENSMUSG00000025137.16	ENSMUST00000026129.16	1881	14	21	-1	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_7	79.5574296680368	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTAGGCTCCCGACCCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120508741	120500911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120501598_120501701_120501791_120501938_120502005_120502173_120502240_120502453_120502532_120502826_120502910_120503288_120503428_120503855_120503910_120504204_120504250_120504466_120504552_120505156_120505224_120506116_120506279_120506674_120506764_120508589
tx.3779	chr11	-	1808	13	FSM	ENSMUSG00000025137.16	ENSMUST00000106188.4	1486	13	9	-331	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_7	91.5034911295131	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTAGGCTCCCGACCCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120508742	120500911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120501598_120501701_120501791_120501938_120502005_120502173_120502240_120502453_120502532_120502826_120502910_120503288_120503428_120504204_120504250_120504466_120504552_120505156_120505224_120506116_120506279_120506674_120506764_120508589
tx.378	chr1	+	1419	11	FSM	ENSMUSG00000006304.15	ENSMUST00000113820.9	1439	11	20	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1389	junction_1	306.215936881149	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAGAATTTGTTGATTTT	7848	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74275675	74307368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_74275770_74275976_74276059_74285238_74285274_74287290_74287404_74290412_74290459_74293986_74294174_74295116_74295211_74301617_74301745_74302901_74303003_74303511_74303613_74306929
tx.3780	chr11	-	926	3	FSM	ENSMUSG00000025137.16	ENSMUST00000126148.2	513	3	-6	-407	-3	407	multi-exon	FALSE	canonical	3	395	junction_2	25	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGAAGAAAAAAAAAACCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120508742	120505594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120506279_120506674_120506764_120508589
tx.3781	chr11	-	1705	10	FSM	ENSMUSG00000025138.15	ENSMUST00000080202.12	1727	10	22	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	54	junction_9	11.3376897945103	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGTGTCCCGATGACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120515818	120509197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120509876_120510988_120511096_120511249_120511331_120511472_120511710_120511782_120511882_120512806_120512880_120512966_120513038_120515315_120515421_120515498_120515637_120515702
tx.3782	chr11	-	1465	2	ISM	ENSMUSG00000051510.14	ENSMUST00000106180.2	732	3	266	-895	266	670	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	358	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCCAAGCTGCGAGCCT	9879	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120520708	120519162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_120520563_120520643
tx.3783	chr11	-	1499	3	FSM	ENSMUSG00000051510.14	ENSMUST00000058162.14	4923	3	205	3219	161	671	multi-exon	FALSE	canonical	3	302	junction_2	28	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGCCAAGCTGCGAGCCTA	7563	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120524221	120519161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120520563_120520643_120520708_120524187
tx.3784	chr11	+	933	2	Intergenic	novelGene_226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGGGTTTCTGTTACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120524575	120525958	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_120525319_120525768
tx.3785	chr11	-	1794	7	ISM	ENSMUSG00000025140.16	ENSMUST00000026133.15	1861	8	461	-2	356	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	976	junction_6	20.9735282889858	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCCAGAGCTCCAGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120534113	120530239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_120531175_120531967_120532132_120532254_120532348_120532475_120532698_120532940_120533121_120533717_120533789_120533984
tx.3786	chr11	-	1869	8	FSM	ENSMUSG00000025140.16	ENSMUST00000026133.15	1861	8	-6	-2	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	750	junction_7	93.9428832116752	518	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCCCCAGAGCTCCAGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120534580	120530239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120531175_120531967_120532132_120532254_120532348_120532475_120532698_120532940_120533121_120533717_120533789_120533984_120534114_120534505
tx.3787	chr11	-	1049	4	ISM	ENSMUSG00000042988.11	ENSMUST00000055439.4	1433	7	1599	-57	1599	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_3	2.44948974278318	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAAGCTCACCCTGAAC	3949	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120547271	120544613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_120545353_120545589_120545638_120546589_120546738_120547157
tx.3788	chr11	-	1555	9	ISM	ENSMUSG00000042988.11	ENSMUST00000106177.8	2212	11	1860	-7	-702	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_3	6.77772085586298	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCACCCTGAACCTTGTTT	1648	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120549572	120544606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_-_120545353_120545589_120545638_120546589_120546738_120547157_120547259_120547385_120547578_120548318_120548422_120548711_120548771_120549156_120549218_120549475
tx.3789	chr11	+	1786	16	FSM	ENSMUSG00000025142.19	ENSMUST00000026135.15	1820	16	34	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	887	junction_3	62.8477525453377	782	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGAGTTTCTTTTCTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120563851	120600273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120563997_120564865_120564922_120568336_120568452_120569245_120569347_120577469_120577528_120579354_120579429_120579737_120580168_120591969_120592110_120592306_120592389_120593309_120593377_120594428_120594492_120594897_120594951_120599483_120599536_120599755_120599826_120599896_120600073_120600169
tx.379	chr1	+	1601	10	FSM	ENSMUSG00000006304.15	ENSMUST00000006467.14	1404	10	25	-222	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1867	junction_3	197.32307280632	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGAGAATTTGTTGATTTT	7873	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74275700	74307368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_74276059_74285238_74285274_74287290_74287404_74290412_74290459_74293986_74294174_74295116_74295211_74301617_74301745_74302901_74303003_74303511_74303613_74306929
tx.3790	chr11	+	522	6	ISM	ENSMUSG00000025142.19	ENSMUST00000106159.10	1615	15	26938	-3	1085	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	901	junction_2	70.3118766639037	244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGAGTTTCTTTTCTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120594424	120600273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_120594492_120594897_120594951_120599483_120599536_120599755_120599826_120599896_120600073_120600169
tx.3791	chr11	+	559	5	NNC	ENSMUSG00000025142.19	novel	468	3	NA	NA	2647	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	40	junction_1	436.370542085508	328	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGAGTTTCTTTTCTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120595986	120600273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_120596144_120599483_120599536_120599755_120599826_120599896_120600073_120600169
tx.3792	chr11	+	628	5	NNC	ENSMUSG00000025142.19	novel	468	3	NA	NA	-604	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	48	junction_1	432.921759674886	387	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGAGTTTCTTTTCTGCAG	193	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120598879	120600273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_120599106_120599483_120599536_120599755_120599826_120599896_120600073_120600169
tx.3793	chr11	-	612	5	FSM	ENSMUSG00000025144.18	ENSMUST00000055424.13	606	5	-6	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	556	junction_4	137.848422189012	4662	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTGCTTTCTCTTTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120604570	120601767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120602133_120602215_120602305_120602528_120602583_120602669_120602722_120604518
tx.3794	chr11	-	561	4	NIC	ENSMUSG00000025144.18	novel	606	5	NA	NA	-7	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	126	junction_3	359.512942125253	1349	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCCTGCTTTCTCTTTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120604571	120601767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_120602133_120602215_120602305_120602528_120602583_120604518
tx.3795	chr11	+	2464	18	FSM	ENSMUSG00000025145.14	ENSMUST00000026139.14	2492	18	28	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_12	7.88805763716247	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCGTCCAGTTCCTTTCT	6092	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120604778	120611954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120604880_120605098_120605355_120605743_120605806_120605975_120606047_120606246_120606426_120606631_120606761_120607881_120607995_120608305_120608365_120608650_120608729_120608862_120608999_120609069_120609148_120609267_120609380_120609475_120609547_120609865_120609959_120610291_120610385_120610759_120610934_120611011_120611160_120611443
tx.3796	chr11	+	928	5	FSM	ENSMUSG00000018012.12	ENSMUST00000134322.2	717	5	194	-405	194	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_2	3.80788655293195	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTCTCGCTGTCTGCCCT	4536	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120613033	120614796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120613129_120613334_120613453_120613631_120613695_120614006_120614167_120614304
tx.3797	chr11	-	873	7	FSM	ENSMUSG00000039450.12	ENSMUST00000106148.10	830	7	-44	1	-6	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_2	29.9035486560077	196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACAGATCTGTGCTATCT	9978	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120618113	120616225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120616434_120616563_120616723_120616913_120617014_120617094_120617138_120617236_120617392_120617824_120617923_120618003
tx.3798	chr11	-	892	8	FSM	ENSMUSG00000039450.12	ENSMUST00000026144.5	892	8	-1	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_3	11.7438650940369	766	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACAGATCTGTGCTATCT	9983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120618108	120616225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120616434_120616563_120616682_120616767_120616833_120616913_120617014_120617094_120617138_120617236_120617392_120617824_120617923_120618003
tx.3799	chr11	+	1592	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000078249.6	novel	1626	1	NA	NA	-7	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	1960	junction_1	0	3509	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAGATTTACAAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120653612	120655237	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr11_+_120653817_120653849
tx.38	chr1	+	2155	7	FSM	ENSMUSG00000056763.17	ENSMUST00000119714.8	1268	7	-12	-875	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	91	junction_2	18.4157239577729	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTGGGATCTTGATGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10109997	10138202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_10110105_10115300_10115410_10117648_10117752_10128944_10129049_10134557_10134639_10135547_10135647_10136650
tx.380	chr1	-	1375	9	ISM	ENSMUSG00000006299.14	ENSMUST00000178235.8	1756	11	1513	-2	-25	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1233	junction_8	52.5522061858491	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCAGTGTCTGTGTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74322326	74319002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_74319469_74319941_74320097_74320247_74320339_74320487_74320592_74320685_74320802_74320894_74320979_74321185_74321331_74321569_74321710_74322252
tx.3800	chr11	-	2090	8	FSM	ENSMUSG00000025158.8	ENSMUST00000026156.8	2118	8	35	-7	13	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_3	23.1137382947714	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCCTCTTGTCATACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120674998	120671566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120672730_120672804_120672891_120673208_120673375_120673454_120673544_120673832_120673987_120674093_120674197_120674560_120674610_120674718
tx.3801	chr11	+	1926	13	FSM	ENSMUSG00000025156.18	ENSMUST00000100134.10	1925	13	3	-4	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	682	junction_1	150.079122650539	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAAGGCTCCTTTCCTTT	1397	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120675103	120679927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120675169_120675946_120676040_120676525_120676708_120677127_120677293_120677377_120677514_120677597_120677676_120677834_120677896_120678205_120678292_120678522_120678618_120678701_120678808_120678887_120678969_120679069_120679208_120679287
tx.3802	chr11	+	1856	14	FSM	ENSMUSG00000025156.18	ENSMUST00000116305.8	1827	14	-29	0	1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	682	junction_1	155.049677093711	593	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAAGGCTCCTTTCCTTTC	1395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120675101	120679928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120675169_120675946_120676040_120676525_120676708_120677127_120677293_120677377_120677514_120677597_120677676_120677834_120677896_120678205_120678292_120678522_120678618_120678701_120678808_120678887_120678969_120679069_120679208_120679287_120679423_120679495
tx.3803	chr11	+	1848	14	FSM	ENSMUSG00000025156.18	ENSMUST00000208737.2	1843	14	-5	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_6	299.627579489159	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAAGGCTCCTTTCCTTT	1399	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120675105	120679927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120675169_120675946_120676040_120676525_120676708_120677127_120677293_120677377_120677514_120677597_120677676_120677837_120677896_120678205_120678292_120678522_120678618_120678701_120678808_120678887_120678969_120679069_120679208_120679287_120679423_120679495
tx.3804	chr11	+	1792	13	ISM	ENSMUSG00000025156.18	ENSMUST00000172809.2	2000	14	603	0	603	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	883	junction_12	108.213780186362	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAAGGCTCCTTTCCTTTC	2237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120675943	120679928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_120676040_120676525_120676708_120677127_120677293_120677377_120677514_120677597_120677676_120677834_120677896_120678205_120678292_120678522_120678618_120678701_120678808_120678887_120678969_120679069_120679208_120679287_120679423_120679495
tx.3805	chr11	-	2329	13	NIC	ENSMUSG00000025155.16	novel	1930	14	NA	NA	0	2	intron_retention	FALSE	canonical	1	60	junction_5	232.013454470976	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGAGATCTCTAGTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120687215	120680024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_120680386_120680482_120680559_120680668_120680707_120682030_120682177_120682680_120682770_120682852_120682954_120683180_120683326_120683516_120683621_120683853_120683937_120684659_120684773_120685093_120685145_120685728_120685838_120686302
tx.3806	chr11	-	2118	14	NIC	ENSMUSG00000025155.16	novel	1930	14	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	60	junction_5	245.992976279198	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCAGAGATCTCTAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120687221	120680026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_120680386_120680482_120680559_120680668_120680707_120682030_120682177_120682680_120682770_120682852_120682954_120683180_120683326_120683516_120683621_120683853_120683937_120684659_120684773_120685093_120685145_120685728_120685838_120686302_120686550_120686764
tx.3807	chr11	-	1838	14	NIC	ENSMUSG00000025155.16	novel	1863	14	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	60	junction_5	231.283555057935	270	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCAGAGATCTCTAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120687221	120680026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr11_-_120680386_120680482_120680559_120680668_120680707_120682030_120682177_120682680_120682770_120682852_120682954_120683180_120683326_120683516_120683621_120683853_120683937_120684659_120684773_120685093_120685145_120685728_120685838_120686302_120686550_120687044
tx.3808	chr11	-	970	2	FSM	ENSMUSG00000025153.10	ENSMUST00000155276.3	976	2	477	-471	477	29	multi-exon	FALSE	canonical	3	691	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGCCTTCGGTTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120698954	120697901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120698818_120698900
tx.3809	chr11	+	544	2	Intergenic	novelGene_227	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATATATCTGGCCACTTGC	3366	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120717354	120743522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_120717764_120743387
tx.3810	chr11	-	539	2	NNC	ENSMUSG00000048445.7	novel	3403	19	NA	NA	20974	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTCTGTCTTGTCCTACT	4478	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120743523	120717354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_120717751_120743380
tx.3811	chr11	+	390	3	Intergenic	novelGene_228	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATACTGAAGAAGTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120823777	120824563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_120823918_120824166_120824235_120824381
tx.3812	chr11	+	2136	5	FSM	ENSMUSG00000025161.17	ENSMUST00000100130.10	2386	5	25	225	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	128.437484793186	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTCTGGCCCTCATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120839917	120849601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120839977_120846051_120846296_120846624_120846769_120847180_120847949_120848680
tx.3813	chr11	+	2250	6	FSM	ENSMUSG00000025161.17	ENSMUST00000168579.8	4335	6	-8	2093	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	280	junction_1	37.4197808652055	179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTCTGGCCCTCATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120839898	120849601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_120839977_120844999_120845095_120846051_120846296_120846624_120846769_120847180_120847949_120848680
tx.3814	chr11	+	1531	2	ISM	ENSMUSG00000025161.17	ENSMUST00000100130.10	2386	5	7446	225	1287	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	287	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTCTGGCCCTCATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120847338	120849601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_120847949_120848680
tx.3815	chr11	-	1841	10	FSM	ENSMUSG00000025162.19	ENSMUST00000070575.14	3500	10	-14	1673	-14	226	multi-exon	TRUE	canonical	3	176	junction_1	174.428237039028	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTCTTTTTATTGTTTCT	1000	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120881932	120854247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120854733_120855773_120855837_120858820_120858961_120859848_120860021_120862392_120862542_120863202_120863374_120863791_120864021_120864646_120864796_120874058_120874170_120881760
tx.3816	chr11	-	1181	6	NNC	ENSMUSG00000025162.19	novel	3675	9	NA	NA	-15	235	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_5	220.316499609085	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTATTGTTTCTTTCTTGTCT	1040	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120881892	120854238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_120854733_120858820_120858961_120859848_120860021_120862392_120862542_120863202_120863297_120881760
tx.3817	chr11	-	1789	9	FSM	ENSMUSG00000025162.19	ENSMUST00000018274.10	3675	9	213	1673	-25	226	multi-exon	FALSE	canonical	3	400	junction_1	79.8474130764423	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTCTTTTTATTGTTTCT	989	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120881943	120854247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_120854733_120858820_120858961_120859848_120860021_120862392_120862542_120863202_120863374_120863791_120864021_120864646_120864796_120874058_120874170_120881760
tx.3818	chr11	-	1683	3	FSM	ENSMUSG00000039337.4	ENSMUST00000039146.4	2046	3	363	0	363	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_1	13.5	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTTGCAGTCTCCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121009140	121007040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_121008523_121008652_121008727_121009013
tx.3819	chr11	+	1735	3	FSM	ENSMUSG00000039329.9	ENSMUST00000039088.9	1745	3	10	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	732	junction_1	1	4259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTATGTGTATGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121036978	121039145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_121037049_121037353_121037428_121037554
tx.382	chr1	-	1779	11	FSM	ENSMUSG00000006299.14	ENSMUST00000006462.14	1817	11	34	4	-24	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1233	junction_8	50.6802722960325	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCAGTGTCTGTGTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74323863	74319002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_74319469_74319941_74320097_74320247_74320339_74320487_74320592_74320685_74320802_74320894_74320979_74321185_74321331_74321569_74321710_74322252_74322373_74323044_74323201_74323661
tx.3820	chr11	+	1667	2	ISM	ENSMUSG00000039329.9	ENSMUST00000039088.9	1745	3	383	0	369	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	734	junction_1	0	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTATGTGTATGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121037351	121039145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_121037428_121037554
tx.3821	chr11	-	1291	9	FSM	ENSMUSG00000025169.7	ENSMUST00000026169.7	1308	9	12	5	12	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_7	19.9483708607996	353	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAAGTGTGTGATCTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121095525	121068421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_121068765_121074236_121074361_121085905_121086060_121087562_121087620_121088256_121088322_121090591_121090635_121091736_121091813_121093716_121093935_121095314
tx.3822	chr11	+	2159	13	FSM	ENSMUSG00000039307.17	ENSMUST00000106117.8	2149	13	-1	-9	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	4.64503916979059	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGAAACTCTAATCAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121095259	121113482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_121095669_121098464_121098602_121102867_121102978_121104808_121104897_121105585_121105751_121107718_121107903_121108913_121108986_121109368_121109565_121110666_121110750_121111908_121111988_121112061_121112164_121112326_121112417_121113038
tx.3823	chr11	-	2383	7	FSM	ENSMUSG00000039294.15	ENSMUST00000038709.14	2417	7	34	0	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	26.4790273403101	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGCCTTTCTGTTTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121120101	121113413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_121115059_121115374_121115520_121116629_121116727_121117594_121117669_121118068_121118111_121119153_121119297_121119864
tx.3824	chr11	+	2316	11	NNC	ENSMUSG00000000056.8	novel	4395	11	NA	NA	-6	-2086	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	31.4294447930599	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGTGGCCCACCTAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121128072	121144596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_+_121128178_121129244_121129348_121133329_121133471_121135419_121135553_121135761_121135897_121136163_121136283_121137751_121137882_121139954_121140019_121141118_121141257_121141585_121141744_121143506
tx.3825	chr11	-	2263	10	FSM	ENSMUSG00000025173.14	ENSMUST00000026173.13	2321	10	50	8	-2	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	419	junction_4	31.7350139610984	350	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGTAAAGAGCAGAGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121245221	121218057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_121219291_121219618_121219741_121220151_121220254_121220972_121221059_121226209_121226401_121227801_121227897_121229382_121229471_121231939_121232042_121240057_121240133_121245052
tx.3826	chr11	-	2239	10	NNC	ENSMUSG00000025173.14	novel	2321	10	NA	NA	-4	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	67	junction_4	138.714023252567	62	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTGTAAAGAGCAGAGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121245231	121218057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_121219291_121219618_121219741_121220151_121220254_121220972_121221025_121226209_121226401_121227801_121227897_121229382_121229471_121231939_121232042_121240057_121240133_121245052
tx.3827	chr11	+	2509	6	FSM	ENSMUSG00000039253.8	ENSMUST00000038096.8	2520	6	11	0	11	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	26	junction_4	7.30479294709987	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCTAAGACTGGTATATTT	3868	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121312237	121322114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_+_121312430_121315751_121315904_121316380_121316473_121317446_121317530_121319870_121319994_121320247
tx.3828	chr11	+	515	4	ISM	ENSMUSG00000039230.15	ENSMUST00000151666.2	1324	11	7640	-1	7640	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	285	junction_3	24.7790233867277	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCAGCCTCTGCCTATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121500170	121507990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr11_+_121500254_121500806_121500917_121502489_121502575_121507753
tx.3829	chr11	-	2815	13	FSM	ENSMUSG00000046605.15	ENSMUST00000067399.14	2864	13	15	34	15	-34	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_9	15.1867998238236	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATTAATAAAGATTTAAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121563964	121507056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr11_-_121508679_121510460_121510555_121514257_121514333_121514747_121514817_121514917_121515054_121520698_121520824_121521597_121521694_121530577_121530674_121535352_121535419_121542434_121542500_121561695_121561796_121561882_121562000_121563810
tx.383	chr1	+	618	3	FSM	ENSMUSG00000026179.15	ENSMUST00000113805.8	740	3	122	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1381	junction_1	89	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGCCAGGTTGAATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74324210	74326613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_74324297_74325000_74325170_74326250
tx.3830	chr11	-	974	4	NNC	ENSMUSG00000046605.15	novel	2864	13	NA	NA	15	-27019	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	36.4173340899938	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTATTGTCTCCACTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121563964	121545112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr11_-_121545716_121561695_121561796_121561882_121562000_121563810
tx.3831	chr11	-	604	5	Intergenic	novelGene_230	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	77.1536616110992	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTTGTCTTGCTTGGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121816164	121795182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_121795440_121797606_121797657_121798775_121798837_121799014_121799142_121816055
tx.3832	chr11	-	2769	4	Intergenic	novelGene_231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_1	27.2070252365491	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCTTGTCTTGCTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121816164	121795184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_121797657_121798775_121798837_121799014_121799142_121816055
tx.3833	chr11	-	441	3	Intergenic	novelGene_232	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_1	12.5	619	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCAATGTCAGGTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121816166	121798633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_121798837_121799014_121799142_121816055
tx.3834	chr11	+	565	3	Intergenic	novelGene_233	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	3	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGACTGTTTCCGTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121816407	121826067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_+_121816553_121824785_121824872_121825733
tx.3835	chr11	-	3235	4	Intergenic	novelGene_234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	17.326921891156	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAATTGTGACCTGATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121847568	121832033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr11_-_121834966_121836089_121836151_121836329_121836457_121847453
tx.3836	chr12	+	860	4	FSM	ENSMUSG00000079179.10	ENSMUST00000178331.8	812	4	-31	-17	-9	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_3	69.5621225156974	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCATAGATTTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3285494	3288290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_3285930_3287284_3287413_3287590_3287661_3288063
tx.3837	chr12	+	882	4	FSM	ENSMUSG00000079179.10	ENSMUST00000178074.8	4006	4	-9	3133	-9	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_1	34.8934887272046	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTCAGGACAAATTTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3285494	3288277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_3285930_3287284_3287413_3287590_3287661_3288028
tx.3838	chr12	+	827	4	NNC	ENSMUSG00000079179.10	novel	4006	4	NA	NA	-3	17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	44	junction_1	68.3569065030496	76	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCATAGATTTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3285500	3288290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_3285930_3287346_3287413_3287590_3287661_3288028
tx.3839	chr12	+	1054	3	ISM	ENSMUSG00000079179.10	ENSMUST00000178074.8	4006	4	1171	3136	64	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_2	36.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCTCTCAGGACAAATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3286674	3288274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_3287413_3287590_3287661_3288028
tx.3840	chr12	-	2579	3	ISM	ENSMUSG00000020671.10	ENSMUST00000021001.10	3513	6	56622	45	56622	-45	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1286	junction_2	74.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGATGGTCTACTTCTGTTC	6596	False	NA	-67	True	NA	NA	NA	3303347	3297472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_3299871_3302611_3302714_3303268
tx.3841	chr12	-	769	4	ISM	ENSMUSG00000020671.10	ENSMUST00000021001.10	3513	6	52969	2000	52969	-2000	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1286	junction_2	60.8513671899727	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTGTACAACAGTGGGA	2943	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3307000	3299427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_3299871_3302611_3302714_3303268_3303359_3306866
tx.3842	chr12	-	1496	6	FSM	ENSMUSG00000020671.10	ENSMUST00000021001.10	3513	6	17	2000	17	-2000	multi-exon	FALSE	canonical	3	1286	junction_2	62.4422933595492	308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTGTACAACAGTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3359952	3299427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_3299871_3302611_3302714_3303268_3303359_3306866_3307006_3314688_3314750_3359291
tx.3843	chr12	+	1924	6	ISM	ENSMUSG00000020668.11	ENSMUST00000219895.2	2962	8	749	867	749	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_1	11.2071405808975	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCATTGACCTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3438129	3454066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_3438258_3439622_3439742_3440437_3440555_3451682_3451792_3452433_3452607_3452788
tx.3844	chr12	+	1939	5	ISM	ENSMUSG00000020668.11	ENSMUST00000219895.2	2962	8	2099	867	2099	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_3	10.2072278312968	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCATTGACCTTTATTTT	1123	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3439479	3454066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_3439742_3440437_3440555_3451682_3451792_3452433_3452607_3452788
tx.3845	chr12	-	1830	3	FSM	ENSMUSG00000071456.7	ENSMUST00000095903.7	1923	3	15	78	-11	-78	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_1	5.5	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGCAGTATGATTTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3476725	3455387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_3456712_3457643_3457925_3476500
tx.3846	chr12	-	2152	3	FSM	ENSMUSG00000071456.7	ENSMUST00000168012.3	3569	3	262	1155	-2	277	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	29.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGAGCTATCGATCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3476749	3455032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_3456712_3457700_3457925_3476500
tx.3847	chr12	-	995	2	FSM	ENSMUSG00000071456.7	ENSMUST00000180149.2	948	2	0	-47	0	47	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGTAAATGAATAGGCACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3476747	3457176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_3457925_3476500
tx.3848	chr12	-	441	2	NNC	ENSMUSG00000071456.7	novel	3569	3	NA	NA	-6	-18826	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	43	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTAGAAATCGCATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3476753	3476049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_3476238_3476500
tx.3849	chr12	-	2309	2	Intergenic	novelGene_370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGAATGTGGCTTTGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3608114	3601815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_3603951_3607940
tx.385	chr1	-	2157	12	NNC	ENSMUSG00000006301.18	novel	2378	12	NA	NA	33	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	38.8406364690682	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCTTGAGTTGCTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74343341	74327407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_74328678_74329029_74329084_74329910_74330007_74330358_74330447_74330589_74330628_74330853_74330894_74331615_74331667_74331993_74332048_74332163_74332229_74333066_74333162_74334356_74334599_74343277
tx.3850	chr12	+	1224	7	NNC	ENSMUSG00000071454.14	novel	3689	7	NA	NA	-3	-2383	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	135.946067737663	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCTGGGCCTCTTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3622519	3694404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_3622648_3639170_3639239_3641905_3641987_3646648_3646867_3667605_3667692_3682809_3682965_3693916
tx.3851	chr12	+	2985	18	FSM	ENSMUSG00000020661.16	ENSMUST00000172689.8	2328	18	56	-713	40	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	19.4274446476198	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCCCGACTTCATAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3941783	3958555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_3941861_3945542_3945759_3945989_3946149_3946577_3946686_3946885_3947043_3947297_3947448_3947564_3947610_3949192_3949273_3949586_3949700_3949863_3950048_3950276_3950362_3951548_3951695_3952380_3952472_3952665_3952815_3954139_3954226_3955592_3955663_3956764_3956884_3957605
tx.3852	chr12	+	1931	7	ISM	ENSMUSG00000020661.16	ENSMUST00000172689.8	2328	18	9942	-1154	1389	449	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_6	9.3704618645804	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGTGCTTTCTGTCTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3951669	3958996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_3951695_3952380_3952472_3952665_3952815_3954139_3954226_3955592_3955663_3956764_3956884_3957605
tx.3853	chr12	+	1907	6	ISM	ENSMUSG00000020661.16	ENSMUST00000172689.8	2328	18	10653	-1155	2100	450	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_5	9.85900603509299	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGCTTTCTGTCTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3952380	3958997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_3952472_3952665_3952815_3954139_3954226_3955592_3955663_3956764_3956884_3957605
tx.3854	chr12	+	868	3	ISM	ENSMUSG00000020657.17	ENSMUST00000219923.2	2934	9	-38	19569	8	-6737	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	2	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAGAAAAGAAAGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4132590	4139635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_4132874_4135953_4136037_4139133
tx.3855	chr12	+	1099	7	FSM	ENSMUSG00000020657.17	ENSMUST00000020986.15	4698	7	11	3588	11	-2186	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_5	5.84284938098603	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTCACTGTTGTGTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4132593	4157018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_4132874_4135953_4136037_4139133_4139204_4146212_4146378_4147223_4147347_4153053_4153215_4156801
tx.3856	chr12	-	2213	7	FSM	ENSMUSG00000020652.18	ENSMUST00000140975.8	4348	7	324	1811	-5	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_6	17.0953209972788	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGCAGATTCTTTGTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4283970	4263477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_4264631_4265258_4265431_4266518_4266779_4267207_4267323_4281515_4281683_4283530_4283658_4283751
tx.3857	chr12	-	2178	7	NNC	ENSMUSG00000020652.18	novel	4348	7	NA	NA	-2	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	55	junction_6	14.9666295470958	70	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCTGCAGATTCTTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4283967	4263479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_4264631_4265258_4265431_4266518_4266779_4267207_4267323_4281515_4281683_4283530_4283658_4283781
tx.3858	chr12	+	574	2	FSM	ENSMUSG00000096199.3	ENSMUST00000179139.3	3840	2	14	3252	14	-3252	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_1	0	1075	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACTACTATCATCATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4284040	4286698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_4284279_4286362
tx.3859	chr12	+	641	2	NNC	ENSMUSG00000096199.3	novel	3840	2	NA	NA	366	-3252	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTACTACTATCATCATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4284392	4286698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_4284698_4286362
tx.386	chr1	+	1156	5	ISM	ENSMUSG00000026177.12	ENSMUST00000027368.6	2315	15	8434	0	37	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	7.87400787401181	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTAAAGAGTTCTAGGTTA	4358	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74422795	74425221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_74422904_74423182_74423333_74423855_74423930_74424299_74424454_74424551
tx.3860	chr12	-	306	2	NNC	ENSMUSG00000112819.2	novel	457	3	NA	NA	-23	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	157	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTCTTGGCTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4603808	4602542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_4602731_4603690
tx.3861	chr12	-	321	2	NIC	ENSMUSG00000112819.2	novel	457	3	NA	NA	-23	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	47	junction_1	0	883	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTCTTGGCTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4603808	4602542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_4602746_4603690
tx.3862	chr12	-	486	3	FSM	ENSMUSG00000112819.2	ENSMUST00000217932.2	457	3	-26	-3	-26	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	2.5	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTCTTGGCTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4603811	4602542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_4602746_4603013_4603176_4603690
tx.3863	chr12	+	1110	2	FSM	ENSMUSG00000020640.11	ENSMUST00000218211.2	942	2	95	-263	95	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	68	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTCAAAGCTTGACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4762443	4763952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_4762641_4763039
tx.3864	chr12	-	1159	7	FSM	ENSMUSG00000050545.11	ENSMUST00000053458.7	2851	7	1	1691	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	2.69258240356725	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCCGTATGTGATATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4819231	4797906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_4798178_4798263_4798352_4812326_4812408_4812999_4813192_4814078_4814148_4818389_4818522_4818905
tx.3865	chr12	+	773	4	FSM	ENSMUSG00000037361.9	ENSMUST00000046207.9	1180	4	10	397	-7	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1039	junction_3	63.8609600790829	12097	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCTTCTGTTAAACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4867553	4877262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_4867820_4870593_4870713_4876757_4876897_4877013
tx.3866	chr12	-	958	4	FSM	ENSMUSG00000020635.9	ENSMUST00000020964.7	976	4	16	2	16	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	6.34209919681348	233	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCGTGTTGTGGGAGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4891575	4883175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_4883796_4884738_4884852_4888168_4888217_4891398
tx.3867	chr12	-	1004	4	FSM	ENSMUSG00000020635.9	ENSMUST00000219880.2	246	4	-141	-617	15	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	23.2999761564017	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCGTGTTGTGGGAGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4891576	4883175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_4883841_4884738_4884852_4888168_4888217_4891398
tx.3868	chr12	+	586	2	FSM	ENSMUSG00000051721.7	ENSMUST00000219069.2	605	2	23	-4	4	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	907	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGTGGTGTGTGCCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4893350	4899347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_4893452_4898862
tx.3869	chr12	-	1363	7	FSM	ENSMUSG00000020634.13	ENSMUST00000020962.12	2696	7	206	1127	-60	231	multi-exon	FALSE	canonical	3	1036	junction_3	130.609362434534	554	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTATTGCCCGTGCTTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4957499	4930158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_4930772_4933822_4933982_4935720_4935859_4941314_4941422_4944537_4944680_4952219_4952273_4957348
tx.3870	chr12	+	2718	7	FSM	ENSMUSG00000037669.16	ENSMUST00000037383.13	2737	7	19	0	-8	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	35	junction_1	76.8839312788367	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGTGTGTGGTCTGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8258125	8335759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_8258193_8270599_8270756_8277219_8277364_8288442_8288616_8318363_8318599_8325807_8325891_8333899
tx.3871	chr12	+	2720	7	NIC	ENSMUSG00000037669.16	novel	2737	7	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	188	junction_5	23.7533623350932	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTGTGTGTGGTCTGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8258135	8335759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_8258205_8270599_8270756_8277219_8277364_8288442_8288616_8318363_8318599_8325807_8325891_8333899
tx.3872	chr12	+	2646	6	ISM	ENSMUSG00000037669.16	ENSMUST00000037383.13	2737	7	12491	7	12405	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	188	junction_4	25.5233226677092	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTCACTACTGTGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8270597	8335752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_8270756_8277219_8277364_8288442_8288616_8318363_8318599_8325807_8325891_8333899
tx.3873	chr12	+	2948	7	FSM	ENSMUSG00000020605.10	ENSMUST00000020927.10	2959	7	4	7	4	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_1	12.8765506078125	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGAATTTCAGTGTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8363435	8393817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_8363498_8367784_8367951_8371518_8371727_8373869_8374102_8386237_8386396_8387632_8387769_8391831
tx.3874	chr12	+	1389	3	ISM	ENSMUSG00000020605.10	ENSMUST00000020927.10	2959	7	7	21142	7	-1316	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	13.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTAGCTGAGTGATTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8363438	8372682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_8363498_8367784_8367951_8371518
tx.3875	chr12	+	484	3	NNC	ENSMUSG00000112276.2	novel	1194	3	NA	NA	8353	-41368	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_1	0	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAATTGAGCATTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8569553	8571294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_8569746_8570846_8570989_8571144
tx.3876	chr12	-	731	2	Intergenic	novelGene_371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTGGTCTCGCTTCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8691042	8649707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_8650238_8690841
tx.3877	chr12	+	263	2	NNC	ENSMUSG00000020592.15	novel	2311	6	NA	NA	-10	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCTATGAACTCTACTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8821312	8843064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_8821459_8842947
tx.3878	chr12	+	2529	5	FSM	ENSMUSG00000020592.15	ENSMUST00000020911.14	3157	5	-13	641	-13	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_4	19.0574788468989	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTACTGCTTCTGCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8821309	8843074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_8821702_8839406_8839489_8840384_8840867_8841290_8841427_8841637
tx.3879	chr12	+	1389	7	FSM	ENSMUSG00000020585.5	ENSMUST00000020909.4	1773	7	381	3	381	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	924	junction_4	59.5158708991886	4890	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATGTGCCTCATGTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8972044	8988739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_8972295_8981627_8981749_8984695_8984773_8984865_8984989_8985986_8986083_8986696_8986796_8988116
tx.388	chr1	+	3001	8	FSM	ENSMUSG00000026174.10	ENSMUST00000087215.7	3268	8	261	6	259	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	963	junction_5	46.4318680148337	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTTGTTTTGTTTTGTTT	1121	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74545477	74569995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_74545621_74556228_74556409_74558059_74558176_74561476_74561587_74562662_74562773_74566150_74566250_74566750_74566843_74567844
tx.3880	chr12	+	789	3	FSM	ENSMUSG00000066637.3	ENSMUST00000085741.2	1000	3	2	209	2	-209	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_2	13	1719	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTATTCCCAACTTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9079998	9086185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_9080197_9084921_9085089_9085761
tx.3881	chr12	+	1453	2	FSM	ENSMUSG00000020621.7	ENSMUST00000020947.7	1480	2	26	1	26	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	0	179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGTGTGCATTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10440797	10445561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_10441227_10444537
tx.3882	chr12	-	1642	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000066632.4	novel	1255	1	NA	NA	-49	429	multi-exon	FALSE	canonical	2	86	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCTTCCATCCATAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10950289	10948556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_-_10949128_10949218
tx.3883	chr12	-	1695	12	ISM	ENSMUSG00000051235.11	ENSMUST00000166117.4	5268	14	-46	7187	-11	1634	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_9	5.8124972229621	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCTTTTACTTTTAATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11315813	11296107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_11296352_11298215_11298347_11299130_11299212_11300052_11300090_11300714_11300866_11302004_11302094_11304351_11304426_11305157_11305269_11306838_11307016_11310882_11311070_11312407_11312595_11315587
tx.3884	chr12	-	1750	11	ISM	ENSMUSG00000051235.11	ENSMUST00000166117.4	5268	14	-29	8979	2	-158	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_8	5.88302643203309	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTGTGATAAACTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11315796	11297899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_11298347_11299130_11299212_11300052_11300090_11300714_11300866_11302004_11302094_11304351_11304426_11305157_11305269_11306838_11307016_11310882_11311070_11312407_11312595_11315587
tx.3885	chr12	-	1274	10	ISM	ENSMUSG00000051235.11	ENSMUST00000166117.4	5268	14	-35	10245	0	-1424	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_7	6.06345051095211	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACATACCAAAGACCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11315802	11299165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_11299212_11300052_11300090_11300714_11300866_11302004_11302094_11304351_11304426_11305157_11305269_11306838_11307016_11310882_11311070_11312407_11312595_11315587
tx.3886	chr12	+	1876	8	NIC	ENSMUSG00000020608.8	novel	3373	10	NA	NA	-1	-1274	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	100	junction_2	207.697877127488	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGATTCTGTTTAATTT	4559	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11316128	11336381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_11316290_11321729_11321873_11329605_11329743_11330341_11330404_11332360_11332442_11333071_11333174_11335098_11335219_11335311
tx.3887	chr12	+	2115	10	FSM	ENSMUSG00000020608.8	ENSMUST00000218866.2	3373	10	-16	1274	8	-1274	multi-exon	FALSE	canonical	3	624	junction_2	43.5943704599856	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGATTCTGTTTAATTT	4544	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11316113	11336381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_11316290_11321729_11321873_11323994_11324113_11326260_11326367_11329605_11329743_11330341_11330404_11332360_11332442_11333071_11333174_11335098_11335219_11335311
tx.3888	chr12	+	3820	27	FSM	ENSMUSG00000020608.8	ENSMUST00000020931.6	5603	27	245	1538	1	204	multi-exon	TRUE	canonical	3	574	junction_19	50.8148542090207	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGTGTTTCCAGGTTG	4562	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11316131	11368248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_11316290_11321729_11321873_11323994_11324113_11326260_11326367_11329605_11329743_11330341_11330404_11332360_11332442_11333071_11333174_11335098_11335219_11335311_11335411_11339128_11339276_11339637_11339727_11339892_11340058_11340713_11340893_11341526_11341732_11344485_11344601_11344923_11345085_11347150_11347287_11348262_11348344_11349259_11349431_11350571_11350710_11351522_11351669_11356078_11356205_11359199_11359306_11364607_11364761_11366619_11366718_11367770
tx.3889	chr12	+	1187	11	ISM	ENSMUSG00000020608.8	ENSMUST00000020931.6	5603	27	240	30602	-3	1529	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	606	junction_10	47.1454133506113	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATTAGTGAAGAGACAAATG	4557	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11316126	11339184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_11316290_11321729_11321873_11323994_11324113_11326260_11326367_11329605_11329743_11330341_11330404_11332360_11332442_11333071_11333174_11335098_11335219_11335311_11335411_11339128
tx.389	chr1	+	1533	8	FSM	ENSMUSG00000026172.13	ENSMUST00000113733.10	1488	8	23	-68	12	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_1	21.8136822818587	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTACCTACAAGATCTACAT	1154	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74627470	74631351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_74627553_74628644_74629038_74629118_74629259_74629423_74629619_74629829_74629894_74630118_74630289_74630747_74630866_74630980
tx.3890	chr12	+	1580	10	ISM	ENSMUSG00000020608.8	ENSMUST00000218022.2	5272	26	31098	1532	2680	204	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	574	junction_2	56.2988059869439	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGTGTTTCCAGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11347203	11368248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_11347287_11348262_11348344_11349259_11349431_11350571_11350710_11351522_11351669_11356078_11356205_11359199_11359306_11364607_11364761_11366619_11366718_11367770
tx.3891	chr12	-	225	2	Intergenic	novelGene_372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	768	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTGTCCTCTTTTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11934595	11931075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_11931287_11934581
tx.3892	chr12	+	646	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000078377.6	novel	614	1	NA	NA	-37	61	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAACTAAGAACATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12073008	12073720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_12073454_12073519
tx.3893	chr12	+	1405	12	FSM	ENSMUSG00000020589.18	ENSMUST00000069005.10	1771	12	-30	396	8	-340	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	14.2718586881045	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTGATGTCTGAAGCGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12312147	12423000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_12312240_12354181_12354324_12390679_12390760_12408045_12408168_12409213_12409320_12411435_12411573_12412015_12412094_12412252_12412370_12412461_12412542_12414720_12414848_12419894_12419966_12422747
tx.3894	chr12	-	657	2	Intergenic	novelGene_373	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGCGAAGTCACCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12871714	12851287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_12851697_12871466
tx.3895	chr12	+	470	2	Intergenic	novelGene_374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGGATTCTTGTTTAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12877984	12879249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_12878176_12878970
tx.3896	chr12	-	2494	2	FSM	ENSMUSG00000037169.16	ENSMUST00000130990.2	2522	2	27	1	27	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	927	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGGCGATGTTTTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12990590	12986097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_12987612_12989610
tx.3897	chr12	-	2596	3	FSM	ENSMUSG00000037169.16	ENSMUST00000043396.15	2674	3	74	4	-15	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	794	junction_2	66.5	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGGCGATGTTTTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12991841	12986097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_12987612_12989610_12990488_12991636
tx.3898	chr12	-	550	3	ISM	ENSMUSG00000037149.11	ENSMUST00000071103.10	4842	26	28379	2324	8545	-2324	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2128	junction_1	55.5	355	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTTGTGTCTTCTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13270835	13269297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_13269630_13270347_13270469_13270738
tx.3899	chr12	-	2494	26	FSM	ENSMUSG00000037149.11	ENSMUST00000071103.10	4842	26	24	2324	24	-2324	multi-exon	FALSE	canonical	3	1685	junction_15	174.121171601847	331	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTTGTGTCTTCTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13299190	13269297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_13269630_13270347_13270469_13270738_13270835_13273676_13273720_13273793_13273867_13273942_13274016_13275399_13275492_13277305_13277453_13279093_13279146_13279242_13279432_13280292_13280383_13281445_13281545_13284040_13284102_13285994_13286134_13287213_13287329_13287729_13287807_13289106_13289180_13289491_13289569_13290559_13290644_13290851_13290936_13292300_13292349_13293860_13293958_13294968_13294999_13295686_13295751_13296026_13296079_13299104
tx.39	chr1	+	375	2	NNC	ENSMUSG00000048960.14	novel	11053	40	NA	NA	11307	-32	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATGTTTGGTTTGGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11365523	11368090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_11365740_11367931
tx.390	chr1	-	731	2	FSM	ENSMUSG00000026171.13	ENSMUST00000149649.2	423	2	162	-470	162	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAGCCTATGTGGTATGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74633798	74632910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_74633562_74633718
tx.3900	chr12	-	1246	11	ISM	ENSMUSG00000037149.11	ENSMUST00000071103.10	4842	26	18890	2328	-944	-2328	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1873	junction_10	102.055328131362	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAAGGCTTGTGTCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13280324	13269301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_13269630_13270347_13270469_13270738_13270835_13273676_13273720_13273793_13273867_13273942_13274016_13275399_13275492_13277305_13277453_13279093_13279146_13279242_13279432_13280292
tx.3901	chr12	+	1490	14	ISM	ENSMUSG00000020576.11	ENSMUST00000042953.10	7234	52	-11	261850	-11	-7703	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_4	5.96339921332748	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCCATCATCCACGAGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13319122	13371962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_13319266_13321164_13321220_13322657_13322695_13323788_13323867_13324175_13324224_13329388_13329433_13335183_13335318_13338671_13338806_13339882_13339982_13350093_13350233_13356904_13356974_13360176_13360306_13367698_13367763_13371645
tx.3902	chr12	-	1867	7	FSM	ENSMUSG00000045679.15	ENSMUST00000054536.11	1928	7	57	4	6	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_2	25.4165300542777	217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTCTTAAGCTGTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17050062	17038652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_17039897_17042278_17042321_17043453_17043575_17045614_17045673_17047634_17047705_17047774_17047858_17049813
tx.3903	chr12	-	1747	6	FSM	ENSMUSG00000045679.15	ENSMUST00000222203.2	1706	6	6	-47	6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	66.9943281181325	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTCTTAAGCTGTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17050062	17038651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_17039897_17042278_17042321_17045614_17045673_17047634_17047705_17047774_17047858_17049813
tx.3904	chr12	+	1745	13	FSM	ENSMUSG00000020571.14	ENSMUST00000239402.2	2125	13	-15	395	-15	-395	multi-exon	FALSE	canonical	3	2590	junction_6	180.731134715509	7146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAAATGTATGAAATTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17316580	17334376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_17316653_17320396_17320539_17323945_17324004_17324384_17324512_17327198_17327306_17328514_17328646_17328836_17328952_17329579_17329721_17330378_17330464_17330567_17330641_17330911_17331071_17333200_17333298_17333938
tx.3905	chr12	+	1272	9	ISM	ENSMUSG00000020571.14	ENSMUST00000239402.2	2125	13	10677	395	31	-395	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2590	junction_2	167.632783189924	1845	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAAATGTATGAAATTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17327272	17334376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_17327306_17328514_17328646_17328836_17328952_17329579_17329721_17330378_17330464_17330567_17330641_17330911_17331071_17333200_17333298_17333938
tx.3906	chr12	+	695	3	ISM	ENSMUSG00000020571.14	ENSMUST00000239402.2	2125	13	14315	395	3669	-395	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2705	junction_1	188	4283	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAAATGTATGAAATTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17330910	17334376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_17331071_17333200_17333298_17333938
tx.3907	chr12	-	1436	13	FSM	ENSMUSG00000020566.20	ENSMUST00000221129.2	1425	13	-8	-3	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_8	6.04841577054135	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTTCTTGTGTTCTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17374739	17334722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_17334950_17335113_17335247_17338083_17338182_17341429_17341524_17341628_17341722_17344145_17344215_17344676_17344776_17347729_17347822_17351121_17351217_17358272_17358359_17371598_17371667_17373338_17373512_17374630
tx.3908	chr12	-	742	3	NNC	ENSMUSG00000114024.2	novel	279	3	NA	NA	-27	570	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTATCCTCTGACCCCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17398401	17393831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_17394304_17394398_17394550_17398282
tx.3909	chr12	+	3022	21	FSM	ENSMUSG00000061458.10	ENSMUST00000046011.12	3021	21	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	221	junction_7	25.2103153490788	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTATTTGTTTAGCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17398457	17480096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_17398621_17400516_17400563_17402641_17402741_17405237_17405316_17406921_17406960_17408102_17408240_17409090_17409157_17411134_17411196_17412595_17412682_17418309_17418389_17419466_17419617_17423562_17423630_17429248_17429302_17452073_17452201_17454971_17455052_17455233_17455333_17456807_17456898_17466028_17466200_17466714_17466963_17474650_17474754_17479115
tx.391	chr1	-	1469	10	FSM	ENSMUSG00000026171.13	ENSMUST00000027357.12	1479	10	6	4	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_3	8.63384096891663	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAGCCTATGTGGTATGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74640550	74632910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_74633562_74633718_74633854_74634367_74634461_74634789_74634928_74635024_74635097_74637520_74637591_74637688_74637757_74637851_74637952_74638224_74638300_74640483
tx.3910	chr12	-	746	4	Intergenic	novelGene_376	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	6.84754619472471	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTAGGTTGTTGAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17514671	17508324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_17508571_17508845_17508977_17509178_17509309_17514432
tx.3911	chr12	-	615	3	Intergenic	novelGene_377	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	5.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTAGGTTGTTGAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17514671	17508324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_17508571_17509178_17509309_17514432
tx.3912	chr12	+	603	4	Intergenic	novelGene_378	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGTGGTATACGTGTTC	5910	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17563626	17575752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_17563752_17568350_17568468_17574356_17574429_17575463
tx.3913	chr12	+	1937	12	FSM	ENSMUSG00000011179.9	ENSMUST00000171737.3	2208	12	271	0	93	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	389	junction_11	306.963561516955	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCAGGGAATGTTTGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17595065	17601085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_17595170_17597096_17597195_17597283_17597402_17597633_17597808_17597950_17598124_17598309_17598445_17598545_17598628_17598787_17598872_17599424_17599588_17599668_17599782_17599863_17600079_17600607
tx.3914	chr12	+	1425	8	ISM	ENSMUSG00000011179.9	ENSMUST00000171737.3	2208	12	3174	0	151	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	389	junction_7	382.474168795643	281	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCAGGGAATGTTTGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17597968	17601085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_17598124_17598309_17598445_17598545_17598628_17598787_17598872_17599424_17599588_17599668_17599782_17599863_17600079_17600607
tx.3915	chr12	+	966	4	ISM	ENSMUSG00000011179.9	ENSMUST00000221613.2	1982	8	1737	422	-32	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	389	junction_3	504.482793451758	513	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCAGGGAATGTTTGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17599426	17601084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_17599588_17599668_17599782_17599863_17600079_17600607
tx.3916	chr12	+	1906	2	NIC	ENSMUSG00000113093.2	novel	1050	3	NA	NA	17	1125	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTGCCTTGGTCATGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17607716	17615239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_17607910_17613526
tx.3917	chr12	+	1410	2	Intergenic	novelGene_380	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGTCTGGTGTGGTCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17642213	17650836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_17642300_17649512
tx.3918	chr12	+	337	2	Intergenic	novelGene_381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGGAATTTTAAGTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17642244	17649540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_17642300_17649258
tx.3919	chr12	+	1574	4	FSM	ENSMUSG00000071379.3	ENSMUST00000071858.5	1526	4	-52	4	-52	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	8.52447456836295	303	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGGTCTGTGAGTTTCCT	8572	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17740804	17841930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_17741048_17836147_17836550_17837545_17837652_17841107
tx.3920	chr12	+	530	4	NNC	ENSMUSG00000113642.2	novel	550	2	NA	NA	-8545	-160525	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	17	junction_3	60.3342541366198	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTTTTCTAATTTTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17942189	17951940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_17942310_17950660_17950788_17950987_17951049_17951718
tx.3921	chr12	+	2089	4	NNC	ENSMUSG00000114025.2	novel	1214	3	NA	NA	-10201	-507	intron_retention	FALSE	canonical	3	46	junction_1	45.4190366354119	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATACTGGAGAGAAATTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17942188	17954169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_17942310_17950660_17950788_17950987_17951049_17952389
tx.3922	chr12	+	449	3	NNC	ENSMUSG00000113642.2	novel	550	2	NA	NA	-8546	-161277	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	46	junction_1	55.5	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTATTTATTTATTATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17942188	17951188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_17942310_17950660_17950788_17950987
tx.3923	chr12	+	765	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000113402.2	novel	324	1	NA	NA	-298	16923	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	20.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTATGAATGTATTCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18437457	18455002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_18437882_18453327_18453389_18454722
tx.3924	chr12	+	2848	4	Intergenic	novelGene_383	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_3	34.2150064542836	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTTGTATTTTGTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19116400	19127637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_19116514_19123371_19123499_19123700_19123762_19125090
tx.3925	chr12	+	790	4	NNC	ENSMUSG00000073184.5	novel	241	3	NA	NA	-54	7828	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	24	junction_3	2.62466929133727	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAAAGAAAAGAATATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19342759	19359093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_19342877_19350884_19351012_19351214_19351276_19358608
tx.3926	chr12	+	440	3	ISM	ENSMUSG00000116606.2	ENSMUST00000232483.2	654	4	-40	1589	-40	-1589	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_1	60	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGATTTATTTATTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20476873	20483829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_20476993_20483306_20483434_20483635
tx.3927	chr12	-	657	3	NNC	ENSMUSG00000099759.2	novel	1735	2	NA	NA	18	32265	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGTGTGTGAGTTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20865762	20822116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_20822270_20848304_20848393_20865346
tx.3928	chr12	-	1668	2	FSM	ENSMUSG00000099759.2	ENSMUST00000189625.2	1735	2	59	8	59	-8	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGGGCTAAACCTTCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20865721	20854389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_20855683_20865346
tx.3929	chr12	-	885	6	FSM	ENSMUSG00000069755.6	ENSMUST00000208744.2	928	6	209	-166	209	166	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1.49666295470958	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAAACCCTATGAGTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20971054	20950577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_20950936_20952270_20952332_20952533_20952661_20964759_20964843_20965748_20965793_20970842
tx.3930	chr12	-	310	2	ISM	ENSMUSG00000062352.16	ENSMUST00000173729.8	1701	7	14636	598	662	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_1	0	327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTGGGGTCTGGACAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21321462	21320691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_21320959_21321419
tx.3931	chr12	-	981	7	FSM	ENSMUSG00000062352.16	ENSMUST00000076260.12	1921	7	55	885	-10	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	216	junction_3	20.4728817924807	1285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTGGGGTCTGGACAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21336230	21320691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_21320959_21321419_21321570_21322056_21322150_21324766_21324904_21326820_21326900_21329400_21329532_21336106
tx.3932	chr12	+	2279	18	FSM	ENSMUSG00000054309.10	ENSMUST00000067284.10	2499	18	-1	221	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	692	junction_10	70.3324286444819	313	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGGGTGCCTGTTTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21336357	21364836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_21336546_21340248_21340313_21341751_21341850_21343226_21343356_21345030_21345209_21346647_21346738_21347789_21347941_21350042_21350219_21351416_21351576_21352359_21352507_21355303_21355457_21356773_21356883_21357993_21358093_21358904_21359000_21360197_21360286_21362298_21362369_21363767_21363865_21364648
tx.3933	chr12	+	477	5	ISM	ENSMUSG00000054309.10	ENSMUST00000221042.2	1892	13	17179	0	-710	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	803	junction_1	47.5887329102173	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGGGTGCCTGTTTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21358965	21364836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_21359000_21360197_21360286_21362298_21362369_21363767_21363865_21364648
tx.3934	chr12	+	445	4	ISM	ENSMUSG00000054309.10	ENSMUST00000221042.2	1892	13	18409	0	520	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	897	junction_1	11.0252236056942	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGGGGTGCCTGTTTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21360195	21364836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_21360286_21362298_21362369_21363767_21363865_21364648
tx.3935	chr12	+	706	4	FSM	ENSMUSG00000062054.8	ENSMUST00000223345.2	1890	4	-19	1203	6	-621	multi-exon	FALSE	canonical	3	412	junction_2	19.3964487013015	210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTGCAATTTTGCTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21366395	21370156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_21366514_21367376_21367430_21367898_21368048_21369770
tx.3936	chr12	+	919	6	FSM	ENSMUSG00000062054.8	ENSMUST00000076813.8	1141	6	10	212	-4	-212	multi-exon	FALSE	canonical	3	356	junction_4	39.1131691377725	2388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGTTCATGATTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21366399	21373608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_21366514_21367376_21367430_21367898_21368048_21369770_21369933_21371334_21371457_21373289
tx.3937	chr12	+	882	6	NIC	ENSMUSG00000062054.8	novel	1141	6	NA	NA	1	-212	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	85	junction_2	143.346293987672	267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGTTCATGATTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21366404	21373608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_21366514_21367376_21367430_21367930_21368048_21369770_21369933_21371334_21371457_21373289
tx.3938	chr12	-	3539	16	ISM	ENSMUSG00000052593.17	ENSMUST00000064536.13	4443	19	22055	289	-7348	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_12	14.8629292761106	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTCTTAATTGTATTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21401578	21373806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_21375628_21376119_21376171_21378045_21378135_21379054_21379134_21380033_21380165_21382076_21382212_21382570_21382675_21383954_21384155_21386633_21386787_21390472_21390562_21390675_21390821_21392864_21392979_21395621_21395712_21397297_21397432_21399785_21399955_21401543
tx.3939	chr12	-	1126	3	ISM	ENSMUSG00000052593.17	ENSMUST00000232107.2	834	4	-17	29431	-17	-3339	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	115	junction_1	26.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATTCTAGTGGGAGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21423557	21403242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_21404015_21411659_21411793_21423336
tx.3940	chr12	-	1807	5	FSM	ENSMUSG00000076432.14	ENSMUST00000103002.8	2110	5	303	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3292	junction_3	152.582764426393	1276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTATGGCTTTGTAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21467134	21440329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_21441417_21444965_21445062_21446282_21446447_21448241_21448366_21466798
tx.3941	chr12	-	1873	6	FSM	ENSMUSG00000076432.14	ENSMUST00000135088.9	2197	6	66	258	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2872	junction_5	274.352328220484	7001	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTATGGCTTTGTAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21467572	21440329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_21441417_21444965_21445062_21446282_21446447_21448241_21448366_21466798_21467133_21467504
tx.3942	chr12	+	680	4	NIC	ENSMUSG00000097055.3	novel	554	4	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.4142135623731	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTCTCTCCTATTTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21467882	21471065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_21468084_21468216_21468292_21468630_21468836_21470866
tx.3943	chr12	+	406	2	ISM	ENSMUSG00000097055.3	ENSMUST00000226706.2	554	4	687	0	687	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTCTCTCCTATTTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21468628	21471065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_21468836_21470866
tx.3944	chr12	+	649	5	NIC	ENSMUSG00000109975.2	novel	363	4	NA	NA	-25	163	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	112	junction_2	32.0507410210747	842	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGTTATCTTCTGTCTTAG	6075	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21593282	21604685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_21593347_21595309_21595401_21599867_21599956_21604009_21604108_21604377
tx.3945	chr12	-	2860	4	Intergenic	novelGene_388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_2	11.0855260988773	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGTATTTTGTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22302675	22291526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_22294077_22295404_22295466_22295667_22295795_22302553
tx.3946	chr12	+	384	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000116774.2	novel	156	1	NA	NA	-82084	115	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTCAGTCATTCATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20272208	20354563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_20272433_20354403
tx.3947	chr12	-	887	4	NNC	ENSMUSG00000073164.12	novel	3370	5	NA	NA	8562	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	9.56846672960488	65	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCCCAGCTGAGCTCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23051437	23009676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_23010256_23042788_23042850_23043051_23043179_23051317
tx.3948	chr12	+	948	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000092465.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGCACCAGGATCCATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23267608	23281174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_23267812_23271095_23271151_23280484
tx.3949	chr12	-	2174	4	Intergenic	novelGene_389	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_2	10.5303793326209	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGTTTGGTCATGAGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23455124	23444667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_23446506_23447833_23447895_23448096_23448224_23454976
tx.3950	chr12	-	438	3	NNC	ENSMUSG00000073158.5	novel	2245	4	NA	NA	10411	-31024	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_2	8	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGATTTATTTATTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24136836	24124226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_24124421_24124622_24124750_24136719
tx.3951	chr12	-	881	4	NNC	ENSMUSG00000114120.2	novel	578	3	NA	NA	-43374	-4888	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.84321537348893	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCACCTGTGCTCATCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24401626	24357695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_24358277_24390254_24390316_24390513_24390641_24401514
tx.3952	chr12	+	1990	15	FSM	ENSMUSG00000059669.9	ENSMUST00000075954.9	2209	15	222	-3	-30	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_4	28.2355254592363	306	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGGAAACTTGCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24548579	24608541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_24548649_24550434_24550534_24554945_24555034_24559082_24559181_24559452_24559549_24564783_24564935_24566857_24567009_24573100_24573201_24594269_24594418_24597011_24597190_24597568_24597616_24599417_24599509_24605988_24606060_24606517_24606741_24608161
tx.3953	chr12	+	548	4	FSM	ENSMUSG00000059669.9	ENSMUST00000222710.2	521	4	-27	0	-27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_3	107.002596022506	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATCTTCTGTCTTAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24548582	24559747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_24548649_24550434_24550534_24554945_24555034_24559452
tx.3954	chr12	+	1922	14	ISM	ENSMUSG00000059669.9	ENSMUST00000075954.9	2209	15	2076	-3	1805	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	207	junction_3	27.8701554019739	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGGAAACTTGCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24550433	24608541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_24550534_24554945_24555034_24559082_24559181_24559452_24559549_24564783_24564935_24566857_24567009_24573100_24573201_24594269_24594418_24597011_24597190_24597568_24597616_24599417_24599509_24605988_24606060_24606517_24606741_24608161
tx.3955	chr12	+	2103	10	FSM	ENSMUSG00000020649.12	ENSMUST00000020980.12	2193	10	41	49	41	-49	multi-exon	FALSE	canonical	3	5416	junction_9	442.930588436653	2332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTCATGGCATACAAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24758280	24764096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_24758445_24758558_24758634_24758937_24759085_24759323_24759441_24760355_24760490_24761445_24761541_24761667_24761802_24762659_24762765_24762859_24762974_24763078
tx.3956	chr12	+	1535	2	ISM	ENSMUSG00000020649.12	ENSMUST00000020980.12	2193	10	41	4216	41	341	intron_retention	FALSE	canonical	3	5890	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTGTGGGGCCTGGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24758280	24759929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_24758445_24758558
tx.3957	chr12	+	1037	4	NNC	ENSMUSG00000020646.18	novel	6792	12	NA	NA	-25	-16126	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	79.4019311268099	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCTTACAGTTTTACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24881582	24960738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_24881774_24928189_24928336_24932715_24932794_24960116
tx.3958	chr12	+	2700	12	FSM	ENSMUSG00000020646.18	ENSMUST00000221952.2	6792	12	-21	4113	-21	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_3	37.4053074415034	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAACTCTTGTTAAAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24881586	25010283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_24881774_24928189_24928336_24932715_24932794_24984565_24984622_24989292_24989348_24996504_24996686_24998186_24998380_25001384_25001489_25004184_25004250_25005275_25005409_25007571_25007724_25008933
tx.3959	chr12	+	2803	13	FSM	ENSMUSG00000020646.18	ENSMUST00000110942.11	2351	13	-32	-420	-18	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_3	25.3874148611735	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTAAAATGGGTGTTAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24881589	25010293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_24881774_24928189_24928336_24932715_24932794_24974197_24974294_24984565_24984622_24989292_24989348_24996504_24996686_24998186_24998380_25001384_25001489_25004184_25004250_25005275_25005409_25007571_25007724_25008933
tx.396	chr1	-	2489	9	FSM	ENSMUSG00000033159.15	ENSMUST00000168720.8	3669	9	-34	1214	25	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	100	junction_8	23.1405353222435	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGGCCTTTTCCTTCTGT	9333	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75119316	75112411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_75113577_75113969_75114088_75114398_75114461_75115990_75116120_75116202_75116324_75116464_75116547_75117541_75117651_75118059_75118148_75118701
tx.3960	chr12	-	480	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020646.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	23	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGGGGAAAGTACGCAAGCAA	576	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25002304	25000203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_25000511_25002131
tx.3961	chr12	-	1270	3	FSM	ENSMUSG00000020644.10	ENSMUST00000020974.7	1270	3	2	-2	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCGGGATTCTGAATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25146089	25143797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_25144576_25145309_25145374_25145661
tx.3962	chr12	+	568	3	NNC	ENSMUSG00000113616.2	novel	389	2	NA	NA	-5796	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGTGGTAAATACAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28024799	28032236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_28024973_28030592_28030692_28031940
tx.3963	chr12	-	672	7	FSM	ENSMUSG00000061477.5	ENSMUST00000074267.5	954	7	53	229	-22	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	10789	junction_4	2567.89392736971	61673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTTGTAGTAACTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28685899	28681081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_28681193_28681622_28681774_28683766_28683832_28684207_28684352_28685414_28685487_28685578_28685663_28685854
tx.3964	chr12	+	1434	8	FSM	ENSMUSG00000020630.10	ENSMUST00000020959.9	1455	8	23	-2	1	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	155	junction_3	35.1318217284442	1181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATCTAGTTTGAGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28699623	28709590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_28699816_28702023_28702140_28703061_28703224_28705583_28705684_28707270_28707326_28707631_28707717_28708169_28708295_28708991
tx.3965	chr12	+	857	2	ISM	ENSMUSG00000020630.10	ENSMUST00000221496.2	1970	6	4386	-6	4386	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	247	junction_1	0	262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATCTAGTTTGAGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28708036	28709590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_28708295_28708991
tx.3966	chr12	+	1656	4	FSM	ENSMUSG00000020629.13	ENSMUST00000020957.13	1652	4	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	316	junction_2	13.6950923894494	1381	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTCTCTCGAGAGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28725225	28732174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_28725372_28727776_28727897_28729388_28729569_28730964
tx.3967	chr12	-	1303	5	ISM	ENSMUSG00000020628.17	ENSMUST00000020954.15	3377	12	48833	-1	-11	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_3	20.4006740084733	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCCTGAGGAGACATGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28751619	28740626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_28741557_28741757_28741846_28742492_28742594_28747142_28747242_28751534
tx.3968	chr12	-	2943	12	FSM	ENSMUSG00000020628.17	ENSMUST00000020954.15	3377	12	51	383	-20	-383	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_11	21.61993264567	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACAGTTCATTGTCTTCCT	8300	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28800401	28741010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_28741557_28741757_28741846_28742492_28742594_28747142_28747242_28751534_28751609_28753524_28753598_28761870_28761984_28771050_28771190_28772361_28772476_28787731_28787849_28796297_28797536_28800160
tx.3969	chr12	-	936	6	ISM	ENSMUSG00000020628.17	ENSMUST00000020954.15	3377	12	46901	382	-1943	-382	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_3	18.3455716727498	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACAGTTCATTGTCTTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28753551	28741009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_28741557_28741757_28741846_28742492_28742594_28747142_28747242_28751534_28751609_28753524
tx.3970	chr12	-	906	2	ISM	ENSMUSG00000020673.15	ENSMUST00000021005.15	3299	17	58474	-344	20849	344	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	8493	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30124149	30104313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_30105163_30124092
tx.3971	chr12	+	1155	2	Intergenic	novelGene_393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAGAACTCTCGCGAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30631462	30634379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_30631943_30633704
tx.3972	chr12	+	1295	5	FSM	ENSMUSG00000043061.11	ENSMUST00000057151.10	2971	5	20	1656	20	581	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_1	9.17877987534291	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTATCTGTTTCTACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30634444	30639558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_30634562_30635468_30635590_30637198_30637254_30638472_30638567_30638650
tx.3973	chr12	+	2583	6	NNC	ENSMUSG00000043061.11	novel	2971	5	NA	NA	20	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	70.6784266944306	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGTGTGCTTTCGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30634444	30641218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_30634562_30635468_30635590_30637198_30637254_30638472_30638567_30638650_30640426_30640797
tx.3974	chr12	-	1433	6	FSM	ENSMUSG00000044573.17	ENSMUST00000062740.15	3066	6	-8	1641	-8	909	multi-exon	FALSE	canonical	3	836	junction_3	311.492279198057	2725	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCAGTGTCTGCCTGCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30961578	30944965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_30945953_30946114_30946221_30947743_30947806_30954868_30954983_30955067_30955142_30961488
tx.3975	chr12	-	1431	6	FSM	ENSMUSG00000044573.17	ENSMUST00000074038.7	2754	6	12	1311	-6	909	multi-exon	FALSE	canonical	3	735	junction_4	354.017287713467	2413	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCAGTGTCTGCCTGCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30961576	30944965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_30945953_30946114_30946221_30947743_30947806_30954716_30954831_30955067_30955142_30961488
tx.3976	chr12	+	1740	10	FSM	ENSMUSG00000020669.16	ENSMUST00000020997.15	1750	10	5	5	5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	6.36153564813317	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAAGTACTTTGTGTTCAC	8044	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30961671	31010156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_30962227_30972233_30972345_30974762_30974877_30976808_30976874_30989572_30989686_30990289_30990419_30991965_30992129_30992788_30992868_31008846_31008904_31009802
tx.3977	chr12	+	1004	8	ISM	ENSMUSG00000020669.16	ENSMUST00000128814.2	1370	11	12647	-1	12647	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_3	5.51435973303394	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAAGTACTTTGTGTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30974832	31010156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_30974877_30976808_30976874_30989572_30989686_30990289_30990419_30991965_30992129_30992788_30992868_31008846_31008904_31009802
tx.3978	chr12	+	2736	2	FSM	ENSMUSG00000036136.10	ENSMUST00000041133.10	3088	2	45	307	45	-307	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCTCAGGTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31123904	31129943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_31125322_31128624
tx.3979	chr12	+	1831	4	Intergenic	novelGene_394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGAGACCAGAAAACATCT	5484	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31275724	31284058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_31275785_31277051_31277275_31279404_31279536_31282641
tx.3980	chr12	+	1327	7	ISM	ENSMUSG00000002900.18	ENSMUST00000002979.16	5784	33	58166	0	-62	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_2	10.8589440861746	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTATGTTTCTTTTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31373457	31379643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_31373665_31374174_31374320_31376168_31376377_31376566_31376709_31377643_31377821_31379108_31379269_31379355
tx.3981	chr12	-	2231	14	FSM	ENSMUSG00000020664.11	ENSMUST00000110857.5	2544	14	28	285	-11	-285	multi-exon	FALSE	canonical	3	710	junction_4	70.0417457938204	2556	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTGGTTATTCTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31401424	31381560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_31382242_31382337_31382428_31383423_31383562_31383865_31384056_31384611_31384783_31385464_31385656_31390278_31390381_31390862_31391007_31391376_31391478_31392742_31392813_31393373_31393443_31394821_31394902_31399595_31399675_31401299
tx.3982	chr12	-	2940	6	FSM	ENSMUSG00000020659.17	ENSMUST00000185739.8	3945	6	0	1005	0	-898	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	67.8250691116493	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACAAGGGGTATACTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31549556	31535832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_31538314_31540466_31540541_31541510_31541595_31542077_31542176_31544580_31544749_31549521
tx.3983	chr12	-	1886	6	FSM	ENSMUSG00000020659.17	ENSMUST00000101499.10	3900	6	59	1955	0	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_4	37.6542162313864	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTATGTGAATTTAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31549556	31536889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_31538314_31540466_31540541_31541510_31541595_31542077_31542179_31544580_31544749_31549521
tx.3984	chr12	-	1848	5	ISM	ENSMUSG00000020659.17	ENSMUST00000101499.10	3900	6	4866	1959	4805	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	107	junction_4	38.758063677124	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATTTTTATGTGAATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31544749	31536893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_31538314_31540466_31540541_31541510_31541595_31542077_31542179_31544580
tx.3985	chr12	-	1872	6	FSM	ENSMUSG00000020659.17	ENSMUST00000064240.14	3937	6	1	2064	1	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_4	65.6310901935965	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTTATGTGAATTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31549553	31536891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_31538314_31540466_31540541_31541510_31541595_31542077_31542179_31544589_31544749_31549521
tx.3986	chr12	-	1739	7	FSM	ENSMUSG00000020650.16	ENSMUST00000020979.9	1949	7	217	-7	217	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	313	junction_3	46.7618077780005	361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTGGAGTTTTTATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31684381	31645352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_31646377_31650642_31650744_31667073_31667180_31674113_31674250_31676724_31676876_31680791_31680893_31684261
tx.3987	chr12	-	1789	8	FSM	ENSMUSG00000020650.16	ENSMUST00000177962.9	6155	8	-21	4387	2	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	313	junction_3	46.0678293167714	646	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATTGGAGTTTTTATTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31684655	31645352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_31646377_31650642_31650744_31667073_31667180_31674113_31674250_31676724_31676876_31680791_31680893_31684261_31684380_31684603
tx.3988	chr12	-	743	5	ISM	ENSMUSG00000020650.16	ENSMUST00000177962.9	6155	8	-21	32963	2	10145	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	339	junction_4	35.979160635012	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGTAGATGAAGCTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31684655	31673928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_31674250_31676724_31676876_31680791_31680893_31684261_31684380_31684603
tx.3989	chr12	-	1790	7	NNC	ENSMUSG00000020648.4	novel	1773	7	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_6	54.8009022634563	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGGTATGACTCGCCTGTA	9067	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31704818	31690048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_31690944_31691500_31691748_31692762_31692886_31696619_31696738_31698764_31698887_31702289_31702441_31704684
tx.3990	chr12	-	1783	7	NNC	ENSMUSG00000020648.4	novel	1773	7	NA	NA	-6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_6	43.9621048934951	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACGGTATGACTCGCCTGTA	9054	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31704831	31690048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_31690944_31691500_31691728_31692762_31692886_31696619_31696738_31698764_31698887_31702289_31702441_31704684
tx.3991	chr12	+	402	5	ISM	ENSMUSG00000035933.6	ENSMUST00000036862.5	2997	23	4	267277	4	-255669	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_4	10.3047319227625	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCCCGTACTGCACAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31704871	31720352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_31704983_31710715_31710856_31715463_31715522_31719768_31719824_31720314
tx.3992	chr12	+	723	4	ISM	ENSMUSG00000035933.6	ENSMUST00000219672.2	750	5	6519	196	6519	-196	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_2	3.77123616632825	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCTTCCTCTTTCTGTTA	1041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31950638	31975825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_31950973_31969649_31969777_31970552_31970633_31975643
tx.3993	chr12	-	2637	11	FSM	ENSMUSG00000002996.18	ENSMUST00000172314.9	3142	11	303	202	2	-202	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_10	30.1004983347452	170	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTTGATTTCTGGTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32000231	31976454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_31977507_31978582_31978725_31980680_31981005_31983355_31983501_31984283_31984441_31986970_31987084_31987168_31987281_31987616_31987759_31990276_31990506_31993827_31994012_32000194
tx.3994	chr12	-	1540	9	FSM	ENSMUSG00000002996.18	ENSMUST00000167458.9	2733	9	-16	1209	-5	221	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_8	33.3164280048147	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGATTTCTTCCCATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32000238	31980590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_31981005_31983355_31983501_31984283_31984441_31986970_31987084_31987168_31987281_31987616_31987759_31990276_31990506_31993827_31994012_32000194
tx.3995	chr12	-	975	3	FSM	ENSMUSG00000002996.18	ENSMUST00000175666.2	979	3	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_2	45	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAACTGTAGATTGTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32000229	31989749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_31990506_31993827_31994012_32000194
tx.3996	chr12	+	414	2	ISM	ENSMUSG00000020572.9	ENSMUST00000020886.9	4527	11	32	23029	32	-4692	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1021	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGGTATTGCTTTTCCCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32870365	32880319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_32870626_32880165
tx.3997	chr12	+	2757	11	FSM	ENSMUSG00000020572.9	ENSMUST00000020886.9	4527	11	29	1741	29	-1741	multi-exon	FALSE	canonical	3	823	junction_5	70.9532240282286	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGACATCATTTATTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32870362	32901607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_32870626_32880165_32880323_32883030_32883135_32884900_32885030_32888297_32888457_32889149_32889287_32890923_32891150_32892683_32892804_32896704_32896846_32898615_32898751_32900421
tx.3998	chr12	+	990	4	ISM	ENSMUSG00000020572.9	ENSMUST00000020886.9	4527	11	22436	2247	21970	-2247	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	857	junction_1	69.6291765154682	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTGGTGTTGTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32892769	32901101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_32892804_32896704_32896846_32898615_32898751_32900421
tx.3999	chr12	-	531	3	NNC	ENSMUSG00000097494.8	novel	1451	7	NA	NA	25213	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTGTATGTGTGTATGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32978569	32974950	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_32975044_32975374_32975535_32978291
tx.4	chr1	+	2448	8	NNC	ENSMUSG00000025903.15	novel	2507	9	NA	NA	-25	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	279.122604909435	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGATTGCTTTATATAGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4878093	4916958	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_4878206_4898781_4898873_4900490_4900539_4902533_4902605_4907223_4907298_4909609_4909712_4911178_4911356_4915185
tx.40	chr1	-	627	3	Intergenic	novelGene_5	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_2	5.5	408	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCTCTTATTCCAGAAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11465747	11456078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_11456468_11457012_11457110_11465606
tx.4000	chr12	+	2004	5	FSM	ENSMUSG00000020570.16	ENSMUST00000020885.13	2019	5	23	-8	23	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_3	20.9806458432528	703	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGCCCCGTTGTTATATT	8448	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33004205	33026911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_33004359_33015371_33015500_33017534_33017743_33024126_33024319_33025588
tx.4001	chr12	-	1284	5	NNC	ENSMUSG00000035860.10	novel	2953	20	NA	NA	-861	2325	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCCTGGTGCTGAAGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33103846	33098457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_33099164_33100982_33101082_33102104_33102212_33103391_33103564_33103646
tx.4002	chr12	+	1689	4	FSM	ENSMUSG00000020564.18	ENSMUST00000110824.9	1675	4	-10	-4	8	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	2.35702260395516	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGTACATTGAGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33197699	33301149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_33197915_33198431_33198501_33267710_33267816_33299849
tx.4003	chr12	+	463	4	FSM	ENSMUSG00000020562.8	ENSMUST00000020878.8	673	4	212	-2	212	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_3	13.0213499897497	471	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATGTGTCTGGTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33445064	33451268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_33445198_33448277_33448443_33448546_33448635_33451191
tx.4004	chr12	+	2333	4	FSM	ENSMUSG00000020561.9	ENSMUST00000020877.9	4325	4	-11	2003	-11	1674	multi-exon	FALSE	canonical	3	454	junction_3	49.8687165354081	1732	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AATAAAAAGAATACCCCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33479622	33489388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_33479908_33483503_33483646_33486934_33487144_33487691
tx.4005	chr12	+	1200	4	NNC	ENSMUSG00000020561.9	novel	4325	4	NA	NA	-11	535	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	255.223213851893	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTACAGTTCAGTGGAAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33479622	33488249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_33479908_33483503_33483646_33486934_33487150_33487691
tx.4006	chr12	+	1060	2	FSM	ENSMUSG00000035799.7	ENSMUST00000049089.7	1628	2	567	1	567	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTTTAAAGTTTGGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34008236	34009827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_34008638_34009168
tx.4007	chr12	+	1174	7	FSM	ENSMUSG00000020590.17	ENSMUST00000222101.2	1145	7	-28	-1	3	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	96	junction_3	5.7373048260195	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATACTGTTTAATTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35097187	35141968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_35097411_35128898_35129012_35132867_35132971_35135937_35136028_35136861_35136984_35141361_35141484_35141567
tx.4008	chr12	+	506	4	ISM	ENSMUSG00000020590.17	ENSMUST00000222101.2	1145	7	-23	5958	8	-5958	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_3	1.24721912892465	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGAGCCTCTCCAGCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35097192	35136009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_35097411_35128898_35129012_35132867_35132971_35135937
tx.4009	chr12	+	778	8	FSM	ENSMUSG00000020581.12	ENSMUST00000020898.12	784	8	0	6	0	-6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.989743318610787	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGAATAGTGTTGTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36042905	36054080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_36042969_36045508_36045655_36045893_36045958_36046073_36046127_36047421_36047496_36048581_36048646_36051684_36051769_36053850
tx.4010	chr12	-	1619	5	ISM	ENSMUSG00000020577.18	ENSMUST00000020896.17	1932	6	18485	6	15931	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	804	junction_3	18.1985576351534	352	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTGTATATGGGTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36074003	36064561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_36065772_36070488_36070603_36071799_36071914_36072751_36072833_36073903
tx.4011	chr12	-	1948	6	FSM	ENSMUSG00000020577.18	ENSMUST00000020896.17	1932	6	-25	9	-14	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	804	junction_3	64.3913037606787	1032	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTTTGTATATGGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36092513	36064564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_36065772_36070488_36070603_36071799_36071914_36072751_36072833_36073903_36074072_36092249
tx.4012	chr12	-	1033	5	ISM	ENSMUSG00000020547.6	ENSMUST00000020856.6	1871	12	46968	4	-87	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1036	junction_4	70.8568098350469	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTGTATATGGTCAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36159856	36141837	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_36142309_36142965_36143089_36154260_36154400_36157494_36157642_36159703
tx.4013	chr12	-	1849	12	FSM	ENSMUSG00000020547.6	ENSMUST00000020856.6	1871	12	18	4	18	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	931	junction_9	81.950499068161	1375	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTGTATATGGTCAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36206806	36141837	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_36142309_36142965_36143089_36154260_36154400_36157494_36157642_36159703_36159875_36163966_36164077_36168985_36169122_36170717_36170784_36173933_36174038_36179990_36180168_36184889_36184955_36206666
tx.4014	chr12	-	1648	4	FSM	ENSMUSG00000020547.6	ENSMUST00000222842.2	1567	4	-80	-1	-15	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	931	junction_1	59.7345982008938	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTAGTGAATTTTAAGGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36206800	36172765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_36174038_36179990_36180168_36184889_36184955_36206666
tx.4015	chr12	+	2417	10	FSM	ENSMUSG00000036188.5	ENSMUST00000041640.5	2456	10	39	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	149	junction_5	20.5882622678524	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTTGTTTCATAATTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36207151	36247290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_36207423_36215868_36215934_36220447_36220587_36226578_36226678_36232346_36232508_36236724_36236940_36237648_36237785_36243668_36243798_36244982_36245113_36246218
tx.4016	chr12	+	2449	10	FSM	ENSMUSG00000043153.7	ENSMUST00000062041.6	2690	10	246	-5	8	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	4.59468291736341	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCTCCTACAACATGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36431763	36739448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_36432024_36440344_36440622_36476287_36476438_36523100_36523206_36526698_36526745_36551976_36552072_36571431_36571522_36571957_36572051_36597827_36597960_36738247
tx.4017	chr12	+	1799	10	FSM	ENSMUSG00000043153.7	ENSMUST00000221452.2	1924	10	128	-3	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	6.48264539813992	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATACCAGTTCTGTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36431576	36633463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_36432024_36440344_36440622_36476287_36476438_36523100_36523206_36526698_36526745_36551976_36552072_36571431_36571522_36571957_36572051_36597827_36597960_36633099
tx.4018	chr12	-	664	2	NNC	ENSMUSG00000113608.2	novel	549	2	NA	NA	28308	911	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTATCTTCTTCCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38097426	38096180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_38096710_38097291
tx.4019	chr12	-	817	3	NNC	ENSMUSG00000113608.2	novel	549	2	NA	NA	27894	905	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.5	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAAGTGTTATCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38097840	38096186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_38096710_38097291_38097424_38097678
tx.4020	chr12	-	1377	3	NNC	ENSMUSG00000113608.2	novel	549	2	NA	NA	27478	905	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	36	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAAAGTGTTATCTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38098256	38096186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_38096710_38097291_38097424_38097534
tx.4021	chr12	+	1338	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000113520.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCAGTCGTGATTTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38780097	38792429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_38780406_38791399
tx.4022	chr12	+	2820	13	NNC	ENSMUSG00000004151.18	novel	6576	13	NA	NA	-44	-412	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	7.23225798458238	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGCTTCCGCTGCTGTCCTT	483	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38830238	38916886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_38830421_38830846_38830979_38831797_38831886_38833236_38833285_38843169_38843224_38877776_38877907_38881079_38881269_38885067_38885316_38902218_38902287_38904158_38904228_38906939_38907110_38911285_38911388_38915546
tx.4023	chr12	-	1128	2	FSM	ENSMUSG00000047446.19	ENSMUST00000146905.2	3710	2	52	2530	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	0	249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCCTAGTGTTTTGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40087376	40085819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_40086833_40087261
tx.4024	chr12	-	550	3	FSM	ENSMUSG00000001627.13	ENSMUST00000170119.8	574	3	215	-191	215	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	660	junction_2	16	792	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTGTAGTGAGCAGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40254426	40253127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_40253451_40253917_40254014_40254295
tx.4025	chr12	-	1812	12	FSM	ENSMUSG00000001627.13	ENSMUST00000001672.12	3378	12	4	1562	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	551	junction_11	48.4295518005619	351	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTGTAGTGAGCAGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40273184	40253127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_40253451_40253917_40254014_40254295_40254425_40256987_40257123_40262308_40262418_40262937_40263117_40263207_40263259_40263976_40264135_40266188_40266314_40267156_40267242_40267376_40267482_40272867
tx.4026	chr12	+	686	2	FSM	ENSMUSG00000035983.5	ENSMUST00000038121.5	1366	2	694	-14	23	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTATGTTCACAACTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40273450	40275251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_40273553_40274667
tx.4027	chr12	-	1565	12	FSM	ENSMUSG00000055917.16	ENSMUST00000069637.15	2188	12	118	505	-10	-505	multi-exon	FALSE	canonical	3	359	junction_6	45.6703965821071	1165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAAGAAACTTTGTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40495783	40365549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_40365903_40367089_40367265_40368533_40368577_40370600_40370698_40372528_40372597_40378673_40378807_40379483_40379595_40385282_40385375_40413132_40413216_40414080_40414170_40428671_40428874_40495664
tx.4028	chr12	-	1086	8	ISM	ENSMUSG00000055917.16	ENSMUST00000069637.15	2188	12	120	7293	-8	2136	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	359	junction_2	44.603010788831	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAGATACTTTTGGGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40495781	40372337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_40372597_40378673_40378807_40379483_40379595_40385282_40385375_40413132_40413216_40414080_40414170_40428671_40428874_40495664
tx.4029	chr12	+	363	4	FSM	ENSMUSG00000056899.11	ENSMUST00000140790.2	347	4	-28	12	9	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	185	junction_1	32.8667342798493	865	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAACTCAGTAACTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41074097	41160944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_41074145_41074559_41074633_41118308_41118446_41160838
tx.403	chr1	+	1198	10	FSM	ENSMUSG00000026197.13	ENSMUST00000160439.8	1206	10	5	3	-4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_1	30.0361921605614	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATGAGTGCTGTTTCTTT	2037	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75145294	75148270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_75145352_75145474_75145551_75145828_75145924_75146143_75146276_75146408_75146561_75147010_75147104_75147182_75147244_75147329_75147398_75147619_75147693_75147879
tx.4030	chr12	+	317	3	ISM	ENSMUSG00000056899.11	ENSMUST00000140790.2	347	4	433	12	231	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	246	junction_2	7.5	502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTAACTCAGTAACTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41074558	41160944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_41074633_41118308_41118446_41160838
tx.4031	chr12	+	171	2	ISM	ENSMUSG00000056899.11	ENSMUST00000134965.8	977	6	601219	251483	557236	-251483	internal_fragment	FALSE	canonical	3	237	junction_1	0	1345	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTCGAGTAAACCTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41675546	41750542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_41675613_41750437
tx.4032	chr12	-	747	2	Intergenic	novelGene_395	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGACTTTTATTTTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43258709	43249621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_43250160_43258500
tx.4033	chr12	-	2017	3	FSM	ENSMUSG00000014905.5	ENSMUST00000015049.5	2461	3	255	189	-3	-189	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_1	7	332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTGTTACTATCTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44256854	44252530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_44254189_44254869_44255097_44256722
tx.4034	chr12	+	746	2	ISM	ENSMUSG00000036257.16	ENSMUST00000043082.16	13507	10	13	39350	-6	292	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	297	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGTTACTTTGCAGATAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44315943	44329965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_44316085_44329360
tx.4035	chr12	+	3439	10	FSM	ENSMUSG00000036257.16	ENSMUST00000043082.16	13507	10	20	10048	1	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_3	27.4419701988589	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGAAAAGTTAATCAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44315950	44359267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_44316085_44329360_44330488_44330575_44330726_44334953_44335106_44337348_44337444_44342680_44342853_44346016_44346075_44351693_44351889_44354701_44354898_44358107
tx.4036	chr12	+	1211	3	ISM	ENSMUSG00000036257.16	ENSMUST00000043082.16	13507	10	35925	10226	5799	-37	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	243	junction_2	14	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCATTTTAACGTTTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44351855	44359089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_44351889_44354701_44354898_44358107
tx.4037	chr12	-	1497	6	FSM	ENSMUSG00000046314.17	ENSMUST00000053768.14	4553	6	319	2737	-72	-2733	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	7.73563184232549	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCCTAGTCCTCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45121173	44902003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_44902661_44908007_44908166_44948656_44948823_44949642_44949774_45066249_45066439_45120977
tx.4038	chr12	+	267	2	Intergenic	novelGene_396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGACTAGAATTCATTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45342999	45351551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_45343018_45351302
tx.4039	chr12	+	299	2	Intergenic	novelGene_400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCATTCTATCAGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47889076	47895149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_47889175_47894948
tx.404	chr1	+	1195	10	NIC	ENSMUSG00000026197.13	novel	1206	10	NA	NA	-4	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	39	junction_1	43.344727846634	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATGAGTGCTGTTTCTTT	2037	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75145294	75148270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_75145352_75145477_75145551_75145828_75145924_75146143_75146276_75146408_75146561_75147010_75147104_75147182_75147244_75147329_75147398_75147619_75147693_75147879
tx.4040	chr12	-	252	2	Intergenic	novelGene_401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATCATGATCAGCTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48956256	48955921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_48956067_48956149
tx.4041	chr12	+	1072	9	ISM	ENSMUSG00000035293.14	ENSMUST00000119211.8	2926	16	11	9912	11	-178	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_8	18.4657622371783	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGTTGAAAATGTTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51395081	51410138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_51395228_51398187_51398229_51400386_51400485_51400582_51400685_51402663_51402789_51403809_51403976_51406524_51406632_51407713_51407831_51409968
tx.4042	chr12	+	2975	15	FSM	ENSMUSG00000035293.14	ENSMUST00000054308.13	6803	15	217	3611	-10	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_10	21.5917595770389	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCTAGAACCTATGTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51395060	51420158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_51395228_51398187_51398229_51400386_51400485_51400582_51400685_51402663_51402789_51403809_51403976_51406524_51406632_51407713_51407831_51409968_51410094_51410199_51410330_51412037_51412343_51414557_51414740_51415828_51416002_51418342_51418534_51419212
tx.4043	chr12	+	2105	25	FSM	ENSMUSG00000020952.11	ENSMUST00000021335.7	2096	25	-8	-1	-8	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	358	junction_5	42.0133700610757	771	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTTATTCTTGTTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51424354	51496885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_51424420_51430887_51430959_51433832_51433922_51436064_51436156_51437088_51437212_51438965_51439054_51440603_51440694_51443462_51443519_51444475_51444562_51446781_51446882_51459286_51459427_51460877_51460969_51461632_51461707_51462297_51462380_51469689_51469787_51472820_51472892_51474647_51474728_51478270_51478334_51480013_51480090_51486065_51486120_51489313_51489367_51491766_51491801_51492453_51492520_51494354_51494424_51496689
tx.4044	chr12	-	432	2	Intergenic	novelGene_402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTATTCTTGACTTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51582186	51579874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_51580123_51582002
tx.4045	chr12	+	836	5	NNC	ENSMUSG00000020955.10	novel	757	6	NA	NA	-141	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	34.3974926411795	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTGACGTTTGAGTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51737674	51785716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_51737765_51763724_51763934_51767418_51767506_51769762_51769832_51785335
tx.4046	chr12	+	787	5	NIC	ENSMUSG00000020955.10	novel	1035	6	NA	NA	237	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	28.6749019178793	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTGACGTTTGAGTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51738056	51785716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_51738098_51763724_51763934_51767418_51767506_51769762_51769832_51785335
tx.4047	chr12	+	748	4	NIC	ENSMUSG00000020955.10	novel	1035	6	NA	NA	25902	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	32.4995726467629	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGTGACGTTTGAGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51763721	51785715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_51763934_51767418_51767506_51769762_51769832_51785335
tx.4048	chr12	+	619	2	ISM	ENSMUSG00000020955.10	ENSMUST00000021338.10	1035	6	39624	0	39624	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATGTGACGTTTGAGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51777443	51785715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_51777683_51785335
tx.4049	chr12	-	1658	10	ISM	ENSMUSG00000035247.17	ENSMUST00000042052.9	8988	43	192	54243	-26	-17958	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_5	8.71496513383448	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GATACAAACAAAGATGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51876127	51844747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_51844795_51845436_51845552_51847497_51847597_51847678_51847756_51848946_51849218_51849317_51849600_51850451_51850680_51853144_51853380_51874134_51874297_51875985
tx.405	chr1	+	1227	9	FSM	ENSMUSG00000026197.13	ENSMUST00000027394.12	1316	9	88	1	-35	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_8	17.9304210770411	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTATGAGTGCTGTTTCT	2129	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75145386	75148268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_75145551_75145828_75145924_75146143_75146276_75146408_75146561_75147010_75147104_75147182_75147244_75147329_75147398_75147619_75147693_75147879
tx.4050	chr12	-	1958	11	ISM	ENSMUSG00000035181.7	ENSMUST00000218254.2	4111	13	-14	9264	10	-3110	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	15	junction_10	12.1363091588835	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGCTGTTAGTGTGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52018094	51992145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_51992316_51994537_51994789_51996714_51996871_51997711_51997968_51999269_51999428_52002162_52002338_52002903_52003054_52003861_52003971_52005635_52005848_52008215_52008428_52017985
tx.4051	chr12	-	1171	3	FSM	ENSMUSG00000020956.15	ENSMUST00000021339.8	2564	3	0	1393	0	-1393	multi-exon	FALSE	canonical	3	170	junction_1	5	1334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCAGTTTTTCTTAAAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52053284	52045682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_52046657_52051661_52051732_52053157
tx.4052	chr12	+	1192	11	FSM	ENSMUSG00000035142.19	ENSMUST00000040090.16	2987	11	9	1786	9	-1786	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_4	16.265300489078	1173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTGCTCTATGATGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52144528	52357741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_52144675_52145135_52145284_52147249_52147285_52190751_52190843_52227874_52227915_52227999_52228091_52317821_52317916_52333120_52333207_52349463_52349585_52352580_52352664_52357484
tx.4053	chr12	+	1195	11	NNC	ENSMUSG00000035142.19	novel	2987	11	NA	NA	-9	-1786	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	73.9422071620803	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCTGCTCTATGATGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52144529	52357741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_52144679_52145135_52145284_52147249_52147285_52190751_52190843_52227874_52227915_52227999_52228091_52317821_52317916_52333120_52333207_52349463_52349585_52352580_52352664_52357484
tx.4054	chr12	+	1214	2	NNC	ENSMUSG00000035133.10	novel	9323	7	NA	NA	-12	-28392	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	119	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAGAGAAGAATATATAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52550786	52564030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_52550832_52562861
tx.4055	chr12	-	951	2	Intergenic	novelGene_403	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTATTGTGTGTGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54222052	54216982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_54217723_54221841
tx.4056	chr12	-	1164	3	Intergenic	novelGene_404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTATTGTGTGTGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54222780	54216982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_54217723_54221841_54221969_54222483
tx.4057	chr12	-	1996	5	FSM	ENSMUSG00000035105.6	ENSMUST00000039516.4	2662	5	9	657	9	-657	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_3	5.24404424085076	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCTCTGCCAGCCTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54250637	54226423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_54227442_54228416_54228491_54230665_54230803_54232326_54232447_54249990
tx.4058	chr12	-	1028	2	FSM	ENSMUSG00000112705.2	ENSMUST00000217997.2	384	2	-88	-556	-88	556	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGGAACTCTTCCTGTCT	5441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54363889	54362393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_54363234_54363701
tx.4059	chr12	-	1331	2	FSM	ENSMUSG00000044408.8	ENSMUST00000056228.8	1346	2	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	293	junction_1	0	2083	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTCTCTTTTATGGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54703343	54692176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_54693321_54703156
tx.406	chr1	-	549	4	ISM	ENSMUSG00000026198.16	ENSMUST00000160081.8	3772	16	7620	-3	203	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	155	junction_1	13.9283882771841	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGCTGTGGTTTGGTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75149310	75148359	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_75148633_75148757_75148827_75148909_75149005_75149198
tx.4060	chr12	-	1042	6	FSM	ENSMUSG00000054302.16	ENSMUST00000161592.8	4186	6	17	3127	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	353	junction_3	29.9973332148043	1006	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAAAAGGAGTGGTTATCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54742649	54720251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_54720636_54725294_54725409_54732644_54732757_54738784_54738881_54739559_54739742_54742495
tx.4061	chr12	-	430	3	ISM	ENSMUSG00000054302.16	ENSMUST00000160085.2	676	4	0	1889	0	-1889	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	393	junction_1	26	166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGTAGCATTTAGCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54742647	54738784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_54738881_54739559_54739742_54742495
tx.4062	chr12	-	1878	13	ISM	ENSMUSG00000005656.10	ENSMUST00000005798.9	1928	14	201	-5	-18	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	824	junction_2	114.005725977056	470	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAAGGTCTTTTCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54842287	54793128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_54793845_54798566_54798653_54798725_54798886_54801074_54801162_54803820_54803861_54807183_54807260_54810404_54810511_54812368_54812465_54814803_54814928_54817503_54817626_54830187_54830299_54830799_54830905_54842238
tx.4063	chr12	-	1909	14	FSM	ENSMUSG00000005656.10	ENSMUST00000005798.9	1928	14	24	-5	8	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	824	junction_2	126.191832929968	990	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAAGGTCTTTTCTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54842464	54793128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_54793845_54798566_54798653_54798725_54798886_54801074_54801162_54803820_54803861_54807183_54807260_54810404_54810511_54812368_54812465_54814803_54814928_54817503_54817626_54830187_54830299_54830799_54830905_54842238_54842287_54842432
tx.4064	chr12	-	1023	9	ISM	ENSMUSG00000005656.10	ENSMUST00000005798.9	1928	14	201	10493	-18	33	internal_fragment	FALSE	canonical	3	983	junction_3	75.7156481514885	218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGTGGTGACATGTCAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54842287	54803626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_54803861_54807183_54807260_54810404_54810511_54812368_54812465_54814803_54814928_54817503_54817626_54830187_54830299_54830799_54830905_54842238
tx.4065	chr12	-	1052	10	ISM	ENSMUSG00000005656.10	ENSMUST00000005798.9	1928	14	24	10495	8	31	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	826	junction_9	114.99565209172	437	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTGTGGTGACATGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54842464	54803628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_54803861_54807183_54807260_54810404_54810511_54812368_54812465_54814803_54814928_54817503_54817626_54830187_54830299_54830799_54830905_54842238_54842287_54842432
tx.4066	chr12	-	1318	4	FSM	ENSMUSG00000062929.9	ENSMUST00000223450.2	2726	4	-77	1485	2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	134.037308239162	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGTTGCCTTGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54909660	54907078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_54908023_54908121_54908199_54908453_54908619_54909528
tx.4067	chr12	-	1454	4	FSM	ENSMUSG00000062929.9	ENSMUST00000078124.8	2940	4	9	1477	9	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_2	55.9603033904888	1101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGTTGCCTTGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54909653	54907078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_54908023_54908121_54908199_54908310_54908619_54909528
tx.4068	chr12	-	1198	4	FSM	ENSMUSG00000062929.9	ENSMUST00000221374.2	1128	4	-68	-2	11	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_2	123.758725842755	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGTTGCCTTGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54909651	54907078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_54908023_54908121_54908199_54908564_54908619_54909528
tx.4069	chr12	-	670	2	NIC	ENSMUSG00000062929.9	novel	2940	4	NA	NA	-7	-255	intron_retention	FALSE	canonical	3	292	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATTTTTTTTTTTACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54909669	54908089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_54908619_54909528
tx.4070	chr12	-	549	3	ISM	ENSMUSG00000062929.9	ENSMUST00000078124.8	2940	4	1	2489	1	-256	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	200	junction_1	46	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAATTTTTTTTTTTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54909661	54908090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_54908199_54908310_54908619_54909528
tx.4071	chr12	+	557	2	FSM	ENSMUSG00000113209.2	ENSMUST00000220682.2	507	2	-40	-10	-40	7	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGACACATTTGATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54909735	54910459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_54909895_54910061
tx.4072	chr12	-	2269	7	ISM	ENSMUSG00000035021.14	ENSMUST00000173433.8	5788	27	77358	0	-13995	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	33	junction_1	5.43650214343336	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCTGAATTCTGAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54955934	54940335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_54941287_54941742_54941831_54942814_54942958_54945122_54945584_54946784_54947012_54947095_54947344_54955783
tx.4073	chr12	-	1158	8	ISM	ENSMUSG00000035021.14	ENSMUST00000173433.8	5788	27	698	41190	127	5618	internal_fragment	TRUE	canonical	3	24	junction_3	5.82745087267747	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGTATTCAGTATATTAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55032594	54981525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_54981692_54982266_54982367_54988286_54988422_54990761_54990850_54993586_54993689_55001482_55001627_55021888_55022168_55032450
tx.4074	chr12	-	1123	8	FSM	ENSMUSG00000062198.6	ENSMUST00000021406.6	1105	8	-25	7	-25	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_4	27.3898536256157	481	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATGTTTTGTTTGCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55126920	55092452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_55092729_55095671_55095763_55100085_55100193_55104026_55104138_55106241_55106364_55107839_55107979_55109772_55109895_55126765
tx.4075	chr12	-	1097	8	Fusion	ENSMUSG00000062198.6_ENSMUSG00000112022.3	novel	1105	8	NA	NA	-61	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_4	24.4423520027957	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCTGAAATGTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55201742	55092459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr12_-_55092729_55095671_55095763_55100085_55100193_55104026_55104138_55106241_55106364_55107839_55107979_55109772_55109895_55201606
tx.4076	chr12	-	1711	5	Fusion	ENSMUSG00000062198.6_ENSMUSG00000112022.3	novel	798	6	NA	NA	-78	-2506	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	66.4417037710503	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGTAGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55201759	55103044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr12_-_55104138_55106159_55106364_55107839_55107979_55109772_55109895_55201606
tx.4077	chr12	+	2159	16	FSM	ENSMUSG00000073079.7	ENSMUST00000220578.2	4498	16	252	2087	-12	389	multi-exon	FALSE	canonical	3	524	junction_1	133.408578767967	502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCGTTAACTTTCTTTA	2828	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55127298	55160065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_55127522_55135954_55136065_55136920_55137013_55138033_55138119_55142599_55142705_55143893_55143961_55144040_55144099_55146697_55146849_55148124_55148274_55148607_55148709_55149252_55149340_55151975_55152050_55152401_55152511_55155286_55155458_55157870_55157967_55159584
tx.4078	chr12	+	673	3	ISM	ENSMUSG00000112449.2	ENSMUST00000110708.4	3646	16	28533	1233	3447	-1233	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	830	junction_1	69.5	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCGTTAACTTTCTTTA	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	55230421	55235125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_55230518_55232930_55233027_55234644
tx.4079	chr12	+	1345	4	NIC	ENSMUSG00000095595.3	novel	3922	5	NA	NA	0	-2510	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	52.085399958999	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGTGGATTTCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55171253	55186379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_55171508_55177400_55177575_55183902_55184001_55185560
tx.4080	chr12	+	1402	5	FSM	ENSMUSG00000094103.3	ENSMUST00000177978.3	3863	5	-49	2510	-49	-2510	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_4	12.794041581924	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGTGGATTTCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55246327	55261443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_55246572_55252464_55252639_55257516_55257584_55258966_55259065_55260624
tx.4081	chr12	+	1237	3	NIC	ENSMUSG00000095595.3	novel	3922	5	NA	NA	10	-2510	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	4	junction_2	60	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGTGGATTTCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55171263	55186379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_55171508_55177400_55177575_55185560
tx.4082	chr12	+	2159	16	FSM	ENSMUSG00000112449.2	ENSMUST00000110708.4	3646	16	254	1233	-12	-1233	multi-exon	FALSE	canonical	3	704	junction_7	105.372650889856	626	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCGTTAACTTTCTTTA	2608	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55202142	55235125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_55202366_55211014_55211125_55211980_55212073_55213093_55213179_55217659_55217765_55218953_55219021_55219100_55219159_55221757_55221909_55223184_55223334_55223667_55223769_55224312_55224400_55227035_55227110_55227461_55227571_55230346_55230518_55232930_55233027_55234644
tx.4083	chr12	+	671	3	ISM	ENSMUSG00000112449.2	ENSMUST00000110708.4	3646	16	28535	1233	3449	-1233	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	830	junction_1	69.5	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCGTTAACTTTCTTTA	6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	55230423	55235125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_55230518_55232930_55233027_55234644
tx.4084	chr12	+	1401	5	NNC	ENSMUSG00000095595.3	novel	3922	5	NA	NA	5	-2510	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	49.4033146661234	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGTGGATTTCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55171258	55186379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_55171508_55177400_55177575_55182452_55182520_55183902_55184001_55185566
tx.4085	chr12	+	1398	5	FSM	ENSMUSG00000094103.3	ENSMUST00000177978.3	3863	5	-45	2510	-45	-2510	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_4	12.794041581924	179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACTGTGGATTTCCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55246331	55261443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_55246572_55252464_55252639_55257516_55257584_55258966_55259065_55260624
tx.4086	chr12	+	1080	4	ISM	ENSMUSG00000112449.2	ENSMUST00000110708.4	3646	16	252	22612	-14	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	808	junction_1	80.4335474510204	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTCTGTGTGTCTGTGTC	2606	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55202140	55213746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_55202366_55211014_55211125_55211980_55212073_55213093
tx.4087	chr12	+	2164	16	FSM	ENSMUSG00000079108.7	ENSMUST00000218879.2	3642	16	249	1229	249	-413	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_11	270.209005524736	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCGTTAACTTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55277201	55309392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_55277430_55286078_55286189_55287044_55287137_55288157_55288243_55292723_55292829_55294017_55294085_55294164_55294223_55296788_55296940_55298428_55298578_55298911_55299013_55299556_55299644_55302323_55302398_55302752_55302862_55304209_55304381_55307187_55307284_55308911
tx.4088	chr12	+	668	3	ISM	ENSMUSG00000079108.7	ENSMUST00000164243.2	2317	15	18179	413	18179	-413	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	713	junction_1	139	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTTCGTTAACTTTCTTTA	1027	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55304289	55309392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_55304381_55307187_55307284_55308911
tx.4089	chr12	-	1516	13	ISM	ENSMUSG00000021022.10	ENSMUST00000021410.10	4216	14	306	2513	-30	-2513	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	216	junction_9	34.6025047262959	444	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAATATCTTGCTTACTAG	NA	False	NA	-100	True	NA	NA	NA	55349477	55328288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_55328591_55329698_55329759_55331561_55331700_55334705_55334843_55335223_55335300_55335375_55335432_55336444_55336578_55339288_55339360_55340566_55340665_55344562_55344676_55345195_55345301_55345678_55345807_55349378
tx.4090	chr12	+	552	3	ISM	ENSMUSG00000021023.15	ENSMUST00000183654.2	943	7	73859	19	73859	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	389	junction_1	18	2437	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCAGTTTAGTTGGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55423929	55429279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_55424048_55426066_55426263_55429041
tx.4091	chr12	-	1344	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021024.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTGACTTAGAAGCAAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55438336	55436510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_55437482_55437963
tx.4092	chr12	+	983	7	FSM	ENSMUSG00000021024.15	ENSMUST00000021412.9	1042	7	59	0	39	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2423	junction_5	124.008960249743	23378	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCGGTGCATCCTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55445618	55465239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_55445777_55454253_55454349_55454786_55454869_55456911_55457068_55458971_55459151_55461188_55461284_55465021
tx.4093	chr12	-	1111	6	FSM	ENSMUSG00000021025.9	ENSMUST00000021413.9	1578	6	48	419	48	-419	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_5	20.9914268214431	509	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAGAAAGGGTATACTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55539384	55536613	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_55536755_55537190_55537452_55537555_55537645_55537904_55538116_55538454_55538564_55539084
tx.4094	chr12	+	1104	3	Intergenic	novelGene_406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55554423	55604698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_55554722_55564425_55564527_55603993
tx.4095	chr12	+	2574	10	FSM	ENSMUSG00000012076.9	ENSMUST00000059250.8	2609	10	35	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_3	20.0277585143997	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTAGTGTTGTGTGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55883143	55916521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_55883431_55888355_55888447_55891180_55891309_55892068_55892149_55906875_55906973_55907872_55907957_55908174_55908240_55909918_55909959_55912735_55912863_55914946
tx.4096	chr12	+	728	3	NIC	ENSMUSG00000012076.9	novel	481	2	NA	NA	8	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAAGAACCCAGTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55883162	55886520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_55883431_55885626_55885844_55886277
tx.4097	chr12	-	1473	9	NNC	ENSMUSG00000021028.9	novel	1512	9	NA	NA	23	-13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	94	junction_1	75.0598719356755	239	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTATAAACTTTTTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56392656	56375100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_56375582_56377013_56377053_56382582_56382681_56384087_56384241_56384548_56384615_56386985_56387083_56387169_56387389_56389020_56389141_56392456
tx.4098	chr12	-	1479	9	FSM	ENSMUSG00000021028.9	ENSMUST00000021416.9	1512	9	20	13	20	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_1	38.7193427113633	483	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTATAAACTTTTTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56392659	56375100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_56375585_56377013_56377053_56382582_56382681_56384087_56384241_56384548_56384615_56386985_56387083_56387169_56387389_56389020_56389141_56392456
tx.4099	chr12	-	1886	3	FSM	ENSMUSG00000021028.9	ENSMUST00000218321.2	724	3	-32	-1130	27	1130	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_1	16.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGAAAGAATAGAAAGAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56392652	56385818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_56387389_56389020_56389141_56392456
tx.41	chr1	-	555	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000057715.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_1	4.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTTAGCTCCGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11694876	11689685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_11689905_11690580_11690730_11694689
tx.4100	chr12	+	467	1	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000112626.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATGTACAATGTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56456672	56457139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_56456700_56457100
tx.4101	chr12	+	1169	5	FSM	ENSMUSG00000047022.19	ENSMUST00000148418.8	1168	5	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_4	7.69740215917033	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATTGTATGTATTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57277221	57372862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_57277398_57350130_57350338_57352796_57352924_57354144_57354251_57372309
tx.4102	chr12	+	2109	11	FSM	ENSMUSG00000047022.19	ENSMUST00000123498.8	2117	11	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_10	14.6659469520382	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGTTGGTATTTTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57277239	57543985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_57277398_57350130_57350338_57352796_57352924_57354144_57354251_57372309_57372440_57378781_57378816_57379074_57379246_57410912_57411021_57461101_57461197_57503738_57503970_57543243
tx.4103	chr12	+	2043	2	FSM	ENSMUSG00000079104.5	ENSMUST00000139049.2	1720	2	66	-389	66	389	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCTGTAAAGTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57277263	57287057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_57277398_57285148
tx.4104	chr12	-	3666	20	FSM	ENSMUSG00000020986.14	ENSMUST00000021375.12	4109	20	80	363	80	-363	multi-exon	FALSE	canonical	3	521	junction_10	53.3728846882441	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAAATAAGAGTGCTTTT	2758	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59058723	59005531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_59006873_59013765_59013832_59015598_59015755_59018025_59018113_59019666_59019829_59021367_59021446_59025247_59025402_59029353_59029461_59031917_59032008_59032876_59032958_59036135_59036260_59037758_59037875_59038910_59039070_59043921_59044067_59045044_59045125_59048604_59048842_59051275_59051363_59052044_59052103_59053775_59054022_59058631
tx.4105	chr12	+	691	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000020986.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59058548	59059571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_59058871_59059202
tx.4106	chr12	+	1076	10	NNC	ENSMUSG00000060121.16	novel	1588	10	NA	NA	29	96	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	247.647150419929	3313	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATGAGCAATTGGAACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59060207	59074769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_59060400_59060755_59060841_59063651_59063746_59063953_59064014_59064797_59064912_59067174_59067220_59068453_59068523_59071788_59071900_59073640_59073700_59074522
tx.4107	chr12	-	1212	6	FSM	ENSMUSG00000020993.10	ENSMUST00000021380.10	1255	6	5	38	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_5	16.4146276229466	1106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTTGAAAGTTTATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59108242	59089915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_59090463_59091038_59091133_59094908_59094993_59097053_59097172_59098426_59098495_59107941
tx.4108	chr12	+	2698	9	FSM	ENSMUSG00000020994.6	ENSMUST00000021381.6	3485	9	38	749	0	-749	multi-exon	FALSE	canonical	3	465	junction_8	34.8308412186671	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTGTCACAAGATACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59113707	59120035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_59113902_59114564_59114637_59115070_59115140_59115511_59115585_59115687_59115783_59115901_59115978_59116927_59117084_59117164_59117304_59118211
tx.4109	chr12	+	527	6	FSM	ENSMUSG00000020994.6	ENSMUST00000217773.2	2924	6	52	2345	10	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	539	junction_4	10.733126291999	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTATTGGTGCCTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59113759	59115977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_59113902_59114564_59114637_59115070_59115140_59115511_59115585_59115687_59115783_59115901
tx.411	chr1	+	1507	8	FSM	ENSMUSG00000026201.13	ENSMUST00000027401.11	2876	8	5	1364	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_4	30.7265756142723	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATTTTAGGTCAATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75187486	75190886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_75187697_75187883_75188059_75188568_75188789_75189243_75189378_75189529_75189651_75189776_75189873_75190219_75190342_75190457
tx.4110	chr12	+	203	2	Intergenic	novelGene_407	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGAATGGCGAAACCCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60753719	60850619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_60753813_60850509
tx.4111	chr12	-	2034	5	FSM	ENSMUSG00000020948.10	ENSMUST00000222508.2	6459	5	9	4416	9	-37	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	2.9474565306379	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAGACCTAAGCAATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65012299	64990022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_64990388_64996787_64996997_64998149_64998594_65003612_65004512_65012182
tx.4112	chr12	+	2838	14	FSM	ENSMUSG00000035597.20	ENSMUST00000120580.8	4069	14	1	1230	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_3	84.525476709793	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAATTGTTGATGAATTCAT	7508	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65083107	65108930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_65083243_65089234_65089582_65090005_65090132_65090779_65090899_65094886_65095055_65100059_65100226_65100744_65100853_65101929_65102095_65102411_65102539_65103024_65103294_65104502_65104688_65106644_65106720_65107924_65108040_65108197
tx.4113	chr12	-	954	7	FSM	ENSMUSG00000020949.10	ENSMUST00000021332.10	1022	7	60	8	15	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	9641	junction_1	417.22073161444	66897	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACTTATTTATTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65120721	65109205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_65109515_65110451_65110550_65112510_65112579_65113415_65113552_65115775_65115884_65116724_65116827_65120588
tx.4114	chr12	+	875	4	NNC	ENSMUSG00000055884.9	novel	1682	7	NA	NA	-1	-6654	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	44	junction_3	59.9462722406953	342	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGGATTAAAAAGCAAAAGGA	9279	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65122375	65134204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_65122952_65123815_65123989_65129805_65129884_65134156
tx.4115	chr12	-	3437	13	NIC	ENSMUSG00000047534.18	novel	4017	14	NA	NA	-22	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	78	junction_12	86.8969296862029	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTTTCTGGGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65219400	65179507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_65180400_65180577_65180633_65183523_65183624_65185418_65185571_65187506_65187665_65189996_65190167_65195495_65196325_65199461_65199605_65200579_65200668_65201492_65201624_65203765_65203840_65205168_65205636_65219222
tx.4116	chr12	-	3207	13	NNC	ENSMUSG00000047534.18	novel	4017	14	NA	NA	-22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_12	101.824467699184	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTTGTTTCTGGGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65219400	65179507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_65180400_65180577_65180633_65183523_65183624_65185418_65185571_65187506_65187665_65189996_65190167_65195495_65196325_65199461_65199605_65200579_65200668_65201492_65201624_65203765_65203840_65205168_65205406_65219222
tx.4117	chr12	-	977	6	FSM	ENSMUSG00000047534.18	ENSMUST00000221296.2	969	6	4	-12	3	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_5	123.279195325083	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATGCAGAAGATAAAGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65219369	65199534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_65199605_65200579_65200668_65201492_65201624_65203765_65203840_65205168_65205636_65219222
tx.4118	chr12	-	1597	7	ISM	ENSMUSG00000047534.18	ENSMUST00000052201.9	4017	14	-9	20027	9	12	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	216	junction_5	67.8298524905435	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GATGCAGAAGATAAAGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65219363	65199534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_65199605_65200579_65200668_65201492_65201624_65203765_65203840_65205168_65205636_65208176_65208803_65219222
tx.4119	chr12	-	742	6	NNC	ENSMUSG00000047534.18	novel	969	6	NA	NA	7	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_5	145.629117967527	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGATGCAGAAGATAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65219365	65199535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_65199605_65200579_65200668_65201492_65201624_65203765_65203840_65205168_65205406_65219222
tx.412	chr1	-	1417	3	ISM	ENSMUSG00000026202.14	ENSMUST00000079464.13	2083	4	1189	578	-1	62	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	248	junction_2	2.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTCCCCTTTGTAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75194079	75192193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_75193238_75193470_75193620_75193855
tx.4120	chr12	+	1998	2	FSM	ENSMUSG00000035560.6	ENSMUST00000046331.5	2228	2	231	-1	27	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGATGACCTCTTTGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65272521	65275229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_65274272_65274981
tx.4121	chr12	+	656	1	FSM	ENSMUSG00000113948.2	ENSMUST00000221295.2	556	1	-49	-51	-49	51	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67557480	67558136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_67557500_67558100
tx.4122	chr12	+	597	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000113948.2	novel	556	1	NA	NA	-37	50	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67557492	67558135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_67557586_67557631
tx.4123	chr12	+	5193	2	Intergenic	novelGene_408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68605012	68610273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_68605477_68605544
tx.4124	chr12	+	981	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000113600.2	novel	680	1	NA	NA	-2935	196	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACCAACTCCCATAAGTTC	7651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69166939	69170750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_69166981_69167192_69167219_69169836
tx.4125	chr12	-	374	2	ISM	ENSMUSG00000034892.9	ENSMUST00000037023.9	390	3	252	0	120	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25878	junction_1	0	541	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTGTGTGTGTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69205708	69204495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_69204596_69205434
tx.4126	chr12	-	337	3	FSM	ENSMUSG00000034892.9	ENSMUST00000037023.9	390	3	53	0	53	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25458	junction_2	210	44552	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTGTGTGTGTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69205907	69204495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_69204596_69205434_69205535_69205770
tx.4127	chr12	+	771	3	FSM	ENSMUSG00000034883.10	ENSMUST00000222520.2	767	3	0	-4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	59	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCAATGTCTCAGCAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69215594	69225783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_69215837_69218635_69218735_69225353
tx.4128	chr12	+	1495	4	FSM	ENSMUSG00000034883.10	ENSMUST00000110621.3	1500	4	7	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_3	15.6276108929747	355	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATGTCTCAGCAGTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69215594	69225785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_69215837_69218635_69218735_69221165_69221888_69225353
tx.4129	chr12	-	490	2	FSM	ENSMUSG00000049751.7	ENSMUST00000054544.7	526	2	39	-3	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5332	junction_1	0	143290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAGCCTTGTGTTTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69230818	69229511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_69229940_69230756
tx.413	chr1	-	1477	4	FSM	ENSMUSG00000026202.14	ENSMUST00000186213.7	2840	4	41	1322	-10	62	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_2	27.6526068692749	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTCCCCTTTGTAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75195897	75192193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_75193238_75193470_75193620_75193855_75194079_75195836
tx.4130	chr12	+	254	2	NNC	ENSMUSG00000113190.2	novel	523	2	NA	NA	3	-6400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	17	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGACATTCATTATCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69274702	69278658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_69274771_69278472
tx.4131	chr12	+	265	2	FSM	ENSMUSG00000051890.14	ENSMUST00000127791.2	228	2	-39	2	-39	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATCAGGTCCGAGTGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69288648	69289414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_69288788_69289288
tx.4132	chr12	+	1542	13	FSM	ENSMUSG00000020978.11	ENSMUST00000021362.5	1905	13	141	222	108	-222	multi-exon	TRUE	canonical	3	493	junction_10	56.6727937863977	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCTGTCTATTGTTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69343636	69357239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_69343922_69346989_69347070_69349097_69349216_69350307_69350424_69350654_69350737_69351317_69351402_69352401_69352483_69352556_69352616_69353963_69354074_69354391_69354465_69355731_69355820_69356760_69356814_69356926
tx.4133	chr12	+	1033	10	ISM	ENSMUSG00000020978.11	ENSMUST00000021362.5	1905	13	6838	222	1159	-222	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	493	junction_7	64.7902598989831	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACCTGTCTATTGTTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69350333	69357239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_69350424_69350654_69350737_69351317_69351402_69352401_69352483_69352556_69352616_69353963_69354074_69354391_69354465_69355731_69355820_69356760_69356814_69356926
tx.4134	chr12	-	1383	14	ISM	ENSMUSG00000020982.10	ENSMUST00000220674.2	2370	20	-22	16490	1	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	286	junction_8	27.062496156579	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGAACAAGCAGCTGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69403938	69387754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_69387851_69388046_69388256_69388346_69388425_69390902_69390966_69391453_69391530_69391682_69391754_69393089_69393164_69395624_69395712_69399080_69399149_69400567_69400717_69401420_69401547_69402803_69402907_69403052_69403122_69403824
tx.4135	chr12	-	1016	6	FSM	ENSMUSG00000049882.11	ENSMUST00000238784.2	875	6	82	-223	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_4	48.4710222710435	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGAAGCAGCATGGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69629802	69624401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_69624715_69626679_69626785_69627891_69628012_69629049_69629120_69629304_69629405_69629494
tx.4136	chr12	-	3129	8	NIC	ENSMUSG00000020988.10	novel	3340	10	NA	NA	0	-13	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	44	junction_4	181.049998731887	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTAATGTTTCTTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69771647	69737219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_69739271_69746259_69746392_69748057_69748216_69748976_69749145_69759395_69759528_69768085_69768238_69768851_69768968_69771427
tx.4137	chr12	-	3320	10	FSM	ENSMUSG00000020988.10	ENSMUST00000021370.10	3340	10	9	11	9	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	420	junction_5	64.6821287356699	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTAATGTTTCTTGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69771638	69737217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_69739271_69746259_69746392_69748057_69748216_69748976_69749145_69752538_69752574_69753897_69754061_69759395_69759528_69768085_69768238_69768851_69768968_69771427
tx.4138	chr12	-	3290	9	NNC	ENSMUSG00000020988.10	novel	3340	10	NA	NA	37	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	183.285595110472	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTAATGTTTCTTGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69771610	69737217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_69739271_69746259_69746392_69748057_69748216_69748976_69749145_69753864_69754061_69759395_69759528_69768085_69768238_69768851_69768968_69771427
tx.4139	chr12	-	615	3	ISM	ENSMUSG00000020988.10	ENSMUST00000021370.10	3340	10	9	30743	9	-8455	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	564	junction_2	31.5	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGATTTGTGATTTCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69771638	69767949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_69768238_69768851_69768968_69771427
tx.4140	chr12	+	1599	6	FSM	ENSMUSG00000054894.7	ENSMUST00000220916.2	1599	6	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	68.5787138987018	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGGCTAGTCTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69771723	69791434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_69771789_69772228_69772329_69784724_69784836_69787672_69787882_69788418_69788591_69790492
tx.4141	chr12	+	1496	5	FSM	ENSMUSG00000054894.7	ENSMUST00000021372.6	1485	5	-10	-1	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_1	45.2513811943901	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTGAAGGCTAGTCTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69771725	69791433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_69771789_69784724_69784836_69787672_69787882_69788418_69788591_69790492
tx.4142	chr12	+	1388	4	NIC	ENSMUSG00000054894.7	novel	1599	6	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_1	90.3487071788462	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGGCTAGTCTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69771723	69791434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_69771789_69787672_69787882_69788418_69788591_69790492
tx.4143	chr12	+	2012	5	NIC	ENSMUSG00000054894.7	novel	1599	6	NA	NA	6	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	110	junction_1	42.1270400099509	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGTGAAGGCTAGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69771747	69791431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_69772329_69784724_69784836_69787672_69787882_69788418_69788591_69790492
tx.4144	chr12	+	2339	8	FSM	ENSMUSG00000021072.13	ENSMUST00000021471.13	2795	8	40	416	40	-416	multi-exon	FALSE	canonical	3	450	junction_7	45.1044140108849	459	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGTTGAAGAGAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70499908	70514398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_70500095_70502785_70502902_70503354_70503401_70505552_70505682_70507118_70507165_70507252_70507355_70511173_70511241_70512751
tx.4145	chr12	+	532	4	ISM	ENSMUSG00000048285.10	ENSMUST00000057859.9	4662	14	-59	25019	-59	-18434	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_1	5.73488351136175	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAATGGAAAAAGGAGGCCAG	728	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70872228	70923989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_70872348_70910650_70910917_70919264_70919356_70923933
tx.4146	chr12	+	1470	13	FSM	ENSMUSG00000021076.7	ENSMUST00000021479.6	4022	13	37	2515	-21	142	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_4	23.8006769278149	1970	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTCTCTTGTGTCGTAT	9682	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70984667	71008977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_70984806_70987571_70987645_70989032_70989116_70990182_70990292_70994225_70994334_70996477_70996546_70999723_70999804_71001392_71001429_71003046_71003127_71003373_71003448_71004805_71004888_71006614_71006817_71008640
tx.4147	chr12	+	946	11	FSM	ENSMUSG00000060073.10	ENSMUST00000160027.8	2846	11	60	1840	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3391	junction_8	417.753084967664	31679	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTGGGTAATTGAAGCTAT	4780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71021454	71041281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_71021542_71025506_71025590_71030092_71030217_71031266_71031369_71031445_71031520_71033636_71033710_71035197_71035264_71037258_71037306_71039786_71039855_71040279_71040345_71041124
tx.4148	chr12	+	440	2	FSM	ENSMUSG00000060073.10	ENSMUST00000161041.2	1022	2	-27	609	-2	-609	multi-exon	FALSE	canonical	3	4712	junction_1	0	430	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTTGGTGGTGATAGCT	4780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71021454	71025859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_71021542_71025506
tx.4149	chr12	-	920	3	FSM	ENSMUSG00000085622.10	ENSMUST00000136690.3	1063	3	232	-89	-4	89	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	2	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAAGCTTGTTTTCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71062374	71056479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_71057254_71061229_71061282_71062280
tx.4150	chr12	-	998	3	NNC	ENSMUSG00000085622.10	novel	1063	3	NA	NA	1	84	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	7	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTAAAGCTTGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71062368	71056484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_71057254_71061229_71061282_71062191
tx.4151	chr12	-	809	2	ISM	ENSMUSG00000085622.10	ENSMUST00000136690.3	1063	3	235	3995	-1	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAGAAAGAAAGAAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71062371	71060563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_71061282_71062280
tx.4152	chr12	+	339	2	ISM	ENSMUSG00000048118.18	ENSMUST00000125125.2	1320	10	20238	9974	-11395	-9974	internal_fragment	FALSE	canonical	3	99	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGTGCTCACACTTGGTT	8741	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71083719	71084139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_71083964_71084044
tx.4153	chr12	+	174	2	Intergenic	novelGene_409	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTTAAAAAATTTAAAAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71093465	71123097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_71093477_71122934
tx.4154	chr12	+	643	5	FSM	ENSMUSG00000021078.6	ENSMUST00000021482.6	578	5	-64	-1	-47	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.433012701892219	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGATTGGACACATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71158154	71169996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_71158355_71158479_71158524_71164299_71164382_71168637_71168781_71169822
tx.4155	chr12	+	567	4	FSM	ENSMUSG00000021078.6	ENSMUST00000221962.2	584	4	110	-93	110	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACATGATTGGACACATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71158353	71169994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_71158524_71164299_71164382_71168637_71168781_71169822
tx.4156	chr12	-	881	5	FSM	ENSMUSG00000021079.17	ENSMUST00000221559.2	718	5	-39	-124	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_4	64.161417534216	2240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTTGTCTTTACTGTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71183447	71169945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_71170461_71172235_71172332_71173106_71173172_71178774_71178861_71183328
tx.4157	chr12	-	796	4	FSM	ENSMUSG00000021079.17	ENSMUST00000021486.10	794	4	-1	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_3	97.112763779479	672	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTTGTCTTTACTGTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71183448	71169945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_71170461_71172235_71172332_71173106_71173172_71183328
tx.4158	chr12	-	567	2	NNC	ENSMUSG00000113572.2	novel	1078	2	NA	NA	767	73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTGTTAGGCTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71316364	71315444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_71315914_71316266
tx.4159	chr12	+	358	2	Intergenic	novelGene_410	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGTCTGTGTCAGGTAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71408679	71409200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_71408848_71409010
tx.4160	chr12	+	572	3	ISM	ENSMUSG00000113630.2	ENSMUST00000222756.2	1271	6	34304	22121	-18018	-22121	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTAGCATTTTCATCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71569362	71580786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_71569516_71576492_71576593_71580467
tx.4161	chr12	-	593	2	Intergenic	novelGene_411	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGTAGAAATAGCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72100225	72098951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_72099396_72100076
tx.4162	chr12	-	1744	5	FSM	ENSMUSG00000019718.9	ENSMUST00000019862.3	1831	5	29	58	29	-58	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_4	3.20156211871642	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATAGAGGTGGGTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72132184	72120259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_72120811_72123917_72124056_72124137_72124261_72126260_72126431_72131422
tx.4163	chr12	+	1242	7	FSM	ENSMUSG00000005078.17	ENSMUST00000057257.10	1292	7	44	6	44	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	493	junction_1	87.1563091360701	2802	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATCCCGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72132674	72147629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_72132958_72136088_72136181_72136729_72136885_72140710_72140918_72141459_72141642_72146820_72146898_72147383
tx.4164	chr12	+	1222	7	FSM	ENSMUSG00000005078.17	ENSMUST00000117449.8	1874	7	46	606	46	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_1	199.890525593942	678	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAATCCCGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72132676	72147629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_72132958_72136106_72136181_72136729_72136885_72140710_72140918_72141459_72141642_72146820_72146898_72147383
tx.4165	chr12	+	2829	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00002076562.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.24721912892465	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTCTTGGTCTCCTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72162684	72177194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_72163072_72163449_72163497_72168656_72168754_72174896
tx.4166	chr12	-	1520	7	FSM	ENSMUSG00000021087.19	ENSMUST00000021497.16	1544	7	23	1	-15	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_2	4.27200187265877	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGACATTTCTCTCTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72283475	72258527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_72259352_72263544_72263604_72263688_72263736_72264192_72264263_72266030_72266170_72270105_72270314_72283302
tx.4167	chr12	+	1276	9	ISM	ENSMUSG00000021090.17	ENSMUST00000161957.2	2520	16	109	14130	109	5314	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_7	3.31426839589071	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCCGAGAGTTGAGCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72489131	72506854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_72489245_72496093_72496175_72496421_72496641_72497450_72497592_72497998_72498063_72498736_72498808_72500818_72501002_72502756_72502913_72506606
tx.4168	chr12	+	1024	2	ISM	ENSMUSG00000034501.8	ENSMUST00000044352.8	4300	11	-10	37888	-10	-37888	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	0	547	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTGGGAGAGTTAGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72583146	72589005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_72583314_72588148
tx.4169	chr12	-	400	3	NNC	ENSMUSG00000109482.3	novel	873	6	NA	NA	15010	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_2	1	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGAGTAAGTAGTAGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72640856	72622778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_72622893_72624511_72624657_72640715
tx.417	chr1	-	1690	14	FSM	ENSMUSG00000026209.16	ENSMUST00000187836.7	1862	14	172	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	848	junction_13	52.2384156632446	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTCTGTGCTTTTTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75293621	75285208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_75285354_75285942_75286111_75288435_75288538_75288635_75288676_75289048_75289210_75290069_75290154_75291007_75291086_75291773_75291882_75291988_75292065_75292262_75292394_75292588_75292715_75292973_75293088_75293184_75293274_75293353
tx.4170	chr12	-	1276	7	FSM	ENSMUSG00000021094.11	ENSMUST00000021512.11	1385	7	107	2	4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_1	5.61990510002912	348	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTAAGACTGCAGACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72711576	72697128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_72697392_72699008_72699225_72699874_72699998_72703073_72703314_72704101_72704209_72706117_72706271_72711402
tx.4171	chr12	+	1440	5	ISM	ENSMUSG00000021096.12	ENSMUST00000021514.10	7668	6	23024	5255	532	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	299	junction_2	42.9498253779919	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAATCATGTATGCGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72831008	72841338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_72831311_72833445_72833564_72837406_72837516_72839551_72839610_72840485
tx.4172	chr12	+	1041	2	ISM	ENSMUSG00000021096.12	ENSMUST00000222896.2	1103	3	532	6452	532	-1990	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	418	junction_1	0	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGCAATGCATTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72831008	72834184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_72831311_72833445
tx.4173	chr12	-	1923	5	NNC	ENSMUSG00000021098.15	novel	640	5	NA	NA	-33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_4	10.917302780449	38	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTATGGGTATTTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72964713	72958432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_72960049_72962129_72962257_72963447_72963505_72963596_72963654_72964647
tx.4174	chr12	-	600	5	ISM	ENSMUSG00000021098.15	ENSMUST00000131033.8	1939	8	-63	6817	-14	136	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_4	10.280442597476	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGCCTATTATAAATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72964694	72959824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_72960049_72962129_72962257_72963447_72963505_72963596_72963654_72964559
tx.4175	chr12	-	563	4	NIC	ENSMUSG00000021098.15	novel	1939	8	NA	NA	-27	213	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	10	junction_3	11.7756811551038	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTGTAGCAGAATCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72964707	72959747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_72960049_72963447_72963505_72963596_72963654_72964559
tx.4176	chr12	-	503	4	NIC	ENSMUSG00000021098.15	novel	2051	18	NA	NA	-15	136	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_1	9.42809041582063	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGCCTATTATAAATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72964646	72959824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_72960049_72963447_72963505_72963596_72963654_72964481
tx.4177	chr12	-	675	5	ISM	ENSMUSG00000021098.15	ENSMUST00000044000.12	2051	18	21	31910	21	168	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	8.16624148553054	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCTTAGATATTTTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72964659	72959792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_72960049_72962129_72962257_72963447_72963505_72963596_72963654_72964481
tx.4178	chr12	-	2718	2	FSM	ENSMUSG00000051367.9	ENSMUST00000050029.8	3316	2	467	131	467	-131	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGTTGGCTTGCTCATGCTT	9062	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73093486	73088731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_73090604_73092640
tx.4179	chr12	-	1062	4	NIC	ENSMUSG00000034442.12	novel	2066	5	NA	NA	-30	87	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	20	junction_1	38.0029238641216	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATATTGTATAGACTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73333514	73327167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_73327407_73329385_73329511_73331408_73332050_73333457
tx.418	chr1	-	1632	15	FSM	ENSMUSG00000026209.16	ENSMUST00000113605.10	1571	15	-61	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	252	junction_14	185.094639334056	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTCTGTGCTTTTTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75293650	75285208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_75285354_75285942_75286111_75288435_75288538_75288635_75288676_75289048_75289210_75290069_75290154_75291007_75291086_75291773_75291882_75291988_75292065_75292262_75292394_75292588_75292715_75292973_75293088_75293184_75293274_75293353_75293448_75293534
tx.4180	chr12	-	1137	2	ISM	ENSMUSG00000034442.12	ENSMUST00000116420.4	2066	5	5184	6	1146	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGATTTTGTAATTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73328299	73326790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_73327407_73327778
tx.4181	chr12	-	1713	5	FSM	ENSMUSG00000034442.12	ENSMUST00000116420.4	2066	5	-30	383	-29	87	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_2	19.266226926931	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATATTGTATAGACTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73333513	73327167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_73327407_73327778_73328431_73329385_73329511_73331408_73332050_73333457
tx.4182	chr12	+	1875	16	FSM	ENSMUSG00000044712.16	ENSMUST00000140523.8	3032	16	63	1094	-15	1090	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_10	3.76769897358528	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGCCAATGGCTGGACAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73333615	73399729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_73333807_73335166_73335298_73338933_73339008_73356918_73356972_73365750_73365791_73376753_73376833_73383795_73383879_73384283_73384343_73388181_73388248_73388480_73388535_73390442_73390523_73391566_73391668_73397287_73397413_73398524_73398670_73398852_73398948_73399230
tx.4183	chr12	+	615	4	ISM	ENSMUSG00000044712.16	ENSMUST00000126488.8	589	5	65	25086	-2	-18252	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_3	3.09120616516523	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATGTTTTTGTTTTGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73333628	73340704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_73333807_73335166_73335298_73338933_73339008_73340472
tx.4184	chr12	-	460	2	NNC	ENSMUSG00000087700.3	novel	818	3	NA	NA	22794	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTGAGTGGAAACTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73893592	73889812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_73890147_73893466
tx.4185	chr12	-	685	2	NNC	ENSMUSG00000087700.3	novel	818	3	NA	NA	-23	10637	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAACTTCAACATTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73996611	73962617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_73963089_73996397
tx.4186	chr12	-	528	2	NNC	ENSMUSG00000087700.3	novel	1451	7	NA	NA	-39	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCTGTTTACTGTATAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73996627	73973249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_73973548_73996397
tx.4187	chr12	-	645	2	NIC	ENSMUSG00000087700.3	novel	1451	7	NA	NA	-33	147	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCAAGCTTTTATTTAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73996621	73973107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_73973529_73996397
tx.4188	chr12	+	1677	4	ISM	ENSMUSG00000021109.14	ENSMUST00000021530.8	4724	15	34382	638	4616	-638	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	468	junction_2	17.8200885394982	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCTGGGTCAGCGCTTACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73989059	73993666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_73989160_73990852_73990962_73991684_73991812_73992325
tx.4189	chr12	+	1002	4	ISM	ENSMUSG00000021113.6	ENSMUST00000021532.6	6275	10	-29	18989	16	1978	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_3	14.8174071805952	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAAAAGAAAAAGATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74011270	74016751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_74011521_74014681_74014842_74015012_74015154_74016300
tx.419	chr1	-	1680	15	FSM	ENSMUSG00000026209.16	ENSMUST00000066668.14	2488	15	139	669	-51	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	522	junction_14	119.683362013511	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTCTGTGCTTTTTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75294142	75285208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_75285354_75285942_75286111_75288435_75288538_75288635_75288676_75289048_75289210_75290069_75290154_75291007_75291086_75291773_75291882_75291988_75292065_75292262_75292394_75292588_75292715_75292973_75293088_75293184_75293274_75293353_75293448_75293978
tx.4190	chr12	+	1729	10	FSM	ENSMUSG00000021113.6	ENSMUST00000021532.6	6275	10	-29	4575	16	284	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_3	11.7473401244707	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTCTAGTGTGTGAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74011270	74031165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_74011521_74014681_74014842_74015012_74015154_74016300_74016406_74016954_74017114_74018658_74018728_74019310_74019374_74021784_74021936_74029251_74029354_74030636
tx.4191	chr12	-	427	3	NNC	ENSMUSG00000113031.2	novel	636	3	NA	NA	63	233	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCAGGCAGTCCAGTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74363873	74360741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_74360904_74362065_74362187_74363729
tx.4192	chr12	-	433	3	NNC	ENSMUSG00000113031.2	novel	636	3	NA	NA	60	233	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10	105	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCAGGCAGTCCAGTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74363876	74360741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_74360907_74362065_74362187_74363729
tx.4193	chr12	-	2222	2	FSM	ENSMUSG00000045690.9	ENSMUST00000062370.9	2979	2	-1	758	-1	43	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCGCACGCGTGAGGTCTG	6409	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75716312	75678127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_75680283_75716245
tx.4194	chr12	+	3183	28	FSM	ENSMUSG00000021048.8	ENSMUST00000021443.7	3241	28	58	0	-57	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	837	junction_20	135.484134190258	316	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTGGTGTTGAAACATAAA	7969	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76302129	76366577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_76302319_76317191_76317277_76326177_76326238_76326930_76326985_76327153_76327291_76327402_76327504_76329661_76329799_76330705_76330818_76335654_76335783_76336204_76336303_76336458_76336633_76337754_76337892_76340164_76340212_76340913_76341022_76341128_76341204_76344255_76344359_76347161_76347239_76348031_76348173_76349732_76349802_76350407_76350520_76350615_76350756_76353995_76354038_76357682_76357784_76358579_76358758_76361174_76361283_76361722_76361876_76364380_76364475_76366354
tx.4195	chr12	+	2535	22	ISM	ENSMUSG00000021048.8	ENSMUST00000220046.2	3040	27	27497	-1	-10155	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	837	junction_14	149.554940647606	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTTGGTGTTGAAACATAAA	405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76329683	76366577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_76329799_76330705_76330818_76335654_76335783_76336204_76336303_76336458_76336633_76337754_76337892_76340164_76340212_76340913_76341022_76341128_76341204_76344255_76344359_76347161_76347239_76348031_76348173_76349732_76349802_76350407_76350520_76350615_76350756_76353995_76354038_76357682_76357784_76358579_76358758_76361174_76361283_76361722_76361876_76364380_76364475_76366354
tx.4196	chr12	-	1632	3	FSM	ENSMUSG00000056459.15	ENSMUST00000176278.8	1672	3	84	-44	-54	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_2	3	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTAATGTAGAAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76416292	76395674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_76397048_76402662_76402843_76416213
tx.4197	chr12	-	1640	3	FSM	ENSMUSG00000056459.15	ENSMUST00000176187.8	488	3	-27	-1125	-27	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	42	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAGTTAATGTAGAAACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76416194	76395674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_76397048_76402662_76402843_76416107
tx.4198	chr12	-	1547	3	NIC	ENSMUSG00000056459.15	novel	1672	3	NA	NA	-24	18	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_1	31	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGAGTGAGTGATTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76416262	76395655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_76396974_76402662_76402843_76416213
tx.4199	chr12	+	1452	11	FSM	ENSMUSG00000052221.9	ENSMUST00000063977.9	1515	11	65	-2	-18	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_4	1.57797338380595	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCCTACTCGTACAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76464376	76486268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_76464491_76465701_76465767_76473522_76473610_76474658_76474757_76474853_76474921_76475608_76475708_76482916_76483052_76484369_76484413_76484729_76484909_76485138_76485328_76485892
tx.42	chr1	-	1046	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000057715.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATTGCCTTAGCTCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11691412	11689690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_11689905_11690580
tx.4200	chr12	+	1723	2	FSM	ENSMUSG00000073000.4	ENSMUST00000219367.2	855	2	5	-873	5	873	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAGTACACTGTAGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76491275	76496307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_76491440_76494748
tx.4201	chr12	+	1149	3	ISM	ENSMUSG00000073000.4	ENSMUST00000101281.3	1598	4	-58	820	5	1	intron_retention	FALSE	canonical	2	4	junction_2	20	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTGCCTCAGTCGTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76491275	76497290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_76491440_76494748_76494928_76496484
tx.4202	chr12	-	378	2	NIC	ENSMUSG00000021061.16	novel	8084	32	NA	NA	-25176	-12416	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGGAATTGTCCAAAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76656036	76655319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_76655472_76655810
tx.4203	chr12	+	583	5	NNC	ENSMUSG00000090258.8	novel	676	4	NA	NA	-8	114	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	214.20317457965	1136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACAGCTAGAGTGAGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76812320	76830068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_76812413_76820031_76820168_76822367_76822439_76829586_76829727_76829924
tx.4204	chr12	+	634	4	FSM	ENSMUSG00000090258.8	ENSMUST00000041262.14	676	4	11	31	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	492	junction_2	1.88561808316413	3614	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGCCTAATGGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76812322	76829923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_76812413_76820031_76820168_76822367_76822439_76829586
tx.4205	chr12	-	958	2	FSM	ENSMUSG00000042808.11	ENSMUST00000082431.6	1010	2	54	-2	52	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_1	0	1051	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGGGTCTCTGTCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76842219	76839108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_76839775_76841927
tx.4206	chr12	+	2608	12	FSM	ENSMUSG00000033373.17	ENSMUST00000041008.10	2613	12	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	246	junction_4	27.7548298231568	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGCTGTCTTTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76884192	76968186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_76884426_76909259_76909325_76920149_76920223_76921805_76921898_76934505_76934653_76934745_76934830_76944100_76944188_76953718_76953849_76956984_76957118_76961393_76961506_76963187_76963303_76966849
tx.4207	chr12	+	1910	6	NNC	ENSMUSG00000033373.17	novel	384	2	NA	NA	-7309	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	53	junction_1	113.544000281829	84	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGCTGTCTTTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76948950	76968186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_76949034_76953718_76953849_76956984_76957118_76961393_76961506_76963187_76963303_76966849
tx.4208	chr12	+	1438	2	ISM	ENSMUSG00000033373.17	ENSMUST00000041008.10	2613	12	79014	0	6436	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	346	junction_1	0	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGCTGTCTTTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76963201	76968186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_76963303_76966849
tx.4209	chr12	-	1945	4	FSM	ENSMUSG00000059436.14	ENSMUST00000082136.7	1926	4	-17	-2	-17	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	8.28653526310404	231	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGGTAGTAGTGTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77008992	76984045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_76985530_76986740_76986865_76999942_77000051_77008763
tx.421	chr1	+	1517	13	FSM	ENSMUSG00000033021.17	ENSMUST00000037796.14	1539	13	23	-1	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_1	48.5514475124641	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGCTTGGACTCCTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75412596	75419819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_75412656_75413421_75413483_75413580_75413679_75414894_75414999_75415485_75415673_75415988_75416049_75417055_75417187_75418118_75418254_75418373_75418472_75418628_75418676_75418828_75418922_75419087_75419257_75419544
tx.4210	chr12	-	2039	5	NNC	ENSMUSG00000059436.14	novel	1926	4	NA	NA	-22	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	27.5714979643834	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGGTAGTAGTGTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77008997	76984045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_76985530_76986199_76986289_76986740_76986865_76999942_77000051_77008763
tx.4211	chr12	-	2690	4	NIC	ENSMUSG00000059436.14	novel	1926	4	NA	NA	-6	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	20	junction_1	20.7257220756131	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCGGTAGTAGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77008981	76984048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_76986289_76986740_76986865_76999942_77000051_77008763
tx.4212	chr12	-	465	3	ISM	ENSMUSG00000059436.14	ENSMUST00000082136.7	1926	4	-20	2692	-20	-1219	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_2	6.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGCAACCAAGCTCATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77008995	76986739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_76986865_76999942_77000051_77008763
tx.4213	chr12	+	1431	4	ISM	ENSMUSG00000021065.17	ENSMUST00000218851.2	2099	6	38467	0	38467	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_2	9.93310961716756	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTGAAGTTTCTGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77495381	77522763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_77495494_77496873_77497051_77510833_77510985_77521772
tx.4214	chr12	+	1205	10	NNC	ENSMUSG00000047454.13	novel	3300	23	NA	NA	54	-175636	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	23.5235631801681	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTGGATCATTTAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78273480	78555231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_78273616_78390125_78390205_78423133_78423192_78459114_78459208_78501530_78501626_78528072_78528140_78538811_78539085_78540723_78540832_78551390_78551526_78555069
tx.4215	chr12	+	3402	15	NIC	ENSMUSG00000021112.10	novel	5283	15	NA	NA	-27	614	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	104	junction_7	16.9175672492428	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTTTTATACATACATACACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78795653	78885469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_78795720_78841018_78841108_78843639_78844165_78856525_78856735_78864014_78864093_78864398_78864546_78865977_78866140_78867581_78867660_78871462_78871647_78872630_78872703_78873034_78873107_78876426_78876595_78877626_78877830_78879138_78879250_78884231
tx.4216	chr12	+	4071	15	FSM	ENSMUSG00000021112.10	ENSMUST00000082024.7	5470	15	-39	1438	27	1195	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	32.6002378856977	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACATTCTTGGGTTGAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78795726	78886050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_78795881_78841018_78841108_78843639_78844165_78856525_78856735_78864014_78864093_78864398_78864546_78865977_78866140_78867581_78867660_78871462_78871647_78872630_78872703_78873034_78873107_78876426_78876595_78877626_78877830_78879138_78879250_78884231
tx.4217	chr12	+	1732	11	ISM	ENSMUSG00000021112.10	ENSMUST00000082024.7	5470	15	-42	14423	24	-3607	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	33.7051924783111	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAGGAAAAAGGTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78795723	78873065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_78795881_78841018_78841108_78843639_78844165_78856525_78856735_78864014_78864093_78864398_78864546_78865977_78866140_78867581_78867660_78871462_78871647_78872630_78872703_78873034
tx.4218	chr12	-	1325	9	FSM	ENSMUSG00000021114.10	ENSMUST00000021536.9	3667	9	85	2257	-58	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	904	junction_8	86.5761947650739	2914	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTGTTTCTTTTTCTTTTT	54	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78908327	78889755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_78890385_78891999_78892079_78894540_78894608_78895169_78895274_78896513_78896559_78897245_78897314_78899038_78899119_78904000_78904119_78908192
tx.4219	chr12	+	1491	8	FSM	ENSMUSG00000021116.11	ENSMUST00000071230.8	3405	8	225	1689	-41	-1689	multi-exon	FALSE	canonical	3	3896	junction_3	411.382487498445	12461	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTAGGCTTCTTCCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78908817	78932095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_78908955_78913299_78913542_78921337_78921418_78923865_78924018_78926724_78926832_78927905_78928004_78930031_78930176_78931564
tx.422	chr1	+	1797	13	NIC	ENSMUSG00000033021.17	novel	1692	14	NA	NA	6	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	82	junction_1	58.385869199852	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAGCTTGGACTCCTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75412617	75419819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_75412957_75413421_75413483_75413580_75413679_75414894_75414999_75415485_75415673_75415988_75416049_75417055_75417187_75418118_75418254_75418373_75418472_75418628_75418676_75418828_75418922_75419087_75419257_75419544
tx.4220	chr12	-	1601	9	FSM	ENSMUSG00000021118.8	ENSMUST00000021544.8	1583	9	-22	4	-22	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_6	8.60868021243675	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGTTATGGTTCTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78953760	78935468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_78936082_78936685_78936765_78938902_78938987_78940850_78940953_78941161_78941350_78941646_78941739_78942905_78943088_78946828_78946994_78953664
tx.4221	chr12	-	2350	4	FSM	ENSMUSG00000021120.12	ENSMUST00000072154.9	2339	4	-16	5	-16	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_1	16.0485374896143	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAAGTATGGACTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79136441	79127442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_79129271_79130389_79130474_79132420_79132631_79136213
tx.4222	chr12	-	1093	3	FSM	ENSMUSG00000021120.12	ENSMUST00000217998.2	2868	3	-5	1780	1	-1780	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	16.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTATCCTGTGGCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79136424	79129801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_79130474_79132420_79132631_79136213
tx.4223	chr12	+	1147	6	ISM	ENSMUSG00000021125.7	ENSMUST00000021550.7	1428	8	16813	2	16813	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.8	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTGGTCTTGTTGCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79194363	79203073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_79194540_79196642_79196803_79197505_79197601_79197726_79197832_79198695_79198833_79202599
tx.4224	chr12	-	1040	6	FSM	ENSMUSG00000021124.14	ENSMUST00000055262.13	1490	6	209	241	-10	71	multi-exon	FALSE	canonical	3	652	junction_4	37.0534748707864	2169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTACATGTATAACATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79219232	79203031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_79203346_79204621_79204684_79207182_79207357_79211721_79211914_79213124_79213184_79218993
tx.4225	chr12	-	1038	6	NNC	ENSMUSG00000021124.14	novel	1490	6	NA	NA	-13	71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	289.79095914124	136	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTACATGTATAACATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79219235	79203031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_79203346_79204621_79204684_79207182_79207357_79211721_79211914_79213124_79213179_79218993
tx.4226	chr12	-	2487	7	NNC	ENSMUSG00000066441.15	novel	3262	7	NA	NA	-66	-345	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	44.4425346811913	232	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATCAATTTTGACTTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79238633	79221455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_79223025_79229426_79229617_79231897_79232108_79233187_79233293_79235254_79235411_79235758_79235882_79238499
tx.4227	chr12	-	1057	3	ISM	ENSMUSG00000066441.15	ENSMUST00000085254.7	1673	7	5671	0	5671	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_2	10.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCGCTGTTTCTCAGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79232064	79222324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_79223025_79229426_79229617_79231897
tx.4228	chr12	+	1736	7	FSM	ENSMUSG00000021123.13	ENSMUST00000021548.12	1678	7	-59	1	-59	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	2.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTGGTGTCTTTTCTCA	316	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79255628	79269438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_79255883_79257614_79257734_79258161_79258318_79259426_79259532_79260317_79260528_79265449_79265640_79268736
tx.4229	chr12	-	1221	5	ISM	ENSMUSG00000066440.6	ENSMUST00000219842.2	4831	20	-10	17426	0	4866	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_4	7.72576857018122	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTAGTAGTGCATGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79343056	79333954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_79334654_79337647_79337738_79340599_79340679_79342250_79342547_79342999
tx.4230	chr12	-	2228	3	FSM	ENSMUSG00000066440.6	ENSMUST00000219571.2	824	3	-4	-1400	0	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_2	9.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGGATAGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79343056	79338803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_79340679_79342250_79342547_79342999
tx.4231	chr12	-	827	4	NNC	ENSMUSG00000066440.6	novel	824	3	NA	NA	-1	17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	23.2522400354604	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAGGATAGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79343057	79338803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_79338886_79340287_79340679_79342250_79342547_79342999
tx.4232	chr12	+	883	7	NNC	ENSMUSG00000059060.16	novel	1759	8	NA	NA	-31	-181250	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_1	21.6365174852352	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTGTCCCTTTTCCTTCTT	8682	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79344093	79374180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_79344197_79347315_79347422_79349249_79349364_79350105_79350223_79361605_79361743_79371740_79371861_79373994
tx.4233	chr12	+	821	7	ISM	ENSMUSG00000059060.16	ENSMUST00000079533.12	1759	8	-8	181250	-8	-181250	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	14.6021307425397	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AAGTGTCCCTTTTCCTTCTT	8705	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79344116	79374180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_79344158_79347315_79347422_79349249_79349364_79350105_79350223_79361605_79361743_79371740_79371861_79373994
tx.4234	chr12	+	717	4	ISM	ENSMUSG00000059060.16	ENSMUST00000218039.3	2187	11	360261	0	330471	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_3	13.2245562832516	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGGGGTCTCCAAAGAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79704597	79861152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_79704695_79813844_79813949_79849963_79850043_79860715
tx.4235	chr12	-	508	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000059060.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGTTGGGTTTTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79854600	79852583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_79852928_79854436
tx.4236	chr12	+	337	2	Intergenic	novelGene_412	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAGAAAGAAAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80057304	80060834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_80057457_80060649
tx.4237	chr12	-	1283	2	FSM	ENSMUSG00000021127.8	ENSMUST00000021552.3	2990	2	1	1706	1	92	multi-exon	FALSE	canonical	3	257	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAACCTTGGTATGTTAC	9168	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80159786	80156233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_80157323_80159592
tx.4238	chr12	-	1138	2	ISM	ENSMUSG00000097729.3	ENSMUST00000219349.2	778	6	5619	3561	5413	-115	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACCTGTCTCTTCATTGTT	8017	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80173957	80170880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_80171901_80173839
tx.4239	chr12	+	666	3	Intergenic	novelGene_414	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTGTATATTGGAAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80345445	80353291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_80345504_80345997_80346110_80352795
tx.4240	chr12	+	582	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000112278.2	novel	728	1	NA	NA	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAGGTCTTTTTTTATAT	1678	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80481957	80482710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_80482087_80482257
tx.4241	chr12	+	3188	9	FSM	ENSMUSG00000032705.10	ENSMUST00000038185.10	3310	9	122	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_6	24.0724816959116	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCAGTGATTGTAAATGTG	2785	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80509990	80544896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_80510055_80522496_80522963_80527228_80527486_80531019_80531147_80536175_80536508_80537554_80537662_80537868_80538005_80539315_80539673_80543554
tx.4242	chr12	+	348	2	NNC	ENSMUSG00000021130.9	novel	502	4	NA	NA	17555	-28	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCTAAGAGTAAATCACTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80662431	80677718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_80662567_80677505
tx.4243	chr12	-	840	5	FSM	ENSMUSG00000021131.15	ENSMUST00000166931.2	506	5	-10	-324	6	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	979	junction_4	3763.79924411491	5531	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTCACTGAGTGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80690616	80680806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_80681302_80684263_80684385_80687730_80687819_80689562_80689620_80690537
tx.4244	chr12	-	793	4	FSM	ENSMUSG00000021131.15	ENSMUST00000021559.14	1293	4	489	11	-4	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	8000	junction_3	570.898122843881	51372	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTCACTGAGTGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80690626	80680806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_80681302_80684263_80684385_80687730_80687819_80690537
tx.4245	chr12	+	3188	7	FSM	ENSMUSG00000048833.10	ENSMUST00000085245.7	5201	7	-17	2030	-4	1432	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_2	10.9455724179028	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATACTGTATTTATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80690995	80728081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_80691751_80709243_80709353_80713308_80713510_80719999_80720069_80722622_80722709_80723905_80724041_80726248
tx.4246	chr12	+	4638	7	NIC	ENSMUSG00000048833.10	novel	5201	7	NA	NA	0	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	11	junction_1	36.9864840178139	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTTATGTGAGTGGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80691013	80730109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_80691191_80709243_80709353_80713308_80713510_80719999_80720069_80722622_80722709_80723905_80724041_80726248
tx.4247	chr12	-	966	2	FSM	ENSMUSG00000044062.8	ENSMUST00000153297.2	944	2	-22	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACATGGATATTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80739262	80733143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_80733782_80738934
tx.4248	chr12	+	2285	2	FSM	ENSMUSG00000066438.7	ENSMUST00000153762.2	956	2	-25	-1304	-25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTACTGGTTTCCTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80768480	80770988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_80768870_80769092
tx.4249	chr12	-	1133	3	FSM	ENSMUSG00000112880.2	ENSMUST00000219062.2	1118	3	8	-23	8	23	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGGAGAGAAAGGGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80992162	80989423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_80989717_80989815_80990004_80991510
tx.4250	chr12	+	1495	8	FSM	ENSMUSG00000021134.18	ENSMUST00000094693.11	1527	8	28	4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1278	junction_1	232.390680904869	13875	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTTTTGGTCTGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80992305	80997277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_80992447_80993349_80993495_80994084_80994156_80994269_80994369_80994569_80994640_80995868_80995943_80996267_80996379_80996493
tx.4251	chr12	+	1621	8	FSM	ENSMUSG00000021134.18	ENSMUST00000110356.3	1568	8	-53	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	562	junction_1	476.276244656911	4334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTTTTGGTCTGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80992305	80997277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_80992573_80993349_80993495_80994084_80994156_80994269_80994369_80994569_80994640_80995868_80995943_80996267_80996379_80996493
tx.4252	chr12	+	1118	5	ISM	ENSMUSG00000021134.18	ENSMUST00000110356.3	1568	8	1931	0	1140	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1780	junction_2	98.8037828223191	259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTTTTGGTCTGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80994289	80997277	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_80994369_80994569_80994640_80995868_80995943_80996267_80996379_80996493
tx.4253	chr12	+	3228	13	NNC	ENSMUSG00000021136.14	novel	3496	13	NA	NA	-7401	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	56.7330493529908	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGGCAGCTGGTGCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81066180	81233181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_81066271_81151380_81151547_81152672_81152786_81182549_81182650_81184738_81184787_81197392_81197483_81199446_81199528_81214280_81214474_81215002_81215086_81216959_81217066_81226252_81226498_81230761_81230816_81231322
tx.4254	chr12	+	3197	13	NNC	ENSMUSG00000021136.14	novel	3496	13	NA	NA	-7399	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	43.9365072196991	54	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGCTGGTGCCTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81066182	81233185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_81066271_81151380_81151547_81152672_81152786_81182549_81182650_81184738_81184787_81197425_81197483_81199446_81199528_81214280_81214474_81215002_81215086_81216959_81217066_81226252_81226498_81230761_81230816_81231322
tx.4255	chr12	+	2156	3	ISM	ENSMUSG00000021136.14	ENSMUST00000021564.11	3439	13	152657	-1	152657	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_1	0.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCAGCTGGTGCCTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81226258	81233185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_81226498_81230761_81230816_81231322
tx.4256	chr12	+	691	2	ISM	ENSMUSG00000021136.14	ENSMUST00000021564.11	3439	13	157047	1338	157047	-1338	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	175	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCATGTTTTCTTCTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81230648	81231846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_81230816_81231322
tx.4257	chr12	-	670	4	FSM	ENSMUSG00000091803.8	ENSMUST00000110340.9	668	4	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	188	junction_1	77.5127229699888	969	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGTTCTCAGTGTTCCAT	998	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81531884	81405797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_81406119_81521360_81521424_81527704_81527777_81531670
tx.4258	chr12	-	425	4	FSM	ENSMUSG00000091803.8	ENSMUST00000168463.8	431	4	6	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	143.25501736414	415	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGTATGCTTTTCAGTCT	1001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81531881	81518866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_81518946_81521360_81521424_81527704_81527777_81531670
tx.4259	chr12	-	605	4	FSM	ENSMUSG00000091803.8	ENSMUST00000002757.11	2007	4	13	1389	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	95.530099968544	1422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGTATGCTTTTCAGTCT	1001	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81531881	81518866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_81519126_81521360_81521424_81527704_81527777_81531670
tx.4260	chr12	-	839	4	FSM	ENSMUSG00000090935.11	ENSMUST00000163402.8	4655	4	22	3794	-9	61	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_1	30.6920185064456	634	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCAGCCTTCCTGTCTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81579663	81548508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_81548941_81551317_81551414_81557602_81557740_81579489
tx.4261	chr12	-	1022	7	NNC	ENSMUSG00000002679.15	novel	1059	8	NA	NA	18	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	185.882056392996	243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATCATGCCTTTCCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81641762	81620337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_81620735_81626327_81626460_81628574_81628684_81629406_81629490_81635756_81635849_81638027_81638188_81641713
tx.4262	chr12	-	1043	8	FSM	ENSMUSG00000002679.15	ENSMUST00000161211.8	1059	8	9	7	9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	360	junction_7	64.9976451692753	2038	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCATCATGCCTTTCCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81641771	81620337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_81620735_81621298_81621327_81626343_81626460_81628574_81628684_81629406_81629490_81635756_81635849_81638027_81638188_81641713
tx.4263	chr12	-	648	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042734.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTACTTTGCAAATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81710774	81709933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_81710208_81710400
tx.4264	chr12	-	546	2	Intergenic	novelGene_415	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGGTTTTATCTTCTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82212574	82203387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_82203785_82212425
tx.4265	chr12	-	1347	2	Intergenic	novelGene_416	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGGCCCACCAATCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82212548	82208149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_82209374_82212425
tx.4266	chr12	+	2014	5	NIC	ENSMUSG00000042700.17	novel	1831	4	NA	NA	-49	9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	46	junction_3	33.3269785609197	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82216144	82359807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_82216278_82216789_82216851_82281236_82281303_82312730_82312800_82358122
tx.4267	chr12	+	242	3	FSM	ENSMUSG00000042700.17	ENSMUST00000222312.2	1416	3	-84	1258	-29	-1258	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_1	11.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGGATGGATTGGCACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82216164	82281304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_82216278_82216789_82216851_82281236
tx.4268	chr12	+	425	2	ISM	ENSMUSG00000042700.17	ENSMUST00000053969.7	7488	21	137992	1508	8794	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	164	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGAATGTCTTTATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82496114	82497048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_82496166_82496674
tx.4269	chr12	+	2007	14	FSM	ENSMUSG00000021222.10	ENSMUST00000021645.9	2008	14	80	-79	80	74	multi-exon	TRUE	canonical	3	216	junction_9	23.528907060372	265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTATGTACTTCTTTGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83567319	83588768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_83567392_83572917_83573015_83575941_83576043_83576750_83576909_83577597_83577681_83579052_83579156_83580640_83580785_83581633_83581684_83582673_83582754_83584486_83584589_83584717_83584816_83586081_83586256_83586562_83586678_83588138
tx.427	chr1	-	313	2	ISM	ENSMUSG00000026245.17	ENSMUST00000189529.7	1801	17	45176	0	45109	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1276	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTGCGTAGCTGCATTA	2379	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78420323	78401721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_78401983_78420271
tx.4270	chr12	-	2972	11	NNC	ENSMUSG00000042628.9	novel	4036	12	NA	NA	-9271	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	38.7479031690748	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCATCGTATGGATCATGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83653267	83593617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_83594890_83597594_83597709_83598239_83598421_83599149_83599321_83601716_83601835_83601938_83602037_83602374_83602484_83605387_83605495_83615622_83615838_83621405_83621911_83653185
tx.4271	chr12	-	3953	12	NNC	ENSMUSG00000042628.9	novel	4036	12	NA	NA	-11	-90	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_11	34.1123568895786	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CATGAGGAAAAAAATCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83644007	83593712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_83594890_83597594_83597709_83598239_83598421_83599149_83599321_83601716_83601835_83601938_83602037_83602374_83602484_83605387_83605495_83615622_83615838_83621405_83621911_83641171_83642093_83643770
tx.4272	chr12	-	2639	11	ISM	ENSMUSG00000042628.9	ENSMUST00000048319.6	4036	12	2310	761	775	485	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_10	9.82293235240883	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTCCATTTATCCATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83641686	83594383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_83594890_83597594_83597709_83598239_83598421_83599149_83599321_83601716_83601835_83601938_83602037_83602374_83602484_83605387_83605495_83615622_83615838_83621405_83621911_83641171
tx.4273	chr12	-	792	5	ISM	ENSMUSG00000042628.9	ENSMUST00000048319.6	4036	12	42187	1034	-3330	212	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	123	junction_2	2.27760839478607	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCCAGTTCCCTCTCCGACT	4663	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83601809	83594656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_83594890_83597594_83597709_83598239_83598421_83599149_83599321_83601716
tx.4274	chr12	+	1094	10	ISM	ENSMUSG00000010608.16	ENSMUST00000048155.16	4226	19	-11	19107	-11	17	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	212	junction_1	85.0034131486117	306	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAGGAAATTGAGAAAGAAC	3970	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83679014	83710790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_83679192_83689402_83689524_83691172_83691223_83692910_83693079_83694971_83695030_83698060_83698219_83706196_83706383_83707081_83707136_83707368_83707453_83710752
tx.4275	chr12	+	2678	12	FSM	ENSMUSG00000019969.15	ENSMUST00000041806.13	2690	12	12	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	287	junction_9	21.5122490573192	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGCTCTCTGTCCTGGCTGG	3357	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83734937	83781869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_83735068_83746128_83746196_83746285_83746426_83759077_83759329_83761537_83761680_83769764_83769833_83771269_83771491_83774999_83775099_83775471_83775559_83777312_83777487_83778447_83778567_83780689
tx.4276	chr12	+	2251	9	ISM	ENSMUSG00000019969.15	ENSMUST00000101225.2	3023	12	23831	104	-12245	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	287	junction_6	22.6163657557973	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGCTCTCTGTCCTGGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83759167	83781869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_83759329_83761537_83761680_83769764_83769833_83771269_83771491_83774999_83775099_83775471_83775559_83777312_83777487_83778447_83778567_83780689
tx.4277	chr12	-	3630	12	NIC	ENSMUSG00000021224.16	novel	3468	13	NA	NA	-15	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	42	junction_7	30.4074262351803	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTTGCCCATGAAGGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83968679	83840844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_83842929_83843970_83844118_83846281_83846432_83847786_83848081_83850553_83850759_83854874_83855016_83858059_83858135_83878695_83878771_83888991_83889133_83902213_83902299_83923441_83923587_83968591
tx.4278	chr12	-	775	4	ISM	ENSMUSG00000021224.16	ENSMUST00000136848.8	567	6	-22	23419	-15	232	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_2	23.3666428910958	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTTCGGGATAGCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83968679	83878369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_83878771_83888991_83889133_83923441_83923587_83968591
tx.4279	chr12	-	1917	2	ISM	ENSMUSG00000021224.16	ENSMUST00000126943.2	429	4	-11	63689	-11	-32746	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GTGAACCAAAAAAATAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83968675	83921753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_83923587_83968591
tx.428	chr1	-	673	5	ISM	ENSMUSG00000026245.17	ENSMUST00000189529.7	1801	17	26512	0	26445	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1276	junction_1	63.4719426203421	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTGCGTAGCTGCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78438987	78401721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_78401983_78420271_78420428_78431390_78431509_78435201_78435295_78438942
tx.4280	chr12	+	1386	3	FSM	ENSMUSG00000072949.7	ENSMUST00000168120.3	2272	3	189	697	189	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_1	2	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTGTAACCGAAAATTGT	3008	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84056452	84064448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84056741_84061152_84061356_84063553
tx.4281	chr12	+	709	8	FSM	ENSMUSG00000042523.13	ENSMUST00000123491.8	5727	8	-24	5042	-24	18	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	4.44007721940573	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTGTGGAGCAGAGTTC	9888	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84161115	84185249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84161174_84168056_84168096_84171248_84171359_84173735_84173792_84178105_84178162_84182340_84182468_84183270_84183412_84185127
tx.4282	chr12	+	696	7	NIC	ENSMUSG00000042523.13	novel	5727	8	NA	NA	-19	49	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.67707520800338	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACATCTCTCACTTCCATCC	9893	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84161120	84185280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_84161174_84171248_84171359_84173735_84173792_84178105_84178162_84182340_84182468_84183270_84183412_84185127
tx.4283	chr12	+	554	3	ISM	ENSMUSG00000042523.13	ENSMUST00000136159.2	403	6	-36	9040	-11	-9040	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	4.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACAGCCTGGGAAGGAAA	9901	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84161128	84171718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_84161174_84168056_84168096_84171248
tx.4284	chr12	+	1183	9	ISM	ENSMUSG00000072946.13	ENSMUST00000123614.8	3168	10	127	4836	-6	1043	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	204	junction_5	23.3492505233037	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACATGGAGTGGGTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84332132	84357770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_84332251_84339057_84339143_84341990_84342110_84344784_84344977_84349010_84349182_84352699_84352910_84354549_84354672_84355118_84355207_84357692
tx.4285	chr12	+	1313	10	FSM	ENSMUSG00000072946.13	ENSMUST00000123614.8	3168	10	128	1727	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	204	junction_5	23.1948270094864	587	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTGATTCTAGTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84332133	84360879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84332251_84339057_84339143_84341990_84342110_84344784_84344977_84349010_84349182_84352699_84352910_84354549_84354672_84355118_84355207_84357692_84357733_84360710
tx.4286	chr12	+	585	5	ISM	ENSMUSG00000072946.13	ENSMUST00000123693.2	1386	11	20557	-3	20557	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	217	junction_3	19.0328663106743	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTGATTCTAGTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84352743	84360879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_84352910_84354549_84354672_84355118_84355207_84357692_84357733_84360710
tx.4287	chr12	+	2334	12	FSM	ENSMUSG00000042472.12	ENSMUST00000045931.12	2597	12	264	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	183	junction_3	18.7929123266993	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTTTGGCTCTTGTTTTA	1847	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84363889	84390498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84363949_84368585_84368766_84369657_84369794_84372344_84372564_84374052_84374245_84376575_84376727_84378408_84378591_84379708_84379799_84384389_84384516_84385415_84385557_84386875_84387004_84389768
tx.4288	chr12	+	1531	12	FSM	ENSMUSG00000021235.14	ENSMUST00000021661.13	1602	12	67	4	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	205	junction_6	16.3656564409681	1516	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTCTCTTTTCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84408808	84420566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84409012_84413658_84413794_84414916_84414976_84415359_84415484_84417029_84417161_84417697_84417806_84417881_84417945_84418224_84418333_84418912_84419116_84419192_84419309_84419424_84419592_84420452
tx.4289	chr12	-	2164	16	FSM	ENSMUSG00000021236.17	ENSMUST00000110272.9	4972	16	7	2801	7	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	43	junction_8	4.47014789713072	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTGTCCTCAGTATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84455796	84423449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_84424155_84425953_84426070_84427094_84427152_84429005_84429147_84430992_84431095_84431921_84431984_84432570_84432651_84432911_84433001_84433511_84433548_84433753_84433830_84439179_84439324_84441397_84441478_84443452_84443733_84446113_84446187_84452179_84452250_84455743
tx.429	chr1	-	1897	17	FSM	ENSMUSG00000026245.17	ENSMUST00000068333.14	1951	17	37	17	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	979	junction_9	154.241693455434	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCTTGCGTAGCTGCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78465497	78401721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_78401983_78420271_78420428_78431390_78431509_78435201_78435295_78438942_78439024_78439471_78439680_78439908_78439971_78443603_78443656_78444607_78444670_78445888_78445960_78447719_78447829_78449120_78449272_78452826_78452943_78454829_78454900_78456593_78456749_78458944_78459001_78465421
tx.4290	chr12	+	713	4	NNC	ENSMUSG00000057265.14	novel	2187	12	NA	NA	-27	-13646	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2.16024689946929	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGCGCATGTTTTGCTT	4316	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84455817	84461549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_84456030_84457810_84458044_84460037_84460104_84461347
tx.4291	chr12	+	2184	6	FSM	ENSMUSG00000085793.4	ENSMUST00000137170.4	2270	6	84	2	84	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_1	15.7810012356631	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGAGGCCCAGGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84498279	84578345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84498318_84503014_84503090_84504722_84504761_84506392_84506460_84509142_84509227_84576463
tx.4292	chr12	+	2190	5	NNC	ENSMUSG00000085793.4	novel	2270	6	NA	NA	62	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	65.6296426929174	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGAGGCCCAGGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84498257	84578345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_84498318_84503014_84503112_84506392_84506460_84509142_84509227_84576463
tx.4293	chr12	+	2131	4	NNC	ENSMUSG00000085793.4	novel	2270	6	NA	NA	-8	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	75.3230081419718	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGAGGCCCAGGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84503013	84578345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_84503112_84506392_84506460_84509142_84509227_84576463
tx.4294	chr12	-	2447	19	FSM	ENSMUSG00000021240.7	ENSMUST00000021666.6	2309	19	-16	-122	-16	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_18	37.2765772285566	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAGACTGATTTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84664160	84649304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_84649934_84650067_84650184_84650722_84650800_84651106_84651160_84651754_84651805_84652121_84652159_84652645_84652738_84652873_84653083_84655343_84655434_84655579_84655672_84655748_84655871_84656152_84656248_84658494_84658546_84659098_84659225_84659553_84659671_84660678_84660819_84661850_84661979_84662099_84662219_84664056
tx.4295	chr12	-	1566	11	ISM	ENSMUSG00000021240.7	ENSMUST00000021666.6	2309	19	8275	-122	2810	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_10	22.5166604983954	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATAGACTGATTTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84655869	84649304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_84649934_84650067_84650184_84650722_84650800_84651106_84651160_84651754_84651805_84652121_84652159_84652645_84652738_84652873_84653083_84655343_84655434_84655579_84655672_84655748
tx.4296	chr12	-	1155	4	FSM	ENSMUSG00000021242.10	ENSMUST00000021668.10	3299	4	215	1929	-23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2850	junction_3	124.194292228839	19630	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTGCTTGGTTTTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84819711	84803264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_84803987_84807493_84807667_84812050_84812159_84819559
tx.4297	chr12	+	859	4	FSM	ENSMUSG00000021241.8	ENSMUST00000021667.7	883	4	27	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	133.217449641137	1281	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTATCGTGTTTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84820051	84821862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84820146_84820348_84820452_84820566_84820683_84821316
tx.4298	chr12	+	746	3	FSM	ENSMUSG00000021241.8	ENSMUST00000222022.2	485	3	-50	-211	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_2	92.5	599	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTATCGTGTTTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84820048	84821862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84820146_84820348_84820452_84821316
tx.4299	chr12	+	722	3	FSM	ENSMUSG00000021241.8	ENSMUST00000222449.2	374	3	0	-348	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_1	24	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTATCGTGTTTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84820051	84821862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84820146_84820369_84820452_84821316
tx.43	chr1	+	501	3	NNC	ENSMUSG00000099498.2	novel	288	4	NA	NA	5855	15827	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTGTGTGAAGAACAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13144916	13164713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_13145004_13148829_13148887_13164356
tx.4300	chr12	+	1609	2	FSM	ENSMUSG00000021241.8	ENSMUST00000223089.2	843	2	-14	-752	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	319	junction_1	0	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTATCGTGTTTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84820050	84821862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84820146_84820348
tx.4301	chr12	+	841	4	FSM	ENSMUSG00000021241.8	ENSMUST00000222982.2	727	4	-30	-84	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	90.0900783783776	222	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTTATCGTGTTTTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84820048	84821862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_84820146_84820369_84820452_84820566_84820683_84821316
tx.4302	chr12	+	715	8	FSM	ENSMUSG00000021243.15	ENSMUST00000021669.15	749	8	32	2	32	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1900	junction_1	151.77601649692	5388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTATGTTGTCTCAATTCT	4661	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85017702	85030075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_85017740_85017988_85018057_85019763_85019836_85020864_85021014_85026168_85026242_85027288_85027377_85029009_85029105_85029942
tx.4303	chr12	+	679	7	ISM	ENSMUSG00000021243.15	ENSMUST00000171040.2	731	8	233	-10	233	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1987	junction_6	120.703148260516	1572	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTATGTTGTCTCAATTCT	4946	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85017987	85030075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_85018057_85019763_85019836_85020864_85021014_85026168_85026242_85027288_85027377_85029009_85029105_85029942
tx.4304	chr12	+	2736	14	NNC	ENSMUSG00000004789.11	novel	2764	15	NA	NA	-2	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	93.6372201321827	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGGCTCCGGGATCTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85157629	85180860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_85157765_85162046_85162096_85165132_85165189_85165300_85165376_85165555_85165612_85166006_85166119_85168760_85168914_85169553_85169631_85170547_85170646_85175084_85175216_85176565_85176640_85177233_85177318_85177670_85177839_85179392
tx.4305	chr12	+	2741	15	FSM	ENSMUSG00000004789.11	ENSMUST00000053811.10	2764	15	25	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	294	junction_7	23.9123612470237	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCGGGATCTGTGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85157631	85180864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_85157734_85158271_85158306_85162046_85162096_85165132_85165189_85165300_85165376_85165555_85165612_85166006_85166119_85168760_85168914_85169553_85169631_85170547_85170646_85175084_85175216_85176565_85176640_85177233_85177318_85177670_85177839_85179392
tx.4306	chr12	-	1794	6	ISM	ENSMUSG00000019235.10	ENSMUST00000221972.2	2881	11	10797	425	-478	-34	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_5	16.4073154415949	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGCTCTCCTGTGTCAGA	613	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85187241	85182447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_85183258_85183519_85183616_85185204_85185288_85185426_85185517_85185851_85186443_85187117
tx.4307	chr12	-	1796	6	NIC	ENSMUSG00000019235.10	novel	2881	11	NA	NA	-478	-35	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_4	48.0441463656084	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTGGCTCTCCTGTGTCAG	613	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85187241	85182448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_85183258_85183519_85183616_85185204_85185288_85185426_85185520_85185851_85186443_85187117
tx.4308	chr12	-	1662	5	ISM	ENSMUSG00000019235.10	ENSMUST00000221972.2	2881	11	11596	433	321	-42	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_4	9.5655632348545	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATTCTCTGGCTGGCTCTCCT	1412	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85186442	85182455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_85183258_85183519_85183616_85185204_85185288_85185426_85185517_85185851
tx.4309	chr12	-	924	3	ISM	ENSMUSG00000004791.8	ENSMUST00000220985.2	1226	7	6674	-330	295	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACATGTCTAGGATGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85216374	85213414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_85214189_85216131_85216192_85216284
tx.431	chr1	+	1356	6	ISM	ENSMUSG00000032883.16	ENSMUST00000142704.8	2976	15	41193	-13	2420	13	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	450	junction_2	17.4310068556007	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCGAATATATGCCTGACA	2587	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78676792	78684697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_78676886_78677472_78677548_78678985_78679178_78681202_78681318_78682950_78683109_78683974
tx.4310	chr12	-	838	2	FSM	ENSMUSG00000004791.8	ENSMUST00000222850.2	688	2	476	-626	476	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATGTCTAGGATGTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85216193	85213412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_85214189_85216131
tx.4311	chr12	+	1455	8	FSM	ENSMUSG00000004788.12	ENSMUST00000004910.12	1605	8	18	132	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	336	junction_7	13.1661284657074	511	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGTTCGTTTATTGTTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85266272	85273270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_85266499_85266595_85266717_85266870_85267020_85268250_85268415_85269517_85269614_85270154_85270293_85271328_85271396_85272776
tx.4312	chr12	+	1509	7	NIC	ENSMUSG00000004788.12	novel	1605	8	NA	NA	-6	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	336	junction_6	13.6188186793944	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGTTCGTTTATTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85266313	85273268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_85266717_85266870_85267020_85268250_85268415_85269517_85269614_85270154_85270293_85271328_85271396_85272776
tx.4313	chr12	-	1893	2	ISM	ENSMUSG00000021245.16	ENSMUST00000220854.2	4699	13	-1	32264	-1	-32264	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCCAGTAGTCGTGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85317374	85314417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_85316249_85317312
tx.4314	chr12	-	833	2	FSM	ENSMUSG00000008822.16	ENSMUST00000117138.3	735	2	-93	-5	19	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	443	junction_1	0	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTACATTGCTTCCCCCC	4327	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85327173	85319177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_85319602_85326764
tx.4315	chr12	-	623	3	FSM	ENSMUSG00000008822.16	ENSMUST00000008966.13	648	3	19	6	2	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	386	junction_2	28.5	3107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTACATTGCTTCCCCCC	4310	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85327190	85319177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_85319602_85326764_85326857_85327083
tx.4316	chr12	+	2474	3	FSM	ENSMUSG00000045064.6	ENSMUST00000059341.5	4482	3	65	1943	65	469	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAGTGTGGACAATGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85335429	85344189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_85335560_85336325_85337656_85343175
tx.4317	chr12	-	2970	4	ISM	ENSMUSG00000034290.10	ENSMUST00000040992.8	5386	22	33032	6	33032	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	92	junction_1	15.9652400197707	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCAGCGAGGGCTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85353104	85346293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_85348701_85350240_85350448_85352236_85352399_85352910
tx.4318	chr12	-	1097	2	ISM	ENSMUSG00000034290.10	ENSMUST00000040992.8	5386	22	33035	5205	33035	-5205	internal_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTGTGGTTGGAGGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85353101	85351492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_85352399_85352910
tx.4319	chr12	-	1341	5	FSM	ENSMUSG00000021248.10	ENSMUST00000040766.9	1482	5	145	-4	-12	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1293	junction_2	34.3110769285955	3269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCTTGTGTATGTGTGTTT	8609	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85421476	85389557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_85390324_85390998_85391126_85397576_85397651_85401568_85401681_85421214
tx.432	chr1	-	2767	12	FSM	ENSMUSG00000073643.12	ENSMUST00000113512.8	4551	12	30	1754	-1	1341	multi-exon	FALSE	canonical	3	564	junction_7	59.0382982576312	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79739456	79681732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_79683288_79683960_79684070_79685168_79685300_79686809_79686912_79691574_79691681_79692590_79692718_79702361_79702475_79704282_79704434_79707372_79707428_79711516_79711591_79717778_79717847_79739280
tx.4320	chr12	+	440	2	Intergenic	novelGene_418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGTCTTAGCTCCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85571429	85572156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_85571668_85571954
tx.4321	chr12	+	388	2	Intergenic	novelGene_419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGTCTTAGCTCCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85571432	85572156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_85571619_85571954
tx.4322	chr12	+	1514	4	FSM	ENSMUSG00000034271.17	ENSMUST00000177587.9	1645	4	127	4	127	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	88.8606899715629	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGCCTCGAGTGGTG	6377	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85645927	85686648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_85646002_85654906_85655140_85678418_85678524_85685546
tx.4323	chr12	+	1348	2	ISM	ENSMUSG00000034271.17	ENSMUST00000171754.3	1559	4	31486	4	29282	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGCTGCCTCGAGTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85678277	85686648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_85678524_85685546
tx.4324	chr12	+	3347	10	FSM	ENSMUSG00000034258.5	ENSMUST00000040461.4	3435	10	-6	94	-6	-94	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_4	3.8522079607466	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTAATTCATTTCTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85793306	85860265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_85794364_85829730_85829873_85832861_85833003_85842948_85843017_85845271_85845376_85849908_85850020_85851141_85851248_85851369_85851482_85851969_85852026_85858815
tx.4325	chr12	+	1892	5	ISM	ENSMUSG00000034258.5	ENSMUST00000040461.4	3435	10	56632	1	28341	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_4	2.12132034355964	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTGCCTCATCATTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85849944	85860358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_85850020_85851141_85851248_85851369_85851482_85851969_85852026_85858815
tx.4326	chr12	-	472	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034258.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACGTCCACTTTGAACAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85861650	85860246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_85860502_85861433
tx.4327	chr12	-	1198	5	FSM	ENSMUSG00000021252.12	ENSMUST00000021676.12	1169	5	-28	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	716	junction_4	65.9104506129339	2744	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGTCTGTGTACTTTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85871324	85862220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_85862968_85863089_85863209_85866252_85866344_85868861_85869023_85871244
tx.4328	chr12	+	955	5	ISM	ENSMUSG00000012609.20	ENSMUST00000176008.8	5482	10	-47	24373	-37	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_4	10.1334840997556	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTTAATATGGTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85871704	85892457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_85871861_85873226_85873399_85878668_85878776_85890551_85890635_85892020
tx.4329	chr12	+	996	6	ISM	ENSMUSG00000012609.20	ENSMUST00000153570.9	655	7	-78	3634	-25	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_4	19.5693638118361	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCTTAATATGGTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85871716	85892457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_85871861_85873226_85873399_85878668_85878776_85890551_85890635_85890719_85890773_85892020
tx.433	chr1	-	1788	3	ISM	ENSMUSG00000073643.12	ENSMUST00000187005.7	1359	11	54157	-1335	15075	1335	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	678	junction_2	2.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79685298	79681738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_79683288_79683960_79684070_79685168
tx.4330	chr12	+	807	9	FSM	ENSMUSG00000007867.10	ENSMUST00000222821.2	783	9	-24	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_5	10.7637992827812	646	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATTTCTTCCATTCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86129336	86209233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_86129415_86131867_86131961_86158384_86158450_86185566_86185600_86186825_86186870_86207922_86207996_86208225_86208302_86208760_86208824_86208951
tx.4331	chr12	+	729	8	ISM	ENSMUSG00000007867.10	ENSMUST00000223269.2	787	9	2486	0	2486	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	179	junction_4	10.6349443259627	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATTTCTTCCATTCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86131867	86209233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_86131961_86158384_86158450_86185566_86185600_86186825_86186870_86207922_86207996_86208225_86208302_86208760_86208824_86208951
tx.4332	chr12	+	335	2	ISM	ENSMUSG00000097543.2	ENSMUST00000181667.2	3160	5	-4	24868	-4	-24868	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCGGCTTTGGCATTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86216110	86217008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_86216220_86216782
tx.4333	chr12	+	1306	3	NIC	ENSMUSG00000097543.2	novel	3160	5	NA	NA	-5	-22187	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	11	junction_2	2.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAAGAAAAAAGAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86216109	86219689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_86216220_86216782_86217055_86218765
tx.4334	chr12	+	3824	9	FSM	ENSMUSG00000021254.10	ENSMUST00000071106.6	3829	9	0	5	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_8	8.71421252896669	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACATCTGTGTCTTGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86288648	86338139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_86288719_86290808_86291481_86303641_86303707_86307350_86307528_86308389_86308470_86311955_86312024_86313917_86313958_86315749_86315836_86335573
tx.4335	chr12	+	2666	2	ISM	ENSMUSG00000021254.10	ENSMUST00000071106.6	3829	9	-6	44746	-6	-10665	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTTGCTTCTTGGTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86288642	86293398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_86288719_86290808
tx.4336	chr12	+	1812	10	FSM	ENSMUSG00000021254.10	ENSMUST00000221368.2	4355	10	17	2526	0	-2112	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_9	9.46077020329245	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTAGAGCTTTTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86288648	86336032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_86288719_86290808_86291481_86303641_86303707_86307350_86307528_86308389_86308470_86311955_86312024_86313917_86313958_86315749_86315836_86328222_86328318_86335573
tx.4337	chr12	+	641	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000097488.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGCTCCGGGATCCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86352567	86358033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_86352655_86356744_86356838_86356921_86357039_86357689
tx.4338	chr12	-	759	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021255.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	7.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTCTCCAGGTCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86516816	86471840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_86472015_86508048_86508306_86516488
tx.4339	chr12	-	837	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021255.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_2	7.78888096369861	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTCTCCAGGTCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86516816	86471840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_86472015_86476368_86476447_86508048_86508306_86516488
tx.434	chr1	-	2057	6	ISM	ENSMUSG00000073643.12	ENSMUST00000113512.8	4551	12	46833	1763	7720	1332	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	633	junction_3	21.3297913726318	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAACAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79692653	79681741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_79683288_79683960_79684070_79685168_79685300_79686809_79686912_79691574_79691681_79692590
tx.4340	chr12	-	776	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021255.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	13.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACTGTGTGGCAGCCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86516815	86478775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_86478968_86508048_86508306_86516488
tx.4341	chr12	-	1898	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021255.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	12	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCGGCTTGTTTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86516852	86504778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_86506056_86508048_86508306_86516488
tx.4342	chr12	+	3902	6	FSM	ENSMUSG00000021255.18	ENSMUST00000167891.2	1344	6	-1	-2557	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	623	junction_2	30.0905300717684	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGAGTCGTTCATGCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86516889	86568396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_86517330_86535320_86535438_86552588_86552700_86553122_86553285_86561054_86561325_86565594
tx.4343	chr12	-	2513	4	NIC	ENSMUSG00000021257.15	novel	3850	10	NA	NA	23	-1433	intron_retention	FALSE	canonical	3	89	junction_1	5.79271573232759	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCAGAGAGGTGCTAAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86773211	86766552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_86768155_86768614_86768842_86769618_86770195_86773103
tx.4344	chr12	+	613	5	NNC	ENSMUSG00000059114.9	novel	1854	14	NA	NA	20196	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.06155281280883	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGTGCTGCCGAGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86807976	86810571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_86808134_86808429_86808538_86809335_86809419_86809587_86809682_86810400
tx.4345	chr12	+	1436	5	NNC	ENSMUSG00000059114.9	novel	1854	14	NA	NA	20267	1219	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.27760839478607	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAATAAATATTTTAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86808047	86811790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_86808340_86808429_86808538_86809335_86809419_86809587_86809682_86810931
tx.4346	chr12	+	1004	4	Intergenic	novelGene_420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGCCTCAGTTTCTTTCA	8868	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86876587	86886294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_86876956_86877252_86877397_86884769_86885037_86886069
tx.4347	chr12	-	1213	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034157.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTTTAAGTGGACCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86994092	86987770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_86988480_86991947_86992299_86993939
tx.4348	chr12	+	708	3	ISM	ENSMUSG00000034157.13	ENSMUST00000187814.7	4098	4	2	4726	2	245	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_1	2	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTTTTTAAGAGAGAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86994118	87007410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_86994274_86999517_86999706_87007045
tx.4349	chr12	-	2789	21	FSM	ENSMUSG00000034126.6	ENSMUST00000037788.6	5064	21	315	1960	-113	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_16	10.2834819006016	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGATATTCTCTGGTATCT	5964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87194361	87155594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_87156068_87156777_87156893_87157075_87157217_87158110_87158217_87158297_87158358_87158652_87158725_87163304_87163382_87164158_87164251_87164712_87164865_87166345_87166425_87169615_87169686_87171585_87171653_87174075_87174186_87175726_87175810_87177062_87177170_87178445_87178606_87180133_87180243_87182268_87182378_87184776_87184882_87186417_87186503_87193944
tx.4350	chr12	+	1665	9	FSM	ENSMUSG00000021033.12	ENSMUST00000063117.10	1656	9	-9	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	449	junction_5	40.5555175037873	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGCTTTTGTCATGGACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87194482	87211497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_87194619_87204666_87204719_87205851_87205920_87206413_87206495_87206823_87206950_87208248_87208328_87208813_87208867_87209761_87209812_87210477
tx.4351	chr12	-	357	3	NNC	ENSMUSG00000072919.5	novel	656	5	NA	NA	8437	7395	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	22.5	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATGCTTGTCTTTATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87271893	87260418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_87260543_87270931_87271084_87271812
tx.4352	chr12	-	713	4	NNC	ENSMUSG00000072919.5	novel	1101	6	NA	NA	8439	69	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	41	junction_2	1.69967317119759	337	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTTGGGTGTTTCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87271891	87267959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_87268219_87269818_87270042_87270931_87271084_87271812
tx.4353	chr12	-	616	4	NNC	ENSMUSG00000072919.5	novel	1101	6	NA	NA	8441	63	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	11	junction_2	15.7973274814304	74	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCAGTATTCTTGGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87271889	87267965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_87268219_87269818_87269953_87270931_87271084_87271812
tx.4354	chr12	-	2536	20	FSM	ENSMUSG00000021038.18	ENSMUST00000072744.15	2524	20	-12	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_1	8.24352343784865	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCTTCCCCATCTGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87313042	87285646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_87286611_87288010_87288116_87288710_87288801_87289259_87289347_87291228_87291319_87291613_87291656_87292902_87293038_87293592_87293669_87296161_87296236_87297250_87297279_87298489_87298593_87299408_87299443_87299939_87300033_87301003_87301061_87303258_87303324_87304188_87304228_87305854_87305996_87307405_87307509_87310678_87310772_87312925
tx.4355	chr12	+	1390	9	FSM	ENSMUSG00000021037.8	ENSMUST00000021425.8	1377	9	-1	-12	-1	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	2699	junction_7	143.152890295656	6076	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATCTATGTTGACTGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87313470	87320765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_87313696_87314928_87315120_87316648_87316732_87317110_87317229_87318112_87318202_87319345_87319475_87319896_87319999_87320220_87320273_87320364
tx.4356	chr12	-	1979	4	ISM	ENSMUSG00000050671.13	ENSMUST00000051601.6	1350	5	1919	-1040	1855	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	6.16441400296898	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGTTTGATAAAGGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87331992	87325415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_87326977_87329073_87329158_87329419_87329561_87331799
tx.4357	chr12	-	2592	6	FSM	ENSMUSG00000050671.13	ENSMUST00000125733.8	2526	6	-70	4	-70	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	6.95701085237043	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGTTTGATAAAGGATTT	7599	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87346549	87325415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_87326977_87329073_87329158_87329419_87329561_87331799_87332161_87333668_87333912_87346347
tx.4358	chr12	-	989	2	ISM	ENSMUSG00000050671.13	ENSMUST00000125733.8	2526	6	-73	7716	-73	-3934	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTCTGCTTGGTTTGTTT	7596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87346552	87333127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_87333912_87346347
tx.4359	chr12	+	895	4	Intergenic	novelGene_422	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	5.71547606649408	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCTTGTTGGGCATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87346643	87348079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_87347023_87347116_87347291_87347591_87347707_87347852
tx.436	chr1	+	1338	4	FSM	ENSMUSG00000026248.10	ENSMUST00000027464.9	1424	4	86	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_2	2.44948974278318	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGTCTTTCCTTTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79753820	79759162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_79754029_79755574_79756044_79757204_79757384_79758680
tx.4360	chr12	+	1041	3	Intergenic	novelGene_423	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_2	1	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCTTGTTGGGCATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87346643	87348079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_87347023_87347116_87347291_87347591
tx.4361	chr12	+	1358	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021036.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_4	6.09815545882523	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGTTGTAAAAGAAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87346656	87357249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_87347023_87347116_87347291_87347591_87347783_87352843_87352918_87356696
tx.4362	chr12	-	892	5	ISM	ENSMUSG00000021036.11	ENSMUST00000169845.8	3769	6	2199	1565	2199	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	499	junction_2	42.1092329543059	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTCTACTTGTGAAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87388423	87356408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_87356795_87359471_87359602_87360824_87360961_87382805_87382933_87388310
tx.4363	chr12	-	2045	12	FSM	ENSMUSG00000021036.11	ENSMUST00000021424.5	6710	12	89	4576	-25	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	499	junction_2	40.0427457550466	416	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTCTACTTGTGAAATCAC	8785	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87435040	87356407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_87356795_87359471_87359602_87360824_87360961_87382805_87382933_87388310_87388531_87389417_87389524_87393481_87393576_87397034_87397160_87402299_87402449_87403321_87403477_87415704_87415900_87434819
tx.4364	chr12	-	927	2	ISM	ENSMUSG00000021036.11	ENSMUST00000170720.2	704	4	15375	-4	15375	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	597	junction_1	0	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTCTACTTGTGAAATCA	9013	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87360012	87356408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_87356795_87359471
tx.4365	chr12	-	2127	8	NIC	ENSMUSG00000079036.11	novel	2154	8	NA	NA	-1	21	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	77	junction_6	101.263245543283	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTGTGTCAGGCGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87490610	87474825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_87476041_87478169_87478309_87480888_87480980_87485166_87485330_87487075_87487185_87488040_87488114_87488412_87488551_87490411
tx.4366	chr12	-	1949	6	FSM	ENSMUSG00000079036.11	ENSMUST00000162961.8	3857	6	0	1908	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_2	59.8431282604778	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGTATCTGTCTTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87490609	87474846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_87476041_87478169_87478364_87480888_87480980_87485166_87485330_87487075_87487185_87490411
tx.4367	chr12	-	1891	6	FSM	ENSMUSG00000079036.11	ENSMUST00000162247.8	1883	6	-8	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_2	71.1983145867934	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTGTATCTGTCTTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87490606	87474846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_87476041_87478169_87478309_87480888_87480980_87485166_87485330_87487075_87487185_87490411
tx.4368	chr12	+	397	4	FSM	ENSMUSG00000021040.16	ENSMUST00000161023.8	2701	4	16	2288	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3495	junction_2	126.36015546401	7121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACACGTTTTTATTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87490681	87496688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_87490797_87494333_87494393_87496062_87496171_87496573
tx.4369	chr12	-	2243	14	FSM	ENSMUSG00000021039.10	ENSMUST00000021428.9	2232	14	-16	5	-16	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	814	junction_13	97.7330623652505	194	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCAATTCTGTTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87519060	87496684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_87497487_87497575_87497740_87499351_87499470_87500627_87500725_87502359_87502502_87503621_87503739_87505662_87505729_87506190_87506261_87507176_87507282_87508434_87508542_87508631_87508728_87511319_87511482_87515379_87515534_87519017
tx.4370	chr12	-	979	10	ISM	ENSMUSG00000021039.10	ENSMUST00000021428.9	2232	14	-16	5763	-16	-5763	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	814	junction_9	103.771234625991	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAGAAACATGAAGAGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87519060	87502442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_87502502_87503621_87503739_87505662_87505729_87506190_87506261_87507176_87507282_87508434_87508542_87508631_87508728_87511319_87511482_87515379_87515534_87519017
tx.4371	chr12	+	1486	2	FSM	ENSMUSG00000079034.3	ENSMUST00000110152.3	1873	2	-11	398	-11	-398	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTCTGATTCTTGCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87561074	87564638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_87561276_87563353
tx.4372	chr12	+	1096	2	FSM	ENSMUSG00000092019.5	ENSMUST00000164838.3	1850	2	-2	756	-2	-756	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTTGAGTTATTTATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87665636	87668969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_87665828_87668064
tx.4374	chr12	+	1033	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000095717.2	novel	435	1	NA	NA	-1976	95	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATGTGGCTTGTTAATGC	6403	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87991797	87994303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_87991990_87993462
tx.4375	chr12	-	1033	2	FSM	ENSMUSG00000093847.3	ENSMUST00000218054.3	1856	2	-5	828	-5	97	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTCTTGTTAATGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88290801	88287719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_88288562_88290610
tx.4376	chr12	-	479	3	NNC	ENSMUSG00000113490.2	novel	324	2	NA	NA	618	6280	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGGTGTGATGGTGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88306926	88300400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_88300538_88305116_88305191_88306658
tx.4377	chr12	+	905	2	ISM	ENSMUSG00000021044.16	ENSMUST00000101165.9	2158	11	-10	92532	-10	-2203	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATTTTGTGTCTGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88327313	88335957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_88327366_88335104
tx.4378	chr12	+	2352	11	FSM	ENSMUSG00000021044.16	ENSMUST00000222695.2	2253	11	-96	-3	-2	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	17	junction_1	17.7822945651004	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGTTCCTTCTCAATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88327321	88428493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_88327554_88335104_88335251_88338464_88338549_88368742_88368947_88397790_88397950_88407852_88408012_88413410_88413528_88422248_88422399_88423506_88423705_88425779_88425974_88427784
tx.4379	chr12	+	1064	2	ISM	ENSMUSG00000021044.16	ENSMUST00000222695.2	2253	11	-75	92533	19	-2203	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTATTTTGTGTCTGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88327342	88335957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_88327554_88335104
tx.4380	chr12	+	1021	2	FSM	ENSMUSG00000021044.16	ENSMUST00000221630.2	3214	2	-6	2199	-6	-2199	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGTCTGTGAATGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88327578	88335961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_88327743_88335104
tx.4381	chr12	+	2286	11	FSM	ENSMUSG00000021044.16	ENSMUST00000166940.3	2199	11	-80	-7	-6	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	20.9752234791432	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTCCTTCTCAATCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88327578	88428495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_88327743_88335104_88335251_88338464_88338549_88368742_88368947_88397790_88397950_88407852_88408012_88413410_88413528_88422248_88422399_88423506_88423705_88425779_88425974_88427784
tx.4382	chr12	+	2119	10	ISM	ENSMUSG00000021044.16	ENSMUST00000166940.3	2199	11	7445	-3	7445	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	5.14241620684717	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGACTGTTCCTTCTCAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88335103	88428491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_88335251_88338464_88338549_88368742_88368947_88397790_88397950_88407852_88408012_88413410_88413528_88422248_88422399_88423506_88423705_88425779_88425974_88427784
tx.4383	chr12	-	1980	3	ISM	ENSMUSG00000020961.16	ENSMUST00000052969.15	9896	7	137950	6275	65488	2259	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_2	3	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCATTTCTCTGGGCCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91615260	91606057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_91606580_91608494_91608698_91614005
tx.4384	chr12	-	1495	4	FSM	ENSMUSG00000020964.15	ENSMUST00000172246.8	1484	4	5	-16	-4	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	369	junction_2	17.2819751957543	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAGAGAGAAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91815908	91798932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_91799997_91808411_91808629_91809999_91810038_91815732
tx.4385	chr12	-	672	3	FSM	ENSMUSG00000020964.15	ENSMUST00000169843.2	617	3	-2	-53	-2	53	multi-exon	FALSE	canonical	3	369	junction_1	20	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATGTCCTCGCTTTTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91815916	91808178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_91808629_91809999_91810038_91815732
tx.4386	chr12	+	2045	12	FSM	ENSMUSG00000021007.15	ENSMUST00000048402.12	2052	12	7	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_2	12.115149999242	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCACATATTTATTATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98594422	98636074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_98594594_98598221_98598297_98600482_98600579_98603824_98603873_98614607_98614742_98624471_98624906_98625808_98625876_98628230_98628347_98629423_98629478_98630486_98630565_98635090_98635149_98635360
tx.4387	chr12	+	969	2	FSM	ENSMUSG00000021007.15	ENSMUST00000130136.2	938	2	-26	-5	2	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGTAAAGAGTGCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98594422	98599019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_98594594_98598221
tx.4388	chr12	+	2309	14	FSM	ENSMUSG00000021013.17	ENSMUST00000085109.10	2272	14	-29	-8	-29	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_7	3.54347470962493	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCACTTTTCACAAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98886803	98949499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_98887043_98908476_98908598_98909561_98909626_98909720_98909881_98910083_98910174_98912827_98912873_98923539_98923626_98927660_98927749_98930755_98930867_98940900_98941041_98942235_98942411_98942685_98942809_98946060_98946145_98948716
tx.4391	chr12	-	1862	6	FSM	ENSMUSG00000021176.7	ENSMUST00000046485.5	2068	6	-7	213	-7	-213	multi-exon	TRUE	canonical	3	69	junction_2	7.87400787401181	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAATGAAGAAGCAATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99849708	99684003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_99685363_99820868_99820960_99821796_99821899_99844615_99844662_99849020_99849117_99849540
tx.4392	chr12	+	361	1	FSM	ENSMUSG00000113223.2	ENSMUST00000221445.2	351	1	-17	7	-17	-7	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTCTCACGTCACCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99871169	99871530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_99871200_99871500
tx.4393	chr12	-	380	3	FSM	ENSMUSG00000021176.7	ENSMUST00000221801.2	3131	3	54	2697	-7	48	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_2	4.5	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAGTTGGTATGTCATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99849708	99844545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_99844662_99849020_99849117_99849540
tx.4394	chr12	+	2063	16	FSM	ENSMUSG00000021177.17	ENSMUST00000153627.8	2036	16	-25	-2	-5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	362	junction_1	45.8998910674089	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTACAGGCCTGGAATGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99850770	99921480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_99850812_99857435_99858005_99859876_99859921_99860968_99861025_99864522_99864620_99868606_99868642_99872294_99872388_99875937_99876106_99876541_99876621_99877853_99878040_99878533_99878583_99880309_99880377_99881708_99881817_99901263_99901367_99911498_99911608_99921221
tx.4395	chr12	+	773	7	ISM	ENSMUSG00000021177.17	ENSMUST00000021594.5	2019	15	20528	-5	53	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	436	junction_6	34.6073209981164	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTACAGGCCTGGAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99877959	99921478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_99878040_99878533_99878583_99880309_99880377_99881708_99881817_99901263_99901367_99911498_99911608_99921221
tx.4396	chr12	+	1541	11	FSM	ENSMUSG00000021178.10	ENSMUST00000021595.10	1591	11	10	40	10	-40	multi-exon	FALSE	canonical	3	1446	junction_1	298.758363899657	1877	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTGTAATGAGTACCATG	3983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100076422	100089624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_100076471_100078589_100078644_100079314_100079412_100081096_100081222_100081678_100081865_100082045_100082175_100082957_100083055_100085331_100085522_100086245_100086398_100087251_100087407_100089316
tx.4397	chr12	+	1494	10	ISM	ENSMUSG00000021178.10	ENSMUST00000021595.10	1591	11	2176	40	2115	-40	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2088	junction_7	130.11229717649	1109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTGTAATGAGTACCATG	6149	False	NA	-38	True	NA	NA	NA	100078588	100089624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_100078644_100079314_100079412_100081096_100081222_100081678_100081865_100082045_100082175_100082957_100083055_100085331_100085522_100086245_100086398_100087251_100087407_100089316
tx.4398	chr12	+	1442	9	ISM	ENSMUSG00000021178.10	ENSMUST00000021595.10	1591	11	2899	40	2838	-40	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2088	junction_6	134.860518221606	723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTGTAATGAGTACCATG	6872	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100079311	100089624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_100079412_100081096_100081222_100081678_100081865_100082045_100082175_100082957_100083055_100085331_100085522_100086245_100086398_100087251_100087407_100089316
tx.4399	chr12	-	892	3	ISM	ENSMUSG00000021179.9	ENSMUST00000021596.9	3718	14	9	23931	9	-5312	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_1	11.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCTGGCTATTTTTTTTT	8565	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100125898	100115641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_100116310_100117469_100117594_100125798
tx.44	chr1	+	487	3	NNC	ENSMUSG00000099498.2	novel	288	4	NA	NA	9608	15825	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_1	1	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTTGTGTGTGAAGAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13148669	13164711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_13148745_13148829_13148887_13164356
tx.4400	chr12	-	1250	2	Intergenic	novelGene_425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTCTCAATTATTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100147235	100145844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_100146935_100147075
tx.4401	chr12	+	728	6	FSM	ENSMUSG00000001175.17	ENSMUST00000110082.11	4115	6	92	3295	-2	24	multi-exon	FALSE	canonical	3	3420	junction_5	211.830687106472	7162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCATTTCTTCATTCTGTT	9257	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100165785	100172778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_100165976_100168651_100168683_100169833_100169978_100171871_100171979_100172356_100172493_100172658
tx.4402	chr12	+	722	5	NNC	ENSMUSG00000001175.17	novel	4115	6	NA	NA	-1	24	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1532.38105166437	308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCATTTCTTCATTCTGTT	9258	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100165786	100172778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_100166002_100169833_100169978_100171871_100171979_100172356_100172493_100172658
tx.4403	chr12	+	1979	2	ISM	ENSMUSG00000113679.2	ENSMUST00000220721.2	1230	4	-73	4921	-44	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTCTGAGCTCTGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100256470	100263653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_100256684_100261887
tx.4404	chr12	+	1163	3	ISM	ENSMUSG00000113679.2	ENSMUST00000223300.2	4791	4	13646	3514	-1	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTCTGAGCTCTGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100256513	100263653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_100256684_100261887_100261990_100262762
tx.4405	chr12	+	1269	4	NNC	ENSMUSG00000113679.2	novel	1230	4	NA	NA	0	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	7	junction_3	2.94392028877595	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCTTGCCTTAGTCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100256514	100268568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_100256684_100261887_100261990_100267215_100267355_100267709
tx.4406	chr12	+	716	3	NIC	ENSMUSG00000113679.2	novel	724	3	NA	NA	-12	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_2	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTCTGAGCTCTGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100256531	100263653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_100256684_100261887_100261990_100263191
tx.4407	chr12	-	1069	2	ISM	ENSMUSG00000033530.9	ENSMUST00000223255.2	695	3	7298	-840	7298	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	240	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTGGCTTTTGTCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100291870	100267028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_100268030_100291802
tx.4408	chr12	-	1234	8	NIC	ENSMUSG00000021180.10	novel	1039	8	NA	NA	12	22	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_1	9.9979589753844	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACTGTTTCAAGATTACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100691367	100560620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_100560824_100562073_100562178_100564148_100564233_100582255_100582364_100585784_100585901_100620529_100620749_100644776_100644849_100691039
tx.4409	chr12	-	408	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000113113.2	novel	403	1	NA	NA	-27	56	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAGTATCCACAACATAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100711221	100710735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_-_100711043_100711120
tx.4410	chr12	-	932	8	ISM	ENSMUSG00000021182.17	ENSMUST00000085096.10	6313	30	101	55036	27	1605	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_5	4.32364170012044	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGTGGTGGTGTGGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100995141	100933994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_100934252_100934512_100934654_100936650_100936735_100937479_100937539_100950158_100950229_100988552_100988662_100994494_100994596_100995030
tx.4411	chr12	-	1619	3	ISM	ENSMUSG00000041846.16	ENSMUST00000222956.2	6009	5	6091	0	967	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	499	junction_2	93	191	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTATTAATTGTATGTTTC	7298	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101008837	101005770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_101007039_101008083_101008311_101008713
tx.4412	chr12	-	2020	2	ISM	ENSMUSG00000041846.16	ENSMUST00000222956.2	6009	5	6093	0	969	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	685	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTATTAATTGTATGTTTC	7300	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101008835	101005770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_101007039_101008083
tx.4413	chr12	+	620	3	FSM	ENSMUSG00000097121.3	ENSMUST00000221614.2	706	3	82	4	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	1	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTGTTTGGTTTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101050018	101054438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_101050285_101050542_101050759_101054300
tx.4414	chr12	+	410	2	FSM	ENSMUSG00000097121.3	ENSMUST00000180800.2	2431	2	1273	748	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTTGTTTGGTTTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101050012	101054438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_101050285_101054300
tx.4415	chr12	-	2350	11	FSM	ENSMUSG00000021186.10	ENSMUST00000021603.9	5829	11	107	3372	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_2	1.74355957741627	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGTGTTTGGTTAATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101785207	101716195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_101717163_101723514_101723711_101726959_101727087_101728060_101728184_101731414_101731535_101734651_101734769_101737503_101737627_101775974_101776230_101778412_101778465_101780800_101780856_101784992
tx.4416	chr12	-	627	3	ISM	ENSMUSG00000021188.15	ENSMUST00000176728.2	1186	9	-6	12489	-6	10041	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_2	5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGCAAGAGCTGGTTTTCG	7542	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101879405	101868493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_101868602_101872013_101872076_101878948
tx.4417	chr12	+	1762	2	NNC	ENSMUSG00000093579.2	novel	844	2	NA	NA	18	322	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAGTCTGCCTCATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101879516	101881916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_101880216_101880853
tx.4418	chr12	-	2001	11	FSM	ENSMUSG00000021189.12	ENSMUST00000021606.12	5363	11	17	3345	14	835	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_2	46.8375917399689	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTAAAAATATTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101924488	101888504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_101889464_101892742_101892841_101899226_101899324_101900506_101900674_101903595_101903729_101908375_101908464_101911658_101911726_101912092_101912179_101914262_101914308_101914533_101914699_101924392
tx.4419	chr12	-	2100	11	NIC	ENSMUSG00000021189.12	novel	5363	11	NA	NA	14	937	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	37	junction_9	87.9545337091841	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGTGGGTTGACCCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101924488	101888402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_101889464_101892742_101892841_101899226_101899324_101900506_101900674_101903595_101903729_101908375_101908464_101911658_101911726_101912092_101912179_101914262_101914305_101914533_101914699_101924392
tx.442	chr1	+	1689	2	ISM	ENSMUSG00000026142.16	ENSMUST00000027322.14	3636	7	118	103438	-72	22198	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATAAGTGTCCAACTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82294290	82319649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_82294370_82318039
tx.4420	chr12	-	988	9	FSM	ENSMUSG00000021189.12	ENSMUST00000161011.8	1000	9	14	-2	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_2	19.5380238253514	197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTTGTCTGTTTATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101924488	101899182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_101899324_101900506_101900674_101903595_101903729_101908375_101908464_101911658_101911726_101912092_101912179_101914262_101914308_101914533_101914699_101924392
tx.4421	chr12	-	262	2	ISM	ENSMUSG00000113902.2	ENSMUST00000221191.2	511	3	6288	-14	6288	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1985	junction_1	0	1139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAAGTGTGATTCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101935898	101934354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_101934470_101935751
tx.4422	chr12	-	336	3	FSM	ENSMUSG00000113902.2	ENSMUST00000221422.2	861	3	519	6	192	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1653	junction_2	166	5210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAAGTGTGATTCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101941994	101934354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_101934470_101935751_101935897_101941918
tx.4424	chr12	+	3308	15	FSM	ENSMUSG00000041781.10	ENSMUST00000047357.10	5732	15	-14	2438	-14	-2438	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_8	15.7246718923623	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTCTAAGCTGAGTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101942232	101970245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_101942394_101948172_101948355_101949434_101949595_101949678_101949785_101951479_101951610_101953516_101953633_101954891_101955080_101956047_101956339_101963077_101963179_101963513_101963715_101964795_101964949_101965631_101965858_101966935_101967236_101968886_101969022_101969387
tx.4426	chr12	-	1890	14	FSM	ENSMUSG00000021190.15	ENSMUST00000021607.9	1990	14	116	-16	116	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	371	junction_3	48.4071734133467	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGGCTTTGTGGTTTGTG	7605	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102405956	102360340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_102360872_102361100_102361169_102361902_102362074_102364441_102364643_102366163_102366254_102366396_102366516_102368143_102368211_102368928_102368992_102369685_102369762_102370518_102370605_102372054_102372137_102379723_102379822_102389843_102390015_102405889
tx.4427	chr12	+	2808	13	FSM	ENSMUSG00000021192.17	ENSMUST00000179218.9	2827	13	128	-109	71	107	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_3	16.7257286836777	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTTCTTTTTTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102435521	102464273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_102435623_102438256_102438825_102440804_102441033_102442428_102442649_102443055_102443180_102445856_102446061_102450662_102450834_102453378_102453508_102455677_102455777_102458271_102458498_102460012_102460119_102461958_102462023_102463705
tx.4428	chr12	+	978	2	ISM	ENSMUSG00000021192.17	ENSMUST00000179218.9	2827	13	116	25043	59	-24720	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAAAATTAGTCTTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102435509	102439121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_102435623_102438256
tx.4429	chr12	+	1875	8	FSM	ENSMUSG00000021194.7	ENSMUST00000021610.7	1883	8	7	1	7	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	24	junction_1	6.51841974088562	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTCTTTGATTTATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102521234	102531286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_102521430_102522143_102522191_102524724_102524819_102525547_102525617_102527603_102527763_102527925_102528343_102528856_102529333_102530868
tx.4430	chr12	+	1855	8	NNC	ENSMUSG00000021194.7	novel	1883	8	NA	NA	4	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	12.2574425537786	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTCTTTGATTTATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102521231	102531286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_102521430_102522143_102522191_102524724_102524819_102525547_102525617_102527626_102527763_102527925_102528343_102528856_102529333_102530868
tx.4431	chr12	+	888	2	ISM	ENSMUSG00000021194.7	ENSMUST00000021610.7	1883	8	7635	1	4536	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTCTTTGATTTATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102528862	102531286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_102529333_102530868
tx.4432	chr12	-	2917	10	FSM	ENSMUSG00000057963.10	ENSMUST00000046518.12	2918	10	-4	5	-4	-5	multi-exon	TRUE	canonical	3	205	junction_5	27.4851250454756	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGCATTCTGTACGTGGTCA	2403	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102671193	102534845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_102536744_102540180_102540344_102545363_102545432_102550545_102550712_102554154_102554196_102554722_102554822_102572347_102572466_102589558_102589685_102641701_102641727_102670980
tx.4433	chr12	-	2063	2	ISM	ENSMUSG00000057963.10	ENSMUST00000046518.12	2918	10	130849	0	19996	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTACGTGGTCACAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102540340	102534840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_102536744_102540180
tx.4434	chr12	-	1936	2	FSM	ENSMUSG00000041716.8	ENSMUST00000174651.2	2795	2	872	-13	872	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_1	0	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATACATTGTAATACTACAT	6362	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102724059	102707977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_102709654_102723799
tx.4435	chr12	-	1791	2	FSM	ENSMUSG00000096458.8	ENSMUST00000178384.2	1284	2	-4	-503	-4	503	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATCTTTGTATACATTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102709924	102707985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_102709654_102709801
tx.4436	chr12	+	856	2	NNC	ENSMUSG00000046675.8	novel	3367	2	NA	NA	-43	-2158	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	65	junction_1	0	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTTTGCTTGCTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102709977	102711662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_102710030_102710858
tx.4437	chr12	-	1155	2	FSM	ENSMUSG00000091931.6	ENSMUST00000173969.2	1152	2	-3	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	237	junction_1	0	522	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATATTTTCTGTAGCCTCTT	6359	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102724062	102719533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_102720426_102723799
tx.4438	chr12	+	671	3	ISM	ENSMUSG00000041712.8	ENSMUST00000046404.8	3261	11	9	15453	9	-15453	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	541	junction_2	11	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCACCAAAATATTTTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102724234	102728513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_102724438_102727629_102727764_102728179
tx.4439	chr12	+	3252	11	FSM	ENSMUSG00000041712.8	ENSMUST00000046404.8	3261	11	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	541	junction_2	45.0115540722602	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTTTTCTGATTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102724234	102743966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_102724438_102727629_102727764_102728179_102728241_102729716_102729813_102732066_102732121_102732504_102732611_102734328_102734538_102735352_102735503_102736039_102736203_102737477_102737540_102741952
tx.444	chr1	+	1708	8	FSM	ENSMUSG00000026150.15	ENSMUST00000160786.8	1645	8	-23	-40	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_5	134.32947615198	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATGTCTATGGAAAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82702637	82730111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_82702806_82704948_82705058_82706936_82707158_82708833_82709004_82713139_82713229_82724803_82724864_82728240_82728326_82729305
tx.4440	chr12	+	509	2	FSM	ENSMUSG00000043319.6	ENSMUST00000053611.5	458	2	-42	-9	-42	9	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTGCTTTCTTTTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102865532	102866794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_102865751_102866503
tx.4441	chr12	-	722	2	ISM	ENSMUSG00000021200.15	ENSMUST00000127447.2	2399	6	11633	-4	11633	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGCCCTGTGATTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103290210	103287400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_103287934_103290021
tx.4442	chr12	+	2762	6	FSM	ENSMUSG00000021203.16	ENSMUST00000021620.13	2791	6	30	-1	30	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_1	8.60232526704263	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCAGTCTGGCTTCTTAAT	8206	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103354986	103372605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_103355133_103366454_103366551_103367207_103367327_103369075_103369161_103369492_103369688_103370484
tx.4443	chr12	-	2879	9	FSM	ENSMUSG00000041645.15	ENSMUST00000044923.15	2850	9	-28	-1	-17	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	750	junction_8	40.7106788815908	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGAGGGTGTTGCAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103392106	103374239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_103374737_103376186_103376317_103377387_103377577_103382454_103382531_103383536_103384053_103384322_103384477_103385220_103385743_103390130_103390857_103392037
tx.4444	chr12	-	560	2	FSM	ENSMUSG00000041645.15	ENSMUST00000220705.2	4274	2	-17	3731	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	750	junction_1	0	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGATACTTTTCAGAGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103392106	103390365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_103390857_103392037
tx.4445	chr12	+	530	3	FSM	ENSMUSG00000064215.14	ENSMUST00000153670.2	527	3	1	-4	1	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATTGTTCCCCTTTCTGTG	10003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103403886	103406502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_103403965_103405659_103405822_103406212
tx.4446	chr12	-	1525	5	FSM	ENSMUSG00000071178.12	ENSMUST00000186166.7	1762	5	237	0	237	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.82915619758885	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCCTTGACTCTGTGGGTTT	7606	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103706537	103694414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_103694693_103695489_103695641_103696508_103696780_103698219_103698852_103706344
tx.4447	chr12	+	2060	5	NIC	ENSMUSG00000041449.17	novel	1226	4	NA	NA	-16	738	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	40	junction_3	10.7325439668328	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAGAGTGTTCACAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104214147	104220666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_104214232_104216398_104217017_104217730_104218005_104218943_104219095_104219733
tx.4448	chr12	+	2964	2	ISM	ENSMUSG00000079014.5	ENSMUST00000109958.3	2200	6	4	2196	4	1440	intron_retention	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAAAAAAAAAATCTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104229384	104233435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_104229474_104230560
tx.4449	chr12	+	415	2	Intergenic	novelGene_427	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGTCTTGGCTCCATTTT	645	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104343713	104349131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_104343932_104348934
tx.445	chr1	+	1648	7	NIC	ENSMUSG00000026150.15	novel	1715	8	NA	NA	-1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	326	junction_5	73.6809940818451	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATGTCTATGGAAAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82702637	82730111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_82702806_82704948_82705058_82706936_82707158_82708833_82709004_82713139_82713229_82728240_82728326_82729305
tx.4452	chr12	+	754	4	FSM	ENSMUSG00000112954.2	ENSMUST00000222329.2	757	4	9	-6	9	6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGACTCCTGAATCACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104486235	104492242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_104486510_104488300_104488416_104489405_104489469_104491940
tx.4453	chr12	-	1203	2	Intergenic	novelGene_428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGGTTGGATTTACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104564478	104559620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_104560487_104564141
tx.4454	chr12	-	2269	5	ISM	ENSMUSG00000021097.16	ENSMUST00000109936.3	11866	13	82963	8299	-1242	64	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_1	6.13901457890434	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGAGGAGCTTGAGTTACT	3698	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104748372	104737674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_104738223_104740031_104740103_104740747_104740809_104743203_104743401_104746980
tx.4455	chr12	-	537	2	FSM	ENSMUSG00000113722.2	ENSMUST00000222812.2	527	2	-10	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGTGTCTCGTCTACTC	8328	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104998546	104996875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_104997085_104998218
tx.4456	chr12	+	724	2	FSM	ENSMUSG00000021102.5	ENSMUST00000021522.5	2925	2	151	2050	151	117	multi-exon	FALSE	canonical	3	651	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTGTGTGTGAGTCATTAAA	6511	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104999099	105007115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_104999242_105006533
tx.4457	chr12	+	1755	2	Intergenic	novelGene_430	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTTATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105043743	105082790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_105043885_105081176
tx.4458	chr12	-	1354	5	NNC	ENSMUSG00000041359.15	novel	1398	4	NA	NA	-3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	850.691777320082	296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCGTGCTCTTGGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105188999	105183011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_105183321_105183364_105183961_105184481_105184552_105184917_105185089_105188791
tx.4459	chr12	-	1284	4	NNC	ENSMUSG00000041359.15	novel	1398	4	NA	NA	-3	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	917.824601980139	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCGTGCTCTTGGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105188999	105183011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_105183321_105183364_105183961_105184917_105185089_105188791
tx.446	chr1	+	1710	8	FSM	ENSMUSG00000026150.15	ENSMUST00000073025.12	1706	8	-1	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_5	154.121870675152	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATGTCTATGGAAAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82702638	82730111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_82702806_82704948_82705058_82706936_82707158_82708833_82709004_82713136_82713229_82724803_82724864_82728240_82728326_82729305
tx.4460	chr12	-	1398	4	FSM	ENSMUSG00000041359.15	ENSMUST00000041316.15	1398	4	-3	3	-3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	814.330945555238	1490	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCGTGCTCTTGGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105188999	105183011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_105183961_105184481_105184552_105184917_105185089_105188791
tx.4461	chr12	-	1328	3	FSM	ENSMUSG00000041359.15	ENSMUST00000101071.4	1299	3	-24	-5	-3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	973.5	428	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCGTGCTCTTGGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105188999	105183011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_105183961_105184917_105185089_105188791
tx.4462	chr12	+	1281	3	FSM	ENSMUSG00000097929.10	ENSMUST00000180458.9	3282	3	182	1819	182	-1817	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	9	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGGAGAAGCACTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105303034	105348372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_105303217_105303488_105303819_105347603
tx.4463	chr12	+	1214	3	NNC	ENSMUSG00000097929.10	novel	3282	3	NA	NA	-114	-1817	intron_retention	FALSE	canonical	3	11	junction_1	10.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTGGAGAAGCACTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105303137	105348372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_105303253_105303488_105303819_105347603
tx.4464	chr12	+	1123	2	FSM	ENSMUSG00000094910.2	ENSMUST00000178224.2	5786	2	1	4662	1	-4662	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACACTGGAATGAACTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105420115	105454692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_105420410_105453863
tx.4465	chr12	+	1654	3	FSM	ENSMUSG00000044715.8	ENSMUST00000051934.7	2720	3	-9	1075	-9	-1075	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_2	9.5	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAAAGGACCTGGCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105651633	105668207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_105651718_105664976_105665236_105666896
tx.4466	chr12	+	521	2	FSM	ENSMUSG00000044715.8	ENSMUST00000222284.2	1064	2	547	-4	-8	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_1	0	340	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGAGGGTGTAAATACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105651634	105665414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_105651718_105664976
tx.4467	chr12	+	803	4	ISM	ENSMUSG00000041323.7	ENSMUST00000040876.7	3099	18	55406	13597	16107	-13597	internal_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_2	6.54896090146283	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTGAGTACCACTGTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105727640	105735109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_105727856_105730211_105730281_105732812_105733011_105734788
tx.4468	chr12	+	1621	6	ISM	ENSMUSG00000041323.7	ENSMUST00000040876.7	3099	18	55410	14	16111	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_2	5.54977477020464	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATCCTGAAGAAGAAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105727644	105748692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_105727856_105730211_105730281_105732812_105733011_105734788_105735010_105747108_105747268_105747929
tx.4469	chr12	+	1085	9	FSM	ENSMUSG00000021111.16	ENSMUST00000166735.8	1033	9	-52	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1577	junction_3	94.8235202890085	2791	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTAGTCTTATTTCTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105750963	105775968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_105751174_105765909_105766084_105766942_105767010_105771185_105771268_105772745_105772856_105773423_105773478_105774813_105774926_105775601_105775692_105775782
tx.447	chr1	+	1654	7	NIC	ENSMUSG00000026150.15	novel	1706	8	NA	NA	-4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	164	junction_4	124.696520489636	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAATGTCTATGGAAAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82702634	82730111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_82702806_82704948_82705058_82706936_82707158_82708833_82709004_82713136_82713229_82728240_82728326_82729305
tx.4470	chr12	+	867	8	ISM	ENSMUSG00000021111.16	ENSMUST00000163805.2	1170	9	-26	1703	-26	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1577	junction_2	98.994537058097	1406	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTAGTCTTATTTCTGTGA	4465	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105765917	105775968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_105766084_105766942_105767010_105771185_105771268_105772745_105772856_105773423_105773478_105774813_105774926_105775601_105775692_105775782
tx.4471	chr12	+	1984	2	FSM	ENSMUSG00000113835.2	ENSMUST00000220934.2	2076	2	-27	119	-27	-119	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGTCACAGCTGGAAAAAGT	3324	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105866072	105868290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_105866201_105866434
tx.4472	chr12	+	1639	13	FSM	ENSMUSG00000021115.16	ENSMUST00000072040.7	1509	13	45	-175	-10	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	439	junction_12	159.966901958568	1227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCCGGTCTTTTACACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105976531	106041654	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_105976618_106002798_106002964_106009095_106009152_106017193_106017264_106018018_106018107_106022060_106022170_106022279_106022373_106024101_106024235_106024834_106024956_106025876_106025936_106028888_106029068_106036783_106036875_106041265
tx.4473	chr12	+	1687	14	FSM	ENSMUSG00000021115.16	ENSMUST00000085026.12	3711	14	-19	2043	-10	-26	multi-exon	FALSE	canonical	3	514	junction_12	169.729126349489	1143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTCTACATGGATTCCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105976531	106041642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_105976618_106002798_106002964_106009095_106009152_106017193_106017264_106018018_106018107_106022060_106022170_106022279_106022373_106024101_106024235_106024834_106024956_106025876_106025936_106028888_106029068_106036783_106036875_106039877_106039938_106041265
tx.4474	chr12	+	517	4	ISM	ENSMUSG00000021115.16	ENSMUST00000085026.12	3711	14	52345	2226	31920	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	514	junction_2	262.603630337942	331	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTGAAGGGTAATTTATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106028895	106041459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_106029068_106036783_106036875_106039877_106039938_106041265
tx.4475	chr12	-	1345	2	ISM	ENSMUSG00000056770.16	ENSMUST00000148119.8	3056	5	6289	-230	6289	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	471	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGTTTTTGTTTGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108074917	108072694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_108073938_108074815
tx.4476	chr12	-	2657	13	FSM	ENSMUSG00000056770.16	ENSMUST00000071095.14	2755	13	87	11	0	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	469	junction_9	51.1017503505397	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGACTGGTGTTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108145486	108072700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_108073938_108074815_108074977_108077480_108077567_108078388_108078556_108079577_108079653_108084500_108084616_108085364_108085424_108124012_108124270_108124534_108124608_108126491_108126641_108129231_108129325_108131321_108131432_108145411
tx.4477	chr12	+	598	6	NNC	ENSMUSG00000021258.11	novel	2789	12	NA	NA	-49	-13015	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	32.8791727389848	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCAAAACGGCTCGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108145788	108155390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_108145816_108145996_108146140_108148435_108148468_108152634_108152882_108153437_108153520_108155323
tx.4478	chr12	+	2569	12	FSM	ENSMUSG00000021258.11	ENSMUST00000221167.2	2789	12	221	-1	62	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_11	12.5217166726353	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTTATGTGTGAGTACAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108146058	108169617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_108146140_108148435_108148468_108152634_108152882_108153437_108153520_108155323_108155456_108159930_108160037_108160600_108160659_108161325_108161496_108161841_108162111_108162597_108162632_108165567_108165643_108168334
tx.4479	chr12	+	662	4	ISM	ENSMUSG00000021258.11	ENSMUST00000101055.5	2627	11	15921	924	-3426	289	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_3	1.24721912892465	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCCCCCACCCACCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108161917	108168694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_108162111_108162597_108162632_108165567_108165643_108168334
tx.4480	chr12	+	925	8	ISM	ENSMUSG00000021262.16	ENSMUST00000172409.2	1955	15	40414	-3	64	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	151	junction_2	17.4274004290452	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGGCTCTGGCTCACTCT	6180	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108642425	108654775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_108642483_108646087_108646149_108647749_108647814_108649453_108649521_108649606_108649670_108652308_108652376_108652666_108652725_108654287
tx.4481	chr12	+	538	2	ISM	ENSMUSG00000021262.16	ENSMUST00000223548.2	569	3	319	0	319	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	199	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGGCTCTGGCTCACTCT	4270	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108652674	108654775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_108652725_108654287
tx.4482	chr12	+	1598	5	FSM	ENSMUSG00000021264.13	ENSMUST00000021692.9	6178	5	960	3620	960	964	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_1	10.779030568655	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTCTGTAAGCACAGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108759858	108782454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_108760018_108772404_108772568_108778844_108778906_108780531_108780691_108781398
tx.4483	chr12	-	2722	9	ISM	ENSMUSG00000021266.17	ENSMUST00000161410.8	2764	10	4649	4	-132	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1852	junction_6	109.028021054223	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGTCACTGTCTGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108854475	108825959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_108827353_108828728_108828870_108831938_108832226_108833602_108833704_108841039_108841223_108841591_108841712_108846968_108847078_108848620_108848835_108854301
tx.4484	chr12	-	1865	11	NIC	ENSMUSG00000021266.17	novel	1824	11	NA	NA	-10	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	246	junction_1	519.514003661114	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGTCACTGTCTGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108860073	108825959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_108826260_108827194_108827353_108828728_108828870_108831938_108832226_108833602_108833704_108841039_108841223_108841591_108841712_108846968_108847078_108848620_108848835_108854301_108854475_108859994
tx.4485	chr12	-	2801	10	FSM	ENSMUSG00000021266.17	ENSMUST00000109848.10	2831	10	26	4	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1835	junction_9	109.614475929657	865	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGTCACTGTCTGACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108860074	108825959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_108827353_108828728_108828870_108831938_108832226_108833602_108833704_108841039_108841223_108841591_108841712_108846968_108847078_108848620_108848835_108854301_108854475_108859994
tx.4486	chr12	+	1618	4	NNC	ENSMUSG00000040877.17	novel	2657	7	NA	NA	-17651	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	31.6262900483478	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCGTGGTCATGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108969076	108994380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_108969174_108990888_108991060_108992335_108992477_108993171
tx.4487	chr12	+	1514	3	FSM	ENSMUSG00000021268.18	ENSMUST00000129245.8	1498	3	-2	-14	-2	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_2	159.5	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGGAGAAATAAAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109506881	109511216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_109506983_109509582_109509689_109509909
tx.4488	chr12	+	1559	3	ISM	ENSMUSG00000021268.18	ENSMUST00000143836.8	1896	10	-6	26938	-2	15	intron_retention	FALSE	canonical	3	281	junction_2	112.5	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGGAGAAATAAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109506881	109511217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_109506983_109509582_109509733_109509909
tx.4489	chr12	+	1247	5	ISM	ENSMUSG00000097451.12	ENSMUST00000238473.2	1689	9	5198	-249	16	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	549	junction_2	38.8104367406501	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTGAAGTACAATTATTGA	4362	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109622299	109628150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_109622369_109623221_109623275_109624486_109624556_109626156_109626242_109627179
tx.4490	chr12	+	535	2	FSM	ENSMUSG00000097391.9	ENSMUST00000182300.2	694	2	159	0	159	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGCTTGCGTGTCTGTATT	4948	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109714556	109715892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_109714728_109715528
tx.4491	chr12	-	655	2	Intergenic	novelGene_432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCGGGCCAAAATAACGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109913498	109912212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_109912630_109913260
tx.4492	chr12	+	213	2	Intergenic	novelGene_433	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACGTTCATGTTACACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109913603	109913912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_109913701_109913796
tx.4493	chr12	+	680	2	Intergenic	novelGene_434	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGAACATTTGTTTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109918215	109919719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_109918700_109919523
tx.4494	chr12	-	794	2	Intergenic	novelGene_437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCTGGCTGTTTTCTTTCT	7163	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110386429	110349726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_110350376_110386284
tx.4495	chr12	+	1534	12	FSM	ENSMUSG00000017843.15	ENSMUST00000221715.2	2367	12	58	775	57	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	738	junction_1	90.3704039902189	295	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCTCTTGTATAAGTACT	4978	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110452229	110537347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_110452387_110488924_110489125_110510508_110510620_110512028_110512122_110512204_110512336_110517495_110517556_110519218_110519328_110521276_110521331_110527731_110527903_110534161_110534290_110535387_110535490_110537129
tx.4496	chr12	+	389	3	ISM	ENSMUSG00000017843.15	ENSMUST00000221715.2	2367	12	82049	775	81928	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	966	junction_2	39	244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCTCTTGTATAAGTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110534220	110537347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_110534290_110535387_110535490_110537129
tx.4497	chr12	-	1589	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000113361.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCCTTCTATTTCAGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110558037	110555696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_-_110556617_110557368
tx.4498	chr12	+	1100	6	ISM	ENSMUSG00000018707.14	ENSMUST00000018851.14	14342	77	63147	26	1410	-26	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	584	junction_1	43.3192797724062	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGCTCCCGCCTCTTGCCG	2251	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110631032	110633353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_110631182_110631516_110631671_110632097_110632241_110632391_110632561_110632727_110632856_110632996
tx.4499	chr12	+	965	4	ISM	ENSMUSG00000018707.14	ENSMUST00000018851.14	14342	77	64049	21	2312	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	646	junction_2	25.2498624858742	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCGCCTCTTGCCGCTCTG	3153	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110631934	110633358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_110632241_110632391_110632561_110632727_110632856_110632996
tx.45	chr1	-	599	3	Intergenic	novelGene_6	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATCTATTTATTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13176160	13160603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_13161041_13174549_13174641_13176089
tx.4500	chr12	+	177	1	Intergenic	novelGene_438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATCTTTAAAATAAAATAT	9409	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110638190	110638367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_110638200_110638400
tx.4501	chr12	+	289	2	Intergenic	novelGene_439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTTCTTTTTAAAAGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110656841	110720381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_110657106_110720356
tx.4502	chr12	-	2772	11	FSM	ENSMUSG00000021270.14	ENSMUST00000094361.11	3281	11	86	423	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11114	junction_7	1521.95811046165	7777	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGGAATGTGTCTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110662743	110657461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_110658084_110658547_110658882_110659037_110659307_110659453_110659602_110659745_110659937_110660144_110660311_110660456_110660778_110661004_110661139_110661485_110661853_110661952_110662115_110662685
tx.4503	chr12	-	808	5	ISM	ENSMUSG00000021270.14	ENSMUST00000094361.11	3281	11	86	3652	-20	-82	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11114	junction_1	618.781261836523	6760	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTCTGATGATAAACCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110662743	110660690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_110660778_110661004_110661139_110661485_110661853_110661952_110662115_110662685
tx.4504	chr12	+	2378	3	FSM	ENSMUSG00000037957.15	ENSMUST00000095410.8	2384	3	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_2	4	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGTTTGTAGAACTCTGAT	5352	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110704431	110761462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_110704712_110745729_110745913_110759547
tx.4505	chr12	-	1301	9	NNC	ENSMUSG00000056458.17	novel	1693	12	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	97.9903534793094	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAAGGGTTTGTTTCATTT	7662	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110807371	110774231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_110774556_110774638_110774840_110776342_110776458_110777038_110777176_110778212_110778315_110779948_110780128_110781401_110781451_110781564_110781644_110807256
tx.4506	chr12	+	526	1	FSM	ENSMUSG00000096942.2	ENSMUST00000181233.2	438	1	-35	-53	-35	53	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	44	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCAACCCAAGGAAAATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110864512	110865038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_110864500_110865000
tx.4507	chr12	+	1318	6	ISM	ENSMUSG00000021275.17	ENSMUST00000165978.3	7778	20	-7	45690	-7	469	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	3.42928563989645	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTGATTCATTTTTTTAA	5376	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110855690	110893138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_110855761_110862520_110862809_110881083_110881213_110881780_110881913_110885302_110885461_110892597
tx.4508	chr12	+	460	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000096942.2	novel	438	1	NA	NA	-36	52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAACCCAAGGAAAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110864511	110865037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_110864563_110864628
tx.4509	chr12	+	458	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000096942.2	novel	438	1	NA	NA	-36	54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACCCAAGGAAAATCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110864511	110865039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_110864647_110864716
tx.451	chr1	+	311	2	NNC	ENSMUSG00000073633.10	novel	1088	5	NA	NA	3	-52414	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAGTGAGTGTGTGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84817576	84825794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_84817694_84825600
tx.4510	chr12	+	387	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000096942.2	novel	438	1	NA	NA	-36	54	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAACCCAAGGAAAATCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110864511	110865039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr12_+_110864688_110864828
tx.4511	chr12	-	1583	4	NNC	ENSMUSG00000037904.15	novel	1563	4	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	18	junction_1	38.9386982604994	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGGGATCTGCCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110945429	110942860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_-_110943983_110944079_110944205_110944381_110944562_110945273
tx.4512	chr12	-	1565	4	FSM	ENSMUSG00000037904.15	ENSMUST00000135131.2	1563	4	0	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	45.784519460427	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGGGATCTGCCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110945429	110942860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_110943983_110944097_110944205_110944381_110944562_110945273
tx.4513	chr12	-	1459	3	FSM	ENSMUSG00000037904.15	ENSMUST00000128353.8	2577	3	44	1074	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	17	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGGGATCTGCCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110945430	110942860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_110943983_110944381_110944562_110945273
tx.4514	chr12	-	1680	3	FSM	ENSMUSG00000037904.15	ENSMUST00000043459.13	1706	3	26	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	30.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGAGGGATCTGCCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110945429	110942860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_110944205_110944381_110944562_110945273
tx.4515	chr12	+	2636	11	ISM	ENSMUSG00000037896.18	ENSMUST00000116388.4	2720	12	162	-5	162	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_6	7.22564875980005	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GGAAAAAAAAAAAAGTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111006393	111079823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_111006456_111048157_111048242_111059514_111059568_111063888_111064051_111066353_111066473_111068063_111068143_111070044_111070240_111075005_111075084_111075287_111075346_111076214_111076445_111078307
tx.4516	chr12	+	2061	5	ISM	ENSMUSG00000037896.18	ENSMUST00000116388.4	2720	12	63818	6	63818	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	6.40312423743285	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AATACCAAAAAGGAAAAAAA	2147	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111070049	111079812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_111070240_111075005_111075084_111075287_111075346_111076214_111076445_111078307
tx.4517	chr12	+	1675	12	NNC	ENSMUSG00000021278.8	novel	1024	7	NA	NA	-284	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_1	8.49696105130758	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCCTGGTCCTACTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111237244	111242693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_111237456_111238130_111238250_111238331_111238377_111240576_111240665_111240792_111241011_111241144_111241283_111241387_111241497_111241590_111241674_111241778_111241927_111242005_111242184_111242266_111242361_111242449
tx.4518	chr12	+	1531	12	FSM	ENSMUSG00000021278.8	ENSMUST00000021707.8	1701	12	1	169	1	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	7.23969772438711	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATAGCCTGGTCCTACTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111237529	111242691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_111237599_111238130_111238250_111238331_111238377_111240576_111240665_111240792_111241011_111241144_111241283_111241387_111241497_111241590_111241674_111241778_111241927_111242005_111242184_111242266_111242361_111242449
tx.4519	chr12	+	796	5	ISM	ENSMUSG00000021278.8	ENSMUST00000220551.2	1024	7	427	0	427	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_2	5.02493781056044	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTGATAGCCTGGTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111241534	111242686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_111241674_111241778_111241927_111242005_111242184_111242266_111242361_111242449
tx.4520	chr12	+	1779	5	ISM	ENSMUSG00000021282.18	ENSMUST00000050993.11	1969	11	3392	-785	-51	709	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2160	junction_1	107.067735569592	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATACTTCTGAGTCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111508607	111512142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_111508745_111509113_111509276_111509533_111509699_111509960_111510096_111510962
tx.4521	chr12	+	1482	3	FSM	ENSMUSG00000021282.18	ENSMUST00000221243.2	622	3	270	-1130	270	712	multi-exon	FALSE	canonical	3	2291	junction_2	85	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATACTTCTGAGTCAGAGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111509534	111512145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_111509699_111509960_111510096_111510962
tx.4522	chr12	+	1269	2	ISM	ENSMUSG00000021282.18	ENSMUST00000221243.2	622	3	742	-1127	742	709	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2291	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCATACTTCTGAGTCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111510006	111512142	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_111510096_111510962
tx.4523	chr12	+	1482	7	ISM	ENSMUSG00000007411.17	ENSMUST00000075281.8	3321	16	53304	402	3318	122	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_6	160.516527359508	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGTCTTGTTTCCATTG	1600	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111594260	111622250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_111594349_111594623_111594737_111595395_111595550_111600050_111600269_111606370_111606475_111613904_111614163_111621703
tx.4524	chr12	+	935	5	ISM	ENSMUSG00000007411.17	ENSMUST00000221459.2	2807	18	64932	344	-14676	122	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	315	junction_3	78.2000639385928	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTGTCTTGTTTCCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111606416	111622250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_111606475_111613904_111614163_111618391_111618419_111619823_111619869_111621703
tx.4525	chr12	+	1270	3	ISM	ENSMUSG00000007411.17	ENSMUST00000075281.8	3321	16	65460	-5	-14676	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_2	209.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGCACTGTCTCCTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111606416	111622657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_111606475_111613904_111614163_111621703
tx.4526	chr12	-	511	2	FSM	ENSMUSG00000001270.10	ENSMUST00000222705.2	2839	2	2328	0	1531	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8476	junction_1	0	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGAGTGTTGCTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111636388	111635794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_111636176_111636258
tx.4527	chr12	-	1434	8	FSM	ENSMUSG00000001270.10	ENSMUST00000001304.9	1472	8	38	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7551	junction_6	311.265160273359	8195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGAGTGTTGCTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111638734	111635794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_111636176_111636258_111636449_111636595_111636720_111637306_111637479_111637648_111637782_111637858_111638014_111638199_111638408_111638663
tx.4528	chr12	+	1992	4	NIC	ENSMUSG00000060950.13	novel	2131	4	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	64	junction_1	70.7153920067383	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTGTCTTGTTCCCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111644538	111650336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_+_111644596_111645036_111645397_111647235_111647503_111649028
tx.4529	chr12	+	2413	3	FSM	ENSMUSG00000060950.13	ENSMUST00000084947.10	2433	3	20	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_2	1	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTGTCTTGTTCCCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111644558	111650336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_111645397_111647235_111647503_111649028
tx.4530	chr12	-	2084	2	FSM	ENSMUSG00000049792.7	ENSMUST00000054636.7	2139	2	55	0	55	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_1	0	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTCCCCCTGTGCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111679636	111675921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_111677847_111679477
tx.4531	chr12	+	1063	5	FSM	ENSMUSG00000037787.15	ENSMUST00000040519.12	1065	5	5	-3	5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	492	junction_3	10.0343161201947	805	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGCAAGTTGAGAATAAGCC	1546	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111679699	111700657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_111679853_111689045_111689244_111690773_111690838_111696455_111696547_111700100
tx.4532	chr12	-	220	1	Intergenic	novelGene_440	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTTATTTAGTTTTATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111680498	111680278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_111680300_111680500
tx.4533	chr12	+	698	4	NNC	ENSMUSG00000021288.20	novel	806	3	NA	NA	-41	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	59.689939595286	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCAGAATGAAAGCCTGTT	2813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111761744	111773148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_111761845_111761981_111762113_111772441_111772509_111772748
tx.4534	chr12	+	600	3	FSM	ENSMUSG00000021288.20	ENSMUST00000141435.2	806	3	194	12	194	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	18.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACCAGAATGAAAGCCTGTT	3048	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111761979	111773148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_111762113_111772441_111772509_111772748
tx.4535	chr12	-	2455	8	FSM	ENSMUSG00000021287.13	ENSMUST00000021715.6	2422	8	-32	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_7	12.8809303758284	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAACACTTGCAAATTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111780307	111769625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_111771107_111771177_111771225_111771348_111771562_111774266_111774422_111776185_111776399_111777291_111777430_111778494_111778654_111780258
tx.4536	chr12	+	1324	8	NNC	ENSMUSG00000021286.9	novel	794	8	NA	NA	-1	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	78	junction_6	286.13568923338	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGGCTCTGGCCTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111780640	111794822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_111780812_111789675_111789727_111790188_111790358_111791286_111791363_111791450_111791543_111792012_111792067_111793979_111794120_111794251
tx.4537	chr12	+	1278	7	FSM	ENSMUSG00000021286.9	ENSMUST00000021714.9	1308	7	32	-2	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	470	junction_5	111.029525602677	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGGCTCTGGCCTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111780635	111794822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_111780812_111789675_111789727_111790188_111790358_111791286_111791363_111791450_111791543_111793976_111794120_111794251
tx.4538	chr12	+	1331	8	FSM	ENSMUSG00000021286.9	ENSMUST00000223211.2	794	8	-5	-532	-5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	188	junction_5	258.732309855699	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGGCTCTGGCCTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111780636	111794822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_111780812_111789675_111789727_111790188_111790358_111791286_111791363_111791450_111791543_111792012_111792067_111793976_111794120_111794251
tx.4539	chr12	+	1275	7	NNC	ENSMUSG00000021286.9	novel	1308	7	NA	NA	-6	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	53	junction_5	264.970700686363	31	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGGCTCTGGCCTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111780635	111794822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_111780812_111789675_111789727_111790188_111790358_111791286_111791363_111791450_111791543_111793979_111794120_111794251
tx.4540	chr12	+	300	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021290.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATAGAAATGATAAACAT	7447	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111927808	111929789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_111927964_111929644
tx.4541	chr12	+	306	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021290.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	446	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATAGAAATGATAAACAT	7447	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111927808	111929789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_111927992_111929666
tx.4542	chr12	+	322	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021290.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATAGAAATGATAAACAT	7447	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111927808	111929789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_111928008_111929666
tx.4543	chr12	-	398	4	FSM	ENSMUSG00000021290.7	ENSMUST00000021719.7	366	4	-32	0	-32	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	2424	junction_1	129.659382828839	9185	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCTGCTTCCCCTGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111933443	111927808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_111927973_111928866_111928891_111929663_111929788_111933357
tx.4544	chr12	-	374	3	NIC	ENSMUSG00000021290.7	novel	366	4	NA	NA	-32	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1348	2166	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCTGCTTCCCCTGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111933443	111927808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_111927973_111929663_111929788_111933357
tx.4546	chr12	+	1804	13	FSM	ENSMUSG00000011148.15	ENSMUST00000021726.8	1777	13	-8	-19	-8	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_2	10.1005362893924	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGTCTTGACTTCGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112586470	112607792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_112586745_112594734_112594838_112598687_112598751_112599128_112599180_112599502_112599570_112600577_112600686_112600813_112600896_112601034_112601162_112601864_112602020_112602827_112602953_112604618_112604717_112606045_112606196_112607391
tx.4547	chr12	+	1532	12	ISM	ENSMUSG00000011148.15	ENSMUST00000021726.8	1777	13	8254	-19	8206	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_1	10.5470218271078	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGTCTTGACTTCGTCC	5487	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112594732	112607792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_112594838_112598687_112598751_112599128_112599180_112599502_112599570_112600577_112600686_112600813_112600896_112601034_112601162_112601864_112602020_112602827_112602953_112604618_112604717_112606045_112606196_112607391
tx.4548	chr12	+	516	3	FSM	ENSMUSG00000064326.14	ENSMUST00000109755.5	333	3	-75	-108	-75	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	805	263	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGACTCCCTCCCTTCCA	7068	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112611325	112615579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_112611519_112614258_112614416_112615413
tx.4549	chr12	+	703	4	FSM	ENSMUSG00000064326.14	ENSMUST00000021728.12	924	4	221	0	-67	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1700	junction_3	44.6542271235322	4819	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGACTCCCTCCCTTCCA	7076	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112611333	112615579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_112611519_112613271_112613467_112614258_112614416_112615413
tx.4550	chr12	+	491	3	ISM	ENSMUSG00000064326.14	ENSMUST00000021728.12	924	4	2186	0	447	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1700	junction_2	19.5	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGGACTCCCTCCCTTCCA	9041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112613298	112615579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_112613467_112614258_112614416_112615413
tx.4551	chr12	-	1317	4	ISM	ENSMUSG00000001729.15	ENSMUST00000128300.9	1342	12	14614	-847	23	-5	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	299	junction_2	40.1081870279207	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGTGGTTTGCTTTCTGG	9705	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112623384	112620259	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_112621212_112621560_112621664_112622935_112623024_112623210
tx.4552	chr12	-	334	2	FSM	ENSMUSG00000001729.15	ENSMUST00000159815.2	944	2	23	587	23	-587	multi-exon	FALSE	canonical	3	396	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACTGTGCCCATCTCTGG	9705	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112623384	112622863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_112623024_112623210
tx.4553	chr12	+	1991	11	FSM	ENSMUSG00000052160.8	ENSMUST00000063888.5	1982	11	-13	4	-13	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	2.92574776766556	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACATGTCTGTCTGTGTTCT	4267	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112727075	112735420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_112727218_112728959_112729044_112729830_112729998_112730396_112730581_112730881_112731003_112731431_112731560_112733136_112733338_112733931_112734072_112734187_112734354_112734458_112734556_112734859
tx.4554	chr12	+	1949	5	FSM	ENSMUSG00000037594.12	ENSMUST00000037014.11	1960	5	6	5	6	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_2	3.74165738677394	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTGTGTTTTTGTTGAC	3907	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112772562	112779867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_112773429_112774493_112774631_112775802_112775933_112778082_112778200_112779168
tx.4555	chr12	-	1984	2	FSM	ENSMUSG00000047832.10	ENSMUST00000220899.2	1994	2	15	-5	15	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	463	junction_1	0	647	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTGTTAGGAGCCTTTT	9627	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112793028	112783851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_112785733_112792925
tx.4556	chr12	-	2150	2	FSM	ENSMUSG00000047832.10	ENSMUST00000062092.7	2425	2	270	5	255	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAATGTGTTAGGAGCCTT	9916	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112792739	112783853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_112785733_112792468
tx.4557	chr12	-	781	5	FSM	ENSMUSG00000002804.5	ENSMUST00000002881.5	734	5	-19	-28	-12	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_2	82.3995600716412	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCGCTGGCTTTGAGCAC	8835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112905756	112898346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_112898671_112901975_112902178_112902414_112902480_112902898_112902943_112905610
tx.4558	chr12	-	816	5	FSM	ENSMUSG00000002804.5	ENSMUST00000221397.2	1241	5	-11	436	-11	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	180	junction_2	18.0277563773199	925	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCGCTGGCTTTGAGCAC	8836	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112905755	112898346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_112898671_112901975_112902214_112902414_112902480_112902898_112902943_112905610
tx.4559	chr12	-	369	2	ISM	ENSMUSG00000011158.9	ENSMUST00000011302.9	2615	18	39542	-42	267	42	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGGTCTGGATCCCACTT	5027	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112924782	112923662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_-_112923979_112924729
tx.4560	chr12	+	1019	4	ISM	ENSMUSG00000021144.15	ENSMUST00000109723.8	2790	20	34918	-4	1648	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	473	junction_1	39.8580815728337	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCTTCTGCGTCTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113096815	113100830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_113096958_113099416_113099449_113099900_113100053_113100137
tx.4561	chr12	+	1164	7	FSM	ENSMUSG00000006356.11	ENSMUST00000084882.9	1439	7	275	0	-61	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	743	junction_5	14.1745076340121	1488	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCCAGTGTCGTGTGTGTG	5897	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113104130	113109126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_113104235_113107078_113107232_113107634_113107776_113107848_113107918_113108018_113108114_113108429_113108488_113108582
tx.4562	chr12	+	468	6	NNC	ENSMUSG00000006360.12	novel	445	5	NA	NA	-202	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	168.854256683093	136	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTGTGTTTTTGTCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113115429	113117499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_113115521_113115701_113115774_113116900_113116996_113117074_113117133_113117237_113117285_113117394
tx.4563	chr12	+	408	5	FSM	ENSMUSG00000006360.12	ENSMUST00000006523.12	445	5	39	-2	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	402	junction_4	13.838352503098	2827	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTGTGTTTTTGTCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113115670	113117499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_113115774_113116900_113116996_113117074_113117133_113117237_113117285_113117394
tx.4564	chr12	+	742	5	NNC	ENSMUSG00000037466.14	novel	584	6	NA	NA	-19	1209	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	28	junction_2	98.7572782127981	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGGCGCATGCCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113120021	113122418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_113120192_113120294_113120374_113121197_113121348_113121688_113121788_113122174
tx.4565	chr12	+	937	6	NNC	ENSMUSG00000037466.14	novel	2441	8	NA	NA	-11	1209	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	62	junction_5	67.517108942845	90	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTGGCGCATGCCTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113120029	113122418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_113120192_113120294_113120374_113120780_113120984_113121197_113121348_113121688_113121788_113122174
tx.4566	chr12	+	3361	8	FSM	ENSMUSG00000037466.14	ENSMUST00000049271.13	2441	8	-21	-899	-21	-605	multi-exon	FALSE	canonical	3	152	junction_3	28.4088230043027	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCAATGGCGGAACGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113120019	113129063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_113120192_113120294_113120374_113120780_113120984_113121197_113121348_113121688_113121788_113124922_113125010_113125332_113125513_113126672
tx.4567	chr12	-	495	2	Intergenic	novelGene_443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGGCTGGCCTCTTTAA	9955	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113887052	113883867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_113884190_113886879
tx.4568	chr12	+	1944	3	FSM	ENSMUSG00000042063.12	ENSMUST00000073551.6	1958	3	19	-5	19	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	2	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGTGTAATGTCCTCTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116011362	116024217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_116011487_116018341_116018469_116022524
tx.4569	chr12	+	405	2	FSM	ENSMUSG00000042063.12	ENSMUST00000182566.2	498	2	-6	99	-6	-99	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTGTCCTTTTCCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116011377	116018637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_+_116011487_116018341
tx.457	chr1	+	1959	6	FSM	ENSMUSG00000026223.16	ENSMUST00000027425.16	2230	6	288	-17	-50	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	192	junction_3	14.9853261559434	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTTCTGACTTTGGCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85822289	85836413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_85822511_85830730_85830872_85832934_85833124_85834142_85834254_85834728_85834880_85835267
tx.4571	chr12	-	1503	9	NIC	ENSMUSG00000042050.9	novel	3256	8	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_1	7.20134536041704	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTCTTAGATTAATGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116226608	116201588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr12_-_116201680_116205298_116205402_116209624_116209842_116210319_116210398_116211614_116211924_116218024_116218117_116219450_116219872_116221040_116221095_116226470
tx.4572	chr12	-	1416	3	FSM	ENSMUSG00000042050.9	ENSMUST00000221029.2	1404	3	-10	-2	-10	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAAGTATTAGTTTTATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116226616	116218655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_116219872_116221040_116221095_116226470
tx.4574	chr12	-	2483	2	FSM	ENSMUSG00000112980.2	ENSMUST00000220477.2	2941	2	13	445	13	-445	multi-exon	FALSE	canonical	2	13	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCAAGTCCAGTCTCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116368817	116366011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr12_-_116368264_116368586
tx.4575	chr12	+	2444	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000112980.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCAGCAGCTCTGCGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116366012	116368817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr12_+_116368270_116368630
tx.4576	chr12	+	601	4	ISM	ENSMUSG00000042029.8	ENSMUST00000084828.5	4684	29	-28	49013	-28	103	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	123	junction_1	41.4755617469158	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGTGTTAAGAAAAGATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	116368993	116376218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_116369082_116369321_116369498_116370817_116370931_116375994
tx.4578	chr12	+	726	6	NNC	ENSMUSG00000056553.15	novel	3458	23	NA	NA	765705	1313	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.22710574513201	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATATTTGATGGTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117215157	117241782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr12_+_117215217_117217222_117217281_117219165_117219231_117233196_117233271_117240178_117240368_117241501
tx.4579	chr12	-	994	3	Intergenic	novelGene_444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTTTTTATTTATGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117412883	117410738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_-_117411420_117411825_117412052_117412796
tx.458	chr1	+	3234	25	FSM	ENSMUSG00000026229.18	ENSMUST00000027432.9	3112	25	23	-145	1	145	multi-exon	FALSE	canonical	3	1352	junction_6	102.249660417801	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTAGTTGATTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85992363	86067018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_85992528_85998304_85998349_85999335_85999410_85999548_85999719_86003520_86003727_86005077_86005222_86006289_86006517_86009758_86009820_86010868_86010998_86012903_86012993_86013751_86013831_86014296_86014471_86016530_86016643_86017715_86017913_86019724_86019821_86021997_86022063_86044296_86044412_86046231_86046349_86054177_86054281_86055857_86056028_86058358_86058452_86060435_86060523_86061359_86061507_86064684_86064839_86066801
tx.4581	chr12	+	1465	3	ISM	ENSMUSG00000021175.16	ENSMUST00000021592.16	2957	10	32120	2	31747	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	152	junction_1	23	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCATGTTGTCACCTGTCT	8487	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117839369	117842439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr12_+_117839460_117840640_117840778_117841201
tx.4583	chr12	+	846	2	Intergenic	novelGene_445	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGTGAAGCATGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118265305	118327306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr12_+_118265441_118326595
tx.4584	chr13	+	1483	2	NNC	ENSMUSG00000096107.3	novel	1626	3	NA	NA	-130	-811	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATTAGTTGGGTGGCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3411026	3413051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_3411388_3411929
tx.4585	chr13	+	189	2	Intergenic	novelGene_446	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAACCCCTGAGGGGGGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3426670	3428033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_3426771_3427944
tx.4586	chr13	+	660	4	NIC	ENSMUSG00000097709.9	novel	2568	4	NA	NA	2	11	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_2	6.18241233033047	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGCTTCCCTTCACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3528231	3542417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_3528391_3529908_3530002_3535048_3535221_3542181
tx.4587	chr13	+	2205	11	FSM	ENSMUSG00000021218.11	ENSMUST00000223396.2	4303	11	48	2050	-17	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1666	junction_3	147.697833430284	969	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTGGTATTGAGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3588110	3615821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_3588344_3598862_3598971_3600988_3601089_3604411_3604547_3606313_3606513_3606925_3607058_3609991_3610092_3611865_3612038_3614539_3614685_3614858_3614914_3614995
tx.4588	chr13	+	1512	7	ISM	ENSMUSG00000021218.11	ENSMUST00000059515.8	2077	10	18301	-1	2392	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1692	junction_2	127.113357109139	333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTGGTATTGAGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3606430	3615821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_3606513_3606925_3607058_3609991_3610092_3611865_3612038_3614539_3614685_3614858_3614914_3614995
tx.4589	chr13	-	1087	5	ISM	ENSMUSG00000033799.11	ENSMUST00000222909.2	5193	9	15553	-541	-1	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	10.8972473588517	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATTTGTAGTCTGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3619538	3616034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_3616668_3616917_3617033_3617435_3617618_3618751_3618858_3619487
tx.459	chr1	+	1619	13	ISM	ENSMUSG00000026229.18	ENSMUST00000027432.9	3112	25	24244	-145	-21954	145	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1395	junction_5	95.2417975470854	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTAGTTGATTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86016584	86067018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_86016643_86017715_86017913_86019724_86019821_86021997_86022063_86044296_86044412_86046231_86046349_86054177_86054281_86055857_86056028_86058358_86058452_86060435_86060523_86061359_86061507_86064684_86064839_86066801
tx.4590	chr13	+	498	2	FSM	ENSMUSG00000033781.8	ENSMUST00000156595.2	456	2	-39	-3	18	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCATTCTTTGGAGAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3684049	3684785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_3684176_3684413
tx.4591	chr13	+	2373	6	FSM	ENSMUSG00000033781.8	ENSMUST00000042288.8	4453	6	18	2062	18	1274	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_4	6.61513416341649	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTGGTTGGATGAAGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3684049	3701760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_3684176_3692064_3692253_3693474_3693626_3694915_3695051_3699318_3699511_3700179
tx.4592	chr13	-	3428	12	FSM	ENSMUSG00000021215.16	ENSMUST00000091853.12	2680	12	24	-772	-18	129	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_9	26.5501241222916	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTCTCTCCTGGTGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3968196	3932560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_3934474_3934802_3934990_3936047_3936219_3936537_3936796_3937370_3937448_3937570_3937668_3937977_3938041_3938354_3938523_3938870_3938979_3957796_3957857_3962867_3962935_3967937
tx.4593	chr13	-	1214	9	FSM	ENSMUSG00000021214.15	ENSMUST00000021635.9	1200	9	-11	-3	-11	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.27760839478607	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACTCTTGTGTATGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4200664	4182617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_4182836_4185201_4185285_4186600_4186767_4187132_4187243_4192125_4192249_4193216_4193295_4194288_4194406_4195204_4195373_4200513
tx.4594	chr13	-	1235	9	ISM	ENSMUSG00000045410.19	ENSMUST00000091848.7	3463	10	1614	2140	1558	-2133	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_4	12.5797456254091	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCTTGACAGAAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4657559	4642888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_4643298_4643560_4643644_4645069_4645154_4645658_4645732_4647483_4647582_4648768_4648892_4651216_4651295_4652679_4652797_4657389
tx.4595	chr13	-	1308	10	FSM	ENSMUSG00000045410.19	ENSMUST00000091848.7	3463	10	15	2140	15	-2133	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_4	13.8082101181387	404	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCTTGACAGAAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4659158	4642888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_4643298_4643560_4643644_4645069_4645154_4645658_4645732_4647483_4647582_4648768_4648892_4651216_4651295_4652679_4652797_4657389_4657558_4659083
tx.4596	chr13	-	541	3	ISM	ENSMUSG00000045410.19	ENSMUST00000131982.2	412	4	-28	1226	12	-1226	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_2	4	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCCTGTGACCTATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4659161	4652501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_4652797_4657389_4657558_4659083
tx.4597	chr13	+	1628	4	FSM	ENSMUSG00000000078.8	ENSMUST00000000080.8	4225	4	27	2570	27	549	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_1	9.7410927974683	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATGGAAAAACATGGAGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5911507	5917823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_5911842_5914766_5915344_5916637_5916762_5917230
tx.4598	chr13	+	714	4	ISM	ENSMUSG00000021193.11	ENSMUST00000021611.10	3318	26	29295	0	283	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	974	junction_1	64.1924190747371	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGAGTTTTACTCATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6627479	6630078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_6627552_6628476_6628623_6629453_6629557_6629685
tx.4599	chr13	-	623	3	ISM	ENSMUSG00000021196.15	ENSMUST00000142972.2	550	6	2394	-294	2394	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1227	junction_2	94.5	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTACTTGGTTTATTGT	6062	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6634737	6631209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_6631629_6632438_6632542_6634636
tx.46	chr1	-	2391	7	ISM	ENSMUSG00000042414.8	ENSMUST00000047577.7	2564	8	1458	-32	1458	32	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	343	junction_5	37.0135110466435	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGTTCCTCTTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13195929	13183648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_13184712_13186003_13186106_13188986_13189190_13192584_13192856_13194586_13194745_13194842_13194897_13195389
tx.460	chr1	+	1012	9	ISM	ENSMUSG00000026229.18	ENSMUST00000139715.8	2518	21	25371	-16	-20827	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1395	junction_4	74.968326645324	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGAAAAAAAGGAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86017711	86060487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_86017913_86019724_86019821_86021997_86022063_86044296_86044412_86046231_86046349_86054177_86054281_86055857_86056028_86058358_86058452_86060435
tx.4600	chr13	-	944	6	FSM	ENSMUSG00000021196.15	ENSMUST00000131648.8	2680	6	330	1406	-11	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	1227	junction_2	102.634107391257	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTACTTGGTTTATTGT	2127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6638672	6631209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_6631629_6632438_6632542_6634636_6634737_6636515_6636628_6637087_6637150_6638524
tx.4601	chr13	-	1254	9	ISM	ENSMUSG00000021196.15	ENSMUST00000138703.8	4145	22	48130	1406	-1887	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1033	junction_8	165.335076435704	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTACTTGGTTTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6650683	6631209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_6631629_6632438_6632542_6634636_6634737_6636515_6636628_6637087_6637150_6638524_6638690_6647894_6648048_6648774_6648863_6650631
tx.4602	chr13	-	2715	22	FSM	ENSMUSG00000021196.15	ENSMUST00000138703.8	4145	22	24	1406	24	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	963	junction_15	143.890705562911	608	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTACTTGGTTTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6698789	6631209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_6631629_6632438_6632542_6634636_6634737_6636515_6636628_6637087_6637150_6638524_6638690_6647894_6648048_6648774_6648863_6650631_6650703_6652748_6652896_6653114_6653185_6653434_6653500_6654991_6655118_6655671_6655765_6664739_6664836_6669210_6669320_6669555_6669601_6670921_6671088_6671942_6672133_6675171_6675250_6685960_6686035_6698606
tx.4603	chr13	-	836	7	FSM	ENSMUSG00000021196.15	ENSMUST00000137327.2	931	7	-19	114	-19	-114	multi-exon	FALSE	canonical	3	1119	junction_4	51.1913621185797	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAACTGGCAATTTGGCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6698780	6669210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_6669320_6669555_6669601_6670921_6671088_6671942_6672133_6675171_6675250_6685960_6686035_6698606
tx.4604	chr13	-	582	4	NIC	ENSMUSG00000113241.2	novel	1355	5	NA	NA	194	-470	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCTTGCATATTTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7225767	7204601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_7204831_7211128_7211241_7214194_7214245_7225576
tx.4605	chr13	-	3890	5	FSM	ENSMUSG00000021147.18	ENSMUST00000164183.9	1780	5	80	-2190	80	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	30.7774267930248	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCATCTGTTACAAGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8920935	8900514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_8903771_8904035_8904132_8906867_8906965_8911123_8911302_8920672
tx.4606	chr13	-	1605	5	FSM	ENSMUSG00000021147.18	ENSMUST00000176922.8	3780	5	-14	2189	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_4	6.36396103067893	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTGTATACAGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8921073	8902704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_8903771_8904035_8904132_8906867_8906965_8911123_8911302_8920905
tx.4607	chr13	+	2540	5	FSM	ENSMUSG00000058258.15	ENSMUST00000169314.9	3027	5	411	76	-31	-76	multi-exon	TRUE	canonical	3	487	junction_1	56.3576747213722	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGCTTGTTAATATCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8935947	8942411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_8936033_8936767_8936941_8937520_8937614_8937958_8938090_8940353
tx.4608	chr13	+	2451	4	ISM	ENSMUSG00000058258.15	ENSMUST00000169314.9	3027	5	1230	81	-338	-81	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	573	junction_1	25.5907969568923	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGTCTGGCTTGTTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8936766	8942406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_8936941_8937520_8937614_8937958_8938090_8940353
tx.4609	chr13	-	1375	8	ISM	ENSMUSG00000021149.9	ENSMUST00000021574.8	2442	16	10756	145	409	-145	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	688	junction_6	60.4074600069378	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGATGACTTACATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9035330	9022660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_9023311_9024199_9024344_9024980_9025047_9027271_9027470_9028563_9028665_9029464_9029517_9029937_9030016_9035244
tx.461	chr1	+	1565	12	ISM	ENSMUSG00000026229.18	ENSMUST00000027432.9	3112	25	25371	-145	-20827	145	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1395	junction_4	94.4650007337975	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTTAGTTGATTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86017711	86067018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_86017913_86019724_86019821_86021997_86022063_86044296_86044412_86046231_86046349_86054177_86054281_86055857_86056028_86058358_86058452_86060435_86060523_86061359_86061507_86064684_86064839_86066801
tx.4610	chr13	-	2450	17	FSM	ENSMUSG00000021149.9	ENSMUST00000222098.2	8783	17	39	6294	6	-145	multi-exon	FALSE	canonical	3	688	junction_6	47.6523871385264	521	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGATGACTTACATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9046080	9022660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_9023311_9024199_9024344_9024980_9025047_9027271_9027470_9028563_9028665_9029464_9029517_9029937_9030016_9035244_9035356_9035673_9035764_9037284_9037351_9037791_9037984_9039088_9039182_9040733_9040835_9041750_9041888_9041967_9042072_9042680_9042852_9045984
tx.4612	chr13	-	738	3	ISM	ENSMUSG00000021156.18	ENSMUST00000222038.2	1591	4	1231	343	856	226	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_2	13.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAAATTTTAAAACATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9739690	9736671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_9737021_9739098_9739285_9739487
tx.4613	chr13	-	902	7	ISM	ENSMUSG00000021156.18	ENSMUST00000110636.9	4117	15	138	10842	-16	-537	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_6	49.4873721266345	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTCTTTGTAATTCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9815212	9745710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_9745863_9747679_9747773_9748663_9748742_9760181_9760344_9770808_9770969_9785367_9785503_9815090
tx.4614	chr13	-	803	6	NIC	ENSMUSG00000021156.18	novel	1582	13	NA	NA	25	-537	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	58	junction_5	49.6346653056108	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTCTTTGTAATTCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9814948	9745710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_9745863_9747679_9747773_9748663_9748742_9770808_9770969_9785367_9785503_9814763
tx.4615	chr13	-	734	6	ISM	ENSMUSG00000021156.18	ENSMUST00000062658.15	3796	14	-10	10837	-10	-537	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_5	56.1334125098412	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTTCTTTGTAATTCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9815206	9745710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_9745863_9747679_9747773_9748663_9748742_9770808_9770969_9785367_9785503_9815090
tx.4616	chr13	-	957	7	ISM	ENSMUSG00000021156.18	ENSMUST00000223421.2	1582	13	-36	6148	28	-542	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_6	43.4626276242015	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAACAGTTCTTTGTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9814945	9745715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_9745863_9747679_9747773_9748663_9748742_9760181_9760344_9770808_9770969_9785367_9785503_9814763
tx.4617	chr13	-	212	2	ISM	ENSMUSG00000021156.18	ENSMUST00000154994.8	867	8	25	40196	-1	-23097	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAAATTTAAACAAAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9814455	9785364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_9785503_9814381
tx.4618	chr13	-	304	2	ISM	ENSMUSG00000021156.18	ENSMUST00000128658.8	676	5	44	37685	-20	-23097	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAAATTTAAACAAAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9814929	9785364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_9785503_9814763
tx.4619	chr13	-	257	2	ISM	ENSMUSG00000021156.18	ENSMUST00000062658.15	3796	14	-13	50491	-13	-23097	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGTAAATTTAAACAAAAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9815209	9785364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_9785503_9815090
tx.4620	chr13	-	1182	5	ISM	ENSMUSG00000021311.10	ENSMUST00000220473.2	1784	8	6759	-3	6756	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_4	14.2543852901484	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTGAATACAAGGAGAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12208617	12201420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_12201978_12202926_12203040_12204232_12204426_12205089_12205291_12208499
tx.4621	chr13	-	623	4	NNC	ENSMUSG00000052374.17	novel	3013	21	NA	NA	296	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	32.3831231765354	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGACAAACTTTATTAAG	3103	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12288686	12284311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_12284539_12285663_12285823_12287584_12287651_12288515
tx.4622	chr13	-	1075	7	ISM	ENSMUSG00000052374.17	ENSMUST00000168193.8	2920	22	61765	-9	3593	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_5	11.7473401244707	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGACAAACTTTATTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12293840	12284311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_12284539_12285663_12285823_12287584_12287651_12289963_12290111_12291248_12291429_12292284_12292420_12293679
tx.4624	chr13	-	1194	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000113931.2	novel	466	1	NA	NA	-34	47008	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGCGGCAGGGTGGAAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12440520	12393012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_-_12393625_12439938
tx.4625	chr13	+	960	6	ISM	ENSMUSG00000050244.10	ENSMUST00000222091.2	2482	17	9492	1392	-175	4	internal_fragment	FALSE	canonical	3	404	junction_2	52.3182568516957	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTATTTGTCTTTATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12449113	12453778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_12449173_12449254_12449424_12449927_12450083_12450550_12450710_12452714_12452824_12453469
tx.4626	chr13	-	2497	10	NNC	ENSMUSG00000057554.14	novel	2736	10	NA	NA	36	-197	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	22.4152725712726	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTTATTTTCATTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12476338	12454501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_12455876_12462027_12462194_12463299_12463389_12466281_12466309_12467602_12467660_12468161_12468286_12469615_12469827_12471224_12471314_12474054_12474198_12476121
tx.4627	chr13	-	2554	9	NNC	ENSMUSG00000057554.14	novel	2792	10	NA	NA	0	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	25.7342184649155	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTGGAATGAATACTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12476387	12454302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_12455876_12462027_12462194_12463299_12463389_12467580_12467660_12468161_12468286_12469615_12469827_12471224_12471314_12474054_12474198_12476307
tx.4628	chr13	-	1202	10	NNC	ENSMUSG00000057554.14	novel	2792	10	NA	NA	0	66	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	18.5718491337539	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGCTTTCACCATATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12476387	12455659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_12455876_12462027_12462194_12463299_12463389_12466281_12466309_12467602_12467660_12468161_12468286_12469615_12469827_12471224_12471314_12474054_12474198_12476307
tx.4629	chr13	-	1175	9	NNC	ENSMUSG00000057554.14	novel	2792	10	NA	NA	0	66	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	25.3118055460293	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCGCTTTCACCATATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12476387	12455659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_12455876_12462027_12462194_12463299_12463389_12467602_12467660_12468161_12468286_12469615_12469827_12471224_12471314_12474054_12474198_12476307
tx.4630	chr13	-	1289	7	FSM	ENSMUSG00000097715.3	ENSMUST00000221825.2	1301	7	20	-8	20	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_4	60.7602300485733	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCATTCTTAACCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12665249	12632220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_12632389_12632613_12632739_12634654_12634784_12636246_12636397_12638757_12638981_12645583_12645634_12664805
tx.4631	chr13	+	572	2	ISM	ENSMUSG00000110123.2	ENSMUST00000209949.2	915	10	24490	-217	24490	217	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCATGTTTGTTTCACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13522438	13525229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_13522733_13524951
tx.4632	chr13	-	2219	8	FSM	ENSMUSG00000021306.12	ENSMUST00000223093.2	2351	8	-52	184	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	66.0247325335169	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTAGCCATTTTGTAGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13568201	13533203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_13534009_13535412_13535658_13535882_13536008_13538028_13538158_13539630_13539781_13542173_13542397_13548943_13548994_13567709
tx.4633	chr13	-	1340	7	FSM	ENSMUSG00000021306.12	ENSMUST00000220628.2	3634	7	5	2289	-5	-2289	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_3	22.9249984853992	486	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGTCATTCTTAACCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13568204	13535489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_13535658_13535882_13536008_13538028_13538158_13539630_13539781_13542173_13542397_13548943_13548994_13567709
tx.4634	chr13	+	602	2	ISM	ENSMUSG00000005397.9	ENSMUST00000222142.2	3803	14	-87	37488	29	-37488	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	728	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCCTTATGGAGGGCCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13612164	13638561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_13612512_13638306
tx.4635	chr13	+	1845	6	ISM	ENSMUSG00000005397.9	ENSMUST00000222142.2	3803	14	-79	24854	37	-24854	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	684	junction_5	39.004615111548	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGGTGGAGGAATGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13612172	13651195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_13612512_13638306_13638607_13639894_13640122_13642815_13643193_13647364_13647515_13650743
tx.4636	chr13	+	3740	12	FSM	ENSMUSG00000039242.11	ENSMUST00000099747.5	3892	12	152	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	178	junction_5	19.409889274617	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGCCTTTTCCTATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14129205	14173659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_14129505_14140894_14141043_14145351_14145453_14150022_14150220_14155185_14155282_14161937_14162049_14165373_14165453_14165953_14166138_14168999_14169126_14169700_14169861_14170311_14170369_14171477
tx.4637	chr13	+	2386	13	NIC	ENSMUSG00000039242.11	novel	2439	13	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	13	junction_12	55.6334107249312	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGCCTTTTCCTATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14129205	14173659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_14129505_14140894_14141043_14145351_14145453_14150022_14150220_14155185_14155282_14161937_14162049_14165373_14165453_14165953_14166138_14168999_14169126_14169700_14169861_14170311_14170369_14171477_14171610_14172963
tx.4638	chr13	+	3681	12	NIC	ENSMUSG00000039242.11	novel	3892	12	NA	NA	14	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	22	junction_7	55.6602741252905	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGCCTTTTCCTATTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14129223	14173659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_14129505_14140894_14141043_14145351_14145453_14150022_14150220_14155185_14155282_14161937_14162049_14165373_14165453_14165994_14166138_14168999_14169126_14169700_14169861_14170311_14170369_14171477
tx.4639	chr13	+	2797	6	ISM	ENSMUSG00000039242.11	ENSMUST00000221300.2	2397	13	36106	12	3427	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	186	junction_2	22.7033037243481	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGCCTTTTCCTATTTTTG	1075	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14165364	14173659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_14165453_14165953_14166138_14168999_14169126_14169700_14169861_14170311_14170369_14171477
tx.464	chr1	+	1239	6	FSM	ENSMUSG00000062590.14	ENSMUST00000153389.8	1024	6	-8	-207	-2	207	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_5	12.3870900537616	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAGAAAGAAAAAAGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86082499	86098260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_86082566_86084639_86084728_86087716_86087846_86090386_86090558_86092417_86092574_86097631
tx.4640	chr13	-	1844	17	FSM	ENSMUSG00000039233.13	ENSMUST00000039894.13	1844	17	5	-5	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_4	17.0705109399221	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTCTGCCCTTTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14214218	14172531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_14172767_14172947_14173040_14174642_14174703_14175694_14175764_14178127_14178282_14179727_14179869_14180372_14180438_14180527_14180593_14181026_14181123_14183199_14183277_14184213_14184317_14185126_14185227_14189319_14189409_14194286_14194473_14202282_14202368_14203860_14203992_14214122
tx.4641	chr13	-	1885	13	FSM	ENSMUSG00000039233.13	ENSMUST00000159239.8	1855	13	-9	-21	8	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_7	16.4519502390041	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAAATTGGCAGTGTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14214215	14177627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_14178282_14179727_14179869_14180372_14180438_14180527_14180593_14181026_14181123_14183199_14183277_14184213_14184317_14185126_14185227_14189319_14189409_14194286_14194473_14202282_14202368_14203860_14203992_14214122
tx.4642	chr13	-	1956	4	FSM	ENSMUSG00000039233.13	ENSMUST00000160776.2	909	4	-8	-1039	-4	1039	multi-exon	FALSE	canonical	3	140	junction_1	12.4988888395018	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTTGGTCATGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14214210	14192820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_14194473_14202282_14202368_14203860_14203992_14214122
tx.4643	chr13	-	1150	4	FSM	ENSMUSG00000021302.11	ENSMUST00000170957.3	4244	4	75	3019	0	291	multi-exon	FALSE	canonical	3	192	junction_3	35.1883819210577	442	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGACTCAGTAGCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14237998	14228262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_14229041_14229734_14229806_14232380_14232474_14237790
tx.4644	chr13	+	1183	11	ISM	ENSMUSG00000039219.19	ENSMUST00000110533.2	3020	15	-26	10570	-11	18	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	58	junction_10	8.57671265695663	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGATAACAGCAGCGAAGAA	1417	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14238357	14329697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_14238618_14239409_14239465_14294725_14294837_14301035_14301102_14303759_14303851_14307020_14307101_14310752_14310845_14317564_14317704_14319871_14319952_14328000_14328078_14329565
tx.4645	chr13	-	810	3	FSM	ENSMUSG00000015672.5	ENSMUST00000221699.2	1174	3	-22	386	-20	74	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	520.5	219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATGGATTAATTTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14787632	14784883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_14785326_14786007_14786190_14787446
tx.4646	chr13	-	788	3	NNC	ENSMUSG00000015672.5	novel	3013	3	NA	NA	-21	74	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	556.5	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATGGATTAATTTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14787633	14784883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_14785326_14786000_14786190_14787476
tx.4647	chr13	-	781	3	FSM	ENSMUSG00000015672.5	ENSMUST00000220621.2	3013	3	117	2115	-21	74	multi-exon	FALSE	canonical	3	1082	junction_1	15.5	6725	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAATGGATTAATTTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14787633	14784883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_14785326_14786007_14786190_14787476
tx.4648	chr13	-	1459	2	NIC	ENSMUSG00000015672.5	novel	3013	3	NA	NA	-21	70	intron_retention	FALSE	canonical	3	1113	junction_1	0	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGCTCAATGGATTAATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14787633	14784887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_14786190_14787476
tx.4649	chr13	+	852	8	FSM	ENSMUSG00000015671.12	ENSMUST00000170836.4	2911	8	12	2047	12	-2047	multi-exon	FALSE	canonical	3	4380	junction_5	234.832723791352	27869	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAGTTTTTAAGAGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14787836	14800174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_14787901_14790596_14790674_14791321_14791455_14793886_14794010_14795309_14795392_14798182_14798257_14799787_14799846_14799933
tx.4650	chr13	+	1116	2	Intergenic	novelGene_447	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTATCTGGATTCGTGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15572143	15602234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_15572269_15601243
tx.4651	chr13	-	487	3	FSM	ENSMUSG00000055137.8	ENSMUST00000220514.2	1351	3	-25	889	-25	-886	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	1.5	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTGCTTCTTTTTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17869379	17858183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_17858438_17859293_17859371_17869223
tx.4652	chr13	+	693	2	FSM	ENSMUSG00000012429.10	ENSMUST00000221480.2	582	2	-31	-80	-31	80	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGATTTTTGTGAATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17869745	17871921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_17869944_17871426
tx.4653	chr13	+	897	2	FSM	ENSMUSG00000012429.10	ENSMUST00000049744.4	2672	2	6	1769	6	80	multi-exon	FALSE	canonical	3	374	junction_1	0	718	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGATTTTTGTGAATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17870003	17871921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_17870406_17871426
tx.4654	chr13	+	902	1	FSM	ENSMUSG00000081285.3	ENSMUST00000118792.3	825	1	-77	0	-77	0	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	82	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAAAAAAAGCCCAGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17995453	17996355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_17995500_17996400
tx.4655	chr13	-	489	3	ISM	ENSMUSG00000008859.9	ENSMUST00000009003.9	2688	5	50995	1740	50705	-1740	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	817	junction_1	49.5	438	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAGGCTCAATTGACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18067829	18056895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_18057087_18063091_18063267_18067706
tx.4656	chr13	-	632	4	ISM	ENSMUSG00000008859.9	ENSMUST00000009003.9	2688	5	47230	1740	46940	-1740	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	817	junction_1	52.9297227987787	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAGGCTCAATTGACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18071594	18056895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_18057087_18063091_18063267_18067706_18067916_18071537
tx.4657	chr13	-	1174	3	FSM	ENSMUSG00000075054.6	ENSMUST00000099735.6	8744	3	4	7566	4	-61	multi-exon	FALSE	canonical	3	467	junction_2	27.5	1432	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTATTTATGTATTTATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18167930	18163480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_18164368_18166212_18166335_18167765
tx.4658	chr13	-	957	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000075053.4	novel	853	1	NA	NA	-36	433	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGGATGAATAAAAAAAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18206214	18204892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_-_18205000_18205364
tx.4659	chr13	+	3183	29	FSM	ENSMUSG00000041236.9	ENSMUST00000072961.6	3199	29	9	7	9	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	419	junction_25	60.5186237990473	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGAATCCTTTATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18901468	19050974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_18901507_18907357_18907397_18923611_18923717_18929431_18929510_18966816_18966892_18975756_18975820_18978496_18978563_18994601_18994722_18995736_18995884_18998396_18998464_19007949_19008048_19011773_19011904_19013392_19013509_19014906_19014964_19022821_19022884_19023817_19023900_19025327_19025421_19026322_19026451_19027638_19027784_19029477_19029520_19030056_19030108_19033055_19033194_19036510_19036566_19037516_19037658_19038694_19038832_19046706_19046807_19046907_19046953_19048202_19048283_19050289
tx.4660	chr13	+	1199	4	NNC	ENSMUSG00000076749.3	novel	924	3	NA	NA	-16230	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.69967317119759	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTCTATTTTTGTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19382042	19401194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_19382318_19398272_19398603_19400033_19400079_19400645
tx.4661	chr13	-	1237	8	ISM	ENSMUSG00000003062.14	ENSMUST00000197565.3	1391	10	19071	0	-8708	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	731	junction_1	53.5430400972633	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTGTGTGTTGTCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19560833	19541845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_19542300_19543147_19543222_19551913_19552010_19554419_19554538_19554649_19554704_19556757_19556836_19557305_19557384_19560548
tx.4662	chr13	-	1295	9	FSM	ENSMUSG00000003062.14	ENSMUST00000039694.13	1327	9	32	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	699	junction_8	60.3857392105123	302	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTGTGTGTTGTCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19579933	19541845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_19542300_19543147_19543222_19551913_19552010_19554419_19554538_19554649_19554704_19556757_19556836_19557305_19557384_19560548_19560832_19579873
tx.4663	chr13	-	1281	9	NNC	ENSMUSG00000003062.14	novel	1128	8	NA	NA	-4	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_1	340.955069437309	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTCATGCCCCTGCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19579933	19549124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_19549516_19549601_19549725_19551913_19552010_19554419_19554538_19554649_19554704_19556757_19556836_19557305_19557384_19560548_19560832_19579873
tx.4664	chr13	-	1155	8	FSM	ENSMUSG00000003062.14	ENSMUST00000200323.3	1128	8	-26	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_1	267.855352374968	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTCATGCCCCTGCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19579930	19549124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_19549516_19551913_19552010_19554419_19554538_19554649_19554704_19556757_19556836_19557305_19557384_19560548_19560832_19579873
tx.4665	chr13	-	348	2	ISM	ENSMUSG00000003062.14	ENSMUST00000196712.2	4167	3	35	6949	-1	185	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	699	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGCTCATGACTTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19579930	19560540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_19560832_19579873
tx.4666	chr13	+	324	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000003062.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGGCTGATATTCCGAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19566752	19569424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_19566929_19569276
tx.4667	chr13	-	2343	3	FSM	ENSMUSG00000002808.8	ENSMUST00000002885.8	2363	3	6	14	6	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_2	5.5	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAATTGGTTATCTTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19803968	19775889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_19777519_19778616_19778826_19803463
tx.4668	chr13	+	1816	6	FSM	ENSMUSG00000021319.8	ENSMUST00000002883.7	1764	6	-56	4	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	1.72046505340853	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTTCATGTGTTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19807288	19816995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_19808048_19809197_19809279_19809363_19809430_19811275_19811475_19814235_19814300_19816348
tx.4669	chr13	-	697	2	Intergenic	novelGene_448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCATGTCATAGCTTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20200675	20190716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_20191327_20200588
tx.467	chr1	+	2347	2	FSM	ENSMUSG00000079445.4	ENSMUST00000113306.4	2582	2	229	6	-68	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	186	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGAATTAGCTGCTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86231184	86235021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_86231277_86232766
tx.4670	chr13	-	1192	2	Intergenic	novelGene_449	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCCGCATGAAAAGGTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20229111	20218838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_20219904_20228984
tx.4671	chr13	+	1582	3	ISM	ENSMUSG00000041112.18	ENSMUST00000072519.7	5464	22	499029	1830	116922	-1830	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_2	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTTGGGGAGCTGGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20773817	20790693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_20773897_20784349_20784428_20789268
tx.4672	chr13	+	1876	11	NNC	ENSMUSG00000021322.9	novel	2921	21	NA	NA	-74261	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	56	junction_6	9.14549069213894	50	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTGGTGTGGGCATAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21120541	21208420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_21120623_21125983_21126076_21163633_21163717_21178800_21178838_21179589_21179665_21184067_21184241_21186824_21186884_21187066_21187127_21189200_21189298_21197281_21197359_21207378
tx.4673	chr13	+	1890	8	FSM	ENSMUSG00000021326.14	ENSMUST00000021761.13	4204	8	455	1859	162	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	719	junction_6	36.2209771220141	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACGTTTTGTTTTTGTTATG	1384	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21364555	21377034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_21365085_21366153_21366250_21367901_21368133_21372210_21372234_21374024_21374141_21374261_21374295_21375389_21375417_21376199
tx.4674	chr13	+	1310	7	ISM	ENSMUSG00000021326.14	ENSMUST00000221464.2	1400	8	895	-11	895	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	719	junction_5	39.0939040431284	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATACGTTTTGTTTTTGTTA	3031	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21366202	21377032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_21366250_21367901_21368133_21372210_21372234_21374024_21374141_21374261_21374295_21375389_21375417_21376199
tx.4675	chr13	+	1259	6	ISM	ENSMUSG00000021326.14	ENSMUST00000221464.2	1400	8	2597	-10	2597	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	719	junction_4	37.8227444800083	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCATACGTTTTGTTTTTGTT	4733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21367904	21377031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_21368133_21372210_21372234_21374024_21374141_21374261_21374295_21375389_21375417_21376199
tx.4676	chr13	+	1280	5	FSM	ENSMUSG00000004341.9	ENSMUST00000004453.9	1340	5	61	-1	61	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	5.71729831301464	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGACTCTGAGTGATGTT	986	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21496355	21503795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_21496515_21497817_21497972_21501154_21501273_21501738_21501839_21503046
tx.4677	chr13	+	1952	4	FSM	ENSMUSG00000036721.15	ENSMUST00000225545.2	4405	4	-9	2462	-9	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	12.0277457017791	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGTATACTGTCCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21546980	21553997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_21547043_21547749_21548222_21550784_21550927_21552721
tx.4678	chr13	+	3717	3	ISM	ENSMUSG00000036721.15	ENSMUST00000225545.2	4405	4	19	2464	7	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	44	junction_1	9.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTGTATACTGTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21547008	21553995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_21547043_21547749_21548222_21550784
tx.4679	chr13	+	1892	3	FSM	ENSMUSG00000036721.15	ENSMUST00000099720.3	2182	3	294	-4	294	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_1	5	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTATACTGTCCTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21547748	21553998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_21548222_21550784_21550927_21552721
tx.468	chr1	-	300	2	FSM	ENSMUSG00000026234.13	ENSMUST00000188682.2	601	2	303	-2	303	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	7412	junction_1	0	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGACTTAATACTTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86278630	86278215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_86278419_86278533
tx.4680	chr13	-	2574	6	FSM	ENSMUSG00000021327.20	ENSMUST00000116434.11	2600	6	20	6	-4	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_5	29.6486087363303	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCAGCCTGTTGGTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21586905	21571178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_21572877_21578131_21578256_21578686_21578752_21578928_21579077_21580269_21580745_21586841
tx.4681	chr13	-	2811	6	NIC	ENSMUSG00000021327.20	novel	2600	6	NA	NA	8	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	3	junction_5	39.8015075091384	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTTGGTTCTTACTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21586857	21571173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_21572877_21578131_21578256_21578686_21578752_21578928_21579077_21580269_21580745_21586561
tx.4682	chr13	-	2569	6	FSM	ENSMUSG00000021327.20	ENSMUST00000070785.16	2561	6	-15	7	3	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_5	21.2452347598232	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTCAGCCTGTTGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21586898	21571179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_21572877_21578131_21578256_21578686_21578752_21578928_21579077_21580269_21580748_21586841
tx.4683	chr13	-	536	2	NNC	ENSMUSG00000055313.16	novel	2965	4	NA	NA	-1	-12256	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGTCTTGGAGTCCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21625229	21619619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_21619856_21624929
tx.4684	chr13	-	1902	6	FSM	ENSMUSG00000022228.15	ENSMUST00000110485.3	4366	6	3	2461	3	-2461	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	4.81663783151692	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAAGTGCCTATAGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21637897	21628810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_21630000_21631955_21632065_21632336_21632655_21633443_21633504_21633610_21633687_21637747
tx.4685	chr13	-	986	2	NNC	ENSMUSG00000082396.5	novel	1234	2	NA	NA	-31	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAATCCACATACCCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21690734	21688473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_21689403_21690677
tx.4686	chr13	-	751	2	FSM	ENSMUSG00000063894.16	ENSMUST00000110481.3	728	2	-19	-4	-19	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGCAGATGAAAATTTTAATT	6579	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21715262	21710588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_21711192_21715114
tx.4687	chr13	+	269	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000063894.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTAGTGCCTTACACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21715283	21718814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_21715325_21717471_21717571_21718685
tx.4688	chr13	+	1093	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000080770.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATATGAGTCTTTTTGTT	168	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22050014	22064925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_22050143_22062750_22062889_22064098
tx.4689	chr13	+	2759	6	FSM	ENSMUSG00000006720.17	ENSMUST00000102978.8	3198	6	145	294	120	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	13.42236938845	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGCTTTAAGTTTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22129426	22144655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_22129589_22129725_22129970_22131172_22131241_22133829_22133957_22134403_22134500_22142593
tx.469	chr1	-	2399	14	FSM	ENSMUSG00000026234.13	ENSMUST00000027438.8	8202	14	28	5775	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	5685	junction_13	926.263678639546	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCAGACTTAATACTTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86287094	86278215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_86278419_86278533_86278758_86279088_86279216_86279919_86280042_86280231_86280356_86280847_86281003_86281453_86281578_86282741_86282867_86283773_86283916_86284092_86284180_86284277_86284464_86284678_86285175_86285828_86285946_86286927
tx.4690	chr13	-	347	2	NNC	ENSMUSG00000071493.6	novel	3156	2	NA	NA	1657	3797	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTGAGTGTATGTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22955838	22951846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_22952000_22955644
tx.4691	chr13	-	646	3	Intergenic	novelGene_451	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	7.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	7929	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23361257	23354442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_23354656_23355328_23355478_23360973
tx.4692	chr13	-	2612	4	ISM	ENSMUSG00000046351.12	ENSMUST00000145451.8	1261	5	990	-1690	0	1689	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_1	26.0426999794995	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGTGTATAAGTAGGGTG	10003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23552381	23539511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_23541884_23546749_23546825_23546972_23547046_23552289
tx.4693	chr13	-	2594	4	FSM	ENSMUSG00000046351.12	ENSMUST00000050101.9	4844	4	20	2230	6	1698	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	41.5772373621272	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTAGGGTGTGGTTTATT	9026	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23553358	23539502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_23541884_23546972_23547046_23552289_23552376_23553304
tx.4694	chr13	-	3262	5	FSM	ENSMUSG00000046351.12	ENSMUST00000145451.8	1261	5	194	-2195	-7	-1734	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_4	37.5499667110372	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGATTTATTTAT	9207	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23553177	23539006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_23541884_23546749_23546825_23546972_23547046_23552289_23552376_23553026
tx.4695	chr13	-	2683	5	FSM	ENSMUSG00000046351.12	ENSMUST00000125328.2	815	5	-11	-1857	3	1695	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	23.1124966197942	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATAAGTAGGGTGTGGTTT	9009	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23553375	23539505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_23541884_23546749_23546825_23546972_23547046_23552289_23552376_23553304
tx.4696	chr13	-	1284	3	FSM	ENSMUSG00000036376.4	ENSMUST00000041782.4	4456	3	-10	3182	-10	-3182	multi-exon	FALSE	canonical	3	221	junction_1	5.5	920	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTTTTTAGTTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23608046	23605712	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_23606506_23606652_23606853_23607755
tx.4697	chr13	-	548	3	Intergenic	novelGene_452	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAATTTTGCTTCTGTTTCCT	3713	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23618842	23617462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_23617701_23617800_23617859_23618590
tx.4698	chr13	+	735	2	FSM	ENSMUSG00000018102.6	ENSMUST00000018246.6	1156	2	1	420	1	-420	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	188	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGTCATGTTATATCACGT	184	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23868182	23876471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_23868605_23876158
tx.4699	chr13	-	546	3	ISM	ENSMUSG00000006715.12	ENSMUST00000175689.8	723	7	7770	-246	7734	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1558	junction_1	43	504	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGTGGAGAATTAAGTGT	-51	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	24937689	24935827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_24936214_24937330_24937442_24937640
tx.47	chr1	-	2728	8	FSM	ENSMUSG00000042414.8	ENSMUST00000047577.7	2564	8	-132	-32	-132	32	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_7	84.2663415993041	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGGTTCCTCTTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13197519	13183648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_13184712_13186003_13186106_13188986_13189190_13192584_13192856_13194586_13194745_13194842_13194897_13195389_13196081_13197333
tx.470	chr1	-	613	3	ISM	ENSMUSG00000026234.13	ENSMUST00000185676.7	3072	12	-8	6629	-8	188	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5685	junction_2	152	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGATAGCGATGAGGATGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86287094	86284845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_86285175_86285828_86285946_86286927
tx.4700	chr13	-	978	7	FSM	ENSMUSG00000006715.12	ENSMUST00000110382.9	963	7	-15	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1483	junction_6	81.6382603658086	12838	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGTGGAGAATTAAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24945921	24935827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_24936214_24937330_24937442_24937640_24937724_24940582_24940719_24941578_24941657_24944142_24944201_24945795
tx.4701	chr13	-	693	3	FSM	ENSMUSG00000006717.8	ENSMUST00000006900.7	721	3	25	3	25	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	260	junction_1	3	1053	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGCTAAGGAAGTATTTTC	4842	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25015475	25001933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_25002175_25004697_25004883_25015208
tx.4702	chr13	+	1951	7	FSM	ENSMUSG00000035958.4	ENSMUST00000038039.3	1957	7	0	6	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	768	junction_5	64.0791611125559	653	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGACTACGACTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25015661	25026130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_25015913_25015992_25016079_25019998_25020170_25020837_25020930_25022129_25022249_25024370_25024542_25025069
tx.4703	chr13	+	1865	6	NIC	ENSMUSG00000035958.4	novel	1957	7	NA	NA	0	-5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	37	junction_1	322.122585361536	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGACTACGACTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25015661	25026130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_25015913_25019998_25020170_25020837_25020930_25022129_25022249_25024370_25024542_25025069
tx.4704	chr13	-	673	5	ISM	ENSMUSG00000035936.7	ENSMUST00000037615.7	5647	10	19124	3940	19124	-3940	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	3.64005494464026	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACATTCCATCCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25102520	25095501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_25095750_25096230_25096290_25097726_25097897_25099744_25099904_25102483
tx.4705	chr13	-	328	2	ISM	ENSMUSG00000021339.5	ENSMUST00000021772.4	7035	11	26636	5452	1056	681	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	177	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGAGACTAAGAAGAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25177726	25176917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_25177172_25177652
tx.4706	chr13	+	2194	10	FSM	ENSMUSG00000035910.16	ENSMUST00000069614.7	6634	10	-295	4735	-46	436	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	2.86744175568088	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGTTTCAGAGATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25239940	25389954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_25240547_25245217_25245273_25286315_25286393_25286503_25286636_25291573_25291721_25294049_25294105_25303229_25303390_25371658_25371760_25386147_25386451_25389396
tx.4707	chr13	+	2237	11	NNC	ENSMUSG00000035910.16	novel	6634	10	NA	NA	-47	436	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_8	7.00285656000464	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGTTTCAGAGATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25239939	25389954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_25240547_25245217_25245273_25286315_25286393_25286503_25286636_25291573_25291721_25294049_25294105_25303229_25303390_25349109_25349152_25371658_25371760_25386147_25386451_25389396
tx.4708	chr13	+	763	2	ISM	ENSMUSG00000035910.16	ENSMUST00000160363.2	661	4	14809	-436	14809	436	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGTTTCAGAGATAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25386245	25389954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_25386451_25389396
tx.4709	chr13	-	2229	5	NIC	ENSMUSG00000048978.15	novel	2222	4	NA	NA	0	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.87228132326901	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTTGTGTGTGGTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25453953	25436024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_25437735_25446182_25446383_25452004_25452074_25452535_25452657_25453824
tx.471	chr1	+	1208	5	FSM	ENSMUSG00000026238.15	ENSMUST00000045897.15	1216	5	-4	12	-4	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	19621	junction_2	1755.19477195552	8000	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGTCTCAAAGCCTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86454443	86458422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_86454673_86456894_86456967_86457177_86457275_86457452_86457527_86457686
tx.4710	chr13	+	739	5	NNC	ENSMUSG00000086363.8	novel	682	4	NA	NA	-22	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.707106781186548	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGAGTTATAGTTTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29200253	29212787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_29200375_29200692_29200798_29207158_29207196_29207613_29207707_29212404
tx.4711	chr13	-	2613	16	FSM	ENSMUSG00000006191.18	ENSMUST00000006353.14	2629	16	16	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_3	17.6728291138937	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGTGTTTATTGGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30039641	29509283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_29510212_29538612_29538778_29541482_29541567_29627990_29628054_29658511_29658693_29701395_29701542_29736211_29736379_29809603_29809708_29875581_29875703_29893077_29893127_29901703_29901801_29961199_29961285_30030210_30030324_30033921_30034092_30038880_30038925_30039545
tx.4712	chr13	-	1658	13	ISM	ENSMUSG00000006191.18	ENSMUST00000006353.14	2629	16	31	118470	0	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	156	junction_1	16.5797734872612	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTTGCATTTTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30039626	29627753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_29628054_29658511_29658693_29701395_29701542_29736211_29736379_29809603_29809708_29875581_29875703_29893077_29893127_29901703_29901801_29961199_29961285_30030210_30030324_30033921_30034092_30038880_30038925_30039545
tx.4713	chr13	-	917	5	NNC	ENSMUSG00000006191.18	novel	3372	17	NA	NA	0	-2119	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3	junction_1	86.9554483629404	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACAGTGTTCTTGAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30039626	30023096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_30023606_30030210_30030324_30033921_30034092_30038880_30038925_30039545
tx.4714	chr13	-	440	3	ISM	ENSMUSG00000006191.18	ENSMUST00000129231.2	694	6	15	12806	-3	-12806	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	200	junction_2	1	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAGGAATTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30039633	30033783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_30034092_30038880_30038925_30039545
tx.4715	chr13	-	1900	7	NNC	ENSMUSG00000016477.19	novel	5097	7	NA	NA	8	-3193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	48.4644772545372	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGATGAATTAATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30170038	30093750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_30094149_30095175_30095312_30097386_30097497_30100819_30100988_30102558_30102779_30104096_30104209_30169282
tx.4716	chr13	-	869	2	ISM	ENSMUSG00000016477.19	ENSMUST00000102948.11	5097	7	7	13539	7	-1413	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	134	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGGATGCTTTCATCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30170039	30104096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_30104209_30169282
tx.4717	chr13	+	827	2	FSM	ENSMUSG00000038732.16	ENSMUST00000153269.3	854	2	27	0	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGTCTGGTTAGTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30320498	30347608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_30320746_30347028
tx.4718	chr13	-	1188	2	FSM	ENSMUSG00000038462.4	ENSMUST00000042834.4	1363	2	31	144	31	-144	multi-exon	FALSE	canonical	3	2063	junction_1	0	1600	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTGTTCTCATCTAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30729314	30724434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_30725325_30729016
tx.4719	chr13	+	1077	8	FSM	ENSMUSG00000069255.14	ENSMUST00000091672.13	1161	8	84	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_7	7.4258236676383	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCATGTGCAGTGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30844065	30895214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_30844130_30852787_30852822_30856375_30856459_30880218_30880269_30889608_30889684_30891912_30892085_30892659_30892733_30894688
tx.472	chr1	+	845	3	ISM	ENSMUSG00000026238.15	ENSMUST00000045897.15	1216	5	2789	15	2708	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20058	junction_1	2011.5	4137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGGTGTCTCAAAGCCTG	NA	False	NA	27	True	NA	NA	NA	86457236	86458419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_86457275_86457452_86457527_86457686
tx.4720	chr13	+	446	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000113515.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATACATTTGTCTCTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30972563	30973656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_30972733_30972934_30973089_30973533
tx.4721	chr13	-	3091	28	NNC	ENSMUSG00000021357.15	novel	4256	28	NA	NA	1	-1182	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	32.7342879513478	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGGTCCTGAAAGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31158050	30999083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_30999375_31001980_31002041_31004560_31004623_31006614_31006738_31010021_31010078_31040636_31040779_31048813_31048931_31051954_31052022_31055101_31055164_31055824_31055885_31056271_31056353_31059241_31059304_31060713_31060836_31061221_31061384_31061530_31061597_31066231_31066357_31070171_31070298_31084767_31084887_31089635_31089739_31090485_31090568_31090714_31090861_31095152_31095234_31109705_31109831_31111290_31111405_31119477_31119605_31122098_31122276_31124592_31124754_31157978
tx.4722	chr13	-	1303	3	Intergenic	novelGene_453	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	4	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGATCCATCCACACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31865485	31856377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_31857213_31861404_31861533_31865145
tx.4723	chr13	-	1538	3	Intergenic	novelGene_454	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	5.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGATCCATCCACACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31865485	31856377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_31857213_31861404_31861768_31865145
tx.4724	chr13	-	1087	7	ISM	ENSMUSG00000038372.15	ENSMUST00000041859.9	1713	11	210661	4	99162	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_5	9.96103519832262	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACAGAGTTTGCTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32312062	32003565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_32003962_32004124_32004194_32101602_32101700_32124466_32124586_32284339_32284468_32310982_32311088_32311889
tx.4725	chr13	-	1599	11	FSM	ENSMUSG00000038372.15	ENSMUST00000041859.9	1713	11	110	4	-6	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_5	9.43186089804128	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACAGAGTTTGCTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32522613	32003565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_32003962_32004124_32004194_32101602_32101700_32124466_32124586_32284339_32284468_32310982_32311088_32311889_32312083_32409117_32409228_32411197_32411286_32418335_32418381_32522364
tx.4726	chr13	-	994	5	NIC	ENSMUSG00000038372.15	novel	382	4	NA	NA	-2	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_1	36.2422405488402	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTGAAACTTTCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32522609	32341314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_32341821_32409117_32409228_32411197_32411286_32418335_32418381_32522364
tx.4727	chr13	+	1933	7	FSM	ENSMUSG00000021400.9	ENSMUST00000021832.7	2633	7	700	0	622	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_2	20.5081284697881	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCAGTTCTTCAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32986720	33006592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_32987028_32989320_32989513_32990741_32990984_33000235_33000466_33004201_33004358_33005021_33005102_33005866
tx.4728	chr13	-	804	3	ISM	ENSMUSG00000044734.17	ENSMUST00000076352.8	1918	7	5395	615	0	-615	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	149	junction_2	0.5	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTCTTTTGTATGTTCAA	4884	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33029773	33026689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_33027206_33029291_33029460_33029653
tx.4729	chr13	-	1299	7	FSM	ENSMUSG00000044734.17	ENSMUST00000076352.8	1918	7	0	619	0	-619	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_6	10.85382677011	277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAATCTTTCTTTTGTATGT	4869	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33035168	33026693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_33027206_33029291_33029460_33029653_33029797_33031372_33031491_33032601_33032740_33034221_33034398_33035124
tx.473	chr1	-	1127	5	FSM	ENSMUSG00000026239.15	ENSMUST00000027444.15	1159	5	11	21	11	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	312	junction_1	25.5391855782443	995	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCGATGCTTCCATCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86510258	86470736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_86471306_86473423_86473530_86474378_86474505_86475250_86475340_86510021
tx.4730	chr13	+	2291	7	FSM	ENSMUSG00000045827.11	ENSMUST00000006391.5	3397	7	29	1077	29	-1077	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1.73205080756888	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCTGATGTGATTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33188552	33200861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_33188679_33190515_33190694_33191988_33192127_33192750_33192869_33194669_33194813_33197844_33198001_33199429
tx.4731	chr13	+	1858	7	FSM	ENSMUSG00000021403.4	ENSMUST00000006392.3	3253	7	92	1303	-43	-1303	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_4	6.66874967458085	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTGACATGCCATGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33211490	33224564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_33211584_33213434_33213613_33216898_33217037_33217509_33217628_33219498_33219642_33221954_33222111_33223532
tx.4732	chr13	-	1390	7	FSM	ENSMUSG00000052180.16	ENSMUST00000110273.9	1325	7	-65	0	-65	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	772	junction_6	71.5830908028488	1458	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTCAGAACCGAGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34089218	34063798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_34064316_34064604_34064761_34077786_34077930_34079251_34079370_34081326_34081480_34083244_34083420_34089090
tx.4733	chr13	-	1321	7	FSM	ENSMUSG00000060147.16	ENSMUST00000043552.17	1547	7	217	9	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_6	98.4119742036845	1278	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCAGAACTGTCTGTCTG	8474	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34119964	34101909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_34102426_34102723_34102880_34106908_34107052_34109294_34109413_34114007_34114161_34115454_34115630_34119904
tx.4734	chr13	+	1039	7	FSM	ENSMUSG00000046949.17	ENSMUST00000058978.9	3842	7	7	2796	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_1	21.7995922489899	199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGTTGCACTGTATTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34148676	34169630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_34148784_34152172_34152261_34156294_34156460_34163514_34163646_34165407_34165522_34166430_34166533_34169298
tx.4735	chr13	+	1117	8	FSM	ENSMUSG00000046949.17	ENSMUST00000021843.13	1063	8	-53	-1	11	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_2	70.4179939898249	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGTTGCACTGTATTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34148680	34169630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_34148784_34150027_34150110_34152172_34152261_34156294_34156460_34163514_34163646_34165407_34165522_34166430_34166533_34169298
tx.4736	chr13	+	1221	7	FSM	ENSMUSG00000038286.12	ENSMUST00000040656.8	1253	7	31	1	-4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_3	28.0356915377524	454	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTAGTGTTCCTGTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34221610	34258056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_34221753_34228406_34228511_34230768_34230936_34234263_34234418_34244416_34244549_34247892_34248017_34257658
tx.4737	chr13	+	1044	6	NIC	ENSMUSG00000038286.12	novel	1253	7	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	34	junction_2	72.3972375163583	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTAGTGTTCCTGTTTGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34221621	34258057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_34221753_34228406_34228511_34234263_34234418_34244416_34244549_34247892_34248017_34257658
tx.4738	chr13	-	1606	4	FSM	ENSMUSG00000058672.8	ENSMUST00000056427.10	1610	4	0	4	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_2	19.2006944318862	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTATGGTCCTTTTCTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34261990	34258260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_34259512_34260160_34260272_34260531_34260641_34261855
tx.4739	chr13	+	302	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000045136.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCGAGGGCCGGGTGGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34311203	34314337	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_34311319_34314150
tx.474	chr1	+	1964	7	FSM	ENSMUSG00000026240.13	ENSMUST00000027446.11	2231	7	31	236	0	-62	multi-exon	FALSE	canonical	3	303	junction_3	30.6743649757687	185	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGTGTCAATATTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86514852	86533986	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_86514958_86516885_86517064_86520012_86520089_86524472_86524562_86526724_86526928_86528804_86528911_86532779
tx.4740	chr13	-	1709	4	FSM	ENSMUSG00000045136.7	ENSMUST00000075774.5	2182	4	0	473	0	-473	multi-exon	FALSE	canonical	3	472	junction_3	10.4986771653491	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTGTCCTCTTTTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34314337	34311203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_34312515_34312854_34312966_34313228_34313338_34314159
tx.4741	chr13	+	436	2	FSM	ENSMUSG00000071451.11	ENSMUST00000124996.8	474	2	42	-4	42	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_1	0	1454	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTCATTTTACTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34346988	34362155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_34347233_34361963
tx.4742	chr13	+	510	3	FSM	ENSMUSG00000071451.11	ENSMUST00000147632.3	555	3	44	1	44	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1035	junction_1	31.5	7341	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTCATTTTACTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34346990	34362155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_34347233_34350043_34350120_34361963
tx.4743	chr13	+	297	2	FSM	ENSMUSG00000021413.10	ENSMUST00000221639.2	1727	2	0	1430	0	-1430	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_1	0	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAACACAGAAGTAAACATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35059486	35067319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_35059678_35067213
tx.4744	chr13	+	4431	15	FSM	ENSMUSG00000021413.10	ENSMUST00000077853.5	7844	15	224	3189	22	200	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_7	21.2239035437088	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTTGTAGCCATTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35059508	35086858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_35059678_35067213_35068411_35070652_35070827_35072106_35072263_35073494_35073577_35074477_35074689_35076072_35076147_35077743_35077835_35078417_35078566_35079301_35079440_35079949_35080104_35083091_35083207_35083813_35083966_35084346_35084434_35085375
tx.4745	chr13	+	871	4	NIC	ENSMUSG00000085962.9	novel	982	5	NA	NA	6	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCAGGGGATCTGATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35147970	35174438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_35148067_35148606_35148820_35167115_35167191_35173951
tx.4746	chr13	-	695	5	ISM	ENSMUSG00000021417.16	ENSMUST00000110251.9	1395	10	6643	-9	867	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	161	junction_1	15.3846514422654	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTAAGAATTCATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35171472	35161730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_35162050_35162632_35162777_35164244_35164335_35170049_35170171_35171451
tx.4747	chr13	-	971	7	ISM	ENSMUSG00000021417.16	ENSMUST00000110251.9	1395	10	3825	-9	-742	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	161	junction_1	15.0996688705415	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTAAGAATTCATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35174290	35161730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_35162050_35162632_35162777_35164244_35164335_35170049_35170171_35171451_35171552_35172265_35172336_35174163
tx.4748	chr13	-	1594	10	FSM	ENSMUSG00000021417.16	ENSMUST00000021854.14	1746	10	153	-1	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_9	45.5959170795038	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTAAGAATTCATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35178111	35161730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_35162050_35162632_35162777_35164244_35164335_35170049_35170171_35171451_35171552_35172265_35172336_35174163_35174353_35174700_35174800_35177050_35177214_35177812
tx.4749	chr13	-	1689	10	NIC	ENSMUSG00000021417.16	novel	1746	10	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	11	junction_9	56.5674512702303	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTAAGAATTCATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35178108	35161730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_35162050_35162632_35162777_35164244_35164335_35170049_35170171_35171451_35171552_35172265_35172336_35174163_35174353_35174700_35174800_35177050_35177312_35177812
tx.475	chr1	+	1349	4	FSM	ENSMUSG00000053333.16	ENSMUST00000188121.7	1173	4	-174	-2	-174	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	49.2769948578667	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTACTTTTCTTTATAACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86631355	86676055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_86631594_86672402_86672551_86673062_86673221_86675250
tx.4750	chr13	-	1510	10	NIC	ENSMUSG00000021417.16	novel	1426	10	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	26	junction_9	51.9781530555072	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTAAGAATTCATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35178113	35161730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_35162050_35162632_35162777_35164244_35164335_35170049_35170171_35171451_35171552_35172265_35172336_35174163_35174353_35174700_35174800_35177050_35177312_35177996
tx.4751	chr13	-	1414	10	FSM	ENSMUSG00000021417.16	ENSMUST00000171229.8	1426	10	12	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_9	38.39206450927	223	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTAAGAATTCATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35178115	35161730	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_35162050_35162632_35162777_35164244_35164335_35170049_35170171_35171451_35171552_35172265_35172336_35174163_35174353_35174700_35174800_35177050_35177214_35177996
tx.4752	chr13	+	3187	7	NNC	ENSMUSG00000059288.15	novel	3470	10	NA	NA	-2856	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	95	junction_1	63.2334739060114	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGGAGTGTTTCTCTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35922439	36058047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_35922622_35999891_36000559_36040645_36040903_36042058_36042232_36047181_36047393_36055560_36055705_36056494
tx.4753	chr13	+	2445	6	NNC	ENSMUSG00000059288.15	novel	3470	10	NA	NA	90711	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	65	junction_1	80.650852444348	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGGGAGTGTTTCTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36037505	36058045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_36037615_36040645_36040903_36042058_36042232_36047181_36047393_36055560_36055705_36056494
tx.4754	chr13	+	2010	4	ISM	ENSMUSG00000059288.15	ENSMUST00000163595.3	3575	7	116834	-6	95335	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	213	junction_1	30.2691628926573	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGGAGTGTTTCTCTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36042129	36058047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_36042232_36047181_36047393_36055560_36055705_36056494
tx.4755	chr13	-	1033	8	NNC	ENSMUSG00000021418.16	novel	4380	8	NA	NA	325	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_7	192.402639041683	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTTGCTTGTTTGTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36089986	36080686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_36080909_36082547_36082683_36082797_36082997_36085288_36085415_36085995_36086092_36087670_36087740_36088401_36088547_36089945
tx.4756	chr13	-	1148	8	FSM	ENSMUSG00000021418.16	ENSMUST00000171686.9	4380	8	0	3232	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	464	junction_5	45.6195446836425	1733	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTTGCTTGTTTGTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36090342	36080686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_36080909_36082547_36082683_36082797_36082997_36085288_36085415_36085995_36086092_36087670_36087740_36088401_36088547_36090186
tx.4757	chr13	-	886	3	FSM	ENSMUSG00000046573.8	ENSMUST00000053265.8	2086	3	137	1063	137	-1063	multi-exon	FALSE	canonical	3	325	junction_1	9.5	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCATTTATTTCCTGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36301372	36163440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_36163891_36276788_36276910_36301057
tx.4758	chr13	-	740	3	NNC	ENSMUSG00000046573.8	novel	2086	3	NA	NA	-329	-1063	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	15	junction_2	155	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCATTTATTTCCTGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36301838	36163440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_36163891_36276788_36276910_36301669
tx.4759	chr13	+	1680	7	NIC	ENSMUSG00000021420.14	novel	2125	7	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	85.194711625129	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACATAGCATTTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36301627	36721567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_36301777_36388491_36389125_36416104_36416265_36430345_36430478_36525919_36526081_36594061_36594214_36721274
tx.476	chr1	+	3126	21	FSM	ENSMUSG00000053333.16	ENSMUST00000065694.8	3085	21	-37	-4	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_5	12.4998999996	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGTGTAGATGCCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86631527	86977818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_86631594_86672402_86672551_86673062_86673221_86681948_86682003_86688009_86688112_86748943_86749173_86782081_86782183_86784848_86785097_86806124_86806299_86858475_86858556_86887464_86887578_86901121_86901230_86917813_86918048_86948759_86948840_86971738_86971923_86972551_86972639_86974758_86974907_86975169_86975301_86975409_86975515_86976554_86976657_86977344
tx.4760	chr13	+	1679	7	FSM	ENSMUSG00000021420.14	ENSMUST00000021857.13	2125	7	446	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	195	junction_1	25.2300526268883	340	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACATAGCATTTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36301840	36721567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_36301989_36388491_36389125_36416104_36416265_36430345_36430478_36525919_36526081_36594061_36594214_36721274
tx.4761	chr13	+	1068	6	NNC	ENSMUSG00000021420.14	novel	726	5	NA	NA	-11800	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	93.2660710011953	35	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGACATAGCATTTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36404304	36721567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_36404475_36416104_36416265_36430345_36430478_36525919_36526081_36594061_36594214_36721274
tx.4762	chr13	-	608	4	NNC	ENSMUSG00000100760.2	novel	526	3	NA	NA	1844	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.24721912892465	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGCTGAGTCTGTTTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37617281	37605808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_37606132_37613995_37614157_37615394_37615464_37617226
tx.4763	chr13	-	505	2	Fusion	ENSMUSG00000114791.2_ENSMUSG00000100760.2	novel	399	2	NA	NA	92	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGCTGAGTCTGTTTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37624338	37605808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr13_-_37606132_37624156
tx.4764	chr13	+	616	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000114791.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTTGCTTCTCTCTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37620811	37623853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_37620937_37621996_37622153_37623518
tx.4765	chr13	-	646	2	FSM	ENSMUSG00000099847.2	ENSMUST00000187093.2	354	2	-55	-237	-55	237	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTACCCTCCTTGACCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37637239	37635950	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_37636445_37637087
tx.4766	chr13	-	857	2	NNC	ENSMUSG00000114724.2	novel	571	2	NA	NA	2203	131	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCTGTCTTTCCATAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37746745	37745789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_37746408_37746506
tx.4767	chr13	+	1346	7	NNC	ENSMUSG00000039087.18	novel	7437	10	NA	NA	-107	-19027	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_6	40.6915907228454	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCGTGTGTTCTGTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38009843	38097640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_38010029_38072846_38072949_38076527_38076635_38077747_38077961_38082387_38082478_38083599_38083764_38097155
tx.4768	chr13	-	2493	8	FSM	ENSMUSG00000021427.11	ENSMUST00000021864.8	9333	8	46	6794	-14	-6794	multi-exon	FALSE	canonical	3	888	junction_3	64.8026832399866	537	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAGCTGTATAATCTGTTT	5892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38178147	38162170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_38163783_38167368_38167463_38169239_38169319_38169950_38170028_38171492_38171756_38173479_38173568_38175972_38176086_38177980
tx.4769	chr13	+	1076	3	FSM	ENSMUSG00000021428.10	ENSMUST00000223910.2	2509	3	5	1428	5	-302	multi-exon	FALSE	canonical	3	223	junction_2	6	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAGTTGTTATCTGTATTG	4743	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38221225	38227618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_38221508_38224048_38224251_38227026
tx.477	chr1	-	674	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084106.5	novel	891	1	NA	NA	-20	50	multi-exon	FALSE	canonical	1	18	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATCACCAGTTGAAGGGCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86837425	86836464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_86836834_86837120
tx.4770	chr13	+	1813	4	ISM	ENSMUSG00000021428.10	ENSMUST00000226006.2	2307	5	-31	2454	6	77	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	187	junction_3	20.3960780543711	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAATTTTTGTCTCTGAATG	4744	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38221226	38229123	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_38221508_38224048_38224251_38227026_38227118_38227884
tx.4771	chr13	+	2480	17	FSM	ENSMUSG00000021428.10	ENSMUST00000021866.10	2738	17	256	2	6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_3	18.4889113727661	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGTAGTTTGCATTCTTGC	4744	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38221226	38245407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_38221508_38224048_38224251_38227026_38227118_38227884_38227955_38229248_38229292_38231220_38231314_38232855_38232969_38233051_38233133_38234199_38234287_38234783_38234922_38236244_38236349_38236853_38236961_38240137_38240204_38241112_38241233_38242663_38242718_38243915_38244069_38244730
tx.4772	chr13	-	387	2	Intergenic	novelGene_456	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGATAATTCATCATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38263459	38262195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_38262457_38263333
tx.4773	chr13	+	1049	6	NNC	ENSMUSG00000021431.16	novel	871	6	NA	NA	0	172	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	98.3959348753799	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38388920	38399578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_38389105_38393852_38393967_38394182_38394244_38395042_38395118_38398580_38398644_38399026
tx.4774	chr13	+	1182	9	FSM	ENSMUSG00000021431.16	ENSMUST00000091641.13	1785	9	-10	613	-3	72	multi-exon	FALSE	canonical	1	67	junction_6	66.7082032062025	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCAAAATTGTACACTACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38388910	38411028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_38389105_38393852_38393967_38394182_38394244_38395042_38395118_38400300_38400490_38401349_38401472_38404663_38404753_38405210_38405370_38410849
tx.4775	chr13	+	1440	5	ISM	ENSMUSG00000021431.16	ENSMUST00000223557.2	871	6	-1	-172	-1	172	intron_retention	FALSE	canonical	3	102	junction_4	60.6356949329353	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38388912	38399578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_38389105_38393852_38393967_38394182_38394244_38395042_38395118_38398580
tx.4776	chr13	+	1196	9	NNC	ENSMUSG00000021431.16	novel	1785	9	NA	NA	-1	79	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	88.1585928880447	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGTACACTACACACTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38388912	38411035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_38389105_38393852_38393967_38394182_38394244_38395042_38395127_38400300_38400490_38401349_38401472_38404663_38404753_38405210_38405370_38410849
tx.4777	chr13	+	303	2	FSM	ENSMUSG00000021431.16	ENSMUST00000223893.2	382	2	151	-72	151	72	multi-exon	FALSE	canonical	3	213	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCAAAATTGTACACTACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38405245	38411028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_38405370_38410849
tx.4778	chr13	-	1798	4	ISM	ENSMUSG00000038991.18	ENSMUST00000160653.2	2586	10	20824	-7	-1148	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1041	junction_1	51.4263227021597	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGGTCTTTGCTTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38691066	38684241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_38685685_38687406_38687537_38688699_38688783_38690924
tx.4779	chr13	-	1749	5	FSM	ENSMUSG00000038982.11	ENSMUST00000035899.8	5634	5	25	3860	8	-3860	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_3	8.98262211161084	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTATTTGAGATTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38819060	38786676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_38788005_38796618_38796678_38803065_38803196_38814968_38815052_38818911
tx.478	chr1	-	820	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000084106.5	novel	891	1	NA	NA	-20	49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCACCAGTTGAAGGGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86837425	86836465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_86836834_86836973
tx.4780	chr13	-	617	5	FSM	ENSMUSG00000038982.11	ENSMUST00000224902.2	612	5	-3	-2	-3	2	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	32.8357655613509	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTCCTTATTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38819040	38795807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_38796024_38796618_38796678_38803065_38803196_38814968_38815052_38818911
tx.4781	chr13	-	1031	4	FSM	ENSMUSG00000001707.9	ENSMUST00000001757.9	2553	4	40	1482	-8	-1482	multi-exon	FALSE	canonical	3	1400	junction_3	42.6640624205223	6506	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTGTTTGTTATCTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38842994	38829664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_38830287_38838971_38839068_38840015_38840217_38842882
tx.4782	chr13	-	552	2	FSM	ENSMUSG00000001707.9	ENSMUST00000224487.2	533	2	-8	-11	-8	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	1400	junction_1	0	262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGAGCATGGTTTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38842994	38839776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_38840217_38842882
tx.4783	chr13	+	444	3	NNC	ENSMUSG00000114813.2	novel	734	4	NA	NA	-58439	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATTTTCTCACACTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38849178	38911105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_38849334_38908953_38909090_38910952
tx.4784	chr13	+	389	3	NNC	ENSMUSG00000114813.2	novel	734	4	NA	NA	-58436	-93	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCATTTTCTCACACTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38849181	38911105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_38849334_38877504_38877589_38910952
tx.4785	chr13	-	349	2	ISM	ENSMUSG00000114319.2	ENSMUST00000225304.2	498	3	6	10980	6	-10980	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTATTAGCATACTGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39009688	39008199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_39008419_39009558
tx.4786	chr13	-	1928	10	FSM	ENSMUSG00000021432.16	ENSMUST00000225432.2	2216	10	292	-4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	14.9004929904357	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGGTGGGAAGAACTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39144508	39116111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_39116893_39118713_39118784_39121217_39121330_39121722_39121816_39123850_39123949_39127034_39127143_39128475_39128631_39138084_39138207_39139624_39139913_39144407
tx.4787	chr13	-	1616	9	NIC	ENSMUSG00000021432.16	novel	802	9	NA	NA	4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	5	junction_8	17.7552809045647	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGGTGGGAAGAACTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39144501	39116111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_39116893_39118713_39118784_39121217_39121330_39121722_39121816_39123850_39123949_39127034_39127143_39138084_39138207_39139796_39139913_39144385
tx.4788	chr13	-	1743	9	NIC	ENSMUSG00000021432.16	novel	2216	10	NA	NA	0	-26	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	39	junction_6	8.40293847412915	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATTAATAAAATTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39144508	39116141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_39116893_39118713_39118784_39121217_39121330_39121722_39121816_39123850_39123949_39127034_39127143_39138084_39138207_39139624_39139913_39144407
tx.4789	chr13	-	1571	9	FSM	ENSMUSG00000021432.16	ENSMUST00000224645.2	802	9	-25	-744	0	-26	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_7	12.4473892845046	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTATTAATAAAATTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39144508	39116141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_39116893_39118713_39118784_39121217_39121330_39121722_39121816_39123850_39123949_39127034_39127143_39138084_39138207_39139796_39139913_39144407
tx.479	chr1	-	1564	2	ISM	ENSMUSG00000026247.14	ENSMUST00000162015.2	574	3	-441	-227	-441	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTGGCCTCCAGACAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87077079	87075376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_87075809_87075947
tx.4790	chr13	+	3928	3	FSM	ENSMUSG00000021360.17	ENSMUST00000110191.10	4352	3	429	-5	429	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	71.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATAGTGGATATTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41013658	41114368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_41014750_41107051_41107148_41111627
tx.4791	chr13	-	498	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021360.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTCTCTCAGTGCTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41047217	41044513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_41044755_41045994_41046101_41047066
tx.4792	chr13	-	617	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021360.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTCTCTCAGTGCTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41047221	41044513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_41044870_41045994_41046101_41047066
tx.4793	chr13	+	3989	3	FSM	ENSMUSG00000021360.17	ENSMUST00000067778.8	4038	3	49	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_1	29	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATAGTGGATATTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41071125	41114368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_41072278_41107051_41107148_41111627
tx.4794	chr13	+	815	3	NNC	ENSMUSG00000021360.17	novel	334	2	NA	NA	-2610	304	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	90.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAACTGTCCAGCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41097597	41112008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_41097936_41107051_41107148_41111627
tx.4795	chr13	-	690	4	Intergenic	novelGene_459	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.942809041582063	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTTGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41123260	41119806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_41120059_41120567_41120733_41122509_41122647_41123124
tx.4796	chr13	+	1709	10	FSM	ENSMUSG00000038683.17	ENSMUST00000046951.10	1722	10	11	2	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	605	junction_5	43.1108247413169	1022	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGAGCTTAATTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41154509	41166489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_41154890_41158212_41158376_41161491_41161613_41161686_41161762_41162361_41162415_41162694_41162841_41162923_41163022_41164658_41164759_41165809_41165934_41166040
tx.4797	chr13	+	921	6	FSM	ENSMUSG00000021361.8	ENSMUST00000021790.7	914	6	-11	4	-11	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	613	junction_2	43.7154434954056	3861	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTCTGGTGTCGTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41169756	41176058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_41169875_41170590_41170650_41171181_41171259_41171831_41171934_41174594_41174683_41175581
tx.4798	chr13	+	862	5	NIC	ENSMUSG00000021361.8	novel	914	6	NA	NA	-11	-4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	108	junction_1	251.069089097005	663	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTCTGGTGTCGTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41169756	41176058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_41169875_41171181_41171259_41171831_41171934_41174594_41174683_41175581
tx.4799	chr13	-	2718	4	ISM	ENSMUSG00000021362.8	ENSMUST00000021791.8	3073	5	4321	-3	-179	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_3	1.69967317119759	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTAATCTCTTCAAGAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41259338	41254900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_41257166_41258044_41258171_41258886_41259000_41259124
tx.48	chr1	-	1386	11	FSM	ENSMUSG00000025935.11	ENSMUST00000027068.11	2938	11	35	1517	0	-1517	multi-exon	FALSE	canonical	3	1226	junction_5	62.5811473208985	337	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTGTTGTCCTGTTCCTG	9691	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13660099	13636438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_13636621_13639694_13639856_13640162_13640307_13642026_13642132_13642227_13642299_13646591_13646677_13648323_13648383_13649673_13649791_13649913_13650036_13651246_13651311_13659823
tx.480	chr1	-	815	5	ISM	ENSMUSG00000026247.14	ENSMUST00000027463.11	2695	17	5388	-3	-723	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_4	2.9474565306379	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTGGCCTCCAGACAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87077361	87075376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_87075809_87075947_87076025_87076346_87076443_87076855_87076922_87077217
tx.4800	chr13	+	1719	11	Fusion	ENSMUSG00000038651.16_ENSMUSG00000114388.2	novel	2641	29	NA	NA	-10	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_2	8.27345151674922	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCAGTTAGTGTGGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41306853	41332504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr13_+_41306957_41308994_41309122_41316547_41316622_41316769_41316840_41324946_41325022_41326119_41326224_41327290_41327389_41327673_41327774_41327873_41327933_41330358_41330421_41331657
tx.4801	chr13	-	1113	8	FSM	ENSMUSG00000021364.17	ENSMUST00000021793.15	3840	8	0	2727	0	-2609	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_4	7.79848232226067	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAACTGGAGCCATGCCGAC	7559	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41373881	41338583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_41338884_41340328_41340464_41340904_41341030_41343421_41343594_41345363_41345442_41348122_41348311_41350610_41350675_41373830
tx.4802	chr13	-	1011	7	ISM	ENSMUSG00000021364.17	ENSMUST00000117096.2	3797	8	22963	2661	22963	-2661	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_4	8.28653526310404	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATCATTTGTACCCAGAAT	9204	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41350675	41338635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_41338884_41340328_41340464_41340904_41341030_41343421_41343594_41345363_41345442_41348122_41348311_41350610
tx.4803	chr13	+	523	2	FSM	ENSMUSG00000091264.4	ENSMUST00000165561.4	4483	2	320	3640	320	-3640	multi-exon	FALSE	canonical	3	181	junction_1	0	205	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGGCCATTGCAGATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41403639	41426413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_41403791_41426041
tx.4804	chr13	+	848	2	Intergenic	novelGene_460	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCTTGCTTTCTTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41894770	41901165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_41894875_41900421
tx.4805	chr13	+	981	3	Intergenic	novelGene_461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGACCCTCTTGCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41894771	41901160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_41894875_41898582_41898722_41900421
tx.4806	chr13	-	1109	7	FSM	ENSMUSG00000058022.15	ENSMUST00000121404.8	1602	7	68	425	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_6	3.97562014729219	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTGACATCTCCTGTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42001092	41918033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_41918269_41920811_41920964_41930983_41931100_41967690_41967793_41969613_41969749_41981618_41981862_42000966
tx.4807	chr13	+	456	4	ISM	ENSMUSG00000021366.9	ENSMUST00000060148.6	8753	9	-16	30474	-16	-79	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_2	1.24721912892465	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCATCAGAGTCTCATAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42205480	42308028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_42205567_42208875_42209019_42276635_42276690_42307855
tx.4809	chr13	+	725	5	FSM	ENSMUSG00000054728.18	ENSMUST00000136576.8	716	5	-50	41	-50	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_4	2.29128784747792	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGAAAGGAAAAAGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43276282	43288846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_43276531_43281613_43281676_43286395_43286537_43287402_43287480_43288649
tx.481	chr1	+	982	7	FSM	ENSMUSG00000026254.18	ENSMUST00000113233.8	1807	7	32	793	7	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	965	junction_1	498.771713534581	5436	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTCTCATGCTCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87141667	87155785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_87141742_87147302_87147418_87148641_87148777_87152074_87152180_87153571_87153725_87153818_87153956_87155522
tx.4810	chr13	-	728	5	ISM	ENSMUSG00000021368.16	ENSMUST00000179852.9	1246	8	6133	0	-58	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	210	junction_1	30.5941170815567	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGGCGTGGCCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43318827	43305215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_43305457_43306545_43306676_43308164_43308311_43312738_43312877_43318754
tx.4811	chr13	-	1193	8	FSM	ENSMUSG00000021368.16	ENSMUST00000021797.9	1239	8	50	-4	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_7	94.4833426632246	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGGCGTGGCCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43324927	43305215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_43305457_43306545_43306676_43308164_43308311_43312738_43312877_43318754_43318943_43322249_43322331_43323277_43323424_43324804
tx.4812	chr13	-	1208	8	FSM	ENSMUSG00000021368.16	ENSMUST00000179852.9	1246	8	38	0	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_7	48.9393627307283	579	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGGCGTGGCCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43324922	43305215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_43305457_43306545_43306676_43308164_43308311_43312738_43312877_43318754_43318943_43322249_43322331_43323277_43323424_43324784
tx.4813	chr13	+	1398	9	FSM	ENSMUSG00000054021.7	ENSMUST00000223194.2	1398	9	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	63.0811729044411	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTATTTTTTTGTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43518981	43548679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_43519021_43524194_43524345_43525307_43525442_43530170_43530397_43533148_43533237_43533975_43534030_43536584_43536709_43538973_43539090_43548212
tx.4814	chr13	+	1472	9	NIC	ENSMUSG00000054021.7	novel	1579	9	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	172	junction_8	20.7710736361893	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTATTTTTTTGTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43519103	43548679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_43519217_43524194_43524345_43525307_43525442_43530170_43530397_43533148_43533237_43533975_43534030_43536584_43536709_43538973_43539090_43548212
tx.4815	chr13	+	939	8	FSM	ENSMUSG00000063200.5	ENSMUST00000071926.5	1800	8	-8	869	-8	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1274	junction_1	87.1250567299906	5772	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTGGTCACATTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43551857	43555468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_43552135_43552210_43552272_43552986_43553046_43554068_43554098_43554328_43554411_43554772_43554895_43554975_43555054_43555237
tx.4816	chr13	+	750	7	NIC	ENSMUSG00000063200.5	novel	1800	8	NA	NA	12	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	1367	junction_3	68.3408532447629	775	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTGGTCACATTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43552122	43555468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_43552272_43552986_43553046_43554068_43554098_43554328_43554411_43554772_43554895_43554975_43555054_43555237
tx.4817	chr13	-	1259	3	ISM	ENSMUSG00000038546.10	ENSMUST00000222651.2	1951	14	66363	-587	-60	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	240	junction_2	11.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATATTAGTGTCAGTTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43566020	43556152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_43557166_43560087_43560200_43565886
tx.4818	chr13	-	146	2	ISM	ENSMUSG00000021371.6	ENSMUST00000223347.2	579	3	1594	-44	1594	44	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	180	junction_1	0	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTCATTGTTTTGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43698002	43695130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_43695206_43697931
tx.4819	chr13	-	245	3	FSM	ENSMUSG00000021371.6	ENSMUST00000223347.2	579	3	378	-44	378	44	multi-exon	FALSE	canonical	3	180	junction_1	24.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTCATTGTTTTGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43699218	43695130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_43695206_43697931_43698047_43699163
tx.482	chr1	+	1088	7	FSM	ENSMUSG00000026254.18	ENSMUST00000113231.4	1119	7	30	1	30	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1076	junction_1	458.210801802935	5614	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTCTCATGCTCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87142037	87155785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_87142218_87147302_87147418_87148641_87148777_87152074_87152180_87153571_87153725_87153818_87153956_87155522
tx.4820	chr13	-	751	9	FSM	ENSMUSG00000021371.6	ENSMUST00000021800.6	4339	9	326	3262	326	44	multi-exon	FALSE	canonical	3	180	junction_1	32.5720355519885	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTCATTGTTTTGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43713311	43695130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_43695206_43697931_43698047_43699163_43699218_43702126_43702199_43703007_43703050_43704472_43704575_43705072_43705177_43708371_43708492_43713244
tx.4821	chr13	-	637	3	Intergenic	novelGene_464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGCTAATGTTCATATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44363650	44357026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_44357201_44360829_44360917_44363274
tx.4822	chr13	-	536	5	NNC	ENSMUSG00000112936.2	novel	450	3	NA	NA	-18731	-16006	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_1	1.4790199457749	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTTGGTCATGGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44563324	44533317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_44533446_44533621_44533700_44550656_44550729_44553579_44553638_44563124
tx.4823	chr13	-	622	2	ISM	ENSMUSG00000113010.2	ENSMUST00000222236.2	1298	4	19601	-7	19601	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTCTTTTTGTTGTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44638423	44625894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_44626251_44638157
tx.4824	chr13	+	1427	6	ISM	ENSMUSG00000038518.16	ENSMUST00000173704.8	4135	19	570	23626	-24	1	internal_fragment	FALSE	canonical	3	632	junction_5	48.981629209327	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAACAGGTAACCCTCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44884819	45049958	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_44885393_44976855_44976992_45001755_45001898_45027758_45027929_45038179_45038357_45049729
tx.4825	chr13	+	2392	5	ISM	ENSMUSG00000038518.16	ENSMUST00000174683.8	8353	16	182334	2	72921	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	689	junction_1	75.9946544172681	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTTGTCTGTCTTGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45067179	45075114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_45067310_45067721_45067853_45068239_45068424_45069892_45070001_45073275
tx.4826	chr13	+	1410	3	ISM	ENSMUSG00000038518.16	ENSMUST00000044608.14	5019	19	184021	-2	74061	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	870	junction_2	4	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCCATCCCTTTTGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45068319	45074473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_45068424_45069892_45070001_45073275
tx.4827	chr13	-	1267	10	FSM	ENSMUSG00000057531.15	ENSMUST00000072329.15	1362	10	95	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	444	junction_2	46.8187996428785	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTGCAGCTGGTGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45155528	45075554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_45075931_45076624_45076769_45084471_45084628_45106647_45106671_45123521_45123655_45136216_45136350_45139510_45139572_45145494_45145546_45147160_45147215_45155392
tx.4828	chr13	-	1271	9	NNC	ENSMUSG00000057531.15	novel	1362	10	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	173.034498005456	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTGCAGCTGGTGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45155527	45075554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_45075931_45076624_45076769_45084471_45084628_45123493_45123655_45136216_45136350_45139510_45139572_45145494_45145546_45147160_45147215_45155392
tx.4829	chr13	+	1057	2	ISM	ENSMUSG00000038175.11	ENSMUST00000038275.11	3065	7	-4	20083	-4	-19106	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTGTTGTTGTTTTTTTC	4391	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45543213	45545415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_45543520_45544664
tx.483	chr1	+	535	3	ISM	ENSMUSG00000026254.18	ENSMUST00000113231.4	1119	7	11582	1	11582	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2105	junction_2	105.5	1126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTCTCATGCTCTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87153589	87155785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_87153725_87153818_87153956_87155522
tx.4830	chr13	+	3069	7	NNC	ENSMUSG00000038175.11	novel	3065	7	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	16.5403546918841	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGCCTTTGTGATCTTAT	4395	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45543217	45565498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_45543520_45544664_45544856_45557875_45558062_45559368_45559567_45560032_45560202_45561831_45562253_45563896
tx.4831	chr13	+	1659	10	NNC	ENSMUSG00000000253.14	novel	1580	9	NA	NA	14	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_5	25.8370965001015	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTGCTGGAGTTTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45660933	45699858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_45661220_45667870_45667991_45670474_45670559_45674327_45674502_45674602_45674696_45683183_45683266_45685769_45685877_45692500_45692544_45695954_45696115_45699348
tx.4832	chr13	+	1567	9	FSM	ENSMUSG00000000253.14	ENSMUST00000000260.13	1580	9	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_4	10.0428768288773	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTGCTGGAGTTTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45660932	45699858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_45661220_45667870_45667991_45670474_45670559_45674327_45674502_45683183_45683266_45685769_45685877_45692500_45692544_45695954_45696115_45699348
tx.4833	chr13	-	459	3	Intergenic	novelGene_466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGTAAAGGTCTTACAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46165976	46155183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_46155376_46155954_46156087_46165841
tx.4834	chr13	-	941	2	Intergenic	novelGene_468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTCAGGGTAATGTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46165976	46163064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_46163871_46165841
tx.4835	chr13	+	1775	13	FSM	ENSMUSG00000021373.17	ENSMUST00000021802.16	3713	13	209	1729	-68	26	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	4.58257569495584	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTGTGATTTTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46655532	46802028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_46655688_46678890_46679013_46684452_46684554_46713979_46714058_46763071_46763216_46763539_46763626_46768725_46768832_46789096_46789287_46791324_46791498_46793298_46793423_46793515_46793599_46800001_46800143_46801756
tx.4836	chr13	+	631	6	ISM	ENSMUSG00000021373.17	ENSMUST00000021802.16	3713	13	223	40173	-54	-27895	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	4.87442304278158	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTTTACACAAACAGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46655546	46763584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_46655688_46678890_46679013_46684452_46684554_46713979_46714058_46763071_46763216_46763539
tx.4837	chr13	+	575	2	ISM	ENSMUSG00000021373.17	ENSMUST00000225824.2	1634	12	144198	-26	6306	26	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTGTGATTTTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46799839	46802028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_46800143_46801756
tx.4838	chr13	+	867	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021375.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTGTCTGTTTGCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46966182	46969140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_46966409_46968499
tx.4839	chr13	-	969	8	ISM	ENSMUSG00000021376.12	ENSMUST00000021806.11	2708	9	1629	1634	0	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_1	10.9935045757549	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTAGCCATGGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47195057	47178652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_47178954_47180727_47180773_47182357_47182444_47185893_47185969_47188496_47188550_47189370_47189504_47193579_47193673_47194874
tx.484	chr1	+	1888	4	FSM	ENSMUSG00000026255.16	ENSMUST00000027472.7	1854	4	-34	0	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_2	0.942809041582063	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCAGTGTGCCTTTTTGGT	1374	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87192050	87238561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_87192477_87217189_87217338_87225350_87225486_87237382
tx.4840	chr13	-	1035	9	FSM	ENSMUSG00000021376.12	ENSMUST00000021806.11	2708	9	39	1634	-27	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_8	22.6436387314407	397	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTAGCCATGGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47196647	47178652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_47178954_47180727_47180773_47182357_47182444_47185893_47185969_47188496_47188550_47189370_47189504_47193579_47193673_47194874_47195056_47196579
tx.4841	chr13	-	1034	9	NIC	ENSMUSG00000021376.12	novel	2708	9	NA	NA	17	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	43	junction_8	30.2438010177292	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTATTAGCCATGGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47196669	47178652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_47178954_47180727_47180773_47182357_47182444_47185893_47185969_47188496_47188550_47189370_47189504_47193579_47193673_47194874_47195056_47196602
tx.4842	chr13	+	1074	8	ISM	ENSMUSG00000038080.18	ENSMUST00000037025.16	4987	21	40	24171	-31	7378	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_2	9.42424142998322	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGCTATGCAGTTGGCCT	1201	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47197014	47214584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_47197147_47201378_47201479_47202653_47202782_47204085_47204176_47205264_47205377_47207094_47207212_47212251_47212291_47214228
tx.4843	chr13	-	2557	10	ISM	ENSMUSG00000021377.16	ENSMUST00000021807.13	2556	11	334	0	-26	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1428	junction_1	93.7092956902645	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCTTGTATTTAATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47259332	47238257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_47239556_47239900_47239970_47241500_47241650_47241952_47242092_47251630_47251820_47252818_47252940_47253649_47253745_47255098_47255209_47255448_47255551_47259047
tx.4844	chr13	-	2549	11	FSM	ENSMUSG00000021377.16	ENSMUST00000021807.13	2556	11	7	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1333	junction_10	113.482333426838	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCTTGTATTTAATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47259659	47238257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_47239556_47239900_47239970_47241500_47241650_47241952_47242092_47251630_47251820_47252818_47252940_47253649_47253745_47255098_47255209_47255448_47255551_47259047_47259214_47259548
tx.4845	chr13	-	765	3	NNC	ENSMUSG00000097326.3	novel	672	3	NA	NA	-3	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	6	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTCTTTGTATGTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48427363	48425889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_48426292_48426385_48426624_48427238
tx.4846	chr13	-	670	3	FSM	ENSMUSG00000097326.3	ENSMUST00000180777.3	672	3	1	1	1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTCTTTGTATGTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48427359	48425889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_48426292_48426385_48426533_48427238
tx.4847	chr13	+	1115	2	FSM	ENSMUSG00000053181.2	ENSMUST00000065465.2	786	2	-34	-295	-34	295	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCATGTGGAGATGGTCTC	3943	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48667011	48668630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_48667106_48667609
tx.4849	chr13	-	2188	4	ISM	ENSMUSG00000038014.8	ENSMUST00000060805.7	5105	18	78825	-3	78825	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	225	junction_3	32.0312347560939	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGGTGTGGCTTTTAAAT	1254	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49042668	49032691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_49034572_49038748_49038846_49039212_49039355_49042599
tx.485	chr1	+	1424	3	NIC	ENSMUSG00000026255.16	novel	353	2	NA	NA	-99	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCAGTGTGCCTTTTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87236848	87238561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_87237219_87237382_87237569_87237693
tx.4850	chr13	-	804	3	ISM	ENSMUSG00000038014.8	ENSMUST00000060805.7	5105	18	191	66721	191	-66721	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	231	junction_1	14.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAAACGTAGCTTGATTTTC	6574	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49121302	49099415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_49099501_49102532_49102780_49120830
tx.4851	chr13	+	1220	2	Intergenic	novelGene_469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCATGCTTGCTTTCCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49121826	49123379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_49122081_49122413
tx.4852	chr13	-	1452	5	Intergenic	novelGene_471	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAATGAAGCACGTGCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49334319	49322542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_49323595_49325589_49325745_49325829_49325885_49326522_49326583_49334189
tx.4853	chr13	+	1177	4	FSM	ENSMUSG00000037966.16	ENSMUST00000049022.15	1187	4	16	-6	16	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	352	junction_2	21.013223349966	469	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCCATGTGCCACCCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49340976	49349726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_49341114_49347211_49347441_49348369_49348534_49349079
tx.4854	chr13	-	805	6	FSM	ENSMUSG00000037960.12	ENSMUST00000048946.7	804	6	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	362	junction_5	10.4115320678563	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCCTGTCGAATGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49369502	49356425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_49356712_49357193_49357266_49357404_49357465_49358667_49358822_49361479_49361623_49369412
tx.4855	chr13	-	597	2	ISM	ENSMUSG00000021384.15	ENSMUST00000058196.13	1418	5	10777	139	3101	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTAGCCACCTTATCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49390993	49384304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_49384808_49390899
tx.4856	chr13	+	2845	13	FSM	ENSMUSG00000021385.11	ENSMUST00000220447.2	4421	13	-13	1589	-13	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_9	16.41053184865	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAACATCCTATAGAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49574711	49616460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_49574943_49584344_49584393_49585845_49585942_49587304_49587372_49588945_49589068_49590186_49590277_49595428_49595488_49596897_49596971_49599778_49600053_49602712_49602864_49603456_49603560_49612088_49612169_49615009
tx.4857	chr13	+	858	7	NNC	ENSMUSG00000021385.11	novel	4421	13	NA	NA	-14	-24823	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_6	51.3173676470473	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTTCTGGAAGGGCAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49574710	49591554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_49574943_49584344_49584393_49585845_49585942_49587304_49587372_49588945_49589068_49590186_49590277_49591351
tx.4858	chr13	-	962	6	NIC	ENSMUSG00000021391.11	novel	1144	8	NA	NA	7	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	4	junction_4	81.0668859646157	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGCTTTGTACAGTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49806254	49617495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_49617814_49618170_49618263_49619154_49619235_49780730_49780828_49803596_49803776_49806058
tx.4859	chr13	-	1133	8	FSM	ENSMUSG00000021391.11	ENSMUST00000021818.9	1144	8	9	2	-9	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_6	22.1387092889263	174	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTATAGTGCTTTGTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49806252	49617500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_49617814_49618170_49618263_49619154_49619235_49780730_49780828_49794701_49794791_49801041_49801131_49803596_49803776_49806058
tx.486	chr1	+	1242	4	FSM	ENSMUSG00000048000.16	ENSMUST00000174583.8	3015	4	-7	1780	-6	282	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_3	78.7922726047562	246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAAAGAGTTTTCTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87254744	87283726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_87254815_87261991_87262057_87282125_87282209_87282702
tx.4860	chr13	+	692	5	ISM	ENSMUSG00000021392.9	ENSMUST00000222197.2	4368	17	254	20000	-1	-57	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_1	5.53962995154008	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAACAACAGGCAACCCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49806807	49812214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_49807159_49807822_49807979_49808648_49808712_49810150_49810230_49812171
tx.4861	chr13	+	902	4	ISM	ENSMUSG00000037851.14	ENSMUST00000047363.14	4396	34	11	45188	11	766	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1400	junction_1	175.617640217478	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AATGGTCTCTGTATTTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49835616	49842555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_49835680_49840861_49840988_49841632_49841790_49841999
tx.4862	chr13	+	1169	10	ISM	ENSMUSG00000037851.14	ENSMUST00000047363.14	4396	34	14	30893	14	-8407	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1400	junction_1	130.116187395044	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGAATCTTTTTGTCTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49835619	49856850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_49835680_49840861_49840988_49841632_49841790_49841999_49842120_49843923_49844007_49844969_49845088_49846499_49846648_49855319_49855408_49855963_49856025_49856642
tx.4863	chr13	+	1406	11	NNC	ENSMUSG00000037851.14	novel	4426	34	NA	NA	14	-7960	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	514.720594109076	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGCTTTTGGTTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49835619	49857297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_49835680_49840861_49840988_49841632_49841790_49841999_49842120_49843923_49844007_49844969_49845088_49846499_49846648_49855319_49855408_49855963_49856025_49856642_49856739_49856948
tx.4864	chr13	+	1097	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000094886.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGGTGATTTATGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50097438	50105148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_50097471_50100049_50100190_50104223
tx.4865	chr13	+	1809	10	FSM	ENSMUSG00000037816.11	ENSMUST00000046974.5	1798	10	1	-12	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_8	4.29469957557504	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCTGCATGAACTTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50571900	50587817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_50572024_50573875_50573914_50577237_50577399_50577787_50577907_50579592_50579803_50580657_50580817_50585575_50585787_50586206_50586383_50586463_50586592_50587333
tx.4867	chr13	+	1931	10	NIC	ENSMUSG00000037816.11	novel	2316	11	NA	NA	0	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	3	junction_2	7.03957069398096	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGACACATTCCTGCATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50571921	50587809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_50572024_50573875_50574065_50577237_50577399_50577787_50577907_50579592_50579803_50580657_50580817_50585575_50585787_50586206_50586383_50586463_50586592_50587333
tx.4869	chr13	+	1414	6	FSM	ENSMUSG00000021395.12	ENSMUST00000095797.6	4434	6	13	3007	13	-2955	multi-exon	FALSE	canonical	3	703	junction_1	64.2227374066226	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGTTACTGCCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51254928	51303575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_51255027_51277123_51277325_51281960_51282010_51293392_51293647_51298337_51298572_51302997
tx.487	chr1	+	1014	5	ISM	ENSMUSG00000048000.16	ENSMUST00000173850.8	2520	9	-25	25034	-6	194	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_4	32.0078115465584	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAACAAACATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87254744	87293571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_87254815_87261991_87262057_87282125_87282209_87291825_87291956_87292905
tx.4871	chr13	+	2015	6	NNC	ENSMUSG00000021395.12	novel	4434	6	NA	NA	22	-2420	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	65	junction_1	289.12599329704	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATTGGTCCATTTGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51254937	51304110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_51255102_51277123_51277325_51281960_51282010_51293392_51293647_51298337_51298572_51302997
tx.4872	chr13	+	1172	6	NNC	ENSMUSG00000021395.12	novel	4434	6	NA	NA	463	-3268	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	46	junction_1	296.576735432839	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATTGCTTTCCAGTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51255378	51303262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_51255548_51277123_51277325_51281960_51282010_51293392_51293647_51298337_51298572_51302997
tx.4873	chr13	+	1255	2	ISM	ENSMUSG00000021395.12	ENSMUST00000223152.2	4085	4	10076	2419	10076	-2419	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	720	junction_1	0	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTGGTCCATTTGTACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51298430	51304111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_51298572_51302997
tx.4874	chr13	+	980	2	FSM	ENSMUSG00000021396.6	ENSMUST00000021828.6	1167	2	184	3	147	-3	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGCAGCTCTGATGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51325241	51329221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_51325661_51328660
tx.4875	chr13	+	431	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000112959.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTCAACTGTCCTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51555211	51558832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_51555275_51557581_51557675_51558557
tx.4876	chr13	-	827	2	NNC	ENSMUSG00000021448.9	novel	3644	11	NA	NA	132422	55	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAGACATGCTTATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51588698	51585021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_51585318_51588167
tx.4877	chr13	+	605	3	FSM	ENSMUSG00000062248.6	ENSMUST00000075853.6	692	3	84	3	84	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	3514	junction_2	7.5	10402	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCACCATTGTTGAAATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51799351	51804693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_51799508_51803620_51803749_51804372
tx.4878	chr13	+	3326	17	FSM	ENSMUSG00000035139.15	ENSMUST00000040117.15	3328	17	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_13	19.2596363867546	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCAGGCTATTGTGATCTT	5496	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51805734	51838080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_51805857_51806642_51806792_51808421_51808672_51809134_51809277_51810916_51811147_51816656_51816736_51819307_51819511_51824842_51824966_51827105_51827196_51827923_51828066_51830322_51830490_51831176_51831316_51832869_51833027_51833768_51833990_51836035_51836191_51836479_51836670_51837313
tx.488	chr1	+	1556	2	ISM	ENSMUSG00000026288.15	ENSMUST00000170300.8	3942	23	41670	2	8568	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	579	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACTGGGCCTCCTGACTGT	4454	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87645630	87648222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_87646007_87647042
tx.4880	chr13	+	1078	4	FSM	ENSMUSG00000021453.3	ENSMUST00000021903.3	1071	4	0	-7	0	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_3	4.02768199119819	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATGCCTTTTTATTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52000713	52002511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_52000869_52001387_52001490_52001591_52001806_52001904
tx.4881	chr13	+	924	3	ISM	ENSMUSG00000021453.3	ENSMUST00000021903.3	1071	4	673	-7	607	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_2	4	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATGCCTTTTTATTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52001386	52002511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_52001490_52001591_52001806_52001904
tx.4882	chr13	+	867	2	ISM	ENSMUSG00000021453.3	ENSMUST00000021903.3	1071	4	832	-7	766	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAATGCCTTTTTATTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52001545	52002511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_52001806_52001904
tx.4883	chr13	-	825	3	Intergenic	novelGene_472	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATGTCCTCTTAAGCTGG	1695	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52598540	52596466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_52597007_52597120_52597241_52598375
tx.4885	chr13	-	1807	5	Intergenic	novelGene_473	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	5	junction_1	1.58113883008419	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCTTTGGGTCATGATGT	8324	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52727278	52708390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_52709757_52709963_52710015_52714215_52714317_52715084_52715256_52727160
tx.4886	chr13	+	1245	3	ISM	ENSMUSG00000021457.15	ENSMUST00000120135.8	5363	14	288	35855	24	-748	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_1	5.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATCTTAGTATCTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52737496	52766973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_52737642_52764831_52765289_52766330
tx.4889	chr13	+	972	4	ISM	ENSMUSG00000021457.15	ENSMUST00000055087.7	5122	14	41326	5171	41220	-3	internal_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_1	4.32049379893857	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAACAATCTCTGAGCCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52792214	52797647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_52792284_52794640_52794831_52795900_52796042_52797075
tx.489	chr1	+	3029	17	FSM	ENSMUSG00000026289.16	ENSMUST00000113186.8	3004	17	-22	-3	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_8	19.4867743610891	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTTGCGTCTTGATTGTC	7286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87683775	87720147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_87684037_87687772_87687867_87693059_87693166_87693830_87693905_87694527_87694780_87699113_87699180_87701866_87701954_87703478_87703582_87706643_87706750_87707846_87707918_87709392_87709465_87713597_87713719_87713962_87714069_87717052_87717203_87717293_87717342_87718307_87718410_87718937
tx.4890	chr13	-	1187	10	FSM	ENSMUSG00000021460.18	ENSMUST00000021913.16	1320	10	133	0	-70	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	269	junction_3	77.7090172246741	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAAGTTATACCAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53083564	52989154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_52989588_52992121_52992170_52993593_52993645_52994912_52995101_53041276_53041334_53043138_53043232_53052685_53052773_53073036_53073125_53073234_53073303_53083490
tx.4891	chr13	-	578	4	FSM	ENSMUSG00000021460.18	ENSMUST00000110031.4	3235	4	22	2635	2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_1	164.004742478855	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGTTCCCAGTGTGGCGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53083695	53066880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_53067098_53073036_53073125_53073234_53073303_53083490
tx.4892	chr13	+	1593	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021464.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	3	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGACTTATCAGCTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53338474	53340979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_53338633_53339455_53339592_53339680
tx.4893	chr13	-	2576	15	FSM	ENSMUSG00000021468.9	ENSMUST00000021920.8	2606	15	30	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_11	13.0690864412232	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTCTGTTTGGATAGCAG	1859	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53531403	53486783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_53488014_53489376_53489451_53491643_53491762_53496207_53496263_53497163_53497261_53497814_53497911_53498836_53498945_53505636_53505727_53508186_53508317_53512796_53512930_53521347_53521421_53521901_53521996_53527364_53527460_53527997_53528106_53531328
tx.4894	chr13	-	1214	2	FSM	ENSMUSG00000021469.10	ENSMUST00000021922.10	2453	2	237	1002	237	-1002	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATGTAAAAATTCAAGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53626873	53621921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_53622630_53626367
tx.4895	chr13	+	595	3	ISM	ENSMUSG00000021474.10	ENSMUST00000021930.10	2783	11	0	19098	0	-630	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	779	junction_1	87.5	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AATGAAAGAAGATATAGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54225887	54243263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_54225952_54239467_54239643_54242907
tx.4896	chr13	+	1221	11	FSM	ENSMUSG00000021474.10	ENSMUST00000021930.10	2783	11	0	1562	0	-1562	multi-exon	FALSE	canonical	3	779	junction_1	55.358919787149	1075	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCTTCTGGTAGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54225887	54260799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_54225952_54239467_54239643_54242907_54243079_54245241_54245341_54246391_54246468_54247019_54247106_54247872_54248001_54250749_54250800_54258820_54258871_54259766_54259815_54260525
tx.4897	chr13	+	1158	10	ISM	ENSMUSG00000021474.10	ENSMUST00000021930.10	2783	11	13579	1562	-498	-1562	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	858	junction_8	32.8299020579685	208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCTTCTGGTAGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54239466	54260799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_54239643_54242907_54243079_54245241_54245341_54246391_54246468_54247019_54247106_54247872_54248001_54250749_54250800_54258820_54258871_54259766_54259815_54260525
tx.4898	chr13	+	490	5	ISM	ENSMUSG00000021474.10	ENSMUST00000021930.10	2783	11	22045	1562	1203	-1562	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	858	junction_3	39.2897887497502	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCCTTCTGGTAGATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54247932	54260799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_54248001_54250749_54250800_54258820_54258871_54259766_54259815_54260525
tx.4899	chr13	-	406	2	Intergenic	novelGene_474	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACCTTGGTGACTTATACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54486594	54485567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_54485816_54486436
tx.49	chr1	-	1046	7	FSM	ENSMUSG00000025937.7	ENSMUST00000027071.7	4494	7	26	3422	26	3243	multi-exon	FALSE	canonical	3	2151	junction_5	155.94015946296	4206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGATACTTGTAATCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13730744	13696975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_13697129_13697579_13697662_13700288_13700438_13708454_13708634_13717608_13717736_13720944_13721109_13730552
tx.490	chr1	+	1320	5	FSM	ENSMUSG00000026289.16	ENSMUST00000134603.2	1674	5	-59	413	21	-413	multi-exon	FALSE	canonical	3	195	junction_1	13.2759180473518	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGTCTGACCAGTATCTAT	7266	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87683755	87695292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_87684037_87687772_87687867_87693059_87693166_87693830_87693905_87694527
tx.4900	chr13	-	1340	6	FSM	ENSMUSG00000025872.6	ENSMUST00000026990.6	2335	6	9	986	9	-986	multi-exon	FALSE	canonical	3	501	junction_3	36.0699320764539	1506	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAAACCAAAACGGCCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54616653	54607635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_54608051_54611284_54611386_54611494_54611657_54613992_54614198_54615638_54615796_54616353
tx.4901	chr13	-	1594	2	FSM	ENSMUSG00000025872.6	ENSMUST00000135404.2	465	2	-4	-1125	-4	1125	multi-exon	FALSE	canonical	3	549	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAAGGTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54616643	54614491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_54615796_54616353
tx.4902	chr13	-	2638	9	FSM	ENSMUSG00000025871.19	ENSMUST00000026989.15	2727	9	84	5	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	520	junction_7	24.8696602308918	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCAGGTCTGTCTTGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54713164	54699035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_54700631_54700710_54700851_54701010_54701118_54704339_54704465_54707010_54707138_54709505_54709685_54711997_54712086_54712327_54712435_54712994
tx.4903	chr13	-	2553	8	FSM	ENSMUSG00000025871.19	ENSMUST00000153065.8	2502	8	-51	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_6	177.014469603419	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCAGGTCTGTCTTGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54713167	54699035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_54700631_54700710_54700851_54701010_54701118_54704339_54704465_54707010_54707138_54709505_54709685_54712327_54712435_54712994
tx.4904	chr13	+	1015	4	NIC	ENSMUSG00000025870.11	novel	1046	4	NA	NA	-10	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_3	37.8623236946117	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGATTTATTCACTTACTT	2696	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54722849	54727350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_54723091_54723562_54723762_54726605_54726782_54726951
tx.4905	chr13	+	2641	4	FSM	ENSMUSG00000025870.11	ENSMUST00000026988.11	1046	4	40	-1635	8	1635	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_3	14.6363322667334	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCTGAAGTGACTTTACT	2714	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54722867	54730576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_54723091_54723562_54723762_54726605_54726782_54728533
tx.4906	chr13	+	1161	3	FSM	ENSMUSG00000025870.11	ENSMUST00000156024.2	654	3	17	-524	17	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_2	15	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTATTCACTTACTTTAT	2723	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54722876	54727353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_54723091_54723562_54723762_54726605
tx.4907	chr13	-	1091	5	FSM	ENSMUSG00000025869.12	ENSMUST00000026987.12	1756	5	16	649	-16	-298	multi-exon	FALSE	canonical	3	1006	junction_4	30.4302481094059	2633	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGACTAGGTGGGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54737887	54732646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_54733238_54733632_54733740_54736410_54736481_54737475_54737585_54737673
tx.4908	chr13	+	634	2	FSM	ENSMUSG00000025868.7	ENSMUST00000026986.7	648	2	5	9	5	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	1416	junction_1	0	8823	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGATGAACTATTTCTTAA	5983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54738024	54738962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_54738233_54738536
tx.4909	chr13	-	1027	5	FSM	ENSMUSG00000047547.15	ENSMUST00000091609.11	2186	5	0	1159	0	-22	multi-exon	FALSE	canonical	3	406	junction_1	26.0708170182678	1287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCCGCAACTGGTGTCAGC	7405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54759157	54741372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_54741856_54746534_54746647_54746856_54746975_54754456_54754504_54758890
tx.491	chr1	+	721	4	ISM	ENSMUSG00000070738.11	ENSMUST00000027517.14	5695	30	2	29030	2	-284	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	363	junction_2	19.7033556081755	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATCTTTTCCCTCTTTGTGT	4072	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87781010	87843182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_87781179_87808089_87808201_87809580_87809662_87842821
tx.4910	chr13	-	432	3	ISM	ENSMUSG00000047547.15	ENSMUST00000146301.2	3174	4	-52	3004	0	-3004	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	422	junction_2	19	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGGGCACACCTGGAGGA	7405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54759157	54746856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_54746975_54754456_54754504_54758890
tx.4911	chr13	+	1940	11	FSM	ENSMUSG00000025873.17	ENSMUST00000126071.9	4322	11	16	2366	-1	111	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	132.701770900015	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCGCATCCTTTGCCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54769612	54809510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_54769717_54786062_54786132_54789231_54789367_54793057_54793135_54796104_54796244_54797790_54797877_54797971_54798064_54799855_54800034_54803218_54803391_54804094_54804239_54808766
tx.4912	chr13	+	1880	11	FSM	ENSMUSG00000025873.17	ENSMUST00000026991.16	1748	11	-23	-109	0	109	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_3	87.926617130423	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTGCGCATCCTTTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54769613	54809508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_54769717_54786062_54786132_54789231_54789310_54793057_54793135_54796104_54796244_54797790_54797877_54797971_54798064_54799855_54800034_54803218_54803391_54804094_54804239_54808766
tx.4913	chr13	-	734	5	ISM	ENSMUSG00000034928.17	ENSMUST00000177950.8	3941	11	107	3737	-47	-8	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	234	junction_4	191.270096983297	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCACCCACCACCGCCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54835514	54830948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_54831030_54831407_54831576_54831773_54831900_54832150_54832302_54835306
tx.4914	chr13	-	1317	6	NNC	ENSMUSG00000034891.14	novel	1351	6	NA	NA	34	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_2	32.6680271825527	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGCGCCGCCTAGGCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54914374	54906672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_54907355_54907680_54907767_54910451_54910575_54910734_54910774_54913375_54913506_54914117
tx.4915	chr13	+	1747	3	ISM	ENSMUSG00000074895.11	ENSMUST00000110003.9	2131	6	2288	-8	2281	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGGAATCTAAATATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54934113	54936272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_54934546_54934661_54934802_54935097
tx.4916	chr13	+	1518	8	FSM	ENSMUSG00000025875.15	ENSMUST00000026993.14	1585	8	66	1	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	352	junction_3	20.9606044468071	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGGTTTATGTTCACCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54937255	54944588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_54937495_54940421_54940473_54940552_54940700_54941007_54941179_54942865_54942992_54943223_54943272_54943778_54943896_54943969
tx.4917	chr13	+	1138	9	NIC	ENSMUSG00000025875.15	novel	1048	9	NA	NA	-19	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	98	junction_8	99.0959131347	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGGTTTATGTTCACCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54937256	54944588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_54937495_54940421_54940473_54940552_54940700_54941007_54941179_54942865_54942992_54943223_54943272_54943778_54943896_54943969_54944032_54944410
tx.4918	chr13	+	1236	6	ISM	ENSMUSG00000025875.15	ENSMUST00000145574.2	718	7	-139	0	-8	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	352	junction_1	23.7200337267888	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTGGTTTATGTTCACCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54940544	54944588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_54940700_54941007_54941179_54942865_54942992_54943223_54943272_54943778_54943896_54943969
tx.4919	chr13	+	901	2	Intergenic	novelGene_475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGGAAGATCTCAGATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54969137	54975858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_54969309_54975128
tx.492	chr1	-	1695	2	FSM	ENSMUSG00000005501.15	ENSMUST00000189586.2	1661	2	-7	-27	-6	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAATAGCCTTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87936279	87933589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_87935165_87936159
tx.4920	chr13	-	577	4	FSM	ENSMUSG00000025878.17	ENSMUST00000133187.2	2735	4	29	2129	-16	192	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_3	8.65383665716478	337	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGTCCATGTTGCTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55248083	55225077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_55225341_55233422_55233508_55240939_55241095_55248009
tx.4921	chr13	-	540	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000005320.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGTGTGTGTGTGTGTGTGT	7116	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55314835	55313393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_55313759_55314660
tx.4922	chr13	+	1032	4	ISM	ENSMUSG00000005320.10	ENSMUST00000005452.6	3324	18	14446	19	10969	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	4.92160768674447	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTGTGTGCCTGGTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55314898	55316553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_55314972_55315212_55315351_55315618_55315725_55315838
tx.4923	chr13	+	593	5	NIC	ENSMUSG00000021488.9	novel	12784	23	NA	NA	0	-1998	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	116	junction_1	64.355943781441	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATATAGGCATAAGGTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55357594	55386661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_55357689_55361016_55361131_55361873_55361964_55381707_55381844_55386502
tx.4924	chr13	+	915	6	NIC	ENSMUSG00000021488.9	novel	12784	23	NA	NA	0	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	48	junction_5	91.9469412215545	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGTCTTTTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55357594	55388662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_55357689_55361016_55361131_55361873_55361964_55381707_55381844_55386502_55386676_55388354
tx.4925	chr13	+	892	6	NNC	ENSMUSG00000021488.9	novel	1001	6	NA	NA	-46	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	38	junction_1	108.536445491825	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGTCTTTTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55359585	55388662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_55359657_55361016_55361131_55361873_55361964_55381707_55381844_55386502_55386676_55388354
tx.4926	chr13	+	1006	6	FSM	ENSMUSG00000021488.9	ENSMUST00000224918.2	1001	6	-3	-2	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_5	91.9469412215545	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGTCTTTTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55359628	55388662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55359814_55361016_55361131_55361873_55361964_55381707_55381844_55386502_55386676_55388354
tx.4927	chr13	+	869	6	FSM	ENSMUSG00000021488.9	ENSMUST00000224693.2	852	6	-15	-2	-10	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	114.325150338847	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTGTCTTTTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55359872	55388662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55359921_55361016_55361131_55361873_55361964_55381707_55381844_55386502_55386676_55388354
tx.4928	chr13	-	604	3	ISM	ENSMUSG00000034789.9	ENSMUST00000035242.9	1168	8	1235	-3	-174	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	549	junction_1	45	305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGTGCACTGGGTGTCA	7677	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55468523	55467694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_55468028_55468124_55468188_55468315
tx.4929	chr13	-	879	8	FSM	ENSMUSG00000034789.9	ENSMUST00000035242.9	1168	8	294	-5	128	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	320	junction_3	95.4118890465364	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGCACTGGGTGTCAAA	6736	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55469464	55467692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_55468028_55468124_55468188_55468315_55468367_55468557_55468658_55468739_55468808_55468914_55468994_55469202_55469272_55469350
tx.493	chr1	-	2582	3	ISM	ENSMUSG00000044783.17	ENSMUST00000054674.15	4878	8	8216	1782	-25	575	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	369	junction_1	6	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAGAAGAAAGGTCGCTG	8621	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88197139	88191974	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_88194381_88195669_88195749_88197042
tx.4930	chr13	+	1113	5	FSM	ENSMUSG00000021486.8	ENSMUST00000021942.8	2644	5	1531	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1299	junction_2	62.1248742453456	9890	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTGGAGTCAGATAGCTT	5565	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55469843	55473085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55470095_55470665_55470892_55472143_55472258_55472339_55472419_55472642
tx.4931	chr13	-	1031	6	FSM	ENSMUSG00000021485.15	ENSMUST00000021941.8	1327	6	-13	309	-13	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_2	5.62138772902208	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTCCATGGTTTTGCCC	6142	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55477584	55473289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_55473712_55473825_55474010_55476182_55476298_55476426_55476457_55477081_55477188_55477410
tx.4932	chr13	-	1033	5	NNC	ENSMUSG00000021485.15	novel	1327	6	NA	NA	-23	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	40.9168363879712	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCCATGGTTTTGCCCCG	6132	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55477594	55473287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_55473712_55473825_55474010_55476182_55476298_55477061_55477188_55477410
tx.4933	chr13	-	1241	8	FSM	ENSMUSG00000021484.9	ENSMUST00000021940.8	4315	8	165	2909	-7	-149	multi-exon	FALSE	canonical	3	2192	junction_4	110.260729960528	3359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTCTTGCCCAGCTGAGA	3004	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55510431	55494554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_55494851_55496127_55496248_55498968_55499084_55499192_55499355_55499523_55499604_55500758_55500877_55509933_55510053_55510200
tx.4934	chr13	+	1635	5	ISM	ENSMUSG00000074886.12	ENSMUST00000225925.2	2769	16	8989	-2	-3793	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_4	162.142684077944	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGCCTCCTTTTATTTC	2163	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55602258	55608740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_55602339_55602418_55602557_55606605_55606744_55606825_55606961_55607596
tx.4935	chr13	-	1691	13	FSM	ENSMUSG00000021493.16	ENSMUST00000046246.13	1697	13	8	-2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_4	33.4015967682185	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTCTGTGCCTCCCCGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55661251	55646226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_55646548_55646706_55646823_55646913_55647035_55652470_55652652_55653746_55653982_55654118_55654181_55655142_55655180_55655300_55655438_55656020_55656140_55656592_55656624_55656704_55656857_55660124_55660232_55661179
tx.4936	chr13	-	1005	8	FSM	ENSMUSG00000021493.16	ENSMUST00000069968.13	1006	8	0	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_1	27.1751687376246	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTTGCCTCTGTCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55661251	55654586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_55654937_55655142_55655180_55655300_55655438_55656020_55656140_55656592_55656624_55656704_55656857_55660124_55660232_55661179
tx.4937	chr13	-	999	7	NNC	ENSMUSG00000021493.16	novel	1006	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	54.9861093570205	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTTGCCTCTGTCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55661251	55654586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_55654937_55655142_55655180_55655300_55655438_55656020_55656140_55656679_55656857_55660124_55660232_55661179
tx.4938	chr13	-	2023	16	ISM	ENSMUSG00000021494.10	ENSMUST00000224765.2	2199	17	250	0	16	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	642	junction_9	43.6682442463119	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTTCTTCCTCTCTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55684221	55678228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_55678545_55678993_55679105_55679190_55679263_55679347_55679498_55679644_55679742_55679850_55679923_55680160_55680293_55680811_55680975_55681764_55681902_55681975_55682130_55682228_55682302_55683101_55683239_55683371_55683433_55683542_55683618_55683698_55683859_55684108
tx.4939	chr13	-	2071	17	FSM	ENSMUSG00000021494.10	ENSMUST00000224765.2	2199	17	128	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	642	junction_9	44.9861089671023	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTTCTTCCTCTCTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55684343	55678228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_55678545_55678993_55679105_55679190_55679263_55679347_55679498_55679644_55679742_55679850_55679923_55680160_55680293_55680811_55680975_55681764_55681902_55681975_55682130_55682228_55682302_55683101_55683239_55683371_55683433_55683542_55683618_55683698_55683859_55684108_55684220_55684293
tx.494	chr1	-	4168	8	FSM	ENSMUSG00000044783.17	ENSMUST00000054674.15	4878	8	68	642	-8	-642	multi-exon	FALSE	canonical	3	259	junction_7	57.9852197916479	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAATGTCGGTCTGCCCTGC	8659	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88205287	88190834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_88194381_88195669_88195749_88197042_88197136_88197923_88198022_88200450_88200488_88202763_88202820_88204940_88205008_88205095
tx.4940	chr13	-	821	6	ISM	ENSMUSG00000021494.10	ENSMUST00000224765.2	2199	17	4546	0	4312	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	695	junction_5	35.8641882662915	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGTTCTTCCTCTCTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55679925	55678228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_55678545_55678993_55679105_55679190_55679263_55679347_55679498_55679644_55679742_55679850
tx.4941	chr13	-	540	3	FSM	ENSMUSG00000021495.11	ENSMUST00000225703.2	1234	3	694	0	303	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_1	5.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAGTATGATGGTGATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55690439	55687128	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_55687526_55689436_55689535_55690394
tx.4942	chr13	+	1431	5	FSM	ENSMUSG00000058569.9	ENSMUST00000109905.5	1420	5	-11	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	616	junction_1	31.3847096529504	2048	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTTCGTGGTTACTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55740970	55745510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55741171_55741313_55741415_55742517_55742644_55743280_55743428_55744653
tx.4943	chr13	+	1303	4	NIC	ENSMUSG00000021504.15	novel	2130	6	NA	NA	-19	-536	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	50.1353722989623	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTTTTCTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55747858	55757719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_55748006_55751832_55752196_55756510_55756616_55757031
tx.4944	chr13	+	2135	6	FSM	ENSMUSG00000021504.15	ENSMUST00000064701.8	2130	6	-4	-1	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_4	8.85437744847146	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACACTGGCAAGGAACTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55747873	55758256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55748006_55751832_55752196_55755009_55755236_55756154_55756239_55756510_55756616_55757031
tx.4945	chr13	+	1350	5	NIC	ENSMUSG00000021504.15	novel	2130	6	NA	NA	18	-536	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	7	junction_2	41.0213359119373	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTTTTCTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55747895	55757719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_55748006_55751832_55752196_55756154_55756239_55756510_55756616_55757031
tx.4946	chr13	+	1381	4	FSM	ENSMUSG00000021501.5	ENSMUST00000021963.5	1382	4	5	-4	5	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_2	4.49691252107735	198	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGAAGTCTGTACATTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55770822	55780228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55771070_55772523_55772985_55776389_55776456_55779621
tx.4947	chr13	+	652	4	NNC	ENSMUSG00000021500.18	novel	5664	22	NA	NA	6277	-2118	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	177.811385712189	929	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAATTGTGGTGTGCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55823853	55826951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_55823932_55824582_55824728_55825333_55825408_55826596
tx.4948	chr13	+	296	2	NNC	ENSMUSG00000045767.10	novel	4652	2	NA	NA	-6	-4182	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAACCTCAATCGATCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55840930	55847131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_55840981_55846885
tx.4949	chr13	+	1491	5	FSM	ENSMUSG00000021497.11	ENSMUST00000021959.11	1527	5	42	-6	42	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	237	junction_2	13.4257215820976	756	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGTTTCGCTTGTTTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55862504	55874046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55862658_55865604_55866081_55869391_55869556_55872320_55872452_55873479
tx.495	chr1	-	696	3	ISM	ENSMUSG00000044783.17	ENSMUST00000147393.2	2030	5	-110	9734	17	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	259	junction_2	28.5	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATGCCTCTTTTCTTCCTC	8608	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88205338	88202433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_88202820_88204940_88205008_88205095
tx.4950	chr13	+	340	3	NNC	ENSMUSG00000021496.13	novel	544	4	NA	NA	19	-36253	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	41	junction_2	178.5	36	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCACATTTGTAATTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55875199	55888388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_55875288_55880748_55880881_55888268
tx.4951	chr13	+	515	4	FSM	ENSMUSG00000021496.13	ENSMUST00000124968.8	546	4	31	0	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	322	junction_3	31.7210060089875	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGAGTTATTTGTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55875211	55924643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_55875288_55880748_55880881_55923179_55923261_55924417
tx.4952	chr13	+	440	3	ISM	ENSMUSG00000021496.13	ENSMUST00000124968.8	546	4	5567	0	5567	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	322	junction_2	12	184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGAGTTATTTGTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55880747	55924643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_55880881_55923179_55923261_55924417
tx.4953	chr13	-	1218	5	ISM	ENSMUSG00000015937.16	ENSMUST00000016081.13	2046	9	39426	3	-6147	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1103	junction_1	94.3159583527623	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCCGTGTTTTGTGT	8160	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56244018	56221434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_56222206_56230932_56231108_56232008_56232099_56237570_56237671_56243936
tx.4954	chr13	-	1419	6	NIC	ENSMUSG00000015937.16	novel	2046	9	NA	NA	-14418	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	847	junction_5	174.54008135669	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCCGTGTTTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56252289	56221434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_56222206_56230932_56231108_56232008_56232099_56237570_56237671_56243936_56244045_56252114
tx.4955	chr13	-	1845	9	NIC	ENSMUSG00000015937.16	novel	2046	9	NA	NA	4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	847	junction_5	145.981109651215	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCCGTGTTTTGTGT	6100	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56283249	56221434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_56222206_56230932_56231108_56232008_56232099_56237570_56237671_56243936_56244045_56252114_56252313_56252701_56252809_56276089_56276295_56283158
tx.4956	chr13	-	1850	9	FSM	ENSMUSG00000015937.16	ENSMUST00000016081.13	2046	9	193	3	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	557	junction_5	233.718279933342	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGACTGGCCGTGTTTTGTGT	6098	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56283251	56221434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_56222206_56230932_56231108_56232008_56232099_56237570_56237671_56243936_56244048_56252114_56252313_56252701_56252809_56276089_56276295_56283158
tx.4957	chr13	-	554	2	Intergenic	novelGene_478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGCATCTAGAGTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56567435	56566021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_56566397_56567256
tx.4958	chr13	+	1831	8	NNC	ENSMUSG00000021509.6	novel	3374	8	NA	NA	-11	-2332	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	13	junction_7	4.23300925429402	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAATGTGTTTTTGCGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56586156	56619720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_56586349_56590601_56590646_56596810_56596883_56598833_56599093_56611315_56611559_56612767_56612902_56618162_56618294_56618964
tx.4959	chr13	+	924	4	FSM	ENSMUSG00000035509.18	ENSMUST00000124981.2	3507	4	-36	2619	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_3	0.816496580927726	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGTTTCTCACTGGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56670289	56675280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_56670436_56671322_56671417_56673454_56673586_56674727
tx.496	chr1	-	834	2	FSM	ENSMUSG00000044783.17	ENSMUST00000126739.2	2780	2	-26	1972	-26	-1972	multi-exon	FALSE	canonical	3	259	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGATTTCGGATCACAGTCTG	8619	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88205327	88204405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_88205008_88205095
tx.4960	chr13	+	792	3	FSM	ENSMUSG00000035509.18	ENSMUST00000121095.8	798	3	6	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	2	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAGTTTCTCACTGGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56670290	56675280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_56670436_56671322_56671417_56674727
tx.4961	chr13	+	1363	5	FSM	ENSMUSG00000021540.17	ENSMUST00000138677.8	1398	5	36	-1	9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	17.4696164811939	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAACTAGTCTTCTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56850887	56881028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_56850945_56871241_56871810_56875216_56875469_56876322_56876443_56880662
tx.4962	chr13	-	1854	7	ISM	ENSMUSG00000021541.15	ENSMUST00000173067.9	2022	8	77546	-657	77546	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.21108319357027	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGGGGGTCTGTGTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56958383	56920919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_56921747_56923929_56924006_56930323_56930405_56931435_56931658_56937414_56937611_56952325_56952591_56958196
tx.4963	chr13	+	757	5	FSM	ENSMUSG00000050002.15	ENSMUST00000051490.15	764	5	10	-3	5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	87.5928079239386	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGGCTGTACTGTAAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58305472	58311763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_58305551_58307690_58307722_58307965_58308053_58310651_58310696_58311246
tx.4964	chr13	+	715	4	FSM	ENSMUSG00000050002.15	ENSMUST00000109868.4	1462	4	3	744	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_3	23.6220236220354	656	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCGGGCTGTACTGTAAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58305470	58311763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_58305551_58307690_58307722_58307965_58308053_58311246
tx.4965	chr13	-	673	6	ISM	ENSMUSG00000021552.8	ENSMUST00000091579.6	1523	12	30339	3	102	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_5	66.2299026120377	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATCTGTGTGATCTTCACT	9892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58391663	58381162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_58381473_58384330_58384409_58384800_58384872_58386462_58386527_58389467_58389570_58391615
tx.4966	chr13	-	1174	4	FSM	ENSMUSG00000021550.7	ENSMUST00000022032.7	3051	4	13	1864	13	-1864	multi-exon	TRUE	canonical	3	402	junction_2	21.2289111041209	346	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGGTGGTGCACGCCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58533026	58529494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_58529824_58530221_58530418_58531963_58532224_58532637
tx.4967	chr13	-	2631	15	NNC	ENSMUSG00000021546.19	novel	2704	16	NA	NA	5	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2386.43420275557	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGACGTGTGCCCAATTTG	5131	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58549950	58539049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_58540231_58541009_58541180_58541505_58541589_58541884_58541974_58542123_58542179_58542291_58542600_58542978_58543108_58543387_58543502_58544001_58544074_58544640_58544714_58545566_58545611_58546969_58547027_58547706_58547805_58548146_58548232_58549877
tx.4968	chr13	-	1420	3	ISM	ENSMUSG00000021546.19	ENSMUST00000224531.2	514	4	322	-1021	106	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4513	junction_1	1062	346	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTATGACGTGTGCCCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58541576	58539051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_58540231_58541009_58541180_58541505
tx.4969	chr13	-	2679	15	NNC	ENSMUSG00000021546.19	novel	2676	16	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1994.19465229062	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTATGACGTGTGCCCAAT	4751	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58550330	58539052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_58540231_58541009_58541180_58541505_58541589_58541884_58541974_58542123_58542179_58542291_58542600_58542978_58543108_58543387_58543502_58544001_58544074_58544640_58544714_58545566_58545611_58546969_58547027_58547706_58547805_58548146_58548232_58550206
tx.497	chr1	+	1533	4	NNC	ENSMUSG00000100908.2	novel	316	2	NA	NA	-69	9689	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.657891697365	31	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCGAGTGACAATGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88387335	88402969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_88387678_88397558_88397777_88398642_88398830_88402183
tx.4970	chr13	-	768	3	FSM	ENSMUSG00000021546.19	ENSMUST00000177051.8	874	3	106	0	106	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5484	junction_1	576.5	514	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGGTGGTCTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58541576	58539763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_58540291_58541009_58541180_58541505
tx.4971	chr13	-	1975	15	NNC	ENSMUSG00000021546.19	novel	2704	16	NA	NA	8	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2351.55163386533	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTGGTCTTTTTTTTT	5134	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58549947	58539762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_58540291_58541009_58541180_58541505_58541589_58541884_58541974_58542123_58542179_58542291_58542600_58542978_58543108_58543387_58543502_58544001_58544074_58544640_58544714_58545566_58545611_58546969_58547027_58547706_58547805_58548146_58548232_58549877
tx.4972	chr13	-	2028	15	NNC	ENSMUSG00000021546.19	novel	2754	16	NA	NA	1	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1939.41602824465	394	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTGGTCTTTTTTTTT	4752	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58550329	58539762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_58540291_58541009_58541180_58541505_58541589_58541884_58541974_58542123_58542179_58542291_58542600_58542978_58543108_58543387_58543502_58544001_58544074_58544640_58544714_58545566_58545611_58546969_58547027_58547706_58547805_58548146_58548232_58550206
tx.4973	chr13	+	2542	3	FSM	ENSMUSG00000035367.10	ENSMUST00000225828.2	3594	3	6	1046	6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	177.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAAAGAATGTTTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58550067	58557912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_58550332_58554815_58554905_58555723
tx.4974	chr13	+	2624	4	NIC	ENSMUSG00000035367.10	novel	3594	3	NA	NA	7	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_1	176.305290775846	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTGAAAGAATGTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58550068	58557910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_58550332_58552384_58552470_58554815_58554905_58555723
tx.4975	chr13	+	2553	4	NNC	ENSMUSG00000035367.10	novel	2447	4	NA	NA	-99	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	169.267703817224	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTGAAAGAATGTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58550414	58557910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_58550604_58552381_58552470_58554815_58554905_58555723
tx.4976	chr13	+	2522	4	FSM	ENSMUSG00000035367.10	ENSMUST00000225815.2	2447	4	-71	-4	-71	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	162.181653983701	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTGAAAGAATGTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58550442	58557910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_58550604_58552384_58552470_58554815_58554905_58555723
tx.4977	chr13	+	2447	3	FSM	ENSMUSG00000035367.10	ENSMUST00000042450.10	3855	3	356	1052	-81	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_1	108.5	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGTGAAAGAATGTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58550432	58557910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_58550604_58554815_58554905_58555723
tx.4978	chr13	-	659	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055254.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGGTGCACAATTTAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59058473	59056455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_59056776_59058134
tx.4979	chr13	-	883	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055254.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	1	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGGTGCACAATTTAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59059827	59056455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_59056897_59058134_59058480_59059730
tx.498	chr1	+	1673	3	NNC	ENSMUSG00000100908.2	novel	316	2	NA	NA	-66	9689	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_1	9	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCGAGTGACAATGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88387338	88402969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_88388039_88398642_88398830_88402183
tx.4980	chr13	-	659	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055254.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGGTGCACAATTTAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59059828	59056455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_59056776_59058134_59058376_59059730
tx.4981	chr13	-	780	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055254.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CGGTGCACAATTTAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59059828	59056455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_59056897_59058134_59058376_59059730
tx.4982	chr13	-	1357	5	NNC	ENSMUSG00000021557.16	novel	4143	25	NA	NA	-3325	3	intron_retention	FALSE	canonical	2	6	junction_4	9.73396116696589	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCTTGTCATCTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59616427	59597347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_59598129_59608282_59608444_59609810_59609988_59613798_59613931_59616321
tx.4983	chr13	-	2040	9	NNC	ENSMUSG00000021557.16	novel	4143	25	NA	NA	3358	-3	intron_retention	FALSE	canonical	2	3	junction_8	9.16429893663449	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCATTTCTCTTGTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59625794	59597353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_59598129_59608282_59608444_59609810_59609988_59613798_59613931_59621501_59621632_59622345_59622527_59623473_59623628_59624807_59624953_59625609
tx.4984	chr13	-	1236	5	NNC	ENSMUSG00000021557.16	novel	4143	25	NA	NA	-3331	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_4	11.2583302491977	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACCCAAGAATCATTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59616433	59597693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_59598129_59608282_59608444_59609810_59609988_59613798_59613931_59616102
tx.4985	chr13	-	563	5	FSM	ENSMUSG00000021557.16	ENSMUST00000167096.8	508	5	-55	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_4	4.06201920231798	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTATGTTCCTGTTGTTGC	1011	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59705169	59679718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_59679891_59680985_59681054_59684062_59684188_59692200_59692266_59705036
tx.4986	chr13	+	2572	23	FSM	ENSMUSG00000021555.16	ENSMUST00000022038.15	3793	23	93	1128	-6	42	multi-exon	FALSE	canonical	3	649	junction_6	70.4314478267713	421	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGCTGCCCTGTGGAGAA	1303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59733201	59782608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_59733274_59733966_59734096_59743162_59743197_59745853_59745969_59747542_59747618_59748717_59748886_59755059_59755127_59755201_59755246_59755958_59756010_59756574_59756659_59757292_59757408_59760450_59760630_59764557_59764618_59765733_59765841_59770679_59770747_59772318_59772418_59773232_59773412_59775691_59775829_59776731_59776800_59777813_59777955_59778394_59778518_59780761_59780843_59782231
tx.4987	chr13	+	456	5	ISM	ENSMUSG00000021555.16	ENSMUST00000166923.9	779	10	-3	8980	-3	47	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	670	junction_1	98.3234458305851	853	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGCCTACCTGATTCTT	1306	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59733204	59747651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_59733274_59733966_59734096_59743162_59743197_59745853_59745969_59747542
tx.4988	chr13	-	1915	9	ISM	ENSMUSG00000021556.13	ENSMUST00000095739.10	3689	11	10100	1588	10092	-1588	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	427	junction_3	41.0028581320864	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCACCTATGGTCTGTGTT	9613	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59813494	59784397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_59785216_59786118_59786227_59787933_59788156_59790056_59790202_59792906_59793037_59797376_59797480_59798509_59798565_59812011_59812192_59813340
tx.4989	chr13	-	1824	10	FSM	ENSMUSG00000021556.13	ENSMUST00000022039.7	3954	10	13	2117	13	-1747	multi-exon	FALSE	canonical	3	421	junction_9	46.3947102135844	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAGCCTAAAGCAACATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59823612	59784556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_59785216_59786118_59786227_59787933_59788156_59790056_59790202_59792906_59793037_59797376_59797480_59798509_59798565_59812011_59812192_59813340_59813491_59823540
tx.499	chr1	+	2072	5	NNC	ENSMUSG00000100908.2	novel	316	2	NA	NA	-62	9689	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	9.24662100445346	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCGAGTGACAATGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88387342	88402969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_88388039_88390701_88390815_88393237_88393528_88398642_88398830_88402183
tx.4990	chr13	-	437	2	ISM	ENSMUSG00000021556.13	ENSMUST00000095739.10	3689	11	37366	2079	37358	-2079	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	476	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAAATGAGGCTGTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59786228	59784888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_59785216_59786118
tx.4991	chr13	-	602	3	ISM	ENSMUSG00000021556.13	ENSMUST00000095739.10	3689	11	35494	2079	35486	-2079	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	476	junction_1	13.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAAATGAGGCTGTCCTGT	8718	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59788100	59784888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_59785216_59786118_59786227_59787933
tx.4992	chr13	+	558	3	Intergenic	novelGene_480	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTTGAATGTGGACACTT	4039	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59827346	59828719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_59827414_59828175_59828548_59828600
tx.4993	chr13	+	206	2	Intergenic	novelGene_481	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTTGAATGTGGACACTT	5153	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59828460	59828719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_59828548_59828600
tx.4994	chr13	-	649	3	NNC	ENSMUSG00000050876.10	novel	5325	5	NA	NA	-434	-1857	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.5	50	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAGTATTTGTATCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59858578	59854420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_59854706_59858067_59858145_59858291
tx.4995	chr13	+	462	3	NNC	ENSMUSG00000097502.3	novel	1239	3	NA	NA	904	6	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	2	junction_2	0.5	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAGTAGATGATGTTTAATA	6317	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59882367	59885290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_59882455_59882560_59882653_59885007
tx.4996	chr13	-	1914	4	FSM	ENSMUSG00000044792.8	ENSMUST00000057115.7	1942	4	23	5	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	417	junction_3	1.63299316185545	707	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTAGTGGTTCCTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59917601	59903227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_59904818_59906703_59906810_59910555_59910610_59917437
tx.4997	chr13	+	1307	2	NNC	ENSMUSG00000089875.3	novel	1350	2	NA	NA	-67	-155	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGTGAAGTTCATTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59917711	59919766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_59917948_59918695
tx.4998	chr13	+	1439	2	FSM	ENSMUSG00000089875.3	ENSMUST00000162450.3	4862	2	-32	3455	-31	-155	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTTGTGAAGTTCATTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59917747	59919766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_59918161_59918740
tx.4999	chr13	-	1195	2	FSM	ENSMUSG00000035248.10	ENSMUST00000224320.2	4337	2	3146	-4	-1608	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	107	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATCCACATTATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59930042	59919689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_59920674_59929831
tx.5	chr1	+	2454	9	FSM	ENSMUSG00000025903.15	ENSMUST00000027036.11	2507	9	49	4	-24	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	734	junction_8	45.3636349403352	1046	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCGATTGCTTTATATAGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4878094	4916958	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_4878206_4878677_4878710_4898806_4898873_4900490_4900539_4902533_4902605_4907223_4907298_4909609_4909712_4911178_4911356_4915185
tx.50	chr1	-	1502	6	NIC	ENSMUSG00000025937.7	novel	4494	7	NA	NA	21	3243	intron_retention	FALSE	canonical	3	2151	junction_4	166.606842596575	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTGATACTTGTAATCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13730749	13696975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_13697662_13700288_13700438_13708454_13708634_13717608_13717736_13720944_13721109_13730552
tx.500	chr1	+	478	3	FSM	ENSMUSG00000097398.3	ENSMUST00000181016.3	479	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	3	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACTTGGTCTTGGCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88682612	88683458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_88682681_88682805_88683013_88683255
tx.5000	chr13	-	2131	2	FSM	ENSMUSG00000035248.10	ENSMUST00000225179.2	619	2	4	-1516	4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGTGTTACATGCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59970924	59967928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_59969925_59970789
tx.5001	chr13	-	3440	2	FSM	ENSMUSG00000035248.10	ENSMUST00000225576.2	2499	2	39	-980	20	980	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACGGTTTTGTTTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59970908	59966946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_59969925_59970446
tx.5002	chr13	-	1659	2	ISM	ENSMUSG00000035248.10	ENSMUST00000071703.6	5869	28	14	48944	0	-392	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGTAGCTTTACAAATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59970947	59968318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_59969925_59970894
tx.5003	chr13	-	617	2	Intergenic	novelGene_482	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGAGAAAACCCTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60019422	60015623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_60016086_60019267
tx.5004	chr13	-	911	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021559.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAGAAGAAGAAAGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60750441	60748377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_60749057_60750209
tx.5005	chr13	-	1645	8	NNC	ENSMUSG00000050345.10	novel	1432	8	NA	NA	7963	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_7	2.96922995583236	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGGACTTCTTTTTTTAGT	1598	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61004326	60990425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_60990791_60992122_60992241_60992893_60993057_61000913_61001139_61001329_61001477_61001569_61001693_61002626_61002764_61003959
tx.5006	chr13	+	905	3	Intergenic	novelGene_483	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	11	39	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAGAAAAAAAATGAAAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61765144	61779813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_61765281_61776870_61776998_61779171
tx.5007	chr13	+	2470	4	Intergenic	novelGene_484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_2	9.0921211313239	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTACTTGGTCCTCCGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61765152	61783722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_61765281_61776870_61776998_61779171_61779363_61781698
tx.5008	chr13	+	1293	4	NNC	ENSMUSG00000113566.2	novel	478	4	NA	NA	-118709	289	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	69	junction_1	214.715832878921	241	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCCTTGGTAATGGTGTC	1158	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62126852	62260150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_62126970_62254561_62254689_62254881_62254943_62259162
tx.5009	chr13	+	1272	4	FSM	ENSMUSG00000113566.2	ENSMUST00000222324.2	886	4	-27	-359	-5	289	multi-exon	FALSE	canonical	3	481	junction_1	27.9801516952444	2016	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCCTTGGTAATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62245556	62260150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_62245653_62254561_62254689_62254881_62254943_62259162
tx.501	chr1	+	438	3	FSM	ENSMUSG00000097398.3	ENSMUST00000180596.2	358	3	-53	-27	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	1	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACTTGGTCTTGGCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88682622	88683458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_88682774_88682928_88683013_88683255
tx.5010	chr13	+	437	3	FSM	ENSMUSG00000113081.2	ENSMUST00000221637.2	452	3	20	-5	20	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	513	junction_2	20.5	2773	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCAGGTATCTGAATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62411399	62421106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_62411510_62420579_62420707_62420906
tx.5011	chr13	+	1513	4	NNC	ENSMUSG00000113081.2	novel	452	3	NA	NA	20	278	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	125	junction_3	193.294823750893	332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGATGGCCCGTTGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62411399	62423345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_62411510_62420579_62420707_62420906_62420968_62422130
tx.5012	chr13	-	1624	4	FSM	ENSMUSG00000113623.2	ENSMUST00000221436.2	633	4	-10	-981	-10	433	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_1	23.5372045918796	561	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGGGTGCATATTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62564867	62549873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_62551194_62555228_62555290_62555482_62555610_62564751
tx.5013	chr13	-	2030	4	FSM	ENSMUSG00000113450.2	ENSMUST00000221747.2	2492	4	7	455	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	11.5566238822398	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTGCATATCACAGTTAT	9519	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62614639	62601284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_62603008_62604500_62604562_62604746_62604874_62614520
tx.5014	chr13	-	632	4	NNC	ENSMUSG00000114172.2	novel	1732	3	NA	NA	-9966	-1218	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_1	33.8755893757667	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGTAGTCTCCAAACACATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62801032	62788917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_62789246_62790689_62790751_62790936_62791064_62800916
tx.5015	chr13	-	2486	4	FSM	ENSMUSG00000074863.6	ENSMUST00000221999.2	615	4	-46	-1825	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_3	44.0176732183285	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTGGTTCCTGGGAAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62832778	62819597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_62821755_62823062_62823124_62823332_62823469_62832646
tx.5016	chr13	-	668	4	FSM	ENSMUSG00000091183.6	ENSMUST00000201047.4	3279	4	8	2603	8	-1195	multi-exon	TRUE	canonical	3	25	junction_3	2.05480466765633	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGGAGAAAAACCCTTCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62933614	62922616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_62922977_62924530_62924592_62924776_62924904_62933494
tx.5017	chr13	-	1178	3	ISM	ENSMUSG00000091183.6	ENSMUST00000201047.4	3279	4	15	3640	-9	996	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAATCTTAAAAAAAAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62933607	62923653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_62924592_62924776_62924904_62933494
tx.5018	chr13	-	1332	7	FSM	ENSMUSG00000021456.9	ENSMUST00000021907.9	1354	7	22	0	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_2	7.5	473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTTGTTATGGGTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63006214	62984690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_62985095_62988084_62988205_62989599_62989738_62997190_62997332_63001787_63001881_63002717_63002881_63005941
tx.5019	chr13	-	1164	7	NNC	ENSMUSG00000069805.11	novel	1479	7	NA	NA	-7040	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4.93288286231625	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTTTTTCTTTAGTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63027612	63012569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_63012982_63015152_63015273_63016795_63016934_63018979_63019121_63020503_63020597_63022962_63023126_63027515
tx.502	chr1	+	354	2	NIC	ENSMUSG00000097398.3	novel	358	3	NA	NA	11	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	1269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACTTGGTCTTGGCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88682622	88683458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_88682774_88683255
tx.5020	chr13	-	1302	7	FSM	ENSMUSG00000069805.11	ENSMUST00000092888.11	1479	7	174	3	19	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4.93288286231625	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTTTTTCTTTAGTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63035922	63012569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_63012982_63015152_63015273_63016795_63016934_63018979_63019121_63020503_63020597_63022962_63023126_63035687
tx.5021	chr13	-	1118	7	NNC	ENSMUSG00000069805.11	novel	1479	7	NA	NA	-153	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4.93288286231625	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTTTTTCTTTAGTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63036249	63012569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_63012982_63015152_63015273_63016795_63016934_63018979_63019121_63020503_63020597_63022962_63023126_63036198
tx.5022	chr13	+	1065	6	FSM	ENSMUSG00000021458.18	ENSMUST00000222929.2	1055	6	-3	-7	-3	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	29.9933325924279	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGCTTCTGAATTTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63387839	63450103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_63387970_63388070_63388146_63429955_63430073_63444671_63444759_63446525_63446671_63449592
tx.5023	chr13	-	2506	15	FSM	ENSMUSG00000021461.18	ENSMUST00000161977.8	3111	15	9	596	7	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	59	junction_14	18.8014599954148	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGAGTCCTTGTCCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63579529	63459948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_63460618_63465166_63465371_63469680_63469859_63471221_63471304_63473364_63473441_63478334_63478435_63479654_63479708_63488132_63488290_63495233_63495399_63508009_63508075_63509392_63509507_63545896_63545992_63548047_63548133_63550655_63550853_63579263
tx.5024	chr13	-	555	3	ISM	ENSMUSG00000021461.18	ENSMUST00000160151.8	2529	9	23	69695	0	2643	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_2	21	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTAAGAGTCTCAACACACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63579536	63548047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_63548133_63550655_63550853_63579263
tx.5025	chr13	-	1024	5	ISM	ENSMUSG00000021466.13	ENSMUST00000194663.6	7657	24	0	36597	0	-67	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_4	42.2159626207907	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCGCATTTTTTTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63721274	63692739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_63692942_63693050_63693121_63695809_63696000_63711436_63711630_63720905
tx.5026	chr13	+	1401	10	ISM	ENSMUSG00000021470.20	ENSMUST00000067821.13	2743	14	4663	15848	12	-3	internal_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_8	12.6207745648706	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCTGGTTGTTTTCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63967779	64001621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_63967870_63972622_63972743_63982409_63982604_63989237_63989400_63989775_63989984_63992359_63992501_63995154_63995269_63996554_63996675_64000764_64000837_64001441
tx.5027	chr13	-	785	3	Intergenic	novelGene_485	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	1.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTGCCTTGGCTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64116541	64078908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_64079440_64079875_64079955_64116366
tx.5028	chr13	-	1458	12	FSM	ENSMUSG00000033114.12	ENSMUST00000099441.6	2303	12	12	833	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_8	14.1169846708972	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACAGTGTGATATTACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64277157	64244954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_64245499_64246128_64246212_64247083_64247163_64252546_64252615_64254828_64254922_64256138_64256242_64259329_64259399_64260743_64260816_64266229_64266298_64268408_64268496_64270132_64270167_64276999
tx.5029	chr13	-	1266	9	NIC	ENSMUSG00000033114.12	novel	983	11	NA	NA	-5	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	13	junction_8	35.5773804544404	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCACAGTGTGATATTACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64277155	64244955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_64245499_64246128_64246212_64247083_64247163_64252546_64252615_64254828_64254922_64256138_64256242_64259329_64259399_64260743_64260816_64276999
tx.503	chr1	+	593	2	NIC	ENSMUSG00000097398.3	novel	479	3	NA	NA	11	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACTTGGTCTTGGCTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88682622	88683458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_88683013_88683255
tx.5030	chr13	-	3525	5	FSM	ENSMUSG00000044934.14	ENSMUST00000059817.12	3532	5	0	7	0	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_4	7.32717544487642	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATAAAGTACATGGGTCAT	6050	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64301016	64280838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_64283351_64290021_64290161_64291968_64292089_64293343_64293495_64300413
tx.5031	chr13	+	947	7	ISM	ENSMUSG00000021476.10	ENSMUST00000021929.10	2564	8	8193	1103	-4038	-410	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_5	10.7806410858642	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATTGCACTTTTTTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64317875	64333248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_64317991_64321876_64322036_64322603_64322673_64323818_64323903_64329920_64330093_64332386_64332573_64333086
tx.5032	chr13	+	260	2	FSM	ENSMUSG00000021476.10	ENSMUST00000223377.2	828	2	154	414	154	-414	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAGTCATTGCACTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64332470	64333244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_64332573_64333086
tx.5033	chr13	-	2753	14	NIC	ENSMUSG00000033102.16	novel	3075	15	NA	NA	118	-6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	23	junction_13	17.1357268913424	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGACAGAGCCCATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64396338	64343156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_64344490_64349145_64349263_64356920_64357019_64357739_64357900_64358008_64358148_64363313_64363545_64364025_64364114_64367699_64367763_64368493_64368561_64373385_64373463_64391447_64391541_64394338_64394415_64395041_64395133_64396218
tx.5034	chr13	-	1471	5	FSM	ENSMUSG00000021482.11	ENSMUST00000220895.2	2858	5	76	1311	-41	698	multi-exon	TRUE	canonical	2	9	junction_1	71.2635951941803	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTCTGTGGTGAAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64460448	64438942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_64440043_64456635_64456742_64456906_64456961_64460080_64460150_64460306
tx.5035	chr13	-	1296	6	FSM	ENSMUSG00000021482.11	ENSMUST00000222570.2	3011	6	69	1646	-48	384	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_1	21.3672646822189	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTGCTCTTCCAAAGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64460455	64439256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_64440043_64445068_64445201_64456635_64456742_64456906_64456961_64460080_64460150_64460306
tx.5036	chr13	-	788	6	NNC	ENSMUSG00000021482.11	novel	3011	6	NA	NA	-5	-103	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	71.4030811660113	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ATAATTTTATACAAAATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64460393	64439743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_64440043_64445068_64445201_64456635_64456742_64456906_64456961_64460039_64460150_64460306
tx.5037	chr13	-	1390	8	FSM	ENSMUSG00000021477.10	ENSMUST00000021933.8	1971	8	-1	582	-1	-582	multi-exon	FALSE	canonical	3	1187	junction_3	95.3616103822386	12256	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGGACTTCAGTGTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64518121	64511609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_64512015_64513018_64513137_64514292_64514456_64514681_64514907_64515673_64515821_64515929_64516053_64516841_64516979_64518049
tx.5038	chr13	+	1981	8	FSM	ENSMUSG00000021483.9	ENSMUST00000021939.8	4118	8	85	2052	44	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	37	junction_1	3.65892813567591	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCAGCTTGTGTTTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64580212	64587535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_64580485_64580790_64580905_64583931_64584121_64584306_64584429_64584579_64584643_64585202_64585327_64585690_64585847_64586594
tx.5039	chr13	-	394	2	Intergenic	novelGene_487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACAGTTTCCGTGTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65375737	65374126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_65374405_65375621
tx.504	chr1	+	1016	4	Intergenic	novelGene_38	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.59966329107444	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTTTTTTTGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88688607	88699479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_88688685_88689175_88689254_88698452_88698634_88698799
tx.5040	chr13	+	1572	8	FSM	ENSMUSG00000021514.19	ENSMUST00000130799.8	1580	8	7	1	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_7	17.3980998258724	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTCTGCTGTGATAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65426634	65452034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_65426802_65427074_65427155_65428075_65428203_65432734_65432831_65439636_65440120_65442209_65442299_65443413_65443541_65451631
tx.5041	chr13	+	982	5	NNC	ENSMUSG00000021514.19	novel	1580	8	NA	NA	12	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	22.2528088114737	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTGTGTGGAACTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65426639	65452017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_65426933_65427074_65427155_65428075_65428203_65432734_65432831_65451631
tx.5042	chr13	+	1989	4	Intergenic	novelGene_488	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2.49443825784929	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTGCTTGTCTGAGATTC	5598	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65645379	65649616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_65645870_65646065_65646144_65646423_65646466_65648237
tx.5043	chr13	+	641	4	FSM	ENSMUSG00000095909.3	ENSMUST00000238623.2	1525	4	-38	922	-38	-922	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_1	62.9620697104393	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TATCATAAAAGAACCCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66261255	66269360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_66261375_66267450_66267578_66267777_66267839_66269026
tx.5044	chr13	+	465	4	NNC	ENSMUSG00000114426.2	novel	1561	3	NA	NA	-9011	721	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	76	junction_3	16.3299316185545	1245	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGACTTAGCTCCATTAT	5534	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66711973	66724696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_66712084_66720982_66721110_66721308_66721370_66724529
tx.5045	chr13	+	552	3	Intergenic	novelGene_489	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	59	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAGAAAGAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66773918	66783154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_66774068_66782550_66782678_66782878
tx.5046	chr13	-	587	3	NNC	ENSMUSG00000114839.2	novel	1153	3	NA	NA	-3587	-2257	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	46	junction_2	78	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66892964	66888691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_66889043_66889243_66889330_66892814
tx.5047	chr13	-	462	3	ISM	ENSMUSG00000021520.5	ENSMUST00000021993.5	535	4	2576	-12	-16	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5540	junction_1	49.5	6936	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAATTCAATTCAAACGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67050866	67048668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_67048891_67049465_67049633_67050793
tx.5048	chr13	-	482	4	FSM	ENSMUSG00000021520.5	ENSMUST00000021993.5	535	4	53	0	53	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4784	junction_3	381.861231339344	55342	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGGATTATTTGAATTCAA	7765	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67053389	67048680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67048891_67049465_67049633_67050793_67050866_67053356
tx.5049	chr13	+	2470	13	FSM	ENSMUSG00000021518.5	ENSMUST00000021990.4	3424	13	562	392	-56	-117	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_7	19.2476549798209	196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCTTTGTTAGAATGAT	8420	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67081455	67146073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_67081751_67093340_67093433_67101583_67101629_67104445_67104571_67111376_67111536_67114453_67114606_67120557_67120700_67122508_67122622_67124809_67124876_67135817_67135918_67142016_67142086_67143410_67143481_67145031
tx.505	chr1	+	539	4	Intergenic	novelGene_39	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.816496580927726	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAATATGCAGAAACCTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88688610	88695196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_88688685_88689175_88689254_88690716_88690876_88694968
tx.5050	chr13	+	452	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000074824.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTGACTTAGCTCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67260363	67264305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_67260535_67264024
tx.5051	chr13	+	1022	5	Fusion	ENSMUSG00000114677.2_ENSMUSG00000057396.8	novel	3482	4	NA	NA	-21	438	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3.90512483795333	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTCACGTTGAGCAGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67276269	67317280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr13_+_67276379_67284781_67284909_67285373_67285470_67315892_67316003_67316700
tx.5052	chr13	+	1731	4	NNC	ENSMUSG00000058900.6	novel	2591	4	NA	NA	-62	-844	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	5	junction_1	9.80929264637478	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTATAAGCTTCTAGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67321183	67331264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_67321240_67324511_67324639_67325128_67325225_67329812
tx.5053	chr13	-	1893	4	FSM	ENSMUSG00000078995.11	ENSMUST00000057070.9	4126	4	28	2205	28	-2205	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	8.33999733546453	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTCTCACTTTTTGTAAA	2256	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67523901	67513907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67515485_67520295_67520392_67520869_67520997_67523808
tx.5054	chr13	-	1767	4	FSM	ENSMUSG00000078994.10	ENSMUST00000109732.3	2056	4	-16	305	-16	-300	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	14.7196014438797	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTAGAGACTTGTTCCT	5235	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67547902	67537727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67539184_67544162_67544259_67544748_67544876_67547814
tx.5055	chr13	-	2026	4	FSM	ENSMUSG00000078994.10	ENSMUST00000224825.2	379	4	3	-1650	3	-1	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_3	15.4128373622625	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCATTCCTTTGCTTCAAAG	5202	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67547935	67537423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67539184_67544162_67544259_67544748_67544876_67547892
tx.5056	chr13	-	1489	4	FSM	ENSMUSG00000055560.9	ENSMUST00000056470.10	3334	4	-4	1849	-4	906	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	6.23609564462324	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGGAAGTGTGATAAAGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67569541	67555676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67556862_67561226_67561323_67561952_67562080_67569460
tx.5057	chr13	-	516	3	FSM	ENSMUSG00000055560.9	ENSMUST00000224496.2	504	3	-14	2	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_2	2.5	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTCCATGGCTCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67569541	67561014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67561323_67561952_67562080_67569460
tx.5058	chr13	+	670	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055560.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAAATTAGTGGTCACTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67569383	67571328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_67569619_67570893
tx.5059	chr13	-	1772	4	FSM	ENSMUSG00000069206.15	ENSMUST00000075255.6	3238	4	-9	1475	-9	347	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	29.1699998095456	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTAGAGCTTACATTCCA	9929	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67599752	67590026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67591454_67596939_67597036_67597468_67597596_67599630
tx.506	chr1	+	1474	3	Intergenic	novelGene_40	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTTTTTTTGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88688681	88699479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_88689254_88698411_88698634_88698799
tx.5060	chr13	-	2310	4	FSM	ENSMUSG00000071291.11	ENSMUST00000171518.8	2300	4	-11	1	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	12.657891697365	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTGTCTTTGGTCATGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67648633	67638286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67640270_67642125_67642222_67642721_67642849_67648529
tx.5061	chr13	-	2632	4	FSM	ENSMUSG00000097333.8	ENSMUST00000181767.8	2656	4	24	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_2	7.71722460186015	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCCTGGTCATAGTGTTTA	9246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67674272	67663899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67666232_67668744_67668841_67669311_67669439_67674195
tx.5062	chr13	-	4014	4	FSM	ENSMUSG00000095432.10	ENSMUST00000181892.9	5293	4	682	597	-10	-597	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	6.68331255192114	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTTAGTCATGGCATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67701267	67687356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67691030_67693442_67693539_67694743_67694871_67701149
tx.5063	chr13	-	1557	3	FSM	ENSMUSG00000095432.10	ENSMUST00000053289.11	700	3	-5	-852	-5	852	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_2	5.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTGTGTATGTCTGCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67701262	67692221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67693539_67694743_67694871_67701149
tx.5064	chr13	-	444	3	FSM	ENSMUSG00000048280.19	ENSMUST00000125495.10	712	3	1	267	1	-171	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	1.5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACTTTTCTGTCTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67831669	67821013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67821213_67821680_67821808_67831551
tx.5065	chr13	-	3967	4	FSM	ENSMUSG00000071281.13	ENSMUST00000130891.3	1103	4	16	-2880	16	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	31	junction_1	3.85861230093008	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTTGTTATTTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67872429	67853427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_67857049_67858433_67858530_67858999_67859127_67872306
tx.5066	chr13	+	3254	4	FSM	ENSMUSG00000090659.10	ENSMUST00000164936.10	3258	4	8	-4	-3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_3	3.39934634239519	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGATTTTGGTCAGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67927831	67937201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_67927939_67931908_67932036_67932512_67932609_67934277
tx.5067	chr13	-	2823	14	FSM	ENSMUSG00000034617.8	ENSMUST00000223101.2	2728	14	-13	-82	-5	82	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_10	83.6727918422384	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGCTATTGTGTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68730245	68709399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_68710552_68712438_68712622_68712718_68712812_68713228_68713348_68714186_68714374_68715060_68715104_68716890_68717072_68718122_68718212_68719188_68719343_68720696_68720820_68725706_68725825_68727661_68727816_68728669_68728835_68730183
tx.5068	chr13	-	3196	15	FSM	ENSMUSG00000034617.8	ENSMUST00000045827.5	3692	15	-5	501	-5	82	multi-exon	FALSE	canonical	3	277	junction_10	41.7021141733919	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGTGCTATTGTGTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68730245	68709399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_68710552_68712438_68712622_68712718_68712812_68713228_68713348_68714186_68714374_68715060_68715104_68716890_68717072_68718122_68718212_68719188_68719343_68720696_68720820_68723136_68723510_68725706_68725825_68727661_68727816_68728669_68728835_68730183
tx.5069	chr13	-	505	3	ISM	ENSMUSG00000034617.8	ENSMUST00000223101.2	2728	14	-14	18057	-6	52	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	370	junction_2	18.5	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATGTAGAATTGTCAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68730246	68727538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_68727816_68728669_68728835_68730183
tx.507	chr1	+	975	3	Intergenic	novelGene_41	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	6	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTTTTTTTGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88698139	88699479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_88698213_88698411_88698634_88698799
tx.5070	chr13	-	735	3	FSM	ENSMUSG00000034617.8	ENSMUST00000221259.2	532	3	0	-203	0	53	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_2	182.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATGTAGAATTGTCAGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68730213	68727537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_68727816_68728669_68728835_68729921
tx.5071	chr13	+	2625	7	NIC	ENSMUSG00000021532.12	novel	2421	7	NA	NA	-4	9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	49	junction_1	39.5010548382361	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCCGTCTTGTTTTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68730360	68740407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_68730718_68731657_68733122_68733296_68733383_68735778_68735954_68737438_68737509_68738224_68738340_68740049
tx.5072	chr13	+	2367	7	FSM	ENSMUSG00000021532.12	ENSMUST00000051784.10	2421	7	-2	56	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_1	41.7053154086303	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTAATTGTCCGTCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68730364	68740401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_68730470_68731657_68733122_68733296_68733383_68735778_68735954_68737438_68737509_68738224_68738340_68740049
tx.5073	chr13	+	2264	6	ISM	ENSMUSG00000021532.12	ENSMUST00000051784.10	2421	7	1289	56	1261	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_3	7.47261667690776	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTAATTGTCCGTCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68731655	68740401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_68733122_68733296_68733383_68735778_68735954_68737438_68737509_68738224_68738340_68740049
tx.5074	chr13	+	764	4	NNC	ENSMUSG00000021534.9	novel	1826	3	NA	NA	8402	-1	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	8.01387685344754	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGTAGCAGCTGTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68753959	68761405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_68754010_68755329_68755470_68759279_68759397_68760948
tx.5075	chr13	+	631	3	NNC	ENSMUSG00000021534.9	novel	1826	3	NA	NA	8398	2	intron_retention	FALSE	canonical	3	9	junction_1	4.5	64	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTAGCAGCTGTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68753955	68761408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_68754010_68759279_68759397_68760948
tx.5076	chr13	-	1574	5	FSM	ENSMUSG00000021594.12	ENSMUST00000091514.6	2644	5	-21	1091	-21	94	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_3	7.15454401062709	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTCAAAACAGGATTTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69759582	69722658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_69723316_69734703_69734855_69743034_69743137_69748349_69748517_69759085
tx.5077	chr13	-	765	2	ISM	ENSMUSG00000021594.12	ENSMUST00000220731.2	742	3	8136	-93	8136	93	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTCAAAACAGGATTTCCT	5055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69734812	69722659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_69723316_69734703
tx.5078	chr13	+	2812	19	FSM	ENSMUSG00000021595.19	ENSMUST00000109699.11	2834	19	23	-1	-10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1529	junction_7	132.889457914055	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGGCATGAGACTTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69760157	69782454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_69760308_69760419_69760578_69761056_69761162_69763530_69763637_69765524_69765597_69766224_69766310_69767564_69767758_69769723_69769799_69771281_69771413_69774596_69774671_69775154_69775286_69775678_69775776_69777653_69777836_69778120_69778214_69778746_69778883_69779353_69779435_69779650_69779790_69781346_69781387_69781690
tx.5079	chr13	+	2663	18	FSM	ENSMUSG00000021595.19	ENSMUST00000022087.7	4164	18	56	1445	56	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1529	junction_6	134.755603461822	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGGCATGAGACTTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69760418	69782454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_69760578_69761056_69761162_69763530_69763637_69765524_69765597_69766224_69766310_69767564_69767758_69769723_69769799_69771281_69771413_69774596_69774671_69775154_69775286_69775678_69775776_69777653_69777836_69778120_69778214_69778746_69778883_69779353_69779435_69779650_69779790_69781346_69781387_69781690
tx.508	chr1	+	1069	3	Intergenic	novelGene_42	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	4	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTTTTTTTTGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88698160	88699479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_88698328_88698411_88698634_88698799
tx.5080	chr13	+	1654	9	ISM	ENSMUSG00000021595.19	ENSMUST00000109699.11	2834	19	15029	-1	-3695	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1835	junction_8	105.547382724538	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGGCATGAGACTTGGAT	2383	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69775163	69782454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_69775286_69775678_69775776_69777653_69777836_69778120_69778214_69778746_69778883_69779353_69779435_69779650_69779790_69781346_69781387_69781690
tx.5081	chr13	+	1341	7	ISM	ENSMUSG00000021595.19	ENSMUST00000109699.11	2834	19	17613	-1	-1111	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1835	junction_6	118.811709112453	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGGCATGAGACTTGGAT	4967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69777747	69782454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_69777836_69778120_69778214_69778746_69778883_69779353_69779435_69779650_69779790_69781346_69781387_69781690
tx.5082	chr13	+	1254	6	ISM	ENSMUSG00000021595.19	ENSMUST00000109699.11	2834	19	17985	-1	-739	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1835	junction_5	95.8761701362753	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTGGCATGAGACTTGGAT	5339	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69778119	69782454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_69778214_69778746_69778883_69779353_69779435_69779650_69779790_69781346_69781387_69781690
tx.5083	chr13	+	883	4	FSM	ENSMUSG00000021598.10	ENSMUST00000022089.10	913	4	28	2	-22	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	786	junction_3	16.1314048434171	8828	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTCATGTAATTCTTAAA	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	69957987	69964221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_69958172_69959725_69959810_69961822_69961926_69963709
tx.5084	chr13	-	599	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000113074.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGTTTCCGTGTCGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70253289	70251562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_70252015_70253142
tx.5085	chr13	-	505	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000113074.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGTTTCCGTGTCGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70253292	70251562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_70251918_70253142
tx.5086	chr13	-	564	4	FSM	ENSMUSG00000021606.9	ENSMUST00000147407.2	534	4	-27	-3	-17	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	341	junction_3	967.204333231723	1668	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATAGTGAGTTGTTTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73476598	73467994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_73468180_73468412_73468536_73475534_73475589_73476396
tx.5087	chr13	-	503	4	FSM	ENSMUSG00000021606.9	ENSMUST00000022097.6	568	4	63	2	-17	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2374	junction_2	33.95094500403	44277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATAGTGAGTTGTTTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73476598	73467994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_73468180_73468412_73468536_73475534_73475589_73476457
tx.5088	chr13	+	1136	3	FSM	ENSMUSG00000021607.10	ENSMUST00000221730.2	717	3	23	-442	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	303	224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGGAGTAGTAGTGTTCT	9306	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73476654	73480297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_73476740_73478978_73479211_73479478
tx.5089	chr13	+	906	2	FSM	ENSMUSG00000021607.10	ENSMUST00000022098.10	923	2	15	2	15	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	623	junction_1	0	3768	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTCTGGAGTAGTAGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73479121	73480295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_73479211_73479478
tx.509	chr1	+	1803	4	ISM	ENSMUSG00000036206.13	ENSMUST00000066279.11	4995	6	36	10187	-2	-10187	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	7.54247233265651	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATCCATCCTTCAAGACAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88998172	89072603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_88998320_89034979_89035059_89065280_89065526_89071271
tx.5090	chr13	+	3173	11	NNC	ENSMUSG00000021608.16	novel	2141	14	NA	NA	-8238	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	180.699086882032	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTACAGGCTCGAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73642741	73664535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_73643034_73644298_73644360_73647417_73647477_73649474_73649510_73651159_73651215_73653620_73653704_73658114_73658241_73658966_73659121_73659418_73659522_73661938_73662081_73662472
tx.5091	chr13	+	2307	3	NNC	ENSMUSG00000021608.16	novel	2141	14	NA	NA	352	-6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	314.5	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTACAGGCTCGAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73659419	73664535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_73659522_73661938_73662081_73662472
tx.5092	chr13	+	2077	17	FSM	ENSMUSG00000021610.9	ENSMUST00000022102.9	2340	17	265	-2	265	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	235	junction_7	20.082544503872	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTCTTAACCTCTAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73752389	73768726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_73752519_73753048_73753150_73754340_73754531_73755838_73755988_73757022_73757102_73759262_73759381_73759740_73759836_73760512_73760598_73761776_73761881_73762725_73762792_73763291_73763343_73764081_73764165_73764933_73764969_73765696_73765753_73765837_73765883_73766520_73766637_73768151
tx.5093	chr13	+	5132	24	FSM	ENSMUSG00000017756.10	ENSMUST00000017900.9	5142	24	8	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	635	junction_9	57.8026758755535	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACTTCGTGTGCCTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73911823	73964871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_73912010_73932637_73932733_73933162_73933286_73936683_73936831_73938059_73938115_73938768_73938900_73940668_73940911_73942042_73942255_73943216_73943385_73943722_73943822_73944885_73944944_73945645_73945821_73946537_73946657_73947061_73947161_73947731_73947852_73948503_73948609_73949046_73949216_73953532_73953729_73954147_73954318_73954424_73954557_73957103_73957212_73958024_73958204_73961657_73961792_73962961
tx.5094	chr13	+	3077	9	ISM	ENSMUSG00000017756.10	ENSMUST00000017900.9	5142	24	36702	14	-542	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	691	junction_1	50.082432049572	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGTTTAAGGAACTTCGT	4455	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73948517	73964859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_73948609_73949046_73949216_73953532_73953729_73954147_73954318_73954424_73954557_73957103_73957212_73958024_73958204_73961657_73961792_73962961
tx.5095	chr13	-	2270	13	FSM	ENSMUSG00000021569.11	ENSMUST00000022053.11	3399	13	18	1111	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	435	junction_6	23.4319345243955	637	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTCTTATTTTTATTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74085885	74060576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_74061459_74062606_74062677_74063576_74063690_74066529_74066684_74068113_74068221_74068466_74068554_74069291_74069356_74076029_74076103_74077777_74077869_74078278_74078335_74080976_74081107_74084225_74084392_74085608
tx.5096	chr13	-	2393	2	ISM	ENSMUSG00000021569.11	ENSMUST00000022053.11	3399	13	-10	22838	-10	-4481	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	514	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAATCACTTAAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74085913	74082303	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_74084392_74085608
tx.5097	chr13	+	2429	16	FSM	ENSMUSG00000057649.7	ENSMUST00000099384.4	2407	16	-28	6	-1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	92	junction_6	21.3306248280625	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGATCACCCCGTCCGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74085928	74109008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_74086065_74086552_74086768_74086983_74087117_74088355_74088417_74088764_74088910_74090062_74090174_74090809_74090926_74092844_74092978_74094202_74094279_74095795_74095892_74098193_74098327_74099652_74099765_74102663_74102703_74103540_74103644_74105831_74106000_74108356
tx.5098	chr13	+	288	2	ISM	ENSMUSG00000057649.7	ENSMUST00000222191.2	4569	13	-8	22229	2	-563	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_1	0	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAGAAGAAAAAGTCAGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74085931	74086707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_74086065_74086552
tx.5099	chr13	+	2407	16	NIC	ENSMUSG00000057649.7	novel	2430	16	NA	NA	5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	32	junction_6	34.8873743478768	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGCTGAGTACCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74085934	74108932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_74086065_74086552_74086768_74086983_74087117_74088355_74088417_74088764_74088910_74090062_74090174_74090749_74090926_74092844_74092978_74094202_74094279_74095795_74095892_74098193_74098327_74099652_74099765_74102663_74102703_74103540_74103644_74105831_74106000_74108356
tx.51	chr1	-	1153	2	FSM	ENSMUSG00000025930.7	ENSMUST00000027062.7	1741	2	588	0	-49	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCATTGTAAAAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14825626	14823569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_14824550_14825453
tx.510	chr1	+	811	2	NNC	ENSMUSG00000092627.3	novel	1372	2	NA	NA	-45	690	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCTTTGAAGCTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89857910	89860274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_89858176_89859728
tx.5100	chr13	-	2490	12	FSM	ENSMUSG00000021572.10	ENSMUST00000036456.8	3641	12	19	1132	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_5	28.6590098045136	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGGTTCACTCTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74210399	74185750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_74186448_74188169_74188282_74191624_74191752_74195154_74195352_74197014_74197154_74198178_74198484_74199533_74199741_74200999_74201179_74203001_74203111_74206420_74206614_74207560_74207689_74210302
tx.5101	chr13	-	2267	12	NIC	ENSMUSG00000021572.10	novel	3641	12	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	39	junction_5	25.7267908724551	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGGTTCACTCTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74210416	74185750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_74186448_74188169_74188282_74191624_74191752_74195154_74195352_74197014_74197154_74198418_74198484_74199533_74199741_74200999_74201179_74203001_74203111_74206420_74206614_74207560_74207689_74210302
tx.5102	chr13	-	1381	7	ISM	ENSMUSG00000021572.10	ENSMUST00000036456.8	3641	12	22	13394	-16	3003	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	100	junction_3	17.8481247069701	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTCGTGTTCCACGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74210396	74198012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_74198484_74199533_74199741_74200999_74201179_74203001_74203111_74206420_74206614_74207560_74207689_74210302
tx.5103	chr13	-	2409	13	FSM	ENSMUSG00000034152.7	ENSMUST00000035934.7	4922	13	9	2504	9	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_12	37.5695651055774	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCTTGGTGTGATGTCAG	7182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74356819	74320110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_74320364_74321414_74321543_74322105_74322268_74328553_74328677_74330162_74330314_74330395_74330507_74332791_74332893_74337279_74337406_74338188_74338307_74340726_74341409_74347574_74347795_74355025_74355217_74356776
tx.5104	chr13	-	1088	6	FSM	ENSMUSG00000021576.7	ENSMUST00000022060.7	1131	6	35	8	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	601	junction_2	85.1666601435092	4798	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTAGTTTTGGCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74465405	74451635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_74452168_74453659_74453770_74457802_74457962_74459786_74459832_74464448_74464511_74465225
tx.5105	chr13	-	1886	8	ISM	ENSMUSG00000021577.15	ENSMUST00000022062.8	2900	15	17137	0	-4672	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1480	junction_7	167.086315222683	1327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTGGTCAAGGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74481262	74470372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_74471293_74471959_74472074_74475045_74475177_74475365_74475478_74476415_74476535_74479417_74479590_74480217_74480414_74481140
tx.5106	chr13	-	2859	15	FSM	ENSMUSG00000021577.15	ENSMUST00000022062.8	2900	15	41	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1480	junction_7	176.694897308026	2280	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTGGTCAAGGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74498358	74470372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_74471293_74471959_74472074_74475045_74475177_74475365_74475478_74476415_74476535_74479417_74479590_74480217_74480414_74481140_74481310_74482416_74482542_74485509_74485659_74487165_74487331_74487690_74487835_74491455_74491618_74492969_74493057_74498264
tx.5107	chr13	-	1165	3	ISM	ENSMUSG00000021577.15	ENSMUST00000022062.8	2900	15	23222	1	1413	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1923	junction_2	22.5	738	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTTTGGTCAAGGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74475177	74470373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_74471293_74471959_74472074_74475045
tx.5108	chr13	+	1428	3	FSM	ENSMUSG00000021578.18	ENSMUST00000022063.14	9559	3	25	8106	-10	629	multi-exon	FALSE	canonical	3	416	junction_2	9.5	1402	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGTTGCTTTTTTTTTTT	4375	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74498452	74505796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_74498528_74500974_74501106_74504574
tx.5109	chr13	+	1426	3	FSM	ENSMUSG00000021578.18	ENSMUST00000162376.2	762	3	-35	-629	13	629	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	206.5	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGTTGCTTTTTTTTTTT	4371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74498448	74505796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_74498528_74500980_74501106_74504574
tx.511	chr1	+	2071	2	FSM	ENSMUSG00000092627.3	ENSMUST00000173856.2	1372	2	-20	-679	-20	679	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATCGACCCGATTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89857935	89860263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_89858176_89858432
tx.5110	chr13	+	1354	2	ISM	ENSMUSG00000021578.18	ENSMUST00000162376.2	762	3	2490	-629	2490	629	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	416	junction_1	0	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGTTGCTTTTTTTTTTT	6896	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74500973	74505796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_74501106_74504574
tx.5111	chr13	+	1368	2	Fusion	ENSMUSG00000062382.10_ENSMUSG00000076033.3	novel	491	4	NA	NA	-23	2	intron_retention	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAGATAACT	1224	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74547789	74555467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr13_+_74547912_74554221
tx.5112	chr13	+	1493	3	ISM	ENSMUSG00000062382.10_ENSMUSG00000076033.3	ENSMUST00000221435.2	491	4	-23	-653	-23	2	intron_retention	FALSE	canonical	3	85	junction_2	7	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAGAGATAACT	1224	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74547789	74555467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_74547912_74553897_74554023_74554221
tx.5113	chr13	+	576	4	NNC	ENSMUSG00000062382.10	novel	491	4	NA	NA	-23	4381	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	6	junction_3	40.9416929574514	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTTTTTATTAGATATT	1224	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74547789	74559846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_74547912_74553897_74554023_74554221_74554283_74559578
tx.5114	chr13	+	2803	4	NNC	ENSMUSG00000062382.10	novel	491	4	NA	NA	-22	4381	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_3	24.2532930181083	39	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATTTTTTATTAGATATT	1225	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74547790	74559846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_74547912_74553897_74554023_74554221_74554283_74557350
tx.5115	chr13	-	1436	12	ISM	ENSMUSG00000021585.11	ENSMUST00000220738.2	1653	17	8798	-352	6475	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_7	35.4792454754062	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCTTTCCTGCCTGAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74873582	74842377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_74842953_74844009_74844072_74847223_74847293_74848742_74848836_74849334_74849371_74850676_74850770_74852219_74852322_74861764_74861864_74869050_74869123_74869295_74869347_74872896_74872981_74873482
tx.5116	chr13	+	2596	14	FSM	ENSMUSG00000021587.6	ENSMUST00000022075.6	5040	14	82	2362	-8	-2362	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_5	4.93268293596351	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTCAGTGTTTAAGAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75238026	75280618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_75238361_75241201_75241307_75244408_75244520_75246019_75246167_75247395_75247473_75254069_75254159_75258936_75259110_75260660_75260874_75263355_75263457_75273968_75274203_75274842_75275001_75275928_75276063_75278160_75278323_75280060
tx.5117	chr13	+	809	5	ISM	ENSMUSG00000021587.6	ENSMUST00000135349.2	1419	6	6	7201	6	-7201	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_3	3.35410196624968	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGTTTTGGAGACTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75238040	75247521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_75238361_75241201_75241307_75244408_75244520_75246019_75246167_75247395
tx.5118	chr13	+	249	2	ISM	ENSMUSG00000021587.6	ENSMUST00000135349.2	1419	6	8006	7204	8006	-7204	internal_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCTTGTTTTGGAGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75246040	75247518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_75246167_75247395
tx.5119	chr13	+	694	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000074800.5	novel	276	1	NA	NA	-165702	71	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAATATTGCAGGAAAT	8762	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75627312	75793361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_+_75627568_75792922
tx.512	chr1	+	630	3	NNC	ENSMUSG00000092627.3	novel	1372	2	NA	NA	-18	679	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATCGACCCGATTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89857937	89860263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_89858176_89859728_89859871_89860013
tx.5120	chr13	+	3615	12	FSM	ENSMUSG00000001542.8	ENSMUST00000001583.8	4382	12	764	3	-64	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	343	junction_2	37.9194448472108	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTGAATAATTTTGACGT	6216	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75855639	75920480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_75855917_75873071_75873120_75894410_75894533_75898043_75898208_75904393_75904654_75909996_75910122_75910263_75910349_75911666_75912235_75914272_75914340_75917657_75917830_75918664_75918710_75918798
tx.5121	chr13	+	1304	3	FSM	ENSMUSG00000021591.9	ENSMUST00000022082.8	1345	3	39	2	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	287	junction_1	16	1095	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGACTTTTGTCCGGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75988025	75998268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_75988295_75995288_75995418_75997362
tx.5122	chr13	-	533	3	ISM	ENSMUSG00000043190.15	ENSMUST00000167271.9	595	4	10433	0	10182	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAAGTAATTTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76156405	76150885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_76151208_76156101_76156137_76156229
tx.5123	chr13	-	1102	4	NNC	ENSMUSG00000043190.15	novel	595	4	NA	NA	-17	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	36.2981481009094	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAAGTAATTTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76166698	76150885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_76151208_76156101_76156137_76156229_76156406_76166129
tx.5124	chr13	-	596	4	FSM	ENSMUSG00000043190.15	ENSMUST00000167271.9	595	4	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	32.0555074137902	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAAGTAATTTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76166839	76150885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_76151208_76156101_76156137_76156229_76156406_76166776
tx.5125	chr13	-	1580	4	FSM	ENSMUSG00000043190.15	ENSMUST00000050997.2	2807	4	-7	1234	-7	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_3	20.2703943940144	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTAAAGTAATTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76166688	76150887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_76151208_76156101_76156137_76156229_76156406_76165639
tx.5126	chr13	-	1020	4	NNC	ENSMUSG00000043190.15	novel	595	4	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_3	34.4125300177453	31	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTAAAGTAATTTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76166693	76150885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_76151208_76156101_76156137_76156229_76156406_76166206
tx.5127	chr13	-	2031	8	FSM	ENSMUSG00000021592.19	ENSMUST00000239063.2	3657	8	4	1622	4	-1622	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_3	7.18558647997674	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTACTATATATTACTTGCC	9780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76246775	76210162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_76210722_76213398_76213624_76214753_76214979_76220218_76220391_76222893_76223171_76239776_76239937_76242006_76242137_76246492
tx.5128	chr13	+	1216	5	NNC	ENSMUSG00000033991.10	novel	2116	5	NA	NA	-4	-940	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	52	junction_1	99.1476172179645	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGAACTGTAACCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76328539	76337285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_76328672_76330933_76331065_76333245_76333370_76335718_76335814_76336551
tx.5129	chr13	+	1193	5	FSM	ENSMUSG00000033991.10	ENSMUST00000223902.2	2116	5	-4	927	-4	-927	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	121.425903332032	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTTTTTTTTCCATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76328539	76337298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_76328636_76330933_76331065_76333245_76333370_76335718_76335814_76336551
tx.513	chr1	-	2065	12	FSM	ENSMUSG00000026301.17	ENSMUST00000189690.7	2060	12	-2	-3	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_8	12	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAGTAATTTGGTCACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90017868	89969853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_89970465_89973313_89973553_89975510_89975689_89980109_89980197_89994446_89994647_89998233_89998342_90001468_90001552_90005528_90005597_90008581_90008675_90009037_90009145_90017196_90017273_90017653
tx.5130	chr13	-	3737	21	FSM	ENSMUSG00000021597.17	ENSMUST00000151524.9	3747	21	10	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_14	27.7961777947976	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTCATAGTCTTTAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77283582	77191206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_77192150_77194640_77194824_77195228_77195322_77197205_77197337_77197996_77198161_77199267_77199414_77214718_77214867_77231559_77231726_77232450_77232580_77238423_77238588_77239303_77239463_77240476_77240531_77249040_77249176_77251599_77251744_77252652_77252797_77254094_77254224_77260690_77260854_77273348_77273590_77274483_77274560_77274719_77274834_77283471
tx.5131	chr13	-	1065	8	ISM	ENSMUSG00000021597.17	ENSMUST00000151524.9	3747	21	-10	60470	-10	19	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_1	25.2352199620018	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGGTTATTGCAAAACTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77283602	77251676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_77251744_77252652_77252797_77254094_77254224_77260690_77260854_77273348_77273590_77274483_77274560_77274719_77274834_77283471
tx.5132	chr13	-	2014	6	FSM	ENSMUSG00000021597.17	ENSMUST00000162320.2	1241	6	-8	-765	-3	-181	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	13.9283882771841	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTAATGTCATGTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77283587	77252919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_77254224_77260690_77260854_77273348_77273590_77274483_77274560_77274719_77274834_77283471
tx.5133	chr13	-	668	4	ISM	ENSMUSG00000021597.17	ENSMUST00000162320.2	1241	6	-27	19562	-14	-19562	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_1	5.71547606649408	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATTCTTATAGCTGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77283606	77273246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_77273590_77274483_77274560_77274719_77274834_77283471
tx.5134	chr13	+	641	3	FSM	ENSMUSG00000071252.7	ENSMUST00000225992.2	616	3	-23	-2	-12	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	11	206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGTGACTTACACTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77283646	77332125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_77283750_77322971_77323104_77331719
tx.5135	chr13	+	1909	4	FSM	ENSMUSG00000071252.7	ENSMUST00000225605.2	1539	4	-20	-350	-6	350	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	17.5562587763516	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ATACCAAAGACCAAAATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77283652	77342183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_77283750_77322971_77323104_77331719_77331889_77340672
tx.5136	chr13	+	408	2	Intergenic	novelGene_490	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTCTTAACCACCCTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80849173	80853535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_80849433_80853386
tx.5137	chr13	-	2482	2	Intergenic	novelGene_491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTCCTGTGGGCAGAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80990509	80978749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_80980979_80990256
tx.5138	chr13	-	965	3	NNC	ENSMUSG00000069170.15	novel	3823	19	NA	NA	-3524	386	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGTTATAGGCATATGAC	569	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81710755	81708304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_81708984_81709572_81709700_81710596
tx.5139	chr13	-	1616	7	FSM	ENSMUSG00000069170.15	ENSMUST00000146749.2	1592	7	-21	-3	-8	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	8.51958527942137	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTAAAGTGTATATGACAT	2349	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81781281	81727156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_81727970_81729810_81729925_81732159_81732265_81740676_81740773_81741108_81741259_81743295_81743478_81781125
tx.514	chr1	+	2018	2	FSM	ENSMUSG00000044337.6	ENSMUST00000065587.5	3065	2	20	1027	-6	-1027	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_1	0	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCATGTGTGCTTTGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90131721	90143446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_90131810_90141516
tx.5140	chr13	-	1140	6	ISM	ENSMUSG00000069170.15	ENSMUST00000146749.2	1592	7	-40	2333	-27	-33	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_1	7.78716893357271	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTGCTTATTATTTTTAC	2330	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81781300	81729492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_81729925_81732159_81732265_81740676_81740773_81741108_81741259_81743295_81743478_81781125
tx.5141	chr13	-	650	3	Intergenic	novelGene_492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	28.5	172	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGTACTTGTGAACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81792389	81784029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_81784533_81785816_81785901_81792326
tx.5142	chr13	-	749	3	Intergenic	novelGene_493	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_2	15	427	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGTACTTGTGAACTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81792389	81784029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_81784533_81785816_81786000_81792326
tx.5143	chr13	+	2892	3	FSM	ENSMUSG00000035840.8	ENSMUST00000224300.2	4250	3	90	1268	-39	419	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_2	12	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGATTTCAGGGCAGAAC	379	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81805871	81819722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_81806056_81813123_81813389_81817279
tx.5144	chr13	+	2438	3	FSM	ENSMUSG00000035840.8	ENSMUST00000049055.8	2338	3	-101	1	-64	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_2	38	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTCACATTACCTCATTT	354	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81805846	81819302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_81806056_81813123_81813389_81817338
tx.5145	chr13	-	2404	2	ISM	ENSMUSG00000035834.12	ENSMUST00000162535.2	2630	4	9048	-39	9048	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	257	junction_1	0	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGATTTGCAGTGAACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81826356	81821959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_81824242_81826234
tx.5146	chr13	-	3045	8	FSM	ENSMUSG00000035834.12	ENSMUST00000048993.12	3054	8	11	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	220	junction_2	24.1119836409624	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGATTTGCAGTGAACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81859121	81821959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_81824242_81826234_81826379_81830230_81830314_81835244_81835296_81837315_81837376_81842766_81842897_81847862_81848013_81858976
tx.5147	chr13	-	659	4	FSM	ENSMUSG00000035834.12	ENSMUST00000161093.8	424	4	-43	-192	3	192	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	130.922368855237	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAATACTCATTTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81859118	81841772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_81842010_81842766_81842897_81847862_81848013_81858976
tx.5148	chr13	-	790	3	FSM	ENSMUSG00000035834.12	ENSMUST00000161920.2	733	3	-57	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	281	junction_2	6.5	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAATGCTGTGATTACTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81859121	81842401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_81842897_81847862_81848013_81858976
tx.5149	chr13	+	1437	2	FSM	ENSMUSG00000051098.7	ENSMUST00000057598.7	3957	2	-243	2763	-243	166	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAACCAACCCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81859216	81898631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_81860102_81898079
tx.515	chr1	+	1576	8	FSM	ENSMUSG00000034432.12	ENSMUST00000036153.12	2287	8	497	214	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	708	junction_7	24.8185250100297	2179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGGCTCTAGAAATTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90531199	90540849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_90531350_90532096_90532168_90533185_90533235_90534258_90534392_90537814_90537923_90538696_90538760_90539261_90539310_90539895
tx.5150	chr13	+	934	5	FSM	ENSMUSG00000021537.10	ENSMUST00000022009.10	1226	5	171	121	-30	118	multi-exon	FALSE	canonical	3	1314	junction_2	32.392128673491	12823	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTAATGTTTGGTAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81931366	81945153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_81931477_81932759_81932896_81934961_81935077_81940074_81940267_81944772
tx.5151	chr13	+	2586	12	FSM	ENSMUSG00000035762.12	ENSMUST00000057495.10	2857	12	0	271	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_10	57.0470300398157	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTGTAATTTATTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84370418	84443989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_84370554_84399348_84399453_84405879_84405964_84408261_84408360_84420289_84420447_84430829_84430982_84431422_84431484_84432103_84432245_84434803_84434918_84440497_84440673_84441499_84441597_84442721
tx.5152	chr13	+	2473	11	NIC	ENSMUSG00000035762.12	novel	2857	12	NA	NA	-3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_9	71.7933840963079	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGTGTAATTTATTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84370427	84443989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_84370554_84405879_84405964_84408261_84408360_84420289_84420447_84430829_84430982_84431422_84431484_84432103_84432245_84434803_84434918_84440497_84440673_84441499_84441597_84442721
tx.5153	chr13	+	1106	9	FSM	ENSMUSG00000021548.11	ENSMUST00000163600.8	1055	9	-53	2	-11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_4	292.63455772516	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTCTTTGTGATTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85337542	85361027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_85337772_85338872_85338996_85344370_85344445_85345469_85345681_85350559_85350616_85354246_85354318_85356896_85357009_85359972_85360034_85360858
tx.5154	chr13	+	1211	9	FSM	ENSMUSG00000021548.11	ENSMUST00000022030.11	2045	9	21	813	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	824	junction_5	83.2840583485219	1615	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTTTGTGATTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85337547	85361029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_85337772_85338872_85338996_85344370_85344445_85345469_85345681_85350451_85350616_85354246_85354318_85356896_85357009_85359972_85360034_85360858
tx.5155	chr13	+	1022	9	NIC	ENSMUSG00000021548.11	novel	2045	9	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_3	310.456921327259	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTTTGTGATTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85337556	85361029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_85337772_85338872_85338996_85344370_85344445_85345649_85345681_85350451_85350616_85354246_85354318_85356896_85357009_85359972_85360034_85360858
tx.5156	chr13	-	2847	16	ISM	ENSMUSG00000021549.15	ENSMUST00000109552.3	4563	25	54542	296	-3441	-296	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	186	junction_11	27.6691565144697	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAACTGATTAGCTTACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85382606	85363194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_85364307_85364995_85365131_85366300_85366379_85367524_85367614_85369589_85369658_85371576_85371664_85372321_85372438_85373600_85373744_85374652_85374813_85375070_85375244_85376349_85376427_85376726_85376885_85377723_85377802_85378506_85378595_85381707_85381865_85382478
tx.5157	chr13	-	436	3	FSM	ENSMUSG00000017778.15	ENSMUST00000131011.2	540	3	109	-5	-21	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	10515	junction_1	2196	48206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCTCGTCTCTGCAATAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86194914	86192929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_86193028_86193845_86193989_86194719
tx.5158	chr13	-	325	2	ISM	ENSMUSG00000017778.15	ENSMUST00000131011.2	540	3	114	919	-16	-840	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14907	junction_1	0	526	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTAACAGGTAATTAGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86194909	86193853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_86193989_86194719
tx.5159	chr13	-	1189	3	ISM	ENSMUSG00000021614.17	ENSMUST00000159337.8	2273	6	-263	13834	-72	374	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	54	junction_2	6.5	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATGGTACATGGTTTTTA	2534	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89890700	89873178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_89873783_89879577_89879654_89890191
tx.516	chr1	-	1028	3	ISM	ENSMUSG00000026304.14	ENSMUST00000131428.8	1557	6	7599	-2	7549	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCATGAGGTTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90887790	90885854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_90886722_90886889_90886984_90887723
tx.5160	chr13	-	1492	8	FSM	ENSMUSG00000021615.14	ENSMUST00000022115.14	1540	8	55	-7	-17	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_1	13.6993966796993	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTATTTAACTGAACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90237672	89997032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_89997583_90089080_90089229_90139191_90139284_90140572_90140726_90149036_90149204_90210127_90210304_90219659_90219809_90237615
tx.5161	chr13	+	761	4	FSM	ENSMUSG00000012422.15	ENSMUST00000161568.8	8689	4	597	7331	-14	265	multi-exon	FALSE	canonical	3	1033	junction_1	130.199846390078	7495	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGTACCTCTATTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90237838	90253045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_90237903_90246480_90246591_90249026_90249062_90252493
tx.5162	chr13	+	698	3	ISM	ENSMUSG00000012422.15	ENSMUST00000161568.8	8689	4	9238	7331	8599	265	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1303	junction_2	6	703	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGAGTACCTCTATTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90246479	90253045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_90246591_90249026_90249062_90252493
tx.5163	chr13	-	1272	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000094277.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0.82915619758885	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTCTGTATTTCCAAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90741855	90614830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_90615443_90622852_90623028_90650623_90650750_90697212_90697282_90741565
tx.5164	chr13	-	1400	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000094277.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.62466929133727	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTCTGTATTTCCAAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90742052	90614830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_90615443_90622852_90623028_90650623_90650750_90741565
tx.5165	chr13	+	534	4	FSM	ENSMUSG00000049517.9	ENSMUST00000051955.9	937	4	183	220	-76	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	13520	junction_1	3048.72640075601	126430	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTGTGTCTTACTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91071259	91072849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_91071319_91071705_91071866_91072444_91072566_91072655
tx.5166	chr13	-	1119	8	FSM	ENSMUSG00000021619.7	ENSMUST00000022119.6	1583	8	-11	475	-11	38	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_7	11.5121940673747	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAGGAGCAATGGATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91372098	91083949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_91084365_91084705_91084822_91085411_91085510_91170688_91170787_91188968_91189108_91302335_91302432_91356436_91356553_91372057
tx.5167	chr13	-	1276	8	NNC	ENSMUSG00000021619.7	novel	1583	8	NA	NA	6077	87	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	26	junction_2	7.14856914468389	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	4957	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91366001	91083900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_91084365_91084705_91084822_91085411_91085510_91170688_91170787_91188968_91189108_91302335_91302432_91356436_91356553_91365852
tx.5168	chr13	+	892	4	FSM	ENSMUSG00000003992.16	ENSMUST00000144659.2	822	4	-54	-16	18	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	6.12825877028341	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACCAGTGAATTAAAAATAA	2780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91609227	91713345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_91609368_91672703_91672777_91687453_91687516_91712728
tx.5169	chr13	-	1445	5	ISM	ENSMUSG00000021621.16	ENSMUST00000022121.13	1541	6	1545	0	1501	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_2	32.5451609306207	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTTTGTTGAACTGATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91954279	91944651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_91945374_91946941_91947011_91948729_91948823_91948984_91949136_91953869
tx.517	chr1	-	1857	6	FSM	ENSMUSG00000026304.14	ENSMUST00000027529.12	1831	6	-26	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.2	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCATGAGGTTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90897409	90885854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_90886722_90886889_90886984_90887723_90887850_90888832_90888985_90891865_90892026_90896951
tx.5170	chr13	-	1530	6	FSM	ENSMUSG00000021621.16	ENSMUST00000022121.13	1541	6	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_2	29.1108227296997	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTTTGTTGAACTGATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91955813	91944651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_91945374_91946941_91947011_91948729_91948823_91948984_91949136_91953869_91954280_91955728
tx.5171	chr13	-	309	2	ISM	ENSMUSG00000021621.16	ENSMUST00000178084.2	931	4	-35	7110	9	-5454	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGTACTTGAATGAAGACGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91955815	91954057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_91954280_91955728
tx.5172	chr13	+	1076	5	NIC	ENSMUSG00000021707.6	novel	5347	6	NA	NA	420	-3735	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	3	22	junction_4	636.728896391549	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAGAGACTGGATTATTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92491653	92521826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_92491853_92492157_92492208_92494434_92494541_92502172_92502300_92521232
tx.5173	chr13	+	1548	6	FSM	ENSMUSG00000021707.6	ENSMUST00000022218.6	5347	6	420	3379	420	-3379	multi-exon	FALSE	canonical	3	1135	junction_5	174.184270242752	1118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCATTAAAATGGCTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92491653	92522182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_92491853_92492157_92492208_92494434_92494541_92502172_92502300_92504692_92504809_92521232
tx.5174	chr13	-	1766	3	ISM	ENSMUSG00000021706.15	ENSMUST00000156586.8	3146	14	23110	-714	15632	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_2	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGTAATATAAAGATGATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92630472	92623640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_92625132_92629010_92629179_92630365
tx.5175	chr13	-	1820	15	FSM	ENSMUSG00000042167.7	ENSMUST00000048702.7	2990	15	53	1117	53	218	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_4	92.51905484928	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTGAAAATGTTTACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93328738	93283907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_93284174_93285388_93285469_93287191_93287284_93291432_93291570_93296152_93296197_93304433_93304563_93304898_93304976_93308330_93308401_93311147_93311227_93312026_93312119_93312205_93312321_93320586_93320825_93322315_93322406_93322810_93322985_93328601
tx.5178	chr13	-	1961	8	FSM	ENSMUSG00000042118.8	ENSMUST00000015941.8	2467	8	-29	535	-29	-535	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	2.60298102261266	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGTAGCTTGAATGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93810839	93792762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_93793653_93798809_93799039_93799653_93799837_93800181_93800330_93803081_93803274_93805762_93805855_93807920_93808054_93810745
tx.5179	chr13	-	3653	9	FSM	ENSMUSG00000021687.15	ENSMUST00000022197.15	4259	9	483	123	483	-123	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_5	9.45300878027732	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTGTTTGTATAATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94421854	94337940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_94340672_94344643_94344762_94347084_94347187_94361402_94361563_94366221_94366351_94368579_94368689_94369589_94369689_94389500_94389579_94421727
tx.518	chr1	+	2230	13	NIC	ENSMUSG00000026305.16	novel	2849	23	NA	NA	-11	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_11	25.9117090649511	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGGGTTTTGTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90981154	91056666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_90981446_90996284_90996372_91028298_91028335_91028906_91029033_91030968_91031041_91032848_91033020_91035019_91035113_91039877_91040020_91047862_91047913_91050143_91050262_91050799_91050880_91053362_91053468_91055807
tx.5180	chr13	+	4024	27	FSM	ENSMUSG00000021686.7	ENSMUST00000022196.5	4021	27	-4	1	-4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	310	junction_8	45.9393251760748	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCTCTCCTAATCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94495463	94702824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_94495740_94527299_94527376_94531226_94531302_94539845_94539942_94540454_94540616_94545284_94545352_94554468_94554652_94576762_94576922_94580426_94580525_94582429_94582485_94582573_94582646_94584960_94585024_94587460_94587594_94591903_94592014_94598903_94599081_94608183_94608371_94609306_94609438_94613473_94613637_94616234_94616383_94619720_94619869_94630176_94630250_94638425_94638533_94664672_94664905_94668489_94668575_94679286_94679385_94684262_94684402_94702112
tx.5181	chr13	+	1298	12	ISM	ENSMUSG00000021686.7	ENSMUST00000022196.5	4021	27	59113	89310	-54790	-67314	internal_fragment	FALSE	canonical	3	310	junction_2	47.9231478429115	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCATGAAGAAATTTTACTC	6145	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94554580	94613515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_94554652_94576762_94576922_94580426_94580525_94582429_94582485_94582573_94582646_94584960_94585024_94587460_94587594_94591903_94592014_94598903_94599081_94608183_94608371_94609306_94609438_94613473
tx.5182	chr13	+	3173	21	ISM	ENSMUSG00000021686.7	ENSMUST00000022196.5	4021	27	59113	-11	-54790	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	310	junction_2	48.2939954859815	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATCCTTACTGGCTGAACTT	6145	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94554580	94702836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_94554652_94576762_94576922_94580426_94580525_94582429_94582485_94582573_94582646_94584960_94585024_94587460_94587594_94591903_94592014_94598903_94599081_94608183_94608371_94609306_94609438_94613473_94613637_94616234_94616383_94619720_94619869_94630176_94630250_94638425_94638533_94664672_94664905_94668489_94668575_94679286_94679385_94684262_94684402_94702112
tx.5184	chr13	+	1743	9	ISM	ENSMUSG00000021686.7	ENSMUST00000022196.5	4021	27	120766	1	6863	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	349	junction_1	34.9535405931931	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCCTCTCCTAATCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94616233	94702824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_94616383_94619720_94619869_94630176_94630250_94638425_94638533_94664672_94664905_94668489_94668575_94679286_94679385_94684262_94684402_94702112
tx.5185	chr13	+	531	4	FSM	ENSMUSG00000042043.7	ENSMUST00000046644.7	559	4	10	18	10	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1242	junction_3	49.6185449202211	21781	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTTGTTTTATACTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94925427	94979412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_94925511_94968867_94968974_94973615_94973703_94979157
tx.5186	chr13	+	1982	2	FSM	ENSMUSG00000041995.9	ENSMUST00000045909.8	1894	2	-87	-1	-87	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGGTGTTCTGCTTGCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95461657	95474350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_95461853_95472563
tx.5187	chr13	-	1091	2	ISM	ENSMUSG00000021681.9	ENSMUST00000022189.9	3249	14	22535	0	22517	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	274	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTCTTCTTTGTATTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95489325	95487190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_95488211_95489254
tx.5188	chr13	-	2773	2	FSM	ENSMUSG00000021678.10	ENSMUST00000022185.10	2741	2	-18	-14	-18	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTTCTTTCAGGCTGTGT	9808	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95661753	95648225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_95650790_95661544
tx.5189	chr13	+	444	3	Intergenic	novelGene_495	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTTTGGGTAAGTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95661842	95666048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_95661944_95664461_95664574_95665817
tx.519	chr1	+	2120	12	NIC	ENSMUSG00000026305.16	novel	2849	23	NA	NA	17	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_10	27.2156979494562	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGGGTTTTGTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90981192	91056666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_90981446_90996284_90996372_91028298_91028335_91028906_91029033_91032848_91033020_91035019_91035113_91039877_91040020_91047862_91047913_91050143_91050262_91050799_91050880_91053362_91053468_91055807
tx.5190	chr13	+	476	3	Intergenic	novelGene_496	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.5	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCTTTGGGTAAGTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95661846	95666048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_95661980_95664461_95664574_95665817
tx.5191	chr13	-	3325	2	FSM	ENSMUSG00000048376.7	ENSMUST00000059193.7	3336	2	21	-10	21	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGTGTCTGGAATAGATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95754974	95738300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_95741446_95754794
tx.5192	chr13	+	1055	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100475.2	novel	967	1	NA	NA	-753	-85	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTGTGTTGCTACCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96269123	96270758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_+_96269288_96269867
tx.5193	chr13	+	872	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100475.2	novel	967	1	NA	NA	-689	-85	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCTGTGTTGCTACCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96269187	96270758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_+_96269288_96269986
tx.5194	chr13	+	430	2	Intergenic	novelGene_498	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACTGACATAGCCTGATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96512274	96521409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_96512547_96521251
tx.5195	chr13	+	2286	13	FSM	ENSMUSG00000021671.10	ENSMUST00000099295.6	5183	13	29	2868	29	-2317	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_9	14.0798812337163	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACAGCCTGCCAGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96524830	96551377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_96525040_96526730_96526871_96528095_96528184_96529734_96529853_96530999_96531078_96533147_96533339_96535201_96535379_96537257_96537363_96538083_96538264_96539387_96539542_96540913_96541192_96547097_96547275_96550986
tx.5196	chr13	+	1296	5	ISM	ENSMUSG00000021671.10	ENSMUST00000099295.6	5183	13	13364	2670	-2845	-2119	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	109	junction_1	19.4983973700404	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGAGCTTTCCTGCCTTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96538165	96551575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_96538264_96539387_96539542_96540913_96541192_96547097_96547275_96550986
tx.5197	chr13	-	872	5	NNC	ENSMUSG00000047117.14	novel	704	6	NA	NA	-126	-3916	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2.04633819296811	29	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTTGTAAAGTGCATACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96582651	96576367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_96576595_96577282_96577375_96578064_96578164_96580786_96580886_96582296
tx.5198	chr13	-	1885	3	ISM	ENSMUSG00000021670.15	ENSMUST00000168855.2	1177	6	14850	-1314	890	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	484	junction_2	30.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTAAGCAGTGGCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96788421	96785469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_96787142_96787517_96787673_96788363
tx.5199	chr13	-	2077	4	ISM	ENSMUSG00000021670.15	ENSMUST00000168855.2	1177	6	14577	-1314	617	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	470	junction_3	32.5610537640019	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTAAGCAGTGGCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96788694	96785469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_96787142_96787517_96787673_96788363_96788523_96788603
tx.52	chr1	-	1506	3	FSM	ENSMUSG00000025930.7	ENSMUST00000190719.2	741	3	-365	-400	272	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCATTGTAAAAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14825942	14823569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_14824550_14824729_14824767_14825453
tx.520	chr1	+	1165	3	ISM	ENSMUSG00000070732.3	ENSMUST00000094698.2	3851	16	-42	17666	-28	404	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_2	6	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGAAGGCTAATGATGC	4222	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91072782	91080851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_91072892_91077804_91077896_91079886
tx.5200	chr13	-	4379	20	FSM	ENSMUSG00000021670.15	ENSMUST00000022176.15	4425	20	51	-5	-10	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_19	35.2932314809179	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTAAGCAGTGGCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96807393	96785469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_96787142_96787517_96787673_96788363_96788523_96788603_96788745_96789165_96789337_96791323_96791430_96792057_96792216_96792361_96792521_96793070_96793266_96795090_96795267_96795378_96795627_96795724_96795886_96796401_96796519_96796625_96796733_96799536_96799643_96801269_96801355_96802317_96802406_96802620_96802733_96803028_96803217_96807318
tx.5201	chr13	-	834	8	ISM	ENSMUSG00000021670.15	ENSMUST00000022176.15	4425	20	59	10963	-2	219	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	390	junction_7	33.7802019060918	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAACCCCGTAACCCAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96807385	96796437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_96796519_96796625_96796733_96799536_96799643_96801269_96801355_96802317_96802406_96802620_96802733_96803028_96803217_96807318
tx.5202	chr13	+	605	2	Intergenic	novelGene_499	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAATCTGCTTGAATTGGC	284	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97199717	97202287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_97199806_97201770
tx.5203	chr13	+	1797	12	NNC	ENSMUSG00000041817.15	novel	6013	13	NA	NA	-346	-6366	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	28	junction_1	76.8971621954868	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGAGTACTTGATGTGT	8371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97207804	97259657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_97207887_97228325_97228461_97230098_97230199_97230569_97230656_97234047_97234220_97243461_97243642_97246530_97246660_97247803_97247911_97250146_97250187_97250616_97250768_97254882_97255040_97259199
tx.5204	chr13	+	1026	2	NNC	ENSMUSG00000041817.15	novel	6013	13	NA	NA	57781	758	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGCACCTGTTATATCTTTTA	NA	False	NA	-78	True	NA	NA	NA	97265931	97268279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_97266776_97268097
tx.5205	chr13	-	1068	6	FSM	ENSMUSG00000060739.9	ENSMUST00000073456.9	2700	6	64	1568	0	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	555	junction_1	171.768914533451	11322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTTTAGTTTGGGGCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97274381	97267499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_97267737_97268350_97268544_97270046_97270227_97271801_97271953_97272028_97272217_97274262
tx.5206	chr13	+	3156	21	FSM	ENSMUSG00000021666.17	ENSMUST00000161639.8	3157	21	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_1	31.6045487232455	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCCTAACAAATCTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97274486	97312959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_97274568_97278434_97278519_97279515_97279601_97282154_97282213_97282727_97282826_97285816_97285943_97286832_97286922_97289735_97289825_97291697_97291759_97291928_97292109_97296594_97296676_97297526_97297676_97299359_97299501_97299582_97299683_97301518_97301706_97304773_97304851_97307993_97308133_97309019_97309200_97309447_97309564_97311369_97311553_97312107
tx.5207	chr13	-	1794	14	FSM	ENSMUSG00000021665.10	ENSMUST00000022169.10	1905	14	27	84	27	-84	multi-exon	FALSE	canonical	3	2035	junction_5	137.076923076923	2943	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTCTATCCCTGAATCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97334838	97312922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_97313098_97313304_97313410_97313563_97313655_97314387_97314563_97315851_97315925_97317589_97317677_97318340_97318522_97320184_97320315_97322075_97322178_97325469_97325581_97325813_97325861_97327720_97327787_97330629_97330776_97334533
tx.5208	chr13	+	708	3	Intergenic	novelGene_500	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGTTACACCAGTGTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97342068	97348307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_97342218_97342377_97342485_97347855
tx.5209	chr13	-	3093	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000078952.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	10.2089285540757	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGATGTGTCTCCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97619112	97613202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_97615981_97618046_97618132_97618599_97618764_97619046
tx.521	chr1	+	3269	15	NIC	ENSMUSG00000070732.3	novel	3851	16	NA	NA	0	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	55	junction_1	30.8108945746435	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTCAAGACTCCAAGCTG	4250	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91072810	91098012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_91072892_91079886_91081383_91081615_91081675_91083106_91083278_91084376_91084561_91084639_91084663_91084785_91084871_91090079_91090195_91090773_91090903_91092635_91092716_91092816_91092888_91094520_91094807_91096414_91096561_91096678_91096819_91097809
tx.5210	chr13	-	340	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000078952.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	6.5	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCCTCTTTCTGAAGGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97619123	97618032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_-_97618132_97618599_97618764_97619046
tx.5211	chr13	+	638	3	NNC	ENSMUSG00000078952.10	novel	2764	3	NA	NA	46	-3329	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	182	junction_2	6.5	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCACAGGTGTTGGAAGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97619254	97630186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_97619286_97619456_97619541_97629663
tx.5212	chr13	+	463	4	NNC	ENSMUSG00000078952.10	novel	492	3	NA	NA	48	1886	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	87.5912222898061	17	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAAGTTCTTCGTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97619256	97628094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_97619286_97619456_97619541_97625686_97625857_97627914
tx.5213	chr13	+	2716	3	FSM	ENSMUSG00000078952.10	ENSMUST00000179324.2	2764	3	48	0	48	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_2	70.5	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGCGAACTCAAGACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97619256	97633515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_97619286_97619456_97619541_97630912
tx.5214	chr13	+	2923	4	NNC	ENSMUSG00000078952.10	novel	2764	3	NA	NA	49	-367	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	166	junction_3	11.8602979164381	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGGATGCAATGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97619257	97633148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_97619286_97619456_97619541_97629663_97630239_97630912
tx.5215	chr13	+	601	4	NNC	ENSMUSG00000078952.10	novel	492	3	NA	NA	50	1121	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_3	86.5139680437019	98	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGATACTGGCTAGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97619258	97627329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_97619286_97619456_97619541_97625686_97625857_97627009
tx.5216	chr13	+	2903	3	NNC	ENSMUSG00000078952.10	novel	2764	3	NA	NA	-8	-361	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	166	junction_2	8	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGCAATGTCCTTTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97619454	97633154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_97619541_97629663_97630239_97630912
tx.5217	chr13	+	2689	2	ISM	ENSMUSG00000078952.10	ENSMUST00000179324.2	2764	3	246	0	-8	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGCGAACTCAAGACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97619454	97633515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_97619541_97630912
tx.5218	chr13	+	1498	8	FSM	ENSMUSG00000021661.17	ENSMUST00000226100.2	1476	8	-26	4	-26	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	57.4651624722247	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAGCTCTGATTATATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98399620	98410422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_98399985_98403823_98403983_98404937_98405004_98407562_98407661_98408161_98408288_98408733_98408801_98409279_98409361_98409885
tx.5219	chr13	+	1877	9	FSM	ENSMUSG00000021661.17	ENSMUST00000022164.16	1755	9	-124	2	-21	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	142	junction_1	23.3559414282533	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTCTGATTATATGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98399625	98410424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_98399985_98402658_98403041_98403823_98403983_98404937_98405004_98407562_98407661_98408161_98408288_98408733_98408801_98409279_98409361_98409885
tx.522	chr1	+	3216	14	ISM	ENSMUSG00000070732.3	ENSMUST00000094698.2	3851	16	7540	-1	7540	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_2	21.6385039240472	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTCCAGTGCTTTCTGTA	6662	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91080364	91098518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_91081383_91081615_91081675_91083106_91083278_91084376_91084561_91084639_91084663_91084785_91084871_91090079_91090195_91090773_91090903_91092635_91092716_91092816_91092888_91094520_91094807_91096414_91096561_91096678_91096819_91097809
tx.5220	chr13	+	416	2	FSM	ENSMUSG00000021661.17	ENSMUST00000223606.2	1887	2	-37	1508	-19	-1508	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	0	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAAGAAATCATGAAGAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98399627	98402717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_98399985_98402658
tx.5221	chr13	+	2384	8	FSM	ENSMUSG00000021661.17	ENSMUST00000123924.8	2328	8	-58	2	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_1	24.7839645327212	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGCTCTGATTATATGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98399643	98410424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_98399985_98402658_98403041_98403823_98403983_98404937_98405004_98407562_98407661_98408161_98408288_98408733_98408801_98409279
tx.5222	chr13	-	924	6	FSM	ENSMUSG00000021660.15	ENSMUST00000022163.15	1091	6	166	1	166	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	579	junction_5	2432.68485422999	1526	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGTTTATCATTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98453309	98446404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_98446710_98447488_98447546_98449599_98449802_98450146_98450261_98452737_98452807_98453132
tx.5223	chr13	-	864	6	FSM	ENSMUSG00000021660.15	ENSMUST00000152704.8	888	6	24	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5972	junction_2	361.40138350593	76435	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGTTTATCATTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98453490	98446404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_98446710_98447488_98447546_98449599_98449802_98450146_98450261_98452737_98452807_98453373
tx.5224	chr13	-	496	3	NNC	ENSMUSG00000114521.2	novel	809	3	NA	NA	76	-71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTTGTTTGTGTCACGTAT	252	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98754094	98744989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_98745225_98746803_98746937_98753966
tx.5225	chr13	-	721	3	NNC	ENSMUSG00000114689.2	novel	570	2	NA	NA	-1185	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_2	24.5	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACAATCCTCCTCCATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98854203	98849586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_98850076_98852942_98853093_98854121
tx.5226	chr13	+	1041	2	NNC	ENSMUSG00000114203.2	novel	960	2	NA	NA	-16503	67	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	22	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAAGGCTGTCAGTCCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99114155	99133993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_99114293_99133089
tx.5227	chr13	-	1694	10	FSM	ENSMUSG00000021650.8	ENSMUST00000022153.8	1704	10	8	2	8	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_5	28.5894740191448	580	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTCGGGTTGTGTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99481205	99456156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_99456902_99458068_99458183_99463145_99463221_99466459_99466574_99468943_99469036_99469395_99469475_99473170_99473289_99476408_99476539_99479820_99479914_99481071
tx.5228	chr13	+	1845	11	FSM	ENSMUSG00000041632.8	ENSMUST00000052249.7	1849	11	4	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	414	junction_10	37.2860563750043	749	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTGTGGTGTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99481297	99552070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_99481384_99484839_99484918_99499472_99499544_99501732_99501792_99536769_99536885_99540011_99540091_99541495_99541612_99546316_99546420_99547785_99547929_99548702_99548874_99551246
tx.5229	chr13	+	1551	7	ISM	ENSMUSG00000041632.8	ENSMUST00000052249.7	1849	11	55476	0	54718	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	414	junction_6	16.3239769119606	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTGTGGTGTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99536769	99552070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_99536885_99540011_99540091_99541495_99541612_99546316_99546420_99547785_99547929_99548702_99548874_99551246
tx.523	chr1	+	1310	10	FSM	ENSMUSG00000034343.15	ENSMUST00000191368.7	1110	10	-46	-154	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	94.7511360236793	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATGCTTTAATTATTTT	319	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91178040	91213649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_91178160_91181936_91182116_91189988_91190019_91192939_91193006_91202971_91203040_91204107_91204179_91205982_91206041_91207226_91207260_91211668_91211732_91213026
tx.5230	chr13	+	1124	3	ISM	ENSMUSG00000041632.8	ENSMUST00000052249.7	1849	11	66506	0	65748	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	414	junction_2	3.5	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTTGTGTGGTGTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99547799	99552070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_99547929_99548702_99548874_99551246
tx.5231	chr13	-	1912	3	FSM	ENSMUSG00000052727.7	ENSMUST00000224702.2	2150	3	-92	330	-92	24	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	1.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTCGAGGAAAAGAAAGAGGA	4598	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99581067	99570784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_99572210_99578141_99578283_99580721
tx.5232	chr13	-	2032	5	ISM	ENSMUSG00000052727.7	ENSMUST00000064762.6	11808	7	-28	12815	-28	40	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_3	7.32717544487642	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAAGCCCAAGAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99653076	99570768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_99572210_99578141_99578283_99580721_99580805_99644615_99644718_99652811
tx.5233	chr13	-	1618	3	NNC	ENSMUSG00000052727.7	novel	2669	3	NA	NA	-80	-753	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	24	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTTTCTCATTGCCAAGA	4610	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99581055	99576894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_99578038_99578141_99578283_99580721
tx.5234	chr13	-	484	4	ISM	ENSMUSG00000052727.7	ENSMUST00000064762.6	11808	7	-35	20302	-35	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_2	7.54247233265651	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCATAAACTGCTGGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99653083	99578255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_99578283_99580721_99580805_99644615_99644718_99652811
tx.5235	chr13	-	496	3	ISM	ENSMUSG00000052727.7	ENSMUST00000064762.6	11808	7	-71	22765	-71	-2561	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTATTTCAGTTCTGGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99653119	99580718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_99580805_99644615_99644718_99652811
tx.5236	chr13	-	1439	2	FSM	ENSMUSG00000052727.7	ENSMUST00000223820.2	1364	2	-60	-15	-38	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAGTGGATGAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99653086	99643553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_99644718_99652811
tx.5237	chr13	-	527	2	NNC	ENSMUSG00000052727.7	novel	11808	7	NA	NA	-41	-7774	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	27	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTGCATTTGGAAATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99653089	99651342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_99651592_99652811
tx.5238	chr13	+	1668	3	NNC	ENSMUSG00000097027.3	novel	2481	2	NA	NA	-23	4280	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCTCTCTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99653113	99662548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_99653367_99656017_99656993_99662108
tx.5239	chr13	+	621	2	NNC	ENSMUSG00000097027.3	novel	2481	2	NA	NA	22	4253	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAATTAAGCATGTGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99653158	99662521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_99653367_99662108
tx.524	chr1	+	1262	10	FSM	ENSMUSG00000034343.15	ENSMUST00000178627.8	1363	10	3	98	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	274	junction_9	29.8142396999972	1244	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATGCTTTAATTATTTT	322	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91178043	91213649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_91178160_91181981_91182116_91189988_91190019_91192939_91193006_91202971_91203040_91204107_91204179_91205982_91206041_91207226_91207260_91211668_91211732_91213026
tx.5240	chr13	-	1284	10	NNC	ENSMUSG00000021646.10	novel	2123	17	NA	NA	-46	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	100.77269373431	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTAGGGTTGTTGAGAT	5647	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100108370	100085039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_100085465_100088663_100088750_100090643_100090759_100091122_100091280_100095312_100095380_100097403_100097485_100100315_100100389_100104148_100104245_100104341_100104442_100108286
tx.5241	chr13	-	2128	17	NNC	ENSMUSG00000021646.10	novel	2123	17	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	79.0217533341295	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTAGGGTTGTTGAGAT	669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100152147	100085039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_100085465_100088663_100088750_100090643_100090759_100091122_100091280_100095312_100095380_100097403_100097485_100100315_100100389_100104148_100104245_100104341_100104442_100108286_100108352_100112916_100113031_100125043_100125157_100126755_100126884_100127719_100127822_100130074_100130160_100136757_100136825_100151893
tx.5242	chr13	-	2032	17	NNC	ENSMUSG00000021646.10	novel	2123	17	NA	NA	-2	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	94.6644567670464	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTCTAGGGTTGTTGAGAT	667	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100152149	100085039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_100085465_100088663_100088750_100090643_100090759_100091220_100091280_100095312_100095380_100097403_100097485_100100315_100100389_100104148_100104245_100104341_100104442_100108286_100108352_100112916_100113031_100125043_100125157_100126755_100126884_100127719_100127822_100130074_100130160_100136757_100136825_100151893
tx.5243	chr13	-	393	2	ISM	ENSMUSG00000021646.10	ENSMUST00000221846.2	472	3	-21	7310	0	-7310	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATTATTATTATTATTATT	669	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100152147	100146109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_100146249_100151893
tx.5244	chr13	+	553	3	FSM	ENSMUSG00000021643.16	ENSMUST00000022145.15	601	3	43	5	-30	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	3	613	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTATTGGTGAATATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100244562	100250741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_100244738_100245530_100245640_100250472
tx.5245	chr13	+	1212	9	FSM	ENSMUSG00000021645.17	ENSMUST00000022147.15	1222	9	13	-3	7	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	544	junction_6	97.8154352594722	4927	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGACTTTATAGATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100261372	100274201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_100261474_100263094_100263167_100263377_100263498_100264312_100264514_100264722_100264870_100267587_100267684_100268863_100268975_100272196_100272248_100273888
tx.5246	chr13	-	2002	17	NIC	ENSMUSG00000021639.18	novel	1630	18	NA	NA	-11	449	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_1	76.8251871133419	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACTGTCTTCTTAAAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100629098	100596276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_100596929_100605422_100605535_100607386_100607427_100612977_100613081_100613611_100613719_100615698_100615763_100617047_100617156_100617511_100617600_100617719_100617811_100619445_100619552_100622578_100622634_100622981_100623033_100625356_100625444_100625643_100625681_100625990_100626069_100626583_100626673_100628964
tx.5247	chr13	-	1570	16	FSM	ENSMUSG00000021639.18	ENSMUST00000066984.14	1656	16	-29	115	-11	113	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_10	29.724213848122	1269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTCTGTTATTTTGAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100629098	100605202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_100605535_100607386_100607427_100612977_100613081_100613611_100613719_100615698_100615763_100617047_100617156_100617511_100617600_100617719_100617811_100619445_100619552_100622578_100622634_100622981_100623033_100625356_100625444_100625643_100625681_100625990_100626069_100626583_100626673_100628964
tx.5248	chr13	-	2719	17	FSM	ENSMUSG00000021635.15	ENSMUST00000177848.3	2392	17	-12	-315	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_16	17.1335516968899	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGTTCTTCTTATCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100787567	100753671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_100754441_100755601_100755660_100759305_100759427_100760927_100761075_100764017_100764165_100764267_100764354_100765907_100766091_100767563_100767676_100769389_100769460_100769703_100769830_100769958_100770012_100770370_100770508_100773449_100773607_100780027_100780112_100781498_100781754_100786185_100786290_100787457
tx.5249	chr13	+	1207	3	FSM	ENSMUSG00000078941.10	ENSMUST00000084721.8	1222	3	16	-1	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1279	junction_2	251.5	4693	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGGTACTTTGGCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100787866	100792568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_100787954_100790698_100790792_100791541
tx.525	chr1	+	1327	11	FSM	ENSMUSG00000034343.15	ENSMUST00000059743.12	1154	11	11	-184	3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	126.177692164661	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATTTGATGCTTTAATTAT	322	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91178043	91213646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_91178160_91181481_91181550_91181981_91182116_91189988_91190019_91192939_91193006_91202971_91203040_91204107_91204179_91205982_91206041_91207226_91207260_91211668_91211732_91213026
tx.5250	chr13	+	924	5	FSM	ENSMUSG00000078941.10	ENSMUST00000022135.15	1298	5	380	-6	-3	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	650	junction_4	426.823734110464	4986	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTTTAATAGTAGGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100787866	100802873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_100787954_100790698_100790792_100800402_100800462_100800558_100800705_100802334
tx.5251	chr13	+	1236	3	FSM	ENSMUSG00000052293.15	ENSMUST00000167256.8	1230	3	-5	-1	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	171	junction_1	554	290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGGTACTTTGGCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100788109	100792568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_100788226_100790698_100790792_100791541
tx.5252	chr13	+	658	2	ISM	ENSMUSG00000078941.10	ENSMUST00000022135.15	1298	5	13099	-6	12452	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	650	junction_1	0	1371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTTTAATAGTAGGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100800585	100802873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_100800705_100802334
tx.5253	chr13	-	1310	12	FSM	ENSMUSG00000069089.9	ENSMUST00000091299.8	1988	12	13	665	3	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	644	junction_3	44.8636133370117	4187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGAGTACAAGGATAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100867434	100839803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_100840015_100840898_100841047_100842874_100843025_100846581_100846669_100848004_100848105_100853008_100853128_100854079_100854191_100855809_100855879_100857093_100857162_100859187_100859222_100866965_100867026_100867281
tx.5254	chr13	-	670	4	FSM	ENSMUSG00000061474.12	ENSMUST00000109333.8	701	4	27	4	25	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1082	junction_3	81.5693297481079	6364	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAATGTCCCTTTTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100881140	100872466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_100872782_100875521_100875710_100877675_100877740_100881037
tx.5255	chr13	-	2339	9	FSM	ENSMUSG00000041431.17	ENSMUST00000072119.15	2489	9	61	89	-23	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	2476	junction_6	457.563588477055	5941	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAATTCTCATTTGCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100923017	100915246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_100916294_100916529_100916641_100917283_100917425_100917665_100917903_100918132_100918292_100919972_100920156_100921964_100922127_100922240_100922412_100922889
tx.5256	chr13	-	1171	3	FSM	ENSMUSG00000021629.11	ENSMUST00000225129.2	589	3	202	-784	202	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	263	junction_2	22.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTATTTGCAAATGAATAATT	3660	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100943269	100939155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_100939970_100940369_100940499_100943041
tx.5257	chr13	-	2554	4	ISM	ENSMUSG00000032621.9	ENSMUST00000210489.2	6330	10	11973	2272	1055	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	148	junction_3	30.8220700148449	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCGGAAAGAGTCTTCAGTT	NA	False	NA	34	True	NA	NA	NA	103889117	103878127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_103880225_103881292_103881438_103885266_103885363_103888901
tx.5258	chr13	-	3087	12	FSM	ENSMUSG00000032621.9	ENSMUST00000074616.7	3934	12	86	761	84	-761	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_3	30.0305629441708	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCATATGGTAAATTTGTG	10003	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103911030	103878880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_103880225_103881292_103881438_103885266_103885363_103888901_103889211_103889532_103889653_103894693_103894809_103895676_103895808_103896923_103897103_103897537_103897703_103900389_103900515_103905824_103905959_103910806
tx.5259	chr13	-	623	2	ISM	ENSMUSG00000032621.9	ENSMUST00000210269.2	619	3	4315	-490	4315	490	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	223	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTTTTCACGTTGACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103881319	103879628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_103880225_103881292
tx.526	chr1	+	1259	10	FSM	ENSMUSG00000034343.15	ENSMUST00000171165.8	5654	10	-15	4410	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_1	86.300651614781	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATGCTTTAATTATTTT	322	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91178043	91213649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_91178160_91181984_91182116_91189988_91190019_91192939_91193006_91202971_91203040_91204107_91204179_91205982_91206041_91207226_91207260_91211668_91211732_91213026
tx.5260	chr13	-	823	3	FSM	ENSMUSG00000032621.9	ENSMUST00000210269.2	619	3	277	-481	277	481	multi-exon	FALSE	canonical	3	193	junction_2	15	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGATGTAAGACGTTTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103885357	103879637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_103880225_103881292_103881438_103885266
tx.5261	chr13	-	1739	9	ISM	ENSMUSG00000032621.9	ENSMUST00000074616.7	3934	12	59	10572	57	284	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_7	26.6760074786314	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATGTGTTGTGCTTTTTCC	10013	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103911057	103888691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_103889211_103889532_103889653_103894693_103894809_103895676_103895808_103896923_103897103_103897537_103897703_103900389_103900515_103905824_103905959_103910806
tx.5262	chr13	-	532	2	ISM	ENSMUSG00000032621.9	ENSMUST00000211139.2	641	3	75	2316	75	-2316	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACCTGTGGAAAATTGTACT	9994	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103911039	103905659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_103905959_103910806
tx.5263	chr13	-	2528	13	FSM	ENSMUSG00000021710.12	ENSMUST00000109315.5	4162	13	0	1634	0	-106	multi-exon	TRUE	canonical	3	279	junction_1	22.4276614920058	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATGACTGTAATTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104246122	104161198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_104161589_104172094_104172232_104173361_104173491_104173805_104173993_104182696_104182899_104187002_104187370_104189011_104189148_104195248_104195410_104195974_104196078_104198252_104198361_104205702_104205852_104209270_104209531_104245923
tx.5264	chr13	-	1305	6	ISM	ENSMUSG00000021710.12	ENSMUST00000109315.5	4162	13	58860	1634	11100	-106	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	279	junction_1	19.6672316303032	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATGACTGTAATTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104187262	104161198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_104161589_104172094_104172232_104173361_104173491_104173805_104173993_104182696_104182899_104187002
tx.5265	chr13	-	1159	5	ISM	ENSMUSG00000021710.12	ENSMUST00000224945.2	2486	12	-28	23916	0	8397	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	279	junction_2	26.9756834945845	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCCTGGAACATTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104246122	104195634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_104196078_104198252_104198361_104205702_104205852_104209270_104209531_104245923
tx.5266	chr13	+	3782	11	FSM	ENSMUSG00000042743.14	ENSMUST00000044385.14	3048	11	23	-757	-9	757	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_7	16.2775919595006	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGATTTTGTCTTTGACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104246271	104279000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_104246478_104247577_104247698_104254831_104254936_104257974_104258045_104260697_104260798_104265736_104265842_104268444_104268584_104268673_104268737_104271111_104271150_104271347_104271432_104276247
tx.5267	chr13	+	730	4	ISM	ENSMUSG00000042743.14	ENSMUST00000044385.14	3048	11	23	19969	-9	-10221	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_2	12.9700509722291	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCTTGCTATTTGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104246271	104258274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_104246478_104247577_104247698_104254831_104254936_104257974
tx.5268	chr13	-	885	5	ISM	ENSMUSG00000021711.18	ENSMUST00000141557.8	3502	13	28240	1789	28222	9	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	393	junction_2	190.270859566041	336	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTATTTTCTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104286693	104280452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_104280754_104280911_104281060_104283751_104283853_104284591_104284791_104286557
tx.5269	chr13	-	888	5	ISM	ENSMUSG00000021711.18	ENSMUST00000179891.2	1689	13	28222	-9	28222	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	494	junction_2	147.320017309258	418	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTATTTTCTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104286693	104280452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_104280754_104280911_104281063_104283751_104283853_104284591_104284791_104286557
tx.527	chr1	+	2191	12	FSM	ENSMUSG00000026307.13	ENSMUST00000027532.13	2202	12	7	4	7	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_11	10.6693350656825	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACCTGCTGAAGTGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91226066	91248793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_91226171_91228249_91228363_91230490_91230592_91232995_91233177_91236035_91236164_91236372_91236538_91237518_91237626_91243210_91243248_91244785_91244870_91245313_91245414_91246759_91246836_91247798
tx.5270	chr13	-	906	6	ISM	ENSMUSG00000021711.18	ENSMUST00000022224.16	2342	13	26239	628	26223	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	346	junction_5	206.42616113274	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTATTTTCTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104288692	104280452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_104280754_104280911_104281063_104283751_104283853_104284591_104284791_104286557_104286692_104288672
tx.5271	chr13	-	978	7	NIC	ENSMUSG00000021711.18	novel	3502	13	NA	NA	23521	9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	331	junction_5	218.870141611159	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTATTTTCTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104291394	104280452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_104280754_104280911_104281060_104283751_104283853_104284591_104284791_104286557_104286692_104290803_104290849_104291344
tx.5272	chr13	-	981	7	ISM	ENSMUSG00000021711.18	ENSMUST00000144060.8	3538	12	23583	1796	23521	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	331	junction_5	200.142449270513	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTATTTTCTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104291394	104280452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_104280754_104280911_104281063_104283751_104283853_104284591_104284791_104286557_104286692_104290803_104290849_104291344
tx.5273	chr13	-	1713	12	NNC	ENSMUSG00000021711.18	novel	3502	13	NA	NA	-8	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	249.125412341616	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTATTTTCTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104314941	104280452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_104280754_104280911_104281060_104283751_104283853_104284591_104284791_104286557_104286698_104290799_104290849_104291344_104291418_104297474_104297603_104303366_104303452_104304970_104305071_104306327_104306397_104314621
tx.5274	chr13	-	1716	12	NNC	ENSMUSG00000021711.18	novel	1689	13	NA	NA	-8	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	239.911863982044	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTATTTTCTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104314941	104280452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_104280754_104280911_104281063_104283751_104283853_104284591_104284791_104286557_104286698_104290799_104290849_104291344_104291418_104297474_104297603_104303366_104303452_104304970_104305071_104306327_104306397_104314621
tx.5275	chr13	-	1703	12	NIC	ENSMUSG00000021711.18	novel	3502	13	NA	NA	-8	9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	331	junction_5	173.024051258921	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTATTTTCTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104314941	104280452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_104280754_104280911_104281060_104283751_104283853_104284591_104284791_104286557_104286692_104290803_104290849_104291344_104291418_104297474_104297603_104303366_104303452_104304970_104305071_104306327_104306397_104314621
tx.5276	chr13	-	1706	12	FSM	ENSMUSG00000021711.18	ENSMUST00000144060.8	3538	12	36	1796	-8	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	331	junction_5	157.730704704606	308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTTTATTTTCTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104314941	104280452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_104280754_104280911_104281063_104283751_104283853_104284591_104284791_104286557_104286692_104290803_104290849_104291344_104291418_104297474_104297603_104303366_104303452_104304970_104305071_104306327_104306397_104314621
tx.5277	chr13	-	1612	2	FSM	ENSMUSG00000118537.2	ENSMUST00000133280.2	1609	2	-1	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_1	0	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTGATTTTGTATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104314948	104310227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_104311513_104314621
tx.5278	chr13	+	3743	11	FSM	ENSMUSG00000021712.16	ENSMUST00000022225.12	3416	11	32	-359	-10	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_1	34.1	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGTTGTTATTCTAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104315336	104339884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_104315470_104317581_104317745_104321233_104321356_104323908_104324188_104324568_104324752_104326170_104326387_104328524_104328660_104334497_104334628_104335101_104335213_104336576_104336702_104337738
tx.5279	chr13	+	3240	11	NNC	ENSMUSG00000021712.16	novel	3416	11	NA	NA	4471	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	80.9177977950463	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGACTGTGACGTATACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104320076	104339528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_104320173_104320495_104320549_104321233_104321356_104323908_104324188_104324568_104324752_104326170_104326387_104328524_104328660_104334497_104334628_104335101_104335213_104336576_104336702_104337738
tx.528	chr1	-	1310	12	NIC	ENSMUSG00000026309.15	novel	1368	12	NA	NA	12	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	85	junction_9	124.787157635487	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTATTTGAGTGACTGGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91326465	91303552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_91303805_91304039_91304122_91306187_91306308_91309572_91309695_91311025_91311114_91312286_91312381_91312961_91313069_91314936_91315064_91316066_91316169_91318328_91318386_91318853_91318920_91326372
tx.5280	chr13	-	1143	5	FSM	ENSMUSG00000021713.10	ENSMUST00000225798.2	1375	5	2	230	2	-230	multi-exon	FALSE	canonical	3	287	junction_3	28.4198434196953	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATCTTGCATTGATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104365349	104356410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_104356993_104359345_104359467_104359599_104359701_104361857_104361961_104365113
tx.5281	chr13	-	397	3	ISM	ENSMUSG00000021713.10	ENSMUST00000225798.2	1375	5	0	3464	0	7	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	287	junction_1	39.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGAAGAAGGAATTGAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104365351	104359644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_104359701_104361857_104361961_104365113
tx.5282	chr13	+	1005	10	NIC	ENSMUSG00000021714.16	novel	1353	10	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	409	junction_5	30.3205101100449	1238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCATAGTTTGTCTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104365453	104386125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_104365511_104367236_104367388_104369165_104369223_104370654_104370728_104372686_104372734_104378696_104378780_104378862_104378962_104379253_104379381_104381785_104381840_104385868
tx.5283	chr13	+	1067	10	NNC	ENSMUSG00000021714.16	novel	1353	10	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_1	135.125547474365	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCATAGTTTGTCTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104365473	104386125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_104365593_104367236_104367388_104369165_104369223_104370654_104370728_104372686_104372734_104378696_104378780_104378862_104378962_104379253_104379381_104381785_104381840_104385868
tx.5284	chr13	+	948	9	ISM	ENSMUSG00000021714.16	ENSMUST00000022227.8	1217	10	1341	0	1341	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	409	junction_4	31.9821727685909	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGCATAGTTTGTCTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104367236	104386125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_104367388_104369165_104369223_104370654_104370728_104372686_104372734_104378696_104378780_104378862_104378962_104379253_104379381_104381785_104381840_104385868
tx.5285	chr13	-	599	3	ISM	ENSMUSG00000021715.13	ENSMUST00000022228.13	2071	14	155566	185	131228	-185	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	752	junction_1	56.5	2536	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTTGCAGATTGCATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104797895	104767832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_104768247_104794536_104794641_104797814
tx.5286	chr13	-	1865	14	FSM	ENSMUSG00000021715.13	ENSMUST00000022228.13	2071	14	21	185	21	-185	multi-exon	FALSE	canonical	3	502	junction_8	84.1316241226496	868	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTTGCAGATTGCATTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104953440	104767832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_104768247_104794536_104794641_104797814_104797925_104856929_104857028_104929006_104929159_104932917_104932952_104933771_104933852_104938639_104938710_104940758_104940863_104941425_104941525_104943144_104943289_104944227_104944341_104947724_104947822_104953194
tx.5287	chr13	+	1423	5	FSM	ENSMUSG00000021716.15	ENSMUST00000022230.15	2365	5	29	913	29	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_4	17.2536228079786	2135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCCAGTGTATATGATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104953713	104974869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_104953875_104963562_104963611_104969361_104969506_104970755_104970829_104973872
tx.5288	chr13	+	461	3	ISM	ENSMUSG00000021716.15	ENSMUST00000022230.15	2365	5	15744	1599	-1125	-685	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_2	17	359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTGGGGCCCTTCTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104969428	104974183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_104969506_104970755_104970829_104973872
tx.5289	chr13	+	360	2	Intergenic	novelGene_501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGGGTTTTTCCCTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105060861	105065522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_105061034_105065334
tx.529	chr1	-	1336	12	FSM	ENSMUSG00000026309.15	ENSMUST00000027534.13	1368	12	33	-1	5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	426	junction_9	38.9197096809944	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTGAGTGACTGGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91326472	91303551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_91303805_91304039_91304122_91306187_91306308_91309572_91309695_91311025_91311114_91312286_91312381_91312961_91313069_91314936_91315064_91316066_91316187_91318328_91318386_91318853_91318920_91326372
tx.5290	chr13	-	1472	6	NNC	ENSMUSG00000021720.12	novel	1017	4	NA	NA	87	30465	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.49666295470958	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATCTTTCAAACCCTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105430823	105355888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_105356084_105383170_105383207_105386118_105387076_105388759_105388856_105407412_105407548_105430770
tx.5291	chr13	-	2635	10	NIC	ENSMUSG00000042590.18	novel	2484	22	NA	NA	21	-30325	intron_retention	FALSE	canonical	3	480	junction_9	34.7662387672968	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAAAAGAAAAAACTAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107073432	107027487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_-_107029124_107032312_107032384_107033723_107033773_107035426_107035486_107037192_107037326_107046707_107046912_107047251_107047325_107056031_107056133_107061520_107061665_107073267
tx.5292	chr13	-	2219	8	ISM	ENSMUSG00000042590.18	ENSMUST00000186005.2	2484	22	31	35260	31	-35260	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	480	junction_7	37.6248940604651	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTACAGACTACTAAAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107073422	107032422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_107033773_107035426_107035486_107037192_107037326_107046707_107046912_107047251_107047325_107056031_107056133_107061520_107061665_107073267
tx.5293	chr13	-	603	4	ISM	ENSMUSG00000042590.18	ENSMUST00000186005.2	2484	22	14	49976	14	-49976	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	480	junction_3	30.6521704868604	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAACCCTGAAGAGTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107073439	107047138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_107047325_107056031_107056133_107061520_107061665_107073267
tx.5294	chr13	+	1241	12	FSM	ENSMUSG00000021692.10	ENSMUST00000022203.10	2051	12	-30	840	2	-840	multi-exon	TRUE	canonical	3	504	junction_4	50.5395680025492	2649	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTAGTGTTTTATATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107083636	107095428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_107083792_107084093_107084168_107085208_107085296_107086062_107086125_107086199_107086294_107086376_107086427_107088325_107088450_107088823_107088917_107089941_107090007_107091183_107091248_107093601_107093709_107095162
tx.5295	chr13	+	1077	11	ISM	ENSMUSG00000021692.10	ENSMUST00000022203.10	2051	12	436	840	417	-840	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	504	junction_3	47.0604929850931	395	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCTAGTGTTTTATATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107084102	107095428	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_107084168_107085208_107085296_107086062_107086125_107086199_107086294_107086376_107086427_107088325_107088450_107088823_107088917_107089941_107090007_107091183_107091248_107093601_107093709_107095162
tx.5296	chr13	-	1132	3	ISM	ENSMUSG00000021693.21	ENSMUST00000117423.9	2023	20	31637	-792	11999	-71	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_1	9	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAAATTCTGAGAGGAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107101627	107097838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_107098733_107100848_107100985_107101525
tx.5297	chr13	-	681	4	ISM	ENSMUSG00000021693.21	ENSMUST00000117423.9	2023	20	28052	-274	8414	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_3	16.3571255285137	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTGCCAATTTTATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107105212	107098356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_107098733_107100848_107100985_107101525_107101628_107105145
tx.5298	chr13	+	994	3	NNC	ENSMUSG00000071181.3	novel	1810	3	NA	NA	-10	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATAATGTTATTATGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107159050	107168559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_107159660_107162906_107162964_107168231
tx.5299	chr13	-	827	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000049233.8	novel	586	1	NA	NA	-40	299	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAATATTGTCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107551269	107550344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_-_107550852_107550949
tx.53	chr1	+	1647	10	FSM	ENSMUSG00000025925.15	ENSMUST00000188371.7	2268	10	0	621	0	-39	multi-exon	FALSE	canonical	3	905	junction_7	69.1671798285292	1248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGGTTTGTTCTATTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15875869	15913655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_15876182_15877864_15877961_15883264_15883387_15886109_15886197_15889157_15889308_15889874_15889988_15901730_15901791_15903624_15903714_15908405_15908513_15913144
tx.530	chr1	-	441	3	FSM	ENSMUSG00000026309.15	ENSMUST00000185886.7	606	3	347	-182	347	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	489	junction_1	10.5	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTGAGTGACTGGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91306292	91303550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_91303805_91304039_91304122_91306187
tx.5300	chr13	-	862	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000049233.8	novel	586	1	NA	NA	-40	299	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAGAATATTGTCAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107551269	107550344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_-_107550605_107550667
tx.5301	chr13	-	816	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000049233.8	novel	586	1	NA	NA	-40	298	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAGAATATTGTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107551269	107550345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_-_107551121_107551228
tx.5302	chr13	+	362	2	Intergenic	novelGene_503	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGAGTTGTCACAGAAACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107846594	107848948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_107846783_107848774
tx.5303	chr13	-	611	3	Intergenic	novelGene_504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACCTTCCTATTTCCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108180881	108164188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_-_108164542_108171252_108171369_108180739
tx.5304	chr13	+	1911	3	FSM	ENSMUSG00000071180.6	ENSMUST00000095458.6	1918	3	7	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_1	47	375	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTCCTGAGTTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108180986	108185706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_108181021_108182958_108183103_108183973
tx.5305	chr13	+	2107	3	FSM	ENSMUSG00000071180.6	ENSMUST00000225972.2	2097	3	-10	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	82	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTCCTGAGTTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108181012	108185706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_108181243_108182958_108183103_108183973
tx.5306	chr13	+	2035	3	FSM	ENSMUSG00000071180.6	ENSMUST00000226042.2	1092	3	-10	-933	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	87.5	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTCCTGAGTTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108181009	108185706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_108181168_108182958_108183103_108183973
tx.5307	chr13	+	1878	2	FSM	ENSMUSG00000071180.6	ENSMUST00000224361.2	830	2	13	-1061	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	191	junction_1	0	557	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTCCTGAGTTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108182957	108185706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_108183103_108183973
tx.5308	chr13	-	497	3	ISM	ENSMUSG00000068184.8	ENSMUST00000163558.3	678	4	66998	2	66859	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	548	junction_2	2.5	478	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCCTTCGTATTTCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108228159	108189124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_108189489_108217886_108217928_108228067
tx.5309	chr13	-	615	5	NNC	ENSMUSG00000068184.8	novel	678	4	NA	NA	12	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	252.741345054583	1198	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCCTTCGTATTTCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108295145	108189124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_108189199_108189247_108189489_108217886_108217928_108228067_108228158_108294976
tx.531	chr1	-	1318	4	FSM	ENSMUSG00000067071.9	ENSMUST00000086851.2	1335	4	2	15	2	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_1	18.4932420089069	515	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGGTGTACTGTCATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91340942	91339219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_91340205_91340442_91340525_91340614_91340702_91340778
tx.5310	chr13	-	666	4	FSM	ENSMUSG00000068184.8	ENSMUST00000163558.3	678	4	10	2	10	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	548	junction_2	39.4151691047439	2824	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCCTTCGTATTTCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108295147	108189124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_108189489_108217886_108217928_108228067_108228158_108294976
tx.5311	chr13	+	1645	12	FSM	ENSMUSG00000021694.19	ENSMUST00000054835.15	2111	12	0	466	0	-458	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_3	12.8281714780819	251	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCTCCTTGAGCGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108295271	108331053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_108295405_108297168_108297265_108302923_108303026_108305901_108306026_108309235_108309318_108310525_108310595_108312087_108312155_108314150_108314252_108315105_108315231_108320258_108320457_108323730_108323815_108330589
tx.5312	chr13	+	1538	11	FSM	ENSMUSG00000021694.19	ENSMUST00000123657.8	2395	11	7	850	0	-463	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_2	15.1489273547667	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAACTTGTCTCCTTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108295271	108331048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_108295405_108297168_108297265_108305901_108306026_108309235_108309318_108310525_108310595_108312087_108312155_108314150_108314252_108315105_108315231_108320258_108320457_108323730_108323815_108330589
tx.5313	chr13	+	1485	11	ISM	ENSMUSG00000021694.19	ENSMUST00000054835.15	2111	12	1921	469	1855	-461	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_2	12.1016527796826	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTGTCTCCTTGAGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108297192	108331050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_108297265_108302923_108303026_108305901_108306026_108309235_108309318_108310525_108310595_108312087_108312155_108314150_108314252_108315105_108315231_108320258_108320457_108323730_108323815_108330589
tx.5314	chr13	+	1791	8	NNC	ENSMUSG00000021696.10	novel	4013	8	NA	NA	3	-607	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	37.4045724586758	260	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTGTTGGATTCAATGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108350946	108420000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_108351035_108393200_108393333_108403723_108403919_108407166_108407248_108408338_108408396_108410819_108410926_108416110_108416248_108419005
tx.5315	chr13	+	581	2	FSM	ENSMUSG00000021697.13	ENSMUST00000168037.2	674	2	-10	103	-10	-103	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGGCTTTTGTTGCAATGA	2873	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	108452891	108460908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_108453004_108460439
tx.5316	chr13	+	777	2	NNC	ENSMUSG00000021699.18	novel	2284	15	NA	NA	-47	-47657	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAAAGCAATCTGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	109397140	109423940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_109397480_109423502
tx.5317	chr13	+	863	3	Intergenic	novelGene_505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCTGAGTCCGAGATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	110167895	110171094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_110168031_110169741_110170015_110170639
tx.5318	chr13	-	3120	13	FSM	ENSMUSG00000032745.19	ENSMUST00000047627.14	3694	13	244	330	161	-78	multi-exon	FALSE	canonical	3	874	junction_7	122.771100245765	186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAATGTAGCATGTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111626401	111562543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_111563186_111570081_111570185_111572930_111573119_111574490_111574659_111575637_111575779_111577165_111577351_111584429_111584490_111585466_111585534_111589557_111589782_111589906_111590031_111603384_111603505_111623956_111624905_111626251
tx.5319	chr13	-	3060	12	FSM	ENSMUSG00000032745.19	ENSMUST00000091236.11	3299	12	161	78	161	-78	multi-exon	FALSE	canonical	3	389	junction_6	235.263031976713	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAAATGTAGCATGTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111626401	111562543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_111563186_111570081_111570185_111572930_111573119_111574490_111574659_111575637_111575779_111577165_111577351_111585466_111585534_111589557_111589782_111589906_111590031_111603384_111603505_111623956_111624905_111626251
tx.532	chr1	+	2635	10	NNC	ENSMUSG00000034292.14	novel	3474	15	NA	NA	6575	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	17.1363450300131	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAGTGTATGGACTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91428990	91457024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_91429147_91433144_91433217_91435214_91435306_91447299_91447385_91447777_91447862_91448605_91448730_91448908_91448946_91450552_91450630_91453600_91453825_91455339
tx.5320	chr13	-	1925	2	ISM	ENSMUSG00000032745.19	ENSMUST00000091236.11	3299	12	160	60665	160	-45855	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1177	junction_1	0	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAGTTTTTGAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111626402	111623130	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_111624905_111626251
tx.5321	chr13	+	527	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116016.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCTATCAAGATTCCAACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111654250	111657685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_111654347_111657254
tx.5322	chr13	-	475	2	NNC	ENSMUSG00000085634.3	novel	663	2	NA	NA	17503	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTGTTTTTTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111668942	111658883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_111659245_111668828
tx.5323	chr13	-	694	2	FSM	ENSMUSG00000085634.3	ENSMUST00000132880.3	663	2	-31	0	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTGTTTTTTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111686476	111658883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_111659245_111686143
tx.5324	chr13	+	940	2	Intergenic	novelGene_506	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	196	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	253	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111686577	111688692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_111686713_111687887
tx.5325	chr13	+	485	4	NNC	ENSMUSG00000086649.2	novel	621	4	NA	NA	3	27	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_3	12.0277457017791	26	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGGGGTGAACACAATT	864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111716797	111781391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_111716936_111717450_111717511_111778756_111778863_111781210
tx.5326	chr13	+	1308	3	ISM	ENSMUSG00000086649.2	ENSMUST00000156236.2	621	4	-12	1513	-12	482	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTATGAGTTTTTCTTTTT	849	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	111716782	111779851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_111716936_111717450_111717511_111778756
tx.5327	chr13	+	1787	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000114656.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATATACCCTGCCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112546938	112559931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_112547240_112548578_112548733_112554513_112554635_112558720
tx.5328	chr13	+	1170	2	ISM	ENSMUSG00000021756.13	ENSMUST00000184276.8	3009	18	-115	30914	14	-6426	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	406	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAACAACAAAAAAAGCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112600659	112610165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_112600785_112609120
tx.5329	chr13	+	603	3	ISM	ENSMUSG00000021756.13	ENSMUST00000184276.8	3009	18	-145	29154	15	-4666	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	401	junction_2	2.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTAGTCCTTTTCTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112600629	112611925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_112600785_112609120_112609208_112611564
tx.533	chr1	+	2144	5	ISM	ENSMUSG00000034292.14	ENSMUST00000187588.2	2374	8	2630	0	2630	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_1	4	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTATGGACTGTCAAATTT	5722	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91448613	91457029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_91448730_91448908_91448946_91450552_91450630_91453600_91453825_91455339
tx.5330	chr13	+	2291	6	NNC	ENSMUSG00000021756.13	novel	8678	17	NA	NA	10	491	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_5	158.377523657873	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTGCACGCTCTTCTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112600624	112620641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_112600785_112609120_112609208_112611564_112611644_112616518_112616825_112617957_112618079_112619103
tx.5331	chr13	+	1715	8	ISM	ENSMUSG00000021756.13	ENSMUST00000184276.8	3009	18	-150	13417	10	7512	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	350	junction_7	23.2922865396444	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTTTTTGGTACTAGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112600624	112627662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_112600785_112609120_112609208_112611564_112611644_112616518_112616825_112617957_112618079_112624242_112624404_112625037_112625193_112627016
tx.5332	chr13	+	2807	5	ISM	ENSMUSG00000021756.13	ENSMUST00000184276.8	3009	18	-135	20932	-6	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	401	junction_2	8.38152730712011	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAACACCGTTCCAATATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112600639	112620147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_112600785_112609120_112609208_112611564_112611644_112616518_112616825_112617957
tx.5333	chr13	+	1245	6	NNC	ENSMUSG00000021756.13	novel	3004	6	NA	NA	7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_5	163.571880223955	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCGTTCCAATATTATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112600652	112620150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_112600785_112609120_112609208_112611564_112611644_112616518_112616825_112617957_112618079_112619630
tx.5334	chr13	-	734	2	ISM	ENSMUSG00000021758.15	ENSMUST00000075748.7	2762	21	52649	0	52649	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCCAACAGCATTTTTC	9892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112736186	112734866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_112735566_112736151
tx.5335	chr13	-	2902	22	FSM	ENSMUSG00000021758.15	ENSMUST00000099166.10	3012	22	112	-2	-62	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_3	9.06389513461723	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTCCAACAGCATTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112788897	112734866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_112735566_112736151_112736269_112736385_112736657_112737945_112738046_112741020_112741167_112748508_112748676_112750230_112750361_112757149_112757305_112757741_112757895_112758698_112758842_112759191_112759240_112759332_112759381_112761314_112761357_112761878_112761960_112762855_112762958_112765371_112765432_112770418_112770470_112772501_112772580_112777683_112777762_112781042_112781101_112787865_112787953_112788809
tx.5336	chr13	+	1177	2	ISM	ENSMUSG00000047789.6	ENSMUST00000223674.2	2063	3	-14	3028	1	519	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GGAAAAGAAAAGAAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112797300	112807191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_112797407_112806120
tx.5337	chr13	+	320	2	Intergenic	novelGene_507	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTGGATTTGGACTCAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112891652	112892114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_112891849_112891990
tx.5338	chr13	+	1574	6	FSM	ENSMUSG00000021759.15	ENSMUST00000016144.12	1598	6	15	9	15	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	199	junction_2	66.7730484551964	523	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGGGAAGCGTTTGTAGT	9652	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112937340	113004419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_112937801_112971392_112971548_112993279_112993561_112996177_112996236_113003329_113003507_113003976
tx.5339	chr13	+	1571	6	FSM	ENSMUSG00000021759.15	ENSMUST00000070951.8	1272	6	-56	-243	15	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	139.137342219837	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGGGAAGCGTTTGTAGT	9652	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112937340	113004419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_112937801_112987936_112988089_112993279_112993561_112996177_112996236_113003329_113003507_113003976
tx.534	chr1	+	1369	5	FSM	ENSMUSG00000026311.17	ENSMUST00000086843.11	2490	5	151	970	-19	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	3.93700393700591	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTCTCTGTTTTGGATTCT	8936	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91468416	91482840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_91468587_91471877_91472020_91474649_91474953_91479775_91480162_91482472
tx.5340	chr13	+	1420	5	NIC	ENSMUSG00000021759.15	novel	1598	6	NA	NA	14	-9	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	68	junction_1	115.720298565118	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGGGAAGCGTTTGTAGT	9651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112937339	113004419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_112937801_112993279_112993561_112996177_112996236_113003329_113003507_113003976
tx.5341	chr13	-	285	2	ISM	ENSMUSG00000016018.5	ENSMUST00000223559.2	498	4	3948	-83	3948	83	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	648	junction_1	0	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGTGACAGGCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113005605	113004305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_113004530_113005544
tx.5342	chr13	-	657	5	ISM	ENSMUSG00000016018.5	ENSMUST00000022281.5	3689	27	50855	354	-68	83	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	630	junction_4	32.7060774168961	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGTGACAGGCTTCATT	8943	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113013077	113004305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_113004530_113005544_113005650_113009432_113009596_113011129_113011187_113012969
tx.5343	chr13	-	704	6	ISM	ENSMUSG00000016018.5	ENSMUST00000022281.5	3689	27	46371	354	500	83	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	630	junction_4	30.5195019618604	179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGTGACAGGCTTCATT	4459	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113017561	113004305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_113004530_113005544_113005650_113009432_113009596_113011129_113011187_113012969_113013076_113017512
tx.5344	chr13	-	3330	27	FSM	ENSMUSG00000016018.5	ENSMUST00000022281.5	3689	27	5	354	5	83	multi-exon	TRUE	canonical	3	524	junction_21	59.6473487509525	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAGTGACAGGCTTCATT	7241	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113063927	113004305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_113004530_113005544_113005650_113009432_113009596_113011129_113011187_113012969_113013076_113017512_113017677_113019633_113019823_113023288_113023400_113023968_113024098_113027812_113027882_113028421_113028595_113032006_113032158_113035298_113035425_113038006_113038109_113039932_113040044_113041519_113041600_113043518_113043651_113045428_113045532_113046349_113046449_113047443_113047569_113049633_113049725_113050889_113051065_113054122_113054236_113055101_113055165_113056893_113056961_113058163_113058302_113063763
tx.5345	chr13	+	1077	3	FSM	ENSMUSG00000042426.7	ENSMUST00000223866.2	1736	3	24	635	24	-635	multi-exon	FALSE	canonical	3	291	junction_2	16	217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATGTGTACTTAAATTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113064205	113068076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_113064508_113066160_113066235_113067375
tx.5346	chr13	+	764	5	ISM	ENSMUSG00000042426.7	ENSMUST00000224176.2	1272	8	220	8500	26	1052	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	291	junction_2	20.0499376557634	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GTAATTTTTTAAAAAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113064207	113069763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_113064508_113066160_113066235_113067375_113067490_113069040_113069171_113069617
tx.5347	chr13	+	1151	7	NNC	ENSMUSG00000042426.7	novel	1272	8	NA	NA	29	2112	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_6	118.452522134398	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTTGCCCTGATCTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113064210	113074350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_+_113064508_113066160_113066235_113067375_113067490_113069040_113069171_113069617_113069764_113072002_113072132_113074089
tx.5348	chr13	-	932	3	NNC	ENSMUSG00000021760.6	novel	1042	3	NA	NA	-4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	10.5	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCATTTTTTTTTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113182931	113179286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_113179834_113182068_113182228_113182705
tx.5349	chr13	-	1043	3	FSM	ENSMUSG00000021760.6	ENSMUST00000022282.6	1042	3	5	-6	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	4	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGCATTTTTTTTTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113182939	113179286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_113179834_113181965_113182228_113182705
tx.535	chr1	-	1150	6	ISM	ENSMUSG00000026313.17	ENSMUST00000189303.7	3287	23	51541	-216	20187	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_3	7.66811580507233	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAACTGGACAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91883036	91860463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_91861109_91861377_91861520_91862323_91862409_91873621_91873756_91875139_91875259_91883011
tx.5350	chr13	+	379	2	Intergenic	novelGene_508	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTTTAATTTCTCCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113425126	113426146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_113425260_113425900
tx.5351	chr13	-	2913	2	NNC	ENSMUSG00000042364.12	novel	4447	2	NA	NA	7348	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCATCGCTTGTCTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113742829	113728719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_113731399_113742595
tx.5352	chr13	+	487	2	Intergenic	novelGene_510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113855102	113860379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_113855377_113860166
tx.5353	chr13	+	1645	3	Intergenic	novelGene_511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	12	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTTTTGTAACTTAGTCTG	1863	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113872542	113876379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_113872828_113872948_113873083_113875153
tx.5354	chr13	+	1512	2	Intergenic	novelGene_512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTGTAACTTAGTCTGA	1863	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113872542	113876380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_113872828_113875153
tx.5355	chr13	+	3357	5	FSM	ENSMUSG00000042348.11	ENSMUST00000091201.7	3364	5	3	4	3	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	349	junction_1	23.636571240347	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGCGTTTCCTGACTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113931043	114293993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_113931233_114058782_114058928_114070599_114070660_114104117_114104327_114291239
tx.5356	chr13	+	500	2	ISM	ENSMUSG00000042348.11	ENSMUST00000224068.2	1002	4	-108	232713	9	-232713	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	349	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATATTAGCACGGACTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113931049	114059099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_113931233_114058782
tx.5357	chr13	+	1246	2	Intergenic	novelGene_513	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTTGTTTCACCATTTTC	78	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114335152	114349164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_114335276_114348041
tx.5358	chr13	+	251	2	Intergenic	novelGene_514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCAGTGCTCTGACGTGAA	98	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114335172	114336657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr13_+_114335276_114336509
tx.5359	chr13	-	293	2	ISM	ENSMUSG00000021764.9	ENSMUST00000225707.2	686	6	80159	0	80159	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1600	junction_1	0	439	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTACACTTGGCAGTTTCTA	NA	False	NA	-60	True	NA	NA	NA	114444426	114425183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_114425403_114444352
tx.536	chr1	-	1467	10	FSM	ENSMUSG00000026260.13	ENSMUST00000027478.7	2020	10	77	476	-16	-207	multi-exon	FALSE	canonical	3	1166	junction_5	87.5025220095095	998	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGTGTCTGCGTGGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92401505	92367207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_92367630_92379732_92379842_92388101_92388188_92390012_92390068_92390799_92390880_92392082_92392205_92395102_92395190_92397584_92397801_92398538_92398708_92401384
tx.5360	chr13	-	667	5	FSM	ENSMUSG00000021764.9	ENSMUST00000022286.8	1698	5	178	853	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1521	junction_3	83.4187478927849	23377	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTACACTTGGCAGTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114524616	114425183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_114425403_114444352_114444427_114453392_114453566_114487983_114488063_114524494
tx.5361	chr13	-	588	4	FSM	ENSMUSG00000021764.9	ENSMUST00000225035.2	571	4	-17	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_3	707.770364517256	1275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTACACTTGGCAGTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114524616	114425183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_114425403_114444352_114444427_114453392_114453566_114524494
tx.5362	chr13	+	1079	6	FSM	ENSMUSG00000015536.15	ENSMUST00000166176.9	1855	6	-12	788	3	11	multi-exon	TRUE	canonical	3	20	junction_1	59.3450924677011	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTTTAGTCAATGATAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114954782	114965278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_114954860_114957337_114957483_114961102_114961231_114961746_114961898_114962693_114962818_114964824
tx.5363	chr13	+	1081	7	NIC	ENSMUSG00000015536.15	novel	1193	7	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	8	junction_5	58.0672502840935	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGATCCTGTCTCCTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114954793	114965265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_114954860_114955871_114955994_114957337_114957483_114961102_114961231_114961746_114961802_114962693_114962818_114964824
tx.5364	chr13	+	1197	7	FSM	ENSMUSG00000015536.15	ENSMUST00000166104.9	1193	7	15	-19	-7	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_2	16.9844700306551	503	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTTTAGTCAATGATAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114954786	114965278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_114954860_114955871_114955994_114957337_114957483_114961102_114961231_114961746_114961898_114962693_114962818_114964824
tx.5365	chr13	-	1611	2	FSM	ENSMUSG00000042275.10	ENSMUST00000109226.5	1600	2	-11	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTCTAGTTCGAGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115226733	115224890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_115225498_115225729
tx.5366	chr13	-	769	2	NNC	ENSMUSG00000042275.10	novel	1600	2	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTCTAGTTCGAGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	115226734	115224890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr13_-_115225498_115226572
tx.5367	chr13	+	2256	9	FSM	ENSMUSG00000021728.9	ENSMUST00000022242.9	2923	9	353	314	-91	-314	multi-exon	FALSE	canonical	3	356	junction_8	42.5617198900608	707	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCCCTTGTGCTGCTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	117357160	117410637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_117357494_117369262_117369353_117385807_117386001_117386236_117386323_117400930_117401059_117403855_117404136_117405465_117405500_117408580_117408636_117409580
tx.5368	chr13	-	1198	5	FSM	ENSMUSG00000021731.11	ENSMUST00000022245.10	3319	5	417	1704	-154	-1704	multi-exon	FALSE	canonical	3	1748	junction_3	110.939172522604	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATAACAGTATTGGGCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118523371	118516620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_118517206_118519411_118519589_118521102_118521209_118521769_118521916_118523187
tx.5369	chr13	+	2166	3	FSM	ENSMUSG00000021732.15	ENSMUST00000022246.9	4114	3	-69	2017	-69	764	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	4	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCTCTCTCTCTCCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118851165	118926634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_118852248_118918041_118918146_118925654
tx.537	chr1	-	402	3	FSM	ENSMUSG00000073616.11	ENSMUST00000097642.4	438	3	24	12	24	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	610	junction_1	1	10400	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGATTTTAATTCCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92569683	92564878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_92565126_92567408_92567482_92569601
tx.5370	chr13	-	844	4	FSM	ENSMUSG00000025453.19	ENSMUST00000144599.2	1885	4	-183	1224	-183	-1224	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_3	27.3536509852382	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACAGTTCTGGCGATGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119545716	119531231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_119531365_119533282_119533513_119541087_119541291_119545438
tx.5371	chr13	+	1617	11	FSM	ENSMUSG00000025451.16	ENSMUST00000109203.9	1525	11	-92	0	-92	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_1	94.7694043454954	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTGCTAGCTGGTTAGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119565044	119593927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_119565177_119566695_119566866_119574504_119574691_119577294_119577408_119582272_119582385_119584250_119584377_119586439_119586547_119587231_119587350_119588327_119588383_119592231_119592326_119593523
tx.5372	chr13	+	928	4	FSM	ENSMUSG00000062822.9	ENSMUST00000224081.2	978	4	-7	57	-1	-57	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	38.4389848403357	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCAGATGTGGAAATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119599302	119606304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_119599656_119602609_119602841_119603402_119603493_119606050
tx.5373	chr13	+	2541	13	FSM	ENSMUSG00000062822.9	ENSMUST00000026519.10	2565	13	24	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_1	23.5189049253763	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTATTTCATTTCTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119599327	119622653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_119599656_119602546_119602841_119603402_119603493_119606050_119606698_119608674_119608777_119610368_119610493_119611368_119611461_119612472_119612543_119614219_119614391_119615963_119616059_119617470_119617567_119620988_119621030_119622262
tx.5374	chr13	+	988	4	ISM	ENSMUSG00000062822.9	ENSMUST00000026519.10	2565	13	0	16351	0	-59	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_1	22.7596133534821	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGCAGATGTGGAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119599303	119606302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_119599656_119602546_119602841_119603402_119603493_119606050
tx.5375	chr13	+	2494	13	NIC	ENSMUSG00000062822.9	novel	2565	13	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	42	junction_1	29.2546292633035	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTATTTCATTTCTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119599311	119622653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr13_+_119599656_119602609_119602841_119603402_119603493_119606050_119606698_119608674_119608777_119610368_119610493_119611368_119611461_119612472_119612543_119614219_119614391_119615963_119616059_119617470_119617567_119620988_119621030_119622262
tx.5376	chr13	-	848	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000074635.4	novel	1133	1	NA	NA	17	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCCGGGTCTGTCTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119624902	119623792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr13_-_119624160_119624421
tx.5377	chr13	+	926	5	ISM	ENSMUSG00000093930.3	ENSMUST00000224188.2	3464	11	-76	7028	9	-954	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_1	226.961863536586	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGAAAGGTGGGTTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120151923	120162768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_120152050_120156524_120156584_120161199_120161658_120162043_120162170_120162611
tx.5378	chr13	+	484	3	ISM	ENSMUSG00000093930.3	ENSMUST00000224188.2	3464	11	-70	8292	15	242	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_1	26.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAAATCGAAATCAGTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120151929	120161504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_120152050_120156524_120156584_120161199
tx.5379	chr13	+	3283	10	FSM	ENSMUSG00000093930.3	ENSMUST00000179869.3	3245	10	-38	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	428	junction_1	79.8526420630178	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCAGCTCTTTGAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120151943	120169618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_120152050_120161199_120161658_120162043_120162170_120162611_120162777_120164070_120164237_120165055_120165227_120165960_120166068_120166592_120166719_120166883_120167048_120167924
tx.538	chr1	+	1295	2	FSM	ENSMUSG00000047067.8	ENSMUST00000060913.8	1314	2	22	-3	22	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGAGTTGCTCTTTATGGTT	2877	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92834724	92836160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_92835146_92835286
tx.5380	chr13	+	3338	11	FSM	ENSMUSG00000093930.3	ENSMUST00000224188.2	3464	11	-52	178	33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_1	180.959553491934	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCAGCTCTTTGAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120151947	120169618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_+_120152050_120156524_120156584_120161199_120161658_120162043_120162170_120162611_120162777_120164070_120164237_120165055_120165227_120165960_120166068_120166592_120166719_120166883_120167048_120167924
tx.5381	chr13	+	1817	2	ISM	ENSMUSG00000093930.3	ENSMUST00000179869.3	3245	10	14943	0	14925	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	654	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCAGCTCTTTGAGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120166924	120169618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_120167048_120167924
tx.5382	chr13	-	1263	3	ISM	ENSMUSG00000095930.2	ENSMUST00000178142.2	4103	4	28189	1822	10701	-1822	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_2	4	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCTTAGCCTAAAAGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120189229	120173451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_120174332_120175643_120175913_120189115
tx.5383	chr13	+	820	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000095930.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACGCCAGCATTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120203497	120207621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_120203732_120204509_120204630_120207155
tx.5384	chr13	+	616	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000095930.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	30	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCACGCCAGCATTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120204479	120207621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr13_+_120204630_120207155
tx.5385	chr13	-	453	4	FSM	ENSMUSG00000094870.9	ENSMUST00000224946.2	1783	4	451	879	414	-74	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_3	5.73488351136175	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGCAGAAACTTCAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120251823	120237918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr13_-_120237986_120244307_120244453_120250395_120250498_120251684
tx.5386	chr13	-	493	5	ISM	ENSMUSG00000094870.9	ENSMUST00000178271.3	2966	8	-13	11197	-13	-75	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_4	53.3479146733966	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTGCAGAAACTTCAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120252355	120237919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_120237986_120244307_120244453_120250395_120250498_120251684_120251824_120252314
tx.5387	chr13	-	755	5	ISM	ENSMUSG00000094870.9	ENSMUST00000223722.2	3109	7	-233	11196	-233	-75	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_4	61.5441914399726	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTGCAGAAACTTCAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120252658	120237919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_-_120237986_120244307_120244453_120250395_120250498_120251684_120251824_120252355
tx.5388	chr13	+	913	2	ISM	ENSMUSG00000094796.3	ENSMUST00000225029.2	1595	5	7352	-64	-402	64	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGTTCTTCTTAAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120769279	120770379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr13_+_120769467_120769653
tx.5389	chr14	+	414	3	ISM	ENSMUSG00000058317.13	ENSMUST00000151926.8	666	5	8	284606	8	14873	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	67.5	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTACTTCGGTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3576289	3598202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_3576469_3581246_3581431_3598151
tx.539	chr1	+	2533	12	FSM	ENSMUSG00000026270.12	ENSMUST00000027488.11	2902	12	369	0	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_4	15.6743724089108	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGATTAGTCTTGTTCCAAA	2629	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92862466	92875663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_92862737_92865666_92865799_92867044_92867242_92868004_92868223_92870203_92870346_92871021_92871189_92871400_92871664_92872416_92872620_92872738_92873001_92874495_92874696_92874936_92874983_92875230
tx.5390	chr14	+	362	2	FSM	ENSMUSG00000058317.13	ENSMUST00000144873.2	2135	2	-126	1899	9	-1899	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGCCAGCCGTTGTTAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3576290	3581430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_3576469_3581246
tx.5391	chr14	-	1012	4	FSM	ENSMUSG00000021772.16	ENSMUST00000132374.9	4598	4	29	3557	-21	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_3	10.6144555520604	586	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGAACTCTTCCAGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4198531	4189249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_4189750_4191150_4191393_4192889_4193001_4198372
tx.5392	chr14	-	693	2	ISM	ENSMUSG00000021772.16	ENSMUST00000022294.15	1199	5	7123	-6	7086	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_1	0	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGGGAACTCTTCCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4191346	4189252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_4189750_4191150
tx.5393	chr14	-	853	3	ISM	ENSMUSG00000021772.16	ENSMUST00000132374.9	4598	4	5557	3560	5429	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_2	11	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGGGAACTCTTCCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4193003	4189252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_4189750_4191150_4191393_4192889
tx.5394	chr14	+	739	4	FSM	ENSMUSG00000012405.17	ENSMUST00000080281.14	1922	4	46	1137	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8735	junction_1	3197.35060462391	52647	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGCTTAAAGGTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4198674	4200736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_4198738_4199235_4199418_4199652_4199790_4200379
tx.5395	chr14	+	836	4	FSM	ENSMUSG00000012405.17	ENSMUST00000079419.12	883	4	47	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1636	junction_1	5972.09066315046	16247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGCTTAAAGGTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4198713	4200736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_4198874_4199235_4199418_4199652_4199790_4200379
tx.5396	chr14	+	810	4	FSM	ENSMUSG00000012405.17	ENSMUST00000100799.9	802	4	-8	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	877	junction_1	6301.70655898508	8917	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGCTTAAAGGTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4198717	4200736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_4198852_4199235_4199418_4199652_4199790_4200379
tx.5397	chr14	+	1813	3	FSM	ENSMUSG00000012405.17	ENSMUST00000112598.9	802	3	164	-1175	164	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	10327	junction_1	2922.5	1761	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTATGTTATCTTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4199233	4201871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_4199418_4199652_4199790_4200379
tx.5398	chr14	-	749	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000114243.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATGTTTAGTTTGATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6155420	6109671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_6110307_6155306
tx.5399	chr14	-	2536	12	FSM	ENSMUSG00000021785.9	ENSMUST00000022310.7	2935	12	27	372	-20	22	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_2	12.9506373690434	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTGCCTAAAAATTGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6220456	6158208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_6158905_6159271_6159450_6175089_6175276_6178827_6178993_6186289_6186401_6187877_6188024_6188948_6189071_6191741_6191965_6199122_6199289_6208962_6209200_6215006_6215122_6220265
tx.54	chr1	-	904	7	FSM	ENSMUSG00000043716.14	ENSMUST00000058437.14	1163	7	259	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5309	junction_1	773.772953348289	205759	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCGGAGTCTTTGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16174627	16171518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_16171584_16171950_16172161_16172713_16172824_16172915_16173054_16173391_16173559_16173733_16173909_16174588
tx.540	chr1	+	1302	4	FSM	ENSMUSG00000026270.12	ENSMUST00000117814.8	1268	4	-33	-1	-33	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_1	7.1336448530109	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCGGACCTGCTGTGGTT	2617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92862454	92868695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_92862737_92865666_92865799_92867044_92867242_92868004
tx.5400	chr14	-	1435	4	ISM	ENSMUSG00000021785.9	ENSMUST00000153109.2	3296	5	-27	11940	20	374	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_2	8.52447456836295	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTTTTTTTTTGCCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6220463	6198403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_6199289_6208962_6209200_6215006_6215122_6220265
tx.5401	chr14	+	1497	3	FSM	ENSMUSG00000021786.14	ENSMUST00000112624.3	1586	3	4	85	4	-85	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	10	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATGTAGATATGTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6220592	6229132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_6220642_6226964_6227973_6228692
tx.5402	chr14	+	1531	3	FSM	ENSMUSG00000021786.14	ENSMUST00000112625.9	3434	3	-8	1911	-8	-52	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	6.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTTAGCACAATTGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6226423	6229165	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_6226474_6226964_6227973_6228692
tx.5403	chr14	-	2343	2	FSM	ENSMUSG00000021733.12	ENSMUST00000224197.2	679	2	-18	-1646	-15	1646	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACAGCAGCAGAGTGGCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7766713	7738449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_7740562_7766482
tx.5404	chr14	+	653	3	Intergenic	novelGene_237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	7.5	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGCTTTGTCTTGGTTCCTT	6878	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8013474	8018481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_8013751_8017395_8017543_8018251
tx.5405	chr14	-	408	4	NIC	ENSMUSG00000068758.9	novel	1128	10	NA	NA	1072	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_3	14.1656862405839	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTGTGCTGCTATCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8119070	8114269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_8114394_8114689_8114757_8117743_8117847_8118956
tx.5406	chr14	-	573	4	NIC	ENSMUSG00000068758.9	novel	1128	10	NA	NA	368	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_3	13.2748718344933	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTGTGCTGCTATCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8119774	8114269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_8114394_8114689_8114757_8117743_8117847_8119495
tx.5407	chr14	-	728	6	NIC	ENSMUSG00000068758.9	novel	1128	10	NA	NA	358	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_5	12.5793481548131	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCCTGTGCTGCTATCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8119784	8114269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_8114394_8114689_8114757_8117743_8117847_8118598_8118714_8118795_8118826_8119495
tx.5408	chr14	+	1076	3	FSM	ENSMUSG00000114883.2	ENSMUST00000224991.2	1104	3	31	-3	31	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTCTTGGTATTTTTAAA	4313	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8122529	8141762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_8122621_8140289_8140478_8140965
tx.5409	chr14	+	1337	8	FSM	ENSMUSG00000021737.5	ENSMUST00000022256.5	1387	8	39	11	-12	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	1151	junction_1	36.7689975886408	5352	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGTTTAATTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8348817	8357578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_8349025_8349570_8349777_8352792_8352939_8353159_8353380_8353506_8353616_8355471_8355641_8357159_8357238_8357376
tx.541	chr1	+	1815	9	ISM	ENSMUSG00000026270.12	ENSMUST00000027488.11	2902	12	6028	-2	-55	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_1	7.88986691902975	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTAGTCTTGTTCCAAAAA	2931	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92868125	92875665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_92868223_92870203_92870346_92871021_92871189_92871400_92871664_92872416_92872620_92872738_92873001_92874495_92874696_92874936_92874983_92875230
tx.5410	chr14	+	957	7	ISM	ENSMUSG00000021737.5	ENSMUST00000022256.5	1387	8	965	11	87	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1215	junction_2	21.7025344142107	992	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGTTTAATTTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8349743	8357578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_8349777_8352792_8352939_8353159_8353380_8353506_8353616_8355471_8355641_8357159_8357238_8357376
tx.5411	chr14	+	923	8	FSM	ENSMUSG00000053453.10	ENSMUST00000065865.10	937	8	12	2	-5	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	370	junction_1	118.776758531907	2535	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTTTGTGCTCATTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8508497	8520749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_8508579_8515106_8515225_8516224_8516353_8516600_8516688_8518499_8518558_8519397_8519465_8519561_8519632_8520435
tx.5412	chr14	+	1071	9	NIC	ENSMUSG00000053453.10	novel	951	9	NA	NA	-7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	66	junction_1	272.312292001298	257	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTTTGTGCTCATTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8508521	8520749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_8508579_8512131_8512304_8515106_8515225_8516224_8516353_8516600_8516688_8518499_8518558_8519397_8519465_8519561_8519632_8520435
tx.5413	chr14	+	715	6	ISM	ENSMUSG00000053453.10	ENSMUST00000225401.2	951	9	7686	0	1094	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	621	junction_3	39.4035531392792	925	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTTTGTGCTCATTCAAA	NA	False	NA	-85	True	NA	NA	NA	8516233	8520749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_8516353_8516600_8516688_8518499_8518558_8519397_8519465_8519561_8519632_8520435
tx.5414	chr14	-	1195	5	FSM	ENSMUSG00000033111.17	ENSMUST00000225294.2	1191	5	-4	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_4	54.4196655631032	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACGGCCCTCTTGAGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10185509	10167783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_10168616_10172106_10172182_10182369_10182494_10184294_10184379_10185429
tx.5415	chr14	-	1158	5	FSM	ENSMUSG00000033111.17	ENSMUST00000163392.3	2452	5	40	1254	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_4	38.2295697072306	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCACGGCCCTCTTGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10185550	10167785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_10168616_10172106_10172182_10182369_10182494_10184294_10184379_10185505
tx.5416	chr14	+	916	2	Intergenic	novelGene_239	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTGTAAGCGTCTGGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10933461	10938507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_10933671_10937800
tx.5417	chr14	+	212	2	ISM	ENSMUSG00000060579.14	ENSMUST00000161302.8	860	7	4	871396	4	-551381	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCTGTAAAAGAAGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12016318	12048285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_12016405_12048159
tx.5418	chr14	+	1608	2	Intergenic	novelGene_240	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTTCTTTCATTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12258497	12260345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_12258865_12259104
tx.5419	chr14	+	651	5	ISM	ENSMUSG00000060579.14	ENSMUST00000179394.8	453	6	551422	-301	551422	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	3	junction_2	1.22474487139159	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTGGTGTTCTGGAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12599597	12919681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_12599744_12607726_12607757_12705964_12706034_12896261_12896361_12919374
tx.542	chr1	-	1257	3	ISM	ENSMUSG00000026273.14	ENSMUST00000027492.14	1366	4	806	21	754	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_2	4	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGGGGGTGCAACCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93232831	93228947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_93229518_93230439_93230625_93232329
tx.5420	chr14	+	1178	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000045799.7	novel	336	1	NA	NA	-183	706	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTTTACAGTGTTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13669254	13670479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_13669618_13669664
tx.5421	chr14	+	1155	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000045799.7	novel	336	1	NA	NA	-182	706	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATTTTACAGTGTTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13669255	13670479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_13669596_13669664
tx.5422	chr14	+	1163	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000045799.7	novel	336	1	NA	NA	-182	705	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATTTTACAGTGTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13669255	13670478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_13669654_13669713
tx.5423	chr14	+	951	4	ISM	ENSMUSG00000021747.13	ENSMUST00000225744.2	2390	13	-14	141558	-13	-141558	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	157	junction_2	15.5134350376268	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACTTTTAGTCAGTTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13803519	13825794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_13803796_13807424_13807515_13810290_13810385_13825303
tx.5424	chr14	+	1800	4	FSM	ENSMUSG00000021750.17	ENSMUST00000120411.9	2093	4	297	-4	297	4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.4142135623731	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCAGCACTGTTACCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14152046	14172221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_14152269_14168539_14168715_14170106_14170264_14170975
tx.5425	chr14	-	1499	3	FSM	ENSMUSG00000021752.15	ENSMUST00000022272.14	1650	3	151	0	151	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_1	7.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTAAAGGTTGTATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14255482	14246209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_14247587_14249552_14249623_14255430
tx.5426	chr14	-	1569	3	NNC	ENSMUSG00000021752.15	novel	1650	3	NA	NA	332	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_2	110.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTAAAGGTTGTATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14255301	14246209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_14247587_14249552_14249623_14255179
tx.5427	chr14	+	1450	10	FSM	ENSMUSG00000021748.10	ENSMUST00000022268.10	1513	10	63	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2290	junction_6	170.664134819183	8250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAGTCTTGGAGTACTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14296810	14303777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_14296883_14296955_14297010_14298242_14298351_14298443_14298507_14298597_14298634_14299326_14299613_14299953_14300065_14300336_14300429_14302918_14303061_14303291
tx.5428	chr14	-	2771	18	FSM	ENSMUSG00000033885.16	ENSMUST00000036682.9	2812	18	38	3	-3	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	68	junction_2	18.5091392369855	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGTTGTAGCTTTGCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14371524	14304658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_14305839_14314427_14314488_14317622_14317693_14318191_14318279_14318768_14318847_14321644_14321694_14323500_14323580_14325061_14325180_14325535_14325698_14328228_14328331_14329026_14329132_14331708_14331784_14332353_14332428_14332826_14332905_14338982_14339170_14347380_14347429_14349901_14349953_14371356
tx.5429	chr14	-	2785	18	FSM	ENSMUSG00000033885.16	ENSMUST00000225653.2	2765	18	-17	-3	-14	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_2	21.2781870861862	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGTTGTAGCTTTGCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14371535	14304658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_14305839_14314427_14314491_14317622_14317693_14318191_14318279_14318768_14318847_14321644_14321694_14323500_14323580_14325061_14325180_14325535_14325698_14328228_14328331_14329026_14329132_14331708_14331784_14332353_14332428_14332826_14332905_14338982_14339170_14347380_14347429_14349901_14349953_14371356
tx.543	chr1	-	1302	4	FSM	ENSMUSG00000026273.14	ENSMUST00000027492.14	1366	4	43	21	7	-21	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_3	7.36357401145817	573	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCAGGGGGTGCAACCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93233594	93228947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_93229518_93230439_93230625_93232329_93232829_93233546
tx.5430	chr14	-	1199	6	FSM	ENSMUSG00000023156.5	ENSMUST00000023924.4	2401	6	-35	1237	-35	43	multi-exon	FALSE	canonical	3	219	junction_4	6.88767014308903	1020	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATCAAATGACACCCGGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14389441	14379175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_14379866_14380975_14381055_14382232_14382310_14385771_14385857_14385978_14386066_14389260
tx.5431	chr14	-	946	5	ISM	ENSMUSG00000023156.5	ENSMUST00000023924.4	2401	6	3400	1250	3400	30	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_4	7.58287544405155	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTGCTCTTATTATCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14386006	14379188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_14379866_14380975_14381055_14382232_14382310_14385771_14385857_14385978
tx.5432	chr14	-	1496	9	FSM	ENSMUSG00000025277.15	ENSMUST00000166497.9	2226	9	-1	731	-1	-633	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_8	7.63216876123687	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTGTTGCTTCCGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14466872	14413740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_14414303_14419864_14419966_14420144_14420200_14424147_14424306_14426946_14427080_14428540_14428655_14429868_14430026_14441383_14441537_14466809
tx.5433	chr14	-	1339	8	FSM	ENSMUSG00000025277.15	ENSMUST00000225234.2	1958	8	-16	635	1	-635	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_7	23.7589940005541	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTGTTGTTGCTTCCGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14466870	14413742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_14414303_14419864_14419966_14420144_14420200_14424147_14424306_14426946_14427080_14428540_14428655_14429868_14430026_14466809
tx.5434	chr14	-	2120	6	NNC	ENSMUSG00000025278.10	novel	9100	46	NA	NA	52551	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_5	247.863349448845	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTCCCTGTCATTCTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14532481	14518184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_14519469_14521125_14521330_14523759_14523979_14527551_14527729_14530593_14530727_14532378
tx.5435	chr14	+	1458	3	Fusion	ENSMUSG00000093985.8_ENSMUSG00000091472.3	novel	1813	6	NA	NA	-171	-9009	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTGGACAGAATGAATTGTT	5760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15154552	15454649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_+_15154809_15447079_15447231_15453598
tx.5436	chr14	+	943	5	FSM	ENSMUSG00000094021.8	ENSMUST00000169215.8	984	5	55	-14	55	14	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGTGTATGCTTCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15424857	15433252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_15424996_15425726_15425890_15426844_15426977_15427652_15427837_15432926
tx.5437	chr14	+	1637	4	NNC	ENSMUSG00000090691.4	novel	2053	7	NA	NA	-177	-9033	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	11.0855260988773	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGACAGAATGTATTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15579633	15592238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_15579954_15581334_15581449_15584666_15584818_15591186
tx.5438	chr14	+	941	5	NNC	ENSMUSG00000095797.9	novel	1753	5	NA	NA	-8	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3.35410196624968	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGCAGTGTATGCTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16991934	17000333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_16992073_16992803_16992967_16993921_16994054_16994729_16994914_17000009
tx.5439	chr14	-	2100	8	NNC	ENSMUSG00000094132.8	novel	882	7	NA	NA	-5	1062	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	10.6961751699056	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTATGCTTCAGCTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17614202	17592859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_17593998_17596548_17596732_17597407_17597540_17598489_17598653_17599386_17599522_17609286_17609438_17612629_17612744_17614118
tx.544	chr1	+	1319	10	FSM	ENSMUSG00000026275.14	ENSMUST00000027494.11	10315	10	783	8213	-18	-8213	multi-exon	FALSE	canonical	3	496	junction_6	62.1028617061949	2179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATGAAAGTTATTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93271358	93292998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_93271434_93273877_93274010_93278046_93278103_93278670_93278737_93279227_93279359_93280238_93280402_93282050_93282168_93285478_93285584_93288447_93288535_93292611
tx.5440	chr14	-	2123	8	NNC	ENSMUSG00000094132.8	novel	882	7	NA	NA	-33	1057	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	10.6961751699056	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCAGTGTATGCTTCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17614230	17592864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_17593998_17596548_17596732_17597407_17597540_17598489_17598653_17599386_17599522_17609286_17609438_17612629_17612744_17614118
tx.5441	chr14	-	1139	2	ISM	ENSMUSG00000079391.11	ENSMUST00000164512.8	1990	7	-2	16459	-2	-16459	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAAATGTCCTCATAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18287199	18281336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_18282389_18287112
tx.5442	chr14	-	2116	9	NNC	ENSMUSG00000091563.9	novel	1961	7	NA	NA	-91689	5	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	2.27760839478607	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTATGCTTCTGCGTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18450936	18336983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_18338138_18341636_18341820_18342497_18342630_18343579_18343743_18344474_18344610_18354336_18354488_18357666_18357781_18359162_18359171_18450860
tx.5443	chr14	-	1960	8	Fusion	ENSMUSG00000079402.10_ENSMUSG00000096793.8	novel	1955	7	NA	NA	21	0	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.49897938350513	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGTGTATGCTTCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18817722	18639087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_-_18640221_18642105_18642289_18642964_18643097_18644049_18644213_18654751_18654903_18658123_18658238_18659614_18659670_18817693
tx.5444	chr14	-	1723	5	Fusion	ENSMUSG00000079402.10_ENSMUSG00000096793.8	novel	1955	7	NA	NA	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.1650635094611	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGTGTATGCTTCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18817750	18639087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_-_18640221_18642105_18642289_18642964_18643097_18644049_18644213_18817638
tx.5445	chr14	-	373	3	NNC	ENSMUSG00000096488.2	novel	1933	7	NA	NA	-33	189074	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATAAGCTCTCCTGGTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19057192	18846898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_18847020_19055566_19055681_19057054
tx.5446	chr14	-	1971	8	Fusion	ENSMUSG00000095195.8_ENSMUSG00000096488.2	novel	1955	7	NA	NA	20	0	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1.74963553055941	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCAGTGTATGCTTCTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19057139	18875552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_-_18876696_18880194_18880378_18881053_18881186_18882135_18882299_18892819_18892971_18896174_18896289_18897665_18897721_19057109
tx.5447	chr14	-	1732	5	Fusion	ENSMUSG00000095195.8_ENSMUSG00000096488.2	novel	1955	7	NA	NA	-4	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.6393596310755	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTATGCTTCTGCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19057163	18875550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_-_18876696_18880194_18880378_18881053_18881186_18882135_18882299_19057054
tx.5448	chr14	-	1763	5	NIC	ENSMUSG00000095195.8	novel	1955	7	NA	NA	-55	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.6393596310755	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTATGCTTCTGCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18897805	18875550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_18876696_18880194_18880378_18881053_18881186_18882135_18882299_18897665
tx.5449	chr14	-	1735	5	NIC	ENSMUSG00000096574.8	novel	1955	7	NA	NA	-27	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.6393596310755	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTATGCTTCTGCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19137173	19114971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_19116117_19119615_19119799_19120474_19120607_19121556_19121720_19137061
tx.545	chr1	+	1242	9	ISM	ENSMUSG00000026275.14	ENSMUST00000027494.11	10315	10	3304	8213	2451	-8213	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	496	junction_5	61.4715381294465	488	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGATGAAAGTTATTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93273879	93292998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93274010_93278046_93278103_93278670_93278737_93279227_93279359_93280238_93280402_93282050_93282168_93285478_93285584_93288447_93288535_93292611
tx.5450	chr14	-	2108	8	NNC	ENSMUSG00000096574.8	novel	1955	7	NA	NA	0	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.38505138783324	21	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTATGCTTCTGCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19137146	19114971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_19116117_19119615_19119799_19120474_19120607_19121556_19121720_19122451_19122587_19132241_19132393_19135569_19135684_19137061
tx.5451	chr14	-	1936	6	NNC	ENSMUSG00000096574.8	novel	1955	7	NA	NA	-77	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.46969384566991	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGTATGCTTCTGCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19137223	19114971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_19116117_19119615_19119799_19120474_19120607_19121556_19121720_19132241_19132393_19137061
tx.5452	chr14	+	761	3	ISM	ENSMUSG00000021806.5	ENSMUST00000224263.2	4105	19	41821	0	4822	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1731	junction_2	5	226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTGGTCTAAATATCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19860125	19861855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_19860172_19861021_19861135_19861253
tx.5453	chr14	+	717	2	ISM	ENSMUSG00000021806.5	ENSMUST00000224263.2	4105	19	42715	0	5716	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1731	junction_1	0	1661	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTGGTCTAAATATCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19861019	19861855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_19861135_19861253
tx.5454	chr14	-	985	8	FSM	ENSMUSG00000021807.7	ENSMUST00000022341.7	1562	8	11	566	11	-566	multi-exon	FALSE	canonical	3	1848	junction_5	420.22365279378	13583	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTTGTTTGTTTTGCTCTG	1699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19873881	19861984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_19862306_19862416_19862466_19864604_19864674_19866252_19866342_19867128_19867216_19869974_19870075_19872633_19872759_19873736
tx.5455	chr14	-	583	2	ISM	ENSMUSG00000043004.14	ENSMUST00000161247.2	419	4	85290	-322	85290	184	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_1	0	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATGGCTGACATTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19941471	19925538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_19926004_19941353
tx.5456	chr14	-	624	3	ISM	ENSMUSG00000043004.14	ENSMUST00000161247.2	419	4	15997	-322	15997	184	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_2	20.5	353	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATGGCTGACATTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20010764	19925538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_19926004_19941353_19941470_20010721
tx.5457	chr14	-	683	4	FSM	ENSMUSG00000043004.14	ENSMUST00000160013.8	3826	4	231	2912	41	184	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_3	22.3755819291179	896	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATGGCTGACATTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20027086	19925538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_19926004_19941353_19941470_20010721_20010763_20027025
tx.5458	chr14	-	788	2	FSM	ENSMUSG00000045107.6	ENSMUST00000059666.6	2315	2	40	1487	40	337	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	288	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGCTGGTTTGTCTCATTA	5345	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20133211	20127190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_20127713_20132945
tx.5459	chr14	-	3374	5	FSM	ENSMUSG00000023243.10	ENSMUST00000024011.10	3392	5	18	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_3	12.5573683548744	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGTGTGTGGTATGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20231859	20190124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_20192526_20194702_20194872_20195023_20195191_20196568_20196681_20231334
tx.546	chr1	+	3214	13	FSM	ENSMUSG00000026276.21	ENSMUST00000027495.15	3779	13	38	527	9	-527	multi-exon	FALSE	canonical	3	766	junction_1	78.56892762975	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTAGTCCTCTTTTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93406723	93437455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_93406791_93416845_93416877_93418878_93419000_93423300_93423388_93425062_93425187_93426733_93426869_93426994_93427113_93428179_93428282_93429228_93429375_93431156_93431241_93433265_93433324_93434684_93434805_93435434
tx.5460	chr14	+	773	2	NNC	ENSMUSG00000114439.2	novel	486	2	NA	NA	-4930	169	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCCGTTCCAAAGGCATAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20260639	20271662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_20260846_20271095
tx.5461	chr14	-	1563	8	ISM	ENSMUSG00000021810.4	ENSMUST00000022344.4	3132	14	11976	400	11905	-400	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	500	junction_4	19.0926847835735	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTCAGTCTGTGACATTC	8864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20386213	20370319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_20371020_20374440_20374650_20377291_20377360_20378670_20378858_20378950_20379058_20380021_20380108_20383396_20383526_20386136
tx.5462	chr14	-	2687	14	FSM	ENSMUSG00000021810.4	ENSMUST00000022344.4	3132	14	45	400	-6	-400	multi-exon	FALSE	canonical	3	477	junction_8	30.9081479462529	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTCAGTCTGTGACATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20398144	20370319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_20371020_20374440_20374650_20377291_20377360_20378670_20378858_20378950_20379058_20380021_20380108_20383396_20383526_20386136_20386266_20386949_20387143_20388196_20388376_20388476_20388565_20393323_20393442_20396678_20396890_20397861
tx.5463	chr14	+	1730	8	FSM	ENSMUSG00000039599.17	ENSMUST00000224721.2	4483	8	-25	2778	-4	497	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_7	47.5106862308097	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGAATATGTTCTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20398302	20418632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_20398463_20401379_20401485_20402771_20402908_20406422_20406566_20408091_20408209_20409822_20409985_20413330_20413519_20417913
tx.5464	chr14	+	2007	9	ISM	ENSMUSG00000039599.17	ENSMUST00000225942.2	2151	14	35	6874	-3	115	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_7	68.9373583407429	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGGTACTTGTCCATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20398324	20426470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_20398463_20401379_20401485_20402771_20402908_20406422_20406566_20408091_20408209_20409822_20409985_20413330_20413519_20424397_20424523_20425577
tx.5465	chr14	+	1550	7	NIC	ENSMUSG00000039599.17	novel	4483	8	NA	NA	-7	497	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	59	junction_5	78.3207436691512	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGAATATGTTCTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20398320	20418632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_20398463_20401379_20401485_20402771_20402908_20406422_20406566_20408091_20408209_20413330_20413519_20417913
tx.5466	chr14	-	1377	5	FSM	ENSMUSG00000021811.8	ENSMUST00000022345.7	1631	5	33	221	-1	-221	multi-exon	TRUE	canonical	3	896	junction_2	62.1711347813437	2327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCTGGTGGATTATTTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20438945	20434926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_20435547_20435867_20435955_20438024_20438280_20438367_20438509_20438671
tx.5467	chr14	-	642	3	FSM	ENSMUSG00000049960.5	ENSMUST00000061444.5	2572	3	11	1919	11	4	multi-exon	TRUE	canonical	3	1591	junction_2	40	16252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTCCTCTGGCATAGCCTG	8538	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20443691	20441290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_20441529_20441960_20442222_20443548
tx.5468	chr14	-	1761	13	FSM	ENSMUSG00000021814.18	ENSMUST00000065504.17	2851	13	182	908	-10	361	multi-exon	FALSE	canonical	3	603	junction_12	120.241741458151	591	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTGTTTAATGTTAAAAGA	8160	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20530019	20506235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_20506670_20508637_20508751_20510226_20510303_20510380_20510552_20512622_20512794_20512974_20513089_20514676_20514772_20514911_20515015_20517938_20518004_20519455_20519558_20521435_20521641_20523342_20523398_20529962
tx.5469	chr14	-	3509	13	ISM	ENSMUSG00000021816.12	ENSMUST00000161445.8	3298	14	14788	-504	-7716	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	82	junction_1	51.8593182455081	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAGCTGTCTCTAAAATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20581827	20549431	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_20551731_20553314_20553345_20558691_20558790_20559483_20559566_20565590_20565669_20570621_20570748_20573647_20573743_20573846_20573925_20574027_20574168_20574424_20574571_20578225_20578338_20581011_20581137_20581727
tx.547	chr1	+	3259	13	NIC	ENSMUSG00000026276.21	novel	477	6	NA	NA	-17	-527	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	6	junction_1	275.56259371612	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTAGTCCTCTTTTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93406924	93437455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_93407037_93416845_93416877_93418878_93419000_93423300_93423388_93425062_93425187_93426733_93426869_93426994_93427113_93428179_93428282_93429228_93429375_93431156_93431241_93433265_93433324_93434684_93434805_93435434
tx.5470	chr14	-	2142	11	ISM	ENSMUSG00000021816.12	ENSMUST00000161445.8	3298	14	14788	7794	-7716	9	internal_fragment	FALSE	canonical	3	105	junction_2	33.4640105187648	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGCTCGTTGAATATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20581827	20557729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_20558790_20559483_20559566_20565590_20565669_20570621_20570748_20573647_20573743_20573846_20573925_20574027_20574168_20574424_20574571_20578225_20578338_20581011_20581137_20581727
tx.5471	chr14	-	2136	11	ISM	ENSMUSG00000021816.12	ENSMUST00000161989.2	2322	12	14681	0	-7716	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_2	34.294168600507	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGTAATCTGGCTCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20581827	20557738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_20558790_20559483_20559569_20565590_20565669_20570621_20570748_20573647_20573743_20573846_20573925_20574027_20574168_20574424_20574571_20578225_20578338_20581011_20581137_20581727
tx.5472	chr14	-	925	2	NIC	ENSMUSG00000097577.3	novel	1554	3	NA	NA	0	-570	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTGCCAGGATTAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20753096	20737873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_20738682_20752979
tx.5473	chr14	-	1569	3	FSM	ENSMUSG00000097577.3	ENSMUST00000180987.2	1554	3	-16	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACACAGTAGGCTCTGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20753096	20737304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_20738682_20738832_20738908_20752979
tx.5474	chr14	+	568	3	FSM	ENSMUSG00000063787.5	ENSMUST00000071215.5	616	3	48	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1953	junction_1	51.5	22116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGCCATTTCTTCTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20753121	20754493	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_20753266_20753357_20753477_20754188
tx.5475	chr14	-	706	2	ISM	ENSMUSG00000039308.7	ENSMUST00000224829.2	1147	6	1051	-19	1051	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGTCTGCTTCATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20774603	20773797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_20774429_20774528
tx.5476	chr14	-	805	3	ISM	ENSMUSG00000039308.7	ENSMUST00000047490.6	3305	13	5544	-7	803	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTTTTGTCTGCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20774851	20773799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_20774429_20774528_20774632_20774778
tx.5477	chr14	-	1840	19	FSM	ENSMUSG00000021820.19	ENSMUST00000100837.11	3564	19	-31	1755	6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_6	6.2610396328366	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGATTGTTTAAAAAAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20844150	20786697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_20786921_20787326_20787572_20788916_20789012_20789394_20789471_20792772_20792822_20794671_20794717_20805726_20805771_20810211_20810255_20810464_20810549_20814213_20814337_20814928_20815024_20815463_20815548_20815979_20816083_20816220_20816294_20820131_20820198_20821074_20821130_20829271_20829332_20842586_20842682_20843968
tx.5478	chr14	-	1879	20	FSM	ENSMUSG00000021820.19	ENSMUST00000080440.14	3604	20	-26	1751	-2	-7	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_6	9.18507762457831	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATAAGATTGTTTAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20844124	20786701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_20786921_20787326_20787572_20788916_20789012_20789394_20789471_20792772_20792822_20794671_20794717_20795859_20795929_20805726_20805771_20810211_20810255_20810464_20810549_20814213_20814337_20814928_20815024_20815463_20815548_20815979_20816083_20816220_20816294_20820131_20820198_20821074_20821130_20829271_20829332_20842586_20842682_20843968
tx.5479	chr14	+	762	6	ISM	ENSMUSG00000021823.11	ENSMUST00000226113.2	3934	8	20	11787	20	-11787	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	268	junction_5	12.0764233115604	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAGGAATAGAAGAAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20979485	21037062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_20979757_21017605_21017677_21032641_21032793_21033435_21033545_21035694_21035818_21037025
tx.548	chr1	+	2084	2	ISM	ENSMUSG00000116048.2	ENSMUST00000168776.8	3267	13	27959	0	27959	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1012	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTAGTCCTCTTTTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93434741	93437455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93434805_93435434
tx.5480	chr14	+	2330	3	ISM	ENSMUSG00000021823.11	ENSMUST00000022369.9	5267	21	99844	3	7239	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	294	junction_1	8	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGCTCTAATTGAGGTTA	2286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21079309	21083741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_21079448_21079849_21079955_21081654
tx.5481	chr14	-	2675	7	NIC	ENSMUSG00000021824.14	novel	6732	9	NA	NA	-11	1207	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	34	junction_6	106.531163932855	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATTTTTAAAGTTTGATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21102274	21084874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_21086772_21087180_21087326_21088045_21088254_21089195_21089330_21090119_21090206_21091020_21091159_21102207
tx.5482	chr14	-	3116	9	FSM	ENSMUSG00000021824.14	ENSMUST00000154460.8	6732	9	243	3373	-12	1199	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_8	42.1092329543059	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAACCAAATGATTTTTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21102275	21084882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_21086772_21087180_21087326_21088045_21088254_21089195_21089330_21090119_21090206_21091020_21091159_21094720_21094893_21095555_21095832_21102207
tx.5483	chr14	-	2165	9	NIC	ENSMUSG00000021824.14	novel	6732	9	NA	NA	2	264	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	26	junction_8	95.1609656056516	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTGCCATTCTCATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21102574	21085817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_21086772_21087180_21087326_21088045_21088254_21089195_21089330_21090119_21090206_21091020_21091159_21094720_21094893_21095555_21095832_21102522
tx.5484	chr14	+	976	8	NIC	ENSMUSG00000039197.11	novel	1782	11	NA	NA	14	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_7	129.691313258421	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTGTTCTTCCCAACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21102655	21376861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_21102769_21142434_21142510_21153887_21153942_21219867_21219947_21284900_21285074_21290530_21290640_21368080_21368252_21376659
tx.5485	chr14	+	317	2	FSM	ENSMUSG00000039197.11	ENSMUST00000223558.2	289	2	-23	-5	14	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	364	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATGATCCATTTTAACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21102655	21103993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_21102769_21103789
tx.5486	chr14	+	1769	11	FSM	ENSMUSG00000039197.11	ENSMUST00000045376.11	1782	11	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	304	junction_9	34.7499640287584	1179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTCTGTCTTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21102654	21498637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_21102769_21142434_21142510_21153887_21153942_21219867_21219947_21284900_21285074_21290530_21290640_21368080_21368252_21419138_21419175_21431570_21431686_21473570_21473658_21497881
tx.5487	chr14	+	1485	8	ISM	ENSMUSG00000039197.11	ENSMUST00000224069.2	1818	11	93689	-7	93689	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	304	junction_6	26.2942532714287	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTCTGTCTTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21219908	21498637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_21219947_21284900_21285074_21290530_21290640_21368080_21368252_21419138_21419175_21431570_21431686_21473570_21473658_21497881
tx.5488	chr14	-	831	2	Intergenic	novelGene_244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	30	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATATGTGTGTTTGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21528365	21526403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_21527123_21528253
tx.5489	chr14	-	1645	6	ISM	ENSMUSG00000021768.16	ENSMUST00000075040.9	1745	8	1812	-2	-325	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_3	0.748331477354788	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTTGTATGACAGTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21796878	21783460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_21783920_21784963_21785185_21790171_21790346_21793502_21793598_21794815_21795011_21796377
tx.549	chr1	-	747	2	ISM	ENSMUSG00000026277.15	ENSMUST00000154008.8	705	4	1853	-466	1853	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	197	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGCCTGGCCAGACAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93551230	93549614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_93550249_93551117
tx.5490	chr14	+	1558	6	FSM	ENSMUSG00000021770.12	ENSMUST00000022292.10	1574	6	16	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	7.55248303539968	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTGTCCCAGGCTCCTG	2630	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21800614	21843370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_21800849_21825030_21825624_21830153_21830250_21833746_21833865_21842471_21842623_21843004
tx.5491	chr14	+	1336	10	FSM	ENSMUSG00000021771.15	ENSMUST00000022293.14	1954	10	258	360	-39	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2055	junction_4	139.679350612946	11647	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATGGTGTGCATGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21881594	21895587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_21881736_21881918_21881978_21882951_21883021_21883868_21883919_21887811_21887965_21888058_21888112_21888458_21888687_21890486_21890638_21893949_21894008_21895213
tx.5492	chr14	-	923	7	FSM	ENSMUSG00000021773.12	ENSMUST00000124549.9	2314	7	67	1324	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	244	junction_3	15.9661099415815	2685	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTCTGAGCATCCTCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21898978	21897246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_21897496_21897681_21897816_21897940_21897996_21898069_21898189_21898277_21898384_21898608_21898737_21898846
tx.5493	chr14	-	2441	6	NNC	ENSMUSG00000021782.15	novel	6336	27	NA	NA	1663	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	61.1764660633483	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGTGTGTAGACCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24194593	24184020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_24185742_24186636_24186747_24187197_24187308_24188304_24188433_24188675_24188820_24194365
tx.5494	chr14	-	4664	31	FSM	ENSMUSG00000025280.9	ENSMUST00000026322.9	4687	31	25	-2	-18	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_23	15.9947560851118	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTAAGTGTTTTTTGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24537095	24498761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_24499291_24500762_24500896_24502260_24502393_24502578_24502744_24503238_24503404_24504637_24504731_24504922_24505017_24505931_24506103_24507084_24507168_24507286_24507374_24510031_24510146_24511767_24511939_24513621_24513760_24514319_24514439_24515328_24515441_24517002_24517176_24519332_24519498_24520601_24520741_24520887_24521016_24521805_24521876_24524240_24524382_24525807_24525950_24526080_24526185_24529173_24529311_24529426_24529590_24529703_24529944_24532447_24532603_24532854_24533027_24534185_24534324_24534454_24534591_24536940
tx.5495	chr14	-	1414	9	NNC	ENSMUSG00000025280.9	novel	775	3	NA	NA	4	-5710	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3	junction_1	46.1923627345474	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTTCTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24537116	24527283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_24527381_24529173_24529311_24529426_24529590_24529703_24529944_24532447_24532603_24532854_24533027_24534185_24534324_24534454_24534591_24536940
tx.5496	chr14	-	775	3	FSM	ENSMUSG00000025280.9	ENSMUST00000225014.2	775	3	16	-16	10	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_2	5.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCCCAACTGAAAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24537110	24533854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_24534324_24534454_24534591_24536940
tx.5497	chr14	+	540	5	FSM	ENSMUSG00000025290.18	ENSMUST00000225023.2	1613	5	-27	1100	10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	4092	junction_4	3560.754932244	46968	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCTGCTCTGCTGCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24540758	24545927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_24540827_24541817_24541884_24541974_24542185_24543450_24543562_24545842
tx.5498	chr14	+	553	5	NNC	ENSMUSG00000025290.18	novel	1613	5	NA	NA	10	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	5247.91465131627	23417	4	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTCTGCTCTGCTGCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24540758	24545927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_24540827_24541817_24541884_24541974_24542185_24543450_24543567_24545834
tx.5499	chr14	+	1563	6	FSM	ENSMUSG00000021868.8	ENSMUST00000022419.7	1549	6	-14	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	443	junction_3	21.4532048887806	272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTGTCTCTGGTTTTGGA	378	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25694579	25700892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_25694848_25695896_25695928_25696427_25696517_25697996_25698094_25698689_25698766_25699890
tx.55	chr1	-	841	6	ISM	ENSMUSG00000043716.14	ENSMUST00000058437.14	1163	7	259	430	-1	55	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5452	junction_5	662.022839485165	4467	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAAGTTAGTGTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16174627	16171948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_16172161_16172713_16172824_16172915_16173054_16173391_16173559_16173733_16173909_16174588
tx.550	chr1	-	2071	12	FSM	ENSMUSG00000026277.15	ENSMUST00000027498.14	4249	12	27	2151	27	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	133	junction_7	20.1461601451751	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGATGTACAGAGCCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93563417	93549623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_93550249_93551117_93551255_93552274_93552347_93552755_93552871_93553182_93553329_93553502_93553689_93553772_93553931_93554746_93554856_93555375_93555433_93556755_93556987_93563019_93563106_93563268
tx.5500	chr14	+	2364	15	FSM	ENSMUSG00000021866.16	ENSMUST00000022416.15	2394	15	26	4	-1	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	387	junction_6	25.4603533329122	223	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTTCTGGTGCCAGCAT	1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	25842605	25887224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_25842720_25869287_25869351_25870492_25870606_25872935_25873323_25874367_25874456_25874633_25874729_25875094_25875209_25877084_25877176_25877532_25877613_25877774_25877832_25879507_25879602_25883339_25883436_25884350_25884410_25884565_25884689_25886434
tx.5501	chr14	+	1550	10	ISM	ENSMUSG00000021866.16	ENSMUST00000022416.15	2394	15	32103	4	32076	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	387	junction_1	24.4348466006043	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCTTTCTGGTGCCAGCAT	1819	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25874682	25887224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_25874729_25875094_25875209_25877084_25877176_25877532_25877613_25877774_25877832_25879507_25879602_25883339_25883436_25884350_25884410_25884565_25884689_25886434
tx.5502	chr14	+	1386	8	ISM	ENSMUSG00000021866.16	ENSMUST00000133547.2	2733	14	34476	10	34476	-10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	430	junction_1	16.420494909144	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAAATGTCTTTCTGGTGC	4219	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25877082	25887218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_25877176_25877532_25877613_25877774_25877832_25879507_25879602_25883339_25883436_25884350_25884410_25884565_25884689_25886434
tx.5503	chr14	-	550	4	FSM	ENSMUSG00000095304.10	ENSMUST00000183431.8	536	4	-13	-1	-11	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	49	junction_3	71.4624998785299	331	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTAGCCATGACCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25902911	25888826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_25888951_25889319_25889444_25891184_25891280_25902704
tx.5504	chr14	-	412	4	NNC	ENSMUSG00000095304.10	novel	439	4	NA	NA	-12	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	26	junction_3	82.174610839764	280	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTAGCCATGACCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25902912	25888826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_25888951_25889319_25889444_25891184_25891280_25902843
tx.5505	chr14	-	536	4	FSM	ENSMUSG00000095304.10	ENSMUST00000052286.16	1555	4	122	897	122	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_3	28.7170100579198	937	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTAGCCATGACCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25903402	25888826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_25888951_25889319_25889444_25891184_25891280_25903209
tx.5506	chr14	-	1398	4	FSM	ENSMUSG00000072676.13	ENSMUST00000185006.9	2147	4	47	702	18	168	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_1	7.40870359029762	633	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCAGTTCCACATGCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25928049	25924425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_25925332_25925945_25926006_25926221_25926326_25927721
tx.5507	chr14	-	2169	4	ISM	ENSMUSG00000021870.18	ENSMUST00000142679.8	1565	11	37625	-1558	7554	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_2	20.8539897594894	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATGTTTGAGTTGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26143702	26134326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_26136144_26137357_26137448_26139267_26139403_26143575
tx.5508	chr14	-	2535	6	ISM	ENSMUSG00000021870.18	ENSMUST00000142679.8	1565	11	32736	-1559	2665	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_2	16.8522995463527	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCATGTTTGAGTTGTACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26148591	26134325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_26136144_26137357_26137448_26139267_26139403_26143575_26143748_26147719_26147838_26148389
tx.5509	chr14	-	467	2	FSM	ENSMUSG00000090861.2	ENSMUST00000166902.2	566	2	107	-8	107	8	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTATTTATTATATTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26359231	26349553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_26349887_26359097
tx.551	chr1	+	1510	5	FSM	ENSMUSG00000026278.15	ENSMUST00000027499.13	1468	5	-42	0	-42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	2.9474565306379	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGAGACTCTACTCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93613339	93623486	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_93613577_93614139_93614392_93616878_93617008_93621781_93621946_93622758
tx.5510	chr14	+	1701	6	FSM	ENSMUSG00000021877.13	ENSMUST00000022429.9	2165	6	49	415	49	29	multi-exon	FALSE	canonical	3	1593	junction_4	101.482215190643	1996	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTGTGTGTTCTTTTGAG	1735	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26359277	26377998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_26359642_26367813_26367895_26368068_26368179_26374260_26374333_26374991_26375118_26377050
tx.5511	chr14	+	1208	4	ISM	ENSMUSG00000021877.13	ENSMUST00000112318.10	1367	5	8615	-29	-6049	29	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1593	junction_2	130.958008537088	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTGTGTGTTCTTTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26368116	26377998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_26368179_26374260_26374333_26374991_26375118_26377050
tx.5512	chr14	-	2438	3	FSM	ENSMUSG00000043702.10	ENSMUST00000052932.10	7725	3	228	5059	228	-5059	multi-exon	FALSE	canonical	3	278	junction_2	18	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTATAGCTTCTTCGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26390810	26386171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_26387123_26387532_26387612_26389402
tx.5513	chr14	-	2396	22	FSM	ENSMUSG00000040760.12	ENSMUST00000036570.5	7642	22	702	4544	-25	-4544	multi-exon	FALSE	canonical	3	262	junction_6	31.5683759207952	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAACAAGACCTGCTTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26692487	26645488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_26645829_26647373_26647464_26647915_26647967_26649685_26649833_26650396_26650434_26650515_26650691_26662200_26662254_26664604_26664788_26665868_26665961_26667501_26667559_26669077_26669121_26671398_26671588_26672508_26672668_26673391_26673475_26674934_26675082_26680409_26680469_26681381_26681424_26682907_26682996_26684762_26684835_26685603_26685664_26686815_26686915_26692357
tx.5514	chr14	-	3010	21	NIC	ENSMUSG00000040760.12	novel	7642	22	NA	NA	-16	-3849	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	51	junction_18	68.3302824522188	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAATCTTTTGAATTTCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26692478	26644793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_26645829_26647373_26647464_26647915_26647967_26649685_26649833_26650396_26650434_26650515_26650691_26662200_26662254_26664604_26664788_26665868_26665961_26667501_26667559_26669077_26669121_26671398_26671588_26672508_26672668_26673391_26673475_26674934_26675082_26680409_26680469_26681381_26681424_26682907_26682996_26685603_26685664_26686815_26686915_26692357
tx.5515	chr14	-	1640	16	ISM	ENSMUSG00000040760.12	ENSMUST00000036570.5	7642	22	684	21190	-43	10948	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	283	junction_1	27.6115917686757	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTCTGCTGCTGTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26692505	26662134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_26662254_26664604_26664788_26665868_26665961_26667501_26667559_26669077_26669121_26671398_26671588_26672508_26672668_26673391_26673475_26674934_26675082_26680409_26680469_26681381_26681424_26682907_26682996_26684762_26684835_26685603_26685664_26686815_26686915_26692357
tx.5516	chr14	-	1391	10	ISM	ENSMUSG00000040760.12	ENSMUST00000036570.5	7642	22	708	31106	-19	1032	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	309	junction_5	27.4671520992702	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGAGTTTTCATTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26692481	26672050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_26672668_26673391_26673475_26674934_26675082_26680409_26680469_26681381_26681424_26682907_26682996_26684762_26684835_26685603_26685664_26686815_26686915_26692357
tx.5517	chr14	-	550	7	ISM	ENSMUSG00000040760.12	ENSMUST00000142645.8	1226	8	-46	6050	-41	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	309	junction_2	32.542280190546	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGAAAATGACAAGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26692503	26680425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_26680469_26681381_26681424_26682907_26682996_26684762_26684835_26685603_26685664_26686815_26686915_26692357
tx.5518	chr14	+	857	4	FSM	ENSMUSG00000040726.11	ENSMUST00000035433.10	1141	4	284	0	284	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_1	19.2584757675391	588	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGTATTTTAATATACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26722602	26724286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_26722834_26723328_26723529_26723775_26723878_26723962
tx.5519	chr14	+	780	2	Intergenic	novelGene_246	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCTTCTTGGTTATGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26742915	26743985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_26743235_26743524
tx.552	chr1	-	721	5	FSM	ENSMUSG00000026279.15	ENSMUST00000189728.7	713	5	-11	3	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	175.089262948931	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTGTGTAGACTGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93659659	93633111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_93633378_93642619_93642724_93644353_93644464_93652878_93653039_93659578
tx.5520	chr14	+	1029	2	NNC	ENSMUSG00000040717.7	novel	2186	4	NA	NA	42	-34273	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGTGTCTTGGTGTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26760939	26776933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_26761187_26776151
tx.5521	chr14	+	1188	7	ISM	ENSMUSG00000021895.11	ENSMUST00000224981.2	3618	10	-30	9541	-30	-8938	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	15.4775823549919	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGGTTGTGTGTTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27057992	27116327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_27058227_27084746_27084855_27101547_27101719_27106110_27106174_27107801_27107899_27108049_27108127_27115889
tx.5522	chr14	-	564	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021895.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATACCTGTTTTTCTATTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27150651	27125502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_27125768_27140915_27141062_27150498
tx.5523	chr14	+	1123	4	NIC	ENSMUSG00000040640.12	novel	1356	4	NA	NA	1	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	15	junction_1	19.3448241713959	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTATTGTCTGTTTATTT	2341	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27344399	27375762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_27344572_27350368_27350423_27374643_27375441_27375662
tx.5524	chr14	+	1059	3	NIC	ENSMUSG00000040640.12	novel	1356	4	NA	NA	11	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	35	junction_1	11	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTATTGTCTGTTTATTT	2351	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27344409	27375762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_27344572_27374643_27375441_27375662
tx.5525	chr14	+	553	2	ISM	ENSMUSG00000040640.12	ENSMUST00000210327.2	1099	4	29432	-3	204	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTATTGTCTGTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27374987	27375762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_27375441_27375662
tx.5526	chr14	+	905	5	FSM	ENSMUSG00000042682.11	ENSMUST00000112268.4	1678	5	118	655	-2	167	multi-exon	FALSE	canonical	3	836	junction_3	72.5443829665674	7720	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTTCAGTAGTACATGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29690382	29696964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_29690494_29691982_29692074_29693744_29693829_29695317_29695405_29696432
tx.5527	chr14	-	1166	3	ISM	ENSMUSG00000015966.18	ENSMUST00000223643.2	1533	4	769	-269	769	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACTAATGTGTAGCTTCCT	1306	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29721282	29718158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_29719147_29719965_29720062_29721200
tx.5528	chr14	+	1640	6	FSM	ENSMUSG00000021962.10	ENSMUST00000224453.2	960	6	118	-798	18	798	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_5	66.8538704937867	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAGTATCACTTTTAGCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30201609	30233249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_30201774_30204149_30204191_30206415_30206544_30224782_30224850_30227502_30227642_30232148
tx.5529	chr14	+	319	3	FSM	ENSMUSG00000021962.10	ENSMUST00000225518.2	2044	3	0	1725	0	-1725	multi-exon	FALSE	canonical	3	168	junction_2	6	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAACCATTTCTTCTGTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30201591	30206511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_30201774_30204149_30204191_30206415
tx.553	chr1	-	1518	5	ISM	ENSMUSG00000026279.15	ENSMUST00000190116.7	5558	6	4056	3455	-770	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	370	junction_4	26.4988207284777	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTGTGTAGACTGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93678446	93633111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_93633378_93642619_93642724_93644353_93644464_93652878_93653039_93677568
tx.5530	chr14	-	743	2	Intergenic	novelGene_248	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTCCCCACAGAGGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30267034	30263484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_30264114_30266920
tx.5531	chr14	+	2079	14	FSM	ENSMUSG00000021957.8	ENSMUST00000022529.8	3223	14	48	1096	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1855	junction_3	147.090520774709	2276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCAGACTCTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30271135	30295581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_30271338_30280677_30280796_30281708_30281823_30282543_30282642_30287444_30287637_30288898_30289018_30290120_30290315_30290931_30291097_30291912_30292070_30292159_30292291_30292919_30293004_30293108_30293203_30294164_30294288_30295293
tx.5532	chr14	+	480	3	ISM	ENSMUSG00000021957.8	ENSMUST00000225039.2	1401	8	3178	0	1472	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2212	junction_1	58	9588	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCAGACTCTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30293133	30295581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30293203_30294164_30294288_30295293
tx.5533	chr14	-	1702	10	ISM	ENSMUSG00000021948.18	ENSMUST00000112207.8	2139	15	3664	-238	1513	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	102	junction_9	12.2151494687216	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGCTGTGGGGACATTTA	4087	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30326115	30317310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_30317983_30320674_30320804_30321274_30321464_30321566_30321706_30323125_30323189_30323716_30323809_30323989_30324164_30324270_30324372_30324693_30324785_30326063
tx.5534	chr14	+	2375	13	FSM	ENSMUSG00000052395.18	ENSMUST00000064230.16	2387	13	13	-1	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_11	8.01171017948103	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGTGTCTTTCCCTGTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30376329	30413275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_30376433_30380265_30380352_30382153_30382271_30383227_30383418_30385034_30385137_30388635_30388774_30396126_30396206_30398806_30398858_30399643_30399775_30401187_30401333_30404707_30404814_30411661_30411912_30412398
tx.5535	chr14	+	1270	8	FSM	ENSMUSG00000006526.14	ENSMUST00000006701.8	3742	8	181	2291	177	-45	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_2	11.5387545750335	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTTTTGTAACTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30547727	30596876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_30547848_30584836_30584886_30586385_30586482_30588579_30588702_30592707_30592821_30593437_30593516_30594506_30594657_30596334
tx.5536	chr14	+	1077	4	ISM	ENSMUSG00000006526.14	ENSMUST00000227776.2	1156	6	4317	-160	250	124	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_3	13.2245562832516	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATGGATTTGTTTGCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30592718	30597081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30592821_30593437_30593516_30594506_30594657_30596334
tx.5537	chr14	-	634	2	Intergenic	novelGene_249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACTGTTATTATTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30673319	30672571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_30673045_30673158
tx.5538	chr14	-	704	4	FSM	ENSMUSG00000021917.17	ENSMUST00000228736.2	702	4	-1	-1	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1717	junction_2	34.7658836600865	11703	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACATTTGTTTTCTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30723321	30721782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_30722180_30722634_30722722_30722800_30722861_30723161
tx.5539	chr14	+	1424	10	NNC	ENSMUSG00000021916.17	novel	1498	10	NA	NA	-7	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	11	junction_5	43.7670601657863	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATTTGCTTCCCCATTTT	3519	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30723349	30733948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_30723386_30728415_30728470_30728589_30728689_30730610_30730825_30731691_30731728_30732037_30732123_30732253_30732367_30732820_30732988_30733077_30733191_30733441
tx.554	chr1	-	1938	6	FSM	ENSMUSG00000026279.15	ENSMUST00000190116.7	5558	6	165	3455	35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	370	junction_4	24.3770383763081	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTGTGTAGACTGTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93682337	93633111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_93633378_93642619_93642724_93644353_93644464_93652878_93653039_93677568_93678708_93682178
tx.5540	chr14	+	1499	10	FSM	ENSMUSG00000021916.17	ENSMUST00000168584.9	1498	10	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	28.2055944017416	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATTTGCTTCCCCATTTT	3526	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30723356	30733948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_30723386_30728415_30728470_30728589_30728689_30730610_30730825_30731691_30731810_30732037_30732123_30732253_30732367_30732820_30732988_30733077_30733191_30733441
tx.5541	chr14	-	1856	15	FSM	ENSMUSG00000042354.8	ENSMUST00000037739.8	1947	15	91	0	-17	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	775	junction_10	82.9678140200482	1959	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTTTAAGATTTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30741018	30734389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_30734592_30734679_30734747_30735123_30735282_30735385_30735523_30735609_30735753_30736009_30736185_30736546_30736635_30736862_30736984_30737231_30737342_30738278_30738412_30738783_30738865_30739013_30739125_30739232_30739371_30739764_30739824_30740885
tx.5542	chr14	-	410	2	FSM	ENSMUSG00000058351.12	ENSMUST00000049732.11	311	2	-99	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	152	junction_1	0	1234	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTGATTTCAGCCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30850894	30846461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_30846567_30850589
tx.5543	chr14	-	486	2	FSM	ENSMUSG00000058351.12	ENSMUST00000090205.5	426	2	-34	-26	19	26	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	492	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTGTTTCTTAAAAATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30850894	30846609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_30846791_30850589
tx.5544	chr14	+	770	6	ISM	ENSMUSG00000071547.5	ENSMUST00000090212.5	1407	13	1466	-3	1466	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	601	junction_3	26.0967430918113	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTGCTTCATTCCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30858275	30861081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30858327_30858552_30858635_30860080_30860168_30860288_30860430_30860565_30860631_30860737
tx.5545	chr14	+	724	5	ISM	ENSMUSG00000071547.5	ENSMUST00000090212.5	1407	13	1738	-3	-1432	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	601	junction_2	27.6992779689291	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTGCTTCATTCCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30858547	30861081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30858635_30860080_30860168_30860288_30860430_30860565_30860631_30860737
tx.5546	chr14	+	600	4	FSM	ENSMUSG00000071547.5	ENSMUST00000227690.2	737	4	138	-1	138	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	601	junction_1	31.5911379978626	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTGCTTCATTCCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30860117	30861081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_30860168_30860288_30860430_30860565_30860631_30860737
tx.5547	chr14	+	560	3	ISM	ENSMUSG00000071547.5	ENSMUST00000227690.2	737	4	299	-1	299	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	622	junction_2	27	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTGCTTCATTCCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30860278	30861081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30860430_30860565_30860631_30860737
tx.5548	chr14	+	397	2	ISM	ENSMUSG00000071547.5	ENSMUST00000227690.2	737	4	598	-1	598	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	622	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTCTGCTTCATTCCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30860577	30861081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30860631_30860737
tx.5549	chr14	-	2637	14	FSM	ENSMUSG00000021910.16	ENSMUST00000172142.8	2780	14	143	0	17	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	57	junction_1	267.283529621824	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCACATCTTTTTCCTTT	9439	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30928640	30905269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_30906355_30906898_30907008_30907268_30907383_30908715_30908845_30909015_30909202_30909606_30909676_30910595_30910752_30911687_30911784_30912952_30913049_30913341_30913506_30914537_30914587_30925183_30925367_30926398_30926483_30928523
tx.555	chr1	+	343	2	Intergenic	novelGene_46	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACCCAAAACAAACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93662922	93663490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_93663187_93663411
tx.5550	chr14	-	2409	11	FSM	ENSMUSG00000021910.16	ENSMUST00000165981.8	2415	11	10	-4	10	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	935	junction_6	81.5207948930824	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAGAAAGAAAGAAAAGAAA	9432	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30928647	30907642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_30908845_30909015_30909202_30909606_30909676_30910595_30910752_30911687_30911784_30912952_30913049_30913341_30913506_30914537_30914587_30925183_30925367_30926398_30926483_30928523
tx.5551	chr14	-	1282	8	ISM	ENSMUSG00000021910.16	ENSMUST00000164989.8	2276	11	0	2593	0	21	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	935	junction_3	91.9329835771023	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAATTGCAAAGTGAGAAT	9422	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30928657	30910275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_30910752_30911687_30911784_30912952_30913049_30913341_30913506_30914537_30914587_30925183_30925367_30926398_30926483_30928523
tx.5552	chr14	-	441	4	ISM	ENSMUSG00000021910.16	ENSMUST00000164989.8	2276	11	7	6857	7	-4243	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1041	junction_1	79.1468396224525	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGTACATACATAGCACTTG	9429	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30928650	30914539	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_30914587_30925183_30925367_30926398_30926483_30928523
tx.5553	chr14	-	605	4	NNC	ENSMUSG00000021910.16	novel	1763	3	NA	NA	5	5527	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	38	junction_1	532.482863574031	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAACTCTCTGTGTTTTCTG	9427	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30928652	30917373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_30917583_30925183_30925367_30926398_30926483_30928523
tx.5554	chr14	-	584	3	FSM	ENSMUSG00000021910.16	ENSMUST00000171735.2	1763	3	1	1178	0	262	multi-exon	FALSE	canonical	3	1094	junction_1	67.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTTCTACTTCATGACA	9422	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30928657	30925000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_30925367_30926398_30926483_30928523
tx.5555	chr14	-	786	4	NNC	ENSMUSG00000021902.8	novel	2084	11	NA	NA	-189	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	12.675435561221	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGGGTCTCCTTGTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30962140	30959651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_30960111_30960293_30960440_30961587_30961695_30962066
tx.5556	chr14	-	1976	10	FSM	ENSMUSG00000021902.8	ENSMUST00000226565.2	1971	10	-11	6	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_2	5.27280467453541	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCGGGTCTCCTTGTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30973283	30959651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_30960111_30960293_30960440_30961587_30961695_30962230_30962391_30962815_30962941_30963682_30963785_30969999_30970092_30970951_30971005_30971564_30971675_30972661
tx.5557	chr14	+	680	4	ISM	ENSMUSG00000021901.11	ENSMUST00000188453.2	814	9	-100	1790	-23	333	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	401	junction_2	20.7417989148054	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGATGTTGACATCTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30973436	30975304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30973612_30973706_30973737_30973856_30973912_30974884
tx.5558	chr14	+	3399	17	FSM	ENSMUSG00000021901.11	ENSMUST00000022458.11	3460	17	47	14	-6	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	305	junction_12	31.9899886683318	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTGGTTGCTATCTCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30973453	30981887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_30973612_30973706_30973737_30973856_30973912_30974884_30975018_30975412_30975533_30975989_30976052_30976123_30976267_30976517_30976597_30977042_30977167_30977469_30977618_30978067_30978253_30978617_30978749_30979245_30979725_30979837_30979999_30980240_30980334_30980414_30980488_30980662
tx.5559	chr14	+	1330	3	ISM	ENSMUSG00000021901.11	ENSMUST00000190788.7	3855	16	6807	0	854	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	365	junction_1	7	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTGGTTGCTATCTCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30980301	30981887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_30980334_30980414_30980488_30980662
tx.556	chr1	+	1665	13	FSM	ENSMUSG00000026280.18	ENSMUST00000027502.16	4173	13	83	2425	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	280	junction_10	29.445217495093	610	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATGAATTTCTGGGGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93682709	93715907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_93682777_93695774_93695877_93695974_93696047_93701491_93701591_93702854_93702957_93703349_93703423_93706006_93706087_93708439_93708634_93712133_93712213_93712474_93712621_93713631_93713689_93714232_93714327_93715407
tx.5560	chr14	+	3647	21	FSM	ENSMUSG00000021893.15	ENSMUST00000022451.14	3648	21	4	-3	4	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	214	junction_6	22.7354348979737	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAGTTTAATGTCCAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31058598	31093944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_31058941_31061991_31062101_31066398_31066557_31067415_31067484_31069614_31069816_31071755_31071843_31074323_31074451_31076051_31076138_31077221_31077316_31080562_31080710_31081163_31081271_31082081_31082203_31085435_31085581_31086404_31086505_31087412_31087549_31088124_31088201_31090012_31090159_31091154_31091218_31091677_31091809_31092658_31092752_31092834
tx.5561	chr14	+	2434	13	ISM	ENSMUSG00000021893.15	ENSMUST00000022451.14	3648	21	18659	0	-10259	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	220	junction_5	24.4180886957918	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATGTAGTTTAATGTCCAG	5092	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31077253	31093941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_31077316_31080562_31080710_31081163_31081271_31082081_31082203_31085435_31085581_31086404_31086505_31087412_31087549_31088124_31088201_31090012_31090159_31091154_31091218_31091677_31091809_31092658_31092752_31092834
tx.5562	chr14	-	1954	6	FSM	ENSMUSG00000021891.9	ENSMUST00000055303.5	3946	6	10	1982	0	783	multi-exon	FALSE	canonical	3	247	junction_5	24.3359815910516	217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCACACTAACCGGGTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31216987	31200758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_31201768_31204747_31204890_31209527_31209699_31214278_31214414_31215553_31215922_31216858
tx.5563	chr14	-	1653	5	FSM	ENSMUSG00000021891.9	ENSMUST00000228181.2	793	5	-49	-811	-1	613	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	108.841628065736	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTTGTGGCTTAGTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31216998	31200928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_31201768_31209527_31209699_31214278_31214414_31215553_31215922_31216858
tx.5564	chr14	-	2376	5	FSM	ENSMUSG00000021891.9	ENSMUST00000228727.2	2388	5	6	6	-3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	247	junction_4	24.3823706804732	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAGAATGAGACCTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31216981	31203310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_31204890_31209527_31209699_31214278_31214414_31215553_31215922_31216858
tx.5565	chr14	+	610	4	ISM	ENSMUSG00000021890.7	ENSMUST00000022446.7	4918	6	702	7489	-95	1894	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	261	junction_1	2.35702260395516	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACGAAGCCTCCAGCTGGA	6304	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31217057	31224326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_31217329_31219665_31219761_31222076_31222214_31224219
tx.5566	chr14	+	4003	6	FSM	ENSMUSG00000021890.7	ENSMUST00000022446.7	4918	6	737	178	-60	-178	multi-exon	FALSE	canonical	3	223	junction_4	16.2357629940819	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATTTAATGTCTTGTTTT	6339	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31217092	31231637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_31217329_31219665_31219761_31222076_31222214_31224219_31224411_31226243_31226478_31228527
tx.5567	chr14	+	1260	3	FSM	ENSMUSG00000021890.7	ENSMUST00000228952.2	627	3	-80	-553	-80	553	multi-exon	FALSE	canonical	3	261	junction_1	2.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTCCTACTTTTAAAATA	6319	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31217072	31222985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_31217329_31219665_31219761_31222076
tx.5568	chr14	-	486	3	ISM	ENSMUSG00000021884.19	ENSMUST00000140078.9	503	4	0	188	0	116	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_2	0.5	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGTTTTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31336268	31329809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_31330001_31332058_31332246_31336160
tx.5569	chr14	-	559	4	ISM	ENSMUSG00000021884.19	ENSMUST00000167066.8	1566	15	25443	-158	-1124	116	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_3	3.09120616516523	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGTTTTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31337392	31329809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_31330001_31332058_31332246_31336160_31336269_31337319
tx.557	chr1	+	1038	2	ISM	ENSMUSG00000026280.18	ENSMUST00000187824.7	420	6	-47	9312	36	876	intron_retention	FALSE	canonical	3	287	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGCTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93682662	93696698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93682777_93695774
tx.5570	chr14	-	1062	6	ISM	ENSMUSG00000021884.19	ENSMUST00000165955.8	1500	14	21645	-158	-4922	116	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_3	3.07245829914744	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGTTTTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31341190	31329809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_31330001_31332058_31332246_31336160_31336269_31337319_31337479_31338316_31338472_31340928
tx.5571	chr14	-	2286	17	FSM	ENSMUSG00000021884.19	ENSMUST00000022437.16	2644	17	-296	654	-3	116	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_9	6.10199762372946	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGTTTTGTTTTGTTTT	6649	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31363217	31329809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_31330001_31332058_31332246_31336160_31336269_31337319_31337479_31338316_31338472_31340928_31341031_31341801_31341886_31342959_31343066_31344795_31344932_31348296_31348410_31351989_31352085_31352917_31352996_31354852_31354926_31356155_31356237_31357700_31357742_31362450_31362556_31362745
tx.5572	chr14	-	1911	17	NIC	ENSMUSG00000021884.19	novel	2644	17	NA	NA	-5	116	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_16	13.265910259006	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGTTTTGTTTTGTTTT	6647	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31363219	31329809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_31330001_31332058_31332246_31336160_31336269_31337319_31337479_31338316_31338472_31340928_31341031_31341801_31341886_31342959_31343066_31344795_31344932_31348296_31348410_31351989_31352085_31352917_31352996_31354852_31354926_31356155_31356237_31357700_31357742_31362450_31362556_31363122
tx.5573	chr14	+	1928	4	FSM	ENSMUSG00000021900.11	ENSMUST00000090147.7	2324	4	11	385	11	-385	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	7.40870359029762	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATACTGGCTGGGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31363024	31390151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_31363093_31384026_31384283_31387838_31387989_31388697
tx.5574	chr14	+	1684	3	FSM	ENSMUSG00000021900.11	ENSMUST00000128014.2	689	3	28	-1023	-1	-385	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	7.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATACTGGCTGGGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31363012	31390151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_31363093_31387838_31387989_31388697
tx.5575	chr14	+	652	2	NNC	ENSMUSG00000046005.5	novel	3897	2	NA	NA	17492	-3052	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGTTGTTTTCTTCATCT	4910	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31645976	31650621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_31646028_31650020
tx.5576	chr14	-	575	2	FSM	ENSMUSG00000021905.15	ENSMUST00000124303.9	809	2	120	114	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGAGTGTCTTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31807566	31804828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_31805204_31807366
tx.5577	chr14	-	653	3	FSM	ENSMUSG00000021905.15	ENSMUST00000067955.12	2953	3	-3	2303	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	570	junction_1	6	5671	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGAGTGTCTTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31807569	31804828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_31805204_31806863_31806939_31807366
tx.5578	chr14	+	2019	8	FSM	ENSMUSG00000021906.15	ENSMUST00000022462.14	2376	8	358	-1	-14	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	171	junction_6	23.2422908000191	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATGTTTAATGTTTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31807727	31825160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_31808011_31813592_31813717_31814024_31814089_31817321_31817429_31818443_31818586_31821345_31821589_31822942_31823052_31824213
tx.5579	chr14	-	442	2	NNC	ENSMUSG00000115760.2	novel	965	2	NA	NA	718	112	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGTGTGTGAAAGAGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31877310	31876592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_31876977_31877252
tx.558	chr1	+	1601	12	ISM	ENSMUSG00000026280.18	ENSMUST00000027502.16	4173	13	13145	2425	-27	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	280	junction_9	28.3639277374311	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATGAATTTCTGGGGCAC	2044	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93695771	93715907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93695877_93695974_93696047_93701491_93701591_93702854_93702957_93703349_93703423_93706006_93706087_93708439_93708634_93712133_93712213_93712474_93712621_93713631_93713689_93714232_93714327_93715407
tx.5580	chr14	+	3398	10	FSM	ENSMUSG00000056234.16	ENSMUST00000163336.8	4065	10	62	605	-11	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	533	junction_6	51.0289194210886	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTTGTGTTTGTGTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31881883	31901207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_31881968_31892704_31892860_31894259_31894401_31894563_31894653_31894845_31894955_31895357_31895448_31896346_31896491_31897895_31898913_31899189_31899331_31899779
tx.5581	chr14	-	1161	7	FSM	ENSMUSG00000013701.14	ENSMUST00000013845.13	1173	7	12	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3717	junction_4	299.373048590253	7438	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATAGTATCTCCATTTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31923843	31902118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_31902628_31911100_31911212_31913298_31913358_31915359_31915445_31915810_31915905_31920925_31920985_31923599
tx.5582	chr14	+	3811	18	NNC	ENSMUSG00000021911.17	novel	4413	18	NA	NA	-4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_15	124.385771168587	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCATGCCACTTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31923901	32019177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_31924143_31930113_31930181_31930668_31931632_31932411_31932596_31936280_31936404_31936523_31936608_31939616_31939692_31960487_31960581_31964145_31964304_31971973_31972054_31976492_31976554_31980034_31980111_31984640_31984789_31993586_31993666_31996806_31996920_32006055_32006162_32017155_32017285_32018146
tx.5583	chr14	+	1099	3	ISM	ENSMUSG00000021911.17	ENSMUST00000164137.8	3013	9	13	33856	-9	6	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	299	junction_1	35	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGACAACAAATTGACTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31923918	31931196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_31924423_31930113_31930181_31930668
tx.5584	chr14	+	1582	6	NNC	ENSMUSG00000021911.17	novel	2786	15	NA	NA	-12999	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	173.575804765526	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCATGCCACTTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31984664	32019177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_31984789_31993586_31993666_31996806_31996920_32006055_32006162_32017155_32017285_32018146
tx.5585	chr14	+	1199	3	ISM	ENSMUSG00000021911.17	ENSMUST00000171871.2	587	5	8459	-876	8459	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	433	junction_1	5.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCCCATGCCACTTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32006122	32019177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_32006162_32017155_32017285_32018146
tx.5586	chr14	-	593	3	Fusion	ENSMUSG00000115691.2_ENSMUSG00000090459.2	novel	391	2	NA	NA	-10422	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	10	209	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATTGACAAAGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32027353	32014876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_-_32015223_32016885_32016987_32027207
tx.5587	chr14	-	701	4	Fusion	ENSMUSG00000115691.2_ENSMUSG00000090459.2	novel	391	2	NA	NA	-10422	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	11.2249721603218	116	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGTCATTGACAAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32027353	32014880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_-_32015223_32016561_32016674_32016885_32016987_32027207
tx.5588	chr14	-	1853	2	NNC	ENSMUSG00000115691.2	novel	1833	2	NA	NA	10691	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGTCCGACAGAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32029251	32025604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_32027353_32029146
tx.5589	chr14	-	1064	6	ISM	ENSMUSG00000051506.18	ENSMUST00000130509.10	10158	62	214182	16	52453	-16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	3.37045990927054	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTGCTTGAGCGTTACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32692841	32681519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_32681962_32682698_32682811_32686495_32686581_32688320_32688504_32689429_32689610_32692779
tx.559	chr1	-	970	5	FSM	ENSMUSG00000026281.16	ENSMUST00000027503.14	1003	5	28	5	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1212	junction_3	505.005136112495	8308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCACGAGCTTTGGTTCTG	2338	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93729628	93720302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_93720666_93722447_93722646_93726101_93726193_93728523_93728633_93729419
tx.5590	chr14	-	2141	13	ISM	ENSMUSG00000051506.18	ENSMUST00000130509.10	10158	62	198358	19	36629	-19	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_12	4.80378901377745	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGCTGCTTGAGCGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32708665	32681522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_32681962_32682698_32682811_32686495_32686581_32688320_32688504_32689429_32689610_32692779_32692939_32693534_32693720_32695492_32695644_32696111_32696325_32697111_32697204_32699046_32699201_32707613_32707724_32708587
tx.5591	chr14	-	1480	7	ISM	ENSMUSG00000051506.18	ENSMUST00000130509.10	10158	62	213165	21	51436	-21	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_6	5.06622805119022	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAAGGCTGCTTGAGCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32693858	32681524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_32681962_32682698_32682811_32686495_32686581_32688320_32688504_32689429_32689610_32692779_32692939_32693534
tx.5592	chr14	+	1106	2	ISM	ENSMUSG00000041673.13	ENSMUST00000120866.8	1231	3	3796	-2	-71	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGGACTATGGTTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32717150	32731355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_32717266_32730364
tx.5593	chr14	+	735	2	ISM	ENSMUSG00000063506.15	ENSMUST00000111955.2	2148	6	47593	-2	4920	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGCCTGTCACCAGCCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33089252	33091893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_33089401_33091306
tx.5594	chr14	-	2879	12	NIC	ENSMUSG00000021936.15	novel	2587	12	NA	NA	-20	254	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.14655787270487	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATTTCTGAAATGATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33169135	33102751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_33104282_33105830_33105909_33108518_33108583_33109128_33109254_33110756_33110940_33112198_33112271_33114898_33115065_33124580_33124720_33124821_33124881_33130004_33130135_33132812_33132982_33168971
tx.5595	chr14	-	690	2	ISM	ENSMUSG00000021936.15	ENSMUST00000132379.2	1619	3	-19	3626	-18	-3626	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAGTGAAAAAAAAAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33169133	33132453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_33132982_33168971
tx.5596	chr14	+	1879	12	FSM	ENSMUSG00000021950.16	ENSMUST00000022519.15	1880	12	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	1.55345522642137	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTCTGTGGATTTGTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33807938	33822528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_33808034_33811467_33811559_33812563_33812659_33813757_33813872_33814486_33814578_33815334_33815415_33815840_33815901_33816354_33816449_33816679_33816776_33818486_33818546_33819813_33819937_33821647
tx.5597	chr14	-	1929	9	NIC	ENSMUSG00000041471.10	novel	3317	11	NA	NA	-3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_7	26.1745940751714	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTGAAGCTTTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34032453	33958989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_33959544_33960794_33960911_33963243_33963473_33967118_33967326_33970840_33970976_33971133_33971329_33981581_33981690_34030996_34031052_34032123
tx.5598	chr14	+	2643	13	FSM	ENSMUSG00000021794.17	ENSMUST00000022322.17	3390	13	389	358	389	-358	multi-exon	FALSE	canonical	3	1379	junction_7	93.7817723938577	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTATGTTTCTTTTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34033072	34066864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_34033300_34041838_34041920_34043724_34043781_34047469_34047534_34051245_34051341_34056068_34056249_34057258_34057397_34058049_34058188_34058452_34058534_34060716_34060841_34061883_34061976_34064075_34064139_34065560
tx.56	chr1	-	3001	11	FSM	ENSMUSG00000025920.20	ENSMUST00000162007.8	2964	11	-37	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_9	11.3207773584679	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTTGATTCATATAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16589501	16414514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_16416236_16436302_16436364_16439978_16440111_16444897_16445036_16460044_16460258_16462740_16462849_16464274_16464435_16510546_16510683_16533258_16533419_16579565_16579633_16589396
tx.560	chr1	-	501	4	ISM	ENSMUSG00000026281.16	ENSMUST00000027503.14	1003	5	28	2256	0	-2108	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1212	junction_2	579.476967234726	1880	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACGGGGAGAGTTTGGCC	2338	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93729628	93722553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_93722646_93726101_93726193_93728523_93728633_93729419
tx.5601	chr14	-	456	3	FSM	ENSMUSG00000043681.6	ENSMUST00000052126.6	408	3	-52	4	-52	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	2248	junction_2	168.5	24956	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGAGTCCTGAGTTTACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34077442	34073841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_34074035_34075654_34075718_34077242
tx.5602	chr14	+	827	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000023064.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_2	2	143	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGCCTCAGTGTCCCAGG	1398	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34087415	34096922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_34087676_34088315_34088446_34096485
tx.5603	chr14	+	2026	2	ISM	ENSMUSG00000041445.10	ENSMUST00000111908.3	3974	7	23508	0	23252	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGCCTGTTTACTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34120929	34126244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_34121581_34124869
tx.5604	chr14	-	752	3	ISM	ENSMUSG00000021798.15	ENSMUST00000022328.14	2468	13	46532	111	34892	-111	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAAGACTCCCTAGCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34264059	34251105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_34251507_34258521_34258638_34263824
tx.5605	chr14	+	860	4	ISM	ENSMUSG00000041408.19	ENSMUST00000151285.8	1820	11	13369	0	2088	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1010	junction_3	44.6791027463872	246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTGGTTGTTGTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34461315	34468176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_34461396_34463013_34463103_34466765_34466862_34467581
tx.5606	chr14	+	1298	3	Intergenic	novelGene_250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	29.5	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGCAGTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34496503	34500225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_34496610_34498763_34498879_34499148
tx.5607	chr14	+	1194	2	Intergenic	novelGene_251	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCAGTTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34498763	34500227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_34498879_34499148
tx.5608	chr14	-	507	2	ISM	ENSMUSG00000058690.15	ENSMUST00000090024.11	7509	11	3	66055	3	-40201	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGCAGAACTTAATAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36690731	36662947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_36663222_36690498
tx.5609	chr14	-	1455	9	FSM	ENSMUSG00000041028.17	ENSMUST00000165649.4	3188	9	-43	1776	-23	-1044	multi-exon	FALSE	canonical	3	4955	junction_4	366.305861780835	6385	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATTGTTTTATGTATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36857252	36843824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_36844184_36847116_36847289_36847858_36848048_36849543_36849653_36852592_36852735_36853494_36853607_36855127_36855228_36855589_36855761_36857151
tx.561	chr1	-	625	2	FSM	ENSMUSG00000026281.16	ENSMUST00000112890.3	1055	2	0	430	0	-430	multi-exon	FALSE	canonical	3	2511	junction_1	0	15779	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGGTTTTTGGTTTTGTTT	2338	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93729628	93728216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_93728633_93729419
tx.5610	chr14	-	546	2	Intergenic	novelGene_252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAATTATTAATTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37814373	37813328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_37813757_37814255
tx.5611	chr14	+	447	2	Intergenic	novelGene_253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTCTTAGCTCCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40171841	40178017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_40172121_40177849
tx.5612	chr14	-	477	2	ISM	ENSMUSG00000037833.15	ENSMUST00000225854.2	1150	4	20618	-1	-19343	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGTTGCCAATAATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40594605	40582338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_40582697_40594486
tx.5613	chr14	-	1140	5	NNC	ENSMUSG00000037833.15	novel	1150	4	NA	NA	-748	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_4	7.91754381105656	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAGTTGCCAATAATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40615971	40582338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_40582697_40594486_40594635_40596036_40596197_40614738_40614927_40615685
tx.5614	chr14	-	2452	8	NIC	ENSMUSG00000037824.7	novel	2477	8	NA	NA	-77	0	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	2	11	junction_7	223.728607459838	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATTTTGGTGATAAATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40688841	40628403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_40630087_40631541_40631662_40633069_40633115_40635318_40635445_40637336_40637508_40638759_40638907_40640586_40640638_40688732
tx.5615	chr14	-	2474	9	FSM	ENSMUSG00000037824.7	ENSMUST00000047652.6	2475	9	-66	67	-66	-65	multi-exon	FALSE	canonical	3	610	junction_1	26.6868413267663	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGGGTCTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40688830	40628468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_40630087_40631541_40631662_40633069_40633115_40635318_40635445_40637336_40637508_40638759_40638907_40640586_40640638_40656144_40656243_40688732
tx.5616	chr14	-	1012	2	ISM	ENSMUSG00000021792.16	ENSMUST00000153830.8	1003	5	6712	-791	5283	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	270	junction_1	0	215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCTCTGTGCACAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40719778	40715691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_40716595_40719669
tx.5617	chr14	-	1571	6	FSM	ENSMUSG00000021792.16	ENSMUST00000022317.15	1537	6	-29	-5	-16	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_5	72.4911029023562	280	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCTCTGTGCACAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40735761	40715691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_40716595_40719669_40719835_40720800_40720942_40724392_40724485_40725997_40726161_40735654
tx.5618	chr14	-	1588	6	FSM	ENSMUSG00000021792.16	ENSMUST00000118466.8	1567	6	-16	-5	-16	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	166	junction_5	66.6111101844129	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACCTCTGTGCACAAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40735761	40715691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_40716595_40719669_40719835_40720800_40720942_40724392_40724485_40725997_40726178_40735654
tx.5619	chr14	+	1037	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000091847.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	5	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATGATCCATTTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41085317	41102275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_41085450_41089611_41090056_41101814
tx.562	chr1	+	835	8	FSM	ENSMUSG00000026283.14	ENSMUST00000027505.13	4533	8	10	3688	-8	25	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	74.6873756509937	246	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTATTTTGACTGATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93731696	93746129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_93731762_93733769_93733842_93739503_93739671_93740128_93740241_93740387_93740482_93744096_93744233_93744359_93744422_93746002
tx.5620	chr14	+	1119	2	Intergenic	novelGene_254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCAAGAATGTGTTTGTC	8682	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41146560	41148278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_41146812_41147410
tx.5621	chr14	+	327	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000095518.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGCAAGAATGTGTTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41284438	41437626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_41284568_41437428
tx.5622	chr14	+	1651	3	NNC	ENSMUSG00000052334.12	novel	1576	5	NA	NA	-4479	-58477	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	73	junction_2	76	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAGAAAGAAAGAAAGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41761472	41767299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_41761595_41761988_41762060_41765841
tx.5623	chr14	+	737	3	Intergenic	novelGene_256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	13.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41955833	41961650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_41955902_41956497_41956982_41961465
tx.5624	chr14	-	1408	2	Intergenic	novelGene_257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGATGGCAAATCTAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42977693	42976228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_42977323_42977379
tx.5625	chr14	-	1413	2	Intergenic	novelGene_258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGATGGCAAATCTAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42977700	42976228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_42977293_42977351
tx.5626	chr14	+	1440	4	FSM	ENSMUSG00000115483.2	ENSMUST00000228505.2	1591	4	-192	343	-10	-336	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_2	11.5854314646552	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTTCACTCTTAAGAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43132482	43163125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_43132821_43157302_43157435_43158114_43158297_43162337
tx.5627	chr14	+	996	2	Intergenic	novelGene_259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAATGTGCAAGAATGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43769273	43770779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_43769402_43769911
tx.5628	chr14	+	1745	3	NNC	ENSMUSG00000091477.2	novel	1314	4	NA	NA	-11090	335	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGACATGTATGCTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43769942	43789005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_43770400_43783111_43783244_43787849
tx.5629	chr14	+	1218	3	Fusion	ENSMUSG00000091698.9_ENSMUSG00000049235.9	novel	660	2	NA	NA	1	-349	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTGATCTCCAACTCTTCA	9944	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43935285	43993056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_+_43935631_43987358_43987491_43992315
tx.563	chr1	+	419	4	ISM	ENSMUSG00000026283.14	ENSMUST00000190476.2	918	8	8321	-25	8321	25	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	185	junction_3	15.6276108929747	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTATTTTGACTGATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93740387	93746129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93740482_93744096_93744233_93744359_93744422_93746002
tx.5630	chr14	-	1723	6	NNC	ENSMUSG00000079267.10	novel	1746	5	NA	NA	-45849	-330	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	1.01980390271856	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTCTAAGAAACTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44621890	44568228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_44569014_44573046_44573229_44573910_44574043_44574996_44575160_44575887_44576020_44621561
tx.5631	chr14	-	1644	15	NIC	ENSMUSG00000021831.10	novel	4418	16	NA	NA	33	1921	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_7	176.639737711466	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAAATTTTAATACTAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45555996	45523272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_45523546_45525189_45525324_45525432_45525520_45529818_45529889_45530387_45530635_45531760_45531854_45531967_45531995_45536502_45536541_45537298_45537420_45539149_45539224_45539305_45539380_45541005_45541045_45542705_45542790_45543968_45544089_45555833
tx.5632	chr14	+	1561	14	FSM	ENSMUSG00000021832.9	ENSMUST00000022380.9	2234	14	40	633	0	-633	multi-exon	FALSE	canonical	3	1632	junction_5	93.5359944006622	5205	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATACTCTTGTCTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45567284	45586529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_45567390_45568286_45568367_45568443_45568484_45569362_45569416_45572109_45572178_45572373_45572489_45574934_45575023_45578086_45578149_45578229_45578354_45578738_45578801_45580857_45580979_45581103_45581185_45584200_45584273_45586039
tx.5633	chr14	+	599	3	ISM	ENSMUSG00000021832.9	ENSMUST00000022380.9	2234	14	13903	633	3237	-633	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1688	junction_1	45.5	193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATACTCTTGTCTTTTCT	7610	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45581147	45586529	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_45581185_45584200_45584273_45586039
tx.5634	chr14	-	1458	5	FSM	ENSMUSG00000037722.9	ENSMUST00000227468.2	1490	5	735	-703	-97	703	multi-exon	FALSE	canonical	3	1091	junction_1	77.5387000148958	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATCTTGTCTTGTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45622206	45614907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_45615944_45618393_45618456_45619012_45619141_45620850_45620914_45622037
tx.5635	chr14	-	1551	6	FSM	ENSMUSG00000037722.9	ENSMUST00000046191.9	2788	6	120	1117	-48	703	multi-exon	FALSE	canonical	3	1091	junction_1	71.0419594324368	1732	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATCTTGTCTTGTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45626298	45614907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_45615944_45618393_45618456_45619012_45619141_45620850_45620914_45622037_45622206_45626204
tx.5636	chr14	-	1510	6	NNC	ENSMUSG00000037722.9	novel	2788	6	NA	NA	-23	703	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	35	junction_5	472.912930675405	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATCTTGTCTTGTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45626441	45614907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_45615944_45618393_45618456_45619012_45619141_45620850_45620914_45622037_45622206_45626388
tx.5637	chr14	-	3236	15	FSM	ENSMUSG00000037712.18	ENSMUST00000045905.15	3293	15	57	0	57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	310	junction_11	31.8875575504085	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTCTTTTGTACTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45767518	45696251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_45697481_45699223_45699366_45699572_45699698_45702180_45702403_45702540_45702648_45704794_45704920_45705959_45706010_45706696_45706832_45710228_45710337_45713029_45713133_45713344_45713571_45719888_45720024_45741953_45742188_45766881_45767049_45767390
tx.5638	chr14	-	600	4	ISM	ENSMUSG00000037712.18	ENSMUST00000150660.3	816	6	-97	6598	57	19	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	322	junction_3	38.0525951808809	924	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGATGACCAGTCTGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45767518	45719952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_45720024_45741953_45742188_45766881_45767049_45767390
tx.5639	chr14	-	524	3	ISM	ENSMUSG00000037712.18	ENSMUST00000150660.3	816	6	-92	28599	62	175	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	322	junction_2	45	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGTGACCTGCCCTTCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45767513	45741953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_45742188_45766881_45767049_45767390
tx.564	chr1	+	1628	9	ISM	ENSMUSG00000073609.10	ENSMUST00000097633.10	3232	10	0	3902	0	-3902	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	12.5573683548744	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTATGTCTGCCATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93752961	93776168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93753042_93754006_93754363_93756927_93756986_93757478_93757619_93760317_93760512_93763008_93763178_93765661_93765806_93766542_93766686_93775824
tx.5640	chr14	-	483	2	NNC	ENSMUSG00000115391.2	novel	1035	2	NA	NA	1827	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGACTGTACACCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45790032	45789305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_45789705_45789948
tx.5641	chr14	-	1074	3	ISM	ENSMUSG00000037697.20	ENSMUST00000141487.8	1729	11	19174	-604	1115	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_1	6.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCACTAGTTCAATTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45839069	45832179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_45833122_45836558_45836643_45839021
tx.5642	chr14	+	644	2	NNC	ENSMUSG00000082475.3	novel	508	3	NA	NA	8596	100	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAATTAGAGATGTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45950588	45951280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_45951157_45951204
tx.5643	chr14	-	725	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000044285.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTCTTTATATATATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46322435	46321482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_46321648_46321875
tx.5644	chr14	+	727	2	NNC	ENSMUSG00000044285.9	novel	750	2	NA	NA	-2	-20	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAACTCAAGAAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46321482	46322437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_46321631_46321858
tx.5645	chr14	+	622	4	FSM	ENSMUSG00000079261.3	ENSMUST00000111826.3	733	4	111	0	111	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTGCACGTAAAGTCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46617034	46621065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_46617099_46617735_46617844_46620533_46620675_46620756
tx.5646	chr14	-	1779	3	ISM	ENSMUSG00000021835.16	ENSMUST00000074077.12	2064	4	3308	0	-57	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_2	1.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAAGACCTTTCTATCTTAT	9673	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46624818	46620976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_46622170_46623171_46623552_46624612
tx.5647	chr14	+	424	2	FSM	ENSMUSG00000086746.3	ENSMUST00000127359.2	344	2	-80	0	-80	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCATCTCCTGGTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46624895	46626739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_46625080_46626499
tx.5648	chr14	+	805	8	FSM	ENSMUSG00000037628.11	ENSMUST00000067426.6	917	8	37	75	-8	74	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_6	72.4563204099335	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGATCCTCCTAATGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46998034	47009051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_46998106_46999984_47000068_47001980_47002037_47002452_47002498_47004632_47004856_47006322_47006355_47007292_47007394_47008857
tx.5649	chr14	+	739	8	NIC	ENSMUSG00000037628.11	novel	917	8	NA	NA	-7	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	194	junction_1	23.9395497204172	473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTCCAGCATAGTCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46998035	47008983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_46998106_46999984_47000068_47001980_47002037_47002452_47002498_47004632_47004856_47006322_47006355_47007289_47007394_47008857
tx.565	chr1	+	802	2	ISM	ENSMUSG00000073609.10	ENSMUST00000112881.8	3459	10	-28	25597	6	293	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTGGCTAAAGTGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93752967	93754473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93753303_93754006
tx.5650	chr14	-	1334	5	FSM	ENSMUSG00000015759.12	ENSMUST00000015903.12	1538	5	101	103	24	-103	multi-exon	FALSE	canonical	3	505	junction_4	16.1322658049017	3072	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGCTTTGCTGTGCATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47025767	47013126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_47014007_47016345_47016490_47017569_47017683_47021568_47021638_47025639
tx.5651	chr14	-	634	7	FSM	ENSMUSG00000062014.14	ENSMUST00000111817.8	4171	7	22	3515	22	10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	212.21091447478	847	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTACTTACAGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47059677	47049120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_47049281_47051700_47051775_47052361_47052445_47053055_47053106_47053634_47053685_47054842_47054940_47059557
tx.5652	chr14	+	436	2	FSM	ENSMUSG00000055128.16	ENSMUST00000140114.3	419	2	-17	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACTGTAGACGTGAAGATGA	614	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47069658	47077871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47069837_47077613
tx.5653	chr14	+	1230	6	NNC	ENSMUSG00000055128.16	novel	1324	6	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_2	17.9398996652713	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGGACACTGTCTTTGTC	628	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47069672	47091650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_47069837_47077613_47077754_47083333_47083509_47083641_47083790_47090835_47090944_47091155
tx.5654	chr14	+	1228	6	FSM	ENSMUSG00000055128.16	ENSMUST00000068532.10	1324	6	98	-2	4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_4	10.2097992144802	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGACACTGTCTTTGTCGA	635	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47069679	47091652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47069837_47077613_47077754_47083330_47083509_47083641_47083790_47090835_47090944_47091155
tx.5655	chr14	+	885	4	FSM	ENSMUSG00000055128.16	ENSMUST00000133989.8	873	4	-4	-8	-4	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_2	7.78888096369861	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCCTTCTGTGGTAGATATT	637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47069681	47084053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47069837_47077613_47077754_47083330_47083509_47083641
tx.5656	chr14	-	1301	4	ISM	ENSMUSG00000037572.18	ENSMUST00000187531.8	4260	25	31381	0	-181	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	309	junction_2	20.757863302587	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTCTTGCTATGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47482908	47478400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_47479270_47481259_47481399_47482441_47482570_47482743
tx.5657	chr14	-	1481	7	ISM	ENSMUSG00000037572.18	ENSMUST00000187531.8	4260	25	28971	0	-2591	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	309	junction_2	30.8094502096714	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTCTTGCTATGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47485318	47478400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_47479270_47481259_47481399_47482441_47482570_47482743_47482915_47483289_47483334_47484837_47484892_47485242
tx.5658	chr14	-	1987	10	ISM	ENSMUSG00000037572.18	ENSMUST00000187531.8	4260	25	24798	-2	4227	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	301	junction_9	32.907652305306	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTCTTGCTATGGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47489491	47478398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_47479270_47481259_47481399_47482441_47482570_47482743_47482915_47483289_47483334_47484837_47484892_47485242_47485356_47485452_47485671_47488216_47488349_47489374
tx.5659	chr14	-	2020	11	ISM	ENSMUSG00000037572.18	ENSMUST00000187531.8	4260	25	20692	0	121	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	301	junction_9	38.057982079979	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTCTTGCTATGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47493597	47478400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_47479270_47481259_47481399_47482441_47482570_47482743_47482915_47483289_47483334_47484837_47484892_47485242_47485356_47485452_47485671_47488216_47488349_47489374_47489490_47493560
tx.566	chr1	+	563	2	ISM	ENSMUSG00000073609.10	ENSMUST00000097633.10	3232	10	-16	25597	-16	293	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTGGCTAAAGTGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93752945	93754473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_93753042_93754006
tx.5660	chr14	-	4264	25	FSM	ENSMUSG00000037572.18	ENSMUST00000187531.8	4260	25	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	98	junction_11	68.6814304516795	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTGTCTTGCTATGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47514293	47478400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_47479270_47481259_47481399_47482441_47482570_47482743_47482915_47483289_47483334_47484837_47484892_47485242_47485356_47485452_47485671_47488216_47488349_47489374_47489490_47493560_47493718_47495977_47496116_47498796_47499039_47500895_47501081_47503130_47503316_47504437_47504631_47505528_47505671_47506112_47506220_47507591_47507685_47509592_47509689_47510323_47510375_47510568_47510681_47511369_47511522_47512200_47512313_47513977
tx.5661	chr14	+	2334	2	FSM	ENSMUSG00000048379.10	ENSMUST00000065562.6	6877	2	-11	4554	-11	1512	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGGCGAATGGAACCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47514376	47529005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47514679_47526973
tx.5662	chr14	-	384	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000114977.2	novel	1035	1	NA	NA	-12102	-764	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGAGGCCGACCTGGCCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47548101	47535728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_-_47535881_47547869
tx.5663	chr14	+	1067	3	NNC	ENSMUSG00000021840.18	novel	4542	4	NA	NA	3	-3477	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	122.5	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAGTGTGCTTAATGTGAT	9633	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47535728	47557075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_47535863_47547844_47548571_47556868
tx.5664	chr14	+	1061	4	FSM	ENSMUSG00000021840.18	ENSMUST00000166743.9	4542	4	5	3476	5	-3476	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_2	12.2836838484589	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTGTGCTTAATGTGATT	9635	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47535730	47557076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47535863_47546023_47546046_47547871_47548571_47556868
tx.5665	chr14	-	389	3	Intergenic	novelGene_261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGTGTGGTGGTCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47601316	47594604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_47594780_47600014_47600062_47601149
tx.5666	chr14	-	511	4	Intergenic	novelGene_262	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.71404520791032	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGTGTGGTGGTCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47602567	47594604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_47594780_47600014_47600062_47601149_47601315_47602443
tx.5667	chr14	-	417	4	Intergenic	novelGene_263	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	4.24264068711928	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGTGTGGTGGTCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47602591	47594604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_47594780_47600014_47600062_47601149_47601197_47602443
tx.5668	chr14	-	482	4	Intergenic	novelGene_265	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.71404520791032	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAAGTGTGGTGGTCCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47602646	47594604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_47594780_47600014_47600062_47601149_47601315_47602551
tx.5669	chr14	+	957	6	FSM	ENSMUSG00000050335.18	ENSMUST00000142734.8	1419	6	99	363	-4	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	33	junction_1	23.7941169199447	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCATCGCTTTGGGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47611368	47623254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47611410_47616979_47617002_47617509_47617876_47619052_47619142_47622058_47622225_47622981
tx.567	chr1	+	525	2	NNC	ENSMUSG00000073609.10	novel	3232	10	NA	NA	5	293	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACTTGGCTAAAGTGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93752966	93754473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_93753042_93754023
tx.5670	chr14	+	962	5	NIC	ENSMUSG00000050335.18	novel	1298	6	NA	NA	-4	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	40.4907396820557	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCATCGCTTTGGGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47611368	47623254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_47611437_47617509_47617876_47619052_47619142_47622058_47622225_47622981
tx.5671	chr14	+	982	6	FSM	ENSMUSG00000050335.18	ENSMUST00000150290.9	1298	6	25	291	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	20.2286924935845	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCATCGCTTTGGGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47611370	47623254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47611437_47616979_47617002_47617509_47617876_47619052_47619142_47622058_47622225_47622981
tx.5672	chr14	+	918	5	ISM	ENSMUSG00000050335.18	ENSMUST00000146468.4	1072	6	5557	-3	5557	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_1	3.39116499156263	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCATCGCTTTGGGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47616977	47623254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_47617002_47617509_47617876_47619052_47619142_47622058_47622225_47622981
tx.5673	chr14	-	345	2	ISM	ENSMUSG00000037544.15	ENSMUST00000178773.2	577	3	-16	2744	-9	-2212	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	538	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGAAGGGTCTTTTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47655673	47653791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_47654029_47655565
tx.5674	chr14	+	3051	3	FSM	ENSMUSG00000037536.15	ENSMUST00000168833.9	2993	3	-58	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	10.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGTCTGGTCTTAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47710017	47769415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47710175_47763661_47763772_47766631
tx.5675	chr14	+	3116	4	FSM	ENSMUSG00000037536.15	ENSMUST00000163324.8	3132	4	12	4	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_2	28.4526897771644	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAGGTCTGGTCTTAAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47710029	47769415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_47710175_47738250_47738328_47763661_47763772_47766631
tx.5676	chr14	+	350	2	ISM	ENSMUSG00000021843.18	ENSMUST00000190252.7	4436	41	6	72575	1	-333	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	625	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATCCAGAATGGGACCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47886773	47901439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_47886897_47901212
tx.5677	chr14	-	1804	2	ISM	ENSMUSG00000021848.17	ENSMUST00000135279.2	737	3	480	-1239	480	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGGTCTAGTTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48898909	48895133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_48896784_48898755
tx.5678	chr14	-	2062	4	NNC	ENSMUSG00000021848.17	novel	2592	6	NA	NA	-94	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_3	13.7194104181711	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGGTCTAGTTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48900423	48895133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_48896784_48898755_48898908_48899900_48900117_48900379
tx.5679	chr14	-	2938	4	FSM	ENSMUSG00000021848.17	ENSMUST00000118578.9	2144	4	-792	-2	-377	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_3	16.8720676464584	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTGGGTCTAGTTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48903355	48895133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_48896784_48898755_48898908_48899900_48900117_48902435
tx.568	chr1	+	2896	10	NNC	ENSMUSG00000073609.10	novel	3232	10	NA	NA	9	-310	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	13.736497298245	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTTACCTTGTTCTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93752970	93779760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_93753042_93754023_93754363_93756927_93756986_93757478_93757619_93760317_93760512_93763008_93763178_93765661_93765806_93766542_93766686_93775824_93775991_93778288
tx.5680	chr14	-	4119	17	NNC	ENSMUSG00000061244.15	novel	12699	18	NA	NA	8	1352	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_12	42.5506591458934	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAGAAAAATATCAAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49303845	49249859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_49251807_49252873_49253090_49253654_49253764_49254930_49255018_49256858_49256980_49260655_49260765_49270727_49270876_49272264_49272475_49273455_49273539_49274215_49274357_49274460_49274506_49275129_49275240_49279914_49280007_49286160_49286356_49288776_49288925_49289754_49289850_49303582
tx.5681	chr14	-	2753	18	FSM	ENSMUSG00000061244.15	ENSMUST00000162175.9	12699	18	271	9675	14	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_14	16.0953043938104	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAGTTTTTCAGTGAAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49303839	49251221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_49251807_49252873_49253090_49253654_49253764_49254930_49255018_49256858_49256980_49260655_49260765_49270727_49270876_49272264_49272475_49273455_49273539_49274215_49274357_49274460_49274506_49275129_49275240_49276811_49276841_49279941_49280007_49286160_49286356_49288776_49288925_49289754_49289850_49303582
tx.5682	chr14	+	3090	8	FSM	ENSMUSG00000036291.7	ENSMUST00000037473.6	6321	8	35	3196	-1	264	multi-exon	TRUE	canonical	3	109	junction_2	12.7487494384703	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCTGCTTCTTTTTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49303986	49325140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_49304322_49311005_49311652_49316151_49316380_49317692_49317833_49318292_49318379_49318467_49318587_49321315_49321413_49323701
tx.5683	chr14	+	1181	2	FSM	ENSMUSG00000036291.7	ENSMUST00000228238.2	3514	2	35	2298	0	-2298	multi-exon	FALSE	canonical	3	152	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGACATTATCTTCCTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49303987	49311852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_49304322_49311005
tx.5684	chr14	+	896	3	FSM	ENSMUSG00000036282.16	ENSMUST00000138478.2	2157	3	152	1109	152	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	313	junction_2	8.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAAGTATTCTTGTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49415507	49425721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_49415633_49418162_49418219_49425006
tx.5685	chr8	-	213	1	Intergenic	novelGene_368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	20	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGAAATTGCCTTAGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	129473264	129473051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr8_-_129473100_129473300
tx.5686	chr14	-	2751	8	FSM	ENSMUSG00000036242.16	ENSMUST00000118129.2	3100	8	-3	352	-3	-352	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	11.3730795642829	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGCCCTTTTCTTGGTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50020831	49919476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_49919871_49920068_49920204_49926723_49926756_49988875_49989140_50005865_50006058_50007835_50008085_50010318_50011697_50020724
tx.5687	chr14	-	1838	10	FSM	ENSMUSG00000006288.9	ENSMUST00000006451.8	1842	10	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	788	junction_6	38.5313724991294	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTATAGTTCTGTCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51022972	51002871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_51003480_51004599_51004745_51009572_51009788_51009930_51010078_51010733_51010791_51012747_51012840_51014718_51014870_51015213_51015426_51018931_51019065_51022894
tx.5688	chr14	-	908	4	FSM	ENSMUSG00000006288.9	ENSMUST00000226768.2	2366	4	-20	1478	4	-828	multi-exon	FALSE	canonical	3	834	junction_3	1.69967317119759	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGGAACTCACTCTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51022972	51014384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_51014870_51015213_51015426_51018931_51019065_51022894
tx.5689	chr14	-	1489	4	FSM	ENSMUSG00000071470.5	ENSMUST00000095932.5	1509	4	18	2	18	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_1	17.4419672692682	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTTTTCTTTTCTTTTTG	8894	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51033167	51026706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_51027470_51029429_51029764_51031014_51031332_51033092
tx.569	chr1	+	746	3	Intergenic	novelGene_47	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTTGCTTTCCAAAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93874574	93880296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_93874757_93874934_93875052_93879849
tx.5690	chr14	-	1454	4	NNC	ENSMUSG00000071470.5	novel	1509	4	NA	NA	14	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_1	82.8908251188809	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTTTTCTTTTCTTTTTG	8890	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51033171	51026706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_51027470_51029468_51029764_51031014_51031332_51033092
tx.5691	chr14	-	1318	2	NNC	ENSMUSG00000071470.5	novel	444	3	NA	NA	5090	-4309	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	150	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTATGAGTTGTTCTT	1962	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51040099	51035570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_51036656_51039866
tx.5692	chr14	+	1813	16	FSM	ENSMUSG00000036023.7	ENSMUST00000036126.7	1894	16	81	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	692	junction_5	52.2695577431708	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGGCTTCTTTGGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51045378	51058758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_51045445_51047530_51047672_51047956_51048028_51049232_51049284_51052326_51052424_51052808_51052885_51053653_51053757_51054429_51054581_51054788_51054928_51056666_51056731_51056810_51056946_51057117_51057246_51057398_51057499_51057934_51058034_51058251_51058377_51058491
tx.5693	chr14	+	500	3	NIC	ENSMUSG00000097431.3	novel	636	3	NA	NA	0	-132	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATGGAGGCAATTTCTT	2371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51107819	51110159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_51108014_51109207_51109284_51109929
tx.5694	chr14	+	866	2	FSM	ENSMUSG00000097431.3	ENSMUST00000181482.2	2513	2	-13	1660	0	19	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGTGGGCTGGTGAGATGGC	2371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51107819	51114800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_51108014_51114128
tx.5695	chr14	+	484	3	NNC	ENSMUSG00000097431.3	novel	971	4	NA	NA	-1	-132	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	30	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATGGAGGCAATTTCTT	2370	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51107818	51110159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_51108014_51109207_51109284_51109946
tx.5696	chr14	-	1268	11	FSM	ENSMUSG00000006289.15	ENSMUST00000159292.8	3388	11	32	2088	11	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	62	junction_9	170.895289578151	832	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGGTTGTGTTTTTCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51162318	51153138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_51153356_51153608_51153708_51153798_51153875_51154070_51154162_51154256_51154323_51154688_51154768_51154910_51154961_51155292_51155389_51157072_51157249_51157386_51157507_51162120
tx.5697	chr14	+	1250	5	NNC	ENSMUSG00000035960.15	novel	1239	5	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	499.206119754155	2672	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGGCTTTCTTTGTCCCT	169	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51162414	51164596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_51162492_51162673_51162782_51162973_51163162_51163617_51163811_51163912
tx.5698	chr14	+	1391	4	FSM	ENSMUSG00000035960.15	ENSMUST00000154288.3	935	4	21	-477	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1054	junction_2	68.6310587286997	663	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTGGCTTTCTTTGTCCCT	210	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51162455	51164596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_51162782_51162973_51163162_51163617_51163811_51163912
tx.5699	chr14	-	1568	6	ISM	ENSMUSG00000035953.15	ENSMUST00000049312.14	1594	7	335	0	279	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	781	junction_5	33.7579620237952	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTCCCACTTAACAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51167978	51164671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_51165495_51166277_51166369_51166462_51166516_51166658_51166765_51167040_51167148_51167590
tx.57	chr1	-	1156	5	FSM	ENSMUSG00000025920.20	ENSMUST00000115359.10	1151	5	-6	1	4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	33.2217925464596	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTGTTTGTTGTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16589490	16529939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_16530644_16533258_16533419_16556243_16556375_16579565_16579633_16589396
tx.570	chr1	+	1171	3	FSM	ENSMUSG00000051185.10	ENSMUST00000059975.8	2112	3	187	754	182	-754	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_2	1	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACATGTGTTTTATATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95241534	95262255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_95241976_95252833_95252969_95261660
tx.5700	chr14	-	980	2	ISM	ENSMUSG00000035953.15	ENSMUST00000161669.2	356	4	232	-651	232	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	864	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTCCCACTTAACAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51166434	51164671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_51165495_51166277
tx.5701	chr14	-	1468	7	NNC	ENSMUSG00000035953.15	novel	1594	7	NA	NA	275	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	307.887425314297	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTCCCACTTAACAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51167982	51164671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_51165495_51166277_51166369_51166462_51166516_51166658_51166765_51167040_51167148_51167590_51167782_51167885
tx.5702	chr14	-	1575	7	FSM	ENSMUSG00000035953.15	ENSMUST00000160835.9	2755	7	33	1147	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	698	junction_6	55.5447767321305	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTCCCACTTAACAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51168273	51164671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_51165495_51166277_51166369_51166462_51166516_51166658_51166765_51167040_51167148_51167590_51167782_51168069
tx.5703	chr14	+	1338	6	FSM	ENSMUSG00000115338.3	ENSMUST00000048615.13	2942	6	204	1400	0	1118	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_1	38.2015706483385	622	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTGTGTGTGGTTCGGTA	9234	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51181962	51189469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_51182051_51185308_51185479_51187714_51187819_51187999_51188176_51188288_51188480_51188860
tx.5704	chr14	+	1473	2	FSM	ENSMUSG00000021876.16	ENSMUST00000022428.13	1518	2	45	0	45	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGTGTCGGGATTTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51328578	51343604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_51328711_51342263
tx.5705	chr14	-	839	2	FSM	ENSMUSG00000035896.6	ENSMUST00000080126.4	992	2	-26	179	-26	-179	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGCATTTAGGGCAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51384268	51382633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_51383377_51384172
tx.5706	chr14	-	1573	2	FSM	ENSMUSG00000047894.3	ENSMUST00000228835.2	896	2	12	-689	12	689	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTGTTTTGTCTTCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51436593	51432091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_51433399_51436327
tx.5707	chr14	+	1557	14	NNC	ENSMUSG00000004561.15	novel	1623	14	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	48.1261901412816	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTGGATGTTCTGATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52122368	52129325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_52122481_52122607_52122762_52122844_52122980_52124354_52124437_52124679_52124762_52125429_52125504_52126198_52126294_52126603_52126679_52126984_52127093_52127319_52127389_52128134_52128186_52128565_52128659_52128823_52129009_52129083
tx.5708	chr14	+	736	6	ISM	ENSMUSG00000004561.15	ENSMUST00000168413.8	1844	13	4664	-8	2361	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_3	17.2209175133034	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTGGATGTTCTGATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52126996	52129325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_52127093_52127319_52127389_52128134_52128186_52128565_52128659_52128823_52129009_52129083
tx.5709	chr14	+	1370	4	FSM	ENSMUSG00000072572.10	ENSMUST00000047726.12	2334	4	27	937	27	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	1.24721912892465	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCATTGCAATTCTGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52131093	52133265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_52131372_52131545_52131677_52131912_52131964_52132355
tx.571	chr1	+	497	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000081051.5	novel	531	1	NA	NA	-38	54	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	354	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAAGGATGGAACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95426307	95426930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_95426544_95426669
tx.5710	chr14	-	2003	15	FSM	ENSMUSG00000004558.16	ENSMUST00000111632.5	2103	15	102	-2	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	127	junction_6	11.1385064766607	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCATTGTTAATCCGGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52150843	52142737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_52143764_52143969_52144022_52144146_52144183_52144405_52144454_52144702_52144755_52145041_52145087_52145524_52145629_52145786_52145844_52146024_52146112_52146330_52146392_52147514_52147578_52147771_52147893_52148136_52148243_52148922_52149004_52150779
tx.5711	chr14	+	1269	7	FSM	ENSMUSG00000072571.4	ENSMUST00000100638.4	1234	7	-39	4	-39	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	12	junction_4	6.83130051063973	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTGAGTGACGCCAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52254282	52257247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_52254399_52254512_52254655_52255207_52255319_52255410_52255468_52255998_52256110_52256188_52256336_52256662
tx.5712	chr14	+	969	3	ISM	ENSMUSG00000072571.4	ENSMUST00000100638.4	1234	7	1551	4	1497	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_2	0.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGCTGAGTGACGCCAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52255872	52257247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_52256110_52256188_52256336_52256662
tx.5713	chr14	-	1372	9	FSM	ENSMUSG00000060373.16	ENSMUST00000227242.2	2617	9	-5	1250	-3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1744	junction_2	852.637149891441	1080	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8743	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341467	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_52312618_52312711_52312894_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319284_52319361_52321571_52321849_52335471_52335498_52341345
tx.5714	chr14	-	1348	9	FSM	ENSMUSG00000060373.16	ENSMUST00000228748.2	1691	9	0	343	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1620	junction_2	876.028386740407	1208	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341464	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_52312618_52312711_52312873_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319284_52319361_52321571_52321849_52335471_52335498_52341345
tx.5715	chr14	-	1323	8	NIC	ENSMUSG00000060373.16	novel	1691	9	NA	NA	-1	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	1620	junction_2	930.149406475834	1145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341465	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_52312618_52312711_52312873_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319284_52319361_52321571_52321849_52341345
tx.5716	chr14	-	1411	9	FSM	ENSMUSG00000060373.16	ENSMUST00000111610.12	2847	9	18	1418	-3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	714	junction_5	1135.23408929612	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8743	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341467	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_52312618_52312711_52312894_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319245_52319361_52321571_52321849_52335471_52335498_52341345
tx.5717	chr14	-	1347	8	FSM	ENSMUSG00000060373.16	ENSMUST00000227536.2	1301	8	-42	-4	-4	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1725	junction_7	903.44372897739	957	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8742	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341468	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_52312618_52312711_52312894_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319284_52319361_52321571_52321849_52341345
tx.5718	chr14	-	1372	8	NIC	ENSMUSG00000060373.16	novel	2498	9	NA	NA	10	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	714	junction_5	1238.64623270566	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8735	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341475	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_52312618_52312711_52312873_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319245_52319361_52321571_52321849_52341345
tx.5719	chr14	-	1393	8	NIC	ENSMUSG00000060373.16	novel	2847	9	NA	NA	10	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	714	junction_5	1223.61628639314	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8735	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341475	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_52312618_52312711_52312894_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319245_52319361_52321571_52321849_52341345
tx.572	chr1	+	1804	3	FSM	ENSMUSG00000097814.6	ENSMUST00000202118.2	410	3	7	-1401	7	1401	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	4.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAAAAATTTGCACTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96799964	96807027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_96800116_96800209_96800394_96805558
tx.5720	chr14	-	1398	9	FSM	ENSMUSG00000060373.16	ENSMUST00000228198.2	2498	9	-19	1119	10	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	714	junction_5	1148.92795139643	228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTCTCCAAAATAATCTCT	8735	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52341475	52312251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_52312618_52312711_52312873_52313069_52313184_52314859_52315021_52318716_52318765_52319245_52319361_52321571_52321849_52335471_52335498_52341345
tx.5721	chr14	-	336	3	ISM	ENSMUSG00000053754.15	ENSMUST00000089752.11	8190	37	4928	29409	4928	-3171	internal_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_1	4	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTCCCAGAACCAGTGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52470101	52465016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_52465138_52468894_52469010_52470001
tx.5722	chr14	-	2603	7	ISM	ENSMUSG00000022159.17	ENSMUST00000022765.14	2906	8	513	0	209	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	132	junction_5	7.58653778449403	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCATGTGTCATTTCTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52516489	52499215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_52501275_52502155_52502225_52503646_52503759_52506098_52506192_52506374_52506458_52512899_52512968_52516370
tx.5723	chr14	-	2704	8	FSM	ENSMUSG00000022159.17	ENSMUST00000022765.14	2906	8	195	7	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_5	9.75202752335772	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTTTTATTTCATGTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52516807	52499222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_52501275_52502155_52502225_52503646_52503759_52506098_52506192_52506374_52506458_52512899_52512968_52516370_52516443_52516652
tx.5724	chr14	+	757	3	ISM	ENSMUSG00000016831.13	ENSMUST00000152493.2	2997	5	12	6090	12	-703	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	568	junction_2	6	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCACATCTCCATGTCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52517033	52523724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_52517114_52517277_52517347_52523116
tx.5725	chr14	+	716	5	ISM	ENSMUSG00000016831.13	ENSMUST00000022766.8	5350	10	441	9028	22	26	internal_fragment	FALSE	canonical	3	458	junction_4	49.6890329952194	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGACCCAAATGAACCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52517043	52524830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_52517114_52517277_52517347_52523116_52523360_52524185_52524447_52524757
tx.5726	chr14	+	3175	9	ISM	ENSMUSG00000016831.13	ENSMUST00000022766.8	5350	10	441	1889	22	-1889	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	458	junction_4	39.6389959509572	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTTTTAAATGTGCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52517043	52531969	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_52517114_52517277_52517347_52523116_52523360_52524185_52524447_52524757_52524989_52528217_52528299_52528931_52529676_52529976_52530141_52530657
tx.5728	chr14	-	500	4	ISM	ENSMUSG00000022160.19	ENSMUST00000022767.16	2025	11	8383	14	6	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	140	junction_3	16.5730705262081	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTGAAGTGAAATTATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52534202	52532311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_52532551_52533530_52533644_52533972_52534039_52534120
tx.573	chr1	+	3798	2	FSM	ENSMUSG00000097814.6	ENSMUST00000181489.3	3849	2	48	3	36	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAACATAATCATCTCTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96799993	96808956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_96800394_96805558
tx.5732	chr14	+	675	4	Fusion	ENSMUSG00000094212.4_ENSMUSG00000094562.6	novel	385	2	NA	NA	-33	1340	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGAGGACAAAGTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53994779	54002491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr14_+_53994919_53997877_53997967_54000842_54000881_54002082
tx.5733	chr14	+	517	3	NNC	ENSMUSG00000087666.4	novel	426	2	NA	NA	-12	2094	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGCCTTAGTCTTTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54032801	54035514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_54032964_54033144_54033246_54035260
tx.5734	chr14	-	1280	2	Intergenic	novelGene_268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	37	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATAAAGAAAGAGATACCTA	7528	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54173711	54172003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_54173060_54173487
tx.5735	chr14	-	649	3	FSM	ENSMUSG00000022174.9	ENSMUST00000022781.8	878	3	223	6	33	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1530	junction_1	8	8502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGCCATTCGTTCCTTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54491338	54472941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_54473171_54480155_54480326_54491088
tx.5736	chr14	+	418	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022174.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGTGGCTCGCGCGTGCGC	3902	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54480154	54491338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_54480330_54491095
tx.5737	chr14	+	2382	7	FSM	ENSMUSG00000040997.15	ENSMUST00000041197.13	2401	7	20	-1	20	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	303	junction_1	38.1200588783502	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGACACTGTTTAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54496708	54506622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_54496777_54499082_54499172_54500107_54500481_54500625_54500781_54502737_54502850_54504451_54504639_54505224
tx.5738	chr14	+	699	3	FSM	ENSMUSG00000040997.15	ENSMUST00000197802.2	647	3	-50	-2	-9	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	303	junction_1	51.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAGAGTTAAACATCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54496679	54500620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_54496777_54499082_54499172_54500107
tx.5739	chr14	+	2314	6	ISM	ENSMUSG00000040997.15	ENSMUST00000041197.13	2401	7	2394	-1	-1350	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	334	junction_4	30.6763752747941	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGATGACACTGTTTAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54499082	54506622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_54499172_54500107_54500481_54500625_54500781_54502737_54502850_54504451_54504639_54505224
tx.574	chr1	+	2006	5	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000044768.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTAGAGAGATTTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97532737	97558678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_97532996_97533874_97533936_97543054_97543319_97554869_97554985_97557370
tx.5740	chr14	-	1048	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000105501.2	novel	2175	1	NA	NA	-782	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACTTGGTGTCCGTGTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54589875	54586921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_-_54587803_54589708
tx.5741	chr14	+	1519	10	FSM	ENSMUSG00000000959.8	ENSMUST00000000985.7	2538	10	-7	1026	0	10	multi-exon	TRUE	canonical	3	499	junction_4	29.1475598792348	1258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTCTGGGCTTCTTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54598290	54606104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_54598375_54598778_54598926_54600738_54600953_54604165_54604310_54604481_54604568_54604722_54604888_54605044_54605150_54605249_54605413_54605609_54605691_54605774
tx.5742	chr14	-	912	5	ISM	ENSMUSG00000000958.11	ENSMUST00000000984.9	2132	10	35211	0	9918	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_2	16.7089048115069	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGAGTGGCTTTATTCT	6299	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54611706	54606898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_54607344_54607549_54607734_54610396_54610547_54611298_54611396_54611670
tx.5743	chr14	-	2201	12	NNC	ENSMUSG00000000958.11	novel	2126	11	NA	NA	-156	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	22	junction_10	53.1871792169678	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGAGTGGCTTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54655393	54606898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_54607344_54607549_54607734_54610396_54610547_54611298_54611396_54611670_54611775_54612004_54612129_54615222_54615368_54616452_54616579_54645959_54646506_54649041_54649104_54654045_54654228_54655357
tx.5744	chr14	-	2166	11	NNC	ENSMUSG00000000958.11	novel	2126	11	NA	NA	-183	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	45	junction_9	44.7447203589429	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTGAGTGGCTTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54655420	54606898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_54607344_54607549_54607734_54610396_54610547_54611298_54611396_54611670_54611775_54612004_54612129_54615222_54615368_54616452_54616579_54645959_54646506_54654045_54654228_54655357
tx.5745	chr14	+	411	5	FSM	ENSMUSG00000010406.13	ENSMUST00000010550.12	418	5	0	7	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1056	junction_1	196.876230154887	6808	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAGACTCTCTCTGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54664365	54667206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_54664418_54664490_54664549_54664627_54664696_54666040_54666106_54667038
tx.5746	chr14	+	490	4	NIC	ENSMUSG00000010406.13	novel	418	5	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	1056	junction_1	226.233409459248	650	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAGACTCTCTCTGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54664365	54667206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_54664418_54664490_54664696_54666040_54666106_54667038
tx.5747	chr14	+	360	4	FSM	ENSMUSG00000010406.13	ENSMUST00000199195.3	463	4	103	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1331	junction_1	96.858430482615	761	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCAGACTCTCTCTGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54664489	54667206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_54664549_54664627_54664696_54666040_54666106_54667038
tx.5748	chr14	+	1339	3	ISM	ENSMUSG00000022175.10	ENSMUST00000022782.10	4228	7	4452	1217	-224	537	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	186	junction_1	24	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTTGGTAAATCAGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54706045	54707737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_54706239_54706492_54706623_54706721
tx.5749	chr14	-	2533	17	FSM	ENSMUSG00000023110.13	ENSMUST00000023873.12	2691	17	148	10	16	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	685	junction_14	59.4941895797396	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGCTGCTTTACCCTGCTT	4843	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54754834	54744653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_54745405_54746348_54746414_54746745_54746863_54747000_54747095_54747290_54747401_54748335_54748512_54748597_54748721_54748804_54748864_54748958_54749037_54749449_54749612_54750747_54750912_54752053_54752104_54752231_54752345_54752759_54752895_54753562_54753649_54753953_54754073_54754703
tx.575	chr1	-	2550	20	NIC	ENSMUSG00000040648.16	novel	6239	31	NA	NA	-4519	-1510	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_15	76.9574116852717	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCTCAATTTTAAAGATGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97678380	97640668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_97640870_97647558_97647632_97648830_97649005_97651394_97651560_97654913_97655031_97655119_97655228_97656642_97656758_97657635_97657764_97661610_97661835_97662691_97662834_97668186_97668370_97668548_97668671_97668794_97668921_97671781_97671868_97672887_97672998_97673119_97673196_97674142_97674230_97675271_97675374_97677266_97677389_97678291
tx.5750	chr14	-	1563	10	FSM	ENSMUSG00000022177.10	ENSMUST00000022784.9	1587	10	24	0	24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	401	junction_5	37.1423687391577	323	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTTTAGTCATTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54791794	54779241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_54779715_54779839_54779909_54781235_54781367_54781661_54781808_54783182_54783280_54786322_54786458_54787125_54787258_54787350_54787494_54789593_54789668_54791631
tx.5751	chr14	-	3387	8	FSM	ENSMUSG00000022178.12	ENSMUST00000054487.10	3397	8	10	0	10	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	297	junction_5	54.835933399886	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTGAGTGTATTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54815005	54804928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_54806514_54806932_54807002_54807701_54807754_54807833_54807965_54809057_54809121_54809222_54809291_54810848_54810951_54813688
tx.5752	chr14	-	553	2	ISM	ENSMUSG00000022193.8	ENSMUST00000022803.6	899	3	1318	0	1304	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1863	junction_1	0	676	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGGAGTCCACAGTTATT	9942	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54854161	54851575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_54851939_54853971
tx.5753	chr14	-	894	3	FSM	ENSMUSG00000022193.8	ENSMUST00000022803.6	899	3	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1854	junction_2	4.5	6769	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGGAGTCCACAGTTATT	8629	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54855474	54851575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_54851939_54853971_54854279_54855250
tx.5754	chr14	-	1007	6	ISM	ENSMUSG00000022185.20	ENSMUST00000022793.15	4735	19	-34	23351	-34	-386	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_3	38.9512515845127	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGGAAGAAGAAGAAGATGA	2596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54924422	54902968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_54903092_54904529_54904619_54916199_54916320_54916697_54916810_54922467_54922534_54923925
tx.5755	chr14	+	1484	3	FSM	ENSMUSG00000040822.8	ENSMUST00000228027.2	811	3	-42	-631	-21	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	179.5	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTGGTGATTCACATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54923651	54928201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_54924111_54924493_54924578_54927260
tx.5756	chr14	+	1050	2	FSM	ENSMUSG00000040822.8	ENSMUST00000038539.8	1843	2	793	0	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	385	junction_1	0	1379	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTACTGGTGATTCACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54924465	54928198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_54924578_54927260
tx.5757	chr14	-	1033	2	FSM	ENSMUSG00000052435.8	ENSMUST00000064290.8	1241	2	202	6	202	-6	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGAAGCTGTTCACTGGG	18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	54949429	54947822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_54948332_54948905
tx.5758	chr14	+	1226	15	FSM	ENSMUSG00000112858.3	ENSMUST00000218311.2	1201	15	-12	-13	-12	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_1	4.37525509460387	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGTTGTATGAGGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55051585	55091565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55051743_55053942_55054044_55056993_55057047_55057594_55057670_55075569_55075686_55076681_55076743_55077723_55077753_55079339_55079387_55079595_55079639_55079805_55079867_55080243_55080293_55086123_55086164_55086751_55086847_55087992_55088055_55091328
tx.576	chr1	-	563	2	ISM	ENSMUSG00000040648.16	ENSMUST00000042509.13	5882	28	353	55415	353	-19292	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	213	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCATGCTGAAGAGGAGGAG	9187	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97697783	97689187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_97689547_97697579
tx.5760	chr14	-	2917	2	FSM	ENSMUSG00000057156.11	ENSMUST00000142283.4	4713	2	32	1764	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGCCACTTCTGTGTTTC	5560	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55101583	55093007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_55095739_55101397
tx.5761	chr14	+	911	8	NIC	ENSMUSG00000092232.2	novel	1245	9	NA	NA	-59	47	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_1	1114.29847978036	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATATACTGTGGAAGGGGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55120838	55135641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_55120964_55121253_55121342_55132304_55132420_55133085_55133154_55133273_55133381_55134408_55134497_55134577_55134730_55135473
tx.5762	chr14	+	926	7	FSM	ENSMUSG00000022194.16	ENSMUST00000022808.14	1030	7	114	-10	106	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	2071	junction_6	205.041797906887	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGATATACTGTGGAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55131718	55135636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55131952_55132304_55132420_55133085_55133154_55133273_55133381_55134408_55134497_55134577_55134730_55135473
tx.5763	chr14	+	787	7	FSM	ENSMUSG00000022194.16	ENSMUST00000172557.2	700	7	-42	-45	3	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	922.719651657834	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAGATATACTGTGGAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55132032	55135636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55132127_55132304_55132420_55133085_55133154_55133273_55133381_55134408_55134497_55134577_55134730_55135473
tx.5764	chr14	+	670	6	ISM	ENSMUSG00000022194.16	ENSMUST00000172557.2	700	7	252	-44	37	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2071	junction_5	209.02210409428	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAGATATACTGTGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55132326	55135635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55132420_55133085_55133154_55133273_55133381_55134408_55134497_55134577_55134730_55135473
tx.5765	chr14	+	1035	2	ISM	ENSMUSG00000022194.16	ENSMUST00000172557.2	700	7	2524	-786	2309	751	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2071	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAATTGGCCCTTTGGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55134598	55136377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55134730_55135473
tx.5768	chr14	+	1106	11	FSM	ENSMUSG00000022204.10	ENSMUST00000022815.10	1200	11	95	-1	95	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1001	junction_1	176.552230232303	512	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTTTTGCCATACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55253005	55261595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55253046_55253625_55253686_55254522_55254595_55258510_55258649_55258850_55258936_55259012_55259066_55259277_55259402_55259494_55259664_55260506_55260664_55260792_55260851_55261445
tx.5769	chr14	+	1067	10	ISM	ENSMUSG00000022204.10	ENSMUST00000022815.10	1200	11	714	-1	714	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1280	junction_6	108.708580873616	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACATTTTTTGCCATACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55253624	55261595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55253686_55254522_55254595_55258510_55258649_55258850_55258936_55259012_55259066_55259277_55259402_55259494_55259664_55260506_55260664_55260792_55260851_55261445
tx.577	chr1	+	1918	8	FSM	ENSMUSG00000026333.15	ENSMUST00000112844.10	2046	8	3	125	3	-125	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	7.99744857273052	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCTTTTTCTATATGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97697899	97720569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_97697981_97703171_97703318_97705050_97705245_97710651_97710958_97712477_97712670_97712779_97712948_97713700_97713984_97720021
tx.5770	chr14	-	512	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115077.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACTAAGTTACAGGTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55407845	55403191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_55403561_55407702
tx.5771	chr14	+	1317	8	FSM	ENSMUSG00000022210.8	ENSMUST00000022821.8	1392	8	75	0	-42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_3	11.5987332172483	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTGCGTGTTTATTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55716289	55727797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55716491_55717482_55717661_55723573_55723676_55724549_55724621_55724716_55724769_55725040_55725176_55725616_55725673_55727275
tx.5772	chr14	+	2226	10	FSM	ENSMUSG00000040618.8	ENSMUST00000048781.4	3400	10	90	1084	-33	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1356	junction_5	122.962304772893	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTCCCTGTGTCTGCATA	8981	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55777812	55786390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55777971_55779862_55780109_55781045_55781231_55781316_55781521_55781851_55782040_55782341_55782505_55782663_55782883_55785153_55785292_55785496_55785593_55785761
tx.5773	chr14	+	1245	5	ISM	ENSMUSG00000040618.8	ENSMUST00000226770.2	2417	9	4478	-60	940	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1534	junction_2	95.7062563263238	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACTTCCCTGTGTCTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55782340	55786389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55782505_55782663_55782883_55785153_55785292_55785496_55785593_55785761
tx.5774	chr14	+	2704	15	NIC	ENSMUSG00000022214.16	novel	2624	15	NA	NA	-2	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	48	junction_1	27.5910366989435	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGTGTCTGTGTCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55797936	55807521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_55798085_55798531_55798900_55800348_55800477_55800828_55800957_55801176_55801242_55801509_55801611_55801827_55801975_55802190_55802246_55802554_55802624_55802940_55802999_55803093_55803280_55804320_55804475_55804704_55804858_55806479_55806587_55806684
tx.5775	chr14	+	872	2	FSM	ENSMUSG00000022215.7	ENSMUST00000022826.7	971	2	97	2	97	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGTCTCCTCCGATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55813170	55814409	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55813405_55813771
tx.5776	chr14	+	1020	11	FSM	ENSMUSG00000022216.18	ENSMUST00000174259.8	1112	11	92	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	117	junction_4	54.1775783881118	724	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCATGTCTTTATTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55815908	55818985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55816071_55817051_55817085_55817227_55817291_55817387_55817499_55817570_55817617_55817786_55817885_55818051_55818121_55818200_55818269_55818374_55818430_55818508_55818596_55818757
tx.5777	chr14	+	653	7	FSM	ENSMUSG00000022216.18	ENSMUST00000174148.8	724	7	148	-77	78	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	234	junction_1	24.8774775427271	339	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCATGTCTTTATTGTATG	NA	False	NA	86	True	NA	NA	NA	55817568	55818985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55817617_55817786_55817885_55818051_55818121_55818200_55818269_55818374_55818430_55818508_55818596_55818757
tx.5778	chr14	-	876	5	FSM	ENSMUSG00000022217.15	ENSMUST00000022828.9	855	5	-18	-3	-18	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_1	3.69966214673719	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTATTTATTGTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55822777	55818975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_55819201_55819337_55819433_55819512_55819583_55822135_55822213_55822368
tx.5779	chr14	-	838	11	FSM	ENSMUSG00000079197.11	ENSMUST00000161807.8	962	11	122	2	8	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	915	junction_9	61.4455856835949	2560	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTACCTGTGTTGTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55828422	55824899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_55825023_55825110_55825198_55825496_55825552_55825689_55825758_55825900_55825970_55826757_55826856_55826937_55826969_55827075_55827163_55827489_55827553_55827951_55827985_55828298
tx.578	chr1	+	925	2	FSM	ENSMUSG00000026333.15	ENSMUST00000122925.2	517	2	-25	-383	-3	383	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTCCTGCTCATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97697900	97699113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_97697981_97698268
tx.5780	chr14	-	834	10	NNC	ENSMUSG00000079197.11	novel	962	11	NA	NA	6	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	322.110747000676	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTACCTGTGTTGTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55828424	55824899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_55825023_55825110_55825198_55825496_55825552_55825689_55825758_55825900_55825970_55826757_55826856_55826937_55826969_55827075_55827163_55827489_55827553_55828271
tx.5781	chr14	+	3430	21	FSM	ENSMUSG00000047098.19	ENSMUST00000019443.15	3485	21	34	21	-2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_6	30.6031044176894	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTCTTGGTGGTCCTTCTT	4208	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55829198	55841129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55829530_55829625_55829773_55829917_55830074_55830289_55830350_55830462_55830533_55831751_55831930_55832379_55832759_55832926_55833218_55833463_55833713_55833798_55833985_55834108_55834316_55836094_55836269_55836360_55836460_55836552_55836643_55838505_55838621_55838735_55838855_55839098_55839213_55839337_55839396_55840059_55840157_55840712_55840882_55840988
tx.5782	chr14	+	811	7	ISM	ENSMUSG00000047098.19	ENSMUST00000133903.3	4939	15	8170	-2	-105	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	183	junction_1	12.3749298538977	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTCTTGGTGGTCCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55838507	55841129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55838621_55838735_55838855_55839098_55839213_55839337_55839396_55840059_55840157_55840712_55840882_55840988
tx.5783	chr14	-	700	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000002325.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTGAATATTCCTCGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55843719	55842204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_55842726_55843068_55843187_55843658
tx.5784	chr14	+	1726	5	ISM	ENSMUSG00000002325.16	ENSMUST00000138037.2	2343	9	1774	0	533	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_1	17.4427635425124	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGGTCATGTGGTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55843809	55847487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55843896_55843993_55844066_55844970_55845313_55846141_55846258_55846377
tx.5785	chr14	+	2097	20	FSM	ENSMUSG00000002324.9	ENSMUST00000002395.8	2184	20	87	0	87	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_6	6.49738920505725	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTGCCTCTTTTTTTTTTT	1415	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55855580	55862852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55855811_55856002_55856116_55856198_55856268_55856354_55856498_55856577_55856654_55857036_55857158_55858691_55858777_55859671_55859752_55859883_55860020_55860101_55860175_55860250_55860343_55860620_55860671_55860953_55861092_55861377_55861445_55861532_55861700_55861805_55861855_55862179_55862244_55862341_55862459_55862529_55862637_55862732
tx.5786	chr14	+	528	6	ISM	ENSMUSG00000002324.9	ENSMUST00000002395.8	2184	20	6134	1	602	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_5	3.05941170815567	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACTTTGCCTCTTTTTTTTTT	7462	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55861627	55862851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55861700_55861805_55861855_55862179_55862244_55862341_55862459_55862529_55862637_55862732
tx.5787	chr14	-	3499	30	FSM	ENSMUSG00000002319.17	ENSMUST00000047131.16	3846	30	29	318	-24	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_28	76.4571487859417	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAGGAAGCAGCTGTGACGT	9774	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55873112	55863174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_55863499_55863610_55863681_55864796_55864902_55864991_55865125_55865241_55865451_55865562_55865689_55866048_55866097_55866250_55866445_55866523_55866633_55866716_55866775_55866850_55866929_55867205_55867325_55867434_55867547_55867751_55867873_55868054_55868169_55868273_55868388_55868598_55868729_55868888_55868998_55869489_55869600_55869756_55869811_55870417_55870583_55870790_55870875_55870961_55871064_55871168_55871235_55871471_55871652_55871736_55871867_55872461_55872504_55872588_55872669_55872819_55872907_55872986
tx.5788	chr14	-	756	5	FSM	ENSMUSG00000002329.8	ENSMUST00000226659.2	1730	5	0	974	0	890	multi-exon	FALSE	canonical	3	428	junction_3	25.3673017879316	399	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTTGTTTCCATTTTTCT	2342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55897908	55896324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_55896532_55896656_55896743_55896826_55896935_55897444_55897686_55897794
tx.5789	chr14	-	690	6	FSM	ENSMUSG00000002329.8	ENSMUST00000002400.7	1733	6	54	989	-3	890	multi-exon	FALSE	canonical	3	347	junction_4	50.5750926840476	1685	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTTGTTTCCATTTTTCT	2339	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55897911	55896324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_55896532_55896656_55896743_55896826_55896935_55897444_55897556_55897624_55897686_55897794
tx.579	chr1	+	1708	8	NIC	ENSMUSG00000026333.15	novel	2046	8	NA	NA	0	-127	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_3	18.8148877222268	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCACCTTTTTCTATATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97697896	97720567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_97697981_97703171_97703318_97705050_97705245_97710862_97710958_97712477_97712670_97712779_97712948_97713700_97713984_97720021
tx.5790	chr14	-	780	4	FSM	ENSMUSG00000010376.16	ENSMUST00000010520.10	824	4	44	0	44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1795	junction_3	42.0502345085283	16483	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGACTCTTTCTTCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55909537	55899719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_55900083_55900871_55900955_55901268_55901317_55909251
tx.5791	chr14	+	1496	10	FSM	ENSMUSG00000002326.7	ENSMUST00000002397.7	1993	10	43	454	20	430	multi-exon	TRUE	canonical	3	97	junction_1	15.6828127988557	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTAGACGTTCTTCTATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55909734	55916203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_55909842_55910162_55910259_55910406_55910527_55912783_55912868_55913015_55913190_55914211_55914294_55914384_55914492_55914662_55914706_55915327_55915488_55915680
tx.5792	chr14	+	832	4	ISM	ENSMUSG00000002326.7	ENSMUST00000002397.7	1993	10	4692	456	-30	428	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_1	15.2970585407784	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTTAGACGTTCTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55914383	55916201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55914492_55914662_55914706_55915327_55915488_55915680
tx.5793	chr14	+	684	2	ISM	ENSMUSG00000002326.7	ENSMUST00000227696.2	545	3	911	-428	911	428	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	162	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTTAGACGTTCTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55915324	55916201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55915488_55915680
tx.5794	chr14	-	1708	9	FSM	ENSMUSG00000007589.10	ENSMUST00000007733.8	2956	9	12	1236	-4	1105	multi-exon	FALSE	canonical	3	280	junction_6	40.8281459290034	433	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTAGGTCATTCCTCCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55919265	55916558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_55916867_55916970_55917063_55917322_55917388_55917471_55917914_55918067_55918165_55918251_55918360_55918456_55918547_55918681_55918769_55918846
tx.5795	chr14	-	1420	9	FSM	ENSMUSG00000002332.17	ENSMUST00000002403.10	1477	9	57	0	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_7	15.4833580014156	419	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTGAGTTCTCATTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55983090	55976476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_55976878_55977008_55977090_55977392_55977463_55978183_55978331_55978639_55978773_55980910_55980991_55981114_55981259_55982374_55982546_55982897
tx.5796	chr14	+	1669	9	ISM	ENSMUSG00000019297.10	ENSMUST00000019441.9	3694	10	729	1436	729	-1436	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	659	junction_1	23.4464149711635	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTATTTTATTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55983878	55991521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55984068_55986788_55986900_55987448_55987591_55988509_55988703_55989514_55989656_55989993_55990120_55990268_55990506_55990716_55990823_55991097
tx.5797	chr14	+	561	3	ISM	ENSMUSG00000019297.10	ENSMUST00000019441.9	3694	10	7325	1436	3792	-1436	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	698	junction_2	18	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTATTTTATTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55990474	55991521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55990506_55990716_55990823_55991097
tx.5798	chr14	+	463	2	ISM	ENSMUSG00000019297.10	ENSMUST00000019441.9	3694	10	7634	1436	4101	-1436	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	698	junction_1	0	298	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTTATTTTATTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55990783	55991521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_55990823_55991097
tx.5799	chr14	-	1879	10	FSM	ENSMUSG00000022221.15	ENSMUST00000022830.14	1892	10	13	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_2	8.73194786861711	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGTCTGAGGTGTCAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56026309	56022451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_56022809_56023318_56023377_56023482_56023816_56024039_56024108_56024213_56024382_56024570_56024618_56024738_56024897_56025280_56025591_56025694_56025839_56026073
tx.58	chr1	-	1036	4	NIC	ENSMUSG00000025920.20	novel	1151	5	NA	NA	-7	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	3	junction_1	38.8529993122224	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTGTTTGTTGTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16589501	16529939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_16530644_16533258_16533419_16579565_16579633_16589396
tx.580	chr1	-	1484	12	ISM	ENSMUSG00000056536.15	ENSMUST00000190811.7	3015	26	-11	83794	0	6029	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	56	junction_9	9.63979355768114	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAATCTGTAGTTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105591398	105568324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_105568450_105572203_105572245_105574422_105574540_105575833_105575965_105577007_105577133_105580828_105580936_105583658_105583758_105584390_105584513_105585326_105585576_105586611_105586732_105587017_105587092_105591224
tx.5800	chr14	-	2114	9	ISM	ENSMUSG00000022221.15	ENSMUST00000168716.8	1964	10	5	-1	5	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	118	junction_2	9.25928587959136	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAGTCTGAGGTGTCAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56026309	56022451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_56022809_56023318_56023377_56023482_56023816_56024039_56024108_56024213_56024382_56024570_56024618_56024738_56024897_56025280_56025591_56025694
tx.5801	chr14	+	806	3	Intergenic	novelGene_270	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGGAGCCTTTGTTTTTGTTT	8420	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56026387	56031234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_56026690_56030596_56030943_56031076
tx.5802	chr14	+	1142	4	FSM	ENSMUSG00000023411.13	ENSMUST00000226869.2	2217	4	1394	-319	1394	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_3	8.05536398239638	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCAGGCTCCAGAGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56069119	56071400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_56069166_56069404_56069532_56069679_56070262_56071013
tx.5803	chr14	-	1221	6	FSM	ENSMUSG00000022223.10	ENSMUST00000111325.5	1255	6	34	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_5	35.4547599061113	421	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCACTGGCTTCCGCTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56137681	56134739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_56135470_56135699_56135844_56136640_56136763_56137103_56137187_56137270_56137378_56137646
tx.5804	chr14	-	1188	5	FSM	ENSMUSG00000022223.10	ENSMUST00000227139.2	867	5	306	-627	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_3	15.0499169432924	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCACTGGCTTCCGCTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56137379	56134739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_56135470_56135699_56135844_56136640_56136763_56137103_56137187_56137270
tx.5805	chr14	+	3536	26	NIC	ENSMUSG00000000365.10	novel	5264	37	NA	NA	-29	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	349	junction_12	57.9852946875326	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTATTGGTTTCCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56640124	56726893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_56640282_56643033_56643129_56658531_56658624_56661914_56662027_56663056_56663129_56665344_56665446_56668934_56669107_56671777_56671855_56672053_56672129_56676060_56676366_56678987_56679078_56697422_56697582_56699337_56699528_56700480_56700650_56703083_56703275_56705121_56705264_56708747_56708902_56712854_56712971_56715045_56715164_56718148_56718267_56719423_56719652_56720530_56720682_56720820_56720940_56722610_56722702_56724418_56724535_56726767
tx.5806	chr14	+	419	3	NNC	ENSMUSG00000000365.10	novel	1609	11	NA	NA	-31	-31439	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	12	junction_2	271	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCATTGTGAACTCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56640122	56647931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_56640282_56643033_56643129_56647766
tx.5807	chr14	+	1293	10	ISM	ENSMUSG00000000365.10	ENSMUST00000225361.2	1609	11	-32	2970	-29	-2970	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	453	junction_4	32.6602412425979	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTTAATGTTCATGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56640124	56676400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_56640282_56643033_56643129_56658531_56658624_56661914_56662027_56663056_56663129_56665344_56665446_56668934_56669107_56671777_56671855_56672053_56672129_56676060
tx.5808	chr14	-	677	4	ISM	ENSMUSG00000064128.9	ENSMUST00000065302.8	4363	17	41677	0	-12	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_3	6.16441400296898	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTTTTACATTCTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56767626	56764217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_56764569_56767144_56767266_56767346_56767432_56767506
tx.5809	chr14	-	1135	8	ISM	ENSMUSG00000064128.9	ENSMUST00000065302.8	4363	17	36322	1	-5367	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_5	10.8477402894684	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATCTGTTTTACATTCTTTGA	5345	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56772981	56764218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_56764569_56767144_56767266_56767346_56767432_56767506_56767648_56769692_56769807_56770032_56770098_56772212_56772298_56772807
tx.581	chr1	-	1977	7	ISM	ENSMUSG00000056536.15	ENSMUST00000190811.7	3015	26	-25	95280	-10	-5303	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_4	11.5289490703475	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAGACCAATGATTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105591412	105579810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_105580936_105583658_105583758_105584390_105584513_105585326_105585576_105586611_105586732_105587017_105587092_105591224
tx.5810	chr14	+	700	3	ISM	ENSMUSG00000054509.8	ENSMUST00000161553.2	6387	35	4	73779	4	-73777	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_2	2	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTTGCTTATGTGTGT	1091	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56813079	56823472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_56813188_56821615_56821749_56823013
tx.5811	chr14	+	570	4	NNC	ENSMUSG00000054509.8	novel	6387	35	NA	NA	4	-73777	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	10.0332779621949	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTTGCTTATGTGTGT	1091	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56813079	56823472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_56813188_56821615_56821749_56823013_56823210_56823339
tx.5812	chr14	+	792	3	ISM	ENSMUSG00000079184.11	ENSMUST00000116468.2	2939	14	10	23211	10	242	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	870	junction_1	10.5	1193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGCTGAAGTAAGAGATTTAA	1788	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56905714	56911676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_56906022_56909861_56910018_56911347
tx.5813	chr14	+	2927	14	FSM	ENSMUSG00000079184.11	ENSMUST00000116468.2	2939	14	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	627	junction_4	88.7108193370776	272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTCTACTAGTCGTTGTGA	1790	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56905716	56934887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_56906022_56909861_56910018_56911347_56912197_56913978_56914076_56916020_56916276_56922414_56922541_56922618_56922708_56925821_56925963_56926485_56926573_56928363_56928519_56930880_56931036_56933077_56933206_56934115_56934200_56934587
tx.5814	chr14	-	1453	6	ISM	ENSMUSG00000021938.13	ENSMUST00000022507.13	4114	9	16289	1734	-160	1542	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	327	junction_4	20.2918702932973	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGTTTGAAAGTAAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56999484	56959900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_56960738_56962762_56962933_56965976_56966035_56986291_56986401_56996086_56996172_56999290
tx.5815	chr14	-	1131	4	ISM	ENSMUSG00000021938.13	ENSMUST00000022507.13	4114	9	29419	1731	12970	1545	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	362	junction_2	7.40870359029762	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTTGAAAGTAAATCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56986354	56959897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_56960738_56962762_56962933_56965976_56966035_56986291
tx.5816	chr14	-	3006	8	FSM	ENSMUSG00000040123.18	ENSMUST00000111285.9	5351	8	10	2335	-9	405	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_6	24.4798959581623	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTATTTTTGTTTTCTTGTG	8831	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57049163	57030379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_57031958_57034060_57034268_57035124_57035288_57036366_57036650_57041605_57041697_57041871_57042321_57048196_57048317_57049048
tx.5817	chr14	-	2909	7	NIC	ENSMUSG00000040123.18	novel	5290	8	NA	NA	-16	402	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	42	junction_6	15.7630016882008	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTTATTTTTGTTTTCTT	8805	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57049189	57030382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_57031958_57034060_57034268_57035124_57035288_57036366_57036650_57041605_57041697_57041871_57042321_57049048
tx.5818	chr14	-	1634	5	ISM	ENSMUSG00000040123.18	ENSMUST00000225699.2	2455	7	-37	3835	-18	23	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_4	17.7394334746068	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATTTGTTGTAATAATTCA	8803	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57049191	57034619	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_57035288_57036366_57036650_57041605_57041697_57041871_57042321_57049048
tx.5819	chr14	+	685	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000114500.2	novel	943	1	NA	NA	-156	490	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTAGGAACCTTGTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57102713	57104302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_57102826_57103729
tx.582	chr1	+	931	2	FSM	ENSMUSG00000026319.14	ENSMUST00000191150.2	874	2	-54	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	0	262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTCTGCTTCATAGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105591607	105592878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_105592359_105592698
tx.5820	chr14	+	383	3	NNC	ENSMUSG00000021945.10	novel	1281	3	NA	NA	-78	-14257	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	53.5	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCAGTTCTTTTAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57124031	57127067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_57124156_57125251_57125315_57126871
tx.5821	chr14	+	1367	3	FSM	ENSMUSG00000021945.10	ENSMUST00000223669.2	1281	3	-88	2	-88	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_1	21.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATTTTTTTCATGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57124021	57141322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_57124156_57125251_57125315_57140152
tx.5822	chr14	+	1210	4	NIC	ENSMUSG00000021945.10	novel	6974	24	NA	NA	-86	7368	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	109	junction_1	18.6726180988812	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTCTACAGAAGGGGCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57124023	57148692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_57124156_57125251_57125315_57140152_57141010_57148534
tx.5823	chr14	+	557	3	NNC	ENSMUSG00000021945.10	novel	1281	3	NA	NA	41	-14222	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_2	14	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGGTGGTGGTGCCCACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57124150	57127102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_57124414_57125251_57125315_57126871
tx.5824	chr14	+	2271	11	ISM	ENSMUSG00000021945.10	ENSMUST00000022511.10	6974	24	54179	2164	3597	185	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	159	junction_1	13.7713470655561	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGTGACTTTCTGCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57179454	57197994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_57179585_57180709_57180826_57181522_57181695_57183947_57184074_57185403_57185499_57186966_57187136_57187633_57187786_57193636_57193752_57194308_57194561_57195638_57195760_57197171
tx.5825	chr14	-	2388	2	FSM	ENSMUSG00000046352.8	ENSMUST00000055698.8	2406	2	7	11	7	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCTAACGTGACCAATGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57342152	57336067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_57338229_57341925
tx.5826	chr14	-	1336	7	ISM	ENSMUSG00000021947.12	ENSMUST00000022517.9	1497	8	15662	41	15589	-41	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	23	junction_1	3.62476052848859	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGCTGGTGCTTATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57620324	57512490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_57513020_57513373_57513481_57523821_57523928_57541049_57541245_57550424_57550587_57600378_57600506_57620214
tx.5827	chr14	-	1450	8	FSM	ENSMUSG00000021947.12	ENSMUST00000022517.9	1497	8	6	41	6	-41	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_7	4.40778532015472	195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGCTGGTGCTTATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57635980	57512490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_57513020_57513373_57513481_57523821_57523928_57541049_57541245_57550424_57550587_57600378_57600506_57620214_57620323_57635864
tx.5828	chr14	-	919	4	NNC	ENSMUSG00000021947.12	novel	899	4	NA	NA	-5	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	10.3387082795139	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAACAAAACAACAACAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57635958	57579062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_57579653_57600378_57600506_57620214_57620323_57635864
tx.5829	chr14	+	3091	26	NNC	ENSMUSG00000040040.17	novel	3088	26	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_25	13.8873179556025	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTGAGGCTAATGACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57661519	57755393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_57661645_57667994_57668091_57672251_57672315_57674683_57674741_57675698_57675753_57676322_57676387_57677162_57677233_57678387_57678479_57679334_57679440_57681811_57681915_57683021_57683137_57684997_57685230_57688127_57688199_57692917_57693005_57710431_57710532_57713499_57713587_57715347_57715535_57717353_57717463_57718113_57718265_57718852_57718969_57725028_57725082_57726348_57726415_57733629_57733737_57744661_57744729_57754437_57754553_57754793
tx.583	chr1	-	1010	3	NNC	ENSMUSG00000099843.2	novel	471	3	NA	NA	-226	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTTCTGATTTTAAAACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105918238	105907081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_105907355_105916748_105916834_105917586
tx.5830	chr14	+	767	3	NNC	ENSMUSG00000040040.17	novel	4226	23	NA	NA	27574	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.5	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTGAGGCTAATGACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57744676	57755393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_57744729_57754437_57754553_57754793
tx.5831	chr14	+	716	2	NNC	ENSMUSG00000040040.17	novel	4226	23	NA	NA	37334	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCTGAGGCTAATGACTTC	8265	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57754436	57755393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_57754553_57754793
tx.5832	chr14	-	812	4	ISM	ENSMUSG00000021951.8	ENSMUST00000022518.8	836	5	5484	-2	3844	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	213	junction_3	22.6421435969889	254	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTCATGAGGTTGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57803542	57787052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_57787337_57787818_57788100_57795490_57795574_57803378
tx.5833	chr14	-	843	5	FSM	ENSMUSG00000021951.8	ENSMUST00000022518.8	836	5	-5	-2	-5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_4	52.3115665986023	954	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTCATGAGGTTGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57809031	57787052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_57787337_57787818_57788100_57795490_57795574_57803378_57803542_57808999
tx.5834	chr14	-	688	4	NIC	ENSMUSG00000021951.8	novel	880	5	NA	NA	-13	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	8	junction_3	119.268138615847	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTCATGAGGTTGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57809039	57787052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_57787337_57787818_57788100_57795490_57795574_57808999
tx.5835	chr14	-	3516	23	NNC	ENSMUSG00000021952.17	novel	8680	23	NA	NA	4	26	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_17	74.741551942523	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCCTTTCTGCAAAGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57902442	57819701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_57819926_57822056_57822150_57823323_57823442_57824036_57824168_57825409_57825529_57827397_57827579_57828242_57828537_57831284_57831460_57834431_57834602_57835342_57835503_57839945_57840124_57841042_57841189_57841820_57841964_57842579_57842757_57850729_57850905_57851143_57851302_57855587_57855706_57866813_57866968_57867672_57867790_57875675_57875815_57880538_57880681_57885875_57885982_57902344
tx.5836	chr14	-	475	4	FSM	ENSMUSG00000021952.17	ENSMUST00000172539.8	707	4	-9	241	-6	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	139.907906217705	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAGAAAAGAAAAGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57902430	57879476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_57879618_57880538_57880681_57885875_57885982_57902344
tx.5837	chr14	-	1385	3	FSM	ENSMUSG00000021952.17	ENSMUST00000173940.8	1893	3	268	240	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	257	junction_1	39	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GAAAAGAAAAGAAAAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57902424	57879481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_57880681_57885875_57885982_57902344
tx.5838	chr14	+	712	4	FSM	ENSMUSG00000021963.18	ENSMUST00000128764.9	5125	4	34	4379	-4	-68	multi-exon	FALSE	canonical	3	2836	junction_1	125.222468697381	4290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAAAATATGAAGAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58035670	58039716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_58035812_58035944_58036055_58038950_58039074_58039378
tx.5839	chr14	-	2268	9	FSM	ENSMUSG00000021965.4	ENSMUST00000022536.3	2260	9	-7	-1	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_3	28.547110186497	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTTATGTTGCCAACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58063627	58044016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_58044989_58045431_58045536_58047399_58047601_58049036_58049123_58054101_58054209_58057610_58058020_58059492_58059659_58060357_58060420_58063466
tx.584	chr1	-	380	2	NIC	ENSMUSG00000099843.2	novel	471	3	NA	NA	-9	-15	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTGTGTTGCAACATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105918021	105907094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_105907355_105917901
tx.5840	chr14	-	1206	4	ISM	ENSMUSG00000021965.4	ENSMUST00000225646.2	1242	7	17	9780	-5	2143	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	216	junction_1	9.42809041582063	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGCAGTTAACAGTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58063625	58057200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_58058020_58059492_58059659_58060357_58060420_58063466
tx.5841	chr14	+	529	2	FSM	ENSMUSG00000021967.5	ENSMUST00000022538.5	2877	2	2	2346	2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	956	junction_1	0	3714	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTGTCTCATACGGAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58063692	58064407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_58063780_58063965
tx.5842	chr14	-	2802	12	NIC	ENSMUSG00000021969.9	novel	5186	13	NA	NA	-31	651	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	34	junction_1	61.0282416672129	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAGAAAAAAAGAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58127764	58072497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_58074104_58076546_58076663_58078285_58078376_58080644_58080772_58084377_58084520_58094066_58094188_58095084_58095118_58095996_58096067_58102977_58103099_58111349_58111454_58115889_58115917_58127519
tx.5843	chr14	-	2861	13	FSM	ENSMUSG00000021969.9	ENSMUST00000089473.5	5186	13	-16	2341	-16	648	multi-exon	FALSE	canonical	3	200	junction_2	22.1702691308277	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAGAAAAAAAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58127749	58072500	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_58074104_58075047_58075125_58076546_58076663_58078285_58078376_58080644_58080772_58084377_58084520_58094066_58094188_58095084_58095118_58095996_58096067_58102977_58103099_58111349_58111454_58115889_58115917_58127519
tx.5844	chr14	-	1783	12	NNC	ENSMUSG00000021969.9	novel	5186	13	NA	NA	-12	144	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	69.4422883044523	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAACACTCAAAGAAGGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58127745	58073566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_58074104_58075047_58075125_58076546_58076663_58078285_58078376_58080644_58080772_58084377_58084520_58094066_58094188_58095084_58095118_58095996_58096067_58102977_58103099_58111349_58111454_58127500
tx.5845	chr14	-	540	5	ISM	ENSMUSG00000021969.9	ENSMUST00000226057.2	2179	14	-79	22869	-25	5014	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_2	18.4577219612822	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTGCTCAGCATGTGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58127758	58096017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_58096067_58102977_58103099_58111349_58111454_58115889_58115917_58127519
tx.5847	chr14	+	3678	12	FSM	ENSMUSG00000035469.18	ENSMUST00000043227.13	3903	12	225	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	265	junction_1	28.7856139459962	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTGTACAGTTGTGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59438901	59474714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_59439034_59447373_59447544_59447883_59448035_59455044_59455212_59458865_59459025_59460641_59460750_59462081_59462225_59463756_59463948_59465703_59465831_59467335_59467488_59467858_59467990_59472667
tx.5848	chr14	-	1333	11	NNC	ENSMUSG00000068245.15	novel	2666	11	NA	NA	-5079	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	278	junction_1	39.5924235176378	1709	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGTGTGCACCGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59607998	59586180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_59586501_59586670_59586838_59588595_59588668_59590099_59590232_59590766_59590831_59591756_59591825_59592588_59592639_59593765_59593900_59596924_59597033_59599182_59599305_59607902
tx.5849	chr14	-	1503	10	NNC	ENSMUSG00000068245.15	novel	1130	10	NA	NA	-5079	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	300	junction_3	34.2669260690571	797	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGTGTGCACCGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59607998	59586180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_59586838_59588595_59588668_59590099_59590232_59590766_59590831_59591756_59591825_59592588_59592639_59593765_59593900_59596924_59597033_59599182_59599305_59607902
tx.585	chr1	-	1541	5	ISM	ENSMUSG00000009905.6	ENSMUST00000010049.6	5518	10	15910	3441	15866	-3441	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	165	junction_2	17.1099386322687	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTTCTTACTCTCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106671547	106651629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_106652752_106655358_106655461_106662276_106662361_106667060_106667145_106671398
tx.5850	chr14	-	2952	13	NIC	ENSMUSG00000071350.13	novel	2995	14	NA	NA	-19	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	13	junction_10	30.6467326516584	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGTGATTATTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59678352	59639453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_59639866_59644094_59644184_59646626_59646968_59649539_59649634_59650160_59650261_59650929_59651129_59653147_59653318_59654857_59654975_59656449_59657011_59660836_59660934_59668591_59668718_59674885_59675215_59678035
tx.5851	chr14	-	2681	13	NIC	ENSMUSG00000071350.13	novel	2995	14	NA	NA	-12	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	1	junction_12	33.2498955721	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTTGTGATTATTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59678345	59639454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_59639866_59644094_59644184_59646626_59646968_59649539_59649634_59650160_59650261_59650929_59651129_59653147_59653318_59654857_59654975_59656449_59657011_59660836_59660934_59663937_59664004_59668591_59668718_59678035
tx.5852	chr14	-	2994	14	FSM	ENSMUSG00000071350.13	ENSMUST00000161459.8	2995	14	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_12	10.965249034588	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTTTGTGATTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59678332	59639457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_59639866_59644094_59644184_59646626_59646968_59649539_59649634_59650160_59650261_59650929_59651129_59653147_59653318_59654857_59654975_59656449_59657011_59660836_59660934_59663937_59664004_59668591_59668718_59674885_59675215_59678035
tx.5853	chr14	-	1827	6	ISM	ENSMUSG00000071350.13	ENSMUST00000161459.8	2995	14	4	16638	-3	3874	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_4	10.0518654985033	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCTGTACTTTCCCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59678329	59656095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_59657011_59660836_59660934_59663937_59664004_59668591_59668718_59674885_59675215_59678035
tx.5854	chr14	-	1792	5	FSM	ENSMUSG00000071350.13	ENSMUST00000111253.3	1774	5	-21	3	-12	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	96	junction_3	10.4043260233424	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCATTGTGCTAGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59678345	59659972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_59660934_59663937_59664004_59668591_59668718_59674885_59675215_59678035
tx.5855	chr14	-	1190	3	ISM	ENSMUSG00000071350.13	ENSMUST00000111253.3	1774	5	-12	8188	-3	437	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_1	14.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59678336	59668157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_59668718_59674885_59675215_59678035
tx.5856	chr14	-	621	2	ISM	ENSMUSG00000071350.13	ENSMUST00000111253.3	1774	5	-5	14918	-3	-6293	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGTGGGTCAAATAACTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59678329	59674887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_59675215_59678035
tx.5857	chr14	+	1508	11	FSM	ENSMUSG00000021981.11	ENSMUST00000022553.6	3037	11	-22	1551	-13	-1551	multi-exon	FALSE	canonical	3	224	junction_1	43.2892596379287	299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTGTGATTGCTTATGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59678407	59784801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_59678468_59696542_59696691_59699083_59699152_59734251_59734394_59736992_59737158_59743713_59743833_59757014_59757184_59764204_59764265_59766290_59766357_59776510_59776655_59784434
tx.5858	chr14	-	839	5	FSM	ENSMUSG00000021982.15	ENSMUST00000225103.2	2579	5	0	1740	0	-1740	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_3	7.29297607290741	257	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTGGTTTCAAATGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59835395	59823761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_59824058_59827236_59827415_59829909_59829985_59834310_59834409_59835203
tx.5859	chr14	+	444	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021983.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAGCTGAATAAAATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60414737	60421698	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_60414791_60415313_60415515_60420871_60421044_60421680
tx.586	chr1	-	2039	10	FSM	ENSMUSG00000009905.6	ENSMUST00000010049.6	5518	10	38	3441	-6	-3441	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_2	12.4017123469222	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACCTTCTTACTCTCAGAG	8299	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106687419	106651629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_106652752_106655358_106655461_106662276_106662361_106667060_106667145_106671398_106671591_106675217_106675314_106675500_106675567_106680941_106680999_106683173_106683264_106687273
tx.5860	chr14	-	2428	4	ISM	ENSMUSG00000114797.2	ENSMUST00000041905.8	3913	15	22651	-4	3281	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_2	24.4948974278318	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTAGGTCTCAGCAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60466305	60455522	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_60457608_60459031_60459128_60460765_60460865_60466157
tx.5861	chr14	-	3859	15	FSM	ENSMUSG00000114797.2	ENSMUST00000041905.8	3913	15	56	-2	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_2	25.178546099278	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTGTAGGTCTCAGCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60488900	60455524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_60457608_60459031_60459128_60460765_60460865_60466157_60466360_60469522_60469606_60469995_60470115_60471678_60471759_60475900_60476076_60476929_60476996_60478222_60478248_60479995_60480107_60480805_60480944_60481962_60482113_60484772_60484916_60488611
tx.5862	chr14	+	376	3	ISM	ENSMUSG00000021993.11	ENSMUST00000063562.9	3015	19	87511	616	87446	-616	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	264	junction_2	13	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGTGTCTCACCTGCTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61109532	61141062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_61109589_61112682_61112757_61140816
tx.5863	chr14	+	323	2	ISM	ENSMUSG00000021993.11	ENSMUST00000063562.9	3015	19	90658	616	90593	-616	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	264	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGTGTCTCACCTGCTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61112679	61141062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_61112757_61140816
tx.5864	chr14	-	1002	6	FSM	ENSMUSG00000060548.14	ENSMUST00000225730.2	744	6	-96	-162	-37	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_5	18.2756668824971	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTCTTAGCAAATTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61275436	61211808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_61212204_61234053_61234140_61242523_61242703_61261617_61261729_61262192_61262286_61275298
tx.5865	chr14	-	676	5	ISM	ENSMUSG00000060548.14	ENSMUST00000225730.2	744	6	-96	22014	-37	-22014	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_4	19.6532440070335	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGTGTCTAGAAAGCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61275436	61233984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_61234140_61242523_61242703_61261617_61261729_61262192_61262286_61275298
tx.5866	chr14	-	904	5	ISM	ENSMUSG00000060548.14	ENSMUST00000224371.2	1239	6	10	22175	10	-22014	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_4	15.833114033569	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTGTGTCTAGAAAGCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61283929	61233984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_61234140_61242523_61242703_61261617_61261729_61262192_61262286_61283563
tx.5867	chr14	+	1599	2	FSM	ENSMUSG00000043157.9	ENSMUST00000055159.8	1482	2	-107	-10	-107	10	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCATGTGTGTGCATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61547094	61549395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_61547387_61548088
tx.5868	chr14	-	846	4	FSM	ENSMUSG00000021928.10	ENSMUST00000022494.10	10092	4	-3	9249	-3	-1226	multi-exon	FALSE	canonical	3	296	junction_1	24.8506650928211	2123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGGGTGTGACTTAGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61597891	61578439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_61578854_61579536_61579676_61584820_61584891_61597668
tx.5869	chr14	-	2713	3	ISM	ENSMUSG00000021929.10	ENSMUST00000022496.9	4069	17	69397	-4	2614	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	460	junction_1	79	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGAAAGACTTATTTCTG	6949	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61607926	61602655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_61605179_61605576_61605672_61607831
tx.587	chr1	-	2848	11	FSM	ENSMUSG00000009907.18	ENSMUST00000094646.6	4633	11	58	1727	-3	-1727	multi-exon	TRUE	canonical	3	455	junction_4	35.0793386482699	429	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTGGCTTTTATATGTTT	82	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106724400	106698886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_106700279_106701736_106701878_106704999_106705220_106706698_106706781_106707691_106707841_106708233_106708391_106710395_106710516_106714432_106714501_106717658_106717816_106719407_106719520_106724150
tx.5870	chr14	-	4056	17	NNC	ENSMUSG00000021929.10	novel	4069	17	NA	NA	21	4	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_16	150.394156614378	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTGAAAGACTTATTTCTG	6567	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61677302	61602655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_61605179_61605576_61605672_61607831_61607995_61608150_61608223_61608319_61608425_61610406_61610536_61611732_61611865_61620683_61620729_61622036_61622207_61622551_61622639_61624872_61624959_61628612_61628709_61628847_61628901_61628996_61629027_61629204_61629295_61640446_61640492_61677167
tx.5871	chr14	-	1083	12	NNC	ENSMUSG00000021929.10	novel	4069	17	NA	NA	32	-2647	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	177.041340832124	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGGTAAAGGCATGCACTG	6578	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61677291	61610410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_61610536_61611732_61611865_61620683_61620729_61622036_61622207_61622551_61622639_61624872_61624959_61628612_61628709_61628847_61628901_61628996_61629027_61629204_61629295_61640446_61640492_61677167
tx.5872	chr14	+	362	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021929.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTGCGCTGATTGGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61676741	61680164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_61676785_61679845
tx.5873	chr14	-	1180	5	FSM	ENSMUSG00000021930.15	ENSMUST00000022497.15	4002	5	150	2672	22	-360	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_1	8.67467578644874	654	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTTCTTTTGCTGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61794185	61772113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_61772691_61777585_61777689_61783130_61783298_61787192_61787310_61793969
tx.5874	chr14	+	1492	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000114902.2	novel	864	1	NA	NA	-1779	200	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTAATAATTGGTCACATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61794467	61797310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_61794890_61796240
tx.5875	chr14	+	190	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000098088.2	novel	352	2	NA	NA	-60650	12	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGAACATTTCCTT	1112	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61806282	61867875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_61806340_61867742
tx.5876	chr14	+	1582	3	FSM	ENSMUSG00000035235.14	ENSMUST00000039562.8	1550	3	-32	0	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_1	49	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTGAGTTTGTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61836956	61843395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_61837020_61837242_61837345_61841978
tx.5877	chr14	+	1521	2	ISM	ENSMUSG00000035235.14	ENSMUST00000039562.8	1550	3	252	0	252	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	246	junction_1	0	315	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTGAGTTTGTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61837240	61843395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_61837345_61841978
tx.5878	chr14	-	685	3	FSM	ENSMUSG00000097589.10	ENSMUST00000180917.9	3544	3	-27	2886	-27	-8	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	6	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATTTTTTTTAAGGCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61886298	61872683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_61873041_61880808_61880905_61886066
tx.5879	chr14	+	429	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000097997.2	novel	656	3	NA	NA	13365	211	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTAGTCATTTAAGTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61899763	61904972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_61899902_61904681
tx.588	chr1	-	1024	4	ISM	ENSMUSG00000009907.18	ENSMUST00000094646.6	4633	11	46	16848	-15	-474	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	531	junction_2	14.3836326735943	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTAAAAGGCTGCCAGCAGT	70	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106724412	106714007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_106714501_106717658_106717816_106719407_106719520_106724150
tx.5880	chr14	+	409	2	Intergenic	novelGene_272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGTATTCATTCATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61946901	61953901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_61947055_61953645
tx.5881	chr14	+	988	11	FSM	ENSMUSG00000021932.14	ENSMUST00000022499.13	1494	11	25	481	25	-481	multi-exon	TRUE	canonical	3	538	junction_2	112.951139879153	3091	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTCTTGCCTATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62569541	62609960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_62569626_62584016_62584092_62585969_62586078_62587848_62587926_62590971_62591087_62597911_62597977_62598777_62598884_62601478_62601561_62602707_62602751_62607920_62608002_62609808
tx.5882	chr14	+	880	10	NIC	ENSMUSG00000021932.14	novel	1494	11	NA	NA	25	-481	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	239	junction_2	190.414168473765	1371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTCTTGCCTATTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62569541	62609960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_62569626_62584016_62584092_62587848_62587926_62590971_62591087_62597911_62597977_62598777_62598884_62601478_62601561_62602707_62602751_62607920_62608002_62609808
tx.5883	chr14	+	784	2	NNC	ENSMUSG00000014547.11	novel	3080	4	NA	NA	-8	-88320	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAAAGGTTGTCCAGACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63075154	63076852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_63075507_63076420
tx.5884	chr14	+	1719	12	FSM	ENSMUSG00000014547.11	ENSMUST00000014691.10	6646	12	33	4894	-3	-4894	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_9	5.80111132128866	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGTGTTGTGTTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63075159	63194064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_63075507_63123258_63123327_63137703_63137778_63162578_63162634_63167676_63167828_63171738_63171852_63181469_63181597_63186091_63186198_63189363_63189466_63190460_63190592_63192309_63192419_63193728
tx.5885	chr14	+	653	3	FSM	ENSMUSG00000054763.10	ENSMUST00000067990.8	618	3	-42	7	-42	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_1	3	360	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATAAATTTCCCGTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63284397	63286052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_63284500_63284892_63285068_63285676
tx.5886	chr14	+	570	4	NIC	ENSMUSG00000054763.10	novel	618	3	NA	NA	-42	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	6	junction_3	14.3527000944073	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCCGTTTCAAATTCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63284397	63286059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_63284500_63284892_63285068_63285676_63285752_63285841
tx.5887	chr14	+	1949	10	FSM	ENSMUSG00000021939.9	ENSMUST00000006235.9	4743	10	24	2770	24	1290	multi-exon	FALSE	canonical	3	6333	junction_1	582.432086858605	4671	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTGCTGCAGTTTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63359934	63380602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_63360015_63370764_63370916_63371413_63371500_63373056_63373172_63373855_63373975_63375481_63375568_63375799_63375944_63376447_63376565_63379182_63379312_63379680
tx.5888	chr14	-	1676	8	FSM	ENSMUSG00000021273.12	ENSMUST00000054963.10	2860	8	-66	1250	-62	-1250	multi-exon	FALSE	canonical	3	727	junction_5	70.2819395037456	2214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTCCTTGTCTTTCTCAT	4245	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63415308	63383851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_63384418_63388598_63388752_63389775_63389953_63394007_63394200_63396466_63396596_63400750_63400935_63401980_63402079_63415131
tx.5889	chr14	-	1557	9	FSM	ENSMUSG00000021953.15	ENSMUST00000022522.15	1881	9	324	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2964	junction_2	186.921733286956	19867	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCTTTTTACTTAGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63746217	63729795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_63730296_63731190_63731461_63731805_63731897_63733168_63733342_63733438_63733589_63734393_63734465_63735046_63735090_63737569_63737770_63746158
tx.589	chr1	-	460	3	ISM	ENSMUSG00000009907.18	ENSMUST00000094646.6	4633	11	58	20558	-3	1112	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	531	junction_1	17	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAAGAAACCACAGAAGCC	82	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106724400	106717717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_106717816_106719407_106719520_106724150
tx.5890	chr14	-	313	2	Intergenic	novelGene_273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTTCCAGAGAACAGAAAA	6529	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64097704	64092547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_64092683_64097526
tx.5891	chr14	+	1465	8	NNC	ENSMUSG00000021958.6	novel	1295	7	NA	NA	-62	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_6	31.4324672910034	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTGCTGAGCCTTTCACA	4025	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64097750	64157301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_64097897_64101664_64101775_64103551_64103645_64105967_64106047_64109750_64109844_64115560_64115638_64130171_64130283_64156545
tx.5892	chr14	+	1358	7	FSM	ENSMUSG00000021958.6	ENSMUST00000022528.6	1295	7	-65	2	-65	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_4	11.9443152447793	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGAGCCTTTCACAT	4022	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64097747	64157302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_64097897_64101664_64101775_64103551_64103645_64105967_64106047_64109750_64109844_64115560_64115638_64156545
tx.5893	chr14	+	1203	6	ISM	ENSMUSG00000021958.6	ENSMUST00000022528.6	1295	7	3858	2	3858	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	56	junction_3	13.001538370516	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTGCTGAGCCTTTCACAT	7945	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64101670	64157302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_64101775_64103551_64103645_64105967_64106047_64109750_64109844_64115560_64115638_64156545
tx.5894	chr14	-	1335	6	ISM	ENSMUSG00000054733.10	ENSMUST00000067927.9	1860	11	14993	-4	7	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_3	9.47839648885823	314	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGCCTGCTGTGAGTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64678359	64360069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_64360803_64447876_64447984_64471277_64471383_64522512_64522633_64551135_64551205_64678158
tx.5895	chr14	+	1702	15	NIC	ENSMUSG00000060012.10	novel	5603	40	NA	NA	-2	21569	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19.1930312608403	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGCGAGAGGACGAGGACCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64889988	64983778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_64890106_64907072_64907167_64951522_64951584_64952836_64952930_64954922_64955104_64959755_64959844_64962148_64962284_64964522_64964636_64965661_64965774_64973596_64973810_64974943_64975055_64975955_64976091_64979755_64979887_64982324_64982412_64983747
tx.5896	chr14	-	2396	7	ISM	ENSMUSG00000021972.15	ENSMUST00000022544.14	3396	11	88307	0	-39247	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_3	11.8462370959446	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGGCTGTCCGGGATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65098992	65049048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_65050869_65054465_65054586_65063049_65063145_65064220_65064317_65066034_65066118_65089333_65089488_65098964
tx.5897	chr14	-	3418	11	FSM	ENSMUSG00000021972.15	ENSMUST00000022544.14	3396	11	-22	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_3	9.87167665596883	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGGCTGTCCGGGATTTCT	7663	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65187321	65049048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_65050869_65054465_65054586_65063049_65063145_65064220_65064317_65066034_65066118_65089333_65089488_65098964_65099076_65125023_65125110_65134098_65134576_65140687_65140768_65187025
tx.5898	chr14	-	1377	6	ISM	ENSMUSG00000021972.15	ENSMUST00000022544.14	3396	11	97811	992	-29743	-992	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_3	12.3709336753537	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTATTTGTATTTTTGT	8577	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65089488	65050040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_65050869_65054465_65054586_65063049_65063145_65064220_65064317_65066034_65066118_65089333
tx.5899	chr14	+	411	5	ISM	ENSMUSG00000021975.10	ENSMUST00000224593.2	3476	8	-4	17738	-4	-17738	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	242	junction_3	12.031209415516	600	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGGATTCACAGGCACAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65187746	65230511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_65187817_65217570_65217699_65223751_65223813_65227980_65228044_65230422
tx.59	chr1	-	383	3	NNC	ENSMUSG00000025920.20	novel	3030	14	NA	NA	-7	-46206	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	46.5	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCATTATGCCATGTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16589501	16576642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_16576854_16579565_16579633_16589396
tx.590	chr1	+	1756	7	FSM	ENSMUSG00000026315.14	ENSMUST00000112706.4	4581	7	-46	2871	-46	288	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1.34370962471642	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGCCAAGGTGATTTCAAT	6160	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107517689	107535343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_107518018_107525184_107525368_107526629_107526768_107530529_107530648_107532333_107532477_107533513_107533667_107534650
tx.5900	chr14	+	2423	17	FSM	ENSMUSG00000021975.10	ENSMUST00000239450.2	2677	17	253	1	-4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_12	28.2795752266543	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCAGTTCTATTGCACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65187746	65277283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_65187817_65217570_65217699_65223751_65223813_65227980_65228044_65230422_65230563_65232430_65232518_65244694_65244816_65245439_65245575_65253978_65254091_65257764_65257946_65263853_65263915_65266334_65266507_65269668_65269794_65271376_65271545_65273846_65273946_65274794_65274933_65276721
tx.5901	chr14	+	610	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021978.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4.54606056566195	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCAAATCAGTTCCACGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65335605	65348462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_65335830_65338153_65338226_65338376_65338499_65348270
tx.5902	chr14	+	738	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021978.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGTGCCAGAACTCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65335632	65348739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_65335830_65338153_65338226_65348270
tx.5903	chr14	+	753	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000021978.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCAGTGCCAGAACTCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65335614	65348739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_65335830_65338153_65338226_65348273
tx.5904	chr14	+	1206	4	NNC	ENSMUSG00000114693.2	novel	589	3	NA	NA	-27	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.942809041582063	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGCTTTGCAAGAGTAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65409776	65422883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_65409884_65412146_65412735_65413951_65414128_65422548
tx.5905	chr14	+	507	3	FSM	ENSMUSG00000114693.2	ENSMUST00000223930.2	589	3	-13	95	-13	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTTATGGCAGAATTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65409790	65422786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_65409884_65413951_65414128_65422548
tx.5906	chr14	-	1501	4	ISM	ENSMUSG00000007989.8	ENSMUST00000131309.3	12734	7	31	42800	31	-25530	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_2	4.49691252107735	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTAGTGGCGTGTGTTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65499881	65472697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_65473381_65477166_65477364_65490392_65490913_65499780
tx.5907	chr14	+	1285	8	FSM	ENSMUSG00000034532.10	ENSMUST00000224629.2	3781	8	32	2464	-5	6	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_5	3.88087934491604	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGAAAGGTCCTGCGAGT	2570	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65504098	65558956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_65504233_65508148_65508285_65524580_65524617_65531232_65531440_65532841_65533007_65536634_65536865_65540548_65540652_65558682
tx.5908	chr14	-	1467	3	ISM	ENSMUSG00000022031.7	ENSMUST00000225355.2	2771	15	44954	0	44952	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	459	junction_2	7	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCGTCGTGTGGTGCTTT	5176	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65785547	65767897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_65769050_65784582_65784665_65785314
tx.5909	chr14	-	1511	4	ISM	ENSMUSG00000022031.7	ENSMUST00000225355.2	2771	15	43584	0	43582	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	434	junction_3	16.1314048434171	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCGTCGTGTGGTGCTTT	3806	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65786917	65767897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_65769050_65784582_65784665_65785314_65785543_65786868
tx.591	chr1	+	353	3	Intergenic	novelGene_49	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTGCAGCTCAGTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113073108	113078483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_113073287_113074688_113074739_113078358
tx.5910	chr14	-	2560	13	ISM	ENSMUSG00000022031.7	ENSMUST00000225355.2	2771	15	6696	0	6694	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	408	junction_12	44.3874982399324	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCGTCGTGTGGTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65823805	65767897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_65769050_65784582_65784665_65785314_65785543_65786868_65786935_65788833_65788925_65797569_65797764_65800700_65800828_65802760_65802923_65815373_65815529_65818196_65818266_65819563_65819628_65820338_65820410_65823706
tx.5911	chr14	-	2839	15	FSM	ENSMUSG00000022031.7	ENSMUST00000022609.7	2851	15	12	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_14	46.0192949772602	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCGTCGTGTGGTGCTTT	3456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65830512	65767897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_65769050_65784582_65784665_65785314_65785543_65786868_65786935_65788833_65788925_65797569_65797764_65800700_65800828_65802760_65802923_65815373_65815529_65818196_65818266_65819563_65819628_65820338_65820410_65823706_65823846_65827954_65828055_65830373
tx.5912	chr14	-	2790	15	FSM	ENSMUSG00000022031.7	ENSMUST00000225355.2	2771	15	-19	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_14	90.9467493893531	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTCGTCGTGTGGTGCTTT	3448	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65830520	65767897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_65769050_65784582_65784665_65785314_65785543_65786868_65786935_65788833_65788925_65797569_65797764_65800700_65800828_65802760_65802923_65815373_65815529_65818196_65818266_65819563_65819628_65820338_65820410_65823706_65823846_65827954_65828055_65830430
tx.5913	chr14	+	470	3	ISM	ENSMUSG00000061356.14	ENSMUST00000079469.7	2567	19	36643	-20	36643	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGGTATCATTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65879358	65885913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_65879444_65882458_65882550_65885619
tx.5914	chr14	+	1688	8	FSM	ENSMUSG00000022033.10	ENSMUST00000022612.10	1720	8	32	0	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	729	junction_5	59.6342594316319	2476	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCAGCATTATCTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66043317	66055271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_66043584_66046663_66046739_66049379_66049474_66050414_66050558_66051255_66051426_66052620_66052751_66054048_66054226_66054638
tx.5915	chr14	+	1493	8	NIC	ENSMUSG00000022033.10	novel	451	5	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	110	junction_1	250.309767272148	272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCAGCATTATCTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66043680	66055271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_66043752_66046663_66046739_66049379_66049474_66050414_66050558_66051255_66051426_66052620_66052751_66054048_66054226_66054638
tx.5916	chr14	-	2846	11	FSM	ENSMUSG00000022034.11	ENSMUST00000022613.10	2913	11	70	-3	-16	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	933	junction_8	61.5078043828586	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTTCAGTGGCTTGTGA	6414	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66071373	66056483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_66057548_66059029_66059191_66061566_66061708_66062294_66062385_66063928_66064061_66064616_66064738_66065917_66065973_66067110_66067202_66068453_66069244_66070112_66070191_66071250
tx.5917	chr14	-	585	3	ISM	ENSMUSG00000022034.11	ENSMUST00000022613.10	2913	11	68	12375	-18	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1081	junction_1	21	370	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAGAAGAGTTTAACTGCCAA	6412	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66071375	66068861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_66069244_66070112_66070191_66071250
tx.5918	chr14	+	2172	9	FSM	ENSMUSG00000022035.7	ENSMUST00000022614.7	2230	9	58	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	231	junction_2	11.4229757506527	704	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCATTGATATCTGAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66074808	66104056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_66074934_66077896_66077945_66083744_66083785_66089065_66089118_66091550_66091627_66093872_66093977_66094142_66094346_66097618_66097665_66102578
tx.5919	chr14	+	2117	8	NIC	ENSMUSG00000022035.7	novel	2230	9	NA	NA	7	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	6	junction_1	86.3017960415657	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCATTGATATCTGAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66074815	66104056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_66074934_66083744_66083785_66089065_66089118_66091550_66091627_66093872_66093977_66094142_66094346_66097618_66097665_66102578
tx.592	chr1	-	607	3	FSM	ENSMUSG00000097648.2	ENSMUST00000180837.2	1009	3	-32	434	-32	-434	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1.5	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTAGTACTCCTTCCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113891896	113819548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_113819779_113837064_113837094_113891548
tx.5920	chr14	+	1648	9	FSM	ENSMUSG00000022037.16	ENSMUST00000022616.14	1810	9	161	1	2	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_1	2.72717802865893	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCCTTGGGTCTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66206092	66218995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_66206138_66209180_66209302_66210773_66210923_66212291_66212463_66213029_66213442_66214354_66214460_66217099_66217330_66218302_66218479_66218756
tx.5921	chr14	+	1603	8	ISM	ENSMUSG00000022037.16	ENSMUST00000022616.14	1810	9	3248	2	428	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_4	2.6954231805876	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCCCTTGGGTCTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66209179	66218994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_66209302_66210773_66210923_66212291_66212463_66213029_66213442_66214354_66214460_66217099_66217330_66218302_66218479_66218756
tx.5922	chr14	+	1392	7	ISM	ENSMUSG00000022037.16	ENSMUST00000022616.14	1810	9	4933	0	-1253	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_3	2.75378527364305	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTTGGGTCTGTTTTTTA	950	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66210864	66218996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_66210923_66212291_66212463_66213029_66213442_66214354_66214460_66217099_66217330_66218302_66218479_66218756
tx.5923	chr14	-	2286	12	FSM	ENSMUSG00000034450.9	ENSMUST00000059970.9	2263	12	-23	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_5	1.97086212624353	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTTGCCCTTGAGGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66246679	66224234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_66225144_66225630_66225722_66227827_66227993_66228478_66228629_66234272_66234350_66235008_66235117_66237282_66237469_66240039_66240131_66241530_66241626_66243285_66243412_66245487_66245590_66246493
tx.5924	chr14	-	2047	19	FSM	ENSMUSG00000022040.9	ENSMUST00000070515.2	2035	19	-8	-4	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	171	junction_15	18.7001188350354	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTTGTGTTCTTGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66361957	66321821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_66322210_66322379_66322439_66322744_66322826_66323682_66323753_66324413_66324517_66325748_66325783_66326954_66327030_66330247_66330360_66332186_66332273_66333134_66333162_66336252_66336288_66339041_66339121_66339595_66339692_66341174_66341244_66344662_66344786_66345425_66345617_66347564_66347725_66354159_66354245_66361783
tx.5925	chr14	-	733	6	ISM	ENSMUSG00000022040.9	ENSMUST00000225309.2	2032	18	22327	-2	22327	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	194	junction_5	14.9586095610521	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTTTCTTGTGTTCTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66325782	66321823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_66322210_66322379_66322439_66322744_66322826_66323682_66323753_66324413_66324517_66325748
tx.5926	chr14	-	630	3	NNC	ENSMUSG00000085984.8	novel	759	4	NA	NA	0	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	6	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAAGGCCTTACTATGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66534389	66532774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_66533036_66533403_66533594_66534210
tx.5927	chr14	-	599	3	FSM	ENSMUSG00000085984.8	ENSMUST00000153646.8	764	3	172	-7	-17	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	2	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCAAGGCCTTACTATGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66534406	66532775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_66533036_66533403_66533594_66534257
tx.5928	chr14	+	2023	3	FSM	ENSMUSG00000046204.15	ENSMUST00000089236.11	5518	3	28	3467	-10	-1259	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	6.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTGAACTTTAGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67148646	67155005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_67148743_67152770_67152900_67153207
tx.5929	chr14	-	1320	6	FSM	ENSMUSG00000022051.16	ENSMUST00000022634.9	3238	6	5	1913	5	121	multi-exon	FALSE	canonical	3	675	junction_1	44.8508639827596	2994	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCAGAGCCGCTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67246321	67224600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_67225225_67226583_67226734_67226854_67226959_67231325_67231399_67236969_67237154_67246136
tx.593	chr1	-	485	2	NNC	ENSMUSG00000097648.2	novel	1009	3	NA	NA	-34	-39490	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACTGTGTCTTTAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113891898	113858604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_113858740_113891548
tx.5930	chr14	-	2042	9	ISM	ENSMUSG00000022052.10	ENSMUST00000089230.7	4010	10	2134	1614	1872	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	602	junction_4	72.2495674727538	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATCTGGTTTTCTTTTTCT	439	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67307759	67253118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_67254103_67257164_67257257_67259722_67259893_67260474_67260640_67261081_67261260_67261976_67262090_67266313_67266480_67276323_67276422_67307683
tx.5931	chr14	-	2409	10	FSM	ENSMUSG00000022052.10	ENSMUST00000089230.7	4010	10	-10	1611	-10	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	602	junction_4	68.1900032498157	219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGGTTTTCTTTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67309903	67253115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_67254103_67257164_67257257_67259722_67259893_67260474_67260640_67261081_67261260_67261976_67262090_67266313_67266480_67276323_67276422_67307683_67307759_67309538
tx.5932	chr14	+	442	3	Intergenic	novelGene_275	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAGCATTCTTTATCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67421817	67433924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_67421894_67422521_67422651_67433687
tx.5933	chr14	-	3435	15	FSM	ENSMUSG00000048922.19	ENSMUST00000163100.8	3841	15	211	195	-24	-195	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	110.056131318597	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTAGAATGACTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67952848	67913998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_67915472_67917610_67917780_67931074_67931204_67932413_67932500_67934115_67934192_67935387_67935621_67936137_67936211_67937631_67937868_67941416_67941493_67943079_67943247_67944801_67944950_67950536_67950692_67952131_67952306_67952390_67952455_67952672
tx.5934	chr14	-	438	3	Intergenic	novelGene_276	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGGGTTCAGGTCAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68274541	68270704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_68270961_68272789_68272907_68274476
tx.5935	chr14	-	606	3	FSM	ENSMUSG00000114621.2	ENSMUST00000223853.2	640	3	35	-1	35	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTCTTTCTGCTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68288744	68281875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_68282134_68282294_68282454_68288555
tx.5936	chr14	-	1524	2	NNC	ENSMUSG00000022054.12	novel	3680	4	NA	NA	39676	-937	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGACACATCAACTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68322619	68320975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_68322420_68322539
tx.5937	chr14	+	2176	4	FSM	ENSMUSG00000022055.8	ENSMUST00000022639.8	3380	4	-1	1205	-1	-1205	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_3	13.589211407093	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTGCTGTGGTTTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68321310	68325339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_68322459_68323422_68323548_68323935_68324256_68324756
tx.5938	chr14	+	644	2	ISM	ENSMUSG00000022055.8	ENSMUST00000022639.8	3380	4	2883	1205	2883	-1205	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTTTGCTGTGGTTTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68324194	68325339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_68324256_68324756
tx.5939	chr14	-	2014	2	ISM	ENSMUSG00000022054.12	ENSMUST00000022638.6	3334	3	1847	267	1847	-267	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAAGCCAAATGTGTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68360448	68356998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_68358834_68360269
tx.594	chr1	+	876	4	Intergenic	novelGene_50	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAGTCTATAATTAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	114698661	114784750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_114698975_114778223_114778260_114780015_114780105_114784312
tx.5940	chr14	-	1725	4	FSM	ENSMUSG00000034248.8	ENSMUST00000037064.5	4174	4	128	2321	-2	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	79.79974937304	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATTTCTCTTTTCATGGGG	670	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69522433	69481617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_69482804_69485029_69485087_69486842_69487072_69522180
tx.5941	chr14	-	1383	2	ISM	ENSMUSG00000034248.8	ENSMUST00000184914.2	2212	4	-93	4393	52	-4393	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAAGCATACCCGGGTGCT	594	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69522509	69486017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_69487072_69522180
tx.5942	chr14	+	2970	13	NNC	ENSMUSG00000095463.9	novel	3589	13	NA	NA	-3	472	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	116	junction_8	28.7096334974091	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTGACATTTTAAACAGA	7314	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69574635	69604137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_69574738_69584934_69585044_69586521_69586720_69588151_69588358_69591850_69592002_69592842_69592947_69594161_69594222_69594443_69594575_69596270_69596438_69599087_69599413_69601016_69601103_69601771_69601934_69602968
tx.5943	chr14	+	2994	13	NNC	ENSMUSG00000095463.9	novel	3589	13	NA	NA	-11	472	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	116	junction_8	28.7096334974091	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACTTGACATTTTAAACAGA	7290	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69574611	69604137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_69574738_69584934_69585044_69586521_69586720_69588151_69588358_69591850_69592002_69592842_69592947_69594161_69594222_69594443_69594575_69596270_69596438_69599087_69599413_69601016_69601103_69601771_69601934_69602968
tx.5944	chr14	-	884	5	ISM	ENSMUSG00000034194.19	ENSMUST00000121142.4	1958	7	2115	-4	-65	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_3	13.5531361684298	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTGCGTCCAAGTGCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69942827	69934752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_69935052_69936032_69936129_69937408_69937480_69941402_69941576_69942582
tx.5945	chr14	-	1945	7	FSM	ENSMUSG00000034194.19	ENSMUST00000121142.4	1958	7	17	-4	17	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	174	junction_3	17.7333646616265	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTGCGTCCAAGTGCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69944925	69934752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_69935052_69936032_69936129_69937408_69937480_69941402_69941576_69942582_69943328_69943995_69944134_69944502
tx.5946	chr14	-	1728	8	FSM	ENSMUSG00000034194.19	ENSMUST00000118374.8	1726	8	1	-3	1	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_7	41.9007573844168	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTGCGTCCAAGTGCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69945032	69934752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_69935052_69936032_69936129_69937408_69937480_69941402_69941576_69942582_69943328_69943995_69944134_69944502_69944631_69944954
tx.5947	chr14	-	2679	10	FSM	ENSMUSG00000034190.10	ENSMUST00000036381.10	2649	10	-30	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	245	junction_7	17.0583602471336	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTTTGTTGTTGTCTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69970013	69954448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_69955750_69955963_69956147_69956577_69956639_69956847_69956947_69957196_69957317_69957560_69957610_69958376_69958511_69958655_69958842_69967571_69967744_69969639
tx.5948	chr14	-	2964	9	NIC	ENSMUSG00000034190.10	novel	2649	10	NA	NA	-58	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	245	junction_6	15.4495145554804	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTTTGTTGTTGTCTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69970048	69954448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_69955750_69955963_69956147_69956577_69956639_69956847_69957317_69957560_69957610_69958376_69958511_69958655_69958842_69967571_69967744_69969639
tx.5949	chr14	+	542	2	NNC	ENSMUSG00000022074.7	novel	2787	6	NA	NA	4	-10725	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATCTTCTTCCTCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70004937	70006410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_70005241_70006171
tx.595	chr1	-	1011	6	FSM	ENSMUSG00000026374.15	ENSMUST00000027623.9	7063	6	219	5833	39	278	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	408.588007655633	9494	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCACGGATGGGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118238927	118228340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_118228768_118232420_118232501_118232929_118233046_118236474_118236572_118237502_118237597_118238730
tx.5950	chr14	+	1857	8	NNC	ENSMUSG00000022074.7	novel	3179	8	NA	NA	6	415	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	19.7556501863572	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGAACACAGCCACTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70004926	70020538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_70005241_70008229_70008327_70010825_70010937_70012534_70012644_70013520_70013724_70015169_70015265_70017952_70018023_70019680
tx.5951	chr14	+	1013	6	NNC	ENSMUSG00000022074.7	novel	2787	6	NA	NA	6	-1787	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	22.5831795812724	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTTTGCCTACCTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70004926	70015348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_70005241_70008229_70008327_70010825_70010937_70012534_70012644_70013520_70013724_70015169
tx.5952	chr14	+	1183	2	ISM	ENSMUSG00000022074.7	ENSMUST00000022663.7	3179	8	12787	1312	2790	425	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTGCTGTTTACTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70017707	70020548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_70018023_70019680
tx.5953	chr14	+	1521	9	FSM	ENSMUSG00000022089.10	ENSMUST00000022680.9	1767	9	1	245	0	-245	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_3	8.98523093748847	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACAGTGTACTTTAACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70337554	70375410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_70337646_70356052_70356102_70361289_70361331_70361631_70361694_70366298_70366436_70366966_70367008_70371898_70372041_70372184_70372320_70374587
tx.5954	chr14	+	938	8	ISM	ENSMUSG00000022089.10	ENSMUST00000022680.9	1767	9	0	3097	0	583	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_3	8.9511143987546	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACTCTTCGCCCCTTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70337553	70372558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_70337646_70356052_70356102_70361289_70361331_70361631_70361694_70366298_70366436_70366966_70367008_70371898_70372041_70372184
tx.5955	chr14	-	1960	7	NNC	ENSMUSG00000044551.14	novel	1983	7	NA	NA	25	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2.91070819942883	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGTGACTGTTAAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70396926	70391855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_70392726_70393298_70393403_70393609_70393726_70393864_70393968_70394107_70394249_70394623_70395104_70396780
tx.5956	chr14	-	901	4	ISM	ENSMUSG00000022090.11	ENSMUST00000153735.8	1578	10	8763	0	-83	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.942809041582063	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAGTGTATTTTCTTCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70405505	70401679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70402243_70403538_70403657_70405109_70405238_70405413
tx.5957	chr14	-	1936	10	ISM	ENSMUSG00000022091.7	ENSMUST00000227259.2	2481	21	12367	-464	12367	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_5	4.24554959434284	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCCTGTCTGCTTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70429705	70417916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70418681_70421114_70421222_70421455_70421557_70422276_70422586_70424307_70424434_70428176_70428292_70428464_70428512_70428596_70428650_70428881_70429025_70429534
tx.5958	chr14	-	1781	10	NNC	ENSMUSG00000022091.7	novel	3061	21	NA	NA	12941	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	7.64166616179973	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATAAACGTGGGTGCCAGGGA	261	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70429131	70417936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_70418681_70421114_70421222_70421455_70421557_70422276_70422586_70424307_70424434_70428176_70428292_70428464_70428512_70428596_70428650_70428881_70429025_70429095
tx.5959	chr14	+	400	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00002076268.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCTAATAGCACGAGTTGTT	4775	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70526997	70538247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_70527147_70537996
tx.596	chr1	+	1871	7	FSM	ENSMUSG00000026377.13	ENSMUST00000027626.13	1889	7	9	9	-6	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	402	junction_6	29.1985539976821	1546	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGCTGGCTTGAAGTGGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118249577	118261543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_118249728_118251311_118251456_118255354_118255464_118257082_118257295_118258335_118258393_118260073_118260209_118260479
tx.5960	chr14	-	1997	8	FSM	ENSMUSG00000000776.14	ENSMUST00000180358.3	2032	8	79	-44	79	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_3	15.9910689359494	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGTGGTTCTGCTCACAT	1967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70680651	70676191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_70677019_70677157_70677311_70677453_70677720_70678038_70678208_70678476_70678602_70678743_70678896_70679791_70679836_70680390
tx.5961	chr14	-	2033	9	FSM	ENSMUSG00000000776.14	ENSMUST00000000793.13	2016	9	-15	-2	-15	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_3	16.2244992218558	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTAAGTGGTTCTGCTCA	1716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70680902	70676194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_70677019_70677157_70677311_70677453_70677720_70678038_70678208_70678476_70678602_70678743_70678896_70679791_70679836_70680390_70680561_70680772
tx.5962	chr14	-	570	5	ISM	ENSMUSG00000000776.14	ENSMUST00000000793.13	2016	9	-24	2340	-24	-24	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_4	8.90224690738243	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAGAGAGAAACAGACGA	1707	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70680911	70678536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70678602_70678743_70678896_70679791_70679836_70680390_70680561_70680772
tx.5963	chr14	+	1624	8	FSM	ENSMUSG00000033589.5	ENSMUST00000047218.5	1565	8	-57	-2	46	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_3	37.0515360886781	841	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTCTCTTCACATCTCAT	6510	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70782736	70786375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_70783179_70783916_70783990_70784369_70784447_70784554_70784676_70785106_70785221_70785379_70785516_70785624_70785780_70785869
tx.5964	chr14	+	1446	3	FSM	ENSMUSG00000045211.6	ENSMUST00000089049.4	3926	3	192	2288	-18	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	3	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGCTTGCCTAAATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70815268	70817723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_70815551_70816351_70816566_70816773
tx.5965	chr14	-	1199	2	NNC	ENSMUSG00000022095.10	novel	4033	17	NA	NA	15160	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCTGACTCTCCCCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70822115	70820734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_70821059_70821240
tx.5966	chr14	-	2695	14	NIC	ENSMUSG00000022099.18	novel	2643	16	NA	NA	-12	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	54.765773443168	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATTGTTTCTATCCATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70864506	70841109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_70842295_70842407_70842489_70843132_70843182_70843333_70843399_70850107_70850214_70850735_70850861_70852282_70852436_70852673_70852731_70853053_70853154_70853513_70853559_70854724_70854881_70855394_70855470_70855678_70855849_70864178
tx.5967	chr14	-	2787	15	NIC	ENSMUSG00000022099.18	novel	5418	16	NA	NA	-38	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	59.4984565054474	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTATTGTTTCTATCCATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70864532	70841109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_70842295_70842407_70842489_70842736_70842803_70843132_70843182_70843333_70843399_70850107_70850214_70850735_70850861_70852282_70852436_70852673_70852731_70853053_70853154_70853513_70853559_70854724_70854881_70855394_70855470_70855678_70855849_70864178
tx.5968	chr14	-	1311	3	ISM	ENSMUSG00000022099.18	ENSMUST00000022694.17	5418	16	21958	2416	12042	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_2	75	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCCCTAAATCTATTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70842790	70841118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70842295_70842407_70842489_70842736
tx.5969	chr14	-	1592	5	FSM	ENSMUSG00000022101.7	ENSMUST00000022697.7	1689	5	97	0	83	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	15.3195136998535	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCGGGTCCGCTGAAGAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70879611	70873642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_70874464_70875906_70876014_70876241_70876420_70878971_70879009_70879162
tx.597	chr1	-	756	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000064302.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTGTTTTGGAGTGAAAT	6050	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118453215	118445711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_118446089_118447149_118447318_118453004
tx.5970	chr14	-	1081	4	ISM	ENSMUSG00000022101.7	ENSMUST00000022697.7	1689	5	6	2045	6	-1739	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	17.4610678049451	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTATATGAGTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70879702	70875687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70876014_70876241_70876420_70878971_70879009_70879162
tx.5971	chr14	-	1008	9	FSM	ENSMUSG00000047911.7	ENSMUST00000062629.5	997	9	-7	-4	-7	4	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_7	2.75850956133924	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCTCTGCCTCCCCCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70890531	70884737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_70884990_70885076_70885111_70885484_70885526_70885699_70885852_70886910_70887005_70889562_70889677_70889768_70889855_70889971_70890136_70890460
tx.5972	chr14	-	623	4	ISM	ENSMUSG00000022100.15	ENSMUST00000226607.2	2769	22	-63	31781	15	-22743	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	395	junction_2	20.0720922897661	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAATACTCTTCAGCATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71004053	70940549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_70940830_70942103_70942198_70944726_70944874_71003951
tx.5973	chr14	+	1704	5	NIC	ENSMUSG00000022102.14	novel	404	3	NA	NA	-22	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.38484800354236	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCTGTGGCCTGTAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71010689	71015935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_71010805_71012905_71013188_71013423_71013512_71014255_71014438_71014898
tx.5974	chr14	+	762	3	NNC	ENSMUSG00000090216.2	novel	503	2	NA	NA	-3982	103	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACAGGTGGAATATATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72823209	72840910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_72823328_72827153_72827269_72840381
tx.5975	chr14	-	1163	2	NNC	ENSMUSG00000115611.2	novel	1024	2	NA	NA	-6278	238	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAGAAGACAAAGTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73084962	73077842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_73078835_73084791
tx.5976	chr14	+	910	3	NNC	ENSMUSG00000115532.2	novel	1537	6	NA	NA	57980	-4386	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTACAGCCTCTCAGTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73084772	73093322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_73085021_73090947_73091124_73092836
tx.5977	chr14	+	778	4	FSM	ENSMUSG00000022106.15	ENSMUST00000165646.8	591	4	-139	-48	-21	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_2	3.29983164553722	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTTCCAACTCACTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73380410	73392653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_73380629_73388972_73389056_73391754_73391849_73392270
tx.5978	chr14	-	602	3	Intergenic	novelGene_278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_2	43	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAAATTGCCTTAGCTCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73431988	73424813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_73425028_73425702_73425852_73431749
tx.5979	chr14	-	838	5	FSM	ENSMUSG00000022108.9	ENSMUST00000226722.2	935	5	103	-6	103	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	633	junction_1	98.2776678599976	417	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTTTTTTCTAAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73605842	73600318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_73600584_73601981_73602133_73603191_73603303_73603760_73603968_73605738
tx.598	chr1	+	4325	15	FSM	ENSMUSG00000026380.11	ENSMUST00000027629.10	9269	15	-1	4945	0	-4945	multi-exon	FALSE	canonical	3	1477	junction_7	202.362891350955	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTATGTGCATTGGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118555674	118607953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_118555833_118559971_118560124_118580030_118580108_118580598_118580705_118581445_118581553_118584097_118584251_118586737_118586849_118589709_118589802_118592488_118592538_118592627_118592722_118593845_118593937_118596360_118596465_118597118_118597262_118603304_118603357_118605117
tx.5980	chr14	-	1143	6	FSM	ENSMUSG00000022108.9	ENSMUST00000022704.9	1796	6	0	653	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	633	junction_1	88.6128658830082	1709	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCTTTTTTCTAAGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73622729	73600318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_73600584_73601981_73602133_73603191_73603303_73603760_73603968_73605738_73605868_73622449
tx.5981	chr14	+	1333	7	FSM	ENSMUSG00000022109.7	ENSMUST00000022705.7	1328	7	0	-5	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_6	14.7356333046425	2392	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTCAATTTTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73747464	73755990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_73747626_73748594_73748662_73751244_73751416_73752729_73752788_73754075_73754163_73754646_73754779_73755333
tx.5982	chr14	-	2508	3	ISM	ENSMUSG00000033405.5	ENSMUST00000043813.3	3579	5	23011	659	-20	-659	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	19	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATGTGCTGTATATCTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73762671	73756975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_73759115_73760737_73760935_73762499
tx.5983	chr14	+	1617	11	FSM	ENSMUSG00000022110.14	ENSMUST00000160507.8	2229	11	121	491	20	-132	multi-exon	FALSE	canonical	3	1524	junction_2	74.4957045741565	3424	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTGGTCTCTTTTCTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73790225	73833091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_73790338_73797880_73798062_73806073_73806174_73806301_73806465_73816795_73816925_73819118_73819258_73828196_73828359_73828449_73828593_73830071_73830193_73831116_73831206_73832813
tx.5984	chr14	+	1436	10	NIC	ENSMUSG00000022110.14	novel	2229	11	NA	NA	20	-132	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	74	junction_1	503.772435397836	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGGTGGTCTCTTTTCTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73790225	73833091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_73790338_73806073_73806174_73806301_73806465_73816795_73816925_73819118_73819258_73828196_73828359_73828449_73828593_73830071_73830193_73831116_73831206_73832813
tx.5985	chr14	+	1282	8	NNC	ENSMUSG00000022110.14	novel	435	2	NA	NA	7019	-12	intron_retention	FALSE	canonical	3	52	junction_1	572.614982660554	129	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTACTACAAAGATAAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73813112	73833211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_73813214_73816795_73816925_73819118_73819258_73828196_73828359_73828449_73828593_73830071_73830193_73831116_73831206_73832813
tx.5986	chr14	-	1132	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000075581.6	novel	747	1	NA	NA	-177126	51	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAGTAACTATGGCAAGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74211856	74033932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_-_74034780_74211571
tx.5987	chr14	-	1575	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000057886.6	novel	552	1	NA	NA	-75	1106	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAACCCTCCCAGAAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74193066	74191333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_-_74192702_74192859
tx.5988	chr14	+	1073	9	NIC	ENSMUSG00000021996.17	novel	1988	9	NA	NA	-10	10	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_8	441.393514196799	2538	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTATTTTACCACCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74969748	74987298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_74969829_74973399_74973475_74975868_74975958_74978596_74978696_74979453_74979579_74980658_74980779_74982087_74982187_74982989_74983162_74987084
tx.5989	chr14	+	995	8	FSM	ENSMUSG00000021996.17	ENSMUST00000177137.8	853	8	-9	-133	-9	10	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	471.460301962456	1456	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTATTTTACCACCATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74973397	74987298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_74973475_74975868_74975958_74978596_74978696_74979453_74979579_74980658_74980779_74982087_74982187_74982989_74983162_74987084
tx.599	chr1	+	567	3	FSM	ENSMUSG00000026380.11	ENSMUST00000190652.2	478	3	1	-90	0	90	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_2	993	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATTTAGTGGCCATATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118555675	118565586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_118555833_118559971_118560124_118565328
tx.5990	chr14	+	3544	15	ISM	ENSMUSG00000021998.17	ENSMUST00000131802.2	3594	16	7581	8	10	-8	3prime_fragment	TRUE	canonical	2	7	junction_11	4.86396579606663	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTCCGAATAAAATGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75435349	75468248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_75435604_75436719_75436884_75437819_75437950_75440075_75440209_75442004_75442087_75443558_75443725_75445859_75446003_75447878_75447975_75449770_75449967_75451924_75452004_75452548_75452664_75453767_75453902_75461510_75461635_75464406_75464532_75466645
tx.5991	chr14	+	591	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115615.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGTGAGCATGCGCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75609286	75616294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_75609485_75615901
tx.5992	chr14	+	511	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115615.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAACCCAGTGAGCATGCGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75611332	75616291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_75611454_75615901
tx.5993	chr14	+	1792	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115615.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGTTTGTCAAGGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75616814	75633728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_75616938_75632059
tx.5994	chr14	-	2620	10	FSM	ENSMUSG00000022003.8	ENSMUST00000022580.8	3588	10	32	936	0	-936	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_9	8.56348838577675	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTTTTTTTAATTAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76024445	75998492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_76000131_76000768_76000850_76004342_76004482_76006255_76006381_76007005_76007102_76007610_76007697_76008878_76008974_76012434_76012583_76014435_76014567_76024364
tx.5995	chr14	+	814	6	FSM	ENSMUSG00000060126.15	ENSMUST00000110894.9	1169	6	238	117	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	5160	junction_2	168.161113221815	92579	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAAGAACTCTTTGCTGTG	1076	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76082770	76085738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_76082897_76083056_76083131_76083642_76083834_76084133_76084240_76084683_76084801_76085538
tx.5996	chr14	-	1522	8	FSM	ENSMUSG00000067995.5	ENSMUST00000088922.5	1467	8	-51	-4	-51	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	468	junction_6	43.0538343595692	314	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGCAACTGTTATCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76248356	76134372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_76135094_76144222_76144367_76155073_76155174_76186877_76186960_76232860_76233006_76234348_76234368_76245144_76245219_76248119
tx.5997	chr14	-	1526	7	NNC	ENSMUSG00000067995.5	novel	1467	8	NA	NA	-51	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	207.983706626799	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAGATGGCAACTGTTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76248356	76134375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_76135094_76144222_76144367_76155073_76155174_76186877_76186960_76232860_76233032_76245144_76245219_76248119
tx.5998	chr14	-	1219	8	FSM	ENSMUSG00000022008.5	ENSMUST00000022585.5	5389	8	-48	4218	-48	-4218	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_3	16.688013540214	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATGTGCACAAATACGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76348248	76327893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_76328187_76332446_76332546_76335893_76336059_76336499_76336632_76339885_76339992_76343493_76343593_76344760_76344894_76348056
tx.5999	chr14	+	1674	10	FSM	ENSMUSG00000022009.2	ENSMUST00000022586.2	3974	10	6	2294	6	-2294	multi-exon	FALSE	canonical	3	441	junction_7	36.4295362461713	611	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATAGTGTGTCTGTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76348336	76372525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_76348767_76349363_76349438_76351614_76351714_76352417_76352481_76353223_76353301_76361925_76362019_76363577_76363772_76368252_76368370_76370411_76370639_76372225
tx.6	chr1	+	412	4	ISM	ENSMUSG00000033813.16	ENSMUST00000081551.14	2547	10	-35	11117	-35	-11117	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	1526	junction_2	170.069266934257	498	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCAATTTCATCACAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4928001	4957011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_4928200_4937692_4937756_4948249_4948356_4956966
tx.60	chr1	-	600	6	NIC	ENSMUSG00000025939.20	novel	493	6	NA	NA	-9	10	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	170.737693553591	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAATGGTGGTGGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16689492	16634551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_16634693_16652150_16652227_16655499_16655656_16668174_16668278_16672485_16672578_16689460
tx.600	chr1	-	501	2	NNC	ENSMUSG00000048402.15	novel	6637	14	NA	NA	-14	-184433	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGTGTGATGGATGAGG	1215	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118981363	118980204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_118980374_118981031
tx.6000	chr14	+	577	4	Intergenic	novelGene_280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTTGGTCACTGTATC	11	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	76414773	76440088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_76415074_76416656_76416728_76417099_76417188_76439970
tx.6001	chr14	+	1189	2	Intergenic	novelGene_281	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACCTGGTGTTTGAGTTA	4955	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76432272	76440931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_76432501_76439970
tx.6002	chr14	-	558	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022010.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACTGAGGGTCTGCAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76732537	76720736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_76721156_76732398
tx.6003	chr14	+	1483	3	FSM	ENSMUSG00000022010.20	ENSMUST00000177207.2	1476	3	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	1157	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACGTGTTTCTATATGAC	6268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76741646	76745203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_76741734_76742688_76742738_76743856
tx.6004	chr14	+	1728	3	FSM	ENSMUSG00000022010.20	ENSMUST00000022587.10	1762	3	32	2	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2255	junction_1	40	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACACGTGTTTCTATATGAC	6571	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76741949	76745203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_76742282_76742688_76742738_76743856
tx.6005	chr14	-	837	2	Intergenic	novelGene_282	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTATTTCTTAAAATATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76753006	76751992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_76752575_76752751
tx.6006	chr14	-	898	2	Intergenic	novelGene_283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTTATTTCTTAAAATATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76753023	76751992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_76752575_76752707
tx.6007	chr14	+	652	4	NNC	ENSMUSG00000115092.2	novel	415	3	NA	NA	-10613	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	12	junction_2	4.24264068711928	98	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCCACCCTCCTGTTCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76753418	76768195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_76753538_76764032_76764202_76766569_76766669_76767930
tx.6008	chr14	+	1478	4	NNC	ENSMUSG00000115092.2	novel	415	3	NA	NA	-10612	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_3	6.54896090146283	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGCCACCCTCCTGTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76753419	76768193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_76753538_76764032_76764202_76766569_76766669_76767101
tx.6009	chr14	-	637	2	ISM	ENSMUSG00000052584.11	ENSMUST00000227076.2	865	5	16751	-4	16385	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	106	junction_1	0	720	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCATGTGCGAGTTACCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76777547	76770251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_76770687_76777345
tx.601	chr1	+	347	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000099860.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGGTAATAGTAACACCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119233294	119247245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_119233438_119247041
tx.6010	chr14	-	395	3	Intergenic	novelGene_284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTGGGCGAGTTGTTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76863176	76845735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_76845903_76862305_76862394_76863036
tx.6011	chr14	-	2249	7	NIC	ENSMUSG00000044350.15	novel	2444	8	NA	NA	16	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	14	junction_6	20.3258182833776	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTTATCCATTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77274065	77261639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_77262415_77266967_77267129_77268176_77268403_77270625_77270792_77271444_77271624_77272232_77272846_77273936
tx.6012	chr14	-	1471	5	ISM	ENSMUSG00000044350.15	ENSMUST00000062789.15	2444	8	2492	2	1932	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_3	13.7931142241337	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTTGTTATCCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77271589	77261641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_77262415_77266967_77267129_77268176_77268403_77270625_77270792_77271444
tx.6013	chr14	-	2431	8	FSM	ENSMUSG00000044350.15	ENSMUST00000062789.15	2444	8	11	2	11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_3	13.9737362978714	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTTGTTATCCATTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77274070	77261641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_77262415_77266967_77267129_77268176_77268403_77270625_77270792_77271444_77271624_77272232_77272846_77273251_77273431_77273936
tx.6014	chr14	-	1132	4	ISM	ENSMUSG00000044350.15	ENSMUST00000139809.2	2391	5	265	1647	2	963	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_3	14.0079342596338	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTCTTGTTCTCAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77274079	77271426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_77271624_77272232_77272846_77273251_77273431_77273936
tx.6015	chr14	+	1954	6	FSM	ENSMUSG00000034795.15	ENSMUST00000048208.10	1721	6	-43	-190	-43	137	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.16619037896906	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACATTGAGAAGTTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77274168	77349834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_77274412_77305299_77305394_77306276_77306390_77329107_77329507_77330209_77330327_77348846
tx.6016	chr14	+	1227	4	FSM	ENSMUSG00000034795.15	ENSMUST00000095625.11	1195	4	-33	1	-23	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTTCCACATTGAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77274188	77349643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_77274412_77305299_77305394_77306276_77306390_77348846
tx.6017	chr14	+	1095	2	ISM	ENSMUSG00000022012.10	ENSMUST00000227662.2	3064	17	326894	-1	134684	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCGATTTTGTGTAATAAT	4597	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77944979	77959201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_77945126_77958252
tx.6018	chr14	-	658	6	FSM	ENSMUSG00000022013.5	ENSMUST00000226459.2	6193	6	0	5535	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	520	junction_3	59.8618409339372	4370	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGCTGATGCTTTTCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78112366	78063655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_78063911_78077607_78077679_78081835_78081913_78090337_78090412_78094378_78094431_78112237
tx.6019	chr14	+	1610	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034731.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGGTGGTCACGTCGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78901501	78904072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_78901847_78902807
tx.602	chr1	+	568	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000099860.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAGGTAATAGTAACACCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119233292	119247245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_119233438_119234108_119234328_119247041
tx.6020	chr14	+	1973	2	ISM	ENSMUSG00000058997.9	ENSMUST00000227676.2	3823	5	-11	45151	-11	-45151	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TAAGACATAAAGATGAGAGG	9335	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79086620	79107928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_79086884_79106218
tx.6021	chr14	-	736	4	ISM	ENSMUSG00000022018.8	ENSMUST00000022595.8	918	5	736	-6	736	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_2	13.3666251038423	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAAAGCTGCCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79538349	79526189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_79526560_79527683_79527747_79529110_79529219_79538154
tx.6022	chr14	-	911	5	FSM	ENSMUSG00000022018.8	ENSMUST00000022595.8	918	5	13	-6	13	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_2	11.7046999107196	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAAAGCTGCCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79539072	79526189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_79526560_79527683_79527747_79529110_79529219_79538154_79538341_79538888
tx.6023	chr14	-	2833	20	FSM	ENSMUSG00000022020.16	ENSMUST00000022597.15	13223	20	30	10360	30	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_14	26.2237337258888	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTGTTTGTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79628188	79573068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_79573372_79573827_79573926_79576973_79577118_79577477_79577577_79578426_79578536_79580565_79580760_79582334_79582549_79588812_79588942_79593160_79593314_79593806_79593977_79596895_79596969_79606517_79606625_79607441_79607538_79612175_79612296_79614807_79614962_79618934_79619070_79620675_79620834_79622093_79622199_79624461_79624547_79628001
tx.6024	chr14	-	1992	15	ISM	ENSMUSG00000022020.16	ENSMUST00000022597.15	13223	20	53	17922	-33	-2214	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	151	junction_9	25.5670387293436	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAGAAGAAGAAGAAGAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79628165	79580630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_79580760_79582334_79582549_79588812_79588942_79593160_79593314_79593806_79593977_79596895_79596969_79606517_79606625_79607441_79607538_79612175_79612296_79614807_79614962_79618934_79619070_79620675_79620834_79622093_79622199_79624461_79624547_79628001
tx.6025	chr14	-	1948	14	NIC	ENSMUSG00000022020.16	novel	2154	16	NA	NA	40	-9568	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_1	42.6480019579572	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAAGTTTGCTTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79628178	79587984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_79588271_79588812_79588942_79593160_79593314_79593806_79593977_79596895_79596969_79606517_79606625_79607441_79607538_79612175_79612296_79614807_79614962_79618934_79619070_79620675_79620834_79622093_79622199_79624461_79624547_79628001
tx.6026	chr14	-	2104	5	ISM	ENSMUSG00000022020.16	ENSMUST00000022597.15	13223	20	52	54770	-34	4566	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_3	11.4318633651737	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGATTTTCTTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79628166	79617478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_79619070_79620675_79620834_79622093_79622199_79624461_79624547_79628001
tx.6027	chr14	-	348	3	FSM	ENSMUSG00000022020.16	ENSMUST00000165337.2	368	3	-77	97	11	-97	multi-exon	FALSE	canonical	3	171	junction_1	8.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGAATTTGTTCGTAAAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79628207	79622141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_79622199_79624461_79624547_79628001
tx.6028	chr14	+	859	3	ISM	ENSMUSG00000022022.4	ENSMUST00000227610.2	2008	10	-214	17993	0	-17993	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_2	9.5	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTTGTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79635211	79639347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_79635477_79637131_79637240_79638861
tx.6029	chr14	+	1803	11	FSM	ENSMUSG00000022022.4	ENSMUST00000022600.4	1799	11	0	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_10	10.5683489722851	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTGCCTACAGAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79635211	79661031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_79635477_79637131_79637240_79638861_79639288_79640264_79640357_79644016_79644099_79644285_79644394_79649081_79649255_79650426_79650545_79653317_79653455_79656627_79656727_79660836
tx.603	chr1	-	614	2	Intergenic	novelGene_51	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGGCTCAGTAGGGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119371895	119367864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_119368350_119371766
tx.6030	chr14	+	503	4	ISM	ENSMUSG00000022022.4	ENSMUST00000022600.4	1799	11	15261	-4	15047	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	73	junction_3	11.3431330181157	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTGCCTACAGAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79650472	79661031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_79650545_79653317_79653455_79656627_79656727_79660836
tx.6031	chr14	-	1528	10	FSM	ENSMUSG00000022023.7	ENSMUST00000022601.7	3704	10	470	1706	-88	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	326	junction_1	16.1780219761789	551	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATCTGTTATTTAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79718490	79699082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_79699570_79703622_79703790_79704712_79704904_79707544_79707621_79708126_79708174_79709791_79709966_79714242_79714373_79714481_79714545_79717812_79717886_79718370
tx.6032	chr14	-	2110	8	NIC	ENSMUSG00000022023.7	novel	3704	10	NA	NA	-88	12	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	39	junction_3	112.21899144448	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAATATCGGGGTCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79718490	79698377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_-_79699570_79703622_79703790_79704712_79704904_79709791_79709966_79714242_79714373_79714481_79714545_79717812_79717886_79718370
tx.6033	chr14	-	929	9	ISM	ENSMUSG00000022023.7	ENSMUST00000227584.2	1512	11	-88	4643	-88	-1883	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	341	junction_1	13.7925478066962	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTACTCCAAAACAGAATCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79718490	79703734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_79703790_79704712_79704904_79707544_79707621_79708126_79708174_79709791_79709966_79714242_79714373_79714481_79714545_79717812_79717886_79718370
tx.6034	chr14	-	515	5	ISM	ENSMUSG00000022023.7	ENSMUST00000227584.2	1512	11	-88	10745	-88	-7985	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	347	junction_3	12.3768937944866	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACAGCCGACGGCCACTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79718490	79709836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_79709966_79714242_79714373_79714481_79714545_79717812_79717886_79718370
tx.6035	chr14	+	1107	12	NNC	ENSMUSG00000022024.11	novel	7392	13	NA	NA	-56	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	532.160061051666	2289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCGTGTGTTCGAGAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79825192	79866417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_79825307_79825393_79825452_79832808_79832900_79834187_79834258_79834835_79834907_79840286_79840354_79844685_79844718_79846395_79846493_79847679_79847788_79857148_79857240_79862280_79862463_79866291
tx.6036	chr14	+	1110	13	FSM	ENSMUSG00000022024.11	ENSMUST00000054908.10	7392	13	63	6219	-55	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1684	junction_8	86.763527603609	4178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCGTGTGTTCGAGAGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79825193	79866417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_79825307_79825393_79825452_79832808_79832900_79834187_79834258_79834835_79834907_79840286_79840341_79840909_79840927_79844685_79844718_79846395_79846493_79847679_79847788_79857148_79857240_79862280_79862463_79866291
tx.6037	chr14	+	243	2	FSM	ENSMUSG00000022024.11	ENSMUST00000226320.2	510	2	267	0	267	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1882	junction_1	0	1634	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCGTGTGTTCGAGAGAGC	NA	False	NA	18	True	NA	NA	NA	79862345	79866417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_79862463_79866291
tx.6038	chr14	-	1048	6	ISM	ENSMUSG00000022025.14	ENSMUST00000022603.8	1433	7	631	155	545	-32	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATAATGTTATCCTAAACGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79898979	79875287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_79875618_79879335_79879503_79882802_79882957_79887751_79887863_79894028_79894170_79898834
tx.6039	chr14	-	480	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000097927.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACATAGCTCTGTCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80217735	80212566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_-_80212932_80217620
tx.604	chr1	+	1068	2	Intergenic	novelGene_52	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACGTCGTACTGAGTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119371590	119373534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_119372082_119372957
tx.6040	chr14	-	1734	4	ISM	ENSMUSG00000022021.15	ENSMUST00000168889.3	4582	28	330531	-4	-20804	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_1	22.5141930543577	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACGTATGTCTCTTCTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87048129	86892798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_86894019_87009521_87009582_87010042_87010139_87047771
tx.6041	chr14	+	2675	14	FSM	ENSMUSG00000022019.17	ENSMUST00000168275.9	2657	14	-18	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_12	16.6232175269033	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTCTGGTTCACTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87654056	87782940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_87654285_87694469_87694555_87696192_87696259_87709511_87709673_87712134_87712277_87714825_87714898_87718169_87718320_87722994_87723136_87723627_87723785_87724597_87724724_87743194_87744043_87749080_87749207_87776832_87776958_87782692
tx.6042	chr14	-	1331	2	Intergenic	novelGene_285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGGAAAATGCAAAAAGATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93453177	93451632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_93452530_93452743
tx.6043	chr14	-	669	2	Intergenic	novelGene_286	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGGACTCAGCAGAACTTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93453779	93452682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_93452744_93453171
tx.6044	chr14	-	2456	4	NNC	ENSMUSG00000033186.10	novel	2240	3	NA	NA	9	284	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	385.421270242777	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTGACAATTCAGATAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99283547	99271695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_99271756_99271814_99273947_99277950_99278097_99283429
tx.6045	chr14	-	2228	3	FSM	ENSMUSG00000033186.10	ENSMUST00000042662.10	2240	3	9	3	9	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	792	junction_1	24.5	622	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGCCTTGTCCTTTTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99283547	99271982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_99273947_99277950_99278097_99283429
tx.6046	chr14	+	910	2	FSM	ENSMUSG00000022070.8	ENSMUST00000226823.2	1071	2	175	-14	20	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_1	0	170	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACTCAGCAAAATGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99283832	99285362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_99284117_99284736
tx.6047	chr14	+	2699	12	FSM	ENSMUSG00000022070.8	ENSMUST00000022656.8	2726	12	27	0	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_1	51.3357124417381	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCGTTTTCCTTGTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99283839	99311976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_99284117_99284736_99284905_99287428_99287536_99290953_99291000_99294174_99294257_99297675_99297742_99298410_99298468_99298955_99299120_99299704_99299841_99305443_99305998_99310037_99310185_99311081
tx.6048	chr14	-	2524	19	ISM	ENSMUSG00000033166.12	ENSMUST00000042471.11	5150	21	2067	2068	1227	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	393	junction_13	28.27946949753	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCATTTTTATTGAGTTG	4594	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99335139	99314709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_99314902_99315697_99315821_99316563_99316723_99316823_99316993_99317100_99317316_99318661_99318819_99320085_99320173_99321462_99321591_99323309_99323395_99323482_99323548_99324824_99324927_99325169_99325287_99326197_99326345_99327053_99327192_99327400_99327515_99328763_99328929_99332608_99332777_99334192_99334267_99335020
tx.6049	chr14	+	463	2	ISM	ENSMUSG00000022064.11	ENSMUST00000228246.2	1546	4	476	6503	-7	-6503	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATGATGATCGACAACTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99337335	99338697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_99337566_99338464
tx.605	chr1	-	2069	4	ISM	ENSMUSG00000004451.15	ENSMUST00000004565.15	2289	5	21135	5	-5580	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	982	junction_2	60.4041941148681	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGATTTCGCCCTTTTTCC	9769	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119411389	119398039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_119399556_119403624_119403803_119405644_119405854_119411223
tx.6050	chr14	+	972	4	FSM	ENSMUSG00000022064.11	ENSMUST00000228246.2	1546	4	476	98	-7	-98	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_3	7.25718035235908	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGAAGTTGGCTTGGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99337335	99345102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_99337566_99338464_99338738_99342604_99342706_99344734
tx.6051	chr14	+	2805	18	FSM	ENSMUSG00000022064.11	ENSMUST00000022650.9	2797	18	-7	-1	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	66	junction_8	18.7005171736119	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAGACTGTAGAGTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99337335	99491930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_99337566_99338464_99338738_99342604_99342706_99344734_99344934_99350405_99350526_99370671_99370806_99373888_99373998_99374477_99374660_99377972_99378099_99388078_99388178_99416750_99416917_99423916_99424068_99425153_99425245_99433784_99433888_99448375_99448507_99458994_99459080_99480274_99480446_99491596
tx.6052	chr14	+	1148	3	ISM	ENSMUSG00000005148.9	ENSMUST00000005279.8	3352	4	2769	1593	2306	-1593	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3503	junction_2	111	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGCAAAGGAACTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99538895	99550879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_99539691_99540853_99540914_99550586
tx.6053	chr14	+	449	3	Intergenic	novelGene_287	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGAGTCTTGATTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99576572	99588766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_99576681_99578571_99578664_99588517
tx.6054	chr14	-	818	2	ISM	ENSMUSG00000072294.6	ENSMUST00000228216.2	5890	8	-20	278515	-20	99462	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAACCAACCAACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100522135	100386582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_100387232_100521966
tx.6055	chr14	-	851	3	NNC	ENSMUSG00000075486.11	novel	519	3	NA	NA	-2	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	218.5	840	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGTTTTATGACGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101877895	101871205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_101871829_101874389_101874543_101877820
tx.6056	chr14	+	1185	4	FSM	ENSMUSG00000022111.10	ENSMUST00000227815.2	1270	4	25	60	-2	-60	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2159.4787951417	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTTCTCGTTTTCACTA	115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101891427	101905198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_101891556_101903196_101903326_101903947_101904105_101904427
tx.6057	chr14	+	909	8	NIC	ENSMUSG00000022111.10	novel	903	9	NA	NA	-4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1532.99751720448	5270	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTGTTGTTTTTGCTAC	113	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101891425	101933561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_101891556_101903196_101903326_101903947_101904105_101904427_101904514_101905964_101906013_101928007_101928084_101932594_101932654_101933337
tx.6058	chr14	+	894	8	NIC	ENSMUSG00000022111.10	novel	903	9	NA	NA	-3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	44	junction_1	1518.39837745338	2936	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTGTTGTTTTTGCTAC	114	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101891426	101933561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_101891542_101903196_101903326_101903947_101904105_101904427_101904514_101905964_101906013_101928007_101928084_101932594_101932654_101933337
tx.6059	chr14	+	408	2	ISM	ENSMUSG00000022125.8	ENSMUST00000022721.8	2445	4	90	5749	90	-1417	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAGGTCATATTAATTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103307741	103309315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_103307904_103309069
tx.606	chr1	-	2209	5	FSM	ENSMUSG00000004451.15	ENSMUST00000004565.15	2289	5	75	5	75	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	967	junction_4	66.8169140263152	392	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGATTTCGCCCTTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119432449	119398039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_119399556_119403624_119403803_119405644_119405854_119411223_119411387_119432306
tx.6060	chr14	+	2352	4	FSM	ENSMUSG00000022125.8	ENSMUST00000022721.8	2445	4	90	3	90	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_2	4.96655480858378	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGGGCTTGCATCTTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103307741	103315061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_103307904_103309069_103309236_103310622_103310849_103313263
tx.6061	chr14	+	303	3	NNC	ENSMUSG00000115762.2	novel	486	3	NA	NA	39932	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGCGCGTGTGTTTGGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103741418	103750055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_103741527_103749176_103749266_103749949
tx.6062	chr14	+	1524	3	NNC	ENSMUSG00000055717.14	novel	2863	7	NA	NA	35017	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_1	23.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATCAGCTCACGCATGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103936950	103942343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_103937081_103939952_103940275_103941271
tx.6064	chr14	-	3463	6	FSM	ENSMUSG00000022120.5	ENSMUST00000022716.4	3420	6	-43	0	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_2	11.8490505948789	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCTTTTGATGTCATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104760111	104714971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_104717734_104740782_104740872_104743528_104743778_104745374_104745467_104747737_104747874_104759976
tx.6065	chr14	-	630	4	ISM	ENSMUSG00000022120.5	ENSMUST00000228448.2	1056	6	-59	3474	-47	191	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_2	9.84321537348893	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTTGTAGTCTGGGGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	104760128	104743527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_104743778_104745374_104745467_104747737_104747874_104759976
tx.6066	chr14	-	1121	4	ISM	ENSMUSG00000091509.8_ENSMUSG00000022119.16	ENSMUST00000163545.8	3270	22	52171	-491	5648	491	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	206	junction_1	13.9283882771841	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	GAAAAAAAAGAGAAAATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105362125	105351909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_105352723_105354421_105354536_105358417_105358505_105362018
tx.6067	chr14	-	1735	9	ISM	ENSMUSG00000091509.8_ENSMUSG00000022119.16	ENSMUST00000163545.8	3270	22	37722	-489	-8801	489	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_8	52.6444441513062	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAAAAAAGAGAAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105376574	105351911	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_105352723_105354421_105354536_105358417_105358505_105362018_105362220_105366000_105366106_105367668_105367837_105368918_105368994_105369317_105369444_105376526
tx.6068	chr14	+	959	6	NNC	ENSMUSG00000053253.17	novel	2532	8	NA	NA	-21	6067	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	12	junction_5	165.687175122277	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTCCTCATTGTGAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105496231	105538445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_105496438_105525050_105525214_105529665_105529800_105532232_105532327_105535436_105535562_105538208
tx.6069	chr14	+	1592	8	FSM	ENSMUSG00000053253.17	ENSMUST00000138283.2	1695	8	103	0	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_7	99.9552961302691	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTGCCTCGTTTAGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105496290	105546305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_105496438_105525050_105525214_105529665_105529800_105532232_105532327_105535436_105535562_105539732_105539800_105542164_105542271_105545549
tx.607	chr1	-	616	4	FSM	ENSMUSG00000098447.3	ENSMUST00000185095.3	607	4	-9	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	4.32049379893857	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGATTTGAATCCCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119454098	119447819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_119447988_119448121_119448209_119448474_119448600_119453862
tx.6070	chr14	+	2286	8	FSM	ENSMUSG00000053253.17	ENSMUST00000181969.8	2532	8	243	3	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	271	junction_7	54.1807255433901	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACCTCTTGTATTTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105496250	105546729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_105496438_105525050_105525214_105529665_105529800_105532232_105532327_105535436_105535562_105539732_105539800_105542164_105542271_105545319
tx.6071	chr14	+	385	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000060143.8	novel	384	1	NA	NA	-1	64964	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGAGAGAGAGAGAAGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	105919260	105984609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_105919616_105984579
tx.6072	chr14	-	680	4	NNC	ENSMUSG00000115796.2	novel	505	3	NA	NA	3309	151	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGACAGACTGCTCTTCCAGA	4558	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106096626	106090355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_-_106090819_106091255_106091373_106096048_106096114_106096591
tx.6073	chr14	+	1311	3	NNC	ENSMUSG00000022113.7	novel	584	2	NA	NA	-6	18266	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTGATTTACTTTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	106343625	106391559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_106343774_106389123_106389224_106390496
tx.6074	chr14	-	844	3	Intergenic	novelGene_289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTAGTATTTAGCCCCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	107202529	107136774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_107136939_107188815_107188844_107201877
tx.6075	chr14	-	628	3	Intergenic	novelGene_291	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	112608938	112603670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_-_112603884_112604558_112604708_112608672
tx.6076	chr14	+	2017	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000058126.8	novel	2147	1	NA	NA	13	-46	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CGATCAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	113552052	113554140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr14_+_113553477_113553547
tx.6077	chr14	-	1580	11	ISM	ENSMUSG00000022130.11	ENSMUST00000022727.10	1682	12	2074	-2	2071	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_8	16.100931650063	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAATGTCTTTTTATTTTG	2324	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118368085	118349885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_118350570_118351724_118351823_118352528_118352588_118353490_118353657_118354381_118354426_118355148_118355209_118357051_118357151_118359130_118359274_118364906_118364998_118365634_118365704_118368018
tx.6078	chr14	-	1692	12	FSM	ENSMUSG00000022130.11	ENSMUST00000022727.10	1682	12	-8	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_8	15.4084875183551	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTAATGTCTTTTTATTTTG	242	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118370167	118349885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_118350570_118351724_118351823_118352528_118352588_118353490_118353657_118354381_118354426_118355148_118355209_118357051_118357151_118359130_118359274_118364906_118364998_118365634_118365704_118368018_118368086_118370055
tx.6079	chr14	-	741	5	ISM	ENSMUSG00000022130.11	ENSMUST00000228543.2	1594	12	0	8986	0	8965	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_1	23.054283766797	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTTAAAAAATCTGTATTC	242	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118370167	118358871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_118359274_118364906_118364998_118365634_118365704_118368018_118368086_118370055
tx.608	chr1	-	564	5	NNC	ENSMUSG00000098447.3	novel	607	4	NA	NA	-42	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	3.8405728739343	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGATTTGAATCCCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119454131	119447819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_119447988_119448121_119448209_119448474_119448600_119453862_119454007_119454091
tx.6080	chr14	+	1876	9	FSM	ENSMUSG00000022131.4	ENSMUST00000022728.4	1875	9	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_5	22.6463987203264	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAATTAGCATTTGTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118374568	118400673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_118374753_118377148_118377308_118385496_118385698_118390980_118391162_118391288_118391339_118395308_118395467_118397404_118397597_118398968_118399047_118400000
tx.6081	chr14	+	819	2	FSM	ENSMUSG00000090534.2	ENSMUST00000164755.2	2322	2	491	1012	-157	-1012	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTACTCTGACAGTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	118474134	118475159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_118474357_118474562
tx.6084	chr14	+	1655	12	FSM	ENSMUSG00000022136.9	ENSMUST00000022734.9	5141	12	-7	3493	-7	-3493	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_10	14.8340684499182	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTCTTTATTATTATTTTT	2322	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119175380	119215616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_119175583_119190520_119190632_119195279_119195405_119198197_119198273_119205400_119205554_119207511_119207694_119208094_119208215_119209774_119209881_119210104_119210226_119212543_119212677_119214121_119214271_119215438
tx.6085	chr14	+	386	2	NNC	ENSMUSG00000022136.9	novel	5141	12	NA	NA	39763	-3494	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTCTTTATTATTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119215150	119215615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_119215360_119215438
tx.6086	chr14	-	1289	6	FSM	ENSMUSG00000042104.19	ENSMUST00000131424.8	1170	6	94	-213	94	-12	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	1.01980390271856	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATTTTTAAACTACTCAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119244035	119223616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_119224326_119232357_119232485_119235508_119235626_119239182_119239298_119240237_119240399_119243975
tx.6087	chr14	+	2553	9	FSM	ENSMUSG00000022139.18	ENSMUST00000088419.13	4552	9	0	1999	0	72	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_3	5.41842920042331	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTATATTTTTAAAGTTG	6829	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120513080	120667110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_120513318_120562205_120562825_120616561_120616727_120622802_120623004_120626311_120626576_120633123_120633178_120633862_120634017_120642049_120642145_120666346
tx.6088	chr14	+	967	2	FSM	ENSMUSG00000051615.15	ENSMUST00000062117.14	4191	2	268	2956	268	-2956	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACAAGAGTACTGAAGTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120716123	120741650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_120716453_120741012
tx.6089	chr14	+	3961	26	NNC	ENSMUSG00000030662.11	novel	4518	26	NA	NA	-22	-2	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_7	256.482432926702	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCCTGTGTAGAACTTCA	1809	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121148613	121184828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_121148756_121154767_121154849_121157334_121157528_121159537_121159641_121160451_121160549_121160892_121160998_121163612_121163740_121163824_121163946_121165869_121165958_121166712_121166820_121170255_121170381_121170462_121170553_121170641_121170816_121172440_121172660_121173833_121173918_121175976_121176110_121176187_121176310_121176871_121176969_121178233_121178407_121179043_121179156_121179241_121179298_121180060_121180184_121181091_121181312_121181744_121181974_121183488_121183631_121184130
tx.609	chr1	+	1695	2	FSM	ENSMUSG00000098923.2	ENSMUST00000183607.2	681	2	-17	-997	-4	-757	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGTGTGAAGATATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119453885	119455956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_119454278_119454653
tx.6090	chr14	+	1851	9	ISM	ENSMUSG00000030662.11	ENSMUST00000228277.2	4140	26	23612	2	23612	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1174	junction_2	90.6220689181173	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCCTGTGTAGAACTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121176870	121184828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_121176969_121178233_121178407_121179043_121179156_121179241_121179298_121180060_121180184_121181091_121181312_121181744_121181974_121183488_121183631_121184130
tx.6091	chr14	+	1566	7	ISM	ENSMUSG00000030662.11	ENSMUST00000228277.2	4140	26	25799	2	25799	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1201	junction_3	93.8398458367588	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCCTGTGTAGAACTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121179057	121184828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_121179156_121179241_121179298_121180060_121180184_121181091_121181312_121181744_121181974_121183488_121183631_121184130
tx.6092	chr14	+	2766	12	NNC	ENSMUSG00000025555.15	novel	4885	27	NA	NA	10286	-30	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	10	junction_1	35.1415085025488	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAGCACATACAAGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121502605	121521126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_121502734_121505284_121505367_121509091_121509330_121510155_121510287_121512786_121512856_121512997_121513088_121513648_121513732_121513804_121513918_121514310_121514478_121517247_121517356_121518231_121518384_121519721
tx.6093	chr14	+	1838	12	NNC	ENSMUSG00000025555.15	novel	4885	27	NA	NA	11495	-935	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	36.2427536216917	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCCAATCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121503814	121520221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_121503920_121505284_121505367_121509091_121509330_121510155_121510287_121512786_121512856_121512997_121513088_121513648_121513732_121513804_121513918_121514310_121514478_121517247_121517356_121518231_121518384_121519721
tx.6094	chr14	+	1989	12	NNC	ENSMUSG00000025555.15	novel	4885	27	NA	NA	12233	-935	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	37.0706272533751	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCCAATCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121504552	121520221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_121504809_121505284_121505367_121509091_121509330_121510155_121510287_121512786_121512856_121512997_121513088_121513648_121513732_121513804_121513918_121514310_121514478_121517247_121517356_121518231_121518384_121519721
tx.6095	chr14	-	1152	2	ISM	ENSMUSG00000063410.9	ENSMUST00000079817.8	2676	11	87227	-2	11368	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	297	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTTTGCATACTATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121529519	121523752	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_121524777_121529391
tx.6096	chr14	-	1494	4	ISM	ENSMUSG00000025557.11	ENSMUST00000088386.8	3121	23	39289	-7	26506	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_3	7.58653778449403	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTTTGTGTGTCTTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121703375	121697025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_121698186_121699878_121699987_121702314_121702459_121703293
tx.6097	chr14	+	2154	9	FSM	ENSMUSG00000041765.7	ENSMUST00000039803.7	2139	9	-14	-1	-14	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	342	junction_2	40.200862863874	298	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTCAGTAGTTTTTATAC	8872	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122116017	122258447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_122116187_122142534_122142663_122144702_122144823_122145622_122145733_122211020_122211145_122220679_122220728_122231636_122231883_122246202_122246326_122257361
tx.6098	chr14	+	1719	6	NIC	ENSMUSG00000041765.7	novel	688	5	NA	NA	59	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	57	junction_1	151.832275883621	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTTTTCAGTAGTTTTTAT	2069	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122183784	122258445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr14_+_122183879_122211020_122211145_122220679_122220728_122231636_122231883_122246202_122246326_122257361
tx.6099	chr14	+	923	2	FSM	ENSMUSG00000071229.4	ENSMUST00000045976.7	913	2	-11	1	-11	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	0	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACCTGTTCTTTGTAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122272074	122275831	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_122272425_122275258
tx.61	chr1	-	1551	6	NIC	ENSMUSG00000025939.20	novel	2181	6	NA	NA	-5	-351	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	127	junction_3	123.769139933992	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGTGGACATTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16689513	16640356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_16641507_16652150_16652227_16655499_16655577_16668174_16668278_16672485_16672578_16689460
tx.610	chr1	-	3377	25	FSM	ENSMUSG00000026383.15	ENSMUST00000052404.13	6442	25	-17	3082	-17	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_7	8.61674322983393	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGATAATGTTAAAGTAGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119576683	119475848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_119476926_119477616_119477748_119478251_119478294_119481935_119482011_119482781_119482873_119495525_119495591_119497774_119497904_119500535_119500634_119506643_119506808_119526734_119526851_119527927_119527968_119532957_119532986_119535716_119535824_119536846_119537017_119543075_119543146_119544130_119544220_119545093_119545182_119545283_119545405_119547896_119547950_119548404_119548450_119549615_119549695_119551655_119551699_119561274_119561380_119570206_119570389_119576514
tx.6100	chr14	+	2792	17	FSM	ENSMUSG00000025544.14	ENSMUST00000026624.11	3107	17	44	271	44	-271	multi-exon	TRUE	canonical	3	817	junction_12	125.603480743967	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTGTATCACTCCCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122344493	122396745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_122344848_122361127_122361196_122363517_122363612_122370691_122370820_122374783_122374914_122377061_122377187_122378610_122378723_122379775_122379856_122380818_122380928_122382508_122382642_122384076_122384197_122385399_122385458_122387261_122387422_122388145_122388298_122389375_122389488_122392739_122392912_122396060
tx.6101	chr14	+	1044	4	ISM	ENSMUSG00000025544.14	ENSMUST00000026624.11	3107	17	43773	271	43543	-271	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	989	junction_1	174.264167286336	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTGTATCACTCCCTGC	4151	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122388222	122396745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_122388298_122389375_122389488_122392739_122392912_122396060
tx.6102	chr14	+	1235	8	FSM	ENSMUSG00000025545.11	ENSMUST00000026625.7	1231	8	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	643	junction_7	45.2372430997437	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTATGGTTTTGCTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122419111	122639646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_122419194_122548655_122548843_122608652_122608842_122613293_122613396_122615195_122615290_122616614_122616783_122621609_122621735_122639358
tx.6103	chr14	+	970	5	ISM	ENSMUSG00000025545.11	ENSMUST00000026625.7	1231	8	3	24034	3	-24027	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	648	junction_1	14.6180539060437	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTATGGGGTCTACTCGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122419118	122615612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_122419194_122548655_122548843_122608652_122608842_122613293_122613396_122615195
tx.6104	chr14	+	1684	3	ISM	ENSMUSG00000025545.11	ENSMUST00000026625.7	1231	8	7	29568	7	-29561	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	648	junction_1	10.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGATTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122419122	122610078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_122419194_122548655_122548843_122608652
tx.6105	chr14	+	1255	8	NNC	ENSMUSG00000025545.11	novel	1231	8	NA	NA	19441	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	101	junction_1	209.063900005989	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTATGGTTTTGCTATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122514893	122639646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr14_+_122514996_122548655_122548843_122608652_122608842_122613293_122613396_122615195_122615290_122616614_122616783_122621609_122621735_122639358
tx.6106	chr14	-	2035	2	FSM	ENSMUSG00000041703.8	ENSMUST00000039118.7	4767	2	1446	1286	1446	1112	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACAAAAACAAAAAAAATCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122701643	122695492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_122697188_122701303
tx.6107	chr14	+	500	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041703.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTTGCTTAGACTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122702347	122703566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_122702409_122703127
tx.6108	chr14	+	351	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041703.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTTGCTTAGACTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122702366	122703566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr14_+_122702409_122703127_122703265_122703394
tx.6109	chr14	+	2484	24	FSM	ENSMUSG00000041650.16	ENSMUST00000038374.13	2592	24	-8	116	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_1	20.0942015919555	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTAGTTTGCCCTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122771742	123127240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_+_122771872_122795126_122795205_122800190_122800239_122800330_122800400_122820028_122820143_122822468_122822523_122854165_122854298_122875792_122875830_122887663_122887743_122896089_122896193_122901665_122901761_122905932_122906084_122922293_122922438_122923514_122923590_122927510_122927580_122929591_122929668_122938466_122938578_122951434_122951538_122975313_122975417_123027767_123027867_123050605_123050660_123114175_123114317_123124458_123124537_123126898
tx.611	chr1	-	2394	13	ISM	ENSMUSG00000026383.15	ENSMUST00000191046.7	6870	17	46	16173	-18	10740	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_11	9.003085890713	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTGCATAGTTTTCATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119576684	119534644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_119535824_119536846_119537017_119543075_119543146_119544130_119544220_119545093_119545182_119545283_119545405_119547896_119547950_119548404_119548450_119549615_119549695_119551655_119551699_119561274_119561380_119570206_119570389_119576514
tx.6110	chr14	+	924	7	ISM	ENSMUSG00000041650.16	ENSMUST00000038374.13	2592	24	179680	116	-10	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	109	junction_2	15.3884877605162	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTAGTTTGCCCTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	122951430	123127240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_+_122951538_122975313_122975417_123027767_123027867_123050605_123050660_123114175_123114317_123124458_123124537_123126898
tx.6111	chr14	-	1017	2	ISM	ENSMUSG00000041625.16	ENSMUST00000038075.12	1076	3	12627	0	12550	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTTTGGTCCTTCTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123137947	123128271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr14_-_123129229_123137887
tx.6112	chr14	-	530	4	FSM	ENSMUSG00000041625.16	ENSMUST00000161322.3	524	4	-5	-1	-5	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	17.6131264181639	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGCTGTTGCTGTTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123150565	123128281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_123128494_123129020_123129229_123137887_123137945_123150512
tx.6113	chr14	-	3391	18	FSM	ENSMUSG00000041594.19	ENSMUST00000037726.14	3416	18	25	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_13	13.8696352514015	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCTTGGTTTCTTTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	123220670	123156382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr14_-_123157556_123158644_123158715_123163375_123163489_123164963_123165079_123170231_123170374_123170508_123170617_123170739_123170820_123178716_123178849_123179226_123179399_123180566_123180770_123182085_123182251_123182919_123183013_123187900_123188005_123200709_123200798_123209151_123209369_123210581_123210698_123215485_123215699_123220583
tx.6114	chr15	+	226	2	Intergenic	novelGene_516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTTCTTACTGAGCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3053633	3059997	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_3053726_3059863
tx.6115	chr15	+	2013	5	FSM	ENSMUSG00000064373.14	ENSMUST00000159216.10	2085	5	75	-3	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	1.78535710713571	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGTGTCTTTATTGTTCA	9352	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3300477	3309992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_3300535_3304142_3304359_3305048_3305262_3306638_3306757_3308583
tx.6116	chr15	-	1141	6	NIC	ENSMUSG00000091119.3	novel	798	9	NA	NA	-33	-10	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	9	junction_3	10.2878569196893	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTCTTTGTTGTTCTTTC	8063	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3333041	3309561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_3310232_3310504_3310589_3312299_3312428_3327582_3327689_3330586_3330676_3332977
tx.6117	chr15	-	954	9	FSM	ENSMUSG00000091119.3	ENSMUST00000165386.2	798	9	-30	-126	-30	126	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_4	8.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAAAATTGCATTTATTTTG	8066	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3333038	3309982	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_3310232_3310504_3310589_3312299_3312428_3319606_3319710_3321861_3321927_3323334_3323404_3327582_3327689_3330586_3330676_3332977
tx.6118	chr15	-	1173	2	NNC	ENSMUSG00000091119.3	novel	798	9	NA	NA	-15	-19757	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGTTATTATACTAAAATGT	8081	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3333023	3329973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_3330676_3332552
tx.6119	chr15	-	1496	6	FSM	ENSMUSG00000041935.11	ENSMUST00000046633.10	5076	6	-2	3582	-2	613	multi-exon	FALSE	canonical	3	175	junction_4	35.1681674245332	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGCATGGTTACTCCAAAAA	2178	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4025228	4015098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_4015962_4018072_4018188_4019036_4019169_4021199_4021347_4021839_4021947_4025096
tx.612	chr1	-	1439	3	NNC	ENSMUSG00000026383.15	novel	6442	25	NA	NA	-15	-14400	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTCTTGTTCTCTCCGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119576681	119564080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_119565171_119570206_119570389_119576514
tx.6120	chr15	-	1368	6	NNC	ENSMUSG00000041935.11	novel	5076	6	NA	NA	2	522	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	12	junction_2	95.3217708605962	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGAAACTTATTTATTTTG	2182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4025224	4015189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_4015962_4018072_4018155_4019036_4019169_4021199_4021347_4021839_4021947_4025096
tx.6121	chr15	-	1460	7	NNC	ENSMUSG00000041935.11	novel	5076	6	NA	NA	-2	465	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_5	107.135039397326	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGTGACTAATATTTAGA	2178	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4025228	4015246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_4015962_4018072_4018188_4019036_4019169_4021199_4021347_4021437_4021550_4021839_4021947_4025096
tx.6122	chr15	-	241	2	ISM	ENSMUSG00000041935.11	ENSMUST00000046633.10	5076	6	-2	10321	-2	-6126	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACTAAAGCAAATGTGAAGTC	2178	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4025228	4021837	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_4021947_4025096
tx.6123	chr15	+	641	4	NNC	ENSMUSG00000097662.2	novel	3526	3	NA	NA	-6	7110	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2.05480466765633	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTATGTGGTCTTGAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4025514	4052450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_4025611_4026886_4026967_4028795_4028867_4052056
tx.6124	chr15	+	2016	17	FSM	ENSMUSG00000022186.15	ENSMUST00000110690.9	3527	17	271	1240	-30	124	multi-exon	FALSE	canonical	3	193	junction_7	29.8008362927955	215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAATTTTCATGTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4056135	4183586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_4056332_4064741_4064851_4066572_4066664_4076946_4077083_4083196_4083347_4087150_4087258_4089417_4089479_4120649_4120758_4121892_4122008_4123496_4123592_4125953_4126003_4130608_4130682_4131285_4131362_4158315_4158406_4172273_4172355_4177046_4177149_4183209
tx.6125	chr15	+	1706	15	ISM	ENSMUSG00000022186.15	ENSMUST00000110690.9	3527	17	10713	1240	-10163	124	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_5	28.9722773896506	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTGAATTTTCATGTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4066577	4183586	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_4066664_4076946_4077083_4083196_4083347_4087150_4087258_4089417_4089479_4120649_4120758_4121892_4122008_4123496_4123592_4125953_4126003_4130608_4130682_4131285_4131362_4158315_4158406_4172273_4172355_4177046_4177149_4183209
tx.6126	chr15	+	526	4	ISM	ENSMUSG00000022186.15	ENSMUST00000110690.9	3527	17	102447	1368	-13693	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	235	junction_3	26.7706306736817	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGGAAAACATTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4158311	4183458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_4158406_4172273_4172355_4177046_4177149_4183209
tx.6127	chr15	+	408	4	FSM	ENSMUSG00000041841.9	ENSMUST00000045356.9	835	4	-35	462	-35	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	15185	junction_3	3886.71174930972	30940	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTGGTGATCTAAGGTA	2213	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5146091	5148160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_5146167_5146768_5146905_5147100_5147186_5148048
tx.6128	chr15	+	334	3	FSM	ENSMUSG00000041841.9	ENSMUST00000227635.2	925	3	592	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	15185	junction_2	4434.5	1219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTGGTGATCTAAGGTA	2889	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5146767	5148160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_5146905_5147100_5147186_5148048
tx.6129	chr15	-	491	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068706.4	novel	482	1	NA	NA	-39	67	multi-exon	FALSE	canonical	1	14	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAGAAAATGTGTCACCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5150656	5150068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_5150399_5150495
tx.613	chr1	-	1486	2	FSM	ENSMUSG00000036975.6	ENSMUST00000037906.6	3341	2	35	1820	35	-1820	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_1	0	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGTCTCTGAATTCCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119840903	119837439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_119838885_119840862
tx.6130	chr15	+	1682	9	FSM	ENSMUSG00000050697.10	ENSMUST00000228218.2	4618	9	-16	2952	14	-2952	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_2	19.5316249964001	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGCTTATTTCTTTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5173356	5208421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_5173478_5190083_5190226_5194192_5194287_5198048_5198194_5199409_5199498_5203688_5203914_5205966_5206454_5206559_5206687_5208168
tx.6131	chr15	+	1582	8	NIC	ENSMUSG00000050697.10	novel	4655	9	NA	NA	-10	-2952	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	34	junction_2	45.007482371132	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGCTTATTTCTTTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5173362	5208421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_5173478_5190083_5190226_5198048_5198194_5199409_5199498_5203688_5203914_5205966_5206454_5206559_5206687_5208168
tx.6132	chr15	+	1663	5	FSM	ENSMUSG00000022151.17	ENSMUST00000022751.15	1832	5	155	14	-12	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	41.1430431543414	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGGTCAAAAAAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5215195	5247803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_5215250_5219062_5219285_5237849_5237932_5241479_5241612_5246630
tx.6133	chr15	+	1610	4	ISM	ENSMUSG00000022151.17	ENSMUST00000022751.15	1832	5	4021	14	2227	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_1	10.4986771653491	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTGGTCAAAAAAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5219061	5247803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_5219285_5237849_5237932_5241479_5241612_5246630
tx.6134	chr15	-	1308	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115093.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGGTGTTGTATTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6074077	6054170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_6055131_6073729
tx.6135	chr15	-	1257	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115093.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	1.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGGTGTTGTATTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6074122	6054170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_6055131_6073729_6073988_6074083
tx.6136	chr15	-	1475	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115093.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCTGGTGTTGTATTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6074155	6054170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_6055316_6073729_6073988_6074083
tx.6137	chr15	-	619	3	Intergenic	novelGene_518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTACAAGAAAATGTTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6074126	6070756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_6071075_6073729_6073988_6074083
tx.6138	chr15	-	482	3	NIC	ENSMUSG00000089647.3	novel	3376	7	NA	NA	-13042	-2271	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTGAATAGGTCTATGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6649405	6636178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_6636386_6639577_6639674_6649226
tx.6139	chr15	+	867	2	NNC	ENSMUSG00000022148.17	novel	569	4	NA	NA	-655	3012	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGAGTATTATTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6683336	6684361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_6683491_6683648
tx.614	chr1	-	886	2	FSM	ENSMUSG00000050777.8	ENSMUST00000056089.8	1311	2	287	138	287	-138	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTAAAATGTCTTCCTACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120001517	119995244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_119996055_120001441
tx.6140	chr15	+	1002	1	FSM	ENSMUSG00000067547.7	ENSMUST00000146631.2	819	1	-66	-117	-66	117	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CTTCAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6683337	6684339	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_6683300_6684300
tx.6141	chr15	+	847	7	NNC	ENSMUSG00000050310.10	novel	2633	7	NA	NA	0	-1790	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	30.4119859412188	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTAGCCTTCCTTGATTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6737861	6786306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_6737933_6738113_6738162_6764845_6764948_6773808_6773874_6774929_6775062_6780138_6780203_6785941
tx.6142	chr15	+	717	8	NNC	ENSMUSG00000050310.10	novel	4695	8	NA	NA	0	980	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	28.2727242899497	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCACCTTCTTAATCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6737861	6789076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_6737933_6738113_6738162_6764845_6764948_6773808_6773874_6774929_6775062_6780138_6780203_6785941_6786069_6788968
tx.6143	chr15	+	851	2	FSM	ENSMUSG00000054263.13	ENSMUST00000226826.2	299	2	1	-553	1	553	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATCTTGCCTGATTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7159048	7162687	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_7159308_7162095
tx.6144	chr15	-	557	4	ISM	ENSMUSG00000039828.8	ENSMUST00000045766.8	2126	18	211786	-5	-1031	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_1	26.9814751264641	168	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTTGTCCTTTCTGTTAT	6705	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7916889	7902537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_7902735_7913761_7913925_7915043_7915161_7916809
tx.6145	chr15	-	2130	18	FSM	ENSMUSG00000039828.8	ENSMUST00000045766.8	2126	18	1	-5	1	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	158	junction_1	88.3053055575902	216	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTTGTCCTTTCTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8128674	7902537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_7902735_7913761_7913925_7915043_7915161_7916809_7916890_7918556_7918658_7949967_7950107_7951549_7951635_7953688_7953789_8006448_8006624_8049069_8049147_8065211_8065366_8072191_8072326_8075912_8075973_8108643_8108849_8111945_8112067_8123159_8123244_8128439_8128506_8128602
tx.6146	chr15	-	1583	3	ISM	ENSMUSG00000039828.8	ENSMUST00000227371.2	1130	4	186	-542	168	542	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	289	junction_1	94	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTCCTCTCTGATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8128507	8121168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_8122600_8123159_8123244_8128439
tx.6147	chr15	-	1519	4	FSM	ENSMUSG00000039828.8	ENSMUST00000227371.2	1130	4	19	-408	1	408	multi-exon	FALSE	canonical	3	289	junction_1	79.3823378060608	748	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGGCTGCTACTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8128674	8121302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_8122600_8123159_8123244_8128439_8128506_8128602
tx.6148	chr15	-	233	3	ISM	ENSMUSG00000039828.8	ENSMUST00000227371.2	1130	4	15	1442	-3	-1442	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	426	junction_2	25.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACATGTATTTTCCTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8128678	8123152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_8123244_8128439_8128506_8128602
tx.6149	chr15	+	458	2	ISM	ENSMUSG00000022142.9	ENSMUST00000230017.2	4391	34	-4	44567	-4	-22465	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	237	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTCGTTATTATAAATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8138815	8141953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_8139087_8141766
tx.615	chr1	-	431	3	FSM	ENSMUSG00000026385.17	ENSMUST00000112648.8	504	3	120	-47	120	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2709	junction_1	28.5	891	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGGGTTACTCTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120047748	120041019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_120041264_120044115_120044179_120047624
tx.6150	chr15	+	414	2	ISM	ENSMUSG00000039801.8	ENSMUST00000110617.2	10469	53	-10	100833	-10	-16740	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCCTTGTGTGGTTAAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8198579	8199809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_8198974_8199789
tx.6151	chr15	-	751	4	ISM	ENSMUSG00000022141.8	ENSMUST00000052965.8	9423	47	93919	48107	93919	-48107	internal_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	2.82842712474619	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CAAAAGAAAAGGAAAGCTTA	7051	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8380028	8368207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_8368237_8368358_8368557_8372958_8373142_8379687
tx.6152	chr15	-	664	3	ISM	ENSMUSG00000022141.8	ENSMUST00000052965.8	9423	47	93977	48258	93977	-48258	internal_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATGCATCAGTTCCAGTG	7109	False	NA	-112	True	NA	NA	NA	8379970	8368358	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_8368557_8372958_8373142_8379687
tx.6153	chr15	-	1571	9	ISM	ENSMUSG00000022141.8	ENSMUST00000052965.8	9423	47	-176	68541	-176	-68541	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_5	2.87228132326901	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAAATTAAATTAGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8474123	8388641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_8388751_8390399_8390497_8391201_8391363_8395275_8395428_8396113_8396214_8398944_8399073_8401514_8401681_8403443_8403587_8473608
tx.6154	chr15	-	2999	9	ISM	ENSMUSG00000005360.15	ENSMUST00000005493.14	4163	10	2054	609	878	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_5	7.91260860904923	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGACAGATGAATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8738194	8664216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_8665824_8668539_8668675_8671665_8671861_8672383_8672618_8675143_8675437_8679026_8679070_8680332_8680538_8717771_8717910_8738045
tx.6155	chr15	-	907	4	ISM	ENSMUSG00000005360.15	ENSMUST00000153455.8	1252	5	1693	151	865	-151	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_1	21.483844059096	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGTAGCTCCTCTGTGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8738207	8710155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_8710661_8717194_8717297_8717771_8717910_8738045
tx.6156	chr15	-	1389	2	FSM	ENSMUSG00000005360.15	ENSMUST00000133309.2	1373	2	2	-18	2	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTGAAATTTTTGATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8739963	8737075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_8738324_8739822
tx.6157	chr15	+	555	3	Intergenic	novelGene_519	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCATGACTCATAATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8758591	8794897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_8758736_8793647_8793886_8794724
tx.6158	chr15	+	2983	12	NIC	ENSMUSG00000022253.18	novel	4135	13	NA	NA	39	299	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	231	junction_7	43.3900243705397	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTTTACTTTGTTTTCTT	7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	9071693	9110247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_9071846_9083349_9083439_9084241_9084331_9085804_9085887_9091254_9091339_9092802_9092940_9096102_9096182_9100194_9100291_9103070_9103127_9103413_9103468_9106816_9106941_9108306
tx.6159	chr15	-	3128	10	FSM	ENSMUSG00000054115.13	ENSMUST00000096482.10	3118	10	-10	0	-10	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	163	junction_7	20.0690167197789	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACTTGAGCTGCTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9140462	9112072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_9113956_9116947_9117056_9117177_9117230_9121638_9121770_9122323_9122423_9123956_9124092_9125146_9125291_9127972_9128085_9139518_9139791_9140270
tx.616	chr1	-	549	4	FSM	ENSMUSG00000026385.17	ENSMUST00000027634.13	569	4	10	10	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2709	junction_1	24.2532930181083	20535	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGGGTTACTCTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120048798	120041019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_120041264_120044115_120044179_120047624_120047743_120048674
tx.6160	chr15	-	546	2	ISM	ENSMUSG00000054115.13	ENSMUST00000191316.2	1391	3	-28	12307	-15	-12307	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCTTGGGGAATCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9140467	9139441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_9139791_9140270
tx.6161	chr15	-	462	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000049152.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACCGTCTTGGCTACATTT	0	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	9357170	9354832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_9355049_9356924
tx.6162	chr15	+	925	5	FSM	ENSMUSG00000039676.5	ENSMUST00000042360.5	949	5	25	-1	25	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_4	9.67923034130297	268	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGCCTCCTTTGAAGCTG	22	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9436138	9466125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_9436254_9457782_9457920_9461742_9461921_9462676_9462887_9465840
tx.6163	chr15	+	697	4	FSM	ENSMUSG00000039676.5	ENSMUST00000226688.2	739	4	43	-1	43	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	38.1138644939957	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGCCTCCTTTGAAGCTG	40	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9436156	9466125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_9436254_9457782_9457920_9461742_9461921_9465840
tx.6164	chr15	+	358	2	Intergenic	novelGene_521	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGGTGGTCGTGTCGTTCTT	984	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9557194	9560641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_9557498_9560586
tx.6165	chr15	-	1509	9	FSM	ENSMUSG00000072663.13	ENSMUST00000159368.2	1422	9	-84	-3	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_2	3.23795846174715	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTGGCATTTTATTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9748947	9704394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_9704628_9713186_9713375_9716417_9716607_9717536_9717724_9723679_9723745_9725200_9725342_9729702_9729956_9740597_9740701_9748797
tx.6166	chr15	-	1217	8	ISM	ENSMUSG00000044224.17	ENSMUST00000136591.8	2060	12	9335	7	226	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	660	junction_1	75.8117970465585	489	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTGCCTTTCTGCTTCAG	9300	False	NA	95	True	NA	NA	NA	10461267	10446848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_10447313_10447781_10447858_10449661_10449835_10451640_10451684_10452291_10452451_10454855_10454944_10460040_10460193_10461205
tx.6167	chr15	-	1238	10	FSM	ENSMUSG00000022247.13	ENSMUST00000022855.12	2664	10	27	1399	-11	-1399	multi-exon	FALSE	canonical	3	2074	junction_1	190.855449147086	9484	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTACTTTATTCTTTTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10486006	10476263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_10476683_10476892_10477022_10478754_10478857_10478978_10479030_10479158_10479233_10479334_10479385_10479666_10479738_10481801_10481846_10483380_10483493_10485820
tx.6168	chr15	+	1475	6	FSM	ENSMUSG00000022248.15	ENSMUST00000022856.15	1514	6	30	9	-1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	345	junction_1	183.88039590995	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGACTTACTGTACTGTCC	34	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10486133	10493766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_10486351_10486538_10486803_10488075_10488185_10490341_10490601_10492850_10492950_10493239
tx.6169	chr15	+	1581	6	NNC	ENSMUSG00000022248.15	novel	1514	6	NA	NA	0	-4	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_5	316.528039832177	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGACTTACTGTACTGTCC	35	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10486134	10493766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_10486803_10488075_10488185_10490341_10490601_10492850_10492950_10493239_10493477_10493557
tx.617	chr1	+	513	6	FSM	ENSMUSG00000026388.16	ENSMUST00000112644.9	488	6	-25	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	7.2773621594641	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGTTTGATTTATCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120048899	120115919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_120048948_120078332_120078478_120088335_120088387_120093864_120093903_120099130_120099213_120115770
tx.6170	chr15	+	1410	7	NNC	ENSMUSG00000022248.15	novel	1514	6	NA	NA	0	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	324.625639091486	330	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCGACTTACTGTACTGTCC	35	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10486134	10493766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_10486368_10486538_10486803_10488075_10488185_10490341_10490601_10492850_10492950_10493239_10493477_10493557
tx.6171	chr15	-	607	2	NNC	ENSMUSG00000022246.15	novel	594	3	NA	NA	26397	17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTAGTGCTGACTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10687229	10633042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_10633353_10686932
tx.6172	chr15	-	592	3	ISM	ENSMUSG00000022246.15	ENSMUST00000226530.2	2375	6	-100	38972	-100	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_2	4	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACAACTAGTGCTGACTTCT	-3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10714810	10633044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_10633353_10690456_10690539_10714608
tx.6173	chr15	+	1558	5	FSM	ENSMUSG00000022244.8	ENSMUST00000070877.7	2577	5	0	1019	0	600	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_2	9.36416040016402	585	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGCAGTGGTTTTAAGTT	49	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10981841	10995693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_10982140_10983435_10983580_10984771_10984933_10988844_10989032_10994925
tx.6174	chr15	-	534	2	ISM	ENSMUSG00000022241.7	ENSMUST00000228710.2	617	4	2228	-407	2228	345	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3318	junction_1	0	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGACCTCTGTCCTCACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11385203	11383745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_11384246_11385169
tx.6175	chr15	-	2623	19	FSM	ENSMUSG00000022241.7	ENSMUST00000022849.7	4005	19	21	1361	21	343	multi-exon	FALSE	canonical	3	2899	junction_10	215.823487548918	901	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAAGACCTCTGTCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11399730	11383747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_11384246_11385169_11385285_11387137_11387211_11387348_11387454_11387557_11387659_11387786_11387865_11388166_11388305_11388383_11388547_11389661_11389829_11390397_11390497_11391146_11391294_11391899_11391979_11392055_11392121_11392317_11392436_11392872_11392995_11393242_11393367_11394309_11394501_11397266_11397348_11399571
tx.6176	chr15	-	742	4	ISM	ENSMUSG00000022241.7	ENSMUST00000226944.2	859	6	692	-343	27	343	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3108	junction_3	88.3176086632785	667	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCAAGACCTCTGTCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11387404	11383747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_11384246_11385169_11385285_11387137_11387211_11387348
tx.6177	chr15	-	995	2	ISM	ENSMUSG00000022206.8	ENSMUST00000226139.2	3788	7	44603	2122	44603	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGGAGGAGGTGTGTGACAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11846471	11844467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_11845375_11846383
tx.6178	chr15	+	587	2	FSM	ENSMUSG00000115240.2	ENSMUST00000227557.2	751	2	164	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAAATGTTCTTTCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11906768	11907476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_11907075_11907195
tx.6179	chr15	-	683	5	FSM	ENSMUSG00000022205.16	ENSMUST00000022816.15	3372	5	53	2636	7	66	multi-exon	FALSE	canonical	3	7728	junction_1	236.548620794965	56407	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGTACCCTTTTTTGAT	862	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11996091	11984060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_11984384_11986541_11986651_11991044_11991168_11993874_11993948_11996036
tx.618	chr1	-	2770	5	FSM	ENSMUSG00000026389.17	ENSMUST00000112640.8	2752	5	-2	-16	-2	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_4	6.57647321898295	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCCTTTGTTTATTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120193016	120154136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_120155659_120161971_120162137_120169161_120169690_120171497_120171998_120192961
tx.6180	chr15	+	634	3	FSM	ENSMUSG00000022201.17	ENSMUST00000124621.2	513	3	-37	-84	-2	84	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	305.5	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTGGAAACATTTTTACC	38	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12117914	12122507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_12118034_12118324_12118425_12122092
tx.6181	chr15	+	4437	20	NNC	ENSMUSG00000022201.17	novel	4850	20	NA	NA	-2	-419	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	3	junction_8	139.4086243492	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGAAAATTATTTGGTG	38	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12117914	12185350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_12118034_12118324_12118425_12136481_12136765_12137990_12138136_12140519_12140739_12146234_12146483_12149613_12149806_12150258_12150555_12152886_12153084_12154531_12154652_12156348_12156495_12159684_12159848_12160570_12160777_12162199_12162351_12166230_12166373_12170901_12171000_12171844_12171941_12180707_12180820_12180928_12181027_12184044
tx.6182	chr15	-	3722	9	FSM	ENSMUSG00000022195.8	ENSMUST00000057256.5	3966	9	8	236	0	233	multi-exon	FALSE	canonical	3	264	junction_8	28.8809517675578	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTTAATTTTTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12824727	12808498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_12810931_12812018_12812159_12814276_12814344_12815935_12816058_12816405_12816469_12817943_12818371_12821489_12821640_12823646_12823793_12824552
tx.6183	chr15	-	2761	2	ISM	ENSMUSG00000022195.8	ENSMUST00000227299.2	3206	8	-13	10198	-2	934	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGTCAGGGCTGGAGACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12824729	12819055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_12821640_12824552
tx.6184	chr15	-	862	3	FSM	ENSMUSG00000022195.8	ENSMUST00000228888.2	1971	3	4	1105	4	-1105	multi-exon	FALSE	canonical	3	264	junction_2	25	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTAAGCTTACGTGGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12824723	12821094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_12821640_12823646_12823793_12824552
tx.6185	chr15	-	1507	2	ISM	ENSMUSG00000022195.8	ENSMUST00000228888.2	1971	3	0	2471	0	-2471	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	264	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTTTTCTTACTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12824727	12822460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_12823793_12824552
tx.6186	chr15	-	506	2	NNC	ENSMUSG00000022195.8	novel	3966	9	NA	NA	4	-2467	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTCTTACTTTAAAAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12824712	12822456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_12822803_12824552
tx.6187	chr15	+	682	4	ISM	ENSMUSG00000022191.17	ENSMUST00000090292.13	4519	35	0	101026	0	-274	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	495	junction_3	35.565276448931	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ACCCTCCGCCCCCGCCCGTC	53	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12824948	12834351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_12825025_12826150_12826254_12827312_12827379_12833914
tx.6188	chr15	+	776	7	ISM	ENSMUSG00000022191.17	ENSMUST00000090292.13	4519	35	90530	45	36685	-44	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	681	junction_1	86.6506395437064	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCGGTTGTTGTCTTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12915478	12935332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_12915531_12924141_12924284_12926076_12926160_12926291_12926396_12928948_12929042_12929750_12929798_12935077
tx.6189	chr15	+	387	3	ISM	ENSMUSG00000022191.17	ENSMUST00000090292.13	4519	35	104008	45	50163	-44	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	780	junction_2	57	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCGGTTGTTGTCTTAATG	4858	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12928956	12935332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_12929042_12929750_12929798_12935077
tx.619	chr1	-	650	4	Intergenic	novelGene_56	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3.29983164553722	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGGTGTGTTCTTGGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	120228558	120223578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_120223908_120224004_120224116_120228248_120228305_120228404
tx.6190	chr15	+	298	2	ISM	ENSMUSG00000022191.17	ENSMUST00000090292.13	4519	35	104806	45	50961	-44	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	780	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCGGTTGTTGTCTTAATG	5656	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12929754	12935332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_12929798_12935077
tx.6191	chr15	-	691	2	Intergenic	novelGene_523	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGTTTCCGTGTCGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19864163	19857389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_19857770_19863852
tx.6192	chr15	-	1088	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040420.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTTCTCGTTGGTGA	2055	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22702954	22699818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_22700670_22702717
tx.6193	chr15	-	1085	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040420.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGACCGTTTTCTCGTTGG	9785	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22705105	22699821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_22700670_22704868
tx.6194	chr15	+	1512	2	Intergenic	novelGene_524	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	3	1235	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTAGCTGGGTAAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22703488	22705094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_22704559_22704652
tx.6195	chr15	-	1022	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040420.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACAGTATTAATTGGTC	9795	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22705095	22703980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_22704588_22704680
tx.6196	chr15	-	1370	3	NNC	ENSMUSG00000045763.9	novel	1855	2	NA	NA	-15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	47.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAACTGGCTTTTGGCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25413865	25363362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_25364346_25364845_25365005_25413637
tx.6197	chr15	-	1498	2	Intergenic	novelGene_525	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGCTTAATAGAAAATATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25622352	25620207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_25621364_25622010
tx.6198	chr15	+	1801	9	FSM	ENSMUSG00000022270.17	ENSMUST00000022881.15	3248	9	111	1336	111	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_6	4.98591766879478	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAACCAAAAACACCAACCC	19	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25843376	25972437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_25843699_25889566_25889674_25895198_25895230_25964309_25964437_25966718_25966804_25968492_25968631_25969881_25969947_25970183_25970311_25971638
tx.6199	chr15	+	1477	7	NIC	ENSMUSG00000022270.17	novel	579	6	NA	NA	-57	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	5	junction_1	10.719919153924	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCAAAAACACCAACCCCCAT	17	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25933580	25972441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_25933713_25964309_25964437_25966718_25966804_25968492_25968631_25969881_25969947_25970183_25970311_25971638
tx.62	chr1	-	1630	6	FSM	ENSMUSG00000025939.20	ENSMUST00000117146.9	2181	6	200	351	-5	-351	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_5	28.7888867447145	463	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTGTGGACATTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16689513	16640356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_16641507_16652150_16652227_16655499_16655656_16668174_16668278_16672485_16672578_16689460
tx.620	chr1	-	2358	5	ISM	ENSMUSG00000003721.15	ENSMUST00000003818.14	2697	6	8054	3	-242	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	166	junction_4	17.3691536926817	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGTGTTAGTCCTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121247699	121232084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_121233677_121234592_121234693_121234868_121235036_121239929_121240055_121247325
tx.6200	chr15	+	976	6	FSM	ENSMUSG00000052253.7	ENSMUST00000061875.8	2802	6	774	1052	774	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	450	junction_2	26.9962960422351	383	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCGTATTTGAGCAGTGTT	740	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25985225	25997515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_25985270_25986883_25987133_25987246_25987410_25991538_25991652_25996191_25996336_25997252
tx.6201	chr15	+	425	3	ISM	ENSMUSG00000052253.7	ENSMUST00000061875.8	2802	6	776	11187	776	-3170	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	450	junction_2	27	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGGAATTTGCAGACTTCTA	742	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25985227	25987380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_25985270_25986883_25987133_25987246
tx.6202	chr15	+	509	3	ISM	ENSMUSG00000052253.7	ENSMUST00000226884.2	723	5	4669	-143	-3572	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	513	junction_2	8.5	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCGTATTTGAGCAGTGTT	7064	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25991549	25997515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_25991652_25996191_25996336_25997252
tx.6203	chr15	-	673	4	NNC	ENSMUSG00000115138.2	novel	1237	5	NA	NA	493	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.816496580927726	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTTTGACTTGGCTCCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27463042	27459917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_27460254_27461343_27461420_27461806_27461958_27462932
tx.6204	chr15	-	465	2	NIC	ENSMUSG00000115138.2	novel	1237	5	NA	NA	495	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGACTTTGACTTGGCTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27463040	27459919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_27460277_27462932
tx.6205	chr15	-	925	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000115722.2	novel	363	1	NA	NA	-40	64739	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAGAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28123747	28058605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_28059045_28123261
tx.6206	chr15	+	1001	6	ISM	ENSMUSG00000022240.11	ENSMUST00000226119.2	4111	22	633779	105918	123671	-98653	internal_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_5	13.0843417870369	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTTGAATGTTATTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30806975	30922269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_30807046_30847373_30847558_30881268_30881387_30887239_30887426_30905805_30905980_30922000
tx.6207	chr15	+	1419	4	FSM	ENSMUSG00000039168.16	ENSMUST00000044524.16	1555	4	136	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_3	1.69967317119759	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCTCTCTTACGGTTCAG	127	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31224595	31274487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_31224730_31235918_31236016_31272534_31272578_31273342
tx.6208	chr15	-	815	5	FSM	ENSMUSG00000022236.11	ENSMUST00000110408.3	957	5	143	-1	143	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.6583123951777	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGAGTTTTTCTCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31453740	31441355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_31441527_31443437_31443614_31449109_31449272_31451227_31451352_31453558
tx.6209	chr15	-	1064	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068964.6	novel	435	1	NA	NA	-14	744	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAACCCACTTCCTCTAG	6652	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31446977	31445784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_31446680_31446808
tx.621	chr1	-	2062	5	FSM	ENSMUSG00000003721.15	ENSMUST00000186915.2	674	5	-49	-1339	-3	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	81.0524521529115	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGTGTTAGTCCTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121255497	121232084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_121233677_121234592_121234693_121234868_121235036_121239929_121240055_121255419
tx.6210	chr15	-	1164	8	ISM	ENSMUSG00000039100.11	ENSMUST00000090227.6	6260	26	52704	3026	-6358	-3026	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_6	21.879073964659	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACAAATGTATATTAATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31478495	31459062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_31459426_31462087_31462224_31465399_31465533_31467835_31467926_31469688_31469824_31471762_31471945_31475891_31475962_31478440
tx.6211	chr15	+	541	2	Intergenic	novelGene_526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACAGTCCCTGTAGGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31531476	31532608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_31531670_31532260
tx.6212	chr15	+	1095	6	FSM	ENSMUSG00000022235.16	ENSMUST00000070918.14	1155	6	64	-4	64	4	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	2.60768096208106	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGTAGCTTCACTTTTAAA	119	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31569007	31590269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_31569086_31581985_31582220_31584110_31584219_31585440_31585584_31588313_31588406_31589829
tx.6213	chr15	+	596	3	ISM	ENSMUSG00000022235.16	ENSMUST00000070918.14	1155	6	16572	0	13265	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATGCGTAGCTTCACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31585515	31590265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_31585584_31588313_31588406_31589829
tx.6214	chr15	-	846	6	ISM	ENSMUSG00000022234.16	ENSMUST00000022842.16	1853	11	7665	78	389	-78	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5789	junction_5	205.802429528905	1559	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTCTGCAGTTACTGCTGGT	7514	False	NA	-12	True	NA	NA	NA	31594285	31591023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_31591202_31592430_31592612_31592791_31592930_31593012_31593199_31593660_31593781_31594242
tx.6215	chr15	-	422	3	ISM	ENSMUSG00000022234.16	ENSMUST00000022842.16	1853	11	9093	81	350	-81	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6210	junction_2	107.5	1672	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCGTCTGCAGTTACTGCT	8942	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31592857	31591026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_31591202_31592430_31592612_31592791
tx.6216	chr15	-	1742	11	FSM	ENSMUSG00000022234.16	ENSMUST00000022842.16	1853	11	30	81	30	-81	multi-exon	FALSE	canonical	3	5476	junction_6	308.656459514458	12228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCGTCTGCAGTTACTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31601920	31591026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_31591202_31592430_31592612_31592791_31592930_31593012_31593199_31593660_31593781_31594242_31594393_31594479_31594673_31595790_31595990_31597556_31597722_31598145_31598207_31601746
tx.6217	chr15	+	1161	5	FSM	ENSMUSG00000039065.12	ENSMUST00000042702.7	1164	5	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	6.68954408012983	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAACCGTGACAAGGAGTG	118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31602266	31617681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_31602296_31606056_31606335_31608241_31608380_31609711_31609763_31617016
tx.6218	chr15	+	694	2	FSM	ENSMUSG00000039065.12	ENSMUST00000160146.2	4655	2	271	3690	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACCGTGACAAGGAGTGTT	120	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31602268	31617683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_31602296_31617016
tx.6219	chr15	+	1127	4	ISM	ENSMUSG00000039065.12	ENSMUST00000042702.7	1164	5	3790	8	3790	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	3.2659863237109	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGCTTTATAACCGTGAC	1240	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31606053	31617673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_31606335_31608241_31608380_31609711_31609763_31617016
tx.622	chr1	-	2455	6	FSM	ENSMUSG00000003721.15	ENSMUST00000003818.14	2697	6	239	3	8	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	166	junction_4	17.805617091244	447	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGTGTTAGTCCTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121255514	121232084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_121233677_121234592_121234693_121234868_121235036_121239929_121240055_121247325_121247702_121255419
tx.6220	chr15	+	1896	5	FSM	ENSMUSG00000022261.7	ENSMUST00000022871.7	3527	5	74	1557	74	-1557	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	11.0227038425243	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGATCAGTTTTTGT	100	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32920942	33033524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_32921452_33017247_33017360_33023794_33023932_33028192_33028329_33032522
tx.6221	chr15	+	1380	2	ISM	ENSMUSG00000022261.7	ENSMUST00000022871.7	3527	5	107339	1300	107339	-1300	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCACTGTTATAAATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33028207	33033781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_33028329_33032522
tx.6222	chr15	+	1080	2	Intergenic	novelGene_527	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATTCGAATTTCAAGGGT	143	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33221528	33223215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_33222161_33222767
tx.6223	chr15	+	2646	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000115318.2	novel	2906	1	NA	NA	1	4129	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAGATGCTTGCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33831594	33838628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_+_33831870_33836257
tx.6224	chr15	+	813	2	FSM	ENSMUSG00000022255.17	ENSMUST00000172082.2	4582	2	9	3760	9	-3760	multi-exon	FALSE	canonical	3	602	junction_1	0	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGCTTGGGAACGCATAT	36	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34082848	34099731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_34083560_34099629
tx.6225	chr15	+	1666	9	ISM	ENSMUSG00000022255.17	ENSMUST00000022865.17	6919	12	-16	11264	9	16	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	477	junction_6	54.812749429307	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAGAAGAAGCAAGGGGAA	36	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34082848	34134506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_34083560_34099629_34099732_34114169_34114255_34114944_34115122_34116456_34116523_34118025_34118257_34123813_34123913_34131309_34131435_34134436
tx.6226	chr15	+	2610	12	FSM	ENSMUSG00000022255.17	ENSMUST00000022865.17	6919	12	-36	4345	-11	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	477	junction_6	48.3699585751527	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAAAAGGTCATTTATCATT	16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	34082828	34141425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_34083560_34099629_34099732_34114169_34114255_34114944_34115122_34116456_34116523_34118025_34118257_34123813_34123913_34131309_34131435_34134436_34134545_34136832_34136974_34139886_34140044_34140837
tx.6227	chr15	+	1813	7	FSM	ENSMUSG00000022257.5	ENSMUST00000022867.5	1902	7	89	0	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	358	junction_4	34.9698282650757	1238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCGTGGCTCCGCTGACT	79	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34238262	34284448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_34238569_34258826_34258939_34272489_34272564_34273373_34273497_34276281_34276381_34277577_34277674_34283445
tx.6228	chr15	-	696	5	NNC	ENSMUSG00000094447.3	novel	572	4	NA	NA	-10056	-5818	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.29903810567666	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCTTCAGATACATAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34368074	34355139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_34355414_34355687_34355779_34356495_34356580_34357919_34358015_34367922
tx.6229	chr15	-	456	5	NNC	ENSMUSG00000058600.14	novel	886	5	NA	NA	30	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	777	junction_4	1906.75842400132	2424	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGGTGTCTGTTTGCTTTC	391	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34443338	34440650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_34440751_34441377_34441509_34442780_34442927_34443170_34443224_34443312
tx.623	chr1	-	1075	6	NIC	ENSMUSG00000003721.15	novel	2697	6	NA	NA	12	30	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	17	junction_5	70.4346505634833	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGAAATTTCTAAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121255510	121233393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_121233677_121234592_121234693_121234868_121235036_121239929_121240055_121247325_121247635_121255419
tx.6230	chr15	-	545	4	FSM	ENSMUSG00000058600.14	ENSMUST00000009039.6	570	4	30	-5	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4307	junction_1	558.07426825548	11021	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGGTGTCTGTTTGCTTTC	391	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34443338	34440650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_34440751_34441377_34441509_34442780_34442927_34443170
tx.6231	chr15	-	505	5	FSM	ENSMUSG00000058600.14	ENSMUST00000079735.12	886	5	381	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3551	junction_4	804.634194836387	18824	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGGTGTCTGTTTGCTTTC	324	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34443405	34440650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_34440751_34441377_34441509_34442780_34442927_34443170_34443224_34443330
tx.6232	chr15	-	966	6	FSM	ENSMUSG00000022323.12	ENSMUST00000022946.6	1004	6	37	1	37	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_4	17.7245592328836	995	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGGTTTTTAATTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34495364	34484167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_34484682_34485745_34485802_34486756_34486826_34487887_34487943_34488719_34488826_34495198
tx.6233	chr15	+	3295	16	FSM	ENSMUSG00000022325.15	ENSMUST00000079028.6	3275	16	-9	-11	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_3	10.1552394796425	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGATTTGTTTTTAATCT	85	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34495459	34530794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_34495562_34499434_34499579_34502456_34502625_34505104_34505281_34506564_34506814_34508265_34508354_34508749_34508938_34509908_34510166_34510477_34510572_34512059_34512172_34512877_34512998_34515987_34516104_34517972_34518165_34526308_34526464_34529028_34529377_34530008
tx.6234	chr15	+	1360	4	ISM	ENSMUSG00000022325.15	ENSMUST00000079028.6	3275	16	22625	-11	2158	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_2	3.77123616632825	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGATTTGTTTTTAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34518093	34530794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_34518165_34526308_34526464_34529028_34529377_34530008
tx.6235	chr15	-	1767	11	FSM	ENSMUSG00000038879.9	ENSMUST00000040791.9	4331	11	449	2115	-20	592	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	2.40831891575846	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTACAGGGGTGTTCTGTG	282	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34678909	34575059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_34575718_34577715_34577811_34578853_34578918_34582866_34582956_34584775_34584912_34600160_34600258_34609318_34609441_34625117_34625178_34648811_34648984_34650527_34650597_34678704
tx.6236	chr15	-	1212	7	NNC	ENSMUSG00000038879.9	novel	4331	11	NA	NA	-18039	587	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3.97562014729219	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGAGTTTACAGGGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34600956	34575064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_34575718_34577715_34577811_34578853_34578918_34582866_34582956_34584775_34584912_34600160_34600258_34600878
tx.6237	chr15	-	1155	8	ISM	ENSMUSG00000038879.9	ENSMUST00000040791.9	4331	11	457	9709	-12	-7002	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_2	2.31234486517695	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGACATTGGCGTTCAAA	290	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34678901	34582653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_34582956_34584775_34584912_34600160_34600258_34609318_34609441_34625117_34625178_34648811_34648984_34650527_34650597_34678704
tx.6238	chr15	-	664	5	ISM	ENSMUSG00000022329.16	ENSMUST00000018476.14	2914	11	107	197560	-30	-577	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	251	junction_1	35.5272782520699	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTTGGCTTTAGTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35155845	35073201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_35073368_35099579_35099695_35114674_35114804_35115710_35115792_35155672
tx.6239	chr15	-	641	4	NNC	ENSMUSG00000022329.16	novel	2914	11	NA	NA	17	-41517	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	124.022399410572	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAAGATTTCATTTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35155879	35114141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_35114366_35114674_35114804_35115710_35115792_35155672
tx.624	chr1	+	2390	24	FSM	ENSMUSG00000026339.19	ENSMUST00000036025.16	7274	24	17	4867	-9	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_5	11.149101195474	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTATTGAGCAACTGCTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121358794	121429322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_121358987_121362261_121362376_121365524_121365620_121369510_121369623_121373368_121373468_121375952_121376010_121383799_121383901_121389192_121389230_121389615_121389709_121389961_121390013_121390827_121390915_121403760_121403878_121405563_121405627_121408543_121408618_121409724_121409807_121410329_121410396_121411015_121411070_121414331_121414395_121418850_121418960_121420633_121420717_121422124_121422163_121424712_121424798_121426936_121427051_121428918
tx.6240	chr15	+	1806	4	NIC	ENSMUSG00000022330.6	novel	1724	4	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	17	junction_3	14.8548533034381	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTTCTTGAGATTCATCT	117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35296243	35303451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_35296614_35300334_35301102_35302057_35302158_35302882
tx.6241	chr15	+	1724	4	FSM	ENSMUSG00000022330.6	ENSMUST00000022952.6	1724	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_3	10.1434160364686	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTTCTTGAGATTCATCT	117	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35296243	35303451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_35296614_35300334_35301102_35302057_35302158_35302964
tx.6242	chr15	+	939	3	FSM	ENSMUSG00000022330.6	ENSMUST00000228684.2	579	3	5	-365	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	9.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTTCTTGAGATTCATCT	135	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35296261	35303451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_35296614_35302057_35302158_35302964
tx.6243	chr15	-	172	2	FSM	ENSMUSG00000014313.16	ENSMUST00000127999.2	3038	2	2870	-4	-6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	8821	junction_1	0	6928	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTCTTTGCTTGGTTATT	2711	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35935483	35932124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_35932244_35935430
tx.6244	chr15	-	426	4	FSM	ENSMUSG00000014313.16	ENSMUST00000014457.15	503	4	74	3	35	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	8539	junction_3	472.446822404384	83361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTCTTTGCTTGGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35938318	35932124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_35932244_35935430_35935560_35937300_35937431_35938270
tx.6245	chr15	-	379	3	FSM	ENSMUSG00000014313.16	ENSMUST00000153512.2	738	3	359	0	-117	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8821	junction_1	415.5	13052	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGTCTTTGCTTGGTTAT	762	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35937432	35932125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_35932244_35935430_35935560_35937300
tx.6246	chr15	+	472	4	FSM	ENSMUSG00000045996.13	ENSMUST00000180159.8	489	4	21	-4	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	328	junction_3	234.864973028239	4127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTCTATTCAATGTCTTG	130	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36174176	36177157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_36174228_36175132_36175203_36175529_36175623_36176899
tx.6247	chr15	+	583	4	FSM	ENSMUSG00000045996.13	ENSMUST00000057177.7	601	4	19	-1	19	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	181	junction_1	282.916948944385	1134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTCTATTCAATGTCTTG	151	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36174197	36177157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_36174360_36175132_36175203_36175529_36175623_36176899
tx.6248	chr15	+	2413	9	FSM	ENSMUSG00000037617.13	ENSMUST00000227582.2	2388	9	-14	-11	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_4	7	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGCCTGCGTGTCTGTAT	58	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36210593	36235767	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_36210968_36211245_36211346_36216312_36216466_36221551_36221713_36224254_36224388_36227281_36227409_36233348_36233490_36234446_36234816_36234912
tx.6249	chr15	-	1516	2	FSM	ENSMUSG00000022280.10	ENSMUST00000227735.2	1136	2	-32	-348	-19	348	multi-exon	FALSE	canonical	3	197	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGTTCATACATTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36283312	36264916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_36266178_36283057
tx.625	chr1	+	627	2	ISM	ENSMUSG00000026339.19	ENSMUST00000128924.2	762	5	-46	9059	-13	-9059	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	91	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAGGAGAGAGGGAGGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121358790	121362692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_121358987_121362261
tx.6250	chr15	-	584	2	Intergenic	novelGene_530	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAACTGTCATTTGTCACTCA	201	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36455332	36453829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_36454096_36455014
tx.6251	chr15	-	2419	4	ISM	ENSMUSG00000048307.9	ENSMUST00000057486.9	2509	5	823	0	718	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	290	junction_1	26.2466929133727	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCATCGGCCATTTTCTTA	622	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36496143	36477813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_36479620_36484126_36484286_36485940_36486274_36496022
tx.6252	chr15	-	2477	5	FSM	ENSMUSG00000048307.9	ENSMUST00000057486.9	2509	5	32	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_4	35.6195171219375	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCATCGGCCATTTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36496934	36477813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_36479620_36484126_36484286_36485940_36486274_36496022_36496140_36496872
tx.6253	chr15	-	2174	14	NNC	ENSMUSG00000013611.15	novel	2344	14	NA	NA	-4625	-237	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	7.6522031479667	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCGCCAATTTGAATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36560343	36504794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_36505620_36507844_36507902_36517744_36517823_36523588_36523703_36525719_36525924_36527830_36527924_36530919_36530990_36534560_36534649_36537653_36537745_36539442_36539554_36545694_36545760_36546925_36547041_36555404_36555480_36560155
tx.6254	chr15	+	644	2	Intergenic	novelGene_531	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTAGTCGTGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36560488	36566205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_36560637_36565709
tx.6255	chr15	-	897	5	FSM	ENSMUSG00000022283.16	ENSMUST00000146577.8	725	5	192	-364	-101	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	5911	junction_3	364.961984321655	384	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTTATGCTTTTATTTA	9993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36598364	36595903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_36596344_36596806_36596900_36597207_36597339_36597700_36597786_36598216
tx.6256	chr15	-	1002	6	ISM	ENSMUSG00000022283.16	ENSMUST00000001809.15	2817	15	10674	-1	13	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5911	junction_3	326.690679389541	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTTATGCTTTTATTTA	9955	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36598543	36595903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_36596344_36596806_36596900_36597207_36597339_36597700_36597786_36598216_36598372_36598445
tx.6257	chr15	-	1371	8	ISM	ENSMUSG00000022283.16	ENSMUST00000001809.15	2817	15	9504	-1	293	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5838	junction_6	322.899112316361	195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTTATGCTTTTATTTA	9881	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36599713	36595903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_36596344_36596806_36596900_36597207_36597339_36597700_36597786_36598216_36598372_36598445_36598557_36599195_36599287_36599448
tx.6258	chr15	-	2104	14	ISM	ENSMUSG00000022283.16	ENSMUST00000001809.15	2817	15	3090	-1	-417	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5069	junction_10	536.868533707468	301	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTTATGCTTTTATTTA	3467	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36606127	36595903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_36596344_36596806_36596900_36597207_36597339_36597700_36597786_36598216_36598372_36598445_36598557_36599195_36599287_36599448_36599722_36600836_36600933_36601113_36601252_36601558_36601654_36603089_36603230_36605685_36605802_36605987
tx.6259	chr15	-	2818	15	FSM	ENSMUSG00000022283.16	ENSMUST00000001809.15	2817	15	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	5069	junction_10	538.55476006794	2484	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGTTATGCTTTTATTTA	377	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36609217	36595903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_36596344_36596806_36596900_36597207_36597339_36597700_36597786_36598216_36598372_36598445_36598557_36599195_36599287_36599448_36599722_36600836_36600933_36601113_36601252_36601558_36601654_36603089_36603230_36605685_36605802_36605987_36606182_36608557
tx.626	chr1	-	2212	13	FSM	ENSMUSG00000001674.12	ENSMUST00000001724.12	2258	13	42	4	42	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_12	122.318232492135	518	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAATGTTTTTTATACCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121495676	121481567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_121481868_121482944_121483123_121483419_121483477_121485133_121485248_121486139_121486293_121486894_121487057_121487860_121488001_121489009_121489325_121489418_121489520_121489787_121489924_121492221_121492333_121493609_121493898_121495519
tx.6260	chr15	-	419	3	Intergenic	novelGene_532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	1.5	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGGTTATCCTAGCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36658035	36652512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_36652768_36655307_36655362_36657925
tx.6261	chr15	-	441	2	NNC	ENSMUSG00000115127.2	novel	289	2	NA	NA	-98	-61813	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACATCAGCGTTCTGGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36696007	36694825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_36695071_36695811
tx.6262	chr15	+	582	3	Intergenic	novelGene_534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCGTTGTATAGCTGGTA	19	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36726341	36731108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_36726442_36728723_36728773_36730675
tx.6263	chr15	+	572	3	Intergenic	novelGene_538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCGTTGTATAGCTGGTA	199	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36727122	36731108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_36727213_36728723_36728773_36730675
tx.6264	chr15	+	438	2	Intergenic	novelGene_537	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATGTCTCATATTGGAT	-9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	36726914	36728863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_36727213_36728723
tx.6265	chr15	-	2033	6	FSM	ENSMUSG00000022285.18	ENSMUST00000110361.8	2285	6	267	-15	267	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	223	junction_5	1591.90916826306	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGCTAATGTAGCTTCCATC	13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	36794508	36771797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_36773022_36775482_36775579_36775659_36775824_36776489_36776614_36790927_36791233_36794388
tx.6266	chr15	-	2697	5	ISM	ENSMUSG00000022285.18	ENSMUST00000022894.14	3288	7	3547	3	1423	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3946	junction_3	159.548386077704	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGGCATGAGTCTCAGTGG	3286	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36791235	36771016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_36773022_36775482_36775579_36775659_36775824_36776489_36776614_36790927
tx.6267	chr15	-	2821	6	FSM	ENSMUSG00000022285.18	ENSMUST00000110362.4	2122	6	224	-923	-94	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	2654	junction_5	629.488808478753	1182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATGATGGGAGGCATGAGT	664	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36793857	36771024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_36773022_36775482_36775579_36775659_36775824_36776489_36776614_36790927_36791233_36793722
tx.6268	chr15	-	848	2	Intergenic	novelGene_539	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGATTATTGTGTGGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36828271	36825479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_36826212_36828155
tx.6269	chr15	-	749	4	FSM	ENSMUSG00000062397.9	ENSMUST00000078976.9	4417	4	84	3584	84	17	multi-exon	TRUE	canonical	3	6501	junction_2	212.49836600679	4909	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTCTAGAAATTCTGTTC	239	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37007562	37000854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_37001168_37002082_37002191_37003929_37004067_37007371
tx.627	chr1	-	2019	12	ISM	ENSMUSG00000001674.12	ENSMUST00000001724.12	2258	13	1856	5	1589	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	571	junction_7	87.1971263458562	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATGTTTTTTATACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121493862	121481568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_121481868_121482944_121483123_121483419_121483477_121485133_121485248_121486139_121486293_121486894_121487057_121487860_121488001_121489009_121489325_121489418_121489520_121489787_121489924_121492221_121492333_121493609
tx.6270	chr15	-	552	3	ISM	ENSMUSG00000062397.9	ENSMUST00000226453.2	517	4	3192	-181	235	10	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6501	junction_2	120	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGATAAATGGTTCTAGAAAT	3734	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37004067	37000861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_37001168_37002082_37002191_37003929
tx.6271	chr15	+	3030	3	ISM	ENSMUSG00000022286.17	ENSMUST00000161933.2	3617	9	29317	-4	11983	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAACAGCTCTCTAGTACTTT	198	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37347963	37363810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_37348099_37358613_37358679_37360980
tx.6272	chr15	-	1513	9	FSM	ENSMUSG00000022292.17	ENSMUST00000022901.16	4561	9	97	2951	-77	342	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_4	8.71779788708135	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATATGTCTTTTTTTTTTCC	7205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37961250	37927146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_37927642_37929281_37929396_37931845_37931951_37937459_37937594_37944741_37944837_37945282_37945417_37946978_37947096_37953842_37953999_37961087
tx.6273	chr15	-	1081	8	ISM	ENSMUSG00000022292.17	ENSMUST00000022901.16	4561	9	58	5062	58	-1769	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_3	9.17850194526229	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTAGTGGTTTTAGTTAC	7166	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37961289	37929257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_37929396_37931845_37931951_37937459_37937594_37944741_37944837_37945282_37945417_37946978_37947096_37953842_37953999_37961087
tx.6274	chr15	-	1279	6	Fusion	ENSMUSG00000085442.2_ENSMUSG00000022292.17	novel	690	4	NA	NA	31	66	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	21.5165052924493	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAATTGGGAA	7139	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37961316	37943504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr15_-_37944053_37944741_37944837_37945282_37945417_37946978_37947096_37953842_37953999_37961087
tx.6275	chr15	-	1944	5	ISM	ENSMUSG00000022292.17	ENSMUST00000022901.16	4561	9	53	19311	53	1785	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_2	5.71729831301464	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAGAATTGGG	7161	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37961294	37943506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_37944837_37945282_37945417_37946978_37947096_37953842_37953999_37961087
tx.6276	chr15	-	1041	4	ISM	ENSMUSG00000022292.17	ENSMUST00000022901.16	4561	9	53	20660	53	436	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	5.79271573232759	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTTTTTGTTTTTATAGG	7161	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37961294	37944855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_37945417_37946978_37947096_37953842_37953999_37961087
tx.6277	chr15	-	1082	4	ISM	ENSMUSG00000037487.8	ENSMUST00000226369.2	3562	7	4969	-29	246	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	953	junction_2	19.7540431867054	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTTTAGCTTTTTTATGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37973356	37968108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_37968750_37970505_37970592_37971991_37972137_37973146
tx.6278	chr15	-	592	5	ISM	ENSMUSG00000037487.8	ENSMUST00000226414.2	8397	59	40464	60395	-22908	-19263	internal_fragment	FALSE	canonical	3	524	junction_1	33.9300751546471	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAAATCCAGTGCTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38038205	38028931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_38028995_38029742_38029898_38030865_38030977_38031065_38031183_38038059
tx.6279	chr15	+	608	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000115771.2	novel	462	1	NA	NA	-43	33476	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTGCTTTTGTTTCATA	193	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38079302	38113283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_+_38079488_38079665_38079746_38112940
tx.628	chr1	-	408	2	ISM	ENSMUSG00000001674.12	ENSMUST00000001724.12	2258	13	42	12083	42	-1322	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	390	junction_1	0	577	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGAAAAAGAGGAAAATGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	121495676	121493646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_121493898_121495519
tx.6280	chr15	-	3047	4	FSM	ENSMUSG00000037465.11	ENSMUST00000074043.7	3044	4	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2013	junction_1	150.900261394369	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTGAGTCTGTTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38300953	38294656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_38296409_38296858_38297772_38297865_38298097_38300802
tx.6281	chr15	-	681	3	ISM	ENSMUSG00000037465.11	ENSMUST00000074043.7	3044	4	-3	2816	-3	66	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	2313	junction_2	18.5	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGAAATGTTGAGGCTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38300953	38297472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_38297772_38297865_38298097_38300802
tx.6282	chr15	-	492	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000115456.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTTCCAGGCAGCTAGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38343388	38313593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_38313714_38343016
tx.6283	chr15	+	589	3	NNC	ENSMUSG00000115456.2	novel	527	3	NA	NA	1057	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	2.5	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATGGTGCGACTTTATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38313593	38343388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_38313716_38336050_38336148_38343018
tx.6284	chr15	-	802	2	NNC	ENSMUSG00000115405.2	novel	686	2	NA	NA	12413	80	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATACATAGCAATGGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38391985	38385797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_38386513_38391898
tx.6285	chr15	-	2849	12	FSM	ENSMUSG00000037458.16	ENSMUST00000065308.13	4871	12	0	2022	0	-1208	multi-exon	FALSE	canonical	2	359	junction_2	59.7608180323933	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTGACTGATAGAAAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38519510	38489692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_38490717_38491719_38491935_38492487_38492604_38493717_38493881_38494535_38494611_38495516_38495599_38497507_38497643_38498912_38499086_38500541_38500716_38501647_38501845_38514716_38514854_38519152
tx.6286	chr15	-	4106	12	NIC	ENSMUSG00000037458.16	novel	4871	12	NA	NA	0	49	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	62	junction_3	129.988874285519	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTGATTTTGTGTATATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38519510	38488432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_38490717_38491719_38491935_38492487_38492601_38493717_38493881_38494535_38494611_38495516_38495599_38497507_38497643_38498912_38499086_38500541_38500716_38501647_38501845_38514716_38514854_38519152
tx.6287	chr15	+	2058	13	FSM	ENSMUSG00000022295.9	ENSMUST00000022904.8	2071	13	11	2	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1269	junction_12	107.259679697866	1218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAGTGCTAGTCATTTATT	195	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38662187	38692688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_38662328_38673100_38673265_38674140_38674209_38676271_38676358_38677762_38677858_38679563_38679656_38681310_38681410_38683184_38683254_38687047_38687141_38687259_38687354_38689368_38689467_38690776_38690904_38691855
tx.6288	chr15	+	1196	4	FSM	ENSMUSG00000054196.8	ENSMUST00000067072.5	1166	4	-30	0	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	1.88561808316413	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTGTTTATTTGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38940296	38950516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_38940555_38943877_38944100_38947660_38947878_38950017
tx.6289	chr15	-	2472	7	NNC	ENSMUSG00000022299.10	novel	5905	7	NA	NA	-19	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_1	35.1267546022813	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTCAATTTGGCCTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38976130	38954624	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_38956051_38960914_38961061_38961523_38961638_38963267_38963429_38965377_38965464_38969226_38969378_38975742
tx.629	chr1	-	2665	12	FSM	ENSMUSG00000026341.17	ENSMUST00000178474.8	2565	12	-103	3	57	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2308	junction_6	123.717286351378	1333	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTGATGGTTTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125363387	125320645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_125321828_125322804_125322889_125324843_125324970_125325188_125325282_125331129_125331304_125333581_125333726_125335028_125335137_125336256_125336353_125339000_125339112_125343992_125344118_125345985_125346042_125363021
tx.6290	chr15	-	2363	7	FSM	ENSMUSG00000022299.10	ENSMUST00000022908.10	5905	7	-9	3551	-9	186	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_3	10.9392260542813	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTGTTTGCTATAATATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38976120	38958176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_38959504_38960914_38961061_38961523_38961638_38963267_38963429_38965377_38965464_38969226_38969378_38975742
tx.6291	chr15	+	1517	11	FSM	ENSMUSG00000022300.11	ENSMUST00000022909.10	1551	11	34	0	34	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	478	junction_2	96.4514903980234	1570	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGCAGTTGTGTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38976293	39010251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_38976447_38982105_38982306_38982739_38982848_38986607_38986698_38987723_38987880_38991284_38991363_38993610_38993694_39001478_39001644_39007017_39007154_39008485_39008650_39010067
tx.6292	chr15	+	486	3	ISM	ENSMUSG00000022300.11	ENSMUST00000226224.2	6477	4	11368	-3	-1338	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	771	junction_2	43	284	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGCAGTTGTGTGTTTTT	697	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39007015	39010251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_39007154_39008485_39008650_39010067
tx.6293	chr15	-	1263	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037386.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	7	junction_2	11	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACCGTTTTCTCGTTGGTGAT	2124	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39110546	39105321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_39106174_39108258_39108441_39110317
tx.6294	chr15	-	1333	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000037386.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	116	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCGTTTTCTCGTTGGTGA	2104	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39110566	39105322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_39106174_39108258_39108492_39110317
tx.6295	chr15	+	1632	6	ISM	ENSMUSG00000037386.17	ENSMUST00000227381.2	4581	24	179304	-17	29594	17	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	8.62554346113913	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAAAATCAGCCATTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39479696	39545866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_39479907_39538335_39538478_39542643_39542757_39543025_39543128_39544384_39544525_39544941
tx.6296	chr15	+	1814	6	FSM	ENSMUSG00000037386.17	ENSMUST00000226410.2	3685	6	-50	1921	-50	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	17.2348484182484	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	GCAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39522911	39545847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_39523323_39538335_39538478_39542643_39542757_39543025_39543128_39544384_39544525_39544941
tx.6297	chr15	-	1407	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022303.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTATGGCTGCAATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39618273	39614132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_39614702_39617435
tx.6298	chr15	+	1922	3	ISM	ENSMUSG00000022303.10	ENSMUST00000227368.2	1825	4	8120	-1	8108	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10	junction_1	7	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCCTTGATCATGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39617447	39624331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_39618622_39622877_39623019_39623724
tx.6299	chr15	+	1854	3	ISM	ENSMUSG00000022303.10	ENSMUST00000022913.6	1997	4	8356	3	8344	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCCTTGATCATGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39617683	39624331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_39618622_39622709_39623019_39623724
tx.63	chr1	-	434	3	FSM	ENSMUSG00000079658.10	ENSMUST00000185393.7	366	3	30	-98	30	-53	multi-exon	FALSE	canonical	3	2400	junction_2	162.5	1802	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGTAGTTCAGTTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16718233	16713467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_16713703_16715909_16716054_16718178
tx.630	chr1	-	2544	13	FSM	ENSMUSG00000026341.17	ENSMUST00000027579.17	2554	13	6	4	6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	364	junction_12	606.954190107366	617	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTGATGGTTTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125363458	125320645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_125321828_125322804_125322889_125324843_125324970_125325188_125325282_125331129_125331304_125333581_125333726_125335028_125335137_125336256_125336353_125339000_125339112_125343992_125344118_125345985_125346042_125363021_125363195_125363386
tx.6300	chr15	+	1834	3	NNC	ENSMUSG00000022303.10	novel	1997	4	NA	NA	8177	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	11	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGCCTTGATCATGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39617516	39624331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_39618622_39622896_39623019_39623724
tx.6301	chr15	-	1198	3	Intergenic	novelGene_543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGAGTTCACTCAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39640737	39633461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_39634502_39640454_39640539_39640663
tx.6302	chr15	-	1176	3	Intergenic	novelGene_542	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	1	2	junction_1	5.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCTGAGTTCACTCAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39640732	39633461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_39634502_39640471_39640539_39640663
tx.6303	chr15	-	704	2	NNC	ENSMUSG00000022304.14	novel	2110	10	NA	NA	8382	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	85	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTAGTGTCTGAGTTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39648265	39646092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_39646496_39647964
tx.6304	chr15	-	714	2	ISM	ENSMUSG00000022304.14	ENSMUST00000110306.9	2110	10	72601	0	8382	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	216	junction_1	0	615	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTAGTGTCTGAGTTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39648265	39646092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_39646506_39647964
tx.6305	chr15	+	563	3	NNC	ENSMUSG00000115367.2	novel	1064	3	NA	NA	15	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_2	1	60	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTTCTGCCGTCACCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40026017	40031472	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_40026222_40028595_40028677_40031194
tx.6306	chr15	-	728	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048559.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGTGACTCCTTCCTCCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41037382	41031670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_41031968_41032739_41032953_41037164
tx.6307	chr15	+	294	3	Intergenic	novelGene_544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_1	14.5	273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTGTCTTGCCTTAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41210833	41215818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_41210883_41214473_41214592_41215691
tx.6308	chr15	+	247	2	Intergenic	novelGene_545	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_1	0	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTGTCTTGCCTTAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41214471	41215818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_41214592_41215691
tx.6309	chr15	+	1287	4	ISM	ENSMUSG00000022307.17	ENSMUST00000166917.3	798	6	20565	-935	1273	-802	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	253	junction_2	24.0554914035583	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGTATATGTTATTAGTTA	4235	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41714892	41723639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_41714924_41716717_41716814_41718316_41718391_41722553
tx.631	chr1	-	810	6	ISM	ENSMUSG00000026341.17	ENSMUST00000187460.7	667	7	58	-6	58	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2383	junction_3	132.122064773451	199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ACGGGTACAGTAATAGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125363386	125335079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_125335137_125336256_125336353_125339000_125339112_125343992_125344118_125345985_125346042_125363021
tx.6310	chr15	+	573	4	Intergenic	novelGene_547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9.0921211313239	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCATCTACTGTCTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42811099	42817507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_42811196_42813764_42813895_42814164_42814368_42817363
tx.6311	chr15	+	596	4	Intergenic	novelGene_548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	5.73488351136175	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAATCATCTACTGTCTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42811105	42817507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_42811222_42813761_42813895_42814164_42814368_42817363
tx.6312	chr15	+	586	4	Intergenic	novelGene_549	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	5.73488351136175	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTACAATCATCTACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42811106	42817501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_42811222_42813764_42813895_42814164_42814368_42817363
tx.6313	chr15	+	558	4	Intergenic	novelGene_550	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_2	8.73053390247253	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCTACTGTCTTTACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42811108	42817510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_42811222_42813761_42813895_42814202_42814368_42817363
tx.6314	chr15	-	1511	13	FSM	ENSMUSG00000022336.4	ENSMUST00000022960.4	1506	13	0	-5	0	5	multi-exon	TRUE	canonical	3	2495	junction_1	136.260065887095	6056	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTTTGCTTGAATTTCCTT	2663	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43146115	43113448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_43113634_43114875_43115011_43115600_43115704_43124455_43124566_43125994_43126097_43126604_43126732_43128896_43129022_43129529_43129656_43134274_43134380_43135671_43135715_43138632_43138751_43141703_43141819_43145998
tx.6316	chr15	+	1219	11	FSM	ENSMUSG00000022337.8	ENSMUST00000022962.8	1231	11	22	-10	10	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	590	junction_9	74.0384359640315	1648	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTAGTTTCTTTTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43340646	43391169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_43340722_43355565_43355680_43358135_43358201_43358559_43358646_43360456_43360515_43371040_43371127_43371257_43371318_43374210_43374293_43375095_43375207_43377140_43377246_43390792
tx.6317	chr15	-	3028	10	FSM	ENSMUSG00000038736.11	ENSMUST00000227843.2	5077	10	-15	2064	0	844	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_5	79.6338844685826	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTAGTGATGTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44291284	44238622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_44240083_44243455_44243616_44251864_44251991_44259906_44260052_44263415_44263624_44264677_44264861_44268744_44268926_44269205_44269389_44284114_44284270_44291057
tx.6318	chr15	-	3024	10	FSM	ENSMUSG00000038736.11	ENSMUST00000038719.8	2600	10	420	-844	1	844	multi-exon	FALSE	canonical	3	194	junction_5	53.0869308043159	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGTAGTGATGTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44291283	44238622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_44240083_44243455_44243616_44251864_44251991_44259906_44260052_44263415_44263621_44264677_44264861_44268744_44268926_44269205_44269389_44284114_44284270_44291057
tx.6319	chr15	+	564	5	FSM	ENSMUSG00000022338.9	ENSMUST00000226827.2	558	5	1	-7	1	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	313	junction_1	272.243457221657	1717	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTTTTATTTTGGAATAAA	9617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44291488	44299270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_44291567_44292955_44293033_44295833_44295905_44297294_44297370_44299007
tx.632	chr1	+	2742	16	NNC	ENSMUSG00000026342.11	novel	2733	16	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_11	28.5233627439372	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGCTTAAGCGATGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	125488747	125523557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_125489022_125490011_125490103_125490236_125490379_125494204_125494349_125496283_125496347_125498283_125498366_125500049_125500241_125502402_125502485_125503908_125503997_125506999_125507065_125512189_125512299_125512810_125512971_125515101_125515193_125517547_125517703_125518769_125518867_125522649
tx.6320	chr15	+	617	5	FSM	ENSMUSG00000022338.9	ENSMUST00000060652.5	3000	5	-4	2387	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	627	junction_1	138.867742834684	4571	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAATTTTTTTATTTTGGA	9631	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44291502	44299265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_44291639_44292955_44293033_44295833_44295905_44297294_44297370_44299007
tx.6321	chr15	+	482	4	ISM	ENSMUSG00000022338.9	ENSMUST00000226827.2	558	5	1467	-2	1412	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	895	junction_1	43.5150037981793	637	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAATTTTTTTATTTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44292954	44299265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_44293033_44295833_44295905_44297294_44297370_44299007
tx.6322	chr15	+	1321	7	FSM	ENSMUSG00000022339.10	ENSMUST00000227691.2	1945	7	136	488	-118	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	13.0894359440479	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTGTATATCCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44482706	44504423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_44482766_44487838_44487937_44490952_44491032_44491771_44491931_44493500_44493609_44500159_44500252_44503697
tx.6323	chr15	+	1451	7	NIC	ENSMUSG00000022339.10	novel	1931	7	NA	NA	-57	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_1	30.6689310758189	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTGTATATCCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44482767	44504423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_44482957_44487838_44487937_44490952_44491032_44491771_44491931_44493500_44493609_44500159_44500252_44503697
tx.6324	chr15	+	1623	7	FSM	ENSMUSG00000022339.10	ENSMUST00000022964.9	1613	7	-9	-1	-9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_1	29.9467119322899	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTGTATATCCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44482977	44504423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_44483339_44487838_44487937_44490952_44491032_44491771_44491931_44493500_44493609_44500159_44500252_44503697
tx.6325	chr15	+	1732	7	FSM	ENSMUSG00000022339.10	ENSMUST00000226165.2	1931	7	-2	201	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	30.3076814612328	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTGTATATCCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44482833	44504423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_44483304_44487838_44487937_44490952_44491032_44491771_44491931_44493500_44493609_44500159_44500252_44503697
tx.6326	chr15	+	1265	6	ISM	ENSMUSG00000022339.10	ENSMUST00000022964.9	1613	7	4849	-1	4849	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_3	8.20731381147328	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTTGTATATCCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44487835	44504423	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_44487937_44490952_44491032_44491771_44491931_44493500_44493609_44500159_44500252_44503697
tx.6327	chr15	-	445	2	Intergenic	novelGene_551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAACCCTGAGAACTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47033332	47022219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_47022513_47033180
tx.6328	chr15	-	394	2	ISM	ENSMUSG00000022312.12	ENSMUST00000226756.2	520	4	2516	-122	2516	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1963	junction_1	0	1451	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGTGTGTATTTATGG	1131	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51651429	51649955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_51650222_51651301
tx.6329	chr15	+	387	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022312.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGATACTACAACCAAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51649955	51651429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_51650209_51651295
tx.633	chr1	-	429	2	NNC	ENSMUSG00000102014.2	novel	465	2	NA	NA	176	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTTGATGAATTTAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127701615	127681353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_127681691_127701523
tx.6330	chr15	-	878	6	ISM	ENSMUSG00000022312.12	ENSMUST00000022925.10	1295	8	66224	2	-8750	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1820	junction_5	65.783280550608	303	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGTGTGTATTTATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51662695	51649955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_51650222_51651301_51651435_51653388_51653510_51659783_51659934_51661008_51661109_51662587
tx.6331	chr15	-	1244	8	NNC	ENSMUSG00000022312.12	novel	1295	8	NA	NA	-29	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	673.611951515477	180	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGTGTGTATTTATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51728879	51649955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_51650222_51651301_51651426_51653388_51653510_51659783_51659934_51661008_51661109_51662587_51662756_51705863_51706021_51728721
tx.6332	chr15	-	1254	8	FSM	ENSMUSG00000022312.12	ENSMUST00000022925.10	1295	8	39	2	-30	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1820	junction_5	77.7200628104822	8441	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTGTGTGTATTTATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51728880	51649955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_51650222_51651301_51651435_51653388_51653510_51659783_51659934_51661008_51661109_51662587_51662756_51705863_51706021_51728721
tx.6333	chr15	+	973	3	FSM	ENSMUSG00000022313.11	ENSMUST00000137116.3	2921	3	18	1930	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	321	junction_1	13	730	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGCATCTTCAGTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51740842	51746080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_51741107_51744411_51744587_51745546
tx.6334	chr15	-	1730	2	ISM	ENSMUSG00000022314.11	ENSMUST00000022927.11	3956	14	26707	364	26470	-364	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	805	junction_1	0	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTTGGAACATACTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51828436	51825999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_51827644_51828350
tx.6335	chr15	-	2278	6	ISM	ENSMUSG00000022314.11	ENSMUST00000022927.11	3956	14	21748	364	21511	-364	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	690	junction_2	41.1757210015805	365	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATTTTGGAACATACTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51833395	51825999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_51827644_51828350_51828435_51829977_51830128_51831183_51831333_51831746_51831919_51833316
tx.6336	chr15	+	1025	2	FSM	ENSMUSG00000068522.5	ENSMUST00000090025.5	1348	2	323	0	323	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTGTTTCTAGTGGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51903825	51909118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_51903927_51908194
tx.6337	chr15	+	880	4	FSM	ENSMUSG00000038622.9	ENSMUST00000037115.9	1007	4	-4	131	-4	-131	multi-exon	FALSE	canonical	3	604	junction_2	11.2644968324772	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGCTTACTTGTTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52575833	52593829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_52576083_52582741_52582901_52584419_52584525_52593462
tx.6338	chr15	-	1179	5	FSM	ENSMUSG00000058656.14	ENSMUST00000078673.14	9019	5	31	7809	31	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.29903810567666	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACAAGTGTTTTCTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53765895	53325014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_53325613_53521745_53521887_53583010_53583141_53723499_53723679_53765764
tx.6339	chr15	-	528	3	NIC	ENSMUSG00000058656.14	novel	471	3	NA	NA	70	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATGGGCAAATTAGTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53765856	53682189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_53682447_53723499_53723679_53765764
tx.634	chr1	-	431	2	FSM	ENSMUSG00000102014.2	ENSMUST00000188163.2	465	2	33	1	33	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGGTTGATGAATTTAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127701758	127681353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_127681691_127701664
tx.6340	chr15	-	1307	9	FSM	ENSMUSG00000022422.14	ENSMUST00000023059.13	1324	9	17	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_7	27.4268914571083	767	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTATCCCTGACTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54953870	54939494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_54939662_54943588_54943738_54945562_54945718_54946441_54946495_54947444_54947584_54950148_54950240_54950997_54951133_54952350_54952520_54953621
tx.6341	chr15	-	932	2	FSM	ENSMUSG00000053749.13	ENSMUST00000137301.2	855	2	-42	-35	-42	35	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTTGTGTTTCCCATAT	9964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54976898	54975223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_54975993_54976735
tx.6342	chr15	+	2012	9	FSM	ENSMUSG00000022419.17	ENSMUST00000096433.10	8547	9	59	6476	-48	-1407	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_7	6.05702071979286	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGGTTTTACCAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	54975771	55116191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_54976016_55012736_55012916_55015183_55015308_55044260_55044440_55072126_55072313_55075587_55075723_55078883_55078955_55081564_55081670_55115402
tx.6343	chr15	-	734	6	ISM	ENSMUSG00000022370.14	ENSMUST00000172387.8	1223	7	2303	0	1830	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	905	junction_4	60.8946631487522	649	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAATGTCTCTTACTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55418841	55397489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_55397734_55402425_55402548_55403518_55403606_55406719_55406781_55411537_55411632_55418715
tx.6344	chr15	-	802	7	FSM	ENSMUSG00000022370.14	ENSMUST00000172387.8	1223	7	421	0	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	905	junction_4	55.6070039553372	4147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAATGTCTCTTACTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55420723	55397489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_55397734_55402425_55402548_55403518_55403606_55406719_55406781_55411537_55411632_55418715_55418840_55420653
tx.6345	chr15	-	708	6	FSM	ENSMUSG00000022370.14	ENSMUST00000164542.8	730	6	22	0	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_4	366.126754007407	500	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCAATGTCTCTTACTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55420723	55397489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_55397734_55402425_55402548_55403518_55403606_55406719_55406781_55418715_55418840_55420653
tx.6346	chr15	+	1516	5	ISM	ENSMUSG00000022369.14	ENSMUST00000170046.8	3197	17	-27	45162	-27	-3426	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	11.2249721603218	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGTTTGGTTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55420963	55429047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_55421134_55421896_55421978_55426098_55426173_55426332_55426485_55428008
tx.6347	chr15	+	2964	22	FSM	ENSMUSG00000022369.14	ENSMUST00000022998.14	3144	22	180	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_14	23.9707872097639	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTGGATTGCATGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55420983	55489819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_55421134_55421896_55421978_55426098_55426173_55426332_55426485_55428008_55428068_55429589_55429735_55430573_55430692_55432441_55432556_55434690_55434786_55436291_55436365_55440843_55440962_55449706_55449881_55452051_55452160_55460737_55460900_55466579_55466698_55470039_55470196_55474333_55474430_55480877_55481145_55483033_55483272_55484018_55484133_55488786_55488853_55489533
tx.6348	chr15	+	393	2	ISM	ENSMUSG00000022369.14	ENSMUST00000169517.2	590	7	-309	10496	18	-10496	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTACAGAAGTGTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55420821	55421977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_55421134_55421896
tx.6349	chr15	+	477	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060429.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	13	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55735028	55740289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_55735293_55740076
tx.635	chr1	+	2886	4	FSM	ENSMUSG00000026349.15	ENSMUST00000125760.8	665	4	6	-2227	6	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	495	junction_3	16.8193010820572	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAACAGCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127701906	127723553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_127702123_127702837_127702920_127719341_127719471_127721094
tx.6350	chr15	+	492	3	FSM	ENSMUSG00000086541.9	ENSMUST00000165880.2	638	3	55	91	55	-91	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATGGAAGAGTCTACCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56628910	56641383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_56628993_56629676_56629827_56641123
tx.6351	chr15	-	1175	8	FSM	ENSMUSG00000022365.7	ENSMUST00000022993.7	3175	8	-18	2018	-18	143	multi-exon	TRUE	canonical	3	365	junction_5	42.5977866628236	315	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATTTTCTGGTGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57755862	57734915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_57735303_57738892_57739004_57740813_57740867_57741880_57741977_57742444_57742472_57743395_57743461_57746830_57746943_57755538
tx.6352	chr15	-	1177	7	NNC	ENSMUSG00000022365.7	novel	3175	8	NA	NA	-22	143	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	168.746769516404	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCATTTTCTGGTGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57755866	57734915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_57735303_57738892_57739004_57740813_57740867_57741880_57742002_57743395_57743461_57746830_57746943_57755538
tx.6353	chr15	+	1033	7	ISM	ENSMUSG00000022364.15	ENSMUST00000022992.13	3311	21	41337	-3	-4877	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	202	junction_4	52.0664639347312	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCTGAACTGTCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57816931	57833460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_57817037_57818668_57818805_57821732_57821826_57824238_57824380_57827199_57827321_57831304_57831401_57833119
tx.6354	chr15	+	601	2	NIC	ENSMUSG00000022364.15	novel	914	6	NA	NA	5250	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCAAAGCTGAACTGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57827058	57833458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_57827321_57833119
tx.6355	chr15	+	664	3	ISM	ENSMUSG00000022364.15	ENSMUST00000161329.2	914	6	5285	3	5285	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	284	junction_1	37.5	305	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAAGCTGAACTGTCTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57827093	57833460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_57827321_57831304_57831401_57833119
tx.6356	chr15	+	504	2	NNC	ENSMUSG00000022364.15	novel	3311	21	NA	NA	11005	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	504	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAAGCTGAACTGTCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57832813	57833459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_57832978_57833119
tx.6357	chr15	-	565	2	Intergenic	novelGene_554	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAATTTATTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57839085	57837903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_57838339_57838955
tx.6358	chr15	-	642	2	Intergenic	novelGene_555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAATTTATTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57839451	57837903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_57838339_57839244
tx.6359	chr15	-	2478	2	Intergenic	novelGene_557	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAATTTATTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57840482	57837903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_57839652_57839752
tx.636	chr1	+	3389	9	FSM	ENSMUSG00000026349.15	ENSMUST00000027587.15	6738	9	26	3323	26	-1194	multi-exon	FALSE	canonical	3	399	junction_6	47.8289595851718	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGTGCATTGTACCTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127701926	127732475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_127702123_127702837_127702920_127719341_127719471_127721094_127721156_127722991_127723055_127725577_127725624_127727126_127727291_127729342_127729414_127729898
tx.6360	chr15	-	1055	2	Intergenic	novelGene_558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAATTTATTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57840482	57837903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_57838339_57839862
tx.6361	chr15	+	2295	4	FSM	ENSMUSG00000051225.10	ENSMUST00000160942.8	2876	4	278	303	-213	-303	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	4.49691252107735	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTCCCTGGACCTGATGG	9491	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57849092	57874102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_57849938_57856302_57856471_57858609_57858735_57872945
tx.6362	chr15	+	1555	2	NNC	ENSMUSG00000051225.10	novel	529	2	NA	NA	-33	-304	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTTCCCTGGACCTGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57865508	57874101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_57865908_57872945
tx.6363	chr15	-	555	3	ISM	ENSMUSG00000101892.2	ENSMUST00000100655.5	1341	6	5574	11	-846	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	846	junction_2	60	936	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCTCCCAGGTAATTTCA	283	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57892137	57885665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_57885960_57888669_57888803_57892009
tx.6364	chr15	-	1337	6	FSM	ENSMUSG00000101892.2	ENSMUST00000100655.5	1341	6	-7	11	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	653	junction_4	117.266534015464	2584	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTCTCCCAGGTAATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57897718	57885665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_57885960_57888669_57888803_57892009_57892441_57894352_57894497_57895379_57895476_57897479
tx.6365	chr15	+	947	6	FSM	ENSMUSG00000022359.11	ENSMUST00000227142.2	786	6	-35	-126	-4	126	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	23.3203773554375	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTGGTTGCTGGGAATTGAA	2656	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58004768	58018847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_58004978_58011729_58011830_58014001_58014053_58015992_58016142_58016975_58017101_58018534
tx.6366	chr15	+	1387	6	FSM	ENSMUSG00000022359.11	ENSMUST00000067563.9	1383	6	-4	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_4	11.5516232625549	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCTTTTGAAGAATCTG	2656	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58004768	58022050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_58004978_58011729_58011830_58014001_58014053_58015992_58016142_58016975_58017101_58021297
tx.6367	chr15	+	1238	5	FSM	ENSMUSG00000022359.11	ENSMUST00000228761.2	798	5	-19	-421	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_3	18.5	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCTTTTGAAGAATCTG	2656	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58004768	58022050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_58004978_58011729_58011830_58014001_58014053_58016975_58017101_58021297
tx.6369	chr15	+	692	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022358.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTATATGTTCCTTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58024840	58048285	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_58025072_58047824
tx.637	chr1	+	1031	5	FSM	ENSMUSG00000026349.15	ENSMUST00000149760.8	1040	5	27	-18	27	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	475	junction_4	23.7539470404394	763	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAACAGCTTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127701927	127723555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_127702123_127702837_127702920_127719341_127719471_127721094_127721156_127722991
tx.6370	chr15	-	373	4	ISM	ENSMUSG00000050891.11	ENSMUST00000228538.3	915	12	24077	0	6528	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_3	7.11805216802087	997	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTTTCCTTTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58781499	58772822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_58772920_58776582_58776710_58777589_58777661_58781421
tx.6371	chr15	-	926	12	FSM	ENSMUSG00000050891.11	ENSMUST00000228538.3	915	12	-11	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_6	18.2181455270914	303	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTTTCCTTTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58805587	58772822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_58772920_58776582_58776710_58777589_58777661_58781421_58781499_58788000_58788042_58788125_58788212_58792988_58793032_58793122_58793267_58795753_58795818_58798284_58798335_58800532_58800599_58805527
tx.6372	chr15	-	862	11	NIC	ENSMUSG00000050891.11	novel	915	12	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	33	junction_8	26.3417918904542	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTTTCCTTTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58805587	58772822	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_58772920_58776582_58776710_58777589_58777661_58781421_58781499_58788000_58788042_58788125_58788212_58792988_58793032_58793122_58793267_58798284_58798335_58800532_58800599_58805527
tx.6373	chr15	+	667	4	FSM	ENSMUSG00000022354.5	ENSMUST00000022980.5	704	4	41	-4	-11	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	3308	junction_3	178.75557489364	9215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGCCTGAAGTGTTCTT	2857	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58805645	58811341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_58805788_58808116_58808310_58809200_58809315_58811123
tx.6374	chr15	-	370	3	Intergenic	novelGene_559	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTTTAGTCGTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58985245	58976628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_58976780_58977837_58977919_58985107
tx.6375	chr15	+	2795	11	FSM	ENSMUSG00000022351.15	ENSMUST00000022977.14	2758	11	-36	-1	-32	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	657	junction_1	53.8835782033822	243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTCTTTTGGTTTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59186893	59203042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_59187979_59189644_59189898_59193162_59193344_59194684_59194782_59195462_59195577_59195655_59195828_59196310_59196407_59197883_59198027_59198418_59198516_59201588_59201677_59202573
tx.6376	chr15	-	4064	29	NNC	ENSMUSG00000022350.8	novel	4033	29	NA	NA	-27	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_22	96.5820735891268	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTTGCCCTGCTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59246043	59203845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_59204209_59205466_59205555_59206936_59207091_59209041_59209139_59210762_59210893_59211662_59211767_59212740_59212821_59212908_59213012_59213787_59213951_59215873_59215999_59217186_59217367_59218062_59218165_59218668_59218750_59220233_59220375_59221141_59221253_59221980_59222057_59222135_59222303_59223320_59223434_59224349_59224480_59227682_59227811_59231111_59231284_59232971_59233086_59235038_59235196_59238011_59238205_59239243_59239345_59240224_59240310_59241001_59241148_59241728_59242035_59245889
tx.6377	chr15	+	780	4	ISM	ENSMUSG00000059586.11	ENSMUST00000168722.3	2679	5	0	83959	0	-83959	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	929	junction_1	3.85861230093008	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAACAATGGTAATTCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59246095	59327554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_59246205_59250716_59250888_59287873_59287981_59327161
tx.6378	chr15	+	1172	8	FSM	ENSMUSG00000059586.11	ENSMUST00000227173.2	1122	8	-38	-12	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_4	348.219025608766	438	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCAGCATGGTCCTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59246095	59473533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_59246205_59250716_59250888_59287873_59287981_59327161_59327316_59368625_59368704_59463545_59463647_59463986_59464094_59473188
tx.6379	chr15	+	1094	7	FSM	ENSMUSG00000059586.11	ENSMUST00000079703.11	1054	7	-40	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	776	junction_4	74.7677886674618	2583	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCAGCATGGTCCTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59246095	59473533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_59246205_59250716_59250888_59287873_59287981_59327161_59327316_59463545_59463647_59463986_59464094_59473188
tx.638	chr1	+	996	3	FSM	ENSMUSG00000026349.15	ENSMUST00000126850.8	4500	3	29	3475	29	-1264	multi-exon	FALSE	canonical	3	526	junction_2	4	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAAATAAACTCATTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127701929	127720062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_127702123_127702837_127702920_127719341
tx.6380	chr15	-	821	2	Intergenic	novelGene_560	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCTCCAGTCATTCAACAAA	5582	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59519999	59519028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_59519653_59519802
tx.6381	chr15	+	752	3	NNC	ENSMUSG00000097493.4	novel	3074	3	NA	NA	-103	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGGTGAGTTCCTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60696086	60700501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_60696276_60699180_60699212_60699969
tx.6382	chr15	+	833	3	FSM	ENSMUSG00000097493.4	ENSMUST00000180730.3	3074	3	2243	-2	173	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGGTGAGTTCCTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60696362	60700501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_60696633_60699180_60699212_60699969
tx.6383	chr15	+	2646	7	NNC	ENSMUSG00000097039.9	novel	1563	9	NA	NA	-19	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.2746350930146	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTAAGCGTGATTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61909815	62122824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_61910051_62031845_62031978_62047315_62047398_62114022_62114151_62114282_62114411_62116567_62116691_62121006
tx.6384	chr15	+	1334	7	NIC	ENSMUSG00000097039.9	novel	1563	9	NA	NA	22	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	16	junction_2	6.0736223860962	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTATTGAAGTCATGATTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61909856	62121376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_61910051_61978996_61979315_62021087_62021202_62047315_62047398_62114022_62114151_62114282_62114411_62121006
tx.6385	chr15	+	720	2	ISM	ENSMUSG00000097039.9	ENSMUST00000182956.8	1342	7	21	141856	21	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTCTTTCTTTTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61909855	61979521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_61910051_61978996
tx.6386	chr15	+	1223	6	NIC	ENSMUSG00000097039.9	novel	1342	7	NA	NA	20	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	9	junction_2	8.29457654133109	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTGAAGTCATGATTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61909854	62121377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_61910051_61978996_61979315_62047315_62047398_62114022_62114151_62114282_62114411_62121006
tx.6387	chr15	+	1478	8	NIC	ENSMUSG00000097039.9	novel	1563	9	NA	NA	20	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	16	junction_2	5.85191404236115	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGAAGTCATGATTGTCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61909854	62121379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_61910051_61978996_61979315_62021087_62021202_62047315_62047398_62114022_62114151_62114282_62114411_62116567_62116707_62121006
tx.6388	chr15	-	1820	13	FSM	ENSMUSG00000022378.15	ENSMUST00000228226.2	1896	13	78	-2	65	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	743	junction_12	159.721024150096	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGGCTTGGTTTACTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63932114	63802790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_63803529_63807427_63807499_63809146_63809274_63810512_63810593_63811493_63811611_63813779_63813858_63815032_63815170_63816171_63816278_63821854_63821977_63828448_63828532_63842778_63842818_63894418_63894470_63932043
tx.6389	chr15	-	1805	13	NIC	ENSMUSG00000022378.15	novel	1896	13	NA	NA	-7	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	70	junction_12	311.438095775067	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTGTGGCTTGGTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63932334	63802793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_63803529_63807427_63807499_63809146_63809274_63810512_63810593_63811493_63811611_63813779_63813858_63815032_63815170_63816171_63816278_63821854_63821977_63828448_63828532_63842778_63842818_63894418_63894470_63932275
tx.639	chr1	+	4228	24	FSM	ENSMUSG00000036104.13	ENSMUST00000037649.6	4243	24	13	2	-3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	17.6995509005001	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATGTGTGGACTTGTGGCT	3042	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127796522	127871603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_127796567_127796661_127796718_127801816_127801893_127816892_127817026_127818754_127818834_127829315_127829436_127831408_127831575_127837587_127837688_127843375_127843458_127845957_127846027_127847304_127847379_127852464_127852558_127853011_127853179_127855196_127855287_127855685_127855859_127858126_127858182_127858443_127858816_127862153_127862292_127865074_127865303_127865725_127865823_127865934_127866039_127866311_127866428_127866782_127866886_127870110
tx.6390	chr15	-	166	2	ISM	ENSMUSG00000022377.17	ENSMUST00000176358.2	631	8	41946	1279	41946	-1279	internal_fragment	FALSE	canonical	3	112	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCTACTTCTAGCATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64038394	64032066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_64032147_64038308
tx.6391	chr15	+	904	2	FSM	ENSMUSG00000015002.19	ENSMUST00000174135.2	1425	2	4	517	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGATTTGTCAGACTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65658886	65662683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_65659096_65661988
tx.6392	chr15	+	1981	15	NIC	ENSMUSG00000015002.19	novel	5215	23	NA	NA	-2	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	6	junction_14	139.24783367677	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAACTGTCTTGGCTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65658886	65725954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_65659096_65687183_65687261_65690281_65690410_65691568_65691720_65696462_65696585_65701575_65701726_65709283_65709422_65714490_65714570_65717757_65717894_65719996_65720159_65721611_65721727_65722972_65723025_65724809_65724983_65725379_65725456_65725741
tx.6393	chr15	+	3969	23	FSM	ENSMUSG00000015002.19	ENSMUST00000015146.16	5215	23	0	1246	0	-1246	multi-exon	FALSE	canonical	3	451	junction_16	48.5493912261498	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65658888	65744419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_65659096_65687183_65687261_65690281_65690410_65691568_65691720_65696462_65696585_65701575_65701726_65709283_65709422_65714490_65714570_65717757_65717894_65719996_65720159_65721611_65721727_65722972_65723025_65724809_65724983_65725379_65725456_65726477_65726640_65727264_65727397_65728370_65728439_65729312_65729441_65733500_65733593_65737726_65737776_65738572_65738677_65739118_65739169_65743001
tx.6394	chr15	+	2694	14	ISM	ENSMUSG00000015002.19	ENSMUST00000211878.2	2541	23	38006	-1317	-2881	-1241	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	451	junction_7	59.1685987405742	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAAGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65720088	65744424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_65720159_65721611_65721727_65722972_65723025_65724809_65724983_65725379_65725456_65726477_65726640_65727264_65727397_65728370_65728439_65729312_65729441_65733500_65733593_65737726_65737776_65738572_65738677_65739118_65739169_65743001
tx.6395	chr15	-	2889	16	NNC	ENSMUSG00000005125.14	novel	2889	16	NA	NA	0	-3	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_13	11.8122347118947	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCTTGTGTCTTTTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66841488	66801169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_66802958_66805712_66805765_66808101_66808138_66809046_66809095_66809715_66809768_66810491_66810549_66811991_66812096_66813860_66813918_66814913_66815001_66815852_66815914_66816624_66816688_66818280_66818402_66820227_66820334_66831206_66831247_66832320_66832402_66841352
tx.6396	chr15	-	2917	15	NNC	ENSMUSG00000005125.14	novel	2889	16	NA	NA	-35	-3	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_13	12.1235140053012	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCTTGTGTCTTTTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66841524	66801169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_66802958_66805712_66805765_66808101_66808138_66809046_66809095_66809715_66809768_66810491_66810549_66811991_66812096_66813860_66813918_66814913_66815001_66815852_66815914_66816624_66816688_66818280_66818402_66820227_66820366_66832320_66832402_66841352
tx.6397	chr15	-	711	2	ISM	ENSMUSG00000047921.18	ENSMUST00000023276.16	3301	22	465027	0	465027	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTGTTGATTTCAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72462632	72461468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_72462012_72462464
tx.6398	chr15	+	502	1	FSM	ENSMUSG00000096173.3	ENSMUST00000166418.4	204	1	-55	-243	-55	243	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAAGAAAATTTGCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72785150	72785652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_72785200_72785700
tx.6399	chr15	+	853	3	FSM	ENSMUSG00000068391.9	ENSMUST00000089765.9	871	3	20	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	479	junction_2	8	557	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCTTCATTGAAGTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	72962260	72965926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_72962433_72964681_72964809_72965372
tx.64	chr1	-	501	4	FSM	ENSMUSG00000079658.10	ENSMUST00000188641.7	2014	4	-6	1519	-6	-53	multi-exon	FALSE	canonical	3	1161	junction_3	673.864641864785	5712	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGTAGTTCAGTTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16727114	16713467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_16713703_16715909_16716054_16718178_16718232_16727045
tx.640	chr1	+	310	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000058603.11	novel	414	1	NA	NA	-42	51	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAACAGCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	127966263	127966770	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_127966492_127966688
tx.6400	chr15	-	466	3	Intergenic	novelGene_562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTTGCTGTCAATTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73534279	73525672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_73525815_73525933_73526082_73534103
tx.6401	chr15	-	2061	2	FSM	ENSMUSG00000045281.6	ENSMUST00000064166.5	2144	2	83	0	83	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	16	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGGGCCAACAGCCCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73579271	73566452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_73568412_73579169
tx.6402	chr15	+	787	5	NIC	ENSMUSG00000059895.14	novel	1680	6	NA	NA	-7	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_1	48.9406528358582	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTGTGTGAAGAGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73596639	73629075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_73596698_73625604_73625698_73627142_73627274_73627876_73627952_73628645
tx.6403	chr15	+	1670	6	FSM	ENSMUSG00000059895.14	ENSMUST00000230177.2	1680	6	9	1	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	34.6028900527109	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTGTGTGAAGAGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73596655	73629075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_73596698_73622977_73623877_73625604_73625698_73627142_73627274_73627876_73627952_73628645
tx.6404	chr15	+	1626	5	ISM	ENSMUSG00000059895.14	ENSMUST00000053232.8	3260	6	2757	1540	2757	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_1	9.24662100445346	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGTGTGTGAAGAGTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73622979	73629075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_73623877_73625604_73625698_73627142_73627274_73627876_73627952_73628645
tx.6405	chr15	+	735	4	FSM	ENSMUSG00000059895.14	ENSMUST00000229339.2	6459	4	5726	-2	5378	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_3	6.23609564462324	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTGTGAAGAGTGTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73625600	73629077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_73625698_73627142_73627274_73627876_73627952_73628645
tx.6406	chr15	-	964	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082585.4	novel	648	1	NA	NA	-103	554	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAAGTTTTATTGGTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73966285	73964980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_73965166_73965506
tx.6407	chr15	-	924	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082585.4	novel	648	1	NA	NA	-124	521	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGAAAACAGGCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73966306	73965013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_73965166_73965534
tx.6408	chr15	-	3392	2	FSM	ENSMUSG00000046380.4	ENSMUST00000050234.4	5853	2	203	2258	203	-2258	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTTGTCATGATTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74581181	74576407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_74579714_74581095
tx.6409	chr15	+	962	3	FSM	ENSMUSG00000022598.7	ENSMUST00000023265.5	860	3	-101	-1	-101	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGAACCTGTGTCCTTAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74586586	74588919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_74586756_74587869_74587978_74588234
tx.641	chr1	+	1550	9	FSM	ENSMUSG00000056211.14	ENSMUST00000188381.7	1130	9	-19	-401	1	348	multi-exon	FALSE	canonical	3	211	junction_3	23.1432360528946	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTAATAGTCATTATCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128031038	128107267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_128031221_128079480_128079690_128080925_128081137_128095629_128095745_128096715_128096795_128102685_128102746_128102828_128102970_128106619_128106729_128106823
tx.6410	chr15	+	1468	2	FSM	ENSMUSG00000056665.3	ENSMUST00000070923.3	1784	2	50	266	50	-266	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCGTGTGCCGGGGAGGTTC	4690	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74593102	74596222	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_74593657_74595308
tx.6411	chr15	-	547	3	FSM	ENSMUSG00000022595.8	ENSMUST00000023260.5	513	3	-34	0	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	1.5	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGAGTCTCGTTTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74606212	74604095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_74604389_74604815_74604936_74606078
tx.6412	chr15	-	623	3	FSM	ENSMUSG00000044678.12	ENSMUST00000168815.8	612	3	-10	-1	-10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_2	7.5	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTTGGTTTGACTTCTGT	1219	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74671392	74668721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_74669121_74670383_74670483_74671267
tx.6413	chr15	-	646	4	FSM	ENSMUSG00000044678.12	ENSMUST00000060301.6	791	4	146	-1	146	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_3	10.2740233382816	644	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCTTGGTTTGACTTCTGT	922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74671689	74668721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_74669121_74670383_74670483_74671267_74671345_74671618
tx.6414	chr15	+	740	4	NNC	ENSMUSG00000022587.15	novel	1122	4	NA	NA	-36	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	59	junction_3	242.845629979211	102	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGCTATGTCCTGGTTGT	8351	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74827465	74831180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_74827567_74829628_74829727_74830117_74830238_74830759
tx.6415	chr15	+	743	4	NNC	ENSMUSG00000022587.15	novel	2281	4	NA	NA	-36	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	59	junction_3	242.10511950161	150	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGCTATGTCCTGGTTGT	8351	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74827465	74831180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_74827567_74829625_74829727_74830117_74830238_74830759
tx.6416	chr15	+	1158	4	FSM	ENSMUSG00000022587.15	ENSMUST00000190810.7	924	4	442	-676	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	397	junction_1	104.416899441081	909	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGCTATGTCCTGGTTGT	8354	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74827468	74831180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_74827567_74829625_74829727_74830117_74830238_74830341
tx.6417	chr15	+	1155	4	FSM	ENSMUSG00000022587.15	ENSMUST00000191436.7	1122	4	-33	0	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	296	junction_1	144.768781165001	686	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGCTATGTCCTGGTTGT	8354	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74827468	74831180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_74827567_74829628_74829727_74830117_74830238_74830341
tx.6418	chr15	-	864	4	FSM	ENSMUSG00000075602.11	ENSMUST00000187994.7	955	4	92	-1	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	7.54247233265651	336	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAAGTTCTCCATTTTTCT	9600	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74869788	74866725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_74867329_74868300_74868418_74869383_74869467_74869727
tx.6419	chr15	-	910	3	FSM	ENSMUSG00000068348.5	ENSMUST00000089689.5	408	3	-115	-387	-115	387	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_2	2	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAAAGTCTCTGTTTTTCTT	1237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75110732	75107058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75107668_75109440_75109558_75110548
tx.642	chr1	+	2434	12	FSM	ENSMUSG00000056211.14	ENSMUST00000191016.7	2438	12	5	-1	5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	198	junction_9	26.662258588834	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTAGAGAGTGCAAGAGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128031042	128110869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_128031221_128079480_128079690_128080925_128081137_128095629_128095745_128096715_128096795_128102685_128102746_128102828_128102970_128106619_128106729_128106823_128106920_128109453_128109492_128109574_128109626_128109722
tx.6420	chr15	-	729	2	ISM	ENSMUSG00000068348.5	ENSMUST00000089689.5	408	3	1062	-392	1062	392	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTCTGTTTTTCTTTTGCT	2414	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75109555	75107053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_75107668_75109440
tx.6421	chr15	-	842	4	NNC	ENSMUSG00000068348.5	novel	408	3	NA	NA	-300	386	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_3	32.5678778348646	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAAAGTCTCTGTTTTTCT	1052	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75110917	75107059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_75107668_75109440_75109558_75110548_75110631_75110882
tx.6422	chr15	-	972	3	Fusion	ENSMUSG00000101289.2_ENSMUSG00000068348.5	novel	408	3	NA	NA	-177	386	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	38	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCAAAGTCTCTGTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75186990	75107059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr15_-_75107668_75109440_75109558_75186743
tx.6423	chr15	+	723	2	ISM	ENSMUSG00000022583.13	ENSMUST00000189654.2	818	3	1076	-1	1076	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCAAGATCTCAGTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75141626	75144085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_75141746_75143481
tx.6424	chr15	+	1426	2	ISM	ENSMUSG00000047003.16	ENSMUST00000161785.8	3540	3	14	5959	9	697	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGCTCAACCCTTGGGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75488541	75491190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_75488670_75489892
tx.6425	chr15	-	1905	14	FSM	ENSMUSG00000000934.10	ENSMUST00000000958.9	1903	14	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_8	11.6872458678823	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTTTGTCACTGTGACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75550649	75528881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75529064_75529532_75529680_75535204_75535300_75535863_75535992_75537435_75537551_75538101_75538171_75539268_75539455_75539670_75539815_75540474_75540620_75541135_75541324_75541910_75542034_75546140_75546263_75547867_75547981_75550501
tx.6426	chr15	+	890	4	NIC	ENSMUSG00000022580.14	novel	2146	11	NA	NA	-360	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.29983164553722	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGAGTCTGAGTCGGGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75584076	75586257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_75584301_75585067_75585215_75585298_75585461_75585900
tx.6427	chr15	+	958	5	ISM	ENSMUSG00000022580.14	ENSMUST00000143056.8	2146	11	7919	-3	-351	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.41869858279434	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTGAGTCTGAGTCGGGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75584085	75586257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_75584301_75584850_75584928_75585067_75585215_75585298_75585461_75585900
tx.6428	chr15	-	559	2	ISM	ENSMUSG00000075600.4	ENSMUST00000100538.4	3362	12	85255	0	56199	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	213	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGCCTGTCTTGACTACC	5327	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75628509	75626278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_75626800_75628471
tx.6429	chr15	-	3374	12	FSM	ENSMUSG00000075600.4	ENSMUST00000100538.4	3362	12	-12	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_8	44.618492997359	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGCCTGTCTTGACTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75713776	75626278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75626800_75628471_75628816_75629388_75629574_75648838_75648971_75650914_75650985_75651128_75651288_75651362_75651406_75657301_75657487_75681376_75681528_75709315_75709513_75711104_75712414_75713698
tx.643	chr1	+	679	4	ISM	ENSMUSG00000056211.14	ENSMUST00000188381.7	1130	9	-12	11153	8	-10167	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_3	33.9411254969543	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATAAGTTACCCAGAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128031045	128095713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_128031221_128079480_128079690_128080925_128081137_128095629
tx.6430	chr15	+	1821	11	FSM	ENSMUSG00000022575.6	ENSMUST00000023238.6	1792	11	-32	3	-32	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	7.7614431647729	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGCTGTGTTGAGGGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75734143	75739254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_75734331_75735253_75735478_75736092_75736286_75736797_75736967_75737271_75737375_75737608_75737660_75737935_75738026_75738144_75738321_75738394_75738540_75738638_75738713_75738845
tx.6431	chr15	-	1175	4	Intergenic	novelGene_564	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_3	10.1434160364686	311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGGGTCCCATCAGATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75754364	75741182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_75741955_75743124_75743208_75744217_75744419_75754245
tx.6432	chr15	+	1444	2	Intergenic	novelGene_565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTCAAAGCCCACCCCCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75752792	75754388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_75753269_75753420
tx.6433	chr15	-	556	2	Intergenic	novelGene_566	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCAATGGTTTATGTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75754364	75753085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_75753523_75754245
tx.6434	chr15	-	1718	13	FSM	ENSMUSG00000022574.8	ENSMUST00000023237.8	1898	13	173	7	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_8	7.1351049201972	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTCAGCCATGTGTCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75766157	75762811	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75762910_75762997_75763106_75763195_75763351_75763428_75763532_75763632_75763714_75763811_75763897_75764190_75764332_75764405_75764603_75764953_75765070_75765154_75765286_75765401_75765485_75765568_75765697_75765865
tx.6435	chr15	-	181	2	ISM	ENSMUSG00000055762.17	ENSMUST00000134222.2	793	3	932	-4	932	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3397	junction_1	0	3499	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCGCCTCTTGTGTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75767657	75767336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_75767441_75767580
tx.6436	chr15	-	367	3	FSM	ENSMUSG00000055762.17	ENSMUST00000134222.2	793	3	430	-4	430	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3397	junction_1	15.5	4575	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCGCCTCTTGTGTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75768159	75767336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75767441_75767580_75767776_75768091
tx.6437	chr15	-	980	8	FSM	ENSMUSG00000055762.17	ENSMUST00000154584.9	2312	8	49	1283	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2715	junction_5	241.1927842695	16573	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCGCCTCTTGTGTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75781155	75767336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75767441_75767580_75767776_75768091_75768314_75768488_75768590_75768668_75768769_75772539_75772612_75772980_75773105_75781093
tx.6438	chr15	-	908	7	FSM	ENSMUSG00000055762.17	ENSMUST00000109972.9	1624	7	28	688	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	464	junction_5	1042.33482571048	3259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCGCCTCTTGTGTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75781155	75767336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75767441_75767580_75767776_75768091_75768314_75768488_75768590_75768668_75768769_75772980_75773105_75781093
tx.6439	chr15	-	1300	6	FSM	ENSMUSG00000022571.10	ENSMUST00000053918.9	1339	6	42	-3	42	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_1	15.2525407719501	716	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGGACTTTAGTAGAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75793367	75788322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75788929_75789085_75789179_75790100_75790314_75790521_75790702_75791077_75791143_75793224
tx.644	chr1	+	818	5	ISM	ENSMUSG00000056211.14	ENSMUST00000188381.7	1130	9	-16	10047	4	-9061	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	211	junction_3	31.1769145362398	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGTGTCTAGACTACCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128031041	128096819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_128031221_128079480_128079690_128080925_128081137_128095629_128095745_128096715
tx.6440	chr15	+	2409	2	FSM	ENSMUSG00000050846.10	ENSMUST00000037260.8	2486	2	79	-2	79	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGTGTAATTGGCATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75812879	75821251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_75813009_75818971
tx.6441	chr15	+	1699	4	FSM	ENSMUSG00000034429.16	ENSMUST00000109967.10	1703	4	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	16.779617264871	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGAAGCCTGTTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75841031	75847595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_75841254_75844971_75845058_75845390_75845505_75846318
tx.6442	chr15	+	1651	4	FSM	ENSMUSG00000034429.16	ENSMUST00000109966.8	1803	4	149	3	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_3	7.71722460186015	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGAGAAGCCTGTTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75841120	75847595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_75841254_75844930_75845058_75845390_75845505_75846318
tx.6443	chr15	-	1185	2	NNC	ENSMUSG00000098176.3	novel	2458	2	NA	NA	487	-790	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCTCTGACACTTGCCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75853804	75852510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_75853537_75853645
tx.6444	chr15	-	733	5	ISM	ENSMUSG00000022568.18	ENSMUST00000136390.8	3071	22	14153	5	71	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	414	junction_4	34.6770817687994	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTCTCTTGTCCTTTTGTC	9371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75920415	75919011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_75919387_75919469_75919522_75919963_75920002_75920070_75920214_75920290
tx.6445	chr15	-	454	2	FSM	ENSMUSG00000022568.18	ENSMUST00000229940.2	439	2	121	-136	121	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	498	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTTCTCTTGTCCTTTTGTC	9119	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75919548	75919011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75919387_75919469
tx.6446	chr15	-	1874	12	FSM	ENSMUSG00000002524.18	ENSMUST00000100527.13	1881	12	1	6	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	225	junction_7	445.848082194703	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGAAGTCCCTGTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75952761	75942036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75942477_75942597_75942834_75943030_75943167_75943314_75943506_75943588_75943803_75944081_75944175_75944255_75944418_75946455_75946507_75947390_75947481_75947585_75947682_75949449_75949552_75952698
tx.6447	chr15	-	1820	11	NNC	ENSMUSG00000002524.18	novel	1821	11	NA	NA	0	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	121	junction_10	401.11844884024	182	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGAAGTCCCTGTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75952761	75942036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_75942477_75942597_75942834_75943030_75943167_75943314_75943506_75943588_75943803_75944081_75944175_75944255_75944418_75947390_75947481_75947585_75947682_75949449_75949549_75952698
tx.6448	chr15	-	1823	11	FSM	ENSMUSG00000002524.18	ENSMUST00000002599.11	1821	11	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1143	junction_7	140.604729650179	1228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGAAGTCCCTGTGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75952761	75942036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_75942477_75942597_75942834_75943030_75943167_75943314_75943506_75943588_75943803_75944081_75944175_75944255_75944418_75947390_75947481_75947585_75947682_75949449_75949552_75952698
tx.6449	chr15	+	1741	7	FSM	ENSMUSG00000022564.8	ENSMUST00000023225.8	1725	7	-13	-3	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_1	10.0567832276971	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGCTTCTCCTTGTCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76130961	76134107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76131101_76132050_76132378_76132458_76132569_76132648_76132850_76132971_76133101_76133177_76133322_76133416
tx.645	chr1	+	2191	13	NNC	ENSMUSG00000026353.10	novel	4113	13	NA	NA	139	572	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_6	101.309858848979	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGAATGATCTTATTTTTG	233	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128172037	128205329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_128172290_128179939_128180043_128183169_128183199_128183855_128183975_128186568_128186741_128187180_128187275_128188567_128188626_128190529_128190695_128194026_128194152_128197605_128197709_128200557_128200690_128202538_128202742_128204693
tx.6450	chr15	-	1057	7	ISM	ENSMUSG00000022562.16	ENSMUST00000171340.9	4081	27	8790	2	-271	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	15	junction_6	6.45497224367903	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTATTGGGTTATTGGGC	7796	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76182511	76180802	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_76180982_76181120_76181219_76181316_76181478_76181558_76181717_76181818_76181969_76182105_76182241_76182335
tx.6451	chr15	+	836	3	FSM	ENSMUSG00000034259.9	ENSMUST00000230512.2	1728	3	-18	910	-18	668	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	318	2782	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCTTACTGTACAGCACTT	929	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76211646	76213963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76211868_76213229_76213437_76213555
tx.6452	chr15	+	1185	7	FSM	ENSMUSG00000022551.9	ENSMUST00000023210.8	1520	7	10	325	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	4240	junction_5	258.32822575596	11299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATTTTAGCTGGTCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76227732	76230135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76227893_76228501_76228699_76228781_76228909_76229011_76229170_76229252_76229414_76229676_76229778_76229854
tx.6453	chr15	+	1201	7	NIC	ENSMUSG00000022551.9	novel	1520	7	NA	NA	6	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	92	junction_1	1700.84897102071	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATTTTAGCTGGTCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76227738	76230135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_76227893_76228479_76228699_76228781_76228909_76229011_76229170_76229252_76229414_76229676_76229778_76229854
tx.6454	chr15	-	1367	9	FSM	ENSMUSG00000022552.17	ENSMUST00000023211.16	1734	9	367	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_7	14.1862609591111	274	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGTGTTCTGTTCTTGGA	18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	76234944	76231239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76231386_76231458_76231588_76231681_76231795_76231863_76232018_76232095_76232205_76232285_76232428_76232500_76232636_76234254_76234430_76234680
tx.6455	chr15	+	1680	8	FSM	ENSMUSG00000022553.17	ENSMUST00000023212.15	1686	8	6	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	425	junction_1	86.5157765487702	317	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGGAACCTGGGAGTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76235511	76238573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76235860_76236619_76236753_76236845_76236975_76237046_76237213_76237337_76237460_76237540_76237661_76237785_76237921_76238046
tx.6456	chr15	+	1252	5	ISM	ENSMUSG00000022554.8	ENSMUST00000023213.8	1993	6	808	15	224	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_1	11.9268604418766	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGACATCCAG	4352	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76253905	76255622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_76253953_76254055_76254155_76254361_76254454_76254531_76254655_76254731
tx.6457	chr15	-	2483	16	FSM	ENSMUSG00000022557.12	ENSMUST00000023217.11	2491	16	5	3	5	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	559	junction_11	43.9047453775405	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGACCCTGGCTGGCAGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76361472	76337191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76337579_76337662_76337771_76337843_76337929_76338016_76338306_76338377_76338559_76338651_76338785_76338873_76338944_76339017_76339099_76339169_76339332_76339407_76339621_76339695_76339798_76339881_76340000_76340071_76340227_76350971_76351053_76358947_76359122_76361328
tx.6458	chr15	+	2116	13	FSM	ENSMUSG00000022556.12	ENSMUST00000227478.2	2084	13	-30	-2	-7	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	205	junction_11	40.4687808343941	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACATACATACATATATA	7114	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76361614	76385174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76361918_76380169_76380279_76380652_76380790_76381035_76381161_76381818_76381895_76381967_76382030_76382151_76382249_76382353_76382491_76382621_76382892_76384147_76384254_76384330_76384397_76384466_76384537_76384616
tx.6459	chr15	+	681	2	FSM	ENSMUSG00000022556.12	ENSMUST00000228781.2	1427	2	738	8	244	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	303	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATACATACATACATACATA	3892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76384409	76385170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76384537_76384616
tx.646	chr1	+	2204	12	NNC	ENSMUSG00000026353.10	novel	4113	13	NA	NA	129	572	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	114.066386354034	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGAATGATCTTATTTTTG	223	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128172027	128205329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_128172290_128179939_128180078_128183855_128183975_128186568_128186741_128187180_128187275_128188570_128188626_128190529_128190695_128194026_128194152_128197605_128197709_128200557_128200690_128202538_128202742_128204693
tx.6460	chr15	-	1794	17	FSM	ENSMUSG00000022555.13	ENSMUST00000023214.11	1888	17	94	0	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_16	22.0368122411115	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCAGGGGTTGTGGAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76396057	76386214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76386589_76386691_76386755_76386843_76386932_76387018_76387085_76387158_76387272_76387353_76387399_76387473_76387516_76387589_76387629_76387717_76387822_76387905_76387981_76388064_76388173_76388314_76388421_76388548_76388602_76388685_76388772_76388865_76388907_76390765_76390854_76395754
tx.6461	chr15	-	407	2	ISM	ENSMUSG00000022559.9	ENSMUST00000023219.9	1710	9	2345	2	1596	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_1	0	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTATTTATTTATTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76420590	76419922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_76420164_76420424
tx.6462	chr15	-	1728	9	FSM	ENSMUSG00000022559.9	ENSMUST00000023219.9	1710	9	-20	2	-9	-2	multi-exon	TRUE	canonical	3	128	junction_8	22.8988946239769	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTATTTATTTATTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76422955	76419922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76420164_76420424_76420672_76420772_76421005_76421092_76421207_76421289_76421398_76421488_76421621_76421922_76421987_76422116_76422276_76422524
tx.6463	chr15	+	2191	4	ISM	ENSMUSG00000022560.10	ENSMUST00000023220.10	5289	5	-2	3218	-2	-740	intron_retention	FALSE	canonical	3	120	junction_1	1.69967317119759	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTTGTTAATCCCATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76423029	76425590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_76423396_76423582_76423803_76423893_76424780_76424871
tx.6464	chr15	+	2281	3	FSM	ENSMUSG00000022560.10	ENSMUST00000230994.2	2889	3	-132	740	0	-740	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_1	0.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTTGTTAATCCCATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76423031	76425590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76423396_76423582_76423803_76423893
tx.6465	chr15	+	2071	5	FSM	ENSMUSG00000022560.10	ENSMUST00000023220.10	5289	5	0	3218	0	-740	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_4	5.2618912949623	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGGTTGTTAATCCCATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76423031	76425590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76423396_76423582_76423803_76423893_76424780_76424871_76424996_76425113
tx.6466	chr15	+	1999	15	FSM	ENSMUSG00000022550.19	ENSMUST00000162503.8	2040	15	41	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_10	17.9268638913668	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTTTTCTTTGTGTTTTAT	3143	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76460598	76480016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76460695_76471957_76472062_76473268_76473419_76477433_76477510_76477630_76477832_76477918_76478060_76478137_76478252_76478352_76478485_76478563_76478648_76478728_76478811_76478873_76478953_76479046_76479139_76479213_76479467_76479536_76479654_76479738
tx.6467	chr15	+	375	2	ISM	ENSMUSG00000022550.19	ENSMUST00000160094.2	598	3	393	-100	393	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGTTTTCTTTGTGTTTTAT	2124	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76479556	76480016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_76479654_76479738
tx.6468	chr15	-	869	7	ISM	ENSMUSG00000034022.9	ENSMUST00000229269.2	1433	12	974	3	-420	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	570	junction_6	18.0616229121921	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGAGTGTGTGGTCATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76481318	76480005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_76480133_76480208_76480348_76480419_76480550_76480615_76480772_76480850_76480899_76480976_76481044_76481116
tx.6469	chr15	-	425	3	ISM	ENSMUSG00000034022.9	ENSMUST00000229287.2	439	4	318	-3	318	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	602	junction_1	9	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGAGTGTGTGGTCATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76480580	76480007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_76480133_76480208_76480348_76480419
tx.647	chr1	+	2201	13	FSM	ENSMUSG00000026353.10	ENSMUST00000027592.6	4113	13	126	1786	126	572	multi-exon	FALSE	canonical	3	326	junction_2	38.8918550456119	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGAATGATCTTATTTTTG	220	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128172024	128205329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_128172290_128179939_128180043_128183169_128183199_128183855_128183975_128186568_128186741_128187180_128187275_128188570_128188626_128190529_128190695_128194026_128194152_128197605_128197709_128200557_128200690_128202538_128202742_128204693
tx.6470	chr15	-	533	4	ISM	ENSMUSG00000034022.9	ENSMUST00000229269.2	1433	12	1538	5	144	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	602	junction_1	7.58653778449403	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGAGTGTGTGGTCATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76480754	76480007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_76480133_76480208_76480348_76480419_76480550_76480615
tx.6471	chr15	-	1001	10	FSM	ENSMUSG00000115987.2	ENSMUST00000229019.2	941	10	-59	-1	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_8	311.796586112021	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGTGGGCAGCTATACTG	9612	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76510265	76506307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76506551_76506670_76506763_76506854_76506909_76507370_76507473_76507588_76507695_76508285_76508376_76508647_76508686_76508791_76508919_76509333_76509406_76510188
tx.6472	chr15	-	880	9	NNC	ENSMUSG00000115987.2	novel	911	10	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	341.849382038347	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTGTGGGCAGCTATACT	9611	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76510266	76506308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_76506551_76506670_76506763_76506854_76506909_76507370_76507473_76507588_76507695_76508285_76508376_76508647_76508686_76509327_76509406_76510188
tx.6473	chr15	-	906	10	FSM	ENSMUSG00000115987.2	ENSMUST00000078803.5	911	10	5	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	892	junction_9	85.8889607589177	1874	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCTGTGGGCAGCTATACT	9608	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76510269	76506308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76506551_76506670_76506763_76506854_76506909_76507370_76507473_76507588_76507695_76508285_76508376_76508647_76508686_76508791_76508821_76509333_76509406_76510188
tx.6474	chr15	-	1388	4	FSM	ENSMUSG00000053929.18	ENSMUST00000176274.2	1854	4	461	5	257	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_1	196.445638508186	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTATCCTGTCTGTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76540659	76531131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76531969_76532298_76532511_76533140_76533380_76540559
tx.6475	chr15	-	1245	2	FSM	ENSMUSG00000053929.18	ENSMUST00000231152.2	1271	2	23	3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_1	0	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGGAATTTGTTTATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76543933	76542335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76543066_76543418
tx.6476	chr15	-	1671	3	FSM	ENSMUSG00000033837.6	ENSMUST00000037824.6	1365	3	90	-396	-56	396	multi-exon	FALSE	canonical	3	304	junction_2	19.5	462	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCAAGTCTGGTATTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76554058	76552028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76553341_76553428_76553534_76553804
tx.6477	chr15	+	2801	12	FSM	ENSMUSG00000033819.17	ENSMUST00000135388.3	2827	12	25	1	25	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	37	junction_1	32.5360575565374	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGCCTTCCCATGTGTCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76555871	76579118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76555963_76573527_76573695_76574371_76575353_76575896_76575968_76576054_76576201_76577036_76577141_76577213_76577339_76577426_76577553_76577638_76577715_76577794_76577925_76578067_76578231_76578497
tx.6478	chr15	+	2631	11	FSM	ENSMUSG00000033819.17	ENSMUST00000037551.15	2692	11	61	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_1	16.1864140562386	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTCCCATGTGTCTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76555875	76579119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76555963_76574371_76575353_76575896_76575968_76576054_76576201_76577036_76577141_76577213_76577339_76577426_76577553_76577638_76577715_76577794_76577925_76578067_76578231_76578497
tx.6479	chr15	+	1040	6	FSM	ENSMUSG00000022546.6	ENSMUST00000229140.2	982	6	-31	-27	-31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_4	4.40908153700972	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGACTCACCTGACTGG	5958	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76582379	76583875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76582583_76582655_76582793_76582914_76583090_76583195_76583352_76583435_76583549_76583619
tx.648	chr1	-	750	3	ISM	ENSMUSG00000026355.12	ENSMUST00000027601.11	2910	17	24754	0	8553	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3600	junction_2	88	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGTTGGATTCATTTC	4410	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128262647	128259326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_128259789_128261253_128261394_128262499
tx.6480	chr15	+	1584	5	FSM	ENSMUSG00000019080.9	ENSMUST00000019224.9	2246	5	-3	665	-3	84	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	6.01560470775798	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGCAGTTTGGATCTTCT	9240	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76585661	76587774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76586551_76586843_76586992_76587078_76587204_76587273_76587384_76587462
tx.6481	chr15	+	2238	4	FSM	ENSMUSG00000033728.15	ENSMUST00000127208.8	4849	4	3	2608	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	34.1792659696229	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTAGTGTTGCTTTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76594840	76599291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76595128_76597066_76597421_76597600_76598186_76598279
tx.6482	chr15	+	2262	5	NIC	ENSMUSG00000033728.15	novel	2286	6	NA	NA	-3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	50.5933543066676	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCTAGTGTTGCTTTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76594845	76599291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_76595037_76595163_76595284_76597066_76597421_76597600_76598186_76598279
tx.6483	chr15	-	533	3	NNC	ENSMUSG00000033697.17	novel	542	3	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	4	junction_2	9	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTCAGCCCATGTTTTAAAT	8372	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76702167	76642240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_76642501_76649684_76649852_76702061
tx.6484	chr15	-	1403	4	FSM	ENSMUSG00000022526.9	ENSMUST00000080406.7	4036	4	-9	2642	-9	-1241	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	4.24264068711928	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGACCTAAGTCGGCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76755644	76738450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76738815_76754006_76754121_76754481_76754615_76754852
tx.6485	chr15	+	844	6	FSM	ENSMUSG00000003970.10	ENSMUST00000004072.10	851	6	7	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5295	junction_1	2369.37927736359	126302	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGCGTGTGTGAGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76788284	76790514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76788310_76788502_76788651_76788738_76788881_76789017_76789237_76790055_76790172_76790320
tx.6486	chr15	+	822	5	FSM	ENSMUSG00000003970.10	ENSMUST00000229183.2	1020	5	198	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10804	junction_2	302.309754225695	46438	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGCGTGTGTGAGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76788499	76790514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_76788651_76788738_76788881_76789017_76789237_76790055_76790172_76790320
tx.6487	chr15	+	308	2	ISM	ENSMUSG00000003970.10	ENSMUST00000229183.2	1020	5	1756	0	1555	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11497	junction_1	0	902	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGGCGTGTGTGAGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76790057	76790514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_76790172_76790320
tx.6488	chr15	-	2188	5	FSM	ENSMUSG00000054967.8	ENSMUST00000229055.2	2212	5	23	1	-13	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_4	6.04152298679729	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAGATGGCTCTGAGTTTG	8508	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76809625	76794571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76796376_76801489_76801604_76801834_76801962_76802168_76802262_76809575
tx.6489	chr15	-	1736	13	FSM	ENSMUSG00000033565.19	ENSMUST00000228087.2	1694	13	-46	4	12	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	23	junction_12	49.6258221314491	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGTGCATTTCCACGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77038000	76968003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_76968407_76969777_76969851_76970266_76970356_76978650_76978691_76982139_76982273_76983439_76983533_76983638_76983693_76987078_76987140_76989776_76989870_76997804_76997859_77001120_77001268_77016916_77017142_77037729
tx.649	chr1	-	2929	17	FSM	ENSMUSG00000026355.12	ENSMUST00000027601.11	2910	17	-19	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2842	junction_6	235.478734443261	1433	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGTTGGATTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128287420	128259326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_128259789_128261253_128261394_128262499_128262656_128263466_128263603_128265852_128266015_128267086_128267216_128269021_128269178_128271147_128271256_128272033_128272176_128273608_128273751_128276105_128276257_128276661_128276808_128277040_128277207_128279169_128279420_128281196_128281308_128283249_128283397_128287195
tx.6491	chr15	+	735	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116284.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACCTTCTAGCCAAAATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77255028	77258062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_77255477_77257775
tx.6496	chr15	-	1286	4	FSM	ENSMUSG00000005354.17	ENSMUST00000005487.12	1298	4	12	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1083	junction_2	92.120693778446	831	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTGCTGTTCTGTGGGC	2727	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77813194	77799246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_77800058_77808742_77808867_77811891_77812155_77813106
tx.6497	chr15	-	407	2	ISM	ENSMUSG00000016554.10	ENSMUST00000100484.6	1899	15	11017	3	685	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1835	junction_1	0	384	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTCGTCCTGTGCTCCC	5585	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77843996	77843200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_77843323_77843711
tx.6498	chr15	-	510	3	ISM	ENSMUSG00000016554.10	ENSMUST00000100484.6	1899	15	10756	3	424	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1835	junction_1	3.5	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTCGTCCTGTGCTCCC	5324	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77844257	77843200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_77843323_77843711_77843996_77844153
tx.6499	chr15	-	607	4	ISM	ENSMUSG00000016554.10	ENSMUST00000100484.6	1899	15	9142	3	-1190	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1835	junction_1	2.86744175568088	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTCGTCCTGTGCTCCC	3710	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77845871	77843200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_77843323_77843711_77843996_77844153_77844297_77845813
tx.65	chr1	-	462	4	NNC	ENSMUSG00000079658.10	novel	534	4	NA	NA	-7	-53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	126	junction_3	1156.21518566206	431	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGTAGTTCAGTTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16727115	16713467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_16713703_16715909_16716054_16718178_16718232_16727085
tx.650	chr1	-	2156	16	FSM	ENSMUSG00000026356.16	ENSMUST00000027602.15	2175	16	19	0	19	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1712	junction_8	135.919976456737	4197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATAGTGTTGTGTGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128345077	128291443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_128292063_128294434_128294507_128294657_128294770_128296101_128296183_128297229_128297273_128299876_128300024_128301673_128301822_128303914_128304050_128306502_128306615_128314853_128314914_128316855_128316937_128319007_128319111_128333102_128333206_128341396_128341490_128343090_128343149_128344888
tx.6500	chr15	-	1889	15	FSM	ENSMUSG00000016554.10	ENSMUST00000100484.6	1899	15	7	3	7	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1461	junction_9	114.082520258677	581	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTTCGTCCTGTGCTCCC	2752	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77855006	77843200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_77843323_77843711_77843996_77844153_77844297_77845813_77845944_77846045_77846132_77846639_77846771_77847377_77847526_77848219_77848353_77849102_77849216_77850337_77850411_77850881_77850968_77851502_77851640_77852375_77852422_77852656_77852790_77854882
tx.6501	chr15	+	876	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000019146.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGTTATTTATTGCATG	3837	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77885825	77921503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_77885969_77896575_77896681_77920875
tx.6502	chr15	-	1004	7	NNC	ENSMUSG00000016637.8	novel	1013	7	NA	NA	13	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_3	103.316262030718	255	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACGGCTTCTGTTCTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78058294	78043662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_78043909_78048389_78048500_78049346_78049465_78050169_78050234_78051269_78051330_78052112_78052193_78057968
tx.6503	chr15	-	1122	2	FSM	ENSMUSG00000044986.11	ENSMUST00000058659.9	1144	2	22	0	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	371	junction_1	0	597	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTCTGCCTCCTTGCCC	8106	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78290085	78283755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_78284231_78289438
tx.6504	chr15	-	1138	2	NNC	ENSMUSG00000044986.11	novel	1144	2	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTCTGCCTCCTTGCCC	8084	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78290107	78283755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_78284225_78289438
tx.6505	chr15	+	1261	2	FSM	ENSMUSG00000071711.13	ENSMUST00000229739.2	1311	2	57	-7	57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGTGGTTGTGAGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78294238	78298213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_78294865_78297578
tx.6508	chr15	-	369	2	FSM	ENSMUSG00000116097.2	ENSMUST00000229702.2	394	2	25	0	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCGCTGTGGTCGGAGTAT	2878	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78465791	78458610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_78458873_78465684
tx.6509	chr15	-	1892	8	FSM	ENSMUSG00000018169.13	ENSMUST00000018313.6	1865	8	-27	0	-27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_5	11.4749060731561	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGTCCAGCTTCCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78657702	78640081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_78640845_78641496_78641583_78643392_78643559_78645005_78645092_78648514_78648669_78651017_78651121_78651341_78651391_78657217
tx.651	chr1	-	799	3	Intergenic	novelGene_57	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTTCTCTTTCTCCTCCA	4694	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	128354960	128347503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_128347901_128348078_128348367_128354846
tx.6510	chr15	-	1333	6	ISM	ENSMUSG00000018169.13	ENSMUST00000018313.6	1865	8	6580	0	269	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_5	9.76933979345585	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGTCCAGCTTCCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78651095	78640081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_78640845_78641496_78641583_78643392_78643559_78645005_78645092_78648514_78648669_78651017
tx.6511	chr15	+	776	7	ISM	ENSMUSG00000033128.10	ENSMUST00000230192.2	2665	17	-3	8497	-3	1875	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	379	junction_6	69.8866145187252	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTCAGAGGCTGATATTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78761747	78770284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_78761818_78765237_78765323_78766327_78766404_78767467_78767567_78768284_78768409_78769455_78769557_78770063
tx.6512	chr15	+	2676	17	FSM	ENSMUSG00000033128.10	ENSMUST00000041587.8	3034	17	358	0	-3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	379	junction_6	54.6157028701453	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGCTGCTCTTGTCACCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78761747	78778785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_78761818_78765237_78765323_78766327_78766404_78767467_78767567_78768284_78768409_78769455_78769557_78770063_78770145_78772310_78772449_78772617_78772700_78773202_78773311_78773915_78774069_78775636_78775702_78776113_78776287_78776652_78776841_78777366_78777537_78777738_78777850_78777933
tx.6513	chr15	-	708	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116069.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCTAGAGAGGTGTCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78783903	78782390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_78782845_78783649
tx.6514	chr15	+	2513	18	FSM	ENSMUSG00000022436.17	ENSMUST00000001226.11	2375	18	-135	-3	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	356	junction_17	50.4832700370451	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAGTAACTGGCCAAACGAAA	4398	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78783967	78796250	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_78784162_78785345_78785389_78785598_78785704_78786754_78786832_78787053_78787166_78787258_78787336_78787752_78787898_78788469_78788539_78788663_78788755_78789229_78789376_78789970_78790083_78790455_78790538_78790622_78790704_78791413_78791531_78792160_78792259_78792552_78792713_78794207_78794300_78795538
tx.6515	chr15	-	499	2	Intergenic	novelGene_568	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTCTGAGTCACATCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78806091	78804248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_78804621_78805964
tx.6516	chr15	+	530	4	FSM	ENSMUSG00000068220.7	ENSMUST00000089377.6	800	4	1	269	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1912	junction_2	63.4367576584918	3865	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAGCCCTTTCATGGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78810925	78814396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_78811005_78812169_78812250_78813832_78814005_78814197
tx.6517	chr15	+	942	6	FSM	ENSMUSG00000033099.11	ENSMUST00000138880.9	3721	6	6	2773	6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	420	junction_1	39.9929993873928	573	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCAGTCTGTGCTTGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78819138	78825065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_78819276_78820678_78820785_78821333_78821383_78822007_78822151_78824265_78824367_78824659
tx.6518	chr15	+	836	2	ISM	ENSMUSG00000033088.20	ENSMUST00000229943.2	762	5	-9	9496	-9	-4378	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCAGTGGTTCTCTTTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78832109	78833077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_78832249_78832380
tx.6519	chr15	+	2550	14	FSM	ENSMUSG00000033088.20	ENSMUST00000109687.9	2570	14	21	-1	-15	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_8	26.3687999246734	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGCTCTGTGGATGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78867261	78890065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_78867409_78872091_78872149_78875016_78875086_78875184_78875275_78875528_78875639_78877103_78877633_78878241_78878353_78883996_78884145_78885720_78885824_78886247_78886408_78886484_78886599_78887905_78887993_78888644_78888806_78889401
tx.652	chr1	-	2769	9	NNC	ENSMUSG00000026399.13	novel	2533	10	NA	NA	-25	27	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.0178514522438	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTTAAATGTGAATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390213	130366736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_130368117_130376038_130376146_130377153_130377301_130380120_130380313_130384557_130384644_130385823_130385924_130387318_130387511_130389558_130389745_130389834
tx.6520	chr15	+	1670	8	FSM	ENSMUSG00000033088.20	ENSMUST00000130663.10	1660	8	-10	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_7	63.6226118191786	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCATACAGAAATGGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78867266	78879059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_78867409_78872091_78872149_78875016_78875086_78875184_78875275_78875528_78875639_78877103_78877633_78878241_78878353_78878497
tx.6521	chr15	+	1474	9	FSM	ENSMUSG00000006378.16	ENSMUST00000006544.9	2370	9	5	891	5	-891	multi-exon	FALSE	canonical	3	1189	junction_6	75.224663508719	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTCAGTCTGCTTTATTC	637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78915078	78921662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_78915321_78918130_78918262_78919159_78919262_78919456_78919604_78919976_78920132_78920219_78920303_78920466_78920639_78920952_78921075_78921342
tx.6522	chr15	+	1466	9	NNC	ENSMUSG00000006378.16	novel	2370	9	NA	NA	5	-891	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	433.666634640019	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACTTCAGTCTGCTTTATTC	637	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78915078	78921662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_78915321_78918130_78918262_78919159_78919262_78919456_78919604_78919984_78920132_78920219_78920303_78920466_78920639_78920952_78921075_78921342
tx.6523	chr15	+	1910	13	FSM	ENSMUSG00000033047.6	ENSMUST00000040518.6	1942	13	27	5	27	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1651	junction_4	129.272537257102	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGTTTGTGGTCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78959405	78978600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_78959493_78959970_78960020_78961030_78961242_78962273_78962354_78963192_78963255_78965786_78965857_78966053_78966128_78968311_78968484_78969756_78969912_78970633_78970805_78973663_78974162_78977536_78977618_78978400
tx.6525	chr15	+	550	5	FSM	ENSMUSG00000033020.8	ENSMUST00000230271.2	885	5	332	3	-10	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2023	junction_4	39.9335385359224	2781	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCCCGTTACCTGCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79025540	79035971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_79025635_79028793_79028864_79030252_79030384_79035535_79035608_79035788
tx.6526	chr15	+	379	2	NNC	ENSMUSG00000075555.13	novel	905	4	NA	NA	-86	-5850	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTGTTTTCCATTCGAAT	3806	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79093424	79094518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_79093676_79094390
tx.6527	chr15	+	351	2	ISM	ENSMUSG00000075555.13	ENSMUST00000148028.2	905	4	-120	7065	-120	-5850	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAGTGTTTTCCATTCGAAT	3772	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79093390	79094518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_79093614_79094390
tx.6528	chr15	+	1968	13	FSM	ENSMUSG00000068206.14	ENSMUST00000018295.14	1977	13	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	173	junction_9	26.1878894826512	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATGGGCTCCTTGCAATG	4392	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79113590	79133666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_79113771_79113949_79114054_79114743_79114856_79123783_79123913_79125426_79125494_79127167_79127258_79129054_79129109_79129489_79129553_79130177_79130312_79130607_79130701_79131464_79131516_79132351_79132497_79132920
tx.6529	chr15	-	1203	6	ISM	ENSMUSG00000018126.16	ENSMUST00000169462.8	2276	13	23890	-6	-255	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.489897948556636	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGGAGCCTGATTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79145752	79142389	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_79142853_79143003_79143048_79143387_79143596_79143851_79143975_79145273_79145488_79145601
tx.653	chr1	-	2683	9	NIC	ENSMUSG00000026399.13	novel	2533	10	NA	NA	-57	-5	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	9	junction_2	25.6855990780826	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATACACTGTTGTCTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390245	130366768	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_130368117_130375355_130375377_130377153_130377301_130380120_130380313_130384557_130384644_130385823_130385924_130387318_130387511_130389558_130389745_130389834
tx.6531	chr15	-	3338	9	FSM	ENSMUSG00000009035.16	ENSMUST00000074991.10	3627	9	289	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	271	junction_8	29.0298876160415	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTGCCTGCCAGCGAGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79287480	79244883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79247086_79249484_79249680_79249986_79250157_79250786_79250879_79253869_79253946_79254097_79254189_79261246_79261413_79262663_79262914_79287384
tx.6532	chr15	-	2656	10	ISM	ENSMUSG00000022433.22	ENSMUST00000117786.9	2695	11	3113	-2	131	2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	402	junction_1	63.5343787563128	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TACCCTCTGTCTGCCTCTTT	5144	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79323087	79302053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_79303388_79304104_79304169_79304783_79304924_79305017_79305211_79309039_79309189_79309699_79309871_79310458_79310688_79313911_79314061_79314254_79314366_79322971
tx.6534	chr15	-	1452	11	FSM	ENSMUSG00000022433.22	ENSMUST00000120859.9	1392	11	8	-68	5	51	multi-exon	FALSE	canonical	3	332	junction_10	81.5738315883225	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAACAAACAAACCAC	8161	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79326195	79303297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79303388_79304104_79304169_79304783_79304924_79305017_79305211_79309039_79309189_79309699_79309871_79310458_79310688_79313911_79314061_79314254_79314366_79322971_79323060_79326127
tx.6535	chr15	-	1412	11	NIC	ENSMUSG00000022433.22	novel	1392	11	NA	NA	17	51	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	24	junction_10	159.216487839671	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGAAAAACAAACAAACCAC	8036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79326320	79303297	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_79303388_79304104_79304169_79304783_79304924_79305017_79305211_79309039_79309189_79309699_79309871_79310458_79310688_79313911_79314061_79314254_79314366_79322971_79323060_79326292
tx.6536	chr15	-	2690	11	NIC	ENSMUSG00000022433.22	novel	1392	11	NA	NA	9	-4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	37	junction_10	155.61375260561	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATAGATACCCTCTGTCTGC	8438	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79339758	79302059	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_79303388_79304104_79304169_79304783_79304924_79305017_79305211_79309039_79309189_79309699_79309871_79310458_79310688_79313911_79314061_79314254_79314366_79322971_79323060_79339690
tx.6537	chr15	+	1397	5	FSM	ENSMUSG00000010830.9	ENSMUST00000010974.9	1411	5	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_3	14.7986485869487	154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGTCAAGTATTTATTTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79400625	79411940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_79400842_79407011_79407113_79409004_79409164_79409867_79410121_79411272
tx.6538	chr15	-	1348	9	ISM	ENSMUSG00000055065.8	ENSMUST00000229431.2	2821	11	-10	2839	-10	-2839	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	55	junction_8	11.5427195668958	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTATAATATTTGTGGAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79430770	79421700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_79421747_79422759_79422933_79423018_79423180_79423519_79423662_79424613_79424680_79425234_79425369_79426687_79426788_79427906_79428058_79430395
tx.6539	chr15	-	1928	12	FSM	ENSMUSG00000022429.12	ENSMUST00000229408.2	1931	12	-11	14	-1	-14	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_5	21.834085113127	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAATCTAGTTTTCAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79489311	79445825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79446784_79452839_79452957_79468519_79468581_79469062_79469178_79469298_79469373_79475805_79475848_79477335_79477389_79480444_79480528_79484246_79484394_79485717_79485763_79486601_79486686_79489162
tx.654	chr1	-	2512	9	NNC	ENSMUSG00000026399.13	novel	2533	10	NA	NA	15	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	25.1094479230428	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGTCTCCTGTAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390453	130366761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_130368117_130376038_130376146_130377153_130377301_130380120_130380313_130384557_130384644_130385823_130385924_130387318_130387511_130389558_130389745_130390306
tx.6540	chr15	-	2113	14	FSM	ENSMUSG00000022429.12	ENSMUST00000023065.8	2219	14	0	106	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_6	20.9451241307391	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAGACTATTTAAAAATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79489309	79445803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79446784_79452839_79452957_79468519_79468581_79469062_79469178_79469298_79469373_79469869_79469962_79472951_79473025_79475805_79475848_79477335_79477389_79480444_79480528_79484246_79484394_79485717_79485763_79486601_79486686_79489162
tx.6541	chr15	-	1948	11	NIC	ENSMUSG00000022429.12	novel	2219	14	NA	NA	3	14	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	4	junction_6	24.8927700346908	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATTTAAAAATTAAAATACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79489306	79445797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_79446784_79452839_79452957_79468519_79468581_79469062_79469178_79469298_79469373_79469869_79469962_79480444_79480528_79484246_79484394_79485717_79485763_79486601_79486686_79489162
tx.6542	chr15	-	552	5	ISM	ENSMUSG00000022429.12	ENSMUST00000229408.2	1931	12	-9	34587	0	-33815	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_1	18.3507493035026	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTCTTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79489309	79480398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_79480528_79484246_79484394_79485717_79485763_79486601_79486686_79489162
tx.6543	chr15	-	819	4	ISM	ENSMUSG00000022429.12	ENSMUST00000229408.2	1931	12	-13	38043	-3	-37271	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_3	2.82842712474619	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTACCTTTATACTACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79489313	79483854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_79484394_79485717_79485763_79486601_79486686_79489162
tx.6544	chr15	+	1132	5	FSM	ENSMUSG00000022428.9	ENSMUST00000023064.9	1147	5	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_3	15.1224171348366	289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCTGTGTAGCAAAAATAG	9574	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79543414	79551861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_79543495_79545571_79545726_79549846_79549953_79550031_79550151_79551188
tx.6545	chr15	+	1054	4	ISM	ENSMUSG00000022428.9	ENSMUST00000023064.9	1147	5	2170	0	0	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	177	junction_2	16.5730705262081	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCTGTGTAGCAAAAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79545569	79551861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_79545726_79549846_79549953_79550031_79550151_79551188
tx.6546	chr15	+	781	2	ISM	ENSMUSG00000022428.9	ENSMUST00000023064.9	1147	5	6643	0	4473	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_1	0	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTCTGTGTAGCAAAAATAG	3159	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79550042	79551861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_79550151_79551188
tx.6547	chr15	+	1030	4	FSM	ENSMUSG00000022427.5	ENSMUST00000023062.5	1569	4	6	533	6	187	multi-exon	FALSE	canonical	3	903	junction_3	55.9305124437656	964	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTATTGCTGTGTTTGTG	8184	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79555067	79557068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_79555210_79555373_79555493_79556097_79556216_79556417
tx.6548	chr15	-	1367	3	ISM	ENSMUSG00000022420.17	ENSMUST00000023055.8	1472	4	9442	0	-144	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	121	junction_1	19	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGTCTGTGGTGTATTGA	9685	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79649226	79645653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_79646727_79647710_79647795_79649016
tx.6549	chr15	-	1434	4	ISM	ENSMUSG00000022420.17	ENSMUST00000162713.9	1357	7	11115	-684	-976	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_3	39.4743235815666	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGTCTGTGGTGTATTGA	8853	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79650058	79645653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_79646727_79647710_79647795_79649016_79649223_79649987
tx.655	chr1	-	2756	10	NIC	ENSMUSG00000026399.13	novel	2533	10	NA	NA	-44	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_9	18.9912260443255	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTTGTCTCCTGTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390232	130366763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_130368117_130375355_130375377_130376064_130376146_130377153_130377301_130380120_130380313_130384557_130384644_130385823_130385924_130387318_130387511_130389558_130389745_130389834
tx.6550	chr15	-	1520	5	ISM	ENSMUSG00000022420.17	ENSMUST00000162713.9	1357	7	2524	-684	19	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_3	39.8591269347436	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGTCTGTGGTGTATTGA	262	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79658649	79645653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_79646727_79647710_79647795_79649016_79649223_79649987_79650055_79658559
tx.6551	chr15	-	1464	4	FSM	ENSMUSG00000022420.17	ENSMUST00000023055.8	1472	4	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_3	38.6091526281874	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTAGTCTGTGGTGTATTGA	251	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79658660	79645653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79646727_79647710_79647795_79649016_79649223_79658559
tx.6552	chr15	-	3183	5	FSM	ENSMUSG00000089715.13	ENSMUST00000109627.8	5806	5	430	2193	16	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	17.0367250374008	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAGAAAAAATAGAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79718459	79710289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79713180_79717712_79717780_79717902_79717969_79718115_79718160_79718343
tx.6553	chr15	-	566	5	NNC	ENSMUSG00000089715.13	novel	576	4	NA	NA	4	295	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	66.3739406695128	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACCAGCTTTCGGGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79718522	79717150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_79717361_79717712_79717780_79717902_79717969_79718115_79718160_79718343
tx.6554	chr15	+	445	2	Intergenic	novelGene_569	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCCGCCTCAACAGTAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79731180	79735989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_79731271_79735634
tx.6555	chr15	+	1847	8	FSM	ENSMUSG00000009585.19	ENSMUST00000175752.8	1977	8	-38	168	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_4	224.554434107971	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTAAGTTGTGCATGATTG	8253	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79776610	79792119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_79776771_79779611_79779760_79781895_79782173_79782311_79782427_79789644_79789802_79790541_79790804_79791051_79791165_79791504
tx.6556	chr15	+	1932	9	FSM	ENSMUSG00000009585.19	ENSMUST00000175714.8	1953	9	23	-2	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	242	junction_5	144.740284648055	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAAGTTGTGCATGATTGGG	8269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79776626	79792121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_79776771_79779611_79779760_79781895_79782173_79782311_79782427_79783220_79783320_79789644_79789802_79790541_79790804_79791051_79791165_79791504
tx.6557	chr15	-	2953	7	NIC	ENSMUSG00000053411.17	novel	2899	7	NA	NA	-4	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	156	junction_1	121.853737461488	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTGTGTCTGGTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79855324	79800003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_79802252_79802477_79802678_79802953_79803027_79805572_79805640_79807672_79807739_79814786_79814831_79855069
tx.6558	chr15	-	3175	6	FSM	ENSMUSG00000053411.17	ENSMUST00000132821.8	528	6	-5	-2642	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_5	93.730251253264	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTTCTGTGTGTCTGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79855324	79800007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79802678_79802953_79803027_79805572_79805640_79807672_79807739_79814786_79814831_79855069
tx.6559	chr15	-	692	2	NNC	ENSMUSG00000053411.17	novel	663	6	NA	NA	-5	-4810	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTCTCTTCTTGGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79855325	79819558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_79819995_79855069
tx.656	chr1	-	2422	9	NIC	ENSMUSG00000026399.13	novel	2533	10	NA	NA	15	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	9	junction_2	21.5982493503525	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACTGTTGTCTCCTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390453	130366765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_130368117_130375355_130375377_130377153_130377301_130380120_130380313_130384557_130384644_130385823_130385924_130387318_130387511_130389558_130389745_130390306
tx.6560	chr15	+	765	2	Intergenic	novelGene_570	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTACACTGTAGATGTCTTC	9593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79856620	79874000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_79856837_79873451
tx.6561	chr15	+	457	3	Intergenic	novelGene_572	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGAATGGAGTCATCTG	9626	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79856653	79874534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_79856837_79873451_79873597_79874405
tx.6563	chr15	-	1476	10	NIC	ENSMUSG00000060036.15	novel	1351	10	NA	NA	1	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	214	junction_7	9920.80080773053	347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTTTCCCACATTTCTT	3572	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79967553	79961992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_79962096_79962187_79962308_79962531_79962628_79962907_79963010_79963890_79964052_79964566_79964754_79965096_79965413_79965815_79965985_79966590_79966784_79967524
tx.6564	chr15	-	1298	10	FSM	ENSMUSG00000060036.15	ENSMUST00000081650.15	1351	10	52	1	-1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	16287	junction_9	4874.04926341766	2061	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTTTCCCACATTTCTT	3570	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79967555	79961992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_79962096_79962187_79962308_79962531_79962628_79962907_79963010_79963890_79964052_79964566_79964754_79965096_79965233_79965815_79965985_79966590_79966784_79967524
tx.6565	chr15	+	802	4	FSM	ENSMUSG00000022415.13	ENSMUST00000009728.13	819	4	17	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1267	junction_2	72.7232195840274	1405	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGCCTGTGTGGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79975551	79997642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_79975694_79994644_79994883_79995799_79995946_79997366
tx.6566	chr15	+	612	3	ISM	ENSMUSG00000022415.13	ENSMUST00000009728.13	819	4	19158	0	-4981	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1267	junction_1	47.5	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGTGCCTGTGTGGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79994692	79997642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_79994883_79995799_79995946_79997366
tx.6568	chr15	+	2963	11	FSM	ENSMUSG00000022414.9	ENSMUST00000023050.9	2964	11	0	1	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_3	7.29109045342327	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGTCATCTTGTCTATCT	4993	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80017327	80045907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_80017390_80032427_80032565_80032887_80033042_80033982_80034070_80034627_80034767_80036865_80036980_80037832_80037945_80039957_80040103_80041804_80042028_80042951_80043109_80044274
tx.6569	chr15	+	1412	3	FSM	ENSMUSG00000042406.9	ENSMUST00000109605.5	1725	3	313	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1292	junction_2	43	2883	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTATGTGGGTTTTCAGTGT	4458	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80139697	80141742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_80139887_80140407_80140723_80140834
tx.657	chr1	-	2664	8	NIC	ENSMUSG00000026399.13	novel	2533	10	NA	NA	-233	0	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	0	0	junction_1	25.7959022216431	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTTGTCTCCTGTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390714	130366763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_130368117_130377153_130377301_130380120_130380313_130384557_130384644_130385823_130385924_130387318_130387511_130389558_130389745_130390306
tx.6570	chr15	-	821	4	FSM	ENSMUSG00000051518.9	ENSMUST00000052499.9	838	4	13	4	13	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	697	junction_3	66.5181679443043	2468	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGATTCAAGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80148503	80144819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_80145332_80145497_80145596_80148183_80148319_80148427
tx.6571	chr15	+	456	4	ISM	ENSMUSG00000047888.11	ENSMUST00000067689.9	17332	25	-53	156279	-53	-96682	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_2	3.39934634239519	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAGTCACAGTTTATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80595460	80669007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_80595690_80631606_80631675_80643740_80643832_80668939
tx.6572	chr15	+	535	5	ISM	ENSMUSG00000047888.11	ENSMUST00000067689.9	17332	25	-59	82332	-59	-22735	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_2	3.57071421427143	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGCCACCCAGAAGGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80595454	80742954	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_80595690_80631606_80631675_80643740_80643832_80668939_80669008_80742881
tx.6573	chr15	+	1886	13	FSM	ENSMUSG00000022407.11	ENSMUST00000023043.10	3711	13	14	1811	0	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	932	junction_8	68.052471585453	325	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGTACATTAAGTTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80832704	80853336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_80832902_80836397_80836602_80839820_80839866_80840413_80840494_80844595_80844768_80845556_80845604_80846896_80846988_80847860_80847931_80848080_80848229_80850292_80850384_80851312_80851403_80851789_80851967_80852862
tx.6575	chr15	+	2751	22	FSM	ENSMUSG00000042303.20	ENSMUST00000139517.9	2997	22	29	217	15	184	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_4	14.7956603308487	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGCCTCCCATCTTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80861994	80896274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_80862067_80886769_80886866_80887560_80887647_80888004_80888072_80890607_80890814_80890906_80891015_80891647_80891792_80892051_80892248_80892489_80892636_80892884_80893110_80893424_80893480_80893607_80893736_80893834_80893991_80894141_80894197_80894429_80894480_80894610_80894764_80894917_80894989_80895061_80895111_80895186_80895273_80895438_80895562_80895662_80895724_80895856
tx.6576	chr15	+	444	5	NNC	ENSMUSG00000042303.20	novel	401	5	NA	NA	20	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_4	66.5972033947372	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTGGCTTTTTGTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80861999	80888387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_80862067_80886769_80886866_80887560_80887647_80888004_80888072_80888259
tx.6577	chr15	-	1706	9	FSM	ENSMUSG00000022404.9	ENSMUST00000023040.9	1724	9	16	2	3	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	302	junction_6	19.7638400873919	186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCATGAAAGTTGCTCTTGA	6864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81244997	81203113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_81203978_81207810_81207894_81211241_81211338_81211417_81211564_81213250_81213368_81222136_81222289_81224174_81224242_81228301_81228363_81244877
tx.6578	chr15	-	1632	12	FSM	ENSMUSG00000022403.16	ENSMUST00000172107.8	3346	12	339	1375	-110	406	multi-exon	FALSE	canonical	3	2366	junction_3	110.211442162196	688	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATACGGTTCCTGAAGTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81283905	81249244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_81249780_81250547_81250691_81253594_81253644_81255658_81255776_81259004_81259108_81261888_81262000_81262116_81262202_81267180_81267248_81272530_81272602_81273851_81273925_81276465_81276524_81283685
tx.6579	chr15	+	512	5	FSM	ENSMUSG00000022400.10	ENSMUST00000023036.7	1675	5	55	1108	7	-125	multi-exon	FALSE	canonical	3	4160	junction_1	231.400491572512	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGTTGCTGTTTCATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81350551	81359462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_81350652_81352355_81352435_81355152_81355224_81358043_81358130_81359286
tx.658	chr1	-	2701	9	NNC	ENSMUSG00000026399.13	novel	2533	10	NA	NA	1	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	28.0178514522438	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACTGTTGTCTCCTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390187	130366765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_130368117_130376051_130376146_130377153_130377301_130380120_130380313_130384557_130384644_130385823_130385924_130387318_130387511_130389558_130389745_130389834
tx.6582	chr15	-	1122	4	ISM	ENSMUSG00000063765.13	ENSMUST00000072910.6	2548	6	3230	6	-29	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_3	7.87400787401181	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAAATACCTAGCATTAGT	8225	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81578258	81570371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_81570604_81576308_81576508_81577187_81577355_81577734
tx.6588	chr15	-	862	4	FSM	ENSMUSG00000061360.9	ENSMUST00000023117.10	1663	4	4	797	4	152	multi-exon	FALSE	canonical	3	1228	junction_3	69.0426599204354	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAACGTCTACTTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81756108	81749517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_81750094_81754532_81754700_81755366_81755391_81756013
tx.659	chr1	-	2512	10	FSM	ENSMUSG00000026399.13	ENSMUST00000027650.13	2533	10	21	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_3	13.0705587551887	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGTTGTCTCCTGTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130390460	130366763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_130368117_130375355_130375377_130376064_130376146_130377153_130377301_130380120_130380313_130384557_130384644_130385823_130385924_130387318_130387511_130389558_130389745_130390306
tx.6590	chr15	+	1406	8	ISM	ENSMUSG00000022477.14	ENSMUST00000023116.7	2918	18	37545	0	-435	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1833	junction_4	147.318341959007	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCTGCCTGAGTGATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81794054	81799334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_81794117_81794613_81794726_81796086_81796210_81796406_81796563_81797306_81797499_81797880_81798014_81798438_81798561_81798828
tx.6592	chr15	+	750	3	ISM	ENSMUSG00000022477.14	ENSMUST00000023116.7	2918	18	41382	0	3402	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2170	junction_1	6.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCTGCCTGAGTGATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81797891	81799334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_81798014_81798438_81798561_81798828
tx.6595	chr15	+	2088	13	FSM	ENSMUSG00000022471.15	ENSMUST00000069530.13	2114	13	26	0	26	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	579	junction_9	64.3868516598433	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGTGCACTTTTCAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81900595	81924286	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_81900677_81901310_81901400_81903181_81903295_81906645_81906785_81907007_81907263_81909705_81909890_81911425_81911613_81913322_81913492_81913763_81913926_81915333_81915464_81919877_81919979_81921657_81921772_81923922
tx.6597	chr15	-	1239	3	FSM	ENSMUSG00000063480.9	ENSMUST00000080622.9	2077	3	21	817	2	136	multi-exon	FALSE	canonical	3	3045	junction_2	110	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAAATATGGCAGCTGTGCC	4927	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81931778	81925542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_81926570_81928097_81928219_81931687
tx.66	chr1	-	561	4	FSM	ENSMUSG00000079658.10	ENSMUST00000186948.7	641	4	-22	102	2	-53	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_3	1146.38165062465	1105	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGTAGTTCAGTTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16727264	16713467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_16713703_16715909_16716054_16718178_16718232_16727135
tx.660	chr1	+	1027	3	ISM	ENSMUSG00000016529.6	ENSMUST00000016673.6	1310	5	1478	-3	1478	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGGTGTCTATTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	130949059	130952714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_130949219_130950225_130950292_130951912
tx.6603	chr15	-	1961	3	FSM	ENSMUSG00000068105.12	ENSMUST00000089161.10	1924	3	-37	0	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	3	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGTGCCTGGGTGCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82108591	82105943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_82107478_82107919_82108124_82108368
tx.6604	chr15	-	983	5	FSM	ENSMUSG00000068101.12	ENSMUST00000230408.2	593	5	-6	-384	-6	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1067	junction_2	109.17045158833	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTTGTAGATGCAGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82128617	82118276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_82118711_82123493_82123586_82124079_82124160_82125527_82125621_82128333
tx.6605	chr15	-	896	6	FSM	ENSMUSG00000068101.12	ENSMUST00000089157.11	1202	6	9	297	9	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1067	junction_2	108.849253557386	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTGTTGTAGATGCAGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82128940	82118276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_82118711_82123493_82123586_82124079_82124160_82125527_82125621_82128333_82128414_82128823
tx.6606	chr15	-	1908	10	FSM	ENSMUSG00000022453.9	ENSMUST00000023088.8	1913	10	-10	15	-10	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	252	junction_2	15.084944665313	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AACTGTTTTCTAATCAACCA	1334	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82223037	82213747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_82214409_82214855_82215000_82216533_82216732_82218986_82219149_82219697_82219793_82220043_82220222_82220970_82221143_82221587_82221724_82222438_82222516_82222952
tx.6608	chr15	+	604	3	FSM	ENSMUSG00000022452.17	ENSMUST00000023086.15	705	3	76	25	16	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1353	junction_2	125	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTCGTCCCCATTTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82230230	82233266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_82230471_82232100_82232242_82233043
tx.6609	chr15	+	588	3	NNC	ENSMUSG00000022452.17	novel	705	3	NA	NA	25	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	801.5	35	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTCGTCCCCATTTCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82230239	82233266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_82230471_82232100_82232242_82233050
tx.661	chr1	-	1918	2	ISM	ENSMUSG00000016526.9	ENSMUST00000016670.9	3164	3	1968	986	1873	-986	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	221	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCATTGTTTTCATTCTCA	2205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131064109	131056177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_131057983_131063996
tx.6610	chr15	-	508	3	FSM	ENSMUSG00000022450.7	ENSMUST00000023085.7	590	3	69	13	1	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	3916	junction_1	175	2824	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTGAACCCCTTTCCTGTG	6281	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82238454	82234353	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_82234573_82235179_82235296_82238281
tx.6612	chr15	+	673	3	NIC	ENSMUSG00000100199.2	novel	1118	4	NA	NA	91	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_1	1.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTGTGGTCCTATGAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82783371	82790019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_82783470_82785916_82786016_82789543
tx.6613	chr15	+	1300	12	FSM	ENSMUSG00000058586.13	ENSMUST00000078218.11	1371	12	72	-1	-13	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_2	9.92534113742268	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCCAAGTGGCTGTTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82984476	83000876	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_82984549_82985844_82985995_82986072_82986187_82986499_82986542_82986825_82986846_82987134_82987210_82988509_82988623_82989811_82989892_82996410_82996446_82998557_82998641_82999767_82999865_83000457
tx.6614	chr15	-	1908	7	FSM	ENSMUSG00000018040.10	ENSMUST00000018184.10	4363	7	42	2413	-8	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	832	junction_3	73.7437379639037	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTCTCTCCTGAGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83006960	83000046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83001173_83001749_83001949_83002277_83002376_83003385_83003504_83004092_83004219_83006032_83006176_83006862
tx.6615	chr15	-	3238	9	FSM	ENSMUSG00000041815.15	ENSMUST00000058793.14	3299	9	61	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	462	junction_6	74.2839779158332	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTGAGCTATAATGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83033524	83010176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83012257_83013394_83013462_83015681_83015812_83016777_83016856_83017347_83017528_83019494_83019591_83021668_83021756_83022332_83022724_83033395
tx.6616	chr15	-	886	3	FSM	ENSMUSG00000041815.15	ENSMUST00000149802.2	2393	3	12	1495	12	645	multi-exon	FALSE	canonical	3	496	junction_1	85	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAGAAGAAGAAATTTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83033518	83021383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83021756_83022332_83022724_83033395
tx.6617	chr15	-	550	2	FSM	ENSMUSG00000041815.15	ENSMUST00000150926.2	837	2	-25	312	23	-312	multi-exon	FALSE	canonical	3	666	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATCCAGGTAGGTTGTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83033562	83022340	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83022724_83033395
tx.6618	chr15	-	2041	9	FSM	ENSMUSG00000018042.19	ENSMUST00000018186.16	2422	9	380	1	380	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1513	junction_1	61.7454451761423	254	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGCCAGCGTTTCTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83056413	83037695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83038924_83043026_83043127_83044304_83044391_83044538_83044623_83045021_83045152_83046050_83046158_83046432_83046506_83050275_83050408_83056312
tx.6619	chr15	-	2019	2	ISM	ENSMUSG00000047878.14	ENSMUST00000049530.14	2092	3	21115	0	21070	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAATGCCTCATGGTCACA	7909	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83114860	83110922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_83112796_83114714
tx.662	chr1	+	1994	15	FSM	ENSMUSG00000026427.17	ENSMUST00000068805.14	2009	15	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	546	junction_5	43.4650340351123	918	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTTATTTCTAATCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131080932	131101215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_131081163_131081965_131082157_131082904_131082989_131083369_131083461_131085928_131086037_131088146_131088362_131089021_131089140_131091256_131091303_131092139_131092244_131092356_131092507_131092856_131092947_131094063_131094160_131095856_131095978_131098673_131098849_131101040
tx.6620	chr15	-	2130	3	FSM	ENSMUSG00000047878.14	ENSMUST00000164614.3	1974	3	2	-158	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	34	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAATGCCTCATGGTCACA	2268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83135930	83110922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83112796_83114714_83114859_83135817
tx.6621	chr15	-	2047	3	FSM	ENSMUSG00000047878.14	ENSMUST00000049530.14	2092	3	45	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_2	20.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAATGCCTCATGGTCACA	2268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83135930	83110922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83112796_83114714_83114859_83135900
tx.6623	chr15	-	1222	2	ISM	ENSMUSG00000047878.14	ENSMUST00000049530.14	2092	3	45	2744	0	945	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATGAAATAATTTGAGTCTA	2268	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83135930	83113666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_83114859_83135900
tx.6625	chr15	-	2194	3	NIC	ENSMUSG00000075511.10	novel	4969	3	NA	NA	0	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	28	junction_1	13	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAGTCCAGCTTAAGTCTC	245	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83251483	83241735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_83243152_83249229_83249715_83251190
tx.6626	chr15	-	2001	3	NIC	ENSMUSG00000075511.10	novel	2270	4	NA	NA	2	-4086	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	30	junction_1	12	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGGAGCATTTTTGTTG	247	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83251481	83246904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_83248130_83249229_83249715_83251190
tx.6627	chr15	-	643	2	ISM	ENSMUSG00000075511.10	ENSMUST00000178628.9	4969	3	0	11317	0	-6546	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAATCACTTTCTTCAGC	245	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83251483	83249364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_83249715_83251190
tx.6628	chr15	-	3144	11	FSM	ENSMUSG00000016664.17	ENSMUST00000171436.8	3693	11	23	526	-13	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	507	junction_5	57.2486681067778	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTGACAGTCCCTTTGCCT	7130	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83348784	83260333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83261932_83263199_83263397_83263884_83264008_83265962_83266085_83269187_83269309_83270862_83271039_83272715_83272872_83274623_83274860_83276701_83276859_83286067_83286201_83348659
tx.663	chr1	-	540	3	ISM	ENSMUSG00000026425.16	ENSMUST00000189892.2	1044	6	12663	-1	-2022	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	53.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGGTTGCCAGATCTCTTG	7529	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131226140	131222955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_131223278_131224057_131224205_131226069
tx.6631	chr15	-	2058	12	FSM	ENSMUSG00000022442.17	ENSMUST00000016897.12	2060	12	0	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_11	7.21110255092798	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATCTGACTTTATCTTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83395094	83367971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83368515_83373669_83373834_83376743_83376831_83380472_83380617_83381520_83381630_83382352_83382488_83384122_83384304_83386281_83386491_83389450_83389568_83389683_83389845_83390480_83390529_83394934
tx.6632	chr15	+	943	5	FSM	ENSMUSG00000016758.5	ENSMUST00000016902.5	942	5	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	7.58287544405155	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCTTAGGTCGTCCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83411062	83428836	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_83411138_83425495_83425644_83427265_83427365_83427780_83427899_83428333
tx.6633	chr15	-	1279	2	ISM	ENSMUSG00000048755.10	ENSMUST00000229724.2	688	3	3635	-1028	3635	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCTGGCTCTCTCTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83433453	83430999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_83432144_83433318
tx.6634	chr15	+	832	4	FSM	ENSMUSG00000041736.8	ENSMUST00000047419.8	837	4	1	4	1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_1	54.5119762580257	395	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACAGACTCTGTACTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83447793	83458400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_83447846_83455585_83455797_83456400_83456540_83457970
tx.6635	chr15	+	890	4	NNC	ENSMUSG00000041736.8	novel	837	4	NA	NA	6061	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	99	junction_1	92.1013934024164	169	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAACAGACTCTGTACTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83454136	83458400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_83454247_83455585_83455797_83456400_83456540_83457970
tx.6636	chr15	-	3038	14	FSM	ENSMUSG00000016757.12	ENSMUST00000016901.5	3774	14	16	720	16	-691	multi-exon	FALSE	canonical	3	239	junction_9	15.0977093760069	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGGACATGGTTCTTCC	4687	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83479342	83460010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83461250_83461947_83462087_83462835_83462905_83464268_83464351_83464695_83464848_83465868_83465981_83466245_83466441_83466546_83466664_83468856_83468934_83471051_83471186_83471274_83471435_83472703_83472903_83475579_83475750_83479149
tx.6637	chr15	-	1341	8	FSM	ENSMUSG00000018865.10	ENSMUST00000229826.2	1319	8	-20	-2	-20	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_2	10.0285307284481	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTGCATTTCCAGGGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83989830	83961343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83961784_83962969_83963099_83964387_83964527_83970800_83970896_83974159_83974287_83974792_83974874_83976490_83976622_83989631
tx.6638	chr15	-	1210	7	FSM	ENSMUSG00000018865.10	ENSMUST00000082365.6	2383	7	125	1048	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	29.8105126870818	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAAGTGCATTTCCAGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83989830	83961345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_83961784_83964387_83964527_83970800_83970896_83974159_83974287_83974792_83974874_83976490_83976622_83989631
tx.6639	chr15	+	3070	9	NNC	ENSMUSG00000041653.6	novel	1313	8	NA	NA	-66	2287	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_8	14.5425023637612	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCTGTCTCTTCTGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84051971	84073724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_84052262_84055282_84055516_84056916_84056983_84058468_84058679_84061016_84061078_84063380_84063537_84065120_84065254_84070177_84070283_84071908
tx.664	chr1	-	416	2	ISM	ENSMUSG00000026425.16	ENSMUST00000189893.7	3171	5	-9	163281	-9	-88632	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_1	0	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCCTCCGGGCGCTGCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131455099	131453044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_131453332_131454970
tx.6640	chr15	+	1673	15	FSM	ENSMUSG00000022437.8	ENSMUST00000023071.8	4629	15	-7	2963	-7	-2963	multi-exon	FALSE	canonical	3	1573	junction_6	135.39963524504	2060	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGTGTCCTGGATGTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84076434	84098505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_84076586_84079944_84080056_84081205_84081308_84082774_84082863_84083973_84084081_84084493_84084625_84084830_84084919_84086430_84086560_84086969_84087042_84088209_84088297_84091071_84091143_84092033_84092102_84094684_84094832_84095237_84095380_84098326
tx.6641	chr15	+	900	8	ISM	ENSMUSG00000022437.8	ENSMUST00000023071.8	4629	15	9984	2963	0	-2963	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1706	junction_2	110.407963333027	1441	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGGTGTCCTGGATGTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84086425	84098505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_84086560_84086969_84087042_84088209_84088297_84091071_84091143_84092033_84092102_84094684_84094832_84095237_84095380_84098326
tx.6643	chr15	+	1615	13	FSM	ENSMUSG00000022438.7	ENSMUST00000023072.7	3784	13	14	2155	-9	-2155	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_4	7.38052994182818	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACTCCTGAGTCTCAGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84116257	84197734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_84116388_84155431_84155522_84157699_84157771_84166962_84167066_84174587_84174729_84176982_84177099_84179757_84179817_84182166_84182187_84187608_84187671_84188035_84188105_84193053_84193156_84196903_84196977_84197155
tx.6644	chr15	+	1689	9	NNC	ENSMUSG00000036106.16	novel	1830	8	NA	NA	-6414	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	23	junction_1	42.0979141407267	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCCTGTCTGCCCCCTGGTG	8456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84547406	84587874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_84547463_84565400_84565521_84572103_84572185_84577664_84577714_84577959_84578018_84583321_84583414_84583791_84583933_84585564_84585701_84586918
tx.6645	chr15	+	1564	8	NNC	ENSMUSG00000036106.16	novel	1719	9	NA	NA	-6411	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	49.7864828799045	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTCCTGTCTGCCCCCTGG	8459	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84547409	84587872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_84547463_84572103_84572185_84577664_84577714_84577959_84578018_84583321_84583414_84583791_84583933_84585564_84585701_84586918
tx.6646	chr15	+	1828	8	FSM	ENSMUSG00000036106.16	ENSMUST00000065499.5	1830	8	1	1	1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_7	10.3844467687921	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACTCCTGTCTGCCCCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84565203	84587872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_84565521_84572103_84572185_84577664_84577714_84577959_84578018_84583321_84583414_84583791_84583933_84585564_84585701_84586918
tx.6647	chr15	-	775	2	ISM	ENSMUSG00000116396.2	ENSMUST00000229841.2	1237	3	1358	-52	1358	52	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGTTGCACGAATGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84603109	84598777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_84599341_84602897
tx.6649	chr15	+	1524	12	NNC	ENSMUSG00000078954.10	novel	1544	12	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	58.989143138924	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGGGGTTTTGTGCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84604252	84656408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_84604314_84617096_84617231_84624908_84624997_84626093_84626226_84629969_84630057_84640538_84640638_84641220_84641332_84649873_84649948_84650511_84650590_84651301_84651431_84654197_84654302_84655981
tx.665	chr1	+	1393	4	FSM	ENSMUSG00000055184.5	ENSMUST00000068613.5	2191	4	-39	837	-39	-837	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_2	3.29983164553722	215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGAACGTTTACTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131455601	131466773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_131456591_131458391_131458470_131461546_131461672_131466572
tx.6650	chr15	-	1959	3	NNC	ENSMUSG00000100967.2	novel	8038	2	NA	NA	-3123	-2241	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATAAGACTTGCCTTGGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84807362	84796879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_84798533_84800095_84800307_84807267
tx.6651	chr15	+	1831	8	FSM	ENSMUSG00000016619.11	ENSMUST00000165443.4	4766	8	-18	2953	-18	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	399	junction_4	38.703477668983	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTTCTCCCTTCCTAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84807593	84824211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_84807852_84811568_84811648_84813572_84813657_84817735_84817920_84819064_84819725_84821687_84821770_84822558_84822678_84823846
tx.6652	chr15	+	977	4	ISM	ENSMUSG00000016619.11	ENSMUST00000230411.2	1900	9	11713	-52	11713	52	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	488	junction_1	6.0184900284226	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGAAGATGGTTTTTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84819362	84824260	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_84819725_84821687_84821770_84822558_84822678_84823846
tx.6653	chr15	+	563	3	ISM	ENSMUSG00000016619.11	ENSMUST00000230411.2	1900	9	14040	-2	14040	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	499	junction_1	1.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTCTCCCTTCCTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84821689	84824210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_84821770_84822558_84822678_84823846
tx.6654	chr15	+	442	2	ISM	ENSMUSG00000022435.7	ENSMUST00000023070.7	1093	6	4139	-16	4139	16	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGAAGCAGGAGATGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84905480	84906764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_84905597_84906438
tx.6655	chr15	+	2444	9	FSM	ENSMUSG00000022434.9	ENSMUST00000023069.9	2518	9	74	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_8	15.0742951742362	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTGTGCTCAGTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84921363	84947031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_84921446_84928980_84929037_84929820_84930074_84932559_84932782_84934894_84935024_84937771_84938058_84939854_84939888_84942942_84943027_84945732
tx.6657	chr15	-	615	3	NIC	ENSMUSG00000022432.8	novel	4047	25	NA	NA	-17	-43612	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	11	junction_2	66	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAAATTGTATTTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85016182	84998708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_84999088_85000039_85000123_85016029
tx.6658	chr15	-	565	4	ISM	ENSMUSG00000022432.8	ENSMUST00000023068.8	4047	25	-16	62872	-16	-56665	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_3	11.8977121983832	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTACAAAAAGCTGAAGAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85016181	85011761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_85011873_85011959_85012073_85013871_85014061_85016029
tx.6659	chr15	+	944	5	ISM	ENSMUSG00000006369.15	ENSMUST00000109432.4	2273	15	33288	0	-24161	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	356	junction_4	44.6227240315963	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTCTTGTACCTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85123493	85136086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_85123621_85124820_85124941_85126211_85126344_85128383_85128508_85135645
tx.666	chr1	+	360	2	Intergenic	novelGene_58	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAATACTCATGTCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131490690	131496576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_131490805_131496330
tx.6660	chr15	+	1885	12	FSM	ENSMUSG00000016541.11	ENSMUST00000163242.3	1937	12	52	0	52	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1134	junction_3	91.244743989915	756	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGGGACCCTTGATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85220497	85347413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_85220782_85243654_85243847_85249477_85249561_85259522_85259620_85260744_85260904_85267104_85267186_85271191_85271358_85275838_85275948_85277537_85277708_85322302_85322367_85346480_85346669_85347121
tx.6661	chr15	+	472	2	ISM	ENSMUSG00000016541.11	ENSMUST00000163242.3	1937	12	126043	0	126043	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1366	junction_1	0	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGGGACCCTTGATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85346488	85347413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_85346669_85347121
tx.6662	chr15	-	940	4	FSM	ENSMUSG00000064284.13	ENSMUST00000125947.8	706	4	41	-275	41	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	301	junction_1	22.0151463012778	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTGGTTTGAGTCACTG	8733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85695250	85691172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_85691740_85692456_85692569_85693412_85693526_85695102
tx.6663	chr15	-	903	4	NIC	ENSMUSG00000064284.13	novel	997	5	NA	NA	-2	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_3	153.805793851279	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTGGTTTGAGTCACTG	8121	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85695862	85691172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_85691740_85692456_85692569_85693412_85693526_85695751
tx.6664	chr15	-	1053	5	FSM	ENSMUSG00000064284.13	ENSMUST00000144067.8	761	5	-20	-272	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	131.723906334424	239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTGGTTTGAGTCACTG	8118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85695865	85691172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_85691740_85692456_85692569_85693412_85693526_85695102_85695250_85695751
tx.6665	chr15	-	996	5	FSM	ENSMUSG00000064284.13	ENSMUST00000071876.13	997	5	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_4	106.509389257473	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGGTGGTTTGAGTCACTG	8087	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85695896	85691172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_85691740_85692456_85692569_85693412_85693526_85695102_85695250_85695839
tx.6666	chr15	+	2703	12	FSM	ENSMUSG00000022385.12	ENSMUST00000170629.3	2641	12	-19	-43	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	528	junction_1	58.9672832668062	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGGACGTGTAGAGCTG	7118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85743926	85760774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_85743996_85744204_85744297_85746101_85746160_85746268_85746897_85748307_85748464_85751675_85751803_85752880_85753259_85755709_85755783_85757840_85758078_85759175_85759420_85759736_85759953_85760349
tx.6667	chr15	+	769	4	ISM	ENSMUSG00000022385.12	ENSMUST00000170629.3	2641	12	-18	13912	-18	-13912	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	528	junction_1	77.5800661682282	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAGGATCACCAGCAAGCTC	7119	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85743927	85746819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_85743996_85744204_85744297_85746101_85746160_85746268
tx.6668	chr15	+	861	3	ISM	ENSMUSG00000022385.12	ENSMUST00000231074.2	2692	11	15053	0	15053	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	640	junction_1	43.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTTGGACGTGTAGAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85759199	85760774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_85759420_85759736_85759953_85760349
tx.6669	chr15	+	1523	11	FSM	ENSMUSG00000022386.13	ENSMUST00000023019.12	1526	11	5	-2	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_4	10.36532681588	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATGTGTCTGGGGCTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85763525	85781595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_85763660_85766874_85767041_85769286_85769394_85774405_85774529_85776767_85776941_85778026_85778081_85778154_85778222_85779126_85779228_85780560_85780706_85781035_85781119_85781225
tx.667	chr1	+	895	3	ISM	ENSMUSG00000042268.11	ENSMUST00000049027.10	4739	21	21782	1704	15313	-1704	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCAGGAGTCTCTGTCTTTG	4764	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131693541	131697538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_131693765_131695546_131695619_131696938
tx.6670	chr15	-	1109	8	FSM	ENSMUSG00000035891.17	ENSMUST00000156546.2	2162	8	-32	1085	-32	-1085	multi-exon	TRUE	canonical	3	9	junction_7	5.62429133857986	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGTCAACAGTTCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86036681	86025606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_86025814_86026882_86027092_86028722_86028929_86029688_86029766_86030485_86030592_86033478_86033632_86035735_86035811_86036605
tx.6671	chr15	-	507	3	NNC	ENSMUSG00000035891.17	novel	2162	8	NA	NA	8742	-1087	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_2	5.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTTTGTCAACAGTTCTG	6285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86027907	86025608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_86025814_86026882_86027092_86027814
tx.6672	chr15	-	564	2	Intergenic	novelGene_574	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACTTTTTGCTGTGTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86098589	86097939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_86098365_86098450
tx.6673	chr15	+	1120	8	ISM	ENSMUSG00000051864.11	ENSMUST00000063414.9	3229	13	-21	186691	-21	19650	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_4	6.79735843049733	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCGTGGTCTTCATTTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86098638	86196013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_86098838_86118930_86118988_86119716_86120055_86123317_86123495_86176334_86176406_86183847_86183977_86185746_86185810_86195927
tx.6674	chr15	+	3263	13	FSM	ENSMUSG00000051864.11	ENSMUST00000063414.9	3229	13	-34	0	-34	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_12	8.71779788708135	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCTTTTTATTGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86098625	86382704	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_86098838_86118930_86118988_86119716_86120055_86123317_86123495_86176334_86176406_86183847_86183977_86185746_86185810_86195927_86196043_86235854_86235965_86250805_86250882_86275277_86275406_86333392_86333489_86381013
tx.6676	chr15	-	932	2	Intergenic	novelGene_577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATAGATCTTCATAACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88546724	88540199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_88540776_88546368
tx.6677	chr15	-	842	3	Intergenic	novelGene_576	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATCTTCATAACCTTGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88546825	88540194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_88540776_88546368_88546528_88546723
tx.6678	chr15	-	2476	6	ISM	ENSMUSG00000022387.18	ENSMUST00000109380.8	3259	12	29499	-1262	-408	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	571	junction_1	43.1212244724103	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTGTCCCGTGTTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88585475	88571236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_88572684_88573711_88573867_88574064_88574175_88575410_88575539_88575951_88576088_88584975
tx.6679	chr15	-	1934	5	ISM	ENSMUSG00000022387.18	ENSMUST00000109380.8	3259	12	38925	-1258	9018	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	571	junction_1	40.9206549312202	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTAGTTTTTGTCCCGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88576049	88571240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_88572684_88573711_88573867_88574064_88574175_88575410_88575539_88575951
tx.668	chr1	+	1868	13	FSM	ENSMUSG00000042251.13	ENSMUST00000112393.9	6900	13	17	5015	0	70	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_3	6.31741420378799	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAGGTTTAAATACTAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131725135	131744184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_131725325_131726333_131726421_131728831_131729065_131729463_131729551_131730038_131730173_131730457_131730578_131731789_131731866_131732324_131732387_131732630_131732710_131734636_131734709_131739772_131739942_131741628_131741729_131743724
tx.6680	chr15	+	2312	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022387.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTGGCACAGAAATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88592699	88595117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_88594893_88594998
tx.6681	chr15	+	523	3	FSM	ENSMUSG00000034333.16	ENSMUST00000041297.15	5425	3	42	4860	42	-4860	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_1	12	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGGACATTATAAGCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88635904	88663859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_88636006_88638962_88639137_88663611
tx.6682	chr15	-	2136	10	FSM	ENSMUSG00000035845.18	ENSMUST00000162183.8	2130	10	-7	1	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	14.1691718917785	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATTGTGTCTTGTTGTTGGT	9237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88703528	88689447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_88690258_88690601_88690678_88690760_88690925_88695499_88695724_88696258_88696363_88698656_88698852_88699496_88699671_88700060_88700194_88700269_88700458_88703460
tx.6683	chr15	-	1509	7	ISM	ENSMUSG00000035845.18	ENSMUST00000162183.8	2130	10	2	5621	2	3743	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14.8548533034381	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTCGGTGTCTCTTCCTG	9246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88703519	88695067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_88695724_88696258_88696363_88698656_88698852_88699496_88699671_88700060_88700194_88700269_88700458_88703460
tx.6684	chr15	+	1368	10	FSM	ENSMUSG00000023272.5	ENSMUST00000024042.5	1366	10	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	902	junction_1	99.7619388566824	604	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGACGTGTTGGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88703846	88710886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_88704038_88704133_88704217_88704731_88704843_88705337_88705430_88706161_88706339_88707269_88707366_88707944_88708029_88708850_88708947_88709352_88709494_88710589
tx.6685	chr15	+	829	6	ISM	ENSMUSG00000023272.5	ENSMUST00000024042.5	1366	10	2375	0	2375	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	956	junction_5	103.114305506074	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGACGTGTTGGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88706223	88710886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_88706339_88707269_88707366_88707944_88708029_88708850_88708947_88709352_88709494_88710589
tx.6686	chr15	+	1649	3	ISM	ENSMUSG00000035828.12	ENSMUST00000042818.11	2427	6	1041	2	1041	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	856	junction_1	44	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAACTTCTGTTTATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88747429	88749927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_88747752_88748518_88748696_88748777
tx.6687	chr15	+	1534	2	ISM	ENSMUSG00000035828.12	ENSMUST00000042818.11	2427	6	1923	2	-811	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	944	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAACTTCTGTTTATTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88748311	88749927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_88748696_88748777
tx.6688	chr15	-	723	2	FSM	ENSMUSG00000093394.2	ENSMUST00000177166.2	730	2	24	-17	15	17	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGGAGAGACCCTTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88775704	88774693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_88775099_88775386
tx.6689	chr15	-	480	2	NNC	ENSMUSG00000093394.2	novel	1234	2	NA	NA	324	13	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAACAGAGGAGAGACCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88775362	88774697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_88775099_88775283
tx.669	chr1	+	981	2	ISM	ENSMUSG00000013275.10	ENSMUST00000086559.7	4697	11	34	18257	34	332	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCTGCCTGTCATGTCCT	5236	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131755748	131758346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_131756132_131757748
tx.6690	chr15	+	592	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022388.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGATGTGTAGTGCACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88775457	88783671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_88775663_88781763_88781910_88783430
tx.6691	chr15	+	2019	11	ISM	ENSMUSG00000015365.16	ENSMUST00000146993.8	4133	27	-4	49483	-4	10594	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_4	7.62954782408499	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTGACACATGGTAATTT	2903	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88867107	88889868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_88867265_88869717_88869903_88872589_88872753_88878008_88878122_88879043_88879229_88880258_88880400_88880871_88881099_88881482_88881607_88882970_88883166_88888121_88888237_88889454
tx.6692	chr15	+	2034	12	ISM	ENSMUSG00000015365.16	ENSMUST00000146993.8	4133	27	-9	49206	-9	10871	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	47	junction_4	7.60382678775509	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTCGTAAGCCGTGTTTG	2898	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88867102	88890145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_88867265_88869717_88869903_88872589_88872753_88878008_88878122_88879043_88879229_88880258_88880400_88880871_88881099_88881482_88881607_88882970_88883166_88888121_88888237_88889454_88889633_88889899
tx.6693	chr15	+	867	5	FSM	ENSMUSG00000015365.16	ENSMUST00000156949.2	845	5	-12	-10	-12	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_4	9.33742469849155	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTGTAGTCAAGTGCTGT	2895	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88867099	88879284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_88867265_88869717_88869903_88872589_88872753_88878008_88878122_88879043
tx.6694	chr15	+	2466	14	ISM	ENSMUSG00000015365.16	ENSMUST00000146993.8	4133	27	0	43262	0	-11735	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_13	10.1817797586303	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTGTTTCAAAGTATTATT	2907	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88867111	88896089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_88867265_88869717_88869903_88872589_88872753_88878008_88878122_88879043_88879229_88880258_88880400_88880871_88881099_88881482_88881607_88882970_88883166_88888121_88888237_88889454_88889633_88889899_88889971_88891784_88891877_88895565
tx.6695	chr15	+	470	5	ISM	ENSMUSG00000015363.14	ENSMUST00000169891.8	1422	10	-23	3392	-1	-2571	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	7.34846922834953	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCGAGAGGCCAAGGAGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88960273	88966941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_88960345_88965182_88965248_88965555_88965635_88966153_88966321_88966853
tx.6696	chr15	+	2371	10	FSM	ENSMUSG00000015363.14	ENSMUST00000081702.12	2439	10	64	4	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_1	6.70175948888899	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCCCGCTTTGTGAAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88960279	88971276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_88960345_88965182_88965248_88965555_88965635_88966153_88966321_88966853_88966995_88968900_88969012_88969105_88969246_88969476_88969650_88969728_88969841_88969958
tx.6697	chr15	-	2171	3	ISM	ENSMUSG00000051786.16	ENSMUST00000041656.14	5357	25	-255	14904	-29	3125	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCTTTGTATAATATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89007344	88999516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89000459_89004712_89004877_89006279
tx.6698	chr15	-	945	3	ISM	ENSMUSG00000022610.11	ENSMUST00000230509.2	930	8	2730	-297	394	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGTTGTGTGGCCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89017091	89014786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89015422_89016697_89016872_89016955
tx.6699	chr15	-	1912	12	FSM	ENSMUSG00000022610.11	ENSMUST00000088827.8	1808	12	-104	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	1.87634249459548	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGTTGTGTGGCCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89024928	89014786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_89015422_89016697_89016872_89016955_89017035_89017103_89017184_89017281_89017354_89018814_89018930_89019325_89019374_89019629_89019660_89019779_89019892_89021603_89021663_89024330_89024461_89024550
tx.67	chr1	-	483	4	FSM	ENSMUSG00000079658.10	ENSMUST00000115352.10	960	4	0	477	0	-53	multi-exon	TRUE	canonical	3	1066	junction_3	717.825574603995	11210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACCTGTAGTTCAGTTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16727266	16713467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_16713703_16715909_16716054_16718178_16718232_16727215
tx.670	chr1	+	450	2	ISM	ENSMUSG00000013275.10	ENSMUST00000146360.2	553	4	1502	-225	1502	225	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCAAATTCTCATTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131772079	131774592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_131772225_131774287
tx.6700	chr15	-	1091	6	ISM	ENSMUSG00000022610.11	ENSMUST00000230509.2	930	8	956	-297	956	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_5	1.62480768092719	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTGGTTGTGTGGCCCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89018865	89014786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89015422_89016697_89016872_89016955_89017035_89017103_89017184_89017281_89017354_89018814
tx.6701	chr15	-	2562	15	ISM	ENSMUSG00000036606.18	ENSMUST00000060808.10	6394	36	10452	0	1311	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	301	junction_13	43.3185283447993	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTGACTGGGTTTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89044439	89039751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89040589_89040700_89040776_89041195_89041272_89041388_89041454_89041594_89041743_89041837_89041999_89042103_89042259_89042438_89042524_89042627_89042729_89042829_89042987_89043161_89043309_89043429_89043497_89043663_89043846_89043975_89044206_89044363
tx.6702	chr15	-	981	3	ISM	ENSMUSG00000015377.11	ENSMUST00000229416.2	1969	12	2875	0	2875	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	87	junction_2	14	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGTCCCTGACTATTGG	5750	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89070172	89069014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89069313_89069394_89069470_89069564
tx.6703	chr15	-	911	4	ISM	ENSMUSG00000015377.11	ENSMUST00000229416.2	1969	12	2870	2	2870	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_3	13.4412301024373	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTCTGGTCCCTGACTATT	5745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89070177	89069016	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89069313_89069394_89069470_89069564_89069668_89069740
tx.6704	chr15	+	1073	3	FSM	ENSMUSG00000054136.7	ENSMUST00000066991.7	1298	3	225	0	225	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_1	15	379	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGGCCACTCTCTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89207147	89208934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_89207337_89207479_89207604_89208174
tx.6705	chr15	+	866	2	ISM	ENSMUSG00000054136.7	ENSMUST00000066991.7	1298	3	575	0	575	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGGCCACTCTCTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89207497	89208934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_89207604_89208174
tx.6706	chr15	-	2737	13	NNC	ENSMUSG00000022614.9	novel	2815	13	NA	NA	0	-2	intron_retention	TRUE	canonical	0	0	junction_11	68.2647521704202	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTACTAGTGGTTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89239836	89235343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_89236091_89236185_89236283_89236355_89236468_89236561_89236731_89236806_89236990_89237061_89237159_89237236_89237343_89237412_89237548_89237659_89237802_89238031_89238211_89238285_89238520_89238762_89239021_89239558
tx.6707	chr15	-	2766	14	NNC	ENSMUSG00000022614.9	novel	2906	14	NA	NA	5	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_12	66.7675469479281	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTTACTAGTGGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89239857	89235345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_89236091_89236185_89236283_89236355_89236468_89236561_89236731_89236806_89236990_89237061_89237159_89237236_89237343_89237412_89237548_89237659_89237802_89238031_89238211_89238285_89238501_89238629_89238659_89238762_89239021_89239558
tx.6708	chr15	+	2045	20	NNC	ENSMUSG00000008690.16	novel	3299	20	NA	NA	12	17	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_14	237.547405970056	200	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTTCACCGGACAGACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89239950	89255783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_89240147_89244558_89244661_89247633_89247690_89247807_89247893_89247968_89248038_89248124_89248205_89248290_89248446_89248815_89248900_89249436_89249535_89253586_89253659_89253818_89253886_89254010_89254119_89254227_89254282_89254440_89254516_89254597_89254692_89254806_89254879_89254955_89255012_89255094_89255197_89255296_89255447_89255513
tx.6709	chr15	+	486	3	FSM	ENSMUSG00000008690.16	ENSMUST00000147733.2	644	3	175	-17	175	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	1104	junction_1	14.5	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGTTCACCGGACAGACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89255130	89255783	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_89255197_89255296_89255447_89255513
tx.671	chr1	+	160	2	Intergenic	novelGene_59	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTCATGATTATATTCACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131779599	131779916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_131779648_131779804
tx.6710	chr15	-	1213	3	FSM	ENSMUSG00000091780.4	ENSMUST00000167643.4	1145	3	-62	-6	-34	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_2	1.5	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGCTCTGTACCAGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89258083	89255833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_89256669_89257625_89257806_89257885
tx.6711	chr15	-	1355	4	ISM	ENSMUSG00000022615.8	ENSMUST00000023285.5	2037	11	2909	-300	2909	300	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_3	10.6770782520313	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTGCTCTGTACCAGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89258333	89255833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89256669_89257625_89257806_89257885_89258027_89258134
tx.6712	chr15	-	452	3	FSM	ENSMUSG00000078938.10	ENSMUST00000109314.9	448	3	0	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAAAGGACCCCTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89294466	89274372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_89274643_89281528_89281638_89294393
tx.6713	chr15	-	2703	19	FSM	ENSMUSG00000078937.9	ENSMUST00000109313.9	2895	19	-24	216	-24	-216	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_15	11.4655953418569	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGCTGTTAGGTGCCTAT	5192	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89310090	89300823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_89301183_89301347_89301441_89302034_89302149_89302934_89303088_89303178_89303314_89303393_89303559_89304094_89304212_89304290_89304397_89304894_89305081_89305547_89305744_89306327_89306413_89306491_89306600_89307694_89307773_89307858_89307997_89308142_89308245_89308467_89308646_89308919_89309060_89309390_89309551_89310000
tx.6714	chr15	-	416	2	FSM	ENSMUSG00000022617.16	ENSMUST00000115278.3	543	2	235	-108	235	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	407	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGACTTAAGTGACATTC	4155	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89311127	89310562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_89310865_89311013
tx.6715	chr15	-	1346	10	ISM	ENSMUSG00000022617.16	ENSMUST00000023289.13	1707	11	587	-7	118	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_8	78.7223594447169	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGACTTAAGTGACATTC	1767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89313515	89310562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89310865_89311013_89311096_89311526_89311631_89311763_89311873_89311994_89312077_89312159_89312219_89312336_89312433_89312613_89312748_89312916_89313031_89313251
tx.6716	chr15	-	1422	10	FSM	ENSMUSG00000022617.16	ENSMUST00000171140.8	1416	10	1	-7	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	259	junction_9	49.0736408087093	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGACTTAAGTGACATTC	1641	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89313641	89310562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_89310865_89311013_89311096_89311526_89311631_89311763_89311873_89311994_89312077_89312159_89312219_89312336_89312433_89312613_89313031_89313251_89313361_89313579
tx.6717	chr15	-	1245	11	FSM	ENSMUSG00000022617.16	ENSMUST00000023289.13	1707	11	469	-7	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_8	79.2225346729073	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGACTTAAGTGACATTC	1649	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89313633	89310562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_89310865_89311013_89311096_89311526_89311631_89311763_89311873_89311994_89312077_89312159_89312219_89312336_89312433_89312613_89312748_89312916_89313031_89313251_89313361_89313579
tx.6719	chr15	-	2703	8	ISM	ENSMUSG00000022620.15	ENSMUST00000165199.8	3492	9	1269	14	-43	-14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_5	9.89743318610787	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGTCTACAAAGTAATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89360359	89356692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89357761_89357871_89357975_89358209_89358338_89358430_89358556_89358742_89358913_89358989_89359209_89359324_89359566_89359710
tx.672	chr1	+	1203	6	FSM	ENSMUSG00000026433.14	ENSMUST00000027693.8	1226	6	23	0	23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	27.6506781110337	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGGGTTGTGATGCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131795000	131800625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_131795149_131795256_131795514_131797670_131797743_131798417_131798600_131799804_131799927_131800203
tx.6720	chr15	-	1539	8	ISM	ENSMUSG00000022621.17	ENSMUST00000023294.15	1640	9	1496	-2	-28	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_3	6.34066886319204	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGGGTCTCAGTTACCTT	2814	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89474630	89466733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_89467634_89467801_89467886_89468112_89468211_89468481_89468594_89470461_89470542_89471116_89471197_89472390_89472421_89474475
tx.6721	chr15	-	1606	9	FSM	ENSMUSG00000022621.17	ENSMUST00000023294.15	1640	9	36	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_3	5.95818764390649	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGGGTCTCAGTTACCTT	1354	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89476090	89466733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_89467634_89467801_89467886_89468112_89468211_89468481_89468594_89470461_89470542_89471116_89471197_89472390_89472421_89474475_89474630_89476022
tx.6722	chr15	-	938	12	ISM	ENSMUSG00000052560.16	ENSMUST00000064391.12	3366	20	57	53798	1	-53798	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2.16661368869327	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAATACACCAATTCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90563578	90425483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_90425514_90436176_90436253_90452451_90452494_90453662_90453768_90456147_90456252_90469080_90469145_90486015_90486093_90499313_90499354_90503834_90503939_90532780_90532828_90533445_90533487_90563370
tx.6724	chr15	-	685	4	FSM	ENSMUSG00000052560.16	ENSMUST00000014777.9	697	4	15	-3	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	0.816496580927726	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTGGTTGTTGTGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90563576	90527525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_90527917_90532780_90532828_90533445_90533487_90563370
tx.6725	chr15	-	444	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000067870.6	novel	378	1	NA	NA	-67	59	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGGAACTATGGCAAGGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90648926	90648422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_90648695_90648754
tx.6727	chr15	-	451	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000067870.6	novel	378	1	NA	NA	-18357	49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAATTGGAACTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90667216	90648432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_90648861_90667193
tx.6728	chr15	+	2793	13	FSM	ENSMUSG00000078932.9	ENSMUST00000190436.7	2041	13	-29	-723	-29	723	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_9	6.39172642301489	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTCTTGATAATTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91083667	91145820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_91083802_91115782_91115823_91119943_91120083_91123134_91123268_91123620_91123670_91124845_91125023_91126772_91126889_91129815_91130334_91131061_91131132_91132717_91132779_91137065_91137130_91141563_91141647_91144611
tx.6729	chr15	+	2598	12	NIC	ENSMUSG00000078932.9	novel	2041	13	NA	NA	-11	723	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	5	junction_5	8.52221210564216	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTCTTGATAATTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91083685	91145820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_91083802_91115782_91115823_91119943_91120083_91123134_91123268_91123620_91123670_91126772_91126889_91129815_91130334_91131061_91131132_91132717_91132779_91137065_91137130_91141563_91141647_91144611
tx.673	chr1	+	1308	5	FSM	ENSMUSG00000026433.14	ENSMUST00000112386.8	1202	5	42	-148	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_1	6.13901457890434	401	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGGGTTGTGATGCTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131795003	131800625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_131795514_131797670_131797743_131798417_131798600_131799804_131799927_131800203
tx.6730	chr15	+	2002	8	ISM	ENSMUSG00000078932.9	ENSMUST00000190436.7	2041	13	-23	14062	-23	-14053	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_5	5.72855361593241	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAGTATATGTTTATATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91083673	91131035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_91083802_91115782_91115823_91119943_91120083_91123134_91123268_91123620_91123670_91124845_91125023_91126772_91126889_91129815
tx.6732	chr15	-	283	2	Intergenic	novelGene_578	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTTAATCTGTTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91518623	91515980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_91516176_91518535
tx.6733	chr15	+	1098	2	NNC	ENSMUSG00000097068.3	novel	1619	4	NA	NA	11	-11041	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATCTCTTGTGAAGATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92242250	92264943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_92242465_92264059
tx.6735	chr15	-	2156	5	FSM	ENSMUSG00000022634.10	ENSMUST00000133736.2	1870	5	103	-389	-24	386	multi-exon	TRUE	canonical	3	44	junction_2	48.2875501552937	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCTCAGATACCTCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93234713	93181772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_93183504_93184290_93184444_93215419_93215490_93234220_93234347_93234637
tx.6736	chr15	-	1637	3	ISM	ENSMUSG00000022634.10	ENSMUST00000080299.7	1676	4	328	2	328	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	141	junction_2	7.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTTGCATTTTGTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93234361	93182160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_93183504_93184290_93184444_93234220
tx.6737	chr15	-	1701	4	FSM	ENSMUSG00000022634.10	ENSMUST00000080299.7	1676	4	-27	2	-27	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_3	11.0453610171873	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTTTTGCATTTTGTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93234716	93182160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_93183504_93184290_93184444_93234220_93234347_93234637
tx.6738	chr15	-	830	7	NNC	ENSMUSG00000022635.10	novel	877	8	NA	NA	-8	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	256.711035126181	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTTGTGGAATAGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296190	93283990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_93284168_93285457_93285534_93285627_93285741_93288931_93289040_93289334_93289447_93295039_93295137_93296043
tx.6739	chr15	-	912	9	NNC	ENSMUSG00000022635.10	novel	877	8	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	285.365965691426	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTTGTGGAATAGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296192	93283990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_93284168_93285457_93285534_93285627_93285741_93288931_93289040_93289334_93289447_93291583_93291646_93293467_93293497_93295050_93295137_93296043
tx.674	chr1	-	509	2	Intergenic	novelGene_60	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAATGTTATCATGATACAG	6628	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131821199	131802030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_131802419_131821078
tx.6740	chr15	-	850	8	FSM	ENSMUSG00000022635.10	ENSMUST00000076070.9	877	8	23	4	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	583	junction_1	44.8289265214016	936	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTTGTGGAATAGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296192	93283990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_93284168_93285457_93285534_93285627_93285741_93288931_93289040_93289334_93289447_93293467_93293497_93295050_93295137_93296043
tx.6741	chr15	-	738	7	NIC	ENSMUSG00000022635.10	novel	877	8	NA	NA	-10	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	43	junction_4	235.838515844116	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGTTGTGGAATAGTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296192	93283990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_93284168_93285457_93285534_93285627_93285741_93288931_93289040_93293467_93293497_93295050_93295137_93296043
tx.6742	chr15	+	1207	9	FSM	ENSMUSG00000036167.17	ENSMUST00000068457.15	3351	9	-38	2182	12	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_4	61.4527257328754	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTATCTTAATTAGAATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296242	93387197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_93296343_93308572_93308665_93321894_93321957_93339381_93339594_93349997_93350055_93353331_93353412_93357552_93357673_93362985_93363127_93386854
tx.6743	chr15	+	1033	7	NIC	ENSMUSG00000036167.17	novel	1154	8	NA	NA	12	11	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	68	junction_5	39.6722685120083	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAATTAGAATGTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296242	93387200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_93296343_93308572_93308665_93321894_93321957_93339381_93339594_93353331_93353412_93362985_93363127_93386854
tx.6744	chr15	+	1360	9	NIC	ENSMUSG00000036167.17	novel	3573	10	NA	NA	12	11	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	55	junction_3	46.1078897803836	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAATTAGAATGTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296242	93387200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_93296343_93308572_93308665_93318164_93318372_93321894_93321957_93339381_93339594_93353331_93353412_93357552_93357673_93362985_93363127_93386854
tx.6745	chr15	+	1153	8	FSM	ENSMUSG00000036167.17	ENSMUST00000109256.11	1154	8	12	-11	12	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	108	junction_5	28.6199587843226	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAATTAGAATGTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296242	93387200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_93296343_93308572_93308665_93321894_93321957_93339381_93339594_93353331_93353412_93357552_93357673_93362985_93363127_93386854
tx.6746	chr15	+	1240	8	NIC	ENSMUSG00000036167.17	novel	3573	10	NA	NA	12	11	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	55	junction_3	53.2326430464831	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTAATTAGAATGTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93296242	93387200	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_93296343_93308572_93308665_93318164_93318372_93321894_93321957_93339381_93339594_93353331_93353412_93362985_93363127_93386854
tx.6747	chr15	-	2711	2	ISM	ENSMUSG00000036158.13	ENSMUST00000109255.3	4144	8	16046	-3	16046	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCGAGTCCGCATCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93401358	93396991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_93399185_93400840
tx.6748	chr15	-	2793	9	FSM	ENSMUSG00000033356.4	ENSMUST00000049151.4	2840	9	47	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_8	4.64858849544676	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGAATTGTCTCTATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94441381	94420568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_94421533_94423671_94423726_94425677_94425956_94427336_94427419_94429454_94429554_94431364_94431558_94434394_94434555_94437933_94438856_94441340
tx.6749	chr15	-	2747	8	ISM	ENSMUSG00000033356.4	ENSMUST00000049151.4	2840	9	2571	7	2510	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_6	2.1189138534559	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACTATCGAATTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94438857	94420575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_94421533_94423671_94423726_94425677_94425956_94427336_94427419_94429454_94429554_94431364_94431558_94434394_94434555_94437933
tx.675	chr1	+	693	3	Intergenic	novelGene_61	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	1	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCTTTAGAATAAAGCCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131807796	131812564	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_131807860_131811662_131811895_131812166
tx.6751	chr15	+	1547	10	NNC	ENSMUSG00000059883.17	novel	2831	12	NA	NA	-14	5180	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	7	junction_3	9.63788819653397	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGCTTTGTCTTGGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94441509	94460014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_94441708_94445716_94445885_94449683_94449830_94451715_94451899_94452566_94452728_94454507_94454573_94456130_94456246_94456649_94456760_94459326_94459511_94459797
tx.6752	chr15	+	1832	9	ISM	ENSMUSG00000059883.17	ENSMUST00000074936.10	2831	12	10080	613	10051	-613	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_8	12.598983093885	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACATGAGTGGAATCTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94451603	94465574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_94451899_94452566_94452728_94454507_94454573_94456130_94456246_94456649_94456760_94459326_94459511_94460898_94460962_94464619_94464779_94464894
tx.6753	chr15	-	2989	9	FSM	ENSMUSG00000022451.13	ENSMUST00000023087.13	3025	9	33	3	33	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	499	junction_8	20.6333316505115	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGAGTTGTGTATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94487727	94475834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_94477872_94478824_94478947_94479097_94479249_94480630_94480757_94482261_94482367_94483328_94483425_94484238_94484418_94486108_94486187_94487632
tx.6754	chr15	-	2914	8	NIC	ENSMUSG00000022451.13	novel	3025	9	NA	NA	30	-3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	38	junction_7	174.476242462043	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGAGTTGTGTATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94487730	94475834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_94477872_94478824_94478947_94479097_94479249_94480630_94480757_94482261_94482367_94483328_94483425_94484238_94484418_94487632
tx.6755	chr15	+	624	4	NNC	ENSMUSG00000063296.6	novel	2717	8	NA	NA	-6	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_3	46.5044800709208	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AACCAAAACCCCACAGCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94527124	94615048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_94527184_94535941_94536245_94612742_94612876_94614919
tx.6756	chr15	-	907	3	FSM	ENSMUSG00000045608.8	ENSMUST00000229611.2	477	3	-57	-373	-57	373	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_2	14.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTCCAAGTTTTATATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95530766	95522245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_95522899_95530158_95530347_95530700
tx.6757	chr15	+	810	2	FSM	ENSMUSG00000064210.8	ENSMUST00000226682.2	480	2	-59	-271	-6	271	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAATCGTGTCTTTCGCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95688717	95729114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_95688938_95728524
tx.6759	chr15	-	870	3	NNC	ENSMUSG00000097536.3	novel	2449	7	NA	NA	85583	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTTGAAGGTTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96095906	96032697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_96033410_96034739_96034810_96095818
tx.676	chr1	+	954	7	FSM	ENSMUSG00000026434.13	ENSMUST00000189946.7	2375	7	118	1303	96	-1303	multi-exon	FALSE	canonical	3	331	junction_5	461.648284832608	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGGGTTTTTTTTTTGTT	9400	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131838389	131859114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_131838489_131846742_131846793_131849680_131849787_131852323_131852380_131855801_131855955_131857353_131857501_131858771
tx.6760	chr15	+	417	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000097536.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAGCAGCACTCCTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96080409	96089528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_96080575_96080750_96080932_96089457
tx.6761	chr15	+	582	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000097536.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTAAGCAGCACTCCTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96080420	96089528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_96080932_96089457
tx.6763	chr15	+	743	5	ISM	ENSMUSG00000033237.20	ENSMUST00000096250.5	8507	21	103360	2681	12119	-1290	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_4	7.25861557047899	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAACAAAAACTGCTGTGG	1046	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96288813	96300192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_96288896_96288984_96289071_96290235_96290360_96290453_96290546_96299833
tx.6764	chr15	-	1016	5	ISM	ENSMUSG00000033228.9	ENSMUST00000047835.8	5766	15	42733	916	582	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_2	73.1864058415222	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGTAATGGGATGTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96315991	96312452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_96312798_96312912_96313033_96313657_96313829_96314729_96315071_96315952
tx.6765	chr15	-	1118	5	FSM	ENSMUSG00000033228.9	ENSMUST00000228072.2	4519	5	528	2873	528	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	104.145331148352	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTGTAATGGGATGTGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96316045	96312452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_96312798_96312912_96313033_96313609_96313829_96314729_96315071_96315952
tx.6766	chr15	+	2539	2	FSM	ENSMUSG00000116160.2	ENSMUST00000229356.2	632	2	-34	-1873	-34	1873	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTACTCTGAACTTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96395748	96398642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_96395869_96396223
tx.6767	chr15	-	2752	16	FSM	ENSMUSG00000023169.16	ENSMUST00000100262.4	3183	16	428	3	428	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	92	junction_15	98.2259074220691	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAACAATGGTTTGTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96539415	96473870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_96474694_96476410_96476509_96476601_96476744_96477195_96477315_96482224_96482326_96483430_96483511_96484742_96484854_96484972_96485032_96486808_96486892_96487940_96488023_96488300_96488394_96490387_96490462_96507736_96507853_96514022_96514099_96521836_96522051_96538934
tx.6768	chr15	-	2688	16	FSM	ENSMUSG00000023169.16	ENSMUST00000088452.11	7266	16	6	4572	6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_15	89.8033901859439	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGGAACAATGGTTTGTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96540788	96473870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_96474694_96476410_96476509_96476601_96476744_96477195_96477315_96482224_96482326_96483430_96483511_96484742_96484854_96484972_96485032_96486808_96486892_96487940_96488023_96488300_96488394_96490387_96490462_96507736_96507853_96514022_96514099_96521836_96522051_96540371
tx.6769	chr15	-	2509	16	FSM	ENSMUSG00000023169.16	ENSMUST00000088454.13	6966	16	-123	4580	26	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_15	70.2442089348929	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGATCTCAGGAACAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96540254	96473878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_96474694_96476410_96476509_96476601_96476744_96477195_96477315_96482224_96482326_96483430_96483511_96484742_96484854_96484972_96485032_96486808_96486892_96487940_96488023_96488300_96488394_96490387_96490462_96507736_96507853_96514022_96514099_96521836_96522051_96540008
tx.677	chr1	+	581	6	ISM	ENSMUSG00000026434.13	ENSMUST00000062264.8	5998	7	96	6592	96	-342	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1163	junction_5	193.114059560665	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAAAATGCCCAAACCCAGA	9400	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131838389	131857467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_131838489_131846742_131846793_131849680_131849787_131852323_131852380_131855801_131855955_131857350
tx.6771	chr15	-	674	2	ISM	ENSMUSG00000022462.8	ENSMUST00000229141.2	6116	10	-171	8173	-171	-8173	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	311	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGCAACTTGCGGTTCAA	821	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96596743	96595718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_96596145_96596495
tx.6772	chr15	-	929	3	NIC	ENSMUSG00000022462.8	novel	4660	16	NA	NA	21	-8175	intron_retention	FALSE	canonical	3	252	junction_2	29.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAGCAACTTGCGGTTC	NA	False	NA	-83	True	NA	NA	NA	96597590	96595720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_96596145_96596495_96596699_96597288
tx.6773	chr15	-	784	4	ISM	ENSMUSG00000022462.8	ENSMUST00000023099.8	4660	16	21	10449	21	-8176	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	252	junction_3	28.8020061029706	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAAGCAACTTGCGGTT	NA	False	NA	-83	True	NA	NA	NA	96597590	96595721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_96595919_96596062_96596145_96596495_96596699_96597288
tx.6774	chr15	-	547	2	ISM	ENSMUSG00000022462.8	ENSMUST00000023099.8	4660	16	21	11181	21	-8908	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	252	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCTTGCACACACGGGTGC	NA	False	NA	-83	True	NA	NA	NA	96597590	96596453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_96596699_96597288
tx.6775	chr15	-	1823	15	FSM	ENSMUSG00000022464.15	ENSMUST00000231039.2	3923	15	152	1948	152	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1416	junction_8	96.7698721879145	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGCCGTGCAGTGCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96917680	96894648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_96894973_96896323_96896422_96897369_96897515_96903700_96903826_96906293_96906395_96906538_96906619_96906743_96907020_96907827_96907887_96907995_96908079_96908164_96908247_96910780_96910874_96911318_96911393_96914008_96914125_96914641_96914733_96917604
tx.6776	chr15	-	1987	16	FSM	ENSMUSG00000022464.15	ENSMUST00000023101.10	3932	16	0	1945	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1416	junction_8	94.9644143877063	142	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGCCGTGCAGTGCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96953837	96894648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_96894973_96896323_96896422_96897369_96897515_96903700_96903826_96906293_96906395_96906538_96906619_96906743_96907020_96907827_96907887_96907995_96908079_96908164_96908247_96910780_96910874_96911318_96911393_96914008_96914125_96914641_96914733_96917604_96917743_96953735
tx.6777	chr15	-	629	3	Intergenic	novelGene_583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATCTATCTATCCCACTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96983854	96967940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_96968444_96980507_96980562_96983782
tx.6778	chr15	-	815	3	Intergenic	novelGene_585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_2	5.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAGTTTCTAGAATTTGTC	1701	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97029512	97026296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_97026566_97026963_97027102_97029104
tx.6779	chr15	-	1448	2	Intergenic	novelGene_586	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAGTTTCTAGAATTTGTC	1466	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97029747	97026296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_97027102_97029104
tx.678	chr1	+	940	7	FSM	ENSMUSG00000026434.13	ENSMUST00000062264.8	5998	7	95	4963	95	1287	multi-exon	FALSE	canonical	3	1163	junction_5	186.902306626275	326	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCATTGGGTTTTTTGTTTGT	9399	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	131838388	131859096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_131838489_131846742_131846793_131849680_131849787_131852323_131852380_131855801_131855955_131857350_131857501_131858771
tx.6780	chr15	-	1048	3	Intergenic	novelGene_587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAGTTTCTAGAATTTGTC	1455	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97029758	97026296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_97027102_97029104_97029265_97029675
tx.6781	chr15	-	826	3	FSM	ENSMUSG00000116295.2	ENSMUST00000231024.2	655	3	-19	-152	-19	152	multi-exon	FALSE	canonical	3	219	junction_1	244.5	428	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGTATTTAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97065144	97058661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_97059277_97064383_97064508_97065057
tx.6782	chr15	-	807	3	NIC	ENSMUSG00000116295.2	novel	510	4	NA	NA	-17	151	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	219	junction_1	28	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAGTATTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97065142	97058662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_97059277_97064383_97064492_97065057
tx.6783	chr15	-	953	4	NIC	ENSMUSG00000116295.2	novel	510	4	NA	NA	-20	150	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	708	junction_3	16.5797734872612	767	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAGTATTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97065145	97058663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_97059277_97059835_97059964_97064383_97064508_97065057
tx.6784	chr15	-	937	4	FSM	ENSMUSG00000116295.2	ENSMUST00000229999.2	510	4	-22	-405	-21	149	multi-exon	FALSE	canonical	3	275	junction_3	214.206027511418	299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAGTATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97065146	97058664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_97059277_97059835_97059964_97064383_97064492_97065057
tx.6785	chr15	+	820	2	Intergenic	novelGene_588	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTGAGTCTATTTTAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97070618	97071784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_+_97070924_97071269
tx.6787	chr15	-	508	3	Intergenic	novelGene_589	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTTGTATTCAGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97302468	97299678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_97299826_97301709_97301808_97302205
tx.6788	chr15	-	350	3	Intergenic	novelGene_590	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_1	3.5	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTTTGTATTCAGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97302471	97299678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr15_-_97299826_97301709_97301808_97302366
tx.679	chr1	-	274	2	ISM	ENSMUSG00000026437.12	ENSMUST00000189733.2	509	3	687	-133	687	30	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	168	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGTTGGTAGCATTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132043306	132042538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_132042709_132043202
tx.6790	chr15	-	2262	17	FSM	ENSMUSG00000022466.7	ENSMUST00000023104.7	2271	17	5	4	5	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_16	35.978292066189	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTATAAGGGTCGATATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97603701	97572981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_97573261_97576266_97576368_97576950_97577049_97578215_97578403_97579499_97579721_97581707_97581807_97581913_97581985_97584322_97584445_97585991_97586120_97589062_97589192_97591094_97591166_97591984_97592107_97594378_97594507_97596796_97596920_97598948_97599093_97601082_97601251_97603630
tx.6791	chr15	-	2194	16	ISM	ENSMUSG00000022466.7	ENSMUST00000023104.7	2271	17	2455	2	2455	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	254	junction_7	32.2446205677095	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAAGGGTCGATATTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97601251	97572979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_97573261_97576266_97576368_97576950_97577049_97578215_97578403_97579499_97579721_97581707_97581807_97581913_97581985_97584322_97584445_97585991_97586120_97589062_97589192_97591094_97591166_97591984_97592107_97594378_97594507_97596796_97596920_97598948_97599093_97601082
tx.6792	chr15	+	1618	3	FSM	ENSMUSG00000081534.4	ENSMUST00000117892.2	2536	3	34	884	34	561	multi-exon	TRUE	canonical	3	145	junction_2	1	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCAGGGTGTTTCTTTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97682269	97689689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_97682498_97687783_97687952_97688467
tx.6794	chr15	+	1449	8	FSM	ENSMUSG00000052369.9	ENSMUST00000229428.2	1455	8	8	-2	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_1	28.3318527024094	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCACTGTCTCTGACTGCC	7688	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97862117	97868157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_97862217_97862720_97862912_97864127_97864192_97864817_97864978_97865067_97865209_97865957_97866008_97866489_97866544_97867467
tx.6795	chr15	+	1603	8	FSM	ENSMUSG00000052369.9	ENSMUST00000064200.9	1623	8	22	-2	-4	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	38.9117263685331	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCACTGTCTCTGACTGCCT	7703	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97862132	97868158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_97862385_97862720_97862912_97864127_97864192_97864817_97864978_97865067_97865209_97865957_97866008_97866489_97866544_97867467
tx.6796	chr15	+	1555	7	NIC	ENSMUSG00000052369.9	novel	1623	8	NA	NA	-8	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_5	66.079917944528	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCACTGTCTCTGACTGC	7699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97862128	97868156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_97862385_97862720_97862912_97864127_97864192_97864817_97864978_97865067_97865209_97866489_97866544_97867467
tx.6797	chr15	+	1381	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022483.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTTTGTTCTCTCTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97891046	97895555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_+_97891628_97894755
tx.68	chr1	+	1638	3	FSM	ENSMUSG00000025940.7	ENSMUST00000065373.6	1710	3	-6	78	-3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	512	junction_1	10.5	1150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCCAGTATGTGTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16735427	16748421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_16735730_16737891_16737998_16747191
tx.680	chr1	-	498	4	NNC	ENSMUSG00000101549.2	novel	359	4	NA	NA	1954	6210	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	85	junction_1	10.077477638554	992	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCCTTCTTAATTTCGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132206195	132196243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_132196405_132202453_132202560_132202761_132202875_132206077
tx.6801	chr15	+	1225	7	ISM	ENSMUSG00000033065.15	ENSMUST00000051226.8	2879	23	19147	-6	19147	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	97	junction_3	9.49853789918334	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGGGCGCTCTTGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98025493	98030328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_98025641_98026059_98026225_98027146_98027209_98027602_98027715_98029299_98029400_98029482_98029589_98029795
tx.6802	chr15	+	891	4	ISM	ENSMUSG00000033065.15	ENSMUST00000051226.8	2879	23	21214	-4	21214	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	100	junction_3	8.9938250421547	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGGGCGCTCTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98027560	98030326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_98027715_98029299_98029400_98029482_98029589_98029795
tx.6803	chr15	-	2072	3	ISM	ENSMUSG00000048175.14	ENSMUST00000059112.12	1049	4	2844	-1077	2844	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_2	11	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGCCACTTCCAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98040696	98032517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_98034320_98039164_98039270_98040531
tx.6804	chr15	-	2167	4	FSM	ENSMUSG00000048175.14	ENSMUST00000123626.8	1100	4	10	-1077	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_3	16.7531091641721	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGCCACTTCCAGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98043577	98032517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98034320_98039164_98039270_98040531_98040696_98043481
tx.6805	chr15	-	2136	10	NIC	ENSMUSG00000022992.18	novel	3596	10	NA	NA	-29	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	77	junction_9	343.824388135198	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATCTGGATCGATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98432174	98416688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_98417429_98418198_98418307_98422339_98422594_98424455_98424553_98426743_98426911_98427170_98427335_98429203_98429319_98429600_98429780_98431398_98431658_98432121
tx.6806	chr15	-	2218	9	ISM	ENSMUSG00000022992.18	ENSMUST00000230542.2	3596	10	353	1150	333	0	intron_retention	FALSE	canonical	1	385	junction_5	243.009130486902	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATCTGGATCGATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98431792	98416688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_98417429_98418198_98418307_98422339_98422594_98424455_98424553_98426743_98426911_98427170_98427335_98429203_98429319_98429600_98429780_98431398
tx.6807	chr15	-	2180	10	FSM	ENSMUSG00000022992.18	ENSMUST00000230542.2	3596	10	266	1150	246	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	385	junction_5	229.121025758101	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATCTGGATCGATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98431879	98416688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98417429_98418198_98418307_98422339_98422594_98424455_98424553_98426743_98426911_98427170_98427335_98429203_98429319_98429600_98429780_98431398_98431658_98431782
tx.6808	chr15	-	2030	10	NIC	ENSMUSG00000022992.18	novel	2324	10	NA	NA	-25	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	77	junction_9	387.907205398405	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGATCTGGATCGATTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98432170	98416688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_98417429_98418198_98418307_98422441_98422594_98424455_98424553_98426743_98426911_98427170_98427335_98429203_98429319_98429600_98429780_98431398_98431658_98432121
tx.6809	chr15	-	2153	8	FSM	ENSMUSG00000011960.13	ENSMUST00000168928.8	2011	8	-122	-20	-78	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	14.8681278071516	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AGAGGCAAAAACTTCAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98465639	98441071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98442490_98444404_98444476_98446546_98446593_98449794_98449858_98452481_98452543_98458077_98458207_98462927_98463010_98465356
tx.681	chr1	-	597	5	NNC	ENSMUSG00000101549.2	novel	359	4	NA	NA	1953	6210	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	24	junction_2	39.6169155790806	353	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACCCTTCTTAATTTCGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132206196	132196243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_132196405_132196619_132196718_132202453_132202560_132202761_132202875_132206077
tx.6810	chr15	-	2291	9	FSM	ENSMUSG00000011960.13	ENSMUST00000012104.7	2175	9	-100	-16	-56	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	11.1439445440113	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGAGGCAAAAACTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98465617	98441075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98442490_98444404_98444476_98444625_98444790_98446546_98446593_98449794_98449858_98452481_98452543_98458077_98458207_98462927_98463010_98465356
tx.6811	chr15	-	1110	6	NNC	ENSMUSG00000011960.13	novel	2015	3	NA	NA	-63	-2481	intron_retention	FALSE	canonical	3	14	junction_1	12.5123938556936	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTTGAATTTATTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98465624	98449013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_98449521_98449794_98449858_98452481_98452543_98458077_98458207_98462927_98463010_98465356
tx.6813	chr15	-	399	3	ISM	ENSMUSG00000003360.16	ENSMUST00000161030.2	793	5	-20	4383	-10	77	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_2	4	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGGAGTGACTGGGGTTA	6984	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98560785	98554482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_98554594_98556110_98556317_98560703
tx.6814	chr15	-	1633	5	FSM	ENSMUSG00000054855.14	ENSMUST00000003451.11	2203	5	0	570	0	-570	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	4.54835134966506	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGGTGGGGTTTTGTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98575342	98567655	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98568724_98570391_98570527_98571726_98571837_98574367_98574456_98575110
tx.6815	chr15	-	712	6	FSM	ENSMUSG00000003355.8	ENSMUST00000003445.8	734	6	24	-2	-22	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	632	junction_4	33.5177564881661	1491	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTTGTATTTTTCACTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98626055	98622248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98622484_98624364_98624436_98624780_98624815_98625091_98625180_98625563_98625630_98625837
tx.6816	chr15	-	690	5	NNC	ENSMUSG00000003355.8	novel	734	6	NA	NA	-23	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	293.574841394831	130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACGTTGTATTTTTCACTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98626056	98622248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_98622484_98624364_98624436_98625080_98625180_98625563_98625630_98625837
tx.6817	chr15	+	414	2	NNC	ENSMUSG00000097414.3	novel	334	2	NA	NA	-29	-365	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACTTGTGCAGAGCTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98704875	98710891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_98705106_98710707
tx.6818	chr15	-	871	3	ISM	ENSMUSG00000067713.8	ENSMUST00000229544.2	862	8	1666	-589	1666	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	338	junction_2	29	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAGTGTTTGATTTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98711926	98710677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_98711362_98711477_98711625_98711886
tx.6819	chr15	-	1561	11	ISM	ENSMUSG00000067713.8	ENSMUST00000168846.3	1652	12	5787	0	394	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	338	junction_2	19.5757503049053	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAGTGTTTGATTTCTGC	4538	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98723615	98710677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_98711362_98711477_98711625_98711886_98711925_98712068_98712235_98712389_98712517_98713063_98713119_98713194_98713241_98713377_98713437_98713539_98713622_98713756_98713867_98723568
tx.682	chr1	+	1071	2	ISM	ENSMUSG00000042115.5	ENSMUST00000046071.5	4269	5	5100	1793	5100	-1793	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGGCATCTTTATCCCTGT	5133	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132231463	132233302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_132231569_132232336
tx.6820	chr15	-	1620	12	FSM	ENSMUSG00000067713.8	ENSMUST00000168846.3	1652	12	32	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	244	junction_11	39.9075377622816	420	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCAGTGTTTGATTTCTGC	9381	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98729370	98710677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98711362_98711477_98711625_98711886_98711925_98712068_98712235_98712389_98712517_98713063_98713119_98713194_98713241_98713377_98713437_98713539_98713622_98713756_98713867_98723568_98723615_98729310
tx.6821	chr15	-	1539	12	ISM	ENSMUSG00000022999.16	ENSMUST00000109127.8	2548	17	4612	-6	-2140	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_9	7.86245393106896	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTCCCTGTGTCTATCT	8	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98809481	98801795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_98802390_98802545_98802708_98803796_98803864_98804124_98804216_98805417_98805492_98805774_98805853_98806400_98806478_98806556_98806641_98806729_98806803_98807083_98807149_98807268_98807338_98809376
tx.6822	chr15	-	2171	17	FSM	ENSMUSG00000022999.16	ENSMUST00000023736.10	2304	17	133	0	-43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_9	10.4395581803063	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCTTGTCCCTGTGTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98815979	98801797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98802390_98802545_98802708_98803796_98803864_98804124_98804216_98805417_98805492_98805774_98805853_98806400_98806478_98806556_98806641_98806729_98806803_98807083_98807149_98807268_98807338_98809376_98809504_98810024_98810129_98810278_98810419_98811437_98811472_98813017_98813103_98815730
tx.6823	chr15	-	1612	4	FSM	ENSMUSG00000023004.9	ENSMUST00000077577.8	1743	4	129	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3388	junction_1	4057.60923040485	7074	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTTTCTGGATACTTT	160	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98832317	98829307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98830444_98830572_98830722_98830853_98831077_98832213
tx.6824	chr15	-	1651	4	FSM	ENSMUSG00000072235.7	ENSMUST00000097014.7	1803	4	152	0	152	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1268	junction_3	1593.04014038846	2552	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGTCTTGTGTTCTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98851432	98847717	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_98848896_98849068_98849218_98849349_98849573_98851331
tx.6825	chr15	+	1555	4	FSM	ENSMUSG00000043091.10	ENSMUST00000058914.10	1982	4	430	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	774	junction_1	4660.1984459415	2275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCATCTGGTTCATAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98928201	98935994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_98928306_98931974_98932198_98932329_98932479_98934915
tx.6826	chr15	+	2265	14	FSM	ENSMUSG00000032783.10	ENSMUST00000230054.2	2639	14	374	0	-29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	17.6655315775427	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGCAGCCAGTGCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98972829	98981290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_98972949_98973230_98973380_98973488_98973679_98975168_98975327_98975409_98975548_98975712_98975793_98976127_98976205_98976664_98976784_98978746_98978831_98979071_98979132_98979715_98979851_98980006_98980587_98980789_98980984_98981108
tx.6827	chr15	+	734	3	FSM	ENSMUSG00000032783.10	ENSMUST00000230868.2	714	3	-2	-18	-2	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_1	11	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGGGCCTTTTTAGCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98972865	98973965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_98972974_98973230_98973380_98973488
tx.6828	chr15	+	2248	14	FSM	ENSMUSG00000032783.10	ENSMUST00000039665.8	2255	14	13	-6	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_1	8.88852727732572	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGCAGCCAGTGCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98972871	98981290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_98972974_98973230_98973380_98973488_98973679_98975168_98975327_98975409_98975548_98975712_98975793_98976127_98976205_98976664_98976784_98978746_98978831_98979071_98979132_98979715_98979851_98980006_98980587_98980789_98980984_98981108
tx.6829	chr15	+	1434	8	ISM	ENSMUSG00000032783.10	ENSMUST00000039665.8	2255	14	3266	-6	3214	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_4	9.22728872111722	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGCAGCCAGTGCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98976124	98981290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_98976205_98976664_98976784_98978746_98978831_98979071_98979132_98979715_98979851_98980006_98980587_98980789_98980984_98981108
tx.683	chr1	-	2397	3	ISM	ENSMUSG00000042066.17	ENSMUST00000136828.3	2771	4	6040	-1	3916	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	27	junction_2	1.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTCTGAGGTCTGCTGA	3016	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132288770	132284052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_132285556_132286640_132286777_132288012
tx.6830	chr15	+	221	2	FSM	ENSMUSG00000032783.10	ENSMUST00000229224.2	451	2	232	-2	232	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGCAGCCAGTGCTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98980944	98981290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_98980984_98981108
tx.6831	chr15	+	1424	3	NIC	ENSMUSG00000038009.8	novel	381	3	NA	NA	-147	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	6	junction_1	26	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCACGGAATCCTAGCCCA	3876	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98997145	99002618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_98997195_98998703_98999657_99002196
tx.6832	chr15	+	1543	3	FSM	ENSMUSG00000038009.8	ENSMUST00000061295.7	1564	3	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_1	3.5	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACCACGGAATCCTAGCCCA	4044	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	98997313	99002618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_98997482_98998703_98999657_99002196
tx.6833	chr15	-	1365	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000038009.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATCCTTAGGCCTGAGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99002628	98998715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_98999645_99002192
tx.6834	chr15	+	2918	13	FSM	ENSMUSG00000051934.6	ENSMUST00000063517.6	3096	13	170	8	-68	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	296	junction_2	25.9147909289056	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACGTGACTCCTTAGCGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99024606	99111088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_99024769_99047514_99047812_99064960_99065041_99071282_99071392_99072282_99072333_99076187_99076447_99078461_99078642_99083839_99083976_99097088_99097148_99103478_99103589_99106713_99106817_99108762_99108978_99109930
tx.6835	chr15	+	1030	5	NNC	ENSMUSG00000037579.8	novel	572	2	NA	NA	-377	73	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	11.8953772533703	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATAGCCTCAGCAAGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99122364	99126774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_99122471_99124188_99124423_99124861_99124997_99125789_99125924_99126353
tx.6836	chr15	+	1076	5	NNC	ENSMUSG00000037579.8	novel	572	2	NA	NA	-304	78	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	10.2225241501304	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCAGCAAGCCTCAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99122437	99126779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_99122585_99124188_99124423_99124861_99124997_99125789_99125924_99126353
tx.6837	chr15	-	1902	15	FSM	ENSMUSG00000037570.17	ENSMUST00000041190.17	1916	15	12	2	3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	647	junction_2	85.1129201923742	243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTTCTTTTATTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99149830	99140699	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_99141102_99141198_99141327_99141560_99141649_99141805_99141889_99142025_99142119_99142228_99142258_99142528_99142605_99144807_99144947_99145159_99145269_99146331_99146442_99146582_99146742_99147248_99147388_99147756_99147896_99148343_99148464_99149742
tx.6838	chr15	+	1241	7	ISM	ENSMUSG00000023007.16	ENSMUST00000023745.13	2619	25	11572	-515	-13	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_2	37.578436488083	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAACTCCTTTGTCCTCTTC	212	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99212735	99214895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99212862_99213071_99213168_99213363_99213451_99213603_99213782_99213967_99214030_99214123_99214262_99214341
tx.6839	chr15	+	997	10	FSM	ENSMUSG00000023010.16	ENSMUST00000023749.15	2452	10	103	1352	-1	-56	multi-exon	FALSE	canonical	3	1506	junction_9	135.383406171756	877	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGGTTCTTCCCCGTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99290865	99306578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_99290922_99299460_99299545_99299941_99300051_99302294_99302416_99303597_99303647_99303741_99303840_99304032_99304113_99304457_99304559_99305148_99305225_99306355
tx.684	chr1	-	1254	2	FSM	ENSMUSG00000097760.3	ENSMUST00000180835.2	1540	2	17	269	17	-269	multi-exon	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTATTCTATACACTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132404766	132394439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_132395387_132404459
tx.6840	chr15	+	2434	10	FSM	ENSMUSG00000023010.16	ENSMUST00000159209.8	944	10	19	-1509	19	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_1	555.512064964378	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGCTGGTGTCTCAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99291118	99307925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_99291265_99299460_99299545_99299941_99300051_99302294_99302416_99303597_99303647_99303741_99303840_99304032_99304113_99304457_99304559_99305148_99305225_99306355
tx.6841	chr15	+	2271	9	ISM	ENSMUSG00000023010.16	ENSMUST00000023749.15	2452	10	8696	24	493	-24	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1506	junction_8	141.701049749111	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATAAAGAAAATTCCTTAACC	4213	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99299458	99307906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99299545_99299941_99300051_99302294_99302416_99303597_99303647_99303741_99303840_99304032_99304113_99304457_99304559_99305148_99305225_99306355
tx.6842	chr15	-	1260	2	FSM	ENSMUSG00000037525.6	ENSMUST00000040313.6	1276	2	16	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_1	0	206	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGCTGTGTCGTTTCTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99372595	99367959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_99368961_99372336
tx.6843	chr15	-	2898	17	FSM	ENSMUSG00000023015.15	ENSMUST00000023756.12	2933	17	33	2	-11	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	453	junction_16	66.1194172974173	196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAAGTGATGTTGGTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99549504	99518379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_99519346_99520099_99520206_99521449_99521574_99521807_99521941_99522118_99522225_99524063_99524263_99524342_99524439_99526514_99526680_99528989_99529121_99529960_99530079_99530595_99530677_99532122_99532177_99534012_99534083_99535518_99535656_99537494_99537701_99540763_99540853_99549387
tx.6844	chr15	-	3030	18	FSM	ENSMUSG00000023015.15	ENSMUST00000171702.8	3052	18	22	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_16	174.822975218819	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGATGTTGGTTTTCTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99549502	99518376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_99519346_99520099_99520206_99521449_99521574_99521807_99521941_99522118_99522225_99524063_99524263_99524342_99524439_99526514_99526680_99528989_99529121_99529960_99530079_99530595_99530677_99532122_99532177_99534012_99534083_99535518_99535656_99537494_99537701_99540763_99540853_99541273_99541405_99549387
tx.6845	chr15	+	402	2	ISM	ENSMUSG00000023017.11	ENSMUST00000227670.2	2788	8	3626	1779	3626	213	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	4228	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99596696	99597232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99596781_99596914
tx.6846	chr15	+	400	2	ISM	ENSMUSG00000023018.6	ENSMUST00000229236.2	1842	12	-4	9518	-4	-507	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	287	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAAGATGACCCCTGGGGGT	7699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99600167	99601174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99600380_99600986
tx.6847	chr15	-	840	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000115938.2_ENSMUSG00000092014.2	novel	294	1	NA	NA	-21	82	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAGAAACCTAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99708484	99604360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr15_-_99604742_99708025
tx.6848	chr15	+	606	2	FSM	ENSMUSG00000023020.4	ENSMUST00000023761.4	2090	2	0	1484	0	478	multi-exon	FALSE	canonical	3	1440	junction_1	0	4434	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTTTTAGTGGTTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99623527	99625929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_99623730_99625525
tx.6849	chr15	-	1958	10	FSM	ENSMUSG00000023021.16	ENSMUST00000023762.13	2096	10	140	-2	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	244	junction_2	16.8332416572494	433	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTGTCTCTTTAGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99670342	99633470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_99634318_99636545_99636703_99637286_99637394_99637482_99637612_99638824_99638918_99639489_99639541_99643769_99643828_99644917_99645049_99649116_99649223_99670063
tx.685	chr1	+	3395	14	NIC	ENSMUSG00000026439.15	novel	3385	15	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_3	94.1666657939292	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAGTATACATGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132405104	132433397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_132405266_132411789_132411816_132412483_132412540_132417325_132417467_132418160_132418324_132420290_132420401_132421552_132421673_132421758_132421913_132422007_132422080_132422594_132422713_132423943_132424014_132424536_132424767_132425667_132425746_132431501
tx.6850	chr15	-	1893	10	NIC	ENSMUSG00000023021.16	novel	2096	10	NA	NA	-22	2	intron_retention	FALSE	canonical	3	38	junction_2	75.4335616434901	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTGTCTCTTTAGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99670368	99633470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_99634318_99636545_99636612_99637286_99637394_99637482_99637612_99638824_99638918_99639489_99639541_99643769_99643828_99644917_99645049_99649116_99649223_99670063
tx.6851	chr15	-	4203	11	FSM	ENSMUSG00000023022.15	ENSMUST00000073691.5	4243	11	40	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	692	junction_4	128.449367456597	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCCAGTGTCCACACTGCT	7278	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99773297	99676350	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_99679172_99681400_99681535_99692289_99692400_99694622_99694681_99699991_99700094_99704303_99704453_99705539_99705625_99717374_99717840_99724672_99724719_99741555_99741705_99773213
tx.6852	chr15	-	664	2	FSM	ENSMUSG00000023022.15	ENSMUST00000171450.2	2680	2	5	2011	5	-2011	multi-exon	FALSE	canonical	3	1109	junction_1	0	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAGAAAAGAAAAGAAAA	7283	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99773292	99741119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_99741705_99773213
tx.6853	chr15	+	4477	16	NIC	ENSMUSG00000023025.17	novel	6530	16	NA	NA	-10	337	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	302	junction_1	90.2603641325102	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCACTTGATAAGGATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99870706	99912229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_99870865_99882797_99882937_99883918_99884075_99885283_99885360_99888173_99888311_99889605_99889710_99891203_99891315_99892544_99892599_99894347_99894558_99895253_99895358_99898716_99898930_99899682_99899732_99903121_99903284_99905487_99905610_99908172_99908342_99909716
tx.6854	chr15	+	915	7	ISM	ENSMUSG00000023025.17	ENSMUST00000230956.2	2192	15	-6	17227	-6	977	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	302	junction_1	130.68973010744	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTTGTATATGTTGTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99870710	99891352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99870865_99882797_99882937_99883918_99884075_99885283_99885360_99888173_99888311_99889605_99889710_99891203
tx.6855	chr15	+	1238	10	ISM	ENSMUSG00000023025.17	ENSMUST00000100206.4	6530	16	51	18885	-5	4979	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	323	junction_1	104.011751472824	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TCGGTAAGATCAAAAAAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99870711	99895354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99870865_99882800_99882937_99883918_99884075_99885283_99885360_99888173_99888311_99889605_99889710_99891203_99891315_99892544_99892599_99894347_99894558_99895253
tx.6856	chr15	+	826	4	ISM	ENSMUSG00000023025.17	ENSMUST00000229891.2	4207	5	-31	4707	1	-4705	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	302	junction_1	157.28177121191	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTTTTTAAGAGTTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99870718	99885668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99870865_99882797_99882937_99883918_99884075_99885283
tx.6857	chr15	+	622	5	ISM	ENSMUSG00000023025.17	ENSMUST00000229553.2	1420	6	1	2092	1	-2092	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	323	junction_1	130.062244713829	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACAGATTTAATTCTTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99870718	99888281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99870865_99882800_99882937_99883918_99884075_99885283_99885360_99888173
tx.6858	chr15	+	4464	16	FSM	ENSMUSG00000023025.17	ENSMUST00000100206.4	6530	16	57	2009	0	338	multi-exon	FALSE	canonical	3	323	junction_1	85.9835643209406	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACTTGATAAGGATTAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99870717	99912230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_99870865_99882800_99882937_99883918_99884075_99885283_99885360_99888173_99888311_99889605_99889710_99891203_99891315_99892544_99892599_99894347_99894558_99895253_99895358_99898716_99898930_99899682_99899732_99903121_99903284_99905487_99905610_99908172_99908342_99909716
tx.6859	chr15	+	1133	5	ISM	ENSMUSG00000023025.17	ENSMUST00000230956.2	2192	15	3	19789	2	-1583	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	302	junction_1	138.720041810836	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTGGTTGTGGATTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	99870719	99888790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_99870865_99882797_99882937_99883918_99884075_99885283_99885360_99888173
tx.686	chr1	+	3500	14	NIC	ENSMUSG00000026439.15	novel	3385	15	NA	NA	12	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	277	junction_4	39.7596328248497	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAGTATACATGCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132405116	132433397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_132405266_132411789_132411816_132412483_132412657_132417325_132417467_132418160_132418324_132420290_132420401_132421552_132421673_132421758_132421913_132422007_132422080_132422594_132422713_132423943_132424014_132424536_132424767_132425667_132425746_132431501
tx.6860	chr15	+	561	2	ISM	ENSMUSG00000023027.14	ENSMUST00000163855.8	831	6	-30	21397	22	38	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	255	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGAGCCAGGCGTTAGGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100125721	100130932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_100125964_100130613
tx.6861	chr15	+	2344	7	FSM	ENSMUSG00000023027.14	ENSMUST00000023769.11	2365	7	25	-4	25	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	255	junction_1	32.1334024895521	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTTCGGAATGCAAAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100125724	100159129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_100125964_100130613_100130713_100143125_100143227_100149949_100150081_100151974_100152155_100152234_100152395_100157695
tx.6862	chr15	+	1905	2	FSM	ENSMUSG00000054619.8	ENSMUST00000067752.5	1946	2	37	4	9	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGCTTGGCTGCATTTG	575	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100202678	100212232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_100203226_100210874
tx.6863	chr15	-	2908	18	NNC	ENSMUSG00000023030.17	novel	3025	17	NA	NA	-4	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	61.8741886808506	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTGTCTAGGGGTGCGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100320940	100285778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_100286319_100286443_100287043_100293150_100293205_100295544_100295699_100297294_100297369_100299148_100299299_100299432_100299553_100300178_100300266_100301061_100301221_100301688_100301845_100303452_100303525_100303624_100303696_100304160_100304268_100305981_100306102_100307080_100307207_100307963_100308113_100310071_100310144_100320842
tx.6864	chr15	-	2138	17	NNC	ENSMUSG00000023030.17	novel	3025	17	NA	NA	-18	-856	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	51.073476482417	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTCAGGTGAGTTAGGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100320901	100286634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_100287043_100293150_100293205_100295544_100295699_100297294_100297369_100299148_100299299_100299432_100299553_100300178_100300266_100301061_100301221_100301688_100301845_100303452_100303525_100303624_100303696_100304160_100304268_100305981_100306102_100307080_100307207_100307963_100308113_100310071_100310144_100320842
tx.6865	chr15	-	2050	16	NNC	ENSMUSG00000023030.17	novel	4415	16	NA	NA	26	-2396	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	46.9039680861036	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTAGCTTAGGCTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100320910	100292839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_100293205_100295544_100295699_100297294_100297369_100299148_100299299_100299432_100299553_100300178_100300266_100301061_100301221_100301688_100301845_100303452_100303525_100303624_100303696_100304160_100304268_100305981_100306102_100307080_100307207_100307963_100308113_100310071_100310144_100320842
tx.6866	chr15	+	2367	9	FSM	ENSMUSG00000037353.10	ENSMUST00000229648.2	1222	9	-56	-1089	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	16.3587705833904	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGGGAATTACTTATG	2363	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100366931	100377045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_100367020_100367565_100367718_100369540_100369657_100370429_100370513_100372903_100373091_100373186_100373289_100373382_100373536_100374670_100374768_100375656
tx.6867	chr15	+	2432	9	FSM	ENSMUSG00000037353.10	ENSMUST00000037001.10	2502	9	70	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	24.1761116600664	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGGGAATTACTTATG	2405	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100366973	100377045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_100367127_100367565_100367718_100369540_100369657_100370429_100370513_100372903_100373091_100373186_100373289_100373382_100373536_100374670_100374768_100375656
tx.6868	chr15	+	2289	8	FSM	ENSMUSG00000037353.10	ENSMUST00000230294.2	2266	8	-22	-1	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_2	31.1808418417333	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGGGAATTACTTATG	2325	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100366893	100377045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_100367020_100367565_100367718_100370429_100370513_100372903_100373091_100373186_100373289_100373382_100373536_100374670_100374768_100375656
tx.6869	chr15	+	2860	8	NIC	ENSMUSG00000037353.10	novel	2502	9	NA	NA	-3	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	81	junction_1	12.9362644830535	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGGGAATTACTTATG	2416	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100366984	100377045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_100367718_100369540_100369657_100370429_100370513_100372903_100373091_100373186_100373289_100373382_100373536_100374670_100374768_100375656
tx.687	chr1	+	3595	14	FSM	ENSMUSG00000026439.15	ENSMUST00000190997.7	2856	14	28	-767	-11	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_13	83.2346081867393	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACCACAAGTATACATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132405132	132433394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_132405266_132411789_132411816_132412483_132412657_132417325_132417467_132418160_132418324_132420290_132420401_132421552_132421673_132421758_132421913_132422007_132422080_132422594_132422713_132423943_132424014_132424536_132424767_132425667_132425860_132431501
tx.6870	chr15	-	451	3	NNC	ENSMUSG00000009733.10	novel	371	2	NA	NA	3	8984	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	36.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGTTTTAAAGTGTTTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100449886	100434962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_100435161_100449205_100449363_100449790
tx.6871	chr15	-	3681	2	FSM	ENSMUSG00000009739.18	ENSMUST00000177335.2	3654	2	-24	-3	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTCTGCCTATTTTGTTG	8482	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100478136	100473198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_100476500_100477756
tx.6872	chr15	-	1874	2	FSM	ENSMUSG00000097093.3_ENSMUSG00000116164.2	ENSMUST00000181034.3	881	2	-30	-963	-30	-1	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTGAGTATTCGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100513021	100511054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_100512572_100512664
tx.6873	chr15	+	1851	4	FSM	ENSMUSG00000000346.10	ENSMUST00000000356.10	2135	4	279	5	279	-5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	569.007518013212	1197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCACGCCAGCATTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100513508	100518637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_100513606_100514793_100514913_100515805_100516052_100517248
tx.6874	chr15	-	921	4	FSM	ENSMUSG00000053559.14	ENSMUST00000172334.9	920	4	99	-100	14	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	417	junction_3	158.779371736032	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAACTAAATTTTTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100534722	100519229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_100519908_100520509_100520591_100534067_100534137_100534629
tx.6875	chr15	-	2022	11	NNC	ENSMUSG00000098112.9	novel	2036	11	NA	NA	10	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	55.7526680975897	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGGTGTCTTGCCCTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100567424	100538962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_100539446_100542689_100543418_100546960_100547044_100548080_100548157_100549839_100549926_100550265_100550374_100554075_100554172_100554590_100554686_100554940_100554996_100560397_100560479_100567293
tx.6876	chr15	-	969	2	NNC	ENSMUSG00000098112.9	novel	1901	10	NA	NA	5425	1	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAGGTGTCTTGCCCTGAAC	8809	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100543175	100538962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_100539446_100542689
tx.6877	chr15	-	2024	11	NNC	ENSMUSG00000098112.9	novel	2036	11	NA	NA	10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	44.5157275577969	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGAGGTGTCTTGCCCTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100567424	100538963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_100539446_100542689_100543421_100546960_100547044_100548080_100548157_100549839_100549926_100550265_100550374_100554075_100554172_100554590_100554686_100554940_100554996_100560397_100560479_100567293
tx.6878	chr15	-	735	4	FSM	ENSMUSG00000023031.9	ENSMUST00000229235.2	456	4	-77	-202	-77	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	10.8730042868667	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGTGCTTGCATTTATAA	5877	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100581077	100572302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_100572599_100573204_100573355_100579023_100579170_100580934
tx.6879	chr15	-	1094	6	ISM	ENSMUSG00000023031.9	ENSMUST00000023775.9	1108	8	2549	1	-8	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	9	junction_4	10.6695829346793	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGTGCTTGCATTTATAA	8434	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100583253	100572302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_100572599_100573204_100573355_100579023_100579170_100580767_100580905_100582460_100582587_100583014
tx.688	chr1	+	2589	7	ISM	ENSMUSG00000026439.15	ENSMUST00000027700.15	3385	15	16615	0	-9683	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	281	junction_2	35.844184403548	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAGTATACATGCTTGT	4205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132421787	132433397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_132421913_132422007_132422080_132422594_132422713_132423943_132424014_132424536_132424767_132425667_132425746_132431501
tx.6880	chr15	+	1187	7	NNC	ENSMUSG00000023033.15	novel	2565	15	NA	NA	-8	264	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	23.092206477511	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCCACCCCCATTCCACT	6699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100768555	100857933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_100768625_100834151_100834482_100853290_100853412_100854911_100855000_100855341_100855471_100857220_100857313_100857575
tx.6881	chr15	-	815	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000023033.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACCCGAGAGCCTGTTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100820295	100819258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_100819853_100820074
tx.6882	chr15	+	1012	6	NNC	ENSMUSG00000023033.15	novel	2565	15	NA	NA	3	161	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	21.4102779057162	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCTTAGGCCCTCACAGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100834154	100857830	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_100834482_100853290_100853412_100854911_100855000_100855341_100855471_100857220_100857313_100857575
tx.6883	chr15	+	827	4	FSM	ENSMUSG00000023033.15	ENSMUST00000202971.2	840	4	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_2	7.25718035235908	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGCTTGGCCTTGCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	100868015	100872648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_100868149_100869400_100869543_100870634_100870842_100872303
tx.6884	chr15	+	863	4	ISM	ENSMUSG00000000532.12	ENSMUST00000000544.12	4418	9	41	14655	41	-14655	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_2	3.85861230093008	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCAGTGGCCACTTGTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101071988	101096910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_101072117_101091812_101092053_101092689_101092939_101096664
tx.6885	chr15	-	1221	3	NNC	ENSMUSG00000097915.3	novel	1393	3	NA	NA	146	0	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_2	3.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCGCCTCTGCTTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101122512	101119075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_101120071_101121361_101121515_101122439
tx.6886	chr15	-	1320	3	FSM	ENSMUSG00000097915.3	ENSMUST00000229239.2	484	3	-6	-830	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	0.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCCGCCTCTGCTTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101122664	101119075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_101120071_101121361_101121515_101122492
tx.6887	chr15	-	1146	2	ISM	ENSMUSG00000097915.3	ENSMUST00000180639.3	1393	3	485	5	485	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGGATGCCGCCTCTGCTTC	820	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101121517	101119080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_101120071_101121361
tx.6888	chr15	+	715	7	NNC	ENSMUSG00000000531.6	novel	2033	8	NA	NA	4137	2336	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_6	93.3394343244055	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGGACTCTGTCTTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101126205	101132973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_101126281_101126712_101126768_101126871_101126975_101128414_101128509_101128605_101128673_101128865_101128933_101132719
tx.6889	chr15	+	2572	8	FSM	ENSMUSG00000023034.8	ENSMUST00000228985.2	2553	8	-19	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_1	37.8897433754997	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGAGTCTTTTTTTCTGTTT	498	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101152130	101172676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_101152233_101156188_101156308_101167963_101168851_101169616_101169747_101170033_101170186_101170598_101170802_101170895_101171075_101171876
tx.689	chr1	+	1950	2	ISM	ENSMUSG00000026439.15	ENSMUST00000027700.15	3385	15	20519	0	-5779	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	368	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCACAAGTATACATGCTTGT	8109	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132425691	132433397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_132425746_132431501
tx.6890	chr15	+	695	2	ISM	ENSMUSG00000023034.8	ENSMUST00000023779.8	2477	7	-68	4212	-68	459	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGACTTATGAAGGCCTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101164658	101168464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_101164853_101167963
tx.6891	chr15	+	2545	7	FSM	ENSMUSG00000023034.8	ENSMUST00000023779.8	2477	7	-68	0	-68	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	46.5895195653844	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGAGTCTTTTTTTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101164658	101172676	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_101164853_101167963_101168851_101169616_101169747_101170033_101170186_101170598_101170802_101170895_101171075_101171876
tx.6892	chr15	+	1241	3	FSM	ENSMUSG00000037204.8	ENSMUST00000048393.8	1270	3	29	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	465	junction_2	16.5	2774	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTCTTGGCCTGTGTCCT	8059	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101182181	101188826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_101182427_101184813_101185132_101188148
tx.6893	chr15	+	898	2	FSM	ENSMUSG00000037204.8	ENSMUST00000230525.2	605	2	298	-591	298	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	465	junction_1	0	502	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTCTTGGCCTGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101184911	101188826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_101185132_101188148
tx.6894	chr15	+	1690	9	FSM	ENSMUSG00000023039.18	ENSMUST00000068904.9	4094	9	-112	2516	-112	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	16.0078105935821	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCGGCTAGCTAGGAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101310170	101325678	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_101310661_101311849_101312062_101314101_101314163_101316198_101316295_101317383_101317549_101318354_101318481_101321150_101321372_101324969_101325005_101325394
tx.6895	chr15	+	1041	8	NNC	ENSMUSG00000023039.18	novel	3563	8	NA	NA	2680	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	25	junction_1	10.6885404971485	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCTAGGAGTGGTACTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101313009	101325685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_101313056_101314101_101314163_101316198_101316295_101317383_101317549_101318354_101318481_101321150_101321372_101324969_101325005_101325394
tx.6896	chr15	-	1805	9	FSM	ENSMUSG00000049382.11	ENSMUST00000023952.10	1958	9	145	8	145	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_8	4.93552175559991	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTTGCTATGTATGCATTC	6037	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101912772	101905140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_101905569_101906094_101906154_101906287_101906509_101906825_101906952_101907208_101907374_101907865_101907962_101909014_101909076_101909851_101910061_101912332
tx.6897	chr15	-	669	3	ISM	ENSMUSG00000049382.11	ENSMUST00000023952.10	1958	9	6445	11	6445	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGCTTTGCTATGTATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101906472	101905143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_101905569_101906094_101906154_101906287
tx.6898	chr15	+	1406	7	FSM	ENSMUSG00000023043.8	ENSMUST00000023803.8	1437	7	26	5	26	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_3	6.13731754650732	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCACTTTGTGTCTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101936640	101940457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_101937110_101937900_101937984_101938257_101938415_101939053_101939219_101939329_101939456_101939730_101939955_101940275
tx.6899	chr15	+	385	2	ISM	ENSMUSG00000023043.8	ENSMUST00000023803.8	1437	7	3137	5	3137	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	33	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATCACTTTGTGTCTTCCTT	581	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101939751	101940457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_101939955_101940275
tx.69	chr1	+	1639	3	FSM	ENSMUSG00000025940.7	ENSMUST00000177501.2	1636	3	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_1	240	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACCCAGTATGTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16735427	16748419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_16735730_16737888_16737998_16747191
tx.690	chr1	-	1980	11	FSM	ENSMUSG00000054387.14	ENSMUST00000067398.13	1914	11	-8	-58	-7	58	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_9	94.8116026654966	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGTGTTATGTAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132953102	132919033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_132919964_132922240_132922322_132924300_132924448_132929020_132929182_132931528_132931629_132932391_132932460_132936874_132936931_132938802_132938937_132940374_132940453_132946514_132946623_132952985
tx.6900	chr15	+	3700	15	FSM	ENSMUSG00000058655.10	ENSMUST00000169681.3	3854	15	150	4	59	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	620	junction_1	87.2144027143242	589	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATGGTTAATGTTGCAGT	NA	False	NA	-35	True	NA	NA	NA	101982357	102005604	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_101982399_101990410_101990549_101992595_101992805_101993113_101993231_101994437_101994493_101994939_101995075_101997050_101997189_101997291_101997466_101998300_101998530_101999831_101999930_102001420_102001635_102002092_102002149_102003106_102003213_102003411_102003485_102003687
tx.6901	chr15	+	2351	9	ISM	ENSMUSG00000058655.10	ENSMUST00000169681.3	3854	15	14910	591	2659	-591	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	809	junction_2	43.485450152896	273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACGATTGAGCAAGGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101997117	102005017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_101997189_101997291_101997466_101998300_101998530_101999831_101999930_102001420_102001635_102002092_102002149_102003106_102003213_102003411_102003485_102003687
tx.6902	chr15	+	1658	7	ISM	ENSMUSG00000058655.10	ENSMUST00000169681.3	3854	15	16274	858	4023	-858	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	820	junction_6	39.4985935051982	1059	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGCCAGTGAGTTTTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101998481	102004750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_101998530_101999831_101999930_102001420_102001635_102002092_102002149_102003106_102003213_102003411_102003485_102003687
tx.6903	chr15	+	1879	6	ISM	ENSMUSG00000058655.10	ENSMUST00000169681.3	3854	15	17622	591	-3169	-591	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	820	junction_5	40.897921707588	821	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACGATTGAGCAAGGTCCT	340	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	101999829	102005017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_101999930_102001420_102001635_102002092_102002149_102003106_102003213_102003411_102003485_102003687
tx.6904	chr15	-	1362	2	ISM	ENSMUSG00000036966.16	ENSMUST00000139279.8	2666	10	17978	-2	10670	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	187	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GACGGAAGGGGAATCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102026649	102024960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102026149_102026475
tx.6905	chr15	-	2439	11	FSM	ENSMUSG00000036966.16	ENSMUST00000154032.2	2456	11	17	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_5	18.3913022921162	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGACGGAAGGGGAATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102044652	102024962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_102026149_102026475_102026649_102026726_102026847_102027362_102027421_102027702_102027853_102036973_102037160_102038712_102038849_102039100_102039226_102040302_102040379_102041850_102041998_102044570
tx.6906	chr15	-	758	6	ISM	ENSMUSG00000036966.16	ENSMUST00000154032.2	2456	11	11	12011	11	1673	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	170	junction_1	16.2406896405294	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTAGTAAGTAGAAGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102044658	102036973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102037160_102038712_102038849_102039100_102039226_102040302_102040379_102041850_102041998_102044570
tx.6907	chr15	+	861	3	ISM	ENSMUSG00000023045.14	ENSMUST00000160465.2	1628	13	10892	-342	10892	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_1	3	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTCTCTCTTTTAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102070442	102071909	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_102070580_102070988_102071135_102071331
tx.6908	chr15	-	1028	4	ISM	ENSMUSG00000023044.3	ENSMUST00000023805.3	2279	15	10000	0	-39	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	98	junction_2	11.1455023315337	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTGGTATGTTTTAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102087493	102085433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102086222_102086961_102087052_102087215_102087268_102087395
tx.6909	chr15	-	392	2	FSM	ENSMUSG00000001281.11	ENSMUST00000230550.2	449	2	60	-3	60	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGCCTCTACTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102125025	102124429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_102124703_102124906
tx.691	chr1	-	1972	11	FSM	ENSMUSG00000054387.14	ENSMUST00000188090.7	7105	11	57	5076	-2	58	multi-exon	FALSE	canonical	3	199	junction_6	81.9383304687129	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGGTGTTATGTAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132953097	132919033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_132919964_132922240_132922322_132924300_132924448_132929020_132929182_132931528_132931629_132932391_132932460_132936874_132936931_132938802_132938937_132940374_132940450_132946514_132946623_132952985
tx.6910	chr15	-	2664	15	FSM	ENSMUSG00000001281.11	ENSMUST00000001327.11	2683	15	19	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_13	6.6719791758105	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTGAGCCTCTACTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102140360	102124429	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_102124703_102124906_102125068_102125326_102125533_102125681_102125902_102126208_102126433_102126931_102127126_102127608_102127756_102130523_102130614_102130776_102130873_102131075_102131235_102131765_102132008_102132736_102132908_102132992_102133195_102135832_102136037_102140285
tx.6911	chr15	-	2689	8	FSM	ENSMUSG00000001288.16	ENSMUST00000063339.14	2718	8	31	-2	31	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_4	9.19183310979738	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCGGGTGTGGATCCCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102154904	102143372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_102144659_102147239_102147399_102147824_102148030_102148292_102148470_102148562_102148724_102149492_102149635_102150270_102150420_102154494
tx.6912	chr15	+	1041	2	NNC	ENSMUSG00000097050.2	novel	2192	2	NA	NA	-14	-1119	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTTTGTGTGTGCGTGTTC	1664	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102178983	102181437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_102179766_102181178
tx.6913	chr15	+	1684	2	FSM	ENSMUSG00000045665.6	ENSMUST00000051341.6	1754	2	66	4	66	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	355	junction_1	0	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCACTTGTCCTCTCCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102187954	102190185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_102188065_102188611
tx.6914	chr15	+	390	2	ISM	ENSMUSG00000058290.5	ENSMUST00000064924.6	6658	31	27502	0	1080	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	407	junction_1	0	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGTGAGAGTTGAAGCTA	7487	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102232202	102232792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_102232243_102232442
tx.6915	chr15	+	631	6	FSM	ENSMUSG00000001289.13	ENSMUST00000166658.8	1062	6	48	383	-4	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	835	junction_1	29.5932424718887	5787	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGGGTGGTCTATTCTTGCA	382	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102234598	102239925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_102234696_102234867_102234971_102235252_102235285_102236956_102237032_102237146_102237253_102239707
tx.6916	chr15	+	1193	7	FSM	ENSMUSG00000001285.13	ENSMUST00000113682.9	1480	7	3	284	3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	485	junction_2	12.1620995994387	764	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGTCCCTGATCCACCAA	5930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102240146	102246290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_102240389_102240524_102240638_102242636_102242797_102245266_102245420_102245535_102245659_102245763_102245946_102246070
tx.6917	chr15	-	491	4	ISM	ENSMUSG00000036678.9	ENSMUST00000230406.2	697	7	745	-4	-294	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	522	junction_3	31.2089730686545	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGATGTAACTCCGAGTG	9782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102247690	102246686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102246941_102247075_102247161_102247251_102247334_102247620
tx.6918	chr15	-	1748	16	FSM	ENSMUSG00000036678.9	ENSMUST00000041208.9	1811	16	59	4	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	447	junction_7	35.3844912669692	754	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTACCAGGATGTAACTCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102259135	102246690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_102246941_102247075_102247161_102247251_102247334_102247620_102247689_102247759_102247854_102247965_102248057_102248198_102248260_102248378_102248504_102248765_102248887_102252523_102252668_102254011_102254111_102254921_102254969_102255112_102255205_102255470_102255527_102258387_102258516_102258930
tx.6919	chr15	+	1974	5	ISM	ENSMUSG00000001280.14	ENSMUST00000001326.7	7754	6	-70	6418	-23	-2693	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	16.6939360247965	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCACATTTGTCACATCCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102314744	102338421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_102314858_102316206_102316368_102316650_102318155_102334065_102334232_102338391
tx.692	chr1	-	1666	5	FSM	ENSMUSG00000054387.14	ENSMUST00000185418.2	496	5	-29	-1141	-2	1141	multi-exon	FALSE	canonical	3	238	junction_3	59.7620280780363	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAGATGGTTGTGAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	132953097	132935693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_132936931_132938802_132938937_132940374_132940450_132946514_132946623_132952985
tx.6920	chr15	+	902	4	ISM	ENSMUSG00000023047.12	ENSMUST00000023809.11	1938	11	7002	-8	46	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	123	junction_2	13.3666251038423	511	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCAATGTGTTTTTACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102360803	102363073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_102360995_102361179_102361328_102361466_102361604_102362647
tx.6921	chr15	+	1067	4	FSM	ENSMUSG00000023048.14	ENSMUST00000164957.8	1055	4	6	-18	6	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	427	junction_1	130.244215056008	876	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGACTGGGCTAGTTTTG	2411	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102367642	102371235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_102367691_102368542_102368582_102368804_102369155_102370605
tx.6922	chr15	+	545	2	ISM	ENSMUSG00000056851.15	ENSMUST00000230631.2	585	3	1161	-295	1161	30	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	634	junction_1	0	1289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGATGCCACAGTGACTTA	5016	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102399116	102407346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_102399239_102406923
tx.6923	chr15	-	1065	3	ISM	ENSMUSG00000023050.10	ENSMUST00000171565.8	4318	16	9780	667	9780	-418	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	70	junction_1	11	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTCGAGGGTTTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102409355	102407877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102408612_102408942_102409205_102409286
tx.6924	chr15	-	476	3	FSM	ENSMUSG00000023050.10	ENSMUST00000167677.2	563	3	98	-11	6	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	4.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGTCTTTGGACACCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102419129	102417535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_102417814_102418353_102418441_102419018
tx.6925	chr15	+	1565	9	FSM	ENSMUSG00000023051.12	ENSMUST00000023813.9	1523	9	-42	0	-10	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	312	junction_3	28.7706447616316	408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTTGTTCTTTTTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102426851	102432111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_102427038_102427556_102427727_102428909_102429013_102429555_102429649_102430158_102430232_102430415_102430534_102430858_102430987_102431283_102431486_102431619
tx.6926	chr15	+	1485	9	NIC	ENSMUSG00000023051.12	novel	782	8	NA	NA	13	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	98	junction_1	96.5083383703191	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCTTGTTCTTTTTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102427173	102432111	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_+_102427280_102427556_102427727_102428909_102429013_102429555_102429649_102430158_102430232_102430415_102430534_102430858_102430987_102431283_102431486_102431619
tx.6927	chr15	-	341	2	ISM	ENSMUSG00000062683.12	ENSMUST00000075630.10	441	4	2624	-154	2618	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4680	junction_1	0	354	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGAGTCTCCTGTGTATA	9903	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102573560	102571294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102571564_102573488
tx.6928	chr15	-	682	5	FSM	ENSMUSG00000062683.12	ENSMUST00000185641.7	731	5	49	0	49	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3206	junction_4	667.870870752723	2819	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTCTTGAGTCTCCTGTG	3950	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102579513	102571298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_102571564_102573488_102573683_102574197_102574291_102576145_102576215_102579452
tx.6929	chr15	-	590	3	FSM	ENSMUSG00000062683.12	ENSMUST00000187160.2	635	3	-39	84	-33	-84	multi-exon	FALSE	canonical	3	4743	junction_1	34	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATGTTGCCCTAGTTGGTT	7246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102576217	102573257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_102573683_102574197_102574291_102576145
tx.693	chr1	+	2754	2	FSM	ENSMUSG00000046062.6	ENSMUST00000052529.4	5594	2	131	2709	-70	-2709	multi-exon	FALSE	canonical	3	372	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCTCTTTTCCTATTTAG	5698	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133059011	133064812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_133061354_133064400
tx.6930	chr15	-	603	4	ISM	ENSMUSG00000062683.12	ENSMUST00000185641.7	731	5	80	1973	80	-98	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	3206	junction_3	741.096634874442	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTTTCCTCATTATGT	3981	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102579482	102573271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102573683_102574197_102574291_102576145_102576215_102579452
tx.6931	chr15	-	848	2	ISM	ENSMUSG00000023055.11	ENSMUST00000229231.2	2226	13	11093	-206	1279	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTGTCATGACGTATGTT	8409	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102617058	102615211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_102615982_102616980
tx.6932	chr15	-	654	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000001655.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGAGTTTGTGGGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102840080	102837212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_102837498_102839711
tx.6933	chr15	-	523	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000001655.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGAGTTTGTGGGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102840091	102837212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_102837356_102839711
tx.6934	chr15	+	647	2	NNC	ENSMUSG00000050328.3	novel	1031	2	NA	NA	-4778	127	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGCAGGCCCTGCGGGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102840413	102847171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_102840603_102846713
tx.6935	chr15	+	597	2	NNC	ENSMUSG00000022484.8	novel	1909	2	NA	NA	-34817	-688	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCTCAGACTCTTCTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102840413	102879640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_+_102840603_102879232
tx.6936	chr15	-	392	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000050328.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGATTGTGACGATTTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102845972	102843895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr15_-_102844120_102844214_102844333_102845922
tx.6937	chr15	+	1918	2	FSM	ENSMUSG00000022484.8	ENSMUST00000001699.8	1909	2	-12	3	-12	-3	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTCAAATGGATGGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102875218	102880325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_102876044_102879232
tx.6938	chr15	+	1358	2	FSM	ENSMUSG00000022485.4	ENSMUST00000001709.3	2923	2	425	1140	425	613	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTAAAGATTCAATTACTTCT	1411	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	102922671	102924721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_102922968_102923659
tx.6939	chr15	-	2336	4	NNC	ENSMUSG00000036061.11	novel	3601	5	NA	NA	-230	-4	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_1	44.976537093121	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTTTTGTTTTGCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103066659	103061720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_103063559_103064508_103064629_103066043_103066346_103066583
tx.694	chr1	+	2365	2	FSM	ENSMUSG00000046062.6	ENSMUST00000122956.2	3688	2	-11	1334	-11	-1334	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTGCATTGTAGACATTT	5757	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133059070	133066187	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_133059649_133064400
tx.6940	chr15	-	3322	4	ISM	ENSMUSG00000036061.11	ENSMUST00000229371.2	3882	7	3780	4	6	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_3	17.3781471969828	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAGTTTTGTTTTGCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103071739	103061720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_103064629_103066043_103066346_103066583_103066655_103071698
tx.6941	chr15	-	455	2	ISM	ENSMUSG00000036061.11	ENSMUST00000229377.2	3601	5	3745	4250	-230	-1480	internal_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTTCTATAGGGGTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103066659	103065966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_103066346_103066583
tx.6942	chr15	-	541	3	NNC	ENSMUSG00000036061.11	novel	3882	7	NA	NA	-2	-1478	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_1	25	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCTATAGGGGTGAGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103071756	103065964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr15_-_103066346_103066552_103066655_103071698
tx.6943	chr15	-	509	3	ISM	ENSMUSG00000036061.11	ENSMUST00000229371.2	3882	7	3762	4250	-3	-1480	internal_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_2	7.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTTCTATAGGGGTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103071757	103065966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_103066346_103066583_103066655_103071698
tx.6944	chr15	-	447	2	FSM	ENSMUSG00000036061.11	ENSMUST00000229429.2	3752	2	-3	3308	-3	-1471	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGGGTGAGGTGAGGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103071757	103065957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103066346_103071698
tx.6945	chr15	-	2129	5	FSM	ENSMUSG00000009575.15	ENSMUST00000108813.10	3661	5	36	1496	-11	1072	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_4	189.635176061827	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGACTTCGTCAGCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103123743	103106609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103108219_103109227_103109329_103113918_103114106_103121498_103121682_103123694
tx.6946	chr15	-	2230	6	FSM	ENSMUSG00000009575.15	ENSMUST00000122182.2	1146	6	-12	-1072	-12	1072	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_5	207.473757376686	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCCAGACTTCGTCAGCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103123744	103106609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103108219_103109227_103109329_103113918_103114106_103121498_103121682_103123448_103123549_103123694
tx.6947	chr15	-	1569	6	NIC	ENSMUSG00000009575.15	novel	1146	6	NA	NA	-41	336	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	31	junction_5	201.842512865848	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTGTAAGCTGTAGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103148284	103107345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr15_-_103108219_103109227_103109329_103113918_103114106_103121498_103121682_103123448_103123549_103148159
tx.6948	chr15	-	1335	4	ISM	ENSMUSG00000009575.15	ENSMUST00000122182.2	1146	6	2060	-336	2060	336	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	445	junction_1	11.5566238822398	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTCTGTAAGCTGTAGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103121672	103107345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_103108219_103109227_103109329_103113918_103114106_103121498
tx.6949	chr15	-	1466	5	FSM	ENSMUSG00000009575.15	ENSMUST00000118152.8	8803	5	-42	7379	-42	332	multi-exon	FALSE	canonical	3	412	junction_4	23.5902522241709	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGAGTCTGTAAGCTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103148285	103107349	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103108219_103109227_103109329_103113918_103114106_103121498_103121682_103148159
tx.695	chr1	+	832	4	ISM	ENSMUSG00000103421.2	ENSMUST00000094557.7	1865	5	9319	1083	9229	893	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2.16024689946929	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGAGATTTGGCGTTGATG	761	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133246856	133249681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_133247111_133247890_133248070_133248728_133248793_133249346
tx.6950	chr15	-	491	3	ISM	ENSMUSG00000009575.15	ENSMUST00000118152.8	8803	5	-43	13954	-43	-6243	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	412	junction_2	28.5	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAGAGGTGAGCTTCCTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103148286	103113924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_-_103114106_103121498_103121682_103148159
tx.6951	chr15	+	1921	11	FSM	ENSMUSG00000046434.17	ENSMUST00000036004.16	1918	11	-1	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2223	junction_7	4396.07925429012	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103148857	103153384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_103148956_103149506_103149624_103149872_103150020_103150329_103150541_103150632_103150726_103150806_103150900_103151070_103151146_103151348_103151508_103152051_103152208_103152385_103152456_103152682
tx.6952	chr15	+	1762	10	FSM	ENSMUSG00000046434.17	ENSMUST00000087351.9	1737	10	-23	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	9291	junction_7	1545.88284736515	512	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103148857	103153384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_103148956_103149506_103149624_103149872_103150020_103150329_103150541_103150632_103150726_103150806_103150900_103151070_103151146_103152051_103152208_103152385_103152456_103152682
tx.6953	chr15	+	1074	5	ISM	ENSMUSG00000046434.17	ENSMUST00000087351.9	1737	10	1948	-2	1908	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9291	junction_2	1571.76944476599	644	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103150828	103153384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_103150900_103151070_103151146_103152051_103152208_103152385_103152456_103152682
tx.6954	chr15	+	597	6	ISM	ENSMUSG00000046434.17	ENSMUST00000230171.2	1283	11	1970	-1	1908	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	551	junction_4	5430.2473755806	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTTTCTTGTCTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103150828	103155120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_103150900_103151070_103151146_103152051_103152208_103152385_103152456_103154772_103154849_103154971
tx.6955	chr15	+	1149	5	ISM	ENSMUSG00000046434.17	ENSMUST00000036004.16	1918	11	2225	-2	2163	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2223	junction_1	5430.92802843124	509	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103151083	103153384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_103151146_103151348_103151508_103152051_103152208_103152385_103152456_103152682
tx.6956	chr15	+	990	4	ISM	ENSMUSG00000046434.17	ENSMUST00000087351.9	1737	10	2203	-2	2163	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9291	junction_1	1808.10514689335	3189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAATGACAACTGTATGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103151083	103153384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_103151146_103152051_103152208_103152385_103152456_103152682
tx.6957	chr15	+	513	5	ISM	ENSMUSG00000046434.17	ENSMUST00000230171.2	1283	11	2225	-1	2163	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	551	junction_3	5536.34904517408	599	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTTTCTTGTCTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103151083	103155120	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr15_+_103151146_103152051_103152208_103152385_103152456_103154772_103154849_103154971
tx.6958	chr15	-	1674	3	FSM	ENSMUSG00000058794.13	ENSMUST00000075192.13	1697	3	20	3	20	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTCTATTGTGTCTTCTT	4191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103163846	103156641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103157876_103159355_103159526_103163576
tx.6959	chr15	+	1689	9	FSM	ENSMUSG00000060992.10	ENSMUST00000100162.5	1676	9	-16	3	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	554	junction_1	173.470458580128	674	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCCTTTGTGTGATGGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103181320	103208292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_+_103181369_103197527_103197597_103199101_103199184_103199755_103199848_103203148_103203205_103204959_103205038_103205160_103205213_103206313_103206353_103207119
tx.696	chr1	-	314	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116158.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTAAGTCAGTGCTGGGG	1284	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133257262	133249488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_133249612_133257071
tx.6960	chr15	-	2341	8	FSM	ENSMUSG00000000552.11	ENSMUST00000168828.3	2298	8	-43	0	-43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_6	68.2405708519799	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAAGGACTCAGACTGTCT	6876	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103248563	103222321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103223653_103223787_103223884_103224053_103224224_103224308_103224552_103226375_103226539_103228716_103228828_103241491_103241629_103248473
tx.6962	chr15	-	793	10	FSM	ENSMUSG00000022487.15	ENSMUST00000141364.8	700	10	-37	-56	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_9	37.8499310957182	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCAAGTACTTTTTTTTT	8416	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103338843	103310884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103310986_103313235_103313270_103318050_103318146_103328384_103328449_103328899_103328984_103329616_103329744_103333857_103333959_103336766_103336812_103338603_103338685_103338782
tx.6963	chr15	-	715	9	FSM	ENSMUSG00000022487.15	ENSMUST00000023129.15	819	9	51	53	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_8	17.7019596372831	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGCAAGTACTTTTTTTTT	8413	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103338846	103310884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103310986_103313235_103313270_103318050_103318146_103328384_103328449_103328899_103328984_103329616_103329744_103333857_103333959_103336766_103336812_103338782
tx.6964	chr15	-	728	7	FSM	ENSMUSG00000022490.8	ENSMUST00000023133.8	1306	7	17	561	8	-146	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_5	12.4688500761787	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGAGCTTTTCTTCTTTC	2069	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103446413	103439266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103439377_103439780_103439888_103440752_103440909_103441464_103441529_103441883_103441922_103442776_103442838_103446221
tx.6965	chr15	-	667	6	FSM	ENSMUSG00000022490.8	ENSMUST00000228813.2	821	6	8	146	8	-146	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	80.2331602269286	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGAGCTTTTCTTCTTTC	2069	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	103446413	103439266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr15_-_103439377_103439780_103439888_103440752_103440909_103441464_103441529_103441883_103441922_103446221
tx.6966	chr16	+	351	2	Intergenic	novelGene_592	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAGTTATGTGTTTCTCACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3163134	3163542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_3163333_3163389
tx.6967	chr16	+	223	2	Intergenic	novelGene_593	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGACAAACAGGTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3163697	3164497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_3163826_3164402
tx.6968	chr16	+	3227	6	FSM	ENSMUSG00000022529.12	ENSMUST00000023176.5	3241	6	19	-5	19	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_1	57.158026557956	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGAATATGTATAAATCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3561975	3568650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_3562632_3563640_3563822_3564285_3564360_3564634_3564759_3566012_3566130_3566575
tx.6969	chr16	+	2391	7	NNC	ENSMUSG00000005982.15	novel	2350	7	NA	NA	-17	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	55.8141758178173	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTCTCTAGTTATTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3702505	3722634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_3702671_3712232_3712349_3715114_3715245_3717735_3717833_3718506_3718744_3719648_3719990_3721329
tx.697	chr1	+	584	3	NIC	ENSMUSG00000115958.2	novel	656	3	NA	NA	-3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_1	18	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACAGTGTGTTATTTTTCC	5605	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133251700	133257460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_133251787_133254947_133255079_133257093
tx.6970	chr16	+	563	3	FSM	ENSMUSG00000014232.15	ENSMUST00000137745.2	515	3	-46	-2	-46	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	17.5	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGCTCTTTCGGAGTCCC	3262	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3726856	3731438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_3727018_3729314_3729427_3731148
tx.6971	chr16	+	1610	12	FSM	ENSMUSG00000014232.15	ENSMUST00000040881.14	1779	12	169	0	-45	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_6	16.217019933921	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGGCTGCTATTATTAT	3263	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3726857	3759011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_3727018_3729314_3729427_3731148_3731234_3733286_3733467_3735689_3735786_3737344_3737429_3741703_3741838_3746353_3746496_3747703_3747777_3751570_3751679_3755422_3755479_3758631
tx.6972	chr16	+	649	5	ISM	ENSMUSG00000014232.15	ENSMUST00000040881.14	1779	12	19775	0	19494	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_3	6.70820393249937	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGGCTGCTATTATTAT	642	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3746463	3759011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_3746496_3747703_3747777_3751570_3751679_3755422_3755479_3758631
tx.6973	chr16	+	438	2	ISM	ENSMUSG00000014232.15	ENSMUST00000040881.14	1779	12	28732	0	28451	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTTGGCTGCTATTATTAT	7670	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3755420	3759011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_3755479_3758631
tx.6974	chr16	-	1176	2	FSM	ENSMUSG00000039738.17	ENSMUST00000171762.2	715	2	-25	-436	-25	436	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGTCCAGACTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3821659	3818430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_3819543_3821595
tx.6975	chr16	-	2302	18	FSM	ENSMUSG00000005981.12	ENSMUST00000006137.9	2320	18	14	4	14	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	963	junction_15	112.803285922348	241	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGGCAGACGTTTTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3895677	3857838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_3858089_3858222_3858296_3861816_3861963_3862476_3862563_3863306_3863446_3863743_3863930_3867214_3867363_3870728_3870799_3871344_3871466_3872617_3872774_3873660_3873735_3874193_3874304_3878620_3878782_3880193_3880266_3883096_3883238_3886119_3886203_3886720_3886886_3895556
tx.6976	chr16	-	3893	6	NIC	ENSMUSG00000022519.15	novel	5000	7	NA	NA	-16	122	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	24	junction_5	3.76297754444536	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTCTCTCTCTCTCCCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4359696	4297957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_4301149_4304140_4304375_4305356_4305474_4310157_4310254_4311642_4311745_4359543
tx.6977	chr16	+	406	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022519.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACTTTCAATGAAGCCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4313942	4318357	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_+_4314108_4318116
tx.6978	chr16	-	1553	4	ISM	ENSMUSG00000005718.9	ENSMUST00000005862.9	2247	7	8454	2	1562	-2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	105	junction_3	12.657891697365	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCTGTAGTTATTGAGGA	5727	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4369264	4362526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_4363612_4365118_4365275_4367194_4367336_4369093
tx.6979	chr16	-	1719	6	ISM	ENSMUSG00000005718.9	ENSMUST00000005862.9	2247	7	7852	3	960	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_5	12.3028451993838	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGATGCTGTAGTTATTGAGG	5125	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4369866	4362527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_4363612_4365118_4365275_4367194_4367336_4369093_4369265_4369609_4369709_4369798
tx.698	chr1	+	749	3	NNC	ENSMUSG00000116158.2	novel	496	2	NA	NA	-1055	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	21.5	53	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACAGTGTGTTATTTTTCC	7799	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133253894	133257460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_133254146_133254947_133255079_133257093
tx.6980	chr16	-	2326	2	ISM	ENSMUSG00000005718.9	ENSMUST00000005862.9	2247	7	11357	4	4465	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGATGCTGTAGTTATTGAG	8630	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4366361	4362528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_4363612_4365118
tx.6981	chr16	-	2179	7	FSM	ENSMUSG00000005718.9	ENSMUST00000005862.9	2247	7	66	2	66	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_5	11.6010057035299	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGCTGTAGTTATTGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4377652	4362526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_4363612_4365118_4365275_4367194_4367336_4369093_4369265_4369609_4369709_4369798_4369965_4377291
tx.6982	chr16	-	477	4	NIC	ENSMUSG00000014301.14	novel	596	5	NA	NA	-19	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	48	junction_3	586.024648704207	275	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTTCCTGTTTGAGAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4442819	4434328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_4434498_4434676_4434743_4434989_4435127_4442714
tx.6983	chr16	-	564	5	FSM	ENSMUSG00000014301.14	ENSMUST00000014445.7	596	5	31	1	-21	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1132	junction_4	70.3491293478462	4350	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTTCCTGTTTGAGAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4442821	4434328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_4434498_4434676_4434743_4434989_4435127_4435782_4435868_4442714
tx.6984	chr16	+	2609	12	FSM	ENSMUSG00000004069.18	ENSMUST00000060067.12	2648	12	39	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_10	248.960018695956	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGGTCATTTCTTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4501972	4525559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_4502209_4505100_4505235_4507844_4507929_4511075_4511277_4512227_4512381_4514252_4514401_4515114_4515180_4517612_4517742_4519032_4519149_4520074_4520173_4523707_4523825_4524431
tx.6985	chr16	+	2490	11	FSM	ENSMUSG00000004069.18	ENSMUST00000115854.4	2505	11	15	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	681	junction_10	58.1896898084188	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGGTCATTTCTTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4501974	4525559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_4502209_4505100_4505235_4507844_4507929_4511075_4511277_4512227_4512381_4514252_4514401_4515114_4515180_4517612_4517742_4519032_4519149_4520074_4520173_4524431
tx.6986	chr16	+	1223	2	ISM	ENSMUSG00000004069.18	ENSMUST00000060067.12	2648	12	21796	0	21751	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGGTCATTTCTTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4523729	4525559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_4523825_4524431
tx.6987	chr16	-	1192	5	FSM	ENSMUSG00000063445.15	ENSMUST00000120056.8	2440	5	-10	1258	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_4	12.1243556529821	295	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGGTTTCCCAAAAGAAAAGG	4833	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4536983	4529180	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_4529468_4531503_4531695_4532280_4532531_4534160_4534400_4536758
tx.6988	chr16	+	1215	6	FSM	ENSMUSG00000004070.16	ENSMUST00000004172.15	1730	6	22	493	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	381	junction_2	14.4277510374971	600	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCTGCCTAACAGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4544248	4584113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_4544336_4580422_4580542_4581592_4581711_4582469_4582962_4583626_4583754_4583841
tx.6989	chr16	+	1129	5	ISM	ENSMUSG00000004070.16	ENSMUST00000118885.8	1392	6	5655	-4	5564	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	381	junction_1	15.6204993518133	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCTGCCTAACAGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4580421	4584113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_4580542_4581592_4581711_4582469_4582962_4583626_4583754_4583841
tx.699	chr1	-	400	3	Intergenic	novelGene_63	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTGTTTTTCAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133262363	133261293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_133261466_133261663_133261860_133262331
tx.6990	chr16	-	2333	4	NIC	ENSMUSG00000004071.14	novel	3953	6	NA	NA	-6	-409	intron_retention	FALSE	canonical	3	434	junction_3	32.1074584619974	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTGTGTCTGTGCTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4607805	4585611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_4587660_4587906_4588016_4588534_4588600_4607694
tx.6991	chr16	-	2515	6	FSM	ENSMUSG00000004071.14	ENSMUST00000004173.12	3953	6	54	1384	-1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	434	junction_5	28.1240110937256	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCATATTTCTATTTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4607800	4584708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_4586514_4586608_4586883_4587503_4587660_4587906_4588016_4588534_4588600_4607694
tx.6992	chr16	-	1371	3	FSM	ENSMUSG00000039568.7	ENSMUST00000037843.7	1851	3	476	4	-34	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	334	junction_1	8.5	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAGGCTCTGTAGTCTTGCC	135	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4697703	4692645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_4693734_4694225_4694286_4697480
tx.6993	chr16	+	3138	17	FSM	ENSMUSG00000022517.18	ENSMUST00000070658.16	3138	17	-2	2	1	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	137	junction_15	100.835804033091	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTCTATGTGTGCCTTTGT	2925	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4704113	4756158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_4704338_4725231_4725351_4728583_4728673_4729185_4729333_4731553_4731672_4733616_4733684_4733968_4734019_4736729_4736778_4738176_4738246_4740457_4740618_4742286_4742397_4745538_4745766_4748554_4748679_4748976_4749020_4750063_4750163_4752058_4752104_4754759
tx.6994	chr16	+	3095	16	FSM	ENSMUSG00000022517.18	ENSMUST00000023159.10	3095	16	1	-1	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_15	54.4223810169636	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTATGTGTGCCTTTGTTC	2925	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4704113	4756160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_4704338_4725231_4725351_4728583_4728673_4729185_4729333_4731553_4731672_4733616_4733684_4733968_4734019_4736729_4736778_4738176_4738246_4740457_4740618_4742286_4742397_4745538_4745766_4748554_4748679_4748976_4749020_4750063_4750163_4754759
tx.6995	chr16	+	1270	3	FSM	ENSMUSG00000022516.11	ENSMUST00000230931.2	1618	3	350	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	527	junction_2	18	773	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGCTTCTGAGTGCCATG	94	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4756974	4758885	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_4757158_4757241_4757503_4758059
tx.6996	chr16	-	2443	17	FSM	ENSMUSG00000022515.7	ENSMUST00000023157.6	2398	17	-42	-3	-10	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	59	junction_1	12.8608842522589	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGGGGCTCATTTGTGAT	8181	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4782079	4759296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_4759662_4759762_4759852_4760074_4760159_4760556_4760643_4760942_4761116_4761422_4761565_4763918_4764044_4765128_4765297_4765512_4765623_4766089_4766228_4768476_4768633_4771682_4771819_4773721_4773804_4775504_4775627_4775831_4776031_4778260_4778433_4781983
tx.6997	chr16	-	2043	15	NIC	ENSMUSG00000022515.7	novel	2398	17	NA	NA	3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	6	junction_14	24.9154693362356	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGGTGGGGGCTCATTTGT	8207	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4782053	4759299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_4759662_4759762_4759852_4760074_4760159_4760556_4760643_4760942_4761116_4761422_4761565_4763918_4764044_4765128_4765297_4765512_4765623_4766089_4766228_4768476_4768633_4771682_4771819_4773721_4773804_4775504_4775627_4781983
tx.6998	chr16	-	979	5	NIC	ENSMUSG00000022515.7	novel	1779	11	NA	NA	0	152	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	6	junction_4	36.2586196648466	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCCTGTCTCTACCTCCT	8191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4782069	4768079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_4768633_4771682_4771819_4773721_4773804_4775504_4775627_4781983
tx.6999	chr16	-	1209	7	ISM	ENSMUSG00000022515.7	ENSMUST00000229765.2	1779	11	-1	4588	0	11	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_6	6.51707159867238	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTAGTGCCCCTGTCCTGG	8191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4782069	4768220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_4768633_4771682_4771819_4773721_4773804_4775504_4775627_4775831_4776031_4778260_4778433_4781983
tx.7	chr1	+	2587	10	NNC	ENSMUSG00000033813.16	novel	2547	10	NA	NA	-33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	595.509678995881	686	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTTTTTGTCTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4928003	4968132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_4928200_4937692_4937756_4948249_4948356_4956966_4957055_4959679_4959826_4960962_4961020_4962134_4962293_4963639_4963787_4965156_4965229_4966578
tx.70	chr1	+	1082	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100398.2	novel	472	1	NA	NA	-143799	237	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ACATATAGTAAAGATTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17321382	17465890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_17321450_17464875
tx.700	chr1	-	459	3	Intergenic	novelGene_64	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTATTTATTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133262376	133261300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_133261466_133261663_133261913_133262331
tx.7000	chr16	+	370	4	NIC	ENSMUSG00000096215.9	novel	382	4	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	9	junction_1	19.6694913225759	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCGAGTCTGGACTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4825151	4826173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_4825190_4825607_4825753_4825835_4825919_4826069
tx.7001	chr16	+	446	4	FSM	ENSMUSG00000096215.9	ENSMUST00000178155.9	429	4	-17	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_3	13.8804418757713	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCGAGTCTGGACTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4825183	4826173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_4825283_4825607_4825753_4825835_4825934_4826069
tx.7002	chr16	+	428	4	FSM	ENSMUSG00000096215.9	ENSMUST00000185147.8	399	4	-29	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	9.41629792788369	336	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCGAGTCTGGACTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4825186	4826173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_4825283_4825607_4825753_4825835_4825919_4826069
tx.7003	chr16	+	286	3	FSM	ENSMUSG00000096215.9	ENSMUST00000183477.8	247	3	-39	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	21.5	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCGAGTCTGGACTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4825183	4826173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_4825283_4825835_4825919_4826069
tx.7004	chr16	-	1384	11	FSM	ENSMUSG00000022540.17	ENSMUST00000202281.4	1355	11	-29	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	412	junction_7	47.5572286829247	641	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTCTGTCTGTCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4831410	4826593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_4827117_4827341_4827469_4827764_4827815_4827903_4828018_4828330_4828430_4828710_4828807_4829475_4829557_4830104_4830160_4830290_4830374_4831166_4831239_4831326
tx.7005	chr16	-	3308	16	FSM	ENSMUSG00000022536.15	ENSMUST00000115844.3	3292	16	-9	-7	-3	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	744	junction_6	120.52477845747	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTATCATTGTACCCAAAT	8107	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4867730	4831765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_4833467_4836263_4836389_4836703_4836884_4837150_4837314_4838130_4838233_4839201_4839313_4844371_4844472_4847197_4847272_4847366_4847418_4848048_4848106_4849750_4849838_4854099_4854340_4854782_4854922_4865597_4865678_4866613_4866651_4867669
tx.7006	chr16	-	3296	16	FSM	ENSMUSG00000022536.15	ENSMUST00000023189.15	3280	16	-9	-7	-9	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	303	junction_6	221.604291976086	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGTATCATTGTACCCAAAT	8101	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4867736	4831765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_4833467_4836263_4836389_4836703_4836884_4837150_4837314_4838130_4838233_4839201_4839295_4844371_4844472_4847197_4847272_4847366_4847418_4848048_4848106_4849750_4849838_4854099_4854340_4854782_4854922_4865597_4865678_4866613_4866651_4867669
tx.7007	chr16	-	1582	10	ISM	ENSMUSG00000022536.15	ENSMUST00000115844.3	3292	16	0	11934	0	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1044	junction_8	69.7961759184521	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAACTTT	8116	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4867721	4843706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_4844472_4847197_4847272_4847366_4847418_4848048_4848106_4849750_4849838_4854099_4854340_4854782_4854922_4865597_4865678_4866613_4866651_4867669
tx.7009	chr16	+	1757	13	FSM	ENSMUSG00000039427.15	ENSMUST00000100196.9	1755	13	3	-5	3	-4	multi-exon	TRUE	canonical	3	181	junction_11	10.4029910228848	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAAGTGTTTGCTCTGAGCC	1283	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5051487	5062772	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_5051722_5052829_5052908_5053026_5053131_5054183_5054333_5056508_5056599_5056919_5057031_5057769_5057892_5058007_5058047_5058322_5058383_5059149_5059261_5060352_5060468_5061551_5061628_5062304
tx.701	chr1	+	1484	9	NNC	ENSMUSG00000070645.6	novel	1592	9	NA	NA	478	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	2.17586189819115	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTCGGATGGGTTCTTTG	7883	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133280124	133288061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_133280307_133281864_133282016_133282539_133282664_133283232_133283352_133284122_133284320_133286141_133286262_133286675_133286821_133287071_133287171_133287714
tx.7010	chr16	-	1420	8	FSM	ENSMUSG00000022544.15	ENSMUST00000064635.12	2170	8	23	727	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	270	junction_1	73.3462573645565	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGACTGTCCTGTCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5073824	5062742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_5063250_5065316_5065464_5066428_5066695_5066775_5066910_5067210_5067313_5068338_5068420_5070888_5070952_5073704
tx.7011	chr16	-	1396	8	NNC	ENSMUSG00000022544.15	novel	2170	8	NA	NA	-4	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	166.156061384151	38	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGACTGTCCTGTCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5073824	5062742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_5063250_5065340_5065464_5066428_5066695_5066775_5066910_5067210_5067313_5068338_5068420_5070888_5070952_5073704
tx.7012	chr16	-	987	7	FSM	ENSMUSG00000022544.15	ENSMUST00000139584.2	987	7	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	438	junction_1	22.2517165380311	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATCCTTCTCTTTCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5073820	5065238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_5065464_5066428_5066695_5066775_5066910_5067210_5067313_5068338_5068420_5070888_5070952_5073704
tx.7013	chr16	+	1352	11	FSM	ENSMUSG00000039345.17	ENSMUST00000046470.16	1825	11	-9	482	-9	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_3	20.7113495455994	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCCCTTGAGATGCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8288642	8308066	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_8288730_8291694_8291831_8295830_8296194_8299990_8300032_8300119_8300265_8302125_8302198_8302683_8302738_8303728_8303810_8305222_8305326_8306522_8306692_8307965
tx.7014	chr16	+	546	2	ISM	ENSMUSG00000039345.17	ENSMUST00000046470.16	1825	11	-8	16394	-8	186	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	183	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAACCACTTACCATCCACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8288643	8292154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_8288730_8291694
tx.7015	chr16	-	2709	2	FSM	ENSMUSG00000043140.11	ENSMUST00000052505.10	3391	2	34	648	34	-648	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTTGTGGGTTAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8455542	8451740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_8454257_8455349
tx.7016	chr16	+	1794	9	FSM	ENSMUSG00000022711.17	ENSMUST00000023396.10	1842	9	53	-5	4	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_5	22.2528088114737	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTGGCCGAATCATACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8455590	8475400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_8455693_8460601_8460714_8463232_8463310_8464036_8464129_8466511_8466612_8466745_8466822_8469273_8469390_8473414_8473553_8474419
tx.7017	chr16	-	2806	3	ISM	ENSMUSG00000008393.10	ENSMUST00000008537.10	2858	4	7731	11	7731	-11	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	357	junction_2	26	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGCAAGATGAGGTGACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8482288	8476454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_8478968_8481450_8481574_8482118
tx.7018	chr16	-	744	4	FSM	ENSMUSG00000008393.10	ENSMUST00000008537.10	2858	4	0	2114	0	-2114	multi-exon	FALSE	canonical	3	300	junction_3	44.5146667465405	468	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCACCTGCGGAGGCTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8490019	8478557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_8478968_8481450_8481574_8482118_8482287_8489976
tx.7019	chr16	-	2022	9	NNC	ENSMUSG00000022710.18	novel	4488	31	NA	NA	3108	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	322.798989310685	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCCGATGACTGCTGTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8512337	8507464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_8508751_8509009_8509101_8509218_8509291_8509419_8509540_8510243_8510344_8510877_8510983_8511565_8511644_8511733_8511843_8512276
tx.702	chr1	+	696	4	ISM	ENSMUSG00000070645.6	ENSMUST00000094556.3	1592	9	7909	2	6510	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_2	1.24721912892465	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTCGGATGGGTTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133286156	133288061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_133286262_133286675_133286821_133287071_133287171_133287714
tx.7020	chr16	-	643	3	NNC	ENSMUSG00000022710.18	novel	4745	32	NA	NA	8924	-42764	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	70	junction_1	15	151	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGATTCCTGAGTATCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8601248	8566587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_8566919_8574679_8574937_8601193
tx.7021	chr16	-	705	3	NNC	ENSMUSG00000022710.18	novel	4745	32	NA	NA	-45	-42765	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	70	junction_1	174.5	206	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGATTCCTGAGTATCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8610217	8566588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_8566919_8574679_8574937_8610099
tx.7022	chr16	-	172	2	Intergenic	novelGene_596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACCTTAAAAAAAAAAAAACT	2567	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8621363	8610970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_8611122_8621342
tx.7023	chr16	+	1687	3	NNC	ENSMUSG00000116469.2	novel	673	3	NA	NA	53037	927	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	30	junction_2	3.5	96	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTCTCCTCTCCCTAGT	6146	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8951045	8956235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_8951217_8953545_8953645_8954818
tx.7024	chr16	+	510	3	FSM	ENSMUSG00000039209.13	ENSMUST00000044103.6	805	3	14	281	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	487	junction_1	5	4203	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGCTTCTGTGTTACAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9988105	9992494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_9988189_9988278_9988356_9992144
tx.7025	chr16	-	1328	5	FSM	ENSMUSG00000022505.10	ENSMUST00000078357.5	3440	5	14	2098	14	-2098	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_1	14.2894191624432	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGGTTTGTCTGTAAGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10131818	10101710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_10102480_10103318_10103466_10105918_10106025_10110125_10110289_10131675
tx.7026	chr16	-	1609	7	FSM	ENSMUSG00000039179.14	ENSMUST00000043415.13	1803	7	190	4	148	-4	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_5	2.40947204913349	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCTGTCTTTAGGAAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10213164	10175815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_10176300_10179121_10179277_10196760_10196984_10200653_10200798_10203926_10203998_10205018_10205103_10212716
tx.7027	chr16	+	1236	11	FSM	ENSMUSG00000022503.11	ENSMUST00000023146.5	2121	11	-12	897	-12	185	multi-exon	FALSE	canonical	3	699	junction_1	76.2262422004391	1132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTTAGGGCCTGCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10229799	10241395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_10229860_10229933_10230039_10231474_10231609_10235524_10235594_10237516_10237550_10238119_10238211_10238837_10238993_10239090_10239202_10239440_10239544_10240685_10240770_10241104
tx.7028	chr16	+	1177	10	ISM	ENSMUSG00000022503.11	ENSMUST00000023146.5	2121	11	121	897	5	185	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	711	junction_2	67.1451348632384	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCTTAGGGCCTGCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10229932	10241395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_10230039_10231474_10231609_10235524_10235594_10237516_10237550_10238119_10238211_10238837_10238993_10239090_10239202_10239440_10239544_10240685_10240770_10241104
tx.7029	chr16	+	3745	3	Intergenic	novelGene_597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATAAATATGCCAATGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10286371	10293236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_10286474_10289437_10289520_10289675
tx.703	chr1	+	2237	8	FSM	ENSMUSG00000070644.14	ENSMUST00000135222.9	2297	8	42	18	38	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_5	9.79379228628721	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGGTCTTGGAAGGACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133291351	133308056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_133291757_133293313_133293574_133296487_133296611_133300872_133301016_133302264_133302349_133304643_133304790_133306186_133306261_133307054
tx.7030	chr16	+	800	4	ISM	ENSMUSG00000068663.15	ENSMUST00000038145.13	3730	21	-32	127076	0	5207	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_3	11.9536140513607	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10363240	10386516	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_10363507_10377884_10378014_10381000_10381135_10386245
tx.7031	chr16	+	1310	2	ISM	ENSMUSG00000068663.15	ENSMUST00000130148.2	704	3	29	2352	-3	1355	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAAGAGTCCTGAGCTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10363269	10378957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_10363507_10377884
tx.7032	chr16	+	595	2	NNC	ENSMUSG00000037991.10	novel	3742	2	NA	NA	-1	-2916	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGAATTTCAGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10652930	10658186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_10653032_10657692
tx.7033	chr16	+	674	2	FSM	ENSMUSG00000037991.10	ENSMUST00000037913.9	3742	2	204	2864	195	-2864	multi-exon	TRUE	canonical	3	158	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGGCATAGTGGCCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10653126	10658238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_10653255_10657692
tx.7034	chr16	-	2007	4	FSM	ENSMUSG00000022500.16	ENSMUST00000023143.14	2235	4	12	216	12	-216	multi-exon	FALSE	canonical	3	313	junction_3	22.4548930574657	274	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAAGGCCTTGTGTTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10810973	10777354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_10778916_10781120_10781278_10784288_10784514_10810909
tx.7035	chr16	-	413	3	NNC	ENSMUSG00000022500.16	novel	2235	4	NA	NA	15	-7275	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_2	2	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGTCAAGGAATTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10810970	10791469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_10791638_10793290_10793475_10810909
tx.7036	chr16	-	3766	23	FSM	ENSMUSG00000037965.16	ENSMUST00000037633.16	3825	23	51	8	0	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_12	24.8770530528646	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTCATAGTTTTGGTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10994206	10954463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_10955350_10956884_10957049_10958580_10958715_10959526_10959636_10963043_10963150_10963509_10963644_10964230_10964308_10965132_10965315_10966308_10966410_10967074_10967272_10968458_10968621_10969002_10969190_10969729_10969795_10970922_10971128_10973883_10974165_10974391_10974426_10976417_10976457_10976546_10976628_10976829_10976989_10978867_10979066_10980503_10980544_10982455_10982558_10994083
tx.7037	chr16	+	697	3	NIC	ENSMUSG00000096959.2	novel	2481	4	NA	NA	1021	-626	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAACTGTCTTGGCTACATT	4716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10997060	11009530	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_10997377_10997996_10998193_11009345
tx.7038	chr16	+	617	2	NNC	ENSMUSG00000096959.2	novel	2481	4	NA	NA	7514	-628	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTAACTGTCTTGGCTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11003553	11009528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_11003988_11009345
tx.7039	chr16	-	931	2	FSM	ENSMUSG00000005846.13	ENSMUST00000129962.2	769	2	373	-535	373	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2708	junction_1	0	416	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGCTGTACTGTTGGTATT	9663	False	NA	20	True	NA	NA	NA	11012486	11010833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_11011602_11012323
tx.704	chr1	+	1689	7	NNC	ENSMUSG00000070644.14	novel	2297	8	NA	NA	519	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	29.4886984001216	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACGGTCTTGGAAGGACAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133295543	133308056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_133295661_133296487_133296611_133300872_133301016_133302264_133302349_133304643_133304790_133306186_133306261_133307054
tx.7040	chr16	-	1920	9	NNC	ENSMUSG00000005846.13	novel	1945	9	NA	NA	29	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	907.175424049836	3052	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCGCTGTACTGTTGGTATT	983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11021166	11010833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_11011602_11012323_11012576_11014137_11014261_11014336_11014431_11017248_11017351_11017434_11017584_11019158_11019295_11020181_11020322_11021010
tx.7041	chr16	+	563	3	FSM	ENSMUSG00000097537.3	ENSMUST00000230166.2	517	3	-329	283	0	-283	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTATCTTCAATGCTCTA	9699	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11021229	11041196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_11021612_11025355_11025441_11041100
tx.7042	chr16	+	461	2	FSM	ENSMUSG00000097537.3	ENSMUST00000181526.3	2942	2	17	2464	17	-283	multi-exon	FALSE	canonical	1	6	junction_1	0	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTATCTTCAATGCTCTA	9716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11021246	11041196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_11021612_11041100
tx.7043	chr16	-	1529	9	ISM	ENSMUSG00000062203.16	ENSMUST00000080030.14	2898	15	21535	346	-4157	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1334	junction_7	161.26874891001	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTCGGTATTTGAATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11050538	11038261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_11038744_11040448_11040618_11041075_11041166_11042283_11042458_11045978_11046060_11047072_11047167_11048373_11048515_11048700_11048856_11050395
tx.7044	chr16	+	817	3	NNC	ENSMUSG00000022496.6	novel	815	3	NA	NA	986	-9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTTTAATTCTGGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11132661	11137929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_11132929_11133038_11133198_11137538
tx.7045	chr16	-	2701	4	FSM	ENSMUSG00000065979.13	ENSMUST00000096272.11	2663	4	-6	-32	-6	32	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_3	6.59966329107444	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ACATGCCTGTGCTGTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11727293	11621552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_11623448_11646038_11646462_11705441_11705661_11727129
tx.7046	chr16	-	263	2	ISM	ENSMUSG00000065979.13	ENSMUST00000073371.7	1922	3	16	3475	-6	-3475	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	85	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGTGACGAGTGGGGGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11727293	11705561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_11705661_11727129
tx.7047	chr16	+	1820	6	ISM	ENSMUSG00000022545.14	ENSMUST00000023206.14	3480	11	5	21739	5	-635	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	54	junction_5	9.76933979345585	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCTTTTGTCCGTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12927552	12944859	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_12928006_12929594_12929776_12939859_12940056_12941197_12941406_12943114_12943296_12944258
tx.7048	chr16	+	668	5	FSM	ENSMUSG00000009569.15	ENSMUST00000115809.8	667	5	3	-4	3	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_3	24.5814971065637	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATGTGTATGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13074372	13150790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13074419_13082942_13083004_13144245_13144436_13149877_13149941_13150482
tx.7049	chr16	+	2131	7	ISM	ENSMUSG00000009569.15	ENSMUST00000009713.14	5815	17	28	29234	3	-29234	intron_retention	FALSE	canonical	3	39	junction_6	10.2374584519575	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TTCACTAGGAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13074372	13203693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_13074419_13082942_13083004_13144245_13144436_13196127_13196194_13197703_13197760_13199391_13199468_13202057
tx.705	chr1	-	664	4	FSM	ENSMUSG00000090553.9	ENSMUST00000172079.2	653	4	11	-22	11	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3763	junction_3	471.411356107027	956	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACATTGTTTCATTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133537774	133531611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_133531815_133534238_133534318_133536634_133536698_133537455
tx.7050	chr16	+	602	4	NIC	ENSMUSG00000009569.15	novel	667	5	NA	NA	6	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	4	junction_3	23.2139804619735	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATGTGTATGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13074375	13150790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_13074419_13082942_13083004_13144245_13144436_13150482
tx.7051	chr16	-	1275	3	NNC	ENSMUSG00000022685.10	novel	2906	24	NA	NA	117853	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	188.5	74	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCCTTTAACTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13367993	13355823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_13356767_13358918_13359113_13367855
tx.7052	chr16	-	2895	24	NNC	ENSMUSG00000022685.10	novel	2906	24	NA	NA	-6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_21	74.3588346795189	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCCTTTAACTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13486019	13355823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_13356767_13358918_13359113_13384433_13384603_13420891_13420967_13424011_13424099_13425114_13425171_13443372_13443443_13443977_13444089_13446237_13446314_13447446_13447490_13449393_13449438_13458116_13458195_13465106_13465164_13466282_13466364_13468498_13468542_13469661_13469701_13470508_13470575_13472312_13472458_13474779_13474841_13482519_13482602_13482684_13482753_13483761_13483846_13485397_13485476_13485874
tx.7053	chr16	+	1725	4	ISM	ENSMUSG00000022684.16	ENSMUST00000023365.13	3003	8	99	13796	7	1844	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	82	junction_1	10.3708994574027	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAGAAAGAAAGTAACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13489820	13507680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_13489943_13502925_13503263_13505254_13505460_13506619
tx.7054	chr16	+	2896	8	FSM	ENSMUSG00000022684.16	ENSMUST00000023365.13	3003	8	102	5	10	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_1	10.7760126660835	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACAACCTTTATAGAGAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13489823	13521471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13489943_13502925_13503263_13505254_13505460_13506619_13506790_13510296_13510442_13515196_13515371_13516736_13516940_13519928
tx.7055	chr16	+	1662	2	FSM	ENSMUSG00000079737.5	ENSMUST00000225585.2	1705	2	43	0	43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGTACTTTGGTATCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13489835	13496252	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13489943_13494697
tx.7056	chr16	-	793	3	NIC	ENSMUSG00000022683.14	novel	1423	4	NA	NA	-59	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	7	junction_2	25	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTGTGTAAGAGGTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13548366	13532920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_13533461_13542972_13543080_13548220
tx.7057	chr16	-	957	4	FSM	ENSMUSG00000022683.14	ENSMUST00000023364.7	1423	4	468	-2	-72	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_3	8.17856276425687	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCTTGTGTAAGAGGTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13548379	13532920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_13533461_13542972_13543080_13545826_13545978_13548220
tx.7058	chr16	-	342	2	FSM	ENSMUSG00000115907.2	ENSMUST00000229709.2	301	2	-11	-30	-11	30	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGTTGTCTTGGTTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13557079	13555685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_13555865_13556916
tx.7059	chr16	+	1111	10	FSM	ENSMUSG00000022681.16	ENSMUST00000023362.15	1175	10	63	1	8	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	538	junction_1	69.8729004852541	1175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTTAGATGACTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13637177	13653314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13637301_13644746_13644850_13644923_13644990_13645251_13645361_13646868_13646943_13648981_13649036_13649470_13649525_13650200_13650299_13652544_13652659_13652998
tx.706	chr1	-	490	5	FSM	ENSMUSG00000090553.9	ENSMUST00000166915.8	503	5	10	3	10	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3763	junction_3	447.106461035848	53685	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACATTGTTTCATTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133538019	133531611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_133531815_133534238_133534318_133536634_133536698_133537455_133537483_133537901
tx.7060	chr16	+	1008	9	FSM	ENSMUSG00000022681.16	ENSMUST00000136618.8	1014	9	8	-2	8	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_1	197.353743313878	306	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTTTAGATGACTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13637177	13653314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13637301_13644923_13644990_13645251_13645361_13646868_13646943_13648981_13649036_13649470_13649525_13650200_13650299_13652544_13652659_13652998
tx.7061	chr16	-	896	2	ISM	ENSMUSG00000022680.15	ENSMUST00000023361.12	4228	24	66541	1004	495	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	113	junction_1	0	232	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTTGCTGTTTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13654450	13652015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_13652711_13654249
tx.7062	chr16	-	1233	11	ISM	ENSMUSG00000022680.15	ENSMUST00000115802.2	2466	14	21	9485	17	803	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	195	junction_3	12.7342059037853	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTGTTGCCTTTCTTAAA	10005	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13720974	13676625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_13676823_13676973_13677023_13677817_13677903_13687666_13687746_13690318_13690388_13693841_13694032_13697289_13697437_13699741_13699823_13702429_13702496_13705560_13705635_13720778
tx.7063	chr16	+	1240	4	FSM	ENSMUSG00000022679.14	ENSMUST00000128757.8	3089	4	1	1848	1	475	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	87.8179936004006	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAATCATTTCTTTCCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13721025	13765635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13721145_13762529_13762601_13764421_13764452_13764615
tx.7064	chr16	+	1495	5	FSM	ENSMUSG00000022679.14	ENSMUST00000148966.2	2315	5	-1	821	-1	465	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	78.6431815226215	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTCTAGAAAACGAATCATTT	520	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13758557	13765625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13758888_13759983_13760038_13762529_13762601_13764421_13764452_13764615
tx.7065	chr16	+	1479	4	FSM	ENSMUSG00000022679.14	ENSMUST00000143697.8	580	4	-7	-892	0	475	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	74.5311269798659	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAATCATTTCTTTCCTCTC	521	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13758558	13765635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13758888_13762529_13762601_13764392_13764452_13764615
tx.7066	chr16	+	1461	4	FSM	ENSMUSG00000022679.14	ENSMUST00000023360.14	3087	4	19	1607	-11	475	multi-exon	FALSE	canonical	3	154	junction_1	20.3960780543711	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAATCATTTCTTTCCTCTC	510	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13758547	13765635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13758888_13762529_13762601_13764421_13764452_13764615
tx.7067	chr16	-	925	2	FSM	ENSMUSG00000065968.9	ENSMUST00000230206.2	553	2	-366	-6	-366	6	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCGTGGCTTCATTATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13805118	13799556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_13799857_13804493
tx.7068	chr16	+	2160	6	FSM	ENSMUSG00000044117.13	ENSMUST00000056521.12	2394	6	22	212	22	-212	multi-exon	TRUE	canonical	3	47	junction_1	4.9152822909778	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGGTTGCTTAGTACTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13804489	13919152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_13804758_13867246_13867371_13906809_13906884_13911752_13911868_13913767_13913851_13917656
tx.7069	chr16	+	2266	9	NNC	ENSMUSG00000022678.17	novel	2287	9	NA	NA	-3	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_8	99.5386231570439	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTTGTGCATTGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13981158	14010792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_13981233_13987315_13987440_13988201_13988356_13993154_13993304_14001339_14001477_14003557_14003738_14006176_14006269_14007950_14008101_14009586
tx.707	chr1	-	332	3	ISM	ENSMUSG00000090553.9	ENSMUST00000172079.2	653	4	1100	-21	978	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4068	junction_2	406	1007	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACATTGTTTCATTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133536685	133531612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_133531815_133534238_133534318_133536634
tx.7070	chr16	-	1123	3	NNC	ENSMUSG00000022677.16	novel	1465	5	NA	NA	12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_2	214.5	43	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTATGGTCATGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14135227	14117107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_14118074_14122317_14122405_14135157
tx.7071	chr16	-	1451	5	FSM	ENSMUSG00000022677.16	ENSMUST00000023357.14	1465	5	14	0	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	293	junction_3	56.7384349449295	846	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTATGGTCATGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14135225	14117107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_14118074_14122317_14122452_14128910_14128996_14131679_14131878_14135157
tx.7072	chr16	-	1168	3	FSM	ENSMUSG00000022677.16	ENSMUST00000230495.2	1147	3	-17	-4	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_2	185.5	195	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTATGGTCATGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14135225	14117107	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_14118074_14122317_14122452_14135157
tx.7073	chr16	+	257	2	ISM	ENSMUSG00000023088.18	ENSMUST00000154748.8	603	6	-14	6424	2	-1462	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	123	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTAAGTCACCTGGTATCC	7160	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14179425	14207845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_14179508_14207670
tx.7074	chr16	+	1600	2	ISM	ENSMUSG00000023088.18	ENSMUST00000146032.2	2642	8	11803	-827	11803	827	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTAAACGACCATTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14290679	14292733	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_14290870_14291323
tx.7075	chr16	+	702	2	Intergenic	novelGene_598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTTCTTATGAGTCTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14633040	14635048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_14633473_14634778
tx.7076	chr16	+	1968	6	FSM	ENSMUSG00000068617.6	ENSMUST00000090277.3	2752	6	-2	786	-2	-786	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2.41660919471891	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTTTAATGAGTAGTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14724498	14743215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_14724677_14734689_14734849_14735506_14735612_14738158_14738311_14738644_14738750_14741946
tx.7077	chr16	-	1188	4	FSM	ENSMUSG00000022674.16	ENSMUST00000115777.10	4207	4	22	2997	5	-169	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_1	627.165050046636	2542	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACTGTGCTATTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15412366	15373537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_15374408_15394878_15395005_15398922_15399072_15412323
tx.7078	chr16	-	1063	3	FSM	ENSMUSG00000022674.16	ENSMUST00000115776.2	1236	3	4	169	4	-169	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_1	698.5	475	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGACTGTGCTATTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15412367	15373537	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_15374408_15398922_15399072_15412323
tx.7079	chr16	-	999	3	ISM	ENSMUSG00000022673.6	ENSMUST00000023353.4	3589	16	11167	206	9073	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1506	junction_1	97	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGGTTTAAAATTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15444097	15441966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_15442634_15443425_15443560_15443899
tx.708	chr1	-	482	4	NNC	ENSMUSG00000090553.9	novel	503	5	NA	NA	10	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	2134.95688220837	1488	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATTGTTTCATTCTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133538019	133531610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_133531815_133534238_133534318_133536634_133536716_133537901
tx.7080	chr16	-	3333	16	FSM	ENSMUSG00000022673.6	ENSMUST00000023353.4	3589	16	50	206	50	7	multi-exon	TRUE	canonical	3	1276	junction_6	130.715909088714	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTTGGTTTAAAATTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15455214	15441966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_15442634_15443425_15443560_15443899_15444129_15445512_15445721_15446456_15446585_15447165_15447532_15448124_15448385_15449562_15449684_15449980_15450202_15452302_15452442_15452912_15453009_15453093_15453190_15453856_15453959_15454049_15454214_15454484_15454647_15454974
tx.7081	chr16	-	638	3	FSM	ENSMUSG00000022671.14	ENSMUST00000023351.11	1035	3	395	2	-230	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	566	junction_1	21	5063	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTATGTGGAGTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15680816	15666306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_15666594_15680261_15680408_15680611
tx.7082	chr16	-	730	4	FSM	ENSMUSG00000022671.14	ENSMUST00000117136.2	758	4	35	-7	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_3	237.265439727089	391	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTATGTGGAGTCCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15681198	15666306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_15666594_15680261_15680408_15680611_15680797_15681086
tx.7083	chr16	-	3246	20	FSM	ENSMUSG00000041974.11	ENSMUST00000040248.9	3282	20	36	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	251	junction_3	29.6569490345649	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTTTGTGGTTTTAGTGTT	1983	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15964679	15707087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_15707650_15713006_15713061_15713389_15713505_15715087_15715182_15720772_15720920_15721920_15722126_15730382_15730443_15730532_15730674_15733163_15733252_15754416_15754558_15784465_15784717_15786391_15786582_15855353_15855574_15865867_15865969_15871129_15871381_15932690_15932846_15936670_15936848_15957869_15957937_15958571_15958728_15964608
tx.7084	chr16	+	1093	5	FSM	ENSMUSG00000022792.17	ENSMUST00000059955.15	1574	5	469	12	-106	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	300	junction_2	32.9952648117878	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTCATTTCTTTACACAAGA	9988	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16121310	16127492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_16121612_16122399_16122568_16124326_16124483_16125073_16125245_16127195
tx.7085	chr16	-	2682	10	ISM	ENSMUSG00000022789.16	ENSMUST00000115749.3	3893	20	34844	-10	-6243	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	417	junction_5	305.141133102555	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTCTGATGTGCTTCAA	5250	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16141553	16130091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_16131908_16132127_16132288_16134197_16134308_16134465_16134643_16136308_16136342_16136627_16136706_16137315_16137373_16139447_16139541_16141193_16141284_16141485
tx.7086	chr16	-	3956	18	FSM	ENSMUSG00000022789.16	ENSMUST00000023477.15	3951	18	-18	13	-18	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	164	junction_4	261.707977990631	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCAGTAAGTGAATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16176841	16130106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_16131908_16132127_16132288_16134197_16134308_16134465_16134643_16137315_16137373_16139447_16139541_16141193_16141284_16141485_16141642_16141838_16141960_16147666_16147874_16149864_16149997_16151692_16151814_16154716_16154880_16156456_16156544_16158859_16158932_16159285_16159333_16163861_16164010_16176627
tx.7087	chr16	-	4035	19	NIC	ENSMUSG00000022789.16	novel	3893	20	NA	NA	-13	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	286	junction_4	248.941642474747	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAAGTGAATTCTTTCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16176836	16130100	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_16131908_16132127_16132288_16134197_16134308_16134465_16134643_16136627_16136706_16137315_16137373_16139447_16139541_16141193_16141284_16141485_16141642_16141838_16141960_16147666_16147874_16149864_16149997_16151692_16151814_16154716_16154880_16156456_16156544_16158859_16158932_16159285_16159333_16163861_16164010_16176627
tx.7088	chr16	-	2235	4	FSM	ENSMUSG00000022789.16	ENSMUST00000230958.2	2913	4	681	-3	681	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	945	junction_3	158.394724940223	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCAGTAAGTGAATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16134629	16130106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_16131908_16132127_16132288_16134197_16134308_16134465
tx.7089	chr16	-	3977	19	NIC	ENSMUSG00000022789.16	novel	2151	19	NA	NA	-6	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	332	junction_5	248.085384544699	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCAGTAAGTGAATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16176829	16130106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_16131908_16132127_16132288_16134197_16134308_16134465_16134643_16136308_16136342_16137315_16137373_16139447_16139541_16141193_16141284_16141485_16141642_16141838_16141960_16147666_16147874_16149864_16149997_16151692_16151814_16154716_16154880_16156456_16156544_16158859_16158932_16159285_16159333_16163861_16164010_16176627
tx.709	chr1	+	1269	2	Intergenic	novelGene_66	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTAATAGTCTCTGTCTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	133595707	133604898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_133595807_133603728
tx.7090	chr16	-	4063	20	NIC	ENSMUSG00000022789.16	novel	3893	20	NA	NA	-14	3	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	417	junction_5	244.836267297011	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCCAGTAAGTGAATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16176837	16130106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_16131908_16132127_16132288_16134197_16134308_16134465_16134643_16136308_16136342_16136627_16136706_16137315_16137373_16139447_16139541_16141193_16141284_16141485_16141642_16141838_16141960_16147666_16147874_16149864_16149997_16151692_16151814_16154716_16154880_16156456_16156544_16158859_16158932_16159285_16159333_16163861_16164010_16176627
tx.7091	chr16	-	342	2	ISM	ENSMUSG00000022789.16	ENSMUST00000230038.2	1074	6	-24	9532	-16	-9532	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1358	junction_1	0	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CAACAGGAGAAGAAAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16176839	16163879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_16164010_16176627
tx.7092	chr16	-	748	2	FSM	ENSMUSG00000059305.13	ENSMUST00000075017.5	766	2	20	-2	-18	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGGTCTGGCTGGTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16687099	16686264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_16686843_16686929
tx.7093	chr16	+	1103	7	NNC	ENSMUSG00000026181.14	novel	4922	8	NA	NA	-9	4577	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	33.9546265870598	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGTGTATGAGTGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16714428	16737635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_16714489_16721187_16721456_16728802_16728946_16731897_16732101_16733023_16733213_16735523_16735668_16737539
tx.7094	chr16	+	2676	9	FSM	ENSMUSG00000063358.18	ENSMUST00000069107.14	5099	9	250	2173	65	531	multi-exon	FALSE	canonical	3	513	junction_8	49.657420140398	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGATAAGATTCAGTGTTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16801495	16863144	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_16801604_16833761_16833945_16836149_16836340_16841315_16841433_16843889_16844005_16844221_16844354_16853305_16853416_16856177_16856304_16861549
tx.7095	chr16	+	917	5	NNC	ENSMUSG00000022773.20	novel	3322	5	NA	NA	0	258	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	19.0705925445435	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCCTAGTGAATACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16888092	16902724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_16888228_16895638_16895923_16899461_16899506_16899931_16900041_16902379
tx.7096	chr16	+	281	3	ISM	ENSMUSG00000022773.20	ENSMUST00000239090.2	459	4	3783	-62	3783	62	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_1	2.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTTGGTGACAATGCTT	2905	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16899482	16902528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_16899506_16899931_16900041_16902379
tx.7097	chr16	-	1130	7	NNC	ENSMUSG00000049916.13	novel	1266	8	NA	NA	2	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	46	junction_6	94.3705756873166	123	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTTGTATGTCCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16943002	16931261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_16931491_16935343_16935449_16935657_16935729_16936155_16936377_16938819_16938944_16939159_16939416_16942878
tx.7098	chr16	-	1300	8	FSM	ENSMUSG00000049916.13	ENSMUST00000093336.8	1266	8	-34	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_7	117.062516003464	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTTGTATGTCCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16943004	16931261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_16931491_16935343_16935449_16935657_16935729_16936155_16936377_16938819_16938944_16939159_16939416_16941375_16941519_16942853
tx.7099	chr16	-	1157	7	FSM	ENSMUSG00000049916.13	ENSMUST00000231681.2	1156	7	0	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	255	junction_4	26.8824602048746	638	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTTGTATGTCCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16943004	16931261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_16931491_16935343_16935449_16935657_16935729_16936155_16936377_16938819_16938944_16939159_16939416_16942853
tx.71	chr1	-	310	2	Intergenic	novelGene_7	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGATCCTTACTTTTAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18014823	17983192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_17983333_18014653
tx.710	chr1	-	1038	2	FSM	ENSMUSG00000020423.7	ENSMUST00000020692.7	2743	2	1	1704	1	-1704	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_1	0	408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTCTCTTTTGTTTTTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134006857	134004611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_134005442_134006649
tx.7100	chr16	+	1506	4	ISM	ENSMUSG00000041774.17	ENSMUST00000069064.7	1297	5	-30	2	0	-2	intron_retention	TRUE	canonical	3	70	junction_3	17.4547032821147	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGGCTGGTTTATAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16964812	16966708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_16965011_16965096_16965257_16965461_16965562_16965660
tx.7101	chr16	+	1323	5	FSM	ENSMUSG00000041774.17	ENSMUST00000069064.7	1297	5	-26	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_3	15.4171171105366	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGCTGGTTTATAAAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16964816	16966710	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_16965011_16965096_16965257_16965461_16965562_16965660_16965839_16966019
tx.7102	chr16	+	1587	3	FSM	ENSMUSG00000041774.17	ENSMUST00000232344.2	1580	3	-9	2	-9	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_2	5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGGCTGGTTTATAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16964830	16966708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_16965011_16965096_16965257_16965461
tx.7103	chr16	+	947	2	ISM	ENSMUSG00000041774.17	ENSMUST00000069064.7	1297	5	738	2	734	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	87	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGGCTGGTTTATAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16965580	16966708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_16965839_16966019
tx.7104	chr16	-	691	4	FSM	ENSMUSG00000038965.18	ENSMUST00000090192.12	2609	4	8	1910	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1494	junction_3	290.114153777823	5661	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCTGCTTGCTTTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17019348	16971788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_16972147_16977853_16978041_16994275_16994372_17019298
tx.7105	chr16	+	1393	10	NNC	ENSMUSG00000055692.22	novel	1631	10	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	43	junction_8	80.0083328993508	22	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGTGTGTGGGGTTTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17094160	17096525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_17094333_17094497_17094622_17094700_17094752_17094825_17094904_17095057_17095115_17095205_17095266_17095391_17095457_17095532_17095588_17095714_17095756_17095835
tx.7106	chr16	+	1411	10	FSM	ENSMUSG00000055692.22	ENSMUST00000164950.11	1631	10	220	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_4	58.6725586266908	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGTGTGTGGGGTTTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17094160	17096525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17094333_17094497_17094622_17094700_17094752_17094825_17094904_17095057_17095115_17095205_17095266_17095391_17095457_17095532_17095606_17095714_17095756_17095835
tx.7107	chr16	+	1644	8	FSM	ENSMUSG00000055692.22	ENSMUST00000232092.2	1627	8	-17	0	-17	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	181	junction_2	39.2189042297154	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGTGTGTGGGGTTTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17094155	17096525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17094333_17094497_17094622_17094700_17095115_17095205_17095266_17095391_17095457_17095532_17095606_17095714_17095756_17095835
tx.7108	chr16	+	1134	6	FSM	ENSMUSG00000055692.22	ENSMUST00000231322.2	1503	6	369	0	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	186	junction_4	34.92506263416	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGTGTGTGGGGTTTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17094909	17096525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17095115_17095205_17095266_17095391_17095457_17095532_17095606_17095714_17095756_17095835
tx.711	chr1	+	726	2	ISM	ENSMUSG00000026450.15	ENSMUST00000086475.3	1688	11	11672	-2	11672	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATTGTGACTTAAAGAAGCT	208	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134078055	134079279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134078344_134078841
tx.7110	chr16	-	897	4	FSM	ENSMUSG00000041720.15	ENSMUST00000231917.2	669	4	-227	-1	-227	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_2	11.5854314646552	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTTTTGTTTTGTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17100166	17098215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17098485_17098580_17098665_17098883_17098974_17099712
tx.7111	chr16	+	992	5	FSM	ENSMUSG00000022765.11	ENSMUST00000023449.11	3447	5	39	2416	39	-2416	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_2	7.59522876548166	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCTTTGAAATATTAGTTT	1423	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17223888	17246275	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17224224_17237127_17237325_17240329_17240416_17244900_17245006_17246006
tx.7112	chr16	+	3112	21	FSM	ENSMUSG00000022761.13	ENSMUST00000023444.11	3394	21	282	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	77	junction_5	14.8690113995518	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTGTCTCCGAGTCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17326833	17344197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17327083_17327489_17327553_17329929_17329987_17333671_17333752_17333837_17333947_17335319_17335404_17336380_17336439_17337250_17337391_17338299_17338502_17338754_17338911_17339308_17339420_17340020_17340114_17340244_17340341_17340421_17340588_17340831_17341002_17341140_17341298_17341959_17342087_17342171_17342322_17343102_17343209_17343286_17343368_17343540
tx.7114	chr16	-	1630	3	ISM	ENSMUSG00000022760.18	ENSMUST00000231548.2	1110	5	-8	0	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	101	junction_1	8.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTGTTTGGCTTGGCTGG	7267	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17348919	17345941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_17346605_17346798_17346940_17348093
tx.7115	chr16	-	1154	5	FSM	ENSMUSG00000022760.18	ENSMUST00000100125.12	1248	5	-2	96	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_4	27.8118679703468	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTGTTTGGCTTGGCTGG	7184	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17349002	17345941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17346605_17346798_17346940_17348093_17348250_17348641_17348722_17348888
tx.7116	chr16	-	448	3	Intergenic	novelGene_600	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	1	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTACACTGGAGCCTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17436174	17424574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_17424860_17435247_17435361_17436124
tx.7118	chr16	-	1243	4	FSM	ENSMUSG00000012114.18	ENSMUST00000232667.2	1189	4	-41	-13	16	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_3	17.4419672692682	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCGCATAGACTGTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17540795	17500125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17501053_17503316_17503369_17515470_17515559_17540619
tx.7119	chr16	+	455	3	FSM	ENSMUSG00000022750.19	ENSMUST00000129199.8	464	3	-7	16	-7	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	178	junction_1	154	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTAGAGCTCAGCCTGAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17577474	17589675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17577559_17582247_17582511_17589567
tx.712	chr1	+	1688	10	FSM	ENSMUSG00000064246.11	ENSMUST00000082060.10	1687	10	1	-2	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_5	1.61780219761789	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGTGCTATAATTGCGGC	803	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134110142	134117769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_134110291_134110517_134110548_134111234_134111440_134111861_134111919_134112886_134113038_134114242_134114365_134115607_134115732_134116232_134116416_134116934_134117052_134117218
tx.7120	chr16	+	3130	4	FSM	ENSMUSG00000022750.19	ENSMUST00000144116.2	3266	4	-47	183	-2	-183	multi-exon	FALSE	canonical	3	178	junction_1	142.007824510561	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAGTTGATAAAGAGAGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17577479	17596887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17577559_17582247_17582511_17589567_17589734_17594265
tx.7121	chr16	+	2586	7	NIC	ENSMUSG00000022750.19	novel	2544	7	NA	NA	-22	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	178	junction_1	113.988912716203	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGCTACAGTCTGAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17577504	17611246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_17577559_17582247_17582511_17589567_17589734_17594265_17594985_17602066_17602260_17607000_17607235_17610289
tx.7122	chr16	+	2600	7	NNC	ENSMUSG00000022750.19	novel	2544	7	NA	NA	-20	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	179.822520527572	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGCTACAGTCTGAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17577506	17611246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_17577575_17582247_17582511_17589567_17589734_17594265_17594985_17602066_17602260_17607000_17607235_17610289
tx.7123	chr16	+	1157	2	ISM	ENSMUSG00000022750.19	ENSMUST00000120488.3	2596	7	26380	0	25078	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	453	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGGCTACAGTCTGAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17607034	17611246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_17607235_17610289
tx.7124	chr16	-	3010	4	ISM	ENSMUSG00000003166.21	ENSMUST00000117945.8	4003	10	41873	0	-4610	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	328	junction_2	10.8730042868667	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGGTCAGTTCTTGCTGT	5672	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17667651	17658218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_17660642_17661835_17662073_17662846_17663000_17667454
tx.7125	chr16	-	3999	10	FSM	ENSMUSG00000003166.21	ENSMUST00000117945.8	4003	10	4	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_7	73.3575717518876	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGGTCAGTTCTTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17709520	17658218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17660642_17661835_17662073_17662846_17663000_17667454_17667659_17674615_17674793_17675121_17675199_17676223_17676435_17677267_17677391_17690426_17690550_17709249
tx.7126	chr16	-	4012	10	FSM	ENSMUSG00000003166.21	ENSMUST00000012152.13	4045	10	33	0	0	0	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	135.772503989233	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATGGTCAGTTCTTGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17709524	17658218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17660642_17661835_17662073_17662846_17663000_17667454_17667659_17674615_17674793_17675121_17675199_17676223_17676444_17677267_17677391_17690426_17690550_17709249
tx.7127	chr16	-	1432	7	FSM	ENSMUSG00000003166.21	ENSMUST00000155611.8	1468	7	-34	70	10	-70	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	165.862392763801	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGACTGTTTACAGTTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17709547	17667244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17667659_17674615_17674793_17675121_17675199_17676223_17676444_17677267_17677391_17690426_17690550_17709249
tx.7128	chr16	-	1420	7	ISM	ENSMUSG00000003166.21	ENSMUST00000117945.8	4003	10	-21	9027	12	-71	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	236	junction_4	83.6932228770977	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGACTGTTTACAGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17709545	17667245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_17667659_17674615_17674793_17675121_17675199_17676223_17676435_17677267_17677391_17690426_17690550_17709249
tx.7129	chr16	-	2816	10	NNC	ENSMUSG00000003527.10	novel	2785	10	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_6	61.8764200485507	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTATTTTTCTATCAATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17729184	17718572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_17720188_17720681_17720798_17722865_17722976_17724134_17724238_17724972_17725107_17725383_17725468_17725553_17725784_17727768_17727865_17727951_17728121_17729025
tx.713	chr1	+	753	2	FSM	ENSMUSG00000064246.11	ENSMUST00000134812.2	735	2	-14	-4	-14	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGGTGTGCTATAATTGCGGC	5609	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134116849	134117769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_134117052_134117218
tx.7130	chr16	-	1749	10	FSM	ENSMUSG00000003527.10	ENSMUST00000232423.2	2785	10	-20	1056	13	1053	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_7	33.1126025018337	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCCAGGCTGCTGATCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17729199	17719628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17720188_17720681_17720798_17722865_17722976_17724134_17724238_17724972_17725107_17725383_17725502_17725613_17725784_17727768_17727865_17727951_17728121_17729025
tx.7131	chr16	-	1754	10	FSM	ENSMUSG00000003527.10	ENSMUST00000003621.10	2821	10	11	1056	11	1053	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_7	18.4397584408805	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCCAGGCTGCTGATCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17729201	17719628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17720188_17720681_17720798_17722865_17722976_17724134_17724238_17724972_17725107_17725383_17725502_17725613_17725787_17727768_17727865_17727951_17728121_17729025
tx.7132	chr16	-	822	2	ISM	ENSMUSG00000022738.8	ENSMUST00000012279.6	1172	3	483	1	483	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTCCAGGATTTCAAGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17732440	17730971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_17731583_17732229
tx.7133	chr16	-	1087	5	ISM	ENSMUSG00000003528.16	ENSMUST00000129270.8	816	6	601	-459	601	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1746	junction_4	71.2758724955367	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCTGTCCATCCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17744606	17743086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_17743792_17743893_17743968_17744052_17744169_17744298_17744404_17744519
tx.7134	chr16	-	1149	6	FSM	ENSMUSG00000003528.16	ENSMUST00000129270.8	816	6	126	-459	126	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1746	junction_4	78.4973884915925	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCTGTCCATCCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17745081	17743086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17743792_17743893_17743968_17744052_17744169_17744298_17744404_17744519_17744605_17745017
tx.7135	chr16	-	1630	9	FSM	ENSMUSG00000003528.16	ENSMUST00000003622.16	1666	9	36	0	26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1593	junction_8	124.030175259894	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCCTGTCCATCCCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17746047	17743086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_17743792_17743893_17743968_17744052_17744169_17744298_17744404_17744519_17744605_17745017_17745157_17745230_17745331_17745408_17745517_17745849
tx.7136	chr16	+	1676	3	NNC	ENSMUSG00000059280.5	novel	759	2	NA	NA	-1001	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGGTCTGGCTGGTTTGT	56	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17797290	17799138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_17798268_17798352_17798475_17798561
tx.7137	chr16	+	776	2	FSM	ENSMUSG00000059280.5	ENSMUST00000075371.5	759	2	-16	-1	-16	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGGTCTGGCTGGTTTGT	959	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17798275	17799138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17798475_17798561
tx.7138	chr16	+	1086	2	Intergenic	novelGene_601	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTGTTTCTTGTGGGTGA	NA	False	NA	-91	True	NA	NA	NA	17829585	17834855	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_17829831_17834014
tx.7139	chr16	+	1038	5	FSM	ENSMUSG00000003531.16	ENSMUST00000151266.8	1086	5	29	19	-11	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	350	junction_3	38.8546972707291	663	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGTCTGTGCTACCTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17884295	17889208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_17884464_17884559_17884721_17887287_17887389_17887954_17888096_17888741
tx.714	chr1	-	515	2	ISM	ENSMUSG00000026458.14	ENSMUST00000189862.7	2985	5	5457	1586	5457	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTGCTTGGACTAATTGGC	8342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134227089	134226112	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_134226567_134227028
tx.7146	chr16	-	1055	6	FSM	ENSMUSG00000005732.15	ENSMUST00000115645.10	1085	6	28	2	28	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	10558	junction_4	1553.51498222579	8152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAGCTGACAAGGCTATG	7161	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18066568	18057649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_18058058_18058757_18058824_18059608_18059738_18063064_18063223_18065152_18065290_18066411
tx.7147	chr16	+	2307	12	FSM	ENSMUSG00000022721.20	ENSMUST00000115640.8	2367	12	60	0	-59	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_1	22.0168980933485	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCTGTGGTGAACCAGAGC	329	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18066806	18071366	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_18067116_18067349_18067898_18068317_18068427_18068683_18068866_18069019_18069135_18069222_18069339_18069412_18069525_18069989_18070113_18070265_18070342_18070582_18070700_18070787_18070885_18070963
tx.7148	chr16	-	1592	9	NIC	ENSMUSG00000013539.15	novel	1622	9	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	52	junction_8	63.9256159532311	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGTTGGCTTTTTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18161777	18118688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_18119417_18120549_18120655_18121546_18121701_18125833_18125905_18128732_18128848_18130502_18130623_18134509_18134599_18142220_18142315_18161661
tx.7149	chr16	-	1499	9	FSM	ENSMUSG00000013539.15	ENSMUST00000115628.10	1622	9	125	-2	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_8	57.8273291792038	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGTGTTGGCTTTTTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18161781	18118688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_18119417_18120549_18120655_18121546_18121701_18125833_18125905_18128732_18128848_18130502_18130623_18134509_18134599_18142220_18142315_18161758
tx.715	chr1	-	3295	9	NNC	ENSMUSG00000042305.13	novel	1689	9	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	283.900923519104	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGGCTCAACTTGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134289696	134273834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_134275933_134277820_134277977_134280088_134280174_134280712_134280876_134282398_134282580_134283297_134283455_134288494_134288663_134289271_134289362_134289499
tx.7150	chr16	-	1737	7	NNC	ENSMUSG00000000326.14	novel	1397	6	NA	NA	92	8	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	81.8299388298005	17	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCACTGAGTTATTCTTTTC	3980	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18245262	18225627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_18226036_18226269_18226791_18229432_18229565_18229876_18230071_18230439_18230708_18243053_18243111_18245105
tx.7151	chr16	-	1329	6	FSM	ENSMUSG00000000326.14	ENSMUST00000000335.12	1397	6	83	-15	83	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_5	48.2825020064205	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGGACTGGTGAGATGGCT	3971	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18245271	18226278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_18226791_18229432_18229565_18229876_18230071_18230439_18230708_18243053_18243111_18245105
tx.7152	chr16	-	1312	5	FSM	ENSMUSG00000000326.14	ENSMUST00000115609.10	1866	5	291	263	43	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	108	junction_4	51.7656981021216	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGGGACTGGTGAGATGGCT	3931	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18245311	18226278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_18226791_18229432_18229565_18229876_18230071_18230439_18230708_18245105
tx.7153	chr16	+	565	4	FSM	ENSMUSG00000075704.18	ENSMUST00000131303.8	532	4	-33	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_1	7.03957069398096	238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCTCCCTGACTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18245178	18256562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_18245310_18248560_18248627_18255310_18255368_18256251
tx.7154	chr16	+	1421	8	FSM	ENSMUSG00000000884.18	ENSMUST00000090086.11	3549	8	-7	2135	3	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_1	38.76564858485	186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCAAGGTGGGAACTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18317630	18383294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_18317702_18317795_18317891_18359184_18359326_18359721_18359848_18362860_18363024_18366842_18366942_18371116_18371333_18382784
tx.7155	chr16	+	1351	7	ISM	ENSMUSG00000000884.18	ENSMUST00000231621.2	1485	8	332	-4	105	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	265	junction_4	25.8419340521478	190	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTCAAGGTGGGAACTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18317794	18383294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_18317891_18359184_18359326_18359721_18359848_18362860_18363024_18366842_18366942_18371116_18371333_18382784
tx.7156	chr16	-	1091	10	ISM	ENSMUSG00000000028.16	ENSMUST00000096990.10	1747	18	15712	-1	15677	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	368	junction_7	65.2490007491719	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCTCTGGGTCTGTGATC	8684	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18614664	18599201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_18599324_18600645_18600713_18603555_18603633_18603822_18603942_18605518_18605603_18605679_18605819_18611927_18612090_18613511_18613611_18613844_18613977_18614574
tx.7157	chr16	-	1318	14	ISM	ENSMUSG00000000028.16	ENSMUST00000096990.10	1747	18	6210	-1	6175	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	368	junction_7	60.0377593217693	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCTCTGGGTCTGTGATC	5950	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18624166	18599201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_18599324_18600645_18600713_18603555_18603633_18603822_18603942_18605518_18605603_18605679_18605819_18611927_18612090_18613511_18613611_18613844_18613977_18614574_18614695_18616098_18616150_18617425_18617488_18620550_18620600_18624131
tx.7158	chr16	-	1901	19	ISM	ENSMUSG00000000028.16	ENSMUST00000000028.14	2143	20	331	5	-15	1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	368	junction_7	53.1151788307469	262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCCCTCTGGGTCTGTGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18630391	18599201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_18599324_18600645_18600713_18603555_18603633_18603822_18603942_18605518_18605603_18605679_18605819_18611927_18612090_18613511_18613611_18613844_18613977_18614574_18614695_18616098_18616150_18617425_18617488_18620550_18620600_18624131_18624188_18626029_18626174_18627481_18627620_18629138_18629232_18630054_18630115_18630264
tx.7159	chr16	+	1067	12	NIC	ENSMUSG00000005262.14	novel	1996	12	NA	NA	0	-39	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	52	junction_2	122.971810248132	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTACTGGCTCTGACAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18631050	18653115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_18631168_18633579_18633687_18634078_18634112_18636652_18636775_18639788_18639920_18641972_18642046_18643737_18643807_18644502_18644569_18645004_18645053_18645767_18645857_18646385_18646468_18652985
tx.716	chr1	-	1777	8	NNC	ENSMUSG00000042305.13	novel	3149	8	NA	NA	-5	230	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	214.632196074673	687	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATGATTTTGTATTTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134289696	134275189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_134275933_134277820_134277977_134280088_134280174_134282398_134282580_134283297_134283455_134288494_134288663_134289271_134289362_134289499
tx.7160	chr16	+	1083	12	FSM	ENSMUSG00000005262.14	ENSMUST00000005394.13	1996	12	11	902	4	-45	multi-exon	FALSE	canonical	3	393	junction_10	35.0072011482124	643	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACAGTTACTGGCTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18631054	18653109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_18631168_18633579_18633713_18634078_18634112_18636652_18636775_18639788_18639920_18641972_18642046_18643737_18643807_18644502_18644569_18645004_18645053_18645767_18645857_18646385_18646468_18652985
tx.7161	chr16	+	804	9	ISM	ENSMUSG00000005262.14	ENSMUST00000005394.13	1996	12	5609	902	-5323	-45	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	393	junction_7	30.0749064836451	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTACAGTTACTGGCTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18636652	18653109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_18636775_18639788_18639920_18641972_18642046_18643737_18643807_18644502_18644569_18645004_18645053_18645767_18645857_18646385_18646468_18652985
tx.7162	chr16	+	1279	3	FSM	ENSMUSG00000071632.11	ENSMUST00000055413.13	1281	3	2	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_1	45.5	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGTCTCAATTAGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18655329	18658910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_18655370_18655455_18655624_18657839
tx.7163	chr16	+	1364	2	FSM	ENSMUSG00000071632.11	ENSMUST00000190776.2	930	2	-74	-360	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_1	0	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCTGTCTCAATTAGGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18655330	18658910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_18655624_18657839
tx.7164	chr16	-	690	3	ISM	ENSMUSG00000022706.17	ENSMUST00000119273.2	778	4	1131	-9	1131	9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1816	junction_1	11	263	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTCTTTTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18694158	18690966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_18691413_18692286_18692446_18694073
tx.7165	chr16	-	776	4	FSM	ENSMUSG00000022706.17	ENSMUST00000023391.16	1280	4	305	199	-18	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	1642	junction_3	87.6711025493704	4776	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGTCTTTTGTTTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18695307	18690966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_18691413_18692286_18692446_18694073_18694158_18695220
tx.7166	chr16	+	1680	10	ISM	ENSMUSG00000022702.17	ENSMUST00000120532.9	2044	13	20673	0	20298	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	109	junction_3	10.891156226527	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCTTGCTGATTATCCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18716459	18746761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_18716539_18718112_18718208_18729397_18729494_18730795_18730957_18735189_18735358_18737725_18737840_18741066_18741138_18741603_18741710_18744397_18744614_18746187
tx.7167	chr16	+	849	2	Intergenic	novelGene_603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATAAGGAATCTGCTGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18854553	18859460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_18854906_18858963
tx.7168	chr16	+	2018	4	FSM	ENSMUSG00000022686.15	ENSMUST00000079780.10	4258	4	115	2125	-50	-286	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_1	15.8954920234218	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCAAGGAATTCATATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19579098	19589088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_19579228_19579390_19579578_19583857_19583965_19587493
tx.7169	chr16	+	4081	3	FSM	ENSMUSG00000022686.15	ENSMUST00000131557.8	444	3	-13	-3624	-13	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_1	14.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCATCAGTAATGTGAATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19579322	19591212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_19579578_19583857_19583965_19587493
tx.717	chr1	-	1700	8	NNC	ENSMUSG00000042305.13	novel	3149	8	NA	NA	0	161	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	245.748087376036	52	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGATTGATTTGTGCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134289691	134275258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_134275933_134277820_134277977_134280088_134280174_134282398_134282580_134283297_134283452_134288494_134288663_134289271_134289362_134289499
tx.7170	chr16	+	2165	8	FSM	ENSMUSG00000062901.4	ENSMUST00000023509.5	8172	8	26	5981	5	-5981	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_2	11.8562822407122	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTTCAAGCAGTCATAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	19916317	19941990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_19916422_19920741_19920805_19925412_19926394_19933310_19933496_19934633_19934753_19936617_19936807_19938859_19939049_19941655
tx.7171	chr16	-	1328	10	FSM	ENSMUSG00000033918.17	ENSMUST00000048642.15	1348	10	20	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1528	junction_6	107.954723019524	3108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTTCGTTCCTTCAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20121117	20098569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_20098836_20101472_20101571_20101673_20101776_20104514_20104586_20105669_20105820_20106606_20106703_20112103_20112153_20116342_20116484_20116880_20117077_20120958
tx.7172	chr16	-	1530	2	ISM	ENSMUSG00000022822.17	ENSMUST00000134413.9	523	3	1514	-1166	1514	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	522	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTTGTTGTATAAAACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20152462	20150052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_20151456_20152335
tx.7173	chr16	-	2265	7	ISM	ENSMUSG00000022822.17	ENSMUST00000079158.13	5811	30	64059	0	1671	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	439	junction_6	35.3949933684915	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTCTTGTTGTATAAAACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20181085	20150052	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_20151456_20152335_20152501_20153855_20153970_20157625_20157705_20163384_20163545_20176118_20176309_20180931
tx.7174	chr16	+	1162	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022822.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGCTGATGATCAGAGGT	5558	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20194384	20196141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_+_20194493_20195087
tx.7175	chr16	-	1282	8	ISM	ENSMUSG00000022822.17	ENSMUST00000115547.9	5372	31	-17	67529	1	-18	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	160	junction_3	84.1085304708101	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTTTTCTCAGTGTGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20245102	20217584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_20217711_20218224_20218399_20218555_20218790_20223315_20223464_20224138_20224295_20224476_20224635_20241054_20241236_20244997
tx.7176	chr16	-	652	5	FSM	ENSMUSG00000022822.17	ENSMUST00000134962.2	4526	5	-28	3902	1	1080	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_2	11.3578166916005	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTGCGAAGGGTTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20245102	20223411	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_20223464_20224138_20224295_20224476_20224635_20241054_20241236_20244997
tx.7178	chr16	+	444	3	Intergenic	novelGene_604	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTGCCAGCTGATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20266787	20278043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_20266906_20271001_20271084_20277799
tx.7179	chr16	+	1413	10	ISM	ENSMUSG00000003235.14	ENSMUST00000003320.14	2554	16	3926	0	-2020	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2657	junction_1	181.446111443659	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTGTTTGTACTTGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20321492	20328073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_20321593_20323394_20323541_20323948_20324091_20324211_20324314_20324877_20324986_20325130_20325222_20325757_20325882_20326777_20326904_20327458_20327570_20327710
tx.718	chr1	+	1624	9	FSM	ENSMUSG00000026456.19	ENSMUST00000027726.14	1837	9	209	4	-5	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	291	junction_1	53.3666562565053	445	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAATCATTGTCGTCGTGTC	8180	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134333727	134339474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_134333792_134334050_134334201_134334336_134334410_134334783_134334891_134335311_134335442_134336141_134336226_134337338_134337425_134338230_134338331_134338644
tx.7180	chr16	+	1905	11	FSM	ENSMUSG00000022841.16	ENSMUST00000090023.13	2080	11	26	149	-15	-149	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_4	799.773617969485	425	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTGCTGGCTAAATGTTAAT	1379	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20354253	20362657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_20354352_20356367_20356485_20358057_20358324_20359082_20359166_20359724_20359861_20359959_20360102_20360496_20360617_20360705_20360842_20360946_20361045_20361388_20361501_20362060
tx.7181	chr16	+	2465	21	FSM	ENSMUSG00000003234.17	ENSMUST00000003319.6	3090	21	68	557	1	4	multi-exon	TRUE	canonical	3	293	junction_13	17.6705970470723	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGCCTCTCTGCTCGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20367394	20379572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_20367496_20367715_20367864_20367984_20368065_20368493_20368541_20368753_20368852_20368951_20369075_20369170_20369438_20370223_20370305_20370393_20370454_20370555_20370613_20370711_20370735_20370848_20370905_20371008_20371210_20371303_20371381_20377309_20377355_20377446_20377580_20378040_20378130_20378390_20378483_20378664_20378798_20378932_20379021_20379106
tx.7182	chr16	-	1427	9	NNC	ENSMUSG00000033809.16	novel	1451	9	NA	NA	3	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	107.475578621378	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATAAAGTTAGTGGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20429502	20424208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_20424468_20424611_20424755_20425273_20425353_20425509_20425716_20426513_20426635_20427235_20427397_20427491_20427640_20427736_20427837_20429292
tx.7183	chr16	+	993	3	FSM	ENSMUSG00000115219.3	ENSMUST00000115522.10	1134	3	0	141	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	220	junction_2	23	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCTGGCTTCTAGGATTT	5899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20430342	20437620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_20430571_20436375_20436660_20437139
tx.7184	chr16	+	2928	21	FSM	ENSMUSG00000006998.17	ENSMUST00000007212.9	2961	21	33	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2673	junction_8	225.447882003801	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTCTGTCTATTTCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20470434	20482164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_20470602_20470993_20471051_20471342_20471508_20473297_20473420_20473567_20473793_20474002_20474162_20474308_20474454_20474630_20474692_20475292_20475440_20475617_20475725_20476231_20476360_20476723_20476812_20478155_20478319_20478428_20478531_20478706_20478853_20479092_20479177_20480314_20480484_20480565_20480661_20480842_20480970_20481371_20481491_20481812
tx.7185	chr16	+	694	4	ISM	ENSMUSG00000006998.17	ENSMUST00000172207.8	3001	21	10111	0	2396	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2849	junction_3	257.852671112789	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTCTGTCTATTTCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20480564	20482164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_20480661_20480842_20480970_20481371_20481491_20481812
tx.7186	chr16	+	523	3	ISM	ENSMUSG00000006998.17	ENSMUST00000172207.8	3001	21	10464	0	2749	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2849	junction_2	177	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTCTGTCTATTTCCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20480917	20482164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_20480970_20481371_20481491_20481812
tx.7188	chr16	+	813	5	FSM	ENSMUSG00000021018.9	ENSMUST00000021405.8	950	5	137	0	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	628	junction_4	109.533955922353	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTTCTCCATTGTCATTGC	1041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20536551	20541017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_20536745_20537573_20537658_20537740_20537835_20539268_20539353_20540659
tx.719	chr1	+	1840	8	NIC	ENSMUSG00000026456.19	novel	1837	9	NA	NA	6	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	337	junction_4	39.0227563122351	215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAATCATTGTCGTCGTGTCT	8224	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134333771	134339475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_134334201_134334336_134334410_134334783_134334891_134335311_134335442_134336141_134336226_134337338_134337425_134338230_134338331_134338644
tx.7191	chr16	-	1588	6	FSM	ENSMUSG00000022847.16	ENSMUST00000076422.13	1558	6	-37	7	-8	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_1	5.38887743412299	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCTATATGTGCTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20549385	20543914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_20544833_20545055_20545224_20547131_20547219_20547468_20547597_20547813_20547968_20549252
tx.7195	chr16	+	742	4	FSM	ENSMUSG00000097290.10	ENSMUST00000211443.2	767	4	25	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_2	60.8896999134957	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGGTTGAAAGGTCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21613092	21627790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_21613197_21614599_21614726_21625720_21625870_21627427
tx.7196	chr16	+	593	3	FSM	ENSMUSG00000097290.10	ENSMUST00000209449.2	580	3	1	-14	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_2	32	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGGGTTGAAAGGTCCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21613092	21627790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_21613197_21614599_21614726_21627427
tx.7197	chr16	-	1358	5	FSM	ENSMUSG00000022856.10	ENSMUST00000023562.9	1360	5	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_1	14.1244468918255	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTGCAGGTTCTGAATGT	9192	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21766300	21753075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_21753796_21755730_21755870_21756682_21756845_21764750_21764905_21766117
tx.72	chr1	+	544	2	Intergenic	novelGene_8	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATGTATCTCTGTTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18222883	18230509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_18223166_18230247
tx.720	chr1	+	2017	8	FSM	ENSMUSG00000026457.15	ENSMUST00000027727.15	3123	8	92	1014	-1	-1011	multi-exon	FALSE	canonical	3	879	junction_4	75.4485904170407	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTTGGCATTCAAAGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134343207	134360075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_134343324_134350658_134350894_134351695_134351813_134352488_134352661_134353646_134353834_134355819_134356008_134358794_134358989_134359267
tx.7203	chr16	-	500	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022855.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGTTCCTGTTCTAAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21867993	21867444	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_21867654_21867702
tx.7205	chr16	-	2273	5	ISM	ENSMUSG00000033581.18	ENSMUST00000134188.8	3267	14	20898	-62	-4523	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	902	junction_2	64.8478989636519	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AGATCTTGGTGTCTTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21886970	21877761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_21879636_21880609_21880724_21882331_21882464_21883842_21883918_21886892
tx.7206	chr16	-	2338	10	FSM	ENSMUSG00000022858.17	ENSMUST00000162413.9	1687	10	-3	-648	-3	634	multi-exon	TRUE	canonical	3	442	junction_8	660.884723143114	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAGTGACTGATGCAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22084679	22064563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_22065617_22065939_22066014_22067185_22067246_22067799_22067884_22069614_22069731_22071356_22071546_22073157_22073321_22073733_22073868_22077735_22078012_22084490
tx.7207	chr16	-	1143	3	ISM	ENSMUSG00000022858.17	ENSMUST00000023564.10	1369	8	6748	-586	3354	586	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2015	junction_2	44.5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAGTGTTGGTTTTCTTTTTA	8866	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22067249	22064611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_22065617_22065939_22066014_22067185
tx.7208	chr16	-	2013	9	FSM	ENSMUSG00000022858.17	ENSMUST00000161286.8	3403	9	76	1314	-3	585	multi-exon	FALSE	canonical	3	1235	junction_5	313.549014310363	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAAGTGTTGGTTTTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22084679	22064612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_22065617_22065939_22066014_22067185_22067246_22067799_22067884_22069614_22069731_22071356_22071546_22073157_22073321_22073733_22073868_22084490
tx.721	chr1	+	2155	8	FSM	ENSMUSG00000026457.15	ENSMUST00000112237.2	3446	8	280	1011	172	-1011	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_1	322.905874956825	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTTGGCATTCAAAGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134343473	134360075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_134343728_134350658_134350894_134351695_134351813_134352488_134352661_134353646_134353834_134355819_134356008_134358794_134358989_134359267
tx.7211	chr16	-	3216	7	ISM	ENSMUSG00000013089.16	ENSMUST00000168774.8	3773	13	24706	-3	-9979	3	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	940	junction_4	61.8456860976486	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCATTCCTGCAACCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22230558	22200062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_22202442_22205506_22205609_22211404_22211575_22211736_22211806_22218069_22218130_22220421_22220682_22230382
tx.7216	chr16	+	1885	10	FSM	ENSMUSG00000004460.18	ENSMUST00000004574.14	1927	10	21	21	0	-21	multi-exon	FALSE	canonical	3	939	junction_3	70.1998909640038	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTACTGTTTAGAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22676615	22691117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_22676860_22681291_22681449_22684203_22684302_22685669_22685803_22687460_22687604_22687870_22687954_22688165_22688224_22689320_22689433_22689689_22689850_22690420
tx.7219	chr16	+	1280	6	ISM	ENSMUSG00000022868.7	ENSMUST00000232556.2	1336	7	1831	0	-521	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	9.66643677887566	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGTCATGTTCCTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22712987	22718193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_22713186_22713544_22713630_22713943_22714108_22715257_22715360_22716877_22716962_22717546
tx.722	chr1	+	1767	6	ISM	ENSMUSG00000026457.15	ENSMUST00000112237.2	3446	8	8401	1011	8293	-1011	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	879	junction_2	65.4125370246408	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTTGGCATTCAAAGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134351594	134360075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134351813_134352488_134352661_134353646_134353834_134355819_134356008_134358794_134358989_134359267
tx.7221	chr16	+	1649	8	NNC	ENSMUSG00000022871.14	novel	1520	8	NA	NA	-98	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	163.600059877241	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCTTCAACCTGTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22736985	22758507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_22737341_22747824_22748064_22748382_22748494_22750999_22751088_22752982_22753147_22754391_22754491_22756596_22756708_22758025
tx.7222	chr16	+	1369	5	NNC	ENSMUSG00000022877.10	novel	1734	7	NA	NA	4709	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	3.08220700148449	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTAACTACTTTAACTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22774558	22780407	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_22774662_22774789_22774957_22776216_22776298_22777910_22778013_22779491
tx.7223	chr16	-	859	7	ISM	ENSMUSG00000060459.15	ENSMUST00000115349.9	1577	11	25027	0	-4082	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_4	2.74873708374511	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGGTCTCCTTTCAGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22822791	22804603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_22804819_22806994_22807076_22815772_22815860_22815960_22816069_22818563_22818737_22819280_22819366_22822681
tx.7225	chr16	-	550	3	Intergenic	novelGene_605	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.5	2	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGTGTTGCATGTGTGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22921666	22916194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_22916524_22919862_22919947_22921529
tx.7226	chr16	+	2710	11	FSM	ENSMUSG00000022884.17	ENSMUST00000077605.12	2708	11	-1	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	675	junction_10	433.482883168413	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAGGTGGTCTGGCCATTT	6053	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22926507	22932697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_22926571_22927337_22927384_22927468_22927602_22927869_22928010_22928734_22928904_22928983_22929094_22929329_22929474_22929875_22930014_22930252_22930343_22930566_22930647_22931100
tx.7227	chr16	+	1894	11	FSM	ENSMUSG00000022884.17	ENSMUST00000023599.13	2208	11	314	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1278	junction_10	308.304135554488	196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAGGTGGTCTGGCCATTT	6053	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22926507	22932697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_22926571_22927337_22927384_22927468_22927602_22927869_22928010_22928734_22928904_22928983_22929094_22929329_22929474_22929875_22930014_22930252_22930343_22930566_22930647_22931916
tx.7228	chr16	+	1754	10	FSM	ENSMUSG00000022884.17	ENSMUST00000147117.8	1947	10	4	189	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	563	junction_3	486.088189935799	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATAGGTGGTCTGGCCATTT	6053	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22926507	22932697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_22926571_22927337_22927384_22927468_22927602_22928734_22928904_22928983_22929094_22929329_22929474_22929875_22930014_22930252_22930343_22930566_22930647_22931916
tx.7229	chr16	-	1178	10	NNC	ENSMUSG00000022881.16	novel	1228	11	NA	NA	150	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	509.559165563604	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAATATACAATTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22946291	22932693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_22932858_22932936_22933054_22933194_22933276_22933352_22933483_22934124_22934246_22934464_22934609_22936693_22936814_22939658_22939739_22943285_22943365_22946149
tx.723	chr1	+	1551	5	ISM	ENSMUSG00000026457.15	ENSMUST00000112237.2	3446	8	9293	1011	9185	-1011	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	879	junction_1	70.310027734314	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTTGGCATTCAAAGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134352486	134360075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134352661_134353646_134353834_134355819_134356008_134358794_134358989_134359267
tx.7230	chr16	-	1231	11	NNC	ENSMUSG00000022881.16	novel	1228	11	NA	NA	0	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	486.513966911537	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGAATATACAATTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22946487	22932693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_22932858_22932936_22933054_22933194_22933276_22933352_22933483_22934124_22934246_22934464_22934609_22936693_22936814_22939658_22939739_22943285_22943365_22946149_22946292_22946434
tx.7235	chr16	+	1526	11	FSM	ENSMUSG00000038127.16	ENSMUST00000100026.10	7089	11	140	5423	29	412	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_6	12.5415310070182	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGAGCAGTGAAGTGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27207758	27265545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_27207888_27224396_27224460_27225400_27225528_27228073_27228165_27235997_27236116_27254311_27254428_27255117_27255163_27255247_27255353_27257050_27257128_27263293_27263401_27264997
tx.7237	chr16	-	3062	2	FSM	ENSMUSG00000051065.10	ENSMUST00000100023.3	3055	2	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGTTGTCATTATTACTT	4790	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28748432	28644927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_28647762_28748204
tx.724	chr1	+	1298	4	ISM	ENSMUSG00000026457.15	ENSMUST00000112237.2	3446	8	10532	1011	10424	-1011	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	988	junction_3	34.8361242901037	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTTGGCATTCAAAGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134353725	134360075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134353834_134355819_134356008_134358794_134358989_134359267
tx.7241	chr16	-	382	2	ISM	ENSMUSG00000097313.3	ENSMUST00000232297.2	699	4	-61	31286	-60	5570	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	93	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGCGGTGTGGTATTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29765395	29757627	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_29757886_29765271
tx.7249	chr16	-	731	6	ISM	ENSMUSG00000022538.21	ENSMUST00000144666.8	2724	11	28	9803	-1	4437	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	195.314105993397	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTTAAATAGCTTAAAGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30406382	30396633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_30396816_30399776_30399864_30400873_30400961_30401348_30401470_30404371_30404499_30406255
tx.725	chr1	+	3264	12	FSM	ENSMUSG00000026455.15	ENSMUST00000027725.11	3408	12	0	144	0	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	104	junction_1	24.9889231659096	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAAGAGAATTTGTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134383268	134418612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_134383404_134386203_134386405_134391564_134391719_134395388_134395607_134400131_134400282_134403525_134403641_134411484_134411592_134413455_134413652_134414747_134414907_134415381_134415481_134416672_134416860_134417069
tx.7254	chr16	-	1530	6	FSM	ENSMUSG00000047714.15	ENSMUST00000060188.14	4078	6	49	2499	49	-2499	multi-exon	FALSE	canonical	3	769	junction_1	115.541161496672	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCTGCTCTGCTTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31094046	31072853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_31073552_31077154_31077323_31079391_31079487_31080047_31080126_31084122_31084231_31093663
tx.7255	chr16	-	1121	5	FSM	ENSMUSG00000047714.15	ENSMUST00000115233.2	958	5	-236	73	49	-73	multi-exon	FALSE	canonical	3	993	junction_1	34.2746261832277	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGTTGTTGTTTGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31094046	31076865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_31077323_31079391_31079487_31080047_31080126_31084122_31084231_31093663
tx.7256	chr16	-	822	4	ISM	ENSMUSG00000022548.15	ENSMUST00000023207.15	979	5	3428	-37	182	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_3	14.7044966667419	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGTTTCCTGTGGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31129984	31115936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_31116395_31119212_31119302_31122227_31122350_31129831
tx.7257	chr16	-	966	5	FSM	ENSMUSG00000022548.15	ENSMUST00000023207.15	979	5	50	-37	50	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_4	27.2614654778499	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGTTTCCTGTGGATTC	8760	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31133362	31115936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_31116395_31119212_31119302_31122227_31122350_31129831_31129983_31133216
tx.7258	chr16	-	935	6	FSM	ENSMUSG00000022548.15	ENSMUST00000130560.8	2074	6	212	927	-2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_5	47.7887015935775	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGTTTCCTGTGGATTC	8708	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31133414	31115936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_31116395_31119212_31119302_31122227_31122350_31129831_31129983_31133216_31133287_31133369
tx.726	chr1	+	2545	8	ISM	ENSMUSG00000026455.15	ENSMUST00000116528.2	3277	12	16849	0	-2876	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_3	17.9977322834556	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTTAAGAGAATTTGTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134400141	134418611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134400282_134403525_134403641_134411484_134411592_134413455_134413652_134414747_134414907_134415381_134415481_134416672_134416860_134417069
tx.7260	chr16	+	1688	7	FSM	ENSMUSG00000046598.16	ENSMUST00000115227.10	3122	7	31	1403	-13	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	475	junction_4	18.4812217008388	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTTGTGTGCATGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31247596	31276316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_31247806_31256809_31256936_31265409_31265483_31266370_31266482_31268641_31268784_31273845_31273999_31275442
tx.7261	chr16	+	1021	2	ISM	ENSMUSG00000046598.16	ENSMUST00000149039.2	807	7	18943	-748	-3082	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	535	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTCTTGTGTGCATGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31273851	31276316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_31273999_31275442
tx.7265	chr16	+	1711	4	FSM	ENSMUSG00000022774.14	ENSMUST00000023460.7	2070	4	72	287	-16	-287	multi-exon	FALSE	canonical	3	415	junction_1	12.2565175405668	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCATCGGAGTCTCGCTAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31767402	31777003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_31767546_31772942_31773125_31775108_31775248_31775756
tx.727	chr1	+	1687	2	ISM	ENSMUSG00000026455.15	ENSMUST00000116528.2	3277	12	33420	2	13695	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTTTAAGAGAATTTGTG	965	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134416712	134418609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134416860_134417069
tx.7273	chr16	-	929	5	NIC	ENSMUSG00000023791.19	novel	993	6	NA	NA	-2	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	30	junction_4	167.537309277665	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTAGTTTGTCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31918548	31903233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_31903445_31904054_31904156_31906111_31906326_31911161_31911304_31918287
tx.7275	chr16	-	993	6	FSM	ENSMUSG00000023791.19	ENSMUST00000096109.11	993	6	8	-8	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	398	junction_3	17.8258239641258	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTTAGTTTGTCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31918548	31903233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_31903445_31904054_31904156_31906111_31906326_31911161_31911304_31915817_31915882_31918287
tx.7277	chr16	+	1695	4	FSM	ENSMUSG00000035790.16	ENSMUST00000115168.9	1718	4	15	8	15	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_3	4.96655480858378	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTCTTACTGGCTTTTCT	6507	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31918632	31926879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_31918930_31921784_31921863_31922701_31922866_31925723
tx.7279	chr16	+	1160	3	FSM	ENSMUSG00000022787.11	ENSMUST00000178573.8	1153	3	2	-9	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_1	36.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTAATTTTGGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32066046	32075901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_32066086_32070640_32071137_32075276
tx.728	chr1	+	1980	2	FSM	ENSMUSG00000042229.10	ENSMUST00000047978.9	2861	2	-8	889	-8	-889	multi-exon	FALSE	canonical	3	479	junction_1	0	678	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGTCATCTGTTTTCTGG	6630	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134422377	134435623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_134422548_134433813
tx.7281	chr16	+	2014	10	FSM	ENSMUSG00000053774.10	ENSMUST00000232137.2	4384	10	-74	2444	-63	-2444	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_3	51.2071561357021	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTTGGTCATCGTACTT	8189	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32151011	32204269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_32151179_32171616_32171765_32178825_32178894_32188132_32188246_32191211_32191359_32194044_32194136_32194714_32194843_32200079_32200474_32200583_32200664_32203591
tx.7283	chr16	+	810	5	NNC	ENSMUSG00000014075.16	novel	838	5	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	109.323773718254	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATGAATAGTTTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32238551	32247917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_32238750_32241637_32241772_32244058_32244129_32245675_32245740_32247573
tx.7284	chr16	+	740	4	NNC	ENSMUSG00000014075.16	novel	838	5	NA	NA	-12	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	118.894911581615	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCATGAATAGTTTTTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32238551	32247917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_32238750_32241637_32241772_32245675_32245740_32247573
tx.7286	chr16	-	1481	9	FSM	ENSMUSG00000035699.9	ENSMUST00000042042.9	2618	9	107	1030	-69	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_3	5.50993421013355	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGCTTGCACAAGACACACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32306590	32294351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_32294697_32295190_32295297_32295984_32296132_32296365_32296478_32297122_32297282_32297533_32297608_32298467_32298623_32304952_32305048_32306302
tx.729	chr1	+	2623	9	ISM	ENSMUSG00000042207.18	ENSMUST00000047714.14	8714	27	57763	3092	-3946	671	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	763	junction_3	83.4385065482359	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTAGACTACAGCTTCTTC	4817	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134545671	134559931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134545786_134547297_134547437_134548580_134548761_134549672_134549832_134552448_134552935_134555002_134555115_134556335_134556491_134558170_134558492_134558974
tx.7293	chr16	+	3434	9	FSM	ENSMUSG00000022800.15	ENSMUST00000023489.11	4312	9	28	850	2	-850	multi-exon	FALSE	canonical	3	485	junction_4	65.3632876697615	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCACATGAGTTATTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32698178	32728395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_32698367_32704493_32704623_32711634_32711784_32715454_32715568_32718743_32718841_32719247_32719310_32721002_32721078_32722788_32722916_32725901
tx.7294	chr16	+	1187	9	ISM	ENSMUSG00000022801.14	ENSMUST00000156928.8	2165	13	-6	9591	-5	5531	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	60	junction_4	4.89738450603993	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACGACGTGAAACAACCCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32734486	32799825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_32734774_32770661_32770807_32772426_32772554_32775669_32775776_32779764_32779902_32782004_32782115_32794249_32794344_32796098_32796220_32799765
tx.7296	chr16	-	1271	8	NNC	ENSMUSG00000035578.17	novel	5618	11	NA	NA	6391	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_7	7.43406390357582	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAATTCTCACCTAGCATC	6111	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32863849	32836994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_32837434_32839810_32839913_32840883_32841016_32849384_32849460_32851144_32851307_32855910_32855993_32861133_32861263_32863699
tx.7298	chr16	+	463	5	FSM	ENSMUSG00000060636.15	ENSMUST00000078804.12	491	5	9	19	-4	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	3858	junction_1	2402.68870226669	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCACATCTGTCCTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32876831	32880540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_32876881_32877505_32877549_32877759_32877913_32879048_32879194_32880467
tx.7299	chr16	+	482	5	FSM	ENSMUSG00000060636.15	ENSMUST00000115079.8	510	5	17	11	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3184	junction_1	2675.04705566089	712	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCACATCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32876852	32880535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_32876926_32877505_32877549_32877759_32877913_32879048_32879194_32880467
tx.73	chr1	-	1274	4	NNC	ENSMUSG00000041872.10	novel	825	5	NA	NA	-2969	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGAAGTCTGTGCTGGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20857463	20847367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_20848229_20849514_20849736_20854396_20854484_20857358
tx.730	chr1	+	950	2	ISM	ENSMUSG00000042207.18	ENSMUST00000047714.14	8714	27	70347	3335	7718	428	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1075	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTGTGTTGGTGCTTTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134558255	134559688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134558492_134558974
tx.7300	chr16	+	522	5	FSM	ENSMUSG00000060636.15	ENSMUST00000115078.8	500	5	-22	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	927	junction_1	3609.33805392346	357	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTTTTTCACATCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32876874	32880535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_32876988_32877505_32877549_32877759_32877913_32879048_32879194_32880467
tx.7301	chr16	+	493	4	FSM	ENSMUSG00000060636.15	ENSMUST00000115075.2	518	4	41	-16	41	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	8092	junction_3	1051.6733755729	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCACATCTGTCCTAAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32877428	32880542	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_32877549_32877759_32877913_32879048_32879194_32880467
tx.7302	chr16	+	2467	14	FSM	ENSMUSG00000022808.6	ENSMUST00000023502.6	3161	14	-13	707	-11	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	473	junction_8	41.4737387501677	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGATTTGTATTATTTTAA	9270	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33071800	33119932	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_33071972_33084628_33084751_33087119_33087256_33088387_33088538_33090025_33090074_33097311_33097368_33101002_33101076_33104779_33104842_33106356_33106423_33108061_33108152_33110468_33110569_33112110_33112257_33115010_33115126_33118800
tx.7303	chr16	-	722	3	NNC	ENSMUSG00000097318.3	novel	665	2	NA	NA	-5	6587	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	4	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGGAGAACAGGCTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33201102	33193636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_33194022_33200608_33200729_33200885
tx.7304	chr16	-	738	3	NNC	ENSMUSG00000097318.3	novel	737	2	NA	NA	0	6587	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	16.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATGGAGAACAGGCTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33201097	33193636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_33194022_33200608_33200750_33200885
tx.7305	chr16	-	717	2	FSM	ENSMUSG00000097318.3	ENSMUST00000231849.2	665	2	-52	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGGAATTCTCTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33201097	33200223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_33200729_33200885
tx.7306	chr16	-	744	2	FSM	ENSMUSG00000097318.3	ENSMUST00000180923.2	737	2	-6	-1	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	0	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGGAATTCTCTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33201103	33200223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_33200750_33200885
tx.7307	chr16	+	2818	9	FSM	ENSMUSG00000022811.18	ENSMUST00000165418.9	9830	9	5	7007	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_3	9.03811374126261	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGTAAATAATACTGGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33201210	33317726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_33201398_33241690_33241773_33247563_33247700_33254995_33255345_33277245_33277372_33287224_33287349_33288469_33288554_33315714_33315834_33316115
tx.731	chr1	+	945	7	NNC	ENSMUSG00000026429.10	novel	1116	7	NA	NA	-6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	165	junction_1	233.142779333943	506	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTTTATATGAAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134890296	134901900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_134890348_134895464_134895637_134896978_134897049_134898987_134899094_134899638_134899738_134899843_134899928_134901537
tx.7310	chr16	+	1520	6	ISM	ENSMUSG00000022817.16	ENSMUST00000232262.2	2130	11	27857	5	-2688	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	209	junction_4	8.76356092008266	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTAGATCTGATTACTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33740167	33769518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_33740585_33760859_33761083_33764473_33764575_33766860_33766981_33768084_33768252_33769026
tx.7311	chr16	-	1232	4	ISM	ENSMUSG00000022814.7	ENSMUST00000131990.2	3283	5	4834	1802	4834	-1802	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1087	junction_1	69.1391511534689	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAAGACTGGTATTTGTTT	4632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33782539	33776965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_33777306_33779422_33779538_33780546_33780723_33781938
tx.7312	chr16	-	1636	6	FSM	ENSMUSG00000022814.7	ENSMUST00000023510.7	3484	6	34	1814	-1	-1802	multi-exon	FALSE	canonical	3	1087	junction_1	75.962095811003	925	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAAGACTGGTATTTGTTT	8674	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33787374	33776965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_33777306_33779422_33779538_33780546_33780723_33781938_33782611_33784141_33784296_33787195
tx.7313	chr16	-	1493	5	FSM	ENSMUSG00000022814.7	ENSMUST00000131990.2	3283	5	-12	1802	-12	-1802	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_4	482.354123025812	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAAGACTGGTATTTGTTT	8663	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33787385	33776965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_33777306_33779422_33779538_33780546_33780723_33781938_33782611_33787195
tx.7314	chr16	-	753	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022832.12_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGTCTTAGCTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34488982	34477888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_34478284_34488624
tx.7315	chr16	+	999	6	NNC	ENSMUSG00000035376.11	novel	3598	7	NA	NA	1	-2599	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	574.173980601699	2850	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTGTTACATAAAGCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34842798	34926948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_34843006_34846194_34846313_34895955_34896065_34920125_34920248_34922315_34922495_34926684
tx.7316	chr16	+	793	5	NNC	ENSMUSG00000035376.11	novel	3598	7	NA	NA	3394	-2599	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	630.35882638383	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCTGTTACATAAAGCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34846193	34926948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_34846313_34895955_34896065_34920125_34920248_34922315_34922495_34926684
tx.7318	chr16	-	1668	7	FSM	ENSMUSG00000034473.15	ENSMUST00000043521.5	3992	7	46	2278	-20	655	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_4	6.0736223860962	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGGTCTTCCAAATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35184242	35133778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_35134658_35139173_35139240_35149867_35149984_35167968_35168164_35169200_35169365_35181930_35182130_35184193
tx.7319	chr16	-	1823	17	FSM	ENSMUSG00000022844.9	ENSMUST00000023550.9	1809	17	-10	-4	-10	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	428	junction_7	56.9566378374812	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGGTAGAGTATGTTTTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35311253	35217677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_35217909_35218646_35218782_35224382_35224454_35228003_35228135_35230663_35230825_35231296_35231368_35243235_35243373_35250102_35250175_35250262_35250355_35258482_35258551_35269772_35269834_35273820_35273914_35276465_35276512_35276831_35276916_35284704_35284793_35286900_35287028_35311098
tx.732	chr1	+	1090	7	FSM	ENSMUSG00000026429.10	ENSMUST00000027687.8	1116	7	26	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_1	158.492902049272	1339	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTTTATATGAAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134890328	134901900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_134890525_134895464_134895637_134896978_134897049_134898987_134899094_134899638_134899738_134899843_134899928_134901537
tx.7322	chr16	+	1595	8	FSM	ENSMUSG00000022849.6	ENSMUST00000231579.2	1703	8	14	94	14	-94	multi-exon	TRUE	canonical	3	531	junction_3	35.6118531058502	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACGTGTATATTTGCTTT	5418	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35590758	35645824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_35590910_35607559_35607746_35621906_35622089_35634287_35634425_35637521_35637694_35639048_35639133_35645058_35645170_35645252
tx.7323	chr16	+	1079	5	ISM	ENSMUSG00000022849.6	ENSMUST00000231579.2	1703	8	43540	94	43508	-94	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	565	junction_1	26.042033330752	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATACGTGTATATTTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35634284	35645824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_35634425_35637521_35637694_35639048_35639133_35645058_35645170_35645252
tx.7324	chr16	-	791	2	FSM	ENSMUSG00000034422.15	ENSMUST00000135669.2	580	2	-198	-13	-36	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATGAAAGGAAGGAAGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35691950	35686281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_35686659_35691536
tx.7328	chr16	-	588	4	ISM	ENSMUSG00000003955.9	ENSMUST00000231351.2	640	5	18960	0	-15	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	971	junction_1	46.8069320602076	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACTTGTCTTTGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35872779	35864215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_35864462_35866748_35866858_35870211_35870321_35872655
tx.7329	chr16	-	691	5	FSM	ENSMUSG00000003955.9	ENSMUST00000004057.9	718	5	-58	85	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	971	junction_1	40.7982842776507	2058	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGACTTGTCTTTGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35891943	35864215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_35864462_35866748_35866858_35870211_35870321_35872655_35872779_35891839
tx.733	chr1	+	895	6	ISM	ENSMUSG00000026429.10	ENSMUST00000027687.8	1116	7	5161	0	-3553	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	687	junction_5	56.6568618968612	755	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGTGTTTATATGAAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	134895463	134901900	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_134895637_134896978_134897049_134898987_134899094_134899638_134899738_134899843_134899928_134901537
tx.7330	chr16	+	674	5	FSM	ENSMUSG00000075229.12	ENSMUST00000164916.9	1073	5	391	8	-4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	859	junction_1	27.9284800875379	4478	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTGTACATATTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35892445	35912482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_35892508_35903060_35903187_35905386_35905534_35910270_35910331_35912203
tx.7332	chr16	+	2349	7	ISM	ENSMUSG00000022900.15	ENSMUST00000023617.13	3042	8	14245	483	-7315	-420	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	275	junction_4	15.8683822601914	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTACTTCTATTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36528584	36546683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_36528783_36529840_36529991_36535862_36535983_36536468_36536616_36541899_36542032_36542244_36543042_36545878
tx.7333	chr16	+	1336	2	ISM	ENSMUSG00000022900.15	ENSMUST00000153802.2	1922	5	14215	6764	-7290	-6764	internal_fragment	FALSE	canonical	3	311	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATTGTGGGGATGAAGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36528609	36531003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_36528783_36529840
tx.7334	chr16	+	2053	6	ISM	ENSMUSG00000022900.15	ENSMUST00000023617.13	3042	8	15599	483	-5961	-420	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	275	junction_3	16.2061716639063	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTCTACTTCTATTCATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36529938	36546683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_36529991_36535862_36535983_36536468_36536616_36541899_36542032_36542244_36543042_36545878
tx.7336	chr16	-	899	6	ISM	ENSMUSG00000022899.11	ENSMUST00000164579.9	1068	7	2461	3	-14	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.894427190999916	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATCTGTGTGTCAGCATAT	8323	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36602841	36592238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_36592504_36592783_36592875_36594903_36595004_36595959_36596053_36601927_36602070_36602633
tx.7337	chr16	-	965	5	NIC	ENSMUSG00000022838.15	novel	1030	6	NA	NA	-30	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_4	5.24404424085076	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTGGTATTCTCATGTG	8170	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36648653	36614105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_36614289_36620948_36621207_36628376_36628523_36630833_36630971_36648412
tx.7338	chr16	-	1056	6	FSM	ENSMUSG00000022838.15	ENSMUST00000114829.9	1030	6	-26	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	12	junction_4	1.32664991614216	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTGGTATTCTCATGTG	8174	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36648649	36614105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_36614289_36620948_36621207_36628376_36628523_36630833_36630971_36645019_36645115_36648412
tx.7339	chr16	-	818	4	FSM	ENSMUSG00000022838.15	ENSMUST00000147053.2	667	4	-73	-78	-23	-1	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	4.49691252107735	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTTGTTGGTATTCTCAT	8177	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36648646	36614108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_36614289_36620948_36621207_36628376_36628523_36648412
tx.734	chr1	-	1060	2	FSM	ENSMUSG00000097993.8	ENSMUST00000182120.2	717	2	-332	-11	-179	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTCTGCATCCTTCAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135037506	135036223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_135036434_135036656
tx.7340	chr16	-	915	6	FSM	ENSMUSG00000022838.15	ENSMUST00000023537.6	849	6	-61	-5	-27	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	3.81575680566778	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTGGTATTCTCATGTG	8173	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36648650	36614105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_36614289_36620948_36621065_36628376_36628523_36630833_36630971_36645019_36645115_36648412
tx.7341	chr16	+	2280	15	FSM	ENSMUSG00000022837.15	ENSMUST00000023535.4	2257	15	-17	-6	6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_14	52.2779073016196	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTCATGTTATTTCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36648752	36693081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_36648855_36649365_36649436_36651863_36651977_36652190_36652354_36655877_36656008_36660231_36660326_36663720_36663821_36667842_36668022_36669988_36670099_36671546_36671657_36676652_36676796_36678816_36678966_36687920_36688053_36691812_36691970_36692553
tx.7342	chr16	+	1622	13	NIC	ENSMUSG00000022837.15	novel	2797	14	NA	NA	5	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	51	junction_1	67.3747294366862	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCAAGTCTGAAAGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36648751	36679934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_36648802_36649365_36649436_36651863_36651977_36652190_36652354_36655877_36656008_36660231_36660326_36663720_36663821_36667842_36668022_36669988_36670099_36671546_36671657_36676652_36676796_36678816_36678966_36679723
tx.7343	chr16	+	1668	13	NIC	ENSMUSG00000022837.15	novel	2257	15	NA	NA	-9	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	130	junction_12	42.1751473685102	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAAGTCTGAAAGCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36648759	36679935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_36648855_36649365_36649436_36651863_36651977_36652190_36652354_36655877_36656008_36660231_36660326_36663720_36663821_36667842_36668022_36669988_36670099_36671546_36671657_36676652_36676796_36678816_36678966_36679723
tx.7344	chr16	+	1575	12	NIC	ENSMUSG00000022837.15	novel	2797	14	NA	NA	555	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	130	junction_11	41.8057293712771	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCAAGTCTGAAAGCATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36649363	36679935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_36649436_36651863_36651977_36652190_36652354_36655877_36656008_36660231_36660326_36663720_36663821_36667842_36668022_36669988_36670099_36671546_36671657_36676652_36676796_36678816_36678966_36679723
tx.7345	chr16	+	306	2	ISM	ENSMUSG00000022837.15	ENSMUST00000129123.2	546	4	7257	0	6916	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTTCAAGTCTGAAAGCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36678870	36679934	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_36678966_36679723
tx.7346	chr16	+	737	3	ISM	ENSMUSG00000022837.15	ENSMUST00000023535.4	2257	15	39231	-6	16046	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_2	0.5	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTCATGTTATTTCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36688000	36693081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_36688053_36691812_36691970_36692553
tx.7347	chr16	+	602	5	ISM	ENSMUSG00000034243.18	ENSMUST00000114812.9	11001	22	-28	45492	0	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_2	6.45658578507248	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACTCCATGCAAAGGCC	1449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36695501	36707955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_36695626_36705372_36705551_36706492_36706591_36707600_36707766_36707918
tx.7348	chr16	+	606	5	NNC	ENSMUSG00000034243.18	novel	11001	22	NA	NA	-7	-5	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	13	junction_2	9.40744386111339	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAACTCCATGCAAAGGCC	1442	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36695494	36707955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_36695626_36705372_36705551_36706495_36706591_36707600_36707766_36707918
tx.7349	chr16	+	1001	4	ISM	ENSMUSG00000034206.16	ENSMUST00000071452.12	7290	25	-23	77401	-23	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_3	9.03081145609604	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATTTATTTGTTTA	3725	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36832124	36837953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_36832422_36833468_36833649_36835440_36835572_36837560
tx.735	chr1	-	867	4	NIC	ENSMUSG00000097993.8	novel	6108	37	NA	NA	241	0	intron_retention	FALSE	canonical	2	2	junction_2	6.79869268479038	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTGTGTCTGCTTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135037961	135036234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_135036434_135036656_135036793_135037300_135037418_135037546
tx.7350	chr16	+	1094	5	ISM	ENSMUSG00000034206.16	ENSMUST00000183112.8	7386	26	-20	77401	-20	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_3	8.6421930087218	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATTTATTTGTTTA	3728	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36832127	36837953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_36832422_36833468_36833649_36835440_36835572_36836674_36836771_36837560
tx.7351	chr16	+	883	5	NNC	ENSMUSG00000034206.16	novel	7290	25	NA	NA	-23	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_4	13.4721935853075	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATTTATTTGTTTA	3725	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36832124	36837953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_36832422_36833468_36833649_36835440_36835572_36837560_36837718_36837835
tx.7352	chr16	+	976	6	NNC	ENSMUSG00000034206.16	novel	7386	26	NA	NA	-20	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_5	12.2474487139159	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTATTTATTTATTTGTTTA	3728	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36832127	36837953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_36832422_36833468_36833649_36835440_36835572_36836674_36836771_36837560_36837718_36837835
tx.7353	chr16	-	3021	5	FSM	ENSMUSG00000022828.11	ENSMUST00000023525.9	3084	5	58	5	45	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	285	junction_4	13.7204227340122	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAAGAGGTGGTTATACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37360093	37330156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_37332182_37336080_37336323_37343112_37343315_37356082_37356556_37360014
tx.7354	chr16	+	2018	8	FSM	ENSMUSG00000022827.15	ENSMUST00000023524.13	2031	8	13	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_4	11.0896163971859	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTGTCATTTCTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37360259	37392747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_37360323_37362208_37362301_37377182_37377313_37380356_37380472_37383977_37384129_37387681_37387754_37390749_37390789_37391391
tx.7355	chr16	+	269	2	ISM	ENSMUSG00000022827.15	ENSMUST00000128036.2	4332	4	-16	22005	4	-22005	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGATTTAGCTCCCACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37360250	37362405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_37360323_37362208
tx.7356	chr16	-	473	3	FSM	ENSMUSG00000022820.5	ENSMUST00000023514.4	971	3	65	433	-22	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	6062	junction_1	348	7665	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACAGTTTCTTTTTCTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37474750	37467964	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_37468082_37469375_37469523_37474541
tx.7357	chr16	+	1247	11	FSM	ENSMUSG00000022816.12	ENSMUST00000114763.3	3789	11	154	2388	-28	-300	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_9	10.1607086367044	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTTTAAGAGAAACTAAAGGA	5305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37597388	37654488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_37597515_37597655_37597713_37636067_37636173_37639265_37639396_37641517_37641551_37642962_37643094_37647087_37647207_37649068_37649182_37649475_37649587_37651918_37651996_37654243
tx.7358	chr16	+	608	5	ISM	ENSMUSG00000022812.15	ENSMUST00000023507.13	8303	11	104956	5395	-14081	-90	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_3	5.61248608016091	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGTTCATTTTAGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38014318	38061051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_38014357_38028356_38028453_38040333_38040521_38049039_38049139_38060863
tx.7359	chr16	-	1244	7	NNC	ENSMUSG00000022809.5	novel	2553	9	NA	NA	40670	-687	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_5	2.28521820013368	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGGTGTTAGGTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38074516	38069371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_38069752_38071134_38071241_38071489_38071607_38071755_38071899_38073189_38073465_38074101_38074290_38074481
tx.736	chr1	-	1025	5	ISM	ENSMUSG00000097993.8	ENSMUST00000183317.8	6108	37	22377	-1	247	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	13	junction_2	2.06155281280883	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTGTGTCTGCTTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135037955	135036234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_135036434_135036656_135036793_135037023_135037188_135037300_135037418_135037546
tx.7360	chr16	+	409	3	FSM	ENSMUSG00000046516.11	ENSMUST00000050273.9	444	3	26	9	-5	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	2901	junction_2	455	12831	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTGAACCGTCTTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38167378	38173116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_38167570_38169602_38169692_38172987
tx.7361	chr16	-	914	5	ISM	ENSMUSG00000002847.8	ENSMUST00000002926.8	1974	11	25423	0	10072	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_2	28.8823042709546	437	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATTTTGGTTGTTTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38228084	38216478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_38216898_38217700_38217866_38221237_38221347_38225898_38225989_38227953
tx.7362	chr16	-	1552	4	FSM	ENSMUSG00000002844.10	ENSMUST00000002923.10	2966	4	41	1373	20	-1373	multi-exon	FALSE	canonical	3	1151	junction_2	86.2824818063706	863	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTGTCTGACTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38273024	38265764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_38266467_38267609_38267971_38270490_38270846_38272890
tx.7363	chr16	-	1048	2	ISM	ENSMUSG00000002844.10	ENSMUST00000002923.10	2966	4	5110	1373	5089	-1373	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1336	junction_1	0	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTTGTCTGACTTTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38267955	38265764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_38266467_38267609
tx.7364	chr16	+	579	2	FSM	ENSMUSG00000097576.3	ENSMUST00000231660.2	485	2	-94	0	-94	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTAGGGACTTTTATTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38272657	38273856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_38272823_38273442
tx.7365	chr16	-	1564	7	FSM	ENSMUSG00000002846.10	ENSMUST00000002925.6	1573	7	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_6	22.2666916167525	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTTGTCTGGATCGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38343016	38318708	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_38319446_38322923_38323035_38325773_38325853_38329200_38329269_38331080_38331170_38338728_38338895_38342702
tx.7366	chr16	-	2719	11	FSM	ENSMUSG00000034064.15	ENSMUST00000036210.7	2758	11	39	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	749	junction_10	82.4351866620074	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATTGGCTCCTCATTTACT	6269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38370581	38345498	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_38347144_38347938_38347996_38349806_38349975_38352145_38352205_38355086_38355187_38358268_38358329_38363199_38363322_38366110_38366247_38368799_38368944_38369704_38369796_38370444
tx.7367	chr16	+	1866	9	NNC	ENSMUSG00000002845.15	novel	1645	9	NA	NA	-23	38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_8	237.230603790911	387	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGGCTCTGGAGTGACA	7047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38379036	38411746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_38379125_38384476_38384664_38393415_38393639_38396104_38396189_38402331_38402487_38405537_38405881_38406582_38406771_38408544_38408670_38411273
tx.7368	chr16	+	1415	7	NNC	ENSMUSG00000002845.15	novel	2871	9	NA	NA	-2212	38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_6	270.279330816596	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGGCTCTGGAGTGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38393591	38411746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_38393639_38396104_38396189_38402331_38402487_38405537_38405881_38406582_38406771_38408544_38408670_38411273
tx.7369	chr16	+	550	2	NNC	ENSMUSG00000002845.15	novel	660	2	NA	NA	192	38	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	885	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGGCTCTGGAGTGACA	4621	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38408592	38411746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_38408670_38411273
tx.737	chr1	+	1542	7	FSM	ENSMUSG00000026426.11	ENSMUST00000125774.2	1495	7	-48	1	-48	-1	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	183.490235889179	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGGGTGTGTATGGTGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135075358	135084006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_135075466_135080208_135080290_135080530_135080605_135081913_135082008_135082145_135082214_135082450_135082522_135082959
tx.7370	chr16	+	2104	7	FSM	ENSMUSG00000022793.18	ENSMUST00000023482.13	2304	7	0	200	0	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	15	junction_1	6.0184900284226	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCTTGGTCTTGTTTTTTT	3912	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38562625	38589211	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_38562731_38572363_38572762_38574280_38574514_38578040_38578229_38583430_38583554_38586276_38586382_38588259
tx.7371	chr16	+	2163	7	FSM	ENSMUSG00000022793.18	ENSMUST00000114712.8	2168	7	0	5	0	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	7.60847480700888	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCAGTTCTTGGTCTTGT	3914	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38562627	38589205	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_38562798_38572363_38572762_38574280_38574514_38578040_38578229_38583430_38583554_38586276_38586382_38588259
tx.7372	chr16	+	654	5	NNC	ENSMUSG00000086175.3	novel	1094	6	NA	NA	20825	23280	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATGACTGACATTCTAATT	8382	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38670094	38672886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_38670132_38670256_38670350_38670704_38670803_38672345_38672418_38672532
tx.7373	chr16	-	1391	3	FSM	ENSMUSG00000047261.10	ENSMUST00000102817.5	1420	3	29	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTGGTGTCTCTGTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42160985	42068804	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_42069478_42112161_42112730_42160835
tx.7374	chr16	-	3062	9	NNC	ENSMUSG00000022704.17	novel	3856	9	NA	NA	-7	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	45.3360714552993	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCGCTGTGCATTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43710055	43681769	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_43683665_43687772_43687891_43689308_43689461_43691979_43692184_43696991_43697205_43698319_43698397_43700661_43700718_43701355_43701577_43709929
tx.7375	chr16	-	1838	6	ISM	ENSMUSG00000022704.17	ENSMUST00000156568.8	3856	9	-27	9252	10	1014	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_4	18.1041431722134	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATGGGAATTAAGTGTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43710038	43691021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_43692184_43696991_43697205_43698319_43698397_43700661_43700718_43701355_43701577_43709929
tx.7377	chr16	+	940	6	ISM	ENSMUSG00000022701.19	ENSMUST00000122014.8	1822	8	-9	24010	-9	7075	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	7.7614431647729	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAACTGAGGGAGACACTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43710252	43735920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_43710402_43718452_43718595_43725708_43725847_43727150_43727330_43728774_43728999_43735812
tx.7378	chr16	+	1706	7	ISM	ENSMUSG00000022701.19	ENSMUST00000122014.8	1822	8	9	7636	9	-7636	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	8.29993306532582	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACATTTTCCCTTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43710270	43752294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_43710402_43718452_43718595_43725708_43725847_43727150_43727330_43728774_43728999_43735812_43735967_43751556
tx.738	chr1	+	1351	5	ISM	ENSMUSG00000026426.11	ENSMUST00000125774.2	1495	7	5133	-5	720	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	419	junction_1	39.3533670732251	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTATGGTGCTGGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135080539	135084012	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_135080605_135081913_135082008_135082145_135082214_135082450_135082522_135082959
tx.7381	chr16	-	3742	15	FSM	ENSMUSG00000052459.14	ENSMUST00000063661.13	3896	15	155	-1	-23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_14	86.121532541792	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGCAGTTCTCTATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43959404	43906006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_43907880_43909268_43909441_43911533_43911629_43919089_43919294_43920304_43920369_43921927_43922043_43922125_43922249_43927297_43927407_43928087_43928251_43929857_43930010_43931457_43931596_43931860_43932076_43934976_43935106_43937149_43937246_43959310
tx.7382	chr16	-	1398	2	ISM	ENSMUSG00000052459.14	ENSMUST00000063661.13	3896	15	50136	629	49920	-629	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	471	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAAGATCAATTTTTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43909423	43906636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_43907880_43909268
tx.7383	chr16	-	3098	15	FSM	ENSMUSG00000052459.14	ENSMUST00000114666.9	4234	15	263	873	-24	-630	multi-exon	FALSE	canonical	3	337	junction_14	44.4035299203538	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAAAGATCAATTTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43959405	43906637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_43907880_43909268_43909441_43911533_43911629_43919089_43919294_43920304_43920369_43921927_43922043_43922125_43922249_43927297_43927407_43928087_43928251_43929857_43930010_43931457_43931596_43931860_43932076_43934976_43935106_43937149_43937246_43959324
tx.7384	chr16	+	1823	5	FSM	ENSMUSG00000022698.18	ENSMUST00000063520.15	3557	5	-48	1782	8	-484	multi-exon	FALSE	canonical	3	375	junction_1	525.255652040033	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCATTGAGTGTTTAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43960200	43981053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_43960475_43976775_43976910_43977436_43977557_43978242_43978310_43979825
tx.7385	chr16	+	1826	5	FSM	ENSMUSG00000022698.18	ENSMUST00000161326.8	4487	5	-15	2676	8	-484	multi-exon	FALSE	canonical	3	958	junction_1	274.815733719887	280	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTCATTGAGTGTTTAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43960200	43981053	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_43960475_43976772_43976910_43977436_43977557_43978242_43978310_43979825
tx.7386	chr16	+	718	6	ISM	ENSMUSG00000068284.15	ENSMUST00000119746.8	12708	7	148	14520	-3	13	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	10.2097992144802	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTACTTCTGGGTATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43993756	44033308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_43993874_44019266_44019385_44020976_44021042_44022100_44022130_44025360_44025444_44033002
tx.7388	chr16	+	3078	18	FSM	ENSMUSG00000043065.13	ENSMUST00000050897.7	4627	18	289	1260	-4	94	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	35.5942143737688	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGATACTTTTTTTTTCTA	6397	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44167772	44207600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_44167870_44175802_44175899_44176507_44176556_44178122_44178267_44185946_44186050_44186895_44187003_44187995_44188112_44190242_44190383_44190600_44190742_44191042_44191309_44192896_44193029_44196004_44196156_44197160_44197386_44199218_44199704_44202381_44202566_44205033_44205137_44205981_44206070_44207148
tx.7389	chr16	+	2946	17	ISM	ENSMUSG00000043065.13	ENSMUST00000050897.7	4627	18	8354	1260	7429	94	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	119	junction_12	15.197527553849	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGATACTTTTTTTTTCTA	2555	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44175837	44207600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_44175899_44176507_44176556_44178122_44178267_44185946_44186050_44186895_44187003_44187995_44188112_44190242_44190383_44190600_44190742_44191042_44191309_44192896_44193029_44196004_44196156_44197160_44197386_44199218_44199704_44202381_44202566_44205033_44205137_44205981_44206070_44207148
tx.739	chr1	+	691	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000079139.5	novel	1231	1	NA	NA	28	188	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	191	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATTCTTATTACCTGGG	4189	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135159760	135161151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_135160090_135160789
tx.7390	chr16	+	1027	5	ISM	ENSMUSG00000043065.13	ENSMUST00000050897.7	4627	18	32020	1260	-6243	94	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_1	11.8400802362146	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTGATACTTTTTTTTTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44199503	44207600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_44199704_44202381_44202566_44205033_44205137_44205981_44206070_44207148
tx.7391	chr16	+	2721	9	FSM	ENSMUSG00000036208.14	ENSMUST00000048788.14	2866	9	-19	164	-19	-164	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	9.69455388349562	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAATGCTTAAAACCATTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44544644	44557483	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_44544832_44547390_44547546_44549604_44549685_44549944_44550077_44550482_44550561_44551694_44552060_44552420_44552483_44554903_44555161_44556078
tx.7392	chr16	+	2256	6	ISM	ENSMUSG00000036208.14	ENSMUST00000048788.14	2866	9	5332	156	2514	-156	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_3	7.00285656000464	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCATTATCTAATCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44549995	44557491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_44550077_44550482_44550561_44551694_44552060_44552420_44552483_44554903_44555161_44556078
tx.7393	chr16	-	1078	6	FSM	ENSMUSG00000022668.11	ENSMUST00000162512.8	3415	6	15	2322	11	52	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_4	12.4739729036101	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGCTGGCTTTTCTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44566711	44559452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_44559732_44560391_44560511_44562866_44562967_44564100_44564232_44565757_44565857_44566361
tx.7394	chr16	-	1299	6	NIC	ENSMUSG00000022668.11	novel	3415	6	NA	NA	11	161	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_4	40.3187301387333	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTACTGTCTTCAATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44566711	44559343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_44559732_44560391_44560511_44562866_44562967_44564100_44564232_44565645_44565857_44566361
tx.7395	chr16	+	1324	12	FSM	ENSMUSG00000022663.4	ENSMUST00000023343.4	2057	12	120	613	120	31	multi-exon	FALSE	canonical	3	353	junction_3	33.1011472673263	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATGTTTTCATTTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44979267	45008288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_44979535_44982768_44982811_44987342_44987393_44990228_44990300_44992008_44992117_44995611_44995662_44998592_44998675_45003018_45003054_45003183_45003340_45004044_45004173_45006528_45006598_45008022
tx.7397	chr16	+	790	7	ISM	ENSMUSG00000022663.4	ENSMUST00000150390.2	2081	10	9362	-31	9362	31	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	355	junction_5	34.9475797922164	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATGTTTTCATTTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44995607	45008288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_44995662_44998592_44998675_45003018_45003054_45003183_45003340_45004044_45004173_45006528_45006598_45008022
tx.7398	chr16	+	307	2	ISM	ENSMUSG00000022663.4	ENSMUST00000150390.2	2081	10	20311	-31	20311	31	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	467	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGATGTTTTCATTTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45006556	45008288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_45006598_45008022
tx.7399	chr16	-	1377	2	ISM	ENSMUSG00000022661.15	ENSMUST00000163230.8	2347	6	16763	-8	8022	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTTCTCTATGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45212653	45202489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_45203821_45212607
tx.74	chr1	-	1958	11	ISM	ENSMUSG00000041859.11	ENSMUST00000053266.11	3031	17	7284	4	-7088	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2274	junction_6	181.743665639273	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTGTCTGTGTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20883252	20873195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_20873879_20875040_20875132_20875486_20875564_20876020_20876125_20876965_20877107_20878944_20879096_20879819_20879947_20880281_20880457_20882188_20882398_20882787_20882920_20883184
tx.740	chr1	+	1220	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000079139.5	novel	1231	1	NA	NA	30	188	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_1	0	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATTCTTATTACCTGGG	4191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135159762	135161151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_135160090_135160258
tx.7400	chr16	-	289	2	FSM	ENSMUSG00000022661.15	ENSMUST00000172091.2	281	2	-4	-4	1	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAAGCCTATCCTTTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45229385	45227552	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_45227675_45229218
tx.7401	chr16	-	1087	4	FSM	ENSMUSG00000022658.11	ENSMUST00000096057.5	1240	4	153	0	153	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_1	1.63299316185545	197	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCAGAGTATAACTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45544818	45531592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_45532073_45533294_45533398_45543285_45543461_45544489
tx.7402	chr16	-	1201	4	NIC	ENSMUSG00000033157.18	novel	2848	5	NA	NA	-9	402	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	92	junction_3	111.547697819762	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTGCCATGCTATATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45563279	45551511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_45552323_45557255_45557394_45557886_45557999_45563139
tx.7403	chr16	-	1385	5	FSM	ENSMUSG00000033157.18	ENSMUST00000066983.13	2848	5	36	1427	-12	399	multi-exon	FALSE	canonical	3	291	junction_3	18.7932833746528	478	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGGGTGCCATGCTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45563282	45551514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_45552323_45557255_45557394_45557886_45557999_45560681_45560866_45563139
tx.7404	chr16	-	2025	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000048087.7	novel	2093	1	NA	NA	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	1	11	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AATAAAAAAAAATAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45975440	45973343	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr16_-_45974209_45974280
tx.7405	chr16	+	1480	7	FSM	ENSMUSG00000058550.16	ENSMUST00000096045.9	1479	7	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	369	junction_4	76.5188792971309	961	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGGCTTTTGTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48104097	48114601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_48104205_48108240_48108359_48109401_48109569_48109690_48109742_48111376_48111678_48113273_48113470_48114061
tx.7406	chr16	+	1738	7	FSM	ENSMUSG00000072419.6	ENSMUST00000097175.5	1948	7	-1	211	-1	-211	multi-exon	FALSE	canonical	3	478	junction_4	51.0968579160098	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATATCTGGTTGGTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48130838	48139875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_48130903_48131937_48132074_48134245_48134398_48134491_48134546_48136024_48136281_48137650_48137847_48138995
tx.7407	chr16	+	1423	5	ISM	ENSMUSG00000072419.6	ENSMUST00000097175.5	1948	7	3517	215	3517	-215	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	478	junction_2	37.9407432715808	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGATATCTGGTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48134356	48139871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_48134398_48134491_48134546_48136024_48136281_48137650_48137847_48138995
tx.7408	chr16	+	1411	4	ISM	ENSMUSG00000072419.6	ENSMUST00000097175.5	1948	7	3650	188	3650	-188	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	478	junction_1	42.9444085093999	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCAAGACAGGGTCTTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48134489	48139898	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_48134546_48136024_48136281_48137650_48137847_48138995
tx.7409	chr16	-	723	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022652.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	705	junction_1	0	1147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCACTTTGGCTGTGAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48422131	48420464	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_48421063_48422006
tx.741	chr1	-	943	2	ISM	ENSMUSG00000003051.14	ENSMUST00000185752.2	1901	9	3375	-2	2586	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	594	junction_1	0	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCCTGAGCTCTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135182801	135181314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_135182119_135182662
tx.7410	chr16	+	685	2	Intergenic	novelGene_608	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTTCCCTTTTATCTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48420470	48422135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_48421065_48422044
tx.7411	chr16	+	917	8	NNC	ENSMUSG00000022652.8	novel	3045	27	NA	NA	16999	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	194	junction_1	345.998525418587	517	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCCTTTTGATTGCTAT	694	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48432028	48451274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_48432112_48432651_48432725_48436057_48436125_48438864_48439015_48442924_48443013_48444652_48444707_48447275_48447471_48451067
tx.7412	chr16	+	1004	8	NNC	ENSMUSG00000022652.8	novel	3045	27	NA	NA	17022	11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	485	junction_1	244.404064898224	1334	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCCTTTTGATTGCTAT	717	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48432051	48451274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_48432222_48432651_48432725_48436057_48436125_48438864_48439015_48442924_48443013_48444652_48444707_48447275_48447471_48451067
tx.7413	chr16	+	836	7	ISM	ENSMUSG00000022652.8	ENSMUST00000023330.8	3045	27	181050	-11	17620	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1153	junction_1	21.2948872319677	296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTCCTTTTGATTGCTAT	1315	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48432649	48451274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_48432725_48436057_48436125_48438864_48439015_48442924_48443013_48444652_48444707_48447275_48447471_48451067
tx.7414	chr16	-	1747	16	ISM	ENSMUSG00000064061.14	ENSMUST00000114516.8	3331	31	-150	21815	74	-2152	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_3	21.6788683591495	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AACTAAGAGTAATAAAAAGG	4271	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48814454	48768056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_48768086_48768769_48768940_48770363_48770397_48774089_48774167_48778015_48778069_48778781_48778875_48780017_48780120_48781470_48781591_48792584_48792700_48795785_48795911_48798244_48798326_48799908_48800026_48801261_48801418_48802422_48802496_48804897_48804999_48814152
tx.7415	chr16	-	1573	15	ISM	ENSMUSG00000064061.14	ENSMUST00000114516.8	3331	31	4	22519	4	-2856	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	44	junction_2	22.4353947764578	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTATTAAATTTAACTATGAA	4425	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48814300	48768760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_48768940_48770363_48770397_48774089_48774167_48778015_48778069_48778781_48778875_48780017_48780120_48781470_48781591_48792584_48792700_48795785_48795911_48798244_48798326_48799908_48800026_48801261_48801418_48802422_48802496_48804897_48804999_48814152
tx.7416	chr16	-	399	4	ISM	ENSMUSG00000064061.14	ENSMUST00000114516.8	3331	31	18	55085	18	-35422	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	90	junction_2	7.71722460186015	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAAAGGTGTGTTCCCTAAC	4439	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48814286	48801326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_48801418_48802422_48802496_48804897_48804999_48814152
tx.7417	chr16	-	234	2	NNC	ENSMUSG00000064061.14	novel	5820	32	NA	NA	26	-44696	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTCCGATATTTTGTT	4447	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48814278	48810600	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_48810709_48814152
tx.7418	chr16	+	3521	21	FSM	ENSMUSG00000033031.14	ENSMUST00000048374.6	3974	21	0	453	0	-399	multi-exon	FALSE	canonical	2	173	junction_10	25.4173169315725	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTTTGTTCTTTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48814550	48839615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_48814743_48817733_48817882_48819317_48819431_48820623_48820719_48821353_48821451_48821928_48822052_48822154_48822301_48824289_48824366_48824631_48824848_48826050_48826211_48827412_48827555_48829440_48829541_48831071_48831191_48833537_48833734_48834159_48834235_48834327_48834439_48835255_48835453_48836306_48836421_48836641_48836725_48837714_48837855_48838737
tx.7419	chr16	+	1414	5	ISM	ENSMUSG00000033031.14	ENSMUST00000130080.8	3079	10	6479	400	-947	-400	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	218	junction_3	17.5410233452897	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTCTTTTGTTCTTTGCTT	NA	False	NA	-19	True	NA	NA	NA	48835252	48839614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_48835453_48836306_48836421_48836641_48836725_48837714_48837855_48838737
tx.742	chr1	-	1921	9	FSM	ENSMUSG00000003051.14	ENSMUST00000185752.2	1901	9	-20	0	-20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	367	junction_7	94.095363860288	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGGCCTGAGCTCTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135186196	135181316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_135182119_135182662_135182859_135183712_135183830_135183971_135184062_135184208_135184329_135184516_135184613_135184742_135184965_135185352_135185521_135186086
tx.7420	chr16	+	1447	10	NIC	ENSMUSG00000032965.12	novel	2601	11	NA	NA	-18	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	3	junction_1	50.3957180230794	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGTTCAGAGAAGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49519577	49584480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_49519913_49523512_49523632_49526453_49526545_49532201_49532271_49557034_49557158_49578757_49578830_49579679_49579812_49581316_49581380_49582963_49583031_49584104
tx.7421	chr16	+	1860	5	ISM	ENSMUSG00000032965.12	ENSMUST00000046777.11	2601	11	-2	52120	-2	1139	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	148	junction_2	8.03118920210451	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGTTATAAGCTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49519593	49533369	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_49519913_49522216_49522380_49523512_49523632_49526453_49526545_49532201
tx.7422	chr16	+	1603	11	FSM	ENSMUSG00000032965.12	ENSMUST00000046777.11	2601	11	-11	1009	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_7	10.0915806492343	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATGTTCAGAGAAGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49519584	49584480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_49519913_49522216_49522380_49523512_49523632_49526453_49526545_49532201_49532271_49557034_49557158_49578757_49578830_49579679_49579812_49581316_49581380_49582963_49583031_49584104
tx.7423	chr16	+	1301	11	FSM	ENSMUSG00000055447.20	ENSMUST00000229206.2	1316	11	19	-4	8	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_9	24.8766959220874	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAATCCCATTTTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49676026	49731448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_49676196_49688127_49688476_49704527_49704618_49714539_49714648_49715731_49715825_49716718_49716812_49718402_49718496_49727143_49727176_49728416_49728442_49729065_49729099_49731231
tx.7424	chr16	+	1243	9	NIC	ENSMUSG00000055447.20	novel	1313	10	NA	NA	8	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	49	junction_8	11.8532695911297	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAATCCCATTTTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49676026	49731448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_49676196_49688127_49688476_49704527_49704618_49714539_49714648_49715731_49715825_49716718_49716812_49718402_49718496_49727143_49727176_49731231
tx.7425	chr16	+	1266	10	NIC	ENSMUSG00000055447.20	novel	1358	11	NA	NA	10	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	19	junction_9	22.7107414625278	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAATCCCATTTTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49676028	49731448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_49676196_49688127_49688476_49704527_49704618_49714539_49714648_49715731_49715825_49716718_49716812_49718402_49718496_49727143_49727176_49728416_49728442_49731231
tx.7426	chr16	+	1290	10	FSM	ENSMUSG00000055447.20	ENSMUST00000084838.14	5250	10	35	3925	24	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_2	24.0960014099978	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGGAATCCCATTTTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49676042	49731448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_49676196_49688127_49688476_49689380_49689444_49704527_49704618_49714539_49714648_49715731_49715825_49716718_49716812_49718402_49718496_49727143_49727176_49731231
tx.7427	chr16	-	1925	11	ISM	ENSMUSG00000022641.16	ENSMUST00000114477.8	4516	13	93	6056	13	234	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_10	4.40567815438214	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGAAATCCAAGGAGAAGAA	9808	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50252659	50044975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_50045657_50061216_50061298_50068144_50068220_50071676_50071758_50082778_50082847_50086539_50086733_50094909_50095153_50100731_50100903_50151391_50151466_50249272_50249345_50252473
tx.7428	chr16	-	1784	2	FSM	ENSMUSG00000022639.15	ENSMUST00000186535.2	2896	2	-15	1127	-6	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAAACCCATAGGAGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50553106	50547114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_50548573_50552780
tx.7429	chr16	-	1483	2	Intergenic	novelGene_609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACATTTGTTTATCTATTCA	4604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50586522	50583889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_50585199_50586348
tx.743	chr1	-	1982	9	FSM	ENSMUSG00000003051.14	ENSMUST00000003135.14	2095	9	110	3	-20	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_7	111.074791807142	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCCTGAGCTCTCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135186196	135181315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_135182119_135182662_135182859_135183712_135183830_135183971_135184062_135184208_135184329_135184516_135184613_135184742_135185025_135185352_135185521_135186086
tx.7430	chr16	-	425	2	Intergenic	novelGene_611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTGTTTTTCCTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55609201	55596649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_55596986_55609112
tx.7431	chr16	-	1352	3	NNC	ENSMUSG00000075033.5	novel	6436	6	NA	NA	-120	-25632	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_2	2.5	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTGGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55715768	55685947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_55686914_55710944_55711213_55715650
tx.7432	chr16	+	636	6	FSM	ENSMUSG00000098274.8	ENSMUST00000023269.5	677	6	41	0	41	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9815	junction_1	1495.09793659145	8004	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGGTGCTGATTGATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55786678	55791798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_55786802_55786909_55786986_55787422_55787534_55789872_55790010_55790474_55790539_55791673
tx.7433	chr16	+	2165	2	ISM	ENSMUSG00000022601.12	ENSMUST00000184618.2	3159	3	1100	0	1100	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTGGCGTTGAGCTTGAC	6255	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55826654	55829276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_55826714_55827170
tx.7434	chr16	-	2366	6	NNC	ENSMUSG00000071533.12	novel	2200	5	NA	NA	-2	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	104	junction_4	1006.61305375998	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGGTGGTCTTATTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55850051	55835870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_55837681_55838834_55838891_55842417_55842493_55844586_55844750_55844824_55845001_55849965
tx.7435	chr16	-	2453	5	FSM	ENSMUSG00000071533.12	ENSMUST00000130818.8	938	5	-24	-1491	-4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	279	junction_4	876.141113063415	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGGTGGTCTTATTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55850063	55835870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_55837681_55838834_55838891_55842417_55842493_55844586_55845001_55849965
tx.7436	chr16	-	1447	5	FSM	ENSMUSG00000071533.12	ENSMUST00000125040.8	2200	5	-4	757	-4	537	multi-exon	FALSE	canonical	3	494	junction_4	790.763357459107	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCATTGTATGAAGGCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55850063	55836625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_55837681_55838834_55838891_55842417_55842493_55844586_55844750_55849965
tx.7437	chr16	-	1486	5	FSM	ENSMUSG00000071533.12	ENSMUST00000114444.9	2295	5	39	770	-4	524	multi-exon	FALSE	canonical	3	1624	junction_1	369.138439477657	175	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GGAAAAAAAGGTATAGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55850063	55836638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_55837681_55838834_55838891_55842417_55842493_55844586_55844802_55849965
tx.7438	chr16	-	634	4	FSM	ENSMUSG00000071533.12	ENSMUST00000122253.2	792	4	-4	162	-4	-162	multi-exon	FALSE	canonical	3	1778	junction_3	312.848206004126	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACACACGTGCACATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55850063	55838644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_55838891_55842417_55842493_55844586_55844802_55849965
tx.7439	chr16	-	582	4	ISM	ENSMUSG00000071533.12	ENSMUST00000125040.8	2200	5	-4	2776	-4	-162	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	494	junction_3	909.968131310103	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACACACGTGCACATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55850063	55838644	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_55838891_55842417_55842493_55844586_55844750_55849965
tx.744	chr1	-	1480	8	ISM	ENSMUSG00000041926.16	ENSMUST00000077340.14	2288	11	11604	-3	453	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	267	junction_3	12.6942056522989	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTGGAGTTATAGAATGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135200218	135190446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_135190868_135191790_135191934_135192920_135193146_135194607_135194717_135194907_135195021_135195820_135195935_135199266_135199503_135200099
tx.7440	chr16	-	1863	2	FSM	ENSMUSG00000044763.9	ENSMUST00000059052.9	3002	2	34	1105	34	-1105	multi-exon	FALSE	canonical	3	404	junction_1	0	318	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTTGAATATCAGACTTT	7420	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55858148	55854076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_55855655_55857863
tx.7442	chr16	+	861	6	ISM	ENSMUSG00000052917.16	ENSMUST00000049128.11	1130	7	-22	2461	18	142	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_2	7.36478105580879	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGGCTAGTGTGACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55895804	55944441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_55895942_55902718_55902772_55909746_55909828_55917702_55917795_55931968_55932167_55944141
tx.7443	chr16	+	1026	7	ISM	ENSMUSG00000052917.16	ENSMUST00000202000.2	3218	8	-44	2646	12	208	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_6	8.60232526704263	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATGTATTTCTTTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55895798	55959614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_55895942_55902718_55902772_55909746_55909828_55917702_55917795_55931968_55932167_55944141_55944334_55959347
tx.7444	chr16	+	933	6	FSM	ENSMUSG00000052917.16	ENSMUST00000202799.4	698	6	-33	-202	18	202	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_5	9.74884608556315	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCTAAGTATGTATTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55895804	55959608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_55895942_55902718_55902772_55917702_55917795_55931968_55932167_55944141_55944334_55959347
tx.7445	chr16	-	590	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052917.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_1	0	240	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAGAACAATCATTAAA	4060	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55936673	55933754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_55934262_55936590
tx.7447	chr16	-	1872	8	FSM	ENSMUSG00000022757.20	ENSMUST00000065515.14	1945	8	73	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	474	junction_2	54.3950027716757	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGTCTTGTTGCCTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56537740	56510694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_56511517_56514762_56514853_56517821_56517960_56521431_56521600_56524789_56524937_56525973_56526058_56532973_56533204_56537547
tx.7448	chr16	-	1595	6	FSM	ENSMUSG00000022754.7	ENSMUST00000023435.6	2701	6	3	1103	3	226	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_5	1.32664991614216	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTCATTTTTTTTTTCTTA	6305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56706526	56626626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_56627140_56631888_56632035_56642587_56642773_56643750_56643958_56646028_56646222_56706175
tx.7449	chr16	+	2263	12	FSM	ENSMUSG00000022752.10	ENSMUST00000166897.3	5964	12	30	3671	30	-2851	multi-exon	FALSE	canonical	3	1304	junction_5	122.457278770872	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTTTTTTTTTTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56942095	56973397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_56942558_56953439_56953614_56955015_56955143_56957060_56957171_56958392_56958542_56960941_56961150_56963083_56963219_56965053_56965162_56966392_56966510_56968095_56968194_56970182_56970306_56972945
tx.745	chr1	-	2258	11	FSM	ENSMUSG00000041926.16	ENSMUST00000077340.14	2288	11	30	0	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_8	16.9602476397015	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAAGTTGGAGTTATAGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135211792	135190449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_135190868_135191790_135191934_135192920_135193146_135194607_135194717_135194907_135195021_135195820_135195935_135199266_135199503_135200099_135200217_135205126_135205276_135206504_135206646_135211299
tx.7450	chr16	+	1798	11	ISM	ENSMUSG00000022752.10	ENSMUST00000166897.3	5964	12	11375	3673	-4420	-2853	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1304	junction_4	127.787362442458	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTGTTTTTTTTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56953440	56973395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_56953614_56955015_56955143_56957060_56957171_56958392_56958542_56960941_56961150_56963083_56963219_56965053_56965162_56966392_56966510_56968095_56968194_56970182_56970306_56972945
tx.7451	chr16	+	2982	9	ISM	ENSMUSG00000022752.10	ENSMUST00000166897.3	5964	12	15007	2177	-788	-1357	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1304	junction_2	142.492050216845	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAAGCTTTTCTATCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56957072	56974891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_56957171_56958392_56958542_56960941_56961150_56963083_56963219_56965053_56965162_56966392_56966510_56968095_56968194_56970182_56970306_56972945
tx.7452	chr16	+	1281	8	ISM	ENSMUSG00000022752.10	ENSMUST00000166897.3	5964	12	16436	3671	641	-2851	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1304	junction_1	143.907424891058	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTTTTTTTTTTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56958501	56973397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_56958542_56960941_56961150_56963083_56963219_56965053_56965162_56966392_56966510_56968095_56968194_56970182_56970306_56972945
tx.7453	chr16	-	1232	9	ISM	ENSMUSG00000022751.10	ENSMUST00000023432.10	1286	10	1116	2	1116	-1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	674	junction_8	38.3012320297925	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATTTTGATGTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56986579	56977029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_56977530_56977846_56977903_56979780_56979880_56980429_56980509_56981492_56981568_56982053_56982148_56983880_56983970_56984560_56984682_56986460
tx.7454	chr16	-	1308	10	FSM	ENSMUSG00000022751.10	ENSMUST00000023432.10	1286	10	-24	2	-15	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	674	junction_8	39.9499687108764	1152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATTTTGATGTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56987719	56977029	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_56977530_56977846_56977903_56979780_56979880_56980429_56980509_56981492_56981568_56982053_56982148_56983880_56983970_56984560_56984682_56986460_56986580_56987643
tx.7455	chr16	-	2139	5	ISM	ENSMUSG00000022749.9	ENSMUST00000023431.8	3690	18	48514	0	18	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_4	21.6376408140999	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGCCCTGGAGGATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57003353	56989224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_56990804_56991985_56992181_56993386_56993523_56998294_56998384_57003213
tx.7456	chr16	-	2021	4	NNC	ENSMUSG00000022749.9	novel	3690	18	NA	NA	3683	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_3	80.5536398239638	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGCCCTGGAGGATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56994936	56989224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_56990804_56991985_56992181_56993386_56993523_56994825
tx.7457	chr16	-	2000	4	ISM	ENSMUSG00000022749.9	ENSMUST00000023431.8	3690	18	53483	0	235	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	159	junction_3	17.1529071070248	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGCCCTGGAGGATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56998384	56989224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_56990804_56991985_56992181_56993386_56993523_56998294
tx.7458	chr16	-	3749	18	FSM	ENSMUSG00000022749.9	ENSMUST00000023431.8	3690	18	-59	0	-59	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	134	junction_12	18.4520326427881	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGCCCTGGAGGATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57051926	56989224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_56990804_56991985_56992181_56993386_56993523_56998294_56998384_57003213_57003354_57004742_57004850_57007000_57007044_57009624_57009796_57011836_57011930_57012971_57013095_57018643_57018748_57019086_57019134_57019221_57019347_57028566_57028691_57032733_57032939_57034526_57034633_57038671_57038784_57051676
tx.7459	chr16	-	970	9	ISM	ENSMUSG00000022748.9	ENSMUST00000114371.5	1150	10	283300	2	283230	-2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	200	junction_5	23.459739448681	930	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGACAGTTTCTCTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57143909	57122364	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_57122646_57124042_57124132_57127188_57127277_57127731_57127793_57131615_57131719_57133020_57133081_57136524_57136655_57138268_57138344_57143826
tx.746	chr1	-	863	5	ISM	ENSMUSG00000062580.10	ENSMUST00000081104.10	7280	6	3907	6333	-32	270	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2684	junction_1	61.2632638699572	991	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTCCTTTGAAAGTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135237609	135229283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_135229742_135232167_135232279_135233826_135233956_135236872_135236937_135237508
tx.7460	chr16	-	520	2	FSM	ENSMUSG00000022748.9	ENSMUST00000232413.2	529	2	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_1	0	404	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTATTTATGTTTTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57427218	57381795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_57382126_57427028
tx.7461	chr16	-	1547	5	ISM	ENSMUSG00000022747.18	ENSMUST00000114358.9	2264	11	48311	-11	13493	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_2	0.433012701892219	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTTGAGCTTTTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58296295	58290104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_58291091_58292673_58292827_58293771_58293910_58294016_58294204_58296212
tx.7462	chr16	-	1462	11	ISM	ENSMUSG00000022747.18	ENSMUST00000114357.10	1918	12	578	329	-54	-329	3prime_fragment	FALSE	canonical	1	1	junction_6	1.78885438199983	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATGTGTATTAAGTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58343970	58290903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_58291091_58292673_58292827_58293771_58293910_58294016_58294204_58296212_58296309_58305125_58305190_58306757_58306862_58309266_58309345_58314042_58314225_58327810_58327978_58343864
tx.7463	chr16	-	555	2	FSM	ENSMUSG00000022747.18	ENSMUST00000137850.8	837	2	282	0	282	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAGTCGTTACATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58327979	58323223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_58323610_58327810
tx.7464	chr16	-	859	3	NIC	ENSMUSG00000022747.18	novel	810	3	NA	NA	-37	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	4	junction_1	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAGTCGTTACATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58343744	58323223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_58323610_58327810_58327978_58343438
tx.7465	chr16	-	752	3	NIC	ENSMUSG00000022747.18	novel	810	3	NA	NA	38	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATAGTCGTTACATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58343878	58323223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_58323610_58327810_58327978_58343679
tx.7466	chr16	+	2441	6	ISM	ENSMUSG00000022742.7	ENSMUST00000060077.7	3097	7	2231	2	-1613	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_1	28.5895085652062	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAAAAGTATTTGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58492885	58500747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_58493035_58493698_58493810_58494742_58494885_58495604_58495824_58498307_58498413_58499032
tx.7467	chr16	+	2090	6	FSM	ENSMUSG00000022744.13	ENSMUST00000162057.8	1540	6	82	-632	-16	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	183.824916700648	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTGTCTAAATTGTTTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58548369	58554603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_58548448_58549535_58549587_58549800_58550111_58551664_58551776_58552943_58553082_58553201
tx.7468	chr16	+	2043	5	FSM	ENSMUSG00000022744.13	ENSMUST00000023426.12	2147	5	91	13	-22	-13	multi-exon	FALSE	canonical	3	351	junction_1	33.101170674162	300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGTGTCTAAATTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58548363	58554601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_58548448_58549800_58550111_58551664_58551776_58552943_58553082_58553201
tx.7469	chr16	+	1983	10	FSM	ENSMUSG00000022724.16	ENSMUST00000023407.12	2159	10	12	164	12	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	227	junction_9	29.2042614850793	365	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATACATATCTTTGAGCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59292149	59312660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_59292309_59295872_59296333_59299532_59299653_59300653_59300783_59303367_59303472_59306895_59306999_59307790_59307963_59309707_59309797_59311567_59311658_59312103
tx.747	chr1	-	916	6	FSM	ENSMUSG00000062580.10	ENSMUST00000081104.10	7280	6	31	6333	31	270	multi-exon	FALSE	canonical	3	2331	junction_5	176.235070289656	5828	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTCCTTTGAAAGTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135241485	135229283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_135229742_135232167_135232279_135233826_135233956_135236872_135236937_135237508_135237609_135241431
tx.7470	chr16	-	1324	8	FSM	ENSMUSG00000022722.19	ENSMUST00000023405.16	1696	8	0	372	0	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_5	9.94064014692275	369	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGAGTGTTCTGTTCATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59459530	59433683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_59434208_59439157_59439214_59441581_59441712_59443383_59443479_59444240_59444310_59444642_59444705_59452673_59452824_59459292
tx.7471	chr16	-	1235	7	ISM	ENSMUSG00000022722.19	ENSMUST00000023405.16	1696	8	-3	5414	-3	2856	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	88	junction_4	10.7341614587364	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATATCTTGTTTATTTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59459533	59438725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_59439214_59441581_59441712_59443383_59443479_59444240_59444310_59444642_59444705_59452673_59452824_59459292
tx.7472	chr16	+	1380	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000092029.2	novel	661	1	NA	NA	-175	1819	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGATAAGACCTTATATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61197443	61200098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr16_+_61198646_61199920
tx.7473	chr16	-	3512	10	FSM	ENSMUSG00000022911.12	ENSMUST00000089289.6	3528	10	16	0	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_2	10.3494497975067	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATTTATCTAATTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62667387	62614047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_62616072_62622084_62622154_62623082_62623200_62624199_62624426_62626904_62627011_62632211_62632415_62633521_62633628_62647526_62647777_62651105_62651177_62667047
tx.7474	chr16	-	1076	6	ISM	ENSMUSG00000022911.12	ENSMUST00000089289.6	3528	10	16	12857	16	5308	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_5	7.11617874986288	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGAGTTGTGGCAAGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62667387	62626904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_62627011_62632211_62632415_62633521_62633628_62647526_62647777_62651105_62651177_62667047
tx.7475	chr16	+	3284	15	FSM	ENSMUSG00000022912.9	ENSMUST00000023629.9	3303	15	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_5	24.011476847711	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAGCAATTTCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62674688	62749709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_62674868_62705763_62705922_62709343_62709369_62719238_62719326_62720688_62720812_62720915_62721048_62723854_62723981_62728024_62728147_62730360_62730477_62734160_62734351_62738437_62738606_62739875_62740045_62744878_62745028_62746690_62746917_62748395
tx.7476	chr16	+	1497	2	ISM	ENSMUSG00000022912.9	ENSMUST00000127502.2	791	4	4902	-954	4902	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	354	junction_1	0	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATGAGCAATTTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62746731	62749707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_62746917_62748395
tx.7477	chr16	-	1349	3	FSM	ENSMUSG00000059920.10	ENSMUST00000076991.7	5522	3	205	3968	205	-3968	multi-exon	FALSE	canonical	3	170	junction_1	18.5	614	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCCTGTGTGCCTTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64591319	64586466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_64587357_64589286_64589526_64591099
tx.7478	chr16	+	1022	3	FSM	ENSMUSG00000054604.8	ENSMUST00000067744.8	4425	3	41	3362	41	159	multi-exon	FALSE	canonical	3	981	junction_2	152	307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTCATTTTTATATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64672399	64676508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_64672600_64673161_64673389_64675913
tx.7479	chr16	+	1019	3	NNC	ENSMUSG00000054604.8	novel	4425	3	NA	NA	41	159	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	384	junction_2	450.5	91	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTCATTTTTATATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64672399	64676508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_64672600_64673161_64673389_64675916
tx.748	chr1	+	903	2	ISM	ENSMUSG00000048096.8	ENSMUST00000059352.3	3948	3	40202	1242	40202	-1242	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTCAAGTGGCTATACCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135292746	135294561	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_135292908_135293819
tx.7480	chr16	-	1863	6	FSM	ENSMUSG00000004843.8	ENSMUST00000004965.8	1872	6	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	234	junction_5	16.0573970493352	390	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGACTGCCTAACGCGCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65359603	65336013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_65337137_65337305_65337413_65342162_65342266_65343734_65343930_65347848_65347941_65359360
tx.7481	chr16	+	620	2	Intergenic	novelGene_612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCATTCATGACTATGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65359675	65360399	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_65359749_65359852
tx.7482	chr16	+	643	2	Intergenic	novelGene_613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATGACTATGTATACATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65359679	65360406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_65359769_65359852
tx.7483	chr16	+	646	2	Intergenic	novelGene_614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATACCTACTTGGATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66356643	66357942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_66356801_66357453
tx.7484	chr16	+	434	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00002075424.1	novel	98	1	NA	NA	4	14893	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTTGCAACCCCATAGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73771332	73786319	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr16_+_73771585_73786137
tx.7485	chr16	+	376	1	Intergenic	novelGene_615	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTTGTTTTTAACTCAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74409878	74410254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_74409900_74410300
tx.7486	chr16	-	1649	5	FSM	ENSMUSG00000032932.16	ENSMUST00000046283.16	4237	5	24	2564	-6	-946	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_2	5.78791845139511	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTCAGTATTTCTAAAGTAA	4005	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75563685	75554473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_75555337_75556302_75556471_75557983_75558198_75561831_75562173_75563622
tx.7487	chr16	-	466	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000050299.9	novel	402	1	NA	NA	-61	59	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_1	0	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAGTACTTGCAAAGCAAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76200601	76200079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr16_-_76200265_76200320
tx.7488	chr16	+	1626	3	ISM	ENSMUSG00000022867.12	ENSMUST00000239066.2	4986	26	100112	0	29918	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTGTGTGTCTATTGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76910705	76913668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_76910745_76911771_76911968_76912277
tx.7489	chr16	+	2773	7	FSM	ENSMUSG00000022865.15	ENSMUST00000023572.15	5742	7	214	2755	-46	1759	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_4	8.97527467855751	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAATTTATTGTATATCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78098597	78134893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_78098763_78122044_78122212_78125841_78126047_78130249_78130406_78131056_78131180_78131709_78131849_78133075
tx.749	chr1	-	1434	3	FSM	ENSMUSG00000041889.8	ENSMUST00000159918.2	1404	3	-27	-3	-27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	3.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATGAGTCCGTCCTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135301215	135298794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_135299735_135299934_135300103_135300889
tx.7490	chr16	+	1704	8	FSM	ENSMUSG00000022865.15	ENSMUST00000114229.4	1657	8	-46	-1	-46	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_7	23.9965983983955	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAAAATGAACATTTTAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78098597	78156663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_78098763_78122044_78122212_78125841_78126047_78130249_78130406_78131056_78131180_78131709_78131849_78133075_78133260_78156098
tx.7491	chr16	-	1293	5	NNC	ENSMUSG00000022863.16	novel	1414	5	NA	NA	618	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	349.459135665388	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATGTGTGGTTTTGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78173080	78156750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_78157427_78161689_78161898_78166000_78166139_78170132_78170312_78172988
tx.7492	chr16	-	1578	5	FSM	ENSMUSG00000022864.15	ENSMUST00000114218.2	1271	5	-31	-276	20	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	62	junction_4	107.072405408677	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTATTTTGGGTATTTTT	3212	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78373576	78341572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_78342173_78343393_78343457_78344463_78344980_78372808_78372943_78373311
tx.7493	chr16	-	1895	4	ISM	ENSMUSG00000022864.15	ENSMUST00000114219.8	1576	5	18	-1	-5	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	299	junction_1	8.65383665716478	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATTGCTATTTTGGGTATT	3261	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78373527	78341575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_78342173_78343393_78343457_78344463_78344980_78372808
tx.7494	chr16	-	1509	5	FSM	ENSMUSG00000022864.15	ENSMUST00000232052.2	6127	5	-2	4620	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_4	82.0381009043969	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGGGTTACTCAATCATTT	3241	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78373547	78341845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_78342173_78343393_78343457_78344463_78344980_78372808_78372943_78373078
tx.7495	chr16	-	1285	5	FSM	ENSMUSG00000022864.15	ENSMUST00000114220.9	2644	5	-39	1398	22	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_4	113.984648089118	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGGCTTCATCGGGGGACT	3214	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78373574	78341828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_78342173_78343393_78343457_78344463_78344980_78372808_78372943_78373346
tx.7496	chr16	-	354	2	Intergenic	novelGene_616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATATCCTTCTGCTTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79991862	79990017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_79990287_79991777
tx.7497	chr16	-	1084	10	FSM	ENSMUSG00000022889.8	ENSMUST00000116584.2	2294	10	505	705	-7	-705	multi-exon	FALSE	canonical	3	703	junction_1	110.666443551761	4923	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTTTGTCCCTGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84532125	84515168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_84515273_84517157_84517206_84520725_84520880_84522012_84522079_84524371_84524485_84527306_84527375_84527715_84527816_84529229_84529370_84531294_84531502_84532041
tx.7498	chr16	+	1432	9	NNC	ENSMUSG00000053062.17	novel	4370	10	NA	NA	31	-6	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_7	1361.98577452189	2588	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAAAGTGAAATGTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84571041	84619912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_84571442_84598457_84598527_84603722_84603831_84606231_84606385_84609786_84609987_84612056_84612157_84613153_84613275_84618147_84618191_84619674
tx.7499	chr16	+	1403	9	NIC	ENSMUSG00000053062.17	novel	4370	10	NA	NA	47	-6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	40	junction_7	1349.13685369572	1127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTAAAGTGAAATGTCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84571057	84619912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_84571442_84598457_84598527_84603722_84603831_84606231_84606385_84609786_84609987_84612056_84612157_84613153_84613262_84618147_84618191_84619674
tx.75	chr1	-	2984	17	FSM	ENSMUSG00000041859.11	ENSMUST00000053266.11	3031	17	43	4	-9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2257	junction_11	181.480370839383	427	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTGTCTGTGTGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20890493	20873195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_20873879_20875040_20875132_20875486_20875564_20876020_20876125_20876965_20877107_20878944_20879096_20879819_20879947_20880281_20880457_20882188_20882398_20882787_20882920_20883184_20883339_20884622_20884732_20884912_20885152_20886872_20887004_20887466_20887676_20888016_20888130_20890354
tx.750	chr1	-	1494	5	FSM	ENSMUSG00000041889.8	ENSMUST00000041240.4	1763	5	265	4	105	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_2	2.8613807855649	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAACTATGAGTCCGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135302710	135298798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_135299735_135299934_135300103_135300889_135301024_135302115_135302288_135302626
tx.7500	chr16	+	1208	4	FSM	ENSMUSG00000053062.17	ENSMUST00000098407.3	1998	4	-215	1005	48	-1005	multi-exon	FALSE	canonical	3	4189	junction_2	31.1555238547945	1119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTGTGGTCATATCCACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84571058	84606879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_84571442_84598457_84598527_84603722_84603831_84606231
tx.7501	chr16	-	250	2	FSM	ENSMUSG00000022890.14	ENSMUST00000144799.2	514	2	264	0	264	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6096	junction_1	0	1718	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAATGTCCTTTAAATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84625437	84624758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_84624884_84625312
tx.7502	chr16	-	481	4	ISM	ENSMUSG00000022890.14	ENSMUST00000023608.14	809	5	765	0	-28	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5740	junction_3	655.078790850553	65501	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAAATGTCCTTTAAATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84631748	84624758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_84624884_84625312_84625438_84628216_84628396_84631696
tx.7503	chr16	+	2494	10	FSM	ENSMUSG00000008976.17	ENSMUST00000114184.8	2202	10	-13	-279	-13	279	multi-exon	FALSE	canonical	3	375	junction_1	83.9617784882715	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTCTTTTGAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84631799	84658482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_84631912_84635968_84636072_84638216_84638362_84641169_84641255_84643011_84643258_84649347_84649543_84653349_84653404_84653921_84654063_84654267_84654461_84657262
tx.7504	chr16	+	2581	10	FSM	ENSMUSG00000008976.17	ENSMUST00000009120.8	4987	10	221	2185	221	279	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_1	99.7045016753055	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTTTTTCTTTTGAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84632232	84658482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_84632432_84635968_84636072_84638216_84638362_84641169_84641255_84643011_84643258_84649347_84649543_84653349_84653404_84653921_84654063_84654267_84654461_84657262
tx.7505	chr16	+	485	4	NNC	ENSMUSG00000044442.12	novel	3473	4	NA	NA	-3	-3744	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	12	junction_3	53.2749680640188	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTTCTTGGTGTTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87151111	87158814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_87151275_87153065_87153153_87153785_87153877_87158670
tx.7506	chr16	+	576	5	FSM	ENSMUSG00000044442.12	ENSMUST00000118115.2	1951	5	-21	1396	-3	619	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_4	12.0208152801713	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGACAGAGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87151111	87163177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_87151275_87153065_87153153_87153785_87153877_87159407_87159492_87163026
tx.7507	chr16	+	1079	5	FSM	ENSMUSG00000044442.12	ENSMUST00000118310.8	1700	5	-3	624	-3	433	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_4	45.8768732587564	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGTCATTTTGTTTTCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87151111	87165006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_87151275_87153065_87153153_87153785_87153877_87159407_87159492_87164352
tx.7508	chr16	+	1600	6	FSM	ENSMUSG00000044442.12	ENSMUST00000054442.11	1884	6	39	245	-3	-245	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_5	18.2931681236466	545	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAAAGTAAAATAAAATCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87151111	87165385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_87151275_87153065_87153153_87153785_87153877_87159407_87159492_87163026_87163169_87164352
tx.7509	chr16	-	1543	5	ISM	ENSMUSG00000052299.10	ENSMUST00000039449.9	7743	30	49924	1472	49875	-1472	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_4	15.6584641647896	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATGTGTGGAGAAAACAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87179576	87175010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_87175896_87176563_87176732_87177554_87177750_87178349_87178571_87179502
tx.751	chr1	-	4038	24	FSM	ENSMUSG00000041879.14	ENSMUST00000041023.14	6247	24	48	2161	7	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	518	junction_15	35.6964730086209	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAGTCTGCATACTCTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135358189	135312210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_135313216_135313664_135313742_135313956_135314059_135314421_135314545_135315111_135315246_135316248_135316416_135317050_135317327_135318275_135318405_135319233_135319383_135321873_135322101_135327781_135327942_135329970_135330111_135331025_135331133_135331961_135332061_135333558_135333711_135334254_135334314_135334496_135334598_135334689_135334810_135335725_135335813_135337130_135337220_135346974_135347177_135347728_135347816_135348029_135348092_135358005
tx.7510	chr16	-	1277	6	ISM	ENSMUSG00000052299.10	ENSMUST00000039449.9	7743	30	37912	2015	37863	-2015	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_4	14.538225476309	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTCTAAATTATAGAACTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87191588	87175553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_87175896_87176563_87176732_87177554_87177750_87178349_87178571_87179502_87179675_87191409
tx.7511	chr16	-	285	2	ISM	ENSMUSG00000052299.10	ENSMUST00000232095.2	2360	12	36	14422	36	-14422	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GATGTTACAACAAAGCTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87229415	87224497	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_87224681_87229313
tx.7512	chr16	-	2025	5	FSM	ENSMUSG00000041079.13	ENSMUST00000039101.12	2009	5	-16	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_1	7.71362431027076	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGTGCTTGTTATCAGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87237477	87230294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_87231515_87233460_87233824_87233951_87234020_87234181_87234403_87237324
tx.7513	chr16	+	1454	7	FSM	ENSMUSG00000025616.15	ENSMUST00000131206.8	1405	7	-45	-4	13	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_5	32.3045404445464	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTCTCTACCTTCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87251885	87267916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_87251991_87255528_87255631_87258852_87259029_87261622_87261727_87263140_87263245_87266562_87266751_87267241
tx.7514	chr16	+	2654	3	ISM	ENSMUSG00000025616.15	ENSMUST00000131206.8	1405	7	-18	6586	-2	-1908	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	214	junction_2	2.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAACCCTCCAGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87251912	87261326	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_87251991_87255528_87255631_87258852
tx.7515	chr16	+	1152	10	ISM	ENSMUSG00000025616.15	ENSMUST00000026710.12	3205	18	316	10332	-8	2161	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	153	junction_5	28.9767893491956	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTAATGTCTGATTTTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87251906	87270073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_87251991_87255528_87255631_87258852_87259029_87261622_87261727_87263140_87263245_87266562_87266751_87267241_87267338_87268599_87268731_87268968_87269057_87269994
tx.7516	chr16	+	2879	18	FSM	ENSMUSG00000025616.15	ENSMUST00000026710.12	3205	18	324	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	153	junction_5	31.0441141639032	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTTTTATTAGAGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87251914	87280403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_87251991_87255528_87255631_87258852_87259029_87261622_87261727_87263140_87263245_87266562_87266751_87267241_87267338_87268599_87268731_87268968_87269057_87269994_87270074_87271469_87271562_87272304_87272362_87273601_87273776_87276013_87276678_87277762_87277858_87278601_87278689_87279747_87279905_87279994
tx.7517	chr16	+	2913	18	NIC	ENSMUSG00000025616.15	novel	3205	18	NA	NA	5	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	21	junction_5	55.1537642982143	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTTTTATTAGAGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87251877	87280403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_+_87251991_87255528_87255631_87258852_87259029_87261622_87261727_87263140_87263245_87266565_87266751_87267241_87267338_87268599_87268731_87268968_87269057_87269994_87270074_87271469_87271562_87272304_87272362_87273601_87273776_87276013_87276678_87277762_87277858_87278601_87278689_87279747_87279905_87279994
tx.7518	chr16	-	313	2	ISM	ENSMUSG00000025613.14	ENSMUST00000177376.8	1567	14	10863	-113	1145	113	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4874	junction_1	0	2706	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCCGTCTGTTTAATCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87281813	87280762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_87280954_87281691
tx.7519	chr16	-	1000	8	ISM	ENSMUSG00000025613.14	ENSMUST00000177376.8	1567	14	8074	-113	1129	113	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4300	junction_7	466.186263904312	2970	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCCGTCTGTTTAATCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87284602	87280762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_87280954_87281691_87281812_87282467_87282633_87282721_87282794_87283123_87283240_87283320_87283409_87283482_87283550_87284421
tx.752	chr1	-	979	6	NNC	ENSMUSG00000041879.14	novel	6247	24	NA	NA	15	-911	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	247.823808380067	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CACACAAAATTTGTAACATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135358214	135322813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_135322994_135336980_135337220_135346974_135347177_135347728_135347816_135348029_135348092_135358005
tx.7520	chr16	-	1846	15	NIC	ENSMUSG00000025613.14	novel	2394	15	NA	NA	3	113	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_11	1309.6116888262	9228	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCCGTCTGTTTAATCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87292758	87280762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_87280954_87281691_87281812_87282467_87282633_87282721_87282794_87283123_87283240_87283320_87283409_87283482_87283550_87284421_87284601_87285694_87285833_87287208_87287271_87287372_87287554_87288185_87288340_87290594_87290675_87291224_87291316_87292616
tx.7521	chr16	+	349	2	ISM	ENSMUSG00000025612.6	ENSMUST00000156958.2	2210	4	-92	7386	-33	-7386	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCTCGGTGCTGGCTGCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87495799	87512422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_87495945_87512218
tx.7522	chr16	+	643	5	FSM	ENSMUSG00000022982.11	ENSMUST00000023707.11	641	5	-1	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	320.427351360648	1527	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTGTGACTCCTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90017640	90023218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_90017818_90019667_90019765_90021243_90021314_90022032_90022151_90023037
tx.7523	chr16	+	502	3	NNC	ENSMUSG00000053414.9	novel	3068	11	NA	NA	-32	-75469	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCTAAGACTTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90197399	90203443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_90197506_90199330_90199394_90203110
tx.7524	chr16	+	439	2	NNC	ENSMUSG00000053414.9	novel	3068	11	NA	NA	-32	-75469	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGTCTAAGACTTCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90197399	90203443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_90197506_90203110
tx.7525	chr16	-	1287	5	FSM	ENSMUSG00000022978.12	ENSMUST00000099554.5	1333	5	41	5	41	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	276	junction_1	13.865424623862	1218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGTTCATTTGTTTGGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90524251	90516204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_90516867_90517541_90517639_90518523_90518647_90523180_90523248_90523913
tx.7526	chr16	+	546	2	Intergenic	novelGene_618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCAGAAGGATATGGCCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90524388	90525582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_90524560_90525207
tx.7527	chr16	-	1248	5	FSM	ENSMUSG00000039929.15	ENSMUST00000140942.8	1218	5	-12	-18	-1	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_1	7.22841614740048	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTATAAGGGTTTGGGATAT	8678	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90607281	90596376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_90597005_90600214_90600348_90601335_90601488_90602285_90602426_90607086
tx.7528	chr16	+	1030	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000116836.2	novel	2579	1	NA	NA	-694	11	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGCGCTGGAGACGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90721725	90725009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr16_+_90721807_90724060
tx.7529	chr16	-	1110	7	FSM	ENSMUSG00000022972.11	ENSMUST00000023694.11	1430	7	285	35	-3	-35	multi-exon	FALSE	canonical	3	724	junction_4	16.7994708911389	2328	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTTAGGACAGCTGTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90731717	90722731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_90722971_90723232_90723329_90723985_90724118_90724237_90724397_90726803_90726872_90727881_90728050_90731469
tx.753	chr1	-	786	5	ISM	ENSMUSG00000041879.14	ENSMUST00000161032.8	4226	25	-12	24777	-12	-1186	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	606	junction_1	19.6468827043885	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTGACCGTAGTCTTTGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135358208	135336987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_135337220_135346974_135347177_135347728_135347816_135348029_135348092_135358005
tx.7530	chr16	-	910	6	ISM	ENSMUSG00000022974.13	ENSMUST00000023698.12	2732	18	20756	-130	-4177	130	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	305	junction_4	27.0820974076972	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTGTTTAGTGTAAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90820296	90811673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_90812067_90813733_90813889_90816050_90816198_90818938_90819006_90819556_90819634_90820225
tx.7531	chr16	-	376	2	Intergenic	novelGene_619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGGTGCTTTCAGAGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90996879	90991377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_90991669_90996794
tx.7532	chr16	+	435	2	Intergenic	novelGene_620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTTAGCTCCGTTTCTT	2427	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91050710	91052598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_91050926_91052378
tx.7533	chr16	-	1001	2	Intergenic	novelGene_622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCATTTCTTTGTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91145772	91130920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_91131558_91145408
tx.7534	chr16	+	1150	7	FSM	ENSMUSG00000022971.19	ENSMUST00000117836.8	1099	7	-49	-2	18	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_6	3.19722101554181	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGCTCTGTCTCTAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91169688	91190930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_91169963_91180748_91180842_91181870_91181913_91182829_91182954_91184831_91185005_91188608_91188767_91190644
tx.7535	chr16	+	517	3	ISM	ENSMUSG00000022971.19	ENSMUST00000117836.8	1099	7	15192	0	253	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_2	4	903	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATGGCTCTGTCTCTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91184929	91190928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_91185005_91188608_91188767_91190644
tx.7536	chr16	+	443	2	ISM	ENSMUSG00000093701.8	ENSMUST00000161517.8	760	5	-1	25411	-1	-25411	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_1	0	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTATGGCTCTGTCTCTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91188607	91190928	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_91188767_91190644
tx.7537	chr16	+	1804	7	FSM	ENSMUSG00000022969.14	ENSMUST00000023691.12	1850	7	42	4	42	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	1.63299316185545	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTAGGGGGTTTGTTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91203164	91222718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_91203261_91204505_91204630_91208770_91208929_91211500_91211668_91216219_91216368_91218620_91218779_91221765
tx.7538	chr16	+	646	4	ISM	ENSMUSG00000022967.14	ENSMUST00000023689.11	3909	11	-9	12138	-9	-870	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	180	junction_3	5.55777733351102	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGTTTCTGTTTTTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91282116	91292191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_91282305_91286583_91286708_91289518_91289698_91292036
tx.7539	chr16	-	1146	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022967.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	4	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACATGGGCTTTTAAAACGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91293267	91289468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_91290172_91291858_91292210_91293175
tx.754	chr1	-	1347	7	ISM	ENSMUSG00000009418.17	ENSMUST00000040599.15	12767	30	132934	6844	1486	-2576	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_2	9.54666899441312	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGATTCTGGTCTTTTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135380159	135369161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_135369518_135371371_135371570_135376668_135376788_135377632_135377830_135378307_135378380_135378523_135378679_135379909
tx.7540	chr16	-	1420	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022967.14_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	1	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CTTAAAAAAAAAAAAGAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91293328	91289215	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_91290172_91291858_91292210_91293215
tx.7541	chr16	-	2249	7	FSM	ENSMUSG00000022964.15	ENSMUST00000023686.15	2347	7	93	5	-43	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	77	junction_3	6.43989302878722	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCGACATGGAATCTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91394595	91371395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_91373047_91374861_91374920_91377089_91377183_91378582_91378651_91380163_91380277_91383829_91383970_91394469
tx.7542	chr16	-	3303	22	FSM	ENSMUSG00000022962.16	ENSMUST00000023684.14	3518	22	6	209	6	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1247	junction_21	231.829967404665	317	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTATCTAGCATTTATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91443834	91418282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_91418637_91418734_91418851_91419780_91419923_91420258_91420390_91421214_91421353_91422201_91422409_91424914_91425068_91425309_91425562_91426930_91427130_91427493_91427604_91427864_91427960_91430762_91430995_91432881_91433051_91433394_91433481_91433879_91433968_91434817_91434944_91435614_91435684_91436227_91436340_91438099_91438275_91438481_91438578_91439844_91440035_91443771
tx.7543	chr16	-	1872	11	FSM	ENSMUSG00000022962.16	ENSMUST00000120450.2	1865	11	-11	4	6	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1247	junction_10	242.657701299588	657	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTGAGTGTTTTGATTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91443834	91430296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_91430995_91432881_91433051_91433394_91433481_91433879_91433968_91434817_91434944_91435614_91435684_91436227_91436340_91438099_91438275_91438481_91438578_91439844_91440035_91443771
tx.7544	chr16	-	718	4	ISM	ENSMUSG00000022962.16	ENSMUST00000120450.2	1865	11	-10	7612	7	138	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1247	junction_3	399.201703403179	249	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGGGCTAGAGAGATGGCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91443833	91437904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_91438275_91438481_91438578_91439844_91440035_91443771
tx.7545	chr16	+	423	3	ISM	ENSMUSG00000022961.19	ENSMUST00000114036.9	7945	5	-14	9286	-13	-9286	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	478	junction_2	6	14019	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAATATAAAAGACAACCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91444753	91451635	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_91444873_91448517_91448685_91451498
tx.7546	chr16	-	1119	2	FSM	ENSMUSG00000022960.14	ENSMUST00000231425.2	308	2	-117	-694	-117	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGTAAGAAACAAATAGTGCT	6532	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91478395	91476146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_91476915_91478044
tx.7547	chr16	-	1474	13	FSM	ENSMUSG00000058240.15	ENSMUST00000073466.13	1965	13	356	135	4	69	multi-exon	FALSE	canonical	1	405	junction_2	358.43629334777	4034	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTCATTTGATTTTGTTATC	9184	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91525507	91486344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_91486804_91487591_91487638_91489486_91489593_91491069_91491189_91492148_91492248_91496064_91496177_91497959_91498094_91504112_91504182_91505716_91505762_91509082_91509156_91511636_91511715_91514291_91514364_91525445
tx.7548	chr16	-	1667	9	ISM	ENSMUSG00000058240.15	ENSMUST00000073466.13	1965	13	356	5016	4	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1431	junction_2	88.070195724774	403	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTCTTTTTTCTCTTTTTT	9184	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91525507	91491225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_91492248_91496064_91496177_91497959_91498094_91504112_91504182_91505716_91505762_91509082_91509156_91511636_91511715_91514291_91514364_91525445
tx.7549	chr16	-	607	6	FSM	ENSMUSG00000058240.15	ENSMUST00000141664.9	762	6	-21	176	2	-176	multi-exon	FALSE	canonical	3	1466	junction_2	55.2268050859363	970	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGTGTGTGTGTACTCG	9182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91525509	91503906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_91504182_91505716_91505762_91509082_91509156_91511636_91511715_91514291_91514364_91525445
tx.755	chr1	+	1758	6	FSM	ENSMUSG00000026421.15	ENSMUST00000027677.8	1823	6	65	0	65	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	392	junction_1	35.0884596413123	1138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGCTTTCCTGTCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135656949	135679970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_135657013_135667137_135667251_135672996_135673166_135674457_135674588_135678302_135678397_135678781
tx.7550	chr16	+	987	5	ISM	ENSMUSG00000022957.21	ENSMUST00000126374.3	793	7	7253	-237	-962	74	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_2	8.03118920210451	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTTTGCTATTTTGGTTT	3303	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91657951	91667459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_91658128_91660144_91660267_91664907_91665026_91666505_91666698_91667080
tx.7551	chr16	-	883	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000022957.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	1.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTAGTTATCATACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91700784	91694331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_-_91694837_91699252_91699465_91700618
tx.7552	chr16	+	1355	7	FSM	ENSMUSG00000022957.21	ENSMUST00000232198.2	1167	7	-42	-146	-8	10	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_2	3.24893144826965	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGAACTGTGTAGGCCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91700908	91709234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_91701102_91702174_91702388_91703645_91703768_91705290_91705374_91705653_91705738_91706092_91706267_91708748
tx.7553	chr16	-	667	6	ISM	ENSMUSG00000022956.12	ENSMUST00000139277.8	710	7	868	-94	868	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	5679	junction_2	340.84741454205	2260	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGCGTGAGGAGCCTTGT	2092	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91727294	91722106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_91722280_91722428_91722516_91723346_91723460_91723740_91723871_91725786_91725898_91727241
tx.7554	chr16	-	739	7	FSM	ENSMUSG00000022956.12	ENSMUST00000023677.10	838	7	94	5	-42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5653	junction_6	394.832348387684	21812	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGGCGTGAGGAGCCTTGT	905	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91728481	91722106	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_91722280_91722428_91722516_91723346_91723460_91723740_91723871_91725786_91725898_91727241_91727293_91728407
tx.7555	chr16	+	825	3	FSM	ENSMUSG00000039680.11	ENSMUST00000047429.9	846	3	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	238	junction_1	10.5	1035	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGACGGCTGTATTGCTTCT	6306	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	91855178	91909115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_91855369_91896481_91896622_91908620
tx.7556	chr16	+	517	4	FSM	ENSMUSG00000051989.12	ENSMUST00000063641.11	517	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	229	junction_1	48.3482735529983	1042	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTGTCTGCATTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92098173	92109929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_92098232_92102175_92102286_92107688_92107858_92109749
tx.7557	chr16	+	459	3	ISM	ENSMUSG00000051989.12	ENSMUST00000063641.11	517	4	4002	0	3992	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	322	junction_1	8.5	183	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTGTCTGCATTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92102175	92109929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_92102286_92107688_92107858_92109749
tx.7558	chr16	-	2231	4	FSM	ENSMUSG00000022951.17	ENSMUST00000232239.2	2319	4	90	-2	90	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	250	junction_3	18.4932420089069	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACGTTGTTGGTCGTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92262941	92188840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_92190517_92192753_92192914_92194150_92194325_92262720
tx.7559	chr16	-	2190	4	FSM	ENSMUSG00000022951.17	ENSMUST00000023672.10	2190	4	2	-2	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_3	123.764112551077	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GACGTTGTTGGTCGTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92196963	92188840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_92190517_92192753_92192914_92194150_92194325_92196783
tx.756	chr1	+	1699	5	ISM	ENSMUSG00000026421.15	ENSMUST00000027677.8	1823	6	10249	0	10249	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	436	junction_2	26.9478663348325	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGCTTTCCTGTCTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135667133	135679970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_135667251_135672996_135673166_135674457_135674588_135678302_135678397_135678781
tx.7560	chr16	+	645	3	NNC	ENSMUSG00000051297.9	novel	706	3	NA	NA	-7826	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGGTCTAGAGTTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92267803	92294258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_92267966_92288901_92289064_92293937
tx.7561	chr16	+	798	3	NNC	ENSMUSG00000051297.9	novel	706	3	NA	NA	-7785	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGGTCTAGAGTTGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92267844	92294258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_92267966_92275500_92275857_92293937
tx.7562	chr16	+	775	3	Intergenic	novelGene_624	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTGTGGTGTGTTAACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	92368322	92374433	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_92368670_92373167_92373394_92374231
tx.7563	chr16	-	1752	11	NIC	ENSMUSG00000022948.17	novel	1816	12	NA	NA	2	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	56	junction_10	28.7090578041147	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGCAGACTGTCTTAGTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93400701	93380344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_93380573_93382066_93382191_93383124_93383206_93384706_93384789_93386798_93386974_93387761_93388192_93390134_93390224_93393185_93393224_93396099_93396196_93398525_93398687_93400453
tx.7564	chr16	+	1052	3	FSM	ENSMUSG00000051483.10	ENSMUST00000039659.9	1237	3	18	167	18	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	426	junction_1	12.5	2863	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGAGGTTTACAAATGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93404742	93407226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_93405143_93405676_93405785_93406682
tx.7565	chr16	+	1200	3	FSM	ENSMUSG00000022947.9	ENSMUST00000039620.7	1170	3	-31	1	-31	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_2	11	464	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTATTTGGTTTTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93480071	93487877	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_93480502_93481934_93482043_93487215
tx.7566	chr16	+	1174	4	FSM	ENSMUSG00000022946.11	ENSMUST00000226335.2	1189	4	0	15	0	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	5.24933858267454	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGTGGTTATTTTTGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93508818	93537547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_93508957_93513037_93513201_93536041_93536224_93536856
tx.7567	chr16	-	1849	3	NNC	ENSMUSG00000097768.3	novel	1580	2	NA	NA	-159	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	59	junction_1	9	126	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TACACCTTTAAATAATATAA	6412	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93591948	93589020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_93590271_93590397_93590505_93591456
tx.7568	chr16	-	1844	3	NNC	ENSMUSG00000097768.3	novel	1580	2	NA	NA	-160	53	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	38	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGGGTGAGTGACCAGCC	6411	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93591949	93588970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_93590271_93590453_93590505_93591456
tx.7569	chr16	+	709	3	ISM	ENSMUSG00000022946.11	ENSMUST00000227278.2	1573	10	9060	-2	-1540	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	68	junction_1	2.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTAATTGTCATGTGTATAG	942	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93604781	93607476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_93604868_93606179_93606310_93606983
tx.757	chr1	+	1411	2	FSM	ENSMUSG00000041801.6	ENSMUST00000038945.6	1435	2	22	2	22	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	639	junction_1	0	579	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCTGTCTACTGAGTGAAAT	6767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135693878	135696872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_135694633_135696215
tx.7571	chr16	+	771	3	NNC	ENSMUSG00000022946.11	novel	7319	37	NA	NA	-419	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	35.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACACGTAATTGTCATGTG	2063	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93605902	93607471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_93606056_93606179_93606310_93606983
tx.7572	chr16	-	415	2	Intergenic	novelGene_625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGAGACCCTGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93623356	93622847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_93623188_93623281
tx.7573	chr16	+	625	4	ISM	ENSMUSG00000039456.11	ENSMUST00000232425.2	2114	14	-32	25258	0	703	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	614	junction_3	26.4112770527204	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCTTGTCTTGCCGTGTCT	1088	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93629122	93642332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_93629237_93638258_93638332_93641081_93641215_93642027
tx.7574	chr16	+	1856	3	ISM	ENSMUSG00000039456.11	ENSMUST00000202261.5	4179	17	38753	-4	10361	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	566	junction_1	20	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTAACTGAAAGTTATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93667761	93672965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_93668141_93670124_93670283_93671646
tx.7575	chr16	+	1920	14	FSM	ENSMUSG00000022945.13	ENSMUST00000023666.11	1922	14	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	827	junction_1	52.2487224157954	538	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTGCTGACTTCGCT	4368	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93680790	93703003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_93680864_93681353_93681510_93682246_93682380_93684009_93684128_93684929_93685034_93688387_93688485_93689001_93689087_93689619_93689714_93691624_93691695_93691782_93691875_93696910_93697074_93697812_93698245_93701893_93701986_93702792
tx.7576	chr16	+	1850	13	ISM	ENSMUSG00000022945.13	ENSMUST00000023666.11	1922	14	562	0	261	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	863	junction_6	46.2174810602607	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTGCTGACTTCGCT	4928	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93681350	93703003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_93681510_93682246_93682380_93684009_93684128_93684929_93685034_93688387_93688485_93689001_93689087_93689619_93689714_93691624_93691695_93691782_93691875_93696910_93697074_93697812_93698245_93701893_93701986_93702792
tx.7577	chr16	+	1823	3	NNC	ENSMUSG00000116947.2	novel	452	2	NA	NA	-618	1074	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	232	junction_1	14.5	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATAGTGGAGCATGTGTCCT	2246	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93811681	93814169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_93811971_93812291_93812370_93812713
tx.7578	chr16	+	1059	4	NNC	ENSMUSG00000116947.2	novel	452	2	NA	NA	-579	1916	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	174	junction_3	36.1693547388148	1014	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGGCTCCGCGTGATTCA	2285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93811720	93815011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_+_93811971_93812291_93812370_93812713_93813006_93814572
tx.7579	chr16	-	755	5	Intergenic	novelGene_626	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	0.707106781186548	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGCATTCCCTTCTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93870104	93861491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_93861716_93862709_93862886_93863660_93863742_93863982_93864059_93869906
tx.758	chr1	+	1021	5	ISM	ENSMUSG00000026418.17	ENSMUST00000148201.8	1150	9	5522	9	298	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_1	20.1912728672563	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGGTTTCCAATGGTTTCTG	3869	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135733092	135738718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_135733369_135735258_135735349_135736370_135736548_135737363_135737474_135738350
tx.7580	chr16	+	1545	4	FSM	ENSMUSG00000022941.9	ENSMUST00000023660.9	1531	4	-14	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_3	1.63299316185545	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTGACAATCATCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94129264	94137794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_94129457_94130204_94130281_94134114_94134183_94136585
tx.7581	chr16	-	804	5	FSM	ENSMUSG00000022940.18	ENSMUST00000113910.8	966	5	157	5	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_4	95.9283586850104	851	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACCTTGAGTAGATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94171396	94165310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_94165647_94166213_94166333_94168419_94168493_94170947_94171052_94171224
tx.7582	chr16	-	1136	4	FSM	ENSMUSG00000022940.18	ENSMUST00000138514.2	695	4	-187	-254	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	395	junction_3	26.0298973404728	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACCTTGAGTAGATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94171555	94165310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_94165647_94166213_94166333_94168419_94168493_94170947
tx.7583	chr16	-	736	5	FSM	ENSMUSG00000022940.18	ENSMUST00000113906.9	745	5	4	5	4	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	162	junction_4	117.933243828871	901	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTCAACCTTGAGTAGATCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94171567	94165310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_94165647_94166213_94166333_94168419_94168493_94170947_94171052_94171463
tx.7584	chr16	+	1308	11	FSM	ENSMUSG00000040785.20	ENSMUST00000119131.3	3781	11	-54	2527	1	-1714	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_10	14.2197046382828	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGACTTGACTAGCCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94171602	94195527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_94171721_94184770_94184926_94185204_94185248_94185642_94185794_94186194_94186283_94188195_94188250_94189123_94189245_94191060_94191147_94192873_94192969_94193970_94194034_94195193
tx.7586	chr16	-	2154	8	FSM	ENSMUSG00000022898.14	ENSMUST00000023615.7	2547	8	387	6	-2	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	328	junction_4	18.1490428150369	649	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTAATGGTTTGGACTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94327302	94298647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_94299942_94302393_94302547_94302940_94303092_94305160_94305236_94306222_94306304_94311596_94311747_94313088_94313233_94327196
tx.7587	chr16	+	1329	3	Intergenic	novelGene_627	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATGTGTATATGTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94544917	94547360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_94545201_94545999_94546070_94546384
tx.7588	chr16	+	448	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043301.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCAGTACTTCTGTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94656116	94656878	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_+_94656240_94656553
tx.7589	chr16	+	402	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000043301.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	6.94422221866655	53	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGCTGCATCACACAGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94656116	94668291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_+_94656240_94659190_94659253_94667462_94667539_94668150
tx.759	chr1	-	491	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000026418.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGCCTTGTGTGGGGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135736668	135736097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_135736522_135736601
tx.7590	chr16	+	869	5	Intergenic	novelGene_628	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.3247516529061	36	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTTGTGGTTTCCTGGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94656116	94670834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_94656205_94659190_94659253_94667462_94667539_94669783_94670200_94670607
tx.7591	chr16	-	1223	2	Intergenic	novelGene_629	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTAATTTGCTCAATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94902698	94900906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_-_94901984_94902552
tx.7592	chr16	+	576	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117232.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCCTAGGTTGTGTCTGC	2616	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95722535	95732872	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr16_+_95722646_95732406
tx.7593	chr16	-	1000	7	FSM	ENSMUSG00000022913.17	ENSMUST00000023630.16	1044	7	44	0	-26	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1101	junction_3	73.0062782688357	7988	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTAACTTTATTTTCTTAA	NA	False	NA	-87	True	NA	NA	NA	95792116	95781132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_95781312_95783301_95783439_95784992_95785192_95788492_95788556_95789159_95789312_95790691_95790799_95791953
tx.7594	chr16	-	2244	5	FSM	ENSMUSG00000022914.18	ENSMUST00000113827.4	2382	5	138	0	40	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	425	junction_4	11.1214882097676	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGTAAGTATTCTATAAAATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95883588	95867867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_95869828_95883013_95883074_95883177_95883208_95883321_95883381_95883453
tx.7595	chr16	-	1204	6	FSM	ENSMUSG00000040681.17	ENSMUST00000050884.16	2174	6	0	970	0	646	multi-exon	FALSE	canonical	3	5886	junction_4	404.27841891449	7658	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGAAATGCCTGATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95928929	95922787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_95923618_95925922_95926046_95928352_95928404_95928510_95928541_95928631_95928662_95928789
tx.7596	chr16	-	1211	5	NNC	ENSMUSG00000040681.17	novel	2174	6	NA	NA	0	646	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2886.14405392385	1597	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGAAATGCCTGATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95928929	95922787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_95923618_95925922_95926046_95928352_95928404_95928510_95928541_95928752
tx.7597	chr16	-	1209	4	NNC	ENSMUSG00000040681.17	novel	2174	6	NA	NA	0	646	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3210.85391895815	2139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGAAATGCCTGATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95928929	95922787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_95923618_95925922_95926046_95928352_95928404_95928724
tx.7598	chr16	-	1181	4	NNC	ENSMUSG00000040681.17	novel	2174	6	NA	NA	0	646	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	3210.85391895815	17089	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTGGAAATGCCTGATTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95928929	95922787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_95923618_95925922_95926046_95928352_95928404_95928752
tx.7599	chr16	+	2497	5	FSM	ENSMUSG00000023147.18	ENSMUST00000023913.11	2495	5	-7	5	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	306	junction_2	29.2350389088163	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTACTGTGGAAAGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95946599	95959047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_95946779_95953012_95953179_95954170_95954239_95955280_95955396_95957078
tx.76	chr1	+	2220	11	FSM	ENSMUSG00000041809.6	ENSMUST00000038447.6	2146	11	-74	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	4.06939798987516	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GACTGGTGCCTTATTTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21021837	21061065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_21022021_21025558_21025781_21030353_21030642_21031376_21031527_21037547_21037741_21042998_21043220_21045122_21045264_21048866_21049081_21049633_21049782_21059591_21059827_21060840
tx.760	chr1	+	2303	10	FSM	ENSMUSG00000041782.15	ENSMUST00000038760.10	2993	10	316	374	316	261	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_3	17.5119007154183	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCTGGTAATGTCGATGG	5934	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135746651	135760706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_135746755_135753492_135753631_135754901_135755785_135756452_135756558_135757426_135757471_135758637_135758711_135758820_135758959_135759262_135759350_135759611_135759687_135760049
tx.7600	chr16	+	689	3	ISM	ENSMUSG00000023147.18	ENSMUST00000233227.2	1101	4	4	1450	0	-858	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	306	junction_2	22	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAATTGCCTTTCTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95946610	95954525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_95946779_95953012_95953179_95954170
tx.7601	chr16	+	2315	4	ISM	ENSMUSG00000023147.18	ENSMUST00000232832.2	2678	5	6405	5	6	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	306	junction_1	33.7078955472189	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGGGTACTGTGGAAAGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95953015	95959047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_95953179_95954170_95954239_95955280_95955396_95957078
tx.7602	chr16	+	707	2	Intergenic	novelGene_630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGGCTGTTGTAATGAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	96559762	96560850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr16_+_96560009_96560389
tx.7603	chr16	-	807	8	NNC	ENSMUSG00000022938.9	novel	806	8	NA	NA	27	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_7	13.0384048104053	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGAATGTCACAGGAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97313703	97272289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr16_-_97272424_97276447_97276581_97276934_97277023_97277579_97277631_97279548_97279608_97282986_97283111_97302059_97302204_97313629
tx.7604	chr16	-	820	8	FSM	ENSMUSG00000022938.9	ENSMUST00000231414.2	806	8	-14	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_7	10.770329614269	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGAATGTCACAGGAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97313744	97272289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_97272424_97276447_97276581_97276934_97277023_97277579_97277631_97279548_97279608_97282986_97283111_97302059_97302204_97313657
tx.7605	chr16	-	678	7	NIC	ENSMUSG00000022938.9	novel	806	8	NA	NA	-16	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_6	15.0268278607148	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGAATGTCACAGGAGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97313746	97272289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_97272424_97276447_97276581_97276934_97277023_97277579_97277631_97279548_97279608_97282986_97283111_97313657
tx.7606	chr16	-	3559	8	FSM	ENSMUSG00000005251.16	ENSMUST00000019386.10	3591	8	32	0	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	9.512612465478	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCGCAGACTATTATTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97564955	97543132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_-_97545445_97547059_97547325_97548492_97548597_97549222_97549382_97551292_97551343_97552693_97552843_97556267_97556560_97564727
tx.7607	chr16	+	1328	6	FSM	ENSMUSG00000080717.11	ENSMUST00000232308.2	669	6	-18	-641	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_4	50.8409283943557	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTTGGTCATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97798515	97817956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_97798637_97809828_97809956_97810143_97810205_97811318_97811369_97816865_97816920_97817041
tx.7608	chr16	+	536	4	ISM	ENSMUSG00000080717.11	ENSMUST00000232308.2	669	6	-15	5767	4	348	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	112	junction_3	8.80656320908194	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTACTCTGCAAATTCATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97798518	97811548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_97798637_97809828_97809956_97810143_97810205_97811318
tx.7609	chr16	+	551	5	FSM	ENSMUSG00000080717.11	ENSMUST00000232387.2	546	5	-3	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	48.9508682251909	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTGTCTTAGCTACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97798523	97832638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_97798637_97809828_97809956_97810143_97810205_97816865_97816920_97832442
tx.761	chr1	+	1960	8	ISM	ENSMUSG00000041782.15	ENSMUST00000038760.10	2993	10	8668	374	-2729	261	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	102	junction_1	11.9249352884053	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTCTGGTAATGTCGATGG	3813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135755003	135760706	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_135755785_135756452_135756558_135757426_135757471_135758637_135758711_135758820_135758959_135759262_135759350_135759611_135759687_135760049
tx.7610	chr16	+	1278	5	FSM	ENSMUSG00000080717.11	ENSMUST00000231913.2	1230	5	-48	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_4	45.9292934846597	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTTGGTCATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97798515	97817956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr16_+_97798637_97809828_97809956_97810143_97810205_97816865_97816920_97817041
tx.7611	chr16	+	971	2	ISM	ENSMUSG00000080717.11	ENSMUST00000231913.2	1230	5	18300	0	7035	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCCTTGGTCATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97816863	97817956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_+_97816920_97817041
tx.7612	chr16	-	3611	4	NIC	ENSMUSG00000116673.2	novel	1556	5	NA	NA	-56	-892	intron_retention	FALSE	canonical	3	11	junction_3	25.8069758011279	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATCCTAACTCAAAATATCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97883706	97864603	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr16_-_97867866_97868954_97869016_97869203_97869331_97883545
tx.7613	chr16	-	568	4	ISM	ENSMUSG00000116673.2	ENSMUST00000232614.2	497	5	1	14276	1	-962	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_3	16.6599986661331	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTGGAGAGAAACCCTATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97883209	97867605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_97867866_97868954_97869016_97869203_97869331_97883089
tx.7614	chr16	-	407	3	ISM	ENSMUSG00000116673.2	ENSMUST00000232614.2	497	5	-5	15532	-5	-2218	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_2	20	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTACTTCTTTAAGTGTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	97883215	97868861	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr16_-_97869016_97869203_97869331_97883089
tx.7615	chr17	-	816	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000068141.6	novel	720	1	NA	NA	-35	148	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	CAAAAAAAAACAAAAACAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3095043	3094140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_-_3094877_3094963
tx.7616	chr17	-	1257	4	FSM	ENSMUSG00000116995.2	ENSMUST00000232087.2	1210	4	-32	-15	-32	15	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	2.62466929133727	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACCATCCGGCCCTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3165102	3162049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_3162848_3163562_3163623_3164462_3164621_3164861
tx.7617	chr17	-	1327	5	NNC	ENSMUSG00000116995.2	novel	1210	4	NA	NA	-10	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_1	1.11803398874989	27	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCACCATCCGGCCCTATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3165080	3162049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_3162848_3162936_3163029_3163562_3163623_3164462_3164621_3164861
tx.7618	chr17	-	1540	4	NNC	ENSMUSG00000116995.2	novel	1210	4	NA	NA	2	-1	intron_retention	FALSE	canonical	3	8	junction_1	1.24721912892465	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAAAAAAAAAAAAAGGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3165068	3162065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_3162848_3162936_3163029_3163562_3163623_3164462
tx.7619	chr17	-	1348	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000046201.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGCTGTTAATTTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3207416	3204395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_3205520_3206490_3206611_3207312
tx.762	chr1	+	776	7	ISM	ENSMUSG00000026414.14	ENSMUST00000179863.8	1097	15	7113	-1	-1462	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_4	2.40947204913349	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATATGGAATAGTGTTTCTC	7906	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135775725	135779999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_135775836_135776548_135776627_135777087_135777199_135778448_135778559_135779089_135779181_135779433_135779475_135779764
tx.7620	chr17	+	1210	2	NIC	ENSMUSG00000116858.2	novel	1354	3	NA	NA	65	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTGGTTGCAAGTCCTTTC	8601	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3248449	3309173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_3248499_3308012
tx.7621	chr17	-	1421	7	FSM	ENSMUSG00000036983.8	ENSMUST00000041003.8	1402	7	6	-25	6	25	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_2	6.8414585839246	880	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCCCAAAGGACTGGGGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3608050	3569505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_3570071_3571919_3572048_3586352_3586473_3593371_3593524_3595857_3595967_3605206_3605359_3607855
tx.7622	chr17	+	647	2	NNC	ENSMUSG00000116852.2	novel	350	2	NA	NA	-290	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	36	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTACTCTTTCTGTTGTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3607808	3610138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_3608135_3609817
tx.7623	chr17	-	666	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000069729.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTCACTGATGATTTACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5103610	5097616	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_5098041_5102907_5103034_5103494
tx.7624	chr17	-	2172	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000069729.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTACAGTCTGTTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5103855	5099241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_5100466_5102907
tx.7625	chr17	-	1471	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000069729.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTATGTGTTACAGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5103620	5099246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_5100466_5102907_5103034_5103494
tx.7626	chr17	-	506	3	Intergenic	novelGene_632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATGAGATTATCATGGGA	1298	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5438948	5434735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_5434979_5438219_5438358_5438823
tx.7627	chr17	-	962	4	FSM	ENSMUSG00000004945.16	ENSMUST00000005053.14	948	4	-13	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	675	junction_1	16.0485374896143	7215	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGGGGGCGTGTGTGTCTGT	3455	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5490531	5461143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_5461743_5483716_5483855_5489806_5489908_5490407
tx.7628	chr17	-	1921	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034265.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACCGTGGTGTTGTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5577547	5572998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_5574721_5577348
tx.7629	chr17	-	497	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000034265.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCTTGTCTTAGCTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5691311	5683971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_5684318_5691160
tx.763	chr1	+	1444	6	FSM	ENSMUSG00000026411.18	ENSMUST00000063719.15	1806	6	48	314	-47	248	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_1	45.0759359303831	361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTGCAGATCTCAAGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135945752	135962766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_135945801_135946243_135946346_135947395_135947488_135952355_135952465_135955134_135955267_135961805
tx.7630	chr17	-	571	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000096962.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAAAAAAGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5898623	5886419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_5886816_5897018_5897074_5898503
tx.7631	chr17	+	1109	8	ISM	ENSMUSG00000002365.11	ENSMUST00000002436.11	3331	18	78757	921	78734	-921	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	196	junction_1	18.3291893894266	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATTTTTATAACTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5970360	5981308	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_5970450_5970844_5970949_5972404_5972483_5974879_5974957_5976346_5976437_5977480_5977596_5978479_5978572_5980844
tx.7632	chr17	+	956	7	ISM	ENSMUSG00000002365.11	ENSMUST00000002436.11	3331	18	79307	919	79284	-919	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_6	13.6259556239798	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTTATAACTCTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5970910	5981310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_5970949_5972404_5972483_5974879_5974957_5976346_5976437_5977480_5977596_5978479_5978572_5980844
tx.7633	chr17	+	988	3	ISM	ENSMUSG00000002365.11	ENSMUST00000002436.11	3331	18	85562	919	85539	-919	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTTATAACTCTTTCAG	1189	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5977165	5981310	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_5977596_5978479_5978572_5980844
tx.7634	chr17	-	906	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000023805.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTCTCCAAAGTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6026055	6017332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_6017763_6018509_6018769_6025838
tx.7635	chr17	-	2143	17	FSM	ENSMUSG00000015659.13	ENSMUST00000097432.10	4007	17	0	1864	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_6	12.4296457612436	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCATCTGTTGTTAAGGTCT	2593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6130016	6094334	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_6094526_6095919_6096064_6099105_6099289_6100237_6100336_6100999_6101095_6101964_6102107_6106881_6107033_6110477_6110641_6111822_6111937_6115223_6115353_6116945_6117068_6117803_6117936_6119573_6119664_6121027_6121165_6122108_6122146_6124430_6124523_6129893
tx.7636	chr17	-	1618	8	ISM	ENSMUSG00000015659.13	ENSMUST00000097432.10	4007	17	0	21997	0	756	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	78	junction_3	11.8545608204141	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCAGGTTTTGTTTTCTTT	2593	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6130016	6114467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_6115353_6116945_6117068_6117803_6117936_6119573_6119664_6121027_6121165_6122108_6122146_6124430_6124523_6129893
tx.7637	chr17	+	793	3	FSM	ENSMUSG00000034345.15	ENSMUST00000039487.10	2245	3	51	1401	0	-16	multi-exon	FALSE	canonical	3	932	junction_1	74.5	6313	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGTTTGGTTAAATTATC	1741	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6130111	6135391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_6130187_6131076_6131150_6134746
tx.7638	chr17	+	1666	5	ISM	ENSMUSG00000038141.12	ENSMUST00000088940.6	4405	17	-13	16474	-13	-13924	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	500	junction_1	49.2620543623589	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6320731	6342115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_6320866_6330872_6330977_6337200_6337257_6339260_6339349_6340831
tx.7639	chr17	+	1884	17	NNC	ENSMUSG00000038141.12	novel	4405	17	NA	NA	-5	25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	216.5692369082	304	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATTGAGTCTGTGGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6320739	6356064	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_6320866_6330872_6330977_6337200_6337257_6339260_6339349_6340831_6340954_6345198_6345310_6345996_6346078_6347502_6347603_6348126_6348258_6348423_6348516_6349637_6349696_6351166_6351270_6351676_6351729_6353495_6353581_6354523_6354611_6354851_6354919_6355643
tx.764	chr1	+	1399	5	ISM	ENSMUSG00000026411.18	ENSMUST00000063719.15	1806	6	536	314	441	248	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	407	junction_3	14.0066948278314	117	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGTTGCAGATCTCAAGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	135946240	135962766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_135946346_135947395_135947488_135952355_135952465_135955134_135955267_135961805
tx.7640	chr17	+	1781	17	NNC	ENSMUSG00000038141.12	novel	4405	17	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_14	237.645407790157	285	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGAGACTTTTTGTTGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6320739	6358589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_6320866_6330872_6330977_6337200_6337257_6339260_6339349_6340831_6340954_6345198_6345310_6345996_6346078_6347502_6347603_6348126_6348258_6348423_6348516_6349637_6349696_6351166_6351270_6351676_6351729_6353495_6353581_6354523_6354611_6354851_6354919_6358271
tx.7641	chr17	-	709	5	FSM	ENSMUSG00000092074.3	ENSMUST00000169415.3	3321	5	62	2550	-20	-2550	multi-exon	TRUE	canonical	3	2579	junction_4	2048.76394138027	2824	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTGTGTTCCTTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6367713	6360818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_6361219_6361567_6361646_6361983_6362108_6365191_6365234_6367648
tx.7642	chr17	-	829	5	Fusion	ENSMUSG00000118494.2_ENSMUSG00000092074.3	novel	3321	5	NA	NA	102	-2550	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_4	3028.61844534765	175	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTGTGTTCCTTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6371909	6360818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr17_-_6361219_6361567_6361646_6361983_6362108_6365191_6365234_6371724
tx.7643	chr17	+	705	5	FSM	ENSMUSG00000096255.3	ENSMUST00000179569.3	771	5	66	0	66	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	3024	junction_1	2440.4692555941	22365	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTGTGTTCCTTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6697576	6703695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_6697638_6699278_6699321_6702406_6702531_6702868_6702947_6703295
tx.7644	chr17	+	440	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000096780.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GATTAATAAGAGCACTTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6713006	6714826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_6713287_6714666
tx.7645	chr17	-	1094	5	NNC	ENSMUSG00000096780.8	novel	1626	16	NA	NA	-10120	-15007	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	324	junction_3	195.078670028273	1501	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGTGCGTGTTTCTTTTCCCC	2348	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6744541	6723807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_6724528_6725999_6726088_6728054_6728111_6734317_6734422_6744415
tx.7646	chr17	-	496	2	Intergenic	novelGene_633	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGTTTCCGTGTCGTTA	8370	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6774409	6764230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_6764581_6774263
tx.7647	chr17	+	357	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116992.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTAGCTTTTCCTGGCTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6408587	6428663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_6408775_6428493
tx.7648	chr17	+	710	5	FSM	ENSMUSG00000000579.15	ENSMUST00000092966.5	2589	5	100	1779	-21	351	multi-exon	TRUE	canonical	3	5304	junction_1	1714.27572169707	19585	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTGTGTTCCTTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6869169	6875299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_6869236_6870885_6870928_6874010_6874135_6874472_6874551_6874899
tx.7649	chr17	-	710	5	FSM	ENSMUSG00000095677.3	ENSMUST00000179554.3	771	5	61	0	-21	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	5415	junction_4	1216.82506959711	5013	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTTGTGTTCCTTGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6923238	6916336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_6916737_6917085_6917164_6917501_6917626_6920709_6920752_6923172
tx.765	chr1	-	876	2	NNC	ENSMUSG00000097403.3	novel	2097	3	NA	NA	279	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTGTTTATAGGTATTT	3156	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136342953	136340579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_136341416_136342913
tx.7650	chr17	+	2660	16	NIC	ENSMUSG00000041831.18	novel	2244	16	NA	NA	0	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	13	junction_1	13.5522035928561	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCCAGCATTTATTAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6930412	7005449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_6930610_6940859_6941395_6943610_6943830_6954660_6954726_6967051_6967104_6968636_6968704_6970278_6970358_6973292_6973418_6976495_6976631_6982782_6982962_6995637_6995741_7000350_7000522_7001864_7001971_7002776_7002874_7003809_7004016_7005125
tx.7651	chr17	+	1896	14	ISM	ENSMUSG00000041831.18	ENSMUST00000097430.10	2423	16	17151	-214	323	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	46	junction_10	5.41420441685162	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTCCCAGCATTTATTAACAA	1715	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6943642	7005449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_6943830_6954660_6954726_6967051_6967104_6968636_6968704_6970278_6970358_6973292_6973418_6976495_6976631_6982782_6982962_6995637_6995741_7000350_7000522_7001864_7001971_7002776_7002874_7003809_7004016_7005125
tx.7652	chr17	-	874	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000041831.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTAGTCCTGCTGGGACT	826	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6947907	6946489	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_6946691_6947234
tx.7653	chr17	-	1526	3	ISM	ENSMUSG00000052397.9	ENSMUST00000064234.7	3164	13	41741	234	1778	-234	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	975	junction_1	45.5	1778	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTGTCTGATTGCATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7008442	7005673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_7006867_7007028_7007281_7008361
tx.7654	chr17	-	2901	13	FSM	ENSMUSG00000052397.9	ENSMUST00000064234.7	3164	13	29	234	29	-234	multi-exon	FALSE	canonical	3	786	junction_7	74.9893973987138	383	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTGTCTGATTGCATGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7050154	7005673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_7006867_7007028_7007281_7008361_7008455_7008819_7008981_7009752_7009884_7010088_7010253_7014662_7014760_7020381_7020529_7021384_7021469_7022009_7022285_7023246_7023343_7026877_7026962_7050030
tx.7655	chr17	+	944	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052397.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGGAGACCTGCTGACTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7012198	7013588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_7012576_7013021
tx.7656	chr17	-	1317	2	ISM	ENSMUSG00000023806.11	ENSMUST00000232602.2	1263	3	-432	20307	-31	-20307	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	89	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCTCTGGGCCCCTTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7216112	7208574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_7209156_7215376
tx.7657	chr17	-	2312	4	NNC	ENSMUSG00000052031.9	novel	2312	4	NA	NA	-50	-51	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	227.371941980535	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCCGATGTTATATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7228605	7222460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_7224424_7225052_7225168_7228135_7228190_7228425
tx.7658	chr17	-	1713	9	ISM	ENSMUSG00000071984.12	ENSMUST00000097425.10	5845	20	46428	13	2469	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.58113883008419	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTGTTCTTTAGATGAAT	9860	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7977378	7957413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_7958163_7959499_7959623_7960453_7960616_7961724_7961755_7965396_7965477_7969175_7969285_7972351_7972583_7975089_7975234_7977293
tx.7659	chr17	+	1545	8	FSM	ENSMUSG00000073471.4	ENSMUST00000097423.3	2189	8	324	320	-18	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	57	junction_4	7.41482244134913	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTTTTCATTTATTTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8164808	8198336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_8165136_8171380_8171469_8188978_8189121_8191655_8191802_8192768_8192973_8194876_8195040_8197549_8197637_8197948
tx.766	chr1	-	1206	2	ISM	ENSMUSG00000097403.3	ENSMUST00000181746.2	2097	3	296	931	271	-4	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTATGTTTTGTTTATAGG	3148	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136342961	136340584	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_136341416_136342586
tx.7660	chr17	-	967	9	FSM	ENSMUSG00000095687.3	ENSMUST00000097420.7	1793	9	308	518	-4	-518	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	240.913852600883	1088	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTTTGGCTTTTTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8366621	8347425	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_8347719_8349056_8349132_8350874_8350921_8353735_8353850_8356719_8356791_8360427_8360486_8361349_8361403_8364373_8364435_8366425
tx.7661	chr17	+	3070	12	FSM	ENSMUSG00000069135.12	ENSMUST00000024636.15	3077	12	0	7	0	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	299	junction_6	38.250587420542	85	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCCTCCATTTTACAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8384371	8415300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_8384531_8384755_8384810_8387866_8387922_8388359_8388449_8388837_8388976_8391759_8391841_8401059_8401287_8403232_8403346_8405344_8405414_8410229_8410270_8411016_8411114_8413352
tx.7662	chr17	+	3140	13	FSM	ENSMUSG00000069135.12	ENSMUST00000097419.10	3505	13	36	329	-3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	46	junction_7	116.477107908235	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTTACAGTGTTGGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8384368	8415307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_8384531_8384755_8384810_8387866_8387922_8388359_8388449_8388837_8388976_8391759_8391841_8394350_8394411_8401059_8401287_8403232_8403346_8405344_8405414_8410229_8410270_8411016_8411114_8413352
tx.7663	chr17	+	2338	6	ISM	ENSMUSG00000069135.12	ENSMUST00000024636.15	3077	12	16820	31	113	-31	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	323	junction_1	15.3362316101447	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGGATTAAAATGTTGGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8401191	8415276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_8401287_8403232_8403346_8405344_8405414_8410229_8410270_8411016_8411114_8413352
tx.7664	chr17	+	930	4	NIC	ENSMUSG00000023861.18	novel	958	5	NA	NA	-9	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	5	junction_1	472.094858641307	1791	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGTGTGACTATATATC	2146	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8502618	8516494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_8502794_8515366_8515464_8515655_8515789_8515969
tx.7665	chr17	+	990	5	FSM	ENSMUSG00000023861.18	ENSMUST00000124023.8	555	5	-44	-391	12	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	407.512576493045	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAGTGTGACTATATATC	2167	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8502639	8516494	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_8502794_8512246_8512328_8515366_8515464_8515655_8515789_8515969
tx.7666	chr17	+	847	6	FSM	ENSMUSG00000073468.13	ENSMUST00000145276.8	810	6	-35	-2	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	190	junction_1	242.374586126516	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTCTGGATCAACTGTA	2955	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8529965	8546274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_8530118_8539431_8539514_8540631_8540668_8542108_8542168_8543265_8543296_8545786
tx.7667	chr17	+	1010	8	FSM	ENSMUSG00000073468.13	ENSMUST00000154553.2	1049	8	39	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	730	junction_5	48.6457414710199	537	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTTTCTGGATCAACTGTA	2962	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8529972	8546274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_8530118_8537675_8537763_8538250_8538334_8539431_8539514_8540631_8540668_8542108_8542168_8543265_8543296_8545786
tx.7668	chr17	+	2202	8	FSM	ENSMUSG00000062327.11	ENSMUST00000074667.9	2046	8	-161	5	-161	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_5	7.70634511957782	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTCTTTGTGGATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8653093	8661323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_8653569_8654022_8654288_8654942_8655078_8655809_8655872_8655981_8656044_8657447_8657622_8658741_8658872_8660424
tx.7669	chr17	+	2195	8	NIC	ENSMUSG00000062327.11	novel	2046	8	NA	NA	-151	-5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	13	junction_5	9.95295054191449	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTCTTTGTGGATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8653103	8661323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_8653569_8654022_8654288_8654942_8655078_8655809_8655872_8655981_8656044_8657444_8657622_8658741_8658872_8660424
tx.767	chr1	+	1892	2	FSM	ENSMUSG00000026404.13	ENSMUST00000129218.7	1364	2	34	-562	34	562	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTCACAAATACTGAATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136343042	136346092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_136343162_136344319
tx.7670	chr17	+	1204	3	ISM	ENSMUSG00000062327.11	ENSMUST00000177118.2	761	7	3204	-749	3204	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	42	junction_1	1	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTCTTTGTGGATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8657446	8661323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_8657622_8658741_8658872_8660424
tx.7671	chr17	+	369	2	Intergenic	novelGene_634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTTCTCAGGTATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8708950	8712243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_8709050_8711973
tx.7672	chr17	-	1040	3	FSM	ENSMUSG00000117341.2	ENSMUST00000233459.2	585	3	-41	-414	-41	414	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTTTGTCTTACTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9945331	9923856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_9924688_9941118_9941218_9945221
tx.7673	chr17	-	1901	7	ISM	ENSMUSG00000062078.16	ENSMUST00000233645.2	8547	8	36405	5991	-42	501	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1001	junction_1	105.822834124882	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AACAAAGAAACCCTTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10501904	10427520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_10428561_10432287_10432363_10435088_10435389_10436644_10436733_10457821_10457966_10492875_10492993_10501767
tx.7674	chr17	-	561	3	ISM	ENSMUSG00000062078.16	ENSMUST00000233828.2	5428	7	440	63647	440	-60425	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1078	junction_1	60.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAAGAAGCTTGCACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10537850	10492764	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_10492993_10501767_10501911_10537660
tx.7675	chr17	-	371	2	ISM	ENSMUSG00000062078.16	ENSMUST00000233828.2	5428	7	36386	63641	-42	-60419	internal_fragment	FALSE	canonical	3	1078	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGCTTGCACTTGTACAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10501904	10492758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_10492993_10501767
tx.7676	chr17	-	504	2	NNC	ENSMUSG00000037196.7	novel	1475	5	NA	NA	201533	-127	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATAGTGTACTGTGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10648421	10622067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_10622408_10648257
tx.7677	chr17	+	547	2	ISM	ENSMUSG00000023827.9	ENSMUST00000024594.9	1915	9	15	67524	15	12466	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	227	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAAAATCCTTCCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12338185	12371008	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_12338303_12370578
tx.7678	chr17	+	1896	9	FSM	ENSMUSG00000023827.9	ENSMUST00000024594.9	1915	9	15	4	15	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	218	junction_3	26.473748790075	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCTGTGGCAAGTGTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12338185	12438528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_12338303_12370578_12370837_12417638_12417809_12429097_12429260_12429525_12429680_12432341_12432445_12434162_12434239_12435580_12435780_12437871
tx.7679	chr17	-	682	2	FSM	ENSMUSG00000014426.10	ENSMUST00000233716.2	755	2	518	-445	518	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	265	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCAGCGTCTGTTACTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12448585	12446507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_12447008_12448403
tx.768	chr1	+	2137	8	FSM	ENSMUSG00000026404.13	ENSMUST00000027655.8	2166	8	27	2	27	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	8.75750407085377	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCGTTATTTATTTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136343035	136367894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_136343162_136344319_136345135_136347147_136347316_136352532_136352623_136360049_136360302_136361450_136361604_136362243_136362373_136367490
tx.7680	chr17	-	814	4	ISM	ENSMUSG00000014426.10	ENSMUST00000233755.2	5237	26	85803	5	-2729	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	220	junction_3	18.5532267334343	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGAAGTCAGCGTCTGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12451832	12446512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_12447008_12448403_12448584_12451298_12451406_12451800
tx.7681	chr17	-	666	3	ISM	ENSMUSG00000014426.10	ENSMUST00000232931.2	3576	12	10	22838	0	86	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	131	junction_1	28	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATCGATTCCAGATGTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12537673	12490921	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_12491108_12496807_12496999_12537384
tx.7682	chr17	-	488	2	FSM	ENSMUSG00000014426.10	ENSMUST00000233683.2	3813	2	1	3324	1	-3324	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCGAGCCTGTCACTTGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12537682	12496808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_12496999_12537384
tx.7683	chr17	-	915	2	Intergenic	novelGene_635	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTACCTGCAATTTCCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12579173	12577989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_12578529_12578797
tx.7684	chr17	-	1808	19	FSM	ENSMUSG00000073460.6	ENSMUST00000163394.3	2092	19	284	0	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	109	junction_10	13.5984067694222	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTCTGTACATGGCCAGTGC	2974	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13128833	13107615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_13107857_13108962_13109062_13109165_13109342_13109607_13109708_13111022_13111066_13111206_13111261_13111645_13111711_13113246_13113303_13114398_13114485_13116147_13116218_13118419_13118564_13118727_13118805_13122094_13122196_13124392_13124482_13124648_13124773_13125384_13125425_13127939_13128014_13128348_13128407_13128722
tx.7685	chr17	-	996	4	FSM	ENSMUSG00000057388.10	ENSMUST00000079121.4	1219	4	227	-4	-15	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	996	junction_2	30.9120616516523	1720	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTTACTGTGTTGTGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13135005	13130231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_13130637_13132656_13132889_13134524_13134712_13134833
tx.7686	chr17	+	1896	12	FSM	ENSMUSG00000068039.14	ENSMUST00000151287.8	2446	12	41	509	-16	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3235	junction_8	179.622239047203	5329	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCTGGGTTCCTGTCCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13135309	13143445	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_13135517_13136684_13136771_13136929_13137059_13138237_13138336_13138701_13138813_13139162_13139345_13139626_13139754_13140989_13141166_13141495_13141620_13142104_13142298_13142416_13142581_13143146
tx.7687	chr17	-	2087	9	FSM	ENSMUSG00000023832.15	ENSMUST00000007005.14	2250	9	13	150	13	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	922	junction_2	90.2592619901138	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGCTTCTTGTCAGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13179621	13161926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_13162920_13163286_13163398_13165147_13165303_13166243_13166367_13167400_13167545_13171138_13171257_13175105_13175288_13178881_13179017_13179495
tx.7688	chr17	-	1345	7	ISM	ENSMUSG00000023832.15	ENSMUST00000007005.14	2250	9	13	3009	13	-1496	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	965	junction_2	78.864158878134	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAATTGAGTTTGTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13179621	13164785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_13165303_13166243_13166367_13167400_13167545_13171138_13171257_13175105_13175288_13178881_13179017_13179495
tx.769	chr1	+	2011	7	NIC	ENSMUSG00000026404.13	novel	2166	8	NA	NA	24	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	4	junction_6	23.4004985701872	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCGTTATTTATTTCAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136343032	136367894	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_136343162_136344319_136345135_136347147_136347316_136352532_136352623_136360049_136360302_136361450_136361604_136367490
tx.7690	chr17	-	1577	6	FSM	ENSMUSG00000060475.14	ENSMUST00000159986.8	3187	6	41	1569	41	-702	multi-exon	FALSE	canonical	3	178	junction_1	176.193756983612	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAATTCAAGGAATACTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13211038	13193140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_13194362_13199708_13199837_13200636_13200696_13202343_13202400_13204802_13204841_13210963
tx.7691	chr17	-	1595	6	FSM	ENSMUSG00000060475.14	ENSMUST00000233867.2	446	6	0	-1149	0	-716	multi-exon	FALSE	canonical	3	14	junction_5	266.82773469038	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGTTGGGTTTTTTTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13213056	13193154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_13194362_13199708_13199837_13200636_13200696_13202343_13202400_13204802_13204841_13212949
tx.7692	chr17	+	954	5	FSM	ENSMUSG00000006818.6	ENSMUST00000007012.6	5861	5	127	4780	-52	-262	multi-exon	FALSE	canonical	3	3082	junction_4	106.177622406984	8816	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTCTGTGTGAATTGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13226830	13234241	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_13226956_13227070_13227274_13229406_13229524_13232319_13232500_13233912
tx.7693	chr17	-	380	3	Intergenic	novelGene_636	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTCTAGATCAGCACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13394671	13389248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_13389445_13394351_13394500_13394635
tx.7694	chr17	+	1965	3	Fusion	ENSMUSG00000090211.4_ENSMUSG00000060417.7	novel	2463	3	NA	NA	11	761	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCGGAGGTTTTCCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13721226	13739292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr17_+_13721317_13736990_13738577_13739003
tx.7695	chr17	+	2410	2	Fusion	ENSMUSG00000090211.4_ENSMUSG00000060417.7	novel	2463	3	NA	NA	-7	761	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCGGAGGTTTTCCTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13721208	13739292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr17_+_13721317_13736990
tx.7696	chr17	-	933	2	Intergenic	novelGene_638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTGGGGCTCCCGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13909070	13907455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_13908279_13908960
tx.7697	chr17	-	1417	3	FSM	ENSMUSG00000038347.16	ENSMUST00000148430.2	1839	3	422	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTTTTGGCCTGGTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13981665	13936697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_13937896_13948183_13948285_13981547
tx.7698	chr17	+	573	4	ISM	ENSMUSG00000068036.17	ENSMUST00000139347.8	822	5	71	1492	11	-1467	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	139	junction_3	92.0664011581979	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAAGAAAGAGAAGGAGGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13980871	14029288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_13981041_14024200_14024397_14027538_14027655_14029196
tx.7699	chr17	+	601	2	Intergenic	novelGene_639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGGCCTCTCCTGGAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14389689	14391194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_14390051_14390954
tx.77	chr1	-	932	8	ISM	ENSMUSG00000041779.6	ENSMUST00000037998.6	6492	11	66400	5070	30827	2944	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	66	junction_1	8.1215259448868	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCTGAGCCGCCAGATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21083053	21071592	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_21071860_21073193_21073358_21074061_21074206_21074449_21074555_21075790_21075862_21076373_21076459_21077076_21077136_21083016
tx.770	chr1	+	1733	2	FSM	ENSMUSG00000041498.14	ENSMUST00000201158.2	574	2	-1156	-3	-88	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTGTGTGCTGTGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136395584	136399462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_136396913_136399057
tx.7700	chr17	-	539	2	NNC	ENSMUSG00000046991.13	novel	413	2	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTCTCAGTTCAGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15163339	15159571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_15159843_15163071
tx.7701	chr17	-	431	2	FSM	ENSMUSG00000046991.13	ENSMUST00000228221.2	413	2	-17	-1	-8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTCTCAGTTCAGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15163356	15159571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_15159843_15163196
tx.7702	chr17	-	330	2	FSM	ENSMUSG00000046991.13	ENSMUST00000228869.2	1800	2	3	1467	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTTCTCAGTTCAGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15163417	15159571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_15159843_15163358
tx.7703	chr17	+	1591	2	FSM	ENSMUSG00000050088.10	ENSMUST00000164837.3	2523	2	-11	943	-11	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTAAGGTCATCGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15163480	15165253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_15163582_15163763
tx.7704	chr17	+	1526	2	FSM	ENSMUSG00000050088.10	ENSMUST00000052691.9	2506	2	35	945	-11	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTAAGGTCATCGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15163480	15165253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_15163582_15163828
tx.7705	chr17	-	616	4	ISM	ENSMUSG00000023883.14	ENSMUST00000024657.12	1663	12	10574	-2	2007	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	756	junction_1	68.7814574495837	192	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGATGACCTTAAACATCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15170961	15165268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_15165447_15166460_15166650_15166916_15167026_15170821
tx.7706	chr17	-	671	5	ISM	ENSMUSG00000023883.14	ENSMUST00000024657.12	1663	12	8615	-2	48	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	756	junction_1	59.9848939317225	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGATGACCTTAAACATCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15172920	15165268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_15165447_15166460_15166650_15166916_15167026_15170821_15170978_15172881
tx.7707	chr17	-	1037	7	ISM	ENSMUSG00000023883.14	ENSMUST00000024657.12	1663	12	6341	-2	-2226	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	756	junction_1	78.1039193781095	430	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CGATGACCTTAAACATCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15175194	15165268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_15165447_15166460_15166650_15166916_15167026_15170821_15170978_15172881_15173036_15174276_15174387_15175053
tx.7708	chr17	-	756	4	FSM	ENSMUSG00000116780.2	ENSMUST00000097399.6	712	4	6	-50	6	50	multi-exon	TRUE	canonical	3	13	junction_1	6.64997911442	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGAGCCTCGTGTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15199046	15184453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_15184618_15187807_15187964_15190648_15190856_15198817
tx.7709	chr17	-	584	3	NIC	ENSMUSG00000079710.11	novel	752	4	NA	NA	29	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	13	junction_1	9	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGAGCCTCGTGTTACC	8907	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15230402	15216047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_15216212_15222241_15222449_15230189
tx.771	chr1	+	3115	2	FSM	ENSMUSG00000041483.15	ENSMUST00000047734.15	4933	2	65	1753	65	-1753	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AGAAAAGAAAAAAGGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136552703	136556038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_136552790_136553009
tx.7710	chr17	-	647	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116895.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	36	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACGGGTTCTTTGGAAGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15241510	15233025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15233378_15240017_15240222_15241419
tx.7711	chr17	-	809	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116953.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15210143	15208135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15208854_15210052
tx.7712	chr17	-	772	4	FSM	ENSMUSG00000079710.11	ENSMUST00000179539.9	752	4	11	-31	-2	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_1	7.25718035235908	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGAGCCTCGTGTTACCT	8876	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15230433	15216046	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_15216212_15219403_15219560_15222241_15222449_15230189
tx.7713	chr17	-	599	3	FSM	ENSMUSG00000116780.2	ENSMUST00000231584.2	459	3	-90	-50	7	50	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	7.5	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGAGCCTCGTGTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15199045	15184453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_15184618_15190648_15190856_15198817
tx.7714	chr17	-	432	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036552.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACGGGTTCTTTGGAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15273636	15264402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15264753_15273554
tx.7715	chr17	-	809	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116895.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15241510	15239503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15240222_15241419
tx.7716	chr17	-	559	3	FSM	ENSMUSG00000079707.11	ENSMUST00000097398.12	517	3	-44	2	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	7.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGAGCCTCGTGTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15261745	15247415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_15247580_15253608_15253816_15261557
tx.7717	chr17	-	779	4	FSM	ENSMUSG00000079707.11	ENSMUST00000040746.8	720	4	-59	0	-59	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	14	junction_1	6.37704215656966	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGAGCCTCGTGTTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15261809	15247415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_15247580_15250770_15250927_15253608_15253816_15261557
tx.7718	chr17	-	639	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116953.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	35	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGTTCTTTGGAAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15210134	15201652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15202006_15208649_15208854_15210052
tx.7719	chr17	-	555	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116895.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGTTCTTTGGAAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15241510	15233024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15233378_15240110_15240222_15241419
tx.772	chr1	+	455	3	FSM	ENSMUSG00000097113.8	ENSMUST00000181524.8	413	3	-44	2	-44	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	3	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCCTTTCTTGCTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136611089	136618540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_136611212_136616481_136616549_136618274
tx.7720	chr17	-	641	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116895.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	36	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGGTTCTTTGGAAGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15242339	15233024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15233378_15240017_15240222_15242255
tx.7721	chr17	-	800	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036552.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCATGCTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15272808	15270817	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_15271527_15272717
tx.7722	chr17	+	794	3	ISM	ENSMUSG00000036552.20	ENSMUST00000228803.2	1271	6	3200	5	497	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	59	junction_2	18.5	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATGAACTCTATGTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15280212	15284487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_15280247_15281330_15281445_15283841
tx.7723	chr17	+	776	3	ISM	ENSMUSG00000036552.20	ENSMUST00000231241.2	1571	7	6892	-6	497	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_2	39.5	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTCTATGTTGCCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15280212	15284491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_15280247_15281330_15281445_15283863
tx.7724	chr17	-	978	3	NIC	ENSMUSG00000097624.3	novel	1179	5	NA	NA	29	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	27.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCTCTTTTCTTTCTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15461016	15451841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_15452674_15460531_15460624_15460962
tx.7725	chr17	-	1183	5	FSM	ENSMUSG00000097624.3	ENSMUST00000181658.2	1179	5	0	-4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_2	9.14808723176599	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTCTTTTCTTTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15461045	15451842	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_15452674_15453041_15453145_15454190_15454265_15460531_15460624_15460962
tx.7726	chr17	-	856	4	NNC	ENSMUSG00000097624.3	novel	1218	5	NA	NA	8	-4596	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_2	16.779617264871	35	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTGATCTCCGCTGCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15461037	15456442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_15456884_15457287_15457536_15460531_15460624_15460962
tx.7727	chr17	+	2665	2	ISM	ENSMUSG00000014763.9	ENSMUST00000055352.8	4420	11	70	29318	24	-4733	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCTTTGTTTTTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15616533	15624382	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_15616823_15622006
tx.7728	chr17	+	2956	11	NNC	ENSMUSG00000014763.9	novel	5787	11	NA	NA	24	-1398	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	14.3	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCATTAGTCTTTGAACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15616533	15652302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_15616823_15622006_15623396_15626016_15626198_15627858_15627961_15634940_15635114_15637894_15637988_15643139_15643347_15644531_15644641_15646450_15646538_15651838_15651891_15652028
tx.7729	chr17	-	626	4	NNC	ENSMUSG00000116718.2	novel	1056	5	NA	NA	-5928	305	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAGAGAGGTGATCGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15661155	15641758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_15641970_15644545_15644706_15652001_15652104_15661002
tx.773	chr1	-	2931	9	FSM	ENSMUSG00000026398.15	ENSMUST00000192929.6	1756	9	26	-1201	26	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_8	13.3041346956501	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGGAGGGCAGAGATAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136881342	136771999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_136773449_136810001_136810150_136818420_136818541_136868146_136868788_136871024_136871167_136872696_136872816_136876459_136876598_136879839_136879903_136881231
tx.7730	chr17	-	821	6	FSM	ENSMUSG00000014769.11	ENSMUST00000014913.11	1758	6	-1	938	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4315	junction_4	304.330741135364	14887	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATTTTCTTACACTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15718561	15696220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_15696468_15697576_15697684_15710417_15710548_15713359_15713442_15714677_15714786_15718414
tx.7731	chr17	+	1857	9	FSM	ENSMUSG00000014767.18	ENSMUST00000014911.12	1891	9	27	7	3	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	123	junction_2	77.8728932299295	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCATTGTTTTGTTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15720176	15737682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_15720287_15721415_15721465_15723226_15723391_15724535_15724910_15727604_15727693_15733791_15733884_15734491_15734660_15735877_15735973_15736965
tx.7732	chr17	+	1893	10	NIC	ENSMUSG00000014767.18	novel	2067	10	NA	NA	-4	-14	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	42	junction_2	107.763229258625	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCTGAGACCATTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15720179	15737675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_15720287_15721415_15721465_15721573_15721620_15723226_15723391_15724535_15724910_15727604_15727693_15733791_15733884_15734491_15734660_15735877_15735973_15736965
tx.7733	chr17	+	668	2	Intergenic	novelGene_640	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGGTCTCCGTTTCGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16988410	16991245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_16988713_16990879
tx.7734	chr17	-	533	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000116623.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTAAAACCATTTGTCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17142345	17044937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_17045107_17045591_17045700_17103748_17103811_17142151
tx.7735	chr17	+	2089	4	FSM	ENSMUSG00000060149.8	ENSMUST00000232328.2	1598	4	-11	-480	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	5.55777733351102	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCCCAAGTGGCCTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17171802	17194419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_17171971_17191161_17191289_17191432_17191494_17192686
tx.7736	chr17	+	2696	4	FSM	ENSMUSG00000096696.2	ENSMUST00000127027.2	2667	4	-35	6	-35	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_3	31.9826341768293	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACCTTCTAAGGGATGCAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17284339	17309884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_17284469_17305782_17305910_17306151_17306213_17307505
tx.7737	chr17	+	2318	4	Intergenic	novelGene_641	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_3	58.5168541723	178	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCCCCAAGTATGCTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17399554	17426650	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_17399714_17422956_17423084_17423325_17423387_17424679
tx.7738	chr17	+	1610	8	FSM	ENSMUSG00000116564.2	ENSMUST00000232396.2	1596	8	-7	-7	-7	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	346	junction_3	41.8120185826896	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGTCTTTTGAATTAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17594826	17608023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_17594933_17597980_17598120_17598744_17598862_17601073_17601250_17603547_17603637_17605145_17605338_17605842_17605936_17607325
tx.7739	chr17	+	2033	10	FSM	ENSMUSG00000116564.2	ENSMUST00000024620.8	3220	10	256	931	-7	-931	multi-exon	FALSE	canonical	3	346	junction_3	38.1895855495244	364	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCAATCTGTAGTTCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17594826	17614230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_17594933_17597980_17598120_17598744_17598862_17601073_17601250_17603547_17603637_17605145_17605338_17605842_17605936_17607325_17607836_17610229_17610327_17613716
tx.774	chr1	-	573	5	ISM	ENSMUSG00000026398.15	ENSMUST00000192929.6	1756	9	26	97824	26	-2302	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_4	15.9902313929474	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGAGAGAGTCTGCCAGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	136881342	136871024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_136871167_136872696_136872816_136876459_136876598_136879839_136879903_136881231
tx.7740	chr17	+	894	3	FSM	ENSMUSG00000047786.13	ENSMUST00000140134.2	2678	3	24	1760	24	-1760	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTACTTTAGAAAGCATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17669105	17677889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_17669400_17674521_17674600_17677367
tx.7741	chr17	-	1936	2	ISM	ENSMUSG00000023845.8	ENSMUST00000231666.2	2472	6	396	7936	-13	-7936	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATTAGGGGGATACATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17844916	17797959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_17799635_17844655
tx.7742	chr17	+	2284	15	FSM	ENSMUSG00000007564.16	ENSMUST00000007708.14	2410	15	115	11	-61	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1213	junction_1	77.3781135010385	344	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGGTTCTCTAGTCTTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21165687	21186167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_21165846_21171604_21171696_21174876_21174978_21176049_21176283_21176966_21177115_21177218_21177375_21178981_21179097_21179201_21179273_21179650_21179786_21180727_21180902_21181214_21181276_21181846_21182002_21182835_21182979_21185500_21185593_21185716
tx.7743	chr17	+	2089	5	NIC	ENSMUSG00000023882.16	novel	2832	5	NA	NA	11	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	14	junction_1	8.22724133595217	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGTTTTGTTTTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21643505	21655420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_21643580_21647593_21647634_21647998_21648091_21650456_21650584_21653664
tx.7744	chr17	+	2333	5	FSM	ENSMUSG00000023882.16	ENSMUST00000165230.8	2832	5	17	482	11	4	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	11.7340317027013	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCGTTTTGTTTTCTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21643505	21655420	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_21643824_21647593_21647634_21647998_21648091_21650456_21650584_21653664
tx.7745	chr17	+	2578	5	FSM	ENSMUSG00000023892.9	ENSMUST00000039577.8	2574	5	0	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	22.3271135617661	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTCTCTCTCTCTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21670635	21685853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_21670684_21672698_21672790_21676558_21676651_21681922_21682050_21683633
tx.7746	chr17	+	2533	4	ISM	ENSMUSG00000023892.9	ENSMUST00000039577.8	2574	5	2060	-4	2060	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	124	junction_2	4.78423336480244	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTTCTCTCTCTCTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21672695	21685853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_21672790_21676558_21676651_21681922_21682050_21683633
tx.7747	chr17	+	796	5	NNC	ENSMUSG00000057409.8	novel	3065	5	NA	NA	-4	-2211	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	104	junction_4	24.0572234474388	408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGTTGTCTGAACAGTAAT	1471	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21709255	21727815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_21709528_21711487_21711579_21720472_21720565_21725242_21725370_21727601
tx.7748	chr17	-	394	3	NNC	ENSMUSG00000097781.2	novel	2478	3	NA	NA	-94	-5321	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTCAAAGTCCTGATAGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21756234	21753776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_21753967_21754684_21754739_21756084
tx.7749	chr17	+	2571	7	NNC	ENSMUSG00000067931.7	novel	2652	6	NA	NA	-18	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	non_canonical	0	0	junction_6	39.6880194629171	5	1	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCATGGAAAGATTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21787251	21808961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_21787508_21789310_21789390_21794118_21794219_21803291_21803405_21805041_21805169_21806966_21807229_21807327
tx.775	chr1	-	555	3	FSM	ENSMUSG00000079283.3	ENSMUST00000112025.3	565	3	10	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	0	252	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGTCCACAAGATGCACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	138784580	138779720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_138779912_138781308_138781411_138784318
tx.7751	chr17	+	2653	6	FSM	ENSMUSG00000067931.7	ENSMUST00000088787.7	2652	6	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_2	15.6025638918737	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGCATGGAAAGATTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21787268	21808961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_21787508_21789310_21789390_21794118_21794219_21803291_21803405_21805041_21805169_21806966
tx.7752	chr17	-	436	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035868.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TGTAGAAAATAAATGAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21898770	21864565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_21864849_21898617
tx.7753	chr17	+	2988	5	Genic_Genomic	ENSMUSG00000073448.4_ENSMUSG00000067929.4	novel	842	1	NA	NA	-10198	559	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	5.44862367942584	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATGTTTGTGAGCACCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21898889	21911580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_+_21899118_21900505_21900595_21904941_21905026_21906708_21906836_21909120
tx.7754	chr17	+	4256	6	FSM	ENSMUSG00000067928.7	ENSMUST00000073312.7	4209	6	-47	0	-47	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_5	11.689311356962	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATGTGGAAATTCAATGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21926675	21944617	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_21926876_21927591_21927704_21928185_21928278_21938027_21938104_21939924_21940052_21940968
tx.7755	chr17	+	3032	6	FSM	ENSMUSG00000061544.14	ENSMUST00000182827.8	640	6	-92	-2300	-92	-1607	multi-exon	FALSE	canonical	3	170	junction_1	15.5254629560603	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTTTTTTGTTTTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21949683	21966342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_21950033_21955038_21955103_21958415_21958494_21961476_21961604_21962839_21962939_21964027
tx.7756	chr17	-	594	4	NIC	ENSMUSG00000069743.6	novel	3686	5	NA	NA	3	-2015	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_3	20.6774165590278	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATACTATGGTACAGAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22064737	22038863	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_22039170_22040050_22040178_22042824_22042873_22064624
tx.7757	chr17	-	3678	5	FSM	ENSMUSG00000069743.6	ENSMUST00000084141.6	3686	5	3	5	3	-5	multi-exon	TRUE	canonical	3	21	junction_3	11.3880419739304	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTTCAACAACTCGAACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22064737	22035870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_22039170_22040050_22040178_22042824_22042873_22059604_22059696_22064624
tx.7758	chr17	-	811	6	NNC	ENSMUSG00000069743.6	novel	3686	5	NA	NA	-1	-2016	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_4	13.6674796506159	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAATACTATGGTACAGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22064741	22038864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_22039170_22040050_22040178_22042824_22042873_22059126_22059250_22059604_22059696_22064624
tx.7759	chr17	-	751	5	FSM	ENSMUSG00000069743.6	ENSMUST00000232918.2	2735	5	5	1979	5	-1979	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	16.8077363139716	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAACAAAAACTCAAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22064748	22038827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_22039170_22040050_22040178_22042824_22042873_22059585_22059696_22064624
tx.7760	chr17	-	2851	6	NNC	ENSMUSG00000069743.6	novel	3686	5	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_5	18.7360614858086	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTAAAAATATAGTGAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22064740	22036848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_22039170_22040050_22040178_22042824_22042873_22059604_22059696_22063404_22063553_22064624
tx.7761	chr17	-	2641	5	FSM	ENSMUSG00000078546.9	ENSMUST00000190066.7	2221	5	240	-660	-47	660	multi-exon	TRUE	canonical	2	10	junction_1	2.29128784747792	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTCGTTGTTTCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22128667	22097890	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_22100076_22100938_22101066_22106291_22106340_22127029_22127178_22128534
tx.7762	chr17	-	559	4	ISM	ENSMUSG00000078546.9	ENSMUST00000190066.7	2221	5	255	2270	-32	-2270	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	13	junction_3	1.24721912892465	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGGTCTTCATTGCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22128652	22100820	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_22101066_22106291_22106340_22127029_22127178_22128534
tx.7763	chr17	-	3389	5	NIC	ENSMUSG00000071267.12	novel	3265	6	NA	NA	-236	0	combination_of_known_splicesites	TRUE	canonical	1	1	junction_3	32.101401838549	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGACTTGGTTGTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181681	22145940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_22148471_22149346_22149474_22151973_22152095_22172868_22173035_22181236
tx.7764	chr17	-	3226	6	NNC	ENSMUSG00000071267.12	novel	3265	6	NA	NA	-24	-3	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	30	junction_5	22.8508205541945	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTTGGACTTGGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181469	22145943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_22148471_22149346_22149474_22151973_22152095_22160706_22160832_22172868_22172962_22181236
tx.7765	chr17	-	904	6	NNC	ENSMUSG00000071267.12	novel	3265	6	NA	NA	-24	-1048	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_3	29.5607848339654	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTTCTACCATTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181469	22148214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_22148471_22149346_22149474_22151973_22152095_22160757_22160832_22172868_22172962_22181236
tx.7766	chr17	-	3295	6	NNC	ENSMUSG00000071267.12	novel	3265	6	NA	NA	-268	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	10	junction_5	29.1849276168367	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGTTGGACTTGGTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181713	22145943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_22148471_22149346_22149474_22151973_22152095_22160706_22160832_22172868_22172962_22181411
tx.7767	chr17	-	3217	6	NNC	ENSMUSG00000071267.12	novel	3265	6	NA	NA	2	-8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	15	junction_3	26.7776025812618	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAACAAGTTGGACTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181443	22145948	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_22148471_22149346_22149474_22151973_22152095_22160757_22160832_22172868_22173035_22181236
tx.7768	chr17	-	1020	6	FSM	ENSMUSG00000071267.12	ENSMUST00000091879.12	3265	6	-29	2274	-16	-1048	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_3	17.9041894538681	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGTTCTACCATTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181461	22148214	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_22148471_22149346_22149474_22151973_22152095_22160706_22160832_22172868_22173035_22181236
tx.7769	chr17	-	2505	3	FSM	ENSMUSG00000071267.12	ENSMUST00000126485.2	2481	3	-10	-14	-10	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_2	18	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAAAAAAACTAAGACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181455	22158711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_22160832_22172868_22173035_22181236
tx.777	chr1	+	878	3	ISM	ENSMUSG00000033952.15	ENSMUST00000199998.2	3982	15	-6	17002	-5	198	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_1	3.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTTAAAAGTACAAGATGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139382504	139385070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_139382943_139384477_139384622_139384774
tx.7770	chr17	+	1611	5	NNC	ENSMUSG00000053347.16	novel	1338	6	NA	NA	-12	18397	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	9.44722181384559	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGATTGTATAAGATCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181520	22231744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_22181801_22207011_22207083_22209759_22209887_22225286_22225364_22230688
tx.7771	chr17	+	829	3	FSM	ENSMUSG00000053347.16	ENSMUST00000153985.8	1598	3	6	763	6	-763	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	3	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAAGATCTGTTGGTTGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181545	22210262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_22181801_22207011_22207083_22209759
tx.7772	chr17	+	2743	4	FSM	ENSMUSG00000053347.16	ENSMUST00000055349.15	2741	4	-2	0	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	11	junction_3	5.73488351136175	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGGACTTGTTTGTTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22181530	22213347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_22181801_22207011_22207083_22209759_22209887_22211072
tx.7773	chr17	-	2744	4	NNC	ENSMUSG00000117234.2	novel	1756	2	NA	NA	-11433	618	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1.69967317119759	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGATCTTGGCTGTTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22300302	22285626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_22287883_22288751_22288879_22297569_22297618_22299989
tx.7774	chr17	-	2674	5	FSM	ENSMUSG00000063383.6	ENSMUST00000080249.6	2872	5	199	-1	199	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	1.11803398874989	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACTTGGCTGTTTCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22384972	22363338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_22365516_22366369_22366497_22369015_22369064_22382167_22382317_22384799
tx.7775	chr17	-	636	4	ISM	ENSMUSG00000063383.6	ENSMUST00000080249.6	2872	5	181	2909	181	-2909	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	23	junction_2	0.816496580927726	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGTTCTTTACTGTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22384990	22366248	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_22366497_22369015_22369064_22382167_22382317_22384799
tx.7776	chr17	-	358	4	NNC	ENSMUSG00000096433.3	novel	4882	5	NA	NA	17	-22696	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_2	13.2748718344933	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTCCCTGTAAGGCCTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22444580	22438941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_22439062_22439248_22439342_22442991_22443076_22444519
tx.7777	chr17	-	3207	6	FSM	ENSMUSG00000117284.2	ENSMUST00000233465.2	3474	6	0	267	0	-267	multi-exon	FALSE	canonical	2	21	junction_5	14.9853261559434	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTAACTCAAAGGAACATACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22533818	22505118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_22507883_22508749_22508877_22511388_22511437_22528485_22528579_22532217_22532302_22533727
tx.778	chr1	+	551	2	ISM	ENSMUSG00000033952.15	ENSMUST00000199998.2	3982	15	24	17452	22	-252	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	84	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTAATGTTTTAATCATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139382534	139384620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_139382943_139384477
tx.7784	chr17	+	958	7	FSM	ENSMUSG00000071266.14	ENSMUST00000120222.8	2926	7	-37	2005	0	-1154	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_4	20.6881608655772	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTGTGTGTTCTATCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22643202	22673665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_22643411_22647461_22647547_22663148_22663273_22665777_22665875_22670077_22670134_22672432_22672560_22673404
tx.7785	chr17	+	3043	5	NNC	ENSMUSG00000117055.3	novel	1733	2	NA	NA	-13376	1034	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	3.26917420765551	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCATCAGTTTTTAGTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22893324	22910475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_22893506_22905293_22905368_22906456_22906513_22906703_22906831_22907870
tx.7786	chr17	+	2363	4	NNC	ENSMUSG00000117055.3	novel	1733	2	NA	NA	-13383	421	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	10.2089285540757	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAGTACTGGACTACCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22893317	22909862	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_22893506_22906456_22906513_22906703_22906831_22907870
tx.7787	chr17	+	2824	3	NNC	ENSMUSG00000117055.3	novel	1733	2	NA	NA	-13291	1030	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAACTGCATCAGTTTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22893409	22910471	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_22893506_22906703_22906831_22907870
tx.7788	chr17	-	1880	4	NNC	ENSMUSG00000117183.2	novel	2370	2	NA	NA	-22982	-832	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	75	junction_3	5.43650214343336	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAATGCTTTACTGAAAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22958900	22933594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_22935000_22935788_22935916_22937255_22937339_22958635
tx.7789	chr17	-	745	5	FSM	ENSMUSG00000059142.17	ENSMUST00000088696.13	5683	5	-25	4963	4	-3415	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_3	9.36416040016402	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGATGAAGCTTTTCTCTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23086104	23071418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23071741_23076223_23076351_23080479_23080536_23084220_23084311_23085954
tx.779	chr1	+	767	3	ISM	ENSMUSG00000033952.15	ENSMUST00000053364.12	9867	28	36767	0	8016	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	129	junction_1	9.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTGTGTGTGTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	139419279	139421829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_139419433_139420444_139420615_139421385
tx.7790	chr17	+	240	2	Intergenic	novelGene_642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAAAAAAGTAAAATAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23095260	23097164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_23095412_23097075
tx.7792	chr17	-	2675	6	FSM	ENSMUSG00000071256.5	ENSMUST00000095606.5	2686	6	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_4	6.49923072370877	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGACTCTTTAGCTGGC	6695	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23783201	23775740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23777287_23778356_23778523_23778607_23778679_23778958_23779077_23780119_23780635_23782942
tx.7793	chr17	+	2812	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000071256.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_2	4	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTTAATATAACAATGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23776375	23782588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_23776518_23777629_23777728_23780016
tx.7796	chr17	+	2460	5	NIC	ENSMUSG00000023902.19	novel	2609	7	NA	NA	-20	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	18	junction_2	109.005733794145	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCCTGATTTTTTTACTTTT	859	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23819809	23829993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_23819934_23824478_23824939_23826553_23826619_23827081_23827140_23828240
tx.7797	chr17	-	1511	13	FSM	ENSMUSG00000041319.15	ENSMUST00000047436.11	1504	13	-7	0	-7	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	423	junction_10	38.5186643070603	111	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTTGCATTTTATTCCC	787	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23892823	23887591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23887861_23887949_23888085_23888169_23888281_23888364_23888428_23888500_23888551_23888820_23888924_23889009_23889082_23889166_23889216_23889296_23889335_23889422_23889527_23889614_23889680_23889765_23889882_23892487
tx.7798	chr17	-	1439	14	FSM	ENSMUSG00000041319.15	ENSMUST00000095579.11	1450	14	11	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_13	93.5049281997111	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTTTGCATTTTATTCCC	765	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23892845	23887591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23887861_23887949_23888085_23888169_23888281_23888364_23888428_23888500_23888551_23888820_23888924_23889009_23889082_23889166_23889216_23889296_23889335_23889422_23889527_23889614_23889680_23889765_23889882_23892487_23892714_23892807
tx.7799	chr17	+	596	3	ISM	ENSMUSG00000023904.11	ENSMUST00000179928.2	597	4	319	-53	319	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	343	junction_1	29	1768	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTTCTCAGCAGCCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23892919	23894201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_23893043_23893520_23893650_23893857
tx.78	chr1	-	1427	11	FSM	ENSMUSG00000041779.6	ENSMUST00000037998.6	6492	11	-7	5072	-7	2942	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	7.25534285888682	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCCCCTGAGCCGCCAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21149460	21071594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_21071860_21073193_21073358_21074061_21074206_21074449_21074555_21075790_21075862_21076373_21076459_21077076_21077136_21083016_21083134_21083625_21083736_21107620_21107685_21149217
tx.780	chr1	+	467	2	NNC	ENSMUSG00000052726.17	novel	362	3	NA	NA	-32	-46417	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCAAAGCAGCTGATACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140173863	140232608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_140174090_140232367
tx.7800	chr17	-	991	4	FSM	ENSMUSG00000023905.16	ENSMUST00000024698.10	984	4	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	6.34209919681348	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATATGGCCTGATCCCTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23896449	23894418	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23895021_23895112_23895248_23895492_23895598_23896300
tx.7801	chr17	+	1503	3	FSM	ENSMUSG00000023906.4	ENSMUST00000024699.4	1622	3	116	3	-7	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	4	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGTGTCTGATGTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23898338	23901417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_23898382_23898731_23898796_23900021
tx.7802	chr17	+	1524	2	FSM	ENSMUSG00000023906.4	ENSMUST00000233364.2	1078	2	35	-481	35	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAATGTGTCTGATGTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23898667	23901417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_23898796_23900021
tx.7803	chr17	-	1019	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000023906.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGGAGAGTCATGTTAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23901166	23899999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_23900821_23900968
tx.7804	chr17	-	535	6	FSM	ENSMUSG00000043747.13	ENSMUST00000177300.8	461	6	-74	0	-74	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.8	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGTTTGCCTCTGCATGCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23925387	23924031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23924210_23924502_23924545_23924766_23924845_23924971_23925032_23925121_23925152_23925240
tx.7805	chr17	+	1950	8	FSM	ENSMUSG00000023908.9	ENSMUST00000024701.9	2040	8	95	-5	-38	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	384	junction_2	52.6761379583211	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTTCTTGTCCCTTTATT	3033	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23945404	23955709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_23945616_23951310_23951799_23952796_23953291_23953939_23954047_23954173_23954347_23954536_23954695_23955297_23955376_23955468
tx.7806	chr17	+	1100	6	ISM	ENSMUSG00000023908.9	ENSMUST00000233954.2	2902	7	7505	-8	-753	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	419	junction_1	49.6765538257235	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTTCTTGTCCCTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23952947	23955709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_23953291_23953939_23954047_23954173_23954347_23954536_23954695_23955297_23955376_23955468
tx.7807	chr17	-	1567	3	FSM	ENSMUSG00000023909.5	ENSMUST00000233776.2	422	3	-12	-1133	-12	-550	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCTGCCACATGAGCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23959853	23955709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23956974_23957113_23957336_23959772
tx.7808	chr17	-	1042	4	ISM	ENSMUSG00000040680.10	ENSMUST00000046525.10	2123	10	3210	0	3210	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6	junction_1	2.16024689946929	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTTTAGCAAGTTCTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23961597	23960170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_23960946_23961170_23961250_23961330_23961457_23961535
tx.7809	chr17	-	1262	3	NIC	ENSMUSG00000040680.10	novel	2123	10	NA	NA	3213	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	7	junction_2	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGCTTTAGCAAGTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23961594	23960172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_23961250_23961330_23961457_23961535
tx.781	chr1	+	719	7	ISM	ENSMUSG00000052726.17	ENSMUST00000120796.8	3540	28	-82	233314	-45	25181	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.94405318873308	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTTCATGTCCACTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140173850	140304206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_140174090_140278945_140279026_140282191_140282292_140290686_140290736_140293262_140293323_140302845_140302921_140304090
tx.7810	chr17	-	3308	8	NIC	ENSMUSG00000040097.17	novel	2943	7	NA	NA	-35	-7	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	72	junction_1	24.7831410768016	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACAGAGCTGCTGTGTGTC	7570	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23990531	23971773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_23972838_23974627_23974919_23975520_23975785_23979177_23979442_23979580_23980091_23981139_23981569_23981949_23982293_23990388
tx.7811	chr17	-	635	2	ISM	ENSMUSG00000040097.17	ENSMUST00000227733.2	729	3	268	1616	268	-3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGTTGTGTGTTTGACTA	4945	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23975627	23974390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_23974919_23975520
tx.7812	chr17	-	616	2	ISM	ENSMUSG00000023911.13	ENSMUST00000024704.10	694	3	6024	-2	-266	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTAGTTTTTGTTGTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23999031	23995887	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_23996074_23998601
tx.7813	chr17	-	667	3	NNC	ENSMUSG00000023911.13	novel	694	3	NA	NA	-149	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_2	1	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTAGTTTTTGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24005204	23995889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_23996074_23998601_23999031_24005150
tx.7814	chr17	-	709	3	FSM	ENSMUSG00000023911.13	ENSMUST00000024704.10	694	3	-15	0	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTAGTTTTTGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24005070	23995889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_23996074_23998601_23999031_24004974
tx.7815	chr17	+	793	5	ISM	ENSMUSG00000039218.18	ENSMUST00000190686.7	8864	15	24	14707	-10	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	209	junction_1	15.9275704361965	530	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAGATAGAGGACGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24022184	24029003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_24022373_24025905_24026177_24027039_24027148_24027327_24027493_24028942
tx.7816	chr17	+	526	4	ISM	ENSMUSG00000039218.18	ENSMUST00000088621.11	8564	14	-14	14712	-14	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	102.568134536133	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGAAAGATAGAGGACGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24022180	24029003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_24022373_24027039_24027148_24027327_24027493_24028942
tx.7817	chr17	-	480	3	FSM	ENSMUSG00000055839.7	ENSMUST00000232702.2	581	3	104	-3	-104	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	11428	junction_1	404.5	4589	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGCATTTCTCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24047953	24043715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24043954_24046441_24046548_24047817
tx.7818	chr17	-	531	4	FSM	ENSMUSG00000055839.7	ENSMUST00000069579.7	537	4	2	4	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	7596	junction_3	2024.23060829431	13764	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTACTGCATTTCTCATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24048108	24043715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24043954_24046441_24046548_24047817_24047953_24048056
tx.7819	chr17	+	903	4	FSM	ENSMUSG00000024128.14	ENSMUST00000183252.8	1002	4	95	4	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.816496580927726	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAGCCTGAGTGGTCCTC	8807	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24160901	24164577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_24160981_24161353_24161475_24161585_24161692_24163980
tx.782	chr1	+	1070	8	NNC	ENSMUSG00000052726.17	novel	5790	27	NA	NA	-70	26153	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	4.10077145554495	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCTGCTGAGGTTCACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140173825	140305178	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_140174090_140278945_140279026_140282191_140282292_140290686_140290736_140293262_140293323_140302845_140302921_140304090_140304175_140304820
tx.7820	chr17	+	708	2	NNC	ENSMUSG00000024128.14	novel	920	4	NA	NA	1375	0	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGAGCCTGAGTGGTCCTC	418	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24162731	24164577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_24162843_24163980
tx.7822	chr17	+	1284	5	NNC	ENSMUSG00000050762.6	novel	1253	6	NA	NA	-23	12	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.93190525885234	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAGAAAAAAGAAAA	4508	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24257094	24264940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_24257336_24261752_24261939_24263233_24263506_24263832_24264003_24264525
tx.7823	chr17	-	1844	2	ISM	ENSMUSG00000016946.7	ENSMUST00000017090.6	2443	6	17432	-4	4264	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	997	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGCAACTGTGAATATCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24275027	24266703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_24268419_24274898
tx.7824	chr17	-	1894	3	ISM	ENSMUSG00000016946.7	ENSMUST00000017090.6	2443	6	15682	6	2514	-6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	997	junction_1	73.5	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGTGTTCAGCAACTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24276777	24266713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_24268419_24274898_24275025_24276714
tx.7825	chr17	-	1628	6	FSM	ENSMUSG00000016946.7	ENSMUST00000017090.6	2443	6	105	710	105	-710	multi-exon	FALSE	canonical	3	983	junction_3	66.4090355298133	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCATTTCCTTGTATAACTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24292354	24267417	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24268419_24274898_24275025_24276714_24276811_24278195_24278288_24279216_24279326_24292150
tx.7826	chr17	-	2020	4	ISM	ENSMUSG00000016946.7	ENSMUST00000017090.6	2443	6	14170	7	1002	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	983	junction_3	72.8209371601938	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACTGTGTTCAGCAACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24278289	24266714	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_24268419_24274898_24275025_24276714_24276811_24278195
tx.7827	chr17	-	1462	11	FSM	ENSMUSG00000036820.13	ENSMUST00000040735.12	1496	11	34	0	-2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	306	junction_8	20.5156038175824	235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGTCTGCGTCATGCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24382706	24374806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24375060_24375544_24375647_24376501_24376571_24376713_24376822_24376891_24377037_24377117_24377207_24377283_24377497_24377613_24377669_24381949_24382090_24382169_24382307_24382555
tx.7828	chr17	-	1161	3	FSM	ENSMUSG00000024121.14	ENSMUST00000024932.12	1183	3	23	-1	23	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1416	junction_2	838.5	2938	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGCTTGTGTTCTGGCGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24388412	24382838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24383583_24383672_24383857_24388179
tx.7829	chr17	-	2134	10	FSM	ENSMUSG00000024118.15	ENSMUST00000024930.8	2166	10	12	20	12	-20	multi-exon	FALSE	canonical	3	183	junction_7	23.2426810463471	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CCTTTTTTAAAAATTCAAAA	3349	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24439752	24434047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24434980_24435223_24435415_24436654_24436757_24436862_24436975_24437143_24437238_24438126_24438181_24438704_24439108_24439225_24439285_24439490_24439590_24439664
tx.783	chr1	-	1049	2	NNC	ENSMUSG00000102368.2	novel	553	4	NA	NA	-40	-68843	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCTGTTGTTGACCTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	140584182	140566756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_140567689_140584065
tx.7830	chr17	-	1564	9	NIC	ENSMUSG00000024118.15	novel	2166	10	NA	NA	6	-8	intron_retention	FALSE	canonical	3	24	junction_6	68.678599286823	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGCTGGAGAGATGGCTTG	3343	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24439758	24434220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_24434980_24435223_24435415_24436654_24436757_24436862_24436975_24437143_24437238_24438126_24438181_24439225_24439285_24439490_24439590_24439664
tx.7831	chr17	-	1256	2	ISM	ENSMUSG00000072082.8	ENSMUST00000115390.5	4133	17	26363	1032	5677	-1032	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	804	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTACTGTGCTTCAACTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24444020	24442203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_24443321_24443881
tx.7832	chr17	-	3068	17	FSM	ENSMUSG00000072082.8	ENSMUST00000115390.5	4133	17	33	1032	-29	-1032	multi-exon	FALSE	canonical	3	665	junction_16	77.1289504660863	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTACTGTGCTTCAACTGA	8708	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24470350	24442203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24443321_24443881_24444052_24445448_24445577_24445657_24445758_24449289_24449378_24450284_24450466_24450758_24450883_24453343_24453509_24456054_24456207_24458820_24458899_24459752_24459858_24460361_24460416_24461113_24461308_24462252_24462321_24463453_24463561_24468224_24468380_24470268
tx.7834	chr17	+	1043	5	ISM	ENSMUSG00000024130.17	ENSMUST00000136295.2	3139	11	-57	17000	-1	-1166	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	7.72576857018122	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGATAGTCAGTCCCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24571018	24585318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_24571226_24579861_24580064_24583450_24583561_24583666_24583932_24585059
tx.7835	chr17	+	1055	4	NNC	ENSMUSG00000024130.17	novel	1703	7	NA	NA	8	873	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	8.99382504215469	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTACCATTGTCTTGAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24571027	24580826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_24571226_24576892_24576966_24579861_24580064_24580244
tx.7836	chr17	+	1104	6	ISM	ENSMUSG00000024130.17	ENSMUST00000234109.2	1703	7	-16	1169	8	-1169	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	3.46410161513775	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGTATGATAGTCAGTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24571027	24585315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_24571226_24576892_24576966_24579861_24580064_24583450_24583561_24583666_24583932_24585059
tx.7837	chr17	-	1074	4	NIC	ENSMUSG00000073437.11	novel	1256	5	NA	NA	-5	5	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1.24721912892465	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGGAGGGAGAGGACGCAC	7311	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24633408	24628449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_24629146_24629231_24629328_24630898_24631058_24633285
tx.7838	chr17	+	1095	7	FSM	ENSMUSG00000024132.7	ENSMUST00000234304.2	1137	7	42	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	455	junction_1	41.5508390074403	819	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTTAGCTCTTGTGTTC	4882	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24645656	24658294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_24645717_24645826_24645914_24652106_24652235_24655151_24655299_24656193_24656316_24656405_24656585_24657922
tx.7839	chr17	+	1146	6	NIC	ENSMUSG00000024132.7	novel	1137	7	NA	NA	38	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	503	junction_1	25.350345165303	131	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTTAGCTCTTGTGTTC	4941	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24645715	24658294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_24645914_24652106_24652235_24655151_24655299_24656193_24656316_24656405_24656585_24657922
tx.784	chr1	-	2456	17	FSM	ENSMUSG00000026361.10	ENSMUST00000018337.9	11586	17	252	8878	-17	-1517	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_10	26.4054178862975	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGACTATGATTCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143578379	143483415	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_143484296_143485107_143485250_143491040_143491142_143493016_143493179_143503239_143503328_143503583_143503620_143510769_143510828_143543362_143543428_143545727_143545807_143547067_143547167_143553376_143553594_143561660_143561750_143567012_143567066_143567151_143567215_143571130_143571201_143574954_143575061_143578231
tx.7840	chr17	+	458	2	FSM	ENSMUSG00000024132.7	ENSMUST00000235124.2	499	2	141	-100	141	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	556	junction_1	0	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTCTTAGCTCTTGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24656498	24658294	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_24656585_24657922
tx.7841	chr17	-	2589	14	NIC	ENSMUSG00000024137.10	novel	2574	14	NA	NA	-13	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	73	junction_6	16.2546306556464	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCAGTTTGTTGTGATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24674302	24662757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_24663312_24663387_24663451_24663520_24663664_24663749_24663949_24664095_24664314_24664419_24664529_24664919_24665130_24665487_24665655_24665755_24665909_24666063_24666185_24666271_24666466_24668595_24668708_24670379_24670532_24674108
tx.7842	chr17	-	1417	2	FSM	ENSMUSG00000024137.10	ENSMUST00000226743.2	1377	2	-28	-12	-28	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAGATTTTTTTTTTTAA	7384	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24689193	24684419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24685707_24689063
tx.7843	chr17	+	1055	2	FSM	ENSMUSG00000043445.8	ENSMUST00000053024.8	2627	2	75	1497	32	-1249	multi-exon	FALSE	canonical	3	1130	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAGCTACCTAAATTAATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24689440	24690587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_24690124_24690215
tx.7844	chr17	-	3313	9	FSM	ENSMUSG00000024142.16	ENSMUST00000179163.3	3340	9	27	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_8	23.0813777751676	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTGAGGCCGATTGCTTTC	9614	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24698025	24692524	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24694926_24695019_24695184_24695298_24695424_24696154_24696308_24696403_24696480_24696836_24697000_24697084_24697137_24697293_24697433_24697985
tx.7845	chr17	-	3353	9	FSM	ENSMUSG00000024142.16	ENSMUST00000070888.14	3358	9	4	1	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_8	10.0374299499424	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGTGTGAGGCCGATTGCT	9591	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24698048	24692527	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24694926_24695019_24695184_24695298_24695424_24696154_24696308_24696403_24696480_24696836_24697000_24697084_24697137_24697293_24697453_24697985
tx.7846	chr17	+	295	2	FSM	ENSMUSG00000093565.2	ENSMUST00000176921.2	298	2	3	0	3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	77	junction_1	0	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGTTTCAGACGTTGTG	4767	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24747224	24747718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_24747411_24747609
tx.7847	chr17	-	1399	9	FSM	ENSMUSG00000079657.11	ENSMUST00000035797.16	1575	9	166	10	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_8	7.78520230951001	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTGTCATCTGTGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24752696	24748037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24748618_24748714_24748792_24748887_24748945_24749028_24749095_24749364_24749418_24749616_24749684_24749759_24749802_24751185_24751297_24752350
tx.7848	chr17	-	1757	7	NIC	ENSMUSG00000079657.11	novel	1658	8	NA	NA	-3	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	65	junction_6	8.12403840463596	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTTGTGTCATCTGTGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24752689	24748038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_24748618_24748714_24748945_24749028_24749418_24749616_24749684_24749759_24749802_24751185_24751297_24752350
tx.7849	chr17	+	1080	6	FSM	ENSMUSG00000041429.4	ENSMUST00000047611.4	1079	6	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	194	junction_2	26.3772629360971	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTCTTGGCCCGTTGGCTTC	908	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24851655	24857812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_24851829_24852900_24853140_24853698_24853870_24854561_24854722_24857397_24857504_24857581
tx.785	chr1	+	925	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000089640.2	novel	1069	1	NA	NA	243	421	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CCAAACAGGCCAAACAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143559210	143560457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_143559632_143559953
tx.7850	chr17	-	1241	2	ISM	ENSMUSG00000002504.16	ENSMUST00000019684.13	1717	6	4253	6	4220	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	161	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGAACTCTGGCGCCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24859711	24858265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_24859364_24859568
tx.7859	chr17	-	120	2	FSM	ENSMUSG00000090101.2	ENSMUST00000161706.2	183	2	63	0	63	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	215	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTATCGTATGTTGGTGTTT	4364	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24938876	24938504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24938582_24938833
tx.786	chr1	-	647	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018196.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTCAGTCTCAGTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143615277	143610453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_143611038_143615214
tx.7860	chr17	+	950	6	FSM	ENSMUSG00000044533.16	ENSMUST00000170715.8	998	6	47	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3280	junction_1	2855.80020309545	857	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTATGTTTTTTTTTGTCT	6237	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24939083	24940899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_24939107_24939246_24939427_24939507_24939706_24939942_24940277_24940596_24940689_24940776
tx.7861	chr17	+	1087	5	FSM	ENSMUSG00000044533.16	ENSMUST00000054289.13	1094	5	3	4	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	8303	junction_1	1140.19655651997	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATTATGTTTTTTTTTGTCT	6240	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24939086	24940899	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_24939427_24939507_24939706_24939942_24940277_24940596_24940689_24940776
tx.7862	chr17	-	673	4	FSM	ENSMUSG00000040048.15	ENSMUST00000045602.9	732	4	59	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2001	junction_1	127.206743357243	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGTGTTTCTGGTGACTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24943393	24941033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_24941195_24941354_24941495_24941628_24941768_24943160
tx.7864	chr17	+	1151	9	FSM	ENSMUSG00000024158.18	ENSMUST00000118788.8	1191	9	40	0	40	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	330	junction_6	27.6812210713328	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGCTTATGGACTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25069503	25083424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_25069643_25071704_25071881_25072605_25072671_25075611_25075730_25076489_25076599_25079919_25080024_25080286_25080389_25082650_25082731_25083166
tx.7866	chr17	-	1355	6	FSM	ENSMUSG00000039183.7	ENSMUST00000234597.2	1434	6	74	5	74	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	605	junction_4	61.1391854705311	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTGGTCAAGGTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25104814	25101590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_25102289_25102779_25102850_25103098_25103210_25103374_25103530_25104392_25104592_25104692
tx.7867	chr17	-	1413	7	FSM	ENSMUSG00000039183.7	ENSMUST00000044252.7	1427	7	9	5	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	605	junction_4	56.4111888034831	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGTGGTCAAGGTGTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25105313	25101590	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_25102289_25102779_25102850_25103098_25103210_25103374_25103530_25104392_25104592_25104692_25104812_25105252
tx.787	chr1	+	674	4	FSM	ENSMUSG00000018196.19	ENSMUST00000185362.7	3337	4	38	2625	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	459	junction_1	59.84981202978	3555	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCGATTGGCCAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143615332	143622514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_143615497_143617385_143617450_143620784_143620962_143622245
tx.7870	chr17	+	893	3	FSM	ENSMUSG00000038880.14	ENSMUST00000043907.14	918	3	25	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	645	junction_1	12	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTTGTGGTTTCATTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25114114	25115263	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_25114463_25114635_25114679_25114761
tx.7871	chr17	+	703	5	FSM	ENSMUSG00000073435.11	ENSMUST00000024978.7	715	5	-6	18	-6	-18	multi-exon	FALSE	canonical	3	182	junction_1	9.82344135219425	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGCGCTGGTGAAGTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25115467	25116478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_25115534_25115601_25115733_25115825_25115928_25116001_25116115_25116187
tx.7872	chr17	+	689	4	FSM	ENSMUSG00000073435.11	ENSMUST00000145688.8	484	4	56	-261	54	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	183	junction_3	9.17726659862414	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGCTGGTGAAGTTTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25115550	25116479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_25115733_25115825_25115928_25116001_25116115_25116187
tx.7874	chr17	-	2552	4	ISM	ENSMUSG00000024165.10	ENSMUST00000024981.9	2672	5	4521	0	4468	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	1697	junction_3	76.1051903617618	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGTGCCAATATTTTTCT	9294	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25175142	25161443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_25163653_25164553_25164603_25167611_25167755_25174991
tx.7875	chr17	-	2627	5	FSM	ENSMUSG00000024165.10	ENSMUST00000024981.9	2672	5	42	3	-2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1697	junction_3	70.6872513258225	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATCTGGTGCCAATATTTT	4815	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25179621	25161446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_25163653_25164553_25164603_25167611_25167755_25174991_25175141_25179541
tx.7878	chr17	+	886	2	FSM	ENSMUSG00000067722.5	ENSMUST00000088307.5	3030	2	18	2126	18	-2126	multi-exon	FALSE	canonical	3	314	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAATTTTCTCACCTCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25403545	25404510	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_25403615_25403693
tx.7879	chr17	-	1168	11	FSM	ENSMUSG00000035521.14	ENSMUST00000038973.7	1234	11	-20	86	-12	-86	multi-exon	FALSE	canonical	3	143	junction_3	15.4275727189989	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACTCCATGACTTCTGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25459110	25453376	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_25453697_25453781_25453864_25453953_25454086_25454155_25454239_25454318_25454434_25454507_25454602_25454678_25454763_25454829_25454885_25458748_25458817_25458887_25458946_25459033
tx.788	chr1	+	511	3	ISM	ENSMUSG00000018196.19	ENSMUST00000111957.10	580	4	2032	0	1272	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	576	junction_1	9	902	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCCCGATTGGCCAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143617384	143622514	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_143617450_143620784_143620962_143622245
tx.7881	chr17	+	1172	6	FSM	ENSMUSG00000015126.10	ENSMUST00000063574.7	1192	6	21	-1	21	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	375	junction_2	34.9685573050991	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTTGCTTTGTACGTGGC	4624	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25459164	25461773	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_25459339_25459417_25459638_25460037_25460232_25460661_25460836_25461132_25461197_25461427
tx.7883	chr17	-	1305	8	FSM	ENSMUSG00000015120.16	ENSMUST00000173084.8	1286	8	-14	-5	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_7	2152.45295286232	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTTGTTGCATTATCAT	4733	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25492371	25480889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_25481466_25483739_25483820_25484092_25484203_25487514_25487588_25488165_25488250_25488376_25488454_25491511_25491740_25492294
tx.7884	chr17	-	1091	7	FSM	ENSMUSG00000015120.16	ENSMUST00000174031.8	824	7	123	-390	-28	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4214	junction_6	321.557148886477	798	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTTGTTGCATTATCAT	4719	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25492385	25480889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_25481466_25483739_25483820_25484092_25484203_25487514_25487588_25488165_25488250_25488376_25488454_25492294
tx.7885	chr17	-	1128	7	NIC	ENSMUSG00000015120.16	novel	1138	7	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	247	junction_6	1729.90957535037	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTTGTTGCATTATCAT	4521	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25492583	25480889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_25481466_25483739_25483820_25484092_25484203_25487514_25487588_25488165_25488250_25488376_25488454_25492455
tx.7886	chr17	-	1145	7	FSM	ENSMUSG00000015120.16	ENSMUST00000173713.8	890	7	4	-259	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	206	junction_6	1745.07048568246	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTTTTGTTGCATTATCAT	3824	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25493280	25480889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_25481466_25483739_25483820_25484092_25484203_25487514_25487588_25488165_25488250_25488376_25488454_25493135
tx.789	chr1	+	1324	11	FSM	ENSMUSG00000018189.13	ENSMUST00000189936.7	1696	11	4	368	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	615	junction_8	216.947090323885	2617	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTAAACTCCATTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143653013	143682675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_143653215_143659703_143659768_143661867_143661974_143670014_143670141_143670220_143670283_143670417_143670549_143672499_143672564_143674128_143674232_143675658_143675773_143677872_143677972_143682421
tx.7890	chr17	+	1748	10	NNC	ENSMUSG00000002279.20	novel	1858	11	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	39.1949858219166	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGCTTCTCTACCTATACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25798150	25881697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_25798354_25804516_25804831_25831269_25831419_25850708_25850775_25864122_25864291_25873393_25873581_25874061_25874216_25874358_25874543_25874974_25875088_25881487
tx.79	chr1	+	840	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000100819.2	novel	571	5	NA	NA	-12519	-6200	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTGTACATTCTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21236692	21251451	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_21236776_21250694
tx.790	chr1	+	1321	11	FSM	ENSMUSG00000018189.13	ENSMUST00000018333.13	1845	11	-5	529	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	576	junction_8	227.497274708951	1860	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGCTAAACTCCATTCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	143653013	143682675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_143653215_143659703_143659768_143661867_143661974_143670014_143670141_143670220_143670283_143670417_143670549_143672499_143672564_143674128_143674232_143675661_143675773_143677872_143677972_143682421
tx.791	chr1	-	1688	14	NIC	ENSMUSG00000006010.15	novel	3273	14	NA	NA	-2	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	32	junction_12	29.9368170945323	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTTTAGTGCTATTGAAC	963	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150268501	150238272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_150238640_150239241_150239350_150247779_150247951_150250545_150250637_150251246_150251376_150256062_150256129_150257249_150257346_150258018_150258160_150258808_150258846_150260179_150260287_150262108_150262205_150264273_150264371_150265986_150266108_150268440
tx.7910	chr17	-	1265	4	FSM	ENSMUSG00000057411.10	ENSMUST00000235327.2	1267	4	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_3	24.4449494897321	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGACTTTTGTTTGTTCC	8394	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26011345	26009479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_26009753_26009906_26009958_26010319_26010461_26010545
tx.7911	chr17	-	906	5	FSM	ENSMUSG00000057411.10	ENSMUST00000072735.9	1321	5	410	5	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_4	48.7185796180472	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGACTTTTGTTTGTTCC	8377	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26011362	26009479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_26009753_26009906_26009958_26010319_26010461_26010545_26010651_26011026
tx.7912	chr17	-	1353	3	FSM	ENSMUSG00000057411.10	ENSMUST00000236842.2	1886	3	527	6	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	227	junction_2	3.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGACTTTTGTTTGTTCC	8391	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26011348	26009479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_26009753_26009906_26009958_26010319
tx.7913	chr17	-	637	5	FSM	ENSMUSG00000057411.10	ENSMUST00000236683.2	627	5	-10	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_4	82.996987897152	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTGACTTTTGTTTGTTCC	8368	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26011371	26009479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_26009753_26009906_26009958_26010319_26010461_26010545_26010651_26011304
tx.7916	chr17	-	1257	7	FSM	ENSMUSG00000039615.10	ENSMUST00000044911.10	1803	7	417	129	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1378	junction_3	85.5336191213724	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGCATGTGCTGGTGCAGT	6762	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26051918	26049607	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_26049985_26050075_26050193_26050282_26050340_26050517_26050606_26050769_26050936_26051019_26051219_26051665
tx.792	chr1	-	1728	14	FSM	ENSMUSG00000006010.15	ENSMUST00000111913.9	3273	14	330	1215	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_9	14.7515920312223	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTTTAGTGCTATTGAACCG	963	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150268501	150238270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_150238640_150239241_150239350_150247779_150247951_150250545_150250637_150251246_150251376_150256062_150256129_150257249_150257346_150258018_150258160_150258808_150258846_150260179_150260287_150262108_150262205_150264273_150264409_150265986_150266108_150268440
tx.7920	chr17	-	833	5	FSM	ENSMUSG00000025732.7	ENSMUST00000026828.7	842	5	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	256	junction_1	22.6770809408971	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCGGGTGTTGGTGATTG	7771	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26087729	26082671	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_26083014_26083224_26083327_26083567_26083696_26087387_26087518_26087598
tx.7922	chr17	+	808	6	FSM	ENSMUSG00000025731.17	ENSMUST00000026827.16	1243	6	429	6	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	287	junction_5	67.7542618585724	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATTGCTTGCTGGGAATACC	7197	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26094476	26096137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_26094701_26094933_26095097_26095193_26095254_26095468_26095537_26095634_26095714_26095923
tx.7927	chr17	-	881	5	FSM	ENSMUSG00000024177.10	ENSMUST00000025007.7	1006	5	125	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	296	junction_2	23.847169643377	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTCTACTTACTAGTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26314451	26310707	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_26311127_26312590_26312704_26312832_26312935_26313110_26313245_26314338
tx.7929	chr17	+	1037	5	FSM	ENSMUSG00000024181.10	ENSMUST00000025014.10	1068	5	31	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	613.108677152754	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGAGTCCTGTGAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26342504	26345587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_26342824_26343529_26343683_26344230_26344366_26344451_26344539_26345244
tx.793	chr1	+	791	6	NNC	ENSMUSG00000006005.19	novel	7480	51	NA	NA	-17	8494	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	212.194627641701	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAATGAAATTCTGGAACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150269117	150279740	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_150269410_150270949_150271055_150274350_150274425_150278005_150278103_150279348_150279457_150279625
tx.7938	chr17	+	1668	9	FSM	ENSMUSG00000024188.17	ENSMUST00000025023.15	1700	9	33	-1	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	393	junction_1	74.6521098161331	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATATGTTTACATTAGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26471902	26499694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_26472066_26474004_26474100_26476899_26476999_26485256_26485368_26486188_26486333_26494647_26494825_26496519_26496609_26498306_26498337_26498934
tx.794	chr1	+	243	2	ISM	ENSMUSG00000006005.19	ENSMUST00000130779.2	229	3	327	-142	327	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	790	junction_1	0	287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCACTGTTTTCTTCATTT	5520	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	150324948	150325684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_150324990_150325482
tx.7943	chr17	+	762	4	NNC	ENSMUSG00000015575.16	novel	823	4	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	381	junction_3	528.401993435553	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGCTCCAGTGTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26895388	26918621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_26895553_26901651_26901700_26914328_26914443_26918185
tx.7944	chr17	+	778	4	FSM	ENSMUSG00000015575.16	ENSMUST00000015719.16	823	4	45	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1134	junction_3	173.829418300432	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGCTCCAGTGTTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26895388	26918621	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_26895553_26901651_26901700_26914328_26914459_26918185
tx.795	chr1	-	969	2	Intergenic	novelGene_69	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTATAGGTGTATTAATGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151178912	151173864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_151174714_151178792
tx.7950	chr17	-	783	5	ISM	ENSMUSG00000024194.17	ENSMUST00000236623.2	622	6	86	-126	86	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	797	junction_3	67.913547985656	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTTCTCTGTGACATG	9516	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27158279	27156945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_27157151_27157391_27157442_27157545_27157592_27157700_27157761_27157857
tx.7951	chr17	-	700	6	ISM	ENSMUSG00000024194.17	ENSMUST00000025027.10	741	7	123	0	2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	511	junction_5	169.834507683215	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTTCTCTGTGACATG	9375	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27158420	27156945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_27157151_27157391_27157442_27157545_27157592_27157700_27157761_27157857_27158067_27158290
tx.7953	chr17	-	655	7	FSM	ENSMUSG00000024194.17	ENSMUST00000025027.10	741	7	86	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	300	junction_6	250.570959122472	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTTCTCTGTGACATG	9338	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27158457	27156945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_27157151_27157391_27157442_27157545_27157592_27157700_27157761_27157857_27158067_27158290_27158343_27158424
tx.7954	chr17	-	628	6	FSM	ENSMUSG00000024194.17	ENSMUST00000114935.9	662	6	35	-1	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	227	junction_5	278.895392575783	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTTTCTCTGTGACATG	9313	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27158482	27156945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_27157151_27157391_27157442_27157545_27157592_27157700_27157761_27157857_27158067_27158424
tx.7955	chr17	+	410	2	FSM	ENSMUSG00000048731.16	ENSMUST00000142141.3	451	2	41	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCGTAGCGCCGGTTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27237001	27241491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_27237145_27241224
tx.7957	chr17	-	1972	6	FSM	ENSMUSG00000057789.15	ENSMUST00000078691.12	2387	6	413	2	-9	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	126	junction_3	5.45527267879434	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACCTCGCCTGGCATCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27247570	27238785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_27240010_27240140_27240322_27241412_27241557_27241715_27241852_27244766_27244868_27247384
tx.7958	chr17	+	740	4	ISM	ENSMUSG00000048731.16	ENSMUST00000154731.3	1108	5	2130	0	-325	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_1	7.84573486395988	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCTGGGCTGTCTGTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27251507	27255351	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_27251632_27251734_27251946_27253738_27253879_27255086
tx.796	chr1	+	578	3	Intergenic	novelGene_70	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTGCCTCTGTCTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151186463	151188348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_151186568_151187427_151187504_151187950
tx.7961	chr17	-	481	4	FSM	ENSMUSG00000024208.17	ENSMUST00000025045.15	500	4	14	5	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	2713	junction_1	153.559977424675	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTCCTGGTTTGGAACTCA	1961	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27352876	27341641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_27341815_27344120_27344191_27344857_27344933_27352713
tx.797	chr1	-	339	2	NNC	ENSMUSG00000100954.6	novel	475	2	NA	NA	-259	-1159	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTATCGGTGTGCCATAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151220092	151219643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_151219955_151220064
tx.7974	chr17	+	1629	5	FSM	ENSMUSG00000046711.17	ENSMUST00000232265.2	1681	5	49	3	8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3635	junction_2	873.596123789477	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTGGTGTAAGGAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27775596	27782645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_27775686_27778506_27778678_27779901_27779986_27780434_27780486_27781411
tx.7975	chr17	+	1592	5	FSM	ENSMUSG00000046711.17	ENSMUST00000114888.11	1631	5	42	-3	-5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2165	junction_2	1373.00680533638	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTGGTGTAAGGAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27775600	27782645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_27775686_27778506_27778645_27779901_27779986_27780434_27780486_27781411
tx.7976	chr17	+	1606	5	FSM	ENSMUSG00000046711.17	ENSMUST00000232552.2	917	5	10	-699	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1035	junction_1	1979.76797882984	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTGGTGTAAGGAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27775624	27782645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_27775724_27778506_27778645_27779901_27779986_27780434_27780486_27781411
tx.7977	chr17	+	1639	5	FSM	ENSMUSG00000046711.17	ENSMUST00000119486.9	1030	5	37	-646	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1035	junction_1	1821.9597964829	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTGGTGTAAGGAGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27775624	27782645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_27775724_27778506_27778678_27779901_27779986_27780434_27780486_27781411
tx.7979	chr17	-	631	5	FSM	ENSMUSG00000062753.15	ENSMUST00000154473.9	862	5	35	196	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	219	junction_4	17.0934929139717	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCCTCCTTGGGTGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27784695	27782742	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_27782991_27783122_27783229_27783358_27783385_27783535_27783725_27784633
tx.798	chr1	+	3315	15	FSM	ENSMUSG00000023150.15	ENSMUST00000023918.13	3511	15	47	149	6	-142	multi-exon	TRUE	canonical	3	1145	junction_2	98.7764172879585	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGTTCAGCTTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151220274	151240024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_151220507_151225126_151225355_151226731_151226861_151227304_151227475_151227580_151227657_151229670_151229845_151230384_151230511_151231879_151231988_151235372_151235503_151235703_151235929_151236468_151236591_151236682_151236810_151236893_151237026_151237212_151237387_151238862
tx.7982	chr17	-	579	6	FSM	ENSMUSG00000052146.17	ENSMUST00000114882.9	887	6	304	4	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4719	junction_5	828.025700084243	6004	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCACTTGTGTATGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27854215	27849395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_27849481_27850173_27850230_27851252_27851331_27853045_27853218_27853299_27853450_27854177
tx.7983	chr17	+	400	2	FSM	ENSMUSG00000087387.3	ENSMUST00000133274.3	388	2	-14	2	-14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGACTCTGCTCTCCTTTG	6326	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27854302	27855840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_27854406_27855543
tx.7984	chr17	+	1431	8	ISM	ENSMUSG00000040276.16	ENSMUST00000097360.3	1800	10	17499	-31	-1761	-2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	26	junction_1	11.2866184086307	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGACAGCGTTTGCAGCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27921669	27927664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_27921831_27923818_27924055_27924598_27924755_27924890_27925067_27925967_27926089_27926192_27926321_27926853_27927042_27927399
tx.7985	chr17	-	3165	3	ISM	ENSMUSG00000056692.14	ENSMUST00000114863.10	3892	5	34469	11	34296	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_2	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCCGCCTTTATCCTGTGTG	3436	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28005130	27970219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_27972970_27986884_27987214_28005044
tx.7986	chr17	-	584	3	ISM	ENSMUSG00000056692.14	ENSMUST00000114859.9	3573	5	34386	2356	34296	-325	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	16	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAGGTTGTAGTTTTGAGCA	3436	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28005130	27972575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_27972970_27987109_27987214_28005044
tx.7988	chr17	+	749	6	FSM	ENSMUSG00000024217.11	ENSMUST00000071006.9	758	6	12	-3	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1664	junction_1	167.935225607971	6347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGTGTCCCTGTCCCTTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28059072	28070942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_28059144_28059437_28059481_28061243_28061353_28064156_28064247_28066926_28067032_28070611
tx.7989	chr17	+	1417	7	ISM	ENSMUSG00000039512.13	ENSMUST00000114849.3	8634	21	33582	3693	-82	-875	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_1	9.63788819653397	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGTGTCCTGCGTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28108996	28115322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_28109171_28112114_28112267_28112352_28112504_28113520_28113784_28114243_28114353_28114433_28114535_28114855
tx.799	chr1	+	464	2	ISM	ENSMUSG00000023150.15	ENSMUST00000111887.10	2783	8	11	7196	2	-7196	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1410	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTGAATATTCTGCATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151220270	151225354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_151220507_151225126
tx.7990	chr17	-	683	2	FSM	ENSMUSG00000024218.14	ENSMUST00000233106.2	1478	2	793	2	725	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACAGGGTTTCTCTGTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28121520	28120099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_28120764_28121501
tx.7991	chr17	-	1242	5	FSM	ENSMUSG00000024218.14	ENSMUST00000025057.5	1220	5	-20	-2	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	141	junction_3	9.9373034571759	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACAGGGTTTCTCTGTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28126718	28120099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_28120764_28121501_28121599_28122074_28122163_28124235_28124385_28126474
tx.7992	chr17	+	2592	14	FSM	ENSMUSG00000024220.15	ENSMUST00000073534.10	2864	14	272	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_10	10.6092512939298	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGGCTCCTCCATCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28396374	28424860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_28396500_28408770_28408927_28413939_28414021_28414121_28414200_28416747_28416948_28419084_28419202_28419412_28419489_28419981_28420108_28420234_28420415_28421088_28421323_28421408_28421573_28422059_28422225_28423428_28423543_28424084
tx.7993	chr17	+	2040	10	ISM	ENSMUSG00000002257.9	ENSMUST00000002327.6	2277	11	9256	7	1	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	110	junction_1	15.2542242682049	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCACTGCTCCTGCCCTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28436007	28447575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_28436080_28436574_28436761_28438718_28438956_28439050_28439198_28442645_28442755_28442861_28443161_28444818_28444986_28445074_28445274_28446780_28446872_28447042
tx.7996	chr17	-	480	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000002250.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTTGCTTTGCTTGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28518020	28515943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_28516116_28517712
tx.7997	chr17	+	717	6	FSM	ENSMUSG00000037805.16	ENSMUST00000042334.16	830	6	112	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5482	junction_4	1458.64553610533	6690	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGTGTGCCTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28547556	28550006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_28547593_28547784_28547860_28547940_28548022_28548347_28548497_28549498_28549672_28549803
tx.7998	chr17	+	950	6	FSM	ENSMUSG00000037805.16	ENSMUST00000129935.8	949	6	-1	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	728	junction_3	2914.49848859113	1708	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGTGTGCCTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28547556	28550006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_28547593_28547784_28547860_28547940_28548255_28548347_28548497_28549498_28549672_28549803
tx.7999	chr17	+	1043	5	FSM	ENSMUSG00000037805.16	ENSMUST00000150103.3	1022	5	-17	-4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5482	junction_3	1550.72344004339	346	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGTGTGCCTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28547556	28550006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_28547593_28547784_28547860_28547940_28548497_28549498_28549672_28549803
tx.8	chr1	+	2587	10	NNC	ENSMUSG00000033813.16	novel	2547	10	NA	NA	-33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	595.509678995881	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTTTTTGTCTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4928003	4968132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_4928200_4937692_4937756_4948249_4948356_4956966_4957055_4959679_4959826_4960962_4961029_4962143_4962293_4963639_4963787_4965156_4965229_4966578
tx.80	chr1	+	660	2	NNC	ENSMUSG00000100819.2	novel	571	5	NA	NA	-12538	440	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	40	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTGTTCCTTCAAGTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21236673	21258091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_21236776_21257533
tx.800	chr1	+	2354	9	ISM	ENSMUSG00000023150.15	ENSMUST00000023918.13	3511	15	10254	4	-6516	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1216	junction_1	78.3014008495378	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTTGCACTGTGGGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151230481	151240169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_151230511_151231879_151231988_151235372_151235503_151235703_151235929_151236468_151236591_151236682_151236810_151236893_151237026_151237212_151237387_151238862
tx.8000	chr1	-	457	1	FSM	ENSMUSG00000084416.4	ENSMUST00000120360.2	654	1	227	-30	227	30	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1029	0	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65033536	65033079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_65033100_65033500
tx.8002	chr17	-	2936	7	NIC	ENSMUSG00000024222.18	novel	3858	14	NA	NA	10	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	57	junction_6	192.900377282046	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTCATTGTTCATGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28637491	28618070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_28620126_28621582_28621823_28625058_28625245_28629483_28629568_28631007_28631099_28634842_28635000_28637368
tx.8003	chr17	-	2907	7	NNC	ENSMUSG00000024222.18	novel	1414	7	NA	NA	-10	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_6	204.007080487146	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTTTTCATTGTTCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28637511	28618073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_28620126_28621582_28621823_28625058_28625245_28629483_28629568_28631007_28631099_28634842_28635000_28637414
tx.8004	chr17	-	568	2	FSM	ENSMUSG00000097714.2	ENSMUST00000180802.2	671	2	-30	133	-30	-133	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTAGGGACTGTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28742152	28741487	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_28741738_28741834
tx.8005	chr17	+	359	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000066170.8	novel	2679	1	NA	NA	-43	-687	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGATGGTGGACATGGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28742223	28743634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_+_28742341_28743392
tx.8006	chr17	-	2077	2	Intergenic	novelGene_644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	10	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCAGTGTTGTCGCTCTTTC	7617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28762658	28760150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_28760443_28760873
tx.8007	chr17	-	732	3	Intergenic	novelGene_645	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCAGTGTTGTCGCTCTTTC	7617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28762658	28760150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_28760443_28760873_28761101_28762445
tx.8008	chr17	-	500	4	NNC	ENSMUSG00000024225.6	novel	611	3	NA	NA	-8044	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	1.63299316185545	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCGTCTCTGCCTGTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28787784	28777186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_28777415_28777734_28777858_28779544_28779662_28787752
tx.8009	chr17	+	1150	4	FSM	ENSMUSG00000062252.10	ENSMUST00000080780.8	1313	4	81	82	-26	-82	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.24721912892465	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGTATAATTTCTTTATC	8645	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28794707	28802485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_28795387_28798904_28799142_28801953_28802000_28802297
tx.801	chr1	+	1727	4	ISM	ENSMUSG00000023150.15	ENSMUST00000097543.8	3337	14	16426	-2	-303	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1382	junction_2	23.7627158941622	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATCCTTGCACTGTGGGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151236694	151240168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_151236810_151236893_151237026_151237212_151237387_151238862
tx.8010	chr17	-	2488	16	FSM	ENSMUSG00000004865.17	ENSMUST00000130643.9	4653	16	223	1942	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	554	junction_1	86.150875406657	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTGGTTTCTATGCTCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28841460	28808563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_28809216_28810174_28810268_28811191_28811262_28813143_28813252_28817875_28817977_28818444_28818844_28819216_28819431_28819842_28819869_28821661_28821828_28822411_28822519_28824272_28824361_28825280_28825369_28826057_28826167_28827619_28827739_28840950_28841012_28841373
tx.8011	chr17	-	1074	10	ISM	ENSMUSG00000004865.17	ENSMUST00000233440.2	4804	15	0	12587	0	101	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	656	junction_9	88.918328458212	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCATTGCAGCAGTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28841461	28819208	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_28819431_28819842_28819869_28821661_28821828_28822411_28822519_28824272_28824361_28825280_28825369_28826057_28826167_28827619_28827739_28840950_28841012_28841373
tx.8012	chr17	+	1383	12	FSM	ENSMUSG00000004864.14	ENSMUST00000233984.2	2937	12	24	1530	-15	199	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_6	12.7227264607489	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTCAATGCCCCTTTTCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28988294	28997677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_28988503_28988984_28989115_28990131_28990191_28994227_28994337_28994527_28994558_28995108_28995157_28995275_28995391_28995475_28995548_28996455_28996536_28996696_28996776_28997050_28997228_28997401
tx.8013	chr17	+	1334	2	Intergenic	novelGene_646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAATAATCAAACAAATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29004394	29017920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_29004515_29016706
tx.8014	chr17	+	2322	2	NNC	ENSMUSG00000063952.17	novel	4046	9	NA	NA	-15677	1814	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	175	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAGAAAAAAGAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29004386	29027096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_29004515_29024902
tx.8016	chr17	-	979	2	ISM	ENSMUSG00000048905.6	ENSMUST00000062357.6	4597	12	15612	1783	5988	-1783	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCCAGTTAATTATTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29118686	29117148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_29117898_29118456
tx.8017	chr17	-	1018	3	FSM	ENSMUSG00000045378.6	ENSMUST00000051526.6	1019	3	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTCCTCTGTGTGTCTCTTTT	6214	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29161237	29152957	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29153781_29160215_29160344_29161170
tx.8018	chr17	+	2221	7	FSM	ENSMUSG00000005936.20	ENSMUST00000118762.9	3853	7	34	1598	4	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	347	junction_1	75.1962247870345	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAACAAGTGTGCTCTTAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29171429	29186925	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29171544_29180387_29180662_29181783_29181887_29182224_29182346_29182934_29183133_29183947_29184059_29185625
tx.8019	chr17	+	2394	8	FSM	ENSMUSG00000005936.20	ENSMUST00000233197.2	4196	8	202	1600	0	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_2	164.609370626217	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAACAAGTGTGCTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29171433	29186923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29171544_29176852_29177032_29180387_29180662_29181783_29181887_29182224_29182346_29182934_29183133_29183947_29184059_29185625
tx.802	chr1	+	1247	2	ISM	ENSMUSG00000023150.15	ENSMUST00000097543.8	3337	14	17029	146	300	-146	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1437	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGTGTTTTGTTCAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151237297	151240020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_151237387_151238862
tx.8020	chr17	+	2088	6	ISM	ENSMUSG00000005936.20	ENSMUST00000168507.2	2400	8	8197	6	8197	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	466	junction_4	47.1788088022578	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTCTCTCCAGTATTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29180386	29186905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_29180662_29181783_29181887_29182224_29182346_29182934_29183133_29183947_29184059_29185625
tx.8021	chr17	-	3311	14	FSM	ENSMUSG00000024006.18	ENSMUST00000119274.3	3354	14	38	5	1	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_13	173.563487011723	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGAACTGTGGTGGATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29226931	29189858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29191651_29192018_29192114_29193255_29193352_29193519_29193644_29194792_29194911_29196513_29196576_29198176_29198280_29201005_29201161_29203050_29203175_29207151_29207236_29210271_29210395_29211390_29211443_29218982_29219119_29226684
tx.8022	chr17	-	3304	14	FSM	ENSMUSG00000024006.18	ENSMUST00000009138.13	3351	14	42	5	-2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	678	junction_3	53.1740471465247	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCGAACTGTGGTGGATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29226927	29189858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29191651_29192018_29192114_29193255_29193352_29193519_29193644_29194792_29194911_29196513_29196576_29198176_29198280_29201005_29201161_29203050_29203175_29207151_29207236_29210271_29210395_29211390_29211443_29218982_29219116_29226684
tx.8023	chr17	-	678	4	FSM	ENSMUSG00000024006.18	ENSMUST00000232723.2	627	4	-53	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	701	junction_1	11.2644968324772	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATAGACATGTTCACTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29226939	29210156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29210395_29211390_29211443_29218982_29219116_29226684
tx.8024	chr17	-	569	4	ISM	ENSMUSG00000024006.18	ENSMUST00000232724.2	1298	8	12	11129	-2	-102	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	151	junction_3	265.612918025879	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCCAGAAATTCAAAGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29226927	29210256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_29210395_29211390_29211443_29218982_29219119_29226684
tx.8025	chr17	+	1442	6	FSM	ENSMUSG00000071172.14	ENSMUST00000130216.3	2618	6	45	1131	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1420	junction_1	257.831728070849	14184	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTAGTAGTCAGTCGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29251646	29261216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29251761_29255214_29255423_29257463_29257599_29259748_29259788_29260180_29260268_29260357
tx.8026	chr17	+	1447	5	NNC	ENSMUSG00000071172.14	novel	2618	6	NA	NA	0	8	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	858.014677904755	655	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTCAGTCGAGCGAACCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29251646	29261225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_29251761_29255214_29255423_29257463_29257634_29260180_29260268_29260357
tx.8027	chr17	-	1466	2	FSM	ENSMUSG00000085912.3	ENSMUST00000233478.2	1437	2	-32	3	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACGTAGCTCCATCATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29291805	29278027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29279333_29291644
tx.8028	chr17	-	678	2	FSM	ENSMUSG00000085912.3	ENSMUST00000233135.2	1433	2	4	751	4	-340	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTGCCCGGGTCAACTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29291817	29278778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29279333_29291693
tx.8029	chr17	-	767	2	FSM	ENSMUSG00000085912.3	ENSMUST00000133221.3	3218	2	70	2381	70	-346	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGAACCTTGCCCGGGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29298083	29278784	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29279333_29297864
tx.803	chr1	-	3605	20	FSM	ENSMUSG00000052748.15	ENSMUST00000064771.12	3688	20	84	-1	65	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_7	20.5845328266092	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGCTTTTCCGTTTACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151304122	151243448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_151244340_151246329_151246395_151248058_151248126_151255133_151255266_151260067_151260256_151264370_151264520_151267186_151267326_151270359_151270524_151272956_151273103_151276830_151276925_151278705_151278895_151279545_151279648_151281166_151281297_151283326_151283387_151286521_151287210_151288541_151288598_151295850_151295935_151297784_151297872_151299257_151299357_151304047
tx.8030	chr17	-	434	3	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117050.2	novel	1046	1	NA	NA	806	5274	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTGGACATGGTGTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29312629	29307115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_-_29307256_29309777_29309926_29312483
tx.8031	chr17	+	1939	3	FSM	ENSMUSG00000023067.15	ENSMUST00000119901.9	922	3	4	-1021	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	83	junction_1	538	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAATGTCTTGTCATTAGA	1861	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29309956	29319696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29310076_29317370_29317812_29318317
tx.8032	chr17	+	1910	3	FSM	ENSMUSG00000023067.15	ENSMUST00000023829.8	1913	3	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1159	junction_2	73.5	2319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAATGTCTTGTCATTAGA	4650	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29312745	29319696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29312836_29317370_29317812_29318317
tx.8033	chr17	+	1820	2	FSM	ENSMUSG00000023067.15	ENSMUST00000122348.3	1172	2	495	-1143	495	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1159	junction_1	0	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTATAATGTCTTGTCATTA	9273	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29317368	29319694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29317812_29318317
tx.8034	chr17	-	1815	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000023067.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAACACAAGAAGGACCCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29319694	29317368	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_29317805_29318315
tx.8035	chr17	+	1078	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024008.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCAGTCTCTAAGTCGACAG	2240	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29378506	29384332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_29378790_29383537
tx.8036	chr17	-	1210	4	FSM	ENSMUSG00000024007.16	ENSMUST00000024802.10	1462	4	227	25	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1356	junction_1	125.889722464633	1737	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGTGGTCTAGTATTGTT	9916	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29482933	29469801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29470700_29471223_29471293_29480710_29480866_29482845
tx.8037	chr17	+	1309	9	FSM	ENSMUSG00000052712.18	ENSMUST00000064709.13	2812	9	138	1365	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	208	junction_1	54.6168472176855	287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCATGGGTTGGTTGCTTAG	449	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29487899	29520499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29487977_29496830_29496922_29501033_29501242_29501651_29501866_29512980_29513136_29513248_29513389_29515533_29515664_29517615_29517740_29520329
tx.8038	chr17	+	1236	8	ISM	ENSMUSG00000052712.18	ENSMUST00000149405.4	1435	9	3778	4	1171	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	287	junction_3	36.8936696079809	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCATGGGTTGGTTGCTTAG	1180	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29496826	29520499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_29496922_29501033_29501242_29501651_29501866_29512980_29513136_29513248_29513389_29515533_29515664_29517615_29517740_29520329
tx.8039	chr17	-	933	5	FSM	ENSMUSG00000024012.19	ENSMUST00000235118.2	1867	5	934	0	934	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	492	junction_4	304.221444839117	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTCTGTGCAAGCCTCTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29555178	29551049	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29551753_29552487_29552564_29552748_29552817_29552931_29552980_29555140
tx.804	chr1	-	721	6	ISM	ENSMUSG00000052748.15	ENSMUST00000111883.9	2855	19	51	42789	51	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	144	junction_1	12.983065893694	167	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAATAAAGACAGTTCTGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151304136	151286903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_151287210_151288541_151288598_151295850_151295935_151297784_151297872_151299257_151299357_151304047
tx.8040	chr17	-	629	2	FSM	ENSMUSG00000097125.3	ENSMUST00000235107.2	1161	2	-144	676	-144	45	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGGTAGCAGGTCTCAGGC	7976	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29683273	29682268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29682631_29683006
tx.8041	chr17	+	2285	5	FSM	ENSMUSG00000024014.9	ENSMUST00000234294.2	1578	5	-44	-663	-44	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1677	junction_3	119.340636415263	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACCTTTGAGTTTTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29710234	29715082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29710406_29710493_29710545_29710638_29711006_29712695_29712873_29713563
tx.8042	chr17	+	2053	3	ISM	ENSMUSG00000024014.9	ENSMUST00000024811.9	2698	6	925	1	373	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1677	junction_1	101	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTGAGTTTTCCATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29710651	29715085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_29711006_29712695_29712873_29713563
tx.8043	chr17	+	1700	2	FSM	ENSMUSG00000024014.9	ENSMUST00000234270.2	867	2	314	-1147	314	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1879	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTGAGTTTTCCATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29712694	29715085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29712873_29713563
tx.8044	chr17	+	1974	9	NNC	ENSMUSG00000042203.9	novel	3595	13	NA	NA	0	-22088	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_8	44.8857925740428	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCATATGTATTTATGTATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29768758	29803780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_29768969_29783405_29783463_29787365_29787674_29789560_29789741_29790638_29790710_29791943_29792073_29794129_29794196_29797802_29797918_29802942
tx.8045	chr17	+	484	2	NNC	ENSMUSG00000099329.3	novel	902	7	NA	NA	-9	-128950	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	40	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTAAGTTTTGTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29768763	29772036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_29768969_29771757
tx.8046	chr17	+	1989	8	FSM	ENSMUSG00000090083.12	ENSMUST00000024817.15	5404	8	80	3335	6	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	261	junction_5	10.0387006232919	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCAGCTGGGCTTCGGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29833843	29860630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29834053_29840482_29840612_29845479_29846224_29847933_29847997_29850644_29850735_29853634_29853743_29854791_29854997_29860189
tx.8047	chr17	+	1058	6	ISM	ENSMUSG00000090083.12	ENSMUST00000234362.2	1780	9	12126	-2	-1542	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	261	junction_3	9.32952303175248	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTCAGCTGGGCTTCGG	3891	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29846067	29860625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_29846224_29847933_29847997_29850644_29850735_29853634_29853743_29854791_29854997_29860189
tx.8048	chr17	+	546	4	ISM	ENSMUSG00000024019.19	ENSMUST00000235031.2	1271	10	11	14152	4	96	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	432	junction_2	6.53197264742181	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGCTTCGATCAGGAGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29879598	29895216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_29879746_29882145_29882281_29893112_29893265_29895104
tx.8049	chr17	+	3721	24	FSM	ENSMUSG00000024019.19	ENSMUST00000024816.13	6380	24	39	2620	13	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	368	junction_15	33.7979652859003	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTGGCTCTGTGCTGGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29879607	29922333	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_29879746_29882145_29882281_29893112_29893265_29895104_29895264_29897963_29898057_29899562_29899635_29900891_29900987_29901095_29901169_29904824_29905024_29906009_29906129_29908868_29908966_29909281_29909415_29910218_29910399_29913221_29913279_29913758_29913817_29914399_29914469_29916057_29916190_29916922_29917046_29917611_29917704_29918193_29918263_29919207_29919256_29919944_29920058_29920458_29920568_29921127
tx.805	chr1	+	1609	3	FSM	ENSMUSG00000053286.12	ENSMUST00000185230.7	1527	3	-66	-16	-36	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_2	4.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGACAAAAGCCCCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151304351	151312474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_151304854_151309544_151309656_151311478
tx.8051	chr17	-	426	4	FSM	ENSMUSG00000024018.19	ENSMUST00000128751.3	1397	4	30	941	-5	140	multi-exon	FALSE	canonical	3	251	junction_3	23.9072281027215	377	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTATTTCCTGCTGACAAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29935988	29923246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_29923444_29924244_29924298_29924462_29924558_29935907
tx.8052	chr17	-	383	2	Intergenic	novelGene_647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGGAAGGATATTGGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29992468	29985017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_29985322_29992389
tx.8053	chr17	-	1524	9	FSM	ENSMUSG00000043557.17	ENSMUST00000165528.8	1477	9	-46	-1	-46	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_8	2.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGCCAGCACCTTCTTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30061441	30051028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_30051374_30051886_30051996_30052195_30052327_30056965_30057101_30057410_30057564_30058522_30058547_30058778_30058957_30059770_30059871_30061092
tx.8054	chr17	+	981	6	FSM	ENSMUSG00000044477.13	ENSMUST00000226208.3	3039	6	445	1613	24	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	90	junction_1	13.1301180497359	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTTTTGAGCATGGCTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30224151	30427383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_30224283_30279783_30279825_30354296_30354480_30372276_30372343_30411536_30411705_30426991
tx.8056	chr17	+	628	3	ISM	ENSMUSG00000044477.13	ENSMUST00000234902.2	2289	4	17113	1609	17113	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	114	junction_2	3.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTGAGCATGGCTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30372276	30427385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_30372343_30411536_30411705_30426991
tx.8058	chr17	-	1296	6	FSM	ENSMUSG00000062202.15	ENSMUST00000236910.2	1375	6	0	79	0	-79	multi-exon	FALSE	canonical	3	100	junction_1	4.24264068711928	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGTGCTCACCGTAACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30795233	30732528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_30732650_30736077_30736298_30743686_30743952_30746275_30746640_30749127_30749340_30795119
tx.8059	chr17	-	863	7	FSM	ENSMUSG00000024026.14	ENSMUST00000167624.2	895	7	37	-5	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	704	junction_1	947.318613537998	1132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCTGGGCAGCAAGTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30831596	30811834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_30812049_30813088_30813201_30815347_30815438_30816778_30816847_30819012_30819154_30822993_30823077_30831441
tx.806	chr1	+	2654	15	FSM	ENSMUSG00000053286.12	ENSMUST00000065625.12	2749	15	95	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_10	24.5323609686038	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTGACTGGGCTCGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151304387	151333912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_151304854_151309544_151309656_151311478_151311593_151315266_151315332_151316556_151316687_151318337_151318462_151318997_151319078_151324004_151324249_151325650_151325864_151327798_151327990_151328827_151328907_151329635_151329803_151330728_151330792_151333213_151333341_151333432
tx.8060	chr17	-	961	6	FSM	ENSMUSG00000024026.14	ENSMUST00000236335.2	9865	6	37	8867	-10	63	multi-exon	FALSE	canonical	3	2881	junction_3	241.0424029087	2772	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGATTCATCATTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30831596	30812776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_30813201_30815347_30815438_30816778_30816847_30819012_30819154_30822993_30823077_30831441
tx.8061	chr17	-	370	2	ISM	ENSMUSG00000099474.2	ENSMUST00000188852.2	845	4	2582	8	2582	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	432	junction_1	0	483	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGACCGAATTCTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30843297	30841422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_30841669_30843173
tx.8062	chr17	-	1239	2	ISM	ENSMUSG00000099474.2	ENSMUST00000188852.2	845	4	1720	1239	1720	-1239	internal_fragment	FALSE	canonical	3	280	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AATAAAGAAAATATCTAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30844159	30842653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_30843588_30843854
tx.8063	chr17	+	890	2	ISM	ENSMUSG00000033826.11	ENSMUST00000237551.2	3099	11	22	23197	4	388	intron_retention	FALSE	canonical	3	45	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGGGTTGGACTTAGTAA	221	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30845930	30854998	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_30846117_30854294
tx.8064	chr17	-	350	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024030.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCCCAGGGCTGTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31303740	31301145	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_31301374_31303618
tx.8065	chr17	+	2060	3	ISM	ENSMUSG00000024030.8	ENSMUST00000024829.8	5832	15	53473	2211	195	1289	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_2	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTCTTCATTTAATTTCAAG	4565	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31330133	31334751	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_31330354_31331902_31332022_31333030
tx.8066	chr17	-	271	2	ISM	ENSMUSG00000024033.11	ENSMUST00000236379.2	1190	9	18794	0	18794	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	67	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCCTCTGATGTCGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31477141	31473992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_31474194_31477071
tx.8068	chr17	-	1155	9	FSM	ENSMUSG00000024033.11	ENSMUST00000024832.9	1191	9	36	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_8	7.5	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCCTCTGATGTCGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31496321	31473992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_31474194_31477071_31477201_31477761_31477922_31480728_31480801_31484787_31484924_31485316_31485408_31492290_31492397_31492498_31492613_31496175
tx.8069	chr17	+	297	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024033.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTGGAGGTGGGTACCACC	6042	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31477086	31483395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_31477258_31483269
tx.807	chr1	+	1505	7	FSM	ENSMUSG00000053286.12	ENSMUST00000188179.7	1567	7	106	-44	0	44	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_2	23.1732604525129	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAAAGGTTTTCATATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151304398	151319503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_151304854_151309544_151309656_151311478_151311593_151315266_151315332_151316556_151316687_151318337_151318462_151318997
tx.8070	chr17	+	459	4	NIC	ENSMUSG00000024036.17	novel	3389	20	NA	NA	-38	-141	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	8	junction_3	69.4086129781856	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTCCTGGTGGATCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31515139	31526790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_31515230_31519263_31519482_31526253_31526336_31526721
tx.8071	chr17	+	995	3	ISM	ENSMUSG00000024036.17	ENSMUST00000165149.3	3389	20	6	43366	6	-596	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	22.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGAGATCTTCCAACACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31515194	31526335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_31515890_31519263_31519482_31526253
tx.8072	chr17	+	1064	4	NIC	ENSMUSG00000024036.17	novel	3389	20	NA	NA	6	-141	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	8	junction_3	65.1067499487487	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTTCCTGGTGGATCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31515194	31526790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_31515890_31519263_31519482_31526253_31526336_31526721
tx.8073	chr17	+	1916	19	FSM	ENSMUSG00000041119.13	ENSMUST00000127929.8	1891	19	-25	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_18	14.1770114735436	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTCTGTATTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31605202	31695133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_31605331_31633074_31633146_31634253_31634332_31639218_31639263_31662139_31662195_31662811_31662883_31667340_31667426_31672375_31672455_31674027_31674103_31678048_31678136_31678874_31678980_31679152_31679236_31680544_31680702_31685328_31685443_31688767_31688873_31689654_31689784_31690732_31690829_31692131_31692254_31694901
tx.8074	chr17	+	1924	19	FSM	ENSMUSG00000041119.13	ENSMUST00000047168.13	2089	19	14	151	14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	53	junction_18	8.45777456647338	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTCTGTATTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31605197	31695133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_31605331_31633074_31633146_31634253_31634332_31639218_31639263_31662139_31662195_31662811_31662883_31667340_31667426_31672375_31672455_31674027_31674103_31678048_31678136_31678874_31678980_31679152_31679236_31680544_31680702_31685328_31685443_31688767_31688873_31689654_31689784_31690732_31690829_31692131_31692254_31694898
tx.8075	chr17	+	317	2	ISM	ENSMUSG00000041119.13	ENSMUST00000236367.2	1290	3	2143	139	2143	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGGTCTGTATTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31692168	31695133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_31692254_31694901
tx.8076	chr17	-	1907	11	FSM	ENSMUSG00000024037.14	ENSMUST00000171171.9	4154	11	454	1793	12	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	400	junction_7	39.3020355706928	143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGTTCAGCAGCAGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31731271	31715088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_31715903_31717471_31717542_31717962_31718147_31718782_31718848_31719587_31719687_31720188_31720250_31721744_31721858_31722483_31722641_31728742_31728887_31729551_31729621_31731140
tx.8077	chr17	-	1067	3	ISM	ENSMUSG00000024037.14	ENSMUST00000169454.8	1300	6	2122	-11	2122	7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	448	junction_2	5.5	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATGTTCAGCAGCAGCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31718145	31715088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_31715903_31717471_31717542_31717962
tx.8078	chr17	-	1099	4	ISM	ENSMUSG00000024037.14	ENSMUST00000169454.8	1300	6	1451	-8	1451	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	443	junction_3	6.68331255192114	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGGAATGTTCAGCAGCAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31718816	31715091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_31715903_31717471_31717542_31717962_31718147_31718782
tx.8079	chr17	+	459	3	FSM	ENSMUSG00000024038.18	ENSMUST00000064798.16	493	3	29	5	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3604	junction_2	48.5	7164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCACTATGTGGTTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31739117	31750300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_31739236_31740542_31740667_31750083
tx.808	chr1	+	2471	15	NIC	ENSMUSG00000053286.12	novel	2749	15	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	28	junction_1	47.2939138337512	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCTGACTGGGCTCGCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151304398	151333912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_151304682_151309544_151309656_151311478_151311593_151315266_151315332_151316556_151316687_151318337_151318462_151318997_151319078_151324004_151324249_151325650_151325864_151327798_151327990_151328827_151328907_151329635_151329803_151330728_151330792_151333213_151333341_151333432
tx.8081	chr17	+	2043	11	FSM	ENSMUSG00000006705.14	ENSMUST00000097352.11	4252	11	53	2156	-20	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_5	23.0781281736626	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATGCTTGTCTTTCGATTCGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31783760	31824511	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_31783863_31802669_31802778_31807433_31807562_31809576_31809749_31811078_31811250_31814198_31814299_31815769_31815868_31818488_31818618_31821759_31821837_31822160_31822334_31823726
tx.8082	chr17	+	1858	3	FSM	ENSMUSG00000006705.14	ENSMUST00000176895.2	1855	3	3	-6	3	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	129	junction_1	18	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAGATTAGGAGTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31783735	31809056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_31783863_31802669_31802778_31807433
tx.8083	chr17	-	1248	7	ISM	ENSMUSG00000024039.16	ENSMUST00000235180.2	1826	9	1868	-3	1868	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	223	junction_1	32.736320298205	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCGTGTCGACCTTAT	9596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31839988	31831615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_31832268_31834447_31834533_31835019_31835129_31836100_31836236_31836361_31836437_31838111_31838218_31839902
tx.8084	chr17	-	1290	8	ISM	ENSMUSG00000024039.16	ENSMUST00000067801.14	2533	17	16224	19	1868	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_2	83.8292725649907	100	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCGTGTCGACCTTAT	9596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31839988	31831615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_31832268_31833502_31833545_31834447_31834533_31835019_31835129_31836100_31836236_31836361_31836437_31838111_31838218_31839902
tx.8085	chr17	-	2459	17	FSM	ENSMUSG00000024039.16	ENSMUST00000236853.2	6226	17	19	3748	-15	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_2	62.6156118212543	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCGTGTCGACCTTAT	1930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31856154	31831615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_31832268_31833502_31833545_31834447_31834533_31835019_31835129_31836100_31836236_31836361_31836437_31838111_31838218_31839902_31839988_31840411_31840538_31841400_31841493_31843202_31843273_31843972_31844108_31844464_31844545_31844856_31844992_31846449_31846557_31851801_31852129_31856056
tx.8086	chr17	-	2417	16	FSM	ENSMUSG00000024039.16	ENSMUST00000078509.12	2403	16	-15	1	-15	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	223	junction_1	29.2615789047686	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGGTCGTGTCGACCTTAT	1930	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31856154	31831615	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_31832268_31834447_31834533_31835019_31835129_31836100_31836236_31836361_31836437_31838111_31838218_31839902_31839988_31840411_31840538_31841400_31841493_31843202_31843273_31843972_31844108_31844464_31844545_31844856_31844992_31846449_31846557_31851801_31852129_31856056
tx.8087	chr17	-	959	9	FSM	ENSMUSG00000061613.14	ENSMUST00000237323.2	975	9	17	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_6	2395.95355495469	140	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGTGACTTCTTGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31877712	31866054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_31866330_31866976_31867070_31867156_31867291_31867640_31867740_31867818_31867869_31870619_31870687_31871475_31871543_31873952_31874041_31877626
tx.8088	chr17	-	908	8	FSM	ENSMUSG00000061613.14	ENSMUST00000166526.9	923	8	15	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1007	junction_5	2353.82216310201	1013	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGTGACTTCTTGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31877728	31866054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_31866330_31866976_31867070_31867156_31867291_31867640_31867740_31867818_31867869_31871475_31871543_31873952_31874041_31877626
tx.8089	chr17	-	909	8	FSM	ENSMUSG00000061613.14	ENSMUST00000014684.6	1046	8	137	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4626	junction_6	706.208473585007	5096	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGGTGTGACTTCTTGTAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31877729	31866054	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_31866330_31866976_31867070_31867156_31867291_31867640_31867740_31867818_31867869_31870619_31870687_31873952_31874041_31877626
tx.809	chr1	-	2359	3	ISM	ENSMUSG00000026484.14	ENSMUST00000185945.2	570	4	773	-1813	773	-100	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	498	junction_2	21	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCTAAGCAGAAAGTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151349097	151345256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_151347169_151347388_151347561_151348822
tx.8090	chr17	+	1118	6	Intergenic	novelGene_649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	3.24961536185438	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTTTAAAAAAGTGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31943246	31950728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_31943325_31944045_31944165_31945955_31946064_31948635_31948677_31949717_31949795_31950033
tx.8091	chr17	+	2443	2	Intergenic	novelGene_650	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTTTTTAAAAAAGTGATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31948046	31950728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_31949795_31950033
tx.8092	chr17	-	1153	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117355.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCCTGTCTCAAGTTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32009617	32003693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_32004725_32009495
tx.8093	chr17	+	922	2	Intergenic	novelGene_651	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAGTCTTTTTTAAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32028265	32029449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_32028451_32028712
tx.8094	chr17	+	523	2	Intergenic	novelGene_652	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCTTTCAAAGGCTTGGGA	2132	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32038558	32047660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_32038729_32047307
tx.8096	chr17	-	340	3	ISM	ENSMUSG00000024042.8	ENSMUST00000234331.2	2554	12	727	4515	727	-12	internal_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_2	4	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGAAATGTTTGGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32074040	32070520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_32070571_32073181_32073299_32073867
tx.8097	chr17	-	436	4	ISM	ENSMUSG00000024042.8	ENSMUST00000234331.2	2554	12	24	4515	24	-12	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_3	7.78888096369861	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAGAAATGTTTGGTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32074743	32070520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_32070571_32073181_32073299_32073867_32074039_32074645
tx.8098	chr17	-	593	3	Intergenic	novelGene_653	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCATAAAGAATTCTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32090097	32088874	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_32089117_32089641_32089871_32089975
tx.8099	chr17	-	1314	6	NIC	ENSMUSG00000002076.13	novel	1479	7	NA	NA	-14	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	97	junction_3	514.177634675022	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGGGTTTAGGAAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32253496	32165055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_32165786_32226649_32226768_32230149_32230283_32241739_32241844_32252234_32252386_32253418
tx.81	chr1	-	956	2	Intergenic	novelGene_9	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGTTTCCCTCTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21263525	21259269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_21260108_21263407
tx.810	chr1	-	2930	7	FSM	ENSMUSG00000026484.14	ENSMUST00000076110.11	3160	7	125	105	3	-105	multi-exon	FALSE	canonical	3	460	junction_6	52.4404424085076	172	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTATCTAAGCAGAAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151376581	151345261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_151347169_151347388_151347561_151348822_151349096_151351890_151352107_151352622_151352784_151354287_151354377_151376469
tx.8100	chr17	-	1425	7	NIC	ENSMUSG00000002076.13	novel	3115	9	NA	NA	8	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	97	junction_4	419.803393136464	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGGGTTTAGGAAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32253503	32165055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_32165786_32206321_32206426_32226649_32226768_32230149_32230283_32241739_32241844_32252234_32252386_32253418
tx.8101	chr17	-	1570	8	FSM	ENSMUSG00000002076.13	ENSMUST00000002145.12	2867	8	-16	1313	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	776	junction_1	207.062940248828	932	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGGGTTTAGGAAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32253498	32165055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_32165786_32206321_32206426_32226649_32226768_32230149_32230283_32232291_32232442_32241739_32241844_32252234_32252386_32253418
tx.8102	chr17	-	1471	7	FSM	ENSMUSG00000002076.13	ENSMUST00000133308.3	1479	7	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	341	junction_1	334.770941590415	439	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTGGGTTTAGGAAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32253503	32165055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_32165786_32226649_32226768_32230149_32230283_32232291_32232442_32241739_32241844_32252234_32252386_32253418
tx.8103	chr17	+	1773	12	NNC	ENSMUSG00000058392.14	novel	4874	16	NA	NA	0	155	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	202.128140356475	40	4	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGAAGAAAACTATGAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32255376	32276160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_32255579_32264902_32264986_32266647_32266706_32267526_32267613_32268399_32268462_32268922_32269053_32270119_32270185_32270656_32270824_32271712_32271802_32272830_32272933_32274873_32274972_32275529
tx.8104	chr17	-	1437	8	NNC	ENSMUSG00000037577.14	novel	1591	7	NA	NA	-16	142	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	6.49018096662888	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCTGAGTGACTAAAAGCATT	978	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32408539	32403491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_32404096_32404189_32404327_32404419_32404524_32407149_32407279_32407384_32407543_32407713_32407846_32408008_32408094_32408451
tx.8105	chr17	-	3275	10	ISM	ENSMUSG00000024045.7	ENSMUST00000002699.7	3731	14	4515	6	-280	-4	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	426	junction_6	69.9387739295266	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAAGACATTTGTGTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32535644	32522651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_32524681_32525463_32525560_32528392_32528524_32529551_32529646_32529926_32530069_32531259_32531348_32533084_32533119_32534415_32534463_32534628_32534759_32535160
tx.8106	chr17	-	2309	11	ISM	ENSMUSG00000024045.7	ENSMUST00000002699.7	3731	14	4067	1021	-728	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	426	junction_6	73.0521046924728	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTTGTTTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32536092	32523666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_32524681_32525463_32525560_32528392_32528524_32529551_32529646_32529926_32530069_32531259_32531348_32533084_32533119_32534415_32534463_32534628_32534759_32535160_32535642_32536040
tx.8107	chr17	-	2684	14	FSM	ENSMUSG00000024045.7	ENSMUST00000002699.7	3731	14	26	1021	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	426	junction_6	74.0811964579343	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTTGTTTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32540133	32523666	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_32524681_32525463_32525560_32528392_32528524_32529551_32529646_32529926_32530069_32531259_32531348_32533084_32533119_32534415_32534463_32534628_32534759_32535160_32535642_32536040_32536321_32536819_32536853_32537744_32537784_32540058
tx.8109	chr17	-	2085	13	NNC	ENSMUSG00000002625.11	novel	2102	14	NA	NA	0	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_11	107.69594545138	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTTCGTTTGTGCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32569569	32540397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_32540760_32540869_32540966_32551452_32551584_32551784_32551891_32551976_32552119_32553561_32553671_32554536_32554598_32554931_32555003_32555080_32555178_32555258_32555713_32557244_32557489_32564269_32564373_32569460
tx.811	chr1	-	2568	4	ISM	ENSMUSG00000026484.14	ENSMUST00000187048.7	3201	8	24456	106	-193	-105	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	498	junction_2	40.5709255502016	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTATCTAAGCAGAAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151352106	151345261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_151347169_151347388_151347561_151348822_151349096_151351890
tx.8110	chr17	-	1991	15	NNC	ENSMUSG00000002625.11	novel	1987	15	NA	NA	1	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_12	112.646390016163	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTTCGTTTGTGCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32569568	32540397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_32540760_32540869_32540966_32551452_32551584_32551784_32551891_32551976_32552119_32553561_32553671_32554536_32554598_32554931_32555003_32555080_32555178_32555258_32555713_32557244_32557329_32557430_32557489_32557760_32557798_32564297_32564373_32569460
tx.8111	chr17	-	2093	14	NNC	ENSMUSG00000002625.11	novel	2102	14	NA	NA	1	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_11	104.63857209094	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GGTCTTCGTTTGTGCTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32569568	32540397	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_32540760_32540869_32540966_32551452_32551584_32551784_32551891_32551976_32552119_32553561_32553671_32554536_32554598_32554931_32555003_32555080_32555178_32555258_32555713_32557244_32557489_32557760_32557798_32564297_32564373_32569460
tx.8112	chr17	-	918	5	NNC	ENSMUSG00000002625.11	novel	2102	14	NA	NA	1	188	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_2	166.06399368918	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTGAATAAGCTGACCTACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32569568	32555258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_32555713_32557244_32557489_32557760_32557798_32564297_32564373_32569460
tx.8113	chr17	+	1945	8	ISM	ENSMUSG00000061126.6	ENSMUST00000003413.7	1599	12	13530	-800	3741	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_7	8.14912039825809	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTGCTCCGTTTATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32700965	32712253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_32701186_32702178_32702447_32705743_32705811_32705919_32706050_32708593_32708728_32710116_32710182_32710780_32710864_32711275
tx.8114	chr17	+	292	2	ISM	ENSMUSG00000091586.3	ENSMUST00000236129.2	401	3	-68	2372	-12	-2372	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	31	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCGCGGCACTGGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32725423	32726030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_32725553_32725867
tx.8115	chr17	+	2961	13	FSM	ENSMUSG00000091586.3	ENSMUST00000165999.2	1693	13	-11	-1257	-11	8	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_12	8.54725426997206	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAAAAATGAGAAATTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32725424	32749125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_32725553_32725867_32726067_32736867_32737013_32739336_32739391_32739476_32739605_32741091_32741214_32742975_32743247_32743552_32743620_32743808_32743939_32746814_32746949_32747020_32747086_32747249_32747333_32747690
tx.8116	chr17	+	808	7	ISM	ENSMUSG00000048440.17	ENSMUST00000169591.8	2242	13	7	6850	-4	523	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	19.5505043981536	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTTCTTGTTCGTTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32755538	32763922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_32755630_32755968_32756171_32759244_32759390_32761711_32761766_32761850_32761979_32763081_32763204_32763856
tx.8117	chr17	+	806	7	ISM	ENSMUSG00000048440.17	ENSMUST00000003416.15	2227	13	-5	6849	-5	523	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_3	12.7725834852973	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTTCTTGTTCGTTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32755537	32763922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_32755630_32755971_32756171_32759244_32759390_32761711_32761766_32761850_32761979_32763081_32763204_32763856
tx.8118	chr17	-	3089	4	FSM	ENSMUSG00000024298.16	ENSMUST00000159086.10	10851	4	4	7758	4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_3	1.24721912892465	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACTTTTGTTGTATATCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33007257	32992227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_32994983_32996130_32996192_32996374_32996502_33007111
tx.8119	chr17	-	2218	4	FSM	ENSMUSG00000055202.12	ENSMUST00000200914.5	3536	4	-4	1322	-4	408	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_3	3.09120616516523	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAGCCTAATTGAT	4480	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33028909	33015971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33017848_33019360_33019422_33019785_33019913_33028755
tx.812	chr1	+	695	3	ISM	ENSMUSG00000026483.14	ENSMUST00000111875.2	1296	6	-400	48680	-90	-3396	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_1	1.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAGATACATTGTGATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151446846	151517253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_151447336_151512154_151512286_151517178
tx.8120	chr17	-	844	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117468.2	novel	816	1	NA	NA	-18	75	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGAGAGAACACAAACATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33072012	33071103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr17_-_33071900_33071964
tx.8121	chr17	-	1199	3	NNC	ENSMUSG00000117654.2	novel	1195	2	NA	NA	-74	-12463	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	4	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCATTGGTGTTTTACCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33096990	33095098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_33096101_33096681_33096851_33096962
tx.8122	chr17	-	2534	4	FSM	ENSMUSG00000095325.4	ENSMUST00000228075.3	5337	4	23	2780	23	1863	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_3	10.4986771653491	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTTCCTTTGTCATGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33110593	33100972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33103140_33104676_33104738_33104930_33105058_33110414
tx.8123	chr17	-	1746	13	FSM	ENSMUSG00000024055.16	ENSMUST00000075253.13	1752	13	6	0	-4	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	129	junction_12	13.5285192587117	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATGAGCATCAGACCAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33166370	33143661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33143929_33144297_33144381_33144510_33144576_33144663_33144798_33148111_33148242_33148443_33148511_33148828_33149097_33149514_33149637_33151386_33151515_33151602_33151657_33160029_33160175_33165778_33165978_33166286
tx.8124	chr17	+	2202	4	FSM	ENSMUSG00000053600.9	ENSMUST00000039132.9	2376	4	0	174	0	-174	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	5.18544972870135	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTTTATAAGGTCAGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33184787	33198033	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33184904_33194887_33195015_33195200_33195259_33196132
tx.8125	chr17	+	2804	4	FSM	ENSMUSG00000053390.17	ENSMUST00000087666.11	2950	4	-61	207	-3	-207	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_3	3.55902608401044	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTGTGGAATTTGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33212109	33224224	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33212233_33220597_33220725_33220931_33220993_33221731
tx.8126	chr17	-	3408	4	FSM	ENSMUSG00000067430.8	ENSMUST00000087654.5	3407	4	11	-12	11	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	84	junction_1	5.73488351136175	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAGATTTTTGTGTATGTGT	2770	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33252365	33235824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33238944_33240431_33240484_33240679_33240807_33252255
tx.8127	chr17	+	1926	4	FSM	ENSMUSG00000067424.14	ENSMUST00000131722.9	6440	4	4	4510	4	1137	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	9.7410927974683	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTCTATGAAGTTTGCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33308287	33325169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33308454_33321204_33321332_33321516_33321578_33323597
tx.8128	chr17	+	1882	4	FSM	ENSMUSG00000067424.14	ENSMUST00000140829.2	758	4	14	-1138	14	1138	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_1	2.05480466765633	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTATGAAGTTTGCTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33311445	33325170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33311567_33321204_33321332_33321516_33321578_33323597
tx.8129	chr17	-	3539	4	FSM	ENSMUSG00000094441.3	ENSMUST00000008830.10	3544	4	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_3	10.077477638554	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTGTTGTGTTGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33474114	33458691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33461925_33462686_33462745_33462981_33463109_33473993
tx.813	chr1	+	1639	10	NNC	ENSMUSG00000026483.14	novel	6531	14	NA	NA	-3	11769	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	66.4158243824095	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTGTGTTCATGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151447120	151577702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_151447336_151512154_151512286_151517178_151517311_151520625_151520741_151525029_151525195_151565269_151565386_151571440_151571546_151571875_151572039_151575859_151576048_151577393
tx.8131	chr17	+	3214	4	FSM	ENSMUSG00000096910.3	ENSMUST00000099414.5	5788	4	2	2572	2	502	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_3	21.7613316585993	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATAGTCGATCCTAGAATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33508519	33523643	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33508644_33519554_33519682_33519918_33519977_33520738
tx.8132	chr17	-	2285	4	FSM	ENSMUSG00000003929.12	ENSMUST00000054072.9	6639	4	4	4350	0	681	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_3	5.43650214343336	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTCACCTGCCTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33577848	33552665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33554628_33555428_33555484_33555695_33555823_33577707
tx.8133	chr17	-	2434	5	FSM	ENSMUSG00000003929.12	ENSMUST00000235063.2	812	5	1	-1623	1	686	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_3	15.2540978100968	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGCCTGTTTTTTTCCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33577841	33552660	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33554628_33555428_33555484_33555695_33555823_33557074_33557226_33577707
tx.8134	chr17	-	664	3	ISM	ENSMUSG00000003929.12	ENSMUST00000054072.9	6639	4	6	6770	2	-802	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_2	6	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCATAAAACCTGACCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33577846	33555085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_33555484_33555695_33555823_33577707
tx.8135	chr17	-	2730	4	FSM	ENSMUSG00000055240.18	ENSMUST00000167107.10	2659	4	22	-93	4	93	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_1	5.79271573232759	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTGGTCTGCCATTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33613593	33599135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33601561_33605395_33605442_33605658_33605786_33613461
tx.8136	chr17	-	1316	3	FSM	ENSMUSG00000055240.18	ENSMUST00000174512.4	6095	3	9	4770	-9	301	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	2.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAGGAACCTAACCAGTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33613588	33604379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33605442_33605658_33605786_33613461
tx.8137	chr17	+	1122	5	FSM	ENSMUSG00000024299.18	ENSMUST00000174170.3	1798	5	-18	694	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_4	5.3851648071345	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCACGAGTGATGGGCAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33743177	33750929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33743233_33747257_33747445_33747653_33748001_33749106_33749264_33750553
tx.8138	chr17	+	745	3	FSM	ENSMUSG00000024299.18	ENSMUST00000234715.2	2533	3	-24	1812	-18	-1812	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_2	2	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGGCTGAAAGCAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33743159	33748138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33743233_33747257_33747445_33747653
tx.8139	chr17	+	675	2	ISM	ENSMUSG00000024299.18	ENSMUST00000234715.2	2533	3	4071	1812	-33	-1812	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGGCTGAAAGCAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33747254	33748138	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_33747445_33747653
tx.814	chr1	-	1462	2	NNC	ENSMUSG00000100594.2	novel	1381	2	NA	NA	-3	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGCTTTTGGTCATGGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151630772	151624696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_151625980_151630593
tx.8140	chr17	+	1250	4	ISM	ENSMUSG00000024300.18	ENSMUST00000173426.2	3667	18	19587	2	4049	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_3	1.69967317119759	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAAGAAGTAAATTACTGAG	3313	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33821163	33826736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_33821584_33823230_33823427_33823523_33823694_33826272
tx.8141	chr17	+	1209	7	FSM	ENSMUSG00000073423.11	ENSMUST00000166627.8	1211	7	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_2	162.952702749397	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGGTACCTATGCCTTC	4919	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33848065	33850690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33848191_33848595_33848673_33848770_33849054_33849340_33849449_33849549_33849656_33850102_33850438_33850515
tx.8142	chr17	+	1132	6	FSM	ENSMUSG00000073423.11	ENSMUST00000073570.12	1197	6	2	63	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	354	junction_1	31.6569107779012	540	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGGTACCTATGCCTTC	4919	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33848065	33850690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33848191_33848770_33849054_33849340_33849449_33849549_33849656_33850102_33850438_33850515
tx.8143	chr17	-	1394	5	ISM	ENSMUSG00000059208.16	ENSMUST00000087582.13	2370	17	26971	-3	633	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1636	junction_4	197.719972435766	231	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCTTGCCTTTTTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33877422	33865209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_33865634_33867786_33867839_33868568_33869372_33871246_33871301_33877361
tx.8144	chr17	-	1772	10	ISM	ENSMUSG00000059208.16	ENSMUST00000087582.13	2370	17	19825	-3	976	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1616	junction_5	167.511267356432	186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGGCTTGCCTTTTTTGTTT	6050	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33884568	33865209	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_33865634_33867786_33867839_33868568_33869372_33871246_33871301_33877361_33877440_33877843_33877889_33879186_33879289_33882198_33882260_33883558_33883609_33884465
tx.8145	chr17	-	1355	5	FSM	ENSMUSG00000079557.12	ENSMUST00000172767.9	1398	5	40	3	10	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	227	junction_1	25.5196003103497	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGTTATGTTTCTAAGCTG	2716	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33937604	33910491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33911128_33915010_33915221_33921986_33922183_33928718_33928947_33937519
tx.8146	chr17	+	646	2	NNC	ENSMUSG00000090952.3	novel	925	2	NA	NA	-75	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTCTGATTTCATTTTCT	3402	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33978890	33980845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_33979207_33980515
tx.8147	chr17	+	932	2	FSM	ENSMUSG00000090952.3	ENSMUST00000170103.3	925	2	-6	-1	-6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTCTGATTTCATTTTCT	3471	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33978959	33980845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_33979562_33980515
tx.8148	chr17	-	1871	7	FSM	ENSMUSG00000002289.17	ENSMUST00000002360.17	3308	7	287	1150	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_1	6.14862224856557	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGTTCTCTGTTGTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34000517	33993873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_33994543_33995923_33996206_33996293_33996390_33997345_33997460_33999503_33999622_33999756_33999868_34000036
tx.8149	chr17	+	1908	9	ISM	ENSMUSG00000042099.17	ENSMUST00000172649.8	2652	11	7297	-3	-87	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	265	junction_4	41.1868835310466	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTCGTATTGTGTGGATGGA	4432	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34036793	34041891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34037419_34037499_34037600_34037773_34037972_34038065_34038154_34038753_34038971_34040742_34040889_34040979_34041181_34041259_34041350_34041648
tx.815	chr1	-	593	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100685.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGAGAAAGAGAGAAAAAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151757388	151756227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_151756737_151757304
tx.8150	chr17	-	205	2	ISM	ENSMUSG00000067288.14	ENSMUST00000173480.8	372	3	1135	0	1016	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11527	junction_1	0	821	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTGTCTAGAAATTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34042304	34042023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_34042091_34042166
tx.8151	chr17	-	315	4	FSM	ENSMUSG00000067288.14	ENSMUST00000173844.8	382	4	67	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11527	junction_1	4307.03060897722	55496	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTGTCTAGAAATTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34043469	34042023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34042091_34042166_34042305_34043272_34043321_34043407
tx.8152	chr17	-	391	3	ISM	ENSMUSG00000067288.14	ENSMUST00000173019.8	437	4	-3	4023	-1	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	16929	junction_2	2573.5	1182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTGTCTAGAAATTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34043469	34042023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_34042305_34043272_34043321_34043407
tx.8153	chr17	+	499	4	FSM	ENSMUSG00000041881.14	ENSMUST00000048249.8	528	4	21	8	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	7458	junction_2	513.174650798558	26196	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCAATCTGTCTTTTCTT	4095	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34043566	34057283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34043655_34044574_34044625_34048640_34048791_34057072
tx.8154	chr17	+	449	3	FSM	ENSMUSG00000041881.14	ENSMUST00000173132.8	438	3	-11	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	616	junction_1	4049.5	2294	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCCAATCTGTCTTTTCTT	4095	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34043566	34057283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34043655_34048640_34048791_34057072
tx.8155	chr17	-	1239	5	NNC	ENSMUSG00000079553.12	novel	2357	11	NA	NA	-462	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	270.257747345011	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTTTCTTGTTTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34102662	34094639	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_34094844_34100402_34100479_34100961_34101036_34101130_34101422_34102068
tx.8156	chr17	+	2606	8	FSM	ENSMUSG00000024308.16	ENSMUST00000025161.10	2898	8	290	2	-15	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_6	36.6951033823983	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGCGGGCCTCTCATTCTC	582	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34138595	34148264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34138699_34138844_34139025_34139222_34139484_34144383_34144783_34144981_34145324_34145401_34145492_34145600_34145681_34147113
tx.8157	chr17	+	834	3	ISM	ENSMUSG00000041354.17	ENSMUST00000173284.2	943	8	2013	-463	550	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_2	4	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTGTCCCCATCCTTCAGT	1709	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34154911	34156661	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34155008_34155836_34155952_34156038
tx.8158	chr17	-	404	3	FSM	ENSMUSG00000008668.16	ENSMUST00000174758.8	499	3	95	0	-53	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21077	junction_1	1139	1247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCGTCTCAGTTTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34171568	34170972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34171093_34171194_34171287_34171376
tx.8159	chr17	-	546	5	FSM	ENSMUSG00000008668.16	ENSMUST00000008812.9	560	5	14	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20050	junction_4	1387.25833481007	40125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTCCGTCTCAGTTTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34174637	34170972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34171093_34171194_34171287_34171376_34171566_34174051_34174151_34174591
tx.816	chr1	-	909	2	ISM	ENSMUSG00000032666.17	ENSMUST00000128433.8	772	3	5685	-318	5685	318	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGTCTTCTCCCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151791293	151768335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_151769184_151791232
tx.8160	chr17	-	1599	7	NNC	ENSMUSG00000061232.17	novel	1619	8	NA	NA	-1	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	24.862399097611	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGTCACTATGCTGTGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34219258	34214994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_34215478_34215589_34215629_34215967_34216132_34216258_34216535_34218244_34218521_34218707_34218978_34219167
tx.8161	chr17	-	1555	8	FSM	ENSMUSG00000061232.17	ENSMUST00000172912.8	1570	8	5	10	-1	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_6	28.0698836361489	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATCTGGGTCACTATGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34219258	34215000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34215451_34215589_34215629_34215800_34215834_34216011_34216132_34216258_34216535_34218244_34218521_34218707_34218978_34219167
tx.8162	chr17	-	1589	8	FSM	ENSMUSG00000061232.17	ENSMUST00000025181.18	1619	8	63	-33	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_6	28.3196045170126	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTCACTATGCTGTGTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34219258	34214993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34215478_34215589_34215629_34215800_34215834_34216011_34216132_34216258_34216535_34218244_34218521_34218707_34218978_34219167
tx.8163	chr17	-	529	2	ISM	ENSMUSG00000024325.9	ENSMUST00000174054.2	2552	3	2121	0	2121	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	0	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCAGTTCTCTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34240785	34240057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_34240458_34240656
tx.8164	chr17	-	1717	7	FSM	ENSMUSG00000024325.9	ENSMUST00000025183.9	2034	7	25	292	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_3	8.5764535535124	79	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCAGTTCTCTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34243629	34240057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34240458_34240656_34240931_34241269_34241660_34241952_34242169_34242266_34242428_34243262_34243393_34243483
tx.8165	chr17	-	2010	6	NIC	ENSMUSG00000024325.9	novel	2034	7	NA	NA	-3	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	78	junction_2	4.01995024844836	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCAGTTCTCTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34243629	34240057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_34240458_34240656_34240931_34241269_34242169_34242266_34242428_34243262_34243393_34243483
tx.8166	chr17	-	368	3	ISM	ENSMUSG00000073422.12	ENSMUST00000173425.9	709	6	749	-82	-4	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	166	junction_1	20.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCGGTTCTTCTTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34245736	34245006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_34245200_34245369_34245445_34245636
tx.8167	chr17	-	524	6	FSM	ENSMUSG00000073422.12	ENSMUST00000173425.9	709	6	267	-82	267	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	139	junction_4	24.8885515850159	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCGGTTCTTCTTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34246218	34245006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34245200_34245369_34245445_34245636_34245680_34245824_34245910_34245989_34246076_34246176
tx.8168	chr17	-	532	2	FSM	ENSMUSG00000073422.12	ENSMUST00000173616.8	534	2	2	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCCGGTTCTTCTTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34245730	34245006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34245445_34245636
tx.8169	chr17	-	2372	7	FSM	ENSMUSG00000024327.17	ENSMUST00000025186.16	2320	7	-55	3	7	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	543	junction_6	39.6512575112344	293	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCAGCCTTTGTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34250649	34247245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34248043_34248483_34248681_34248819_34248958_34249063_34249229_34249341_34249396_34249539_34249709_34249797
tx.817	chr1	-	1681	6	FSM	ENSMUSG00000032666.17	ENSMUST00000044581.14	9559	6	-183	8061	-183	318	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_2	7.73045923603508	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGTCTTCTCCCATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151966059	151768335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_151769184_151791232_151791294_151796797_151796875_151856176_151856272_151882295_151882519_151965682
tx.8170	chr17	-	1666	7	NIC	ENSMUSG00000024327.17	novel	1550	8	NA	NA	-11	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	33	junction_6	218.983763984659	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGCAGCCTTTGTCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34250667	34247245	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_34248043_34248483_34248681_34248819_34248958_34249063_34249229_34249341_34249396_34249539_34249709_34250521
tx.8171	chr17	+	2367	10	FSM	ENSMUSG00000039656.18	ENSMUST00000116612.3	2283	10	-78	-6	-78	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	64.8690989609074	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTTTCTGGACTGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34251296	34257373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34251459_34251800_34252019_34252528_34252686_34252995_34253176_34254627_34254801_34255298_34255429_34255598_34255732_34255846_34255939_34256140_34256247_34256357
tx.8172	chr17	+	1651	6	ISM	ENSMUSG00000039656.18	ENSMUST00000116612.3	2283	10	3252	-6	-670	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_3	42.2402651506829	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTTTCTGGACTGAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34254626	34257373	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34254801_34255298_34255429_34255598_34255732_34255846_34255939_34256140_34256247_34256357
tx.8173	chr17	+	1071	5	FSM	ENSMUSG00000024334.10	ENSMUST00000025192.8	1088	5	16	1	16	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	7.14142842854285	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCGTGTGTCCTTTTCAC	3781	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34311329	34314207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34311503_34312806_34313056_34313281_34313564_34313656_34313793_34313976
tx.8174	chr17	+	1162	4	ISM	ENSMUSG00000024334.10	ENSMUST00000025192.8	1088	5	1350	-120	1268	120	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	6.79869268479038	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACCTGTGCCTTGTTGACCCA	549	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34312663	34314328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34313056_34313281_34313564_34313656_34313793_34313976
tx.8175	chr17	+	1250	3	ISM	ENSMUSG00000024334.10	ENSMUST00000174670.2	1231	4	1285	0	1285	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	15	junction_1	2	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCGTGTGTCCTTTTCAC	566	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34312680	34314207	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34313564_34313656_34313793_34313976
tx.8176	chr17	-	3645	12	ISM	ENSMUSG00000024335.21	ENSMUST00000114242.9	4483	13	2413	7	-845	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	318	junction_10	50.8649158990899	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGAGTTAGTTTTCTTA	9360	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34338308	34331003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_34331683_34331829_34331953_34332150_34332456_34332543_34332807_34332905_34333152_34333323_34333453_34333863_34334239_34334335_34334551_34334641_34334781_34335171_34335310_34335881_34336186_34337579
tx.8177	chr17	+	1127	5	FSM	ENSMUSG00000037649.11	ENSMUST00000236322.2	1108	5	-36	17	-36	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	3.83242742918897	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGTGACCTCTCCCTCCACG	6762	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34354565	34358057	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34354733_34356087_34356373_34356876_34357156_34357380_34357510_34357790
tx.8178	chr17	+	1301	6	FSM	ENSMUSG00000079547.5	ENSMUST00000114232.4	1404	6	98	5	98	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_3	6.61513416341649	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTCTCCCAAGTTTGTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34372143	34379199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34372428_34374406_34374689_34376219_34376505_34378317_34378435_34378602_34378639_34378902
tx.8179	chr17	-	767	5	ISM	ENSMUSG00000096727.4	ENSMUST00000174576.4	1352	6	1991	46	1446	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3.8405728739343	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATTAGTTGCAAATAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34404747	34401006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_34401326_34402062_34402205_34402588_34402719_34403255_34403388_34404703
tx.818	chr1	-	1080	5	NNC	ENSMUSG00000014980.15	novel	1133	5	NA	NA	-16	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	184.305961650729	49	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTCGTAATCATCCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152262387	152246485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_152247035_152247504_152247647_152259012_152259149_152259449_152259525_152262209
tx.8180	chr17	-	1057	6	NIC	ENSMUSG00000096727.4	novel	1352	6	NA	NA	15	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_5	5.12249938994628	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATTAGTTGCAAATAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34406297	34401006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_34401326_34402062_34402205_34402588_34402719_34403255_34403388_34404703_34404772_34406031
tx.8181	chr17	-	912	6	FSM	ENSMUSG00000096727.4	ENSMUST00000174576.4	1352	6	394	46	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	3.70944739819828	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TCATTAGTTGCAAATAAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34406344	34401006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34401326_34402062_34402205_34402588_34402719_34403255_34403388_34404703_34404772_34406223
tx.8182	chr17	+	1184	6	FSM	ENSMUSG00000073421.7	ENSMUST00000040828.7	1212	6	26	2	-15	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	17.3735431043872	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTGGCTTTGATAATTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34482208	34488391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34482380_34483734_34484008_34486309_34486592_34486896_34487008_34487434_34487459_34488068
tx.8183	chr17	+	1058	5	ISM	ENSMUSG00000073421.7	ENSMUST00000040828.7	1212	6	1503	6	1381	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_2	5.35607132140714	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTTGATTTGGCTTTGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34483685	34488387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34484008_34486309_34486592_34486896_34487008_34487434_34487459_34488068
tx.8184	chr17	+	1035	4	NNC	ENSMUSG00000073421.7	novel	1212	6	NA	NA	1403	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	27.7888866675551	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGATTTGGCTTTGATAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34483707	34488388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_34484008_34486309_34486592_34486896_34487030_34488068
tx.8185	chr17	+	607	4	ISM	ENSMUSG00000073421.7	ENSMUST00000237866.2	889	5	4214	-2	362	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_1	3.85861230093008	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGATTTGGCTTTGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34486437	34488386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_34486592_34486896_34487008_34487434_34487459_34488068
tx.8186	chr17	+	1173	5	NNC	ENSMUSG00000060586.12	novel	1669	6	NA	NA	20	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	84.2388716686068	525	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCTTCATAGAGTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34524860	34535174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_34525022_34528564_34528835_34533143_34533426_34534016_34534128_34534825
tx.8187	chr17	+	1175	6	FSM	ENSMUSG00000060586.12	ENSMUST00000235530.2	1669	6	20	474	20	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_2	11.7064085013295	1037	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGCTTCATAGAGTTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34524860	34535174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34525022_34528564_34528835_34533143_34533426_34534016_34534128_34534529_34534554_34534847
tx.8188	chr17	+	1343	4	FSM	ENSMUSG00000034786.18	ENSMUST00000038244.15	1343	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	3.29983164553722	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGAAGACTGGTATCTGGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34808779	34810728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34809235_34809434_34809538_34809715_34809916_34810143
tx.8189	chr17	+	1858	9	FSM	ENSMUSG00000034673.15	ENSMUST00000038149.13	3068	9	344	866	-127	-73	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	5.02338282435253	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAATCTGTATTTCTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34811580	34815508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34811749_34812545_34812620_34812840_34813089_34813211_34813403_34813555_34813692_34813774_34813929_34814238_34814328_34814601_34814689_34814797
tx.819	chr1	-	1089	5	FSM	ENSMUSG00000014980.15	ENSMUST00000015124.15	1133	5	44	0	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_4	96.4219243740758	2934	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGTCGTAATCATCCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152262389	152246485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_152247035_152247504_152247647_152259012_152259149_152259449_152259532_152262209
tx.8190	chr17	-	1135	6	FSM	ENSMUSG00000015478.14	ENSMUST00000015622.8	1238	6	97	6	68	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1022	junction_5	40.2124358874217	3575	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGGAAGTCTCCCCAGTC	892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34822567	34820070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34820641_34820714_34820833_34820907_34820963_34821058_34821172_34821264_34821284_34822307
tx.8191	chr17	-	1126	5	NNC	ENSMUSG00000015478.14	novel	1238	6	NA	NA	68	-7	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	470.136682253151	837	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTGGGAAGTCTCCCCAGT	892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34822567	34820071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_34820641_34820714_34820833_34820907_34820963_34821058_34821183_34822307
tx.8192	chr17	+	1373	2	NNC	ENSMUSG00000092395.2	novel	366	2	NA	NA	-55	2017	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCGGCCCAGGATCGTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34820069	34822567	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_34821183_34822307
tx.8193	chr17	+	2148	7	FSM	ENSMUSG00000034254.18	ENSMUST00000037489.15	2190	7	25	17	25	14	multi-exon	FALSE	canonical	3	118	junction_1	5.07991688470939	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCCTGTTGTACTTCAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34824859	34832406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34825146_34829418_34829619_34829845_34829980_34830247_34830424_34830578_34830675_34830764_34830841_34831226
tx.8194	chr17	-	1714	9	FSM	ENSMUSG00000015474.17	ENSMUST00000171121.9	1710	9	-5	1	-5	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	52	junction_2	7.8700381193486	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCGTGGCTTGGCTTATTCCC	3925	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34846414	34835636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_34836462_34836637_34836693_34841824_34841910_34842004_34842089_34844610_34844719_34844809_34844906_34845432_34845587_34845778_34845970_34846298
tx.8195	chr17	+	1224	2	FSM	ENSMUSG00000033739.9	ENSMUST00000036720.9	1270	2	49	-3	-28	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGGTCTGTGTTGTGGAA	7408	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34863786	34865301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34863928_34864218
tx.8196	chr17	+	2527	18	FSM	ENSMUSG00000015461.16	ENSMUST00000015605.15	2566	18	39	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	325	junction_9	22.8588265568706	146	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGCGGCCACCTTCCTAGTG	9780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34866158	34874048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_34866291_34866633_34866714_34867192_34867272_34867550_34867643_34868091_34868228_34869274_34869361_34869473_34869610_34869693_34869826_34869959_34870094_34870535_34870722_34870803_34870896_34871621_34871802_34871962_34872071_34872187_34872270_34872475_34872547_34872677_34872790_34872894_34872980_34873444
tx.8197	chr17	-	1097	7	FSM	ENSMUSG00000061207.12	ENSMUST00000077477.12	1120	7	23	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_1	4.59770474137791	631	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTCTTTCTGTGTCCTTTGT	5596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35055898	35042968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35043301_35043489_35043638_35043726_35043825_35050988_35051129_35051421_35051518_35055405_35055543_35055752
tx.8198	chr17	-	1163	4	FSM	ENSMUSG00000061207.12	ENSMUST00000160993.2	768	4	8	-403	8	403	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_3	3.29983164553722	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAATAGGTCAATG	5599	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35055895	35050341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35051129_35051421_35051518_35055405_35055543_35055752
tx.8199	chr17	+	1427	7	FSM	ENSMUSG00000040482.17	ENSMUST00000180043.8	1447	7	20	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_1	19.7434940057619	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTGCTGTGTCTGAATG	2996	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35056014	35058162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35056193_35056368_35056731_35056876_35057113_35057201_35057422_35057523_35057660_35057788_35057884_35057962
tx.82	chr1	-	1582	3	Intergenic	novelGene_10	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGTTTCCCTCTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21272403	21259269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_21260108_21263407_21263524_21271775
tx.820	chr1	+	1806	4	NNC	ENSMUSG00000008475.14	novel	1914	4	NA	NA	77	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	649.932817040859	59	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTCTTAATTGAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152642369	152651331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_152642607_152644613_152644685_152647114_152647292_152650010
tx.8200	chr17	+	1448	7	FSM	ENSMUSG00000040482.17	ENSMUST00000046244.15	1519	7	23	48	23	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	48.3439643480847	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTTGCTGTGTCTGAAT	2999	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35056017	35058161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35056218_35056368_35056731_35056876_35057113_35057201_35057422_35057523_35057660_35057788_35057884_35057962
tx.8201	chr17	+	1379	11	FSM	ENSMUSG00000024369.17	ENSMUST00000165953.3	1381	11	2	0	2	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	201	junction_1	101.735146335964	495	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTATTGTAACTGCTTT	6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	35069385	35075348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35069439_35069886_35069970_35071319_35071390_35071491_35071638_35072400_35072476_35072588_35072627_35072783_35073110_35073196_35073342_35073420_35073476_35073671_35073775_35075063
tx.8202	chr17	+	1505	11	FSM	ENSMUSG00000024369.17	ENSMUST00000173357.8	1399	11	12	-118	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_1	84.0802592764794	790	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTATTGTAACTGCTTT	6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	35069385	35075348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35069565_35069886_35069970_35071319_35071390_35071491_35071638_35072400_35072476_35072588_35072627_35072783_35073110_35073196_35073342_35073420_35073476_35073671_35073775_35075063
tx.8203	chr17	+	703	5	ISM	ENSMUSG00000024369.17	ENSMUST00000165953.3	1381	11	3611	0	83	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	503	junction_4	23.2849200127464	370	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTATTGTAACTGCTTT	3258	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35072994	35075348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_35073110_35073196_35073342_35073420_35073476_35073671_35073775_35075063
tx.8204	chr17	-	2577	18	FSM	ENSMUSG00000024371.15	ENSMUST00000025230.15	2641	18	63	1	-11	0	multi-exon	TRUE	canonical	1	4	junction_13	3.65842630716852	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCCTGTCTGTCTTATGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35101013	35081581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35082008_35082154_35082205_35082320_35082451_35082599_35082692_35082838_35082916_35083020_35083187_35083283_35083402_35083487_35083583_35083704_35083846_35085493_35085584_35091342_35091484_35092437_35092577_35094863_35094998_35095129_35095232_35095309_35095487_35098857_35099044_35100547_35100773_35100925
tx.8205	chr17	-	418	3	ISM	ENSMUSG00000024371.15	ENSMUST00000174880.8	407	4	463	-3	453	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_2	4	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTGGGTGTTGACATCAT	7944	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35114070	35112322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_35112451_35112586_35112677_35113870
tx.8206	chr17	-	710	4	FSM	ENSMUSG00000024371.15	ENSMUST00000174279.2	535	4	-169	-6	-169	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_2	0.942809041582063	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTGGGTGTTGACATCAT	4604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35117410	35112322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35112451_35112586_35112677_35114382_35114544_35117079
tx.8207	chr17	+	1011	5	ISM	ENSMUSG00000013787.16	ENSMUST00000013931.12	4026	27	12251	0	247	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	414	junction_3	11.4972822875669	258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTGGTGATTGTTTCAG	1768	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35130197	35133027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_35130455_35130554_35130642_35131364_35131444_35131609_35131786_35132615
tx.8208	chr17	+	809	4	FSM	ENSMUSG00000013787.16	ENSMUST00000124002.2	1359	4	549	1	549	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	414	junction_2	9.2736184954957	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTCTGGTGATTGTTTCAG	2070	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35130499	35133027	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35130642_35131364_35131444_35131609_35131786_35132615
tx.8209	chr17	+	344	2	ISM	ENSMUSG00000007034.16	ENSMUST00000169230.2	2246	18	11243	80	11243	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	0	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTTTATGGCTTTATTTT	5632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35147937	35149332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_35148040_35149090
tx.821	chr1	+	1814	4	NNC	ENSMUSG00000008475.14	novel	1914	4	NA	NA	83	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	649.932817040859	1277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTTTTCTTAATTGAATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152642375	152651331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_152642621_152644613_152644685_152647114_152647292_152650010
tx.8210	chr17	+	1791	6	FSM	ENSMUSG00000007038.6	ENSMUST00000007253.6	2474	6	85	598	24	-598	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_3	26.914680009244	158	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTGGAGTCTGTGGTTC	8008	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35150313	35154299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35150524_35150891_35151085_35151541_35151805_35152978_35153162_35153258_35153482_35153580
tx.8211	chr17	-	969	3	FSM	ENSMUSG00000092203.8	ENSMUST00000174039.8	934	3	-34	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_2	40	662	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAATAGACTTTTTCTGT	6010	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35171444	35169216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35169452_35169673_35169824_35170860
tx.8212	chr17	-	581	5	FSM	ENSMUSG00000092203.8	ENSMUST00000172501.8	579	5	0	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_4	37.0497975702972	10747	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAATAGACTTTTTCTGT	6010	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35171444	35169216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35169452_35169673_35169824_35170860_35170902_35171111_35171150_35171327
tx.8213	chr17	-	540	4	FSM	ENSMUSG00000092203.8	ENSMUST00000174714.8	520	4	-20	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_2	75.5439533575579	745	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAATAGACTTTTTCTGT	6010	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35171444	35169216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35169452_35169673_35169824_35171111_35171150_35171327
tx.8214	chr17	-	431	4	FSM	ENSMUSG00000092203.8	ENSMUST00000173070.8	434	4	3	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	32.4995726467629	3143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAAATAGACTTTTTCTGT	6010	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35171444	35169216	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35169452_35170860_35170902_35171111_35171150_35171327
tx.8215	chr17	+	853	5	FSM	ENSMUSG00000007050.18	ENSMUST00000114011.11	840	5	-13	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1192	junction_1	217.150869213089	1607	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTGGTTTGTCGTCTGCT	88	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35200842	35204867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35201062_35201595_35201664_35204084_35204116_35204224_35204285_35204392
tx.8216	chr17	+	873	5	FSM	ENSMUSG00000007050.18	ENSMUST00000007266.14	873	5	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	278	junction_1	596.250995806296	1897	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCCTGGTTTGTCGTCTGCT	243	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35201104	35204867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35201344_35201595_35201664_35204084_35204116_35204224_35204285_35204392
tx.8217	chr17	-	2937	2	Intergenic	novelGene_655	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	307	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTGTCTGTTTCTTTTATC	269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35219334	35215700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_35218446_35219142
tx.8218	chr17	-	2874	3	Intergenic	novelGene_656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	153.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTGTCTGTTTCTTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35219809	35215700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_35218446_35219142_35219182_35219719
tx.8219	chr17	-	2885	3	Intergenic	novelGene_657	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	153.5	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTTGTCTGTTTCTTTTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35219817	35215700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_35218446_35219142_35219185_35219719
tx.822	chr1	+	350	2	ISM	ENSMUSG00000026480.13	ENSMUST00000027754.7	2596	15	27219	735	11540	-735	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATGACAACTCAGAAGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152710859	152712006	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_152710956_152711752
tx.8220	chr17	-	608	2	Intergenic	novelGene_658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAAAAGAAAGGGGGGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35219817	35218674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_35219185_35219719
tx.8221	chr17	-	536	4	NIC	ENSMUSG00000036185.10	novel	665	5	NA	NA	-17	-1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	3	junction_3	24.4449494897321	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCCTTTGGTTTGGCTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35246907	35244935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_35245124_35245313_35245434_35245669_35245763_35246772
tx.8222	chr17	-	677	5	FSM	ENSMUSG00000036185.10	ENSMUST00000174037.8	665	5	-13	1	-13	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_4	14.8218588577816	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCCTTTGGTTTGGCTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35246903	35244935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35245124_35245313_35245434_35245669_35245763_35246419_35246565_35246772
tx.8223	chr17	-	601	4	FSM	ENSMUSG00000036185.10	ENSMUST00000173211.8	618	4	16	1	16	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_3	4.54606056566195	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCCTTTGGTTTGGCTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35246619	35244935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35245124_35245313_35245434_35245669_35245763_35246419
tx.8224	chr17	-	869	4	FSM	ENSMUSG00000036185.10	ENSMUST00000174117.2	651	4	85	-303	-17	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	16.4181471413663	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AAAGCCTTTGGTTTGGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35246907	35244937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35245434_35245669_35245763_35246419_35246565_35246772
tx.8225	chr17	-	856	4	FSM	ENSMUSG00000036185.10	ENSMUST00000040151.9	935	4	89	-10	-13	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	19	junction_3	16.4181471413663	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAAAAAGCCTTTGGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35246903	35244942	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35245434_35245669_35245763_35246419_35246561_35246772
tx.8226	chr17	-	597	5	NIC	ENSMUSG00000007035.16	novel	2391	11	NA	NA	0	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	6.86931583201704	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTAGACAGCTTATTTTATT	1770	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35265721	35258121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_35258395_35260445_35260492_35263000_35263111_35263292_35263415_35265675
tx.8227	chr17	+	1155	6	FSM	ENSMUSG00000007041.10	ENSMUST00000007257.10	1466	6	289	22	289	-22	multi-exon	TRUE	canonical	3	1084	junction_1	70.1524055182714	5322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTAGTGTTGTTTTTACACA	1965	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35269230	35277703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35269463_35271410_35271521_35271756_35271883_35272008_35272116_35274202_35274385_35277305
tx.8228	chr17	+	1310	7	FSM	ENSMUSG00000007039.13	ENSMUST00000007255.13	1342	7	36	-4	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	393	junction_1	36.6488593122472	3306	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCTGTGACTGGTTTCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35278046	35281071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35278249_35279078_35279438_35279578_35279679_35279808_35279883_35279980_35280101_35280451_35280602_35280766
tx.8229	chr17	+	1109	6	ISM	ENSMUSG00000007039.13	ENSMUST00000007255.13	1342	7	1067	-4	286	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	436	junction_2	25.772853935876	1033	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGGCTGTGACTGGTTTCTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35279077	35281071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_35279438_35279578_35279679_35279808_35279883_35279980_35280101_35280451_35280602_35280766
tx.823	chr1	-	1479	8	ISM	ENSMUSG00000042772.16	ENSMUST00000111836.4	3928	23	-8	19490	-8	-12434	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_7	20.4869296312133	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGAAGCAGCAGCAGCAAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152778405	152734110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_152734766_152735102_152735254_152736200_152736273_152737431_152737604_152742331_152742465_152744002_152744121_152746510_152746543_152778259
tx.8230	chr17	+	1072	4	NNC	ENSMUSG00000092586.9	novel	962	3	NA	NA	-56	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	2.16024689946929	18	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTTGTGTTTATTGTTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35284307	35289026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_35284420_35286302_35286421_35287842_35287954_35288295
tx.8231	chr17	-	634	3	NNC	ENSMUSG00000073413.10	novel	546	3	NA	NA	829	101	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	8	junction_2	7	87	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTCGTTTGGGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35296203	35290317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_35290736_35293150_35293289_35296125
tx.8232	chr17	-	821	3	FSM	ENSMUSG00000073413.10	ENSMUST00000172639.8	690	3	4	-135	4	101	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	7	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTTCGTTTGGGTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35297037	35290317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35290736_35293150_35293289_35296772
tx.8233	chr17	+	1989	20	FSM	ENSMUSG00000007036.16	ENSMUST00000007251.14	1945	20	-44	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	106	junction_5	22.1293102285439	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGCTGCTTATGAGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35308222	35321963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35308433_35309344_35309402_35309997_35310065_35310546_35310634_35313226_35313313_35315279_35315354_35315457_35315581_35317669_35317785_35317874_35317977_35319310_35319375_35319614_35319665_35319937_35320062_35320217_35320323_35320517_35320582_35320803_35320861_35320945_35321009_35321121_35321199_35321273_35321373_35321450_35321498_35321645
tx.8234	chr17	+	707	3	FSM	ENSMUSG00000034482.3	ENSMUST00000037849.3	509	3	-16	-182	-16	182	multi-exon	TRUE	canonical	2	3	junction_1	2.5	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTCGTCTCCTCTGATGG	6695	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35327238	35331149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35327397_35329642_35329808_35330765
tx.8235	chr17	-	925	7	FSM	ENSMUSG00000024387.14	ENSMUST00000025246.13	961	7	36	0	36	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	826	junction_1	47.9780042195264	8858	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGCTGTCTCCTACTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35340226	35335173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35335402_35336671_35336862_35336971_35337048_35337434_35337551_35338729_35338833_35339420_35339504_35340097
tx.8236	chr17	+	1256	3	NIC	ENSMUSG00000092417.4	novel	1518	3	NA	NA	15	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	40	junction_1	24	164	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTTTACTTTCTTGAAT	4604	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35340473	35343791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_35340527_35342028_35342636_35343195
tx.8237	chr17	+	1479	3	FSM	ENSMUSG00000092417.4	ENSMUST00000165306.3	1518	3	40	-1	40	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	21.5	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTTTACTTTCTTGAAT	4629	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35340498	35343791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35340775_35342028_35342636_35343195
tx.8238	chr17	+	1204	2	FSM	ENSMUSG00000092417.4	ENSMUST00000052167.9	1295	2	100	-9	100	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	0	161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTGTTTACTTTCTTGAAT	6158	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35342027	35343791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35342636_35343195
tx.8239	chr17	+	274	2	FSM	ENSMUSG00000043311.8	ENSMUST00000174311.2	346	2	-52	124	-52	-124	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTGAAACTTGGGGTGCT	2115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35345296	35345762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35345427_35345618
tx.824	chr1	-	1815	7	NIC	ENSMUSG00000042772.16	novel	3928	23	NA	NA	-10	-12437	intron_retention	FALSE	canonical	3	249	junction_6	20.8199957306005	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAGAAGCAGCAGCAGCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152778407	152734113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_152735254_152736200_152736273_152737431_152737604_152742331_152742465_152744002_152744121_152746510_152746543_152778259
tx.8240	chr17	-	387	4	ISM	ENSMUSG00000024391.8	ENSMUST00000025249.7	1013	6	1162	0	1162	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	34	junction_2	3.55902608401044	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCTGGGTTTTGTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35349864	35347972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_35348112_35349055_35349155_35349383_35349483_35349814
tx.8241	chr17	-	895	6	FSM	ENSMUSG00000024391.8	ENSMUST00000025249.7	1013	6	118	0	118	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_5	5.65685424949238	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCTGGGTTTTGTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35350908	35347972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35348112_35349055_35349155_35349383_35349483_35349814_35349895_35350170_35350326_35350585
tx.8242	chr17	-	658	3	ISM	ENSMUSG00000024393.15	ENSMUST00000173558.2	763	5	426	-101	426	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	504	junction_1	7.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGGAAAGTCATGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35368916	35368051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_35368378_35368485_35368577_35368675
tx.8243	chr17	-	1126	7	ISM	ENSMUSG00000024393.15	ENSMUST00000025253.12	6888	31	13990	0	45	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	439	junction_4	35.7619443915829	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGGGGAAAGTCATGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35369883	35368051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_35368378_35368485_35368577_35368675_35368771_35368884_35369098_35369203_35369303_35369473_35369685_35369792
tx.8244	chr17	-	586	2	ISM	ENSMUSG00000024393.15	ENSMUST00000174805.2	6741	29	3613	9331	3613	-1286	internal_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCTCGCTTCCAGCGGCAG	1934	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35378332	35377394	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_35377560_35377911
tx.8245	chr17	-	492	3	ISM	ENSMUSG00000024393.15	ENSMUST00000025253.12	6888	31	24	13126	24	-5069	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_1	2	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAGATAGCTGTGGGACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35383849	35381177	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_35381356_35381847_35382023_35383710
tx.8246	chr17	-	413	4	FSM	ENSMUSG00000073412.7	ENSMUST00000097336.5	415	4	0	2	0	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_2	1.24721912892465	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATCAGGCTTCTCTATATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35407415	35404072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35404287_35405560_35405581_35405921_35406018_35407332
tx.8247	chr17	+	1134	3	NNC	ENSMUSG00000024399.6	novel	1160	3	NA	NA	-7548	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCGGCCCTTGCCAGTGTCTT	5183	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35405866	35415281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_35406083_35414025_35414342_35414679
tx.8248	chr17	-	1452	4	FSM	ENSMUSG00000042419.9	ENSMUST00000048994.7	1447	4	-5	0	-5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_2	9.89949493661167	153	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCAGAGTCTCCTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35454773	35439150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35439953_35440112_35440335_35453927_35454208_35454625
tx.8249	chr17	+	1688	11	FSM	ENSMUSG00000019432.16	ENSMUST00000068056.12	1739	11	27	24	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2129	junction_1	149.184985839729	6010	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACCGTGTCTGTGGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35460748	35472659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35460829_35462088_35462427_35463111_35463240_35463431_35463525_35465912_35466097_35467926_35468046_35470222_35470355_35471722_35471833_35471939_35472085_35472182_35472331_35472448
tx.825	chr1	-	328	3	ISM	ENSMUSG00000042772.16	ENSMUST00000111836.4	3928	23	-62	29404	-62	-22348	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	249	junction_2	20	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	ACAAGAAAGTAGAACAGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152778459	152744024	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_152744121_152746510_152746543_152778259
tx.8250	chr17	+	1610	10	FSM	ENSMUSG00000019432.16	ENSMUST00000173731.8	2848	10	1241	-3	444	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2134	junction_3	141.063246475377	675	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAACCGTGTCTGTGGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35462086	35472659	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35462427_35463111_35463240_35463431_35463525_35465912_35466097_35467926_35468046_35470222_35470355_35471722_35471833_35471939_35472085_35472182_35472331_35472448
tx.8251	chr17	+	1593	8	FSM	ENSMUSG00000073411.13	ENSMUST00000172785.8	2102	8	366	143	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_3	6.54341856605645	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAAAGTGACCTTGATTG	2085	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35482071	35486332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35482163_35482354_35482625_35482814_35483091_35484759_35485036_35485162_35485280_35485457_35485491_35485663_35485703_35485841
tx.8252	chr17	+	1605	7	NNC	ENSMUSG00000073411.13	novel	2102	8	NA	NA	0	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	18.033918659632	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGAAAGTGACCTTGATTG	2085	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35482071	35486332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_35482163_35482354_35482625_35482814_35483091_35484759_35485036_35485162_35485325_35485663_35485703_35485841
tx.8253	chr17	-	428	2	NNC	ENSMUSG00000079505.3	novel	3122	2	NA	NA	3191	80537	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATTAAATATATGATTTCAAA	2609	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35596077	35515459	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_35515700_35595889
tx.8254	chr17	+	1665	6	NIC	ENSMUSG00000091705.9	novel	1150	5	NA	NA	876	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	1	3	junction_4	2.33238075793812	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCTCTGTGTTTGTTTCTGTT	5756	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35562093	35565738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_35562365_35563730_35564007_35564133_35564251_35564429_35564463_35564635_35564685_35564819
tx.8255	chr17	+	934	4	NIC	ENSMUSG00000067235.15	novel	1473	7	NA	NA	866	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_3	3.09120616516523	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCCAGAGTCTGTGTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35781859	35785452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_35781999_35783979_35784256_35784382_35784487_35785037
tx.8256	chr17	+	1346	5	FSM	ENSMUSG00000024406.17	ENSMUST00000025271.17	1362	5	14	2	14	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3795	junction_3	232.519354033164	18422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAGCTGAATTTTGTTTTC	3050	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35816928	35821667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_35817381_35819999_35820121_35820304_35820436_35820877_35821037_35821184
tx.8257	chr17	-	704	2	ISM	ENSMUSG00000050410.16	ENSMUST00000160885.2	1732	4	2059	-3	1821	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCGTTGAATCTAAGTCT	9971	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35825623	35823630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_35824082_35825370
tx.8258	chr17	-	1663	4	FSM	ENSMUSG00000050410.16	ENSMUST00000161012.8	1665	4	7	-5	3	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_3	21.6846079563875	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGAATCTAAGTCTGCTTT	9340	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35827714	35823625	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35824082_35825370_35825918_35826774_35827328_35827607
tx.8259	chr17	-	1624	4	NIC	ENSMUSG00000050410.16	novel	1665	4	NA	NA	-7	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	33	junction_3	19.7989898732233	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGCGTTGAATCTAAGTCT	9326	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35827728	35823630	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_35824082_35825370_35825918_35826774_35827328_35827655
tx.826	chr1	-	486	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042751.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTGTGTCCTGTACTTGGG	3376	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152867832	152866077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_152866430_152867236_152867319_152867780
tx.8260	chr17	+	1498	3	NNC	ENSMUSG00000039269.6	novel	1290	2	NA	NA	-3384	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCTCCGCGTCAGTTTC	25	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35874962	35879849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_35875226_35878401_35878518_35878730
tx.8261	chr17	-	611	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000090509.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTATTAGTATATTAGTGT	1737	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35914638	35913930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_35914380_35914476
tx.8262	chr17	-	3657	29	FSM	ENSMUSG00000038838.16	ENSMUST00000043674.15	4425	29	17	751	17	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_15	44.4260449442414	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGCAAGTGTGAGCCTTTACT	1778	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35978467	35967276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35967545_35967627_35967751_35967841_35968018_35968098_35968211_35969023_35969231_35969918_35970072_35970153_35970282_35970366_35970446_35970543_35970613_35970691_35970797_35970893_35971020_35971105_35971177_35971295_35971402_35971615_35971692_35971767_35971845_35972466_35972549_35972793_35972898_35972994_35973123_35973895_35973987_35974353_35974443_35974962_35975075_35975387_35975508_35975662_35975745_35976677_35976776_35976864_35976932_35977022_35977145_35977546_35977648_35977735_35977818_35977964
tx.8263	chr17	-	1653	14	FSM	ENSMUSG00000001524.15	ENSMUST00000001565.15	1679	14	24	2	-12	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	142	junction_8	17.8418429806661	241	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACGCGGCTTCAGACGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35984607	35978623	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_35978895_35979319_35979399_35979501_35979550_35980200_35980332_35980520_35980654_35980839_35980924_35981081_35981151_35981256_35981369_35981548_35981638_35981757_35981855_35982117_35982250_35982884_35982990_35983577_35983721_35984447
tx.8264	chr17	+	1125	2	FSM	ENSMUSG00000003541.7	ENSMUST00000003635.7	1131	2	0	6	0	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCAGTTCTCGAAGTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36132575	36133809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_36132821_36132929
tx.8265	chr17	+	1707	13	FSM	ENSMUSG00000059714.14	ENSMUST00000001569.15	1825	13	112	6	-5	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_8	11.7434970184448	230	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGTTATCTATACTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36134233	36143677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_36134394_36134698_36134756_36135018_36135095_36135170_36135262_36135457_36135602_36135724_36135845_36136322_36136419_36136629_36136783_36140734_36140917_36141010_36141057_36141545_36141684_36141834_36142000_36143398
tx.8266	chr17	+	1626	13	NIC	ENSMUSG00000059714.14	novel	651	8	NA	NA	-12	-9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	2	junction_1	54.6198986939131	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTTATCTATACTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36134405	36143674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_36134488_36134698_36134756_36135018_36135095_36135170_36135262_36135457_36135602_36135724_36135845_36136322_36136419_36136629_36136783_36140734_36140917_36141010_36141057_36141545_36141684_36141834_36142000_36143398
tx.8267	chr17	-	1691	4	FSM	ENSMUSG00000001525.11	ENSMUST00000001566.10	2649	4	74	884	-15	800	multi-exon	FALSE	canonical	3	8733	junction_1	667.796376150695	12382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTCCTTTCTCTTTCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36149124	36145696	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36146932_36147054_36147166_36147519_36147629_36148888
tx.8268	chr17	+	975	4	NNC	ENSMUSG00000061607.16	novel	7335	16	NA	NA	-29	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	63.7024332345319	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTCCTGCAGTGAATTA	9361	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36152538	36170562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_36152572_36155323_36155463_36156730_36156784_36169812
tx.8269	chr17	+	1033	4	NNC	ENSMUSG00000061607.16	novel	422	3	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	66.2872536767062	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTCCTGCAGTGAATTA	9389	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36152566	36170562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_36152658_36155323_36155463_36156730_36156784_36169812
tx.827	chr1	+	662	3	NNC	ENSMUSG00000042751.15	novel	4626	11	NA	NA	-3142	3522	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_2	8.5	66	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGAGCGTCCCACATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152966083	152973865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_152966288_152969782_152969860_152973484
tx.8270	chr17	+	1436	4	FSM	ENSMUSG00000059791.15	ENSMUST00000074259.15	1466	4	28	2	8	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_1	13.2748718344933	616	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATCCACTTGTCTGTCCATG	4617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36172237	36176292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_36172410_36174330_36174528_36175003_36175181_36175402
tx.8271	chr17	+	1741	3	FSM	ENSMUSG00000034595.18	ENSMUST00000190496.2	1395	3	-344	-2	-344	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	4	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCTGCCTTCCTTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36178950	36186488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_36179678_36184617_36184832_36185688
tx.8272	chr17	+	1085	3	NNC	ENSMUSG00000034595.18	novel	3524	3	NA	NA	1968	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	41	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCTGCCTTCCTTTGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36181262	36186488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_36181334_36184617_36184832_36185688
tx.8273	chr17	+	1023	7	ISM	ENSMUSG00000024422.15	ENSMUST00000025292.15	3351	20	8094	0	-23	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1011	junction_1	73.3325757536626	3207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCCTTATGTCATTGCTT	7359	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36198804	36203562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_36198890_36198975_36199095_36199246_36199315_36200089_36200253_36200330_36200493_36201806_36201981_36203310
tx.8274	chr17	+	1013	6	ISM	ENSMUSG00000024422.15	ENSMUST00000025292.15	3351	20	8190	0	-17	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1016	junction_3	64.0387382761403	299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGCCTTATGTCATTGCTT	7455	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36198900	36203562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_36199095_36199246_36199315_36200089_36200253_36200330_36200493_36201806_36201981_36203310
tx.8275	chr17	-	1054	5	FSM	ENSMUSG00000050705.16	ENSMUST00000146451.8	2081	5	1037	-10	-154	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	307	junction_3	46.1756158594555	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGGTTTTCACGTCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36206966	36203568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36203859_36203931_36204002_36205810_36206012_36206175_36206265_36206562
tx.8276	chr17	-	1124	6	NIC	ENSMUSG00000050705.16	novel	1193	6	NA	NA	4	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	32	junction_5	147.212227752996	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGGTTTTCACGTCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36208008	36203568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_36203859_36203931_36204002_36205810_36206012_36206175_36206265_36206562_36206965_36207936
tx.8277	chr17	-	1184	6	FSM	ENSMUSG00000050705.16	ENSMUST00000148482.8	1193	6	9	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_5	123.227269709265	224	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGGTTTTCACGTCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36208003	36203568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36203859_36203931_36204002_36205810_36206012_36206175_36206265_36206562_36206965_36207871
tx.8278	chr17	-	1242	6	FSM	ENSMUSG00000050705.16	ENSMUST00000148721.8	1293	6	51	0	51	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_5	90.4765162901402	287	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCAGGTTTTCACGTCACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36208272	36203568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36203859_36203931_36204002_36205810_36206012_36206175_36206265_36206562_36206965_36208082
tx.8279	chr17	-	1082	7	FSM	ENSMUSG00000024436.17	ENSMUST00000025305.16	1079	7	-4	1	-4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1264	junction_4	57.4071714451542	6235	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGACTCCCTTTGGGCTG	4292	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36227285	36221271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36221849_36222310_36222371_36223229_36223297_36225225_36225295_36225383_36225482_36225587_36225697_36227183
tx.828	chr1	+	421	3	FSM	ENSMUSG00000042751.15	ENSMUST00000190960.2	539	3	-15	133	-15	-133	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_2	72	209	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TAGGTGTGGCTTGTTTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152969210	152970210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_152969301_152969782_152969860_152969956
tx.8280	chr17	-	1924	4	FSM	ENSMUSG00000038500.16	ENSMUST00000172429.8	1878	4	-46	0	-46	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	103	junction_2	20.5101600838869	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTTCTCTCATTTCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36289909	36283432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36284696_36285414_36285706_36289272_36289336_36289602
tx.8281	chr17	+	1982	12	FSM	ENSMUSG00000024429.10	ENSMUST00000087200.4	2848	12	271	595	-266	-595	multi-exon	FALSE	canonical	3	575	junction_1	37.9601792225955	251	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCTTCCCCAGGTGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36291013	36299759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_36291140_36291508_36291675_36291953_36292091_36292198_36292351_36292449_36292522_36293416_36293625_36293838_36293935_36294286_36294482_36298356_36298536_36298616_36298780_36299004_36299146_36299412
tx.8282	chr17	+	1670	10	ISM	ENSMUSG00000024429.10	ENSMUST00000087200.4	2848	12	1233	593	696	-593	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	585	junction_5	37.9046887877841	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTTCCCCAGGTGGCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36291975	36299761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_36292091_36292198_36292351_36292449_36292522_36293416_36293625_36293838_36293935_36294286_36294482_36298356_36298536_36298616_36298780_36299004_36299146_36299412
tx.8283	chr17	+	860	5	ISM	ENSMUSG00000024429.10	ENSMUST00000087200.4	2848	12	3709	595	3172	-595	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	612	junction_2	28.4901298698339	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCTTCCCCAGGTGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36294451	36299759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_36294482_36298356_36298536_36298616_36298780_36299004_36299146_36299412
tx.8284	chr17	+	797	4	ISM	ENSMUSG00000024429.10	ENSMUST00000087200.4	2848	12	7647	595	7110	-595	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	612	junction_1	30.4302481094059	127	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCCTTCCCCAGGTGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36298389	36299759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_36298536_36298616_36298780_36299004_36299146_36299412
tx.8285	chr17	+	746	2	FSM	ENSMUSG00000092604.2	ENSMUST00000172480.2	487	2	26	-285	26	285	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTGCGTTGCTGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36302784	36304915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_36303117_36304501
tx.8286	chr17	-	866	4	ISM	ENSMUSG00000073406.11	ENSMUST00000173080.10	1138	6	732	-79	702	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_3	156.853080584631	248	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTTTCCTGCATTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36394383	36391001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_36391216_36391890_36392008_36392133_36392410_36394124
tx.8287	chr17	-	1243	6	FSM	ENSMUSG00000073406.11	ENSMUST00000173080.10	1138	6	-26	-79	-26	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_4	160.992670640623	261	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTTTCCTGCATTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36395141	36391001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36391216_36391890_36392008_36392133_36392410_36394124_36394401_36394587_36394858_36395051
tx.8288	chr17	-	934	5	FSM	ENSMUSG00000073406.11	ENSMUST00000195833.6	829	5	-26	-79	-26	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_4	176.893329438959	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTTTCCTGCATTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36395141	36391001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36391216_36391890_36392008_36392133_36392410_36394587_36394825_36395051
tx.8289	chr17	-	967	5	FSM	ENSMUSG00000073406.11	ENSMUST00000194244.6	862	5	-26	-79	-26	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	214	junction_3	129.95191418367	629	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTTTCCTGCATTGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36395141	36391001	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36391216_36391890_36392008_36392133_36392410_36394587_36394858_36395051
tx.829	chr1	+	846	5	NIC	ENSMUSG00000042751.15	novel	539	3	NA	NA	-18	-3091	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	201	junction_1	18.7799760383234	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTGTGTGTGAGTGTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152969207	152991819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_152969301_152969782_152969860_152987887_152987990_152988125_152988194_152991313
tx.8290	chr17	+	662	2	NNC	ENSMUSG00000092474.2	novel	1031	3	NA	NA	-178	-237	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACTGTGGTATACTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36478695	36482460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_36479105_36482207
tx.8291	chr17	-	526	5	FSM	ENSMUSG00000024446.14	ENSMUST00000025319.7	729	5	202	1	-11	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	621	junction_3	61.4262769505038	3636	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTCTGTGGTATCTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36568759	36566559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36566691_36566835_36566962_36568333_36568417_36568497_36568599_36568674
tx.8292	chr17	-	585	4	FSM	ENSMUSG00000024446.14	ENSMUST00000173486.8	579	4	-7	1	5	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	621	junction_3	70.7153920067383	358	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTCTGTGGTATCTCAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36568742	36566559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36566691_36566835_36566962_36568333_36568417_36568497
tx.8293	chr17	-	426	4	FSM	ENSMUSG00000024446.14	ENSMUST00000077535.5	437	4	-11	22	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_3	333.755399456948	361	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTCTGTGGTATCTCAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36568759	36566558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36566691_36566835_36566962_36568333_36568417_36568674
tx.8294	chr17	-	3051	7	FSM	ENSMUSG00000045409.17	ENSMUST00000113706.10	3204	7	146	7	-38	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	8.81286937760152	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGTGATCTCTTGAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36582313	36569771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36571814_36572382_36572499_36573001_36573025_36574620_36574852_36578016_36578113_36579500_36579959_36582228
tx.8295	chr17	-	1504	5	FSM	ENSMUSG00000045409.17	ENSMUST00000113704.10	1465	5	-38	-1	-38	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	19.421315609402	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTCATTGTGTTTGTCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36582313	36573495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_36574130_36574620_36574852_36578016_36578113_36579500_36579959_36582228
tx.8296	chr17	+	492	2	ISM	ENSMUSG00000024457.17	ENSMUST00000134325.8	4338	5	6	18161	1	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_1	0	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAGAAATGTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37148038	37148762	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_37148157_37148388
tx.8297	chr17	+	3185	8	NNC	ENSMUSG00000024457.17	novel	3203	10	NA	NA	1	8	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_5	89.3383844647725	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTCAAGACAGTCATCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37148038	37170280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_37148157_37148356_37148465_37161547_37162021_37162118_37162215_37163354_37163607_37167547_37167664_37167880_37167914_37168291
tx.8298	chr17	+	529	2	FSM	ENSMUSG00000024457.17	ENSMUST00000124307.2	522	2	6	-13	-1	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AGAAAAGAAAAGAAATGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37148031	37148760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_37148157_37148356
tx.8299	chr17	+	3149	8	NNC	ENSMUSG00000024457.17	novel	3187	10	NA	NA	-12	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_5	94.4031735889926	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCATCTGGTGCTGTCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37148052	37170290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_37148157_37148388_37148465_37161547_37162021_37162118_37162215_37163354_37163607_37167547_37167664_37167880_37167914_37168291
tx.83	chr1	+	1105	5	FSM	ENSMUSG00000025933.16	ENSMUST00000027065.12	1168	5	63	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_4	3.08220700148449	319	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCTCATTCATTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21288861	21300391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_21289114_21295781_21295868_21296168_21296271_21296815_21296904_21299814
tx.830	chr1	+	533	3	NNC	ENSMUSG00000042751.15	novel	539	3	NA	NA	0	3522	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	42	junction_2	79.5	116	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGAGCGTCCCACATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152969225	152973865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_152969301_152969782_152969860_152973484
tx.8300	chr17	+	1879	4	FSM	ENSMUSG00000036492.13	ENSMUST00000040498.12	1579	4	127	-427	-10	427	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	1.4142135623731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGGGTTTTGCTGATTTCT	6984	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37253936	37259305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_37254343_37256065_37256089_37256295_37256388_37257947
tx.8301	chr17	-	636	3	FSM	ENSMUSG00000036398.14	ENSMUST00000040402.14	1599	3	29	934	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	708	junction_2	5	2702	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCATTGCCTCCGTTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37262576	37260181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_37260447_37260768_37260878_37262314
tx.8302	chr17	-	742	4	FSM	ENSMUSG00000036315.14	ENSMUST00000113669.9	742	4	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	586	junction_1	61.9157133170212	388	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGATGTTATGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37269374	37265247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_37265445_37268457_37268568_37268723_37268825_37269040
tx.8303	chr17	-	664	5	FSM	ENSMUSG00000036315.14	ENSMUST00000172518.8	710	5	48	-2	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	583	junction_4	61.4532342517463	3074	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTGATGTTATGTGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37269377	37265247	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_37265445_37268457_37268568_37268723_37268825_37269040_37269189_37269269
tx.8304	chr17	+	988	3	NNC	ENSMUSG00000036214.15	novel	976	3	NA	NA	-5	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	121.5	423	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGCTAATGGTACCATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37269478	37276517	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_37269599_37275248_37275325_37275725
tx.8305	chr17	+	1311	3	FSM	ENSMUSG00000036214.15	ENSMUST00000172672.8	652	3	23	-682	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_1	106.5	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTTTGCTAATGGTACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37269533	37276515	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_37269979_37275248_37275325_37275725
tx.8306	chr17	-	1962	4	FSM	ENSMUSG00000024459.19	ENSMUST00000145260.2	2459	4	775	-278	283	278	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_1	46.3680924774785	272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTTAAGTGAGACTGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37299654	37294674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_37295995_37298307_37298416_37298546_37298823_37299396
tx.8307	chr17	+	1666	5	NNC	ENSMUSG00000036036.16	novel	1749	5	NA	NA	-4	-20	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1406.78256582174	521	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGGGAGGGGAGGTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37313441	37321504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_37313632_37314177_37314208_37315688_37315796_37316941_37317087_37320310
tx.8308	chr17	+	1704	5	FSM	ENSMUSG00000036036.16	ENSMUST00000069250.14	1749	5	25	20	-4	-20	multi-exon	FALSE	canonical	3	426	junction_1	1286.78268852981	907	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGGGAGGGGAGGTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37313441	37321504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_37313670_37314177_37314208_37315688_37315796_37316941_37317087_37320310
tx.8309	chr17	+	1652	4	NIC	ENSMUSG00000036036.16	novel	375	4	NA	NA	0	-20	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1458.01973771124	220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAAGGGGAGGGGAGGTCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37313445	37321504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_37313652_37315688_37315796_37316941_37317087_37320310
tx.831	chr1	+	525	3	NNC	ENSMUSG00000042751.15	novel	4638	12	NA	NA	306	3522	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	13	75	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGAGCGTCCCACATTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	152969531	152973865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_152969599_152969782_152969860_152973484
tx.8310	chr17	+	1614	4	FSM	ENSMUSG00000024462.18	ENSMUST00000174456.8	1595	4	-17	-2	-9	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	13.0213499897497	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTGTAATTTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37356902	37360361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_37357182_37357586_37357669_37358345_37358550_37359312
tx.8311	chr17	+	1371	4	NNC	ENSMUSG00000024462.18	novel	1460	3	NA	NA	6	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	5	junction_1	31.5629881700422	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTGTAATTTGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37357465	37360361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_37357502_37357586_37357669_37358345_37358550_37359312
tx.8312	chr17	+	1463	3	FSM	ENSMUSG00000024462.18	ENSMUST00000172789.2	1460	3	-2	-1	-2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	4.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTTTTGTAATTTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37357457	37360360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_37357669_37358345_37358550_37359312
tx.8313	chr17	+	456	4	NNC	ENSMUSG00000092390.2	novel	1406	3	NA	NA	-13773	-1056	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_2	1.4142135623731	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TACAAATACATAAAAGGATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38306764	38322231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_38306872_38320538_38320666_38320869_38320931_38322070
tx.8314	chr17	+	632	4	NNC	ENSMUSG00000092390.2	novel	1406	3	NA	NA	-13775	-1045	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	12.7279220613579	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAGGATACACAGTGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38306762	38322242	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_38307035_38320538_38320666_38320869_38320931_38322070
tx.8315	chr17	-	1463	9	FSM	ENSMUSG00000023919.10	ENSMUST00000087114.5	1942	9	476	3	476	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_2	14.1283181943216	364	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTGATGTGTGAGTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41245462	41233944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_41234508_41235179_41235258_41235392_41235513_41238029_41238160_41240904_41240971_41242540_41242668_41243686_41243742_41243971_41244107_41245273
tx.8316	chr17	+	3343	13	FSM	ENSMUSG00000023921.10	ENSMUST00000169611.4	3674	13	0	331	0	-331	multi-exon	FALSE	canonical	3	278	junction_5	30.8112533554436	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACTCTTGTAGTGTGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41245575	41272548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_41245671_41247934_41248354_41249405_41249774_41252206_41252365_41254697_41254870_41257912_41258162_41262645_41262758_41263669_41263786_41265992_41266109_41267097_41267230_41269220_41269369_41269592_41269761_41271458
tx.8317	chr17	+	2506	12	ISM	ENSMUSG00000023921.10	ENSMUST00000169611.4	3674	13	2359	1073	2359	-1073	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	278	junction_4	32.142760068068	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTCTGAAAATCATTTATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41247934	41271806	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_41248354_41249405_41249774_41252206_41252365_41254697_41254870_41257912_41258162_41262645_41262758_41263669_41263786_41265992_41266109_41267097_41267230_41269220_41269369_41269592_41269761_41271458
tx.8318	chr17	+	1944	8	ISM	ENSMUSG00000023921.10	ENSMUST00000169611.4	3674	13	12527	328	-7976	-328	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	311	junction_2	28.4726865179776	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTTGTAGTGTGATGTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41258102	41272551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_41258162_41262645_41262758_41263669_41263786_41265992_41266109_41267097_41267230_41269220_41269369_41269592_41269761_41271458
tx.8319	chr17	+	1101	2	ISM	ENSMUSG00000023921.10	ENSMUST00000169611.4	3674	13	24162	343	3659	-343	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	326	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAGTCTGAAGAACTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41269737	41272536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_41269761_41271458
tx.832	chr1	-	2319	6	NNC	ENSMUSG00000026479.14	novel	4916	23	NA	NA	-3232	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_5	46.8529614859082	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGCTGAGTTTCTGATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153006212	152998503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_153000030_153002561_153002662_153002751_153002911_153004702_153004903_153005781_153005897_153005993
tx.8320	chr17	-	649	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000023915.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGGTTACTTAAAGCATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43351085	43329897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_43330346_43350884
tx.8321	chr17	+	1872	3	NNC	ENSMUSG00000023915.6	novel	3627	6	NA	NA	60718	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	6	junction_1	116.5	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGTGTGGTTTTGGTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43388176	43400080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_43388373_43396226_43396456_43398633
tx.8322	chr17	+	994	4	ISM	ENSMUSG00000039601.17	ENSMUST00000044895.13	3226	5	32265	2122	32265	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	10	junction_1	4.18993502999218	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATATCTCTGTTCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44147158	44348281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_44147389_44328657_44328832_44331843_44332016_44347863
tx.8323	chr17	+	2523	4	FSM	ENSMUSG00000023960.14	ENSMUST00000024756.5	2534	4	19	-8	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	7.40870359029762	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGTGTTTTGTTTTGCTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44389754	44397458	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_44389874_44391537_44392402_44393634_44393812_44396095
tx.8324	chr17	+	1620	3	ISM	ENSMUSG00000023960.14	ENSMUST00000024756.5	2534	4	21	3177	-13	-3177	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_2	5.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGGAAGGCTGTTTCCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44389756	44394273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_44389874_44391537_44392402_44393634
tx.8325	chr17	-	1777	4	FSM	ENSMUSG00000023961.17	ENSMUST00000143137.2	4445	4	-49	2717	-4	-2717	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_3	11.5854314646552	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAACTTGAGTCCTTCTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44416704	44409923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_44410569_44412201_44412373_44412697_44413556_44416601
tx.8326	chr17	+	392	2	Intergenic	novelGene_661	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAAGTTTGTTCTAATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44416785	44417274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_44416959_44417055
tx.8327	chr17	+	1448	12	FSM	ENSMUSG00000038954.15	ENSMUST00000050630.14	1508	12	57	3	57	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_7	13.7774519348892	265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGGGAGTGGCCTGCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45088095	45430174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_45088316_45097496_45097598_45234065_45234151_45302620_45302708_45305203_45305295_45313976_45314117_45344124_45344201_45347598_45347712_45348962_45349071_45352102_45352274_45359168_45359280_45430029
tx.8328	chr17	-	2837	16	FSM	ENSMUSG00000023932.10	ENSMUST00000024727.10	3027	16	187	3	-9	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	561	junction_9	75.0022221893014	258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGAGTGTAGCCTTTTGTTT	2371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45744476	45702812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_45703231_45703918_45704132_45715519_45715718_45718721_45718965_45719261_45719343_45721699_45721865_45722753_45722917_45724047_45724197_45726478_45726668_45727870_45728016_45730526_45730746_45735426_45735527_45736777_45736906_45737445_45737608_45738864_45738969_45744316
tx.8329	chr17	-	727	6	ISM	ENSMUSG00000023932.10	ENSMUST00000024727.10	3027	16	187	27863	-9	8029	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	580	junction_1	48.2493523272593	150	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGAGGCGTTGATTATAA	2371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45744476	45730672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_45730746_45735426_45735527_45736777_45736906_45737445_45737608_45738864_45738969_45744316
tx.833	chr1	-	1378	2	ISM	ENSMUSG00000026479.14	ENSMUST00000185356.7	4916	23	48748	12879	-10065	-9537	internal_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTTGATTCCCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153013045	153011380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_153012650_153012936
tx.8330	chr17	+	561	2	FSM	ENSMUSG00000097119.3	ENSMUST00000233673.2	2578	2	-50	2067	-16	39	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGACACACATTTTTAATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45744740	45747156	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_45745154_45747008
tx.8331	chr17	+	3343	22	FSM	ENSMUSG00000023938.9	ENSMUST00000024733.9	3349	22	-3	9	-3	-9	multi-exon	TRUE	canonical	3	146	junction_8	22.4045468336421	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGGTGTATGTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45817763	45831760	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_45818008_45818444_45818637_45819406_45819553_45819790_45819959_45820321_45820467_45825417_45825564_45825710_45825820_45826170_45826210_45826325_45826438_45826870_45827005_45827378_45827524_45827746_45827920_45828027_45828142_45828238_45828380_45828618_45828757_45828837_45828948_45829075_45829185_45829463_45829587_45829780_45829892_45830438_45830523_45830629_45830741_45831211
tx.8332	chr17	+	648	2	ISM	ENSMUSG00000023938.9	ENSMUST00000024733.9	3349	22	12880	4	4103	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	196	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTATGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45830646	45831765	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_45830741_45831211
tx.8333	chr17	+	874	4	FSM	ENSMUSG00000037089.12	ENSMUST00000226086.2	850	4	-24	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_3	186.912338335976	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGAGCCAGCTCTAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45874861	45876981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_45874995_45875505_45875700_45875850_45876006_45876589
tx.8334	chr17	+	1842	4	FSM	ENSMUSG00000037089.12	ENSMUST00000224905.2	1906	4	65	-1	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	396	junction_3	17.6823829464998	327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTTTTGGTTGGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45874864	45878597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_45874995_45875505_45875700_45875850_45876006_45877234
tx.8335	chr17	+	1451	3	ISM	ENSMUSG00000037089.12	ENSMUST00000226086.2	850	4	-17	0	-5	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	433	junction_1	0.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGGAGCCAGCTCTAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45874868	45876981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_45874995_45875505_45875700_45875850
tx.8336	chr17	-	799	3	ISM	ENSMUSG00000023944.15	ENSMUST00000024739.14	2520	11	4296	3	761	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	10930	junction_2	637.5	12466	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGTCCTGCTCTCCTTGT	NA	False	NA	-88	True	NA	NA	NA	45879901	45878703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_45879051_45879154_45879489_45879783
tx.8337	chr17	-	1660	6	ISM	ENSMUSG00000023944.15	ENSMUST00000024739.14	2520	11	2809	3	-726	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9221	junction_4	1117.92046228701	2802	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGTCCTGCTCTCCTTGT	NA	False	NA	29	True	NA	NA	NA	45881388	45878703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_45879051_45879154_45879489_45879783_45880053_45880165_45880314_45880395_45880753_45881183
tx.8338	chr17	-	1845	7	ISM	ENSMUSG00000023944.15	ENSMUST00000024739.14	2520	11	2526	2	837	-2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	9221	junction_4	1135.85847367629	4490	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGTCCTGCTCTCCTTGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45881671	45878702	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_45879051_45879154_45879489_45879783_45880053_45880165_45880314_45880395_45880753_45881183_45881493_45881591
tx.8339	chr17	-	2515	11	FSM	ENSMUSG00000023944.15	ENSMUST00000024739.14	2520	11	2	3	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	9221	junction_4	988.252604347694	18888	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGTCCTGCTCTCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45884195	45878703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_45879051_45879154_45879489_45879783_45880053_45880165_45880314_45880395_45880753_45881183_45881493_45881591_45881726_45881943_45882104_45882338_45882546_45882690_45882838_45884092
tx.834	chr1	-	3077	3	ISM	ENSMUSG00000026478.15	ENSMUST00000027752.15	7622	28	106234	0	2592	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	518	junction_2	275.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATCTTGTGTGGCCTAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153102298	153094667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_153097476_153099404_153099505_153102129
tx.8340	chr17	-	912	6	ISM	ENSMUSG00000023944.15	ENSMUST00000024739.14	2520	11	2	2631	2	39	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	9263	junction_4	453.58333302713	7642	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGATCAAAGAGAAGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45884195	45881331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_45881493_45881591_45881726_45881943_45882104_45882338_45882546_45882690_45882838_45884092
tx.8341	chr17	-	979	8	ISM	ENSMUSG00000058626.17	ENSMUST00000120717.8	2591	22	26167	-8	26139	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_6	2.24971653543195	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTAATTCTTCAATACCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45944084	45941121	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_45941538_45941651_45941711_45942713_45942828_45942934_45943014_45943306_45943376_45943624_45943690_45943800_45943859_45943965
tx.8342	chr17	+	607	3	FSM	ENSMUSG00000023939.8	ENSMUST00000024734.8	645	3	38	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	814	junction_1	143	10139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTCTGAGCTGTGATCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45997285	46009421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_45997354_46006407_46006499_46008973
tx.8343	chr17	+	648	2	FSM	ENSMUSG00000023939.8	ENSMUST00000148537.2	510	2	-43	-95	-43	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1100	junction_1	0	1545	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTCTGAGCTGTGATCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46006298	46009421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_46006499_46008973
tx.8344	chr17	-	1428	2	Intergenic	novelGene_663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGCATAGAGTGAGATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46037387	46034525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_46035836_46037269
tx.8345	chr17	+	752	5	FSM	ENSMUSG00000097727.9	ENSMUST00000233473.2	735	5	-8	-9	-8	4	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1.22474487139159	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCCACGGCAACTGATCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46078112	46092182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_46078234_46087083_46087345_46090184_46090318_46091845_46091900_46091999
tx.8346	chr17	+	2681	3	Intergenic	novelGene_665	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACCTTGGTCATGGGATT	8954	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46133254	46138808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_46133538_46136005_46136084_46136488
tx.8347	chr17	+	937	3	Intergenic	novelGene_666	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCTTGAATTTTTTTTTC	8957	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46133257	46137226	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_46133379_46136005_46136084_46136488
tx.8348	chr17	+	2027	3	Intergenic	novelGene_669	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0.5	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTACCTGACTCCGATGTGT	1291	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46162449	46166891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_46162586_46163405_46163656_46165250
tx.8349	chr17	+	685	3	Intergenic	novelGene_668	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGATGTGTGACTATTTTTAC	1285	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46162443	46166903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_46162586_46165250_46165459_46166568
tx.835	chr1	-	916	4	ISM	ENSMUSG00000026478.15	ENSMUST00000027752.15	7622	28	105103	2324	1461	-2324	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	518	junction_2	245.292116102867	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGGAACTTTCCCTTGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153103429	153096991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_153097476_153099404_153099505_153102129_153102289_153103256
tx.8350	chr17	-	660	5	FSM	ENSMUSG00000023951.19	ENSMUST00000142321.2	640	5	343	-363	343	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_2	181.57987223258	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATATATTCTTTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46335385	46329395	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46329806_46331916_46332049_46333202_46333275_46334990_46335021_46335369
tx.8351	chr17	-	2202	7	NNC	ENSMUSG00000023951.19	novel	3451	7	NA	NA	253	-228	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	13	junction_6	187.412794535367	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTCTCCTTTTTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46342029	46328146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_46329806_46331916_46332049_46334990_46335021_46335369_46335447_46336272_46336470_46339276_46339326_46341971
tx.8352	chr17	-	1212	4	FSM	ENSMUSG00000023951.19	ENSMUST00000133605.8	874	4	-200	-138	-200	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	338	junction_2	71.0602248487546	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATATTCTTTTTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46336007	46329393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46329806_46331916_46332049_46334990_46335021_46335369
tx.8353	chr17	-	554	4	Intergenic	novelGene_671	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.471404520791032	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46416228	46405048	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_46405274_46407455_46407578_46411897_46412013_46416136
tx.8354	chr17	+	870	6	FSM	ENSMUSG00000023967.10	ENSMUST00000024763.10	884	6	12	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1040	junction_5	46.4732180938656	7631	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCGTGTGGTCAGTGCTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46421923	46439834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_46422056_46428865_46428898_46433649_46433758_46436215_46436340_46436568_46436639_46439430
tx.8355	chr17	-	1255	3	FSM	ENSMUSG00000034509.10	ENSMUST00000171172.3	1272	3	17	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	95	junction_1	3.5	372	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTTTTGATTTAGACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46464462	46458312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46459211_46463704_46463968_46464368
tx.8356	chr17	+	649	2	FSM	ENSMUSG00000023952.14	ENSMUST00000165686.2	608	2	-53	12	-3	-12	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAATCCCATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46472033	46473072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_46472253_46472642
tx.8357	chr17	-	731	3	ISM	ENSMUSG00000023953.10	ENSMUST00000233438.2	2130	10	-15	26197	8	-5859	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	22	junction_1	3	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGTCAGCATCTGGTGTCT	7131	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46513563	46509347	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46509695_46510317_46510461_46513322
tx.8358	chr17	+	1735	13	ISM	ENSMUSG00000067150.7	ENSMUST00000087031.7	5081	32	37	21925	2	12004	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	141	junction_5	50.2186192783336	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAAGTGCTTCAGGCAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46513744	46532599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_46513952_46515580_46515703_46517412_46517486_46518704_46518843_46519000_46519184_46525115_46525143_46525502_46525689_46526657_46526735_46528507_46528608_46529470_46529555_46530316_46530443_46531686_46531778_46532278
tx.8359	chr17	+	2011	5	FSM	ENSMUSG00000067150.7	ENSMUST00000233340.2	2137	5	-39	165	-4	-165	multi-exon	FALSE	canonical	3	272	junction_2	19.3180614969515	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAATGTGGTGTAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46513703	46520430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_46513952_46515580_46515703_46517412_46517486_46518704_46518843_46519000
tx.836	chr1	-	1155	6	ISM	ENSMUSG00000026478.15	ENSMUST00000027752.15	7622	28	81650	29685	-675	10	internal_fragment	TRUE	canonical	3	720	junction_2	45.6271848791924	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACTTACTAATGAGGGCTT	3205	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153126882	153124352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_153124899_153125310_153125501_153125590_153125714_153126132_153126270_153126357_153126457_153126822
tx.8360	chr17	-	1239	9	FSM	ENSMUSG00000067148.16	ENSMUST00000087026.13	1314	9	68	7	-18	-7	multi-exon	TRUE	canonical	3	702	junction_8	54.719597723302	5904	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTCAGGCTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46558912	46554852	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46555147_46555231_46555349_46555451_46555602_46555724_46555878_46555956_46556077_46556541_46556675_46557032_46557141_46558654_46558727_46558820
tx.8361	chr17	+	1496	9	FSM	ENSMUSG00000071074.10	ENSMUST00000095263.10	2035	9	19	520	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_8	7.84219357067906	1038	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTGTAGCTCCTGTTGGC	2599	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46559024	46562943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_46559255_46559766_46559965_46560104_46560212_46561336_46561383_46561495_46561589_46561719_46561852_46562039_46562154_46562289_46562414_46562491
tx.8362	chr17	+	1072	7	ISM	ENSMUSG00000071074.10	ENSMUST00000095263.10	2035	9	1095	520	146	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_6	8.41955396021006	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTGTAGCTCCTGTTGGC	3675	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46560100	46562943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_46560212_46561336_46561383_46561495_46561589_46561719_46561852_46562039_46562154_46562289_46562414_46562491
tx.8363	chr17	-	2589	12	NIC	ENSMUSG00000012296.17	novel	2559	11	NA	NA	-1	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	25	junction_3	128.047189132086	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTTCTCCTTCCCACTT	5826	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46593932	46568792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_46570410_46570862_46570947_46571020_46571129_46571805_46571836_46572061_46572129_46572344_46572507_46573327_46573357_46574614_46574740_46575808_46575905_46582725_46582856_46593271_46593366_46593885
tx.8364	chr17	-	2435	10	FSM	ENSMUSG00000012296.17	ENSMUST00000012440.14	2426	10	-5	-4	-1	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_7	101.660412679532	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTTCTCCTTCCCACTT	5817	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46593941	46568792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46570410_46570862_46570947_46571020_46571129_46572061_46572129_46572344_46572507_46573327_46573357_46574614_46574737_46575808_46575905_46593271_46593366_46593885
tx.8365	chr17	-	2450	11	NIC	ENSMUSG00000012296.17	novel	2559	11	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	25	junction_3	135.013925207736	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTAATTTCTTTCTCCTT	5828	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46593930	46568799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_46570410_46570862_46570947_46571020_46571129_46571805_46571836_46572061_46572129_46572344_46572507_46573327_46573357_46574614_46574740_46575808_46575905_46593271_46593366_46593885
tx.8366	chr17	-	2428	10	FSM	ENSMUSG00000012296.17	ENSMUST00000225080.2	2412	10	-13	-3	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_7	91.006850915633	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCTTAATTTCTTTCTCCTT	5820	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46593938	46568799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46570410_46570862_46570947_46571020_46571129_46572061_46572129_46572344_46572507_46573327_46573357_46574614_46574740_46575808_46575905_46593271_46593366_46593885
tx.8367	chr17	+	172	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117269.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AATAAAGAATGTGGAGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46705886	46731169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_46706028_46731138
tx.8368	chr17	-	678	3	ISM	ENSMUSG00000067144.8	ENSMUST00000233715.2	1410	10	3863	-174	3863	-56	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_1	4.5	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGGGAAGTCATTGACTT	7508	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46744692	46743164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46743444_46743872_46744080_46744500
tx.8369	chr17	+	1133	4	FSM	ENSMUSG00000040658.8	ENSMUST00000046497.8	1190	4	57	0	57	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	629	junction_2	31.4960314960472	7470	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCACGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46807693	46810550	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_46807899_46809350_46809420_46809568_46809680_46809802
tx.837	chr1	-	543	2	FSM	ENSMUSG00000073538.11	ENSMUST00000186785.7	1964	2	0	1421	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_1	0	1266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTTGAGGGGTGTGGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153283536	153281993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_153282348_153283347
tx.8370	chr17	-	1299	9	ISM	ENSMUSG00000040327.17	ENSMUST00000183078.8	3070	18	16699	3	-2895	-3	3prime_fragment	TRUE	canonical	0	0	junction_4	2.42061459137964	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCCCAGGAGGAGCACCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46814892	46811538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46811857_46811932_46812007_46812678_46812813_46813055_46813174_46813310_46813422_46813538_46813614_46814014_46814109_46814397_46814562_46814681
tx.8371	chr17	-	880	5	ISM	ENSMUSG00000003546.11	ENSMUST00000003642.7	2322	16	9622	-3	9622	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_2	12.051970793194	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATTTTGTGTTCGGAGTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46946448	46941553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46942000_46942753_46942818_46942958_46943075_46943675_46943817_46946335
tx.8372	chr17	+	1023	7	FSM	ENSMUSG00000002767.14	ENSMUST00000002844.14	1031	7	8	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	984	junction_4	70.4430423975443	4639	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCTTACTACCTTTTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46957162	46961058	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_46957325_46958315_46958485_46959162_46959305_46959397_46959514_46959584_46959696_46959960_46960035_46960809
tx.8373	chr17	-	1147	4	FSM	ENSMUSG00000023971.10	ENSMUST00000233247.2	406	4	-36	-705	-19	215	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_3	166.85522666871	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAACTTAAGGCATGCACCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46985232	46978168	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46979013_46980830_46980949_46981036_46981112_46985122
tx.8374	chr17	-	1435	7	FSM	ENSMUSG00000023971.10	ENSMUST00000233136.2	1289	7	44	-190	-21	187	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_2	28.055995596109	1084	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	TAAATAAATCTTTAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46985234	46978196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46979013_46980830_46980949_46981036_46981112_46983261_46983367_46983450_46983518_46983631_46983774_46985122
tx.8375	chr17	+	825	4	FSM	ENSMUSG00000002768.9	ENSMUST00000233430.2	945	4	123	-3	-15	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	590	junction_1	155.5913450892	5064	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCACACCGCCTGTGCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46992034	46994031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_46992089_46992542_46992824_46992934_46993038_46993644
tx.8376	chr17	-	2891	15	FSM	ENSMUSG00000059409.10	ENSMUST00000002839.9	2926	15	35	0	35	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	369	junction_9	37.0099958918988	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTCTGAGTCGCCTTGGTGT	1144	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47015893	46993916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_46995053_46995186_46995304_46995431_46995505_46995590_46995693_46996227_46996356_46996444_46996616_46996979_46997034_46997188_46997358_46997484_46997616_46997959_46998053_46998175_46998287_46998371_46998572_46998762_46998956_47010994_47011073_47015758
tx.8377	chr17	-	633	5	ISM	ENSMUSG00000059409.10	ENSMUST00000002839.9	2926	15	37	4341	37	-1024	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	464	junction_1	7.54983443527075	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCTTCATCGAATCCCACAG	1146	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47015891	46998257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46998287_46998371_46998572_46998762_46998956_47010994_47011073_47015758
tx.8378	chr17	-	600	4	ISM	ENSMUSG00000059409.10	ENSMUST00000002839.9	2926	15	41	4455	41	-1138	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	464	junction_3	7.36357401145817	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGCACAGGGAAAGGACA	1150	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47015887	46998371	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_46998572_46998762_46998956_47010994_47011073_47015758
tx.8379	chr17	+	1197	8	ISM	ENSMUSG00000002763.17	ENSMUST00000002840.9	3200	17	11651	0	2903	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_6	12.6200359002044	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTCTTGTGAGAGGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47034039	47036467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_47034171_47034249_47034456_47034599_47034662_47034844_47034954_47035316_47035434_47035552_47035631_47035750_47035891_47036113
tx.838	chr1	-	729	6	ISM	ENSMUSG00000042699.12	ENSMUST00000188345.2	2346	19	-1	13747	-1	188	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_2	16.7403703662733	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATCCAAGGAGAATATAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153363398	153353834	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_153353936_153354611_153354728_153356877_153356996_153358487_153358629_153359485_153359619_153363278
tx.8380	chr17	-	1037	6	FSM	ENSMUSG00000002769.10	ENSMUST00000002846.9	1035	6	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_3	8.1338797630651	236	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTGTGCCTGGTGTTTCTT	2977	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47040096	47036589	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_47036898_47036986_47037109_47037194_47037338_47037531_47037643_47038190_47038319_47039871
tx.8381	chr17	-	1854	6	FSM	ENSMUSG00000023973.14	ENSMUST00000059844.13	1908	6	5	49	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	416	junction_4	48.1730214954387	800	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGCTACTGCTATGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47063135	47046679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_47047835_47048100_47048219_47048652_47048776_47054111_47054209_47058346_47058471_47062898
tx.8382	chr17	-	971	2	ISM	ENSMUSG00000036858.9	ENSMUST00000041012.9	1283	4	6473	-11	6473	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CACAGGCATGTCACAAAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47068165	47066577	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_47067329_47067945
tx.8383	chr17	-	1376	6	ISM	ENSMUSG00000063888.8	ENSMUST00000078286.6	2606	7	763	1194	744	-1194	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1943	junction_1	142.355892045254	840	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTGTGTATACCTTTA	NA	False	NA	-111	True	NA	NA	NA	47092819	47086026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_47086663_47088977_47089198_47089335_47089446_47090210_47090349_47091316_47091478_47092708
tx.8384	chr17	-	1415	7	FSM	ENSMUSG00000063888.8	ENSMUST00000078286.6	2606	7	-3	1194	-3	-1194	multi-exon	FALSE	canonical	3	1943	junction_1	138.303309994937	6734	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGGTGTGTATACCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47093585	47086026	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_47086663_47088977_47089198_47089335_47089446_47090210_47090349_47091316_47091478_47092708_47092818_47093544
tx.8385	chr17	-	1692	2	Intergenic	novelGene_674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTGTTGACAACTTTAATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47211500	47207777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_47209237_47211267
tx.8386	chr17	-	595	2	Intergenic	novelGene_675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGCATGTGTGTGTGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47403176	47400287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_47400808_47403101
tx.8387	chr17	-	411	2	Intergenic	novelGene_676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	177	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTTTTAATCTACACTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47403178	47400318	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_47400653_47403101
tx.8388	chr17	+	760	2	NNC	ENSMUSG00000064043.16	novel	3503	12	NA	NA	-16066	-87969	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	43	junction_1	0	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGAATTTATTTTTATCT	2027	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47507246	47541747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_47507415_47541155
tx.8389	chr17	+	1018	7	FSM	ENSMUSG00000034729.17	ENSMUST00000119945.8	1018	7	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	774	junction_2	381.394116659162	1515	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCTGGTTTTGTTTACT	7141	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47679815	47689606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_47679880_47683351_47683417_47683497_47683571_47685897_47686035_47686858_47686968_47688684_47688775_47689126
tx.839	chr1	-	1412	12	FSM	ENSMUSG00000042684.9	ENSMUST00000041874.9	1735	12	326	-3	-8	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_4	13.2309429459759	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTATTGTCTTAATCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153425465	153378757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_153379304_153384857_153384898_153388291_153388377_153390985_153391033_153391147_153391297_153394628_153394722_153400092_153400169_153403810_153403869_153411617_153411706_153413173_153413248_153421008_153421093_153425393
tx.8390	chr17	+	1017	7	FSM	ENSMUSG00000034729.17	ENSMUST00000120737.8	1017	7	2	-2	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	977	junction_2	314.646892034018	1674	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGGCTGGTTTTGTTTACT	7139	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47679813	47689606	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_47679880_47683351_47683417_47683500_47683571_47685897_47686035_47686858_47686968_47688684_47688775_47689126
tx.8391	chr17	+	1670	4	FSM	ENSMUSG00000023979.15	ENSMUST00000024774.14	1668	4	-2	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	4.64279609239471	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTGTCCTGGAGGTGAA	1128	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47696315	47703892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_47696622_47700034_47700185_47701905_47702027_47702799
tx.8392	chr17	+	1494	3	NIC	ENSMUSG00000023979.15	novel	1668	4	NA	NA	13	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	7.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATTGTCCTGGAGGTGAA	1154	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47696341	47703892	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_47696622_47701905_47702027_47702799
tx.8393	chr17	-	524	3	ISM	ENSMUSG00000023982.9	ENSMUST00000059348.9	873	4	4870	0	4870	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	4	440	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGAGTCTCAGCTTTTTT	6706	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47706639	47705482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_47705746_47706032_47706127_47706472
tx.8394	chr17	-	626	2	NNC	ENSMUSG00000047150.9	novel	614	2	NA	NA	-688	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	7	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGGGTTGCCACCTGGTGAG	5866	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47733493	47724299	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_47724820_47733387
tx.8395	chr17	+	1413	2	ISM	ENSMUSG00000034382.15	ENSMUST00000150819.3	4866	5	31505	494	31505	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCTGGTTTGTGTGTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47779234	47781069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_47779779_47780200
tx.8396	chr17	-	2536	9	FSM	ENSMUSG00000023980.8	ENSMUST00000067103.4	2784	9	4	244	-1	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	80	junction_1	52.1152568831815	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGTAAATGACTCAGACATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47813213	47799218	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_47800822_47801067_47801208_47804486_47804630_47805266_47805415_47807502_47807628_47809102_47809166_47809464_47809564_47812208_47812366_47813155
tx.8397	chr17	-	1249	6	ISM	ENSMUSG00000023980.8	ENSMUST00000233274.2	1692	7	848	385	831	-385	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	187	junction_3	15.9323570133235	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTACTATTCTGGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47812366	47803973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_47804630_47805266_47805415_47807502_47807628_47809102_47809166_47809464_47809564_47812208
tx.8398	chr17	-	1306	7	FSM	ENSMUSG00000023980.8	ENSMUST00000233274.2	1692	7	1	385	-1	-385	multi-exon	FALSE	canonical	3	187	junction_3	14.5535409971442	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGTTACTATTCTGGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47813213	47803973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_47804630_47805266_47805415_47807502_47807628_47809102_47809166_47809464_47809564_47812208_47812366_47813155
tx.8399	chr17	+	464	2	NNC	ENSMUSG00000034165.17	novel	283	2	NA	NA	-2	-23174	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGATCGTGTATGTTTAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47815973	47866637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_47816192_47866391
tx.84	chr1	+	1288	5	FSM	ENSMUSG00000025933.16	ENSMUST00000027064.8	1261	5	-24	-3	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_4	35.5984550226551	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTTCTCATTCATTTCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21288861	21300391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_21289114_21295781_21295868_21296168_21296271_21296815_21296904_21299631
tx.840	chr1	+	1389	7	NNC	ENSMUSG00000026473.17	novel	2792	7	NA	NA	-27	107	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	54.2486558973277	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTAATCTTGCTTTTGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153775662	153784035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_153775806_153778679_153778859_153780282_153780449_153782094_153782242_153782765_153782894_153783031_153783232_153783609
tx.8400	chr17	+	1956	5	FSM	ENSMUSG00000034165.17	ENSMUST00000182209.8	1977	5	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3602	junction_2	267.432701814868	445	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGGCTCTTGTGATCCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47904415	47910614	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_47904778_47905658_47905875_47908344_47908505_47908927_47909065_47909533
tx.8401	chr17	-	1694	7	FSM	ENSMUSG00000023988.9	ENSMUST00000024783.9	3854	7	255	1905	255	-1905	multi-exon	FALSE	canonical	3	435	junction_6	15.1180539605981	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTTGTGTTTTGGTCCCT	2596	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47922162	47912160	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_47912824_47913316_47913420_47913562_47913724_47914780_47914915_47915179_47915319_47917763_47917927_47921831
tx.8402	chr17	+	610	3	FSM	ENSMUSG00000023984.18	ENSMUST00000146105.8	599	3	-4	-7	-4	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_2	122	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTATTGTCCAGAACTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47922509	47961221	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_47922618_47923887_47924043_47960874
tx.8403	chr17	+	1880	4	FSM	ENSMUSG00000092558.4	ENSMUST00000024778.3	2054	4	7	167	4	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	195	junction_2	32.2937902527543	662	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGTTTTGGCCTTCTGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47922513	47935176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_47922618_47923887_47924043_47929733_47929988_47933809
tx.8404	chr17	+	1601	5	ISM	ENSMUSG00000090115.8	ENSMUST00000024779.15	8252	7	42038	5667	8	15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	71	junction_4	30.9141957682874	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCCTTTTGTCAGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47983652	47991996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_47984344_47985640_47985846_47989768_47989878_47990588_47990795_47991606
tx.8405	chr17	+	1452	5	FSM	ENSMUSG00000090115.8	ENSMUST00000152724.2	1443	5	6	-15	6	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_4	46.8794997840207	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCCTTTTGTCAGTTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47983650	47991996	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_47984344_47985640_47985846_47989768_47989878_47990588_47990644_47991606
tx.8406	chr17	-	528	3	FSM	ENSMUSG00000033475.16	ENSMUST00000113302.10	749	3	129	92	14	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	3748	junction_1	369	15169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGGTATTTTATTCTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47998979	47997662	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_47997934_47998112_47998214_47998823
tx.8409	chr17	+	694	5	ISM	ENSMUSG00000023987.15	ENSMUST00000024782.12	1388	9	3932	-1	3930	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	133	junction_1	119.423615755009	395	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCTGTTGAGTCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48041698	48045408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_48041724_48043309_48043430_48043885_48044037_48044681_48044781_48045109
tx.841	chr1	+	516	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000100627.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.816496580927726	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTATGGAATGTTTTGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	153972082	153988826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_153972314_153980782_153980821_153988037_153988083_153988624
tx.8410	chr17	+	701	4	ISM	ENSMUSG00000023987.15	ENSMUST00000024782.12	1388	9	5511	-1	5509	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	283	junction_1	65.5303152916436	515	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCTGTTGAGTCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48043277	48045408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_48043430_48043885_48044037_48044681_48044781_48045109
tx.8411	chr17	+	653	4	NNC	ENSMUSG00000023987.15	novel	1388	9	NA	NA	5778	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	74	junction_1	164.050805138733	132	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCTGTTGAGTCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48043546	48045408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_48043651_48043885_48044037_48044681_48044781_48045109
tx.8412	chr17	+	760	3	ISM	ENSMUSG00000023987.15	ENSMUST00000024782.12	1388	9	5908	-1	5906	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	421	junction_1	1	214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCAGCCTGTTGAGTCATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48043674	48045408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_48044037_48044681_48044781_48045109
tx.8413	chr17	+	2247	9	FSM	ENSMUSG00000023990.19	ENSMUST00000086932.10	2342	9	92	3	92	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	431	junction_4	27.2370955683604	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTATGTTGTCCTGGCTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48048046	48103341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_48048242_48096889_48097122_48097202_48097458_48097855_48097937_48098950_48099072_48099161_48099219_48099833_48099910_48100585_48100734_48102259
tx.8414	chr17	+	2331	9	NIC	ENSMUSG00000023990.19	novel	2296	8	NA	NA	787	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	36	junction_1	141.519378090069	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTATGTTGTCCTGGCTCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48050614	48103341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_48050894_48096889_48097122_48097202_48097458_48097855_48097937_48098950_48099072_48099161_48099219_48099833_48099910_48100585_48100734_48102259
tx.8415	chr17	-	905	2	ISM	ENSMUSG00000032717.15	ENSMUST00000113280.8	1281	4	12358	2	12286	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCCCAGGACTCTTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48131808	48126254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_48127090_48131738
tx.8416	chr17	-	898	2	NNC	ENSMUSG00000032717.15	novel	580	3	NA	NA	14620	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTCCCCAGGACTCTTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48129474	48126254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_48127090_48129411
tx.8417	chr17	-	1341	4	ISM	ENSMUSG00000023991.17	ENSMUST00000113263.8	3156	17	53107	0	7660	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_3	14.290634073484	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTGTTGGCTTTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48182218	48178688	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_48179729_48180028_48180199_48180649_48180717_48182154
tx.8418	chr17	+	857	3	Intergenic	novelGene_680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_2	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCCGAGCCCCAGTTTTCT	892	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48235758	48239780	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_48235950_48238160_48238304_48239257
tx.8419	chr17	-	1202	3	Intergenic	novelGene_681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTCATCCAGCTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48266439	48262557	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_48263139_48264653_48264815_48265979
tx.842	chr1	+	2449	8	FSM	ENSMUSG00000026470.15	ENSMUST00000027743.13	4589	8	3	2137	-1	1275	multi-exon	TRUE	canonical	3	152	junction_7	29.3257565972304	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGGGTATTTTATCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155034463	155079268	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_155034674_155049731_155049902_155053599_155053695_155063523_155063587_155067174_155067301_155068964_155069072_155073086_155073182_155077685
tx.8422	chr17	-	1435	9	FSM	ENSMUSG00000023994.14	ENSMUST00000162460.8	3706	9	145	2126	4	-10	multi-exon	TRUE	canonical	3	22	junction_4	12.5492778676703	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGCACTTATGTTGAGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48716789	48696042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_48696371_48698276_48698379_48698903_48699078_48699367_48699535_48700207_48700314_48700448_48700581_48702677_48702825_48707465_48707609_48716653
tx.8424	chr17	+	1166	6	NNC	ENSMUSG00000040771.15	novel	1135	6	NA	NA	31	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	404.287818268124	124	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTGCACACATGAACGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48717072	48724287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_48717266_48717852_48717933_48718291_48718437_48721253_48721313_48722248_48722362_48723711
tx.8425	chr17	+	1163	6	FSM	ENSMUSG00000040771.15	ENSMUST00000046651.7	1135	6	-35	7	31	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	381.26547181721	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTGCACACATGAACGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48717072	48724287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_48717266_48717855_48717933_48718291_48718437_48721253_48721313_48722248_48722362_48723711
tx.8426	chr17	+	1233	6	FSM	ENSMUSG00000040771.15	ENSMUST00000167180.8	1324	6	96	-5	18	5	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	371.627232586634	269	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTTGCACACATGAACGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48717137	48724287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_48717401_48717855_48717933_48718291_48718437_48721253_48721313_48722248_48722362_48723711
tx.8427	chr17	+	1242	6	NNC	ENSMUSG00000040771.15	novel	1324	6	NA	NA	13	6	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	403.460233480327	137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTTGCACACATGAACGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48717132	48724288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_48717401_48717852_48717933_48718291_48718437_48721253_48721313_48722248_48722362_48723711
tx.8428	chr17	-	885	2	ISM	ENSMUSG00000040694.5	ENSMUST00000046549.5	1420	3	9509	-1	9197	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGGCCTGTTCTCTTAA	8295	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48730449	48726257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_48726662_48729968
tx.8429	chr17	-	1227	3	FSM	ENSMUSG00000040694.5	ENSMUST00000046549.5	1420	3	194	-1	-118	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_2	11.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGTGGCCTGTTCTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48739764	48726257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_48726662_48729968_48730534_48739506
tx.843	chr1	+	915	3	ISM	ENSMUSG00000026470.15	ENSMUST00000195693.6	870	5	5887	-680	-1752	455	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	152	junction_2	0.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCACCTGTGTCGGTCTAGCC	6704	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155069014	155078448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_155069072_155073086_155073182_155077685
tx.8439	chr17	-	2892	10	NIC	ENSMUSG00000010592.10	novel	2976	11	NA	NA	-1	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	158	junction_3	120.807570689102	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTGACTTACTGTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50600628	50586421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_50588340_50590155_50590255_50591265_50591380_50593278_50593351_50594555_50594696_50594782_50594847_50595138_50595191_50595641_50595734_50596119_50596267_50600434
tx.844	chr1	-	4466	15	FSM	ENSMUSG00000026469.15	ENSMUST00000027741.12	7492	15	-48	3074	18	207	multi-exon	FALSE	canonical	2	7	junction_5	3.69569523436472	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCCTGTGAATTGTCAGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155293123	155154520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_155156817_155158958_155159181_155165940_155166078_155168854_155169022_155183367_155183563_155184696_155184869_155188504_155188685_155188916_155189108_155200059_155200142_155204344_155204429_155206083_155206234_155207908_155208133_155221298_155221401_155260356_155260409_155292911
tx.8440	chr17	-	2943	11	FSM	ENSMUSG00000010592.10	ENSMUST00000010736.9	2976	11	36	-3	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	352	junction_4	74.6324996231534	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACTGACTTACTGTCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50600628	50586421	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_50588340_50590155_50590255_50591265_50591380_50592023_50592075_50593278_50593351_50594555_50594696_50594782_50594847_50595138_50595191_50595641_50595734_50596119_50596267_50600434
tx.8442	chr17	-	1759	16	NNC	ENSMUSG00000023923.11	novel	2508	14	NA	NA	-1	33917	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.80996514432398	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATGTGATTTTTGTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	51486323	51146547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_51146769_51159560_51159668_51181593_51181737_51224554_51224728_51226019_51226090_51226189_51226241_51227542_51227632_51242483_51242587_51270720_51270789_51273579_51273655_51273743_51273834_51275217_51275327_51291632_51291703_51332101_51332233_51450386_51450450_51486127
tx.8447	chr17	-	2325	9	FSM	ENSMUSG00000023940.15	ENSMUST00000024736.14	3628	9	35	1268	-12	-1268	multi-exon	FALSE	canonical	3	305	junction_7	54.3666660279992	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTATGTGTGTATGTATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53996326	53983081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_53983740_53983934_53984125_53985937_53986730_53988472_53988517_53990581_53990659_53994111_53994309_53994738_53994887_53995017_53995149_53996238
tx.8452	chr17	-	556	5	FSM	ENSMUSG00000024174.10	ENSMUST00000233301.2	1813	5	4	1253	0	-1253	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_3	2.54950975679639	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGTGTCAGGCATCAATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56019624	56005346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_56005588_56006991_56007107_56013105_56013153_56017838_56017907_56019539
tx.846	chr1	+	577	4	FSM	ENSMUSG00000033701.14	ENSMUST00000080138.13	993	4	416	0	410	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	223	junction_3	63.2525800966956	614	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCCTTGGTCATGGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155434281	155448034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_155434606_155440402_155440468_155443330_155443428_155447943
tx.8465	chr17	+	1779	13	FSM	ENSMUSG00000011589.10	ENSMUST00000011733.9	1748	13	-30	-1	-28	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_12	6.07533721057706	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTCCTGCACTGGTTCTTG	3903	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56293480	56303882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_56293654_56294742_56294839_56295123_56295256_56295673_56295776_56297211_56297235_56297418_56297541_56298166_56298377_56300842_56300942_56302356_56302517_56302857_56302938_56303071_56303324_56303420_56303510_56303641
tx.8466	chr17	+	1749	12	NNC	ENSMUSG00000011589.10	novel	1748	13	NA	NA	-9	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	18.7038688710064	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCCTCCTGCACTGGTTCT	3922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56293499	56303880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_56293654_56294742_56294839_56295123_56295256_56295673_56295790_56297418_56297541_56298166_56298377_56300842_56300942_56302356_56302517_56302857_56302938_56303071_56303324_56303420_56303510_56303641
tx.8469	chr17	+	1299	12	ISM	ENSMUSG00000003199.17	ENSMUST00000149441.8	1701	13	350	125	218	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	800	junction_1	72.3614663904886	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAAGCCTGTGGCTGGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56316550	56323665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_56316587_56317276_56317514_56317987_56318112_56318617_56318700_56318865_56318963_56319270_56319344_56319415_56319493_56321940_56322110_56322207_56322279_56322470_56322561_56322903_56322997_56323515
tx.847	chr1	+	940	8	FSM	ENSMUSG00000033701.14	ENSMUST00000035560.9	5592	8	555	4097	551	138	multi-exon	TRUE	canonical	3	134	junction_7	98.5478232605254	219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCGACGTCTCAGCAACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155434422	155562979	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_155434606_155440402_155440468_155443330_155443428_155477199_155477283_155491612_155491719_155500614_155500705_155552949_155552981_155562694
tx.8470	chr17	+	1264	11	ISM	ENSMUSG00000003199.17	ENSMUST00000149441.8	1701	13	1075	125	-164	12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	830	junction_3	65.4189574970436	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAAGCCTGTGGCTGGGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56317275	56323665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_56317514_56317987_56318112_56318617_56318700_56318865_56318963_56319270_56319344_56319415_56319493_56321940_56322110_56322207_56322279_56322470_56322561_56322903_56322997_56323515
tx.8472	chr17	-	2125	9	NIC	ENSMUSG00000003200.11	novel	2073	10	NA	NA	25	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	585	junction_1	56.6192050014834	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCACTGTCCCATCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56343610	56323749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_56324737_56324843_56324901_56324982_56325108_56325574_56325679_56325803_56326174_56326315_56326460_56326925_56326999_56327122_56327192_56343414
tx.8476	chr17	-	1714	11	FSM	ENSMUSG00000019578.12	ENSMUST00000019722.12	2949	11	28	1207	17	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_10	25.0960156200143	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGCCTCCCAGTGTTTCAT	6334	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56382000	56375251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_56375684_56375959_56376109_56376183_56376315_56376393_56376614_56376690_56376776_56377651_56377728_56377887_56377986_56379400_56379530_56379719_56379785_56380072_56380237_56381835
tx.8477	chr17	+	601	3	ISM	ENSMUSG00000002833.12	ENSMUST00000224101.2	594	4	436	-223	194	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	635	junction_2	129	212	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTTTTATTGGCTTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56406174	56407605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_56406388_56406858_56406986_56407344
tx.8478	chr17	+	598	3	ISM	ENSMUSG00000002833.12	ENSMUST00000225342.2	3354	12	17751	-13	194	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	309	junction_2	292	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGCTTTTATTGGCTTAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56406174	56407605	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_56406388_56406858_56406986_56407347
tx.8479	chr17	-	1969	9	FSM	ENSMUSG00000011305.12	ENSMUST00000019808.12	1986	9	15	2	15	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3.19912097301743	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTAGGTTTTGGAACTTG	1108	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56424581	56418602	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_56419542_56419869_56419984_56420898_56421099_56422092_56422274_56422550_56422634_56423257_56423454_56423828_56423890_56424082_56424198_56424501
tx.848	chr1	-	2464	13	FSM	ENSMUSG00000033684.15	ENSMUST00000194632.2	2433	13	-27	-4	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_7	5.99247212944893	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAACGTGTTTGACTTGATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155688617	155653903	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_155654598_155655463_155655685_155657020_155657201_155658270_155658419_155659148_155659272_155662539_155662670_155665043_155665179_155666726_155666873_155667939_155668031_155670291_155670395_155671096_155671143_155679442_155679544_155688271
tx.8480	chr17	+	1442	2	FSM	ENSMUSG00000044469.9	ENSMUST00000077788.7	2379	2	19	918	19	-918	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTGTCTGGAGTTTACCAAA	432	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56469495	56480037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_56469607_56478706
tx.8481	chr17	-	908	6	FSM	ENSMUSG00000019579.14	ENSMUST00000019723.8	1710	6	4	798	4	-798	multi-exon	FALSE	canonical	3	1137	junction_1	57.4505004329814	1359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGATGGATTCTCATCGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56490916	56483541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_56484004_56484698_56484772_56485263_56485346_56486363_56486426_56489664_56489716_56490738
tx.8482	chr17	-	721	2	ISM	ENSMUSG00000024197.11	ENSMUST00000019726.8	3645	8	9643	2004	9643	-2004	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	665	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTAGTCTGTCATCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56587868	56586479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_56587074_56587741
tx.8483	chr17	-	1584	7	ISM	ENSMUSG00000024197.11	ENSMUST00000019726.8	3645	8	2634	2004	2634	-2004	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	572	junction_5	31.4536696322279	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTAGTCTGTCATCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56594877	56586479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_56587074_56587741_56587868_56588406_56588607_56591132_56591431_56593212_56593296_56593447_56593647_56594793
tx.8484	chr17	-	1641	8	FSM	ENSMUSG00000024197.11	ENSMUST00000019726.8	3645	8	0	2004	0	-2004	multi-exon	FALSE	canonical	3	548	junction_7	40.8821102534533	338	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTAGTCTGTCATCCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56597511	56586479	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_56587074_56587741_56587868_56588406_56588607_56591132_56591431_56593212_56593296_56593447_56593647_56594793_56594877_56597453
tx.8485	chr17	-	722	2	ISM	ENSMUSG00000073380.3	ENSMUST00000097303.3	1056	3	2292	0	2272	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGAGTTGTCTGCTGGGC	5002	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56604994	56601110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_56601665_56604826
tx.8487	chr17	-	909	2	NIC	ENSMUSG00000073380.3	novel	1056	3	NA	NA	-59	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGAGTTGTCTGCTGGGC	2651	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56607345	56601110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_56601665_56606990
tx.8488	chr17	-	1111	3	FSM	ENSMUSG00000073380.3	ENSMUST00000097303.3	1056	3	-55	0	-55	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	4	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGAGTTGTCTGCTGGGC	2655	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56607341	56601110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_56601665_56604826_56605033_56606990
tx.8489	chr17	-	662	5	ISM	ENSMUSG00000042625.17	ENSMUST00000075510.12	3277	21	19321	3	-697	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_1	32.5883414736007	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAAGGTTTCTGCTGCCAGGC	2176	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56872264	56869941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_56870244_56870361_56870432_56870511_56870625_56871503_56871635_56872218
tx.849	chr1	-	1125	2	FSM	ENSMUSG00000033684.15	ENSMUST00000140809.2	2664	2	-30	1569	-17	-1569	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTATGTGCGTTGGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155688614	155678761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_155679544_155688271
tx.8490	chr17	-	1077	7	ISM	ENSMUSG00000042625.17	ENSMUST00000075510.12	3277	21	17978	5	408	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_1	26.6108791453587	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAAGGTTTCTGCTGCCAG	833	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56873607	56869943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_56870244_56870361_56870432_56870511_56870625_56871503_56871635_56872218_56872262_56872944_56873083_56873325
tx.8491	chr17	-	371	2	ISM	ENSMUSG00000042625.17	ENSMUST00000156640.2	552	4	9066	-5	1084	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACAAGGTTTCTGCTGCCAG	4008	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56870432	56869943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_56870244_56870361
tx.8492	chr17	-	1612	6	ISM	ENSMUSG00000042625.17	ENSMUST00000155983.2	1090	10	-20	4755	3	308	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	101	junction_2	19.8957281847134	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAATCCGTAGAAAATGAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56891582	56883022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_56883906_56884842_56884906_56885640_56885845_56885920_56885986_56889983_56890072_56891273
tx.8493	chr17	+	412	4	ISM	ENSMUSG00000071054.13	ENSMUST00000095224.11	3106	21	8860	7453	-595	2318	internal_fragment	TRUE	canonical	3	422	junction_3	59.1175852762009	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAGAGGAGCAGGAGGAGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56900918	56905841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_56901042_56902651_56902715_56904787_56904816_56905643
tx.8494	chr17	-	533	4	FSM	ENSMUSG00000049760.7	ENSMUST00000052832.6	755	4	53	169	-36	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1891	junction_3	98.6610358753647	4426	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGCCGGTTTTCTGGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56916718	56914620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_56914842_56915637_56915693_56915845_56916024_56916639
tx.8495	chr17	+	389	4	FSM	ENSMUSG00000057863.7	ENSMUST00000080492.7	383	4	-3	-3	-3	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	5436	junction_1	2487.77200634535	16165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTGTATGTGTGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56920412	56921246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_56920449_56920585_56920681_56920906_56921042_56921123
tx.8496	chr17	+	695	2	ISM	ENSMUSG00000057863.7	ENSMUST00000080492.7	383	4	-1	-3	-1	3	intron_retention	FALSE	canonical	3	5436	junction_1	0	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTGTATGTGTGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56920414	56921246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_56920449_56920585
tx.8497	chr17	+	612	3	NIC	ENSMUSG00000057863.7	novel	383	4	NA	NA	0	3	intron_retention	FALSE	canonical	3	5436	junction_1	2267	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTGTATGTGTGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56920415	56921246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_56920449_56920585_56921042_56921123
tx.8498	chr17	+	501	2	NIC	ENSMUSG00000057863.7	novel	383	4	NA	NA	248	3	intron_retention	FALSE	canonical	3	9970	junction_1	0	356	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTGTATGTGTGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56920663	56921246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_56921042_56921123
tx.8499	chr17	-	297	2	ISM	ENSMUSG00000041168.11	ENSMUST00000233732.2	4362	16	12210	0	12210	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	804	junction_1	0	752	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTAAGCCTGAGTCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56921665	56921296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_56921564_56921635
tx.85	chr1	-	378	2	Intergenic	novelGene_11	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTTGTGAGATCTTTGT	1130	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21324608	21323506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_21323669_21324392
tx.850	chr1	-	1669	10	FSM	ENSMUSG00000026466.17	ENSMUST00000097527.10	4234	10	398	2167	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_4	20.1935083078146	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCTAATTATCTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155911775	155882526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_155883456_155889063_155889121_155893256_155893326_155893963_155894006_155898045_155898127_155898894_155898934_155906132_155906178_155907159_155907220_155909471_155909547_155911503
tx.8500	chr17	-	1313	9	ISM	ENSMUSG00000041168.11	ENSMUST00000233732.2	4362	16	9094	0	9094	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	752	junction_3	59.2725431797894	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCCTAAGCCTGAGTCTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56924781	56921296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_56921564_56921635_56921801_56921873_56922092_56922249_56922416_56922503_56922645_56922925_56923043_56923129_56923253_56923358_56923447_56924753
tx.8501	chr17	+	734	3	ISM	ENSMUSG00000040828.11	ENSMUST00000233947.2	1617	12	10911	-2	10911	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	13	junction_1	1.5	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGATCAGGTTGCTAAGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56969692	56971456	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_56969846_56970267_56970426_56971033
tx.8502	chr17	-	2065	2	FSM	ENSMUSG00000054723.7	ENSMUST00000067931.7	2226	2	161	0	161	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGACTCTACCTTTTTTC	7729	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57023816	57020935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_57022818_57023633
tx.8503	chr17	-	1992	2	FSM	ENSMUSG00000054723.7	ENSMUST00000164907.3	1965	2	-27	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGACTCTACCTTTTTTC	6838	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57024707	57020935	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_57022818_57024597
tx.8504	chr17	+	552	4	FSM	ENSMUSG00000002379.8	ENSMUST00000002452.8	545	4	3	-10	3	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	2627	junction_1	54.2975342186201	26506	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAAGGCAGGCTTGCTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57024769	57029147	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57024943_57028034_57028128_57028318_57028442_57028984
tx.8505	chr17	+	2259	13	FSM	ENSMUSG00000007603.10	ENSMUST00000007747.10	2025	13	-24	-210	-3	-41	multi-exon	TRUE	canonical	3	220	junction_6	33.8230690505755	169	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTCTGCCTCTGAATGCTG	9220	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57071753	57077051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57071942_57072524_57072793_57073781_57074289_57074632_57074675_57074782_57074936_57075033_57075151_57075347_57075414_57075517_57075629_57075805_57075903_57076049_57076126_57076249_57076439_57076533_57076663_57076735
tx.8506	chr17	-	406	3	ISM	ENSMUSG00000024206.16	ENSMUST00000233643.2	4141	5	22649	4229	22649	-4229	internal_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_2	18	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATAGGCCCCTGAGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57115290	57111137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57111397_57112357_57112448_57115233
tx.8507	chr17	-	486	3	ISM	ENSMUSG00000024206.16	ENSMUST00000233000.2	812	6	-48	17527	-6	-4229	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	62	junction_2	116	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATAGGCCCCTGAGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57138019	57111137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57111397_57112357_57112448_57137882
tx.8508	chr17	-	585	4	ISM	ENSMUSG00000024206.16	ENSMUST00000233643.2	4141	5	-87	4229	-13	-4229	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_2	15.2970585407784	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCATAGGCCCCTGAGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57138026	57111137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57111397_57112357_57112448_57115233_57115326_57137882
tx.8509	chr17	+	504	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024206.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCTGTGTCCCTGACCTTT	4748	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57111385	57114408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_57111449_57112236_57112389_57114119
tx.851	chr1	-	1714	11	FSM	ENSMUSG00000026466.17	ENSMUST00000136331.8	2723	11	462	547	32	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	47	junction_4	24.0865107477194	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGCCTAATTATCTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155911764	155882526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_155883456_155889063_155889121_155893256_155893326_155893963_155894006_155895713_155895770_155898045_155898127_155898894_155898934_155906132_155906178_155907159_155907220_155909471_155909547_155911503
tx.8510	chr17	-	726	3	ISM	ENSMUSG00000024207.9	ENSMUST00000043062.5	2609	15	28014	0	28014	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	2	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGCCTTGAGTCTTCATTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57153433	57150102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57150378_57152403_57152514_57153092
tx.8511	chr17	+	698	4	NNC	ENSMUSG00000024209.10	novel	2677	14	NA	NA	8482	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	5	junction_1	29.6797723860694	148	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTCGCACCCCGAGGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57190984	57195906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_57191026_57192083_57192224_57193440_57193688_57195636
tx.8512	chr17	+	665	3	ISM	ENSMUSG00000024209.10	ENSMUST00000025048.7	2677	14	9599	-2	9573	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_2	9	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTCGCACCCCGAGGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57192075	57195906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_57192224_57193440_57193688_57195636
tx.8513	chr17	+	986	6	FSM	ENSMUSG00000002660.9	ENSMUST00000002735.9	983	6	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1307	junction_4	119.017645750536	6300	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGAAGCACCTTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57297301	57303188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57297514_57297605_57297678_57298293_57298391_57299825_57300014_57300447_57300554_57302877
tx.8514	chr17	+	738	4	FSM	ENSMUSG00000002661.15	ENSMUST00000002737.7	917	4	-4	183	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	443	junction_1	15.369522511198	4617	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATGGGATCTTCAAATGAC	367	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57304338	57306139	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57304568_57305388_57305563_57305670_57305796_57305929
tx.8515	chr17	-	422	3	ISM	ENSMUSG00000002658.10	ENSMUST00000002733.7	1717	13	7273	-3	7273	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	618	junction_1	38	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTGCGAGTCATCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57311015	57310401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57310632_57310720_57310812_57310914
tx.8516	chr17	-	655	5	ISM	ENSMUSG00000002658.10	ENSMUST00000002733.7	1717	13	6859	-3	6859	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	585	junction_3	56.3227307576612	459	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTGCGAGTCATCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57311429	57310401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57310632_57310720_57310812_57310914_57311054_57311121_57311196_57311308
tx.8517	chr17	-	1830	13	FSM	ENSMUSG00000002658.10	ENSMUST00000002733.7	1717	13	-110	-3	-110	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	510	junction_7	59.552672763977	654	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGTGCGAGTCATCACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57318398	57310401	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_57310632_57310720_57310812_57310914_57311054_57311121_57311196_57311308_57311429_57311510_57311573_57311665_57311820_57312359_57312545_57313985_57314157_57314712_57314907_57316687_57316761_57317975_57318023_57318108
tx.8518	chr17	+	1171	4	FSM	ENSMUSG00000044279.16	ENSMUST00000097299.10	1206	4	35	0	-17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_1	33.4099120355355	507	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTAGCTGTAAGCTCTT	1561	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57369265	57372918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57369374_57369594_57369767_57370636_57370699_57372089
tx.8519	chr17	+	795	5	FSM	ENSMUSG00000044279.16	ENSMUST00000169543.8	778	5	-16	-1	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_4	66.6520817379322	366	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTAGCTGTAAGCTCTT	1562	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57369266	57372918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57369374_57369594_57369767_57370636_57370699_57372089_57372234_57372608
tx.852	chr1	+	2432	2	NIC	ENSMUSG00000050565.17	novel	2491	3	NA	NA	-6	-5	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	23	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATGACTCAGCAGGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155911465	155929270	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_155911667_155927039
tx.8520	chr17	+	1376	3	FSM	ENSMUSG00000044279.16	ENSMUST00000163763.2	868	3	-17	-491	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	202	junction_2	10.5	91	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTAGCTGTAAGCTCTT	1577	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57369281	57372918	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57369767_57370636_57370699_57372089
tx.8521	chr17	-	1014	4	FSM	ENSMUSG00000079414.4	ENSMUST00000233039.2	1014	4	12	-12	-8	12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.471404520791032	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTTTGTTTTATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57412930	57399022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_57399770_57409054_57409154_57410349_57410485_57412897
tx.8522	chr17	-	943	3	FSM	ENSMUSG00000079414.4	ENSMUST00000233454.2	1560	3	-36	653	-16	12	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTTTGTTTTATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57412958	57399022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_57399770_57410349_57410485_57412897
tx.8523	chr17	+	1284	3	FSM	ENSMUSG00000035678.9	ENSMUST00000039490.9	1290	3	12	-6	12	6	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTTTATTATTTTCCTTG	5	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57412336	57414763	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57412861_57413249_57413287_57414040
tx.8524	chr17	-	850	6	ISM	ENSMUSG00000005823.10	ENSMUST00000232778.2	2166	16	10699	-30	10699	30	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_3	18.6504691629996	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGCGGAGCCCTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57543964	57541913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_57542367_57542922_57543048_57543155_57543240_57543373_57543424_57543696_57543741_57543870
tx.8525	chr17	+	2016	14	FSM	ENSMUSG00000019487.12	ENSMUST00000224947.2	2016	14	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_12	68.855048845232	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTTGGAGTCTGCACCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57556454	57570427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57556572_57557741_57557858_57557954_57558012_57560261_57560410_57560496_57560560_57561056_57561162_57561259_57561389_57562017_57562165_57562272_57562468_57564234_57564345_57568289_57568423_57568639_57568789_57569353_57569473_57569999
tx.8526	chr17	+	2003	14	FSM	ENSMUSG00000019487.12	ENSMUST00000019631.11	2224	14	-17	238	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	302	junction_12	30.2353686068634	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTCTTGGAGTCTGCACCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57556464	57570427	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_57556572_57557741_57557858_57557954_57558012_57560261_57560410_57560496_57560560_57561056_57561162_57561259_57561389_57562017_57562165_57562272_57562468_57564234_57564345_57568289_57568423_57568639_57568789_57569356_57569473_57569999
tx.8527	chr17	+	1643	2	Intergenic	novelGene_682	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATTTGTCTTAGCTCCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57892021	57896043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_57892195_57894573
tx.8528	chr17	-	1851	7	FSM	ENSMUSG00000024228.13	ENSMUST00000025065.12	4113	7	36	2226	36	-1733	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_4	5.17740818900302	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGAAAGAGCGGATTCCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59320331	59308838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_59309287_59310323_59310524_59313498_59313613_59314618_59314787_59316849_59317440_59318037_59318250_59320212
tx.8529	chr17	-	1240	3	ISM	ENSMUSG00000024228.13	ENSMUST00000174122.2	1244	5	-47	3120	-47	-3120	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	49	junction_2	5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAAGGAGGGGAGGAGGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59320310	59316509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_59317440_59318037_59318250_59320212
tx.853	chr1	+	1770	3	FSM	ENSMUSG00000050565.17	ENSMUST00000111754.9	2491	3	-3	724	-3	-724	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	87	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAATTTTCTCCTCTTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155911468	155928551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_155911667_155916820_155916881_155927039
tx.8530	chr17	-	1168	3	ISM	ENSMUSG00000023965.14	ENSMUST00000169134.2	2063	6	226607	529	226607	-529	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	6	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGTGTTCGCTTTTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63532099	63366461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_63367407_63387415_63387559_63532019
tx.8531	chr17	+	593	4	ISM	ENSMUSG00000000127.16	ENSMUST00000232945.2	2948	15	-11	127023	-11	-11832	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_1	31.3155978174881	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TATGACAACATCAGAAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64170998	64218560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_64171051_64203012_64203279_64214275_64214450_64218459
tx.8532	chr17	+	2768	19	NIC	ENSMUSG00000000127.16	novel	2973	18	NA	NA	-10	6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	108	junction_1	24.9886393940413	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTAGCTAACCACAGCAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64170999	64446198	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_64171051_64203012_64203279_64214275_64214450_64218459_64218560_64228607_64228792_64230356_64230495_64231053_64231174_64241284_64241408_64248285_64248476_64280059_64280153_64288474_64288682_64298588_64298712_64336284_64336342_64342441_64342558_64344564_64344660_64385846_64385971_64440435_64440591_64444704_64444828_64445869
tx.8533	chr17	+	738	4	ISM	ENSMUSG00000000127.16	ENSMUST00000038080.7	2068	14	140881	-14	140881	14	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_2	15.369522511198	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACAGCAACCCTGCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64385847	64446206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_64385971_64440435_64440591_64444704_64444828_64445869
tx.8534	chr17	-	4709	10	FSM	ENSMUSG00000024083.17	ENSMUST00000172818.8	4740	10	9	22	9	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	104	junction_6	24	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTCGGTGTTCATTTCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64638902	64588021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_64590534_64593995_64594118_64594522_64594638_64596927_64597040_64599833_64600020_64604718_64604905_64615616_64616662_64618165_64618367_64619995_64620114_64638790
tx.8535	chr17	-	4505	9	FSM	ENSMUSG00000024083.17	ENSMUST00000172733.2	4488	9	-17	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_5	42.6614580154031	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTTCATTTCTAATATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64638877	64588014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_64590534_64593995_64594118_64594522_64594638_64596927_64597040_64599833_64600020_64615616_64616662_64618165_64618367_64619995_64620114_64638790
tx.8536	chr17	-	1218	4	ISM	ENSMUSG00000024083.17	ENSMUST00000232842.2	3559	5	40	13013	18	-13013	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	161	junction_1	4.92160768674447	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGACGATTATGATGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64638842	64615814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_64616662_64618165_64618367_64619995_64620114_64638790
tx.8537	chr17	-	186	2	ISM	ENSMUSG00000024083.17	ENSMUST00000232842.2	3559	5	-11	17229	-11	-17229	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	173	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATATATGTCACAGTACACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64638893	64620030	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_64620114_64638790
tx.8538	chr17	+	1117	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000073377.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64841659	64843392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_64841801_64842416
tx.8539	chr17	+	1046	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000073377.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64841660	64843392	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_64841731_64842416
tx.854	chr1	+	1930	3	NIC	ENSMUSG00000050565.17	novel	2491	3	NA	NA	1	-731	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	36	junction_1	105	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGTTCTAATTTTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155911472	155928544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_+_155911838_155916820_155916881_155927039
tx.8540	chr17	+	353	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000045036.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTGGTCTGTGGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65749568	65769056	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_65749623_65768757
tx.8541	chr17	-	1415	6	FSM	ENSMUSG00000024091.10	ENSMUST00000024897.10	3369	6	228	1726	228	367	multi-exon	FALSE	canonical	3	3309	junction_3	105.717737395387	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGTTTGTGTCTGTCATG	3191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65920322	65887047	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_65887843_65889574_65889749_65899285_65899367_65900434_65900539_65901896_65902050_65920214
tx.8542	chr17	-	3364	7	FSM	ENSMUSG00000056515.10	ENSMUST00000070673.9	3473	7	109	0	-3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	62	junction_1	10.1775897605147	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGAGTGTCCTTTCCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66079638	65958723	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_65961499_65974860_65974971_66003265_66003373_66004985_66005058_66024476_66024559_66029002_66029083_66079500
tx.8543	chr17	-	555	3	FSM	ENSMUSG00000056515.10	ENSMUST00000233258.2	555	3	-2	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	45	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAAGTGGAAATCTTAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66079637	66028262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_66028601_66029002_66029083_66079500
tx.8544	chr17	+	539	4	ISM	ENSMUSG00000061950.18	ENSMUST00000160664.8	3784	20	40	37698	-10	312	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	222	junction_1	69.8426803609369	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCCAGTTTACATATGTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66090400	66111219	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_66090445_66090618_66090664_66110205_66110291_66110854
tx.8545	chr17	-	3672	10	FSM	ENSMUSG00000024096.18	ENSMUST00000024905.11	3811	10	143	-4	143	4	multi-exon	FALSE	canonical	1	202	junction_3	142.261973611371	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTCTATTGTCCACTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66191806	66155408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_66157191_66159114_66159239_66159684_66159807_66161086_66161195_66164656_66164789_66165967_66166130_66168250_66168601_66171268_66171728_66174526_66174826_66191672
tx.8546	chr17	-	710	3	ISM	ENSMUSG00000024096.18	ENSMUST00000024905.11	3811	10	128	16053	128	221	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	383	junction_2	139.5	451	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GAAAAAGCCAATTCAGGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66191821	66171465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_66171728_66174526_66174826_66191672
tx.8547	chr17	-	691	3	ISM	ENSMUSG00000024096.18	ENSMUST00000166543.10	3799	10	478	15710	-366	216	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_2	268	347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAGAAAAAGCCAATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66192315	66171470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_66171728_66174526_66174826_66192180
tx.8548	chr17	-	4023	5	FSM	ENSMUSG00000024098.7	ENSMUST00000024906.6	4086	5	57	6	-32	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_1	25.0636689253589	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAGTCATGTTTTTTAT	8751	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66258164	66230065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_66233462_66236541_66236809_66244795_66244896_66255652_66255810_66258061
tx.8549	chr17	-	1540	4	ISM	ENSMUSG00000024098.7	ENSMUST00000024906.6	4086	5	56	5570	-33	1055	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	263	junction_1	9.97775303139718	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTCATGTCATAATTTTGGA	8750	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66258165	66235629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_66236809_66244795_66244896_66255652_66255810_66258061
tx.855	chr1	+	2410	3	FSM	ENSMUSG00000050565.17	ENSMUST00000097526.3	2589	3	-27	206	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	163	junction_1	41.5	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCAGGTTTTATTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155916635	155929276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_155916749_155916820_155916881_155927039
tx.8550	chr17	-	847	8	FSM	ENSMUSG00000024099.16	ENSMUST00000143987.9	1697	8	50	800	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	4006	junction_3	144.496027768297	27813	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAAGCTTTATTCGGTTTGCT	5502	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66408504	66386432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_66386583_66387805_66387883_66390392_66390503_66394397_66394567_66396226_66396344_66396425_66396489_66398858_66398925_66408409
tx.8551	chr17	+	1852	11	NNC	ENSMUSG00000024101.16	novel	1831	11	NA	NA	-16	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	39.5182236442885	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGGAGCTGTCCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66418623	66426443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_66418731_66420857_66421012_66422665_66422778_66422948_66423096_66423254_66423392_66423623_66423757_66423967_66424170_66424258_66424439_66425057_66425217_66425805_66425875_66425991
tx.8552	chr17	+	518	2	ISM	ENSMUSG00000024101.16	ENSMUST00000116556.4	1831	11	7169	-1	2540	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	115	junction_1	0	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGTGGGAGCTGTCCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66425808	66426443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_66425875_66425991
tx.8553	chr17	+	1291	7	ISM	ENSMUSG00000035842.11	ENSMUST00000224497.2	4141	27	25040	721	4944	64	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	130	junction_2	27.5560035805872	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGTCTCCGTGTTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66455647	66458448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_66455799_66456025_66456095_66456207_66456309_66456962_66457048_66457325_66457405_66457568_66457724_66457797
tx.8554	chr17	+	846	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117010.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0.5	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCAGTCTCCCGTGTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66622556	66629315	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_66622652_66628154_66628305_66628714
tx.8555	chr17	-	509	2	NNC	ENSMUSG00000117010.2	novel	228	2	NA	NA	-35	257	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	161	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATTCTGTTGTATCAGGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66626542	66625813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_66626128_66626347
tx.8556	chr17	-	612	2	ISM	ENSMUSG00000052105.18	ENSMUST00000134139.8	2423	6	24761	-8	-7625	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	214	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTAGTACAGTTTTCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66661165	66654952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_66655517_66661117
tx.8557	chr17	-	908	3	ISM	ENSMUSG00000052105.18	ENSMUST00000134139.8	2423	6	20821	-8	-11565	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	214	junction_1	7	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTAGTACAGTTTTCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66665105	66654952	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_66655517_66661117_66661373_66665016
tx.8558	chr17	+	1183	4	Intergenic	novelGene_684	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCTCTCTCCCATATCCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67781981	67787290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_67782346_67783781_67783972_67784132_67784241_67786769
tx.8559	chr17	+	506	3	Intergenic	novelGene_685	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGTACATACCCATTCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69258382	69324304	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_69258474_69321114_69321252_69324026
tx.856	chr1	+	2350	2	FSM	ENSMUSG00000050565.17	ENSMUST00000065648.15	2529	2	-27	206	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_1	0	375	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCAGCAGGTTTTATTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	155916635	155929276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_155916749_155927039
tx.8560	chr17	+	427	3	Intergenic	novelGene_686	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACCCATTCTTATTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69258393	69324312	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_69258474_69302117_69302179_69324026
tx.8561	chr17	-	777	3	FSM	ENSMUSG00000100572.2	ENSMUST00000187090.2	764	3	-3	-10	-3	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_1	7	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAACGTATGTCCTGACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69584206	69582346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_69582902_69583120_69583191_69584054
tx.8562	chr17	+	1734	5	ISM	ENSMUSG00000024044.20	ENSMUST00000223565.2	3026	6	2920	-4	2920	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_4	17.3259198889987	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTCGTCTTCCATGTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69591628	69596984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_69591912_69592896_69593029_69593707_69593807_69594251_69594333_69595845
tx.8563	chr17	+	498	3	FSM	ENSMUSG00000049672.16	ENSMUST00000112674.8	3743	3	-47	3292	-47	-3292	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	58	123	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTGTGTCCTCGCCGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69689997	69694453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_69690265_69692415_69692500_69694306
tx.8564	chr17	+	294	3	FSM	ENSMUSG00000049672.16	ENSMUST00000062369.14	3625	3	39	3292	39	-3292	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_1	68.5	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTGTGTCCTCGCCGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69690352	69694453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_69690416_69692415_69692500_69694306
tx.8565	chr17	+	577	3	FSM	ENSMUSG00000049672.16	ENSMUST00000112676.4	4358	3	40	3741	40	-3292	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_1	80	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTGTGTCCTCGCCGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69690874	69694453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_69691221_69692415_69692500_69694306
tx.8566	chr17	+	232	2	ISM	ENSMUSG00000049672.16	ENSMUST00000112676.4	4358	3	1580	3741	1580	-3292	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	201	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGTGTGTCCTCGCCGCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69692414	69694453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_69692500_69694306
tx.8567	chr17	-	272	2	ISM	ENSMUSG00000097282.2	ENSMUST00000181546.2	2481	3	4159	1018	4159	-1018	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTTATTGTATGTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71058418	71053341	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_71053515_71058319
tx.8568	chr17	+	557	2	FSM	ENSMUSG00000093622.2	ENSMUST00000175668.2	385	2	-30	-142	-30	142	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_1	0	715	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGGTCTATCTTTTTTTT	250	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71141628	71143181	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_71141798_71142793
tx.8569	chr17	+	380	3	NNC	ENSMUSG00000100865.3	novel	443	4	NA	NA	-1008	-18980	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTCATAAAACTATTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71159753	71163980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_71159899_71161472_71161556_71163828
tx.857	chr1	-	1515	7	ISM	ENSMUSG00000060985.16	ENSMUST00000167528.9	3210	18	32011	-2	3053	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	2	12	junction_4	2.5603819159562	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTGTGATCTATATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156098907	156082865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_156083416_156087300_156087506_156090398_156090543_156090975_156091159_156094782_156094942_156098135_156098271_156098768
tx.8570	chr17	+	556	3	ISM	ENSMUSG00000100865.3	ENSMUST00000176549.2	443	4	-168	21267	-168	-21267	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCATGTATTATTTGGTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71160593	71161693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_71160801_71161219_71161348_71161472
tx.8571	chr17	-	970	4	FSM	ENSMUSG00000034868.10	ENSMUST00000038446.10	2143	4	350	823	-10	70	multi-exon	FALSE	canonical	3	1955	junction_2	187.919013289118	3011	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGATGCTGACTCAAGTGG	3394	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71297535	71280950	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_71281492_71282453_71282616_71284042_71284242_71297467
tx.8572	chr17	-	956	4	FSM	ENSMUSG00000024048.16	ENSMUST00000148960.8	1937	4	343	638	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2551	junction_2	294.524475496803	21296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTAGTTGTTTAGCGTTA	2270	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71309206	71301288	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_71301780_71303104_71303267_71303691_71303891_71309102
tx.8573	chr17	-	1299	4	NNC	ENSMUSG00000024053.12	novel	3939	8	NA	NA	-29	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	6.59966329107444	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCTTTTCTGTATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71563370	71559166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_71560089_71562113_71562243_71562974_71563008_71563155
tx.8574	chr17	-	1148	3	NNC	ENSMUSG00000024053.12	novel	3939	8	NA	NA	-43	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	8.5	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCTTTTCTGTATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71563384	71559166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_71560089_71562113_71562274_71563318
tx.8575	chr17	-	1160	4	ISM	ENSMUSG00000024053.12	ENSMUST00000233148.2	758	5	12198	-845	-53	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	7	junction_2	4.49691252107735	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTCCTTTTCTGTATTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71563394	71559166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_71560089_71562113_71562243_71562974_71563008_71563318
tx.8576	chr17	-	2167	17	FSM	ENSMUSG00000024056.11	ENSMUST00000024851.10	2201	17	32	2	-18	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	248	junction_10	48.8427003246135	494	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGTGTCCCCTCCCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71833820	71803096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_71803349_71806261_71806365_71807266_71807398_71808503_71808597_71811760_71811851_71814254_71814408_71815562_71815769_71818339_71818485_71819387_71819495_71821183_71821278_71824538_71824629_71825732_71825836_71827754_71827928_71828022_71828147_71830576_71830655_71832627_71832738_71833705
tx.8577	chr17	-	649	4	ISM	ENSMUSG00000024056.11	ENSMUST00000233750.2	3847	10	-20	14408	-3	1870	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	147.044966667419	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCCAAGTCTAGGAATCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71833805	71830077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_71830439_71830576_71830655_71832627_71832738_71833705
tx.8578	chr17	-	1205	4	NNC	ENSMUSG00000085492.8	novel	781	3	NA	NA	-3	44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	34.8807492274273	146	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTTTTACTGTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71905753	71895507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_71895980_71897482_71897518_71898852_71898942_71905144
tx.8579	chr17	-	1298	3	FSM	ENSMUSG00000085492.8	ENSMUST00000143828.2	781	3	-514	-3	-12	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	30	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTATGTATTTTTTAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71905762	71895548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_71895980_71897482_71897518_71904930
tx.858	chr1	-	3057	16	NNC	ENSMUSG00000026600.13	novel	8371	16	NA	NA	14	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	20.6128331116537	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGACATGTACTCATATGTGA	1748	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156301852	156257360	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_156258686_156259773_156259920_156260416_156260553_156261722_156261822_156263362_156263461_156265273_156265404_156266857_156266904_156267270_156267353_156268076_156268156_156268798_156269082_156269950_156270059_156272124_156272185_156274110_156274260_156285511_156285575_156294250_156294369_156301717
tx.8580	chr17	-	1412	4	NNC	ENSMUSG00000085492.8	novel	781	3	NA	NA	4	44	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	34.8807492274273	149	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTTTTTACTGTTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71905746	71895507	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_71895980_71897482_71897518_71898852_71898942_71904930
tx.8581	chr17	-	1084	3	NNC	ENSMUSG00000085492.8	novel	781	3	NA	NA	-12	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	23	junction_2	31	191	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTATGTATTTTTTAAGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71905762	71895548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_71895980_71897482_71897518_71905144
tx.8582	chr17	+	3431	18	FSM	ENSMUSG00000041057.11	ENSMUST00000047086.10	3450	18	14	5	14	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1341	junction_7	117.232918130641	551	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCAGCGCGTGTCTCGTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71923223	71966021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_71923481_71932347_71932486_71933767_71933890_71937155_71937277_71938999_71939137_71940618_71940722_71943551_71943617_71945303_71945476_71947228_71947316_71948281_71948414_71949699_71949829_71955767_71955855_71957011_71957044_71957562_71957627_71959775_71959890_71960447_71960518_71964335_71964386_71964470
tx.8583	chr17	+	3000	16	ISM	ENSMUSG00000041057.11	ENSMUST00000047086.10	3450	18	10592	7	-9748	-7	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1341	junction_5	112.751920407395	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACCCAGCGCGTGTCTCGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71933801	71966019	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_71933890_71937155_71937277_71938999_71939137_71940618_71940722_71943551_71943617_71945303_71945476_71947228_71947316_71948281_71948414_71949699_71949829_71955767_71955855_71957011_71957044_71957562_71957627_71959775_71959890_71960447_71960518_71964335_71964386_71964470
tx.8584	chr17	+	1780	15	ISM	ENSMUSG00000041057.11	ENSMUST00000047086.10	3450	18	13966	1119	-6374	-66	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1341	junction_4	116.099622949343	595	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACATGAGTGTCCAATATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	71937175	71964907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_71937277_71938999_71939137_71940618_71940722_71943551_71943617_71945303_71945476_71947228_71947316_71948281_71948414_71949699_71949829_71955767_71955855_71957011_71957044_71957562_71957627_71959775_71959890_71960447_71960518_71964335_71964386_71964470
tx.8585	chr17	+	1201	3	NNC	ENSMUSG00000039770.7	novel	3120	3	NA	NA	231	673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	122	281	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGGTCCTCTGTTACT	976	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73143678	73156502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_73143787_73153273_73153443_73155578
tx.8586	chr17	+	1223	3	NNC	ENSMUSG00000039770.7	novel	2419	3	NA	NA	43	673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	50.5	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGGTCCTCTGTTACT	1871	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73144573	73156502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_73144704_73153273_73153443_73155578
tx.8587	chr17	+	1327	3	NNC	ENSMUSG00000039770.7	novel	704	3	NA	NA	50	673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	14.5	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTGGTCCTCTGTTACT	1878	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73144580	73156502	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_73144815_73153273_73153443_73155578
tx.8588	chr17	+	697	3	FSM	ENSMUSG00000024063.14	ENSMUST00000024857.14	3069	3	0	2372	0	230	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	4	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACCGAGTCGGTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73225299	73246570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_73225574_73228182_73228286_73246250
tx.8589	chr17	-	449	3	Intergenic	novelGene_688	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGAAAGAAAGAAAGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73314431	73311528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_73311716_73313545_73313739_73314362
tx.859	chr1	+	444	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000101523.3	novel	2633	1	NA	NA	-41	-2176	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGAAATAAAGATTTTGGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156351540	156352038	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_156351693_156351746
tx.8590	chr17	-	2268	2	Intergenic	novelGene_689	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGAAAGAAAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73314428	73311536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_73313739_73314362
tx.8591	chr17	+	3144	6	NIC	ENSMUSG00000054469.15	novel	4467	6	NA	NA	52	-1239	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	2	7	junction_1	29.4659125092029	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTATTTGTTCTTACCTACAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73415040	73549124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_73415141_73468817_73468987_73476490_73476690_73494869_73495017_73503673_73503791_73546712
tx.8592	chr17	-	653	4	FSM	ENSMUSG00000024067.15	ENSMUST00000232687.2	694	4	43	-2	43	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	2414	junction_1	149.934059580278	2594	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATAGTTGTTGTATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74623155	74606474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_74606820_74614714_74614858_74622896_74622945_74623038
tx.8593	chr17	-	686	5	FSM	ENSMUSG00000024067.15	ENSMUST00000233581.2	734	5	42	6	-13	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1923	junction_4	306.562391692132	6916	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATAGTTGTTGTATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74623416	74606474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_74606820_74614714_74614858_74622896_74622945_74623038_74623112_74623339
tx.8594	chr17	+	684	7	ISM	ENSMUSG00000024068.9	ENSMUST00000224711.2	2066	17	34696	0	6387	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	226	junction_1	11.5421931287872	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTTCAAGGCCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74680677	74695481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_74680750_74681117_74681198_74682077_74682121_74684035_74684116_74688964_74689036_74694028_74694070_74695184
tx.8595	chr17	+	600	6	ISM	ENSMUSG00000024068.9	ENSMUST00000224711.2	2066	17	35148	0	6839	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_4	9.3680307429043	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTTCAAGGCCTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74681129	74695481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_74681198_74682077_74682121_74684035_74684116_74688964_74689036_74694028_74694070_74695184
tx.8596	chr17	+	1922	14	FSM	ENSMUSG00000024069.15	ENSMUST00000024870.9	2148	14	4	222	4	-10	multi-exon	TRUE	canonical	3	152	junction_5	21.3572043468894	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATTGGAAGTTGTGAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74702606	74730994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_74702664_74708906_74708994_74710998_74711084_74712679_74712723_74714215_74714282_74715840_74715922_74716347_74716384_74717328_74717424_74719268_74719318_74719601_74719722_74722614_74722718_74725614_74725663_74726526_74726596_74730011
tx.8597	chr17	-	998	2	ISM	ENSMUSG00000039193.10	ENSMUST00000234086.2	3154	8	14301	-520	14301	509	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCATATATGCTATTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74740900	74733302	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_74734130_74740729
tx.8598	chr17	+	1287	4	ISM	ENSMUSG00000024072.10	ENSMUST00000234432.2	1991	7	4456	-11	78	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	423	junction_2	44.5645599103144	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATACCTTGTCCTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74801000	74806966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_74801095_74803584_74803663_74805303_74805418_74805965
tx.8599	chr17	+	1194	3	ISM	ENSMUSG00000024072.10	ENSMUST00000234432.2	1991	7	7039	-11	2661	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	423	junction_1	1.5	254	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAATACCTTGTCCTATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74803583	74806966	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_74803663_74805303_74805418_74805965
tx.86	chr1	-	469	3	Intergenic	novelGene_12	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_2	28.5	203	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTTGTGAGATCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21326247	21323506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_21323669_21324392_21324563_21326110
tx.860	chr1	+	1092	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000101523.3	novel	2633	1	NA	NA	-47	134160	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTTTTTTTTTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156351534	156488374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_156352424_156488171
tx.8600	chr17	-	399	3	NNC	ENSMUSG00000117358.2	novel	327	3	NA	NA	237	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	48.5	464	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCATTGGTCTCAGTGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74834402	74826657	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_74826911_74830509_74830574_74834320
tx.8601	chr17	+	1378	4	FSM	ENSMUSG00000024078.8	ENSMUST00000234751.2	644	4	-12	-722	-12	722	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_3	63.6605581711837	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGTTGAGTTTCTGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75024744	75031390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_75025007_75025628_75025807_75028515_75028646_75030582
tx.8602	chr17	-	2747	8	FSM	ENSMUSG00000002017.11	ENSMUST00000112507.4	2817	8	63	7	-10	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	156	junction_4	28.1765570527511	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCTTGCTCTGGGAGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75858878	75844087	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_75845857_75845941_75846110_75846395_75846513_75847105_75847187_75848190_75848376_75851742_75851878_75854605_75854755_75858735
tx.8603	chr17	-	1917	8	FSM	ENSMUSG00000056121.17	ENSMUST00000070039.14	1939	8	22	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	258	junction_3	15.727267365169	238	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCGGAGTCTTGAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78725538	78685313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_78686175_78689036_78689103_78692172_78692249_78708058_78708328_78710168_78710311_78712156_78712274_78720292_78720402_78725261
tx.8604	chr17	-	1165	6	ISM	ENSMUSG00000056121.17	ENSMUST00000070039.14	1939	8	26	6680	-9	-6679	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	258	junction_1	18.0731845561318	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTTGTTTGAATTCTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	78725534	78691993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_78692249_78708058_78708328_78710168_78710311_78712156_78712274_78720292_78720402_78725261
tx.8605	chr17	+	1109	9	NIC	ENSMUSG00000050668.11	novel	4134	10	NA	NA	-26	4	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	12	junction_1	40.2086355774478	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGTGATGTGGCATTGTGA	8804	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79142969	79152791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_79143108_79145259_79145332_79146415_79146643_79147506_79147549_79148391_79148513_79148647_79148739_79149541_79149659_79151247_79151330_79152572
tx.8606	chr17	+	1224	10	FSM	ENSMUSG00000050668.11	ENSMUST00000170759.3	4134	10	-39	2949	-17	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	101	junction_6	15.3405779986718	455	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTACAAGTGATGTGGCATTG	8813	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79142978	79152788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_79143108_79144222_79144350_79145259_79145332_79146415_79146643_79147506_79147549_79148391_79148513_79148647_79148739_79149541_79149659_79151247_79151330_79152572
tx.8607	chr17	+	402	3	ISM	ENSMUSG00000050668.11	ENSMUST00000170759.3	4134	10	6538	2948	-1467	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	104	junction_2	9.5	133	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACAAGTGATGTGGCATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79149555	79152789	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_79149659_79151247_79151330_79152572
tx.8608	chr17	-	1867	13	NNC	ENSMUSG00000024079.5	novel	4313	16	NA	NA	8917	849	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	4	junction_12	17.083739832562	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGCAATAGGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79181060	79161933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_79162691_79162771_79162829_79163995_79164098_79165929_79166062_79171267_79171449_79172730_79172851_79173743_79173867_79176185_79176237_79176904_79176940_79177915_79177965_79178082_79178163_79178577_79178699_79181001
tx.8609	chr17	-	2375	16	FSM	ENSMUSG00000024079.5	ENSMUST00000024884.5	4313	16	-3	1941	-3	849	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_8	9.77525219907679	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGCAATAGGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79190005	79161933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_79162691_79162771_79162829_79163995_79164098_79165929_79166062_79171267_79171449_79172730_79172851_79173743_79173867_79176185_79176237_79176904_79176940_79177915_79177965_79178082_79178163_79178577_79178699_79181371_79181509_79183610_79183732_79185570_79185703_79189828
tx.861	chr1	-	2306	6	FSM	ENSMUSG00000060519.12	ENSMUST00000079625.11	3285	6	19	960	-2	446	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_5	7.96492310069595	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGGGATCTCAATTAGCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156501907	156482146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_156483514_156484041_156484167_156494168_156494348_156496940_156497207_156501099_156501217_156501655
tx.8610	chr17	-	831	8	ISM	ENSMUSG00000024079.5	ENSMUST00000024884.5	4313	16	18	16912	-1	4302	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	45	junction_1	8.58094709581783	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTATCATTGTGCACGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79189984	79176904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_79176940_79177915_79177965_79178082_79178163_79178577_79178699_79181371_79181509_79183610_79183732_79185570_79185703_79189828
tx.8611	chr17	-	722	4	FSM	ENSMUSG00000024079.5	ENSMUST00000171852.2	704	4	-18	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	45	junction_1	9.80929264637478	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGGTTCCTCTTTCCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79189995	79181206	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_79181509_79183610_79183732_79185570_79185703_79189828
tx.8612	chr17	-	1143	4	ISM	ENSMUSG00000038045.15	ENSMUST00000146474.8	764	5	-1	-12	-1	12	intron_retention	FALSE	canonical	3	141	junction_3	32.273139846559	358	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGCTGTCAGTGTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79202530	79192313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_79192646_79196359_79196517_79198274_79198370_79201971
tx.8613	chr17	-	777	5	FSM	ENSMUSG00000038045.15	ENSMUST00000146474.8	764	5	-1	-12	-1	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_4	54.3570372628973	600	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTGCTGTCAGTGTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79202530	79192313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_79192646_79196359_79196517_79198274_79198370_79201971_79202099_79202464
tx.8614	chr17	+	616	5	FSM	ENSMUSG00000062691.11	ENSMUST00000180077.7	602	5	-14	0	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	686	junction_1	395.694563394546	1104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACGTGTGTGGGTCTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79223914	79227735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_79223955_79225785_79225902_79226484_79226530_79227187_79227273_79227405
tx.8615	chr17	+	742	5	FSM	ENSMUSG00000062691.11	ENSMUST00000063817.7	753	5	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	300	junction_1	562.646592009585	1243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACGTGTGTGGGTCTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79223956	79227735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_79224123_79225785_79225902_79226484_79226530_79227187_79227273_79227405
tx.8616	chr17	+	578	4	ISM	ENSMUSG00000062691.11	ENSMUST00000063817.7	753	5	1838	0	1655	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1564	junction_2	26.0298973404728	2330	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACGTGTGTGGGTCTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79225783	79227735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_79225902_79226484_79226530_79227187_79227273_79227405
tx.8617	chr17	-	1302	13	ISM	ENSMUSG00000024081.10	ENSMUST00000233484.2	2920	16	5656	-99	-5401	99	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	573	junction_9	40.5020575609026	262	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTGTCATTTATAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79238814	79227174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_79227447_79227977_79228060_79228150_79228210_79229063_79229151_79229558_79229744_79229942_79230001_79230664_79230766_79231874_79231942_79233342_79233412_79233511_79233615_79234297_79234352_79236706_79236796_79238738
tx.8618	chr17	-	3328	16	FSM	ENSMUSG00000024081.10	ENSMUST00000024885.10	4070	16	2	740	2	99	multi-exon	FALSE	canonical	3	465	junction_13	57.736720454914	186	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTACTGTCATTTATAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79244493	79227174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_79227447_79227977_79228060_79228150_79228210_79229063_79229151_79229558_79229744_79229942_79230001_79230664_79230766_79231874_79231942_79233342_79233412_79233511_79233615_79234297_79234352_79236706_79236796_79238738_79238926_79239538_79239771_79242003_79243497_79244303
tx.8619	chr17	-	441	2	ISM	ENSMUSG00000024081.10	ENSMUST00000232899.2	530	3	-26	599	3	-599	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	619	junction_1	0	393	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAAAAGAAGGTGAAAAATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79244492	79243244	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_79243497_79244303
tx.862	chr1	-	3000	20	FSM	ENSMUSG00000026594.15	ENSMUST00000063199.13	2947	20	-71	18	0	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	93	junction_5	55.0008310186526	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAATTGAAAATATAAAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156767172	156635703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_156636764_156639014_156639107_156641007_156641114_156645310_156645404_156647382_156647489_156648956_156649035_156651560_156651616_156655709_156655862_156656541_156656699_156657954_156658023_156660234_156660326_156660464_156660603_156697010_156697138_156712102_156712196_156714660_156714751_156715516_156715601_156728155_156728207_156729355_156729461_156735208_156735349_156767058
tx.8620	chr17	+	1416	10	FSM	ENSMUSG00000024082.6	ENSMUST00000024887.6	1749	10	2	331	1	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	388	junction_6	40.441391826191	962	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAGTTTTCAAACTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79244566	79254597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_79244631_79244919_79245084_79245969_79246051_79247023_79247135_79249497_79249712_79250681_79250741_79251262_79251374_79252369_79252514_79253724_79253899_79254303
tx.8621	chr17	+	1353	9	ISM	ENSMUSG00000024082.6	ENSMUST00000024887.6	1749	10	354	331	174	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	388	junction_5	38.719948024242	135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CATAAGTTTTCAAACTAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79244918	79254597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_79245084_79245969_79246051_79247023_79247135_79249497_79249712_79250681_79250741_79251262_79251374_79252369_79252514_79253724_79253899_79254303
tx.8622	chr17	-	2223	9	NIC	ENSMUSG00000024070.16	novel	1265	7	NA	NA	-3	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	70	junction_1	42.4941172399192	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGGTGAGGTGTGATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79328248	79278983	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_79279270_79279831_79280016_79282163_79282242_79282803_79282997_79289202_79289361_79290954_79291087_79292643_79292783_79320052_79320971_79328113
tx.8623	chr17	+	1724	7	FSM	ENSMUSG00000024084.9	ENSMUST00000040789.6	2059	7	338	-3	56	3	multi-exon	TRUE	canonical	3	226	junction_1	6.47216261298253	526	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGAATAACTATTGCCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79359672	79397810	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_79359818_79371356_79371504_79378101_79378381_79384910_79385088_79386895_79386996_79389175_79389293_79397051
tx.8624	chr17	-	1846	2	NNC	ENSMUSG00000036533.10	novel	2265	2	NA	NA	10292	-279	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	40	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTTTATTGCAAAGTCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79650144	79641434	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_79643146_79650009
tx.8625	chr17	-	1983	2	FSM	ENSMUSG00000036533.10	ENSMUST00000068958.9	2265	2	2	280	2	-280	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTTTTTATTGCAAAGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79662518	79641435	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_79643146_79662245
tx.8626	chr17	-	375	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000036368.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGGGAGGAGTTCTTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	79961737	79960004	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_79960176_79960298_79960426_79961660
tx.8627	chr17	-	2435	11	ISM	ENSMUSG00000059811.14	ENSMUST00000112437.8	3371	12	30997	671	-8996	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	301	junction_5	38.8638649647716	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAAGTTGTGATTCTTTTT	1256	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80172555	80156491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_80157708_80159953_80160386_80161262_80161335_80161982_80162040_80163564_80163693_80164536_80164676_80167215_80167309_80168531_80168589_80168857_80168909_80172131_80172237_80172470
tx.8628	chr17	-	1644	2	ISM	ENSMUSG00000059811.14	ENSMUST00000223273.2	3968	4	3178	671	-197	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	341	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAAGTTGTGATTCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80160381	80156491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_80157708_80159953
tx.8629	chr17	-	2876	13	FSM	ENSMUSG00000059811.14	ENSMUST00000068282.7	3618	13	69	673	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	301	junction_5	41.6619997386374	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGAAAGTTGTGATTCTTTTT	3820	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80203483	80156491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_80157708_80159953_80160386_80161262_80161335_80161982_80162040_80163564_80163693_80164536_80164676_80167215_80167309_80168531_80168589_80168857_80168909_80172131_80172237_80172470_80172606_80183230_80183476_80203337
tx.863	chr1	-	2223	19	FSM	ENSMUSG00000026594.15	ENSMUST00000027886.14	4237	19	-48	2062	2	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	179	junction_5	32.038605185342	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAACTTTGTACTAATTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156767161	156636391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_156636764_156639014_156639107_156641007_156641114_156645310_156645404_156647382_156647489_156651560_156651616_156655709_156655862_156656541_156656699_156657954_156658023_156660234_156660326_156660464_156660603_156697010_156697138_156712102_156712196_156714660_156714751_156715516_156715601_156728155_156728207_156729355_156729461_156735208_156735349_156767058
tx.8630	chr17	-	2088	12	ISM	ENSMUSG00000024095.16	ENSMUST00000184635.8	3009	13	8585	351	8493	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_9	163.83830973108	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAATGTGTTCATCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80361071	80337266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_80337970_80339969_80340069_80340156_80340215_80341474_80341677_80342759_80342882_80346020_80346239_80351922_80351995_80356036_80356110_80356193_80356291_80357235_80357322_80358056_80358295_80360951
tx.8631	chr17	-	2641	13	FSM	ENSMUSG00000024095.16	ENSMUST00000184635.8	3009	13	17	351	-16	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	159.429974178843	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAATGTGTTCATCTTCAT	3587	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80369639	80337266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_80337970_80339969_80340069_80340156_80340215_80341474_80341677_80342759_80342882_80346020_80346239_80351922_80351995_80356036_80356110_80356193_80356291_80357235_80357322_80358056_80358295_80360951_80361071_80369085
tx.8632	chr17	-	2226	13	NNC	ENSMUSG00000024095.16	novel	3116	13	NA	NA	342	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	159.429974178843	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAATGTGTTCATCTTCAT	4004	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80369222	80337266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_80337970_80339969_80340069_80340156_80340215_80341474_80341677_80342759_80342882_80346020_80346239_80351922_80351995_80356036_80356110_80356193_80356280_80357222_80357322_80358056_80358295_80360951_80361071_80369085
tx.8633	chr17	+	2296	7	FSM	ENSMUSG00000035473.11	ENSMUST00000039205.11	2314	7	19	-1	19	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_3	8.09149072929224	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGACTCTTGTTCTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80434918	80492531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_80435335_80445441_80445597_80452408_80452616_80457517_80457600_80488989_80489132_80490620_80490796_80491412
tx.8634	chr17	+	1607	5	ISM	ENSMUSG00000035473.11	ENSMUST00000039205.11	2314	7	17627	-1	-54	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	126	junction_1	8.76070773396762	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGACTCTTGTTCTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80452526	80492531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_80452616_80457517_80457600_80488989_80489132_80490620_80490796_80491412
tx.8635	chr17	-	920	7	ISM	ENSMUSG00000024097.12	ENSMUST00000235069.2	1040	8	1273	-7	827	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1059	junction_3	398.894200676487	892	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGATTTTTGTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80513459	80508738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_80509032_80509597_80509634_80510119_80510174_80511559_80511662_80511741_80511817_80512690_80512868_80513276
tx.8636	chr17	-	1049	8	FSM	ENSMUSG00000024097.12	ENSMUST00000235069.2	1040	8	-2	-7	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1059	junction_3	412.241508371597	9723	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGATTTTTGTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80514734	80508738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_80509032_80509597_80509634_80510119_80510174_80511559_80511662_80511741_80511817_80512690_80512868_80513276_80513458_80514603
tx.8637	chr17	-	1923	7	FSM	ENSMUSG00000024097.12	ENSMUST00000235036.2	1921	7	0	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1059	junction_3	429.146601472685	271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGATTTTTGTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80514734	80508738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_80509032_80509597_80509634_80510119_80510174_80511559_80511662_80511741_80512868_80513276_80513458_80514603
tx.8638	chr17	-	1025	8	NIC	ENSMUSG00000024097.12	novel	2288	8	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	229	junction_3	678.209978922608	1089	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGATTTTTGTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80514734	80508738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_80509032_80509597_80509634_80510119_80510174_80511583_80511662_80511741_80511817_80512690_80512868_80513276_80513458_80514603
tx.8639	chr17	-	1036	7	NNC	ENSMUSG00000024097.12	novel	1040	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	824.318792835771	258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGATTTTTGTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80514734	80508738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_80509032_80510096_80510174_80511559_80511662_80511741_80511817_80512690_80512868_80513276_80513458_80514603
tx.864	chr1	-	1610	12	ISM	ENSMUSG00000026594.15	ENSMUST00000190648.7	2498	15	-4	9738	2	-63	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_3	27.825311029426	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACTGTTTATATTTCTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156767167	156656184	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_156656699_156657954_156658023_156660234_156660326_156660464_156660603_156697010_156697138_156712102_156712196_156714660_156714751_156715516_156715601_156728155_156728207_156729355_156729461_156735208_156735349_156767058
tx.8640	chr17	-	1013	7	NIC	ENSMUSG00000024097.12	novel	1040	8	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	135	junction_1	782.029553292088	522	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTTTGATTTTTGTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80514734	80508738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_80509032_80510119_80510174_80511559_80511662_80511741_80511817_80512690_80512868_80513276_80513458_80514603
tx.8641	chr17	-	1228	3	ISM	ENSMUSG00000024097.12	ENSMUST00000235069.2	1040	8	-2	3206	0	-496	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	2057	junction_1	159	321	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATAGGCCCAGAGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80514734	80511951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_80512868_80513276_80513458_80514603
tx.8642	chr17	+	1083	3	FSM	ENSMUSG00000055760.13	ENSMUST00000069486.13	1134	3	29	22	29	-22	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_1	34	2290	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCGTTTCGGGTTCTTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80531898	80535904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_80532100_80533049_80533194_80535166
tx.8643	chr17	+	1292	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035051.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTTTATGTGTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80540173	80550342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_+_80540458_80549334
tx.8644	chr17	+	634	5	FSM	ENSMUSG00000045257.11	ENSMUST00000061703.10	644	5	13	-3	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_3	10.1242283656583	721	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTTGAATTATGTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80597653	80604905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_80597767_80599753_80599808_80601898_80602006_80602941_80603079_80604682
tx.8645	chr17	+	1107	2	Intergenic	novelGene_691	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAACTGAGCTTGCTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80806817	80812485	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_80806934_80811494
tx.8646	chr17	-	1856	10	FSM	ENSMUSG00000024246.10	ENSMUST00000025093.6	1833	10	-21	-2	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_3	16.3940669785982	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTGCTTATAGACTCTT	8143	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81372517	81333758	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_81334400_81340060_81340170_81344926_81345042_81345533_81345606_81351528_81351617_81357365_81357419_81360323_81360402_81361552_81361963_81363203_81363340_81372363
tx.8647	chr17	-	395	3	ISM	ENSMUSG00000024246.10	ENSMUST00000234801.2	2239	11	0	28091	0	-28091	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_1	11.5	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTCTCAAAGGGATGCTAAC	8149	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	81372511	81361851	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_81361963_81363203_81363340_81372363
tx.8648	chr17	+	930	2	Intergenic	novelGene_692	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAAGTTACCTAATCTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	82422119	82442133	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_82422265_82441348
tx.8649	chr17	-	1068	3	FSM	ENSMUSG00000024248.15	ENSMUST00000025095.9	1076	3	0	8	0	-8	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	644	9529	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTTTTAGTTTGTTTGTTT	9947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83821759	83809354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_83810167_83811528_83811658_83821632
tx.865	chr1	-	443	5	ISM	ENSMUSG00000026594.15	ENSMUST00000190648.7	2498	15	-8	69120	1	-904	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	247	junction_1	17.6776695296637	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AATATAGTTCTGCACCAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156767171	156715566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_156715601_156728155_156728207_156729355_156729461_156735208_156735349_156767058
tx.8650	chr17	+	327	2	Intergenic	novelGene_693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGGTGGTGGTCTTATTC	3194	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	83830297	83831114	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_83830417_83830906
tx.8651	chr17	+	1668	14	FSM	ENSMUSG00000055817.19	ENSMUST00000112350.8	1723	14	59	-4	31	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	649	junction_11	147.297388673592	469	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTTGTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84013650	84100306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_84013715_84015827_84015896_84022042_84022137_84045757_84045885_84061282_84061347_84062987_84063106_84070339_84070443_84073935_84074036_84083010_84083200_84089330_84089406_84091705_84091765_84096349_84096472_84099081_84099231_84099970
tx.8652	chr17	+	862	6	ISM	ENSMUSG00000055817.19	ENSMUST00000112350.8	1723	14	69487	-4	-13271	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	649	junction_3	204.487065605627	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCTTTGTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84083078	84100306	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_84083200_84089330_84089406_84091705_84091765_84096349_84096472_84099081_84099231_84099970
tx.8653	chr17	-	449	4	Intergenic	novelGene_694	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3.09120616516523	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	5808	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84182138	84171827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_84171970_84172203_84172308_84180690_84180797_84182041
tx.8654	chr17	-	1685	3	Intergenic	novelGene_695	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	2	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGGTCATGGTGTC	5782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84182164	84171827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_84173284_84180690_84180797_84182041
tx.8655	chr17	+	755	3	FSM	ENSMUSG00000117431.2	ENSMUST00000235072.2	440	3	-285	-30	-285	10	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTTGCTCTGGATACTCG	2193	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84316037	84320847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_84316398_84319125_84319229_84320555
tx.8656	chr17	+	653	2	NIC	ENSMUSG00000117431.2	novel	440	3	NA	NA	-286	10	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGGTTGCTCTGGATACTCG	2192	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84316036	84320847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_+_84316398_84320555
tx.8657	chr17	+	954	8	NNC	ENSMUSG00000040852.7	novel	2807	10	NA	NA	-54	-6302	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	3.98978286964827	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATGTTTTCATAAACCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84819268	84873202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_84819393_84829123_84829254_84854890_84854954_84864799_84864950_84866917_84867002_84867515_84867598_84871245_84871426_84873061
tx.8658	chr17	+	1375	13	FSM	ENSMUSG00000024253.10	ENSMUST00000025101.10	1354	13	-26	5	-26	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	61	junction_6	7.6412622575651	392	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGCAACATCTAAGTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84933897	84963011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_84934005_84935712_84935831_84939063_84939099_84940946_84941017_84943659_84943749_84950299_84950487_84951532_84951602_84952146_84952225_84954672_84954750_84955073_84955145_84956643_84956742_84957136_84957230_84962728
tx.8659	chr17	+	584	5	ISM	ENSMUSG00000024253.10	ENSMUST00000025101.10	1354	13	20787	5	-1992	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_4	2.73861278752583	273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGCAACATCTAAGTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84954710	84963011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_84954750_84955073_84955145_84956643_84956742_84957136_84957230_84962728
tx.866	chr1	-	379	2	NNC	ENSMUSG00000101768.2	novel	722	3	NA	NA	11694	-68499	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGAGTTGCACACAAGGCCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	156869910	156868828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_156869083_156869785
tx.8660	chr17	-	355	2	ISM	ENSMUSG00000024120.13	ENSMUST00000112308.9	4393	38	84531	0	25157	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	633	junction_1	0	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTTATGTATTTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85013455	85012674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_85012901_85013326
tx.8661	chr17	+	1870	5	ISM	ENSMUSG00000061130.14	ENSMUST00000080217.14	2670	6	36006	79	325	-79	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	718	junction_4	374.08855903382	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCTCAGTTTCCACTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85301432	85322040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_85301968_85310693_85310812_85312339_85312452_85312936_85312995_85320993
tx.8662	chr17	+	2543	5	ISM	ENSMUSG00000061130.14	ENSMUST00000234851.2	1307	7	325	6651	325	-69	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	708	junction_4	378.362921016317	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGACATATTACTCTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85301432	85324556	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_85301968_85310693_85310812_85312339_85312452_85312936_85312995_85322836
tx.8663	chr17	-	2232	14	FSM	ENSMUSG00000024127.16	ENSMUST00000072406.5	3255	14	-35	1058	-15	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_13	48.4489605166915	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTTTGTGTAATTTTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85397684	85371955	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_85372162_85372469_85372544_85373059_85373184_85373575_85373726_85376312_85376530_85377855_85378032_85379339_85379538_85383293_85383480_85384036_85384254_85385916_85386053_85388491_85388699_85389399_85389467_85390620_85390744_85397533
tx.8664	chr17	-	772	5	ISM	ENSMUSG00000024127.16	ENSMUST00000234994.2	2196	9	8371	0	8371	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	189	junction_3	11.7553179455087	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTTTGTGTAATTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85376531	85371956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_85372162_85372469_85372544_85373059_85373184_85373575_85373726_85376312
tx.8665	chr17	-	2767	15	FSM	ENSMUSG00000024127.16	ENSMUST00000171795.9	2734	15	-32	-1	-15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	148	junction_9	21.6455679584736	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTCTTTGTGTAATTTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85397684	85371956	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_85372162_85372469_85372544_85373059_85373184_85373575_85373726_85376312_85376530_85377855_85378032_85379339_85379538_85383293_85383480_85384036_85384254_85385916_85386053_85388491_85388699_85389399_85389467_85390620_85390744_85395767_85396304_85397533
tx.8666	chr17	-	1631	6	FSM	ENSMUSG00000024127.16	ENSMUST00000234036.2	1625	6	-24	18	-14	-18	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_4	17.1043854025802	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGGAAAGATCTATGCTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85397683	85385504	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_85386053_85388491_85388699_85389399_85389467_85390620_85390744_85395767_85396304_85397533
tx.8667	chr17	+	466	3	ISM	ENSMUSG00000071037.7	ENSMUST00000234822.2	741	4	31	89173	31	-52660	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	95	junction_2	7	171	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAAGTTCTATGCTCACTATG	2258	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85398064	85421276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_85398292_85403917_85404091_85421210
tx.8668	chr17	-	715	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000071037.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTGTGTATGTAAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85470009	85466390	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_85466943_85469846
tx.8669	chr17	+	1046	8	ISM	ENSMUSG00000071037.7	ENSMUST00000095188.7	1595	11	301021	-1	299490	1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	62	junction_3	5.28764443523479	109	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATTGTTTCAATCTATCG	7751	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85699000	85766017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_85699062_85700885_85700941_85702029_85702094_85709853_85709921_85738898_85738974_85746954_85747019_85759623_85759756_85765489
tx.867	chr1	+	808	3	FSM	ENSMUSG00000049881.14	ENSMUST00000061537.12	1194	3	385	1	97	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	989	junction_1	26.5	11289	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGCTGGCCCAGTGTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157240306	157247805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_157240696_157241313_157241366_157247438
tx.8670	chr17	+	660	2	ISM	ENSMUSG00000071037.7	ENSMUST00000095188.7	1595	11	361644	-1	360113	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	65	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAATTGTTTCAATCTATCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	85759623	85766017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_85759756_85765489
tx.8671	chr17	-	2074	11	ISM	ENSMUSG00000024135.11	ENSMUST00000095187.4	3530	21	35839	9	10935	-9	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_9	12.8611819052527	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGCTGGTGACTTTGGTGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	86416764	86292101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_86292912_86295752_86295938_86307748_86307902_86308858_86309036_86311274_86311382_86358513_86358597_86365103_86365196_86405939_86406048_86406632_86406724_86410270_86410429_86416654
tx.8672	chr17	+	281	2	ISM	ENSMUSG00000024140.11	ENSMUST00000024954.11	5516	16	75285	3936	4652	3852	internal_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AGGTGTCAGGTGAGTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87136412	87136902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_87136529_87136737
tx.8673	chr17	-	968	6	FSM	ENSMUSG00000024145.7	ENSMUST00000024957.7	988	6	20	0	20	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	301	junction_5	28.3760462362183	2512	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGGCTTCAGATGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87332814	87304683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_87304996_87316230_87316340_87327828_87327946_87329286_87329379_87331092_87331342_87332725
tx.8674	chr17	-	859	5	NIC	ENSMUSG00000024145.7	novel	988	6	NA	NA	20	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	23	junction_1	138.539705499904	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTGGCTTCAGATGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87332814	87304683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_87304996_87327828_87327946_87329286_87329379_87331092_87331342_87332725
tx.8675	chr17	+	1162	5	FSM	ENSMUSG00000024146.10	ENSMUST00000024959.10	1184	5	21	1	21	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	592	junction_4	35.4427355039083	3961	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCCTGTTGTGTCTTCAATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87332998	87343237	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_87333104_87335126_87335193_87338435_87338491_87341683_87341788_87342405
tx.8676	chr17	-	353	2	Intergenic	novelGene_697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGAGGTCTCAAATGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87486190	87483563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_87483741_87486014
tx.8677	chr17	-	287	2	Intergenic	novelGene_698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAAGAGGTCTCAAATGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87490645	87483563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_87483741_87490535
tx.8678	chr17	-	599	2	ISM	ENSMUSG00000117384.2	ENSMUST00000234580.2	1396	4	2022	13	2022	-13	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTATATCACAGTATGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87500348	87499656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_87499956_87500048
tx.8679	chr17	-	1826	4	NIC	ENSMUSG00000024150.13	novel	2017	5	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	9	junction_3	142.964642093382	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTGTTGACGTTGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87573323	87562085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_87563486_87564574_87564735_87565355_87565518_87573219
tx.868	chr1	+	1629	10	FSM	ENSMUSG00000033488.12	ENSMUST00000046743.11	1618	10	-9	-2	-6	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_7	9.08125188520113	139	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157286140	157316632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_157286216_157286313_157286423_157289522_157289620_157291978_157292038_157292534_157292601_157293281_157293392_157294735_157294818_157298185_157298368_157299757_157299987_157316012
tx.8680	chr17	-	1806	4	FSM	ENSMUSG00000024150.13	ENSMUST00000024963.11	2038	4	17	215	-14	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_3	69.8108555710038	297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTGTTGACGTTGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87573346	87562085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_87563486_87564574_87564735_87565355_87565518_87573262
tx.8681	chr17	-	1785	4	NNC	ENSMUSG00000024150.13	novel	2017	5	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	147.196769288218	27	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTGTTGACGTTGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87573373	87562085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_87563486_87564574_87564735_87565355_87565518_87573310
tx.8682	chr17	-	2909	3	FSM	ENSMUSG00000024150.13	ENSMUST00000145895.8	751	3	-58	-2100	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	165	junction_2	67	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGCTGTTGACGTTGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87573360	87562085	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_87564735_87565355_87565518_87573262
tx.8683	chr17	-	1005	4	ISM	ENSMUSG00000036438.15	ENSMUST00000040440.7	1205	6	11027	0	10940	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6557	junction_1	315.455226617027	371	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGCTCTGAATCTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87743336	87740839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_-_87741484_87742503_87742640_87743031_87743139_87743218
tx.8684	chr17	-	1167	6	FSM	ENSMUSG00000036438.15	ENSMUST00000040440.7	1205	6	38	0	38	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	6557	junction_1	335.908082665482	2962	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGCTCTGAATCTGAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87754325	87740839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_-_87741484_87742503_87742640_87743031_87743139_87743218_87743363_87750123_87750155_87754220
tx.8685	chr17	-	636	3	NNC	ENSMUSG00000117361.2	novel	423	2	NA	NA	-742	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0.5	17	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACATTGTTTGATCTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87838914	87836929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_87837291_87838534_87838682_87838786
tx.8686	chr17	-	1750	3	Intergenic	novelGene_699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTCACTCTCAGTCGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87920937	87916868	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_87918513_87919863_87919926_87920893
tx.8687	chr17	+	1412	9	FSM	ENSMUSG00000045394.10	ENSMUST00000234623.2	1745	9	108	225	108	-202	multi-exon	FALSE	canonical	3	196	junction_4	21.0535032714273	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTAAGTTTGTTTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87944217	87958332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_87944323_87947323_87947432_87947715_87947957_87948861_87948928_87949529_87949594_87950969_87951072_87953564_87953769_87957041_87957087_87957855
tx.8688	chr17	+	564	3	ISM	ENSMUSG00000045394.10	ENSMUST00000234623.2	1745	9	9617	225	9617	-202	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	244	junction_1	1.5	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTCTAAGTTTGTTTGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87953726	87958332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_87953769_87957041_87957087_87957855
tx.8689	chr17	+	1776	2	FSM	ENSMUSG00000024151.14	ENSMUST00000174240.2	1752	2	-19	-5	-19	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1709	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	95	AAAAAAAAAAAAAAACAAAA	4852	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87979948	87987125	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_87980235_87985635
tx.869	chr1	+	1216	8	FSM	ENSMUSG00000033488.12	ENSMUST00000193791.6	778	8	-4	-434	-4	2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_7	18.9725903258746	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTGCTTCTTGGTCATGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	157286142	157316632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_157286216_157286313_157286423_157289522_157289620_157291978_157292038_157292534_157292601_157293281_157293392_157294735_157294818_157316012
tx.8690	chr17	+	1559	8	ISM	ENSMUSG00000024151.14	ENSMUST00000173097.8	2502	10	-38	12704	-17	1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1629	junction_6	24.7732574707947	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGAGTTTGTATTTTTTTGG	4854	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87979950	88004132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_87980235_87985635_87985791_87987227_87987507_87989958_87990106_87992864_87993015_87993723_87993858_87996369_87996570_88003922
tx.8691	chr17	+	814	4	ISM	ENSMUSG00000024151.14	ENSMUST00000173097.8	2502	10	-32	26776	-11	-2934	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1646	junction_2	25.7725090401036	71	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGAGAACAGATAAATAGTGC	4860	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87979956	87990060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_87980235_87985635_87985791_87987227_87987507_87989958
tx.8692	chr17	+	3083	16	FSM	ENSMUSG00000024151.14	ENSMUST00000024967.14	3283	16	200	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1624	junction_8	132.693531618287	234	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGGGGGTACCTTGTATT	4861	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	87979957	88031141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_87980235_87985635_87985791_87987227_87987507_87989958_87990106_87992864_87993015_87993723_87993858_87996369_87996570_88003922_88004033_88014609_88014734_88015879_88016031_88020056_88020155_88024882_88025129_88026028_88026234_88026715_88026964_88028310_88028487_88030758
tx.8693	chr17	+	883	4	ISM	ENSMUSG00000024151.14	ENSMUST00000024967.14	3283	16	46400	0	22189	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1932	junction_3	24.3082062046727	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTGGGGGTACCTTGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88026157	88031141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_88026234_88026715_88026964_88028310_88028487_88030758
tx.8694	chr17	+	4251	10	FSM	ENSMUSG00000005370.5	ENSMUST00000005503.5	4251	10	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2207	junction_2	252.867310151411	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTTTCCATTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88282489	88298320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_88282834_88287618_88287819_88290872_88291043_88291873_88294410_88295613_88295883_88296571_88296690_88296854_88296945_88297621_88297777_88297858_88298059_88298151
tx.8695	chr17	+	1506	4	ISM	ENSMUSG00000005370.5	ENSMUST00000005503.5	4251	10	0	5655	0	458	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	2207	junction_2	20.0720922897661	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGAAGGGCTATAAGGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88282489	88292665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_88282834_88287618_88287819_88290872_88291043_88291873
tx.8696	chr17	+	2863	7	ISM	ENSMUSG00000005370.5	ENSMUST00000005503.5	4251	10	10058	0	5417	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2616	junction_4	121.673972383397	227	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTTTCCATTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88292547	88298320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_88294410_88295613_88295883_88296571_88296690_88296854_88296945_88297621_88297777_88297858_88298059_88298151
tx.8697	chr17	+	735	5	ISM	ENSMUSG00000005370.5	ENSMUST00000005503.5	4251	10	14079	0	9438	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2616	junction_2	148.201509776385	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTTTCCATTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88296568	88298320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_88296690_88296854_88296945_88297621_88297777_88297858_88298059_88298151
tx.8698	chr17	+	370	2	ISM	ENSMUSG00000005370.5	ENSMUST00000005503.5	4251	10	15368	0	10727	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2637	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATTTTTCCATTTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88297857	88298320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_88298059_88298151
tx.8699	chr17	+	420	2	Intergenic	novelGene_700	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGTTGGTTTGTTTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88373890	88382161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_88373996_88381846
tx.87	chr1	-	537	3	Intergenic	novelGene_13	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_2	34	125	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTTGTGAGATCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21326421	21323506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_21323669_21324392_21324563_21326216
tx.870	chr1	+	623	3	FSM	ENSMUSG00000058267.14	ENSMUST00000135680.8	2999	3	29	2347	29	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2655	junction_1	51	18858	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCTTTCCTTCAAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160022813	160027393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_160022882_160024515_160024675_160026997
tx.8700	chr17	+	483	3	NNC	ENSMUSG00000117369.2	novel	725	2	NA	NA	-9725	1417	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATTGTTTTCTTGATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88466189	88479449	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_88466247_88476260_88476347_88479109
tx.8701	chr17	+	686	2	Intergenic	novelGene_701	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTAATTTCTCCTTATTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88472682	88474689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_88472792_88474112
tx.8702	chr17	+	4195	6	FSM	ENSMUSG00000034998.19	ENSMUST00000112238.9	5085	6	2	888	2	-888	multi-exon	FALSE	canonical	3	257	junction_4	10.9288608738514	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGGAGCCTTTTCTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88748140	88797073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_88748313_88770140_88770692_88783283_88783379_88786703_88786769_88791828_88791898_88793830
tx.8703	chr17	+	501	2	ISM	ENSMUSG00000034998.19	ENSMUST00000134107.2	2892	3	-39	15022	8	10	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	288	junction_1	0	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCAACTTCAAAGCCCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88748146	88770475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr17_+_88748313_88770140
tx.8704	chr17	+	3045	22	FSM	ENSMUSG00000034709.9	ENSMUST00000038551.8	3141	22	96	0	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_5	9.91871727497827	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCGGTCTGTGACAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88837641	88895795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_88837747_88850272_88850342_88852748_88852896_88854995_88855098_88856921_88857087_88857218_88857278_88858089_88858185_88862277_88862331_88863009_88863160_88866016_88866119_88866204_88866294_88869536_88869674_88873068_88873162_88876507_88876636_88880030_88880184_88882619_88882713_88884565_88884809_88886209_88886243_88887862_88887980_88889842_88889942_88891280_88891410_88895111
tx.8705	chr17	+	353	2	FSM	ENSMUSG00000034709.9	ENSMUST00000189734.2	695	2	-2	344	-2	-344	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTGTAGAAAAAGACTGAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88837641	88850520	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_88837747_88850272
tx.8706	chr17	+	585	2	FSM	ENSMUSG00000033855.16	ENSMUST00000137138.2	767	2	-53	235	-53	-235	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACTCAGCCCACTCCAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88905058	88943022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_88905170_88942548
tx.8707	chr17	-	762	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033855.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_2	14.6590889515307	106	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCGGCCTCCTTTGATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88932932	88923786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_88924018_88928723_88928829_88930105_88930383_88932783
tx.8708	chr17	-	500	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033855.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	9.5	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCGGCCTCCTTTGATGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88932947	88923786	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr17_-_88924018_88928723_88928829_88932783
tx.8709	chr17	-	1895	2	Intergenic	novelGene_702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAGTAGTGGTTAACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	89120451	89117281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_-_89119079_89120353
tx.871	chr1	+	557	2	ISM	ENSMUSG00000058267.14	ENSMUST00000097193.3	787	3	1641	-11	1641	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2757	junction_1	0	1433	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCTTTCCTTCAAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160024513	160027393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_160024675_160026997
tx.8710	chr17	+	487	3	NNC	ENSMUSG00000024256.8	novel	2011	3	NA	NA	281	-1300	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	3	junction_1	1	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTTTTTCTTTTTATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	93509784	93511691	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_93509847_93510212_93510312_93511365
tx.8711	chr17	+	2428	2	Intergenic	novelGene_703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAAGAAAAGAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	94990760	94995307	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr17_+_94992351_94994469
tx.8712	chr17	-	2996	9	NIC	ENSMUSG00000055660.10	novel	6640	9	NA	NA	-20	353	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	71	junction_6	15.2151240547029	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTAAATTTTTTGATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95057467	95034159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr17_-_95034824_95040516_95040609_95040974_95041082_95042763_95042939_95046881_95046952_95047813_95048184_95051359_95051423_95055044_95055846_95056813
tx.8713	chr17	+	373	3	NNC	ENSMUSG00000098090.9	novel	1275	10	NA	NA	-2	19018	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	73	114	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCATGGTTCATTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95057525	95101578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_95057661_95063861_95063952_95101430
tx.8714	chr17	+	370	4	NNC	ENSMUSG00000098090.9	novel	1275	10	NA	NA	0	19018	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	134	junction_3	26.8493740874697	238	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCATGGTTCATTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95057527	95101578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_95057661_95063861_95063952_95092912_95092936_95101454
tx.8715	chr17	+	464	4	NNC	ENSMUSG00000098090.9	novel	1275	10	NA	NA	2	19018	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	78.1280999384984	74	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCATGGTTCATTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95057529	95101578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_95057661_95062638_95062734_95063861_95063952_95101430
tx.8716	chr17	+	464	5	NNC	ENSMUSG00000098090.9	novel	1275	10	NA	NA	1	19018	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	132	junction_1	29.2232783924049	200	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCATGGTTCATTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95057528	95101578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_+_95057661_95062638_95062734_95063861_95063952_95092912_95092936_95101454
tx.8717	chr17	-	496	4	NNC	ENSMUSG00000066057.8	novel	1909	5	NA	NA	0	14314	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	31	junction_3	11.5854314646552	83	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGAATGTAATCAATGTGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95142226	95126171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr17_-_95126373_95127763_95127825_95128042_95128170_95142119
tx.8718	chr17	+	508	4	FSM	ENSMUSG00000095193.3	ENSMUST00000234295.2	3079	4	-20	2591	-20	674	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_3	17.6635217326557	255	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGCAATCAATGTGGTAAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	95172325	95183158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr17_+_95172441_95181413_95181541_95181729_95181791_95182953
tx.8719	chr18	-	1836	6	NIC	ENSMUSG00000063889.17	novel	1996	8	NA	NA	7	-47	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	13	junction_2	27.7459907013608	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTACTATTTGGTATTTATT	-13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3337582	3267009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_3268130_3273421_3273579_3295039_3295183_3295321_3295417_3325360_3325479_3337379
tx.872	chr1	-	1500	6	FSM	ENSMUSG00000014226.11	ENSMUST00000014370.11	2098	6	44	554	-26	-554	multi-exon	FALSE	canonical	3	4235	junction_5	193.777810907235	26691	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAGTTCTGCAATCTGTT	7340	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160040401	160030490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_160031294_160032537_160032636_160033665_160033766_160034182_160034280_160035948_160036166_160040216
tx.8720	chr18	-	972	4	NIC	ENSMUSG00000063889.17	novel	2662	10	NA	NA	-20	-2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	8	junction_2	34.3737626039914	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGAATCATTTTAGGAAAGG	80	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3337609	3267265	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_3267733_3273421_3273579_3325360_3325479_3337379
tx.8721	chr18	-	1159	4	FSM	ENSMUSG00000063889.17	ENSMUST00000149803.8	1422	4	-28	291	-28	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_2	16.5797734872612	77	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTGTGCATTTTAATGTA	13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3337617	3294474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_3295183_3295321_3295417_3325360_3325479_3337379
tx.8722	chr18	-	1302	5	FSM	ENSMUSG00000063889.17	ENSMUST00000142690.2	1256	5	-39	-7	-24	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_3	27.3072792493137	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTTGTGCATTTTAATGTA	76	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3337613	3294474	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_3295183_3295321_3295417_3299161_3299309_3325360_3325479_3337379
tx.8723	chr18	+	2861	21	NIC	ENSMUSG00000024231.16	novel	3727	20	NA	NA	17	23	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	200	junction_1	171.970666103263	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATAATGCCTTTTTCTATGA	-18	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3383004	3435408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_3383173_3399845_3399987_3405684_3405788_3414129_3414225_3417534_3417641_3418563_3418647_3419346_3419444_3419531_3419643_3421202_3421366_3423468_3423594_3424449_3424558_3425511_3425572_3426094_3426224_3426316_3426404_3426757_3426911_3427162_3427241_3429569_3429637_3430911_3431115_3431483_3431586_3433993_3434111_3434843
tx.8724	chr18	+	2840	21	FSM	ENSMUSG00000024231.16	ENSMUST00000162301.8	3828	21	21	967	-4	25	multi-exon	FALSE	canonical	3	782	junction_1	80.8420682565705	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAATGCCTTTTTCTATGATG	9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3383252	3435410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_3383398_3399845_3399987_3405684_3405788_3414129_3414225_3417534_3417641_3418563_3418647_3419346_3419444_3419531_3419643_3421202_3421366_3423468_3423594_3424449_3424558_3425511_3425572_3426094_3426224_3426316_3426404_3426757_3426911_3427162_3427241_3429569_3429637_3430911_3431115_3431483_3431586_3433993_3434111_3434843
tx.8725	chr18	+	1427	3	FSM	ENSMUSG00000024232.3	ENSMUST00000025075.3	5074	3	0	3647	0	-3647	multi-exon	FALSE	canonical	3	117	junction_2	19.5	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAGTGGTGTCTTTCATGA	-8	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	3507922	3512757	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_3508286_3511256_3511545_3511981
tx.8726	chr18	-	479	2	FSM	ENSMUSG00000024235.12	ENSMUST00000172805.2	2048	2	58	1511	0	-1511	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAGTTGAGTGCTGTGTGCT	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4352957	4348965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_4349339_4352851
tx.8727	chr18	+	656	4	NNC	ENSMUSG00000117401.2	novel	845	4	NA	NA	-549	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.4142135623731	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCTACTAGTATAATTAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4353008	4368923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_4353083_4354100_4354193_4367858_4368041_4368615
tx.8728	chr18	+	1033	4	FSM	ENSMUSG00000117401.2	ENSMUST00000235048.2	845	4	-185	-3	-185	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.24721912892465	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCTACTAGTATAATTAGT	306	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4353372	4368923	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_4353824_4354100_4354193_4367858_4368041_4368615
tx.8729	chr18	+	923	4	ISM	ENSMUSG00000024234.8	ENSMUST00000025077.7	2651	9	11	13802	0	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_2	28.2881993457028	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTAGTGATTATTTCTAGTC	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4375602	4383528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_4375779_4379568_4379742_4380653_4380888_4383188
tx.873	chr1	+	609	3	NNC	ENSMUSG00000026715.13	novel	4970	8	NA	NA	10236	77	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_1	1.5	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGAGAATGGACTTTTCCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160827182	160830110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_160827473_160827558_160827624_160829856
tx.8730	chr18	+	2103	9	FSM	ENSMUSG00000024234.8	ENSMUST00000025077.7	2651	9	3	545	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	181	junction_2	18.3711730708738	120	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCTAGTATCTATTTTCT	-9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4375594	4396785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_4375779_4379568_4379742_4380653_4380888_4383188_4383414_4386170_4386383_4386952_4387180_4394973_4395067_4395155_4395230_4396104
tx.8731	chr18	+	990	4	ISM	ENSMUSG00000024234.8	ENSMUST00000234924.2	1880	7	3792	545	3792	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	221	junction_3	1.88561808316413	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTCTAGTATCTATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4387037	4396785	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_4387180_4394973_4395067_4395155_4395230_4396104
tx.8732	chr18	+	700	3	Intergenic	novelGene_705	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGCTTTTGTCTCATGATA	874	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4404441	4475575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_4404546_4465324_4465821_4475475
tx.8733	chr18	+	307	3	Intergenic	novelGene_706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACTGGTTTTTACATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4806332	4809999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_4806474_4808367_4808418_4809883
tx.8734	chr18	+	551	4	ISM	ENSMUSG00000024236.19	ENSMUST00000126977.8	7907	38	-9	72646	-9	-232	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_1	20.6774165590278	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTAAAGTATTTTGTGGTGC	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	4920530	5046645	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_4920875_5037107_5037166_5040147_5040240_5046588
tx.8735	chr18	-	572	4	NNC	ENSMUSG00000050945.9	novel	953	3	NA	NA	2	68267	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	7.76029781788188	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACAGGGTCACAAAGGGTT	364	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5334437	5141761	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_5142096_5245385_5245454_5288860_5288939_5334345
tx.8736	chr18	-	1020	3	FSM	ENSMUSG00000050945.9	ENSMUST00000234411.2	953	3	-29	-38	-3	38	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_2	4.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAACAGTTTCTCCTACA	359	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5334442	5244608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_5245454_5288860_5288939_5334345
tx.8737	chr18	-	3905	15	NIC	ENSMUSG00000041225.17	novel	2500	17	NA	NA	-7	-21	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	24	junction_14	49.5805364214299	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCAGTAATATTTTCCTTCCT	-30	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6135977	6024447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_6026731_6027574_6027678_6027959_6028095_6028193_6028272_6031729_6031829_6033140_6033258_6034449_6034553_6037017_6037117_6039353_6039456_6049276_6049359_6052861_6052924_6061846_6061973_6064340_6064422_6069830_6070092_6135803
tx.8738	chr18	-	2315	9	ISM	ENSMUSG00000041225.17	ENSMUST00000182066.8	4506	16	72969	764	-4687	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_6	14.2565774293833	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGCGTTTTAGTTCTTAAT	13	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6039394	6025190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_6026731_6027574_6027678_6027959_6028095_6028193_6028272_6031729_6031829_6033140_6033258_6034449_6034553_6037017_6037117_6039353
tx.8739	chr18	-	1033	3	ISM	ENSMUSG00000041225.17	ENSMUST00000182383.8	2500	17	-92	85065	-10	-42967	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTGTTATAAATTTGGTTG	-33	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6135980	6111620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_6112440_6115813_6115851_6135803
tx.874	chr1	+	501	12	FSM	ENSMUSG00000053332.14	ENSMUST00000162558.8	502	12	3	-2	0	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1206	junction_7	1656.43137771865	3757	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTGCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160862735	160866109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_160862765_160863321_160863375_160863552_160863585_160863777_160863815_160864118_160864150_160864389_160864423_160864693_160864735_160864857_160864886_160865074_160865118_160865564_160865608_160865794_160865843_160866026
tx.8740	chr18	-	4812	26	FSM	ENSMUSG00000006740.15	ENSMUST00000025083.14	6032	26	8	1212	8	875	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_8	215.348105169282	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAAGTGACAGGAAGGGTCTC	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6241515	6202213	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_6203708_6208186_6208336_6208999_6209217_6210699_6210805_6211023_6211096_6211191_6211253_6212516_6212619_6213186_6213297_6213392_6213455_6213969_6214088_6214511_6214701_6216222_6216367_6216740_6216948_6220223_6220293_6220801_6220996_6222718_6222868_6223545_6223692_6223970_6224076_6225317_6225443_6225596_6225685_6225767_6225824_6226381_6226431_6226863_6226969_6227587_6227662_6234814_6234903_6240981
tx.8741	chr18	-	1551	2	ISM	ENSMUSG00000006740.15	ENSMUST00000168031.2	1959	9	6298	-876	6298	876	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	921	junction_1	0	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGTGACAGGAAGGGTCTCA	8673	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6208242	6202212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_6203708_6208186
tx.8742	chr18	+	372	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000006740.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGCTGGTTGTTCTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6207656	6208238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_6207845_6208054
tx.8743	chr18	-	1475	11	ISM	ENSMUSG00000006740.15	ENSMUST00000163210.2	2006	17	-61	8210	-8	-1919	intron_retention	FALSE	canonical	3	809	junction_7	115.848867063947	301	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	ATAAAACTCTACGGAACACT	-13	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6241531	6222778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_6222868_6223545_6223692_6223970_6224076_6225317_6225443_6225596_6225685_6225767_6225824_6226381_6226431_6226863_6226969_6227587_6227662_6234814_6234903_6240981
tx.8744	chr18	-	631	2	FSM	ENSMUSG00000006740.15	ENSMUST00000234166.2	829	2	-398	596	-11	-596	multi-exon	FALSE	canonical	3	966	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATTGTTAAAGGTAAATATGC	-16	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6241534	6234824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_6234903_6240981
tx.8745	chr18	-	699	2	NNC	ENSMUSG00000024240.14	novel	565	2	NA	NA	847	242	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	2	3	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTAAATTAAAGTACTTGTGA	904	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6490009	6488917	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_6489331_6489723
tx.8746	chr18	-	620	2	FSM	ENSMUSG00000024240.14	ENSMUST00000050542.6	565	2	-27	-28	-27	28	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGTTTTGACAGTTGAATGT	4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6490883	6489131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_6489331_6490462
tx.8747	chr18	+	2224	7	FSM	ENSMUSG00000073639.7	ENSMUST00000234810.2	6515	7	45	4246	-13	943	multi-exon	FALSE	canonical	3	943	junction_6	99.6015673683011	1540	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATTTTGTGTCTTGTCTGTC	-6	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	6765189	6790183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_6765333_6770053_6770110_6778494_6778557_6783119_6783193_6784569_6784689_6784938_6785006_6788479
tx.8748	chr18	-	3290	17	NIC	ENSMUSG00000057440.9	novel	4981	17	NA	NA	0	-1685	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	86	junction_16	10.4634781502137	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATATTTGTGAGATATTTGA	-17	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7626861	7349648	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_7351145_7353153_7353298_7355017_7355127_7356141_7356236_7379988_7380070_7403185_7403357_7439568_7439634_7440082_7440280_7440431_7440507_7441552_7441639_7442792_7442875_7443973_7444106_7458931_7459013_7461637_7461716_7512943_7513063_7561725_7561873_7626728
tx.8749	chr18	-	1256	12	ISM	ENSMUSG00000057440.9	ENSMUST00000235093.2	3786	13	-47	4324	-11	9	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_11	9.14529188360676	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAATAAGTCCATGTATGAA	-33	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7626877	7403311	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_7403357_7439568_7439634_7440082_7440280_7440431_7440507_7441552_7441639_7442792_7442875_7443973_7444106_7458931_7459013_7461637_7461716_7512943_7513063_7561725_7561873_7626728
tx.875	chr1	+	488	11	NNC	ENSMUSG00000053332.14	novel	502	12	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	1939.64689827814	923	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTGCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160862735	160866109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_160862765_160863321_160863375_160863552_160863585_160863777_160863815_160864118_160864150_160864389_160864423_160864693_160864735_160865059_160865118_160865564_160865608_160865794_160865843_160866026
tx.8750	chr18	-	1211	11	FSM	ENSMUSG00000057440.9	ENSMUST00000234444.2	1891	11	-60	740	-11	-740	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_10	9.53991614218909	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTAAGTTTGTTAATAAGAAC	-33	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7626877	7439568	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_7439634_7440082_7440280_7440431_7440507_7441552_7441639_7442792_7442875_7443973_7444106_7458931_7459013_7461637_7461716_7512943_7513063_7561725_7561873_7626728
tx.8751	chr18	-	796	2	FSM	ENSMUSG00000057440.9	ENSMUST00000234366.2	675	2	-11	-110	-11	110	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAACAGTGGGTATTGGTA	-33	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7626877	7561225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_7561873_7626728
tx.8752	chr18	+	535	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117462.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGTGCGCCCTAGGTCATCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7838908	7845391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_7838943_7840382_7840534_7845041
tx.8753	chr18	+	3106	14	FSM	ENSMUSG00000024283.16	ENSMUST00000074919.11	3070	14	-27	-9	-9	9	multi-exon	TRUE	canonical	3	146	junction_1	117.532571338518	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATTTTGTTACTTTTTTTCC	339	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7868822	7927076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_7869092_7869990_7870028_7871548_7871745_7901495_7901603_7905399_7905516_7905931_7906045_7910515_7910825_7916051_7916298_7917552_7917676_7918432_7918582_7920131_7920251_7921421_7921609_7921855_7921984_7926069
tx.8754	chr18	+	987	4	ISM	ENSMUSG00000024283.16	ENSMUST00000171486.8	1608	13	-216	24132	0	-3485	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_1	199.474866141633	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTTTAATCAAATATGTGC	7	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	7868849	7902007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_7869092_7869990_7870028_7871548_7871745_7901495
tx.8755	chr18	+	1814	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000091019.2_ENSMUSG00000117428.2	novel	790	1	NA	NA	-23	106	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGGAATCATGCTC	6723	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7932758	8052098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_+_7933633_8051158
tx.8756	chr18	-	483	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117644.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGACCTGTAGTATGTCCTC	7073	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9308302	9304912	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_9305145_9306080_9306214_9308184
tx.8757	chr18	-	1035	3	ISM	ENSMUSG00000024286.9	ENSMUST00000234779.2	1341	7	53889	-13	53889	13	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	74	junction_1	9	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATTTTCTCTAGCCTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9332920	9315937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_9316673_9319408_9319572_9332783
tx.8758	chr14	+	319	1	Intergenic	novelGene_292	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	1	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAATGAGCACTCTTTGAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	119340247	119340566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr14_+_119340200_119340600
tx.8759	chr18	+	3335	10	FSM	ENSMUSG00000036103.10	ENSMUST00000234965.2	8024	10	22	4667	16	-22	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_7	3.52066211505664	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAATCTGTCCAGCTGAAGAA	-9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	9707616	9877977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_9707760_9720920_9720972_9840238_9840362_9846786_9846886_9848103_9849151_9858545_9859035_9859837_9859975_9866743_9866854_9874788_9874935_9876987
tx.876	chr1	+	460	11	FSM	ENSMUSG00000053332.14	ENSMUST00000159706.8	557	11	99	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3085	junction_7	1053.46856146731	7632	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTGCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160862735	160866109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_160862765_160863321_160863375_160863552_160863585_160863777_160863815_160864118_160864150_160864389_160864423_160864857_160864886_160865074_160865118_160865564_160865608_160865794_160865843_160866026
tx.8760	chr18	+	2214	3	ISM	ENSMUSG00000024287.9	ENSMUST00000234890.2	891	4	-7	-146	-7	17	intron_retention	FALSE	canonical	3	775	junction_2	42.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCACTGGGGCACTGGAAG	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	9958169	9961317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_9958247_9959097_9959172_9959254
tx.8761	chr18	+	1048	4	FSM	ENSMUSG00000024287.9	ENSMUST00000234890.2	891	4	-11	-146	3	17	multi-exon	FALSE	canonical	3	775	junction_2	35.5621521658443	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCACTGGGGCACTGGAAG	-1	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	9958165	9961317	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_9958247_9959097_9959172_9959254_9959316_9960485
tx.8762	chr18	+	2112	21	NNC	ENSMUSG00000024287.9	novel	4134	21	NA	NA	-7	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_17	177.913574524262	408	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATTGTACAGTTGGCTGGTG	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	9958169	9993727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_9958247_9959097_9959172_9959254_9959316_9960485_9960553_9962372_9962492_9963262_9963312_9963822_9963919_9968750_9968834_9970254_9970329_9975598_9975708_9977846_9977979_9984433_9984535_9986288_9986356_9986552_9986604_9986690_9986762_9987069_9987166_9987598_9987669_9989690_9989775_9992127_9992276_9992831_9992908_9993320
tx.8763	chr18	+	2301	20	NNC	ENSMUSG00000024287.9	novel	4134	21	NA	NA	-1	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_16	182.47716815401	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTATTGTACAGTTGGCTGG	9	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	9958175	9993725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_9958247_9959097_9959172_9959254_9959316_9960485_9960553_9962372_9962492_9963262_9963312_9963822_9963919_9968750_9968834_9970254_9970329_9975598_9975708_9977846_9977979_9984433_9984535_9986288_9986604_9986690_9986762_9987069_9987166_9987598_9987669_9989690_9989775_9992127_9992276_9992831_9992908_9993320
tx.8764	chr18	+	2296	2	FSM	ENSMUSG00000024287.9	ENSMUST00000234805.2	2047	2	-10	-239	-7	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	860	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAGCACTGGGGCACTGGAA	3	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	9958169	9961316	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_9958247_9959097
tx.8765	chr18	+	879	6	NNC	ENSMUSG00000024287.9	novel	1875	14	NA	NA	781	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	322.192737348315	190	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTATTGTACAGTTGGCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9987069	9993725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_9987166_9987598_9987669_9989690_9989775_9992127_9992276_9992831_9992908_9993320
tx.8766	chr18	-	2332	16	FSM	ENSMUSG00000047879.18	ENSMUST00000092096.14	4726	16	23	2371	23	157	multi-exon	FALSE	canonical	3	792	junction_3	60.9526592255553	301	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTAACAACTTTTGACATTTC	-37	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10030118	9995436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_9996249_9997172_9997281_9997716_9997775_10000494_10000624_10001770_10001864_10002367_10002434_10004895_10005011_10005629_10005716_10007766_10007848_10009951_10010083_10012212_10012272_10016540_10016645_10017990_10018096_10022817_10022851_10024533_10024680_10029912
tx.8767	chr18	-	2321	15	NNC	ENSMUSG00000047879.18	novel	4726	16	NA	NA	23	161	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	238.03764065237	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAACTTTTGACATTTCTTTT	-37	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10030118	9995432	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_9996249_9997172_9997281_9997716_9997775_10000494_10000624_10001770_10001864_10002367_10002434_10004895_10005011_10005629_10005716_10007766_10007848_10009951_10010083_10012212_10012272_10016540_10016645_10017990_10018096_10024515_10024680_10029912
tx.8768	chr18	+	1748	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047879.18_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TACGAGAGTGCTAATGTAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10039513	10045973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_10039644_10044355
tx.8769	chr18	-	1254	11	ISM	ENSMUSG00000024290.10	ENSMUST00000234610.2	4320	33	46211	14692	-5304	3921	internal_fragment	FALSE	canonical	3	159	junction_8	18.1559907468582	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GGAAAATAGAAAGCTACAAC	2335	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10104117	10080447	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_10080540_10083121_10083211_10084317_10084412_10090812_10090979_10092128_10092224_10093907_10093978_10095412_10095598_10097482_10097644_10099256_10099408_10100921_10101029_10104073
tx.877	chr1	+	447	10	NNC	ENSMUSG00000053332.14	novel	557	11	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1774.59954794189	3824	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTGCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160862735	160866109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_160862765_160863321_160863375_160863552_160863585_160863777_160863815_160864118_160864150_160864389_160864423_160865059_160865118_160865564_160865608_160865794_160865843_160866026
tx.8770	chr18	-	1499	2	Intergenic	novelGene_707	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAAAAAAAAGCTTTTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10276060	10273547	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_10274701_10275714
tx.8771	chr18	+	917	2	NNC	ENSMUSG00000042942.19	novel	8420	33	NA	NA	-21236	-4626	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTTGTAGAAAATTCATATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10532549	10533663	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_10532598_10532794
tx.8772	chr18	-	4575	11	FSM	ENSMUSG00000024293.17	ENSMUST00000025142.13	4545	11	-30	0	-30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_3	14.2393820090621	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTCTCACTAGCTTGCAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10610382	10566506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_10567647_10571954_10572143_10574874_10575019_10577000_10577091_10582054_10582187_10584247_10584363_10585977_10586042_10588438_10588551_10593745_10595876_10596338_10596442_10610025
tx.8773	chr18	-	1519	3	ISM	ENSMUSG00000024293.17	ENSMUST00000145320.2	2249	11	-29	27943	-6	1333	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	135	junction_1	2	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAATAAAACCTGTGCCTGTA	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10610138	10594572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_10595876_10596338_10596442_10610025
tx.8774	chr18	+	452	4	FSM	ENSMUSG00000002477.6	ENSMUST00000234207.2	439	4	7	-20	7	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	110	junction_2	847.378047600689	644	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTGTCTGTTGATTGTCAAA	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10617802	10627975	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_10617927_10623630_10623708_10626948_10627018_10627793
tx.8775	chr18	+	613	4	FSM	ENSMUSG00000002477.6	ENSMUST00000002551.5	858	4	28	217	7	58	multi-exon	FALSE	canonical	3	1823	junction_2	40.4337592722825	12782	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTACTATATTCACATAGTG	-4	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10617802	10628013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_10617927_10623630_10623708_10626825_10627018_10627793
tx.8776	chr18	-	1949	9	FSM	ENSMUSG00000002475.17	ENSMUST00000117828.9	1962	9	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	3.63145976158349	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTTCTTTGTGAGTTTT	-24	True	NA	NA	False	NA	NA	NA	10706758	10644410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_10645236_10647725_10647892_10647969_10648019_10652187_10652362_10658779_10658893_10682068_10682115_10704547_10704731_10706000_10706165_10706529
tx.8777	chr18	+	1513	5	FSM	ENSMUSG00000041238.17	ENSMUST00000234184.2	3714	5	-28	2229	-3	746	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_1	25.5966306376445	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTGGAATATGTCTTTACT	3242	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11790436	11826922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_11790750_11793791_11793999_11805638_11805682_11810651_11810748_11826068
tx.8778	chr18	+	631	4	FSM	ENSMUSG00000041238.17	ENSMUST00000234744.2	857	4	-200	426	12	-426	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_1	16.0277537068951	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTTTAGAAGATAGGTACGTT	3257	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11790451	11810734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_11790750_11793791_11793999_11805638_11805682_11810651
tx.8779	chr18	+	3278	19	FSM	ENSMUSG00000041238.17	ENSMUST00000047322.8	3209	19	-63	-6	-17	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	177	junction_1	21.3625378803961	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTAAAATGTGGATGTGTTAC	3228	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11790422	11875941	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_11790750_11793791_11793999_11805638_11805682_11810651_11810748_11826068_11826182_11829799_11829867_11838748_11838925_11848790_11848896_11851889_11851988_11853601_11853715_11854696_11855583_11855660_11855788_11858463_11858553_11860229_11860342_11865246_11865388_11867532_11867603_11871629_11871727_11873982_11874125_11875672
tx.878	chr1	+	444	9	NNC	ENSMUSG00000053332.14	novel	346	8	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1869.76893208091	805	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTGCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160862735	160866109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_160862765_160863321_160863375_160863552_160863585_160863777_160863815_160864118_160864150_160864389_160864423_160865509_160865608_160865794_160865843_160866026
tx.8780	chr18	-	1920	2	NNC	ENSMUSG00000049411.16	novel	670	10	NA	NA	100104	1587	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGTGCTGGCCTGGTGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12107584	12095919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_12097716_12107460
tx.8781	chr18	+	631	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000049411.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGATTTAAAATGTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12111994	12113189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_12112254_12112817
tx.8783	chr18	+	1915	13	FSM	ENSMUSG00000024404.8	ENSMUST00000025270.8	3790	13	14	1861	0	21	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_8	18.23058327829	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTATAGATGTGTAGCCACA	5519	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12261811	12288583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_12262031_12268908_12269025_12269749_12269896_12269984_12270093_12270296_12270407_12272373_12272518_12275992_12276121_12281847_12282046_12282575_12282736_12285855_12285937_12286027_12286118_12286969_12287078_12288276
tx.8784	chr18	+	1785	12	NIC	ENSMUSG00000024404.8	novel	3790	13	NA	NA	2	21	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	17	junction_6	114.557142260861	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTATAGATGTGTAGCCACA	5521	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12261813	12288583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_12262031_12268908_12269025_12269749_12269896_12269984_12270093_12270296_12270407_12272373_12272518_12281847_12282046_12282575_12282736_12285855_12285937_12286027_12286118_12286969_12287078_12288276
tx.8785	chr18	+	2214	6	ISM	ENSMUSG00000024404.8	ENSMUST00000234148.2	3078	13	0	15870	0	1486	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	395	junction_3	13.7054733592095	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAAAATAAGTTTTTGCCTA	5519	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12261811	12273888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_12262031_12268908_12269025_12269749_12269896_12269984_12270093_12270296_12270407_12272373
tx.8786	chr18	+	926	6	ISM	ENSMUSG00000024404.8	ENSMUST00000235084.2	1365	8	9642	-1	-27	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	378	junction_1	22.2261107708929	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GATAATATAATTCTTTAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12281845	12288563	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_12282046_12282575_12282736_12285855_12285937_12286027_12286118_12286969_12287078_12288276
tx.8787	chr18	+	2136	20	FSM	ENSMUSG00000024410.16	ENSMUST00000025276.15	2170	20	16	18	-6	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	252	junction_9	24.4724957266604	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGTACCTACAACATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12301789	12323036	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_12301960_12302289_12302367_12304605_12304691_12309193_12309251_12311244_12311332_12312169_12312311_12312545_12312650_12313541_12313632_12313722_12313829_12314640_12314753_12317035_12317081_12317265_12317320_12317948_12318078_12318705_12318813_12321265_12321386_12321616_12321695_12321876_12321982_12322069_12322139_12322216_12322443_12322862
tx.8788	chr18	+	1227	7	ISM	ENSMUSG00000024410.16	ENSMUST00000126523.9	1282	9	9	1029	9	-480	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	285	junction_6	11.4515889242013	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTCTTATGGGACATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12301782	12313148	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_12301960_12302289_12302367_12304605_12304691_12309193_12309251_12311244_12311332_12312169_12312311_12312545
tx.8789	chr18	+	1272	9	FSM	ENSMUSG00000024410.16	ENSMUST00000126523.9	1282	9	12	-2	-10	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	285	junction_6	11.1740491765519	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTTGATTTGATGTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12301785	12314179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_12301960_12302289_12302367_12304605_12304691_12309193_12309251_12311244_12311332_12312169_12312311_12312545_12312650_12313541_12313632_12313722
tx.879	chr1	+	346	8	FSM	ENSMUSG00000053332.14	ENSMUST00000159663.8	346	8	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	131	junction_6	1912.24889508	943	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTGCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160862735	160866109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_160862765_160863321_160863375_160863552_160863585_160863777_160863815_160864118_160864150_160864389_160864423_160865794_160865843_160866026
tx.8790	chr18	-	1539	3	NNC	ENSMUSG00000101406.2	novel	1085	2	NA	NA	-305	599	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTAGCCTCCTCTTTTAC	6579	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12637788	12633647	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_12634942_12637093_12637209_12637658
tx.8791	chr18	+	757	4	NNC	ENSMUSG00000024421.17	novel	10548	75	NA	NA	19797	-57595	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	20	junction_1	23.0988215187606	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTGTGTCATACACCCCC	4999	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12657052	12658475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_12657178_12657562_12657674_12657782_12657895_12658066
tx.8792	chr18	+	628	5	ISM	ENSMUSG00000024421.17	ENSMUST00000188815.2	5551	38	20875	54246	20875	-54246	internal_fragment	FALSE	canonical	3	72	junction_2	2.1650635094611	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACGGCCTATGAGAACATCCT	6077	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12658130	12661824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_12658235_12658840_12659038_12660605_12660723_12661351_12661507_12661769
tx.8793	chr18	+	1693	11	NNC	ENSMUSG00000024424.16	novel	483	3	NA	NA	5247	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_1	18.5245782678041	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGTGACCTTGCAGGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12828031	12870109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_12828172_12828292_12828620_12830947_12831117_12853006_12853101_12857995_12858104_12861676_12861787_12863050_12863175_12866014_12866113_12867943_12868049_12869036_12869076_12869730
tx.8794	chr18	+	1635	11	NNC	ENSMUSG00000024424.16	novel	483	3	NA	NA	5247	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	19.1324331960156	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTGTGACCTTGCAGGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12828031	12870109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_12828114_12828292_12828620_12830947_12831117_12853006_12853101_12857995_12858104_12861676_12861787_12863050_12863175_12866014_12866113_12867943_12868049_12869036_12869076_12869730
tx.8795	chr18	-	2444	13	FSM	ENSMUSG00000044252.19	ENSMUST00000118313.8	2893	13	449	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	43	junction_12	94.3352473304061	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTGTGAATGCTTTCAGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12995321	12888384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_12889365_12890664_12890756_12891823_12891948_12892455_12892573_12895622_12895750_12895965_12896056_12896538_12896647_12899859_12900043_12901594_12901693_12904355_12904491_12921376_12921453_12952561_12952719_12995163
tx.8796	chr18	+	453	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000044252.19_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCCACAAGAGATAAACATTT	4435	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12978979	12986559	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_12979063_12981558_12981709_12986339
tx.8797	chr18	+	3452	11	FSM	ENSMUSG00000024423.7	ENSMUST00000025290.7	3763	11	311	0	-38	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	761	junction_9	40.2394085443611	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTCTTATGGCTACATTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	13105290	13126007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_13105430_13107769_13107899_13109035_13109089_13109525_13109589_13115146_13115233_13117295_13117422_13118275_13118374_13119380_13119455_13121351_13121443_13122801_13122937_13123549
tx.8798	chr18	-	489	3	NNC	ENSMUSG00000024420.10	novel	6206	8	NA	NA	40	-123984	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGAGGAGTCCTTGCGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14105804	14103910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_14104112_14104420_14104462_14105557
tx.8799	chr18	-	1752	2	ISM	ENSMUSG00000037013.18	ENSMUST00000235011.2	2086	4	17512	0	3795	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	979	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTCATTTGTTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14766668	14758685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_14760369_14766599
tx.88	chr1	-	761	4	Intergenic	novelGene_14	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_3	28.3901391331568	72	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCTTTGTGAGATCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21326703	21323506	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_21323669_21324392_21324563_21326110_21326225_21326388
tx.880	chr1	+	416	9	NNC	ENSMUSG00000053332.14	novel	759	10	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	2269.71826445486	661	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTGCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160862735	160866109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_160862765_160863321_160863375_160863552_160863585_160863777_160863815_160864389_160864423_160865059_160865118_160865564_160865608_160865794_160865843_160866026
tx.8800	chr18	-	2946	11	FSM	ENSMUSG00000037013.18	ENSMUST00000040924.9	3098	11	146	6	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	178	junction_3	289.216597034126	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTCATTTGTTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14815825	14758685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_14760369_14766599_14766734_14769552_14769676_14770448_14770542_14773313_14773419_14774012_14774181_14784079_14784302_14788083_14788238_14803365_14803451_14812443_14812521_14815723
tx.8801	chr18	-	2852	10	FSM	ENSMUSG00000037013.18	ENSMUST00000092041.11	2911	10	61	-2	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	595	junction_3	115.228382991837	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTCATTTGTTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14815824	14758685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_14760369_14766599_14766734_14769552_14769676_14773313_14773419_14774012_14774181_14784079_14784302_14788083_14788238_14803365_14803451_14812443_14812521_14815723
tx.8802	chr18	-	2651	9	FSM	ENSMUSG00000037013.18	ENSMUST00000234524.2	2603	9	-22	-26	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_5	300.413048984228	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTCATTTGTTTCTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14815845	14758685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_14760369_14766599_14766734_14769552_14769676_14773313_14773419_14774012_14774181_14788083_14788238_14803365_14803451_14812443_14812521_14815723
tx.8803	chr18	-	632	5	ISM	ENSMUSG00000037013.18	ENSMUST00000234997.2	2196	7	-10	12067	4	4054	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	807	junction_1	60.391948966729	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GCAACCAAATCAAGGTAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14815831	14784093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_14784302_14788083_14788238_14803365_14803451_14812443_14812521_14815723
tx.8804	chr18	+	739	5	NNC	ENSMUSG00000036743.5	novel	1023	6	NA	NA	16	661	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	3	12	junction_4	35.0142828000232	26	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTACACTTATTTATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14839223	14865189	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_14839390_14854223_14854351_14859560_14859686_14864035_14864159_14864991
tx.8805	chr18	+	1675	7	FSM	ENSMUSG00000036743.5	ENSMUST00000040860.3	1692	7	17	0	17	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_2	7.18795288428261	173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTATAGAGTGTCTCCTTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14839224	14895355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_14839390_14854223_14854351_14859560_14859686_14864035_14864159_14890338_14890459_14890678_14890742_14894403
tx.8806	chr18	+	1537	6	NIC	ENSMUSG00000036743.5	novel	1692	7	NA	NA	-11	-1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	14	junction_1	33.7792835921664	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTATAGAGTGTCTCCTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14839234	14895354	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_14839390_14859560_14859686_14864035_14864159_14890338_14890459_14890678_14890742_14894403
tx.8807	chr18	+	496	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000058064.7	novel	534	1	NA	NA	-21	52	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAGGAAAAATGCTATCCAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15965829	15966436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_+_15966247_15966357
tx.8808	chr18	-	1742	3	NNC	ENSMUSG00000024304.15	novel	3785	15	NA	NA	53894	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTGGTGACTGGTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16749232	16721940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_16723411_16734678_16734844_16749125
tx.8809	chr18	-	1888	2	ISM	ENSMUSG00000024331.12	ENSMUST00000075214.9	4508	16	26296	4	4957	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	8	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCGTGTGCAGGTGGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20166239	20163693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_20165461_20166118
tx.881	chr1	+	432	9	NNC	ENSMUSG00000053332.14	novel	759	10	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2347.09346852655	954	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGAAGTGTGCATTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160862735	160866109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_160862765_160863321_160863375_160863552_160863585_160863777_160863831_160864389_160864423_160865059_160865118_160865564_160865608_160865794_160865843_160866026
tx.8810	chr18	+	976	7	FSM	ENSMUSG00000044393.16	ENSMUST00000121837.2	953	7	-23	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	147	junction_4	16.303544263612	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGTGTTTGTGTTCTTTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20691279	20715973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_20691402_20706545_20706582_20707996_20708132_20712096_20712259_20712390_20712536_20713568_20713736_20715764
tx.8811	chr18	+	1823	2	NNC	ENSMUSG00000044393.16	novel	5766	15	NA	NA	44402	5	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTCTCCATGTCTTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20735704	20737583	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_20736600_20736655
tx.8812	chr18	-	900	3	ISM	ENSMUSG00000056124.6	ENSMUST00000070080.6	5808	9	57086	3170	57086	-3170	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	329	junction_2	4	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATTGGTGTTCAGCTTTAG	9269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20822375	20820825	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_20821526_20821991_20822094_20822277
tx.8813	chr18	+	643	2	Intergenic	novelGene_708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20895477	20911828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_20895821_20911528
tx.8814	chr18	+	805	4	Antisense	novelGene_ENSMUSG00002076630.1_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	7.93025150224688	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTGAGTTTTGTTTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20895657	20997370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_20895821_20951304_20951388_20963808_20964032_20997034
tx.8815	chr18	+	627	2	Intergenic	novelGene_709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	0	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20895490	20911828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_20895821_20911531
tx.8816	chr18	+	503	3	Intergenic	novelGene_710	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATGTGTGTGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20895728	20911826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_20895821_20901723_20901840_20911531
tx.8817	chr18	+	1878	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000033382.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	6.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTAAATGCTAATGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20895735	20965518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_20895821_20951304_20951388_20963808
tx.8818	chr18	-	1169	2	Intergenic	novelGene_711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTGTCTTAGGGTTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20900260	20898170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_20899047_20899967
tx.8819	chr18	-	691	2	Intergenic	novelGene_712	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTAGCCCAAGGCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21076862	21066329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_21066903_21076744
tx.882	chr1	-	2716	17	FSM	ENSMUSG00000026709.11	ENSMUST00000035430.4	3619	17	6	897	4	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	321	junction_5	41.9044672439586	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAGAGTCTTCCTGTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160898222	160869067	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_160869501_160871182_160871259_160872528_160872640_160872827_160873047_160874346_160874500_160877507_160877571_160878900_160879009_160881510_160881691_160884030_160884101_160885016_160885124_160887614_160887662_160888305_160888430_160890351_160890448_160890816_160890919_160892794_160892862_160896649_160896750_160897562
tx.8820	chr18	+	1543	6	FSM	ENSMUSG00000033107.7	ENSMUST00000050004.3	1348	6	-34	-161	-34	161	multi-exon	FALSE	canonical	3	69	junction_1	22.5335305711289	327	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATTTTTTTTTTGATAGAAGA	5307	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21077647	21117080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_21077815_21107355_21107513_21110785_21110881_21112107_21112199_21114227_21114336_21116155
tx.8821	chr18	+	1543	7	NNC	ENSMUSG00000033107.7	novel	1348	6	NA	NA	-34	56544	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	45.7993813640898	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAATCATCCAAATGTGGCT	5307	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21077647	21173463	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_21077815_21107355_21107513_21110785_21110881_21112107_21112199_21114227_21114336_21116155_21116977_21173359
tx.8822	chr18	+	1574	6	FSM	ENSMUSG00000033107.7	ENSMUST00000234316.2	1406	6	130	-298	130	160	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_1	19.3349424617711	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AATTTTTTTTTTGATAGAAG	1349	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21094658	21117079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_21094858_21107355_21107513_21110785_21110881_21112107_21112199_21114227_21114336_21116155
tx.8823	chr18	+	1458	6	NNC	ENSMUSG00000033107.7	novel	1348	6	NA	NA	389	159	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	47.3767875652202	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAATTTTTTTTTTGATAGAA	1608	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21094917	21117078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_21095002_21107355_21107513_21110785_21110881_21112107_21112199_21114227_21114336_21116155
tx.8824	chr18	+	2474	8	FSM	ENSMUSG00000024317.16	ENSMUST00000234107.2	2422	8	-59	7	-59	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_1	133.739008703443	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTGCAGTTTTGTAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21134338	21160585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_21134598_21135013_21135227_21141781_21141948_21143733_21143850_21150875_21150933_21153944_21154057_21157465_21157574_21159142
tx.8825	chr18	+	2236	7	FSM	ENSMUSG00000024317.16	ENSMUST00000234536.2	2271	7	30	5	30	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	249	junction_6	95.8227530391399	511	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGCAGTTTTGTAAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21134994	21160587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_21135227_21141781_21141948_21143733_21143850_21150875_21150933_21153944_21154057_21157465_21157574_21159142
tx.8826	chr18	+	2128	6	FSM	ENSMUSG00000024317.16	ENSMUST00000052396.7	2769	6	-53	694	30	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_5	108.138799697426	358	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGCAGTTTTGTAAAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21134994	21160587	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_21135227_21141781_21141948_21143733_21143850_21150875_21150933_21153944_21154057_21159142
tx.8827	chr18	+	2177	6	NIC	ENSMUSG00000024317.16	novel	2271	7	NA	NA	30	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	50	junction_3	152.012367917877	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTGCAGTTTTGTAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21134994	21160585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_21135227_21141781_21141948_21143733_21143850_21153944_21154057_21157465_21157574_21159142
tx.8828	chr18	+	2068	5	FSM	ENSMUSG00000024317.16	ENSMUST00000234545.2	1769	5	-156	-143	31	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_3	174.891930917353	57	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTGCAGTTTTGTAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21134995	21160585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_21135227_21141781_21141948_21143733_21143850_21153944_21154057_21159142
tx.8829	chr18	+	455	3	NNC	ENSMUSG00000024313.9	novel	617	7	NA	NA	-310	-16611	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	73	junction_2	15	543	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAGCATGTCTTGGTTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21194669	21200631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_21194811_21194905_21195074_21200485
tx.883	chr1	-	2164	17	NIC	ENSMUSG00000026709.11	novel	3619	17	NA	NA	3	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_16	96.678510409501	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTATTTAGAGTCTTCCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160898223	160869070	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_160869501_160871182_160871259_160872528_160872640_160872827_160873047_160874346_160874500_160877507_160877571_160878900_160879009_160881510_160881691_160884030_160884101_160885016_160885124_160887614_160887662_160888305_160888430_160890351_160890448_160890816_160890919_160892794_160892862_160896649_160896750_160898112
tx.8830	chr18	-	445	3	FSM	ENSMUSG00000086287.2	ENSMUST00000132571.2	418	3	-27	0	-27	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTAAATGGCTTTATTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23885389	23883503	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_23883617_23884636_23884881_23885301
tx.8831	chr18	+	2545	7	FSM	ENSMUSG00000024277.15	ENSMUST00000025127.5	4026	7	-7	1488	-7	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	115	junction_6	13.0596920161065	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTTGAAATTTCTTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23937033	24025426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_23937279_23965909_23966038_23986710_23986857_23991000_23991215_24011000_24011141_24016594_24016754_24023913
tx.8832	chr18	+	566	4	ISM	ENSMUSG00000024277.15	ENSMUST00000025127.5	4026	7	26	35834	-10	-2614	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	14.0079342596338	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTAACTATGACGGGAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23937066	23991080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_23937279_23965909_23966038_23986710_23986857_23991000
tx.8833	chr18	+	796	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117405.2	novel	592	1	NA	NA	-29	241	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	432	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAGGTCCTATAGCTGAACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24077986	24078848	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_+_24078717_24078782
tx.8834	chr18	+	2368	3	FSM	ENSMUSG00000063281.10	ENSMUST00000074941.8	3040	3	26	646	26	-646	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_1	18.5	247	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTGTCTCTTGCATCGTT	1085	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24122714	24137787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_24122789_24123234_24123448_24135706
tx.8835	chr18	-	3158	4	NNC	ENSMUSG00000051469.15	novel	5732	4	NA	NA	28	1660	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	114.638562447372	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTTGGAATTGCCTTACTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24153839	24145321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_24147743_24150340_24150489_24150724_24151226_24153751
tx.8836	chr18	-	3569	4	NIC	ENSMUSG00000051469.15	novel	5732	4	NA	NA	-19	1651	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	27	junction_3	102.009803450453	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATAAAGTAGCTTGGAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24153396	24145330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_24147743_24150340_24150489_24150724_24151226_24152888
tx.8837	chr18	-	3147	4	FSM	ENSMUSG00000051469.15	ENSMUST00000066497.12	5732	4	18	2567	18	1656	multi-exon	FALSE	canonical	3	144	junction_3	47.8957200593122	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGTAGCTTGGAATTGCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24153849	24145325	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_24147743_24150340_24150489_24150724_24151226_24153768
tx.8838	chr18	-	3190	4	FSM	ENSMUSG00000051469.15	ENSMUST00000153337.2	1513	4	-27	-1650	23	1650	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_3	83.8212383587835	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGATAAAGTAGCTTGGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24153404	24145331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_24147743_24150340_24150489_24150724_24151226_24153274
tx.8839	chr18	-	681	2	Intergenic	novelGene_713	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	5	junction_1	0	121	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTTTTGTTTTTTCGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24234467	24233608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_24234107_24234284
tx.884	chr1	+	1734	5	FSM	ENSMUSG00000026708.17	ENSMUST00000111620.10	1910	5	176	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	79	junction_2	18.1710621593786	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGTTATTTATTCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160898512	160913908	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_160898927_160902326_160902501_160905798_160906051_160910477_160911021_160913557
tx.8840	chr18	-	884	5	FSM	ENSMUSG00000047989.12	ENSMUST00000153360.8	2498	5	91	1523	-27	94	multi-exon	FALSE	canonical	3	634	junction_3	55.0789206502814	1154	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCAGTAAGATTATGCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24254919	24239336	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_24239716_24244771_24244840_24245717_24245830_24247133_24247245_24254705
tx.8841	chr18	+	378	2	Intergenic	novelGene_714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTAATTTTGCTATTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24425039	24429196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_24425092_24428870
tx.8842	chr18	+	317	2	ISM	ENSMUSG00000024273.9	ENSMUST00000234955.2	458	3	-43	2049	-24	-2049	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	181	junction_1	0	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTGCATGAAAACCCCAGAT	316	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24603882	24604280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_24604038_24604118
tx.8843	chr18	+	1052	5	FSM	ENSMUSG00000024273.9	ENSMUST00000097646.5	1065	5	-18	31	0	-31	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_2	17.066048165876	307	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGTTTTTATGATAAAGG	341	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24603907	24610824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_24604038_24604118_24604142_24606006_24606207_24608581_24608782_24610325
tx.8844	chr18	+	1029	4	NIC	ENSMUSG00000024273.9	novel	1065	5	NA	NA	0	-31	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	12	junction_1	89.4886709154976	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GACAGTTTTTATGATAAAGG	341	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24603907	24610824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_24604038_24606006_24606207_24608581_24608782_24610325
tx.8845	chr18	-	1335	8	NNC	ENSMUSG00000040446.5	novel	4299	7	NA	NA	15	332	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	25	junction_1	90.8764579648926	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGGTAGTACTATAGTAGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24663246	24620674	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_24620902_24621192_24621389_24639890_24640067_24640161_24640289_24641050_24641149_24641226_24641334_24642849_24642980_24662972
tx.8846	chr18	-	1325	7	FSM	ENSMUSG00000040446.5	ENSMUST00000046206.5	4299	7	-9	2983	-9	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	196	junction_1	46.8807589054993	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTTTGTAAGTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24663270	24620999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_24621389_24639890_24640067_24640161_24640289_24641050_24641149_24641226_24641334_24642849_24642980_24662972
tx.8847	chr18	-	999	7	NNC	ENSMUSG00000040446.5	novel	2950	5	NA	NA	13	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	105.459971342475	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTGTCTCATGTTTTTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24663248	24638482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_24638568_24639890_24640067_24640161_24640289_24641050_24641149_24641226_24641334_24642849_24642980_24662972
tx.8848	chr18	-	2319	6	ISM	ENSMUSG00000040446.5	ENSMUST00000046206.5	4299	7	14	20468	14	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	215	junction_1	43.046951111548	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTATTGTCTCATGTTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24663247	24638484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_24640067_24640161_24640289_24641050_24641149_24641226_24641334_24642849_24642980_24662972
tx.8849	chr18	+	2771	22	FSM	ENSMUSG00000024271.9	ENSMUST00000234266.2	3466	22	0	695	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	667	junction_5	86.0279973411599	311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTGTCTGATTTTGCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24737017	24771869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_24737190_24739913_24739993_24742686_24742758_24744969_24745127_24745504_24745583_24747472_24747538_24748217_24748285_24748945_24749084_24750457_24750554_24752134_24752236_24752438_24752571_24755135_24755295_24755535_24755725_24758568_24758636_24759181_24759275_24759444_24759503_24760051_24760125_24764415_24764609_24765815_24765938_24767395_24767530_24767957_24768066_24771450
tx.885	chr1	-	2062	8	FSM	ENSMUSG00000026705.17	ENSMUST00000148952.8	4182	8	33	2087	33	1587	multi-exon	FALSE	canonical	3	82	junction_4	11.5387545750335	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGACTGTATGTGTGTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160959048	160926101	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_160926856_160929020_160929205_160930548_160930665_160932970_160933066_160934276_160934436_160936791_160937366_160957958_160958023_160958932
tx.8850	chr18	+	2751	15	FSM	ENSMUSG00000039616.11	ENSMUST00000068006.9	2903	15	152	0	-35	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_8	5.18878303533257	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACTGCCTGCCATTATTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24786899	24834632	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_24787125_24793046_24793137_24797073_24797141_24799066_24799709_24803621_24803699_24807287_24807488_24809616_24809734_24812442_24812869_24816185_24816349_24819683_24819763_24821994_24822120_24825574_24825681_24828930_24829070_24832909_24833015_24834442
tx.8851	chr18	+	436	4	ISM	ENSMUSG00000039616.11	ENSMUST00000234253.2	2498	12	-42	23852	-42	-23852	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_3	3.09120616516523	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCACAGCTGGGAGTACAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24786892	24799113	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_24787125_24793046_24793137_24797073_24797141_24799066
tx.8852	chr18	+	372	2	ISM	ENSMUSG00000039616.11	ENSMUST00000068006.9	2903	15	46087	-2	45900	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTGCCTGCCATTATTGAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24832834	24834634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_24833015_24834442
tx.8853	chr18	-	1241	7	FSM	ENSMUSG00000024269.12	ENSMUST00000115817.3	4159	7	344	2574	31	-2574	multi-exon	FALSE	canonical	3	238	junction_5	17.5823459438406	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCATCAGTATCGACTAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25301720	25271667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_25272197_25273502_25273664_25274577_25274695_25282170_25282300_25284256_25284345_25291300_25291381_25301583
tx.8854	chr18	+	549	5	ISM	ENSMUSG00000033632.17	ENSMUST00000162149.2	1427	6	-6	86846	0	14829	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	40	junction_3	4.32290411644765	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATACTTTATTTTTTAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25302070	25337119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_25302144_25307743_25307780_25308399_25308543_25315111_25315207_25336917
tx.8855	chr18	+	729	6	NNC	ENSMUSG00000033632.17	novel	1427	6	NA	NA	0	16356	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	18.5083764820148	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGCTTTATGTTGAAATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25302070	25338646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_25302144_25307743_25307780_25308399_25308543_25315111_25315207_25336917_25337034_25338380
tx.8856	chr18	+	1036	5	FSM	ENSMUSG00000033632.17	ENSMUST00000161262.8	1021	5	0	-15	0	15	multi-exon	FALSE	canonical	1	4	junction_4	17.7200451466693	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAGCTCAAGTTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25302070	25322305	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_25302144_25307743_25307780_25308399_25308543_25315111_25315207_25321616
tx.8857	chr18	-	1272	2	ISM	ENSMUSG00000024268.17	ENSMUST00000025117.14	2899	13	266718	211	-135	-211	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAGGAAAAAAAAACCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25620089	25611735	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_25612769_25619850
tx.8858	chr18	-	1056	6	ISM	ENSMUSG00000024268.17	ENSMUST00000223704.2	2492	13	248893	18120	-3851	7022	internal_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_1	5.17687164221791	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTGTCTGCATCCCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25638147	25630254	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_25630588_25634257_25634408_25635989_25636138_25637195_25637340_25637545_25637626_25637946
tx.8859	chr18	-	676	2	Intergenic	novelGene_716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGAGTGTCTTTTCTATAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26619197	26615228	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_26615767_26619059
tx.886	chr1	+	619	2	ISM	ENSMUSG00000044835.16	ENSMUST00000052245.9	849	6	-40	12722	4	-11826	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAAGGTCAAACTTACCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	160970296	160979039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_160970411_160978534
tx.8860	chr18	+	3143	25	FSM	ENSMUSG00000033628.16	ENSMUST00000115812.10	3257	25	114	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_11	21.8495089571063	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGCCTTGTTTTCCCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30405913	30481179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_30406072_30407321_30407511_30410024_30410169_30415009_30415140_30421803_30421891_30423523_30423620_30426111_30426184_30426671_30426777_30427388_30427482_30431625_30431812_30435972_30436128_30436618_30436710_30438027_30438096_30444272_30444379_30445604_30445722_30449895_30450028_30452553_30452683_30453286_30453357_30455222_30455288_30456574_30456660_30457596_30457672_30466213_30466383_30469146_30469238_30477003_30477130_30480775
tx.8861	chr18	+	697	4	ISM	ENSMUSG00000033628.16	ENSMUST00000131405.2	3144	25	60327	-6	60327	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_2	34.4512538072113	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGCCTTGTTTTCCCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30466306	30481179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_30466383_30469146_30469238_30477003_30477130_30480775
tx.8862	chr18	-	2959	8	FSM	ENSMUSG00000024259.10	ENSMUST00000060396.7	4371	8	-9	1421	0	-1421	multi-exon	FALSE	canonical	3	132	junction_7	28.1852472628023	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTATTTTATGGTTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31742964	31714641	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_31716823_31727629_31727688_31730091_31730149_31733184_31733286_31735775_31735854_31738805_31738864_31740274_31740318_31742581
tx.8863	chr18	+	463	3	ISM	ENSMUSG00000024260.15	ENSMUST00000234769.2	4176	18	-38	65778	-30	-39	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	198	junction_1	13.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACCAGCAGTACCACTCTCTT	6775	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31767393	31780289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_31767543_31769034_31769153_31780093
tx.8864	chr18	+	2610	12	ISM	ENSMUSG00000024260.15	ENSMUST00000235017.2	4030	21	-30	44606	-30	31180	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	116	junction_5	28.8610235037836	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGGGATGAAGATGAGGATG	6775	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31767393	31811508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_31767543_31769034_31769153_31780093_31780330_31781186_31781346_31782597_31782710_31783543_31783669_31786554_31786680_31799393_31799542_31799688_31799780_31799957_31800063_31807407_31807550_31810408
tx.8865	chr18	+	1349	5	ISM	ENSMUSG00000024260.15	ENSMUST00000025109.8	4015	21	76951	-2	76155	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	176	junction_3	5.22015325445528	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATGAGCAGTTTGCCTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31844386	31856116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_31844500_31844661_31844788_31848393_31848498_31853709_31853824_31855224
tx.8866	chr18	+	1051	4	FSM	ENSMUSG00000024258.5	ENSMUST00000025106.5	1015	4	-31	-5	-31	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	694	junction_1	16.2138486760204	2574	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTGTATTTATTTGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31922180	31929759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_31922298_31924892_31925074_31928340_31928437_31929102
tx.8867	chr18	+	949	3	FSM	ENSMUSG00000024258.5	ENSMUST00000234146.2	706	3	-26	-217	-25	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_2	315.5	125	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATTGTATTTATTTGTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31922186	31929759	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_31922298_31924892_31925074_31929102
tx.8868	chr18	-	320	2	Intergenic	novelGene_717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTAAATGGTTTTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31937053	31936195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_31936460_31936997
tx.8869	chr18	+	1179	6	FSM	ENSMUSG00000024400.17	ENSMUST00000234344.2	2416	6	-84	1321	-1	-1321	multi-exon	FALSE	canonical	3	387	junction_4	31.1088411870323	1135	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCTAAAGCCTGCAGAAATCA	5649	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31937144	31967154	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_31937308_31960314_31960542_31962284_31962354_31962927_31963033_31966362_31966459_31966635
tx.887	chr1	-	1437	5	FSM	ENSMUSG00000026701.16	ENSMUST00000071718.12	2387	5	53	897	0	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	1689	junction_3	62.8823305865805	10725	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTTGTCATGTTTTAAAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161078736	161068578	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_161069420_161071144_161071292_161071765_161071913_161074826_161074984_161078591
tx.8870	chr18	+	1227	3	ISM	ENSMUSG00000024384.5	ENSMUST00000212675.2	2936	15	-34	17044	-7	-4232	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_2	5.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGACAGTGATGATGATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32200786	32213528	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_32201093_32203159_32203276_32212723
tx.8871	chr18	+	2794	14	FSM	ENSMUSG00000024384.5	ENSMUST00000025243.5	9613	14	10	6809	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	171	junction_3	17.4029855290822	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGTTGTCTCATCATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32200803	32230572	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_32201093_32203159_32203276_32212723_32213631_32216318_32216512_32217231_32217290_32217705_32217804_32219325_32219477_32220122_32220206_32221308_32221439_32222441_32222560_32223481_32223594_32224198_32224256_32226170_32226283_32230202
tx.8872	chr18	+	3437	13	ISM	ENSMUSG00000024384.5	ENSMUST00000025243.5	9613	14	2363	5880	-54	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_2	17.8854379003951	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGCATACTTTTTATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32203156	32231501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_32203276_32212723_32213631_32216318_32216512_32217231_32217290_32217705_32217804_32219325_32219477_32220122_32220206_32221308_32221439_32222441_32222560_32223481_32223594_32224198_32224256_32226170_32226283_32230202
tx.8873	chr18	-	1219	2	Fusion	ENSMUSG00000117650.2_ENSMUSG00000117481.2	novel	537	2	NA	NA	-2172	70	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTTGTGACCTGAAAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32247532	32245023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr18_-_32246026_32247315
tx.8874	chr18	+	2678	15	FSM	ENSMUSG00000024382.14	ENSMUST00000025241.7	2708	15	30	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	78	junction_6	14.4393524078881	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTGTCTCTATTTTATTG	NA	False	NA	-86	True	NA	NA	NA	32373382	32403204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_32373475_32373682_32373889_32376016_32376254_32377851_32377902_32378541_32378678_32378804_32378973_32379619_32379825_32381215_32381531_32387133_32387319_32390242_32390446_32394354_32394452_32397600_32397719_32398670_32398790_32400216_32400370_32402810
tx.8875	chr18	+	668	3	ISM	ENSMUSG00000024382.14	ENSMUST00000142213.8	2781	14	25262	0	8347	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_2	6.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTTGTCTCTATTTTATTG	1021	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32398668	32403204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_32398790_32400216_32400370_32402810
tx.8876	chr18	+	871	4	ISM	ENSMUSG00000024381.17	ENSMUST00000234373.2	2682	6	3654	-4	3654	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_1	5.55777733351102	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGAGGCGTGTCTTTCTT	6267	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32564740	32568790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_32564796_32565035_32565147_32565376_32565479_32568187
tx.8877	chr18	+	818	3	ISM	ENSMUSG00000024381.17	ENSMUST00000234373.2	2682	6	3947	-4	3947	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_1	1.5	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAACGAGGCGTGTCTTTCTT	6560	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32565033	32568790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_32565147_32565376_32565479_32568187
tx.8878	chr18	+	2859	23	FSM	ENSMUSG00000038299.17	ENSMUST00000053663.11	4455	23	35	1561	7	-367	multi-exon	FALSE	canonical	3	587	junction_7	67.2070318044693	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTATGTGCCAAGTGTGCTG	8999	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32970312	32999086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_32970612_32972484_32972513_32974095_32974197_32974949_32975068_32976814_32976948_32978643_32978699_32979882_32980016_32980194_32980371_32980641_32980763_32981348_32981415_32982125_32982213_32983439_32983589_32985033_32985149_32985537_32985704_32985916_32986026_32987832_32987913_32992272_32992381_32994079_32994178_32994554_32994701_32995977_32996098_32996233_32996316_32997705_32997894_32998905
tx.8879	chr18	+	1521	12	ISM	ENSMUSG00000038299.17	ENSMUST00000166214.9	2906	24	13097	367	-2699	-367	internal_fragment	FALSE	canonical	3	650	junction_4	69.3480859490252	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTATGTGCCAAGTGTGCTG	3224	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32983460	32999086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_32983589_32985033_32985149_32985537_32985704_32985916_32986026_32987832_32987913_32992272_32992381_32994079_32994178_32994554_32994701_32995977_32996098_32996233_32996316_32997705_32997894_32998905
tx.888	chr1	+	610	2	Intergenic	novelGene_72	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	0	148	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGCAATTGTGGTGCCTG	525	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161705393	161709164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_161705610_161708770
tx.8880	chr18	+	1334	11	ISM	ENSMUSG00000038299.17	ENSMUST00000166214.9	2906	24	14729	367	-1067	-367	internal_fragment	FALSE	canonical	3	650	junction_3	72.4434262027963	187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTATGTGCCAAGTGTGCTG	4856	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32985092	32999086	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_32985149_32985537_32985704_32985916_32986026_32987832_32987913_32992272_32992381_32994079_32994178_32994554_32994701_32995977_32996098_32996233_32996316_32997705_32997894_32998905
tx.8881	chr18	+	606	2	ISM	ENSMUSG00000038299.17	ENSMUST00000234798.2	3063	8	11626	70	11626	-50	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	776	junction_1	0	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTATCTGTAATATACTTA	2809	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32997785	32999403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_32997894_32998905
tx.8882	chr18	-	1438	6	FSM	ENSMUSG00000024378.10	ENSMUST00000025236.9	5097	6	22	3637	-19	413	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_1	4.66476151587624	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTGCATTTATTCTGGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33346893	33336044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_33336869_33338103_33338219_33339172_33339300_33341229_33341280_33342095_33342211_33346686
tx.8883	chr18	-	1027	5	FSM	ENSMUSG00000024378.10	ENSMUST00000141617.2	979	5	-51	3	-10	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_3	4.65698400254929	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATAAGAATTTGGAATCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33346925	33337722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_33338219_33339172_33339300_33341229_33341280_33342095_33342211_33346686
tx.8884	chr18	-	2044	5	FSM	ENSMUSG00000042834.16	ENSMUST00000168890.2	2185	5	138	3	-37	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_4	6.79613860953409	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACTGTGCTTTGGCTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33596944	33570074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_33571893_33575868_33575947_33595073_33595141_33596430_33596473_33596905
tx.8885	chr18	-	2075	4	FSM	ENSMUSG00000042834.16	ENSMUST00000051087.16	659	4	253	-1669	-51	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	5.90668171555645	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGCTTTGGCTCATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33596539	33570071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_33571893_33575868_33575947_33595073_33595141_33596430
tx.8886	chr18	-	1966	3	FSM	ENSMUSG00000042834.16	ENSMUST00000171533.9	3311	3	1348	-3	1348	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	37	junction_1	6.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTGCTTTGGCTCATTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33595140	33570071	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_33571893_33575868_33575947_33595073
tx.8887	chr18	+	434	3	FSM	ENSMUSG00000087590.3	ENSMUST00000146010.3	430	3	-1	-3	-1	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	377	junction_1	24	18566	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CACGTGTATGTTGTGTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33927943	33929042	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_33928178_33928435_33928499_33928905
tx.8888	chr18	-	945	6	ISM	ENSMUSG00000024376.8	ENSMUST00000025234.7	3566	24	196578	632	-7243	-42	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	167	junction_1	21.9508541975022	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTAAGTGTCCTTGTCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33943394	33930011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_33930524_33931560_33931643_33931743_33931855_33934623_33934693_33935565_33935614_33943271
tx.8889	chr18	-	3590	23	ISM	ENSMUSG00000024376.8	ENSMUST00000025234.7	3566	24	322	0	322	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	125	junction_9	28.0317116763164	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTGGTCTGGTCTCTTTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34139650	33929379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_33930524_33931560_33931643_33931743_33931855_33934623_33934693_33935565_33935614_33943271_33943392_33957511_33957590_33958459_33958508_33961156_33961271_33961779_33961864_33965647_33965739_33987288_33987411_33992594_33992673_33994198_33994291_34007194_34007259_34007790_34007880_34009961_34010050_34011964_34012086_34013239_34013338_34019403_34019483_34024477_34024530_34054882_34054988_34139037
tx.889	chr1	+	674	2	Intergenic	novelGene_73	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCAAAGCCTTCTTTGATTG	3019	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161709090	161711110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_161709422_161710767
tx.8890	chr18	+	729	3	Intergenic	novelGene_718	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTATGGTCTTGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34158688	34162060	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_34158778_34158861_34158980_34161538
tx.8891	chr18	-	541	2	Intergenic	novelGene_719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	123	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGTGGTAATTGTGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34161598	34159959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_34160386_34161483
tx.8892	chr18	+	834	5	FSM	ENSMUSG00000014504.17	ENSMUST00000072576.10	876	5	2	40	2	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	833	junction_3	511.998291012773	7823	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCATCTTTAAGTTAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34464199	34469612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_34464313_34464802_34464879_34467345_34467418_34467509_34467622_34469151
tx.8893	chr18	-	626	4	NIC	ENSMUSG00000005873.7	novel	2852	5	NA	NA	-20	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	1	3	junction_2	233.445687235573	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGCTTTGCCTTTGTTGTC	5541	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34506442	34480044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_34480222_34482687_34482857_34505457_34505552_34506256
tx.8894	chr18	-	766	5	FSM	ENSMUSG00000005873.7	ENSMUST00000006027.7	2852	5	-21	2107	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	477	junction_1	38.3495436739474	4354	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGCTTTGCCTTTGTTGTC	5540	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34506443	34480044	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_34480222_34482687_34482857_34490144_34490284_34505457_34505552_34506256
tx.8895	chr18	-	465	6	ISM	ENSMUSG00000003778.15	ENSMUST00000145431.2	599	9	-26	1976	21	-1976	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	307	junction_5	70.121038212508	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGGTTCCATTTGTGCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34757633	34746267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_34746350_34747500_34747624_34747800_34747851_34749717_34749788_34756507_34756605_34757590
tx.8896	chr18	+	2972	19	FSM	ENSMUSG00000003779.17	ENSMUST00000237407.2	3674	19	230	472	-42	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	938	junction_13	99.0044268869321	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGATTCCAAATTTAGAA	6207	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34758017	34765858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_34758114_34758510_34758695_34759768_34759859_34759947_34760068_34760605_34760745_34760837_34761026_34761105_34761236_34761437_34761633_34761727_34761840_34761937_34762007_34762193_34762338_34762477_34762644_34763054_34763220_34763339_34763480_34763574_34763678_34764198_34764395_34764573_34764666_34764978_34765117_34765353
tx.8897	chr18	+	1037	5	ISM	ENSMUSG00000003779.17	ENSMUST00000166044.3	3107	19	5486	0	1596	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	989	junction_1	106.372870131439	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGATTCCAAATTTAGAA	933	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34763571	34765858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_34763678_34764198_34764395_34764573_34764666_34764978_34765117_34765353
tx.8898	chr18	-	2087	17	FSM	ENSMUSG00000024370.18	ENSMUST00000025228.12	2084	17	0	-3	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	73	junction_1	259.182247655969	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTACTGTTCTTTCTAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34784788	34764000	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_34764355_34767135_34767218_34767445_34767566_34767640_34767720_34769338_34769401_34769755_34769832_34770111_34770232_34770372_34770527_34774148_34774231_34774347_34774446_34774525_34774704_34776851_34776985_34777077_34777184_34778118_34778162_34779954_34780093_34784442_34784516_34784599
tx.8899	chr18	+	928	4	ISM	ENSMUSG00000003779.17	ENSMUST00000166044.3	3107	19	6116	0	2226	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1104	junction_2	71.5557280881288	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTGGATTCCAAATTTAGAA	1563	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34764201	34765858	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_34764395_34764573_34764666_34764978_34765117_34765353
tx.89	chr1	+	1061	6	NNC	ENSMUSG00000025934.16	novel	1457	7	NA	NA	3295	193	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	25	junction_1	18.4867520132661	174	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTGGAGTATTCGAACATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21327039	21335438	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_21327270_21327554_21327607_21329071_21329205_21330271_21330414_21333016_21333149_21335066
tx.890	chr1	+	1471	2	FSM	ENSMUSG00000026698.9	ENSMUST00000111594.3	3290	2	9	1810	7	-705	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCATTGTCTAGTATTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161796763	161799194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_161796849_161797808
tx.8900	chr18	-	3031	16	FSM	ENSMUSG00000024370.18	ENSMUST00000133181.2	4133	16	2	1100	2	895	multi-exon	FALSE	canonical	3	906	junction_9	78.8679909722569	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCCATATAATATTTGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34784786	34765835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_34767218_34767445_34767566_34767640_34767720_34769338_34769401_34769755_34769832_34770111_34770232_34770372_34770527_34774148_34774231_34774347_34774446_34774525_34774704_34776851_34776985_34777077_34777184_34778118_34778162_34779954_34780093_34784442_34784516_34784599
tx.8901	chr18	-	485	3	ISM	ENSMUSG00000024370.18	ENSMUST00000133181.2	4133	16	0	15134	0	35	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1063	junction_2	73.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATATATATATATGGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34784788	34779869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_34780093_34784442_34784516_34784599
tx.8902	chr18	+	1300	2	Intergenic	novelGene_720	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTGGTCTCTCGTGAGTTC	7133	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34784988	34786610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_34785412_34785733
tx.8903	chr18	-	1964	15	FSM	ENSMUSG00000044201.11	ENSMUST00000060710.9	1945	15	-19	0	-19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	155	junction_14	20.2922524674833	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTCTAGATGTCTCTAAGCC	2773	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34884605	34866045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_34866447_34866629_34866742_34867771_34867906_34868423_34868523_34871268_34871332_34873380_34873483_34876990_34877117_34877923_34878023_34880276_34880367_34880662_34880697_34881967_34882014_34882569_34882665_34883790_34884017_34884166_34884265_34884366
tx.8904	chr18	+	1661	4	NNC	ENSMUSG00000097755.3	novel	2398	3	NA	NA	-86	-16	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.63299316185545	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACTGTTGAAATCGGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34884775	34891722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_34885189_34887536_34887623_34887728_34888453_34891284
tx.8905	chr18	-	2339	11	FSM	ENSMUSG00000024360.9	ENSMUST00000025218.8	3709	11	28	1342	28	-1342	multi-exon	FALSE	canonical	3	901	junction_10	88.1591742248077	1617	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAAAGATGATTTTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35065032	35037179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_35038124_35039034_35039183_35040667_35040733_35041094_35041251_35042195_35042326_35042797_35042989_35043168_35043308_35046606_35046747_35047052_35047229_35064621_35064726_35064886
tx.8906	chr18	-	2201	10	ISM	ENSMUSG00000024360.9	ENSMUST00000025218.8	3709	11	327	1342	327	-1342	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1038	junction_9	65.5033690585812	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCAAAGATGATTTTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35064733	35037179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_35038124_35039034_35039183_35040667_35040733_35041094_35041251_35042195_35042326_35042797_35042989_35043168_35043308_35046606_35046747_35047052_35047229_35064621
tx.8907	chr18	-	842	2	ISM	ENSMUSG00000024359.11	ENSMUST00000025217.11	3049	17	15693	219	646	-219	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6613	junction_1	0	144	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCTTTGTGAATGGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35071717	35070685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_35071447_35071636
tx.8908	chr18	-	998	3	ISM	ENSMUSG00000024359.11	ENSMUST00000025217.11	3049	17	15329	219	282	-219	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	6556	junction_2	28.5	571	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCTTTGTGAATGGTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35072081	35070685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_35071447_35071636_35071778_35071985
tx.8909	chr18	-	1846	9	ISM	ENSMUSG00000024359.11	ENSMUST00000025217.11	3049	17	8319	219	2086	-219	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	5978	junction_5	294.169593941998	831	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCTTTGTGAATGGTGAT	8518	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35079091	35070685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_35071447_35071636_35071778_35071985_35072079_35072395_35072491_35073249_35073368_35073892_35073998_35074917_35075146_35076128_35076339_35078996
tx.891	chr1	+	1466	2	FSM	ENSMUSG00000026698.9	ENSMUST00000160881.2	704	2	-10	-752	-10	-706	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCATTGTCTAGTATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	161796857	161799193	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_161796939_161797808
tx.8910	chr18	-	2825	17	FSM	ENSMUSG00000024359.11	ENSMUST00000025217.11	3049	17	5	219	5	-219	multi-exon	TRUE	canonical	3	5978	junction_5	267.479905787332	3279	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCTTTGTGAATGGTGAT	204	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35087405	35070685	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_35071447_35071636_35071778_35071985_35072079_35072395_35072491_35073249_35073368_35073892_35073998_35074917_35075146_35076128_35076339_35078996_35079090_35079548_35079712_35080963_35081071_35081158_35081233_35082069_35082195_35084276_35084459_35085448_35085537_35085729_35085789_35087222
tx.8911	chr18	+	1636	7	FSM	ENSMUSG00000037815.8	ENSMUST00000236969.2	1656	7	0	20	0	-20	multi-exon	FALSE	canonical	3	1595	junction_4	198.935221170667	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAGAAAAAATATCACAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35251939	35316083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_35252035_35285653_35285761_35287397_35287594_35307305_35307473_35308149_35308270_35312737_35313008_35315402
tx.8912	chr18	+	3692	18	FSM	ENSMUSG00000037815.8	ENSMUST00000042345.8	3733	18	37	4	9	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1584	junction_14	159.493141807844	88	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTCTAAGAAGCAGAAGTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35251948	35387828	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_35252035_35285653_35285761_35287397_35287594_35307305_35307473_35308149_35308270_35312737_35313008_35315402_35315607_35355117_35355199_35356475_35356629_35368660_35368754_35372435_35372593_35377007_35377209_35377749_35377902_35382754_35382866_35383898_35384081_35384218_35384325_35385668_35385804_35386657
tx.8913	chr18	+	1300	9	NNC	ENSMUSG00000037815.8	novel	1453	10	NA	NA	12	15915	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_8	775.28071528963	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGGTTTTGTCATACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35251951	35332018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_35252035_35285653_35285761_35287397_35287594_35307305_35307473_35308149_35308270_35312737_35313008_35315402_35315607_35321870_35321927_35331921
tx.8914	chr18	-	1184	6	ISM	ENSMUSG00000024357.11	ENSMUST00000235619.2	1524	9	157703	0	1876	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	128	junction_3	7.6	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTCTGTCTCTTGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35474244	35399448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_35399963_35402091_35402257_35402666_35402764_35450894_35451017_35458336_35458529_35474150
tx.8915	chr18	-	1675	10	FSM	ENSMUSG00000024357.11	ENSMUST00000025215.10	1703	10	28	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_3	10.8423039781937	293	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTCTGTCTCTTGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35631954	35399448	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_35399963_35402091_35402257_35402666_35402764_35450894_35451017_35458336_35458529_35474150_35474251_35481692_35481814_35551109_35551249_35571319_35571434_35631843
tx.8916	chr18	+	723	4	FSM	ENSMUSG00000117869.2	ENSMUST00000235679.2	1190	4	37	430	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_1	16.2685791225499	3947	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTGGAATTTCATTGGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35686460	35690939	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_35686523_35687479_35687515_35689668_35689745_35690389
tx.8917	chr2	+	181	1	Intergenic	novelGene_782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62877601	62877782	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_62877600_62877800
tx.8918	chr18	+	1458	4	FSM	ENSMUSG00000037058.17	ENSMUST00000041314.17	1475	4	17	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2803	junction_2	114.719948860983	7389	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGTGCTTGTGTTATTGG	4657	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35731686	35750239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_35731813_35743923_35744088_35746375_35746556_35749251
tx.8919	chr18	+	1213	3	ISM	ENSMUSG00000037058.17	ENSMUST00000235476.2	1569	7	11406	1	5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2803	junction_1	137	4220	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGTGCTTGTGTTATTGG	3350	False	NA	-14	True	NA	NA	NA	35744042	35750239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_35744088_35746375_35746556_35749251
tx.892	chr1	+	1337	8	FSM	ENSMUSG00000026696.16	ENSMUST00000135241.8	1461	8	30	94	-7	-94	multi-exon	FALSE	canonical	3	271	junction_7	26.2336440784092	471	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTGGAGTGTTTGAAAACGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162398188	162422840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_162398350_162401866_162401986_162405440_162405488_162409387_162409439_162415764_162415866_162417033_162417114_162420194_162420247_162422114
tx.8920	chr18	-	673	6	FSM	ENSMUSG00000024352.13	ENSMUST00000025209.12	702	6	29	0	-1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	154	junction_2	20.7980768341691	1322	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCTGTAATGCCCAACCTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35795210	35789741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_35789898_35790001_35790105_35793335_35793407_35793496_35793628_35793844_35793911_35795064
tx.8921	chr18	-	680	4	FSM	ENSMUSG00000024352.13	ENSMUST00000096573.4	710	4	30	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	181	junction_2	13.2748718344933	263	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTTGTTTTATCCCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35795209	35793068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_35793407_35793496_35793628_35793844_35793911_35795064
tx.8922	chr18	-	1321	9	NIC	ENSMUSG00000024350.7	novel	5146	8	NA	NA	-4	5	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	16	junction_7	22.8250821466211	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTACTCTCTGCTGACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35836178	35808078	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_35808297_35813818_35813992_35814972_35815083_35816270_35816378_35819720_35819907_35830030_35830177_35833856_35834044_35835464_35835559_35836078
tx.8923	chr18	-	1120	7	ISM	ENSMUSG00000024350.7	ENSMUST00000025208.7	5146	8	2135	3926	2135	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_2	9.01849950564579	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCACTTTACTCTCTGCTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35834039	35808081	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_35808297_35813818_35813992_35814972_35815083_35816270_35816378_35819720_35819907_35830030_35830177_35833856
tx.8924	chr18	-	1222	8	FSM	ENSMUSG00000024350.7	ENSMUST00000025208.7	5146	8	0	3924	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_2	8.80630571852711	253	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTTACTCTCTGCTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35836174	35808079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_35808297_35813818_35813992_35814972_35815083_35816270_35816378_35819720_35819907_35830030_35830177_35833856_35834044_35836078
tx.8925	chr18	+	1577	2	FSM	ENSMUSG00000073598.4	ENSMUST00000097617.3	2504	2	-166	1093	-166	6	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CACAGTGGTACTGTCTTTTA	1176	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35859875	35862829	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_35860150_35861526
tx.8926	chr18	-	1921	8	FSM	ENSMUSG00000024349.11	ENSMUST00000115728.5	2299	8	32	346	32	6	multi-exon	TRUE	canonical	2	5	junction_4	3.35638289270592	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAATGGCCTCTTCCCCTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35873575	35867079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_35867752_35868155_35868343_35868931_35869171_35871733_35871843_35872092_35872274_35872403_35872631_35872977_35873068_35873359
tx.8927	chr18	+	1725	7	FSM	ENSMUSG00000091896.9	ENSMUST00000170693.9	2480	7	22	733	-7	615	multi-exon	FALSE	canonical	3	837	junction_2	121.947734706308	847	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTTGTGTGAATAGGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35904632	35939488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_35905066_35926517_35926582_35932893_35932926_35933004_35933083_35933162_35933269_35934326_35934421_35938570
tx.8928	chr18	+	2157	3	NIC	ENSMUSG00000046668.10	novel	1169	2	NA	NA	-128	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	329	junction_2	30	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACACTCCTGGCTTCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35963238	35994741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_35963293_35991445_35992510_35993702
tx.8929	chr18	+	3408	2	FSM	ENSMUSG00000046668.10	ENSMUST00000235169.2	857	2	-30	-2521	-30	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGATAACACTCCTGGCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35963336	35994737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_35963453_35991445
tx.893	chr1	-	735	5	FSM	ENSMUSG00000040225.16	ENSMUST00000182288.2	1342	5	-31	638	-3	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_3	1.78535710713571	584	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGCAAATGATGAAAACTA	3442	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162568097	162548098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_162548176_162548998_162549109_162550678_162550857_162552272_162552439_162567893
tx.8930	chr18	+	2197	3	NIC	ENSMUSG00000046668.10	novel	857	2	NA	NA	-8	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	58	junction_1	135.5	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAACACTCCTGGCTTCTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35963358	35994741	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_35963453_35991445_35992510_35993702
tx.8931	chr18	+	1694	2	ISM	ENSMUSG00000046668.10	ENSMUST00000060722.8	2302	3	29017	-3	4067	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	329	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTCCTGGCTTCTTGCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	35991857	35994744	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_35992510_35993702
tx.8932	chr18	+	535	3	FSM	ENSMUSG00000046727.14	ENSMUST00000152804.9	445	3	-83	-7	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_2	356.5	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCAATTCTTTTCTTTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36481743	36526430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36481870_36499567_36499795_36526248
tx.8933	chr18	+	836	3	FSM	ENSMUSG00000046727.14	ENSMUST00000050584.10	831	3	-6	1	-6	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	759	junction_1	90	4343	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGTGTGACTTACTCCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36481743	36536032	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36481870_36499567_36499795_36535549
tx.8934	chr18	-	702	4	FSM	ENSMUSG00000024346.7	ENSMUST00000025204.7	1109	4	0	407	0	122	multi-exon	FALSE	canonical	3	3024	junction_2	66.9792671072342	8047	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGCATGTGCTTTTCTCCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36587577	36537135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_36537514_36565358_36565444_36584132_36584300_36587505
tx.8935	chr18	-	1727	4	NNC	ENSMUSG00000024486.7	novel	2375	6	NA	NA	7233	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	26.0810701893581	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATGTTCTGTTTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36641187	36637984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_36639418_36639687_36639779_36640501_36640658_36641140
tx.8936	chr18	-	2373	6	FSM	ENSMUSG00000024486.7	ENSMUST00000025363.7	2375	6	-3	5	-3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_4	10.9068785635488	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCATGTTCTGTTTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36648861	36637984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_36639418_36639687_36639779_36640501_36640658_36645609_36645788_36648139_36648314_36648520
tx.8937	chr18	-	938	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024483.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCCGGCTCCTCACTAATTC	7292	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36693266	36692204	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_36692806_36692929
tx.8938	chr18	+	710	4	ISM	ENSMUSG00000117942.2	ENSMUST00000140061.8	2235	8	10180	0	10180	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	172	junction_1	18.1536650722535	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGGCTCCATTGTTGTCC	7839	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36791092	36798970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_36791192_36794049_36794160_36798334_36798509_36798643
tx.8939	chr18	+	670	3	FSM	ENSMUSG00000090264.2	ENSMUST00000036765.8	744	3	76	-2	76	2	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	104	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGCTCCATTGTTGTCCTC	660	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36797188	36798972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36797356_36798334_36798509_36798643
tx.894	chr1	-	724	5	NIC	ENSMUSG00000040225.16	novel	670	6	NA	NA	-7	15	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	7	junction_1	13.8270568090248	245	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	GAAGCAAATGATGAAAACTA	3438	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	162568101	162548098	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr1_-_162548176_162549013_162549109_162550678_162550857_162552272_162552439_162567893
tx.8940	chr18	-	847	4	FSM	ENSMUSG00000006050.13	ENSMUST00000173202.3	1299	4	478	-26	146	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1470	junction_2	40.4227658628155	1022	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTCTGATGTCAGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36803183	36800298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_36800713_36800843_36800953_36801704_36801902_36803056
tx.8941	chr18	-	892	5	FSM	ENSMUSG00000006050.13	ENSMUST00000173875.9	1979	5	522	565	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1172	junction_4	156.810992918226	5774	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCATTCTGATGTCAGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36803346	36800298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_36800713_36800843_36800953_36801704_36801902_36803056_36803183_36803300
tx.8942	chr18	+	2561	3	FSM	ENSMUSG00000033272.13	ENSMUST00000170288.2	403	3	0	-2158	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	222	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGTTGTCCTGTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36812635	36816913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36812677_36813480_36813668_36814580
tx.8943	chr18	+	2473	3	FSM	ENSMUSG00000033272.13	ENSMUST00000036158.7	2462	3	-9	-2	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	269	junction_1	96	116	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGTTGTCCTGTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36812635	36816913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36812677_36813568_36813668_36814580
tx.8944	chr18	+	2363	4	FSM	ENSMUSG00000033272.13	ENSMUST00000050476.11	2362	4	6	-7	2	-1	multi-exon	TRUE	canonical	3	118	junction_3	140.362229804017	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGTTGTCCTGTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36812637	36816913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36812677_36813568_36813668_36814580_36814819_36814926
tx.8945	chr18	+	2413	3	ISM	ENSMUSG00000033272.13	ENSMUST00000050476.11	2362	4	848	-7	818	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_2	171.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGTTGTCCTGTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36813479	36816913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_36813668_36814580_36814819_36814926
tx.8946	chr18	+	2434	2	ISM	ENSMUSG00000033272.13	ENSMUST00000036158.7	2462	3	922	-2	905	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	461	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACAGTTGTCCTGTCTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36813566	36816913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_36813668_36814580
tx.8947	chr18	+	553	3	Intergenic	novelGene_725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACGAAGTCTCATGACTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36832068	36852073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_36832186_36842074_36842145_36851707
tx.8948	chr18	-	482	2	ISM	ENSMUSG00000014294.5	ENSMUST00000014438.5	572	3	101	121	101	-121	intron_retention	FALSE	canonical	3	3066	junction_1	0	1296	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAATGTCCTCTTCATTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36877509	36875505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_36875712_36877233
tx.8949	chr18	-	432	3	FSM	ENSMUSG00000014294.5	ENSMUST00000014438.5	572	3	15	125	15	-125	multi-exon	FALSE	canonical	3	2929	junction_2	68.5	37846	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAGAATGTCCTCTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36877595	36875509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_36875712_36877233_36877341_36877472
tx.895	chr1	-	2525	5	FSM	ENSMUSG00000040124.6	ENSMUST00000045138.6	2538	5	13	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_3	10.1827059272082	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGTATGGTCTGTCATTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163231225	163212476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_163214267_163219978_163220120_163222159_163222262_163224380_163224739_163231091
tx.8950	chr18	+	1511	7	FSM	ENSMUSG00000042660.9	ENSMUST00000049323.9	1619	7	19	89	19	-89	multi-exon	FALSE	canonical	3	263	junction_5	28.487814158962	1394	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCATGTAAGCCCAAACCAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36893291	36896774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36893534_36895029_36895131_36895218_36895307_36895407_36895588_36895710_36895811_36895901_36896072_36896144
tx.8951	chr18	+	2174	12	FSM	ENSMUSG00000019143.16	ENSMUST00000019287.9	2002	12	7	-179	7	179	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_9	36.3770429831556	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGACCTGAGTTCATTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36916290	36924926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36916548_36918617_36918696_36918921_36919042_36919163_36919260_36920554_36920681_36920951_36921060_36921218_36921318_36921629_36921724_36922209_36922338_36923186_36923304_36923521_36923669_36924122
tx.8952	chr18	+	2411	13	FSM	ENSMUSG00000019143.16	ENSMUST00000152954.8	3336	13	237	688	14	180	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_10	16.7752711519731	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGACCTGAGTTCATTTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36916297	36924927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36916548_36918617_36918696_36918921_36919042_36919163_36919260_36920554_36920681_36920951_36921060_36921218_36921318_36921629_36921724_36922209_36922338_36922419_36922663_36923186_36923304_36923521_36923669_36924122
tx.8953	chr18	+	1260	6	FSM	ENSMUSG00000001383.10	ENSMUST00000001419.10	2310	6	51	999	51	584	multi-exon	FALSE	canonical	3	554	junction_5	81.4331627778266	2393	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTTAACCTCGTTTCTTC	6667	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36926979	36931720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_36927013_36927349_36927444_36928093_36928218_36929089_36929164_36929551_36929698_36930931
tx.8954	chr18	-	1750	2	FSM	ENSMUSG00000051316.9	ENSMUST00000066272.6	3302	2	21	1531	21	-1531	multi-exon	FALSE	canonical	3	1260	junction_1	0	1239	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGATGTTGTTCTATGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37777236	37775074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_37776586_37776997
tx.8955	chr18	+	2315	4	FSM	ENSMUSG00000102428.2	ENSMUST00000044851.8	5080	4	2765	0	2572	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	109	junction_1	53.597263611743	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGACCGCGTCTGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37901397	37974926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_37901594_37958073_37958133_37966317_37966407_37972955
tx.8956	chr18	+	2309	4	NNC	ENSMUSG00000102918.2	novel	4687	4	NA	NA	-22	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	99.533355659743	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGACCGCGTCTGTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37939440	37974926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_37939631_37958073_37958133_37966317_37966407_37972955
tx.8957	chr18	+	2178	3	FSM	ENSMUSG00000102543.6	ENSMUST00000192875.2	5777	3	5308	-1709	5308	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	212	junction_1	9.5	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTGACCGCGTCTGTTTAA	2325	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37958014	37974926	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_37958133_37966317_37966407_37972955
tx.8958	chr18	-	1988	2	ISM	ENSMUSG00000024456.17	ENSMUST00000115629.9	5416	26	54776	-4	1767	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCCCTCTAGCCTCCTTTG	2479	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37984693	37976653	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_37978552_37984603
tx.8959	chr18	-	1922	15	FSM	ENSMUSG00000024454.17	ENSMUST00000043498.9	2032	15	30	80	-12	-80	multi-exon	FALSE	canonical	3	500	junction_2	40.0044002681746	369	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTGCTAGTTACCGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38088039	38070104	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_38070737_38074005_38074164_38074431_38074512_38074760_38074820_38074930_38075021_38076508_38076574_38076730_38076805_38077181_38077263_38077944_38078079_38078392_38078449_38078563_38078621_38078746_38078829_38085523_38085667_38087734_38087818_38087911
tx.896	chr1	+	535	3	ISM	ENSMUSG00000026585.14	ENSMUST00000077642.12	4012	21	72	123006	72	-123006	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	150	junction_2	5	236	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGCAGAAGGAGTCTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163607223	163621672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_163607472_163610553_163610686_163621517
tx.8960	chr18	-	1296	3	NIC	ENSMUSG00000097080.9	novel	380	4	NA	NA	59	3	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAAGATAGGAACGATTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383559	38371454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_38372243_38372625_38372805_38383230
tx.8961	chr18	-	1258	2	FSM	ENSMUSG00000097080.9	ENSMUST00000181871.3	1229	2	0	-29	0	-12	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTGGGTTTCCTACATATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383251	38371469	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_38372243_38382766
tx.8962	chr18	-	895	4	FSM	ENSMUSG00000097080.9	ENSMUST00000235608.2	886	4	-26	17	-1	-2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1.4142135623731	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGGAGTTTTCATTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383252	38372127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_38372243_38372625_38372805_38373891_38374007_38382766
tx.8963	chr18	-	443	2	FSM	ENSMUSG00000097080.9	ENSMUST00000181757.8	1173	2	60	670	60	-2	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGGGAGTTTTCATTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383558	38372127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_38372243_38383230
tx.8964	chr18	+	1847	7	FSM	ENSMUSG00000024442.7	ENSMUST00000236078.2	1837	7	-16	6	0	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_6	32.9515637801236	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGAATGTTTTGAAGATAT	3967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383311	38388599	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_38383453_38384138_38384254_38384335_38384454_38385873_38386019_38386960_38387123_38387332_38387422_38387522
tx.8965	chr18	+	2395	13	FSM	ENSMUSG00000024442.7	ENSMUST00000025314.7	2394	13	-4	3	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_6	27.9179104200551	178	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCGGTCTTGCCCTTGAGT	3963	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383307	38395679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_38383453_38384138_38384254_38384335_38384454_38385873_38386019_38386960_38387123_38387332_38387422_38387522_38387620_38390310_38390454_38391080_38391240_38391322_38391416_38392949_38393110_38394116_38394339_38394932
tx.8966	chr18	+	1193	2	ISM	ENSMUSG00000024442.7	ENSMUST00000235762.2	780	3	-25	-306	-3	306	intron_retention	FALSE	canonical	3	386	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACCAAACAAACAAACATTAG	3960	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383304	38385183	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_38383453_38384138
tx.8967	chr18	+	357	3	FSM	ENSMUSG00000024442.7	ENSMUST00000235762.2	780	3	-18	441	0	-441	multi-exon	FALSE	canonical	3	386	junction_1	3.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGGACGCCATCTCATGGGTA	3967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38383311	38384436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_38383453_38384138_38384254_38384335
tx.8968	chr18	+	2840	8	FSM	ENSMUSG00000060450.15	ENSMUST00000236649.2	2822	8	-16	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	128	junction_3	44.1310663864829	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAAGTAGACACGGTGTCC	969	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38429730	38450897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_38429852_38432806_38432980_38433481_38433644_38440917_38441449_38442537_38442767_38446264_38446438_38447725_38447857_38449577
tx.8969	chr18	+	2510	6	NIC	ENSMUSG00000060450.15	novel	2886	8	NA	NA	3	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	28	junction_1	90.4486594704421	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAAGTAGACACGGTGTCC	964	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38429725	38450897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_38429852_38440917_38441449_38442537_38442767_38446264_38446438_38447725_38447857_38449577
tx.897	chr1	+	3878	20	FSM	ENSMUSG00000026585.14	ENSMUST00000027877.7	3946	20	63	5	63	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	150	junction_2	20.2454468052323	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTGTCCAACTCTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163607214	163744673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_163607472_163610553_163610686_163621517_163621673_163623553_163623610_163624820_163624963_163641937_163642038_163643393_163643519_163645401_163645501_163653256_163653436_163656701_163656865_163676229_163676331_163683604_163683714_163685040_163685154_163689523_163689690_163690279_163690406_163693007_163693107_163696269_163696356_163710951_163711142_163715774_163715875_163743293
tx.8970	chr18	+	2992	9	FSM	ENSMUSG00000060450.15	ENSMUST00000072376.13	3040	9	43	5	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	120	junction_3	53.7248487666555	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGAAGTAGACACGGTGTCC	969	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38429730	38450897	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_38429852_38432806_38432980_38433481_38433644_38434708_38434861_38440917_38441449_38442537_38442767_38446264_38446438_38447725_38447857_38449577
tx.8971	chr18	+	657	4	NNC	ENSMUSG00000060450.15	novel	743	5	NA	NA	-3	-381	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_3	97.7991138337494	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGTCTTTGTCTACTA	966	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38429727	38434370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_38429852_38432806_38432980_38433481_38433644_38434172
tx.8972	chr18	-	2278	7	FSM	ENSMUSG00000052102.16	ENSMUST00000063814.15	2289	7	30	-19	3	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	1055	junction_1	137.188434886716	1097	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAATTTTGGCATTCTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38472026	38460591	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_38462027_38463538_38463714_38465020_38465206_38466206_38466390_38468068_38468171_38471143_38471276_38471960
tx.8973	chr18	-	2206	6	ISM	ENSMUSG00000052102.16	ENSMUST00000063814.15	2289	7	781	-13	687	5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1055	junction_1	141.903347388284	165	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTGTGAATTTTGGCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38471275	38460597	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_38462027_38463538_38463714_38465020_38465206_38466206_38466390_38468068_38468171_38471143
tx.8974	chr18	-	659	2	ISM	ENSMUSG00000052102.16	ENSMUST00000235590.2	2085	6	3	10080	3	-796	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1104	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGTCTGAATGTTAGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38472026	38470682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_38471276_38471960
tx.8975	chr18	+	1169	2	Intergenic	novelGene_726	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGGCAGGCATTAGAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38508565	38510163	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_38508756_38509184
tx.8976	chr18	-	835	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117986.2	novel	379	1	NA	NA	-5598	39	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAACCCAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38551935	38545919	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_-_38546624_38551804
tx.8977	chr18	+	1704	8	FSM	ENSMUSG00000024425.5	ENSMUST00000236085.2	1796	8	82	10	5	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	612	junction_4	51.8734724387826	658	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTACTGTAGATTAGTGTT	9149	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38552041	38598240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_38552230_38575969_38576058_38580743_38580875_38584607_38584696_38585357_38585483_38589107_38589175_38593597_38593704_38597329
tx.8978	chr18	+	1283	5	ISM	ENSMUSG00000024425.5	ENSMUST00000236085.2	1796	8	32660	12	257	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	612	junction_1	37.6497011940334	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTTACTGTAGATTAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38584619	38598238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_38584696_38585357_38585483_38589107_38589175_38593597_38593704_38597329
tx.8979	chr18	+	864	5	NNC	ENSMUSG00000036452.19	novel	607	5	NA	NA	-5238	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	11.5758369027902	22	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGGACTTTGAGCGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39419249	39440426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_39419308_39419579_39419740_39429837_39429977_39439754_39439906_39440070
tx.898	chr1	+	1670	3	ISM	ENSMUSG00000026585.14	ENSMUST00000027877.7	3946	20	103800	5	103800	-5	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	171	junction_2	12	281	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCACTGTCCAACTCTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163710951	163744673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_163711142_163715774_163715875_163743293
tx.8980	chr18	+	1057	4	NIC	ENSMUSG00000036452.19	novel	2515	12	NA	NA	-5159	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	20	junction_3	5.8878405775519	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGGGACTTTGAGCGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39419328	39440426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_39419740_39429837_39429977_39439754_39439906_39440070
tx.8981	chr18	+	913	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024431.16_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGATCACTTTTTAAAAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39623920	39625331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_39624092_39624589
tx.8982	chr18	-	1230	3	ISM	ENSMUSG00000024487.6	ENSMUST00000025364.6	3328	6	8606	1533	8515	-1533	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	266	junction_2	7	118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGCTGTGAAGTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40343876	40338481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_40339454_40340739_40340922_40343800
tx.8983	chr18	-	1724	6	FSM	ENSMUSG00000024487.6	ENSMUST00000025364.6	3328	6	71	1533	-15	-1533	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_2	22.8962879087419	495	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCTGCTGTGAAGTTTACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40352411	40338481	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_40339454_40340739_40340922_40343800_40343947_40345095_40345269_40351798_40351919_40352280
tx.8984	chr18	-	397	3	ISM	ENSMUSG00000056671.8	ENSMUST00000235606.2	868	7	38803	0	38755	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	300	junction_2	18	508	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATGCTTTCTCCAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42045504	42008664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_42008919_42014277_42014351_42045434
tx.8985	chr18	-	843	7	FSM	ENSMUSG00000056671.8	ENSMUST00000235606.2	868	7	25	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	300	junction_2	31.5722275988812	3086	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTATGCTTTCTCCAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42084282	42008664	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_42008919_42014277_42014351_42045434_42045541_42065665_42065827_42068232_42068307_42070698_42070757_42084165
tx.8986	chr18	-	3858	32	NNC	ENSMUSG00000024493.10	novel	3980	32	NA	NA	-1	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_20	403.630442136044	134	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTTGGGCCATGTTATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42395184	42335413	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_42335784_42343084_42343218_42344227_42344324_42345572_42345678_42347824_42347936_42349916_42350028_42350532_42350674_42351568_42351710_42352922_42353014_42354543_42354728_42358818_42358883_42360300_42360359_42361070_42361284_42361722_42361862_42362693_42362777_42362855_42362922_42363006_42363093_42366864_42366943_42367645_42367787_42368549_42368604_42369643_42369725_42369803_42369892_42374967_42375194_42375768_42375837_42376031_42376096_42376841_42376955_42377813_42377976_42379004_42379143_42383893_42383975_42384357_42384446_42390134_42390260_42395025
tx.8987	chr18	+	504	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000096699.2	novel	438	1	NA	NA	-12	2772	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TAGAGGTAATTTAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42385450	42388672	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_+_42385935_42388652
tx.8988	chr18	-	1033	2	FSM	ENSMUSG00000024493.10	ENSMUST00000237520.2	452	2	-23	-558	4	558	multi-exon	FALSE	canonical	3	1504	junction_1	0	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CAAAACCACCACTCACAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42395179	42389380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_42390260_42395025
tx.8989	chr18	-	415	2	FSM	ENSMUSG00000117662.2	ENSMUST00000236263.2	414	2	-1	0	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGGTAACTGAGTTTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42408263	42407446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_42407614_42408015
tx.899	chr1	+	1136	6	ISM	ENSMUSG00000026584.15	ENSMUST00000170359.8	4288	14	265	14798	250	-4532	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_2	14.0939703419583	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTAAAGTTTCTTTATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163757623	163767881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_163757756_163761047_163761263_163762200_163762387_163763986_163764101_163766308_163766366_163767449
tx.8990	chr18	+	449	3	ISM	ENSMUSG00000024491.17	ENSMUST00000236240.2	6301	21	5	49335	5	-7136	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	108	junction_1	4	958	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTAAAGAAGAGGTAATATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42408441	42425161	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_42408658_42421172_42421292_42425047
tx.8991	chr18	+	643	3	ISM	ENSMUSG00000024491.17	ENSMUST00000237798.2	5565	16	34191	2690	34191	-2594	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	127	junction_2	3.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTAACTCTTAGCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42466376	42471902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_42466463_42470027_42470139_42471456
tx.8992	chr18	+	2162	9	ISM	ENSMUSG00000024498.17	ENSMUST00000025375.15	4101	21	41906	-51	25	51	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	625	junction_6	61.7368407031004	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACCTGTTTTTTATTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42686471	42708670	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_42686563_42693998_42694118_42697147_42697299_42700935_42701101_42701492_42701676_42704079_42704260_42704888_42704973_42706324_42706426_42707582
tx.8993	chr18	+	2031	8	ISM	ENSMUSG00000024498.17	ENSMUST00000025375.15	4101	21	49470	-48	7589	48	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	625	junction_5	65.9863931552002	46	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAGACCTGTTTTTTATTTT	NA	False	NA	-32	True	NA	NA	NA	42694035	42708667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_42694118_42697147_42697299_42700935_42701101_42701492_42701676_42704079_42704260_42704888_42704973_42706324_42706426_42707582
tx.8994	chr18	-	1906	14	FSM	ENSMUSG00000024501.21	ENSMUST00000025379.14	2106	14	196	4	196	-4	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_3	2.11223541811477	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAATTGAAGCCAAAATGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43526246	43457356	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_43457486_43458789_43458953_43461389_43461570_43462755_43462927_43465936_43466079_43466945_43467103_43475306_43475428_43478170_43478240_43486945_43487027_43487807_43487870_43491298_43491464_43494026_43494212_43496567_43496657_43526054
tx.8995	chr18	-	1408	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000043424.11	novel	2379	1	NA	NA	30	-611	multi-exon	FALSE	canonical	2	14	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTAAATTTTGTGTTATATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43610831	43609093	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_-_43610174_43610503
tx.8996	chr18	+	572	3	Intergenic	novelGene_728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	11	junction_1	3.5	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCCCTGATTGTTCTAGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44499339	44509095	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_44499514_44501242_44501420_44508874
tx.8997	chr18	+	381	2	FSM	ENSMUSG00000024472.10	ENSMUST00000202306.2	398	2	20	-3	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_1	0	1199	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCCTTTTTGTTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44513588	44529155	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_44513754_44528939
tx.8998	chr18	+	1606	11	NNC	ENSMUSG00000024472.10	novel	8616	11	NA	NA	0	-7016	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	39.6892932665725	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTAGTTGCCTGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44513593	44551020	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_44513754_44528939_44529092_44532684_44532819_44533383_44533483_44538276_44538430_44538523_44538637_44538719_44538828_44543249_44543386_44545582_44545694_44548443_44548496_44550632
tx.8999	chr18	-	387	2	Intergenic	novelGene_730	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCATGGTGTGTCCTTATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45692400	45691124	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_45691359_45692247
tx.9	chr1	+	2584	10	NNC	ENSMUSG00000033813.16	novel	2547	10	NA	NA	-33	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	717.755606812731	150	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTTTTTGTCTTTTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4928003	4968132	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_4928200_4937692_4937756_4948249_4948356_4956966_4957055_4959682_4959826_4960962_4961020_4962134_4962293_4963639_4963787_4965156_4965229_4966578
tx.90	chr1	+	1016	5	ISM	ENSMUSG00000025934.16	ENSMUST00000121676.8	894	8	16538	-192	3624	192	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	69	junction_1	2	90	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTGGAGTATTCGAACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21327368	21335437	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_21327607_21329071_21329205_21330271_21330414_21333016_21333149_21335066
tx.900	chr1	+	4065	14	FSM	ENSMUSG00000026584.15	ENSMUST00000027876.11	4368	14	290	13	250	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_8	12.9505203112215	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGGTTACAATTATTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163757623	163782682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_163757756_163761047_163761263_163762200_163762387_163763986_163764101_163766308_163766366_163767449_163767553_163768675_163768788_163771392_163771471_163772364_163772505_163773732_163773918_163776710_163776883_163778136_163778296_163779505_163780186_163780950
tx.9000	chr18	-	447	2	Intergenic	novelGene_731	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	122	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCATGGTGTGTCCTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45692400	45691126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_45691359_45692185
tx.9001	chr18	-	2720	9	FSM	ENSMUSG00000024477.5	ENSMUST00000236216.2	7477	9	160	4597	-3	657	multi-exon	FALSE	canonical	3	105	junction_2	12.5642100826116	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCGTTGTCGTCTTGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46413900	46373014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_46374769_46379628_46379738_46381937_46382123_46387345_46387392_46391151_46391285_46392670_46392823_46395956_46396025_46407656_46407776_46413746
tx.9002	chr18	-	650	3	NNC	ENSMUSG00000024477.5	novel	1039	2	NA	NA	0	5205	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	5	junction_1	69	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAAGTCCTGCTGAATCCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46413897	46401352	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_46401733_46407656_46407776_46413746
tx.9003	chr18	-	1939	5	ISM	ENSMUSG00000071855.6	ENSMUST00000072835.7	2801	10	20995	8	-83	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_3	12.794041581924	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCCCGTTGGTTGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46424000	46415225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_46416354_46416743_46416863_46418679_46418776_46420416_46420831_46423818
tx.9004	chr18	-	1645	4	ISM	ENSMUSG00000071855.6	ENSMUST00000072835.7	2801	10	24277	8	3199	-8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_3	14.6590889515307	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGCCCGTTGGTTGTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46420718	46415225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_46416354_46416743_46416863_46418679_46418776_46420416
tx.9005	chr18	-	3621	3	FSM	ENSMUSG00000033319.6	ENSMUST00000036226.6	5726	3	24	2081	24	-2081	multi-exon	FALSE	canonical	3	135	junction_1	21.5	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGATTTCTGTCCCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46659014	46636893	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_46639457_46657168_46657897_46658684
tx.9006	chr18	-	2190	2	ISM	ENSMUSG00000033319.6	ENSMUST00000036226.6	5726	3	1341	2983	1341	-2983	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	135	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGGCTCCCACTTCTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46657697	46637795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_46639457_46657168
tx.9007	chr18	-	1004	2	ISM	ENSMUSG00000033319.6	ENSMUST00000036226.6	5726	3	8	22426	8	-22426	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	178	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGGACACAAAGAAATCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46659030	46657238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_46657897_46658684
tx.9008	chr18	+	1891	3	FSM	ENSMUSG00000057561.11	ENSMUST00000078079.11	2865	3	10	964	4	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1498	junction_1	106	4308	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATATCATGAGAGGCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46730780	46742314	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_46730868_46731707_46731768_46740570
tx.9009	chr18	+	1803	2	FSM	ENSMUSG00000057561.11	ENSMUST00000235973.2	2651	2	916	-68	627	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	1710	junction_1	0	540	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATATCATGAGAGGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46731707	46742313	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_46731768_46740570
tx.901	chr1	-	1045	8	ISM	ENSMUSG00000041406.15	ENSMUST00000045876.8	3179	24	30255	252	-2518	-252	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	213	junction_6	36.6672850906413	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATCTTTATTTGACATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163792110	163781574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_163781909_163782905_163783026_163784396_163784478_163785061_163785167_163786856_163786971_163788145_163788242_163789532_163789656_163792038
tx.9010	chr18	-	1543	5	FSM	ENSMUSG00000033022.9	ENSMUST00000035804.9	1595	5	40	12	0	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_1	18.3166590840142	1571	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACACATTGCCTTTTTGAT	2617	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46861422	46846271	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_46847029_46848663_46848834_46853353_46853509_46856384_46856463_46861039
tx.9011	chr18	-	646	4	FSM	ENSMUSG00000032905.6	ENSMUST00000035648.6	4765	4	7	4112	7	1291	multi-exon	FALSE	canonical	3	312	junction_1	11.8977121983832	867	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTTAGAGTGTGCCATTACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46874639	46867322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_46867577_46868321_46868385_46870461_46870599_46874447
tx.9012	chr18	+	1248	6	FSM	ENSMUSG00000024480.10	ENSMUST00000025357.9	1520	6	65	207	-1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	541	junction_4	49.1064150595419	102	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACTGTCAGTGTTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46875007	46923686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_46875149_46887437_46887530_46891069_46891182_46912254_46912327_46913727_46913836_46922963
tx.9013	chr18	+	802	2	ISM	ENSMUSG00000024480.10	ENSMUST00000234998.2	1407	4	23075	4	23075	-4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	568	junction_1	0	112	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAACTGTCAGTGTTGACTT	6780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46913756	46923686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_46913836_46922963
tx.9014	chr18	+	2254	5	FSM	ENSMUSG00000073568.3	ENSMUST00000234910.2	2257	5	-3	6	-3	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	262	junction_1	19.1441897190766	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGTTTTCAGGGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47054878	47067293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_47054960_47059048_47059157_47059378_47059483_47061585_47061726_47065472
tx.9015	chr18	+	484	4	ISM	ENSMUSG00000073568.3	ENSMUST00000234910.2	2257	5	-3	5523	-3	-5513	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	262	junction_1	9.41629792788369	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCACGCATTCTCCTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47054878	47061776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_47054960_47059048_47059157_47059378_47059483_47061585
tx.9016	chr18	+	2173	4	FSM	ENSMUSG00000073568.3	ENSMUST00000097580.2	2169	4	0	-4	0	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	279	junction_2	15.9234278833282	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTGGGTTTTCAGGGTTTCT	2986	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47059048	47067293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_47059157_47059378_47059483_47061585_47061726_47065472
tx.9017	chr18	+	822	6	FSM	ENSMUSG00000042705.10	ENSMUST00000234961.2	792	6	-3	-27	0	27	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_5	518.443593846042	213	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGGACTTTTAATTCTAAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47091924	47168901	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_47091996_47093482_47093574_47096726_47096838_47100806_47100963_47123545_47123657_47168619
tx.9018	chr18	+	1568	7	FSM	ENSMUSG00000042705.10	ENSMUST00000049388.9	1610	7	42	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1216	junction_3	103.11913282973	2251	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCAAGCGTACAATGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47091924	47221062	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_47091996_47093482_47093574_47096726_47096838_47100806_47100963_47123545_47123657_47219318_47219379_47220094
tx.9019	chr18	+	574	2	Intergenic	novelGene_732	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTGCTTTGTGTAATGGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47849666	47855945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_47849693_47855397
tx.902	chr1	-	2922	24	FSM	ENSMUSG00000041406.15	ENSMUST00000045876.8	3179	24	5	252	5	-252	multi-exon	TRUE	canonical	2	170	junction_8	40.7878461455702	92	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATCTTTATTTGACATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163822360	163781574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_163781909_163782905_163783026_163784396_163784478_163785061_163785167_163786856_163786971_163788145_163788242_163789532_163789656_163792038_163792225_163792303_163792394_163793976_163794029_163794642_163794726_163795722_163795910_163799415_163799531_163799775_163799922_163804312_163804378_163805648_163805730_163810233_163810373_163811892_163811978_163813573_163813737_163814455_163814597_163815174_163815280_163817273_163817363_163818288_163818329_163822178
tx.9020	chr18	+	641	3	NNC	ENSMUSG00000118139.2	novel	700	3	NA	NA	-1090	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.5	10	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTAAGTGTCTCCTCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47865084	47878005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_47865190_47866864_47867032_47877636
tx.9021	chr18	+	1696	2	NNC	ENSMUSG00000059040.6	novel	1791	2	NA	NA	-1	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	37	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAGAAAAAGAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	48179712	48181467	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_48180005_48180063
tx.9022	chr18	+	349	3	ISM	ENSMUSG00000037416.14	ENSMUST00000180611.8	11319	43	352	120401	25	-88061	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	64	junction_1	7	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGTCAGTATTTTATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	49966088	49976920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_49966244_49973453_49973580_49976852
tx.9023	chr18	+	1741	2	FSM	ENSMUSG00000062210.14	ENSMUST00000148989.3	1002	2	39	-778	-25	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_1	0	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGACTCGGGATTTAGATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50112532	50224846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_50112694_50223266
tx.9024	chr18	+	1665	2	NNC	ENSMUSG00000062210.14	novel	1002	2	NA	NA	29795	-3	intron_retention	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGACTCGGGATTTAGATTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50216143	50224846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_50216229_50223266
tx.9025	chr18	+	2648	24	FSM	ENSMUSG00000024507.7	ENSMUST00000025385.7	2684	24	29	7	29	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	285	junction_3	18.279183363144	218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTCTCCCTTCCTGCTCCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	50261296	50329329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_50261477_50263192_50263247_50272514_50272623_50273406_50273467_50275536_50275559_50275659_50275707_50277807_50277893_50279456_50279645_50288193_50288286_50291451_50291477_50293201_50293331_50295168_50295270_50297681_50297919_50299950_50300003_50303786_50303859_50305094_50305199_50306730_50306797_50310238_50310309_50310973_50311081_50312113_50312201_50314998_50315086_50316225_50316365_50324778_50324907_50328921
tx.9026	chr18	+	1496	8	FSM	ENSMUSG00000024528.9	ENSMUST00000025406.9	2656	8	-5	1165	-5	-1165	multi-exon	FALSE	canonical	3	351	junction_5	82.8179710360657	805	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATGTGAATTTAGGGAATATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52598759	52623838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_52598858_52608667_52608757_52609371_52609445_52616704_52616777_52620583_52620666_52621322_52622044_52623089_52623128_52623515
tx.9027	chr18	+	1000	3	ISM	ENSMUSG00000024528.9	ENSMUST00000025406.9	2656	8	22751	1054	994	-1054	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	531	junction_1	29	201	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTTAGGTTTTCTCATTCAT	5487	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52621515	52623949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_52622044_52623089_52623128_52623515
tx.9028	chr18	-	462	2	Intergenic	novelGene_733	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCATGTCTATTCTCTATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53166726	53165737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_53166099_53166625
tx.9029	chr18	+	2019	15	NNC	ENSMUSG00000034484.9	novel	2067	15	NA	NA	-21	-30	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	254.699312515598	1118	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATTAGTAATAAATTATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53309409	53353907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_53309560_53322726_53322845_53327501_53327666_53330926_53330994_53331257_53331302_53332828_53332971_53336112_53336192_53342659_53342736_53343401_53343516_53343770_53343865_53345824_53346031_53349452_53349597_53351173_53351259_53351360_53351433_53353443
tx.903	chr1	+	1426	2	FSM	ENSMUSG00000041396.14	ENSMUST00000111490.2	1419	2	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	291	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGACTGTTCAATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163822450	163824812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_163822547_163823482
tx.9030	chr18	+	630	3	NNC	ENSMUSG00000034484.9	novel	2067	15	NA	NA	8724	-23	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	445	397	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AATAAATTATTTGAGTATAT	1645	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53351171	53353914	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_53351259_53351360_53351433_53353443
tx.9031	chr18	+	1913	7	FSM	ENSMUSG00000024535.17	ENSMUST00000165032.9	1977	7	66	-2	0	2	multi-exon	TRUE	canonical	3	19	junction_3	2.70801280154532	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATTTGAGTTTGTCTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53378799	53523994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_53378925_53460483_53460568_53473201_53473307_53516141_53516237_53517688_53517722_53518249_53518315_53522588
tx.9032	chr18	-	1321	5	FSM	ENSMUSG00000024538.9	ENSMUST00000025419.9	1403	5	82	0	82	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_3	12.8354976529934	2577	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTTTTTTTGCAAGACTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53551105	53539403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_53540138_53542196_53542382_53544058_53544153_53544577_53544692_53550911
tx.9033	chr18	-	3272	13	ISM	ENSMUSG00000048799.9	ENSMUST00000049811.8	4554	21	21409	0	21402	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	219	junction_10	25.5183757320093	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTGTGGTCGGTCTCTTT	5780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53856210	53814794	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_53816537_53818954_53819101_53830666_53830766_53836193_53836317_53839891_53840054_53842128_53842222_53846453_53846544_53847835_53847989_53848071_53848169_53851518_53851702_53852287_53852438_53854694_53854873_53856154
tx.9034	chr18	-	4579	21	NNC	ENSMUSG00000048799.9	novel	4554	21	NA	NA	-7	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	60.8760215520036	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGTTGTGTGGTCGGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53877642	53814796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_53816537_53818954_53819101_53830666_53830766_53836193_53836317_53839891_53840054_53842128_53842222_53846453_53846544_53847835_53847989_53848071_53848169_53851518_53851702_53852287_53852438_53854694_53854873_53856154_53856378_53857421_53857654_53860618_53860817_53864162_53864312_53868714_53868857_53871549_53871665_53873123_53873281_53877353_53877420_53877559
tx.9035	chr18	-	1321	8	ISM	ENSMUSG00000048799.9	ENSMUST00000237145.2	3801	15	-29	15591	16	-15591	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_7	17.7096768197848	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGACTCTGCTTTGCAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53877664	53857264	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_53857654_53860618_53860817_53864162_53864312_53868714_53868857_53871549_53871665_53873123_53873281_53877353_53877420_53877559
tx.9036	chr18	-	405	4	ISM	ENSMUSG00000048799.9	ENSMUST00000237145.2	3801	15	10	29875	-6	5450	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	229	junction_3	22.464787260659	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGGTCCTTTTGGCTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53877625	53871548	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_53871665_53873123_53873281_53877353_53877420_53877559
tx.9037	chr18	-	1643	2	FSM	ENSMUSG00000048799.9	ENSMUST00000235928.2	474	2	-186	-983	-118	983	multi-exon	FALSE	canonical	3	229	junction_1	0	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATTGTAGTGATTTTCTGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53877798	53876015	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_53877420_53877559
tx.9038	chr18	-	341	2	ISM	ENSMUSG00000053644.14	ENSMUST00000174704.8	1789	18	33865	-6	-1504	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	479	junction_1	0	73	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATAGGTTTGGTGAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56661425	56659815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_56660080_56661348
tx.9039	chr18	-	1885	18	FSM	ENSMUSG00000053644.14	ENSMUST00000066208.13	1914	18	29	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	343	junction_7	37.2351547251364	1219	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATAGGTTTGGTGAGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56695352	56659815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_56660080_56661348_56661425_56664561_56664636_56664782_56664881_56665052_56665170_56665559_56665667_56667261_56667347_56670275_56670371_56671772_56671815_56675296_56675395_56678036_56678115_56679975_56680021_56681518_56681652_56683367_56683492_56684231_56684313_56692293_56692360_56693847_56693902_56695104
tx.904	chr1	+	1516	2	FSM	ENSMUSG00000041396.14	ENSMUST00000045694.14	1513	2	-3	0	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_1	0	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGTGACTGTTCAATTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163822454	163824812	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_163822641_163823482
tx.9040	chr18	-	2072	20	FSM	ENSMUSG00000053644.14	ENSMUST00000174518.8	4131	20	37	2022	37	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_19	109.003545140448	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATAGGTTTGGTGAGTTTTT	2891	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56705986	56659815	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_56660080_56661348_56661425_56664561_56664636_56664782_56664881_56665052_56665170_56665559_56665667_56667261_56667347_56670275_56670371_56671772_56671815_56675296_56675395_56678036_56678115_56679975_56680021_56681518_56681652_56683367_56683492_56684231_56684313_56692293_56692360_56693847_56693902_56695104_56695277_56695554_56695748_56705916
tx.9041	chr18	+	1366	2	ISM	ENSMUSG00000008301.12	ENSMUST00000008445.7	1942	5	189	11010	189	-3598	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	376	junction_1	0	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	GAAAAAAAAAAGACAGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56706082	56709774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_56706208_56708533
tx.9042	chr18	+	1547	5	FSM	ENSMUSG00000008301.12	ENSMUST00000008445.7	1942	5	191	204	191	-204	multi-exon	FALSE	canonical	3	376	junction_1	34.4818792991333	3187	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTCAGCTGTTACATTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56706084	56720580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_56706208_56708533_56709121_56713251_56713373_56717362_56717447_56719948
tx.9043	chr18	+	1198	4	ISM	ENSMUSG00000008301.12	ENSMUST00000008445.7	1942	5	2866	204	2866	-204	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	396	junction_3	27.6325090347503	1003	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTCAGCTGTTACATTCA	795	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56708759	56720580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_56709121_56713251_56713373_56717362_56717447_56719948
tx.9044	chr18	-	875	2	Intergenic	novelGene_735	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACGAGTTTTCCATTAGTACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56796528	56795131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_56795900_56796421
tx.9045	chr18	+	1843	8	ISM	ENSMUSG00000024590.9	ENSMUST00000025486.9	2843	11	23212	0	2584	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1199	junction_3	106.106992594979	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACTGTTCTTTTTAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56864096	56886496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_56864213_56866283_56866410_56872892_56873114_56873758_56873985_56876282_56876388_56881048_56881169_56882770_56882882_56885678
tx.9046	chr18	+	1049	3	ISM	ENSMUSG00000024590.9	ENSMUST00000025486.9	2843	11	40164	0	19536	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1374	junction_1	63.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACTGTTCTTTTTAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56881048	56886496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_56881169_56882770_56882882_56885678
tx.9047	chr18	+	882	2	ISM	ENSMUSG00000024590.9	ENSMUST00000025486.9	2843	11	41933	0	21305	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1501	junction_1	0	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTACTGTTCTTTTTAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56882817	56886496	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_56882882_56885678
tx.9048	chr18	-	1866	5	NIC	ENSMUSG00000032656.15	novel	860	4	NA	NA	-8	700	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.4142135623731	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTTACTGATGCAATACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57058628	56908223	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_56909181_56916090_56916301_56940735_56940941_56944903_56945148_57058378
tx.9049	chr18	-	1144	5	NIC	ENSMUSG00000024592.16	novel	726	6	NA	NA	8	523	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	31	junction_4	31.2329953734828	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ATGTGTTTTTGTACTCTGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57108418	57090162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_57090994_57091594_57091652_57095472_57095591_57106455_57106557_57108381
tx.905	chr1	-	985	2	Intergenic	novelGene_74	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	3	junction_1	0	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAAGTATGCTGGTTTTGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	163848585	163839571	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_-_163840406_163848434
tx.9050	chr18	-	1122	4	ISM	ENSMUSG00000024592.16	ENSMUST00000025488.15	2400	5	1882	1245	1760	536	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_1	12.0277457017791	129	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTCTGATTTATATTTTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57106558	57090149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_57090994_57091594_57091652_57095472_57095591_57106455
tx.9051	chr18	-	1145	5	FSM	ENSMUSG00000024592.16	ENSMUST00000025488.15	2400	5	0	1255	0	526	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_4	15.0228991875736	145	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTTGTACTCTGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57108440	57090159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_57090994_57091594_57091652_57095472_57095591_57106455_57106557_57108405
tx.9052	chr18	-	1215	6	NNC	ENSMUSG00000024592.16	novel	2400	5	NA	NA	0	526	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_1	42.9958137497129	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTTTTGTACTCTGATTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57108440	57090159	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_57090994_57091189_57091260_57091594_57091652_57095472_57095591_57106455_57106557_57108405
tx.9053	chr18	+	911	5	FSM	ENSMUSG00000024594.10	ENSMUST00000238057.2	523	5	-12	-376	-12	376	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_1	350.033123432626	2368	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCTCTTTTTACTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57506951	57522683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_57507100_57507598_57507763_57514699_57514804_57517245_57517349_57522291
tx.9054	chr18	+	967	5	NIC	ENSMUSG00000024594.10	novel	523	5	NA	NA	-12	376	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	294	junction_1	276.069284781918	5514	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATCCTCTTTTTACTGTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57506951	57522683	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_57507156_57507598_57507763_57514699_57514804_57517245_57517349_57522291
tx.9055	chr18	+	1962	5	FSM	ENSMUSG00000024601.10	ENSMUST00000025503.10	3377	5	20	1395	6	789	multi-exon	FALSE	canonical	3	445	junction_3	47.2175814713121	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTTGTTTTCCATGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58792557	58812045	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_58792870_58804279_58804400_58804519_58804724_58806321_58806439_58810836
tx.9056	chr18	-	1550	2	FSM	ENSMUSG00000038059.8	ENSMUST00000042710.8	1990	2	440	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTGTTTTGTTTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60634619	60607262	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_60608658_60634464
tx.9057	chr18	-	1468	2	NNC	ENSMUSG00000038059.8	novel	1990	2	NA	NA	11795	-4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCAACTGTGTTTTGTTTGTT	7250	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60622853	60607266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_60608658_60622776
tx.9058	chr18	+	684	2	FSM	ENSMUSG00000024603.9	ENSMUST00000223590.2	1530	2	-13	859	0	-859	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTACTGTTGGGAATCAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60659272	60660191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_60659438_60659672
tx.9059	chr18	+	496	3	NNC	ENSMUSG00000024603.9	novel	1724	9	NA	NA	-4	-4904	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	98.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTAGCAGTAAATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60659268	60671136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_60659438_60667664_60667736_60670880
tx.906	chr1	+	2556	4	ISM	ENSMUSG00000026578.7	ENSMUST00000027867.7	1909	6	0	4167	0	-4167	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	28	junction_1	11.4406682011537	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATCAAGACTCTGTAGGGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164103153	164111249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_164103331_164105742_164105884_164107435_164108384_164109959
tx.9060	chr18	+	467	3	NNC	ENSMUSG00000024603.9	novel	1724	9	NA	NA	4	-4904	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_2	96.5	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTATTAGCAGTAAATGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60659276	60671136	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_60659438_60667664_60667736_60670901
tx.9061	chr18	+	2222	13	FSM	ENSMUSG00000024603.9	ENSMUST00000025505.7	3738	13	2	1514	2	-687	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_9	21.4333592534835	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCCATGCCCTGTTCTATAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60659274	60690324	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_60659438_60667664_60667736_60671335_60671515_60674643_60674688_60677110_60677219_60678819_60678894_60679292_60679406_60679838_60679949_60683257_60683332_60684959_60685015_60685916_60686025_60688178_60688277_60689299
tx.9062	chr18	+	2111	11	FSM	ENSMUSG00000024604.8	ENSMUST00000025506.7	2210	11	14	85	-14	-85	multi-exon	FALSE	canonical	3	519	junction_10	72.8288404411329	317	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTGCTGGACTTATGTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60693821	60705797	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_60693952_60694322_60694377_60696837_60696868_60697434_60697568_60698689_60698791_60699424_60699598_60700442_60700644_60702428_60702594_60703852_60703942_60704071_60704204_60704894
tx.9063	chr18	+	341	3	FSM	ENSMUSG00000024608.12	ENSMUST00000142980.2	662	3	-17	338	-16	60	multi-exon	FALSE	canonical	3	20921	junction_1	3556	2218	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GAGGAAACAGGTACAGAAGA	NA	False	NA	-33	True	NA	NA	NA	60907720	60910153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_60907759_60909472_60909624_60910001
tx.9064	chr18	+	428	4	ISM	ENSMUSG00000024608.12	ENSMUST00000025511.11	597	5	53	657	-16	30	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20921	junction_1	3285.52556255802	1541	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTAAGTGTCCCCTCTGGTTA	NA	False	NA	-33	True	NA	NA	NA	60907720	60910961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_60907759_60909472_60909624_60910001_60910164_60910884
tx.9065	chr18	+	544	5	FSM	ENSMUSG00000024608.12	ENSMUST00000025511.11	597	5	53	0	-16	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	20921	junction_1	2863.01274883644	394316	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTTCTGGTGTTGTGT	NA	False	NA	-33	True	NA	NA	NA	60907720	60911618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_60907759_60909472_60909624_60910001_60910164_60910884_60910962_60911502
tx.9066	chr18	+	508	4	FSM	ENSMUSG00000024608.12	ENSMUST00000122279.2	667	4	160	-1	160	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	24831	junction_3	1445.1337500576	62915	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTGGTTCTGGTGTTGTGT	NA	False	NA	-10	True	NA	NA	NA	60909470	60911618	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_60909624_60910001_60910164_60910884_60910962_60911502
tx.9067	chr18	+	1376	8	FSM	ENSMUSG00000024610.16	ENSMUST00000050487.16	1224	8	-154	2	-154	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_2	5.45108115095397	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTCTTGCTTCTGCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60936765	60945722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_60937083_60940979_60941150_60941303_60941384_60942099_60942163_60943053_60943147_60943399_60943491_60944930_60944994_60945223
tx.9068	chr18	+	1102	7	ISM	ENSMUSG00000024610.16	ENSMUST00000050487.16	1224	8	4017	2	3960	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	17	junction_1	5.7373048260195	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CACTCTTGCTTCTGCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60940936	60945722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_60941150_60941303_60941384_60942099_60942163_60943053_60943147_60943399_60943491_60944930_60944994_60945223
tx.9069	chr18	-	468	2	ISM	ENSMUSG00000024613.17	ENSMUST00000175934.8	4595	26	34373	0	14471	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1601	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTGCCTTCCCCATGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60947628	60946826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_60947261_60947594
tx.907	chr1	+	1906	6	FSM	ENSMUSG00000026578.7	ENSMUST00000027867.7	1909	6	3	0	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	28	junction_1	8.97552226892675	76	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTGGTGTCATCTTGTAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164103156	164115416	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_164103331_164105742_164105884_164107435_164108384_164109959_164110107_164113809_164113965_164115075
tx.9070	chr18	-	784	4	ISM	ENSMUSG00000024613.17	ENSMUST00000175934.8	4595	26	32720	0	12818	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1176	junction_3	174.501830617587	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTGCCTTCCCCATGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60949281	60946826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_60947261_60947594_60947641_60948029_60948125_60949072
tx.9072	chr18	-	1227	2	ISM	ENSMUSG00000024619.9	ENSMUST00000025521.9	1750	3	15679	0	15679	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	995	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCGCTGCCATCCTTTCTCGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61153592	61151933	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_61153014_61153445
tx.9073	chr18	+	1105	4	NNC	ENSMUSG00000024620.12	novel	5407	23	NA	NA	20482	-15673	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	5	junction_3	5.31245915016974	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCCTGCTCAAATCTAAGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61198753	61202455	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_61198980_61199569_61199686_61201167_61201292_61201816
tx.9074	chr18	-	3512	4	FSM	ENSMUSG00000034320.15	ENSMUST00000146409.8	7814	4	11	4291	11	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	28	junction_2	1.4142135623731	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAAGAATGAACGACAGTTCC	8726	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61344673	61330281	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_61332731_61334752_61335476_61337381_61337518_61344469
tx.9075	chr18	-	795	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000091957.4	novel	965	1	NA	NA	-15	-11	multi-exon	FALSE	canonical	1	147	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAGAATCTTGGACC	7408	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61393058	61392089	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_-_61392484_61392657
tx.9076	chr18	+	2329	10	FSM	ENSMUSG00000024576.15	ENSMUST00000165123.8	4083	10	-1	1755	-1	2	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_9	613.012254927549	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGTGAAATTTTTTTAAA	427	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61688343	61721377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_61688945_61689573_61689681_61701334_61701462_61702534_61702634_61708480_61708621_61709577_61709657_61710248_61710324_61711737_61711845_61713409_61713523_61720496
tx.9077	chr18	+	2365	10	FSM	ENSMUSG00000024576.15	ENSMUST00000165721.8	2323	10	-40	-2	-1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	816	junction_9	364.192494210831	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGTGAAATTTTTTTAAA	427	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61688343	61721377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_61688945_61689573_61689681_61701334_61701462_61702534_61702634_61708480_61708621_61709577_61709657_61710248_61710324_61711737_61711845_61713409_61713559_61720496
tx.9078	chr18	+	1622	8	ISM	ENSMUSG00000024576.15	ENSMUST00000165123.8	4083	10	12989	1755	-7254	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_7	688.538825547052	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGTGAAATTTTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61701333	61721377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_61701462_61702534_61702634_61708480_61708621_61709577_61709657_61710248_61710324_61711737_61711845_61713409_61713523_61720496
tx.9079	chr18	+	1658	8	ISM	ENSMUSG00000024576.15	ENSMUST00000165721.8	2323	10	12950	-2	-7254	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	816	junction_7	410.611689049001	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAAGTGAAATTTTTTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61701333	61721377	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_61701462_61702534_61702634_61708480_61708621_61709577_61709657_61710248_61710324_61711737_61711845_61713409_61713559_61720496
tx.908	chr1	-	2088	5	ISM	ENSMUSG00000026577.14	ENSMUST00000120447.8	2430	7	4908	-218	4691	218	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	158	junction_1	18.2619823677497	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTAGTGCCCTTTCCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164130150	164118739	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_164119981_164123278_164123499_164125807_164125937_164127113_164127314_164129852
tx.9080	chr18	-	977	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000098098.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCTGACTCTTTTGTTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61774063	61761094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_61761723_61769960_61770080_61773833
tx.9081	chr18	+	633	3	FSM	ENSMUSG00000098098.8	ENSMUST00000183087.2	588	3	-44	-1	-44	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_1	11.5	162	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CGAATGACTTTCTTAATAGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61772679	61780544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_61772840_61778233_61778437_61780274
tx.9082	chr18	+	470	2	ISM	ENSMUSG00000098098.8	ENSMUST00000183087.2	588	3	5509	3	5509	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTACGAATGACTTTCTTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61778232	61780540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_61778437_61780274
tx.9083	chr18	+	713	3	FSM	ENSMUSG00000024578.4	ENSMUST00000025471.4	693	3	-20	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1.5	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCATTGATTGGGCTTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61820985	61825609	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_61821076_61823188_61823479_61825276
tx.9084	chr18	-	1665	4	ISM	ENSMUSG00000024579.8	ENSMUST00000025472.7	2017	6	5269	-1	5247	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_2	4.98887651569859	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTGACTTATTCTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61835437	61829906	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_61831048_61831434_61831576_61832363_61832576_61835266
tx.9085	chr18	-	1450	4	FSM	ENSMUSG00000024580.9	ENSMUST00000062991.9	4038	4	-2	2590	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_1	10.9645894689324	405	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAATATTTTTTACAGTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61859396	61848084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_61849199_61851824_61851907_61852772_61852927_61859296
tx.9086	chr18	+	918	2	FSM	ENSMUSG00000098702.2	ENSMUST00000184678.2	890	2	-26	-2	17	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCGATCTCTCAGTTTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61859477	61868990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_61860074_61868668
tx.9087	chr18	-	1564	3	ISM	ENSMUSG00000033032.16	ENSMUST00000154876.8	2842	16	50659	0	50659	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTCAGAGGGTAGCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61869023	61863331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_61864382_61866774_61866904_61868638
tx.9088	chr18	-	1705	5	NNC	ENSMUSG00000033032.16	novel	2842	16	NA	NA	49247	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	21	junction_1	5.2618912949623	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTCAGAGGGTAGCTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61870435	61863331	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_61864382_61866774_61866904_61868638_61868818_61869853_61870019_61870253
tx.9089	chr18	+	792	4	ISM	ENSMUSG00000045629.9	ENSMUST00000051720.6	4536	17	-186	44488	-186	-44488	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	19	junction_3	3.09120616516523	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATGTCATCTGAAGACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62085959	62104298	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_62086239_62094014_62094114_62101059_62101188_62104012
tx.909	chr1	-	2435	7	FSM	ENSMUSG00000026577.14	ENSMUST00000120447.8	2430	7	205	-210	-12	210	multi-exon	FALSE	canonical	3	158	junction_1	15.0738920727933	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTTGTGGTTAGTGCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164134853	164118747	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_164119981_164123278_164123499_164125807_164125937_164127113_164127314_164129852_164130290_164134007_164134086_164134715
tx.9090	chr18	-	1676	8	ISM	ENSMUSG00000042211.8	ENSMUST00000048688.8	4254	22	33780	-94	5814	94	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	255	junction_7	26.2826085121717	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTTGCCATGGACTTGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62647986	62637131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_62637952_62638545_62638660_62639008_62639113_62639674_62639821_62640904_62641072_62643780_62643884_62644084_62644186_62647865
tx.9091	chr18	-	801	2	FSM	ENSMUSG00000041789.8	ENSMUST00000048109.7	809	2	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTTGCACTAGAAGCTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	62889410	62887860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_62888246_62888994
tx.9092	chr18	+	1436	10	NNC	ENSMUSG00000024581.14	novel	3567	12	NA	NA	2	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	75.6758845747629	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTCTTTCGATGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63110933	63130436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_63111096_63113536_63113605_63115689_63115775_63119214_63119360_63119481_63119549_63120024_63120096_63124871_63124951_63127382_63127463_63128033_63128164_63129887
tx.9093	chr18	+	1441	10	NNC	ENSMUSG00000024581.14	novel	3567	12	NA	NA	6	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	75.6758845747629	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGTTCTTTCGATGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63110937	63130436	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_63111096_63113536_63113605_63115689_63115819_63119249_63119360_63119481_63119549_63120024_63120096_63124871_63124951_63127382_63127463_63128033_63128164_63129887
tx.9095	chr18	-	1290	8	FSM	ENSMUSG00000024583.4	ENSMUST00000237004.2	4343	8	41	3012	41	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	853	junction_1	53.8088074120031	1611	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTTAAGTCTTCGTCATTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	63825467	63797176	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_63797404_63804652_63804758_63807119_63807293_63808514_63808585_63809949_63810073_63812423_63812598_63815281_63815379_63825146
tx.9097	chr18	-	402	2	Intergenic	novelGene_736	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTGGTACGTATAATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64232065	64229973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_64230285_64231974
tx.9098	chr18	+	1074	2	FSM	ENSMUSG00000045991.20	ENSMUST00000175965.10	16234	2	926	14234	926	-14234	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAATCACAAAGACATCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64474016	64519824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_64474682_64519415
tx.9099	chr18	-	2786	10	FSM	ENSMUSG00000024588.11	ENSMUST00000025484.9	2059	10	-2	-725	-2	721	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_9	95.9785212597583	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTTGAGTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64622136	64589610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_64591289_64591725_64591786_64594591_64594757_64595177_64595286_64597156_64597256_64600798_64600906_64603752_64603888_64608127_64608277_64611721_64611842_64621971
tx.91	chr1	+	678	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000101227.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCAGTTTCCTTTGCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23151615	23159936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_23151685_23152363_23152571_23159534
tx.910	chr1	+	1736	14	FSM	ENSMUSG00000026575.16	ENSMUST00000193683.6	1740	14	4	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_2	20.0017750691572	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACTTTGGTTTTATTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164135244	164264869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_164135324_164135628_164135820_164140421_164140508_164155861_164155970_164160180_164160348_164168297_164168409_164170782_164170834_164172787_164172996_164175342_164175449_164206927_164206993_164208209_164208279_164213268_164213371_164230538_164230647_164264584
tx.9100	chr18	-	2298	12	ISM	ENSMUSG00000024587.11	ENSMUST00000025483.11	2687	15	4784	-3	53	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4499	junction_3	332.653916404382	330	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAACACTTTGCTGACTT	NA	False	NA	23	True	NA	NA	NA	64644895	64632725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_64633721_64634373_64634506_64634814_64634947_64636578_64636693_64637408_64637545_64637918_64638119_64638227_64638450_64640842_64640930_64642315_64642387_64643523_64643603_64644681_64644772_64644855
tx.9101	chr18	-	2597	15	FSM	ENSMUSG00000024587.11	ENSMUST00000025483.11	2687	15	93	-3	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2259	junction_14	785.439045946889	1078	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAACACTTTGCTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64649586	64632725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_64633721_64634373_64634506_64634814_64634947_64636578_64636693_64637408_64637545_64637918_64638119_64638227_64638450_64640842_64640930_64642315_64642387_64643523_64643603_64644681_64644772_64644855_64644949_64645054_64645121_64648396_64648477_64649486
tx.9102	chr18	-	2600	15	FSM	ENSMUSG00000024587.11	ENSMUST00000237400.2	2745	15	137	8	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3478	junction_14	514.735973533014	1545	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAAAACACTTTGCTGACTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	64649586	64632725	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_64633721_64634373_64634506_64634814_64634947_64636578_64636693_64637408_64637545_64637918_64638119_64638227_64638450_64640842_64640930_64642315_64642387_64643523_64643603_64644681_64644772_64644855_64644949_64645054_64645121_64648396_64648480_64649486
tx.9103	chr18	+	1039	6	ISM	ENSMUSG00000024589.19	ENSMUST00000237818.2	550	7	1662	-468	-2	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_1	23.3632189562997	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGAGCATATTTTTTTTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65338597	65346388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_65338765_65341119_65341180_65341462_65341571_65342723_65342821_65343333_65343407_65345854
tx.9104	chr18	+	795	6	FSM	ENSMUSG00000024516.14	ENSMUST00000025394.14	860	6	41	24	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	349	junction_3	14.5244621242922	566	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATGGCTTCCTTTTGTGGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	65933626	65950731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_65933783_65942515_65942626_65945735_65945886_65947908_65948029_65949891_65949950_65950530
tx.9105	chr18	-	3552	14	FSM	ENSMUSG00000041891.17	ENSMUST00000048260.15	3581	14	13	16	-5	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	538	junction_1	125.2370060817	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGGTTTTTTCCTCCATTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66135697	66113824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_66115782_66116895_66116959_66117223_66117346_66120825_66120977_66124402_66124474_66124564_66124759_66126145_66126279_66126649_66126709_66127855_66127980_66129752_66129853_66130670_66130733_66131445_66131554_66131636_66131792_66135444
tx.9106	chr18	-	452	3	ISM	ENSMUSG00000041891.17	ENSMUST00000120461.9	1741	14	14739	1122	5778	574	internal_fragment	FALSE	canonical	3	989	junction_2	47	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTTCATAGTACTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66120953	66116756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_66116959_66117223_66117346_66120825
tx.9107	chr18	-	1730	13	FSM	ENSMUSG00000041891.17	ENSMUST00000236866.2	4676	13	17	2929	-1	574	multi-exon	FALSE	canonical	3	864	junction_5	66.5663307452716	204	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTTCATAGTACTACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66135693	66116756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_66116959_66117223_66117346_66120825_66120977_66124402_66124474_66124564_66124759_66126145_66126279_66126649_66126709_66127855_66127980_66129752_66129853_66130670_66130733_66131445_66131554_66131636_66131792_66135444
tx.9108	chr18	-	906	8	ISM	ENSMUSG00000041891.17	ENSMUST00000120461.9	1741	14	-4	10598	-4	-24	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	865	junction_5	52.4878994801348	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGAGGAGTTTGAGCACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66135696	66126232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_66126279_66126649_66126709_66127855_66127980_66129752_66129853_66130670_66130733_66131445_66131554_66131636_66131792_66135444
tx.9109	chr18	-	858	7	ISM	ENSMUSG00000041891.17	ENSMUST00000120461.9	1741	14	-2	11015	-2	-441	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	865	junction_4	54.1410195692693	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTATACACGTTTCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66135694	66126649	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_66126709_66127855_66127980_66129752_66129853_66130670_66130733_66131445_66131554_66131636_66131792_66135444
tx.911	chr1	+	727	6	FSM	ENSMUSG00000026575.16	ENSMUST00000192710.2	687	6	-32	-8	-32	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	52.9550752997293	99	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGACTTTGGTTTTATTTCA	7352	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164200805	164264869	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_164200904_164206927_164206993_164208209_164208279_164213268_164213371_164230538_164230647_164264584
tx.9110	chr18	+	2660	3	FSM	ENSMUSG00000024521.9	ENSMUST00000025399.9	2727	3	62	5	2	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	99	junction_2	7	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCCACTGGTCTTTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	66591665	66598626	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_66591884_66593913_66594070_66596340
tx.9111	chr18	-	2321	11	FSM	ENSMUSG00000062526.5	ENSMUST00000073054.5	2494	11	168	5	5	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_4	12.1016527796826	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTAAGGAGTTTGGATCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67378733	67358118	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_67358956_67359853_67359995_67360667_67360791_67360874_67360950_67361083_67361193_67362000_67362076_67362745_67362850_67366671_67366781_67370420_67370804_67377034_67377119_67378452
tx.9112	chr18	-	506	3	NNC	ENSMUSG00000062526.5	novel	2494	11	NA	NA	14	-13706	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_1	19.5	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGAGTAACTTCTGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67378724	67376521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_67376672_67377034_67377119_67378452
tx.9113	chr18	+	1382	8	FSM	ENSMUSG00000024525.8	ENSMUST00000025403.8	5054	8	40	3632	-26	1931	multi-exon	FALSE	canonical	3	959	junction_6	106.526800307122	1277	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTTGGGTCTTCCTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67422295	67451910	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_67422577_67435245_67435380_67439740_67439846_67442121_67442168_67443716_67443826_67448689_67448799_67449951_67450104_67451464
tx.9114	chr18	+	949	5	NNC	ENSMUSG00000024526.10	novel	1115	5	NA	NA	168	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	60.5655636480005	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTCCTTGCAACTGGTTT	6376	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67476841	67500853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_67476915_67491779_67491925_67493165_67493313_67499444_67499627_67500451
tx.9115	chr18	+	787	4	NNC	ENSMUSG00000024526.10	novel	1115	5	NA	NA	183	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	66.7349650150171	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTCCTTGCAACTGGTTT	6391	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67476856	67500853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_67476915_67491779_67491925_67499444_67499627_67500451
tx.9116	chr18	+	879	4	ISM	ENSMUSG00000024526.10	ENSMUST00000025404.10	1115	5	15103	2	15103	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	128	junction_2	7.78888096369861	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTTCCTTGCAACTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67491776	67500853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_67491925_67493165_67493313_67499444_67499627_67500451
tx.9117	chr18	+	1767	4	FSM	ENSMUSG00000001473.8	ENSMUST00000001513.8	1758	4	-9	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	606	junction_3	34.2928563989645	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATCGGTCTCTTGAACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67523777	67535819	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_67523885_67524394_67524504_67526015_67526127_67534379
tx.9118	chr18	-	2595	14	ISM	ENSMUSG00000024527.11	ENSMUST00000025408.10	3094	17	8663	0	-4561	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	687	junction_13	36.0216897185226	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAAGGGTTGCCATGTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67573579	67537833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_67538585_67540335_67540531_67542467_67542669_67547147_67547264_67548568_67548680_67554055_67554182_67554277_67554386_67556014_67556169_67558958_67559097_67562050_67562325_67564723_67564849_67567224_67567300_67573251_67573405_67573511
tx.9119	chr18	-	891	2	ISM	ENSMUSG00000024527.11	ENSMUST00000025408.10	3094	17	41767	0	28543	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	752	junction_1	0	89	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGAAGGGTTGCCATGTTGTG	8781	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67540475	67537833	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_67538585_67540335
tx.912	chr1	-	1678	3	ISM	ENSMUSG00000026576.13	ENSMUST00000027863.13	2580	6	16733	3	2097	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1267	junction_2	13	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTCACGTGTGTGACTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164269191	164264680	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_164266109_164266867_164266952_164269025
tx.9121	chr18	+	1224	7	NNC	ENSMUSG00000024530.9	novel	1404	7	NA	NA	-5	746	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	4.95535624910617	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTATTTTTGTGACTGTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67597948	67613651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_67598027_67605926_67606096_67606810_67606901_67609864_67609936_67610033_67610137_67612137_67612211_67613011
tx.9122	chr18	+	1078	7	FSM	ENSMUSG00000024537.6	ENSMUST00000025418.4	1059	7	0	-19	0	19	multi-exon	FALSE	canonical	3	396	junction_3	27.1871088733041	1356	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATCTCTTTGAATCAGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67774668	67787251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_67774806_67777378_67777551_67779062_67779122_67781197_67781317_67781842_67782017_67786222_67786344_67786955
tx.9123	chr18	-	1570	10	NNC	ENSMUSG00000024539.18	novel	1568	10	NA	NA	3	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	132.404915801473	330	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TATGTTGGTTTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67857655	67798580	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_67798945_67805736_67805839_67808789_67808957_67810779_67810933_67813909_67814120_67814512_67814648_67821960_67822060_67828689_67828795_67844906_67844998_67857511
tx.9124	chr18	-	567	3	ISM	ENSMUSG00000024539.18	ENSMUST00000120934.8	1497	10	48752	1	14403	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	388	junction_1	19	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTATGTTGGTTTGTGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67808891	67798581	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_67798945_67805736_67805839_67808789
tx.9125	chr18	-	1895	9	NNC	ENSMUSG00000024539.18	novel	1568	10	NA	NA	0	-769	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	140.12890271104	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACATTTTCCCTTTCCTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67857658	67805050	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_67805839_67808789_67808957_67810779_67810933_67813909_67814120_67814512_67814648_67821960_67822060_67828689_67828795_67844906_67844998_67857511
tx.9126	chr18	+	1682	8	FSM	ENSMUSG00000079614.5	ENSMUST00000237700.2	1684	8	14	-12	14	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	1621	junction_6	144.078210053585	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCAGTGTGTGAAATGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67908058	67925675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_67908191_67912274_67912326_67916984_67917132_67917956_67918169_67920225_67920325_67921761_67921903_67922409_67922568_67924933
tx.9127	chr18	+	1546	9	FSM	ENSMUSG00000079614.5	ENSMUST00000025421.9	3542	9	112	1884	13	1010	multi-exon	FALSE	canonical	3	1509	junction_8	173.331285043987	580	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTTTGAGTGGTAATGTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67908057	67926673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_67908191_67912274_67912326_67916984_67917132_67917956_67918169_67920225_67920325_67921761_67921903_67922409_67922568_67924933_67925085_67926219
tx.9128	chr18	+	1439	4	FSM	ENSMUSG00000024542.10	ENSMUST00000224387.2	1425	4	5	-19	5	19	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_2	11.1455023315337	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAGAAAAAGAAATTATTT	118	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	67933187	67938466	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_67933257_67933724_67933896_67936058_67936227_67937435
tx.9129	chr18	+	707	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117891.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTACCCCTTTGTCTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68250954	68253454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_68251052_68252844
tx.913	chr1	-	2176	6	FSM	ENSMUSG00000026576.13	ENSMUST00000027863.13	2580	6	399	5	66	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1015	junction_5	105.155123508082	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATTCCTCACGTGTGTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164285525	164264682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_164266109_164266867_164266952_164269025_164269211_164270763_164270920_164281057_164281187_164285329
tx.9130	chr18	-	2070	4	FSM	ENSMUSG00000038121.7	ENSMUST00000042852.7	9651	4	116	7465	-15	-7465	multi-exon	FALSE	canonical	3	166	junction_3	16.3367343397905	237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACTGCTTGTAATTCAACGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68433288	68400722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_68402024_68405633_68405746_68408832_68409346_68433144
tx.9131	chr18	-	1663	3	ISM	ENSMUSG00000038121.7	ENSMUST00000042852.7	9651	4	24318	7469	24187	-7469	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	187	junction_2	9.5	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTCACTGCTTGTAATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68409086	68400726	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_68402024_68405633_68405746_68408832
tx.9132	chr18	+	1537	10	ISM	ENSMUSG00000009535.14	ENSMUST00000009679.11	5008	11	10	4519	10	1089	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	765	junction_7	145.735681591328	63	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTTTTCTGATACATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68433435	68453404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_68433497_68438850_68439271_68440716_68440859_68442391_68442518_68444678_68444792_68446735_68446918_68447058_68447224_68451064_68451183_68452188_68452291_68453296
tx.9133	chr18	+	2053	11	FSM	ENSMUSG00000009535.14	ENSMUST00000009679.11	5008	11	10	2945	10	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	765	junction_7	139.06832852954	847	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCAATTCTGAGACTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68433435	68454978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_68433497_68438850_68439271_68440716_68440859_68442391_68442518_68444678_68444792_68446735_68446918_68447058_68447224_68451064_68451183_68452188_68452291_68453296_68453331_68454388
tx.9134	chr18	+	663	3	FSM	ENSMUSG00000009535.14	ENSMUST00000148937.2	3791	3	184	2944	184	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	1085	junction_2	8	1375	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCAATTCTGAGACTCT	9922	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	68452251	68454978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_68452291_68453296_68453331_68454388
tx.9135	chr18	+	625	2	ISM	ENSMUSG00000009535.14	ENSMUST00000148937.2	3791	3	1228	2944	1228	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1085	junction_1	0	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTGCAATTCTGAGACTCT	NA	False	NA	-95	True	NA	NA	NA	68453295	68454978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_68453331_68454388
tx.9136	chr18	+	2959	13	FSM	ENSMUSG00000053477.19	ENSMUST00000114978.9	2437	13	412	-934	-13	36	multi-exon	FALSE	canonical	3	8	junction_1	33.3437483729043	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAAAAGAAAGTCAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69726470	69817450	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_69726656_69766647_69766754_69769901_69770036_69775953_69776087_69784292_69784361_69785464_69785544_69788031_69788109_69790817_69791022_69808769_69808906_69811037_69811201_69814639_69814870_69815753_69815895_69816147
tx.9137	chr18	+	1469	5	ISM	ENSMUSG00000053477.19	ENSMUST00000202474.4	1810	13	63141	-575	-4114	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_2	40.9351621469856	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTGTTGATTTGTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69808655	69816844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_69808906_69811037_69811189_69814639_69814870_69815753_69815895_69816147
tx.9138	chr18	+	1337	4	ISM	ENSMUSG00000053477.19	ENSMUST00000114978.9	2437	13	84958	-413	-1753	225	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	57	junction_1	39.4067112163511	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGGATTTTTTTTTTTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69811016	69816929	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_69811201_69814639_69814870_69815753_69815895_69816147
tx.9139	chr18	+	1233	4	ISM	ENSMUSG00000053477.19	ENSMUST00000202474.4	1810	13	65509	-575	-1746	140	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_1	45.7626728046147	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTGTTGATTTGTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69811023	69816844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_69811189_69814639_69814870_69815753_69815895_69816147
tx.914	chr1	+	491	3	Intergenic	novelGene_75	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCAGTGCCTTCCGTGACTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	164292002	164294384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_+_164292107_164293370_164293485_164294111
tx.9140	chr18	+	975	3	FSM	ENSMUSG00000053477.19	ENSMUST00000146908.2	3693	3	1963	755	-718	140	multi-exon	FALSE	canonical	3	123	junction_1	14	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTTTGTTGATTTGTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69814732	69816844	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_69814870_69815753_69815895_69816147
tx.9141	chr18	+	1489	2	FSM	ENSMUSG00000053477.19	ENSMUST00000136019.3	1001	2	238	-726	238	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAGAAAAAAAGAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69815688	69817430	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_69815895_69816147
tx.9142	chr18	-	1440	3	Intergenic	novelGene_739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAGTGTTATATAATAAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69912840	69901947	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_69903186_69908344_69908478_69912771
tx.9143	chr18	+	512	2	Intergenic	novelGene_740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTCTTTCTGAGTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	69966659	69967867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_+_69966838_69967533
tx.9144	chr18	-	3503	8	NIC	ENSMUSG00000044906.7	novel	2291	9	NA	NA	-11	0	intron_retention	FALSE	canonical	3	98	junction_4	41.1701298496463	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATATGTTGTTACGTCTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70605562	70585282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_70586460_70589544_70589616_70591387_70591520_70597032_70597136_70600405_70601589_70602519_70602849_70604743_70605051_70605361
tx.9145	chr18	-	3216	9	FSM	ENSMUSG00000044906.7	ENSMUST00000067556.4	2291	9	5	-930	5	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_5	54.5590276672889	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTGTTACGTCTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70605546	70585280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_70586460_70589544_70589616_70591387_70591520_70597032_70597136_70600405_70600557_70600829_70601589_70602519_70602849_70604743_70605051_70605361
tx.9146	chr18	-	2944	9	NIC	ENSMUSG00000044906.7	novel	2291	9	NA	NA	6	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	27	junction_5	65.9430388668887	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTTGTTACGTCTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70605569	70585280	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_70586460_70589544_70589616_70591387_70591520_70597032_70597136_70600405_70600557_70601124_70601589_70602519_70602849_70604743_70605051_70605361
tx.9147	chr18	-	1737	4	FSM	ENSMUSG00000044906.7	ENSMUST00000237800.2	4393	4	8	2648	8	-2648	multi-exon	FALSE	canonical	3	180	junction_3	21.483844059096	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCTCTGTGTCCTTGCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70605567	70600693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_70601589_70602519_70602849_70604743_70605051_70605361
tx.9148	chr18	-	940	3	ISM	ENSMUSG00000044906.7	ENSMUST00000237800.2	4393	4	21	4363	-3	-4363	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	180	junction_2	26	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACCACAAACAAACCATATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70605554	70602408	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_70602849_70604743_70605051_70605361
tx.9149	chr18	+	1435	9	NNC	ENSMUSG00000079608.11	novel	534	5	NA	NA	-489	9	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.96452920568771	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TATAGTATACATTTTAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70605035	70634146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_70605081_70606272_70606426_70607355_70607437_70609170_70609265_70609452_70609503_70616482_70616610_70629184_70629303_70631618_70631713_70633473
tx.915	chr1	-	1096	8	FSM	ENSMUSG00000040848.12	ENSMUST00000043338.10	5535	8	89	4350	-28	551	multi-exon	FALSE	canonical	3	60	junction_5	7.62380803664362	104	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCTTTCTCTTGCCCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165021918	165006255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_165006865_165009620_165009651_165011395_165011452_165011538_165011575_165012576_165012659_165015537_165015624_165015816_165015904_165021808
tx.9150	chr18	+	1387	8	ISM	ENSMUSG00000079608.11	ENSMUST00000114959.9	1496	9	746	-4	0	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1.95875845725744	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGGGTTATAGTATACATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70606270	70634141	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_70606426_70607355_70607437_70609170_70609265_70609452_70609503_70616482_70616610_70629184_70629303_70631618_70631713_70633473
tx.9151	chr18	-	2433	10	NNC	ENSMUSG00000038425.19	novel	2778	10	NA	NA	-10	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	40	junction_9	93.0357690406634	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTAGGCTCTCACTGTAAGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70663349	70641753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_70642816_70649864_70650068_70650447_70650576_70654920_70655013_70655772_70655952_70656233_70656471_70658446_70658600_70659627_70659793_70661772_70661896_70663258
tx.9152	chr18	-	2426	10	FSM	ENSMUSG00000038425.19	ENSMUST00000043286.15	2591	10	164	1	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_9	76.3322820564839	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTAGGCTCTCACTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70663341	70641755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_70642816_70649864_70650068_70650447_70650576_70654920_70655013_70655772_70655952_70656233_70656471_70658446_70658600_70659627_70659793_70661772_70661899_70663258
tx.9153	chr18	-	2302	9	NIC	ENSMUSG00000038425.19	novel	2778	10	NA	NA	-4	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	116	junction_8	75.0961883187156	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTAGGCTCTCACTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70663343	70641755	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_70642816_70649864_70650068_70650447_70650576_70654920_70655013_70655772_70655952_70656233_70656471_70658446_70658600_70659627_70659793_70663258
tx.9154	chr18	-	790	4	NIC	ENSMUSG00000038425.19	novel	2778	10	NA	NA	-11	-14331	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	116	junction_3	81.3893249893512	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGTGCAAGTACTTTTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70663350	70656090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_-_70656471_70658446_70658600_70659627_70659793_70663258
tx.9155	chr18	+	840	4	ISM	ENSMUSG00000024513.17	ENSMUST00000074058.11	1953	7	48412	0	-1172	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	48	junction_1	2.05480466765633	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTGGAACTTCTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70749671	70759202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_70749727_70750906_70751085_70755653_70755793_70758734
tx.9156	chr18	+	576	2	ISM	ENSMUSG00000024513.17	ENSMUST00000128555.2	494	3	4841	-354	4841	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGATTGGAACTTCTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	70755684	70759202	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_70755793_70758734
tx.9157	chr18	-	1534	2	ISM	ENSMUSG00000024515.14	ENSMUST00000131339.8	487	3	719	-1160	719	11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	378	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTTGGTTTTTAAAATGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73774915	73772068	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_73773541_73774853
tx.9158	chr18	-	2488	4	FSM	ENSMUSG00000036941.3	ENSMUST00000041138.3	4971	4	-4	2487	-4	-2487	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_1	4.32049379893857	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTAGGAGTTTATTATCAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73887554	73870595	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_73872372_73875407_73875873_73880237_73880403_73887472
tx.9159	chr18	-	1986	16	FSM	ENSMUSG00000024556.5	ENSMUST00000025439.5	2638	16	-11	663	0	-663	multi-exon	FALSE	canonical	3	442	junction_8	47.5095312074909	229	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGTCATCTGTGGTTTAT	360	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73948520	73903636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_73903880_73906200_73906300_73908449_73908521_73914112_73914216_73918765_73918909_73921424_73921540_73924154_73924269_73924679_73924778_73924871_73924982_73927516_73927621_73927851_73928014_73929384_73929461_73930899_73931050_73934799_73934934_73938122_73938241_73948374
tx.916	chr1	-	1748	7	FSM	ENSMUSG00000040843.11	ENSMUST00000043235.8	4380	7	-4	2636	-4	660	multi-exon	FALSE	canonical	3	508	junction_2	54.8414381041684	1640	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCATAGTTTGCTGTTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165064516	165042490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_165043450_165045351_165045415_165047667_165047764_165050097_165050230_165055073_165055174_165055836_165056017_165064298
tx.9160	chr18	-	655	5	ISM	ENSMUSG00000024556.5	ENSMUST00000025439.5	2638	16	29605	663	29605	-663	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	540	junction_3	46.8641654145254	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGGTGTCATCTGTGGTTTAT	9784	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73918904	73903636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_73903880_73906200_73906300_73908449_73908521_73914112_73914216_73918765
tx.9161	chr18	-	713	4	FSM	ENSMUSG00000024556.5	ENSMUST00000237619.2	715	4	-3	5	-3	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	527	junction_1	22.8375908439475	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTCACATCTTTGTTTT	357	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	73948523	73930737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_73931050_73934799_73934934_73938122_73938241_73948374
tx.9162	chr18	-	783	3	NNC	ENSMUSG00000024558.13	novel	426	2	NA	NA	-15	-87547	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCAGAGTTGGTTTTTTTAC	9373	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74198445	74191787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_74192051_74193461_74193648_74198111
tx.9163	chr18	-	1129	7	NNC	ENSMUSG00000036223.17	novel	2630	7	NA	NA	0	-283	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	85	junction_5	150.093766988802	147	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTACTGCCTTTAGGAACGT	6765	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74340850	74329832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_74330123_74330584_74330755_74332970_74333109_74335660_74335759_74337334_74337460_74339833_74339956_74340664
tx.9164	chr18	-	1103	7	FSM	ENSMUSG00000036223.17	ENSMUST00000177604.2	2605	7	39	1463	0	-283	multi-exon	FALSE	canonical	3	429	junction_6	32.9768437274131	1273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CGTACTGCCTTTAGGAACGT	6765	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74340850	74329832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_74330123_74330584_74330755_74332970_74333109_74335660_74335759_74337334_74337460_74339859_74339956_74340664
tx.9165	chr18	+	778	2	FSM	ENSMUSG00000024561.12	ENSMUST00000224907.2	1349	2	589	-18	19	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTAGTGTTCTGAGCACGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74401264	74403011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_74401505_74402473
tx.9166	chr18	+	2823	15	FSM	ENSMUSG00000024561.12	ENSMUST00000097530.5	2833	15	-5	15	-5	-15	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_10	20.6853245819645	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAAAAAACCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74401240	74415788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_74401505_74402473_74402610_74406279_74406395_74406483_74406729_74406805_74406889_74407086_74407128_74407485_74407633_74407715_74407845_74408218_74408330_74408413_74408489_74409477_74409787_74409872_74410011_74410371_74410501_74410587_74410650_74414949
tx.9167	chr18	+	1800	8	ISM	ENSMUSG00000024561.12	ENSMUST00000097530.5	2833	15	6475	2	1132	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_3	21.27372625027	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AACCAAGCATAAGGTTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74407720	74415801	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_74407845_74408218_74408330_74408413_74408489_74409477_74409787_74409872_74410011_74410371_74410501_74410587_74410650_74414949
tx.9168	chr18	-	264	2	Intergenic	novelGene_741	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCACGTTTACTTCACCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74911864	74910961	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_74911203_74911841
tx.9169	chr18	-	416	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000089235.3	novel	140	1	NA	NA	-61	668	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCACGTTTACTTCACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74911832	74910963	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr18_-_74911203_74911655
tx.917	chr1	+	750	5	FSM	ENSMUSG00000026568.7	ENSMUST00000027853.6	1025	5	181	94	-6	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	408	junction_4	28.8704000665041	1237	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGTCTTTACATTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165288786	165308689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_165289081_165302522_165302564_165305789_165305875_165307035_165307148_165308471
tx.9170	chr18	+	1607	10	FSM	ENSMUSG00000036880.11	ENSMUST00000041053.11	1516	10	-91	0	-91	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	191	junction_8	17.7325814376939	605	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTAACCTTTTCTTGTTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	74912176	74939279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_74912337_74920189_74920357_74925421_74925551_74926357_74926475_74928201_74928350_74931382_74931559_74932115_74932246_74934367_74934439_74937071_74937227_74938925
tx.9171	chr18	+	766	7	FSM	ENSMUSG00000062328.9	ENSMUST00000079716.6	775	7	-1	10	-1	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	6761	junction_1	2088.63605148325	6422	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGACCATGTAAATATGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75133546	75136442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_75133615_75134261_75134315_75134420_75134462_75134736_75134872_75135094_75135194_75135731_75135924_75136264
tx.9172	chr18	+	878	3	FSM	ENSMUSG00000036299.6	ENSMUST00000236421.2	524	3	-13	-341	-12	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	91	junction_1	354	673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCCTGCTTTTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75138926	75143005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_75138972_75141721_75141898_75142348
tx.9173	chr18	+	1071	3	FSM	ENSMUSG00000036299.6	ENSMUST00000237263.2	1266	3	-23	218	8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	388	junction_1	205.5	1002	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCCTGCTTTTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75138947	75143005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_75139186_75141721_75141898_75142348
tx.9174	chr18	+	968	3	FSM	ENSMUSG00000036299.6	ENSMUST00000040284.6	979	3	12	-1	11	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_1	315	429	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTCCTGCTTTTTGTCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75138950	75143005	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_75139086_75141721_75141898_75142348
tx.9175	chr18	+	2502	17	FSM	ENSMUSG00000035765.11	ENSMUST00000039608.9	2456	17	-44	-2	-40	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	162	junction_13	17.5886149255705	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTGACTTATTTTTAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75151811	75420037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_75152056_75176149_75176341_75186051_75186105_75188351_75188446_75189700_75189835_75196171_75196245_75213273_75213400_75215435_75215579_75247860_75248044_75252181_75252361_75256528_75256655_75258494_75258609_75259895_75259991_75332233_75332337_75363060_75363244_75376355_75376470_75419690
tx.9176	chr18	-	1535	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035765.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATTCTGGCTTCTTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75328328	75324002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_75324996_75327096_75327256_75327945
tx.9177	chr18	-	243	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035765.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTTTGTTTCTCTATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75327125	75324781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_75324996_75327096
tx.9178	chr18	-	519	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035765.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	1	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGGTTTGTTTCTCTATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75327915	75324781	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_-_75324996_75327096_75327256_75327769
tx.9179	chr18	+	538	2	NNC	ENSMUSG00000035765.11	novel	2456	17	NA	NA	120182	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	16	junction_1	0	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGTGACTTATTTTTAAAC	8101	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75378677	75420037	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_75378869_75419690
tx.918	chr1	-	1653	3	ISM	ENSMUSG00000026566.16	ENSMUST00000111435.9	2285	6	29811	0	1035	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	372	junction_2	16	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGTTGTCTGCTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165432287	165419808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_165421247_165429318_165429425_165432178
tx.9180	chr18	-	779	2	NNC	ENSMUSG00000102047.2	novel	650	2	NA	NA	-12575	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACCTGCTGTCTCATGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75442975	75421718	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_75422241_75442718
tx.9181	chr18	-	1180	2	Intergenic	novelGene_743	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCTAGTGTTCTCCATAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75477952	75476640	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_75477628_75477759
tx.9182	chr18	+	1563	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052928.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTGAGTCAAGGCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	75598248	75604686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_75598509_75602199_75602302_75603485
tx.9183	chr18	+	2013	10	FSM	ENSMUSG00000024563.17	ENSMUST00000091831.13	1645	10	193	-561	-152	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	75.1282031834933	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAGTGGATTAACTTGGAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76374964	76438362	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_76375051_76395510_76395799_76420998_76421193_76422109_76422245_76425980_76426056_76431518_76431573_76432853_76433067_76435149_76435288_76435453_76435599_76437677
tx.9184	chr18	+	2111	11	FSM	ENSMUSG00000024563.17	ENSMUST00000168423.9	8089	11	318	5660	-148	9	multi-exon	FALSE	canonical	3	248	junction_5	13.3850663054017	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGAAGTCCTTGACCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76374968	76438374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_76375051_76395510_76395799_76419930_76420021_76420998_76421193_76422109_76422245_76425980_76426056_76431518_76431573_76432853_76433067_76435149_76435288_76435453_76435599_76437677
tx.9185	chr18	+	2455	11	NNC	ENSMUSG00000024563.17	novel	8089	11	NA	NA	-145	433	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	6	junction_8	78.8274064015809	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCGACCTTTTGCCTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76374971	76438798	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_76375051_76395510_76395799_76419930_76420021_76420998_76421193_76422109_76422245_76425980_76426056_76431518_76431573_76432853_76433067_76435226_76435288_76435453_76435599_76437677
tx.9186	chr18	+	2140	11	NIC	ENSMUSG00000024563.17	novel	1305	8	NA	NA	-52	9	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	22	junction_1	75.1644197742522	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGAAGTCCTTGACCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	76375192	76438374	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr18_+_76375304_76395510_76395799_76419930_76420021_76420998_76421193_76422109_76422245_76425980_76426056_76431518_76431573_76432853_76433067_76435149_76435288_76435453_76435599_76437677
tx.9187	chr18	+	494	3	FSM	ENSMUSG00000090000.3	ENSMUST00000026487.6	1402	3	22	886	-6	37	multi-exon	FALSE	canonical	3	1641	junction_2	78	5161	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGATTTTTTTTTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77017734	77028422	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_77017913_77027263_77027366_77028208
tx.9188	chr18	+	1543	7	FSM	ENSMUSG00000025421.16	ENSMUST00000097522.11	5477	7	28	3906	-7	-4	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	128.264050562372	259	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAGATGTTTTAATTAGACAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77031815	77059097	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_77031882_77038808_77038920_77042673_77042883_77044534_77044620_77052746_77052964_77054839_77054904_77058306
tx.919	chr1	-	2177	5	FSM	ENSMUSG00000026566.16	ENSMUST00000068705.13	2171	5	-6	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	343	junction_1	201.827896981562	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGTTGTCTGCTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165462096	165419808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_165421247_165432178_165432312_165433177_165433392_165436006_165436174_165461871
tx.9190	chr18	-	1573	6	NNC	ENSMUSG00000025420.14	novel	1515	6	NA	NA	14014	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	19	junction_1	3.26190128606002	43	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTATTTCTGCTTTTTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77120925	77097736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_77098742_77099679_77099801_77103697_77103741_77105156_77105324_77106880_77106952_77120759
tx.9191	chr18	-	451	2	Intergenic	novelGene_744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACAGTGACTCCAACTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77120940	77114611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr18_-_77114882_77120759
tx.9192	chr18	+	2166	13	NNC	ENSMUSG00000025423.17	novel	3060	14	NA	NA	-26653	-120	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	417	junction_12	260.606810582959	108	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TTGATTCTTTCAAGAAAAAA	6432	False	NA	-90	True	NA	NA	NA	77126250	77234513	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_77126678_77184944_77185420_77193500_77193586_77207607_77207659_77207751_77207843_77214552_77214688_77216651_77216758_77217745_77217820_77220786_77220948_77221629_77221764_77223475_77223648_77232698_77232839_77234398
tx.9193	chr18	+	2913	14	NNC	ENSMUSG00000025423.17	novel	3060	14	NA	NA	-26653	102	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	706	junction_12	216.509206932155	90	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTATGTTTAAGAATACTACA	6432	False	NA	-90	True	NA	NA	NA	77126250	77241134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_77126678_77184944_77185420_77193500_77193586_77207607_77207659_77207751_77207843_77214552_77214688_77216651_77216758_77217745_77217820_77220786_77220948_77221629_77221764_77223475_77223648_77232698_77232839_77237756_77237795_77240310
tx.9194	chr18	+	1167	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000097666.3_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATCACCAAAGCCTCCCGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77811497	77819694	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr18_+_77811827_77818856
tx.9195	chr18	-	1020	2	NNC	ENSMUSG00000097666.3	novel	1269	2	NA	NA	-8	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGGATTCTTCTTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77820447	77817192	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_-_77818179_77820413
tx.9196	chr18	-	1010	9	FSM	ENSMUSG00000041840.9	ENSMUST00000048192.9	1003	9	-6	-1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1190	junction_6	88.5180066427165	1510	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTTGTTATCTGTTGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77855486	77845266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_77845454_77846169_77846218_77847136_77847209_77848167_77848234_77848606_77848731_77849681_77849817_77851772_77851909_77854563_77854739_77855419
tx.9197	chr18	+	904	7	ISM	ENSMUSG00000025428.16	ENSMUST00000026495.15	2471	12	267	2993	4	-1223	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5078	junction_4	254.603449832611	1226	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCGCTTCAGTACTTGGCTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77861695	77867576	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_77861811_77863476_77863556_77865218_77865389_77866161_77866336_77866431_77866599_77866778_77866928_77867526
tx.9198	chr18	+	1423	10	ISM	ENSMUSG00000025428.16	ENSMUST00000026495.15	2471	12	267	1574	4	196	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5078	junction_4	221.297687892727	1397	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACTCAACAGCTCTTGAGTCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77861695	77868995	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_77861811_77863476_77863556_77865218_77865389_77866161_77866336_77866431_77866599_77866778_77866928_77867526_77867679_77867778_77868004_77868684_77868793_77868911
tx.9199	chr18	+	2204	12	FSM	ENSMUSG00000025428.16	ENSMUST00000026495.15	2471	12	267	0	4	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5078	junction_4	224.265707226978	4845	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGTCTTGGTTGATGAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77861695	77870569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_77861811_77863476_77863556_77865218_77865389_77866161_77866336_77866431_77866599_77866778_77866928_77867526_77867679_77867778_77868004_77868684_77868793_77868911_77869057_77869498_77869650_77870000
tx.92	chr1	-	254	3	ISM	ENSMUSG00000026155.14	ENSMUST00000133398.2	1271	7	43	27579	43	-27579	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	448	junction_1	26	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTAAAACCTTCATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23931032	23915454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_23915531_23916789_23916876_23930940
tx.920	chr1	-	2284	6	FSM	ENSMUSG00000026566.16	ENSMUST00000111435.9	2285	6	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	372	junction_2	205.630737002035	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGTTGTCTGCTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165462097	165419808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_165421247_165429318_165429425_165432178_165432312_165433177_165433392_165436006_165436174_165461871
tx.9200	chr18	+	1021	5	NNC	ENSMUSG00000025429.10	novel	2267	15	NA	NA	1	-83844	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	9.44391338376205	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATAGTAGAGTGATTATTTT	2211	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77877614	77883272	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr18_+_77877687_77881229_77881341_77882004_77882171_77882305_77882451_77882745
tx.9201	chr18	+	2666	9	ISM	ENSMUSG00000025429.10	ENSMUST00000114741.4	2267	15	75691	-878	75691	878	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_2	5.23061898822692	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTAATTTGTATTCTTGTGT	9084	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	77957935	77971457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_77958146_77959267_77959314_77959468_77959549_77961060_77961160_77961972_77962070_77963537_77963620_77965294_77965330_77967055_77967117_77969501
tx.9202	chr18	-	1379	6	FSM	ENSMUSG00000024570.8	ENSMUST00000025462.7	1377	6	2	-4	2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	236	junction_3	30.0026665481587	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTGTGTATACGCACAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80243871	80235475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_80236098_80236446_80236515_80238233_80238319_80240464_80240578_80240878_80241099_80243600
tx.9203	chr18	+	1660	4	FSM	ENSMUSG00000024571.16	ENSMUST00000125127.8	1683	4	25	-2	-7	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1096	junction_3	900.996608699993	62	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTACACGTTTGTTGTGGGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80250037	80255949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_80250117_80250368_80250559_80253276_80253346_80254627
tx.9204	chr18	+	726	4	FSM	ENSMUSG00000057130.13	ENSMUST00000145963.9	4078	4	28	3324	28	193	multi-exon	FALSE	canonical	3	2407	junction_2	310.116465577406	363	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATCTGCTGTGCTTACTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80250037	80265746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_80250117_80250368_80250559_80261918_80262023_80265393
tx.9205	chr18	-	837	4	FSM	ENSMUSG00000078963.4	ENSMUST00000237192.2	1104	4	-19	286	-19	-286	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	16.9901932498329	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCATAGCCTTCTGATGTAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80280067	80273258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_80273777_80276629_80276725_80278663_80278731_80279910
tx.9209	chr18	+	841	2	ISM	ENSMUSG00000034006.18	ENSMUST00000134545.3	3258	4	-37	17663	-14	-5997	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	39	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAAGGCTCCCTTGACTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80299484	80300703	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_80299619_80299996
tx.921	chr1	-	1824	3	FSM	ENSMUSG00000026566.16	ENSMUST00000194437.6	643	3	-8	-1173	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_1	400.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGGTGTTGTCTGCTTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165462090	165419808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_165421247_165436006_165436174_165461871
tx.9210	chr18	+	1960	5	FSM	ENSMUSG00000034006.18	ENSMUST00000070135.8	1911	5	-45	-4	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_3	7.26291952316697	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATGCTTCATGTGGTGTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	80299487	80335931	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_80299619_80299996_80300334_80306634_80306769_80326490_80326708_80334790
tx.9219	chr18	-	1833	10	ISM	ENSMUSG00000024644.18	ENSMUST00000168419.3	2152	11	1078	0	-141	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	554	junction_9	37.548322774924	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAACTGCCGTGGTCTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84699106	84685593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_-_84686226_84686662_84686811_84687055_84687198_84687921_84688087_84688877_84689039_84690198_84690284_84693101_84693303_84695443_84695533_84696832_84696996_84699059
tx.9220	chr18	-	2021	11	FSM	ENSMUSG00000024644.18	ENSMUST00000168419.3	2152	11	131	0	131	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	554	junction_9	38.6638073655454	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAACTGCCGTGGTCTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84700053	84685593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_84686226_84686662_84686811_84687055_84687198_84687921_84688087_84688877_84689039_84690198_84690284_84693101_84693303_84695443_84695533_84696832_84696996_84699059_84699204_84699962
tx.9221	chr18	-	2066	12	FSM	ENSMUSG00000024644.18	ENSMUST00000025546.17	2124	12	54	4	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	418	junction_11	64.2627612178223	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAACTGCCGTGGTCTGACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84703773	84685593	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_84686226_84686662_84686811_84687055_84687198_84687921_84688087_84688877_84689039_84690198_84690284_84693101_84693303_84695443_84695533_84696832_84696996_84699059_84699204_84699962_84700053_84703727
tx.9222	chr18	+	807	5	FSM	ENSMUSG00000024646.15	ENSMUST00000160180.9	833	5	21	5	-18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	946	junction_4	54.2425110038243	722	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATATGTGTCTGTCTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84869483	84897991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_84869733_84889629_84889759_84891264_84891295_84895951_84895987_84897627
tx.9223	chr18	+	1770	10	FSM	ENSMUSG00000034391.13	ENSMUST00000224467.3	1910	10	140	0	-106	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	723	junction_3	71.0602248487546	901	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTCTGTTTGGTGTCTTATTT	940	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84953046	84999598	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_84953306_84975444_84975556_84976396_84976502_84977193_84977437_84978134_84978345_84980718_84980846_84982233_84982317_84983555_84983711_84995491_84995617_84999246
tx.9224	chr18	-	610	2	FSM	ENSMUSG00000024645.6	ENSMUST00000235629.2	673	2	65	-2	65	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	66	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTTAAAAGCATTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84966108	84965410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_84965871_84965958
tx.9225	chr18	-	1323	6	FSM	ENSMUSG00000024645.6	ENSMUST00000025547.4	2418	6	0	1095	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	52	junction_4	6.15142259969188	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATGTTAAAAGCATTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	84969649	84965410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_84965871_84965958_84966065_84966147_84966222_84967318_84967417_84967514_84967578_84969127
tx.9226	chr18	-	2734	4	FSM	ENSMUSG00000056153.16	ENSMUST00000125362.8	2814	4	76	4	-17	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	64	junction_2	64.5652125115891	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCAATTTAGAAATTGTTGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	88912400	88886622	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_-_88889043_88905115_88905190_88905332_88905458_88912285
tx.9227	chr18	+	1244	7	ISM	ENSMUSG00000024614.8	ENSMUST00000236213.2	1776	11	-8	7665	-3	5097	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_5	18.7053171287976	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTAAGATGTCCTCTTTC	4782	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90528317	90542367	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_90528502_90529402_90529458_90532328_90532369_90535517_90535642_90537228_90537275_90539080_90539162_90541653
tx.9228	chr18	+	797	5	ISM	ENSMUSG00000024614.8	ENSMUST00000236213.2	1776	11	-10	12412	-5	350	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	198	junction_4	16.6188898546203	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATCAAGAGAAGAAAATT	4780	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90528315	90537620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_90528502_90529402_90529458_90532328_90532369_90535517_90535642_90537228
tx.9229	chr18	+	2369	4	ISM	ENSMUSG00000024614.8	ENSMUST00000236213.2	1776	11	5	12412	3	350	intron_retention	FALSE	canonical	3	213	junction_3	11.3137084989848	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GAAATCAAGAGAAGAAAATT	4795	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90528330	90537620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_90528502_90529402_90529458_90532328_90532369_90535517
tx.923	chr1	+	311	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000040723.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCTTGACTCTAGCTGCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165482831	165483658	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_+_165483025_165483540
tx.9230	chr18	+	816	8	ISM	ENSMUSG00000024614.8	ENSMUST00000236213.2	1776	11	-2	7436	-2	5326	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	190	junction_5	19.3496295381929	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCGGATTATTTAGGGACT	4788	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90528323	90542596	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr18_+_90528502_90529402_90529458_90532328_90532369_90535517_90535642_90537228_90537275_90539080_90539162_90541653_90541754_90542404
tx.9231	chr18	+	3494	16	FSM	ENSMUSG00000024614.8	ENSMUST00000025515.7	4611	16	61	1056	11	-1056	multi-exon	FALSE	canonical	3	189	junction_13	15.4033185457622	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTTTTTGAGGATATTTTTA	4803	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90528338	90560335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_90528502_90529402_90529458_90532328_90532369_90535517_90535642_90537228_90537275_90539080_90539162_90541653_90541754_90542404_90542483_90545999_90546067_90548183_90548283_90551106_90551165_90551344_90551399_90552505_90552563_90555198_90555329_90556622_90556692_90558062
tx.9232	chr18	+	1774	11	FSM	ENSMUSG00000024614.8	ENSMUST00000236213.2	1776	11	5	-3	3	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_10	65.2935678302235	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CAACTATTGTTACCACATGT	4795	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90528330	90550035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_90528502_90529402_90529458_90532328_90532369_90535517_90535642_90537228_90537275_90539080_90539162_90541653_90541754_90542404_90542483_90545999_90546067_90548183_90548283_90549122
tx.9233	chr18	+	1990	4	FSM	ENSMUSG00000110277.3	ENSMUST00000211710.2	2003	4	19	-6	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_2	1.63299316185545	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTGTCTTGGTCATAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90597919	90610652	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_90598024_90607079_90607207_90607397_90607459_90608954
tx.9234	chr18	+	461	3	FSM	ENSMUSG00000110277.3	ENSMUST00000209821.2	513	3	-36	88	-7	-88	multi-exon	FALSE	canonical	3	89	junction_2	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTCTTCAGACACTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	90597912	90607620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr18_+_90598024_90607079_90607207_90607397
tx.9235	chr19	+	813	7	FSM	ENSMUSG00000024829.13	ENSMUST00000025743.7	802	7	-13	2	-8	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1715	junction_6	72.3058703625708	4155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCCTGTGACTTGCTGTTA	7358	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3333046	3341199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_3333172_3334759_3334818_3335309_3335396_3336874_3337039_3337702_3337756_3338983_3339088_3340976
tx.9236	chr19	+	4271	19	FSM	ENSMUSG00000024900.6	ENSMUST00000025835.6	4317	19	47	-1	-16	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	230	junction_1	37.3718386086055	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCATCTGTCCCTGTCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3373331	3435734	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_3373375_3399188_3399343_3402484_3402625_3406316_3406489_3408175_3408278_3412084_3412223_3414477_3414556_3415674_3415783_3416329_3416418_3418854_3419051_3420706_3420896_3421571_3421678_3425092_3425210_3426410_3426576_3428367_3428503_3430016_3430170_3431609_3431724_3431931_3432025_3433754
tx.9237	chr19	-	1013	7	NNC	ENSMUSG00000024907.8	novel	788	6	NA	NA	-337	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1.97202659436654	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTGGGACTGTTTGGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3464881	3459916	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_3460166_3461128_3461207_3461557_3461648_3463294_3463350_3464031_3464113_3464311_3464544_3464653
tx.9238	chr19	-	2548	5	ISM	ENSMUSG00000024908.16	ENSMUST00000025846.16	4841	23	108534	0	3819	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	424	junction_4	27.0231382337433	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCCTCGTGAGCCTTTTTG	4622	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3517186	3504927	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_3507052_3509360_3509481_3514544_3514696_3516492_3516600_3517140
tx.9239	chr19	-	1951	7	ISM	ENSMUSG00000024908.16	ENSMUST00000025846.16	4841	23	-2	56017	0	550	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	325	junction_6	70.1492456599974	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTGGTTTGGTTTGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3625722	3560944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_3562042_3564653_3564720_3568244_3568383_3571733_3571921_3576701_3576935_3594107_3594256_3625640
tx.924	chr1	+	899	4	FSM	ENSMUSG00000040713.13	ENSMUST00000111432.10	2163	4	16	1248	16	142	multi-exon	FALSE	canonical	3	459	junction_1	24.0554914035583	706	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTCAGAGAAAAATGCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165591330	165601629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_165591708_165597381_165597502_165598200_165598386_165601412
tx.9240	chr19	-	1819	6	ISM	ENSMUSG00000024908.16	ENSMUST00000223919.2	2237	14	-2	33170	-2	549	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_5	129.618825793169	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTTTTTGGTTTGGTTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3625739	3560945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_3562042_3564653_3564720_3568244_3568383_3571733_3571921_3576701_3576935_3625640
tx.9241	chr19	-	636	4	ISM	ENSMUSG00000024908.16	ENSMUST00000113997.9	4952	24	-3	66845	-3	4983	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	325	junction_3	54.0144013718152	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCAAGGTGCTAAGTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3625752	3571777	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_3571921_3576701_3576935_3594107_3594256_3625640
tx.9242	chr19	-	852	4	ISM	ENSMUSG00000024913.17	ENSMUST00000177294.2	2835	14	24027	-8	24027	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	98	junction_2	9.84321537348893	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGCCATTCCTTTGTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3641765	3634827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_3635292_3636382_3636481_3640973_3641114_3641615
tx.9243	chr19	-	603	3	FSM	ENSMUSG00000118249.2	ENSMUST00000236650.2	571	3	-28	-4	-28	4	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACTTTGGTGGTATCTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3758204	3739681	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_3740001_3756645_3756786_3758060
tx.9244	chr19	+	1915	4	FSM	ENSMUSG00000035372.3	ENSMUST00000039048.2	1882	4	-34	1	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_1	53.9897109539298	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCTTGTGTGGGTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3758298	3767880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_3758437_3764403_3764626_3765637_3765803_3766490
tx.9245	chr19	+	1917	4	FSM	ENSMUSG00000035372.3	ENSMUST00000237320.2	772	4	1	-1146	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_1	87.4541149530554	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCTTGTGTGGGTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3758293	3767880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_3758437_3764406_3764626_3765637_3765803_3766490
tx.9246	chr19	+	1659	3	FSM	ENSMUSG00000035372.3	ENSMUST00000235295.2	1643	3	-14	-2	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	4	junction_1	146.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CAGCTTGTGTGGGTCTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3758332	3767880	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_3758437_3765637_3765803_3766490
tx.9247	chr19	+	1656	8	NNC	ENSMUSG00000045098.20	novel	1721	10	NA	NA	5	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	99.3606089566932	13	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAATTGACCAAAACTATAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3818153	3855470	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_3818341_3836388_3836628_3843067_3843216_3846639_3846709_3852074_3852241_3852787_3852898_3854394_3854562_3854900
tx.9248	chr19	+	1660	8	NNC	ENSMUSG00000045098.20	novel	1721	10	NA	NA	-7	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	99.3606089566932	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TTTTTAGAATTGACCAAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3818158	3855465	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_3818341_3836388_3836628_3843067_3843216_3846639_3846709_3852074_3852241_3852787_3852898_3854394_3854592_3854916
tx.9249	chr19	+	2873	9	NNC	ENSMUSG00000045098.20	novel	2975	10	NA	NA	-3	0	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	94.9986842014141	6	3	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTGTTTTCTTGAGTCTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3818130	3858835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_3818341_3836388_3836628_3843067_3843216_3846639_3846709_3852074_3852241_3852787_3852898_3854394_3854562_3854900_3855054_3857224
tx.9250	chr19	-	603	4	ISM	ENSMUSG00000059734.8	ENSMUST00000236801.2	1005	7	1235	4	1235	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1612	junction_1	125.865007051205	851	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTACCTGTTGTGTTGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3961253	3958866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_3959075_3959152_3959282_3960897_3961071_3961160
tx.9251	chr19	-	721	6	ISM	ENSMUSG00000059734.8	ENSMUST00000236801.2	1005	7	736	4	736	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1612	junction_1	163.614180314544	875	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTACCTGTTGTGTTGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3961752	3958866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_3959075_3959152_3959282_3960897_3961071_3961160_3961257_3961565_3961617_3961688
tx.9252	chr19	-	768	7	FSM	ENSMUSG00000059734.8	ENSMUST00000237341.2	780	7	12	0	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1174	junction_6	307.096076171611	3798	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTACCTGTTGTGTTGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3962762	3958866	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_3959075_3959152_3959282_3960897_3961071_3961160_3961257_3961565_3961617_3961688_3961747_3962709
tx.9253	chr19	+	641	3	NIC	ENSMUSG00000110949.2	novel	787	4	NA	NA	12	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	5	junction_1	39.5	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTCTGGCATCTTCCGTG	3525	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4050591	4052102	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_4050848_4051627_4051706_4051795
tx.9254	chr19	+	775	4	FSM	ENSMUSG00000110949.2	ENSMUST00000025802.10	787	4	12	0	12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	59	junction_1	10.4243305140746	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCCTCTGGCATCTTCCGTGT	3525	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4050591	4052103	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_4050848_4051195_4051329_4051627_4051706_4051795
tx.9255	chr19	-	1551	10	FSM	ENSMUSG00000037916.15	ENSMUST00000042497.14	1661	10	107	3	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	1250	junction_6	107.070877644232	1816	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTTGTCTGGAACTTTGCTT	6533	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4062699	4057499	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_4057666_4057769_4057916_4058047_4058130_4058342_4058510_4058593_4058807_4059343_4059534_4059825_4060010_4061101_4061273_4061345_4061429_4062550
tx.9256	chr19	-	769	7	FSM	ENSMUSG00000060803.7	ENSMUST00000169613.4	821	7	52	0	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1999	junction_6	828.939215034626	2332	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGTGTCTTTGGTGCTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4087933	4085406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_4085662_4085823_4085932_4086687_4086792_4087103_4087192_4087289_4087397_4087584_4087621_4087862
tx.9257	chr19	-	773	7	FSM	ENSMUSG00000038155.12	ENSMUST00000042700.12	797	7	24	0	-21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1174	junction_6	961.706469424706	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGTGTCTTTGGTGCCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4092239	4090284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_4090540_4090707_4090816_4090981_4091086_4091397_4091486_4091583_4091691_4091902_4091939_4092164
tx.9258	chr19	+	912	4	FSM	ENSMUSG00000024856.11	ENSMUST00000025779.11	1080	4	165	3	-54	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	620	junction_3	36.1754981536767	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCAGCCTTTCTGTGTGTG	7041	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4147346	4149014	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_4147508_4147816_4147918_4148004_4148138_4148497
tx.926	chr1	-	775	4	ISM	ENSMUSG00000026564.10	ENSMUST00000085992.4	4018	6	695	9722	695	-9722	internal_fragment	FALSE	canonical	3	43	junction_2	2.62466929133727	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAGCGGTTGGTTTCTCTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165954770	165935443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_165935760_165937620_165937853_165939599_165939695_165954638
tx.9260	chr19	-	1240	6	FSM	ENSMUSG00000024847.16	ENSMUST00000025767.14	1261	6	24	-3	24	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	269	junction_5	15.3310143173894	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTTTGCAGAACTAATCTAT	3926	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4171551	4164460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_4164797_4165080_4165223_4165319_4165497_4165981_4166171_4168086_4168267_4171335
tx.9261	chr19	+	943	7	FSM	ENSMUSG00000024845.20	ENSMUST00000140267.10	938	7	0	-5	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	568	junction_2	70.8411760364142	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACAGTTGCACTTTCCTGG	4370	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4175958	4181731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_4176200_4177055_4177121_4177548_4177639_4177758_4177836_4181029_4181075_4181227_4181282_4181360
tx.9262	chr19	+	897	6	FSM	ENSMUSG00000024845.20	ENSMUST00000150627.11	1472	6	0	575	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	226	junction_4	186.716255318063	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACAGTTGCACTTTCCTGG	4371	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4175959	4181731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_4176200_4177055_4177121_4177548_4177639_4177758_4177836_4181227_4181282_4181360
tx.9266	chr19	+	1867	11	NIC	ENSMUSG00000024835.16	novel	1888	11	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	402	junction_1	75.9439925208044	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTTTGACCTACTGTTGTGG	3589	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4198631	4204034	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_4198729_4199340_4199544_4199861_4199985_4200088_4200219_4200438_4200621_4200705_4200826_4201393_4201499_4201578_4201725_4202520_4202579_4203225_4203490_4203595
tx.927	chr1	+	667	4	ISM	ENSMUSG00000000544.15	ENSMUST00000166860.2	2227	8	-50	8890	0	90	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	180	junction_1	21.6999743983464	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGAAGAGTTACAACGCCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165957985	165985188	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_165958174_165974207_165974363_165980136_165980354_165985081
tx.9270	chr19	+	1388	7	FSM	ENSMUSG00000040385.8	ENSMUST00000046094.6	1473	7	85	0	-9	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	3675	junction_3	183.825475806689	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATAGCCTCTGTCTCTCTT	3362	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4242148	4245419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_4242271_4242743_4242876_4243020_4243252_4243765_4243871_4244465_4244690_4244770_4244906_4244980
tx.9271	chr19	+	640	3	ISM	ENSMUSG00000040385.8	ENSMUST00000236718.2	613	4	948	-380	-24	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3692	junction_1	207	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCATAGCCTCTGTCTCTCTT	5837	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4244623	4245419	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_4244690_4244770_4244906_4244980
tx.9274	chr19	-	2088	11	FSM	ENSMUSG00000024824.8	ENSMUST00000025740.8	2081	11	-7	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	334	junction_4	40.0660704337224	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCTGTGTGTTCCCCGTGAC	5991	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4251642	4245194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_4246082_4246179_4246382_4247111_4247250_4247337_4247403_4247475_4247586_4247669_4247780_4250270_4250371_4250463_4250579_4250927_4251057_4251327_4251399_4251481
tx.9277	chr19	+	916	4	FSM	ENSMUSG00000024854.5	ENSMUST00000025773.5	913	4	-5	2	-5	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_3	2.16024689946929	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTCTGACCTTACATCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4281947	4283686	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_4282243_4282516_4282607_4282801_4282914_4283267
tx.928	chr1	+	2335	7	FSM	ENSMUSG00000000544.15	ENSMUST00000060833.14	2515	7	180	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	176	junction_6	19.1398362932741	48	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTTTCTTTGTTCACCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165957986	165994079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_165958174_165974207_165974363_165980136_165980354_165985081_165985238_165991341_165991462_165992148_165992285_165992715
tx.9285	chr19	-	1424	8	FSM	ENSMUSG00000024889.6	ENSMUST00000025823.6	1425	8	3	-2	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_6	48.136286113662	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGGTCTTGGAACCTTGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4675665	4672620	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_4673271_4673528_4673592_4673853_4673926_4674041_4674210_4674712_4674792_4675040_4675125_4675220_4675324_4675460
tx.9289	chr19	+	1194	2	ISM	ENSMUSG00000033760.18	ENSMUST00000036744.8	1783	4	5480	0	655	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTTTTCTTAACTGAGTGGC	228	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4812078	4815968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_4812676_4815371
tx.929	chr1	+	789	4	FSM	ENSMUSG00000000544.15	ENSMUST00000027847.7	787	4	2	-4	2	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_3	86.0736119067085	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTCTTTCTCGGTGTCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	165957987	165981709	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_165958174_165974207_165974363_165980136_165980354_165981478
tx.9291	chr19	-	1493	2	ISM	ENSMUSG00000006456.11	ENSMUST00000006625.8	3165	3	8475	353	8353	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	363	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGGTTGTCATTGTCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4853187	4850949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_4851834_4852578
tx.9293	chr19	-	1033	8	FSM	ENSMUSG00000034108.7	ENSMUST00000037246.7	1067	8	34	0	-11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	527	junction_5	30.737864703499	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTGTGTCTCTGTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4889326	4875393	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_4875693_4875797_4875902_4875971_4876050_4882860_4882922_4883368_4883547_4884200_4884339_4888858_4888932_4889224
tx.9294	chr19	+	1939	14	FSM	ENSMUSG00000083282.4	ENSMUST00000119694.3	1980	14	35	6	3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	86	junction_8	8.77530154238379	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGTGTGGTGTAAGTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4905192	4910940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_4905515_4905725_4905825_4906097_4906183_4906274_4906337_4906539_4906616_4907997_4908112_4908214_4908361_4908443_4908541_4908619_4908701_4909430_4909551_4909629_4909695_4909785_4909877_4910277_4910337_4910418
tx.9297	chr19	+	3617	2	FSM	ENSMUSG00000006463.14	ENSMUST00000162754.2	939	2	-1064	-1614	-1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	165	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	ATCATGTCTTTTTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4928730	4935424	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_4930427_4933503
tx.93	chr1	-	429	4	ISM	ENSMUSG00000026155.14	ENSMUST00000027339.14	2289	10	147	30749	147	-27579	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	425	junction_3	31.3723161756065	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTAAAACCTTCATCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23961251	23915454	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_23915531_23916789_23916876_23930940_23931075_23961118
tx.930	chr1	-	1561	12	FSM	ENSMUSG00000040629.9	ENSMUST00000038782.4	1546	12	-15	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_10	4.55453638177285	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGGCACTCTTGCTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166066328	166028953	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_166029305_166029843_166029920_166032358_166032492_166033421_166033485_166053158_166053301_166053405_166053461_166054134_166054260_166061733_166061776_166062969_166063126_166064441_166064542_166065831_166065925_166066103
tx.9300	chr19	-	2619	17	ISM	ENSMUSG00000063904.5	ENSMUST00000025851.4	2683	18	1224	0	0	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	689	junction_7	73.2661831525978	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTGCAGTGTATGTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4977091	4957256	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_4957826_4959873_4960037_4963800_4963981_4964607_4964729_4964837_4964963_4965046_4965110_4966306_4966400_4966725_4966839_4966919_4967115_4967899_4967959_4968047_4968179_4968272_4968404_4971168_4971263_4972349_4972425_4973094_4973233_4973711_4973802_4976812
tx.9301	chr19	-	2647	18	FSM	ENSMUSG00000063904.5	ENSMUST00000025851.4	2683	18	35	1	-5	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	495	junction_17	96.7659038009169	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTGCAGTGTATGTTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4978280	4957257	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_4957826_4959873_4960037_4963800_4963981_4964607_4964729_4964837_4964963_4965046_4965110_4966306_4966400_4966725_4966839_4966919_4967115_4967899_4967959_4968047_4968179_4968272_4968404_4971168_4971263_4972349_4972425_4973094_4973233_4973711_4973802_4976812_4977088_4978247
tx.9302	chr19	-	1210	6	ISM	ENSMUSG00000063904.5	ENSMUST00000235781.2	2556	17	11991	0	-5	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	722	junction_5	82.6065372715743	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTCTGCAGTGTATGTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4965100	4957258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_4957826_4959873_4960037_4963800_4963981_4964607_4964729_4964837_4964963_4965046
tx.9304	chr19	+	815	5	FSM	ENSMUSG00000024902.6	ENSMUST00000025836.6	3045	5	179	2051	-4	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	572	junction_2	14.5859521458148	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCAGCTTCTCTCCTGAG	3722	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5012353	5014976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5012544_5012906_5013003_5013353_5013448_5013533_5013694_5014701
tx.9305	chr19	+	438	2	ISM	ENSMUSG00000024902.6	ENSMUST00000237974.2	513	5	1173	-241	1129	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	600	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTCTCAGCTTCTCTCCTGAG	4899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5013530	5014976	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_5013694_5014701
tx.931	chr1	+	1944	8	FSM	ENSMUSG00000026563.14	ENSMUST00000027846.8	2215	8	271	0	29	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	160	junction_4	12.2357789173508	72	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCTTTTCCTGTTTATTCAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166206936	166221190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_166207046_166209695_166209788_166209965_166210032_166214234_166214333_166216130_166216341_166217404_166217557_166219391_166219555_166220136
tx.9310	chr19	+	2401	12	FSM	ENSMUSG00000024891.7	ENSMUST00000236152.2	2619	12	211	7	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	72	junction_1	10.4311992290135	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGACGGATTCCTGGAGTGTT	4269	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5074098	5081993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5074306_5074538_5074621_5076055_5076217_5076385_5076526_5077052_5077188_5077370_5077469_5077707_5077793_5078868_5079000_5079239_5079349_5079436_5079523_5080315_5080519_5081029
tx.9313	chr19	+	1374	10	FSM	ENSMUSG00000080268.5	ENSMUST00000116567.4	1388	10	9	5	9	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	224	junction_4	16.1528195757556	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTGGTGTGGCTGATGTGT	2739	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5091390	5099940	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5091519_5095920_5096067_5096163_5096255_5096421_5096550_5096677_5096758_5096842_5096940_5097419_5097513_5098536_5098602_5099020_5099061_5099434
tx.9315	chr19	+	1112	8	FSM	ENSMUSG00000024875.6	ENSMUST00000025811.6	1488	8	0	376	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	484	junction_7	32.2509294281512	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGGCTTGACCCTGGTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5138572	5142533	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5138777_5139446_5139659_5139799_5139905_5140031_5140111_5141395_5141454_5141568_5141725_5142156_5142251_5142329
tx.9316	chr19	-	1859	6	FSM	ENSMUSG00000024870.7	ENSMUST00000025804.7	1913	6	54	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	994	junction_1	78.6628247649422	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCGGTGGTGACTGAGTGTGG	1555	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5157046	5149232	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5150601_5150694_5150827_5154668_5154765_5154860_5154957_5155205_5155279_5156952
tx.932	chr1	-	1250	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000060568.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTGATATAATACATCAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	166850989	166843816	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr1_-_166845023_166850945
tx.9320	chr19	-	692	2	ISM	ENSMUSG00000024853.11	ENSMUST00000237781.2	1894	8	9521	0	9521	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3092	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTGGCTAACTACTTGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5324915	5323959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5324556_5324819
tx.9321	chr19	-	3191	21	FSM	ENSMUSG00000024853.11	ENSMUST00000025774.11	3222	21	31	0	-16	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	1448	junction_15	340.757138589935	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACTGGCTAACTACTTGGA	3897	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5345452	5323959	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5324556_5324819_5325006_5325091_5325192_5329296_5329399_5329497_5329641_5329869_5329978_5333670_5333779_5333885_5333976_5334602_5334753_5336216_5336445_5336604_5336686_5336838_5336977_5337096_5337313_5337562_5337655_5337937_5338035_5338331_5338442_5341332_5341451_5343107_5343348_5344326_5344405_5345068_5345116_5345289
tx.9322	chr19	-	1159	9	ISM	ENSMUSG00000024853.11	ENSMUST00000025774.11	3222	21	33	13137	-14	200	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1448	junction_3	167.102326435032	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTACAGAGGGTGGTGTGCTC	3899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5345450	5337096	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5337313_5337562_5337655_5337937_5338035_5338331_5338442_5341332_5341451_5343107_5343348_5344326_5344405_5345068_5345116_5345289
tx.9323	chr19	-	940	8	ISM	ENSMUSG00000024853.11	ENSMUST00000025774.11	3222	21	33	13606	-14	-265	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1448	junction_2	177.082593435829	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGGTTGGTGATGAAGCTTG	3899	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5345450	5337565	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5337655_5337937_5338035_5338331_5338442_5341332_5341451_5343107_5343348_5344326_5344405_5345068_5345116_5345289
tx.9324	chr19	-	821	5	ISM	ENSMUSG00000024853.11	ENSMUST00000235182.2	933	9	-21	3857	-16	74	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1668	junction_1	98.2445927265211	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	AATTGTTGTTTGCTTTTGTT	3897	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5345452	5341157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5341451_5343107_5343348_5344326_5344405_5345068_5345116_5345289
tx.9327	chr19	-	744	3	FSM	ENSMUSG00000024844.16	ENSMUST00000025762.16	1261	3	515	2	-47	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	4588	junction_2	727	471	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTTGGTGTTCTGTGTCAG	8696	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5416681	5414667	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5415187_5415845_5415985_5416595
tx.9328	chr19	+	1038	6	FSM	ENSMUSG00000024841.9	ENSMUST00000025759.9	2556	6	240	1278	36	-1278	multi-exon	TRUE	canonical	3	703	junction_2	59.7581793564697	1193	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTGGTGTCTGAGTGGCTC	2032	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5417008	5420276	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5417239_5418085_5418305_5418449_5418559_5418644_5418754_5418922_5418971_5419953
tx.9329	chr19	-	1054	6	ISM	ENSMUSG00000039330.6	ENSMUST00000235569.2	1726	8	1928	-2	1928	2	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	37	junction_4	4.9152822909778	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTACAGTGTGAGACTTCTGA	6912	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5450626	5440074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5440226_5440636_5440756_5440941_5441042_5444310_5444482_5449940_5450089_5450261
tx.933	chr1	-	1139	7	FSM	ENSMUSG00000026558.14	ENSMUST00000053686.9	4731	7	401	3191	-35	153	multi-exon	FALSE	canonical	3	994	junction_5	17.625738755203	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTTGTGTAACTGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167112488	167053642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_167054091_167055300_167055350_167057461_167057560_167062260_167062404_167064171_167064269_167065057_167065218_167112344
tx.9330	chr19	-	423	3	FSM	ENSMUSG00000024914.17	ENSMUST00000124478.8	674	3	248	3	248	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	999	junction_1	16	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATTTTGGTTTCTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5473703	5472835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5473054_5473358_5473448_5473587
tx.9331	chr19	-	457	4	ISM	ENSMUSG00000024914.17	ENSMUST00000136579.3	734	6	687	-35	96	1	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	999	junction_1	13.0724477007517	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATTTTGGTTTCTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5473855	5472835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5473054_5473358_5473448_5473587_5473682_5473799
tx.9332	chr19	-	817	7	FSM	ENSMUSG00000024914.17	ENSMUST00000113674.8	939	7	141	-19	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	65	junction_3	385.460655147405	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATTTTGGTTTCTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5474808	5472835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5473054_5473358_5473448_5473587_5473703_5473799_5473920_5474209_5474304_5474388_5474462_5474700
tx.9333	chr19	-	799	7	FSM	ENSMUSG00000024914.17	ENSMUST00000025853.16	992	7	196	-3	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	999	junction_1	76.7282361469506	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATTTTGGTTTCTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5474811	5472835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5473054_5473358_5473448_5473587_5473682_5473799_5473920_5474209_5474304_5474388_5474462_5474700
tx.9334	chr19	-	748	7	NNC	ENSMUSG00000024914.17	novel	992	7	NA	NA	-72	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	3	junction_6	406.756547444401	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGATTTTGGTTTCTTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5475079	5472835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_5473054_5473358_5473448_5473587_5473682_5473799_5473920_5474209_5474304_5474388_5474462_5475019
tx.9335	chr19	+	1478	2	FSM	ENSMUSG00000047423.11	ENSMUST00000159759.3	1528	2	53	-3	40	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	164	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACACTGTCCTGATGGTTATC	300	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5475224	5477344	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5475337_5475978
tx.9336	chr19	-	868	2	FSM	ENSMUSG00000095098.3	ENSMUST00000236881.2	4165	2	-61	3358	-61	-3358	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGAAGCCTGGCCAGCTTGTG	5270	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5507593	5506570	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5507213_5507367
tx.9337	chr19	+	1210	10	FSM	ENSMUSG00000024911.8	ENSMUST00000225141.2	1209	10	0	-1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	126	junction_5	12.1837779216647	210	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGGTCCTTGTTCCAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5510643	5515080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5510807_5510988_5511188_5511417_5511545_5512559_5512661_5513198_5513333_5513631_5513741_5513814_5513879_5514156_5514244_5514361_5514460_5514952
tx.9338	chr19	+	1229	10	FSM	ENSMUSG00000024911.8	ENSMUST00000025847.7	1215	10	-11	-3	2	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_5	35.2423706830007	53	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGGTCCTTGTTCCAGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5510645	5515080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5510807_5510988_5511188_5511417_5511545_5512559_5512661_5513198_5513354_5513631_5513741_5513814_5513879_5514156_5514244_5514361_5514460_5514952
tx.9339	chr19	+	372	3	ISM	ENSMUSG00000024911.8	ENSMUST00000226017.2	721	4	426	-3	-210	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	136	junction_1	6	60	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GACTGGTCCTTGTTCCAGGT	3182	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5514097	5515080	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_5514244_5514361_5514460_5514952
tx.934	chr1	-	1204	7	NNC	ENSMUSG00000026558.14	novel	4731	7	NA	NA	11030	153	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	45	junction_6	361.009541271265	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTTTTGTGTAACTGTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167101140	167053642	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_-_167054091_167055300_167055350_167057461_167057560_167062260_167062404_167064171_167064269_167065057_167065218_167100931
tx.9340	chr19	-	334	3	FSM	ENSMUSG00000024906.11	ENSMUST00000140365.8	393	3	59	0	59	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_2	1.5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAAGCAATGCCAAGGTCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5533542	5532867	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5533058_5533135_5533220_5533482
tx.9341	chr19	-	772	2	FSM	ENSMUSG00000024906.11	ENSMUST00000144422.2	748	2	-13	-11	-13	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGACATGGGTAGGGCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5538352	5537484	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5537920_5538015
tx.9342	chr19	+	1120	4	FSM	ENSMUSG00000056201.9	ENSMUST00000209469.2	2354	4	66	1168	5	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	6173	junction_3	71.2850303749361	5530	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTTTTGGGTTTGGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5540548	5544061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5540631_5542524_5542833_5543182_5543260_5543408
tx.9343	chr19	+	1039	3	ISM	ENSMUSG00000056201.9	ENSMUST00000116560.3	1148	6	2011	-4	1931	4	intron_retention	FALSE	canonical	3	6173	junction_2	53.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGGCTTTTGGGTTTGGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5542523	5544061	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_5542833_5543182_5543260_5543408
tx.9345	chr19	+	622	4	FSM	ENSMUSG00000024925.12	ENSMUST00000025864.11	1126	4	2	502	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	228	junction_3	35.9845645921816	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGAGTCTGTGGGCACCT	5047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5651902	5652965	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_5652109_5652220_5652403_5652477_5652598_5652851
tx.9347	chr19	-	1903	12	FSM	ENSMUSG00000024926.11	ENSMUST00000235701.2	1905	12	3	-1	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_9	58.4797768251612	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTATCAGGAGTTCTTAC	3632	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5660073	5653043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5653581_5653661_5653744_5653857_5654018_5655399_5655494_5655570_5655712_5657578_5657669_5657743_5657993_5658282_5658358_5658665_5658741_5659263_5659401_5659490_5659560_5659879
tx.9349	chr19	-	1807	13	FSM	ENSMUSG00000024926.11	ENSMUST00000236229.2	1386	13	-19	-402	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	222	junction_9	61.0948147463342	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCTATCAGGAGTTCTTAC	3629	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5660076	5653043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5653581_5653661_5653744_5653857_5654018_5655399_5655494_5655570_5655712_5657578_5657669_5657743_5657993_5658282_5658358_5658665_5658741_5659263_5659401_5659490_5659560_5659879_5659947_5660045
tx.935	chr1	+	1219	7	FSM	ENSMUSG00000052428.11	ENSMUST00000195015.6	1573	7	355	-1	-3	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	491	junction_3	23.6108496717552	360	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTTGTCTCCTGTTCAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167136301	167158355	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_167136503_167136874_167136953_167141675_167141736_167143811_167143859_167146830_167146899_167153444_167153590_167157735
tx.9356	chr19	-	644	3	ISM	ENSMUSG00000079478.10	ENSMUST00000025885.6	699	4	130	5	63	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	466	junction_2	18.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGTGGTTTGTTCTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5781625	5780335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5780741_5781268_5781354_5781471
tx.9357	chr19	-	689	4	FSM	ENSMUSG00000079478.10	ENSMUST00000025885.6	699	4	5	5	5	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	466	junction_2	15.6276108929747	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCGTGGTTTGTTCTTTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5781750	5780335	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5780741_5781268_5781354_5781471_5781624_5781703
tx.936	chr1	+	2413	11	FSM	ENSMUSG00000026687.15	ENSMUST00000028004.11	2835	11	177	245	-68	-245	multi-exon	FALSE	canonical	3	593	junction_2	45.3586816386896	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTGTGTTTTTCTGTCCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167177736	167195856	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_167177986_167180088_167180235_167181995_167182126_167183240_167183376_167184098_167184296_167184878_167185020_167188971_167189161_167189372_167189461_167192076_167192219_167193343_167193457_167194973
tx.9365	chr19	-	2397	11	FSM	ENSMUSG00000024826.16	ENSMUST00000136983.8	3314	11	58	859	-6	12	multi-exon	FALSE	canonical	3	642	junction_2	68.1739686390634	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTTTGTCTCTTGACTCCT	1330	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5962841	5947402	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5948660_5951244_5951327_5952131_5952245_5952390_5952520_5952658_5952797_5954267_5954347_5954481_5954575_5955416_5955581_5956551_5956660_5957028_5957190_5962768
tx.9366	chr19	-	299	3	ISM	ENSMUSG00000024826.16	ENSMUST00000142995.8	725	4	-44	1441	-6	-1030	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	781	junction_2	34.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCACCTGAGGATCCCAGGCT	1330	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5962841	5956594	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_5956660_5957028_5957190_5962768
tx.937	chr1	-	671	6	FSM	ENSMUSG00000026688.6	ENSMUST00000028005.3	1097	6	11	415	11	-415	multi-exon	FALSE	canonical	3	373	junction_1	22.7912263820971	987	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTCCTGCCTGCATCTCTTT	4967	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	167221399	167199949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_167200212_167201361_167201435_167203020_167203079_167204829_167204904_167205860_167205985_167221319
tx.9371	chr19	-	2416	18	FSM	ENSMUSG00000024833.16	ENSMUST00000025752.15	2421	18	1	4	1	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	334	junction_17	37.0964328301216	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGATTTTAATCTTTTTTTT	1627	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6014229	5990573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_5991046_5992023_5992151_5992377_5992438_5993250_5993358_5993582_5993692_5996497_5996572_5997731_5997771_5998429_5998555_6000473_6000517_6001169_6001233_6001658_6001815_6003092_6003182_6003718_6003913_6006035_6006143_6008845_6008904_6009060_6009153_6011118_6011244_6013853
tx.9379	chr19	-	688	4	FSM	ENSMUSG00000007338.11	ENSMUST00000007482.8	1764	4	27	1049	0	260	multi-exon	FALSE	canonical	3	907	junction_2	10.0332779621949	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCATGTGTCCACTTGAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6107788	6104700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_6105013_6105105_6105231_6106958_6107110_6107688
tx.9380	chr19	+	557	5	FSM	ENSMUSG00000038274.14	ENSMUST00000178310.9	613	5	56	0	-42	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	11442	junction_1	1294.53167207295	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTATGTTTTCTTCATT	1038	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6107929	6109549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6108032_6108272_6108356_6108457_6108603_6109173_6109230_6109378
tx.9381	chr19	+	545	5	FSM	ENSMUSG00000038274.14	ENSMUST00000043074.14	508	5	-34	-3	-33	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1236	junction_1	5677.26170790109	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTATGTTTTCTTCATT	1047	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6107938	6109549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6108032_6108275_6108356_6108457_6108603_6109173_6109230_6109378
tx.9382	chr19	+	521	5	FSM	ENSMUSG00000038274.14	ENSMUST00000236217.2	503	5	-18	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	54	junction_1	6188.20864628852	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTATGTTTTCTTCATT	1089	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6107980	6109549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6108032_6108257_6108356_6108457_6108603_6109173_6109230_6109378
tx.9383	chr19	+	585	4	FSM	ENSMUSG00000038274.14	ENSMUST00000237840.2	472	4	-110	-3	-110	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	14010	junction_2	399.82023738453	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTATGTTTTCTTCATT	1251	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6108142	6109549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6108356_6108457_6108603_6109173_6109230_6109378
tx.9384	chr19	-	1477	10	FSM	ENSMUSG00000024799.17	ENSMUST00000025713.12	1471	10	-6	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	192	junction_3	30.8704981223334	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTGTGTTTTTCTTCTATCC	9955	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6117878	6112850	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_6113104_6113353_6113477_6113556_6113638_6113851_6114021_6114108_6114229_6116340_6116445_6116528_6116724_6116997_6117053_6117152_6117350_6117698
tx.9385	chr19	-	1343	8	FSM	ENSMUSG00000024792.10	ENSMUST00000160977.8	922	8	-15	-406	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	381	junction_7	88.3658905474556	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCTGAAGCAGCTTTTTC	6453	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6134960	6130791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_6131245_6131876_6131995_6132210_6132358_6132428_6132502_6132614_6132809_6133978_6134091_6134381_6134492_6134824
tx.9386	chr19	-	1282	8	FSM	ENSMUSG00000024792.10	ENSMUST00000025707.9	1287	8	5	0	5	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	219	junction_7	142.172789382555	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTTCTGAAGCAGCTTTTTC	6445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6134968	6130791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_6131245_6131876_6131995_6132210_6132358_6132428_6132502_6132614_6132809_6133978_6134091_6134381_6134492_6134893
tx.9387	chr19	+	1957	6	FSM	ENSMUSG00000024791.11	ENSMUST00000025704.3	2024	6	63	4	63	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	368	junction_5	42.0218990527558	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACGTTTGCAGACTGCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6135075	6141803	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6135239_6135427_6135520_6136431_6136498_6136581_6136618_6140080_6140555_6140677
tx.9390	chr19	-	877	5	FSM	ENSMUSG00000024944.7	ENSMUST00000025893.7	1286	5	407	2	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	648	junction_1	48.4890451545501	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCTGGCTGAGCCATTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6191171	6184414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_6184832_6186008_6186090_6187507_6187671_6187759_6187871_6191066
tx.94	chr1	-	653	3	FSM	ENSMUSG00000026154.5	ENSMUST00000027338.4	683	3	24	6	-2	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	315	junction_1	0.5	2771	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTAGATTTATTATTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24044713	24035025	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_24035442_24042237_24042388_24044626
tx.940	chr1	-	2096	15	FSM	ENSMUSG00000026683.15	ENSMUST00000028000.13	2068	15	-28	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	87	junction_14	29.0531708199618	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTGTTATCCAGGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	169359025	169325879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_169326490_169332033_169332170_169333550_169333727_169334812_169334954_169337968_169338107_169339735_169339799_169341013_169341111_169342480_169342555_169344129_169344228_169349939_169350002_169350423_169350501_169351472_169351548_169352880_169353019_169356304_169356381_169358890
tx.9408	chr19	+	548	4	FSM	ENSMUSG00000032946.17	ENSMUST00000113471.3	535	4	-13	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	116.70761186258	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGAGTGAGGGTCATGTCACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6451718	6453668	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6451894_6452501_6452605_6453053_6453117_6453461
tx.941	chr1	-	2017	14	FSM	ENSMUSG00000026683.15	ENSMUST00000111368.8	2405	14	11	377	11	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	65	junction_13	32.5556419455247	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTACTGTTATCCAGGATGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	169359022	169325879	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_169326490_169332033_169332170_169333550_169333727_169334812_169334954_169337968_169338107_169339735_169339799_169341013_169341111_169342480_169342555_169344129_169344228_169349939_169350002_169350423_169350501_169351472_169351548_169352880_169353019_169358890
tx.9412	chr19	+	678	5	ISM	ENSMUSG00000032946.17	ENSMUST00000149205.2	919	7	4641	-2	4641	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	149	junction_1	9.57535900110278	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATCAGCCTAAAACCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6463075	6465243	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_6463257_6463457_6463495_6463894_6464072_6464821_6464885_6465023
tx.9416	chr19	-	1232	6	FSM	ENSMUSG00000024953.18	ENSMUST00000025904.12	1262	6	30	0	30	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	493	junction_5	11.3912246927185	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCACTGGTACAGGGTTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6887444	6884073	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_6884320_6884433_6884496_6884609_6884649_6884909_6885042_6885349_6885485_6886826
tx.9417	chr19	+	994	4	FSM	ENSMUSG00000038812.17	ENSMUST00000116551.10	985	4	-9	0	-9	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	803	junction_1	23.6971634495683	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGGTTTCTCTTTGCAGCAA	9305	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6887105	6888396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6887631_6887730_6887833_6887951_6888042_6888119
tx.9425	chr19	+	920	4	FSM	ENSMUSG00000024959.15	ENSMUST00000113423.10	990	4	70	0	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	67	junction_1	15.9234278833282	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCGCGCCTCTATCCTTCG	9391	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6919938	6929261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6919993_6920234_6920415_6928007_6928199_6928766
tx.9426	chr19	+	867	3	FSM	ENSMUSG00000024959.15	ENSMUST00000235240.2	1169	3	302	0	-13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_1	2.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCCGCGCCTCTATCCTTCG	9686	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6920233	6929261	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6920415_6928007_6928199_6928766
tx.9429	chr19	+	716	4	FSM	ENSMUSG00000056612.8	ENSMUST00000070850.8	999	4	281	2	8	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	3100	junction_3	78.5295415043848	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AACAGGCTTGGCTGGTCTTT	1861	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6952616	6954690	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_6952875_6953911_6953996_6954225_6954259_6954349
tx.9430	chr19	-	1071	6	FSM	ENSMUSG00000024963.13	ENSMUST00000025915.13	1074	6	3	0	3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	154	junction_3	27.3978101314685	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTCCGATTCGGTCCTTCAG	9279	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6969868	6965278	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_6965477_6965556_6965644_6966790_6966956_6967048_6967234_6968085_6968180_6969526
tx.9433	chr19	-	1053	6	FSM	ENSMUSG00000037349.10	ENSMUST00000041686.10	1000	6	-53	0	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	112	junction_2	17.04582060213	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCGTTAGCTTCTGCTGCT	6992	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6973458	6970385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_6970571_6970800_6970895_6971029_6971128_6972038_6972138_6972609_6973104_6973375
tx.9442	chr19	-	1031	7	FSM	ENSMUSG00000024767.12	ENSMUST00000025679.11	1713	7	38	644	38	-636	multi-exon	TRUE	canonical	3	1089	junction_1	76.373351955305	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCCGAGTGTGCGCTTCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7183643	7176210	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_7176605_7176736_7176932_7177027_7177113_7177307_7177427_7181422_7181522_7181754_7181817_7183566
tx.9443	chr19	-	497	2	FSM	ENSMUSG00000035885.6	ENSMUST00000039758.6	550	2	45	8	-28	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	12296	junction_1	0	2066	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGAAATGCATCATGTCC	7411	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7194936	7192525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_7192850_7194763
tx.9445	chr19	+	485	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035885.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AACCAGCCGGAAGTTCCGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7192526	7194936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_+_7192842_7194766
tx.9446	chr19	-	964	2	ISM	ENSMUSG00000024758.16	ENSMUST00000235593.2	2403	9	53455	-569	53390	569	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	635	junction_1	0	155	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATCTGCATGTGGGCTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7407177	7404338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_7405241_7407115
tx.9447	chr19	-	1736	7	FSM	ENSMUSG00000024758.16	ENSMUST00000088169.7	2762	7	-47	1073	18	569	multi-exon	FALSE	canonical	3	635	junction_1	35.2735343029618	468	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TAATCTGCATGTGGGCTCCC	8992	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7460614	7404338	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_7405241_7407115_7407175_7408350_7408398_7409330_7409401_7409816_7409956_7412295_7412504_7460303
tx.9448	chr19	-	587	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024759.15_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCTGAACTTGGATAGAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7471510	7470164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_7470413_7471171
tx.9449	chr19	+	1990	13	FSM	ENSMUSG00000024759.15	ENSMUST00000025668.9	4368	13	-21	2399	19	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	31	junction_6	6.18409698788397	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCTTGGAAGCAGTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7471781	7511566	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_7472027_7486712_7486928_7487347_7487492_7494242_7494348_7495910_7495962_7498151_7498209_7498474_7498568_7499433_7499573_7506306_7506435_7506972_7507030_7507884_7507957_7509380_7509813_7511314
tx.9450	chr19	+	782	5	FSM	ENSMUSG00000060675.14	ENSMUST00000025925.11	3523	5	-3	2744	-3	-910	multi-exon	TRUE	canonical	3	141	junction_1	31.8825971338597	475	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGCAGTAGCTACCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7534820	7563166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_7534930_7535296_7535361_7552301_7552405_7556318_7556588_7562929
tx.9451	chr19	+	1000	5	FSM	ENSMUSG00000060675.14	ENSMUST00000136756.2	1901	5	-9	910	-1	-910	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_1	71.8135606971274	115	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGCAGTAGCTACCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7534840	7563166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_7535168_7535296_7535361_7552301_7552405_7556318_7556588_7562929
tx.9452	chr19	+	1098	4	NIC	ENSMUSG00000060675.14	novel	1901	5	NA	NA	22	-910	intron_retention	FALSE	canonical	3	191	junction_2	16.9771087709958	41	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACTGCAGTAGCTACCTGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7534871	7563166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_7535361_7552301_7552405_7556318_7556588_7562929
tx.9453	chr19	-	2467	10	FSM	ENSMUSG00000024972.17	ENSMUST00000159983.8	2470	10	4	-1	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_8	5.03322295684717	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTACTCATATGTTAGTGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7584554	7574023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_7575537_7576124_7576276_7578012_7578102_7578610_7578638_7579407_7579447_7580373_7580494_7581333_7581548_7581668_7581758_7584026_7584189_7584491
tx.9454	chr19	-	1432	8	FSM	ENSMUSG00000010095.14	ENSMUST00000206598.2	1393	8	-19	-20	-19	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	2940	junction_7	103.964868477534	1130	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGACTTTCATCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8690368	8684930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_8685459_8685557_8685642_8686368_8686510_8686593_8686775_8686913_8686973_8687078_8687148_8689197_8689293_8690093
tx.9455	chr19	-	1865	9	FSM	ENSMUSG00000010095.14	ENSMUST00000010239.6	1819	9	4	-50	4	20	multi-exon	FALSE	canonical	3	2610	junction_8	198.183902915953	1005	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGACTTTCATCCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8691239	8684930	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_8685459_8685557_8685642_8686368_8686510_8686593_8686775_8686913_8686973_8687078_8687148_8689197_8689293_8690093_8690268_8690705
tx.9456	chr19	+	574	9	FSM	ENSMUSG00000108414.2	ENSMUST00000205909.2	709	9	135	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	781	junction_1	124.260814418706	657	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATTGTGATGGCTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8701503	8703807	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_8701554_8701766_8701848_8702035_8702086_8702377_8702411_8702585_8702621_8702848_8702888_8703145_8703191_8703430_8703467_8703602
tx.9458	chr19	+	1226	11	FSM	ENSMUSG00000042729.12	ENSMUST00000049424.11	1204	11	-22	0	-10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1012	junction_8	78.6635875103596	1143	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGGACCTTTTGTGATGG	953	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8713180	8717988	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_8713270_8713350_8713458_8713539_8713662_8715017_8715094_8715211_8715359_8715516_8715619_8716629_8716731_8716810_8716867_8717182_8717329_8717459_8717517_8717765
tx.9459	chr19	-	838	5	FSM	ENSMUSG00000118346.2	ENSMUST00000010249.7	818	5	7	-27	7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	161	junction_4	40.2833712591188	574	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCATGGATTTCTTGATGT	5081	False	NA	28	True	NA	NA	NA	8751824	8749888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_8750199_8750391_8750471_8750653_8750789_8750868_8751057_8751698
tx.9460	chr19	-	871	8	FSM	ENSMUSG00000071662.5	ENSMUST00000096261.5	890	8	19	0	19	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1319	junction_5	79.6292429106959	4673	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTGGTTTGGTTTTATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8775922	8770490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_8770769_8770989_8771024_8771499_8771572_8771665_8771732_8771843_8771895_8774599_8774760_8775587_8775698_8775822
tx.9461	chr19	+	1920	2	NNC	ENSMUSG00000071661.8	novel	2004	2	NA	NA	-63	7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	10	junction_1	0	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GAACTGGTGTTGGCTGGTTT	5365	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8779855	8782217	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_8779896_8780337
tx.9462	chr19	+	2067	2	FSM	ENSMUSG00000071661.8	ENSMUST00000172175.3	2004	2	-53	-10	-53	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGGTGTTGGCTGGTTTCTT	5375	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8779865	8782220	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_8780050_8780337
tx.9463	chr19	+	1861	13	ISM	ENSMUSG00000071659.5	ENSMUST00000096753.5	5118	14	2848	2399	2586	-2399	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	96	junction_3	15.0966791786214	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATTGTCTTATTCTATAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8800221	8809108	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_8800304_8800593_8800671_8800893_8801034_8801584_8801676_8801769_8801883_8802223_8802488_8802634_8802758_8803335_8803465_8804007_8804177_8807113_8807315_8808251_8808326_8808588_8808697_8808818
tx.9464	chr19	-	782	3	FSM	ENSMUSG00000071658.6	ENSMUST00000096259.6	1643	3	-16	877	-16	-877	multi-exon	TRUE	canonical	3	189	junction_2	8	473	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGACAACGTCTGTGTTAGCG	4746	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8816574	8815173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_8815636_8815917_8816018_8816354
tx.9465	chr19	+	1077	10	FSM	ENSMUSG00000071655.13	ENSMUST00000166407.9	1033	10	-36	-8	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	339	junction_1	323.787653323045	435	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCCTGGCTCCTTCCAGA	5876	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8848886	8853028	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_8848950_8849034_8849121_8849222_8849277_8849371_8849479_8849581_8849652_8850877_8851070_8851158_8851211_8851502_8851620_8852523_8852717_8852885
tx.9466	chr19	-	737	2	FSM	ENSMUSG00000071654.7	ENSMUST00000096253.7	821	2	20	64	20	-64	multi-exon	FALSE	canonical	3	500	junction_1	0	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGGTTTTGTATGTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8858267	8857441	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_8857981_8858069
tx.9467	chr19	-	102	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000093314.3	novel	76	1	NA	NA	4	312	multi-exon	FALSE	canonical	3	548	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACCCTGTGTTCGCTACCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8866134	8865750	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_-_8865832_8866113
tx.9468	chr19	+	619	4	FSM	ENSMUSG00000071653.10	ENSMUST00000096251.10	806	4	47	140	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2965	junction_2	196.086715511276	293	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCGTGTGGGATGAAGTGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8866263	8868105	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_8866329_8866487_8866613_8867366_8867465_8867774
tx.9473	chr19	+	1439	10	FSM	ENSMUSG00000071644.11	ENSMUST00000052248.8	1864	10	128	297	128	-297	multi-exon	FALSE	canonical	3	5201	junction_1	1272.81743475733	16439	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTTTTCCTGTCCTGCCTCC	971	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8944532	8955546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_8944590_8945579_8945739_8946525_8946590_8946727_8946871_8947207_8947352_8949870_8950001_8950267_8950473_8954681_8954855_8954948_8955074_8955307
tx.9474	chr19	+	1149	7	NIC	ENSMUSG00000069833.14	novel	1188	7	NA	NA	1	17	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	11	junction_5	26.9222130508537	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCATGATGGGTTTTGCGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8966648	9054295	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_8966794_8977025_8977137_8977463_8977621_8978039_8978228_9014522_9014623_9022988_9023081_9053939
tx.9475	chr19	+	1055	6	FSM	ENSMUSG00000069833.14	ENSMUST00000092955.11	830	6	-10	-215	1	15	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_5	17.6703140888893	50	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCACCATGATGGGTTTTGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8966648	9054293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_8966794_8977025_8977137_8977463_8977621_8978039_8978228_9014522_9014623_9053939
tx.9476	chr19	-	1388	7	FSM	ENSMUSG00000024654.9	ENSMUST00000049948.6	4195	7	27	2780	27	-2780	multi-exon	FALSE	canonical	3	393	junction_3	31.0344790336311	529	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTGTAAGAAAGACCCAGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9112973	9090011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_9090573_9091547_9091659_9093865_9093985_9095892_9096051_9096551_9096695_9112150_9112352_9112878
tx.9477	chr19	-	814	5	ISM	ENSMUSG00000024654.9	ENSMUST00000049948.6	4195	7	16304	3060	16199	-3060	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	393	junction_3	13.7181449183189	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CGCAGTCTGTCCCTCCTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9096696	9090291	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_9090573_9091547_9091659_9093865_9093985_9095892_9096051_9096551
tx.9478	chr19	-	1294	6	ISM	ENSMUSG00000024654.9	ENSMUST00000049948.6	4195	7	649	2779	544	-2779	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	393	junction_3	33.0611554547024	80	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTAAGAAAGACCCAGGTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9112351	9090010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_9090573_9091547_9091659_9093865_9093985_9095892_9096051_9096551_9096695_9112150
tx.9479	chr19	+	1191	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000067608.6	novel	781	1	NA	NA	-142	351	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCAAGTGACCATAGGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9260601	9261875	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_+_9261246_9261328
tx.9480	chr19	-	559	3	Intergenic	novelGene_880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAATCTGTCTGTTGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9493140	9446152	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_9446306_9454039_9454152_9492846
tx.9481	chr19	+	446	2	NNC	ENSMUSG00000100141.2	novel	1112	2	NA	NA	-296	-1003	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ATTATGCACCTCACAAATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9584171	9584737	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_9584206_9584325
tx.9482	chr19	-	1100	5	ISM	ENSMUSG00000024660.10	ENSMUST00000237439.2	2643	18	18641	-335	1820	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	446	junction_4	34.9070193514141	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGCTGTGGATATTGTGA	NA	False	NA	-42	True	NA	NA	NA	9854183	9849705	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_9850238_9851583_9851735_9852179_9852288_9852461_9852541_9853953
tx.9483	chr19	+	590	2	FSM	ENSMUSG00000118100.2	ENSMUST00000235252.2	330	2	-257	-3	-12	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGCCTTGCTCATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9877041	9878478	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_9877385_9878231
tx.9484	chr19	+	869	4	FSM	ENSMUSG00000024661.8	ENSMUST00000025563.8	929	4	55	5	-3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5325	junction_2	217.148694574836	18038	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCTTTTCTTTGTGATTG	4924	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	9960064	9962457	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_9960348_9961544_9961692_9961923_9962050_9962144
tx.9489	chr19	-	2203	2	FSM	ENSMUSG00000024742.16	ENSMUST00000025651.6	2341	2	138	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	832	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGAATGTGTCTGAATGTT	2168	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10181294	10176501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10178462_10181051
tx.9490	chr19	-	2091	2	FSM	ENSMUSG00000024742.16	ENSMUST00000116542.9	2100	2	9	0	9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	443	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCAGAATGTGTCTGAATGTT	2164	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10181298	10176501	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10178462_10181167
tx.9491	chr19	+	404	4	FSM	ENSMUSG00000036372.15	ENSMUST00000040372.14	606	4	196	6	-8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	2797	junction_1	495.826806679734	5436	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCTGCCTCATGTCCATTC	4173	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10181573	10185182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_10181629_10183787_10183898_10184527_10184665_10185080
tx.9492	chr19	+	350	3	ISM	ENSMUSG00000036372.15	ENSMUST00000166412.2	447	4	390	6	390	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3159	junction_2	411.5	1137	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGCCTGCCTCATGTCCATTC	252	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10183786	10185182	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_10183898_10184527_10184665_10185080
tx.9493	chr19	+	621	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000035735.11_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AGAACACTGACTGCGTCGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10229372	10231575	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_+_10229452_10230717_10230922_10231237
tx.9494	chr19	-	1793	4	FSM	ENSMUSG00000024668.9	ENSMUST00000235243.2	997	4	-96	-700	-6	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_2	80.2426874480715	47	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAATATATTATTGTTTGATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10502552	10479007	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10480494_10494343_10494454_10494683_10494751_10502422
tx.9495	chr19	-	1942	4	FSM	ENSMUSG00000024668.9	ENSMUST00000025570.8	2981	4	-73	1112	-6	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	201	junction_1	14.7196014438797	347	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGAATATATTATTGTTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10502552	10479009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10480494_10494343_10494454_10494532_10494751_10502422
tx.9496	chr19	-	2044	5	FSM	ENSMUSG00000024668.9	ENSMUST00000235853.2	2025	5	-26	7	0	-7	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_4	101.25802437338	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGGAATATATTATTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10502546	10479011	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10480494_10494343_10494454_10494532_10494751_10498312_10498423_10502422
tx.9497	chr19	+	1017	6	ISM	ENSMUSG00000034820.5	ENSMUST00000235162.2	3124	7	-18	3405	-18	186	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	152	junction_5	49.9983999743992	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTCCCCCCACCAAATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10502611	10512799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_10502692_10503315_10503425_10509144_10509364_10510183_10510288_10510656_10510830_10512467
tx.9498	chr19	-	1031	5	FSM	ENSMUSG00000024667.13	ENSMUST00000154383.2	927	5	-17	-87	-12	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	49	junction_4	15.1224171348366	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGGGCTGGTTGATTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10533132	10527826	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10528405_10529136_10529339_10531892_10531986_10532426_10532529_10533076
tx.9499	chr19	-	1613	5	FSM	ENSMUSG00000024666.7	ENSMUST00000025568.3	1590	5	-23	0	-23	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	102	junction_4	27.5896266738062	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTCTTGGTGTCTTCATGGT	1487	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10554749	10547841	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10548633_10548892_10548969_10552200_10552373_10552603_10552876_10554447
tx.95	chr1	+	2008	16	FSM	ENSMUSG00000073725.9	ENSMUST00000191471.7	4453	16	31	2414	1	641	multi-exon	FALSE	canonical	3	113	junction_9	21.4185796810983	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCCCTTTGTTGCTTTTAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24717741	24802115	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_24717898_24724477_24724655_24732021_24732083_24743901_24744000_24745057_24745126_24750592_24750682_24753989_24754064_24767626_24767753_24770827_24770981_24782963_24783029_24783336_24783440_24783946_24784052_24785885_24786036_24787880_24787960_24801272_24801365_24801703
tx.9500	chr19	+	2850	8	FSM	ENSMUSG00000034445.9	ENSMUST00000237814.2	3130	8	281	-1	-1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	19.4768308196049	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTCTCTTTTGTTCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10554816	10567194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_10555448_10556345_10556439_10557826_10557927_10559661_10559861_10562545_10562755_10564054_10564210_10565185_10565343_10565888
tx.9501	chr19	+	2328	8	NIC	ENSMUSG00000034445.9	novel	2634	9	NA	NA	1	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	18	junction_1	27.7319531315376	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAGAGGTCTCTTTTGTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10554815	10567191	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_10554928_10556345_10556439_10557826_10557927_10559661_10559861_10562545_10562755_10564054_10564210_10565185_10565343_10565888
tx.9502	chr19	+	2239	7	NIC	ENSMUSG00000034445.9	novel	2661	8	NA	NA	0	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	17	junction_1	29.2845237853262	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGGTCTCTTTTGTTCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10554814	10567194	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_10554928_10557826_10557927_10559661_10559861_10562545_10562755_10564054_10564210_10565185_10565343_10565888
tx.9503	chr19	+	2758	7	FSM	ENSMUSG00000034445.9	ENSMUST00000168445.2	1474	7	0	-1284	0	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	16	junction_1	29.6516816086748	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCTCTTTTGTTCAGACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10554817	10567196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_10555448_10557826_10557927_10559661_10559861_10562545_10562755_10564054_10564210_10565185_10565343_10565888
tx.9504	chr19	-	2307	18	FSM	ENSMUSG00000034371.10	ENSMUST00000236607.2	2516	18	210	-1	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_17	13.858404068355	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGACTTTGTCCCTGTTTACA	9729	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10582808	10569560	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10570154_10570510_10570601_10570689_10570724_10570827_10570932_10571033_10571141_10571794_10571933_10572066_10572187_10572657_10572775_10573375_10573466_10573561_10573647_10573721_10573757_10574295_10574386_10574673_10574753_10576395_10576578_10576671_10576783_10577934_10578125_10581531_10581638_10582772
tx.9505	chr19	+	4216	27	FSM	ENSMUSG00000024740.11	ENSMUST00000025649.10	4459	27	246	-3	-14	3	multi-exon	FALSE	canonical	3	2606	junction_4	266.254060724097	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTATTGGTCTCTGCTTT	616	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10582936	10607186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_10583131_10584208_10584358_10585156_10585274_10585614_10585837_10588065_10588181_10589007_10589106_10590236_10590396_10591471_10591556_10592215_10592333_10592851_10592955_10596412_10596489_10596583_10596693_10598904_10599084_10599184_10599349_10599425_10599534_10599653_10599862_10600702_10600799_10600890_10601003_10602087_10602212_10602530_10602696_10603259_10603355_10603955_10604127_10604489_10604600_10604852_10605023_10605125_10605229_10605788_10605913_10606442
tx.9506	chr19	+	1796	9	ISM	ENSMUSG00000024740.11	ENSMUST00000025649.10	4459	27	19407	-3	-313	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	3022	junction_4	211.272927749866	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTTATTGGTCTCTGCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10602097	10607186	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_10602212_10602530_10602696_10603259_10603355_10603955_10604127_10604489_10604600_10604852_10605023_10605125_10605229_10605788_10605913_10606442
tx.9507	chr19	+	2683	5	FSM	ENSMUSG00000048832.10	ENSMUST00000087951.7	2686	5	2	1	2	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	85	junction_1	17.2699160391705	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCTGTGGTGTCCATGATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10666116	10691989	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_10666344_10683573_10683673_10687633_10687806_10688634_10688718_10689887
tx.9508	chr19	+	2501	4	NIC	ENSMUSG00000048832.10	novel	2686	5	NA	NA	-2	2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	6	junction_2	51.9893151415643	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTCTGTGGTGTCCATGAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10666124	10691987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_10666344_10683573_10683673_10688634_10688718_10689887
tx.9510	chr19	-	1927	4	FSM	ENSMUSG00000034659.15	ENSMUST00000038128.15	2188	4	261	0	-9	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	149	junction_2	8.28653526310404	66	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCTCTGCTGACAAACTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10859104	10848023	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10849514_10849950_10850054_10851605_10851851_10859015
tx.9511	chr19	+	2119	16	FSM	ENSMUSG00000024735.14	ENSMUST00000025642.14	2134	16	15	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	125	junction_6	13.7346277707115	113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGTCAGCTTCTTGTGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10872609	10882896	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_10872833_10874866_10875017_10875180_10875258_10876346_10876489_10876568_10876643_10876733_10876797_10877538_10877581_10877687_10877763_10878053_10878130_10878290_10878401_10879707_10879864_10880065_10880136_10880331_10880418_10880654_10880826_10881001_10881108_10882398
tx.9512	chr19	-	1694	4	FSM	ENSMUSG00000024732.8	ENSMUST00000025639.7	3003	4	0	1309	0	-1309	multi-exon	FALSE	canonical	3	231	junction_1	21.483844059096	87	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTGAATTCTTGTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10926630	10920153	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_10920654_10920841_10920917_10922646_10922777_10925641
tx.9513	chr19	+	982	3	NNC	ENSMUSG00000097091.2	novel	1022	3	NA	NA	95599	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTAGTTGTTTTGGTTCCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11269779	11277253	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_11269885_11270003_11270177_11276549
tx.9514	chr19	+	1018	4	FSM	ENSMUSG00000024683.7	ENSMUST00000167199.3	1162	4	-13	157	-13	10	multi-exon	FALSE	canonical	3	302	junction_3	22.4499443206436	1173	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAACTTCTCTTTGGTCAGTT	148	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11747741	11752167	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_11747889_11748165_11748232_11750238_11750388_11751511
tx.9515	chr19	-	1308	5	ISM	ENSMUSG00000041488.17	ENSMUST00000069285.6	2810	11	33209	790	-2829	-790	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	477	junction_4	26.7721870604551	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAGACAAAGGTAAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11763097	11755638	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_11756538_11758930_11759045_11760389_11760501_11762753_11762889_11763048
tx.9516	chr19	-	1127	3	ISM	ENSMUSG00000041488.17	ENSMUST00000069285.6	2810	11	35805	788	-233	-788	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	487	junction_1	25	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAGACAAAGGTAAGCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11760501	11755636	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_11756538_11758930_11759045_11760389
tx.9517	chr19	-	1195	4	ISM	ENSMUSG00000041488.17	ENSMUST00000069285.6	2810	11	33489	783	-2549	-783	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	487	junction_1	22.6862660362314	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GACAAAGGTAAGCAGCAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11762817	11755631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_11756538_11758930_11759045_11760389_11760501_11762753
tx.9518	chr19	-	1940	11	FSM	ENSMUSG00000041488.17	ENSMUST00000069285.6	2810	11	81	789	-11	-789	multi-exon	FALSE	canonical	3	392	junction_5	58.7316779940774	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAGACAAAGGTAAGCA	7218	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11796225	11755637	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_11756538_11758930_11759045_11760389_11760501_11762753_11762889_11763048_11763123_11763888_11763998_11765532_11765601_11766920_11766996_11769109_11769210_11780857_11780942_11796055
tx.9519	chr19	-	364	3	ISM	ENSMUSG00000041488.17	ENSMUST00000211047.2	870	11	-157	10156	15	-6676	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	543	junction_1	23	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGCCAAGTGAGTGTTGACC	7201	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11796242	11769116	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_11769210_11780857_11780942_11796055
tx.952	chr1	-	1276	6	FSM	ENSMUSG00000026659.14	ENSMUST00000027970.14	1374	6	98	0	15	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	209	junction_3	62.7917191992702	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCTGTGTTAGATGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170713011	170701756	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_170702140_170707228_170707416_170707698_170707796_170708141_170708261_170708483_170708598_170712635
tx.9520	chr19	+	3277	4	FSM	ENSMUSG00000024691.14	ENSMUST00000025595.5	3267	4	-9	-1	-9	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_1	5.90668171555645	28	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTTTTCTTTAGTTATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	12550877	12567127	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_12550945_12554453_12554535_12561286_12561487_12564198
tx.9522	chr19	+	477	2	Intergenic	novelGene_882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCACCGTGTGTATGCTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	14632823	14660346	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_14632923_14659968
tx.9523	chr19	-	1416	4	ISM	ENSMUSG00000024640.10	ENSMUST00000162053.8	2291	9	9634	1	3349	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	2829	junction_2	302.244933787152	334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATTCATTGCCTGTGAATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15892352	15882491	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_15883516_15884293_15884432_15886664_15886794_15892227
tx.9524	chr19	-	1570	5	ISM	ENSMUSG00000024640.10	ENSMUST00000162053.8	2291	9	7438	0	1153	0	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	2829	junction_2	275.301085177665	273	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATTCATTGCCTGTGAATTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15894548	15882490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_15883516_15884293_15884432_15886664_15886794_15892227_15892398_15894440
tx.9525	chr19	-	2099	9	FSM	ENSMUSG00000024640.10	ENSMUST00000025542.10	2617	9	67	451	-62	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	2829	junction_2	225.154079188008	2446	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCATTCATTGCCTGTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	15902356	15882492	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_15883516_15884293_15884432_15886664_15886794_15892227_15892398_15894440_15894614_15895569_15895776_15896818_15896889_15898299_15898361_15902227
tx.9527	chr19	-	1747	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117711.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	0.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATTGAGAACTTTTAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16013469	15991716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_15993261_16005957_16006037_16013345
tx.9528	chr19	-	1404	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117711.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	2	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAGAATGTTGCACCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16013472	16000480	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_16001679_16005957_16006037_16013345
tx.953	chr1	-	1311	3	FSM	ENSMUSG00000059498.14	ENSMUST00000168817.2	1298	3	-17	4	-17	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	151	junction_2	7.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTAAGGATCTCCTTTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170885640	170878746	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_170879422_170881507_170881763_170885259
tx.9530	chr19	-	1050	11	ISM	ENSMUSG00000046230.12	ENSMUST00000224428.2	2689	19	-11	11912	4	-4957	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_4	6.00333240792145	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGACATTTAGATTGACTTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16758287	16723300	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_16723443_16726889_16726948_16727210_16727292_16727485_16727546_16729482_16729543_16731615_16731726_16736950_16737053_16737304_16737401_16739512_16739556_16743860_16743905_16758033
tx.9531	chr19	-	544	5	ISM	ENSMUSG00000046230.12	ENSMUST00000225764.2	2591	6	-17	7289	-17	-7289	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_2	3.49106001094224	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAACAGAAAGTATTTGATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16758314	16736972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_16737053_16737304_16737401_16739512_16739556_16743860_16743905_16758033
tx.9532	chr19	+	320	2	NNC	ENSMUSG00000118126.2	novel	1168	2	NA	NA	-17424	34	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCCATCAATAGATGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	16879272	16902412	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_16879349_16902168
tx.9533	chr19	+	538	4	NNC	ENSMUSG00000039126.11	novel	1803	9	NA	NA	0	-10724	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_3	44.3045019031801	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGACTTCCTGTCTGTTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17114129	17160443	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_17114256_17145626_17145707_17156153_17156355_17160312
tx.9534	chr19	+	1872	9	FSM	ENSMUSG00000039126.11	ENSMUST00000223920.2	1803	9	0	-69	0	69	multi-exon	FALSE	canonical	3	57	junction_3	14.3352711868315	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACTAGCCTTTATGAAATAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17114129	17199017	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_17114256_17145626_17145707_17156153_17156355_17170619_17170794_17176476_17176580_17177144_17177277_17179005_17179093_17185594_17185694_17198147
tx.9535	chr19	-	2107	3	FSM	ENSMUSG00000038843.19	ENSMUST00000174236.8	4606	3	26	2473	26	55	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_2	7	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTTATCCTTGTAAATAATTT	8060	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17334005	17305977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_17307853_17310473_17310621_17333920
tx.9536	chr19	+	1534	4	FSM	ENSMUSG00000024712.10	ENSMUST00000025617.4	2482	4	70	878	70	510	multi-exon	FALSE	canonical	3	326	junction_3	47.0744091837593	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGACTTGCTTGGAATTGAA	1394	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17371476	17377835	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_17371757_17372561_17372714_17375941_17376045_17376836
tx.9537	chr19	+	2099	3	ISM	ENSMUSG00000024712.10	ENSMUST00000025617.4	2482	4	1170	18	645	-18	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	326	junction_2	36	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCTCTTCCCCTGTCAACC	2494	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	17372576	17378695	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_17372714_17375941_17376045_17376836
tx.9538	chr19	-	827	5	ISM	ENSMUSG00000024725.14	ENSMUST00000236728.2	1322	11	41310	3	41239	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	989	junction_2	52.3330679398791	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATCTGTTTTTGTGCTATC	195	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18567843	18558175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_18558693_18562005_18562108_18563910_18563990_18567068_18567119_18567764
tx.9539	chr19	-	1267	10	FSM	ENSMUSG00000024725.14	ENSMUST00000025631.7	2726	10	-25	1484	9	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	989	junction_2	42.8315679128904	1519	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTATCTGTTTTTGTGCTATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18609178	18558175	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_18558693_18562005_18562108_18563910_18563990_18567068_18567119_18567764_18567873_18569946_18570001_18571219_18571284_18573714_18573766_18581529_18581577_18608983
tx.9540	chr19	+	1703	9	FSM	ENSMUSG00000037847.15	ENSMUST00000237347.2	1940	9	0	237	0	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	68	junction_8	10.6880482315528	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGTTTGGTAGGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18609313	18629555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_18609446_18613442_18613507_18616881_18616973_18617249_18617299_18618487_18618636_18618766_18618839_18619537_18619645_18622418_18622503_18628599
tx.9541	chr19	+	1369	2	FSM	ENSMUSG00000037847.15	ENSMUST00000162446.2	1341	2	-12	-16	0	16	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAAAGAGGATCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18609313	18614679	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_18609446_18613442
tx.9542	chr19	+	1887	10	NNC	ENSMUSG00000037847.15	novel	1940	9	NA	NA	0	-3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	8	junction_8	32.8389260136259	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAAGTGTTTGGTAGGTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18609313	18629555	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_18609446_18613442_18613507_18616881_18616973_18617249_18617299_18618487_18618636_18618766_18618839_18619537_18619645_18622418_18622503_18625715_18625900_18628599
tx.9543	chr19	+	1251	8	FSM	ENSMUSG00000024726.11	ENSMUST00000025632.11	4518	8	395	2872	-170	106	multi-exon	FALSE	canonical	3	696	junction_5	231.025928397305	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	ACACAAGTAAAAAAAAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18648522	18681692	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_18648567_18655051_18655248_18656467_18656632_18667593_18667735_18668780_18668960_18671012_18671127_18680724_18680829_18681383
tx.9545	chr19	+	1862	8	NIC	ENSMUSG00000024726.11	novel	1714	8	NA	NA	-91	563	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	36	junction_1	433.244145714536	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TACATAATTTCGAATTAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	18648601	18682149	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_18648800_18655051_18655248_18656467_18656632_18667593_18667735_18668780_18668960_18671012_18671127_18680724_18680829_18681383
tx.9546	chr19	-	1402	13	FSM	ENSMUSG00000024659.16	ENSMUST00000025561.8	1674	13	272	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_4	3.1446603773522	38	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGGTGTGTCATTGTCTCTC	7277	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	20368036	20350791	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_20351135_20352588_20352712_20354015_20354075_20354970_20355067_20355759_20355854_20357012_20357070_20357703_20357784_20359413_20359505_20360225_20360340_20361120_20361216_20361838_20361948_20362056_20362137_20367975
tx.9547	chr19	+	2077	5	ISM	ENSMUSG00000024750.12	ENSMUST00000025659.12	2467	6	3207	266	413	-266	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	378	junction_4	0.707106781186548	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGACTTCTTGTTTATTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21253816	21259388	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_21253950_21254341_21254454_21255018_21255123_21256988_21257115_21257786
tx.9548	chr19	+	1948	4	FSM	ENSMUSG00000024750.12	ENSMUST00000141568.2	1582	4	993	-1359	933	-267	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_3	0.816496580927726	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGACTTCTTGTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21254336	21259387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_21254454_21255018_21255123_21256988_21257115_21257786
tx.9549	chr19	+	1730	2	FSM	ENSMUSG00000024750.12	ENSMUST00000133175.2	4260	2	3582	-1052	3582	-267	multi-exon	FALSE	canonical	3	378	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGGAGACTTCTTGTTTATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21256985	21259387	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_21257115_21257786
tx.955	chr1	-	1172	6	FSM	ENSMUSG00000058076.13	ENSMUST00000111336.10	3171	6	0	1999	0	243	multi-exon	TRUE	canonical	3	578	junction_5	147.434866975217	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTTGACTCTTTGGAATCT	456	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	170978172	170956732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_170957475_170963561_170963726_170966262_170966325_170971126_170971229_170973324_170973382_170978127
tx.9550	chr19	-	1859	3	FSM	ENSMUSG00000035171.10	ENSMUST00000179768.8	962	3	116	-1013	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	207	junction_2	1.5	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTGTCTTGTTGTTGT	628	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21630165	21574675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_21576233_21596472_21596580_21629970
tx.9551	chr19	-	1555	4	FSM	ENSMUSG00000035171.10	ENSMUST00000038830.10	1614	4	59	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	194	junction_1	6.94422221866655	82	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTGTCTTGTTGTTGT	512	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21630281	21574675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_21575699_21576118_21576233_21596472_21596580_21629970
tx.9552	chr19	-	1325	3	NNC	ENSMUSG00000035171.10	novel	1614	4	NA	NA	-138243	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	97	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTTGTGTGTCTTGTTGTTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21768583	21574675	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_21575699_21576118_21576233_21768395
tx.9553	chr19	-	687	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047368.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTTGGTCATGGTGTCTCT	529	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21652270	21644405	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_21644914_21646698_21646808_21652200
tx.9554	chr19	-	1124	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000047368.5_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATTCACACTGGAATAAAG	529	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21652270	21645753	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_21646808_21652200
tx.9555	chr19	+	1805	3	ISM	ENSMUSG00000047368.5	ENSMUST00000052556.5	2259	4	25214	-1	-1895	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	120	junction_2	16.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCGGCTGTGCTTGTGTGCC	2542	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21656102	21663002	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_21656187_21658231_21658412_21661461
tx.9556	chr19	+	427	2	Intergenic	novelGene_883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGTTGGGCAGAATAGGTGG	9955	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	21690460	21691146	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_21690623_21690881
tx.9557	chr19	+	2533	2	Intergenic	novelGene_884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	3428	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACTTTCTCTGCCTCTTTTA	1177	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	22699835	22702582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_22700550_22700763
tx.9558	chr19	+	558	2	Intergenic	novelGene_885	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGGGAAGTGGATGAAGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23074175	23087410	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_23074363_23087039
tx.9559	chr19	+	475	2	FSM	ENSMUSG00000044387.6	ENSMUST00000142712.2	414	2	-43	-18	-43	18	multi-exon	FALSE	canonical	3	58	junction_1	0	223	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTTACGAAACAGGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23112220	23113099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_23112319_23112722
tx.956	chr1	+	574	4	NNC	ENSMUSG00000005681.13	novel	518	4	NA	NA	-3203	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	84	junction_1	24.4176620957499	9	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCATGCCTCTTGTGTCTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171049419	171053944	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_171049548_171052855_171052936_171053234_171053368_171053711
tx.9560	chr19	+	876	2	Fusion	ENSMUSG00000033863.3_ENSMUSG00000044387.6	novel	414	2	NA	NA	-43	-11	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_1	0	68	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAACAAAAAAAAACCAACCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23112220	23142824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr19_+_23112319_23142046
tx.9561	chr19	+	938	2	Fusion	ENSMUSG00000033863.3_ENSMUSG00000044387.6	novel	414	2	NA	NA	-20	-12	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ACAACAAAAAAAAACCAACC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23112243	23142823	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Fusion_chr19_+_23112405_23142046
tx.9562	chr19	+	525	2	NNC	ENSMUSG00000044387.6	novel	414	2	NA	NA	-7	18	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	12	junction_1	0	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AGAGTTACGAAACAGGGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23112256	23113099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_23112405_23112722
tx.9563	chr19	+	1881	2	FSM	ENSMUSG00000033863.3	ENSMUST00000036884.3	4486	2	428	2177	428	486	multi-exon	FALSE	canonical	3	482	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCCATGCTTTCTGATAACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23119017	23143321	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_23119624_23142046
tx.9565	chr19	-	2471	19	NNC	ENSMUSG00000024943.10	novel	5683	25	NA	NA	6340	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_14	131.477559931085	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGGTTATTTTTGGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23234890	23186088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_23186333_23187614_23187711_23187787_23187968_23191114_23191235_23191429_23191535_23192008_23192105_23192518_23192564_23195768_23195895_23205537_23205661_23206278_23206403_23208921_23209092_23209182_23209357_23211326_23211460_23213237_23213333_23216244_23216363_23219999_23220155_23221218_23221475_23232040_23232113_23234851
tx.9566	chr19	-	2429	18	NNC	ENSMUSG00000024943.10	novel	3448	24	NA	NA	6340	-2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	114.071124537664	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATTGGTTATTTTTGGAAAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23234890	23186088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_23186333_23187614_23187711_23187787_23187968_23191114_23191235_23191429_23191535_23192005_23192105_23195768_23195895_23205537_23205661_23206278_23206403_23208921_23209092_23209182_23209357_23211326_23211460_23213237_23213333_23216244_23216363_23219999_23220155_23221218_23221475_23232040_23232113_23234851
tx.9567	chr19	-	2420	18	NNC	ENSMUSG00000024943.10	novel	5683	25	NA	NA	6340	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_13	112.473264797096	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAGAAAGATTGGTTATTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23234890	23186094	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_23186333_23187614_23187711_23187787_23187968_23191114_23191235_23191429_23191535_23192008_23192105_23195768_23195895_23205537_23205661_23206278_23206403_23208921_23209092_23209182_23209357_23211326_23211460_23213237_23213333_23216244_23216363_23219999_23220155_23221218_23221475_23232040_23232113_23234851
tx.9568	chr19	-	1286	10	NNC	ENSMUSG00000024943.10	novel	3448	24	NA	NA	6340	-14230	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	130.467629966731	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TAAATGTTCAGAAAGCAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23234890	23206328	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_23206403_23208921_23209092_23209182_23209357_23211326_23211460_23213237_23213333_23216244_23216363_23219999_23220155_23221218_23221475_23232040_23232113_23234851
tx.9569	chr19	-	1458	10	NNC	ENSMUSG00000024943.10	novel	5683	25	NA	NA	6340	-15567	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	163.441989557816	13	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCTTCTTTCCTGCATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23234890	23207665	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_23207912_23208921_23209092_23209182_23209357_23211326_23211460_23213237_23213333_23216244_23216363_23219999_23220155_23221218_23221475_23232040_23232113_23234851
tx.957	chr1	+	597	5	NNC	ENSMUSG00000005681.13	novel	518	4	NA	NA	-3195	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	10	junction_1	60.9631035955356	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCATGCCTCTTGTGTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171049427	171053943	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_171049548_171050883_171050916_171052855_171052936_171053234_171053368_171053711
tx.9570	chr19	-	522	4	ISM	ENSMUSG00000024943.10	ENSMUST00000226111.2	3265	24	15073	33901	6340	20942	internal_fragment	FALSE	canonical	3	330	junction_3	57.2266449207787	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAGAAGTGTTACTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23234890	23219999	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_23220155_23221218_23221475_23232040_23232113_23234851
tx.9571	chr19	+	586	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000044424.5	novel	571	1	NA	NA	-39	49	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGGGGCTCAGAACTGAACAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23597073	23597732	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_+_23597102_23597174
tx.9572	chr19	+	850	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000051255.7	novel	633	1	NA	NA	-21	265	multi-exon	FALSE	canonical	3	409	junction_1	0	110	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAGAAACAGCGGATCAGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23653190	23654109	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_+_23653644_23653712
tx.9573	chr19	+	1738	5	ISM	ENSMUSG00000074925.5	ENSMUST00000237333.2	12574	7	0	21636	0	-10166	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	15	junction_4	2.27760839478607	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTTAGTGTGAGGGTTGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23664792	23687396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_23664910_23671684_23671855_23680441_23680509_23683070_23683176_23686117
tx.9574	chr19	+	1432	7	FSM	ENSMUSG00000074925.5	ENSMUST00000237333.2	12574	7	-1	11143	-1	327	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_4	3.54338193757822	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTTTTGTTTTATTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23664791	23697889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_23664910_23671684_23671855_23680441_23680509_23683070_23683176_23686117_23686332_23695176_23695467_23697421
tx.9575	chr19	+	1321	2	ISM	ENSMUSG00000074925.5	ENSMUST00000236951.2	601	4	30530	-1071	-5285	257	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCTGGATAAACTGCAAGGT	7642	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23695357	23698633	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_23695467_23697421
tx.9576	chr19	-	552	3	Intergenic	novelGene_886	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_2	6.5	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTCCCTACAGTCATACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23933017	23884646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_23885008_23885116_23885214_23932923
tx.9577	chr19	-	611	5	Intergenic	novelGene_887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	5.40254569624358	17	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTGTCCCTACAGTCATACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	23934114	23884646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_23885008_23885116_23885214_23894351_23894383_23932923_23932974_23934042
tx.9578	chr19	-	554	4	ISM	ENSMUSG00000024812.12	ENSMUST00000233027.2	4668	23	67	37997	67	26	5prime_fragment	FALSE	canonical	1	2	junction_3	179.723862262824	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATTTTTTTATCAGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24151486	24109865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_24110073_24112213_24112339_24116142_24116197_24151318
tx.9579	chr19	-	618	5	NNC	ENSMUSG00000024812.12	novel	4728	24	NA	NA	69	26	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_4	166.67408316832	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATTTTTTTATCAGAACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24202321	24109865	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_24110073_24112213_24112339_24116142_24116197_24171072_24171194_24202210
tx.958	chr1	+	358	2	ISM	ENSMUSG00000005681.13	ENSMUST00000005824.12	492	4	594	1	585	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	ATGCCTCTTGTGTCTTTGGG	1988	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171053244	171053946	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_171053368_171053711
tx.9580	chr19	-	796	5	FSM	ENSMUSG00000059363.11	ENSMUST00000081333.11	1114	5	15	303	15	106	multi-exon	FALSE	canonical	3	359	junction_4	29.2018835008977	577	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCTGTCCCCGGACCTGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24257954	24239119	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_24239418_24244665_24244764_24249710_24249832_24254544_24254640_24257770
tx.9581	chr19	-	2302	12	ISM	ENSMUSG00000024867.15	ENSMUST00000025800.15	2573	15	158733	0	-79797	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	28	junction_9	6.02748525609119	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGGTCATACATTGATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24374503	24272157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_24272919_24281395_24281511_24323600_24323746_24327497_24327654_24332481_24332567_24335393_24335443_24335574_24335659_24337303_24337516_24356165_24356466_24359051_24359205_24367707_24367826_24374379
tx.9582	chr19	-	823	5	NNC	ENSMUSG00000024867.15	novel	1216	4	NA	NA	-79784	20192	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	18.6077940659284	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTTTATCTTGTGTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24374490	24353332	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_24353474_24356165_24356466_24359051_24359205_24367707_24367826_24374379
tx.9583	chr19	-	1420	15	FSM	ENSMUSG00000024878.10	ENSMUST00000025815.10	1929	15	0	509	0	-509	multi-exon	FALSE	canonical	3	171	junction_14	17.2858618647773	396	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATCCTCTGGAGGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	24938965	24897788	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_24898067_24898384_24898515_24899960_24900027_24900119_24900189_24905690_24905740_24909027_24909085_24915759_24915805_24918112_24918200_24920046_24920094_24925432_24925471_24926565_24926626_24930623_24930716_24932699_24932797_24935267_24935355_24938747
tx.9584	chr19	+	1495	2	ISM	ENSMUSG00000052085.8	ENSMUST00000025831.8	7805	48	200704	258	44426	-258	3prime_fragment	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGCTTCCCTGTGCCACTGCT	2517	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25177601	25179538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_25177909_25178350
tx.9585	chr19	+	1415	2	Intergenic	novelGene_889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGCTTTTGGTCATGGTCT	3738	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25186141	25191041	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_25186671_25190155
tx.9586	chr19	+	964	2	Intergenic	novelGene_888	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAGACTGCTAAAGTAA	3728	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25186131	25188212	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_25186671_25187787
tx.9587	chr19	-	730	3	Intergenic	novelGene_890	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTAAATGAGTGGGCTCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25444493	25400239	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_25400632_25409486_25409669_25444337
tx.9588	chr19	+	1206	3	ISM	ENSMUSG00000032702.17	ENSMUST00000049400.15	5637	14	193974	0	8710	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	2	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTTGCTTGCCCCTGCTTCA	1211	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25408312	25411860	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_25408444_25410228_25410328_25410884
tx.9589	chr19	+	1612	2	ISM	ENSMUSG00000024837.16	ENSMUST00000160814.2	1362	4	-84	49553	5	-49553	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	132	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTGTCCCTCAAATAGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25482986	25488076	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_25483566_25487043
tx.959	chr1	-	1610	13	FSM	ENSMUSG00000013593.13	ENSMUST00000013737.13	1623	13	8	5	8	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	1142	junction_12	107.460457843804	45	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTCAGCTTGTAATGTGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171074683	171062426	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_171062657_171062841_171062900_171063925_171064010_171064174_171064271_171064708_171064839_171065513_171065634_171065855_171065942_171066083_171066162_171066278_171066467_171066842_171066964_171068515_171068707_171073659_171073767_171074562
tx.9590	chr19	+	2313	5	FSM	ENSMUSG00000024837.16	ENSMUST00000025755.11	2340	5	27	0	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	122	junction_3	4.08503365959205	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTCTTGTGTGTATATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	25483008	25581693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_25483566_25487043_25487228_25523182_25523467_25537230_25537376_25580550
tx.9591	chr19	-	750	3	FSM	ENSMUSG00000118001.2	ENSMUST00000237584.2	503	3	-65	-182	-65	182	multi-exon	TRUE	canonical	1	1	junction_2	2.5	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CCAAACCAAACCAAACCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26461915	26460774	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_26461343_26461656_26461733_26461809
tx.9592	chr19	+	2068	9	NNC	ENSMUSG00000024921.18	novel	876	7	NA	NA	27	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	11	junction_1	7.69740215917033	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGTCGCCTTTTCTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	26693310	26755721	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_26693393_26693514_26693593_26698128_26698348_26729223_26729442_26748337_26748444_26748907_26749010_26751572_26751706_26753500_26753644_26754734
tx.9594	chr19	-	298	2	ISM	ENSMUSG00000041360.9	ENSMUST00000236585.2	515	4	17990	-8	5113	8	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	1523	junction_1	0	179	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTGGTTTAATGTCAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27371674	27367452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_27367714_27371637
tx.9595	chr19	-	2083	17	ISM	ENSMUSG00000041360.9	ENSMUST00000076219.6	3471	18	2696	1355	-20	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1425	junction_9	73.1752765198055	274	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTGGTTTAATGTCAACT	NA	False	NA	-61	True	NA	NA	NA	27404529	27367452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_27367714_27371637_27371729_27373694_27373783_27376281_27376505_27377078_27377222_27389581_27389663_27393285_27393340_27394134_27394234_27396194_27396274_27397417_27397522_27398696_27398872_27399754_27399822_27400053_27400148_27400905_27400982_27401608_27401745_27403195_27403415_27404436
tx.9596	chr19	-	2150	18	FSM	ENSMUSG00000041360.9	ENSMUST00000076219.6	3471	18	-34	1355	-34	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	1256	junction_17	93.320929312512	592	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTTTGGTTTAATGTCAACT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	27407259	27367452	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_27367714_27371637_27371729_27373694_27373783_27376281_27376505_27377078_27377222_27389581_27389663_27393285_27393340_27394134_27394234_27396194_27396274_27397417_27397522_27398696_27398872_27399754_27399822_27400053_27400148_27400905_27400982_27401608_27401745_27403195_27403415_27404436_27404529_27407191
tx.9597	chr19	+	2431	12	FSM	ENSMUSG00000024935.12	ENSMUST00000025875.5	3800	12	49	1320	-12	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	74	junction_8	5.75246982529323	21	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CGCAGCTTCCCTTGTACTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28812522	28890040	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_28812733_28856412_28856554_28870234_28870328_28871853_28871969_28873483_28873527_28874906_28875003_28878841_28879027_28880085_28880194_28882011_28882135_28882732_28882928_28886830_28886966_28889053
tx.9598	chr19	+	1215	7	FSM	ENSMUSG00000024780.8	ENSMUST00000225310.2	4079	7	16	2848	1	737	multi-exon	FALSE	canonical	3	25	junction_6	62.7147421974203	34	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTTTCAATTTCTTGACC	3837	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28967767	28990323	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_28968070_28972440_28972723_28976660_28976752_28984371_28984488_28984972_28985096_28989288_28989454_28990187
tx.9599	chr19	+	2630	7	FSM	ENSMUSG00000024780.8	ENSMUST00000050148.5	5179	7	-117	2666	2	979	multi-exon	FALSE	canonical	3	145	junction_6	22.9449825064702	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGCAGTGCTCACTGGCT	3852	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28967782	28994971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_28968070_28972440_28972723_28976660_28976752_28984371_28984488_28984972_28985096_28989288_28989454_28993405
tx.96	chr1	-	2624	4	ISM	ENSMUSG00000048874.16	ENSMUST00000186733.7	7567	16	-57	27089	57	3	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	122	junction_2	3.09120616516523	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGAATGGCTATTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30912719	30868508	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_-_30870641_30876185_30876348_30902067_30902337_30912658
tx.9600	chr19	+	2345	6	ISM	ENSMUSG00000024780.8	ENSMUST00000050148.5	5179	7	4539	2666	-4278	979	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_5	23.5677746085624	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGCAGTGCTCACTGGCT	8508	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	28972438	28994971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_28972723_28976660_28976752_28984371_28984488_28984972_28985096_28989288_28989454_28993405
tx.9601	chr19	-	2809	5	FSM	ENSMUSG00000024782.8	ENSMUST00000025696.5	2809	5	1	-1	1	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	26	junction_1	7.58287544405155	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCCGGGCTGTCTCCATGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29025360	28998231	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_29000347_29003611_29003731_29004570_29004744_29015271_29015392_29025078
tx.9602	chr19	-	977	4	ISM	ENSMUSG00000024782.8	ENSMUST00000025696.5	2809	5	28	5069	28	-1	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	29	junction_3	6.37704215656966	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CATCATTCTTATGAGACAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29025333	29003301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_29003731_29004570_29004744_29015271_29015392_29025078
tx.9603	chr19	-	1003	2	Intergenic	novelGene_893	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATTGCTTGCTTGCTTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29035650	29033821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_29034628_29035453
tx.9604	chr19	-	394	2	Intergenic	novelGene_894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTTGGGTTTTATACTTCA	10051	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29037861	29036162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_29036482_29037786
tx.9605	chr19	+	1773	9	FSM	ENSMUSG00000024785.8	ENSMUST00000064393.6	1803	9	38	-8	38	8	multi-exon	TRUE	canonical	3	369	junction_1	16.9958634673264	985	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGTAGTGTAAATCAGAGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29078812	29121251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_29079041_29093122_29093195_29095624_29095801_29098669_29098745_29099165_29099291_29105398_29105525_29108049_29108207_29111799_29111904_29120541
tx.9606	chr19	-	707	2	FSM	ENSMUSG00000050957.5	ENSMUST00000052380.5	708	2	1	0	1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	39	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTACTGCTTATATGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29302755	29298743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_29299140_29302444
tx.9607	chr19	-	809	2	FSM	ENSMUSG00000039097.6	ENSMUST00000044143.6	745	2	20	-84	20	84	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGTCCTTTTAATGGTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29312050	29309022	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_29309567_29311785
tx.9608	chr19	-	834	5	ISM	ENSMUSG00000016495.13	ENSMUST00000143467.8	1020	6	1043	12	480	-12	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	35	junction_3	10.4163333279998	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTGAATTTGACCCCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29338327	29326010	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_29326406_29327759_29327870_29328443_29328575_29335716_29335804_29338216
tx.9609	chr19	-	854	6	FSM	ENSMUSG00000016495.13	ENSMUST00000143467.8	1020	6	95	71	-2	7	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_3	10.1390334845093	311	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCTCGTGTGTATGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29339275	29326069	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_29326406_29327759_29327870_29328443_29328575_29335716_29335804_29338216_29338328_29339196
tx.9610	chr19	-	717	5	NIC	ENSMUSG00000016495.13	novel	1020	6	NA	NA	-2	1	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	19	junction_2	17.2825779327044	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCAAATTTCTCGTGTGTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29339275	29326075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_29326406_29327759_29327870_29335716_29335804_29338216_29338328_29339196
tx.9611	chr19	-	1724	2	ISM	ENSMUSG00000097855.9	ENSMUST00000180737.2	2319	4	-217	15900	-212	-15900	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	5	junction_1	0	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TGCTATAAAAGTATATTAAT	766	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29499606	29496962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_29498370_29499289
tx.9612	chr19	-	2831	15	FSM	ENSMUSG00000046324.13	ENSMUST00000159692.8	7058	15	26	4201	1	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	290	junction_6	30.8387014999672	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTGAGCATATGTTCAAAGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29625789	29589814	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_29590080_29590168_29590333_29593122_29593239_29593916_29594120_29595217_29595371_29600468_29600660_29601040_29601216_29604246_29604468_29606003_29606217_29608742_29608836_29609790_29609938_29614690_29614797_29617256_29617385_29623366_29623669_29625435
tx.9613	chr19	-	1960	7	FSM	ENSMUSG00000046324.13	ENSMUST00000159243.2	1950	7	1	-11	1	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	310	junction_3	23.0410262117139	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAATATATATATATATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29625789	29605386	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_29606217_29608742_29608836_29609790_29609938_29614690_29614797_29617256_29617385_29623366_29623669_29625435
tx.9614	chr19	+	471	3	ISM	ENSMUSG00000024806.5	ENSMUST00000235954.2	739	5	6702	-23	6702	23	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	41	junction_1	3.5	181	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGTCTGGGCAGTAATGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29682035	29685849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_29682117_29684207_29684322_29685573
tx.9615	chr19	-	227	2	Intergenic	novelGene_895	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATTGTGGTAGTGACCCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	29995591	29995269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_29995359_29995453
tx.9616	chr19	+	1601	6	NNC	ENSMUSG00000024817.14	novel	3536	16	NA	NA	622	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	113.876072991652	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACGCATCCAGCTTTACTT	3333	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30063715	30071126	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_30063809_30064575_30064717_30065878_30065980_30066585_30066744_30069440_30069540_30070117
tx.9617	chr19	-	1593	9	NNC	ENSMUSG00000024827.11	novel	3767	25	NA	NA	26632	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	434.894743012605	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGAATTTCCCATTTGATTT	9342	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30095999	30075845	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_30076511_30077236_30077318_30078142_30078316_30080378_30080475_30088068_30088185_30091121_30091264_30092587_30092701_30093798_30093949_30095942
tx.9618	chr19	-	708	2	ISM	ENSMUSG00000024827.11	ENSMUST00000025778.9	3767	25	75549	0	45351	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1393	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCGAATTTCCCATTTGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30077280	30075846	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_30076511_30077236
tx.9619	chr19	+	731	3	NNC	ENSMUSG00000024863.7	novel	1089	6	NA	NA	4990	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_1	0.5	41	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTATGACTCTTGTGCTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	30215331	30217082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_30215462_30215786_30215856_30216550
tx.962	chr1	-	857	6	FSM	ENSMUSG00000062963.11	ENSMUST00000111302.4	914	6	206	-149	159	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	530	junction_3	38.9943585663362	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTGGTTCTCATTGATG	7526	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171122354	171116135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_171116545_171116743_171116835_171117090_171117168_171117456_171117521_171117721_171117790_171122206
tx.9620	chr19	+	908	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000052920.17_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATAATGCCTGCTTTGGGTA	5787	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31091334	31095162	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_+_31091557_31094476
tx.9621	chr19	-	1828	2	ISM	ENSMUSG00000040451.19	ENSMUST00000134415.2	1595	6	34965	-1417	34965	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	193	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGTGGCTATTATATTGT	5518	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32102658	32100129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_32101925_32102625
tx.9622	chr19	-	3242	6	FSM	ENSMUSG00000040451.19	ENSMUST00000151289.9	3262	6	18	2	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_5	43.4069118920017	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGTGGCTATTATATTGT	8037	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32188395	32100129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_32101925_32102625_32102793_32106940_32107095_32120145_32120264_32136923_32137764_32188227
tx.9623	chr19	-	3376	7	NNC	ENSMUSG00000040451.19	novel	3665	10	NA	NA	-3461	-5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	40	junction_6	60.6538447988987	16	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGAAAGTATGTGGCTATTAT	4115	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32219687	32100134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_32101925_32102625_32102793_32106940_32107095_32120145_32120264_32136923_32137764_32200908_32200991_32219462
tx.9624	chr19	-	2404	5	NIC	ENSMUSG00000040451.19	novel	3262	6	NA	NA	16	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	5	junction_4	81.1464725049709	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTATGTGGCTATTATATTGT	8035	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32188397	32100129	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_32101925_32102625_32102793_32106940_32107095_32120145_32120264_32188227
tx.9625	chr19	+	594	2	FSM	ENSMUSG00000097787.3	ENSMUST00000181612.3	1647	2	1	1052	1	-1052	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TGTGTCTGCTCCTGTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32366616	32367538	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_32366777_32367104
tx.9626	chr19	-	629	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000062456.5	novel	714	1	NA	NA	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	2	223	junction_1	0	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAGAAATGTTAGTAAAAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32443976	32443266	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_-_32443480_32443560
tx.9627	chr19	-	563	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000062456.5	novel	714	1	NA	NA	2	-3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAGAAATGTTAGTAAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32443976	32443267	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_-_32443728_32443873
tx.9628	chr19	-	731	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000062456.5	novel	714	1	NA	NA	-14629	-9	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	AAAAAAAAAGAAATGTTAGT	7961	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32458607	32443273	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_-_32443977_32458579
tx.9629	chr19	+	2417	5	FSM	ENSMUSG00000024896.10	ENSMUST00000025827.10	2613	5	186	10	32	-10	multi-exon	FALSE	canonical	3	240	junction_4	28.9687331445474	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTACCAAGTCATCTCTGCAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32463354	32492754	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_32463960_32468737_32468936_32471270_32471369_32475783_32475918_32491372
tx.963	chr1	-	968	7	FSM	ENSMUSG00000062963.11	ENSMUST00000080001.9	1007	7	39	0	2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	257	junction_6	130.826539101718	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTGTGGTTCTCATTGATG	7322	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171122558	171116135	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_171116545_171116743_171116835_171117090_171117168_171117456_171117521_171117721_171117790_171122206_171122401_171122493
tx.9630	chr19	+	878	2	FSM	ENSMUSG00000024896.10	ENSMUST00000236287.2	896	2	40	-22	40	22	multi-exon	FALSE	canonical	3	317	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCACTCTTCTTAAGGTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32463362	32469018	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_32463960_32468737
tx.9631	chr19	-	2846	10	FSM	ENSMUSG00000013662.7	ENSMUST00000235412.2	3771	10	0	925	0	259	multi-exon	FALSE	canonical	3	346	junction_2	45.0335951413833	225	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCCAATTACAGCACTGAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32689731	32649962	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_32651765_32654116_32654251_32661401_32661453_32664632_32664723_32673191_32673299_32675839_32676041_32678919_32679041_32679939_32680039_32684234_32684410_32689665
tx.9632	chr19	+	516	3	ISM	ENSMUSG00000013663.8	ENSMUST00000013807.8	8292	9	58030	6084	4302	2099	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	145	junction_1	4	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CTTGAATAAACTGAAATGGA	720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	32792926	32797476	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_32792984_32795235_32795461_32797242
tx.9633	chr19	-	1371	5	FSM	ENSMUSG00000071573.15	ENSMUST00000163093.2	1378	5	10	-3	10	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	8.20060973342836	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCGTTTTATAGCCTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33369685	33115143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_33115675_33145721_33145898_33179874_33180049_33359766_33359926_33369354
tx.9634	chr19	-	1628	7	FSM	ENSMUSG00000071573.15	ENSMUST00000096114.13	1597	7	-28	-3	2	3	multi-exon	FALSE	canonical	2	11	junction_4	3.8151743807532	35	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCGTTTTATAGCCTCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33369693	33115143	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_33115675_33145721_33145898_33179874_33180049_33359766_33359926_33367316_33367460_33368479_33368586_33369354
tx.9635	chr19	-	2757	11	FSM	ENSMUSG00000024766.16	ENSMUST00000112508.9	2839	11	79	3	79	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	39	junction_5	12.3109707172099	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGTTTTCTGTTTCTTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	33567629	33532562	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_33533880_33534506_33534579_33535664_33535737_33536911_33537056_33556761_33556899_33557864_33557975_33559452_33559652_33560446_33560565_33562269_33562376_33565600_33565744_33567290
tx.9636	chr19	+	1988	11	FSM	ENSMUSG00000024776.19	ENSMUST00000239240.2	1988	11	-2	2	-2	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	14.1918990977247	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTCCGGTTGTCACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34169626	34217731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_34169996_34197586_34197667_34203941_34204160_34207492_34207569_34208830_34208927_34211360_34211719_34212609_34212735_34213675_34213814_34216175_34216289_34216902_34217003_34217416
tx.9637	chr19	+	2019	11	FSM	ENSMUSG00000024776.19	ENSMUST00000054956.15	2024	11	3	2	3	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_1	15.5630973780928	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCTGTCCGGTTGTCACATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34169631	34217731	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_34170032_34197586_34197667_34203941_34204160_34207492_34207569_34208830_34208927_34211360_34211719_34212609_34212735_34213675_34213814_34216175_34216289_34216902_34217003_34217416
tx.9638	chr19	+	1467	9	FSM	ENSMUSG00000024778.14	ENSMUST00000025691.13	1481	9	14	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_8	3.55096817783545	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTGCTCTGTTGTCTTGCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34268079	34305172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_34268145_34284524_34284679_34292578_34292717_34293968_34294078_34295989_34296052_34296182_34296237_34296709_34296790_34297960_34297986_34304392
tx.9639	chr19	-	2970	10	FSM	ENSMUSG00000024781.17	ENSMUST00000049572.15	2969	10	1	-2	1	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	30	junction_9	6.37704215656966	31	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CATCGGTGTGGTGTTTGCTT	5916	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34504873	34469715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_34471614_34472459_34472532_34477496_34477569_34478902_34479050_34484408_34484546_34486388_34486499_34488222_34488422_34500821_34500940_34502137_34502247_34504765
tx.964	chr1	+	622	4	FSM	ENSMUSG00000006412.11	ENSMUST00000135941.8	1735	4	29	1084	29	200	multi-exon	FALSE	canonical	3	1860	junction_3	112.860779527503	170	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATAGCCTGAACCTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171173266	171185738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_171173355_171184097_171184187_171184272_171184397_171185417
tx.9640	chr19	-	1833	4	ISM	ENSMUSG00000033610.17	ENSMUST00000238065.2	2342	6	56052	-1	56048	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_2	8.33999733546454	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTTAGTGTACATGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34799201	34788293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_34789788_34791091_34791218_34798499_34798624_34799112
tx.9641	chr19	-	2491	6	ISM	ENSMUSG00000033610.17	ENSMUST00000112460.3	2760	7	36845	0	36777	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_2	13.4966662550424	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTTCTTAGTGTACATGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34818472	34788293	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_34789788_34791091_34791218_34798499_34798624_34799112_34799290_34804519_34804774_34818156
tx.9642	chr19	+	620	4	ISM	ENSMUSG00000024795.12	ENSMUST00000087341.7	5564	32	-16	46413	-16	-1136	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	103	junction_1	107.26084508752	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAATTGACCCCCCTGGATGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	34899744	34906722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_34899834_34902024_34902173_34906260_34906348_34906426
tx.9643	chr19	+	1156	11	FSM	ENSMUSG00000024800.9	ENSMUST00000025714.9	1145	11	-15	4	0	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	930	junction_4	72.6416547168359	2475	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATATGGATTTTTAAATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36061115	36082173	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_36061219_36062465_36062522_36064358_36064416_36064723_36064799_36066538_36066611_36071775_36071866_36077571_36077689_36078208_36078239_36078633_36078672_36079220_36079301_36081735
tx.9644	chr19	+	1104	11	NIC	ENSMUSG00000024800.9	novel	1145	11	NA	NA	1	-6	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	67	junction_7	297.230701644362	128	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACATATGGATTTTTAAATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36061116	36082171	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_36061219_36062465_36062522_36064358_36064416_36064723_36064799_36066538_36066611_36071775_36071866_36077571_36077640_36078208_36078239_36078633_36078672_36079220_36079301_36081735
tx.9645	chr19	+	785	3	NNC	ENSMUSG00000118032.2	novel	602	2	NA	NA	-16305	59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTCTGACTCTCTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36212821	36233795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_36212985_36213375_36213511_36233308
tx.9646	chr19	+	666	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000117990.2_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	0.5	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTGGCTGATTGTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36212831	36220720	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_+_36212985_36213375_36213511_36220342
tx.9647	chr19	+	758	3	NNC	ENSMUSG00000118032.2	novel	602	2	NA	NA	-16267	59	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_2	2	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCTTCTGACTCTCTTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36212859	36233795	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_36212985_36219029_36219176_36233308
tx.9648	chr19	+	1484	9	FSM	ENSMUSG00000024805.17	ENSMUST00000225920.2	6443	9	197	4762	-31	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_1	36.9382931386928	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGCTTATTCTTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36325905	36433608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_36325970_36389355_36389637_36411969_36412067_36414554_36414611_36414702_36414763_36417398_36417548_36420243_36420343_36422387_36422478_36433020
tx.9649	chr19	+	1553	9	FSM	ENSMUSG00000024805.17	ENSMUST00000062389.6	1566	9	29	-16	29	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	71	junction_8	19.6580136331217	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGCTTATTCTTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36387176	36433608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_36387310_36389355_36389637_36411969_36412067_36414554_36414611_36414702_36414763_36417398_36417548_36420243_36420343_36422387_36422478_36433020
tx.965	chr1	+	536	3	FSM	ENSMUSG00000006412.11	ENSMUST00000138323.2	474	3	138	-200	138	200	multi-exon	FALSE	canonical	3	1860	junction_2	137.5	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTATAGCCTGAACCTTTAT	9641	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171184095	171185738	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_171184187_171184272_171184397_171185417
tx.9650	chr19	+	1609	10	FSM	ENSMUSG00000024805.17	ENSMUST00000225411.2	1626	10	33	-16	33	4	multi-exon	FALSE	canonical	3	44	junction_8	28.4843470118477	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCAGCTTATTCTTGAGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36387180	36433608	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_36387310_36389355_36389637_36411969_36412067_36414554_36414611_36414702_36414763_36417398_36417548_36420243_36420343_36422387_36422478_36427963_36428024_36433020
tx.9651	chr19	-	385	3	Intergenic	novelGene_896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTGAGGGCTCTTCTTGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36476664	36475151	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_36475254_36475389_36475542_36476533
tx.9652	chr19	-	411	3	Intergenic	novelGene_897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	1	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGACACTTGAGGGCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36475976	36475158	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_36475254_36475389_36475542_36475812
tx.9653	chr19	+	2670	5	ISM	ENSMUSG00000024811.12	ENSMUST00000025729.12	6481	27	51253	590	4912	-590	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	888	junction_3	109.879479430875	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TAGCATGGTAATTCATTGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	36862884	36870287	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_36862958_36864465_36864572_36866108_36866296_36867291_36867449_36868140
tx.9654	chr19	+	1614	6	FSM	ENSMUSG00000023307.15	ENSMUST00000024078.15	1809	6	171	24	138	-24	multi-exon	FALSE	canonical	3	653	junction_3	49.1747902893342	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ATGCAATGTTGACATCTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37185112	37199526	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_37185304_37188069_37188273_37194581_37194713_37197701_37197886_37198037_37198205_37198788
tx.9655	chr19	+	1125	5	ISM	ENSMUSG00000023307.15	ENSMUST00000024078.15	1809	6	3296	154	3263	20	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	653	junction_2	54.554445281755	1271	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTCAGCATTGAAGTGATTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37188237	37199396	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_37188273_37194581_37194713_37197701_37197886_37198037_37198205_37198788
tx.9656	chr19	+	1220	4	ISM	ENSMUSG00000023307.15	ENSMUST00000024078.15	1809	6	9639	25	-8	-25	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	653	junction_1	62.4624331543013	272	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATGCAATGTTGACATCTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37194580	37199525	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_37194713_37197701_37197886_37198037_37198205_37198788
tx.9657	chr19	-	461	4	ISM	ENSMUSG00000056999.17	ENSMUST00000154339.8	2001	15	30814	152	14300	-152	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	876	junction_3	23.1132477644796	93	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATGTAGAATATTTTTAA	9947	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37253977	37247980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_37248237_37248903_37248972_37249553_37249627_37253913
tx.9658	chr19	-	497	5	ISM	ENSMUSG00000056999.17	ENSMUST00000154339.8	2001	15	29614	152	13100	-152	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	876	junction_3	22.4874965258474	221	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAGATGTAGAATATTTTTAA	8909	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37255177	37247980	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_37248237_37248903_37248972_37249553_37249627_37253913_37253976_37255139
tx.9659	chr19	-	1365	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000080885.2_ENSMUSG00000118211.2	novel	642	1	NA	NA	-36	78	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCAAGTTATGCTGGGCGGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37402331	37272475	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr19_-_37273242_37401732
tx.966	chr1	-	1292	4	FSM	ENSMUSG00000045259.5	ENSMUST00000061878.5	1558	4	-3	269	-3	-269	multi-exon	FALSE	canonical	3	17	junction_1	1.88561808316413	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTTGTCTCTGAATCCTTT	7868	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171188369	171186282	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_171186549_171187022_171187222_171187309_171187470_171187702
tx.9660	chr19	+	3524	22	FSM	ENSMUSG00000053799.9	ENSMUST00000066439.8	3543	22	0	19	0	-19	multi-exon	TRUE	canonical	3	69	junction_16	11.2298193902402	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAAGATGCTCTTTCAGCT	1869	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37538865	37672488	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_37539014_37558830_37559003_37560040_37560089_37560305_37560397_37562159_37562206_37565383_37565589_37566867_37567024_37570640_37570710_37574258_37574343_37576085_37576133_37576264_37576386_37578298_37578371_37579315_37579414_37582109_37582216_37585542_37585653_37587013_37587126_37588006_37588142_37597373_37597554_37628069_37628212_37641830_37641905_37670107_37670221_37671293
tx.9661	chr19	+	819	5	ISM	ENSMUSG00000053799.9	ENSMUST00000238817.2	2692	22	58565	2	58565	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	79	junction_1	9.2736184954957	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CATGTCTCTGCTTGCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	37597471	37671701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_37597554_37628069_37628212_37641830_37641905_37670107_37670221_37671293
tx.9662	chr19	-	751	3	ISM	ENSMUSG00000048612.17	ENSMUST00000226084.2	3926	10	8	42692	8	-42692	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	137	junction_1	8.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTGTGTGTATGTGTATGTG	8864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38031839	38010553	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_38011093_38012789_38012846_38031683
tx.9663	chr19	+	2553	10	NIC	ENSMUSG00000024989.16	novel	2757	10	NA	NA	0	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	96	junction_2	88.367917758024	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGTCTAGTATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38043458	38062870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_38043530_38045857_38046015_38046236_38046432_38048528_38048805_38051050_38051120_38057527_38057679_38058087_38058399_38059518_38059591_38060212_38060339_38061745
tx.9664	chr19	+	2467	10	FSM	ENSMUSG00000024989.16	ENSMUST00000236044.2	2442	10	-26	1	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	35	junction_2	104.602716958317	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGTCTAGTATGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38043458	38062870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_38043530_38045857_38045929_38046236_38046432_38048528_38048805_38051050_38051120_38057527_38057679_38058087_38058399_38059518_38059591_38060212_38060339_38061745
tx.9665	chr19	+	2530	10	NIC	ENSMUSG00000024989.16	novel	2442	10	NA	NA	0	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	113	junction_2	84.0640555296898	59	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTGTCTAGTATGTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38043458	38062871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_38043530_38045857_38045991_38046236_38046432_38048528_38048805_38051050_38051120_38057527_38057679_38058087_38058399_38059518_38059591_38060212_38060339_38061745
tx.9666	chr19	+	1424	4	ISM	ENSMUSG00000024989.16	ENSMUST00000169673.3	2757	10	14809	-2	14762	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	313	junction_3	16.8720676464584	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTGTGTCTAGTATGTGTGT	3232	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38058298	38062871	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_38058399_38059518_38059591_38060212_38060339_38061745
tx.9667	chr19	+	1206	2	ISM	ENSMUSG00000024989.16	ENSMUST00000169673.3	2757	10	16768	-1	16721	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	313	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGTGTCTAGTATGTGTG	5191	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38060257	38062870	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_38060339_38061745
tx.9668	chr19	-	946	5	ISM	ENSMUSG00000024990.14	ENSMUST00000112335.4	937	6	104	-3	1	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	7	junction_2	3.67423461417477	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTATGAGTTGAAGACTT	5313	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38113172	38105074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_38105358_38106719_38106933_38112476_38112584_38112743_38112881_38112966
tx.9669	chr19	-	940	6	FSM	ENSMUSG00000024990.14	ENSMUST00000112335.4	937	6	0	-3	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_5	4.31740662898458	29	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCTATGAGTTGAAGACTT	5209	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38113276	38105074	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_38105358_38106719_38106933_38112476_38112584_38112743_38112881_38112966_38113096_38113205
tx.9670	chr19	-	1406	14	FSM	ENSMUSG00000054237.7	ENSMUST00000067167.6	1402	14	0	-4	0	4	multi-exon	TRUE	canonical	3	295	junction_2	36.3583414649629	468	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTCAGAGTCTTTCCTTTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38212586	38176924	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_38177249_38178276_38178356_38184144_38184184_38188007_38188127_38189994_38190038_38193143_38193258_38195710_38195757_38201808_38201894_38202821_38202906_38204278_38204356_38207905_38207952_38208079_38208176_38210284_38210362_38212409
tx.9671	chr19	-	957	9	ISM	ENSMUSG00000054237.7	ENSMUST00000067167.6	1402	14	3	16057	3	5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	315	junction_8	31.196954979613	217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTTTAGCATTATGGAAGCG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38212583	38192985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_38193258_38195710_38195757_38201808_38201894_38202821_38202906_38204278_38204356_38207905_38207952_38208079_38208176_38210284_38210362_38212409
tx.9672	chr19	-	873	8	NIC	ENSMUSG00000054237.7	novel	1402	14	NA	NA	3	6	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	6	junction_2	129.037567698523	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTTAGCATTATGGAAGCGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38212583	38192984	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_38193258_38195710_38195757_38202821_38202906_38204278_38204356_38207905_38207952_38208079_38208176_38210284_38210362_38212409
tx.9673	chr19	+	471	4	Intergenic	novelGene_898	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	5.43650214343336	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGACAGCTGTAGATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38336529	38338203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_38336730_38336923_38337006_38337531_38337604_38338086
tx.9674	chr19	+	351	3	Intergenic	novelGene_899	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	6	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GATGACAGCTGTAGATTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38337129	38338203	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_38337292_38337531_38337604_38338086
tx.9675	chr19	-	1511	2	NNC	ENSMUSG00000118335.2	novel	596	2	NA	NA	-1957	1318	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	9	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TTATCTGAATAAAACAGAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38378508	38374092	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_38375486_38378390
tx.9676	chr19	-	840	4	ISM	ENSMUSG00000024999.8	ENSMUST00000025963.8	3977	21	25043	1003	25043	-1003	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	233	junction_1	22.8813364023074	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCATGGTTTTTTTTTTT	6468	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38782638	38777574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_38778142_38778731_38778817_38781144_38781243_38782548
tx.9677	chr19	-	2955	21	FSM	ENSMUSG00000024999.8	ENSMUST00000025963.8	3977	21	19	1003	19	-1003	multi-exon	FALSE	canonical	3	233	junction_1	18.6711006638602	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CCTTCATGGTTTTTTTTTTT	2307	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38807662	38777574	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_38778142_38778731_38778817_38781144_38781243_38782548_38782678_38783415_38783598_38783929_38784002_38784081_38784146_38784240_38784314_38787341_38787443_38787753_38787835_38792842_38792975_38795530_38795660_38795969_38796146_38798451_38798546_38798741_38798904_38800787_38800919_38802524_38802579_38803129_38803288_38804026_38804160_38806381_38806590_38807536
tx.9678	chr19	-	486	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000048720.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGGTCTAAGAGCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38903395	38902157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_38902558_38903309
tx.9679	chr19	+	424	4	ISM	ENSMUSG00000025001.12	ENSMUST00000025965.12	5868	22	40	32588	40	-2037	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1647	junction_3	68.2658203072535	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATATAGTAAGCCAGGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38919398	38926907	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_38919520_38919834_38919957_38923857_38923981_38926849
tx.9680	chr19	+	460	5	ISM	ENSMUSG00000025001.12	ENSMUST00000025965.12	5868	22	40	30544	40	7	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1647	junction_3	59.1375515218545	334	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GTAAACTAACTTTGTTCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38919398	38928951	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_38919520_38919834_38919957_38923857_38923981_38926849_38926907_38928914
tx.9681	chr19	+	3056	22	FSM	ENSMUSG00000025001.12	ENSMUST00000025965.12	5868	22	41	2771	41	-2771	multi-exon	TRUE	canonical	3	1554	junction_5	143.18806117019	393	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGTCACATTATTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38919399	38956724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_38919520_38919834_38919957_38923857_38923981_38926849_38926907_38928914_38928952_38929040_38929106_38930897_38930937_38932157_38932386_38933834_38934018_38935168_38935313_38938631_38938829_38940278_38940376_38941986_38942149_38943134_38943275_38943357_38943497_38945478_38945563_38945641_38945762_38947487_38947605_38948112_38948273_38953040_38953138_38953850_38953928_38956176
tx.9682	chr19	+	365	3	ISM	ENSMUSG00000025001.12	ENSMUST00000025965.12	5868	22	42	35514	42	-4963	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1753	junction_2	29.5	152	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGTATGTATGATTAACTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38919400	38923981	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_38919520_38919834_38919957_38923857
tx.9683	chr19	+	2300	15	ISM	ENSMUSG00000025001.12	ENSMUST00000025965.12	5868	22	12990	2773	216	-2773	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1637	junction_4	114.586501502274	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATCTGGTCACATTATTTTT	954	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	38932348	38956722	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_38932386_38933834_38934018_38935168_38935313_38938631_38938829_38940278_38940376_38941986_38942149_38943134_38943275_38943357_38943497_38945478_38945563_38945641_38945762_38947487_38947605_38948112_38948273_38953040_38953138_38953850_38953928_38956176
tx.9684	chr19	+	1477	6	ISM	ENSMUSG00000025002.6	ENSMUST00000025966.5	1995	9	11631	3	11631	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_5	0.4	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATTGGAATTCTTTACTTT	21	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39007093	39031134	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_39007248_39019705_39019883_39022682_39022825_39023888_39024077_39026543_39026686_39030460
tx.9685	chr19	+	344	2	Intergenic	novelGene_900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTAGTAGTCTTGGTTTCCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	39948007	39960199	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_39948197_39960044
tx.9686	chr19	-	622	2	ISM	ENSMUSG00000067225.3	ENSMUST00000048959.5	1786	9	33493	0	33493	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTCAGACTTTTCTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40028778	40026383	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_40026863_40028635
tx.9687	chr19	-	1430	7	FSM	ENSMUSG00000055044.13	ENSMUST00000068439.13	2571	7	75	1066	75	124	multi-exon	FALSE	canonical	3	193	junction_3	18.3938395484285	1113	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTGTGACCTCTTAGTTGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40259985	40210682	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_40211216_40211494_40211613_40218950_40219103_40231849_40232044_40238062_40238148_40240353_40240506_40259789
tx.9688	chr19	+	434	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000055044.13_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	0.5	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AAGGAAGGACACGAGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40260079	40263063	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_+_40260225_40262589_40262672_40262856
tx.9689	chr19	-	3457	19	FSM	ENSMUSG00000025007.14	ENSMUST00000025979.13	3527	19	70	0	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	945	junction_12	98.5252364738204	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCACAGTTCGTTTTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40576837	40538700	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_40539774_40541967_40542064_40543034_40543222_40545862_40545985_40546094_40546291_40551345_40551484_40553279_40553501_40555015_40555110_40556765_40556840_40557476_40557622_40558911_40559037_40562214_40562306_40562654_40562814_40566021_40566127_40566215_40566366_40568305_40568521_40573933_40574050_40574570_40574637_40576753
tx.9690	chr19	-	867	7	ISM	ENSMUSG00000025007.14	ENSMUST00000134749.8	2493	16	35	17177	-4	110	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1135	junction_3	86.92461612736	149	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAGTGATCTTCAGGGGGTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40576832	40562677	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_40562814_40566021_40566127_40566215_40566366_40568305_40568521_40573933_40574050_40574570_40574637_40576753
tx.9691	chr19	-	1713	12	FSM	ENSMUSG00000025008.16	ENSMUST00000135795.8	1686	12	-26	-1	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_8	4.71501908359634	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAACAGTTCTCAACCCATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40600673	40593540	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_40593904_40594146_40594242_40594669_40594778_40595721_40595848_40596069_40596151_40596663_40596700_40597135_40597252_40597345_40597455_40597645_40597777_40599737_40599857_40600094_40600219_40600368
tx.9692	chr19	+	348	2	NNC	ENSMUSG00000048120.17	novel	319	2	NA	NA	22	-1147	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCACGAGTTTCTTTATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40600862	40601442	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_40600968_40601199
tx.9693	chr19	+	1510	2	NNC	ENSMUSG00000049164.8	novel	1345	4	NA	NA	-547	-19046	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	6	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAACCAAAAAAAAACCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40882601	40886849	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_40882790_40885527
tx.9694	chr19	+	587	5	FSM	ENSMUSG00000049164.8	ENSMUST00000050092.7	6840	5	-50	6303	-50	-5807	multi-exon	FALSE	canonical	3	75	junction_1	19.3196790863617	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAGCTATTTTGTGATGAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40883098	40900088	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_40883235_40885527_40885610_40896502_40896648_40899476_40899554_40899941
tx.9695	chr19	+	1395	2	ISM	ENSMUSG00000049164.8	ENSMUST00000050092.7	6840	5	11	19544	11	-19048	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	75	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAAAAACCAAAAAAAAACCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40883159	40886847	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_40883235_40885527
tx.9696	chr19	-	613	3	NNC	ENSMUSG00000061132.14	novel	1701	17	NA	NA	58655	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	27	junction_2	6.5	266	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAGGTGTGATGCATTTTCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40923936	40917370	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_40917737_40922870_40923027_40923845
tx.9697	chr19	-	794	3	Intergenic	novelGene_901	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTCATTCTCTGGGCCTTGG	5288	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	40995198	40993117	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_40993345_40994363_40994553_40994820
tx.9698	chr19	-	2633	12	ISM	ENSMUSG00000025016.12	ENSMUST00000237871.2	3170	15	17176	-3	17176	3	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	1059	junction_11	63.3451779557681	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGTGACAGTAGATGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41235243	41202227	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_41203579_41205539_41205617_41205786_41205871_41206608_41206756_41209675_41209745_41211522_41211663_41220781_41220913_41223119_41223215_41227116_41227284_41229015_41229148_41233882_41233961_41235081
tx.9699	chr19	-	1510	3	ISM	ENSMUSG00000025016.12	ENSMUST00000237871.2	3170	15	46548	0	46548	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1245	junction_2	18	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTTGTGACAGTAGATG	8676	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41205871	41202230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_41203579_41205539_41205617_41205786
tx.97	chr1	-	1152	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000117091.2	novel	726	1	NA	NA	-999	302	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	0	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAAGTCTTCTTGTGTCATGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31018048	31016021	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_-_31017085_31017959
tx.970	chr1	+	1784	10	FSM	ENSMUSG00000026641.14	ENSMUST00000161241.8	2167	10	0	383	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	185	junction_1	10.3363197596069	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTTGTCTGTCTTCCTCCTTT	6737	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171238880	171246327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_171239009_171242004_171242098_171243072_171243123_171243282_171243399_171243702_171243805_171244377_171244574_171244809_171244898_171245040_171245100_171245208_171245433_171245599
tx.9700	chr19	-	1529	4	ISM	ENSMUSG00000025016.12	ENSMUST00000237871.2	3170	15	45791	0	45791	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1172	junction_3	45.3455865793158	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGTTTTGTGACAGTAGATG	7919	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41206628	41202230	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_41203579_41205539_41205617_41205786_41205871_41206608
tx.9701	chr19	-	2808	7	NNC	ENSMUSG00000025017.11	novel	4482	17	NA	NA	88163	15	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	4	junction_6	1.88561808316413	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAAAGTGCTTTTTGAGGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41285372	41260800	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_41262793_41270309_41270447_41271518_41271590_41275908_41276065_41281191_41281265_41284742_41284949_41285199
tx.9702	chr19	+	485	3	NIC	ENSMUSG00000025019.18	novel	4833	8	NA	NA	5	-13025	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_2	50	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTGTCCTCTTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41471080	41534582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_41471223_41471965_41472040_41534313
tx.9703	chr19	+	539	4	ISM	ENSMUSG00000025019.18	ENSMUST00000067795.13	4833	8	23	33426	23	-30333	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_3	9.20144916122817	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GCCTGGCAGTGGTGGTGCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41471098	41517274	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_41471223_41471965_41472040_41516459_41516526_41516999
tx.9704	chr19	+	627	5	ISM	ENSMUSG00000025019.18	ENSMUST00000067795.13	4833	8	9	16118	9	-13025	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	83	junction_3	9.51314879522022	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCATTGTCCTCTTTAATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41471084	41534582	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_41471223_41471965_41472040_41516459_41516526_41516999_41517080_41534313
tx.9705	chr19	-	3250	12	FSM	ENSMUSG00000025154.16	ENSMUST00000026150.15	5103	12	-7	1860	-7	1352	multi-exon	FALSE	canonical	3	296	junction_2	42.9826026693522	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TATAGTGAGGTCAAACAGAA	4520	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41790493	41756886	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_41758636_41761488_41761568_41762504_41762616_41767548_41767648_41769596_41769789_41770769_41770836_41772764_41772852_41773210_41773438_41774996_41775207_41776744_41776826_41780185_41780452_41790410
tx.9706	chr19	-	598	4	ISM	ENSMUSG00000025154.16	ENSMUST00000177495.2	1652	12	-8	16607	-8	-16607	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	356	junction_2	45.8475735453906	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGCTGACCCATAAACATTT	4519	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41790494	41775039	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_41775207_41776744_41776826_41780185_41780452_41790410
tx.9707	chr19	-	435	3	ISM	ENSMUSG00000025154.16	ENSMUST00000177495.2	1652	12	-11	18311	-11	-18311	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	356	junction_1	52.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAGAGTACGCAAAGCTTCA	4516	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41790497	41776743	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_41776826_41780185_41780452_41790410
tx.9708	chr19	-	770	6	ISM	ENSMUSG00000035049.5	ENSMUST00000038677.5	4340	34	25329	-5	25329	5	3prime_fragment	TRUE	canonical	3	392	junction_5	21.8668699177546	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATGAGTGGCTTGGCCCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41859283	41851284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_41851752_41853610_41853694_41853959_41854028_41855144_41855212_41857208_41857259_41859248
tx.9709	chr19	-	4352	34	FSM	ENSMUSG00000035049.5	ENSMUST00000038677.5	4340	34	-12	0	-12	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	269	junction_16	39.9184430265499	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCCCTGATGAGTGGCTTGGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41884624	41851289	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_41851752_41853610_41853694_41853959_41854028_41855144_41855212_41857208_41857259_41859248_41859375_41859573_41859744_41859860_41860029_41860171_41860264_41861347_41861506_41862181_41862290_41862674_41862781_41862967_41863049_41863155_41863315_41864973_41865068_41865539_41865608_41865774_41865930_41866222_41866386_41866467_41866533_41868540_41868663_41868797_41868941_41870597_41870713_41871861_41871960_41872151_41872264_41874085_41874178_41874525_41874625_41875238_41875367_41875449_41875589_41878204_41878322_41878507_41878614_41879522_41879600_41880976_41881061_41883586_41883817_41884377
tx.9710	chr19	+	1748	4	FSM	ENSMUSG00000011752.8	ENSMUST00000011896.8	1775	4	27	0	27	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	5418	junction_2	350.959003620398	5067	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTACTGTTTGTCTTGTGT	4087	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41900388	41907099	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_41900626_41904043_41904319_41905081_41905263_41906044
tx.9711	chr19	-	988	7	NNC	ENSMUSG00000034321.15	novel	1018	8	NA	NA	83	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	350.071738679692	189	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTCATTTGTTAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41921604	41911990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_41912528_41913149_41913235_41913627_41913675_41914966_41915005_41916463_41916553_41919794_41919870_41921487
tx.9712	chr19	-	1043	8	NNC	ENSMUSG00000034321.15	novel	1018	8	NA	NA	-9	14	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	324.550552648566	1214	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTCATTTGTTAGTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41921746	41911990	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_41912528_41913149_41913235_41913627_41913675_41914966_41915005_41916463_41916553_41919794_41919870_41921487_41921604_41921690
tx.9713	chr19	+	1874	12	NIC	ENSMUSG00000025157.9	novel	1821	11	NA	NA	3	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	79	junction_8	134.380796050282	55	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTAGCTTCTCTGTGCCT	4132	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41921921	41932541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_41922105_41923176_41923323_41926041_41926290_41926461_41926657_41926802_41926892_41927246_41927276_41928038_41928173_41928295_41928344_41929088_41929175_41929954_41930079_41930374_41930446_41932020
tx.9714	chr19	+	1821	11	FSM	ENSMUSG00000025157.9	ENSMUST00000026154.9	1821	11	-2	2	-2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	323	junction_7	37.0513157661101	318	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTAGCTTCTCTGTGCCT	4137	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41921926	41932541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_41922105_41923176_41923323_41926041_41926290_41926461_41926657_41926802_41926892_41927246_41927276_41928038_41928173_41929088_41929175_41929954_41930079_41930374_41930446_41932020
tx.9715	chr19	+	1717	11	NIC	ENSMUSG00000025157.9	novel	1821	11	NA	NA	0	-2	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	31	junction_1	121.178422171606	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TATGTAGCTTCTCTGTGCCT	4139	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41921928	41932541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_41922105_41923278_41923323_41926041_41926290_41926461_41926657_41926802_41926892_41927246_41927276_41928038_41928173_41929088_41929175_41929954_41930079_41930374_41930446_41932020
tx.9716	chr19	-	593	4	ISM	ENSMUSG00000025159.9	ENSMUST00000168484.8	2368	18	0	10996	0	-1105	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	248	junction_1	7.71722460186015	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGCTCTGGAGAAATACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41969569	41952531	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_41952843_41954652_41954754_41958141_41958191_41969437
tx.9717	chr19	+	1385	3	NNC	ENSMUSG00000025171.3	novel	1529	3	NA	NA	-266	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_1	51	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCCTAGCACATGACTTCCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41969935	42023084	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_41970036_42020327_42020556_42022027
tx.9718	chr19	+	1697	3	FSM	ENSMUSG00000025171.3	ENSMUST00000026170.3	1529	3	-168	0	-168	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_1	5.5	141	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGCCTAGCACATGACTTCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	41970033	42023082	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_41970448_42020327_42020556_42022027
tx.9719	chr19	-	1903	6	NNC	ENSMUSG00000049670.10	novel	1800	5	NA	NA	0	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	45.0244378088167	32	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AATTTGTGTTATGAACTTTC	4140	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42074796	42063379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_42064695_42064893_42065004_42066399_42066519_42066922_42067023_42067117_42067216_42074635
tx.972	chr1	+	998	2	FSM	ENSMUSG00000103711.2	ENSMUST00000194029.2	543	2	-454	-1	232	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	27	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATGAGTTGTATTTAATTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171246832	171247920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_171247669_171247758
tx.9720	chr19	-	1805	5	NNC	ENSMUSG00000049670.10	novel	1800	5	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	43.8541617181312	182	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTGTGTTATGAACTTT	4139	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42074797	42063380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_42064695_42064893_42065004_42066399_42066519_42066922_42067023_42074635
tx.9721	chr19	-	1920	6	NNC	ENSMUSG00000049670.10	novel	1800	5	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	43.8068487796144	40	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAATTTGTGTTATGAACTTT	4139	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42074797	42063380	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_42064695_42064893_42065004_42066399_42066519_42066922_42067023_42067100_42067216_42074635
tx.9722	chr19	-	1022	3	FSM	ENSMUSG00000018821.4	ENSMUST00000018965.4	1044	3	22	0	22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	851	junction_1	12	3156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTGTCAGAGTGTGCTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42117476	42111711	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_42112288_42113186_42113466_42117309
tx.9723	chr19	+	795	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000018821.4_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAATGAAAAGTAGAGACATA	5601	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42111771	42113468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_+_42112290_42113191
tx.9724	chr19	+	2738	2	FSM	ENSMUSG00000044345.10	ENSMUST00000061111.10	3066	2	323	5	15	-5	multi-exon	FALSE	canonical	3	88	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTTGTGTTTGGGTCTCACG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42136161	42140137	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_42137999_42139236
tx.9725	chr19	+	2587	12	FSM	ENSMUSG00000018820.14	ENSMUST00000099443.11	2573	12	-13	-1	-13	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	55	junction_1	33.3877792261314	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTTGTCAGGTCTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42159019	42180157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_42159108_42159984_42160183_42165827_42165899_42167727_42167930_42169940_42170037_42171097_42171211_42171866_42172004_42172556_42172629_42174243_42174389_42177635_42177683_42177960_42178043_42178821
tx.9726	chr19	+	2704	12	NIC	ENSMUSG00000018820.14	novel	5611	13	NA	NA	-13	1	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	125	junction_1	17.7223769463382	26	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGGTTTTGTCAGGTCTCCTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42159019	42180157	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_42159225_42159984_42160183_42165827_42165899_42167727_42167930_42169940_42170037_42171097_42171211_42171866_42172004_42172556_42172629_42174243_42174389_42177635_42177683_42177960_42178043_42178821
tx.9727	chr19	-	894	5	ISM	ENSMUSG00000042401.9	ENSMUST00000048630.8	2618	15	133721	494	-10108	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_1	10.2347447452294	52	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTTGTGGAAAACTATATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42286501	42271967	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_42272120_42272561_42272706_42275611_42275655_42276291_42276438_42286092
tx.9728	chr19	-	1233	10	NNC	ENSMUSG00000042401.9	novel	2618	15	NA	NA	-19186	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	12	junction_9	18.8325958557674	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAACCTTTGTGGAAAACTAT	2505	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42295579	42271970	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_42272120_42272561_42272706_42275611_42275655_42276291_42276438_42286092_42286262_42286721_42286823_42287595_42287679_42290563_42290701_42293108_42293255_42295464
tx.9729	chr19	+	911	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000042401.9_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTTGTCCAGTGTAATGAAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42286574	42303051	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_+_42286888_42302453
tx.9730	chr19	+	1338	6	FSM	ENSMUSG00000025184.11	ENSMUST00000160107.2	950	6	-28	-360	11	360	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	35.4942248823664	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTATGGTGTTTATAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42507208	42579809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_42507297_42564464_42564641_42570358_42570430_42571263_42571360_42571841_42571983_42579043
tx.9731	chr19	+	3112	7	FSM	ENSMUSG00000025184.11	ENSMUST00000026188.10	4112	7	27	973	-12	360	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_3	8.08290376865476	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTATGGTGTTTATAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42507224	42579809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_42507297_42550990_42552781_42564464_42564641_42570358_42570430_42571263_42571360_42571841_42571983_42579043
tx.9732	chr19	+	3041	6	ISM	ENSMUSG00000025184.11	ENSMUST00000026188.10	4112	7	43792	973	-1690	360	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	76	junction_2	7.93977329651168	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCATTATGGTGTTTATAAAT	51	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42550989	42579809	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_42552781_42564464_42564641_42570358_42570430_42571263_42571360_42571841_42571983_42579043
tx.9733	chr19	-	985	5	NNC	ENSMUSG00000060224.5	novel	3137	16	NA	NA	20022	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_4	5.35607132140714	2	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTGCTTGTATTGTTTTTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42720889	42715079	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_42715429_42716095_42716217_42718060_42718168_42719757_42719913_42720636
tx.9734	chr19	-	483	5	NNC	ENSMUSG00000060224.5	novel	869	4	NA	NA	-13	-1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	3.03108891324554	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGGTTGTTGTTGTTGTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42740956	42735544	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_42735659_42735785_42735860_42735935_42736030_42737822_42737843_42740775
tx.9735	chr19	-	2746	20	NNC	ENSMUSG00000025188.16	novel	2847	20	NA	NA	0	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	30.5371124282743	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCAAGCCTGTCCCTGGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42768404	42743634	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_42744236_42744696_42744780_42746231_42746346_42748144_42748298_42748807_42748869_42748948_42749084_42749450_42749513_42750534_42750715_42750831_42751000_42752233_42752284_42754351_42754422_42754568_42754656_42755148_42755273_42755556_42755718_42758044_42758154_42759192_42759336_42759555_42759694_42766560_42766723_42766992_42767086_42768352
tx.9736	chr19	-	819	6	ISM	ENSMUSG00000025188.16	ENSMUST00000069298.13	3196	18	0	11403	0	-2673	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	80	junction_5	24.5715282390005	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCATTGTCCTGTTATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42768404	42757922	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_42758154_42759192_42759336_42759555_42759694_42766560_42766723_42766992_42767086_42768352
tx.9737	chr19	-	431	3	NNC	ENSMUSG00000074852.5	novel	4231	12	NA	NA	410731	-17596	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.5	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCATGACTATGTAGCTATAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	42801397	42792573	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_42792779_42794728_42794876_42801318
tx.9738	chr19	+	975	2	FSM	ENSMUSG00000025189.10	ENSMUST00000225191.2	318	2	125	-782	125	721	multi-exon	FALSE	canonical	3	7	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ACAACTTACATGAAAAATTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43482079	43484201	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_43482251_43483397
tx.9739	chr19	-	1991	9	FSM	ENSMUSG00000025190.14	ENSMUST00000026196.14	2058	9	67	0	-53	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	761	junction_5	49.6934351801121	994	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGGAGTTTGTGATCCATTCA	8384	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43512977	43488190	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_43488997_43491346_43491490_43492960_43493127_43493214_43493366_43495360_43495466_43495760_43495874_43496308_43496433_43504119_43504302_43512776
tx.9740	chr19	+	713	3	FSM	ENSMUSG00000118236.2	ENSMUST00000237632.2	1214	3	536	-35	536	35	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGTGTATAGTCTTATTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43634724	43641009	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_43634860_43635408_43635654_43640676
tx.9741	chr19	-	1327	4	FSM	ENSMUSG00000040414.9	ENSMUST00000046038.9	1535	4	214	-6	193	6	multi-exon	FALSE	canonical	3	130	junction_2	77.3146529162199	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGGGTTTGTCTTGCCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43663106	43652233	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_43653083_43654210_43654268_43655353_43655583_43662914
tx.9742	chr19	+	1527	9	FSM	ENSMUSG00000025192.14	ENSMUST00000144314.2	1829	9	-55	357	-24	-357	multi-exon	FALSE	canonical	2	6	junction_1	3.11247489949718	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TCTCAAGTTTTGACTAGCCA	2752	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43678223	43710656	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_43678344_43678617_43678721_43679456_43679640_43692637_43692844_43693318_43693470_43700173_43700278_43704712_43704770_43705888_43706023_43710187
tx.9743	chr19	-	2245	5	ISM	ENSMUSG00000040018.10	ENSMUST00000045562.6	4798	9	9223	1866	-3675	-1866	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	354	junction_3	46.1789995560753	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCAGTCAGCTAACCCAG	8321	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43732216	43723558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_43725292_43726475_43726590_43728275_43728431_43730271_43730354_43732055
tx.9744	chr19	-	2020	3	ISM	ENSMUSG00000040018.10	ENSMUST00000045562.6	4798	9	13006	1851	108	-1851	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	372	junction_2	51.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCAGGATTTTTGTTTGGGA	7509	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43728433	43723543	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_43725292_43726475_43726590_43728275
tx.9745	chr19	-	2055	4	ISM	ENSMUSG00000040018.10	ENSMUST00000045562.6	4798	9	11115	1866	-1783	-1866	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	354	junction_3	53.3062431198781	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCAGTCAGCTAACCCAG	5618	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43730324	43723558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_43725292_43726475_43726590_43728275_43728431_43730271
tx.9746	chr19	-	2913	9	FSM	ENSMUSG00000040018.10	ENSMUST00000045562.6	4798	9	19	1866	19	-1866	multi-exon	FALSE	canonical	3	354	junction_3	36.2782217728488	84	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTTCAGTCAGCTAACCCAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43741420	43723558	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_43725292_43726475_43726590_43728275_43728431_43730271_43730354_43732055_43732224_43735174_43735362_43737228_43737352_43739782_43739974_43741260
tx.9747	chr19	+	1273	9	FSM	ENSMUSG00000025193.15	ENSMUST00000112047.10	1233	9	-40	0	-40	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	18	junction_1	5.45435605731786	94	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTATAGTCTCAGGTTCTTTC	9234	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43741496	43757077	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_43741660_43744058_43744131_43747166_43747227_43748288_43748499_43749127_43749164_43751311_43751446_43753398_43753427_43755639_43755746_43756613
tx.9748	chr19	+	1227	9	FSM	ENSMUSG00000025193.15	ENSMUST00000026199.14	1298	9	76	-5	-26	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	9	junction_5	8.4400459121974	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTATAGTCTCAGGTTCTT	9248	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43741510	43757075	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_43741660_43744058_43744131_43747166_43747227_43748288_43748499_43749127_43749164_43751341_43751446_43753398_43753427_43755639_43755746_43756613
tx.9749	chr19	+	1209	8	NIC	ENSMUSG00000025193.15	novel	1233	9	NA	NA	-17	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_4	11.4855721384239	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTGTTATAGTCTCAGGTT	9257	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43741519	43757072	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_43741660_43744058_43744131_43747166_43747227_43748288_43748499_43751311_43751446_43753398_43753427_43755639_43755746_43756613
tx.975	chr1	+	1903	9	NNC	ENSMUSG00000038235.5	novel	2518	10	NA	NA	14	366	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	81.7212296468916	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTTGTTGAACATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171265116	171291579	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_171265270_171287930_171288000_171288105_171288214_171288396_171288544_171288768_171288975_171289130_171289234_171289372_171289485_171290456_171290509_171290626
tx.9750	chr19	-	1501	2	ISM	ENSMUSG00000025195.10	ENSMUST00000212592.2	3901	14	29951	-2	29951	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	52	junction_1	0	51	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGAGTGTGTTTCCTTCAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43838256	43835258	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_43836718_43838214
tx.9751	chr19	-	915	6	ISM	ENSMUSG00000025196.5	ENSMUST00000026210.5	1828	9	16441	0	-1422	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_2	10.0119928086271	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGCCACTTGCATGCCT	9999	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43958554	43944745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_43945076_43948424_43948544_43952169_43952270_43954613_43954754_43956891_43957004_43958440
tx.9752	chr19	-	1256	8	NNC	ENSMUSG00000025196.5	novel	1828	9	NA	NA	-7127	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	3	junction_7	14.059639731791	14	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGCCACTTGCATGCCT	4424	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43964259	43944745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_43945076_43948424_43948544_43952169_43952270_43954613_43954754_43956891_43957004_43958440_43958624_43962371_43962528_43964143
tx.9753	chr19	-	1336	8	ISM	ENSMUSG00000025196.5	ENSMUST00000026210.5	1828	9	5558	0	5558	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	24	junction_2	8.50929863533453	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGGTGCCACTTGCATGCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43969437	43944745	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_43945076_43948424_43948544_43952169_43952270_43954613_43954754_43956891_43957004_43958440_43958624_43962371_43962528_43969241
tx.9754	chr19	-	932	3	NNC	ENSMUSG00000025197.10	novel	1916	9	NA	NA	21544	0	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	1	1	junction_2	7	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCTTTGTATGTTTGACT	9495	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43996094	43993460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_43994062_43995462_43995605_43995905
tx.9755	chr19	-	1141	3	NNC	ENSMUSG00000025197.10	novel	1916	9	NA	NA	21529	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	2	junction_2	6.5	15	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTTTCTTTGTATGTTTGACT	9480	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	43996109	43993460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_43994062_43995462_43995605_43995711
tx.9756	chr19	-	3211	12	FSM	ENSMUSG00000025198.17	ENSMUST00000071698.13	3228	12	18	-1	-1	1	multi-exon	TRUE	canonical	3	64	junction_11	39.5783562189201	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGTGTGTGTTCTATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44058196	44023381	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44025588_44027611_44027692_44029185_44029276_44036073_44036166_44037560_44037620_44044560_44044635_44047489_44047616_44050281_44050344_44051457_44051505_44056038_44056121_44057710_44057835_44058027
tx.9757	chr19	-	3043	11	FSM	ENSMUSG00000025198.17	ENSMUST00000170801.8	3172	11	126	3	-5	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_6	17.066048165876	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGATTGTGTGTGTTCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44057839	44023385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44025588_44027611_44027692_44029185_44029276_44036073_44036166_44037560_44037620_44044560_44044635_44047489_44047616_44050281_44050344_44051457_44051505_44056038_44056121_44057710
tx.9758	chr19	-	3113	12	FSM	ENSMUSG00000025198.17	ENSMUST00000112028.10	3136	12	20	3	-9	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	111	junction_11	27.8217466521579	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGATTGTGTGTGTTCTATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44058204	44023385	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44025588_44027611_44027692_44029185_44029276_44036073_44036166_44037560_44037620_44044560_44044635_44047489_44047616_44050281_44050344_44051457_44051505_44056038_44056121_44057710_44057835_44058129
tx.9759	chr19	-	2184	14	FSM	ENSMUSG00000025200.8	ENSMUST00000026218.7	3581	14	12	1385	-3	-1	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_12	11.4813973542901	64	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGACAGATGTCTTATGTTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44124303	44098460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44099100_44101387_44101486_44102112_44102233_44102962_44103173_44109311_44109392_44110287_44110400_44111582_44111724_44113246_44113332_44115804_44115924_44117636_44117852_44119850_44119953_44120524_44120604_44121438_44121524_44124204
tx.9760	chr19	-	889	5	FSM	ENSMUSG00000057506.6	ENSMUST00000079033.6	885	5	9	-13	6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	1199	junction_4	51.0165414351071	3753	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGGGTTTTTTGGTTTTTG	972	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44134876	44127684	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44128153_44130562_44130668_44131459_44131580_44134379_44134497_44134797
tx.9761	chr19	-	772	3	ISM	ENSMUSG00000057506.6	ENSMUST00000237867.2	683	5	-38	837	6	-837	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	1199	junction_2	45	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAAGGAAAGAAAA	972	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44134876	44131003	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_44131580_44134379_44134497_44134797
tx.9762	chr19	+	733	3	NNC	ENSMUSG00000025202.9	novel	3489	6	NA	NA	-250	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_1	19	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGAAATTCTCCTGTTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44226003	44230461	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_44226141_44226814_44227048_44230098
tx.9763	chr19	+	906	3	FSM	ENSMUSG00000025202.9	ENSMUST00000237324.2	655	3	-240	-11	-240	11	multi-exon	FALSE	canonical	3	31	junction_1	4	159	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCTCCTGTTCTTAGTCTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44226013	44230468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_44226317_44226814_44227048_44230098
tx.9764	chr19	+	5040	6	FSM	ENSMUSG00000025203.7	ENSMUST00000026221.7	5455	6	408	7	6	-7	multi-exon	FALSE	canonical	3	2597	junction_1	100.817458805507	70	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCAAAATGTCTCGTGGTGT	1475	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44282520	44295296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_44282851_44283342_44283626_44286478_44286610_44288047_44288254_44289650_44289884_44291439
tx.9765	chr19	+	2650	3	ISM	ENSMUSG00000025203.7	ENSMUST00000237039.2	2166	6	-19	3927	-19	-3927	intron_retention	FALSE	canonical	3	2597	junction_1	78	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCCAAAAACCTTGCTCATTG	1450	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44282495	44288490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_44282851_44283342_44283626_44286478
tx.9766	chr19	-	1578	6	FSM	ENSMUSG00000037071.4	ENSMUST00000041331.4	4832	6	-17	3271	-17	267	multi-exon	FALSE	canonical	3	439	junction_3	163.124001912655	561	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCATGCCACAAGACATTATA	7423	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44396165	44386164	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44386558_44388580_44388814_44390131_44390338_44391603_44391735_44394925_44395200_44395824
tx.9767	chr19	-	373	3	NNC	ENSMUSG00000091471.2	novel	225	2	NA	NA	9017	3687	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	5.5	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTGTGGTTATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44532253	44528473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_44528609_44531704_44531829_44532139
tx.9768	chr19	-	450	4	NNC	ENSMUSG00000091471.2	novel	225	2	NA	NA	6965	3687	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	2	2	junction_1	4.96655480858378	24	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTGTTGTGGTTATGGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44534305	44528473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_44528609_44531704_44531829_44532139_44532252_44534226
tx.9769	chr19	-	374	3	ISM	ENSMUSG00000025204.11	ENSMUST00000168083.2	603	5	1695	-2	-844	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	4404	junction_1	319.5	1297	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCTCTGGTTTCTGTGTCT	3690	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44542163	44538689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_44538852_44541136_44541293_44542107
tx.977	chr1	-	2284	8	FSM	ENSMUSG00000026556.16	ENSMUST00000027837.13	5698	8	3	3411	3	58	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_3	8.90768986749708	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGGGAACCACCCTGCCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171854859	171831937	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_171832430_171833656_171833889_171835477_171835614_171836073_171836211_171837007_171837616_171840394_171840516_171840649_171840913_171854564
tx.9770	chr19	-	657	5	FSM	ENSMUSG00000025204.11	ENSMUST00000026222.11	680	5	12	11	-2	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	4404	junction_1	502.944517317765	17503	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GTGCTCTGGTTTCTGTGTCT	1986	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44543867	44538689	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44538852_44541136_44541293_44542107_44542208_44543369_44543497_44543755
tx.9771	chr19	+	1593	8	FSM	ENSMUSG00000036450.5	ENSMUST00000040455.5	6194	8	-2	4603	-2	-4603	multi-exon	FALSE	canonical	3	98	junction_5	13.1583759310508	33	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGAGTCTGCCTTCTGCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44551286	44560110	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_44551494_44551728_44551980_44554316_44554466_44556773_44556920_44557842_44557950_44558331_44558396_44558665_44558777_44559552
tx.9772	chr19	+	879	2	FSM	ENSMUSG00000036450.5	ENSMUST00000131032.2	868	2	2	-13	2	13	multi-exon	FALSE	canonical	3	119	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GATTGTGTTTTATGTGTGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44551290	44552404	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_44551494_44551728
tx.9773	chr19	+	604	3	Intergenic	novelGene_902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	3.5	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTCCTTGTCAAATTTGTCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44658134	44663403	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_44658227_44661584_44661701_44663007
tx.9774	chr19	-	812	3	FSM	ENSMUSG00000025208.10	ENSMUST00000097715.4	1398	3	0	586	0	397	multi-exon	FALSE	canonical	3	460	junction_1	27.5	2265	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTGGAGGCTGTCTTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44994881	44993853	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_44994380_44994501_44994609_44994702
tx.9775	chr19	+	3546	5	FSM	ENSMUSG00000025209.6	ENSMUST00000026227.3	3488	5	-62	4	-62	-4	multi-exon	FALSE	canonical	3	97	junction_1	30.3593066455741	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTGTTTCTGTGCGTTTTTT	2491	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	44994934	45001197	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_44996815_44997718_44997960_44998570_44998679_44998856_44998999_45000022
tx.9776	chr19	+	2919	11	FSM	ENSMUSG00000025212.18	ENSMUST00000062213.13	2867	11	-55	3	43	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	75	junction_2	13.7767920794356	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGTTCTTGATCTTCAGTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45036057	45044818	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_45036330_45037542_45037707_45038182_45038354_45038666_45038766_45039088_45039165_45039314_45039401_45040534_45040663_45040849_45040900_45042108_45042159_45042740_45042789_45043043
tx.9777	chr19	-	435	2	NNC	ENSMUSG00000100417.3	novel	678	2	NA	NA	599	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTGTTTGTTTGTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45291177	45288889	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_45289200_45291052
tx.9778	chr19	-	403	2	NIC	ENSMUSG00000100417.3	novel	797	5	NA	NA	11	4	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TACTGATGCGTTGGGTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45299518	45288904	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_45289200_45299410
tx.9779	chr19	+	752	5	ISM	ENSMUSG00000025217.16	ENSMUST00000224478.2	2194	14	71582	-4	71582	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	590	junction_4	37.3120288914983	1079	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTCTTGCTTTGCCGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45505528	45517736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_45505573_45507247_45507359_45507880_45507960_45515702_45515896_45517411
tx.9780	chr19	+	711	4	ISM	ENSMUSG00000025217.16	ENSMUST00000224478.2	2194	14	73298	-4	73298	4	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	590	junction_3	35.6682242650545	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TCTCTCTTGCTTTGCCGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45507244	45517736	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_45507359_45507880_45507960_45515702_45515896_45517411
tx.9781	chr19	-	2303	9	FSM	ENSMUSG00000025218.7	ENSMUST00000026239.7	2324	9	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	33	junction_8	11.9973955507018	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTGCCTGCTGTCTGTGAGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45548949	45540713	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_45541610_45541947_45542117_45543529_45543659_45544360_45544535_45546153_45546472_45546694_45546855_45547063_45547359_45548018_45548156_45548924
tx.9782	chr19	-	1064	2	ISM	ENSMUSG00000025218.7	ENSMUST00000026239.7	2324	9	6853	2	6853	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	37	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATTGCCTGCTGTCTGTGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45542117	45540715	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_45541610_45541947
tx.9783	chr19	+	826	6	FSM	ENSMUSG00000041035.10	ENSMUST00000047057.9	1353	6	-3	530	-3	214	multi-exon	FALSE	canonical	3	416	junction_3	22.5601418435257	1472	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGACTGACTGCCCCTTTCTC	3689	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45549050	45566196	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_45549147_45553349_45553431_45560323_45560449_45560843_45560978_45565431_45565535_45565909
tx.9784	chr19	-	875	6	FSM	ENSMUSG00000056209.8	ENSMUST00000070215.8	888	6	13	0	13	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	216	junction_3	39.9229257444892	3803	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTTGTGTGGCTTTTTCAA	4900	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45738017	45736172	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_45736491_45736602_45736720_45736984_45737079_45737188_45737309_45737495_45737582_45737877
tx.9785	chr19	+	648	2	FSM	ENSMUSG00000087367.2	ENSMUST00000133963.2	751	2	103	0	103	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	15	junction_1	0	15	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTAAGTGTATCATATAGATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45738049	45740749	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_45738117_45740168
tx.9786	chr19	-	3214	8	ISM	ENSMUSG00000025220.9	ENSMUST00000026243.5	5057	16	15771	0	4106	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	653	junction_7	102.460345739118	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGCTGTGCTGCTTTTT	NA	False	NA	66	True	NA	NA	NA	45756219	45738697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_45740720_45743045_45743206_45746343_45746537_45746787_45746874_45749542_45749648_45750623_45750710_45753888_45754064_45755832
tx.9787	chr19	-	5036	16	FSM	ENSMUSG00000025220.9	ENSMUST00000026243.5	5057	16	21	0	21	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	653	junction_7	84.8678973464054	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGCTGTGCTGCTTTTT	5497	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45771969	45738697	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_45740720_45743045_45743206_45746343_45746537_45746787_45746874_45749542_45749648_45750623_45750710_45753888_45754064_45755832_45756447_45758489_45758649_45760120_45760406_45762100_45762200_45764486_45764659_45765325_45765457_45767025_45767124_45767470_45767523_45771370
tx.9788	chr19	-	2223	9	ISM	ENSMUSG00000025220.9	ENSMUST00000026243.5	5057	16	7	17135	7	449	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	667	junction_8	64.544074088951	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAAGTGCTCGTTGTCCCGT	5483	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45771983	45755832	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_45756447_45758489_45758649_45760120_45760406_45762100_45762200_45764486_45764659_45765325_45765457_45767025_45767124_45767470_45767523_45771370
tx.9789	chr19	-	2087	9	NIC	ENSMUSG00000025221.17	novel	2395	10	NA	NA	8	-3	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	3	6	junction_8	6.92820323027551	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCCCGCTGTCTCTGCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45785475	45780787	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_45782157_45782439_45782503_45782637_45782743_45782918_45783027_45783178_45783250_45783416_45783487_45784018_45784144_45784717_45784772_45785353
tx.9790	chr19	-	1994	7	ISM	ENSMUSG00000025221.17	ENSMUST00000239049.2	2113	8	7775	15	-95	-15	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	16	junction_1	4.2687494916219	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGCTATGCACAGCCCGCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45784238	45780799	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_45782157_45782439_45782503_45782637_45782743_45782918_45783027_45783178_45783250_45783416_45783487_45784018
tx.9791	chr19	-	3755	26	FSM	ENSMUSG00000039901.11	ENSMUST00000045396.9	3676	26	-82	3	-82	-3	multi-exon	TRUE	canonical	3	159	junction_20	17.3221707646588	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTCTTTAGTGTCTCGTTAGT	6565	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	45987009	45805805	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_45807418_45808712_45808830_45834546_45834626_45874390_45874467_45879646_45879774_45880504_45880588_45910055_45910145_45920789_45920851_45922224_45922295_45924800_45924867_45928883_45928943_45934440_45934543_45939100_45939195_45941063_45941140_45941862_45941910_45945118_45945180_45946845_45946890_45948751_45948809_45953602_45953690_45953800_45953876_45954680_45954774_45961261_45961370_45963405_45963553_45963657_45963715_45967038_45967152_45986854
tx.9792	chr19	-	828	2	ISM	ENSMUSG00000025223.16	ENSMUST00000056931.14	2295	11	5511	-1	768	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	350	junction_1	0	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCACTCATGTTCCCCTATT	9023	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46022549	46021031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_46021781_46022470
tx.9793	chr19	-	822	2	ISM	ENSMUSG00000025223.16	ENSMUST00000152946.8	2108	11	11104	0	768	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_1	0	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCACTCATGTTCCCCTATT	9023	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46022549	46021031	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_46021781_46022476
tx.9794	chr19	+	1045	5	ISM	ENSMUSG00000055491.15	ENSMUST00000111899.8	5246	14	23	9860	-19	248	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	329	junction_4	51.9681392778306	40	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGAGGGCTGTGTTGTACTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46045000	46051490	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46045183_46049841_46050016_46050582_46050730_46050840_46050943_46051050
tx.9795	chr19	+	356	2	ISM	ENSMUSG00000055491.15	ENSMUST00000062322.11	5205	14	15654	102	484	6	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	554	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAAGTGGTATTTGGTTTTT	3378	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46060676	46061246	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46060774_46060987
tx.9796	chr19	+	3521	13	NNC	ENSMUSG00000015176.12	novel	3523	13	NA	NA	0	-7	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_10	328.668610541919	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGTTCCTAATGTGTTCAGAG	244	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46064408	46073960	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_46064589_46067141_46067198_46067314_46067461_46067569_46067698_46068346_46068525_46069742_46069862_46069979_46070116_46070686_46070816_46070954_46071066_46071178_46071807_46071958_46072066_46072189_46072283_46072450
tx.9797	chr19	+	784	4	NNC	ENSMUSG00000015176.12	novel	3634	13	NA	NA	7251	71	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	382.309066361527	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CAACACATGGTAATAATTTT	7320	False	NA	22	True	NA	NA	NA	46071743	46072971	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_46071807_46071958_46072066_46072189_46072283_46072450
tx.9798	chr19	+	2101	9	ISM	ENSMUSG00000025224.17	ENSMUST00000176992.8	5981	37	34088	-1	-4	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	81	junction_2	9.62986889838071	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTCCTTCCCGCTGATTTTC	768	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46268614	46274949	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46268863_46268976_46269171_46271473_46271625_46271758_46271890_46272060_46272163_46272443_46272558_46272688_46272870_46273143_46273273_46274098
tx.9799	chr19	+	3004	23	FSM	ENSMUSG00000025225.16	ENSMUST00000073116.13	2979	23	-18	-7	-18	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	47	junction_13	7.7085334275273	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAATGTGCTGCCCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46293164	46300468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46293260_46294368_46294464_46294721_46294804_46294924_46294966_46295209_46295309_46295380_46295533_46295802_46295910_46295998_46296158_46296394_46296500_46296611_46296698_46296783_46296923_46297067_46297194_46297303_46297514_46297593_46297736_46298093_46298209_46298281_46298496_46298646_46298817_46298935_46299039_46299162_46299315_46299447_46299518_46299720_46299894_46300019_46300132_46300211
tx.98	chr1	-	650	3	FSM	ENSMUSG00000086727.9	ENSMUST00000135245.3	889	3	14	225	-13	-225	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TACTGAAAGAACTATTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31261751	31242236	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_-_31242470_31243332_31243555_31261556
tx.9800	chr19	+	2126	15	ISM	ENSMUSG00000025225.16	ENSMUST00000236820.2	2827	21	2000	-129	1877	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_5	8.2909466237799	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAGCAACCCCAATGTGCTGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46296436	46300462	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46296500_46296611_46296698_46296783_46296923_46297067_46297194_46297303_46297514_46297593_46297736_46298093_46298209_46298281_46298496_46298646_46298817_46298935_46299039_46299162_46299315_46299447_46299518_46299720_46299894_46300019_46300132_46300211
tx.9801	chr19	+	1635	11	ISM	ENSMUSG00000025225.16	ENSMUST00000236820.2	2827	21	2950	-135	2827	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	47	junction_1	8.63712915267567	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAATGTGCTGCCCATCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46297386	46300468	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46297514_46297593_46297736_46298093_46298209_46298281_46298496_46298646_46298817_46298935_46299039_46299162_46299315_46299447_46299518_46299720_46299894_46300019_46300132_46300211
tx.9802	chr19	+	1344	4	FSM	ENSMUSG00000025226.12	ENSMUST00000026256.9	1348	4	3	1	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_3	4.08248290463863	24	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGCGTGGTGCATAGGGGA	6316	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46316625	46318884	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46316966_46317113_46317268_46317526_46318033_46318540
tx.9803	chr19	+	1238	5	FSM	ENSMUSG00000025226.12	ENSMUST00000177667.2	1243	5	4	1	4	-1	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	11.8004237212059	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTGCGTGGTGCATAGGGG	6320	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46316629	46318883	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46316741_46316841_46316966_46317113_46317268_46317526_46318033_46318540
tx.9804	chr19	+	1111	3	ISM	ENSMUSG00000025226.12	ENSMUST00000177667.2	1243	5	379	2	379	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_2	5	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTGCGTGGTGCATAGGG	6695	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46317004	46318882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46317268_46317526_46318033_46318540
tx.9805	chr19	+	1056	2	ISM	ENSMUSG00000025226.12	ENSMUST00000177667.2	1243	5	692	3	692	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	21	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTTCTTGCGTGGTGCATAGG	7008	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46317317	46318881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46318033_46318540
tx.9806	chr19	-	343	2	ISM	ENSMUSG00000036748.17	ENSMUST00000236046.2	1167	10	7641	-4	1089	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	995	junction_1	0	258	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTCATTCTGCTCATTT	9036	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46319406	46318978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_46319274_46319358
tx.9807	chr19	-	1243	10	NIC	ENSMUSG00000036748.17	novel	1941	10	NA	NA	-3	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	123	junction_9	336.420298561116	286	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTCATTCTGCTCATTT	5841	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46327080	46318978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_46319274_46319358_46319420_46319490_46319553_46319728_46319906_46319984_46320113_46320195_46320258_46320351_46320496_46321056_46321141_46326751_46326860_46326958
tx.9808	chr19	-	1200	10	FSM	ENSMUSG00000036748.17	ENSMUST00000167861.8	1941	10	13	728	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	50	junction_9	353.322781114268	242	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTCATTCTGCTCATTT	5835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46327086	46318978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_46319274_46319358_46319420_46319490_46319553_46319728_46319906_46319984_46320113_46320195_46320258_46320351_46320496_46321056_46321141_46326751_46326860_46327007
tx.9809	chr19	-	1038	9	NIC	ENSMUSG00000036748.17	novel	1050	9	NA	NA	-9	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	390	junction_8	277.077155319597	622	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTCATTCTGCTCATTT	5835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46327086	46318978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_46319274_46319358_46319420_46319490_46319553_46319728_46319906_46319984_46320059_46320195_46320258_46320351_46320496_46321056_46321141_46327007
tx.9810	chr19	-	1089	9	FSM	ENSMUSG00000036748.17	ENSMUST00000235485.2	1790	9	-27	728	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	133	junction_8	321.93700859019	267	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTCATTCTGCTCATTT	5835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46327086	46318978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_46319274_46319358_46319420_46319490_46319553_46319728_46319906_46319984_46320113_46320195_46320258_46320351_46320496_46321056_46321138_46327007
tx.9811	chr19	-	1092	9	FSM	ENSMUSG00000036748.17	ENSMUST00000051234.9	1833	9	13	728	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_8	253.325599525591	747	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGCTCATTCTGCTCATTT	5835	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46327086	46318978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_46319274_46319358_46319420_46319490_46319553_46319728_46319906_46319984_46320113_46320195_46320258_46320351_46320496_46321056_46321141_46327007
tx.9812	chr19	+	2237	9	FSM	ENSMUSG00000025227.15	ENSMUST00000086969.13	2278	9	43	-2	-12	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	169	junction_1	30.2561977122044	69	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTGGGTCTGTGCCGTG	4241	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46345361	46363693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46345424_46354749_46354993_46355648_46355732_46356147_46356601_46356704_46356829_46357675_46357773_46360374_46360547_46360620_46360815_46362884
tx.9813	chr19	+	2176	8	ISM	ENSMUSG00000025227.15	ENSMUST00000086969.13	2278	9	9430	-2	-424	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	197	junction_3	20.0834991666171	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTCTTTGGGTCTGTGCCGTG	5675	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46354748	46363693	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46354993_46355648_46355732_46356147_46356601_46356704_46356829_46357675_46357773_46360374_46360547_46360620_46360815_46362884
tx.9814	chr19	-	2751	11	FSM	ENSMUSG00000025228.6	ENSMUST00000040270.6	2757	11	4	2	4	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	273	junction_3	19.222122671547	163	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATCAGTCTGACCTCTTTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46384182	46365251	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_46366909_46367046_46367088_46367851_46367914_46368020_46368196_46368687_46368781_46369355_46369573_46370732_46370858_46372658_46372785_46373451_46373528_46375890_46375956_46384068
tx.9815	chr19	+	1836	7	ISM	ENSMUSG00000025231.18	ENSMUST00000118440.3	2681	10	-121	22911	9	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	63	junction_6	13.5123400391395	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTGACTTGGTTTACTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46385343	46442482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46385724_46389562_46389698_46413437_46413575_46438267_46438411_46439017_46439104_46439329_46439403_46441600
tx.9816	chr19	+	1851	7	ISM	ENSMUSG00000025231.18	ENSMUST00000111867.9	1747	12	-30	32010	-8	-5	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	32	junction_6	24.709422404329	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAAAATACCTGACTTGGTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46385326	46442477	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46385724_46389562_46389698_46413437_46413575_46438267_46438411_46439017_46439104_46439329_46439403_46441597
tx.9817	chr19	+	1693	12	FSM	ENSMUSG00000025231.18	ENSMUST00000039922.13	4522	12	81	2748	-27	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	63	junction_6	14.4473967456865	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCAGAGTGCCACACCCATC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46385415	46474495	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46385724_46389562_46389698_46413437_46413575_46438267_46438411_46439017_46439104_46439329_46439403_46441600_46441755_46443173_46443286_46462010_46462146_46463946_46464086_46472038_46472108_46474293
tx.9818	chr19	+	2565	6	NNC	ENSMUSG00000025034.10	novel	3580	6	NA	NA	623	-396	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	429.31275312993	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CAAGAGCACAGCCCTTGTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46490763	46504891	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_46491457_46501161_46501258_46501546_46501781_46502891_46502924_46503060_46503177_46503497
tx.9819	chr19	+	1410	2	ISM	ENSMUSG00000025034.10	ENSMUST00000026008.9	3580	6	12904	512	-54	-512	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1125	junction_1	0	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AAAAAAAAAGGAGAAAAAAA	148	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46503044	46504775	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46503177_46503497
tx.9820	chr19	-	779	5	ISM	ENSMUSG00000025035.10	ENSMUST00000026009.10	843	6	14711	11	10	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	254	junction_1	33.9300751546471	138	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTTGAAATAGTATTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46546821	46519545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_46519826_46530790_46530977_46531920_46531972_46540011_46540129_46546676
tx.9821	chr19	-	927	6	FSM	ENSMUSG00000025035.10	ENSMUST00000026009.10	843	6	-95	11	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	254	junction_1	35.3870032639103	1664	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAGTTGAAATAGTATTAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46561627	46519545	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_46519826_46530790_46530977_46531920_46531972_46540011_46540129_46546676_46546821_46561478
tx.9822	chr19	+	1602	12	FSM	ENSMUSG00000025036.8	ENSMUST00000026011.8	3205	12	-2	1605	0	-1605	multi-exon	FALSE	canonical	3	36	junction_10	6.85384611817119	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAACAAAAAACCACCAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46561803	46583729	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46561899_46570922_46571103_46571245_46571417_46574143_46574243_46576373_46576450_46576662_46576749_46578579_46578641_46578922_46578990_46579559_46579610_46579931_46579982_46580738_46580787_46583110
tx.9823	chr19	+	1323	11	ISM	ENSMUSG00000025036.8	ENSMUST00000026011.8	3205	12	3	4203	3	2142	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	36	junction_10	6.8622153857191	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCTCATGCTCTGGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46561808	46581131	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46561899_46570922_46571103_46571245_46571417_46574143_46574243_46576373_46576450_46576662_46576749_46578579_46578641_46578922_46578990_46579559_46579610_46579931_46579982_46580738
tx.9824	chr19	+	3919	5	FSM	ENSMUSG00000047731.18	ENSMUST00000099376.11	3911	5	-8	0	-7	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	116	junction_1	18.7666592658363	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TACACAATCTCCTGCCGCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46587544	46645821	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46587733_46595150_46595199_46632791_46632895_46640912_46641075_46642403
tx.9825	chr19	+	695	5	FSM	ENSMUSG00000062376.8	ENSMUST00000074912.8	2176	5	8	1473	8	-1473	multi-exon	FALSE	canonical	3	167	junction_1	5.33853912601566	376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTACCTCAGCTTGTTAAAA	9079	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46678352	46690348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46678525_46687994_46688058_46688176_46688221_46689213_46689235_46689953
tx.9826	chr19	+	689	4	NNC	ENSMUSG00000062376.8	novel	2176	5	NA	NA	13	-1473	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	81.4411853220879	95	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTACCTCAGCTTGTTAAAA	9084	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46678357	46690348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_46678525_46687994_46688058_46688176_46688241_46689953
tx.9827	chr19	+	668	4	NIC	ENSMUSG00000062376.8	novel	2176	5	NA	NA	14	-1473	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	0	0	junction_3	81.4411853220879	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGTACCTCAGCTTGTTAAAA	9085	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46678358	46690348	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_46678525_46687994_46688058_46688176_46688221_46689953
tx.9828	chr19	+	586	5	ISM	ENSMUSG00000003559.9	ENSMUST00000003655.9	1736	11	0	31365	0	-515	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	174	junction_4	14.0801278403287	74	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATGTATATGTTACTACTT	5974	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46695896	46698169	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46695976_46696194_46696239_46696508_46696637_46697406_46697558_46697985
tx.9829	chr19	+	1736	11	FSM	ENSMUSG00000003559.9	ENSMUST00000003655.9	1736	11	0	0	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	159	junction_6	16.3612346722367	349	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACAATGGATGTCTGTAGTTT	5974	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46695896	46729534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_46695976_46696194_46696239_46696508_46696637_46697406_46697558_46697985_46698123_46700659_46700730_46703627_46703710_46708327_46708460_46708752_46708896_46713342_46713478_46728899
tx.9830	chr19	+	1190	6	ISM	ENSMUSG00000003559.9	ENSMUST00000237219.2	1719	9	4261	3	257	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	159	junction_1	10.5565145763173	151	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CAATGGATGTCTGTAGTTTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46700667	46729535	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46700730_46703627_46703710_46708327_46708460_46708752_46708896_46713342_46713478_46728899
tx.9831	chr19	+	1371	7	NNC	ENSMUSG00000064105.14	novel	4955	8	NA	NA	-46154	-11	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	48.9605850546017	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTTTTTTCCAAGAGATCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46807944	46866790	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_46808062_46842339_46842484_46845274_46845417_46847381_46847552_46856976_46857071_46865646_46865832_46866271
tx.9832	chr19	+	848	4	ISM	ENSMUSG00000064105.14	ENSMUST00000235671.2	1296	5	2883	239	2883	-22	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	14.0554457615387	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTGTTTCATTATGTTTTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46856981	46866779	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_46857071_46860094_46860161_46865646_46865832_46866271
tx.9833	chr19	-	1904	18	FSM	ENSMUSG00000025041.18	ENSMUST00000168536.9	3728	18	0	1824	0	355	multi-exon	TRUE	canonical	3	118	junction_5	15.8666589126981	160	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTTGTGTATCTGTTCTCT	7192	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	46950747	46877091	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_46877491_46878208_46878386_46878507_46878569_46878684_46878737_46879947_46880119_46880673_46880741_46880943_46881052_46881957_46882000_46882959_46883044_46884946_46885001_46886014_46886109_46887060_46887119_46887241_46887334_46892316_46892413_46893413_46893532_46912700_46912775_46939284_46939405_46950710
tx.9834	chr19	-	1803	10	FSM	ENSMUSG00000025050.9	ENSMUST00000026032.7	2159	10	356	0	342	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	486	junction_3	49.2396507895471	36	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTGAGGTGTGTTGACATA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47038987	47022055	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_47023125_47025676_47025764_47028482_47028582_47031204_47031233_47034248_47034358_47036385_47036446_47036546_47036603_47037238_47037336_47037428_47037529_47038889
tx.9835	chr19	+	1164	2	ISM	ENSMUSG00000025049.7	ENSMUST00000026027.7	3260	11	14462	3	14462	-3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	222	junction_1	0	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAATTTATTGTACAAATTGA	2902	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47070646	47071915	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_47070761_47070865
tx.9836	chr19	-	460	5	FSM	ENSMUSG00000071528.5	ENSMUST00000237720.2	425	5	-13	-22	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2533.27548590752	3620	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTTGTCTTTATTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47079086	47071902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_47072009_47073207_47073298_47074393_47074487_47074572_47074669_47079011
tx.9837	chr19	-	370	4	FSM	ENSMUSG00000071528.5	ENSMUST00000096014.5	362	4	-4	-4	0	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	3669	junction_3	1157.30270696804	36782	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCTGGTTGTCTTTATTTACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47079086	47071902	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_47072009_47074393_47074487_47074572_47074669_47079011
tx.9838	chr19	+	287	3	ISM	ENSMUSG00000025047.10	ENSMUST00000072141.4	6761	36	-2	38049	-2	-34665	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	191	junction_2	3.5	241	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	TTGAAAATTGAAAAGAGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47079204	47082255	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_47079307_47081220_47081340_47082189
tx.9839	chr19	+	1512	7	ISM	ENSMUSG00000025047.10	ENSMUST00000072141.4	6761	36	36480	719	1098	-105	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	251	junction_3	18.5060050314005	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTGTGTGTAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47115686	47119585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_47115807_47116384_47116532_47116713_47116962_47117580_47117750_47118067_47118222_47118386_47118553_47119077
tx.9840	chr19	+	1217	5	ISM	ENSMUSG00000025047.10	ENSMUST00000072141.4	6761	36	37535	719	-355	-105	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	251	junction_1	19.536824204563	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTGTGTGTGTGTGTAAAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47116741	47119585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_47116962_47117580_47117750_47118067_47118222_47118386_47118553_47119077
tx.9841	chr19	+	867	3	NIC	ENSMUSG00000006435.17	novel	4158	6	NA	NA	11420	-1640	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	3	junction_1	55.5	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGTCCCTGGAGGATTGGGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47228769	47246234	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_47229111_47245150_47245298_47245855
tx.9842	chr19	+	894	3	ISM	ENSMUSG00000006435.17	ENSMUST00000111807.5	3606	6	24534	1636	24534	-1636	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	77	junction_1	18.5	101	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCTGGAGGATTGGGCTGAAA	1547	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47241883	47246238	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_47242248_47245150_47245298_47245855
tx.9843	chr19	-	911	6	NIC	ENSMUSG00000053617.13	novel	799	5	NA	NA	-1	4	combination_of_known_junctions	TRUE	canonical	1	2	junction_1	1.83303027798234	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCAACTGTGTTCCTGTGTT	8075	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47452687	47352043	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_47352444_47353061_47353154_47361822_47361900_47386254_47386331_47412928_47413010_47452502
tx.9844	chr19	-	1960	10	FSM	ENSMUSG00000042694.18	ENSMUST00000049369.16	1992	10	21	11	-4	-6	multi-exon	FALSE	canonical	3	124	junction_2	7.26907877057606	180	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CTTGGCATTTCAATTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47525537	47489482	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_47490157_47496244_47496318_47498773_47498897_47502249_47502422_47504529_47504654_47505465_47505634_47513125_47513195_47517075_47517172_47524634_47524811_47525252
tx.9845	chr19	-	794	2	FSM	ENSMUSG00000042694.18	ENSMUST00000182714.2	690	2	-52	-52	-4	52	multi-exon	FALSE	canonical	3	136	junction_1	0	126	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CATGTGCTTAAGGTATTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47525537	47524301	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_47524811_47525252
tx.9846	chr19	+	1438	5	NNC	ENSMUSG00000025066.11	novel	1657	4	NA	NA	67	-55	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	786.61442270022	1961	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCAATTTGTTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47720187	47723972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_47720261_47721068_47721144_47721240_47721428_47721957_47722351_47723262
tx.9847	chr19	+	1438	5	NNC	ENSMUSG00000025066.11	novel	1657	4	NA	NA	67	-55	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	786.61442270022	898	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTCCAATTTGTTTTCATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47720187	47723972	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_47720261_47721068_47721192_47721288_47721428_47721957_47722351_47723262
tx.9848	chr19	+	1487	5	NNC	ENSMUSG00000025066.11	novel	1657	4	NA	NA	67	-54	at_least_one_novel_splicesite	TRUE	canonical	0	0	junction_2	786.61442270022	2655	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCCAATTTGTTTTCATTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47720187	47723973	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_47720261_47721068_47721192_47721240_47721428_47721957_47722351_47723262
tx.9849	chr19	-	973	6	NNC	ENSMUSG00000044948.18	novel	1940	15	NA	NA	16382	50	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_5	4.58693797647189	8	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTCGCTTGTATTTATTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47735637	47725994	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_47726327_47726467_47726622_47727216_47727298_47728108_47728274_47735067_47735181_47735509
tx.9850	chr19	-	887	6	NNC	ENSMUSG00000044948.18	novel	1940	15	NA	NA	16380	51	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	1	1	junction_5	4.31740662898458	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTCGCTTGTATTTATTAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47735639	47725993	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_47726327_47726467_47726622_47727216_47727298_47728108_47728274_47735067_47735181_47735598
tx.9851	chr19	-	648	2	Intergenic	novelGene_903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGATTACTTTCATTTCTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47843366	47841549	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_47841921_47843089
tx.9852	chr19	+	1144	6	FSM	ENSMUSG00000025068.9	ENSMUST00000026050.8	1182	6	38	0	-22	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	277	junction_4	32.103582354622	2889	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTGAGTCCAAACCACCTCAG	8506	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	47843446	47853229	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_47843562_47843653_47843763_47846297_47846521_47847870_47847970_47851817_47851922_47852735
tx.9853	chr19	-	699	3	ISM	ENSMUSG00000025027.19	ENSMUST00000235453.2	1679	6	3564	-2	324	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1398	junction_2	80.5	81	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTCTGCTTTGTCTGCCTCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52984740	52979611	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_52980151_52983851_52983951_52984679
tx.9854	chr19	-	786	4	ISM	ENSMUSG00000025027.19	ENSMUST00000235453.2	1679	6	2902	-1	-338	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1351	junction_3	89.0655189546812	250	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTGCTTTGTCTGCCTCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	52985402	52979612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_52980151_52983851_52983951_52984679_52984757_52985330
tx.9855	chr19	-	2481	21	FSM	ENSMUSG00000025027.19	ENSMUST00000183108.8	4078	21	1598	-1	25	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	790	junction_19	199.189727395767	299	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTGCTTTGTCTGCCTCT	5084	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53027047	52979612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_52980151_52983851_52983951_52984679_52984757_52985330_52985505_52986304_52986375_52987582_52987644_52988819_52988892_52990904_52990983_52991109_52991169_52992194_52992246_52993194_52993285_52994585_52994797_52996301_52996384_52998498_52998595_53000196_53000341_53000619_53000713_53001829_53001935_53003041_53003106_53013689_53013815_53020439_53020529_53026944
tx.9856	chr19	-	2399	20	NIC	ENSMUSG00000025027.19	novel	4078	21	NA	NA	18	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	690	junction_19	186.942819408855	292	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	GCTCTGCTTTGTCTGCCTCT	5077	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53027054	52979612	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_52980151_52983851_52983951_52984679_52984757_52985330_52985505_52986304_52986375_52987582_52987644_52988819_52988892_52990904_52990983_52991109_52991169_52992194_52992246_52993194_52993285_52994585_52994797_52996301_52996384_52998498_52998595_53000196_53000341_53000619_53000713_53001829_53001935_53003041_53003106_53013689_53013815_53026944
tx.9857	chr19	-	363	2	Intergenic	novelGene_904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTCTCTTTGATTCTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53094309	53079813	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_53080028_53094160
tx.9858	chr19	+	543	2	NNC	ENSMUSG00000025026.16	novel	380	4	NA	NA	20	-20066	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TATTACTAGTCCCCTGAACC	2503	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53131206	53185195	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_53131521_53184966
tx.9859	chr19	+	4242	15	FSM	ENSMUSG00000025026.16	ENSMUST00000237430.2	4054	15	-188	0	-10	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	178	junction_5	22.1124214791929	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATTTGGTATAATGGGGT	2513	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53131216	53235518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_53131521_53205231_53205447_53215021_53215161_53219610_53219763_53220554_53220636_53221456_53221607_53222003_53222148_53222255_53222355_53223209_53223393_53225024_53225283_53226833_53226954_53227837_53227925_53230934_53231059_53232740_53232837_53233428
tx.986	chr1	+	2240	8	NNC	ENSMUSG00000003464.14	novel	1917	8	NA	NA	5	385	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	80	junction_2	126.880950146994	1	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTTTATACATGTATACAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	171954333	171963235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr1_+_171954416_171956197_171956308_171956771_171956888_171957468_171957555_171958178_171958341_171960696_171960874_171961566_171961612_171961773
tx.9860	chr19	+	1334	4	ISM	ENSMUSG00000025026.16	ENSMUST00000050096.15	4297	14	40	15343	0	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	192	junction_2	11.4406682011537	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CAGCTGTGTTCCCTGTCATG	2523	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53131226	53220296	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_53131521_53205231_53205447_53215021_53215161_53219610
tx.9861	chr19	+	2121	2	ISM	ENSMUSG00000025026.16	ENSMUST00000236296.2	4075	16	49422	0	46329	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	212	junction_1	0	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCATTTGGTATAATGGGGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53232805	53235518	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_53232837_53233428
tx.9862	chr19	+	2330	6	FSM	ENSMUSG00000025025.15	ENSMUST00000003870.15	2627	6	289	8	289	-8	multi-exon	FALSE	canonical	3	46	junction_1	71.8843515655528	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAGTGCAGTCGAGTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53299237	53361716	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_53299405_53319781_53319915_53334881_53334912_53357972_53358088_53358620_53358793_53360003
tx.9863	chr19	+	816	3	FSM	ENSMUSG00000025025.15	ENSMUST00000237837.2	939	3	123	0	-112	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_2	76	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATGCTGTATTTATTGGTGA	4585	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53318014	53320992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_53318152_53319781_53319915_53320446
tx.9864	chr19	+	2258	6	FSM	ENSMUSG00000025025.15	ENSMUST00000111737.3	2340	6	221	-139	-62	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	157	junction_1	29.7859027058103	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCGAGTTGTGTGTTAATGT	4635	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53318064	53361724	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_53318152_53319781_53319915_53334881_53334912_53357972_53358088_53358620_53358793_53360003
tx.9865	chr19	-	1969	6	FSM	ENSMUSG00000025024.8	ENSMUST00000025997.7	1948	6	-19	-2	-19	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	184	junction_4	26.9102211064867	942	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCCAGTGTGTTAACAAAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53379028	53367824	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_53369033_53369671_53369826_53371987_53372150_53372884_53373028_53377733_53377854_53378846
tx.9866	chr19	-	610	4	ISM	ENSMUSG00000025024.8	ENSMUST00000025997.7	1948	6	-22	4161	-22	910	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_2	11.8133634311129	97	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGAGTGACGCTTCCCAGAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53379031	53371987	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_53372150_53372884_53373028_53377733_53377854_53378846
tx.9867	chr19	-	870	3	ISM	ENSMUSG00000025024.8	ENSMUST00000236962.2	1478	6	-24	4151	-20	437	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	184	junction_1	12	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AAAAAAGTGAATTGCTGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53379029	53372460	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_53373028_53377733_53377854_53378846
tx.9868	chr19	-	654	4	NIC	ENSMUSG00000097636.9	novel	3261	10	NA	NA	2087	-1077	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0.942809041582063	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGGGGTTTTAGTTTATTGTC	3640	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53437835	53433521	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_53433776_53435206_53435319_53435586_53435745_53437705
tx.9869	chr19	+	1115	5	ISM	ENSMUSG00000024974.11	ENSMUST00000025930.10	4851	29	40723	679	-2237	346	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1084	junction_1	84.6994687114388	382	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGTTGCTTTCAGTTACTAG	6384	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53629551	53633585	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_53629742_53629955_53630148_53630291_53630470_53632274_53632382_53633137
tx.9870	chr19	+	1757	6	ISM	ENSMUSG00000043639.16	ENSMUST00000164202.9	4892	14	166173	891	269	-891	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	12	junction_2	2.13541565040626	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTGTCACTGTGTTTCAAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53831909	53852920	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_53832276_53838532_53838620_53839607_53840248_53841934_53842067_53847822_53847945_53852510
tx.9871	chr19	+	2281	12	FSM	ENSMUSG00000024975.14	ENSMUST00000025931.14	2381	12	92	8	16	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	114	junction_5	6.73954654285478	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTCTTTAGTGGGAGTGCAT	560	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53891821	53918283	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_53891920_53895879_53895987_53897542_53897846_53899358_53899454_53901242_53901357_53908045_53908268_53909648_53909747_53910447_53910563_53914636_53914745_53914965_53915077_53915624_53915765_53917513
tx.9872	chr19	+	1756	13	FSM	ENSMUSG00000024975.14	ENSMUST00000165617.3	1733	13	-23	0	18	0	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_12	33.2949779329489	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTAGTGGGAGTGCATT	562	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53891823	53918284	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_53891920_53895879_53895987_53897542_53897846_53899358_53899454_53901242_53901357_53908045_53908268_53909648_53909747_53910447_53910563_53914636_53914745_53914965_53915077_53915624_53915765_53917513_53917624_53918147
tx.9873	chr19	-	685	3	ISM	ENSMUSG00000084957.4	ENSMUST00000236370.2	662	4	647	-94	599	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	143	junction_2	31.5	519	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGGGCTTGTACACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53932012	53919440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_53919934_53920560_53920637_53931896
tx.9874	chr19	-	768	4	FSM	ENSMUSG00000084957.4	ENSMUST00000236370.2	662	4	-12	-94	-9	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_3	45.8427263102398	630	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGGGCTTGTACACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53932671	53919440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_53919934_53920560_53920637_53931896_53932011_53932586
tx.9875	chr19	-	785	4	FSM	ENSMUSG00000084957.4	ENSMUST00000135402.4	2043	4	109	1149	-40	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	76	junction_3	53.0806514236172	611	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTGTTGGGCTTGTACACTAC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53932949	53919440	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_53919934_53920560_53920637_53931896_53932011_53932847
tx.9876	chr19	+	2209	9	NNC	ENSMUSG00000024976.15	novel	3965	9	NA	NA	-35	-1416	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	220	junction_1	61.2775448267961	129	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTATATAAGTTTTCTTT	3890	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53933268	54019882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_53933327_53975884_53976815_53991439_53991578_54005979_54006111_54014780_54014970_54016148_54016272_54017899_54018038_54018291_54018410_54019498
tx.9877	chr19	+	548	2	NNC	ENSMUSG00000024976.15	novel	443	3	NA	NA	-34	302	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	220	junction_1	0	19	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGGTCATTAAGGAGCTTAA	3891	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53933269	53976375	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_53933327_53975884
tx.9878	chr19	+	2276	9	FSM	ENSMUSG00000024976.15	ENSMUST00000025932.9	3965	9	9	1680	4	-1416	multi-exon	FALSE	canonical	3	29	junction_1	123.021784148174	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTATATAAGTTTTCTTT	3941	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53933319	54019882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_53933445_53975884_53976815_53991439_53991578_54005979_54006111_54014780_54014970_54016148_54016272_54017899_54018038_54018291_54018410_54019498
tx.9879	chr19	+	2153	8	ISM	ENSMUSG00000024976.15	ENSMUST00000025932.9	3965	9	42572	1680	-513	-1416	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	368	junction_1	19.5333310115854	103	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGCTTATATAAGTTTTCTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	53975882	54019882	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_53976815_53991439_53991578_54005979_54006111_54014780_54014970_54016148_54016272_54017899_54018038_54018291_54018410_54019498
tx.9880	chr19	+	674	2	ISM	ENSMUSG00000118099.2	ENSMUST00000237370.2	1560	3	9	14081	9	-14081	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	5	junction_1	0	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CGTATTAGGTCTGATGTTGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55087942	55092166	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_55088065_55091614
tx.9881	chr19	-	1716	11	ISM	ENSMUSG00000024982.11	ENSMUST00000225963.2	2647	18	-20	18256	0	7365	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	11	junction_1	160.521182402822	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGCCTTGGTCATGATGTCCC	7441	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55304462	55277978	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_55278117_55290989_55291037_55291122_55291269_55292128_55292171_55292841_55293010_55297335_55297390_55298174_55298337_55300056_55300217_55301620_55301713_55302732_55303205_55304227
tx.9882	chr19	-	2167	11	FSM	ENSMUSG00000024982.11	ENSMUST00000224897.2	2168	11	6	-5	0	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	431	junction_6	59.8815497461447	207	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GCATTGTTTTTAGTTTGCTT	7445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55304458	55286727	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_55287321_55290989_55291037_55291122_55291269_55292128_55292171_55292841_55293010_55297335_55297390_55298174_55298337_55300056_55300217_55301620_55301713_55302732_55303205_55304227
tx.9883	chr19	-	1261	2	ISM	ENSMUSG00000024982.11	ENSMUST00000076891.7	2263	11	4	15539	0	15	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	26	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAAAAACTGGTGGTGGGGGG	7445	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55304458	55302290	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_55303205_55304111
tx.9884	chr19	-	640	2	ISM	ENSMUSG00000024982.11	ENSMUST00000223807.2	3457	11	-1	13562	-1	-491	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	482	junction_1	0	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCTTTATAATTACTTCAATG	7444	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55304459	55302796	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_55303205_55304227
tx.9885	chr19	+	1613	4	FSM	ENSMUSG00000024983.11	ENSMUST00000226069.2	1599	4	-13	-1	-13	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	4	junction_3	51.1620519091597	19	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATCATGCATCTTTTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55304745	55355936	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_55304977_55310370_55310430_55316777_55316889_55354724
tx.9886	chr19	+	995	2	NNC	ENSMUSG00000024983.11	novel	1599	4	NA	NA	5	-14078	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	14	junction_1	0	91	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGGTTTTCTTGTTAATGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55304731	55306992	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_55304977_55306242
tx.9887	chr19	+	879	8	FSM	ENSMUSG00000024983.11	ENSMUST00000095950.3	3405	8	-53	2579	3	-2579	multi-exon	FALSE	canonical	3	70	junction_7	16.8219972606327	362	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATTCTTTCGTGCTGACAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55304729	55612414	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_55304977_55310370_55310430_55316777_55316889_55369373_55369452_55380215_55380301_55486942_55487014_55487674_55487737_55612248
tx.9888	chr19	-	381	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000024985.21_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAAAAGTTTTGCGAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	55731651	55730701	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_55731025_55731593
tx.9889	chr19	+	2374	7	FSM	ENSMUSG00000025076.13	ENSMUST00000026062.10	2350	7	-24	0	-24	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	21	junction_1	6.36177822799744	23	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCCTGACTGGTCCGGTCTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56385536	56430776	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_56385750_56392847_56392958_56421673_56421811_56422233_56422363_56424658_56424835_56425150_56425281_56429297
tx.9890	chr19	+	853	3	FSM	ENSMUSG00000025076.13	ENSMUST00000235386.2	519	3	-195	-139	-46	139	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	10.5	9	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCTGTGACGGTCTCCATGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56385514	56397292	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_56385750_56392847_56392958_56396784
tx.9891	chr19	+	1138	7	NNC	ENSMUSG00000025076.13	novel	2350	7	NA	NA	6	4622	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_6	12.1575308165579	3	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CATGTTGCCCATGTGATCCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56385566	56435398	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_56385750_56392847_56392958_56421673_56421811_56422233_56422363_56424658_56424835_56425150_56425281_56435125
tx.9892	chr19	+	172	2	Intergenic	novelGene_905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGATGTAAAACAGTGGAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56499006	56499766	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_+_56499164_56499751
tx.9893	chr19	-	805	2	ISM	ENSMUSG00000025077.15	ENSMUST00000182059.3	4109	10	18	17791	18	-6949	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	276	junction_1	0	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAGGAAATGAAAAAAGGA	8183	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56536466	56535391	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_56536136_56536405
tx.9894	chr19	-	600	2	ISM	ENSMUSG00000025077.15	ENSMUST00000182276.3	4087	10	-201	18193	-201	-7351	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	30	junction_1	0	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCTGAATGAAATAGTGTCAC	7773	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56536876	56535793	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_56536136_56536618
tx.9895	chr19	+	555	3	NNC	ENSMUSG00000117859.2	novel	444	2	NA	NA	251	7476	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0.5	5	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACCTGTGGTTCTACTTCCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56657800	56670279	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_+_56657948_56661098_56661215_56669987
tx.9896	chr19	-	1261	5	ISM	ENSMUSG00000035173.15	ENSMUST00000118592.8	6445	16	-4	20607	-4	-8049	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	51	junction_2	2.17944947177034	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCCTTGAGAGGAAACTTAGA	5193	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56810626	56796519	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_56796623_56797624_56797754_56798670_56798798_56801426_56802122_56810419
tx.9897	chr19	-	1259	2	ISM	ENSMUSG00000035173.15	ENSMUST00000118592.8	6445	16	-18	25171	-18	-12613	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	53	junction_1	0	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGCATACTGTTACAATCTGT	5179	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	56810640	56801083	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_56802122_56810419
tx.9898	chr19	-	1959	8	ISM	ENSMUSG00000025085.17	ENSMUST00000111529.8	5927	17	9	15457	7	-7293	5prime_fragment	TRUE	canonical	3	57	junction_3	10.6751666812968	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTTTTTGTTTTGTTGTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57107432	57036778	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_57037942_57049684_57049815_57052197_57052234_57056522_57056679_57057291_57057370_57068244_57068304_57071947_57072036_57107183
tx.9899	chr19	+	675	3	ISM	ENSMUSG00000033478.6	ENSMUST00000237170.2	5110	15	24271	2639	24271	-2639	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	86	junction_1	7.5	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCACTAATTTTATAACTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57373732	57375379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_57373827_57374711_57374816_57374902
tx.99	chr1	+	1237	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000094215.3	novel	696	1	NA	NA	-995	419	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCTTGTGTCATGAAGTAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	31325030	31327140	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr1_+_31325118_31325990
tx.9900	chr19	+	1667	8	FSM	ENSMUSG00000025086.14	ENSMUST00000026073.14	3789	8	27	2095	0	1893	multi-exon	FALSE	canonical	3	146	junction_6	27.9131305507436	176	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTCTCCTGCCTGTTCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57441370	57477342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_57441629_57446521_57446621_57452801_57452858_57461130_57461213_57472012_57472086_57473504_57473645_57475696_57475754_57476440
tx.9901	chr19	+	1081	3	ISM	ENSMUSG00000025086.14	ENSMUST00000026073.14	3789	8	32179	2095	32134	1893	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	146	junction_1	3	20	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGCTCTCCTGCCTGTTCGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57473522	57477342	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_57473645_57475696_57475754_57476440
tx.9902	chr19	-	437	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000054843.10_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	83	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGCTTTGTCTTGGTTCCTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	57935623	57801881	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_57802099_57935403
tx.9903	chr19	+	591	5	NIC	ENSMUSG00000025090.10	novel	855	7	NA	NA	0	19	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	1	2	junction_3	17.7675969112314	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTCTGATCTGCCTGTCTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58500423	58541536	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_58500459_58500742_58500868_58501047_58501134_58539855_58539948_58541283
tx.9904	chr19	+	876	5	ISM	ENSMUSG00000025090.10	ENSMUST00000069419.8	1009	9	-27	25281	2	-25281	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	16.7089048115069	32	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATATGGTTTTGTTATGAGC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58500425	58516179	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_58500498_58500742_58500868_58501047_58501134_58514279_58514397_58515703
tx.9905	chr19	-	2056	6	ISM	ENSMUSG00000025092.8	ENSMUST00000236429.2	1510	7	11	10821	11	0	5prime_fragment	FALSE	canonical	2	6	junction_1	2.72763633939717	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTACTTCTGTCAGGTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58849433	58808150	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_58809549_58810495_58810601_58813682_58813870_58815987_58816113_58816684_58816771_58849278
tx.9906	chr19	-	604	3	FSM	ENSMUSG00000025092.8	ENSMUST00000237786.2	612	3	18	-10	-13	10	multi-exon	FALSE	canonical	2	3	junction_1	1	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCATGTGTATATTTTTTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	58932068	58917065	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_58917395_58920321_58920416_58931887
tx.9907	chr19	+	506	1	FSM	ENSMUSG00000067038.7	ENSMUST00000086764.7	396	1	-83	-27	-83	27	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	26	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAGCCCAGATCACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59310719	59311225	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_59310700_59311200
tx.9908	chr19	-	512	2	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000067038.7_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	384	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGATCTGGGCTTCTATGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	59314127	59310719	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr19_-_59311213_59314108
tx.9909	chr19	-	757	3	ISM	ENSMUSG00000057858.9	ENSMUST00000235995.2	1146	4	13939	-3	13939	3	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	238	junction_2	29.5	54	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTTTGTGTGTGTGTGTAAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60201162	60187327	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_60187920_60188401_60188509_60201104
tx.9910	chr19	-	1720	8	FSM	ENSMUSG00000057858.9	ENSMUST00000065286.2	2035	8	3	312	0	1	multi-exon	FALSE	canonical	3	51	junction_7	81.0915330641484	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTGTGTGTGTGTGTA	9776	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60215126	60187329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_60187920_60188401_60188509_60201104_60201195_60208471_60208572_60208761_60208793_60208921_60209010_60209485_60209737_60214663
tx.9911	chr19	-	1645	8	NIC	ENSMUSG00000057858.9	novel	2035	8	NA	NA	0	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	98	junction_7	67.6669515090684	231	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTTTTGTGTGTGTGTGTA	9773	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60215129	60187329	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_60187920_60188401_60188509_60201104_60201195_60208471_60208572_60208761_60208793_60208921_60209010_60209485_60209737_60214741
tx.9912	chr19	-	1311	8	FSM	ENSMUSG00000057858.9	ENSMUST00000238054.2	951	8	-12	-348	-1	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	34	junction_7	86.2054972440971	107	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TTTTTTTTGTGTGTGTGTGT	9772	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60215130	60187330	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_60187920_60188401_60188509_60201104_60201195_60208471_60208572_60208761_60208793_60208921_60209010_60209485_60209737_60215075
tx.9913	chr19	-	458	3	NNC	ENSMUSG00000033417.17	novel	2861	7	NA	NA	3355	304	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_2	110.5	6	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTTTTTGTTTTGTTTTGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60522632	60517174	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_60517526_60517902_60517947_60522569
tx.9914	chr19	-	1392	2	ISM	ENSMUSG00000024991.9	ENSMUST00000238125.2	826	4	18922	-722	8883	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1494	junction_1	0	217	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTAGTGTTTTGTCAATGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60751706	60749554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_60750743_60751502
tx.9915	chr19	-	1591	3	ISM	ENSMUSG00000024991.9	ENSMUST00000025955.8	5125	22	26409	0	7917	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1469	junction_2	12.5	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTAGTGTTTTGTCAATGG	NA	False	NA	-9	True	NA	NA	NA	60752672	60749554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_60750743_60751502_60751703_60752469
tx.9916	chr19	-	2396	6	ISM	ENSMUSG00000024991.9	ENSMUST00000025955.8	5125	22	21881	0	3389	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1162	junction_5	125.870727335628	75	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTAGTGTTTTGTCAATGG	9766	False	NA	25	True	NA	NA	NA	60757200	60749554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_60750743_60751502_60751703_60752469_60752672_60754771_60755434_60756012_60756102_60757145
tx.9917	chr19	-	2182	4	ISM	ENSMUSG00000024991.9	ENSMUST00000025955.8	5125	22	23718	0	5226	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1353	junction_3	61.4292727903852	114	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGTTAGTGTTTTGTCAATGG	8837	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60755363	60749554	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_60750743_60751502_60751703_60752469_60752672_60754771
tx.9918	chr19	+	2355	9	NIC	ENSMUSG00000024993.16	novel	2307	9	NA	NA	0	8	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	138	junction_1	88.7623230881211	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTGATGTCTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60800028	60824673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_+_60800112_60803029_60803247_60805968_60806049_60809644_60809794_60810732_60810845_60814268_60814370_60819224_60819333_60821021_60821117_60823263
tx.9919	chr19	+	2275	8	FSM	ENSMUSG00000024993.16	ENSMUST00000119633.8	2267	8	0	-8	0	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	56	junction_2	141.985771060601	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTGATGTCTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60800028	60824673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_60800112_60803029_60803247_60809644_60809794_60810732_60810845_60814268_60814370_60819224_60819333_60821021_60821117_60823263
tx.992	chr1	+	2274	7	FSM	ENSMUSG00000038034.16	ENSMUST00000039506.15	2278	7	2	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	675	junction_3	44.2329691017408	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGCCTGTTGTGTCTTCTC	3745	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172139935	172147406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_172140161_172143717_172144096_172144921_172145384_172145603_172146012_172146120_172146535_172146859_172146991_172147150
tx.9920	chr19	+	2340	9	FSM	ENSMUSG00000024993.16	ENSMUST00000025957.9	2307	9	-25	-8	1	8	multi-exon	FALSE	canonical	3	273	junction_1	50.1458809375207	202	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTGATGTCTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60800023	60824673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_+_60800112_60803049_60803247_60805968_60806049_60809644_60809794_60810732_60810845_60814268_60814370_60819224_60819333_60821021_60821117_60823263
tx.9921	chr19	+	2228	8	ISM	ENSMUSG00000024993.16	ENSMUST00000025957.9	2307	9	3025	-8	2596	8	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	326	junction_2	35.2883168502332	37	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTACTTGATGTCTTTTCATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60803073	60824673	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_+_60803247_60805968_60806049_60809644_60809794_60810732_60810845_60814268_60814370_60819224_60819333_60821021_60821117_60823263
tx.9922	chr19	-	1025	5	NNC	ENSMUSG00000063698.10	novel	1309	14	NA	NA	9843	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_4	13.7204227340122	20	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATCAAAAGGTATACCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60840019	60827185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr19_-_60827489_60830556_60830675_60832646_60832733_60839396_60839513_60839617
tx.9923	chr19	-	734	6	ISM	ENSMUSG00000063698.10	ENSMUST00000124921.2	1218	13	7706	-10	7706	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	18	junction_4	6.30555310817378	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATCAAAAGGTATACCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60842156	60827185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_60827489_60830556_60830675_60832646_60832733_60839396_60839513_60840449_60840529_60842124
tx.9924	chr19	-	1170	13	NIC	ENSMUSG00000063698.10	novel	1309	14	NA	NA	9	0	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	13	junction_11	6.73094016876956	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATCAAAAGGTATACCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60849853	60827185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_60827489_60830556_60830675_60832646_60832733_60839396_60839513_60840449_60840529_60842124_60842191_60842301_60842359_60842444_60842499_60844264_60844291_60845647_60845703_60845787_60845815_60848466_60848533_60849736
tx.9925	chr19	-	1263	14	FSM	ENSMUSG00000063698.10	ENSMUST00000135808.8	1309	14	46	0	-6	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	10	junction_12	6.9961950774782	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATCAAAAGGTATACCTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60849871	60827185	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_60827489_60830556_60830675_60832646_60832733_60839396_60839513_60840449_60840529_60842124_60842191_60842301_60842359_60842444_60842499_60844264_60844291_60845647_60845703_60845787_60845815_60847101_60847177_60848466_60848533_60849736
tx.9926	chr19	-	1437	7	FSM	ENSMUSG00000024997.8	ENSMUST00000025961.7	1478	7	24	17	24	-17	multi-exon	FALSE	canonical	3	658	junction_4	52.5148127251308	778	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTTGCGTTTTTGACTTATTC	1471	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	60862970	60852505	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_60853158_60853603_60853770_60855953_60856058_60858441_60858578_60859857_60860000_60861565_60861702_60862869
tx.9927	chr19	-	576	4	FSM	ENSMUSG00000074733.15	ENSMUST00000180544.3	2568	4	-50	2042	5	-753	multi-exon	FALSE	canonical	3	24	junction_1	12.675435561221	44	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCTTATGAGTGTAATCAATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61129250	61108610	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_61108891_61115444_61115506_61115875_61116003_61129142
tx.9928	chr19	-	470	3	FSM	ENSMUSG00000074733.15	ENSMUST00000143264.8	4825	3	-21	4376	6	171	multi-exon	FALSE	canonical	3	41	junction_2	7	49	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTGGCTTTGAGAATTACTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61129249	61115269	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr19_-_61115506_61115875_61116003_61129142
tx.9929	chr19	-	1538	7	NIC	ENSMUSG00000059326.8	novel	1771	11	NA	NA	-7	1	intron_retention	FALSE	canonical	3	89	junction_5	22.3364425696364	2	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGCTTTTGTTTTCTTTTGC	9864	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61215128	61212838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr19_-_61213472_61213570_61213653_61213761_61214091_61214229_61214260_61214365_61214494_61214652_61214823_61214962
tx.993	chr1	+	2437	6	ISM	ENSMUSG00000038034.16	ENSMUST00000039506.15	2278	7	-1	2	-1	-2	intron_retention	FALSE	canonical	3	675	junction_3	48.3553513067582	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGCCTGTTGTGTCTTCTC	3742	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172139932	172147406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_172140161_172143717_172144096_172144921_172145384_172145603_172146012_172146120_172146535_172146859
tx.9930	chr19	-	1424	8	ISM	ENSMUSG00000059326.8	ENSMUST00000237386.2	1771	11	697	-9	4	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	89	junction_6	20.6861878398834	22	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTGCTTTTGTTTTCTTTTG	9875	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61215117	61212839	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr19_-_61213472_61213570_61213653_61213761_61213859_61213960_61214091_61214229_61214260_61214365_61214494_61214652_61214823_61214962
tx.9931	chr19	-	442	3	Intergenic	novelGene_906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	42	junction_2	4	86	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CAGTGTCAGGTGTCTGATTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61301957	61286913	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_61287117_61287295_61287423_61301845
tx.9932	chr19	-	768	3	Intergenic	novelGene_907	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_2	1.5	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAAAAAAAGGTCTGAGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61301968	61291320	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_61291734_61292476_61292709_61301845
tx.9933	chr19	-	1485	2	Intergenic	novelGene_908	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	1	junction_1	0	25	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAAAAGGTCTGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	61301944	61291322	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr19_-_61292709_61301845
tx.9934	chr1_GL456212v1_random	-	811	3	Intergenic	novelGene_79	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_2	0.5	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACACAGGATCTTTTTTCCC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151235	149439	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_GL456212v1_random_-_149985_150276_150428_151120
tx.9935	chr1_GL456212v1_random	-	1378	3	Intergenic	novelGene_78	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1.5	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTATGTTGCTAGCTGGGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	151235	148728	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_GL456212v1_random_-_149028_149864_149985_150276
tx.9936	chr1_MU069434v1_random	-	672	3	Intergenic	novelGene_81	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_1	27	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	AAACAATGCCTCTTTTCTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7772	4895	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_MU069434v1_random_-_5277_7393_7461_7548
tx.9937	chr1_MU069434v1_random	-	637	2	Intergenic	novelGene_82	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	94	junction_1	0	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCTGCCACCTCTGACACATT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	7738	7013	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr1_MU069434v1_random_-_7461_7548
tx.9938	chr2	+	254	2	FSM	ENSMUSG00000026643.17	ENSMUST00000155761.2	2450	2	-71	2267	-2	-2267	multi-exon	FALSE	canonical	3	266	junction_1	0	540	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGAGAAGCCAAATTCTGGGG	985	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3285246	3305905	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_3285444_3305848
tx.9939	chr2	+	1781	14	FSM	ENSMUSG00000026643.17	ENSMUST00000081932.13	4461	14	1	2679	1	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	230	junction_10	26.4695873268632	263	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TTGAAGTAGTTGTTAACAAT	988	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3285249	3327235	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_3285444_3305848_3305985_3306433_3306477_3308019_3308070_3310503_3310649_3313492_3313612_3313698_3313791_3313897_3314015_3315730_3315902_3317176_3317286_3323607_3323779_3325867_3326036_3326300_3326439_3327107
tx.994	chr1	+	798	3	ISM	ENSMUSG00000038034.16	ENSMUST00000039506.15	2278	7	6190	2	-203	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	745	junction_2	38	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GAGGCCTGTTGTGTCTTCTC	9933	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172146123	172147406	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_172146535_172146859_172146991_172147150
tx.9940	chr2	-	1031	2	FSM	ENSMUSG00000049950.7	ENSMUST00000062672.7	1042	2	11	0	11	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	304	junction_1	0	969	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTAGGATCCTGCATGGA	2328	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3333669	3329985	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_3330911_3333563
tx.9941	chr2	+	551	4	FSM	ENSMUSG00000026644.8	ENSMUST00000228935.2	534	4	-12	-5	-12	5	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_2	3.77123616632825	96	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTGTATGGATATTTA	1026	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3337192	3342035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_3337259_3341369_3341491_3341591_3341655_3341734
tx.9942	chr2	+	532	4	NNC	ENSMUSG00000026644.8	novel	534	4	NA	NA	-8	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.65383665716478	12	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTGTATGGATATTTA	1030	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3337196	3342035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_3337259_3341384_3341491_3341591_3341655_3341734
tx.9943	chr2	+	518	4	NNC	ENSMUSG00000026644.8	novel	534	4	NA	NA	-15	5	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	8.65383665716478	7	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGTCTGTGTATGGATATTTA	1023	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3337189	3342035	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_3337259_3341369_3341491_3341591_3341619_3341734
tx.9944	chr2	+	3753	14	FSM	ENSMUSG00000026648.19	ENSMUST00000102988.10	2469	14	-29	-1255	-10	1255	multi-exon	FALSE	canonical	3	20	junction_5	4.46419019339905	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TTCATAAGTACTTGAGTATG	992	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3425157	3456384	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_3425364_3426400_3426453_3430304_3430390_3434783_3434844_3437474_3437531_3438025_3438128_3438712_3438786_3438988_3439130_3441794_3441897_3444690_3444828_3445237_3445293_3448110_3448200_3451315_3451411_3453884
tx.9945	chr2	+	1451	12	ISM	ENSMUSG00000026648.19	ENSMUST00000102988.10	2469	14	-12	6620	7	5266	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	20	junction_5	4.48136637958772	10	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AATCAATGGATATTCATTCT	1009	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3425174	3448509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_3425364_3426400_3426453_3430304_3430390_3434783_3434844_3437474_3437531_3438025_3438128_3438712_3438786_3438988_3439130_3441794_3441897_3444690_3444828_3445237_3445293_3448110
tx.9946	chr2	+	416	4	ISM	ENSMUSG00000026648.19	ENSMUST00000132565.8	655	8	-12	4178	7	-4178	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	25	junction_3	4.49691252107735	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTCTTAGTGTTGATATGATT	1009	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3425174	3434873	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_3425364_3426400_3426453_3430304_3430390_3434783
tx.9947	chr2	-	2071	4	ISM	ENSMUSG00000026646.17	ENSMUST00000100458.4	2169	5	9497	11	9497	-11	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	203	junction_3	12.0277457017791	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AACTTACTTTCATCTTTCTG	9097	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3465959	3458628	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_3459767_3460793_3460924_3463517_3463665_3465303
tx.9948	chr2	-	1534	12	ISM	ENSMUSG00000109865.2	ENSMUST00000027961.12	1795	14	1714	2	1643	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	902	junction_5	77.4526248161358	243	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACTGGAGTCTTTGTTTTC	5656	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3512137	3489888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_3490107_3490734_3490806_3491973_3492148_3492557_3492771_3495534_3495638_3497600_3497757_3499058_3499221_3500243_3500349_3502084_3502176_3503530_3503637_3503773_3503823_3512051
tx.9949	chr2	-	1754	14	FSM	ENSMUSG00000109865.2	ENSMUST00000027961.12	1795	14	39	2	-32	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	902	junction_5	73.9537677425134	2716	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTACTGGAGTCTTTGTTTTC	3981	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3513812	3489888	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_3490107_3490734_3490806_3491973_3492148_3492557_3492771_3495534_3495638_3497600_3497757_3499058_3499221_3500243_3500349_3502084_3502176_3503530_3503637_3503773_3503823_3512051_3512135_3512210_3512292_3513670
tx.9951	chr2	+	3131	4	FSM	ENSMUSG00000026655.16	ENSMUST00000027965.11	3156	4	16	9	-4	-9	multi-exon	FALSE	canonical	3	121	junction_1	8.49836585598797	56	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GACCACGCAGCCATGTTTGT	960	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	3714510	3783170	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_3714674_3773832_3774017_3779454_3779606_3780537
tx.9953	chr2	+	1250	2	NNC	ENSMUSG00000026657.18	novel	6761	24	NA	NA	46435	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCCCAGTTGCCTCTTGGACA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4617421	4618854	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_4617710_4617892
tx.9954	chr2	-	3437	10	FSM	ENSMUSG00000039449.15	ENSMUST00000035721.14	3522	10	-24	109	3	-109	multi-exon	FALSE	canonical	3	138	junction_5	16.2305914484172	78	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACAACTCTATTGACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4656921	4626977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_4629338_4638243_4638400_4640441_4640514_4640638_4640780_4641958_4642028_4643659_4643807_4648461_4648576_4650379_4650485_4653051_4653130_4656726
tx.9955	chr2	-	3243	9	ISM	ENSMUSG00000039449.15	ENSMUST00000035721.14	3522	10	3767	109	3762	-109	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	138	junction_5	16.6278193098193	7	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTTACAACTCTATTGACTGT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4653130	4626977	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_4629338_4638243_4638400_4640441_4640514_4640638_4640780_4641958_4642028_4643659_4643807_4648461_4648576_4650379_4650485_4653051
tx.9956	chr2	-	475	2	ISM	ENSMUSG00000039449.15	ENSMUST00000140818.8	551	5	-38	9120	-12	-4367	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	186	junction_1	0	61	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	AAAACCCAGATCTTGAATTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4656936	4652864	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_4653130_4656726
tx.9957	chr2	+	2359	9	FSM	ENSMUSG00000026662.14	ENSMUST00000027973.14	5319	9	243	2717	243	-297	multi-exon	FALSE	canonical	3	382	junction_1	74.2242169039189	359	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGCTCTTGTATAATCAGAT	4335	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4886617	4912651	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_4886672_4889142_4889417_4893993_4894098_4896397_4896506_4897995_4898151_4901499_4901591_4904274_4904375_4910282_4910496_4911391
tx.9958	chr2	+	2248	8	NIC	ENSMUSG00000026662.14	novel	5319	9	NA	NA	245	-302	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	91	junction_2	174.392707205693	67	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTTAATTGCTCTTGTATAAT	4337	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4886619	4912646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_+_4886672_4889142_4889417_4896397_4896506_4897995_4898151_4901499_4901591_4904274_4904375_4910282_4910496_4911391
tx.9959	chr2	+	2286	8	ISM	ENSMUSG00000026662.14	ENSMUST00000115019.2	2933	9	2086	317	-53	-317	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	440	junction_1	51.033402426894	42	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAATATTTAATTTTTTTAA	6859	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4889141	4912631	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_4889417_4893993_4894098_4896397_4896506_4897995_4898151_4901499_4901591_4904274_4904375_4910282_4910496_4911391
tx.9960	chr2	+	1430	9	FSM	ENSMUSG00000026664.8	ENSMUST00000027975.8	1438	9	8	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	390	junction_4	31.960669188864	2046	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GGCATATTAAGTCAATTTCT	999	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4923837	4943541	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_4923956_4927638_4927698_4930408_4930520_4932160_4932330_4933481_4933564_4935523_4935706_4940779_4940930_4942486_4942622_4943117
tx.9961	chr2	+	1095	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000069188.6_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	8.5	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACAATTTTTTTGCTTATTTT	4812	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	4959487	4965240	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_4959581_4962729_4962788_4964296
tx.9962	chr2	-	1868	10	ISM	ENSMUSG00000026669.15	ENSMUST00000150091.8	2356	12	1774	0	1774	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	627	junction_5	83.0967010680632	18	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTGTGAAACGTGACTC	8146	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5004595	4995534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_4996288_4996905_4996949_4997688_4997835_4998553_4998668_4999380_4999494_5000531_5000677_5001914_5002144_5003344_5003454_5003540_5003652_5004490
tx.9963	chr2	-	3409	19	ISM	ENSMUSG00000026669.15	ENSMUST00000027980.8	3494	20	2014	0	1567	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	627	junction_5	61.7022920117735	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTGTGAAACGTGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5015588	4995534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_4996288_4996905_4996949_4997688_4997835_4998553_4998668_4999380_4999494_5000531_5000677_5001914_5002144_5003344_5003454_5003540_5003652_5004490_5004592_5005670_5005868_5006074_5006192_5008818_5008987_5009756_5009923_5011154_5011390_5011877_5012013_5012138_5012244_5013290_5013624_5015499
tx.9964	chr2	-	3446	20	FSM	ENSMUSG00000026669.15	ENSMUST00000027980.8	3494	20	48	0	10	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	560	junction_19	72.612354435182	27	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGGCTGTGAAACGTGACTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5017554	4995534	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_4996288_4996905_4996949_4997688_4997835_4998553_4998668_4999380_4999494_5000531_5000677_5001914_5002144_5003344_5003454_5003540_5003652_5004490_5004592_5005670_5005868_5006074_5006192_5008818_5008987_5009756_5009923_5011154_5011390_5011877_5012013_5012138_5012244_5013290_5013624_5015499_5015587_5017515
tx.9965	chr2	-	896	4	FSM	ENSMUSG00000026669.15	ENSMUST00000125851.2	866	4	-30	0	8	0	multi-exon	FALSE	canonical	3	560	junction_3	90.1566537878499	8	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGCGCGCGCGTGTGTGTGTG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5017556	5011808	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_5012244_5013290_5013624_5015499_5015587_5017515
tx.9966	chr2	-	2095	11	ISM	ENSMUSG00000026672.12	ENSMUST00000114996.8	2614	14	17845	1	-9003	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	118	junction_4	15.7800506970035	65	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGTGTGTTATCTGATTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5051011	5025453	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_5026293_5028877_5028961_5031924_5032056_5036070_5036230_5037941_5038036_5038964_5039115_5039778_5039895_5041481_5041582_5044949_5045085_5047257_5047332_5050797
tx.9967	chr2	-	1592	11	FSM	ENSMUSG00000039145.17	ENSMUST00000114987.4	1295	11	21	-318	21	318	multi-exon	FALSE	canonical	3	40	junction_3	6.22976725086901	17	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTTGAGATGTGTCCTT	1198	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5680836	5303379	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_5303913_5306306_5306425_5308101_5308190_5315802_5315882_5317899_5318013_5343992_5344069_5359479_5359607_5366799_5366939_5449880_5449956_5570459_5570592_5680724
tx.9968	chr2	-	487	3	FSM	ENSMUSG00000039128.14	ENSMUST00000130142.2	592	3	107	-2	107	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	991	junction_2	39.5	643	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCCTACTGTGATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5803302	5799473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_5799692_5800359_5800498_5803171
tx.9969	chr2	-	1245	12	NNC	ENSMUSG00000039128.14	novel	1827	13	NA	NA	-22	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	320.522971417981	749	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCCTACTGTGATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5849774	5799473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_5799692_5800359_5800498_5803171_5803301_5809704_5809845_5812241_5812318_5815606_5815656_5826086_5826194_5827912_5828009_5837891_5837925_5838466_5838525_5846763_5846836_5849645
tx.997	chr1	+	1384	5	FSM	ENSMUSG00000026547.16	ENSMUST00000111230.8	1586	5	200	2	2	-2	multi-exon	FALSE	canonical	3	984	junction_4	118.904373342615	16	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCTGGCTGTTTCTAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172327813	172334945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr1_+_172327900_172332686_172332895_172333327_172333503_172333752_172333856_172334133
tx.9970	chr2	-	1232	11	NNC	ENSMUSG00000039128.14	novel	1827	13	NA	NA	-21	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	441.700452795783	264	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCCTACTGTGATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5849773	5799473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_5799692_5800359_5800498_5803171_5803301_5809704_5809845_5812241_5812318_5815606_5815656_5826086_5826194_5827912_5828009_5838445_5838525_5846763_5846836_5849645
tx.9971	chr2	-	1245	12	NNC	ENSMUSG00000039128.14	novel	1827	13	NA	NA	-22	2	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_9	321.946943937575	515	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCCTACTGTGATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5849774	5799473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_5799692_5800359_5800498_5803171_5803301_5808757_5808787_5809721_5809845_5812241_5812318_5815606_5815656_5826086_5826194_5827912_5828009_5838445_5838525_5846763_5846836_5849645
tx.9972	chr2	-	1262	13	FSM	ENSMUSG00000039128.14	ENSMUST00000043864.9	1827	13	196	369	-27	2	multi-exon	FALSE	canonical	3	980	junction_5	82.7531050105607	3331	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCCTACTGTGATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5849779	5799473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_5799692_5800359_5800498_5803171_5803301_5808757_5808787_5809721_5809845_5812241_5812318_5815606_5815656_5826086_5826194_5827912_5828009_5837891_5837925_5838466_5838525_5846763_5846836_5849645
tx.9973	chr2	-	1230	12	NIC	ENSMUSG00000039128.14	novel	1827	13	NA	NA	-28	2	combination_of_known_splicesites	FALSE	canonical	3	91	junction_9	296.801433468727	356	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GGAAGCCTACTGTGATGGTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5849780	5799473	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_5799692_5800359_5800498_5803171_5803301_5808757_5808787_5809721_5809845_5812241_5812318_5815606_5815656_5826086_5826194_5827912_5828009_5838466_5838525_5846763_5846836_5849645
tx.9974	chr2	-	1012	8	NIC	ENSMUSG00000039128.14	novel	600	7	NA	NA	-26	0	combination_of_known_junctions	FALSE	canonical	3	70	junction_1	373.173538445478	276	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGGTCATCATTGCTTTTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5849778	5814365	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NIC_chr2_-_5814830_5815606_5815656_5826086_5826194_5827912_5828009_5837891_5837925_5838466_5838525_5846763_5846836_5849645
tx.9975	chr2	+	822	3	FSM	ENSMUSG00000025817.13	ENSMUST00000138549.8	1677	3	-4	859	-4	-859	multi-exon	FALSE	canonical	3	607	junction_1	40	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCATTGCAGACTTCGAAGTA	1932	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5850059	5861372	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_5850197_5859626_5859730_5860790
tx.9976	chr2	+	1379	9	NNC	ENSMUSG00000025817.13	novel	4764	10	NA	NA	-2	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_7	239.550490502524	2862	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGACTTGGGGGTTTTTTT	1934	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5850061	5873551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_5850197_5859626_5859730_5860790_5860859_5865837_5865888_5867111_5867220_5868389_5868486_5869157_5869271_5871164_5871219_5872899
tx.9977	chr2	+	1447	10	NNC	ENSMUSG00000025817.13	novel	4764	10	NA	NA	0	4	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_8	320.9755192388	255	0	NA	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAAGACTTGGGGGTTTTTTT	1936	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5850063	5873551	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_+_5850197_5852931_5853002_5859626_5859730_5860790_5860859_5865837_5865888_5867111_5867220_5868389_5868486_5869157_5869271_5871164_5871219_5872899
tx.9978	chr2	-	2401	12	FSM	ENSMUSG00000025816.16	ENSMUST00000102981.10	2448	12	52	-5	-46	5	multi-exon	TRUE	canonical	3	221	junction_3	37.3630833845388	136	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTGTTCTCTAAGAGTATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5900191	5875792	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_5876833_5878553_5878631_5879037_5879230_5881174_5881373_5881651_5881813_5882665_5882820_5887391_5887502_5887628_5887761_5891309_5891389_5896100_5896167_5897964_5898033_5900067
tx.9979	chr2	-	1380	6	ISM	ENSMUSG00000025816.16	ENSMUST00000026926.5	756	8	-72	3936	41	17	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	245	junction_1	28.7193314685422	119	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	AAGAAAGAAAGAAAGAAAAA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5900202	5886601	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_5887502_5887628_5887761_5891309_5891389_5896100_5896167_5897964_5898033_5900067
tx.998	chr1	+	1299	4	ISM	ENSMUSG00000026547.16	ENSMUST00000111228.2	716	5	3867	-645	3867	-2	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	984	junction_3	119.08633656115	1	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GATTCTGGCTGTTTCTAGGG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	172332685	172334945	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr1_+_172332895_172333327_172333503_172333752_172333856_172334133
tx.9980	chr2	-	513	5	ISM	ENSMUSG00000025816.16	ENSMUST00000026926.5	756	8	-65	4923	48	-970	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	272	junction_1	20.6397674405503	108	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATGTTTGTGGTAAAGATG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5900195	5887588	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_5887761_5891309_5891389_5896100_5896167_5897964_5898033_5900067
tx.9981	chr2	-	1247	3	ISM	ENSMUSG00000025815.14	ENSMUST00000026924.7	3852	18	-56	33003	-7	-5299	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	50	junction_2	4	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCTGGATAGCATTAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5947610	5934991	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_5935798_5937197_5937354_5947325
tx.9982	chr2	+	387	2	ISM	ENSMUSG00000043241.15	ENSMUST00000060092.13	5174	22	-14	98945	-14	-97744	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	197	junction_1	0	433	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	GAGGAAGAAAAGAAGAAACA	1664	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	5956265	5962569	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_5956365_5962281
tx.9983	chr2	+	1884	6	ISM	ENSMUSG00000043241.15	ENSMUST00000060092.13	5174	22	88654	5	-10304	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	220	junction_2	12.63962024746	13	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTGGCATGATTTGTTTTAT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6044933	6061509	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_6045022_6045273_6045373_6051708_6051877_6055148_6055291_6056319_6056441_6060243
tx.9984	chr2	-	2057	4	FSM	ENSMUSG00000045319.14	ENSMUST00000054254.12	2061	4	12	-8	5	8	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	15.3260852434302	4	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGCTTGTTAAATTTTTATAG	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6134945	6104827	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_6106172_6107623_6107877_6118703_6118925_6134706
tx.9985	chr2	-	1925	4	FSM	ENSMUSG00000045319.14	ENSMUST00000114942.9	4398	4	52	2421	-13	-3	multi-exon	FALSE	canonical	3	22	junction_3	5.90668171555645	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAAAGAAATGCTTGTTA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6134970	6104838	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_6106172_6107623_6107877_6118703_6118925_6134852
tx.9986	chr2	-	1505	5	FSM	ENSMUSG00000039063.6	ENSMUST00000042658.5	1851	5	-8	354	-8	-354	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	2.1650635094611	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCTGGGTCATTTCATTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	6217852	6193629	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_6194463_6200393_6200595_6211225_6211324_6213278_6213401_6217601
tx.9987	chr2	+	1838	2	Intergenic	novelGene_746	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GATTCTGGTCTGTGGTGTTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	8533502	8540361	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Intergenic_chr2_+_8533819_8538839
tx.9988	chr2	-	1826	3	ISM	ENSMUSG00000025782.13	ENSMUST00000026888.11	4792	7	-11	37184	-11	-35658	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	137	junction_1	7	98	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGAGACAGAGAGAGGGAGA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10053418	9956546	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_9957757_10047237_10047481_10053045
tx.9989	chr2	-	1097	10	FSM	ENSMUSG00000025781.15	ENSMUST00000114897.9	1166	10	69	0	3	0	multi-exon	TRUE	canonical	3	3857	junction_2	289.314942238504	8446	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCAGTCTCATTATTAATAAT	9573	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10085252	10060840	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_-_10060973_10061580_10061618_10063806_10063904_10064311_10064468_10068096_10068162_10068253_10068398_10068917_10069123_10073420_10073553_10074503_10074539_10085158
tx.9990	chr2	+	1405	5	FSM	ENSMUSG00000037262.8	ENSMUST00000042512.8	1472	5	-38	105	-7	-105	multi-exon	FALSE	canonical	3	38	junction_2	5.40832691319598	156	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TAACTGTTATTTTATCTTTG	4787	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10085396	10097512	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_10085556_10090540_10090636_10094923_10094968_10095051_10095175_10096528
tx.9991	chr2	-	378	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000025780.8_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	14	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGCCTTGATCATAGTGTC	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10182179	10176968	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_-_10177106_10179127_10179254_10182064
tx.9992	chr2	-	624	4	NNC	ENSMUSG00000086748.2	novel	1020	4	NA	NA	8800	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	3	118	junction_3	186.111674957687	2553	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTGTTCATTCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10370052	10344090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_10344284_10346331_10346540_10350061_10350197_10369964
tx.9993	chr2	-	711	5	NNC	ENSMUSG00000086748.2	novel	1020	4	NA	NA	8799	3	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_3	255.585968902833	163	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GTTTGTGTTCATTCTGTTTT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10370053	10344090	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_10344284_10346331_10346540_10350061_10350197_10351924_10352011_10369964
tx.9994	chr2	+	2333	7	FSM	ENSMUSG00000061186.16	ENSMUST00000114861.8	1813	7	-22	-498	-21	498	multi-exon	FALSE	canonical	2	9	junction_1	22.0334341903894	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CTGTTGCTTTCCATCCACTT	2742	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10375299	10444446	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	FSM_chr2_+_10375364_10376219_10376271_10384995_10385047_10398075_10398218_10406799_10406895_10409248_10409490_10442757
tx.9995	chr2	+	897	3	ISM	ENSMUSG00000061186.16	ENSMUST00000114864.9	1901	6	31	45177	17	593	5prime_fragment	FALSE	canonical	3	38	junction_1	3.5	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	85	AACAAAAAACAAAAAAAACA	4720	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10377277	10398771	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_+_10377428_10384995_10385047_10398075
tx.9996	chr2	-	1860	2	NNC	ENSMUSG00000086748.2	novel	1020	4	NA	NA	-17479	-34252	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAAAAACAACACATCCAGCA	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	10396331	10378345	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	NNC_chr2_-_10380085_10396210
tx.9997	chr2	-	2472	2	Genic_Genomic	ENSMUSG00000082424.5	novel	1000	1	NA	NA	-11406	195	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	11	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAAAAAAAAAGAAAAGTGCT	NA	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11426247	11413646	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Genic_Genomic_chr2_-_11414954_11425082
tx.9998	chr2	+	327	3	Antisense	novelGene_ENSMUSG00000026773.20_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CATGGTGGCAAAAATCTCTC	7579	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11543294	11548400	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	Antisense_chr2_+_11543371_11545479_11545632_11548301
tx.9999	chr2	-	537	4	ISM	ENSMUSG00000037197.12	ENSMUST00000040314.12	1599	12	15467	2	-627	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	3	1349	junction_3	33.7934904974316	58	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TGTGTGCTCTCTGGTTGTTT	4124	False	NA	NA	False	NA	NA	NA	11592606	11590249	ES_CapTrap_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_CapTrap_ONT	ISM_chr2_-_11590540_11590644_11590718_11591677_11591777_11592531
